TitleGenColors Logo
spacer
Home spacerGenomes
spacerMethods
spacerDocumentation spacerContactspacer spacerLeibniz FLI
spacer
QuickSearch
2024-05-06 05:24:14

Gene list

Applied filters:

COG category: NOT ANALYZED
Organism: Citrobacter freundii

Number of genes found: 123

Free access
Sort by:

 

Show UniProt / TrEMBL protein name View in Fasta format (DNA) View in Fasta format (Protein)  

 
Citrobacter freundii
NameLocus tagProduct / DescriptionGenomic elementTypeBeginLengthStrandGC-content
NA pCTX-M3 misc_feature64640 1358 + 0.603093
NA pCTX-M3 repeat_region80404 14 + 0.571429
NA pCTX-M3 terminator54286 24 + 0.5
NA pCTX-M3 repeat_region1557 22 + 0.181818
NA pCTX-M3 repeat_region64609 14 + 0.714286
NA pCTX-M3 misc_feature65960 38 + 0.526316
NA pCTX-M3 -35_signal65740 6 + 0.5
NA pCTX-M3 repeat_region3085 28 + 0.321429
NA pCTX-M3 misc_feature31516 19 + 0.473684
NA pCTX-M3 -10_signal65763 6 + 0.333333
NA pCTX-M3 repeat_region79595 14 + 0.5
NA pCTX-M3 terminator55962 18 + 0.666667
NA pCTX-M3 repeat_region63800 14 + 0.5
NA pCTX-M3 misc_feature67754 1311 + 0.567506
IS26 pCTX-M3 repeat_region63800 823 + 0.526124
IS26 pCTX-M3 repeat_region79595 823 + 0.521264
ISEcp1 pCTX-M3 repeat_region1557 1556 + 0.329692
aac3 pCTX-M3 RBS63639 5 - 0.6
blaCTX-M3 pCTX-M3 -35_signal3161 7 + 0.571429
blaCTX-M3 pCTX-M3 RBS3231 3 + 0.666667
blaCTX-M3 pCTX-M3 terminator4126 26 + 0.423077
blaCTX-M3 pCTX-M3 -10_signal3183 6 +
blaTEM1 pCTX-M3 RBS57804 5 - 0.4
excA pCTX-M3 RBS53611 5 + 0.6
intI pCTX-M3 -35_signal65905 6 - 0.5
intI pCTX-M3 -10_signal65882 6 - 0.333333
klcA pCTX-M3 RBS27881 5 + 0.6
korC pCTX-M3 RBS22099 5 + 0.8
mel pCTX-M3 RBS75442 5 + 0.6
mph1 pCTX-M3 RBS76975 5 + 0.4
mucA pCTX-M3 protein_bind4714 18 + 0.222222
mucA pCTX-M3 -10_signal4720 6 +
mucA pCTX-M3 RBS4736 5 + 0.8
mucA pCTX-M3 -35_signal4698 6 + 0.5
mucB pCTX-M3 RBS5111 5 + 0.6
nbrB pCTX-M3 RBS72373 3 + 0.666667
nikA pCTX-M3 RBS31708 5 + 0.6
nikB pCTX-M3 RBS32018 5 + 0.6
nuc pCTX-M3 RBS18633 4 + 0.75
orf10 pCTX-M3 RBS11718 4 + 0.75
orf11 pCTX-M3 RBS12053 4 + 0.75
orf12 pCTX-M3 RBS12634 4 + 0.75
orf13 pCTX-M3 RBS14077 5 - 0.6
orf14 pCTX-M3 RBS14197 5 + 0.6
orf15 pCTX-M3 RBS14657 4 + 0.75
orf16 pCTX-M3 RBS14900 4 + 0.75
orf17 pCTX-M3 RBS15485 5 + 0.6
orf18 pCTX-M3 RBS15969 4 + 0.5
orf19 pCTX-M3 RBS19300 5 + 0.6
orf2 pCTX-M3 RBS7321 5 - 0.8
