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COG category: Transcription
Organism: Thiomicrospira denitrificans ATCC 33889, ATCC 33889

Number of genes found: 89

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# Thiomicrospira denitrificans ATCC 33889, ATCC 33889

>Tmden_0133 hypothetical protein
ATGAAAAAAATCATATATTCACTTACATGTATCTCTCTTTTAACCTCTTG
TGCTATGGCTGATATTGCTAGAGCTGAGATGGGAGCAGGAGTATGGATGC
AGAGTTCAAAAGGAAACGTTAACTATTCTGATGGTGGAGCTAATGGAACT
TATGTCTCAAGAGAAAAAGATAACAGTGAGCTTTACGTATGGGCGCTGGT
TAAGCACCCCGTTCCTATGCTTCCAAATTTAAGATTAGAGTATGCCAGTA
TAAAAGATGATGGTCTTGCTACTGGAAAATTTAAAGATTTTGATATTGGT
GCAGCAACGACTACACTCTCATACGATATGAAACAGTACGATATAATTGG
GTACTACAACATTTTAGATAATACCGCTTGGACAACGTTTGATTTAGGTC
TTGATATCAAGATTGTTGATGCTTCATATGTAGCTGCACCTTCAGCTCCA
TTTACTGGATATAGCGATAGTGTAACATTTGCAGTTCCACTTTTATATGC
AAGAGTTAGAGTTGAGATACCATCATCTGAGCTTGGAATTGAAGCTGATA
TAAAGTATATAACGACAGGAAATTCCACTGTTTATGATGCAAGAATAAAA
GCTGACTACACCCTGGATTTTTCCCCAGTAATTCAGCCAGCTTTAGAGGT
AGGTTATAGAGTTCAAAAGTTAGATATTGATGAGAGCAGCGTTGATGCAA
GAGTTGATATTGATTTCTCAGGTATCTATGCAGGCTTGATGTTTCGTTTT
TAA
>Tmden_0555 transcriptional regulator, MerR family
ATGATTCATGATTATGACGAACCAGTATATTTAATAAGTATCGTTGCAAA
AGTTTTAGAAATACATCCACAGACGCTTAGGCAGTATGAGAGAGAAAATC
TTGTAACTCCATCAAGGTCAAATGGAAAGATAAGACTCTATTCACAAAGG
GATATAGATAGAATAAAACTTATACTAAGACTCACACGTGAGCTTGGAGT
AAATCTTGCTGGAGTTGATATTATCTTGAGATTAAAAGAGAATGTTGATG
GAATGGAACAGGATATTTTAGATCTTAGACAAGAAGTTATGAGAGCAAAA
AACTCTCAAACAGTCTCTCACGATAAAGCGCTTGTTGCTAAAAAAAGTAT
CTACGAGATGATAATTTTTAAGAAGTAA
>Tmden_1553 transcription termination factor Rho
ATGAGCGAAATCGATTCACAGCAGCCTCGCAAAAGCATTAACAACAAAAG
CAGCGCAAAGACAAGAACACACAAACCAGTAAAAGGTGTAAGTGTTGAAG
ATCTTCGCATCAAGAGTATTGAAGATTTAACAGCTATGGCTGTTGAACTA
AACATAGAACAACCAAATGAGCTAAAACGCCAAGACCTCATCTTTGAGAT
ATTAAAAGCACAAACAGAACAAGGCGGATTTATCCTCTTTAGCGGTATTT
TAGAGATTATGCAAGATGGTTATGGTTTTATCCGCTCTATTGACAAGAGT
TTTGATGAGAGTATAAACGATGCCTATGTATCAAATACGCAAATCAAACG
CTTTGCTCTGCGTAACGGAGATGTTGTCACAGGGCAAGTTAGACCTCCTA
AAGAGCAAGAGAGGTACTACGCACTTATTAAGATAGAAGCCGTTAATGGC
CTTCCTCCTGAAGAGAGTAAAAAAAGACCTCTCTTTGAAAACCTCACTCC
ACTTTATGCAACAGAACAAATCAAACTAGAATATAGAGAAAAAGGTCTAA
CTGGCCGTATGATGGACCTTTTTGCTCCTATTGGAAAGGGTCAGCGTGGA
CTTATCGTTGCACCTCCAAGAAGTGGTAAAACAGAGCTTTTAAAAGAGAT
TGCTCATGGTATCACGCATAATCATCCAGAGATAGATTTGATGGTTTTAC
TTGTTGATGAGAGACCTGAAGAGGTAACTGACATGGAGAGAAGTGTTAAG
GGTGAAGTTTATAGCTCTACTTTTGATATGCCTGCAAAAAACCATGTAAA
AGTGGCTGAAATGGTTATAGAAAAAGCAAAAAGACGCGTTGAGCTAGGTA
AAAACGTTGTGATTTTACTTGACTCTATCACTCGTCTTGCACGTGCTTAC
AACACAGTTACTCCATCAAGCGGAAAAGTCTTAAGCGGTGGTGTTGATGC
AAATGCTCTTCATAAACCAAAGAGATTTTTTGGAGCTGCTCGTAATATAG
AAAATGGTGGAAGTTTAACTATCATCGCAACTGCACTTGTTGATACAGGA
