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# Streptococcus pyogenes phage 5005.3

>M5005_Spy1007 phage protein
TTGCTTATAACAATCCACAACGCAAATTTAGAAAAAGTTGCTTATATTGA
TAACGATAAGCAAGACACCTTGAATTATTATGACGACAAATTTTCACAGT
ATTTAAATACGGCCAATTCGACATTTGAGTTTACGGTTTATAAGCGAGGA
ATTAAGTCCGACACAGTCAAAGAGAAAGCCTATCTGACACTTACAGAAAG
GTCTTTTGTGTCGTTTAAATATAATGGCAAGTCTTATCTGTTTAACGTAA
TGACAACAGACGAGACAGACATCGAGATACGTTGTTACTGCGAGAACCTC
AATCTCGAGTTGCTCAATGAGTATGCAGGACCTTATAAAGCGGCAACTCA
GATGTCTTTTGTCGATTATTGTAATTTGTTTGGCATCCTTAAAAACGGTG
CTATTACCATTGGCACTAATGAGACAACCGACCAAAAACGCACAATCGAA
TGGACTGGTCAAGATACCAATCTTAAACGCTTGTTATCTATCGCCAATAA
TTTTGATGCGGAAATAGAATTTGTAACGCATCTTAAAAACGATTCTAGTC
TTAAATCGTTTGTCATGAATGTCTACAAGAAGAACGACGCTACTAATCAG
GGCGTTGGTCGTAGACGAGATGATATTATTTTGCAATATGGCAAAAATAT
CGAGAGTGTCAGACGTAAGATTAATAAAACAGGCATTTACAATGCTATAA
GACCAAGCGGTAAAATAACAACGACTACAACCACAACGACTGCTAAACAA
GGCTCTGTGCAAACAGGGTCTGTTTTGTGGTCTGGCGGTAACTTGACTTA
TGCAGGTCATGTAATGCAATCATCTGTTGTTAACACTATTTTAAGCCTAT
GTAGCAAATACAAACTTTTACCATCTGGTGTTTTTAGCCAGCTATACCTT
GAATCGTTTTGGGGAGATACCCCAGTCGGAAGAGCCGATAATAACTGGGG
TGGTATCACTTGGACTGGCGCAACAACTAGGCCAAGCGGAATAAATGTCT
CCCAAGGGCAGTCTCGTGCTGAAGGTGGTTATTATAACCATTACGCCAGT
GTTGATGACTACTTGAAAGATTACGCTTACCTCTTGGCCGAGCAAGGCAT
TTATGCCGTAAAAGGTAAGCTAACCATTGATGAGTACACAAGAGGTCTGT
TTAGGGTCGGTGGCGCAACATATGATTATGCTGCAGCTGGATATGATCAT
TATGCACCTTTGATGCGAGACATCAGAGCAGGTATTAACCGTAATAATAA
CGGCGCTATGGATAACGTCGATAACCAATTTAAAAATGGTGGCTCGACTA
GTCAAAACACTACTCAGATAGCTGCTAAAACAAAAGCGGTACTTGCGGAA
GCAAATGGACTGAAAGGTCAACGAGTAGGCTCTGGTCAGTGCTATGCGTT
AGCTGCTTGGTACGCCATGAAATTAGATGGTCCAGGTCTGAACGGTGGTG
TAACTAGTTTTAGAGGGCTTATTGGTGCTGGTGCTGCCGCTGCTCAGATT
GGTACGGATTACAACTGGGGTCAGTTTGGCTGGAAAGTTGTACAACCGAA
TAAAGTCGCAGACTTAATCACAGGCTCGATTGTTAACATCAGAGCAAACG
CTGGCAGTCCTGTTTTTACAGGCGCTTGGGGGCATACTGTTGTTGTTAAA
TCTCTATCTGGAGATACACTCACAGTATTAGAGCAAAACTATAACAACGT
GCAAACAGTCCAAGAGCATACATATAGCGCTAGCGCTTATTTATCAGTTG
TACAGACAGTCTGTTATCCGCCAGAAATCGTTCAAGGAAAACGCGTCGAA
GGTACTGCACAAGCAGAACAACCGCAATCTGAAACGACCACAATATCTGA
AGAAAAAGAGGTCTTAATTAATCCATCACTTTATCGTGAGTGGAAAAACG
AAGCGGGACAAGTCGAGTTTTACGTTAAAAACAGTATGCTCTACGCACCT
CTGTCAAAATCTCTTTACCCGTCAGCGTTTACTGGCATCGAGACGGACGA
TAACTGGATACGAAAAGACTTAGATGTTGACACAGAGAGCGAGGAAAAGC
TTATCTCTGTTGCTCTCGCAGACCTGAGAAAACATTGTTATCCAGCGGTG
