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# Streptococcus pyogenes phage 5005.3

>M5005_Spy1574 universal stress protein family
GTGGCCTTATTTTTAGTAGGTACAATTGGATTAAGCACGTTTAGATACAT
GACAATTGGATTAACATCAGAATATAGGCTTTGTCATGTTAAGATTGATC
TGTTGATAGTGAGAGCTAATAAAAAATGTTATAATACTATGAAATAA
>M5005_Spy0785 two-component response regulator
ATGTACAAATTAGTCATTATTGAAGATGAACATATTATTAGGAAATGGTT
GCGATACGCTATTGATTATAAAGCTTTAGATATTTTGGTCATTGGCGAGG
CTAAAGATGGCAAAGAAGGAGCTGTTTTAATCAAAGAGAGTCAACCAGAT
ATCGTTTTAACCGATATTAACATGCCCATCATGACAGCTTTTGACATGTT
TGAAGTAACAAAAGATCAAACTTACGCCAAAATTATTTTATCTGGCTATG
CTGATTTTCCAAATGCAAGGTCTGCCATACACTACGGTGTACTTGAATTT
TTAACAAAACCGATTGAAAAAGCAGCTCTTTGGGAATGTCTTCAAACCAT
TATTGCTAAAATAGAAAAGCAAAAGGGGTCTAATCAAAAAACAGATGCTT
GCGTCTATATTCCCTTACCCCAGATGACTGATCAGATTCCTGAAGTAGTC
AAAGATATTTTGGAGTGGGTACATGCTCATTTTCAAGACAAGATCAGCAC
GAGCCGCCTAGCTCATGACTTAGGGTATAGTGAGAGTTATATCTATCAAA
ATATCAAAAAGCATCTTCAGATGCCTTTAAGTGATTACATTAATCAATAT
CGGATTAATCAGGCAATTCAATTGATGCAACAAGAACCAGATTTAATGGT
ATATGAAATAGCACAAGCTGTAGGTATTTATGACTATCGCTATTTTGATA
GGGTTTTTAAAAAGTATCTAGGACAAACTGTAAAGGCTTTTAAAGAAGAG
CATTTTATGAAAGATACCGATAGGAGTAAGCCATGTTAA
>M5005_Spy1276 transcription regulator, crp family
GTGATTCGAAGAGAAGATTATCAATACCTTAGAAAACTAAACGATTTTCG
CTACTTTTCTATTGAACAATTTGACAAAATTGTAGGGCAGATGGAATTCC
GAAAAGCTAAAAAGGACCATATCCTTTTTTTTGAGGGAGATAAAAGAGAT
AAGCTTTTTCTAGTGACCTCTGGTTATTTCAAGGTGGAGCAGTCCGATCA
ATCAGGAACCTTCATGTATACGGATTTCATCAGACACGGCACCATTTTTC
CTTACGGTGGCCTCTTTACAGATGATTATTACCATTTTTCAGTGGTAGCC
ATGACAGACGTGACTTATTTTTACTTTCCAGTCGATTTATTTGAAGATTA
TTCGCTTGAAAATCGTCTACAAATGAAACACTTATATAGTAAGATGTCTA
AGCTGCTCGAGTTACATGAGTTGAGGGTCCGAAACTTGATTACATCAAGT
GCTAGTTCTCGTGTGATTCAATCTCTGGCGATTTTGCTGGTTGAAATGGG
TAAAGACAGTGATACCTTACCTTTTCAATTAACAACAACAGATATTGCTC
AAATAAGTGGGACGACAAGAGAAACAGTTAGCCATGTGCTTAGAGATTTG
AAGAAGCAAGAATTGATTACCATAAAAGGTAAGTATTTGACTTATCTAGA
TAAAGACTATTTTTTACAATACACAAAGTGA
>M5005_Spy1418 phage protein
ATGCACTTTGATTTACTACAGGCAGGAGCTGCGGCAGCGGCTCTCATGTC
TGTTTTTGGTCTTTGGAAGGCAGTTGTAACGCCTTTTAAAAAAGCCATGG
AAGCTAATGAGTTTGCCATGGCTCAACTCAAGGACTCTCTCAAAGAGTTA
GCTTATGAGCTTAAAAATCTTGATCGCGATCGTGAAATTACCAAAAAAAT
TATCGATCGTCACGAAGAGCGTTTAGGTCGCGTCGAAGACGAAGTTATTA
TCAACAAAGAGCGTATTATCACGCTATTTAAAAAAGGGGAAGAAAAATGA
>M5005_Spy1295 hypothetical cytosolic protein
GTGGCAAAACAAAAAAATCGTAAAAAAGCATTGAAATTAGAAATGAAGCG
TAATGGCTTGTTAAAAAAAGCAGGTCAAGTTTTTGATAAGGCAGTTGAAA
GTGTTGAAACAGCTGTGGATAAAACCATTTCTGCTGGTAAAAATCTTGTG
GAAAAAGGCAGCCAAACAGTTGAAAACCTGACAGCAAGCAAGGAAAGACT
TACTCTTGATGAGTTTGCAGGGCAGCCAGTTGTAGCTGGTATCCGCTCTG
ACCTTGTCGAAACCCTATATGCAGAAGGCATCCATTCAGCGCAAGCTTTT
AAGGAGTGGACAGAAAAAGACCTCCTTGCTCTTAAGGGCATTGGTCCAGC
AACGGTTAAAAAATTGGTCGAAAATGGTGCAAGCTTTAAAAAATAG
>M5005_Spy1514 universal stress protein family
ATGTCACTAAAATATAAACGTATCCTCGTTGCTATTGATGGCTCTTATGA
GTCTGAATTAGCTTTCAATAAAGGCGTTAACGTAGTACTACGTAACGACG
CTACCTTACTACTAGTACACGTTATTGATACCCGTGCCTTGCAAAGCGTA
GCTACTTTTGATACTTACATCTATGAAAAATTAGAACAAGAAGCTAAGGA
TGTTTTAGATAATTTTGAAAAACAAGCACAGATAGCAGGAATTACAAACA
TCAAACAAATTATTGAATTTGGCAACCCCAAAAACTTACTAGCTCACGAT
ATTCCAGATCGTGAGAACGCTGATTTAATTATGGTAGGAGCTACTGGTCT
TAATACCTTTGAACGCCTCCTTATTGGCTCATCTTCTGAGTACATTATGC
GACACGCTAAGATTGACTTACTTGTAGTCCGAGATAGCACTAAAACACTC
TAG
>M5005_Spy0270 ABC transporter substrate-binding protein
ATGATTAAAAAACAGTATTTAGGAAGGGCAACAATTGCCCTAGCATCGAC
CCTTGTGCTAGCAGCTTGTGGGTCATCAAAAACAGCTGAGTCAGGAAATC
AGGGGAGTTCTAAAGAAGTCTTATTTGCAACGGTTGGAACAACAGCTCCC
TTTTCTTATGAAAAAGGTGGTCAACTAACTGGCTACGATATCGAGGTGGC
TAAAGCAGTCTTTAAAGGATCGGATGATTACAAGGTGTCCTTTAAAAAAA
CAGAATGGTCTTCTATCTTTACAGGTTTGGACTCAGGAAAATACCAAATG
GGTGGTAACAACATTTCCTTTACCAAAGAGCGTTCAGCTAAGTACCTTTT
TTCTTATCCAATCGGATCAACACCTTCTGTTTTAGTTGTTCCAAAAGACA
GTGATATCAAGAGCTTTGATGATATCCAAGGGCATACGACACAAGTTGTT
CAAGGGACTACAAGTGTTGCACAGTTAGAAGACTTTAATAAGAAACACAG
TGACAACCCGGTTACTCTAAAATTCACCAATGAGAACATTACTCAAATGT
TAACCAATTTGAGTGAAGGCAAGGCAGATTTCAAGATTTTTGACGCTCCA
ACGGTTAACGCCATTATTAAAAATCAAGGGTTAGATAATCTCAAAACAAT
TGAACTCACCTCAACAGAGCAACCATTTATTTATTTTATCTTTAGTCAAG
ATCAAGAGAAATTGCAAAGCTTTGTTAACAAGCGTATTAAAGAGTTGACT
GCTGATGGAACTCTTAGCAAGCTTGCCAAAGAGCACCTTGGCGGTGATTA
CGTGCCATCAGATAAAGAGTTGAAACTTCCTACAGCTAACTAA
>M5005_Spy1401 PTS system, galactose-specific IIA component
GTGTTTCCTAATATTCTATTTACTGAAGCAAGGACGCAGCCAGAGCTTTT
TGATCTTGTTGCTAGCCACTTGGAAAAGGTTGGGTATGTGACGCAAGAGT
ACCATCAGGCTTTAGTGGAGCGTGAGGCGGTATTTCCGACAGGACTCAAA
GTGGACCTCAAAGATGGGTCAGATATTTTGTATGCGGCTATTCCGCATAC
AGAAACCAAGTATTGCTTGGTTGATCAAGTGGTCTATGTTAGAAATAGTC
AAGCCCTTACCTTTAAGCACATGATTAATCCAGAGGAAGACTGTTTGGTA
ACGGATTTCTTCTTTATTATCAATAGTCAAAACGAGGGTCAAACGACGAT
TCTATCCAATCTCATTACCTTCTTTATTACGAAAGGCAATCTTAGCTATC
TAGCCAGTCTAAAAGATGATAAACAAGCTATTTCAAACTATTTAATAGAA
AAAGGAGTGTTTCAGCATGATTAA
>M5005_Spy0036 protein tyrosine phosphatase
ATGAAAAAAGTATGTTTTGTCTGTCTGGGTAATATTTGTCGAAGCCCCAT
GGCTGAGTTTGTAATGAAGTCAATAGTATCAAGTGATGTTATGATGATAG
AAAGTCGTGCTACTTCTGATTGGGAGCATGGAAACCCTATTCACTCAGGT
ACACAGTCCATATTAAAAACTTACCAAATTAATTATGATATAACTAAATG
CTCCAAGCAGATAACTATAACTGATTTTAACACCTTTGACTATATTATTG
GTATGGATAGCGATAATGTGAAAAATCTCAAAGAGATGTCGCAACATCAA
TGGGACTCTAAAATCTACCTGTTTAGAGAAGGGGGTGTTCCTGATCCTTG
GTACACTAACGATTTTGAAGAAACCTACCAATTAGTTAGAAAAGGATGCC
AGGATTGGCTTTCTCGTTTAATGAGTAAAGAGTATTGA
>M5005_Spy1305 two-component response regulator
ATGTATAAGGTACTATTAGTTGACGATGAATACATGATTTTACAAGGGCT
CACCATGATTATTGATTGGCAGGCACTTGGATTTGAAGTGGTTCAAACAG
CAAGATCAGGCAAGGAAGCCTTAGCCTATTTGACTCAGTACCCAGTGGAT
GTCATGATTTCAGATGTTACCATGCCTGGAATGACAGGACTGGATTTAAT
AGAAGCAGCTAAAACCTATCATCCTCAGCTACAAACCTTGATTTTATCTG
GTTATCAAGAATTCTCCTATGTGCAAAAGGCTATGGAATTAGAAACCAAG
GGGTATTTGTTAAAACCTGTTGATAAGGCAGAATTACAGGCTAAAATGAA
ACAATTTAAAGACTGGTTGGATGCCCAGCAGGCAGAATCAATCCGGCAAG
AAGCCTATCATGACAGCCTTTTGACCCTTTGGCTTACAGATGAATTGAGT
GAGAAAGAATTTCAGCAGTTAAGTCAAGGCTTGCCAGCGGCTGCTTTAAC
TGGTTTTACAGTGCTGTATTTGGACTGTCAAGAGTGGCAAGCAGCCATCG
ATGCTTATTTTGAACGAGAAGGTCAGCCTTTTTATCTCAAAAAAGAAGAA
GATAAGAAGGTTTATCTGGCTGTCCTACTTGGTAAAACTGATCAAGCCAA
GGCGTTTACCTATGATCTACAAAAGCGATTCTCAAGAAACATGCATCAAC
TTATTTTGGGAGAAACAGTTGATGACTGGGAAAATGTTTATGAAAGCTAC
AATCAGGTGCTTAAGAGCCTCTTTTACAATTGTGAAGTGTCACCAATTAG
AGCAAAAGATAAGTCCAAAATTGAACTACCAGAGTCCCGTTTGCAGTTCT
TTGCTTTTAACAAGGCGTTGATGATTGGGGACGAACCTACAATCTTGTCT
AAATTAGAAGCTATTTTTGACGAGATGAAGACCTTGAACTTTTCACCAGA
GGATGTGAAGCATGTTTCGTTCTTGTTGTTTTCTGACATTTATCGTCAAT
TTCCCATTTTAGATAAAATGACTTATCTGTCCATGGTAAAAACTATTCAT
GACAGCCAATCCATTGATTGCATTTTGAGGGAACTAAAAAAAGTGTTGGA
TGTCACCAATCAGAACAATTCCCCTGAAAAACGCTATTCAGATTTAGTTA
GTGAAACCATTGATTGCATTCGCAAGGAATACCATCAAGAATTAACTCTT
AAAGCTATCGCTGATAGGTTACATGTCAATGGGGTTTATTTAGGGCAATG
CTTTAAAAATGAAACCGAGCGTAGTTTTACCCAGTACTTAAATCATGTTA
GGATTCAAAAAGCGCAACAGTTATTGCTTTACACCAACCAATCCATCAAT
GAAATTGCTTATGAAACAGGTTACAATACCAATCATTATTTTATCAAGAT
GTTTAAAAAGTTGAATGGTTTATCGCCAAAAGAGTTCAGAGATCGTTACA
AGGACAATTACCAAGCCATCAAGGGCGACCAGTAA
>M5005_Spy1280 two-component sensor kinase
ATGAAGCGTTATCCCCTACTGGTCCAGTTGATTTCGTATGTTTTTGTGAT
CGTAATTGCCCTCATTACCACGCTTGGTTTGCTTTATTACCAGACGAGTT
CTCGTAATATCAGGCAACTAATTGAACGTGATACCCGGCAGAGCATTCGG
CAAAGTTCCCAATTTATTGACGCTTACATCAAGCCTCTTAAAGAAACAAC
TTCGGTGCTGGCGAAAAATACGGAAATTCAAGCCTTTGCTAGTCAAATTC
ATCAAGAAAATGACAAACAGGTTCTTCAGCTCATGAAGATGGTTCTTGCG
ACCAATTCCGATTTACAAGCAGCTGTTCTGGTGACTAAGGATGGTCGAAC
GGTGTCTACCAATTCTCAGTTGACCATGAAAACCTCCAGTGACATGATGG
CAGAACCCTGGTATAAAGCAGCCATAGACCGTCAAGCCATGCCAATCTTA
ACCCCAGCTCGGCAATTATCCCTTTCTTCTAAAAAAGAATGGGTAGTTTC
TGTGACCCAAGAGGTAGTAGATAGGGCTGGGCATAATTTAGGTGTGCTAA
GACTTGATATTGCATACCCGACCATTAAAGCGTCTTTAGATCAGCTTCAG
CTAGGCCGCCAAGGCTTTGCCTTTATTGTGAATGATAAGCATGAATTTGT
TTACCATCCCAAAAAGAGTGTTTACAGTTCTTCTAAGGAGATGGCTGCGA
TGAAACCTTATTTAGCGATTCAGAATGGTTACACTAAGGACAAGACATCT
TTTGTTTACCAAAAACTCATTCCTAACAGTCAATGGACTTTAGTGGGAGT
GGCGTCACTGGATCAGTTGCACCGGGTGCAGCGCCAAATTTTTTGGTCCT
TTCTTGGAACAGGGCTTCTAGCCTGTCTGATTTGTGGCTTTGCAACTGTC
TTAGTCTTACGCAGATGGATTCGTCCCATTCAACAATTGCAGCAAGTTAT
TCTTGCTATTCAAAAAGGAGATCGTCAGTTACGTGCCCAAGAAACGGGTT
CTCCAGAATTGACAGACCTTGCCCAACAGTTTAATGCGCTCTTAGATCAA
ATTGATAGCTTGATGGTTGCCGTTGCGGATAAGGAAAAGGCGATTGGGCA
GTATAGGTTACAAGCCTTGGCTAGTCAGATTAACCCGCATTTTCTCTATA
ACACCTTGGACACTATTATTTGGATGGCAGAATTTAATGACAGCAAGCGC
GTGGTAGAAGTGACCAAGTCTCTAGCTAAGTATTTTCGTTTGGCCCTTAA
TCAGGGGAACGAATACATTCGTTTGGCAGATGAACTGGATCACGTTAGCC
AATACCTCTTTATTCAAAAACAGCGCTATGGAGACAAGCTAAGTTATGAA
GTGCAAGGCTTAGATGTCTACGCAGACTTTGTTATTCCTAAGCTTATCTT
ACAGCCCTTAGTAGAAAATGCTATCTACCATGGCATCAAAGAAGTCGATC
GCAAGGGCATGATCAAGGTTACGGTATCTGATACAGCTCAGCATCTGATG
TTGACTGTTTGGGATAATGGTAAAGGCATTGAAGACTCTTCACTGACCAA
TAGTCAGAGCTTGTTGGCTAGGGGAGGTGTGGGCCTTAAAAATGTTGACC
AGCGGTTAAAACTTCACTATGGTGAAGGCTACCACATGACCATTCATAGC
CAGTCAGACCAGTTCACTGAAATACAATTAAGCCTTCCTAAAATGCATGA
ATTAATGGCAGACGACACACAGGAAAACGAGTAA
>M5005_Spy1416 phage-associated cell wall hydrolase
ATGACCTTTTTAGATAACATTAAGCAAGGCTGCTTAGATGGCTGGACTAA
GTACAAAATCTTGCCATCCTTGACCGCAGCACAAGCAATCTTAGAGAGCG
GGTGGGGTAAACATGCCCCACATAACGCTCTGTTTGGGATTAAAGCTGAT
GCAAGCTGGACAGGTAAGTCTTTTAACACTAAGACGCAGGAGGAGTACCA
GCCTGGTATCGTCACGGATATTGTGGACCGATTTAGGGCCTATGATAGCT
GGACTGATAGCATTATCGACCATGGCAAGTTTTTAAACGATAATCCACGC
