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COG category: Signal transduction mechanisms
Organism: Thiomicrospira denitrificans ATCC 33889, ATCC 33889
Number of genes found: 179
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# Thiomicrospira denitrificans ATCC 33889, ATCC 33889 >Tmden_1171 transcriptional regulators, TraR/DksA family GTGCAAGAGAGCGAGTTAAAATATTTTAAAGAGATTCTTGAGAGCAGAAA AGAACAGATAATAAAAAATATTAGAGGCGTTAATGAAGAGCTAAGCCAAT TAAGCTCTCTAGAGTTAAAAGATGAGGGCGACCATGCATCTGTGGACAAT AGCTCAATGATTGAGAGCGCAATAGTTCATCAACAAGAACAAGAATTAAG AGAGATAAACGTTACGCTTGGAAAAATTGCAACAGGTGATTATGGAATCT GCGAGATGTGTGAAGACCCTATTGGTTTTCAAAGACTTAAAGTTAAGCCT CATGCGATATACTGCATTGATTGTAGAGAAATAGTAGAAAAATCTAGATA G >Tmden_1196 putative diguanylate phosphodiesterase (EAL domain) ATGAAAACATATATCTCTCTTATATTTTTTTTAATTACTCTCTTTAGCTC TGCATCTGCCCTATATTATTATCATATAGAAGATGAAGCTCTAAAGAGAG TAGCGCATGATAAAGAGATACTAAAAGCTCAAGTATTAAGAGTCGCTAAA GAGTCTGTAACTAACCTTACTCTATTTGAGAGCAGCATCAAAACTCTGCA ACAAACGAACCCTCTAAGTGAAGTCAAACTTCAACTAAAAAAACTCTCTT TTAGTGAAGATATCCTACTTAAAAAAGTTTTTTTAAACAGTACGGGATGG TTTGTAAGTGATGTTACTGTAGATAACACTGATGGAGAGATTTCAGTTGA TGATAGCGGTATATATACACTACAACTGTCTAAAGATAAACAAGAGGCTG TTGAGATAAAATTTCAAGCTATAAAAGATTCTATTATCAAAGATTTTCTT ATACCTTTTGCGACAAATAGAGTAGTTTTAAGCACAAATGAGACAAACTC AACTGCTACTTTTGAAGAGATACAAGAAGATGACTTCTCTCTTTTTATAA AAGATAACTTTATAGTTGATAGAGAGTTACTAAGAGATAAGTTCTATACA TTTATAATCGCTTTATCTATATTTATGAGCATGATGGCACTCTCTGGCTA CCTTTTTTACAGATTCGTTATAATTAAAAACTTCTCACACTCCATAAAAG GTTTAAATAATTATGTTGAAAATATTATTAAAGGAAAGATGTTAAAAGAG TCTGCTTTGGAGTCAAATTCTAAAGAGCTAAAAAATCTCTATGCAAATAC AATTGAGTTAAGCAAAAAATTCATAAATGTCTCAAATGAGCTAACAGTTA GCAAAGATATTATCTATCAAAAAGAGAGAAGTGATGAGCTAACTGGGCTT CCAAATAAAAAATCATTCGAGAATGATTTAAAATATATGTTTATATCAAA TAAAGATGGCTACATTATCTATCTTAAGATAGACAAAATTGGACTATTTA CTAAAAACCATGGACCAGAAATTGTAGATTCTTTGATTGAGGATTTTGCA CAGTTAATAAATAATTTTATAAATAAAGAGCGAAATAGAAATGGTGCAAT TTATAGATTTTTCGGTGGAGAATTCTCAATTATACTATATGAAAACTCTA TAGAAAAAGTTGAAAAGTTTCTTCTAGATATTCTTGAGCTAACAGATACG CTAAGAGATAAATACTACTTCTTTGATCGTGCTATCTACTATGGTGCTTC ACCTTTTGACCATTATGGCACTATCGAGTCTATCATGCAGAGTGCTCAGG AAGCTTATGAAGTAGCACTTAAAGAGAAAACAAAATCATACTTTATAGTA GATTTAATGCAACAAGCTGAATTTAATAAAAAATTAGAAGGAAGCGTCAA AGATATTATTAAAAGAAATGACTTTGTACTTCAGTATCTTCATGACACGC TCACTTTTGGAGAAAATCCTAAACTCCTTATGCAAGAGGTTTCACCACTA ATTATAGATAGTTTTACATATGAAAATATACCAACTGGTAAATTTATATC TGTGGCAGAGAAGATTGGAGTTGTTGCTGATTTTGATAAGGCGTTAATAC TCAAAGTTTTAGAGCAGATAGAGTTTGGAGGGTTAGAGCATAAAATCTGT GTTGTTTTATCAATTCCTTCAATTGCCAATAAACTCTTTATATCTTGGTT AGAGACCATGGCTATAGAGAATCCTCTTATTAAAAATATTATATTTACCT CCGCTTGTTATAGTGTGGCTAGTAATTTTGAAGATTTTAAACACTTTAAC TCAATACTTAAGGCGCACAACCTTGAGAATATGATAAAAAAATATGACCC GACAGATTTAAGCCTAGAGAGTCTAATAGAGCTTAAACCATCATATTTAA AACTAGATAGAAACTTCTGCCAAGACTTTAAAAAAGATAGCACAAAACAA CATGTAGTAAAGCAGATTTTACTATTCTCAGATACACATGATATAAAAGT TATAGGTGATTCACTAAAGAGTGAGCAGGATTATCTGGCATTTGAGATGC TTGGTGTCTATGGAAATTGTCATTAA >Tmden_1035 CheC, inhibitor of MCP methylation TTGAATTTACAATTTAATGAAGATCAACTTGACGCACTAAGAGAGTTTAT GAATGTCTCTATAGGTGCTGCTACAGCTAGTATGGCAAATCTGCTAAATG CTTTTGGAACAATGCATATTCCTAAAATTGAAGTTTGTAACAGTGATGAA CTTGCAGTTAAAATTCAAGAATCTATAGATATAAGGTCTATGTATTTTGT AACAAAGCAGCTCTTTACTGGCAAGTTTGGCGGAGAGTGTATGTTTGTTA 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AGATGCTAGCAAATATTGCTCATCAGTGGAGACAACCTCTAACAGAGCTT AGCTTAGCGATGTTTAACATTAAAAAAGCTATGCAAAATGAAAATGGCGC CGAGGCTTCAAAGTTTTATAATGAGAGCAAACATATTATAAAAAATATGT CTCAGACGATTGATGATTTTACAAACTTTTTCTCTCCAGATAAAGAGCTA CACTATTTTAATATCAAAGATAGTATTACAGAGGCAGTTTTACTTTTAGA AAATGTTCTAAGTGAGCAGATGATAAGTCTTAAAAAAGAGCTCATAGATA TAAAAATACTTGGTATAACAAATGAGTTGACACAGGTTATAGTTAATCTG ATAAACAACTCAAAAGATGCTTTTATACACAATGGTATTCTTCTTAGAGA