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COG category: Transcription
Organism: Mycoplasma synoviae 53, 53

Number of genes found: 20

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# Mycoplasma synoviae 53, 53

>MS53_0127 conserved hypothetical protein
TTGAAAAACAAAAAACTAACATATAGTGAAATTTCACAAATTAGCGGAAT
TTCAATTGCATCTATTTCTAGATATTATCGCGATGGTTATCTTTCAAAAG
AAAAAAAACTAATTCTAGAAAAAATAATAAGTGACTATGGACTAGAAACC
AAAGATCATTTCAAGCTAACTAAAACCGTTAACTATAATTTAATCTTTGC
GCTAATTCCGCAGTGACAAAATCATAAATTTAGTCCAATTATAAGCGGGC
TAGTTAACGAAGCTAATAAAGTAAAGCAAAAAGTCTTTAATTTATACTAT
AACACCGATAAAAACGATTTTATTGAAAATATTTATCTAGCGCTAAAACA
CAATCCAATTGGTATCGTGGTATTTTTCAATAAAAAAAACGAAGAGCAAC
TTGAGTTTTTAAAAAAACTATCAGACCAATGCAACATCTTTATCTACGGA
TACACCTACGATGGTTTAAATAGCATTAAAATCGATTTTACCAAAGCCTT
TTATAAACTAGCTTATTTCATGGATTTATATTTTTTATCTAAAAAAAATA
TTGCCAAAAAATTAGTCTACGTATTTAATAATAAAACCGAAAAAGCAATT
CAAAATGAAAAGATCGCAGGAATTGAAAACTACGCTAAAAAAAATAATAT
TGAAACTGCTTTTTATAATTTAAATTTATATTCTAAAAAAGACGTTGCTT
CCTTTTTTGAATTTTGCAAAAAAGGAAGTTATAAATACATCGTATCTTCT
ACTAGAGAAATTTTTGCGAGCTTAATGGCGGGTAATTCTGATAACTTATA
TATAACCGATATTGGTTATATTTCAATTTATGATCAGATTCGAAATTATT
TATTAAAAATTCACATCGACTATCCTAATATTGGAATTGAATTTCACCGT
ATGATTAGTAGCTATCTTCTGGAAAGTGAATCTGGTACAATAAATAAAAA
CATGGAAGTAGAGATTATAAAATAA
>MS53_0511 conserved hypothetical protein
ATAATGAAACTAAATAAAAAAGTTCTTCTTTATTCTGGTGCAGCCCTAGC
TGGAGTTGCTACCATTTCTGGTCTTGTTGCTGGAAAAATTAACTTTAAAT
ATAAACCAAGTATTTGAAACTATAAATCATATATTTCAGATGAAAATTTA
AGAGTTATTGATAAAAACTTTGACTATAAACAATTTGATACTATTTCACA
ATTCAGTAACGCTTTAATAAATAATAAAGCCGTTGCTGGAATTGGTTCAG
ATTTCTTTGCATTTAATTTAGTTAAAAATAACCACATTCAAAAAATCGAT
TATTCAAAACTTTTCGGAGTACCTGAATTAAAAGATTTTAATACTCTTCA
AAAATTCATGCAACTAATTTTAAAGCCTGAAATTTGAAATCACTTTAATA
ATAAATACTACACCAAAGCGCTAAATGAAATTAGCAAAAACAAAAGCCAA
GATCAATATCTTTGAGAATATATGTTTCCATATTATTCTCAAGATGCAGT
TCTGGCATACAACATTAAAAAAGTTAATATCCCTGAAAAATATAAGCTCG
AAGATGGCTCAGCTAACTTTGATTTAATTTATTCAGATATGAATTTAACC
GGAGATAAAAATTCAATGGTTAATCTTTTAAAAATGCTTAATTTCATCGG
TTACAAAGAAATAATTTGAACCGATGCTGTTAGAGATAACATGCTTTATG
GATCGGCTTATACTAGGCTGCAAAATGGAAGCTCAACTGATAAAAACTAC
ACCGGTAATGTAACTTTTGATAATTACAAAAATCAAATCGATTCATTTAC
TAATTTAATTAAAGATGGAACCTCTAACGACGTTAAAGACAATCAAAAAA
TTACCTTCGAAGGTGATGGACTTCAAATTGTTAATACACTTCTAGATCCT
ACTAGATTTGACATTACTTCTTCACTAATGTATAACGGAGATGCAATCGA
TGCATACTATGGAGAAGATAACTTTGAAAGCGTTGGTGATGGAGCTATTA
GAGTTGTTAAATTTAAAAACAATCTTTTATTAGTTGATGGACTAGTAGTG
GCAGCAACTAATAACGATGAAACCAATGAATTAATCTACGATACGCTTAG
AAATTCATGAATTAAAAACGTAGGAAATATCTACACTCAATATAAAGACC
TACTTTCTAAGAATTTAATCAGCGATAGCGATTCAGTTGAAACTCAACAA
AAAGTATTAACCGAAAGCGCCGTGGCAGATTATTGAAAAGACTTCCGTAA
CATTGACTTTGAATCATTTGCAGAAGATAATGACTTTGAACAATCTGCTG
CAACAGAAACTCTTGATAAATATTATTCAATGTTAAATTTAGCTTTAGTT
GAAAACAAAGATAAATTTAATAGTTTTTATGAAATGCAAGATGATCCTGA
TGCAGATTTCGAAGAAAAAATAAATCCTTATCCAAGCATTTTCTTAAGTT
ATCTAAAAGACAATAAAGACGAATTATTAGATAAAATAGTTAGCTCTTAC
AAAAATAATTCACTGAAAGATCTGCTAGAAGAGCAAGATAATTTTGAAGA
TAAATATTTAGTAAATTTAGTTAATGAAAATTATGAAGACTTAACTAGCG
AAGATTATTATCCAACTTCAACAGAAGATAGCGAACTTAAAGAATCACTA
AGTCAATTTCTTGCAAATGCGCTTTCGTTTATTGATATTTCAGAAGATCA
ATATAGCGACTTACTTACTGAAAAATATTTAAATTTAAATAACTACGATC
ATATAAATTACGATCCAACTCAAAATATCGATTACGAATTTATAAAAAGA
AATTATTTCGCATCAGCTCTTGATGGTCAAGACGAAAATGCTTTAAATAT
TTACCAAATAGTAAAAACTGATGAAGTAGATTACAAAGGAATAGAACCTA
TTTCACAAGATCTACAAAGCTTAGTTGATTCATATTACTACAATAGAACT
AAATCTTAA
>MS53_0095 conserved hypothetical protein
ATAATTGAAGCACTATTATATATCCAAGGTGATGAAGGATTAAATCTAGA
ACAAGTTAAAGAAGTCTTTAACTTGAATAACACTCACGAAGCTAAAAAAA
TAATGCAAGATTTTCAAAAAGATTTCAACAACCTAGATAGAGGCTTAAAA
GTTGTAGTTTTTGATGAAATCTTTAAACTAGCAACTAGAGAATCTGTTAG
AGCTTACGTTTCTAAATTAGTAACTACTACTGGAAAACAAAGACTAACCA
GCGCTGCTATTGAAGTAGCTGGAATTATCGCTTACAAAGGGCCAATTACT
