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COG category: Replication, recombination and repair
Organism: Chlamydia muridarum Nigg, Nigg
Number of genes found: 69
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# Chlamydia muridarum Nigg, Nigg >TC0538 integration host factor beta subunit, putative ATGGCAACGATGACTAAGAAGAAACTAATCAGTACGATATCTCAAGATCA TAAAATACATCCTAACCACGTGAGAACTGTTATCCAAAATTTTTTGGATA AGATGACAGATGCTCTGGTTCAGGGGGATAGATTAGAGTTTAGAGATTTT GGCGTTCTGCAGGTTGTAGAAAGAAAACCTAAAGTTGGGCGTAACCCTAA GAATGCAGCAGTGCCTATCCATATCCCTGCTAGAAGAGCCGTGAAGTTCA CTCCTGGCAAAAGAATGAAACGTTTGATTGAAACACCAACAAAATCTTCT TAG >TC0713 conserved hypothetical protein ATGACAACATATCCTGTACCTCAAAATCCTCTTTTATTACGAGTCCTTCG CTTGATGGATGCTTTCTCGAAGTCTGATGATGAGAGAGATTTCTATGTAG ATCGCGTGGAAGGATTTATCTTGTACATAGATCTTGATAAAGATCAGGAA GATTTAGATAAGGTCTATCAAGAACTAGAAGAGAATGCAGATCGGTATTG TTTAATTCCAAAATTGACCTTCTACGAGATCAAGAAGATCATGGAGACAT TCGTAAATGAAAAAATTTACGATATTGATACCAAAGAAAAGTTTTTAGAA ATCGTACAGTCTAAAAATGCTCGTGAGCAGTTTTTAGAGTTTTTATACGA CCATGAGACAGAACAAGAGAAGTGGCAGCAGTTTTATGTTGAGCGTTCTC GCATTCGTATTATTGAGTGGTTGCGGAACAATAAGTTCCAGTTCGTTTTT GAAGAAGATCTTGATTTTTCAAAACATGTTTTAGAGCAGTTGAAGGTACA CTTGTTTGACGCAAAAGTGTCAAAAGAGTTGACACAGGCTCGTCAGCTTC TTGTGAATAAATCTAAAGTATACTATTCGAATGAAGCTTTGAATCCTCGT CCTAAGAGAGGGCGTCCTCCCAAACAGTCTGCAAAGGTCGAGGCAGAGAC CACCGTGTCTAGTGATATCTATACAAAAGTACCTTCTGCAGCGAGACGCT TTCTGTTCTTACCAGAAATTACGTCTGCTTCCTCGTTAACTTTTTCTGAA AAGTTTGATACGGAAGAAGAGTTCTTAGCACACTTGCGAGGAGGGGGTCG GTTGGAAGACCAACTAAATCTAGCTAAGTTTTCTGAGCGTTTTGATTCTT TGCGTGAATTGTCCGCTAAGCTTGGTTATGATGGAGATGGAGATGCCAGC GACTTCTTTGGTGAGGAATATGACGACGACGATGATGATGACGATGATGT TAAGCCGAAAAAGGCTGCCAAGCGTGGTCGTAAGAAGGCTCGTTCATAA >TC0755 conserved hypothetical protein ATGCAAATCATCCTCCCAGGAATCGTTCTAACCCACTCTCCAGCAGAAAA ACAACATGTCATAGCAAAAATCTTCTCTCCTGCAGGGCTTCTCTCTGCCT TCGCAAAAAATGGAGCCTCTCTATCCTGTGATTTTCGAGAATCTCTGCTC CCTATTTCGTTCAGCCTTTTTACCATTCAACATACTCCTCCCAAAATGCG AAAAGTACTACAAGGAGAACTGAAAAATCCGTTCACAACGATTAAAAATT CTTATCGACTATTGCAAAGCACCGGAAAAATGATTCAAGCCATTCTCAAA ACACAATGGCAAGAAAAACCTTCCCCCCAACTCTTTTCTCTTTTTTTAAA