ACTTATGAAGTATCTGGTTTTATTGGTGATTTAGATATTGGTGACACTAT
CAAAATCAATGACCCAGAATATACCCCAAGTTTAATTTTAGAAGCAAGGG
TTAGCGAGCAACACATCTCGTTTACAGAGCCTAATCAAAATAAGACAGTA
TTTGATAATTACAGAGCTTTAGAGAGCAAAGTCTCACAAGGTTTAATTGA
TCGCATGAATGAACTAGCAGAAGCTGCTAAACCTTACGACTTGCGGTTAA
TGACAGATAACGGAAATGTGTTTTTAAATGGCGAAGGTCGTACGATTTTA
ACCGCTGAACTTTGGAAAGGTAACAAAAAGTTTGATGCAAGCTATCAATT
TAAACGTGATGGTCAATTAGTCGGCGCTGGATTGCAGTTGGCAGTTGACG
CTAAGGATGTACCAGCTGATAGACCTCTAATCATTACTGTTGAGGCTTAT
TTAAATAATGAGCTGATTGCAAGTAAACAGATTACGTTTACTAACTCGCT
TGGAGAACAAGGACCAGCTGGACGTGGGATTGTCTCTACAGAGGACTATT
ACTTAGCGTCACCAAATCGTACAGGTGTCACATCTGCAACATCTGGTTGG
ACTAAGACGCCTCAGGAAATTACTGAGACTAATAAATATCATTGGTATTA
TCACGTTGATGTTTATTCAGATGGCACTCGAAAAGAGACTACACCGGCTA
TTATTGGTGTTTACGGCGATAAAGGTTCAGATGGCAAGCAAGGCAAACGT
GGGGAGATGGGACCATCAGGACCTCCTGGCGCTTTAGATAAAAAGCAACT
ACAAGACATCAATAATAAAATTGATGGCAAAGCAGACCAGAATTTGACCA
TCGAGCAAATCAATAAATTAGCCGAGTTACAATCTATTGCCAACGCTGAG
TTACAAGCAAAGGCTAGCATCGACGCTTTAGCTAGCTTACAAAAGCAAGT
ACAGTCTGCAATAGCGGCAATGAATGCTAGCCAAAAGTTATCAGAGCAAG
ACCTTATTACAGCTAGTCAACGGGCTATCAAAGCAACCAACGACATCTTA
GACTTAAAAGAGCAATGGAATTTTATTGACAATTATATGTCAGCGTCTGA
AGAGGGACTTATTATCGGCTCTAAAGACGGTACAAGTTCCGTGCGTGTTG
CCAAAGACCGTATTGCCTTTTACTCAGCTGGCGCAGAAGTCGCTTCGATT
ACTGGTGGTATGCTCAAAATTGATAATGGTATGTTTGTGGCTACTTTGCA
AGTTGGACATTTTCGCGAGGAGATGTACAAAGTTGATGGGGTAGATAAAC
ACATAAATGTTACAAGATATTACGAAACGATTGTGGGGTGA
>M5005_Spy0089 comG operon protein 4
GTGACAAAAAGCTATCAAAAAGTAGAAGAGCATCTGTTTTTTAGCCATTT
TGAACATTTGTATCGACATCAGCAAAAGTTAGCCATATTACAGCAAAAAC
AGCGCGTCTTGGATATTTCTTCAACAAAAATTGTTACAGAAGGTAATAGC
CTAACAGTTCCTAAATCAATAACAGTGAATCATCCTTATCGGTTAGTTAT
TGATCAGATGGGAGGCAACCATTCCTTAGCTAAAATTATTTTTGACATGA
CTGATCGACGCTTTAAATACCAATTTTATCTAGGGAGTGGGAATTATCAA
AAAACAAGTCAAAGCTTACATAGCCCTTGA
>M5005_Spy1171 phage-associated cell wall hydrolase
ATGACCTTTTTAGATAAAATTAAACAAGGCTGTTTAGATGGCTGGACAAC
GTACAAAATCTTGCCATCCTTGACCGCAGCGCAGACAATCTTAGAAAGCG
GGTGGGGCAAACATGCCCCACACAACGCTCTGTTTGGTATTAAGGCAGAT
AGCTCTTGGACTGGTAAATCATTTGATACCAAAACCCAAGAGGAATATCA
AGCAGGTGTTGTCACGGATATTGTGGACCGATTTAGGGCGTATGATAGTT
GGACTGACAGCATTATTGATCACGGTAAATTTTTAAACGATAATCCACGG
TATCAGGCTGTGATTGGTGAGACTGATTACAAAAAAGCTTGTCACGCTAT
AAAAGATGCAGGTTATGCCACAGCTAGCGGTTATGCAGAGTTGCTTATCC
AACTAATCGAGGAAAATGACCTTCAGGAATGGGATGAAGAGGCTATTGTC
AGAAAGGAGAAGCAAATGATTAGTTCTCAATGTCGAGAAGTCATTGAATT