AGAGGTCAAATTTCTAAAATCAGAGGTGCAGTATCTGATCACATAGTTAA
TAACTTACTTAAAAAAGGAATTATTCACGAAGTGGGAGTATCACACACTC
AAGGTAATCCAGTTTTATATGAAGTAAGTTCACAGTTCTATGATCATTTT
AAAATTTCATCTAAACAAGATCTTCCAAAAATGCGTGATTTTGATTACTC
AGATGGTTTTGAAGATGAAAGTGAATTTGACATTTTCCAAAGTCAAAGAG
AAATTTAA
>MS53_0006 conserved hypothetical protein
ATAAAGTTAGTTATTGATGTTGGTAATTCTTATTTAAAAATAGGAGTTTT
TCATGATTTAGAATTAATAGAGCTTAAAAAATTTAAAACAAAATATTTTA
AAATTTCATATTTTGAAAACTTTTACAAAAAAGTATTTGCAAAATACAAA
TTTAATTTATTTATAGTTTTTGGTAGCGTGGTTCCAAGTATTGAGCAAAA
GTTTTTAGATTTTGTTAAAGAAAATAATTTAGAAAACAACTTTTTTTTAA
TTAATAATTATTTAAAACTTTCTTTTAAAGTGCCACAAGAAAAATTAGGC
CTTATTGGTAACGATTTACTTGGTGCTATGGAATATGCTTCTAAAGAAAC
GAGTAATGCACTTATTTTTCTTTTTGGTACAGCATCAGTTGCTCTTCTTC
TAGAAAAGCTAAATTTTAGCGGAGCAATAATAGCACCTGGAATGAATTTT
AGTTTTAATAATTTATTATCTAAAGCTAAAAAACTAAAAGGATTTAAGCT
TCACAAAGAAAATGTTTCACTGTGAAATTTAAACACTCAAGATGCTCTTG
AATCTGGATATGAGAATTTAAAAAATGGTTTTATTAAACAAATAATTTGT
AAAAGTAATTCTAATTATCCTGTTTATATTTCTGGAGGAGATATTAGTAA
TTTAAGCCCAGAAATTAGTCATCAATTTGTAGATAATATCGTACTTAAAG
GTTATTTACTTATTTACCTTAAAAATTGTTAA
>MS53_0324 hypothetical protein
ATGACTCAAAACAAACCTAAAACACAAAGACAAAAAAGAATTGAAAAAAT
TCAAATTCTATATCAAGTAGAGCTATTAAACTTACAAAAAGACTTTGATT
TTGTATTAAATATGGAACCATATTTAGATGCAAAGCAAACTAAAGAGGTT
TTTGTAGTTTTAAAAAATTATGACTATTTTAAAAACTTTTTAGAAAGCCT
TTTAGATCCAAGCTGAAACTGACAAAGATTAAGTTATATGCTTAGAGCAA
TTCTACTTAACGCATGTGCTGAATTTGAATTCATCGACGCTAGAATAGTA
ATCAACGAAGCGGTAGAAATTACTAAAATATTTTTCCAATTAACAAGCGA
TACATCTGCAAAAGAATATAATTCTATTGATTATAATTTATTTAAATTTA
CAAATGCACTTTTAGAAACTTACTACAAAACAAAGGTAAAAATTGAAGCT
ATTAAATCAAACGTTAAATAA
>MS53_0548 conserved hypothetical protein
ATAGTTGCAAAAGAGCTAAATATTACTGTTTCACAGGTAGAAACAGTGCT
AAATTACTTCAAAGAAGGAGCCACAGTGCCTTTTATTGCAAGATATCGTC
AAAGCCAGACCAATAATTTAAACGAAGAACAAATTTATGCCATTCAAAGC
CTATATTTATATGCCAGTGAGCTTAGCAAGCGTAAAGAAAAAATAATCGA
AAAGCTTAAAGAGCTTAATTTATTAAACAATGATCTTGAGCAAAAAATTA
ATTCTTGCACCAAAAAAAGCGAACTGGAATCTATTTATGAACCATATAAA
TCAGGAAAAATAACTAAAGCTAAAATGGCAATCGAATTAGGATTAATGCC
GCTAGCTTTAAAAATTTGAAACAATAAAAATTCTAGATTTGATTTAAATT
TTGAAGCTAGAAAATTTTTAAGCGATAAACTAAAAACTTTAGATGAAGTT
ATTTTAAATGTTAACTATATTTTAAGCCAAAAAATTAGTGAAGATTTTGA
TCTTAGAGAAAAGCTAAAAGAAAATATTTTAGCTTACGGAAAACTCATTT
GCAAGAAAACTAAAGAACAAGACGAAAACGATAGATTTAAAAATTATTAT
CAATATTCAACACCTATTAAATATGTTAAAAATCACAATATAATGGCAAT
TAATAGAGGAAGCAATTTAAAGAAAATAAAGTGAGATGTTTACCTTAATT
TTGAAATTTTAGAAAGAATTTCCTTAAGAAAAATTACTAAATTTAAATTC
AATGAAGCCTTATTAAAAGATGCAGTTAACGATGCTTTAAAAAGACTAAT
TTTACCTAGTTTGAAAAATAAAATATTTAGCGATTTATTCGATGAGGCAG
AGAAAAAATCAATTGAAATTTTTTCTAATAATGTTGAAACTCTACTAAGC
GCTCCTGCGGTATCTGGGCACAACATATTAGCTATAGATCCTGGTTATGT
AAGTGGATGCAAACTGGCTGCTCTTTCAGAAAAAGGAAGCGTTTTAGAAA
TAGCAACCATTTATCCAAATGAACCTAGAAGTAATGTTTCACAAGCCAAA
ACCAAAGTTTTAGAATTAATTAAAAAACATAATATTACTATCATAGTAAT
AGGTAATGGAACCGCTTCAAGAGAAACCGAGCAATTTATTAATAATTTAA
TTCAAGAAAATAATCTTGATAATATTTACTTTTGCATAGTTTCAGAAGCA
GGAGCTTCGGTATATTCAGCTAGTGAAATTGCAATCGAAGAATTTCCAAA
TTTAAGCGTTGAAAAAAGATCTGCAATTAATATTGGAAGAAAATTTTTAG
ATCCATTAAATGAACTTGTAAAAATAGATCCAAAGTCAATTGGAGTAGGT
CAATATCAACACGATGTAAATCAAAAAGAACTTCAAAATTATTTAAATTT
TAAAGTTCAAAAAGTAGTTAATAATTACGGAGTTGATTTAAATAGCGCAT
CAAGAGAAATTCTTTCGTATATATCAGGTCTTGACAAAAAAACTTCCCAA
AATATAATTAATTATAGAAACAAAAATAAAAGTTTTAAATCAAGAGATGA
AGTTTTAAAAGTTGATGGAATAGGCCCAAAAACTTTTGAACAATCTATTG
GTTTTTTAAGAGTTTTTAATTCAAGTAATTTTTTAGATAAAACCGCAATT
CATCCAGAGTCATATAGCCTTGCCAACAAGATAATTAGTGAATATAAATT
AATTCCATCTGAAGAAGGAATTAAAAACTTAGAATTAAATGCTAAAGAAT
TATCAGAAAAATATAGTTCTTCAATTGAAGAGATAAATTTGATTTTATCT
TCACTTAAAAATCCAACTAAAATAATTAGATCTTCAAAGCAAGGATACCT
CTTAAAGAAAAATTTAATTAATTTAGAAAATTTAAAAATTGGAGATATAG
TAGATGCGACAATTGATAATATCACCGATTTTGGATTATTTTGTTATATA
GGTTTAAAGGAAAGTCTTTTTGTTCATATTTCTAATTTAGCTAAAAAAGG
