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COG category: Replication, recombination and repair
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300, USA300; FPR3757
Number of genes found: 145
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# Staphylococcus aureus subsp. aureus USA300, USA300; FPR3757 >SAUSA300_1023 conserved hypothetical protein ATGCGCGTCATTGCAGGTAAACATAAAAGTAAAGCTTTAGAAAGTATGGA AGGCCGTAATACGAGACCAACTATGGATAAAGTTAAAGAAGGTATCTTTA ATAGTTTATATGATGTGTCAGGTATAGGTTTAGATTTATTTGCAGGAAGC GGGGCGCTTGGAATAGAAGCACTCTCTCGAGGTATGGATAAGGTAATCTT TGTTGATCAAAATTTTAAAGCTGTAAAAGTTATTAAATCAAATCTTGCGA ATTTGGATTTAGAGGCACAATCTGAAGTTTATAAAAATAATGCAGATAGA GCTTTAAAAGCATTGTCAAAACGTGATATTCAATTTGATGTCATTTTCTT AGATCCACCTTATAATAAAGGTCTCATTGATAAAGCTTTAAAACTAATTT CAGAGTTTAATTTATTGAAAGAAAATGGTATCATCGTTTGTGAATTTAGC AATCATGAAGAAATAGATTATCAACCGTTTAATATGATTAAACGTTACCA TTATGGGTTGACAGACACATTGTTATTAGAAAAGGGAGAATAG >SAUSA300_1309 transposase, IS200 family ATGTCATCTGACACAAACAGTTTAGCACATACAAAATGGAATTGTAAGTA TCATATTGTCTTTGCACCTAAATACAGAAGACAAGTGATATATGGAAAAA TAAAAAAAGATATAGGGATTATATTGCGTCAATTATGTGAAAGAAAAGGT GTAGAGATAATTGAAGCAGAGGCATGTAAAGATCATATCCATATGTTAGT TAGTATACCACCCAAACTTGGGGTATCATCATTTGTTGGCTATTTAAAAG 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ATCATAAATTATTTACAGATAAGCATGATATAAACGGTAATGTACCTATA TTCATTAATATTGGTGAATGGGACGGAGGTGATGAGGGGTTAGATAAGGC AGTGAAAGATGTATCTAACGATAATCCTAATCATACTGTGATTGTGGATG ATATACCGTTAGAAGATTATGAGTCAATTAGGTTTTTATAA >SAUSA300_2485 methylated DNA-protein cysteine methyltransferase ATGGAGTATAAGAGTTACTATGATTCGCCTGTAGGACGATTGGAACTTTT GAGTGATGGGGTAAGTCTGACCGCTGTTTTGTTTGAAAATCAACAAGGTG ATGGTACTAGGGAAGAAAATACGTCTTTAGCGATATTTAGAGAGGCGACA CAGTGGTTAGACGCGTATTTTAAAGGTGACAATCCTGAAATCACAATACC TTTAAAGCCAACAGGTAGTCATTTTCAACAGTGTGTTTGGAATGAATTAA GACAGGTTCCTTATGGGACTCTAACAACGTATGGTGCTATTGCCAAAAAA GTAGGCAAGCTGCTTAACAAGCCAAAAATGTCAGCCCAAGCGGTTGGAGG TGCAGTCGGAAGTAATCCATTATCTATTATCGTGCCATGTCATCGTGTTG TCGGTAAAACGGGTAGCTTAACAGGGTTCGGTGGAACGATTAATAATAAA ATTAAGCTGTTAGAGTTGGAGAATATCGATATGTCAAAGCTTTATGTACC AAAACATAGCACGAAGCCGTAA >SAUSA300_2101 SAP domain protein GTGAGCGTAAATGCACGTGATTTATTAGTATTACACACTAATGTAAATAG ATTGGTTGGAGAAGAGATATTTGCTAATAAGTGCCTTGCTAATAATGATG TTCAAATTATGAATTCAATAAAAAAATTAATTGAAGCTGAGTTATTAACA 