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# Rickettsia typhi str. Wilmington, Wilmington

>RT0452 two-component sensor histidine kinase
ATGCCAAATATAGATCTCTTCATTCTTACTAGCTTTTTAGGAATTAACTT
ACTAATCGGACTTCTAAACATTAAAAATATAAAAAATAATCGTGAATATG
CCGTAGGCGAAAGGAATTTTTCTACAAGTGCAATAGTCGCAACTCTGATT
GCGACTTGGATCAGTACTAGTATTTTTTTAATAGATAATTCAATAATATA
TCAAAATGGATTATTTTACTTATTGCCTAGTATATTTGGTAGCATTGTGA
GTTGGTTATTAATGAGTTACTTTATAGCGCCTCGTTGTGAGAATATTTTA
GGTAGCTTATCGGTAGCAGAAATAATAGGTGCAGCGTATGGTAACAAAGT
GCGTATTCTTACTGCAATAGTTAGTATATTAATGTCTATAGGTAGGATTG
CTATGCAATTTCACGTAGCAGGTTTAATATTACAGCTATTCTTTAATATT
TCAAATTTTTATATAAATTTATGTATCGCTACTATAATAATAAGTTATTC
TGCTTTTGGTGGTGTAAAATCAGTTACTTTCACCAAAGCTGTACAGTTTT
TTACCTATAGTTTAATTATTCCAATAATAGGAATTGTTATATGGAATGTT
TTGAGTGATCCGTATATAGTAATAAATTCAAATGTACAGAATAGTTTAAT
TGATTTACAAGAATTATTTCATTGTACTAGTCCTAAATTTTGGATTGCTT
TAAATATTTTTATATATTTTGCTATTCCGTCGTTTAGTCCATCGATATTT
CAAAGCATATTGATTGCAAAAGACACAAAACAAATATCAAGAACATTTTT
TATTTCTGCAGTTATTTGTCTTTGTTGGTCCATTATATTCATTTGGATTA
CAATATTATTGTCTCAAAATTCGGTCATTGAAACAAATGAGCTATTTTTA
CGAATCATTAAAAGCTATATAGGATTTAAGGGGTTAATAGTTGGAGTTGT
TATGGCAATGATAATTGCAAGTACTAACTCTTATATTAATGTTGCAGCAG
TAACTTTTACTAATGATATCATTAAAAAAACTTCATTGAATTATAATTAT
ATAACCGCAATTACTATAGGATTAATAGGTTTTATTATATCACTCTATAC
ACAAGATCTAATAAATCTCTTTTTACTATTAACTAGTATCTATTTTCCGT
TAATTACATTACCGCTAATTTTATTAATATACGGTTTCAAATCTACTACT
AAAAGTTTTTTTATAGGCACTATTGCCGCAATATTCACTATTATATCGTG
GCAAATATTTTCTTTAAGGGCGGTTTTAGGCATTTATCCTATGCTACCCA
CAACTATTGTAACTTTAATCTTTTTTCTTGGAAGACATTATATTTTAAAG
CAGCCCGGAGGATTTAGTACTTTAAAAGAGCCACTATCAGTGAAAATAAT
CAGGCAGGACAGAAAAAGAAAATTTTTAACTTTATTTCGTGCTGTTAAGA
ATTTTAACATCTTTAAATATTGGAAAAGTACATTACCAAATCAAGAAATT
ACTTATAGTTATGTTGGAATATTTATTTTAATATCGATGTTCTCATCTTT
GTATACCACATCAGGTAGCAGAATAATGAACCATTTGGTAATATATAATA
TTATTTATCATACTACATTTATAGCTGCTGCAATATTAATAACTTACCCT
TTATGGTCTTTAAAATTTAAAAAAAAATATATTATATCTTTCTCTTGGTT
TATAGCTACTTTTGTTATATTAATATTTTTTGGTAGTTTACTTGTTATAT
TAAATGATTTTGATCAGTTACAATTAATGTATTCAGTAATTAACTCACTT
ATAATTGCAACGATATTTAGGTGGCAAGCTACTTTACTTATGACTGTTAC
AGGCGTGTTTGCTAGTATAGAATTTTATAAATATTTTATAGATGAAAAGT
TATTAATTAGTATAGATAGCTTTCAATTTAAAGTAGTATATTTCTTAACA
TTATTTAGTAGCCTTTTAATAGTATTCTTAAAACCAAGACAAGATCAAGA
AATGTTAATTAATTTAAAAAATACCCATTTAGGTAATAGAGTTAATTATA
GAGAACAAGAGTTAGAGAAACTACTGGATTTAAAACATGAGTTCTTACGT
AATATAAACCATGAAATCAATACACCCCTAACAGGTATTATTAGTCTTGG
TGAAACATTATGGGCTAATTATGATAAGTTTAATGAGGATCAGCGTCGCA
