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# Rickettsia conorii str. Malish 7, Malish 7

>RC0703 similarity to alkaline phosphatase synthesis sensor protein (phoR)
TTGAAACATGAGTTCTTACGTAATATAAACCATGAAATCAATACACCGCT
AACCGGTATTATTAGCCTTGGTGAAACCTTATGGGCTAATTATGATAAAT
TTAATGAAGATCAGCGTCGCAATGCAGTAGAGATTATAGCTAAAAGCTCT
ATTAAATTAAATAGCTTGATAAATAATATTCTAGATTTTTCAAAATTATC
CAGTCTTAATTATGCACTCAATAAAAAAGATATAAACTTAAGCGAATTGC
TACATGAAAGGATTAAAATATGTAAGAAATTATATCTAAACGGCAAAATC
TTAAATTTTGTATCTGATATTGAAAAGAATATAATAATTATATTCTTTTC
AATTTTAACTGTGATCCTCATTATATTAAACACACATTCGATAATCTAA
>RC1099 similarity to (p)ppGpp 3-pyrophosphohydrolase
ATGCTGCTCTACTTCCACTATACTATTGAGGATACAGAACTTACTGAAAA
GCTGATCATCGAAATTTTTGGTAAAGAAATAGTAAAACATGTAGAAGGTT
TAACTAGAATTAAACCTCACGGACAAATCAGTGTCGAGGAAAGCTTAAAC
CTATTAATTAAGCAAAAACGATAG
>RC0258 unknown
ATGTCTGAAAATACTATATTTAAAAATATACTGATACCTATAGATTTAAA
TGATAAAAAATCTATAAAAGGTATTCTTTCTAAGGCTTTAATGCTTGCGA
CGAACTTTCAAGCAAAATTACATTTTATGTATGTAATTCCTGAATTCGGT
ACGAAAATGTTTGAAGATTATTTACCTAAACATTGGAGAACAGAGAAAAA
AGAAAAGTATAAAGCTCAAATTAAAGAGCTTATCAAACAATATATTCCCG
ATGAAATTGCAACAGATTATTATATAGGTAGCGGTGCCGTTTATGATGAA
ATAATTAAGCACTCTAATGAAATTAAAGCCGATTTAATCATAATCTCTGC
AGTCAGACTACAATTAAAAGATTATATGCTTGGACCTAATGCTTCTAAAA
TCGTCCGTCATTCAGATATATCAGTGTTAGTAGTAAGAGACGAGTAA
>RC1032 unknown
ATGACATTTAAAGCACAAAAAATCGCTAAACCTGAATTAATTGCAAATAC
AGTAGCACTACTTGTAAATTCTAGCGAAAAATTAATTGAAAGTACTCCTT
CAGCTATAAAAGCTTATAGTCAGCTTAAAGCAAATCAGCGTTGGACTAAA
ATGAACCTAAATATGGAAGGGTTAGATATTGAAACTAAAAAAGAGTTATT
AAAAGGCAAAAAACCTCAAATAGTAGAGTTAGTTGAAAATGCCAAAAAAA
TTATTGATAATTTATCTCCTGTTTTAGAAAAAAATTACCGTGATATTTAG
>RC0426 similarity to (p)ppGpp 3-pyrophosphohydrolase
ATGAAAGATATAGAATATTGGGAAAAAAATTTTGAAAGCTGTAAATATTC
AGATCAATTAATCGAAAGGCTTTTATTTTTAAATACCCAAGTCAAACAAC
CTATCGATATTAGAGAAGTTCAAAAAGGTATTTATTATGCTCGTAAATAT
CATGGTGCGCAAATGCGTCAATCAGGTGACCCTTATTATTCTCATCCAAT
TGCAGTAACGATTATGGTAGCGGAATTTGTAGCAAAAGAAGTGCCTAAAC
TCTTTACTTTTAGAATGCTACAAGCTGCATTACTTCATGACACTATTGAA
GATACTGAACTTACTGAAGAAATAATTAGCAATATTTTTGATGAAGAAGT
AGCAAGGCATGTAGCGGGTCTAACTAGAATTAAACCTTGGGGCAAAATAA
GTAGCGAGAAAAGTCTTATGTTATTAATTAAACAAAAAAGATACGATACT
GCTCTTATAAAACTTTTTGATAGAATACATAATTTACAAACTTTGGAAGC
AAAATCGCCTGAAAAAGCTCATAAAATAATTAAAGAGACATTAAAAAGCT
TTTTAGTGTTAAGTGAAATACTTGAAATACCTTCAGTTTCAGAGCTTATA