GATTTCAATACGTATAAAGAAAAAAAGTGATTTTGCTCTTATTGAGTTTG AAGACAATGCAGGCGGAATAGCAAAAGAGAATATAGAAAAAATATTTGAG CCATACTTTACGACTAAGCATAAAAGCCGTGGAACGGGGCTGGGATTGTT TATGTCAAGGATGATTTGTGAGCAAGGACTTGGCGCCTCACTTGATGTAG TGAGCAAAAAACACACAACAATATTTAGTATAAAAATTCCATTGGATGAA GATGAAAAATAG >Tmden_1010 signal transduction histidine kinase ATGAGAACTGTTTTTTTTATTTTTCTTATTACTTTTCATCTCTTTGCTAC AACATCAATTGCCCAAAAATCAGCTCAATTAGGACTCACTCAAGAAGAAA AACAGTGGCTTATAGATAATCCTCGCATCCTTGTTGGAATGGATCCAAAT TATGCACCTTATGAGTGGATAGATAAAAATGGCAACCACATAGGTGTTGT TGTAGATTATATTCATGAACTTGAAAAGATACTAGATGTACGTTTTGAGA 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ATTTGGGGAGAGGTAGTTTCAAAAGCGGTCTATGATAAAAATAGAAATAT CATTGGTTACCACGGTATTAGCAGAGATACAACGATGCGAAAAGAGATGG AGAGAGAAAAAGAGTTATTGTACCAAGAGTTAGATCACAGAGTCAAAAAT AACCTTCAAGTAATCTCAAGCATAGTCTCTTTGCACTCTTGCCAAGAAGA TATATCAAAGTCACTAGAAGATATTCACAATACTATCAGTGCAATCTCTT TAGCTCACGATAAACTTCATCAAGATGAGTTGCACAAAACCTTAGAGATA AAACACTATGTTAGCGCTCTTTTAGATAATCTTTTGGCAAGTTCTGTTTT AAAGATACAAAAAGAGATAGATTCTACACAAATCTATCTAGGTGCGTCTC ACTCTATCACTCTTGGCATCATCATCAATGAATTTGTCAGCAACTCTATC AAATATGCTTTTCAAAGCATAAGTTCACCCAAAATTACACTTACAATCAC GCAAGACAAAGAGTTCATCAATGTTTTAATTTCAGATAACGGCATAGGCT TTAAAGGAAAGAAGCAAAGTTCTGGTATTGGGATGGATATTATTAAAACT CTTGCAAAAAGCAGATTCAAAACCGATGTGATATTTTTTGATAATAACGG AACATCATTAACGTTTAAAATTCCTTTATAA >Tmden_0544 putative signal transduction protein ATGACTGATGAGATACTAAAAAAAATAAAACAACTCCCGCCACTCCCAGA GTCTGCTATGCAGATAGAAGCTGTTTATCAGGATCCAGATAGTACTTTTA ATGATATGGTAAAAATTTTAGAAAAAGATCCCCTCTTAACAGCAGATATA TTAAAAGCCGCTAACTCACCTTTATATGGCTTTAGTCGTGAAATAAACAC TATAAATCAGGCAGTTGGTCTCTTTGGCATGGGCACCGTTAGAGGTTTTG CACTAGCTAGTATTGTCAAGAAGAGTTTTGTACTTGATTTATCTCCATAT AATATTGATGGTGACATGTTCTCTGCTCTATCTAAAAAGCAACATGCACT TGTTACTTCATGGTGCTTAAGAAAAGAGGCTAAACTTTTAGGTATTCTCT CTCCTGCTGCTTTTTTAGTTGAGATAGGAAAAGTTCTAATCGCACAGCAA ATCATATCTTCTAATAGTCAAGAAAAATTTAAAGAAGTACTAAATTCTCT TGGTGATGTTGAAGCAGCAGAGAGAGAAGTTACTGGTGTTGACACTCCAG AGGTAAGTGCTACTATCTTTGAGCATTGGAGATTTGAAACAGGATTGGTT GAGACGATACGAAACTGCCTAAATCCAGAAAATGCAAAAGATGATATTAA AAAAGCAGTACAAATTTTACAAGTTGCTCGCAGAGCAGTCCAGATTAATG GTTCTATCACAGAAGAGAGTATTGCTTCAGCTAAAGAGCTTATACTCAAA TATAATCTTGATATGGAAAGTTTTGAAAAAGCTTTAGAGAATATCTGA >Tmden_1034 response regulator receiver domain protein (CheY-like) TTGAAAATTTTGATTGTAGATGATTCGAAAATTGCTAGAATGGGTGTTAT AAAAAGTCTAAAAGTAGTGCAGCCCGATGCTGAACTTATTCAAGCAACAA ATGGACTAGAAGCTGTTGAATTTTATGAAAAAGAGAATCCTGATGTAGTT TTTTTAGACTTAACAATGCCCGTTATGGATGGGTATGAGGCACTAAAGAG GATACGAGAGATAGATAAAGAGGCTCAAGTCATAGTTGTAAGTGCAGATA TTCAAAGCGAAGCAAAGCTAAGAGTATTAGTAGCAGGAGCTAAAAATATG TATCCAAAACCGATAAATGTTGATATTATGGTACAGATTTTTGAGCAAGA TTTATTATTATAG >Tmden_1358 diguanylate cyclase/phosphodiesterase (GGDEF & EAL domains) ATGAATATACCAAATAGAACTAAGCGAAATACGCTTATGCTCGCACTCTT TATCTTACTATCATCATCATTGATTGCATATCTGTTTTTAAACTATCAAC TTAAAAAATCCATAAATAGTGAGTTCGAGAGAGTTGTAGAATCAACACAT AGACTCTTTGAAATCAATTTAAAAGATGAAAAAGAATATTTAGATATAAG CTTAGATGAGCTTCTCTTAAGTGATGGACTATCTAAGGCTGTAGCAAATG GTGACTATAAAGCGATAGACTCTATTGTCTCTCCATACTATAAAAAATTA AAGCAGAGCAAAAAAGCTGTAAACATTTTAACATTTCGCTCAGAGGATGG TATTACGCTTTATCGTGCTCACAAGCCTGAATTTTTTGGGGATAAGGTGA GCCAGCAGAGAAAACTCATAGCGGATACAAATTTTTTTAAACGTTCATTT GATGGTTTTGAAGTGGGTAAATTTGAGATGACATATCGTGTTACAAGACC AATATTTTATAATGAAAAATATGTCGGGAATTTAGAGCTTGGAATTTCAC CAGAGTATTTTTTACATGAATTAAATGCGGTTTTTAAGACGGAACTAGGC ATTGCTATTGATAAAAAATTGCTTGATATTTTCTCCAATAAAGAAGAAAA AGGGACAGTAGCGATAGATGATAGATATGTGTTAATTGATAATAAACAAA ATTTAAAAAAATATTTTATGGATGAGAATAGAAGTGAGAGTTTGTATAAA GTAAGCATGAATATATCACTAAAAAATCATCTCTCAGAGAGTCTTGGACA TTTGATTGTTGGTTTTGATATTAGAGATATAGCGGAGAAAAATACAAATT TTATATACATGCTATTTTTTATGATAGCTTTGATGATGTTTATTCTAGTA 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ACATGTTGTAAAAAAATTAAGAGATATAGGAATTTTGATTGCGATTGATG