AGCAGAATGGATGAAGTTATCTTTGAAGAGTTCAAAGGTACTGGTAACTC
TGAGGTAATTCTTGACCGTAAAATTGCCGATAGAAGAATCTTCCCAGCTA
TTGATATATTAAAATCTGGAACGAGAAAAGATGAACTTCTAATAGGTCCT
GAAGTTCTACAAAAAGTATTTATTCTACGTCAAATGATTCACAAACAAGA
CAATGAGATAGAAGCACTCAAATTTGTTTACACAACAATGGGTAAAAAAC
CTACAAATGAAGAATTTTTAGAAAGTATGAATACTAACCAATAG
>Tmden_0327 DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit
ATGAAAAAGATTAAAACTACTCCACTTGCTCCACAAGAGTTTGAGGTAGA
GCAGATTAGTGAGAATGAAGCTAATATAATGGCATATCCTTTTGAAACTG
GGTTTGCTATATCTTTAGCTCATCCACTTCGCCGTTTTTTGTTAAGTAGT
TCAGTTGGTTATGCACCAATAGCTATAAAAATTGAGGGCGCAAAGCATGA
GTTTGATTCAGTACGCGGCATGCTTGAAGATATTTCAGATTTTATTTTAA
ATCTTAAAGAGACTCGTTTTAAGCTACTTGGTGGTGCTACTGAAGCAGAG
ATTAATTACAACTTTACTGGTCCTTGTGATATAAAAGGTAGTAATCTTTC
AAATAGTGAAGTAGAAATAGTAACTCCAAATACTCATCTTGCTACATTAA
ATGAAGACTCTACACTGAATTTTAGCATTAGAATTGCGCAAGGTATTGGT
TACGTTGCTAGTGAAGACACATATGATGAACTACAAGATGGATACATAGC
ATTAGATGCTTATTTTACTCCTGTTAGAAGTGCAACATATAAAATTGAAA
ATGTATTGGTAGAAGATAATCCTAACTTTGAGAGAGTTATCTTAAATATT
AAAACTGATGGACAAATAACTCCATTGGATGCATTTAGAAATTCACTAGA
AGTCATGTATGCACAACTAGCAGTATTTAACAGTGAGATCAGCGTGAAAG
CTCCAGCTACTATAGAGAGAGCTGAAGAGAGTCCAGATCTTAAAAAATTA
ACAGCGCATATTGATAGTTTAGGTTTAAGTGCAAGAAGTTTTAATTGTCT
TGATCGCTCAAATATTAAACTAATAGGTGAAATAGCATTGATGAGTACAA
ATGATCTTAAAAATGTTAAAAATCTAGGCAAAAAATCGTATGATGAGATT
GTAGAAAAACTTCAAGAGTTTGGTTATGAAGTTGGTGGCGATCTTGCAGA
TGATGTAGTAAGTGCATTAAAAAAGAAAATAGAAGCTTTATAA
>Tmden_0587 conserved hypothetical protein
ATGAAATTTGAAGTAATACAAAATGAATATAGTGCACTTTTAAAAGAGAT
ACAAAGCTACTTTAAAAATTCACAAAACTCAATTCACAAAGCGAGAAATG
AGATAAAAATCATAGATTTTAAACAAAAAAGCTTAGTTATAAAATCTTTT
AAAGTTCCACATCTAATAAATAGAGTTGTTTATACATTTTTTAGAGACTC
TAAAGCCAAAAAATCTTACGAAAACAGCGTAAAAATAGCTCAGTTTGTAC
CAAAACCAATAGGCTTTGTAGAGCTTAAAAAGTCTGGTTTGCTACATGAG
AGTTACTTTGTAAGTGAAAATTTTGAATATGACTTTACGATAAGAGAACC
TCTTTTGGAGAGTGTTTTTTTAGATAGAGAGAAGATATTTAAAGCGTTTG
CAGAGTTCACATTTAAGTTACATGTAGAGGGTATTTTTCATCTTGATTAC
TCGCCGGGAAATATATTAATAAAAAAAGAGAGTGATGGATATATTTTTAA
AATAGTTGATATCAACAGAATGGAGTTTAAACCTCTAAACTTAGATAAAC
GCCTTAAAAACTTCTCAAAACTCTGGGCGAAAGATGAAGATTTAAAAATC
ATCATAAAAGAGTACGCTAGACTTTATAAAAGTGATGAAGAGCGCTCAAT
TAAGATAGCTTTACAATATTCGCAAGCTCACAAAAATAGAAAAAACAGAA
AAAAAAGATTGCGAGGAGAAGCAGTTGTTGATTGA
>Tmden_1011 response regulator receiver domain protein (CheY-like)
ATGCTAGTTTCAGCCTCCATCAAAGGCAAAAATCTCACATTTGATTATTA
TTATAACAAAGAAACGCAGATGCTTTTTTATAAAAATGAGCAGATAACTC
TCTCAAAACAAGAATCTCAACTTTTTCACATATGTTATCTAAGTAAAGGC
TCCTTTGTTCCCATGCACACGATTGAGTACTATATTTGGGGTGAGGAATA
CGTGAATGATTCGACAAAAAGAGGACTTATTTATCGTTTGAAGAAAAAAT
TAAACCATACTATTTTTGAGTATTTGGGTGGATTTGGATGCAAAGTGGAT
GGACTTTGA
>Tmden_1759 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAAAAAATATTAATGATTGAAGATGATTTGGAACTTGCTGAAATTCT
