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COG category: Intracellular trafficking and secretion
Organism: Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

Number of genes found: 55

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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_0025 unknown
TTGCAAAAAATAGAAGAAGTTTTAAGTGAAAAACGATTTGTAACAGTCAG
TGCTTTCGCTGGAACAGGTAAAAGTACAATAGCTATAGAATATGGTTGTA
AACAAAGAGATGAAGCAAAGAAAATAGTGCGCTTTATTTATGCAGATTCT
GCATATAAAGTCCTTGAAGCATATAGGCAACTCGCTAAAGAGTTTGCTAT
TTATACAATAGGCGAAAAGAAAGAAGATATAATAAGATTAGTCCATGAGA
GGATTGCTAATTTAAATTCAAATACATTATTTGTTTTTGATAACGTAGAA
GCATATAAAGACATTGAGACTTATATTAACGGTATAATTAATATGCCTAA
CGATAAGACGCAAGTTATAATTACTACTAGAAATAATAATTTAAGTGAGG
ATATAACAAATATTAAATTACTGCCTTTTAGCAACGAAGAAGCAAGATTA
TATTTAGAAAAATCTTTAGGAAATAGATTAAACGAGAAAGATAGTTATAA
ATTAGTAGAAGAGTTTGGTAGTAAAGATGCTGTATCACCTTATAGGCTAT
CTAAAGCAGTAGCGTATTTAAAAGAAAATAAATTACTTAAGGTAAATGAT
TACATTAATTACTTTAAAAATAGCAAAGATGATCATATAGAAACCGTTTT
ATTACTACAATTACTAGAAAAATCACCTTTAGCTTGGTTGATATTGTAA
>RF_0643 RND efflux system, outer membrane protein
ATGAACCTACTAGATAATCGACATTGCGAGGAGCGAAGCGACGTGGCAAT
CTCGTTTAATATCCTGAGATTGCTTCGTCAATTGCTATGCAATTTCCTCG
TAATGACGGATAAGCTGATCCACGCAATAATAACCTCTAGAAATGGTATA
AATATCCTCATTATATCGATTTCGTCATTTCTATTATGTAGTTGTAGTAC
TAAACAAAATAATACTATCCCTAATCTCTCATTACCTACTACTTGGAATA
ATTATTCTTTAGCACAAAAAGATAATATGCCGCAGCAATGGTGGCTACAA
TTTAACGATCCGGTATTAAATCAGCTAATCGAAGAATCTTTAACCGGTAA
CTCCGATATTGAGCTGGCAATGAGTAATGTGCTAGCAGCGAAAGCTCAAC
TTAACCTTGTTAATTCTTATAGATTTCCACAAATCAATTTACAGGGAGGA
GCAAATCGAACAAAAAATAGCAAGGAAACGGTACGTTTATCAGTTATAAG
TAACGTCACTATGAGTTACTTTAATCTTTTAGCATTAGACAAACAAATCT
ATCTAACTGAAAAGCTAATTGAGGCTCAAACGGAAATTTATAAATTAAAT
CAGAAATTATATAATCTTGGTGTGGGTGATTTAATATCGGTTAGTGAAGC
TGCTTCCGAGCTTGCACTTACTAATTTATCATTACCGCCTTTAAAACAAC
AAAGACATGAGCAGGAAACCGCTTTAAAAATTTTAGTAGGTAGGACTCCT
GAAAATATAGTAAACGGCTTAATTTATCGTGATAAACCAATAGATTACTT
CCCTGCTCTACCGGTATTACCTAAAATATTACCGTCAGAGCTTTTAGAAC
AAAGACCTGACATTAAAGCAGCAGAGCAGAATTTACTAGCAGCAGACGCA
AACTTAAAAGCCATAAAAGCTACTTATTTTCCACAACTTTCTTTAACAGG
CTTATTAGGATTCGGTAGCAATAAACTTAATACTCTCTTTAACAGCTCAG
CACAGACTTGGCAAATAGGCGGCAACATAGCAGGACCTATTTTTGATTTT
GGCAAAACTAGAGCTAACGTACAAATTGCCGAAAGTGTTAAAGAACAATA
TATAGCACAATATAAATCAGTAGTACGCACAGCTTTCGGGGAAGTTATGG
ATGCTTTATCGCTTGAGCAAACATCAAACAGTAATTTTCATATTTGGCAA
CAAAATGAAGCAGCTTTAACATCTATATTTAAGCTTGCCGCTCAGCGTTA
TAAACGAGGTAATATAGATTACTTAACAGTGCTTACAGCTAAACAAAACG
TACTACAAAACGAAATTGACGGGGTGGCTATAAAACTTTCACAGCTAAGT
TCTATGGTTAATATTTTCCATGCTTTGGGCGGAAAGTGGTAG
>RF_1031 unknown
ATGTTCATGATAAATAATTACCTCACCGAAATATGGTTAATAATCGGCAT
AATTTGTGTAGTCGTTGAATTCTTTGCAGTTCCAAACATTGGATTCTTAT
TCTTTGGGCTTGGAGCATTATCAAATACTCTTGTAGTATATAACTATCCT
CTAGTTAGCTTAACAAACCAAATAACATTTTTTGGTATATTATCGCTTAT
TTGGTTTTGCATATTATATTATCCTCTTAAAAAATATGTTTATAATAAAA
CTGATAAGACAGAAAACTACTCGGATATGATAGGCAAAACGGTAGAGGTT
TATAGTTCTACCGTCTCTTCTGATAGTATAGGACAAGTAAGATGGTCCGG
TGCTATTATGAATGCTTACCTTGCTCCAAATGAAGAAGTAGCAAAAACAG
GCGAGCAACTTTTCATTACCGAAGTCAAAGGCAATATATTAATCTGCTCT
AAACATAGACCTGCTCATCACTAA
>RF_0476 Cell surface antigen-like protein Sca7
GTGAAGATTAGTAATGCAGCAGCAAATGTAACGGCAGCTGGGCAAATCAG
TGGAGTAGTAAGTTATACGGCAGATGGAAAGTTAACGGCAAATAACGGGA
TTAGCGGCAGCGTAACAACGGCTACAAATGATACAGGCACACTGACGATA
GGAGCAGGGAATGTAACCGGTACGATCGGTACTAATGGGAAAAGTTTAAA
ATTAGTAAATATCGGAGCAAATCCTATTACGTTCTCATCTAATGTATTTG
CTCCTGTTGCTTTAACTGATCAAAATTCACAATTAACATTAGCAGACGGT
ATTGTAGTTACCGGATCAGTAACCACAAAAAACAATACAAGAGGAGTATT
ATCGCTTGGAGTCGGAAGTAGCATAACGAACGGAATAGGAGCAAATAACT
TCAGCTTAGAAAGAGTAGAGCTCAGAGCTGGAGCAAGCAGTTTAGGCGGT
AATATATATGCTGGAGCTGTGAAGCTTATGGCCGATACTTCAGTCGTAAC
GCTTGAGGATAATGCAAAGGTTTATGGCAGTGTAACAACGAAGACGGACA
CAAAAGGTGTATTAGTTCTTGGTCGGAATAGCAGCGTTGCGGGTATCGGA
GCAAACGGGTTTGCTCTTGAAAGAGTAGAGATAGGAGCGGGAGCGAGTAG
TTTAAGAGGTAATATATTTACGGGAACAGTGAAGCTTATGGCCGATGATT
CAGCTTTAACGTTAGAGGATAATGCAACAATTCACGGTAGCGTAACAACG
AAGACTAATGAGAAAGGTATATTAATTTTCAGCCGGAACGGTAGTGTAAC
GGATAATATAGGGGAAAATGGAGCAGCTTTAGAGAAAGTAATATTTAAAG
GTGTAGATACTATAGAAGGTGCGGCTTATGCTCAAACTTTTACTATAGCA
AATGCAAATGCTAATGTCACGGTTAAAGGATTAATGACCGGTGACGTAAA
TTATGAAGCAGACGGTACATTAGCATCCGAAAGTATAATAGGAGATATCG
ACTTTAAGGGGACTAACGGAATATTTAGTATAAATGACGGTCGTGCAATT
GATGGAGCTGTACTTAGTACCGGCGGGGTCGGTGGTATTTTAAATTTTAA
AGGTAATGCTAATGTAACTCAGAATGTTGGTGCTGATGAAGAAAATAGCT
CTGCTACTATAAATATCCAAGGAGATGATACAACAAATGTATCTCTAGCA
AATGATGTATTTGTAGGTGGTGTTAATTTTACAAATAGTGGGAAACTACA
ACTTAGTAAGAGTTTCTCGGCAAAGAATGTTGATTTTGGAGCAAAAGGCG
GTACTTTAGAGTTTAACGGTAATGATAAATATATTTTCAATGCCGTTATA
GCAAACGGACAAACCGGTATATTAAATGTTTTAACTAAGTTAGCGGCTAC
GGATGCAAGCGTTGGTACGCTTAAAACAATAAATATAGGGAATGCTAATG
CAGGACAGAGTTTTTTAATTGCAGTAAATAATGCTAACTTAGCTCTACTA
ACTAGTCCAAATAGCAGTATTAATTTTAGTAATGCAAATTCACAATTAAC
ATTAACCGCTCCTGTAGATCAAACTGTTACGCTTGCTAACAATTTAAAAG
GTGGTGGTATTGTTACTTTAAACGGTAATGGTCATAATTTAGTTGTAAGC
GGTAAGAACGGAGCAATGCTAGGTACGGCAGGTAATGAGTTAGCTGAATT
AAATATTAAGGGGGACGTTACTATCACTAATAATTTGGACATCCATAATA
TTAATAAGTTAAATATTCAAAAAGGAGCATATTTTACCGATCAAAGTTTA
ACGTCCGCTAAGGTTGCTGAAATAAATATAGGTCAGCTAATAGATAAAAC
TTCATATGCAGCTACTTATGCTTTAGACGCCGTAAACGGTGATTTCGAGT
TAAATACCGGCGGTATGAAGTTTATACATGAAGATTCGGCATTAGATCTT
AAAAATAGCTCAAATGCTAATGATCATACTATAAATTTACAAACAGAAAT
ATATGTTGAGAATATAGTATTGGATATTCATGCTATTACGCTTAATAGAG
TAAATGCAAATATTAGATTTGAAGATGATACCATATATACCGCAACGGGG
AATATAGAAAGTGATATCATAGATTTCCAAGGTAAAGCAGGTGTAATTAA
TATTGCTGATAATGTAAAAATTGATAGTAGAGTTACAAGTACTGCTGATA
CGAGTGGTATATTGAACTTTGAAGGGGCAGGGGAAGTTACTAAGCTAATT
ACTAATATAAAAATGTTAAAAACAGGTAACGGTAATGTAGCATTAACTGC
CGGCGGTGATTACTCTATCGGTGAGATTCAAGGTAACGGTAATAATAATT
TAACTTTTGGTCCTAATTCTAGATTAACGACAACTTATATTAATAAGACC
GGCGGGTAG
>RF_0151 unknown
ATGCTTTCATCATTAAAAAAACAATTTGATAACGATAAGGCGTTTTTATT
AAATCATACAAAAGAATTTTTAACTACATCCGGAGTAGGCGTTCCTTTAG
AAACAAATAGAGCTAAAATTGAAGAAGCTGTTGAAAAAGGCAGCTTTACC
GAGGCATTACAGGGTTTAGAAATTTTACGTCATGAGAAAACCGGTATAAA
GCTTACTAAAATTGAAGGAAAAAATGGCGAAACTTCAATATTAATACGTG
ACGGTCGCAACAATCCTAATGAAAAAATTGTTTTAGGCACTGAAGCTTTT
GAAATGCAATATTTAAACGCTATCAGAGGTGCGATAGACATAGCAAAGAC
CGAAAATAAACCTGAGCTTGCACTGAAATTAAATAAAGAAGCAGTAAAAT
TTATTAATAGTTTTAATGCTTTGAATATGGAAAAATCACAAGAAAATATC
TCAAAAAATATGCAAACTGAGATTGACAATGTTGCTGAATTGCTAGGAAC
AAACGGTATTAAAAATGCTCATAAAAAATTAAATGTTGCTAAAGATTTTC
AAAATTTCAATGATGAGCATTGTAATATAGTAACTTTGTCAAAAGTCACC
AATGATGAGGGAAAAGAGCATATTGTAGTCGAAGCGGAAGTAGCTTTTAA
AGGCTTGACAAAAGAACAAAAGCAAGAATATCAAAATAGAGAAGGTAAAA
ACTGGTATAATGTAATGCCTGAATGGGAGAGGAAGCTTGTTGATCAGTAC
GCTGATACAATTCAAAACGGTAGGCATGTTATCCCAACCCAGTTACGACA
AATTGTTGGCATGAAAAATGCCTTTGAGAAAATTGGGGCAATAACCGACA
AAGACGGTAAAAATTTTGAAACACTGCTTATATCTAAACATGCAGGTACA
TTAGCCTCGATTTCAAATGATATAGATTCTAGACAAAAAATTACCGACTT
AAATGCACGCCAAGCCCAAGAATGGCTTGAAGACGGCGTTACTATTCATA
CCAATACATTAAACTCAGGTCCTATAGGAGCTGGCAATGATCCCACAATT
GTTGATCAGACAAAAAAATCTATGGAAAATGTCGGTGGGAAAAATACTAA
TACTCCTCTTAATTTATTTAGGCTTATAGGAGTAACAAATAATTTTTCAG
GAGTAGTGATACTTTAA
>RF_1052 unknown
ATGCCGGAGGCTCAAATTGATACGGTTGATTGGGAAGCTGAAACAACAAC
AAATCACTGTCTAAGTAATTTTATTATAAACTTATTTCATATAAGAGAAG
TAAAAGATTTTATTGCTAATATAACTATATCTAACCTAGCAAATGTATTT
ACTGCACATATAATCGGTGATAATAATTATAACTTAATAAAGAATGATAG
TACATATTATATGATTGAATCTAGTTGCGATAAAGATATTAGTTTATTGT
CTAGAGGAACAAATGAATGTGCTGTATTTACTTTAGGCAATGATACGGAT
ACTTCATTATTTAGTGCTATAAATGAATTAATTGAAGGTGATAGAGAGGT
AAATAGTGCTGCTACAGGTACTATATTTATCTGTATTACAACAGTAGTAA
CATTAAGTATATTAGGCGTAAGATACCTGGCTAATAAAATTAAGGTACAT
ATAAATTCTGATTACCATGATGATAGTGATCAACATAATATATGTTTAGG
TCAAATAGAGGATCAAGAGGCTCTAAATAATTAA
>RF_1305 Outer memberane protein rOmpA
ATGCTAACCGGTAGTGGAGTCCTTGGTGCTGCAAGAACCGTAACTGCTGA
TGGTGCAGAGCTTGCAGCCGGAACAAATATAGGTCCTGGAGCCGGTGCTT
TTGTAGCGGGTTCTACTTTACAATATACCGGTGCTTTTACGGTTACTGAT
GCTGACGTAAGTGTTCGTGCATTAGATTTAAATAATTTTGCAGCAGGTCT
TTTTTCAGTAACTGGTGATATTTCATTAGGTTCAGTGGTAGATACGGGAG
GAGCTAATAAACTTGCAGTTAATATTGATGATGGTTTAACCTTAACTTTA
ACAGGTACCGGTACTGCAGCCTACGGTGCAAATCCTGCGTTGTTATTCCA
AGGTGGACAAGCTGCTGCTAATAATACATATACTGCTTTAGGTAATATAA
CTCTAGGTGGAGCGAATGCCGGTTTGACTATTGCTTCAGATCCAGATGTA
TTAGGACCAATAACGCTTGCAGGAAATATAGATGGAGGAGGTATAATAAC
TGACAATACAGATGCTGCCATTAACGGAACAATAGGTAATACTAATCCGG
CAGCTCAAATAAGCATTGGAGCAAGTACGCTTTCTCTTGGAGGGGCAGTT
ATTAAAGCCACTACGACTAAGTTAACAAATGCAGCGTCGGTATTAACACT
TACAAATGCAAATGCAGTATTAACAGGTGCTGTTGATAACACCACAGGCG
GTGATGATGTAGGTGTCTTAAATTTAAACGGAGCGTTGAGTCAAGTAACT
GGAAATATAGGTAATACAAATTCATTAGCGACAATAAGTGTAGGAGCAGG
TACGGCTACGTTAGGGGGAGCGGTTATTAAAGCCACTACGACTAAGTTAA
CGAATGCAGCGTCGGTATTAACACTTACAAATGCAGTATTAACAGGTGCT
GTTGATAACACCACAGGCGGTGATAATGTAGGTGTCGTAAATCTAAATGG
AGCATTGAGTCAAGTAACCGGGAATATAGGTAATACAAATTCATTAGCCA
CGATAAATATAGGAGCAGGTGTGGCTACCTTGGATGGAGCGGTTATTAAA
GCTACTACGACTAAGTTAACAGATGATGCGTCAGTATTAATATTTACGAA
TCCTGTAGTAGTAACCGGAGCAATAGATAATACCGGTAATGCCAATAAAG
GTGTGGTAATCTTTACCGGAGCAAGTACGGTAACCGATAATATAGGTAAC
ACGGCAGTATTAGCAGAGGTAAGCGTAGGAGCAGGTTTGCTGCAAATACA
AGGCGGAGTAGTAAAAGCGAATGCAATAAACTTAACGGATAATGCGTCAG
TAGTAACATTTACCGGTGATAGTACGGTAACAGGTAGTATAGGTGGTACA
GAACTCTTCGCAACAGTGAATATAGGAGCAGGAATAACATTACGAGCCGG
AGGAAGCCTAGCTGCGAATAATATAGATTTTGGAGCTGCGAGTAATTTAG
AGTTTAACGGTCCTGCCGGTAAGAATTATAACTTAATCGGAACTATAGCA
AACGGTAATAATGCTACACTTAATATTAATGCTGCTGGTACAGTGATTGC
AAATGATGTTAGTATAGGCACAGTTGCACAAATTAACATTCAAAATAATA
AGATTTTTGTAATAAATGCTAAGAACGCTGATGTTGATATATTAGACGCT
CAGGCGATTAGTTTTAAAGGAGCAGCTTCACGTCTTTTCTTAGCTAACGT
TAGTCTACAGATGATAGAGTTATCACTCTTAAAAATCATTTACCCGGTCT
TGCTAACGGTGGTGGTGAGTTAA
