Show UniProt / TrEMBL protein name		View as list		View in Fasta format (Protein)

# Anaplasma phagocytophilum HZ, HZ

>APH_1100 DNA-binding protein
ATGGAAGAACACGGTGGTTGCAGTAGTATAGTTGCCAGCAGAATCAGATC
TCAGATGGATAAAATCGGCGTAAACGCTCGCGAGCTGGCTGAGAAAGCTT
CTGTTGGGAAGTCATTCGTCTATGATATTCTGAGTGGTAAGTCTAGCAAT
CCCACGTCAAAGAAACTTATGGCCATTGCTGAGGTATTGCAGGTTCCTTT
AGCATATTTAGTGGGCAGTGATGATGGGCTTTGTGAGGTTGCTTCTGGGG
GTATTAGTCCTATATCTTACTTAGAAGATGAGGGTGTAGATGGCAGCATA
AAATATGAAAAATTTTATGTGCCTGCAAATACGAAATTACCGTTTCACAC
AGAACATTTACGCTTCTATGATGTTAAGGGAGATAGTATGTCTCCGACCC
TGTTTGGGCAGGATATTGTGTTAGTAGATATATCAGATAAAGTTGCACAT
CCTGCTGGGGTGTTTGCAATTAAGGATTCAATTGGCATATTGATTCGTAG
ATTGGAGTATATTAGGGACAGTAGCAAAATAGTGTTGCATGTAGTTTGCG
ACAATAAGAAGTACTCATCGTATGAGTGTGCAGTTGAAGATATTGAGATT
TTGGGACGTGTTATATGGTATGCAAGGGCGCTACGGTAG
>APH_1014 putative transcriptional activator, Baf family
ATGCTAGCTATAGTTGATGTTGGAAATACCAACATAAAATTCACTTTATA
TGTCGATGGGGAGTTTTCAGAGAGCTGGTATATATCGACTTATCATGAGC
GTACAGCCTCTGAACTTTATGCCATACTGCGTGTATTGGCATCTCAGGCC
AATATCAATATTCACCATTTAGTTGGGGCTGCGGTGTCTAGTGTTTTTCC
TGCAGTAAACGGTTCTATAACAGAGATGTTCAAGAGCTTTTTCAACATTG
TACCAGTATTCATAACAAGCGCTCATGCAAGTTTACTGGGAATCAATATA
TGTTTAGCGCAGAATACGATAGGCTCTGATCGCCTTGCTGACATAGTCGC
TGCCCGCACATTATACCCTGATAGGGATCTTCTTGTGATAGATATGGGAA
CAATTACCGTTTTTAATCTCGTCAACAAAAATGGAGATCTATACGGACAG
GTTCTCTCTCCTGGTCTTGCGTGTCTGGTAAAGAGCGTGAGGCTGTGCAC
GGCTGCGCTTCCGCAAGTATGTGTAAATAAACCAACAACTAAGGTAATAT
CAGATGCTACTGCATCATCCTTAGAATCTGGATTGTATTGGGGCTATTTA
TCAATGGTCGAGGGAGTAATACAGCGAATATTAAAAGAGGAAAGTGGTAA
ATCTCTGCAAACAGTCGCTACGGGGGGAGCATCCAACTTCTTTCGCGATA
CCACTCATGTTCTCTCAATCGACAAATTATTAACCACAAAAGGCATATTA
CAGATTTACAGAAAGCTAATAGAGAATGAGGAAGGGCGTTAA
>APH_0135 cold shock protein, CSD family
ATGTCTCAGTTAGTGGATGGGAAGGCGTTCTACACCGGTCATGTTAAGTG
GTTTAGCGTAGAGAAGGGTTATGGTTTTATTTGTAAGGACAGCTCCGAAG
GCAGTAAGGGTTCTGCTATGGGGCATGGTGAGAAGGATGTCTTCGTACAT
ATTACATCGCTGCAGAGGAGCAGAATAGATAACCTCAGAGAAGGACAGAA
GGTTAGGTACCAGTTGGATGAAAATAACGGAAAGGTTTCTGCTGTGAACC
TAGAGGTGCTTTCGGAGTAA
>APH_0673 rrf2 family protein /cysteine desulfurase
GTGATAGCGGATTCGCAATCGCTCTCTGAAGGATACTTAGAGCGCGTCAT
TTCACATCTTAAAAGCAGGGGATTAGTAAAACCCACTAGGGGGCCTGGAG
GGGGGTACTCTTTAGGCATGTCACCAGATCGCATAACCTTGGATATGCTA
TTAGATTCCGTGGGAGATAAAGTTAAAATGGTCAGATGTGACGCAGACGG
GAATACCGGGTGTATATCTTCCTATGCGGGGAAGTGTAATAGTCACGACC
TGTGGGAAAGTATGGAAAAGTACATGATGCACTACTTTGCCAATACTACA
ATACTCGATGTATCTAATAATACGCTTAAAGAACTAGGTGGTGGTGGAGA
TTATATTTACGCCGATGATAATGCGTCTTCAGAAGTGTGCCAGCAAGTTC
GGCATAAGTTAGGTAATGCGCTATTGTTTGGTAATTTTTATAATCCTTCA
GCGGTTTATGGCTTAGGACAGAAGGCCAGAAGTTTAGTAGAAGACGTGAG
GCGAGTTGTTATTGAAGCACTTGATGCCAGAGGTTATGAAGTGGTTTTTA
CTTCTTCTGGAACGGAAGCCAATAATCTCGTGTTCAATAGTGTAAATGGC
AGGCATATAATTTCAGCAATAGAGCATCCGTCAGTGATGAATGCAGCAGT
GGATCCGGTGTTGATATCGGTAACAGGAGATGGTGTTGTTTCTTTAGAAG
CGCTGGAGGAAGCTTTAAAGTCGGGCGATAGCAAAGGAAGCCTTGTATCT
GTTATGTTAGCTAACAACGAGATTGGTGTAATTCAGCCTCTAAAAGACGT
TGTGAATATTGCTCATAAATATGGTGCTGTAGTGCATATGGATGCCGTGC
AGGCGTGTGGGAAGATACCTGTAAGTGTGTTGGATATTGGTGCAGATTTT
GTAACCATTTCTTCCCATAAAGTCGGGGGAATTGTGGGTGCTGGTGCTGT
GCTTTACAACGGTAAAAAGGTCAATGTAGTGCCGATGTTACGTGGTGGCA
TGCAGGAAAAAGGGTTACGTGCTGGTACTGAGAATATTCCGGCAATTTAT
TCTTTGGCTATAGCCTTGGAAAATCTCAAAGATCGTCTGCAAAAGATGTC
TAATGTGGCGAGTATGCGTGATTTGCTTGAAAAGAAGATTAAGGAAATGG
TTCCAGAATGCATAATCTGGGGTTCCGGAGCCGACAGGTTACCTAACACG
ACGTGTATATCAATGCCTGGTGTGAGCAGTGAAACACAACTTATAGGGTT
TGATAGCAATGGGATAGCGGTTGGTGTAGGAGCAGCGTGCAGTAGCGGGA
AAATAGGAAGGTCAAAGGTATTAGAAGCACTAGGAGCAAGTGAAGAGGAT
GCTAAGAATGCTATTAGGATCAGCTTAGGTCCTGAAGTAAGCAGTGATCA
AGTAAATAAAATTATCGAATGTTGGTATAAAATCTACAGTAATTTTCACT
CGCTGAGTTGA
>APH_1282 transcriptional regulator, MerR family
GTGATTTATAGTGATCTTGATAACATATCGGACCATAAACAAAGCTCGGA
CAAGGTGTTTGTTCCAATAGGTACAGTAGCCAAAGAAGTAGGTGTTGAGC
AGTATGTGCTGCGTTTCTGGGAAAGCAAGTTTTCACAAATAAGCCCTATA
AAAAGGAGAGGAAGGCGCTTATATGGCAAAAATGATATTGAGATCATAAA
GAAAATAAAGCATATGCTATATGACCTTGGATACACGATCAAGGGCGCAC
AGGCAGAGCTAAAAAAGCAGCACAGTGTTTCAAAGGTTGCGAAAACAAAC
GATATCGCACTTACTCAGTTGCTTGAGAATATGTTGGCTATGCGAGAAAT
GCTTACAAAAAAATTGAACGGAATGTAG
>APH_1099 DNA-binding response regulator
ATGCGCATACTGTTAATAGAAGATGATGTTGCCTGTGCTAAAGCAGTTGA
GGCTTCTTTGTCTGCAGAGGGGCATTTTTGTGAGACTATGGCTTCCGCTC
AGGATTGCTATGGTAGTATAATTCCCAAGAACGATGATTATGACGTTGTT
ATACTGGATATACACTTTCCTGGAAAGATTGATGGATATGATATATTAGT
GAAGCTTCGGGAATCAGGCATCAGAGTACCTGTACTAATATTGTCATGTA
TTTCGTCGGTAGCTCATAAGGTTAAGGGACTTTATTATGGTGCTGATGAT
TACATTACTAAGCCTTTTCATAAGAGTGAGTTACTTGCAAGAATCAAGGC
TGTTGTAAGACGTACTCGTGGACATCCTGAATCGATAGTGCGTGTCGGAA
