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# Shigella flexneri

>gid:1155273  S0193  adhesion protein, fragment
ATGCTACCGCCAAATATTCGTGGTTATGCGCCTCAGATTACTGGTATTGC
AGAAACTAATGCACGTGTTGTTGTATCTCAACAAGGTCGAGTAATATATG
ACTCTACTGTACCAGCTGGAACTTTTTCTATTCAGGACTTGAGTAGTTCT
GTACGAGGAATATTGGATGTTGAAATTTTTGAGCAAAATGGTAAAAGAAA
ACATTTCCAAGTAGAAATGTGCAGGTGTGCCTTTCTTATCCAGACTTGGT
CAGAGTAG
>gid:1155233  mxiA  invasion protein
GTGATCCAGTCTTTTCTTAAGCAAGTAAGTACTAAGCCTGAATTAATTAT
ATTAGTGCTTATGGTTATGATCATTGCTATGTTGATCATACCATTACCTA
CATACCTTGTTGATTTTTTAATAGGGCTTAATATTGTACTTGCTATTCTC
GTTTTTATGGGATCATTTTATATTGAAAGAATATTGAGTTTTTCTACATT
CCCTTCGGTTTTGTTGATAACGACATTATTTCGTCTCGCTTTATCAATAA
GTACTAGTCGACTAATTTTAGTTGATGCGGATGCGGGTAAAATTATTACT
ACATTTGGCCAGTTTGTCATTGGTGATAGTCTGGCTGTAGGTTTTGTTAT
TTTTTCAATAGTAACTGTTGTGCAGTTCATTGTTATAACAAAAGGATCTG
AAAGGGTTGCGGAGGTAGCTGCTCGCTTTTCTCTTGACGGTATGCCGGGG
AAACAAATGAGCATTGATGCGGATTTAAAGGCTGGAATTATTGATGCCGC
AGGAGCTAAAGAAAGACGCAGTATTCTGGAACGTGAGAGTCAATTGTATG
GTTCATTTGATGGAGCAATGAAGTTCATTAAAGGTGATGCAATTGCTGGC
ATCATTATTATTTTTGTCAATTTAATAGGAGGTATTTCTGTTGGTATGAG
TCAACATGGAATGTCCCTATCTGGTGCATTATCTACTTATACCATACTAA
CTATTGGTGACGGATTGGTCTCTCAGATTCCTGCTCTGTTAATTTCTATA
AGTGCAGGATTTATCGTTACAAGAGTTAATGGTGATAGCGATAATATGGG
ACGTAACATAATGTCCCAGATATTTGGGAATCCTTTTGTTCTCATTGTTA
CATCAGCTCTTGCCTTGGCGATAGGGATGTTGCCAGGTTTTCCGTTTTTT
GTTTTTTTCCTGATAGCAGTTACTTTGACGGCTTTATTCTATTATAAAAA
GGTCGTAGAAAAAGAAAAAAGTCTGTCTGAGTCTGATTCTAGTGGCTATA
CTGGTACATTTGATATTGATAATAGCCATGACTCATCTTTGGCAATGATA
GAAAATCTGGATGCTATTAGTTCAGAAACCGTTCCTTTAATTTTATTATT
TGCCGAAAATAAGATAAATGCAAATGATATGGAAGGTCTTATTGAAAGGA
TAAGAAGTCAGTTCTTTATTGATTATGGTGTCAGGCTTCCAACTATTTTA
TATAGAACAAGCAATGAGCTTAAGGTCGATGATATTGTTTTGTTAATAAA
TGAGGTGCGTGCCGATAGTTTTAATATATATTTTGACAAAGTGTGTATTA
CAGATGAAAATGGAGATATAGATGCTCTAGGTATTCCTGTTGTTTCAACT
TCATATAATGAACGTGTTATTTCTTGGGTAGACGTTTCATATACAGAAAA