TATCAGTCTGTTGTTGGTGAGACTGACTATAAAAAAGCCTGTCACGCTAT
CAAGGACGCAGGTTATGCCACGGCAAGTGGATATGCGGAGCTGCTTATCC
AACTAATCGAGGAGAATGACCTACAAAAATGGGATAAGGAAATCTTAACA
AATCAAAAGGAGGTAACGATGACAACCGCAAATGAGATTGTAAAATACTG
TGTCGACCTTGCCAATTCAGGTATGGGAGTTGACAAAGACGGTGCTTATG
GGACGCAATGCTGTGACTTACCATGTTTTATCGTCAAAAACTGGTTCGGC
ATTGATTTATGGGGTAATGCCATAGACCTGTTAAATAGCGCATCTGCGCA
AGGGCTAGAGGTCATATATAATGCCCCTGGAGTCAATCCCAAAGCTAGTG
ACCTTTTTGTCATGGAGGTAGCTGGTAGTCCCTACGGACATACAGGAGCT
GTCATCGAGGATAGTGATGGCTATACTATTAAAACCGTTGAGCAAAATAT
TGACGGTAATTGGGATAGCTTACAAGTAGGTGGACCAGCCCGTTTTAATA
CTCGTGATTTTACTGGCGTTGTCGGCTGGATTAGGTTACCTGTTGACCAT
GCTCATCAGACGGTAGATACAGCACCACAAAACTCTGACACAATCGTAGA
GACACCAAAATCTGGTACCTTTACGCTTGATGTTGTGGAGATTAATATTA
GACGTTGGCCAAGCCTAGCCAGTGAAGTAGTAGGTAGCTACAAACAAGGA
GACACTGTCAGCTTTGACAGCGAGGGTTATGCCAATGGCTACTACTGGAT
TAGTTATCTTGGCGGCTCAGGTATGCGAAATTACATGGCTATTGGGATAA
CTGACAAAGATGGTAACATTATCAGCCTTTGGGGTAAATTAAATTAG
>M5005_Spy0706 cystine-binding protein
ATGAAGAAATCAGTTACATTACTGTCTATCGGACTTGCCAGCCTTTTATT
GGCAGCATGTGCGCCACATCAATCTCAAAAATCAAGTTGGGACACTATCA
AAGAAAAAGGGGTGTTAAAAGTAGCTACCCCAGGAACCTATCAGCCAACT
TCTTTTTACAACGATAATAATGAGTTAGTAGGTTACGAAGTAGATATGGT
CAAAGAAATCGGTAAACGACTTAACATTAAAGTCAAGTTTGTTGAAACAG
GATTTGACCAAGCCTTTACCTCAGTTGATAGTGGTCGAGTGGATATTTCT
TTGAACAACTTTGACATTACCCCAAAACGTCAGAAAAAATACAATATCTC
TACGCCTTATAAATACGGGGTAGGAGGCATGATTGTCCGTGCTGATGGCA
GCTCAAACATGGCTAAAAAAGATCTTAGCGACTGGAAAGGAAAAAAAGCA
GCCGGCGCTTCTGGAACAGAATACATGAAAGTAGCGCAAAAACAGGGAGC
TGAACTGGTGACCTACGATAATGTTACAGGAGATGTTTATCTAAACGATG
TGGCTAACGGTCGAACAGATTTCATCCCAAATGATTACCCAGCTCAAAAA
TTATTTGTGGATTACATGTTATCTCAAAATCCAAATCTAAATGTCAAAAT
GAGCGATGTTCAGTACAACCCAACCGAACAAGGAATTGTTATGAACAAAA
AAGACGATAGCCTCAAGAAAAAAATAGATGCTGTTATTAAAGACATGATA
AAAGATGGTAGCTTGAAGAAAATCTCTGAAACCTACCATGCTGGTCAAGA
TCTGACAAAACCTTTTGGCAAAGACAAAAAAATTCCCGTCATTGATACGA
AAGACGTTAACTAA
>M5005_Spy0596 arginine-binding protein
ATGAATTTTAAAAAAATAAGATTTGGTTTTTTGCTTTGCCTCCTACTTTA
TCCTTTAGCAGCTTGTAACAAGTCTGAACAACTTAATCACTACGAAAGAA
TTAAAAAAACAAGAAAATTAGTCGTTGCTGTAAGCCCTGATTATGCTCCT
TTTGAATTTAAAGCTTTAGTTAATGGAAAAGATACTATTGTTGGAGCAGA
TGTTCAATTAGCTCAGGCTATTGCTGATGAATTAGACGTTGATCTTGAGC
TTTCACCAATGAGTTTTGATAATGTTTTGTCTAGTTTACAGACTGGTAAA
GCTGATCTTGCTATTTCAGGAATCTCACATACTAAAGAAAGAGCTAAAGT
ATATGATTTTTCAATTCCTTACTATCAGGCAGAAAACGCTATAGTGATGA
GAGCATCTGATGCTAAAGTGACCAAAAATATTAGTGACCTAAACGGTAAG
AAAGTAGCCGCTCAAAAAGGTAGTATCGAGGAAGGTTTAGTTAAAATACA
ATTACCAAAGGCCAATCTGATTTCTTTGACTGCTATGGGAGAAGCCATTA
ATGAACTAAAAGCAGGACAAGTCTATGCAGTTACCTTAGAAGCACCTGTA
GCTGCTGGTTTTTTAGCCCAACATAAGGATCTGGCTTTAGCACCCTTTAG
CTTAAAAACCAGTGATGGAGATGCCAAAGCAGTGGCCCTTCCTAAAAATA
GTGGAGACTTAACCAAAGCCGTTAATAAGGTTATTGCTAAGTTAGATGAG
CAAGAACGGTACAAGTCATTTATTGCAGAGACAATAGCACTAACGAAAAA
TACTATGAAGTAA
>M5005_Spy1306 two-component sensor kinase
ATGAGTGTTAAAACATTGGGAAGGTATGTGACTAACCACTTTAAGCAGGG
TTTTTTGATTAATCGACTGATGAAATTATATAGCCTGCTAATTGTAAGTT
TTTTCACTTTAGCAGCTATTGGCTTGAGCAGTTATTCTATTAGTAGTACT
TATAAAAGGGTGGATGCTGAGGCGCAGATGCGATTGGAGGAGACTCTAGG
TAGATTGCAGTCACAAAACGATATTACCCTACGGGTTTTAGACCAGTTGG
TTGGCCGTTCAGAAGATTACCATAATCTCTATCAATACATGACGTTAACC
CCAAACCAATATTTTTCAAACGTTTTTGAAGACTGGGAAAAAGGAAAAGA
CACGGTCCTATTTTCTGAAGAGGTGAGGCGTCTTTTTGACTTGTACCCTG
ATGTGACTTCTATGACCCTACTGCTAGAGGACAGTAGTGCTTATCTGTAC
GCCGATAAGGTCATTAAGACGGGTCGTTTGCTTTATAGCAAGCCTGAAAA
AGTAACCGGAAATGTTTTAGTTCGCTCTATTCGAAATCCAGAATCAGGAG
ATGTGACAGGTCGTCTTTACCTGACCTTTGACAAACCACCGACTTTGGTA
GAGACACAGCAGGATCACTATTTAGCTACTTTTGCTTTTGATTACTATGG
CCGCAAACTCTTCCATCAAGGAGGTCGGAGATTTCCTCATTTAGAGGCTG
AGGTTAAAAAGGCTATCAAGGCAGATCGGGCAGCTGATCTTAGTAATCTT
AGCAAGGCTTATCGGATGCAGTACAATCGCTCGGGAGACCTCTTGGCTTA
TGTGGCTGTCAGAAAATCCTATTTATTAGCGGAAGCTGTCAGGACAGTTT
TTGTGTATGGCCTTGTTTCTCTACTTTTAGCTTGGCTGTTATTGCAGTTG
CTCTTTAGGGTTTTCCGAAATTATATCCAGCAGGTTTCTGAAATTACGGA
TACTGTTGAAATGGTTGCAGCAGGCGATTTGTCTTTAACCATCGACAACA
GCCACATGGAATTGGAACTGTATCATATCTCAGAAGCCATTAATCAGATG
TTGGCCAGCATTAAAGCTTATATTGACGAAGTTTATGTGTTAGAGGTAGA
GCAACGAGATGCCCAAATGAGAGCTCTGCAGTCTCAAATCAACCCTCATT
TTTTATACAACACGTTAGAGTATATTCGGATGTACGCCCTTAGTTGTCAA
CAAGAAGAATTAGCAGATGTCATTTATGCCTTTGCGAGTCTGCTTCGCAA
CAATATTAGCCAAGATAAGATGACCACCTTAAAAGAAGAACTGGCTTTTT
GTGAAAAGTACATTTACCTTTATCAAATGCGGTATCCAGATAGCTTCGCT
TATCATGTAAAAATTGATGAGAGTGTTGCTGACTTAGCCATTCCTAAATT
TGTCATTCAACCTCTCGTTGAAAATTATTTTGTGCATGGGATTGATTATA
GTCGCCATGACAATGCACTAAGCATCAAGGCTTTAGATGAGACGGATTAT
CTCTTGATTCAGGTGCTTGATAATGGACGTGGTATTAGTCAAGAGCGCTT
AGCAGATATGGAAAAAAGGCTTCAAGAGCACCAAACAACAGGCAATAGCT
CTATTGGTTTGCAAAATGTTTACCTCCGTCTCTTTCATCATTTTCGAGAC
AGGGTTTCTTGGTCCATGGCTAAGGAGCCAAATGGTGGCTTTATCATTCA
AATTAGGATTAGAAAGGATGCTTGA
>M5005_Spy0446 hypothetical membrane associated protein
ATGTCTATGATGGATAAAACTGTTTTATATTTTGGGTTGGTTGAAATTTC
TTTTGATGTGCCTGACTTTATATTTCAAAAAATAAAAGAGCAGAATAATA
AAATTAGATATTATAGCAAATCAATAAATATATTAGGTAGTGTAAAATTT
ATTAACAGCAATCAGCAATTTATAGAATATGATGGCAATGGAAATATTTT
AGTTTATGGAAGATTAAAGTATTTTAAAGAAGGAATTTCATTATACTACA
TTGGAGAGTACTTAGCTGAATGTCTCTTGATTGAACATAGTGACACCTTA
TTAATTCATGCAGCAGCAGTTTATAATCCTTTATCTGGCCATTCAATTTT
ACTATTAGGAGATAAAGGTGCTGGAAAAACTACGGTTGCAATAAGGCTTT
GTATAGAACATGGGTATCACCTTATTGGTAATGACCAGGTAATATTTGGT
TCGAACTCTGGAATACTACTAACTTATGCAGGGACATCTTTCTTTAAAAT
AAGAAGGACAGCTGTTTTGTCGGACAATTTACTGTTTAAATTATTTAGCA
AATTTTTTAATCGTTCATTACAATTTAATAAGGCAAGTTGGGATGATAAA
ATTTCAATTTTCCCAAAGGAGTTGGGAATACGAACTTGTAATTTTTCTAC
TGAAATCTCAAAAATTTATTATATAAAGACAGACAAGAAAGAAAAGCAAA
TTTATCATTCAATTTGGAGTGATAGTTTAGCAAGTCTATATCTAAATGAG
CTATTGGGAAGGCATATTTCTGGACAGGTTGCATGTTTTCAATCAGATAA
TGGAAAATATTTTTCTACAATGCCTTTGATAAATTATGAAAAAAATAATC
GGGTACGAGAACAGATAGTGAAGGGTATTTTCGCTAAACAAAAATTATTT
AAAATTACAGCAGCTACGCCAGCTAAGATTGCAGAAGCGATTATAGAAAA
TGTTAAGAAAAACTCATAG
>M5005_Spy1113 GAF domain-containing proteins
ATGAATAAGTCTAAAAAAATTGAGCAATACCAACTAATGATAGCGCAGGC
AAAAGAGCTGTTTGCGAATGAATCAAATGCTTTGGCTAATTTGTCAAATG
CCAGCGCCCTGTTAAACATGACACTACCCAATTCTGTTTTTACGGGATTT
TACCTTTTTGATGGGCAGGAATTAATTCTTGGCCCTTTTCAAGGTAGGGT
TTCTTGCGTCCATATCAAGCTTGGTAAAGGTGTTTGTGGCGAATCAGCTC
AGTCTCGTCGAACCATTATTATAAATGATGTGAAGCAGCATGCCAACTAT
ATTTCCTGTGATGCGGCAGCCATGAGTGAAATTGTTGTGCCTATGGTGAA
AGAAGGCCATTTGATTGGGGTGCTGGACTTGGATTCTAGTCTTGTAGCTG
ATTATGATGAGGTTGATCAAGAATACTTAGAGGCCTTTGTGGATCTATTT
CTTGAAAAGACCACGTTTACCTTTAACATGTTTGGAGTTAAAAACTGA
>M5005_Spy0483 stress-responsive transcriptional regulator
GTGGAAACTAAATTCTATAAACAGCGAAAAAATCGCTTGGTTGCAGGTGT
TATTGCTGGTTTAGCAGATAAGTATGGTTGGGATCTTGCTCTAGCGCGTG
TCTTAGCGGCTCTTCTTATTTACGGAACTGGTTTTGGAGTTTTGCTTTAT
ATTTTGTTGGCCATCTTCTTACCTTACAAGGAAGACTTGCTTGAAGAACG
TTATGGCCGAGGTCCTCGTCGTCGTAAAGACGCTGATGTCTTAAATGAAG
AAGAAGATGGTTGGTTCTGGTAA
>M5005_Spy1626 sensory transduction protein kinase
ATGATAAGAATAAAAAACATAACAAAGAGTAAGTTCTTTGGGACTGCAAT
AATCTTGTTGCAACAATTAATAGCCTTGTTAATTTTGGTCTATAATCGAG
AGAACCTGTCTCTTCTTTTCTCTGAAAAAGTAGCTCTTGTAATGACCCTT
ATTGATACAGCTTTTATTTGGCTGGCAACAATATTACGCCAAAAACAAGG
TGATATTTTTAAAAGGATTATTTCTATCATCTCCTTAACAATTTGGCAAT
ACTTAGTATCTGTGCTGACAAGAGGAACTCCTCTCTTTTTAAGCAGTGGA
CTACAGATTATATTGCTCTATTGTTATACCGTTGAGATTACTAATTTAAT
ATTATATGGGCACAAACAATTTAAAGATAAGTTAGATAAGGGCTTGTTAA
TAATTATTTTTGTTTCTATAACTAGCCTTTTTGTTAATAGAATTTTATTT
AATTTTTTATTCCTGATGGTTTTTACTATTTTACACCTGTATCCGTTACT
AGTTATAGTGCTATATTATAGGTCCTTTAGGCAACAAATATCAGTTGTTA
GACGTTCATTGATACTATTTTCTTTACTTTTGCTGGTAATACTTGGTAGT
GAACTTTATGGAGAAATGCTAGATGTTAATCAAGCCTTTAATAATTTGGG
ATGGTATCTGTTTCCCCTTATAATGAGTGTAATATACTATTTTAAGACCA
TACATGATAAATTGAGTTTTGTTACCCAAAGATGGTTAGGTGATTACAAA
GCTCGTATAGAACTATTATTTCTACTTCTTATCCTTTGTTGGATTGTACT
CATGAAGGTATTAGTTAAAGATTTTTTGCTATTTTTTATAGTTGTTGACG
CAAGCACGTTGTTTTGTCTAGTGGTAATTTCTTGCATCTTTTATTATTTA
GAAAACTCCAAACAAAATTTTGACTATGAAAATAGAAGACTGAACTATTT
TATGAAATCAGAGGAAAACATGAGAGTGGAGTTCTCAAATTATTTGCATG
ATGATGTTTTACAAAATATCATAGCGATAAAAAACTTGTTTTCTCTAGAA
AATAGTAATATAACACATGGTTTTATTGTTAATGAGTTGAATGATTTAGT
TTCTGGTATCAGAGATGAAATGGATACTTACCACCCAATAGTTCCCGCTA
ATCAAACAATGAAAGAAAACATACAGTCTCTTTTTGATGATATTGTTAAA
AGTAGAAAAAGTAATACCTTATTGTATTTTAACTGTTCAGATAATATGGT
AGTGCCATCCCCATATGGAGATATTGTTTATAGGTTTATAAAAGAGCTAA
TAAACAATGCTATAAAATATGGAGATGGAAAAGACATTCGTTTATCTTTA
ACGATTCAATCTGATATTATTATCATTGAGGAGAGCAATCAAGTAGTGGA
AAAAGTACACTCTATAAATTATGGCAGAGGATTGAAATCATTTCAAGAAA
CACTAGCAGCTTTTGATGGAGATCTAGAACTACAAATGGATACTAAACAA
TTTACTATCAGAATATTACTTCCCATAGATTGGAAATTGTGTTATGAAGA
TTTTATTAATTGA
>M5005_Spy1281 two-component response regulator
GTGTACTCATTGTTAATTGTAGAAGACGAATACCTTGTGCGCCAGGGTAT
TCGTTCTTTGGTTGATTTTAGCCAGTTCAAGATTGATCGGGTCAACGAAG
CAGAAAATGGCCAGTTGGCTTGGGACTTGTTTCAGAAAGAGCCTTATGAT
ATTGTTTTGACGGATATCAATATGCCCAAATTAAATGGGATTCAACTAGC
AGAACTCATTAAACAGGAATCCCCCCAAACTCATCTGGTATTTTTGACGG
GCTACGATGATTTTAACTATGCCTTATCTGCTTTGAAATTAGGGGCAGAT
GATTACTTGCTCAAACCCTTTTCCAAGGCAGATGTAGAAGACATGTTAGG
AAAGCTCCGGAAAAAATTAGAACTTTCCAAGAAAACAGAAACCATTCAGG
AATTGGTTGAGCAGCCTCAAAAAGAAGTATCAGCAATAGCAATGGCTATT
CATGAGCGGTTGGCAGATTCTGATTTGACCCTAAAAAGCTTGGCTCAGCA
GCTTGGTTTTAGCCCTAATTACCTTAGCGTCTTGATTAAAAAAGAGTTAG
GGATGCCCTTTCAAGATTATCTGGTACAAGAACGGTTGAAAAAAGCCAAG
CTTCTCTTGTTAACCAGTAATCTTAAAATCTATGAAATTGCAGAGCAGGT