>RF_0345 unknown
ATGCTTATTAAATATCTGTATCATTTTTCGACCGGTGTTGACACCGAAAA
GCATTTGTTAGTTAAAGATGGAATGTTAAGTGCAGAAGAAATAGAATCTA
TTATTTCAAATTATCTATTGTTAGAGATATTAGCTAGTAGTTATTCCAGG
GAAAATAACATAAATGAAGATAGAATTATTGAAGCTAGAATTATAGTAAG
AAGATTATTTGAAATTGCTCGTAATTATTATGAAGATGATAAGCAAAAAG
GCATAAATGAACTTGGAGCAATAAACTATACAAAAGCAACTTATCTTCTT
AATGAAAATATTCAAAAATCACTTAAACAAAAGCAACTTAGTTTTAAAGA
TATTGATTACGTAGTTGGTAATGAGTTAGAGAAGTTATGTGAGTTAATAG
CAGGGAATAGTGCAATTCTTACTCTTAATAATGACCAAATACATAGCAGT
AATGATTTTTTTGATTTAGCAATATTAGGTAGATTAGAAGAAACTCTCAA
AAAATTATCCGAGGATTTTACGGTAAATGATGAGCGGATAAAATTCTATA
GAACACTAACAGAGGAAAATGATAAAAAATTCTTTTTTGAAAATTGGAAG
TTAATAAAATGGTTTTCCGATACCATAACTTATGAGAAACTATTGCAGTT
GTTACCTAGTAAAAAATTTTTATTAGATCTCTTAAAAGATAAAAATCTAT
ATAAACTAGCAGAAAAAATGACTATTGCTAAAAATGAGTTACTTGAAATG
TCACAAGAGGCACAAGAAAATTATTTAAAAGAAATAAAGATTGAAGATTG
TTTAGATGTTCATTTAGACTCTATGAATATAAATACTCTTAGACTTGTTC
TAGAATCAAATACGATTCTTACTAATATCTCATTCAATTCTGATACTAAC
GTAATTATAGAAACAGGAAAATCTTTGAATATTGCCGGTCTACTAACTAT
AGGATCAGGAAGCACTTTAAATATATCAGGTGAGGGTACACTAACTCTAG
GATCAAATATTGTTTCAAAAAATATAATAGAAAATATAAATTATAAAGGA
ATAACTCCTGAAATTCTTTTAAATAATACTATTGCACTCAATTTAAATTT
TACGGAAGAAAATATATATAATAATTCAGATACAATAATATTGGGAAATA
TTGATTCGGAGATTTAA
>RF_0046 Cell surface antigen-like protein Sca10
ATGACTAATATGAAAAAAACTTTTTTTAATAAACTTTTACTAGCAACCAG
TAGCATGGGGCTACTTGCAAGCATGGAAAGCTCGGCAGCGGTTGTTGTTG
CCGTTCCGCACGAGAATAATACTTCTTACGTAATGGATCCAATGCGAGGG
GGAGATAGGCCTCAAGATTGGAGGAGTAATAACGGAGCTCAGTACCAACC
GCAAAACGGGGATGATATTATTTTAAGAAGAGCTCATTTAATTAATTTTA
ATCAAAACATAAATATTAATGATATTAATATTTACGGTTATAGTGCAAGT
ACTTTTATTGACAATTGGCATAACGGTATTAACGATCGAAGAGAAATGGG
AGGAATTGCAATTACTCCCGGATTTGGTGCTAACCGTATTGTTACTATTA
ATAATATTATTAATAGTGATGCCAATAATTACCGTATTGCAGGCAGCAAC
GCTTTAGGGGAAGCATTAATATATGGTAATAAAAACGCAAAAGTGCGGGT
TGATCTTTTAGAATCTTTAAATGATCTTAAATTAATTATTACCGGCAATG
ATATTAGTGCTGTTGATTCTATAGTAATGAGCGGAGGAACTAATGAAATA
ATTTTCCGGAACCCTATTAAAGTAAAGTCTAAAATATACGCTAGAAATAT
TTTACAAGGGAAAGTAAAAATAGAAAGTAATAATATTGTTTTTGAAAGCC
CTATTGGTAATGACGGGAGAGATAATCATAGTATTTCTATATTTAAAGTA
GATGATAATATATCAGTAACCTTAGAAAATAACATTGCTGCCGAAGATAT
TAATTTAGGGAAAAATTCTACAGTAATTATAGATACTACTAAACGAAATA
TAGATGTACGTTCCGGAATTGTAGTCAATAATACAGTAGACAACCAAGGT
ATAGTTCAAGTAAGAGGACACGCAAAAAATACGGTAACTTTTCATGAAAA
TATAGGGGTGCAAGATTTTAAAGCTGCTGAGATACAGATTGAAAACGGAA
AGAAAACTGAATTCAAACAAAAGGTATATGCAAAGAAGATTACAGTAGCA
AGTAATGATGTCGTATTTGAAGAAAAACTTGATATGGCTCAATATAATCA
GAATAATAGAGGTAATAGAACTAATTTAATACATACCGGTAATTTAGAGT
TTACAAATCGCGGCAAAGTAAAGTTTAATAAAGATTATGTCGGTACCATT
ACTACTAGCAAAGCCAATATAGGTGAAGTAATTTTGTAA
>RF_p43 Putative conjugative transfer protein TraD_F
TTGCTCCGAATCACTACATATTCAAGTAACTCAGAATTTGCCAAAGCATT
TGAGAATACTGCAGTTGCAGGAATGATAAATAACTCAGCTCCTGAGACTT
CTACTGGCGTACAAGCAACGCTTAGCAAGAATATCGCAGCTTTAAAGCAT
CTAGCCCCCATAAGGGATTTTTCAATTAGACAGTGGTGTAATGACGAAGA
AAACAAAAGCTGGTTATTTTTAACGGCACTTCCTAGCCAAAGAGCAACAC
TTAGCCCTTTATTATCTGCTTGGATTAGTGTGGCTTTAAAGTCATTAATG
AGCAGAGATATAGGAAGCACAGTAGAGAATCTTTGGTTTATTATGGATGA
GCTGCCTGCTCTTGGTAAAATCAATAGCTTAAATACAGCTCTTGCAGAAA
GCAGAAAATATGGCGGATGCTTTGTTGCAGGTATTCAGAACATATTTCAG
CTTGATAAAATATATGGCTCTGCTGCAGCTAATGATTTACTTGATTTGTT
TAATTCAAAGTTCATTTTTCGTGTTGGCGATCAGCAAACAGCACATAGAT
CGGCAATGATGCTAGGTGAGCAAGAAATACGCAAAACCCAAGAAAGTCTA
TCGTATGGCTCAAACACCATAAGAGATGGTGTTAATATCAATACTATAGA
ACAAAAGAAGATGCAGGTATTACCTGCTGAAATCATGTCTCTACCTAACT
TATCGTGTTTTGTAAAGTTAGCGGGACATTATCCGATTTCTAAATTGAAG
ATGAAATGGCAGAATTGA
>RF_pd43 Putative conjugative transfer protein TraD_F
TTGCTCCGAATCACTACATATTCAAGTAACTCAGAATTTGCCAAAGCATT
TGAGAATACTGCAGTTGCAGGAATGATAAATAACTCAGCTCCTGAGACTT
CTACTGGCGTACAAGCAACGCTTAGCAAGAATATCGCAGCTTTAAAGCAT
CTAGCCCCCATAAGGGATTTTTCAATTAGACAGTGGTGTAATGACGAAGA
AAACAAAAGCTGGTTATTTTTAACGGCACTTCCTAGCCAAAGAGCAACAC
TTAGCCCTTTATTATCTGCTTGGATTAGTGTGGCTTTAAAGTCATTAATG
AGCAGAGATATAGGAAGCACAGTAGAGAATCTTTGGTTTATTATGGATGA
GCTGCCTGCTCTTGGTAAAATCAATAGCTTAAATACAGCTCTTGCAGAAA
GCAGAAAATATGGCGGATGCTTTGTTGCAGGTATTCAGAACATATTTCAG
CTTGATAAAATATATGGCTCTGCTGCAGCTAATGATTTACTTGATTTGTT
TAATTCAAAGTTCATTTTTCGTGTTGGCGATCAGCAAACAGCACATAGAT
CGGCAATGATGCTAGGTGAGCAAGAAATACGCAAAACCCAAGAAAGTCTA
TCGTATGGCTCAAACACCATAAGAGATGGTGTTAATATCAATACTATAGA
ACAAAAGAAGATGCAGGTATTACCTGCTGAAATCATGTCTCTACCTAACT
TATCGTGTTTTGTAAAGTTAGCGGGACATTATCCGATTTCTAAATTGAAG
ATGAAATGGCAGAATTGA
>RF_0475 Cell surface antigen-like protein Sca7
ATGTTAACTTTAATAATAGAGGAGGGAGCTAAGATTATCGGTAGTGTTAC
TAGTACCGGAGGTGTGGCCGGTACTTTAGTGTTCATAGGTGATGGAGAGG
TTACGGGAGATATAGGTACGGATGATGAAAATAAGCCTGATATTATAGAA
ATTTCCGGTGATAATACAAAACAAGTAACGTTAAGAGGAAATGTACTTGT
AAATGATTTAGTTTTTGTTCAAGGTGTTGATTCTTCAGGTAAGGCAAATA
TTGAGAACGGTTTAGTTGCAAGAAGAGTAGTTTTCAATAATGAGAATGCA
GATGGAGGTACATTAGTAATAAATGCACCATCTGCAGTTAATGCTATAGT
AAATCCTAATAACGGTATGATAGTTCTGAATGCTGATTTTACAATTAGTG
ACCCAAGTGCCGGAGATATAAGGGAGATAAAAATAGCTGATAACATAAAA
TATACGATTGATGCTAAAAGTGGAAATGTAGATTTATTAAATAACGGTGC
AAAGATAATATTTGAAGGGGCAGGCTCGGAATTAAATTTAATAAATACCG
GTAATACGGATAAACAGTTTACGTTATATTCCAACTTAAATCCATCAGAT
GCAGAAGATGAATATGGGATAGTAAGAGTAGAGGCAACTACGAACAATCT
TACTATAGCAAATAATGGAGGACCTTATACGATAGGGCAGGATAATACCC
ATCGCCTTAAAGAGTTTGAAGTTAAGGGAGCAGGTAATATCGTAATTGAT
AATACGATATTTACAAAGCAATTTAACATGAATAATACCGGACAGGTAAC
TCTTAATCAGGTCTTAGATTTAGGAGTAGGCGGTGGGGTATTGTTTGCGG
CAGATGGCAAGTTAACGGCAAATAACGGGATTAGCGGCAGCGTAACAACG
GCTACAAATGATACAGGCACATTGACGATAGGCACAGGGAATGTAACCGG
AGCGATAGGCACGAATGGCGGTAGTAAATTAAAAGAAGTAAATTTTAACG
GAGTAAGTAACGTAACAAGTATTGATGCAACAATTGTGAAGATTAGTAAT
GCAGCAGCAAACGTAACGGCAGCTGGGCAAATCAGTGGAGCAGTAAGTTA
TACGGCAGATGGCAAGTTAACGGCAAATAATGGAATTAGCGGCAGCGTAA
CAACGGCTACAAATGATACAGGTACATTGACGATAGGAGCAGGGAATGTA
ACCGGAGCGATAGGCACGAGTGGCGATAATAAATTAAAAGAAGTAAATTT
TAACGGAGCAAGTAACGTAACAAGCATTGATGCAACAATTGTAAAGATTA
ATAATGTAACAGCAGCAGGGCAAATCAGCGGAGCAGTAAGTTATACGGCA
GATGGCAAGTTAACAGCAAATAACGGGATTAACGGGGCGGTAACAACGAA
TGATACAGGTACATTGACGATAGGAGCAGGGAACGTAACCGGAGCGATAG
GCACGAATGGCGGTAATAAATTAAAAGAAGTAAATTTTAACGGAGTAAGT
AATGTAACAAGCATTGATGCAACGTGA
>RF_0704 unknown
ATGAAAAAATATTTTTTAAGATTTCTACCTATTCTATTTATATTATTTAC
TTTTAATGTTTTTGCTAGTGCTACTATCGTACCTGTCAATATAGAGATAA
GTAAAGATAATAAAATAGCAACTATGACGGTACAAAATAATGATTATACA
CCTAAAAAGTTTCAGCTACTTCTTTTAAAACGTGTGTATGAAAACGGTAC
AGAAGAATATAAAGAAACTACGGATTTAGTGGCAACTCCGGTAACATTTA
CCTTGCATGGCGGTAAAACACAATTGATACGGTTAGCTTTAAAAAATACA
CAGAATTTTTCTACTAGAGAAAAAGACTATAGAATCATATTAAGAGAATT
ACCGCGTAGAGTAAAACTAGAGAATAGTGTTACCTCTACGGTAAATCTTG
TTGTTCAACATAGTATACCTATAACAATATCAAGGTAA
>RF_0706 P pilus assembly protein FimD
ATGGGAGATTTTGACGTAACAAACATTCCGGTTATTACCGGTAGAGGTGA
CTTAATAGTTAAAACTCAAGATATAACCGGTAAAATTCAAACAATTACCA
TTCCTTATTATGCCTCACCGAGTTTACTGCACGAAGGGCTTTCAAATTTT
TCTTATGAAGCAGGATTTCAAAGACAAGATTTTGCGATATATAGTAATGA
TTACAAATATTTAGTTCTAAATACCGATTATATGCTTGGTATGAATGATT
ATTTAACAAGCGGTGGACGTTTTGAATTTTTAAAAAATAATGGAGCAGTA
AGGGTAACTAATAACTTAAAAATCGGAAATTTTGGAATTATAGGCATTTC
AGCTGCAAGTAATATCAAAAATTTCGGTCGTTCTCAAAGAATTAATTGTG
GTTATACTTATGAATCGGAATATTTTGACATTAATAGTAATTTAGATTGG
AATAATAGCAATTATCAGGATGTATATAACTATCCCGATAAAACTTTTTC
AAGTTTAAATTATCAGATTTCAGCTAGCTGCGGTAATACCGATTTTGGTA
ATATAAGTGTTAATTTTTTGTCTTTTGTCGTAAATAACACAATACAACAA
GGTAAACGTACAAATATAATATCATCGACTTATCAAAGGAATATTACTAA
AAAAGGTTTCTTAAGTTTTACTATAGGTACTGATTTAAACAGTAAACGTA
AAAATAATTTTGCCTATATGTCATTTAACTTCAATTTAGACGGTAATAAA
AGTATTTCATTTACCGATTCGTATCAAAATAAATATCATACGAAGCAACT
TGGTATTTCTTCACCGGTTACCTCAAATATGGGATGGGGATATAATGCTA
ATATAATTAAAGCTAAAGCTACAAACTATAACGTACAGCTTAATCGTAAC
GGTAAAAATAACGATATTGGAGTTTATCTGCAGAAAAATGATATCGAAAC
AATGAAACAATTTAATATCAAAGGAGGTATTGTCTCTATTGATAAAAGCT
ATTATGTGACGAGACCGATTACCGGAGGTCTTGCTTTGATTAAAGTAAAT
AGTTTAAAAAATGTCGGAGTTTATAATAATAATCTATTAGCCGGCTATAC
TGATGATAAAGGTAAAATGCTTGTACCAAACGTAACACCCTATGTTCCTT
CTGAAATAAGATTAGATGATGAAAATCTACCTCTTAATACCGAGTTTGAG
GAAATTGCTTTAAAAGTTGCTCCAAAAACAAAATCAGCAGTATTATTAGA
TTTCAATGTTAATATAATTAAAAGTGTTGAAATGACTATGTTTGATAGCA
ATAAACATTTTATTTCGTTCGATAGTACGGTTAATATTGAAGGTTTAGAC
GAGGAAATATTTGTAGGTTATGACGGTAAGGTTTATATCAATGATATTAA
AGACCTTGAAGTATTAAACGGCTCTATTTGTGATGAGAATGAAGAGAATA
ATAGATGCTGTCATTTTAGCGTGCCGGTTAATAGAGACTTAAACGATCCT
GTAATTGATTTAGGCGAAGCAATATGCAAATAA
>RF_p56 Hyaluronidase
ATGAATATTTTTTCGTTAGATACGTTTTCGTATGGAATTATAATGGGGTA
TTACGGACCAGTATGGTCTAATGAAGTACTAATTGAATATGCTGATTTTT
GTAAGAAATACGGGTATAAATATTTTATCTATGCACCAAAGATGGATAAG
TTGTTACGTGATAATTGGAATATATTTTTTACTGAATCACGTGTTCAGGA
ATTAAAAAATATCCGTGATACTTTTGAAGAAAAAGGTGTAGCTTTCGGTA
TTGGATTGAGTCCACTAGGGCTTAATAACTTAAAAGATATAGAGAAAGTA
GAAAAAGTACTACAACAGAAAATCACTCAAATCAATAATATTAATCCTAC
TATTCTAGGTATATTTTTCGATGATATCAATAAAGACTCAATTGTTCCTG
ACTTGGGAGTGGGGCAAGTACAGGTTGCTGAGTACATCGCACAAAGAAGT
AATGCCCAGAATTTTGCCTCTGTTCCAAGCTATTACAGTAATGATCAAAT
TTTACAACGTGTGTTAGGACCAACTCCTGAAAGTTATTTTGCTGATTTTA
GTCAGTTAGATCAAAAGTTTTCTATATTTTGGACTGGAGAACATATTATG
AGTGATGGTTATTCTCAAAAAGAATTAGATAATATTTCTAATAAACTAGG
ACGTAAGGTATTAATATGGGATAATTATCCAGTTAATGATCCGACTTACC
TAAAGGATCATTTGCGTATTTCAGGTATAGATAGACCTCAGGAGCTTTCT
TCTTGGACTCCATCGATAGCTTTTAATCCTATGATACAACCAAATATGTC
AAAAATTCCGTTATCTACAGCTCAATGTTTATTTTCTTCAGAGAAATATA
ATAAGCGTGAAATATATATAGAAAAACTTATAGAACTATGTGGAAAAGAT
TTAGCACAAGCTATAGATCAAAACTTACCATATTTTGAATTAAATGGTAT
TAATCGAACTGAAACATCAAATATCAAACGTATGAAAGAGCTATTCTCCT
TGTTTGCTGAGATAAACGAACAGCAATATACGCATGAAATTATCAAGTTA
TTGGGGGGATCACAAGAAATATAA
>RF_0705 P pilus assembly protein FimD
ATGAAATTATCTCCGAATCTCTTGAAGACAATTTACCTCAAACCACAGCG
GACACAAACGTGCATGAGGATAAAAGGACCATTTCCCCAATTACCTCTAG
