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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_p46 unknown
TTGTCAGATCAATATGCAGCTACTAGTAGTAGACTAAACTCGCTATCGTC
TAAAGACTCGATGCTGCGTACTATGTCAGGTCAACAAGCGTTAGAGCTTG
CAAGCCGCTTGATTGCAGAAGAAGCTCGCTCAATTGGGATCTCAGAGCAA
GAGCAGATGCAGTTTAAAGATGCGGTGAGTACCGATAGTACAACTACTGA
TAATACTATTATGAGAAATAATAAAGAAACAGCTACTAGCAATAATGCTA
GCGTTGGTTTCAATGCTTTCGGCTTGGGAGGTGCTTCAGCAAGAGTATCG
GCATCTAATAATACAAGTAGCAGCAGTGAAGAAGTGTTATCAAAAAAACA
AACTATCAACAATGTACTTGAAAAAACAAAATCTGCACTTCAAGAAGGAA
GACTCAATAGCTTTAATAGTGATACTCAATCACTAGCAAGAACTTTAAGT
CAGAACTATCAGGAGCAGGAATCTATTGGTAGAGAAATATCTGATGCAAT
ATCGGCTCAAGACCAGTTAAGTAGAAGTCGTCAATATGTAGCACAAAATG
CAGCTACTATTGATCGTAATATGAATGAGCCGGTACTAAATGCTATAATA
GATAGCAATATTCCGGGTGTTTCAAGTAAGGAGCAAGCTGCAAGATGGGC
AAGAACTCATATACATGAGGCAGCTTCCATAGCAAACTCAGTAATGCCAG
TTGATAATATAGCATTAGATAATGGTAGACATTTAAGTGGTATTAGCTCT
GATGTAAAAAATATACCTATGCGTAGTGAGCAGCATTTAAAAAATGAATA
TCAAGTGCAGACAGGTAAAATAGAAGCATCAGCTGATAAAATAAATAATA
AGCAAGAATTAGCTTATCAAAGCGTTGAAACGAGATTAAATAATAATTTA
AGTAACAGCGTAAAAGAAAGCTACAATAACTTAAATAATACTGCTCAGCT
CGTAGAGCAGAAAGGTAAGAAAATAGAAGATCAGTATGAGGATACCTCGG
ATTCTACTGTAAAAAGAACACTAGATGAAATAGGTAAAAACTCTAGATTA
TAA
>RF_0826 unknown
ATGGAGGTATTTATGGTAAGTACAGCACCGTTAAAATTAATTGCAGTTAT
CGATAGTAAACAAATGATGCTTTACGACGCGTTGGGGATTAAAATTACTA
CTAATAAACCTTTAAAATTATCTTTGGATTTAGAGGAACATCACCACCAT
AGAGAAAAAAGACAAAGCCTTTACCAGAATAAATCTACCCCAGGATCACT
TTTTGAGCCGCATACTTCGCTAAAAGACATAGAACATAAAGAAGCAGCAA
GGAGCGTTATTAAACATTTAGAGAAAGTAACTACTGCTGATCAAGCTAAA
TATAAGGAATTGATTATTGTAGCAGAACCGCAGATGCTTGGATGTGTTAG
ACAAGAACTTAAAAACGGTCTAAAAAAGATGGTTACTAAAGAAATCGCTA
AGGATTTAGTACAACATAGTACAGATGCAGTCGAGCGAGCAGTATTTTCT
TAG
>RF_1329 unknown
ATGAGTTTTCAAAAATTGGCTGATGGAATAAATGATAAAGTATCTACTAA
TATTGCAATAAATACTAAAGATAAAGCTATAATAAAAGATACTATAGAGA
ATATAGTAAACAACATTAAAGCCCTTAATAATGTAACCGATATAGACAAA
ATAACGGCTAGTATGGAAAAGCTTATAGTTAATAAATCTACAAAATTAGA
AATTGTAACTATAGAACACCGACTTAACGAAATAATTGAAAACCAAAATA
TAAATGATGATGTTAGCATGTTAGGTGGTGATAATACTTTTGTACCCGCT
GCTGGTTAA
>RF_0705 P pilus assembly protein FimD
ATGAAATTATCTCCGAATCTCTTGAAGACAATTTACCTCAAACCACAGCG
GACACAAACGTGCATGAGGATAAAAGGACCATTTCCCCAATTACCTCTAG
AAGTAGAATTTGAGAATAGCTCTAATGAAGTTGCGGGCGACAACGAATTG
ATTGTTTCGCTAAAAGTTAATTATACCGAAACCGATATATTCCCGACTAT
AGTGCAAAACGCTCAAGGTCATTGTTTAATTCCTCTTGAAGATATAGAAC
ATTTTGATGTCCAAGAAGATTATCTTAAACAGGGTCTCGCGAACTATCAC
GATACTGCATATATTAATTTAGATTTACTTGAGGGTACTAAATATGATCT
AAACTTCGAGAATTTAGATTTAAACATTACTTTTCCAGCGGAAAAAATGC