CGGTTTTGAGGACATGAATTATTTTTCTCAGCGCTTTAAGCAACTGGTAG
GCGTTACCCCAAGTCAGTATAAAAAAGGAGGCCAGGCATGA
>M5005_Spy1266 ATP-dependent protease La
ATGAAAAGACTTAAAAAAATCAAATGGTGGTTAGTGGGTCTGCTAGCTTT
AATCTCTTTGTTGCTAGCGTTATTTTTTCCGCTACCTTATTATATTGAAA
TGCCTGGAGGCGCTTACGATATTCGGACTGTCTTACAAGTCAATGGCAAA
GAAGACAAACGAAAAGGAGCTTACCAGTTTGTTGCAGTGGGCATTAGTCG
TGCCAGCCTCGCTCAGCTATTATATGCTTGGCTGACACCGTTTACTGAAA
TTAGTACAGCAGAAGATACAACAGGCGGATACAGCGATGCTGATTTCCTT
CGAATTAATCAATTTTACATGGAAACATCACAAAATGCAGCTATTTATCA
AGCTTTATCCTTAGCTGGAAAACCAGTTACATTAGATTATAAAGGCGTAT
ATGTTTTAGACGTAAACAACGAATCTACTTTTAAAGGAACGCTACACTTA
GCAGATACTGTAACAGGTGTAAATGGTAAACAGTTTACTAGTTCAGCAGA
ACTTATTGACTATGTTTCTCACCTAAAACTAGGGGATGAAGTTACGGTTC
AGTTTACGAGTGATAATAAGCCTAAAAAAGGAGTTGGCCGTATTATCAAA
CTGAAAAATGGGAAAAATGGGATTGGCATTGCCTTGACTGATCATACAAG
TGTCAATTCAGAAGACACAGTGATCTTTAGTACTAAAGGAGTAGGAGGAC
CTAGTGCTGGTCTAATGTTTACTCTTGATATATATGATCAAATAACTAAA
GAAGATTTACGCAAGGGCCGTACAATTGCAGGTACAGGAACTATTGGCAA
GGATGGCGAAGTAGGAGATATTGGTGGTGCAGGTCTTAAAGTAGTTGCAG
CAGCTGAAGCTGGTGCAGATATATTTTTTGTTCCGAATAATCCTGTTGAT
AAGGAAATTAAAAAAGTTAATCCAAATGCTATAAGTAATTACGAAGAAGC
CAAACGGGCAGCCAAACGACTAAAGACCAAAATGAAGATTGTTCCTGTTA
CGACTGTTCAAGAGGCACTGGTTTATCTTCGCAAATAA
>M5005_Spy0680 two-component response regulator
ATGAAAATTTTGTTAGCTGAAGACGAATGGCAGATGTCTAATGTTTTGAC
AACTGCCATGACTCATCAAGGTTATGACGTTGATGTGGTTTTTAACGGTC
AAGAGGCAATTGATAAAGCCAAAGACAATGCATATGATATTATGATTTTA
GATATCATGATGCCGATTAAGTCTGGCATTGAGGCTTTAAAGGAGATTCG
CGCTTCAGGAAATTGCTCACATATTATTATGCTGACGGCTATGGCAGAAA
TTAATGACCGTGTTACCGGACTAGATGCGGGAGCTGATGATTATCTGACT
AAACCTTTCTCATTAAAAGAACTTTTAGCTAGATTAAGGTCGATGGAAAG
ACGAGTAGAAAGTTTTACTCCTCAGGTATTACAATTTGCTGGTGTCACAT
TAAATATTAATGAGCAAGAATTGAGTGCCGGTAATGCTATACGATTAGCT
TCTAAAGAAGGTAAATTAATGGCCTTTTTAATGTTAAATCAAGGAAAGTA
CTTGGATACTAAAACGCTTTACCAACATGTTTGGTCAGACCAAGAAGATT
ATGATACTTCTATTGTTTGGGTTTATATTTCTTATCTTCGTCAAAAATTA
TTAGCTATTCAAGCAAATGTCATTATTGCAGGTGATAAAGATACTAGCTA
TTGTTTATTAGAAAAATAG
>M5005_Spy0784 two-component sensor kinase
ATGCGAGGTGAACAGGTGGAAGAACATTTTAAAAAACAATTACAAGATGA
TATTTCTAGACATTTTTCGTACCAATCGTTAATGTTATCATTGTTGCTAA
TTGGTCTTTTTATTATTTTTTCATTAGCGCCACAACAATTAGGCCTCTAT
CGTGATATCAATGCCACTGCAACCCGTTATCACCGTTTGATTAGCAAACA
AGAAGCCTTGCTGGATGACTTAGGGAAAAATAGCTTACTACCTTTTTTAA
ATAAAAACCTCAGCACTGCTGATTTAAGCAAGCACTATTTTCATTTGCGC
CATAGCAGCCAAACGTCACCAGAACTTTTACTATTTTCACCTAGTCAAGA
CCTTTTATTTGCTAGTAACCCACATTTAGGAAATGTTTTTAGTAAATCTG
TTTATATTCAAGAAGTCTTGAGAGCAACTCATCCTCCAAAAACCTTGTTT
AAAGTTGCTATGGATAGTGAAGATGGTCACTACTTGATGATCATTAAGCC
AATGATAGATCAAAACCAACTAAAGGGATATGCTTTTTTAGTGATGAGTG
GCAAAGATTTTCTTCATCCTACAAAAACATTGACGTCAGAGTTGGTCATT
GCTGATAAGCTGGACAATACGTTTACGTTTTCCAATCGTGAGTTTATAGC
ATCTAGTCTAGATAAGATCAATAGCCAGTATTTACACCATTATTTTGTTT
TTCAAGATAATCGAGCCTTTATCACAAGAAAGGTTGCCTTACAAGGAGGT
CTTTGGCTTTACATGTATAGGCCCTTGATTCCAATGGTATCGGTGATGTT
ATTTTCACTTATTTCATCAGCTGTTATCTTTGTGATTTTGCAACGTAAAT
CAAGTGGTTTAGCTAACCGAATTGCAGCTAAAAATTCAAGAGCAATCAAT
CAAATGGTTAGAGATATGAGTGCGATCTCTCGGCAAGAAAAAAGACGTAT
TGACCTTGAGAGTCAAGATGAATTTCAATATTTATCTGATCAAATCAATC
AAATGGTAGAGCGATTGCAACAGTTACATGATAAAACGTTAGATTTGGAA
ACTCAAAAATTATTATTTGAAAAACGGATGTTAGAAGCTCAATTCAATCC
GCATTTCCTCTACAATACGCTAGAAACCATTTTGATTACGAGCCATTATG
ATTCTGCCCTAACAGAAAAAATTGTTATCCAATTGACAAAATTGTTGCGG
TATAGTCTCACGGATTCTAGCAAACCTGTCTTGCTCAAAGATGATTTAAG
TGTCATCGAGTCTTATTTAGTGATTAATCAGGTGCGGTTTGAAGAATTGC
AATATAGCATTAACCTATCCCCAGACCTTGATAGTCTTGAAGTGCCTAAA
TTGTTCTTGTTACCTTTGATAGAAAATGCCATCAAATATGGCTTGAAAGA
ACGACACGATGTCAAGATTAACATTGCTTGTTATTATCAAGATGACCACA
TTATTTTTTCTGTGAGAGATAATGGTTCGGGAATTGATGCTCATCACCAA
AAAGTGATTCGAGAGCAATTGGAAGCTGGAGAGTCACACCATGGGTTAAT
TAACTCTTATCGTCGGCTTAAGTATCATTTTTCAGAAGTATCCTTGGTTT
TTGATCAAGGTGATAAACAGTTTAATGTTAGTTACCATGTTAAGGAGTAG
>M5005_Spy1021 phage protein
ATGGCCAAGACACCACAACAGTATTGGAATGAGCGCCAGAAGCAACTATG
GGCTAATTTAGAGACGTCAGAGCGCGCTTTACAGACTAAGCTTAGCAAAT
ATTACGCTGATGAAGCAAAGTCCTTAGAAAAGGAAATAGGGGCTTATTTT
AGCAAGTATGGAAAAGACAACGTTATTGAATATCGAAATCTTTTGCAGCA
GTTATCTAAAGCTGATAAAGACTTGCTTTATCGAGATTGTGAGCGATTTG
CTAAAAAATATCCACAACGTGCTGATTTAATGCCTGTCAGGACCTCTATT
TATAAATTAGATAGACTGCAAGGACTAGAATTAAGCATTAAAATACAACA
GTTGGAAATAGGTGCTATCGAAGAGGCGGAATTGACTAAGCATTTAACGA
CAGCCTTTAAAAAAGGTTATCAAGAAACCGCTAAAACAATTGGTTTCCAA
GCGGATAAAGTATCCGCTGAGCTGTTTGTTAACAATGATTGGACAGGCAA
AGGTGATTTTAGCTCAAGTATTTGGTCTAACAAAGATAAGCTTGTCGATT
ATCTAACAAATGACTTTAAGACGGCAATTATCAGGGGAGATAGCTTTGAT
AAAGTCGTTAAACAGATGTCAGAGCGTTTTACTGTACGTTCGCAGTCGGA
TATTACACGGCTGATCATGACAGAAGGGACTTATGTCAATAATCAAGCGA
TGATGGCACCGTTTGAGGATAGTGACGACTTTGAGGAGTACGAATTTGTC
TCGGTTTTAGATAGCTCTACTAGCTCAATTTGCAGAGGATTAGACGGTCA
TAAATTTAAACTTAAAGATAGACAGGTTGGGGTTAACTTCCCGCCCATGC
ACGCTAACTGTCGCAGCACATTTGCTATGGTTATTCCAGATGATTATTTA
GAGAGGTAA
>M5005_Spy0999 phage protein
ATGAGTACATTTTTAACAAATATCAACCTTAATAAAAACGAGTTGCAAAA
TGCAGTCGTACAAAATTTAGCTAAAGAACCGCATGAACCAAAATCAGGAC
AATTTTATTTTGACAGTGCTGCTAATAATCTAAAAATCTATAATGGGACA
TCTTGGGTTGTTTTAGACAAGGAAACAGCAGAAAGCATTGTTGACCTTAT
TAATTCTGGTAAATCCAAAATCGATAAATCAAAAGTCGATGGACTTGAAG
AAGCAATTAATCAAGCGTCTATGACTGGTCAAGCTATCGCGACCGCTTTA
AACGAAGATACTGGTGGCGTTACTGTAAACCAAAATAAAATTACAGGGCT
TACAGATAAACTAGCTGAAATTGCGACTAACAAAGCGTCAGCGACTCGGG
AGTCACAAGATGCTTTGCAAGAAGCCAAGGTGTATGCTGACCAAAAAGTA
GCCGGACTTGTTGATAGTGCATCAGAAGATTACAACACGTTTAAAGAGCT
AGAAACTTTTATTAAACAAAACGCGAAAGGTCTCGCAGCAATCTCAAATG
TAGCCAAAAAATTTAGTAAAACGTTTGGCGATGCACGAGCTAAAGAATTT
ACAATCACACACAACCTAAAAACTCGTGATGTTAACGTCACTATCCGAGA
GACTAACTTCCCTTATGCAATCGTCTACGCAGATATTAAAGTCACAGACG
AAAATAGCATCTTAATCGCAACAGGTGCAGAAGTATTAACGCAAAATCAG
TATACTGTGACAATTACTGGATAG
>M5005_Spy1173 phage protein
ATGGCAACAGAGTTGATATTTGGCGTCGGTGGCTTTATTTTAGCTATCGT
CACGACTTACAATATTTTTAATGCAAAATCCATCAAGCATGCGACAGATA
TTACTTTGTTGCAATCTGAGGTAGAGCATTTAAAAATTGTTACACGCCAA
AATGCTCGGCGGCTTGAAGAGCACGCTGAGCAAAATAAAACGTTGATTAC
AATGACAGAGCAAATTAAAAATTTAACAGATGATGTTAAAGATTTAAAAG
ATATGATGAGAGGAGAAATCAAATGA
>M5005_Spy0868 hypothetical protein
ATGTTAGATAGTTATATAAAACGTATTGTCATTCATCAATTTTCTCCCAA
TGACACTGAGTTACTGTTATCAGATCGTTTAGTGAGCATTACACCGCGAA
TTGATGAATATTTCCGAAAAAAATTGGCCAAAGTGTTCTCGGACGAAGCC
AAACGTGGTCAGTTTGAGGCTAATAATACCTTTTTTACAACCATTGGTGA
TGATTTGTTGGAAACGTCTGTTACCATTGCCCAGTTATGGAAGGAAGCCT
TTGTTATTTCAGAGGATCAAAAAACCAATGACTTAGTCTTTGTTCAGTTT
GATAAGGATGGCGAACCCTTTTTTGCTTTCTTGCGAATTGCTTTGAAAGA
ACAGTTTGCTCACCTTTCTGACAATTATGAACATCCATTTACGGTGACGC
AGAATAATCTGCCGAGTCCCACCCAGACACCAGATGAAGCACTAGTCATT
AATCTCAAATCTGGTCAGTACTACTTGATTGAAAAGCGTGTGAAGCATAA
TGGCAGTTTTGCTAATTATTTTTCAGAACACCTCTTGAAAGTTACACCTG
AGCAATCTGTTAAAAAGTCTATCAAAATGATAGAACAAACCGCTCAAAAA
ATTGCAGAGCATTTTAATCAAGATGATTTTACTTTTCAGTCAAAGATGAA
ATCCACTCTTTTTAAGCAGTTAGAAGCAGACGACGTTTTATCACCAGAAA
AATTAGCTGACCAACTCTTTGATGATAATTTAACAGCCCGTTTAACCTTT
GTGGATCAAGTCAAAGATGTCATTCCAGAACCTATAAAAATTAGCGATAT
TGAACATTCTAGACAGATAAAAAAACTAGAAAATCAAAAGCTATCGTTAT
CAAACGGGATAGAATTAACAGTACCAAATGCCATTTATCAGGATGCTGAA
GCGGTTGAATTTTTGTTAAATGATGATGGGACTTATTCAATCTTGATTAA
AAATATAGAGGATATTAAAACCAAATAG
>M5005_Spy0150 PTS system, 3-keto-L-gulonate specific IIA component
ATGAATTTAAAACAAGCCTTTATTGACAACAACTCCATCCGATTGGGGCT
AAGTGCTGATACTTGGCAAGAGGCTGTTCAATTAGCTGTTCAACCTTTGA
TTGATAGCAAAGCAGTGACGTCAGCTTACTACGACGCCATCATTGCATCA
ACAGAAAAATACGGCCCTTATTATGTGTTGATGCCAGGTATGGCTATGCC
CCATGCAGAAGCAGGTTTAGGCGTTAATCGCAATGCATTTGCTTTGGTTA
CACTAACAAAACCAGTTACCTTCTCAGATGGTAAAGAGGTTTCTGTTCTT
TTGACGTTGGCCGCTACAGACCCTTCTATTCACACAACAGTGGCTATCCC
ACAAATTGTGGCCTTGTTTGAACTAGATAACGCCATTGAACGCTTGGTGG
CCTGCCAAAGTCCTAAAGAGGTTCTAGAAATGGTAGAAGAATCTAAAGAT
AGTCCTTACTTAGAAGGTATGGACTTGAATGCTTAA
>M5005_Spy0982 histidine-binding protein
ATGATTATAAAAAAAAGAACCGTAGCAATTTTAGCCATAGCTAGTAGCTT
TTTCTTGGTAGCTTGTCAAGCTACTAAAAGTCTTAAATCAGGAGATGCTT
GGGGAGTTTACCAAAAGCAAAAAAGTATTACAGTTGGTTTTGACAATACG
TTTGTTCCTATGGGCTATAAGGATGAAAGCGGCAGATGCAAAGGTTTTGA
TATTGATTTGGCTAAAGAAGTTTTTCACCAATATGGACTCAAGGTTAACT
TTCAAGCTATTAATTGGGACATGAAAGAAGCAGAACTAAACAATGGTAAA
ATTGATGTAATCTGGAATGGTTATTCAATAACTAAGGAGCGTCAGGATAA
GGTTGCCTTTACTGATTCTTACATGAGAAATGAACAAATTATTGTTGTCA
AAAAAAGATCTGATATTAAAACAATATCAGATATGAAACATAAAGTGTTA
GGAGCACAATCAGCTTCATCAGGTTATGACTCCTTGTTAAGAACTCCTAA
ACTGCTGAAAGATTTTATTAAAAATAAAGACGCTAATCAATATGAAACCT
TTACACAAGCTTTTATTGATTTAAAATCAGATCGTATCGATGGAATATTG
ATTGACAAAGTATATGCCAATTACTATTTAGCAAAAGAAGGGCAATTAGA
GAATTATCGGATGATCCCAACGACCTTTGAAAATGAAGCATTTTCGGTTG
GACTTAGAAAAGAAGACAAAACGTTGCAAGCAAAAATTAATCGTGCTTTC
AGGGTGCTTTATCAAAATGGCAAATTTCAAGCTATTTCTGAGAAATGGTT
TGGAGATGATGTTGCCACTGCCAATATTAAATCTTAA
>M5005_Spy0681 two-component system histidine kinase
ATGTTTAATCGTATCCGCATTCGTTTTATCATGATTGCTTCTATTGCCAT
TTTTATTATTTTAAGTTCAATTGTTGGTATTATTAACACGGCACGCTGTT
ACCAAAGTCAACAAGAAATTAACCGTATTTTACATTTAATTTCCTCAAAT
AAAGGTAAATTACCTGGCACTACGGAAAGCTCTAAACGACTTGGAACGAA
ACTGTCTGAAGATAGCCTAAGCCAGTTTCGGTATTATAGTGTCATTTTTA
ATGCTAATGGACATCTACTTTCTTCTAATACTGCTAATATTTCAGCTTTA
GATAGAGAAGAAGCCCAATATTTTGCTAGACTTTTTGCTAAGTCTGGGGA
AGAAAAAGGCAGTTACCGTCACCAAGATAGTGTTTATTCGTACTTGATTA
CTCAGCTGCCAAATGAAGAAAAACTGGTTGTAATTTTAGATACTACCTTT
TATTTTCGTAGTGTAGGAGATTTATTAGCTGTTTCAGTGATGTTGGCCTT
TGGAGGATTTATCTTTTTTGTTGTTTTAGTGAGTCTTTTTTCCGGTATGG
TCATCAAACCTTTTGTCCAAAATTATGAGAAGCAGCGTCGCTTTATTACT
