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COG category: Replication, recombination and repair
Organism: Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2
Number of genes found: 194
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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2 >RF_1181 Transposase ATGATTTTCTTAGGATACCCTGAAGAAATACGGAAAATAATTTATACAAC AAATGCTGTGGAATCTGTTAATAGTCAACTCCGAAAAGTCACAAAAAATA AACGTGTTTTTCCAAATGATAATGCTGTTTTTAAAAGCTTATATTTGGCA ATTGATTACATGACCAAAAAATGGTCCATGCCCATACCAAATTGGAATGC GGCTATGGCTCATTTTTTAATAAAATTTGACGAAAGAATCTAG >RF_pd64 Transposase GTGACTTATAGTATGAGTTGGATTATACTAAATGAAAAACTTATGGCAAA GGCATATTCATACGATTTAAGAATACGAGTAATAAAAAGTTTAACAGAAG GTAAAACAATAAAAGAGACTTCTGAGATATACTCTATTAGTAGGAAGACT ATAATAGAGTGGAAAGAATTAAAGAAACAAACTGGGGATGTCAAAGCAAA AAGTGGTTATCATACAGGACATCGTAGAATAATAAGAGACATAGAGGGAT TTAAAAAATTTATAGAATTAAATTTTGATAAAACCACCATGGAGCTAGCT AATAACTGA >RF_0914 unknown ATGGTTGTTACTTGGTATTTTATCAAAAATAATCAATTAGATACAACTTT TGAAATAGCAAAATTACTCTTAAACGATAAACATAATTTAATGCATAAAG CAATAGGTTGGATGCTACGTGAAGCAGGAAAAAAAGATGAAAAAAAGTTA ATAGATTTTTTGGATCGTTATATATCACAAATGCCAAGAACCGCAGTTCG TTATGCAATAGAGAAATTTCCTAAAGAGATACGTAAGAATATTTTGCAAA AAAAATAA >RF_0931 Transposase ATGATTTTCTTAGGATACCCTGAAGAAATACGGAAAATAATTTATACAAC AAATGCTGTGGAATCTGTTAATAGTCAACTCCGAAAAATCACAAAAAATA AACGTGTTTTTCCAAATGATAATGCTGTTTTTAAAAGCTTATATTTGGCA ATTGATTACATGACCAAAAAATGGTCCATGCCCATACCAAATTGGAACAA GGCTATGGCTCATTTTTTAATAAAATTTGACGAAAGAATCTAG >RF_0424 Excinuclease ABC, C subunit, N-terminal ATGTATTGGGTATATATATTATGCTCTAATAAGCATGGTACTTTATATAT TGGTATCACTAATAATATAATACGTCGTGCTTATGAACATAAACAAAAAA TAATAAAAGGTTTTACCTCAAAATATAATATTATAAAGCTTGTTTATACA GAAGAATTTACTGATATTAAAGAAGCACTTACAAGAGAGAAAAACTTGAA AAAGTGGAAACGTAACTGGAAAATAGAACTGATAGAAAAAGCTAACCCTG AATGGAAAGATTTAATTGAATAG >RF_0049 Transposase GTGTGTAAATTTCTCAAAGGTTGTATAAAAGAAAATATAACAAAAAGAGA AATTACAATGACACAGAAACAAAATGCTGCAATGGAACAAGCGATAGATT TATTGATCAATAATGATACAGATGTATCAATATTATTCAGGGAAGATGGT TTATTAAAAGAAATAACCAAGCGTCTTGTAGAGAGAGCCCTACAGTCCGA GATGAATAATCATTTAGGATATAGCAAGTACAATCAAAGTGATGCTCAGA ATTCACGTAATGGTTATAACACAAAGAATCTGATTACAAAGAATGGTGCT GTTGAGATTGAAGTGCCAAGAGATAGAAATAGCAGTTTTGCACCATCATT 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ATGATCATAAAAAATCTTCAAGAATTTTATCCGCTTTTAATACCAAATGC TCCACTTATTGCTATTGATTACGGAAGCAAAAAATTAGGAATCGCATTAT CTAATCAAGAACGTAATATTGCTATGCCCTTAAACACTATAATTGAGATA AATAAAAAAATCGTTATTACTTCCTTGCTTAGTATAATCGAAAAATATAA AGTTTGCGGTGTGGTAATAGGCCTACCGATTGATATGAGCGGAGCGGTAA CCGAGCAAACAAATATAGTGATGAAATTTGCTGAAGAGCTAGCAAAATCT ATAAATTTGCCTATATATTTACAAGATGAAAGACTAACTACAAAAGCTGC GAATAATTTCCTTAAATCATTCGGCGTTAAAAGAAAAGATCGTAATAATA ACGATGATGCCGTAGCTGCTAGTATGATTCTTGAAACCGTGCTTGATTCT ATGAAAAAACTTTAA >RF_p48 Transposase ATGGATATGGCAATAGAATATCCAGCATATGGTCAGCTAAGAGTATCAAA TGAGCTTAAGAAGAGTGGAATACTTGTATCACCCGGAGAAGTGAGATCAA TTTGGTTACGTAATGATTTAAACAATATCAGTAAAAGGCTTAAAGCATTA GAAGCAAAGATGGCTCAGGATGGTATTGTTCTGACTGAAGCTCAGTTACA AGTACTAGAGAAGCGTCGTAATGAAAAAGAAGCACATGGAGAGATTGAGA