ATATATCAATAAACTTGGATCACAAGTGTGTTTCATGCAACGGGAACATC
ATACACTTAACTAAGAAAGAATACGGTATGATAGAGCTTTTGTCGTCTAG
GTTGGGCACTGTACTCACGAAGGAGATGTTTTTATCTCATTTATATAGGG
AGTTGGATGAGCCATCTGATGATAAGATCATAGATGTGTTCATGTGTAAG
CTGCGCAAGAAGCTTAAGGTCGCCAATAACGGGAAAAATTACATTGAGAC
GGTATGGGGCAGGGGCTATGTGCTGAAGGAGCATCCTTGTGATGATGGAG
AGGATGATGCTTCTGGGGCCACTGACAAGAGGTGTGCTGTAGCCGGTTCT
ACTGAGGAAGATAGTGCGAGCAAGGCTTCTGGGTATGAATGGTCTGCAGA
GCAAAATCGGGATTATGCGGAAGAAGCCTAG
>APH_1218 DNA-binding protein
ATGTTTATGACTTCTCAAGCACAAAACCAAAATTCCATCCCCATAACTAT
AGAAGGGAAAGCAAAGCCTCATCCAGTAGACGAGTATGTGGGACGAGAAA
TAAAGAAGCAGCGCATCATGAAGGGCATGAGCCAAAATCAGCTTGCAAGC
AGGTTAGGGATTACATTCCAACAAGTACAAAAATACGAAAAGGGTACTAA
CCGTATAGTGATAAGCAGGTTATATGAGCTGGCTCGTGTTTTAGGCATTG
AGATTAATGACCTCATGTCTAAGTTGCAAAATGACATACGGTCTATAACA
GAGGGTACCGACATATCAATAACTTGTCTTCAAGAAGGAGATGAAGCGTC
ATTAGAGGAATTTGATCATAATTATAATGATGGCAAAGAAGTACTAATGC
TTGTTAGGGCATACCGTAGAATAAAAAGTGAAAAAATGCGTGGTGCAATT
CATACACTAGTAAAAGTTATGTGCGCAGAACAATCTAATGATGATTATGA
GACTTCCTATAGGGGTCCTGAGTATGTTATCGTAACAAACCAAGAAGATT
AA
>APH_0047 ATP cone domain protein
ATGAAATGTCCGTTTTGTAACAGTGCGGATACAAGAGTGAAGAACTCTAG
GCACTCCGATGATAATATGTCTGTGAGAAGACGTAGGTTGTGTGAAGTTT
GCAACTCTAGGTTCACGACTCTTGAGGAGTTGTTGCTTAAGCCTATCATG
GTTCTGAAAAAAGATGGAAGAATGGAGCCTTTTGACAAGCAGAAGTTACT
TACATCTATTATGTTGGCTACAAACAAGCGTCCAGTTACCCATGCACAAA
TAAATATGGTGCTAAGCAAGATACTGTATAAGTTTGAGTCGGTGAAAGAG
GATGTTATTCCTGCTAGGGTGATAGGAGAGATAGTAAAAAACAACCTTTT
GGTTTTGGATAAGGTTGCATACATCAGGTTTGTTTCCGTGTATATGGACT
TTAGCGATGCGGATGACTTCTGTAGTTTAGTAGAAAAGATTAAAGAGGGA
TCCGATAAGTGA
>APH_0043 conserved hypothetical protein
ATGAAGTTTCTGGGATATTTGTGTGGGGCAGCAATTATAGCACTGGCTGC
AATAATTGGTGTGCCGTACTTAATTGACTGGGATGCCCGTTACGGTGATT
ATGCATTTGAGCAGCTCGGGGTAGCCGTCAAGAACAGCGGTGTTTCTATA
AAGGTTCTTGGTGATATTCGTGGGAAATTTCTCCCTCCGAAGCTTATAGT
GCGTAATTTGTATTTGGGATGTGACGAAGAATCCAAGGGGTGTTCAGGAG
TTATTGCGGTAGACAGGCTGGAGATAGGTTTATCTGTCTGGTTCCTGCTT
AGAGGGGAAAGAAAGGTCGAGTATATCGATCTGTATGGGCTACGCACTGA
CGCAAAAAGTTTGGGTGATGTTGTAACCACGCAAGCTGGCGCTGGGGTTG
GTAAAGTACGTATATTCGACTCGGTTATAGTGCCCGGTCAAACCTTTGAA
CCATCACCACGCAATGCGGTACATGTAAAGCAAAGCGAAATAAGGTCGCG
TGGCAATTTATATAGGACTAACACAGAGTTTAGGATAGGCAGAGGAAAGT
ATAGTCTTGTAGCAAAGGTTGAACTGCAAGACAGTGGGGATAAGACTGCC
ACTGTAGAGCTCACATCTGGGAATACCAGGGTATCGCTTTCAGGAAAGGG
GCGATACGATGTTGGCGCGGGTGATAGGACTCTTTTAGAGGTATTTGGTG
GCTTTGAGTGGTTGTTAGACGCTAAAACTAGCAATCTTGGTGAATTTTCT
CAAGCTTTGTCTGTGGTAACCCGGATTGATGCGTTAGAACATATTCACTC
TACAGAGGAACTATCGTTACTTGCTGAGTTCAAGCACGATGTTGGTCATG
GATTTGAGGTTAACCGCTTAGATATTGAGGGTAGTAGCCTTACAGGGAAT
GTTAAGGGCAAGTGCAATGCATCGATGTCCTGTGATGCACAGTTGGCTTT
TTCTTTCATGGATATAGATGCGTTGGTAAGGCACGATGATCCTGATGTGA
ATATATACAATACTCCGGTGCGGGGAAGTAGCAGTATTTCCTTTCCAGTG
ATAGTTTTGGGGATGGATGCTCAGGCTGAACTAGACATAAAAGAAATGCG
TTACAAAGGTGGTGTTGTTAGGAACATTTCATCTAGCGCTACCATAAGCG
CCGGGAAGATAGTTGTTGATAGACTGCTTCTTGATCTTCCTGGTAAGAAT
AATGTGCTGCAAGTTAGTGGTACTGCTGTTAATACTGAGGGGAATACAAT
ACCTCGATTTATGGGGACCATTAATGTTGCAGGAGAAGATATAGATACGC
TCATTAGCTGGCTATTTCCTTTTAGTGCCAAGGAGGTACGTGATGACAAA
GGAGATGGAAGTTTTGTGCTAAAAAGTGGGTTTTACGTTGCGCCCCGCAT
TATTGCATTTCCTGACATAAATCTGAATTCGCGCAGGGCTAATATTGCAG
GTAATCTTAAGTACAAATACGGTAGAGGGGGTGGTGTTGTTATAGGTGGA
ATTACAGTCAGCAATTTTGCTTCTAGCGACTATAAAATGGTACACCTTGA
TTCAAAGAGTGATAATGATATTTTAAGTTTTATGTGGCTCAGGAATATCG
CGATTCCTGTACAAGTGGCTGTGAAATTTCGGGATTTCACTATAGGAAGA
CGAGCGATCGACGAGCTAAGTTTTCTAGCAGACGTATCAAGTCGTCGTAT
GAGCATAGAAAAAATACGTTTTTCTGCACAGGATAGTAAGGGTCACGTAT
CTGACGTAAGAGGTTCCGCGAGTGTTACGTTGAGTAGTCAAGGAGTGCGG
CCGAAAGTGTTTTTAAATCTTGTAGGGGATCAATATAGTTCGGAGTTTTT
GTGGGCACCAAAATTGATTGCCCGCAACAGCATAGCAGCTGAAGGAGGAA
GGAGGGTTTCCCAGGAAGGATATTCAAAATATGTGTGGTCAAGCCAGCCT
ATAAATCTCTCAAGTCTTGAGGGGATAGACGGAAATGTGAATGTCAAATT
AAAGAACATGACTTTTTTGGGGAGGTCTCTAACGGACTTGGTTATGTCGT
CTACATTTAAAGAAGGGGTAATGTCTATAGATGATCTTCACTTCAATCAG
GGTGAAGGGAATGTAAAGATTAGTGGCAATGTAGGTATGGGAGATGTAAC
ATCGCTGTCAGTTGTGATTGCCGCTTCCAATGTTGCGATAGGGAGTGAGG
ATTCTGATGATGAAGATGTAGAGGAGCCCAAGGGTATGAATCCTAAGGGC
AATATAAGTGTTAGTGGAACGTTGCAAATGTATGGAAGAAATGTTCTTGA
ACTGATGAATTCTGTGAAGGGTAAACTAAAATTTGCTGCAAGGCGTCTCG
ACGTGAGTGGTGTGGATTTTGATGGCTTTATTACGGATCTCTTCAATACA
GAAAGCAAGGCTGACATAGCATCATTGTCTCGTGTTTATCTATACAGAGG
TAATACAGTTTTTGAGAAGTTTGATGGTGAAATGCAGATAGAAAGGGGAA
CAGCTGTGTCTTCTTTGCAGTTTAGGCTCAACAATGCAGTTGGAGCGGCG
TCCATTAACTTCATGATCCCTCAGTTTACGGTAACGTCGCTTTGCAGATT
TGCATTTGTACCTCCTGGGGGAAACAGTCCTGCTAGTATAGACATGTCGC
TGCAGGGGTATGTATGGCAGCCTAAGCCTACTTTCGATATTGATAGACTA
TTTGAGCTTGTAAAAAGCAGCAGATAG