AACCTCAATCATTTGATGCTTCAGGTGGTCCTATGCAAAATGTCGATACT
AAACTTATCAGCGGTGCATATCTTAATTATGACATAACTCTTAGCCAAAA
TGATGATATTAATTATTTAGCCGGAGTAGAGGAACTTAATTATTTTACTG
AAAACGGCGTATATAGCTATAGTTTTTTATTTCAAACCGAAGCCGTTAAA
TCAAATTTTTCTAAAGTTAAAAATACTGCAAGAAACCAAAATAAATTTAC
ACGTTTAGAAACAAATTGGACATATGAGAATGTAGATAAAATGACTAATT
GGCGGGTAGGGGATAGCATAACTAAAGCATCTTCTTGGTCTAATTCAACT
AGATTTGCCGGTATTCAGTATACTACTAATTTTGCGGTTAGACCGAATTT
AGTTACTTATCCGTTACTGGTTTTAGAGGGAAATCAGAACTTCCAAGCAG
TATAG
>RF_0689 unknown
ATGGCAGAGATTATAACTAATATAAATGATACTATTGAAAAAATTAAAAA
AAGCGATGAAGTAACTGAGATATCGGCGGCAGTAAAAGGTAAAATAGTTG
ATATAAAAAACGTAGATAGTAGATTAGATACTTTGAATAAAAATATTGTT
ACTCCCGATCCTATTCAACAATATTTACAATCTGAAGAATATATCACTAG
TACGCTTGAAGTACTTGCCAGTAAAATTATTAGTGAAGTCGTAGAAAATA
AAGATATACAAAAATTAGTAGATAATTTGCATATCAATTTAGGACAAGAT
ACAAAACTAATACCTAGTGCAGCAGATAAGTTAAAGTTTGATGTCGCAAG
GGCTGAAGCAGCACTTAAAGGTTTTGTACTTCCTCTAAATAAAGGAGGAC
CTTTTGATGAATTATCATTTATGGGTATAGAGGATGAAGAAGAAATCTTT
GCTGGTCCTATAAGAGCAACTAAAGAAGCATTAATAGCCGTAAGCGGAAA
TTCTATACCTAAAGAGCAATATGCACAGGCTGTAAAGATAAAGCTATAG
>RF_0477 Cell surface antigen-like protein Sca7
ATGTCAAACGGTGCAGAAATAGAGGTTAATGATAATATCATCGCTACCGA
TATTGCAGGTGAAAATGAGAATGACGGTACTTTAAAATTAAACAACAAAG
CCCCTATTAATATAACCGGTACCATCGGGAATAATAATAGTTTAGGTATA
GTAGAAGTAGCCGGTAAAGACGTTACTATTACAGGTGAATTAAAAGCCCA
AGCTATTAACTTCTCAAATGCAGGACAAGAAGCGATATTAACGCTACAAG
CGGCAGGTGGAGTTACTAATATTACTACAGCAGGAAATAATCTTCACACT
TTAGCAATAACGGATTTTGATACCGGTAACGGTGCTATTGGGGCTGAAGA
TCACAGATTAAAAGCAATAGAATTAACAGAAAACGGTTTAGTTACGATAA
ATACTAAGAATTTTTATTCGGATGTAACTACTGCGAATAACGGGCAAGGT
AACGTAAAACTTAATATAGAGGGTGGTACTACTTATAATTTAGGAAGTAA
AAATAATAGTTTAGCAAGTGTACAAGTTAGTAAGAATAGTACTATTAAAG
GTGATGTATATTCTAAAGAGATTAACATTGATGCAGGTAAGAATATAGAT
TTTGAACGAGGTAATAATAGAAATGCTAAAAATATAATTATACAGGATGT
TTTAGTAGATAGAGATCTCCTTCCTCGTTCACTTCAGTTATTTACTTATT
TAACTGATATTAAAGTAGATAAGCTGAATTTTGCAGATGCTGCTGCTTCT
ATACATTTTAAAGATGCGGTTTTAGTAAATGCTGAAATTGACGGCGGCGG
TGCTATAAAATTTGATGAAAATGTTTGGTTAAAAGAAGAAATCAAAAATG
TAGAGCGTTTAGAGTTTGGTCCTGAGAAATTTGCTATTCTTGAGAAAAAT
ATTAAAGCAGCTAATTTAGTAGCAAATAAAGCAAATATAGTATTATTGGA
TAATTTAGGAATAGATGCTGATTCACAATTTACGGATAGTGCTTTAGATT
TAGCTACTTACGAATTAAAGCATACCGGAAATGTTACATATAACGGTACT
CTTGAGATTATTACGTATTTTGATGTGACTGCGAAATCGGGAGGGCATAT
ATTAGTCGGTAACGGGGCTAATGTTAATATGTCGGCTTTAGATAGTTTAG
TAATTAAAGTCAAATCACGCTCTGATATTACTAAAATTACTCCTGATACC
AAACATGAAGTAATACTAAAAGAAGCAGGCGGAAATTTTACTCCTGTTGC
TCAAAATAAAGTTACTGTTGATACAGGTGGAGAATTAAACAGGTTAATAA