ACTTTGGAAGCGGTTATGCAAACTATGCACATATCTTGCAGATAAAACCA GATTATCTAAAGATAGACGGCTCACTTATAAAAGATATACTAGAGGATAA TGAGTCAAGGATTTTGGTTCAAAGCATCGTTAGATTTGCAAAAGAGTTAG GAATAACAACAGTTGCAGAGTATGTTGAAACCAAGGAGATATTTGAGCTT CTAAAGAGTTACGGTGTGGACGAATTTCAAGGCTACTATTTTGGTCGTCC AACCGATTTGATAGGTGTTTAG >Tmden_2087 putative PAS/PAC sensor protein ATGCAAAATAGCGATTTAATAAGATTGAATGACATCTGTTTTTGGAACAA AGAAACAGACTCTTTACATGTAGATGATAAAGATATAAAATTGTCAATTT CTCAAAAAAGAGCGCTTAAGCTTTTAATAGAAAATTTAGGTAAGCCTGTA CTAAATGCTGATATATTTTATGAAGTACACGACTCGCTTGATAAAGAGTT TAATGAAAAGAGTGTGAGAAATCTCATAAGCGGACTTAGAAAACTAGTAC TTGAATTAAATATCGTAAATATTTACGGTGGGTATTATATGCTTAAAAAC GAAAATATCAGTAAAGATATTAAATTTAAAGAGCAGCTTTTTGATATAGT AGAACAGTCTGTGAATCCTATAGTTGTTACTGACCCAAATGAACAAGATA ATCCTATTATATATGTAAATAATTCATTTTGTGAGCTTTTTAGATATAAA TATGAAGAGGTAATCGGTAAAAACTGTCGTTTTTTACATAGTAGCGATAA AGAGCAGAAGTCTCTTGAGAATATTAGAGAAGCAATTAGCACACAAAAAT CAGTAGAAGTAAAAATTCGTGACTATACAAAAGATGGCAACAAGCTTTAT GAAGATATTACTATAAGTCCTGTTTTTGATAAAGAAAAAGAGAAGCTTGT CTATTTTTTAGGTATATATAAAGACCTTACATCAATTGAGCAGTTTTTAG AAAAGGTAAAAGAGGTTCTTTAA >Tmden_0317 two component transcriptional regulator, winged helix family ATGCGAATATTAGTTGTTGAAGATGATGAAAAAATTGCATCTTTCATAAA AAAAGGTCTGCAAGAGGAGTCATACAGCGTTGATGTCACATCTAATGGAT ATGAAGCTATCTATCTTGTAGAGACTAACTCTTATGATATTGTTTTGCTT GATTTGATGATTCATGGACTTGGTGGGATAGATGTCTGTAAAAACATAAG AGGCAAAAACATTGCAACTCCAATCATTATGCTAACAGCTAGAGATGCGA TTAAAGATAAAGTTGAGGGTCTTGATTGTGGCGCAAATGACTACTTAACA AAACCTTTTTCATTTGAGGAACTTTTAGCTCGTATCCGTTCCAAACTAAG AACTACCTCAACTCTCTCAAGCACGATAGCTATAGCTGATTTAACTATAA ATACAGCTCGTCGTGAAGTAAAGCGTGGAGATAAAAAGATTAACCTAACC GCAAAAGAGTATGCCCTGCTTGAATACCTAGCAAGAAATTCCAAGAAGCT CTTAAGTGAGACAATTATAAAAGAGAATCTAAGTGATATGGCAGAGGTCA GTATGAGTAATATCGTAAATGTTTATATCTACCGTTTGCGCAATAAAATA GATAAAGATTATGAGCCAAAACTTATACATACAGTAAGAGGATTAGGCTA CATGTTAAGCGAGAAAGATGTTTAA >Tmden_1962 diguanylate cyclase (GGDEF domain) ATGATATATGATTTTTCTGCACTATTCAAAGATGATACAGAAGCAATTTT GGATGAATTTTTAGATAAATGTACTACATGTATAGAGGTAGATAGTGAGC ATAGCGTCTCTATGTCTGTATTTTCAAACCACTATAGAGCTATTTTAAAT ACCTTTGAGAGCAATTTTGAAGAGGAGTATATTTTGGATCTTTTTGAAAA AGTTGCCAAATATGAGAGCTCTTTTAAAACACCCTATATTGTCATCATGA ACGAGCTCTTTTCCCTCAAACATATCTTGTTGGCTAAAATTGCGCAGGGT GGAGAGCATCTCTATATCTCCCAAATGTTAATGTTATTTAAAAATATAAG CAACAGAGTGGCGAAAGTATATTTAGACGAATATATAGATTTAGTTCTCT CACTAAATAACCTAAGAAGGATTTCCATATCTGATTTGGTAGAGAAAAAA ACGATTAGATTTTATGAGGACCATCTTGCTTGGCTTACAAAGTTGGCGCA ATCCATAAAAGAGAAAAATCTAGATATCTTTCCAGAGCTTGAAGCAACAG ATTGTAGTTTTGGAAAATGGCTTCATAATGATGGAAAAAACACAATTCAT AACAACTCAAAATATAGTGCCATCAATACCCTGCATAACAACCTTCATCG CTTTGCACAAAAAATTTTTATGCGTATGCATACCCAAGAGCATGACATTC TAATTACATACCTTGAGAAGTGTGAACTCATATCGCTGAGCATCGGCACT GAACTTGCCATGATAGACAACGTCCTTATGAATCAACAAATCACAAAAGA TTCACTCACAAGCGCACTAAATAGAAACAGCTTGAAAAATATCTTTGAGA GTCAGTATGAACTCTCATTTGCAACGGGCAACCATTTTATTTTGGCTATG TGTGACTTAGATTTTTTCAAAAATATCAACGACACATACGGACATGTTGC AGGAGATAAAATTCTAATAAATTTTGTAAAAATAGTAAAGAAAAACATCA GAAATTCCGACATTATCATAAGATATGGCGGTGAAGAGTTCATAATAATT CTCCCAGCTGTTGACAAAGAAAAAGGGTGCCAAGTTTTAGAAAAAATTCG TAAAGATTTTCAAGAAAGCAAGTTGCATTTTGAAGGTAAAGAGATTCAAG CAACTCTTAGCGTAGGCACAATGGAAATAAAACCAGAGTATCACTACAAA AAGAGTTTTCTTGATGAGTACATTATGCAAGTTGACCAGAAACTATATCT TGCAAAGCGAAACGGAAGAAACAGAGTAGAATCATGTTAG >Tmden_1990 histidine kinase ATGAGTAAGCTTTTAGACACATCCGAGGCTATACTAATTGCACCAAATAT CTATTGGGTTGGAATGCACTTAAAAAATGACCCTTTTCAATGCCACCCTT ATCTAATCAAAAATGGAGATGAATCTATCTTAATAGATCCAGGCTCCATG ATTGAATTTGATGAAACTGTTAGAAAAGTAAAAACTCTAATGGATATGAA AGATATAAAATATATTATCCTTCATCATCAAGACCCCGATTTAGCAGCTG CTGTTCCTGAGATAGAAAAACTTATAAACAGAGATGACCTGCTAATAGTA ACCCACTCAAGAATGTCTCTTTTAGTCAAACACTACCTTATAAAATCCAA CTATTATGAGATAGATAAGATGGATCATAAACTAGTAACATCGAGTGGTT