AATGCAGGCCACGAGTTAAAAACACCACTAGCCATTATCTCAGCCAATAA
TGAATTGGTCGAATTAATGACTGGAGAATCAGAATGGACCAAGAGTACAA
GTGATCAGGTGAAGCGATTGACAGGCTTGATTAATCAAATGATTACTTTG
GCTCGTTTGGAGGAACAGCCAGATGTGGTATTACATATGGTAGACTTTTC
AGCTATTGCTCAAGATGCAGCTGAAGATTTTAAGAGTCTGGTTTTGAAAG
ATGGTAAACGTTTTGATTTGACGATTCAACCGAATATTATGATTAAAGCG
GAGGAAAAGTCATTGTTTGAACTTGTGACAATTTTAGTTGATAATGCCAA
TAAATATTGTGATCCTAAAGGCTTGGTCAAGGTATCTTTAACCACTATTG
GAAGAAGACGAAAACGAGCGAAATTAGAAGTTTCTAATACCTATTTGGAA
GGAAAATCCATTGATTACAGCCGCTTCTTTGAACGCTTTTATCGCGAAGA
CGAATCCCATAATAGCAAAGAAAAAGGTTATGGAATTGGTTTATCTATGG
CAGAAAGTATGGTTAAGTTATTTAAAGGAACGATAACTGTAAATTATAAA
AACGATGCTATTGTTTTTACAGTGGTGATTTGA
>M5005_Spy1837 phosphoesterase, DHH family protein
ATGAAAAAATTTCGTTTTGAAACCATTCATTTGATTATGATGGGATTGAT
TTTATTTGGACTGCTGGCACTTTGTGTCAGTATTATGCAATCAAAAATAT
TAATATTATTAGCTATTTTTCTCGTTTTGCTATTTGTTGTTGCTCTTTTA
TGGTATCAAAAAGAAGCTTATCAATTATCAGACTTAGCTCATATTGAGCT
CTTAAATGAACAAACAGAAGATAACCTAAAAACGCTACTTGATAATATGC
CTGTTGGAGTAGTTCAATTTGATCAAGAGACCAACGCTGTAGAATGGTAT
AATCCTTATGCAGAATTAATTTTTACAACTGAAGAGGGTTTTATACAAAA
CGGTTTGATTCAGCAAATTATTACGGAAAAACGTCGTGAAGATATTTCTC
AAACATTTGAAGTTTCTGGTAATAAATACACTTCTTATATTGATGTATCA
TCAGGAATTTTTTATTTTTTTGATAGCTTTGTGGGAAACAGGCAATTAGC
TGATGCTAGTATGTTAAGACCGGTTGTTGGCATTATTTCGGTTGATAATT
ATGATGATATCACTGATGATTTATCAGATGCAGATACCTCAAAAATTAAT
TCATTTGTAGCTAACTTCATTGATGAGTTTATGGAGTCAAAACGGATTTT
TTACCGTCGTGTTAATATGGATCGCTACTATTTCTTTACAGACTTTAAAA
CATTAAATGATTTGATGGATAATAAATTTTCTGTCTTAGAAGAGTTTCGT
AAAGAAGCTCAAGATGCTCAGCGCCCTTTAACACTCAGCATAGGAATTTC
TTTTGGTGAAGAAAATCATAGCCAGATTGGACAGGTAGCTCTTGAGAATC
TTAATATTGCGCTTGTTCGTGGTGGTGATCAGATTGTCATTCGTGAAAAT
GCGGATCATACGAATCCAATTTATTTCGGGGGAGGGTCTGTTTCTACAGT
TAAACGTTCAAGAACACGTACCCGTGCTATGATGACAGCTATTTCAGATC
GAATCAAGATGGTGGACAATGTTTTTATTGTTGGACATAGGAAACTTGAT
ATGGATGCACTAGGTTCAGCTGTTGGTATGCAATTTTTCGCAGGTAACAT
TATTGAAAATAGTTTTGCCGTTTACAATCCAGATGAGATGAGTCCAGATA
TTGAAAGGGCTATTGAGCGATTGCAGGCTGACGGAAAGACTCGTCTAATC
AGTGTTTCTCAAGCAATGGGTTTAGTGACTCCAAGATCACTTTTAGTAAT
GGTTGACCATTCTAAGATATCTTTAACACTTTCTAAAGAATTTTATGAAC
AGTTTCAAAATGTTATTGTAGTTGATCATCACAGAAGAGATGATGATTTT
CCTGATAATGCTATCTTAACTTTTATTGAAAGTGGAGCAAGTAGTGCTGC
GGAGCTCGTCACTGAGTTAATTCAATTTCAAAATGCTAAAAAATGTTTAA
ATAAGATCCAAGCCAGTGTTTTAATGGCAGGTATTATGCTTGATACTAAA
AATTTTTCTACGCGAGTGACAAGTCGTACCTTTGATGTCGCTAGTTACTT
AAGAAGCAAAGGAAGTGATAGTGTTGAAATTCAAAATATATCCGCAACAG
ATTTTGAAGAATATAAGCAAATAAATGAAATTATTTTACAAGGAGAACGT
CTTGGTGACAGTATCATTGTAGCTGCAGGAGAAAAAAATCATCTTTATAG
CAATGTTATTGCTAGTAAAGCTGCAGATACGATACTGTCAATGGCTCACG
TTGAGGCTAGCTTTGTATTAGTTGAAACAGCTTCTCATAAGATTGCTATT
TCAGCTAGAAGTCGTAGTAAAATCAATGTTCAACGTGTGATGGAAAAATT
AGGTGGAGGAGGCCACTTTAATCTTGCTGCCTGTCAGTTAACGGATATCA
GTCTTCCCCAAGCGAAGTACTTATTATTGAAAACTATTAATATGACAATG
AAAGAAACAGGAGAAGTAGAATCATGA
>M5005_Spy0236 ABC transporter amino acid-binding protein/amino acid ABC transporter permease protein
ATGAAAAAGCTAATCCTTAGCTGTTTGGTCGCCTTGGCCCTTCTGTTTGG
AGGAATGAGCCGGGCTCAAGCAAACCAATATTTAAGAGTCGGAATGGAAG
CAGCCTATGCTCCTTTTAACTGGACTCAAGATGACGCTTCAAACGGGGCT
GTTCCAATTGAAGGAACTAGCCAATACGCCAACGGTTACGATGTCCAAGT
CGCTAAAAAAGTCGCTAAAGCTATGAACAAAGAACTTTTAGTCGTTAAGA
CCTCTTGGACCGGTTTAATTCCAGCATTAACTTCTGGAAAAATCGATATG
ATCGCTGCTGGTATGAGTCCTACCAAAGAGCGTAGAAACGAAATTAGCTT
CTCAAACAGCTACTACACTAGCCAACCTGTTCTAGTCGTAACTGCCAATG
GCAAATATGCTGATGCAACAAGCCTCAAGGATTTTTCTGGAGCTAAAGTA
ACTGCCCAGCAAGGCGTTTGGCATGTCAATCTCTTAACTCAACTAAAAGG
TGCTAAGTTACAAACACCAATGGGAGATTTCTCTCAAATGCGACAAGCCC
TTACTTCGGGTGTTATCGATGCCTATATTTCTGAACGACCTGAAGCCATG
ACTGCTGAAGCTGCTGATAGCCGTTTGAAAATGATCACTCTTAAAAAAGG
GTTTGCTGTTGCTGAATCAGATGCTGCTATCGCTGTCGGAATGAAAAAAA
ATGACGATCGTATGGCAACTGTCAACCAAGTGCTTGAAGGATTTTCTCAA
ACAGATCGTATGGCCCTGATGGATGATATGGTTACCAAACAACCCGTGGA
AAAGAAAGCCGAAGATGCTAAAGCATCATTTCTAGGCCAAATGTGGGCTA
TTTTTAAAGGTAACTGGAAGCAATTCTTACGTGGAACTGGAATGACCCTT
CTGATTTCCATGGTCGGAACCATTACAGGTCTCTTTATTGGATTATTAAT
CGGTATTTTCCGTACAGCTCCTAAAGCTAAGCATAAAGTAGCTGCCTTGG
GACAAAAACTCTTTGGTTGGTTACTCACTATTTATATCGAAATCTTCCGT
GGGACACCTATGATTGTTCAATCTATGGTTATCTACTACGGAACAGCGCA
AGCCTTTGGTATTTCGATCGACCGTACCCTAGCGGCTATTTTTATCGTAT
CTATCAATACGGGTGCCTATATGAGTGAAATTGTTCGCGGTGGTATTTTC
GCTGTCGACAAAGGTCAATTCGAAGCAGCAACTGCTCTTGGCTTTACTCA
CGGACAAACCATGCGTAAAATCGTGCTACCACAAGTTGTTCGCAACATTT
TACCAGCAACAGGTAATGAGTTTGTCATCAATATCAAAGATACTTCTGTC
TTGAATGTTATCTCTGTTGTGGAACTTTACTTCTCAGGTAATACCGTAGC
CACACAAACCTACCAATATTTCCAAACCTTTACGATTATCGCCATTATCT
ACTTTGTTCTTACCTTCACGGTGACACGTATCCTTCGTTATATTGAACGC
CGTTTCGATGCCGATACTTACACCACTGGAGCAAACCAAATGCAGATTGC
GGAGGTCTCAAATGTCTAA
>M5005_Spy0981 cfa, cAMP factor
ATGAAACCCAAACACCTTCTCTGTCTTTCAACAGTTGTTGCTGGATTAGC
TTTATTTTCAACTATGACGCACTCAGTTTTAGCTGATGATGCTTCAAATC
CCGATACTATTTTAATGAATAACAACCAAGCAAATTTTCAAAGAGATGCT
CTAGTGCAAAAGCTTGATGAGGGACATCAACAATTAGAAGCTATTAAACA
TGAAGCTAAAGGTACTGATATTGAGACTACTGTTAACAAAGCTATCGATG
CTGTTGATCACATGAAGAGTTCTATACGCTTCAATACTGAAACGATCTAT
GATTTTAGTTCAATTGGGGCAAGAGTAGAAGCATTATCAGATGCTATCAA
AGCAATCGTATTTTCCACAACCCAATTAACTCATAAAGTAGAAAAAGCGC
ATACTGATATGGGGTTTGCTATTACTAAATTAGTCATTCGTATTATAGAT
CCATTTGCATCTGTTGACGCTATCAAAGCTCAAGTACAAGAAATTAAAGC
ACTTGAGGAAAAAGTTATCAATTATCCTGATTTACAGCCAACAGACCGTG
CTACTATCTATACTAAAGCTAAACTAAATAAAGCTATTTGGAACACTCGT
TTAGAAAGAGATAAAAAGGTTTTGGGAATCAAACCATTTGACGTTTACAA
TAGACTTAACAAAGCTATCACACATGCGGTTGGTGTCCAACTAAATCCGA
CAACCACTGTTCAACAAGTTGACGATGAAGTTATTGCTGTGCAAGATGCT
TTGGAAACAGCTCTTAAGTCATAG
>M5005_Spy0947 ciaH, sensor protein
ATGAATAAATTAAAAAAAGAGATTTTATCAGATAACTATAACCACTTTTT
TCATTTTTTTGCGGTTTTTACAGGTATTTTTGTCATTATGACTATTATTA
TCTTACAGATTATGCGGTTTGGCGTTTATTCGTCAGTTGACAGTAGTTTA
GTTTCTGTTAGTAATAATGCAAGTAGCTATGCTAATCGTACGATGGCTAG
AATATCTTCTTTTTACTTTGATACTGAAAATAACATTATTAAGGCGCTGC
CTGATTCAGATAGTTCTAAGTTATTAGGAACGCCTGCAGCTAATACAGAT
ATCATTTTGTTTAGTGCTAATGGAACAATTTTAAATGCTTTTGATGCGTT
TTCTAACTATCAAAATTTTCATTTAGATAAACGCCGGTTGGGAAGTATTG
AAACCACCAGTTTAATGAATTTTTATGGACAAGAAGAAAAATACCATACG
ATAACTGTAGGGGTTCATATCAAAAATTATCCTGCAGTTGCCTATATGAT
GGCAGTAGTAAATGTGGAACAATTAGACCGCGCTAATGAACGTTATGAGC
GCATTATTATTATAGTTATGAGTGTTTTTTGGCTAATTTCTATTTTAGCA
AGTATTTATTTAGCCAAGTGGAGCAGAAAACCTATTTTAGAAAGCTATGA
AAAACAAAAAATGTTTGTTGAAAATGCTAGTCATGAATTAAGGACCCCTT
TGGCGGTCTTACAGAATCGTCTGGAATCGCTTTTTCGTAAGCCCAACGAA
ACGATATTAGAAAATAGTGAGCATCTCGCTTCTAGTTTAGACGAGGTTCG
CAACATGCGCATCTTAACAACTAATTTATTAAATTTAGCAAGACGAGATG
ATGGCATTAATCCACAGTGGACTCATTTAGATACAGATTTTTTTAATGCT
ATTTTTGAGAATTATGAACTAGTTGCTAAAGAATATGGAAAAATATTTTA
TTTTCAGAACCAAGTCAATAGATCGTTAAGAATGGATAAGGCTTTACTAA
AACAATTAATAACGATTTTATTTGACAATGCTATTAAATATACAGATAAA
AATGGTATTATTGAAATTATAGTGAAAACAACGGACAAAAATTTATTAAT
TTCTGTTATTGATAATGGTCCAGGGATAACAGATGAAGAAAAGAAAAAGA
TTTTTGATCGTTTTTATCGAGTTGACAAAGCTAGAACACGGCAAACAGGT
GGATTTGGCTTGGGGTTGGCTTTAGCTCAGCAAATCGTGATGTCTTTAAA
AGGAAATATTACAGTAAAGGATAATGATCCTAAAGGTAGTATTTTTGAAG
TCAAACTATAA
>M5005_Spy0948 ciaR, transcriptional regulatory protein
ATGATAAAAATATTATTAGTAGAAGATGACTTGAGCTTATCAAATTCCAT
TTTTGATTTTTTAGATGATTTTGCAGACGTCATGCAAGTTTTTGATGGCG
ATGAAGGTTTATACGAAGCAGAAAGTGGTATTTATGATTTGATTTTGTTA
GACCTTATGTTGCCGGAGAAAAATGGCTTTCAAGTCTTAAAAGAATTGCG
AGAAAAAGATATTAAAATTCCTGTATTGATCATGACAGCTAAAGAGGGTT
TAGATGATAAAGGCCACGGATTTGAATTAGGTGCTGATGATTATCTGACA
AAGCCGTTCTATTTAGAAGAGTTAAAAATGCGAATTCAAGCACTGTTAAA
AAGAACAGGGAAATTTGCAGATAAAAATATTAGTTTTGGCAATTTAGTGG
TTGACTTAGCTCGAAAAGAGGTGAAGGTTGAAGGGAAAGTAGTTGAATTA
CTTGGCAAAGAATTTGATTTGTTGGTGTATCTTTTGCAAAATCAAAACGT
TATTTTACCAAAGACACAAATTTTTGATCGTTTATGGGGATTCGATAGTG
ATACTACGATTTCGGTTGTTGAAGTTTACATTTCTAAAATAAGGAAAAAA
TTAAAAGGTACCTGTTTTGTTAACAGGCTTCAAACTTTAAGAAGCGTAGG
ATATATTCTAAAAAACAATGAATAA
>M5005_Spy0282 covR, response regulator
ATGACAAAGAAAATTTTAATTATTGAAGATGAAAAGAATCTGGCTAGATT
CGTTTCTCTTGAGCTGCAACATGAGGGTTATGAAGTCATTGTTGAGGTCA
ATGGTCGTGAAGGGTTAGAAACTGCTTTGGAAAAAGAGTTTGATTTAATC
CTGCTTGACTTAATGTTACCAGAGATGGATGGTTTTGAAGTGACCCGTCG
TTTGCAAACCGAAAAAACAACGTATATCATGATGATGACTGCGCGTGATT
CTATTATGGATGTGGTTGCAGGTTTAGACCGCGGTGCAGACGACTATATT
GTTAAACCGTTTGCCATTGAAGAACTACTTGCCCGTATTCGTGCTATTTT
CCGCCGTCAAGATATTGAATCTGAGAAGAAAGTGCCTAGTCAAGGCATTT
ATCGAGATCTAGTTTTAAATCCACAAAACCGTTCAGTTAATCGTGGCGAC
GATGAGATTTCTCTCACTAAACGTGAATATGATTTGCTTAATATTTTGAT
GACTAATATGAATCGTGTCATGACACGTGAAGAATTATTGTCAAATGTTT
GGAAATATGATGAAGCCGTTGAGACTAATGTTGTAGATGTCTATATTCGT
TATCTCCGCGGCAAAATTGACATTCCAGGCAAGGAATCTTATATCCAAAC
AGTGCGTGGCATGGGATACGTTATTCGTGAGAAATAA
>M5005_Spy0283 covS, transmembrane histidine kinase
TTGAAGAAAGAAAAGCAGTCAGTCTTTCAAGCTGTAAATATTGTTAGAGT
TCGTCTTTCTGAGGTGGACTCTAATTTTACATTAGAGAACTTAGCAGAAG
TTTTGTACAAAAACGATAAAACACATCTGAGAATTGATGACAGAAAGGGC
AGTCGAGTCATTAGGAGTGAGCGCGATATCACAAATACTCTAGATGCGAA
TCAAGATATTTATGTCTATAACATTGATAAACAGATGATTTTTACCACAG
ATAACGAAGAATCATCTCCTGGCTTGCATGGTCCTATCGGTCGTGTGTAT
CACGACCATATCGAAGATCAGTATCGTGGGTTTTCCATGACACAAAAGGT
ATATTCTAATCGGACTGGAAAATTTGTGGGCTATGTTCAAGTCTTTCATG
ATTTAGGCAATTATTATGTCATTAGAGCAAGACTGCTGTTTTGGCTACTA
GTTGTTGAGTTATTTGGCACAAGCTTAGCCTATTTAATCATCTTAATTAC
TACGCGGCGCTTTTTGAAGCCTTTACACAATTTACATGAAGTGATGCGTA
ATATCTCTGAAAATCCTAATAATTTAAACCTGCGCTCAGATATTTCGTCA
GGAGATGAAATCGAAGAATTGTCTGTTATCTTTGACAATATGTTAGACAA