GATGGGTAAGATGGGTAAGCGATGAGAATGGAGTTGTATTACTGAATAAT
AATGATAACGGTGGCGGTAATCCCGAAAATCCTGATCCAGGAGGCGGTGA
TCCAGAGAACCCAGGGGACGGTGATAACGGTGGAGGAAATCCTGGAGACG
GAGAAAGTGGTGTAATAGTGCCTATTTTTGATCCAAAACCGATAAGAGAT
GAGGTTACGGGTCCTATAGCTCCCGGTCTTGTAGAGCAATTAATTGGTAT
CGGCATTGGTAATGAGAGTGATGCAGGTAAAGTATTAAATGATTTAGGAT
CAACAAAAAATGTTTCAGAAACTTTAAATCGGTTAGGCGGAAGAATGGAT
ATACGAGAAGTGAGTGAGGGACTTGGAGAGTTTAATATAGAAGAAATACA
GGACATATTAACAGATATTTCGGTAAATATGGACAGCGTTGTTTCTTCGG
GGATTAATGCTAGACTAGGTGAAGTAAATAATAAAGATGAAGGTACATTT
AAGCTAAACGGTTTAAATAAACCAAATGCTAGTGAAAGTCTTAATAATCA
AGCGGCAGTAGCTGCCGGTGATGAGGATAATATCGGTACGGGTATCTGGG
GCGTTCCTTTTTACGGTAAGGCTACACAAAAATCCCGTAATGATGGGGCA
AGCGGATATAAGTCTAAATCTCAAGGAGGAATAATAGGTTTTGATTATGC
TCTAAGTGATAGTGTAATAGTTGGAGCTGCTTATACTAGAGCTGATAGTA
AATTACGCCATCAAAATTATAAAGTCGGTGATAAGACTAAAGCTATAAGC
GATATATATATTCTATCTATGGACTTTATAATTGTGGGACAAGTAATTTC
TTTGTTGAGGCTATAG
>RF_0704 unknown
ATGAAAAAATATTTTTTAAGATTTCTACCTATTCTATTTATATTATTTAC
TTTTAATGTTTTTGCTAGTGCTACTATCGTACCTGTCAATATAGAGATAA
GTAAAGATAATAAAATAGCAACTATGACGGTACAAAATAATGATTATACA
CCTAAAAAGTTTCAGCTACTTCTTTTAAAACGTGTGTATGAAAACGGTAC
AGAAGAATATAAAGAAACTACGGATTTAGTGGCAACTCCGGTAACATTTA
CCTTGCATGGCGGTAAAACACAATTGATACGGTTAGCTTTAAAAAATACA
CAGAATTTTTCTACTAGAGAAAAAGACTATAGAATCATATTAAGAGAATT
ACCGCGTAGAGTAAAACTAGAGAATAGTGTTACCTCTACGGTAAATCTTG
TTGTTCAACATAGTATACCTATAACAATATCAAGGTAA
>RF_0984 unknown
ATGTCTATAATTAATTTTTCTAGTTTCAGCGGATTAAACAAAGAACAACA
AGAAGAACTACAAAGACTGTTAATAAAATTAAAAGGTTTTACAAAATCTT
TGAAAATGAATGTAAAAGATTTGGAAGATCATTTATTTTATATTTTACAA
AATTCTTTAAATGAATTATCTCACACTGAAAATATCGATATAGAGAAAAT
AGAAAAACTTTTTAATAGAACAATCCAAGAATCTCTAACTACTTTATCTG
AAGCACTTGAGAAAGCATATCAAGAACAGTTAAAAACAAAAGATATCTTT
TTATTTGACGGGATTATTGTAGAAAAATGTTTAAACGTTTTAGAACAAGT
TTTAAAATTTCAGCAAGAATTAGATAAACTCTATCCTGGAGCTTCTAAAA
AAATTATAGAATCATTAGAAAATATATTAGTCGGAGTTATATCCACTCAA
ATACCGATGCTTGGAATATTTATCCAAACAAGCGGAATACTTGAAAAAGT
AAATAATCTTATTGACTCTGAAAAACTATTGCCAAAAATAACAAAACTGC
ATAATGATATAAAAGAAATAAGGGAAGAGGCTAAATCTAATGAGAAGCTT
GAAAATATCTATGAAAAAGCCAAGAACGTTGCCGCAATTTCAGAAATATT
AAAAGAACCGCCTCGAAAAATTATTGAAATAGCAAATAAAAACCCTAATA
ACCAAGCTTCACTAGAGAATGTTGCAAAAGCTTCTAAAGCTATACCAAAA
AGCAAAGATGAAGTAGAAGAAAAAATAGCAGAACTAAAAAGTAATATTGA
AAATGCAATTCCGCAAGATATAAATATTGACAAATTAAACTCTGTAAAGA
ATACTATTTCGGATAATCTAAATGAAGCTAAAACAGAATTATTAAAAGTA
TTAAATCCGGAAGCTTCTTTTGGCGAAAAGATAGAATCCTTATGTAAAGC
CGCAGAAAAAGCTATGGAAATTGCAAGTGACATAAAAAAAATAGTAGGAG
TAATACCAGGAAGTAAAGAACTCGGAAATGTTATAAGTCTAGCAATAAAA