TTAGACTTGATTTTCTTACCACTCCATACTGCCACTCTCCTGGAGCATTT GTAAGTTATGAGCCAACCTCAAAAACTCTATTCTCAGGAGATATTTTTGG AGGAATTGAAGAGTCTTGGGATTTTTATGCAGATGAAACATACTTTTTAA AAGCTAAACTTTTTCATCAAGAGTATATGCCCAGCAAAGATATTTTCAAC TATGCACTCGCTAAGATAGAAAAACTCGACATTGAGCTTATCGCCCCGCA ACACGGCTCTATAATAGAGAAAAAGTACATAAATAAGCTGATTCAAGATA TGAGGGAGCTTGATTGTGGATTGTATATTGAAGAGAAATATAATCGTGAA TTAATAGATACAATAAAAGAGCTTCAACAAAAAGAGATAGCGCTAAAAGA GCGCGATTTACTAATTTTTGAGCAATCAAAAAGAGCAGAAATAGGCGAGA TGATTGGTAACATTGCACATCAGTGGCGCCAACCATTAGCAATAGTAAAT ACTTCAATAGCAATACTCCAAGAAAAAAACAGAGCCTCCTCTCTTAGCAA AGAAGAGCTCTTTGAAAAACTAGAAAAAATTGAAAAACGCATTATATACA TGTCAGAAACAATAGAAGATTTTATGAGTTACTATAGTCCAGACAAAGAG AAATCTTGGTTTAAAATTTGTGATGCAATAGAGAGAAGTCTTGATATAAC AAATTTACAAAAATCAAACACTCATGTTAAAGTAAATCTGCTTATTACAA ATGAATATAAAATTTTTGGATTAATAAATGAGCTTGTACAGGTATTAGTC TCCATAATCTCTAACATAAATGACATAATTAAAATAAAAAATTTAACAGA TGTGAAAATTACTATTTCTATATATAAAGATGATAATTATATAGTCATCT CAATCGCTGATAATTGCGGTGGCATAGAAGATATTAACCTAAAGAAAATA TTTGACCCTTACTTTACTACAAAACACAAATCAATAGGGACTGGTCTTGG ACTGCATATAGCAAAAATGATTGTTGAAGATAATATGCAAGGTTATTTAA GTGCAAAAAATCTATATAATGAAAAAAATGAAAAAATTGGTGCAGAATTT ACTATAAAGGTAAAAAATGAAGATTGA >Tmden_0078 diguanylate cyclase/phosphodiesterase (GGDEF & EAL domains) ATGCTAAATAATATTAGTTTTTATAATTTTATGCATAAACAAATTTTAGT ATTAATCGCCCTGTTTGTCTCTACTGCAACCTCATATGTTTTTATTGGAA TTGCTTACTCCTCTTATATTATAGAGCCATTATGGTATATGTTTGTTCTT ACTCTGTCATATTTTGGATATAAGCTCTATGTAGAGTACTCAGACTCTAA TTTAACGATTCAAGAGAAAGAGATATGGCTTAAAAAACTGCGTTATTTTA TATTTTCTTACTTCTCATCATGGACAATTATGTTTGTTGTTTATGCTATG CGTGATAATATAGAACTTCACTATTTGGCTATTTTTACTCAACTTGGTGT CTCTGTTGTTGCTACTACCCTTCTCGTTTCAGAAAAAAAGTTAGCAACTT TTATACTAGCTTCTTCAATGCTTCCAATAACAATATATCTTTTGTTAATT GGAGAATTTTACTCATATATAATAGCAATATTAACTATTGTGCTTGCATG GGTTCTTTACTACGGTTTAAGAAATACTTATGGGTACCTTCAAAAAAATC AGTATCAAGCTAATCATGATTATCTGACAAATCTTGGAAATAGACGCTAT TTTGTTGAGCTTCTTAAAGATGCAATAAAGAAGCAAAAGAGCAATAATAA GTACATGTTTCTTTTTTTAATAGATTTAGACCATTTCAAAACAATAAATG ACACATTAGGACATGATATAGGAGATAAATTACTAAGTGAAGTTGCTAAA AGAATGGGCTTGCTTGCAAAATTAAATCGTAGCACTATATCAAGAATCGG TGGGGATGAATTTTGTTTACTTAGTGATACATACGAAGATAAAGTCACTT GCCTAAAACGTGCGCAAAGTTTTGCGCAAGAGCTTTTAGAAACAATTAAA CATACATATATAGTAGATGAGCACAATTTATACATTAGCTCAAGTATAGG 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EAL domains) with PAS/PAC sensor(s) TTGATAAATAATCACAATGATGATTCGTTTGCGTTTTATGGTATTAACAG CGATTCTATAGTTGATCAGAGTAATATAGACATAGAAACGATTAAAAGCC TCATAAGAAACCTAAATGAAGCTCAAGAAATCGCACAGATAGGTCATTGG AAGCTTAATATAAACACAAATGAACTTTTTTGGTCAGATGAAACTTATAG AATATTTGGACTCAAACCAAAAGAGGTAAAACCATCTTATGAAAACTTTT TTACATTTGTACATGAAGATGACCGCTCCCTTGTAAATGATGCTTACATT AAATCATTGGAAGACAAAAGCCCATACAGTATCATACATCGCATAATTAC AAAAGATAAAAAACTAAAATATGTTGAAGAGAGATGCGTTCATAAACTTG ATGAGAGTGGTAATGTAGTAAAATCCATTGGAACTGTTCATGATATAACA GAGAGAGTTGAGCATGAAAAGGAGCTAGAGATTGCGTCAAATGTTTTTAA ATACTCATCTGATGGCATAGTTATTACAGATAAAAACAATAACATTGTCT CTGTAAACAAATCTTTTGAAAAACTAACAGGATACTCTAAAGAAGAGATT ATAGGAAAAAATCCAAAACTTCTAAGCTCTGGCTGGGGAGATGAAGAGTT TTATAAAAACATGTGGTCTAGTCTGCTCAGTAATGATTTATGGCGTGATG AACTTTGGGATAGAAAAAAAGATGGCTCACTCTACGCTATAGAGCAGACT ATTATATGCGTAAGAGACAAAAATCAAGATATTGTAAACTACATTGGAAT GTCTCGCGACATAACTGAGGCTAAAAACAAAGAAGAGAAGATTCATCAGC TTGCATTTTATGATTTTCTAACAAAACTTCCAAATGCAAAGCTTTTTCAA CAGGAGGTAGAAGCTTACATCAAATCTACTCACTACAACAATGAAACTTT TGCTATTTTATTTTTAGATTTAGATAATTTCAAATGGGTAAACGACTCAC TTGGTCATCAGATAGGAGACCTTTTGCTTATAGAGATAGCTGCAAAGCTA AAAGAGATTATTTCACAAGATAGTATAATCTCAAGGCTTGGTGGAGATGA ATTTGTAATTCTAGCTCCATATGAAAATTTACTTACTATCTCCCAATTGG CAAACACTATCTTATGCAGTGTAAAAGATCCTATAAAAGTTCAAAATAGA GAAGTAAATGTAAGTTGGAGCATTGGGATAAGTCTCTACCCTCAAAATGG CGAAAACTATAATGATTTGCTAAAAAATGCAGATGCAGCAATGTATGAAT CAAAAAACAGAGGGAAAAATACATTTAGATATTTTAACGATATGATGAAT CAAGATGCCATGTATCGTTTGGAGTTAGATACAAAATTAAGATATGCAAT