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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_0640 RND family efflux transporter
ATGTTACTTGCTTTAATACTTGTAGTGATTGCTATATTTCTCTTTCTGCA
TAATTTACGATCCGTGATTATTCCAACTATTGCCCTCCCCTTATCTATTG
TCGGTACTTTTGCCTTTATGTACTTATTCGGCTTTAGCATCGATAATATG
TCTTTAATGGCTCTAACGCTTGCGATGGGTTTCGTGGTAGACGATGCAAT
AGTAGTGCTTGAAAACATCACACGACATATGGAAAAAGGTGAAGGTAAAA
TAGCGGCATGTATCAACGGTACTAAAGAAATAGGATTTACTATCGTCTCA
ATGACTTTATCCCTAATGGCAGTATTCATTCCGATATTATTTATGAGCGG
AATTTTAGGGAAATTACTGCACGAACTTGCCGTTGTTATTACTACCGCTA
TTTTACTTTCGGGAGTTATTTCGATAACAGTAACTCCAATGCTATGTAAT
GTGTTTTTAAAAGACCGTCATTGCGAGGAACGTAGTGACGAAGCAATCTC
AGGACACCAAACCGAGATTGCCACGGCGTCTTTGACGCCTCGCAATGACG
AATCATTATTAACAGAAAAAGCCTTTGAATATGTTAAACAAAAATATAGT
AGCAGCTTAAAAACGGTAGTAGAGCATTCAAAAACTACTATGCTTATATT
ATTATCGCAACGGCTTATTTATTTGGGAAAGTCTGTAAAGGTTTTATGCT
TGATTCCGATACGGGACAAATCTTAG
>RF_0323 unknown
ATGATGTGGTTATTAATTGCTATTGGTTTAACCGTTTCGGTTCTTATTAT
AGGGGTAGTGTCGATGGCTATCGGAGGAAAGTTTGATAAGAAATTTAGTT
CAAAGTTAATGACTTTAAGAGTTTTTTTTCAGGCAGTTGCTATATTTTTA
TTGATTATAATATATTTTTATAAAGTTAAATTATAA
>RF_1056 unknown
GTGTATAATGGTTTTTTAACAAAAAATAAGGTAGAAATTATGACAAAAAA
TACAACACTATATAATAGTGCTAGCATAGAGAATCTAGGAGCAAGGGATA
GTTCGGTATCAGGCAGTGATACACTCAAATTTGGAAATTTTTCTAATATA
AATTATAATAGCTTAGGTAATGGAGCAATAGTTTCTTCGGCGAATGGACT
TCATGCTACTATAAATACAAGGCTTACTAAAGATATTATATTTAAACCGT
GTTGTCCTAAAAATGATTTTAATTATTATTATGATAATAATGATAACGGA
GGGGAAGGCTTCGGGATATTAATAGGTAATTCTGAGTCTATAGAGGTTTG
TTAA
>RF_pd07 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
TTGAGTCCTATTGAAACTTTGGTAAAACCATCAATTTTGAACACTATTGT
AGCAAAATTAGATGATTTACATTTATCAGCAACGCATAGTGACATAAAAG
GTGATGCTTTTGAATATTTTCTACGAAATTATGGAGGAGCTGATACTGAT
TTTGGCGAGTATTTCACTCCAAGACATATAGTAACTGCTTTGGTCAATTT
GCTAGACCCCAAGTTTGGTGAGAAAGTTTACGATCCATTTTGTGGTACTG
GAGGTATGCTTATTACATCGTATAAGCATATTTACGATAATTTAAGTTTA
AGAACACCGGAAAACATACAAAGATTAAAAAAACAGACTGTTTATGGCGG
GGAAATCACTAAGATGTATCGTATTGCTAAAATGAATATGATATTAGCAG
GAGATGGACATAGCAATATCGTAAGACAAAATAGTTATGGTACCCCTGAT
ACTATAAAGCAAATAGATGTTATTAAAGATGGTTTTGTTACTAAAGAGAA
TATAAAGATAAAATACGATGTAGTAATTAGCAATATGCCTTTTGGTCGTA
AAATGAAGACAGAGCATGCAGGGCTGTATGGTTTTAATACTAGATCAGCT
GAAATTACAGGAGTTTTACACTGTTTAAATTCATTAAATAATAATGAAAA
TGCAAGATTAGGCTTAATAGTTCCTGAGGGCATTTTGTTTGATAAAAGAG
AGCTGATAAGTATTAGGTCTATATCTTTGTCTGATGCCTTAATCTCCTCT
TCGTCTCCAGTAAATTTGTATATATGTTTAGTGATATTATTAATATTATC
ACTAATTCTTTGTGTGTTGCCGTTATCACCAATTACGGCTATACTTCTCT
CAGCTTCCTCTTCCATACTCATAGCAGCTACACCAAGAATGATATTGCTA
CTATTTCTTATCATCAGCTCATCTATTAACTTCTTGGTTCTTGATAATGC
TGTTAATCTAACTAGTAAACACTATAATATTAATTGGATATGTTATTAA
>RF_1097 unknown
ATGTTAAATTTCCTAAATAATACTGCATCACAAAAAAGATTTGTATCTAT
AAATAATAGAACTACGGCAAGCGATTTACCTGAATCGTTTTGGCATTCTA
TTGCTGAAAATAGCTGTGATATTAATTGGAAAAATATACCATTACAAAAA
AGTCCTTTTCAGATTGTTACTACTCAAGGTTTAATTCAAGAATTAAAACC
CAAAACCATAATTGAATTTGGAAGTTTTAAAGGAGCTTCCGCCCTTTGGT
TGGCTGATATACAAAGTTTATCAGTAAAAAACGGTAAAGTTATTAGTATA
GATATCGATTTTGAAAATATTGATCAAGCCGTAAAAGGTGATAATAGAAT
AGAATTTTTACAAGGCGATTCTAATAAAGTAGAGGCAATATTCCCAAAAG
AAAAAATATCCGAAATAGTACATCCCATAGTTTTAATAGAAGATGCTCAT
ATTAATACTATAGGTATTTTAGAATATTTTCATAATAATATCTTTGAAGA
AGGGGATTATTTCATCATTGAAGATACTAATATTGACTATAATAATGCTT
GCTATGATGTTTGGCGGAAAACTTTAGATGAAAAAACTTGTATAGCAAAA
TTAGAAAATTTAAACAATAAAATCGTTAGATTAACTAGCTGGTTGAAAGA
AAAAAAAGATTTATATCTAGTAGATACAAAATATGTAGATCCTTTCGGTA
TTATTAATGCTTCTAAAAATTGGAACTCAGTCATAAAAAAGATTTAA
>RF_0774 Streptomycin 6-kinase
ATGGATAGATTTAGAAATAATATAATTAGTATATATAAAGAGCAAGGGGA
AATCTGGCTTGAAAAACTACCTGAAATTATATCAAAATTAGCTCAAGAAT
GGAACTTGTCTAACCTTAAGCCTATAGATAATTTATCTTTCAATTATGTT
TTATCTGGTTATCAAAATAATAAGCCTATTATACTGAAGCTAAGCTTTAC
TGCTAAAGACCTAACAAACGAAGCAAAGGCTTTAAAAGTTTTTTCAGGGT
TTGGTGCTGCAACTATTCTAGCCCAAAAAGATAAAGCTTTACTGCTTGAG
CGAGCCGTTCCTGGTATTTCTTTAAAAGAATATTCATCAGATAACAAAAT
TGCTATAGCTTGTTCTGTTATGAATAAGCTGCACAGAGCAGCTATACCAG
AAATTCATCACTTCCCTAATATCAAGGATCAGCTGAAAGCTTTGGATAAA
GAATGGGATTTGCCTAAAACTTACTTACAAAAAGCAAGAAAATTGAGAGA
TGAGCTTCTTCAAAATACTGAGCCTCAAATTTTACTTCACGGTGATTTAC
ATCATGAGAATATGTTACAAAATAGTAAGCATTGGGTAGTAATTGACCCT
AAAGGAGTAATTGGATATCCTATAAATGAAGTATGTGCATTTATTATAGA
TATAAAGAAAGATACCGAATTCGCAGCAAATTATTTTGGCTTTAAATTAC
AAGAGGTTAGAAGCTGGTATTTTGTCCAGCTTATGTTAGCTATCTGTTGG
AATCTTGAGGATGGAATAGAAAATGAGTTATTTTTGAAACTTGCCGATAA
AGCATATAGCCTAGTTTAA
>RF_0548 ABC transporter, ATP-binding protein
ATGGTTATAACAAATGTTTTAGATTTAATTGAAGCATGTATAAATAGTAG
TTTTATTAACTATACCGGAAATGATGGCAATACATTAATTGCATTAACCT