TTTTATTAACTTGGTAAATGCTGGGGTTGGCGTGGATAAAGATGGTTTTG
CGGGCTGGCAATGCACAGATGTGCCTTGTTATGCAGCAAAGCACTGGTTT
GGTGTTGATCTTTGGGGAAATGCGATTGACTTACTAGATAGCGCTGCTGC
CGTAGGTTGGGAAGTCCACCGCATGCCGACAGATGCAAATCCACAGACTG
GAGCATTTTTTGTCCAATCAGTGCCATATCATCAATTTGGTCACACAGGA
GTTGTCATTGAGGATAGCGACGGTTATACCATGCGAACTATCGAGCAAAA
CATTGATGGCAATCCTGATGCTTTGTATGTCGGTGCACCAGCTCGTTTTA
ATACTCGTGATTTTACCGGCGTGACAGGATGGTTTTACCCTCCTTACCAA
GGAGATATTGTCACGCAACCAGTCAGCACCGAGCCACAAACGTCTGACAC
TATCGTAGAGACAGCAAAAACAGGTACTTTTACGCTTGATGTCGCAGAAA
TCAATATCAGACGTTGGCCAAGTTTAACTAGCGAGGTAGTAGGTAGCTAT
AAACAAGGTGATACTATCAGCTTTGATAGTGAGGGTTACGCCAATGGTTA
CTACTGGATTAGCTACGTTGGCGGCTCGGGTATGCGAAACTACACGGCTA
TTGGGATAACTGACAAAGACGGTAACATTATCAGCCTTTGGGGCAAATTA
AATTAG
>M5005_Spy1173 phage protein
ATGGCAACAGAGTTGATATTTGGCGTCGGTGGCTTTATTTTAGCTATCGT
CACGACTTACAATATTTTTAATGCAAAATCCATCAAGCATGCGACAGATA
TTACTTTGTTGCAATCTGAGGTAGAGCATTTAAAAATTGTTACACGCCAA
AATGCTCGGCGGCTTGAAGAGCACGCTGAGCAAAATAAAACGTTGATTAC
AATGACAGAGCAAATTAAAAATTTAACAGATGATGTTAAAGATTTAAAAG
ATATGATGAGAGGAGAAATCAAATGA
>M5005_Spy1295 hypothetical cytosolic protein
GTGGCAAAACAAAAAAATCGTAAAAAAGCATTGAAATTAGAAATGAAGCG
TAATGGCTTGTTAAAAAAAGCAGGTCAAGTTTTTGATAAGGCAGTTGAAA
GTGTTGAAACAGCTGTGGATAAAACCATTTCTGCTGGTAAAAATCTTGTG
GAAAAAGGCAGCCAAACAGTTGAAAACCTGACAGCAAGCAAGGAAAGACT
TACTCTTGATGAGTTTGCAGGGCAGCCAGTTGTAGCTGGTATCCGCTCTG
ACCTTGTCGAAACCCTATATGCAGAAGGCATCCATTCAGCGCAAGCTTTT
AAGGAGTGGACAGAAAAAGACCTCCTTGCTCTTAAGGGCATTGGTCCAGC
AACGGTTAAAAAATTGGTCGAAAATGGTGCAAGCTTTAAAAAATAG
>M5005_Spy0090 hypothetical protein
GTGGGAATTATCAAAAAACAAGTCAAAGCTTACATAGCCCTTGAAAGTAT
GATCGCAACAGGCATCCTCTTTAGTATTGTCATTCTCGTCTTAAGCAGTT
TACAGCAGAGTCAGGCTGCTCTAACGTACTATCGAAAGCAGCAAGAAAAG
CTTAATCTAGCCTTGATGGCAGTACAAACTAGAACTAAAGAGATGACATT
GAATGGTTGTCATATTACTATTTTACGTACGGATAGATACATTAGTATTC
ACGATGACGAAGGAGAAGTGATGAAGATTGAGTAA
>M5005_Spy1176 phage infection protein
TTGATATCGATTAAAGATGATAATACCCCTCTTGTAGCAGCCTTTGAAGA
TGAGATTACACAGGAGGCCAATAGTGATTACAAACTAAATTTTAAGTATC
CTGCTAAACACGAGTATCGCCCTTTAATAAAAAAAGGAATAATCTTAGAA
GCTGATGATCTGCATGGTTCTCAGCTTTTTAGGATTTTTGAAATTACTAA
GCGGCATGGCTATATTAACGTTTACGCTAATCAGGTCGCTGATGACAATA
CAATGCACGACTTTGTAAAGCCTAAAGTTACCACTCAACAAGCTTTTGGA
CTAGCTCAGCAGGTCAAAGAGCTTGATTTACAGCTAAAAGACCCTAAGTC
AGATTTGTGGGGCAAAATCAAGTTCAATAATAAGGCAATGCTAGTCGAGT