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ATAATAATGGTCTATCAAAAAGAGACGTGATTAATCAATTTAATGATTTG AAAAAAATGAAAAAATTCCCTTCTAATCTTGAATATGTTGATAGTTACAC TGATTCTCTTACTGGAGTAACAACTTCTGCTTTTTTAAATAAAGATACAG GCAAAGTAACTCTCGGGATGACTGGGACTAATTTACAAGACGAAGCCTTT AAAAAGTTAAAAGAAGGTGAATTTTCAAGACAAAATGTTACCAATGCTTT GGAAACAGTTAAAGATGGATATGCAGATCTTAAAATATTATATTCTCCTG CATCTGATCAAAACTATAGATATGCGAATACACAAGAATTTATAAATAAA ATAAAAAGTAAGTATGACATTGATTTTATTACTGGACATTCACTAGGTGG AAGAGATGCGGTAGTTCTAGGAATGAGTAATGGTATTCCGAACATTGTGG TTTATAATCCAGCTCCTATTTCTATAACTAGTTTGAATCCTAATTCCCCA GATGGAAAACGTTTATTAGAATTATATAAAAATTATAAAGGTAATATTAC TAGGTTTGTTGCAGAAAATGATGCATTGACAGAAAATCTGAAGAAATATA AGCATTATGTTTTTTTCGGTAATGATAAAGTCTTTAAAAATGGTAAAGGT CATGAAATGGAAGGCTTTCTGACCGAAGAAGAACAAAAAGCTATAAAAAA AGAACTTAAAAAACTACAAGGTTATGCAGAAGAAAATAATAAGTCATTTG TAAAGAATTCAAATAATGCTATCTCTAAATTAGCTAGTATAGAATTACTT AGAGCAAATATGATGACTACAAATGGAGGAGGATTATCTTCTTCGCAGCA AAAAGTTTTAGAAAGTTTAACAGCTTTAACAATTGCGCAGTCATTCAGTC AACTGATAGACGATGAAATTAATCAAATCAAAAAAATGTATAATGAAAAG 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hypothetical protein ATGAGTTACACATTGTTTGAAATTGGCCCATTTGCTTTAGATTCCTTCGG TTGGAAAGAAACGATACCACCTAAAAAAGATGGTGACAGTGAAAAAGTGG TTAGAATGGCTAGCCCTATTATTGTTAATGCAAGATTTTCTGATCCAATT ACTGGTGTTGAAAAGTTGATTATTACTAACAACAATGGTAAAAAAGACAT TTTTGAGTCTGATATCTTAACAACACGAAACTTACCTTCTTTAATTAAAT ATGGCTACAGTATTAACGAGAAGTATATTAGATCATTGAGTTATGCCTTG CAATTGATGCGAGATAGATTACCACTTTCTGAATTATATGAGGGTGTAGG TATACTAGAGACACCTTTTGGCTACTTGATATCGCTAGATAAAGTTCTCA AATCTATTCAATTTAATCAGTCCTCACCTTCATACCCTATTGTAGATAGT GCTTATGACTTAACTCCTAAAGGTACATTTGATAATTGGTTTAACATGTA TATTGACGAGGTTAAAGGTCATCTTCTTTTAGAATTGGCAGTCATATTTG GGATTTCTGCCTTAGTGACAAGTTTTCTGAAGCATAAACATGAAATCGAA TTTGCAGGAATTCTCTTTAGTTTTACAGGTCAATCCTCAACCGGTAAGTC AACCGCAGCTGCTTTAGCTGTATCAGTCGCTGGTAACCCTACCAAAGGTA ATGAAACTCTTTTTAGAAGTTGGAATGCCACACGAAACGCACTTGAAGGT TATTTGAGTAACAATTATGGCATTCCTATAGTATTTGATGAGCTTTCATC TACGACACTTAGAGATACCACGGGTTTGTTATATTCCATCGCTGAAGGTC AAGGTCGTCAACGTTCAAACGTTCATGGAGAAGTTAAAACGCCTAAGAAT TGGGGTACTTCTGTCATTTCAACGTCAGAATACAGTATTTTTAATGATTC 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AGTTATGCAACACTTTGATTTAAATACGAATCATTTAGAGGTATTGAATC GACTGTATACACCGCTAATTGGAACGCAAGCAGTGGGTTTATATCATTTT ATGACTCAATTCGTTAAAGAAAGTCATAATGAAACATTGATTCTTTCTCA TTATATTTTTATGAATGAACTTAAAATTAATTTACTAGAGTTTAGACAAC