Gene list
Applied filters:
COG category: NOT ANALYZED
Organism: Pseudomonas putida
Number of genes found: 120
Show UniProt / TrEMBL protein name | View in Fasta format (DNA) | View in Fasta format (Protein) | ||||
Pseudomonas putida | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Name | Locus tag | Product / Description | Genomic element | Type | Begin | Length | Strand | GC-content |
NA | pWW0 | RBS | 39691 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pWW0 | RBS | 27605 | 8 | - | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 108727 | 6 | - | 0.833333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 20163 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 30624 | 6 | + | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 65782 | 8 | - | 0.625 | ||
NA | pWW0 | RBS | 36359 | 6 | - | 0.333333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 94445 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 66776 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 95693 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 109104 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pWW0 | RBS | 19277 | 6 | + | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 2300 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 25048 | 7 | + | 0.714286 | ||
NA | pWW0 | RBS | 77726 | 8 | + | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 16814 | 6 | + | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 10027 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 102775 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | repeat_region | 75589 | 2059 | + | 0.591549 | ||
NA | pWW0 | RBS | 63567 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 21898 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pWW0 | RBS | 24195 | 7 | + | 0.714286 | ||
NA | pWW0 | RBS | 10371 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 27915 | 7 | - | |||
NA | pWW0 | misc_feature | 41212 | 15048 | - | 0.6042 | ||
NA | pWW0 | RBS | 12845 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 65566 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 4559 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 87186 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 38691 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pWW0 | RBS | 16145 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 79362 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 83538 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 22081 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 16371 | 5 | + | 0.6 | ||
NA | pWW0 | RBS | 32625 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 33694 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 2582 | 8 | + | 0.625 | ||
NA | pWW0 | RBS | 22758 | 8 | + | 0.375 | ||
NA | pWW0 | RBS | 17250 | 6 | + | 1 | ||
NA | pWW0 | RBS | 40815 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 11786 | 6 | + | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 64192 | 7 | - | 0.714286 | ||
NA | pWW0 | RBS | 14371 | 6 | + | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 8142 | 6 | + | 0.833333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 109309 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pWW0 | RBS | 23405 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 94969 | 8 | - | 0.625 | ||
NA | pWW0 | RBS | 83827 | 5 | + | 0.8 | ||
NA | pWW0 | RBS | 93037 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pWW0 | RBS | 110027 | 6 | - | 0.833333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 59192 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 10668 | 6 | - | 0.166667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 113832 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 79512 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 61183 | 5 | - | 0.6 | ||
NA | pWW0 | RBS | 41385 | 5 | - | 0.8 | ||
NA | pWW0 | RBS | 64760 | 4 | + | 1 | ||
NA | pWW0 | RBS | 12559 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 8781 | 7 | + | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | RBS | 7158 | 6 | + | 0.833333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 34226 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | repeat_region | 36833 | 1277 | + | 0.595928 | ||
NA | pWW0 | RBS | 25968 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 14077 | 6 | + | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 87262 | 7 | + | 0.714286 | ||
NA | pWW0 | RBS | 62077 | 17 | - | 0.647059 | ||
NA | pWW0 | RBS | 12148 | 9 | + | 0.555556 | ||
NA | pWW0 | RBS | 83446 | 6 | + | 1 | ||
NA | pWW0 | RBS | 32053 | 6 | + | 0.333333 | ||
NA | pWW0 | RBS | 30463 | 8 | - | 0.625 | ||
NA | pWW0 | RBS | 102208 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 31804 | 7 | + | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 3266 | 6 | + | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 103145 | 6 | - | 0.5 | ||
NA | pWW0 | RBS | 93487 | 4 | - | 0.75 | ||
NA | pWW0 | RBS | 8929 | 7 | - | 0.428571 | ||
NA | pWW0 | RBS | 63828 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 57039 | 7 | - | 0.571429 | ||
NA | pWW0 | oriT | 96140 | 431 | + | 0.491879 | ||
NA | pWW0 | RBS | 29428 | 9 | - | 0.555556 | ||
NA | pWW0 | RBS | 28694 | 6 | - | 0.666667 | ||
NA | pWW0 | RBS | 10850 | 7 | + | 0.571429 | ||
KorA | pWW0 | RBS | 116168 | 6 | + | 0.333333 | ||
ORF15 | pWW0 | RBS | 9032 | 6 | + | 1 | ||
dgkA | pWW0 | RBS | 36788 | 6 | - | 0.666667 | ||
korA2 | pWW0 | RBS | 20614 | 5 | + | 0.6 | ||
lspA | pWW0 | RBS | 86286 | 6 | - | 0.666667 | ||
merB | pWW0 | RBS | 88317 | 6 | - | 0.5 | ||
merR | pWW0 | RBS | 88389 | 4 | + | 0.75 | ||
mpfA | pWW0 | RBS | 113464 | 5 | - | 0.6 | ||
mpfB | pWW0 | RBS | 112993 | 7 | - | 0.571429 | ||
mpfC | pWW0 | RBS | 112712 | 7 | - | 0.714286 | ||
mpfF | pWW0 | RBS | 107882 | 5 | - | 0.6 | ||
mpfG | pWW0 | RBS | 107169 | 6 | - | 0.333333 | ||
mpfH | pWW0 | RBS | 106383 | 7 | - | 1 | ||
mpfI | pWW0 | RBS | 105107 | 5 | - | 0.6 | ||
mpfJ | pWW0 | RBS | 104127 | 7 | - | 0.571429 | ||
oriV | pWW0 | rep_origin | 1460 | 241 | + | 0.489627 | ||
parA | pWW0 | RBS | 114074 | 5 | + | 0.6 | ||
parB | pWW0 | RBS | 115228 | 5 | + | 0.6 | ||
parC | pWW0 | RBS | 116514 | 5 | + | 0.4 | ||
recX | pWW0 | RBS | 17878 | 6 | + | 0.5 | ||
rep | pWW0 | RBS | 1720 | 6 | + | 0.666667 | ||
res | pWW0 | RBS | 625 | 7 | + | 0.571429 | ||
ruvA | pWW0 | RBS | 7039 | 8 | - | 0.625 | ||
ruvB | pWW0 | RBS | 6625 | 6 | - | 0.666667 | ||
ssb | pWW0 | RBS | 18294 | 7 | + | 0.428571 | ||
tnpA | pWW0 | RBS | 76141 | 5 | + | 0.6 | ||
tnpA | pWW0 | RBS | 89652 | 6 | + | 0.666667 | ||
tnpA | pWW0 | RBS | 83136 | 6 | - | 0.833333 | ||
tnpA | pWW0 | RBS | 37096 | 6 | + | 0.666667 | ||
tnpA | pWW0 | RBS | 85674 | 5 | - | 0.6 | ||
tnpC | pWW0 | RBS | 80118 | 6 | - | 0.666667 | ||
tnpR | pWW0 | RBS | 26781 | 8 | - | 0.75 | ||
tnpR | pWW0 | RBS | 89090 | 7 | + | 0.428571 | ||
traA | pWW0 | RBS | 96560 | 6 | + | 0.666667 | ||
traB | pWW0 | RBS | 96942 | 7 | + | 0.571429 | ||
traC | pWW0 | RBS | 98504 | 6 | + | 0.833333 | ||
traD | pWW0 | RBS | 96145 | 7 | - | 0.571429 |