TACGGAGTACTTACAGCAGTTTGGATTTGATGTTGTTACAGAAGATGACC
CTTTTAAAGCGGTTAGTATCTTAAAGTTGGAACCATTTGATTTGGTTATC
CTTGATTTAACTCTTCCTGGAATGGATGGTTTAGAAGTTTGTGAAGCAAT
TCGTGAGCGTCAAGACATACCTATAATCATCTCTTCAGCTAGAAGTGATG
TAACAGATAAAGTAAAAGCGTTAGAACTTGGTGCGGATGATTATATTCCA
AAGCCTTACGATCCCAGAGAACTTGAGGCTAGAATCCACTCAGTTTTAAG
ACGTTATGAAGCAAAATCACAACAAAAAGAGGAGTCAAAGAGCGACTTTA
AATGTGACATGTCTTCGATGATGATTACATATCGCGGAAGAAACATAGAC
CTTACAAATGCTGAATTTGGCATACTCTCATATATGATTGCAAAGCAAGG
TTTAGTGGTTTCAAGAGAAGATTTGATTCATAATGTAAATGCTATAAATG
AAGACTCTTCAAACAAAAGTATTGATGTTATGGTCGGTAGAATAAGAAAT
AAACTTGGAGACAAATCTCTAATCGAATCTGTTAGAGGCGTTGGATATAA
ACTTCTTAAATAG
>Tmden_0543 Exoribonuclease II
ATGATGAAATCTCTTCTTATTAAGCTCACACATGGCTTTGATGAACAGGA
TATATCTGCTGATGAGCTTAAATTTGTTAATGATTTTTTAGCAAAAGAGT
ACATAACAAAAGATGGTACTCTCTACAAATTTAACTCAAAGTATCGTGCT
GGAACTCTTGGTCTAGTCCAAAACGGCACTGCATATCTACATGTTATTGG
TGAGTATGTTCGTGATCTCTTTATTGATGATGTAGAGAGTTCAAAAGCAA
AAGAGGGTGACCTTGTAATAGCCCAAAGACTCCTTGGCAAAAGAGGCTCT
CCTAGTGCGAAGATAGTTGAAGTCCTCGGTCGTGCGCAGACGTATAGCGT
TGCTTATATCATTACAAAAGATGCAAAAAAATCATTAGTTGATTTAAAGA
CAGATTTTCCAATCGGCGTAGAAATAACTCAAGATGAGTTAGAGAGCTAT
AAAGATGGCGACGTTTTTAAAATCAATAATCAAGATTTTACTATTATGGA
GCTATTAGGAAACATCAAAGACCCATTAGTTGATGAGAAGATTGTTTTAG
CACACTACAACAAACATGATGCTTTTGAGCCTGAGGTATTAGAAATTGCA
TCCTCATTTACAGAGGTTGACGCTTCAAAGCATCCATTGAGAGTTGATTT
AAGAAAACTTCCATTTTGCACGATAGACCCAGTTACTGCAAAAGATTTTG
ACGACGCAATTTATTATGATGAAAAAGAGAGTACTCTTTATGTTGCAATC
GCCGACGTAAGCTACTATGTAGAGCCTTTTGGGGCGATTGACAATGAAGC
AATTTACAGAAGTTTCTCCATCTATCTTCCTCATCGCTCTATCCCAATGC
TTCCTCGTGAGCTGAGTGAAACACTCTGCTCACTACAGCCACATGTAGAT
AGACTAGCCTATGTTTTTGAGATGAAACTTGACTTAGAAACACTAGAAGT
AAGCAGTTCAAAAGTTTATGAAGCCATTATCCATTCACAAAGAAGATTTA
ATTATGAAGAGGTTGATGAACTTTTTGAAGGCAACTTAGAGCCTCAAAAT
CCATCAGAAATTGAGATTTTTGAGTATATCCATAAATTGAGAGTTATTAC
TGATGCTCTCAAGGCTAAGAGACTAAAAATAGGTTATAACTTCCGCTCAA
ATGAACTTGAGATGTTCCTTGATAAAAATTCAAATATATCAAGTACTTCT
TATGCAGAAGAGACTCCATCACATGCGCTAATTGAGGATTGTATGCTTCT
TGCTAACAAAGAGGCTGCAAAGAGATTTACAAGAGGTATTTTTCGTATCC
ATGAGCCACCAAATCAGATGAAACTGCAAAATCTTTATCAAGAGTTAGCT
GGAATTGGCATGTTTATAAATATCAAAAAATCTATAAAAGAAACGATAAC
AGAGATACAAAAACAAGCCGCCGAGATGAATCTTGTCTCCGAGGTAGATA
CACTGATTATACAGTCACAAATGCAAGCTAGATATGCACCTATAAATGCT
GGACACTTTGGGCTTGGATTTGATGAGTACACACACTTTACTTCACCAAT
TAGAAGATACTCAGACCTAATCGTTCACAGACTTCTAAAAGCTATCAGTA
ATCATGATACAACTGAAGGCTCTTATGTTTTAAGAAATATAGAGTCACTC
TGTATGAGTGTTAGCGAAAAAGAGAGAGAAGCCTCAACTATAGAGGTTGA
ATTTATGGCTAGAAAATTTGCTCGTTGGGCGGCGGAAAATATTGATGAAC
TCTTTAGTGCAAGAGTTACTTCAACTGACCCATTCTTTAAAGCTGAGCTT
CATGACACAATCTCTGGTGCAAGATTTTACATCACACATAATCTTGACGC
TGCTCTTTTTGATGATGTGAAAGTAAGAATAGACAAAGTAGATATCGCTA
