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COG category: Replication, recombination and repair
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H, 34H; BAA-681

Number of genes found: 198

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# Colwellia psychrerythraea 34H, 34H; BAA-681

>CPS_1489 conserved hypothetical protein
ATGTCGCGTACCAACCTCACCAAGGGAAGAACATCCCTCAAACATCATAT
TTACCATGTAATAACATGCACTAAAAATCGCCAACCATTCTTTAATGACT
TCGAATGCGCTCGCTTTTTGATAAACGAAATGACAAATCTAGTAGAACAG
AAGGAAATCAACTCTATTACCTGGGTCATTATGCCAGACCATTTACATTG
GTTATTTGAACTAACGTCGGATAATCATTTATCAAAGGTCATTCAAACAT
TAAAAGGTCGAAGCGCTAGGCTTATAAATCAACATGACGAGGGGCAGAGG
TTTGCATGGCAACGCGGTTTTTATGATCACGCAATAAGAACGGAAGAAAG
TTTATTGTCCGTATCACGGTATATTGTTGCCAATCCATTACGAGCAGGTT
TAGTTGATAACGTAGGTGATTATTCATTATGGGATTCAGTATATTTGCAT
GAAAATGAATAG
>CPS_2566 hypothetical protein
GTGCGCCGTGCTGCTTTGATCAAAGTAGGAACTCTTGATTGCTACCTCGA
AGCAAGTCAGAATAATAATCAAATCAAAGTAAAACAATTTGCTGCAAAAC
AAGTACATGACATTTTGACCACTGATCACAATGTTGTGATCAGCGGACAG
CAAAAACAAACACTATTAGACCAACAAGAAACAACCCCCGTACTGGGAAC
AGCTTTATTAGAAGCTTGGCTTGCCCACGAACAAGATAGCGCTATTATGA
TTTCGCTTTATCAGCAAATTAGTGCGCGCAAAACAACCACACATTTATTA
ACACACAGCTTTAGCCAAAAGCAAAACCCTGACTTTCAAGCTTACATAAT
TAACCAAGTTGATGATGCTAAGGTTTTAGAGAAATTAAGTAAAAAAGCAT
GCAATCATGTATTAGCTCAACAAATTGAAGATAAACTAAGCGCTATACAA
GTCGCCATTGAGAAACCACAAAAATTAGAGAAACAAATACAACTGACGTT
AGCAAAACTTCAAGCGTTAAAAGATGTTGGTGACTATGGTGTTTATAAAA
CCCGTAAGGCACAGTTAATTAACGAATGGCAGACACTAGCACTTGATTTT
GATGTTTTCACGGAAGAAAAAAGTGTCGTATTTAGTGATAAATATCAAAG
CATTATTAGTCAATTAGAAAAGTTATTCATTGCTAAAGCTGAAAATTATC
AACAGCAAATCATTAGCGACAAGTTATCGCATGATAAACAGCAAGACAAA
AAAGAATTTACTCAACAGCTTAATCATATTAGCCAATCAATCACGACAGC
CGTTTTTTCTAGTGACAAATTTGATGAAGATTCTTTTAAAGAGTTGCTGC
GTAACCTAACAACCAATATTAAAGCTTCTGTACTTAATAAAGATGAACAA
CAGAATTTTATTAGCCAAGTTGTACAACTGTCTAAGCGTTTGAATGAAAT
ACCTGAAATTGCTGAATCGGTTAGCCAAGCTACCCACTTAATTTCTAAAA
TATCACAATTGACTTTACCTAAGTCTTTAGAAGAGTTGAACGACCGACAA
CAAACGTATAATGATTGGTTAAAAGCTTGGCGCGTTATTGAAAAGAAAAC
TGCTGGTATTTTGCCAGAGTCTATTGTGCAGGCTCAAAAAGAAATTGTCT
CTACTTGGCAGGGCGGATTGAAGTCATTGCAAAGTCAGCAAAAAGAACTT
TTCTTTCAACACAAAAAGAAACTACAAGACATAAAACGTTTACTCAATAA
TGGTAAATACAAAGTTTGTTTTGGTTTGTTCAAAGGCGTGAAAGAAAGTA
TTCATCACTTGTCTGTACAACAATTGCAACAATTACAACGTGACTTTGAC
CAAGTAAGTGAGAAAATGGTCGAACTTAGCGATTGGGAACATTATATCGC
TACACCACGTAAGCAAGAGTTATTGCTTGCTATTCAAACTCTGGTTGAAA
CGCCATTGGATAATCCCAATGAGCAAGCAAAAAAAGTTAAAGAGTATCGT
GGTACATGGAATTCATTAGGTCATGCTGATGAAGATGTTGATAAGCAACT
CAATGAGCAGTTTAATCAATGCTGTGAACAAGCGTTTGCTCCTTGTCGTT
TATTCTATGCCGAGCAAGATAAAATGCGTTTACAGCATTTAGATCAACGC
CAAAAAATACTAGCAAAAGCAGAGTTGTTTGTTTCACAGCTAAATGACTC
ACAAGAAACACCGAAGCCAGATTTTAAACAACTTGACGGCCAACTCAACA
ATTTACAACAGCAATGGAATAATGCTGGTGAAGTTGATCGTAACCAATAT
AAAAAACTGCAGCTGAAGTTTAAAGAAGCTATTGCCCCGATTAAAAGCGC
CATTAGTGTTTTTCATGCCAGTAATATCACAGCAAAACAAGCATTAATCG
CTAAAGCTGAAGAGTTACTAGCAAGTGAGGATGTTTTAGCAGCAATTGAA
TCAGCTAAACAGTTACAAGAAAAATGGCGTGAAGTAGGTTTTGCCGGAAA
TCATCAAGAAAATCAGCTGTGGCAGAAATTTCGCCAAGTTAATGATGAAT
TATTTGGTAAGAGACAACAATTTAAATCTGAACAACAAGCAGTATTATCG
ACTCAACAACAAGTGTTTATTGAACAAGTGCTTGTCATTGAAGAGTCTCT
TGGCGCTGTAAAAGATGAAGATGATAAGCAAGTATTACAGTCAATTGCGC
AACGTGCAGAAATGTTACTTAAAGACGTTATTGCCAGTAAACCTGTTATC
AAATCTGTCGCTGCACGTATTGAGAAAATCAGTAAGCAAATTGAGCAACT
CATAAAAGCAAAGACCCAAGAAAAAGAACAACAAACATGGTCAAACTTGT
TTGAGTTAATGTCCTTACAAGCTCAAAATAACCAAGAGTTACAAGCATTA
CAAACATCAGCTGTTTACAATAATATGACCAGTTTTTGGCAAAAACGTTT
CCAAGAGCATGTTAAGTTAACTAAACCAGCTCAAAATAGTGCTCGCTTTG
ATAAAACCTTAGAAATTGAAATACTTGGCAAAAGTGATTCACCGGTAGAG
TTAGCCGAACAGCGTATGAAAGTTCAAGTTCAATTAATGCAAGAACAGAT
GCAATCAGGTACTGAGATTGATTTGAATAAATTGCTAATTGATTGGTTGA
TGTTAGGTTCGCTTGTTGAAAGTGACTTACCGCTAATTGAGCGTTTAAAA
ACTATTTATTGCCAATAG
>CPS_2172 ISCps8, transposase
ATGATAAAACATAACATACTTTTCATTGGCTTAGATACCCACAAAACATT
TACTGAAGTTGCCTACATTGAAGGCCAACGTGGCGCTAAATCAATTCACT
TAGGTAAAATCCTCAGTAATAAAGCCGCATTTAAAAAGCTCGCTCGACAG
TTACAATCAAAATACCCCGACGCTACGCTTCATTTTGTTTACGAAGCAGG
CCCTTGCGGCTATTGGATTTACCGTTTACTGACCAGCCTTCATCATTGCT
GTTATGTTATTGCCCCTTCTCTTATTCCAAAAAAAACAGGAGAGCGTATT
AAAACCGATAAACGTGATGCGCTCAAACTCGCTAAATTACTTAAATCAGA
AGATCTAACTACTATCTATGTGCCTGAGCCAGAAGATGAAGCCGTGCGAG
ATTTATCCCGCTCGCGTGAGACGGGCATGAAAGATTTGAAAGATGCTAAA
TACCAACTTAAAGCCTTATTGCTGCGTAACAACATTAACAGCAAAGTGAA
AGATAACTGGTCATTACAACATTTACGTTGGCTTGCTGAATTAGTATTAC
CTCATCCTTGTCAGCAAATTGTTTTACAAGAAGCCGTTTCAACTATCACC
GAACGATTAAAGCGTCTAAAAAGGCTTGATAATGAATTAACCCATCAAGT
AAAAAGTTGGCGATATTATCCTGTAGTCAAAGCGATACAAGCTATGCGTG
GTGTGAGGTTACTCGTGGCAACAGGTGTTATCGCAGAGCTGGGTGATTTA
TCACGATTCGATCATCCCAGAAAACTAATGAGTTACCTTGGTCTTGTGCC
AAGTGAACATTCAAGTGGCGGTAAACGCCGACTAGGTGCTATTACCAAAT
GTGGTAACAGCCGTGCAAGACGACTACTGGTCGAAGGTGCACACTCGTAT
AAACACAACGCCAATATTTCAAAAGAAATGCAACTAAGGCAAGAAGGATT
AAGCAAAGAGATCATCGATATGGCATGGCAAGCACAATTAAGGTTATGTC
GACGGTACAGTCGCCTTATGCATAAAGGTAAACATCGTAATGTGGTTGTG
ACAGCAATTGCTAGAGAAATGATTGCTTATATTTGGGCAATATCCAGAGA
AATAGTATTACCCGTTGTCGATGTAAAATTACGCATGGCGAGAATGCCTG
CGTGA
>CPS_2858 ISCps9, transposase orfA
ATGCCTAGATATACCCAACCTAAAAAGACGTGGTTTTACCCTGTTAATTT
CAAAATTAAAGCTGTCGAGCTAAGCTTACGAAACGACATGTTATCTAAGG
ATGTTGCTCAAGCGTTGGATATTCACCCGTTAATGCTAAGCCGTTGGCGT
AAAGAATACCGAGAAGGGAAGTTTAAAAAAAACCAACACTATCAGAGCAA
TAGTGAACTCATGAGTAAAATCCCCACAAAGAAAGAACTAAATAAAATTA
AACAGCTGCAAAAAGAAAACGACCGTTTAAAAATGGAAAATGATTTACTA
AAAAAGTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTC
ATCGAAAAACACAAAGAAGCCTTAG
>CPS_3336 conserved hypothetical protein
ATGTCTTCTGAAAGCTCAAAGCTGCTAGTGGGAATACATCTCAGAACGCT
AATTGATAAAAAATGGTTGGCAAAAGCTTATCGACGGTCTGGACTGAAAA
GCATTATTAAAGTTCACACTCAAGTTCATGATAAATCAACAGGCAAAGAT
ACAGCAGAAACCCGTTGGAATATTAGCTCGTTAGATTTGCACGTAGTGCA
AGCGCTCAATGCGGTTCGTAGTCATTGGCAAGTTGAAAGTATACATTGGA
TGCTTGATATGACCTTTAGAGTAGATGAATCGAGAATATGTAGAAAGCAA
GGTCCTCATGTATTTAATGTAATGCGAAAGATAGCGATGACACTATTTAA
ACAAGATACGACTAAGTTAGTTAGTATGGCGAGAAAAAAGAAAATGGCAG
GGCTTGACGATGATTATCGCTCAAACCTGTTAGAATCTGGGATTAAAATG
CGCTAG
>CPS_2410 ISCps2, transposase orfA
ATGACAAAATCCAAAAGTTATCAAAGATACCCTGCTGAGTTTAAACGTAT
GGCGTTACTCAAAGCTTCTGAAGACGGTGTTACTGCTAATAGTGTTTGCG
AAGGACTCGGGATCAGTTTTAGGCAACTAAGTCGTTGGCGTGATGAGTTT
CGCTTGCAAGGTGATGATGCTTTCAAAGGGAATAAACAAACTAGCAATAA
TGAATTAACTAAGTTGAAGCAAGAGCTGGCTAAAGTAAAAAAAGAGCGTG
ATTTTTTAAAAGATGCGGTGGTGTTCTTCGCCAAGGAGTCCGGTTAA
>CPS_2857 ISCps9, transposase orfB
GTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTCATCGA
AAAACACAAAGAAGCCTTAGGTGTTAAATACCTTTGCTCATGGCTTGATG
TCTCTCGTAGTGGCTTTTATGCATGGCGACGACGTCCACGTTCAATGCGT
GCTATTAATGATGCGGATTTACTTTTAAATATCAAACAAGTCTTTAATAA
CAATCATCAAACCTACGGCAGCCCACGCGTATTTCATGCATTAAAGCGTG
AAGGTATTACAACGAGTGAGAAGCGTGTTGCACGGTTGATGCGAGAAAAT
GGCTTACGCGCTAGAGCGCTCAAGACTTATAGCAGGCCAGCTAAGGTGAA
GTTCTTTTATAAAGCGATCAAAAACAATCGTAAAAACATAAGTAAGCCTG
ATGCTATCAATCAGCAATGGTCGGGAGATATTACGTACCTGAAAGTAGGA
TCGCGCTGGTATTACTTAGCCGTTGTATTAGATTTATTTTCACGTCGTAT
CATTGGTTGGGCTTTTGGTCAGAACAAATCAACAGCGCTGACACTGAAAG
CGCTGCAGCTAGCAATAAAGAAGCGTAAACCGACACAACCCTTGTTATTT
CATACTGACAGAGGCGCTGAATATCGAGCACATGTAGTGCAGCAGTTCTT
AGTTAAACATAACATTACGGCGAGTATGAACCGTCCAGGTTGTTGTACTG
ATAATGCTGAAGTTGAATCATTTTTTCATTCATTAAAAGCTGATTTAATC
AGAGGGAATGTCTTCGCGACTACTGATAAATTACATTCAAAATTAAAAGG
TTACATGAACTATTTTTACAATAGACAACGATTGCATTCAAGTTTAGGAT
ATAAAACACCTGCTGAGTTTGAATTGGCGGTGAATTAA
>CPS_0895 ISCps3, transposase orfA
ATGCCAAAGTACAACAATCCAAGACGAACTTGGAAGTATTCAAACGACTT
TAAAGTCAATGCTGTTCAACTGAGTTTTGTTGTCGGCGTCACAATCAAAT
CTGTCGCTGAAAAACTCGACATACACCCATTTATGCTGTCACGATGGCGA
AAAGAATATCGTGAAGGGATCATTGTGGTGGATAAACGAAAAAAAGTGGC
AGGGCAATCAAAAGCCAAAAAAGTACTGACCAAAGAACAGCAACTTGAAC
GTGAAAATAAAGCACTCAAGGAGGAGCTGTATATCCTAAAAAAGTGGCAA
CGGTTTCTTGCAGAGGAACATCAAGTCGATATCGATTCATCGAAAAACTC
AGAGCCGACATAA
>CPS_2742 ISCps7, transposase
ATGAATACACAAATTAATCAAAATGAAATTAACGTCGGTGTCGATACCGG
TAAAACTCAACTCGACATTTACATACGTCCCTTAGGTATCTATTTCACCG
TGACTAATGATGAAGATGGCATCAAAACAGCCATGACTGAAATAAAAAAG
CACAAGGTAACTCGTGTTGTTATTGAAGCAACAGGACGATTAGAGCAAGC
CTTTATCATGGCCTGTGCAAAAGCTAAAATCCCCTTTGTTATTGCCAACC
CTGTCAATATTAAACGATTTGCTGGAGCGATAAATCAAAAGGCCAAAACA
GACAAACTTGATGCACAATTAATTGCCCATTATGCGGAGGCTATCAAGCC
TACGTTGTCGCAACTAAAACCAGAGCAGATAAGGCTGATGAGCGACTTAT
TATCTCGTCGACGACAACTCATGGACATGCAAACGATGGAGAAGAATCGT
CTGCAAATAATGCCAAAGGAAATTACGTCATCCATTAAACCAGTGCTAAC
GGTGCTGAAAAATCAGTTAGAGAAAATTGATAATAAAATACATAAACTAA
TTGAAAGTTGTGACGAATATAAAATCAAAAATGACATAATACAGAGCGCA
CCTGGTGTCGGAAAAGTAGTTGCATTTAACTTAATTAGTGAGATGCCAGA
GCTTGGTTACATCAACAATAAAGAAGCAGCATCCTTAGTTGGAGTCGCTC
CGTTTAACCGAGAAAGTGGATCGTATAAAGGCAAGCGAATGATACGTGGT
GGCCGTTCACAAATTAGAACCGCAATGTATATGGCTATGATGTCAGCGAT
TCAATGTAATCCAACATTTAAAACACTATATCAACGATTAGTTGCGGTAG
GTAAACCCAAGAAAGTAGCGATAATAGCGTGCATTAGGAAGCTCGTTATC
ACGCTAAATTCTATGGTGAGAGATGGTGTTTATTGGGATCCGAAAATGAA
TTAA
>CPS_1686 ISCps9, transposase orfB
GTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTCATCGA
AAAACACAAAGAAGCCTTAGGTGTTAAATACCTTTGCTCATGGCTTGATG
TCTCTCGTAGTGGCTTTTATGCATGGCGACGACGTCCACGTTCAATGCGT
GCTATTAATGATGCGGATTTACTTTTAAATATCAAACAAGTCTTTAATAA
CAATCATCAAACCTACGGCAGCCCACGCGTATTTCATGCATTAAAGCGTG
AAGGTATTACAACGAGTGAGAAGCGTGTTGCACGGTTGATGCGAGAAAAT
GGCTTACGCGCTAGAGCGCTCAAGACTTATAGCAGGCCAGCTAAGGTGAA
GTTCTTTTATAAAGCGATCAAAAACAATCGTAAAAACATAAGTAAGCCTG
ATGCTATCAATCAGCAATGGTCGGGAGATATTACGTACCTGAAAGTAGGA
TCGCGCTGGTATTACTTAGCCGTTGTATTAGATTTATTTTCACGTCGTAT
CATTGGTTGGGCTTTTGGTCAGAACAAATCAACAGCGCTGACACTGAAAG
CGCTGCAGCTAGCAATAAAGAAGCGTAAACCGACACAACCCTTGTTATTT
CATACTGACAGAGGCGCTGAATATCGAGCACATGTAGTGCAGCAGTTCTT
AGTTAAACATAACATTACGGCGAGTATGAACCGTCCAGGTTGTTGTACTG
ATAATGCTGAAGTTGAATCATTTTTTCATTCATTAAAAGCTGATTTAATC
AGAGGGAATGTCTTCGCGACTACTGATAAATTACATTCAAAATTAAAAGG
TTACATGAACTATTTTTACAATAGACAACGATTGCATTCAAGTTTAGGAT
ATAAAACACCTGCTGAGTTTGAATTGGCGGTGAATTAA
>CPS_2951 DNA repair protein, RadC family protein
ATGAATGACAACAATGACAAGGTTTATATTAGTGATAAGCCAATGACAGA
AAATCAGATACTGGACGCTGCAGCAGAAATACTAGCGTGTAAATACGTAC
GTAAGGATGCTTTTACCAGCAGCCAAGCGACTAAGGACTTCCTTCGATTT
AAACTAGCCAATAAAGAACATGAAATTTTTGCTGTAATGCTATTAGATAA
CCAACATCAGATGATAGATTTTGTTGAATTGTTCAGGGGGACTATAGATG
CAAGCGCGGTATACCCACGAGAAGTAGTTAAAACGGTATTACTTGAGAAC
GCCGCTGCTGTTATTTTAACGCATAACCACCCAAGCGGGCTCAACTCCCC
TTCTATAGCTGACAAGGATATAACCAAGAGATTGCAAGAGGCATTAGCGT
TAATTGATGTAAGAGTACTGGACCATATAATCATTGGTGAAGGCACTTAT
TCATTTGCTGAAAATGGTCTACTTTAA
>CPS_3101 endo/excinuclease amino terminal domain protein
ATGAAACAGCCAGCGGTATATATACTAGCGAATAAGAAGAACGGAACTTT
ATATATTGGTGTTACCAGTGATTTAGTTAAGCGTATCTGGCAGCATAAAA
ATCATGTTGTTAGTGGGTTTACCGAAGAGTATGAAGTGCATCAGTTGGTA
TACTTTGAACAGCTAGATGATATGGAAAATGCCATTACTCGCGAAAAAGT
AATAAAGAAATGGAATAGGGCTTGGAAAATCAGGCTAATAGAGCAGAACA
ATCCTAAGTGGCTAGATTTGTATAATGATATTGTGTAG
>CPS_1109 hydrolase, TatD family
ATGCAGTTTACCGATAGCCATTGCCACCTTGATGATATTGCTTTTAGTGA
GCAACTACCCGCTTTATTAGCCCAATGTCAGCAACTTGCAATTAACCGTA
TAATCGTGCCCTCTATTGCGCCTGACAACTTCACTCAAGTCCTTAATCTA
GCAAAGCGCTGCCGTGATAACCTTAGTAATATCACCAACACTAATCCGAT
TAAGATTTACCCTTGCTTAGGTATTCATCCGTGGTTTTTACAAGCCCTTA
ATGACTCTCACCTTCAAACATTAAGTGAGTTAGTAATTAAGTCGCGAAAC
GAGATAATTGCCGTAGGAGAGATTGGCATTGACGGCGCTATTGCCAAACA
AGCCGTAAACCATGGACAAACCCCTGAAGATAACTTGCATCATCAACAGC
ATTTTTTTGATTTTCAACTCAATCTCGCTAAACAGCAAAACCTACCGGTA
ATAATACATCACAGGCAATCTCACGATAAAATAATGCCGTTCCTGAAAAA
ATATCAGTTAGAAAGAAAAGGCATCATTCATGGATTCTCAGGTAGTTATC
AACAAGCTATGGGGTATATTGATTTAGGTTTTAAACTCGGTGTCGGTAGT
ACTATTACTTATTCTCGTGCTAAAAAAACCATCAATACCCTCAAGCGCCT
TCCCTTAGAGAGTTTAGCTTTAGAAACTGATGCGCCATCGATGCCGTTAA
GTCGAGAAGTGACAGGTGAAGAAGTTCTGACAAATAATGAGGGTACGGAA
CAAGAAAAGCTTGAGACGGTAGTTAGCTCTCCAACTAACTCCCCAGTAAA
TCTAATAAAAATTTTTGAAGTGTTATCAACCATACGCCCTGAAAGTTCAG
AGGAGATAGCAAATCAGCTTGAACATAACATCAATCAGATATTTTTCACT
TAA
>CPS_3967 conserved hypothetical protein
ATGGAACCTTTTAAAAATTTATACAACGAGCGCTTTTATTTAACCTTATC
GATACATTTAAAAGCCTGTTTGCCAGACTTTGATGAGCAAGAGTTCATGG
CACTTATGTTATGCGATAACTTTGAAGTATTAGAGCTAAAAGAGCGCATG
AGTCATACCAAAGCGGTAATGCATCAGTTTATGCCAACTGATTTCCCTCA
AGCTGCCGACATTTTAGTTAAGTTAATTGCAAGTTTAACCGATGCTGGCA
TTACTGAAGGTAGTGTTGAATATATGTTCTTACCAGAATATATAGAAACC
TATGGCATAAATCACTTTCAAGAATCGGTTGAGGTTATGGAGCAAGTAAC
GCAATTTACCAGTGGTGAATTTGCAGTTCGACCTTTCTTAATTAAATATG
GCAATCAAATGTTAGCGCAAATGATCTTATGGAGCCAACATGAGCATTAC
TTGGTTAGGCGTTTAGCGACTGAAGGTAGCAGACCCCGTTTACCTTGGGC
GATAGCGCTGCAAGAATATAAGAAAGATCCCGTTGAACTCTTACCTATAT
TACATCGTCTAGTTGATGATCCGACAGAAATTGTTCGTCGTAGCGTTGCC
AATAACTTAAATGATATCGCCAAAGATAATCCTCAAGTGGTGATTGCTTT
TGTCAAAGAATACCTAGGTACTAGTGAACAGTTCGACCGAACGCTTAAAC
ATGCTTGTCGAACGTTATTAAAACAGGCTTGCCCTGATACCCTGGCACTT
TTTGGTTACGACAGCACAGGCATTAAACTCACTGAATTTGCGATACTAAC
TAATGAGGTTAATTTTGGCGAGTATGCTCAATTCAGTTTTACTGTAAAAA
ACACCTCAACAAGAAGTAAAAAAATACGCTTGGAATATGGGCTGTATTTT
ATGAAAAAGAACGGACAGTTATCGAAAAAGGTTTTTAAGATCAGTGAACG
TAACCTTGGGGCGAATGAGTCACATCAAGTGGATCGAAAGCAGAGTTTTA
AAGCAATAAGCACACGAGTGTTTTACCCAGGAAAACACCAAGTATCAATC
ATACTTAATGGTAAAGAGTTCGCTGCTAAAGACTTTGTCTTGATAGCCAC
TTCTGACTAA
>CPS_3758 putative primosomal replication protein N''
ATGCCCCAAAATAGACATGAAATTGCTATTAGTCGTTTATCAACATTGCT
AGAACATATATCTGTTCAAGCAAAACAAACGGATCAATTAAACAGCAAAC
AAAAGTCTCATCGATTGATCGAAAATAACAATCTTTTCTCCCAGCATTTA
TTCACTACTGAAAGTGATAAAATTTTTATATACGTTGAAGAAGTAAAAAA
GCGATTGAATGAATTTTCACGGTTATATGCGTTAAGTGGAGACAACCCTA
ACAAAGCTGAGTTTGCAAAGTCGTCCCTACAACGAATAGAGCAACAGATT
TCAGCATTAATGAATGCCATTCAATCTAACCAAACTATGCATCAAGCAGC
ACAAGCAAGCTTTGACGCTAGAAAAAATGTTCGAGTAAAAGCGGCTAAAG
CTGCTCAATTAAAGCAAAACGATGTCTATAATAAAATGGCTAAATCAGTT
TTACTCACAAGCCATCAGTTATATCAACAGTTAAGTGAACATCATGAATT
CGAAAGAAGATTAAGGGATATGATCACCGAGCGCGAGCAACAACGAATTC
GCTCTAAAAGTGCAAATACTGAAAAACTTTCACAGGAAGTACTTGCTCTA
CACCAGCGTTTAGGTCGCTGTCGTAAAGCTATCTCTTCAATTGAACGAAG
TATTGAGCAAGCAGAGAAATCTAAACTCAGATAG
>CPS_0155 methylated-DNA--protein-cysteinemethyltransferase
ATGTTTATTGATTATCTCGACACGCCATTGGGCTTGTTTGAATTTATGGC
AACCGAGCAAGGTATTTGCCAAGCCATATTTTGTGGTGACCAAAGTTATG
ATGATAAAAAAGGTGAACGCAAAGCCAATGACATCACTGCTCTTTGTAAA
CAGCAATTAATAGAATACTTTGCCGGCCAGCGTCAGACTTTTACCGTACC
ATTAGACCCTCAAGGTACTGAATTTCAACAATCCGTATGGGGTTGTTTAG
CAAAGATTCCATTTGGTACTGTGAAATCCTACGGCGAAATAGCCAAGATG
CTCGATAAACCAAAAGCCTCACAGGCTGTTGGTGGCGCTAATGGTAGAAA
TCCCATTACGTTGATTGTACCTTGTCATCGCGTTATTGGTGGTGATGGTT
CATTAACAGGTTATGCTGGTGGTATTGAGCGTAAATTATGGTTATTAAAT
CATGAAGGAGTTGAGGTAAAGCAAACCAATAACAATGCCAATTTAGATAT
CAAGAATGTTATTAATAAGCGACAAGAAAAAACACAATTCCTACGCTAA
>CPS_3321 ISCps4, transposase
ATGACTAAGTTTTCAGTTTATATCGGTATTGATTGGGCAAATGATAAACA
CGATGTATGTGTTCAAGTGGCTAATTCAAGTGCACGAAAGTTTGAAGTAA
TTAAGCACTCACCTAAGTCGATCAATGAATGGATAACCAGCCTTCATAAG
CAATACAAAGGACAAATAGCTGTTGCTATTGAACTATCCAAAGGGCCTAT
CGTTTACGCACTTCAAAAATTTGATTTTATCACTATTCACCCCGTTAACA
CTTCAATGTTAGCTCAATACCGTAAAGCTTTTTCACCCAGCGGTGCAAAA
GACGACCCAACGGACGCAGAGCTTGCTTTAGATTTAATGCTGAGATATCC
CAATAAAATTAAAGCATTAAAAATGGACAGTGAATCGGTTAGGAAGTTGA
CGTATCTAGTCGAACAGCGTCGTAAGTTAGTTGATGATAAAAGGCGGTTC
AGCAACCGATTAATCATTACACTTAAAGAATATTACCCTCACTTACTTGA
TTGGTTTTCACACCGAGGATCGGGGATATTTTGTGATTTCATTACACGTT
GGCCCAACCTACAAAAACTTAAAAGAGCTAGGGCTGATACCTTGAAAAAG
TTTTTTGGCTCATACCCTGGACGTACTGCGGCATATAGCGTTAAGCGAAT
TCAATCTATTAGTGAAGCAGAGCCGCTCACTCTCGATAACGCAGTTATCG
AGTCGCACCAACTGCTTGCAGTTGCATTAGCTAATCAACTGCTTGTTGCT
GTGAAGGTTATTAAGGTCTTTGATAGAGAAATTAGTGAGTTGTTTAATGC
TTTGCCGGATGCAGAACTTTATAAATCATTACCAGGTACTGGCCCGTGTT
TAGCACCTAGGCTATTAGTGGCTATTGGGGAAAACCGTAGTCGATTCAAT
AGCGCATCGGAAATTCAAATGTATGCAGGGATAGCACCCGTAACAGTGCG
TAGTGGTCAAAAGAGCTGGATTCATTGGCGATATCAGTGTTCTAAATTTA
CTCGCCAATCATTTATAGAATGGGCTACTAAAAGCATAAGGCAATCTTAT
TGGGCGGAAATTTATTATCAGCAGCAAAGGGAAAAAGGTAATACCCACCA
GGCAGCTGTGCGTTCGCTAGCATTTAAGTGGATACGGATCATATATCGTT
GTTGGAAAACTAAAGAGCCATACAATGAAGCCAAGTATTTAAAAGCATTG
AGCGATAGGAATTCCCCATTACTTTTTAAAGAAAAAGCTTGTTAA
>CPS_0367 putative phage replication initiation factor
ATGAAAACTAAACCAACAACAATCCCTTGTTTAGTGGATGCCTTGTCACT
GACTTGGTCACCCAAAGAATTATTAAACATTAAGCAGATGGCAAAGATTG
GCGCGTGTATCAAAAGCGAATTAATCGTTAAGGCAAAAGATGCCGCTTTA
AATCGTGAACTGGCAAAACTTGAGAACACAAAAAACAAAGAACTGTTAGG
CACTAACGCCTTTAACGCCCATGAATACGAAGCTATTTTGAGCCGTTACA
AAGAATCATGTAGCACCATCACACGTGAATATAACAATCGTCGACACAAA
GACTTGCCGCTTAAATCACTTGCGCTTTCAGACAACGAAGTTTCTGCACG
TTATGAATTACGTGACATGTTAAAAGGCGAATTAGAAGTCGATACCGGCA
TTAAATATGGTGACCGTTTAAACAACTTATTAGACAACATTGGTGTCGAT
TTACTCGATGTTCTTTGTTGCGGCGAAGTAGAACGCTTTGTTTGTCGTTT
GAATAATGTGTTCACTCAGGAAACTTTTATTTGGACGGTTAAGAATAATC
CGACAGGACGTTTTAATTATTCTTACTCAGCCACTCTGTACGCTGATGGT
GAGCAAGCTGGTGTTATTTGTTGGGGTGGTAAAAACCTTGGTTGTTACGT
GTCGTTCATGGGAACGGGTTGTAACGCTTTGGATATGAAACGCCTCTATG
AAGAAATCAAAAATATTCCAGCGCTTAAAATTACCCGTATTGATTTAGCG
CATGACGATTACGCAGGGAAGCACTCTATTAAGCGAGCATTGAGTAAAGC
CAAGAAAGGCCTGTTTAACTCTGGCGGCCGCCCTGCTTGTTATATGTATG
TTGAATCTGGGCATTTAACAGAAAAAATGCTGAAAGAGAACTTTAAAGAC
TTAAAAGAAATCAGTAACGAGTCCACTAAATCAACGGCTAAGAAAACCTT
TGGCTTTATTCCAAGCAAGGGAAAAACGCTTTATATCGGTTCTCGTGAAT
CTGGCAAGCTGTTACGCATATATGAAAAAGGTAAACAGCTAGGTGATATG
AAATCTAAGTGGGTACGTTGGGAAGTTGAATTGCATTCAAGCCAACGCGT
TATACCACTTGATGCCATGGTAAAGCCGAGTGAATACCTTGCAGCCACTT
ACCCAGCACTCAATTTTTTAAGTGTTGAGCAATGCAAAATTAAAACCCTG
GTTAAACAAGCCACCATGACCATCGAGAAAATTGTTGAAAACCAAGTTAT
CAGTACACGTAAAGCCATCAACATGATGCGCGTAATTTGTGGTTTATCTG
ATAGCGAAATCGTAGAGAAATTTGTAAAAGACATTGAAGAGCCCGACTGT
CGTTCGTCAATGCCTAAACGGTTGAAAGCCTCTGTTATTGAAGAGTGGGT
TTTACAACAACAAGCACAAACGGCAGCAGCTTAA
>CPS_0501 haemagglutinin associated protein
ATGGACAGTAATTTTATAATAAGTCAAAGCGATGCTGTTGATTTCCTGAA
ATCTTTACCTGATGAAAGTTTAGATTTAGTCATTACAGATCCTCCATATG
AATCTTTAGAAAAACATCGAAAAATAGGCACCACAACTCGTCTAAAACAC
AGTAAATCCTCTAGTAACAATTGGTTTGAAATATTTCCAAACTCTCGATT
CGAAGAACTATTCATTGAAATATATAGAACATTAAAAAATAACACTCATT
TTTATTTGCTATGCGATCAAGAAACCGCCTTTATTGTAAAACCAATAGCA
GAATCATGTGGCTTTAAATTCTGGAAGCCTATTGTTTGGGATAAGATGAA
AATAGGCATGGGATATCATTATCGAGCAAGATATGAATTTATTCTTTTCT
TTGAAAAGGGTAAACGAAAATTGAACAATCTTGCGATACCCGATGTATTG
CAAGTACCAAGAGTTTATAGAGGTTATCCAACAGAAAAACCCGTTGCTTT
GATGGATATATTAATAGAACAAAGTACTGAAAAAGGCTTTCTGATTTGTG
ATCCCTTTATGGGATCTGGTTCCGTAGGCGTATCAGCCCTATCACTTTCT
AGGAAATTTTACGGCAATGATTTATCTATAGATTCCTTGAATCATACTAT
CGATCGTATAAAAAATATTGAAGAAACTCCCGATACGTGTTAA
>CPS_2945 putative DEAD/DEAH box helicase
ATGAATAATCTAATTATTTCTTCATTGTTTTCAGGTACTGAGTTAAGGGA
TTTACATCATACGGTTGATAGTGTTATTAGCCATTATCCTGATAACCATT
TTGCACAGAGATTAAAAAAAGTAGTTGATGGGGATAACACGAGTTTATTG
GACTTGCTTTTATCAATTAAAGATTACTTATATTCATCTCAAAAAGAGCT
GGATAACCAGCACAATAACTTTCCAATACCTAGACGTTTATCTAGTGAAG
AGGGAGTACTCTGCGCCAAAGCTATGCTGAATTATCAAGTTGGTTCAAAC
TTCCTTACTTTATCAACTCCAGTAGTTAGTCAAAAGCTGATGGATGTTTA
CGAACAGAAACAAAAACGTAAAGTGAAAAAGGTAGAAATGGATTTAGCCT
TAATTTCAAGGTTATCAGACCAAAACTATAGTCAGTATTCTAGTGCTGGG
CAAAGGATGGCTGTGAGGGTTGCTTTAACATGCCCTCAAGACTCTACTCT
TTTTATTAACTTACCTACTGGGTGCGGTAAAACATTAGTTGCTCATGCCT
GTATGTTATTTAGTAAAAGTAAAGCGCTTACAATAGTTATTGTTCCTACT
GTCGGTTTGGCTATAGAGCAAGGTAAAAGAGCGAAAGAATTACTTGAAAA
AGCGGATAGTGATTCTGTTCAAAATTATGCTTGGCATGGACAGTTGTCGG
ATGGCGAAAAATCTGAAATTAGGGATAATATTGACAATGATAAGCAAAAA
GTAATTTTTACCTCTCCAGAATCAGTTACTGGAAGCCTACTACCTTTATT
ATTCCGATTAGCTAAGCAAAACTCTATTGCGAATATCATAATTGATGAAG
CGCATTTAATTGACACATGGGGGAGCAATTTTCGCTCTGAATTTCAACGT
TTTGGCGCTTTGGTTGCGTCTTTAAGGCAAGTAAGCAATTCACCTTTCAA
AACGATACTTATGTCGGCAACTTTCACTCAAAGCAATATAGGTTCTTTAA
CAACTTTGTACTGTGAATCCGATAACAAACCAATTGTTGTTAATGGTAAT
TTTTTACGTCCAGAAATTAGTTCATCTTATAAGAATGAAGGTGAGAACAA
CCACCTTCAATCAGTTGTAGGGAGAGTGATTGCTTTACCCAAACCACTGA
TTTTATATACAACACTTGTTCAGGATTCTATTGACTTAAGTTGTCATTTG
AAAGCTATAGGACTGAATCGAATTGCCCTGTTTAACGGTAAAACTGATAT
ACGCTCAAGAGAGAAGATAATTGAGCAGTGGCAAAAAGATGACTTAGATA
TAATTATTGCCACCTCGGCCTTTGGTGTTGGTATGGATAAGTCGAATGTG
AAAAGTGTTATTCATGCTTGTATTCCTGATAATATCGATCGTTATTATCA
AGAGATTGGCCGAGCAGGTCGAGACGGTGAAGCAGCAACATCCGAAGTTA
TTTATTATAATAAACAATTAGCTAAAGCCAAAAAAATTAATAGTGAAAGA
ATCATATCTACAGAGTTAGGTTTCAAAAAGTGGAAAGGTATGTGGGATAG
GCGAGTTGAAGTGTCTTCTCATTCCGTTTTAAAAGGAGATTTATATCTGT
TAGATACTTCATATTATCATGAGGGACTCAGCAACCAGAGTGATAGAAAT
GAAGACTGGAATTGGTTAACACTTTTGTTTATGCAGCGTGCAGGTTTAAT
CCGAATTTTTTATGATGTGCCAGAAATTGAAGATGACAGTGAATTAAATG
ATTTTGAAAGGAATAGCCAACGAAAAGAGTATTGGAAGGGCTATAACAGC
AAGATTTTAGTTCTAATCCTTAATGAGCAATGTCTCTCTAATTTATATTG
GGAAACCAATATTCAAAAACACCGTAATAAAGAAAAGAAGACTCAAGATA
ATGGCTTTCTAACTTTATCTGAGAATATAACGTCTCTTGAACAACCTATT
TGTAAAGAGTTAGTGAAGTATTACACTGTAAATGGTAATAGTCCTCAAAG
AGCATGCGGAGGTTGTGTAGCATGCGAAGGGTTTCTGCCGACAGTAGGAG
ATGATGTCTCTGTTGATAATTATAGTTCGTCACACTTACTGCCGAACACT
TTAAATGATTACATCTCTTTTGATAATGTTTGCAGTGTTTATTACGACAA
ATCTCAGGATCTTACATCTGAGTTAAAATGGTCTGTATTCATTAAATTAA
TGCTTGATAGAAAGTACATTTTTGCTGTCAAGGGAGATATCGAATTCTTA
AAAAGGCTAGCGGGAAAACAGAAAGGACTCAAGTCTTTTAAACCATTTTG
GATTTCTCAGAGTTATCTTGATAATAGTAATATTTGGCCATCTTTACATA
TAAATTCATCTATTGGTTCCGAGGTGTTAATTCCATCATTTGAGGATCAG
GCGACATTCTTTTTAGCTGAATATAACCAAAAAACAAAATCAAATAAATA
CCGATTGTGGTGGCAAGATAATAATAAATCTATTCCATTAACAAACTTCA
TTAAAATAGTTGAGAAAAACACGTGTCTGTAA
>CPS_3059 ISCps4, transposase
ATGACTAAGTTTTCAGTTTATATCGGTATTGATTGGGCAAATGATAAACA
CGATGTATGTGTTCAAGTGGCTAATTCAAGTGCACGAAAGTTTGAAGTAA
TTAAGCACTCACCTAAGTCGATCAATGAATGGATAACCAGCCTTCATAAG
CAATACAAAGGACAAATAGCTGTTGCTATTGAACTATCCAAAGGGCCTAT
CGTTTACGCACTTCAAAAATTTGATTTTATCACTATTCACCCCGTTAACA
CTTCAATGTTAGCTCAATACCGTAAAGCTTTTTCACCCAGCGGTGCAAAA
GACGACCCAACGGACGCAGAGCTTGCTTTAGATTTAATGCTGAGATATCC
CAATAAAATTAAAGCATTAAAAATGGACAGTGAATCGGTTAGGAAGTTGA
CGTATCTAGTCGAACAGCGTCGTAAGTTAGTTGATGATAAAAGGCGGTTC
AGCAACCGATTAATCATTACACTTAAAGAATATTACCCTCACTTACTTGA
TTGGTTTTCACACCGAGGATCGGGGATATTTTGTGATTTCATTACACGTT
GGCCCAACCTACAAAAACTTAAAAGAGCTAGGGCTGATACCTTGAAAAAG
TTTTTTGGCTCATACCCTGGACGTACTGCGGCATATAGCGTTAAGCGAAT
TCAATCTATTAGTGAAGCAGAGCCGCTCACTCTCGATAACGCAGTTATCG
AGTCGCACCAACTGCTTGCAGTTGCATTAGCTAATCAACTGCTTGTTGCT
GTGAAGGTTATTAAGGTCTTTGATAGAGAAATTAGTGAGTTGTTTAATGC
TTTGCCGGATGCAGAACTTTATAAATCATTACCAGGTACTGGCCCGTGTT
TAGCACCTAGGCTATTAGTGGCTATTGGGGAAAACCGTAGTCGATTCAAT
AGCGCATCGGAAATTCAAATGTATGCAGTGATAGCACCCGTAACAGTGCG
TAGTGGTCAAAAGAGCTGGATTCATTGGCGATATCAGTGTTCTAAATTTA
CTCGCCAATCATTTATAGAATGGGCTACTAAAAGCATAAGGCAATCTTAT
TGGGCGGAAATTTATTATCAGCAGCAAAGGGAAAAAGGTAATACCCACCA
GGCAGCTGTGCGTTCGCTAGCATTTAAGTGGATACGGATCATATATCGTT
GTTGGAAAACTAAAGAGCCATACAATGAAGCCAAGTATTTAAAAGCATTG
AGCGATAGGAATTCCCCATTACTTTTTAAAGAAAAAGCTTGTTAA
>CPS_3131 phage SPO1 DNA polymerase-related protein
ATGTCAGATTTTTCCACTCTACTTAACGAAGTAAGACGCTGCACCATTTG
TGCTTCTCAACTAGAACATGGAGTACGACCTGTTCTACAGGTTCACCCGA
AGGCAAAGATATTGATTGCTGGTCAAGCTCCTGGTCTGAAGGTTCATACA
TCAGGTGTGCCTTTTGACGATGCAAGCGGTAAACGTTTACGTGAGTGGCT
GGGGTTATCACGAGAAGAGTTTTATGATCCAGAAAAGGTTGCTATTTTAC
CTATGGGTTTTTGCTTTCCTGGATCCGGAAAAACAGGCGATCTTGCGCCG
CGAAAAGAGTGCGCGCCAGCTTGGAGAGAGAAAATACTCGCCCACCTCAA
GCAAATAGAGGTCACTATTGTGCTTGGCAGTTATGCACAAAAATATCATA
TGGGCTTAAAGAACGCTTCGGTCACTGATTTGGTCAAATCGTGGGAAACC
TATTGGCCAAATATCATTCCTCTTCCTCACCCTAGCCCTAGGAATAACAT
TTGGCTTAAGAAGAATCCATGGTTTGAGATAGAATTACTGCCAGTGCTTC
GAAGTCGCATTCGAGAATCATTAAAATAG
>CPS_1896 ISCps9, transposase orfB, truncated
GTGTCCGTTTTATCGGGGGAAGATCACTTTTATGCATGGCGACGACGTCC
ACGTTCAATGCGTGCTATTAATGATGCGGATTTACTTTTAAATATCAAAC
AAGTCTTTAATAACAATCATCAAACCTACGGCAGCCCACGCGTATTTCAT
GCATTAAAGCGTGAAGGTATTACAACGAGTGAGAAGCGTGTTGCACGGTT
GATGCGAGAAAATGGCTTACGCGCTAGAGCGCTCAAGACTTATAGCAGGC
CAGCTAAGGTGAAGTTCTTTTATAAAGCGATCAAAAACAATCGTAAAAAC
ATAAGTAAGCCTGATGCTATCAATCAGCAATGGTCGGGAGATATTACGTA
CCTGAAAGTAGGATCGCGCTGGTATTACTTAGCCGTTGTATTAGATTTAT
TTTCACGTCGTATCATTGGTTGGGCTTTTGGTCAGAACAAATCAACAGCG
CTGACACTGAAAGCGCTGCAGCTAGCAATAAAGAAGCGTAAACCGACACA
ACCCTTGTTATTTCATACTGACAGAGGCGCTGAATATCGAGCACATGTAG
TGCAGCAGTTCTTAGTTAAACATAACATTACGGCGAGTATGAACCGTCCA
GGTTGTTGTACTGATAATGCTGAAGTTGAATCATTTTTTCATTCATTAAA
AGCTGATTTAATCAGAGGGAATGTCTTCGCGACTACTGATAAATTACATT
CAAAATTAAAAGGTTACATGAACTATTTTTACAATAGACAACGATTGCAT
TCAAGTTTAGGATATAAAACACCTGCTGAGTTTGAATTGGCGGTGAATTA
A
>CPS_1590 ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family
ATGAGTGTTGATTCAATTGGCTTATCAGCGGATTTATTAAAAGCGGTTAA
GGCGTGTGGTTATAAGAATTTAACCCCTATTCAACAAGAAGCAATTCCAG
TTATTCGCCAAGGCGTTGACCTTTTAGCAAGCGCACAAACAGGTACAGGT
AAAACAGCTGCTTTTAGCTTACCTATTTTAGATGCAATTGCTAAAGCCAA
TCATGCCGCCAAGAGTTCGACTACTTCTACAGATGAAAACTCTGCAGAAG
AAAAAAGTGCATCAGGACAAGCAATTCGAGCGTTAATATTGACGCCTACT
CGTGAACTTGCCAATCAAGTAGCTGATAACATCAAACAGTTTAGCCAATA
CCTACCGATAAAAAGTGGTGTGGTTTATGGTGGCGGTAAAATGGCATCAC
AAACAAAGATGCTAAAACAAGGCCTTGATGTGTTAGTAGCAACACCGGGT
CGTTTATTAGAGCACTTAGCTCTACGCAATGTTGATTTATCACAAGTGAA
ATTTCTTGTACTTGATGAAGCTGATCGCATGTTAGACATGGGATTTTTAA
CGGATATTGAAAAATTATTGCTAGCTGTTAAACATAAGCATCAAACGTTG
ATGTTTTCTGCAACTTTTTCAGACCGCGTAAAGTCGTTAGCAAATCAGTT
ATTGAAATCACCAAAAACAATCAGTGTTTCTAAAGAAAACACGACTTCGG
GTAAAATAAAGCAAGCCGTTTATTGGGTTACCGAAGAACGTAAGCGAGAA
TTACTTTCAGAGCTTATTGGTGTTAATAATTGGCAGCAAGTACTGGTGTT
TGCCGGAACAAAAGAAAGTGCAAATACGTTAGCAAAAGAATTAAAGCTTG
ACGGAATAAAAGCGGCGTTATGTCACGGCGATAAAACTCAAGGCGCAAGA
AATAAAGCATTAGAGCAGTTTAGTGAAGGTAAAGTGCGCGTATTAGTTGC
AACAGACGTTGCAGCTCGAGGACTCGATATACCCGATCTTGCTTTTGTCG
TTAATTTTCACTTACCATTTTTACCTGAAGATTATGTCCACCGTGTTGGT
CGTACGGGTAGAGCGGGTAAATCAGGTACGGCAATTTCTTTAGTAAGCCC
TAAAGATGAGCGCTTTTTAGAAAACATAGAGCAATTAATTGAACGTAAGT
TTGAACGTATTGTAGCTCCTGGTTATGAGTTTAACCGCCTAGAAGCTAGT
GAATACCAAGAAGCAACGGTAAAGCGCGACAGTAAAAACAGGTATCGTGC
AGCCCAAGAAAAGAATCAAAATTTAGCGAAAAAAGATGTGAAAATTAAAA
GTTTAAGTAAAAATAAAACGGCAAGAACGAACAGTAAATACAATAATAAA
ATTCAGAAAAAACGTTAA
>CPS_2305 hydrolase, TatD family
TTGTTTATAGATTCTCATTGTCATTTAGATCGACTTAACTTATCTCTACA
TGATAATAATTTGGATAATGTTATTGAGGCGGCGACAGCAGCTAAGGTAA
CTAAACTACTATGCGTGAGCGTTACATTAGCTGACTTTCCTGAAATGGCA
GCCAAAACAGCTCATTATGACAATGTATATCTTACTTGTGGTGCTCATCC
TTTAAATCAAAAAGATGCAATTATACCTGAGCAGCTATTAGCATTAAGCC
AAGATGACCGTGTTATAGCGATTGGTGAAACGGGGTTAGATTATCACTAC
GCACCTGAAACAAAAGCGCTACAGCTTGATTCATTTAAAAAGCATATTCA
CGTAGCCAAAGAATTAAATAAACCACTGATTATTCATACTCGTGAGGCAC
AGCAAGATACTTTAGCGTTACTTCGTAGTGAAGGGGCAGATCAGGTAGGC
GGTATACTGCATTGTTTTACAGAAAACTGGGAGATGGCTGAGCAAGCAAT
TAAAATGGGTTTTTACATCTCTTTTTCAGGTATCGTTACCTTTAAAAATG
CCACTGCATTAAGAGAAGTCGCTGCTTTAGTACCTGATGATAAATTTTTG
ATTGAAACTGATGCGCCGTATCTTGCGCCTGTTCCTCATCGTGGTAAAGA
AAATCAACCCGCATATGTTGTAGAAGTTGCCAAACATCTGGCAAGTATTC
GAGGTCAATCTGTTGAAGAAATAGCTAAACTCTCAACGGATAACTTCAAC
CGTCTTTTTAAGTTATAA
>CPS_4987 conserved hypothetical protein
ATGACCCACGAATCATTTAAATCATTATACCAGCGTGCCGCCGATCGAAA
AGGTGGCAAGTTGGCACTTGAGCTATTGCTAGGTAAAAGAATATTGGGCA
AGAAATTACTCGATGATAACGCCGCAGAAGAAAGCATTAGCCAACTCACT
GACGATAGAGTGTTAGCCGCTTTTACCAAGCAGATTTTTAAATCTGGTTT
TGTGTGGCGAGTGGTTGAGAATAAATGGCCTGACTTTGAGGAACATTTTT
TTAATTTTAATATCGAAAAAATGCTAATGATGCCTGAAGAAATGTTGGAA
CGAAAAGCAGCAGATCCGAAGATTATTCGTAATTACAATAAAGTAAAGAC
TATTAAAGCCAATGCGCAGATGATGTTTGATATCTCACTAGAAAAAAGCA
TCAGCTTTGCGCAATTTATTAATGACTGGCCAAGTGAAGACATCATAGGC
TTGTGGGCTTATTTGAAAAAGCATGGTCAACGCTTAGGTGGTAATACTGG
CCCATACGCACTTAGATTATTAGGCAAAGATACCTTCATTTTAAGCAGTG
ATGTTGAAGCTTATTTAAGAGCACAGCAGATAATTGATGGTGGTTTGCAA
AGTAAAAAAAGCTTAACAGCTATTCAAGCGTTTTTTAATACATTACAAAC
ACAAAGTGGCTATAACTTAACGCAATTAAGTCGTTTGATTGCTTTTGCTA
GTGGCGATAATTATGTGCAGGTTGAGGAGTAA
>CPS_3404 Snf2 family protein
ATGGCCAAAAACACGTTTACTCCTGAATTACTTGAAAAACACTTTACCAA
AAATGAATGGAAAAAAGGCGCGAGAATTTTTCAGGCAAATGGCGTTAAAA
CCTGCGCCCTTGACGGTGAAGTAATACGCGGTGTAGTTTTTAGTGAGCGC
TCGCGCGAATCAAGTTATTTAACGCGTTTAGTCTTTGATGGTAAGTTTGG
TGATATTGCCAGTTATTGTGATTGTTATGTCGGTCGCGATTGTAAACATG
GTTCAGCGTTAGCGCAGTGTTATATTCACGAACATTTTGACCGAAACAGC
ATCGCTACCTCAGAAACAATAATAGATAAATGGCTTAACCGTTTTCAAGC
TCAGCCAACTAGATACCAGCCCAATACCCAGCAAAAATCATTATTATACT
TTTTAAAGCCCAACCCATATAACGAAGACGACTTTTTAACTTTAGGTATT
AAGTCAGCTCGACCAAAAAATAGTGGCGGTTGGAATAGTTCTATTGGCAG
TGAATATTCTGCCAGTTCGTTGATTAATAGTGCCTATGCGAATGACGAGG
ATGTTGCTGTACTTACCGAGCTTATGCGTACTAACCAGTATGGCGATACC
ATTAAGTATTTTGATTTATTTGAACGCATTATAAAAACTAATCGTAGCTT
TTGGCATACAACGTACGACTTAAGCGAGCCGGTGACGTTAAGTGAGCCAC
TAGAAGCAGAATGGCAGTGGTTAGCGTTGGGCAACAGTTTACATACGTTA
AAGCTTGTTTTAATGCAGCCATCAGAAAGTATTCGTATTATCAAAGCACA
GCCACTGTGTTTTTATGACGAAGAAAAAAATTGCTTTGGAAAAATTAATA
CTAATACTCAATGTGATTTTGAAGCAGGTTTACTTAATTCCCCTATTTTT
GAAGAAGATAAATTACCCTGGATAATGAGTAAATTATCTATGTCCTTAGG
TGATGCAGTGAAGCGTTTGCCTAAACCTAAAACAAAATACTCACAAGAGT
TAACACAACCTGATGTGTACTTGCACTTTACTACGCCAGTAGCCTCTAAT
CGACAAACGGGTTATGTGCAGGTTAATTTTTCCTATCAAGGTAATTTAGT
TAATCCCCATGATGAAAACGTTACGATTACGCCATCAAACGTAACTAAGC
TTAGTATTGATAGTGATGCCCAGAGTGATGCCGATAGTAATATTGAGAGT
GGTGCTTATAGTAATATTGAGGATGAAGTTGAGCGTGAAAATGTAAGTCC
ACGCGAGATAAAAATTTATCGTGACTTAGCCTTTGAGCAAACGGTTATTG
ATAAATTGACCACGCTGAAATTTAACCCTCAACCTAAACCTAAACGTTAC
ACTTATACTAGTCAGGACGATTTGAACAAAAGTAAAACTCCTGAATTTGC
CATGCTGATGCAAGGCAGTGTCTTGTGGCAACGCTTTTTACATCAAGAAT
TATCACCACTTGAAGATCTAGGCTGGCATATTACTTTTGCTGATGATTTT
TATTATAAAGCGCTTTCTACTGATAGCGTATTTGATGCCGAAGTGATGGA
AACCGATGATCATGACTTTTTCTCATTAGGGTTAAACTTAACCATTGATG
GTAAAAAAATGCCTGCGTTTCCTATTTTGCTTAGCGCTATTGAGCAGCTA
CCGAGATCAGCATTACTTGACCGCGAAAAAGAAGACCTTATTTCTCCTGA
CTCCCCTATTTATGTAGATTTAGACAATGGTGGTTTTGTTGCCCTACGTT
ATCAAAGCGTGCAGCCAATATTAAAACAGTTCATTGAACTATTTATGCCT
AATGCCTTAAGCCATGATGGCACTATAGAGCTATCGCGTTTTCAAGGGCA
TCAAACGTTATCGATGTTAGATGACCAAGGCATGATAGCAAAAGGCACAA
GTAAGCTAAGAGCGCTGGCTGATAAACTAAAAGACTTTCAACAAGTAACT
ACGATTCCTGTACCCGAAGGTTTAAACGCGACGTTAAGAACTTATCAGCA
CCAAGGACTAAACTGGTTACAGTTTTTACGCGAATACCAATTAAACGGTA
TTTTGGCTGATGACATGGGTTTGGGTAAAACCATTCAAACCTTGGCGCAC
TTATTAATTGAAAAACAGCAAGGTCGACTGACTAAACCGATATTAATCGT
TGCGCCTACCAGTGTTATTTTTAACTGGGCTAATGAAATAGATAAATTTA
CCCCTCAACTTTCTTATCAAGTATTACACGGTAACAAACGTCATGAGCAA
TTTGGCTGTCTTGAGGGCGTCGAAAATGGTGAAAATCAGGTTGATATAAT
CATCACCAGTTATGCGTTGATTACTAAAGATTTAGCACATTACACTGACC
GAAAATTTTATTACCTTGTGCTTGATGAAGCCCATTATATAAAAAATACC
AAAACTAAATTATACCAAGCGTTTCTGACACTAAAAGCGCAGCATAAATT
GTGCTTAACGGGTACGCCGATGGAAAATCATTTAGGCGAATTCTGGGCAC
AATTTAATTTTTTACTGCCTGGTTTTTTAGGCGGACAAAGACAATTTACT
AAACTCTTTAGAACACCTATAGAAAAACATGGTGAGCTAGAGCGTAAGCA
GTTATTAAATCAGCGTATTAAGCCGTTTATTTTACGTAGAACCAAAGACA
AAATAGCCACTGAATTACCACCAAAAACTGAAATAATTCAAACCTTGCGT
ATTGAAGGGAAACAAGCTGAGTTGTATGAATCGGTGCGCTTAGCGATGGA
TAGTCGCTTAAAAGATATTATTGCTGATAAAGGTTTAAAACGCAGTCAGA
TAGAAGTATTGGATGCGTTATTAAAACTAAGACAGGTATGTAATCATCCT
AAGTTATTGAAACTTGAAGGCGCTAAAAAAGTAAATCAATCCGCTAAGCT
TGATTATTTAATGGAAACACTGCCAGAGCAAATAGATGAAGGCCGTAAAA
TATTAATCTTTTCACAGTTCACCAGCATGCTCTCTTTAATAGAGGATGAG
TTGATCGATGCAGGTATTGGTTATGTTAAATTAACGGGCTCAACCACTAA
AAGACAAGAGGTAGTTGATAAGTTTCAACGCGGTGAAGTGCCGGTATTTT
TAATTAGCTTACGCGCTGGTGGTGTAGGTTTGAACTTAACAGCAGCCGAT
ACGGTTATTCATTTTGATCCTTGGTGGAACCCAGCAGTAGAAAACCAAGC
CACTGATAGAGCTTATCGAATTGGACAAAACAAACCTGTGTTTGTTTACA
AATTGATTATTGAAAACTCTATAGAAGAAAAGATTCAAAAAATTCAGCAA
AACAAAGCCGAACTCGCCAAAGCCTTGCTATCTGAAGAAGTCAGTGATAA
TAAGCTGAGTTTAACTGACGATATCTTGGACTCGCTACTTACACCACTGA
GCTAG
>CPS_1495 hypothetical protein
GTGGGTAACAACACAAAAAAGTCTATTGAGCAAATCAACGATGTGTCGCG
ACAACTTTTGTCGCGCATACTTGTTATGCAAGCCGACTCAAAAATTCTTC
CTCAAGAGCAGGATTTAAAAAACATCAAAATTCAATCTATTGATGACGAA
AATAAAGAGTTAACTGAATTAACAGAAAAACGACAAATATTGATGACTAA
GTTATTTGAGCAAAATACAGCGGACAGTATTAGCTCAGAATCAGAGGTTT
TAGAGGAGATGATAACTCTTGATAGCAAATTAATAGCTAACGCTAAATTA
TCTAAACAAGCAATAACAGAAAAAATGATTAAAATAAAAAAGAGTAAAAA
AGTCACTAAATCCTACCAAAAGTATTAG
>CPS_4949 serine/threonine protein kinase
ATGAAAACTGATCAAAACGCTTATACAAAACAAGCTGCTCAGGCGCCTCC
TTTAACGCCAGCAATACCGCTAACACAGGCAAAATTACAGGTGTTTTTGG
GCGGTCATAGTAATGCGGGTATAAAAGCAACCAATGAAGATGCTTTTGCT
TCACTAGTGCCCAAAGATGCAGAATTAACGGCTAAAGGTGTTGTTGCTGT
CATTGCTGATGGTGTATCAAGTGCCAGTAAAGCAGCGGAGGCAGCGCAAT
TATCAGTGACACAATTTATTAATGACTATTACGCAACGCCGCAAACGTGG
TCAACACAAAAGTCTGCTAGTAAGGTGTTATCTAGCTTAAATCAATGGTT
ATATGCACAAACCGATGCGGTTTCTGGTTACACATTACAATGGTTAACAA
CCTTTTCAGCATTGATAGTCAAATCGTCTACCGCCTATATTTTTCATGTC
GGTGATACGCGTATCAGCCAGTATCGGCAACACGAGCTAGAAGTACTAAC
TAAGGACCATCAACAAAAGCAGGGACCATCTCATAGTGTGTTAACCCGAG
CTTTGGGCGCTGATCATCGATTGCAAGTTGATGTGCAGCAAGTTGCTATT
CAAGCGGGTGATATTTTTGTACTTACTTGCGATGGCGTTCATGAATATTT
ATCAGCTCAACAAATAAAAAAACAGTTAAATCAATTGCCACAGTCGCCTA
GCACGCAAGCGTTAGAGCAGATGGCGAAATTACTGACGGAATTAGCGATA
AAGAAGGGTAGTAAAGATAATGTCAGCTGTTTATTAGTTTATATCGGCGG
TACGCCTAATAGGGCGTTAGTCGAAATTGAACGAGAACTGTTAAATAAAG
CGATACCACCAGCGTTAGCGGTTGGTAATAGTATTGATGACTATGAAATT
TGCAAAGTTATTCATGCCAGCATTCGGTCACATTTATATTTAGCGAAACA
CCCTAATGAGTCTGAGCCTTGTGTTCTTAAGGTTCCTTCAAAAAACCTCG
CTGATGATAGTAGTTATTTACAAGGTTTCATACGTGAAGCTTGGCTAGGG
GAAAGGTTAAGCAATAGTCATGTGATGAAAATAAAACGTGGCAGCGAGAA
TAGTCGCTTTCTTTATCATATTTGCGAATATATTGATGGCCAAACATTAG
GGCAATGGATGTTTGATAATCCAAAACCTAATCTTGCACAAGTACGTGAT
ATTGTCGGGCAAATTATTATCGCCTTACGTTCATTTCAGCGCTTAGAAGT
TATTCATCGGGATTTAAAGCCTGACAACATAATGATTGATTCTTACGGCA
AGGTTTTTCTCATTGACTATGGCACTGCGCTTATTGCATCACTGGCTGAA
AATAATGATGTTGTTACCGAAACTGTGCCACAAGGCACATTGAATTATAT
CGCACCAGAAACCTTATTAACTTTACATGCTGACCACCAAAGCGATTTAT
TTTCCTTAGGCGTTATCACCTATGAAATGCTTTGTGGAGAATTGCCTTAC
AAGCCGATGCAAAGAGCTGATATGCACAGCTACACTGTTGATGACGAAAA
AAGTCGCGTAGAAAATTATTCACAGTGGCAGTATCGTAGTATTAGACAAT
TTCGCAGCGATTTACCTTTCTGGCTTGATATGGTGCTGTCAAAAGCGACA
CAAGCCGATCCTAAGTTTCGTTTACAGGCGTATTCTGAATTTAAAGCTGA
TTTAAGCAAACCGACGGCTTCGGCATTGGAAGAATATAAAAGTCAGCCTA
TCTTACAGCGTAATCCGGTATTGTTTTGGCAAGGAGCTACCGCGTTATTT
TTTATCTTATGGTTATCAACGATATTTTTCTAA
>CPS_0787 transposase, IS110 family, truncated
TTGGTCCCTCGTCAGTTTTCAACGGGAGGAAAGCCAAGGTTATTCGGTAT
AAGCAAACGAGGAAATAAAGGCATACGAGAGTTATTCATTCACGGTGCAA
GAGCTGTTCTTGTAAGGCTAGAAAAAGCAGTCGCTATCTTTGGCAACTGG
ATATTAGAGTTACTCTCACGAAAACCATATAACGTCGCGGTAGTCACATT
AACGAACAAACTAGCACGTATCGCATGGTCGGTACTGTCAACCAAACAAG
CATTCGAAGTTAGAATGCAAACCTGA
>CPS_3670 protein kinase domain protein
ATGATCAAACGTTTTCTGCCCATCTATCATACGGGTTGGTTTTATCTACT
TTTATTATTCTGGGGATTTTCCTTTTGGTATGCTTCTATCGGCGGCCTAA
ACCAGATAAATCTATTAAATATTCAATGGCTAAGCCAACTTGAATCATCT
CCTGTTTTATCAGATAAAAAACCGACCTTAAATGCTAATGACATTTTAAC
GTTACATTCCGAGTTCAATGGACAAGATATAAAATCAGTAACAACTCTTT
TGTCGTATTACCCCAATAGTCAGATAACCCTGTTAGGTCAACAATCAAGC
AGTTTTATGAATAAACTTGAGGCTTACCTATCCTCAAAACCCCGTAACAG
TAAGATTGTTATTGGCTCAAGCCAAGTTAGCTCTGCATCACCATTAAAGT
CTCAGGCAACAATGCATTTTTCACCATTACTTAATTGGTTTCGCTTTTCG
TCAAAAATTGACACTGAATTGTTGAGTTCAAAGTACTTTATTTTTTCACC
TTTCTTGCAAAGTAAACGACAAACTTTTCCGTTGATATGGCGAAAAGATG
GGATGTTATATCTCACTTTACCAGGCGAAATAATAAAACAGCTAAGTTCA
AATACCGAACTATCCATCAAACAAGATTGGCAATTGAGTTTACTCACGCA
GGTGAATACTTTAGCTCCTAAAAAATATCCTTTGGGTTTTTTTGGTGAGG
TATTTATTTCAGAGAACTTACCCAGGGTTAATCAAATAAATCAAGAACGT
CAAGAAAGATCGGAGACTGTTTTACCTAAGTTAAGCTCTGTAAGCCAGTT
TATTCAACAATACTCTTCAAGCGCTAACACTAACTCTAGGCCTAACTACA
AAGTCATCTTCATTACCGATAATAACTACTCTCAGGATAAAGTACTCAAA
ACATTACTTGGTAAATTGCTTCAAGAAGATTATGTTTATCAGAGTCTGGT
TATTATTTTATTTGCTTGGCTGCTCTTGCTACTAGGCATTTCCCTAACCT
GGTTCATAGGTCAATTATCCTTAAAGCAGCAATCGATCAGTGTACTTAGT
TACGTCGTATTGCTTTTCATTTTACAATATGTCTTTTTCAATCAAGGACA
ATGGCTTGAAGTTCCCCCGATAATAATCTCGATAATGGGGACATGGCTAT
TACTTCTTGCTTATCAAAAAGAATATAAGCTATTTTTAGCTGCACTTAAT
TCCCAAAAAACGCCTTATAAAGAGACTAACGAATTTTTAGTACCGCCTAA
TTCCACTGTTGAGTCCAAAGTGAAGTCCAAGATAAGAGCTAAGCTAAAAA
GCCTACTAACTAACAAACGAGTGAAATCTCCTCAAGTAAAACACAGCAGC
TTTTTACCAGAAGAAAATACCAATGCAGCGAGTCATAATCAATTTCCACC
GATAAATAAACCTTCACCCGTATCTGGGAATGATATTAAACAAACATTAG
TTATCGTTGATAACCCAGTAACAAATACTATCTCGACAACTCATCAAACT
AGGGTTGAAAATTTTGGCCGCTACCAAGTCGAAGGGGTTTTAGGAAAAGG
TGCGATGGGCATCGTTTATCAAGGCGTTGATCCTAAAATCAACCGTCATG
TAGCTATAAAAACATTACAATTAAGTGATGACATTGATTCGCCTGAATTT
GGTGAAGCTAAAGCGCGTTTCTTCAGAGAAGCGCAAACAGCAGGTGGTTT