AAATATCTACGAATCTTATAACTTAAATAATTTAATTAAAGTTGAAATAA
CTGAAATAAACAAAGAAAATAAAAAAATTTCTGGCAAAGAAATTTAA
>MS53_0109 conserved hypothetical protein
TTAGGATTTATAATTTTTAATATGTTATCTGATAAAAATAAAACCGAGCA
AATACTAGAGTATTTAATGGAATTAATCCAAACTGGACAAATGCCGCCAA
ATAAAATTATGCCAAGTCAGCATCAGCTGATGAAAAGGTTTGAATGCTCT
AGAAATATAATTGCTGCCGCTTACAAAAAACTTGAGTTTTTAGGTGCAGT
TTATTCAATTTCTAAAAGAGGATATTTTGTATCAGAGAATTTTCACAACC
TAATAAAACCACTTAGTTTTTTACTTGGTGTATCTCGTCAAGATGGATAC
GAAATTAAAAACGTAGATACTTTGCCTGATTGAGCTACAAAAAAACATAT
TATTTTTACTAATGGTTTTAGAACTTTTTTCAAAAATTATTTTAAAGAAG
ATAAATTAATAGCAGAGTCAGAAATTTTTCTTTCTTTAAAATGCGTTAGC
AAAAAAGAAAACATTAATTTAAATATTCCAATTACCGATCTTTTAATTCG
ACGTAAAATTTTAACCAACGTGGTTTATCAGATCGAATTTGAAAAAATCA
TAAAATTTGGAGCTAACCCTAGCGTTGCTGTAATTTTTTATGGCTACGAT
GCCGATAGCATTTGCATTGACGGTAAATTTTACGTAGATCCAGAGAATTT
TAAATTCTATCATCAAGAATTTTCACTTAACTAA
>MS53_0379 greA, transcription elongation factor GreA
ATGGAACAAGAAAAAATTTTTTTATCACAGGAAACTTTAGATAAATATAA
AAAAGAATACGAAAAACTTGTAAAAGTTGATCGTGTTGAAATTCAAAATG
CTCTTAAAGAAGCTAGAGCTCAAGGGGATTTATCTGAAAATGCCGAATAT
GATGTTGCTAGAGATAAACAAGCTGTTGTAGAAGCTAGAATTTTAGAACT
GGAAGGAATTCTAGATAAAGCTCAACTAATTAAACATAAAGATGAAAATA
CCATTTCAATTGGAAGCAAAGTTACTTTTTTAGATTTAAGCACTAACAAA
GAAGACGAAGTTACAATAATGGGAATTCATGACGCTGATCCATTTAACAA
AAAAATATCAAATTACTCTCCGCTTGCGACTGCAATGATGTCAAAAAAAG
AAGGAGACACTGTGGAAGTTGAAGGATTGGAGAAATACGAAATTAAAATT
ATAAGTGTTCACAATAGAGATTAA
>MS53_0353 hrcA, heat-inducible transcription repressor
ATGAAACAGCTAAAAAAGCAACATGAAGAAATTCTAAAAGCAGTAGTTGG
GGCATATTTAACTCAAAAAAATGAAATTTCTTCTGCGCTTCTTGTTAAAA
ACTATGGCATAAAATTCTCTCCAGCTAAAGTTAGGTATTTAATGACGGCT
TTAGAAGATGAAGGCCTGCTTGTTAAAGAAACTAAATCTAGCGGTAGAAA
GCCAACTAACAAAGGTCTTGAATATTATGCAAAGTTTTTATCAAATGCAT
TTGATTTAAAACTTATTAATAATTTAGAAAAAATCTTTCTAAATCGTAAA
GATAATATCTATAACACAATAGAAGAAGTCACCAAAGAATTAGCGAGCCT
TACCGGAGCTACCTTTGTTACTAAATTTAAAGATCCGAATTTAATACTTA
AATCTATAAATTTATTTGAAGTTAGCGAGAGCCTTGCAACTATTATTTTG
GTGGTGTCTAACGGCGAAGTTTTATCAAGAAAAATTGATATTCCTGAAAA
TAAAGCTATTAAAATTAGCGATTTAAAAATAGCCATGAATATCTTCCAAG
ATAATTTAATAGACTGCAAACTTATCGATTTAGAAAAAAGGATACTGCTA
CTTAAAGACATATTAGCTGAAAAAATAATTCAATACGAAGACGTTATTGA
ATCTTATGTAAAAAGCATACTTGGAATTGGAATTAAAAGCCAAATCTATG
GAAGAGAAAATATTATTCTTTCTAGAAAAATAGCTAGAGAAGATGTTAAT
GAAATATTAAATATCTTAGAAAAAAATTCAATCTGAGATGCTTTAGAGAA
AAATTCCAATGACTTTGAAGAAATTAGAATTTCTATCAACTCTAAGGGGG
CATTTTTTTCAAAAAGAATTGACGAAAATAATAATTTAACTGAAATTTCA
GTAGTAGCTCCCAATGAAAGTGATTCTAATTCAATTAAATCTGGAATTAT
GCTACTAACTAAAATAATAACCAATAATATAAACGAGAAAGAAAAGGATA
AAAATGAAAGAAAACATTCTTAA
>MS53_0195 nagC, N-acetylmannosamine kinase
ATTTTTGCCCTTGATATCGGGGGCACTTCTATTAAATATGGAATTATAGA
TTTCAAATACGATATTTTATTTTCATCTAGCGTTAAAACCAAAAAAGAAA
AAATGATCTTTCAGGTTGAAAAGCTAATTCTAGAGGCCAAAAAAAGCTAC
GATTTTGACTACGTAGCAATATCATCAGCAGGAGTAGTTGATAGCAACAG
TAACAAAATAACCTATACCAATAGCGACTATAGAGTTTGAACCGGCTTTG
ACTTTAATATAGTAGCTAGAAATACCAATACTAAAATCGCAATGATCAAT
GACGCAAATGCTGCTGCGCTTTCAGAGTTAGTTTCTAAAAAACACGATAG
CTTCGTATCTATCACCCTAGGAACTGGCCTAGGCGCTGGAATAGTTTATA
ACGGAGAGATTTTCCAAGGAAAAAACTTTCTTGGCGGAGAGATAGGAAAT
AATTTAGCTTTTAAAAACCAAAAAGAAAAAATCAATGAAGGGCTTTCTTT
TTCTAGATTTAATAAAAAAATATCGCAAAAATTTAAAATTAAATCTAAAA
CTCCAAGCGTATATTATCCAAAGCTATATAAAGAAAATCAAGACTTTAAA
GTCTTATTTAACAACTACGCATCTAAGCTTGCTTATTGAAGCTTTGTGAT
AGCTATAATTTTAAACGTAGATCACGTATATATCGGTGGAGCATTTAGCT
TTGTAGATGATTTTTTATTTGACAAAGCTAAAGATATCTTTATTTCAATG
CAAGATGATTCTCCATATAAAATTAGCTTTTCTAAAGCTAGTTATAAAAA
TAACGCCGGAATAATCGGCGCTACATATTTTTTAAAACAAAAATTTAATC
TAGCTTAG
>MS53_0685 nusA, N-utilization substance protein A
ATAATGGCAAAAAAAAAAGAAAAAGACACTTTTAAAAATGCATCTAATTC
TAAAAAATGATTTCTTCTTTTAAATAGTTTTTCTAAAAACAAAGAAATAT
CAAATGACGAATTCATCGCAATGAGTCAAGAAGTAATCAACCACATCATT
AATAGAAAACTAGACCCCGAAGCCGAGGTTGTTTTTTCTGTTGATAACGA