CGCAGCATCCAGGTTATCTAGGATGTCAGGATACGTGTTATGTAGGTAAT TTTAAAGGTATAGGTAAGGTTTATTCTCAGGTATTTATTGATAGCTATAC TAGAGTAGTGGATGCTAAACTATATGCTGATAAAACAGCAATTACTGCTG CTGATATGCTTAATGACCGGGTGTTACCATGGTATGAGACGCAAGGGATA 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GAGTTGGTAACAAAGCTTGCCCCATATAAAGACTACTTGAGTGAAAGAAT AAAATCAGCCCATCCTGTATCTCTACCTGGTACTGTACTGTTTCAGGAGA TAAAAGAGTTAGGTTACACAGGAGGGATAACCCAACTAAGGGATTATTTA AGAAGTATCAAGCCAGTAGCTAAACAGGAGGATATAATAAGATTTGAGAC TGCTTCTGGTAAACAGATGCAAGTGGATTGGATAGAATTTCGTAAGGGGA AAGATCCTCTATCAGCTTTTGTGGCTACATTAGGATTTAGCCGAGCAAGC TATATAGAATTTGTTAACAATGAAAAACTTATAACACTAATAGAATGCCA TAAGCGAGCATTTGATTATTTTGGCGGAGTACCGGAAGAAGTACTTTATG ACAATATGAAGACAGTAATACTGGATAGGGATACATATGGTCCTTGGGAT ACACCGTTTTAA >RF_1136 unknown ATGCAAGAAGTGGCCAAAGGAGCTGAGATAGTAACAAAATTCAGTAATGT CTCACCTGAATTTAAAAATGACGGTTGGTTAAAGGCTTTCGCTAATTCAC CTGTAAAAGACCCGGTACTCTATGCAATAAATAATAACATTACAATTGAA GGTAAAGATGCTAAAGAGTGGGCGTATGAAAATAATTACCAAATTAAAAC TTCTATAGGCTTGAAAAAAGAAATAATCAAGGAACAACAATGGAGCAAAG ATTTAGAAGGAAAATGGAAAGAAACAGAAGTTGAGGTTAAGAAAGATAAA GTAGAAGTACAAATTTCTGATCCTGTAAAATCAATGCGTACACAAGATAA ATCTTCCGGCGAAAAGTTGGAATCACTAATTGTTGATTTTACAAAACAGG CAACAACTAAAAACGTAACCGATAAAGAAGTAGCAAAATTCTACGACAAT ATAATGAAAGAGCTAAAAAAAGAAAATTATCTTACCCAGCAGGATATTGA 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Endonuclease III ATGCAAGCACAAATAGTTAATAAAATTTTTGAGATTTTTAGCAAGAATAA TCCAAGTCCGAAAACCGAATTAATATATAAGAATGATTTCACCTTATTAG TAGCGGTAATGTTATCTGCTCAAGCCACCGATATATCAGTAAATTTAGCG ACTAAATCTTTATTTGAAACTTATGATACAACGGAAAAAATTTTAGAACT CGGCGAAGACGGGCTTAAAAAATATATAAAATCTATCGGACTATTTAACA GCAAAGCAAAAAATATTATTGCATTATGTAAAATATTGATAAGTAATTAT CAATCTTCAGTACCAAATGATTTTAAGGAATTAATTAAACTGCCCGGTGT CGGCAGAAAAACTGCCAATGTTGTACTAAACTGCTTATTTGGTATGCCGA CAATGGCGGTTGATACACATGTCTTTAGAGTAGCCAAAAGGATTGGACTT GCTAGAGGTAATAGTCCTGAAATAGTAGAAAAAGAGCTACTGCAAATTAT TAATGAGAAATGGTTAACTCATGCCCATCACTGGCTAATTCTGCACGGTA GATATATTTGCAAAGCTAGAAAACCCGATTGCGACATCTGCCCTATTAAA GAGTATTGTGAGTATTATAATTCACCAATTATTTCTAAATAA >RF_1051 nudH, (Di)nucleoside polyphosphate hydrolase ATGAGAAATTCTTCCAAAAAACATCTTGATTTACCATATAGACCAGGAGT CGGCATGATGATATTAAATGCCGATAACCATATATTCGTCGGTAAAAGAA TAGATACAAAAATATCTGCATGGCAAATGCCTCAAGGTGGGATAGTTCCC GGCGAAACTCCAAGTATTGCAGCAATGCGTGAGATGTTAGAAGAAATAGG AAGCGATAAAGGATATATTATTGCCGAAAGCAAATGCTGGTATAGTTATG 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CAAAAGGTAATTTAAATTTTGTTAACTTTCAGATAAAGCTTTTTGCCAAA TCGCAAGTAAGTGAGCTGGTTTAA >RF_0763 recJ, Single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ ATGAAACCACAAGCATCTATAAACGGTAAAATCTGGCAGCAGAAACTGAT TAACGAAGATATAGTCACCGAGTTATGTCGTAGTTTCAAAATTAGTGATT TACTTGCTAGAATAGTATCATTAAGAGTAAATAATCTAGAGGAAGTAGAA AATTTTTTGATACCGAAAATCAAAAATTTATTACCTGATCCTTTTCATCT ACTCGATATGAAAAAGGCTGTAGATAGAACCGTTAAAGCTATTTTAAATA ACCAAAAAATATGTATCTTTGCCGATTATGATGTAGACGGTGCTACTTCA GCTGCTTTACTTAAAAACGTCTTTAGAGATTTAAATATACTATGTGATAT TTATGTTCCTGATCGTATAGCTGAAGGATACGGTCCGACTCCTTTTGCTA TGCAAAAAATTAAAGATAACGGCACAGAATTATTAATTACGGTTGATTGC GGTGCTATGGCACATGAAGCCCTAAAATACGCAAAAGACCTTAACCTTGA