AAATGGACTTACTTGAAGCGATTGGATTGTTAAAGGCGTTTGTCAAACAT GATGAACAAGAAACACAATTTGTTTACCAATTAATTCAACCGCCTTCAGC ACATTTATTTTTTAATGATCCAATGTTGTCAATCTTTTTATATAGTGAAG TCGAGCATCGTCGATTTCATGAGTTGAAGAAATACTTTGAGTATCAACAA ATTGATTTGAGTGAATTTAAACAGGTAACAAGACAATTTACTGATGTTTT TAAAGTGCCGTCTACAAAAATAGATATCGATACAAGTGATATTCCGATTA ATGAACCGTACCAAGGTATCGATTTATCAAATGAATCTTTTGACTTTGAA ATGTTGAGACAAATGTTAGGTAAACATTTTATTAGTCAAGACATTGTTAC CAAAGATGCAAAGCGTTTAATTACACAACTCGCGACTTTATATGGTTTAA CAGCAGATGGCATGAAGCATGTTATTTTAAATTCAATTACAAGTGGACAA CAGTTATCCTTTGAAGAAATGCGTAAACAAGCACGCTCGTATTACTTAAT GGAACACGAAAATCAAATGCCTAAATTACAGGTGAAATCTCCTGCTACAT CATCTTCGGCGGGCAAATCTTCAGAAGTGAATCCAAAGCCACAAAGTGAT GAATGGTTTGAGTTACTTGAACAAACGAGTCCAATTGATATGTTAGCTTC TTGGTCTGAATCAGAACCAACTATATCGCAAAAGACAATGGTTGAAGAAT 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ATGGATTTCGTTAATAATGATACAAGACAAATTGCTAAAAACTTATTAGG TGTCAAAGTGATTTATCAGGATACCACTCAAACGTATACAGGCTACATCG TGGAAACGGAAGCTTACTTAGGTTTGAATGATCGTGCGGCTCATGGCTAT GGCGGTAAAATAACACCTAAAGTCACGTCATTATATAAACGTGGTGGTAC AATTTATGCACATGTCATGCATACGCATTTACTCATTAATTTTGTAACAA AATCTGAAGGTATACCTGAAGGCGTACTTATCCGCGCAATTGAACCAGAA GAAGGTTTATCCGCTATGTTCCGTAACAGAGGTAAGAAAGGCTACGAGGT AACGAATGGCCCAGGAAAATGGACTAAGGCATTTAACATTCCACGGGCTA TCGATGGCGCTACGTTAAATGACTGTAGATTGTCTATTGATACTAAGAAT CGTAAATATCCTAAAGATATTATTGCTAGTCCACGAATCGGTATTCCAAA TAAAGGTGATTGGACACATAAATCTTTACGTTACACAGTGAAAGGTAATC CATTTGTGTCTCGCATGCGTAAATCAGATTGTATGTTTCCCGAAGATACT TGGAAATAA >SAUSA300_1584 ATPase, AAA family ATGGTTGATACAAAAAAATTAACTTCAATGATTTTTTATGGTCCACCTGG TATAGGCAAAACAAGTATTGCCAAAGCAATTTCGGGCAGTACGCAATATA AATTCAGACAATTGAATGCTGTAACTAACACTAAAAAAGATATGCAACTT GTTGTTGAAGAAGCTAAAATGTCTGGTCAAGTTATCTTGTTATTAGATGA AATACATCGACTAGATAAAGCTAAACAAGACTTTTTATTACCTCATTTAG AAAATGGCAAAATCGTCTTGATCGGTGCTACAACTTCAAATCCTTATCAT 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GTTGTTTAGGCAACAAATGATATGTGCGTGTTTATTGGCAAACGTACGAC ATAGTAGTATAGTATGTCTAAACAACATATGTTGCATAGTTGATATGCGT TGTTTAAATACTAAGATAGGAGGGATTGACGTGAGCGAGACAGATGAACC TCAGGGGTTTGAACGCACGCATAATATATTAAATATTAATCAGAGTAGTC TGGGTGTAGTGACATACATTACAAATAAATTAAAGTCGACGTTGAAGCAA CACATAATAATTGCTCGTGGTAAAAAGCGAATCGACTATCGACTGTCGTA TAACTTTTACACTACGTATTATGATAATGTAGAAATCAAGAAAATCGACT GTGAATATACCTATGCTATGCCCATTGCAATTTTAATAAGACACACGATG TCATTCGACAATGCTCATTTCTTTGCTCAGTTACGTCATCCTGTCTTATA A >SAUSA300_1960 putative