>APH_1333 greA, transcription elongation factor GreA
ATGAGCGACTATGTGACTACTAGGTTTCCTATTACGAAGGGGGGCTACCA
GAAATTGGAGTCGGAGCTGGAAGCTCTAAAGAGTGAGAGACCGAAGATTA
TTAAATCTATTTCTGATGCTAGGGAGTTGGGTGATCTTTCGGAGAATGCT
GAGTACCATGCTGCGAGAGAGCGTCAGGGTCTTGTAGAAAGCAAGATAAT
GGAGCTTGAGTCTAAGAAATCTAGGGCTGAAGTCATAGAAGTATCAGAAT
TATCGGGTGATACGGTTATGTTTGGGGCAACTGTTACTGTATCCGTGTAT
GATGAGCAGAGTGATACTACTAGCGAGGTTAAGTATCAGATAGTTGGGGA
ATATGAGGCGGATGTTTCGAAGAATATGATATCAATTAAGTCGCCGTTGG
TCCTGGCTCTATTGGGCAAGCGAGAAGGTGACAGTGTTGAGCTGAAAACG
CCGCGTGGAGACTATAAGGTATATCAAATTAACAAAGTTGAGTTCATATA
G
>APH_0107 mfd, transcription-repair coupling factor
ATGGATATGGGTTCCTCGGAAATAGTCACGGGCATAGCTCCGGAATTAGA
AGATGCGCTGATCACTGAGATATGTCGCAATAATCCCAAAAAATCTTTTG
TATGCGTGCTGCAGGATGATAAACCCCTGGAGCTTTTGGTAAAAACTCTA
AAATTCTTCGATAGCACACACAATATACTATTATTTCCCGCATGGGATAC
GTGCACATATAAGCACACTTCCCCTAGCAGTTATGTGATGACTCATAGAG
TAAAGTGCTTACTGGATTTGTTATCAGTAGGCTCCAAACCCTACATACTG
CTAACAACTATCAGCGCTTTAATCCAAAAAGTATTACCGAAAAATGCCGT
ATCTTCTTCTACATTGCACATAGAAGCTGGAAAAAGCTTATCGATGGACG
AGCTGACCCTACATTTGATAGAGCATGGGTACGTGAAGTCATCAACTGTA
GTACAAGAAGTCGGTAGTTTTGCTGTGCGCGGAGATATAGTGGACATCTT
CCAAGCAGTGAATGAAAACCCCGTCAGAATATACTTTGACTATGATATTG
TAGAATCAATAAAGTTCTTCGATCCAGATACCCAGATTACATGCAGTGAA
CAAATTCTGGATATAGTGATCTTTTCCGCATCTGAATTGATAAAAAATGA
CGGAAACATTGCTAGATTCTCTGAGAAATGCTCCCATCTACGAAGCAACA
ACCCTCCACTTTACGAAGCCGTCGTACATCGGCAAAAATTCGAAGGTGAA
GAACAATTACTACCGTTACTACAAGCTGATGCTTTAGTAACTCTTTTCGA
CTACATACAGGAAGCAGAGCTTGTTCTAAGTGAAGCAACATTTTCCAACA
TAAAACAGCGAATTGAGAACATTTGGGAACAAAATGATACGCAGGATTGC
ACAACTCACTGTACATCGCTGTTTCTTGATTTACAAAGCTACGAGCAAGT
TCTAGCACGATTCCACAAAATACTATTATGTCGCTTTGATTCAGCACCAC
AAAGTATAGTACAAAACCCCGCTACAGTAGCGCTGACGAAGAGCACACTA
GCGCTGTTACCTGACCTCAAATTACAAGCTCGCGAAAGAGGCTGTAATAT
TTTCTCGGTAACTGCAAACCATATGCAAGAAGCAAAAAAGCAAGTGCTAT
TGGCGTGCTATAGCGAAGAATCCATGCAGTATCTTGTTGAGAAGTTCAAA
CACTTCGACATGCATATATCGAGAGTATCAAGTTTCTCCGACATAACCAG
TAAATATAGTACAGCTATACTGCCATTCCAACATGATGTCGAAACTGAAG
ATTTCATAATCATTACAGAACATAGTTTACTCGGTAGGCAATGCTCCATA
AAAAAAGCGAGACGCACGGTTACAAATAATGCTTCTGAGCTTACTATTGG
GGACGTTGTCGTACATAAAGACTACGGTGTAGGTATTTTCATCGCTCTCA
GAACGTTAACCGTTTGTGGGAGCTGTCATGATTTCGTTGAGATTAAGTAT
CGTAACGATGACAAACTATTTGTTCCCGTAGAAGATACTGACCTTATAAC
AAAGTACGGAATTAATACGGATGTAGTCCTAGATAGACTGGGCAGCTCTG
CATGGCACGACAAACAAAACAAGCTGAAAAAGCGCATAGATGATATCGCA
AAGACCCTCTTACATGCAGAGGCCATGCGTAAATTAGCCGACGGAAGCAG
ATTTCTACCCAGCTCATTGTATATAGACTTCTGCAAAGAATGTCCTTATG
TCGAAACAGAAGACCAACTAAAAGCTATAGCAGATGTTGAAAATGACCTT
GCACGCGGCAAAGTCATGGACAGGCTAATATGCGGTGATGTTGGATTTGG
TAAAACAGAAATTGCACTACGCGCTGCTTTTCTTGTAGTCAACGAAGATA
TAACATGCCAAGTGGCTGTGCTTGTACCGACAACTTTACTATGTCGCCAG
CATTTTCTCGCCTTTAAAGAAAGATTCAAGAATTACAAAGTCAATATCCA
ACAGCTTTCAAAAGCAACTGCGAAAAAGAAGCAACAAATCCGGGAAGGAC
TTGAAGAAGGGAGTATCAACATCATTATAGGTACGAGTGCCCTACTATCG
GATAGCATCCAGTTTTTAGACCTCAGATTACTGATTATTGATGAAGAACA
ACATTTTGGCGTACAACAAAAAGAAAAACTCCGGCTATTGAAGCATGACG
TTCATGTACTATCGCTCTCAGCCACACCTATACCTAGGACGCTACATATG
TCACTCTCCAATATAAAAGACCTGAGCATACTCCGCACACCCCCTATTGG
GAGAACTACTGTAGAGATTTCTATAACACACTTCGATGAGAAGACAATAA
AAACAGCCATACTTAACGAGGTCAACAGAGGTGGTAGGGTGTTTTTTACA
TGTCCTCTTATCGCCGATATTGAGCCAGTGCTAACGCGACTACAAAAGCT
TGTTCCGGAAGTCAAAATAGCAGTAGCCCACGGAGGCACCGCACCCCTCG
CGTTAGATAAAATTATGAATGATTTCTTTGATGGCAAATTCTCCCTTCTC
CTGACAACGTCGATAATAGAGAGCGGAATAGATATTCCATTTGCTAATAC
CATAATTATATATAATGCCGATATGTTTGGCCTTGCGCAGCTATATCAAT
TAAAAGGACGCGTTGGCCGCAGCACCACACAAGGATATGCGTATTTGATA
CTCTCAAATAAAGCAACTTCTAATTCTCCCGGCATGAAGAGGTTAGAAGC
ACTGAAATCTCTAAACAGCGTTGGTTCAGGTTTTGCACTATCCCTACAGG
ATATGGACATGAGGGGATTTGGCAATTTAGTCGGAGAAGAACAATCTGGA
AACATAAAAGAAGTTGGCATTGAGCTCTATCACCGCATGTTAGAAGAAGC
CTTAGAAACATGCAAAATGACCACAGAAAGCTCTGCCGTAAGCTGCCATA
ATATAAAGGTGGATATAAATGCAAATGTACGAATTCCCGAGTCATACATA
CAAGAACTCGAACTCAGAATGCAGGTCTACAAAAAAATTAGTAGCTTAAA
GACACCCGAAGAGATAAGTCGCTATTCTGAGGAACTAAAAGACAGATTTG
GCATGCCCCCACGTGAGGTAATCAATCTACTGGATATAATACACATAAAA
CATCTCTGTGCCCGCATCGGCATTGCTGAAATCACCCATTTCAAAAATCA
CCTTACCCTACTATTTGGACGTAGTTTTACACCCCAAGAGTCACTCCTAA
AATACTTTGTAAACAATGCCGGCATTTTCACCATGCAGGGGAACAGTGTG
AATGTGCTAATATCCGCAGTACATGCCAATAATGTGACTAGATATCTGAT
AGCATGTCTAAGAAAAATAAACAGTTTACTTACTCATACACCCGCATCAA
AAGAGACGAAAACAGACTAG
>APH_0445 nusA, N utilization substance protein A
ATGGTGAATTTGTATAATTTTGATAATCTTGAGCTCATAAGAGTTGCCAG
GGATGTTGCAGAGCAAAGAGGTCTGGATCTTGGTGTAATAGTAGAAGCTA
TAGAGCAAGCGCTTGAGGTTGTGAGTCATGTTAAGTATGGGGATAGTAAG
ATTAAGGTCTCCATTGATAGGAAGACGGGGGTGATATCTGTAGCTCGGCA