CTTCCTTCAACGAATCCCTGAAACTCCTCATCCTTATTTTTTTTCTTCTA TGTTCCTGCTTAAGCTTTTACAACATGAAGGAAGTTTAGATTTATCCCAC 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CAAGAAGATGCCAGAGTCTCTACTTACCTATCCGGATTTTTTAGATGAGA TAAAAACTATGCCGGTATATCCCCTGGAAGAGGTTCTTTCAATTATTACT CGGGCTGTGCAAGCTCTTGATACATACTCTTCCGCGTCAAGCTGTCTAGA ATGGATGTCTTTGCAGTTATGGTCTTTTAGAAATCGTCAAAGGACAGCTA TCCGCAATCGAAAAGGATGTTAA >TC0152 mutT/Nudix family protein ATGATGAAAACTAAGCACGAATATTCTTTTGGCGTTATTCCTATCCGATT TTTTGGTACTCCAGATAGAAGTACCTTAAAGGCTTGTTTTATCTGCCATA CAGATGGGAAACATTGGGGGTTCCCTAAGGGACATGCTGAGGAAAAAGAG GGTCCTCAGGAAGCTGCGGAACGAGAACTTGTTGAAGAGACAGGGTTAGG GATTGTTAATTTTTTCCCAAAAATATTTGTAGAAAATTACTCTTTTAACA ACAAAGAAGAAGTCTTTGTGCGTAAAGAAGTGACCTATTTTCTTGCTGAA GTTAAGGGAGAAGTGCATGCTGATCCAGATGAAATTTGTGATGTGCAATG GCTGAGCTTACAGGAAGGTTTACGTCTTTTGAATTTCCCAGAAATTCGTA ATATTGTTACAGAAGCAGATAAGTTTGTGCAAAACTATCTATTTGCTTCA TAA >TC0346 recF protein, putative ATGCGAGTTCATTCTTTATTTCTTAAAGATTTCAGAAATTACTCGGAACT GCGTCTAGAATTAGGACCAGAGATGAATTCTATCTTTGGTCTTAATGCTC AGGGGAAAACAAATATTCTTGAGGCATTGTATATCTTATCTTTAGGAAGA TCCTTCCGAACAAGTCGTTTGACTGAGGCTATACGCTTTGGATCGTCTCA 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TTGAAAATTCTTGCTGGTAAATTCAAAGGGAAGTCTTTAAAGACTTTTTC TAATCCTGCTGTTCGCCCAACTAGTGGTGTTGTAAAAGAGGCTGTTTTCA ATATTTGTGCAAATCACATAGTTGGTGCACGATTTTTAGATTTGTTTGCA GGGTCTGGATCTATGGGGTTTGAGGCCATCAGTAGAGGGGCAGGCTCTGT AACATTTGTGGATTCTTCTGTAGATGCGATTCGGTTAATTCGAGCCAATC TTGCTTTATTGGACAACAATTTACCCGTCCATATTCTTAAGCAAGATGTT CGTTCCGCTCTTCTGCGACTCGGTAAACAGAAACGGGCTTTTGATGTGAT TTATGTGGATCCTCCCTATTCTTTAGAGAATGCATTTCTTCAAGAGGTCT TGTCGTATGTTGTGCAACAATCACTATTGGATCCTGAGGGCATTCTTTTT TTAGAAAATGCTGATACCCAAGAGATTATAGTGAAAGGGTTAGAGCTCCG GAAACGTAGAAAATCTGGAGGGACTTTTCTTGCTGAGTATGTCTTGGAAA GGGAAGCATAG >TC0081 helicase, Snf2 family ATGCAAACAGGTACAAGTAACAGGTCTGTGAACCCCCTATGCTTTAGAGG AGAAATGCTTAATTTTCGTAAATTAAGAAGAGATTTTACAGCTAACATAT TGCAAGACGGAAAAGAGTTATTTACTCAAGGCGCTGTGGTTAGTGCAAAA ATCTTGTCCATGAATAGCGAGACAGTGTGTATTAGTGCACAAATTCGAGG TTCATACGACAATGTTTACGAGTGCGAAATTGAAGTAGATCGAGCGGAAT