ACGCCAACAAAGAGATGTCAAGTGCCATTGCGCAATCAGCTGAGCAGATA
TTGTTACAAGTCAAGTCTATTGATGATGAACGATATTCCAAATTTGAGCA
AACTCTGAATGGTATCAAACAAACTGTCAAAAGTGAGTCAGTTGAATCCG
CACGTACTCAGCTAGCATCAATGTTTGATAGTCGTATTAGTGGACTTGAT
GGCAAATACAGTCGTTTGAGCCAAACAATTGATAGTCTTAGCAGTCGTCT
TGATGATGGTGTTGGTAACTACTCAACGCTATCTCAAAAGGTAAGTGGCA
TTGATTTACGAGTTAGTAATGCAGCTAATGATGTTTCTCGATTGTCTCAG
ACAGCACAAGGATTGCAGTCACAAATCACAAATGCAAACCAAAATTACAG
CAGTTTGTCTCAGACTGTACAGGGACTACAAACAACTGTACGTGATAATC
AATCAAATGCTACAAGTCGGATTAATCAGTTAAGTAACCTGATCAGCACA
AAGGTATCAAAAGGTGATGTTGAGACAACTATTGCTCAGAGTTACGACAA
GATAGCCTTCGCAATCAGGGATAAACTCCCAGCAAGCAAAATGTCTGGCA
GTGAGATTATCTCGGCAATCAATCTTGATAGGTCTGGGGTTAAAATCACT
GGAAAAAATATCACTCTTGATGGTAACAGCTACATCAGCAACGCTGTCAT
CAAAGATGCTCATATTGCTAACATGGATGCCGGTAAGATTAATACTGGTT
ATCTTAATGCTAATAGGATTGCAACCGAGGCCATTACTGGTGAGAAAATT
AAGATGGACTATGCCTTTTTTAATAAACTCACTGCTAACGAGGGATATTT
TAGGACGTTGTTTGCCAAAGACATCTTTGCAACATCAGTCCAATCTGTAA
CACTATCAGCTAGCAAAATTACTGGAGGTGTATTAGCCGCTACAAATGGG
GCAAGTCAGTGGGACCTAAATAATGCCAATATGACCTTTAATCGAGATGC
CACAATTAATTTTAATAGCAAAAACAATGCCTTAGTACGTAAAGATGGCA
CACATACTGCTTTTGTACATTTTAGTAATGCCACACCAAAAGGCTATAGA
GGCTCAGCGTTATATGCCTCTATCGGCATTACCTCATCAGGAGATGGCAT
CGACAGCGCTTCTTCCGGTCGTTTTGCAGGGCTAAGGTCATTTAGGTACG
CTACGGGATATAACCATACTGCTGCAGTCGACCAAACCGAGCTATACGGT
GATAATGTCTTGATTGCAGATGACTTTAGCATCAATCGAGGATTTAAATT
TAGACCACACAAAATGGAAAAAGTGCTCGACATGAACGACTTGTATGCGG
CTGTAGTAGCCTTAGGCCGCTGTTGGGGGCACTTGGCTAACGTCGGCTGG
AATACTGCTCATAGCAATTTTACAAGTGCTGTGAGTAGGGAATTGAATAA
CTACATCACTAAAATTTAA
>M5005_Spy0999 phage protein
ATGAGTACATTTTTAACAAATATCAACCTTAATAAAAACGAGTTGCAAAA
TGCAGTCGTACAAAATTTAGCTAAAGAACCGCATGAACCAAAATCAGGAC
AATTTTATTTTGACAGTGCTGCTAATAATCTAAAAATCTATAATGGGACA
TCTTGGGTTGTTTTAGACAAGGAAACAGCAGAAAGCATTGTTGACCTTAT
TAATTCTGGTAAATCCAAAATCGATAAATCAAAAGTCGATGGACTTGAAG
AAGCAATTAATCAAGCGTCTATGACTGGTCAAGCTATCGCGACCGCTTTA
AACGAAGATACTGGTGGCGTTACTGTAAACCAAAATAAAATTACAGGGCT
TACAGATAAACTAGCTGAAATTGCGACTAACAAAGCGTCAGCGACTCGGG
AGTCACAAGATGCTTTGCAAGAAGCCAAGGTGTATGCTGACCAAAAAGTA
GCCGGACTTGTTGATAGTGCATCAGAAGATTACAACACGTTTAAAGAGCT
AGAAACTTTTATTAAACAAAACGCGAAAGGTCTCGCAGCAATCTCAAATG
TAGCCAAAAAATTTAGTAAAACGTTTGGCGATGCACGAGCTAAAGAATTT
ACAATCACACACAACCTAAAAACTCGTGATGTTAACGTCACTATCCGAGA
GACTAACTTCCCTTATGCAATCGTCTACGCAGATATTAAAGTCACAGACG
AAAATAGCATCTTAATCGCAACAGGTGCAGAAGTATTAACGCAAAATCAG