TACTCATACAGGACCCTAATGCTGCTATAGGACCTCTTATTTCTCAAGGA
GCAAAAATCAGTATTTTATGGTGTGGAAAAAATATAATAAGCACACTATT
CCAATCATATAAAACTTCTTTAATACAAAATACTCAAGATTTAATCGAAC
AAAAGGCTTTAGAACTGTTACTAAACGAGGAATATAAAAGTAAAATCTTA
GGATTAAAGGATATAGAAGCTATTACTAATAATTTATTTATTGATCAGAA
TAGTTACATACCGGCTCAATCTACTTTATTTGAAGTAATAACCTCTGGTC
CTGATCAATCAATCATTAAAAGTAATAAACAATCATTAGAAGAAAAAATT
AACACACTATTTATAAAATTGGATCTAGGTACATTAATTACGCACTTAAG
TGATAAAAATTATGATGTAATAAATGCACCGAGCGGCGGTCAAAAGAAAA
AAATTGGAATCATTAAAGCTATAATTTCAAACCCTAAAATATTAATTTTA
GACGAGGTGTTTGCCAATCTTGATAAAATATCTATAGAAAATGCACAACA
AGCTTTAAAAGAATTTTTACCGGAAACTTTAATGCTTGTAGTACATCATG
ACGGTAAATCTCATGATTATAATAATTTTTATGATCAGTATATAAATCTT
GAAGATTTGTACGCTGAAATAAAATTATTAGGAGAATAG
>RF_0639 RND family efflux transporter
ATGCTTGATTCCGATACGGGACAAATCTTAGTTTTTACTGAAGCAGCCCA
AACTATTTCCTTTGATGCGATGGTCAAAGAACAACAGCAAGTAAGCGATG
TATTACTTAAAAATCCTAATATAGATTCATTCTTTTCGGCAGTCGGTGTT
TCAGGTAGAAATTCTGCCGTCAATCAGGGTACAATCTTTATTAGCTTAAA
ACCAAGAAATCAACGAATTGGGGCAGACGAGGTAATTGACCAGCTACGCT
CAAAACTAAATCATTTAGTAGGTTTAAGGGTATATATCCAGAACGTACCA
ACCATTACGATTGGCGGACAGGCAACCAAAAGCCAATATCAATATACTAT
GCAAGGACTCGATCAAGATGAGCTATTTAGCTTTACACCGAAATTAAAGG
ACAAACTCGCACGACTGCCGGGTTTTACTGACGTAACTTCAGACTTACAA
ATAGCACAGCCACAAACCTTAGTGCAGATTGATAGATATAAGGCTGCAAA
ACTCGGTATATCGGTAGAGCAAATACAGAATATCTTATATGCGGCTTACG
GTGCTGAGCAGATTTCAACATTATATACCCCAACAGCTCAATATGACGTT
ATTTTAGAGCTAGACCCTAAATATCAAACAGATTCATCAATGTTATCTTT
AGTCAATATTAACTCTGCAAACGGCAATTTAGTACCGTTAACGACGCTTG
CTAAAATCGTTAATAATGTCGGTCCTCTTAGTATTTCACATTTCGGGCAA
TTACCTTCGGTTACAGTATCATTTAACCTACAAGACGGGTATTCAATTAG
TGATGCCGTTCCAAAAGTTAATCAAGCAATAAAAGGCCTACAAATGCCGG
CTACGATTACGGGAAGCTTCCAAGGAACGGCTCAAGCATTTCAGTCGTCT
TTTTCCGATCTTGGTTTATTGCTTGGGCTTGCCGTTATAGTCATTTACAT
TATCCTTGGCATGTTATATGAAAGCTTCGTACACCCGATAACCATACTTT
CGGGACTACCTACTGCTATATTCGGAGCATTACTTACATTGCTAATATTT
AATAGCGAGCTTGATATGTACGGATTTGTCGGGCTTATTATGCTAATCGG
TATCGTTAAGAAAAACGCTATTATGATAATCGATTTTGCTCTAGAACTTG
AGAGAACCGACAATAAATCTTCGCATGAAGCAATCTATGAAGCATGTATA
ATAAGATTCAGACCGATTATGATGACTACCTTAGCGGCTCTAATGGGAGC
TATGCCTATTGCTCTTGGAGTCGGAACAACGGGAGCAGAGAGAAGATCGT
TAGGACTTGCCGTAGTTGGCGGCCTACTCACATCACAATTACTTACTCTT
TATATTACACCGATAATTTTCCTATATTTAGAAGCAGCTAAGAGATGGTT
AAAAAATAGCAATTACAAAGCTGAAATTAGAAGCTATCTGGAATTAAATT
GGAAAGATTAA
>RF_0556 unknown
ATGATAAAAAAAATAGCTGCCGGCATCATAATTTGTTTCTCATTATTGTT
ATTTATAATCTTTGGTGCATTATCTTTTGTTAACTACAATTCGGTTACCA
ATAATCTTACCAGTCATTTAGGAATTGCAAAAGAAAATATTGGTAAAATA
AAGATGAATAAATTTCCTTTGCCTTATTTAATTATTGAGACGATAAAGGA
AGGAGGAGAGTTAGATTTAGAGCAGATTAAAATTCATTTTTCGTTGTGGT
CGCTTATAAAATTTAATCCTAAAATTAATAAAATAGACATATTAGATGCT
AAATTTTATTCTAATTCTAATGTATTAAATATTTATAATCATGAAGAGTT
AATAAAGAATTTCTTTAAATATAAATTACAAAATATAAATCTAAATGTTA
CTAATCTAAGTATTATTAATAAACAAGATTATTCTATTTTAAATTTTAAT
AATTGTATATTAAAAAAAGAAAATGCTTTATCATCTAATTACATATTTAA
AACTACAAGTAACTATATAGGTAAAATTTCAGGTTCAATTAATAAACGTG
ACGATATAGTAGATTTTAGTCTTGATATTGATAATAATGATTATGGTTTT
AAGCTATCGCAAATTTACAAAGATTTTAAGCTTACTAGCGGTAGCGGTGA
ATATCAGATTAAAAATTTAGCATCGGTAATGTATAATATATTACCGGATT
TAAACCATCTTTTTAATAAATTTAATCAAAATGAGGCAGTAAACGTTAAA
TTTAATATTTCAAATAATGAAGATGAAATAGAGCTAAAAGACATAGTAAT
AGCATCCTCTTTTATTACAGGTAATGGATTTGTTAACATTGCTAAAAATG
ATAATATTACTACTAATGTGAAATTAGATTTTCCTAAAATAGATCTAAGT
TCGTTAATTTCTCCAAATGCAGAGGTAACATTTAATACTTTTTCTTCAAA
TATTAGATTTATTTTTGCTGATAAATTACTTAAAGCAGACATAGCAATTA
ACGAAATAATTTTAAGTAGTAATGAAGCACTAGAAAAAATAGTCTTTTCT
TCTAACTTATCAAAGGGTACTTTAAAGATAAATGAACTTTCAGGTAATAT
TAAGTCAGGTGGAGAATTTAAGCTTACAGGTAATGTAACACAGAATGCTG
TTAGAAGTATGTTCGATGGACAGCTATATTTAAAGCATAATGATATAAAT
TTGTTACTGAATATTTTAGGATTTAACGATGTTACTATTAAAGAAGCTAT
TCCTTTTAGCTTGTCGTCGGATTTAAAACTCACTTTAATAGATTTATTTT
TTAAAAATTTATTACTTAAAACGGACAATTTAAATTTATCGGGAAATTTT
TCTAGTAAATTTATTGCTCAAACACCTCGTTTAGATGCTACGCTTAATAT
ATCTTCACTTGACTTAAGCGGTAGGACGTATCCGATAATTTCGCCTCTTA
TCGAATTTACAAAAAATTTAACTAAAGATATGAAAACTTTAGATTATCCA
AGTAAATTTATTCCTATTAGAACAATAGGATATTTAGCTAATTTAGATAT
TTTGATAGATAGTGTTAAGTATAATGATCATGTATTTGACAAAATGAATT
TGCTTGCTAAAATCGTACCGGCTAATATAAAAATTAGTAATTTAGATTTT
AAAACCGCGGGCAGCTATTTATCAACTAGCTGGAACTTAGATGCTTCAAG
TGTATTACCGTCTTTGACCATAGAAATTAAGGACGGTAATCTTACTACTG
ATTTATTATCACCGGCAGGAATGCTTAATTTAAGAAATAAATTAATAAAT
GATTATAGTTTAGATAAAGCTATATTGCAATTTTACGGGACATTATCAAC
ATTATCACAGAATAATTTAATATTGAAAAATGTTAAATTTTATGTAGCAA
ATAATAATAATCTATTACAATTTAATAATATTGAAGCAGAATTATTAGGC
GGCAAGCTTCAAGGTAGCGGCAATATTTTATTGGAACCTTATTCTATAAA
TTTCGTATATGCTTTAAATACAATAGATTTAGATAAAGTTTCGGCTCTTA