CTGATACTATAGATTCTAACTGCGATTGTTCTTACAATTATGACTGTCAG CATATCGTAGCCTTACTATTTTATTTGGAGCAGTACTTTAATGAAATGGT 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subunit, putative GTGGTATTGTTGAAAGATATAGAGTTCGTTTGTTTGGATTGTGAAACGAC AGGATTGGATGTAAAAAAAGATCGAGTTATTGAATTTGCTGCGATTCGGT TTACATTCGATGAAGTAATTGATTCTGTGGAGTTTCTTATTCATCCAGAG CGTGCTGTTTCAGCGGAGTCTCAAAAGATTCATAAGATTTCTGATGCCAT GTTAAAAGACAAACCGAAATTTAGTGAGGTATTCTCTACAATCAAGGGTT TCTTTAAGGAACGGGATTATATTGTTGGGCACCATGTAGGGTTTGATTTA CAAGTGCTTTCGCAAGAAAGTGAGCGTTTGGGAGAGACTCTTCTTCCGAA GCAGCATTATGTGATTGATACTTTGCGTTTGGCGAAAGAATATGGCGATA GCCCTAATAATTCTTTAGAAGCCCTAGCGAGGCATTTCAATGTTCCTCAT CAAGGGAATCACCGAGCAATGAAAGATGTGGAAATGAATGTTAAGGTGTT TAAACACTTAACAAAAAGATTCCGTACTTTGTCCCAAGTAACACATATTC TGTCTAAACCTATTAAAATGAAATATATGCCATTAGGGAAGTATAAAGGA CGGTTGTTCACAGATATTCCGCTAGAATATCTATTATGGGCTTCAAAAAT GGACTTTGATCAGGACCTTTTATTTTCTATTCGTAGCGAGATCAAATCTC GGAAAAAGGGCACAGGGTTTACTCAAGCAAATAATCCTTTTTTAGGATTG TAG >TC0843 helicase, Snf2 family TTGATTCTTATGATTCTAAACTCATTATCCATGTTTCGTCGTCAGGCTAC CCGCTTCTTACAAGATAACAGAGAATCTATAGCCGTTTCTTTTTTTAAAA ATACCTATAAAATCACCATTCCTGATGAAGACTCCCCTGATGGAGAGTGG 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exodeoxyribonuclease V, alpha subunit, putative GTGAATGAAACTTTACACGTACAAAATATTCTCCAATCTCTATTAGCTCA ACACATTCTCCTTCCTTTTGATCTAGTTTTCGCTCAGAAGCACTTGGCTC AGACATCTTCTTCCAATCGAGAGGCCGAGGCTTTTTTAGTTGTAGCGTCA GCACTGTTGCGTTGCGGCTATCCTTATTTTACTATCCATAAAGCAACAAT AAGCCCTACGCTTCCAGGAATTTCAAATAGGCTATTATTCCAATGGTTCC AGGCATTGCCTTCTGATGTGAAAGCGACACTTTTTGAAGTGTGTGATGAT AAAATTTATCTACGCTCATTGTTTCTTTTGAGAGAAAAAGTCTTTCAAAA ACTGCATACACTAGCAGAAGCGGTTCCAAGAACTTCTTTAATTTTTGAAA ATGTTTCTCAGCTGTCGGAAGAACAGAACGCAGTGTTAGGAAATGTATTA AATTCTTGTTTTTCTCTTGTTTGCGGTGGACCTGGAACAGGAAAAACATT TTTAGCTGTGCAGATGATTCGATTGATACTTTCACAAATCCCTTCAGCAC AGATTGTGGTGGCATCCCCAACAGGGAAAGCAGCGGCTCATTTGCACAGT GTATTATCTTCTCAGGAGATTATAGGCGCTTCCGTAGAAGTAGTTACCAT TCATAAATTTTTGAAAGATGTGAATAACGGACGTTCCCCAGTAGACTTAC TTCTAATAGATGAAGGATCTATGGTTACTATGAATCTTCTACATGGACTG ATAAAAACTATACGGGGGGAGATTCGAGAAGGGAAGTTATTTGCTGATAG AATGGTCATTTTTGGAGATGTGAATCAGCTTCCTCCTATAGGCATTGGAG