TATACTGTGACAATTACTGGATAG
>M5005_Spy1260 prepilin peptidase family
ATGATAGCTTTTTTTAGTATATGTTCGGGCATCTTATTGACCCATCTTTT
TTACTGTTTACTACTTTATTTTCCTGATAATGGTCAAGAGCAGCTAAGTA
AACAGACTGTCATTGTTTGTGACCAACTAACTTTTGCCAAACGCGTTTTT
CGGCAGTTCCAAAACCATTTTATAACTAGCCAAAAAATCTTCTTTAGCTT
AGAGATAGGTCTAATAATTATCTTATGGGCTAGTATGGTACATTGGGTTA
GTGCTAGTTACTGTTACTTGTTACTCTTTTCTTTATTATTTAGTTTATTT
GATTGGCGTTCTCAAGAATACCCTTTTATCTTGTGGCTTTTTAGCTTTGT
AAGTCTACTCCTGTTTTATTCGATCAATTATTTATCATTGATATTACTGC
TACTAGGTTTATTAGCTCATTTAAGACCTTTTTCAATTGGAGCAGGCGAT
TTTTTCTACCTTGCTAGCTTAGCTTTAGTATTGGATCTAACGTCGTTGAT
TTGGCTAATTCAACTTGCTAGTTTAGCAGGTATTACTGCTTGCTTACTAT
TAGGCATCAAGCGCATACCTTTTATTCCTTATCTTAGTTTTGGATTATTT
TGGATTGTGCTTCTAGAGCATTTTTAG
>M5005_Spy1501 N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase
ATGAGAAAACGACTAAAGTTTCCGTATTTTTTAACGCTTCTAGCTTGCTT
TTTATTGCTGATTGTTTGTCCCTTACTGAGTAGCCAAAGGATAGCTAGTG
CAGATAAAGAAGTAAGGGTGAACTACAGCCAAAAACAATTTATTACAAAA
ATGGGTAAAGAAGTTAAACCATTGGCAAAATATTATGGCATTAGACCATC
TATTTTGATTGCTCAAATTCTTTTGGAAACCCATGATGGAAAAACATTAC
TAGCGTCTAAGTATCATAATCTTTTTAGCAAGAAAGCAACTCCAGGACAA
GTGGCCATTACCCTAAAGTCCCCTAAACAAACCAACCAAAACGTGAGATA
TGCTATTTATAAAGATGACGCTAGTGCAATTAGAGATTATTTACGAATGC
TTCGGCAGGGAAAAGAAGTCGATAAGCGTTTGTATCGTAATCTTGCTACA
GAAAAAGGGTATAAAGCACCAGCTAAAAGTTTACAAAAGTATTTGCATTA
TACTGATAAAACCTATGCTAGGCGACTAATTCAGGTCATTGAAAGTAACG
ATTTAACAAACTATGACTGA
>M5005_Spy0981 cfa, cAMP factor
ATGAAACCCAAACACCTTCTCTGTCTTTCAACAGTTGTTGCTGGATTAGC
TTTATTTTCAACTATGACGCACTCAGTTTTAGCTGATGATGCTTCAAATC
CCGATACTATTTTAATGAATAACAACCAAGCAAATTTTCAAAGAGATGCT
CTAGTGCAAAAGCTTGATGAGGGACATCAACAATTAGAAGCTATTAAACA
TGAAGCTAAAGGTACTGATATTGAGACTACTGTTAACAAAGCTATCGATG
CTGTTGATCACATGAAGAGTTCTATACGCTTCAATACTGAAACGATCTAT
GATTTTAGTTCAATTGGGGCAAGAGTAGAAGCATTATCAGATGCTATCAA
AGCAATCGTATTTTCCACAACCCAATTAACTCATAAAGTAGAAAAAGCGC
ATACTGATATGGGGTTTGCTATTACTAAATTAGTCATTCGTATTATAGAT
CCATTTGCATCTGTTGACGCTATCAAAGCTCAAGTACAAGAAATTAAAGC
ACTTGAGGAAAAAGTTATCAATTATCCTGATTTACAGCCAACAGACCGTG
CTACTATCTATACTAAAGCTAAACTAAATAAAGCTATTTGGAACACTCGT
TTAGAAAGAGATAAAAAGGTTTTGGGAATCAAACCATTTGACGTTTACAA
TAGACTTAACAAAGCTATCACACATGCGGTTGGTGTCCAACTAAATCCGA
CAACCACTGTTCAACAAGTTGACGATGAAGTTATTGCTGTGCAAGATGCT
TTGGAAACAGCTCTTAAGTCATAG
>M5005_Spy0086 comYA, comG operon protein 1
ATGGTACAAGCATTAGCAAAAGCTATTCTAGCAAAAGCTGAACAGGTTCA