TGTTATAGTAATCGATCATCATATAGCTACGGAAATATTACCGGATGCAG TAGCTATAGTAAATCCAAATCGTATTGATGAAAAAAGCGAATGTAAACAT TTGGCAGCCGTAGGAGTTGCTTTCTTATTTGCAACTGCAATATTATCGAA TTTAAAGAAGCAAAATTATTTCACGCAAACAATGCTTCAGCCTAACCTAA TGAAGTATCTAGATTTAGTGGCTCTTGGTACTGTTTGTGATATGATGAAA TTAACAGGCTTAAATCGTGCATTTGTCGCAAGCGGATTGAAAGTAATGCA ACAAAGGCAAAATATAGGGATTAAAACATTATATGATATGGCAGAGCTTA ATGAAATACCGAAATGTTATCATTTAGGTTTTATTTTAGGTCCTCGTATT AATGCCGGCGGTAGAGTAGGAAAGTCAAGTTTAGGGGCTAATCTCCTATC TACTAGTTGTTCTAATGAAGCAAGTAAATTAGCTGAAGAACTTGAAAAAC ATAATAATGAGCGTAAAGTAATTGAGTTATTAATGATAGAAGAGGCAACA GAAATTGCTTTAACTCAACAAGATAGTAGTTTATTATTTATCGTAAAAGA AGGATGGCATCCAGGCGTTATAGGAATCGTTGCCGGTAGATTAAAAGAAA AATTTGATAAGCCGGTAGCGGTTGTGGCTTTAAATGACGGGATTGGTAAA GCTTCATGCCGTTCTATTTTAGGTATTGATTTCGGTGCTGAGATTATCAA TGCTAAAAGCAAAGATTTGCTAATAGCAGGCGGAGGTCATGCTATGGCGG CAGGTTTTACCGTAACTGCTGAAAAATTACAAGAATTGCAGAATTTTTTT AATAATGCTTTTAGAATTAGTATAAATAAACTAGAAAATTATAAGCATGC GGAATATGATATTGATTTAACGGTTAATGGTGTGAATTTCCCTTTAATGA AGGAATTAAACACTTTAGAGCCTTTCGGTCAAGGAAATCATGAGCCTATA TTTAAATTCGATGATTTATTTGTATTAAAAGCGGATATCGTTGGAAGTAA ACATATTAAATGTATGCTGGCTCCAAATAAGCGAGGCTTTGGTAATAAAG CCTTGTCTGCTATTGCCTTTAATTCGGTAGGTACTTCATTTGAAGAGGTT CTATTAAGCCCTAAAGCAAAGAATATTGCCGCAATAGGAACGTTAAAAAC GAATAATTGGCAAGATAATTATACTATTCAATTAATTATAAGAGATATAC TTCTTAAAGAGTAG >RF_1089 recN, DNA repair protein RecN ATGTTTCATAGTCTCTTAGTTAAGAACTTCATTCTGATAGACGAGCTGGA AATTGAGTTTAATAAAGGTTTATGCGTTATTACCGGTGAAACGGGAGCCG GTAAATCTATTTTACTTGACGCTATTTTATTTTGCCTTGGTTATAAAACT TCAAACAATATAATAAAGCGTGGAAAAGATTACGCTGTTGTTAATATAAT ATTCTCTTTAAATGAAGAGATAAAAAACTTTCTAATCCAAAATTTTATTG AGCCTGAAGAGTTATTGCTTGTAAAATGTTTGCAAAAAGCCGAAGGGCGA AAAAATTTTTTTATTAATAATCAAGTAGTTAATAAAGCTATAATGCAGCA ATTAGCTACTTATTTATTTGAACTTCATGGACAAAATAATAATATTTCCC TTCTAGAAGCAAATACGCAGCGTGATATTTTAGATAGTTACGGAAATCTT TTGGACTTCCGAGCCGAGCTTTCCAAATGTTATCAGACTTGGCAAAATAC TCGGAAAGAAATTGCTGAAATAACACTTAAACAAAATTCTATAGACCAAG AAATCGATTATTTGAGCTTTGCAACGGAAGAATTAACTAAGCTGAATATT CAAATAGGTGAAGAAGAAAAATTAGCAAATATACGAAAAGATTTGCAAAA TAAAGATAAGGATTTACAGTTAATAAAAGATGTTCTAGAACAGATTAATA ACCCCGAAATAAATACATCGATTAATAGAGCAGAGAAATTATTAGCAAGG CAAGGCGATAATGAGCGTTTTGAAGCTATTGCTACAAGCTTAGAAGAAGC CTATAATAACCTAGAAGAAGCACGCCAAGGATTATCAAATCTGTTAGATA GTTTTAATTATGAGGAATATAATCTTGAAGAAACAGAAGAACGATTATTT TTAATAAAAGCTATTAGCCGCAAATATAATGTTCCTGCTGATGAATTAGG TATATTTTTAGATAAATCTTTAGAGCAACTCGGTATATTAAAAAACAAAA TAGCGAATAGTAATGAGTTAAAAGCTCAAGAAATGCTATTACAGAAAAAA TATTATGAACTAGCAAGCGATTTATCTGTAAAGCGTCTTATTGCCGCAAA ACATCTAGAAGAATCGTTGCATCAGGAGCTAAAACAGCTTAAAATGGCGA AAGCAATTTTTGAGATTGAGATAATCGCCGGAAAAGAGCCGACAGCCAGC GGCAATGACGATATTGTGTTTAAAGCTTCTACTAACCCCGGAATGGCAAC CGAAGCAATCAATAAAATCGCTTCCGGCGGTGAATTATCAAGATTCATGC TTGCTTTAAAAACTTCTTTGTTTGATAAAATGGTAAAACCATCTATTATA TTTGATGAAATAGATGTTGGGATTGGCGGAGAGGTCGCAGATAAAGTAGG TGAGCGATTAAAAAAACTTAGTAGCGTTACTCAAGTAATAGTTATTACGC ACCAGCCGCAAGTAGCAGGTAAAGCAGATTTGCATATAAAAATAGAGAAA ACACAGCTAGAGAAAGAAACAAAAGTAACGGTAAAAGCTTTAAATTTAGC TGAGAGACAGGAGGAACTCGCCCGCATGATTTCAGGTAAAACAATCACCG AAGCAAGTTTAAAAGCAGCAAAAGAGTTGTTGCATTTGTAA >RF_0868 recO, DNA repair protein RecO ATGAATATCAAAGATGTAGGAGTAATAATTGCTAAAAAACCTTTAAAAGA AAATACATTTATTATTACGGTTTTTACTAAAAATCATGGTTTATATTCGG GAGTTGTAAAAGAATCTTCTAAAAAAAGCAAATTTATATATCAAGAAGGA AATATTGTAGATTTTCTTTGGCAGGCAAGACTACACGAACATATCGGCAT GGCTAAATGCGAACTCATCAAATCTTACACTGGTTATTTTATCATAAATA AAGCTAAATTATATGCCTTTAATTCCGTTATATCTTTAATCAAAGAGTTA TTTCATGAAAGAGAAGAACATTCTAATTTTTTTTCATTTCTAATTAACTA TTTAGATAATTTATCAAAGAATTTTTGTTTTCGTGATTATATTAATTTTG AGCTAGCTTTACTTGCCGAGACGGGTTATAAGCTTGATCTTACCAAGTGC GGCGTGACTCATGTTACAACTGATTTAAACTATGTATCACCTAAATCAGC TAGAGCACTATCATATGAAGTAGGGAAACCTTACAAAGATAAATTATTGA TTTTACCAAAATTTTTACTTTCAGATGATAGTGAGATTACATTAGAAGAA AAAAGACAAGCTTCAACCTTAACAAACTATTTTTTTAATAGGTATTTGTT TCATAATAATAGACAGGCTGAAGCACGCCAAATTTTTATGGAGTATATTT TAAATAATTCTTAG >RF_0672 recR, Recombination protein RecR ATGATATATACCCTGACTATGAATAAAACAAATGATAATGATATAGACCA GCTAATTTATCTTTTTTCCAAATTGCCTGGGCTTGGTAGTAGGTCGGCAA GACGTATAGTGCTTTATCTACTACAAGACAAAGATGTTAGGTTAAAAAGC CTAATTAATAACCTTGTAGAGATAGATAAGAAAATAGTAAAATGCGAGAT TTGCGGTAATATGGATACGGAAAATATTTGCTGTATTTGCTCTTCTGAAT ATAGAGATAAATCGGTTATTGCCGTTGTTGAAACCGTAGCTGAATTATGG GCAATGGAGCGTAGCAGTAATTTTAAAGGTTTATATCACGTACTAGGTCA TAATTTATCGGCAGCTAGTAGGCAAAATCCTAGCATACTTCGGTTACCTG AATTACTTAAAAGATGTTTTGCAGAAAATATTAAAGAAGTTATTATTGCT ACTAATTCTACTTTAGAAGGTCAAACTACTGCCTATTTTATTACTGAATA TCTAAGAGAACATCCTGCTAAAATTTCTCGCCTAGCTAGCGGTATACCTA TCGGAGGTGAACTTGATTATTTAGATGAGGGTACCTTATCTGCCGCTATT AACCTACGCCAACCTTTTGAGTAA >RF_0335 relB1, DNA-damage-inducible protein J ATGACTAAATCAGCTTTCATAAGAGCACGAGTTGATCCGGAATTAAAAGA AGAAGCAGAAAACGTGCTTGATGAGCTTGGCATCACTCCTACACAAGCGG TTACTATGCTATATAAGTACGTAGCACGCGAACATAAATGGCCTACTACA ATAAAAATTCCCAATGCCGTTACTCTAAAAACATTTGAATCAACTGATAA TAAAATCGGACTAATTGCCTCTAATAACACAAAGAAAATGTTTAAAAAAC TTGGTATTTAA >RF_0827 relB2, DNA-damage-inducible protein J ATGATTATGAATACTGTAGATATTAGGTTACGTGTTTCAGAAGATATAAA GACAGAAGCAGAAGAAATATTTAAGCAAATGGGTATGACTATGTCGGAAG CCATGAGGATATTCCTGAATCAATGTATAAATAGCGGCGGTTTGCCTTTC AAACCACATATTAAGATTCCTAATAAAGAAACATTAGAATCATTTAAGCA GGCAAAAAACGGTGAGTTTGAAAGCTATAACTTAAAACAATTTGAAAAAT TTTTAAACGACACCGCTAAATGA >RF_0180 rnhA, Ribonuclease H ATGGATTCAAAAGTAGTTATATATACTGATGGTGCATGTGCAGGTAATCC TGGTCCTGGAGGATGGGGAGCTTTGCTTCAATTTAATGATACTAGCAAAG AAATATTTGGGTATGAGTTGGATACGACTAATAATCGTATGGAAATTACG GCAGCACTTGAAGCATTAAGGATTTTAAAAAAATCTTGTAATGTTGAGAT TTATACTGATAGTAAATATTTGCAACAGGGAATTACCGCTTGGATTCATA ATTGGATAAAAAATAATTGGTGTAAAAGCAACAATGAACCCGTTAAAAAT GCCGATTTATGGCAAAAATTATACGCAGAATTGAGTAAACATACTATTAT TTGGAAATGGGTAAAAGGTCATGCAAATAATAGCGGTAATATTGCTGCCG ATAAACTTGCAGTGCAAGGAAGAGAAACTGCTATAGAAATTTTAAAATGT CGTGGATAG >RF_1061 rnhB, Ribonuclease HII ATGGAAGTAGATCTATTACATTTTGAAAAAAAATATCATAACTATATTGT AGCAGGTATAGATGAAGCAGGTAGAGGACCGCTAGCAGGCCCGGTAGTAG CAAGTGCCGTTATAATAGATAACACTAATATTATACCGGGCATTAAAGAT TCTAAAAAACTTTCTAAAAAGAAAAGAGAACTATTATATGAGCAAATAAC TAGTAATTATGTTTGGGCAGCTGCTATTATTTCCCATATCGAAATTGATG AAATTAATATATTAGAAGCAACTAAAAAAGCTTGTTCTATTGCTGCGGCA AATCTTAGCCTTAAGCCGGAAATAGTTTTAGTTGACGGTAATATGCCGTT