ATTGGAGACACATACTAAGTTGCAATCACGTTTTATTAGTGATGTCAGCC
ATGAATTACGAACACCGGTTGCGATTATTAAAGGGCATATTGGTCTCTTA
CAACGTTGGGGTAAAGATGACAGTGATATTCTTGAAGAAAGCTTGACAGC
AACAGCGCATGAGGCTGACCGTATGGCAATCATGATTAATGATATGTTAG
ACATGGTTCGCGTACAAGGCTCATTTGAGGGACATCAAAATGATATGACA
GTTTTGGAAGATTCTATTGAAACTGTTGTTGGTAATTTTAGAGTTTTAAG
AGAAGATTTTATCTTTACATGGCAGTCAGAAAATCCAAAAACGATAGCCC
GTATTTATAAAAATCATTTTGAGCAGGCTTTGATGATTCTGATTGACAAT
GCTGTGAAGTATTCCCGTAAAGAAAAGAAAATCGCGATTAACCTTTCAGT
GACTGGCAAACAAGAAGCTATTGTTAGAGTTCAAGATAAAGGCGAAGGAA
TTTCTAAAGAAGATATTGAACATATCTTTGAACGCTTTTATAGAACGGAT
AAATCACGTAATCGAACAAGTACCCAGGCTGGATTAGGGATTGGCTTGTC
TATTCTCAAGCAAATTGTAGATGGGTATCATTTACAGATGAAGGTTGAAA
GTGAATTAAATGAAGGTTCAGTGTTTATCTTACATATTCCTTTGGCCCAG
TCTAAAGAGAGTTAG
>M5005_Spy0830 dpiA, transcriptional regulatory protein
ATGAACGTTTTAATCATTGAAGATGATCCTATGGTGGATTTTATCCATCG
CAATTACCTCGAAAAACTAAATCTTTTTGATCGCATTATATCCAGCGACT
CTATGAAAGCTGTTCAAAGCATACTTACTGATTACGCAATTGACCTCATT
TTACTGGATATTCATATTACAGATGGCAATGGGATTCAATTTTTGGAGAA
ATGGCGTACTCAGCATATTCCTTGCGAAGTCATTATTATTTCAGCCGCAA
ATGATGGGAATATTATCCGAGATGGTTTTCATTTAGGAATTATCGACTAC
CTCATCAAGCCCTTTACCTTTGAACGCTTTCAAGAAAGCATCCAACAGTT
TGTTACACATCGAGAACATTTGGCCAATCAGCAACTAGAGCAGGCCCAAA
TTGACCAACTGAAATGTTTGACTAGCAAAAAAGACACTAAAAACAAACAA
TTGTTAGAAAAAGGCTTATCTGAATCCACTTTCCAGTGGATTATGGAAAA
TATCAAAGTCTTTGATCAACCTTTTACTATCCAAGAATTAGCTTCCGCTT
GTCACTTATCCCATGTCTCTGTCCGTAAATACATTGCTTATTTAGAAGAA
AATAAGCAACTGAACAGCCAACAAATTTTTACAAAGGTTGGCCGCCCCTA
TCGCGTGTACTGGTGA
>M5005_Spy0831 dpiB, sensor kinase
ATGAAAAAACCACTACGTTTATGGGCCAGTTTATCGTTGATTTTGGTATC
TATGATTGTTGTCACAACCTCTCTATTTTACGGGATTATGCTACATGATA
CGCACCAATCCATCAAAAATCAGGAAACCCATTTGCTAACGTCAACTGGA
AAAATGTTAGCAAGTCATCAAGCGATTAAAGAATTACTCCTAAACAACCA
ACCAAATGCTAAAACAACAGCCTATACCAACTCCATTGCCTCCATCTATA
ACCTTGATTATGTGGTCGTGATGAACATGAAAGGGATTCGACTCACCCAT
CCTAACCCGAAAAATATCGGAAAACCTTTTCAAGGAGGTGATGAGGAGGC
TGTTCTAGCAGGAAAAAAGGTTATCTCTACCGCCAAGGGCACTTTAGGAA
AGTCACTTCGCTATCTAGTACCTGTGTTTGACGGTGACAAACAGATTGGT
GCTATTGCGGTTGGCATTAAACTAACTACCCTAAATGATGTGGCTTTAAC
GTCAAAACGCAATTATACCCTGTCTTTACTCCTTTGTCTTCTTATTAGTT
TACTGGTCACCAGTTTTATTTCTTTTCGACTCAAGCGTCAACTGCACCAG
TTAGAACCAAGTGAAATTTATCAGCTCTTTGAAGAGCGTAATGCCATGTT
GGATCAAATCGAAGCCGCCGTATTTGTGGTAGATAAAGCTGGTATCTTAC
AGCTCTGCAATCAGGCTGGACAAAAATTAATTGCTCGGAAATGCCAGTTG
GGAAAACCTACTGGCAACAGTTTCAATTACCTCTTTCCTGATTTTCCAAA
ACTTAGTTTGCAAGAGGGGCATGAACAACTCTTTCGGTATGGTGAGGAAG
ACTACTTGTTAGCCATTTCACCCATCTGTGTCAAAAACGATCACCGAGGC
CATATTATTTTCATGCGAGAAGCAGTTAAGGCTATTGATACCTTGGATCA
GCTAGCCTATACCACTGCCTATGCTTCTGCTCTACAAGCCCAAACTCATA
AATTCATGAATCAATTGCATGTTATTTATGGCTTAGTGGATATTGCTTAT
TATGACCAATTGAAAATTTATTTAGACAGTATTTTGGAACCCGAAAATGA
AATTCTCACTAGCTTATCTGTCCTTGTTAAGGAGCCTCTTCTAGCTAGTT
TTCTCATTGGAGAGCAAGAGAAATACCAAGAATTAAATGTCCATCTCAAG
ATTGATGTTTTAAGCGAGATTCCTCATTCTGCCACCAAGAATCAACTTAA
TAATGGTTTGATGATTTACCGCTTTATCCATACTAATCTTCTAACCACAC
TGAGACCCAAATCACTCGTTTTGAGTATTCAACATGACCAGAATCATTTA
ATCAGCCATTACACCTTGACAGACAATTGGATTGATTTGGAGCGGGTACA
GCCTATTTTTGACTTACCTTATTTTCAACAGCTCTTGACCGATACAAATT
CCCAATTCCATCAACATCAAACCGTAACCGAGTTACAGTTCTCAGTGACA
ACACCTTATGTAGGAGGGCAACATGAACGTTTTAATCATTGA
>M5005_Spy0206 fasA, response regulator
ATGATGAACATTTTTATTCTTGAGGATGATTTTATCCAGCAGACACGCAT
AGAATCTATCGTAGTAGGCATCTTAAAAGAGACTAGAATACCATGTAATC
AGCTTGAAGTGTTCTCGACTCCTCAAAAATTATTTGAGAGTATCCAAGAA
AGAGGAGACCATCAGCTGTATTTTTTAGATATTGAAATTGGTGAATATAC
TCGTTGTGGGCTTGAATTAGCTGCAGCTATTCGACAAAAAGATCCTAATG
CCGTTATTGTGTTTGTCACCACTCATTCAGAATTTGCTCCTATTTCTTTT
AAATATAAGGTATCCGCTCTAGATTTTATTGATAAAGCAGGTGGTCAAAA
ACAGTTTAAAGAACAAATCGAAGAATGTATCCGATATACTTACGATATGA
TGTCTAGTCGTGAGTCAAAGGACATGTTTTTATTTGAGACTCCACAGACA
AGATTAAAATTGCCCTATAAGGATATTTTATACTTTGCTACAGCCACAAC
TCCTCACAAAGTTTGTTTATGGACTCAGACAGAAAGATTAGAGTTTTATG
GTAATCTATCTGAGATTCAAGCAGTAGCACCGAAACTTTTTTTGTGCCAT
AGATCCTACCTTGTGAATCTAGATAAGGTTGTTCGAATTGATAAGAGTAA
GCAGCTCCTTTATTTCGAAAATGGTGATTCTTGTATGGTATCACGATTAA
AAATGAAATGTCTGTTTGAACGGTGGGAGGCTCTTCGCTAA
>M5005_Spy0204 fasB, sensory transduction protein kinase
ATGGCTAATAGCGAATATATGTTTTTATTATTATCAATTATTGTCTATTA
TATGACAAAAATTTATATTTTTTCCTTTCTATCTGATATCACATTACCAG
TTTGGAAACAACTAACGATTTTGGCTTTAGCCCTATTTTTCAATCAGTTC
CCGTATTTGTCGCCATTGCTAATTGATCCTCTATTATTTTTAGTTGTTTT
AAGGCAAGAAACCAAGCAATTATTTTCTTTGAAAGCTCTTTTTTTGGCTG
TTGCACCTAGTGTTTTGGTGGATTTGCTATCTCGATTTATGGGTACAATC
GTTATCCCCTATCTTTTTTTGTCGAGTGGTATTTATCTGGGTCATATTAT
CTTTGACTTGCTTGCTTATCTGCTGATTTTTCCAAGTTTTGCTATTATTA
ATTATATGATTGGAAAAGATTACAAGATGATATGCCAATCCGGATATTCG
AAACGATCGCATAATTTCTATCAAACATTGCTGATTTTTGTTTTGGTTTA
TTATGTGGACATTTTTGTCATTTTAGGATTTACGGACCCCTTTTTACATT
TTCATCATTCTCTTTTTGTTCCCACACCTTATAAGTTATTGTTTTTGATG
TTTATACTTCTTTTAGTTTATCTTCTATCTTATTTTAATCATAGTTCTAA
AGAATACCTTAAAAATGAGTTGAGAAGAGAACAACAAGCTTATATGACTA
ACTTAGAGATTTATGGGAAACATCTTGAGAAACTCTATCGAGATGTAAGA
GCTTTTCAAAGTGATTACCTGAGCCGTATAGAGCGTTTAGGTCAAGCCAT
TAAGAGTGAATCCATTACTCAGATTCAAGATATTTATGCCCAAACGGTTC
ATGAAGCTAACGACTACTGGGATGATAAACACTATAATATCTCGAAGCTT
AGGAAAATTAATATCTCATCGATTAAGAGCTTATTGTCAGCTAAAATTAT
CAGTGCGGAAAAATCAGGTATTGATTTGAATGTGGAAGTGCCAGATAATA
TAAAAGAGACTTACATTCCTGAGTTGGACTTACTATTGTTGATGTCTATT
TTTTGTGATAACGCCATTGAGGCAGCTCTTGAAGCACAACAACCTCATAT
GTCAATTGCTTACTTTTTGTTAGGTGACTATCAGATGTTTGTTGTGACAA
ATACGACTAAAAAAAAGGTAGACATTAACAAGATCTTTGAAGAAGGCTAT
TCTTCAAAAGGTTCAGAACGTGGTATCGGCCTTTCTAATGCGCAGCGTAT
TCTCAAAAAGTATCCTTATTTATCCTTGCGGACTAAAAGTTTTGATAAGG
AATTTAGCCAAACCTTGACCATGCCAAAGGAGGAGGTGGATAGATGA
>M5005_Spy0205 fasC, sensory transduction protein kinase
ATGATGGTTATATACAGTATGGCTTTATTCTATGCTACCATCTTTATTAA
CAGCTGGGTCATTTTTGCAAAGGTTTCTGCTATTAAACTAAGCTGGAAAC
GGGTTAGCATTATAGGCATTAGTTTTGTAATTGCTAATATGATATTTGAC
AAAGTCATTTTGATTGACCAACTGTTCTTTATTATTGTTAGTTTGTTAAG
TGCTCCGAAAAAGAAATTATTTGAGCATATGTTTAATGGTTTCTTTACTA
TCTTGATTGTCGAATTACTGTTTCGCGTCATCGGATCTTTCTTTTTACCA
GCTGTCTTAGGATTTAGCATTGGTCAAATTAATAATAACCTTAAGCTTTT
AGAGTTATGTTATCTTTTTGTATTACCAATATTTTATCTGTTTAGCTACA
TTTTCAGTATTGACTTAAGCTTAATAAGGTTTATCAGTGAAGATAAGATG
AAAAAGTGGGTATTTTGGATGAATACTGCCATGTTTTCTTACTACTTTTT
CGCCCATTTTTTGGTAACTGTGCAAAGCGGATTTCTTGCACTATATTTCC
AGTACCGGTCTATTTTAGTATTTATTTATTTAGCTATTTTTATTTGGGTT
ATTGTGAAATTAGATCGATTTGCTAAAGATCAGCTGTCACAAAAATTAAC
ACAAGCACAAAATGAACGTATTGCGTATCTTGAAAATTACAATCAATCGA
TTGAGCAACTTTACCGAGAAATCAGAACAGTTAAACATGATTCTGAAAAT
ATTTTAATTAGTCTAAAAGATAGTATCGATAGTGGTGATATAGATCTGAT
TACTAGAGTTTATGACACGGTTATTCAGCAATCGGCAACTTCTATGATGC
GCACAAATTATGAAATATCTTCTTTAGACAATATCAAAGAGGCTGTGATT
CGCAGTATCATGAATTCCAAATTGCTTGAAGCTCAGTATTTGGGTATTGA
ACTTTATATTGAGATTCCAGATGTTATCGATCATTTACCTATTAAGTTAA
TCGACTTAATTGTACTTTTTACTGGACTAGTGGACAATGCTATTGAGACA
GCCAAAGGCAGTAGACGTCCTTTTTTATCTATTGCATACTTTAAACAAGA
TAACAAGCAATTATTTATTATTGAAAATAGCACAAAAACCAATCGTGTGG
ATATAGCCAAACGCTTTGATGCTCAGCAGCAGAACTCAGCCCACTTTTTG
ACTGTTTTAGATAGTTACCCCCAAATAACGCTTTCGACTAAAAGTGACCA
TTATCGATTAAGACAATTGTTAGAAATGAGATAA
>M5005_Spy0662 fruA, PTS system, fructose-specific IIABC component
ATGAAAATTCAAGATTTATTGAGAAAAGATATTATGATTCTCGATTTACA
GGCTATTTCTAAAGAAGTTGCCATTGACGAGATGATTACTAAATTAGTTG
AAAAAGATATTGTACATGATTTTGATGTCTTTAAAAAGAGTATCATGACA
CGTGAAGAACAAACATCAACAGGGCTTGGTGATGGGATTGCCATGCCTCA
TTCTAAAAATATTGTAGTAGATAAACCAGCGGTCTTGTTTGCGAAATCAA
ATAAAGGTGTGGATTACAAGGCTTTAGATGGTCAACCAACGGATCTCTTC
TTTATGATTGCTGCGCCTCAAGGAGCAAATGATACTCACTTGGCTGCACT
AGCAGAATTATCACAATACCTTTTGAAAGACGGCTTTGCTGATAAACTTC
GTGCTGCAGCGACACCAGAAGCAGTCATTGCTGTTTTTGATGAAGCGTCA
ACAGCTAAAGAAGAAGTGGTTGCTCCAACAAGTGGTCAAGACTTTATCGT
TGCTGTTACAGCTTGTCCGACAGGAATTGCTCACACTTATATGGCAGAAG
AGGCTTTGAAAAAACAAGCTGCAGAAATGGGAGTAGCTATTAAAGTTGAA
ACAAACGGTGCTTCTGGTGTGGCTAATCGTTTAACCGCTGAAGATATTCA
GAGAGCTAAAGGAGTTATTGTTGCAGCTGATAAAGCGGTTGAAATGGACC
GTTTTGATGGTAAACAATTCATTGCTCGCCCTGTTGCAGATGGTATCAAG
AAAAGTCAGGAATTGATTTCTTTGATTTTAAACAATGAAGGAAACACTTA
TCATGCTAAAAATGGAAAATCTGAAACAGCAGTATCAACTGAGAAAACAA
GTTTAGGCGGTGCTTTCTATAAACACTTGATGGGCGGTGTCTCACAAATG
TTGCCATTTGTTATTGGTGGCGGGATTATGATTGCTCTAGCATTTTTATT
GGATAACATGCTTGGTGTGCCAAATGATCAGCTTGGAAGTCTTGGATCCT
ATCATGAAATAGCAGCTATTTTTATGAACATTGGTGGAGCAGCCTTTTCC
TTCATGTTACCAGTACTAGCAGGTTATATCGCTTATTCTATTGCTGAAAA
ACCGGGCTTAGTAGCTGGTTTTGTGGCAGGTGCCATTGCCTCAAATGGTC
TTGCTTTTGGTAAGGTACCATTTGCAGCAGGAGGAGAAGTGAGCTTGGGC
TTAACGGGCGTGCCATCAGGTTTCCTTGGGGCGCTTGTGGGTGGTTTCCT
TGCCGGTGGTGTTATTCTTGCCCTTCGTAAATTGTTGGCAGGCCTACCAC
GTTCTCTAGAAGGGGTTAAATCTATCCTCCTTTACCCATTACTTGGCGTC
CTTGTCACTGGTTTCTTGATGCTTTTTGTCAATATTCCAATGGCAGCTAT
TAACACAGCCCTTAATGATTTCTTACAAGGTCTTTCAGGAAGCTCTGCTG
TCCTTATGGGACTTCTTGTTGGTGGAATGATGGCTGTTGACATGGGTGGT
CCTGTTAATAAGGCAGCTTATGTTTTTGGTACAGGAACTTTAGCAGCTAC
TGTGGCAAATGGTGGTTCGGTCGTTATGGCCGCTGTTATGGCAGGTGGTA
TGGTACCTCCTCTTGCTGTTTTTGTAGCCACTCTCTTGTTTAAAGATAAA
TTTACCAAAGAAGAACGTGAATCAGGCTTGACAAATATTGTTATGGGACT
TTCATTCATCACCGAAGGAGCAATTCCGTTTGGTGCAGCTGACCCAGCAC
GTGCGATTCCTAGCTTTATCGCAGGTTCTGCCTTGACAGGAGCTCTTGTT
GGTTTGGCTGGTATTAAATTAATGGCGCCACATGGTGGTATCTTCGTAAT
CGCTTTAACAAGCAATCCAATCTTATATCTTGTCTTTGTTGTGATTGGTG
CCCTTGTATCAGGTATCTTATTTGGCGCTCTTCGCAAAAAAGCCTAA
>M5005_Spy1076 glnH, transporter
ATGACGCACAAAATAAAAGTATTGCTGCTTGCGATAATGTCTATTTTTTT
GACATGCAATATTGCAAGTGCTGAAACTATTGCTATTGTTTCAGATACAG