TCTAACTAATATTGATGCTAAAATTAAAAGTGCTCAAGATGAATTTTATC
ACCAGTTGTCACAAGCTTTATTAAACAACATAAATGAGATTTTTGGTATA
CAAGAAACAAAAAATATGTTAGATCAGTTTGAAAATCGGTATCCTGATCT
ATTAAAGGAAGTCTTCCGACATGTGACTATACAGAGAATTTCTGAGGTAT
TACAAAGATTGCTTGGAGAAAATATTTCTGTTCGCAATTTAAAACTTATT
ATGGAGTCTTTGGCGCTTTGGGCTCCCAGAGAAAAAGATGTCATAACATT
AGTTGAACATGTCCGTGCATCACTTTCTAGGTATATTTGTAGTAAAATAG
CTGTTTCTGGTGAGATTAAAGTTGTGATGCTTTCCGGATATATTGAGGAT
GCAATAAGAAAAGGGATAAGGCAAACCTCTGGTGGCTCTTTCTTGAATAT
GGATATAGAGGTTTCGGATGAGGTAATGGAAACTTTAGCACATGCTTTGA
GAGAATTGAGAAATGCAAAAAAAAATTTCGTTCTTTTGGTATCAGTAGAT
ATACGTAGGTTTGTTAAAAGACTTATAGATAACAGATTTAAGAGTATACT
CGTTATATCGTATGCTGAGATTGATGAAGCATATACCATTAATGTATTAA
AGACTATTTAG
>gid:1155225  mxiJ  Type III secretion protein
ATGATTAGGTATAAAGGTTTTATTTTATTCTTGTTGCTGATGTTGATTGG
ATGTGAGCAACGTGAAGAGTTAATTTCTAATTTATCTCAAAGACAGGCAA
ATGAAATAATATCTGTGCTAGAACGCCATAATATTACTGCTAGAAAAGTT
GATGGAGGTAAACAGGGGATCTCGGTACAAGTCGAAAAGGGGACATTTGC
ATCGGCAGTTGATTTGATGCGCATGTACGATTTGCCAAATCCGGAGAGAG
TTGATATCTCACAAATGTTTCCTACAGATTCATTAGTGTCTTCTCCAAGA
GCTGAAAAGGCCCGTTTATATAGTGCTATTGAGCAACGGCTGGAACAGTC
TTTAGTTTCTATTGGTGGTGTTATTTCGGCAAAAATACATGTTAGCTATG
ATCTTGAAGAAAAAAATATATCTTCAAAACCGATGCATATATCAGTAATC
GCTATATATGACTCACCGAAAGAGTCTGAACTATTAGTTAGTAATATTAA
GCGATTTTTGAAAAACACCTTTTCTGATGTTAAGTATGAAAATATATCTG
TCATATTAACTCCGAAAGAAGAATATGTTTATACAAATGTACAACCTGTT
AAGGAAGTTAAATCGGAATTTTTAACAAATGAAGTAATATATTTATTTCT
CGGGATGGCTGTACTAGTTGTCATTCTTTTGGTATGGGCATTCAAAACAG
GGTGGTTCAAGAGAAACAAAATATGA
>gid:1155239  spa24  Type III secretion protein
ATGCTGAGTGACATGTCCCTCATCGCTACACTTTCTTTTTTTACGCTATT
ACCATTTTTAGTTGCTGCTGGTACCTGTTATATAAAGTTTTCTATTGTTT
TTGTAATGGTACGAAATGCACTTGGTTTGCAGCAGGTTCCATCAAATATG
ACTCTCAATGGTATTGCATTGATTATGGCTTTGTTCGTGATGAAACCCAT
TATTGAAGCTGGTTATGAAAATTATCTAAATGGCCCTCAAAAATTTGATA
CAATATCTGATATTGTCCGTTTTTCTGATTCTGGCTTGATGGAATATAAG
CAATACTTGAAAAAGCATACAGATCTTGAGTTAGCACGTTTTTTCCAAAG