AAGTAGAATTTGAGAATAGCTCTAATGAAGTTGCGGGCGACAACGAATTG
ATTGTTTCGCTAAAAGTTAATTATACCGAAACCGATATATTCCCGACTAT
AGTGCAAAACGCTCAAGGTCATTGTTTAATTCCTCTTGAAGATATAGAAC
ATTTTGATGTCCAAGAAGATTATCTTAAACAGGGTCTCGCGAACTATCAC
GATACTGCATATATTAATTTAGATTTACTTGAGGGTACTAAATATGATCT
AAACTTCGAGAATTTAGATTTAAACATTACTTTTCCAGCGGAAAAAATGC
AACCTCAATCATTTGATGCTTCAGGTGGTCCTATGCAAAATGTCGATACT
AAACTTATCAGCGGTGCATATCTTAATTATGACATAACTCTTAGCCAAAA
TGATGATATTAATTATTTAGCCGGAGTAGAGGAACTTAATTATTTTACTG
AAAACGGCGTATATAGCTATAGTTTTTTATTTCAAACCGAAGCCGTTAAA
TCAAATTTTTCTAAAGTTAAAAATACTGCAAGAAACCAAAATAAATTTAC
ACGTTTAGAAACAAATTGGACATATGAGAATGTAGATAAAATGACTAATT
GGCGGGTAGGGGATAGCATAACTAAAGCATCTTCTTGGTCTAATTCAACT
AGATTTGCCGGTATTCAGTATACTACTAATTTTGCGGTTAGACCGAATTT
AGTTACTTATCCGTTACTGGTTTTAGAGGGAAATCAGAACTTCCAAGCAG
TATAG
>RF_pd56 Hyaluronidase
ATGAATATTTTTTCGTTAGATACGTTTTCGTATGGAATTATAATGGGGTA
TTACGGACCAGTATGGTCTAATGAAGTACTAATTGAATATGCTGATTTTT
GTAAGAAATACGGGTATAAATATTTTATCTATGCACCAAAGATGGATAAG
TTGTTACGTGATAATTGGAATATATTTTTTACTGAATCACGTGTTCAGGA
ATTAAAAAATATCCGTGATACTTTTGAAGAAAAAGGTGTAGCTTTCGGTA
TTGGATTGAGTCCACTAGGGCTTAATAACTTAAAAGATATAGAGAAAGTA
GAAAAAGTACTACAACAGAAAATCACTCAAATCAATAATATTAATCCTAC
TATTCTAGGTATATTTTTCGATGATATCAATAAAGACTCAATTGTTCCTG
ACTTGGGAGTGGGGCAAGTACAGGTTGCTGAGTACATCGCACAAAGAAGT
AATGCCCAGAATTTTGCCTCTGTTCCAAGCTATTACAGTAATGATCAAAT
TTTACAACGTGTGTTAGGACCAACTCCTGAAAGTTATTTTGCTGATTTTA
GTCAGTTAGATCAAAAGTTTTCTATATTTTGGACTGGAGAACATATTATG
AGTGATGGTTATTCTCAAAAAGAATTAGATAATATTTCTAATAAACTAGG
ACGTAAGGTATTAATATGGGATAATTATCCAGTTAATGATCCGACTTACC
TAAAGGATCATTTGCGTATTTCAGGTATAGATAGACCTCAGGAGCTTTCT
TCTTGGACTCCATCGATAGCTTTTAATCCTATGATACAACCAAATATGTC
AAAAATTCCGTTATCTACAGCTCAATGTTTATTTTCTTCAGAGAAATATA
ATAAGCGTGAAATATATATAGAAAAACTTATAGAACTATGTGGAAAAGAT
TTAGCACAAGCTATAGATCAAAACTTACCATATTTTGAATTAAATGGTAT
TAATCGAACTGAAACATCAAATATCAAACGTATGAAAGAGCTATTCTCCT
TGTTTGCTGAGATAAACGAACAGCAATATACGCATGAAATTATCAAGTTA
TTGGGGGGATCACAAGAAATATAA
>RF_1027 unknown
ATGTTGTTATGGGCGGGTGGAAACTTAATGGTAGATTTATTGAATCCATT
TATAAAACCGACAAATAATACTATAGTAATTTGTGCATTGTTATATTGTA
TCAATATACTAACTGAATTTCTGCATTATAATCCCACATCTCATAAATTA
AATCTAAATTCAAAATTCTCATCCTTAATAAAAAATGTCGAATTACAATT
ATTGACAGGCTTCGTAGTTGCTTATGTCACCTTGGATATATTATGGTATT
ATGAAGCTTTTGCATTAAAGAAAGAATTAGCATTAATTAATTTAAGACTC
ATACTAAAATATATTTTCCTAGCAATATGTTTTTCTATAATTCCTATATG
CTACATATTAAGCAAAGTAAATAAATATTTGGCTAATTTATCACTAACTA
TAATTCTGCTCGTCTGCTTTATTTTACTACCGCTTCATGGAACTAGTAAA
AATCTTAATATATTATATATAATACTAATCGGTAGTTGTTTAGGATCCAT
TTATATTTGCAATATTTTAATACTAATTGATAAATTTAGAGATTACGAAC
TTAGAACAGCTTTATTTTCGTATTTTTCAATGTGCAGCATCGGTATATAT
GCCGGAGCTTTATCATCTCATGTACCTTACGGCACCATTAACGGCAGTGA
TTTCTTATTTTCCGTTTTTGCCGTAGTCGGTAGTTTTGTAGCCTATCATT
TATGGTATTTTATTAGGTATAGATTATATAGATTCTAA
>RF_0772 clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit
ATGTCGTATGTACCGATAGTAATTGAACAAACCTCACGTGGTGAGCGTGC
TTATGATATATATTCAAGATTGCTAAAAGAACGTATAATCTTTGTATGTA
GTACTGTTGAAGATCATATGGCAAACTTAGTCGTTGCACAATTATTGTTT
CTTGAAGCAGAAAATCCTAAAAAAGATATATATATGTATATCAATTCCCC
CGGAGGAGTTGTGACCGCAGGGCTTGCTATTTATGATACAATGCAATATA
TAAAGCCTAAAGTAGCTACATTATGTATAGGTCAAGCTTGTTCTATGGGT
TCACTTTTACTTTGCGGAGGCGAGAAAGGAATGCGTTATAGTTTACCTCA
TAGCCGTATTATGATCCATCAACCGTCAGGAGGTTATAGAGGACAAGCTA
CCGATATAGAAATTCACGCTCAAGAAACCCTAAAAATCAAAAGGTTACTT
AACGAATTGTATAGTAAACACACTGGACAAGAGTTAAAACATATCGAAAA
AAGTATGGAACGTGATAATTTCATGTCACCGGAAGAAGCAAAGAAATTTG
GAATAATCGATAATATAATTTCTTCTAGAGATGCTATGACAATGTCAGCA
AAATAA
>RF_0531 dprA, Putatie DNA processing protein DprA
ATGCTAAAAGAATTATTTTCTGCTCCTAAAATATCTTATGATATTGAAAC
AATTAATATTTTACGTCTTATTAGGAGTGAAAATATCGGTCCTAAAACTT
TCTTTAGTTTAATTAAATTATTTGGTGATGCAGCAACTGCCATAGATAAC
GCTCCGGATTTTTCATTGCGAGGCGGAAAGTCAAAACCAATTAAAATTTT
CAGTAAAAGCGATGCTGAAAAAGAGTTAGAGCTTCTCGAAAAAGACAATG
CTAAGATTATCACATATAAATCTCCGGAATATTCAAAATTATTACTTGAA
ATTTATGATCCACCGCCAATATTAAGCTATAAAGGTAATATAGAGTTATT
AAATCATAATAAATGCGTTGCAATAGTAGGTGCAAGAAACGCTTCTGCAA
ACGGAAGAAGTTTTGCTCATAAAATTGCAAATGATTTAGTAAAAGAAGGA
TATATAACTATTTCAGGATTAGCAAGGGGGATAGATAGCAGCGTACATCA
AGCTGCAATTTCTCAAACTATCGGAGTTATTGCAGGCGGTATTGATCATA
TATATCCACCGGAAAATAAAAAACTATTTGAAAATTTAGCAGAAGAAGGT
TTAATATTAGCTGAGTTACCTATCGGCTCTACCCCGCTTGGAAAACATTT
TCCACAGCGTAATAGGATAATATCGGGGCTAGCCTTAGGAGTAGTGATAG
TAGAAGCAAGCTTAAAATCCGGTTCATTAATAACTGCAAAATTTGCACTT
GAACAAAATAGGGAAATATTTGCCGTTCCCGGCTTTCCTTTAGATCCAAG
ATGTCAAGGTACAAATAAATTGATTAGAGAGGGAGCATATTTAGTGGAAT
CAGTGGACGATATTGTAGCTAATTTACCGCAATATGAAGAATTTATGAAA
AAAGATAATGGATTATTTAAGGATTTTGTTGAGCTAGGAACAGTAAATAC
TAGATATGTTAAAGAACCGTCACAAAAGGAGCGTACTGCTATATTGGAAT
TATTATCGTCAGTACCTATAGATTTTGAATTTTTACAAAAAGAAACGGAG
TTATCGCTTCCTATTATATATACGGTAATATTAGAATTAGAACTCGCCGG
CAAAGCAATACGTCACGCCGGCAATAAAATATCATTAGTTTACGCCTAA
>RF_1106 ffh, Signal recognition particle protein
ATGACAACGGAAAATCGATCCATGCAACAACGCCTACATAAAACAACAAA
ATATATTGTTGCTAAAACATATGGGGCGAAATATATTAGAACCTTATTAA
ATACAATTATTTACATGTTTAAAACTTTAACACAAAATTTAACGAAGATT
TTTGATAAGTTAGTCAGCTCAGGGATTTTAACAGAAGCCCAAATAGATGC
TGCTATGCGGGATATAAGAGTAGCTCTTTTAGAGTCGGATGTTGCATTAC
CGGTGATAAAAGATTTTATAGCGGAAGTTAAACAAAAGGCACTCGGACAG
GAAGTTATTAAATCCGTTTCACCGGGGCAGATGATAATTAAAATTATTCA
TGAAGAGATGATAAATCTCTTAGCTTCAAGTGAAAGTGAGACAAAGCTAA
ATTTAAATTCAAAGCCGCCGGTAAATTTCCTAATGGTAGGGCTGCAAGGG
AGCGGTAAAACTACGGCGAGTAGTAAGCTTGCTTTACGACTTAAAAATCA
AAATAAAAAAGTTTTACTTGTTTCTTTGGATACTTACAGACCGGCCGCAC
AAGAGCAACTTGCTATACTTGCAAACTCAGTACAGATTAATTCATTACCT
ATTGTGCAAGGTGAGAAACCTCTTGATATTGTCAAAAGAGCTATTGCCGA
GGCTAAAATTTCTGCTTATGGCGTCGTAATTTATGATACGGCAGGTCGTA
CACAAATTGATAAAGAGATGATGGAGGAAGCTCTTGCAATAAAAAAGATA
GTGGAGCCTACGGAAACTTTGTTAGTAATTGATAGTATGACGGGACAGGA
TGCAGTAGTTACGGCAAATAGCTTTAATGAAAAGTTAGAAATTTCAGGAT
TAATTTTATCTAGAATTGATGGCGATTCCAAGGGCGGCGCGGCACTCAGC
GTAAAATATATTACTAAAAAGCCGATTAAATTTTTAAGTAGCGGTGAAAA
ACTAACTGATTTAGAAGAATTCGATGCTGAACGTTTAGCTTCTCGAATAC
TTGATATGGGTGATATTATCTCTTTTGTTGAAAAAGCAGCTAGTATTGTT
GATAGAGAAGAAGCCGAAAAAACGGCAGCTAAATTGAAAAAAGGTAAGTT
TGATTTAAATGATTATCTTCAGCAAATGAGAAGCATAAAAAAAATGGGAG
GTTTTGGTAGTATACTTAGCATGTTACCGGGTAGCGGTAAAATTATGGAT
CAAATAGATCAATCAAAATTAAATAGTAAAATAATTGAACATCAAGAAGC
AATTATTTTATCTATGACGCTGAAAGAACGTGAGAATCCTGACATCATTA
ATGCTTCTCGTAGAAAACGTATAGCTGCTGGAGCAGGGACTACGGTACAA
AAGGTAAATATTTTGCTAAAGCAATATAAGCAAATAAGTGAGATGATGAA
AAAAGCCAGTAAAATGAATCCTAAAAATCTATTACGTAACGGAATTGGAA
AATTGTTTTCGTAA
>RF_1238 ftsY, Signal recognition particle-docking protein FtsY
ATGATTTCGATATTTAGTAAATTAAAACAAAGTTTATCTAAAACTTCTAA
TAAAATATCGAAAGGTATCGACAAAATATTTTACAAGAAAAAATTAGATA
CAGAAACTCTAGAAGAGCTTGAAGAGCTGCTTATTGCAAGTGATATGAGC
GTTTCGGTAGTAACTAATATTATTGAAGAGTTTAAAAAGGTAAAATTTGA
CAAAGAAATAGATAGTGATACAGTAAAAGAAGCCCTAGCTGAATTAATAG
AGCAGCAGTTATCAAAATCAGAAATTCCTTTTACACTAAACGAAAATAAA
TTAAACGTAATTTTAGTTTGCGGTGTTAACGGAGCAGGTAAAACCACCAC
TATAGGTAAGCTTGCTGCAATGTACGGGATGCAAGGGAAAAAAGTAGCAG
TTGCGGCCTGCGATACTTTTAGAGCGGCTGCCGTGAATCAGCTAAGCACT
TGGGTAGATAGAGCAAATGCACTACTTATTACCGGTGAAGAATCGGCTGA
CCCTGCGAGTGTTGCTTACCGTGCTATGGAAGAGTCGATAAAACAAAATA
TCGATATACTTTTTATCGATACGGCAGGCAGGCTTCATAATAAGAAAAAT
TTGATGGATGAACTGTCTAAGATTGTAAAGGTTATAAAAAAACTAGACGA
GAATGCTCCTACTCATAGCGTTTTAGTAATTGATGCTATTACAGGACAAA
ATACTTATAACCAAGTAGAACATTTTAATGATGCTACTAATTTGACGGGA
CTTATCGTGACTAAATTAGACGGTAGTGCTAAAGCCGGAGTGCTTGTCGG
AGTGGTACAGAAATTTAATCTACCCGTATATTTTATCGGTATAGGCGAGA
AGATAGAGGACTTAAAAATATTCAACCGACATGATTTTGCTAAAAGTTTG
GTCGGGTTGTGA
>RF_1177 lepB, Signal peptidase I
ATGCAAACAGATAATACAAAATCAAACACTAATAAAACAGCTAAGCAAGA
GTGGGGGTCTTTTGCTTTTGTAATATGTATCGCTTTACTTATTAGAATAC
TTATTATGGAGCCGTTTACCGTTCCGACCGGTTCTATGAAAGCAACCATA
CTTGAGAATGACTATATATTTTCTACGAAATATAGTTATGGTTATAGTAA
TTATTCTTTATCTTTTTTTGATTTTATTCCTCTTTTTAAAGGGCGAATAT
TTGCACGTGAACCGGAGCGTGGCGATATTGTAGTTTTTCGTCCGCCTAAC
GATATGAATGTTAGATATATAAAGCGTTTAATAGGGCTACCCGGCGATAA
AATTCAATTGATTGATGACGTAATATATATTAACGATAAAAAAATAGAAC
GCACGGAAGTTGGAACTTATATTAGCGAAGAAGGAATAAAATATTTGAAG
TTTAAAGAAACGCTGCCAAACGGTAGAACGTATTTTTCTTATAAGCTTGC
TCCTATTTTTGGCGTTATATATAATGATAGATACGGTAATACGGATGTTT
TTTATGTACCTGAAGGAAAATATTTCTTTTTAGGGGATAATAGAGATCAG
TCAAATGATAGTAGAGTAAATCTTGGATTTGTACCGTTTGAAAATTTTAT
TGCTAAAGCACAATTTATTTGGCTCTCAACAAAAATAACTTGGTGGGATA
ATGATATAGGAGTTATTAATCTAGTACTAAAGTTAAAGCCATGGATTGAA
TCTGTTAGGTTAAATCGAATTTTCAGAAACCTTTATAGTACGGATGAGTA
A
>RF_0632 lspA, Lipoprotein signal peptidase
TTGTTGCAATCTCGTGCCAAAGTCCTGAGATTGCTTCGTCGAAACTTGCA
GTTTCTTCTCGCAATGACGATAAAACCGATCCACGCAAAAAATAACATAA
GAGCCATCATTCACAAAACATCTATGTTCCTACTCCTAAAAAAACTATAT
ATAACATTTGCTCGTAGTAGTCGTATAATAATAACCTTAGTGATTATTGA
TCAGTTAAGTAAATGGTGGTTTATTGATGATTTAAGATGGAAGCCGGGCT
TAATGCTTAAGGTTACTTCTTTCTTAAATATGGTTTATACTTGGAATTAC
GGTATTAGTTTTGGTCTAATGCGTGAATATTATCAATATAGCAATGCTAT
TTTTTTAATAACTAACACGCTTATTGTCTGTTATTTATATTATCTGATGA
TACGTTCAAAAACAATAGGGAGTTTTGCAGGTTATAGCTTTGTAATCGGC
GGAGCTGTTGGTAATCTAATTGATAGATTTTTTAGAGGAGCAGTTTTTGA
CTTCATCCATTTTCATTATCAGAATTATAGCTTCCCCGTATTTAATTTAG
CTGATTGCTTTATTACAATAGGAGTAATTATCTTAATAGAAGATTATTAT
AGTACTAAAAAAGTTATTGAAGAAAAGGCTAAAGGGAATTATGATAATGC
TCAAATTGAAGCTATGGCTGAAAAAATTCGTAATGCCGGTCATAACGGGG
ACGATATAGTGAATTAA
>RF_0941 secA, Preprotein translocase SecA subunit
ATGCTTTCTATTTTAAAAAAACTTTTCGGTACTGCAAATGATCGTACTGT
AAAAAAACTATTTTCTGAAATTACAAAAATTAACTCGCTTGAGCCTGCTA
TACAAAAATTATCAGATGAGGAGTTAAAGAATAAAACTGTAGAGTTTAAA
GAAAAGCTTAAAAACGGAGCTACTTTAGACGATATAGTATATGAGGCGTT
TGCGGTAGTTAGGGAAGCGGCTAGAAGAGTTTGCGGTATGCGTCATTTTG
ACGTTCAGCTTATAGGCGGTCTTATATTACACCGAGGCATGATTACGGAA