GGTTCTGGTAGTGAAGGATGACTTCACTTTTGATAGTGAAGAGTGTGGTA
TAGCGGCTGAAGAGGTTAATAAGTATAAGCTTGTGAGAATCTCTGATGCG
TTGGCTGACGGGGAGCAGGTTGAGGTTGGTGATATACTGTTGGAGCCGTT
GCCGCCGATTGATATTGATTATAATTCTGCGAAGCTCGCAAAGCAAAAGG
TTGCGCAGCTAATAATGATGCAGGAAAGGAAGAGGCAATACGAGGAGTTC
AAGGATCGAGTTGGTGATCTTGTATATGGGGTTGTGAAGCGTGTTGAGTA
CAACAACATTATTGTAGATCTAAACGGGAGCGAGGGGTATCTTCCTGTAT
ACAATACTATTAGGGGGGAAGTATTTCGTCCTAATGCTAGGGTCAAGGCG
CATGTAGAGGATGTGCGTAGGGAAGCTACGGGGCCTCAGATTTTTCTTTC
GAGGGTTAGTAAGAGGTTTATGGAGCTTCTGTTTAAGCAGGAGATTTCAG
AAGTATATGATGGTATCGTTACTATAAAGGCCTTGGCTAGGGATGCTGGT
TCTAGGTCTAAGGTTGCGGTTTATTCGTCTGATAAGAATGTGGATCCAGT
TGGGGCGTGTATTGGTGCTCGTGGAGTTAGGATACAGAATATAGTTGCGG
AGCTCAACGGAGAGAAGATAGATGTAATTCCGTATTCTCCGGATCTTGCC
AAGTTTGTGGTTAGTGCGATTGCGCCTGCGGAAGTGGTGAAGGTGATTAT
CGACGAAGATGTAGAAAAGATAGAGCTGGTGGTACCTGAGAGCCAAGTGA
GTTTGGCTATAGGTAGATATGGGCAAAATATAAGGTTGGCTTCAGAGCTG
GTTGGCTGGAGTATTGATGTAATTGGGGATGAGACTGAATCGACTAGGAA
GGCTAAGGAGTTGAGTAGTGGTGCCAAGGTCTTTGTAGAGGATTTGGATG
TTGAGGAAATTATAGGGCAGCTTCTTGTCAGTGAGGGTTTTTCTAGTATT
GAAGATCTAGATAGAGCTGAGGTTGGCGATATTGCGGCTGTTGATGGCTT
CAATGAAGAGATAGCGCGAGAGTTGAAGACGAGGGCGGCTGAGTGTCTGG
CGCGCAAGCGTAAGGAAGCTATTGAGATGCTTGAAAGCATGTCGGTGAGT
GAAGAGGTTATGCAACTTCCGTTCTTGCAGGTAGAAGATATCGTAAAGTT
AAGTGAGAATGGCGTGAGGAGCGTAGAAGATATAGCTTCTCTTTGTACTG
ATGAATTTTATGATATTGTTCCCAGGGCTAAGTTAAGTAAAGAGCAAGTG
GATTCCGTCATTCTGGAATCACGCAAACGAGTTGGGTGGGTTTAG
>APH_0538 nusB, N utilization substance protein B
ATGATGGAAAAAGTGGTTAATGGAGCTCACGATGACATGCCATGGCATGT
TGGAAAAACTTCTGCTAGATTCCTAGCGGTACAGGGTGCTTACGCCATGA
TGTTTGGTGCTTACACAGCATCTGATCTGGAGGACCTCTTGGAGCACTTG
TGTGAAATGCAGGAAGTGCTAGATTTACATAGGGTGGACAAGAAGTTGCT
GTCTAAAATTCTGGGGTGCATGATAGAGAAATGTAACGAGGTGGATAGTT
TAATTTCGGTGCATCTAAATGAAAAATGGTCGATGGAGAGGATAAATTTG
GTGAGCCTAGCTGTGATGAGAGCTGGCGTGTGTGAGTTGCTCTGTTTAAA
GACTAGTGAGTGTGTTATAATAAATGAATATGTAGGGATAGCTTCTACTG
TGCTGGAGAAGAGTGAGGTCAATTTTGTTAATGCCATATTGAATAAGGCA
AAGACTGTGCGGTCTCCTGAATGCGATTTGTCATTATCAACTTTTGCAGA
CGATTCTGATGGGGTCTCTACGGCGAAGTGTGAGAACGGGCTAAATCTGG
GCGCAGGAGCTAGGGTGAAGCTAGAAAGCGTTGATAATGCTGCAGATGCA
GATTTGGGTGGTGTCTCAAAATCTGAAATTCCCGTAGTTTCTAGGGAAGG
TACTACTGGTAGAGTTTTGGGTGATTCTGAAATCCCACATATTGAGTGCT
ATCAAGAAATTGAGGAGGATGATAACGGAGGGACCGAGTCTGTAAGTCTG
GATGATCTTATGGATTCGGGTGGAGATACGAGCGTGGCTGAAGCTCTTCG
TACCGTATCCGAAGTAGAGTCTTCTGATCTGCTGGTGGTAAGTTGCTAG
>APH_1029 nusG, transcription termination/antitermination factor NusG
ATGAAGCATGATGGTATTGGTCACGAGTGGTACATAATCCAAGTTTCCTC
GGGTAATGAGGAGAAGATATCGCAGATGATACTTGAGAGGTCTATGCAGT
TGGGAATGTCGGACATGTTCCGCGAAGTTTTTATTCCCTACGAAGAAGTC
ACCAAGATCAAGTATAACAAGAAGGTGCAGATAAAGAAGAAATTGTCGCC
AGGGTACGTATTTTTGTATATGAAACTGTGTGATGATTCTGTGAATTTTG
TGCGTAAGATTCCTAAGGTGTCCAATTTTCTCCTTGATGACTTTGGTGTA
CCTAAAGTGATTCCTTTGGCTGAAATGGAAGCTATGCGCAGTCGTATGTG
TCAGGGTGTTGCTAGTGATGTAGGTGATGACATTTGCGGCTTTGAAGTTG
GGGATGAGGTGGTTATTAATGACGGCCTGTTCCAGGATTTCAATGGTAAA
ATTGAGTACGTCAATGAAGAGAAGAAAGTTGCTGGTGTTAGCGTGATGAT
TTTTGGCCGGTTAACTAAGATAGAGTTCAAATTTAGTAGTATACAGAAGG
TAGGGGAATAA
>APH_1298 recG, ATP-dependent DNA helicase RecG
ATGGCAATAATACACAATTCTTCATCAAGTCCTTCTAATCGTGTAGGCAA
AACTGCAAAATTACCTGAAGTACCTGGGATGTTTTCCAGCATATACGATA
TACAAGGAGTAGACAACGAGAAGGGCCTGCTTCTAGAAAAACTCTGTGGA
GGCTCAAGGATCGTAGATTTGCTATTATATGCCCCATATAGTTATGTAGA
TCGAAGAAATTCTCAGTTAACTCCTTTATCCCGCAGAGGCAGTGTTGTTA
CATTCCTAGGTGTCGCAAAGAAGCACGTTCCTCCTTACAAAAGAAGGAAA
TCCAGTAAATCCCCCTACAAAGTGCAATTAGGTACGGAAATTGGGGATAT
TTGGCTAATATTTTTCAATTACTCACAGCCATATCTTGAGAGTGTATTAG
AAGTAGGCAAGCAGTGTTTGGTAAGTGGTAAACTTGAAATACATTGTGGA
GAGATGCAGATCACGCATCCGGATTACTGCACTAATAATCTCAAAAAATT
TACGGAAATATGTGCACTGGAACCTGTATACTCCGTAACAAAAGGGTTAC
ATTCCAGGGTTATACACAAGTTAATAAAAGTTGCGCTAAAGTCTATTCAA
GCACAACATGAGTGGCTTCCCGCAGATCTAATAGAAGAAAATTCATGGCT
AAGCTGGCAAGAAAGTGTCTATAAAATGCACACTCCTGAAAACGTTGAAG
AAGTACGACGCATAAAGGGACGACTTGCATACGACGAGCTCATGGCTTAC
CACGCAGCAGTATATTTTGCTCGACAACATGGTAGGAGAAAAGGTGTTGC
ACTCGAAGTGAAGGGTACTAATTATCAGGAGGTCTTAAAAAGGCTGGGCT
TCGAACTCACTGCAGGGCAAAAATCCGCGATAAGAGAGATTACTAGGGCG
CAGACATCTGATCAACAAATGGCAAAACTTCTACAAGGAGATGTAGGAAG
CGGAAAGACAGTTGTTGCGCTATTTGCAATGCTCAACACAGTAGAGAGCA
GCGGGCAGGTGGCCGTTATGGTTCCCACAGAAATGCTAGCAGAACAGCAT
TGCTCCTGGATAAAAAAGTTACTAGAAGGCATGGATATATGTATCGAATT
ATTGACTGGTAAAACAAAAAACAAAAATACGATACATGCTAGATTGCTAT
CAGGTGAAATTCACATTTTGATAGGAACACATGCTTTGTTCCAAGAATCC
GTAAAATTTCATAACTTACGGCTTGTGGTTATAGATGAACAACAGCGCTT
CGGTGTGTTACAACGCATGAAGTTGATAGAAAAGGGAGATTCAGCAGACA
TATTGTTTATCACTGCAACACCCATACCTAGAACACTAGAGCAGATATTG
TATGGCAATATGGATCGCATTACTTTGAAAGATAAGCCCGCATGCAGATT