TAAGGATAAAAGATTTGTTAGTATGATTAACGGTGATAATTTATCGTTAT CGATTGCTGCGGCTTCTATTGTTGCAAAAGTTACTAGGGATCGTTTAATG CTAGATTTAAGTACTGAATTCCCACAATATTTATGGCATAAAAATTCCGG CTACGGTACAAAAGAACATATAGAAGCTATTAATATGCACGGCTTATCAC CGTATCATAGAAGAAGTTTTAAGTGTTGTTGA >RF_0604 ruvA, Holliday junction DNA helicase RuvA ATGATCGGTAAATTAAGCGGTAAGATTGATTCCCAAGGCGATGATTACAT TATAATTGACGTAAATGGGGTAGGGTATCTTGTTTATGCTTCAGGTAAAA CTTTAGGTAAACTTGCTGAAGGTGAGTTTTATAAACTATTTATCGAAACC CATGTTAGAGAGGAGCATATTCATCTTTACGGTTTTCTGACTCTAGAAGA GAAAAATTTTTTTAATTTGTTACAATCAGTAAACGGTATCGGTACAAGAA TGGCTTTATCTATCTTATCAAGCCTTACACCTTCAGATATTCAAATTGCT ATAAATAATGAAGATAAAAATATATTTAAAGCAATATCGGGAGTAGGGGC TAAACTTGCTGAGCGTATAGTGTTAGAGCTGAAAGGTAAAGTAGCGAAAA TATCAAGCGGCTCTGTTATTATTAAAGATAGCTTAAATATTAAGAATATT ACGCCCGTCGCAAGTAATGAAGTAATAAAAGCTCTAGTAAATCTAGGATT TTCTAGATTTGAAGCTCAAAACGCCGTTCAAGGCATCATTATCCAAAACC CCGAAATTTCTATTGATGAGTTAATCAAAACAGCCCTGAAAAACCGAAAT GCCGGTCTCTAA >RF_0606 ruvB, Holliday junction DNA helicase RuvB ATGACTAATATATTATCGCCTGAAAAAATTGAAAATGATCAAGAATTGCC GATAAGACCGTCATATTTGCAAGAATTTGTCGGTCAACAGCAGATTAAAG AGAATCTTTCGGTATTTATTAAAGCTGCAAAATCTCGGAATGAGCATCTT GACCATACTTTATTTTACGGTCCGCCCGGTCTTGGTAAGACTACGCTTGC TAAGATTATCTCTAATGAAATCGGCGGTAATTTCAAATCCACCTCCGGTC CTGCTATACTTAAAGCAGCTGACCTTGCTGCTATCCTAACTAATCTTGAA AAAAACGACGTATTATTTATTGATGAAATTCACCGACTAAATACTGCGGT TGAAGAGGTTTTATATCCTGCTATGGAGGATTTTGAGCTTGATATAATTA TCGGTGAAGGTCCTGCCGCAAGGTCAGTGAAAATAACCTTGCCGAAATTT ACCTTAATCGGGGCTACTACACGCCTTGGGCTGCTTAGTAATCCTTTGCG TGATAGGTTCGGTATTCCTATGCGGCTTAATTTTTATAATACTGAAGAAT TGAAGAAAGTTCTAAATAGAGCGAGTAAATTATTTGATATTGATTTGACC GATTCAGGTTCGGAAGAGATAGCAAAAAGAAGTAGAGGAACGCCAAGAAT TGCATTAAGATTGCTTCGTCGTATAAGAGATTTTGCAGCAGTTGACGGTA AATCAAGAGTAGATAAAGAAATCTCTGATTTTGGGTTAAATCGTTTGGAA GTTGATCACATAGGACTTGATAGCAACGATTATCGTTATCTAAAATTCAT AGCGGATAATTATAACGGCGGTCCTGTCGGAATTGAAACGATTGCAGCAG CCCTTTCTGAACAGCGTGATGCACTTGAAGAAACCATAGAGCCTTATCTT ATACAGATAGGTTTATTACAAAGAACTCCTAGAGGTAGGGTAATCACGAT TGCCGCTTTTGAGCATTTGAAAATGCCGATACCTAATCAATCACATCATC AATTTAATATTTTTAACGAGAATGAGTAA >RF_1173 ruvC, Crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC ATGATAGTACTTGGGATTGATCCGGCACTTGGGAGCCTTGGATGGGCGGT GGTTGCAAAGGATACCGCAAAGCTGAAATATTTAGCTAGCGGTATTATTA AAACAAATAGTAAAGATGAAATTCATAATAGACTTGCCTTTATTAACAGT 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CGGATATAAACGCAAGCCGGAAGTAGAGTCTTTAATCTCTATACTTTTAT CTGATGAAACCACATTAAAAGCAGGAATAGATAAAATTTTTGAGTTACCT GTAGAAAACAATGTTAATAATAATTCAAATAAAGGTCAAAATGGCACTCC TATTCTTCCGCCAACCCCTCCTCTAAATGGGAGTATGCCACCTTCTCCAC CCCCACCTCTGTTAAATGGAACACCGACTTCTACAGCTTTTAATAATTCA AATCCTAATCATAAATTTGATTTAAAAAATTTTGAAGCTACATATCCTAG ATTATATAAATCGTATAATGAATTTATTCAAAATACAACTTCAGCAAGTC AAAGTCAGGCAACCACAACGTCTAATAATATACCTGATACTAAGGCTAAA ATGGGGGAATCACTTGAATTACTTAAACAGAAAGTTGCTAAGCAGAATGA GGTAATAGGCTTAATACATAATGAAGTAACAAAATTGTATAACTTTTCTC CTAAAACTTTTGTAAATTTATTTAACACTGAGAACGAAGAGATTATCAAG AAAATTGAACAAATTGCTAAAAGAGAGGATATACAAAAAATACTTCAAGA TAATGATATAAAAATAACATCTACTTTTGTAAGTAAGATTTTTAATGAAT CGTTAGAACAAACGAAACAACGTCTTCGTTCATCTAATATAATAAATGCA