TGCCTAAAATATTTACTGCAAGTAGCGGAAAAGTAAGTATAAGCGGTAGT
TTAGGGACTAACGGTAATAGCCTTCAAAGCCAGCTATATAACCTTACTAC
AAAATCACAATTTGCTATAAACAATATAGATGTTAATAATTTTGGAATTG
ATTCTTTTATAGAAAAAATTAATACAGCTGATTATAAGGTACAAAATTTA
GATAAAGATATAAATACTGCTATAACCACAGGACAAGAAAATATTAGAGG
TATAAGCGGTGATATTGAACTACAAAAAGGTATTGCCCTTTTAAAGAAAG
TAAAATTTGCAACACAATATAGTAGCGGTGCGGCTTCTTTTGCAGTTAAT
ATATATAATTTTGATATGGATGCATCTAGTATTTTATCATTTTACGTACC
GGCAAGGCTTGTTAAATTAAATCCCTCAAATACAAGTTCCGATAAAGATA
GTTTGGTACATCTTAATATAAAAATGCAAGGGAGTATTTTTGCTCCTAAG
AAAACTTTTGATAGTAGTGAGCTAAAAAAATTACTTATACCACAAACAAA
AACAGAAGAAGCTGCTGATTCAGTTAACCATTAA
>RF_0919 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit
TTGTTCCATTGCAGCATTTTGTTTCTGTGTCATTGTAATTTCTCTTTTTG
TTATATTTTCTTTTATACAACCTTTGAGAAATTTACACACTTATTTGGAC
AGTGCCACCTTATACGTGTTCTAATCAACACTCCTTTACCTGAAGATATA
AAAAATAATCTTTATACAGGTGATTTTGTTTCTTGTAGAGAACATTTTGA
TAAACAAGAATTAGACGGTAATATAGAGCCTACCGAGCAAGATAAAGTAC
TTTATGCTTTATGTCGTCCTGAAAGATTACTTGATTTGGTTGCTAATTTT
TGTGTTTTTGATAATTCAGTAAGAAAAATAGCCCGTCATCATCAGTTTTT
TGCTACACATGTAATCGCAAAAAGAGTATTCCAAGATGATAAGCATACTA
TCAGAAAAGGGGGAGTGATATGGCATACGCAAGGTACGGGCAAATCTTTA
ACAATGATATTTATTGCCAAATTTTTACTTGAATCTGCTAATATTGCAAG
TCCACGTATCATAATTATAACCGACAGAATTGAACTTGATGAGCAAATTA
AACATGCTTTTAAAAATTGTGGATTTGAGCCTAAACTTGCAACTTCATCC
AAAAATTTAATTGAACTACTTAGAGGCGGTACGTCTGTTATAACTTCAGT
AATTCATAAATTTAACAAAGCTTTTTTTCAAGGCTTTCAAGATTTTAATA
ATAATATTTTTGTCCTTGTCGACGAAAGTCATCGTACTCAGTACGGTGAT
TTAGCAGATAAAATGAGAATTATCTTGCCTAATGCTTGTTATCTAGGATT
TTACTGGTACACCGCTTTTAAAAGAGCAAAAAAACACTATGGAGAAGTTT
GGAGAGCTAATTCATAA
>RF_0641 RND family efflux transporter
TTGGGTATTTCAGAAATATTTATTAAGCGTCCGGTTCTTGCTACTTTATT
TATGGCAACTATTTTACTGTTTGGAGCATTCGGCTATAAGCTATTACCGG
TAAGCGTTTTACCTGATATCGATTTCCCGACTATTCAGGTTTCAGTAAGC
TTGCCTGGAGCTGACCCGACTACTATGGCATCTTCGGTTGCATTACCGCT
TGAAAAGCAATTCTCGACAATATCCGATATTGATTCGATGAGTTCGGTTA
ATAGTAACGGCACTACTCAAATTACTTTGCAATTTAATTTAGACCGAGAT
ATAGATGCCGCAGCACAAGACGTACAAGCAGCTATTTCATCCGCCGCTAA
ACAATTACCGAACGACTTACCTACCCCGCCCTCATATCGTAAAGTAAATC
CTGCCGACGCACCTATATTTTATTTATCTTTAACCTCTGATACTCTACCC
TTATATACCGTTGACTATTACGCTGAAACAATTATGGCTGAGCGTTTATC
AATGTTACCGGGCGTTGCACAGGTACAAGTTTACGGCTCACAGCAATATG
CAGTGCGTGTGCAGGTTGACCCTGTTAAAATGGCAGCAAATAATATAGGG
CTTGACCAAGTATCAAATATTATCAGCTCTGCCAACATTAATTTACCGAC
CGGAGCTTTATACGGCAAAGATCTCTACTCAAGCATTAGAGTCCCCGGGC
AGTTACAAAATGCTAAAGAATATAACGATTTAATACTAACTTATAAAAAC
GGTAATCCGCTTTTTCTTAAAAATATAGGTAAAGCCATCGATAGCGTAGC
TAACAATAAAATAGCCGCTTGGTATAGGGATAAGCCGGGGGTAATACTTG
CTATTCAGAAACAACCGGATACTAATACTATTGAAATAGTCGACTCTATA
AAAGAAGTATTGCCGTTACTCCGCAGACAAATCCCTAAGGGTGTTAATAT
TAATATCATGTTTGATAGGTCAATTTCTCTATCAGAGAATCGGTAA
>RF_pd06 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
ATGCCATTATTAAATGAACGTGATGTTGAAACACGAATTGAAGAACAACT
TAAAAATCTTGAATGGATTGACAATCCTAGTTTACCTAATCGTAATGTTT
ACAAACAAAATCCAAAAACAGAAAAACAGAGGAAAGCATTAGGTAGTAAG
CGACCTGATTATACACTTTATCGTGATAATAGTGATGACCCCCTTATTGT
TATTGAAGCGAAGCGACCTAATACAAATCTTTCACAAGCTTTAGAGCAAG
GTAACAATTATGCTAAAGCTATTAATGCACCTATTGTTATAGCAACAGAT
GGAATATTTGCTAAAACTTTTCATACTAAAATGCAGAAACCACTTTTTCT
TGACAAGGAAGAAATTAGTAAGATTATTCAACAATCGTTAGCTATTGAAT
ATATTGATAAGAACGAATATTTTAGCATTGATGAGAAAGTAATTAAAAGT
CGAGACGAATTACTAACGATATTCAAAGAAATCAACAATCAATTCAAGGA
TGCGGGAGTAAGTAGAGGATTGCCTCGAATTGAATTGTTTTGCAATCTTC
TTTTCTTAAAAGTCATTACAGAATTAGTAGGTACTAATAGTCTTATTCAT
TCGCTTCCGGACTGGTGCACATGGGATAAAATAAAGGCAAAAAAGGGAGA
TGATTTATGGACTTTTATCAATACACAAGCTTTTGATTATTTAAGCTTTT
GA
>RF_1377 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
ATGAACACTGTTTTACAAGGTTATGATGGACATAGTGAAATCCAGCAAAT
AGATACCCTAAGAAACCCTTACTATATTAGCTCCAAGACAAGCCAACAAT
TAAAGTTTGACATAATAGCTACTAATATGCCATTTTCTCAAACTATCACT
AAAAAAACTATAAAAAACGGCAAAACTATAACAGAAAATCATATAGCTCC
TCTTTATTATAACGGCATCGCCAAAAATAACGGTGATGCTGCTTGTGTTT
TGCATTGTCTACAAAATTTAAAAGAAAGTGGTAGAATGGCCTTGGTAGTA
CCTGAGGGATTTTTGTTTAGGAAAGACACATCTAGCGTCCGTCAATTTTT
ACTGTCAAAAGCAAAGCTGCAACTCGTTATCTCTCTACCGCAAAGTACTT
TTTTACCTTATACAGGAGTAAAAACGTCGATACTTTATTTTACCGATGCA
CATAAACCAGATAAACAGAAATATTATTGA
>RF_p07 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
TTGAGTCCTATTGAAACTTTGGTAAAACCATCAATTTTGAACACTATTGT
AGCAAAATTAGATGATTTACATTTATCAGCAACGCATAGTGACATAAAAG
GTGATGCTTTTGAATATTTTCTACGAAATTATGGAGGAGCTGATACTGAT
TTTGGCGAGTATTTCACTCCAAGACATATAGTAACTGCTTTGGTCAATTT
GCTAGACCCCAAGTTTGGTGAGAAAGTTTACGATCCATTTTGTGGTACTG
GAGGTATGCTTATTACATCGTATAAGCATATTTACGATAATTTAAGTTTA
AGAACACCGGAAAACATACAAAGATTAAAAAAACAGACTGTTTATGGCGG