AAGCCATGCCAATATAGTCACGATTTATGACGTAGGTGAAGATAATCACC
TAGGTTACATCGCTATGGATTTACTCACAGGCGCGCCATTATCATTATTT
ACCCAAGCGGACAAAATACTCCCTACGCCATTGGTTTATCAGTTATTGAT
TCAGATAACTGATGCGCTAGAATATGCCCATAATCAAAATGTTGTTCACC
GTGATATCAAACCCGCTAATATTATTTATGATGACGATTTGCTCAAAGTT
ACGGTTACTGATTTTGGAATAGCTTATGTCAGTGATAACAGTAATACCCG
AACAGGTATCATTATGGGTAGCCCCTATTATATGTCTCCAGAACAAATAT
TAGGCTTAAAAGTGGATGGTCGCAGCGACATTTTCAGCTTAGGCGTGACT
TTTTATCAATTGCTTTGTGGCCACTTACCTTTTGAAGGAGAGTCCATAGC
AACGGTGGCCTATCAAATAACTAAAGCGAAGGCTATTGCCGTTAATCAAC
GCAATACTAATTTGCCAACAAGTGCGATGCGTATTTGTAGTAAAGCCATG
CATAAAGATATTGATAAGCGTTTCCAATCAATGTCAGAATTTAAATTGGC
ATTAACCAATGCACTTAAACGTGATTTTAAGATCACAGCAAACTAA
>CPS_1152 conserved hypothetical protein
ATGAATAAAGATTTCAGCTTTACTATCAAGAGCATTTGTCTCGATGAAAA
TTATCACCCGTCAGACAAGACGCGTATCACTACTAACTTTGCTAATTTGG
CAAGAGGAAGCTACCGTCAAGCAAACTTACGCAACGCTTTAAAGATGATT
GATAATAGTTTTAATGCCTTGGCGCATTGGGATAACACCAAAGGAGATCG
TTATTCTGTTGAACTTGAAATCATTTCCGTTGATATCGATATTAAAGGTA
GTGGTCAAGCTTTCCCATCGATTGAAATATTGAAAACGAATATTGTCGAC
CATCAAACTAACAAACGCATTGAAGGCATTGTAGGGAATAATTTCTCCTC
TTATGTGCGAGATTATGATTTTAGTGTATTACTGTTGGATCATAATAAGG
ATCAACCTAAATTTAGCATTCCAAATAACTTTGGCGAACTACATGGCAAA
CTCTTTCAGTATTTTGTTAATTCAGATGTTTATAAACAAAATTTTACTAA
AACACCTGTTATATGCCTCAGTGTTTCGGATACCAAAACCTATCATCGAA
CTGAAAATCAGCATCCGGTATTGGGTGTTGAATACCAGCCAAATGAATCT
TCTTTAACTGAGCAATATTTCAAAAAAATGGGCTTACAGGTTCGTTATTT
CATGCCGCCAAACAGTGTTGCGCCTTTGGCTTTCTATTTCTTTGGTGATT
TACTTAATGATTACACTAGTCTTGAGCTTATAAGCACTATTAGCACGATG
GAAACTTTCCAAAAAATATACCGACCTGAGATTTATAATGCGAATGCTGT
GGCTGGAAAATCCTATCAACCAAACTTAAAGAACCTAGATCATTCATTAA
CTCAAATTGTTTATGATCGAGAAGAGCGTAGTCAGTTGGCTAATGAGCAG
GGAAAGTTTACTGAGGAACACTTCATTAAACCGCACCAAACTGTACTTGA
GCAATGGTCTGCTAGTTATGTTAATAGTTACGCTCAATAG
>CPS_4401 endo/excinuclease amino terminal domain protein
ATGACCGAAATAAACAAGACGAACACCTGGTGGGTTTACTTTTTACGCTG
TAACGATAATAGCTTATACGCAGGCGTTACCACAGATATCCTTCGTCGCA
TTGACGAACATAATAACAGTAAACTTGGTGCAAAATATACCCGAGCAAGA
CGACCTGTAAGCTTGGCCTATCTCGAAGAGGCCGATGACAAAAGTACAGC
ATGCCAAAGAGAGTATAAAATTCGTCACCTCACTAAAGTCAAAAAAGAGC
TGTTAGTAAGCAAATATAGCCAAACCAAACAGGTCTGA
>CPS_1251 conserved hypothetical protein TIGR00250
ATGTCGACTAAAACTAAATCACCCATTGGCCAACGCACCGTTATTGGATT
CGATTTTGGTAAAAAATATATCGGCGTTGCCGTAGGCCAAGAAATGACAG
GTAGTGCCACGCCACTAGGTTCGGTAAAGGCCACCGATGGAATTCCTCAT
TGGGATAACTTAGCTAAGTATCTAAAAGAATGGCAACCTGATTTCATCGT
CGTTGGTTTGCCACTAAATATGGACGGTAGTGAGCAACAACTGACTTTAG
ATGCTAAGAAATTCGGTAACCGAATCCATGGCCGTTTTGGTATACAAGTT
GAGTTTCAAGATGAACGATTAACCACTGCCGATGCCAAAGAGCAACTATT
TGCTCGCGGCGGTTTTAAAAATTTGAAAAAAGATAATATTGATGCTGAAT
CAGCTAGGTTAATTATTGAGAGCTATTTTGAGCAACAGTACACTTAA
>CPS_0024 topoisomerase DNA-binding C4 zinc finger domain protein
ATGTCTGAATCTGAAAAACCACTCTTTACTCAACACGAACATGCTTTAGA
GAAAGAATATCAAGTGTGTCCTGATTGTGGATCAGAGTTGACCATGAAGC
ATGGTAAGTCTGGGACTTTTTTAGGTTGTGTTAATTACCCTAATTGTCAA
TATACACGAGCAGTAGTAGAGCATGAACGTGTTGAAGATAAAATATTATC
GGGTAGCGAGTGTCCATTATGCTCCCATGTATTAGCGGTTAAGCAAGGTC
GTTATGGCATGTTTATTGGCTGTAGTAACTTTCCACAATGCCATCATATT
GAACATGAAGCGCAGGAGATAATACAGGACGTGGTATGTCCAAGTTGCAA
ACGTGGTTCATTGCAAGAAAAAACAAGTCGCTTTGGCAAGAAATTTTACT
CCTGTGATGCTTATCCAAAGTGTAAATTTGTCGTTAATCATGAGCCAGTA
GAAGGGCGATGTGAAAAGTGCCAATTTCCTTTGTTGCTAAAAAGAAATAT
GGCTGCTGGAATTAAATATCAGTGTGCAGATAAAAAATGTTCTCATATGC
AAAAAATATGA
>CPS_1800 ISCps10, transposase
ATGCGAGATTATAGGAGTTTGTCCCATACAGGATGGGATTGTAAATACCA
TATTGTATTTATACCTACAAAAAGACGCAAAATGATATTTGGTTCAATCA
GAAAACATTTAGGGGAAGTGTTCCATGAGTTGGCTCGTCAAAAATGCGTG
ATTATTGAGGAGGGACACTTAATGCCAGATCATGTTCATATGTGCTTGAG
TATTCCACCGAAGTTAGCAGTTTCCAATGTTGTTGGTTTTATAAAGGGAA
AAAGTGCGATCTCAATAGCGAGAACATTTAAAGGAAAGCAAAGAAACTTT
ACTGGTGAAGCATTTTGGGCTAGAGGATATTTTGTATCCACGGTTGGGCT
TGATGAAAATATGGTGAGGGAATATATCCGTAATCAAGAAAAACAGGACG
TAGAGCGGGATCAGCTGAAGTTGGGGGGTTAA
>CPS_2962 ISCps9, transposase orfB
GTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTCATCGA
AAAACACAAAGAAGCCTTAGGTGTTAAATACCTTTGCTCATGGCTTGATG
TCTCTCGTAGTGGCTTTTATGCATGGCGACGACGTCCACGTTCAATGCGT
GCTATTAATGATGCGGATTTACTTTTAAATATCAAACAAGTCTTTAATAA
CAATCATCAAACCTACGGCAGCCCACGCGTATTTCATGCATTAAAGCGTG
AAGGTATTACAACGAGTGAGAAGCGTGTTGCACGGTTGATGCGAGAAAAT
GGCTTACGCGCTAGAGCGCTCAAGACTTATAGCAGGCCAGCTAAGGTGAA
GTTCTTTTATAAAGCGATCAAAAACAATCGTAAAAACATAAGTAAGCCTG
ATGCTATCAATCAGCAATGGTCGGGAGATATTACGTACCTGAAAGTAGGA
TCGCGCTGGTATTACTTAGCCGTTGTATTAGATTTATTTTCACGTCGTAT
CATTGGTTGGGCTTTTGGTCAGAACAAATCAACAGCGCTGACACTGAAAG
CGCTGCAGCTAGCAATAAAGAAGCGTAAACCGACACAACCCTTGTTATTT
CATACTGACAGAGGCGCTGAATATCGAGCACATGTAGTGCAGCAGTTCTT
AGTTAAACATAACATTACGGCGAGTATGAACCGTCCAGGTTGTTGTACTG
ATAATGCTGAAGTTGAATCATTTTTTCATTCATTAAAAGCTGATTTAATC
AGAGGGAATGTCTTCGCGACTACTGATAAATTACATTCAAAATTAAAAGG
TTACATGAACTATTTTTACAATAGACAACGATTGCATTCAAGTTTAGGAT
ATAAAACACCTGCTGAGTTTGAATTGGCGGTGAATTAA
>CPS_2899 MutT/nudix family protein
TTGAGCAGTAACAACAGCGCCCTCACATCTGATCCTAATATATCTAATGA
AAACGACCATGGTATAAATCAATTTAAACCCAATACAACTGTTGCTGCCG
TTATCCATTACGGTGGTAAATTTTTGTTTGTTGAAGAACATGAAAAGTGT
CGAGTCGTTTTTAATCAACCTGCTGGGCATTTAGAAGAAAATGAAAGTCT
TACTGCAGCCATAAAGCGAGAAGTACTAGAAGAAACAGGATTACGAGTAG
AACCCGATTTTTTATGCGGTATTTATTATTTTCACCGACCTGATCTTAAG
CTATATTTTTTACGTTTTTGTTTTGTTGTTGAGTTAGAGCAATGGCTAAA
AGGCCAACCACAAGACGATGAAATCATTGACACTCATTGGCTTACTCTTG
AACAAATAAAAGAAAAGAGTGCTCAATTACGTAGTCCTATGGTGTTAGAG
TGCGTCGAAGATTACTTAGCTGGCAATAAAATTCCGTTATCGCAGCTAAA
ATCTAATCTTTAA
>CPS_0185 putative site-specific recombinase, phage integrase family
ATGAGCAACCATCGGGATAAATTCTACATAACTTGGGAAGAAGCCTCTAA
AGCAACCATCGTTTTGGATTGTGCTTATAAAAAAGACTACCTTGAAAAGT
ATAAAAGCGATCCCAAATTACCATCCAACCCTCAAAGAAGTTATCCTGAG
TTCAAAGAGAAAGGGGGATGGTCTGCTTATTTAAGTACAGGTGATAAATT
CTACAGAACGTGGGCAGAAGCCTCTAAAGCAGCCATTGCTTTGGGTTTCA
ATCGCTCCGGTCATTACTTCAACGGATATAAAAAAGACCCTAAATTGCAC
TCAGACCCATCCGTTCACTACCCCGACTTCTATAAAAAAGGTGGTTGGGC
TGGCTTTTTGGGGAATCCAGTGCCTACTCCAAAACACGAAACTTGGGAAG
AAGCTTCTGCTGCGGCTATAAAGTTAGGCATAACAAACACTCATGAGTAC
AAAGCGTTATATAAAAAAGACCCCCTACTGCCATCAGACCCTCAACGGAG
CTATCAAGATGTATGGGATAAAAACGGGGGGTGGTCAGGCTTCTTTGGTA
GGCAATTGGGCTCTATTGACACAAGTAAGATGCTCAAGGTGCTAGAAATA
ATCGATATAGAAGGCTATGCGGAAATAGACCATGTGAAGCTGCCGAAAGA
CCCGCTAAAAACATACGATTTGGAAACGTTTGAAGAACTATTGACGCTTA
AAGTGTATGACTTGGCGCAAGTCAAAGCCTACTGCGAACGAAAAGGGTTC
CAAGAGGTGGCTGAGTATAGAAAAGCTTCCAGTGACCAGCAGCACTTAAA
CAACGCCACACCTATAGGTATCAAAGGGTATGTTTCGGGCAAATCTATCA
TCAGTAAACTTACTAACTTTGAGCGAGCAACAAAAGAACACCCCGACTAC
TCCCAGTGGTTTGACATGGCTATTAAATTTGCACTTTTGGGTAAAAACAT
CCGAAAAAAGAAGGTGATACTCTTTAATTTTGTTATGGAATACTTAGTCG
ATTTGGAGCAACCGACACAGCCAGCAGCTTTCTTCGCAAGGAAGCATGCA
CCGCCACTTTTAACCAGTTTTATGGAAAAGCAGCCTAAGTTTGCACAATC
TATAACTGGAATCAATATATTGAAGGACTTCATTGAAGACACATTTCATA
GATGTTGCCAAGATGAAGACGATGATGGGATATCCGTGGTATTGCCAGGG
TTTATTAACAAATGGTCTCGAATAATATCAACTGTTGAGCCAGTTAAGAT
AGACAGGCCGGATAAATCCGAAAAGTGGCCGTTAGCGATGAATTATATAG
ATCGTGCGGCTAAATTTCTCGTCCCTGACAGCGCCAAAACATTCCAAGAT
GTGATGCAACTGGAATGTGACTGGTTCATCGTCGATGAATCCATCATCGA
TAAGGATGATCTCAATTGCGTTTGGCGAACCAAGATGATCAACTCCGGAT
ATGGCAAGAAAATGAGATATCAAATGTGGTCACCCGTTAGAACTCTTGCG
TTGTTTGTACTCTTTAGTATGCCGCTCAGAGGCCAGCAGATTTGTTGGCT
CGATTCTGGCGAAGCAGATACGGAAATTCCGATTATAAACGCACAAGACG
AGGTCGTATGGGTTAAAAACGACCATCACCTTATCAACGACGTCAATAAA
CGCACTGAAAGACAGGGTTTCTTGAGGCGCTTTAAGGATGCGAAGAAGAC
AACCGTAACCAACGACAAGGGTATCGAAGAAACTCGGCGTGAGGATATTA
TCGGCTCTTACATCACAACCAATAAAACCAGTAAGGATGGAAAAGGCTAT
GAAGTGGCATATATGCCTATCCACCTCATTAAATGGATGATTAGATTGCG
AGAGTGGCAATCAAAATATAACCCCATCGATAAATTAACCTCTTGGGAAT
CGGTAGCACTAATAAACGAAAAGAATAATAAAATACTGAAGGCAATGAAA
TCACAGGCGTTTTTATTCAGAGACCCAGACACATTGCACGCAGAAGATAA
ATGCCAACCTATTGGTCGAGATAAAGCTATGTCCAATACTTTTTCCTGGG
TGTTATACCAAATACAGGATAAAGATATTCCGTTGGCATATCTTCCAGAA
GGAAAAAGTGATTGTCAAATGAATAATTACAAGAGTGATTTCACGCCACA
TGGCATGCGTGTTTCGTTTATCAGCGCCTATATTCTTGATGCAAAACTGC
CCATCTCAATTGTTGCCGCACTTGTTGGGCACGCTTCAATAGTAATGACG
ATTTATTACACAGTGACCACGAATCAAGATTATTATGAGATGCTCAGTGC
TGGACACCAAGCCGCACTAACGGCAGCTCCTGCAAGGATTGCTGGCCTGA
TCAAGAATAAACAACTCAAGCTTTCTAGTAGTGACTTTTTCGATTCAAAC
GGACAGCCCGTTAAACCAATGTATGATAAAGCGCCTTACGCCGCACTCGG
GTTTAAAGACTTCGGGATTTGCCCTGTTGCGTGCTCAAAGTGTCATGAGG
GTGGGGATGAAGTCAAACCAGGTTTGAATGTCTTTGGCCCTGTACGCTCT
GGCTACCTTGGCCCCTCAAATTGCTTTGTCTGTCGGTTTTTTATTACTGG
CCCTGGTTATATTGGTGGGTTGAAGACTATGCTCGCAGAAGTGGGTTTAG
AAGCCAAAGAGTCTGGTAAGCGTATGGAAAAATTTCGTGAAGAGAGAGAA
GAGCTTGAATACTTGCAGTATCGCTCAAGAAAAGATGATTTACCCTTTGA
ACACGAGGCTAAGTTAAATAATATTTTAACGCTACATCAGCAGGAACAGG
AAAAGTTTGATGCTTTATCTTATGATGCTTCAACAATTGCGATCATGGGC
TATAGATGCAGTAAACTACTTCAAAATCAGTCAGAAAACGCTGAGAATAA
AGGCCACCAATTAATCCTACAAGAAGGCAACCCTATGCTTGGTGTCAAGA
TAGATGAAGTTTCTGAGTTCGCTCACATGACAGAAATTTGTCAGAACGCT
GAAATTTATGCTTGTGCCAACCCGAGTCGAGCGTTGCCTAAGCGCACGAA
AATGCTTGATATGTTCGCATTGAACAATGGATTTTCACCTAAAATTTTCC
TGTTATCAGATGAAGATCAACTTAAGGTGGGCAACCAAATAACCAGCATC
ATGTTGAATCGGCTCAACGGCTCATGGGATGATGCAGAAAGGTTGATGGA
TGGCACCGTAACGCTGAAGGATTTAGGACTTTCCGGAAAGGAAATAATGG
AGCCAGTTACCTTAGCTTTGAACCATTGGACTCCCGAAGCACAGGTTCGA
ATTGAGGTGATTAATGTATAA
>CPS_0184 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGACTATTTCAATACAACCCATCAAGGTAAATGTTCTTGTTCGTATCGA
CAATACTGACAAGACCTATGAGCTGCCAGCAGTGTACGTACCAGGTGAAG
GGTATTTAGGTTCTTTCCTTTGCTATATCGTGAAACACCGAACCAAAAGC
AAGAGTTGGAAAGATAAAGCGATCCAGGCAATGATTCTTTTAATTGAGTA
CACATACGCAAATGAGGGGTGCTTTGATACTAAGCAGCAAATGTTTGAAG
AGTTCACCAATAGCCTGCATGCAGGAACTATAAATAAAGATGGAGATGAC
AAAACAGGCCTTCGTTGGAGGCCATTATCAGTAGAAAATGCTAACGCTCT
GAAAGGACATATTACTAAATTTAGTGACCACCTTTTCAAGGAAACAGGTG
GTGAATCGGCGCTTTTAAACCCCATAAGAACAGCGACGGGTGCTGAGAAA
ATGGTTAATCTTGCTGCCTATCATCATAAAAAGAACGCGGTATTCTTAAG
TCATTTATTCGATAAAAACAAGAATAATGATATAGACACCTCACGAAATG
TGAGGAACAGGAAAGAATTTAGAACACCTCAGGTTGATCAGTCTGTCAAT
TTTTCTGAGGAGCATATCGACGCGTTACTTTGGGATGGCTTTATACAACC
AGGCAGCACGTACCTATCTCCTGTACATGAGCGTTATAAGCTAGCCCCCT
TACTAATCACCATGCTAATACATTACGGTGGCATACGTCCGTGCGAAGCT
TTTCATCTCTATGCCGAGGATATTCATCTAGACCCATCAGAGCGTGTCGT
GATCAGGGTATATCACCCAATACAAGGGCGTGCACCGGAGTATTATCGCG
ACCAACCAGGTAATAAAGGCGCTACCAGGATTGAATATCTAAATAAAAAA
TACGGTTTAGATGATAGATTTTCCGACTCTAGGAAGGCATACCATGCGGG
GTGGAAAGAGCCAGCTTTAGCCGACAGCAAAGCTAAGTTTTTTTATGTCT
ATTTTGCCCCCACTGAAAAAGGAATTTTGTTTTACCAGTTGTTTAAGCAA
TACATGATTCACCAGCGAAAAGTCAGGAAGCTAGGAGGGCAAGACACAAA
ACACGCTCCAGAGGCGCACCCGTTTCTCTTCACAAATAGAAATGGCGACC
CGCTATCAATGCGAAGCTTTGAAGATTTTCATAAAGAAGCGGTGAAAGCA
ATTGGGTTAGAGGCATTTCGTGCAAATGGCACTTCCCAATACTGCCACCG
TCATGCATTTAAGAAGCGTCTTGAAGGAATGAGTGTACCAGAGGTACTTC
GGATGGACTTGATGCACCATAAGAGTATTTATTCGCAAAATGAGTACGGT
AAAGCAAGTAATCAAGAAATTTACGATAAGTTGTCTAATGCCAACGCACT
AAGCAGTCATGAAACAGCCCTACTTTCCAACCTTAAAAACGCACAATAA
>CPS_0490 putative site-specific recombinase
ATGTATCGTAAATACGCTATTAGTTATATACGCTTTTCTACTGCAGAACA
ATCACTAGGAGATTCGTATAATAGGCAGTTTGAAGAAGCAGAAAGATTTT
GTTTCGAAAATAATATTAAGATAGTTAAGGATTACAAAGATCTCGGAAAG
TCAGCATACAAGTCAGTTAACCTTGCCCCTGAATCTGGTCTTAATTATTT
TTTAAATGCTTTAAAAAGGGGGGAGATATCAAATCCTAAAGAAACTCATT
TATTAGTTGAATCTCTAGATCGATTATCCCGTGCTCAAGTCACTACAAGT
ATGCATTTATTTTTAGGTATTCTTAAACAAGGAATATCAATTCTTACGTT
AGCGGATGGGAAGGTTTATGAGCAAGGTTGTGAGCTATCAGATATTGTAA
CAAGTGTAATGATGTTGGCAAAAGCGCATCAAGAAAGTGTAGACAAATCT
TATCGTATAGGAAAGGTATGGAAGAGAAAAAAAGAAGCTGCTAGGGCTGA
TGCTAAGAATAAAGCGGGTACAGATAAGAAAGTTACAGCTTTAACAAAAA
TGTGTCCATTTTGGTTGAAAATAGTTAAAGAAAATGATCGATTCGTATAT
GAAATAAAAGAAATAGAAGTGAATACGGTGAAGTTAATTTTTGACTTGGC
TACAGGAGATGCGATTGATAATGAAGTTGAGCTGTCAATATCCGTTGAAA
ATACTAAATTTAGTTCTATTGAAATTGCCAGAATTTTAAATAACGAAAAT
ATTCCCATTATCAAAAGTGGTAAAAGAAAAAGAACAGACTACTGGCATGC
ATCAAATATAAACAGAATTATTACAAATAAAGCAGTTTACGGTATATATC
AGCCTAAATTATTAGTGAAAAAAGAATATACACATCATGATGATTTTAAT
GAATCTTATCCAGTAGAGAAACCGTATTTTGAAAATGATGGTGAAGCAAT
TGAAGAATTTTTCCCTGTAATAATATCTAAAGACAAATTTGATCGCGCAA
CTCATCAACGAGAAGAAAAATTTAAAGGAAAACGAGGTAAAAAAGGAAAA
AGATTTTCAAATTTATTTAATGGATTAGCTCTCTGCAGAAAGTGTCAATC
AAGTATGGTTCATTCAGATAAGGGAACCAGTAAAAAAGGCAAACGTTGGG
TATACTTACAATGTTCAAATGCTCGCATTAAAGGTGGTTGTTCAGCTACG
AGTATTAACTACAGTATATTAGAATATAACGTGCTGCAGTTTGTTCAAGG
AACAAATTTTTCTGAATTAATTAGTAATATTCAATTACCAAGCGTTGGGG
AAATTAGCCAACAGCAAAATATTATCGATATTGTGGAAGCGAACTTAAAT
AAAATAAGCAAACAGTTTCATAAATACATGGAATTTGATGATGACAATGA
TCCCGATTTCGCTGATGAAATAAAACTAAAGCTAATTGAATTAAGAAAGG
AAAAACGTACATTAAATAGTAAATGGAGTAATGAAAAAGTTAAATTAGGA
AATATGTTAACACGCACTTCATCAGTGAACTTAGATGAAATGTCTTTTAA
AAAATTGATAAAAGAAATCGATATTTCAAATCAATCAAAAGAAAATGATG
ACGTATATTTTAAACGTCAAAAAGTTAATAGTTTACTTACATCATTAATT
TCTCATGTTTATGTCGACACCCTGCGTTTAAAAGCTCTAATTTTTTATAA
AAGTAATGTAATACAATTAGTAGATATTAAAGATGAGATTGCAACAGGAA
CCATTTTTTCAACTGTTCGTTTACCAAGCTTTAAGTTTTCATCCAAGATT
GAAAGCTCATATCAGGATGCGTTTAAAGATGCGTTTTATGATCTTGTCAT
GATGTTGATTGACGGAAAAATGAATATGTCTGCAACCTCTTTAAATGAAT
CAGAAAATGAGGGACTGTTAAATTTAGAAAAAAACTTTAGTCATGTAATG
TCTTACCCAAAAATTTTGGCAGATTCTTTTAAAGCAGGAGGGAATGATTT
TAGCGTTAAATTCAATGAAGAGCAGTATTGGTTTGAGGTTAGTTAA
>CPS_1308 endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein
ATGATGAGGTACAATTATCACTCATCACTTAGGCGAGTTATCATCATCAG
CGACAACAATAAAACAGAAATAGATCAATCCCCTTCTTCTGAAACCCTCT
CAGTATCTGTAGCAAATACGCAACTTAAAGTTGCTACTTTCAACTTGTTT
AATTACCTTGAACCGCCAAATGCTTATTATGAATTTGAGCGCATTTATAG
TGCTGAGCAATGGGCAAAAAAACAGAAATGGGTTGCTGAGTATCTAAGTG
AATTTCAACCTGACATTATTGGTTTTCAAGAAGTTTTTAGTGCCGATTCA
TTAAAAGAATTAGTTGCCGCACAGGGGTATGCCTATTTTGCAGTGGTTGA
TCAACCTACTGTTATTGATGACTTTATTTATCGTAGTCCGGTGGTAGCCA
TCGCCTCTCGTTATCCTATTACTGAGGTGGCTGCAGTAAAAGCAAATACT
GAACTAGCGCAAACATTAGGCTTAGCCAATGATTTTTCTTTTAGCCGAAA
GGTCATTAGAGCGACTGTTGAACTCCCGCATATGGGCAAGTGTGATTGTT
ATGTTGTGCACTTTAAATCTAAGCGTTCGATGATTGAAATCGATGAGAAA
AAGAACCATTGGTCGCCAGAAAAAACGATTATAGAAAGTCTAAAAGCTAA
CGTGGCGGGTGGTTGGGGTTCAACCATACAACGCGGCAGTGAAGCGACGT
TATTAATGATTGATATGATTGAACGACGCGAGGCTACAGGCAACCCTATG
GTATTAATGGGGGATTTTAATAATACCTTAGACGATGGTGTGTTAAGTCA
TTTGCTGACAAATACTTTACGTTTTGTTTCTGCCATTGACCGTGATGCTT
ATCTTGCTAAGTATTGTTTAAATGATGCGTGGGATTTACTTCAAACAGCA
ATCAAGAATGAACAACATGAAGCGAGTAAAGCTGATGAAGATAGTAAAAA
CACATCAGATATAGTAGAAAAAAATGATACTGCTGATACTAAAAATAGTA
GTGCTCGCGAAGAGCAAATTGTGCGTACGCCAACACATTATTTTGGTGCT
GATAGCTCGGTACTCGATTACATTTTATTATCGTGTGAATTTGATGCCAG
TTACCACGACAGTCTTTATCAAGTCAGCGCTTACGATACTTACGATCGAC
ACTTAATTAATCCTATTTTCGAGCGTGATGGCGAAAGTACAGATCATGGC
ATTGCGTTAGTGACATTAACGTTAAGATCCTAA
>CPS_1685 ISCps9, transposase orfA
ATGCCTAGATATACCCAACCTAAAAAGACGTGGTTTTACCCTGTTAATTT
CAAAATTAAAGCTGTCGAGCTAAGCTTACGAAACGACATGTTATCTAAGG
ATGTTGCTCAAGCGTTGGATATTCACCCGTTAATGCTAAGCCGTTGGCGT
AAAGAATACCGAGAAGGGAAGTTTAAAAAAAACCAACACTATCAGAGCAA
TAGTGAACTCATGAGTAAAATCCCCACAAAGAAAGAACTAAATAAAATTA
AACAGCTGCAAAAAGAAAACGACCGTTTAAAAATGGAAAATGATTTACTA
AAAAAGTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTC
ATCGAAAAACACAAAGAAGCCTTAG
>CPS_0156 putative methyltransferase
ATGAATCAAGCAAAAAAACAACTAAGTAAAAAGCTCCTTTCTGGGAGAGG
ACAGGGTAAGTCTGCCGGTAAAATCCGTATTATTGCCGGTAAATACAAAG
GTAGAAAATTACCGGTATTAATGGCAGAGGGATTACGCCCAACAACCGAT
AGAGTTAAAGAGACTGTCTTTAATTGGCTCATGCCCTATATTGCTCAAGC
CAATTGCTTAGACTGTTTTGCTGGCTCTGGTAGTTTAGGTTTTGAAGCGT
TATCTCGTGGTGCCGATGAAGTAACCTTGGTGGAATTAAATAGAGCCGCA
GCGAACCAATTACTTGAGAATAAAGACTTACTCAAGGCTGATAACATTAA
TGTTATTAATGATAATGCGCTTGTTTTTCTTAAAAAAGATCCTCTTAAAG
TAGGGTTAACCGCAAAGTCAGACAAACCCTTTGATTTAGTTTTTCTCGAT
CCTCCTTTTAGAAAACAATTGGTCGAACAAACCGCACAATTACTAAATCA
CTTTGGTTTGGCCGATCAGGCACTCATTTATGTAGAGATGGAAGCAGATA
GCACACAAGTTATCCCAGCTAACTGGCAATTAATTAAAGAGAAAATTTCT
GGCCAAGTTGTTTATCAACTGTATCAATATCAGGGATAA
>CPS_3886 ATP-dependent helicase
ATGACCGAAAACAACGTTAGCCAAGTTAGCCAAGCATTTTCTCCAGAAGG
CGCTTTGGCTAAAGCCATCAAAGGCTTCTCGCCACGTCAAGCGCAAACCG
ATATGGCACTTGATGTTGCCCATGCAATAGACAAACAATCATCGCTTATT
GTTGAAGCAGGAACCGGTACCGGAAAAACCTTTGCTTATTTGATCCCTGC
CTTTTTATCGTTAAACCCGAAAAATCCTAAAAAAATAGTAGTCTCTACGG
GTACTAAGAACTTGCAAGAGCAACTCTTTCATAAAGATATTCCCCTAATT
AAAAAGGCGCTAGCGAGTAATGCGCAAGTCGCTTTATTAAAAGGTCGCGC
AAACTATTTATGTAACTATCGGTTAGCGCAGTATCAAGATAGTAGAGGTC
AACTTGATGCTCAAATGTTGCAAGATCTAGTTAAAGTGAAAACCTGGGCA
AATGGCACGCAAAGTGGCGATATTGGCGAATTAGTGAATGTCAGTGAAGA
CTCCAGTATTTTTCCTTTTGTAACGAGTACCTTGGATAATTGTTTGGCAA
GAGATTGCCCAGACTATGAAGCATGCCACTTAGTTCGAGCCCGTCAAAAA
GCAAGTGATGCTGATATTATTGTGGTGAATCATCATTTGTTTTTTGCTGA
TATGGCCTTAAAAGATACTGGTTTTGGTGAGCTTATACCTAAGGCTCAAG
TGATGATTTTTGATGAAGCGCATCAAATTGGGGATATCGCGAGTGAATAT
TTTGGCGAGGCATTTTCTAGCAAGCAACTCGTTGATTTATGTACCGACGT
ATTACAAGTACACCGTAGTAGTTTAACTGATGTTAAACAGTTAGGTTTAG
CAGCCGAAAAACTACAAAAGACTTGCCAAGAGTTTCGCCTGTTATTTAAT
TATGATCCGGAACGTGGCAATTGGCGGGAAAAGTATAAACAAGTTCAATT
TCAGCAAAAATTCGCTAACCTAAAAATTGATTTAGATTTTCTATATCAAG
TGATAAAACTGTGTGTTTCAAGAAATGAAGCGATAGATAATTGCTTTGAC
CGTGCTGTTAATTTACTTGCTCAATACGACGTGATGGCAAATGTTGAAGC
ATACGGCATGAGCTTTTGGTATGAAACCACTCCGCGGAGCGTGGTATTGC
ATCAAACCCCTTTAAACGTTAGTGAAAAGTTTAATACCTTTGTGAAAGAG
TCGGGTGCCGGTTGGATTTTTACCTCAGCAACATTAGCTGTAGATAATAG
CTTTAATCATTTTGCTAAACACTTAGGTTTACAAGATGCTAAACAGTTAT
TACTTGATAGCCCGTTTGATTACCAAGCGCAATCGCAGCTTGTTGTACCG
CGTTATTTACCGCAGGCCAATGATAAAAATCGCGCCTTAAAGTTAGCTGA
GTTGGCAGAGCCGTTGATTAAAGCCAGTAAAGGTGCCTGCTTTATGCTTT
TTACTAGTTATCGTGTAATGCACCAGGTTGCTGAAGTTCTAGCTGAGAGT
ATTGATAACCCCTTATTAGTGCAAGGTAAAATGGCTAAGCGAAAACTGCT
TGAGCAGTTCGTCGAACAAGATGATGCGGTACTGCTAGCTACGGCAAGTT
TTTGGGAAGGTATTGATGTTCGTGGTGATAAGCTCACTTGCGTGATTATT
GATAAGTTACCTTTTGCTTCACCGGACGACCCTCTGTTGCAAGCTCGGTG
TGAAGATGTAAGACGTCAAGGCGGAGAGCCCTTTAGTCAAATTCAATTAC
CTCAAGCGGTTATCGCGTTAAAGCAAGGGGTAGGGCGACTTATTCGTGAT
GTTAGTGATCGTGGTGTGCTAGTGATTTGTGATGATAGGTTAGTGAATAA
ACCTTATGGTGAAACTTTTTTGAAAAGTTTGCCTGATATGAAACGTAGCC
GAGATATTAATAAAGCTGCAAAGTTTTTGGAAACCTTATCCTAG
>CPS_4446 conserved hypothetical protein
ATGGCTAGATCACCTCGCTTAAATTTAAAAGACATTCCGCAACATGTGAT
TCAACGTGGTAATAATCGCCAATCTTGCTTTTTTGAAAACCAAAACTATC
AAGTTTATCTTGATAAACTGCTTGAATATAGCCAAAAGCATCAAGTTGAA
ATTCATGCTTTTATTTTAATGACAAACCATGTGCATTTATTGGTCACACC
AAGAATTGAAAATGGCGTTAGCCTGATGATGCAGTCACTGGGGCGTTATT
ATGTAAGATATATAAATCAAACTTACCACCGAACAGGCACTTTATGGGAA
GGTAGATATAAGTCGAGCTTGGTTGATAGCGATAGTTATTTTTTAATAGT
TACTCGGTATATTGAATTCAACCCGGTACGTGCAGAAATGGTTGTTCGAC
CTGAATTATATCCTTGGTCAAGTTATCATCAGCATGCTTTAGGAAAAACA
ATAAGCTTACTCACGGAGCATGATTGTTATTTAAAGCTTGGTGACTCTGC
CAGTAAACGGCAGCAATCGTATCTTAAATTTTGTAAACGATACTTGAGTG
ATGATGAAGCGTCATTCATCAGAGCATCAGTGAATAAAGCTTGGATTTTA
GGTGATGATAGATTTAAGCAGCAAATAGAGAGGCAACTTGGTGTGTCAGT
TTCGCCCAAAGCAAGAGGTGGAGATAGAAAGTCAATTAAGTATCAGCAAA
GCAAAGGTTAG
>CPS_2015 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGGCTTTGTCCGATACCAAACTACGAAAAATAAAAGCACCATATAATGG
AGAGGCAGAACTAGCCGATAGAGATGGTTTATCTGTAAGAGTCAGTCCTA
AAGCACTAATAACTTTCAATTATCGCTTTAGATGGGAAGGTAAGCAACAA
AGAATTAAACTTGGTCGATATCCAGGCTTGAAACTAATTGATGCAAGAAA
AAAAGTTAATGAATATCGGCATAATTTAGATGAAGGTCTAGACCCAAGGG
TGGTTCAGAATGAAAGTCGGAGCCACAATTTATTTGGTGATATGTGTGAA
GCATTCATGACTAAGTATGTTATGACAGAATTACGGCCTAAAACACAAAC
ATTATATAAATCTACTTTTAATAAATATGTCACACCTTATAAAAACATTG
ATATTGAACGATATAAATATACCGATTGGATCGCTTACTTTGATTGGGTT
AAAAAGGAGTCCAGCTCAGCTAATGCAGGTAGTGTTTTAAAACGATTTAA
AGCTGTAGCGAATTGGGCGAAAGCTAGAGGTCAAATCAAACATTCTCATT
TAATTGATATCCCGATAAAAGCAATTGGTAGTCATCAACAAAAAAGAGAA
CGTTGCTTAGAGTGGGATGAGGTCATTGGCTTATGGCGACAAATAGAATC
AAGCAAATCAACACCGCAATGTAAAACCTGTATCCAACTTCTTTTATTAA
CGGGTGCAAGAAATGCTGAAATCCGTGAAGCGAGAAGGGATGAGTTTGAT
TTAGATAAAAACATTTGGCTTTTACCTCCAGAAAGATCAAAGACTAAAAA
ACAAGTTCGTCGCCCATTGAGTACTGGAGTAATTGAGCTAATTAATAAGC
TCGATCTTATATACGGCCAAGACCGAGAATATTTAATCGCTGGCGATATA
AAAGGTAAGCCGTTAACTACGCACGCTGTGAATCGTTTTGTGCAACGCAT
GAATAATCATTTGAAATATCCACATTTTGTACCTCATGACTTTCGCCGTA
CGATAGTCACTAGATTAAGTGAACATAAAGTTGAATTACATGTTACTGAA
AAAATGCTAGGTCATGAATTAGGAGGGATTTTAACTCGTTACAATAAACA
TGATTGGATTGATGAGCAACGCGAAGCTTATGAATTATATTGGCAGAAAG
TCACACTATTGTTAAAAAACTAA
>CPS_0022 putative DNA processing protein DprA
ATGATTAATAACAGTAAAAGTAATATTGAATACTGGTTAGCTTTAAAGTT
TGTTCCTCGATTAGCCATTCACAAAAAAATAGCGCTTGTTGAGACCTTTG
GTTTGATAGCGTTGTTTTCGTTAGACAATAAACCCTCAGTACTTAGCTCA
GCTAATAACTTAAGTGTGAAACAACTTCACGCTTTTCATCAGCCTGATTG
GCAAACAATAACTCATATTATCCATGCAAGTGCTGCATGTAATAGTGCCA
TCATTTGCTATGACGATACTTATTACCCTCAATTGCTCAAACAAATCTAT
GATCCACCCTTAGTGATATTTATGCAGGGCAATCCATTATTACTTAATGC
TCCGCAGGTGGCCGTAGTTGGAAGTAGAGCTGCTAGCGTAGGAGGTAGAG
ATACCGCATTCAAAATATGCCAACAACTTGCGCAGCATAATTTTATTATT
ACAAGTGGGTTAGCCCTTGGTATCGATGCTGCAGCGCATAGAGGTGCCCT
TAGTGAGCCTGCTAGCACAATCGCGGTAGTTGCTACGGGTTTAGATCAGG
TATACCCAGCCAGACATCATTCTTTGGCGCAGAAAATTATAGATTCAAGC
GGCGCCATCATTAGTGAATTTGTACCTGGAACGCAAGCTAGGGCGGGGCA
TTTTCCAAAAAGAAATCGCCTTATTAGTGGTTTAAGTTTGGGGGTTTTAG
TCGTTGAAGCTGAATTAAAAAGTGGCTCTTTGATAACAGCTCGTTGTGCA
CTAGAGCAAAATAGAGACGTTTTTGCTATACCTAGCTCTATTGAAAATAA
ACAAGCAAAAGGCTGTCACTGGTTAATTAAACAAGGCGCTAAACTTGTAG
AACAATGTGCCGATATAATAGATGAGTTCGCTTTTGCAGATAAACCTAGT
CTACACTTAAAGAGTGAGTTGAAGCCTTTGAAGTCAGCTACACATAGTAC
TCACAAAGGAGGCGATGAAATAAATCAAAAAGTCTTGTGTAACGATGCGT
TGTTGGATAGTGTGGGATTTGAAATTACTCCCGTAGATAAAGTAGTTTTA
CGGAGCGAACTTCCCGTAGAGGAAGTGTTAACTAGATTAACAATGCTGGA
GCTAAATGGTCTGGTATCTGCGGTACCTGGTGGCTATATTAGAACGCAAT
AA
>CPS_0386 conserved hypothetical protein
TTGGAACTTTTTACCGCGAATGAGAGTCCGGAAAAACTGGGGATAGGCAA
AGCTAATATCTTGATTCAACCGAATCATAAAGCGTATGGCCAACTGAATA
AACATGCCTATTTCAGTCAAAGTTATGCCGATTTACATGCTAGACCGTTT
CCTGTTTCAAATGTACCACTTCGCGTTTCACAAGTTTGCTTTCTTCATCA
AGAGGGTGATAGTCAAGCCGTTGAATTAGCTCACTTACATGAGTTATGTC
ATCGATATAGCGTCAATCCTCCTTTAGCCAATGCATCGTGTTTTTACCAA
AAAATGGGTGAATACGAAATTAGGTGGGAGCGCCATACAGAATTTAGTAG
TTACACCTTTTTAATACATGACAGCGGATTGAAACCTTTTGACTGCCCAC
CTGTAGCGCTAGTACCCATTGATTGGCTTGAGGGGATATCAGGTGAGTTA
ATTGCTGCCGTTCATATTGATGCGTTAAGTGAAGGAAGCGTGACCTTAGA
AAGAGATCATTTACGTCAATATTTTGAGGGACAGCGGTTAATGGGCTCTG
AATTACATAATGGCGAGGCTATTATACTCAGTGCGTTGCGGTTACATGAG
GATAACTTTAACCGAATATTGTTGGTTAATACTAGTTTGAATGAATGTCA
AAGTGGCCGCGTGCTTAGAGCACTATTAGAGATTGAAGCCTATCGAAATA
TGACCTTATTGGCTTTTCCGCTTGCACAACAAGTGAGTATCAAAGTCAGC
AAAATGGAATCGCAATTGGCCATGTTGCTCAAGAAGCAAAAAGATATTAA
GTCGTCGAATGATGAGCAGAAACAACTGGCTGAATTGTCAGCAATGGCCG
CTAATATTGCTGAAATCATCGCTAGCTCACGTTATCGCTTTGATGCAGGC
AGTGCTTACTATGAAATGGTAAGAAGTCGGTTGGCTGAATTAGAAGAAAA
AGACATTAATGAATTACAGACTTTTAGTGCCTTTATCGACCGACGATTAT
CTCCGGCATATCGAACCGTACTTGCGGCAAAACGTAGGCTTGATGATTTA
TCGAGTCGAGTCGATCGCGCTAGTGACTTTTTACGCACCCGTATTGATAT
GGCGATTGAAGCACAAAATCAAGCCTTGCTGACATCAATGGATAAAAGGG
CGCAGATGCAATTCAACTTACAACAAACAGTTGAAGGGCTTTCAGTAATT
ATTATGACCTATTACGTACTGGCACTGTGCAAGTATTTATTGGATGCCAG
CAGTAGCCTTGGTTATACATTTAATAGGGAAGTAGCCTTGACGTTGTTGA
TGCCAATTGTACTTATTAGCGTCTGGATGTTTAGCCGCCGGATAAAAAAT
GCAGTACAAAAAATTGCACCCTGA
>CPS_3401 ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family
ATGACAACTGTTACAACGCCTGCCACCTTTACAGAACTTGGCCTTATTAC
CCCCTTATTAGCGCGATTAGCTGAGCTGGAATATCATCAGCCAACGCCTA
TTCAAGCGCGAGCTATCCCAAGTGTATTCGCGGGACGTGACTTAATTGCA
GGGGCAAATACCGGCTCAGGTAAAACAGCCACCTTTGCACTGCCTATGTT
GCAGAAATTACGCGAAGACATTTCATCGGGCAGCAAAAACAGTAAAGGTA
ACTTTGTTACTGGACTAGTTTTAGTACCTACTCGTGAACTCGCCAAGCAA
GTTGCAGACAGTATTAAATCTTATGCAGTGCATTTTAATGGCGAAATTAA
AACCCTTGCTGTTTTTGGTGGCGTATCAGTCAATATTCAAATGCTCGCAT
TACGCGGTGGCGTCGATATTTTGGTGGCAACGCCGGGTCGATTACTTGAT
TTAATTTCAAGTAATGCCATCAAGCTCGATAAGGTTAAAACCTTAGTACT
TGATGAAGCCGACCGCATGTTAAGCCTAGGTTTTACTGAAGAACTAACAG
CGTTGTTGGCATTAACGCCGAAGAAAAAACAAACCTTATTATTTTCAGCG
ACTTTTCCTGAACAAGTAACAACGTTAACGCAAGAACTGCTTAACAACCC
GATTGAAATACAATTACAAAGTGCGGATGCCAGCACGTTAGTTCAACGTG
TTTTTACCGTGAATAAGGGTGAAAAAACAGCGGTATTAGCGCATTTGATT
CAGCAAGAGCAATGGCGACAAGCGCTTATTTTCGTTAATGCCAAACACCA
TTGTGAACACTTAGCTGAAAAATTAGCTAAACGTGGTATTACCGCCGCCG
TGTTTCATGGCGATAAAGGTCAAAGCGAACGTAGTCGTGTGCTTGATGGC
TTTAAAGCTGGCGATATTGAAGTGTTAATTGCTACGGATATTGCTGCCCG
TGGTTTAGACATCGAAAAACTACCGGTGGTCATCAACTTTAACTTACCAA
GAAGTCCATCAGACTACATGCACCGTATTGGTCGAAGTGGTCGTGCTGGC
GAAGTAGGTTTAGCCATATCGCTTATCGACCATGAAGATTATCATCACTT
CAGCGTGATCGAAAAGAAGAACAAATTTAGGCTTAAACGTGAGCAAGTTG
AAGGTTTTGAAGCCGCTGAAATTACCGGTGATTCAATTTTAGCCGTTGAG
AAACCAATGGCAGCGCCTGAAGGTACTGGTAAGAAAAAACGTAAAAAGAA
AACATCAGTAAATGCCGATATCTGGTCAGGATATTCTAAACCAGAATAA
>CPS_4433 conserved hypothetical protein TIGR00252
TTGTTATGGAATAATAAAACCTCAGCCAAAAATACAAGCAGTACCGATAA
AGGACAAGTTACGGAAAGCTATGCACAGCAGTATTTGTCTAAACAAGGCC
TAAGGTTTATTGAAAGAAATTTCCACTCTCGCCAAGGTGAAATTGATCTT
ATTATGCTTGATGGTGATACTTATGTTTTTGTTGAAGTAAAATATCGTAA
AAGCAAAGGCTTTGGTGGTGCAATTGCCGCTATTTCAGCGAGTAAACAAA
ATAAGGTTAAACATTGCATAACATTTTATCTACATCAAAACGGATTAAAT
GAATATAATACTCCCTGCCGCGTAGATGTGGTAGCGCTTGAAGGTGATAT
TACTCAGCCACAAGTTACTTGGTTAAAAAATGCCTTTTAG
>CPS_0042 ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family
TTGGCTAAACGAATGACCTTTTCTTCCTTTTCTTTGGACTCAACATTGCT
TAAAGCAATAACCGAATCTGCTTATGATGAACCAACAGAAATACAAAAGC
AAAGTATCCCTCTTATTCTAGCTAAACATGATGTTATGGCAAGAGCTCAA
ACAGGTACAGGGAAAACAGCTGCTTTTGCACTGCCAATACTTCAACAATT
AATATCAGTTCAACCTTGTAAACCAGAACTAAGAGCATTGGTGCTAACTC
CAACGAGAGAACTTGCTCAGCAAGTGCATAAAAGCTTTTGTCATTACGGG
CAATTTACTGATGTTACAATTGGTATTGCGTACGGCGGCGTTAGTACAAA
AAAACAAATTAGTGAATTGAAAGTGGGTGTTGATATATTAATTGCAACGC
CAGGAAGATTATTAGATCTGCTTAGAACTGAATCTGTCAGCCTATCCAAC
ATAGAAACATTAGTTTTCGATGAAGCAGATCGTATGTTAGATATGGGTTT
TAAAGAAGAAATAGATCAGATTACTCAATATCTACCAAAAACAAAGCAAA
CACTGCTCTTCTCAGCTACATTCGCGGATGATATTTACAAAATGAGTAAA
AACATTTTAGTTGAACCTAAAATGGTTGAGATTGATGAGAAAAACAAAGC
TGCTGATGATGTAGAGCAACTTGTCTATGGTGTTGATGCTGATCGCAAAC
GAGAACTAACTTCGTTTTTAATTGGATCAAGAAATTGGAAACAAGTTTTA
GTGTTCACTCGAACTAAGCAGTGCGCAGATGACCTAGCAAAAGAAATGAC
TAAAGATGGTGTTAAATCATTAGCTATTCATGGCGATAAATCTCAAGGCG
CACGTGAAAAAGCATTACATGAGTTTAAGGAAGGAAAAGTTCGCGCACTA
ATAGCAACCGACGTTGCTGCGCGTGGTATCGATATAAAAGGTTTATCACA
TGTGATTAACTATGAACTTCCTTATAACGCAGAGGATTATGTTCATCGTA
TAGGGCGTACTGCAAGAGCGGGTAATTCAGGATTAGCTGTTTCTCTGGTC
AGTCCTGGAGAAGAATGGTTACTAACAGCTATAGAAGAATTACTTGATAT
CCAGCTATTACAACAATGGTTACCAGGTTATGAGTTAGATTTGACGAAAA
TTGCTAATTCAAATAAAAGACCAATAAATAAAAAGAATGCACGCAAGGAT
GCACTATCCGCAGGTGATAAGTCTAAAGGGCACAGACCTAATACTAGAAA
TAGAAGACGATAG
>CPS_2616 hypothetical protein
ATGGCAGAACATGGCTATTCGCTGCTACGCATTATTATTATTGACAGTTT
TTGGCAAGGGCAAGTCAACGAACTTGATTTAACTGGCCACACTCAACTTG
AAGGCACTAACGGCGCAGGTAAAACTTCATTAATGCGTTTGTTGCCGCTT
TTTTACGGTATGCGACCGAGTGATATTGTCAGTAAAGTTGATCAGGCAAA
AAACTTTGCTGATTTTTACTTACCACGCGAATCCAGTATTTTAGTGTACG
AATATGCAAGACCATTTGGTCAGAAGTGCCAAGTATTAGCGACCAGCGAT
GGTAGAGGTGTGCATTTTAAATTTATTGATGGTGCATACGATAGTCAGCT
TTTTATTTCAAGTACTCAAGGTAGTAAGGCTAAGCCATTTACTATTAGTG
AAATAGAAAAAAATTACCGTAATATTGGTAAAGAAAGTTCAAAGTTTTTA
GGCATAGATAAATACCGTCAAGTTATACAAAATTTGCGCAGCGGCCGTAA
ACACAAAGAAATAAGAGTACTACAAAATCGCTTTTCTTTTAGTGAACAAG
CATGCCCGCATATTGATAAAGTGATCAACGGCACAATAGAAAAGAATCTT
GATTTTGAAGCCGTTAAACGTATGTTAGTGGCGATTGCTAGTGATCATCT
TGCCCGAAATACCAGCGATGAAAAAGAGCAACTCAGTTTAAATAAAGCCG
ATATTACTAACTGGCTTGCTGATATTCAGGCAAGTCGTGCTATTAAAAAA
GTGGCCGATAAAATTTCAGTTTGGCAAAATGATTTCAGTGCCTTTGCTAG
TTTAGTCAATAAGTTACAACATCTTCATGCTGAAACTTTAGCGCATCAAG
AGCGCCTTGAAGTAAAGCAGCAACAACGAGATGAGCTTAAAAGAAGTAGT
ATCGCAAACCGCAGTTCTCTTGAGTCTGAATTAGCTAATACCATTGAAAA
ATATCAAAAAGCAATATCCGATCTTAATGCCAAAATTGAAGCAGATTTAA
GTAAAATTGAATTACTCGATGATGACAAATTTAACTATGATGACGATGAC
GCCAGTAGTTATCAAATTAAGGCAGATCAAGCACCACAAATTCAAGCAGA
GCTGACTGAAGTTATTGCCGTTATTGATGCCTTTGAAGGTAACATCACTA
AAATAGGGCAAAAGTTTGATAAGCTGATTCAAAAAATTGAAGTAGAAAAA
CTTAAAGCTCTTAGTACAAATAAAGAAAGATCGGCTCAGATTACTAGCGA
ATCAAATGGTCAACTAGCGCATATCAATGAAGTTTTTCATCAACAAGAAC
AATCTCTTAATGCTCAACTCCATAAAGAAGAGTTGAAGTTACAAAAAGAT
CAGCAACATTTTCAGCATCAATTAAGCAGTGCTCAACAACAGTTAACACA
GCCTACAATACCACTAGAATTAACAACCGATATTGAAGAAAATGTTATAG
CATTCTCGCAGGCACAACAAAGTTATAATCAATTACTGCAGCAAGAATCA
GCGTTGCAAAAACAACAATATCAATTAGACAAACAACAAGATAAGCAATT
AACTCTTCGCAGTGAAGCGAATCGTTATCTTGAACAATTACGACAAGATT
ATCATCAAGTTGAATTGCAACTATTGCCGCAAGCTGACTCTTTACATCAT
TACTTGATCAACGAACCTCAAGCCGCTGATTGGCAAAAGACTATTGGTCG
TTTACTTACGACTGAACAACTTTCACGTACCGATTTAAACCCGCAGTGGT
TAGAGAGTATCAATGCTCCAGCAAGTCTTTATGGCTTATCGATAGACTTA
CAACAACTGCCTTGTGACGATTCTTTATTTTTAGACGAAGCGCAGCTACG
AGAAAAGCGCCAAGTAATAGAGACTAAGTTACAAACACAAACAGATAAAA
TTACTCAGCTTGATGAGCAGTTAAAGTCTTTAGCTAAAGAAATTAACCAG
CTAAAAGTAAGTGCTTCTGAGCATGCACAAAGTGTAAACCAGAAAAAATT
AACAATGGGCCAATTGCAAACGCAACAAGAAAGCCTGGTAGTTAAAAAAC
AGCTAGCCATTAAAGCGCATCGCCAAACGATTGAGACACAATTACAAATT
TTTAATCAACAATTGAAAGCACTAGAAAAAAAGCAGCATAGTTTTGAAGA
AAATAAAGCTGAACAATTACATGAATTGACTAATGATAAATTAGAAAAGT
GCATGGTAGTTGAAAGTGATAGAGATAATCAGTTAACGCTATTATCTGAG
CAGCTCGTCGCATTAATAACCAGTGCTAAACAACGTACCGCTGAACTTAA
AAAACAACAAACCAGTGATATTAAGCACCTTGATCCTGAGGGTGAAGTAG
ATAAAAGCATTGCCAAACGAGTGCAGTTAGAGAAAAACCTACAGCAATGT
TCTGTGTTTGCCCAAAAAGCACGCGACTATCAAAGTTTTATTAATGAACG
TTATTGTCACCGTGATGCCTTAGTTGAAGAAAACCAAAACAGAAAAATTA
TCAAGCGTAACCTAGAGTCTAATTTTGAAGACAGTAATATTGAGCTGACA
ACAAAAATTAATGACTTAAAACTGTTAATCAGAAAAAATAATCAAGAAAA
ACAAGCTACTGATGATTTACTCGTTCAGCTCAATGACAATAAACGTTTAT
GTGAAATGTCAGCGATTGAGAGTGAGCTATCTGAGCAAGAGCCGGCAAAC
CAAGCTGATTTAACCGTAAGTTTTTGTCATGACTTTTATCAGCAATTTAA
AACTATTGAAAAACGCTTAGCAACGCAACTAAATACCTTTAGTGAACGCT
TTAGGAAGGACCATTCTGGTAGTGAGCTATTTGATAACTGGCAAAAACTA
CTGCTTGATAACGATAGTTATTCAGGTGCAAAAGCATTATTCAAGTATCG
CGAGCCCATTAGCGAGTTATTAAATAGTGCCGAGCAGAAGCAACAAAGTA
CCTATCAACTGGTTACTGTTAATGCCACCATGATTAACGAGTTTTATCAG
CACATAGAAAACTTTGGTCGACGTATCAAGCAAATTGGTAAACGTTTATC
AACAAAAGTGACGGCATTAGCGCATTTTGAAGCCTTAGCTGATATCAGTG
TTACCACAGTAATGAAGCAAGAAGAGTTAGATTACTGGGGTCCTTTGCAA
AAATTTGCTGAAGTGTTTGAGTTATATAAAGACCAATTACGAGATGGTTT
AGGTGATGTACCTGATGACTTAGTGTTTGCTATGCAAAAATTGGCGAGTT
ACTTGCCCAACGAAGGGTTTGTTTTAGCACACAATAATTTGTTTGATTTA
GAATTTACTATTGTCGAAAAAGGCCAAGTAAAACACGCACGTAATGCTAA
GCAGCTTAAAAAAGTGAGTTCAACAGGATTATCTTACCTAGCTATGTTGT
CTTTATTTGCGGGTTTATTAGCGATGTTACGTGGTGACAGCAAACATGCT
AGCCAAATAATTTTACCGGTAGATGAGCTTGGTGAACTAGCAGCAGAAAA
TATTGATCTGTTATTACAAATGTTTAATGACAACCATATCAGTATGTTAT
CTGCATCTCCATCTACAGACCGCCATATATTGTCCTTGTATCACCGTCAT
TATAAGTTAAAAGATAACAAAATTTATCATGCTGATATTCCACAATCTCG
TTTAGATGAATTACTCGCGCAACGTAATCAAACAGTAACAAATGCACAAG
AAGATAAAGCAGGGGAGCCAACTAATGTTTAA
>CPS_2141 comE domain protein
ATGAATATTCAGCCAAAACACCTCAACAAAACCCTTTCAGTCTTAACTTT
AGGTATTATTTTACTTGTTAACTCTTCATTAGGTCTTGCTAAAGAAACTA
ATGTTACTCAGGCTGCACAAGGACAAAGTGCACAATCAGTAAAATCACAA
GTTGTTAACTTGAATAAATCAACCTTTGAACAGTTGGTGACATTAAAGGG
CGTCGGGAATACTAAAGCTCAAGCCATTATTGTTTATCGTCAACAAGTTG
GTGCCTTCAAATCGGTCAATGAGCTAACTAAGGTTAGTGGTATTGGTGAA
AAGATTGTGAGTGATAATAAGGCGAGGTTAAGTATTTAG
>CPS_2629 site-specific recombinase, phage integrase family
TTGGTTTTACAAATAATGTTATTAACTAAACCCGTTCCTTTATATCCACC
ATACATTGATTTGTGTGATTTCGACTTTGATGACTATCCTCAGTTAGATA
AAATATTCTCATCTAATGAACCCTGGTGGCTTGAACAATTTAACTGGGGA
AAGATTTTCCTTACCTACATTGGCAGAAATAAATCTGCACATACTTATGA
GCGCTTTAGAAATGACGTTGAACGTTTTCTTTTATGGTCATTCATTGTAA
AGAAAAAACCAATCGACCAATTACGTAAATCAGACTTATTAGAATATGCT
GACTTTTGTTGGCAGCCACCAGTTGATTGGATTGGCACATCTAATCAAGA
ACGTTTTAAAATAACCAATGGATATTCAGCTGCTAATGAACTTTGGTTTC
CATACAAGATTCAAGCACCTAAGAGCTTAAAGTCACAATTCGTCATTGAT
AAGAAAAAGTATCGTCCATCACAACAAACGCTTTCATCAATGTTTACCGC
CATTATCGTTTTTTATAATTACCTGATGGCTGAAGATTTTTGTATTGGTA
ACCCTGCACAAATAGCTAAAAAAGATTGTCGCCACTTTATCATCGACTCT
CAAGTTAAAGAAATCAAACGTTTAACCGGTAGCCAATGGCAATTCGTCTT
AGATACTGCTGTTGAAATGGCTGATGAAAATGCAATGTTTGAACGAAACT
TATTTGTAATAGCGTCCTTAAAAACCCTATTCTTAAGGATTTCAGAGCTA
TCCGAGCGTCCTAACTGGTCACCAACTATGGGGCATTTTTGGCAAGATGA
CGATGAAAACTGGTGGCTTAAAATCTTTGGCAAAAGCCGAAAATTACGTG
ATATTACGGTTCCTATCGACTTTTTACCCTTTTTAGAACGTTATCGTGCT
TCTCGTGGTTTATTAGGTTTACCCTCAAGCAATGAAAATTCTATTCTTGT
TGAAAAAGTCCGTGGTCAAGGCGGCATGACATCTCGACATTTACGACGTT
TAGTACAAAGTGTTTTCGACCAAGCACACGAAAATATGCGCAGATCAGAA
GGTGAAAACAAAGCACTAAAACTCAAAGAAGCTTCTGCCCATTGGTTAAG
GCACACCGGAGCTAGTATGGAAATTGAACGTGGGCGCCCTCTTAAAGATA
TTTCTGAAGATCTTGGTCATGCCAGTATGGCAACAACGGATACTGTTTAT
GTTCAGAGTGAAAACAAGAAACGTGCAGAAAGCGGTAAACGCAGAAAGGT
AGACTAG
>CPS_3595 MutT/nudix family protein
ATGACATTAGCGTATGGCAATATGCCGTTAGATAGAGGGACTAATCAACG
AAAAAATAAGCGCTGGTTAGCTACAGAATTTACCCGTGAAGATACTTTAT
TTTGCGTTATTAATGATGGTCAATGTCTCTTTGAAGAAGGCGATATTCTT
TCGCCAATTTATCTTAGCAAGTCACAAGTGCCCACGGTAAGTGTTGATAG
TTGCATTTATTTAGGTAAAGGGCACTTAAGCAAGAGAAAACTTGGTCTCG
AAAGCATAGAAAATGACCGTTTAACTATTACTATTACCGGTAATAGTAAT
AGTATCCAGGCATCAGCTATTGCAATTTTTGCTATCGATTTTGATAAATT
ACGCTTTTCTACACAAGAAATATTAGGTGAAATGGGCCAATGGCAAGGGC
TTAGAAAAGTGACGGCCAGTTTATCAGCCATTGATGCTTCAATATTAGCG
TTAGCCAAAGGTTTGGTGCATTGGCATATAAGCCATCAATTTTGTGGTCA
ATGTGGGCATGCAAATCGTTCAGTTGAAGCTGGACACGCGAGGCGTTGCT
CAGATTGTCGAAATATGAGCTTTCCACGTACCGATCCTGCAGTGATCATG
TTGGTAGAAAAAATGTTTGCCGATGGTATTCCACGTTGTTTATTAGGTAG
GCAAGCTAGCTGGGCTGAGGGAATGTATTCAACGCTAGCCGGTTTTGTTG
ACCCTGGTGAAACGCTCGAGCAAGCGGTCATTAGAGAAGTTGTTGAAGAA
ACGGCGATACATGTTGAAAAGCCACACTATATTACCTCACAGCCTTGGCC
ATTTCCTGCCTCGATAATGTTGGGATTTACCGCCGTTGCGACTTCAGAAA
AAATTGATATTAGCCAAGATGATTTAGAAGATGCCCAGTGGTTTTCACGC
GAGCAACTTGTCAATTTTGGCATTAATAATTCAGTTATAGCAGAGGACGG
TGGCGCTGAGAAACCACAATATAAAATGAGTAGTGGTGATTCGATTTCGT
CTTATTTGGTCACGGCATGGAAGAATAAGGAAATAGGGCAGTATTAG
>CPS_0354 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGGCATCAGTAACAATTGATAAACGCCAAAAGGCAAACGGAGATTTCAG
CTATCGATGTACAGTTCGAGTAAAAAAGAATGGTGCGATTATACATAGGG
AATCCAGAACATTCAGTAAAAAAGAATTAGCGAATACTTGGGGAAGAATC
AGAAAAGACGATATTGAGCTAAACAGTATTATTCTTCAAGAAAAGAAAAT
TTCAATTGCTGAATTGATAGACCTATATATCAACGATGCCGATTTATGGG
GAAACACTGGAAGAACTAAACGATACGTAATCGATATGTTACGGGATTCT
CCTATTGCATCAGTTTTAGCAAATGAGCTTAAAACTAGTGATTTAATAAG
CCACTGCAGAATGCGTCGGGATGCAGGGGCTGGAGGTGCGACTGTTTATC
ATGATATTGCATATTTACGAAGCATAATGAAGAAAGCTCTTCCCGTTTTT
GATGTAAAAGCAAATTGGAAAATATTTGAAGATGCAGTTCCTGTATTAAT
TGACATGAAGCTTGTTGGCAAGAGCCAAAAGCGTACACGCAGACCCACAG
AAAATGAATTGGAAAGGCTTATAGAAGCACTAACAGAAAGACAGAAGCAA
CAAAGTAGTAAAATCCCCTTTGTTGATATTCTTAATTTTTCCATACTGAC
ATGTATGAGAATAGGTGAAGTCTGTAAAATTAAATGGGAAGATTTAAATC
ATGAACACAAAACGGTAATTGTAAGAGACAGAAAAGACCCAAGGAAGAAA
GAGGGTAACCATATGATCGTGCCGTTATTAGCTGGTTCATACGACATAGT
GAAAAAGCAATTAGAAACAGATGAGAGAATCTTTCCTTATGCCTCTGCCT
CCGTATCAGCAGGGTTTCAGCGTGTTAGAAATACTTTAGGCATAACTGAC
TTAAGATATCATGACTTAAGACGAGAGGGCGCATCTAGGCTGTTTGAAAA
AGGTTATAGCATTGAAGAAGTGGCACAAGTCACAGGACATAGAAATTTGA
ATATACTTTGGCAAGTATATACGCAGTTATTCCCTCATAAACTGCATGAT
AAATTTGCCGAAGAATAA
>CPS_2408 conserved domain protein
ATGTGCATCCATGATTTTATCTACAAACTGATTTACTCCAAAAGGCAACT
TGAATTATTCAAGCAATGGGATAATCAAGATCCAATTTCTGCACAAGAAA
GGGCACATAACTTGCGAGTTATTAAAGCGCAAGGCTTTGGACTAAATCAA
TAA
>CPS_2355 site-specific recombinase, phage integrase family
GTGACTCAACAACGCAAAGCTGAAGAAAAATGGATGCCACCTCGGGTTTA
TAAAACAAAAGTGGCATATGTATTTCAACCAAAATCTGGCGGGAAAATTC
GTTTGTGTGGATTGGACGTTGCTAAGTCGCTTGTTTGGATGTTATACGAA
AAAGAATGTGCATCATTGGATAATTTCAATTCGGTTGCTAGTTTGTTTGA
AAAGTTCTTTCTCAGCGCATCATTCATCGACAAAGCACCCCGTACTCAAA
AGGATTATCTAGGTTACAAAAAGGATTTGTTGATAGCTTTTGGCAAGATG
GACATCAACAAGGTTGAACCTAAGCATGTACGCATGTTCATGGATAAGAA
AGCTGTTAAGTCTGGGATTAGTCAAGCAAACCGTCACAAATCTGCATTAC
AATCCATATTTTCATGGGCGTATGAACGCGGAAAAATAAAGGTGAATCCT
TGTGTCGGTGTAAAGAAGTTTACCGAAAAAGCGCGTGACCGTTACGTCAC
AGATGTAGAATATCAAGCGTTGCTAAATCACGCTTGTCCCGTCATCTATG
CCGCTGCTGAAATATCTTACCTTTGTATGGCTAGGCGTGGTGACGTTGAG
AGATTACGAAAAGAACAACTTATTGCTGACGGTATTTATATCAAACAAGG
TAAAACTGGCAAGAAACAAATAAAAGAATGGTCTCCACGTCTCAAAAAAG
CTATTTCTCACGCAAACAAAGTGAACCCATCAATTAGTTCAATGTATGTC
ATTCATCAGTTTAACGGTTCAGGTTATGGTACTAATGGTTTTCGTGATCG
TTGGGTATCAACGATGGAACGCGCAAGAAAATCAACTGGTTATTTAATGG
ATTTCACCTTTCACGATCTAAAAGCCAAAGGGATAAGCGATTTTGAAGGC
AATTTAGAAGAAAAAAGAAACGCTGCTGGCCATACAACTATAAAACAAAC
TGCTGATTACGACAGAAAAACTCACATTGTTCCCACTGTCAAAAGTCGAA
ATTAG
>CPS_4955 exonuclase