TGCACAAGATATTTATATTTTGCCAAGAGCAGATCAATATGATCTTTTTT
TACGAATAGGAGATGAAAGGAGATTAGTTGATGTTTATCAGAGCGATCGG
ATGGCTCCTCTTATTAGTCACTTTAAATTCGTTGCAGGAATGATAGTTGG
TGAAAAGAGACGTTGTCAGGTGGGTTCATGTGATTATAAGCTTAGTAAAG
ATAAGCAGTTATCTTTGCGCTTATCTAGCGTGGGTGATTATCGCGGGCAA
GAAAGCTTAGTGATTCGTCTGCTTCATCATCAAAATAAAAGTGTACATTA
TTGGTTTGATGGATTGACAAAAGTAGCCAATCAGGTTGGCGGTAGAGGGT
TGTATTTATTTGCAGGACCAGTTGGGTCTGGGAAGACAACCTTGATGTAC
CAGCTGATTTCGAATTATCATCAAGAAGCACAGGTTATTAGTATAGAAGA
TCCTGTAGAAATTAAAAATCACCAAATTTTACAATTACAAGTGAATGATG
ATATTGGTATGACTTATGACAATTTGATCAAACTGTCTTTACGCCATCGA
CCAGATATTTTAGTTATTGGTGAGATTCGAGATAGTCAAACAGCAAGAGC
CGTTATTAGGGCTAGTCTAACAGGTGCCATGGTTTTTTCAACGGTTCACG
CTAAAAGTATCTCGGGTGTTTATGCAAGATTGTTAGAACTTGGTGTAACG
AAAGCAGAACTGTCTAATTGCTTAGCATTAATTGCTTACCAAAGGTTACT
TAATGGAGGAGCATTGATTGACTCTACTCAAAACGAATTTGAATATTATT
CCTCATCGAACTGGAATCAACAAATTGATCAGCTTCTTGAGGCAGGACAT
CTCAATCCCAAGCAAGCTAAGCTTGAAAAAATTATCTAG
>M5005_Spy0087 comYB, comG operon protein 2
TTGACTCTACTCAAAACGAATTTGAATATTATTCCTCATCGAACTGGAAT
CAACAAATTGATCAGCTTCTTGAGGCAGGACATCTCAATCCCAAGCAAGC
TAAGCTTGAAAAAATTATCTAGTAAACATCAGCATAAATTCATTCAATTA
CTAGCTAATCTTTTATCTACAGGATTTAGCTTCGCAGAGGTTATTGCTTT
TTTAAAAAGAAGCCAGTTGCTTCAGCTAGATTATGTTCTTAAAATGGAAG
AGTCTTTATTAAAAGGACAAGGCTTAGCAGATATGTTGTCGGGTTTAGGT
TTTTCAGATGCTATTCTTACTCAAATTAGTTTAGCTGATAGACACGGTAA
TATTGAAACAACATTAGTAGCGATTCAACATTACTTGAACCAAATGGCAA
GGATCAGACGAAAAACTGTTGAAGTTATCACCTATCCTCTTATTCTTTTA
CTTTTTCTTTTTGTGATGATGCTAGGGTTGAGACGCTATTTAGTCCCTCA
ATTAGAAACTCAAAATCAGATAACTTACTTTCTTAACCATTTTCCTGCCT
TCTTTATAGGTTTTTGCTCAGGTCTTATTTTGTTGTTCGGGATGGTATGG
CTACGATGGCGATCTCAAAGCCGCTTGAAACTCTATAGTCGGCTAAGCCG
TTATCCTTTTTTAGGTAAACTGTTAAAACAATACTTAACTAGTTATTATG
CTAGAGAATGGGGTACGTTAATAGGTCAAGGTCTTGATTTGATGACTATT
TTAGACATTATGGCCATTGAGAAATCCTCACTAATGAAAGAATTAGCTGA
GGACATCAGAATGAGTCTGCTTGAAGGGCAAGCCTTTCACATTAAAGTAG
CTACCTACCCTTTTTTTAAAAAAGAATTAAGTTTAATGATTGAATACGGT
GAAATCAAATCGAAACTGGGGGCTGAGTTGGAAATCTATGCCCAGGAAAG
CTGGGAACAATTTTTTAGTCAGCTTTATCAAGTGACACAACTTATTCAAC
CAGCTATTTTTTTAGTAGTTGCTGTGACAATCGTCATGATTTATGCGGCA
ATCCTATTACCAATTTACCAAAATATGGGAGGTATTTTTTAA
>M5005_Spy0239 mecA, negative regulator of genetic competence
ATGGAAATGAAACAAATTAGCGAGACAACGCTAAAAATAACAATTAGTAT
GGACGATTTAGAAGAAAGAGGAATGGAGTTGAAAGATTTCTTGATTCCTC