ATGCTGTAGAGATTATAGCTAAAAGCTCTATTAGATTGAATAGCTTGATA
AACAATATTCTAGATTTTTCAAAATTATCTAGTCTTAATTATGAATTAAA
TAAAAATTATATAAACTTAAGCGAACTGCTACATGAAAGGATTAAAATAT
GTAAAAAATTATATCTAAACGGCAAAATTTTAAATTTTGTATCTGATATA
GAAGAAAATATAATATTTAACTGTGATCCCCATTACATTCAACACACATT
CGATAATCTAATAATTAATGCTATTAGCTATAGTAGCGAAGGAACAATAA
AAATTGATTTACAAAAACAAACAGATAGTATTTTATTTATGATAAAAGAT
GATGGAATAGGAGTGCCAAAGGAAGAATTGCCGAATATATTTGGCGTATT
TGTCGTAAGTTCTAAAACACGTACACAAGCAGGGGGACGTGGAGTAGGGC
TTGCTTTATGTAAAAAAGTTATAGAACTACACTCTGGAAAAATTTGGGCA
GAAAACGATAAGCAAGGAAAGACACATTTTATTGTTACTATGCCTTTATA
A
>RT0221 histidine kinase sensor protein
ATGAACCATAATAAGTATATAGTAAGATTGTCATTCATTATATTGTTTCT
TAATATTATTATAAATATGCTGTTTTATCGTTATTTTATGATAAAAGAAA
TGATAATGAAACAAGTAGCTTTGGAACATACTAAAATTGTAGAACTGTAC
ACTGATAATATTTGGAATATTCATAAAAACGTCATCAGTAAATTACATCA
ATTCGATTATTTAAAATTATTACAAGATCAAGATTTTATTAATTTTGTAA
AGATTACTGCTCAATGGTTTACCAATCTTAATATTAATATTTCTCTCTAC
GATCTCAAAGGTAATAAATTTATTACTAGTAATATGTTACATATGTATAG
TGTTGACAATTATAAAAATGATAGTTTAATTGAGATAGTAATAGCAAAAA
TCGATAAAATTTTTTTAAAATCTTTTACTTCAGAAGCTCCACTGCGCGAT
GCTTTTAGAGGTATTACAAGTCATATATTACTACCAAAGGTAGTAATAGA
AAATGAAAGTGATTTAACAATAGAACACGCTTCTTTTATTACTAGTTATA
TCCCTGTTATAGATCATAATTTAGATTTTTCTGTAGATGCAGTATTTGAG
ATTAATACTAATATTACTAGTCAGTGGAAAAATATAACATCTCTTGAACA
AAAGGTTTTTATAACATTTATAATTATTTTTATAATATTTTGTACTATAA
TTATTAGTAATACTAACTATGCTAGACAAATTATCGAGGAGCAGCTTGCA
ACAAATCGCAATTTAAAAGCTCAAATAGTAAAAGTAGAAAAAACTAGCTC
ATCCAACACAAAGTTTTTTGCTAATATTAGTCATGAATTACGTACGCCAC
TTAATGCTATAATAGGTTTTTCAGAGATTCTGATGTCTGAACGAGATACA
GAAAAAAGTAAAAATTATATTAAAGATATACATGATGCTGGTAAACATTT
GCTTAGTATGATTAATGATATTTTAGATCTTTCTAAAGCTTCTGCTGATA
AATTAAAAGTAGATAATATAGATCTTGATTTAAATAAATTAATTAGTTCT
TCGCTAATACTGATTAAACCTCGTGCAGATCAAGCGGAAGTAGAGCTAAT
TAGTAGATTGCCGAAAGAGCATATTGTTATAAATGCTGATCCAAAAAGAC
TAAAACAAGTGTTATTAAATCTTTTATCAAATGCTGTGAAATTTACAAAT
ACCGGCGGTAGTGTTACTATTGCACTTGAAAAAGACGAGTTAGCAAAATT
AGTATATATAAAAGTTATAGATACCGGCATTGGTATTGAGGAAAAAGATA
TTCCAAAAACTTTATCAGAGTTTGGTCAAATTGATAGTGAACTTAGTCGA
AAATATGAGGGTACTGGTCTTGGGTTGCCGCTTACTAAAAAGCTAGTTGA
ACTTATGAATGGTAAATTTGATTTGCAAAGTCAGATAAATAAAGGTACCA
CAGTCACAATAACTTTTGTATATGACGGTAGTATTAATTGTTCATGA
>RT0238 conserved hypothetical protein
ATGATAAAAATTGCAATGTCAGAATTAATAACGGATTATAAAAATTTACA
ATATGAGATAGATAAATTGCAAAAAGGTGTATGTTTCGCTTGTAGATTAA
TTAATTATGATGAAATAGAATTTATAGAGCAAGATAAGCATTTTATTATT
CAGGATTTAGATCAAATCATTAAAAATGTAAGCAAAGAACTTAATATTTT