GTCTGAAGAAGAAAATGCTGATTTAAAGAGTGCAGAGAATAATGATTATT
CATTGTTTTCCCTCTTGCCTGCATATGCGCTAAGTGAAATCAAAGATGCG
TTCAAAATAGGTTTTTATTTATATTTGCCATTTGTTGTTGTTGATCTTGT
TATTTCAAGCATTTTACTTGCACTTGGTATGATGATGATGAGTCCAATCA
CAATATCAGTACCAATAAAACTTGTATTATTTGTTGCGCTTGATGGGTGG
GGTATCCTGTCTAAGGCCTTGATTGAACAATATATCAATATTCCTGCTTA
G
>gid:1155238  spa33  Type III secretion protein
ATGCTAAGAATTAAACATTTTGACGCTAACGAAAAACTACAGATTTTATA
TGCAAAGCAACTCTGCGAGCGTTTTTCGATTCAGACATTCAAAAATAAAT
TTACAGGCAGTGAAAGTTTAGTCACTCTTACTTCCGTGTGTGGGGATTGG
GTAATTCGTATTGATACATTATCTTTTTTGAAAAAAAAATACGAGGTATT
TTCAGGATTTTCTACACAAGAATCTTTACTGCATTTATCAAAATGTGTCT
TTATAGAGTCGTCATCTGTATTTTCGATTCCAGAACTGTCTGATAAGATT
ACTTTCCGGATCACGAATGAAATCCAGTATGCAACTACTGGGAGTCATTT
ATGCTGTTTTTCCTCTTCTTTAGGTATTATTTATTTTGACAAGATGCCGG
TATTACGTAATCAAGTTTCTCTTGACTTATTGCATCATCTTTTAGAGTTT
TGCTTAGGTTCATCTAATGTAAGGCTGGCTACTTTAAAAAGAATTCGCAC
TGGTGATATAATCATAGTTCAGAAACTTTATAATTTATTATTGTGTAATC
AAGTTATTATTGGGGATTATATTGTGAATGATAATAATGAGGCAAAAATT
AATCTGTCAGAAAGTAATGGTGAGTCAGAACACACAGAAGTTTCTTTGGC
ATTATTCAATTATGATGATATCAATGTAAAAGTGGACTTTATTCTTTTAG
AAAAAAATATGACAATCAATGAACTAAAAATGTATGTAGAAAACGAATTA
TTCAAGTTTCCCGATGACATAGTTAAACATGTAAATATTAAAGTAAATGG
TTCTTTGGTTGGGCATGGGGAACTTGTTTCTATTGAGGATGGTTATGGTA
TCGAGATTAGTTCTTGGATGGTAAAGGAGTAA
>gid:1155242  spa40  Type III secretion protein
ATGGCAAATAAAACAGAAAAGCCGACACCTAAAAAACTAAAGGATGCCGC
AAAAAAAGGACAGTCATTTAAATTTAAGGATTTAACGACTGTTGTTATTA
TTCTGGTAGGGACATTTACTATAATATCATTCTTTTCCTTAAGTGATGTA
ATGCTCTTATACAGATATGTAATAATTAATGACTTCGAAATTAATGAGGG
TAAATACTTTTTTGCAGTGGTTATTGTCTTTTTTAAGATAATTGGCTTCC
CACTTTTTTTCTGTGTTCTTTCGGCTGTGTTGCCAACATTGGTTCAAACA
AAGTTTGTTCTTGCGACTAAAGCTATCAAGATTGATTTTTCAGTATTAAA
CCCTGTTAAAGGGTTAAAAAAAATATTTAGTATAAAGACAATAAAAGAAT
TTTTCAAAAGCATTCTGCTTCTTATTATTCTAGCATTAACAACCTATTTC
TTTTGGATTAATGACCGAAAAATAATTTTTTCTCAGGTGTTTTCTAGTGT
TGATGGCTTATATCTTATTTGGGGGAGGCTGTTTAAGGATATAATATTAT
