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COG category: Transcription
Organism: Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae), Bp (Baizongia pistaciae)

Number of genes found: 17

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# Buchnera aphidicola str. Bp (Baizongia pistaciae), Bp (Baizongia pistaciae)

>bbp433 cspE, cold shock protein CspA
ATGTCCAAGATTAAAGGTAATGTAAAATGGTTTAATGAATCTAAAGGGTT
TGGTTTCATTACTCCTGAAGATGGAAGCAAAGATGTTTTTGTTCATTTTT
CAGCTATCCAAAGCAACGGATTTAAGACTTTATCAGAAGGTCAAAGTGTT
GAATTCGAAATTACCGAAGGAGCAAAAGGGCCATCAGCGGCTAATGTGAT
TAGTTTATAA
>bbp335 deaD, ATP-dependent RNA helicase
ATGACTCACACTAATATGACATTTTCTAGTTTTGGTTTAAATTCGTGTAT
TATTACTGCATTAAATGATATAGGTTATGTTCAACCATCACCTATTCAGG
CTGCTTGCATTCCTTACCTTATAAAAGGAAAGGATGTATTAGGAATGGCA
CAAACAGGAAGTGGAAAAACTGCTGCTTTTGCGTTGCCGTTATTACATAA
CATAAAATTAGATGTAAGAGTTCCTCAGATTTTAGTATTAACCCCAACTA
GGGAACTAGCTGTTCAGGTAGCTGAAGCTTTTTCTAATTTTTCTAAAAAG
TTAATAGGAGTTCATGTATTAGCATTATATGGAGGGCAAAGATATGATTT
ACAACTAAAATCTTTACGTAAGGGTCCACAAATTATTGTTGGTACTCCAG
GACGTTTATTAGATCATTTAAAACGTAGAACATTAAGTTTATCTAATCTT
CATAGTTTAGTGTTAGATGAAGCTGATGAAATGTTAAGAATGGGATTTAT
TGAAGATGTAGAAACTATTATGACAGAAATTCCTGATAGGCATCAAACGG
CTTTATTTTCTGCTACTATGCCGGAAGCAATACGGAGAATTTCTAGAAGA
TTTATGAAAAATCCGAAAGAAATTCGAATCCAATCAAACATTACTACAAG
ACCAGATATTCAACAAAGTTATTGGATGGTGTATGGCAAAAAAACTGATG
CATTAATTCGTTTTTTAGAAGCTGAAGATTTTTCTGCTACAATAATATTT
GTTCGTACTAAAAATGCTACATTGGAAGTATCTGAAGTTTTAGAACGTTA
TGGTTATAACAGTGCTGCACTTAATGGAGATATGAATCAATCTCTTAGGG
AACAAACATTAGAAAAATTAAAAGATGGTAGATTAGATATTTTAATTGCT
ACGGATGTTGCTGCACGAGGATTGGATGTCGATCGAATTAGTTTTGTTAT
TAATTATGATATTCCTATGGATTCTGAATCGTATGTGCATAGGATTGGGA
GAACAGGCAGAGCTGGGAGAAAAGGAAAAGCGCTGTTATTTGTTGAAAAC
AGAGAACGACGTTTATTGCGTAATATTGAACGGGCTATGAATATTTCTAT
TTCAGAAGTGAATTTGCCGAAATCAGATTTTTTAAGTAAACGACGGCTCG
AAAAATTTGCTCAAAAAGTTCAGATACAATTAGATAGTAAAGATTTACAT
GAATATCGCGGTTTATTGCCAAAATTACAACCTAATAATAATTCTTTAGA
TATTGAATCATTGGCAGCTGCATTATTAAAGATGGCGCAAGGTGAAAGAT
CTCTTATCGTAAAACCAGAGTCTATAGTTAGAGCTAGACATTTAAAAATT
AAGGATACTTATCGAAATAATAATTATAAAAGTTTAAATTATGTATCGCG
CTATAATAGAGATAAAAATGTAGATTTATATCGTATTGATGTAGGACGAA
ATGATGGAGTAGAAGTTCGTCATATTGTGGGTGCAATTGCTAATGAAGGT
GATATAAGTAGTCGAAAGATTGGAAACGTTCGGTTATTTTCTAATTATTC
AACAATTGAATTACCAAAAGGTTTATCTAATACTTTGCCTAAGACATTTA
TTCGTACTAAAATTCTTAATAAATTTATTAATATAAAATTGTTGTATAAT
TCAAATTTTAAAGGTAATTATAATGATATTAAAGATGTAAAGGTATATAA
TAGTAATAAATTACGTTCTAAAAAAATGAATAATAAAAAATTTGTTTCTA