AAACAATATAAAAGGATTGAACAATATGCAAACAAACAAGAATGCGTAAC AGAATTCTTAAGAATTACAAATCCTCTAGAGCAATTAAAGTTTGCTAATA AATATATAAATATTCTTGGACAAAGTACCTTTAATGGTAAACTTAATGAA TTAATAGAAAACCCTAATAAGTTAACGTTCTCACAAAAAATTAATTTTGT ACTTCAAGGGTATCAAGAATTAACTAGGGAAATTCCTACTGCTAAAGCTA ATTTAAATAAATTAAAACAAAATATTTTAGAAAAAATTGAAATTCAACAA TTAATCGCAAATAAAGATATAAGCCGAAAAGATTTATTGGATATACTAAA TAATAAAAATCCTGAGTTATTAAAATCACTTCTTGAAGCTAAGGTTATTT TAGAAGAGAATAAACTTAATAATTCAGCTAACGAAGTTGATTTAAAGGAA ATTATACCTTCTCTTAATTATTTAACTTCAGAGCAATTAACAAGCTTAAT TAATAGAATAACTATAGAAGGAGTAAAAACAGCACTTAAGGCTAAATGGC AGCAAGAAAATAAAACCGTATCTAATAATACTGAAAAGCCGCTGATTTAT AATAACGGTACTCCAATGCCTCCCCCGATTCCTAATGGCAATAGTAACTT TGGAACTAATGATTATCTAATTAGCATGGGTTATACACAGGAATTTATAG ATAGAATGGATAAGGTAAAACCTAACAATAATTTTGGTAAAAATCATAAT TATACAGCTACGGATTTTAAATCTAATGTAGGAAAAAATTATTATGAATC TACTTCAAAATTAGGAGGAACAGATATATTACTAACTGATTCACAAAAGT TAGAGAATGCTATTAAAAAAGAAGTATTAGCAAAATACATAGAAGAACCA AATAGAGATATGCAAGATGATTCTCTTTTAAAACAAGCATTTGAAGAAAA ATTTTACTATGCTGAAGATAAAAATACAAAAGTAATTCCTAAACCCTCTG AAGTAAATTTTGATCCAAACTTCATAGGACCAAGAACCGAAGTAGGACAA GAGATATACGAACTTTATGAACAAGAACTTCTAAAACTTGCAAGAGATCC GGTATTTATTGAGTATGTAAAAAACAATAATAATACACAAAAAGATGAAA GAGAATTATTAATAAGCTTTATTGAACAAATAGAGTCTAAACGTCCTGAA CTAGAACAAAAATACGGTAGTGATGTTCAATCAGAAGATAATAACCAGGA AAAGAAAGTAGGACATTTAAATATGAAACAATTCCAATCATTGTTTCAGC AAGAAAACGAATCTGCAAATGACGAATCCTCAACAAAGGATGATCCACAA CCTGAAGATAGTAATAAAAAGTCAGAGAAATCCGATTCAGAAACCGCTTT ATCACCTAGGTTATTGAGTTCTAACGATAGCAAAAATGATAAATCATCAG ATGACAAAAAATCACTTCTAGTCTTAAGATCTAGTGAAGAAGAATCAAAA AAAGATATAGCTTTAGAAAGCGAAGACGAAGCTATCGATATGTCATTCAA AACTGAAGCAATCGCAGAGCAAGATGAAGCGACACAGAGACAACAGGTAT CTGATGACACTAATAGGAAAGTAGCAATATTAGTTAAGGCAACTTCAACT CTTCATAAACCTGTTCACTATAATATTTTAAGTGATAGATTAAAGGTTGC TGCAATAGGTGCCGGTGATGAAGAAGCTAGTATAAACAGAGGCGTGTGGA TTAGCGGCTTATACGGCATTAATAAACAAGGAACTTGGAAGAATATTCCA AAATATCAAGGTCGTACAACCGGCGTAACTATCGGGGCCGATGCTGAATT CATCAATAGTCATGATGTTATAGGAATAGCTTATAGCCGTTTAGAATTCC AAATTAAATATAATAAAAAACTAGAAAAAACAGCTGTTAACGGTCATCTT TTAAGCATTTACGGTCTAAAAGAACTAATTAAAGGTTTCTCATTGCAGGC TATAACATCTTACGGTCATAATTATATTAAAAATAAATCTAAAAGTATTA ATAATATAATTGGAAAATATCAAAACAATAATTTAAGTTTTCAAACCTTA TTAAATTATAAATATCGTACAAAATACGATTTACATTTTATTCCTAATAT CGGTTTTAAATATGATTATTCAAGAGCTAGCAACTATAAAGAATATAATG TAGATATAGAAAATTTGATGAATCAAAAGAAATCAAATCAATCATTTGAA AGTAGTATTGGCGGTAAAATAGTGTTTAAGCCTATAGCGACCGTAAATAA TATAATATTAACGCCAAGCTTGTACGGTAATATTGAGCGTCACTTCAATA ATAAAAATACAAAAGTTAATGCAAAAGCGACTTTTAAAGGGCAAACATTA CAAGAAACAATTATTATACCAAAACAACCTAAGCTTGGATATAATATCGG TAGTAATATACTTATGAGCAAAAAAAATATAAATGTTCTGCTTGAGTATA ATTATTACACACATAGAAAATATCAAAGCCATCAAGGGCTTATTAAACTA AAAGTCAATTTGTAA >RF_1325 ssb, Single-stranded DNA-binding protein ATGGCAGGTAGTTTAAATAAAGTAATATTAATAGGTAATGTAGGGCGTGA TCCGGAAATTAGAACTACGGGCGAAGGGAAAAAAATCATTAATCTTTCCT TAGCAACAACCGAAACTTGGAAAGATCGCATTACCAGCGAACGAAAAGAA CGAACTGAATGGCATAGAGTAGTGATATTTAGCGAAGGGTTAGTATCTGT TGTAGAACGCTATGTTACAAAAGGTAGTAAATTATATATTGAAGGTTCAT TGCAAACCCGTAAGTGGAATGATAATTCAGGTCAAGAAAAATATACCACG