CTTATGCCCCATTTGAATTTAAAGACTCAGATCAAATTTACAAAGGAATT
GACGTTGATATTATTAATGAAGTAGCCAAACGTCAATCTTGGGATTTCAG
TATGAGTTTCCCGGGTTTTGATGCAGCTGTAAATGCTGTTCAATCTGGTC
AAGCGAGTGCTCTAATGGCCGGTACAACCATTACGAATGCTCGTAAGAAA
GTCTTTCATTTCTCAGAGCCATATTACGATACCAAAATTGTCATTGCGAC
ACGTAAAGCCAATGCCATCAAAAAATACAGTGACTTAAAAGGAAAAACGG
TCGGTGTTAAAAATGGAACAGCGGCTCAAGCCTTTTTGAATAACTATAAA
AAAAAGTATGATTATACTGTTAAAACATTTGACACAGGTGATCTTATGTA
TAATAGTTTATCTGCTGGTTCTATTGCCGCTGTTATGGATGATGAGGCGG
TTATCCAATACGCAATCAGCCAAAACCAAGATATTGCTATTAACATGAAA
GGAGAGCCCATTGGAAGCTTTGGGTTTGCTGTCAAAAAGGGAAGCGGATA
TGATTATCTAGTTAATGATTTCAATACAGCTCTTAAAGCTATGAAAGCTG
ATGGTACCTACCAAGCTATCATGACCAAGTGGTTAGGCACAGATGATAAA
GCTACCACCAGTCAGGCAACGGGAAATCCATCTGCCAAAGCTACACCTAC
AAAGGACAGTTATAAAATTGTCTCTGATTCGTCTTTTGCACCTTTTGAAT
TTCAAAATGGTAAGGGCAAATACGTTGGTATTGACATAGAATTAATCAAA
GCTATTGCTAAACAACAAGGTTTCAAAATTGAAATCGCTAATCCAGGTTT
CGATGCTGCCTTAAATGCTGTGCAATCTAGCCAAGCAGATGGGGTCATTG
CTGGTGCAACTATTACTGACGCTCGTAAAGCTATCTTTGATTTTTCTGAT
CCTTATTATACTTCTAATATCATTTTAGCTGTTAAAGCTGGAAAAAACAT
CAAGAACTATGAAGACTTAGACAGAAAAACAGTCGGTGCTAAAAACGGCA
CTTCATCTTACTCTTGGTTAAAAGAAAACGCTCCTAAATATGGTTATAAT
GTCAAGGCATTTGATGATGGTTCTAGCATGTATGATAGCTTAAATTCAGG
TTCTGTAGATGCTATCATGGATGATGAGGCGGTTCTTAAATACGCTATCT
CTCAAGGTCGTCGCTTTGAAACACCTCTTGAGGGCATTTCTACTGGTGAA
GTTGGTTTTGCTGTCAAGAAAGGAACTAATCCAGAATTAATCGAAATGTT
CAACAATGGCTTAGCTGCTCTCAAAAAATCTGGTCAGTATGATGACATTA
TAGATAAATACCTTGACTCTAAGAAAGCTGCAACTCCTTCTGAAAAAGGT
GCTGATGAGTCTACTATTTCAGGCCTATTATCAAATAACTACAAACAACT
ATTGGCAGGACTTGGAACCACGCTCAGTTTAACCCTTATTTCATTTGCTA
TTGCTATAATTATCGGGATCATCTTTGGGATGATGGCCGTGTCACCAACT
AAATCACTTCGACTTATTTCAACGGTCTTTGTGGACGTTGTTCGAGGGAT
TCCTTTGATGATTGTGGCTGCCTTCATTTTCTGGGGAGTACCAAACCTTA
TCGAGAGTATGACCGGCCACCAGTCACCGATTAATGATTTCTTAGCTGCT
ACAATTGCACTGTCACTTAATGGCGGAGCCTATATTGCTGAAATTGTTCG
CGGTGGTATCGAAGCTGTTCCAGCAGGGCAAATGGAAGCTAGTCGAAGTC
TTGGTTTGTCTTACGGAACCACGATGAGAAAAGTAATTCTCCCACAAGCT
GTGAAACTAATGTTACCTAACTTTATCAATCAGTTTGTTATTTCATTGAA
GGATACAACAATCGTCTCAGCAATTGGTTTAGTGGAACTCTTCCAAACAG
GTAAAATCATTATTGCTAGAAATTACCAGTCGTTCCGTATGTATGCTATT
TTAGCAATTATTTACCTTATCATGATTACACTCTTAACAAGACTTGCAAA
ACGTTTAGAAAAGAGGCTTAACTAA
>M5005_Spy1724 ihk, two component system histidine kinase
GTGAGACTAATCAAAAAAACCTTTTTGGTCATCAATGGCTTAATTATTGT
AGTGGTTACCTCTATTTTGTTAGTGCTTTATTTTGCAATGCCAATTTATT
ACACCAAAGTCAAAGACAAAGAAGTTAAGTGTGAATTTGACCAAACAAGC
AAGCAAATCAAAGGCAAAACGGTAACCGAGATTAGAGATATCCTAACAAA
AAAAATCAACAAAGATAATATTTGGTACAGCTTAGTAGACAGTGATAACC
AACTGCTCTATCCTTCCTTGCAGCTCCTAGACGGCGTCAGTGAAAGCAAA
GACAGTCAAAATGTTAATATCGTCACCACCTTTGACAACTCTTATTCTAA
TGTTAAGGTGATGAGTCAAAAAGTAACCCTACGCGATGGAAAAAAAATGA
CATTGCTTGGGCAATCTTCACTTCAACCCGTAACAGATGCTAGCAAAGTT
CTCCTTGACCTCTACCCGTCACTATTGATTTTTTCAGTGACCGTAGGGAG
TATTGTCGCCTACTTATATAGTAGGACTTCTAGCCGGCGTATCCTTAGCA
TGTCACAAACCGCCAAAAAAATGGTCAACCTAGAACCAAACTTAACGTGT
ACCATTCACGGCAAAGATGAAATAGCAATGTTGGCTAGTGATATTAACCG
TTTGTATGCGAGTCTTTCAACGAGCATCAAATCCTTGCAAAAAGAGTATG
AAAAAGCTTCTGATTCAGAAAGAGAGAAATCTGAGTTTTTACGCATGACA
TCGCACGAGCTAAAGACACCAATCACTAGTGTTATCGGAATGATTGATGG
AATGCTCTATAATGTTGGTGACTTTGCAGATCGTGACAAATATTTGCGAA
AGTGCCGAGACGTCCTTGAAGGGCAAGCCCAACTGGTTCAATCCATTTTA
TCTTTATCTAAGATTGAAACCCTAGCTTCTCAAAATCAAGAACTGTTTTC
ACTAAAAAGCAGCCTAGAAGAAGAAATGGAAGTCTTTCTCGTCTTATCAG
AACTAAAACACCTCAAAGTGACTATCAATCTTGAAGAACAATTCGTCAAA
GCCAATAAAGTATATCTACTAAAGGCGATTAAAAATATTATTGACAATGC
CTTTCACTATACCAAATCAGGCGGCCAAGTGATGATTCAACTAAAAGACA
ACCAACTAGTGATTAAAAATGAAGCAGAGACATTATTGACACAACAGCAG
ATGAAACAGTTATTCCAACCGTTTTATCGACCAGATTATAGTCGTAACAG
GAAAGACGGTGGTACAGGATTGGGGCTGTTTATCACCCACCAGATTCTTG
ATCAGCATCATCTGGCTTATCGCTTTGTTGTTCTTGATCAAAGATGGATG
GTATTTACGATTGATTTTCCATCCCATCATGACGATTGA
>M5005_Spy1725 irr, two-component response regulator
ATGTTTAAAATATTAGTAGTTGAAGATGATGATACCATCAGTCAAGTGAT
TTGTGAGTTTTTAAAAGCGAATAACTATGATCCAGATTGTGTATTTGATG
GCCAAGCTGCCTTAGACAAGTGGCAGACAACGTCTTATGATCTGATTATT
TTAGACATCATGCTCCCTTCCTTAAGTGGCTTAGAAGTGCTAAAAACAAT
TCGAAAGACATCAGATGTCCCTATTATTATGCTAACGGCATTAGATGACG
AGTACACACAGCTTGTAAGCTTCAACCATTTGATTAGTGATTATGTGACC
AAACCATTTTCACCACTCATTTTAATCAAACGTATCGAAAATGTATTACG
CGTCTCTACTCCAGATGAAAAGCGCCAAATCGGAGACTTACTTGTTGATG
AGACCGAACATAGCGTCTATTGGCAAGGAACATTGGTCAAACTAACCAAA
AAAGAATATGACATTATTGATTATTTAGCAAAACGTCACCAAAAAATTGT
CACCAGAGACCAATTGATGGATGACATATGGGGCTATTCTGAACTGGACA
CGCGTGTCCTTGACAACCACATCAAGAACCTTCGTAAAAAAATGACGGGT
ATTCCCCTCAAGACAATTACAGGCATGGGCTATTTATTGGGAGAGCGTGA
GTGA
>M5005_Spy1683 lrp, leucine rich protein
ATGGAGCTAAAAGACTATTTTCCAGAGATGCAAGTAGGCCCTCATCCGTT
AGGAGATAAAGATTGGATGAGTATCAAAGAAGGGGACCAATATGTGCATT
TTCCCAAATCATGTTTATCCGAAAAAGAGCGCTTATTACTTGAGGTGGGG
CTGGGTCAGTGTGAGGTCTTGCAGCCGCTAGGGTCACCTTGGCAGCGGTA
TTTGCTTGATCATCAGGGCAATCCCCCTCAGCTGTATGAGACTTCTCAGT
TCATTTACCTTAATCATCAGCAGGCTTTACCAGATGACTTAGTTGAGTTG
CTCCAACAAATGATTGCAGGGCTTGAAGTCATTTTGCCTATCAGTGCAAC
CCAAACGGCATTTTTATGCCGACAAGCAATCTCAATAAAGGTCTTGCGCT
GGCTTGAAGATCTCCTGCCAACGCTAGAAAGTGATTTTGGTTTGGCCTTA
ACCATGTTTGTTGGAAATGCCTGGTATCAGGTAGCTGCGGGTACATTGAG
AGAGTGTTTTGAGGAGGAATGTCAGCTGTTAACGGCCTATTTAAGGCAAC
AATCAGGCAGAAAATTATTAACATTTTCAGGACTGATGCTGTGGTCTTTG
CTGTCGCACCACACTTTTTTGGCATTGACGCGTCAGTTTCACCAATTCCT
AAGTCCTCAAAGTGATATGGCCGATGTGGTTCACGCGCTATGGTCAGAAC
ACGGCAATCTGGTGCAGACAGCGCAGCGCTTGTATATTCACCGTAACTCC
TTGCAATACAAACTTGATAAATTTGCTCAGCAATCAGGACTCCACTTGAA
GCAATTGGATGATTTAGCCTTTGCTCATCTCTTTTTGTTGAAATATTAG
>M5005_Spy1349 luxS, autoinducer-2 production protein
ATGACAAAAGAAGTTATCGTCGAAAGTTTTGAGCTAGATCATACTATTGT
AAAGGCCCCTTATGTTCGTCTTATTTCTGAAGAATTTGGACCCAAGGGCG
ATCGTATTACAAATTTTGATGTTCGCCTAGTGCAGCCTAACCAAAATTCT
ATTGAAACAGCCGGTTTGCATACCATTGAACACTTACTTGCCAAGCTCAT
CCGCCAACGCATTGATGGGATGATTGATTGCTCTCCTTTTGGCTGTCGAA
CAGGTTTTCACCTTATCATGTGGGGAAAACACAGTTCTACTGATATTGCC
AAGGTGATTAAATCCAGCCTAGAAGAAATTGCAACTGGGATTACTTGGGA
AGATGTTCCTGGAACAACTCTTGAATCCTGTGGGAACTATAAGGATCATA
GCCTCTTTGCCGCCAAAGAATGGGCTCAATTGATTATTGATCAAGGGATT
TCAGACGATCCTTTTAGTCGCCATGTCATCTGA
>M5005_Spy0239 mecA, negative regulator of genetic competence
ATGGAAATGAAACAAATTAGCGAGACAACGCTAAAAATAACAATTAGTAT
GGACGATTTAGAAGAAAGAGGAATGGAGTTGAAAGATTTCTTGATTCCTC
AAGAAAAAACAGAAGAGTTTTTCTATTCTGTGATGGACGAACTCGATCTT
CCAGATAATTTTAAAGATAGTGGTATGCTTAGTTTTCGAGTGACTCCACG
CAAGGACCGTCTAGATGTTTTTGTTACCAAATCTGAGATAAATAAAGATA
TTAATCTTGAAGATTTAGCAGAGTTTGGTGATATGTCCCAAATGACTCCG
GAAGATTTTTTCAAGAGCTTGGAGCAATCCATGCGTGAAAAGGGAGATGT
CAAAGCTCATGAAAAATTGGAAAAAATTGAAGAGATAATGGAAGATGTTG
TTGAAGCCACTCTAGCTAATCAGTCTGAGGCGGCTGATCCATCAACTAAT
CATGAGTCAGAACCTTTAGACTATGTCCATTATGTATTGGATTTTTCAAC
GATTACAGAGGCAGTGGCTTTTGCTAAAACGATTGATTTTTCGATAGAAG
CTTCAGAGTTATATAAGGGGAGCAACTGCTACCATATGACTATTTTATTA
GATGTTCAGCAACAACCATCTTATTTTGCGAACGTCATGTATGCGAGATT
GATTGAGCATGCAAACCCTGGATCAAAAACAAGAGCTTATTTACAAGAGC
ATGGCTTACAATTGATGCTTGATGGTGCTGTTGAGCAATTACAAAAGATT
GAGTTGGGATAA
>M5005_Spy0386 phoH, phoH protein
TTGCAAGAGTATTCTATTGACATTACCTTAACCCATCCTGATGATGTTTT
AGCTCTTTTTGGTAGCAACGAGCGTCATTTGAAGCTAATAGAAGCTCATT
TAGGAGTTATTGTTCACGCAAGAACCGAGCGAGTCCAAGTGATTGGTGAT
GATGAAGAAGCTGTGGAATTGGCTCGATTGACCATCAAAGCCCTACTGGT
TCTAGTGGGTCGTGGCATGGTGGTCAACACATCAGATGTGGTGACAGCTT
TATCTATGGCAGAATCTCATCAGATTGACCAATTTATGGCGCTTTATGAA
GAAGAAATCATTAAAGATAACTATGGTAAGGCAATACGAGTCAAAACATT
AGGTCAAAAAACCTATGTTGATAGTGTCAAACGTCATGATGTGGTTTTTG
GTGTAGGACCTGCAGGGACAGGTAAAACCTTCTTAGCTGTTACGCTTGCA
GTCACTGCTCTGAAAAGAGGACAGGTAAAGCGTATTATTTTGACGCGTCC
TGCGGTAGAAGCTGGCGAAAGCCTAGGTTTTTTACCAGGCGATTTGAAAG
AAAAGGTGGATCCTTACCTCAGACCTGTTTACGATGCCCTTTATCACATT
TTAGGCAAGGAACAAACCACACGCCTGATGGAACGAGATGTGATTGAGAT
TGCTCCGTTAGCTTATATGCGAGGTCGTACTCTGGATGACGCTTTTGTTA
TCTTAGATGAGGCTCAAAACACGACCATCATGCAAATGAAGATGTTTTTG
ACCCGTCTTGGTTTTAATTCTAAAATGATTGTCAATGGAGATACGAGTCA
GATTGACCTCCCTCGAAATGTCAAGTCTGGTTTGATTGATGCTACTCAGA
AATTACAAGGCATTAAACAGATTGATTTTGTCTATTTCTCTGCTAAGGAT
GTTGTCCGACATCCTGTTGTGGCTGATATTATCAAGGCTTATGAAACGTC
CTCAGAGGAGATGAAGGACTTACTAAAACCTAAGGCTAGTGACGTTGAAG
CTGATTACCAGCCAGGCTTGACAAAATACCCTGTGATCGGTCAAGAGCAC
TAA
>M5005_Spy1336 pppL, protein phosphatase 2C
ATGAAGATTTCATTAAAAACAGACATTGGGCAAAAACGCTCAAACAATCA
AGATTTTATCAATAAGTTTGATAATAAAAAAGGCATCACTTTAGTGATTT
TAGCAGACGGTATGGGTGGCCACAGAGCTGGAAATATTGCCAGTGAGATG
ACAGTCACAGACCTGGGAAGAGAATGGGTAAAAACAGACTTCACAGAGTT
AAGTCAGATTAGAGATTGGTTATTTGAAACTATCCAGTCAGAAAATCAAC
GGATTTATGATCTAGGCCAATCAGAAGACTTTAAAGGAATGGGAACGACT
GTTGAAGCAGTAGCTTTAGTTGAATCTAGCGCCATTTATGCTCATATTGG
TGATTCACGGATTGGTCTTGTCCATGATGGGCATTATACCTTATTGACCA
GTGATCATTCTTTAGTGAATGAGTTGGTTAAGGCAGGACAGATCACAGAA
GAAGAAGCTGCTAGCCATCCACAAAGAAATATTATCACTCAATCTATTGG
TCAAGCTTCCCCAGTAGAGCCTGATTTAGGAGTGAGGGTTTTGGAGCCAG
GGGATTATCTTGTCATTAACAGTGATGGTCTAACCAATATGATTTCAAAT
GATGAAATTGTGACTATCTTGGGCAGTAAGGTTAGTCTTGATGAAAAAAA
CCAAGAAATGATTGACTTAGCTAACCTAAGAGGAGGCCTAGATAATATTA
CAATCGCTTTGGTTCATAACGAAAGTGAGGACGTCGAATGA
>M5005_Spy0229 prgA, surface exclusion protein
ATGGACTTAGAACAAACGAAGCCAAACCAAGTTAAGCAGAAAATTGCTTT
AACCTCAACAATTGCTTTATTGAGTGCCAGTGTAGGCGTATCTCACCAAG
TCAAAGCAGATGATAGAGCCTCAGGAGAAACGAAGGCGAGTAATACTCAC
GACGATAGTTTACCAAAACCAGAAACAATTCAAGAGGCAAAGGCAACTAT
TGATGCAGTTGAAAAAACTCTCAGTCAACAAAAAGCAGAACTGACAGAGC
TTGCTACCGCTCTGACAAAAACTACTGCTGAAATCAACCACTTAAAAGAG