ATGCGTACCGGTGAGGGTAAGACCTTAGTTGCGACGCTTCCTGCTTATTT
AAATGCTTTGACCGGAAAAGGCGTACATGTTGTAACTGTGAATGATTATC
TAGCAAGTCGTGATTCTGCATCAATGGGTAAAATTTACAATTTTTTAGGT
TTATCGGTTGGATGTATTGTTGCCGGTATGCCTGATGAAGCAAAACGAGC
CGCCTATAATGCTGATATTACTCATGCAACAAATAATGAACTCGGTTTCG
ACTATTTAAGGGATAATATGAAGTATAGCTTGCAGGAGCGAGTACTTCGT
CCTTTTAATTTTGCTATCATCGATGAGGTTGATTCGATTTTGATAGATGA
AGCAAGAACTCCGCTAGTTATCTCAGGTCCGGTTAATGATAATTCGGAAT
TATACGGTAAAATTGATAAAATTGTACGCATGCTTAATACAAGTGATTTT
GAAAAAGACGAAAAATTAAAAACTATCAATTTAACGGAAACCGGTATTAC
ACATATAGAATCACTTTTAAGTAAAGAACATCTTATAAAACCTGATACCG
GTTTATATGATTTTGAAAATTTAACTTTAGTGCATTACGTTAACCAAGCC
TTAAGAGCTCATAATATGTTTACGGTTGATGTGGATTATTTGGTGCGTGA
AGGTAAAGTAATGATTATAGATGAGTTTACCGGTCGTGTAATGGAGGGGC
GTAGATATTCGGAAGGGCTACATCAAGCATTAGAAGCAAAAGAAAATGTG
AAAATTCAAAATGAAAACCAAACTCTTGCATCTATTACTTTCCAAAATTA
TTTCCGTAATTATCCTAAATTATCGGGTATGACCGGTACCGCTATGACCG
AAGCACCGGAATTAAAGGACATATATAATCTCGATGTGGTTGCAGTTCCA
ACCCATAATAAAGTTACAAGGCTTGACCTTGATGATGAGATTTACGGTAG
TAAAAAAGAAAAATATGATGCTATCTTAAAGCTAATTAAGGATTGTTACG
ATCGTGGTCAGCCTATACTTGTCGGTACGATAAGCATAGAAAAGTCAGAA
GAGCTTTCAAGCGTTTTAAATAAAGAAAAAATCCCTCACAAAGTATTAAA
TGCTAAGTTTCATGAGCAGGAAGCTTTTATTATTGCTCAAGCAGGTAGGT
TTAAGGCAGTAACGATTGCAACCAATATGGCAGGGCGAGGCACTGATATT
ATGCTTGGCGGTAACCCTGAAATGTTAATAGAGCAGCTAGATGAAGATCA
TAACTATGAAACTAAGGCAGCTGAAATAAAAGCTCAAATTTCCGAAGAAA
AGAAGCAGGTTATTGAAGCGGGCGGGTTATTTGTAATAGGTACGGAAAGG
CATGAAAGCCGTAGGATAGATAACCAGCTAAGAGGAAGATCGGGTAGACA
AGGTGATCCAGGAAAAACTAAGTTTTTCCTATCGCTTGATGATGATTTAA
TGCGTATTTTTGCATCAGATCGTATATCAGGAGTCCTTAGAACACTTGGA
TTGAAAGACGGAGAGGCTATCCACCATCCGATGATTAGTCGTTCACTTGA
GAAAGCTCAGCAAAAAGTGGAAGGACATAACTACGAGATGCGTAAAAATT
TATTACGTTTTGATGATGTAATGAATGACCAACGTAAGATAATATACGAG
CAACGTACTGAAATTATTAAATCTAAAGATAGTCACGGTTTCTTAAATAG
TACTACTGAGGAACTCGCTAAAAAGATAGTATTAACTTTTATGCCGGTAG
GCTCTTATAGAGAAGATTGGGATATAGAAAATTTAAGCGTAGAATTGCAT
CGTGTCTTTTCTATGAAATTTGATCATAATTTAGTCAGTAAAAATGACGT
AACGGAAGAAGAAATCACGAAAATCGTTATACAAACGGCTCATGATATAT
ATAAGTCAAAAGAAGAAGCTTATAGTAGTGAGTTAATGCATAATGCCGTG
AAGTATATTTTACTAACTACTCTCGATCAAGTTTGGAAAGATCATTTATA
TAGCTTAGATCATTTAAGACAAGGCATATCGCTTAGAGCTTATGCTCAGA
AAGACCCTCTTAGCGAGTATAAAAGAGAAGCATTTAATTTATTCGAGCAG
ATGCTTAATAATTTAAAAGAATTATTTATTCAAACAGTATATCACTTCCA
TATCGACTTAAAACATATTCAAAAAGAAGATGTTTCGCTTGAACATAAAA
AACTTCAGAAAAATATGCGAGAAAGTCGGGAAGATCCGGCATTTAGTAAA
TATAATGCAGGAAGTAGCCTTGAGACTGACCTTAAACCTGTCGTATCACG
CGTTGACCCAAAAGATAGAAACCCTGATGATCCTACTAGCTGGGGGAGGG
TATCTCGTAATGAGCTATGTCCGTGCGGTTCAGGTAAGAAATATAAATAT
TGTCACGGTGCAAATGAATAG
>RF_0055 secB, Protein-export protein SecB
ATGAGTACAATAAACACCGATACTAATGAGGCAATGCCGCATATTTCCGT
TAATGCACAATATATAAAAGATTTATCTCTTGAGAACCCTTCTGCCCCGT
CTTCTCTTGCGGCTTTAGAACAACGCCCTCAAATTGATTTATCTCTAGAT
ATAAATATTACTAATTTATCGGAAGAAAATTTCTATGAAGTAGAATTAAA
TATCGAAGCAACTGCAAGAAATGAAAAATATAAATTATTTCAGATAGAAT
TAAAATATGCTGGAGTATTTAATTTAATTAATATTGATTCTGAACAACAT
CCGATTTTATTATCTGTTCATTGTCCGGCAATGATATTTCCATTTGCTAG
AAAAATTATAGCTAGCTGTACTCAAGATGCAGGTTTCCAGCCTTTAATGA
TTGATCCTATAGACTTTGGTGCCTTATATCATAAGAAAATGTCAGAGCAT
CAAAACTAA
>RF_0959 secD, Protein-export membrane protein SecD
GTGCAAAATCTTCCTAAATGGAAAATTTTTCTTTCAATTATATGTACGGT
TTTTGCGGTTATTTGTGCCTTACCTAATTTCATGCAGGTAAATTCTAAGT
TTCTGCCTCATGATTCAGTAAATCTAGGGCTTGACCTTAGAGGAGGAGCC
CATTTATTACTCGATGTTGATTTTGACACCTACTTAAATGATTCAATGGA
AAATCTTGCTGACACTTTACGCAAAAATTTTCGTGAGGATAAAATCGGCT
ATAAAAATCTGTTAGTTAGACAAAATAGCATTCAATTAGAAGTAAGATCG
CCTGAGGAATTAAAGCCGTTAAAGAAAATAATTAACAAAATTGATCCGGA
AATTATCGCTGAAGTAAACGAAAATAAAATAAAGCTTAGCTACAGCGAAT
CTAGATTAAATGACTTACTTAATAAGGTAGTAGACCAATCTATTGAGATC
GTTCGCATGAGAGTTGATAGTACCGGCACTAAAGAACCGACACTACAGAA
GCAAGGCGATAAGCATATATTACTACAAGTTCCCGGCGAAGAAAATCCCT
CTTACCTGAAGAATATATTAGGGAAAACTGCAAAGCTAACTTTTCATTTA
GTTGATGAAAATGCCAATATTGAAGAAGCGGTAAAAGGACATGTTCCGGT
AGGTTCAATGCTAGTTAAGGGAGATAGCGAAAGTCATAGGGAATATTATG
TAGTTATAAAGAAAAAAGTTGTTTTGGGTGGAGATCAGCTTACAACCGCT
TCAGCTTCTTTTGACCAAAATTCACAAGCGGTAGTTGCTTTTTCTTTCAA
CAATTTAGGTAGTAAAATATTTGGTGAAATAACCAAAAATAATACCGGTA
AACGCCTTGCTATAGTTTTAGATAATAAATTACTAAGTGCTCCAACGATA
AACGGGGCAATTATGGGCGGAAGCGGTATAATAACAGGAAATTTTACCGT
TGAGTCGGCAAATGAGCTTGCACTATTATTGCGAGCCGGTTCGCTCCCTG
CCCCACTTAAAATTATTGAAGAGAGAAGTATAGGTCCAAGTTTAGGTGCT
GATTCTATAGAGTCGGGCAAAAAGGCAGGACTTATAGGGTTTATAGCAGT
TTGTATATTTATGGTTTGGTCTTACGGTGTACTTGGTTTATTTGCCAATA
TAGCTCTAAGCCTTGCATTGTTATATATTCTAGCTTTACTTTCACTTTTC
CAAGCTACTTTAACTCTCCCGGGAATTGCAGGAATAATACTAACTATGGG
TATGGCTGTTGATGCTAATGTATTGATTTACGAAAGAATTAAAGAGGAGC
TGCATAAAGGAGTTTCTAATCTTTATGCTATTAGAACCGGTTTTGAATCT
GCGTTTGCTACTATCCTTGATTCTAACCTAACTACTTTAATCGTTGCTTT
TTTACTTTATATATTCGGAGTCGGGGCAATAAAAGGTTTTGCCGTTGCAT
TAACAATCGGGATTATATCTTCAATGTTTTCGGCGATTATCATTACTAAA
TTGTTAATAGATATTTGGGTGAAATATTTTATACCTAAAAAATTAGGATT
GGTGTAA
>RF_1152 secE, Preprotein translocase SecE subunit
ATGCTAGTATGTGAGAATTTCAGTGCTGGATCATTGTCTCAATTACCTCT
AGAAGCAGAATTTTGTAAGAAGTCTAATAAATTACCTAACAAAAATATGT
TTAAAGAATATAAAATTTATAAGTTTTTTGAACAAGTTAAACAAGAAACT
TATAAGGTAGTTTGGCCAACTAGAAAAGAGCTTGTTGCTTCAACATTAGT
AGTGGTAGTAGCAGTTTTTATTTTTAGCCTAATTTGTTTGGTACTTGATT
ATAGTATACATAACATAATGCAGCTTTTGCTTAATATCGGCAAATAG
>RF_1179 secF, Protein-export membrane protein secF
ATGCAAATTTATCCTTTAAGACTTTTACCTAATAAAATCGATTTTGATTT
TATGAATTTTAAAAAAGTCAGTTACAGTTTCTCAATTATTTTATCACTCA
TTAGCTTTATTTGGATCGGTATATATAAATTTAATTTCGGTATTGATTTT
GCCGGCGGTATAGTTATTGAAGTAAGGCTTGATCAAGCTCCTGATTTACC
AAAAATGCGGGGGGTTCTAGGTGAGCTTGGAATAGGCGAGGTGGTCTTAC
AGAATTTTGGTAGTGAGCGTGATTTATCGATTAGGTTTGGTAGTAGTAGC
GAAGAAAATCTCATGAAAAATATTGAGTTAATTAAAGCATCTTTGCAAAG
TAATTTTCCGTATAAGTTTGAATATCGTAAGGTAGATTTTGTCGGTCCGC
AAGTCGGTAGGCAGTTAATAGAAGCGGGGGCTATGGCGATGCTATTCTCT
TTCTTAGCTATTATGGTTTATATTTGGGTGCGTTTTGAGTGGTATTTCGG
TCTTGGTATACTTATTGCCTTAGTGCATGACGTAATACTCGCTCTTGGGT
TTATGAGTATGACAAAGCTTGATTTTAACTTAAGCACTATTGCCGCAGTG
TTAACTATTATAGGTTATTCCGTTAATGATTCGGTAGTAATATATGATAG
GATTAGAGAAAATTTACGTAAATATCATAAAAAAAATATCACGGAAATTA
TAAATTTGAGTATCAATGAGACTTTATCAAGAACTATTTTAACGGTAATT
ACTACACTACTTGCCAATTTAGCCCTTATTCTTTTTGGCGGTGAGGCAAT
CCGTAGTTTTAGCGTCCTTGTATTTTTTGGGATAATAGCCGGTACTTATT
CATCAATTTTTATCTCCGCTCCGATACTTACAATGTTTGCTAATAGAAAG
TTTAATAAGAAAGTAATAGAAAGGTAA
>RF_0298 secY, Preprotein translocase SecY subunit
ATGGGGCAGAATTTTTCTAAAAAATCCGGTAATGATTTAGTTAGTCGCAT
TGTTTTTACTATTCTCATTCTTATAGTATGTAGATTTGGGTCTTTTATAC
CTATACCCGGTATAGATTCAATTGCTTTAAGTAGTGTGGCTGAAAAGAAT
CAATCCGGAATACTCGGAATGTTCAACATGCTATCCGGAGGATCGCTAGG
TAGAATGTCTATTTTTGCTTTAGCAATTATGCCGTATATTACCGCCTCAA
TTATTATCCAATTAATGTCAGTTGCATATAAACCTTTAGAAAATTTAAAA
AAAGAAGGGGAAGTAGGTAAAAGAAAAGTAAATCAGCTATCGAGATATTT
AACGGTTCTGCTTGCTTCTTTTCAGGCTTATGGAGTTGCTATAAGTTTAG
AGTCGATTGTAACAAATACCGGTCCTGTAGTAATTTTAGCGGGTTTTTTC
TTTAGGGTTACAACCGTAATTACTTTGGTTGTAGGCACTATGCTATTAAT
GTGGTTAGGAGAACAAATTACACAACGCGGAATAGGTAACGGTACGTCCT
TAATTATATTTATAGGCATAATTTCAGGAGTACCTAGTGCTATTATTAGT
ATGTTTGAATTATCAAGAAAAGGAGCATTATCGCCTTTAATAGCGTTAGC
TGTTTGTATTGGAGTAGTTGTATTAATAGCTATAATTATATTTTTTGAAA
AAGCCCAAAGAAAATTATTGGTGCAGTATCCTAAAAGACAAGTAGGAAAT
AAAATTTATGGAGGAGAAGCAACGCATATGCCTCTTAAATTAAATACTTC
TGGTGTAATACCTCCAATATTTGCTAGTTCAATTTTACTATTTCCTGCTA
CGCTTGCTAATTTTTCTAATAGTAATTCAGAAACTATGGGCATGCTTACT
TATTACTTAGGGCATGGAAAACCTGTATATATTTTATTATATGTAGCATT
AATTATGTTTTTTAGTTTTTTTTATACTGCAATAGTATTTAATTCTGAAG
AAACTGCTAATAATTTAAGAAAATACGGTGCTTATATTCCAGGTAAAAGA
CCAGGGAAAAATACATCTGATTATTTTGATTATATACTTACAAGGCTTAC
GGTTATAGGTGGGATATATTTAAGTGTAATATGTGTAATTCCGGAGCTAT
TAATGAATAAGTATGTAATTTCTCTTTCGTTAGGAGGTACGAGTTTTTTA
ATTGTAGTGAACGTGGTACTTGATACTATGACTCAGATTCAAACTTACTT
ATTTAGTAGTAAGTATGAAGGTTTAATGAAGAAAGTAAAATTAAAAAATT
AA
>RF_0619 sppA1, Signal peptide peptidase SppA
ATGAATGAAGTAAATAAATCAACTATGGCGAATGCAGAATTTGATCAGAT
AATAACCAAACGGCAGATAAGTAAATTAGATCAGTTATTTGCTTCGGTTT
TTGGTGATTCTAAAGAAGTGATTGCCGTTTTACGCCTTAGCGGTGTTATC
GGTAAAGTAAGTACTATGCAATCGGGACTTACTTTAGAATCATTAAATGA
ACTAATAGAAAAAGCTTTTAAAATAAAGAAATTAAAAGCATTATGTTTAA
TTATTAATTCTCCTGGTGGTTCTCCGGTACAATCTGAACTTATTGCGAAA
CGTATTCGTGACCTTGCTAAAGAAAATAAAATAAAAATTTATAGTTTTAT
TGAAGATATGGCGGCTTCAGGCGGATATTGGCTTGCTTGCAGCGGTGACT
GGATATATGCTTCTTATAGTTCGGTTATAGGTAGTATTGGAGTAGTGTCA
AGCGGATTCGGTTTCCATGAAGCGATTAATAAACTTGGAATAGAGCGTAG
AGTTTATACGGAAGGAAAAAATAAAGCAATTTTAGATCCTTTTAAACCTA
TTAATAAAGAGGACCTTAAAATTATTAAAAATTTGCAACAGCAAGTTTAT
GAGCACTTCGTTGATTATGTAAAAACAAGAAGGGCAGGGAAGCTAACACA
ACAAGACGAGATTTTATTTAACGGCGAATTTTGGGCAGGGCAAACGGCTC
TTGATTACGGCTTAATTGATGGTATAGGTGATATGTATAGCATAATGAAA
GAAAAATTCGGCGATAATATTAAGTTTCAATATCTGTGTGCTAAACAGCC
TTGGCTTAAAAAGAAACTTGGCATGGGAAGTAAGATATTAACCGATAATT
TTGCTAATTCTTTAATTGATGCAGTAGAAAATAAAATTGTTAACGATAAA
TTTGATATAAGGTAG
>RF_0766 sppA2, Signal peptide peptidase SppA
ATGAGTATAACACCTGATTATTTAATTGAAAGAAGACAAATAAAATCTCG
TTTGTTAATTTGGAAACTAGCAGCTATTATTTTAATTGCTATCGTATTCT
TACTAGTCGGTAAAGATTTTGCTCCAAAAGAGGTTTTACCTATTAATAGT
AATGAAGACTATATAGCTTCCGTATTAATAGATGAAATAATCCTTGAAGA
CGAAAAGCGTGACAAAAAGCTCAAAAAAATAATCGATGATTCTCATATTA
AAGCGTTAATAGTTAACGTAAATTCTCCCGGCGGTACGGTAGTCGGCTCT
GAAAAAATTTATAATATCTTACGCAAAATATCCGAAAAAAAGCCGGTAGT
AATCGTTATGGGAACAATGGCTGCAAGTGGCGGTTATTTAATCTCTCTCG
GAGGCGATTATATTATTAGCCATAACGGCACTATTACAGGTTCAATCGGT
GTAATACTACAAACAGCCGAGGTAACGGAGCTTGCTCAAAAATTGGGGAT
TAAGTTTAATAATTTCAAATCGGGTGAATTAAAAGCTGTCCCAAATCCTA
CCGAAAAACTGACGGAAGCAGTGCGGGTAGCCATTATGGAAAATATAGAA
GATACTTATAATTTTTTCCTTGAACTTGTTTCAGAGAGGCGTAATCTTCC
CATAGAAGAAGTAAAAAAGCTCGCAGACGGGCGAGTATATTCAGGTCGTC
AGGCTTTAAAGTTAAAGCTTGTAGATGCTATAGGCTCGGAAGATACTGCA