ATGTTCGGCTGGTTACTTGGGTATGAAGCCAAGCGTAAGCAGTTGTTGAA
AAAGGCGCCTGAAGGCGCATTACGAGATTATTTATCCGTACCTTTACCTG
ATATAAATACCCGCATTGATAAGGTAGAAATCTTAGCGGTCGATTTCGAA
ACAACCGGCCTTAATGCCAAACAAGACAAGCTACTGAGTGTTGGTTTTCT
CACACTGAAAAAACAGCAAATGTCACTCAAAACAAGCTATCACCAAATCA
TCAAAACTAAAGCACAACTTGAAGAAAGTAATGTCATTATTCATCACATT
ACCGACAGCCAAAAAGAACAGGGACAAGCATTAGCGATAGTGGTTGAAGC
ATTATTAAAAGCTTTAGCGGGTAAAGTAATGCTGGTACATTTTGCCCGTA
TTGAAAGACAGTTTTTGGCTGAAGCTTGTTATGAGTTATATGGCATGGCA
CCGATTTTTCCCATGATAGATACCCTTGCACTGGCTAAACGTCGTTTAGA
TAAACGTGATGTGGCCTATGATCCATCAGAATTACGTCTGACTAACTTAC
GCAATAATTTTCAGCTACCCGAACACCATGCCCATAATGCATTAAATGAC
GCGATTGCTACCGCTGAATTATTTATGGCACAAATGAGCAAAGCCAATAA
AGACGGTAAAACAACACTTAAAGATGTTTTATTGTAA
>CPS_1289 ISCps2, transposase orfB
ATGATGTGTGCTCTATTGGATATTTCACGTAGTGGTTATTACGCCTGGCT
AAGTCGGCCACTATGTAAAACCAAGCAAGAGAATATTCAGTTAACAGAGC
AGATATCAAAAGTATTTGAGCAAAGCAGATGTGTATATGGAGCTCCAAGA
ATCAGGGCTGCGCTTAACGCTGACGGGCAAGCTTGTGGTAAAAACAGAGT
GGCTAGGTTAATGCGTGTTTTGCAATTAAAAGGCCGTCCTAAGCGTGTAT
TTAGACGTTCAGCTAAGTCTAATCCATACGTTGAGCCTGCGCCAAATTTG
CTACACCAAAACTTTGTTTCAAAGGCGGTAAATCAAGTTTGGTCATCAGA
CATAACTTATATACAAACGAAACAAGGTTTTGTTTATTTAGCCGTCGTAA
TGGACTTGTACTCACGTAAAATTATTGGGTGGTCAATGGATAAAAACATG
GGCCGTCACATTGCAATGAACGCGTTAGGCATGGCTGTGGCAGCAAGAAA
TCCGAGTGATGGCCTCATCATTCATTCTGATAGAGGATCTCAATACATCA
GCGATGACTATCAGCAGATGTTAAACGAAAATGGCATCCTATGCAGCATG
AGCGCTAGAGGAAACTGCTATGACAATGCTGTTGTAGAAAGTTTTTTCGG
GTCACTTAAAAGAGAACGGATTCGTCGGTACAACTACAGAACAAGACAAG
AAGCGCAAATAGATGTGTTTGATTATATTGAATGCTTCTATAATAAAAGG
AGGCTTCACAGCTATCTAAAGTATAAAAACCCTTCGGACTTTGAAGCTGA
AGGAAATATTCTTAATTAG
>CPS_2955 hypothetical protein
ATGAATATCTTAGACTGCTTCTCAGGCAAGCAACTTACTCAAGGACAACA
TGATTTAGTAGAAGAATTAGACCAGTTTTTATTTGATGATACTCGTTCAG
TTTTTTTATTAAAAGGCTGGGCAGGTGTGGGCAAAACATTTATTACTGCC
GGAATCACTAAGTACTTGAATACAGAGGGGCGGCAATTTGTTCTAATGGC
TCCAACAGGTAAAGCAGCAAAAGTTATTGCTAATAAAACAAAGCAAAAAG
CACTAACTATTCATCGAGTTATTTACAGTTATTTTGATGTTAACAACAGC
AACGAAAATAAAGACAAGTTAGAACCTCCAATAGTAGCCTCAAAAATAAA
AGAAAATAAAGATGCGCCTGATACTGTTTATATTATTGATGAATCATCAA
TGATATCAGACAAGTTTAACAAATCAGAAGCATGCTCGTATGGCTCGGGT
TATCTTCTTATTGATTTACTTGAATATATCAACCTAGATAAAAGGCATAA
AAAGAAAGTTATCTTTATTGGTGATAATGCTCAGTTGCCACCTGTGCGTG
ATAATTTCTCTCCAGCTTTGGATAACCAGTACCTTAGAGATAAATATCAA
TTAAATTGCCAAGCATTTGAGTTAAAAGAGGTAGTGCGGCAAAAAGCGGG
TAGCGGCGTTATAGCGATTGCAAAACAGTTAAGGCATACCATAGGCAGTA
ACACCTTCAGCGAACTGTCTTTTGATGTGAGTGCTGGTGATACTCATGTA
TTAACAATAAATGAAATGCTAGAAGAATACTTTCGGGTTTGCGAGGAGAG
AGTTGAAAAAACGAAAGAAGTTATCATCATTGCTTATTCTAATATACAGG
TAAGAAATTACAATAATACTATTAGAGCAAAACTTTTTAGCCCTGATGCT
CCATTACAAATTGGAGAAAAAATCATGTGCGTTTCAAACTTTATCCATGA
TGATAGTTTTATTTCAAATGGTGAGTTTGGCAAAGTAATTAATATTTCGT
CGAATATAGAAATTAGGACGGCTGAAGTCTACACCGAAAGGCATGGTAGG
CGTGTGCTGAAGTATGTTGATTTAGTCTTTTTAGATGTTGAAATCGAATT
TCTAGATGACCACGGTAAACCTTTCATCTTAGCCAGTAAAATACTATCAA
ATTTATTATATGGGGCCATGCCTCGCTTAAGCCAGCTAGAATATAAAGCG
TTATATGCAGATTTTTTTCAAAGAAACCCCAATATCAACTATAACACCTC
TCCTGCAGAGTGTAAGGAGCTTATGAATAAAGACCCTTATCTTAATATTA
TTCAAATAAAATTTGGCTATTCAATCACTTGCCATAAAGCGCAAGGGAGT
GAGTGGGCTCATGTGTTTGTTGATAGATACCATAGGCTCCCTAAATCAAA
TGAATGCCTTAGATGGTTGTATACGGCCGTTACCCGAACATCAAAAAACT
TGTATGTGAGCAAGTAA
>CPS_0188 putative helicase
ATGAACGCAATACCAAATGTAACCATTAGGGTAACCAAAGTCCTGGCTAC
CTACAATAGCGGTAAAATGCGCTTCAGCGGAGTGCCCGTTTGTCCCAATA
CGCATCAAAAACTCAGTAAACGTGACTTTTACCTCATAACAGCCACACCA
GAACAAGCTGTATTTGAACCAGAAATTGGGCAAGTTTGGAAAATTAATGG
AGAAGCATACACAGAAGAAAAACCAAGTTATAAAAAGCATGGAGTAGACC
TTTTTCACGAAATAAGAAGAGCAAAACAATGTGTTTGTGTGTTGCCTAAA
ACAGAAGATGCTTTTATTGCATTCATTAAAGAAATAGCTGCATTCAAAGG
AGTGGGGGCAAAGTGGGCTAAAAAGCTATGGACTGAATTTAAGCTTGAAA
CTCTTAAACACATGGAGCATAGACGCGCTGCTACCCTTGAAACTGTTGTA
ACCCCAAATATTGCGAAATCGCTAATTAATGGCTATTCAAAGTACAGAAA
TTTAAAATACGCAACATGGCTAACGTCTAAAGAAATCCCCATTAAAATTC
AAAAGATGATTTTCGAATTCCAGCCGATTTCAAATGAAATAAGAATCCAC
CAAAGCGGCTATAAATACGCAATTGACCCTCGCACTATAATTGAAGAAAA
TCCGTATATTCTAGCTAGCTCTTTTTCCATGGGATTTTTTGACGTTGATA
AGTTAGTGCGCCGAAAGTTTGAACCAAACATACTCTCGGAAGACCCTAGA
AGAATGATTGCAGCTGTGAGCGAAGCTATCCGATTATGTGTAAAAGGAGA
TTATGAAACAGGAGGCCATACAACCGTTCCATACAAAAAACTACTGAAAG
CATTGACAGAAATTCTACAAGAAACAGAGCAACTTGCTTCGATTGATAAG
TCATACACCAAGCCATTATTCACGATGGAAGAGCTAGCTATTACTGCGCT
CCAGGCACATCAGAAAGATGCTTATGTTATCTACCCTGACGGTCAGTATC
AGCTTACTCCAACCTACTTAATGGAGAATGTCATTGCGCTGCGCATGCTG
AACATGAAGTCACAAATAGTGACCTTTGGTGAAGAAGAAAGTGAGGCATG
TAAAAAAGCATTCGATCTTTCACCTTTCCCATTGCTGTCTAAGCAAAAAG
AAGCGGTATTTACCGCTATTGAAAGCAGTATCAGCGCAATCATTGGGGGC
GCAGGCACAGGTAAAACTACCGTTCTACATGCCGTTTTAACTGCATTTGA
GGCGCTTGGGTATGTCTCAGATGCCAGCTTATGCCCAGATAAAACGACGA
CCAATCACAACATAAAAACAATGGCTTTAAGTTGTCGCGCAGCTAAACGT
ATGCGCGACTGCATCAATAAATCAAGCGATGGTTCTAGGCGAGAGCGACA
AATAAGCGCAACCAGTATTGCCCAATTTATACATCAAACTGTCATTGAAG
ACGCAGAAGGTAAATACCTTGTAGTCATTGATGAAGCAAGCATGTTGGAT
GTTGCAACAATGTATAACATCATCACAAATATCCACCCAAACGTGCGAAT
TTTATTAGTTGGAGACCATTATCAATTACCTCCAATTGGTGGTGGAAACG
TTTTGGCAGACGTGGTTAATTCGGGGGTTATCCCTACCGTAGAGCTTGAT
ATTGTCAAACGACAAAAAGGGAACTCGGGAATCCCAGAATATTCTAAATT
TGTGCGAGAAGGGACTGTACCACCTAAATTGTCAAGTGGCGCAGTCTACT
TTCATGAGGTTGAGAGCGATTTTATAGCTGACAAATGCGCAAGCTTGTTT
GCCCTTTCGCCCTTGGATAGCATGGTTGTTGGCTCTACCAATGCCGTGGT
AAAAGAAGTGAATAAGTTTTGCCAAGACGAGGTAAATCCTGATGGAGAAC
GCTATGCAGAAGGTAAACACTCCGATTTCATAAAGATTGTACTTGGGGGG
CTACGCCAAGGTGACTCTGTTTTGTTTAAAGAGAACATTTCGCTCGATGT
GACGAACGGCTCCTTAGGTAAATTAGTCTCAGTCGAATGTAAAAAAGACA
CTTTTGGCCTTGTGGTAATGGATGATGATGACATTGAAGTTCGCCTAGAA
GAAGAAATAATGCCAGCACTTATGCTTGGATACAGTATGACCGTTCACAA
AGCGCAAGGGTCTCAATTCCCAATTGTCATCATCGCCTTGGCAGGGGGTT
ATATAGATAGATCATGGCTCTACACTGCAATAACTCGTGCCGAATGTGAG
CTACACATAGTGAGTACAAAAAAGAAATTACTGACAGCAATTAATAAACC
ACCAAGTGCTTTGGGTCGAAGAACAAGGTTAAAAATGTTGCTACAAGAAG
GGGCAGATCAAATTTAA
>CPS_4237 RecQ domain protein
ATGAATAACCCACAAGATTACTCTCATAAAGAATGTCTTAAAGCATCACT
TCTCGAGACCTTTGGCTTCGATGGCTTTCGCCCCGGGCAAGAGCAGACCA
TTACGCAATTGCTTAAAGGCCAATCAAGTTTGTCTATATTCCCGACAGGC
TCGGGTAAGTCGTTATGTTATCAGTTAACTGCACTGCATTTACCGCATTT
AACCTTAGTGGTATCGCCTTTATTAGCTTTGATGAAAGATCAATTGTCGT
TTCTTGCAAGCAAAGGTATTAAGGCGGCAAGTATTGATTCGACCTTAAAA
GGCAACGAAGCACAAACCGTCATGGCAGGTGTGCGCGATGGCGATATTAA
AGTATTAATGGTGTCAGTTGAGCGTTTTAAGAATGAACGCTTTAGACAGT
TTATTGAATCTGTACCTGTTTCTATGCTGGTGGTTGATGAAGCGCATTGT
ATTTCTGAGTGGGGGCATAATTTTAGACCCGATTATTTAAAGCTACCGAG
TTATTGCCAAGCGTTGAATATTTCATTAGTGTTGTTACTTACCGCGACGG
CAACGCGTAAAGTAAAACAAGATATGGCAGCTAAGTTTGCTATTCGAGAT
GAACATATTGTGCAAACAGGCTTTTATCGATCTAACCTTGATTTAAGTGT
GCTACCTGTTACGCAAGCGCATAAAAACAAGCAACTTGAGCAAATCATTT
CTGCTCAACAAGGTGCTGGTATTGTTTATGTTACCTTGCAACATTCAGCT
GAAACAGTCGCGCAATATTTAAAACAGCAAGGCATCAATGCTTGTGCTTA
CCATGCTGGTTTTGACAGTGATACGCGCAGTCAAATTCAACAAGACTTTA
TGGCAGGTAAAATACAGGTTATTGTCGCGACTATTGCCTTTGGTATGGGC
ATTGATAAAAGTAATATACGTTTTGTTATTCATTATGACTTGCCAAAGTC
TATAGAAAACTACAGCCAAGAAATAGGACGAGCAGGGCGAGATGGGCTGC
CTTCGCAGTGTTTTACCTTAGCTAATCTTGATGGCTTAAATACCGTTGAA
AACTTTGTTTACGGAGATACACCTGAGTTTACCGGCATTGAAATGTTATT
AAATACAATAAAATCAGAGGTAATAACAAGCACTCACGTAGGCATAAGTG
ACAATCGGTCTGAAGGAAAGTGGGAGTTACAAATATTGCAGTTGTCTAAT
GCTGTTAATATTAAACAACTTCCGCTAAAAACCCTATTAGTACAGTTAGA
GTTAGCGGGCGTGATTGAACCACTTTATGCTTACTTTGCTGACTTTAAAA
TTAAACTATTAAAACCTAAAGCTGAAATTATCAATAGTTTTAATGATCAA
CGTAAAGACTTTTTACAACGTATCTTTAATGCTACAGACTTTAAAAAAGT
CTGGGGTAGTTTGAATTTTGATACTTTACTGCAAGATCAAAGTATTGAAC
GTAATCGTGTTATAGCCGCTCTTGAATACCTACAAGAACAACAATTGATA
GTGCTTGAAACTAAAGGTATGACTGAGGTATTTAATATAAAGCTGAATGA
ATTGGCAGATCCTAGTTTGTGCCAAACACTCAGTAATTATTTTAAAGATA
ATGAAGAAAAAGAAATTAAACGTATCGCCACTTTAGTACGTTTTTTCCAG
CTCGATACTTGTTTAACGGTAAATTTGGCGCGCTACTTTGATGATACTAG
TTTCGATGATAAAAGGTTTGACGGTAATAGCTCCGATAATAATAGTCTCG
ATTCAGCTCGCAATTCAGGAACAGTCCCACAATGTGGTCACTGTAGTGTT
TGTCGTGGTCAAGTGGCAGTACTTGAGCATTCTCAAGCTCAGATCCCATG
GCCGAGTGATGAAGCCTTAAAGCAGGGCATGACGGAATTGGCTGAACGAC
TTAGCGGAAAAATAAATCAGCCATTATCGATTGAAAGTTTTTGCCGATTT
TTTGCTGGTATGTCAGTGCCATTGTTTGGTCGCAATAAAGTAAGACAATT
ATCTGGCTTTGGCGTGTGCGAACAGCAACGATACCAAGCTATACTTGAAA
AACTGGCCAGTTTAAGCAAGTAA
>CPS_1125 ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family
ATGAGTGATACCCCAACCAAGTTTACTGATTTAGGCTTATCAGAAGCATT
ACTAAAAGCAGTACGTGATAAGGGCTATGAAACACCTTCTCCTATTCAAG
CCCAAGCGATCCCAGCAGTTATTTCTGGTCGTGATGTCATGGCAGCCGCA
CAAACAGGTACGGGTAAAACGGCAGGGTTTACTTTGCCATTATTACAGCG
CCTTTCTAGCAGTAAAGGTAACAAGGTTTCATCTAACAACGTAAGAGCGC
TAATATTAACGCCTACTCGCGAGTTAGCTGCACAAATAAGCGAGAGCATT
GAGGTTTACGGTAAGTATTTAAACTTACACTCAATGGTTGTTTTTGGTGG
TGTTAAAATTAATCCACAAATAGCGCGTCTTCGCCAGGGTGTTGATGTAC
TTGTGGCAACACCAGGTCGTCTATTAGATTTATACAATCAAAGAGCAGTT
AAGTTTAGCCAACTTGAAGTCTTTATTCTTGATGAAGCTGATCGTATGTT
AGATATGGGCTTTATTCGCGATATTAAAAAGTTGATGACAGCTTTGCCAA
AAGACCGTCAAAACTTACTATTCTCAGCAACATTTTCACCTGAGATACGT
GCATTAGCTAAAGGCATGGTAAATAACCCATTAGAAATTTCAGTTGATGC
AGAAAATAGCACAGCAGAAAAAGTGACTCAATGGTTAACTGCGGTTGATA
AAAAACGCAAACCTGCTGTATTAACGCACTTAATAAAAGAAAATAATTGG
CAACAAGTCTTAGTTTTTACTAAAACCAAACATGGTGCTAATAAGCTAAC
AAAGCATCTTGAAGCTGAAGGGCTAACTGCGGCGGCTATTCATGGTAATA
AAAGCCAAGGAGCGCGTACTAAAGCACTTGCTGCCTTTAAAGATGGTTCA
GTGAAAATATTAGTAGCAACTGATATTGCAGCACGTGGTATTGATATTGA
TTTGTTACCACAAGTGGTTAATTTCGACCTACCTAATGTACCTGAGGATT
ATGTTCATCGTATTGGTAGAACAGCCCGTGCAGGTAATACCGGACAAGCA
TTATCTCTAGTGTGTGCCGATGAATTAGATTTATTGTGGGGCATTGAACA
TGTTATTCAGCAGCACATCGAACGAAAAGTGATTGAGAAGTTTATACCCG
CTAATGAATTAGGCGAATCACGTGTTATCAAACCTTTAAAACAAGGTAAA
CCACCAAAATCAGCAAAACCTCATGGGGCAGGTAAGGGCAGAGTTGAGCA
CAAAGATGGTCAACGTTCAGGTCGTAATGCTAACGGGAACAATGCAGGTG
GAAATAAAGCAAAACCGGGCAATGATTCTTCTAGACGTAAAAAACCTGAA
TACGATGGTACTGGTCCTAAACCACGTAGAGCTATACGCCCTACAAAATA
A
>CPS_2634 extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein
ATGAAGACTCGTAAGGTAGTGCCAAGTCTATTTTTTGGCAAAAATAAATT
AAAATTAAACTCGATTGCACTTTGTGTTGCTTCAAGCTTTGTTAGCTACA
GTGCTTTAAGTGCTGAAACACTGTGGTCTGAAGACTTTTCTGACCCAGCA
TTAACCAATAAAGGAGCAGTTTATGAAACCATCGATATGGACGGTGTTAC
TCGCTGGTCTATTGATGTTACTAATGCACAATTAACAGCAAACAGTGATT
GGTTTAAAGTCACGAATAATAAAGTCGAAGCAAGAGATGTAGATGGCAGT
GTAGATTGGCTATCGGAGAAAATTGATATTCAAGGCAAGCAGAATATTAA
CATTTCTGTGTTAGCAGAAGAAAGTGGCACCCTTGAATCAGCTGATTTTT
TTGATCTTTCCTATTCAATAGATGATGCGCCTTTTGTTAAGGTAGAAAAC
TGGCAAGGTAAAGGCAGCAGTAGTCACACATTGATTGATGACTTTACGTC
TGCAGCCATAACACAAAGCATTGCAGAAGGAAGTACGCTTCAAATTAAAG
CTTCTATGGCAAACAACTCTGGCTCTGAATATATTCGTTTGGATAACGTA
CTCGTTACTTCTGGTGTTGAAGATGGAGGAGGTGATAGTAGTCAAGGTCC
AGTCACAGATGCTTGTTATAATTGCCCAGACTTAAGCACGATAGAAAGTG
CAGAAGACTTTGTTGATGCTACCTATTATGCCGCTGTGTTTAACGCCATT
GATTCTGTACAAAGTACCGAGGTTATTCGAACCAACATCAATGAAGTCAT
CTCAGCAAATCATAAGCAGTTAACCTATTCAGAAGCATGGACAGCATTAA
CTGTTACTGATGAAGACCCGATGAACCCTGATAATGTTATCTTATTTTAT
CGTGGTATTTCTAAAGCAAAAAATTCCAATGGTAGTGGTTCACAATCGAC
CAACCCTGATAACTGGAACCGTGAACATGTTTGGGCAAAAAGCCACGGCT
TCCCAAGTTCAAGTGCTATGGCTTATTCAGATATTCACCACTTAAGACCG
ACGGATATATCCGTTAACTCTTCAAGAGGTAACTTAGATTTTGATAATAG
TGATGCACCTTTACCAGAAGCTCCAGATAATCGCGTAGACGGAAATTCAT
TTGAACCAAGAGATGCTGTAAAAGGCGATGTTGCTCGTATCGTTTTATAT
ATGGATACTCGTTATGCCGGATTAGATTCTGTAACACCCGACCTACAAGT
TGTCGATACCTTAACCTCTGGTGGTGAAGCCAAATTAGGTAAGTTATGTA
CTTTGTTAGCGTGGAGTGAAGAAGATCCGGTTGATGAGTTTGAAATTAAT
CGAAATAATAAAATTTATGAGTTTCAAGGAAATCGTAATCCATTTATTGA
TCACCCAGAATGGATTTCAACGCTATATAGCGCATCATGTTCAGAGGTTG
ATCCGGTCGACCCCGTTGATCCAGTAGATCCTCCTGCAACGGGAGTTGAT
TTGTTTTTCTCTGAATATGTTGAAGGTTCTAGCTTTAATAAAGCAATAGA
GATTTATAACCCAACAAACAGTGCAATATCATTGGCGGATTATCAATTCA
AGCTTTATTCAAATGGAAGTCTTACCGCTACTGGTACCTATACATTAACG
GGTGAGATACTTGCTAATGATGTGGTGGTACTTGGCTCTAGTCAAATTGC
AGATGATAGTTTATTAGTACCATTTATCGACCATTTTGTAAGTGCTGTTA
ATTTTAATGGTGATGATTATGTAGAGCTCGTACATGGCGATACGATTATC
GATAATATTGGTACTTATGGTGTGAGAGAAAATTGGGGTAAAGATACTTC
ATTACTACGTTTATCTTCAATAACATCAGGTGATACCGACCGAATGGATG
AATTTATTAAAGCAGATCAGTGGCAGTCAAATCCTAAAGATACTTTTGAA
AATTTGGGCTCACATCTCGCTGATACTTCTCCGACAGATCCTGGTACAGG
TGAAGATCCTGTTATTGGAATGTGTGGTGATGAAGCTGACAAAATTAATG
TAATTCAAGGCAGTAGCAATGACTCAACCGTTATTGGTGAAGTTAAAGTT
ATTGAAGGCTCTGTTACGTCAGCCGTGCCAAGCTTAAAAGGGTATTTTGT
ACAAGAAGAAGCAGACGATACTGATGCTGATTTGATGACCTCTGAAGCAA
TATTTGTTTACTTTAATAACATTGCTAACTTCCCCACAGAGGGCAATAAA
ATAAGAATACTTGGTACCATCAAAGAGAGTTTTGGCCGTACCCAATTGAC
GGCGACAACAGACTTTATTGATTGTGGTGTTGGTGAATCAATTGAGCCTA
CAATGGTGTCTTTACCGGTTTCAAGTATCGATTACTGGGAAACTATCGAA
GGCATGTCAGTGAGCTTTAACGATACTTTGAAAGTTAGTGATACTTATAA
TCTGGCTCGTTATGGTCAGCTAACGCTGTCTAATGGACGCTTGATATTGC
CTACCAATATTTATAACGCAGGTAGCGAGCAAGCTATTGATTTAGCGGAT
AAAAACAGCCGAAATAGAATCACATTAGATGATATGAACAACGCGCAAAA
CCCTGACAATGTACCATTTCCAGCACCTGGATTGAGTCATGAAAATACTT
TACGTTTGGGCGATTCTGTTACGGGTTTAACTGGTGTCATTGATTATAGT
TTCAATCAATATCGTGTGTTGCCAACAACGACACCACTATTTAGTACGAC
AAATGTGAGAACAACACAACCTGATCTCAATGAAAGTGGCTCCTTAAAAG
TAGCAAGCTTTAACGTTTTAAATTACTTCAATGGAGACGGTGCTGGTCAA
GGTTTCCCTACTGCGCGCGGTGCAGATACGCTTGAAGAATTTACCCGTCA
AAGCAGTAAAATTGTGTCTGCACTAAAAGAAATTAATGCAGATATTGTTG
GACTGATGGAGTTAGAAAACGATGGTTTTGACAGCAATTCTGCCATAGCA
GATCTTGTTAAACAGCTAAATAGTCAAGTAGGAGAAGGGACATATAACTA
CGTTAGTCTCGACCAAACAGGTGTTGGTGGCGATGCCATTGCAGTAGGAA
TTATTTATAAACCCGCTACTGTCGGAATAGTGGGTAATGCTGTTACTACT
AATCAAAGCCCATTTGATTTTGGTAACCGTCAACCGCTGGTTCAAACCTT
CAAAGAAATAGCGTCGAATGAAGAGCTAACCATTGCGGTTAATCACTTTA
AGTCGAAAGGAAGTTGTGGCAGTGCCTCTGGCAATAATCTTGATCAAGGA
GACGGTCAAGGATGTTGGAATGAGTTGAGAACACAAGCAGCCAATGGCTT
AACGGCTTGGTTAAACACAAAACCTACGGGCACTAGCGATGATGATTTCT
TAATTATTGGTGATTTGAATGCTTACGGTAAAGAAGATCCAATTAATGCG
ATTACCAACAGTAATTATCATAATTTAGTTGCTGACTATATGGGAAGTAC
TGGTTATTCGTATAGTTTTGGTGGTGAAATTGGTTATTTAGACCATGCCC
TTGCAAGCGATAAGTTAGCTAGTCAAGTAGTAGATACTACCGTATGGCAT
ATCAATGCTGATGAGCCTCGTATATTTGATTACAACACCGAATATAAATC
ATCAGAACAACTTTCAACTTACTTTGCTGAAGATGCGTATCGAGCATCAG
ACCATGATCCTGTCATTGTTGTGCTGAATCTACTCAGTGAAGCAGAACTT
ATCGGTGATTTTGATGGCGATGCAGACATAGATCGCAATGATGTGACTCA
ATTTTCTATGATGGTTCGCCGTGGTGAAACAGGTGATATTCAACATGACT
TTAATAACGATAGTGTCGTTAACAGTCTAGATGTTAGAGCATTAATGTCT
TTATGTACTCGTTCGCGTTGTGCGACAGAATAA
>CPS_0149 leucine-rich repeat protein
TTGTACACTAGCGCCGTTTTTAATCATATCTACGGACGCTTTATGTTGCA
TACGCTTTCTCAACTTCGCTCTGGCGAACTCGCCGGCATTAGCCAATTAA
AATTATCTGAAAATCTAAACACATTCCCATTAGAAATTTTAACGTTAGCA
GACAGCTTAGAAATCCTAGATTTATCTAATAATGCCTTATCATCACTACC
TGATGAGTTAGCACAATTGACAAAATTAAAGATTATTTTCGCTTCACAGA
ATCAATTTGAACACTTGCCAGAAGTCTTAGGACAGTTACCAAACCTTGAG
ATGGTTGGCTTTAAATCGAACCAAATAAAACAAGTGGCGGAGCATTCATT
ACCTGCTCAATTACGTTGGTTAATTTTAACGGATAACTTAATTGAAACAT
TACCAAATAGTTTAGGTGAGCGACCAAGGTTACAAAAATTAGCCTTGGCG
GGTAACCAATTAACGCATTTACCGCAAACATTAGCGCAAGCCCATAATTT
GGAACTCGTACGTATTTCTGCAAATAAACTAACAGAATGCCCTGAACAAT
TATTGAACCTGCCGAATTTGGCCTGGTTTGCCTTTGCTGGTAACCCTTTT
ACCGCAGTTGAGCCTACAACTCACAGTGAGTCTTACACCAAAGTTAAGTC
CGTTCCTGAACTATCATCAACAAGCTACACCTTAGAAAATGTATTAGGTC
AGGGTGCCTCGGGTGTTATTTCAAAGGCACACTGGAATAGCCCGCAATCA
CAATTTCCTGAAGATATTGCAGTAAAAGTATTTAAAGGTGAAATTACCAG
TGATGGTTACCCACAAGATGAATTACAAGCTTGTTTGCAAGTAGGCTATC
ACCCAAATTTAGTAGAATCATTAGCGCAAGTGAATGAAGACAACTATCTT
GCGTTAATCATGACGCTGATCCCTGAAAATTATCAAAACCTAGGTTTACC
TCCTTGCTTTAACAGCTGCACCCGAGATACCTTTTCACAGGGTTTCAGGT
TACCTATTACGCTTATTAGTAACATTGTTAGTCAGATGCAAGATGTATTC
GCACACTTGCATAAAAATCAAGTATGTCATGGTGATTTATACGCGCATAA
CACTTTATTTGATAGCCAAGGTAATATCATTTTCGGCGATTTTGGTGCTG
CCACTAGCTATCAAATGCTAACGCCTGCACAACAAGAGAAAGTTAAAAAT
ATTGAGAGCAAGGCGTTAAACCATTTTATCGATGACTTACTGAGTATTTG
TGCTGAGCAAGATAAAACAACTAAAGCATTCGACACGCTAAAAGCGCATA
TAAGTGCTTAA
>CPS_3121 ISCps9, transposase orfA
ATGCCTAGATATACCCAACCTAAAAAGACGTGGTTTTACCCTGTTAATTT
CAAAATTAAAGCTGTCGAGCTAAGCTTACGAAACGACATGTTATCTAAGG
ATGTTGCTCAAGCGTTGGATATTCACCCGTTAATGCTAAGCCGTTGGCGT
AAAGAATACCGAGAAGGGAAGTTTAAAAAAAACCAACACTATCAGAGCAA
TAGTGAACTCATGAGTAAAATCCCCACAAAGAAAGAACTAAATAAAATTA
AACAGCTGCAAAAAGAAAACGACCGTTTAAAAATGGAAAATGATTTACTA
AAAAAGTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTC
ATCGAAAAACACAAAGAAGCCTTAG
>CPS_2959 ISCps3, transposase orfA
ATGCCAAAGTACAACAATCCAAGACGAACTTGGAAGTATTCAAACGACTT
TAAAGTCAATGCTGTTCAACTGAGTTTTGTTGTCGGCGTCACAATCAAAT
CTGTCGCTGAAAAACTCGACATACACCCATTTATGCTGTCACGATGGCGA
AAAGAATATCGTGAAGGGATCATTGTGGTGGATAAACGAAAAAAAGTGGC
AGGGCAATCAAAAGCCAAAAAAGTACTGACCAAAGAACAGCAACTTGAAC
GTGAAAATAAAGCACTCAAGGAGGAGCTGTATATCCTAAAAAAGTGGCAA
CGGTTTCTTGCAGAGGAACATCAAGTCGATATCGATTCATCGAAAAACTC
AGAGCCGACATAA
>CPS_3194 conserved hypothetical protein
ATGAAGCAAGTTGCTCAATTAACGTTGATGGTACAATTACCTGATGATGA
AACGTTTGATAGTTTTAAAAGTGACATTAATCAGGGGGTAGTAACTCAAT
TAAAGTCCTATATAGAATCACAACAATCGACGCCCCACAGTTTTTACCTG
TTTGGCTTATCGAGTGTTGGTAAATCACACCTAATGCATGCAAGCAGCAC
TTATGCTGCGCAGATTGGAAAATCTTCTGTATGTTTATCTTGTGCTGAGT
TAAAACAATTACCCGTAGAAGTTTTAGATGGCTTAGAGCAAATTGATTTA
ATCTGTTTAGATGATATTCATTTGATTGCAGGCGATACACGCTGGCAACA
AGCCATTTTTGATTTATTTAACAGAGTGCTTGAACAAAATAATTACTTAT
TAATTTCAGGTGATGAGAGTGCCCAACAGTTAGGTATAAGCCTACCTGAT
TTAGTGTCGAGACTTACTTGGGGATTAACTGAGCAAGTTAAGCCTGTTGA
TGATGAAGAAAAAGTTATTGCCCTCCAATACCGAGCCACGCAACGCGGTT
TGTTTTTGTCTGATGAAGTAGTCAAATTTTTACTTAATCGCTTGAGCCGA
GATATGGGCAGTTTAATTAACTCACTTGATGTCCTAGACAAAGCTTCTAT
ACAAGAACAAAGAAAAATTACCATTCCTTTTATCAAAGAAGTGCTAACGC
TTCAATAG
>CPS_2958 ISCps3, transposase orfB
GTGGCAACGGTTTCTTGCAGAGGAACATCAAGTCGATATCGATTCATCGA
AAAACTCAGAGCCGACATAAAAGTTACGCGATTACTGACGTTTTTTGATG
TATCTAAAAGTGGTTATTATGACTGGCGTGAGCGCCAACCGAGTGCTATA
GCCATAGAAGATGTTGAGCTTAAACATAAAATACAGCAAATTTTCAAAGA
GAATATAGGACGATATGGGAGCCCTCGAATATTTAAGGCCTTACAAAAGC
AAGGGTACAACATAGGTAAAAAACGTGTCGAACGTTTGTATCGTGCGCTT
GGTTTGGTTGCCAGAGTGATGCGCGTGACGACACGTTCAGCCTTTTATAA
ACGCTTCCTAACGACAGGTAAAAACTTACGACCTGATGGCGAAGTCCCAT
TGGCTAAAGATAAGGTCTGGGTAGCTGATGTCACATATTTGAAAGTTAAA
GGCGTATGGCGTTATTTGTCGGTCATCATGGATTTATATTCACGGCGCAT
TATTAGCTGGAGTTTGGATAAAAGTAGGACGATGGAAGTGACCAAGCGTA
CATTGCAAAATGCAGTTAAGAAACGCAAACCATCCGGTGACTTAATGCTC
CACACTGATAGAGGCGTAGAATATCGTGGGCACATTTACCAGAAAGCATT
GAAACGACATGGGATCACTCATAGTTTGAGTAGAGCTGGAAAATGTACTG
ATAATGCGCATATGGAGTCATTTTTCCATTCAATGAAGACGGAAGTTATT
CGTGGTAATGTGTTTAAAAGTGATAAAGAACTGCGCGGAACACTTGGCAA
CTACATTAACAAATACTACAATGTTTCGAGGATGCATTCAGGGATAAACT
ATTGTTCTCCAATAGAATATGAAGCCCTGGCAGCGTAA
>CPS_1794 protein kinase domain protein
ATGAACGACTTATATGCATTATTTCAAAAGCTTGCCCTTATTGAGAAACC
TTTACAGTCAAACTGCTTTAGTCAACTCGAGAATGAATCTCCTAAAAAAG
CCCAACAGTTAGCACAATTATTAAAGCAACGGAATGTGTCAACAGGCGTT
TTGATTGAAAAAATATTTTCTCCTTTAACCTTTTTAGACAAGCCAGAACT
GAGGTTAGGTAGGATAATTGATAATAAATACAAAATCGTTGAGCTAATTG
GTCAAGGTGGTATGAGTGATGTGTATAAAGCCATAAGGTGTGATGGGTTA
ATAGAACATATCGTAGCGGTTAAATATTTTTCGCTTGCCGACACCTTTGA
AACAGCCTTACAAATGATAAAAAAAGAAGCACAAATATTGGCTCAACTAG
ACCATCATTACATCGCTAGCTTCATAGATATTGGTTATGACGATAATGGC
GAACCTAATATCATGATGGAATATGTGCAAGGTCAAACGCTTTTCGCATT
TTTAAAAACAAAACCTGATGAGACGGTTTTATCTCAGGTTTATGCCACAT
TAGACGAGGCGAAAGGGTACGTAGTAAAACAAGGCGTAACTCATGGCGAT
ATCAGTTTAAACAACGTATTAGTCGATAAAAATGGCAATGCCAATATTAT
TGATTTTGATATAGCTCAGTATAAAACTCAGTAA
>CPS_0887 putative phage replication initiation protein
ATGAAAACTAAACCAACAACAATCCCTTGTTTAGTGGATGCCTTGTCACT
GACTTGGTCACCCAAAGAATTATTAAACATTAAGCAGATGGCCAAAATTG
GCGCCTGTATCAAAAGCGAATTAATTGTTAAGGCAAAAGATGCGGCGTTA
AACCGTGAACTGGCCAAGCTTGAGAACACAAAAAACAAAGAGCTGTTAGG
CACTAACGCGTTTAACGCGCATGAATATGAAGCGATTTTGAGCCGTTATA
AAGAATCTTGTAGCACCATTACCCGTGAATATAACAATCGTCGACATAAA
GATTTACCGCTTAAATCACTTGCCCTTTCAGACAACGAAGTTTCTGCACG
TTACGAATTACGTGACATGTTAAAAGGCGAATTAGAAGTCGATACCGGCA
TTAAATATGGTGACCGTTTAAACAACTTATTAGACAACATTGGCGTCGAT
TTACTTGATGTTCTTTGTTGCGGTGAAGTAGAACGCTTTGTTTGTCGCTT
GAATAATGTGTTCACTCAGGAAACTTTTATTTGGACGGTTAAGAATAATC
CGACAGGACGTTTTAATTATTCTTACTCAGCCACTCTGTACGCTGATGGT
GAGCAAGCTGGTGTTATTTGTTGGGGTGGTAAAAACCTTGGTTGTTACGT
GTCGTTCATGGGAACGGGTTGTAACGCTTTGGATATGAAACGCCTCTATG
AAGAAATCAAAAATATTCCAGCGCTTAAAATTACCCGTATTGATTTAGCG
CATGACGATTACGCAGGGAAGCACTCTATTAAGCGAGCATTGAGTAAAGC
CAAGAAAGGCCTGTTTAACTCTGGCGGCCGCCCTGCTTGTTATATGTATG
TTGAATCTGGGCATTTAACAGAAAAAATGCTGAAAGAGAACTTTAAAGAC
TTAAAAGAAATCAGTAACGAGTCCACTAAATCAACGGCTAAGAAAACCTT
TGGCTTTATTCCAAGCAAGGGAAAAACGCTTTATATCGGTTCTCGTGAAT
CTGGCAAGCTGTTACGCATATATGAAAAAGGTAAACAGCTAGGTGATATG
AAATCTAAGTGGGTACGTTGGGAAGTTGAATTGCATTCAAGCCAACGCGT
TATACCACTTGATGCCATGGTAAAGCCGAGTGAATACCTTGCAGCCACTT
ACCCAGCACTCAATTTTTTAAGTGTTGAGCAATGCAAAATTAAAACCCTG
GTTAAACAAGCCACCATGACCATCGAGAAAATTGTTGAAAACCAAGTTAT
CAGTACACGTAAAGCCATCAACATGATGCGCGTAATTTGTGGTTTATCTG
ATAGCGAAATCGTAGAGAAATTTGTAAAAGACATTGAAGAGCCCGACTGT
CGTTCGTCAATGCCTAAACGGTTGAAAGCCTCTGTTATTGAAGAGTGGGT
TTTACAACAACAAGCACAAACGGCAGCAGCTTAA
>CPS_2062 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGACAGCTTGGAATAAAGATAAACGTGTGGGCCAGAAAAAAGCATTTAA
ACTTGAAGAGATTTGGCGTATTCGAATAAGGTTAGAAATTGAAAATCAAT
TAGAGCAGCTAGCTCTATTTAATTTGGCTATTGATAGTAAACTTAGATCT
TGTGATTTAATAAGCTTAAAAGTTCGCGATATTTCATCAGCCTCACTAAT
TCAATCTCGAGCAATGATTGAACAACAAAAAACTCACAAAGAAGTTCAAT
TTGAAATAACACCAAAGACTCAACAGTGTTTGAGCCAGTGGGTTTATTTA
AAAAGACTATCATCCTCGGACTTTCTATTTCCTAGCCCAAGAAAACTAGG
CCAACATATTTGCTATCACTACTATGCCAATATAGTCAAAAAATGGGTAT
CCACTCTAGGGTTAGATATCACCCAATATGGAACGCACTCGCTTAGACGT
ACCAAGGCATCCTTAATCTATGCAAAAACAAAGAATTTAAGGGCTATCCA
GTTATTACTTGGTCATTCAAAACTACAAAGTACAATTGAATATTTAGGGG
TTGAAATAGAAGATGCATTGTCTATTTCAGAAAGTACAGAAACTTGA
>CPS_0894 ISCps3, transposase orfB
GTGGCAACGGTTTCTTGCAGAGGAACATCAAGTCGATATCGATTCATCGA
AAAACTCAGAGCCGACATAAAAGTTACGCGATTACTGACGTTTTTTGATG
TATCTAAAAGTGGTTATTATGACTGGCGTGAGCGCCAACCGAGTGCTAGA
GCCATAGAAGATGTTGAGCTTAAACATAAAATACAGCAAATTTTCAAAGA
GAATAGAGGACGATATGGGAGCCCTCGAATATTTAAGGCCTTACAAAAGC
AAGGGTACAACATAGGTAAAAAACGTGTCGAACGTTTGTATCGTGCGCTT
GGTTTGGTTGCCAGAGTAATGCGCGTGACGACACGTTCAGCCTTTTATAA
ACGCTTCCTAACGACAGGTAAAAACTTACGACCTGATGGCGAAGTCCCAT
TGGCTAAAGATAAGGTCTGGGTAGCTGATGTCACGTATTTGAAAGTTAAA
GGCGTATGGCGTTATTTGTCGGTCATCATGGATTTATATTCACGGCGCAT
TATTAGCTGGAGTTTGGATAAAAATAGGACGATGGAAGTGACCAAGCGTA
CATTGCAAAATGCAGTTAAGAAACGCAAACCATCCGGTGACTTAATGCTC
CACACTGATAGAGGCGTAGAATATCGTGGGCACATTTACCAGAAAGCATT
GAAACGACATGGGATCACTCATAGTTTGAGTAGAGCTGGAAAATGTACTG
ATAATGCGCATATGGAGTCATTTTTCCATTCAATGAAGACGGAAGTTATT
CGTGGTAATGTGTTTAAAAGTGATAAAGAACTGCGAGGAACACTTGGCAA
CTACATTAACAAATACTACAATGTTTCGAGGATGCATTCAGGGATAAACT
ATTGTTCTCCAATAGAATATGAAGCCCTGGCAGCGTAA
>CPS_1290 ISCps2, transposase orfA
ATGACAAAATCCAAAAGTTATCAAAGATACCCTGCTGAGTTTAAACGTAT
GGCGTTACTCAAAGCTTCTGAAGACGGTGTTACTGCTAATAGTGTTTGCG
AAGAACTCGGGATCAGTTTTAGGCAACTAAGTCGTTGGCGTGATGAGTTT
CGCTTGAAAGGTGATGATGCTTTCAAAGGGAATAAACAAACTAGCAATAA
TGAATTAACTAAGTTGAAGCAAGAGCTGGCTAAAGTAAAAAAAGAGCGTG
ATTTTTTAAAAGATGCGGTGGTGTTCTTCGCCAAGGAGTCCGGTTAA
>CPS_2243 ATP-dependent helicase HrpA
TTGTCTGTTTCGATTAAGTCTGTTATTACTTCATTTTCCCATTTACAAAA
ACTTTTTGAATTATTGCCACAAGCAAAAAAAAGCGATGCTGTACGCTTTA
GAAAAAGGTTAATAAATCTGAAAAAAACGATTACTAAAGAGGTTGGACAA
AAATCACCGACTGAATTGGCGATGCTATCATTATCAGAAAAGCACATTAA
GTTGGTCGAACCGTTACAACAACATATCCTCAGATCTATTCAAGATAAAC
AACAAAAAATCAGAAGTTTACCTAAAATAACGTATCCCGAAGGTTTACCC
ATTTCAGAGAATGCTGCGCAAATTTCAGCAGCTATTGATGCTAATCAAGT
GGTTATCATTGCGGGTGAAACAGGATCTGGAAAAACTACACAAATTCCCA
AGATTTGTCTTGAACTTGGTCGAGGTGTGGATGGTCTTATTGGTCACACT
CAACCTAGACGTATTGCCGCTAGAACCGTTGCTAATCGTATTGCGGAAGA
GTTAGGCACTAAGTTAGGTGAGCAAGTAGGTTATAAGGTTCGTTTTAATG
ACCAAGTCAGCGAGCAAAGTTATATCAAATTGATGACTGACGGTATTTTG
CTGGCGGAAATGCAAAGGGATAGATTACTTCTTAAATACGACACAATTAT
CATCGATGAAGCCCATGAGCGTAGTTTAAATATCGATTTTATTTTGGGCT
ATTTAAAGCAAATACTAATAAAACGACCTGATCTAAAGTTAATCATTACC
TCAGCGACCATTGACCCACAACGTTTTGCGAAACATTTCTCTAGTAAGAA
TGGCTTACCAGCACCTATTATTGAAGTATCAGGAAGAACATTCCCTGTTG
AAATGCGCTATCGACCATTAAATGATCGTGCAGTGATTGATGATGACGAC
CAATCACCGCAAGAAGTTGATATTATCAGTGGTATTTTGTCGGCGGTTGA
TGAGCTAAGTGACTGCGGTAATGGTGACATTCTGGTTTTCCTCAATGGTG
AACGGGAAATACGCGATACTGCTGCTGCGCTAGTTAAAGCTAATTTACGT
CATACTAATGTTTTGCCTCTGTATGCTCGTTTAACGGTTAGTGAGCAGAA
TCAAATATTTAAACCCCACAGTGGACGAAATATTGTATTGGCAACCAACG
TTGCTGAAACGAGCTTAACAGTACCAGGTATCAAGTATGTGATTGATCCG
GGAACGGCACGTATTTCACGTTACAGTTACCGAACTAAAGTACAACGTTT
GCCTATTGAACCAGTTTCACAGGCAAGTGCTAATCAACGCTCTGGCCGTT
GTGGACGTGTTTCTGAAGGTATCTGTATTCGTTTATATTCAGAAGATGAT
TATAAAAGTCGTGCTGAATTTACAGACCCTGAAATTTTACGTACCAATTT
AGCAACCGTCATATTGCAAATGCATGCGCTGGATTTAGGTGATATTGCTA
ATTTTCCGTTTGTTGAAGCCCCTGATAATCGTAATATCACTGACGGTGTT
CGTTTATTGGAAGAAATTGCTGCGGTTGAAAGCATAGAAAACGCGGATAA
AAACGCTAAGGGTAAAGCTTCGTCAACGGCGACACAGTTGACGAAATCAG
GCCGTCTATTAGCAAAGTTCCCTATAGATCCTCGTTTGGCAAAAATGGTC
GTCTCTTCCATAGAATTTGGTTGTATCGAACAAATACTGATTATTGTTAG
TGCATTAAGTATTCAAGATCCACGAGAAAGACCGCATGAGAAACAACAGC
TGAGTGATGAAAAGCATAACCGATTTAAAGATAAGTCATCTGATTTTATA
AGCTTACTTAATCTTTGGCAGTATATTAACGAGCAGAAAAAAGACTTAAC
GCAAAATCAGTTTAGGAAGTTATGTCAGCGCGAGTTTCTTTCTTATGTTC
GTTTACGTGAATGGCAAGATATTTTCAGTCAATTAAAACTAACGTTAAAA
GAACAGCAAATAACGTTAACGTCGATTGATTATCAGTTTTCTATGCCGAA
TGTTCAGCAGGGTCAAGCAGCAAGCACAGCAGTAGATAAGACAAAAGAGA
CAGAGCAAGACTCAGCGTTAACTCCTGTACATCAAGCATTGTTGTCAGGT
TTACTTAGTCATATCGGTCAACAGGATGAAAACCGCGAGTATAAAGGAGC
TCGGGGAATGAAGTTTTTTATCTTTCCAGGCTCAGCGCTAACTAAAAAAT
CACCAAAATGGTTAATGTCTGCGGAGCTAGTAGAAACCAGTCGATTGTTT
GCTCGTATGAATGCCAAGATTGACCCTTTGTGGCTGGAACCGCTTGCTCA
GCATTTAGTTAAGCGAAATTACAGTGAACCTCATTGGGAGAAAAAACAAG
GTGCTGTAATGGCCTTTGAGCAAGTAACATTGTATGGCTTAAGTATTGTT
AGTAAACGTAAGATCAATTTTAATGTCATTGAACCGGTTACTTGTCGTGA
AATATTTATTCGTGAAGCATTGGTCAATGGTGACTGCGTCATTAAAGAAA
AGTTTTTAAGCAAAAACCAGCAATTGGTCGAAAGCATAGAAGAGCTTGAA
CAAAAAGCACGTCGCAGAGACTTTTTAATTGATGAACAGCATTTAGTTGA
TTTTTACAGTGATAAACTTCCTGATACTGTTAACTGTCAACGTAGCTTCC
TCGCTTGGTGGAAAAAAGCTAAACGTGAGAACGAACAGTTATTAGATTTT
AGCAAAGCCTTTTTATTGAATGAGTCTTCGGATGAATTAAGTACTATTGA
GTACCCTGACGTTTGGCAACAAGATAGTATTACCCTACCGCTAACATATC
ATTTTAGTCCTGGTGATATTGATGATGGCATCAGTGTTGTATTGCCGATT
GCCTTATTAAATCAAGTGCAAGAGGTTGGGTTTGATTGGCTGATCCCTGC
ACTGCGAGATGAGCTTGCCATCGCACTAATTAAAGCTTTGCCTAAAACAT
TAAGACGTAATTTTGTTCCCGCACCTAATTATGCACAAGCTTGTTTAGCA
GCTATGCCTGCTGAGCAGGGACATTTACAAGATGCGCTAGCAAAACAATT
GTTACGAATGACTGGGGTACGATTACCTGAAGATGCTTGGCAGGATATTA
CCTTACCAATTCACTTAACCATGAATTTTCAAGTAGTCGATGACAAAGGG
AAGTTAATAAAGCAAGGCAGAGACCTCAACGAACTTAAAGCTGAACTGCA
AGGTAAAGTAAAAGCATCGATTAAACAGGTTGCAGAAAAGGGCATTGAGC
AAGCTGATTTAACGAAATGGGATTTTGGTTCACTACCTAAAGGTTATGAA
AAGAAAGTTGCCAACATCACTATTAAGGCATTTCCTGCATTGGTTGATCA
TAAAAATAGTGTTGCTATCGAGCTTTTTGAGCAAGAACAACATGCCCAAG
AAGCTATGCTGAAAGGGATTAGCCGACTTATCTTATTGAATATCCCAACA
CCATTAAAATATTTACAGGAAAAACTACCGAATAAAGCCAAATTGGGTTT
GTACTTTAATCCTTTTGGTTCAATCAATGAGTTATTACAAGACTGTATTC
AAGGTGCTTGTTTGTCTTTGGTTCAACAATTTTCTCAACACCAAAATAAT
GGACTGCTTCCTAGGGAAGAAAAGCAATTTGCGAAGTGTTGTGATTATGT
TAGAGCTGAAATAGCCGATTGTGTGTTAACTGCAGCCATTAAAGTCGAGC
GTGCATTAACGTTGCGTCATGAAGTGACTAAAAAAATGAAAGGCAGTGTG
CCTTTAAATGTTATTCAATCTCATGGTGATATAAAACAACAATGCGAGCA
GTTAGTATTCAAAGGGTTTGTAACTTACTCAGGTTTGAGCAAACTAGATG
ATATTATTCGATATTTACAAGGCATGTTACGCCGTTTAGAAAAACTGCCA
AGTGACCCTAATCAAGATAGATTAAAGCTTATTGAGGTATCTAAAGTTAA
CGATATGTATCAAGTGATTATGAGCAAGCAACGTAAGGATAAACCAGTAG
ACAATGAGTTACTGGCTACCCGATGGTTGATTGAAGAGCTAAGGATTTCA
TTGTTTGCACAAAATTTAGGTACCTCAGCGCCAATATCAGTTAAGCGTAT
TTTAAATTATTTAAAAGGTTTTTCTTAA
>CPS_2757 ATPase, AAA family
TTGAAGACAAACGATAATCCAACGGGTAAGTCACCTTCAGGGCTAGGTCA
TAATCAAGGGAATAGTGAAGGACAACAAGACTCACTGTTTGACCTTACTC
CTGACAATGACGAGGTAACCTCTACCGATAATACTTCAACGCAAGGTAAC
GCTGCCGCAAGTAGCTTTATGCCGCTTGCTGCAAAAATGCGCCCGAAAAC
GTTAGCCGATTATGTTGGGCAACAACATATTTTAGGTGGAGACTCTCCTT
TAGCTCAATCCATTGAACAAGGTCATTGTCATTCGCTTATCTTTTGGGGG
CCGCCAGGTAGTGGTAAAACCACACTCGCTGAAATTATTGCACAACATGC
TAATGCCGAAATAGAGCGTGTATCTGCTGTAACTTCAGGTATTAAAGAAA
TTCGAAGTGCTATTGAGAAAGCAAAATTACGCGCACAAGGCGAGGGCGCT
AATAAACGTAGAACCGTGCTATTTGTTGATGAAGTACATCGCTTTAATAA
GTCACAGCAAGATGCGTTTTTACCGCACATTGAAGATGGCACCATTATTT
TTATTGGTGCAACTACCGAAAATCCGGCATTTGAGTTAAACCAAGCGTTA
TTGTCACGTGCACGTTTATATACCCTGAAAAAATTAACCCGTGATGATTT
AGCCCAAGTATTACAACGCGCAATCTCATTATGTGAAGCTGAACAACAGC
TGAGTATCAAGTTAAGTGTTGATGCCAAACAAAGTCTACTTAATCGCAGT
GACGGTGATGCGAGACGGTTGCTGAATTTATTAGAAAACTGTCTCGATAG
TTCCGTTACAACACATGAAAACAAGCAAGATGATCAGCACGGTGAACAGG
GTGTAAGCGGTGATATTAAAACGGTCACCGTTGAACTAATCGCCCAAGTT
GCCGGTAGCAAAATTGCCCTTTACGATAAAGGCGGCGATGCCTTTTATGA
TTTAATTAGTGCTTTTCATAAATCGGTGCGTGGCTCTAGCCCTGATGCCG
CGCTTTATTGGTATGCAAGAATTTTAACCGCGGGTGGCGATGCACTTTAT
GTCGCAAGACGTTTACTTGCCATTGCCAGTGAAGATATAGGTAATGCAGA
TCCGCGCGCTATGCAACTTGCCATTAACGCTTGGGATACTTTTCATAGAG
TTGGTCCAAGCGAAGGTGAACGTGCTATTGCGCAAGCAACGGTATACATG
GCACTAGCACCTAAAAGCAATGCGGTTTATCAAGCGTTTAATAAAGCAAA
AATATTAGCTCAACAAACGTGTGATTTAGATGTTCCACTTCATTTAAAAA
ATGCCACCAGCAGTATTACCAAAGACCTTGGTCATGGTAGTGAATATCGC
TATGCCCATGATGAAGTTAATGCGTTTGCCGCAGGTGAGAACTATTTTCC
AGAAGCGTTAGCTAAAGGTGATAGTTCGCATACTCGTTTGTATCAGCCAA
CTGAACGTGGCTTAGAGAAAAAATTAAAAGAAAAGCTCGATTACTTAAAC
CAGCTTGACAGGAATAGCCATGACCAACGCTATTAG
>CPS_1804 protein kinase domain protein
ATGTCTTTGCTTTATAAATTATTTACAGAATATTCTAGTTTGCCAAAAGA
ATTATTAGCGCAGAAAATGACACAACTGCACCAACAAAATCCAACAGTAG
CAACCGAGTTATCCCGCTTATTAGATTACCGTGGTACTTCAGTTAACGAG
ATGCTCGAATACTTACATTTAGGAATCATTAATAACGAAGATACAAGTAT
TCGTATCGGACGCTTAATAAACAACAAATATAAAATTACAAAACTGCTCG
GACAAGGTGGTATGAGTGATGTTTACCTAGCGGAAAGAACAGATGGCTTA
ATTAACCACACCATAGCCGTAAAATATTTTGCCTTGGCTGACTCAAACAA
CACAGCACTAAAGATGATAAAAAAAGAGGCACAAATACTCGCTGATTTAG
ACCACCATCACATTGCGAGTTTTATAGATATTAGCCATGATAATCATCAA
GAGCCTAACATTATGATGGAATACATTGACGGTATTACTTTATATGAGTT
CCTTAATACTTCGCCAAGTGAGGAAGCCAAAGAACAGGTTAACACTAGCT
TAAAAGCGGCCATTGAACATGCAAAAAGCAAAGGTGTTGAACATGGTGAT
TTAAGTAAAAACAATGTACTGGTAGATATTAATGGTAACGCCAACATCGT
CGATTTTGATATCGCTAATTTTAGCGATTCAACGACGAATGACACACAAC
CTTTATGCGTATAA
>CPS_0183 DNA repair protein RadC, n-terminal fragment
ATGTTAAAAGAATCAAGGTTCAAGGAATCAGCGTTAAATGAATCGCCTTT
AAATCAAAACGCCTTAAAAAATTGGCCTGAAATGGAAAGGCCACGAGAGA
AACTAGTCAGTTTAGGTTCATCAAGCTTAAGTGATGCTGAGTTGTTGGCT
ATATTTCTTCGCACAGGAGTTAGAGGTTGCAATGTGGTTGATCTTGCTAG
GCAACTATTGAAGAGCTTCGGTAGTCTTGGTGCAATATTTGCGGCAAGCC
AAGAAGATTTCTGTGCAAGGCATGGACTCGGAATGGCAAAGTATGTGCAA
TTACAAGCCTGTTTAGAAATGTCTAAACGTTATTTAGCAGAGAATATTAA
AGACATAGATTGTTCATTAACTTCTTCACAAGCGACACGTGATTACTTAC
TCAGTGAGTTGCGCTTAGAAACTCGAGAAATATTTGCTGTGCTTTTTTTA
GATATTATACCCGTAAAAACCTCATACTATTTTAATCTTCATTAG
>CPS_3583 putative methylated-DNA binding protein
ATGAAAAACAGGACTAATAACACAATGCTAAATCCTCATTACCAACAAAT
ATGGCAAACGGTACAGTTAATTCCGCAAGGTAAGGTGGCTTGTTATGGGC
AAATTGCGGATTTAGCCGGTTTGCCTGGTAGAGCGCGTCTGGTCGGTAAA
TCGCTTGGTAAAGTACCAAAAGATGGCTGGCGAGGGCAAAGGGTACCTTG
GTTTAGAGTTATTAACTCACAGGGTAAGATTTCTTTCCCTCCAGGCAGTG
AAAATTTTGATAAGCAAAAGCATCATTTGCAAGATGAGCAGGTCGTTGTG
ATTGGTAGCAGGATCAAACTAAAAGAATTCCAATGGAAGCCCGATTTATC
AGAATTATTGTTTTCACTAGAATTTTAA
>CPS_2917 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGGCTAGAAAAGTAAAACCTCTTACCAATACTGAAGTTAAGCAGGCAAA
GCCTAAAGATAAGATTTACAAGTTATCTGACGGCGATGGCTTACAATTGC
GCATAATGCCAAATGGCTCTAAACAATGGCTGTTAGACTACTTCAAACCT
TACACAAAAAAACGTACCTCATTCAGCTTAGGATCATACCCTGATGTTAC
ATTAGCCAATGCAAGAGCCAAGCGTGCATCTTCAAGAGAACTTTTAGCTC
AAGACATCGACCCCAAAGAACATAAAGAAGACCACCACCGTGAACAATTG
CTTATCGCTAGCCACACTTTAAAGAGTGTTGCTGAAGATTGGTTTGCCAT
CAAAAAGACCACGATTACAGAAGTTACTGCTAAAAGCCTATGGCGTAAGT
TTGAAAACCACGTTTTTCCAAAGCTAGGCCACAGGCCAATAGACAAAATA
TTAGCACCAGAGGCTATTGAAGCACTTAAGCCTTTAGCTGCTAAAGGTAA
CCTAGAAACAACAGGTAAAATCATTGGCCATTTAAACAACATAATGACCC
ATGCCGTAAATACGGGGATATTACATCACAATCCGTTATCAGGGATTCGT
AGCGCATTCTCAGCCCCTAAAGTAACTAATATGCCCACCATTAAGCCTAA
TGAATTAGGTAAGCTAATGAAGGTCATCAGTTACGCCAGCATTAAGCTAG
TCACCAGATGTTTAATTGAGTGGCAACTTCACACAATGACCAGGCCCAGC
GAAAGCGCTAAAGCTGAGTGGTCAGAAATAGATTTAGAGAATAGATTATG
GGTTATTCCTGCTGAACGTATGAAAATGAGATTAGAGCATAAAGTACCAC
TGACCAAACAATCCATTGAAATACTTGAACGATTAAAGCCAATTACAGGC
CATCGAACACACCTATTCCCTTCCCACATTAATCACCATAAACACTGCAA
CGTTGAAACAGCAAACAAAGCATTAATACGTATGGGCTATAAAAACAGAT
TAGTCGCTCATGGCTTACGTGCTTTAGCTAGCACTACTTTAAACGAACAA
GAGTTTAATGCTGATGTTATCGAGTCTGCACTATCTCATGTCGATAAAAA
TGAAGTTAGACGTGCCTACAATCGTGCAGAATACCTTGATAGCAGGCGTG
AACTAATGTGCTGGTGGAGTGAGCATATAGAGCAGGCAGTAAGTGGCAAC
TTACCTGTCTCAACGTTAAAAGAGCAAAAGATAATCTGCAACGAATGA
>CPS_3215 putative ATP-dependent RNA helicase SrmB
GTGCAATTTAGTGATTTTGGTTTAGACAGTGCTTTAATGAGTACCATTGA
GCATATGGGTTTTAACGAACCAACACAAATTCAGCAACAGGCGATTCCTG
CGGCAATGGCGGGGCATGATTTAATTGCTTCGTCTAAAACAGGTTCAGGT
AAAACGTTAGCGTTTATTATTCCTGCTTTACAGCGATTAAGTAAAAATCG
TGCTCTGTCAAAGCGTGATCCACGTGTGGTAATTTTAACGCCAACACGTG
AATTAGCTAAACAAGTTTTTAGTCAACTGCGTTTGTTTACGGCGAATACT
CAATATAAAGCGGTATTAATTTTAGGTGGTGAAAACTTTAACGACCAAGT
AAAAGTTTTGCAGAAAGAGCCTGAGTTTATTGTTGCAACACCTGGACGCT
TAGCAGATCATTTAACGCAAGGTCACTTCCATTTAAATGGTTTAGAGCTA
CTGATTTTAGATGAAGCTGATCGCATGCTTGATTTAGGTTTTAGTAAAGA
GCTAACTCAAATAAATAAGGCTGCCGATCATCGTAAACGTCAAACGTTAC
TGTTTTCAGCAACCTTAGATCACGCGCAAGTGAATGAGTTTGCCACTGAA
TTGCTTACTAAGCCTAAACGAATTGCTATTAATGCTGGGCATAGTGAGCA
CGTAGATATTGCTAAACGCTTTTACCTTGCCGATAATCTCACGCAAAAAG
AAGCACTATTACAGCACTTCTTAGTCACTGAGAAATCACAACAAATCATT
ATATTTACTGCAACACGAAGTGATACTGATCGTTTAGCTAAACTACTTAC
TGAGCAAAATCTTAATGCTGTTGCTTTAAGTGGTGAGTTAAACCAAGGTC
AACGTAATCAAATTATGGAAAGCTTTTCTAAAGGCCAACATAAAATATTG
GTAACGACAGATTTAGCCTCACGTGGCCTTGATTTAATCAATGTATCGCA
TGTAATCAATTTTGATATGCCAAAGCATACGGAAGAGTTTGTTCACCGTA
TTGGCCGTACCGGTCGTGCAGGAACGAAAGGTGATGCTATTTCATTAGTC
GGACCAAATGATTGGCTAAGTCTTAAAAACGTAGAAGCTTTTCTACAACA
AAAAATCAGCTTTACTAAAGTTGAAGGTATTAAAGTTAAGTTTAAAGGCT
TAAAACCGAAAAAAGAAAAAGCAGTAAAAGCTAAAGTTAGTGTTGCTAAA
GATAAAAAAGCTGTGTCGAACAAACCAAGAAAAGTTATTAAGAAAACTTT
CCTTGATATAGAGGATGCTGGCGCAATGAAAATTATTAAACGCAAGAAGT
TAACACCAGATCAAATTGAAGATGCGACTAAAAAAGAGCAGGATTAA
>CPS_1822 hypothetical protein
ATGCTAATACAATTTAAAAAGGTGAGAAATGCGCTTATTAGAGATGGTAA
GTTTGGTAAGTATTGTCTTTATGCCATTGGTGAGATTTTTTTAGTCGTTA
CTGGAATTCTCATTGCCCTTCAGGTTAATAATTATGATTTAGCACAGCAA
AAAAAAGCAATCGAACATCACTATTTGTTAACTATTAAACTCCAATTATC
CGCAGATAAAGAAAAACTTTCAGCAGAAATATATGGTATGAATGAGCGAA
TAGATGATTATCTAGTTGGGATGAAATTAATCAATGAAAATGATCAGGAA
AATCTTGAGGTCCTAGCAAGTAAAGTTATTCGCTTGCTCGAATATGGAGA
TTTTAGGCGACAAAGCAGTGTCTTTCAAACGTTAGTTTATAGTGGTGAAA
TCAAATACGTTAATAGCAAAGAAATCATTGAAAATCTGCAAGAAATTGAA
CGTACTTATGAAATTACAGAACGACTTGAAAATACTCAGGCTAATCTTGT
GATGATTCATGCAGCACCAGCAGTTAATAAGAGTATGGATTTTGAATCTG
GAAAGATAATCGCCCCAGATGTAGTGTTTACCACGATGTTCAAAAATAAT
TTCTCTATTGCTATTCGCCTGGCGCAAGAGAAAAAAAGTGAATTTGAGCA
TGCGTTATCAGTGATTGATAACACCATTAAAATGATTGATTCACAAATAA
ATAAAAATGAGCATAATTAA
>CPS_2658 ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family
ATGTCAGAATTTAAAGCATTTTCACTTTTAGAGTCAATTATTGACCGCGT
TAATCTTAAAGGCTACAAACAGCCAACACCGATCCAAAAAGAATGTATCC
CAGCGCTTATAAATGGCAATGATCTTCTTGGTATAGCGCAAACGGGAACA
GGAAAAACTGCGGCCTTTTCATTGCCTATTATCAATAAATTTGGGCGAAA
TAAAATTGATATTAAAGCTAAGAGCACGCGCTCGCTCATACTAACGCCCA
CAAGAGAGCTTGCCTCGCAAATAATGCAAAACATTGATGACTACTCTGAT
GGCTTGGGGCTTAAAACTAAGGTTGTTTATGGTGGTGTAGGAAGACAAGC
TCAAGTTGACTCTATCGAACTTGGACTTGATATTTTAGTGGCCACCCCTG
GAAGGTTATTGGATTTAATTGAAACGGGCGATATAAATTTCAAGGCGTTA
GAAGTATTTGTGTTAGATGAAGCAGATACAATGCTTGATATGGGATTCTT
TAAGGATGTTCAAAGTATCATATCGAAACTGCCAAAGAGCCGACAAACAC
TATTATTTTCAGCTACTATGCCTGCGGAAATAGAGATACTTGCAGAAGCC
ATATTAACGGACCCAACAAAAATTCAAATTACTGCTGAAACGGTTACTAT
CGACTTGGTTAATCAAAGTGTGTACCACCTTGATAAATCGAATAAAGTAC
CCTTGCTATTTAATATCCTGACAAAAGCTGACTATGAAAAAGTGCTCATC
TTTTGTAAAACAAAGTATGGCGCTGACATCATTGTTAAAGCACTAGAAAA
GGCATCAATAACTGCCGCTAGCCTGCACAGTGGTAAAACACAAGCAGTTA
GGGAGGAAGCGTTACAAAACTTTAAAGACTCTACTTTAAGAGTATTAGTT
GCAACTGATGTTGCTGCTCGTGGAATTGATGTTGATAATATTACGTTAGT
CATTAACTATAACCTTCCTGAAGATCCAAGAAACTACATACACCGTATAG
GACGAACTGCTCGTGCCGGGAAAAGTGGTATGGCTATTTCATTTGCTGTA
GAAAATGATATAAGGCAATTAACTAATATTGAAAATAGCATAGGGCAAGT
CATTCCTGTTGTTACAGAACAGCCTTTCCATAAAGAGTTTTCAAAAGCGC
CTATACAAGACAAGAAAAAGAAACAGGTTAAAAAAACAAAGAGAAAATAA