GTGGGGTACGAAAAAAAATTAAGACTAATATTTCTTGTAATCGTCGTAGA
AGTGTATAA
>bbp347 greA, transcription elongation factor GreA
ATGAATGATCAAATTCCAATGACTATATTGGGTGTTGAAAAACTCCGTAA
AGAACTTGAAATGTTGAAAACAATAAAGAGACCTAAGATTATAAAGTCAA
TAATAGAAGCTAGGCAACATGGTGATTTAAAAGAAAATTCTGAATATCAT
GCTGCAAGAGAAGAGCAGGGTTTTTGCGAAGGAAGAATTAAAGAAATTGA
ATTAAAATTGTCTAAAGCTCGAATTATAGATATAACTAAAGTAAAAAATA
ATGGAGTAATTATTTTCGGTTCTACAGTTACTATATTAAATTTAACTAGT
AATCAGGAATTTACATATCGTATTGTAGGAGATGATGAGTCTAATTTTAA
ACGAAAGTTAATTTCTATTAATTCACCTATGTCTAGAGGATTGGTAGGTA
AAAAAGTTTCTGATGTAGCTACGATAAAAACACCTGTAGGTGATGTAAAA
TATAAAATATTAAAAATTGAATATAACTAA
>bbp275 mfd, transcription-repair coupling factor
ATGTTAATAAAAAGCTTAGTACAAAAGAATCAAGTTTATTTTACTAATAA
TAGTCTTGATGAAAAAAATATATGTGATTTATCTAAACTCAAAATAAATC
AACCTATTGTTCATTTTGAACATGGTGTAGGAAGATATCAAGGTTTAACT
ACTGTTACGACTAGAAATATAAAAACTGAATGCGTAGTTATAAATTATGC
ACAAAATTCTAAATTGTATGTTCCTATTACATATTTATATTTAATTAGTC
GATATATAGGAACTTCAAAAAAGGATATTCCGCTACATAGACTTGGAAAT
GATTTATGGAATAAAGAGAAAAAAAAAGCTAACGAAAAAGCATATGATTC
TGCTGCTATACTTCTAAATATTTATTCACATAGAATTTCTCAAAAAGGAT
TTTCATTTAAAAAACATCATACAAAATACAAAATATTTTGCGAACGTTTT
CCATTTACGTTAACACCTGATCAAGATAGTGCTATTAATTCTGTACTAAG
TGATATGTATAAATCAACTCCTATGGATCGATTAGTTTGTGGTGATGTTG
GTTTTGGAAAAACTGAAGTTGCAATGCGAGCTACTTTTTTAGCTGTTTGT
AACCAAAAACAAGTAGCAATTTTAGTTCCAACAACCCTGTTAGCCCAACA
ACATTTTAACAATTTTACTTTACGTTTTAAATATTGGTCTACAAAAATAG
AAATTTTGTCTCGCTTTCAATCCGAAACAAAATGTAATGAGATAATAAAT
AATGTAAATATAGGAAATGTTCATGTACTCATCGGAACTCATAAAATTTT
ACTCAAAAATTTAAAATGGAAAAATTTAGGATTATTAATTGTTGACGAAG
AACACAGATTTGGAGTGCATCACAAAGAACAAATAAAATTAATATCTAAT
AATATTGACGTTTTAACGTTAACTGCTACTCCTATTCCTAGAACTTTAAA
TATGGCATTCGTTGGAATTCGAGACTTATCGATTATTGCTACTCCTCCAA
AACAAAGATTAATTGTCAAAACGTTTGTTCGAGAATTTAGTTATACGGTA
ATTCGTAAAGCTATTCTTAGAGAAATATTACGAGGCGGGCAAGTATATTA
TATTTATAACAATGTAAATAAAATTGAAAGAAAAAAAATAGAATTAAAAA
AACTTGTTCCTGAAGCTAACATTAGAATAGGACATGGACAACTACGTAGT
ACAGATTTAGAATCAATAATGAATGATTTTTATCATAAACGATTTAATGT
ATTAGTTTGTTCTACTATTATAGAAACAGGTATAGATATTCCTAACGTCA
ATACAATTATTATTGAAAATGCTAATAACTTTGGATTAGCACAATTACAC
CAATTACGAGGCAGAGTAGGTCGTTCTCAACACCAAGCGTATGCTTGGTT
GTTAGTACCTTCGTTAAAGGATATAAAATCAGATGCAAAAAAAAGAATTG
ATGCTATTACTTCTATAGAAAGTTTTGGTTCATGTTTTGAATTAGCTAAT
CGTGATTTAGAGATTAGAGGAATTGGAGAAATATTAGGAAATAACCAAAG
TGGGCATATAACAAAAATAGGTTTTTCTTTATACATGAAATTATTAATGA
ATGCTGTAAGAAATATAAAAAATGGTTACTACAAACCATTAAATGACATC
ATAAATACTTATCCTAAAATTGAATTAAATGTATCAAATTTATTACCTGA