CGCTACATTTAAGATAATAAATGAAGATAGAATATTATTTATACTCAATA
CTACTGATTCTGACCTAATTAAAAATTTTGCTAGAAAATTATATTTATTG
TCGCAGCTTTATATTAATGAAGAGAGGCCAGCAATTTATATGAATTGTTA
TATAGCAAGTATTAAATTTACAACAGTAATGAATAATGCGGAATCAATTG
CAAAAGCATTAAATATGTTACTTTCACAAAATAATAATTATTATTATCGT
GAATATAGTAGTACAGCACATGATTTGGAAAATATCAGAAAATCTAATCT
TCAGCTGAACTTATTACGAAAAGCCTTAGTAAAAAAGACTATGCGCTTTG
CTTATCAGCCTATAATAAATCGTAATACTATGAAAATTCATTATTATGAA
TGTCTTCTTCGTATACCTGACGAAAACGGTGTTTATATTTCTGTAGGACA
GATAATACCTATTGCTGAAAATAAAGGATTAATTTTTATAATTGATCAAA
TCGTTTTAGAAATGACTATTAATGAACTGGCACGTAATCCTAACTTAATG
TTAGCAGTTAATATTTCAAATATAGGAACTAGTGATGAAGCTTTATGTGA
AATAGCAGAAAACTTATTGAAAGTTCATAATGTGCGAGATCGTTTAATTA
TTGAAATTACAGAAACTTCTTTCAATGAAAATTATGATAAAATCACTTTA
TTTATTAATAAACTACGTAAGTATGGATGTAAATTTGCATTAGATGATTT
TGGTTCTGGTTTCACTTCTTTTAAACAACTTCAAAGCTTACCAATTGATA
TTATTAAAATTGATGGTAAATATGTGCGTAGTATTACAAGTGATGTACAA
AGTAGGTATTTTGTAGAAAGATTAATTAGAATTTCAGAAGATTTAGGTAT
TGCAACTGTCGCTGAATTTGTAGAAAATGGAGAAATAGCTCAATTTTTAA
TTGATCTAAAAGTGAGTGGGCTGCAAGGAAATTTCTATTCTGAAGCAAAA
TTTGATAGGGTAGATGAAGTGTAA
>RT0186 conserved hypothetical protein
ATGACTAAAAACACGATATTTAAAAATATATTGATACCTATAGATTTAAA
TGATAAGAAATCTATAAAAAGTATTTTTTCTAAGGCTTTAATGCTTGCAA
TAAATTTTCAAGCAAAATTACATTTTATGTATGTAATGCCTGAATTTGGT
ACTAAAATGTTTGAAGATTATTTACCTAAAAATTGGAGAACAGAAAAAAA
AGAAAAATATCAAACTCAAATTAAAGACATTATCAAACAATATATTCCTG
ATACAATTGAAACGGATGATTATATAGGTAGCGGGGCAGTTTATGATGAA
ATAATTAAGCACTCTAATGAAATTAAAGCAGATTTAATAATAATCTCTGC
AGTCAGACTACAATTAAAAGATTATATGCTTGGACCTAATGCTTCTAAAA
TCGTACGTCATTCAGACATATCAGTTTTAGTACTACGAGACGAGTAA
>RT0237 BolA-like protein
ATGAGCCGCATAAAAAGGATGCAAGAAAAATTAAGTGTGTTAAAACCATA
TTTTCAAGAAATAATAGATGAAAGTTATAAGCATGCTAGTCATTATGATG
GAATTCATAGTCATATAAAAATAAGAATTTCTGCAGAAACATTACAAGAG
CAGAGCTTGATTTCATATCATCGCACTATTAATAACTTACTCGCGGATGA
ATTTAATAATGGCTTGCATGCGTTATCGATAGAGGTATTATGA
>RT0229 response regulator protein
ATGACCACAATATTAGTAGTAGACGATATAGAAACCAACATTAAGTTACT
AACAGCAAAACTTTTAAAAGAGTACTATACAGTTCTTACTGCAAATAGCG
GAAAAGAAGCATTATCAATTCTTAAAAAGGAGAAAATCGATACTATACTC
CTTGATGTTATGATGCCGGAAATGGATGGATTTGAGGTATGTAAAATAAT
CAAAACAGATCCAGGCACTACTCATATACCTGTTGTAATGATCACTGCAC
TTTCTGATATTGATGATCGAGTAAAAGGTCTTGAAGCAGGAGCTGATGAA
TTTTTAATAAAGCCTATTAATGATACTGCTTTATTTGTAAGACTGAAATC
ACTATCTAGAATGAAAAGCTTAATTGATGAGTTAAAACTTCGTAATAGTA
CTAATGCATTATTAGGCGTAACAAATATCGAAATTCATGACAATTTGACA
GATAAAAAAATATTACTCATTAATGATGATGTAGTACAAGCTAAAAATAT
AAAACAAATTCTAGTTAAACTTACCAAGTACGTAAAGGTAATAAGTAATT