GGAAATCACTAAGATGTATCGTATTGCTAAAATGAATATGATATTAGCAG
GAGATGGACATAGCAATATCGTAAGACAAAATAGTTATGGTACCCCTGAT
ACTATAAAGCAAATAGATGTTATTAAAGATGGTTTTGTTACTAAAGAGAA
TATAAAGATAAAATACGATGTAGTAATTAGCAATATGCCTTTTGGTCGTA
AAATGAAGACAGAGCATGCAGGGCTGTATGGTTTTAATACTAGATCAGCT
GAAATTACAGGAGTTTTACACTGTTTAAATTCATTAAATAATAATGAAAA
TGCAAGATTAGGCTTAATAGTTCCTGAGGGCATTTTGTTTGATAAAAGAG
AGCTGATAAGTATTAGGTCTATATCTTTGTCTGATGCCTTAATCTCCTCT
TCGTCTCCAGTAAATTTGTATATATGTTTAGTGATATTATTAATATTATC
ACTAATTCTTTGTGTGTTGCCGTTATCACCAATTACGGCTATACTTCTCT
CAGCTTCCTCTTCCATACTCATAGCAGCTACACCAAGAATGATATTGCTA
CTATTTCTTATCATCAGCTCATCTATTAACTTCTTGGTTCTTGATAATGC
TGTTAATCTAACTAGTAAACACTATAATATTAATTGGATATGTTATTAA
>RF_0918 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit
ATGTTAATAGCCCCATCTAGATCTATTGCTATTCATTTTAAAAAATTTTT
GGATGAGATAAATCAAGTAAGTTCTGAAGTTGTTATATCTTCTGTCGATG
ATCGAGAAGGTCATGAGGACATTGAAAGCAAAAATGAAATACAGGAATTT
TTAGTTACCCAAAAAGGCTTAAGATCAAACCAAATTATTGAAAAATTTAA
AAATGCCGATAACCCTGAAATTTTAATTGTAGTCTCAAAATTACTAACCG
GTTTTGATGCACCTCGTAATACTGTAGTTTATATATGCAAAAAACTAAAA
GAGCATAGTCTTTTACAAGCAATCGCTCGTGCAAATCGTTTATTTGAAGA
GAACGAAAAAACTAAGGAATACGGTTATATAATTGACTATGAAGGGTTAG
CAGTCAAATTAGATGATGCCTGCAAACTTTACGATAGTGATAAATTAAAA
AATTTCGATAAAGAAGATTTAAAAGAGGCTATATTTGTCGTAAATGATAA
AATAAAAGAGCTTTTCCCACTACTGCAAAAAATTAAAAATATTTTTACAA
ATGTATCTAATAACTCAGATCTTGAACAACTAGAACAATATTTAGCTGAT
GAAAATATACGGAGTAATTTTTATTTCCTGCTAGACAGGTTAAAAAATTT
GATGTCTATATTATCTAATTCTAATAAATTAGCTGAATCTTTTAAACAAA
AAGAATTAGAAGAATTATATAACGAATTAAAAAACTTTAACAAGCTTAAG
AAAATAGTAGAAAAGCGTTATAATGAAAAAACAGATAAAAAAATATATAC
CGATCAAATCGCAAAGTTACTTGATGAGCATATTACTGCTGGTGATATTA
TTAAAACTAGAATAATTAACATTTTTGATGAGAAAATATTTATAAATTTT
ATGAAAAGAACAGACATTGCAGGTTTAGAGAAAGCTAATCAAATTAATAA
GGAGATAAGATATATTCTTGATAATTGTATGCGTATTGATCCTGCACTTT
TTCAGAAATTTACCAAACTTATAAATGATACAATAGCAAAGTACAATAAA
AGTTTATCAGATAGTGAGCTTTTTAATGAATTTATAAATATAATAAATGA
ATTTAAAAATGATGTACCAAGTGAATTAGGCAACAACAAAACAAAGCTAG
TTTTTTACAGAAAATTACTTAACTTTTTACAGGATAAAACAAATCAAAAT
CAGCATGAAAATGCCATTCAAATTGCTCATGATACCTATAACATCATTAA
GCAGAAAATAATTGTTCATTGGTCAAGAAATACTAAAACCATAAACGAGA
TGAGAAATTCGTTAGATGATTATTTTTTTGATGTTGTTGAGAAAAAAATG
GGTATCATTTTTAAGCCTGAAGATTTAAACGAAGTCGTGGAGAGTTTAAT
TGATTTTGCTAAAGAGCATGAAGCTAAATGA
>RF_p06 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
ATGCCATTATTAAATGAACGTGATGTTGAAACACGAATTGAAGAACAACT
TAAAAATCTTGAATGGATTGACAATCCTAGTTTACCTAATCGTAATGTTT
ACAAACAAAATCCAAAAACAGAAAAACAGAGGAAAGCATTAGGTAGTAAG
CGACCTGATTATACACTTTATCGTGATAATAGTGATGACCCCCTTATTGT
TATTGAAGCGAAGCGACCTAATACAAATCTTTCACAAGCTTTAGAGCAAG
GTAACAATTATGCTAAAGCTATTAATGCACCTATTGTTATAGCAACAGAT
GGAATATTTGCTAAAACTTTTCATACTAAAATGCAGAAACCACTTTTTCT
TGACAAGGAAGAAATTAGTAAGATTATTCAACAATCGTTAGCTATTGAAT
ATATTGATAAGAACGAATATTTTAGCATTGATGAGAAAGTAATTAAAAGT
CGAGACGAATTACTAACGATATTCAAAGAAATCAACAATCAATTCAAGGA
TGCGGGAGTAAGTAGAGGATTGCCTCGAATTGAATTGTTTTGCAATCTTC
TTTTCTTAAAAGTCATTACAGAATTAGTAGGTACTAATAGTCTTATTCAT
TCGCTTCCGGACTGGTGCACATGGGATAAAATAAAGGCAAAAAAGGGAGA
TGATTTATGGACTTTTATCAATACACAAGCTTTTGATTATTTAAGCTTTT
GA
>RF_0331 abcT3, Multidrug resistance ABC transporter ATP-binding protein
GTGATAAAATACCCTACTTTATCTAAATCAACATTTAGCTTAGGTATTTA
TTTTTTAAAATTCGATAAAGTTAAAATTACTTTATTGACTGTAATCTGTA
TTTTACTCGGTATGATTCCGGCAATTGATAGTATATTACTTCAGAAAATT
ATTGATCTAATCGAATCTTTCAGTGATGAGAACGCAAATAACCTTTTATC
TTCCATGATTTACTGGGCAGTATTTTATGCTCTTTGGTGGGAGAGTATTA
ATATAGCATATCGTTCATATGATTATTTGTATCTAAAGACTATGCCCGTA
ATAAAAGGAAAAATACTAAATGAACTTTATAATTATACTCAATATCATAG
CCATAAATTCTTTCAGGATAATCTAGCAGGACATATTAGCAATCGTATTA
CCGAAACCGCAAGATCGTTTGAGATGATTATTTCAATATTCGGCGAAAAA
ATTCTTCGTAAACTAGCTATTATCGTATTTGCATTAATTGCTTTATATTC
CGTACATTACGTTTTTGCTACGATATTTATTTTATGGATTACGGTTTTTT
TAGGGCTGAGTGTTCTTTTCTCGGATAAAATCAATAAATACTCATTAAAT
TATGCTAGAAGCCAATCTTTTGTTGCCGGTAGTATCGTAGATGCAATTAG
CAACATTAATGCGGTTAGAATGTTTACAGCCCATAAATTTGAACGTCAAC
ATCTAGAAACAAGAGTAGAAAATGCCGTAGCCGATGAACAAACTATGCAG
TTCTTCATGTTCAAACTGCGTTATGCTCTTGGGACTTCTTGTTCAATAAT
GATCTTTATAATGATTTATTATTTATCTAAACTTCGTAGTGAATTATCTA
TAAGCATAGGTGATTGCGTATTAGTGCTAACATTATGTATAAATGTAGCA
GACGATATTTGGGATTTAACACAAGAAATCGGTGATATGTTCGAGCAGAT
CGGGGCATTTAATCAAGGCTTATCCCTAATGGCACCGCATATTATAACGG
ATATTGAAAACGCTACTCCTTTAGATATCAAAGAAGGGATTATTGAATTT
AGAAATGTTACCTTTAATTATCACCATAATAATAATTTATTTCGTAATAA
ATCGGTATTAATTCCAAGTAAGCAAAAAGTGGGACTAGTTGGTTTTTCCG
GTTCAGGGAAAACCACTTTTATTAGTTTGCTCACGAGATTACATGATATA
GAAGACGGAATGATTTTAATAGATAACCAAAATATTAAAAACGTAACTCA