TAGTTATATAAAAAAAGTAAATCATAGATTGTTTTTTTATAATAAAATAG
CAACGTCTAATAACTTTTTAGATTTAGAAAAAATCAGACTAACATTGTGT
AAAAATTTTGGTAATTTACCTAATTCAGGAGACTATTTAATAAAAATTGC
TAAGATACGTTTAATTTCTAAAAAAATAGGAGTAAAAAAAATAAAATCTG
ATGTCAAAGGGGGATATATAGAATTTTTTGAAGATAGTAAAATTAACATA
CAAAATTTACTAAAAGAATTCAAAAAAGAAAAAAACTGTTGGAAATTTGA
CACTTCTAATCGTTTAAGATTTTCTAAAAATTTTAAAAATAACAGCGAAA
GAATTGATTGGATTTTAAATATGTTAATAAATATAAATAATTAA
>bbp341 nusA, N utilization substance protein A
ATGAATAAAGAAATTCTAGCAGTTGTAGAAGCGGTTTCTAATGAAAAATC
GTTACCTCGTGAAAAAATTTTTGAAGCATTAGAATGCGCATTAGCTATTG
CTACTAAGAAAAAATACGATCAAGAAATTGATGTACGAGTTAAAATAAAT
AGAAAAAATGGAAATTTTGAAACGTTTCGTCGATGGTTAGTGGTTAATCA
AGTATTACAACCAACTAAAGAAATTACTTTAGAAGCTGCTAAATTTGAAG
ACGTGACAGTAAAAGTTAATGATTATATAGAAGATAAGATGATTTCTGTA
ACATTTGATAGAATAACAACACAAACTGCTAAACAAGTTATTGTTCAAAA
AGTTCGTGAAGCAGAAAGAGCAATGATTGTAGAACAATTTAGGAAATATT
TTGGAAAGATTCTAACAGGAATAGTAAAAAAAATAAATAGAGAAAGTATT
ACTTTAGATTTAGGTAATAATGCTGAAGCTTTGATTTTGAAAGAAGATAT
GCTTCCTAGAGAAAACTTTAGATTAGGTGATCGTGTTCGAGGTGTGTTAT
ATGCTATTTACCCCGAATCTCGCGGAGCTCAATTATTTGTAACTCGATCT
AAACCAGAAATGTTAATTGAATTATTTAAAATTGAAGTTCCAGAAATAGG
AGAAGAAATTATTGAAATAAAATCAGCAGCACGCGATCCAGGATCACGTG
CTAAAATAGCTGTAAAAAGTAATGATAAAAGAGTTGATGCAGTTGGAGCA
TGTGTAGGTATGCGTGGTGCACGCGTTCAAGCAGTTTCTAGTGAATTGTG
TGGTGAGAGAATAGACATTGTATTATGGGATAAAAATTCAGCACAATTCA
TTATTAATTCAATGGCTCCAGCTGAAGTTTCATCTATTGTATTAGATGAA
GATCGTCATACTATTGATATAGCTGTAGATTCTAACAATTTAGCTCAAGC
AATTGGAAGAAATGGGCAAAATGTACGTTTAGCGTCTCAATTAAGTGGAT
GGGAAATAAATGTAATGACAGTAGATGATTTAAAATTAAAACATCAGGAA
GAGAAAGATAAAATTTTAAATATTTTTACAAAATATTTAAAAATTGATCA
GAAAATTTCTAATATTTTAATTGACGAAGGGTTTTCTTCTATAGAAGAAT
TAGTTTACATTCCATTTAATGAATTACTAAATATTAATTCTATAACACAA
GAATTAGCATATTCTATACGAGAAAGTGCAAAAAAGGCTTTATGTGCTAT
AGAGTTAGAAAATAAAAAAGTAATTAATGAACGTAAATTGCATAAAGATT
TGTTAAATTTAAAAGGTATGAACCAAAAACTTGCTTTTAAATTAGCAAAA
AAAAATATTTTTAGTTTAGAAGATTTGGCCGAACAGGGGATTGATGATTT
GATAGATATTGAAAATTTAAATTCTAATACTGCTGGAATGTTAATTATGG
CTGCTAGAAATATATGTTGGTTTGGTAATAAAACTAGTGCATAG
>bbp409 nusB, N utilization substance protein B
ATGAAATCTAAAACAAAAACTAGACGTAAAGCACGGGAATATGCCGTTCA
AGCATTATATTCATGGCAAATATCCAAAAATGATATTTATGATGTCATTA
ATCATTTTAAAAAAAATAAAACTATTAATGAAATAGACCAAATATATTTT
TATGAACTGATAATCGGAATTACTAAAAACTTAAAATATTTAGATGAATT
AATGAGACCTTATTTATCTAGAACTATACAAGAACTTGGACAAATTGAAA
AAGCAATTCTAAGAATATCATTTTTTGAACTAGATAAAAGATATGATATT
CCTTTTAAAGTAACAATTAACGAAAGTATTGAACTAGCAAAATTATTCGG
AGCTAAAGATAGTCATAAATTTATTAATGGTGTTCTAGATAAAGCTTCTT