AAGCAAAAATCTATGCTTCTATTACAGAAATAGTAGAAAAAGAGATTTAA
>Tmden_1976 putative transcriptional regulator, AsnC family
ATGAAAGATGAAATATTATCGCGTATTCAAAAGAAATTTCCTTTGGTTGA
TAGACCATTTAAGGTTATAGCAGATGAATTAGGCATGAGTGAAGATGAAG
TCCTTGCTATATTACAAGAGCAAAAAAAAGCTAATATCATACGTCAAACA
TCAGCTATCTTTGATACTAAAAGACTTGGCTATGTATCTTCTTTGGTGGC
ATTTAAAATTCCAGCAGATAAAATAAGTGATGCTGTAAAAATCATCAATT
CTCATCCTGGAATTTCACACAACTATGAGAGAAATCACGATTTCAATATC
TGGTTTACGCTGGCAGTTGCTCCAAATTCTAAGCTTGGGTTAGAAAGAAC
AGTTGAAGTATTGGCTGAAGCAACAGGAGCTGAGGATTATATTATGCTTC
CAACGCTTAAACTATTTAAGATAAATGTTAAACTAAATACGACAGGAAAA
GATGAGAAGAAAGAGGAAGTTAAAAAGGTAAAACATACAGAAATTGAACT
TACTCCGCTTCATCATGCAATAATTAGAGCGGCTCAATATGATATAGAGA
TGATACAAGAGCCATTTAAGGCGATAATAGAAGAGTTAAATATTGATTAT
GATACTTTTTTCAAAATTTTAGACGAGCTTCAAGAAGCTGGAGTTATGAG
AAGATTTGCTTCAATCCTAAACCATAGAAAAGCAGGATTTAGTGCAAATG
CTATGGTTGTCTGGGATGTAGATGAAGAAAAAGGTGAAGCAATTGGAGAG
AGAGCTGCAGCATTTAGCGCAGTGTCTCACTGCTATCTTCGCCCAAAATA
TTCAAATTGGCCATATAACCTTTTCACTATGGTTCATGGCAAAAGTGAGC
AAGAGACAAACTCGATTATAGAAGAGATGGCTTCTGAGATTGACTCAAAA
TCTCACATGCCACTCTACAGCTCAAGAGAGTTTAAAAAAGTAAGAATAGA
GTATTTTACTCCTGAGTTTGAAGCTTGGGAAAGTAAATATAGCAATTAA
>Tmden_0236 hypothetical protein
ATGATTCGTAAATTAGTATTAATAATTCCAGCATTAGTTTTTGCTTTTGG
AAACAAGCAGCAATATGAAATTGATCAAAAAGCACAACAGATAGGTTTCT
CAAAAATATTTGATAAATATAAAAATGGAATTCTTGAACCAAGTTCACTT
GAATTTAATTCAATGGTATATGATGATAGTAATAATATAATAATTGCCGG
TGCAAAATCGGGTAAACCCATTGTACGAAAAGTTGATGTGCATGGTAATG
AATTATGGAGAAAACAATATGGAGATGATTATGGTGGGGTACAATATATT
GAAAAAGCCTCTGAAAACACCTATATTTTAATAAGAAACACAGAGGATAA
AAAAAATAAAAATTCTTTTTTAACTCAAGTTCTACTTATTGATACATATG
GCAATCTTAAGGGCGAATCTTTATTTCCTCTTCTTTTGGATGAAAATTCT
AAAATTAAACAAACAAATGACAAAGGATTTATCTTAGTTAGTGGCACCAA
TATAATTAAAATGGATGCCAATGGTTTTAAAGTTTGGCACCAAACATATG
AAAATTTAGATCTTAATGATTTTATAGAGTTAGTTAATGATGAATATCTT
TTTGTTGGCAAAAAAAATATAGATGAGAAAAAAATTGATAAAAGTGCACA
TATAATGAGAACCGACAGCAAAGGCAATATTTTATGGAATAAAGATTATA
CAAACATAAATGAATTTCAAAATATTATAGCAAAACCAAATGAGCTTATT
CTAATGGGAAATATGCCATTGCAAGTAACAATAACTAAAATAGATCAAAA
AGGGAATATTATATGGAATTATATACATACAGCTAGTGAAAACACTTTTG
GCCGTGATTTTATAGAAAATAAGTCCGGTAATTTTGTAGTTGCTGGAAAA
ATTTATATGTCGAGTGTCAAATCTGAGTATTTAATGATATTTGAATTAAC
TAACAATGGCGAACTCTTATGGAATCATAGTTACGGGCTTAGTTATGGAA
GTGATACTGCCAACTCAATTTTAGAAGCTCCAGATGGATATATTATGTCT
GGCGTTATTACACCTATTGAACACAAACGGAACGAATCTGGTTTTTTTCC
TAGCAGAGAACGTGGTTGGATATTTAAAGTAAATAGGCAAGGTGTTTACA
GTGATTAA
>Tmden_0718 RNA polymerase Rpb6
ATGAAAATAGAAGAATTAACAGCCAAAATATTAGATAATAACCCAAACAT
GGATCGCTACCAATTAGCAATCGCAGTGGCAAAAAGGACAGATGAACTTT
TAAATGGTGCTAATAGCAAATTAAATGTCTCTAAAAAGATAAAAACAGCT
GATTTGGCTCTTATGGAAATTGCTGAGGGCCTTATTATAATTAAAGGCTT
TGCTGATATAAAAAAATAG
>Tmden_0533 transcriptional regulator, MarR family