ACTAACTTATTACCGCCTCCGGTCTTAGCAGTTGCAAAGCTAGCTCCTGA
TATAGCTAACTTAGTTAATATAGGTAAAGCAGTGGTTACGATGCTTTCTA
AAACACAAAACTTAACTCAACAACAAGGAAGAGCAAAATAG
>RF_pd46 unknown
TTGTCAGATCAATATGCAGCTACTAGTAGTAGACTAAACTCGCTATCGTC
TAAAGACTCGATGCTGCGTACTATGTCAGGTCAACAAGCGTTAGAGCTTG
CAAGCCGCTTGATTGCAGAAGAAGCTCGCTCAATTGGGATCTCAGAGCAA
GAGCAGATGCAGTTTAAAGATGCGGTGAGTACCGATAGTACAACTACTGA
TAATACTATTATGAGAAATAATAAAGAAACAGCTACTAGCAATAATGCTA
GCGTTGGTTTCAATGCTTTCGGCTTGGGAGGTGCTTCAGCAAGAGTATCG
GCATCTAATAATACAAGTAGCAGCAGTGAAGAAGTGTTATCAAAAAAACA
AACTATCAACAATGTACTTGAAAAAACAAAATCTGCACTTCAAGAAGGAA
GACTCAATAGCTTTAATAGTGATACTCAATCACTAGCAAGAACTTTAAGT
CAGAACTATCAGGAGCAGGAATCTATTGGTAGAGAAATATCTGATGCAAT
ATCGGCTCAAGACCAGTTAAGTAGAAGTCGTCAATATGTAGCACAAAATG
CAGCTACTATTGATCGTAATATGAATGAGCCGGTACTAAATGCTATAATA
GATAGCAATATTCCGGGTGTTTCAAGTAAGGAGCAAGCTGCAAGATGGGC
AAGAACTCATATACATGAGGCAGCTTCCATAGCAAACTCAGTAATGCCAG
TTGATAATATAGCATTAGATAATGGTAGACATTTAAGTGGTATTAGCTCT
GATGTAAAAAATATACCTATGCGTAGTGAGCAGCATTTAAAAAATGAATA
TCAAGTGCAGACAGGTAAAATAGAAGCATCAGCTGATAAAATAAATAATA
AGCAAGAATTAGCTTATCAAAGCGTTGAAACGAGATTAAATAATAATTTA
AGTAACAGCGTAAAAGAAAGCTACAATAACTTAAATAATACTGCTCAGCT
CGTAGAGCAGAAAGGTAAGAAAATAGAAGATCAGTATGAGGATACCTCGG
ATTCTACTGTAAAAAGAACACTAGATGAAATAGGTAAAAACTCTAGATTA
TAA
>RF_1296 Phasin family protein
ATGTTAAATAATACACAATTTTTAGATTTAATGAAATCCTATATGAATCC
GGAATTTTATATGAGTTCTATGAAAAATATCCCTAGTGTAGATCTTTCAT
CTATCACAAATACAATGCAAAGAGCTATGAATATTCTTTTAACAACTAAT
CAAATTGCTACAGAAAGCATGCAATCTTTGCTTAAGAAAAATTCCGAGAT
TATACAAAATAATGTTAATACTATTTTGAATACTACTAAAGAAGCAGCAA
ATTCTAAAGATTTCAAACAAGCTAGTGAATGTCATCAAAAATGTTTAAAA
TCTATTTATGAAACATCTATGGATAATGCTAAGGAATTAGCAAGTATTGC
TTATGAGTCTTCAAACAAAATATTAGAAGCTGCAAATAAGCATATTGCCA
AGAATGTTCATCATGCTTCTAATAATATGCAAAATATGGCAGAACAAGTA
CAAAAAAAACTTTAA
>RF_0706 P pilus assembly protein FimD
ATGGGAGATTTTGACGTAACAAACATTCCGGTTATTACCGGTAGAGGTGA
CTTAATAGTTAAAACTCAAGATATAACCGGTAAAATTCAAACAATTACCA
TTCCTTATTATGCCTCACCGAGTTTACTGCACGAAGGGCTTTCAAATTTT
TCTTATGAAGCAGGATTTCAAAGACAAGATTTTGCGATATATAGTAATGA
TTACAAATATTTAGTTCTAAATACCGATTATATGCTTGGTATGAATGATT
ATTTAACAAGCGGTGGACGTTTTGAATTTTTAAAAAATAATGGAGCAGTA
AGGGTAACTAATAACTTAAAAATCGGAAATTTTGGAATTATAGGCATTTC
AGCTGCAAGTAATATCAAAAATTTCGGTCGTTCTCAAAGAATTAATTGTG
GTTATACTTATGAATCGGAATATTTTGACATTAATAGTAATTTAGATTGG
AATAATAGCAATTATCAGGATGTATATAACTATCCCGATAAAACTTTTTC
AAGTTTAAATTATCAGATTTCAGCTAGCTGCGGTAATACCGATTTTGGTA
ATATAAGTGTTAATTTTTTGTCTTTTGTCGTAAATAACACAATACAACAA