>CPS_3374 putative helicase
ATGGACTCAGTACCAAGTGGTGACTCTAGAATTCATGATCAAATAGGTCT
AGCTAATACCATTGTTCAATGGCTTAGTAAGCACATTAAAGATGATCAAT
TAATCAGTGAAAATCTACTCGATAGCCAAGGTAAAATCCTTACTGCGCTG
TTTGATAAGTCGAACCCTATTGCGGCTGATTTACCCAAGTATGTTGAATC
GATAATGCCAATAACCGGGCTAACGCAGAGTGAATTATTCTGTGGTAGTA
ACGTTGGCGTGTCGCTAGAAACTGAGATAAAAAGAGAGATCCAATCTTCT
GATAAAATCTATTGGCTCGTTTCATTTATAAAGTGGACAGGCATTCGAAT
ATTCAAAAAGGAGTTAGAGTCTTTTACTCGCAGCGGTAGGCAATTAAAAA
TAATTACCACTTCTTACATGGGTGCTACCGATGCCAAAGCCGTAGAGTTT
TTAGCATCACTGCCCAACACTGAAGTAAAGCTTAGTTACAATACGAACCG
TGAAAGATTACACGCAAAATCTTACCTATTCATGCGAAATACTGGCTTTG
ACACTGGTTATATTGGATCTTCTAATTTATCTCATTCAGCCTTAACCAGT
GGTTTAGAGTGGAACCTAAAAATCACCTCGCAAGAAATTCCACACATTAT
TAAAAAATCACTCAGTACCTTTGATACCTACTGGGAATCTCCTGACTTTG
AATATTTTGATGGTGAAATTGAAAGCCGTGAAAAACTAAGTAACGCACTG
CAAGAAGCAAGAGGCAGCTTTAATCCCTCAACACCGAGTTTCTATTTTGA
TATCAAGCCTCACTCTCATCAGCAAACCATATTAGAAAAGTTACAGGTTG
AGCGTGATCTACATAACCGATATCGAAATTTAGTCGTTGCAGCAACAGGA
ACAGGTAAAACCATTATTTCTGCCTTTGATTTTTCTCGTTTCTATAATGC
AAACCCCGAAGCAAAGTTTTTGTTCATTGCTCACCGAGAAGAAATACTAA
AACAAGCATTGGGTGCCTATCGTGGTGTATTAAAAAATAGTACATTTGGC
GAGTTGTGGGTTGGTAATAACAAACCTAGCAAGTATCAACACCTATTCGC
TTCGATTCAAAGTGTAAACGCTCAAATTGAAACCTTAGCGCTAAGTGAAG
ATTACTTTGATTATATTGTTATTGACGAAGTACATCATATTTCAGCAAGC
AGCTACCGCGCTGTATTAAAGCACTTTAGCCCACAAATATTATTAGGCTT
AACGGCAACACCCGAACGCCATGATGGCAGCGATATTCTCTGTGACTTTT
GCAATGTTATTGCCGCCGAAATTCGATTACCAGAGGCGATAAATCAACGT
CACCTTTCGCCCTTTCAGTACTTTGCCATAGATGATGATACCGACTTAAC
TAAAATATCATGGTCTAAAGGCCGTTATGATATTGCCGAATTAACACACC
TCTATACGTATAACGATCAACGAGTATTACGTATTCTCCAAAGCCTTAGC
GAGGTTATTACCGATATACCGCATATGCGCGCATTGGCGTTTTGCGTCAG
TAAAGAACACGCAAAATTTATGGCTAAAAAGTTCACACTGCATAATATTG
CTTGTGGCGTGTTAACCAGCGACAACAGTAAAGACCGTGAAGTCTTGCAA
CAACAGCTAAGATCAAAACAGATAAATGTATTGTTTGTCGTTGATATATT
TAATGAAGGGGTCGATATCCCTGAATTAGACACCCTACTCTTTTTACGCC
CTACCGAAAGCTTAACGATATTTCTTCAGCAATTAGGCCGTGGACTGCGA
TTAACAGAAAATAAAGAATGTTGTACTATTCTCGATTTTGTTGGTAATTC
ACGACCAGAGTATGACTTTTCTAGCAAGTTTAGAGCATTAGTAGGTAAAA
CCAACCAGGCGATAGCGAAAGAAGTGAAACAAGGCTTCCCTCACCTACCC
TTGGGTTGTCGCATTGAGTTACAAGAAAAAACGCAAGCAATGATCTTAAG
AAACATTAGCCAAGCGACATTAAACAAAAATAAGTTAATTAGCCTAATAA
TCAGCTTCCAGCATGATACAAAATTACCATTAACGCTGACTAACTTTTTA
CATCTTAACGATAGCATTACCCTAGAAGATATTTACAAGATTAAAATCGG
ACCATTTGGAGGATGGTCTATATTAGTTGCTGCAAGCAAGAACAAAGAAA
TAGCGCCAGAGAATAAAGCCCTTTATGCGGCATATTATCGAGCCATTAAT
AACCGCTTACTTAATTGCTCATCAATCTCCTATTTGCGTTTTATTAAAGC
CCTTTGCGATAACAACTTTTCCATATCGTCAATGTGCGATACCAACACGA
ATAAAACCCCACAGAATCATCAGCAACAGTTTGCATTGATGTGTCACTAT
GACTTTTGGGACAAAACAGGTAAGTCACTTGGCTTTAATGACGTGGCGAC
AGGCTTATTAGCACTGAGAAATACAACACTGCGTTCGGAATTAGCCGAGG
TTATTTCAATGCTAATTGAACGCCTTGAAGTGAGCGAATTTACTATGCCG
AAAGTTAACAATTTGTTAGTCGATTCATCGCCACTTAACATGCATGTTCG
CTATCCAAAAGAACATATTCTGGTCGCTTTTGGTGATAGTACCTTTGTTA
AAAAATCATCGAGTCGTGAAGGTGTTTTAAATATTGCTAACGCAAATACT
GAATTGTTGTTTGTAACGTTGAACAAATGTGAAAAGCAATTTTCAGCCAC
CACCATGTACCACGATTATGCCATTAGCCCGACCTTGTTTCATTGGCAAA
CGCAAAACAGCGCGAGGCCAAATTCAGGAAGAGGTTTAGGTTACATTACG
CAGAAAGAAAATAAGAAAACATTCCTGCTATTTGTGCGTGAACAAGGCAA
AGATGAAAACGGCAGAACTATGGGTTTTGTTAACTTTGGCCCTGTCGATT
TTGTCAAATATGAAGGCAGTCAGCCAATGAATATCACATGGAAACTTAAA
CATCCCATGCCAGCATATTTGTGGCATGAGACGGCTAAGTTGGCGGTAGG
CTGA
>CPS_1157 MutT/NUDIX family protein
ATGCGTTTACTCAAATCAACTATTCACCCTGACATCAACGATCTTTCTGC
CACACGTTTCACCCGGAATGCGACTAGAGCGATTGTGCTTAATGGGGATA
ATATATTACTGCTATATACCAAGCGATATCACGATTACAGTTTGCCTGGT
GGCGGTATAGATGAGGGTGAGAGTAATATCGAAGGACTCATTCGTGAGCT
AAAAGAAGAAACGGGTGCGCATAGTGTTAAAGATGTTGAGGCGTTCGGTC
TTTATGAAGAATTCAGGCCATGGCATAAAGAAGGCTTTGATATCATCCAT
ATGCAATCTTATTGTTATACCTGCACCATTGATGATGAGTTACTTGAACC
TGAACTTGAAGCCCATGAATTAAGTAACGGTATGCACCCAGTGTGGATGA
ATATCCATCAGGCTATTAGCCATAACGAAGAAACAATCGCTAAAAATGAC
AAAAAAGGCCTTTCAATAGAACGTGAAACTTTTTTATTAAAGCGTATTGT
CAGTGAGTTACTAAATGAAGCAGAGCCTGCTATATCTCGTTAG
>CPS_2416 DNA-binding protein
ATGGATTTATCAATTTACTTCAACATGATATTTAGTGCCGCTTGGTATTT
AATACCGATCTTCATATTTGCTATCGTCATAAAGTCTGCATGGTTTAAAG
GCATATTGGGCGAGTGGCAAGTAAACTTGCTCATCAAATTTTTCTTGAAC
AAAAATGATTACCACCTGATTAAAAACGTAACATTACCAACATTCACTGA
TGGTGAAGAGCAGGGGACAACTCAGATCGATCAAATTATCGTGTCAAAAT
ATGGCATTTTTGTGGTTGAAACCAAAAATATGAAAGGTTGGATATTTGGT
AGTGAAAATCAGAAGCAATGGACGCAACAAATCTTTAAGCACAAATCAAA
GTTTCAGAACCCACTTCATCAAAACTATAAGCATGTCAAAACGTTAGAAG
ATCTTCTCCTAACAGGGAGTAACGCAAAGAATGATTGTATATTTTCAGTC
ATTATCTTTATTGGTGATAGTACTTTTAAAACTAAAATGCCAGAAAACGT
GAGGTTTGCGCGAGGTGGAATTGAATTTATTAAAAGTAAAGCAGATGTCA
TTTTTGATCGCGATGAAGTAATTAACAATATCGATAAAATCGAAAACGGT
AGGTTGGAACGTAGCTTCAAAACTAACCGACAACACGTTAAACATGTAAA
AGAAATAGTGCATAAAAAAACTGATACAAAATCGTGCTCTAGGTGCGGTT
CTGAAATGGTATTACGTAAAGCCAGCAAAGGTAAGAATGCAGGTAATGAG
TTTTGGGGATGCCGTTCGTTTCCTAGGTGCAGGAATGTAATAACTGCTTG
CTAA
>CPS_1418 ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family
ATGTCCTTCTCAACACTTAAATTATCTACCCCAATACTCAACGCCATTGC
TGATCTAGGCTATACCAAGCCAACAGCTATTCAACAAAAAGCAATACCTG
TTGTTTTAGCGGGCAAAGATATTATTGCCGCAGCGCAAACTGGTACAGGT
AAAACAGCCAGTTTTGTTTTGCCATTATTAGAGCAGCTTAATAGTCAGTA
CAAAGAAACAGGTAAAAAACTACGTGCTAAACGTATTCGTGCCCTTATTC
TTGTACCTACCCGTGAGCTTGCTGTCCAAGTTGAAGCGAGTATTAGTCAG
TATGCTAAATATTTAGATATTAGCTCTATGGCCATGTATGGCGGCGTTGA
TGCACAGGAACAAAAGCAGCGATTGATTTGGGGAGTAGATATTCTAGTAG
CAACTCCTGGACGTTTGCTCGACATGACACATCAAAGGGTTTTACATTTT
GATGAGCTTGATATGTTGGTACTTGATGAAGCCGATAGAATGCTTGATAT
GGGTTTTATCGATGACATTAATAAAATCATTGAACGTTTACCTGAGCACC
GTCAAAATTTACTGTTTTCTGCCACTATGTCTGAAGAAGTTCGTGGTTTA
GCGAAGAGAACGATTCATAAACCTGTCGAAATTTCTATCGGTGCAGATAA
AGCCTCTAAACCTAAAATAGAGCAGTGGTTGGTTACGGTTGATAAAGCAA
ATAAGTCCGCATTATTAAGCCATATAATTACTACTCAAAATTGGCAACAG
GCGCTTATTTTCATTGAAACTAAGCATGGCGCGGCAAAATTAGTAAGCCA
GTTAGAAAAACGCGGTATTGTCGCTGAAAGTATTCACAGTGGTAGAGCGC
AAGATATTCGTGAAAAAATACTTAACGACTTTAAATCAGGAAAAATAAAA
TTTTTAGTCGCTACCGCTATTGCGGCACGTGGTCTAGATATTGGAGAGCT
TTCGCGCGTTATTAATTATGACTTACCTGCGCAAGTAGATGACTATATTC
ACCGTATTGGCCGAACAGGTCGAGCGGGAGCATCAGGTGAAGCTATTTCT
TTAGTGTCTAAGGATAACTTCAGAGAGCTTTGTGCTATTGAAAGTCGCTT
GGGCCATATTATTGAACGAAAAGAGTTTGAAGAGTTTCCAGTGAAAAAGA
CGGTACCGCTCTCGAAATTAAACTATGTCACGAAATACGCAGCCTCTAAA
AAATAA
>CPS_2953 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGGCTGAAGTACAAGCAGTAAAAGATTTAGACACAGTAAGGCTTATAAG
TCACTTACTAGAAAGGCGATATTCAAAGCAAATGAGGTTTGTTTGGGAGG
TGGGTATAAATTTAGCATTACGCGTATCTGACTTGCTATCGATTAAGTTT
ACTGATTTCACAGATGGACGACTGATTATTAAAGAAGGAAAAACCGGAAA
GCGAGCTGAGATTAAAGTTAATCCCAAAACACAGATGTTAATTAACGATA
TTCAATTACAACATCCACACCATGTGTATTTATTCCAATCTTATCGTAAC
CAAAGAGCAATCAATGGTCCTGCAAGACCATTAACAAGAAGATCTGTATC
CAAAGCTTTTGAATTAGTCAGTGAAGAGTTAAATATTCATATCAACAGTC
ACAGTATGCGTAAGACACGCGGATATCACCTATATAAGAAAACTAATGAC
ATTGCCCGTGTGATGGTAATGCTAAGACATAGTTCCGAGAGTACAACACT
TAGGTATATCGGTATAACCCAGGAGGATGTCGATAGGGACTTTACAGAAC
TAGAGCTTTGA
>CPS_1302 putative helicase
ATGAAGGTATTAGAAAAAGATTATCAGATTAACAGCGTCCGTAAGGCTAT
TGACGCTGGAGCTAACTCCATTATTGCATTACCTACGGGGGGCGGTAAGA
GTATCTGTATACTTAAATTGTGCCAAGCAATGCCGGACAAGAAAGTCGTC
ATTAGTTTACGTAATGCGGCATTGGTTCCTCAATTATTGCACACCCTCAC
TATTAATGGCTTGTCTGTTAGTGTTGTTAAGTCAGGTTATAAGTATATAG
CTGGCGGTGATGTTACTTTGGTAATGGAGCAGTCATTTGGCAGAAGAAAA
CACCTAAACATACAGTGCGATGTGCTTTTACGTGATGAGTATCATGTGGG
ATGCATGGGCGGCGTTTATATCGCGATGCGTGAAGAGTTATCTCCTGACT
TAATTATAGGCCTAACTGCCACGCCCATTGATAGATTAGGCGTTTATATT
GATAAGTCGATGCAATTGATTGAAGAAACGACTACTAAGATGCTGATTGA
AGCGGGTGAATTAGCCAAGCCGGTTTACAAAGTACCTAGTCTATCTCAAG
AGATAGATTACAGTGCTGTCAAAATGTATCGAGGTGACTTTAGTGTCTCT
GGTTTAGATAATATATTACTGGAACATTGCTCTTTAGTGGCACAACAGAC
CGTTGATGATGCACTATCTCATGGTCGTAAAGTAATGCTGTTTGCTAACT
CTATTAATCATGTAGAGTCACTGTCTGAGGCTTTTGATTTACTTGGTATT
GAACATGAGCGTGTTCATTCTCAGCGTTCGTCTGATGAAAATGATGAAAG
CATCCGTAGATATAAGTCAAACGAAGTTAGGCTAATAATCAATATGTCTA
TGCTAACGATTGGCTTTGATGATCCCACCACTGATTGCGTTGTTTTAGCT
AGACCGACCAAGATATTAAGATTGTACTTGCAGATTATCGGCAGGTGTTT
GCGTGCGTCAAAGGGCAAGACTAGTGCATTAATACTCGATTTAGCACAAT
GTATTTCTACCCATGGTTTTGCTGAGGATCTTAGAGATTTTACTCGTAAA
ACTTCGAAATCTGCAGCGATAATGGCTGAACGATTGAGCGTAACCAATAT
AGGTCAATTTGTTGATGGCGAGTTCACCTACAATGAATCAATCGAGCGTA
AGGTTGTCAAGAAAAGAGCACCTGTTATTCGCAGAAAACCTCGGGATGGG
TTGGTTGCCAGCAAGGAACTTGTTGATAGAGCAGCAAGTAATAGAGCAGC
AGCGTTACTCAGGTTAAACCCTAGAATGGAAAAACTGGTCAGCACTATCG
AATTGGTTAATATCGTGTATGAACAGCAAGACGAAAGTAGCAAAATGCTT
GATGAAGTAGCTATGGTTAAGTTAGTTGCCCTGATAGGGTTTGCTTATAG
TGATGCATTAGTTGATAGCTGCACTGCATTAGTTGAAGGATTACACGCCC
AAAACCAATCTATTAGAGGTTTACCGCTCAGAGTTAGCAACTTGATAACC
TCAATTGCTATGCAAGATTTAGGTGTCAAAGAAGTAGTAACCAAGTCTTA
A
>CPS_3684 conserved hypothetical protein
ATGACCAAAGCCAGTTTAATCTGTAATAAAAAAAATAATATAGATTTAGT
CTTAGAGCCAATCAAAGGTGGTGACACTATATCCACCTTGAGTATCAAAG
AATTAATTGATGCATCAGAATTTGCAAAACTTCGCATTAATAACGGTAAT
ATTAAAAATGCTGTTGCTGAGTTAAATGATGTTTTAAAACCCCTACAAGA
TAAAAAAGTAGGCAGAACAATTCGCTATCAAGTACTCGAACGGGTTGATG
CGAAAATTAGTATCACTATAGAATCCGATGAGATGGGGGCTACCGCTGAA
ATTACTAGCGCTCAAGGTGGTAAACATCTTTCTGCAAAAGCGATATTAAA
CGCCGCACAAGAGGCAGGTGTAAAAAAAGGCTTTAGTAAAGAGCATTTAA
TTCAACTTGCACAACTTGCTGCAAAACAAATTCCCAATAGCCAGATTGAT
ATGCAAATTGCTACCGGGAAAATCGCAGTTAATGGCAAAGATGCCCTAAT
ACAGCCTTTAGTTGAAAGTGCCCAAGCCAGAATTTTAAAGCCTAAAAAAC
GAGAAGATGGTAGTGTCGACATGCGAGACTTAGGCGATATTATCTGTGTA
AATATAGGTGATGCTATTGCAAAAAAAGTGCCTTTAACCCAAGGGAAGCA
AGGCTATACTGTTACTGCTACCCCTCTATCACCAGAGCCTGGTAATGATG
TTGAACTCGTCGCGGGAGAAGGAACAAACATAAGTCCTCAAAATACTAAT
ATTCTGGTTTCTGAAAAAGTTGGCTTACCTAAACTTATTAATAATGGTAT
GGAAGTTGATGAGATTTATAAAATTAAAAATGTCACTGTTGCCACCGGTA
ATATCAACTTTACCGGTAGTGTTATTATTGATGGTGATGTTACTGAAGGT
ATGAAAGTAACTGCTTCAGGTGATATTACGGTAGGTGGTTTTGTTGAGTC
AGCAACCCTTGAAGCCGGTGGTGACATCACTATATCTGGTGGGATTATTG
GCCGAAAACATGATGTTGAAAAAAAACATATTACCAATATCACCATGAGT
GTCAATATCAGTGCAAAAGGCAGTATCTATGCAAAGTATGGGCAATATGC
CCAAATTACTTGTTACCAAGATGTTCGTATTGAAAATCAATTACTGCACA
GCATTTTAGATATAAGTGGCCGATTATGGATAGGAAAAAATGAGCAAGCT
AACGGAAAACTAATTGGTGGCTACACCAAAGCAGGGACATCGGTTCATGC
AGGTATTATTGGCGCAACAGCGGGTAGTAATACCATTATTAATTTTGAGC
ATAAAATACTCAAGTTTAAAGATGAAATTCACCAATTAGAAGAGCGACTT
AAAATAGAGTCTGATAAAACAAACGAATTGAAAGTAGCAATCAATAAATT
AAAAAAATTACCAAAAGAAAAAGCCAGGCCAGAATTAGTAGCTAAAATTG
TACCAACCTATCAATATCATGCTAATCAAATGGGTGAAATACTTAACGAA
AAGCTAATCCTCGAAGACAGTTTTCAAGGATATATAGTCAGTATTTATGT
TGAAGCAACGGAGAAGCTTTATCATGGCGTAGAGTTAATTGTTGGCGACT
ATAATGACAGATCTCGTCGTGAATATGGTCCAAGCAAAATGAGATATCGA
GAGCGAAAAATACTGATTGATCCAATAGTGAATACATAA
>CPS_4217 oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family
GTGGTTAATTACTATGGCGAAATCATGCCTCTTAGTGAGAGCAGTTATTA
CTTTGAGCGATTATTTAACACTATTGCATGGCGTAACGATCAAGCCTTAG
TGTTTGGTAAGATCATCGAAACGAAAAGAAAAGTCGCTTGGTGCGCAGAT
ACGATTGACGGTAAACCTTTTGCCTATAGTTATTCTGGCGTGACCAGATA
TTCGATCCCGTTTACTGAAGAGTTACTTACACTCAAAAAACTAGTTGAAC
AGCATAGTCATGAAACCTATAACTCGTGTTTGTTAAACCTTTATCATTCA
GGTGAAGAGGGCATGGCATGGCACAGTGATGGTGAAGCAGATTTAAAAGA
ACAAGGTGCTATTGCTTCATTAAGCTTTGGCGTGGAGCGAAAGTTTGCTT
TTAAGCATAAATGTTCAAAAGAAGTTGTTGCCTTACAGCTTAAACCAGGC
AGTTTGTTAGTGATGAAAGGCACTACGCAGCAGCATTGGTTACATCGCTT
GCCTCCGACAAAAAAAGTCTCTGAACCCAGGATAAACCTCACCTTTAGAA
CCATAGATAAACCGGAACTTAAGTAA
>CPS_0780 exonuclease
ATGAACGCAAACTCTCTAATAATCCTCGATTTTGAAACAACCGGTCTGTC
ACCTGATAATGGCGATAGAGCCATTGAAATTGGTGCGGTAAAACTTGAAA
ATGGCGTGGTAACTGATCGTTTTCAAGAGTTGATGTATCCTGGGCGACCG
GTAAGTCACTTTATTGCTGATTACACTGGCATCACTAATGTAATGCTAAG
TAAAGCCGCGCCATGTCATGAAGTCATGGATCGTTTTAGCGGTTTTATTC
AAGGGCAAAACCTCGTTGCTCATAATGCATCGTTTGATAAGCGTTTTTTA
GATAGTGAGCTAAAGCGTATCTCGTCGGGTTATGATGGGCAGTTTGCCTG
CTCGTTATTGTTATCTCGTCGATTATATCAAACTGCACCTAACCATAAGT
TAGGTACATTAATTAACTATAAAGGCATTGCCTCAAATGGCAGTTTCCAT
AGAGCATTATACGATTCTGAAATGACAGCAAAGCTTTGGGTTGCGATGTT
AGATGATATTCAGCAACAAGCTGGTATTGATGAAGTGCCATTTTCTTTAA
TTCAGAAGTTAACTAAAACGACTAAAGCGAATGTTGGTAAGCTTTTAGCT
AACTACAGATAA
>CPS_0900 site-specific recombinase, phage integrase family
ATGAAGAAAATTAAAAAAGTACAAGATGGAATTTGGAAAACCGATTCAGA
AAGTAAGCCTTATCAAATTGACTTTAGACCTAATGGCCACCACGGCAAAC
GATACAAAAAAAGCTTCTTAACACTTGGTGAAACAAGGCGGTTTATGAAC
CATTTAATTTCAGAAAATAATGGTTTAAAAGAATGGCAACCTGATACAGA
CGATAATCGAAAGTTAAGCACAATTATTGATTTATGGCATAAGTTACATG
GCAAAAATTTAATTGAAGAAAAAGCGCTACTTCAAAAGTTAAAAAATATG
TGTAAAGGACTTAATGATCCTATTGCTAGAAAGTTAACGCCTAAAGTATG
GGTAGCATACAGAGCTATAAGATTAGAGAAAGTATGCGCTAAAACTGTAA
ATGAAGACCAAAATAAAATTAAAGGCGTATTTAATGAGCTGATAAGGCTT
GGGGAATTAAAAACAAACCCACTAAACGGGCTTAAAAACTTAAAGTATTC
AGCGCCTGAAATGGGATTCTTTTCAAAGAACGAAATGATGACCTTATTAA
ATGAGCTAAAGAACTCAGACAATATTGATGCTTATTACATTTCAAAAATA
TGTTTATCAACTGGTGCAAGGTGGGGAGAAGCTGAAAAACTACTAAGTAG
AAACTTAAGAGACAACTTCATTACATTCATTAAAACCAAAAATGGCAAGA
CAAGAATAATCCCCATATCAGACGAGCTTAAAAATGAAATACCCGAAAAA
GAGGGTAGATTGTTTAGTGACAGCATGAAAACATTTAGAACGTCATTAGC
TAAGACCGGTATAACACTCCCCAAAGGACAAGCTACACATGCTTTAAGAC
ATACATTTGCTAGTCATTTTATGATGAATGGCGGGAATATTCTGGTACTA
AAAGAAATACTCGGACATGCACGAATTGAAGAAACTATGAAGTATGCACA
CTTTTGTAAAACACACTTACACGATGCCGTGATGCTAAATCCAATCAGTA
AATAA
>CPS_1707 putative protein kinase
GTGACTAATAAAAAATTACAGCATTTCTACATTGCCCAAGAGCAATCCAT
TTACTTACTCAGTCATAAAGATGCGACTAAGTTAAAACAATGGGTTGATC
TTTGTCAGCAGCAATTAAAGCAACTCGGCTTTGAGGATGTTGCACTGTTA
GGTAAAGGAGCCTATGGCTTTGTTTTCTCAGGTATCAAGCGCAAAGGTAG
TTCAGCAGATCAATTGCCCGTTGTCTTTAAGTTTTCTCGCATTAATTTAC
CTCAACATGTGCAAGATAGGTTGGCAGAAGAGGCCGAGATTCAAGGGCAA
CTTAGCCACCCACAAATTCCAGAAGTAATTGATTATCAGAAAATAAAGCG
ACAATCAATTCTGCAAATGACGCGAGCCCCTGGCATAGATTTAGAGCAAT
TGTCGTTGCAAGTAGGGCCATTAGCACCAGAGTTGGTGGTCAGTATCGCA
TTGCAATTAGCCGATATATTACTGTACTTACGCCAAGCTAATAATCACCG
ACAGTTAAAACCTATTGTGCATGGCGATATAAAGCCTTCAAACTTGGTTT
ACGATAAAAGCACAGGCAAGGTACAACTTATTGATTGGGGCTCATCCGTT
AGTGCACAACTTGATTGTGACAAGCAAAGCACTAGTACTAATGTGATGGA
CCTAATGAGCAGTGACTTACAACATAGCAATGCACGTTTAGGAGATGTTT
ATTTTATTGGGCCTGAACAGCTCAATGGTGGTCTATCTAGTCCTCGTTTT
GATGAACAGGGCTTAGCAGCGACGTTATATGCACTCGCTTCAGGTCAGTC
ATGCCGATATGGCGTAAAAGTGATACCACCGAATGCCTTGGGTTTACCAA
AATTACTGGCTCAAGTCTTAACGGGGATGTTAAGCGATGATGAGAAACTT
AGAGCGCAAGCAGGTGATTACTTTTTTAATAATCTCACTTACCTTAAACA
AGTTGTTCTGGCAGATAAACCAACCAAGATTAACGCCATTGCACAAATTC
CAGTTTGGGTAAAACCTCAAGGTGAGCAAATTGATACCGTAGTATATGGT
TCACGAAAATCATTTTTACGCGAGCAAACAGGGCATGATAGTTTATCGAA
CATTGATGATGCTCAGTTGGACAAATACTATAAAAACTATCTTATGGGTA
TGGGGGATAATGAAAAAGCGTTCATTGCTGCATTAAGTCGGCTTGGTAAT
TTTCCTGTGGTAGGCGGCATTGCGATTCGTTGGGCGAAAGAGGGGGTTTA
CATTGATTCTAACTTAACGTTATTTGATGAAGCACTCAAAACCGCGTTTA
CTAGTGCAGTGAACAATATTATTTATTTGGCTCAGGGCATATTTCGTGTC
GGTATGTTCAAAAGTTGTTTATTTAACGCCCGAAACACGCTTCACGTAGA
ACGTATTAAAGAAAATCAGCCCTTTGTTGCCGATGAAACTCAAGTGATAC
AGTTTGAAGTGAGTGATGTACCTGATGTTGATGATATAACCCGCTTACAT
TCTTATTTTGAGGATGGTAAAGATCCTGATGAATACTTACACCTACCAGA
TGAGTTAATGTCTGTTTTGGCCGAGCTCAATTTAATTCATCATACTGGTT
GTATTATTTTTGAAGTGCTACCCAAGCATTTAAAGATTCATAGCTATTTA
ATGTTGTTGAATCATGAGAAAGAAGCCGAGTTTACAGACTGTTTAGCGAA
GGTACTGACATTGTTACCGACTATTGACGGTGTTGGCATTTCAGGTTTTA
TGAAACTTCCCTACAAAGATACCCGTTTTTTTGAACACATCAGCAGTATG
CCAGACAAGTTTTATCCAAAAAACCCTAAACTTTAG
>CPS_3353 methylated-DNA--protein-cysteinemethyltransferase
ATGGATAACTTTGAGTCACATCGTCACTACCAAGTTGTTGAAAAAGCGAT
ACAGTTCATCAATACGAATTTTGATAAACAGCCGACACTTCTAGATATTG
CTGGTTCGGTACATATGAGTGAACATCATTTACAACGAGTGTTTTCTCAG
TGGGCAGGCATTTCACCTAAACGTTTTTTACAGTTTATTACTAAGCAAGC
GGCTTTAGACGCTTTACAAAACACCAATAACTTACTTGATGCAAGCCATA
GCATAGGACTCTCTGGCTCAGGAAGATTACATGATCTTTTAGTAACATGC
GAAGGTATGACACCCGGTGAATTAAAAGGGGGTGGTGAAGGTGTGATGAT
TCAATACGGTGTTTGTTCAACTCCTTTTGGTGAGGCAATTTTAGCTTGGA
CGTTAAGAGGCGTTTGCTATCTTCAGTTTATAAAAGATAAGCAACAACCA
GTGATTGATGAGTTATATCGACAATGGCCCAACGCCAGTATTACCCCCAA
TAGAGAAGAAGCGGTGCAAATGGGCAACGGCATTTTTTCATCATCGATTG
AACGAGGAAAAATTCATTTATTACTCAAAGGAACGAACTTTCAAATAAAG
GTTTGGGAAGCATTAATTAATACTCATTCTTCACAGCAGCTTTCCTATTC
ACAAGTTTCCCAACTAATCGACTCACCAAAATCTGCCAGGGCCGTCGGTA
CTGCCCTCGCAAACAATACCATTGGTTACTTGATACCTTGTCATCGTGTC
ATAAAAAATAATGGCGAAATTGGCAATTACCGTTGGGGCATTGAACGTAA
AACTGCCATGCTTGCCTGGGAGCGAGCTTCATTAGAAGAGTCTAGTTAA
>CPS_3615 MutT/nudix family protein
ATGACAAAAGATGAATTTTTATTACGCTTTAATTTATTACAGTTGGCCGA
GTCTGAGCATAACTATCAGCACCCTTCACCTCTAAGATCGGCAGCTGTAC
TCATCGCTTTAGTCGAATCAGATAGTGGTGAAGGTTTGCAAGTTTTATTA
ACTAAACGAGCTAGCCACTTAAAACATCACCCATCTCAAGTAAGTTTCCC
CGGTGGAAAAGTAGAACGAGAAGATAAATCACTTATAGATACCGCCCTTC
GAGAAGCTTTTGAAGAAATAGGTTTGTCTCGTGAAGCAGTAACTGTGGCT
GGTCAACTACCCCCCTATGAGACCATTAGTGGTTTTCAAGTTACACCTAT
TATCGCCATTGTTGCCAGTTCACAAATTTATCAGATAGATACAAATGAAG
TCACTGAAGTATTTCAGGTACCCCTACAGCATTTTTTAACCACTACAGAC
CATCATGTTTTTGTTGCCCATAAAGGTGGAAAACAACACAATGTGCATTT
CCTTCCCTATAAAGAATACAATATTTGGGGTGCTACCGCGGTAATGCTCA
AAGATTTAGTTGCCCACATAAACTAG
>CPS_3122 ISCps9, transposase orfB
GTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTCATCGA
AAAACACAAAGAAGCCTTAGGTGTTAAATACCTTTGCTCATGGCTTGATG
TCTCTCGTAGTGGCTTTTATGCATGGCGACGACGTCCACGTTCAATGCGT
GCTATTAATGATGCGGATTTACTTTTAAATATCAAACAAGTCTTTAATAA
CAATCATCAAACCTACGGCAGCCCACGCGTATTTCATGCATTAAAGCGTG
AAGGTATTACAACGAGTGAGAAGCGTGTTGCACGGTTGATGCGAGAAAAT
GGCTTACGCGCTAGAGCGCTCAAGACTTATAGCAGGCCAGCTAAGGTGAA
GTTCTTTTATAAAGCGATCAAAAACAATCGTAAAAACATAAGTAAGCCTG
ATGCTATCAATCAGCAATGGTCGGGAGATATTACGTACCTGAAAGTAGGA
TCGCGCTGGTATTACTTAGCCGTTGTATTAGATTTATTTTCACGTCGTAT
CATTGGTTGGGCTTTTGGTCAGAACAAATCAACAGCGCTGACACTGAAAG
CGCTGCAGCTAGCAATAAAGAAGCGTAAACCGACACAACCCTTGTTATTT
CATACTGACAGAGGCGCTGAATATCGAGCACATGTAGTGCAGCAGTTCTT
AGTTAAACATAACATTACGGCGAGTATGAACCGTCCAGGTTGTTGTACTG
ATAATGCTGAAGTTGAATCATTTTTTCATTCATTAAAAGCTGATTTAATC
AGAGGGAATGTCTTCGCGACTACTGATAAATTACATTCAAAATTAAAAGG
TTACATGAACTATTTTTACAATAGACAACGATTGCATTCAAGTTTAGGAT
ATAAAACACCTGCTGAGTTTGAATTGGCGGTGAATTAA
>CPS_3375 ISCps6, transposase
ATGTCCCACCATATTAAAGGCCAAGGTCGAAACCAAATAACCCTATTTCC
TGAAGCATTGGACGATTTTGTCACCAAAGAAAATCACGTTCGTGTTGTTG
ATGCCTTTGTTGATGAGCTTGATTTACACGCTTTAGGATTCAACCGTGTT
ATCGCCAACAACACAGGCCGTCCAGGTTATCATCCTGCCGCGTTGCTTAA
GTTATACATTTATGGGTATTTGAACCGCATCCAGTCCTCCCGTCGTTTAG
AAAAAGGATCACATCGTAATGTTGAGTTAATGTGGTTACTCGAGCGTTTA
CAGCCAGATTTCAAAACGATTGCAGACTTCAGGAAAGACAATGGTAAGGC
TATCACTAAAGTTTGCCGTCACTTCATCGAGTTATGCCGTCAAATGAATA
TGTTCACCGATGCCGTCGTGGCTATCGATGGCAGTAAATTCAAAGCGGTT
AACAGCAAGCACAACAATTACACGCCGAACAAAGTTAAAGATCATATTCG
TCGTATGGAAACACATATTGAGAATTATTTGAGTCGGCTTGAAACCGCCG
ATGGCAATGATAAAGTTGATGCTGTTCAAACCTCTGCGGCTGAGAAAATC
GCATGGATGAAACAACGCGTAGCTGAACTCAAGGAACTTGCTGTACAAGT
GGAGGCGCATCCAGACAAACAACTTTCCACGGTTGACCCCGATGCTCGCT
TACTTAAGACACAAGGCATGAACAGACAGGTTTGTTATAACGTTCAAAGC
TCTGTTGATACGAAACATCATTTGATAGTGACGCACGAAGTCACCAATAC
CAATGACCGTGGCAAGCTGGCCGATTTGACACGATTAACGCAGCAAGCAT
TGGCGCAAAAAAACATTACAGTGTTGGCAGACAAAGGTTACTACAGCGGA
CGTGATATCAAAGCAACTCAAGATATGGGGGCCTCTGCGCTTGTGCCCAA
AGGGGATACGTCAGGTGCTAAAAAGAAGGGGATCTTCAATCGGTCTTTAT
TCAAATATGACAAAGACCGAGACCTTTACGTCTGTCCTGCGGGGAATGAA
CTACCACATAAGCGAAATGTTGAAGAAGGCGGAATGAAACTCAAGGTCTA
TGTTGACCACATTGCTTGCAGAAACTGTGATATTCGCGCTAAATGTACTC
AATCAAAACGCGAGCCACGAAAGATAAGGCGTTGGATACACGAAGGTGAA
ATGGAAGAAATGCTAACAAGATTGAAAAACGCACCTGACACGGTGCTCAT
TCGAAAACAAACTGTAGAACATCCTTTTGGCACCATTAAAATGTGGATGG
GAGCAACTCACTTCCTTACCAAGCAACTGAAAAATGTCAGTACCGAGATG
AGTCTTCATGTGCTCGCTTATAACCTCAAACGAATGATGTCGATTGTGGG
CAGTGAAAGTCTAATCGAAGCAATAAGGGCGTAG
>CPS_1409 ISCps4, transposase
ATGACTAAGTTTTCAGTTTATATCGGTATTGATTGGGCAAATGATAAACA
CGATGTATGTGTTCAAGTGGCTAATTCAAGTGCACGAAAGTTTGAAGTAA
TTAAGCACTCACCTAAGTCGATCAATGAATGGATAACCAGCCTTCATAAG
CAATACAAAGGACAAATAGCTGTTGCTATTGAACTATCCAAAGGGCCTAT
CGTTTACGCACTTCAAAAATTTGATTTTATCACTATTCACCCCGTTAACA
CTTCAATGTTAGCTCAATACCGTAAAGCTTTTTCACCCAGCGGTGCAAAA
GACGACCCAACGGACGCAGAGCTTGCTTTAGATTTAATGCTGAGATATCC
CAATAAAATTAAAGCATTAAAAATGGACAGTGAATCGGTTAGGAAGTTGA
CGTATCTAGTCGAACAGCGTCGTAAGTTAGTTGATGATAAAAGGCGGTTC
AGCAACCGATTAATCATTACACTTAAAGAATATTACCCTCACTTACTTGA
TTGGTTTTCACACCGAGGATCGGGGATATTTTGTGATTTCATTACACGTT
GGCCCAACCTACAAAAACTTAAAAGAGCTAGGGCTGATACCTTGAAAAAG
TTTTTTGGCTCATACCCTGGACGTACTGCGGCATATAGCGTTAAGCGAAT
TCAATCTATTAGTGAAGCAGAGCCGCTCACTCTCGATAACGCAGTTATCG
AGTCGCACCAACTGCTTGCAGTTGCATTAGCTAATCAACTGCTTGTTGCT
GTGAAGGTTATTAAGGTCTTTGATAGAGAAATTAGTGAGTTGTTTAATGC
TTTGCCGGATGCAGAACTTTATAAATCATTACCAGGTACTGGCCCGTGTT
TAGCACCTAGGCTATTAGTGGCTATTGGGGAAAACCGTAGTCGATTCAAT
AGCGCATCGGAAATTCAAATGTATGCAGGGATAGCACCCGTAACAGTGCG
TAGTGGTCAAAAGAGCTGGATTCATTGGCGATATCAGTGTTCTAAATTTA
CTCGCCAATCATTTATAGAATGGGCTACTAAAAGCATAAGGCAATCTTAT
TGGGCGGAAATTTATTATCAGCAGCAAAGGGAAAAAGGTAATACCCACCA
GGCAGCTGTGCGTTCGCTAGCATTTAAGTGGATACGGATCATATATCGTT
GTTGGAAAACTAAAGAGCCATACAATGAAGCCAAGTATTTAAAAGCATTG
AGCGATAGGAATTCCCCATTACTTTTTAAAGAAAAAGCTTGTTAA
>CPS_0137 single-strand binding protein family protein
TTGTCATTATCGGATGCTGTAAATAAACACCCAAAAAGCCCAAACCCACA
GCTTTGTGCCGTGACCTTATTAGGTAATTTAGTCGCAACTCCTGATATTC
GTTATCGTGCTAATCCTGCAACCGCAGTGACTGAAATTGTGTTAGCTACA
TCCAGTAAATGGCTAGATAAAATAACTAATAAGTATAAAGAGTGGACTAG
CTACCATCATGTAAAAGTAGAAGGTGAGTTGGTCGAATTGGCATTACTAA
ATGCCAACAAAGGTGACATAATTTTACTGCATGGATATTTAAGTAATATT
AAGCCAAAATCGACAGATAAAAGCACTAATCACTTAGGTATTGTACACGC
AAACTTTGTACAAAAATTTGAAAAAGGTTATACACAAGCAATCAACCAAA
TTCATTGTAGTGCTCAATTAACGTCAAAGCCAAAACTGATGTTAACCGAA
CAAAATAAGAATATTACCCAAGCAAATATTGTCATTAACCAGCATATCTA
TAATACCGATAAACAAGCGTGGCAGACAATTTCAGTAGAACGCGCCATTC
ATGTTTGGGGAAAACAAGCGCAATATCTAGCAGAACATGGTGATATTGGT
GATGAACTGATGTTAGAAGGTAAATTAAGTTACACCAGCGGCGTTAGCAA
AGATCAATTTATTGAAGTAAAAAATGTGCATTTATTTAAAGGCACTTAA
>CPS_4852 ISCps5, transposase
ATGGCTAAATTAAATGGCAATTATTCTGTTTATGTTGGAATAGATTGGGC
GAACGACAAACATGATCTATGCATTCAGCAAGCTAATTCAGATAGACGAA
AATTTAAGGTAATAAAGCACTCAGCGAATACGATAAATGATTGGATAATC
AGTCTGCATAAGCAATATAAAGGACAGATAGCCGTTGCTGTTGAATTATC
TAAAGGACCTATTGTATATGCACTTCAGAAGTATAAATTTGTAACTATTC
ATCCGGTTAATCCCTCTATGTTAGCCCAGTACCGTAAAGCCTTTTCTCCC
AGTGGAGCCAAAGACGACCCAACTGACGCTGAGCTTGCACTTGATTTAAT
GCTCAATTATCCAAAGAAAATTAAAGCATTAAAGATGGAAAGTGAACCTG
TTCGAAAACTCACGTACTTAGTCGAACAACGCCGAAGACTGGTAGAAGAT
AGAAGACGCTTTAGTAATCGATTAATTAATACACTCAAGCAATATTATCC
TCACTTATTGGATTGGTTTTCACATCGAGGCTCCGGTATGTTTTGTGATT
TCATTACACGTTGGCCGAACTTACAAAAGTTGAAAAGAGCAAGAACTGAC
ACATTAAGAAAGTTTTTTCATGCCTATCCTGGGCGTACAGCAAGTTGCAC
AGAACAACGCCTCGTGCTCATTAATAAAGCCGAACCACTTACCTTAGATA
ATGCGGTCATTGAATCACACCAGCTCTTAGCTGTGGCTCTCGCTAATCAA
ATGCTAGTGGTAGTCGAAGCGATTAAAATATTTGATAAAGAAATTAGTGT
GTTGTTTGAGACCTTGCCTGATGCTGAACTTTATAAATCATTACCGGGTA
CAGGGCCTTGTTTGGCACCAAGACTACTAGTTGCTATGGGAGAAAATCGT
AGCCGCTTTACGAGTGCATCAGAAATTCAAATGTCTGCTGGTATAGCTCC
TGTGACGGAGCGCAGTGGTCAAAAATGTTGGGTGCATTGGCGATACCAGT
GCTCTAAATTCGTTAGGCAGTCATTTATTGAATGGGCAGCTAAAAGCGTT
CATCAATCTTATTGGGCAGGTATTTATTATCAGCAACAACGTTCAAAAGG
TAACACGCATCAATCATCAGTAAGATCGTTAGCATTTAAGTGGATACGGA
TTTTATATCGTTGTTGGAAAACAAAAGAGGCATATGATGAGTCGAAGTAT
TTAAAAGCATTACGAGATCGAAATTCTCCATTACTTTTTAAAGAAAAAGC
TTGTTAA
>CPS_0999 serine/threonine protein kinase domain protein
ATGGATAACAAGTTACCTCATTACAGCCGTGAACGATTGTTGGGTGAAGG
TGGTATGGGTAAAGTTTACCTAGCCCAAGATAATCAATTACAACGACAAG
TTGCCATTAAAGAATTAACCTACCAGCCTAAAGATGATGAGGTTAATCAC
GCCCTCAAAGAAGCACGTTTATTAGCACGTGTGAACCATTCTAATATTAT
TCAAATTTATAATGTCCATGATGAAGGTGATCATATCTCCTTGGTTATGG
AGTATTTCAACAGTAAAACGCTGACTCAGTTTCAACAGGAAGCCTATACC
ACTCTGGTACAGAAACTAGATTTATTACAGCAACTTTCTGCAGGATTAGC
TGCTGCACATAAAAATGGTGTAATTCATTGTGATTTAAAGCCTAGTAATA
TACTAGTGAATGACCAAGGGCAGTTAAAAATCACTGACTTTGGCATTGCT
TTATTGGCGAGTAATGAAAGCCAAAATAGTGAACAGACAGCAAGTAACAA
TCCGCTGCAGTTTGGAAGTTTACTTTTTATGTCACCAGAGCAAATAAAGC
TGCAGGCGGTAGATTATCGTAGTGATATCTTTTCATTCGGTATTATTGCT
TATCAATTAATGGTGGGTAGCCATCCTTTTGCTTACGGTAATAATGGTGG
TTCTGCGACAGACGTTGCTAAAAGAATTTGTGAACATACACCGGAACACG
CGAAAAATTTAATGCTGAATGCGCCCAGTGCGTTAACTGATTTGTTAATG
GAAATGTTAGTTAAACCGCTTGAGCAACGAACATTAACCGCTGAAGCTAT
CGAGAATCGTTTAAAGCATATTAGAACGGCGCTATTGCAAGCCGAAATAA
GTGAACAAGCGACAATGCCCTTGTCTTCTGGTTCAGCTAACATAGCTGGT
GATGATACTGGTCAGTACACTCAAGCTGTTCATACAACACTGCTTTCCCA
AAATACTCAAATAGTTCAGCCAGCTGACAACCTACAAGCGTCATGGTTTA
AGCAAAACTATAAAACTGTCGCTAGCATAGCTTTACTGTGCCTGGTGATG
ATTTTATTCGTTGGCTTTTACAACACGCAAGAAGTTGAAACTAAACAAGT
GGTTATTTTAAAACCGACACTGGCCGATAGCTCATTAATGGCACCAATGC
AGCAAGATTTAGTTATTTCAGCAGTGGAAGATGCGCTGCGACAAGCGGTA
ATAAATACCAAGAATATGTATTTGATCTCGCAACGTGAAGTGAATGCTAT
TACCAAAGAATATCCAGATGATTTGAATAAGCTAAGGCAGGCGGTAGGTG
CATCAGATATTATTTCAACTACACTTGAGTGCGATAATAGTCGCTGTAAA
GTGAGCTTTTCACGCTTGGTTGTTAATGACAATAGCAGCGACAATTTATC
GGTAAAATCTGAAAAAAACTGGTTAGCACCGGTAGATAAATTTAATGCAA
TTTTTAGCACCAGCCAAACACAGTTTGCCTCGCTTTTTCCTGAAGAATCA
GAAGTCAATCAATCGGGTTTAGTACAACGCCCTATTAATGAAAATGACTA
CCGGAACTATATAGAACTTTACAGTCAGATTAAAGGACAAGGCGAATATA
GTGTCGAAAGCTTAACTAAATTAGAGACGTTGTTAACACGTTCGCCTTAT
TTGTATGCGGCTTATGGTTTATTCCGCGAAACTGCTTCAAACCTATACAC
AGATAGCCGTGATGAAATTCACCTTAAACGACTTGAGTTAGTTCTACAAA
ACTCCCCACCTGAATATCGTTATAGTGTTTACCATGCTATTGATAGCTTT
TTTGTAGCGTATAAAATCAAAGAGCTTGATACAGCGCAGCAACAAATAAT
AGAAGCGAAAAATAAAGGAGCAAGTAGTTTTGTCTTAAGTGAACTCAATG
CAATTTTGTTTTTTTCTAAAGGTCAATATCAAAAGGCGGCAGATACTTTT
GAAGAGGCACTTGTTTTAAGGCCCAGTACCACGTTACTTTATAATCTAGC
CTTTAGTTACTGGCGTATGGGGGATTTATCCAAAGCTGAAGATGCGCTAA
ATAAAATGCTTGAAATTATCCCTGGTAACTATAAAGCACAACAATTGCAA
GCCAATATTTGGTTACTGCAAGGAAAACTTGAGTTAGCGATTACAGCCTA
TGAAAAAATAGTAGCTGCTTTAAGTAATGGTAGAGATTTAACCAACTTAA
GTTTGGCTTATGCATTAAATAAACAATATAAAAAATCTTTAATATATGCA
AAAAAAGCTGTGGATTTGAGTCCGAAAAATAGAATTAGACGATTAAATCT
GGCAGATATTGAGTTCATTTTAGGAAGAGTAAAATCATCAAACTTTAATT
ATAAGAAGGTGATTGATGCTCCAGTTGATAATAATAAATATAGATATTGG
CTGGATATAGCTCAAGCACAGCTCCAGTTAAATCAGCAAAACTTAGCTAT
AGAAGCTTTAAATAAGGCAAAGCACCTTGCGCCAGATAATGGCGAAGTCG
CATATACATCTGCTCTTGTTTATAGTGTTTTAGGTGAAAGGGTTTCTGCA
ATATTTGAAGTTAATAAGGCCTTAGCAAATAAAGTTGGCTCAGTTTGGTT
CAACCTTCCTTGGTTTGATAGTTTGTGTGATGACAAAGAGTTTGAGCTCT
TAATGGTGAAGTATAATAATCAAAAACGTTGTAGAACTTAG
>CPS_2946 SNF2 family protein
GTGAAGATAGGTGTAGGTTCTTTAGTTGAAAGTGAGAGCGCTTTCAAAGG
CGTCGGTAAAGTAGTCTCTATTTCCAGTGAGAAAAAAAGTGCAATAGTGG
GGTTCTTTACTTCTCCGCTATCTCCAATTTCAAATCCAATTGAAGTTGCA
GGTTCCGAGCTTATTGGTAAATCAAAATTGTTCGAGCAAACGGTGGTTTA
TTGTAAAGTTGGGAAGTCAGAGAACTGGCGAGCAGGCTTTTATGATGGGC
AAAGGCCTAATGATGAACACTTAATTAAATATAACTATAACGACTCCGAT
GTAGTTCCTTTGGAGGAAGTTTTTGTACCCAACCTATTAGAAGGCTCTCA
ATTCTGCCCAGCCAACTTCTTAGCTGGAAGAGCTACAACTTCTCCTATGT
ACATCAATGATCGTACATCCTTTTTTAACTCCTACTTAAATCAAAGAGCT
TCATGTTCCTCAATATCCTCAATCCCTAGTAGTGCTGTTAATTTAGAAAT
ACATCAACTATCCGTAGTTCTACAAGTCTTGAATGATAATGTACAGAAGT
ACCTTCTTGGTGATGAAGTAGGGTTAGGTAAAACTATTGAAGCTGGATTT
CTTGTTCGTGAACATATATTAGAATACACAGACAAGGCTTGTGTTCTCAT
TTTAACCCCTCCTTCTCTTGTTCAGCAATGGCGAGGTGAAATGAGTCAGA
AATTTCATTTAGAAGATGTTATGGATGAGGATCTTGATGAAGAAGATCAA
AAAGTCTTTATAGGAAGTTTTCAAGATATTTTGACAAGTAAGTTTATTAC
TAAAAAACCTACAATGGTTGTTATAGATGAAGGTCACCAGTTGGGTTCGT
TTGCTTGGGGTGACGACAATAAAGGTGTATTTTCCCAAATAGCATCAGCT
TGCCATAATTCTATTTCGACAATCGTTCTGTCAGGTACACCTATAACAGG
GAATACCAAAAACTTCTTGGCTATGCTTCATTGCTTGAATCCCGATTCTT
ATCAATTAAATGATGATGGAATATCATCATTTAATAACAAGATTGAAGAA
AGAGAAAAATATTCAGGAATATATGGTGCACTAGTGCCGGAAAGTGATGA
TTTCACTCTGGAGGGTATAGTAGAACAGGTTGAGAGTTTTGATTTTAAAG
ATGATGAATTAAATTTTTTAATCGCTAATCTTAAACCTCATATTGATTAC
TTTTCTGAAGAAAAAGATGAAAATCAACGTAAGTTGGCTGTAAAGGCATT
ACAAGATTACTTTGGGGATAAGTATAGATTATTCCAGCGTTTTATAAGAA
ACAGAAGAGGAAGTAAAAATAGCTATATCGAGCAAATATTCCCAGGGTTA
GGGGATTGTAATACATCATCATGGCAGATAGGCGATGAATTTGTTTCTTT
AGATGAGCAATTAGATGATTACCGAAATTCTTTAATACACGGAGATCAAA
ATTTTGCCGGAATTACACGTGAAAACTATTTCCAATGGTTAGATGCTTTA
CTTATATCTCCCTCTTCACTTGTAGCAAAGGCAGAGGCTGTATTGGCATC
TAATAACACTATTACAAATGAAGAAAAACTGATTTTGACAACAATGATTG
AAATGGGTCATGTTGAGCAATCCAATAAAGATGAATTATTACTGGAAGAG
ATTACATCATGGTTGGAAAAAAACACGGATGGTAAAATTGTCGTTTTTTG
TGGGGATAAAACTGTAGCAGATAATGTCTATAAGTTTATTGAACAAAACT
TGCCTTCAGTTGAAAGACACATTGATGGCAAACTTCCAGGTTTCAATATT
TCACCTCAATATAATGTTCTGATATGTGACCAGTCAGGAGAGGATGGTCT
AAACCTACAAGGAAAATGCCGTCTAGCTATCCATTATAGTTTACCTAGAA
CGGTAATGAGAATTGAACAAAGAATCGGTCGTTTAAATAGATACAGTGCA
AGTAGTATAGGAGTTCTTCCTGTTGAGAACCTAGTACTTACTCCTTGTCG
TGAGGGATTTTATGGTTCTTGGGCTCAGTTACTAAAAACTGATATAGGTG
TTTTTAATCAAAATTGCTCAAGTATTCAATTGGTATTGGATGAGAAAATA
GAGTCTTATTGTGAAAGTATTATTCATCAGGGGTATACACAATTAGACAA
ACTCTCAGAAGAAATAGAAGGAGAGTCTGGTTTAGTTGCAAAAGAAAGAA
AGAAAGTTGCAGATCAGGAAGTATGGAATGGAATGCAAGTAGATCTTTCT
GAAATAAAAACATTCTCAGAAAGATTAAGAATTGTTGATGAAAATGCAGA
TGATTTAAGTAAAGAGATGCAAGGGTGGATTAACAAGAGTCTTAGATTTG
ATTATAGGAAGACTGAGGATGACAACTTTGTCTTTCAATACCAATTAGGA
CGAACCCGCCTAAATGTCGATGACTTCGTGAGTCATTGTATCTTAGGAAT
GGACTTTGATAGCGGTTTAAAAAACCCTTCAACTAAACCCATGAGCGCAT
CTAGAGACCAAAGTGCGAAAACTGGTTCATACCCATTTAGGTATGGACAA
CCTTTTGTTGATACAGTTTATTCATTTTCTCAACAAACCACTTTAGGTAT
ATCAAATGCGATAATCAGAGAGATTAATGTAGCTCTTAAAGAGCCTAAAA
CGTTCTTTAAATTAAACTGGATTTGTACATTAGAGAGTGGTTGCCATACA
AGAGTTAGTCAGAGGAACAACGATCGAAAACTTGCCCCTAAAATTTTAGA
ACGTTGGGTAGACGAGTTGGGAAATGAAGTAACAAAAGAGGCTTTAGTAA
ATATACTGAATAAACCCTATGAGAAGTCACGTGATTTAACTAAAGGCCTA
TACAGGGATTACAATATTAGTGTTGGTTTTGAACAAGATATGTGGGATGC
AGTTGATTCATTTTTAAGTAAAGATGAATGGCGAGATTTAGTGTTGAGTA
TAGCATCAGACTCTACAGAAAAAATAAAATCTGAACTTAATCAACAATAT
GATTTATCTTCAAGGGAAGAGTTTGGCGTCAATCTATCTACTATGAGGTC
TGTTACTTTGATAGGTAAATCGTAA
>CPS_0377 ISCps1, transposase
ATGAACAAAGTTAATACTATTGGCGTAGATTTAGCCAAAAATGTTATTCA
AGTTTCTGTTCTTTCGCCTTTAAATAAAGAACTAACAAACAAAGAGCTTC
CTCGAACAAAGTTCGCCGAGTTCCTGGCTAAACAGCCTATAAGTCTTGTG
GCGTTCGAAGCATGCTCAACAGCACATCATTGGGCGAGATTAGCGAGAAG
TTATGGGCATCGGGTAAAAATCCTGCCCGCAAAGGTAGTATCATCGTTTC
GCCAAGGTCACAAAACTGATAAAAACGATGCACTTGCTGTCGCTGAAGCC
GCTAACAGACCTAATGTAAAAGAAGCACCATTGAAAGAACTTGAGCAGCA
AGGTATGCAGTCAATCCAGCGTTCAAGAGAGCTACTGGTTCAAAATAAAA
CGTGTTTATCAAATCATATTCGTGGTTTATTAATGGAATTTGGCGTATTT
ATTCCTAAAGGTTTCGCTTCTCTTTTTAAAAATATACCTGACATTTTGGA
AGACGGTGAAAATGATATACCAGATATGTTCAGAGCTACACTTAATCTAA
TGTATCAACGTTTACTTGACCTTCGTGATGATGTTGGATTGTTGGATGAA
CAAGTTAAACAATTAGTAAAAAACAATGAAGCATGCTCGAATCTCACTAA
AATGGAAGGCGTTGGGCCAATTAGCGCCATCCTACTATTTTCGACATTAG
GTACTGGCGACGCGTTTAAAAATGGTCGTGAGTTCTCAGCCTATATTGGT
TTAACACCAAAGCAACACAGTAGTGGTGGTAAAGCGAGTTTAATGGGTAT
CAGTAAATTTGTTGCCAATAAGCGACTTCGCTCAGTATTAATACAAGGCG
CTCGCTCATACGTTCATCGCATGAAATCCGTCACCACTAAAAAAGATGAG
TGGTTAGTCAAATTAATTGAACGTGCGGGTTATGGTAAAGCAGCCGTTGC
ATTAGCTAATAAAAATGTTCGAACTGCGTGGGCATTACTAACTCAGGGAA
CAGAATATAGGAAAGAACTAATCGCTTAA
>CPS_0152 hypothetical protein
ATGGTCGATAAAAGTAAATTTTCTAAGGATGTCGAAGAACAAATTCAAAG
TTTGGCTAGTGACATTTACATTCAAGTGGAAGATAAATTAACTCACTTAA
TAGCATCTGCAATTAAGACGGAAACGAGTAAAAATACTGATCAACAAAAC
CAATATCTATCAGAAAAAGAACAATCATTACAAAAAAACTTTACTGAAAA
ACAACAGTCACAACTCAAAGAAGTTACCCAGCTTAAACAAGCATTAGCTG
AAAAAGAGGCTGATGAGGCAACTAATAAGCAAAATTTCCAGGTAGAACTC
ACTCAAAATACTATTAATTACAGTGAGACCATAGAATCTTTGGAAAAAGA
AATTGTTAACTTAAAACAGCAAAAAACACAGCAACAAGATAAAAAACAAA
GCAGTAATAATAAGTTAGATGAAAAGTTACTGGAAACAGAACAAACACTT
AATGATAAAAATCAAGAAATTGACGGTTTAAATGGTCGCATTATGGTATT
AACTGAGCAAGAGCAAAGTTTAATGTCACAGCTTACTGTTGCTAAAGAAA
AAATTCAGCTGAACGAAAAGCAACACAACGAAGCACTAACAACAGTTAAA
AACCAAGCCGAAGCGACAGCCAAACAAAAAATTGATGCGTTAACTGAAAA
ACTACAGTTAAATGAAAAGCAGCACAGTGAGGCACTAACAACAATTAAAA
ACCAAACCGAAGCGACAGCCAAACAAAAAATTGATGCGTTAACTGAAAAA
CTACAGTTAAATGAAAAGCAGCAAAGCGAAGCGGTAATAACGATTAAAAG
CCAAACTGAAGCGACGGCCAAACAACAAATTGATGTGTTAACAGAGAAAC
TTCGGAAACTCGAGGATGATAGTTCTCGTATGCAAGCGGAAGCAATGCAA
AGTAGTGACAGTAAAGTAAAAGACTTAGAGCAGAAGATATCTCAGTTAGC
AGAACAAGCTCAACAGGAACAAAACGGTAAAGCTGAATTACAACAACAGT
TATCAGCACAACAAAAATCAATTGATACAGAGCAAGATAAAAATAAACAA
ACTGAACAAAAAAGCCAAGACTTTCAAGCACAAATTATTAAGCTAACTAA
GCAAGCAGCCATTGATAAACAAAAACTTCTTGATGAAATAAAGTCTATCA
ATGAAGGTTCAGAAAAAATTAAACAACAACACCTTGATGAGAAAGAAGCA
GTTAATGAAGGTGCGGAACAAGTAAAACAGCGCCACCTTGATGAGATAAA
AGCAATTCATGAGGGCGCTGAGCAAGTAAAACAGCAACATCTTGATGAGA
TAAAAGTAATTCATGAGGGCGCTGACCAAGTAAAACAGCAACACCTTGAT
GAGATAAAAGTAATTAATGAGGGCGCTGAACAAGTGAAACAGCAACACCT
TGATGAGATAAAAGCAATTCATGAGGGCGCTGAACAAACGAAACAATTAC
AAGCATCAGCGCAGCAAAACATTATAGAATTAGAAAAAACTAACGAGCAA
CTTAGTCATAAATTAGCAACTGAACAAAATGATATAAAATTATATCAGCA
AGAAGTGACAGTACTTAATGAGCAAGTGAAGGTTGCTCAAGAAGGGCAAG
AAAATATCTTGCAACGCTTTAATAAGAATCGTGATAAACAAGAAATAGAA
AATAATAAGGTGCGAGAAACTATTAAATTCTTACGCGATGAGAATCATCA
GTTAATCAGTGATAACGGTGAGCAAAAGGCTCAGTTTAACGATCAAACAA
GTGAGTTGGAGCATAAGTTGACCGAATATCGATTGAAATTTGAGTATGCT
CAAAAGCAATTAACCAGTTAG
>CPS_2963 ISCps9, transposase orfA
ATGCCTAGATATACCCAACCTAAAAAGACGTGGTTTTACCCTGTTAATTT
CAAAATTAAAGCTGTCGAGCTAAGCTTACGAAACGACATGTTATCTAAGG
ATGTTGCTCAAGCGTTGGATATTCACCCGTTAATGCTAAGCCGTTGGCGT
AAAGAATACCGAGAAGGGAAGTTTAAAAAAAACCAACACTATCAGAGCAA
TAGTGAACTCATGAGTAAAATCCCCACAAAGAAAGAACTAAATAAAATTA
AACAGCTGCAAAAAGAAAACGACCGTTTAAAAATGGAAAATGATTTACTA
AAAAAGTGGCAACGGTATCTGGCGGAAGTCCATCAGAGCGATTTGGATTC
ATCGAAAAACACAAAGAAGCCTTAG
>CPS_2417 conserved hypothetical protein
ATGAAGATTAGCTTTATTGATATACAAAATTTCAGAAAGTTACAAAGCTG
TAGAATTAACTTATCAGATAAAGAAACTCTTCTTGTCGGGGCTAATAACA
GTGGTAAAACATCAGCAACGGATGTATTGATTACATTTTTAGACCAGAAA
GTTAAAAGACCTTTTTCGGTAACTGATTTTACACTTAGCAATTGGAAACC
CCTCAATGAATATGCAATGTCATGGACTAAAGATATTGACAGTATTCAAG
GCACTTCTATAGAAGAATGGCAAAAGTTGTGCCCATCTATTGATATCTGG
CTTGATGCTAGTATTAATGAGGTAGAAAAGGTAGCGCATCTAATACCTAC
ACTAAAATGGAGTGGTGAACCGTTGGGTGTGCGTTTAGTTTTACAGCCTA
AAAATTTAGATGAGCTAAAAGCTCATTTTGTCAGTGAGTATACAGCAGCA
AATAATATTAAGAGTATTTCCCCTAAGGGTACACTGTCACTCTGGCCAAG
AGATATTAAGGATTATTTAAGTAAGGGAAAATTAAATACTCAATTTGAAG
TTAAAGCCTACATTTTAGACCCTGAGAAAAGTAATTCGCCACAAAAACTA
AGAAAAGAACAGTCTTCAATGGAATTCTACCCATTTGATGGAATATTTAA
AGTTGATGTCATAGAAGCGCAAAGGGGGTTTTCCGATCCTAATTCGTCGG
AAATCAAACAAAGTAATGGTGGTTTATCAGGACAATTAAACCAATATTAC
AATCGTCATTTAAATCCTACAGATTTGCCAGATGTAGCTGATTTAGAAGC
CTTAGAAACAATAGATAATGCCAAAGAACTATTTGATATCAGGCTAAACA
AATCCTTTAAAGAAGCTTTAGGTGAAATAAAAACCTTGGGATATCCAGGA
TTTAATGATCCAGATATTAAGCTTTCGAGTCGAATTAACCCCATTGATAG
TTTAGATCATGATGCAGCTATTATTTTTGATACTCAAAAACGTGGCTTTA
CTGGTTTAGATAACTTTTCTCTACCTGAAAAATATAATGGCTTAGGGTAT
AAAAACCTTATTTTTATTGTATTTAAATTAATTTCATTTAGAGATCAATG
GCTTCGAAAAGGAAAAGCCCAAAAAAGACGAAATGCAGACGATATTGCAA
TAGAGCCTATTCATTTAGTACTTATAGAAGAACCAGAAGCGCATTTACAT
GCACAAGTACAACAAGTTTTTATACGTAAAGCATATGACGTTTTACGTTT
GGACGTTAGTAATAAATTAACTACTCAAATGATTGTTAGCAGCCATTCAA
GCTATATCGCGCATGAAGCGGGATTTGAGAAATTAAGATACTTTAAAAGA
AAGCCTGCACTAGGTTTAGATCAAGTAGCTACTGCTGAAGTTGTTGACTT
ATCAACTGTATTTAAAAGTAATTCCAATAAAACAGATGATGTAACTGTCA
CAGCAAAATTTGTAGCTAGATATTTAAAAACAATTCATTGTGATTTGTTT
TTTGCAAATGGCATCATTATGGTTGAAGGGGCGGCAGAACGAATGTTGAT
CCCACACTTTATTCGAACACACTATAATGATTCATTAAATCAAAATTACA
TTTCCATACTTGAAGTCGGTGGAGCTCATGCGCAAAGGCTTAGACCTCTG
ATTGATGCTTTATCATTACCTACTCTAGTTATCACCGATACTGATGCTAC
CAAATCAAAAGATAGCAATGAAAAAATTAGACCTGAAAAAGGCAAAAATT
ACGGTTTTGGTAGCGACACATTGAAGGAGTGGTTTGATTTAAAATCCAAA
ACTTTAGATGAAGTAGTAGAGCTTGATGAAAAGCATAAAGTTCAAGGTAT
GGCTAGAGCAGCTTATCAGTGTGGTATTGCTGTTAATTATGGAGAAGGTG
CTAAAGTAGCTGAAGTAATACCTTATACATTTGAAGATGCTCTCGTGCTC
TCTAATATTGAGTTGTTTAAAAGTTTATCAAATTCAACAGGTATGGTGAA
AAAAATGCACCTAGCATTGGGTAAACCAACCTTAGATGAATGCTGTGATC
AGCTGTACACAGAGCTGAAAGGAATTAAAGCTCAAATGGCATTGGATTTA
CTTTTTGATGTTGAACCTAAAGAATTATGTATCCCTGAATACATTAAAGA
AGGTTTTGAATGGCTTGAAAAAGAACTGAAAAACAATGCGCTAGATTTCA
TCGAGGCTAAAGTTAACACTGCTGTAGAAGATAAGGCAGTAGGTTGA
>CPS_3998 site-specific recombinase, phage integrase family, truncated
TTGACCAAATCGCTGCGAAAGGCGCTTAACCAAACAAGTATTAGGAAACA
TGTAACAGCACACACCTTTCGTCATAGCTTTGCTACACAACTATTGTTAA
ACGGTGCCGACATTAGCACAGTGCAAGAGCTATTAGGACATAATGATTTG
AGAACCACCCAAATATATACCTATGTAATTGGACAGCACTCCTCTGGTAC
AACGAGTCCTATGGATAGAAAATAA
>CPS_2418 putative ATP-dependent DNA helicase
ATGAGAAATCCAAATATTGAATTAGTTGGTGTCGATAAAGAAATTTATAG
TTATCTTAATTTATATAATCCAAAGAGTTTTTTGTTGTTTGCTGGAGCTG
GCTCAGGGAAAACTCGAACATTAGTTAATGTATTACAAGAAATTAAAAAT
AATAATTTACAAACTTTAATTGAAAATGGCCAAAAAGTTGCAGTTATTAC