AACAAACAACAGCTTTTTTTTAAATTACCAACCAAAATACTCATTTGAGC ATGGTAAAACTATAGGTGTTGAAGCTCTAATTAGATGGATAGACAAAGAT TTGGGATTCATTGCACCCGATAAATTTATACCAATAGCAGAAGAGTCTAG CTATATAAATGAGATAGGAAGTTGGGTTATGAAACAAGCCCTTAATGATT TAAAAATCATCAACTCAAAACTCTCATCTCCAATTAGTATCTCTATCAAT GTCTCTGGAAAACAGTTAGAGCATGAATCTTTTTATGATGAAGCAAGAAC ACTTTTAAAAGAGAGTGGTATTGAGCCATCTTTGGTGGAATTTGAGATAA CAGAAACCTCTATTATGCAAAATATTGATCATGTCGTGGATATTTTAAAG AAGATAAAAATGTTAGGCGTAAAAATATCTATAGATGACTTTGGAACAGG ATACTCTTCAATGTCATACTTAAAAAAACTCCCTATTGACACATTAAAGA TAGATAGAGAGTTTATAAAGGAGCTAGAGATTGATGAAGATTCAAAAAGT ATCGTTAACGCAATTATCGCACTCGCCAAATCTTTTAAACTAACTACAGT AGCTGAGGGCGTTGAAAATGAGGAGCAAAAGCTTATACTAGATGGACTAA ATTGCGATATGACACAGGGCTATCTATATAGCAGACCTCTATCGCTAGAT GATTTGTTAGCATTTTTGTCTTAG >Tmden_0587 conserved hypothetical protein ATGAAATTTGAAGTAATACAAAATGAATATAGTGCACTTTTAAAAGAGAT ACAAAGCTACTTTAAAAATTCACAAAACTCAATTCACAAAGCGAGAAATG AGATAAAAATCATAGATTTTAAACAAAAAAGCTTAGTTATAAAATCTTTT AAAGTTCCACATCTAATAAATAGAGTTGTTTATACATTTTTTAGAGACTC TAAAGCCAAAAAATCTTACGAAAACAGCGTAAAAATAGCTCAGTTTGTAC CAAAACCAATAGGCTTTGTAGAGCTTAAAAAGTCTGGTTTGCTACATGAG AGTTACTTTGTAAGTGAAAATTTTGAATATGACTTTACGATAAGAGAACC TCTTTTGGAGAGTGTTTTTTTAGATAGAGAGAAGATATTTAAAGCGTTTG CAGAGTTCACATTTAAGTTACATGTAGAGGGTATTTTTCATCTTGATTAC TCGCCGGGAAATATATTAATAAAAAAAGAGAGTGATGGATATATTTTTAA AATAGTTGATATCAACAGAATGGAGTTTAAACCTCTAAACTTAGATAAAC GCCTTAAAAACTTCTCAAAACTCTGGGCGAAAGATGAAGATTTAAAAATC ATCATAAAAGAGTACGCTAGACTTTATAAAAGTGATGAAGAGCGCTCAAT 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GCTACTAGACTCTTTAAATCGCAACAGCACTCTAAAACAAGAGCTTATTG ACACGCTTACAACCAATGAGACATTTTTTTACAGAGAGTTTAAACAGGTT CAAGAGTTAGTAGAGCTTGTTAAAAAATGCTCTCATAAAGTAGAAATTTT GTGCGCACCCTCGGCTACTGGAGAGGAGCCATACAGTATAGCTATCGCTC TCTTAGAGGCTGGCGTTGCTTCTGAGAGCTTTAACATACTTGGTATAGAT ATCAATCAAGAGGCAATACAAAGAGCAAAAAATGGAGTTTACAAAGAGAG AAACATACGAAATCTCTCTAGCGAGCAGCTCCGTAAATATTTTAAGCAAG AGGGTGGCTTATATCGTTTAAATGATAGCGTTAAGTCAAGAGTCACCTTT AGAGTGATAAATATTTTTGACCACTCTTTTAAAAACATAGGAAATTTCGA TTTTATTTTTTGTAGAAACATGCTTATATATTTTGACAAAGAGACAAAAA TAAAAGCAAAAGAGATTTTACAAAATCTTAGAAAAAATAAAAATCAAGAG ATATTTTTTGGGCACGCAGATCTGTTTTAA >Tmden_0314 protein tyrosine phosphatase TTGAATAAAAAAATATTAGTCTTATGTACAGGAAATAGTTGTCGCTCTAT CATTGCCGAAGCTCTCATAAATGCACATGTAAAAGGTGTTAGAGCTTATA GTGCAGGAGTTCGTGCTAGTGGTGTCGTAAATCCAAACGCAAAAGCAGTT TTGCAAAAAGCTCAAATATGGAGAGACGAGTACCACTCTAAAACTATAGA AGAGATTGAAGATATAGATTTTGACTTAGTTATAACTGTATGTGATAACG CAAAAGAGTCATGTCCAATATTTAAAAAAAAGAGTAAAGTAATACATGTA GGTTTTGTTGACCCTGATGGCAAAGAGATTGCAGAATTTTTTAAAATATT TGATGAGATAAAGAGCAAACTCCTTCCAATTATAGAAAAAGAGCTCTAA >Tmden_0531 two component transcriptional regulator, winged helix family ATGAAAAACTACCTTATCCAAATCATAGAAGATGATTCATCTGTAAAAAA ACTTTTAGAAATTACATTTAGAGAGCATAATCTAAACTATATCTCTTGTG ATAACAAAAAAAATGCCATGATGCTTTTTTTAACACACTCTTCCGACCTG CTTCTGGTAGATTTGGGCTTACCTGATGGTGATGGAAAAGAGTTTATAAG AGAAATAAGAGAGATTTCAAAAGTTACAATAGTTGTTCTTAGTGCAAGAG ATGATGAAAAAGAGATTGTTGCGGCTCTTGATGCAGGAGCGGATGACTAC ATAACAAAACCTTTCTCGGTAAATGAGCTCTTAGCCAGAATCAGAGCAAA TCTTAGACGCAGTATTAGTGGAGAAAATATCTCTAGCAAAATCACTTGTG CCGAGCTAGAGATGGATATAGCCTCAAGAGATATATTTTTTAAAAACGAA CAACTTAAACTCACACCAATTGAGTTTGAACTTCTTAAGTATTTTTTACT AAATGCAAACAAAACACTTACCCACAAACAGATACTCAAAGAGGTTTGGG GAGTTGGATATCAAAGTGAGATGCAGTATCTTAGAACGTATGTAAACACA CTTAGAAAAAAGATAGAACAAAACAGCACAAGACCAACGTATATAAAAAC AGAGTCTGGTATCGGTTATAGATTTTGTTGCAATAACTAA >Tmden_1312 putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family ATGAGAATACATCTAAAAAATACACTCCTTTTTCAAAATGTAGATGAAGA TACTATAAAAAAAATAGAGAGTTTTACTACTGACCATAAAGTAAGTAAAG 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ATCTTCAGTCACCTTCCTCTTCGGTACTTATTTTGGATGAAGAGCTAAAA CCATATAAATACTGGAATGTTGCCTACTCATATCTGGTTATAATCTTTAT