ATGAAAAAGAATAGAGTAAACAGCGACCTCATCACTAACTTTTATGACAA
AGTAGAAGCAAAAGAACTTCCAGAGATTTTTTTGATGACCTTTCCCATAG
CACTTATCCACAAAACTATCTTCTCTCACTCAGAGAGTTTTTTAAAAGAG
CGTTTTGATTTGCTAAACTCAGAGGTTGATGTTTTAGCATCGCTCTATAC
TCATGGCAAAGTTCTATCTCCTACCCAGCTATATGATATGACTATCTTCT
CATCGGGCGGGATGACAAAAGTTTTAAAGAGACTTCAAGAAAGAGATCTC
ATATCAAGAAAAGAGGATGAGTCCGACAAGAGATGTATGCTTGTTTGTTT
AACAAAAAAAGGGGAAGAGCTTATAGTAAAATCTCTAAATGACATCTCAA
AAGAGTGCAGTAAGTATTTTGAAGCCTTTAGCCAAGATGAGACGGAACTA
TTTTCAAACCTGTTAAAAAAAATACTCTTAAATATAAACAAGGTTTAA
>Tmden_1792 hypothetical protein
ATGGGTATTAACATAAGAAAAGCTACTAGTGCTGACGCATCTTTTTTAGC
ACAAATGATTTTACAAAGTACTAGGGCTGATAAAAAAATTGGTGTTTTTG
ACCTGATTTTTAAACTAAACAATGATGAAGAGATTTTAAAAAATTTAGAA
AAATTAACAAATACTACGGCGAAGTCAAATTGTCATTTTAGTAATTTTTT
AATTGCAGAAATTGATGGGAAAAGTGTTGGTTCTCTTGCAAGTTATGAAC
CAAGGTTGATAACTAAAGAGACTTTTATGAGTGCTCTTGAAGAGATTGGC
ATTAATGCTGAGGAGAGTGAGTACTTTGGTTTAATGGAAATTTGCGGTTT
TGCATTAAATAGCAGAACTTTAGTATTTGATTACATGGAAGAGTTAGAGG
GCTTTATGGATGTTGGAATTTTAAAAGCACTTATGCAAAAGAGTCTTTTA
ACTGCAAGGCTAAAAGGTTATAGAATCGCACAAACTATAGTTGAAATTGG
CTCGCTAGAGACACTGCTTTACTATAAAAAACTGGGATTTAAAGAGGTTA
GGCACAAAGATTGTGAGCCATATAAAGAGATTTTTGGAAGACCAGGTTTG
GTTTTACTCTCTATAGAGTTTTGA
>Tmden_1458 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAGATACTCCTTTTAGAAGATGAAGTTATGTTAAATGAATCAATCTG
CGAATACCTTGACTCAGAGGGTCATCATGTAGAGAGTTTTTTTAATGGAC
TGGCGGCACTCGAAGCAATAAAAGAGAACTCTTATGATCTTCTTGTTTTA
GATATCAACGTTCCTGGGATTGATGGACTCTCTTTTTTAGAGAAAATCCA
TGAGCTTAAAATACATGTAAGTGTTATCTATATAAGTGCATTGGTTGATA
TTGAAGATATTTCACGTGCATATACTCTTGGATGTCATGACTATTTAAAG
AAGCCCTTTCATCTAAAAGAGCTATCTTTGCGAGTTGATAGAATAAAGCT
CTCAAGCGTTGTTCCACGAGTTCATTTAAGGCTTTGTAAAAACTATAGTT
ATGATCAAGAAAATAGCACACTTCTTTTTAATCAAGAGGTTCAGATACTA
ACCAAACGCCAAGCTCAGATAATAGATTTACTCTCAAGAAACAGAGGTAG
AATAGTTGACTTTGAACAGTTTCAAACCTATGTTTGGAGTGAGCAGATAG
TTGATAATGCAACTATTAGAGCCGAAATTAATCGACTCAAAAAAAATTTA
AAAGAGGATTTTGTAATCAATGTCAGAGGCATGGGCTATATGATAGACAA
GCCTTAG
>Tmden_1242 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAGATGAAAAATAGAGTATTAAAAGATTTAAAAATTATTCTTGTCGA
AGATGAAGAGAATCTGGCACGTCTGTTAAAAGAGGCGATAGGAGATAATT
TTCATAGTTTTACAGTTGCAAAAGATGGTATTGAGGGGATAGAGTTTTTT
AAAAAAATAAGACCTGATATCGTCATCACTGATATCATGATGCCAAACCT
TGATGGACTAAAGATGGCAAAAGAGCTCAAGCGTATCAATCCAAATATTC
CTATAATCATACTAAGTGCTTTTAGTGAAAAAGAGAAACTGCTTAGCGCC
ATAGATGTTGGAATAACAAAGTATTTTATAAAGCCTTTTGATGCAGAGGA
GCTTTTAGAGTACATAAGCAGCATAACTTCAAGAATAGAAAACAAGATTC
TAAAGCTGAGTGATTGCTACATTTTTAACAAAAACACAAGTTCTCTTTAT
AAAAATGAAAAATATATAGCTCTTAGTAAAAATGATATAAAGTTTCTATA
TCTTTTATTAGATTCTAAAAATAGAACAGTCGATGATATCTCTATAAAAG
AGGCTCTTTGGGGAGGAGATGCGAGTGATGAGAGACTAAGAACTTTTATC
AAGCGTTTTAGAGAAAAAACCTCTAAAATGCTTATAAAAAATATAAAAGG