AAAAGAAGAAATACTTCTGCTAAATAAAAACACCGAAGTTGTAGAAGATA
GCGAAGCTGCTATGTATGATGAACTTTTAGGTATTTCTTACATTGGCCTA
TCAAAAGCTAAAGAAGTAAACAAAAACGCTAAAGTAGGTGATTTAATTTC
ATATCCTATTGAATTCAATAGCTTTGATCAAAAAAATCTAGTAGCTATGA
GAAATGGCTTTAGCGCTGCTATTGCCGAAAAAGCTAAAAATAGATTATTT
GCTAAATACCACCCATTAATTGGTAGCAAATTAATGGTTCAAATCGCTAG
CAAACACGAAAACGGCGGATTCTTTTTAAAACTAGAAGATGGCACTTCAG
CATATCTTCCTAAAAACTCAATTATTAAATCAGTTGAGCTAAACCCTGGG
CAAAAATTTGACGTGTTCCTTAACTCAGTTAATATCGATGCTAAAGGGCT
TTACCTTGAAGTTACCATGACATCACCTGAGCAAGTTAGAGATGTTTTAT
TTAGAGAAATTCCAGAGATTGCTAACGGCGATTTAATCATTAGAAACATT
CAAAGAATTCCAGGTGAAAGATCTAAAGTTGTAGTTTCACTAAATCCAGA
AAAACAAAGTGCTCATACACACGATCTTTTAGGGGCTATGTTTGGTAACA
AAGCTCAAAGAATTAACGATGTTTCAAAATCATTAAATAACGAAAAAATT
GACGTTATTAGATTTGCAGAAAATCCAAAAGACTTTATTAGAAACGCAAT
GTCACCATGTCCTGTAGTTGATGTTGTTAAAAGCAAAAAAGGATTCTATG
TTATAGTTCGCCCTGAAGATGTATCACTAGCTATAGGATCAAATGGTGTT
AACGTTTCACTAGCAAGTAAAGTAACTAATAATAAAATCGATGTTTTAAG
CACCGAACAAGCTTTCCAAGAAAAAATTTACTTCCAAGATAATTACGTTC
CAGTTCACTACACACCAAGAGAAAGAAATAAAAACAATTTCAAAAAACAA
GCTAGAGAAAGGGCTTCTTTTGGTTTTGACTTTGGAATTGAAGAATTTTC
AAAAGACGTTGCCAACTTTATTTCTAAAGTAGAACTTGAAGATTTACTAA
AAGAAGATAAGGCGCAAGAAACTAAGCAAACAGAAGTTGCTAAACCCGCT
ACAGCTACTAGCGTTAAAAAACCTGCTAAATCTACAAAACTTAAAACCGA
AGCAGTTGACTTTAATGCTTACTTTGATGAAACCAATTTAAAAGCTGGCG
CACTTTCTGATGAATATTCTTTTGTTAATAAACTTGATGAATATCAACAA
TTTGAAAATGAATTTTCAGGTCAAAGCGTAGAAGAAGAAATTAAAGAAAC
TCAAAAACAAAAAGTTAAAAAAGAAAAAATATCAGCATTTTCTAAGAACT
TTAAAATTGATGAGGATCTATTAAGTTATGGATTATCTAAAGATTTAGAT
TTAAGTGATTTAGATGATGAAAAATGAAAAAAATAA
>MS53_0361 nusG, transcription antitermination protein
ATGCAAAATTCAAAATTTCGTTGATATTTAATTTCAACTATTACCGGAAA
AGAAGCCGTGATAGTAGAAGCTTTAAAAAATAGAATTAAATCAGAAAACA
TAGAGCAATTTTTTGATTTTAGCGCAACTGAAGATGGGCCTTTTAAAGTC
TTTAAAGTTCCTAGCATAACCAAAACTGAGCTAAATAAAAAACAAAAAGG
GCTAGCATATAAAGTAAAATGAAAAAATATGTTTCCTGGATATATTTTTG
TTAAAGCTGACATGCAAGATTTAGTGTGATATATTATCCGTAATACCTTG
CAAGTTACTGGAATTATCGGTTCTGGTGGTGGGGGAGAAAAACCAACTCC
TGTTTCACAAAATCAAATTAGAAAATCACTTGAAAAAGAAGAAGAAGCTA
AAAAATTATTTGAAGAAAATAAAAACCTTCTTAATTTAAAAGTTGGTGAT
TTAGTGCTTATAACCGATGGTAACTGAGTTGGAAATGAAGCCGTTATTGA
AAAAATAATCGTAGAAGATAACATGGCTGAAATTTCATTTGAAGATTTTA
ATAAAAAAGTTGAATTCAAAATTAATTTAGACTGACTAACACGTATAGAA
CGTAATTAA
>MS53_0121 pknB, serine/threonine-protein kinase
ATCAATGATTCCAACGTTTATAAAAAATATGAAATTATCTCTCCTCTTGG
AGAAGGCGGATACGCCAATGTTTTTAAAATAAAAAGCAAATTTAACAACA
AATACTACGCTTTAAAATATTTAAATATTCAAAATAAAAATAGTGAATTC
GAGCGCTTTACAAACGAAGCGCATTTAATTAAAAATTTAAATACCGAATA
CGTTCCAAAAATTTTTGAATTTTATAAAGACACCAAAGAAGCTTACATGG
TTCTTGAATTAATTAATGGCAGCTTAGTTTCAGAAAAACTAAAAGCTCAC
GGTAGAATAAATGTTAAAGATGCGGTTCAAATCATTAAATCAATTGCATA
TGCTGTGCAAGAAATTCATAGCCATAAAATAATTCATAGAGACATTAAAA
GCGATAATATCTACATTACAATTGATGGAAAAATCAAAATAATAGATTTT
GGTATTTCAATTGAAGATGATGTCGATCAACAAAGATTTACAAGAGAAAG
CTCAGTTGCTTGTTCTCCATTTTTTATGGCACCAGAAATTGTAAATAGAA
ATAAGCCAATTAATAAATCAGTAGATATTTACGCTATTGGAATTTTATTT
TACGAAATGATAACTGGCAAGGTTCCTTTCAAAGGAAAAACCGCTAGTGA
AACTATTAAAAAACATCTTTCAAGCGAAATTCCAAATCCTCAATCAGAAG
TAGAAGAAATTCCAAATTCTGTTGTTAATATAATTTATAAAGCTCTCCAA
AAAGACCCTGAAAAAAGATATAAAAACACTTTAGATTTAATCTTTGATTT
AGAAAATTCACTAAATCCTAAATTTTTAAATCAAAGTTTATTTAATCCTA
AAAATTTACAAGAAAAGAAAAACTTTTCTTGATTTATTCAAAGTAAATTT
TTTCTAGTATTTATTTTTAGTTTTATCGCGCTTTGCTTTATTGGAATTTT
TGTGCTACTGCATTTCTTTGGAGTTTATTAG
>MS53_0675 rncS, dsRNA-specific ribonuclease III
ATGGAAAAAGACAATCAGCCTTCTATTGAAGAATTAAAAGCTTTTCTTCA
GAAAAATAATATTGAATATAAAAACATTGACCTTTTCATTGAAGCTACTA
CTCATAAAACTTATTCAAAGGTAAATAAAAATTCTAAAGACTATGAACGT
TTAGAATTTTTAGGTGATTCTTTGGTTGGTTTTCTAATTAGTGATTACTG
CGTTAGAGAATTTTCATCTCTAGAGCCTGGCGAGCTTTCAAGACTTAGAT
CAAAGCTAGTTGATAAACTGGCTTTATTTAAAATTGCCCAAAAGCTAAAA
GTGGAGCAAATCATTAAAACCGGCCCTAAAAAAGCCCGTAATGAAGTTTT