GGTAAACGTACAAATATAATATCATCGACTTATCAAAGGAATATTACTAA
AAAAGGTTTCTTAAGTTTTACTATAGGTACTGATTTAAACAGTAAACGTA
AAAATAATTTTGCCTATATGTCATTTAACTTCAATTTAGACGGTAATAAA
AGTATTTCATTTACCGATTCGTATCAAAATAAATATCATACGAAGCAACT
TGGTATTTCTTCACCGGTTACCTCAAATATGGGATGGGGATATAATGCTA
ATATAATTAAAGCTAAAGCTACAAACTATAACGTACAGCTTAATCGTAAC
GGTAAAAATAACGATATTGGAGTTTATCTGCAGAAAAATGATATCGAAAC
AATGAAACAATTTAATATCAAAGGAGGTATTGTCTCTATTGATAAAAGCT
ATTATGTGACGAGACCGATTACCGGAGGTCTTGCTTTGATTAAAGTAAAT
AGTTTAAAAAATGTCGGAGTTTATAATAATAATCTATTAGCCGGCTATAC
TGATGATAAAGGTAAAATGCTTGTACCAAACGTAACACCCTATGTTCCTT
CTGAAATAAGATTAGATGATGAAAATCTACCTCTTAATACCGAGTTTGAG
GAAATTGCTTTAAAAGTTGCTCCAAAAACAAAATCAGCAGTATTATTAGA
TTTCAATGTTAATATAATTAAAAGTGTTGAAATGACTATGTTTGATAGCA
ATAAACATTTTATTTCGTTCGATAGTACGGTTAATATTGAAGGTTTAGAC
GAGGAAATATTTGTAGGTTATGACGGTAAGGTTTATATCAATGATATTAA
AGACCTTGAAGTATTAAACGGCTCTATTTGTGATGAGAATGAAGAGAATA
ATAGATGCTGTCATTTTAGCGTGCCGGTTAATAGAGACTTAAACGATCCT
GTAATTGATTTAGGCGAAGCAATATGCAAATAA
>RF_1304 Outer memberane protein rOmpA
ATGACCGTACAAGGTGACGTTGGAGCTAAAACAATAGGTACGGCAGGAAA
TGAATTAGCATCATTAAGTGTTTTAGGTAATGTAGCATTGAATAATATAG
ATGCTACAAATGTTCCTGTATTTAATATCCTAAATGTTACAAACTTTGTT
GATGTAGGTGGTATTACTAATCAAATTAATGTAATAAATAACGGTGCTGC
AGGCGTAGGGCCTACAGGTGGAGCGATTCCTGCCGCTGCCGGTTCTTATA
CGATTGATGCAAATGGCGGTAATGTAGGAATTTTAGCCAACGGTCAGAAT
ATTAATTTTGCTCTTGAAGATGCAACTTTAGTATTACAAAATAGTGCAGC
CGGTAACGGTACGATAACATTAAATGCTGTACTTGATCCACTAGCTCCAA
GTAAAGGTAAGCTTGCTGTAGATTCAGGAGCTGCGGGCGGGAAAGTAATT
CTTGCAAGTGTCGGAAATGCTACTTACGGTACTGCAGTAAATAAATTAAA
AGAATTAGAATTTAGAGGAAACGGAACATTCCAAATAGATACTGAGATAT
TTGCTAACGATTTAGAATTATTAGTGCCGGCAATTACCTATAATAAGGAT
ATTAATTCTAATTTATCATTCGGTGTTGCTACTGCTTTAACTCAAAACGG
TAATATTAAAGGTAATGTAGATTTCAATAATCAAGCAGCAGTTATAACAC
TTGGTGCAAATAAAAATATCACCGATAGTGTTACAAGTACCGGCGGTGTT
AACGGTACAATCATTGCAACTGGTGCAAGTATTATTAATGGACCTATTAC
GAATCTCGCTATGTTAAAAGTAGGTGCCGGGACTGTAAGCATAACCAAAG
GCGGTAATACTAGTATCACCGAAATCCAAGGTAACGGTACTGCACTCTTA
AACATTACCTGCAAACTTTAA
>RF_0474 Cell surface antigen-like protein Sca7
TTGAATATTAATGCCCCAGTAACTCTAAATAGCACCTTTTACACTAGTGC
ATCCTCAGAAACAATAAATGTAAATGACGATGTTATAATAACTCAGCCTA
CTAAAGCCAGTGGTGCCGGAAATATGAATTTTAATATTGCCGGAGATAAA
TCACTTACTTTATCTGCTCCTAATTCGATTCAAGATGGAACAGGTGCAGG
GAGAGTAAGGTTTAATTTTACAGGTGCAAATTCTGTCCTAAATATAGATG
GTACTAATACTACAATTAGAGGGGCAATAACTAACGGAGCAAATGGAACA
TTAAATGTAAATGCCGGAGTTACTACGGCTACTGATTCAACTGTTACTAC
TATTCAAAAGACGAATATCGCCGATAACACTACTTTTAATATTGATAGTG
TTAATAGTAACATGAATTTATTAAATAATGGAACAAGTATAGCGTTTAAA