TTAAAATGGTTACAGGAAGTTAAGAAAATTAATGCTAATCTACTAGTTAA
AGATTATCAATTAAAACCAAAACCAAAATTAATTGACATAATACTTGAAG
ATTTTGATAGTATAGCACCTAGTTTTTTTAAAAATAGTTTTAACGGAATC
AAAGCGATTTTTTAA
>RF_1196 tatA, Twin-arginine translocation protein
ATGGGAATGAGCTTTAGCCATTTATTAATAGTTTTATTAATTATTTTTGT
ATTATTCGGTGCCGGTAAATTACCTCAAGTTATGTCTGATTTAGCCAAAG
GTCTTAAAGCTTTTAAAGACGGCATGAAAGACGAAGGTAGTGATAATGAT
AAGAAAAATAATTGA
>RF_1248 tatC, Sec-independent protein translocase protein TatC
ATGAAATTATATAGTTTTCAAGAACATTTATTAGAATTAAAAATAAGACT
TCTTAGAATATTTACTGCTTTTATAATTATATTTGCTATTTGCTATTATT
TTAGCGACAATATTTATAGTTTTTTATTAAAACCGCTTGCTAAGCTAAGC
GGTGATACGGTACGAAATATAATTTATACAGGGCTTACAGAAGCATTTTT
TACCTATATTAAACTTGCAGCTTTTACTGCTTTTACTATTATTATACCTA
TAATTGCTTTGGAGTGTTATTTATTTATCAGCCCAGGGTTACACCGCCAT
GAAAGAAAAATTATCGCTTTTATTCTTTTTATGTCGCCTATTTTATTTTG
GTGCGGTAGTATTTTTGTTTTTTACTTTGTAATGCCGAAAGCTTGGAATT
TTTTTCTTAGTTTTGAAAAGCGTGATATGATAGTACCGATAGTTTTGGAA
GCAAGAATTAGCGAGTATCTAAATTTAGTTATTCATTTAATTATTGCTTT
TGGAGTTGCTTTTCAACTACCGGTTGTGATAATAATATTAAATATACTAA
AAATAGTTAAGGTACAAACACTTAAGCAAAAAAGACGCATTGCCGTGGTA
ATTAACTTTATTATTGCAGGAATATTAACGCCTCCTGACATTTTAAGCCA
GTTTGCTCTTGCAATACCGCTACTTTTATTATATGAAACTTCAATAATGA
TATGTAATTTTATAGAAAAACCGAGGACACTAAATGTTAAATATCAAATG
GATTAG
>RF_0492 tolB, TolB protein precursor
GTGAGAAATATTATATATTTTATACTATCACTATTATTTAGCTTTAAAGG
TTATGCACTTGAAACAATAAATATTGAGCATGGGCGTGCTGATCCTACGC
CTATAGCAGTTAATAAATTTAATGCCGATAGTTCTGCTGATGACGTAGTA
GGTCACGATGTGGTGAAAGTTATCTCTAATGATTTAAAGCTTTCGGGGTT
ATTTCGTCCTATTTCCTCTGCATCTTTTATAGAAGAGAAGACAGGAATAG
AATATAAACCGCTTTTTGCTGCATGGCGTCAAATTAATGCTAGCCTTTTA
GTAAACGGTGAAGTTAAAAAACTAGAAAGCGGTAAGCTTAAAATTAGCTT
TATATTATGGGATACATTGCTTGAAAAACAGCTTGCCGGCGAAATTCTTG
AAGCACCGGAAAATTTATGGCGAAGAGCAGCACATAAAATTGCCGATAAA
ATTTATGAAAAAATTACCGGTGATGCCGGTTATTTTGATACTAAAATAGT
GTATGTATCAGAAAGCACTTCTTTACCGAAAATAAAAAGAATTGCTTTGA
TGGATTATGACGGGGCTAATAATAAATACCTTACCAATGGAAAGTCACTA
GTATTAACCCCAAGATTTGCTCGTTCAGCGGATAAGATTTTTTATGTTTC
ATACGCAACTAAAAGAAGAGCTCTTGTTTATGAAAAGGATTTAAAAACAG
GTAAAGAAAGCGTAGTAGGTGACTTTTCCGGTATATCTTTTGCCCCTAGA
TTCTCACCGGACGGTAGAAAAGCCGTAATGTCGATAGCTAAAAACGGCTC
GACGCATATTTATGAAATTGACCTTGCTACTAAACGGCTTCATAAATTAA
CTGACGGCTTCGGTATTAATACCTCTCCTAGCTATTCACCGGACGGTAAA
AAAATTGTGTATAATTCTGATAGAAACGGTGTGCCTCAATTATATATCAT
GAATTCGGACGGAAGTGACGTTCAACGTATTAGTTTCGGTGGAGGTTCAT
ACACTGCTCCTAGTTGGTCGCCTAGAGGAGACTATATAGCATTCACTAAA
ATTACTAGAGGAGCTGAAGGAAAAACTTTTAATATCGGAATTATGAAAGC
ATGCCCCCAAGATGATGAGAATAGTGAAAGAATAATAACAAGCGGATATT
TAGTCGAAAGCCCTTGTTGGTCGCCTAACGGACGAGTTATTATGTTTGCT
AAAGGTTGGCCGTCGAGAGCTAAAGCTCCGGGGAAAAATAAAATTTTTGC
AATTGACCTAACAGGTCATAATGAAAGAGAAATTATAACACCGGCGGATG
CTTCTGATCCTGAATGGTCAGGCGTGCTGAATTGA
>RF_0985 tolC, Type I secretion outer membrane protein, TolC family
ATGCGTAAATTAACTACATTTATTATCACCTTATTACTAACCGGTTCAGC
TGCTGCTGTTGATTTGCAGGAAGCTTTAACTGAAGGATATAAGAATAATG
AGGAGCTGAAAGCTGCTAGAATTAAGTTTTTGAATGCGATTGAGCAGTTC
CCTCAAGCTTTTTCAGGATTTATGCCTAGTGCCGGAATGAAGATTGAAAG
AAGTAATAGTAAAACCAAATATAATAAAAAATATACTGATAGGCTTGGTC
TTACTCCAAGAGAGACAGATAGCAATCAAGGTGCATTAACAATTGAGCAA
TCATTATTTAGCGGTGGTTCTAGTGTTGCGGCTCTTAAAGCTGCTCAATC
AGGGTTTAGAGCATCACGAGGCGAATATTATGCCGGCGAACAAAAAATAT
TATTAAATTTAATAACTGCTTATCTTGATTGTTTTGAGAGCAAAGAGAAA
TATGATATTTCTGAAAGTAGGGTTCGTACTAACATACAACAAGTTAACAC
TGTTGAAGAGAAATTAAGACTAGGGGAAGCAACGGCGATAGATATAGCAA
CTGCAAGAGCAGGGCTTGCAGCGGCAGAAACGAATAAACTAGCTGCCTAT
GCCGATTTTCAAGGAAAAAAAGCAAATTTTATTAGAGTATTCGGAATAGA
GGCTACTGATATAACTATGCCTAATTTACCTGATAGATTACCTGCTTCAT
TAGATGAGTTAACAAAAAAAGCTGCTAAGTTAAATCCTGATATTGATTCG
GCAAGGCATAATGTAACTTCGGCGAAGGCTTTGGAAATGGTGCAGAAAGG
AAAATTACTGCCGCAAGTGAGCGTAAAGTTGCAATCAGGTAGAACTAACT
ATAATCCACAAGATCCAGCTGTTCAAAATATAAACAATAAAAGCTATACT
ACTATTCTTTCGGTAAATATCCCTATTTATCCAAATGGAGGGGCTCAATA
TTCAGAAATTAGAAAAGCTAAAAACCAAACAAGAAATAGTGCAGTTCAGC
TTGATAGTGCGATAAAGCAGACACAAGCGGGTGTTGTAAGTGTATGGGAA
GGATTTGAAGCGGCAAAATCTCGTATTGTTGCAGCTAATCAAGGCGTGGA
GGCTGCACAAATATCATATGACGGTACAGTGCAAGAGGAAATAGTCGGCT
CCAAAACTATACTCGATGTTTTAGATGCTGAGCAAAAATTGTATGAAGCA
AAAATAACTCGTGTGGATGCGTATAAGAATTCAGTACTTGCGGCATATCA
AATGAAATTGTTAACCGGTGAGCTAACGGCTCAAAGTTTAAAACTTAAAG
TAAAATATTTTAGTCCTGAAGAAGAGTTTAAGACTATTAAAAAGAAAATG
TTTATAGGTTTCTAA
>RF_0504 tolQ, TolQ protein
ATGAGTACGGATATTAATAATATTAGCGATAGCTTAGAAATTGTTACGCA
AGATCATTTATCGATTTTTTCTTTAATAAGTTCATCCGACATTATCGGTA
AATCGGTTATGTTGATGCTGCTTATTGCTTCCATTTGGTCGTGGGCTATT
ATTTTGGATAAAATATTTAAGCTAGCACAAGTGCAGCGAAGAATGAAAAA
TTTTGAAAATGTGTTTTGGTCCGGTGGAGTATTAGAGCAATTATATGAAA
GCATAAAGAGGTCGGTTAATAATCCGCTAGCTTTGATATTTGTCTCGGCT
ATGGATGAGTGTAAGAGTTTAAATACTAAAGGGCTTTCTGATGCGTTAAA
AAACAACCATAAAGAGCGTATAACGGGTGCAATGTACTTAGCTCAAAATA
GGGAAGTCGAAAAGCTTGAGAAGAATTTAAGCTTCCTGGCAACCGTTGGG
TCAAGTGCTCCTTTCGTAGGTTTATTCGGCACTGTTTGGGGAATTATGCA
CAGCTTCCAATCGATTGCTACTTCAAAAAATACTTCTCTTGCCGTAGTAG
CTCCCGGAATTGCTGAGGCGTTACTTGCAACTGCAATAGGCTTGTTTGCA
GCTATTCCGGCAGTAATTTTTTATAACTATCTTATTTCCCGTATTACTCT
TATAAATAATAAGATTGAAGATTTTAGTAGCGAGTTAAATTCTATACTTT
CTAAGGCAATTGATCAGGAGAAAATGTAA
>RF_0505 tolR, TolR protein
ATGGCTATAAAGCTTGCCGGAAGTAATAGAAAAAGTAAAAGAGCGGTAGT
TAGTGAAATTAGTGTTACTCCGCTCGTTGATGTGATGCTTGTTCTATTAA
TTATTTTCATGATTACTTCTCCAATGCTTGTTTCAGGAGTAAATGTGGAT
TTACCTGAGACAAATTCAAGTCCGATTTCAGGGCAGGATGAACCGCTAGT
CGTTACTATCAATAATAAAGGTGAAATTTTCCTGCTTGAAACTCCTATAG
AGAGAACACATTTAACCGACAAGCTTGCAAATATCACTAAAGAAAAAAAG
GATGCTAGAATTTTTGTAAGAGGCGATAGGAATGTCTCTTATGGGCAGGT
GGTAGAGATAGTTGCCGAAATTCATGCTGCCGGCTTTTCTCGTATAGCTC
TTATTTCAAATATTAAAAATAATGAAAAGTAA
>RF_0467 virB10, VirB10 protein
ATGGCTGAAGAGCAAAATAATAATGATACCGGTTCTTTATCAGGAGCAGA
TGCTCCTGAAGTACAGAGAGAATTATCAAAAGTTTCAGTTAGCTTTAATA
AGAGTATTGCGATAGTAGTCGTAATTTGCGGTATTTTTATATATATTTTT
TATACTCTTTTTTTCGCTAATAAAAAAGAAGAAATATCGGAGACTCAAGT
GCCGACTAATATTGTAAAACCTGTTACTGATGTTGATGATAATATTCCGG
AGATTCCAAAGTTACCTGATCCGCCTAAGCTTGAGACGCCTACTGCTCCT
CCACCACCTCCTCCTCCAGTAGTAGAAGTTCCGCCGGTCTTACCTCCTAC
TACTCCTGTAGAAGAGAATAAAGACAAAACGCTTCCATTGCCGCCGGTTT
CGTTGCCTTCGACTTCAGGAACGTTAGTTGAGAGTGATGCAGAGAAGCAA
CGTCGTGAAGCAAAAAGAAAATCAGCTATAGTGTTAGTTGGTGGTGTAGA
GCCTAAAAAAACACAGGAACAGATTACGACAGAAGCGACCTTTAAAGATC
GTGGCGATATGTCTTTGGTTCTTGGACGCGGTAAATTAATTGATGCAGTA
CTTGAAACGGCAATAAATAGTGATCTCGGCGGTGAAATAAGAGCCATTAT
TAGTAGAGACGTATTTTCTGAGAAAGATAAAGTTATATTGATACCGAAAG
GATCAAAAATATTCGGTAAATATGCAACCTCAACTGATTCGAGCAGTTAT
GGTAGAGTATCTATAATATGGGATAGAATAGATTTGACCAACGGTTATAC
TATAGAATTTGACTCTCCTGCAGTTGATAATTTAGGTAGACCTGGACTAC
AAGGGAGAGTCGATAATAAATATAAAGAACAATTTGCAAATGCCGTATTA
CAATCCGGCTTTAATATAGGCCTTGCTAAAGTTCTTGATAAGTTAGTGCC
GCCTCCTATAGATTCACAGGCAGCAGCTACCAATAGTGCTACGGCAACAC
AATTGTTAAATACTGCTCAAACTATTGCGGCTAATACCGCTATGGATGCA
AATACTAGGATAGTTACAATTTGTACTAATATACTTGCTGCTATTACCGA
TAAAACTTCGACTGCTTATACTACTATGACTCAAGCATGTACAACAGCAC
AAACTGCTTCTTCAGCGAATACTGCTGAGCAGAGACTTCAAACCTTAGTA
CAGGCAGTTAATACAGCAGCTTCAAGTTTGCTTACTACTACCTCTATAGC
ATCGACTCCGACACAAGCACAACAAGCTTCTACTCAAGCTTTTACGGATG
TGACGAATGTTGTACAAAATATGATAACTCAGCAGCCGTTTAAGCCGACG
ACAACGGTTAATCAAGGTACGCCGGTTAGAATATACGTTAATAAGGATTA
TAAATTCCCAAAAGCCGTTTTATTAAAATCAAAGGTAATGAAATGA
>RF_0468 virB11, VirB11 protein
ATGAATGAAGAATTTGCAGCCTTAGAGACGTTTTTACTTCCTTTTAAAAA
TTTATTTGCTGAAGACGGTATTAACGAGATTATGGTTAATAAGCCTGGGG
AAGCATGGGTTGAAAAAAAAGGCGATATATATTCTAAGCAAATACCGGAA
TTGGATAGTGAACATTTACTTTCATTAGGGCGTTTAGTTGCTCAATCTAC
CGAACAGATGATTTCGGAAGAAAAGCCTTTACTTTCCGCAACTTTGCCGA
ACGGTTATCGTATTCAAATAGTATTTCCTCCTGCTTGTGAGATAGGACAA
ATCATTTATTCTATAAGAAAGCCTAGCGGTATGAATCTAACTTTAGATGA
ATATGCTAAAATGGGAGCATTTGATGATACTGCAACAGAGAGTTTAGTAG
ATGAAGATGCAGTAATTTTAAATAATTTCTTAGCCGAAAAAAAGATTAAA
GAATTTATTAGACATGCAGTTGTTTCAAAGAAAAATATCATAATTAGCGG
CGGTACTTCAACCGGTAAAACTACTTTTACTAATGCGGCACTTACTGAAA
TACCTGCAATAGAAAGATTAATTACTGTAGAAGATGCTCGTGAGGTTGTG
CTATCAAGCCATCCTAACAGAGTGCATTTACTTGCTTCCAAAGGAGGACA
GGGGCGTGCAAATGTTACTACTCAAGATTTAATAGAGGCGTGTTTGCGTT
TAAGACCGGATAGAATTATAGTGGGTGAGCTTCGAGGTAAGGAAGCTTTT
AGTTTTTTGCGTGCTATTAATACAGGTCACCCCGGTTCAATATCAACACT
GCATGCGGATAGTCCCGCTATGGCTATTGAGCAGTTAAAGCTTATGGTTA
TGCAAGCAGATCTTGGTATGCCGCCTGAAGAAGTAAAGAAGTATATTTTA
ACCGTTGTAGATATCGTTGTGCAGTTAAAACGCGGTAGCGGTGGGAAAAG
ATATGTTTCGGAGGTTTACTATAAGAAGAATAAGAATGCTGAGGGTATGG
TGTAG
>RF_0087 virB3, Type IV secretory pathway, VirB3-like protein
ATGGCAGGAGCATTAGCATCCGATCTTTTATTTGTAGGGTTAACTAGACC
GCCGATGATATTTGGAGTAAGTATTAAGTTTGCTGCATTAAATATGATAA
TGACGATGATAGTATTTATTTGGAATAACGGCATTATGATTTTATTCATT
GCAGCTGCTTTGCATTTGGTAGCTTATATTATATGTTTTAAAGAACCGAG
ATTCATAGAGCTATATTTAAATAAAATGTCAAGAACTAGCCAATGTCCTA
ATAAATTTTACTACGGAGCAAATTCGTATAATATTTGA
>RF_0088 virB4_1, Type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family
ATGAAGTTATTTAGAACTAGAGCAGCTAAAGAATTAAGGTCTAAACAAGA
AAGACCAACTTCGCATTTTATTCCTTATAAATGTCATTGGGATAGTAATA
CTATTTTAACAAAAGATAATTCTTTATTACAAGTTATTAAAATAAACGGA
TTTTCTTTTGAAACTGCTGATGATGAAGATTTAGACATTAAAAAGAATGT
CAGAAATGCCTTACTTAAAAATATGGCTTCGGGAAATATCGTTATGTATT
TCCATACTATTAGAAGACGTAAAGCAGTAATATTTGACGATACGGAATTT
ACTTATGATCCTACCGTAAAAGTACCTAATGATTTTATTACTTATTTAGG
TGCGGAATGGCGTAAGAAACATGCAGGTGCTAGGTCATTTTTTAACGAAT
TATATGTTAGTATTTTATATAAGCCTGATACTGGCGGTGCTGCTATAGTT
GAGTATTTTTTAAAGAAGCTTAGACAAAAATCTAATAAAACCGCTTGGGA
AAATGACATGAAAGAGATGAAAGAAAATCTTCAAGAAATGTCAACTAGAG
TGGTTAATACATTCAGAAGTTACGGAGCAAGATTACTTGGAGTTCGTCAA
ACGCAGTCAGGTAGTTATTGTGAAATTTTAGAATTCCTTTCATCTTTAAT
CAATTGCGGCGATTCACCAGGTCCTATAGCATTACCGCGTGGTACTATTG
ACGAATATTTACCGACTCATCGCTTATTTTTTGATTCTCGTACTATTGAA