TATGCTGAATGTTATAAAAATAATTTAAAATTTAATATAAATTCTACTTT
TAATAAAATTATAAATTTCGATTCGTTTCCATTTTCTCAAAATAAGTTAC
TCCCATAA
>RC0006 unknown
TTGTTGCTTGGTGTAATATCTGGAGATTATGGTAAACCTCGCCCCGCTGT
TGTTGTTCAATCTAATTTATATAAAAATCATCCCAGTATAACAGTTTGCC
TTCACAATGGATTTAATAGATGCCCCACAACTTTTCACCTGTTATTAACT
CCTACAGAGCTAAATGGTTTTAATTTAGAATCTCATATTATGGTTGATGA
AATTAGTGCTATAAGAAGTGATAAAATTCAAAAAAATTGGTGA
>RC0295 unknown
ATGAAAATACGATTTATTATAATAAGCTTTATAGCTCTAATCCTAGTAGG
GTGGGGATATGCTGCCTATAAATTTGAACATCAAAGTAAAGAAAATATTA
TCTCTATTCTTGATAAATATGAAAAATATATAACTTATGATGCAATAAAA
GTTAATAAATATGGATTTAGTGTTACTTTAAATAAAGTAATGTTAAAACC
TATAGATTTTTATTTTGATGAAATAGTTATTAGACATATACCGTTTTTGA
ATATTACAAAAATTGATTCTTACGGAAATAATGTAAAAATTACTACCGCT
CAAGATGAAAAAAATATTTTTTACTCACCTGATCATCATACAACAATTTG
GTTTAGAAAATCTTTGTTTAATAGAGAGCCTGATTATTGGACATTAAGCT
TGAGTGACAATAAATCAACTCTTTATAGTTCTCTAGATGCAGAAAAATTA
GCAGAGAGTGATATTAGTAATTCTGTAATTACTAATACTAAGACATCGGA
TAACCTTAATTTGTTAATTTTGGATGGAAAAAGTACTGTTTCTTTTATTT
CTGAAAATTACAGAAGAAATTTATATGATAAAATTTTTGAATTTTTGAGA
GATCAAATAGCTAATGACTCTGATACTGCTTTCTTTGAGTATGGTTTGAC
AAAGTTAGATATATTGAATTTACCTATTTCTTACAATTCCAAATTAAAAC
TAAAATATAGTGATGAGTTAGTAGCTCTTGGGAAATTATTAATTCAAAAT
GTTTCTCTAGATCAAAGGCAAGATGAGAATATGCATGCTGTTATTTTTAT
GCAGATGTTAGGAGAATTAGTAAAAGGTAAGCCGTTTTTAGTTGCTTGTG
ATATTGAAAGAAAAGGAAAAGTAGAAAGTAATTTATATAAATTAAATATA
GAAAAAGATAAAATTTTTGATTTTGCTTTAAATATTAAATCTACTATAGA
ACCTTCTGAAACATACCAAAAAACGGCAGCTGAAGCTTTAGGAAGCTACT
TTAGTAATGGTTTAAACAAAAGAGCTGAGTTAGATAAAATTTTTAAACTA
ACTAGCCCTATTACTCAAGAAGATGGGGAAAGAGTAATGGGTGTTTTTGC
AAAAATAAATAATTCCGAATTTAATTTAAAAGGTCAGTTTGATCCTGAAG
CAAAAAAATTATCCGGTAACACTAATCTTGTAATGGATGATTTTAATTTT
GCTATTGATATTGATATGCCTACTATAGATAATCCTCTGAATCTAGAAAG
CGTAATAAAATTATCGGATCCGAGTGTGGTTATAAATAATTTTGTGCATT
ATACTAATAATGCTATTGTACCGGTGCTTAATAAAATAAAAGATTCTAAG
GAATTTGCTTTAAATCTAGGAAAACAATCTTCAGTAATAAAGCAATATGG
CTTTAGGGCAATAGAAGTTTTTAGTAAAAATTCTGAATTAAAAGACGGTG
AATCTTTAGTAGTGGATGTAAAAAGTAAAGACGCCGGACTAACCTTTAAC
GATAAAGCTATTGATCAGATCCTTAGTGATGCAAGAGTATTAGAATTTAT
AAATGCCATGGCTATGATAGATCAAGAAAGCAAGTAG
>RC1027 unknown
TTGGTTTTTATACTTCTCATTTCTAAAAATTTGTATGCTTTAAGCATAGG
CACGAACGAACAACAAGCAATTTTAGAATGCGAAGGGACAGCTGATAAAA
AAACTTTGATAAATGCATGGTATGTAAATGAGCCTTATCAATACTTAATT
GCTGCTTCAAACGGTCATACTACCGTTTCCGGTATGGATATAGAATTAAT
GAACGCTATTGCTGCAAAAATAGGTATCAATATTGAGTACAATCAAGATA
GCTGGTATCAAGTTAGATATTCAAAGCGGCAATGCCGACATGACAGCAGG