TATTTCTGTCTCATTTGTGCTGATTTTAAGAAAACTTCGACCTCTTATTA GGCTTAGAAAAAAGATTGCACTTTATGGTGATGGAGATATGAATGTCTCT TTTAAGGCAAATGGACACGATGAAATAGCACTTGTCTCAAATGAACTAGA AGCAACAAGAGAGAAGATAAATCTTATACTAGAGTCAAGGACTCTGTTTT TAAGAAATATTATGCATGAGCTAAAAACACCAATCGCAAAAGGTACTATT GCAACTCAGATGTTAGAGTCACAAAAACAAAAAGATAGATTTAGCTCCAT ATTTGGTCGTCTTGAGTCACTTGTAAATGAGTTTGCTCTCATTGAAGAGG TTACATGTATGGGAGATAAAACAGATTTTAAAGAGTATCGGCTTGTTGAT ATAATAGATGGCGCAATAGATATGGCGATGATAGAGCGAAGTAGTATAAC TGTTGAGGTTGATGCGGTACATAAGATAAATGCAAATTTTAGGCTCTATA CAACAGCTATAAAAAATATGATAGATAATGGCATAAAGTACTCTATTGAT TCACATGTAAAGATTCTTATAAAAGGGCATGAGTTAGCCTTTGAGAGCAG GGGTGAATGTATAGCTCATCCTCTTCAGTATTATATAGAGCCTTTTACAA AAGACAACCCTTCTAAAAATAGTTTTGGACTTGGATTATATCTTGTTGAC TCTATCTTAAAAGCCCACAATCAGGTTCTAGCACATGAGTATGAAAATGG GATTAACCGTTTTATTTTTGCGTAA >Tmden_0008 histidine kinase ATGAAATTATTATTTATTTTACTGTTTTTACTTACAAATATCTTTGCTGC 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ATGCAAAAAAACATATCTCTAAAGTCACTTATCTACAAAAGCTACCTATC TAGTGCACTTGTTCCTGTATTTGCTATAGAGCTTGTGCTTCTTCTTTTAT ACTTTGGAGTAACTTTTTTTATATCTCAAAAATCGCAAGATATACTTCTT GATGAAGCAAAGTTAGCGCTTAACGAAATAGCCAGCAGAGAGGCTGGACA TATAGATATGCTCTTTAGTGAAGTTAAAAGAGATATGGCTATATTAAAGC GAGACCATGAAAGATTTTTTACTTTAAATGAGTGTAGTTCCCAAAAAGTT AAAGCAGAGTTTGGCAGACATAAAAATGGCGCATTATATAAACTAGTAGA TAATGGCGGTTCATCCATATATGCGCCTAAAGATTTTGATGCAACACCAA AAAATCTAAAAAAGATAGAGTGCAGTGAATTTATAGACCCATTAATGAAA TCTATAGTAGATACAAACCCAATTATTACACAAGCATATATAAATACCTA TGATAAGATAAACAGACTCTATCCATTTATGAGTGATGCTGCTACTCAAT ATGGCGCAGAGCTTGATGCTACAAGTTATAACTTTTATTATCTAGCAGAT GCAAACTACAATCCAAAAAGAAAAGATGTTTGGACAAGTGCATATCTTGA TCCAGCAGGGCAAGGGTGGATGATATCAATTATTGCACCAATATACAATG GTAATTTTTTAGAGGGAGTCAGTGGGCTCGATGTTACGATAGATTCACTT ATAAAAAATGTTCTCTCACTTGATATACCATGGAGTGGTAGTGCGTTTTT GATAGATAAGGATGGAACAATCATAGCTATGCCAAAGCGTATTGAGGAGC TGTTTTCCATAAAAGAGCTAAAGGGGCATACATACACAAGCACTATATCT ACAACCATAGAAAAACCAAAAGAGTTCAATCTGCTTAAGAACTCTAAAGA AATGGAGAGTTTTTTTAAAAAAGCAACTCCCATAGATAAATTTACTATAA AAGGTGCTAACTACATCATCTCTCAAAAAATTATACCTCAGACAAATTGG CGTTTGATGGTAGTTGTAGATGAATTTATCATATATAGACCCATTATGGA GTTTAAATCTCAAGCACAGATTATAGGTTATGTAGTTATTGCACTTATGA TATTTTTTTATCTCATTTTTTTTATATATCTTATGAGAAAATCTAACGCT ATTTCAGAATATATAGCAAAGCCAATAAATGAGCTCTCAACTCTAACAAG CAATCTTGGCACTAAGCCAAATACTCAGCTAAGAGAGACAGGTAATATAG AAGAAATTTATAAACTAGTGCAAAACTTCAATACGCTTAGCAATGAGTTG GATGATAGAACAAATGCTTACATAGAGTCTCAGATGCGTGAGAAAATGAA AGAAAAAGAGGCTCTCTCAGCTTATAGAGAGGGGCTTTTAGAGAGTGCTG GAGGATATTTGCATAATGTTGGAAACTCTTTGGCAATTCTTGATTCAAAG CTTTTTGTACTAAAGAGCAGTGCATCATCTCTGCAAAAGAGTGAGCTTGG ATTTAACAAAGTCATAGAGATGGTGCAAAATTCTCATGCAAAGGGTGAGG AGAAAGTTTCTATGGAGGTTTTTTTGGAGGCTTTTAAAGAAGCTCTTAGT GATGATATAACATCTGAGATACTTGATGTAGTTGATGGCATAGAGAGAGT TAAAAACCATGCTTCAGAGATGATAAAAGATCAGCAAGACAGACTTGCAA ACAGAGATGGGAGTGAGAATTACGTATATAGTTTTTCACTAAATAAAATG CTTAGCGAACTTATAGAGGATTACTCTTTGGAGTTTTTTAGATTTAACAT ATCTATAAAAGTTCACGAAAATGATGAAGTGGTAGTGCAAATAATGAAAT ATAGGCTTCAAAGCGGAGTAGCAAATGTTATTAAAAATGCTATAGAGTCT ATATCATTATCTAAAAACAGTGGCAATGGCATTATAGATATAACTATAAA AAGAGAGAAAAATATGGTGCTTTTGATAGTTCAAGATAATGGCTGTGGAG TTGCAAGAGATGATATAGATAAGATATTTGGCTTTGGATATACGACTAAA AAAGGGGGTAGCGGTTTTGGGCTACATACGCTAAATAATTTTTTAAACAG TATAGGCGGAACGATAAATATAACAAATAATGAAAGTGAAAATGGAGCAA CTTTAATGATGGAGATACCGATAAATGAGTAG >Tmden_0208 response regulator receiver domain protein (CheY-like) ATGTCTAGTGATGTTGATACTTCCTTATTAGACTGCCTTAGCTCTTTAAC ACTTCTTTGTGTTGAAGACAACAAAACTACTCAGCTAATATATCACTCCA TTTTTAAAAATATTACAAAGCGTGTCATTTTTGCAGATAATGGCAAAGAT GGATTTGAAATATTTAAAACGCAAAAGATTGACATAATCATTACAGATTA TGAGATGCCAAATTTAAATGGCATAGAGATGACAAAACTCATAAGAGAGC TAGACAAAGATATCCCAATAATTCTTGTATCTGCGGTGCAAGAGATTGAT ATTATCGTAGAAGCTCTTAAATTAAATGTAAATAATTTTTTAAAAAAACC AATTATTCTTACAGAAGTTATTCAAGCTGTTGAAAAAGTCTCTAAAATAC