TTGGGAATCCTTTTCATGAATTGGTATCGGAATTTACTCAACAGGCATTC 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integrase/recombinase XerD ATGTCCATGCTTTTCCCCCTTCATCAACAGTTGATAGAACAGTTTACAAT CTTTCTTTCTGTCGACCGCGGTATCGCCCCTCTTTCTGTTCAAGCTTATT GCCAAGATATCCTTCTTTTTTTGCAACGCGTACCCATTGAAACTACAGAC ATGATCAACCAAGAGAGTGTTTTTCTTTTTGTAGAAAAATGTCATCAAGC AAAAGAATCAGAAACGACTTTAGCAAGGCGATTGATTGCCCTAAAAGTGT TCTTCCATTTCCTAAAAGACGCTAAGCTTATCCATCAGCAGCCTTTCATA GAACATCCTAAAGTCTGGAAAAGGCTTCCTTCTATTCTTTCAACAGAAGA AGTCAACTCCCTACTGAATCAGCCGCTTAATACTCTGAATTTAGATGCTT ATATAGCAAACAGAGATACGGCTATCCTTTATACATTTTATGCTACAGGA ATTCGTGTATCCGAACTCTGTGATCTTTGTATTGGAGATATCAGTGATGA TTTTATTCGTGTGACTGGAAAGGGCAGGAAAACTCGTCTCGTTCCTATTA GTATCAAAGCACGACAGACTATTGATTCGTACTTGACCATGTTTAGAGAA AGATTTCAAAAGAAAAATCCCTCTGAAGAACATGTATTTTTGTCCATCAG AGGGAAAAAATTAGAACGCTCTTGTGTATGGAAGCGCATTACTTTCTATG CAAAACTCGTCACAACAAAACACATCTCACCACACTCTTTGCGGCACGCA TTTGCCACACACCTACTCAACAACCAAGCAGATCTCCGAATTATTCAAGA AATGCTAGGACATGCACGCATCTCTTCCACGGAAATCTACACGCATGTAG CTTCTGAGAGCATTATTGAAAAATTTCACACCCATCATCCGAGGAGTAGT TCCTAG >TC0575 serine/threonine protein kinase TTGCAACGGTACGAATTAATTAGGCTAATAGGCAGAGGAGGCATGGGCGA AGTCTATTTAGCCCATGATAAGGCTTGCTCTCGTAGGGTAGCTCTAAAGA AGATACGTGAAGATCTGAGTGATAATCCTTTGCTGAGGAAACGCTTTCTT CGGGAAGCAAAAATAGCCGCAGACCTCATACATCCTGGTATCGTTCCTGT ATACTCCATATGTAGTGATGGCGAATCTGTTTATTATACAATGCCTTATA TAGAGGGATTCTCTTTAAAACACTTATTAAAGAGCGTTTGGCAAAAAGAG ATCCTTTCCAAGGAATTGGAAGAAAAAACTTCTGTGAAGGCTTTTCTTCC AATTTTTGATAAAATTTGTGCCACTGTAGAATACATCCATTCAAAGGGGG TTTTACATCGGGATTTAAAGCCGGATAATATCCTGCTGGGCTTGTTTGGA GAAGTCGTTATTGTTGATTGGGGAGCTGCTATCTTTAAGCATGCTAAAGA GTTGCAGCAAGAAAAAGATGAAGAAGGTTTTTCTTCATATGGTCAGAAAA ATATCTGTTATTCCAGTATGACAGTTCCTGGAAAGATTGTGGGGACTCCT GATTATATGGCTCCTGAAAGCTTATTAGGAGCCGAGGCTTCGGAGAAGAC CGACATTTATGCATTAGGTCTTATCCTTTATCAAATGTTGACTTTATCTT TCCCATATCGGAGAAAAAAAGGGCGGAAACTGCCTTATGAAGACAGTATT TTGTCTCCTATAGAGATGGCGCCTTATCGAGAAATTCCCCCTTCTTTATC TCAAATTGCTATGAAAGCAATAGCTGTTGATCCTGTACAGAGGTTTTCTT CTGTTCAAGAGTTGCGTAAAGCTTTGCAGCCACATCTTCAAGGGGAATCA GAATGGACAACTAGAGATATTTTATCGACTAAGGATAGGAAAAATTGGAA 