ATATACAAATGCTGCATCAAACGAAATACAACATCGCCTTGAGTATGACC
CCATATTTACAGTATCAACAATACATAGTTTTATCTGGGAATTAATAAAG
CCGTTCACTTCTGATATTAAAGATTTTATTAAAGTTAAATTAAGAAGTGA
TATAGATGTTTTAACAACTAAAATTAGTAAAGCTAGGGATAAGAATGGTA
AAACAGCATTAGCGAATGCACGTAGCCTAAAGTCCAAACAAAAGCGGTTA
GACGGGTTAGCAGAGGTGGAGAGTTTTACTTATAGCCCAACTAGTAACAA
AACCAGCAAAGGGACACTTAATCATTCAGAAGTAATTATTATAGGTTCTA
TTTTTATAGCTGATCAAAAATTAATGCAATCGGTCCTTATTAATAGATAT
CCAATTTTATTAATAGATGAAAGTCAAGATACGAATAAAGTACTATTAGA
AGCTTTTATTTCAGTGCAGGAAAATAACAAGAACAAGTTCTCGCTCGGCC
TCTTTGGCGATATGATGCAACGTATTTATAGCGGAGGGAAAAATGACTTA
ACTACTTCGCTTCCACCCGATTGGGAAACACCGGCAAAAATAATTAATTA
TCGATGCCCGAAAAGAGTTATCACTTTAATTAACAATATTCGTAAAGGTG
ATGACCAAAATGTACAAGTGCCAAAAGAAGATGCTATTGACGGTTTTGTT
AGGCTGTTTATCGTAGATTCCAACACAACGGATAAACTGGAGTTAGAAAA
TAAAATTCGTTTCCAAATGGCTATGCTTACACATGATGAAGATTGGAATA
TTGCAGAAGAAGTTAAAACACTAACGCTTGAACATGATATGGCTGCCAGC
AGAGGGGGATTTGACGAGTTTTTGCTACCTTTGTCTTCAGTTAGTAGTTT
AAGAGACGCAGCACTAAATGGTACGAGCAAGAATATAAACTTCATTACTT
CAACCTTACTACCATTTATTGATGCAGTAGAAAAAGATGATTCCTTTGAA
GTTGCTCGAATAATCAAAAGTGGTTCATTATTAATAAGTGATTCCAATCA
ATCTTTCTTATTAAATCCTATAGGAACTTTAAAAGATATTGATTCAAATG
TTGTTGAATTTAAGAAAATTTTAGTAAATGGAAAAGTTACGCTACATAAT
GTTTTATCTACAATTCAGAAGTTTGAATTACTTTCTTTACCTGACGAATT
ACTTGTCTACTTAAGTGATATTGAACAAGGTGAACCTAATGAGCCTGAAA
GCGATACTAAGTTGCTTTCAGATGTTGATAAAGCTTGGGGTTTAGCGCTT
AATTCTAGCATTGGTCATGTGAAAAACTATGCTAAATACGTTAATGAAAC
ATTGGGATACGCAACCCATCAAGGAGTTAAGGGGCTAGAATACAAAAGGG
TAATGGCCGTTTTAGATGATAAATTCAAAGGTTTTCTATTTGATTATGAA
AAATTATTTGGAGCAAAAGACTTAACTAAAAAAGACATTGAAAATGAGGA
TTTAGGTAAAGATTCTGCTTTATCTCGAACTCGTAGATTGTTCTACGTTA
TTTGTAGTCGTGCAGAACAAAGCTTAGCTGTAGTTGCATACTCTAATGAT
CCTATTGCTATAGAAAAAACTGCAATTGAATCAGAGTGGTTTAGTAAAGA
CGAAATAGTATTAATCTGA
>CPS_0475 dam, DNA adenine methylase
TTGCAAATTAATATGCGATCACCTTTAAAGTGGGCGGGCGGCAAAAAAAG
AGTTGTAGGTGAAATCCTAAAGGTCTTACCTGTAAAGGGTAAAAAAAGGC
TCGTTGAACCTTTTGTTGGTGGTGGCTCTGTTTTTCTGAATATAGACTTT
GATGAATATCTGTTAATTGATATGAACAAAGATCTAATCTCGCTATTTAA
CATCATAAAAAACCAATCTACACAATTTATTGCTGATGCTCAAATGTACT
TTGCTGGTGATTACAATCACCCTGAGAAGTATTATGAGTTACGTAAGCAG
TTCAATGAATCCAATGATTCATACCAACGCTCAGTACTCTTCTTGTATCT
AAATAGACATGGTTACAATGGACTATGCCGCTATAATAAAAGTGGTGGCT
ACAATGTGCCATTTGGAAGATATAAGCACCCATACTTCCCTAAAGCTGAG
TTAGATTTTTTCTCAAAGAAAGCTCAAAAAGCAACGTTTGTACAAGGTGA
TTTTGAAAAAGCATTTTCTCAACTTAAAAGTGATGATGTTATTTATTGTG
ATCCTCCTTACTCTCCAATTAATAGAACGTCAAATTTCACAGCTTACGCT
GGTAATTCATTTACTGATGAAGATCAGATAAGATTGGTGGCTTGTGCTGA
AAAAGCAAAGCAGAAAGGTGTAGCAACTATTATTTCTAATCATCATGTCG
ATTTTACTCGTGAACTTTATAAAAATGCGGATAAAAGAGAATTTTTTCAA
GTACAGCGTTCAATTAGTCCAAAGGGACAAGGACGAGTTAAAGTTAAAGA
AGTATTAGCACTGTATAAATAA
>CPS_1540 dbpA, ATP-dependent RNA helicase DbpA
TTGAGTACTAATACAACTACTTCATCGTTAGCTTTTTCTTCGTTGAGCTT
AAAACAGGATTTAGTTAAAAACTTATCGTCGCTTGGCTATGAGCAAATGA
CACCTATTCAAGCTAAAACCTTACCTGAATTGCTTAAAGGAAAAGATGTT
ATTGGCGAAGCGAAAACAGGCTCAGGTAAAACGGCTGCTTTTGGTTTAGC
ATTACTTAACAAATTAGAAGTTAAAAAGTTTCGCATTCAATCCATGGTTA
TTTGTCCAACCCGAGAACTGGCTGACCAAGTTGCGAAAGAGTTGAGAAAA
CTAGCGCGTGGTATTCATAATATAAAAATATTGACACTTTGTGGCGGAAC
CCCTTTTGGTCCACAAATTGGTTCTTTAGAGCATGGGGCACATGTTATTG
TTGGTACTCCAGGACGCCTTGAAGAACATGTTATAAAAGGCACTTTACAA
TTAGATAACTTAAACTTATTAGTGCTCGATGAAGCTGACCGTATGCTAGA
AATGGGCTTCCAAGCCGCACTTGATAATATTGTTGGACGTACACCACTTG
ATCGTCAAACATTACTTTTCAGTGCTACCTTTCCTGACCAAATTAAGTCT
ATTAGCGAAAGTATCATGACAGATCCTGTGATGGTTAAAATCGCTTCAAG
TGAAGACCAATCAACTATCAGTCAAAAATTCTTTAAAGTGGGTAATGATG
ACGATCGCCTAGACGCGTTACGTTTATTGTTACTAGGTAATCAAGTTGAA
TCGACCGCTATTTTTTGTAATACCAAAAAAGAGACCCAACAAGTCGCTGA
TGCCTTACACTTTGATGGTTTTAGCGTATTAGCGTTACACGGCGATTTAG
AGCAACGCGATAGAGACCAAACATTATTACGCTTTGCCAACAAAAGTGCT
TCAATTCTTGTTGCGACAGACGTTGCTGCACGAGGCTTGGATATTGATAG
CTTAGACTTAGTTATTAATTATCACATTGCCCGCGATAGTGAAGTGCATG
TGCATAGAATAGGCCGAACAGGTAGAGCAGGCAGTACGGGTATCGCTTAT
TCACTGTTTAGTGACAAAGAAAGTTATAAAGTTGGCTTACTAGAAGACTA
CCTTGAAGCTGTTATTACCCCTGAGCCATTGCCTTCATTAGCGGTACTTT
CCAATGAACGTCCGCAAGCTAAAATGGCAACCATTCAAATTGATGGCGGT
AAAAAGCAAAAAGTTAGAGCTGGAGACATTTTGGGCGCACTTACCGGCGA
TAATGGTGTGCAAGGTTCGCAAGTTGGCAAAATTTCAGTGCTTGATAATA
AGGCCTATGTTGCCGTTACTAAAGCGGCTTTGAACTTAGCCTTGAAAAAA
ATATCTAAGGGCAAAATGAAAGGCCGTACCTTTAATGCTCGCCATTTAAC
TAATTAG
>CPS_1726 deaD, RNA helicase DeaD
ATGACTGATCAAAAAACTGAAACTGTAACAGAACCTGAAGCTGTAGCTTT
TGCCTCTTTAGGCTTACCTGAAAACTTATTATCTGCCGTTCTTTCTATTG
GCTTTACTTCTGCTACCGATATTCAAGCACTAACTATACCACCATTACTT
GCTGGTAAAGATGTGTTAGGTGAAGCTCAAACAGGTACAGGTAAAACTGC
TGCCTTTGGTTTACCTGCATTAGCAAAAATTGATACTTCAATTAAAAAAC
CACAATTAATGGTTTTAGCACCGACTCGTGAATTAGCAATGCAAGTTGCT
GAAGCAATCGAATCTTTCGGTAAAGACATGAAAGGTTTACGTGTTGCTAC
ATTATACGGTGGCCAATCTTATGGACCACAATTTCAACAACTAGAGCGTG
GCGCACAAGTTGTTGTTGGTACTCCTGGTCGTTTAATGGACCACTTACGT
CGCAAAAGCCTTAAATTAGATGAATTACGTGTTTGTGTGCTTGATGAAGC
AGATGAAATGTTAAACATGGGCTTTTTAGAAGACATCCAGTGGATTTTGG
ATCATATACCAAAAACTGCACAAATGTGTTTGTTCTCTGCGACCATGCCA
CCAGCGATTCGTAAAATTGCTAACCGTTTCTTAAAAGATCCTGAGCACAT
TAAAGTTGCTGCTGTTAAAAAAGCAAAAGCTAACATTACTCAGTACGCAT
GGAAAGTTAGTGGCATCACTAAAATGACTGCGTTAGAGCGTATTGCTGAA
GTAGTTGAATACGATGCAATGATTATCTTTGTTCGTACTCGTAACGATAC
TGTTGATATTGCTGAAAAATTAGAACGTGCCGGTTACCCTGCATTAGCAC
TAAATGGTGATTTGAACCAAGCACAACGTGAACGTTGTATTGACCAAATG
AAATCTGGTAAATCATCTATCCTAGTTGCTACAGACGTTGTTGCTCGTGG
TTTGGATATTCCTCGTATCTCTTTGGTAATTAACTATGACTTACCGGGCG
ATAACGAAGCATATGTTCACCGTATTGGTCGTACTGGTCGCGCTGGTCGT
GAAGGTATGTCAATTGCTTTTGTACGTCCACGTGAAATGTACTCAATTCG
TCATTATGAGCGTTTAACGAATGGTACTGTTCTTAATTACGATTTACCAA
ATATCCAAGATATTGGTAAAATACGTATTGAGCGTACTCGTGTTGAAGTA
GCAAAAATTGTTGCTGATAAAGATATCTCAAGCATGCGTGAAATTGTTGA
AGGCATGGCTGCTGAATCTGAAGTTTCTATGATTGATCTTGCTGCTGCAT
TGCTTTTCCAAAAGCAAATGAAGCAACCACTTCAACCAAAAGAAGATCCT
AAGCCTCGTCGTGATGCACGTGAACGTACTGATCGCAATGACCGTGGTAA
CGACCGTAATAGCCGTGGTAATGATCGCAATAGCCGTGGTAATGATAGCC
GTAGTGCTGGTCGTGATTCACGTGGTGGTGAGAACCGTAGTAACCGTGAT
GAAAAACCACGTAAAGCTAAAGTTAATCGCAGTGATGTTGATTGGCAAAC
TTACCGCCTAGAAGTCGGTAAAGAACATGGCGCTCGTCCAGGTGATATTG
TTGGCGCTATCGCTAATGAAATATCGCTTGATAGTAGCTACATCGGTGCT
ATTAATTTACATGACAAACATAGTTTTGTTCAGTTACCTAAAGGTATCCC
AACTGACTTGTTTAACCAGTTGAAAGGAGTACGCGTTCGTCGTCAACCTC
TTTCAATCACTACTTCAGATGAAGCAGTTGTTAGCCAACAACAGCGTCCA
GCTCGTCGTACTGAAAAAGCACCACGTCATACTTAA
>CPS_1040 dinB, DNA polymerase IV
ATGGGTAATCAGAAAAAAATAATTCACATTGATATGGACTGCTTTTATGC
TGCTATTGAAATGCGAGATTTTCCTGAATATCAAAATATCCCATTGGCCG
TTGGTGGTGATGGCCCGCGTAGTGTCTTATGTACTAGTAATTATCAAGCT
CGTCAGTTTGGTGTCCGTTCAGCCATGCCGGCGATTAAAGCCAAACAGCT
TTGTCCACACCTTAAAATTGTTCATGGCCGCATGGATGTTTATAAAGAAA
CCTCCAAAAATATTAGAGAAATATTTTCTCGTTATACCGATCTCATTGAA
CCTTTATCTTTAGATGAGGCCTATCTGGATGTTACTGATGCAACAATGTG
TCAGGGTAGTGCAACGCTTATTGCTGAGAGAATTAGAGCTGATATCTTTA
ATGAATTAAATTTAACGGCATCAGCAGGCATTGCACCGAATAAGTTTTTA
GCAAAAATTGCCAGTGATGAAAATAAACCTAATGGTCAATGCGTTATTAC
CCCAGATAAAGTCGCTAACTTTGTTGAACAACTTTCATTAAAGAAAATAC
CCGGTATTGGTCCAAAAACGTTTGAAAAATTAAATAGGCATGGTTATGTA
ACTTGTGCTGATGTACGTCAAAGTAATATTCGAGCGCTACAAAATATTGT
CGGTAAGTTTGCTAATAGCTTGTACTTAAAATCACATGGTGTCGATAATC
GAGATTTAGAAGTCAGCCGGCAACGCAAATCTCTCGCCATCGAAACAACA
TTGGCGCACGATATATCTACTCAAGATGAGTGTAAGCTTGTTATTGATTC
CTTATACCAAAAATTACTCACTAGACTCGCTCCCCACAGTAATAGGGAAA
TCATTAGGCAAGGTGTGAAGCTTAAGTTTACTGATTTTAATCAAACAACC
GTAGAAACACAAAGCAACGAGTGTCAGCAAGCCCTTTTTATCAGTTTATT
ATCAAAGGCATATAGCCGCTCAAATAAACGCGGTGTACGGCTTGTTGGTC
TAACACTAGGATTTGCTGATAGTCCAGGCGAAAGTCAGCAGTTGTCTCTT
TCGCTATAG
>CPS_2272 dinG, ATP-dependent helicase DinG
ATGTTATCTGATAAGTTAAAACAAGCAATTCGTCAGGCGTATAAAGCCAT
AGGCGAGAATTTAACGCATTTCAATCCACGTAAGCAGCAAACGTTACTTA
TCGCTGAAATCGCAAAAACCTTAGCGGGTGAATACAGCAAAGACAGAAAA
ATAATTACCATTGAAGCGGGTACCGGAACAGGTAAATCACTTGCTTATAG
TCTTGGAGCTATCCCACTTGCGCTTGCTCGTGATAAAAAGGTCTGCATCT
CAACGGCTACTGTCGCACTGCAAGAGCAGTTAGTTGATAAAGATTTACCT
TTCCTAAAAAAGTATGCCGGTCTTAATTTCGACTTTACCCTGGCAAAGGG
AAGACAGCGTTATGTCTGTCGTCAAAAATTAACGCTGGCTGTTACAACCG
GCTCTGGCAATGAACCTGCACAAGCGGGATTTACCTTTGCCGAAAAGCCT
GATGCTAAAGATATTAGAACCCTCAATAAAATGCATAAAGCATTACTTGA
TGGCAGTTGGTTGGGCGATATAGATTCTTGGGAGACACATTTACCTCAAC
ATATTTGGCATCAAGTTCAAAGTGATAAACATAGCTGTTTAAAAAACTTA
TCTGAGCATACCCACTGCCCATTTCACAAAGCACGTGAAACCATGGACCA
AGCTCATGTATTAGTAGTAAATCATAGTTTGTTATTAGCCGATTTAGAGC
TCGGTGGTGGTAAAATACTCTCACCGCCTGAGGATACTTTTTATATTATT
GACGAAGCACACCATCTACCTAAAGTCACTCGCGATTTTTCAAGTGCGAG
TATCACCTTAAAAGGTTCAATTGAATGGCTAACTAAGCTCAGAGATACCG
GCGATAAAATGGCTAAATTGATTAAGTCAAAAAATGCCATTTCTCCGGCA
TTGAAATTGGGAGATGATTGCCAAGATTTATTAGTGGAAATGCAAAAAGT
CCTTAATTTTATTGAAGCTAATGCGAATGTATATTTTTTGGAAAATGAAT
CATCCGCCCAAAATAATAACTTTACTAAAAATTCAAAAAATGATGAGCAA
GTTTATCGATTTGAAAATGGCATCATTCCTCAAACCTTAAAGAACTGGGC
TGAAGATCTACAAAGCCTAAGTAAGAAATCGTTATCACATTTAAATAAAC
TCTATAACGGACTCATTGAGGCGGTAAAGGATGGCGATACACAAATGTAT
GTCGCTGAGCCATTACTTGCAGAAGCTGGCTTTATGCTTCAGCGTTTAGA
GAATCTACAATCACTGTGGTTTATGTATGCCAAATCAGATAGTGATAAGG
GTGCGCCGATGGCACGTTGGTTGGAAAAAATCACCCTCAAACGTCAAGAT
TACTTATTAAGTGCATCGCCAATAGAAGTTGGTTTTACCCTAGAGAATAT
GTTGTGGAGTCAATGTGAAGGCGCTGTCCTTTGCTCTGCGACATTACGTG
CATTAAACTCCTTTGATCATTTTCGTTTTCAAGTAGGTTTAAAAAATAAT
GATGGTAGTCAGTATCAACAAGTCGACTCGCCTTTTGATTATCAAAACAA
TTCACAACTCGTCATTGCAAAAATGGATAATGAAGCCAGTGCTCCTGAAT
TTACGGATGAAGTGATTGCTAAATTGCCAAAGTATCTCAAACAAGGCAAC
GCAAGTTTAGTGCTCTTTTCTTCTTATTGGCAGATGAATAAGGTTGCACT
AGCATTGAGGGAAGATCATAAACTTGAAATTATGGTTCAAGGCGAATTAT
CACGCCAACAAATAATAGCGCTACATAAAAAACGTTGTGATGATAACAAA
GAAAGTATTATTTTTGGCACTCAAAGTTTCTCCGAGGGACTTGATTTACC
TGGCGATTATCTTAATAACTTAATTATTACTAAACTCCCCTTTTCTGTGC
CTACCTCTCCTGTTGAACAAGCACAGGCCGAATATGTTACAGCCAAGGGA
GGTAATCCATTTATGACGCTATCAGTACCAGACACATCAAAAAAATTGGT
TCAAGCATGTGGTAGGTTGTTACGAAATGAAATGGATGAAGGGGTTATTA
CCTTGTTGGATAAACGCGTAGTAACTAAGCGTTATGGCAAACAGTTACTC
GATTCACTTCCCCCCTTTAGTCGAGTATTTGAAAAGTAG
>CPS_0001 dnaA, chromosomal replication initiator protein DnaA
TTGGATCATTCCCCTTGGCAAAGATGCCTATCTGTTCTACAAGAAGAATT
GCCTGCTCAGCAATTTAGTATGTGGATCCGACCCTTACAATGCGTTATAA
ATGATAATGTTATGACGCTTTATGCTCCTAATCGCTTTGTTTTAGATTGG
GTTAGAGATAAATATGTAAATCGTATAAATGAACTTCTTACTATTAACGA
ATCAAATAATCCATTATTACTTCGCTTTGATGTGGGTAGTAAACCGACTA
TTGATAATTCTGTTACCAATAGCCCCGTTTCTAGAAATACGGGTGGCAAC
GAATCATTATTTGCCAAAGCTACTTCAGCGCCTAAAGTTGCTGAGCCAGA
AAGTAATATTCCAAAGAAAACCAATGTACGTTTAAATTACACTTTCGAAA
ATTTCGTTGAGGGTAAATCTAATCAACTTGCTCGAGCTGCTGCTTCACAA
GTTGCAGATAATCCGGGCACTGCTTACAACCCATTATTTATTTATGGTGG
TACTGGTTTAGGTAAAACGCATTTATTACATGCTGTTGGTAATGGGATTT
TGCTCAACAAACCCAATGCAAAAATCGCTTATATGCATTCAGAGCGATTT
GTGCAAGATATGGTTAGAGCATTACAAAATAATGCGATGGAAAAATTCAA
GCAATACTATCGTAGTGTTGATGCACTACTTATCGATGATATTCAATTTT
TTGCTGGTAAAGAGCGAACTCAAGAAGAATTTTTCCATACGTTCAATGCA
TTACTTGAGGGGAATCAACAGGTTATATTAACCAGTGATCGCTATCCAAA
AGAAATTAATGGTGTAGATGATAGATTAAAATCTCGATTTGGTTGGGGCT
TAACTTTAGCAATAGAACCGCCAGAACTTGAAACGCGGGTTGCTATATTA
AAGCGCAAAGCACAAGAAAGTCAGATTAATTTGGCTGATGAAGTTGCCTT
TTTTATTGCTAAACGTCTTCGCTCTAATGTTCGTGAATTGGAAGGGGCTT
TAAACCGTGTTATCGCTAATGCCAATTTTACTGGTCGTGCTATTACTATT
GATTTTGTCCGTGAAGCATTACGAGATTTACTCGCCTTACAAGATAAACT
CGTTACTATAGATAATATTCAACGAACGGTTGCCGAATATTATAAAATTA
AAATAGCGGATTTGTTATCAAAACGTCGAAATCGCTCTGTTGCTCGACCT
CGCCAAATTGCCATGGCATTATCTAAAGAGTTAACCAACCACAGCTTGCC
TGAAATTGGTGATGCATTTGGTGGTCGAGATCATACAACAGTTTTGCATG
CCTGCCGTAAAGTTAAATCATTACGTGAAGAGACGCATGATATTAAAGAA
GATTACTCAAATTTAATCAGAACACTTTCATCTTAA
>CPS_4361 dnaB, replicative DNA helicase
ATGGCCGACAAAAAGCCAGGTAAATTTTCAAAAGAAAGACAATTCATTAA
AGACAAACAAATCGATGAATTAAAAGTACCTCCGCATTCGCTAGAAGCTG
AACAATCGGTTCTTGGCGGACTGCTACTTGATAATGAAACGTGGGATCGA
GTTGCTGAAAAAGCCGTTGCCGCTGATTTTTATAGTCGCTCACATCGCCT
TATTTTTGAAACCATTGGTGGGTTAATCGAATTAGGCGAACCTGTTGATT
TAATCACCCTGTCTGAAGCCCTAGAAAACGACCAAAAACTTGACGATGCT
GGCGGTTTTGTTTATCTCGCAGAGATGATGAAAAACACGCCAAGTGCGGC
AAATATCACTGCTTATGCTGACATTGTACGTGAACGTGCAGTAACCCGTG
AAATGATCAGCGTGGCGAATGAAATCGCTGAAGCAGGTTATGATACGCAA
GGACGAAGCAGCGCCGATTTACTCGATTTTGCTGAAACCAAAGTTTTTGC
AATTGCTGAAAAACGAGCCAACAAGAATGAAGGCCCTGAAAGTCTTAATT
CAGTGTTAGAAAAAACTGTTGATAGAATTGAAAAACTCTGTTCAACGCCA
TCAGGTGGTGTTACCGGTGTGCCGAGTGGTTACGCTGACTTAGATAAAAT
GACAGCAGGTTTACAAAAGTCTGATTTGATCATTGTTGCAGCGCGTCCAT
CGATGGGTAAAACAACCTTTGCGATGAACTTGGCCGAACATGCTGCGATG
ACACAAGAACATCCTGCACTTATCTTCAGTTTAGAAATGCCTGCAGATCA
AATCATGATGCGTATGCTGGCGTCTTTAGGCCGTATTGATCAAACTAAAA
TCCGTACTGGTCAGTTAGAAGATGAAGATTGGGCTCGTCTGTCTTCAACC
ATGGGCTTGCTCATGGAAAAAGGCAAAATGTTTATTGATGATGCGGCAGG
GCTAACGCCGACAGAAGTGCGTTCAAGAGCGCGAAGAATACATCGCGATC
ATGGCGGTATTAGTATGATCATGATTGATTACTTACAATTAATGCGAGCA
CCACAATTCTCTGATAACCGTACCTTAGAAGTTGCTGAAATTTCGCGTTC
ACTCAAAGCCTTAGCTAAAGAATTAAAAGTGCCTGTTGTGGCATTATCTC
AGTTAAACCGTGGTTTGGAGCAACGTTCGGATAAACGACCAATTAACTCA
GATTTACGTGAGTCAGGTTCAATAGAGCAGGATGCAGATTTAATCATGTT
TATTTATCGTGATGAGGTTTATCACGATGACAGTGAATTTAAAGGCATGG
CAGAGATTATTATTGGTAAGCAACGTAACGGACCGATTGGCCGTGTGCCA
TTAACCTTCCAAGGTAAGTATTCTCGCTTTGATAATTATGCCGGACCACA
TGTATTAGAAGAAGACTAA
>CPS_1570 dnaE, DNA polymerase III, alpha subunit
ATGCTTAGCGGAGAAATTGCCACAGAAGCAGAACCAAGCGTTTTTGTACC
GCCAAAATTTATTCATTTACGCGTACATAGTGATTACTCTATGTGTGATG
GTTTGAAGAAAGTAAAGCCGATAGTTGCGAAAGCTGTTGAGCTTAATATG
CCAGCACTTGCCTTAACTGACCAAACTAATTTATGTGGTCTAGTTAAGTA
CTATCACGCTGCTCATGGCGCAGGAATTAAACCAATTATAGGTTGTGATT
TTTGGGTGAAAAGTGATGAGTTGGAAGATGAACTGTCACGTATAGTTGTA
CTTACTACTAACAATGTAGGTTATAAAAATATAACTGAACTTATCTCAAA
AGCCTACATGCGTGGACACATACAAAATAAAGCTGTGATAGATAAGTCGT
GGCTGGTTGAATATAAAGAAGGCTTAATCTTACTTTCTGGTGGCCGAGAA
GGTGATATAGGTAAAGCCTTATTAAAAGGGAATACTGAATTAGTTGATGA
AATGGTGAGTTTTTATCAGCAACATTTCGATCGTTGTTATTTTCTAGAGT
TAGTCAGAACAGGTCGTAATGATGAAGAAAATTATATCCATCTTGCCGTT
GAGCTAGCCGAAAAAGAAAATCTGCCAGTAGTTGCAACTAATGAGGTGAT
GTTTCTTTCCCCAAATGACTTTGATGCCCATGAAATTCGCGTTGCTATTC
ATGACGGCTTTACCTTAGATGATAAACGTCGACCTAAGCGTTATAGCTCT
GAGCAATATTTACGTAGTGAAGAGGAGATGTGCGAGCTGTTTAGCGACAT
CCCTGAAGCCTTAGCCAATAGTGTCGAAATTGCTAAACGCTGTAATGTCA
CTGTCACCTTAGGTGAATACGTCTTACCAGACTTTCCCACGGAAGGTTTG
GAGATAAATGACTTTTTTATCAAAGTATCTGAAAAAGGGTTAGAAAAACG
ACTTGATCAATTATTCGACCGTCAAGCGGATGATTTTGCCGAAATAAGAA
AACCTTATGATGAACGTTTAGCTATTGAGCTAGAAGTGGTAAATAACATG
GGCTTCCCCGGTTATTTCTTGATTGTTATGGAATTCATTCAATGGAGTAA
AGATAACAATATCCCCGTTGGCCCCGGTCGTGGTTCTGGTGCTGGTTCCT
TAGTTGCCTATGCACTAGATATTACCGATCTCGATCCACTTGAATATGAT
TTACTTTTTGAGCGCTTCTTAAACCCTGAGCGTGTCTCTATGCCTGATTT
CGATATCGATTTCTGTATGGATAGACGTGATGAAGTAATCGATCACGTGG
CTGAGCTTTATGGGCGAGATGCGGTTTCGCAAATAATTACTTTTGGTACT
ATGGCGGCAAAAGCGGTTATCCGTGATGTTGGTCGTGTACTTGGCCACCC
ATACGGTTTTGTCGACAGAATTTCAAAACTTATACCGCCTACCCCTGGCA
TGACCTTAGCTAAAGCATTTGAAGAAGAGCCAAAGCTGCCAGAAGTTTAT
GCACAAGATAGTGATGTCAAAGATCTCATTGATATGTGTCGTATCTTAGA
AGGTACCACACGTAATGCAGGTAAGCATGCGGGTGGTGTTGTTATTTCAC
CGACTACTATTACCGATTTTGCCCCATTATATTGTGATGATGAAGGTAAA
AATCCAGTAACCCAATTTGATAAAAATGATGTAGAAGATGCTGGCTTAGT
TAAGTTCGATTTCTTAGGTCTACGAACACTGACCATTTTGCAATGGGCCA
TTGAAATGGCTGATGCAAAATTGATAAAAGCCGGCAAAGAGCCAATCGAT
ATCACCAAAATTGATCTCGAAGATAAAGCAAGCTTTAAGCTATTACTTGC
CTCGAAAACCACAGCAGTTTTTCAGCTTGAATCTAGCGGTATGAAGTCTT
TAATTGATAAATTAAAACCTGATTGCTTTGAAGATATTATCGCATTAGTG
GCGTTATTTCGTCCTGGGCCATTACAATCAGGCATGGTTGATAACTTTAT
TGAACGTAAACATGGCCGTGAAGAAGTCAGTTATCCTGACGCCACTTGGC
AGCATGAAGATTTACAGCCGGTGCTTGAGCCAACCTACGGCATTATCTTG
TATCAAGAGCAAGTAATGCAAATTGCGCAGGTACTTGCAGGTTACTCACT
CGGTGGTGCAGATATGCTTCGCCGTGCAATGGGTAAGAAAAAGCCAGAAG
AAATGGCTAAGCAGCGCGCCGGTTTTGAACAGGGTGCGAAAGATCGTGGT
GTTGATGGCGAACTTGCCATGAAAATTTTCGATTTGGTTGAAAAATTTGC
TGGTTATGGTTTTAACAAATCGCATTCTGCGGCTTATGCCTTAGTGTCTT
ATCAAACGTTATGGATGAAGACACATTTCCCTGCACCGTTTATGGCCGCA
GTAATGTCTGCTGATATGGACAACACTGAAAAAATTGTCACTTTAGTTGA
TGAGTGTGGCAATATGGAAATAGATTTATTGCCACCCGATGTTAACGCTG
GACAATATAAATTTACCGTTAATAGTGATAATCAAATTGTTTATGGTATT
GGTGCTGTTAAAGGAGTTGGTGAAGGCCCTATTGAAGCTATTATTAGTGC
TCGACAATCAGACGGCCCTTTCACAGACTTATTTGATTTCTGTGCACGTC
TAGATCTTAAAAAAACTAATAAACGTGTTTTAGAAAAATTAATTAAATCA
GGTGCTATGGATAGTCTTGGCCCTAAGTATGTACAAGGGAAAGCAAAAGA
GCAGGGCGCTAATCGAGCGGCTCTCTTTGAAACATTACCAGAAGCCATTA
AAGCAGCAGAGCAACATGCAAAAGCAGAATCGTTAGGTCAAAATGACCTT
TTTGGTTTAATAAATGATGAACAAACTGATTCCAGACAAACTTTTAAAGA
AGTCAGAGCTTGGCCTGAGGAAAAGTGGCTAGATGGAGAAAAAGAAACCT
TAGGGCTTTATTTAACCGGCCATCCCATTAATCGCTACTTGTCTGAAATA
AAAAAATATTCTTCGAGCCGCCTAGTTGTTATGCAACCAACGGGTCGAGA
TAGGCAAGCTGTTGCTGTTGGTTTAGTGATAGGCGTACGCGTCCTGGTCA
ATAAACGCGGGCGTCGCTGGGCATTAGTGACGCTAGATGATAAGAGTGCT
CGTATGGATATTCGTCTTTTTCCAGATGACTATGATCGCTTTGCAGAGAT
GCTGGTAAATGACGCTATTTTGGTTTGTAGTGGACAGGTCAGCTTTGATG
ATTATTCTGGTGGTAATACAATGACAGCTCGGGATATAATGACTATCACT
GATGCGCGAGAAAATTATCTTAGTTCCATTGATGTTCAAGTTGATAACAG
CTTGATAGCAGATGATTTTATCGAACAGTTTACTCAGGTATTAACACCTT
TTAAAGAAGGCACCTGTCCAGTGAGAGTTTTTTATCAGCGCGAAGAAGCC
CAAGCTATGCTTGAGTTAGGCGTTCAATGGCGAGTAACGCCAGCCGATAT
GTTACTATACGAATTAAAAACATTGCTTGGTGAAGAACGTGTCGCCATGG
AATTTAAATAA
>CPS_4335 dnaG, DNA primase
ATGGCTGGACGCATTTCTCGACAATTTATTGATGACTTACTCAACAGAGC
AGATATTGTTGATCTAGTTGATAGCCGAGTACCGTTAAAAAAGGCGGGTA
AAAACTACCAGGCCTGTTGCCCATTTCATAATGAAAAATCACCTTCCTTT
ACTGTGAGTCAAGATAAACAGTTTTATCACTGCTTTGGCTGTGGTGAACA
CGGTAATGCTATTTCTTTTTTGATGGAATTTGATCGTCTTGATTTTGTTG
ATGCGGTTGAAGAACTTGCTTCTCATTGCGGAATGGAAGTAGTCCGAGAA
GAAAATACTGCTAGCCCAGAAGAGCAACGTCGACAGCAGCAAGTTTACCA
ACAAAAACAAGATGACTATGAGCTAATGTCGCAAATTAGTCGTTTTTTTC
AGCAGCAATTAAAAGTGGCTAGTGACAAAGAAAGAGCTATCGACTATTTA
AAAGCTCGAGGGCTCAGTGGTGAGGTTGTTAAGCGCTTTGGTATTGGCTA
CATAAGTGACGCTTGGGACGGCGTGATGAATAGTTTTTCGCGTAATGGTC
AAGCCAATCAGCAATTGATCGACTTAGGTATGGCCATTTCAGGCGATAAA
AAACGTCCCTATGATCGTTTTCGTGGACGTATCATGTTTCCCATCAGCGA
TAAACGTGGTCGAGTCATTGGCTTTGGTGGGCGTGTTTTAGGCGATGAAA
AACCCAAGTACTTAAACTCGCCAGAAACACGTGTTTATCATAAGGGCCAA
GAACTTTACGGGTTACATGAGGCTAAGCAAGCCAATAAACAACTTAAGCG
CTTGATTGTTGTTGAAGGTTATATGGATGTCGTCGCGTTAGCACAACATG
GTGTCGATTATGCTGTTGCTTCGCTGGGAACCGCAACGACTTTTGAGCAA
TTACAAACCTTATTTCGCACTGTTCCTGATGTTATCTGTTGTTATGATGG
TGATAGAGCGGGTCGCGACGCTGCCTGGCGAGCGATGGAAAATGCCTTAC
CTCTTATTCGTGACGGTTTTTCATTAAAATTTGTATTTCTGCCTGATGGT
GAAGACCCCGACTCTTTGATTGGAACTCAAGGCCAGCAGGCTTTTGAAAC
TATTATTGATAACGCCGTGCCGTTATCCAAATTCCTCTTTGAGCAACTCA
TGCAGAAAGTTGATATGAGCTCTCTAGAAGGAAGAGCTGCATTAGTTGAG
TCATTTCAGCCTTATTTATCTAAGCTTCCTGACAGTATTTTAAAAGATGC
AATGCTTAATGAAATAGCTAACAATTTTGGTACTGGTAGCGAGCAATTTC
TAGCCAAGTTTACTAAGAGTATAAAAAGTACGGCAGTAAAAACGGCAGTT
AAAACCAGAACAAAGGTCACCCCAGTAAGATCAGCACTTGCTTTATTGTT
AGAACATCCCCATATAGCAAATAGCTTAGGTGATATAAATGTGTTGCAAC
CATTAACTGTGCCAGGAATACCGCTGTTAATGCAAGTGTTAGGTATATGT
CAGCAAAACCCTGATATTAAATCACCACAATTGCTTGAAAGTTTTCGCGG
AACTGAGCAAGGCACACAATTAGCAAAGTTGATGTGTTGGCAGCACAATG
TGGAAGCTGATGCAGCAACTGATGTGTTTCTTGATAATATTGAGAAGCTT
CTGAATGACTTTGTTGAGCAACGTACTGAAGTATTATTACAAAAGGCACG
CGCTGGACAAATGACAGCTGAAGAAAAGCAAGAGTTACAAGCATTACTGA
ATGCTTAA
>CPS_0002 dnaN, DNA polymerase III, beta subunit
ATGAAGTTTTCACTGAATAGGGAATTATTACTTAAACCATTATTATTGGT
TTCTGGCGCAGTAGAACGTAAAAGTACGTTGCCAATTTTAAGTAATATAC
TTTTTGAGGTTAGTGGTCAGTCACTTACTTTGACAGCCACGGATTTAGAA
CTCGAAATGGTTGCTTATGCTGAAATTCAGAATCAAGGTGACGATGGTAA
GATCACTATTCCGGCTCGTAAATTATTAGACATATGTAAAAGTCTACCAG
AGAGTTCTTTAATTTCTTTTGAAGTGATAGATGAAACTATTAAGTTATCT
TCAGGTCGTAGTAAATATTCACTTTCTACGTTACCTGCTGTCGATTTTCC
AAATATTGAAGAATGGAAAGGGGATGTTGAGTTTCAACTTTTAAAATCTG
AATTTTTACGTTTAATAGAAAGCACTCATTTTTCGATGGCCAACCAAGAT
GTCCGTTATTACTTAAACGGCATGTCTATCGAAAGTGAAGGAAATGAGAT
TCGTTCAGTGGCTACAGATGGTCATCGTCTTGCTATTTGTAAAATATCAA
ATGAAACTTTAGCATTACCAGCTAGACAAGTTATTGTTCCCCGTAAAGGT
ATACTTGAAATAATTCGTCTACTTGCTCCTGTTGATGAAGCAGTGCAGGT
GTTTTTAGGCTCTAATCACATTCGCATTATTGATAGTGAGTTCTCTTTTA
CCAGTAAATTGGTCGATGGTCGATTTCCTGATTACAGAAGAGTATTACCG
AGAAACGGCGATAAAGTTTTTGAAACTAACAAAGATGCACTTCGTCAGGT
TTTATCACGTGCCTCAATTTTATCTAATGAGAAATTTAAAGGTGTACGTT
TAAATTTCTCAGATACTAATTTAAAAATTACGGCCAATAACCCAGAGCAA
GAACAAGCTGAGGAAGAAATTGAAATTAACTTTCCTTATGGCGAATTAGA
AATTGGCTTTAACGTTAGCTATGTTCTCGATGTGCTAAGTGCTATCAAAG
ATGAAAATGTTAAATTTACCTTAGCTGATGCAAACAGTAGTGTAGTCATT
GAGGGCAGTAGCAATGGCGAAGCGCTTTATGTTGTTATGCCTATGCGTTT
ATAG
>CPS_2255 dnaQ, DNA polymerase III, epsilon subunit
GTGAACAATATAACCGATACTCAAGACTCAGAGAAAGATAAGCGATTAAT
CATTTTAGATACTGAAACTACAGGTATCAACCCGAGAGAGGGACATCGTA
TTGTAGAAATTGGTTGTGTTGAGATGATCAATCGTCAATTAACGGGTCGA
ACATATCACGCCTACATAAAACCTCTTGATCAACGTGGCCAAGTCTTTCA
GATGGAGCAAGAGGTTATTAATATTCATGGTTTAACCAATGAATTTCTTG
CAGACAAACCCATTTTTTCCCAAGTTGTACACGAGTTTATTGATTTTATT
CGTGGTGCTGAGTTGGTTATACATAATTCCAAGTTCGATGTTGGCTTTAT
GGATCATGAGTTTTCTTTGTTTAATTCAATGGGACGCAGCCAAGATAAAG
TACCGATGACTGAAGACATCTGTACTATTACCGATACCTTGAAAGTCTCA
AAAGATGAACTGGGCTCTCCAAAAACATTAGATTACTTAGCGAGATTTTA
CCGAGTAGACAAGTTAGTAGACCGGACATATCACGGGGCATTGATTGATG
CCCAATTATTAGCGTATGTCTACATTGAGATGACGCGTAAGCAATCAAGT
TTCAATTTGTCGTCAGGTGATGGCACTAATGCCGATGCTAATGCAATCAG
AAGAGTATCCTCGACTCGTAATAAATTAAAGGTTATTGCTGCTTCGGCCG
ATGAATTAGTAGCACATACAGAGCGGGTAGCTGTAATCGGTAAAAAAGGA
GGGGATCCACTTTGGAAATAA
>CPS_3744 dnaX, DNA polymerase III, gamma/tau subunit
ATGAGTTATCAAGTCCTAGCAAGAAAATGGCGCCCAAAGAACTTTCAGCA
ATTGATGGGGCAAGAACATGTCGTCAATGTACTTGCAAATGCTTTATCTC
AAAAGCGTTTACATCATGCTTACCTTTTTACGGGTACGCGAGGTGTTGGT
AAAACGACTATTGCACGGATTTTTGCTAAGAGTCTAAATTGCGAACTTGG
AATAACAGATAAACCCTGTGGAAAATGTGATGCCTGTATTGATATCGACC
AAGGGCGTTTCGTTGATCTTTTGGAAATAGATGCGGCTTCTAAAACGAAA
GTTGATGATACCCGTGAAATTCTAGATAACGTCCAATATGCACCTAGTAG
GGGCCGATTTAAGGTTTACCTGATTGATGAGGTACATATGTTATCTCGTC
ATAGCTTTAATGCGTTACTAAAAACGTTAGAAGAGCCACCTGAGCATGTT
AAATTTATTTTAGCGACTACAGATCCTCAAAAATTACCTATTACAGTGTT
GTCACGGTGTCTACAATTTCATTTAAAAGCGTTAACTGTCAAACAAATTG
AAGATAAGCTTGCTGAAATACTTTCTCATGAACAAGTGAGTCACGAGCAA
GGTTGTCTGACGTTATTAGCTAAAGCTGCTCGTGGCAGTATGCGAGATTC
ATTAAGTTTAACCGACCAGGCTATTGCTCAAGGGCAAGGTCATATTAACT
TAACTAATATTCAACAGATGCTCGGTGGTATAGATCAAAACTGGGTTTAC
CAGTTGGTGATTACTTTACTAAAACAAGACAGCCAAGCGTTGATGACTTT
ATCTCAAGAGATAGCCTCTTATGCGCCAAGTTATAGCCGTTTATTTGCTG
AATTAATTCAACTATTTCATCAAATAGCTCTAATGCAAATAGTTGAGCAA
CCTTTTGATTTACCGGCAGACTTATTGGCTTTATTGAAAAAGTTTAGTCA
AGCCATGTCAGCTGAAGACGTTCAACTTTATTACCAAATAAGCCTTAATG
GCCGAAAAGATTTACCGTACGCTTTTGACGAACAAGCTGCTTTTGATATG
ACGTTGTTGCGACTATTTGCTTTTAAACCAATGCAAAAGTCACAGCTTAC
CAATGAGTCTACTATAGATAATATTGAGCAAAACACAGCGATTAGCTTCG
ATGATGATAACTTGTCAAAAACCACTGAAACTCTTTCAAATAATGCTGAC
ATAGCTAAAGCAGCGGTTACAGAGGCCGTTGTTGAGAGCTTTGCTGAAGT
GGATATTAGTGACTCCGCTGCTGCTACGGACAATACTCAACAAACTGAGT
TAAATGAGCAAATGCTTGCCATTGAGCAACAAGCTGATGAACTCAAACAG
AGTGAGAATAACTCATTAAATCAAACCCCAGCGCAGCATGTGGTTTCTCA
AGAAGTTAAAGCTCCACAACAAGTGCCTGTGGTAGAAAGTTATAAAGAAA
AACAAAATACAGCGCCCATTGTGCCCAATGAACAAGTAGGGCAACTTAGT
ATCCATAGTCCGGTAGGCTCTGTGCTCGCGACTCGGAATATGCTACGTAG
TCGAAAGAAAGAGTTGGAGAAGCAAACAAAAAAGTCCAGTGACGCAACTC
TGCGTCAACCTAATAGGGCAGACAATAGTAAAAATAAAACTCAGGACAGT
GTTAACGCTACAGTTAAGCCTCAAGTTGTATCAACTGAAAGCTTGGTCAT
TGCGCCAGAACCTGACTTACCGTTTCATCAAGATAGTATAGATCCCGCAA
AAGTAACAAAAGCGAATCAAGTTGATAAATGGGCGCATATGATCGATTCA
ATGCAGCTTACCGCGCGTATTCGTCAATTAGCAATACATGCAACAATCAG
TGAAAAATCTACTGATGATAATTTGATTCTTAAGCTAGATCAGGCAACTA
GACATTTAAGTACTGAAATCGCTCATCAACATTTACAGAGCGCTATTTGT
GAATTCTTAGCAAGACAAATCACGGTTACACTTGATATTGTGGAAGAAAC
GGTTGCCGACCCATATCAAATTCAAGGTCAAATTAATGATAAGCGTCTAG
AGTACGCTAAGACTTTATTAAAAGAAGATGCCGTGGTGATTGCCTTGCAA
GAAACTTTTCAAGCAAGTTTGAATGAAGAGAGTATTTCACCTCGCTAA
>CPS_0551 fis, DNA-binding protein Fis
ATGTTCGAACAAAATGTTTCTTCTCCATTTATCACTGGCGATATTCAAAC
ACAAACAAAAACTTCTCCATTACGTAGCCAAGCTAAAATCGCAATCAGCA
ACTACTTATCACAATTGAATGGTAACGATGTTGATGATATGTATGACCTT
GTATTGAGCGAAATTGAAGCGCCAATGTTAGAAGAAGTTATGATGTACAC
TCGCGGTAACCAAACACGCGCTGCCAACTTACTAGGCATCAACCGCGGTA
CGTTACGCAAGAAACTTAAAAAATACGGTATGAACTAA
>CPS_2331 gyrA, DNA gyrase, A subunit
ATGTCCGATCTGGCCAAACAAATAGTTCCAGTTAATATTGAAGATGAACT
AAAAACCTCCTATTTAGATTATGCCATGAGTGTAATAGTTGGGCGCGCAT
TGCCTGACGTTCGTGATGGCTTAAAACCTGTACATCGTCGGGTGTTATTC
GCCATGGATGTATTAGGTAATGATTGGAATAAAGCCTATAAAAAATCAGC
CCGTGTGGTTGGTGATGTAATAGGTAAGTATCACCCTCATGGTGATACTG
CAGTTTACGATACAATAGTTCGTATGGCACAGCCATTCTCCTTACGTTAC
ATGCTTGTCGATGGACAAGGTAACTTCGGCTCTGTTGATGGTGATAGCGC
AGCTGCAATGCGTTATACCGAAATTAGAATGTCTAAAATTGCACATTCTA
TTCTAGCCGATTTAGATAAAGAAACCGTTGATTTTGTACCTAACTATGAT
GGTACAGAACATATACCAGCGGTTATGCCTACCCGTGTACCTAACTTACT
CGTTAATGGTACTTCAGGTATTGCTGTTGGTATGGCAACCAATATTCCTC
CGCATAATTTAACTGAAGTTATCAATGCTTGTTTAGCACTTATTGATAAC
AGTGAATTAACGTTTGAAGAAATTTTAGAACATATCCCTGGTCCTGACTT
TCCAACAGCAGGTATTATTAGTGGTCGTGCAGGTATCGAAGAAGCATACC
GAACCGGTCGCGGTAAAATAAAAATTCGTGCACGTGCAAGTATTGATGTT
CATGAAACCACGGGTAAAGAAACAATAATTGTTCACGAACTACCTTATCA
AGTAAACAAAGCACGCTTAATTGAAAAAATGGCTGAGCTTGTTAAAGATA
AACGTCTTGAAGGTATTTCTGCTTTACGTGATGAGTCTGATAAAGACGGC
ATGCGTATGGTTATTGAAATCAAACGCGGTGAAGTAGGTGAAGTTGTTTT
AAATAACTTATACAAACTGACGCAAATGCAGGTTTCTTTCGGTTTAAATA
TGGTGGCATTAACCAATGGCCAACCGAAAATATTTAATATCAAAGAGATG
TTAGAAGCATTTGTTTTGCATCGCCGTGAAGTTGTTACTCGTCGTACTAT
TTTCGAATTAAGAAAAGCACGTGACCGTGCTCATATCTTAGAAGGTTTAT
CCATTGCATTAGCAAATATAGACCCTATCATCGAAATGATTAAAAATTCG
AATAACAGAAAAGAATCTGAAGAAAAGCTTATTTCCCAAGGTTGGGAACT
CGGTAATGTTGCTAACATGCTCAGCGAAGCGGGTAATGATGCAGCACGTC
CTGAGTGGTTAGAACCTGAATATGGTATTCGTGATGGTTTATATTACTTA
ACCGCCGAACAAGCAAAAGCAATCGTCGACCTACAGTTATATAAACTATC
TGGCATGGAACACGATAAAATTCTAAGCGAGTACAAAGCGTTATTAGACC
TTATTGCAGAATTAATGCATATTTTGGCTACACCTGCTCGTTTAATGGAA
GTGATTTGTGAAGAACTTGTTGCTATTCGTGATGAGTTTGGTGATGAACG
TAGAACTGAAATTACTAACGCTTCACATGATTTGTCTTTAGAAGACTTAA
TCACTGAAGAAGATGTTGTAGTGACACTTTCACATGAAGGTTATGTTAAG
TATCAAGTCTTAAGTGATTACGAAGCTCAGCGTCGCGGTGGTAAAGGTAA
AGCAGCGACTAAGATGAAAGAAGAAGACTTCATCGAACGTTTACTCGTGG
CTAATACACATGACACTATTTTATGTTTCTCAGACCGTGGTAAATTATAT
TGGTTGAAAGTTTTCCAATTACCATTAGCAAGTCGTACCGCAAGAGGTAG
ACCTATTGTAAACATCTTGCCATTAGAAAGTGATGAACGTATCACTGCTA
TCTTACCAGTACGTGATTATGCCGATGATAAATATATCGTTATGGCAACA
GCTTCTGGTACGGTGAAGAAAACGCGTTTAGATGCCTACTCTAATCAACG
TGCTAACGGTATTATTGCCTTAAACCTTCGTGATGATGATACCTTAATCG
GTGTTGATATTACCGACGGTACTAACGATGTTATGTTGTTCTCGGATGCG
GGTAAAGTTGTCCGCTTTAACGAAAAAGTACGTGATAGCGAAACAGGTGA
AATAAAACTTGATCCAGAAACGGGTGAACAACGATGGGCGTTAAAACCAA
TCGGTCGTACCGGTACTGGTGTACGTGGTATCAAGCTTGAAGGTGAGCAA
AAAGTTGTTTCGCTTATTATACCTAAGAATGATGGTCCAATCTTAACCAT
TACTGAAAATGGTTTTGGTAAGCGTACTGATTTAGCTGAATATCCAGCTA
AGAGTAGAGCAACGAAAGGTGTTGTTTCTATTAAAGTTAGTGAACGAAAT
GGTAAGGTTGTTGGTGCAGTTCAAGTAGAAGATCTTGATGAGATAATGCT
AATTACTGACAGTGGTACTCTAGTTCGTACTCGTGTCAATGAAGTGAGCG
TTATTGGTCGTAATACTCAAGGTGTACGTTTGATACGTACTGCTGATGAT
GAACATGTGGTAGCACTACAACGTATTGATGAAATTGAAGAGCCAGCAGA
GCTTGAAGAAGTTGCTGAGGGTGATGAAGTCATTGAAACAAGTGTGGAGC
CCAGCTCTGAAGATAATCCAGAGCATAGCGCTCAACAGGATGTTGCTGAT
ACCTCACAAGACGACAATCAAGAGTAA
>CPS_0004 gyrB, DNA gyrase, B subunit
ATGACAGTAGAAAATGAATATAGCTCGTCCAGTATTAAGGTACTAAAAGG
ACTTGATGCAGTACGAAAAAGACCTGGTATGTATATAGGTGACACGGATG
ATGGCACTGGTTTACATCATATGGTTTTTGAGGTTTTAGATAACTCAATC
GATGAAGCATTAGCGGGACACTGTACTGATATTATAGTGACTATCCATTT
AGATGGCTCAGTGTCAGTGCAAGATGATGGCCGTGGAATACCTACTGAAA
TTCATCCTGAAGAGGGTATATCTGCTGCTGAAGTTATTATGACGGTTCTA
CATGCCGGTGGTAAGTTTGGTGGTGAAGACTCTGGTTATAAAGTATCAGG
CGGTTTACACGGTGTTGGTATTTCAGTAGTAAATGCGTTAAGTGAAAAAC
TTAAGTTGAACATTCGCCGCGATGGCAAATTGTTTGAACAGTTTTATCAT
ATTGGTGTAGCTGAAGCTCCACTAGCTGAAGTTGGTGTAAGCGATAAAAC
AGGTACTGAAGTGCGCTTTTGGCCAAGTACTAATACTTTTACTGATGTTT
TATTTCATTATGAAATATTAGTAAAACGAATTCGTGAATTATCATTCTTG
AACTCTGGCGTATCAATTCGATTAATTGATGAACGCGAAGAAGGTAAAGA
AGACCACTTCCATTACGATGGTGGTATTCAAGCATTTGTTGATTATTTAA
ATACCAATAAGACTCCTGTAAATGAAGAAATATTCTATTTCGATTTAGAA
CGTGAAGATGGCATTGCGGTTGAAGTAGCAATGCAATGGAATGATGGTTT
CCAAGAGAATATTTACTGTTTCACTAATAATATTCCACAGCGTGATGGTG
GAACTCATTTAAGTGGTTTTAGAACAGCACTAACAAGAACCCTGAACTCT
TATATGACCAAAGAAGGTTTAAATAAGACGAAGAAAGGTGGCGCTACTGA
AACTAGTGCTACTGGTGATGATGCTCGTGAGGGATTAACTGCTGTTATAT
CTGTGAAAGTTCCTGATCCTAAGTTCTCTTCACAAACAAAAGATAAACTT
GTTTCGTCTGAAGTAAAAACTGCAGTTGAACAAGCTATGGGTGAAAAACT
AGGTGAATACCTATTAGAGAATCCATCGATAGCACGTACTATCATCATGA
AAATTGTTGATGCTGCTCGAGCACGTGAAGCTGCTCGTAAAGCTCGTGAA
ATGACTCGCCGTAAAGGTGTATTAGATATTGCTGGTTTACCTGGTAAGTT
AGCAGATTGTCAGGAAAAAGATCCTGCATTATCTGAAATATATATTGTGG
AAGGGGACTCTGCTGGTGGTTCAGCTAAGCAGGGGCGTAATCGTAAAAAC
CAAGCTATCCTACCGTTAAAAGGTAAAATTCTTAACGTTGAGAAAGCTCG
ATTTGATAAGATGATATCTTCTCAGGAAGTTGGCACGCTGATTACTGCAC
TAGGTTGTGGTATAGGTCGTGATGAATATAACCCGGAAAAGCTTCGTTAC
CACAGCATCATTATCATGACCGATGCCGATGTCGATGGGTCTCATATCCG
TACCTTATTACTGACTTTCTTCTATCGTCAAATGCCAGAAATTATGGAAC
GTGGACATATCTTTATCGCACAGCCACCACTTTACAAAGTAAAGAAAGGT
AAGCAAGAGCGCTACATTAAAGATGATGATGGTTTAACTGAATACTTAAC
AACACTTGCACTTGATAATGCCTCTATTCATGTGAATGAAGATGCTCCTG
CAATAACAGGTGCTGCTTTAGAGCAATTAGTAAATCAATTCCGTAATACT
ATGGATATCATTAAACGCCTATCTAGACAGATTCCAGCGGATATTCTTGA
GAAAATGGTTTATAGCAGTACTATCAGTGCTGATGATTTTGCTGATGAAG
CTAAAGTTAATGCTTGGGCAAAGAATTTAATTACTCAGCTTGAAAATCAA
GATGGTAATGGTTCAATCTATAAAATTGAAGTGAAGTATAATCAAGAACG
TAACATTTATTTTCCTAACTTTATCGTAAGAAAACACGGTATCGATAAAG
AATATCATTGTAGTTATGAGTTTATCCAATCAAAAGAATTTGCATCGATT
ATGGCATTAAATACCTCAATCAATGACTTGATGGAAGAAGGTGCTTACGT
TAAACGTGGTGATAAAGTTAACCCAGCAGCTAACTTTGAGGATGCGTTAG
AGTGGTTAATGGCAGAATCGAAACGTGGTCAATATATACAACGTTACAAA
GGGTTAGGTGAAATGAACCCTGAGCAGCTGTGGGAAACGACTATGGATCC
TGAAACGCGACGTATGTTACAGGTAACTATTGAAGATGCTATCGCAGCGG
ATCAACTATTCACTACTCTAATGGGTGATCATGTTGAACCACGTAGAAAG
TTTATTGAAGACAATGCCTTAAAAGTTTCAAACCTTGATATATAG
>CPS_2454 helD, helicase IV
TTGCATTTCTACAAGACGAATGTTGTATTGATGAGCAGTAACCCTCAAAC
GGTTGTCGATAGTATTGAACAGCTATCTGACTACTGTATCCCTTCCAGTT
TTTTTCGTCGATTCATTGGTATACCAACAGCGATAAAAATCAGTGATTGT
GGTGTAGTTATTGACGTTGAAGATAGTTTGACCACTATCAAGTGGGAAGA
GCTTATCGTTCCTCCAACTTTTCATCTCAGCTTTTTTGGTCAAATAATTT
CATTTAAAACAGAAAGCAAAAGCTATGTTTTCACCATGCTTGCCTATAAA
TCAAAGCGTAAGCACAAAAATAATTGTGAGCAACGTTGGGCAGCAGCCAA
TATTCATCGTGTTGAAACGTTATTAACCGCCATAGAAAGATTTAAGACTA
ATCGATATATGCGTCGTTCAATAATTGAACGTATTCAATTAGCATCGAGG
CAAGAATTAGTCCGTTGGTTGCCGTGGCTTAATTCAAACAGCTCAAGTAA
ATCAACGAGTTCACTGACCAATGTTATTGAAATAACACAACGATTATCGT
ATTACCAACATTGGCAGCAGCAGGGAATAGCTGATTGTCGAGAAAGCTAC
ATCAGTAAGCAACTTCAAACTCATGAAGCCTTTTTTGATAATGTCGAGTC
TAATCCATTAACACTGTGTCAGCGCAGAGCCTGTATTATCGATAATGACA
ATAATTTATTATTAGCTGGCGCGGGAACCGGAAAAACCAGTGTGATGATT
GGTCGGACAGGTTATTTACTCAATAGCCTGCAAGCGAAGAGCGATGAAAT
ATTATTGTTAGCCTATGGCCGAAAAGCAGCTAATGAAATGGATGAAAGAA
TTAGAGATAAGTTATCGACTGATAAAATCAGCGCGACTACTTTTCATCGT
TTAGGCCTGAGTATTATCGCTCAGGTTGAAGGGGGAAAACCCAGTTTATC
AGTATTAGCAGATGATGAAAAAGCAAAATCTAAATGGATTCAAAGTTATT
TTGAAAGACTCATTAAAGAAGATAGGCAGTATCGCAAGCTCATCCTCGAG
TATTTTGGCAAGTACTATTATGTTGAACGCAGTGCTTTTGACTTTAAAAG
CAAAGGCGAGTACTACCAGTACTTAACGGACAATGATATTCGCAGTTTTA
AAGGTGAGCAAGTCAAAAGCTTCGGGGAGCTTTATATTGCCAATAGCTTA
TTCTCTTATGGCATAGAATATCAGTATGAAGCTAAATACGCTTACGATGT
AAAATCAATCGAACGAAAACAATATCAGCCAGACTTCTTTCTGCCTGAAT
TCAATGTCTATATTGAATATTATGGGATTGATGAGAACGAAGATACAGCG
CCATACATAGATAAAGATGAATACCATGAGGGTATTCAATGGAAACGTGA
TACTCATAATAAATTTAATACTGTGTGTCTTGAATTTACCTATGCGCAAC
ATAAAACAGGTCAATTACTAAGTGCCTTAAAGGCATCATTGATTGAACTA
AAAAATCGTTCTGACTTATCACCCGCTGATTCCTTTCCTAGCGAAAAAAC
ACCTAGCGAATTAATGTCTAGTGAACATATATCTGCTGAACTAAGACCAA
TTGAACTGATACCTAGCGACGTAATACTAGCCACACTCAATGAGAGTGGC
AGAATAACCGAGCTTGCTAAAACATTTACGCAATTAGTTGGGCTTTATAA
AGCTGCTTGTCTAGATACAACTTTAGACTGCACCTTAGCGAGTAGTTTAC
AAAACAGTATTATCGCTAACTCGGTAGAGCCTAAACAAACAGAAAAAGCC
TTAGCATTGCTCAAGCCTATTTTAAGCGCTTATGAACAACACTTAGCACA
GCACCATGAAATTGATTTTGAAGATATGATTAATAAAGCGTTAACCTATG
TTCAAGCAGGTCAATTTAAGTCTCCCTGGCGTTATATCATGGTTGATGAA
TTTCAAGATATATCCGAGCCACGAGCACGTTTGGTAAAAGCGTTACGTGA
CAACAATAAAGAATGTTCTGTTTTTGCAGTAGGCGATGATTGGCAGGCTA
TATACCGATTTAGTGGTGCTGATGTCACTTTAACGACTCAATTCTCTAAT
TACTTTGGATCAACAACTCAATCAGAATTAGATCAAACTTTTCGATTTAA
CAACCAAATTGGCAAAGTTGCAACCGATTTTATTAGCAAAAACCCAGCAC
AAATCACCAAAAAAATCACCTCGTTGAAACAAGTTAATGCACCTGCGGTG
TCGTTGCTCAAACGAGATAACAGTCAATTTCGCTCTCGAAAAACAGGACT
GATCGATGAAATGGCTAATGGTGCAATCGACGATGTTTTAGCGGCTATTT
CAGCTAAAGTATGTAAGCCTGTTACCGTTTATTTATTAGCACGTTTTTGG
TTTTTTTTACCAAGTAACATAGATCTTAACAGGTTAAATAATCAATATCC
CTTACTGACCATTGATGCTCAATCTTTCCATACTTCAAAAGGAAAAGAGG
CCGATTATGTCATTATTGTTGGTCTGAAAAAGGGCGCTCATGGTTTTCCT
TCTGAGAAAGTAACGCCTGCACTTAATGAAGCATTACTGGCGAAAAAAGA
AAAATTTCCCTATGCAGAAGAGCGAAGATTACTTTATGTAGCGCTCACCA
GAGCGAAAGACAGGGTTTATATTATTGCAGATATGACCGAATCAAACCCC
TTTGTTAAAGAACTTGTGAACGATCATCAAATTGAACTGAATGAATTTGA
ATGTACAGCAACTCAATCATTGGTAGACGACTTACATTGTCTGGCTTGTA
AAACAGGGCTATTAAAAAAACGTACCGGCCGTTTTGGTACCTTCTATGCC
TGTTCTAATTCTCCTCGCTGTGAACATAAAGAAAAGCCTTGTGCTAAATG
TGAAAGTCCAATGACACGCAAACGTTACCCAGGTTTTAAAACCTGCTTGA
ATGACTTATGCAAAAGCTTGATACCAACGTGCAGTTTATGTGATGCGGAA
ATGGTGTTACGTACGAGCAAAAAAGGCGAGTTTTGGGGCTGTCGAAATTA
TAAAGGAAACGATCCAATGAGTTGTAAGAATGGCGTAGATAATGCCAACG
TTAACTGGCCTGAATTAGTTGTAGATTAG
>CPS_4519 hepA, RNA polymerase-associated protein HepA
ATGCCATTTCAGGTAGGTCAGCGTTGGATCAGTGACAGTGAATCAGATCA
AGGATTAGGTACAGTAACAGGGGTTGAACACCGCTTTGTTAATATTGTTT
TCACTGCTACAGGTGAATCCCGCAAATATGCTAAAGATAATGCCCCACTA
ACGCGTGTTATATTTAATAAAGATGACCTTATTCCTAGCCACGAAGGCTG
GTCTTTAAAGGTAATTTCACATAGTGAAGCCCAAGGTATCATCAGCTATG
AAGGTATACGCCAAGATACCAATGAGCAAATCATCCTAAAAGAAGTGATG
ATAGATCACTTTATTAAATTCAATAAACCTCACGACCGCTTACTTAATAG
CCAAGTTGATCGTTTAGACTGGTTCCGCTTGCGCAAAGATTGTTTACAAC
ATCAGTATCAACAGCAGCAATCTGATTTAACAGGTTTGACGGGCGGTCGA
GTCAGCTTAATACCACACCAGCTTTACATTGCCGATGAAGTCGGTAATCG
CTTTGCTCCGAGAGTTTTACTTGCCGATGAAGTTGGCTTAGGTAAAACAA
TTGAAGCCGGTTTAATAATCCACCAGCAATTAGTCACTGGTCGTGCAAAA
AGAATTTTGATCATCGTGCCGGAATCTTTAATGCATCAATGGCTGGTTGA
AATGCTACGCCGATTTAACCTTAACTTTAGCATTTTTGATAATGAACGCT
GTGTTGAAACCAGCCAGGATAACTATGTTGATGGTAAGAAAGCTAATCCT
TTTAGTTCAGAACAATTGGTATTGGTTAATCTAGGTTTTATCACTAATAA
TCCACAATGGTTCGACGCACTGGTTAGTGAAGATTGGGATTTGATGGTTG
TCGATGAAGCGCATCACTTAAACTGGCAACAAGATAAACCTAGTATTGAA
TACCAATGTATTGAACAACTCGCGCAAGTTATCCCTGGAGTTTTATTATT
AACCGCTACTCCTGACCAATTAGGTCATGAAAGTCACTTTGCTCGCTTGC
GTTTACTTGATGCTGACCGTTTTTATGATTATCAAAAATTTACCGAAGAA
GAGTCCCACTATAGTGAAGTTGCTGATGCCGCCAATGCATTAGTTGAAGG
GAAGCCCCTTTCTAGTGAGCAAGAGACAACACTCTCTGATTTATTGAAAG
AAACTGATATCAGCATTCAACTAACAGAGTTAAACCAAGCAGACAGTAAA
GAATCAGCAAAAGTACGCCAAGGTTTATTAAAACAGTTACTCGACAGACA
TGGTACTGGTCGTATCTTGTTTAGAAACTCTCGAAATACTATTAAAGGTT
TTCCTGCCCGCCAAGTAGTGCCTACAGTACTTATTATGCCCGAGCAATAT
CAAGAAAATATTAATGAGTTTATGCTCAGTGACTGCCCAGAAGCCCTAGC
TAAATCAAAGCAGGCTAAATATATTTTCACTCCAGAAATGCTACACGGCT
TGGATCAACGAAATGATACGTGGACTGATTTTGATCCTAGAGTTGATTAT
TTAATTGACCTATTACAGTCGCTTAAAAGAGAAAAAGTCTTAGTCATTTG
TGCAAACGCCCAAACAGCTATTGATTTAGAAGCCGTTCTTCGTATTAAAG
AAGGTATCCGCAGCGCTGTTTTCCATGAAGGTCTATCGATATTTGAACGC
GATAAGGCTGCCGCCTATTTTGCCCAAGACGAAGATAGTGCTCAATTATT
GCTTTGTTCTGAGATTGGTAGTGAAGGGCGTAATTTTCAATTTGCTCATC
ATCTAGTACTTTTTGACTTACCAAGTAACCCTGATTTATTAGAGCAACGC
ATTGGCCGCTTAGACAGGATCGGACAAACAGAGATAATCCGTATTCATGT
GCCTTACTTTGCAGATTCGGCACAGCAATTATTATTTGATTGGTACCAAC
AAGGTATGCAAGCATTTGAGCATACTTGTATTACGGGTCGAGTGGTTTTT
GAAACCTTCGGTGAGCAATTACTCTCATTAGCATTAAGCTGCCAGCAGCA
GTCAGTTGAGGCAGAATCACTCATCAGTGATAGTTGGCAGAAACATTTAT
CTATTAAAGCGGAATTAGAATCTGGCCGAGATAAATTATTAGAGCTGAAC
TCATCTGGACAAGGTCGTGCACATGAGTTAGTTGAAAAAATCCAACAAGT
TGATAACGACATAAACTTGCCTCAATTTATGTTTCAAGCACTAGATGTTT
TTGGTGTGCAGCAAGATGATAAAGCCGATAATGCTATTGCCTTAAATCAA
AGCGAGCATATGCTTAATAGTAACTTCCCTTGCTTACCTGAAGACGGCAC
TACGGTTACTTTTGATAGAGAAACAGCCTTAGTTAATGAAAATTATCAAT
TATTAACGTGGGATCATCCTATGGTTCGTGGGGTAATGGATTTGGTCTTG
AGCGATGAAATTGGTAACGCCAGTATTGGTTTATTAAAAAATGAAGCGTT
ACCAGTAGGCACATTTTTCCTTGAATGCTTATTTACTGTTGAAGCTACCG
CCCCTGCTCATTTACAGTTAGGTCGTTATTTACCTACTACGCCAATTCGT
ATTCTGGTAGACAAAAATGGCAATAATTTAGCCGACAAAGTCAGTGAAAA
AGTACTTGATAAACAATTATCACCGGTTAAAAAGCAAATGGCATTACAAC
TTATCAAAGCACTTAAGACCCAAATAACGCCTTTGGTTGCAAAAGCAGAA
ATACACGGCGAGCAACACATTGTTGAAATTCAAAAGAAATCTTTAGCTGC