TTTTGGATATCAACTTCTTCTTAACGAAAATTAA
>Tmden_0135 Competence protein ComEA helix-hairpin-helix region
ATGACTGGCGGTGCTGATGATGAAGTGCTAAGAGAGTTTGAGACTATCTA
CATAGCGGCTAAAAAACTCTTGGAGAGAAAAGAGGAGATAAAAAGACTCA
TTTCAGAGAGAGCAACTCTTACGCAAGAGCTTAGCAAAAGCATAGAAGAT
GCCGATACTATGAGGGTTTTAGAGGATATTTATCGTCCATATAAAGAGAA
AAAAAACTCTCGCGCTGCAACTGCTATAAAAAATGGACTAACACCTCTTG
CAAATATTTTAGAGTCTGCAAAACTTAGTGCTGATGAGTTTAAAACAAAA
GCAAAAGAGTTTGTAAAAGGTGAGCTCTCATCAGTAGAGGCTGCCATAGA
TGGCGCAAAAGATATACTAGCAGAGCGTTATGCAGATATGCCTCGTGAAC
GTGAAGCGATAAGAAATATGATGCTCCGCAGTGGTGTTTTAGAGATAAAA
AGAACAAAAACATTTGACGAAAATGGACTCTTTAAAAACTTTGATGGCAA
GAGTGAGAGAGTAGCTTACATGCCATCTCACCGCTATCTTGCAGTTATGC
GAGGGGTAAATGAAAAAGAGTTAAGTGCAAAGATAACCATAGATGTCCAA
AAGATAGAAGCAAATATCAAAGAGTACAAAATCCCTCGTAATGCTTCCTC
CTCAAAAGAATTTCTTTTTGAAGCCTACAAAGATGGGCTAAAACGCCTTC
TTCTGCCTTCACTTGAGAGAGAAGTGAACTCTGAGCTAAAAGAGAGAGCC
GACATCTCTGCTATATCTGTTTTTGGCAAAAATCTAAATCAACTCCTCAT
GACTCCTCCAGTTACAAAAAGAGTCATTTTAGGCGTGGATCCAGCCTTTA
GAACTGGGTGTAAACTAGCGGTAGTTGATGAGAATGGAAACTACTTAGAG
TCATCTGTTATCTATCCAACAGAGCCTCAAAATGATTATGAAAACTCAAA
AAAGAAGGTCTTAGCCTTTAAAGATAAGTACAACATCACAGGTGTAGCTA
TCGGAAACGGCACAGGCTCACGTGAGACACAAGAGTTTTTTGCACGTCTT
AACAAAGACGAGGGTGCAAACTTAAACTACACAGTTGTATCTGAAGCAGG
TGCTTCTGTTTACTCAGCCTCAAAAGTAGCCTCTCTTGAATATCCAAACC
TTGATGTAACTATCAGAGGCGCCATCTCAATAGCTCACAGACTTCAAGAC
CCAATGGCCTCCCTTGTCAAAATTGACCCAAAATCTTTAGGCATCGGGCA
GTACCAGCACGATGTGGATCAGAAGCTTTTAGAGAAAAAACTAACTGATG
TAACGCAAGATTTGGTTAATCGCATAGGCGTTGATATAAACTCTGCATCT
CTCTCACTTTTATCTTATGTCGCTGGAGTTGGCACAAAAGTGGCGCAAAA
TATCATCACTTATAGAGAAGAAAATGGCGCCTTTAAGACAAAAGAGCAAC
TACTAAGTGTAAAAGGTTTAGGAAAGAAAGCTTATGAACAAGCTGTTGGA
TTTATCCGTATAAAAAACTCTAAAAATATTTTTGATAATAGCGGTATTCA
TCCAGAGAGCTATGAGGTTGCAAAAAAACTTACTGGGCTTGATTTGACAA
ATATTGATGTCCAAGCAAAAGCTAAAGAGCTTTGTGTTGGAGAAGAGACT
CTAAGAGACATCATAAAAGAGCTTTGCAAACCTGGATATGACCCAAGAGA
AGAGCTTCCGCCCATACCTTTTAAAGATGGCATAACAGATATAAAGATGT
TACATGTAGGAAGTTTTGTCTCTGGTGTTGTTAGAAATATTACAGATTTT
GGAGCATTTGTGGACATCGGGCTTAAAAATGATGGGATGATTCATATCTC
AAAAATGGCTCCAACAAAAGTATCGCATCCGCTGGAAGTTCTATCACTAA
ACCAGTATCTCCCGCAGATAGAAGTAATTTCAATAGATGAAGAAAAAGGA
AAAGTCGGACTCTCTCTGGCGTAA
>Tmden_0955 transcriptional regulator, XRE family
ATGTATCTTAAAGAATTTAGAGAGAAATTAAATTTAACACAAAATGAGTT
ATCTAGTATTTTAGATATAGCTCAAACGACAATAGCTAGATATGAAAATG
ATAAAGTTAAGCCAACATCAACTGTTTTATTAAAATATATAAACGAACTT
AATGCCAATCCAAATTTTTTATTTTTGGGCATTGAACCTCATTTATTAAA
CAATCTTCCAAAATTAGATTCATCAAATATGGATTTATTGAATGATATAA
CGCTTATGATGTCTCAAGAACACTTAAGAGAAAAACTCAATAAGATTTTG
ATTGATGAAATTATTCAAAGGTTTGAAAAACAAAACGATTCGCTCGTAGC
AAAACTTCTTGAAATAGTAAAAATGGATGATCCAGTAAAGACTAGACCAT
TTTTATTTTTATATTATATCTTTCAGCTCATTGAAAAAGATTTTACTGAT