GCAAGAAGTCCGCTTGGCAAAAAATATGCCGGAATGATCAGCATACTTGA
ATACGGACCTAATACTTCGGCAGGAATTTTTGACGGATTTCTGCAAATGC
CTTTTGAATTTGTCATGACTCAAAGCTTTGTCTTTGCTAATAGAACCGTA
GCGATCGGTAAAATGCAATTACAGCAAAATAGAATGATACAATCCGGTGA
TAAAGCTACTTCGCAAATTGCTGAAATTAATACGGCCCTTGATATGGCCA
CTAGCGGTGATATCGGTTTCGGTGAGCATCATTTATCGCTTTTATGTTCC
GCGAATAATATTAAAGCTTTGGAAGATATATTATCAATGGCAGCAGTTGA
GCTTTCTAATTCAGGAATTCAGCCGGTTAGAGAAAAAGTTAACATGGAAC
CTAGCTATTGGGGACAGTTGCCGGGAAATATGGATTATATAGTACGTAAA
TCCACTATAAATACTCTTAATATGGCTAGCTTTGCCTCACAACATAATTA
TCCGCTCGGTAAAATTAGAGATAACCATTGGGGAGAATATGTCACAGTAC
TTGATACTACTTCGGGTACGCCGTTTTATTTTAATTTCCATGTAAGGGAT
GTTGGACATACTCTAATTATCGGTCCAACCGGTGCCGGTAAAACAGTTCT
TATGAATTTCTTATGTGCGGAAGCACAAAAATTCAAACCTCGTATGTTCT
TTTTTGATAAAGATCGAGGAGCAGAAATATTTATACGTGCTTTAAACGGA
GTTTATACGGTAATTGATCCGGGATTAAAATGTAATTTTAATCCCTTGCA
GCTTGAAGATACTAGTGAGAATAGAACATTTATTTTAGAGTGGCTTCGTG
TACTTGTAACTTCTAACGGTGAAAGTTTAACTGCACAAGATAATAAAATC
TTATCTCAAGCAGTAAGCGGTAATTTTAGATTAGAGAAAAAAGACAGAAG
GCTTAGTAATGTTATAGCATTTCTTGGTATTGATACACCAAATAGTTTGG
CAAGTAGGATTGCAATGTGGGTTGGTAAAGGTTCACATGCTAAGATATTT
GACAATGAAGTAGATGATATTGATTTACAAAAAGCAAGGGTATTCGGTTT
TGATATGACTGAATTACTTAAAGACCCTGTAAGCCTTGCACCGGTATTGT
TATATATTTTCCATCGCATTAATATCTCTTTAGATGGGCAGAAAACTATG
ATAGTACTTGATGAAGCATGGGCTTTAATCGATAATCCGGTATTTGCACC
TAAGATCAAAGATTGGTTAAAAGTGTTGAGAAAATTAAATACTTTTGTTA
TATTTGCTACGCAGAGTGTTGAAGATGCCGCAAAAAGTAGAATTAGTGAT
ACGTTGATTCAACAAACAGCTACGCAGATTTTTTTACCTAATTTGAAAGC
TACGGATATTTATCGTAGTGCATTTATGTTAAGTCAGCGAGAATATATTT
TAATTAAAACTACCGACTCTACTACACGTTATTTTTTAATAAAACAAGGA
ATAGATGCCGTAGTTGCTAAAGTTAACTTAGACGGTATGAATAATATAAT
TAGTGTTTTATCCGGCAGGGTTGAGACTGTAATATTGCTCGATCAAATTA
GAGAGAAATACGGCAATGATCCGGATAAGTGGTTACCTATATTTTATGAA
GCAGTTAAAACATTATAG
>RF_1250 virB4_2, Type IV secretion/conjugal transfer ATPase, VirB4 family
GTGTTTAGTGATTTACGAAAATTTGACAAAGATATATATAATTATAATGC
TCCTAATTTTATACCTATAGCATGTCATTATAATCAAAATACTTTACTTA
CCAAAGACGGTAAATTACTACAAATTATAAAAATACACGGCATTAACTCA
GAGAAAATAAGCGATAACATACAAAATTTACGTGAAATGGTTAGAGTTTC
TATAAAAAAGAATATAACCGATTATGATTTTGCTTTTTGGCTACATACAA
TACGAGAAAAACAAAATTTAGATGATTCCACTCCTTACAAAAAATTATTA
CCGGCAAATATTCATGCACTATGGCAAAGAAAAAACCATTGGAATGATAA
ATTCGTTAATACTTTATATATATCTATAGTACATGATTCTGCTAAAGTTG
ACATCAAAAATTTTAACTCTTTAATAAATTCTTTATCTAATAAATTAATT
ACTGATTTTGAAAATAACTACTTAGATTCAGCTTTTCAAAAACTAGAAAA
TATCACTAATAATATTTTAAACGATTTAAACGAATTCGGTGCTGAAAAAC
TTGGTATAATATTTGAAAATGATAATATTTTTTCTAATCCTTTATTTTTA
TATAATCGAATAGCTAACCTTAATAATAATGATTGTTTGGTACCTATAAT
AGATTTATCCGATGCACTAGGTAGAAGTATTTATACAATTAGCGGCGATA
AAATGGTAGTTACGGATCATGAGAAAAATAACAAATTCGCTTCTTTACTA
TCTATAAAAGAATATCAAGAAACTCCTTCTAATACACTGGATAAATTTTT
ACAGTTACCGATTGAATTAATAATAACTGAAATATTTTACTTTGTTAGCA
AAAAACAAGTAATATCCAAATTGCGTGGTCAAGATCATATTCTAAAAATT
ACTAACGACTCAACTTTACTTAATCATAAAGGGATTAATAAGCTTGATGC
AGCTAATTTAGATTTTCAATTTTGTAATCAGCAAATTTCAATTGCCGTTA
TAGAAGAAGATGAAAATAAACTAGATGCAGCCGTAGCTAAAGCATCAACC
GAACTTTTTAAACTTGGTATTATTCATGTAAAAGAAGATCTTAATATTGA
ACAAATATTTTGGTCGCAATTACCTGCTAACTTTGCCTTTATCCGCAGAA
TGTCACCATTATCCGTAGAATATATTGCTTCTCTTACCGCTCTTCATAAT
ACTACACTCGGTAATCAATATAATCCTTGGGGTAAGGCTATAACTTTACT
GCGAACCGAGAAAGGTACTCCATATTTCATGAATTTTCATGATAAAACGA
ATAAAGGTAATACTTGCATCTTTGGTACGGAAAAAACCGGCAAAACCGTA
TTATTGAACTTTCTAATATCAGAATCAACTAAATACGATCCAACAATAAT
TTATATCTCTAATAATAATGATTCTAAAATTTTTATCGAGTCAATAGAAG
GCAAATGGCTAGAACCGGACAAACAAATTATCAATCCATTTTTAGTAGAT
GATACAGAAAAATCACAAGCTTTCATTTTAGAATTTTTAAAATTAATCAG
CGGTCATTATATTTCACCTCTTAGTGAAATAGAGATATCCTTTCTAGAGA
AATTAAAAAATAAAATTTTATCAATTGAAAAAGAAAAACGTATTTTTTCC
GATATTTTAAAATTAGAAGATTTTAAAGAGGAAGGAGGAATACAAATACT
TGATAAACTTAAAGTTTTTACCGAAGGACAATTATATTTCGGATTATTTG
ACAGACCACCTCTTAACATTGAAGAAGGGAAAGTTATAGGATTCAATTTA
TATAAACTCTCTGATGAGCCGTTTTCTAAACAATTTTATCCAACGGAGAG
GAAATTTTTAGAACAATTTAATAATAATTTAAAGAAACATCAAGCTATTT
GTGCAGGAGTAATTTATGCTTTTACTTATCATTTAAGCCTAGTTGGCACA
AAACCTAAAATATTTGCTGCCGATAATTTTGATAAACTTTACAGACCTGA
AGTTTATTATGATAATATAAATTTAATCTATAATAATTTATCTCAAAATA
ACGGTATTTTCGTCAGTAATTTCAATTTTATTTATCTTAAGTCATATCCA
AAATATACTATAAAACCTTGGCTTGATTTAATTAATACTAAAATTATTCT
ACCGTCTGACGTTAAAATAGAAGATTTAGATAAAATTTTAGGTTTAAGCG
AGCCGGAAATACGAAAATTATCACAGCTAATACTTTCTGCAAGAATGTTC
TTAATTAATAAGGATAATGAATCGATAGCTTCTGAATTAAGTATTGCCGC
TTTAATAGGAATTGTCCGTATTTTATCAAGCAGACAAGAGGAAATGGATA
TTTATAACAAAATACTTGAACAACACCAAGGTCCTCCGGATAATTGGATT
AATTACCTATATAATGAGTTAAATACGGACTGA
>RF_0089 virB6_1, TrbL/VirB6 plasmid Conjugative transfer protein
ATGAAATTATTTCCTCGTAGTATACTTATAATATTAGTATTAAGCTTTGC
CCTAAATTTAGGGCTAGTTACTAAAACCCATGCCAAGGATACTCTTGATA
GCATTGTAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACCCAAGGCGTAGGG
GATTTGCTGCGTACTGAATTTTCTCATACCTGTATTGTTGCTCCGTTCTT
TACTTTTGCGGTAATGAATCTTGTCTCTCCCGTTTTATACATGAATACGT
TTTTAAAGCTTAAAATAAACGACAGTGATTTATTTAACGATAGTAATTTT
GGAAATTTCCCCGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA
AAATCCAGAATTACGCTTTGCTTTATGTAATAATGCTAAATTAATTGTAT
CTCGGGCAAAATCTGTTGCTGAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTC
TTAACAGGGGGCGACCCTTGGGATGATATAAAGAAAGCGTGGGAAAATAA
AAAAAAGGAATATCATATTCCATATAGTGGTAAGCCCGGTGATGACGGTT
TTGCATTTGATGCAGGCTTCCCTGTAATATATTGGAAAATTATTCAAGAT
AAAGATAGAATATGTGTTTCAACAAAGGGGTTTACAGGAGATGTTCCCGT
CGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCGAAATCCATGTATAATAGTT
TTATGGATGTAGCAGATAAGGACTTTATTCAGGATCCTAAGGAAACGCCT
ACTGATCCTTTAGCTTTAGTTTCCTGTAGTGCAGCAGGCGGCGGATGTTA
TCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAGTAGTCATGACTTCTCCTC
TTATAGAATGTATGAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGAT
GTTTGTAGTTTTGATAATGTAGAACAAGTGGTTAATTTGGCTTCAAGGCA
AGATAGTGCATTATTTCAGTTCCAAGTAGGAATGTATAAAATAGTTACGG
CTTTTCTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGCTTTAAACTATTACTTGCA
GGTGAAATACCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATGAT
ATTTGTAACTTATTTTTCAATAGGAATTAATATAACCCCTGGTAATGGCT
CTCCGTATGACCGACTAGACGGTATGATTCAGTGGGCGTTTCCTTTCTTA
CTTGACGGTATAAACGGTTTAGCAAGTTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTC
CGGTTTATGTAAATTTAACAATCTTTCTTATGACGGTACCGTTTCTTATA
TTGCATTATGGGATGCGTTAGATTGTAGGGTAGCTCATTATTTAGGGCTT
GATATATTATCTACGTTACTTGTCGAAAATGCTTATCGAAGCCATGATTT
TTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCTCCACCATATATTTATTTGC
TAATTCCGGCGATAATCTCCGGTAATATGATGTTAGTGTCACTCGCTCTT
TCTTATCCGTTACTTGTGATTTCGGTTGCTGCCTTTATGGTTAATGCAAC
GATTATGTGTATGATATCTATAGTAATACTCGGTATTTTAGCTCCTCTTT
TTGTACCTATGTTTTTATTCACATATACACGAAATTATTTTGACAGCTGG
GTTAAGCTGATGATTTCGTTCTTGCTACAGCCTATGGTGGTAGTTACTTT
TATGATTACGATGTTTTCGGTATATGATTATGGTTTCTACGGTAAATGTC
AATATAAGAGCAAGTTAATTCACAATAGTATAGAAAATCTTGCACAGAGC
GGCGGTACTTCAAGTCGTGATGTTTTGATATTTTATATTAATAATGATTG
GGATGATATATCACAATATCCTGATAAAGATGCCGTAGAAAGCTGTCAAA
ATAGTTTAGGTTATATGTTAAATAACCCTATTACCACGGCATTTAATTTT
GCAAAAGATAGTGTAAGTGAAATCGTCGATAGTAAACCGGGAGATACCCC
TACCGATAAATTTCTTGCTAAATTCCAGTTTTTATCGGGAGTAGTTTTGG
GGCCCGGAATGTTTTTCATGTCTCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATTAAA
AATATTTTACTTGCGTTAGTTACGGCATGTTTTACATTGTATTTGATGTA
TAATTTTAGTAGTCAGCTAGCTGAATTTGCTGCAGATATGACAGAAGGAG
TAGCTCTTAATAATGTTGCTATAAAACCGCAAGCAATATTTAAGGCAGGC
ATGGCAGCCCTTGCTGCTGCGGGTGCGGCAACTAAGGGAGTAGATCAGAT
AGCAAGTAGAGGAGGAGTTGGTGATTTAAAAGCTGGTCAAGGTGGAGGTG
TAAGTGATAATATTGCTAAGAGCGGAGGCGGAGGACCAAATGATAATATT
GCTGCAAGTGGAGGTACATCGGCACCTACGGTAACAACACCGACAGCTTC
GTCTTCTGTAGCAACTTCTAGCCCAAAAACAGTAAGTAGTGAAGCAAGAT
CAGATGTTGTTACTCCTCCTCCTGCTCCTTCAGAAGCTGTTTCACCACCG
CCTGCTAGTATTAGAACTTCTATTTCTACACCTGCACCGCAAAGTAATAT
TGAAACTGAAAGTGTTGGAAAAATTATAAGAGATAATAATCAAGAAAGTA
AAAAAGAGATTGATAATACTCCGCCTCCACAGGAAAAAGTTGATAATGCA
GCTCCACAAGAAAAAGTTGACAGCACAAGTAAAGGTACAGGAGTAATTGA
TTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGAAAATCCGGCAGGAGTAAAGCAAA
TACGGGAAAATGCAGAGATTCGGGATAAACGTGCAGAAGTAGAGAAAGCA
TGGAACGAATTAGTAGCAAGCGGCGGAGGAAGAATAAGAGATCAGCAAGG
TGAAGAAACATCGGAGCGACGTACGAATGCAGAAAAGAAATGGAATGAAT
TAGTCGATAGCGGTGTAGTAACTGAAATAAGAGAAAGAGATAATAGTGTA
ACTAATAAATTTGATAAATTAGCTGATGAACTTAATAAGTCAGAAAAAGC
AAAGGTAGAAGAAAATAAAAATATAGAAAATGACAGAAAAGAAAATAATA
CTACTACGTCACCGCAAGAAAAAGTTGACAGTACAAGTAGGGGTTCAGGA
GTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGAAAATCCGACGGGAGT
AAAGCAAATACGGGAAAATGCAGAGATTCGGGATAAACGTGTAAAAGTAG
AAACAGCATGGAATGAACTAGTAGCAAGCGGAGGAGGAAGAGTAAGAGAA
CAAGAAGGAGGAGAAGTATCAGAACGACGTGCGAATGCTGTAAAAACATG
GGATGAGTTAGTAAAAAGCGGCGTAGTAACAGAAAAAAAAGATAATAGTT
CTAATGAAAACTCTTAA
>RF_0090 virB6_2, TrbL/VirB6 plasmid Conjugative transfer protein
ATGAAAACTCTTAAAACCTTAAAGATATTTATTATAATTTGTATAGCGTC
TGTAAGCTTAGCTAGCTTTGCCGGCTTTGGAGAATCATGTTCTAGTTTAC
CGACTACTTCAGATGGGTATTTAGAAACGGACACGGCATATGGCTATATA
ATTCGTAATATTGATATGAAAGATCCGAGAGGTAATTGTAACTCAGCTGC
GTCTAGTATAACGTTTTGTTTTAAAAATATAGAAGGTAGTAGTAGCCCTT
GCACCATATATAATTTAAATGAAGGGGACTCTAAGAAAATTAGTGATTTA
AGTACTGATAATAATCCTGATCTTGGAGCAAATCCTGTATTAAAGGATAT
CGTTTTAACGGTTAAAAAATGGGATAATGATCTATGTTTAGTTATGCCGA
CGTCAAGAGGACCGATGCCAGTAGCATGTAAATCTTTAAGTGCTACTCCG
ACGCCTACTCCGCCTGATGATGAAAATTGTAATATAGGAAAAAGTTGCTA
TACGGGAGCAAATTATAGTCAATCGTTAATTAATTTTTCCGGTCTTGCAG
TTCAGTGTTTGAGCGAAACGCTTAATAAAGTATTTTTTGCTGGAAATAGT
TGTAGTTCTCAAGATCAAAATTCTAGAATAACTAATCTTGCAGCTTTTTC
TACGTTTCAAGGTTATTTAAAGAGGATTATAGGTGCGGCATTAATTCTTT
ATACTATGTTTTTTGCCTTTAATATGGCTCTAAATAAAGAATATGCAAGT
ACTGAAAAAATAGCTCTTTTTGTAATAAAGTTCTTATTGGTTGCTTATTT
TTCTATCGGTCTTGGACCTTTAGATTTTAGCGGCGGTCAGCCGACAAAAG
AAAACGGTATGTTAAAATATGGATTACCTCTTTTGACGGGAGCAGCACCG