TAAAACTTAGAAAAAATAACTCTAACAAAAACTAA
>bbp040 nusG, transcription antitermination protein
ATGTACAAAAGTTACAAAAAACGTTGGTATGTACTACAAGCTTTCTCAGG
ATTTGAAGGACGCATAGCACAATCAATACGCGAACATGTTAAACTAAAAA
AAATGGAAAAATTATTTGGGGAAGTTATGGTTCCTTCTGAAGAAGTTATA
GAAATTAAAGCAGGACAAAGAAAAAAAAGTGAATATAAATTTTTTCCAGG
ATATGTATTAATTCAAATGATTATGAACGAATCAAGTTGGCATTTGGTAC
GAAGCATACCCCGTGTTTTAGGATTTATAGGCGGAACTCCTGATCGACCT
TTACCTATCACCGATCAAGAAGTTAACACTATTATTAATAAACTTAAACA
AGTAGGAGATAAGCCAAGACCTAAAACACTATTTGAACCAGGAGAAACAG
TCAGAGTAAACGATGGTCCATTTTCAGATTTTAATGGAATTGTAGAAGAA
GTAGATTACGAAAAAAACAGATTAAAAGTGTCAGTTTCAATTTTTGGACG
ATCAACACCAGTAGAATTAGATTTTAGTCAAGTTAAAAAAAATTAA
>bbp538 rho, rranscription termination factor rho
ATGAATCTTACTGCTTTAAAAAATATACCAGTTTCTGAGTTAATTTTTCT
TGGTGATAATGCAGGATTGGAAAATTTAGCTCGTATGAGAAAACAAGATA
TTATTTTTTCTATATTAAAACAACATGCTAAAAGTGGAGAAGATATATTT
GGGGACGGTGTTTTGGAAATACTACAAGATGGATTTGGCTTTTTGCGTTC
TTCTGATAGTTCATATCTAGCTGGTCCAGATGATATATATGTGTCTCCAA
GTCAGATTAGAAGATTTAATTTACGAACAGGTGATACTATTTCTGGAAAA
ATTCGTCCTCCAAAAGAAGGAGAAAGATATTTTGCGTTATTAAAAGTAAA
TAAAGTTAATTATGATAAACCTGAAAATGCTAGAAGTAAAATTTTGTTTG
AAAATCTGACGCCTTTACATGCTAATTCTCGTTTAAGGATGGAACGAGGG
AATGGATCTACTGAAGATTTAACAGCTCGAGTATTAGATTTAGCTTCTCC
TATTGGAAGAGGACAACGTGGTTTAATTGTAGCCCCACCTAAAGCCGGTA
AAACTATGTTGTTACAAAATATAGCTCAAAGTATTGCTTATAATCATCCT
GATTGCGTATTAATGGTATTGTTGATTGATGAAAGACCAGAAGAAGTAAC
TGAAATGCGCAGATTGGTTAAAGGAGAAGTGGTAGCATCTACATTTGATG
AACCTTCTTCTCGTCATGTACAAGTATCAGAAATGGTTATTGAAAAAGCT
AAGAGATTAGTTGAGCATAAAAAGGATGTAATTATATTGTTAGATTCGAT
TACTAGATTAGCAAGGGCGTACAATACTGTTGTGCCAGCGTCTGGAAAAG
TTCTAACAGGAGGCGTAGATGCCAATGCTTTGCATAGACCTAAACGTTTT
TTTGGTGCAGCTCGTAATGTAGAAGAAGGAGGTAGTTTAACAATTATAGC
TACTGCTTTAATTGATACAGGTTCAAAAATGGACGAAGTAATATATGAAG
AATTTAAAGGTACTGGAAATATGGAATTACCTTTGTCTAGAAAAATAGCA
GAAAAGCGAGTATTTCCAGCAATTGATTATAATCGTTCTGGAACGCGAAA
AGAAGAGTTATTAACTAAATCTGATGAATTGCAAAAGATGTGGATTTTAC
GTAAAATTATTCATCCAATGAGCGAAATTGATGCAATGGAATTTCTAATA
AACAAATTAGCAATGACAAAAACAAACAATGAATTTTTTGATATGATGAA
ACGTTCTTAA
>bbp247 rnb, exoribonuclease II
ATGTTACGGAATCATCCATTGTTATCGAAATTAAAAAGAAAATTAAATTC
TAATATACCAAGAGTTGAAGGAATAGTAAAAAGTACAGAGAAAGGATTTG
GATTTTTGGAAATAGATTCAAAAACTAGTTATTTTATCCCATTTAAAAAT
ATGAAAAAAGTAATGCATGGTGATAGAATTACTGCATTATTAAAGATAGA
TAATTCTCGAGAAATAGCAGAACCTGAAAAGTTAATTGAACCATTTTTAA
CCAGGTTTATTGGAACAATTCAAGTAAACAAATCTATAATATCGATTATA
CCTGATCATCCATTTTTTAAAGAAAAAATTGTTTGTTCTGTTTCTTGCAT