AGATTCTTTAAGAAAAGCCATTAGCCTTATACCGCAAGAGCCGGTACTTT
TTCATCGTACTATTTTAGACAATATCCGATACGGAAAAAAAGAAGCTACT
CTTGAGGAGGTTATAATTGCTGCAAAAGCTGCACATATTCATGATGTTAT
CGATAATCTACCAGACGGTTACGATACTATGTGTGGAGAACGAGGAAATA
ATTTATCCGGCGGTCAGCGTCAAAGAATTATCATAGCAAGAGCCATCTTA
AAAAATGCTCCTATTTTGATTCTTGATGAAGCAACAAGTAGCTTAGATAG
CGAAACGGAAAGTCTGATTCAAGAGTCAATGGATTATTTAATGCAAAATA
AAACCGTGATAGTTATTGCTCATAGATTATCTACTTTACTCAATATGGAT
AGGATTTTAGTCTTTGAAAAAGGTAGTATAATCGATGATGGTAGCCACGC
AGAATTACTAAAAAATAGTAAGCTATATCAAAAATTATGGAACTCCCAAG
TTAAAGGATTGATAGTGTGA
>RF_1109 acrF, Hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1 family protein
ATGTTATTGTCTGAAATTTGTATTAAACGCCCTGTCTTTGCTACAGTTTT
GAGTTTGGTTATCGTAGCTCTTGGAGCAATTTTTTTTACCAAACTACAAA
TTAGAGGAACTCCGGATATTTCAGTTCCCATTATAAATGTCGAAGCTCAT
TATGCAGGTGCCGATGCTTTATATATGGAAAAAGAAATAACGACGCGTAT
AGAAAAAGCTTTAAAGACGGTTAAAAATTTAGATTATATAACTTCTCAAA
GTTCTACAGGCGAAAGTAGTATTACTTTATCATTTTTACTATCTACCGAT
ATTGAAGTAGCATTAAACGATGTTCGTTCTAAAATATCGGATATCACTTA
TATGTTCCCGCAAGATATGAAAGCCCCATCAGTTGCAAAACTTGACGCCG
ATAGTTTCCCAAGCCTCTTCATAAGTGTTGAAAGTGATCAATATAGCGAT
TTAGAATTAACAAAGATCGTCGAAGATAATCTACAAACACCTTTAGATAA
ACTTGAAAGTGTAGGACAGTCACAAATTTACGGCGGTCGGGAATATATAA
TGAGAATAGAACCTGACTCCAAAAAATTATATCAACATAAAATTTCTTTA
TTGGAGATTGAATCCGCAATAAAAGAGCAAAATAAAGATTATCCCGCAGG
TACGATTAAAACAAAAAGTAATAATTTTATAGTCACTCTTGAAGGTTCTT
TATCTACACCGGAAGAATTCGGTAATATTATTCTAAAAGTACAAAACGGA
GGTATCATAAAATTACGAGATATAGCGAAAATATCTTTAACCTCTCCCGA
TGAGGACATAATTTTCAGATATAACGGCAAAAGCTCCATTGCTCTTGGTC
TTATAAAAGAATCAAAAGCTAATGTCATAGATTTATCAAATGAAGTAACT
AAAGAGCTAGAAAGAATTAAAGAATCTATGCCCAAAGGAATAAGCATGGG
TATCGCATATGATGGTGCAACACCTGTAAAAGCATCAATTTATGCGGTAT
TTCAAACAATTTTTGAAGCTTTAATATTAGTAGTTTTAGTCACGTATTTA
TTTCTTGCTTCTGCTAAAATTACTTTAATTCCGTTTGTGACGATTCCGGT
ATCGTTGATCGGTACTTTTAGCGTAATGTATGCTTTCGGATTTTCTATTA
ATATATTTACGCTCCTTGCTATGATACTTGCTATAGGTTTAGTCGTCGAT
GATGCGATAGTTATGCTTGAAAATATTTTTAGATATAATGAAATGGGGCA
TAAACCCATGGAAGCAGCTTTACTTGCTTCTAAAGAAATCGGCTTTGCAA
TCATTGCTATGACTATTACGCTTGCTGCCGTATTTTTACCCGTCGGTTTT
ATAGAGGGTTTTATCGGGAAATTATTTATTGAATTTGCTTGGACTTTAGC
ATTTTGCGTTTTGTTCTCAGGATTTGTTGCTTTAACTTTAACTCCTATGA
TGTCAAGTCGTATGGTTACAAAACATAATACGGACTTACCGAAATTCTTA
GTAAAGTTTAACGACATTCTACAATTTATTCAAAATAAATATATTTACTA
TCTAAAGCTAACTTTTGACAATAAAAAGAAGTTTGTCATCATTATTGCAT
CATCTTTTATAGTGTTGATTATTAGTTTTAAATTTACTCAAAAAATTTTC
GTACCCCAAGAAGATGACGGATTTTTACAAGTTTCTCTTAAAGGACCCGA
AGGTTCTAGTTTAGAATCCTCTACTAAAGTAGTGAAAGAAGCCGAAAAAA
TCCTTGCTAATTATAAAGATATATTAGGTTATCTGATGGTAATAGGTGCA
GGCGGTAGTGATAATGTTTTTGGATTCATTCCGTTAAAAGATTGGGGTGA
GCGTTCTCGTTCCCAAGAAACTATTAAAAATATGTTAAATAAGCAGTTTT
CCGAAATCCCGGGCATGTCGATTTTCGCTATGGATCCACGTTCAATGGTT
AGCGGGAATGCAAGTAGCCCTATCGAGTTTACTATTCAAACGAACCTTGA
ATATGATGATTTAGATAAAATATCACAACAATTTATTGATATAATGAAAA
CAAATCCTATTTTCTTAAACGTCAATAGAAATTTACAATCGGCAATGCCG
ACTATAAGTATAGAAGTCAACCGTGATAAGGCTTATTTATACGGAATGGA
TTTAGCAAATATAGGCAAAACGGTACAATATTTACTTGCAGGTCAACAAA
TCGGGGATTTTAGAATGGGTAATGATTTATATGACGTTATATTGCAATTT
AATCAAAAAGATCGAAAAGATATTAGTGATTTTAGTAAAATTTTAATCAG
AGCAAAAAATAATAATATGTTACCGCTTGAATCTATAGCTAATATTACGG
AAAAAATATCAGTAAAATCATATAGTCATTATAATAATTCAAAATCCGTT
ACTATTTCTTCCGATCTTGCTCCTGACGGAAAAATTAATGATGCAATTAA
TGAAATCAATAAAATAACCGCTAAGTTACTTGACCCTAGTAATACTATAA
TTGAATATATCGGCGAAATTAAACAAATGAGAGAGGCAGACAGTAATATG
CTTATAACATTTGTATTTGCTCTTGTATTTATCTATTTAGTGCTTGCAGC
TCAATTTGAAAGCTTTACTGACCCTTTATTAATATTACTCGCCGTACCTT
TCTCAATAACCGGCGGTGTACTTGCTCTCTGGCTTGCCGGTAATAGCCTT
AATATGTATAGTAATATCGGACTTATTACTTTAATTGGATTAATTACTAA
GAATTCTATTATGATAGTAGAATTTGCTAATCAGCTAAGAGAAAAAGGAG
TAAAGGTTCAAGAAGCTATAATAGAATCCTCAAAACTTCGCTTGCGTCCA
ATTCTAATGACTACCCTTGCTGCTGTAGTGGGAGCTTTACCTCTAGTCTT
TGCAGATGGAGCCGGTGCTGCTGCTCGTAATTCTATAGGCTTTGTAATAG
TTGGAGGATTAAGCATCGGTACTATATTTACAATTTTTGTTATACCTGTA
ATATATCAAACTTTTAAGAAGGATTAA
>RF_1367 ampC, Beta-lactamase AmpC (Class C)
ATGAATAAAAAGCTTATCTTATTTTTTAGTATAATATCATTATTGTTATG
TTCTACAGTCTTTGCACAGACACGAGTAGAATTACCACAAAAACTAAAAA
GTTTTATTAAAAAGCTTGAATTGCAAAAAGACGAATTACAAGGAGGAGCA
ATTGCAATTTTATACAAAGGTGAAGTTATCTATAAAACAACGTTTGGAAA
TCAGAAAGGTAATAAAGGAGCTATTACCGACAAAACTTTATTTCCGTTAG
CATCGGTTTCAAAAGCTGTTTCAGCAACGGCAATTGCATTAATGGTAGAT
CAAGGAAGTTTAGATTTTGATGAAAAATTCAAATTACCATACTTAAAAAA
TACTATTAGTCTTAATAATATTTTAAGCCATACCACAGGTTATCAATTCT
CAGGAAATATTGAAATTGAGCAAGGAATGAGTCGCTCAAAGCTTTTAATG
CTGCTGCAAAAACAACAAGCTAGTTGTAAACCAGGGCAATGTTATAAATA
TAGTAATATCGTTTTCAGTTTACTTGAAGAAGCTTTAAATTGTAAAAAAT
CAAGTTTAAATGCTGCAATAGATAATTTGCGTACAACGCTTAAAACGCAA