ATCATCATCAAATGTTTTATCTGATGTAGTAGAGGCATTAATTGCGGCCA
TTTACCTTGATCAAGGAATGCAAAGCGCTAAAGATTTTATAAAAAGTCAT
TTTTATGAAATCGCCAATAAAGCTCAGAATAAACCAAATAAAGATCCAAA
GTCAGAACTTCAAGAATATTTTCAAACAATTTCTGCTGAAACTGTAAAAT
ATGAAACTATAGAGATACCAAATAAAAGATCTTTTGAATCAAAAGCTTGG
CATCTTAATAAAATTTATGGAACCGGTGTTGGTTTATCAAAAAAAGACGC
AGAGAAAAATGCAGCTGCCAATGCTTTATCAAAACTTAAAACTTAG
>MS53_0024 rpiR, transcriptional regulator
ATGAAAAAACAAGAAAAATCTCAAATATCTCATCCAATTTTGCTTAATAA
TTCTAAGCTTATAAATTCAGAAAATAAAGTTTTAGAATTTATAAATGGAT
TTCAAGGAGAAGTTTTTAATTATTCAATAGAAGATTTAGCTAAGCTTGCA
AATGTTTCAACTGCTACAGTTTTTAGATTTGTTAGAAAATATGGATTTAA
AAATTTTAAAGAAGCTATTATTTTTATAAATAAAAATTTACAAAAATTAA
ATGAAAAATATCCTCTTTCTACTTCGCAGGATAATAATATAAGCACAATA
GTAGCAGGTAATAAATATGTTCTTGATAATTTATATACAAATGAATTGCA
AAAAATAATAGAAAAAGCAGCCCAAATAATATACAATTCAAAACGTATAT
TAATTCATGGAGCTGGTAGCTCAAAGAGAATGGCTGAAACTTTAGTTTCA
AATTTATATAAAGTTAGTTTAAATGTCATTGCTCATGATGATTTTCATTT
GTTTTTACCAGTTTTAGGTAATGCTACAACTGAAGATGTTTGTGTTTTAT
TTTCTGATAATTTAAATTCGCCTGAAGCTGCTTTTACAATTAAGCAATGT
AGAGAGAAAAAAGTTCAAATAATATTAATTACTTCAAAGAAAAAAAGTAA
TTTAATAACAAAAAATGATGTTGTTATTTTATATGAAAAAATTACTTCTA
AACATTTAAATATTCCACTTTCTTCAAAGTGATCACAACTTTTAATTGCT
GATTTACTTTTTGAGAACCTTTTGATTTTAGATAGCAATTTAAGAGAAAA
ATTAAATAATTCAATCCAAATAATAAATAAATGAAAAGCAAATTTATAA
>MS53_0574 rpoA, DNA-directed RNA polymerase subunit alpha
ATGGAAAAATTAACAAAAATTAAGCACAGAATCATTCCAGCAAAAGATTC
ACAAAATAATTCATATAAAAAAGTTCTTAAAATTAAGGGTTTAGAGCGTG
GTTTTGGTAATACATTAGCTGTTGCCCTTAGAAGAATACTTTTATCTAAT
ATCACCGGCATTGCGCCATTTTGTGTTCGTATTGAAGGCGTAGAACACGA
ATTTACAGCGCTTGAAAAAGTTTCAGAAGACATAGTTACTATTTTAAGTA
ATTTAAAAAAGGTAGTTTTAAATTACGATGAAGACTATGTTAAAGACAAC
CAAATCATCAAGCTTTCACTAAATGCCAATGAAGATAATAGAATTACTTC
AAATCATTTAACAGTTACTAATGCTCCTAGAGTTGAAGTTCAAAATAAAG
ACGTTGAAATTGCAACTTTAAGTAAACCAGGAGTTCTTAAACTTGAAATG
TTTTTAAGAGCTGGTAGAGGTTATGTTGACTTTGAAGATAATAAAAAATT
TATCGAAGAAAAAGAAAAAGAACTAAAAGAATTATCAAGCTTATCAAAAG
GAGCTTTCATTGCCATGGATTCAGTGTTTTCACCAGTTGTAAACGTGGCT
TGAAAAGTAACTGAATTAAATACTGCTTCTTTAAAAATTGAAGAACAACT
TGAACTTGAACTTGAAACCAAATTAGGTGTTACTCCTGAATCTGCTATCA
AACTTGCTTGCAAAATTTTAGTAGCGCATTTCCAAACCATTGGAGATTTA
ACAGATTTAGATAGTGACGAAATTTTCCAAAGTGAAAAACAAAGCCTTGA
AAAAGAAGAAGACGATATGGAAATAAGACTTCTTAATCTTTCAATGCGTT
CACAAAATGCTTTAGCTAAAAGTGGAATTAAAACTTTAAACGAACTTGCT
TCATATCCAATTGAAAAGCTAAAAGAAATTAAAAATTTAGGTGAAAAATC
TAGAGAAGAAATTATTCGTAAATTAAACGAATACGGAAAACTTAAAAACT
AG
>MS53_0485 rpoB, DNA-directed RNA polymerase beta subunit
ATAATGCAAAAAGACAAAAAAAATTATAAGCTTCGTAAATTTGGCCCAAT
CACAGAAAGACGTGATTATTCAATTACCAAGCACTCTCTACCAGTTGGAG
ATATTTTAGCTACAAGCAAAAAAAGTTACCAAGATTTTATCAATAAAAAA
ATTGAAGAACTTTTAAATGAAATTTATCCAATTGAAGCTTCAAATAAAGA
AGCTAGCCTTGAATATGAGAAAAAAAGTGTTAAATTCGAGCTTCCATTCA
AAAAAGCAGAACACGAAAATCTTCAAATTAAAACCTGTAAAGCTAAAAAA
ACAAACTTTAGCATGAAAGTTTATATAACACTTAAAAAAGTTGTTTCACA
AACTGGAGTTGTTAAAAAAGAAAAAATTCTTTTAGGAGAAATTCCATACA
TTACTTCTTCTGGAAGTTTTATCATTAACGGTAGTGAAAAAGTTATAGTA
AGTCAGTTGATTCGTTCTCCTGGTGCATACTTTGGAGTTTCTGTTAGAAA
CAAACAATCAGAAGACTTATTTAACAAACTTGAAATTCTTCCAAGAATTG
GATCATGAATTGAAGTTTCACATAAAGTTACCTCTGCTAATTTAGATGCT
ATTAAGATTAAAATCGATAAAAATAAAAATATTAATATCGTTACCTTTCT
AGCATCTTTTGGTCTTTTAGCCGACGATATTCGTTACCTTTTTGGTAAAA
ACGAAGTTCTAGAAGAAACCATTAGAAAAAATAAAACAATCGATATCACC
GAATTTTCTAGACAAGAAATCATGGATCTTTGTCAGGAAAAAATCTTTAG
AATCATCCGTAAAGGAGATAGAATCTCAGAAGAGTCTAAAAGATCACTTC
TTTCAGGAATGCTTTTTGATAAAAAACGTTACAACCTATCAAAAACCGGT
CGTTACATGCTAAATAACAAACTTTCTCTTGTGGAAAGAATTACCAATAC
TTATTTAGCTCAAAAAGTAGTATCGCATTTAGGAAATACCTTTGACGTAG
GAACCTACGTTACTTATGAAATTGCTAAAGAAATTCAAGAATCATTCGAA
GCTAAAGCTAAAGATAATAAAAGCAATCTTCATTTAGAAAAAATTCCAAA
CATTAACCCTGATGATGTTTACTACAAAATTAATAAAGACAATAAATCAC
TAAATAAAAGAATTAATATTGCCAGAATTAAAATCTGACCAACTAAGCGT