AGCTACTTATACTACTGA
>RC0063 similarity to transcriptional regulator
GTGCTATTTTTTTATAAGCCCTTCTTATCTGAGCAAATAGTAGGTACTTT
AAAGAGCTTATTGAGACGTTTCAAGTCAGTTGTACAAGATAATATTATTA
AATTTAAGAATCTAAATATTGATTTAAATACTGAAAAAGTATACAAAGAC
GGACTGAATATTCCTCTAGGTCCTACTGAGTTTAAAATTTTACAACTTTT
TTTTCAGGTTCCAAATGAAGTATTTTTGCGTCAAGAAATAATAAAATATT
TATGGGAAAGTGAAGAGACCTTTAATGAACGTCTCATAGATGTTCATATA
AATAGGATTAGAGACGTCTTAGGGAAAGACAATTTAATTATTACAACCGT
TCGTTTATCGGTTGTTGTCTAA
>RC0374 similarity to (p)ppGpp 3-pyrophosphohydrolase
ATGACTTTTATGGAAGATTTAAGCTCTTGGAAAGAAAAGTTTGAAACTTG
CGTTTACGCTCAAAAACTATTAGACAACATCGAATATTTAAATGCTAAAG
TAAAAAATCCTGTTGATATAGAAGAAGTTAAAAAAGGTATCTACTACGCT
CGCAAGTATCACGACTTACAAATACGTCAATTAGGCGATCCTTATTATTC
TCACCCGATTGAAGTAGCGATTATGCTCGCAGAGTTTGTAGCCGAAGACG
CTCCTAAGCTTTATAATGCTATTATGCTGCAAGCTGTTTTACTGCATGAG
ACTATTGAAGATATAGCACTGACTGAAGAAGTAATAACTATTGGACCGGA
AGTAGCAAAGCACGTAGAGGGTTTAACTAGAATAAAACCTTACGGAAAAA
TAAGTAGTGAGAAAGGTCTGAATTTGCTAGTTAGACAAAAAAGATATGAT
ACAGTATTAATAAAGTTCTTTGACAGAATGTATAATTTACAAACTTTAGG
TGCTAAATCACCTGAAAAAATGAGGAGAGTTTAA
>RC1098 similarity to (p)ppGpp 3-pyrophosphohydrolase
ATGGAAGATATAAAATCTTGGAAAGAAAAGTTTGAAATTTGTGTTTACGC
TAAAAAGCTAGTTGATAAACTCGAATATTTAAACACTAAAGTAAAAAATC
CTGTTGATATAGAGGAAGTTAAAACAGGTATCTACTACGCTCGTAAATAT
CATGGTTCACAAATGCGTCAGTCAGGTGATCCGTATTATTCGCACCCGAT
CGAAGCAGCGATTATACTTGCAAAGTTTGTAGCAGACGAAGCGCCTAAGC
TTTTTACTTCTAATATGATAAATGCTGCTCTACTTCCACTATACTATTGA
>RC0704 similarity to alkaline phosphatase synthesis sensor protein (phoR)
TTGATCTACACATGCAAGAAAATAATATCTTGTTTTATTAGTATAAGAGA
CGATGGAATAGGAGTACTGAAAGAGGAATTGCAGAGTATATTCGGTGTAT
TTGTCGTAAGCTCTAAAACACGTACGGTAGGAGGTAGAGGAGTAGGACTT
GCATTATGTAAGAAAGTAATAGAACTGCACGCCGGAAAAATTTGGGCAGA
AAACGATAAACAGGGAAAGACTACTTTTATTTTTACGATGCCTTTGTAA
>RC1254 unknown
ATGGCAATATCTGTAGAAGAGTTAGAAAAAATACTTAAAGAATCATTTCC
GAACAGTACAATGAAAATTACTGATTTAGTAGGAGATCAAGACCATTATG
CCTTAGAAATATCAGATGTTCAATTTAATGGACTTTCTTTAATTAATCAA
CATAAATTAGTAAAAAACGTCCTGTCTGAAATATTAAATAAAAAACTACA
TGCAATTACCATAAAAACTATCGCAGTTCCCGAAAAATAA
>RC0888 similarity to (p)ppGpp 3-pyrophosphohydrolase
ATGCGTCAATCAGGCAATCCTTATTATTCGCACCCGATTGAGATAAAAAT
TATGCTTGCTGAATTTGTAGCTGAAGAAGCACCTAAGCTTTATAACATTA
TTATGCTGCAAGTGCAAGCCGCTTTACTTCATGATACTATTGAAGACACT
GAATTAACTGCAGAAGCAATTACCGAAATTTTTGGACCGGAAGTAGCAAA
ACACGTAGAAGGTCTAACTAGAATTAAATCTTACGGGAAGATAAGTAGGG