GAAGTTGTGTTACAAAATTTTAATTCACAATTAATATTATTAGATAGTAA AAACTCTAATAATCATACTCAAGATTCAGGGCGTAGCGAATATAAACATC CTGAAGCTAAAAATCATTCCTTTGACCATAGCGACTTAGACGACGAAATA CCGTTTTAA >RF_0236 tatD, Putative deoxyribonuclease, hydrolase ATGCTAATAGATTCGCATTGTCATCTTAATTTACTTACCAAAGATACGGA TTTAGATTCCGTCATTCAAAGAGCATTAGAAAATAATGTACAGTATATGC AAACTATCTGCACTAAAATTGAAGATTTACCAATTGTTTTAGAAATAGCT GAAAAATATGAAAATGTTTTTGCTTCTGTTGGGGTACATCCGTGCGAAGT GAATTCTTCTATTAGTCATTGCGAGGCACTGCAAGTGCTGTGGCAATCTC AGGAAGCTTGGACAAGATTGCCACGTCAAGACTACGTCTCTCCTCGCAAT GACGCTGAGGTAATTATTAAGCTTACCAAGCATCCGAAAATTATCGGAAT CGGTGAGACAGGTCTTGATTATTATCATCAGCCTTACGATAAAAAATTAC AGCAAGATTCATTTGTAGCACATATACATGCGGCATCCGCTACTAATTTA CCTATTATTGTTCATACAAGAGAAGCAGATGAAGATACTATTGATATTTT AACCTCGGAAATGCGTAATAGTAAATTTCCTGGGCTAATCCATTGTTTTA CCTCATCAAAAAATCTAGCAACAAAAATGTTAGATATCGGTTTATATATT TCAATGTCCGGTATTATTACTTTCAAGAATGCAACTGATTTGCAGGAAAT AGTTAAATATGTGCCGCTTGATAGATTATTGATTGAAACCGACTCACCTT ATTTAGCACCTACGCCTATGCGAGGCAAACAAAACGAACCGGCTTTCGTT AGATATGTTGCCGAGAAAGTAGCCGAACTCAAAAATATCACCTCAAAAGA AGTAGCAAATATTACTACTCGTAATTTTAAAACATTATTTTCTAAATTTG AAAAGCATATTCGTTTAATTTGA >RF_p32 tnpR, TnpR resolvase ATGAGATTATTTGGCTATGCTAGGGTATCAACCAATCAGCAACTTTTAGA CCTACAGATAAAACGTTTAAAAGATGCTGGGGTAAAAGAATCAAGAATAT TCCATGACAAAGCAACAGGTAGTAACTTAGACAGAGCAGGGCTAAATAAC TTATTGCATAAGGTAGAAGAAGGGGATGTAATATTGATTACCAAGTTAGA TCGTTTAGGCAGAGATACTGCCGATATGATTAACTTAGTTAATCAGTTTG CTAATATAGGTGTAGCTGTGCGTTTTCTTGATGATGGTATTAGTACGGAA GGCAGTACGGGAAAAATGGTTATTACAATCCTAAGTGCAATAGCAGAGGC CGAGAGAGCACGGATACTTGAAAGAACTAATGAAGGCAGGTTAGAGGCCA AAACTAAAAAGGTATTAAGTTTGGTCGCAACCGTATTATAG >RF_0530 topA, DNA topoisomerase I ATGAAATTAGTAATAGTAGAATCGCCCGCAAAGGCAAAAACGATAAATAA ATATTTAGGTGATGAGTTTAAGGTCATTGCATCATTCGGTCATATTAGAG ATTTACCTTCTAAAAAAGGCTCAGTGTTACCTGATGAAAATTTTGCGATG AAATATGATATTTCCGATAAAGCCGGTAAATATGTAGATGCCATAGTTAA AGATGCAAAAAAAGCTGATGCAGTATATCTTGCAACCGATCCGGATCGTG AGGGTGAAGCTATCTCGTGGCATGTTGCAGAGGTAATAAAAGAAAAAAAT AAGGTTAAATCCGATGATTTTTTCAAAAGGGTAGCCTTTAATGAAATCAC TAAAAAAGCAATTATTCATGCCGTTGAGAACCCTAGAAAACTTGACGCTA ACTTAGTAAATGCCCAGCAAGCAAGAAGAGCTTTAGACTATTTAGTCGGC TTTACCCTTTCACCTCTTTTATGGCGTAAATTACCTGGATGTAAATCGGC GGGACGTGTACAGTCTGTGGCTCTGCGATTAATATGTGAGCGAGAAGATG 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TATGTCTCTCTTGAGAAAAAACGATTTATGCCTGAAGAATTAGGACGTTT GGTAACGGTATTCTTGGTCGGTTTTTTCAAGAAATATGTAGAATATGATT TTACCGCAGGTCTTGAAAATGAATTAGATGAAATAGCGGCAGGTAAGCTT GAGTGGAAAGCTGCTTTAAATAATTTTTGGAGCGGTTTTAACCATAATAT TGAATCGGTAAACGAACAAAAAATAACCGAGATTATTAGCTATGTACAGA AAGCTCTTGATTATCACTTGTTCAGTGAAAATAAAGAATCTAAAGCTTGT CCTTCATGTAAAACAGGCGAGCTTAGCTTAAAGCTCGGTAAGTTCGGAGC GTTTTTAGCATGTAGTAATTACCCTGAATGTACTTTCAGAAAATCTATTG TTAGCGGTAACGATAATAATGAAAATGATGGCGACCTTGCCGCTACTCCT AATGAGAATAAGGTTTTAGGTACTGATAAAGACGGAATAGAAATATATCT GAAAAAAGGACCTTACGGACCTTATGTTCAGCTCGGCGAACAAGAAGGCA AAGTAAAGCCAAAACGTAGCCCCGTGCCTGCTAGCTTGAATCAAAACGAC ATCACACTTGAGATGGCATTAAAGCTTCTAAGCTTACCGCTAAAAATAGG TATTCATAAAGATAGCGGCGAGGAAATTATGATAGGATACGGTAAATTCG GTCCTTACATAAAATATATGGGTAAATTTATTTCAATACCTAAAAAATAT