TTATAGCCGATAACTATCTACGTGAGAAAAGAGAAAAAAAATTAAAAGAG CTTGAGACAAAAGGTAAATATAACTCTCTGCAAGAAGAGTTGGCATTTGC CAAAGAACTAAATATTATCAGAAATGATTTTTACTACCAGATGCATGAAA 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ATGAAAAAATCCTTAGCTCAGCTCTTTGTTGCTCTGCTTATAGCTTTTAT GAGTACTTTGGCTTACATGTACACATCTGAATTTTATCTTCCTTTTGAAA ATAAGATAAAAGATTTGATGTTTAAAGCCAGAGGCGAGATTGTAGGCGAT AAAGAGATAATCATAATTGATATAGATGAGAAAAGCCTAAAAGAGCTAGG GCAGTGGCCATGGAGCAGGGATGTTGTCTCTAAACTTTTGCAAAATTTAG CAGAGTATGAGGTTGGTATAGTTGGGCTTGATATAGTTTTTGCAGAGCCT GATAACAGCTCACCAAAAAAGGTTTTTCAAAAACTAGGACTCTCGACTCA AGGGGTTGTGGATTATGATGCTCTTTTAGCTGAGACTATAGCGCAGACAC CTACTATAGTTGGTTATGTTTTTGCTCTCTCAAACGATGGAATCGCTCCA GAGTCATCCCCAAAATCAAACGCTATCATAGTTGAGCAAAATCGTCCAAA GAGCTCATCTCTAGTAAAGCCTTATCGCACTATTTTAAACATTGAAGCGA TTCAAGAGAGCGCTTATTCAAGTGGCTATTTTAATACTATTCCAGACAAT GATGGCGTTGTCCGCTCTATACCGCTTGTTATGGAATATGATGGAATACT CTATCCATCTCTTAGTTTAGAGATGGTGCGTATTATGCTAGATGAGAAAA AAATCACAATCGTATATGATGATAATGGAGCCTCACATGTAGAGCTTGGT GAGACTATGATACCTACAGATTTTTTTGCTCGCATGCAGATTAACTACAG AGGTAAACAAAATAGTTATCGCTATATCTCTGCTGTTGATGTTTATAATA AAACTGAAGATGCTTCTCATATAGCGGGGAAAATTGCACTTCTTGGAACT TCTGCTGCGGGGCTTATGGATTTGAGAAGTACACCATTTGATAGTGTATT 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AATCCATAGAATATATCCGCTCTCAAGAAGAGATAAAAATTAATAATACA ATCATCAATGATGCACTCTATCGTGTGCCAAAACAGGTTTCACTCTCTAT TGCTCAAAAGCAGTATCTAAGTGAGAAAAAAGAGATTACCATGTGTGTTG ATCCTGAGTGGGAACCGTTTGAGAGCATAGATGAAAAAGGGGTTCATCAG GGAATTGCAGCTGATTTGATTCGTCTTGTTTCTGAGCGAACAGGAGTTGC TATAAAACTGATTAAGACTGCGACATGGGAAGAGTCTTTAGAATTATCTA AAACAAATAAGTGTGATATTTTGAGCTTTCTCAATCAAACACCACAAAGA GAACAGTGGCTTATTTTTAGTGACACGCTTTTATCCGACCCCAATGTTAT TATTACGCGAGAGGATCACCCTTATGTTGTAAATTTAAGTGAAGTTCATA ACGAAACAGTTGCTTTGCCTCAGGGAACTATGTTAGAGGAGCGTCTTAGA AAAGATTTTCCATCCCTAAAGATAATTTCAGCAAAAACTGAAGAAGAGTC TATGTCGATGGTTTCACAAAAAAAAGCAGATATGACTATCCGTTCTTTGA TTGTCTCTGCAAATGCCATTAGAAAAGAGGGTCTTTTTAATCTCAAAATA GCAGGTCAACCAAACAACTACGAAAATATATTTTCTATAGGTGTGCTTAA GAGCGAACCTATATTAATCTCTATTCTCAACAAGGGAATACACAGTATAA CAGACGAAGAAAAAGAACAAATCGTTAACAAACACACAGCTATAGTACTC CAAAAAGAATCTGATGAAAAAGTACTCAAGGCAGCATTTTATGGAACAAT CTTTCTCCTTATGGTTTTAGCTCTTATCTCTCTATGGAACACTCTTTTGA GAAAAAAAGTAAAACAAGAGGTTACGAAAAATATTGAGATTAAGGAGCAG 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two component transcriptional regulator, winged helix family ATGAAAATTTTATATCTTGAAGATGACATAACTCTCTGTGATACTATTGC GGAATATCTCATTGAAGAGGGGTTTGATGTTAAAGCAGTTTATGATGGAG AAGAAGCTTTAGAGCAAGTTTACAAAGAGAGTTTTGATCTGTTTTTATTT GATGTAAATGTTCCAAAAATCAATGGATTTAAGCTATTACATGAGTTAAG AGGAGCAAATATTTTAACTCCTACCATCTTTACAACTTCACTTCAAGGTA TAAATGATTTATCTATGGGTTATGAGAGTGGCGCTGATGACTATATCAAA AAGCCCTTTGCCTTAAAAGAGCTACTCTTTCGCATAAAAGCACTTCTAAA ACGAGAGTTTAAATCACAAAATTTTATTATTAAAATAGAAGATGGAGTAA AGTTTAACACCTTTACAAATGAGCTATATATTAGGGAGCGAAAAACAGCA CTAAACCCAAAAGAGACTCTTTTGCTAAAACTTCTTCTAAAACATCAAAA TGAGTGCGTCTTGCTAGAGGATATCTACTCCGAGCTCTGGACACATGATG AGCCATATAGCGATATGAGTTTAAGAACGTATATAAAAAATCTACGTAAA CTTATAGGAAAAGAGATGATAATAAGCATAAAAAAAGTTGGATATAAACT TGTACAGTAG >Tmden_0006 GTP-binding protein TypA GTGCAAAAAATCAGAAATATAGCAGTTATCGCTCACGTTGACCATGGTAA AACTACACTTGTAGATGGATTACTAGAGCAATCAGGAACATACGGTGCAC ATGAACAACATGATGAAAGAGCAATGGATTCTAATGCACTAGAAAAAGAG CGTGGTATCACAATTCTCTCAAAAAATACAGCAATTCGTTATAAAGATTA 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two component transcriptional regulator, winged helix family ATGCAAGCCATACATAAAAAACTACACTCCCTTACTCTTTTGATTGCAGA AGATGATGAGAGCACTCTAAAGTGGCTTAGTCGTGTTTTGTCCATCTATT TCAAAGAGGTTAGAGTTGCAAAAGATGCCATGGAGGCTTTAGAGCTTTTT GAACAAACTCCATCTGATGTTATCATCTCAGATATCCAGATGCCACAAGT CGATGGTTTGCATCTTCTGCAAAAGATATCACTACTCTCTCCAAGTACCA CGAGAGTTGTCATGACAGCTTACAATACCCCAGAGTACATTAACAGAGCG GTAGAGTCAAATGTTGATTTTTATCTTAAGAAGCCAATAGATATAGATGA