GACTTTGCACAGATGATCTTTAATGCAGCAGGTTCTAGAGGATTATGTCA
ATTTGATAATTCAAAGTATAAGGATGGTTATAAATTTTACGGTTTATGGG
ACGCAATTGATTGCCGTATAGGTTATTATCTTGGCTTGGATTTACTTTAT
AATATAGATAAGAATGGAGTTTTAGGGAATTCAATCGGCAATGGTCCGGG
TGGTAATAATACACCTATACCTAATTTTGATCCTGACGGCAAAAAAGACA
GACCGAAAGATTTAAGTAAAGCAGGAGCACTTAGATTTTTTGCTGTTATG
TTTGGATTCTTTATGGCTGGAAACGTTATTATACTTGCAGCAGGTCTAGT
ATTTTCTGTAATATTTTTATCTATACTTTTATATTTTATTACGCATTATT
TAGTTTGCATGATTACTATTTACGTTATGACATATATTTCTCCTATATTC
ATTCCTATGGCTCTATTTACTCGTACAAAAGCTTATTTTGACGGGTGGTT
AAAAGTATGTATTTCATGTGCATTGCAGCCGGCAGTAGTAGCAGGTTTTA
TAGCTTTATTAATAACTATGTATGATTCTGCAATATTTAAAAATTGTGAA
TTCCTTAGATATGATTATGAAAAAGGGGATATTAGATTTAGCACTTTTGA
GTTAAGGCTACCTAACGGAGGAGCAGATAAATGTCAGGAAAGTTTTGGAT
ATAAAATGTTACAATATTATGCAGGTGAAGGTTGGGAAGAGCATTTATTG
ATACTTTTCCCAATAAAATCAATTGTTAAAGATGTTGTATCTATTTTAGC
GGAACTTTTGTGCGTATTAGTATTTTCGGTTATTTTTTATTATTTCTCTA
AATCTATAGGGCGATTTGCTTCTGATTTAACTAACGGTCCTAATATGGAT
GCAGTAACGGCAAGTCCAACTAAAATCGTTGATTTAGTAAAGAAAGGAGC
AGCTTTCCTTAAGGATGCGGCCATGGCTTCACAAGGTAAGCCGTCGGTAG
GAGATAAGCCGGATGTTGGAGGTAAGCGTAAAGAGGGAGAGCAGCAAGGC
GGGGATTCAGAAAGCGGTGCAGGCGGAGGATTAGCTGATTTAGCAAGCGG
TTCGGGTGGAGGTAAATGA
>RF_0091 virB6_3, TrbL/VirB6 plasmid Conjugative transfer protein
ATGCAGAGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTCGCTATAGTAGCAAC
ATTAGTTTGCTTTATTTTTGCAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAAAG
TCGGTGACGGCTGCTACATGAGATATGCCCCGGACGGTAAAGGAGGTTCA
GATTCAATAACCGGTACTATAACACTTAATGCTAATGCTAATTATGTAAA
CACTTCTAAGATGTTGCCCGATGGCACGACTCAGCTTATTCCTGATCCTA
ATCGTTACGGTGAATGGTTAAATACTCAGGTGCTAGTAGAGAACAATCAA
CCGGTGAATTTACAAGTGGTCGGTCAGGTTAGTTTGTGTTTAGCTTATGT
ACCAAAGGATAATGTACAATTTACTGAAAGTACAAGACCTGGTAAATCTA
ATTTAGATGATAAAGGTAACATGATTCCGATTCCTCGTATTACCGATGCA
AATAATCCGCCTCTCTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATAATGAATGGCG
TAATATTGCCGAATTATACGCTAATGATAGAGTTTTAGTTTCCGTATCTC
CTAATTTTGCTAATACTGATGCGACAGTTGAGGATGCTTTTAAAGGTACT
AAGGTTACGAAAAATTGTTCCCAAGGCCAAACTTCTTATGAGCCGATTTG
TGGAAAATATTCTGTTTATCACGGTGAATATGTTAATGATTGTGAATGGA
GAGACAAATATTGGAAATGTAATTATCATCATTCCTGTGATACGAGTTTT
TGGGGGGGGTGCGGTCTTGGGTGTCCATGTGCCTTTGGAAAAATATGTTG
TGGGGAATGGATATGCGATTCATGTGGAGCATGGGTTAATATTCGTACTT
CAATGCCAGAAGCTTATAAAGATGATGGTAGTGTTACAAAAGCGTGGAGT
GATAATATAAACAATTTATTTTTTGACCTCTTTAATTTAGAGTGTTCTAA
TAACTCCAAGACTCTTCCAAATGGTCAATGTCCTGATGCTGTTAGAGATC
GTAGTCCTAAAAATCTAGATTTTATCAAAGGACGTTGCAGTGGAACATGG
GTTGAGGATCAATGTAATGACGGAACTGTTTCAACACCGGAGCTTTCAAA
TTATAAATATTTTTGGTATACGGCGGATGGTAAAGGAGGCAAAGGACCAA
CCGGATTAATATATCAAATGAATGATGCGGGCTCTGTAAGTCAAGCTCTG
CCTTCTAAGCTAGAATTTGCTAAATTTGTTGCAGATACAGATCAACCGGC
TGACTATAAAGATAAAGACGGTAAATATTTATATAAAGTTATATATAATA
TACCTTTTAATAGCAATACTGAAAAAAGCTATTTACAATATAGGCTTTGG
TCTCCCACCTCACAAGATGCTAGTAAGAATACGGGAGGATATGTTCTAAA
TATTAAACAGACTAAATGTTATAGAGAAAACGGTAATAGTTTTAACGATA
CTTTTGATGATCGGGGGCGAGTGCAATACATAATAGTAAAGCCTTCGGAA
AACCCGAATACTAGCGGTAAAACCTATTCACCTCAAGGAATTAACGTTAA
TAGCGACGGTAAATATAACTTTAATGCGAATGAGGCGGGTTATATATGGA
TGAAAATTCTAAATGATCCTAGTAATAATTTAAGGGACTATAAAGATAGT
GAAGGTAACTATAAAGTACATTTCTCAACATCCTTAAAAGTAGGAAGTTT
TACTATTAAAGTAATGAATCCGTTACTTGAGTTATTTAAAACTAAAGTAC
AAGGGGCTGCTACTTCTATTTTTAAAAATATGGTATGTTATAAAGCTAAT
GATAGCTCGTCCTGTACTAACTTTTTTACCTATATTAAAGCGATTTTAAT
TTTGTATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTTTTGCTTGGTTTTGCTAAGA
TAAACCAAAAAGAGCTAGTAACTAGAATAGCAAAAATCGGGGTAGTTAGC
GGACTTATGAACGGTAATACCTTTGAATTTTTTAATAACTATCTTTTTGA
TGCAATTACTAATTTTTCAGACGCAATTATTGCTAATATGAGTGGATATA
GTTTGTATACTTCTACTAATACTATTTCTAATCCTTTCATGTTTTTAGAT
GCAGTAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACCTTTATCGCTCAATTACT
TTCACTTCTTTCTCTTGGGCTTAGCGGTATTATATATTTTATAATTACTT
TTATTGCGGTTGGTATAGTAATTATTACGGCACTTAGAGCTGTTGCCGTT
TATATTATGGCATTTATGGCAACTTGTATATTAATCGGTATAGCCCCTTT
ATTTATTAGTTTCTTATTATTTGATTTTACTAGGTATTTATTTGATAATT
GGGTGAGGTTTACGATCCGCTATATGATAGAACCGGTAGTTATGATGGCA
GGTATTATAGTGCTAACCCAGCTATTTACCATTTATCTAGATTTTGTTTT
AGGTTATAGCGTTTGTTGGAAATGTGCTTTACCGATAAAAATTCCCTTTA
TCGGTACTATTTTACCTATTGCATTGCTGAATGTACCTATCTTCTGTATT
AATTGGTTTGCCCCTTGGGGAATGGATTATATGTCGGGTATGATGGGAGT
AAATATGCAAAATATCGTAGCTCTAGTTATTATTGCTTATGGTATGTATG
GTTATGTCGAATTTTCAGGGCGTATGGTAGCAAAATTAACTAGTGCTGCC
GGACCTTCGGCTACTGAAATTGGTGGTAGAATGTCTCATGATGCAGGACA
AAAAGCATTAAGTCCAATAGGAATGGATGATAAAACAAGACAAGGTATTA
CCGGCAGAGCGGAAGCACGATTAAAACAACGCAATAAGACGCTCGATCAG
GCTGAGAAAAATAGGAAAAATACGCCAAAAGAAGGGGGCGAAAAGACAAA
TGCAGAACCGCCGCAGCCTGAAGCACGAGGATAG
>RF_0092 virB6_4, TrbL/VirB6 plasmid Conjugative transfer protein
ATGAAAATTCTTAAGAGTTTAGTTTTATTAGTTTTGTTTATGGCGATGCC
AGCTAAAGCTGATGATGCTTTTTCATGGATGTCAACCAGTTTTGGTGGGT
TAAAAAGCTTATTTGGTTGTTTAGAAGTGCCTGAATTTACAAGTTTTAAA
GAAGGTAATATAGGAATTAGTTTATCTACAGCCGGAACTTGGCAATCAAC
AGGTAATAGCGTTGAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAACTGGTCTACTT
CAGGTATTACTCCTGAACCTAGAAAATATCTAGTATTATATAGAATTGAT
CCAAGATTTAGTACGCCACAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAA
ATTACAATTTGAAGCTTTAGGATTTCCTCGTTTTGTTACGGACAATAACA
GTGCAACACCTGGGGCTATACCGCCTGATAAAGACCTTGATGCACTTTCA
TTTACTAAAATGTCTGATTCTGTTAAATATTTTAACTATTCTAACGGTAA
TTCGAGAATTGAAGTTAAGGCTGGCGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTG
GTAAAGATAATTTTTTTAGCCCTAATACTCTAGATAATATTTTAACGCAA
GAACTTGATAGTTCAATATTTGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAA
CCTTGGAAATTTTGATAATAGAATAATTTACTCATCTGCAAAGGAGGTAT
GCGATCTTATAGACGCTTCAAGAGATCCTGATAAACCAAGCGGGTGTAGC
GGTACTGGCTCAGCTACAAAATATAAAAGTATAAATAGTAACGAAGCATT
AGTCGGCAAACCTATGATAACGAGAGCGGTACAGAATTTCATGGGCTTAA
TTAATTCTTGTCCTGCTAATGCCGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTAT
TACGATCAAGGTAGAGGGATGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAA
GGAACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTCAGGCAGCACTCAAAGTAGCTTTA
TATATTATCAAGCCACTAGCGGCGGTACTATGGATTTTACTAGCGATTGG
CAAGTTAATAACATGTTTAGTAATTCAGTTTTAATGAGTGATTGGAGCCG
AAATTTTTCAAATTATGCTAATTTTGTAGATTATATAAATAAGAATGATT
GGTCAGCTAATTTTTTATATTTCGGTCGTTATTCGATGATTGTTGAAATA
GGTAATGGGGCAAATTCAATTAATCCGGGTGATCAGCAAAATATAAGTTT
AGAATATTTAATAACATCTGATGGTACATTACCTGATCCATCTGTTCGTG
GTACACCGGTAGATTATAACTTTGCAGCCGATGCACCGCAAGATGGATAT
TTATGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACAAGGGGTGGTTAG
TGTAAATTATGCTAATTATACCGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATAT
ATAACGGTGCTATTAAACCTATTACCGATCAGTTTAGAACTTTTAGTCAA
AACTTTTATATTAAGTTAGTTAAAAATTCTGCAGTACAGAATATAGCTAA
AGCTGCATTAACCCTTTATGTTACTATATTTGGGCTAATGTTCGTTGCGG
GAGCATTAAAATTAACTGCCGTAGAAGTAATAACACGTATATGCAAAATA
GCTATAGTAGCCTTTTTAATTAGAGAAGAAAGTTGGAGCTTTTTTAATAC
ATACTTCTTTAGTGCATTTACTAACGGTATTGATTTCTTTGTAACTAACG
TAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGAGCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCCT
ATATTTGATAAATATACTAACGGTAGGATTTGGGGATTACTATTTATTGA
ATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCATTTATCGCTATTATAACCATTT
ATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTTATAATAGGCTAT
GTTATTGCATTTATAGGGCTAACTGTTATGATTTCATTAGCACCGTTTTT
CATAATATTAATGTTATTTGAAAAAACTAAAAGTTTATTTGATAATTGGA
TATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTGATTTTC
TTTTTATTGATAGATCAGGTTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTAGTAGT
TAGAGCTTGTTGGGATACTCTGATACCAATAAAAATAGGGCTTGATTTAA
CAAATCTTGGTATTCCGATTAATTTCTCTTTTACATTACCGTTCTTACCA
GGAATACCTTTCTATGTACCGGATGTACCGGAAATTAGTAGCTCGAATAT
TCTAACGAACAAGGCTAATACTTTCTTAGTATTATTTACTACGGCTTTAT
TATTTTATTCATATTGCTTGATGTCATATGGTTTAGTAACTTTTGTAAAT
ATAGTAGTTGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGAATATCAGGAAA
TTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGAGCCGTTATGCAGGATATAGGTT
CGGTAACAAAGCCGATTAAAAAGGCTGCAATGGCTCCGGCTAGAGTTTTC
AAAGACAAGATAATTGATCAAAATTATAAAGCTAGAAAACCGGAAGGAGG
CGAGCATACAAATAAATTCCTTGCCGAGCGTAATGATGTACCGAAGAAAG
AGGAAGGAGAGAGGAAAGAATAA
>RF_0093 virB6_5, TrbL/VirB6 plasmid Conjugative transfer protein
ATGAACAAAAATATTTTTATTACATTATTAATATCATCGTTATTACTGCT
TTCCGGTTGTACCGGCGATACTTGTATTGACCCTGATGATTTCGGTTTTA
TCAAATTCAATGTCTCTTCTAGATATAATCCGGAAGAAATTACTTCAAGA
CAGGAAGGTGATCAGGTAGCACCATGGCGTGATAGTGCTTATAAAGTAAA
TGGTTATCCTTTAACCGTTATGGTAAGACCGTGGAGTTATATACTTGGTG
ATAAAAATACTTCAGGTCAGTTATCTGCATGGTGTCCGTGGTACGGTCAG
AAAAATAACACAACTACTTTGGCTGCTTTTTGCGTTAAGCTACAACCGTG
TACTTTTTGGGATAATGCTAGACTTGATATGTGTACTCCTAATCCCGCAA
ATCAAAATGACGCAATGATTAGTAATCCTCCATGTATAATGACAGACGGG
GTCGGGCTTTATTTTCTTATTGCCGCTAAAAATACCGATCCCAATATTTC
ACCGGACTCACAGCGTAAACCGCAAGGTATAACTCAGCATTTAGGAGAAC
TTACTTCGAGTGTAGGCTATGAATTTTATAGTATTAGTAGTACAGGACAA
TTCTTGCCAGCAGGGGGAATAAATTATCAATATAAAGGTGAGGATAAGTC
AAAATATGCTCAATCTCCTCTTTATTTTAAGATTATAGATAAATTTTATG
ATGATAATAGCGGGCAATATAGATTAGTAATCAAGTCCGGAGTTACTGAT
ACTAGACCCGATCCGTTACAATTTTTAACGGATTTAATAAAAGGAGTATT
ATTTGGTAAGGATGGGATTATAAAGAAAACTTATCAACAAATAATTGATA
CTCCGGGTTATAGGATGAGTGTCTCGGCTATTTTAACTCTATATATAATG
TTTACGGGCTTTTCCTTTTTAATAGGTAATATAAACCTTACTCATGTCGA
ACTTATAGTTAGAATATTAAAAGTTAGTATAGTCTCAATATTATTAAGTA
CGGATAAAGCTTGGACATTTTTTCATGATTATTTATTCGTATTTTTTATT
GACGGGGTTCAGCAAATACTGCAAATAATTAATGAAGCTGCGGCTACCGG
TCCTGGTTCTCAAAGTTTGCTAGGGTTACTTATTTCTCCTCAAACTTTAT
CTAAATTATTTTCTTTACTATTTGTTGATTGGCTTGGTTTTATATATATC
ATTCTATATTTAATAGCCCTATATTTTATTTTCTTTCTTATATTTAAAGC
TACTATTATATATCTAACCGCTCTTATAACTATCGGTATGATTATAATTA
TGGGACCGATATTTATTTGTTTCATGTTATTTAATATAACTCGTTCGTTA
TTTGAGAATTGGTTAAGACAATTAATATCATATGCATTACAGCCTATAAT