CAGATGAATTAGATATTATAAATGAATATACACCAGATTTAGTCATTATC
AGCAGTACACTTGAAAATGAAGATCCTTTAAGAATCAGTGTTATTTTAAG
AGGTAAAGCAGAAATAAGTGGCGTGGTAATAATTTTACAAATTGATGAAG
ATGGAATGCCTTTAGTTGTAAAAGGTATTGAACTCGGCATTAATGATTAT
TTCATTTATCCTATAGAAGAAAATGAATTACTGGCTAGGATTAGAACACA
ATTAAGGCGTAAACAATATCAAGATAATTTACGTAATGATCTTGAACAAA
GTGTTAATTTAGCAGCTAAAGATGGTCTAACAGGTTTATTTAATCGTCGT
TATTTTGATATACATCTCAAACAAATGATTGAGAAAGCTAATAAAGAAAA
TATTAAATTATATTTACTGATGTGTGATATAGACAATTTTAAACATGTAA
ACGATACTTACGGTCATCAAGCAGGAGATAAGGTTTTAACAATTGTATCA
CGTATTTTGAAAAATACTCTCAGAGTAACAGACTTAATAGCAAGGTTCGG
TGGTGAAGAATTTACTATACTTTTAACAGATATAGATATTTCTAAAGCAA
TTGAAACTGCGGAAAGAATTAGAGTAAAAATAGAATATATGGATTTTTAT
ATTGAAGGTCAAATTGAACCGTTAAAAAAAACTATTTCAATAGGAGTAAC
GGAATATAAAAAAGAAGAATCGATAGAATCGATCATTAAACGTGCTGACA
AAGCAATGTATAAAGCTAAAACAACTGGAAAAAATAAAGTAGTACAATTA
TAA
>RT0800 conserved hypothetical protein
ATGGCAATATCTGCAGAAGAGTTAGAAAAAATACTTAAAAAATCCTTTCC
AAGTAGTGTAATAAAAATTACTGATTTAGTAGGAGATCAAGACCATTATG
CTTTAGAAATATCAGATGATCAATTTAATGGACTTTCTTTAATTAATCAA
CATAAATTAGTAAAAAATGCCATATCTGAAATATTAAATAAAAAACTACA
TTCAATCAGCATAAAAACTATTGCCATTCCTAAAAATAGTTACAAATATT
GA
>RT0061 czcR, transcriptional activator protein CzcR
ATGAAAGTGTTATTGATTGAAGACGAATCGGAAATGGCTAACTTAATTGA
GATCACTTTAGCTTCAGAAGGGATAGTTTGCGATAAAGCTTCAGTTGGTG
TAGAAGGTTTAAGACTTGGTAAAATTGGTATCTATGATCTAGTAATTTTA
GATCTTATGTTACCAGACATTAATGGTTTTGAGATATTACTAAGATTACG
TGCGGCAAAAATAAAAACTCCCATCTTAATTTTATCTAGTTTAACCGATA
CTGATCAAAAAATTACAAGTTTCTCTTCCGGTGCTGATGATTATTTAACT
AAACCATTTGTCCGAGAAGAATTAATTGCTAGAATTAAAGCTATAGTTAG
ACGTTCTAAAGGACATGCGGCATCAGTATTTAGGTTTGATAAGGTGAGCG
TCAACCTTGATACTAGAAGTGTAGAAGTTGATGGAAAAAAAATACATTTG
ACAAACAAAGAATATTCTATTTTAGAGTTATTAATAATCAGAAGAGGCAC
TATCTTAACTAAAGAAATGTTCTTAAATCACTTATATAGTAGTGTTGATG
AACCGGAAATGAAAATTATTGACGTATTTATTTGTAAACTTCGTAAAAAG
TTAAGTGATGCTGCTGGCGGTCGAGATTATATCGATACAGTATGGGGACG
CGGTTATATGCTAAAAGAATATGATGAATTACAACAAAAAGAACTTTTAG
CACAAGGAGCATAA
>RT0804 dksA, DnaK suppressor protein
ATGCTAGAAACACCTAAATTACCTATTGGATATAAACCTTCTAAAGATGA
AGAATATATGTGTCCTAATCATCTGGAATATTTTAGACAAAAACTTTTAA
GATGGAAAGAGGATTTATTAAAAGAATCACAAGCGACTTTAAATCATTTA
AAAGAAGAAAATTTAAAAGAATCAGATCTTAACGATTGTGCTACTCATGA
AACAGAAAGAGCTTTTGAGTTACGTAGTAGAAATAGATATTGTAAATTAA
TGAGTAAAATAGAAGAAGCATTATCACGTATTAAAAATGGAGAATATGGT
TATTGTGAAGAAACAGGTGCTCCAATAGGTATCAAAAGATTAGAAGCAAG
GCCTATTGCTGCATTATGTATTGAAGCACAAGAACGTCATGAAAATTATG
AGAGAAGTCATTTAGATGAACCTGGAAATTAA