TATGCAAAGTAAACTCTCATTAGAGCATCATAGGTTAACCGCATTAAAAG
CGATTAACCCAAGTGTGCGCCAAGAAGAGATTGACTTTATTAGCCAACAA
CAAGATGAATTGAGCCACTATATTGATAAAGCGCAATTGACCTTTGAAGC
CATTCGCATGATAGTAGTTACTCACTAA
>CPS_1720 holA, DNA polymerase III, delta subunit
ATGAAAATTTACCATAACCAACTAGACAATACGCTACGACAGGGTTTTAA
ACCTGTGTGGTTGGTTTTTGGTGATGAGCCATGGCAAAAAGATAACAGCT
TAGCTGCTATTAAAAATAATGCTAAAAGCCAAGGATTTAGTGAGATCATT
CGTTTTAGTAGTGATACTGCTTTTGATTGGCAGCAGTTGCTTGATGAATA
TCAATCACTAAGCCTTTTTGCCAGCCAACGTATCATTGAAGTAGAGTTAA
CAACGGTAAAAGTTGGCGATGCAGGAAACAAGGCTTTACTCGCTTTGGCT
GAGCGCTTAACGCAAGACATTAATAGCGGTCATGTTCCACAGGATGTTAT
TTTTATATTCCATGGCGCAAAACTTGATGCAGCTAGTGCAAATAGAAAAT
GGTTTAAAAGTCTAACCCAATTAGGCTGTTATTTACCCTTGTATGATATC
GAGCTAAAGCTCATGCCTCAATGGTTGAATAATCAAGCCAGACAGTTGAA
ACTTAACATCTCTCCCGAATTAAACGCGCTACTTATTGAACTGTTTGAAG
GTAATTTACTTGCCCTTGCCCAAGAGCTAGATAAACTGGTGTTACTCTTT
GGTTCACAAACAATTAGTGTTGAACAAGCAGAGCAGTTAATCATTAAACA
AGCGAAGTTTAATCCTTTTCAGGTCATCGAAGTTTTATTGCGTGGTGATT
GTGCTAAATGTATCACTATGCTCGATCAACTGCAGCAAGAAGGCATGGCG
CCCGCGCAACTGATTTGGGTGTTCCATAAAGAGATAAACCAGTTATACGC
CATGTTAAATCAGTTAGCCCAAGGTGAAAGTATTGCTAATATTTATAAAC
AATACCGTATATGGGATAAACGTAAACCTTTGTACCAACATGCCTTAACT
CACATCAAACTTGATAACGTAAAGCGAGCCATGATGCGTATTGCTGATAT
AGACTTATTAAGTAAAACCAGCAGCGAGTTTAATATTTTTATTCTATTAG
CTGATTTGTGCATCACCTTGTATCACGGTGAAAAAACAGCAGCCTTTAGT
CTTAATTATGGCTAA
>CPS_2303 holB, DNA polymerase III, delta prime subunit
ATGCTACAAATTTGCCACGAAAAGCAAGTGCAATTGAGCCGACAATACCA
ACAAGATACCTTAGCACATGCCATTATCATTCAAGGTATAGAAGGTGCTG
GGCAAGGTGCATTGGCAAAGTGGTTAATTGAGTTGTTAATATGTCAAAAT
CCGTTATCAACAACTAATGCTGCTGGAACTGAAACCATCAGTGAAGCCTG
TGGTCAATGTAAGGCCTGCCTGCTTAAGAAAAGTGATAACTATCCAGACC
ACTTATTGTTGAAGAGCGAGAATAAAACTTTAGGGGTTGACGACATTCGT
CGTGGCAATGCATTTCTAGAAAAGACTGCCCACCTAGGCAAGGTGAAAAC
GATATTGATACCACAAGCTCAGGTAATGACTATTGCTGCAGCTAATGCAT
TACTAAAAACATTAGAGGAGCCAAGTGCCAATAGTTATATTGTATTAATT
ACAGACGATCTTGATAGCTTATTACCGACAATAATAAGTCGGTGTGCTGT
TTATGCCATTAGACCTATGATAGGCGAGGCCTTGTTGGCACAACTCAAGG
TATCGAACCTTGGCGATGTTCAACTATCAAGTAGTGCTCCTTTGACTAAT
AAAGCTAATGACACTGCTTATATTAATTTATCTCATTTACCTGAATTAAC
CGATAAAATTGTTCATCAAGAATTTCAGGTTTTTAATCAATATTTATTAG
ATTATTTACTACATGGTCAAAGTGAAGAAAAGTTATTGAGTCAGATTGTT
GATAATAAGTACAGTTTACGTTGGTTAGAAAAAATAACCTGTAATCTAAT
GAGAGAATATTACCTTGTTAATGCAACGGATCAGACCTTATTGCTTATTA
AACAGAAAATTTCAGTGCAAGTGCTTAATCAAATATATCAAGCTATCATC
ACTAGTAATAAACTGATAAAATCTTATCTTCAAGCTAATCGACAATTCGT
CGGTGAACAGTTACTTATGACGATAAATGATATCGTTAGACCATAG
>CPS_0739 holC, DNA polymerase III, chi subunit
ATGATGCAAACTCAAGTAATGTTTTATCTACTTAAGGATGATGTAACAGA
CGAGAAAGAAGAAGATACTCGTTCTGCTATTTATCATGCCTGTTTGCAAG
CCAGTCATTTCTATCGTCAAAATCAGCGGGTCTATATTTATGCAAAAGAC
CAGCAACATGCTGAACAAATTGATGAGATGCTTTGGGCATTTGATAGCGA
CAGTTTTGTACCCCATAACCTCGTTGGTGAAGGTCCAAAACAAGGCGCTA
TGGTGGAAATAGGTTATCAAGCACCGCAAGGACGTCGTCCTGTGCTTATT
AACCTTAATAGTGCGGTGCCTAACTTTGCCAATCAATTTCAATTTATCGT
TGATTTTGTGCCTAGTGATGAAACACTTAAACAACAAGCGAGAGAACGCT
TTAAAACTTGCCGACAATGGGGTTTTCAAGTTGATAACCAAGCGGTAACC
GTGCCAGAGGAAGTCAGTAAATAG
>CPS_4302 hrpB, ATP-dependent helicase HrpB
TTGTCGATGACCGTGACTACTTATTTACCAATAGAAGCAATTAAGCAACA
ATTTTGCCAAAGCCTCGATGAGCAAAATACCCTCATATTATCGGCTCCTC
CTGGAGCGGGTAAATCAACTTGCTTACCTCTATGGTTATTAACGTTGCCA
AGTTTGGCTAATAAGAAAATTTATTTGCTACAACCTAGACGTTTGGCCGT
TAAAAATATAGCAACATTTTTAGCTGCACAGCTGAAAGAAAAGGTAGGGG
AAACTGTTGGTTATCGATTACGTAATGATAGTAAAACATCAACGAGTACC
CGTCTTGAGGTCATTACTGAAGGCATATTAACGCAGATTATTCAAAAAGA
TGCCGAACTATTAGGTACGGCATTGGTCGTTTTTGATGAATTTCATGAAC
GAAGTCTTCAGGGCGACTTAGCTTTTGCACTCACCCGTGAAGTACAAACA
GAATTACGTGATGATTTAAAAATACTGCTTATGTCGGCAACGTTAGATAT
TGAGTATTTAAGCCAAGCATTGCCTGATGCTTATTTGTTAAATAGTGAAG
GACGGAGCTATCCTATAGAAGTGAGTTATCAAGCCCCTAGGGCTCATCAA
CGTTGGCGTGAACATGCATTGGCGGTTATTAAAGATAAAATGTATAACCA
CATAGGCTCAATCTTAGTTTTTTTACCGGGTGTGGCCGATATTCGGTTTT
TACTTGATAGCTTAATGGCTCAAAAAGTGGAAGGTGTCAAAATTTGTCCC
TTGTTTGGGGAGTTGAGTTTAAAGGAGCAGCAGCAGGCAATAGCACCCTG
TCTAAGTGGACATCGTAAAATTGTTTTAGCTACAAATATTGCAGAGACTT
CATTGACCATTGACGGCATTGATCTTGTTATTGATTGCGGCCTTGAAAAA
GTTGCTGTTTTTGATAGTGCTAGTTTGATGAATAAGCTAATGCAAAAGCA
AATATCAAAGGCTTCAGCTGTACAAAGAGCGGGGCGAGCAGGGCGATTAA
TGCATGGGCAGTGTATTCGCTTATACGGCAAAGATGATTTTGAGCGTAGA
CCGCTGCACAGTGTTAATGATATTCAACAAGCTGATTTACTACCTACACT
CATCGAAGCTGCTCGATGGGGAGTCACAGCCTTAGCTGAGTTGCCTTTAT
TGGAACTGCCCAGTAAAGCTAAAGAGCAACAAGCGTGGCAAGAACTACAA
AGCCTAGACATTGTTGATGATAAATACCTGCTAACCAAACACGGTGAAAA
AGCATCCTGTTTGCCTTGTCACCCACGGTTTGCTCATATGATATTAATGG
CACAAACCCAAGGGCCGAATATAACGCTGTTGGCTTGTTTAATCGCCGCT
TTACTCGAAGAACGCGATATTTTAAAAGGAGAACAAGCGAAATATGATTG
TGATTTAATTCATCGGTTGCAATTACTTATTCAGCATAAAAGTAATAAAA
ATCCATTGTTAGAACGGATTCTACAACAAGCGAGTCGACTGGCTCAAAAT
GTACAATTACGTTTTAGGGTTCATGATCTGGATTTAGCAAAAACAGGTGT
ACTGCTCGCTTATGCTTATCCAGAACGCGTGGCTAAAACCAGAGGGAATC
ATGGTGATTTTATTTGCGTTAATGGCAAAGGAACCTTAGTGAATGAACAA
GATGCTTTAGCAGGTGAAGACTTTATTGTTATCGCTCAAACGAGTCAACT
AGGTGGCCAGTTAACGGTGAGATTAGCTAGTCAGATTAGCTTAGAAGAAA
TAACCAATACCTTTGCTGCACAGATAAAGCAGCAAGATATAGCAAATTTT
GATAATAAAAGCGGTAGAATAATCGCTAAAAGACAAACCTCATTAGGTGC
AATAGTCCTATCAGATCAGCCATTGAAACAAGAGGTAACCGCTGAATCAA
TTAGTGCTATGTGGTGTAGTTTAGTGATGAAAAAAGGGTTAAGTTTTTTA
TCCTGGCAGGCCAAAGATTTAGCACTAAAAGCGCGTTGGTTATGGTTGAA
CAAGTACTTTCCGGAATATGATTTAGTGGTAATCGATGATGAACTGCTAT
TGGCAAAATTAACAACGTGGTTTGCTCCGTTTGTTGGCGGTATAAAAACT
AAAGCGCAGCTCGATAAACTCGATTTATCATCGATGTTATTATCTTTACT
TAGCTATCAAGAACAAAAAATATTAAAACAAGCTGCACCTACTGTTTATG
TTGGACCAACGGGAAGGCATTGCCCAATTAGTTATTCTCAAGATGAATCT
CCAAAAGTTTCATTACCTATGCAAGAATTATATGGTCTAACAATAACGCC
CAATGTTGGCGCTATTGCGGGTATAAGTGAACAAAATCAAGGCATACCTC
TACTTTTAGAGCTACTTTCACCCGCGCAACGCCCTATTCAAGTAACACAA
GATTTAGTTAAATTTTGGTCTGGTAGCTATCAAGCAGTGCAAAAAGATAT
GAAAAGCCGTTATCCTAGGCATTATTGGCCAGATGATCCTGTTAACGCTA
AGGCAACTAATAAAATGAAGCGTCATATAAAAGAATAA
>CPS_1873 hupB1, DNA-binding protein, HU family
ATGAACAAAAGTGAATTGGTAGAGAAAATCGCTGAAGGCGCAGACATTTC
AAAAGCTTCAGCTGGCCGTGCTTTAGATAGTTTAATTGGTTCTGTAACAA
CTGAATTAGCTAATGGCGGTGATGTCGCATTAGTGGGTTTTGGTACTTAC
AAAGTAAATGACCGTGCTGCTCGTACAGGTCGCAATCCTCAAACAGGTGC
AGAGATCCAAATTTCTGCGGCGAAAGTACCTGCTTTTAAAGCGGGTAAAG
CATTGAAAGACGCAGTAAACGTTTAG
>CPS_2063 hupB2, DNA-binding protein, HU family
ATGAACAAAAGTGAATTGATAGCAAAAATTTCTGAAGGTGCAGACATTAC
TAAAGCTTCGGCTGGTCGTGCATTAGATAGTTTAATTGACTCTGTAACCA
CTGAATTAGCTAGTGGCGGTGATGTCGCATTAGTTGGTTTTGGTACTTAC
AAAGTTAATGACCGTGCTGCTCGTACTGGTCGCAACCCTCAAACAGGTGC
AGAGATCCAAATTTCAGCTGCAAAAGTACCTGCTTTTAAAGCTGGCAAAG
CATTAAAAGATGCTGTTAACGGTTAG
>CPS_3781 hupB3, DNA-binding protein, HU family
GTGAATAAATCTCAACTAATCGAGAAAATTGCTGCTGGTGCAGACATTTC
AAAAGCTGCTGCGGGTCGTGCATTAGATTCATTTATTGGCGCTGTAACTG
ATGAATTAAAAGATGGCGAGCAAGTTGCTCTTGTTGGTTTTGGTACTTTC
TCTGTACGTGACCGTGCTGCTCGTACTGGTCGTAACCCACAAACGGGTGC
TACTATCCAAATCGCTGCTGCAAAAATTCCATCTTTCAAAGCTGGTAAAG
CATTAAAAGACGCATGTAACTAG
>CPS_2994 ihfA, integration host factor, alpha subunit
ATGGCGCTTACCAAAGCAGAAGTAGCAGAACATTTATTTGAAAAAGTTGG
GCTGAGCAAGCGCGACGCAAAAGACATGGTTGAAATCTTCTTTGAAGAAA
TTCGCGAAACTTTAGAAAGCGGTGATCAAGTAAAGCTTTCAGGTTTTGGC
AATTTCGACCTACGTCTTAAAAGCGAACGCCCTGGTCGTAATCCAAAAAC
GGGTGAAGATATTCCAATTTCTGCCCGTAAAGTGGTTACCTTTAGACCAG
GCCAAAAACTGAAAAGCCGTGTAGAAGACGGAAATAGTGACTAA
>CPS_2336 ihfB, integration host factor, beta subunit
ATGACTAAGTCAGAACTTATTGAAAAATTAGCCGATAAATTAAGTCATTT
ATCCGCTAAAGAAGTGGAAAAATCTATAAAAGAAATTTTAGAATTGATGG
CGCAGTCCTTGTCAAAAGGAGAGCGTATTGAAATTCGAGGTTTTGGAAGT
TTTTCATTGCATTATCGTGCTCCACGAGTTGGCAGAAATCCAAAAACTGG
TGAATCGGTTGAGTTAAGCGGTAAATACGTTCCTCACTTTAAACCAGGCA
AGGAGTTACGTGAAAGAGTTAATCTTTCTGTAGCATAA
>CPS_0117 kdkA, 3-deoxy-D-manno-octulosonic acid kinase
GTGAGTCAAACAATAACCAGCGCACAATTTTCTAAGTTCGAACAAGGTAA
CGTTACTTGTGTTTACAACCAAACACTGATCACTAATTTCAATGCAGCAA
TGCTTAGTCCGAGTTATTGGCAACAAAGTAACGCCGTAACGGGCTCAGCA
CAAGGGCGTGGCACCACTTGGTTTGTCGAATACAATGATAACAGCAATAC
TCCGCATGATTGGGTATTACGCCATTATTACCGCGGTGGGTTGATCGGTA
AAATTATTAAAGATTCCTATTGGTTTAGCGGCGTAGAAAAAACTCGCGCT
GCATGTGAGTTTGCTTTATTACGTCATATGAATACGCTACAACTTCCTAC
TCCTGAGCCAATCGCTTATCGCGTTATGCAACATGGCTTTCACTATCAAG
CAGACTTGCTTTCCAGTCGAATTGAACATGCTCAAGACTTAGTGGCAATA
TTAAGTGAAAAGGCGTTAACTGATGATATTTGGCACAACATAGGTGCCAC
AATTAAACGCTTTCACCAGCACGGTATTTATCACCATGATTTGAATAGCC
ATAATATTTTGCTGAATGACAAGAAACAGGTGTTTTTGATCGACTTTGAC
CGTGGTGAATTACGCACTAACCCTGTTGAGACTAACTGGAAGCAAGCCAA
CATGGCGCGTTTACAACGTTCTTTTTTAAAGGAATTAAATAAACTGGAGC
AGTTCAATTTTACCGAACAAAACTGGCAAGCGTTGAAGGATGGCTATCAG
GATGCCGATGTTGAAAGGCAGAACTAA
>CPS_4404 lig, DNA ligase, ATP-dependent
ATGAATAAGTATGTTCTACGGATTTTCTTTGCCTTTATTTTATCAGTCCA
TTTGTCTTCAACTGCACAACAAACAACTCAAAAAACTCAAAAATTTAAGC
CTAATATTCAGCATGGCGTGAGCTACCAAAAGGTCGATGACATTAGCCAG
TATTATGTCTCTGAAAAACTGGATGGTATTCGTGGTTACTGGGATGGAAA
ACAATTGTTTACTCGCCGAGGAAATTTAATCAATAGTCCTAGCTGGTTTA
CTCAGCATTGGCCTACATATCCAATGGACGGTGAACTCTGGCTTGCTAGA
GGGCAATTCCAACTATTACTTTCTTGTGCAACTAAACGCATAGCAGTCGA
AAATAAAACGACTAGTTGCTGGAGAAGTGTTCGCTTTATGATATTTGATC
TTCCTAAACATCTAGGGGATTTCAATGAACGAGTAATTAAGATGCGGACT
TTACTTGTACAAAATCAATCGGTTTACTTAGCCATGATAGATCAGGTAAA
ACTGGAGGAATTAAGTGCGCTTGATCACAAACTTGATGAAGTCATCGCAA
CTCACGGTGAGGGCCTTATGCTACACCTCGCTAGCGCTCACTATCAACAA
GGCCGAAATCCCGCATTGATGAAGCTAAAGAAATATCAAGATGCCGAAGC
AACAGTCATTGGTTATACCGAAGGAAAAGGTAAATATCAGAACCAACTTG
GCGCAATCAAAGTAAAAACAAGTGATGGAATAATTTTCAAAATTGGATCA
GGTTTAAGTGATATTCAGCGTGCCAACCCACCAAAAATTGGCACTATTAT
TACCTTCAAGTACAACGGGCTCACACAAGCGGGTATACCAAGGTTTGCCC
GTTTTTGGCGTATAAAAGCTAGCGGTTAA
>CPS_3466 ligA, DNA ligase, NAD-dependent
ATGTCGAATGTCGAAAAGAAAATTAGCCAACTGCAACAGCAGCTTAATCA
ATATAATCATGAATATTATGTATTAGACCAACCTAGTGTGCCTGATGCAG
AATATGACCGATTAATGACAGCATTAATCGATTTAGAAAAGACTAATCCT
GAGCTTAAGACTATTGACTCACCTAGCCAAAAAGTTGGCGGTCAGGCATT
AAAATCTTTCACTCAAGTAACTCATCAGCTGCCGATGCTTTCTCTTGATA
ATGTTTTTTCTTTAGATGATTTTCACGCATTTGTTAAACGCGTAAAAGAT
AGGTTAAATGACAATCAAGCGATAGTCTTTTGTGCCGAGCCTAAATTAGA
CGGTTTAGCAGTGAGTTTACGTTATGAGCACGGGCAGTTAATACAAGCGG
CTACACGTGGCGATGGTAGTGTAGGGGAGAATATTACGACTAACATTCGT
ACAATAAAATCTATTCCGCTTAAGTTAATGGGCACACCAGGTAAAGATTT
TCCTGATATCGTTGAAGTCCGCGGTGAAGTTTTTATGCCTAAGGCAAGTT
TTGACGCATTAAATACATTGGCTAAAAAACGTGGCGAGAAAGGTTTTGCA
AATCCACGTAATGCAGCGGCGGGAAGTTTACGACAACTTGATTCTAAAAT
CACCGCTAAACGTAATTTAGCTTTTTACGCTTATAGCCTTGGATTTGTAG
GGAAACTGTCTGATGGAGGCGCTGAAAGTACCGATTTAACCAATGACTTT
TTTGCTAACTCTCATCATGAAAGACTATGTCAGCTTAAAAGGTTGGGTTT
GCCTATGTGTCCAGAAGTACGCTTACTTGAAAGTGAGCAAGCCTGTGATG
CGTTTTATCAAGATATCTTAGCAAAGCGTAGTGCCTTGAGTTATGAAATT
GATGGCACTGTATTAAAAGTTGATGAAATCTCTTTGCAGAAACGTTTAGG
GTTTGTCGCACGTGCCCCACGTTGGGCTATTGCTTATAAATTCCCTGCGG
AAGAAGAATTAACCTGTGTTGAAGATGTCGAGTTTCAAGTAGGGCGTACC
GGCGCGATTACTCCCGTAGCACGTTTGAAACCGGTATTTGTTGGTGGCGT
AACAGTTTCTAATGCCACATTACATAACCAAGATGAAATAACCCGATTAG
GGCTGAAAGTGAATGATTTCGTGGTTATCCGCCGTGCCGGTGATGTTATT
CCTCAAATTGTTAGCGTAGTACTTGATAAACGACCAGATAATGCCGTCGA
TATAGTCTTTCCTACCAGTTGCCCTGTTTGTGACTCTGCAGTGGCTAAAC
CTGAAGGTGAAGCCGTACTGAGATGTACCGCCGGACTTTTCTGTGCGGCG
CAAAGAAAAGAAGCTATTAAACATTTTGCTTCTCGAAAAGCACATGATGT
TGATGGTTTAGGTGACAAACTAGTAGAGCAACTTGTAGATGAAAAGTTAA
TTAATACGCCCGCTGATTTATTCAAATTAACCGAAATACAAGTTAGTACT
ATAGATCGTATGGGTAAAAAATCAGCGACCAATTTAATTAATGGACTTGA
GCAGGCTAAAAGTACCACACTAGCAAAATTTATTTATGGTCTGGGCATAC
GCGAAGTCGGTGAAGCAACTGCTGCTAATCTAGCAAATCATTTTTATACC
TTAGCGGCAATTGAAAGTGCTTCTCTTGAAGACTTACAAAATGTTTCAGA
TGTTGGCGAAGTCGTTGCCAAAAATATTATTAATTTCTTTAAAGAAGAGC
ATAACTTAGCGATCGTTTCTGGACTAAGTGAAGTAATGCACTGGCCAACT
ATTGAAATAAAGTCAGCTGAGGAGTTACCGCTTGCAGAGCAGATATTTGT
TTTAACAGGCACATTAACCCAAATGGGAAGAACTGAAGCTAAAACAGCCT
TACAGTCCTTGGGAGCTAAAGTATCAGGTAGTGTCTCGAAGAATACACAC
TTCGTTGTTGCAGGTGATAAAGCGGGATCTAAACTGACTAAGGCTCAGGA
TTTAGGTATCTCAGTGCTTACCGAAGATGGGTTAGTAGCGTTACTTGCCG
AACATGGCATAACTATTTAG
>CPS_2139 mfd, transcription-repair coupling factor
ATGAGCAAAGCAAGCAGCCTGTTAACCCCGGTATTGGCCAAGCGCCGAGG
TAAAAATCCCGATAAGAAGAGTTGGCATAATTTACATGGCAGCAGCAGTA
GCTTTGCTCTTTATCAAGCAGCAAAAACAGCGCAAACGCCTATATTATTG
ATAACAAGTAATACTCCTCAAGCGCTTAAAATTGAGCAAGAGTTACTAAG
TTTAGCTAAGAGCGATAGCCAAAATAAGGCTAATATCTGCTTATTTCCTG
ACTGGGAAACACTACCGTACGATAATTTTTCACCTCACCAAGATATTATC
TCTCAGCGTCTTGCTACCTTGTACCAATTATCACGTATGGAGTCTGGCAT
AATTATTGTGCCGGTAACCACTCTAGTACAAAAGCTTGCTCCTAAACAAT
ATATTGAAGCGAACAGCTTAATAATAAAACAAGGCGATAAGAGAGATTTA
CATCAAATGCGACAAGCCCTGGAAGCAAGTGGCTATCGTAATGTTGATCA
AGTATTAGAGCATGGAGAGTTTTCTGCTCGAGGCGCTATTTTAGATCTTT
TCCCTATGGGAAGTAATAAGCCATTTCGTTTAGATTTCTTTGATGATGAA
ATTGATGAAATTAGACTCTTTGATCCAGAAAGTCAGCGTTCAAAAGAGAA
GATTGATGAAATTAATTTATTGCCCGCGCACGAGTTCCCCATCGATGAAG
CGGGTATCAGCTTATTTCGTAGTCAATTTCGTGAACAATTTCAGGGCAAT
ATTCATAAAGAGTCTGTTTATCACAAAGTCAGTAATGGCATTTTGCCGCC
TGGCATCGAGTATTACCTACCACTGTTTTTTGATAATAAACAGGACACTG
AAAAAGAAGGTGCAACCTTAAGTAATACTCTTTGTGATTATTTAACTGAT
AATACTCTGGTCGTTATTAGCGGAGATATTGAGCACTCTTTAACGCAATA
CTGGCTCGATATAGAGTACCGTTATGAAAATAGACGTTACGACCCTACTC
GGCCTTTATTACCGCCAGAACAGCTATTTTTAACCGCTGATACGCTTTAT
AGCGCGTTAAAACCTTTTGATCGCATCACCATTGCTAAGCAAACGAAAAT
AGAGACGATTAAAACTCAACGTAGTGACAATCAGGCTAGCGAAGACCTTG
TTACTGCTGAAGTCGATGCTGAGACAAGTGCTGAAGTAAAAAGCAAAAGT
AGCGAAATATGTTTTGATGTTAAACCGCTGCCTGATTTAACGATTAATCA
TAAACTGAAGCAGCCGTTCGAATTAATCAACCAATTCATCGCCAGTAAAG
AGACGCCCAACAAAGTGCTTTTTGTTGCGCAAAGCCAAGGTCGCCGAGAA
AGTGTGCTTGAGTTACTTGAGCGTGACAATATTAGACCTGCTCAGTTTGA
TAACATTGACGACTTTATTAACGCAACGGATACCCTTGGTATTACCGTTA
ATAGTTTAACTCAGGGTTTTGCCTTCCAAGCGAAAGGTAATAGTCAGAAA
AATGCGATTGCCCTAGTTACTGAAGCCGAGTTATTAGGCGATCATGTATC
TCAAGCTAGAAGACGTACCAAAGCGCAAGATTTACAAGCTGATGCGTTAT
TTAAAAACCTTGCTGAGTTAACCATTGGCCAACCTGTGGTCCATATTGAA
CATGGCATTGGCCGATATTTAGGTCTACAGACCATTGAAAATGGCGGCAT
AGTTACCGAATTTCTGGTGCTTAGTTATGCTAACGAAGCCAAACTTTATG
TCCCTGTTAGCTCTTTACACTTAATTGGTAGATATTCAGGTGCTGATAGT
GACCATGCGCCACTGCATAAGCTAGGTAATGATACTTGGAGTAAAGCTAA
GCAGAAAGCAGCAGAGAAAGTCCGTGACGTTGCCGCCGAATTACTCGATA
TTTACGCAAAACGTGCCAGCAACCATGGTTATAGTTTTAAACGTGATAAA
CAAGACTACCAAGCTTTTAGTGACAGTTTTGGTTTTGAAGAAACCTTCGA
CCAAAAACAAGCCATTAATGCCGTAGTAAGCGATATGTTGTCGCCAAAAA
CCATGGACAGGCTTGTGTGTGGTGATGTTGGTTTTGGTAAAACAGAAGTC
GCTATGCGTGCAGCCTTTGTGGCAGTTAATGATGGTAAACAAGTCGCAAT
ACTTGTCCCCACCACATTACTCGCTCAACAACATTATGAAAACTTTAGAG
ATAGATTTGCTAATTGGCCGGTAGTCACTGAAGTATTATCACGGTTTAAA
ACACCTAAAGAACAAAAAGAAGTGATTGCGAGAGTTGAGTCTGGTCAAGT
CGACATTCTAATCGGTACCCATAAATTACTTCAAAACAGCATTAAATATA
AAGATTTAGGGTTACTGGTAGTCGATGAAGAACATCGATTTGGTGTTAAA
CAAAAAGAAAAAATCAAACAGCTACGCAGTAACGTTGATATTTTAACACT
AACGGCAACCCCTATTCCTCGTACCTTAAATATGGCCATGGGTGGAATGC
GTGACTTGTCTATTATTGCCACGCCACCCGCTAAACGTTTAGCGGTAAAA
ACCTTTGTACGAGAACACGATGAAGCATTAATTCGGGAAGCTGTATTACG
TGAAACCTCACGCGGTGGTCAGGTGTATTATCTGCATAACCATGTTGATA
CTATTGATAAAACTGCAGCAGACATCCAAAAATTAGTGCCTGAGGCTCGT
GTCGTCACGGCCCATGGACAAATGCGTGAGCGTGAGCTTGAACGCATCAT
GAGTGATTTTTATCATCAACGCTTTAACGTCATTGTTTGTACCACAATTA
TTGAAACGGGTATCGATGTACCCAGTGCCAATACCATCATTATGGACAGA
GCAGATCATCTTGGTTTAGCACAATTACACCAACTGCGTGGCCGTGTAGG
TCGCTCGCATCATCAAGCTTATGCCTATCTGTTAACGCCGCATGAAAAAC
GCATTACTAAAGATGCTAAAAAACGCTTAGAGGCTATCGCCTCTCTGGAA
GATTTAGGCGCAGGTTTTACTTTAGCAACTCACGATTTAGAAATTCGTGG
CGCGGGTGAGTTATTAGGTGAAGACCAGAGTGGCTCAATGTGCCAAGTTG
GCTTTAGTTTGTATATGGAAATGCTCGATCAAGCCGTTGCAGCACTTAAA
GAAGGTAAACAACTATCATTAGACCAAGTAATGTCTACGCAGACTGAGAT
TGAGTTACGTGTACCAGCGCTGCTACCTGATGATTACATTTTTGACGTTA
GCTTACGTTTAAGTTTATATAAACGTATTGCTAGCTGTAAAAACAAAAAT
GAGCTAGATGATATTCAAGTTGAGCTCATTGACCGTTTTGGTTTATTGCC
TCAACCAAGTAAAAATTTAGTCCAAATTGCCAAGCTACGCCTTAAAGCGC
AGACTATTGGTATTTCGCGAATTGAGGCGAGTGCCACAGGTGGCTCGATT
GAATTTAGTAATGATACCAGCGTTGACCCTATGCTAATTATTGGTTTAAT
TCAAAAAAATCCAGCAGTGTATAGCATGGCTGGAGCAAGCAAATTGAAGT
TTGTAAAAGCCAACGATGATACTCAAAAACGCTTTACCTTAATTTCTAAT
ATCTTAAATGACTTAGCTAAATAA
>CPS_3626 mutH, DNA mismatch repair protein MutH
ATGAACATACCCTCTTCTGAACAAGCACTCATGCACAACGCCCAAAATTT
AGCTGGTTTAACGTTAGGTGACTTGGCTAAGCAAGCGGGTATTGTCATTC
CAAAAGACTTAACCCGTAATAAAGGTTGGATCGGTTTATTACTGGAGCAT
GTTTTAGGTGCTAGCGCAGGCTCTAGGCCTGAGCCTGACTTCCCCCACTT
AGGCATAGAGTTAAAATCATTGCCTATTAATGAGCAAGCTAAACCACTTG
AGACAACCTTTGTCAGTGTTGCGCCCTTAACAGGCCTTGTCGGTGTAAAT
TGGCATAATTGCTATGTACGCAAAAAATTAGCACGAGTATTATGGGTGCC
AGTGATCTCGCCTAAAGATGTACCAATTAGTGAGCGTATAGTGGGCACAC
CTTTTTTGTGGTCACCTAACGCTGAAGAAGAAGCCTTATTAGCTCAGGAC
TGGCAAGAACTCACCGATATGATTGTACTCGGTGAAGTAGAGAATATTCA
TGGTAAGCATGGACAAGTAATGCAGCTGAGACCCAAAGCGGCTAACAACA
AAGCAAGAACCCAAGCATTCGATCGTAATGGTAAACCTTTTATGACCTTA
CCCCGTGGTTTTTACCTTAAGATTAACTTCACGCAAGGTTTACTACATCG
TTATTTGCGTATCAATTAA
>CPS_0323 mutL, DNA mismatch repair protein MutL
ATGACTATTGCTATATTGCCTGCACGTTTGGCTAACCAAATTGCTGCTGG
TGAAGTGGTTGAACGCCCCGCCTCTGTTATTAAAGAGCTGATTGAAAATA
GTTTAGATGCTGGGGCAACATCTATACATATTGATGTTGATAAAGGAGGC
ATCAAAAAGATAAAAATTACTGATAATGGTCATGGCATAGTTAAAGAAGA
GTTAACGTTGGCACTAAGTCGTCATGCAACCAGTAAAATTAAAAGCCTAA
ATGACTTAGAAGCTATTGGTAGCTTAGGCTTTCGTGGTGAAGCGTTAGCC
AGTATAAGTTCAGTTGCGCGATTAACGTTAACGTCTAAGCCGCAATCTCA
AGCAACTGCGTGGCAAGCTGTTGCTGAAGGGCGGGATATGTCAGTCAATA
TAAAACCTGCAGCTCACCCAGACGGCACTAGTATTGAAGTACTGGACTTG
TTTTTCAATACTCCAGCTAGACGGAAATTTTTACGTACCGAAAAAACCGA
ATTTAATCATATAGATGAAGTAGTGCGCCGGATTGCACTTGCTCACTTTG
AAGTTAGCTTTAGCCTAACCCATAACGGTAATACTGTTCGTCAATATCGG
ATGGCGAGTACTCACGCACAATGTATTAAACGTGTTGCTATGGTCTGTGG
CCCAAAGTTTATTGAACATGCTGTTGAAGTAGATTGCCCGCATGATAATA
TGACATTATCAGGCTGGTTAGCTAAACCTAGTTTCTCGCGCAGCCAAAAC
GATCTTTGTTATAGTTATGTTAATGGCAGAATGATGCGGGATAAGTTAAT
TAATCATGCTATTCGCCAAGCATATGCGGATTTATTACCACCTGATACTT
ACCCTGCATTTGTATTGTTTTTACAGCTTGATCATCGAGAAGTGGATGTA
AATGTCCATCCATCAAAACATGAAGTACGCTTTCATCAAAGCCGTTATGT
TCATGACTTTATTTATTCTGTTTGTCATAAAGCGTTGACGTCAGCCTTAG
CAGGTGAAGAACTATTTACTACAGCTGATAGTGATCTTGCCTTAGTACCA
GAGCAGTCTTATTCCTCGTTAGGCGCAAACGATAGACAAGGAAGCCATTC
ATCCAATACTCCTACTCTAAATTACCCAAGTGCAGATTATATTAGACCAT
TACAGCATGTAAATGATGCAAGTAATAGTCAATCAACATCTAGTTATAGT
GGCTACGGTCAACAACACAAAACTAATGCTATTTCTAAAATTGCAGCGTC
TAACTATCAAGCATTAATGACGCCTGATAAGGGGAGTTCAGCTCAAGTTC
AAAATACGAGTGGCTCTGATCAAGCAAGTGCACAGAAGCATGAGACTACG
ACCCTGCAAAACTCTACTGACCAGAGTGCTTTTTTAAGTGTACACCAGCC
AGGATATGCACTGTATAAAACAGAAAATGGTGTGAGAGTTTTATCATTAT
TTAAGTTAGCGAAAAGTACTTACGGTAAGCTGGTTGAACAAAGCTGGCAG
AATAAAACCGAGCAATCAGATTGTCCTGTTGAATGCTTGGTCAGTCAACC
GTTGTTATTACCTGTGATTTTAAGTCTTTCTGAGCAACAGCTTAGTTTTG
TATTAGCAGAGCAAGAAATACTCTCAAATGCGGGCATAGTGTTTATCCAA
CAGCATAAAAATAAAATACAAATCAGGCAATTTCCCGCGTTATTACGTGA
GCAAGATGTAAGTAATGCGCTAATAATAATTATTGAAGAGTTGATCGAAA
AACGAAGTTTTACCGAAGGAGAGGCTCTTTGTGAAACTAACTTACATCAA
AGCATTGGTTTAGCAATGGTTTTGGCTGAGTATGATGAAACACAAGCTGA
TATTTTATTAAGACTTACGAAAAAACTGTTCCATGAACAACTTAGTCAGC
AATTACTCTTGAATTCTATCCCTCTTGACCTCACATCACATATTAAGACG
TTATTTTAG
>CPS_0212 mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
ATGCCAGAATTACCCGAAGTAGAAGTGTGCCGCTTAGGTATAAGCCCTCA
TGTTATAGCTCAGGAGGTCAGTGAGGTCATTATTCGTAATAAGCGCTTAC
GATGGCCTATTCCAGATGAAGTCTGTTCTGCTGTTGGTTTACCTGTGCTC
AAGGTTGAGCGACGTGCAAAATATCTATTATTGCGTTTTTCAACGGGGAC
TTTATTATTGCATTTAGGCATGTCCGGTACCATTAGAGTAATTGAACAAG
ATACTCCTGTAGCGAAACATGACCACTTTGATCTAGTTTTTAAGCATGGC
AAAAGCTTGCGACTGAATGACCCTCGCCGTTTTGGTGCAGTGTTATGGCT
AGCTAATGATGAAGATGAACTCGGCTTATTAGCGAAACTCGGGCCAGAGC
CATTAAGTGATGACTTTGCTGAGGGGTATTTGTTTAGTAAAGCAAAAAAT
CGCAAAGTACCTATCAAGACTTTTTTAATGAATAACCATGTCGTGGTAGG
AGTCGGTAATATCTATGCTAATGAAGCACTGTTTCAAGCGGGGATTTTAC
CGACAGCGAAAGCAAAAGATATTGATGAACACCGGATGAACAGTTTAACG
GCTATTATAAAAAAAGTGTTGAGTGCTGCCATTGCACAGGGCGGCACTAC
GCTTAAGGATTTTACCCAAGCCGATGGTCGACCTGGTTATTTTGCTCAAT
CACTTATGGTATATGGCCGAGCAGGAGAAGCCTGTGTGACTTGCAAAACA
AAATTACAGGAAATTAGACAGTCTAATCGTAGCTCTGTTTTTTGTCCTAG
CTGTCAACAGGATTAA
>CPS_4137 mutS, DNA mismatch repair protein MutS
ATGACCACTGCCACAAAAGATCTTTCATCACACACCCCTATGATGCGCCA
GTACTTAACTATTAAGGCTGAATTTCCACATACTTTGATCTTTTATCGCA
TGGGTGATTTTTATGAATTATTTTTTGACGATGCCAAAAAAGCTTCTGAC
TTATTAGATATATCACTTACCGCTCGGGGTAAAACTGGCGGTAATGCTAT
TCCAATGGCGGGTGTGCCATATCATGCGGCTGAAAACTACTTAGCGAAGC
TAGTCGCCCTAGGTGAATCGGTCGCTATTTGTGAGCAAATTGGCGATCCT
GCCACGAGTAAAGGCCCAGTAGAGCGAAAAGTCGTACGTGTTATTACACC
CGGTACTGTTAGTGATGAAGCACTGCTAGTCGACAGGCAAGACAATCTCA
TTGTTGCCATCGTCGATAATCAATCCCCAAATGCAAAACTAAAAACAAGC
TCAGCACCCGCTTTTGGTCTTGCTTATTTAGATATGGCCAGTGGTCGATT
TGTACTCACTGAACCACAAACTGCTGAACAACTCCAAGCTGAACTTCAAC
GTTTATCTCCTGCAGAATTACTTTATAGTGAATCTCTACAAGACTTTAGT
TTAATCGAGCAAAGAAAAGGTTTACGTCGTCGTCCAGAGTGGGAGTTTGA
TCTTGATACTGCCATTAGTTTATTGAATAAGCAGTTCGATACCAAAGAAT
TAACTGGTTTTGGTGTTGATGACAAGCCTTTAGGTCTGGCTGCTGCAGGT
TGTTTATTTCAATACGTTAAAGATACTCAACGTACTGCCCTGCCTCATAT
TCGCGCCATTGTTTGTGAGTCTGCCAATAAAGGTGTGGTACTTGATGCAG
CCACTAGACGAAATTTAGAACTGACCCAAAACTTACATGGCGGTTTAGAT
AATACCCTTGCTGCTATTTTAGATAAATCTTCCACACCAATGGGGTCTCG
TTTACTTAAACGCTGGTTACACTTTCCATTACGTGATTTAACGGTTCTTA
ATAACCGCCAAAATACGGTGAGTGATATCATAGCATTAGATCTTATCGCG
CCTATTCAGCCATTATTAAAAGGCTTGGGTGACATTGAACGTATTGTTTC
TAGAATCGCCTTAGGCTCTGCAAGGCCTCGTGATTTTGCTCGTTTACGTC
ATGCTCTACAACAATTACCAGAGTTACAGAATGAGTTAAAAAGTGGATTA
ACAGAATCCCCTACTAACTACTTAGCCACTATTGCTCAGCAAAGCCAGCC
AATGCCTCAACTAGAAGGCTTGCTAGTACATGCCATTGTTGAAAACCCAC
CCGTACTAATACGTGATGGTGGTGTTATCGCACCAGGTTATAATAACGAG
CTTGATGTACTACGCGATTTAAGTGATGGTGCGACTGAGTTTTTAGCGCA
ACTTGAACAACGTGAGAAAGAACGTACTGGCATCCACTCATTGAAAGTAG
GTTATAACAGGGTTCATGGCTTTTTTATTGAAATGAGTCGTACCGCCGCC
GTTGATGTACCTGATGATTACATTCGCCGTCAAACATTAAAAAATAATGA
ACGTTTTATTACCGAAGAATTAAAGCAACATGAAGAGAAAGTACTTAGCG
CTCAAAGTAAGTTTTTAGCCCTAGAGAAATCACTCTATCAAGAGTTATTC
GATAAAGTATTACCTGATTTAGCGCAACTGCAGCAATTAAGTCAAGCCAT
TGCTGAGCTCGATGTATTAACTACCTTCGCAGAACGTGCATTAGCGCTAA
ACTACGTAAAACCTAGCTTAGTTGAAGAACCAGGCATTAGTATTGATGCT
GGTCGTCATGTTGTCGTTGAACAAATGACTAACGATGCCTTTATCGCCAA
CCCAGTGTTGTTAACAGAACAGCGAAAGATGTTAATTATTACTGGTCCAA
ATATGGGCGGTAAATCTACCTATATGCGCCAAACGGCCTTAATAGTTTTA
CTTGCTCATATAGGTTGTTATGTGCCTGCTGACAACGCGACCATAGGTTT
AGTTGATAGGATATTTACCCGAATTGGTGCTTCCGATGATTTAGCCAGTG
GCCGCTCAACCTTCATGGTCGAAATGACTGAAACGGCAAACATTTTACAC
AACGCTACGGATAAAAGTTTAGTGCTGCTTGATGAGATTGGCCGTGGAAC
TAGTACTTACGATGGCTTATCACTCGCTTGGGCTTGTGCTGAAATGTTAG
CACTTAAAACCAAAGCTTTTACTTTATTCGCGACCCATTATTTTGAGCTG
ACTTTACTTGCCGGTCAAATTTCAACCTTAGCCAATGTGCACTTAGATGC
CATGGAGCATGACGATAACATCGTCTTTATGCATGCAGTACAAGAAGGAG
CGGCTAGCAAAAGTTTTGGTTTGCAGGTAGCACAGTTAGCAGGTGTACCA
AAAACAGTGATCAAGCGTGCTAAACAAAGGTTAAGTGAATTAGAGCAACA
GCAAACGCCAAGCATACTACCAGCACCTATACAAAATGATGCCTTTGAAC
AGCTCAGTTTCGCCCCTGAAGAGCATTCAGTGGTAACAACACTTATTGAT
ACCGATATTAATGAGCTAAGCCCGAGACAGGCACTAGACTTATTATTTAG
CTTAAAAGAACAACTCTAA
>CPS_4453 mutT, mutator mutT protein
ATGAGTAAAGTTGTGCACGTTGCGGTAGGAGTTATCACAAGGGCAAGTGA
AGATGAAGCTTGTCAATATTTCTTAACTAAGCGACTAGAAAAGGCCCATC
AAGGCGGAAAATGGGAGTTTCCAGGTGGTAAAGTGGAAAACAACGAAACA
GTTGCTCAAGCACTTGCTAGGGAGCTTAAAGAGGAAGTAGCGATTGACGT
GTTATCTTGTCAGCCACTCATTAAAATTGAGCATACATACCGAAGTAAAG
AGGGAGACGAAAAAGGAGATAAGAGTGTTTGTTTGGATGTTTTTATCGTT
GATAACTTTACGGGTGAACCAAGTGCACAAGAGGGGCAAGGCCAGGGCTG
GTATACTTTAAATGAGCTTGAGAAGCTAGACTTTCCAGAAGCAAATAAAA
CCATTATTGATAAGCTAGTAGAAAGGTCTCTCTAG
>CPS_4148 mutY, A/G-specific adenine glycosylase
ATGAATAATCCTATAGTAATATCAGCCAAATCGGCTGAACAATTTGGCCA
GCAAGTCGTAAGCTGGTATCACCTACAAGGTAGAAAGCACTTACCTTGGC
AACAAGATAAAACCCCATATAGAGTGTGGATTTCAGAGATAATGTTACAA
CAAACACAAGTTGCGACAGTTATCCCTTACTATCAACGTTTTATGGAAAG
TTTTCCGACAATTACCGACTTAGCCAATGCTGATGAAGATGTGGTTTTAC
ATCATTGGACTGGTTTAGGCTATTATGCTCGAGCTCGTAATTTACATAAA
TCAGCTAAAATCATGCTCAATGACTATGATGGCCATTTTCCCATTGAAAT
TGAGCAAGTTATCGCTTTACCTGGCATAGGTCGCTCGACCGCTGGCGCTA
TTTTAAGTTTATCGTTAAAACAATATCATCCTATTTTAGACGGTAATGTA
AAACGGGTGCTGGCACGAAGTTACCTTGTTGAAGGTTATAATGGCTTAAG
TAAATTCGATAAAGCGTTATGGCAATTAAGTGAGAAATTAACGCCTGCCA
TTGAAACCGATAGTTTTAATCAAGCGATGATGGATCTTGGGGCAACTGTG
TGTACTCGTAGTAAACCAAGCTGTGATATATGCCCCGTTGAGCAAAGTTG
CCTAGCCAAAGCGGGTGATCAGCAAATGAATTTTCCTCAGAAAAAACCTA
AGAAAAAAATTCCTGAAAAACAAACAATCATGGTGATCCCAAGATTGAAA
AACGAAAACTGCGATAAAGTTTTAATGGAAAAGCGTCCTCCTGTTGGTAT
TTGGGGCGGCTTATGGTGTTTTCATGAGGTTGATGAGCTAAGCGAAATTA
ATGACTTAATGACGAGTTTGTCACTTAAGGAAATTTCATCACAAACCCTA
ACTGAGTTTAGGCACACTTTCAGTCATTTTCATTTAGATATTACTCCCGT
GGTAGTAGACTGCCAGCAACTTGAAGTTTCAAAAATAAACGAACCTAATC
AGCAAAAGTGGTATGATTTACACCAAGGATTGAGTGTCGGCCTAGCGGCT
TCCACACAAAAACTACTTACTTTGCTTAGAGACTGTTAA
>CPS_2193 nth, endonuclease III
ATGAATAAAGAAAAACGCATAGAAATGTTAACTCGGCTGCGAGACGAGAA
TCCAGAGCCAACCACAGAACTAAACTTTTCTAGCCCGTTTGAATTGCTCA
TTGCCGTTCTACTCTCAGCCCAATCAACTGATGTTGGGGTTAATAAAGCG
ACTGCCAAACTTTACCCTGTTGCCAATACGCCTCAAGCCATTTTAGATCT
TGGCCTCGATGGGTTAAAAAGCTACATAAAGACTATTGGTTTATTTAATA
CCAAGGCACAAAACACCATTAAAACGTGTCAAATGTTGGTCGATTTACAT
GGTGGTGAAGTACCAGAAAATAGAGCTGCACTAGAAGCACTGCCCGGCGT
TGGACGTAAAACGGCTAATGTGGTTTTGAACACTGCTTTTGGCTGGCTAA
AAGATAATGAAGGTAACTACTTTTTAGCGGTAGATACTCATATATACAGG
CTTGCTAACCGAACTAAATATGCCCCAGGTAAAACCGTAGATCAGGTTGA
AGCAAATATCATAAAACTAACACCAAAAAAAACAGAGTTTATGTTTAACT
TACACCATTGGTTCATATTGCATGGACGTTACACCTGCACAGCCAAAAAA
CCAAAGTGTGGCTCTTGTATCATTGAAGATTTATGTGAGTTTAAAGATAA
AGTCGGTGATTAA
>CPS_0424 nudE, ADP compounds hydrolase nudE
ATGGCAGATGAAAACCAGTTACCTATCATTACTCATCGCCAACAAGTGGC
TAAAAGTGCACTATTTGGCATTGAACAAATCGACCTTACTTTTAGTAATG
GCGAACAAAGGCAATATGAGCGCATGATGGGCTCTGGGCGTGGTGCTGTG
ATGATAGTGCCAATGATTGATGATGAAACACTATTATTGGTCCGTGAATA
TTGTGCAGGTACGCACAGTTATTTGTTAGGTTTCCCCAAAGGGCTGATTG
ACGAAGGTGAGCTTGCAGAACAGGCTGCCAACCGAGAACTCCAAGAAGAA
ATTGGTTATGGTAGCGAGCAAATGCATCAGATATCAGAAATGATGATGGC
TCCTGCTTTTTTTAATGCCAAAATGACCATCTTTTTAGCTAAAAACCTAT
ACAGTTCTGAACTTGAAGGGGATGAACCCGAGCCATTAGAAGTGGTGTCT
TGGCCCATTAAAGACTATAAAGAACTATTACAACAAACAGATTTTACTGA
AGCACGCAGTATTGCAGCATTAATGTTGGTACGTGACCTGCTTGCAGTTT
AA
>CPS_4180 nudF, ADP-ribose pyrophosphatase
ATGAAAAGTAATAAAAATAAGCCGGATGCTATGCTGAAGTTTGATAATGA
ACAGGTGTCTGTGCACTCAGTGGTAACGAAATATCAGGGCTTTTTTAAGA
TGAATGAATATTCACTGCAGCATAAACTTTTTTCGGGAGAGCAAAGTCAG
CTATTTACCCGAGAAGTTTTTGAACGTGGTGATGCTGTGGTCGTCATGCC
TTATGATGCAAAGCAAGATAAGGTGCTATTGATAGAGCAGTTTAGACCTG
GTGCTTTAAGAGGGGATGACAGTCCTTGGTTATTAGAATTTATTGCGGGG
ATGTTTGACGAAAATGAAACGCCAATAGAAGTCGCTATAAGAGAGGCCAA
AGAGGAAACTAATTTAACACTTTGCCCTAATGATTTAGTACCTATGATGC
AATATCTTTCTAGCCCTGGCGGTATGAGTGAGCGGATTCACCTATATTTA
GCGCACTTTAATAGTGATCTAGTAACGGATGGTGCTATTCATGGTTTGCC
TGAAGAAAATGAAGATATTTTGTTACATATTGTCAGTCGCACTCAAGCTT
TGGCGCTATTGACCGATGGCAAAATCACTAACGCAGCTACTATTATCGGG
TTACAATGGCTGGCACTGAACTATCAATCGTTATCGATTCAATAG
>CPS_3625 nudH, (di)nucleoside polyphosphate hydrolase
GTGATCGATGCCGAAGGCTATCGCGCCAACGTCGGCATAGTAATAATTAA
TGACATGGGACAAGTATTTTGGGCAAGGCGGTATGGACAACATTCATGGC
AATATCCACAAGGTGGAGTTGATGAAGGTGAGACTGCTGAACAAACCATG
TATCGAGAACTACATGAGGAAGTTGGTTTAAAACCTGAACACGTGAAAAT
TGTTGCTTCAACTAAGCATTGGCTAAAATATAAATTACCAAAACGTTATA
TTAGGCATGACTCTAAACCCGTTTGTATTGGTCAAAAGCAAAAGTGGTTT
TTATTAAAGCTCACTGCAGCTGAGTCATCAGTTGATTTACTTCATAGCTC
GCATCCTGAATTTGATGACTGGCGATGGGTAAGTTATTGGTATCCAGTCA
GACAGGTAGTATCTTTTAAACGAGATGTTTATCGAATGGTCATGAAAGAA
TTTGCTAATTTTGCTTTACCTCTTACGTATGAAAGGCGACCTGATCGCCG
TAAACGTAGGGCTTAA
>CPS_4171 parC, DNA topoisomerase IV, A subunit
ATGTCAGATGCGCTCGAATATAGCCTTGATGGAGTAGAACAGGTCCCATT
AAGACGTTTTACTGAAGAAGCTTATTTAAACTATTCCATGTACGTAATTA
TGGACCGTGCTTTGCCACATATTGGTGATGGCTTAAAGCCCGTGCAAAGA
CGCATAGTTTATGCAATGTCAGAGCTTGGTTTGTCTGCGACTGCTAAATA
TAAAAAATCAGCCCGTACTGTTGGTGACGTATTAGGTAAATTTCATCCCC
ATGGTGATAGTGCTTGTTATGAAGCTATGGTATTGATGGCGCAACCTTTT
TCTTATCGATATCCTTTGGTGGACGGGCAAGGAAACTGGGGAGCACCCGA
TGATCCTAAATCGTTTGCCGCAATGCGTTATACCGAGTCGAGATTATCAC
GTTTTAGTGAAGTATTACTTGCTGAACTAGGGCAAGGCACTGTTGATTGG
CAGCCAAATTTTGATGGCACCATGCAAGAGCCAAAAACACTGCCTGCGCG
TTTACCTCATATTTTACTCAACGGTATTACGGGCATTGCCGTCGGTATGG
CAACGGATATTCCACCACACAATGTGCGTGAAGTTGCTGATGCTTGTGTG
CATTTAATTGAAAATCCTAAAGCAGAAGTGAGTGACTTACTTGAGTTTGT
TAAAGGGCCTGATTATCCTACAGATGCTGAGATTATTACCCCGAAAGCCG
AAATTGAAAAAATATACCAAACAGGGCGTGGTAGCATAAGAATGCGCGCT
GTTTATGATGTAGAACAGGGTGATATTGTCATTACCTCACTTCCTCATCA
AGCCTCGGGTGGTAAAATATTAGAGCAAATTGCGGGACAAATGACAGCGA
AAAAACTGCCTATGGTAGTCGACCTTCGTGATGAATCTGATCATGAAAAT
CCTGTACGTCTTGTCATTATTCCGCGTTCAAACCGTGTTGATGTTGAACA
ATTAATGCAACATTTATTTGCCAGTACCGATTTAGAAAAAAGTTATCGCG
TTAACATCAATATGATAGGTTTAGATAACCGTCCTGCAGTGAAGAACTTG
CTGGTCATTTTATCTGAATGGCTTGAATACCGTCGTGAAACAGTACGCCG
TCGTCTGCAATATCGTTTAGATAAAGTATTGGCGCGCTTGCATATTCTTG
ATGGTTTGTTGGTCGCTTACCTAAATATTGATGAAGTCATTGAAATCATC
CGTGGCTATGATGATCCAAAAGCAGAGTTAATGTCTCGCTTTGCCTTATC
GGACACTCAAGCTCATTCAATTTTAGAGATTAAATTACGTCAACTGGCCA
AGCTCGAAGAAATAAAAATTCGTGCCGAGCAAGATGAACTTCGTATAGAA
CAAGATTATTTAGAGAAGATCCTTAATTCAAAAGCACGCATGAGCACGCT
GATGAAAAAAGAGATCCTTGCTGCAGCAGAACAGTATGGTGATGATCGCC
GCTCTCAATTAGTTGAACGTAGCGAATCAAAAGCACTTACCGAAAAAGAT
TTAGTACCAAGTGAGGCGGTAACCGTTGTCGTTTCTGATAAAGGTTGGGC
CCGCTGTGCTAAAGGTCATGATATTGATCCTACCAGCTTAAGTTATAAAG
CGGGTGATGGTTATTTGTGTGCTTCAAAAGGGCGAAGTAATCGCCCTGTG
GTATTTATAGGTTCTGATGGTCGTGCTTTTACTACTGACGCGCATACCTT
ACCAACAGCACGCTCTCAAGGTGAACCATTAACGGGACGCTTTAACCTTT
CAACAGGGAAAACCTTCGTCCATAGCATAATGTCGGATGACGATGCTCAA
TATCTGCTAGTCAGTGATGCCGGTTATGGCTTTGTTAGTAGTTTTGGCGA
TATGGTTAGTCGAAATAAAAATGGTAAAGCATTAATTAGCTTACCTGAAG
CCGCTAAAGTGTTGATGCCGCAATGCATCAACAATATTGAAAATGATAAC
TGCCTCACTATTACTAGCGAAGGGCGTATGTTGGTTTTTCCGGTTAAAAA
CTTACCAGTACTCAGTAAAGGTAAGGGTAATAAGATTATCAATATCCCTT
CTGCACGATCAAAGTTACGTGAGGAATTTGTTAGTTTACTTTGTATCATC
CCAGAAGGCGCGGCAATTACTCTGCATGCAGGCAAACGCAAGCTTACGCT
AAAAGCGGCAGATATCGAGCACTATAAAGGTGAGCGTGGTCGTCGTGGCA
ATAAACTACCTAGAGGTTTACAACGCGTGTCAGCAGTAGAAATTGAATCG
GGTTCTGTGACTAACTCTGATGAGCAAAGTGAAAATGAAGAGCCTAAAGC
GAGCGAGTAA
>CPS_4176 parE, DNA topoisomerase IV, B subunit
ATGACTGACCAATACAATTCCGACTCCATTGAAGTACTTAGTGGTTTAGA
ACCCGTTCGCCGCCGCCCAGGCATGTATACCGATACCACTAGACCTAATC
ATTTAGGTCAAGAAGTTATTGATAACTCAGTGGATGAAGCGCTTGCCGGT
CACGCACAAAATATTAGTGTTATTTTAGAAAAAGATCAGTCACTTGAAAT
AATTGATGATGGTCGTGGTATGCCTACCGACATTCACCCTGAAGAGGGTG
TGTCAGGGGTTGAGCTTATTTTCTGTAAGCTGCACGCAGGCGGTAAGTTT
TCTAATAAAAGCTATCAGTTTTCAGGTGGTTTGCATGGTGTTGGTATTTC
CGTAGTTAATGCCTTATCAACGCGTGTTGATGTCAGTGTTAGACGAGACA
GTAAAGTCTATGAAATGGCATTTGAAAACGGTGACAAAGTTGAAGAGCTG
CGAGAAACAGGCACAGTAGGAAAACGAAACACAGGTACGAGTGTTAAATT
TTGGCCCGATGCTAGCTATTTTGATACTTCGAAATTTTCGGTGCGCCACC
TTACGCATTTACTTAAAGCTAAAGCGGTATTATGCCCAGGCTTAACCATT
AAATTTCATGATAAAATTGAAGATAAAAAATATCAGTGGTGTTATGAAGA
TGGTCTTACCGATTACCTAAAAGATTCAGTAAAAGATTATGTTTCATTAC
CTGAAGACCCTTTTGTTGGCAGTTTTACTTCACAACTTGAGGCGGCCGAT
TGGGCTGTTACTTGGTTACCGGAAGGTGGTGAAAGTATAGGTGAAAGTTA
TGTTAACTTAATTCCAACCATTGCCGGCGGTACACATGTTAATGGCATGC
GCCAAGGGCTACTTGAATCGATGCGAGAATTTTGTGAATTTCGTCATCTA
TTACCACGCGGTGTCAAACTAACGCCGGATGATATCTGGGATAAATGTAG
TTATATCCTATCTATCAAAATGCAAGACCCGCAATTTGCCGGGCAAACCA
AAGAACGATTATCGTCACGTCAATGTGCCGCTTTTGTTAGTGGCGTAGTC
AAAGATGCTTTTAGTTTATGGCTAAACGAGCATACAGATAAAGCAGAACT
CTTAGCTGACTTTTGCATTAATAACGCCCAAAAACGTATGCGTGCTAGTA
AAAAAGTAGTGCGTAAAAAAATCACTCAAGGACCCGCGTTACCTGGTAAG
TTAACTGATTGTGGTAGCCAAGATTTAGCGCGTACCGAGTTGTTTTTAGT
GGAAGGTGACTCAGCTGGCGGTAGTGCTAAACAAGCTCGCGACCGAGAGT
TTCAAGCGATAATGCCACTGCGAGGTAAAATCCTAAACACCTGGGAAGTC
GATTCAGGGCAAATTCTTGCTTCGGTAGAGGTGCACGATATTTCAGTGGC
ACTGGGCATTGACCCCGACAGTGATGATTTATCTGAATTACGTTACGGTA
AAATTTGTATCTTAGCGGATGCCGATTCCGATGGACTGCATATTGCGACT
TTGTTATGTGCCTTATTTATGCAACACTTTTTACCTTTAGTACAAGCTGG
TCATGTCTACGTTGCCATGCCACCGCTTTATCGCATTGATATTGGAAAAG
AAGTTTTCTACGCATTAGATGAAGCAGAAAAAGACGGTATTTTAGACCGA
ATTGAAGCAGAGAAGAAACGTGGGAAGGTAAACGTGCAACGCTTTAAAGG
TTTGGGTGAGATGAACCCACCGCAATTACGTGAAACTACTATGGATCCTA
ATACCCGTCGATTAGTACAGTTAACCGTTGATGAACATAGTGAAACGATG
GAATTAATGGATATGCTACTTTCTAAAAAGCGTAGTCCAGACAGAAAAAT
TTGGTTGCAAAGTAAAGGTGATATGGCAATTGTTTAA
>CPS_1380 phrB, deoxyribodipyrimidine photolyase
TTGCTACTTTGGCTCCGTAATGACCTTCGAACACACGACAATCCAGCGTT
ACACTATTTCCTGAGTCGTAACGCCTTAAGTCAACATGATTCAGCAGTAC
CAGCGAAAGCTATCTTTTTTATCTGTGAACAACAATGGCAACAACATGAT
TGGTCGCCGATAAAGATAGATTTTATTAAGCGTCACGCCCATGCCCTTGT
TAAAGAACTCGCGCTATTAAATATCGAACTTGAATTGATTGAACTCGATA
ATTTTACCCAGCAAAAAACGTATTTACACAGCTATTGTCAACTGCACAAT
ATTACTGAAGTGGTGGCTAATAGTGAGGTTGAATTTAATGAACAGCAACG
AGATAAAGCCTTATATTTAGAATTAAAGGCTAGCGGTATTCCATTAACCT
TACTTGAAGCAGACGTAATCGTACCAAAAGGCAAAGTCCTGAATCAGTCG
GGTATTATGTATAAGGTTTTTACACCGTTTAAGCGTGCTTGGTTAACCTA
TATTCAGCAAGGCGGCTTTGAGTATTTAGGCAAAGTATCTGTTAAATCGT
CAGCGGTTAACAAGGCTGATAATCAAGAAGAAGATCAGGGAAGTATTTCT
AGTACCTGGCCGCTAGCAACTGTTTTTGAGCAGCAAATACTACCAAAGTT
TTACCAACAAAAAATAAGCACTTACAAACTTAATCGTGATATACCATCGA
TTAAAGGTACGTCGGGTATATCACCTTATTTGGCTGCAGGTGTTATCAGT
CCTCGTTTTGTACTTCGATTATTACTTAACAAACATCCCGATTTGTTAGT
CGCGTCAGACAGTGAAGAATTTTCATGGTTGAATGAGATTATTTGGCGAG
AGTTTTATCGCCACCTGCTTTTTCATGAACAACGATTATGTAAACACCAA
TGTTATAAAGAAAATTATCAAGAGATGTTGTGGCATAACGATGCTGCATT
ATTTGATGCGTGGTGCCAAGGCAGAACTGGCTACCCACTTGTTGATGCTG
CAATGAGGCAGCTCAATCAAACAGGCTGGATGCATAATCGTCTTCGTATG
GTCGTGGCGAGCTTTCTAACCAAACATTTACTCATTGATTGGCGATTAGG
TGAAAAATATTTTATGCAGCACCTGATTGACGGCGATTTAGCTTCAAATA
ATGGTGGCTGGCAATGGGCGGCTAGCACTGGCTGTGATGCACAACCTTAC
TTTAGGATTTTTAATCCTATTAGACAAAGCGAACGTTTTGATCCAAAGGG
CGTTTTCATACGTAAATATATACCAGAGCTTAACAATATTTCTGATAAGG
CGATTCACTTTCCTCATCAATATATTAAGGATAATGAACTAAATATTTAT
TGGCCAGCGATTGTTGAGCACAAAGAGGCTAGGTTAAAAGCGTTAGCTTT
TTATAAGGTGTAA
>CPS_4978 polA, DNA polymerase I
ATGACAATTTCTGCAACCACCCAAGACTCTAATAACTCGCAATCACCCTT
AATATTGGTCGATGGTTCATCGTATTTATTTCGAGCCTATCACGTACCTT
ATTTGCAAGCTCTTTCAACCGCTGATGGTCAACCTACGGGAGCTATTACT
GGTGTATTGAATATGTTTCGTAGTTTAAAAAAAGACTACCCCAATGGCAA
TATCATCGCTATTTTCGATGCTAAAGGTAAAACATTTCGTAATGACATGT
TTCCCGAATACAAAGCCAATCGTCCACCAATGCCTGATGATTTACGTACT
CAAATTGCACCAATACATGAGATTATTACAGCAATGGGTTTGCCACTTTT
AGTTATTCCGGGTGTTGAGGCCGATGATGTTATTGGTACATTGGCAAAAC
AAGCTGATGAGCTTGGTATTGAAACCGTTATTTCGACCGGCGATAAAGAC
ATGGCGCAGCTTGTTACTAAGCATGTTCGTTTGATTAATACCATGACCGA
TGTAGAAATGGATGTTGCTGGCGTTAGTGAAAAGTTTGGTGTTAGACCTG
ATCAAATTATCGACTATCTTGCATTAATGGGGGATAAAGTTGATAACATT
CCTGGCGTTGTTAAGTGTGGTCCCAAAACTGCCGTTAAATGGTTAGCAGA
ACATGGCACCATGCAGGAAGTTATTGCCAATGCGGACAAAGTAAAAGGCA
AGATTGGTGAAAATCTTCGTGATGCATTAGAACAACTGCCATTGTCTTAT
CAATTAGCCACTATTAAATGTGATGTTGAATTAGAACAAACGGCTGGAGA
ATTAGCGGCTAGTGAACCAGACGTAGACGCATTAGCTGAACTTTATCAAA
AGTTCGAACTAAAACGTTTGTTAGCTGACTTAGGTAAAGGTGGAAGTGAC
GTTGGCGCGAGCACTAGTAGCGTAGCTAAAAAAACTAAAGCAGACTCTAC
AGCTTCGGTGGGCGAGCAGGCCGTTGAAATTAAAGCTGTAGACGTTGAAA
AAACTCAATACGATATTATTTTAGACAAAGAGCTTTTTGAACAGTGGTTG
AAAAAGTTACAAGCGTGCGAGTCTTTTGCTTTTGATACTGAAACCACTAG
TGTTCATTATATGAAGGCTGAACTAGTCGGAGTATCGTTTGCTATTGAAG
TGGGGAAAGCTGCTTATGTACCATTGACTCATGATTATGAAGATGCCCCT
GAGCAACTTGATAAAGAGTGGGTATTAGCGCAATTAAAACCGTTACTCGA
AAGTAAAACCATTAAAAAGATTGGTCAAAATCTTAAGTATGATGCCAATG
TATTAAGCCATTATGATATTGCTTTGCAAGGCATCGAGTTTGATACCATG
ATCGAGTCTTATTGTTATAACAGTGTTGCTACCCGACATAATATGGATGC
ATTAGCACTGAAATATCTTGATTATCAAACCGTGCATTTTGAAGATGTAG
CAGGTAAAGGTGCTAAACAACTTACTTTCAACCAAATTGACATTGAAAAA
GCGGGTCACTATGCCGCGGAAGATGCGGATATCACCTTGCGATTACATCA
CGCTATTTTCCCCGCGTTAGCAGAAACCGCTTCAATGTTAAGTGTTTTCA
ATGAAATCGAGATGCCATTATTACCTGTACTGGCCCGCATGGAGCAAACC
GGTGTATTAATTGATAGTGATATCTTAGCTGAACAAAGCTTTACCCTAGG
TCAGCGTTTAGATGAACTAGAAATTGAAGCACATAATTTAGCAGGTAAAA
GCTTTAACTTGGCATCACCGAAGCAATTACAGCAAATTCTTTTTGAAGAT
TTAAAAATCCCGGTCATCAAAAAGACACCCAAAGGTGCTCCTTCAACAGC
AGAAGAAGTATTGCAAGAGTTAGCGCTCGATTACCCATTACCCAAGGTTA
TTTTGGAAAATCGAGGACTTAGTAAACTGAAGTCGACGTACACCGACAAG
TTACCATTAATGGTGAGCGATAAAACTAATCGTTTGCATACTTCGTATCA
TCAGGCGGTTACGGCAACAGGGCGTTTATCTTCAACCGATCCAAACTTGC
AGAACATTCCAATTCGCAGCGAACAAGGCCGCAAAATTCGCCAAGCTTTT
ATTGCACCAAAAGATCATAAAATAGTCGCGATAGATTACTCTCAAATTGA
ATTACGCATAATGGCACATTTGTCGAACGATAAAGGTTTAGTCACTGCCT
TTAGCGAAGGTAAAGATATCCATCGCGCGACAGCGGCAGAAATCTTTGCT
GTTGAACTTGGTGAGGTTACTACCGATCAACGACGTAGTGCTAAAGCTAT