CAGCAAGATAATGAACAAAAAGCTTTAACCTCTGCACAAGAAATTTACAC
TAATACTCTTGCAAGTAGTGAGGAGACGCTATTAGCCCAAGGAGCCGAAC
ATCAAAGAGAGTTAACAGCTACTGAAACAGAGCTTCATAATGCTCAAGCA
GATCAACATTCAAAAGAGACTGCATTGTCAGAACAAAAAGCTAGCATTTC
AGCAGAAACTACTCGAGCTCAAGATTTAGTGGAACAAGTCAAAACGTCTG
AACAAAATATTGCTAAGCTCAATGCTATGATTAGCAATCCTGATGCTATC
ACTAAAGCAGCTCAAACGGCTAATGATAATACAAAAGCATTAAGCTCAGA
ATTGGAGAAGGCTAAAGCTGACTTAGAAAATCAAAAAGCTAAAGTTAAAA
AGCAATTGACTGAAGAGTTGGCAGCTCAGAAAGCTGCTCTAGCAGAAAAA
GAGGCAGAACTTAGTCGTCTTAAATCCTCAGCTCCGTCTACTCAAGATAG
CATTGTGGGTAATAATACCATGAAAGCACCGCAAGGCTATCCTCTTGAAG
AACTTAAAAAATTAGAAGCTAGTGGTTATATTGGATCAGCTAGTTACAAT
AATTATTACAAAGAGCATGCAGATCAAATTATTGCCAAAGCTAGTCCAGG
TAATCAATTAAATCAATACCAAGATATTCCAGCAGATCGTAATCGCTTTG
TTGATCCCGATAATTTGACACCAGAAGTGCAAAATGAGCTAGCGCAGTTT
GCAGCTCACATGATTAATAGTGTAAGAAGACAATTAGGTCTACCACCAGT
TACTGTTACAGCAGGATCACAAGAATTTGCAAGATTACTTAGTACCAGCT
ATAAGAAAACTCATGGTAATACAAGACCATCATTTGTCTACGGACAGCCA
GGGGTATCAGGGCATTATGGTGTTGGGCCTCATGATAAAACTATTATTGA
AGACTCTGCCGGAGCGTCAGGGCTCATTCGAAATGATGATAACATGTACG
AGAATATCGGTGCTTTTAACGATGTGCATACTGTGAATGGTATTAAACGT
GGTATTTATGACAGTATCAAGTATATGCTCTTTACAGATCATTTACACGG
AAATACATACGGCCATGCTATTAACTTTTTACGTGTAGATAAACATAACC
CTAATGCGCCTGTTTACCTTGGATTTTCAACCAGCAATGTAGGATCTTTG
AATGAACACTTTGTAATGTTTCCAGAGTCTAACATTGCTAACCATCAACG
CTTTAATAAGACCCCTATAAAAGCCGTTGGAAGTACAAAAGATTATGCCC
AAAGAGTAGGCACTGTATCTGATACTATTGCAGCGATCAAAGGAAAAGTA
AGCTCATTAGAAAATCGTTTGTCGGCTATTCATCAAGAAGCTGATATTAT
GGCAGCCCAAGCTAAAGTAAGTCAACTTCAAGGTAAATTAGCAAGCACAC
TTAAGCAGTCAGACAGCTTAAATCTCCAAGTGAGACAATTAAATGATACT
AAAGGTTCTTTGAGAACAGAATTACTAGCAGCTAAAGCAAAACAAGCACA
ACTCGAAGCTACTCGTGATCAATCATTAGCTAAGCTAGCATCGTTGAAAG
CCGCACTGCACCAGACAGAAGCCTTAGCAGAGCAAGCCGCAGCCAGAGTG
ACAGCACTGGTGGCTAAAAAAGCTCATTTGCAATATCTAAGGGACTTTAA
ATTGAATCCTAACCGCCTTCAAGTGATACGTGAGCGCATTGATAATACTA
AGCAAGATTTGGCTAAAACTACCTCATCTTTGTTAAATGCACAAGAAGCT
TTAGCAGCCTTACAAGCTAAACAAAGCAGTCTAGAAGCTACTATTGCTAC
CACAGAACACCAGTTGACTTTGCTTAAAACCTTAGCTAACGAAAAGGAAT
ATCGCCACTTAGACGAAGATATAGCTACTGTGCCTGATTTGCAAGTAGCT
CCACCTCTTACGGGCGTAAAACCGCTATCATATAGTAAGATAGATACTAC
TCCGCTTGTTCAAGAAATGGTTAAAGAAACGAAACAACTATTAGAAGCTT
CAGCAAGATTAGCTGCTGAAAATACAAGTCTTGTAGCAGAAGCGCTTGTT
GGCCAAACCTCTGAAATGGTAGCAAGTAATGCCATTGTGTCTAAAATCAC
ATCTTCGATTACTCAGCCCTCATCTAAGACATCTTATGGCTCAGGATCTT
CTACAACGAGCAATCTCATTTCTGATGTTGATGAAAGTACTCAAAGAGCT
CTTAAAGCAGGAGTCGTCATGTTGGCAGCTGTCGGCCTCACAGGATTTAG
GTTCCGTAAGGAATCTAAGTGA
>M5005_Spy0484 ptsK, hpr(ser) kinase
TTGGTGTCGTTGTTCTCATTTAGTAGTGAAAAAATGAGTATTTGCAAGGG
TCTAACGGTCGATTTGTGTTATAATATTGAAAAAGGAGAAATTATGACCG
TTACTGTAAAGATGCTAGTGCAAAAAGTTAAACTTGATGTGGTTTATGCT
ACAGATAACTTGCTGTCAAAAGAGATAACAACATCAGATATTTCACGTCC
AGGTCTTGAAATGACTGGTTATTTTGATTATTATGCTCCAGAAAGGTTGC
AGCTATTTGGAATGAAAGAGTGGTCTTATCTTACACAGATGACTTCTCAC
AACCGTTATTCTGTTTTAAAAGAGATGTTCAAAAAGGACACTCCTGCAGT
GGTTGTCTTTAGAAATTTAGCCATTCCAAAAGAAATGGTTCAAGCTGCAA
AAGAAGAAGGTATTTCACTTTTAAGTAGCCGTGTTTCAACTAGCCGCTTA
GCTGGAGAAATGTCTTATTTTCTTGACGCTTCTTTAGCTGAACGTACTAG
TGTTCACGGCGTTTTAATGGATATTTATGGTATGGGGGTTCTTATCCAAG
GGGATTCTGGAATTGGTAAAAGTGAGACTGGTTTAGAATTAGTTAAGCGA
GGGCATCGTTTGGTTGCAGATGACCGTGTGGATGTCTATGCCAAAGATGA
AGAAACCCTTTGGGGAGAGCCAGCAGAGATCTTGCGCCACTTGCTTGAAA
TTCGTGGGGTAGGTATTATTGATGTGATGTCGCTTTATGGAGCTAGTGCT
GTGAAGGACTCATCACAAGTTCAATTGGCCATTTACCTTGAAAACTTTGA
GGCTGGTAAAGTTTTTGATCGTCTCGGAAACGGTAATGAGGAGATAACTT
TCTCAGGAGTGAGAATCCCTCGTATTCGTATTCCGGTAAAAACAGGTCGA
AATGTTTCAGTGGTTATTGAAGCCGCTGCGATGAATCATCGGGCTAAAGA
AATGGGCTTTGATGCTACAAAAACTTTTGAAGATCGTTTAACTCAACTAA
TCACCAAAAATGAGGTGAGTCAATGA
>M5005_Spy1686 relA, GTPpyrophosphokinase/guanosine-3',5'-bis(diphosp hate)3'-pyrophosphohydrolase
ATGGCAAAAATAATGAACGTAACAGGAGAAGAAGTCATTGCCTTAGCGGC
CACCTATATGACCAAGGCTGATGTGGCTTTTGTGGCAAAGGCTTTAGCAT
ATGCAACAGCGGCCCATTTCTACCAAGTGAGAAAGTCAGGCGAACCCTAT
ATCGTCCATCCGATTCAGGTGGCGGGGATTCTGGCTGATTTGCATCTGGA
TGCTGTGACAGTTGCTTGTGGCTTTTTACATGATGTCGTAGAAGATACGG
ATATTACCTTAGATGAGATCGAAGCAGACTTTGGCCATGATGCTCGTGAT
ATCGTTGATGGTGTCACCAAGTTAGGTAAAGTTGAGTACAAATCTCATGA
GGAGCAACTCGCCGAAAACCATCGCAAAATGCTGATGGCTATGTCCAAAG
ATATTCGCGTGATTTTGGTGAAATTGGCTGACCGCCTGCATAATATGCGC
ACCCTCAAACATTTGCGCAAGGACAAACAAGAGCGCATTTCGCGCGAAAC
CATGGAAATCTATGCCCCCTTGGCGCATCGTTTGGGGATTAGTCGCATCA
AATGGGAACTAGAAGATTTGGCTTTTCGTTACCTCAATGAAACCGAATTT
TACAAAATTTCCCATATGATGAAAGAAAAACGTCGCGAGCGTGAAGCTTT
GGTAGAGGCTATTGTCAGTAAGGTCAAAACCTATACGACACAACAAGGGT
TGTTTGGAGATGTGTATGGCCGACCAAAACACATTTATTCGATTTATCGG
AAAATGCGGGACAAAAAGAAACGATTCGATCAGATTTTTGATCTGATTGC
CATTCGTTGTGTCATGGAAACGCAAAGCGATGTCTATGCTATGGTTGGCT
ATATTCATGAGCTTTGGCGTCCCATGCCAGGCCGCTTCAAGGATTATATT
GCAGCTCCTAAAGCTAATGGCTACCAGTCTATTCATACCACCGTGTATGG
GCCAAAAGGACCTATTGAGATTCAAATCAGAACTAAGGACATGCATCAAG
TGGCTGAGTACGGGGTTGCTGCTCACTGGGCTTATAAAAAAGGCGTGCGT
GGTAAGGTCAATCAAGCTGAGCAAGCCGTTGGCATGAACTGGATCAAAGA
GCTGGTAGAATTGCAAGATGCCTCAAATGGCGATGCAGTGGACTTTGTGG
ATTCGGTCAAAGAAGACATTTTTTCTGAACGGATTTATGTCTTTACACCG
ACAGGGGCCGTTCAGGAGTTACCAAAAGAATCAGGTCCTATTGATTTTGC
TTATGCGATCCATACGCAAATCGGTGAAAAAGCAACAGGTGCCAAAGTCA
ATGGACGTATGGTTCCTCTCACTGCCAAGTTAAAAACAGGAGATGTGGTT
GAAATCATCACCAATGCCAATTCCTTTGGCCCTAGTCGAGACTGGGTAAA
ACTGGTCAAAACCAATAAGGCTCGCAACAAAATTCGTCAGTTCTTTAAAA
ATCAAGACAAGGAATTGTCAGTGAATAAAGGCCGTGATTTGTTGGTGTCT
TATTTTCAAGAGCAGGGCTACGTTGCCAATAAATACCTTGACAAAAAACG
CATTGAAGCCATCCTTCCAAAAGTCAGTGTGAAGAGCGAAGAATCACTCT
ATGCAGCCGTTGGGTTTGGTGACATTAGTCCTATCAGTGTCTTTAACAAG
TTAACCGAAAAAGAGCGCCGTGAAGAAGAAAGGGCCAAGGCTAAAGCAGA
AGCTGAAGAATTGGTTAAGGGCGGTGAGGTCAAACACGAAAACAAAGATG
TGCTCAAGGTTCGCAGTGAAAATGGAGTCATTATCCAAGGAGCATCAGGC
CTCTTGATGCGGATTGCCAAGTGTTGTAATCCTGTACCTGGTGATCCTAT
TGACGGCTACATTACCAAAGGGCGTGGCATTGCGATTCACAGATCGGACT
GTCATAACATTAAGAGTCAAGATGGCTACCAAGAACGCTTGATTGAGGTC
GAGTGGGATTTGGACAATTCGAGTAAAGATTATCAGGCTGAAATTGATAT
CTATGGGCTCAATCGTAGTGGTCTGCTTAATGATGTGCTCCAAATTTTAT
CAAACTCAACCAAGAGCATATCGACAGTCAATGCTCAGCCGACCAAGGAC
ATGAAGTTTGCTAATATTCACGTGAGCTTTGGCATTCCAAATCTGACGCA
TCTGACCACTGTTGTCGAAAAAATCAAGGCAGTTCCAGATGTTTATAGCG
TGAAGCGGACCAATGGCTAA
>M5005_Spy1318 rocA, sensory transduction protein kinase
ATGTTAGAAGATTTTCTTCAATTTTTAGGATTTATATTTTTAGATATTAT
TGAAATTATGTTAACGTTAAAGCTTTTTAGCTTTGTAAGTGCAATTCCGC
TTCGCCTGAAAAATATTTTTTATTTATCACTTAGTATGGTTTTGTTTCAA
GTAGTTTTTTGGGCTTTCTTTCCAGACCATTTCATTCTTGATGTTGTGAT
GTTGGCTCAGTTTCTTTTCTTTGCGCTTATAGCCCTATACTATGGTAAAT
CAATAAAAGCTAAGTTTTTAATGTTTTATGCCTTTTTTCCACTAGTGTCT
ATTAGTTTGGTTAAGCGATTTATTGTATTTTTTGTTATGCCATTGTTTGG
TATGCCTTATTCAGTTGTTAAACATAATACACTACTGATTTACAGCATTA
CTTGTTTTAGTATTTTTTTGATTTATCGCTGCATTCAAGTTTTTCATTTC
GATTTTTCAACCTGGCGCCAATATTTTCAATCACATAGAGCTAGTAAACT
ATTAGTGTTTACTAACTCTTCGATGGCTCTATATTACTTGTGTGTCCAAG
GGATAGATGTGATGTCGCCTTCTTTATCAGGACTTGCTACAACGACTGCT
CGTTCAATCATAGTGCTCTTTTATTTCATTTTGTTTCTTACTTTATTAAT
TCATTTAGAGCGTTATGTAAAACAAAACTCTATTGAGGCAATTGTGCAAC
AAAAAGAATATCGTGAGCTGATTAATTATAGTCAGCACCTTGGATTGCTG
TATCAAGATATTCAAGAGCTTAGGCGGCTATTAACTACCGTGTCTAGTCG
TCTTAAGATTGGAATCGAACAAAATGATATCTCTATTGTGAGACTTACTT
ATGAAGGTATCTTGAATGCTGAAAAGAATAATGCTAAAGATGACAGACTT
GATTTAACTTGTTTAGATAAATTACAAGTTGAAGCAATCAGACATATTGT
TTTAGCTAAATTAATTGAGGCAAAAAATAAGAAGCTTAAGGTTGAGGTAT
CGATCCCTAATTGTATTGCAACGTTTTTTCTAGAAGTAGTAGATTTCACT
AAGCTATTGTCATTTTTGTTAGATAATGCTATAGAAATGAGTTTGGAGAC
AAAGCAACCTTGCTTATCAATAGCATTTCTGGATCAAAACCATAAACTTG
TCATAGTCATTCAAAGCAGTACTAAACAAGGACAAGATGATAGTCAAAGC
GTGTTTGCTATACCGGCTTTGAAAAAAAGAGATGACTGGCAATTTGACTT
AAGGAATGTCACGACCATTTTAAATCGTTATGACTATCTCACAATTAGCT
CGCAGATTCATGATGGCATTTTAACCCAGTTAATAGAAATAGCTAAGCCT
GACTGA
>M5005_Spy1625 salR, transcriptional regulatory protein
ATGAAGATTTTATTAATTGATGACCACAGACTATTTGCAAAGAGTATCCA
ACTGTTATTCCAACAGTATGATGAAGTAGATGTCATAGATACGATTACTT
CTCATTTTAACGATGTGACGATTGATTTGTCTAAGTACGATATTATATTG
CTTGATATTAATTTAGCAAATATTTCTAAAGAAAATGGATTGGAGATAGC
AAAAGAACTCATACAGTCTACTCCTCATTTGAAAGTTGTTATGTTGACAG
GATATGTTAAATCAATCTATAGAGAGAGGGCAAAAAAAGTAGGAGCATAC
GGTTTTGTAGATAAAAATATAGACCCTAAACAACTCATTTCTATCTTAAA
AAAAGTGGATTCTGGAAAAAAGTATTTTGAACAAATCGAATCTCAGGATT
ATGTTGAATCTTTAACTGACCAGGAAATAGCTATCTTAAATTTGAGTAAG
AAAGGATTCTCTATAAAAGAAATAGAGGAAACGTTACAAATTAGTAGGAG
AACAGTATTTAATCATTTGACCCACATCTACTCAAAGCTTTTGGTAAATA
ATAAGCAGGAGGCTATCTACAAAGCCGAACAATTAGGGTATTTTATGGAT
TTCTGA
>M5005_Spy0351 spyA, c3 family ADP-ribosyltransferase
ATGCTAAAAAAGCGCTATCAACTGGCTATTGTCCTTCTTCTTAGCTGTTT
TAGTCTGATCTGGCAAACTGAGGGCTTGGTCGAGCTTTTTGTCTGTGAGC
ACTATGAGCGGGCGGTTTGTGAGGGGACGCCTGCTTATTTTACCTTTTCG
GATCAAAAGGGCGCTGAGACACTGATTAAAAAGCGATGGGGCAAGGGTCT
CATCTACCCAAGGGCTGAGCAAGAGGCGATGGCTGCTTATACCTGTCAGC
AGGCAGGCCCTATCAACACCAGCCTAGACAAAGCCAAAGGTGAGCTCAGC
CAACTCACGCCTGAGCTAAGGGATCAGGTGGCCCAGCTCGATGCTGCGAC
TCACCGGCTAGTCATCCCGTGGAACATTGTAGTATACCGCTATGTATACG
AGACGTTTTTGCGTGATATCGGTGTTTCACATGCTGATCTCACGTCTTAC
TACCGTAACCATCAGTTTGACCCTCATATCCTTTGTAAGATCAAGCTTGG
TACACGCTACACCAAGCACAGTTTTATGAGCACGACAGCCTTGAAAAACG
GCGCCATGACCCATCGACCGGTGGAGGTGCGCATCTGTGTCAAAAAAGGG
GCCAAGGCAGCCTTTGTCGAGCCTTATTCGGCTGTGCCTTCAGAGGTTGA
GCTCTTGTTTCCAAGAGGCTGTCAGCTGGAGGTCGTTGGAGCTTACGTGT
CACAGGACCAAAAAAAGCTCCACATAGAAGCGTATTTCAAGGGCAGTTTG
TGA
>M5005_Spy0805 srtK, nisin biosynthesis sensor protein