GATATACAAATATTACCGCTAGAGCCGAATATACAACTTGCTTATCCGCA
TTCTAAATCAATAATAGACGGACAAGAGGTAATAACATTACTGCTGTTTC
CGCCTTACTACCCAAAGACGGTACCTGCATCTGCCGGTATTTTTGCATCG
ATAGATGGAATGATTGAAATATTCAAACTTAGTTTTGGTTATAAACCTAA
TCTTATTTCTAAAAGTACTTTAGATCGTTTGTATAAAATAGTAAAATCAA
ACAAAGATGTTTTTGGATTTAAATGGCAACCGATTTGGCCTATTGATCAA
AAAATGATTGAGTCATATTACGCTCTTGGATGGCGTATTCTTAAAGTAAA
AGGACGCTCAAATAAGGATTTAATTTTTCACTCAGGCTATATTAACGGTA
TTAATTCTTTTATTGGTTTTATACCCTCAGAAGAACTTGGAATTATTATT
CTAGTGAACCAAGAAGGTAGTTTTCCACTTAAAAATGGGCTGGGACTTTG
GTTTGATTATATAGGTTAA
>RF_1384 ampD, AmpD protein homolog
ATGATAGTAATCGATAAAACATCTTATAGAGCTGTGGGGTTTGATAAACG
TATTAAATTCCTAGTGCTACATTATACACAGTGTGATTTTAAGCAGTCTT
TAGATTTTCTAACCGGTGAAAAGTTAAGTAGCCATTATTTAATAAACAAT
GAAAACCCTGAACATATATTTCAATTAGTAGAAGAGCATGATAGAGCAAG
GCATGCCGGAGTAAGTTACTGGCAAGGTCATGAGCGTATTAATGATACAT
CAATCGGTATTGAAATCGTAAATCCTGCTTTTAAAGTAAATGCAAAAAAC
AATAATATAACCTGGCTGCCTTATTCAAAGCAACAAATTAACAGTGTCAT
AAGTTTGTGTAAACAGATTATCGCTAGATATGATATTAAACCTACTAGAG
TGGTTGGGCATTCTGACATTGCTCCAGGTAGAAAACAGGACCCTGGTCCG
CTATTTCCTTGGAAACTATTATATGATAGCGATATTGGAGCATGGTATGA
TGAGCAAATTTTTAACAAGCTATTGCCTCAAGTCGACATAACCGATATTA
AAGCAATTCAGCAAAAATTTATTACATACGGTTATAAACTTGAAGCTACT
GGAATTTTAGATTCTAAAATGAAAGATGTTATAATTTCGTTTCAAATACA
TTTTCGCCCTAGTAATTTTTCCGGCGATTTGGATGCTGAAACCATAGCAA
TTTTAGATGCCTTAATATTGAAATATAAATCTGAGTTAAGTAATTAA
>RF_1275 blaD, Beta-lactamase Class D
ATGAAAAAAATTATTTTATATATAACTGCCCTAATATCACTTACTATACC
TTTTATAACTAGAGCAGATTGTTTTCTAGTTAAAGAAAATTATAAATTTA
TTAAACAAGAAGGTAATTGTGAGTCTCGTTATGCTCCATGTTCAACATTT
AAAATTGTCTTAAGCTTGATGGGTTACGATGATGGGTTTTTAATTGATGA
AACTCACCCGAAGTTACCTTTTAAAGAAGGATATGACGATTATCTTGAAG
TTTGGAAGCAGCCGCATACGCCTAAAGACTGGATAAAAAACAGCTGTCTT
TGGTATTCACGTCTTATTACTAAAGAATTAGGTTATGAAAAATTCCGTGA
TTATATAACAAAATTTGATTACGGTAACCAAGATATTTCCGGTGATAAAG
GAAAGAATAACGGCTTAACCAATGCATGGCTTTCTAGCTCTTTAGAAATT
TCTCCTGAAGAACAATTAGCTTTTCTTCAAAAACTTGTTGTAAATCAATT
ACCTGTAAGCGTTCAAGCTCAAGAAATGACTAAAAATATTATGTTTATTG
AAGATTTTGCAGATGGGTGGAAGCTCTACGGCAAAACAGGTAGTGGAAAT
CGCCTTAATGAAGATAGAACTGTAAAGCTCAAAGATCGTCAAATAGGTTG
GTTTATAGGTTGGTTACAAAAAAATGACAGAAAAATTTTCTTTGTACATT
TTATTGAAGATAAAAAACACCATGACTCTTATGCAAGTCTACGTTCTAAA
GAAGCAGCAAAAGAAAAGCTAAAAGAATTGATAAATAAAGAATTGAAATA
A
>RF_1044 emrA, Multidrug resistance protein A
TTGGTAAAGTTAATTATGCCGAGTGTATTACAACAAGCTATCGACAAATA
TAAACATCATCCATTTACTAAATATGTAATTATTATAGCCTTAATAATAT
TTATTTATTTGGGATATAAAATTTATGTTTGGGCAAATACACAATCCACG
GATAATGCTTACATAGATGCAGATATTTCAAATGTTAGTGCTGAAGTTAG
CGGTGTTTTAACAAAGTTATTTGTTACCGATAATACTAAAGTTAATAAAG
GTGATCTGATAGGAGAAATTGACGATAGAGATTATAAGGCAAAGCTTGCA
GCACTTGAAGCATCTATTGAAGCTTGCATAAAAAATATAGAAATTATAGA
GCAAAAAATCTCAATAGGGCAGATTAGCCTAGAGCAAGCGTCTGAAAAAT
TAAAGCTTACTAAAATAAGCTTTGATATTGTTTCAACAGATTTTACTAGA
GTGCAGGAATTAAATAAGGCAAAATTTGCTAGCTCTAAAACGTTAGATGA
TTCTAAAAACGCATATCAAAAAGCCAAAACGGATTATAAACAAGCACAGT
TAGATTTAGATATATCTAAGCAAAATTTACAACTTCTTGAGCTTGAAAAA
GCAGCAGAACAGGAAAAACTTAAAGAGCTAACGGAAAACAAAAAAGTAAC
GTTAAGGAGCTTACAAAATACTAAACTTATTGCTATGGTACCCGGTATAT
TCGGTAATAGTAGTTTAGAAGTCGGAAATTACATAGTACCGGGTAGGGCG
TTGTTTTCTATAGTTCAAGATAATACTATGTATATTCAGGCTAATTTTAA
AGAAACGCAAATTAAGAAATTTAAGTCCGGCATGAAAGTCAAAATTGAAT
TTGATGCTTTGCCTAAAAAAATAATTTACGGGAAGATTCGTAATATCGCT
CCTGCTACCGGTTCTAAATTTAGTTTAATCCCGCCCGATAATGCTACAGG
TAATTTTACTAAAATCGTACAACGTGTACCTGTTTTAATAGATTTTGAAT
CCCCAAATGCTAATCTAGTCCCCGGCATGTCAGCAATAGTATCAATCAGA
ACTGATCAAAGTACGTAA
>RF_0210 lolD, Lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD
ATGAATAATACAGTCCTCATTCTAAAAAATATCTCAAAACATTACAGCCA
AGGCAAAACTATTGTTAGGGTACTTGATGATCTTAATTTAACGGTTAATG
AGGGTGAATTAATCGCTATAATAGGTTCTTCAGGTAGCGGCAAATCGACT
TTACTACATATTGCCGGCTTGCTTGATAAACCTACAAACGGTCAAGTCAT
CATACCAAATAGCAAGTATCAAAAATATCATCTCATTCGTCTTCATTATT
TAGGTTTTATCTATCAACAACATCACTTACTTAAAGATTTTACCGCTCTT
GAAAATGTTATTATGCCAAGACTTATTAGCGGTCTTGATCAAAAAGAAGC
AATAGAAGATGCAACAAAGATATTAGATGATTTAGGACTTGGGAAAAAAC
TCTATAATATGCCCGGAGAATTATCGGGCGGAGAACAACAACGGGTCGCT
ATAGCTCGGAGCTTAATTAATAAGCCAAAAATTATTTTAGCAGATGAACC
GACAGGTAATTTAGATCCCAAAACTACAAATGAAGTATTTAATTTATTTT
TAAAAGTAGCAAGAGAACAAAATACCGCAGTTATTATGGTAACACATAAC
CATGAGTTAGCACATAAAATGGATAAATTATATAAGCTAAAGCACGGATT
ATTAAATATAGCTTGA
>RF_0623 mccF, Microcin C7 self-immunity protein
ATGATTCTTAAAAACTTATCTTTACTAATAATATTATTCTTTTCAATATC
AGCTTTTTCTTCAGCTACTAACCTAAAAAATATCCCTATTACTGTTGTTG
CTCCGGCAACAGGTGCTGATAATAAAACTTTATCGGATTTAAAAAATATT
AATGGATTAAATTTACAAATCCTTTCTAAGTGTTTTGCTAAAGGTAAGCT