phage-related DNA recombination protein ATGACTGAAAATAATAAATTACAAACTATTGAACAACAATTAGTACAAGA AAAGAACGTATCTGACAACGTATTAAACAAAGTGAGAGTTTTAGAGTCAC AAGGCAATTTGGAATTGCCAAATGATTATTCACCAAGTAATGCCATGAAA CAAGCATGGTTACAAATCAGCCAAGATAACAAATTAATGAGTTGTAACGA TACAAGCAAAGCAAATGCCTTATTAGACATGGTAACGCAAGGTTTAAATC CAGCTAAAAATCAATGCTACTTTATTCCTTACGGCAACAAAATGCAGTTA CAACGTAGCTATCACGGTAATGTAATGATGTTAAAACGTGATGCAGGTGC TCAAGATGTTGTTGCTCAAGTGATTTATAAAGGCGATACATTCAAGCAAG AAATGGGAGAAACAGGACGTATCAAAGCGATTAAACACGAACAAGACTTC 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putative transposase GTGATATATGGAAAAATAAAAAAAGATATAGGGATTATATTGCGTCAATT ATGTGAAAGAAAAGGTGTAGAGATAATTGAAGCAGAGGCATGTAAAGATC ATATCCATATGTTAGTTAGTATACCACCCAAACTTGGGGTATCATCATTT GTTGGCTATTTAAAAGGAAAAAGTAGTTTAATGATATTTGATAGACATGC TAACTTAAAGTATAGATATGGAAATAGAAAGTTTTGGTGTAAAGGATTTT ATGTGGATACAGTAGGTAGAAATAAAAAAGTGATTGAAAATTATATTCGT AATCAATTACAAGAGGATATCGTTGCAGACCAAATCTCAATGGAAGAATA TTTAGATCCTTTCACTGGAGAGAAAAATAAAAAAAGAAAGAAAAAAGAGT AA >SAUSA300_1658 conserved hypothetical protein ATGGCAGAACAACAAACAATTATGGAACGCTTGTTTCATACATTAGATGA AAAAGCTAAAACATTAAATAATGAAAATGGCCAAAGTTTTATTGAAAATC TTGGGCTAGCAATGGAACAAGTATATACCAATGAAAGAGGATTGTTAGAA CAATCGACGTTACAAGATCGACGTAAAGCATTCCAATTTGCATATTTAAG TTTAATGCAGGAAGAAAAGATACAAGCAAATCATCAAATTACACCAGATT CAATTGGATTGATACTAGGATTTTTAGTTGAGCGTTTTATGAACAACCAA GAAGAATTACATATTGTTGATATTGCAAGTGGTGCCGGTCATTTAAGTGC TACTGTAAAAGAAGTGTTACCTGAAATTGCGGTTATGCATCATTTAATTG AAGTTGATCCAGTTTTATCACGTGTTAGTGTACATTTAGCAAACTTCTTA GAAATTCCTTTCGATGTGTATCCTCAAGATGCCATCATGCCACTACCATT 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ATGGACTATTTTTTTGCACAAGTCGAAATGAGAGATAACCCCAAATTGAA AGGGAAACCAGTCATTGTTGGTGGTAAAGCAAGCAGTAGGGGTGTTGTCT CTACGGCATCCTATGAAGCACGAAAATACGGCGTCCATTCAGCAATGCCT ATGTCACAAGCGCATAAATTATGTCCAAATGGATACTTTGTCACAAGTAA TTTTGGTGCTTACCGAGAAACATCTGCGCAGATTATGTCTATTTTCCGAA GTTATACAGATAAGGTAGAACCGATGTCATTGGATGAAGCGTATTTAGAT ATTACAGAATTAGTGAGACCAGACCTTCCTGCTTCGAAAATTGCTCAGTA TATTAGAAAAGATATTCTAGAGCAGACACATTTAACAGCATCTGCAGGTG TTTCTTATAACAAATTTTTAGCTAAATTAGCGAGTGGTATGAATAAACCT GATGGTATGACTGTGATTGATTATCAAAATGTCCATGATATTTTGATGAC ATTGGATATTGGAGATTTTCCAGGCGTAGGTAAAGCTTCCAAAAAAGTAA TGCATGATAATGGTATTTTTAACGGTAGAGATTTATATGAGAAAACGGAA TTTGAATTAATACGTTTGTTTGGAAAAAGAGGTCGGGGTTTATATAACAA GGCACGCGGTATTGACCATAGTGAAGTGAAATCATCAAGAGTAAGAAAAT