orf20 pCTX-M3 RBS19800 4 + 0.75
orf21 pCTX-M3 RBS20308 5 + 0.6
orf22 pCTX-M3 RBS20835 5 + 0.6
orf23 pCTX-M3 terminator21504 22 + 0.454545
orf23 pCTX-M3 RBS21118 4 + 0.75
orf24 pCTX-M3 RBS21605 4 + 0.75
orf25 pCTX-M3 RBS22429 5 + 0.4
orf26 pCTX-M3 RBS24570 5 + 0.6
orf27 pCTX-M3 RBS25618 5 + 0.6
orf28 pCTX-M3 RBS26581 6 + 0.666667
orf29 pCTX-M3 RBS26904 5 + 0.6
orf3 pCTX-M3 RBS7647 4 - 0.5
orf30 pCTX-M3 RBS27375 6 + 0.666667
orf31 pCTX-M3 RBS28368 4 + 0.75
orf32 pCTX-M3 RBS28806 5 + 0.6
orf33 pCTX-M3 RBS29590 4 + 0.75
orf34 pCTX-M3 RBS30033 4 + 0.75
orf35 pCTX-M3 RBS31453 4 - 0.75
orf36 pCTX-M3 RBS40375 5 + 0.8
orf37 pCTX-M3 RBS46131 4 - 0.75
orf38 pCTX-M3 RBS46043 4 + 0.75
orf39 pCTX-M3 RBS61270 6 - 0.666667
orf4 pCTX-M3 RBS8481 4 - 0.75
orf40 pCTX-M3 RBS61528 5 - 0.8
orf41 pCTX-M3 RBS62767 4 - 0.75
orf42 pCTX-M3 RBS69434 5 + 0.8
orf43 pCTX-M3 RBS73836 4 - 0.5
orf46 pCTX-M3 RBS84108 7 - 0.714286
orf47 pCTX-M3 RBS89375 4 - 0.75
orf5 pCTX-M3 RBS8702 4 - 0.5
orf6 pCTX-M3 RBS8923 4 - 0.75
orf7 pCTX-M3 RBS9649 5 - 0.8
orf8 pCTX-M3 RBS9921 5 - 0.8
orf9 pCTX-M3 RBS11210 4 - 0.5
parA pCTX-M3 RBS17203 4 + 0.75
parB pCTX-M3 RBS18180 4 + 0.75
pemI pCTX-M3 RBS741 5 +
pemK pCTX-M3 RBS1002 5 + 0.8
pri pCTX-M3 RBS36732 4 + 0.75
qacEdelta1 pCTX-M3 RBS67849 4 + 0.75
repA pCTX-M3 RBS54871 4 + 0.75
repB pCTX-M3 RBS54818 5 + 0.4
repC pCTX-M3 RBS54341 4 + 0.75
resD pCTX-M3 RBS16229 4 + 1
rmoA pCTX-M3 RBS26054 4 + 0.5
ssb pCTX-M3 RBS29099 4 + 0.75
sul1 pCTX-M3 RBS68188 5 + 0.8
tir pCTX-M3 RBS1 4 + 0.75
tnpA pCTX-M3 RBS1630 4 + 0.75
tnpA pCTX-M3 -10_signal1597 6 + 0.333333
tnpA pCTX-M3 -35_signal1574 6 + 0.166667
tnpAcp1 pCTX-M3 RBS71310 3 + 0.666667
tnpAcp2 pCTX-M3 RBS59998 4 - 1
tnpIS26cp1 pCTX-M3 RBS63853 4 + 0.75
tnpIS26cp2 pCTX-M3 RBS79648 4 + 0.75
traH pCTX-M3 RBS34010 4 + 0.75
traI pCTX-M3 RBS34504 4 + 0.75
traJ pCTX-M3 RBS35296 4 + 0.75
traK pCTX-M3 RBS36450 4 + 0.75
traL pCTX-M3 RBS39907 5 + 0.6
traN pCTX-M3 RBS41810 4 + 0.75
traO pCTX-M3 RBS42971 4 + 0.75
traP pCTX-M3 RBS44332 5 + 0.6
traQ pCTX-M3 RBS45061 4 + 0.5
traR pCTX-M3 RBS45608 5 + 0.4
traU pCTX-M3 RBS46535 4 + 0.75
traW pCTX-M3 RBS49581 4 + 0.75
traX pCTX-M3 RBS50783 4 + 0.75
traY pCTX-M3 RBS51428 5 + 0.8
trbA pCTX-M3 RBS88522 4 - 0.75
trbB pCTX-M3 RBS87203 4 - 0.75
trbC pCTX-M3 RBS86241 4 - 0.75
trbN pCTX-M3 RBS88918 5 - 0.6