GATTTTCTAAATTTAAGCTTAGATGATGCGATGAAATTAATTGAAGATAA TAAAGCGAAGTTAGAAAAGAAACAGGCGTAA >RF_1324 uvrA, Excinuclease ABC subunit A GTGATTATGAATCAAGAATATATTAAGGTACGCGGTGCTAAAGAGCATAA TCTAAAAAATATAAATGTTGATATTCCAAGGAATAAATTTGTTGTTATCA 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TCCGCAGTAGGTCATGAAGTAGATTATACTTTAATAGATTTAGCAGCCGA TAAAAGAGCTCCAACACCGACTGCTGCCGCAGAATTTGCTGTACCGGTAC GATCTATTTTAAATAATACTCTACAATCTTATGAAAAAATATTATTGAAT AATACTAGCAGGTTAATTAAATATCACGAACAAAATATAATAAATTACGA TAAAATACACAGATATCTCTCTCACTATATGAATAATAAGCAGCAATTAC TGGACGAAACCGGTTTTAATTTGCTAGATGCTTTACCGTGCTTTATTGAA CTACAAGAAACAAAGATTAAATCTTTTTCTAAAGAAAGAGTTAACCCTGC TAAAATACTCAATTACAAAACATTAGAATTAACACATCAAACAGCTTATC TATCAAAATCGGCAAATAATACTTTGAAAAATTTTGAGTATAAATTAGAA TTAAATAGTACGTTACTTGCAAGCCTTGATTATAATAACGTATTAAAACG AGGTTTTGCTATAGTTAAAGGAGAAACGGGTAATTTTTTATCTTCTAAAA TTACTGCTGCAAATGAAAAAATTTTTAATATTAAATTTTCTGACGGCGAA ATTAAAGTAGTTCGTAATACCGTCATTGCGAGCGACTAA >RF_0557 xseB, Exodeoxyribonuclease VII small subunit ATGACCAATACGAAAACTTTAGAAGAAAATATTAGCTTTGAAGAAGCTTT AAAAGAGCTTGAGGAAATTGTTAAAAAAATAGATAATGGACAAGAGAGTC TAGAGACGGCAGTTAATAGCTTTGAAAGAGGTATTTTACTTAAGAATCAT TGTGAGAAAAAACTAAAAGAAGCTCGGTTAAAAATTGAGAAAATTACTAA ACTTGCTGATTCTACGGGGGTCTTAGAAGAGACGGAAGTGTAG >RF_1021 xth1, Exodeoxyribonuclease III ATGAAGATAGTTACTTGGAATATTAATTCATTGCGTCTACGTATTGATTT ATTAAGAAAGTTAGCACATGAACATCAGCCGGATATTATTTTACTTCAGG AAACAAAAGTAGATGATTCGCTATTTCCTCTTGAAGTTATTAAAAATATA GGCTATGAACATGTAACATATTCAGGGCAGAAATCATATAACGGTGTTGC TATTATTTCAAAATTTCCTTTGAATAATGTTTTTTCTTTGGAATTATATA ATAGTGATAAAAGGCATATAGCAGCTATAGTTAATGATATAGAAATACAT AATTTTTATGTTCCTGCCGGTGGTGATATACCTGATATAGAGGTAAACTT AAAATTTAAGCATAAGCTCGAATATGTAAGGTTAATGCAGGAATGGTTAA CTACTAACCGTACTAAAAACGATAAAATTATCATTGTGGGGGACTTGAAT ATTGCACCGCTAGAACATGATGTATGGTCTAGTAAGCAGTTGAGAAATGT TATCAGCCATACCGATATTGAACGCTCATTATTGGTAGAGCTACAAAACT CGTTAGGTTTTATTGACAGTAGTAGACATTTTGTTCCGTTTGATGAAAAA TTCTATACTTGGTGGAGCTATAGAAATATAGATTGGAAAAAATCTAACAG AGGTAGAAGGCTTGATCATATTTGGGTTAGCGATAATTTAAAAGATGCAT TATTTTCTATCCATTTATTGTCGGAAGCACGTGATTGGTCGCCACCTTCG GATCATGTACCGTATTTTGTGACATTAAAAAGCGTCATTGCGAGCGAACG TTAG >RF_0250 xth2, Exodeoxyribonuclease III ATGAAGATAGCTACTTGGAATATTAATTCCATAAAAACAAGACTTAATTT ATTGCGTAATTTTTTATCTAAAGAAAATCCGGATATTTTATTATTGCAAG AAATAAAATGCGAAACCGAAAAATTTCCTTTTGATGAATTATCAGATTTA CCTTATAATTTTTATGTTCACGGGCAAAAATCATATAACGGTGTTGCTAT AATTTCAAAATTTCCTGCAGATGAAATAATTAAGGATTTTCCGAATAATT ACTGCAGTGATCAAGCAAGATTCTTAGAAATAAAATTATCATTACCTATA GGGTTTTGTAATATAATCTCGCTCTATGCTCCTAACGGTTCATTTGTCGG TAGCGATAAATTTGTAGCAAAGCTAGCATTTTATGATAATTTTATCAATT ATCTATCAACTAAAAAATCTTTTGATGAAAAAACTATCATAGGCGGTGAT TTCAATATTGCACCGTTCGATATAGACGTATATTCACCTAAAGCTCTTGC TGAAACTACTTGTTTTACTGAAATTGAACAAAAAAAACTACGTACTATTC TAAATTCCGGCTTTGAGGATTTATATAGATTGAGGCATCCGAGTAAACAA GAATTTTCATGGTGGGATTATAGAGCCGGATGTTTTGAACAAAATAAAGG TATGCGAATTGATATGATTCTTGGTTGTAATAATACTATTGACTATTTAG AAAATTGCTATATGGATTATAATTTAAGGACTCAAGAAAAACCTTCAGAT CATATACCGGTAATTGCGAGTTTTAAGAGATAG
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