TAACTTTGGTTTAATTTACGGTATGTCAGCATTTGGTTTAGCCAAGCAGC
TCCATATTGGTCGTCAGCAGGCGCAAGAGTACCAAGATAAATATTTCCAG
CGTTACCCTGGTGTATTAACGTATATGGAAGATACTCGTCAACAAGCGAG
TGAGCAGGGCTATGTTGAAACCTTATATGGTCGTCGATTATATCTACCTG
ATATTAATGCTAAAAATGGTATGCGTAAAAAAGCGGCCGAGCGAGCTGCA
ATCAATGCACCGATGCAAGGAACCGCTGCGGATATTATTAAAAAGGCCAT
GTTAGCCGTAGATTCATGGTTACTTGAGCAAAATGATGACCGTATAAAAA
TGACTATGCAAGTTCACGATGAACTGATTTTTGAAATTCATCAAGATATT
GTTGAAGAAACCACAGCTAAATTGGTGACGTTAATGAATGATGCGGTAGA
GCTGAGTGTGCCATTAATTGCAGAGGCTGGCATTGGCGATAACTGGGATG
AGGCGCATTAA
>CPS_2273 polB, DNA polymerase II
ATGACAAATTTAAAAACAGCAGGCATACAGAATGGTTTTTTATTGACCCG
ACAGGTGCAAGATAAACGCACTGGGTTAGTAATAACCTTATGGCTGAAGA
CTGATGCCGGACCCGTTAAGTTAGAAGTAACTAATGAGTTAGCGGTATTC
TTTGTCGAAGTAGAGCATCTAGAAACGGCTAAATCTATCTTAGATGACCA
ACGAATATTACTTGAGAAGCATCAAGTTTTATCGTTAAAAACCTTTACTC
AACGTGATGTTGCTGCCTTGTATTTTTCGAGTATGCGAAGCTTCTATCGT
GCTAGAGATGCTTTAAAGTCTCAAAATATAAAATGTTATGAAGATGATAT
TCGCCCTGATGATCGTTTTTTGATGGAGCGCCATATAACAGCAGATATTG
ACTATCTTGGTAATCATCAGCTGTGCGGAGATTATCAACTCACCAAACAA
GTTAAATGTAAGGGAGCAGCAATAGAGCAACAACATAGTTTAACTATGCT
TTCTATCGATATAGAGTGCTCTATGCAAGGTGAGTTGTACTCTATTGGTT
TGTATGCAAATAACAACCACACAGTCTTTAAACGTGTGTTAATGATTGGC
GTATCTCAGCCAGATGCTGATAGCTATATTCATTGGCAAACGGATGAAAA
ACAATTATTACAGCAATTTATTCGAGAAGTTAACCTGTTCGATGCCGATA
TTCTTATTGGTTGGAATGTCATTAATTTTGATTTTATGCTTTTACAAAAA
CGATGTGACCTTCATGGCATTCCTTTTTCTATAGGCCGTGATAGGACCTG
TCCTTACTGGCGTAAAAATGCCAATAATACCGATCAGAACTTTATCGAAA
TAGCGGGTCGTGTAGTTCTTGATGGTATCGACTTATTAAAAACTGCCACT
TACAACTTTTCTAGCTTCTCATTAGATAATGTCTCCCATAGCTTACTTGG
TTTAGGAAAGAAGGTGGCAGATGTTGAAAACCGAGTGCAGGAAATTACCG
ATAATTTTAATCATAACAAATCTGCATTAGCAGCATATAATCTTGAAGAC
TGTCGTTTAGTCTGGTTGATTTTTGAAAAAACTCGGTTACTTGATTTTGC
TAAATTAAGAGCACAACTCACGGGTTTATCTATTGATAGAGTAGGTGGAT
CTGTTGCAGCCTTCACCAATCTGTATTTACCTAAGTTACACCGAAGTGGT
TACATTGCGCCCAATATGGGCGATGGTGAATCTGGCTTAGTGTCTCCTGG
TGGTTATGTCATGGACTCCAAACCGGGCTTATATAAAAATGTACTGGTGC
TTGATTTTAAATCATTGTATCCGAGTATTATTCGTACTTTTAAAATAGAC
CCGATGGGACTTATTGAAGGACTTAAAGCGGTCAGTGAGCAAAAATCAGC
ACACAGTAAATCTGAAAAACTCAGTGATGATTGTTTTGATGATGTAATTC
GTGGTTTTGACGGCGCTTACTTTTCTCGAACGGAACATTTTTTACCAGAT
ATCATCAAGTCACTTTGGTTAGAACGTGATAAAGCAAAATTGCAAAAGGA
TGCCGCTTTATCTCAAGCGATAAAGATAATTATGAGTAGCTTTTATGGTG
TTTTGGGTTCAACAGGCTGTCGTTTTTTTGACCCTAGGTTATCAGGGTCA
ATTACCAAAAGAAGCCATGAAATTTTAAAAAAAACCAGTGTTTGGATTGA
AAAGTTAGGGTATCAAGTCATTTACGGTGATACCGATTCTATTTTTGTTT
CTATCGGCGCCGAGAAAACCAAAACTCAGGCAAAGCAGTTAGGTGCAGAG
TTACGGTCATATATAAATGATAAGTGGCAAAATAGACTAAAGCGTGATTT
TGACATTGAAAGCCAATTAGATATTGAATTTGAAACGCATTTTACTAAAT
TTTTGATGCCAACCATACGTGGAATCCATACGGTAAAAGATCAAAAAAGT
ATTGGTACTAAAAAACGTTATGCCGGTGTTTCTGATGGTGAACTTGTATT
TAAAGGCTTGGAAACTGTACGCAGTGACTGGACTGATTTAAGTAAAGATT
TTCAGCAAGAGTTATACCGACTGATATTTAATGATCAACCTATTGAGGGT
TACATTAAAAAGATAGTTGATGAACTAAAACAAGGGCTTCATGATGAGAA
GCTGATATATAAGAAAAAAATTAGACGAAAACTCAGTGATTATGTAAATA
CCCCACCGCACATCAAAGCAGCATTATTGGCTAATCAAAAGCTTAAAGAG
CTAGGTGACAAGCCGACCTATAAACACCGCAGTTTAATTCGATATGTTAT
TACACTTGATGGGGTTCAACCATTAGAATTTAATACCAGCAAACTAGATT
ATGATTTTTATGTAGAAAAGCAACTCAAACCGATAGCGGATGATATATTA
CCTTTTATTGGTAAAGATTTTGAGTCAATTGCCGGCGATCAGATGGGCCT
TTTTTAA
>CPS_4366 priA, primosomal protein N'
GTGCCTGAACAATACATTCAAGTTGCGATTCCTGTTCCTATGCGACAGTT
ATTTACTTATCGAGTACCAGAAGCGCTAAGTTCCCCTGCTATTAAAGTCG
GTGAACGCGTTGCGGTATCTTTTGGTCCACGAAAGGTGATTGGTATCGTT
ATTGATGCACAAGCACAATGTGACTTTGAGATAAGTAAGGTAAAAGACAT
TACTACTCGTCTTAATGATAATTTCAACTTAAGTCAGTCACTGGTTAGTT
TTTTACAATTATGTGCTCATTATTACCACCACCCCGTTGGCGATGTTTTC
CAACAAGCCTTGCCTATTTTGCTTCGAAAAATAGAAAATATTACCTTAAG
CCCTCCGATGGTATGGCAAGCACAATGCCCAAGTGAAGATAACAGTGACC
TATTAGCCAAATTAGAGAAAAAAGCCGCTAAGCAATTCGCTCTTTATCAA
ATAATTAACAACCATAACGGCATCAGTTGGGTAGAGCTGCGCACATTGGG
ATATAGCAAAGCACAGTTAAACGCTTTGCAGAGCAAAGCGTTAATCATTG
AGAAAGAACAGGTAGCGAGCCAATATACTTGGCAAGAGAATACCCTCAAT
CAAGCTGACAGGTTAGTACTTTCAAGTGAACAAGCCATTATTGTTAGTGC
TATAAACCATTCTTTAGCACAATTTTCGTGCCATCTAATTGATGGGGTTA
CGGGGAGTGGTAAAACAGAAGTCTACTTGCAATCCATGGAAGAAGTACTT
GCCAATAATCAGCAAGTATTAGTGATAGTGCCAGAGATTGGCTTAACACC
CCAAACATTAAACCGCTTTGAACAACGCTTTAATGTGCCTATTGCGTTGC
ACCATTCAGGGCTGAATGATAAAGAACGTTTAGCCACCTGGTTAAGTGCT
CAACAAGGAAGTGCCGCTATTGTTATTGGTACTCGTTCAGCAGTTTTTAC
GCCCTTACATCGCCTTGGATTGATCATTATCGATGAAGAGCATGATTCTT
CATTAAAACAACAAGATAGTTTTCGCTACCATTGCCGAGACATGGCTATT
TTACGCGCAAGGCAATTAAATATTCCAATCGTTTTAGGCACCGCTACGCC
TAGTTTTGAGTCTTTGCAAAATGCGTTATCTGGAAAATATAGCTACCACC
AACTTCTTAACCGAGCAGGTAAAAGTAATAAAGCTAAAATAGCCCTTATT
GATATGAACCAGCAGCAAGTCGAGTTTGGTTTATCTGGCACACTTAAACA
TGAAATGAAGCAAACCTTAGCCCGTGGTGAACAAGTATTATTATTTTTAA
ACCGTCGAGGTTATGCGCCAGCTATAAACTGCCAAGAGTGCCATTGGCTT
GCAGAATGTCAACGCTGTGATAAACCTTATACCTTACACCAAAAGCAACA
ACTGCTGATTTGTCATCATTGTGGCAGTCAAAAGCGCATACCTCCGCAGT
GTCCTAGTTGCGGTAGTGTTCGTATAGCGCCACTAGGCCAGGGCACAGAG
CAATTAGAGTCTCGTTTAGAAGAACTATTTCCTGAAAGTTCTATTGTGCG
TATCGATCGAGATAGCACTCGTAAAAAAGGTGAATTAGCAAAATTATTAC
AAGAGGTCACTGATAAAAAACATCAATTACTGGTTGGAACACAAATGTTA
GCAAAAGGACACCATTTTCCTGATGTCACGCTAGTAGCTGTGCTCGATGT
TGATGGTGCTTTATTTAGTTTTGATTTTCGCGCAAGTGAGCAAATGGCTC
AATTGCTGATTCAGGTAGCAGGACGCGCTGGACGTGCCAGTAAACCCGGG
AAAGTATTAGTGCAAAGTAACTTTGTTGATCATCCTTTGTTGCAAGATTT
AGTACACAATGGTTATCACCATTTTGCCCACCAAGCACTCACTGAGCGAA
AACAAGCACTATTACCACCTTTTACTTTTCAAGCGCTGTTACGAGCTGAT
GCGAATTATCCATCTTACCCAGAAAAATTTTTACGCGCTTTAACACAACG
ACGACTAGAGGGCTGTGAGTTTGCCGGCCCAGTTCCAGCGGCAATGGAAA
AAAAAGCAGGTAAATTTAGATATCACTTGATCATTCAAGCGAAATCACGA
AAAGATTTACATCGCGCAATTTTGCAGTTACTTATTCAAATACCTAACAA
TGAATGGCAGGGTAAGGTTCGTTGGAGTTTAGATATTGATCCTATCGATC
TTAATTGGTAA
>CPS_0416 priB, primosomal replication protein N
GTGATTGTCTCGCAAGAGAATTGCCTAGTGTTGATCGGTGAGGTGGTGAG
AACCCCTAAGCAATCAACCAGCCCTGCAGGTATTAGTCATAGTCAGTTTT
CAATAGACCATAAGTCTATACAAAATGAAGCTGGTATGAATCGACAAGCA
TTTGTCCGAATACAAGTAGTTGCTACAGGTGATTTATCACACTTAACTCG
TGAATTAATTGCAGGGAATGTAGTAAAAGTGACCGGTTTTATAAATCGCC
ACGAATCTAGAAACGGTAATCCGCTTTTAGCATTACATGCTCAGCAAATT
GAAATGATTAATTAG
>CPS_1204 rdgC, recombination associated protein RdgC
ATGTGGTTTAAAAACCTTTACTTTTTTGCTTTTACTCGCCCTTTTGAATG
GTCAGAGCAAGACTTAGAAAAACATTTATCTGAACATCTTTTTACTCCGC
TAGGCTCCACAGAAATATCTCATTTTGGCTGGATAAACGCATTAGGAAAA
CATGGTGATACAAGTGTTCATAGTGCAAACGGTAACTTTCTAATTTGTGC
ACGCAAAGAAGAAAAAATGCTTCCTGCTTCTGTTATTAAAGATATGATAG
AAGAGAAAGTTAATTTACTTGAACAAGAACAAGGCCGTGGTGCTACGAAG
AAAGAAAAGGAACAATTCAAAGAAGATATAACTTTTGAGTTACTCCCTCG
CGCTTTCTCTCGGATAACAGATACTCATGCTTATATAAGCCCGGTTAATA
ATATTATCGTTATCAATTCAAGTTCTCGTGGTAAAGCAGAAGATTTATTA
GCTTTATTACGTAAAGTACTTGGTACCTTACCTGTTAGCAGTTTGGAACC
TGACGTTTGTGCCGATGAAACAATGACTGACTGGCTGAACGAAAAAAGCT
TAGGTGGTAAGTTTACTTTAGGCATGGAAGCCGAATTTAATGCTTTAGGC
GATGATGGCGCAGTTGTTCGTGTAAAAAATCAAGACCTATTAAGTGAAGA
GATTAAATCGCATTTAGATGCCGATAAGTACGTGGTAAAGGTAGCTCTAG
AATGGGATGAATCGTTATCATTCATTTTGTGTGATGACTTAGCGATAAAA
CGAGTGAAGTTTTTTGATGTTATTCACGAACAAAATGATGATATTGATAG
TGATGATGTAATTGCTAAGCTTGACGCAGATTTTGCTCTTATGTCAGGTG
AGTTAAACCGTTTTATTATCGAACTATTAGCTGAGTTTTCTATGAAGACG
ACGGACTTATTGGAAAAAGATTAA
>CPS_4134 recA, recA protein
ATGAAAGACGATAAAGAAAAAGCACTATCAGCAGCCTTAGCCCAAATTGA
ACGTCAATTCGGTAAAGGTTCAATAATGAAGCTTGGTGATAATACCACCA
TGGATGTAGAAACTATTTCTACGGGTTCATTAGGCTTAGATATCGCCTTA
GGTGCTGGCGGCTTACCAATGGGTCGAGTTGTTGAAATTTATGGTCCTGA
ATCAAGCGGTAAAACCACGTTAACTTTAGAAGTTATTGCTGAAGCACAAC
GCAATGGTAAAGTTTGTGCTTTTATCGATGCAGAGCATGCTCTTGACCCT
GTTTATGCTGAAAAATTAGGTGTTAACATTGATGAGTTATTAATTTCTCA
ACCTGATACCGGCGAACAAGCTCTAGAAATTGTTGATATGTTAACGCGCT
CTGGTGCTATCGACGTTATTGTAGTTGACTCTGTTGCCGCGCTTACACCT
AAAGCTGAAATTGAAGGCGATATGGGTGATTCACATATGGGCTTGCAAGC
ACGTATGTTGTCACAAGCGATGCGTAAACTTACCGGTAATTTGAAAAAAT
CTAATACTATGCTTATCTTCATTAACCAAATTCGTATGAAAATTGGTGTT
ATGTTTGGTAGCCCAGAAACGACGACCGGTGGTAATGCGTTAAAATTCTA
CGCTTCTGTACGTTTAGATATCCGTCGTATTGGCGCGGTTAAAAACGGTG
ATGAAATCGTTGGTAATGAAACGCGTGTGAAAGTCGTTAAAAACAAAATT
GCGCCACCGTTTAAACAAGCTGAATTCCAAATTTTATACGGTGAAGGAAT
TAACAACTTAGGTGAGTTAATTGAATTAGGCGTTAAGCATGAGTTTGTAG
AGAAAGCAGGTGCTTGGTATAGCTGTAATGGTGAAAGAATTGGTCAAGGT
AAAGCTAATGCTGCTAAATATTTAGATGAACATCCTGAAATGGCTAAAGA
TGTTGATACTAAATTACGCGATATGTTTTTATCAAAAACTGTTGTGGCAG
AAGATAAATCAGAAGTAAAAGAAAAAGAAAAAGCATAA
>CPS_2768 recB, exodeoxyribonuclease V, beta subunit
ATGACTCAATTTGATACTTCAGACTCTCAACAAACAGCGACTAAAGATAA
TCATCAAGAAGTAACACTACAAAATCTTGATGCAGCGACCATTGAGTTAA
CGGGTAAACATCTTATTGAAGCCAGTGCTGGTACAGGTAAAACCTATAAT
ATTACGCGTATTTATCTACGCTTATTACTTGAACGTGAGTTAACGGTTGA
ACAAATATTGTTAATGACGTTTACCAAAGATGCGACTCAAGAATTACGAG
GGCGAATTGATGCTTTTATTCGTTTAGCCCTCAGTGACTGGGATAGTTTG
TGTTTAAAAGACGCTTACTTTGCCACACTTGCTCAACGTATTGAAAAAAA
ACAGCGAGAATTTTTACTCAAACGCGCACTACTGTTTTTAGATGAAGCAG
CTATTTTTACTATTCATGGTTTTTGTCAGCGGGTATTAAATCAATATGCG
TTTACCAGTGGTTTACCGTTCAATGCCAATATGGCAGCCAATTCGTCTGA
AATAACTCTACAAGTTTGCCAAGATTGGTATCGCAGTTTAGCTAAGTCTG
ATCATGAGTGTTTTATGTTGCTAGCAAGTTATTGGGCAACACCAGATAGC
TTTTTATCCAGTTTTAGTAAAGCCATAGGTCACACCAGCACTTTATCCGT
TGTGGATGTCGAAAGTATTGAGGCTGAATTTATTGTCTTAGTACGTCTGG
CAGCGCAAACATTAACGGCCAACAGTGATTTATTTGAAAATGGCTTAATA
CTGGTTAAAAAGGGCGCAGACCAAGAAAAAAGACGCGATGAGTTGTCTCA
ATTAAAAATCTGGCTTGAGAGCATTATCAGCAAAGAGTTATCACTGCTTG
ATGTTGGCGAGGGTAAGGTAAAAATGCCAGATGGTTTTTTTGATGGCAAA
CGTTATGCAAGATCGACCTATAAAGCTGAGTTACTAGAAGCTTTTGCGCC
GGTAAAAGAAGTTAAAGAACAAGTTAAGAAAATAGCGAACAATATCAACA
AAGCTAGAGCGTACGGCATTGTTAAGTCTGGTATTTACATTATTAGACAG
CAAGTCATTGAGCAGAAAAAAGCACTTAATTTATTAGACTTTGACGATCT
TATTAATACATTAGCTAATTGTCTTCAGTCGGATAGCTCAGGTGATGAAC
ATTCTCAGTTACTCGCTAAACAGCTACTCGCACAATACCCTGTAGCCTTA
ATAGATGAGTTTCAAGATACTGACCCTAAGCAATTCGGCATATTACAATC
GATCTATTACGGCGACAATGCTAAAAAAGCTAATGCCGGTTTATTCCTTA
TTGGCGATCCAAAGCAGGCTATTTATGGTTTTCGTGGTGGTGATATTTTT
GCCTATCTCAATGCACGTAGCGGCTGCGACCACCACTGGCTGATGGATAC
TAATTGGCGTTCAACGCCACAAATGATTGAAGGTTATAACCAGTTTTTTA
CCTACAAACGTAATGGGTCTTCATCTGAAGAAACGGTGTCTAACGAAGTA
AATAAGCAACAAAGTGAGAGTGTCTTTGGTTTTGGCATACCTTATTTACC
AGTACTAGCAGGAAAGAAATCGGCCCAAGCCCAACAAGTTATCTTAGACA
GTGATAAAGCACTGCAATTTATTCATTTTACTAATGATGAAACATCCAAT
GATACTAACCCGCAAGGTGACAAAGTTAGTCAAGGTAGTCGTCCTATGTT
GGCTAACTGGTGTGCGAATGAAATAGTGACTCTGTTGGCCTCGAAAGAGC
AAACAGGTAAAGTAAATCCAAAAGACATCGCCATACTTGTCAGAGATGGT
GCTGAAGCGCGAGATATTAAACATGCCCTGCAACAAGCGGGGCTTGATAG
CGTTTTCTTATCAGATAGAGCTAATTTATTTCATTCTCAGCAAGCTAAGC
AATTATTAGGTTTACTCAAAGGGGTATTATTACCTGAAAATGAACGATTG
TTTGTTGCCGCACTGTCATGTGGATTATTAGGTTTTGATGCTAAAAAGCT
ACACCAATTACAGCAAGACGAAATGGCTTATCAAACGTTGAAGTTTGCTT
TTGTTGATTATAGAACGCAATGGCAACGACAAGGTTTTATCACCATGGCG
ATAAACTTGATGCACAACTTGCTTGATGTTCCTCAAAACAATAAAGATCG
TTGTTTAACCAATGTGCTGCATTTATTTGAGATATTACAAGCGGCTAGTG
TTCGATTAAGTCAAGGACAAGAGCTTCTGCATTGGTTTGAACAGCAGTGT
CACCTTGAAACCAATGATGTTGAAGCCGAGCTACGTTTAGAGAGTGATGG
TGATCTTATTCGTTTAATTACTCAACATGGCTCTAAAGGACTTGAATATC
CTTATGTCTTTATTCCATTTGCTTGTCGTCATAAAGATCCGTTGAAGTTT
GGCAACAAGTCAGTGAGTTATCTTGAATACCACGATGCAAACGGTAAGCT
GTGTTTAAGTCTTGATGGCTCAAAAGAAGCCAAGAAAGCTATGAGTAATG
AAGCTTATGCCGAAAGTATCCGTTTGCTTTATGTGGCGATAACCAGAGCC
GAACGAAGATGTTACGTACTGTGTTGCGCCTTTGATGCATATCATCTATC
ACCTTTAGGCAAAACACTGCAGTTTCAAGAACAAGAGAGCATCATTAAAC
CGTTGCAAGTACTTAAGGCAAGTGCTGAGCACGCTATTGGTATTCGTGAA
GTATCACTTGATTGTTCTATTGACCTTTACCTTGAAAAAAATGATGAAGC
CGCGCTACATCAACCGAAAAATAGCCCACAAGAGTTTGCCAATACCGAAG
TCAGTAAATTCATTGGTAAGATAGAGCGAGATTGGTGGTTGAGTTCATTT
ACCGCCTTAAGCCGTAATATCCGCCATGCAGGTGTTTCTAATCCAGATAG
AGATACTACTGACATAGCGAACAGGCAATTAGATACTGATTCCGAACATA
CTGATATCGAACTACTTAGCGCTGAGCAAATTTGCTTTAAATTATCCAAA
GGTGCTCATACGGGTAACTTATTACACGATATTTTAGAGCAAACTGATTT
TTCTGAACCAGATTGGCAAGAGAGTCTGGAAAAACCTTTATTAGCCTATG
GTGAGTTAAACGCGAGTAACGCTAACAGTATAAGTACTTCATTTACCTCA
GATGATTTAATTCAGTGGTTAGAACAAGTGATTAGCGCACCTTTCATTTC
GAGTCACCACAGTGCACTCACTACCGATAGTGAAAATGCTGGCTGTCTAG
CCGATATTGCTTTCAATAGAACGCTACGTGAAAGTGAGTTTTATTTTCCT
ATGCAAGGCGAGGGTACTAACGCTTTAGCTAATTTGCTAACCGATCACCG
AAATAGGGCAGAGCGTACTGATACTGGCAATAGTATTAGTACTGGTCGGA
ATAGTGGGATAAGCAAGACATTAAACAACACCTTAAAATATCCAGTAATG
TTACCTAGCTATAAAAAGCTCTCAGGCATGATGCATGGTTTTATCGATTT
GATCTTTGAATACCAAGGGAAATATTATCTGTGTGATTATAAATCTAGTC
ACTTAGGTGATAGCTTTCAAGATTATCAGTTTGATGCATTGCTCGATAAT
GTTGAGAAAAATTATTATGACTTACAATACTTAATTTACTCATTAGCATT
ACATCGTTATTTAAAACAAACTTTGGTAGATTATGATGTTAATCAGCATT
TTGGTGGTGTGTATTATTTATATCTACGTGGTATGACAACTGAGCCTGAA
CATAAAGGTGCAGGGGTTTATTATCGAAAAATTACAGAGCAAGAAATCAA
TAATTTAGATGCGCTCTTCTCTAATAAAGAAAGTAATGAAAAATGCAATG
AGGAAGCGTAG
>CPS_2769 recC, exodeoxyribonuclease V, gamma subunit
TTGATCCATCTTTATCCTGCCAACAAAATGGAAAACTTGTTGCTCTTGCT
CAACAAAATTTCCCAGCTTTCCCCTCTAGGTGTATTTAATCAAGAAGTCA
TTGTGGTACAAAATGCAGGTATGCAGCATTGGCTTAATTTAGCCATTGCA
CAAGAACGCGGTATTAGCATGAATATGCGTTACGCGTTACCAGCTCAGTT
TCTATGGAAGCTAATAAGGTCGCTGGCTAGTGATGAGAAGGTGCCTGAAC
AGTCACCTTATTCAAGGGAGGTGCTTTGTTGGCGTATACATGCACTGTTA
GCGCTAGATTCTGTAGTAGAAGATGATGATTTTAGTCAAGCTACGCACTA
TTGGCGTGGCGAAAATACGACAGACGAAGAGGATAATAATACAGTTAATG
ATAGCAAACATGCACAGCTAAAACGGTATCAGTTAGCCACACAATTGGCC
GATTTATATGAGCAGTATTTGATTTTCAGACCGCAGTGGTTAGACAATTG
GCAACAAGGAAATTTTGAACTAGACGGCTTAGAAAAAATATCAGCCAGTG
AGCATAAATGGCAAGGCAAGCTGTGGCGATTATTAATTGCCCAATTACCT
TATAATCCTGTTGAATTAATGCATGATGCTATTGCTAACATTCAGGACAA
AAAAGAGCTTATTCCACCGCGTATTAGTTTTTTTGGTCTTAATACCATGG
CACCAATGTGGTTGAATTTTATTAATGCCCTAAGTGAGCATGTTGAAGTA
CATTTCTTTCATCTTAACCCGTGTTTCTCGTATTGGGGCGATGTCGTTAC
TGAAAAATACGCCTTAAATAAGTTATCACAATGGTCTGATGGCGTTTTAC
CCGAGGAATTGGATGTACATAGCTATGTCGGTAATCCGTTATTAGCCAAC
TTGGGCCAGCAGGGGCGCGAGTTTATCTCAATGTTACAAGATTACAGTAC
CATCGATGTTGAGTTATTTGAGCAAGCTAAAAGTGCCCAAGCAATAAGTA
ATAATAACGACGTAACGAGTGTTTTACATCAGCTGCAAAACGATATTCTT
GAACTGTCTGATGCAAGATCTCCCGATGATGAAGCCATCACTCCCAAAGC
AGTACAACATGATGATTCAATTGTGATCACCAGTTGTCATAGCGCATTAC
GGGAAGTCCAAGCACTACATGACTATTTATTGCATCAATTTAATCAAGAC
AAAAGCTTAACACCTAAAGATATCTTGGTTATGTGTCCACAAATAGAACA
ATATGCCCCCTATGTAAATGCCGTATTTACCCGTGGTTGGCAAGACATAG
CAGGTGAAGTGCCGCCACTACCTTGTTCTATTGCTGATCGCAGTGCTAAA
GATAGTGACCCGCTAGTAGCCGCTTTTACTGAATTACTGACATTGCCGGA
TAGCCGCTTTGGTGTCTCACAATTGTTATCTTTTTTACGTTTACCTGCCA
TGGCTAATAACTTTTCGATTAACGGCGAAGACTTAGCTAAAATTTCTGCT
TGGCTTGAACAAGCCACGGTACACTGGGGATTAGACTTAACCCACAAACA
ATCATTGTTAGGGCAACAAGCAAACGCTTCATTTACTTGGCAACAAGGCT
TGTCACGTTTACTTCGTGGTTTTGCTTATGCCGACAGCGAACAAATTTAT
CAACAACAACTGTTATTGAGTAATGTTGAAGGTAGTGACAGCATCTTACT
CGGTCAGTTAATGTTATTTATCGAACAATTACATTACTTTAGTGAAAATC
TGCAAAGATCTCGCACCGCGATACAATGGCAAACTTTTTTACTTGAACAA
TTAAGCCATTTATTTAGCCGAGTCGATGCCGACAACGTCAGTAATGAAAA
TAGCCTGATGGTGATTGAGCAAGCAATTGCAGGCCTGGTCGAACATTGTC
ACCACGCTCATTTTGAAGATGATATATCACTATTAATTGTGGTTGATTAT
TTAAGCCAACATTTTAGCCAAGGTGATGCCAGTAAGCAGTTTATGGTCGG
GCAGGTAACCTTTTGCTCTATGTTACCTATGCGTAGTATTCCGTTTAAGG
TAATCGCGGTTTTGGGGTTGAATGATGGAGAATTCCCTAGACAACGACAA
GCCTTAGGTTTTGATCTTATGTCGTTGTCAAAAGCTAAATTAGGCGATAG
ATCACGACGTGGGGATGACCGATACTTATTTCTTGAAGCTATAATCTCGT
CAAGAAACTCGTTATACCTGAGTTATCAAGGCCGAAACATCAAAAACAAT
AATGAAAAACAACCGTCATTAGTTGTAAAAGAACTAATGGAATATCTAGC
ACAAGGTTACGGTTGGCAGTTTTCAGAAGAGCAGCTCACTTCTGATAATA
ACAATGATGATACCAATGCCGAAAGCAATCAATCAGGTATCTATCAATTA
GCCATGCAAGCCTTTAGTCCTAATAACTATCGAGGAACTTGGCCAAGTTT
TGATGCTAATTGGTTAGCGCTAGGACAAAGTTCCAATAGCGATAATGACG
AGAGCATGGGAGAAGGTTCTACGCTTGCTATTGAAAGTCTGGCTGTAACA
CCAGAGCAAACGGTTGAGGTCAGTTTATCTTGCCAGCAGTTGATACGTTT
TTATCAGCATCCTGCAAAAATGTTTGCCCAGCAGCAACTTAATTTATATT
TTGAGAATCACGATGTCTTACTTGAAGATGTCGAACCCTTTAGCGTTAAT
CACTTACAAAGCTATTTATTACGACAAGATTTACTCAGTGCCGCATTAAC
TGGAACAATAGAGTCTCCATCAAATAAAGATGGGTCTGAACAGGTGATAA
CCCGCGCGCACTTATCAGGTAAGTTCCCTGATTTACCGACTACAACTAAT
CTATTTAAAGATTATCAGCTGGATGTTCAACAATTTAGCGAAGAAATTAG
CAAAGTTAACTGTGAGAATCCTGAGCTTATCGATTGCAATCTAGTGCTAG
ATATTGACGGTACTGAAGTTGATGGACCTAGCGCCCAAAAAATTAGGGTT
TCACTAAATACGAAATTAGCAGTGAAGAATAATTTGTTAGTGCACTATCG
TAGCTCAAGTGCCAAAGCCAAAGATAAGTTTGTTATGTATTTCCAGCAAC
TTGTCGTACAGGTATGGCAAGATCAAGCTATTGCCAATGAAACTAATATT
ACTGATGACAATCAAAGGTTACAGCAAGTGACTGAAACTATTGGTTTATA
TTTTAACACCAAAGCCCAGAAAGTAGAGCAGTTCAATGTGGCAAACATTG
CTGATGCAAAATCAAAATTGATTAATCTTGTTAAGATGTTTTTCAAAGGT
CAACAACAGGTATTGTTATTAAATGGTGAATTGGCAGATCAGGTATTTAC
TAAAAAACGAGGGCAACTCGTCGAGATGACACAAGCACGTTTTGAAGGTT
TATGGATAGGTGATATGAGCACGCGTGGTTTGAGTGATGATGATTACCTT
AGCTATTTTTGGCCAGAATGTCCGCAGTATCATAATCACCAAGCTGACAT
TGAGTTTATCTATCAAGACTTATATCAAGTAGTCGCCAAACAAGCCGCTA
AGAAAGCGAGTAAAACGACTGCTAAGCCAAGCAAGGAGGCTAAATAA
>CPS_2767 recD, exodeoxyribonuclease V, alpha subunit
ATGGTTGATAATAGTATGAATAAGCCAGTATACAGCCGTTTTAGCCAAGT
AAAAGACACTATCCAAGGTGTTGAAGCGATTGATTATTTCTTTGCTAAAG
AAATGCTCAGTCCGTTAACAGCTCTAACAAATAATCAATCACTCACAGAA
GATACAGCGGGATCAGGATCTGATACAACGGCTAATATAAGTTGCCAACA
TAACTTATACCATTTGTTCTTAGCCTTAAGTGCCAGCCTACGCGCAGGGC
ACAGTTGTTTACCTTTGAGTGAGGTTGCAGATCAACATTGGGGCAAAGGT
TTTACCTCCACCAAGAAAAAAAATAATGTAAATAAAGATAATCAGCAAGA
TAGTGAAGGACTTACTGAGGAACACACTCAAGAGCTCAGTCACGCTGGTT
TTGTTTTTGCGCCGTTAACGCAACTGCAAGTGATGTTAAGCGAGCTAAAT
ATTTTAGCATCTGATCAACAATTATTGGTTCTTCAACATGATAAATTATA
TTTGCGCCGTTATTTTCAGTTTGAAAGTGATTTGGGCGAAGCCATTCATG
CGCGGTTACTGCAGCAGTGCCAGTATGATAATGACAGCATTGGTCAGTGT
ATAGGCAAGTTATTCCCTAATGATTTAGCTCAAGTAGAAGCGCAAGACGT
CGAATCATTAGAAATTGATTGGCAAAAAGTCGCGGTAGCGAATGCCATTA
ATAAAAACTTTAGTGTTATTGCTGGCGGCCCAGGTACAGGTAAAACCTAT
ACCGTTACTAAATTATTAGCCGCTTTGGTTATGTTAGAACAAATGGGGTT
AGCAAAAACAGGAAAACAGCAGGCAGAAGTAGCACAGCAAAAACAGCAGG
GCACAGCTGTTCTTAATATTGCATTGGTTGCGCCTACGGGGAAAGCAGCA
CAACGCTTGTCAGAGTCTATTGTGAATGCAATCTCTGGTTTTAAAAATTT
GATTGATGACAAAGTGCTCGCTGAAATTCCCACGCAGGCACAAACACTTC
ATCGCTTATTAGGAGTATTGCCAAACTCACCAAACTTTAGGCACCACCAA
GATAATCGCTTACCCTATGATATTGTGCTTATTGACGAAGTGTCTATGGT
CGATTTACCTTTAATGACCCGAGTTTTTCGTGCGTTAAAAGACACGGCTA
AAGTCATCTTATTAGGTGATGCTGACCAACTACCCTCGGTAGCTGCCGGT
AGCGTGTTAGCCGACATAGCGCCTCGTCCACATGGTGGATTTAGTCTTGA
GAATGAACAATATTTAGCTCAAGTTTGTCAACTTTTGCCAGCTCAAGTTA
GCGATTATTTTTCAGCGCATAGACTACCTAGTCAAAGCGCTGAACAAAGC
AGCTTCGATTACTTAACCTTCTTAGTTAAATCAAGACGGTTTGACGGGAA
AGGTGGCATTGGTCTGATTGCTAATAGCGTTATAAAAGGGGATGTTAAAC
GTAGTTGGCGACTGCTTAACGATTCTCTTAGTCAGAGCACTCAAGAAGGT
TTCATTCAAGGAGACTATCTTCAAGCAGGCTATCTTCAAGGAGATAAAAG
CCAAAAGCAGCAACCGAGCCAGTTAACACTTGCCCAAGGGGATCTTACTA
CTTGGTTAGCACCGCTAGTGAAGCAATATTATCAACCGATTGAGCATTGT
TCTACTGTGAGCGATGCTTTTGTATTATTATCACAATTTAGAGTCTTATG
TGCTACTAGACAAGGTGATTATGGGGTTGAGCGACTTAATGAAGTGATCA
AAAGCTATTTAGGTAAAAACAACGCACCTTATCAGCAGCATCAGCAAACG
CTTTATCATGGTCAGCCTATTATGATAAATGAGAATGACTACCGCTTAGG
TTTATATAATGGTGATATAGGTATTATCTGGAAAGTGATCGACCAAGCAG
GTAAAACACATCTTATGGCGTGTTTTGAAGATACCACTCTTGAAAGTAAG
AGTGCAGAAAGTAAAGTGGATGAGAGTACAGAAACATCACAGCTAACAAT
CAGACAGATATTACCTTCACGTTTGCCTCAATTTGAAAGTGTTTATGCCA
TGACCATCCACAAAACCCAAGGTAGTGAGTTCTCTCATGTTGCTATGGTT
ATTTCAGCTACACAATCTGAGCAGCAGACCTTACAACAAGGTAAGCAACA
AGGTGGTAGTAGGTTATTATCTAGAGAATTACTTTATACCGGTATTACTC
GGGCGAAAAAGCAGTTAACCATTGCTGCTAATCAACGGGTCTGGCAACAA
GGGGTTACGGCACAAGTTAAACGCCATTCAGGTTTATATTTAGATTTTGA
TAAAGTCTAA
>CPS_0003 recF, DNA replication and repair protein RecF
ATGAGTGTTGCTAGGCTTACTACGTATAACTTTAGAAATTTATCATCTGT
TGCTATTGATTTACATCCCAAGCTTAATTTTTTTATTGGCAATAATGGCA
GTGGAAAAAGTAGTTTACTTGAAGCCCTTTTTTTTCTGGGTCACGGTAAG
TCATTTCGAACGAGTAAAGTAGAGCATCTTGCTTGTTACGAAACCGATAA
TTTTGTTGTCAGTATTAAAGATGTTAACGATTTACAACTTGGTTTAAGTA
AAAATTTACAGACCGGCGTTACGCTCATTAAAATTAATGGTGAGCGTCAT
GCACGTTTATCTGAATTGGCAAAAAATATTGCTGTGCAAATTGTCACTCC
TGAAAGTTTTAAATTGTTTTTTGGAGGACCGAAAGAGCGTCGACGTTTTA
TAGAGTTAGGTATGTTTCACGTGAAACATGATTCATCTAAACAATGGCGT
GAATTTAACAGAGTCTTAAAACAGCGTAATGCTTGTATACGACATAACTT
AGATAAAGCTACCTTTGATTATTGGACTGGTTTATTTTGTCAACTATCAG
AGCAGGTTGCTGAAGTAAGATCTCAATATATTACTAACTTAATTTCAGAA
TTACCTTATTGGTTAGAAATTTTGTTACCAAATATTGCTGATAAGGTAAC
TGTACAATATTTACAGGGTTGGCCACAAAAAAAGAATTTAATGGATTCGC
TGAACGATAGCCATGAGAGAGAACAAGCTTTTGGTTATAGTATTTATGGC
GCACATAAATTTGATGTGAAATTTCTCATTGCAAAGCAGGCATTAGAGAG
CCAGCTTTCAAGGGGACAACAAAAGTTGTTTTTACTGGCATTAACATTTG
CACAGGCTAAATTAATTGCAAGAGTTAATCGAGTAAAACCAATTTTACTT
ATTGATGATATAGGGGCAGAATTAGATATTAATTCTAGGGAATCCTTATC
ACAAGCGCTAAGTATTTTGGATTGCCAAGTTATTATCACGGCAATAGAAG
AAGGTGTATTACAACCTTTTATTGATGACGTTTCAGTTGCTGATAAAGAG
AGTAGTAAGAAAACAAAATATCATATGTTTCACGTGAAACATGGTGGTAT
ATTACCTGTGAATAATTCAGTTAAGATTGAGTAG
>CPS_4976 recG, ATP-dependent DNA helicase RecG
ATGGCACTGGAAGCGTTAAGCCGATTATCACAAGTTCCCCTGAGTACCCT
CAAAGGTGTCGGACCTAGTTTAGCGGAAAAACTAGAGAAAATTGGCTTGC
TGTCAGTGCAAGATATGCTTTTTCACCTGCCTTTACGCTATGAAGATAAA
ACGCGTATTACTACAGTGCGTGATTTATTAGTCGGTACCTCAACCAATAT
TATTGGTGAAATAACTGATAGCCAAATCACCCATGGTAAACGCCGAATGT
TGGTGGTTACTCTTCATGATGGCACTGGCAGTATTCAACTGTGCTTTTTC
AGCTTCTCCGCCAGTCAAAAAAACAGCTTAGCGATTGGCAAAACTATCCG
CTGCTACGGCGAAGTAAAACGTGGGCCACGTGGTTATCAAATTGTTCACC
CCGAATATAAATCCCTTGATGACGATATAGAATTAACCCCGGTTGAAGAA
ACCTTAACGCCTGTTTATCCCAGCACCGACGGTCTAAGACAAATATCCCT
ACGCAGTTTAACCGAACAAGCGTTGATTCGATTACAGCGAGGGCAAGTTG
AAGAGTTATTACCCGCGAATCTTTTTAATGAGCAGTATTCTCTCAGTGAA
GCGTTAACCATCATTCATCGTCCGCCACCCGAGGTATCGGTTGAGCAATT
AGAACAAGGTCGTCATCCTGCTCAGCAACGGTTAATTAAAGAAGAGTTAC
TTGCCCATAACTTAAGTATGCTTAAACTTAGACAAAATAGTGATATCCAT
GATGCGGTATCACTATTGGGTGATGAAAAGATCAGTCAAAAATTTTTGAA
CGCATTACCTTTTTCCCCCACTAATGCGCAAGCACGCGTAGTCGAGGAAA
TAAAAACTGACTTAGCTAAAACTCAACCCATGATGCGTTTAGTGCAAGGC
GATGTTGGCTCAGGAAAAACGTTAGTCGCTGCCCTTGCTGCATTAACCGC
TATTAGTGAAGGTTATCAAGTCGCTTTGATGGCACCTACTGAAATTCTTG
CTGAACAACACGCTATTAATTTTGCTAACTGGTTTACACCACTTGATATT
AGCGTCGGCTGGCTGGCTGGTAAAACCAAGGCAAAAGCTAAAAGACTGGC
GCTTGAGCATATTGCTAGTGGTGAGATGCAAATGGTTATCGGCACCCATG
CACTATTTCAAGCTGATGTAGTCTTTAAAAACCTAGTGTTAGTTATAATT
GATGAGCAACACAAGTTTGGCGTTCATCAACGCCTCACTTTACGTGAAAA
AGGCGTGTTCGATGATAAATACCCTCACCAGTTGATCATGACAGCAACCC
CTATTCCTCGTACCTTGTCTATGACCGCTTATGCAGATTTAGATACCTCG
ATTATTGACGAACTTCCACCCGGTCGTACCCCAATCAATACAGTAGCTTT
ACCTGACTTACGCCGCGGGGATGTCATTGAACGAATTCGCCAAGGTTGTG
TTAATGATGGTAGGCAAGCTTATTGGGTATGTACCTTAATCGAAGAGTCC
GAAGTATTACAATGCCAAGCTGCTGAAGATACTGCGATTTTATTACAAGA
GCAATTACCTGAGTTAAAAATTGGTTTAGTACATGGCCGGATGAAGGCCA
TTGAAAAACAAGAAGTGATGGATGCTTTTAAATCGGGTGATTTACACCTG
CTAATTGCTACTACGGTGATTGAAGTGGGAGTTGATGTACCTAATTCCAG
TTTGATGGTTATAGAGAACCCTGAACGCTTAGGATTGGCCCAGTTACACC
AATTACGTGGTCGTGTTGGCCGAGGCTCTGTCGCCTCTTTTTGCGTGTTA
TTATATAAGGCGCCCTTATCAAAAACAGCCACTAAACGCTTAGCAGTATT
ACGAGAAAGTAATGATGGTTTTGTGATTGCAGAAAAAGATCTGGAAATTA
GAGGGCCTGGGGAGTTACTCGGTACTAGGCAAACAGGTTTAGCAGATCTT
AAGATTGCCGACCTATTGCGTGATGGTTACTTAATACCTGAAATAAAGCA
AAAGGCCTATTTATTATCACGCCAACAACCTGAATGTGCTCAAGCATTAA
TTCAACGTTGGTTAGGTAATAAAGAGCGTTATTCTAACGCCTAA
>CPS_4094 recJ, single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ
ATGAGTAAAACAATTGTTCGCCGAGTGAAAGTAGCTACCGACCATTTGCC
TGATAACCTACCTGAAATCATAAAACAAATTTATGCTAGCCGTGGTATGG
AATCTGCACAAGAGCTTGAACTTAATGTTGCTCATCTACAAGGTATGGTC
GATGAAACAGCGCTTATGGGCATGGACAAAGCTTGTCAGTTATTACATGA
CGCGCTAGTGAATAAATTACGTATTGTTATTGTTGGAGATTTTGATGCCG
ACGGTGCGACTAGTACTGCTTTAATGATGACTGCATTGAGCCTGTTTAAC
AGTAACAATCATGACTTTATTGTGCCAAATCGTTTTGAATATGGCTACGG
CCTAACCCCTGAGATTGTTGACATTGCAGCACAGCAAAATACGCAAATGT
TAATAACGGTGGATAATGGCATCAGTTGTATTGCCGGTGTTAAACGTGCA
AAAGATTTAGGTATGCAGGTAATTGTTACGGATCATCACTTGCCAGGACA
TTCATTACCCATTGCCGACGCCATTGTTAACCCTAATCAGCATGGTTGTA
ACTTTCCGAGTAAAGCTCTTGCTGGCGTGGGGGTAGCTTTTTACTTAATG
CTAGCTTTAAGAAAGTATTGCCGTGAGCAAAACTATTTTTCAGAGCAAGG
TATTGCTGAGCCTAATATTGCTCAACTATTAGATTTGGTTGCTTTAGGTA
CTGTGGCCGATGTGGTTTCATTGGATGCTAATAACCGAATTTTAGTAGAA
CAAGGCTTGAAGCGTATTCGTGCAGGGAAAACTAGACCTGGCATTCAAGC
GCTTATTGAAATTGCGAATAAAAATCAGCAAAGGCTCGTTGCCAGTGATT
TTGGTTTTGCCCTCGGCCCGAGAATTAATGCTGCAGGTCGGTTAGATGAT
ATGTCTTATGGTATTAACTGTTTACTTGCTACTGATTTGTCTAGTGCTCG
TGTGATGGCTGCAGAGCTTGATGATCTCAATAAAACACGCAGAGAAATAG
AGCAGGGTATGCAAGCCGAAGCTGAGCAAGTACTTACTTCTCTCAAGTTT
GATGAAGATAATCTACCTAATGCGATTGCCCTTTATCAACAAGACTGGCA
TCAAGGTGTTATCGGTATTGTTGCTGGCAGGTTAAAAGAGAAATTTCATC
GTCCTTGTATTGTTTTTGCTAATGGCAAAGATGATGACTCAGTTGATGTT
TCCGAGAGAGAAATTAAAGGCTCGGCGCGTTCTATTCCTGGCCTGCATAT
TCGAGACTTATTAGAGCATATTGACAGTCAACACCCAGATATTATTCTTA
AGTTTGGTGGCCATGCAATGGCGGCAGGTTTATCTATAAAACACGGTAAC
TTTGCGCGTTTTCAGCAACTATTTAATGAATTAGCGGGTAAATGGTTAAA
AGAAGAAGATTTGCAGAGTATTATTTTATCTGATGGCGAGCTTATGCTTG
AACATCTTAGTTTAGATTTTGCCGAAAAATTGCGAGACGCTGGTCCTTGG
GGGCAAAACTTCCCTGAGCCATTATTTGATGACACTTTTAAATTGGTACA
GCAGCGTATTGTTGGCGAAAAGCATCTTAAAATAGTGGTAGAAAAACAGG
GAGAAATCTTTGATGGTATTGCTTTTAATGTTGATGTTAAGACTTGGCCG
AACGCTCAAGTAAAACAGGTACATTTAGCTTACCGGTTAGATGTTAATGA
ATTTCGTGGTAAACGCACGGTGCAATTCATGGTTGAAAATATCACAGCTA
TTTAG
>CPS_3825 recN, DNA repair protein RecN
ATGCTGCTGCAACTTAACATTCAAAATTTTGCCATTGTCCGTTCATTAGA
TATTGATTGGCAATCAGGTATGACGACAATTACCGGTGAGACTGGCGCGG
GAAAATCAATTGCTATTGATGCGCTGGGCTTATGTTTAGGTGATAGAGCA
ACCACTAATGTGGTTAGACCAAACTGCAAAAAGGCTGATTTAGCCGCCAC
ATTTGAAATAAAGAAAAATAAAATGGCGCGCGCTTGGCTAAAACAACATG
AACTCGTTTCTGAGCATGATAGCGAATGTATTCTTCGCCGTGTTATCTCC
GCTGAAGGCCGCTCAAAATCATATATCAATGGCAGCCAAGTGCCTTTAGT
GCAATTAAAAGAAATTGGACAGCTGTTAATTAATATCCATGGTCAACATG
ATCACCAGCTTATCGTTAAAGCGAATCAACAGTGTCGTTTGCTTGATAAT
TATGCCAACCACACACCTTTGTTAAGTGCAGTAAAACATTATGCCCAGCA
GTGGAATAAGCTTAATAAAGAATTAGAAATGCTGCAGCAAAGCAAACAAC
AACGTGAAGCTGAACAACAACTCATCCAGTACCAAGTAACTGAACTGGAC
GAATTTTCATTACAACCTGATGAGTTTTCAACACTAGAAAAAGATTATAA
ACGCCATAGTAATGCGCAAGATTTATTGGACTCAACGCTAAGCACATTAC
AAAGCCTATCCGAAAATGATAATTTCAATATCTTAGATGCACTTAGAGAG
TGTAGCGAAAATATCAATTCAATCGCACGCGTTGATAATCAATTAACTGA
TGTAGCCACTATATTATCAGATACCTTAATTCAATTAGATGAAGCAAATA
ACGATTTAACGCACTATTATCAGCAATTAGAACTAGACCCTCAAAATTAT
GCGATCATTGAAGAGCGTTACTCTACCGCAGTGCAGTTGGCCAAAAAACA
CCAACTGTCACCAGAAAATCTAGTTAACTTCCATAGTGAATTAAAACAAC
AGCTCGCTTCAATATCTAATGATGAAACCCGCATTGATACAATTATTGAA
GAATTAGAGCAGACTAGAATTCATTATAATGAAAGCGCTGAACTGTTATC
AGCATCAAGAGAAAAATCAGGTAAAAGCCTGAGCAAGCTGATCAGTAAAA
GCATGCAAGAACTGAACATGCCCCACGGACAATTCTTTATTGCCGTTGAG
AATAATAAAAAACAAGAAAATGGCAAAGAAACTATCAATACCAATGGTAG
TGATACTATTAGCTTTCAAGTTAGCATTAACCCAGGGCAAGCGCTTGAGG
CTATGCATAAGGTTGCCTCCGGTGGTGAACTATCTCGCATCAGTTTAGCT
ATGCAGGTTATTTTGGCCGATAAAGTGATCACGCCAACACTAATATTTGA
TGAAGTTGATGTCGGAATTAGTGGCCCAACAGCGGCTATGGTAGGTAAAA
AGTTAAAGCAGCTATCTAAAAATACTCAAGTAATTTGTGTTACCCATTTA
CCCCAAGTGGCATGTAAGGGACATCAACAACTCTTTGTGAGCAAATTGAC
TGATGGCGAACTCACTGAAACTAAAGTAAGTGAACTAAGTGAATCAAATC
GGGTCAAAGAAATTGCTCGTTTGCTTGCAGGAGATAAAATATCTCAACAC
AGTTTAGCAAATGCGCAAGAGCTATTAGCCAGCTAA
>CPS_4120 recO, recombination protein O
ATGATTGAACAAAACGCATTTGTTTTACATAGTCGCCCGTACCGGGAAAA
CCAGCAGTTAGTTGATTTATTAACAGAGCAAGATGGTAAGGTGACGGCTT
TAGTATATGTTGGTCAATCTAAGCGTTCTATAAAAAAAGGCTTAATTCAG
CCTTTTTTACCGTTAAAACTAACATTGAAAGGTCAGGGTAATGTTAAGTA
TATTACTCAAATAGACTCAATTTCAAAGTCATATTCGCTGGTAAAGTATA
GCCTGTTTAGCTCTTTTTATATCAATGAATTATTGATTCGTTTATTAACA
GAGCAAATTGCTTGTCAGCACTTATTTTCTCAATATCAAACAACTTTGAC
AGCCTTAGCTCAAGGCGAAGAAATTGCCCCGCAATTACGTTTATTTGAAT
TAGCGCTGCTTGAAGAGTTGGGATTGTCATTTGACTTTAGCCCTGTATTT
GAGCACGATGTTAATTACTTTCATTATATCGCCGAGCAAGGCTTTGTTCC
TGTATATGATCCTTTTCCAAAAAACAGCACTCAATGCTTCGATAAAACCC
ATTTACAAGCGATTGCCCAGCGGGGATCTCTATACCAAAATGGAATGTCT
GAAGACGTTAGTTATACTTTCAAGTTACTAATGAGACAGGTTATCAACCA
GTTGTTAGGGAATAAGCCATTAAATAGTCGTAAACTTTTTGCAAACAAAG
CATACAGTTGA
>CPS_0083 recQ, ATP-dependent DNA helicase RecQ
TTGAATTCCTCCGTTGCCAATGCCCAAACCAGTGCAGAAATCAGTACAGA
ACTGAGTGCAGAAAATAATGCCTTATTACTCGATACCTTAAAGCATTATT
TTGGCTATGAGAGCTTTCGTGAGGGACAAGCTAAAATTATCAATAGCTTG
TTGCAAGGGCAGGACTCCTTAGTCTTAATGCCTACCGGTGGTGGTAAATC
TTTATGCTATCAGCTACCCGCGGTACTGTTACCCGGTGTTACTGTTGTTG
TATCGCCGCTGATTGCCTTAATGAAAGACCAAGTAGATGGCTTAACTAGG
CAAGGGATCTCCGCTGCCTTTATTAATTCAAGTTTGGAACAAAGCGAAAT
CAGTGATATTTTCGCTCGATTGGGACGAGGTGAAATTAAATTGCTGTATG
TTGCCCCTGAGCGCCTCACTAATTATTACTTCTTACAAAGTTTGAACCAA
CTGCCATTGAGCTTATTTGCTATTGATGAAGCACACTGTATTTCTCAATG
GGGTCATGATTTCAGACCCGCGTACACCAAGCTACAGTGCTTAAAACAAA
ATTTTCCCACAGTGCCCGTTATGGCGTTAACTGCAACGGCAGATGTGACT
ACTCGTAAAGATATTTTGAACCAACTTGCGCTGCCAAATCCTTATATTCA
TCTTGATAGTTTTGACCGGCCCAATATTCGTTTTACGCTAGCGCCTAAAT
ATAATGGCGAAAAGCAATTGTTGGGTTATATCAAAAAGAAGGGTGAAGAT
AGCGGTATTATTTATTGTAACAGCCGCTGGCAAGTAGAAAAACTAGCTAA
GTATTTAGCTGCCAGTGGCATAAACTGCGCTGCTTACCATGCAGGACTAG
AAAACGAAATTCGTTCTCTAGTACAAGAAGGGTTCACCAAAGATAATATT
CAAATAGTGATCGCTACCGTTGCTTTTGGTTTAGGTATCAATAAACCTAA
TGTGCGTTATGTGATACATTTTGAGCCACCTCGTACTTTAGAGTCTTATT
ATCAAGAGATTGGCCGTGCGGGTCGTGACGGTTTAAATGCAGAAGCGCTA
TTTTTGGTTGATGATAAAGATGTCGCGCGTATTAAAAAACGTATTAGTGA
AGGCGATAATCCGCAGCGAGTGAATGTTGAAATGCAACGTTTTGCTGCCA
TGGATGCCTTTATTGATGCGCAAACGTGTCGTCGGCAGGTGGTACTGAAT
TACTTTGCCGAATATACCGAAAAAGGCTGTGGAAATTGCGATATTTGCTT
AGACCCACCAAGTCAGTTTGATGGCACCATAGAAGCACAAAAAGTACTGT
CATGCGTGTACCGTGTGGAGCAACAAGGTGATATTAATCATGTTATTGCA
GTCTTGCGCGGTGAACTCACTGAAAAAGTTAAGCAGCTAGCGCATGATAA
AGTCTCTACTTTTGGTATAGGTAAAGGAAAAACGGTGGGTTACTGGTTCT
CAATTATTGGCCAACTAATTCACTTAGGTTATTTACAGCAAGATATCGAA
CAACAATCTATTTTATGCTTAACACAAGCGTCGGGCGTGGTATTAAAAGC
GCAAGAGCCTTTGATGTTAGCAAGCCCGCGTCTGCAAAAAGCCAGTTACT
GGCAAGAAAAAAGCCCACAAAAAAGTTATGACCGTGTGTTATTTGCAAAA
TTACGCGAACTTCGTAAAGCCATTGCTGATGGCGAAGATATCGCACCTTT
TATTGTCTTTAATGATGCTACCTTGTCTGAACTGGCACGTATAAAGCCAA
AAACATCGCGTGAAATGCTCAGCATTAGTGGTATCGGAGACGTGAAGTTA
TCCCGTTACGGACAACCCTTTCTCGCGTTAATCAAAGAGCATAAGTAA
>CPS_3690 recR, recombination protein RecR
ATGAAATTTAGTCCACTGGTTCAAGAGTTAATTGATTCATTAAAATGTTT
ACCTGGCGTTGGCGCAAAATCAGCGCAGCGCATGGCATTTCAGTTACTTG
AACGTAATCGTCGTGGTGGTAGTAAGCTTGCCAATACCTTAGCGAAAGCC
ATGACTGATATTGGTCATTGTCAGCAGTGTCGAAACTTTACTGAAGAAGC
ACTATGTGAAATATGCCAAAGCCCAAAGCGACAACTTTCAACTACTTTGT
GTATTGTAGAAACGCCGGGTGACGTTATTGCTATTGAACAAACAGGTGAG
TTCTTTGGGAAGTATTTTGTCTTGATGGGGCATTTATCTCCTATTGATGG
CATAGGACCAGATGATCTAGGCTTAGATATATTAGCGAAGCAATTTGCTA
CAGGTCAGTTTAGTGAAGTTATTTTGGCAACTAATCCGACGGTGGAAGGG
GAGGCAACAGCACACTTTATTGCTGAGTTGGCTCAGCAACATCAAGTGAA
TATCTCTAGAATTGCCCACGGAGTCCCTGTTGGGGGGGAATTAGAATATG
TAGATGGCAATACACTCTCACATGCTTTATCTGGCAGAAAAAGCTATCAG
ATCTAA
>CPS_0300 rep, ATP-dependent DNA helicase Rep
ATGAAACTGAATCCCGGACAAAATGAAGCAGTAAAATTTGTGAGTGGTCC
ATGCCTTGTGTTGGCAGGCGCTGGCTCAGGTAAAACCGGGGTTATTTGTC
AAAAAATCGCCTACCTCATTCAAAAGTGTGACTACAAAGCACGTAATATT
GCCGCGGTAACCTTTACCAATAAAGCGGCACGTGAAATGAAAGAGCGTAT
TCAAAAAATGCTTGGTCGAGACCTAACTCGCGGTTTAACGGTTTCTACGT
TTCACTCGTTAGGGCTTGATATTGTTCGTCGCGAAATAAAAATTCTGGGT
TACAAGCCTGGCTTTACCTTATTTGATGATCAAGACAGCCTAGCATTACT
CAAGGAATTAACCATTGATGAACTTGATGGCGATAAAGACTTGTTGAGCA
AACTACAAAGCAAAATTTCAAATTGGAAAAATGACTTATTCTTACCTGAT
GATGCTCTAAAATCTGCAAGTGATGCTGACAGCAGTGAATATGCTGAATT
TTATCAGCGCTATCATAAACATATGAAAGCATACAATGCATTGGATTTTG
ATGATTTGATTCTGATCCCGACACTGTTAATGAAAAACTATCCTGAAGTG
CGTGAGCGTTGGCAGAACAAAATTCGTTATTTATTGGTGGATGAATATCA
GGATACTAACGCTAGCCAATATGAATTAGTTAAGAATATTACTGGTGAGC
GTGGTCGTTTAACCGTAGTAGGCGATGACGATCAGTCTATTTATTCATGG
CGTGGTGCTAAACCAGAGAATTTAATACTGCTTGGTAAAGACTTTCCCGC
GTTAAAATTAATTAAACTTGAGCAAAATTACCGTTCGAGTGGTCGTATCT
TAAAATGCGCCAATGTTCTGATTGCCAATAACCCGCATGTGTATGACAAA
GCATTATTTAGTGAACTTGCCTACGGTGTAGAACTTAGAGTAATACAAGC
GAAAAATGAAGAAAATGAAATTGAGCGTGTTATAGGCGAACTCATTGGTC
ATCGCTTTATGAACCGCAGTCAATATAAAGATTACGCGGTACTTTATCGT
GGTAATCACCAATCACGTTTACTTGAAAAAGCACTGATGCAAAACCGTAT
CCCTTATAAAATCAGTGGTGGTACTTCGTTTTTTTCCCGTCCAGAAATAA
AAGATGTCATGGCCTATTTGCGGGTACTGGTTAACCCTGACGATGACAAT
GCTTTCTTACGTATTGTGAATGTGCCTAAACGTGAATTAGGCCCAGCGAC
GTTAGAGAAATTAGGCACCTACGCCAACATGCGCCAAATTAGTATGTTTG
CTGCCAGTTTTGAACTTGGTTTAGAACAAACCTTAACCGGTCGCAGCTTA
ATGAAAATGCAAGCATTTACACAATGGGTTGTTGATATTGCTGATCAGGC
CGAACGAGGTGATACTGCCGCAGTATTACGCTCCATGATCCGTCAAATTA
ATTACGAAGACTTCCTATACGATACCTCGATGAGTGCTAAAGCAGCCGAG
ATGCGTATGAAAAATGTCACCGAGCTCTTTAGCTGGGTTACACAAATGCT
TGAAGGTAGTGATGACGAAGAGCCGATGACCTTACCGCAAATTGTTACTC
GTTTAACCTTGCGCGATATGATGGAACGAAATGAAGAAGAGGACAGTAAC
GATCAAGTTCAATTGATGACACTGCATGCTTCTAAAGGCCTCGAGTTTCC
CTATGTATTCTTAATTGGTATGGAAGAAGGTTTATTACCCCATCAAACCA
GTATTGATGAAGGCAGTGTTGAAGAAGAGCGTCGCCTTGCTTATGTTGGT
ATTACTCGCGCTCAGCGTGAATTAATTTTTACTTACGCTAGAGAGCGCAG
GCAATTTGGTGAATTGTCTCGTACTGAAGCTAGTAGATTTTTACATGAAT
TACCCCAAGATGACTTAAATTGGGAATTGGGCGCCGCAAAGAAGAAAACC
GTTGAGCACGTTGAGAAATCAAATCAACAAGGCATGGCAGGTTTACGTGC
CCAACTCGCTAAAGCTAAAGAAGCGAAAAAATAA
>CPS_0174 rhlB, ATP-dependent RNA helicase RhlB
ATGAAAAAAACACACTTAACTGAAACTAAATTCGCTGACCTAAATCTTGC
TCCGCAAGTAGTGACCGGATTAGAAGCCATGGGCTTCGATTATTGTACGT
CTATTCAGGCGAAATCTTTACCCGTTCTTTTGCAAGGCACTGATTTAGCT
GGCCAAGCACAAACTGGTGAAGGTAAAACCATTGCCTTTTTAGCCGCTAC
TTTTCATCATTTGCTTCAAAAAGAAGCTCCTACTCATAATCAACCACGTG
CCTTGATCATGGCTCCTACACGTGAATTAGCAATACAAATTCACCGTGAT
GCAACTGAAATGGCGAAAAGTACCGGATTACGCCTTGGTGTTGTATATGG
GGGCGAAGGTTATGAAAGTCAACGTTTAGAACTAGAAGCTGGTGTTGATA
TTCTTATCGGTACTTGTGGTCGTTTAATTGATTACATGAAGCAAGGTATT
TACAACTTAAAAAATATCGAAGTTATTGTACTTGACGAAGCTGACAGAAT
GTTTGATTTAGGTTTTATTAAAGATATACGTTATATGTTTGATAAAATGC
CTCCTGCAACAGAACGTTTAAGCATGTTGTTCTCTGCAACTTTATCATTC
CGTGTTAAAGAGCTTGCCTTTGACCACATGAACGATCCAACCAGCGTAGA
AGTAGAACCAGAGCAAAAAACTAATAGCCGTATCAGTGAAGAACTATTTT
ATCCATCAAACGAAGATAAAATGACTTTACTACAAACACTAATTGAAGAA
GATTGGCCAGAAAAGGCAATTGTCTTTGCAAATACTAAACATGTTTGTGA
AAAGGTTTTTGATCATCTAAATGCCGATAAAATTCGTGTTGGTTTGTTAA
CTGGCGATGTGCCACAAAAGAAACGTCTAAAAATATTAGAAGAATTTACT
GATGGTACAGTAGATATTCTTGTGGCAACTGATGTTGCTGCACGTGGTTT
ACACATTCCTAGCGTAACGCATGTTTTTAACTATGATTTACCTGATGACT
GCCAAGATTATGTTCACCGTATAGGTCGTACAGGTCGTGCTGGTGAAACT
GGTCATGCGATAAGCTTAGCTTGTGAACAATATGTTTTTAATTTACCAGA
AATTGAAACCTATATTGGCCATGATCTACCAGTAACAAAGTATGACCATG
ATGCTTTATTGACTGACCTTCCAAGACCTAAACCTCGTCAACGCCGCCCT
AGAACAGGCGCTAACAGACAAGGCGGTCGTGCAAACCCTAGACAAGGAAA
CCGTGGTAGTACTCCTAATCGCGGCACTCGTAGCTAA
>CPS_1569 rnhB, ribonuclease HII
ATGGCGAGTAAGCAAATTTTCCCTGATTTTGAATACCCTATCGCGTATTG
CATTGCGGGTGTTGATGAAGTCGGTCGTGGTCCTTTAGTTGGTGATGTGG
TTACAGCGGCGGTAATTTTAGATCCCGATAACCCGATTGAAGGATTGATG
GACTCGAAAAAATTATCAGAAAAGAAGCGTAACTTGTTATCCCTTGAAAT
AAAGGAAAAGGCAATCTCTTGGTCATTAGGGCGTGCTTCTCCACAAGAAA
TTGATACCTTGAATATATTACACGCCACTATGCTTGCGATGCAGCGAGCT
GTTGAAGGACTGAATGTTGAACCTGACTTTGTGCTTGTTGATGGTAATCG
TTGTCCTACATTCTTATGCAATGCCAGTGAAAGTAACCAACAAAATTTAA
AAATTGCTAGCCAAGCGGTAGTGAAAGGTGACGCTAGAGTTACTGAAATA
AGTGCTGCGTCTATTATTGCTAAAGTAGCTCGCGATAATGAAATGATAGC
CTTAGACAAACTCCATCCTGAATATGGTTTCGCCAAGCACAAAGGTTACC
CAACTAAACTTCATTTAGAAAAAATTATCGAGCATGGCGTACTGGATTGT
TATCGACAAAGCTTTAAGCCTGTCGCTAGAGTATTAGGTACATACCATGA
CTGA
>CPS_3473 rnt, ribonuclease T
ATGTCTGAATCAAGCTCTATAGATACCCAGCAAAAAAGCAATCCTAATTC
TGAAAAAGTAAAAAGCAAATTTTCTCAAAGATTTCGCGGTTACTTTCCCG
TTGTTATTGATGTTGAAACAGCCGGTTTTAATTCCCAAACAGATGCCTTA
CTTGAACTTGCAGCCTCAGTGTTACATTTAGATGAAGACACCGGTGATTT
TTCTATCGATGAAACAATACAATTTAACATTGAGCCGTTTGAAGGTGCAA
ACCTTGAACCTAAAGCGTTGGAATTTACCGGTATAGACCCAACAAATCCG
TTACGCGGTGCAGTTGATGAAGATGAAGCACTAAAAGATCTTTTTAAATT
GGTTCGAAAGAAAATGAAAGTTGCAGGTTGTCAGCGAGCTATTATTGTTG
CGCATAATGCAGCCTTTGATTTAGGCTTTTTAAATGCCGCTACCGAGCGC
TGTAAGATTAAACGCAGCCCTTTTCATAGTTTTGTTAGTTTTGACACTAC
AACGCTTGCCGGTCTTGCGCTAGGGCAAACCGTTTTAGCAAAGGCTTGTA
TCGCTGCAAAAATAGACTTTAACAATAGCGAAGCGCATAGTGCATTATAT
GATACTGAAAAAACAGCTGAACTATTTTGTCACATCGTTAATAAGTGGCG
AGCACTAGGTGGTTGGCCGATAGCTGTTGAAGAAACAGAAGTATAA
>CPS_2116 ruvA, Holliday junction DNA helicase RuvA
GTGATTGGTCGTTTACGTGGCATGCTTGTGGAAAAAAACTCTCCTGAAAT
ATTAATTGAATGTGCTGGCGTGGGCTATGAAGTCACCATGCCAATGACGA
GTATTTATGCCTTACCTGAGCTTGAACAGCAGGCAACTATTTATACTCAC
TTTGTTGTACGTGAAGATGCTCAATTGCTTTATGGCTTCGCCAATAAAGT
AGAACGTAAGTTATTCCGGTTATTAATTAAAGTTAATGGTGTAGGTCCTA
AATTAGCGTTAGCTATTTTATCAAACATGTCTGCTGATCAATTTGTTAGT
TGTGTTCGTCACGATGATATTAGCGCCATTGTAAAAATCCCGGGTGTTGG
TAAAAAGACAGCAGAGCGTTTGCTTATTGAAATGCGTGATCGTTTGAAAG
ATTGGCAAGCACAACAAATACACTTAGTTAGTGATGATGGCGTGATACCA
GAACAACTCTCTGCTGAATTGAGCCAAGAAACTACTTTTGTTAATGATAA