AAGAAAAAACAGAAGAGTTTTTCTATTCTGTGATGGACGAACTCGATCTT
CCAGATAATTTTAAAGATAGTGGTATGCTTAGTTTTCGAGTGACTCCACG
CAAGGACCGTCTAGATGTTTTTGTTACCAAATCTGAGATAAATAAAGATA
TTAATCTTGAAGATTTAGCAGAGTTTGGTGATATGTCCCAAATGACTCCG
GAAGATTTTTTCAAGAGCTTGGAGCAATCCATGCGTGAAAAGGGAGATGT
CAAAGCTCATGAAAAATTGGAAAAAATTGAAGAGATAATGGAAGATGTTG
TTGAAGCCACTCTAGCTAATCAGTCTGAGGCGGCTGATCCATCAACTAAT
CATGAGTCAGAACCTTTAGACTATGTCCATTATGTATTGGATTTTTCAAC
GATTACAGAGGCAGTGGCTTTTGCTAAAACGATTGATTTTTCGATAGAAG
CTTCAGAGTTATATAAGGGGAGCAACTGCTACCATATGACTATTTTATTA
GATGTTCAGCAACAACCATCTTATTTTGCGAACGTCATGTATGCGAGATT
GATTGAGCATGCAAACCCTGGATCAAAAACAAGAGCTTATTTACAAGAGC
ATGGCTTACAATTGATGCTTGATGGTGCTGTTGAGCAATTACAAAAGATT
GAGTTGGGATAA
>M5005_Spy0663 mur1.1, autolysin
GTGAAAAAAAGGAGAAGAAGGGCTAAATCATCAGTAAATCGACTTGTCTT
AGGGTTAGTATTACTTAATCTGATTGTTAGTATGTGGACACTAAAATTGG
GAAACCAGCGATTAGCTCCGTATGCGGATCACGAAACTCTGACATTTGTC
AGGAAGATTAGTCATGCTGCTCAATCAGTCGCTCAAAAGAAACAGTTATA
CAGTTCGGTGATGATGGCTCAGGCCATTTTAGAATCCAATAATGGTAAGT
CACAACTAAGTCAAAAACCTTATTATAATTTTTTCGGGATTAAGGGGAGC
TATAAAGAACGGTCAGTCATTTTTCCAACTTTAGAAGACGATGGACAAGG
GAATCTTTATCAAATTGATGCTGCTTTTCGTTCCTATGGGAGCCTGACAG
CTTGTTTTTTAGATTACGCAAGAGTTTTGAATGATCCACTTTATGACAAA
ACCCACAAAAAGTTTTGGTCTCATTATCAAGATGCTACTGCAACCTTAAC
AGGCACTTACGCCACTGATACAACTTACCATACCAAATTAAATGAATTGA
TTGAATGGTATCAACTCACTAATTTTGATGGTCTAATGAAATAG
>M5005_Spy0664 mur1.2, autolysin
ATGACAAAAAAGAAAGGTAAGCTTGTACTTATCAGTCTTTTTGTTCTAGC
AGCTTGTTTAGGAGCTTATAGTGCAATGAGACAATCTCATAAAACTTCAA
ACGTGTCAGCTGAGACTATCGCCAGTTCTTCAACCCGACATTTTATTGAT
GAAATTGGTCCAACTGCTAGTACTATTGGTCAAGAACGTGATCTTTATGC
GTCTGTTATGATAGCACAAGCGATTTTAGAATCAAGTAATGGTAAATCAA
GTCTAAGTCAAGCACCTTATTATAATTTTTTCGGTATTAAGGGTGCCTAT
AACGGTTCTTCTGTGACGATGTCAACTTGGGAAGATGATGGTAATGGCAA
TACCTATACGATTGATCAAGCCTTTAGAGCTTATCCAAGTATTGCAGACT
CCCTTAATGACTACGCGGACTTGCTAAGTTCTAGCACTTATATAGGTGCT
AGAAAATCAAACACGCTATCGTATCAAGATGCTACAGCAGCTCTAACTGG
CTTATACGCTACAGACACCAGTTATAACTTAAAACTAAATAATATTATTG
CAACCTATGGTTTGACGGCTTATGATGTTGCTAATAGCTCAGCTCAAGAA
ACTGGTCTAGCAACTTCGGGTTATGTTTGGAATGAATATCGTCGTAATTA
CACTGATGCGGAGACCCTAGCAGTTGATGAGGCTTGGGCTAAACGCATGA
CTTATTAA
>M5005_Spy0229 prgA, surface exclusion protein
ATGGACTTAGAACAAACGAAGCCAAACCAAGTTAAGCAGAAAATTGCTTT
AACCTCAACAATTGCTTTATTGAGTGCCAGTGTAGGCGTATCTCACCAAG
TCAAAGCAGATGATAGAGCCTCAGGAGAAACGAAGGCGAGTAATACTCAC