GAGAAAGCCTAAACTTATTAATTAAAGAGAAAAGATACAATACGGCATTA
ATAAAATTATTTGACCGAATTCATAACGTGCAAACTTTGGGAGTTAAATC
ACCTGAGAAAGCTAGAAAAATTATTGAAGCGACTTTAATAAATTTTCTTT
TGGTCGCTGCTAATATAAATTATAAACTAGAACAAGAATTAAGTTATGCC
TAA
>RC0321 regulatory components of sensory transduction system
ATGACCACAATATTAGTAGTAGATGATATAGAACCCAATATTAAGTTACT
AACAGCCAAACTTTTAAAAGAGTATTATACGGTTCTTACTGCAAATAGCG
GTAAAGAAGCACTAGCAATTCTTAAAAAAGAAAAAATTGATATTATACTA
CTTGATGTTATGATGCCGGAAATGGATGGATGTGAGGTATGTAAAACGAT
AAAAACCGATCCGGAAACTACTCATATACCGGTTGTAATGGTAACTGCAC
TTTCCGATATTGATGATCGCGTTAAAGGTCTTGAGGCAGGAGCTGATGAG
TTTTTAACAAAGCCGATTAACGATACTGCTCTATTTGTAAGACTTAAATC
GCTATCTAGAATGAAAAGCTTAATTGATGAGTTAAAGCTTCGTAATAGCA
CTAATGCATTATTAGGCGTAATAAATATTGAAATGCATGACACTTTTGCA
GATAAAAAAATATTACTAATTAATGATGATGTGGTACAAGCTAAAAATAT
AAAACAAATGTTACTTAAGCTTACCCAAAACGTAAAGGTAATAAGTAATT
CCGATGAATTAGATATTATAAATGAATATACCCCCGATTTAGTAATTATC
AGTAGTACGCTCGAAAATGACGATCCTTTGAGGATCAGTGTTATTTTAAG
GGGTAAAGCAGAAATAAGCGGCGTAGTAATAATTTTACAAATTGATGAAG
ACGGTATGCCTTTGGTTGTGAAAGGTATTGAACTCGGTATTAATGATTAT
TTCGTTTATCCTATAGAGGAAAGCGAATTGCTTGCTAGAATTAGAACACA
ATTAAGACGTAAGCAATATCAAGATAATTTACGTAATGATCTTGAACAAA
GTGTCAATTTAGCAGTTAAAGACGGTCTAACCGGCTTATTTAATCGTCGC
TATTTCGATATACATCTCAAACAAATTATTGAGAAAACTAATAAAGAAAG
TATTAAATTATATTTACTTATGTGCGATATCGACAATTTTAAACATGTAA
ACGATACTTACGGTCATCAAGCAGGCGATAAGGTTTTAACAATTGTATCC
CGTATTTTGAAGAATACTCTCAGAGTAACAGACTTAATAGCAAGATTCGG
CGGTGAAGAATTTACTATACTCTTAACGGATATAGATATTTCTAAAGCAA
TTGCAACTGCGGAGAGAATTAGAGTTAAAATAGAATATATGAATTTTCAC
ATTGAAGATCAAATTGAACCTTTAAAAACAACTATTTCAATCGGAGTTAC
GAAATATAAAAAAGAAGAATCAATAGAATCTTTCATTGAACGTGCTGACA
AAGCTATGTATGAAGCTAAAACAACTGGTAAAAATAAAGTAGTAAAATTA
TAA
>RC0330 unknown
ATGATACACATGGCAATGTCGGAATTAAGAACGAATTATAAAGATTTACA
AGATGCGATAGATAAATTGGAAAAAGGCGTATGTTTTGCTTGTAGATTAG
TTAATTATGATGAAATAGAATTTATAGAGCAGGGTAAGCATTTTATAATT
GAAGATTTAGATCAAATCATTGAAGATGTAAGCAAAGAACTTAATATTTT
TTCAAAGTTTAAGAAAATAAAGAAAGATAGAATATTATTTATCCTAAATA
CTACTGATTCTGACTTAATTAAAAATTTTGCTAGAAAATTATATTTATTT
TTGCAGCTTTATATTAATGAACAGAAGCCAGCAATTTATATGAATTGTTA
TATTGCTAGTATTAAATTTCCAAAAAAAGTAAGTAATAATGCTAAAGAAA
TTGAAAAAACATTAAATATGTTACTTTCACAAAATAATAATTATTATTAC
CGTGAATATAGCAGTACAGAACATGATTTGGAAAATATAAGAAAATCTAA
TCTTCAGCTTAACTTACTACGACAAGCCTTAGCAAAAAAGACTATGCGAT
TTGCTTATCAGCCTATAATAGATCGTAATACTATGAAGATTCATTATTAT