GCAATGGACGCAAACGAGACTCCTTCTGAAGTTATAGGAAACGATCCTAA
AGCTACTGAAGAACATCTATTGCTATCAGATATCATCGCTGCAATTAGCT
ACTATTTAAATCTAACCGTAGGAATTGGTCAAGATGATGATCCAGATTCA
CTTATGAATAAGAGAATCGTATCAGTAGGAGAGCTTCTTGAAGGTGAATT
AAGAATTGCTTTATTAAAATTAGAAAAAGCAACTCGTGAAAGAATGGGTG
CTAAAGAGCCAGATAAAATTACCGCGAAAAATGTTACAAATAATAAGCTT
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CATGGATCAAATTAATCCTTTAGCTGAAATTTCAAATAAACGTAGAGTTA
CATCCCTAGGGCCTGGTGGACTAAATCGTGACACTGCACAATTTGAAGTT
CGTGACGTGCATTCAACTCACTATGGAAGAATTTGTCCAATTGAAACTCC
TGAAGGACCCAACATAGGTCTGATTTTAAACTACGCCATTTATTCAACCG
TAAATGAGCTTGGATTTTTACAAACTCCATACTATAAAGTTAACGATGGA
GTAGTAGATTACAATGACGTTAGATATCTAACATCATACGAAGAAATCGG
TTATGCTTTTGCTCAATCTTCAGTTCATGTTAATGATAAAAATGAAATCA
TTGATGAACAAATTACCATTAAAAAAGACTATAACTATATCATTGGTTCA
CCAAAAGATATTGACTTTTTAGAGGTTTCTTCTAAACAAATAGTATCCGT
TGCTGCTGCTGCAATTCCATTTTTAGAAAACAACGATGCTAACCGTGCAC
TTATGGGATCAAACATGCAACGTCAAGCAGTTCCTTTAATTGAAGCAGAA
GCTCCGCTAGTAGCCACCGGTATAGAAGCTGATATTGCTAAATTTAGTTC
ATATAACATCGTAGCAAATAACGATGGTGAAGTAATTTACGTGGATGGAA
CTAAAATTCAAGTTAGAACCGCTAAAAAAATCGATACATATAATCTTAAA
AACTTTGAAAAATCTAACCAAGGAACAATCATTCAACAAAAACCTATTGT
TAAAGTAGGAGACCACGTTAAAGAAGGTGATTTATTAGTTGATGGATCTT
CATTTAAAGATGGAGAAATGGCGCTAGGAAAAAACCTTCTAGTTGGATTT
ACAACATGAAATGGATATAACTTCGAGGATGCGATTATTATTAACGAGCG
TCTTGTTAAAGATGATGTTTTAACATCGATTTATATCGAAGAGCAAACCA
TTCAATTTAGAATTTCAAAATCAAGTGAAGATATCATGACTCGTGATATT
CCAAACGTTTCAAAATACTCAATGAGAAATCTTGATGAATTCGGAATTAT
TAAAGTCGGATCAGAAGTAGTAGCTGGCGATGTATTAGTAGGAAGAATTT
CTCCTAAAGGAGAAGAAAATCCATCTCAAGAAGAAAAACTTCTTAATGCA
ATTTTCAACCAAAGACCACAAAACTATAAAGACACTTCTTTAAAAGTTAA
AAACGGACACAACGGAACTGTAATTCACGTTGAGGTTTTAAGCCGTGAAA
ATGGTGATATTTTAGAAGACGGACTTGATTCAATTATTAAAGTATATATC
GCCCAAAAAAGAAAAATTAAAGTCGGTGATAAAATGGCCGGTCGTCACGG
AAACAAAGGGGTTATTTCAATTATTCTTCCAGAAGAAGATATGCCTCACT
TAGAAGATGGAACACCGCTTGATATTATGCTAAATCCTCAAGGGGTTCCT
TCTCGTATGAACATCGGTCAAGTTTTAGAAATGCACCTTGGAATGGCTGC
TAAAAAATTAGGCACAAAATTCGTAACTCCTTCTTTTGATGGTATTAAAA
AAGAAACCATAGAAGATCTGCTTCAAGAAGCAAATCTTGATAAATCAGGA
AAACAAGTAGTAATTGATCCTATTACTGGTGAAAAATTTGACAATCCAAT
TTCTGTTGGAGTTATTTACATGCTTAAACTTAACCACATGGTTGATGATA
AAATGCATGCTCGTAGCGTTGGGCCATATTCACTTATTACTCAACAACCT
CTTGGAGGAAAGAGTCAAAATGGTGGACAAAGATTTGGGGAAATGGAAAC
ATGAGCGCTTGAATCTTATGGAGCTTCAAATATCTTGCAAGAAATTCTTA
CCTATAAATCAGATGATATTTATTCAAGAAATTTAGTTTATAAAGCGCTA
GTTAATGATAGTGCTATTCCTAACCCTGGAATGCCTGAGTCATTTAACGT
TTTAAGCAACGAGCTTAAAGGTCTTCTTATGAAGCTAGGAATTACCGAAA
CTGAAAGCAATAGCGACGAATTAATTCAACACTTTGATCATTTAGGAGTA
GAACATGAGTAA
>MS53_0484 rpoC, DNA-directed RNA polymerase beta chain
ATGAGTAATACATTTTCAAAAAATAACGTAAAAAAAATTAAACAAATTTC
ATTATCACTAGCTACTAATGAAGATGTTTTATCATGATCAAATGGTGTTG
TTTCAAAACCTGAAACTATAAACTATAAAACCTATAAACCAGAAAAAGAT
GGTCTTTTTGATGAAATAATTTTCGGACCAGTTACTGATTTTAAATGTCC
TATTTGCTTTACAAAATACAAAAAAAGTGACGAAAATACAATTTGTAAAA
GAACTACATCTTGTGAAAAAATTCAACCAAAAATTCTTCCTAAAATTTCA
AGAAGAAGCAGGATGGGTCATATTGCACTAAATAATCCTGTAGTGCACTT
TTGATTCTTTAAAATTAACCACTCTACTATTTCAAAATTATTAGGACTCA
AAGTAGCCGGAAGCAATAAACCAGTTACCAAAAGTGATTTAGAAAAAATT
ATTTACTATAAATCACATATCGTGCTAGAAACCGGTGGATTAAAATCACT
ACAAAAAAATACCATAATCGATATTAACGACGCTGCCGATATTTACGCTG
GCGCTTTAGAAGAAATTCTAGAGTTCAATAAAGATAATAAAGATGGCTAC
GAAGAAATTTTAGATACACTAAATGATCTAAAAGAATATGCCGCTTCAAA
AACCGGTCAAGACTATGGAATTGACTTCTATGAATACAACGAAATCATTG
AAGAATATTCTCAAGCAAAAATAGGAACCGGTTCTAAAGCTATTGAATAT
TTACTTAAAAATATTGATCTAGAAAAAGAATCTAAAGAAATTCAAGATGA
AATCGATACCATTAATGATCAAAATAAATATGAAATTTCATCATCTGAAG
CTCTTAAAAGAAATAAGCTTTACAAACGTTTAGCAATTATTAAATCATTT
TTAAAATCAGGACAAAAACCTGAGAATCTTTTAATTTACAATCTTCCTGT
TATTCCAGCAGATTTACGTCCTTTAGTTCAACTAGATGGTGGAAGACACT
CAACTAGTGATATCAATGAGTTATACCGTAGAATTATTATTAGAAATAAC
CGTCTTGAAAAATGATACGAATCAGATGCTCCTGTTTTAATTAAGCAAAA