GGAGCAAGTTCAGAGTTAGATTTAATAAATACCGGTAATACGGATAAGCA
GTTTACGTTATATTCTAATTTAAATCCATCAGATGCAGAAGATGAATATG
GGATAGTAAGAGTAGAAGCAACTACAAATAATCTTACCATAGCAAATAAT
GGAGGACCATATACGATAGGGAAAGATAATACTCATCGTCTTAAAGAATT
TGAAGTTAAAGGAGCAGGTAATATCGTAATTGATAATACGGTATTTACAA
AGTTACTAAGTATGAATAGTACCGGACAGGTAACTCTTAATCAAAGAATA
GATTTAGGAGCAGGCGGTAATATTGCATTTGGAGCGGATGGTACGCTGGT
AGTAAACAATGGGATAACGGGAGATGTTGATTTTAATGATGGTGCCGGCA
CTTTAGTAATGTCTATTAACTTTGAAACTGGTAGTAAGTTCAGTAATGCG
GCGAATGCTACAGTGCAAATATTTAATTCTTTAATATCTTTAAGAGATTC
AAGTGCAGGAAATATAGGGAATATTATAATTGGAAATGATAATAGTTCTG
CTACGCTTTACGCTAATTCTGGAATTAGTTTTACAGGGAATATGATTTTT
GGTTCACAAGGAGGAAAGTTATGGGTGCATAATGATCAAGTGTCATTTTC
AGGAAAGATTATTAATGGTATCAAGGCTGAATTATATTTAGAAAATAATT
TTACAGCTTTAGATCCAAGTATTGGCAGTGTTAATACAGTTAATATAGTC
GATAATAAAACTTATACTATTGATGCTAAAAACGGCAATGTAGATTTATT
AAATAACGGGGCAAAGATAATATTTGAAGGAGCAGATTCAGAAGTAGATT
TAGTAAATACAGGGAATGCAAATAAGCAGTTTATGTTATATTCCAACTTA
AATCCATCAGATGCAGAAGATGAATATGGGATAGTACGAGTAGAAGCAAC
TACAAACAATCTTACTATAGCAAATAATGGAGGACCATATACGATAGGGA
AGGATAATACTCATCGTCTTAAAGAATTTGAAGTTAAAGGAGCAGGTAAT
GTTATAGTTGCTAATCAGGTGTTTACAAAGCGATTTAACATGAATAGTAC
CGGACAGGTAACTCTTAATCAAGTATTAGATTTAGGAGTGGATGGAGAGG
TAATATATAATCAGCCCGGTACATTAAATGTTAGCGGTGATAATCCTATT
ATAGGAAAGGTTAACTTTCAAAATGTTGATGATACTCTTAAGGTAAGTAT
AGGTTCTAATCAAGTTTTCGCAGCTAATATAGATAATATCAATAATGTAG
ATAATAATGGTTCAGTTATTATATCGCAAGGAGGAAATAATATAGCACAA
CCTTCTATTATAAATAGTGTTATAGGTATGAGTAATCCTATAAAGGAATT
AATAATAAATAATGCAAATGAATATAGTCTCAATATTGTATTAAACGGGG
AGGTCAAAGCGTCTAAGATTCAAGTAAATCGTACTAGTGGTAGTAACCCA
AATATGCGGATGACTATAAATAATGATGTTACTGCTGATATAGAAGGCGT
TAGCAATGGTAGTAATAATTTTGTATTAACTATTAATCAAGGAAAGACAG
TTACCGGTGCAATAAATTCTATAAATACCGCTTCAACAACTATAAATTTG
AGAGGTAGTGTTACGGGTCCAATAACCAATGCCACTACTATTAATTTCGA
TGGTACAGGAGATACAAAACTAGGTTCTACTGCAAATACTACAGATTTTA
TAGTAGCTAATGCTAAAGCTAATGTAACTGCCGATGGTCGTATGACCGGT
AATTTAAGTTATAACGCAGCAGGTACGGTAGCAGCTAATAAAGGGATAAC
GGGAGATATCAACTTTAAAGGTAATGACGGAGTATTTAATTTAGGAGACG
GTTCTACGATTGTTGGGGCAGTGACCAGTACCGACTCCGTTGCCGGTAGC
TTGTATTTTATAGGTGATGGAGAGGTTACCGGTGGAGTAGAGGCAAAAAA
AGTAGTGTTTAACGGTATAGATAATATAGAGGGGGCTGCAAATGCAGAAA
TATTTACTGTAGCAAACGTTAATACAAAAGCGGATATTACCGGAAAGATG
GTAGGAAATATAGAATATACTGCTGCAGGTGCTTTAATTGCAAATGGAGG
GCTAACAGGAAATGTTAACTTTAATAATAGAGGAGGGAGCTAA
>RF_0693 sca3, Cell surface antigen Sca3
ATGAAAAAATCAAAAATATTAAGAAAATTTCTAACAACGGCATCATTATG
CGGAACATTATTCACTAGCTCTAATGCTGCAGGAGCAACAATTCCTAATC
TCGGTAGCGTAAGCTTGAGTACCGGTGCCGGTCTTGTAGGAGGAGTATTT