GAATGTCTGCTTCGTATACCTGACGAGAACGGTGTTTATATTTCCGTAGG
TCCTATAATCCCTATTGCTGAAAATAAAGGATTAATTTTTATAATTGATC
AAATTGTTTTAGAAATGACTGTTAATGAACTTGCCCGCAACCCAAACTTA
ATGTTAGCCGTTAATATTTCAAATATAGGAACAGGCGATGAAGCTTTATG
GGAAATAGCAGAAAACTTATTAAAAGCTCATAATGTTCGGGATCGTTTAA
TTATTGAAATTACGGAAACTTCTTTCAATCAGAATTACGATAAAATAACT
TTATTTATTAATAAACTACGTAAGTACGGATGTAAATTTGCATTAGACGA
TTTTGGTGCGGGTTTTACTTCTTTTAAACAACTTCAAAGCTTACCAATTG
ATATTATCAAAATTGACGGTAAATATGTGCGTAGTATTACAAGTGATGTA
CAAAGTAGGTATTTCGTAGAAAGATTAATTAAAATTTCAGAAGATTTAGG
TATTGAAACGGTAGCTGAATTCGTAGAAAACGGAGAAATAGCTAAATTTT
TAATTGATCTAAAAGTCGGTGGGCTACAAGGAAACTTCTATTCCGAAGCA
AAATTTGATAGGGTGGATGAGGTTTAA
>RC0311 barA, histidine kinase sensor protein [EC:2.7.3.-]
ATGAACCATAATAAGTATATAGTAAGATTGTCATTCATTATATTGTTTCT
TAATATTGTCATAAATATGATGTTTTATCGTTATTTTATGATAAAAGAAA
TGATAGTAAAACAAGTGGCTTTGGAACATACTAAAATTGTAGAACTTTAC
ACTGATAATATTTGGAATACTCATCAGAACGTAATCAGTAAATTACGCAA
ATTCGATTATTTAAAACTATTACAAGATCAAGATTTTATTAATTTTGCAA
AGGTTACCACTCAATGGTTCACCAATCTTAATATTAATATTTCTCTCTAC
GATCTCAAAGGTAATAAATTCATCACTAGTAATATGTTACATATGTATAG
TGTAGACAATTATAAAGATGATAGTTTGGTTGAGATAGTTACCGCAAAAA
TCGATAAATTTTTTTTAAAATCCTTTACTTCAAAAGCTCCGCTTCGAGAT
GCTTTTGAAGGTATTACAAGTCATATATTATTACCAAGGGTAGTAATAGA
AAATGAAAGTGATTTAACAGTGGAAGAGGCTTCTTTTGTTACTAGCTATA
TCCCTGTTATAAATAATAATTTAGATTTTCCCGTAGATGCAGTATTTGAG
ATTAACACTAATATTACCAGCCAGTGGCAAAATATAACCTCTCTTGAGCA
AAAGGTTTTTATAACTTTTATCATTATTTTTATAATATTCTGCACTATAA
TTATTAGTAATACTAACTATGCTAGACAAATCATTGAGGAGCAGCTTGAA
ATAAATAGAAATTTAAAAGCTCAAATAGTAAAAGTAGAAAAAACCAGCTC
TTCAAATACAAAGTTTTTTACTAATATTAGTCATGAATTGCGTACACCGC
TTAATGCTATAATAGGCTTTTCGGAAATTCTTATGTCGGAAAGAGATGCA
GAAAAAAGTAAAAATTATATTAAAGATATAAATGATGCCGGTAAGCATTT
GCTTAGTATGATTAATGATATTTTAGATCTTTCTAAAGCTTCTGCCGATA
AATTAAAAGTAGATAGTATAGATCTTGATTTAAATAAATTAATTCGTTCT
TCGCTGATACTTGTTAAGACTCGTGCCGATCAAGCCGAAGTGGCTTTAAT
TAGTAGATTACCGAAAGAGCATGTGGTTATAAAGGCTGATCCAAAAAGGC
TAAAACAAGTATTCTTAAATCTTTTATCAAATGCTGTGAAATTTACGAAT
TCCGGAGGAAGTGTTACTATTGCACTTGAAAAAGATGAGTTAGCAAAATT
AGTATATATAAAAGTTATAGATACCGGTATCGGTATTGAGGAAAAAGATA
TCCCAAAAACTTTATCGGCGTTCGGTCAAATTGATAGTGAGCTTAGTAGA
AAATATGAAGGTACCGGTCTTGGGTTGCCGCTTACTAAAAAGCTGGTTGA
ACTTATGAACGGTAAATTTGATTTGCAAAGTAAGATAAATGAAGGTACCA
CCATAACAATAACGTTTACATATGACTGTAGTATTGAAATATAA
>RC0349 bipA, GTP-binding protein
ATGACATCTATTCGTAATATAGCAATTATTGCCCACGTTGATCATGGAAA