ATTACCGAAATGTGTAAAAACGGGGGATTGGGCAGTAGCTGTATTAATGC
AACATAAATTAATTCAAGGTCATTATAAATTTTTGGCTAAATTAGTAAAA
TATATTATAAAAAAAGATGATGTTTTAGTTCCTTGGTTAGTAACTTTATC
ACGTTATCAATTAGAATCTGATTGTTTTAAATTAAATTCTAGTTCAATAA
TTTTTGATAATTCTTTGAAAAGAGAAGATCTTACACATTTAGATTTTATT
ACAATAGATAATTCTTCTACTAAGGACATTGATGACGCATTATATGTTGA
AAAACAATCTTTAGGAGCTTTTAATTTAATAGTTGCTATTTCTGATCCTA
CTTCATACATCCCTTTTGGAAGTTCGTTAGATAATTTTGCATTAAAAAGA
AGTTTTACTAATTATTTACCCGGATTTACTATTCCTATGTTACCTTCAGA
GTTGTCTGAAAATAAATGTTCATTAAAAGTAAATAAATCTCGCCCAGTGA
TTGCATGTAAAATTAGGATAGATAGCGATGGTTGTATATTACACAATTAT
AGTTATTTTTTTTTAGCATGGATTAAATCTAAAGCGACATTAGTGTATGA
GTGTGTGTCAGATTGGTTAGAACATAAAGGAAAATGGGTTCCAGAATGTA
GTAATATTGCAAATCAGTTATTTATGTTAAATAGTATATATAATATAAGA
CGTAATTGGAGAAAAAATTATGCTGTATTATTTAAAGAACACCCAGAATA
TAATTTTAAATTATCTAGTAATTTTCAAGTTTTAAATGTTTTTATGGAAA
TGAGACGAACAGCGCATAAAATTGTGGAAGAAGCTATGATTGCAGCTAAT
ATATGTGCAGCAAAAGTTTTATCAGAAAAGTTAGGATTTGGAATATATAA
TGTGCATATTGGTTTTGATGCTTCTAATTCTGAAAATGTAGTTAGATTGT
TATCTAAATATGGTTTTAATTTTTGTAAAGATGAAATACGAACATTAAAA
GGGTTTTGTAAGCTTAGACGTATTTTAAATAAGCATTCGTATAAATATTT
AGATAATAGAATTAAAAAATATCAATCGTTTGGAGAACTTCAATTTTTTC
CTGGTCCACATTTTGCATTAGGTTTGGATGCTTATGCTACATGGACTTCA
CCTATTAGAAAATATAGTGATATGGTTAATCATAGACTATTAAAATCTAT
TATTACACATACTCATGTAATTAAACCAAGTTGTGATATTTTGTTAAAAA
TAAACGATCGCAGAAAACGCTTAAAAATGGCAGAACGAGATTTAGAAGAT
TGGTTATATTCAAAATTTTTTTCTTCGATAGAATATACTAAAAATAGTTT
TAACGCAGAAATAATTGATGTATTTCGTTCTGGAATCAGAGTGCGATCAT
TAAAAAACGGTGCAAACATTTTTATTCCATCGTCATTTTTGCATAATATT
CGAAATGAATTGTTATGTCATCAAGATCAAGGGATAGTCTATATTAATGA
TAAAAAAATGTATAGTGTGTCTGATATAATACAAGTAAAATTAATAAATA
TACGTACACAAACTAGAAACTTGATAGGAAAACCTGTTTAA
>bbp239 rnc, ribonuclease III
ATGAATCATACTGTAATACAAAAATTACAAAAAATTTTAGGATATACATT
TATTAAAAAAGATTTATTGATCCAAGCGTTAACTCATAGAAGTGCAAACA
GTAAGCATAATGAGAGATTGGAATTTTTAGGTGATTCTATTTTAAGTTTT
GTTATTGCTAATGCATTATACCATTGTTTTCCGCATGTAAACGAGGGAGA
TATGAGTAGAATGAGAGCTACTTTAGTTAGAGGTCATACATTAGCTAAAA
TAGCATACGAATTTGATTTAGGAGATTACCTTCAGTTAGGACAAGGAGAG
TTAAAAAGTGGAGGTTTTAGAAGAGAATCAATTCTTGCTAACACTGTAGA
AGCACTTATTGGTAGTATTTTTTTAGATAGCAACTTAAAAACCATAGAAA
AATTAATCTTAAAATGGTATAAAAACCGATTGAAAGCAATTAATCCTAGC
GATACCCAAAAAGACCCAAAAACGAGATTACAAGAATATTTGCAGTCTAA
ACATTTACCATTGCCTTCATATTTAGTAGAACAAGTATATGGAGAAGCAC
ATAATCAATTGTTTACTATTTATTGCGAAATTAGCGGAATTAATGAAAAA
ACAATAGGTATTGGTTCTAGTCGAAGAAAAGCAGAACAAGAAGCTGCACA
AAATGCACTAATAAAATTGGGGATAGAGTGA
>bbp442 rpoA, DNA-directed RNA polymerase alpha chain