TGAATTCCGTATGCTTCAAGAAGCCGTTGACGCACTAATTGATAACTCAC
GTAAAAAACCAGGGCCAGTTACTTCAAAAGATGGTCACCCTTTTAAATCT
ATTTCAGATGCTCTTGTTGGTAAAAAAGGTCGTTTCAGACAAAACCTTTT
AGGAAAACGTGTTGACTATTCAGGTAGAAGTGTTATTGTGGTTGGGCCTC
ATTTAAAAATGTATCAAGTGGGAATTCCTAGAGATATGGCCGCTAAGCTT
TTTGAGCCTTGAATTATCAATAGAATAATGAAGGAAGAAGAAGGAATTAA
TTCAGTGAAAGCTGCTAAAAAATTAGTAGACTCACTTAATCCTATCATTT
GACCTTACGTAGAGCAAGTTTTAGAAAATCGTCCTGTTTTACTAAATCGT
GCTCCTACACTTCATAGGCTTTCTATTCAAGCCTTTCAACCTGTTTTAAT
TAGAGGAAAAGCTATTAAAATTCACCCTCTAGTTACAACAGCTTTTAACG
CCGACTTCGATGGGGACCAAATGGCTGTTCACGTTCCTATTTCTAAAGCC
GCCGTTAGAGAAGCGCAAGAATTAATGCTAGCTTCTAAAAATATTTTGGG
GCCTAAAGATGGAGAGCCTATTATTAACCCATCTCAAGATATTATTTTAG
GTCTATATTATTTAACAATTGAAAAAGCTAACCAAAAAAATGAAGGTAAA
TTCTATCCTTCATTTAACGAAATGATGCTAGCTTATGAAAACAAATACAT
TAATTTAGCAACTAGAGTAGTGCTTCCTGTTAGCGCTCTTAAAAAAATTA
GCATTCTTCAAAAAACAGATGCTCCTTATATTTATTCAACCGTTGGTAAA
TTTATATTAAACAACGCCTTTCCTAGAGATTTTGATTTTGTTTTTGGAAA
AAGAGTTACTGAAAAATTAACAAGCACCAACGAGCATGGCGAAGAAGTAG
TTAGCCTTAAAACTAAAATCGATACTTCTGAGCATGACATTAAAAGATAC
GTATTTAACTATGGAGATAACTTCACAGCTAAAATTAAAGAAGCAGATGT
TAATCTTCCATTAAATAAAAAAGAAATCGCTAAAATCGTTAGAAACATTT
ACGAAAAATACGTTCCGATTGTAAATATTGAAGATATTTCACAAGTAATT
AATAAAATTGATAAAACTCAGCTAGATAATCTTCACGAGCTATGTTCTGA
GCTTAAAGACTTTAACGGAAACAAACTAGAAGATAATAGAATTCATCTAG
AACTTCTTGTGCGTTTAATTAAAGAAGAATTTCTTAAAATCCAAGATCAA
TATTTTGCCAAAGATGAAGAATCTATTTTTAATCACAAATATTGAGAGTT
AAAACATTACACAAAGCTTTTAGAAAGAGTTTGATTTAGATATTCAAATT
ATGTTTCTACTGTTTTAGATGTAATTAAAGATTTAGGATTTAAATTCTCA
ACTAAATCTGGAATTACAATTTCAATGAATGACATTGTAACTTCAAAAAC
TACTAAAGAAAGAATTAAAAAAGCTGAAGAAGAAACTGAAGCTTTAAAAG
ATTACTTCAAAAAAGGATATCTAACCGATGACGAAAGATATACCTTAACA
ATTAAAAAATGATCAGACGTTAAAGAATCAATTGAAAAAGAACTTAAAAA
AGTAGTTGATTCTAACTTAGATAACCCGTTATTTATGATGCTTTCATCAG
GAGCTCGTGGAACTTATTCAAACTTCACTCAGCTAGCTGGTATGCGTGGA
CTGATGAATAACAACACCAAAATTCTTAAAGCCGATGCTGAAAACGATCG
TGTTGTTAGATCGATAGTTGAAATTCCAGTTAAATCATCATTTTTAGATG
GACTAACCGCTTATGAATTCTATTCATCAACCCACGGGGCTAGAAAAGGG
CTAACCGATACCGCGCTTAATACCGCTAAGTCAGGATACTTAACCCGTCG
TTTAGTTGAAGTTGCTCAAGGTGTTGTAATCCGCGAAGAAGACTGTGGAA
GTGACTATGGTTTTGTAGTTAAAGACATTAAAGACACCAAAACTAACACC
ATTATCGAATCACTTCAAGAAAGAATCGAAGGTAGATTTACCGCAGTTCC
AATTTATGATCAAAATGGAAAATTAATAGTTAAAGAAAGCGAATTAATAA
CTCCAGAAATAGCTAGTGAAATTGTAGCTAAAGGAATTACCAAAGTAGAA
ATTAGATCTGTTTTATCATGTCATACAAGAAATGGATTATGTAAAAAATG
CTACGGTAAAGATTTAGCAACCAATAGAATAGTAAATATCGGAGAAGCCG
TTGGAGTTATAGCCGCGCAAAGTATAGGTGAGCCTGGAACTCAGCTAACC
ATGCGTACCTTCCATACCGGAGGGGTTGCAGGTGGAGAAGATATAACCGG
TGGATTTGGTCGTTTAATCGAACTTATCGATGCTTATGACCAACCATGAG
GAACTCCTGCTGAAATTTCAAGACACTACGGTAAAGTTAAAAAGATCGAA
ACCCAAAAGAATAAAAAAGGTAAAGAAAGCGGTCAATTTAACATTTCAGT
TGAATACTTTGATGAAGATGGAAACAAACAAACTCATCAATACTTAGTTA
AATCAAGTCAAAGACTTCGTGTAAAACAAGGTGATGAAGTTGTTGCTGGA
CAAAAACTTTCAGAAGGACCTATCGTGCTAAACGAGCTGCTTGAATCAGT
AGATACCAGAGCGGTTCAAAACTATATTCTTAAAGAAGTTCAAAAACTAT
ACCGTCTTCAGGGAATTGCAATTGCCGATAAATATATTGAAATTATTATT
CGTCAAATGCTTTCAAAAATTTCAATAATCGATCCAGGAGATTCAAGTTT
CTACTCAGGATCTCTAGTGGATGCTTTTGTATACCAAAAAGAAAATGGAA
TTCTACTTTCACAAGGTAAAAAACCTGCCTATGGTGTGGTAAAAATTAAA
GGAGCAAAACAAACTCCGCTACTAAGTGATTCATGACTAGCGGCAGCATC
ATACCAAGAAACTGCAAAAATTTTAGTTGATGCTTCTATAGCAAAAAGAA
CTGATAATTTAGAAGGACTAAAAGAAAATATCATTATTGGATATAAAATT
CCAGCCGGAACTAATTCCAATTTCGAAGAAAATGGAAAATATAACCTTAA
AGAATTTTCAAGTTACTTCCCTAATAAATACGATTCAACTCCAGAGCTAA
AACTAGAAGAAATCACCGATGAAAACATCGAAGAAGAATTCGATTATTTA
AAAGAAAACACTATCTCAGAAGAAGAATTCGAAAACCTAGATGACGATAC
TATGTATCACTTAGAAACTAGTGATGAATTCGAAGATGAATCTTTTGGTG
AAGATGACTTTGAATACAGCGAAGAATAA
>MS53_0455 rpoD, DNA-directed RNA polymerase sigma factor
TTAGATCAGCTGAAAAAAAGTAAGCCACATCAGAAAAAATGAAAAGTTGA
AGAAGTTTTAGAATTCATTGAAAGAAAAAAACTTGACATTGAAGAAGAAG
TAGTTGATGAGCTATTTGACTTCTTTGCGCAAAAGAATTTATTTAAAGCT