AACTACGCTTGTTGATAACATGCTTAAACAAAGCGGAACATTTAGAGCTA
ACCAAGCAGTTGCTGAGCGTGCTATGGACTCTAACGATCTTGAGCGTGAG
CGTGGAATCACGATACTTGCCAAATGCACTGCTCTTATGTGGAACGATAT
CCGTATCAATATAGTTGATACGCCAGGACACGCCGATTTTGGCGGTGAAG
TAGAACGCATCCTTAGCATGGTTGACGGTGTAGTGCTACTTGTCGATGCA
TCGGAAGGACCAATGCCGCAAACAAAATTCGTGCTTTCTAAAGCGTTAAA
TCTCGGCTTAAAACCTATTGTCGTTATTAATAAAATCGATAGAGATGACC
AAAGAATTAAAGAAGTTATCGATGAAGTATTTGAGCTATTTGTGGCACTT
GAAGCAAACAACGATCAGCTTGACTTCCCTATAGTTTATGCATCAGGTAG
AGCAGGTAGAGCATCTTTAACCTTTGATGATAAAATTAATCCTTTAGACA
ATTTAGCAGATGATTTAGCACCGCTTTTCGACCTTATAGTACAGCATGTA
CCAAAACCCTTAGCCGATGACAAAGCACCGTTTTCTATGCTTGTTACTAC
TAGAGAATATAACTCTTTCTTCGGTAGGGTTTTAACAGGTCGTGTACAAA
GCGGCACTGTCAAAATTAACCAAAACGTAAAAGTATTAAATCGTGAGAAT
AAAGTACTTGAAACCGGACGTATCACTAAAATATTAGCCTTTAGAGGCTT
AGAGCGAATCGCTATAAATGATGCTACAGCCGGCGATATTATTGCCGTAG
CAGGCGTTGAAAACGCCAACGTTGCCGATACTATCTGCTCCCCTGAGGTA
ACCGAGGCCGTACCGTCTCTACCTATCGATCCGCCGACTTTATCCATGAC
TTTTAGCGTTAATGACTCACCGCTTGCAGGAAGCGAAGGGACAAAAGTTA
CGTCGAGCTTAATTGGAGCTAGGTTAATGCGTGAGCTTGAAAGTAACGTT
GCCTTAAAAGTTACTGAAGCTGCCGAGAAAAATGCTTTCCAAGTTGCAGG
GCGTGGTGAGTTACAACTTGGTATCTTAATTGAAACTATGCGTCGTGAAG
GATTTGAGCTATCTATTAGCAGACCCGAAGTATTATTCCAAACTGATGAG
AAAGGTAATAAGCAAGAACCGATGGAAGAAATCCAAGTTGACGTTGATGA
TGATTATGTTGGAGTAGTCGTAAAATCTTTAGCACTGAGAAAAGCCGAAA
TGACTGATATGAGGCCGTCAGGCGGCGGTAAAAGCCGTGTTACGTTTATC
GGACCGTCTAGAGGGTTAATCGGCTATCACAGCCAGTTTTTAACCGAAAC
ACGAGGCACAGGAATTATGAATCGTATTTTCCATGGATATGCTGATTATA
AAGGAAATATCGAGGGAAGACGTAACGGTGTGCTTATCTCTAACGGTGAC
GGGGCAGCAGTCGCATATGCTCTATGGAATCTAGAAGAAAGGGGAAAAAT
GTTTATAAACCCTAGTGACAAAGTATATAGAGGCATGATTATCGGCGAAC
ATAATCGTGATAATGATTTAGAGGTAAACCCACTAAAAGCGAAACAACTG
AGCAACGTTAGAGCAACAGGTAAAGACGAAGCCATAAGGCTAACTCCGCC
AATGCTTTTAACGTTAGAGCAGGCAATCAGCTATATACAAGATGACGAGC
GAGTTGAAGTCACACCGAAATCTATTCGTTTACGTAAAGCTCTACTTGAC
CCTAACGACCGTAAAAGAGCTGCAAAGTAG
>RC0329 bolA, bolA protein homolog
ATGAACCGCATAGAAATGATACAAGAAAAATTAAGTGTGTTAAAACCACA
TTTTCAAGAAATAATAGATGAAAGCTATAAACATGCTAGTCATTATAACG
GAATTCACAGCCATATAAAAATAAGAATTTCTGCAGAAACATTACAGGGG
AAAAGCCTAATTGCCAATCATCGCACTATTAATAACTTACTTGCCGATGA
ATTTAATAGCGGCTTGCATGCTTTATCGATAGAGGTACTATGA
>RC0101 czcR, transcriptional activator protein czcR
ATGAGAGTTTTGTTAATTGAAGGCGAGCCGGAAATGGCTAACTTAATTGA
ACTAACTTTAGCTTCAGAAGGGATAGTTTGCGATAAAGCTTCAGTTGGTG