ATGCAGAGTTCTGTTACTGAGTTTTTAATACCACGATTAGTAAATATCGA
ACAAATTAGTATGACACATGTAAAAATTACTCTTGAGCCATTAGAACGAG
GTTTTGGACACACGCTTGGAAATGCTTTACGTCGCATTTTGTTATCTTCA
ATGCCTGGATTTGCAGTTACTGAAGTAGAGATTGATGGAATTCTTCATGA
GTATAGTACTAAAGAAGGTGTACAAGAAGATATTATTGAAATTTTGTTAA
ATTTAAAGGGATTAGCGATACGAGTATATGGAAAAGATCAAGTATATTTA
ACGTTAGTGAAGACAGGTATAGGAGTTGTAACTGCAGCTGACATTAATCA
TGGAAATGATGTAGAAATAATTAATTTAGATCATATTATTTGTACTCTTA
CATGTAAAAATGCATCTATATCTATGCGAATTAAGGTTCAATGCGGTCGA
GGTTATGTTCCGGTTATTTCGAGGACAAATGTAATTAGTGATAATAAAGA
AAATTATGTAGGAAAGCTATTAGTAGATGCTTGTTATAGTCCTGTAGAGC
GCATGATATATAAAGTGGAAGCTGCACGTGTAGAAAAGAGAACAGATTTA
GATAAATTAGTTATTGAAATGGAAACTAATGGAACTTTGGATCCAGAAGA
AGCAATTCGTAGAGCTGCTACTATATTGTCTAATCAACTAGAGTCGTTTG
TTTATTTAAGAGATATTAGAGAGCCTGAAATTAAAGAAGAAAAACCAGAA
TTTGATCCTATTTTACTCCGACCGGTAGATGATTTAGAATTAACTGTAAG
ATCTGCTAATTGTTTAAAGGCTGAAATGATTCATTATATTGGTGATTTAG
TTCAAAAAACGGAAGTGGAATTGTTAAGAACACCTAATTTAGGAAAAAAA
TCTTTAACTGAAATTAAAGATGTATTAGCAGCAAAAAATTTATCTTTAGG
TATGAATTTAGAAAATTGGCCTCCTGATAATATTTTAGACAATTAA
>bbp035 rpoB, DNA-directed RNA polymerase beta chain
ATGGTTGTTTACTCTAGTACAGAAAAAAAACGAATACGCAAAGATTTCGG
AAAACGTCCAAAAGTTTTGGATATACCTTACCTTCTTTCTATTCAACTAA
ATTCATTTCAGAAATTTATTAAACATGATCCAAATGGAATACATGGATTA
GAATCAGCATTCCGCTCCATTTTTCCTATTCGGAGTTATAATGGCAATTC
AGAACTACAATATATAAATTATAAATTAGGACAACCTATTTTTAATGTAA
AAGAATGTCAAACACGTGGAATGACCTATTCATCTCCATTACGCGTAAAA
CTACGTTTAGTTATTTATGAAAAAGAAACATTAGACATTACTGTAAAAGA
TATAAAAGAACAAGAAGTATATATGGGAGAAATTCCTTTAATGACTACCA
ATGGAACCTTTATAATTAACGGTACTGAGAGAGTAGTTGTATCTCAATTA
CATCGCAGCCCAGGGGTATTTTTTGATAGTGACAAAGGAAAAACACATTC
ATCAGGAAAAGTTTTATATAACGCTCGAATCATTCCATATAGAGGATCAT
GGTTAGACTTTGAATTTGATCCTAAAGACAATTTATTTTTTCGTATCGAT
AGACGAAGAAAACTACCTATAAGCATTATCTTAAAAGCATTAAATTATAA
TACAGAACAAATATTAGACACATTTTTTAAAAAAAATATTTTTAAATTTA
CTGAAAACAGCATCTTAATGAAATTAGTTCCACATAGACTACGAGGCGAA
ACAGCATCTTTTGACATATGTATCGATAACAAAACTTATATAAAAAAAGG
TCAACGAATTACTGCGCGACATATCAATATACTAAAAGAAAAAAAAATCC
ATACAATTAAAGTTCCCACTGAATATTTAATAGGAAAAATATCGGCTAAA
AATTACTTCAATAAAAAAACTAATGAAATTATTGTATCTGCTAATACAGA
ACTAAATATTAATATTATAAAAGAACTAAAAAATAATGAATATACTAATA
TCGAAACTATTTTTACCAACGATTTAGACCACGGTCCATATATTTCTGAA
ACTCTAAATATCGATCCAACACATGATAAACTCAGTGCTCTAGTAGAAAT
TTATCGTATGATGAGACCAGGCGAACCTCCAACACGCGAAGCAGCTGAAA
ACTTATTTGAAAATTTATTTTTTAGTGAAGAAAGATATGACTTATCCTCA
GTAGGTCGCATGAAATTTAATCGTTCTTTGCAAAAACAAAACATCACAGA
AAGAGGAGTACTCAATCAATCAGATATAATTAGTGTTATTAAAAAGTTAA