ATTTTTAGTCGCAATAGCTTCAAGTAGAGCTAAAGTAGATGAGCAGGTGT TTTTTTTAAATGAGGGCTACATGTATGACTACAAACAGAAGTTAGTAAAA AAAGATGAGCAGAGTATAAAACTAACAAAAAAAGAGGTTTTGCTTCTTGA ACTTTTGTTAAAAAACAGAAAATCTATAGTTAGTATAGAGCAGATTGAAC ATAGCGTTTGGGAGGAGAGTGTTAGTGATGATGCTATTAGAATGGTGGTA GTAGGTATCCGAAAAAAACTCTATCAAGGTGTTATAGAAAATGTTAAAGG GCTTGGATATAGAGTAGAGTAG >Tmden_0749 two component transcriptional regulator, winged helix family ATGGAGGGTATTGTTTTGGTAGAATTTAAAAATTTTTGTGTTTTATATGC AGAAGACGACTTAGAAGTTCAAGCAAATATCTCAAAGATTTTATCTTTGC TTTTTTTAAAAGTACATGTAGCATCAGATGGAGAAGAGGCACTTGAGCTT 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receiver domain protein (CheY-like) ATGGATAAGGAACAAGTAAAAAAGCTTCGTGCAATCTGTAGAGATATTTC AGTGCTTTATGTAGAGGATGATATAAGTATATCAGCTCAGCTAGAAAAAC TCCTTAGAAAAATTTTTAATAATGTGGAAGTTGAAAAAAATGGACTCTCT GGAGTTCAAAGCTATACTAAAAATAGACAAGACATAGTAATAACAGATAT CTCTATGCCTGTTATGGATGGTATTGAGATGTGTAAGAGAATAAAACTTA TAAACAGTGAGCAAAATATTTTAGTAACCTCTGCACATAATGATGCAGAG TATCTTGTCAAACTAATAGATATTGGTGTTGATAAATTTATAACAAAACC CATAGATATGGGTAGTTTTTTATCAAATATCTCAAAAATTGCCATAAGTA TATATAGAGAAAAGAGAGAAACAGTTTTAGAAAGTAGGATAAAAGCTCAA CAAAATCTACAAAAAGAGCTTTTAAATGGCATCATATTTCCACTGGCATA TTTTGATGAAGGTGAGATTGTTTATGCAAATAGCAGTTTTAAGAAACAAT TTTTTACAGAGATAGATGCAGGTGATTTTAGCAGATTTAGATTGGGGTAC CTTTTTGAAAATAAAAAGTACGTTTCAATGAGCAATAGTGAACTAGTACA AGAGATAAGTAACTCCGATGACAAGACATACCTAGTAATGGATGTAAATA AAAAAATTGTCAAAAAATATAGTATAAGTGTTACGAAATTTCAAAATGCT AAAGGTTGTCTTCTAAGTTTTGTAAATCTTAATGCTCTAAATGAAGAGAT AAACAGATTTAGTGAACAGGTGGACTACTTTCCAAAAAGAGAGTCATTCT CTCAAGCACTCTTAGAGCCTAAAAAATCTACAAAAGAGAATTATGAGATT 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methyl-accepting chemotaxis sensory transducer ATGAAAATGACATTTACTCAAAAGTTGTCTATGATAATTGCGGTATTGGT AATAGTTGCGATAGCAATCGCTTGGTCTGGTTTAAGCGGAGCCTCAAGTT TAAATGACTCTATTACAAATTTAACTAAGGTTGAAGCTAAAAAACTCAAT GAAATGGGAATTGTTGCAAGAAATTCAGAATCTTGTAGAAAAAATGAGAA AAATATTATTCTCTCAAAAAGTGTAGATAGTATAAATTCATATGCAAATA TTATCCATAACGATAGACAAGAGATGGATAAATTGCTTATAGGTTTAAAA GATTTAATGGTAAAAGCAGAAAACAGATCAAGGATAGAGACTCTTTTGAG TGATTTGAAAAAGTATGATGAGTTTATATCTGAGATAAAAGCACTCTCAA TAGCTTCATTAGGAGAGAGCGCAGAGGCACTAGAAGCTCAACGAAAAAGT ATTGAGCTCTCAGCTACAAAAGGTTTAGAGTATGGGGAAGCGGTAAGTAC GAATGTTAATACTATATTGAAAAACAACCAAGATAACTTAAATGAGATTG ATGCTCAAACAACAAAAGATTATGAAAATTTAAGAAATCTAAATATCGGA ATTGCAGTAGGTGGTATTGCACTTGCCTTGATTATTGCACTCTTTATGGT TCGCCAGATGATGGCGCTTATATCAAGCAGTGTTACAAACGTTAGCGAAG GCGCAGAACAGGTTGCTAGTGCTTCAAACCAGATAAGTTCATCTTCACAA CAACTAGCAGAGGGTGCTCAAGAACAGGCTGCTTCAGTTGAGGAGATTAC AAGCTCACTTACGGAGATAAAAGCGACAATAGAGCAGAACTCTGAAAATG CAAGAGAAGCAGATATGTTAGGCAAAGATGCAAACGAAGCTGCAAAGATG 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helix family ATGAAAAAAATATTAATGATTGAAGATGATTTGGAACTTGCTGAAATTCT TACGGAGTACTTACAGCAGTTTGGATTTGATGTTGTTACAGAAGATGACC CTTTTAAAGCGGTTAGTATCTTAAAGTTGGAACCATTTGATTTGGTTATC CTTGATTTAACTCTTCCTGGAATGGATGGTTTAGAAGTTTGTGAAGCAAT TCGTGAGCGTCAAGACATACCTATAATCATCTCTTCAGCTAGAAGTGATG TAACAGATAAAGTAAAAGCGTTAGAACTTGGTGCGGATGATTATATTCCA AAGCCTTACGATCCCAGAGAACTTGAGGCTAGAATCCACTCAGTTTTAAG ACGTTATGAAGCAAAATCACAACAAAAAGAGGAGTCAAAGAGCGACTTTA AATGTGACATGTCTTCGATGATGATTACATATCGCGGAAGAAACATAGAC CTTACAAATGCTGAATTTGGCATACTCTCATATATGATTGCAAAGCAAGG TTTAGTGGTTTCAAGAGAAGATTTGATTCATAATGTAAATGCTATAAATG AAGACTCTTCAAACAAAAGTATTGATGTTATGGTCGGTAGAATAAGAAAT AAACTTGGAGACAAATCTCTAATCGAATCTGTTAGAGGCGTTGGATATAA ACTTCTTAAATAG >Tmden_0380 diguanylate cyclase/phosphodiesterase (GGDEF & EAL domains) GTGTATAGTTTAAACAGTAAATTTTTAAAAATTATCCCTATACTCTTTCT TATAATTGGAACAGGTAAAATAATATATATATATTTTGAAACAAAAGAGA AAGAAGCTGATTTTGCAAAAAAAGAGGCAGAGGTTTTAAACAGTTATGTT ATTGAAAACAGAAACTACTACCAAAATCTTTTTCTAAATGGTACTATAGA 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