CAGTAGGGACTGAACGCACATTTGCAACAGACGTGAATGATGATGAAGAG ATTTTAAGAAAAGTATGGGAATTGTCAGGTAAAACAGCTGAACGTCTAAA TAAATTACAGAAGTCAGCTAAAACTGTAACGGTTAAAATTAAAACTTATC AATTTGAAACGCTATCTAAACAGATGAGTTTAAGAGATTCGGTTAGTTCT GAAGAAGATATTTATAATATTGCATATTTACTTTATAACGATTTAAAAGA CCCTGATGTACCAATTCGACTTATTGGTGTCACTGTAGGTAATTTAGAAC AATCAACTTATAAAAATATGACGATATATGACTTTATATAA >SAUSA300_0383 conserved hypothetical protein ATGTTAACTAAAGAATTTGCACAACGCGTAGAACTAAGTGAGAAGCAAGT ACGTAAAATTGTTCAACATTTAGAAGAACGTGGTTACCAACTAAGCAAGA CTGAATATCGTGGTCGTGAAGCAACTGATTTCAAAGAAGAAGATATCGAG CTTTTCAAAGACATTGCCGACAAAGTAAAACAAACAAATAGTTATGATCT AGCGTTTGATGAATTAGAAAAAGAAAAAGACTTCCTGCAAGTCATTGTCA AAAACGATGACAAAAACTTACCTACTAATCAAAATGTCGCTCAACTAGTA GAAGATTTACGCCTAGAAATCCAGAAAATGCGCGAAGAACGTCACCTACT TGGTCAAATGATGAATCAAGTACATCAGCAACAACAAGAATTAAAAGAAC TTCAAAATCAACTTACATCTAAAATCGATTCAAATAGCGAATCCTTAAAA GCCATCCAAACATCACAAGAGGCTATCCAAGAAGCGCAAGCCTCTCAAGC AAAAGCATTAGCTGAATCAACAAATAAAGTTGAAAAGAATGCTGTTACTG AAGATAAAGCTGACAGTAAAGATTCGAAGGTTGCTGGAGTGAATACATCA ACAGACGCTAAGACGGATACTAAAGCAGAAAATGCAGGCGATGGCACTGC TACTAAAGTAGATAAAGAGGATCAAATTTCTGCAACTGAAGCAATTGAAA AAGCCAGCGTTGAGCAGTCTAAAAATGACAATGCAGCTGAGACTTCAAAT AAAGAAGCTACAGTAGATGCAGAAGCGCAACATGATGCTGAACAACAAGT 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protein ATGGCTAAATATCGAGGGAAACCGTTTCAATTATATGTAAAGTTATCGTG TTCGACAATGATGGCGACAAGTATCATTTTAACGAATATCTTGCCGTACG ATGCCCAAGCTGCATCTGAAAAGGATACTGAAATTACAAAAGAGATATTA TCTAAGCAAGATTTATTAGACAAAGTTGACAAGGCAATTCGTCAAATTGA GCAATTAAAACAGTTATCGGCTTCATCTAAAGAACATTATAAAGCACAAC TAAATGAAGCGAAAACAGCATCGCAAATAGATGAAATCATAAAACGAGCT AATGAGTTGGATAGCAAAGACAATAAAAGTTCTCACACTGAAATGAACGG TCAAAGTGATATAGACAGTAAATTAGATCAATTGCTTAAAGATTTAAATG AGGTTTCTTCAAATGTTGATAGGGGTCAACAAAGTGGCGAGGACGATCTT AATGCAATGAAAAATGATATGTCACAAACGGCTACAACAAAACATGGAGA AAAAGATGATAAAAATGATGAAGCAATGGTAAATAAGGCGTTAGAAGACC TAGACCATTTGAATCAGCAAATACACAAATCGAAAGATGCATCGAAAGAT ACATCGGAAGATCCAGCAGTGTCTACAACAGATAATAATCATGAAGTAGC TAAAACGCCAAATAATGATGGTTCTGGACATGTTGTGTTAAATAAATTCC TTTCAAATGAAGAGAATCAAAGCCATAGTAATCGACTCACTGATAAATTA CAAGGAAGCGATAAAATTAATCATGCTATGATTGAAAAATTAGCTAAAAG TAATGCCTCAACGCAACATTACACATATCATAAACTGAATACGTTACAAT CTTTAGATCAACGTATTGCAAATACGCAACTTCCTAAAAATCAAAAATCA GACTTAATGAGCGAAGTAAATAAGACGAAAGAGCGTATAAAAAGTCAACG 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