TTGATATTCGAAACGGACATGGAGAAATTGATGATATTGATCATTTAGGA
AACCGTCGTGTTAGATCAGTAGGAGAAATGGCAGAAAATCAATTTCGGAT
TGGACTAATTCGCGTAGAACGAGCAGTTAAAGATCGATTATCTTTAGGAG
ACTTAGACATGCTTATGCCTCAAGATATGATCAATGCTAAACCTATTTCT
GCAGCAATAAAAGAATTTTTTGGATCTAGTCAATTATCTCAATTCATGGA
CCAAAATAACCCTTTATCAGAAATTACGCATAAACGTCGTATTTCGGCGT
TGGGATTAGGAGGATTAACTCGAGAAAGAGCAGGATTTGAAGTACGAGAC
GTACATCCTACACACTATGGACGAGTATGTCCCATTGAAACACCAGAAGG
TCCTAATATTGGATTAATCAACTCTTTATCAGTATATGCACAAACCAATT
CATATGGATTTTTAGAAACACCGTACCGAAAAATACATAATGGAAAAGTT
ACAAATGAAATTAAATATTTATCTGCAATTGAAGAAGGTAATTTTATTAT
TGCTCAAGCAAATACAAACTTAGATGAAACAGGCGCATTTGTTGAAGATT
TAATAACTTGTCGCTATAAAGGTGAATCAAGTTTATTTAATAAAAATCAA
ATAAATTATATGGATGTATCAACACAGCAAATAGTATCCGTAGGAGCGTC
ATTAATTCCTTTTCTCGAGCATGATGATGCTAACCGAGCGTTGATGGGAG
CAAATATGCAACGACAAGCCGTACCTACCTTACGTTCTGAAAAACCATTA
GTAGGTACAGGAATGGAAAGAGCAGTAGCTGTCGATTCAGGCGTAACAAT
AATAGCAAAGCGAGGAGGGATAGTTCAATATGTCGACGCATCTAGAATAA
TTATTAAAGTTAAAAAAAATGAAATAAATTCAGAAGAAGCCGGGATTGAT
ATTTATAATTTAAAAAAATATACACGATCTAACCAAAATACATGTATTAA
TCAGATACCATGTATTTCGCTAGGAGAAAACGTAGAAAAAGGAAACGTAT
TAGCTGATGGACCATCAACCGATTTAGGAGAACTAGCATTAGGACAAAAT
ATGCGAGTAGCATTTATGCCATGGAATGGATATAACTTTGAAGATTCAAT
ATTAATATCAGAAAAAGTTGTTCAAGAAGATAGATTTACTACTATTCATA
TTCAAGAACTAGCATGTATTTCTCGCGATACTAAATTAGGTTCCGAAGAA
ATTACTTCAGATATACCAAATGTAGGTGAAGCTGCTTTATCAAAATTAGA
CGAATCTGGCATTGTTTATATTGGAGCTGAAGTCAACGGAGGTGACATCC
TTGTTGGAAAGGTTACTCCAAAAGGAGAAACACAACTAACACCAGAAGAA
AAACTATTAAGAGCTATTTTTGGAGAAAAAGCTTCAGACGTTAAAGATTC
TTCTCTTAGAGTACCTAATGGAGTTTTAGGAACAGTAATTGATGTTCAAA
TATTCACTAGAGATGGAGTAAAAAAAGATAAACGAGCTTTAGAAATTGAA
GAAATGCAATTAAAACAAGCAAAAAAAGATCTAACTGAAGAACAAAAAGT
ATTTGAATTAGGATTATTTACTCAAATTAAATCCACGCTTATAAATTCAG
GAATGAACATTGATCAGTTAAACAAAATACCTAAATCAGAACTATTTAAA
GTTAAAGTAACTAATAATTTATACCAAAAAAAAATACATAAACTATTTTT
AAAATATGAAGAATTAAAAAAATGTTTTAATAAAAAATTAGAAACAACAC
GAAATAAAATAACCCAAGGTGATGATTTAGCCCCTGGTGTATTAAAAATT
GTAAAAGTATATTTAGCAGTCAAAAGACACATTCAACCAGGTGATAAAAT
GGCTGGACGTCATGGAAACAAAGGAGTTATTTCTAAAATAAATCCCATAG
AAGATATGCCATACGATCAAAATGGACTTCCTGTTGATGTTGTATTAAAT
CCATTAGGTGTACCATCTAGAATGAATATTGGACAAATTTTAGAAACACA
TTTAGGATTAGCATCAAAGGGACTAGGTAATATCATCGATACTATGCTAA
AACAGCAAAAATCAATTCTGAATATCCGAAAATTTATCCAAAAAGCTTTT
AACTTAGGAAATAATACTAGACAAAAAACAAATTTAAATAATTTTTCTGA
CGATGAAATATTATCTTTAGCTAAAAATTTCAAAAATGGTATACCAATCT
CAACACCTGTATTTGACGGAGCACAAGAAAGCGAAATTAAAGCATTATTA
AAACTAGCTGATCTTCCATCATCCGGGCAAATAACATTATTTGACGGCCG