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binding protein GTGGTTTTTATGTTGTTCGGATATTTGGTAGGATTTCTAGCTGCCGATCC TGAAGAAAGAATGACGTCAGGGGGTAAACGGGTTGTTGTTTTACGTTTAG GCGTTAAATCCCGCGTGGGGTCTAAAGACGAAACAGTATGGTGCCGATGC AATATCTGGAATAATCGTTATGATAAAATGATCCCTTATCTGAAAAAAGG ATCTTCAGTGATTGTTGCGGGAGAGCTTTCTGTAGAGAGCTATATGGGGA GAGACGGTTCTCCTCAAGCTTCTATCTCTGTAAGTGTAGACACACTGAAG TTTAATTCAGGGTCTTCTCGTCCTGAAAGTCGGGGTTCGGATGAGGGGCG TCAGCGATCTAATGATAATGTCTCTCTTGGATTTGAAGGAGAGAGTTTGG ATACAGAAATCGCCCTTGATAAGGAAGTATATGCTGGATTTGGAGAGGAT CAGCAATACGCTAGCGAGGATGTTCCTTTCTAA >TC0124 trcF, transcription-repair coupling factor ATGGATTTCGACCCGACTAGCATAAATTTTTCACATTTTTCTTTATTAAA AGACTCCAAGCTCCCTTCTTTAGTTGAAAATCTTCACTCGGGAGCTAAGG CTTTTATTGTAGCGAAACTATTCAAAGAACTGCGACGCTCTATTGTTATT ATAACAACACCTGCAAGAGTTGATGATTTATTTGAGGATCTCACAACTCT CCTCAAAGAGTCTCCTCTTGAATTCCCTACTTCGGAGATAGATTTATCTC CGAAACTGGTCAATATTGACGCTGTAGGGAAAAGAGATCATATCTTGTAT TCTCTTCAAAAACAGTGCGCCCCTGTTGTCTGCATCACCACACTAAAAGC TTTGCTAGAAAGGACTCCTTCTCCAGAATCCTTGCTTAGCGATCATCTCG AACTTAAAGTAGGAGAAGAGCTCGATCCTGATACCTTAGTAGATCTTTGC AAAAATCTAGGATACCGCCATGAAGCTCTTGCTAGAGAAAAAGGTGATTT TGCTTTTCGAGGAGGGATTGTTGATATTTTCCCCTTATCCTCTTCGGAAC CCTTCCGAATTGAATTTTGGGGAGACCGCATTTCTTCTATTCGGTCTTAT AACCCTTCCGATCAACTTTCTACTGGGAAAATTTCTCAAATCACAATCTC TTCTGCTACAGCAATCATTCCAACAGACAAGTTATCTCATTCTCTTTTAG ATTATTTCGAAACGTTCCCCCTCTGTATCTTTGATGAGGTTTCTTCACTT GAAGATAATTTCTCAGATATTGCTGGGATTCTATCCTCCTTACCGAAACG CTTTATTCCTATTCAAGATCTGTGTCGACGAATACTAAGAGAATCTGTTC CGCTATTCTTTGAAGAAAATCTATTTCCAAATCTTCTTACACATAAAGAT ACCGGGTGTGCTCTAGAAGTTTTTCATGAAAAAATCTCTGTTCAAAGAGT TTCTTTGCCATTTATTTATCCCCATGCGCTAATAGAAACAAGCCATGAAC AGAACCCTCTGCTTGCATTTTTAAAAACTTTCCAAGACTTTTGCTCTGAT CGTACACTCTCTTTAGCTCTATATAGCTCCAATACTAAGTCCTTAAAAGA AGCCCATGATCTAACAGCGAGCTTTATCAAAAAGCCTCAAATTTATGATT GCCCTAAAGCACTTTCTTCTAGTTTTGCTTTAGTAGAATCTGGGTTCGCA GCTATTTCCCTTTCTGAATTCGCTGCTAATAAGGTTCTCCGCAGACAAAA ACAGCGAAACTATTTTTCTTCCACAACAGAAGAAGTATACGTTCCTGTCC CAGGAGAGACCGTTGTCCATTTGCACAATGGAATTGGGAAATTTATCGGC 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