>RT0412 envZ, osmolarity sensor protein EnvZ
ATGGCTATGCACTTTATATCTAAACTATTACCGAAAACATTATTTATACG
GTTCATGTTTATTATCATCATTCCAATTTTAATAGGACAAATAGTTGCTA
TATTTTTGTTTTACGATCGTCATTGGTATAATGTTTCATATTATACTAGT
ACTATTATTATCAATGAAATTGAATCACTTATTAAAGAGCATAAAAATAA
TTCAAGAGAGAGCACACATTTATTAGAAAATTATCTTAATTTATCTTATC
AGTTTCAGTTTAATAAAAAGTTATCTATAAAACAGTCTAAATTAAGTGAA
CCTTTAACTATATTTAAAAATATTTTAGCTACAAAGATTTATGAAAAAAA
TATAGTTAAACTGAATAAGGAAAATAAAATTGAAGTATTTTTAGAATTAA
AAGATGGAATATTATATATTACTTTTCCTGCAAAATTATTACTTAACCCT
ACAGTATATATATTTGTTTTATGGATTATATCTTTAACTATTATATTACT
TTCTGTTTCTATTATTTTTTCAAAAAATCAAATTAAATCAATATTAACAC
TTGCTGATAGTATGGATAAATTTGGTCGAGGTATTTTAAAAAGCAACAAT
TTCAAACCTTCAGGTGCTTTAGAAATAAGAAACGCAGGACTTGCTTTTTT
AAAAATGAAAGCTCGTATTGAAAAACAAATTAATAAAAGAACTAATATGC
TTGCTATGATCTCACATGACCTTAGAACTCCTTTAACAAGAATGAAATTA
CAACTTGAATTGATGGAAGAAAACGAAGCAATCAAAGGATTTAAACAAGA
TATATTAACTATGCAGCAAATGATAAATTCTTATTTAGATTTTGCTAAAG
GCGAAAGTACAGAAGAATTTGAAGAAATTTTATTATTACCTTGGATTGAG
CATCTTTTAAATAAATGGCCTCATATAAATATTGAATTTATAAAATCTAC
TAATTTAAATAAACTAGCAGTACTCATGAAACCAAATTCTTTTGAAAGAG
CATTGTCTAATTTAATCGGTAACGCTATAAAATATGGGACTAAAATTGAA
ATTTCTGTGAAAAATAATCAATCTACCGTAACTATAATTATAGAAGATAA
CGGTATCGGTATAGATGATATGGAAAAACATCTTGTATTTAAACCATTTT
ATAGATCTGATAAAGCAAGACAACTTGATAATTCAAGCAATGTAGGACTT
GGACTTGCTATCACTAAAGAAATAATAAATAATCATAAAGGTTGTATTTA
TTTAGAAGATAGTAAGAATTTAGGTGGACTATTGGTAAGAATAGAAATAC
CTAAAATATAA
>RT0139 glnH, glutamine-binding periplasmic protein GlnH
ATGAAGTTTCTGAAAATATTTTTACTATCTTTCTTGTTAGTTTCTTGTGA
AAAAAAAGAAACGGAAAAAACTTTAATAGTGGGTACTGCTGCAGATAATC
CTCCTTATGAATTTATCCAGGATGGAGAAATAGTGGGGATTGATATTGAT
ATTATCAAAGCAATAAGCCAACGTCTAAATAAAAAAATTATTATAAAAAA
CTTTGACTTTAACGGTTTACTTGCAGCGTTAATTAGTGAGAATATTGATG
TTGCAATTGCAGCACTTTCCGTTACCCAAGAACGTTCAGAATATATTAGC
TTTTCAGATAGTTATGCTAAGGCAAGATTTGCCATAATATATAGAACAGG
CGAGAATATACAAAATAGCAAAGATCTATATAATAAAATAGTAGGAGTAC
AACTCGGTAGTGTTTTAGAAAAAAAAGCACAAGATCTATCACATACAATG
AATATTAAAGTTCATGCTTTAGCAAATCATTTAATGTTAGTTGAAGAATT
AAAAGCCAAGGTCATAGATGCTATTATTTCTGAGGAATTTCAAGGAAAAA
AATTAAAAGAAAATAATTCAAATTTAGAAACCTCTACTTTAGAAGAATTT
TCATCCGATTTTGCTATCGGTATGTCTAAACACTCAGGACTAATTAATGA
AATTAATAGCACAATAAATTTATTAAAAAAAGATGGTACCATTAATAAAA
TTATGAAAAAATGGCTGGGACAATAA
>RT0550 ntrX, nitrogen assimilation regulatory protein NtrX
ATGTCACAATTAGATGTTTTAATATTAGACGATGAAGAGAGTATACGAAA
TCTCATTGCTGCAAATTTGAAAGATGAAGGTTTTAATCCCAAGGTTGCCG
CTAATAGTACTCAAGCTCTTAAAATAATTTCTGAAAAACCAGTCTCTGCA