TAAAGGCGATGCTATTAACGCTTTACTTTCACTTGGCTATAAACAAGTAC
AGGCAGATAAAGCGGTTAAATCCGTATATAATCGCGGTATGTCTAGCGAA
AACATTATTCGCGATGCATTAAAATCAATGATATAG
>CPS_2117 ruvB, Holliday junction DNA helicase RuvB
ATGATAGAAGCAGATCGCTTAATTGAACCAATTGCTTCAGTAGAAGATGA
AAGGGTAGATCGTGCTATTCGTCCTAAAATGCTACAAGATTATACGGGGC
AACAGCATGTTAAAGCGCAAATGGAAATATTTATTCCAGCCGCAAAAAAT
CGTGGCGAACCTTTAGATCACTTACTCATTTTTGGCCCTCCAGGTCTTGG
TAAAACCACTTTAGCTAATATTGTTGCCAATGAAATGGGCGTAAATATTC
GCACTACTTCAGGACCGGTATTAGAGAAAGCCGGCGATTTAGCGGCGCTG
CTAACTAATTTAGAAGAAAACGATATTCTTTTTATTGATGAGATACATCG
TTTAAGTGCTGTGGTTGAAGAAATACTTTATCCTGCAATGGAAGATTATC
AATTAGATATTATGATTGGTGAAGGACCGGCAGCGCGTTCAATCAAGTTA
GACTTACCCCCATTTACACTTATTGGCGCTACCACACGAGCAGGTGCATT
AACGTCACCCTTACGTGACCGATTTGGTATTGTTCAACGGTTAGAGTTTT
ATAATGTTGCAGACTTATCAACTATTGTCAGCCGTTCGGCACATTTTTTG
AACTTAACAATAGATGAGGAGGGGGCATTTGAAGTTGCACGCCGCTCTCG
CGGCACGCCACGTATTGCTAATCGTTTATTACGCCGAGTACGTGATTATG
CCGATATAAAATCGCACGGGGTGGTTAATCAACAAACTGCCGCTGCTGCG
TTAGACATGTTAGAAGTTGACAGTGAAGGCTTTGATATTATGGACAGGAA
GCTATTACATGCCATTATTGATAAATTTATGGGTGGACCTGTTGGCTTGG
ACAATGTTGCTGCAGCCATTGGTGAAGAACGAGAAACTATAGAAGATGTA
ATAGAGCCTTTTTTAATCCAACAAGGCTTTTTGCAACGTACTCCGCGTGG
CAGAATAGCAACAGATAGAGCTTACCAACATTTTGGTATCACTAAAGATC
AAACTAAAGACTAA
>CPS_2115 ruvC, crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC
TTGACAATAATATTAGGAATTGATCCTGGTTCACGCTTTACTGGTTACGG
CGTTATCAAACAAGAAAAGCAACGTTTTACCTACCTTGGTAGTGGTTGCA
TTAAAGCGATGAGTCAAGGTGAAGATTTAGCTTCACGTTTGCAAACAATT
TTTGCTGGCGTATCTGAGTTAATTATTCAATTCAAGCCAGATATGTTTGC
CATTGAACAAGTTTTCATGGGGGTGAATCCTGGCGGAGCTTTGAAACTGG
GCCAAGCACGGGGTGCAGCTATTGTTGCGGCAACCAATTCAGGGTTAACC
ATCGCAGAGTATTCAGCAAGACAAATTAAGCAAGCTGTTGTAGGTACAGG
CGCAGCAGATAAAAACCAAGTACAGCATATGGTAAAAAGTATTTTAAAGT
TACCAGGTACTCCTCAGGCAGATGCTGCCGATGCCTTAGCGGTAGCACTA
TGTCATGGTCATAGTCATACCAGTGCCGCCATATTAGCCGGTCAAGCTAC
AAAAATCGTTAGAGGGCGTTTACGCTAA
>CPS_2014 sbcB, exodeoxyribonuclease I
ATGCAAGACAGAACATCTCAGAACAACACAGAACAACCATCAATCCTTTG
GCACGATTATGAAACTTGGGGAATAAACCCAAAATTTGATAAACCGTCTC
AATTCGCCGGCATTCGTACTGATCTCGATTTAAATATCATTGGCGAGCCT
GAAATGTTTTATTGCACGCCGCCCGTTGATTACTTACCACATCCTGAAGC
CTGTTTAGTTACAGGTATCACGCCACAAAAAGCGCAACGTGAAGGCTTGT
CTGAGGCTGAATTTGCTGCACGTATTCATACTTTATTTACTCAGCCCAAT
ACCTGTGTTGCTGGCTATAACAGTATTCGCTTTGATGATGAGGTGACTCG
TTATCTGCTTTATCGTAACTTTTATGACCCTTATGCACGTGAATGGCAAA
ATGGAAATAGTCGCTGGGATATTATAGATATGGTTCGTGCTTGTTATGCA
CTTCGTCCTGAAGGCATTAATTGGCCAACCGTTAAGCGCGATGGTGAAGA
AGTCATCAGTTTCCGTTTAGAGCTATTAACGGCAGCAAATGACATCAGTC
ATGAAGCGGCCCATGATGCGATGAGTGATGTTTACGCCACCATAGCAATG
GCTAAATTGATCAAAGAAAAACAACCAAAACTTTATGATTTTATCTTTAA
CTTGAAGAATAAAAATCAAGTGAAAGATTTGATCAATACCGCAGAGATGA
CACCTATTGTGCATACTTCGAGCAAAGTATCATCAGCTCATGGCTGCACC
AGTTGGTTTGCGCCAGTAAGTTACCACCCAGTTAATAAAAACGCGGTGAT
CTGTGTCGATTTAGCACGAGATATATCACCTTTATTAACGCTTAGCAGTG
AAGAGATTAAAGCGCGTTTATATACCCGTTATGACGATTTAGCGCCAGAT
GAACTACCAATTCCAGTAAAACTTATTCATGTCAATAAATGCCCTGTTAT
AGCGCCAGCTAAAACGTTACTACCAGAAAACGCAGAGCGCTTAGCAATAC
CGCGCGATGTTTGCTTAGATAATTTAGCTCTATTGAGAAAGCATGCTGAA
CTAAGAGATAAATTAAGCGATGTTTTTGCCACATCAGACTTTGATAATGA
TGACGTAGATGCAGAGCAAGCGTTATATGGTGGCAGTTTCTTTAGTCATA
GTGATAAAGCGCAAATGGATATTTTACGTGGTCTATCACCTGAGCAACTA
GCTAATCATCCATTTCAATTTCAAGATGAGCGTTTAAGTGTATTACTGTT
TCGCTATCGAGCAAGAAACTACCCGTACACGCTATCTACAGAAGAACAAC
AGAAATGGCAGCAGTATTGTCAGAACAAACTGCAATATGGCGGGAAAGGT
ATTTTATCACTTGATGAGTTCATGATGAAGATTGAAAATCTAGCCCATGA
GCATGAAACTGATAAAGCAAAAATGTCGGTATTAAAAGCCTTGTATGAAT
TCTTGCAAGGGTAA
>CPS_2848 sbcC, exonuclease SbcC
ATGAGAATATTAAGTTTACGCTTTGAGAACATCAATTCACTCAAAGGCAG
TTGGAAAATAGATTTTAGTGAAGCTCCTTTTGATAACAATGGTTTATTTG
CTATTACCGGTCCTACTGGCGCAGGTAAAACCACTATACTCGATGCCATT
TGTTTAGCGCTTTATCATCAAACACCGCGTTTAACTGTGTCTAAAAAACA
GAATCAGTTAATGACTCGCCACACCAGCCATTGTATGGCTGAAGTTGAGT
TTGAAGTGAGAGGTCAAGGTTATAGAGCTTTTTGGAGTCAAAAACGCGCC
CGTAATAAACTTGATGGTAACTTATTAGAGCCTGTTGCAGAGTTAGCTAA
ACTCGATGGCACCATAGTGTCTGATAAGCTTAAAATGGTGCGTAGTGATA
TTAGTGAGTTAACAGGGCTTAACTTCTCACGTTTTACCAAATCTATGATG
CTATCTCAGGGAGAGTTTGCTGCCTTTTTAACATCACAACCGAATGACCG
TGCGCAATTATTAGAGCAGCTTACCGGTACTGAAATATATGGCGACATAT
CTAAGCAAGTTTTTGATAATCATCGCAGTGCCAGTGAAGCGCTAAAACTT
TTACAAGCGCAAAGCCAAGGTGTTTCTTTGCTTGATGATGAGCAAGTAAA
GGCGCTTGAGCAACAATTAACAGAAATTACCGAACAAGAGAAAACGGTAA
ACGCGCAATTACAACAAGCGCAACAAGTTAAAGCCTGGTGCACTAATTTT
TCGGTCAATGAACAAAACCAGCATGCAGCGAAAACACAACTACTTGAAAT
AGAAAAGAAAGAGTTAGCCGCAAAACAAGATCTTGATTTACTGACGCTGT
CGTCTTTAGCTGAGCCGATTAAAGCACCGTACGAAAAGATGGTACATTAT
CGTGAGCAATACCAGCAAACCTTACAACAAGTAACTAGTCAAACAGAACA
ATTGGCGATACTTGACCAAGATATTGTTGTGAGTGATGAAGCGTTAACGC
TACTAAAAAATCGTCATGTTGAGGCTGAAGCACAACGCAAAGTAATTGAG
CAAGTATTGCATGATAAAATTCAACCACTTGACCATAACATTACCCACCA
ACAAAATGCATTAACCGAAACAAAAAACACCATAGCCGAACAAAGCGAAA
CACTTGGTGTGAATGCTAATGCGTTGACTGCCTTAGAAGCAGAGCATCAA
AAAGCACAAGAGACTGTTCAACAGCAACAAGCGTATTTATCGCAAGGGCA
GGCGTTAGCAAAATTGCCAGAAAAATTGCCTTTATGGCAAAACCAATATC
AGCAGTTAAGTCAACTACAAGCTAATGTTGTGGCGTTAGTTAACGAGCAA
GACAATACCGAAAAAGCGTTATTAACCTTGCAAACTCGACAACAAGAGCA
ACAACTTCAGATCACGCAAAGTGAAGATGAGTTAAAGCAACTGAATAGCC
GTAAACAGCTGATGGGTGAAAAAACACAGCAGCTAATTCAGCATAGCCAA
GCAGCTCAGGCGATCCTATCAAGTAGGGTTACTAGTACTTCCACTAGTAC
TGGAAATAATGATAAAGGTGAAGGTGTCGTTAACGAGTTAACCGGTGGCA
TGCTCAATCAAGCGATTCTAGACCGTCAAAATCAGCAACTTGCTTTAAAA
CAAGCACAACAGTTGGCGCAGCGTTTTCATGTCCTTACACAAGAGCAACA
GGGGTTATCTGCGCAGCAGAGTCAAGACAAGCAACAGCTGGTTATCACTG
AGCAAGCGCTGGTAAAACTTCGTCAACGTTATAGCGCTACTCAACAGCAG
AAAAAAGATGTAGAAACCTTACTTGCTCAGCAGCAAACTATTATGGCGCT
GAGTGAACATAGAGCAAAACTTCAGCCTGAAGAGTCTTGCCCATTGTGTG
GTTCAACAGATCACCCTGCGATTAATGAATATCGATCCCTTGACAGTGAC
GAACATCAACAGCGTTTAAGCCAATTAACACTTGAGCGAGCGCAACTTGA
AAAGCAAGGTAAAGAGCTAAATGGCGTTCAAGCAAATTTAACTGCGCAAC
TTGAAATGCAGACAAATCGTTTGCAAGGCATAACAAGCGAACAAAGCAAT
TTAGCGCAAAACTGGCAATCGCTAAATATTAATCAGTACGTTTTATTAAG
CCAAAATGAACAGTCATTTTCATTACAAAATGTTGATGTTGAACAGTCAA
TTAATCATCAGCTAACGATGGTGTTTGGGCAGCTTGAAGAGTTACTTTTA
TTGCAAACGTCACTGCAAGAAAATAGCCAGAACCAGCAACAAAACAGTGA
GCAAATTAGCCATTGTGAAAAGCAGTTGTCGACGCTATTTAATCAGCTAC
AACTATTGGAAGAACAAGGTAAGAATCAACAAGGTTCAAAACAAAAGTTT
ACTGAAGAATTACGCTTGAAACAACAGGCGTTTTTGGAGCTGAATGCTCA
GTTGTTAGCTGACATTAAAACGACTGAAATAACACTGCCTCTTGGTGGCG
TAAATGAGAAAATAAAGGAGCAAGACCAGGAACAAAATCTGGAACAAGAA
CAAGCGCGGAAGCTAGTCATTTGTATTGATGAAAAGTGGCTTGAATCATT
GAGTAAGCAGGGCGCTGATTATCAGCAAACCGTGACGACTCACCAAGCGG
CTAAAACTCAGCTTGATAGTCTTGTAAATGACCTCGGGTTGTTAAAGCAG
CAAGTTGTTCATCAACAAAATCAAGTTACCCAGATAAAAAGCCAATTAAC
GCAACAAGAGAACGATTTAATACAAGATTATTCGTTACGCGTTACTCACT
TTGTTGAACTGGGTATTACAGGTGAAGATATGCAAGACTCTGTTTTATTA
AGAGAAAGTATTAATAGTCAACGAGAGTTGAGTGAAGCTGAGTTTACTGT
AGCTGATCAACGCCATAATGAGAAAAAAGCAGCTCAACAGCTTAACAGAG
GACAGTTAACCACCTCGAAATCTTTATTGGATAATCTATTTCCTAAAAAT
GACAATGCAAAAAAGGACTGGTTAGCATTACTTACTGACAGTAAGTTTAC
TGATGAGGAAGAGTTCTTATTAGCGCTACTTAGCGCCGAGAGAAAGCATG
ATTTAACTAAGCTCGCAAACGACATTGACGATAGTAAAAAACAAGCAAAA
ATCTTGCTGTCACAAAGTGAAAAAATAACCCTTGAATTGAATGTTCAAAA
AGATACGTTGAGTGAAAAAGGGGCTGTTGATTTTGTTGAAAGTTCAGTAT
CAGAATCATTGGTAAATTTGTCAGATTTGTTGAAACAATGTCAGCAAAAT
ATCGGGCAGTTTAGCCAACAAATAGAACAAGACAATAGTAACAAAATTCA
ACAGAAAACCTTGCTAGAACAAATTAAATTAGCACAAGATGCTTTGGATG
ATCTTAGTCACCTTAATGCACTTATTGGTTCAGCTGATGGTGCTAAATTT
AGAAAGTTTGCACAAGGCTTAACACTCGCTAATTTAGTCCATCTTGCCAA
CGCACAATTAGAACGTCTCTTTGGTCGCTATCAACTTCAATGCCAACAAA
ATGATACCTTAGAATTAGAGGTACTCGATACCTGGCAAGGGGATACTGCG
CGTGATATTAAAACTTTATCTGGCGGTGAAAGCTTCTTAATAAGTTTAGC
GCTCGCTTTAGCACTATCTGATTTAGTCAGTAATAAAACCAGTATCGACT
CTCTCTTCCTCGATGAAGGTTTTGGCACCTTAGATAATAACACCCTTGAA
GTAGCACTTGATGCGCTCGATAACTTAAATGCTAGTGGCAAAATGATTGG
TGTGATCAGCCATGTTGATGCCTTAAAAGAACGCATTGGCGTGCAGATTA
AAGTTAAAAAACTCAGTGGCCTGGGAGTCAGCAGTTTGGATAAACAGTAT
GAGTTTCATGCTGAAACTGTTAGCTAA
>CPS_2849 sbcD, exonuclease SbcD
ATGCGCATTATTCATACCTCAGATTGGCATCTTGGCCAATATTTTTACGG
CAAAAGCCGCGCCAATGAACATCAACAATTTCTTACCTGGTTATTAGCTC
AAGTTACTCTGCATAACATTGATGCGATTATTGTAGCGGGTGATATTTTT
GATACCTCAACACCGCCAAGTTATGCCCGTGAAATGTACTTTGATTTTAT
TGCCAAGCTCCATGTGACCCAATGCCAGCTCATTATTTTGGCCGGAAATC
ATGATTCTGTCGCTATGTTGTCTGAGTCACAAGCCGTATTGGCAAGCTTG
TCTACCCGTGTTATTACGCAGGTAATACCTGCGTCATTGAGTGAAGATGA
GCTTGAAGAGAAGGCACTTTCAAAACAGGTTTTTCCATTACATGATGCTG
ATGGGAAAACCACAGCCATTATTTGCGCCATTCCTTTTGTTCGTCCGCGT
GATGTGATCAGAAGTCGAGCAGGGCAGTCGGCAAGTGATAAGCAGCAAAG
TTTACAACAAGCGATTAGCGATCATTATCAGTATTTATATCAACAGGCAC
GCAAGCAAGCTGACGCGTTTGAAAAAACGGAGGGCATTGCCTTACCCATT
ATAGCAACCGGGCATTTAACGGCGCTTGGCGTATCAATAAATGACAGTAA
AAGTGATTCCGTAAGAGATATTTATATTGGCTCGTTAGAAGCTTTTCCAG
CCAGTGCCTTTCCCCCAGCCGACTATATTGCTCTTGGCCATATTCACAGA
GCACAACAGGTGGCGAAATCAGAACATATTCGTTATTGCGGCTCGCCTAT
TGCGTTAAGTTTTGATGAAGCCAAGCAAGATAAACGAGTGCTGATGGTTG
AGTTTACGTCAGGGAAACTTAATCAAGTTGAAGCGCTTATTGTGCCGTGT
TTCCAACCACTATACATGGTGAAAACATCGGTAGATGAGCTTGAAACTTC
ACTTCAAGAAACACTGGTCGCATTTGAAGAACGCCAAGTAGCGGAAAAGT
TTCCTGCGAGTGTTAAGGCTTGGCTTGATATTGAAATTGATAATGGTGAT
CACTTAAGTGATTTATCGCAGCGAGTCACTGAACTAGCCGTTGATATGCC
TTTTGAAGTGTTATTGGTTCGTCGATGTAAAAAGGCGCGTCAACGACGAC
AAGCGCAATTATCGCAGCAAGATAACAGCACCTTGAGTGAGTTATCGTTA
ACAGAAGTCTTCGATTCACGCTTATCTCAACTTGAATGGCAAACGGATGA
AGAAGTCGCACGTAAAACACGGTTAACACAATTATTTACAGAACTGTCGG
TGGAAATGAAACAAGCCGCTTCTATTGCGAATCAAAAAAGTGATGCGGAT
AAAGCGCTAATTACTAGTTCATCAGCCCAGGCAGAGTCGACATCGCAAAG
TGCTTTATCAGAAGAAGAGAGCACAGAAGCTGAAAAAGACAGTGTTATCA
CCGAAAAAGACAGTGCTATCGCTGAAAAAGACAGTATGACGCCTGAATCA
CTAGAGCAACACAATTCATGA
>CPS_1580 seqA, seqA protein
ATGAAAAACATCGAAATAGATGAAGAGCTTTACCAATATATTGCCACTAA
TACTCAGTTTATTGGTGAGAGTGCTTCTGCCATTTTACGTCGTTTGCTAA
ATTTGGGTGTCGAAGCCAAACTTGAAACCGTTACCGTTAATGAACCTTCA
GATGTGGTTGAAGTAAATATTCTTCCTGAGTCTGAAGAGAAGGCAGTGAA
AATTGAAACTGCTGAGGTTAAAGAACCAAAAAGTAAAGCTGTTGTTAAGG
TTACCGCTGAGAGCCATGAAACAGTGTTTAACTTTATCAATAAAGAAGAG
TTGGCAATGCAGCGTGGTGCTGTGGGACGGTTTTTATTAATTCTTGCCGC
ATTATATCGTGCTCATCCAGACCAGTTTGGTGTAGTAACAGATATAAGTG
GTAGAGATCGCTTATATTTTGCTAATAGTGAAAATAAATTAGCAGAAAGT
GGCAGTAGTACTAAGCCTCGCCAAATACCAGAAAGTCCATTTTGGGTCAT
AACCAATTCTAACACCACACGTAAAAAAATGATGTTAACTAAAGCCTCAA
TCTCATTGGGTTATAGTGACAGTGATGTAGAAAAAATTCGTGAGTTACTT
TAG
>CPS_4097 srmB, ATP-dependent RNA helicase SrmB
ATGAAATGGGTATTATTAACTCTTAGTGAACTATCCCTTATGTTTGAGCA
ATTCGATCTAGACTCAGAATTATTAGCCAGTATTAATAAAATTGGTTACA
CCAAACCTACCTCAATTCAAGAACTTGTCATCCCTCAAGCGATGGTTGGC
AAAGACGTATTGGCATCAGCGCCGACTGGCACAGGTAAAACTGCCGCATT
TTTATTACCTATTGCTCAGCATTTATTAGATTATCCACGTACCAAACCTG
GTTTCCCGCGTGTATTAATTTTAACGCCGACTCGTGAGTTAGCGATACAA
ATAGGTGAAGACAGTGAACAGCTTACCGAGTTAACGAAAATTAAAACCGG
CGTTATTACCGGTGGTGTTAACTACGGTAGTCATGCTGATATTTTAACGA
GCACAACCGATATTTTAGTCGCCACACCAGGTAGATTATTAGAATATATT
GAAAATGAACAGTTTGATGCCCGTGAAATTGAGATATTAGTGTTAGATGA
AGCTGACCGCATGCTCGATCTTGGCTTTAGTGAAACCATTAATCGCATTG
TTGCTGAAGCACGCTGGCGTAAGCAAACCATGTTGTTTTCAGCGACTCTT
GAAAGTCCAGGCGTACAACTTTTTGCCGAAGAAGTGCTTAATGAGCCAGT
TTTCTTAGAATCAAAACCATCTCGTAAAGAAAAAGCCGTCATTCATCAGT
GGCTTCATTTAGCAGATGATGCGAACCATAAGCTAAACCTACTAGTAAAC
ACCTTAAAACAAGAAGGCGTAGAACGTACCGTTGTTTTTGCTAATAAGCG
TGAAACCGTGCAATACCTTTCAGGTAAGCTTTATGCTGAAGAGTTACCTT
GTGTTTGGTTAGAAGGAAAAATGCCACAAGATAAGCGTAACAAAGCAATA
GAACGTTTTAAAAAAGGTGAAGTTAAAGTGTTGGTGGCAACAGATGTTGC
AGCACGTGGTCTTGATATAGATGATATCAGTCATGTTATTAATTTTGATA
TGCCACGTAAGGTCGATATTTATATTCATCGAATTGGCCGTACTGGTCGC
GCAGGTAAAAAGGGTACAGCTATTTCCTTAGTTGAAGCCCATGATATGGG
TGTTATTGGTAAAATAGAACGTTATACCAAAGAACGCCTGTCACGCCGAT
TTATTCAAGAGTTAAGACCAAAAAACAAAGAATCTCGCGTGGTAAATAAA
AAGGCAAAAATTAAACTTACGACCTCTCAGAAAAAAGCTAAAACCAAAAA
ACAAGTGAAGAAAAAGGCTAAGCGAGCAAAAGCAGCTAAGTAA
>CPS_0930 ssb, single-strand binding protein
ATGGCGGGTGTAAATAAAGTAATCATAGTAGGTAACTTAGGTAAAGATCC
TGAGGTACGTTTTATGCCAAATGGTGGTGCAGTAGCAAATATTACTGTTG
CAACGTCAGACTCATGGAAAGACAAACAAACTGGTGAGCAGAAAGACAAA
ACAGAATGGCATCGTGTTGTTATGTTTGGAAAACTTGCTGAAATTGCTGG
TGAATACTTGAAAAAAGGTTCAAAAGTATATCTTGAAGGATCTTTGCAAA
CGCGTAAGTGGACCAACCAACAAGGTCAAGATCAATATACGACTGAAATC
GTATTACAGGGCTTTAATGGCGTAATGCAAATGTTAGATGGAAAGTCGTC
TCAAGGTCAGGGCGGTGGTTTTGCTAATCAAGGACAACAGCAAAGTGGTG
GCTTCCAGCAACAAGCTCCACAGCAATCGGGTGGATTTTCTAACCAGCCA
GCTCAACAAGGTGGATTTTCTAACCAAGGACAGCAAGCAAAAGCACCAGC
ACAACAAGGTGGCTTTGCTCCGCAACAACAAGCACCAGCACAACAAGGTG
GCTTTGCTCCGCAACAGCAAGCACCAGCACAACAAGGTGGTTTTGCTCCT
CAACAAGCACCAGCACAACAAGGTGGTTATCAGCAACAGCAAGCACCTAA
AGTGAACCCACAAGAACCATCAATTGATTTCGATGATGATATCCCGTTTT
AA
>CPS_2351 tag, DNA-3-methyladenine glycosylase I
ATGTCAGAAAAAAACACCTGCCGTTGCCCCTGGTTAGACACATCAAAGTT
AGATTATGTTAAATACCATGATGAAGAATGGGGTGTGCCAGTATATGAAG
ACAAAAAGATGTTTGAATCATTGGTATTAGAATCAGCGCAGGCTGGTTTA
AGCTGGTATACCATCTTAAAGAAGCGTGAGGGTTATCGTAAGTTGTTTGC
AGACTTTGAGGTAACCAAGGTAGCAAAGTTCACTGATGATGATGTAGAGC
GCTTAATGCAAGATGCTTCAATAGTACGTTACCGACGTAAAATTGAAGCA
GCGATTAATAATGCGAATAGATTTATTGAAATACAGAATGAATTTGGTAG
TTTCACCAAGTTTATTTGGTCATACGTAAACAACGAGACTATTGTAAATA
ACCTTGATACGATTAAAGATTATGTCGCTACTTCGCCTATTAGTGATGCG
TTAGCTAAAGATTTAAAAAAACGTGGCTTTAAGTTTCTCGGTCCAACGAC
ACTGTACTCACACTTACAAGCAACAGGTTTAATCAACGATCATTCAAACA
GTTGTTTTAGAAAGAATGCCTTTAAACTCTTGTAA
>CPS_0167 tatD, deoxyribonuclease TatD
TTGATAGATATAGGCGTTAACTTAACCAATAAACGCTTTGAGAAAGATCG
CGAAGATGTTATTCGACGAGCTCAAAAGGCTCAATTAGATGGTTTGTTGA
TTACCGGTACTAGTGTTGCAGAAAGCCAGAAAGCGTTAGCTTTGTGTCAG
CATTATCAAACAAGTTTCCCTGACTTTTTATTTAGCACTGCAGGTGTGCA
TCCCCATGATGCTGATCATGTGACTGCTGACTATTTAGAGCAACTCAAGC
TATTAGCGAAACAACAGCAAGTTAAGGCCATTGGTGAGTGTGGTTTAGAT
TTTAATCGAAATTTTTCAGCACCTGCACAACAGCAAAAAGTGTTTAGTGA
ACAAGTAGCTTTAGCTTCAGAACTGCAAATGCCACTATTTTTACACCAAA
GAGATGCTTTTGAACCATGGTTTTCTACGTTATCACCCTATTTTTCTGAA
GTTCCGGCTATGGTTGCGCATTGTTTTACTGGCACAAAATCTGAGCTCAC
TCAGTGTATAGCCGCAGATATGTATATAGGTATCACAGGTTGGTTATGTG
ATGAGCGTAGAGGTCAAAGTTTACGAGATATTGTAAGTCTAATTCCTTTA
AATCGATTACTCATTGAGACTGATGCTCCGTATCTAACACCTCGAACAAT
TCGACCAAAACCTAAAAGTAGCCGTAATGAGCCGTGTTACTTACCATTTA
TAGTCAAAGAAATTGCCAGTATTACAGGTCTTGACCAAGAAGAGATAGCT
TGGCAAACTAGCCGTAATGCCGCAAAGGTATTTGATTTTCCATCAAAGAA
AGAAATGATATAA
>CPS_1197 topA, DNA topoisomerase I
ATGGCAAAATCACTAGTTATTGTCGAGTCGCCAGCCAAAGCGAAAACAAT
TAATAAATATCTAGGTAATGACTTTATTGTAAAGTCGAGTGTTGGTCATG
TACGTGATCTTCCGCACAGTAGCACAGGTAAAAAAGTTGCTGCCAAGTCT
CCAGCGGAAGTGCGTAAAATGGAACCAGCAGCAAAAGCTAAATACAAAGC
CAAGCGTGATAAACAAGCGCTGGTTAATCGTATGGGCATTGACCCAGATA
AAAACTGGGCAGCCGATTATCAAATACTGCCAGGAAAAGAAAAAGTTGTT
GCTGAGCTTAAAAAGTTAGCGGATAAAGCAGACATTGTTTATCTCGCAAC
GGATTTGGATCGCGAGGGAGAAGCGATTGCTTGGCATTTAAAAGAGATTA
TCGGTGGGGAAGATGAAAAGTTCCGTCGTGTTGTCTTCAATGAAATAACT
GAATCATCAATTCAACAGGCGTTTGCTACACCGGGTGAGTTGAGTATGCC
GGGTGTTAATGCTCAGCAAGCAAGACGTTTTCTCGATCGTGTGGTTGGCT
TTATGGTCAGTCCATTATTGTGGAAAAAAGTAGCCCGTGGTTTATCTGCC
GGACGTGTTCAATCTGTTGCTGTAAAATTAGTCGTTGAAAAAGAACGTGA
AATCAAAGCATTTGATCCCAAAGAGTTTTGGGAAATTGCCGTAGATACGC
ACGCATCGACAGGTGAAGTACTAACCCTTGATGTGACCCATGAAAATGGC
AAAGCGTTTAAACCGACTACTGAAAAAGAGACCAATGCTGCTTTAGCAAT
ATTAAAGCCAGCGGATTATGCTGTTAGTAAACGTGAAGATAGGCCGTCAA
AAAGTACACCATCTGCACCGTTCATTACCTCAACGCTACAGCAAGCCGCC
AGTACTAAACTGGGATATGGTGTCAAGCGTACTATGGGCTTAGCCCAGCG
TTTGTACGAAGCCGGTCATATAACTTATATGCGTACCGATTCAACAAACT
TAAGTAAAGATGCGGTAGAAATGTGTCGTAAGTACATCAGCGATAGTTTT
GGTGATAATTACTTACCAGAAAATGCAAAAACTTACGGTTCTAAAGCGGG
GGCACAAGAGGCGCATGAAGCCATACGCCCATCAAATGTTAAGCTTGAAG
CTGCATTTCTTGAGGGTATTGAAGCCGATGCGAAGAAGCTGTATGAGTTA
ATTTGGCGTCAGTTTGTTGCCTGTCAAATGACCGCTGCTCGTTATACTGT
TAGTACTTTAACTATTAGTGCTGCTAGCTTTGACTTAAAAGCTAAAGGCC
GAGTGATGCAATTTGATGGTTGGACAATTGTTCATCCACAACTGAGTAAA
GGTGATGATACACACTTACCTGATTTACAAGTTGGCGAAGCGTTAACGTT
AGATAAAATCGAACCAAGCCAGCATTTTACTAAGCCACCAGCACGTTTTG
GTGAAGCTTCTTTAGTTAAAGAATTAGAAAAACGCTCAATTGGTCGTCCG
TCAACTTATGCGTCAATTATTTCTACGATTCAAGATCGTGGTTATGTTCG
GTTGGACAAAAAACGTTTCTATGCTGAAAAAATGGGTGAAATTGTTACTA
ACAGTTTATCTGGTAGCTTTGAAAAGTTAATGAGCTACGAATTCACGTCG
AACATGGAACAAGAACTTGATGAAATAGCAGGTGGTAGTGCTGATTGGAA
AGGGGTTTTAGACGAGTTTTATAAAAACTTTACCAAACAATTATCAAAAG
CTGACCAACCCTCTGAAGATGGTGGTATGCAAACCAATGAACCAGTATTA
ACGGATATTGATTGCCCTACCTGTAATCGTAAAATGGGCATTCGAACCGC
TCAAACAGGTGTGTTTTTAGGCTGTTCTGGATATGCTTTACCACCAAAAG
AACGCTGTACAAAGACTATGAACTTAACCGCTGGTGAAGAAGCGGTGAGT
ATTTTAGCTGAAGATGCTGAAACTGAAGCGCTCATGGCAATGCGTCGTTG
TGATAAATGTGGCACTGCGATGGATAGTTACCTTATTGACGAAACACGTA
AGTTGCATGTTTGCGGTAATAATCCCGTATGTGATGGCATTGAAGTTGAA
AAAGGCGAATTTAAAATTAAAGGTTATGATGGACCAATTTTAGATTGTGA
CCGTTGTGAATCGCCGATGGAGTTGAAATCTGGCCGTTTTGGTAAGTATT
TCGATTGTACCAATGAAGAATGTAAAAATACTCGTAAGTTACTCGCCAGT
GGTGAAGCTGCGCCGCCAAAAGAGGACCCAGTGCAATTACCTGAGCTTGA
GTGTGAAAAGTCTGAAGCTCACTTTGTGCTTCGTGATGGCGCTGCAGGTA
TCTTTTTAGCTGCGCACACTTTTCCTCGCTCAAGAGAAACTCGAGCGCCA
AAAGTAGCAGAATTGCAAAGGTTCAGAGATCGTATTTCAGAAAAATTCTA
TTATTTAGCTGATGCACCTGCAGAAGATAATGAAGGAAATTTATCGGTAG
TACGTTACAGCCGTAAAACGAAAGAGCAGTACGTGATGACCGAGATTGCG
ACTGAAGAAGGCAAACCTAAAGCAACAGGTTGGACTGCGAAATATATTGA
CGGCAAATGGATTGAAGACATTCCCAAGAAAAAGGTGGCTAAAAAGAAAG
CAGCCAAAAAACCAGCAGCAAAGAAAAAAGCTAAAACAGCAGCTGAGTAA
>CPS_4792 topB, DNA topoisomerase III
TTGAAACTCTATATTGCCGAAAAACCGAGTTTAGGTCGCGCTATTGCTGC
CGCATTACCTAAGCCACAAAAAAACCATAAAACACATATTGAGCTCGCTA
ACGGTGATGTGGTCAGTTGGTGTATCGGACACATTTTGGCGCAAGCAGAT
CCTGAAGACTATGATGCCGAATTAAAAAAATGGCGCATGGAAAGTTTGCC
TATAGTGCCGCAGCAATGGCAATTAAAACCCATTGCTCGAACTCGCTCAC
AACTCACTGTCTTAAGAAAATTGGTGAAACAAGCCGATGAAATTATTCAC
GCAGGCGATCCCGACAGAGAAGGTCAATTACTCGTTGATGAAGTGATTGA
TTACTTTAAATTATCCAAAACAAAAAAAGCTAACATTAAACGTCTGCTGA
TCAGCGATTTAAACTTACCTGCCGTTAAGCGAGCCCTTACGTCACTAAAA
CCTAATAGTGATTTTATGCCGTTATCTATTTCTGCTTTAGCACGTTCACG
CGCTGATTGGCTTTATGGTATTAACCTTACCCGTGCATATACATTGCAAG
GGCAAAAAACCGGTTACAACTCGGTATTGTCCGTAGGTCGTGTGCAAACA
CCTTTGTTAGGTTTAGTGGTTAGACGTGAGCAAGAAATTTCAGAATTTGT
CAGTAAACCATTCTTCCAAGTTCAGGCTCATATTGCACTAAGTTCAAAGG
ACGCCGTCGCTTTTACAGCAAAATGGCAACCAAGTGAAAACTGTCAACCA
TATTGCGATGAAGAAGGTCGAGTTTTGGTAAAAGCATTAGCAGAGAATGT
CGTTAAACGCATTGCTAACCAACCCGCAACAATCAGTAATATTGACAGTA
ACGAAAAACAACAAGCCGCCCCATTACCCTTTAATTTATCGCAATTACAA
ATTAGTGCTGCTAAGCAGTTTTCTATGAATGCCAAGCTTGTGCTTGATGT
TTGTCAGGCTTTATATGAAAGACATAAACTGATTACTTACCCACGTTCAG
ATTGTCGGTATTTGCCTAAAGAGCAACTAAAGCAAGCAAGTGGCATTGTT
AATACACTCGCCAACTCATCATTACCTTGTAATAAACCCGCTCAAGGGGC
AAATACTTCTTTTGTGAGTAAAGCATGGAACGATAAAAAAATAACCGCCC
ATCATGCAATTATCCCTACCGAGAAATCACCTGAGAACATCAATTTAAAT
ACCTTTGAAAAAAATGTCTATTTACTGATTGTACGTCAATATTTAGTACA
GTTTTATCCTGCCTATATTTTTCAGCAAACCAAAGTGGAATTATTAATTG
CTGGCGGGAATTTTATGAGCCAAGCAAAAACAGAAAAACAACTGGGCTGG
CAAGTCTTATTCCCAAAAAGTAATAAAACGAATAACCAAAGCAAGTTAGA
ACATGGGCAAGAACAAGAGCAAACATTGCCCCCTTTAACAAAAGGGCAAC
TATTACATTGCCAACAAGGCGAATTAATAGAAAAACACACGTCACCGCCG
CAATCTTTTACTGATGCAACGCTGCTCGGTGCCATGACCGGTATTTCCCG
TTACGTCAATGATGCGGCCATTAAAAAAGTACTGAAAGAAACCGATGGTC
TGGGTACAGACGCTACTCGCGCCGGCATTATAGATTTACTTTTTAAACGC
GGGTTTTTACAACGTCAAGGCAAAGCGATTACTGCAACGAAGGTTGGTGT
TGCGTTAATCACCGCCCTGCCCACCATGGCTACTTTGCCAGATATGACAG
CACAATGGGAAGCAACACTCACAGCAATCAGTGAGAAAAATGCCAACTAT
CTAAGCTTTATGCAACCTTTAACAGTTATAGTCAATGAGATGGTACAAGG
TGCCAGTCAGCAATCTTTTTCTGGTTTACCTAAGGTTGCTTTTAAGCCTA
AACGCGGCAAACGAACATTTCAGAAGAAAGCGGTAAAAAAAGCAAGTTAG
>CPS_1636 umuC1, umuC protein
ATGTTTGGGTTAGTTGATGCTGTTTCTTTCTATGCACGTGCAGAGAAGGT
TTTTGACCCAAGCATTAGGCATAAACCTGTTGTCGTTTTAACGAATAACG
ACGGCTGTATTTGTGCTGTCTGTCCTATTGCGAGGCAGCTAGGTGTACCT
AAATTTGTCCCCTATTTTAAGGTTAAGTCTTTTCTAGCAAAGCACGGTGT
CGTTGTTCGTTCTTCAAACTATGAACTGTATGCAGACCTAAGTGAAAGAA
TGATGAATGTTATTGCGCGTTACTCAGATAACCATTATGTCTATTCTATT
GATGAATCATTCTTACATTTCAAAAACTTTAGCTGTGTTGATAACTGGCA
CGAATACGGCCATGTAATACGTAAGGCGGTGTGGCGAGAAACACGTTTAC
CCGTTGGTGTTGGTTTCGGTGCAACCTTAACATTAGCCAAAGCAGCGAAT
CATGCCTCTAAAAAGCTGTCAGGTTTTGATGGTGTCGCTGTGATAGATGA
TAAAGCCTCTCGTAAAGAAATCCTCTCTAGAATGTCGCTCACTGAGGTTT
GGGGTATTGGCTCCAAGTTGGGTAAACGGCTAAGTATATTAGGGCTTAAA
AATGGCTGGGATTTAGCTAATCAATCACCTAAAGCAATGCGAGGTCAGTT
CGGTGTGGTCGTTGAACGTACAGTGAATGAACTGAACGGCATGCCGTGCT
TACAATGGGATGAAATAGGGCAAGACAAACAAGAGATATTTTCTACACGT
AGTTTTGGGCAACGAGTAACCGACGGTCATGCACTCAAAGCTGCACTATC
AAGTCACGCCAGTATTGTAGGGGCAAAAGTTAGACGACAAGGCTCTTTGA
TTAAACGCTTAGTTATTTTTGCATCAAGTTCGCCACATGATGACAGTTAC
TATAAAAAATCGGTCATTTATGAGTTTCCCATTGCGACTGACAATATCTT
AAAGCTAGTCGGTGCTATTTCTTACGTATTTGATAATATTTATAGACAAG
GTGTTAGCTTTTATCGCTGTGGAGTAGGTGGCGTTGAATTAGAGAATAGT
CAATTTCAGCAACAAGATATGTTTAGTCTTAGTGTGAATAACCCGCCTTT
AATGAAATGCTATGACCAAATAAATCATCGTTATGGTCGTGGGGCTGTTG
AAGTGGCTATCGCTGAAAAAAATGAAAAGTGGGCCATGAGGCGAAACTTC
TTATCACCTCGCTCTACGAGTAACTGGTCAGAAATACCTAAGATAAACTG
TTGA
>CPS_2682 umuC2, umuC protein
ATGTATGCTTTAGTTGATGCAGTATCATTCTACGCAAGTGCTGAAAAAGT
TTTTGACCCCAGCATACGTAATAAACCCGTTGTTGTTTTAACTAATAATG
ATGGTTGTATCTGCGCTGTCTGTCCGATTGCAAGACGCCTTGGTATTCCA
AAATTTATACCGTACTTTCAAGTTAAATCATTGCTTGAAAAGCATGGCGT
GGTTGTTCGTTCTTCAAATTATGAGTTGTATGCGGATTTGAGCGAACGAA
TGATGAATGTCATCGGCCGCTTTTGTGATAACCAGTATATATACAGCATT
GATGAGTCATTTTTATATTTTGATCATTATGAAAGCTGCATAAATGATTG
GCACGAATATGGACATAAAATAAGAAAAGCCATTTGGAAAGAAACGAGAC
TTCCCGTCGGTGTTGGTTTTGGTGAAACAGCAACACTGTCAAAAGCGGCA
AACCATGCAGCCAAAAAACTCTCTGGTTTTAATGGTGTAGCCGTTATTAA
TAGCGCAGTAAGCAGAGACAAAATACTCAAGCGCATGGCGGTAGATGAGG
TATGGGGCATCGGGCGAAAAATATCGAAACGATTAGGGCTTGAGGGTATT
AACAACGCCGCGCAGTTAGCAGAGCAAGATCCTAAACATATACGAAAACA
ATTTAGCGTAGTAACTGAAAGAACCGTGAATGAATTAAACGGCATCAGTT
GTTTGTCTTGGGATGAGGTGAAATCACCCAAAAAAGAGATTTTCTCAACA
CGAAGTTTTGGACAGCGCATTACCACAAAAAATGAATTACGCTCTGCGTT
GGTAACACATGCAGCCATTGTAGGAAGGAAAGTGAGAAGACAAAATTCAC
TCATTAAAAAGTTAATGATATTTGCCTCTAACTCGCCGCATGATGACTTG
TATTACAAGCAATCCATGGTTTTTCCATTTATCATAGCGACTGAAAATAC
CTGTGAAATGGCGCGCGCGGTAAACCAAGTTATTGATTCTATATACAAAG
CAGGAATAAAATTTTACCGTTGTGGTGTAGGTGCAATCGAATTAAATAGT
AAAACGTTTATACAACCAGACTTATTTATGCCCGATCACACTAATAGTAA
CGTAATGAAATGCTTAGATAATGTGAACCACAGATACGGAGATAGCACCT
TAAAGCTGGCCGCTGAAGGGCATCATGAAAAATGGCAAATGCGACGAGCG
TTTTTAAGCCCTCAATACACCAGTCAGTGGCGAGACATTCCTAAAATACA
GTGCTAG
>CPS_4288 ung, uracil-DNA glycosylase
ATGATAAAACCCCAATGGCAGCAGTTAATTGCTGGTGAAGCGAAGCAAAG
CTACTTTAAAAACTTAGTCAAAGAAGTCGCAACGCAAAGAGCATCGGAGA
TTTCAATTTATCCAGCAGAAGGTGATGTGTTTAATGCTTTTAACCACGTT
GATTTAGCAGAGATAAAAGTTGTCATTCTTGGGCAAGATCCTTATCACGG
AAAAGATCAAGCACATGGTTTAGCTTTTTCAGTGCAGGAGGGCATCAAGG
TACCGCCATCACTTGTTAATATTTATAAAGAACTGGCGACCGATGTTGAA
GGCTTTGAAATACCAAAGCATGGCTGTTTAACACATTGGGCAGAGCAAGG
AGTACTGTTGTTAAATACGGTATTAACAGTGCAGCAAGCCAATGCGCATT
CTCACGCTAAGCTGGGTTGGGAGACTTTTACCGAGCAAGCTATTAACGCG
TTAAATGAGCACAATGATGGTTGTGTTTTTATTTTATGGGGAGCACATGC
ACATAAGAAAGGTAAAAATATTAACCAAGAAAAACATTTAGTTTTAGCGG
GTCCACATCCGTCGCCATTGTCTGCTTACAGAGGTTTTTTTGGCTGTAAA
CATTTCTCTCAAGCTAATGCTTGGTTAGCTAAACACGAGGTTAATCAAGT
TGATTGGCATTTACCTTTGGAGGCTTAG
>CPS_0920 uvrA, excinuclease ABC, A subunit
ATGAAGAATATTGAAGTCAGAGGGGCTCGCACACACAACCTCAAAGACAT
TAGTTTAACTATACCTCGAGATAAACTCGTGGTCATTACCGGCCTTTCTG
GTTCAGGAAAATCTTCTCTTGCCTTTGATACACTCTACGCTGAGGGACAA
CGTCGTTATGTAGAATCGCTTTCAGCTTATGCGCGTCAATTTTTATCTTT
AATGGAAAAGCCTGATGTTGATCATATTGAAGGTTTATCGCCCGCTATCT
CCATCGAGCAAAAGTCAACATCTCACAACCCGCGCTCAACCGTAGGTACC
ATCACTGAGATATACGATTATTTGCGTTTGCTTTATGCCAGAGTTGGTGA
ACCTCGTTGTCCAGAGCATGGTCAAGCACTAGCGGCACAAACAGTTTCAC
AAATGGTTGATAAAGTTTTAGAACTTGAAGAAGGCACAAAAGTGATGCTA
CTCGCGCCTATTATACAAGACCGTAAAGGCGAACATGTAAAGCTTCTTGA
TAACTTAGCTGCCCAAGGCTTTATTCGTGCGCGTATTGACGGGGAAGTTT
GTGACTTATCTGATCCACCACCGTTAGAATTACATAAAAAACACACTATA
GAAGTTGTCGTTGACCGTATAAAAGTGCGTGAAGATATTCAATTACGACT
TTCAGAATCTTTTGAAACGACCTTAACGTTAACTTCTGGGACTGCCAAAG
TCGCTTTTATGGATGAGCCGGACCGTGAAGAACTTATTTTCTCAGCTAAC
TTTGCGTGTCCACATTGTGGTTACAGCATGCAAGAGTTAGAGCCACGTTT
GTTCTCTTTTAATAATCCTGCTGGTGCTTGTCAAACCTGTGATGGTTTAG
GTATTGAACAGTACTTTGATAGCTCTCGCGTTATTGCCAATGCAGAGTTA
AGTCTTGCCGGCGGCGCAGTTCGTGGCTGGGATAAACGTAATTTTTATTA
CTTTCAAATGCTGCAAGCCCTTGCCGATCATTATAAATTCCCCGTTGATA
AACCGTTTAATAAGTTATCCGCTAAAGCCCAAAAAGTTGTGCTTTATGGT
AGTGATGAGCAAGAAATTGAATTTAAATACATGAACGACCGTGGTGATGT
TGTGGTGCGTAAGCATCCTTTTGAAGGCATCATCAATAATATGCAACGCC
GTTATAAAGAAACGGAGTCAAATTCGGTACGTGAAGAGCTAGGAAAATAC
CTTAATTCACAACATTGTCCGGATTGTAATGGTAGTCGATTACGCTTAGA
AGCTCGCAATGTTTTTATCGAAGATACACCACTCACTGTCGTGGCTGAAT
TTTCCATTAGTGATGCCCTCAAGTTTTTTCAAGGTTTAACCCTCACAGGC
CAGAAAGCACAAGTTGCTGAAAAAATATTAAAAGAAGTAAACGAACGTTT
AGGATTTTTAGTGAACGTTGGCCTTAATTATCTCAATTTGTCACGTGGCG
CAAACACCCTATCTGGCGGTGAAGCACAGCGAATACGTCTTGCTAGTCAA
ATCGGCGCAGGTTTGGTTGGTGTCATGTATGTTTTAGATGAACCCTCTAT
TGGCCTTCATCAACGTGATAATGAACGCTTACTTGGCACCTTGATACATC
TCCGTGATTTAGGTAATACCGTTATTGTGGTTGAACATGATGAAGATGCT
ATTCGCGCGGCAGATTTTGTGGTGGATATTGGCCCAGGCGCTGGTGTACA
TGGCGGTGAAATTATCGCGCAAGGCACCGTGGATGACATACTCAATTGTA
AAGAGTCTTTAACGGGGAAATACCTTTCTGGCGTAGAACGAATTGAAATA
CCTAAACAGCGTCATGCTTTTGATAAAAAGAATGTCGTTAAGCTCAAAGG
CGCTACCGGTAATAATTTAAAAAATGTCGACTTAGTCATTCCTACCGGTT
TAATGACCTGTGTAACTGGCGTGTCGGGCTCAGGTAAATCCACACTTATT
AACGATACGTTATATAAATTAGCGCATATCGAGCTTAATGGTGCAACGGT
TGATGAACCAGCTCCTTACAAAAGCATTCATGGTTTAGAACTATTAGATA
AAGTTATCGAGATTGATCAAAGTCCAATAGGCCGAACCCCACGCTCAAAT
CCCGCGACATACACTGGCATATTTACGGCCGTGCGCGATATTTTCTCTGC
GACACAAGAGTCACGTTCTCGAGGTTATAAAGCAGGACGATTTAGCTTTA
ATGTTAAAGGTGGACGTTGTGAAGCCTGTCAAGGTGACGGCATGATCAAG
GTAGAAATGCACTTTTTACCTGATGTTTATGTACCGTGTGATGTATGTAA
AAGTAAACGTTATAACCGCGAAACGTTAGAAGTTTTATACAAAGGTAAAA
ATATTCATCAAGTATTAGACTTAACCATTGAAGATGCTTTTGACTTTTTC
AAAGCTATTCCTGCGATTAATCGTAAGTTGCAAACCTTACTCGATGTTGG
TTTAGGCTATATCAAACTAGGGCAGTCAGCAATCACTCTATCGGGCGGTG
AAGCACAACGAGTCAAGTTATCAAAAGAGTTATCAAAAAGAGATACCGGC
AAAACGTTGTATATTTTAGATGAGCCAACCACAGGTTTGCATTTCCACGA
TATAAAACAATTATTAAACGTTATTCATCGCTTGCGTGATCATGGCAATA
CGATTGTGGTGATTGAGCATAACTTAGATGTTGTCAAAACAGCCGATTGG
GTTATCGACTTAGGTCCTGAAGGCGGCGCAGGTGGCGGTGAAATTTTAGT
AACAGGTACTCCTGAACAAGTTGCCAAGCATAAAACGTCACATACAGCGC
GATTTTTAAAACCTTTATTAGCGTCAAAATAA
>CPS_2887 uvrB, excinuclease ABC, B subunit
ATGAAAAAATTAACTATTTGCTCTGAATATACTCCTAGTGGTGATCAACC
AACAGCGATAAAGCAACTGTTAGAAGGTATTGAGTCGGGTTTAGCCCATC
AAACGCTTTTAGGTGTAACCGGCTCAGGTAAAACTTATACCATTGCCAAT
GTGATTGAAAAGCTTAATCGACCTACCATGATGTTAGCGCCCAACAAAAC
GTTGGCGGCGCAATTGTATGGTGAAATGAAGGAATTTTTCCCAGATAATG
CCGTTGAATACTTTGTTTCATATTATGATTATTATCAGCCTGAAGCTTAC
GTGCCAACGACAGATACTTTCATAGAGAAAGATGCTTCAGTTAATGAACA
TATCGAGCAAATGCGGCTATCGGCTACTAAGGCACTTTTAGAGCGCCGAG
ACGTGATTATTATTGCTTCTGTGTCGGCTATTTATGGTTTAGGTGATCCT
GACTCCTATTTAAAAATGATGTTACATATCAGTCGAGGTGACATTATAAA
TCAACGCGATATTTTACGTCGTCTCGCTGAACTACAATATACTCGTAATG
ATGTTGCTTTTGCGCGTGCCACTTATCGAGTGCGCGGTGATGTTATTGAT
ATTTTTCCTGCTGAATCTGACCGCCTGGCTTTACGTGTAGAGCTATTTGA
TGAAGAAATAGAGCGGATAAGTCAATTTGATCCGCTAACAGGACAAGTTG
AAAGAACACTGGATCGGGTAACAGTATACCCAAAGACACACTACGCTACG
CCTAAAGAGAAAATCATAGCAGCAGTAGATAAAATTAAAATAGAGCTGAA
GCATAGGTCACAACAACTCAAAGATAATAATAAATTAGTCGAGGAACAGC
GCCTTACTCAACGAACCCAGTTTGATATTGAAATGATGACTGAACTTGGT
TATTGCTCTGGTATCGAGAACTATTCTCGCTATTTATCAGGGAGAGAAGA
GGGAGGAGCACCACCAACCTTATTCGATTATTTACCTGATGATGGTTTAC
TTATTATTGATGAATCTCATGTTACCGTGCCACAAATTGGCGCTATGTAT
AAAGGAGATAGATCGCGTAAAGAAAACTTGGTGGAATATGGCTTTAGACT
ACCGTCCGCTTTAGATAATAGGCCAATGAAGTTTGAAGAGTTTGAAGCGA
TCTCTCCACAAACAATTTATGTCTCGGCCACACCAAGCAAATTTGAATTA
GAGAAATGTGGTAGCGATATTGCGGAACAAGTGGTTAGACCGACAGGTTT
ACTTGACCCAGAAATCGAAGTTAGACCGGTTGAAACACAAGTTGATGATT
TATTATCAGAGATAAATAAACGACTACCGCTTGACGAAAGGGTCTTAGCC
ACAACATTAACTAAACGTATGGCCGAAGATTTAACGGATTACTTGTATGA
CCATGGCATTAAAGCGCGCTATTTGCATTCAGATGTTGATACGGTTGAAC
GGGTAGAAATTATAAGAGACTTTAGACTAGGTAAATTTGATGTTTTAGTG
GGTATAAATTTACTTCGTGAAGGTTTAGATATGCCAGAAGTATCTTTAGT
GGCAATTTTAGATGCGGATAAAGAGGGCTTTTTACGTTCCGATCGTTCTT
TGATTCAAACGATTGGCCGAGCTGCGCGTAATCTCAATGGTCGAGCAATA
CTGTATGGAGATAGAATTACGGGCTCTATGCGACGTGCTATTGATGAAAC
AGAACGACGTAGAGTGAAGCAACACCAGTACAATTTAGACAACAATATTA
CCCCCCAAGGCGTTGTTAGAAGAATTACCGATGTTATGGGCGTGGGAAGT
TATAGTGATGCTAAGTCACTTGATAAAGTTGCAGAAGCTAATACAAATTA
TCATATTAACCAGCAGGCGGAAGAACCTCTATTAACCACGTCACAAATTG
ACACTAAAATAGTTGAGCTTGAAAAGCTAATGCAGGGGCATGCGCAGAAT
TTAGAATTTGAACAAGCTGCTGCTATGCGCGATAAGATAGCAAAATTACG
AATACAGCAACTATCTACTTAA
>CPS_3270 uvrC, excinuclease ABC, C subunit
ATGCTGCACAATACTACTGATAATGTAGAAAATAACCAAACCATTAAAGC
CTCAACTTTCGATAGTGAGGCTTTTTTGCGTGTAGTTACTGAGCAGGCCG
GTGTTTATCGAATGTATGACAGTAAGCAAGTAGTCATCTATGTAGGTAAA
GCAAAGCAGTTAAAAAAACGTCTTGCGAGTTATTTTCGAAAAGATGTAGG
GTCAGTTAAAACACAAGTTTTAGTGAAACAAATTGCCGCCATTGAAGTAA
CCGTTACCCATACGGAAGGTGAGGCGCTGATCCTTGAAAATAACTACATC
AAAAAGTATCAACCAAAATACAATATTTTATTACGTGATGATAAGTCATA
TCCTTATTTACTCATTACTGCACATAAGCATCCCAAATTGGGTTTACACC
GTGGCGGTAAAAAAGTAAAAGGTGAGTATTTTGGCCCATTTCCTACGGTT
GGTGCCGTTTGGGAAAGTTTGCGATTAATGCAAAAAATATTTCCTATTAG
ACAATGTGAAGATAGCTACTATCGCGCTCGGTCAAGACCCTGTTTACAAC
ATCAACTAGGTCGTTGCTCAGCGCCTTGTGTTGATAAAATATCGGTTGAT
GATTATAAGGAACAAGTCAATTTAGCTAAGTTGTTTTTGCAAGGAAAAAG
CTCGGCGGTGATAGAGCAGTTAGTTGCAAGAATGGAGTTAGCGAGCAATG
AACTACATTTTGAACTTGCGGCAAAATATCGTGATCAAATAGTGACATTA
CGTAAAGTCCAGCAGCAGCAACATGTAAGTGGTCATGTGGCAGAGCTTGA
TGTTGTCGGATTATATCGAGACAAAACCCAAGTCTGTATCCATCTACTCT
TTATTAGGCAACATAAAATTTTAGGCAGTAAAAGTTACTTCCCTACGGTG
CCGAGTGAAAGTAGCGACAGTGAAATATTACAAGCTTTTATTGCTCAGCA
CTACTTAAGCAATGAAATGTTAAGTCATGGCAAAGTACAGAGTAGTATTC
CAAAAGAGATTGTCATTAAAGAGTCAATTGAACAGGTAGTAGAATTAGCA
AGACTGTTGAGTGAACAAGCAGAGTATGACGTTAAGATATCCACTAATAC
CCGTAGTGAGCGAGCCCAGTATTTAAAACTCGCCGGAACTAACGCACATA
CAGCCTTAGTTACCCGAAATAGTCACAAAGAATCAATGCAAGCTCGCTTT
GTTGCGTTAAACGAAGTATTTGAGCTTGAAAATGGCATTCAACGTATTGA
GTGTTTTGATATAAGCCATACCATGGGACAACAAACCGTAGCCTCTAATG
TTGTCTTTAACCAAGAGGGTCCACTAAAAACAGATTATCGCCGTTATAAT
GTTTTCGGTATCACACCAGGGGATGATTATGCCGCCATGGCATTTGCGTT
AAATAAACGGTATGGAAAATTAAAAGCGAATCCAATCAAACCGGAAGAAC
ATGGTGCTTTAGAAAAGTTACCTGATATTGTTTTTATAGATGGTGGTAAA
GGACAGCTTGCTAAAGCCGAAGAGTTTTTTAGCCAGCTTGCACTAACAAG
AACACCCTTGTTAGTGGGGGTTGCTAAAGGAGAGTCACGTAAACCAGGCC
TAGAAACGTTAATTTTAGCGGGTAGCCATCAGTTGATCTCTTTACCTGCT
ACCTCCCCAGCATTGCACTTAGTACAACATATTCGAGATGAGTCACACCG
TTTTGCCATAACAGGGCATAGAGCGAAAAGACAAAAGGTCAGTAAAAAGT
CTCGCTTAGAGTCAATTGAAGGAATAGGTGCAAAAAAACGTCAAAGCCTA
TTAACGTTTTTAGGTGGTTTGCAAGAAGTCATGCAAGCCGATATTACCGC
CTTAGCCAAAGTTCCCGGTATAAGCCATGTTTTAGCTGAAAAAATTCATA
ATGCTCTTCATGATAAATAA
>CPS_0080 uvrD, DNA helicase II
ATGGACGTTTCAGAATTACTCGACTCTCTCAATGATAAGCAACGTGATGT
TGTTGCAGCCCCAAAGCAAAACATGCTTATTTTAGCTGGCGCTGGCAGTG
GTAAAACTCGAGTATTAGTGCAACGTATCGCCTGGTTAATGCAAGTTGAG
GGGATCTCATCGCACAGTATTTTAGCGGTAACCTTTACTAATAAAGCAGC
GGCAGAAATGCGTGCTCGAGTAGAACAAGTGACCAATGGTAATACCCACG
GCATGTGGATTGGTACTTTTCATGGCTTGGCACATCGTTTATTAAGAATG
CATTTCCAAGAAGCTAATTTACCGCAAAGCTTTCAAGTATTAGATAGTGA
TGATCAACTTCGTTTGATTAAACGTATTGTTCGTTCATTAGAGTTAGATG
AGAAAAAATGGCCACCTAAACAATTTGTTTGGTATATCAATGGTAAGAAA
GATGAAGGTTTGCGCCCTCAACATATTGATGCTCAGTTCGACCCGACGGA
AGAATTGTTTGTTAAAGTTTATAAAGCCTATCAAGAAACCTGTGACAGAG
CTGGTTTAGTTGATTTTGCCGAGCTGTTGCTTCGTGCCCATGAATTATGG
TTGAAAAATCCAGCACTATTAGATCATTATCAGCAACGGTTTGGCCATAT
TCTAGTAGACGAATTTCAAGATACCAACGCCATTCAATATGCTTGGCTTA
CTATGCTGGGCAAAGCTCGCAGTAAGGTGATGATTGTTGGTGATGACGAT
CAATCAATCTATGGCTGGCGTGGCGCTAAGATTGAGAATATCGAACGTTT
TTTACAAGAATATGATGACGCGAAAACTATTCGTCTTGAGCAAAATTATC
GTTCAACCGCTAACATTTTGAAATCAGCTAACCAATTAATCTGCAATAAC
AACAATCGCATGGGTAAAGAGTTGTGGACTGATGGAGAAGCGGGCGAAAA
AATCTCAATTTATACTGCTTTTAATGAAATAGATGAAGCGCGCTTTATCG
CTGGCCGTATAAAACAATGGCGTGACGATGGAGGAAAACTTGATGAAATA
GCCATATTGTATCGCTCAAATGCACAATCACGCTTACTTGAAGAAGCGTT
ATTGCAAGGACAATTGCCTTATCGAATTTACGGTGGTCAACGATTCTTCG
AACGACAAGAAATAAAAGATGCGCTTGCTTACATGCGTCTTATTAATAAT
CGTGATGATGATGCGGCCTTTGAGCGTGTTATCAATACGCCTACGCGTGG
TATTGGTAATCAAACCTTGTCATTAGTGAGAGACGCAGCACGGGGTTTGG
AAGTAACAATGTGGCAAGCTTGCCAGCAAATGTTAAAAGCAGAGCAATTA
AAGGGTAGGGGCGCTAAAACGATCACTGCCTTTATTCAACTTATCGAACA
ATTAGAAGATGATACGACTAACTTAGATTTAGATCAGCAGGCGAACTTTA
TTATCAACCACAGTGGTTTAAAGGCCATGTATCAGGCTGAAAAAGGTGAA
CGTGCTGCACAGCGTATTGAAAACTTAAATGAGCTAGTCACCGCATGTCA
AACCTTTGAAAGCGATCCTGAGTTAGCGGAAGAGCAAACCCCGTTAACGG
CATTTTTAACCCATGCGGCATTAGAATCTGGTGAATCTCAAGCAGACGAA
TTTGAAGCCGCAGTACAGTTGATGACAATGCACTCAGCTAAAGGCTTAGA
GTTTCCTTTGGTCTTTATTGCGGGTCTTGAAGAAGGTATGTTCCCTTCGC
AACAGTCGGTTGAAGAAATTGGCCGTTTAGAGGAAGAACGTCGCTTGTGT
TATGTCGGCATGACCAGAGCGATGAGCAAACTCTATTTATGCCACGCCGA
AAGTCGCCGTTTATATGGACAAGAAAAATTCCATAAAGCGAGCCGATTTT
TACGAGAATTACCTGAAGATTGTATCGAAGAAATTCGCATGCAGTCTCAG
GTAAAGCGTCCCAGTAAAGTAGGTAAATTTTCAAATACCTTTACACTTGA
AACCTTTGAAAATACTGGCTTTAAGTTGGGGCAGCAGGTTAAGCATGCTA
AGTTTGGTGAAGGTGTGGTCCTTAACTATGAAGGCAGTGGTGCTCAATCA
CGTATTCAGGTGAATTTCGCCGATGTTGGTAGCAAGTGGTTGGTGGTGGA
ATACGCTAATTTACAAGCGGTTTAA
>CPS_3538 xni, exodeoxyribonuclease IX
TTGTCCGCTCACTTAATACTCATTGATGCTCTAAATTTAATTCGTCGTGT
GTACGCTGTACAAGAGCGTCCTTTTATCCAAATAAAGCAGGATCACGACG
ATGAGCTATCAGCCAGCACCTTAAAACAAGTACTATTTAATACGCAAAAT
ACCTGTGTAAACGCTTTAATAAAAATTATCGACCAACATCAGCCGACGCA
CGCATTGACTGTATTTGATAGTCAAGAGCCCTGCTGGCGGTATCAATTAT
TTGAGGGGTACAAGAAAGGCAGAAAGAAGATGCCTGATCACCTTGCAAAT
AAATTAATTGATATACAAGATGCTTTTATGGAACAAGGTGTTGATTCACT
GACATCAGACGAAGATGAAGCTGATGATCTTATCGCTACTTTAGCGGTGA
AGATGGCACTTCACGGTCAAAAAGTGACTATTATTTCGACCGATAAAGGT
TTCCTACCTTTACTTAGCCCTAACATACATATTTATGATTACTTTAATCG
CCGCTATTTGGATGAAGAACATGTTCAAAGTAAGTTTAGTGTTAAGACGT
CTCAACTGATAGATTTTTGGACGCTAACTGGCGATAATACCAATAAAATT
GAAGGTGTTAGTGGTATTGGCCAAGTTACTGCAGCAAAGTTACTTAACCA
ATATGGTTCATTGAAGGCGATACTTGAAGCGACTGATTTAAAAGACTCGC
TTGCAGAGAAGTTAACACAAAGCCTCGAACAGATGGATTTGGCAAGAAAG
CTATTAACATTGAAACAAGATATCCCTTTAGGCTTTAATTTAAAAGATAT
CCGCTTAACAACCTCTTCATCTGCCCACGAGATTAATGCTAATATAAACC
TAACTACTGATGATAAAAGTTAA
>CPS_4244 xseA, exodeoxyribonuclease VII, large subunit
ATGAGCCAACAGCATATTTTACAAATCAGTGAGTTAACTAAAAAAGTACG
TTTTATTCTAGAAAGCGAATTAAACACTGTTTGGTTAACTGGCGAAGTAT
CAAATTTTATTGCCGCCAGTTCAGGTCATTGGTACTTATCATTGAAAGAT
GCAAAGTCACAAGTTAAGTGCGCCATGTTTAAGGGAAGCAATAGACGTGT
CCGCTTAAGTACGGGTGCAGCTCCGAGTAATGGCCAACAAGTATTAGTTA
GAGCAAAAGTATCTTTATATGAGCCACGTGGAGACTTTCAATTAATAATC
GAGCATATGGAAGATGCTGGCACGGGATTATTACGTCAACAATACGAACA
ATTAAAGAATAAACTTAATAACCAAGGTATTTTTGATTTATCTCGTAAAC
AGCAGCTACCAAAAAATATCAGCTGTGTAGGTATTGTCACTTCACCGACA
GGCGCTGCCGTTAAAGATATTTTAACCGTACTGAAACGTCGTAATCCAAA
TATTAAAGCAATAATCTATCCTTCATTAGTGCAAGGCGAATATGCCCAAG
GCGATATTTGTCATGCCATTGAGAGTGCTAACAGTCGCAACGAATGTGAT
GTACTTATTGTTGGTCGGGGTGGTGGTTCTTTAGAAGATCTATGGCCATT
TAATGAGGAAAGTGTTGTTCACGCCATTTATAAAAGTGCATTACCGATAA
TTAGTGCCGTTGGTCATGAAATTGATACTACCCTGAGTGATTATGTGGCC
GATTTACGTGCCCCAACACCCTCTGCAGCTGCAGAGTTAGTATCAAGTGA
TAGTAGTGAATTACTAAATCAATTACTCATGTTTAAACAGCGCTTGATCA
AAGCTCAACAAAACAAGTTAGTGTATTTAGGCAATGAACAAAGTTATTTA
CAACATCGTTTATCGCAAGTGCATCCCGAACAACAGTTACAGTTACAACA
GCAAAAAGCTGATGAATTGAGCTTACGATTAAAGCAAGCAATGAAGCGTA
ATATAGAACAAGTACAGAGTAAGCCTATTCAGCTTAGCCAACGACTGTTG
CAGCAATCTCCCCTAAAGACTATTCAATTACAGCAACAAAAAATTGACCA
AAATGCACATAGGATCACGCAAGCAATGCAAAATTCATTGCAACATAACA
GTGAAAAATTTGTGCATTTGATTGAGCAATTACAATTAGTTAGTCCACTT
GCTACGATAGCAAGGGGTTACAGTGTGACTCGTAATAGTAAAAACGAAGT
AATTAGCAAAACCGCACAAGTAAAAATAGATGAAGAAATCAGTGTGCAGC
TTAGCGATGGGCACATTAATGCTAGAGTGATATAA
>CPS_1090 xseB, exodeoxyribonuclease VII, small subunit
ATGGCTAAGAAGAAACTAGAAAACCTCTCTTTTGAAGAATCATTAAATGA
ACTTGACACAATAGTGCAAAGTTTAGAGCAAGGTGAATTAAGCTTAGAAG
AATCGATGACACTTTTTGAACGAGGCCTGAACCTGAGCCAATTAAGTCAG
GTGAAATTGCAAGCTGCAGAGCAAAAAGTACAAATTCTGCTTGATAAAAA
TGGTACTGCTAAGTTAACTGACTTTGATAGCAGTGCAGGCGAAAGTTAA
>CPS_3173 xth, exodeoxyribonuclease III
ATGAAAATCATCTCTTTTAATATTAACGGCCTTCGTGCTCGTCTTCACCA
ATTACAAGCGATTATCGATAAACATCAGCCCGATATCATTGGTTTACAAG
AAATCAAAGTTCATGATGAAGCTTTCCCATTAGAAGCTGTTGAAGCCATG
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GTTATGCAAAAAAGAAGCTGAGTCAGTACAACGGGGATTTCCTACAGACG
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TTACGCGCTATTGAAAAGCCTTCAGATCATGCGCCAATTTGGTCAACATT
TTCATAA