TAGAAGGTTTAAGACTTGGTAAAGTTGGTGGTTATGATCTAGTAATCTTA
GACCTTATGTTACCGGATATTAATGGTTTTGAGATATTACTAAGATTGCG
TGCTGCAAAAATAAAAACCCCAATCTTAATTTTATCTAGCTTAACGGATA
CGTATCAAAAGATTACTGGTTTCTCTTCCGGAGCCGATGATTATCTAACC
AAGCCGTTTGTAAGAGAGGAATTAATTGCTAGAATTAAAGCTATAGTTAG
ACGTTCTAAAGGTCATGCAGCATCAGTATTTAGGTTTGATAAGGTTAGCA
TAAACCTAGATACTAGAAGTGTAGAAGTTGACGGCAAAAAAGTACATTTG
ACGAACAAAGAATATGCTATTTTAGAGCTATTAATACTCCGAAGAGGAAC
TATCTTAACTAAAGAAATGTTCTTAAATCACTTATATAGTAGTGTTGATG
AACCAGAAATGAAAATTATTGACGTATTTATTTGTAAACTTCGTAAAAAG
TTAAGTGATGCTGCCGGTGGTAGAGATTATATCGACACAGTATGGGGACG
TGGTTATATGCTAAAAGAATATGATGAGTTACAACAAAAAGAAATTTTAG
CACAAGGAGCATAA
>RC1267 dksA, dnaK suppressor protein homolog
ATGCTAGAAACACCTAAATTACCTATGGGATATAAACCTTCTCAAGATGA
AGAATATATGTGTCCTAATCACCTAGAATATTTTAGACAAAAACTTTTAA
GATGGAAAGAGGATTTATTAAAGGAATCTCAAGAGACTTTAAATCATTTA
AAGGAAGCAAATTTAAAAGAATCCGATCTTAACGATTGTGCTACTCATGA
AACAGAAAGAGCTTTTGAGCTTCGTAGTAGAAATAGATATTGTAAATTAA
TGAGTAAAATAGAAGAAGCATTATCACGTATTAAAAATGGAGAATATGGT
TACTGTGAAGAAACAGGCGACCCAATAGGTATAAAAAGATTAGAAGCACG
ACCTATTGCTGCATTATGTATTGAAGCTCAAGAGCGTCATGAAAATTATG
AGAGAAGTCATTTGGATGAGCCTGGGAATTAA
>RC0592 envZ, osmolarity sensor protein envZ [EC:2.7.3.-]
ATGAGGGCTATGCACTTTATATCTAAATTATTACAGCATATTTCAAAGAG
CTTCAGACAAGATGAATTTAAAAGCGAGCCTACACAGCGTATAAAAATAC
GTGAGCACAGACGAATCTTGAAAAATTCGCTTGTATCAAGCTCTTTGAAA
TATGCTTTACCAAGAACATTATTTGTACGGTTTATGTTTATTATAATCAT
TCCGATTTTAATAGGACAAATCGTTGCTATATTTTTGTTTTACGATCGTC
ATTGGTATAATGTTTCATATTATACTAGTACTATTATTATCAATGAAATA
GAATCATTGATTAAAGAACATAGAAATAATTCAAGAAAGATAACCCATTT
ATCGGAAAATTATCTTAATTTATCTTATCAGTTTCAGCTTAATAAAAAGT
TATCTATAAAACAGCCTAAATTAGGTGAACCTTTAACTATATTCAAAAAT
ATTTTAGCTACAAAAATCCATGAAAAAAATATAGTTAAACTAAATAAGGA
AAATAAAATTGAAGTATTTTTAGAATTAAAAGATGGAGTATTATATATTA
CTTTTCCTGCAAAGTTACTACTTAATCCTACAGTATATATATTTGTTTTA
TGGATTATATCTTTAACTGTTATATTACTTTCTGTTTCTATTATTTTCTC
CAAAAATCAAATTAAATCAATACTCACTCTTGCGGATAGCATGGATAAAT
TTGGTCGAGGTGTTTTAAAAGGCAAAAATTTTAAACCTTCAGGAGCCTTA
GAAATAAGAAAAGCAGGGCTTGCTTTTTTAAAAATGAAAGCTCGTATTGA
AAAACAAATTACTAAAAAAACCACTATGCTTGCTATGATTTCTCATGACC
TGAGAACTCCTTTAACAAGAATGAAGCTACAACTTGAATTGATGGAAGAA
AGCGAAGAAATCGAAGGGTTAAAACAAGATATATTAACTATGCAGCAAAT
GATAAATTCTTATTTAGATTTTGCTAAAGGTGAAAGTACAGAAGAATTTG
AAGACATTTTATTATTACCTTGGATGGAACGTTTTTTTAACAAATGGTCA
CATGTAAATATTGAATTTATAAAACCTACTAATTTAGATAAACTAGAAGT