GTGATACTTGATATTTGGCTTCAAGGTAGCGAAATTGACGGGCTTGGAGT
TTTAGAGATAATTAAAAAACGTTATCCTTTAATACCGGTAATCATTATTA
GCGGTCACGGTACTATAGAAACAGCAGTTAATGCGATAAAAATGGGAGCT
TACGATTATATCGAGAAACCATTTAATAATGATAAATTAATTATTTTACT
TAAAAGAGCTTGCGAAGTAACAAAATTAAAACGTGAAAACATAGATTTAA
AATCAAAGGTTATAGATAAAACTGAATTAGTTGGAGGATGTTCAGTAACT
TTAAAATATAAAATGGAAATAGAAAAAGCAGCTAGCTCTAGCAGTCGTAT
AATGATTCATGGTAAAGTCGGTAGCGGCAAAGAACTTGCAGCAAGATTAA
TTCATAAACAATCTAAGAGAGTTAATAATCCATTTATTATTTTTAGCCCA
ACCTGCATGACTACAGAAAAAATTAATCAAGAATTATTTGGAGAATCAGA
AAAGCAGGAGAATAATAATAAACGTCCTACTATCTTAGAATTTGCAAATA
ATGGGACTTTATATATAGATGAGGTCAGTAATATTCCTATTCCTATCCAG
GTAAAATTATTAAAATTCCTTAAAGATCAAACTATTACAAAACCTTGTGG
GAAAAAGACTAAAGTTGATATAAAAATTATTACCAGTACTTCTAAAAATA
TCCAAGATGAAGTAAATAACGGAAAATTTCTAGAAGATCTATATTATCGC
CTTAATGTATTTTCTCTAAAAGTACCTTCATTATATGAAAGAAAAGAAGA
TATACCACTACTAGTTAAATATTTTGTTAAGCAACTTTCAAAATTTTCAG
GTTTAAAAGAACGTCATTTTTCTGATGAAGCTATTACAGCTCTTCAATCC
TACGAATGGCCTGGTAATATTAGACAATTACGTAACGTTGTTGAATGGAC
TTTAATTATGAATCCGTTAACTACAGGTAATAATGAAATTATAAAACCTT
ATATGATACCTTCAGAAATATTAGCAAATAGTGCTAATCTTACAAAACTT
GAAGACAGCTTTGATATGTTATCTATGCCGCTTAGAGAAGCGAGAGAAGT
TTTTGAGCGTCAATATCTATCAGCGCAAATGAGCCGTTTTAATAATAATA
TTTCAAAAACTTCTTCATTTGTCGGTATGGAAAGATCAGCTTTACATCGA
AAATTAAAATTATTAAGCCTACATATACCACCAACAAATAAAATAAATGA
AGAAGAATATGAGAAAGCAAATGCTTAA
>RT0603 ntrY, nitrogen regulation protein NtrY
ATGTCTATGCTTAGTTATTTAAAACAAAATTTGTGCTTTTATTTGTCTAG
TAAAATACTAATTCTTGCTTTAGCAATATCAGCTATTGTTTCAGCTTGTA
CTACTTTTTATGTGATATCTTTAGAAGCAAAGAATTTTAGTACGATTATT
GGATTTTTGTTAATTGATTTAGCAATTTTTTTGATTTTAGGTATTTTACT
AACTCAAAAGTTTTTTTCTAAAAATAATGATAACGATAGTTCTAGATTAC
AAAATCGTATTGTAATTGCATTTAGTTTAGTAGCTGCTATTCCAACTATA
ATTGTTTCTGTATTTTCTGTTTATTTTTTTAATCTTAGTGTTAAAGCATG
GTTTGATAAGAAGATTTCTACCGTGCTTGATCAATCTGTAATAGTAGCTG
AAACTTATATTGCTGAGCATAAAGTACAGTTAAAAGAAACAGCTTTAGCA
GTTGCCGAAGATTTAAGCGATATGTATTACGATTTAATCCATAATCCTGC
TTTATTTACTAAAACACTTAATACCGAAGCAGATATGCGCTCGCTTGATG
AAGCGATAGTTTTAAATAAATCTACCAATACTATAGTAGCTAATAGTTAT
TTAAGTTTTTCATTATCATTTGCAACTATTCCAGCACACTTAATTAAAAA
AGCTGATTTAGGGGAACCAGTAGAAGTAAAATCCGACCCAACTAAAATCA
GGATGTTAATTAAATTGAAAGAATATAATGATGTGTATTTATTAGTCGGT
AGACTAGTAGATAATAAAATTATCGATCATATAGATGCAACTAACGGAGC
AGCTGCCGAGTATAATAGCCTTAAAAATGAAATAGATAATATACAGATTA
AGTTCTCTATAATGTTTATCTTTATTGCATTATTACTTCTTTTTGTAGCG
ATAAATTTTGGTGTTTTATTTACTGCTCAAATAGTAAAACCGATTAAAAA
ATTAGTTACTGCAACCGACAAAGTTAAAGATGGTGATTTAACAGTGCAGG