GCCTGTGAAAACCAGTATCGTGAAAGTATGCATGATAGATGATTTGTGCA
AAAGGCTGAAAAACATGATATCACGAGAGCATAAAATTTACTGGATATGC
CCTTATATTGAGGGTTCAGAAGATAACGATGTTGCCTCTGTAGAAGAAAG
ATTTGAGTTTCTAAAAAACATGTTCGGCAACAACATTGTTGGTGTATCGC
ATGGAGCCATGACGCAAATCGGCAATGAAAGCGCTTTGCAAGCATTTTAC
GCTGGTAATATTAAGGTGCTAGTTGCTACTTCCATTATCGAAGTGGGTAT
AAACGTCCCTGACGCAACCATCATTGTCATCGAAAATCCTGAGAGATTTG
GTTTATCCCAGTTACATCAGTTGCGCGGGCGCGTTGGCAGAGGCCACCAG
CAGTCTTATTGTATATTGCTACATGGTCCTGTGAGCAAAATTGCATATCG
TAAACTTAGCGTTTTGCGCGACTCTCATGACGGATTTCACATTGCAGAAC
AAGATCTTATATTACGCGGTGGCGGCGATATGTTAGGTTGTCGTCAATCG
GGAATTGCAGCTTTCAAGTTTGCAGATGCTCAAGATTTTCATGCCATGGT
GAAAGCCCATGCTGCTGTTAGTGATATTGTTAAAAACGAAGATGGTCGTA
AGTTAGCCTATAGACTGACTCAAATATTTGGGCACTCGTTGCCCCACATC
AAGTACTAG
>APH_0064 rho-1, transcription termination factor Rho
GTGTGTGGCAAGGTTAGGAGAAGGAAAAAGGCTGTTCCTAGTGCTGTAGT
AGCAGAAGAGGCGACAGGGAGTGGCAGCGAAGAAGGAAGAATCCTGAACC
TATGTGAGCTGAAGAGAAAAAGCACAGGGGAGCTACTAGCAATAGCGGAG
GAGCTAGGTGTAGTAAGCAACGGCAGGATGCTGAAGCAAGAGATAATATT
CCAGCTGATGAAGAGAGTAATCAGCGAAGGAGGAGTGGCAATAGGTGGTG
GTGTAGTAGAAACATTGCCGGATGGATTTGGATTTTTGAGATCAGCAGAA
GCAAATTACGCGGCAAGTAGCGATGACATCTACATATCGGCTGGTCAGAT
AAAGAAATTTAACTTGAGAACGGGTGACATAGTAAGTGGTGAGATACGTG
CACCTGGAGATAAGGAAAGGTATTTTACCTTAGTCAAGGCGTACAGCATA
AACTACACGGAGATAGGTAAGCTACAGAGGTATGTACACTTTGACGATCT
GATTCCAGTATACCCAGAAGATAGAATATTGCTCGAGTGCAATAAGGGTG
CTGGGAACGAGAAGAAAGATATAAGCATGCGTGCTATAGACATAATAGCG
CCACTAGGAAAGGGGCAACGTGCGCTAATAGTAGCACCTCCAAGGGTTGG
TAAGACTGTAATCTTGCAGCAAATCGCGCACTCTATAGCTGTAAACCACC
CCAACATGGAACTGATAGTGCTTTTGATAGGTGAAAGGCCAGAAGAAGTC
ACGGATATGTTGAGGTCAGTAAAGGGAGAAGTTGTAAGTTCTACATTTGA
TGAGCCTGCGTACCGGCACGTACAGTTGGCAGAGATAGTGATAGAAAGAG
CTAAGAGGATGGTAGAGCATAAGAAGGAGGTGGTAATCCTTTTAGACTCT
ATAACAAGATTAGCTAGGGCATATAATGAGGTTATGCCATCATCAGGAAA
GGTGCTTACAGGTGGGGTAGATTCTAATGCGCTACAGAGGCCTAAGAGGT
TTTTTGGAGCAGCTAGGAATATAGAGAATGGGGGATCGCTCACGATAATA
GCGACTGCTCTAATAGAGACGGGATCGAAAATGGATGAAGTGATTTTCGA
GGAGTTCAAGGGTACAGGAAACTGCGAGATAATACTTGATCGGAAGATAG
CAGATAAGAGAATCTACCCAGCGATAGATATATCTAAGTCTGGAACAAGA
AAGGAAGACATGCTGATAGAATCAGCGCTTCTGAAGAAGGTATGGTTACT
GAGAAGGTTGTTATCAGCCATGGGTCCAGTTGAGGCTATGGAGTTTCTGA
GAGACAAGCTTAGCATGGCTAAGGATAACAACGACTTTTTTGAAATGATG
AATAGCTAA
>APH_1071 rho-2, transcription termination factor Rho
ATGGAAAGAGAAGAGTCTGTAGTAGCAGAAGAGGCGACAGGGAGTGGCAG
CGAAGAAGGAAGAATCCTGAACCTATGTGAGCTGAAGAGAAAAAGCACAG
GGGAGCTACTAGCAATAGCGGAGGAGCTAGGTGTAGTAAGCAACGGCAGG
ATGCTGAAGCAAGAGATAATATTCCAGCTGATGAAGAGAGTAATCAGCGA
AGGAGGAGTGGCAATAGGTGGTGGTGTAGTAGAAACATTGCCGGATGGAT
TTGGATTTTTGAGATCAGCAGAAGCAAATTACGCGGCAAGTAGCGATGAC
ATCTACATATCGGCTGGTCAGATAAAGAAATTTAACTTGAGAACGGGTGA
CATAGTAAGTGGTGAGATACGTGCACCTGGAGATAAGGAAAGGTATTTTA
CCTTAGTCAAGGCGTACAGCATAAACTACACGGAGATAGGTAAGCTACAG
AGGTATGTACACTTTGACGATCTGATTCCAGTATACCCAGAAGATAGAAT
ATTGCTCGAGTGCAATAAGGGTGCTGGGAACGAGAAGAAAGATATAAGCA
TGCGTGCTATAGACATAATAGCGCCACTAGGAAAGGGGCAACGTGCGCTA
ATAGTAGCACCTCCAAGGGTTGGTAAGACTGTAATCTTGCAGCAAATCGC
GCACTCTATAGCTGTAAACCACCCCAACATGGAACTGATAGTGCTTTTGA
TAGGTGAAAGGCCAGAAGAAGTCACGGATATGTTGAGGTCAGTAAAGGGA
GAAGTTGTAAGTTCTACATTTGATGAGCCTGCGTACCGGCACGTACAGTT
GGCAGAGATAGTGATAGAAAGAGCTAAGAGGATGGTAGAGCATAAGAAGG
AGGTGGTAATCCTTTTAGACTCTATAACAAGATTAGCTAGGGCATATAAT
GAGGTTATGCCATCATCAGGAAAGGTGCTTACAGGTGGGGTAGATTCTAA
TGCGCTACAGAGGCCTAAGAGGTTTTTTGGAGCAGCTAGGAATATAGAGA
ATGGGGGATCGCTCACGATAATAGCGACTGCTCTAATAGAGACGGGATCG
AAAATGGATGAAGTGATTTTCGAGGAGTTCAAGGGTACAGGAAACTGCGA
GATAATACTTGATCGGAAGATAGCAGATAAGAGAATCTACCCAGCGATAG
ATATATCTAAGTCTGGAACAAGAAAGGAAGACATGCTGATAGAATCAGCG
CTTCTGAAGAAGGTATGGTTACTGAGAAGGTTGTTATCAGCCATGGGTCC
AGTTGAGGCTATGGAGTTTCTGAGAGACAAGCTTAGCATGGCTAAGGATA
ACAACGACTTTTTTGAAATGATGAATAGCTAA
>APH_1149 rnc, ribonuclease III
GTGGAACCTTATTCTGAAGACAGTATTCTTGCTCTGACCGAGAAGGTGTT
TAAGATTTCTGGTTACAGATTTCAGGACCATGAACTCTTAAAAACAGCTG
TGACACACCCAAGCATTGCTGCTGAGAGGTACGCTAGTTATGAACGCCTT
GAGTTCTTAGGCGATGCAGTACTGGGTTTAGTAGTTTCTGAAATGTTATA
CACACTTTTTCCGGATGATAGCGAAGGCTTACTGACGAAAAAACGCATCG
CTCTAGTACGTGGAAGCAAAGTCGTGGAAATTGCGCAATCCCTGAATTTA
GGAAACATTCTTTTGATGTCTAAAGGGGAATTGACTTCTGGAGGAATATC
GAACAATAGCAATTTAGAAAATGCGTTAGAAGCTCTTATAGGAGCAATCT
ACGTTGATGGTGGTTTAGAATCAGTACGTCACTTCATATTGCAGCATTGG
AAGCCCTTGGCTACAAACCTTGCCGATACACCGCTTCAGGATGCTAAGAC
TGCCTTGCAAGAATGGGCACAAGGACATAATTTTGCAATACCATCATATA
GGCTAATAAACAAATCTGGCCTTGAACATGCGCCTGTATTTACTGTTGAA
GTAACCGTTAATGGCCAGCGTGTACATGCTACAGGCTGTAAAAAAAAGTA
CGCTGAAATCGCTGCCGCTAAACTTATGTTGGAAAAGGTTACAAAACAAA
ACGATCCATAG
>APH_0303 rpoA, DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit
ATGGCTGACCATTGGAACAAGTTGACCAGGCCATCTTCTATCAAGGTTGT
AGGTGGTAAGGAGCCTTGTGTTATGGAGTTGGTGATTGAGCCTTTGGAGA
GTGGTTTCGCGCTTACTCTAGGCAATGCTCTGAGGCGTGTTATGATGTCA
TCTCTCAGGGGTTTTGCCGTCTACGGGATAGAGATTGAAGGAGCTTCGCA
TGAGCTTACTGCTCTTTCGGGAGTGAGAGAGGATGTTGCGGATTTGGTAC
TGAACCTCAGTATGCTTAGAGTGAAGTTATTGAACTCGAATCAAAGGGTT
CTGAGGCTTGTTGCTCGGGGTCCGGGAGAGGTAACTGCTGCTTCGATAGT
TGATTCTGCGGATCACGTAGTTTTGAATAAGGATCTGCATATTTGTACGC
TGGGTAAGGATGTGGATTTTTGCATGAAGATCTATGTCAACAGCGGTAAG
GGTTATGTTCCGGCTACGGAGTATAGGGCTGCGTCAAGGTCTGGTGGTGC
TTCCGAAGTTGGTTCTGGATTTATAGCTACTAATGCGCTTTATAGTCCTG
TAAAGAAGGTGGCTTTAAAAATAGAGAGCAGTAGGATAGGGCAGTTTACT
GATTACGACAGGCTTATGTTGACGGTTGAGACAGATGGCTCTGTTGCTCC
TGATGATGCTGTTGCGGTTGCTGCGAAGATATTGCAAGATCAGCTGCAGT
CATTCATAAGTTTTGATGAAGTGGAAGAGACTAGGAAGAGTGTGGATAAG
GAAGAGGGTGTACTTCCTTATGACCATAATCTCCTTAGGAAGGTTGATGA
ACTGGAGCTTTCTGTTAGATCGCATAACTGTTTGAAGAACGATAATATCA
CTTATATAGGTGATCTTGTTCAGAGAACGGAGTCTGATATGTTGAGAACT
CCGAATTTTGGTAGAAAATCTCTTAATGAGATAAATGAGGTCTTGGCTAG
TATGAATCTGCATTTGGGGATGAAGGTGCCGAATTGGCCGCCGGAGTCTA
TAGAGAATTTGAGTAAGCAGTATAGTGAAGATTAA
>APH_1024 rpoB, DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGTCTTCTGCGGGTGATTCTGGTCCCGGGTATGTGCTGAATGATTTTGA
TGCTGTTCCTAGGCTTTCTTACGCGAGGTCTATAGACATTCGCGATTCTT
TGAGTGATTTGATAAGAATACAGAGAGATTCTTATGATGCCTTCATAGGG
ATTGATGAGGGTAGTAGTGGCGGTATACAAAGCATATTCCAGTCGATGTT
TCCCATACGAGATCCTTTGGGGAGGGCTGTACTCGAGTTCGTGAGTTGTA
ATATTGGGGAGCCTCAATATGATGAATACGAGTGCATAAAACGTGGGATA
ACGTTTTCTGTGCCGATGCGCATAACTCTTCGTTTTGTTGTGTGGAAGGT
GCAGGAGGTTTCATTCAAGGAAGTTAAGTACGTCGTAGATGAGGGCACTC
TTGAGAGGAGTGTTAAGTACATGAAGGAGCAGGAGGTGTCTATTGGCGAT
CTTCCGATGATGACATCATATGGAACCTTCATCATCAATGGTATAGAGAG
GGTTATTGTTTCCCAGATGCATCGGTCTCCTGGTGTCTTTTTTGACAGTG
ATAAGGGGAAGACATACAGTTCTGGGAAGCTAATTTATTCTGCGCGTATC
ATCCCTTACAGGGGCTCGTGGCTTGATTTTGAATTTGACATCAAGGACAT
CATTTACTTCCGAATAGATAAAAAGCGTAAACTCCCGGTCACCTACTTAT
TAAAGGCCCTTGGGATGTCTAACAATGATATCCTAGACACATTTTATGAC
AAAGTTCTTTACGTAAGAAGTGATAAGGGTTGGAAGGTACCCTTTGTAGT
GGATCGCTTTAAGGGTGTGAGGCTGTCTTATGATCTTATGGACGTAGACG
GTAATGTGCTGATTAAGGCGAATACTAGGATTACTCTCAGGATTGCTAAA
AAGTTATATGCTGATGGCTTAAGGGAATATTTGGTGCCTTTCGCGGGGAT
TTCTGGGTTGTTCGTGGCAACTGACTTGGTGGATCCTGCTAGTGGTGCTG
TGATTGTTTCTGCGGGTGAGGCGATAGCTGCGGAGCACATTGTAAAATTA
GAATTGTTTGATATCAGTGAGATAGCGTTTTTGAACATAGACTTTTTGAC
AGTTGGTCCTTATGTTCTGAATACTCTATTTTTGGACAGGCATATAACGC
AAGAGGATGCGCTGTTTGAGATATATAGGGTATTGCGTTCTGGAGAATCT
CCAAATTTAGAAGCTGTGAAGTCATTCTTTAAAGGGCTCTTTTTTGAGCC
AGATAGGTATGATTTGTCAGTTGTTGGAAGAATTAAGCTGAACAGTCATT
TGCGCTTAGATATAGATGAGAATCTCACTGTCCTTACTAAGGATGACATA
GTACACGTAATAAAGAAGTTGGTTTTATTGCCTGATGGTGAGGGTGTAGT
TGATGATATAGACCATCTTGGTAATAGGCGGGTAAGGTCTGTAGGGGAGT
TCATAGAGAATCAATTCCGGGTTGGTATATTGCGGCTCGAGAGAATGATT
ATGGATTACATGTCCTCGGTTAACTTTGATAATGCGGTGCCGTGTGACTT
TGTTAATCCTAAGATCTTGGCTACGGTGTTGAAAGACTTTTTCAGTTCTT
CGCAGCTTTCGCAGTTTATGGATCAGACTAATCCTCTCTCAGAGGTTACG
CATAAGCGTAGGTTATCGGCGTTGGGTCCTGGTGGTTTAACGAGAGAAAG
GGCTGGTTTTGAAGTTCGTGACGTTCACCCTACGCACTATGGTAGGATAT
GTCCTATTGAAACTCCGGAAGGACAGAATATTGGTCTTATTAGTAGTCTC
GCTATATATGCTAAGATAAACAAGTATGGCTTTATTGAAAGCCCGTACAG
GAAGGTTATTGATGGCGTAGTTACTGATTCTGTAGAGTATCTTTTGGCTA
CACAGGAGAGTGACTATTATATTGCTGATGCGGGCGCTGCCCTTGATGAG
AATAACCGTTTTGTGGATGATATGCTGTATTGTCGCCATGGCGGTAACTT
CGTGATGGTGAAGCGTGAAGACGTGAATTACATTGATGTATCTCCAAAGC
AGATAGTTTCTGTTGCAGCGTCGCTGATTCCGTTTTTGGAAAACAATGAC
GCGAACCGTGCTCTAATGGGTTCAAATATGCAGCGTCAGGCGGTGCCATT
ACTAAAGGCTGAAGCGCCTTTGGTGGGTACTGGTATGGAATCAGTTGTTG
CGGCAGGTTCAGGTGCCGTCGTATTGGCTAAGCGCGATGGTGTAGTACAC
AGGGTTGACGGGTCTTATATCGTAATCAGGGCTTTTGATAAGAATAAGGA
CGAGTATCTTGGTGTTGATATATACAAACTGAGAAAGTTCCAGCGTTCAA
ATCATAATACATGTATCAATCAGAGGCCTATAGTTAAGATAGGGGATTAC
GTTAGGACTAATGATGTTATTGCCGATGGTGCCGCTATAGATCGTGGTGA
GTTGGCGTTGGGTAAAAATGTCCTTGTTGCCTTTATGTCATGGCAGGGTT
ACAACTTTGAGGACTCGATAGTAATATCCAGTGATGTTGTGAAGAGGGAT
GTCTTCACTTCAATTCACATAGAAGAGTTTGAATGTGTTGTGCGGGATAC
TCCGCTTGGTCCTGAGAAGATCATGCGTTCGGTGCCGGATGTGAATGAGG
AAAGTCTCAGTCATCTGGATGATGTTGGTATTGTAAATATCGGGGCTGAG
GTTTCTGCTGGTAGTGTTTTGGTGGGTAAAGTGACTCCGAGACCGCCGGT
TTCATTGCCGCCTGAGACGAAGCTTTTGGTGACAATTTTCGGTGAGAAGG
TATTCGATTGCGTTGATTCTTCTTTATATTTGCCGCCGGATGTTGAGGGA
ACGGTTATAGACGTTCATGTGTTTGTTAGAAGGGGCGTTGAGGAGAATGA
TAGATCTTTGCTTATCAAGCAAAGTGAGGTGAATAGCTTCAGGAAGGAGC
GTGACTACGAAATAGATGTTGTCAGTGAGTACTTCTATGATGAGCTGAAG
AAGTTGCTTTGTAGTGCTGATTTGCCGTTGAATGGTCATGCTGATGTAGA
GAGTCTTCTAGCTGCGAAGTCTTTGGAAGCGTTATGGGAAATTGGTCTAT
CGAATCCTAAGATATCTGCCAAAGTTGCTGATATGAAGGGTAAATTTGAT