ACCATTTCTTGCAAGTAGCGATGAAGTAAGATTTAATTGCCTGCGGGATG
CATTATTTGATGAGTCTGATAATGTAGTATGGAGTTTACGAGGCGGTTAT
GGTTCTGCTAGAATAATTCCAGGTTTACTAAAGCTATCAAAACCAAATAA
AGAGAAATTCTTTATAGGATATAGCGATATAACGGCTTTACATCTTTTTC
TATCACAAGAATGGGGGTGGAAAACTATTCACGGCAGTAATATAGCCGAC
TTATTAAAAACTGATAAAGATCAAAGTAATTTTACCAAGCTTGCTGAAAT
ATTAAAAGGTAAGGTAAAGCAGGTTACTATAGATAATTTGAGTCCGCTTA
ACGATATAGCAAAATCAAGTGATCTTGTTAACGGTAAACTAACCGGCGGT
AATTTAACTATGGTGCAGACTAGTATAGGAACCAGTTGGCAAATAAAGAC
TAAAGGCAAAATTCTTTTTTTAGAAGATGTGAATGTAGCTCCTTTTAGAT
TAGATCGTGAGCTTTTACACTTAAAGCAGGCAGGGTTACTTGAGGATGTT
AAGGCTATAATATTTGGTTCATTTGGTAAAGATCTTGATGCCACAATGTT
AGTGCTTCGTAATTTTGCAGATAATTTAAATATTCCGGTATTTAAAACAA
ATAGATTCGGTCATGAAAAAATTAACGATCCGATTATTTATAATACTGAT
AGTAAGATTATCATGGGGAAGAATAAAGGATTTAAATTAGTGATGAGGTT
GTAA
>RF_0816 mccF2, Microcin C7 resistance protein
ATGAAAAAGATTATTTTTAACAAACAACGAGATTTGATATCAATTATAGC
ACCGGCGTCAGGCTGTCTTGATGCTCGGGATAAATTAAAAGAAGCTATTA
AAATACTAGCTTTGCATGGTTTTAAAACTTTAATAGATGATAAGATTTTT
TTAGGTGATGAATTGCTCTTTTTCGCTGCTCCTAAAGAGGAAAGGCTGAG
AATGTTTAAAGAGGCTATGGAAAATGAGCAGGTTAAAATAATTTGGGCTT
TTCGCGGTGGATATGGATGTAGTGAATTTGTAGAAGATTGTTTTAATATA
AAGCAAAAAGGTGATAAAATCCTGATAGGCTATAGCGATATTACCGTTTT
ACATTTATTACTAAATAACCATTATAATATCCCAACTATACACGGTTCAG
TATTAACCTCGTTACTACCGCCTACTAATCAGGCTATTATTCCTATAATA
GATGTTCTTGAAGGGAAAAAGAGTGAAATACAACTTATACCTATAAATAA
AATTAGCGAAGAAAATATAACAGGCAAGATAACAGGCGGCAATTTAACGG
TTTTTAGCAAATTGATAGGAACTTCTATTGACCTAAAAAAGGATAATATA
TTACTGCTTGAAGACGTTAATGAAAAAGCTTACGCCGTACATCGTAATCT
AGTTCAGTTAAAAAATGCCGGTACATTTGAATGTATAGAAGCAATAATTT
TCGGTGATTTTACCAAAGGGGATGAGTTTGTAGAACAAGCTATAAAAAGT
TTTTGTTTAAATCATATTCCGCATATAGAAGCTTATAAAGCTGACGGGAT
AGGGCATGGAGAGGTAAATCATCCGGTTATTATGAATCATGAAGTAATTA
TAAACAGTAATGTTTTAAGCTTTACTAGCCCTTTCGAAATAGTAGAAAAC
AAATGA
>RF_0981 mdlB, ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components
ATGAAAACAACATCTCATCCCGTCTCTTTTTTATGGTCGGTTATAATGCC
GTATAAATATTGCTATCTTATTATGATGATGGCTCCGTTTTCAAATGGTG
TTCATCCTATTTTATATAATTATGCCGTAAAGCTTTTGCTTGATCTGTTT
ACCCAAAATGAACAAATTACATTTGCACAAAGCTATAAACCGATAATGTT
TTTTGTAATGGCACAAGCTATACTTGACGTAGCTTGGCGGACTCATAATT
TTGCACAACTTAAAGCAATGCCTTATATCTTTCAAAGCATTATGAATAAA
ATTTGTAATCACTGTTTTCATTTGCCGTATACTTATTTTCAGAATAATCT
TTCCGGCTCTATAGTCGGAAGAGTACGGGGCATAGGTGATAATTATTATA
AAATGCACCAAGCTATTGAGTGGAAATTAAGCAAACCTCTACTCATTACA
CTATTTTCAGGGATTACTCTTGCCTATACTAATATTAAAATATTTACTGT
TATTATTGCCTTTACTGCTCTTTATCTACCGCTTGCATTACATTTTTTTA
CCAAACTTGCTAAAATGGAACAGGCTAAGCAAGATTCTTGGTATAATTTA
TTCGGTATAGTGGCTGACTGTATCACAAACATTTTTACTATTTTTTCATT
TGTCGCAAAAAAGCGAGAATTAAATAAAGTACAAGATTACTACCATAACG
TACATAATCCTTTAACAATTAAATATTATAAATATGATTCCATTATCTCT
ATAATACTCTGTTTAGTATATTGGATATATTTGATAGGAGTTTTTGTATA
TGTAATTTACTTACGTAATTTAGGCGAGATTAGCATTGGTGATATCGCTT
TTATTATGCCGCTTACTTTTTTATTTGCTGAAAATTCGTGGCATACTACT
ATGGAAGTTAAAGACTTTTTAGAAGATGTAGCTAGCTTTCGATCGAGCTT
TAAAATCATGCAAATCCCACGAGATACTATAGATAAAGAAGATGCTGCTG
AATTAAAAATCTCCAAAGGTGAGATTATATTTAAGGATGTATCTTTTTCT
TACGTAAATGATAATAGTAAGCAGCTAAATTCAGAAAGCTTCAGACAGGA
TGAATTTAAGAGCAAGCCTGCGGAGCGTACAATAGTACGTGAGCACAGGC
TTGACTCAAAAAATTCACCTGTATCAAGTTTTCTGAATGACGCTGTATTT
CAGTCTCTTAATTTGCATATAAAAGCCGGTGAGAAAGTAGGTATTGTCGG
GCATTCAGGTAGCGGTAAATCTACTTTGATTGCATTATTGTTAAAGAACT
TTAAAGCCGGAATCGGTGATATTATAATCGATAACCAAAGTATTTACGAT
ACTTCCTCTGACAGTCTACGGGAGCAGATATCGCTAATTCCTCAAGATAT
TATGCTTTTTCATCACTCAGTAGGTGAGAATATCGGATATGCAAAAGAGA
ATGCTTTACCTCATGAAATAGAAAATGCCGCCAAAGCTGCAAATATCCAT
GAATTTATCGAAAGTTTACCGGAAAAATATAACACCATTGTCGGTGAGAG
AGGAGTAAAGCTAAGTGGCGGACAGAGGCAACGTATAGCAATTGCTCGTG
CTATTCTTAAAAACGCTCCAATCTTGGTTTTAGATGAAGCAACTTCAAGT
CTTGATAGCCACACAGAGCAAGAGGTACAAAAATCTATTAACACAATGCT
TGATATTGAGAATGTAACTATAATTGCTATAGCTCACAGATTATCTACTA
TCAAGCATATGGATAGAATTATTGTTATGGATAAAGGCAAAATCGTAGAA
GACGGCCCTTTTAGGGAACTCGTTCGTAAGGAAAAGGGTAAGTTTAGGGA
ACTTTGGGAGCATCAAGTTAACGGCTTTGTCTAG
>RF_0607 msbA1, Multidrug resistance protein
ATGAGTAATAATAATTTAAATGATAGTTATACAGCTGCAGATGTTATAAA
AAGGCTGATAAAAGATCATGTGAAACCTTACGCAAATAAAATATATTTTT
CGATATTTTGCATGGTTATTGCAGCACTTTGTACGGCAGTGATTGTACAT
GCGGTTAGACCTATTATTGATAAGATTTTTTTAACGCATGATAAGAAAAT
GCTTATAATAATGCCTATAGTGCTTACTGTAACTTTTTTTATAAAAGGAA
TTTCAGAGTATTATCAGAATTATCTAATAAAATTTGTTGGGCAGAGGGTA
CTAAATGATTTGCAGATAAAAATGTATGAGCATTTGTTACTTGCCGATAT
TTCTTTTATTCAAAACCAATCTTCAGGACGTTTAATATCTCGTTTTACTA
ATGATATTTCTTTGATGCGTGGGGCTGTTTCTAATTTACTTGTCGGATGT
GCTAAACATTTTCTAACTGTAGTATGTTTAATAATAACGATGTTTCATTT
AGAACCACTATTATCTTGTGTAGTTTTTCTTGTTTTTCCTTTGGCTGTTT