AATAACGGCGATATTATTCAAATAGCGGTTGGAGGGATTGGAATTAAAAT
ATCGGCAGATAAAGCAAATGCTGTTGTTGGCGGGATAAATACATTAATAG
CACTACCTGCTTTTGGTGGGGTTGAGGTAAGTCAAAATGTATCAATAGGT
CCTCTTAGTGCAACAGTAGGGCTTACTCCTAATTTCGGTCCTCTTAAATT
TATTAGTAATAATGTTACGTCAATTATTACCGGAGTCGGTAATCAAACAT
TTAATAATATAGATTTTGCCGGTAAGAATTCTACTTTACAAATTAATAAC
GGTTTAAATATTACAACTCAGATAGATAATACGGTAGCCGGAAATAACGG
TATAATAACTTTTGCAGGTACAGGGACTATATCAAATAATATAGGCTTAA
CTAATTCTCTTTCTCAAATAAATGTAGGCAATGGGGAAGCACAGATTTAT
ATGCCTGGAGCAGGTAATAGCATAATTAATGCTGCAAATATAAATCTTAC
TAACAATAACTCTATACTTACTCTTTTTGACGGTAATGTAACAACGTTAA
CGGGTAATATAAATAATACTACCGGCGTTGACGGTCAAGGGATACTAAAT
CTAGCTCATGATTTAGCCAGTGATAATATAATAACAGGCGATATAGGTAA
TATAGGCTCATTAGCCGCAATAAATGTTTTACTTGGGTCGGCAACACTTA
ATTCTACAATATTAAAAGCTACTAATATTAATTTACAAAGTAATACATCC
GTACTTAATTTAGATGACGACATAATTGTTACGGGTAATATAAACGGTGC
TAACGGAGTAAACGGTACATTAAATTTTATAGGGAATGCTACACTTAACG
GAAATATAAATAATTTAAATATACTTCAGTGTAGTGGAGGTAACGGTAAG
ATTCTTGATTTACAAGGTAATATTACAGTAAATAGTATTGTTTTTGCAGA
TAGTGTTTTAGCTTCCGGAACTATAAGTGTTAACGGTCTATTAAATGTAG
GAGGTATTACTTTTAATAATAGTAATGCTAGCGGCGGTACTTTAATAATA
AATACCGAAAATACAATCAATGTTGCATTATTAAACGCTATAAAAGCAAA
AATACAAATAAATGCTAATTTAACAATCAATGATCCAAGTGCCGGAGATA
TAGGTGATATTAGAATAGCGAATAATACGACATATACAATAGATGCAGCA
AATGGGAATGTAAATTTGCTAAATAACGGCGCTAAGATAATATTTGAAGG
AGCGGATTCAGAATTAGATTTAGTGAATACTAGTAACATAAATGATAGGC
AATTTACCTTCTATAATAATTTAAACAAATCTGGCAATGATGAATATGGA
ATAGTGAGAATAGGAGCAACCACAAAAGACCTAACTATAGAAAATAACGG
TGGTCCTTATACTATAGGACAAGATAATACGCATCGCCTTAAGGAGTTTA
TAGTAGATGGAGCAGGTAATATCGTAGTGGATAATACGGTGTTTACGAAG
TTACTGAGCATGAACAGTACGGGGCAGGTAACATTTAATCAAGCTTTAGA
TTTAGGTGCAGGCGGTAATATTGCCTTTGGAAAAGATGGTACACTAGTAG
TAAACGGTGTAACCGGTTCAGTTACGACTTCTGCAAATAATCAAGGGACA
CTCACCATCAATAGCGGTAATATTAACGGTACGATAGGTAGCAATGGAAG
TAGCTTGAAACTTGTAAATATCGGAGCAAATCTCGTTACGTTCTCAGCGA
ATGTATTTGCACCGGTAGTTTTGACTAATGCAGGTTCTGCTTTAACTTTA
GCAGACGGTGTTACGCTAACCGGAGCAGTAACAACAAATAATAATACAAA
AGGTATATTATCGCTTGGAGTAGGAAGTAACGTAACCGGTCAGATCGGTG
CAAATGGAGCAGCTCTTGAGAAAATAAATATCGGAGCCGGAGCTAGTAGC
CTCGGTAGTAATATATATGTCGGCTCTACGGTATTAACAAATCAAACATC
GGTGTTAACTTTAAACAATAATGTAGTCGTTAACGGAAATATAACTACTA
CTGCCGGAAACGATAGCGGTAAGTTAATATTTGCAGGCGATGGCAGCGTG
ATAAGTAACGTAGGAGCAAATGGAGCAGCATTAGAAGAAGTAATATTTAA
CGGTGTAGATAATATAGGCGGTACAGCTAATGGGGCAGTTTTTAATGTAG
CAAATATAGCAGCAAATGCAACGGTTACGGAACTTATGACTGGTGATTTA
GTATATAATGCAGCAGGAAAAGTAACGGCCACCGGAGGACTTACAGGAAA
TATTGATTTTCAAAATAATGCGGGTACGTTTAATTTAGGGGCGGGTAGCA
CACTTACCGGAACGGTAACTAGTACCGGTGGTGTAAATGGAACATTAAAT