GAGTTGATTACTGAAGCTCATAGTAAATTTGACCAAAAGATAGACAAGCT
TAATTACGGCTATGATTTGCCGCAGGGTGTTCTGACTATTGTAAAGGTCT
TTGTGGCTGTTAAGCATAATTTGCAGCCAGGAGATAAAATGGCTGGTCGG
CATGGTAACAAGGGGGTTATTTCGAGAATAGTTCCTGTTGAGGATATGCC
GCATCTAGAGGATGGTACGCCCGTGGATATAATCTTGAATTCTCTGGGTG
TACCTTCGCGTATGAATATAGGGCAGATCCTTGAAACTCACTTGGGTTGG
GCTGCAGTGAATTTGGGTCATAGGGTAGGTAGGATGCTTGATTCAGGGGA
AGAAGAAGGGCCGGTAGTTGAGAGTATTCGTAGCTTTTTGAGCGAAGTAT
ATGAAGGGCAAAAGCTTAAGGAAGATGTGGCTTCTATGTCGGATGAGGCT
TTGCTGAAGTTTGCCAATAGGCTCAGAAGAGGTGTTCCTATGGCTGCTCC
GGTGTTTGAGGGTCCGAAGGATGCGCAGATTTCCCGGCTTTTGGAATTAG
CGGATGTTGATCCGTCTGGGCAGGTGGATCTTTATGATGGGCGTTCAGGG
CAGAAGTTTGATCGCAAGGTAACTGTTGGATACATTTACATGTTGAAGCT
CCATCACTTGGTGGATGACAAGATACATGCTAGGTCTGTTGGTCCGTATG
GTCTGGTTACTCAGCAACCTCTTGGAGGAAAGTCGCACTTTGGTGGGCAG
AGATTTGGGGAAATGGAATGCTGGGCATTGCAGGCCTATGGTGCTGCTTA
TACTTTGCAGGAAATGCTAACTGTCAAATCTGACGATATCGTAGGTAGGG
TAAGAATCTATGAATCCATAATTAAGGGGGATAGCAACTTCGAGTGTGGT
ATTCCTGAGTCGTTTAATGTCATGGTCAAGGAGTTACGCTCGCTGTGCCT
TGATGTTGTTCTAAAGCAGGATAAAGAGTTTACTAGTAGCAAGGTGGAGT
AG
>APH_1023 rpoC, DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit
ATGAAGACGTTGGATTTGTATGGCTATACCAGTATAGCACAGTCGTTCGA
TAAGATTTGCATATCCATAGCTAGTCCAGAAAGTATAAGGGCTATGTCCT
ATGGAGAAATCAAGGATATCTCTACTACTAACTATCGTACCTTTAAGGTG
GAGAAGGGGGGGCTATTCTGTCCTAAGATCTTTGGTCCGGTTAATGATGA
CGAGTGTCTTTGTGGTAAGTATAGGAAAAAGCGCTACAGGGGCATTGTCT
GTGAGAAATGCGGAGTGGAGGTAACTTCTTCTAAAGTTAGAAGAGAGAGA
ATGGGGCACATAGAGTTGGTCTCACCTGTTGCTCATATTTGGTTTCTTAA
ATCCCTGCCGTCACGTATAGGTGCTCTGCTAGACATGCCTTTAAAGGCTA
TAGAGAATATACTATATAGTGGAGATTTTGTAGTAATTGATCCGGTAGCT
ACTCCTTTTGCTAAGGGGGAAGTAATCAGTGAGGTAGTTTATAATCAGGC
GCGGGATGCCTATGGTGAGGATGGATTTTTTGCGCTCACTGGTGTTGAAG
CTATAAAGGAGTTGCTAACTCGCCTTGATTTGGAGGCTATCAGGGCTACT
TTGAGGAATGAGCTTGAGTCAACTTCTTCGGAAATGAAGCGTAAGAAGGT
TGTTAAGAGGCTCAGGCTTGTTGAGAATTTTATTAAGTCTGGTAATAGGC
CGGAGTGGATGATCTTGACTGTAATTCCTGTTCTTCCACCGGATTTGAGG
CCGTTGGTATCACTGGAAAATGGTAGACCTGCGGTATCAGATTTAAATCA
CCATTACAGGACTATAATAAACCGTAATAACAGATTGGAAAAGCTACTCA
AGCTGAATCCTCCTGCGATCATGATACGCAATGAAAAGAGGATGTTGCAA
GAAGCGGTAGATGCTCTGTTTGACAGCAGTCGGCGTAGTTACGTTTCCAG
TAGAGTTGGAAGCATGGGCTATAAGAAGTCTCTTAGCGACATGCTAAAGG
GTAAGCAGGGTAGGTTTAGGCAGAACTTGCTTGGTAAAAGGGTTGACTAT
TCTGGTAGGTCAGTAATAGTTGTGGGCCCTAGTTTGAAGCTGCATCAGTG
TGGTTTGCCCAAGAAGATGGCTCTTGAGCTGTTCAAGCCGTTCATTTGTT
CTAAGCTGAAGATGTACGGTATTGCTCCGACTGTGAAGTTGGCTAACAAG
ATGATTCAGAGTGAGAAGCCTGATGTTTGGGATGTTTTGGATGAAGTGAT
TAAAGAGCATCCTATTCTCCTTAATAGGGCTCCTACACTGCATAGATTGG
GTCTTCAGGCGTTTGATCCTGTATTGATAGAAGGTAAGGCAATACAGTTG
CATCCGTTGGTATGTAGTGCGTTTAATGCCGATTTCGATGGTGATCAGAT
GGCGGTACACGTGCCATTGTCTCAAGAGGCGCAGCTTGAGGCGCGCGTGT
TGATGATGTCTACAAATAACATCTTGAGTCCTTCTAACGGTAGGCCAATT
ATAGTTCCGTCTAAGGATATCGTTCTTGGGATATACTATTTAACGTTGTT
GGAAGAAGATCCTGAAGTGCGTGAAGTGCAGACTTTTGCGGAGTTCAGCC
ACGTGGAGTACGCATTGCATGAGGGGATTGTGCATACGTGCTCAAGGATA
AAGTACAGAATGCAGAAGAGTGCAGCTGATGGTACTGTATCTAGCGAAAT
AGTTGAGACTACGCCTGGTAGGTTGATATTGTGGCAGATATTCCCGCAGC
ATAAGGATTTGACTTTTGACTTGATCAACCAAGTGCTTACGGTTAAGGAA
ATCACCTCCATTGTGGATCTTGTCTATAGAAGTTGTGGTCAGAGGGAGAC
GGTAGAGTTCTCTGACAAACTGATGTATTTGGGATTCAAGTATGCTTCGC
AATCAGGTATTTCTTTTGGTTGTAAGGATATGATTATTCCTGATACTAAG
GCTGCGCACGTTGAAGATGCTAGCGAAAAGATCAGGGAATTCTCTATACA
GTATCAGGATGGTTTGATAACCAAGAGCGAGCGCTATAACAAAGTGGTTG
ATGAGTGGTCTAAGTGTACCGATTTGATTGCTAGGGATATGATGAAGGCT
ATATCTTTATGTGATGAGAAAGGGAAATATAACTCGATTTACATGATGGC
GAATTCTGGGGCTAGAGGTTCTGCGTCTCAGATGAAGCAGCTTGCTGGTA
TGAGAGGTCTGATGGCGAAACCGTCAGGTGAGATTATTGAGACTCCGATT
ATTTCGAATTTTAGGGAAGGGTTGAGTGTATTTGAATATTTCAATTCTAC
TCACGGGGCTCGTAAAGGTCTTGCTGATACAGCATTGAAGACTGCTAACT
CCGGATATCTAACTCGTAGGCTTGTAGATGTAGCGCAGGATTGTACAGTT
GTTGAACATGATTGCGGCACTAGCGGGGGCGTTGTTGCGAGAGCGGTCAT
AGAGGGTGGTGTTGTAGTAGCAACGCTGGATAGTGTGGTATTAGGAAGGG
TTGCTGCTGTAGATACCTATAATCCTGTTACAGGAGAGAAGTTATTTACT
TCAGGTGAGCTTATTGATGAAAGCAAGCTTGATAAGATAAGAGTTGCGGG
ATTAGATGCGGTGAAGGTGCGGTCACCGCTTACTTGTGAGTCCAAACAAG
GTATTTGTGCTCTATGTTATGGTAGAGATCTAGCTATTGGGGATTTGGTG
TCCATAGGGGAAGCTGTAGGTGTGATCGCTGCTCAGTCTGTTGGGGAACC
GGGTACACAGCTGACGATGAGAACGTTCCACGTTGGTGGTACTGCTATGC
GTGGTGTTGAGGTATCTAATCTGATAGCCTTGATGGATGCGACTGTTAAG
CTGGTTAACAGTAATGTGGTTACTGACAAGTACGGTAATCAGATAGTTAT
GAGTAGGTCGTGTGAAGTTGTGCTGCTGGATGCTGCGGGCAATGAGAAGA
TGCGGCATAGTGTGCCATATGGCGCTAAGTTGTATGCTACCGAAGGGCAA
TCGGTGAGTATGATGGAGAAGATTGCTGAGTGGGATCCTTATACTATACC
TATTATCACTGAGAAGACAGGTACTATAAAGTATGTGGACCTTATATATG
GGGTCTCTATCAACGAGGTACTTGATGAGTCGACTGGTATTTCTAACAGG
GTGGTTGTAGATTGGAAGATGCATTTACAAGGTGCAAATCTGCGGCCTAG
GCTTGTGTTGCTAGACGATAATGGTGCTGTGGTTACATTATCGAGTGACT