ACACCAAAAGAGATTAGTGATTACAAGCAGTATTTAGGGGATGTTATTAC
CAATTATAAAGTGGTCACTTGGAAAAATCAACCACTATTTACTGAAAAAA
TCAAAAGTGAAATCAGAGACTTTTTAGATGTGAAACTAACTACAAAAGAG
TGTGAGCTTCTTGTAAAAAATTACAAGAATACTCTTGAGATGCTCGAACA
GAAGATGCCACCGTCGATGATTAAATATCATCGAAACTCTTTTAAATAG
>Tmden_0406 DEAD/DEAH box helicase-like
ATGAACGTAACAAAAGAGCAAAAAGAGAAGTTTAAAAAGCTAGGCATAAG
CAGCTGTAGTGAACTCTCTTTGATAATCCCATCTCTTTATGAAGATTTAC
GGCTTAGCAATAAACTGAGTCCGCACTCTATGCAACTCATTGACGCTACT
GTTGAAGCCATATATAGAGCTCCTAATTCACTTCAAATTACTTTTTTTGT
CCATAATTTTTCACATACAGTTACAGGTGTAATTTTTCGTCCAAAACCAT
ATCTGCTGCATCAATTCAAAGTTGGGCAGAGAGATTATTATTATGGAATG
ATGGAGTGCAAAGGCGGTACATGTAGTATAAATATGCCAAAAAAAATCAC
AATTATAGGTGCTATAACTCCAAAGTACAAATCAGCCCTAAGAAGTGATG
TGATGTTACGATTTGTGCAAAATCTCTTAACTAAAGAGAATCTGCTCTTG
GATGGCTTAAGAGAAGATGTTGCATGTGAACTTTTAAAACTCCATTTTCC
TCAAAGCGTAATACCAAATATAAAAGAGCTGGATGAGAAAATATTAAGGG
CATTAAAATATACAGAGCTTTTTGTTTATATGAGAGAGTTGGCTAAGAAG
AGACGCTATTATCCTTCTCTCTCACTTACATGTAAGAGTTATGACGAGTG
GCTGCAGACTCTTCCTTTTAGGCTAACAAATGAGCAGATAAAAGCGATAG
AAGATATAAGAGCAGATTTTCAAAAAGGGCTCTCTGCAAGACGAATGATA
GTTGGAGATGTTGGAAGTGGGAAAACTATGGTTATTTTGGCATCAGCTCT
GATGAACTCCCCGAATCGCTCAATCTTAATGGCGCCAACTACAATCCTTG
CAAACCAAATCTATGAAGAGGCAAAAAAATATCTTCCAATGATGAATATA
GCCTTGGTTAGCAGTAAAAACAAAAATATGGATTTAAGTGAGTATGACTT
TATCATTGGCACACATGCACTTTTATATAGGGAACTTCCAATAGCCACTT
TAGTTATGGTTGATGAGCAACACCGTTTTGGAACTGCTCAGAGAAACTTG
CTTGAAAAACTGGTAAGCAGCCAAAATAGTAGCAGCAAAATTTCAGATGC
AAAATCACATTTTTTACAATTCTCAGCAACTCCAATCCCACGAACTCAAG
CGATGATAGAGATGGCTCATATTGATGTTTCGCTTATTACTTCAACACCT
TTTAAAAAAGAGATAAAGAGCAGAGTTATACATAAGAGCGATTTTAAGGA
GCTTCTTGAGCATATAAAAGTTGAGATTGCTCTTGGAAATCAAGTACTTC
TTGTATATCCACTTGTTGAACAGAGTGAAGTTTTAGAGTATCAAAGTATT
GATGAAGCTAGAAGTTTCTGGGAGGCAAGATTTACAAATGTACATGTAAC
GCATGGAAAGGATAAAGATAAAGAAGAAGTTTTAAGAGAATTTGATAAAC
AAGGAGATATCCTCATTGCTACAACTGTTGTAGAAGTTGGTATCTCTTTG
AGTCGCCTTAGCACTGTTGTGATTGTTGGTGCTGAGAGGTTAGGACTCTC
GACTCTTCATCAGCTCCGTGGCAGAGTTAGCCGAACAGGTCTTAAGGGCT
ACTGCTTTTTATATACAAATCAAAATAAATCTGAGCGTCTTGATAAATTT
GTAGATACAACTAGTGGATTTGATATTGCTAATCTTGATTTAAAATTTAG
AAAAAGCGGAGATTTGTTAAGAGGGCATAATCAAAGTGGAAATCAGTTTA
GATGGGTTGATTTGGCAGAGGATGAAGAGATAGTAAAGTTGGTAAAGGAT
GATTTGTTAAAGTGA
>Tmden_0706 sigma 28 (Flagella/Sporulation)
ATGATTAGCGCATATACTCAAGATTTAAAACATAAAGAAGATGAGTTGGC
AATTCAGTATTTGCCCGCTGTTAAAGCTATGGCTTTTAGATTGAAAGAGA
GACTTCCAAGCTCAGTTGATTATATGGATCTCTCAGCAATTGGCACAGAA
GAGTTGATAAAACTTGCAAGAAGATATGATGAGAGTCTCAATGACTCATT
TTGGGGATATGCAAAAAAACGTGTTTATGGTGCAATGCTTGATTATCTTA
GAAGTTTAGATATCGTAAGTCGTGCAAGCAGAAAACTTATAAAAGCGATA
GATTATGCTATTGAAGAACATAGAGCTATACATGATGAGGAGCCAAGTGA
CGAAGAGTTGGCTCTTATAATAGGCGAAGATATTGAGAAAATTCATGAAG
CTAGAATTGCTTCATCCATATACGCAGTTATGCCTCTACATGATCAACTT