GATGAAAATATAGTATCTTCAGAAAAAGATTTAAAGGAAGAGTTTGAAGA
AGAACTAAAGGCAGAAAAAAAATCTAAAAGTGCTAAAGATTTAAAATTAA
ATTTTAACGCAGATTTTGATGATGATTTATTAGATGAAGACGATTCACCA
CTTTTTGATTCTGATGATGACGAAGAATTTGATGATGATTTTATCGAAGA
TGAAGAAGTCGATGTTAATCTAGAAGAATACGATCACGACGAAGAAGACG
AAGAAGAAGATGAAAAATTAGAAGAAGATGACGAACTTGATTTTTCATTA
GTAGCCTCTGATGATGATCTAGATGAACTTGATTTAGATAACTTTTCACC
TGATGAAATTGATCTTCAAATTGATGAAGAAAACAAGAAACAAGATCTTT
CAAATAAACTAACCGAAACAACCGATATCGTTAAATGATACATGCGTTGA
ATCGGTAAGTATGGAAAACTTTTAACTCCTCAAGAAGAAAAAGATTTAGC
TGAAGAAATGGACAAAGGTGGTTCAAGAGGAAAAAGAGCTAGAGATCTAA
TTATTAAAAGAAACCTTCGTTTAGTAGTTAACGCTGCTAAAAAATACAAA
AATAGAGGACTTAGCTTTATTGATTTAGTTTCTGAAGGTAATGCCGGTTT
ATTAAAAGCTGCACAAAAATTTGACATCAAAAAAGGATTTAAATTCTCAA
CATATGCAACTTGATGAATAAGACAATCTATTTCTAGAGCTGTTGCCGAT
CAAGCTAGAATTATTAGAGTGCCTGTTCATATGGTTGAAACCATTAATAA
GATTTATAAAATCGAAAGAGAAATCCAACAAGAAAATGGTGGTGAAATAA
TCGATGAAGAAATCGCAGCAAGACTTGGTGGAAAAAGCAAAAAATATGAT
GCATCATATATTAGATACATTAGAAAAATAAACACAAGTCCTATTTCATT
AGATAAACAAGTCGGAAAAGAAAACGATTCATTCTTTGGAGACTTTGTTA
AAGATGAAAGCATTATTAGCCCTGTTGAATTTGCCGATAAAGAAGAACTA
ATTACCAAAATTAATTACTACGTAGAAAAACTTCTTAGCGAAGCTGAAGC
TGATTTAATTAAAAGATATCACGGAATCGGTTACGATGCAAAAGGTAATC
CAGTAAGATCAGCTACTCTTGATGAAATTTCAAAAGACTTCCGCGGTGAA
GGTAAGAAAATTTCTAAAGAAAGAGTTCGTCAAATAATTACTAAAATTTA
CAAAAAACTAAGAGGATATCCTGAAGTTGTTGAGTTATTTGAAAACTTCA
TAAAATTTAAAAATGAAGATTAA
>MS53_0301 vacB, VACB-like ribonuclease II
ATTATGAACATAGATAAAATTAAATTAATAAATTACATCAAAGCTAGAAA
AAATGTCTCTTTTATTGAACTTGCAAATTATTTAAAAATAAATCGCAAGG
ACAATAAAGAATTTAGCGCTTACTTAGTAAGCCTAATTAAAAGAAATAAA
ATTTTTAAAACCTTTGATTCTAATTATTACGTTCCAGAGCTTTTAAGAAA
ACAAAGTGGAATTATCAAAGTAGCTTCTAAAAAACAATTTGCCTTTTTAG
AATTTGAAAACGAGGCCCAAGAAAAAGAAAGTGTTTTTGTTAAATTCCAA
GATTTAAATTCAGCGCTTAATAACGATGAAGTAATTGCTTCAATTTACAA
AGACCATAACGAAAAAAATCCAACAAGGCAGCTGCTTGCGGTAGTTGATG
AAATAGTTCAAAGAAATAATCAAAAAATAATTGGCTTTATCAAAAAAGAT
AAAAACACCATCTTTTTTGCGCCAGCAGATGGCTGCTTTGATAAAGTAAA
ATTTGAACTTTTAAATTTATCATCTAAAGTTAAAATCAATGACTGCGTAT
TATGTGAAATTAAAAAATATGACAAAAACCTAGTATCACTTGAAATTAAA
AAAGTAATCACCAATACCAGTGATCCGAATGTATTTGTTAAAGCTTATTT
AGAATCTACTAATATCGATTTAGAATTTAGCGCTGAAACTTTAGCTGAAT
CAAAATTAATTCCGCAAGAAGTTGATTTAAATATTAAAGAAAAATTTCAA
AGAAAAAATTTAACTAGTGAACTAATAGTTACAATCGACGGTGAAAGCAC
CAAAGACTTTGACGATGCTATTAATGTTAAAAAACTAGAAAACGGAAACT
TTTTATTATCTGTTCATATTGCCGATGTGGCACATTACGTTAAAGAAAAA
ACAAATCTAGATTCAGAAGCGCTCAAAAGAGGAACTAGCATTTATATCGC
CAATGGCGTTATTCCAATGCTTCCTAGCGAACTTTCTAATGGAATATGTT
CTATTAATCCAAATGTCGATAGATTTGCATTAAGCTGTGACATTGAAATC
GATCAGCACGGAAATAACGTAAATTATAAAATTTATAAATCAGTTATTAA
TTCTAAGTTTAGATTAACTTATAAACAAGTACAAGCTTTTTTTGATAAAG
ATAATAACTTTTTATCTTTAGAACAAAAAAAATCTTCTTATGTTAAAGAG
TTAGAAACAATGCTAACTAATGCTTATGAGTTAAGCCTTATTCTTCATAA
ATATAAAGAAGCTCAAGGTTATGTTGACTTTGAAATTCCAGAACCTAAAA
TTTTCCTAAATGAAGATGGAACTGTAAAGGAAATTAAAATTCACAAAAGA
GTTTATAGCGAAATTTTAATAGAAGACTTCATGGTTAGAACCAATGAAGT
TGTCGCTAAATATCTTAGTGATTTAAAAATGCCAGTTTTATATAGAATTC
ATGAAAATCCATCAGAAGAAAAACTTCAAAGCCTTAAAACTAATTTAACG
GCTTTAGGAATTAATATTAAAAATATTAATTCTATTACAAGCTCAGCTAA
TGATTTTTCAAAGTTTGTTTATCAAACAAGAAACCAAAGAAATGATTACT
TTATAAATTTATTATTTTTAAGAACAATGCAAAAAGCAATTTATTCTTTA
AATAATATCGGTCACTTTGGTCTAGCTTCTGAATTTTATTGTCATTTTAC
TTCTCCGATTAGAAGATATCCAGATCTTTTAGTGCATAGAATTTTAACTA
TGCATCTTGAAGGAAAATCTAGCCAAGAGATTTTAAATCACTTTGATTCT
AAGCTTGATAGCTATGCTCAGCTGAATTCAAATTCTGAGCAAAAAGCAAT
AGAAATCGAAAGAAAAGTTAATGATTTAAAATTTGCTGAATTTTTAAAAT
TCCAAACAGGACAAAAATTCAAAGCTCAAATTGTATCGGTTTTAAATTTT
GGAATTTTTGTTGAATTTGAATTTGGTGGATCAGGACTAATTCACAAAAG
CAATTTCTTTGATGGAAGCTATGAAGCCAATGAAATGCTTACCGTTTTTG
CGAGTGAAACTAAAAGCTATAAAATCGGTGAATATGTTGATGTGGTAATA
ATTGCAACTGATTTACTTGAAGGTAAAATTGACTGCGTGTTAGAGAGTCA
ATATGATGCTTATAAATTAAATTTAACTAGAAAACATGAAAAACCAAGAA
ATTCTAAATAA