TTCCTGAAAATGAGGTAGATAAAGACGAAATAGGAACGCTTTATGTAGCA
TTTAATAGAATGATTAAGCAGCTTTCGCGTCAGCAGCGTGATTTAGTTAT
AGCACAGAGGGCTATGGCTTGGTCGGATGTTGCAAAAAAAGTAGCTCATG
AAATTAAGAACCCATTAACTCCTATTTTACTTGCTTCTGAAAGGTTACTT
AAGAAATTTAGCGCTGAAATTAAGGACAAGTCAGAATTTGAAAGTTATTT
AAAAATGATTATTCGTCATACTAACGATATTAAAAATATAGTATCCGAAT
TTGTTCTGTTTGCACGTCTTCCTGCTCCTAAATTTACGAAGAGTGAATTA
GTTTATTTAGTAAAACATATTATTGAAGCACGTAAATTACTTAATGATAA
TATTGTGTATACATGTGATTCTAATGTAGATCAATTTGATTTTATGTGTG
ATGCTACACAAATAAATCAAGTGATGATCAATGTGTTAAAAAATGCTGAA
GAGTCAATAGAAGGACAAGAATTCGGGAGAATAGATGTTATTTTAGATAT
TAAAGATGATTTTATCAATGTTATTGTAATGGATAACGGTAAAGGATTTC
CTCCTGAGCTCATAGGTAAAGCTACCGAAAGCTATGTAACAACCAGCAGT
AAAGGTATGGGTGTAGGGCTTGCTATAGTTAAAAGAATAGTAGAAGAGCA
TTGTGGTGTTTTAGATATCGCAAACAGAGAAGATAAAGGGGCAATAATCG
ATATAAAATTTGATTTAAAAGAACTGCATTTGAAAGTTAGACGTTCTTGT
GGTTAG
>RT0413 ompR, response regulator protein OmpR
ATGCAACCACATATTTTAATTGTAGATGATGATAGCAGAATATTAGCACT
TTTAAAGCAGTTTTTAAATAAAAATAACTTTTTAGTATCAACGGCAAACT
CAGTTATAGAAGCTAAAAATCTATTAAAAACTTCTAATTATGATCTAATC
ATTTTAGATGTTATGTTACCTGAAATAACAGGGCTTGATTTTGCCACTAC
TATAAGGGATGCTGGTAATACTATTCCTATAGTTATGCTTACTGCTTTAT
CAGAAGCCAATGAGCGTGTTAAAGGGCTTGAAGCTGGTGCATCTGATTAT
ATCACTAAACCTTTTGAACCAAGAGAATTATTACTGCGAATAAATAACTT
AATCAATAACTATAACTTTAAGAAAGCAACAAATATAATTAAATTTGGCA
ATAATTTGTATAATTGCACTACAAAAGAATTTACTAAAAATAATCAAATT
GTATCTCTTAGCTCTACTGAGCAAAAACTACTTGAGATATTAATAAAAAA
TTCCGGGAAGTCTACTAGTCGTTTTGAACTTTCAAAAATAATGGGAGGAC
TGAGTATGCGTTCTATAGACGTACAGATTACAAGAATAAGAAGTAAAATA
GAAGATAACCCAAAAGAACCAAAATATTTAAAAACAGTGCGTAATGATGG
CTATGCACTTTATATCTAA
>RT0302 spoTa, guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase SpoTa
ATGAAAGATATAGAATATTGGGACAAAAATTTTGAAAGCTGTAAATATTC
TGATAAATTGATCGAAAGACTTCTATTTTTAAATAACAAAGTAAAACAAC
CTATTGATATTAGAGAAGTTAAAAAAGGTATTTATTATGCTCGTAAATAT
CATGGTAAGCAAATGCGTCAATCTGGTGATCCTTATTATTCTCATCCAAT
TGCAGTAACAATTATGGTAGCGGAATTTGTAGCAAAAGAAGTTCCTAAAC
TCTTTACTTCTAGAATACTACAAGCCGCATTATTGCATGACACTATTGAA
GATACTGAACTTACGAAAGACATGATTAGCAGTATTTTTGATGAAGAAGT
CGCAAGACATGTAGAAGGTTTAACTAGAATTAAACCTTGTGGGAAAATAA
GTAGTGCAAAAAGCCTTATTTTATTAATTAAACAAAAAAGGTACGATACT
GCTTTGATAAAACTTTTTGATAGAATACATAATTTACAAACTTTAGAAGC
AAAATCGCCTGAAAAAGCTCATAAAATAATTAAAGAAACATTAAAAAGTT
TTTTAGTATTAAGTGAAATACTTGAAATACCTTCAGTTTCAGAGCTTATA
TATGCTGAATGTTATAAAAATAATTTAAAGTTTAATATAAATGCTACTTT
TAATAAAATTATAAATTTCGATTCTTCTCCATTCGCTCAAAATAAGTTAC
TCCCATGA
>RT0615 spoTb, guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase SpoTb