TTTTCTTGGCATTTTCTATTCTTGTTATTATTCTTGACTTTGTGATTGAG
TTCATTTTATACATGAAAGATATGATGATGGATAAACAGGAGATAAAAAG
AGAATATATAGAGCAAGAGGGACACTTTGAGACAAAGTCGAGAAGGCGTG
AGTTGCATATCGAGATTCTTTCAGAGCAGACTAAATCTGATATACGTAAT
TCAAAATTAGTGGTAATGAACCCGACTCATATTGCAATTGGTATTTATTT
TAATCCAGAAATAGCGCCTGCACCTTTTATTTCTCTCATTGAAACTAACC
AGTGTGCCTTGGCTGTCAGAAAATATGCAAATGAAGTTGGTATACCGACT
GTGCGTGATGTGAAATTAGCTAGAAAACTATATAAAACACATACAAAATA
TAGTTTTGTTGATTTTGAACACTTGGATGAAGTCCTACGTCTTATTGTTT
GGCTTGAGCAGGTTGAAAACACTCATTAA
>gid:1155235  spa47  invasion protein
ATGAGCTATACAAAATTGCTCACTCAATTATCTTTTCCTAATAGAATCTC
GGGGCCAATCTTGGAAACAAGTCTTAGCGATGTTTCGATTGGTGAGATTT
GTAACATTCAGGCTGGAATTGAAAGTAATGAAATTGTTGCAAGAGCTCAG
GTTGTAGGATTTCATGATGAAAAAACAATATTAAGCTTGATTGGAAATTC
TCGTGGACTTTCACGGCAAACATTGATTAAGCCCACTGCCCAGTTTCTTC
ATACGCAAGTCGGCCGTGGATTATTGGGAGCAGTAGTCAATCCTTTAGGG
GAGGTTACTGATAAGTTTGCTGTTACGGATAACAGTGAAATTCTTTATCG
ACCTGTAGATAATGCTCCTCCGCTATATAGTGAAAGGGCTGCAATTGAGA
AGCCTTTTTTAACAGGTATTAAGGTTATTGATTCTTTACTCACGTGTGGT
GAAGGACAGCGAATGGGGATTTTTGCGTCAGCTGGTTGTGGCAAAACTTT
TCTCATGAATATGCTCATTGAACATAGTGGTGCTGATATATATGTTATTG
GGTTAATTGGTGAGCGAGGTCGAGAGGTTACTGAAACGGTTGATTATTTG
AAAAACTCTGAGAAAAAAAGCAGGTGTGTTTTAGTATATGCAACTTCGGA
TTACTCTTCGGTTGATCGTTGTAATGCTGCATATATAGCCACTGCTATAG
CCGAATTTTTTAGGACTGAAGGACATAAAGTAGCGCTTTTTATTGATTCA
TTAACAAGGTATGCCAGAGCATTACGTGATGTGGCCTTAGCCGCTGGAGA
ATCACCTGCCAGAAGAGGCTATCCGGTTTCGGTTTTTGATAGCTTACCCA
GACTTCTTGAAAGGCCAGGAAAGTTAAAGGCAGGTGGCTCTATTACTGCA
TTTTACACTGTTCTTTTGGAGGATGATGATTTTGCTGATCCATTAGCTGA
AGAGGTAAGATCCATTTTAGATGGACATATATATTTGAGCAGAAATCTAG
CCCAAAAAGGACAATTTCCTGCAATTGATTCCTTAAAAAGTATAAGCAGG
GTATTTACACAGGTTGTTGATGAAAAACATCGTATTATGGCCGCTGCATT
TCGGGAGCTACTTTCTGAAATAGAAGAGCTAAGGACAATTATTGACTTTG
GTGAATACAAACCGGGGGAGAATGCCTCTCAGGATAAAATCTACAACAAA
ATATCTGTTGTTGAGAGTTTTCTGAAGCAAGATTATCGACTCGGTTTTAC
TTATGAGCAGACAATGGAGCTTATTGGTGAAACAATTAGATAA