ATGCATTAAGCCACATTCTTTTGAAAGAGCCTTGTCTAATTTAATCGGTA
ACGCTATAAAACATGGAACTAAAATTAAGATATCCTCAAAAGATAATTCA
TCTACCGTAGCTATAATTATTGAGGATAACGGTCCCGGTATAGATGATAC
GGAAACACACCTTGTATTTAAACCGTTTTATAGATCGGATAAAGCAAGAC
AGCTTGATAATGCAAGTAACGTAGGGCTTGGGCTTGCTATTACTAAAGAA
ATAATAAACGATCATAAAGGCTCTATTTATTTAGAAGATAGCAAGGATTT
AGGCGGGCTATCGGTAAGAATCGAAATACCTAAAATATGA
>RC0849 ntrX, nitrogen assimilation regulatory protein ntrX
ATGTCACAACTAGATGTTTTAATAGTAGACGATGAAGAGAGTATACGAAA
TCTCATTGCTGCAAATTTGAAAGATGAAGGTTTTAACCCTAAGGTTGCCG
CTAATAGTACTCAAGCCCTTAAAATACTTTCCGAAAAACCGGTCTCTGCA
GTTGTACTTGATATTTGGCTTCAAGGAAGCGAAATTGACGGACTTGGGAT
TTTAGAGATAATAAAAAAACGCTATCCTTTAATGCCGGTAATAATTATTA
GCGGTCACGGTACTATAGAAACAGCAGTAAATGCTATAAAAATGGGTGCT
TACGATTATATAGAAAAACCGTTTAATAATGATAAATTAGTTATTTTACT
TACAAGAGCTTGTGAAGTAACAAAGTTAAAACGCGAAAATATAGATTTAA
AATCAAAGGTTATAGATAAAACTGAATTAGTAGGCGAATGTTCGGTAACT
TTAAAATATAAAATGGCAATAGCAAAGGCAGCTACCTCTAGCTGTCGTAT
AATGATTCACGGTAAAGTCGGTAGCGGTAAAGAACTTGCAGCAAGATTAA
TTCATAAACAATCTAAAAGGGTTAATAATCCGTTCATTATTTTCAGCCCT
ACCTGTATGACTACGGAAAAAATCAATCAAGAATTATTCGGCGAATTGGA
AAAGCAGGCAAATAATAAACGCCCTACTATCTTAGAATTTGCCAATAACG
GTACTTTATATATAGATGAGGTCAGTAATATTCCTATTCCTATCCAAGTA
AAATTATTAAAATTCCTTAAAGATCAAACTATTACAAAACCTTGCGGAAA
AAATATTAAAATTGATATAAAAATTATCACCGGTACTTCTAAAAATATCC
AAGATGAAGTTAATAATGGCAAATTCCTAGAAGATCTATATTATCGCCTT
AATGTATCCTCTCTAAAAGTACCTTCATTATATGAAAGAAAAGAAGATAT
ACCGCTACTCGTTAAGTATTTTGTTAAGCAACTTTCAAAATTTTCAGGTT
TAAAAGAACGTAGCTTTGCCGATGAAACTATCGCTGCTCTTCAATCCTAT
GAATGGCCGGGCAATATTAGACAATTACGTAACGTTGTTGAATGGACTTT
AATTATGAATCCGTTAACTACAGGTAATAATGAAATTATAAAACCTTATA
TGATACCTTCTGAAATATTAGCAAATAGTGCTAATCTTACAAAACTTGAA
GATAGCTTTGATATGTTATCTATGCCGCTTAGAGAAGCTAGAGAAGTTTT
TGAGCGTCAATATCTATCGGCACAAATGAGTCGTTTTAATAATAATATTT
CAAAAACATCCTCATTTGTCGGTATGGAAAGATCGGCTTTGCATCGTAAA
TTAAAATTATTAAGCTTACATATACCTCCTACAAATAGAATAAATGACGA
AGAATATGAGGAAGCAAATGCTTAA
>RC0948 ntrY, nitrogen regulation protein ntrY
ATGCTTAGTTATCTTAAACAAAATTTACATTCTTATTTTTCTAGTAGAGT
ACTAATTTTTACTTTAGCAACAGCAGCTATTATTTTTGCTTGTGCTACTT
TTTATGTGATATCTTTAGAATCAAAGAATTTTAGTACGATTATTGGATTT
TTATTAGTTGATTTAGCAATTTTTTTAATTTTAGGTGTTGTACTAACTCA
AAAATTTTTTACTAAAAATAATAATAACGATAGTTCTAAATTACAAAATC
GTATTGTAATTGCCTTTAGTTTAGTTGCAGCTATTCCAACTATAATTGTT
TCGGTATTTTCTGTTTATTTTTTTAATCTTAGTGTTCAAGCTTGGTTTGA
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