ATGGAAGATATTGATATTTGGCAGGAAAAATTTGAATTTTGTAATTATAG
TAAAAAATTAATTGGTCGAATTGAATATTTGAATACTATAGTAGACTCAC
CTATAGATATAATAGAAGTTAAAAAAGGCATTTATTATACCCGTAAATAT
CATGCTACTCAAATGCGCCAATCAGGAGAACCATATTATTCTCATCCTAT
AGAAGTTGCAATCATGCTTGCAGATTTTACAGCTCTTGAAGCTCCTAAAC
TTTACAAATCATATATGATAAATGTAGCACTTCTGCATGATACTATTGAG
GATACAATACTTACGCATGCTGATATTAGCAAAATTTTTGATAAGAATAT
TGCAGATAATGTAGAACGTTTAACAAGAATTAAGCCATACGGTAAAATTA
GCTCTGGTGAAATGTTGAATTTATTAATCCAAGAACAAAGATATGATATT
GCACTTATTAAAGTATTTGATCGACTGCATAATTTACAAACTATCAATGC
TAAGTCTACAGAAAAGGCTTTAGAAACAGTAAAAGAAACTATAGAAAGTT
TCTTACTCATAGCAGCTTATTTAGAAATACGAACCGTAGAACAACAACTA
TTAAATGTTTGCAATAATTTTATTAAGCAACATTTTCCTTCAGAACAAAA
AGCAATATTCCGATCGGTTTACGAAATTTCTTTTTTCAACTTCAAAATAA
TACAAAATAAATTAAAGAGAATGCAATACTACTTTAGAAAGAAAAAAGCT
TAA
>RT0616 spoTc, guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase SpoTc
ATAACAGGTAGGATAAAACATCCAATATCAATTTTATATAAATTATATCG
TAAGGGTATAAAGTTAGAAGAATTAACAGATATTTTTGCGATAAGAATAG
TAGTAATAGATGAGGAAAAATGTTATAAAGCTTTAAAAATAGTTCATGAA
CTTTATGATCATGAAAAAGATAAATTTAAAAATTATATCCTTAATCCTAA
ACCCAATGGCTATCAATCTTTACATACTATTATTATAACTGAGGATAATT
ATAAAATAGAGATACAAATACGTGATTATAATATGCATTATAATGCAGAG
AGTGGTGATGCAGCACACTGGAAATATAAAAATAGTTTTTAG
>RT0700 spoTd, guanosine-3,5-bis(diphosphate) 3-pyrophosphohydrolase SpoTd
ATGTGGCATGAGGTGGATGTGATTTGCGATATTATGAATCTGCTGAGCAA
AGATTTAGATAAAGCAGATATAGAACATGAGATATATATGCGTCTTAAAG
AACCTTATTCTGTTTTAAAAAAGATGAAAAGGAAAGAAGTACATATTTAT
TCATTGAAAGACTTGATCGCATGTAGGATTATAGTTAAATCTAAAGATCT
ATGTTATAATGCTTTGGATGTAGTTAAGAATTCTCCGTATTTAGATTGTT
TATACACCAAAGATTATATTAATAGACCAAAAAGCAACGGATATCAGTCT
CTTCATAATATAATGCAGCTTTTACACTCTAAACGTACGGTTGAAATACA
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ATTTAAATTATAAAGAAGAACAAGACCGTCATTTTAAAAAAGCTTTTGAC
ATTACTAATGATACAATGCTTTCTAAAGCGCGTCAAATGCTGAAGCAATT
TGCAGGATTAGAAGAGCAAATTGTAGAATATGAAAAAGAAATTATGTGTA
TTTGGCTAAATACGATGAAATGGTGA
>RT0254 typA, GTP-binding protein TypA (tyrosine phosphorylated protein A)
ATGACATCTATTCGTAATATAGCAATTATTGCACACGTTGATCACGGAAA
AACTACACTTGTAGATAATATGCTGAAACAAAGCGGAACATTTAGAGCTA
ATCAGACAGTTGCCGAGCGTGCCATGGATTCTAACGAGCTTGAACGCGAA
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GCAGTTGGTAAAGACGAAGCAATAAGACTTACTCCACCTATGCTTTTAAC
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CGCCAAAATCTATTCGTTTACGTAAAGTTCTCCTTAACCCAAACGATCGT
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