ATCCGGTGCAAAGGATGGGTAGAAAGATAAGAAAAATATTTTCACAATCG
CAAGAGGAGCTTGGACATTATACTTCTAGGCTTGATGAAACATTTCAGTC
AATTAAGATTATTAAATCTTTTGTAGGCGAAAAAATAGAAAGTAATAGAG
CATCGTTGATTATTAATAATATTTTAGAGTTTTACAAAAAAACATCTAAG
CTAGATGCGATGGTTTCACCGATTATGGAGGGTTTAAGCGGTCTTGCAGT
CGGAGGGATGGTTTGGTACGGCGGTAATTTAGTTCTTGAGGGTAAAACAA
CACCCGGTGCATTATTTGCTTTTTTAGCTGCTTTTGCTGCAGCTTATAGA
CCGTTTAAAAGTTTGGTATCGTTAAATATTAATTTGCAGGAAGGAATAGC
CGCAGCTAAGAGGGTATTTAGTATTTTGGATACCGAACCTCTTATTAAAG
ATCATGAAGATGCTAAAGAAGTAGATTTATATAATCCACAAATTACTTTT
GAAAAACTGGCTTTAAGTTTTGAGAGTAAAATAGTTATAAAATATATAGA
TTTAAAGCTAGAGCCTCATAAAATGATTGCGTTTGTTGGACGTTCAGGTA
GTGGTAAGACGTCTCTTAGTAATTTATTAGTGCGTTTTTATGATCCAAAT
GAAGGAAGAATTTTAATTAATAATCATGATATTAAAGATATTAAGCTGAC
GATGCTTAGAGGACAGATTTCCTTAGTTACTCAAGATACTCATTTATTTG
ATACAAGCGTTGCCGAAAATATAGCATACGGTCAGGAAAACGCTACAAGA
GAAGAAATAATTGAAGCAGCGAAATATGCAGATGCTCATGAGTTTATTAT
ACATCTGCCGAACGGTTACGACACACAAATAGGAGTGCAGGGGACAACTC
TTTCAGGCGGTCAGCGTCAGCGTTTAGCTATTGCTAGAGCTTTCTTAAAA
GACGTACCTATTTTAATTTGGGATGAAGCAACAAGTAGCTTAGACCAAGC
TTCCGAACAGAAAATTCTAGAATCTTTAAAGAAATTACGCCAAGGAAAAA
CCACTTTAATCATTACGCATCGTTTAAGCAGTATTACCGACCTTGATAAT
ATTATCGTCATGAAAAACGGTGAGATTTGTGAGCAGGGTACTCACACTCA
ATTGCTTAAGAATAAGGATGAATATTATAGGTTGTATAATAAGGAGTTAA
GGGAGAACGGTTGA
>RF_0214 msbA2, Multidrug resistance protein
ATGACATTTTTTCTTATGGATATCAAACTTTTATATAGATTGATTAAGTA
TCTAAAGTTCTATAAAAAAGACTTGATCATCGTTATGATTTCTTTACTTA
GCGTATCCGCTTCATTATTACTAATCGGTAGTGTTTTTAGAAATTTAGTT
GATAACGGCTTAAGCCAAAACCATATTTTATCGGTTGATAAATCTATATT
ATATATTTGTTTATTAATTATCATCTTAAGTATTGCTAGTTTTTTCCGTT
CATATTTTATCAATAATGTTGCTGAAAAGGCAGTTAATCAAATAAGAAAA
GATGCTTATAGTAATTTAATTACTTATGAAATTGAAGAGTTTGAAGAACT
AAAAATCGGCGATATAATTTCACGCCTAACAAATGATATAGATCAAATAT
CTACTCTCATAGTTAATTTCTTATCTTTTTTCATTCGCAATTCAGTGATG
CTAATTGGCGGCGTTACTTTAATGTTTTTTGAAAGCTTTAAACTCGCTTC
TATAGTAATTATTACCATTCCTATTTTATTAATTCCTTTAATTAAATTCG
GCAAGCATGTTAAGGCTTTATCTAAAAAAGCTCTAGAATCTAAGTCACTT
TTAGCATCGGATATTGATGAAACTTTTAATAATATTAGAGCTATCTATGC
TTTTAACAATCAAACAAATAAAATTACCGATTTTGATACTAAACTACAAA
ACTATTTAACATACTGCAAAACCCGTTTAAAAATTCGTGCTTTATTCTTT
GCGATTTCAATAGCAATTATATTTCTTGCAATTACTTTAGTTGTTTGGAT
TGGAGCTTCGGATATAGTTAAAGGGAATTTATCTGCCGGTCAAATTATCT
CGTTTATTTATTATGCTATTATTGCCGGCTTTAGTAGCGGCGGTATTTTT
GAATTATTAAGTGAAATACATCTACCGCTCGCCGCACTAGAGCGAATAAT
TACAATTATAGATAAGACTCCTATAACACATAATAGTTATTTAGAATTAA
ATAATTCCGATCCAATTTCAATAGAATTTAAAAATGTCGATTTTACCTAT
CATTCAAGACCTAATTTAAGGATTATTAATAATATGTCTTTGAAGATAAA
TGCCGATAAATTTATCGGTATTGTAGGCAGATCAGGCGGAGGCAAAAGTA
CCTTGATGCAGTTACTGCTGCGTTTTTACCGGCAAGAAAGCGGCACTATC
CTTATTAACAATCAAGATATAACTCTTTCAAATCCTGCTGAAATTCGTAA
ATTAATTGCCTATGTTCCCCAAGAAGCTAACATTTTTTCCGGCACTATAA
AATCAAATATTATATTTGGTAATACGCAAGCAAGCGACGACGATATAAAT
GAGATAATAAAAATTACGGGAATAGAAGAATTTGCTGCTAAACTTCATGA
CGGTATCAATGCTAAAATCGGTGAGAGAGGAGTTAGATTATCAGGAGGAC
AAAAACAAAGGATAGCTATTGCTAGAGCATTACTTCGCAAGCCGCAAATT
TTACTTCTTGACGAAGCAATGAGTGCTTTAGATACGATGAGCGAGCAGAA
ATTACTAGAATCTATAAAAGAAATAATGAAAGGGAAAATTATTATATCAA
TTGCCCATCGGATTAGTAGTATAGAATCAGCTGATTATATTTTAGTCATA
GATAAAGGAGGAGTGGCGGCTAGCGGATCACATAATGATTTATCTAAAAA
CTCAGAAATCTATCGTAATATTTGCAGAGAGCAGTTAACAGTATAA
>RF_1022 pbpE, Penicillin-binding protein 4*
ATGATTCGTAGATATTTTTTATTGCTGCTTTTTTTAATTACTAATAGTAT
TAATTGTTTTGCAGATATACAGCAAAGAATCAATGAAGCAGAAAAAGAAT
ATCTAAGTAATAGATTTTTAAATGCCGTTTTTATGTTTGCCGATGACTAT
AAACCTTTATTAACCGGTGCTAAAGGAATCTTTGCTTTAAACGGTGAGCA
ATTAAAAGCAAATGAAATGATGCCTATTGCTTCTGCTACAAAGCCTTTTA
CAGCAGCAGGAATTTTAAAATTACAAGAACAGGAATTATTAAATATTAAC
GATAAAATCTATAAATATCTTGATCCGGAAATGTGGGGTGGAAAAGTACC
GGATTGGGCGTATAAAATATCTATTCATAATTTATTAACGCATAGTAGCG
GTATTGCTGAATATTTTAGTTTTGTTAAACTTGATTTAAATATGCCTAAG
AAAGAGATTCACAAGAAAATATTACAATTTGTTTCTTCTAAATCTTTAGA
AATATCTATAGGGAAAAAATTTAAATATAGTAATACTAATTTTGTTATAC
TAGGTATGATTATCGAAAAGGTGGCTAAAAAAGATTTAGCTAACTTTTTT
TATGATGAATTTTTTAAACCTCTTAATATGAAATCTACTAGCTTTGCTTC
ATATAGTGAAGCCGCTAGAATCCAAAAGAACGTTATTAGTTCTAATTATC
CGGTAAGATATTTTTTAACGCCTAATAATAGTAATAAACCTATATTTACT
CCTGTAACTGCTGATTTTTTAGCAGTTCCTTGTGCTGACGGTGGTATAAT
ATCAACACCGGTTGATCTTATTAAATGGTATAGGGCATTAAATGAGGGGA
AAATTCTTTCTAAGAAGTCGTATAAACTTATGACTACTAAATATTTTTTA
GCAAAAGATATAGAAGGGCGTAAGTCTTATATGGGTTACGGTATTTTCCT
TACGGATCTTGATTCTAAGCATTTAATGATTCATTATACCGGAAAAGCCC
TTGGAATACAAAGTGAAGCAGGGTATGTTTTGCCTGATAATCTTTATTTT
GCTATACTCAGCAATACTATGATTAAAATTCCTGAAGAAGAAAAAGATAA
AATTGACATGAAAAATCCTTTAAATCAACTTGGAATAATTTATTTCAGAG
ATGCAATAATAGGGGCAGCTATAAAAAAGGATTAA