TTTATTTGCCGGTATCGCTTTTATTTCAATGATCATCAGAACCGAAATAT
ATTCAACTCTTGGTTTTGGGGTATGTAAACATGATTTTCCTAATTTAGGT
CCGATAAATGAAATATTCGGTAGTTTTCTTGAGGATATAGATCCAAGCCT
TGGTAATTCAATATTTTATTGGTGGTTCCCTGTACCAATGAAAGGAGGTA
TAAATAATTTCCACAAAGCAAAGATATTAGTCCCTGAAGATCATATAATA
GTAGATGATTCTTGTAAGAATGACCCTGATAAATGTAAGCATTGTGCTGC
GTATGAGTGTATAGATGAACGCTATATTGAATTACCGTTTTTAGATTTAG
TTAAAGATGCAAAAAGGATTAGTAATTTTATAAACGGGAAATTTGTCCAA
CTTGATGGGATATTACTAATTTTCGTGTCTATTTATTTGCTAAGTAAATT
TAATGATACTGCTATATCGACGGCACAATTTATTGCCGGTACTTCAGGTA
ATTTAACAGACATACAAAAAGTTAATCAGCAATCTTATGAATCTGCAGCG
AAGCAAATGAATAGACCATTAAGTTATGTAGCTAAGACGGTAAGTGTACC
TGTAACTACCCGTGTAAGTGCAAAGTTAGAAGAAACTAGTATGTTCTTTG
CTAAAGGATTTGAAGATATAATGATGGGAAGGCTTGAAAAGCAAGCTCTC
GGTTCTTCAGCAAACAAAGCCGTACAAAATGAGGTTAAGAGAAAATACGG
TATAGATTCTAAAGATGTAAAAATGAATGCTATTACTGATTATGAAAACG
GTATTTCAGGATTGTTAAAGAATTTACCTAAAGGGAATGAATTAAAAGCA
AAAGAACTATCGCAAATGAAATTTACTCAGCTTCGAGATAAAATTGCTGC
AAATAAATATGGAGTAAAAGATTACGCCGCTTTAAGTGAAGAACAAAAAA
GAGAGCTTGATAAGTCATTAAAAGATGCTAACTTACGTGAACTCGCTAGC
GATGCGAACTTTACTAAAGATTATCAAGATGCTTATAAATATGCTCACCA
AGAAATGTCAGGGCGAGGTGTCGGTCTGTTCGGTAAAAATATAAAACCGC
TTAGAAGTTGGCAAGAGATGGAGCATCGTGTTGATACAAAACGTAAATTA
AAAGAAGAAAGGCGTGTAGGTATAGGTGAAAAACTCTATGCCGGTTATAC
GGGAATAAAAAGAGGAGCTTTAACTGCAATAGTCGGTAAAGATTTACGTG
ATGCTTATGAGGGTAATCTAACCAGTGCCGAATGGCATGATTTTGAATAT
AACGATCCAAGGCTTAGAACTTATAGCGAAAAATTAAAAGATGATGAAAA
AGCACGGGAACGTGAAGAGCTCCAAATGCATATTAATAAGGAAACATTAG
CTGCTCAAGCAGATATATTATCACCGGAATATCTAGCAAGACTAGAAAAA
GCAGGTAGACAGAGTGATGTAGAATATTATCAAGAATTAGCTCAAAGAAA
GCTTATTCATGAGGTGCGTGGTAGGTTATTCGAGGAAGGTGAACCGGTAA
TGATGGGCGACCGATTTATGCGTGAGAAAGCTACTGATTCTCAGATGCGA
GATATGATAGATAACGCCCATAGAAAACATGCAGAATTTATAGAAGGAGA
TCGATATACTCGTCGCCAAGAGCATTATGATATTATGCACGAGAAAGCTG
AAGGAAATTTAGAACAAACTTATAAAGAGCTTAAAGATCATTTCAAAAGA
GATGATATCAACATTGAGGAAATGCCGGCATTAATAGCACAAAAGATCAA
AGATACTGAGCAGGGACCTGAAGTAGACGCAAAGATTACGGAAGAGCTTA
ATAACTTTAATGCTGATGTTAAAAATTATGAATATAGTACTGAAGTATTA
AATAAAATAGAGGATAGAAAGCAAGCTATTACCGATGAAGTCAATGCTCA
GATCGATCAGATTAATAAATATAGGGAAAATGCCAAAATGGAAAAATATG
TGAGACCAATAGTAAATGAAGGCAGAAAACTAAGAAAATTAGAAGATCAT
TTGAGAGGGATGAAATAG
>RF_0463 virB8_1, VirB8 protein
ATGGACCCATTAACCAACGCAATACAAGAATATATAAAATCCGGCGAATA
TTTTATTGATGCAAGAAAATGGTATAATTTTAAGTATATCTTACCGTTAA
GTCATAGAAGTCTTCTGCTTTTAATATGCACGATTTTTACCTTATTATTA
ACCTTAGTTTGTATAAATATCAACATATTGCTACCAATAAACGAAAAAGT
AAGTTATTTAATAAAAGATGATGCCGAAAAACAAGCTACCGTTACTAATA
CTAAACATTCAACACTCGCCAATCCTTATATCTCTGTTGCAAATATTATG
CTTCAGAATTATGTAAAACAACGAGAAGAATATAATTACGATATATTAAA
AGAACAATTTACCTTTATCAAAAATGCTTCTACGAGTATTGTTTATATGC
AATTTGCTAATTTTATGAATATTGATAACCCATTATCACCGGTCATAAGA
TATCAAAAACTATATAGACGCTCAATTAATATATTATCAATTAACAATAT
AAACGATAACGAGGCAGTTGTTACTTTTGAATCATTGGCACAAAATAGTA
CGGGTGAAATTTTAGAAAATATGGTATGGGAAGCAAGAATCGGATTTATA
ATGGATTCTATCAGTACAAGTACATCACCTGATATGCCCTTCAATTTTAC
CGTTACTAGTTACAAGCTAAAGTTATTAAGGAATAAAAATCAGAAATAA
>RF_0465 virB8_2, VirB8 protein
ATGAATAATATATTTGGCTTCTTTAAATCAAGTAACAACTCGAAAAGCGG
TTCAGGAGATACACAAAATCAAGAAAGTATTAAATCGGCTAATCCTTTAA
AAATTACTCAGAATTGGTATGAAGAGCGATCTGATAAGTTAATTGTTCAA
CGTAACTTACTTATCATATTAATAATACTACTAACCATTTTTATGGTTAT
ATCAACTTTAGTAATAGCATTTGTAGTAAAATCCAAACAGTTTGATCCTT
TTGTTATTCAGCTTAATAGTAATACCGGACGTGCCTCGGTGGTAGAACCT
ATTTCATCACCGGTGTTAACGGCGGATGAGTCTCTTACAAGGTATTTTAT
AAAGAAATACATAACGGCACGGGAAACATATAATCCAGTTGATTTTGCAA
TTATAGCTCGTACGACAATAAGATTATTTTCAACAAGCGGTGTTTATAAT
AATTATCTTGGCTATATAAGAAATAAAGATTTTGATCCTACGATAAAATA
TAAAGAAGATAATACTACATTTTTAGTAATAAAATCATGGTCAAAAATCG
CAGCAGATAAATATATAGTTAGATTTTCCGTAAATGAAACATCAGGAAGC
CAATTAGTTTATAATAAAATAGCGGTAGTAAGTTATGCTTATGTGCCTAT
GCAATTAACAGATTCAGAACTTGACATAAATCCGGTAGGGTTTCAAGTTA
ACGGATATAGGGTAGACGATGACAATAGTTAG
>RF_0462 virB9_1, VirB9 protein
ATGAAGCAACTAATAATATTTTGTACTTTTATAATACTTACATTAGATGT
ATTTGCTCTTACTATATCACGACCTCTAGGTCGAGACCCGCGTCTAAGAG
TTATGACTTATAACCCTGACGATGTTTTCAAATTCACAGGATATTACGGC
TATCAAGCAAGTATAGAACTAGCAAGAGACGAGGAAATAGTCAGTATTTC
TATGGGAGATACTACTTCATGGCAAATAGTACCTGCCGGTCATAGGATTT
TTATTAAACCGATGGAACCTGATGCTACTACTAATATGACTTTAATTACT
AATAAACGGACTTATTTCTTTGAACTATATGCCGCCGAAACTCTTGATAT
GCGTGATCCTGAAATGGTCTTTAACGTAAAGTTTCTTTACCCGGATGACG
AAAATGACAATATGAGCGGTCATATGCAAACTTTTTCTGCTTCCCTAGCC
AGTCCCGATCTAACTCATCCTGAAAAATATAACTTTAATTACTATATTAG
CGGCAGCGAAGAAATAGCTCCTATTAAAATTTTTGACGATGGCGAGTTTA
CTTATCTGCAATTTAGAGACAAAAACGCTGAAATTTCCGGTATTTTTGCT
GTAGATGATTCACTTCGAGAATCTTTAGTAAATTATCGCCTTGCTCAAGA
TAATCCTAATATGGTGATACTTGAACAGGTTTTTCCTAAGCTCGCTATAC
GTAAGGGTAAAAAAGTCACATGCGTATTTAATCAGTCTTTCAAAGCGTAT
TAA
>RF_0466 virB9_2, VirB9 protein precursor
ATGACAATAGTTAGATTTTATTTTTTAGTTTTTATATTATTAAGTGGTTT
TACAGTACAACGAGAATGTCCACTTGTAGATGATCCATGTAATAATAGTA
GTAATAATTATGTAGATGATTTATCTATAACTAAAGATAATAGGATAAAA
ACTTATATATATAATCCAAATGAAGTTTATTTATTAGTTTTGCATTTTGG
CTTTCAATCGCATATAGAATTTGCTAAAAATGAAGAAATCCAAAATATAA
TTCTTGGGGATGCTTATGCTTGGAAAATAACTCCTTTGGCAAATAGATTA
TTTCTTAAGCCTCTTGAAAAAGATATCCGTACAAATATGACTATTATAAC
TAATAAAAGAACATATGAATTTGATATCGCTTCTACGGAACTTATGATGG
GTAATGAAAGGGATTTAGTATATGTAATTAAATTTTACTATCCTAAGAAA
AATGGTAATTACATGGCAAGGTTTTAA
>RF_0469 virD4, VirD4 protein
ATGGAATGGCATAAGATACTTAAAGTTACTAGGAATATATTCGGTCATGC
TATAATTCATCCGGTTGTTATTTTTTGTACCATTTGGATAAGCGGTGCAT
TTGTTGCAATTTTTACTAATGAGGTTGGAGCTTTAGGTGTAGATATAAAT
GCTATAAATATTGCTTATAAGTGGGCTTACTGGCTTATTAACGTTTGGGG
GCAGTTAAAAATTGCCGACTATAATTATTTAAAATTGAAGCTACTTGCAT
CTCTTCTTGGTCCTGCTATTGTTGTCATAATATTTTACATTAAAAATTTT
GAAAGAATAAAATCATTACAATTTTTTGAGCAACCGGAAAAAGTATATGG
AGATGCTAGCTGGGCTAATCCGTCAGATATAGAGGCTGCTGGGCTTAGAT
CCAAAAAAGGTATGTTAATAGGTGTTGATGCCGGTGGATATTTTGTTGCA
GACGGATTCCAGCATGCTTTATTATTTGCTCCTACAGGTTCAGGTAAAGG
TGTGGGTTTTGTGATACCTAATCTGTTATTTTGGAGTGATTCGGTAGTAG
TACATGACATAAAACTCGAAAATCACGGTTTGACGAGCGGTTGGCGTGAG
AAACAAGGTCAGAAAGTTTTTGTATGGGAGCCTTCTAATCCCGATGGTAT
TACGCATTGTTACAATCCGATTGATTGGGTTAGTACTAAGCCCGGGCAGA
TGGTTGATGACGTACAGAAAATTTCAAATCTTATAATGCCGGAAAAGGAT
TTTTGGAATAATGAAGCACGAAGTTTATTCTTAGGTGTAACTTTATATTT
AATAGCTGATCCTACTAAAACTAAATCTTTCGGTGAAGTAGTGCGTACCA
TGAGAAGTGACGACGTAGTTTATAATCTAGCGGTCGTACTCGATACGCTT
GGCGGTGTAATACATCCTGTTGCATATATGAATATTGCTGCGTTTTTACA
AAAAGCCGATAAAGAGCGTTCGGGTGTAATATCTACAATGAACTCATCGC
TTGAATTATGGGCAAATCCGCTTATTGATTCTGCTACTGCATCTTCTGAT
TTCAACGTACAAGAATTTAAAAAAGTCAAAACAACCGTATATGTAGGACT
CACTCCTGATAATATACAGCGTTTACAAAAATTAATGCAGGTGTTTTATC
AGCAGGCGACAGAATTTTTAAGCCGCAAAATGCCGGATTTAAAGGAAGAG
CCGCATGGGGTAATGTTCTTGCTTGATGAGTTCCCGACACTTGGAAAGAT
GGATACTTTTAAAGCCGGTATAGCTTATTTTAGAGGTTATAGAGTTCGGT
TATTTTTGATTATTCAAGATACGCAGCAGTTAAAAGGAACATATGAAGAT
GCAGGGATGAATTCTTTCTTATCTAATGCAACATACCGTATTACTTTTGC
TGCTAATAACTATGAAACGGCAAATTTAATATCGCAGCTTGTCGGTAATA
AGACGGTAGAACAAAGATCATTTAGTAAACCTTTATTTTTTGACCTTAAT
ATTTCTACTAGAACCCAAAACGTTTCTCAAGTTCAAAGAGCTTTACTTTT
ACCTCAAGAAGTAATACAGTTACCGAGAGATGAGCAAATTGTTTTAATAG
AATCCTTTCCGCCTATAAAATCTCGTAAAATTAAGTATTACGAAGATAAA
TTTTTTACTAGTAGATTATTACCGCCGACTTTTGTACCTACTCAAGTACC
TTTTGATCCTAGGGCAAATAATAATGAGGCTCAAGAAGAGACTGAAACAA
CAACTGCTCCGGAAAATAATGAGTAA
>RF_0958 yajC, Preprotein translocase YajC subunit
ATGAGTACCGGATTGACGTATACCTTTAGAAAGAGGTTATACAGGAAGAC
TATTGCAACAATTAGGAAATTACATATGTCAGCAAATACGCAAGATAATC
AAGCAAATAATAACGACACTATAGAGATACAGGAAACTGAGGTAGTGCCT
GTAGAAACAAATTCTTTACAATCGGGGTTAACAAGCTTAACACCGATGGT
TTTAATTTTTGCCGTATTTTACTTCTTATTATTACGTCCGCAAGAAAAAC
GACGCAAAGAAAGAGAGAAATTAGTAAGTGAAGTTAAAAAAGGCGAAGAA
GTTCTAACAAATAGCGGCATTTACGGTATTGTGACTAAAGTAAGTGAAAA
TGACAATAATATTGAAATCGAAATAGCTAAAGACGTACGTATTAAAGCTT
TAAAAAGTGCTATTGTTGATATAACAAGTCGTACAAAAGAAGTAGCAGTA
AAAAAAGAAAATAACAAAAAAGATAAGAAGGTAAGCGGTGCAAAATCTTC
CTAA
>RF_0131 yidC, Preprotein translocase subunit YidC
ATGAATAATAATATAATTAATTTAATAGCCGCTATTATACTGTCTTTAAG
TATAATTTTCGGTTGGCAATATTTTGTTGTAAAACCTGAACAAAAAAAAC
AGCAACAGCAAATAGCAGTGCAGAAAGCAGAAAATTTAAAGAAACAACAG
TTAAAAGCTTTAGTAGAACCTGCAACTGATATTGTTGTTCAAGAAGAAAG
CGGGGTACAGCGTATTAAAATAGAATCTGAATCACTCACCGGTTCTATTT
CACTAAAAGGACTTAGATTTGATGATTTAATATTAAAGAAATATAAGCAA
GATTTATCTAACAATAGTCCTGAAGTGAGATTATTTTCACCGGCTAATAC
AGAAAATGCCTATTTTGCTGAAATTGGTTTAGTTAGTAATTTATCTAGTG
TAAAACTCCCCAACAACGATACTATATGGAATAGTGATAGTGAAATATTA
AGCCCTGAAAAACCTGTTAATTTATTTTGGGTTAATGAAGATGGAGTTAA
ATTTTTAGTTACTATTACTGTCGATGAAAACTATTTATTTACTATAGAGC
AAACTATCGTTAATAATAGCGATAAAGAGCTTCCAATCCAATCATATGGT
TTAATAAATCGTAAATATACCGCAGTGGAAAAAGCGGTAAATATACTGCA
TCAAGGACCTATAGGTTGTATAGACGAGAATCTTAAAGAATATTCGTATG
ATGATATTAAAGATAAGAAAAGTGAAAAATTTGCAGCAAGTAAGGTTGAC
TGGATAGGAATTACCGATAAATATTGGTTATCTTCCTTGATTCCTGATAA
ATCAAGTAATTACAGCTCGAATTTTAATTATGCTCTTAAGCAAGGGACTG
AAAGATACCAGGTAGATTTTATTTCACCGGTACAAATAATAAAGCCCGGC
GAAAATTTCTCCATTAAAAGCAGAATTTTTGCAGGAGCAAAAAAAGTAGA
TTTGCTTGATAAATATGAAAAGCAATATGATATTAAATTATTTGATAGAG
CTATTGATTTCGGCTGGTTTTATATAATTACCAAACCAGTTTTCTACGCC
ATGAATTTTTTCTATGGCTATGTCGGTAATTTCGGTGTTAGTATATTAAT
TGTTACGGTTATAATTAAGCTATTGATGTTTACTTTAGCCAATAAGTCTT
ATCGTTCGATGAAAAAAATGAAAAATTTACAGCCGGAAATCGATAGGATA
AAAAATTTATACAGTGATGATAAGGCACGTTTAAATCAAGAAATAATGGC
TTTATATAAAAAAGAAAAAGTAAATCCGGTAGCGGGTTGTTTGCCTATAC
TTGTTCAAATTCCGCTATTTTTCTCTATCTATAAAGTATTATATGTAACT
ATTGAAATGCGGCAAGTGCCGTTTTACGGCTGGATTAAAGACTTATCTGC
CCCTGACCCTACTACTATTTTTAATTTATTCGGCTTATTACCGTTTTCAC
CGCCGTCATTTTTAATGATTGGAGCATGGCCTATTTTAATGGCTATTACT
ATGTTCTTACAGCAAAAAATGAGTCCTGAACCTGCGGATCCGATGCAAGC
TCAAGTAATGAAATTTATGCCGCTAATTTTTTTATTTATGTTTAGTAGTT
TTCCTGTGGGACTTTTAATATATTGGTCTTGGAATAATATTCTATCCATA
ATTCAACAATATTATATTAATAAATTTAATTAA