TGGAAGCTAGTTATTTTGTCCCGATAGGTGCGGTATTGAATGTACAGGAT
GGGCAAAGGGTACATGCTGGTGATGTTATCACGAGGATACCTAGGGGTTC
TATCAAGACGCGTGATATTACGGGTGGTCTACCTAGGGTTATAGAGCTGT
TTGAAGCTCGTAAGCCGAAGGAGCATGCTATTGTTAGTGACGTTGATGGA
TACGTTGAGTTCGGTAAGGATTATTACCGTTCGAAGAGGCGTATATTTAT
ACGTCCTGTAGACAAGAGCTTGCCTGTAGTTGAATATCTAGTTCCTAAGG
GTAAGCACACAATAGTCAATGAGGGTGATTTTGTGCATAAGGGTGATCTG
TTAATGGACGGTGATCCTGATCAGCACGATATCCTTAGGGTGTTAGGAAC
TGAAGCGCTGGCAAATTACATGATATCCGAGATCCAGCAGGTATATAGGT
TGCAGGGTGTTAAGATAGACAACAAGCACATAGAGGTGATACTCAGGCAG
ATGTTGCAGAAGGTAGAGATTACTGAGCCGGGTGATACAATGTACCTGAT
AGGCGAGCATGTGTCTCGTGAAGAGGTTATGAAGCTGAATAGGAAGCTTG
CTGAGGCTGGAAAGAAAGAAGTTTCTTATGTGCCGATACTGCAGGGGATC
ACTAAGGCTAGTCTGGATACTAACTCTTTCATATCTGCTGCGTCATTCCA
GGAGACAACTAAGGTATTGACTGAGGCGGCTTTTGCAGGAAAAGAAGATC
CTCTATATGGGTTGAAGGAAAATGTGATTGTCGGTCGTCTGATACCAGCA
GGTACAGGGTTCATAATGAACAAGATCAAGAAGCTTGCTATGCTTGATCA
GAGCGACTATGCAACATATTACAATAGCGAATTGCGAGGAATCATGGGTG
ATTTGGGAAGCTCTATAATCGAAGAGTTTCAAACTCCAGCTCCTGATGGT
AGCATAAGCGGCTCCGTTGTGGATTACTAG
>APH_0576 rpoD, RNA polymerase sigma factor RpoD
TTGCGGGATTCATTGATGGATAAGGAGCTTGTTAGAAGTCTAATAACAAA
GGGTATAAAGCAAGGCGGCATAGTTACGTTTGACGATTTGAATGATGCTC
TTTCTGATGATGAGGTAGTAACCTCGGATAGCATAGACGAAACTATATCT
ATGTTGCAAGATTCGGGAATTAGTGTTCTTGAGCAGAGCGATGTGGATGA
CACAGATGATACTGTTACTGGAGAGAGTGTTGTAAAAGACGAAGAGGATG
AAGCTAGTATTCGTTCTTGGGATTTTGGTCAGACTGACGATCCAATACGT
ATGTATTTGTGTGAGATGAGCTCGGTTGAGCTTTTATCACGTGAAGGAGA
GATAGAGATCGCGAAAAGGATCAAGTCAGAAAAGGTCAACATGCTTAGGT
GCATGGTAGAAGCTCCTTTGGTGTTGCGCACGTTTATGTCCTGGCGGGAT
GATTTGGTAAATCAGCAGGTATTGCTGCGTGACCTTATTGATCTAGATGC
AAATTACAGGTGTGGGTTCCCTCAACCTGGGTTTGGTGAGGGAGATGGTG
AAGAATATGGTGTCGGGCGAGGTGATGTAGTATTGCCTCCAGATGATGGG
GATGTAGATCCGGAGTCATCTCTTGATGATGAGGCTGATGAAGACGATGA
ATCTTCTCTTGGTAATGCTTCTATATTAGAGATGGAGAGTGCTTTATTGC
CGAAAGTTATATCTATTTTGGATTCCACGATAGAAGCTGCTGAGAAGATC
TTGGAGATGAAGAAGAAAAAGCGTGACGGCGGCGAGTACGATGAGAATGC
TTATAATGAACTGCACGACAGCATATGGGAGATGGTTTCTCAGATGAAGC
TTAGCGATTCTGCTGTTGCGTCTGTGACTCAGCAAATATACGCTTTAAGT
AAGTCAATAGCGGCGGAGGAGTCCTCTCTTATTTCGTTGGCTGAGAGCTA
CGGTGTAGATAGAAAGAGCTTTTTAGATGCTTATAATAACAATACTATAG
CTGAACAAGCGAAAACCTCATTTGAATGGCAAAATCTGCTAGATAAGGAA
GGTGACACCCTATTGGAGATGCAGAACAGGGTGAAGTTATTATCTGGGGA
GGATTGTCCTGGAAGTTTCAAGGCGTTAGTAGCCAAGATTCAGAAGCATG
AGCGTACGGCGAACAGAGCTAAGCAGGAGATGATCAAGGCAAATCTTCGG
TTAGTTGTGTCTATAGCGAAGAAGTATTCGAATCGTGGATTGCAATTTCT
TGATTTAGTGCAAGAGGGCAATATAGGTTTGATGAAGGCTGTAGATAAGT
TTGATTATAAGCGTGGCTATAAGTTTTCTACGTATGCTACATGGTGGGTG
CGTCAGGCGATCACGCGGGCGATTGCTGATCAAGCTAGGACTATTAGAAT
ACCTGTGCATATGATTGAGACTGTTAACAAGATCAATCGTACGCTGAGGC
AGATGCTGCATGAGATTGGTCGGGAGCCAACTTTGGAGGAGCTTTCTGCT
AGGCTTAATATAAATGTTGAGAAGATCCGTAAGGTGATGAAGATCGTCAA
AGATCCTGTTAGTCTCGAGAGTCCTATAGGGGATGATGATAGTAGTACCT
TTGGTGATTGTATAGAGGATAAGCGTGCTGTAAAGCCTGAGAATGCCGCG
GTGCTTGCTGATTTGCGTGAGATAACTACTAAGGTACTTTCTACTCTTAC
ACCTAAAGAAGAGAGAATTCTCCGTATGCGTTTTGGAATTGGTAAGAGCG
GTAAGGATCATACCTTGGAAGAAGTAGGTAGGCTCTTTAATGTTACTCGT
GAGAGGATAAGGCAGATAGAGGCAAAGGCTTTGCGAAAGCTGCGTCATCC
AAGTCGTGCTAGGAAATTGCGTGGGTTTTTCTAA
>APH_0759 rpoH, RNA polymerase sigma-32 factor
ATGCTTACCGCATCTGGGTTATCGATGGGAGCAGATGATTTACTTGCATA
TATGGAGCAAGTAAGGGCTTTTCCTATGCTAACAGAGAGAGAAGAGAAGG
AATGTGCAGAGAATTGGCATAAAAATAGATCGGTAGCTGACGCTCATAAG
TTGGTAACTAGCCATCTGAGGTTAGTGGTTAAAGTAGCAATGGGTTTTAG
GAGTTATGGCCTTCCTCTCATGGAGTTAATAATGGAAGGAAACATAGGTC
TGATGCAAGCAGTGAAGAAGTTCAATCCCGAATTGGGCTTCAGGTTGTCT
ACATATGCAATATGGTGGATAAAAGCGTCTATAAAAGACTATATACTGCG
TTCCTGGTCGTGTATGCGTATAGGGACCACGCAGGCTCAGAAGAAGTTGT
TTTTTAGTTTGAGGAAGATTAAAAGGAGAATATTAGGCTGTAGTGCTTCG
GCCAGTCAGAGTGATATACGTGCTATAGCGGAGGAATGCGGTACTTCTGA
AAAGGAAGTAGAGAGCATGGATAGGTTTTTCTCCAATAGGGACATATCAC
TCAGTGACAAGGTCTGCTGTGAAAGTGGTACTGAGCTACAAGATCTTATA
CCATGTTCAAGCCCCAATCAGGAGGTTATGTACCTATCCCATGAGGAGAG
TGTGATGAAAGATCAGATGGTAAAGGAGGCTTTATCTACGCTGGATGAAA
GACATAGAGATATTTTTTCGCGAAGAAAGTTAAAGGAACATCCAGACACT
CTAGAAACGTTAAGTGAAGAATATGGAGTCTCAAAGGAAAGAATCAGGCA
GATTGAGCTTCAATCTTTCAGTAAGGTAAGGTCTTTTGTAAACGCTAATA
GATACAAGATATGCTGCTAG
>APH_0514 rpoZ, DNA-directed RNA polymerase, omega subunit
ATGGACTCTGAAGAAAGTAGGTGCTTTTCTGGTTATGATGGAAATAGATT
TAAGCTGGTGATTCTTGCAAGTCAGAGAGCTCACGAGTTAAGCTCGGGCG
CAGCGACTCTGGTAGACCGTCAGGGTGATAAGAATACGGTTGTCGCACTG
AGGGAGATAGCGTCCAATCAGTTAGATCTCTCTACCGTATTCGGGTTGGC
TGTGCAAAGATGTAGAAAATATCTAGAAGAATTTGCTGGTTCTCGTGGTA
TTGCGGGGCACAGCTCCCATGTCTCACCTTCTCGTAGTTCCCGACATACC
GGTCTTGGTAAGAGCTTTGTAGATAATAAGAGCACGTATTCTGCTTCGTT
TCTGGATCAGGATAAGTTTCTTTCAGGTGGAAAAGATGATGGTATAGAAG
GTTTCTAA