CACTGGAGAAAAATTCGAAAGACCAGTAACTGTAGGTTATATGTATATGT
TAAAGTTAAATCATTTAGTCGATGATAAGATGCATGCTCGATCTACTGGA
TCATATAGTTTAGTTACACAACAACCATTAGGAGGAAAAGCACAATTCGG
AGGTCAGCGCTTTGGAGAAATGGAAGTATGGGCACTAGAAGCATACGGTG
CTGCATATACCTTACAAGAAATGTTAACAGTAAAATCTGATGACGTTAAT
GGGCGAACTAAAATGTATAAAAATATAGTTGATGGAAACTATAAAATGGA
GCCGGGAATGCCAGAATCTTTTAACGTATTATTAAAAGAAATTAGATCAT
TAGCTATCAATATAGAATTAGAGAATGAATAG
>bbp034 rpoC, DNA-directed RNA polymerase beta' chain
GTGAAAGATTTATTAAAAATTTTCAAATCACAAATTAAAACTGATGAATT
TGACGCAATTAAAATTGCACTTGCCTCACCAGATATGATTCGTTCATGGT
CATTCGGCGAAGTAAAAAAACCAGAAACTATAAATTATCGCACTTTTAAA
CCAGAAAGAGATGGATTATTTTGCGCACGCATTTTTGGTCCAGTAAAAGA
TTATGAATGTTTATGTGGAAAATATAAACGATTAAAACATCGCGGAGTAA
TTTGTGAAAAATGTGGGGTAGAAGTAACGCAAAGTAAAGTACGTCGCGAA
AGAATGGGACATATCGAACTAGCTACGCCTATTGCTCACATCTGGTTTTT
AAAATCACTACCGTCAAGAATTGGATTACTGTTAGATATGCCGTTACGAG
ACATTGAACGCGTACTATATTTCGAATCATATGTCATAGTTAATGAAGGA
TTGACTAACTTAGAAAAAAATCAAATTTTATCTGAAGAACAATATTTAAA
TGCATTAGAAAAATTTGGAGATGAATTTGATGCTAAAATGGGCGCAGAAG
CTATAAAATTATTACTTAATAGTATAAATTTAAAACAAGAATGTAATAAA
TTAAGAGATGAACTTAATAATAGCAATTCAGAAACAAAAAGAAAAAAACT
CACCAAACGTATTAAATTATTAGAGTCATTTATACATTCAAACAATAAAC
CAGAATGGATGATTTTAACAGTATTACCTATTTTACCACCAGATCTTAGA
CCGTTAGTACCACTGGATGGAGGACGTTTTGCAACATCAGATCTCAACGA
TTTATATCGTCGCGTAATCAATAGAAATAATCGACTTAAAAGACTACTAG
AATTATCAGCACCTGACATCATTGTTAGAAATGAAAAAAGAATGTTACAA
GAAGCCATAGATGCACTATTAGATAATGGAAGAAGAGGAAGAGCTATAAC
AGGTTCAAATAAAAGACCTTTAAAATCTTTAGCTGACATGATAAAAGGAA
AACAAGGACGTTTTCGCCAAAATCTGTTAGGTAAAAGAGTAGATTATTCT
GGGAGATCAGTAATCACTGTTGGACCTTATCTCAGATTACATCAATGTGG
ATTACCAAAAAAAATGGCATTAGAATTATTTAAACCATTCATCTATGGAA
AATTAGAAAAAAAAGGATTGGCTACAACTATTAAAGCAGCTAAAAAAATG
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GCCAAATAGAAGCTAAAGCTTTAAGAAAACTAAGACATCCAAGCCGGTCA
GAAATACTACGTAGTTTTCTAGATGATTAA
>bbp027 rpoH, RNA polymerase sigma-32 factor
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CTATAGAAACATGA
>bbp491 yqgE, conserved hypothetical protein
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ATGGAGCAATGGGTATAATCATAAATAAAAAAATAAAAAATTTAACAATA
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CAATTTGAATAATCCAAAAAATATATTAATGGCACTAGGTCATTGTATAT
GGAAACAACATCAATTAGAACAAGAAATAGCAAAAAATATATGGTTAACT
ACACCCGCTGATATTGATATTATATTTAACACACCTATTTCTGAAAAATG
GAAAAAATCAATGTATAGCATTGGTATTATGAACATATTACAATTAACTT
CTGAAATAGGACATGCATAA
>bbp348 yrbA, YrbA
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