GACGATAGTTTACCAAAACCAGAAACAATTCAAGAGGCAAAGGCAACTAT
TGATGCAGTTGAAAAAACTCTCAGTCAACAAAAAGCAGAACTGACAGAGC
TTGCTACCGCTCTGACAAAAACTACTGCTGAAATCAACCACTTAAAAGAG
CAGCAAGATAATGAACAAAAAGCTTTAACCTCTGCACAAGAAATTTACAC
TAATACTCTTGCAAGTAGTGAGGAGACGCTATTAGCCCAAGGAGCCGAAC
ATCAAAGAGAGTTAACAGCTACTGAAACAGAGCTTCATAATGCTCAAGCA
GATCAACATTCAAAAGAGACTGCATTGTCAGAACAAAAAGCTAGCATTTC
AGCAGAAACTACTCGAGCTCAAGATTTAGTGGAACAAGTCAAAACGTCTG
AACAAAATATTGCTAAGCTCAATGCTATGATTAGCAATCCTGATGCTATC
ACTAAAGCAGCTCAAACGGCTAATGATAATACAAAAGCATTAAGCTCAGA
ATTGGAGAAGGCTAAAGCTGACTTAGAAAATCAAAAAGCTAAAGTTAAAA
AGCAATTGACTGAAGAGTTGGCAGCTCAGAAAGCTGCTCTAGCAGAAAAA
GAGGCAGAACTTAGTCGTCTTAAATCCTCAGCTCCGTCTACTCAAGATAG
CATTGTGGGTAATAATACCATGAAAGCACCGCAAGGCTATCCTCTTGAAG
AACTTAAAAAATTAGAAGCTAGTGGTTATATTGGATCAGCTAGTTACAAT
AATTATTACAAAGAGCATGCAGATCAAATTATTGCCAAAGCTAGTCCAGG
TAATCAATTAAATCAATACCAAGATATTCCAGCAGATCGTAATCGCTTTG
TTGATCCCGATAATTTGACACCAGAAGTGCAAAATGAGCTAGCGCAGTTT
GCAGCTCACATGATTAATAGTGTAAGAAGACAATTAGGTCTACCACCAGT
TACTGTTACAGCAGGATCACAAGAATTTGCAAGATTACTTAGTACCAGCT
ATAAGAAAACTCATGGTAATACAAGACCATCATTTGTCTACGGACAGCCA
GGGGTATCAGGGCATTATGGTGTTGGGCCTCATGATAAAACTATTATTGA
AGACTCTGCCGGAGCGTCAGGGCTCATTCGAAATGATGATAACATGTACG
AGAATATCGGTGCTTTTAACGATGTGCATACTGTGAATGGTATTAAACGT
GGTATTTATGACAGTATCAAGTATATGCTCTTTACAGATCATTTACACGG
AAATACATACGGCCATGCTATTAACTTTTTACGTGTAGATAAACATAACC
CTAATGCGCCTGTTTACCTTGGATTTTCAACCAGCAATGTAGGATCTTTG
AATGAACACTTTGTAATGTTTCCAGAGTCTAACATTGCTAACCATCAACG
CTTTAATAAGACCCCTATAAAAGCCGTTGGAAGTACAAAAGATTATGCCC
AAAGAGTAGGCACTGTATCTGATACTATTGCAGCGATCAAAGGAAAAGTA
AGCTCATTAGAAAATCGTTTGTCGGCTATTCATCAAGAAGCTGATATTAT
GGCAGCCCAAGCTAAAGTAAGTCAACTTCAAGGTAAATTAGCAAGCACAC
TTAAGCAGTCAGACAGCTTAAATCTCCAAGTGAGACAATTAAATGATACT
AAAGGTTCTTTGAGAACAGAATTACTAGCAGCTAAAGCAAAACAAGCACA
ACTCGAAGCTACTCGTGATCAATCATTAGCTAAGCTAGCATCGTTGAAAG
CCGCACTGCACCAGACAGAAGCCTTAGCAGAGCAAGCCGCAGCCAGAGTG
ACAGCACTGGTGGCTAAAAAAGCTCATTTGCAATATCTAAGGGACTTTAA
ATTGAATCCTAACCGCCTTCAAGTGATACGTGAGCGCATTGATAATACTA
AGCAAGATTTGGCTAAAACTACCTCATCTTTGTTAAATGCACAAGAAGCT
TTAGCAGCCTTACAAGCTAAACAAAGCAGTCTAGAAGCTACTATTGCTAC
CACAGAACACCAGTTGACTTTGCTTAAAACCTTAGCTAACGAAAAGGAAT
ATCGCCACTTAGACGAAGATATAGCTACTGTGCCTGATTTGCAAGTAGCT
CCACCTCTTACGGGCGTAAAACCGCTATCATATAGTAAGATAGATACTAC
TCCGCTTGTTCAAGAAATGGTTAAAGAAACGAAACAACTATTAGAAGCTT
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