GTTTCAGATGCAGGTATAATTACCGGTAATATAGATAACCTAAATATATT
AGAGTTTAGCGGCAGTACCGGTACAACGCTTGATTTACAAGGTAATACTA
GGGTAAATAGTATTGTCTTTACAAATAATGCAGCAGCTTCAGGAACTATA
AATGCAGGAGGCGAGTTAACCCTTGGTAGTCTTACTTTTAATGCTAATGC
AGTAGGAGATGTTTTAGTAATAAATGCTCCAAGTACGATTAATGGAGCAA
TATTAAATGGTTTAAAAGGAAAGATAGAAATAAAAGCAAATTTAACAATT
AACGATCCAAGTGCCGGAGAAGTAAATGAGATTGATATAGCTGATAATAC
AACTTATACGATTGATGCTAAAAACGGTAATATAGATTTATTAAAAAATG
GAGCAAAGATAGTATTTGAAGGAGCAGATTCCAGGTTAGATTTAATAAAC
ACTAGTGTCACAGATGATAGAACATTTACCTTATATAATAATTTAAACAA
ATCTGGCAATGATGAATATGGAATAGTGAGAATAGGAGCAACCACAAAAG
ACCTAACCATAGCAAATAACGGCGGTCCTTATACTATAGGGCAGGATAAT
ACCCATCGCCTTAAGAATTTCATAGTAGATGGAGCAGGTAATATCGTAGT
GGATAATACGGTGTTTACGAAGTTACTGAGCATGAACAGTACGGGGCAGG
TAACATTTAATCAAGCTTTAGACCTAGGAGCAGGCGGTAACATATTATTT
GGAGCGGATGGTGAGTTAATAGTAAAAGGTGTAACCGGCTCAGTTACGAC
CTCTGCAAATAATCAAGGAACACTGACAATACAAAGCGGCAATGTTACCG
GTACGATTGGAGCTAACGGCAGCAGCTTAAAACTTGTAAATATTGGAGCA
AATCCCGTTACGTTCTCAGATGACGTATTTGCTCCTGTAGCTTTGACTAA
TGCAGGTTCTGCTTTAACTTTAGCAGATGGTGTTACGCTAACCGGAGCAG
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GATCCATCTCCTATCCTAGATGATACTAAAAACAACCAAGTAGCTTCCGG
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CTATAGGTTCATATGGTAGAAATAAAGTCAAAAATTACGAAAAACGTTTA
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TAGGCGGCGGTATTTCTACTAAATATAATATGATGGAATTTGGTATTAGA
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GATTAAAGTGAATCTGTAG
>RF_0104 secG, Protein-export membrane protein SecG
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TATAGTTATTCTGATGCAGCGTAGCGGATCGGATGGAATTAGTAGTATAA
GCGGCGGTAATAATATGGGAGTAGTCAGTGCTAAAACAGTCGGTAATTTT
CTTACTAAAAGCACTATAATACTTACAACATTATTTTTAATAAACGCAAT
AGTACTTGCTAACCTTTCCTCAAAAAAGAAATCAGATTTAGTTTCTAAAA
TTAATGAAATTGAAGAAAATCAAGCAGAAAATAGTTTACCTATAGCTAAA
TAG
>RF_0468 virB11, VirB11 protein
ATGAATGAAGAATTTGCAGCCTTAGAGACGTTTTTACTTCCTTTTAAAAA
TTTATTTGCTGAAGACGGTATTAACGAGATTATGGTTAATAAGCCTGGGG
AAGCATGGGTTGAAAAAAAAGGCGATATATATTCTAAGCAAATACCGGAA
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ATCATTTATTCTATAAGAAAGCCTAGCGGTATGAATCTAACTTTAGATGA
ATATGCTAAAATGGGAGCATTTGATGATACTGCAACAGAGAGTTTAGTAG
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GAATTTATTAGACATGCAGTTGTTTCAAAGAAAAATATCATAATTAGCGG
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TAAGACCGGATAGAATTATAGTGGGTGAGCTTCGAGGTAAGGAAGCTTTT
AGTTTTTTGCGTGCTATTAATACAGGTCACCCCGGTTCAATATCAACACT
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