ATGTTTAAAAAATATTCAATAAAAAATCGTGTTTGGCGCGCCGTCGTTGA
AATTGTCTTTGGAGTTTGTATCACTGTTTTAATGATTGCGATAATATCGC
TTTCTTTTTCAAAGTTAAATATAGTGACATCTCATAATGTGGGAGAAGAA
TTTTATATTAAAGATAAACAGTCAATCAAACAGTTGAACAATTATATGAA
GACATTGGGATTAGATTATGTTGTTTTTGATAGAAAAACAGATAAAGCTA
TGGAAGGAAAATATTTATCTAAAGAATTTTCTTTATTTAACGAAGTTGCA
GAAGAAAAAAATAATCTGACTTTTAATTCTGTACATTATGATTTATATAC
TAATATCAATTATAATATTGTTATAAGATATAATGAGATACCGGAGTTCT
CTAACCATTACCTTAGAAATGTTTCATATAACATGTTGACATTTTATATT
CTGGGAATAGGAACGAGTATCAGCATTGTAGTTGCTTTAACACGGTTTGT
AAAAGAAATTTCTTTGAATTTCAAGGAAATCAAGAAGTTAGCAAATAAAA
TGGGGATAGAAGTCCTTTCTGAAAATGAAAATTATTCTAAAATAATCGAG
TTTGATGATATACTTAGAACTTTACATATTAAAGGTGATAATTTGAAAAG
TTTGATTGAGCGAGAAATATTGGAAAAGCAAGATCTATCCTTTCAAATTG
CAGCACTTTCGCATGATATAAAAACACCTTTAACGGTTTTAAAAGGAAAT
CTTGAGTTATTAGAATTGACTACTTTAAATAAAAATCAGGAAGGTTATAT
TGTATCTATGAACAATAGTATTTCTGTTTTTGAAGGCTATTTCAATTCTT
TAATATCTTATACACGCATGCTTTCAGAGGATAGATCAGTGAAACTAATT
TTAGTTGAGGAGCTATTAAGTGAGTTACATTTTGAAGTCGATGACTTATT
GAATATCAATAATATTGAATTTTCTATTTGTAATAGACTTATTATCACTT
CTTTTTATGGAGATGAGGAAAATCTGATAAGAGCTCTTTCTAACCTTTTA
GTTAATGCAATAAGATTTATGCCCGTATTAGATAAAAAAATCGAAGTTAT
ACTGTCTGAGTCAGGAGAGCAAATTCATTTTGAAATATGGAATAATGGTG
AGCGTTTCAGTGATAGTACACTGAAAAAGGGAGATAAATTATTTTACACG
GAAGATTATAGCAGAGGTAACAAACATTATGGAATCGGTTTGGCATTTGT
TAAAGGCGTTGCTATCAAACACGGTGGGAATCTTCAATTGAATAATCCAG
CTAGAGGAGGTGCTAGCGCCATAATCTCGATAAAAAAGAAAATTTAA
>M5005_Spy0804 srtR, nisin biosynthesis two-component response regulator
ATGTATAAGATTTTAGCCATAGATGATGATAAAGAAATTCTGAAGCTTAT
GAAGACTGCTTTGGAGATTGAAAATTATCATGTTATAACCTGTCAAGAGA
TAGAATTACCAATAGTTTTTGATGATTTTAAAGGATATGATTTGATCTTA
TTGGATATCATGATGCCTAATATAAGTGGAACTGAGTTTTGTTATAAAAT
TCGGGAAGAAGTTCATTCTCCAATTATTTTTGTTAGCGCTTTAGATGGCG
ATAATGAAATTGTCCAAGCTTTAAATATAGGGGGAGACGATTTTATTGTG
AAACCATTTAGCTTAAAACAATTCGTAGCTAAAGTTAACTCTCATTTGAA
GAGAGAAGAGAGAGCAAAGATAAAGAATGAGGCTGAGGAGAGAGTGAAGC
GTAGTTTTCCACCTATAGAAATCTATCTAGAGGAACGTATGTTATATATT
GATAAACAGCCGTTATTCCTGACTTATAGAGAGTACGAAATTTTAGAATT
ACTGTCACGTCATCCGTATAAAGTTTTCACAAAAGAAGAGATATATGAAC
AAGTATATAGCGATGAAGCTTCAGCATTGTTTCATTCTATTTCAGAATAT
ATCTATCAGATTAGAATGAAATTTTCAAGTTTTGGAATTAATCCAATAAA
AACTATTCGCGGGATTGGTTATAAATGGGATGTTTAA
>M5005_Spy1576 srv, transcription regulator, crp family
ATGTTAATTTCTCTTGAAGATACAAATTATACATTGGTAAAAGAATATTT
GGAGAAAAGCGTGAATCATCACATTTTGCAACGGTATATTGATAATCATA
ACTTTCCTATCATTGAAAAAAGTTATCACAAGTACTTGACTTTTGAAAGT
CTCGAAGAGGACTTCACTTATATTTTAAAAGACGGCATTGTGAAACAGAG
TGTTCTTTCAAAATATGGAATGGAATTTAATTTGAGATATGTTACAGGAC
TTGAAATTACTTCTGTTCTCAACACTGGTTATTCAAAAGATATGGGAGAG
CCTTATAATGTTCGCATCGAGTCAGAGAAAGCTAGTTTTTACAAGGTTCG
CCGCTCAGCATTTTTAAAAGATATAAACGAAGATATTGAACTACAAGGAT
ATGTGAAGGACTTTTACCATAATCGTCTTCAAAAATCCATGAAAAAAATG
CAATGTATGTTAACTAACGGCCGTATCGGTGCCATTTCTACTCAAATATA
TGACTTAATGACCCTATTTGGCGAAGAACTACCAAATGGCCAAATTTTAA
TTAATTTTGTCATTACTAATGAGGAACTCGGTAAATTCTGTGGCATTTCT
ACCGCTAGCAGCGTCAGCCGTATTCTAAAACAGTTGAAAGAAAAAAACAT
CATTCGCATTGATAAACAACATATTATCATTACCAATCTTGATAAATTAA
AAGATAATATCGTTTTCTAA
>M5005_Spy1255 typA, GTP-binding protein
ATGACTAACTTAAGAAACGATATCCGTAACGTAGCGATTATTGCCCACGT
TGACCACGGAAAAACAACACTTGTAGATGAATTATTAAAACAATCCCATA
CTCTTGATGAGCGTAAAGAGCTTCAAGAGCGTGCCATGGATTCCAATGAC
CTTGAAAAAGAACGTGGGATTACAATCCTTGCGAAAAATACGGCAGTAGC
CTATAACGATGTTCGTATTAACATCATGGATACCCCAGGACACGCGGACT
TCGGTGGTGAAGTTGAACGTATCATGAAAATGGTTGACGGGGTTGTTCTT
GTTGTGGATGCCTACGAAGGAACAATGCCCCAGACGCGTTTCGTATTGAA
AAAAGCACTTGAGCAAAACCTTATCCCGATCGTTGTGGTGAACAAGATTG
ACAAACCTTCAGCTCGTCCAGCAGAAGTTGTAGATGAAGTGCTTGAATTA
TTCATCGAACTTGGTGCCGATGATGAGCAATTGGAATTCCCAGTTGTTTA
CGCATCAGCTATTAATGGAACATCATCATTATCAGATGACCCTGCTGACC
AAGAGCATACTATGGCACCGATCTTTGATACGATTATTGATCATATTCCA
GCGCCAGTTGATAATTCAGATGAGCCTTTGCAATTCCAAGTGTCACTTTT
GGACTACAACGATTTCGTAGGTCGTATCGGTATCGGTCGTGTTTTCCGTG
GTACTGTTAAAGTGGGTGACCAAGTAACTCTTTCAAAACTTGATGGTACC
ACTAAAAACTTCCGTGTTACAAAACTGTTTGGTTTCTTCGGTTTGGAACG
TCGTGAAATTCAAGAAGCTAAAGCAGGTGACTTGATTGCTGTTTCAGGTA
TGGAAGATATCTTTGTTGGAGAAACCATTACACCAACTGACTGTGTGGAA
GCTCTGCCAATTCTTCGTATTGATGAGCCAACACTTCAGATGACTTTCTT
GGTCAATAACTCTCCTTTTGCAGGTCGTGAAGGTAAATGGATCACGTCAC
GTAAGGTTGAAGAACGTCTTTTAGCAGAATTGCAAACAGACGTGTCACTT
CGTGTTGACCCAACAGATTCGCCAGATAAATGGACGGTTTCAGGGCGTGG
AGAATTGCATTTATCTATCCTCATTGAAACCATGCGCCGTGAAGGCTATG
AACTTCAAGTATCACGTCCAGAAGTTATCATCAAAGAAATTGATGGTGTC
AAATGTGAACCGTTTGAGCGTGTTCAAATTGATACACCAGAAGAATATCA
GGGTGCAATCATCCAGTCTCTTTCAGAACGTAAAGGGGATATGCTTGATA
TGCAGATGGTTGGTAATGGTCAAACGCGTTTGATTTTCTTGATTCCTGCA
CGTGGTTTGATTGGTTATTCAACAGAGTTTCTTTCAATGACACGTGGATA
TGGTATCATGAATCATACTTTTGATCAGTATCTACCGGTTGTTCAAGGAG
AAATCGGTGGCCGTCATCGTGGTGCCTTGGTTTCTATTGAAAATGGGAAA
GCAACGACATATTCAATCATGCGTATTGAAGAACGTGGAACTATCTTTGT
CAATCCAGGTACAGAAGTTTACGAAGGGATGATTGTTGGTGAAAACTCAC
GTGATAACGACCTTGGTGTTAACATTACAACAGCTAAGCAAATGACAAAT
GTCCGTTCAGCGACTAAAGATCAAACTGCAGTTATCAAGACGCCTCGTAT
CCTAACGCTTGAAGAATCATTAGAGTTCTTGAATGACGACGAATACATGG
AAGTAACGCCAGAATCTATCCGCTTGCGTAAACAAATCTTGAATAAAGCT
GCGCGTGATAAAGCTAATAAAAAGAAAAAATCAGCCGAATAG
>M5005_Spy0436 vicK, two-component sensor histidine kinase
ATGACTAGAGATATCATTGGAAACTTATCCACATTTGAATTAGCGATCCT
TATCTTACTTGTTTTTGTTGCTTTTTACTTTATCCATCTTGCGGTGCGTG
ATTACCGAAATGCACGTATTATTCGGATGATGAGCCATAAAATCCGAGAC
TTGATTAATGGTCGCTATACTGATATAATCGACGAAAAAGCAGACATTGA
GTTAATGGAGCTTTCAGACCAGTTAAATGACCTGTCAGATGTTTTTCGCT
TGACGCATGAAAATCTTGCCCAAGAAAAAAATCGCTTGGCAAGTATTTTG
GCTTATATGTCAGATGGTGTACTTGCTACAGACCGGTCTGGTAAAATCAT
CATGATTAACGAGACAGCTCGCAAGCAATTAAATTTAAGTAAAGAAGAGG
CACTAAAGAAAAACATTACAGATTTGTTAGAAGGTGATACTTCATATACC
TACCGTGATTTGGTATCCAAAACACCAGTGGTAACTGTTAATAGCCGAAA
TGATATGGGTGAGTTTGTCTCATTACGCTTGCGCTTTGCGTTGAATAGGA
GAGAGAGTGGTTTTATTTCGGGCTTGGTTGTGGTGCTCCATGACACCACA
GAACAGGAAAAAGAAGAACGTGAACGCCGTCTTTTTGTCTCTAATGTAAG
TCATGAATTAAGGACCCCTTTAACTTCGGTTAAATCCTACTTGGAGGCTC
TTGATGAAGGTGCACTTAAAGAAGATATTGCTCCAAGTTTCATAAAAGTT
TCTCTTGATGAAACTAATCGGATGATGCGTATGATTTCAGATCTTTTAAA
CCTGTCTCGGATTGATAATCAAGTAACCCAATTAGCAGTAGAGATGACTA
ATTTTACTGCTTTTATAACTTCTATTTTAAACAGATTTGATTTGGTTAAA
AATCAGCATACAGGTACAGGAAAAGTCTATGAAATTGTAAGAGATTACCC
TATTACCTCTGTCTGGATTGAAATTGATAATGATAAAATGACACAGGTTA
TCGAGAATATTTTGAACAATGCCATTAAGTATTCTCCAGATGGTGGAAAA
ATTACAGTCCGTATGAAAACAACAGATACCCAATTAATTATTTCCATTTC
AGACCAAGGACTAGGTATCCCTAAAACAGATTTGCCTCTTATTTTTGATC
GGTTCTATCGTGTAGACAAGGCAAGAAGTCGTGCCCAAGGAGGGACCGGT
CTAGGCCTTGCCATTGCTAAAGAAATCATCAAGCAGCACCATGGCTTTAT
CTGGGCTAAGAGTGACTATGGTAAAGGATCGACCTTTACTATTGTCTTGC
CTTATGAAAAAGATGCAGCCATCTATGAAGAATGGGAGGAAGATGTAGAC
TAA
>M5005_Spy0435 vicR, two-component response regulator
ATGAAAAAAATACTTATTGTGGATGATGAAAAACCGATTTCTGACATTAT
TAAGTTTAATTTGACAAAAGAAGGTTATGACATTGTTACAGCTTTTGATG
GACGCGAAGCGGTAACAATTTTTGAAGAAGAAAAGCCAGATTTAATTATT
CTTGATTTGATGCTCCCTGAGTTGGACGGTCTTGAAGTAGCCAAGGAAAT
TCGTAAAACCAGTCATGTCCCGATTATTATGTTGTCGGCTAAAGATAGTG
AGTTTGACAAGGTTATTGGACTTGAAATTGGGGCTGATGATTACGTGACC
AAGCCCTTTTCTAATCGGGAATTGCTGGCGCGTGTCAAGGCTCATCTGCG
TCGTACCGAAACTATTGAAACGGCTGTTGCAGAAGAAAATGCTTCTTCAG
GTACACAGGAACTGACCATTGGTAATTTACAGATTTTACCAGATGCGTTT
GTTGCTAAAAAACATGGTCAAGAGGTAGAGTTGACCCATCGTGAATTTGA
ACTATTGCATCATCTAGCTAACCATATGGGGCAGGTGATGACACGAGAAC
ACTTATTGGAAATTGTTTGGGGATATGATTATTTTGGCGATGTGCGCACG
GTTGATGTGACTGTTCGTCGCCTCCGTGAAAAAATTGAAGACACACCAAG
TCGTCCTGAGTATATTTTAACAAGACGTGGTGTTGGGTACTACATGAAAT
CTTATGACTAG
>M5005_Spy1332 yvqC, two-component response regulator
ATGAGTAAGATAAAAGTGATATTGGTCGATGATCATGAAATGGTCCGCAT
GGGACTCAAGAGTTTTTTGAATTTACAAGCTGATATTGATGTCGTTGGTG
AGGCCTCTAATGGACGTGAAGGGGTTGATTTGGCATTGGCTTTGAAGCCA
GATGTTTTGGTTATGGATCTAGTGATGCCAGAGTTAGGCGGTGTTGAGGC
AACTTTAGAAGTCCTAAAAAAATGGAAAGAGGCTAAGGTACTTGTGTTAA
CTTCCTATCTAGATAATGAAAAGATATACCCTGTCATTGATGCAGGAGCG
AAGGGTTATATGTTAAAAACATCGAGTGCGGCTGAAATTTTAAATGCCAT
TCGCAAGGTTTCAAAGGGAGAGTTAGCTATTGAAACAGAAGTTGACAAAA
AAATTAAGGCGCATGATCAACACCCTGACTTGCATGAGGAACTAACAGCG
CGTGAGTATGACATTTTACACCTTTTAGCTAAAGGGTATGATAATCAGAC
CATCGCTGATGAACTCTTTATTTCCTTAAAAACCGTCAAAACACATGTGT
CCAATATTCTAGCCAAGTTAGAAGTTGGTGACCGAACCCAAGCGGTTGTC
TATGCTTTTCGACATCATTTAGTCCCCCAAGACGATAATTAA
>M5005_Spy1333 yvqE, two-component sensor protein
ATGAAAAAACGTTACTATGCTCTTGTTTGGCTCTACTCAACCATTACCAT
TTTATCTATTGTTTTTGTGGTCATGGATAATTTAGGAATCACTTTTAACT
ACCTTCGCAATCATTTATGGCAGGTCGAACGTCTAGGGTTTTCGATTTTA
TTGTTGATTGTTTCTGTGACTTTATTATTGTTGTTATTGTGGATTATTAT
GGATGATAACAGTAAGCGTAACATCAACCAAAATCTAAAATATATTCTCA
ATAATCGACGACTCTATCTAGATGAGACATCAGAAATCAATACTAATTTA
AGTCGACTTTCTAAAAAAATGTCTCACCTGACTGCTAACATGCAAAAGAA
AGAAAGTGCTTATATTCTTGATAGCCAAGAAGTTGTAAAACAAGAGCGCA
AACGAATTGCAAGAGATTTACATGACACAGTCAGTCAAGAGCTATTCGCT
TCGTCATTGATTTTATCAGGAATTTCGATGAGTTTGGAACAACTGGACAA
AACACAATTACAAACACAGTTAACAACGGTTGAAGCAATGTTGCAAAATG
CTCAAAATGATCTACGCATTCTCCTTTTGCATCTTAGACCTACCGAGCTA
GCTAATCGGACTTTATCTGAGGGCCTTCATATGATTCTTAAGGAATTAAC
AGATAAAAGTGATATTGAAGTCATTTATAAGGAAACCATTGCTCAGCTTC
CTAAAACAATGGAAGATAATCTTTTTAGAATTGCCCAAGAATTCATTAGC
AACACGTTAAAACATGCTAAAGCTAGTCGAATTGAAGTTTATCTCAATCA
AACCTCAACAGAATTACAATTGAAGATGATTGATGATGGTGTAGGATTTG
ATATGGATCAGGTAAGGGATTTGAGTTATGGTCTGAAGAATATTGAAGAC
CGTGTCAATGATTTAGCAGGAAACCTACATTTAATTAGTCAAAAAGGCAA
AGGAGTTTCCATGGATATTAGACTGCCGATAGTGAAGGGAGATGACGATG
AGTAA