CAAGTTGGAGATGAGGGCGCATCGCTTGCAAATATAGAAAAAGAGGAGTT
GATAGATGTTATTAAAACTGTTCTTGGCTTATATAGTGAGAGAGAACAGA
TGATTATTCAGCTATACTATTTTGAAGAACTTTCTCTAAAAGAGATTAGT
GATGTCTTAGGAATAACAGAATCAAGAATTTCCCAAATTCATAAATCAGT
AATTCATAAGATAAAAGAGAGTGTAGGGGCTTAA
>Tmden_1748 NusA antitermination factor
ATGGAAAAAATTTTAGATATAGTTGAAGCAATAGCAAATGAAAAAGGTCT
CAAGTCAGACAAAGTTAAAGAGGCTCTAAAAGCAGCTTTTATACAAACAG
CAAAGAGAATAATTAACTCAAAATTTGCCTTTGAAGCTGTAATTAATACT
CAAACAAAAACTATTGATATCATTCAAACAATCACAGTTGTCTCAGATAG
TGATGAGAGATTAAAAGATGAAGAGATTGCACCTGCATATATCTCTATCA
CAGAAGCAAGAGAGTATGACGATCAGGTAGAACTTGATGATCAGCTGCAG
ATTCCACATGACTTAGAAGAGTATGGAAGAACTGCTGCATCTCAGCTACA
CAGAGAGATTGAGTACCATATTCAAAGAGTTGTAGAAGATGAGATTTTTA
ACAAGTACAAATCAAAAATAGGCTCTCTTGTAAATGGGCGAGTTACAAGA
GTTGACAATCAAAACTCTACCTATATAGAGATAGATGAAATTCGTGCAGT
TTTACCTATAAAAAACCGTATTAAAGGTGAAATTTTCAAAGTTGGAGACC
ACTTAAAAGCGGTTGTTAGACGTGTTGATATGAATAAAGAGAATGGCATA
CAGATAGAGCTTTCACGAACTTCTCCTAAGTTTTTAGAAGAACTTTTGGC
ACTTGAAGTTCCAGAGATTTCAGATGGAACTGTAATCGTGGAGAGAAGTG
CTCGTATTCCTGGTGAGAGAGCAAAAGTAGCACTCTTTAGCACGCATCCA
CAAGTTGATGCTGTTGGTGCAACTGTTGGTGTAAAAGGTGTTCGTATAAA
TGCTGTTAGCCAAGAGCTAATTGGTGAGAACATAGATTGCATAGAGTACA
CAACTATTCCTGAGTTATTTATATCTAGAATTATGAGTCCTGCTATCATC
TCAAATGTTGAGATACTAAAAGATGAAAACGGAGAGGCTCAAAAAGCGAT
AATAACTCTGCCTACAGATCAAAAATCAAAAGCGATAGGTAAGAATGGTA
TAAATATCCGTCTTGCTTCAATGCTGAGTGGATTGAACATCGAGCTTGTA
GAGAGCGATGTAAAAGTTGCCCAAATGAGTGACATGCAAGATAATAAAGA
GCAAAAAGAGGGCGTTGATGCACTTAAGGCGTTGTTTAACTGA
>Tmden_0719 metal dependent phosphohydrolase
TTGAGTCAAGTTGATATAGGACAGATCAAAAAAATAGATACTGTTGACTT
AGCTATAAAGTATCTTTTTGCTCAAATTCCGCCAAGCCAAGCTTTGCAAA
AAGCTCTGGACTACTCCACTCTAGCACATGTAAACCAGTTTAGAAAAAGT
GGTGAACCATATATAATTCATCCAATTCTAGTGGCTAGTATTGTCTCCTC
CATAACAAATGATGAGTCTATGGCAATTGCTGCACTTCTACATGATGTTG
TAGAAGATACAGAAGTTGATATAGAAGAGATAAAAGATGTCTTTGGTGCA
GATGTAGCGCATCTTGTTGAAGGTCTTACAAAAATTGATTCAATTAGAGA
TACAGAACTAGTATCTTCAAATTCAAATGAAAAACTTGTAGTATCAGCAC
TCTCCTTTCGTAAAATGCTCCTAGCAAGTATTAAAGATGTAAGAGTTTTA
GTTGTAAAGCTATGCGATAGACTTCACAATATGCTAACTCTTGAATCTTT
AAGCGCGCAAAAACAGCAGAGAATCGCAGAAGAGACTCTTGTCGTTTATG
CACCAATTGCTCATCGTTTGGGTATCTCCTTTTTAAAAAATCTTCTAGAA
GATTTAAGTTTTTCAACTCTTTTTAAAGAAGAAAAAGAGCAGATAGATAG
CTACCTTGAAGTGCACTACCATGCAATAGAGATGAAGCTTATCGAATTTA
AAGAAGCAATTGAGAAAGTTTTAGTACAAAATGGCTTTTGTGAAGATGAT
TTTGAGATACTCTCTAGGGTAAAACATAAATATTCAATTTATCTTAAAAT
GCAGAGAAAGGGTGTTGGAATAGAGGAGATTTTAGATCTCTTAGCGCTAA
GAATTTTAACAAAAGATCCTGTTAAGTGTTATAGCATCTTAGGACTTATT
CATCTCCATTTTCAACCATTATCTTCAAGATTTAAAGACTATATCGCCGT
TCCAAAAGATAATGGTTATAGAACAATTCACACTACAGTATTTTACAAAA
CTGCTATTTTTGAAGTACAAATCAGAACTTATGAGATGCATGAAACAGCG
GAGCTTGGAGTTGCAGCACATTGGAAATACAAAAGTGGCGGCAACGATGC
GATTAAGTTGGATTGGCTTCATAATCTTGGATATCAAAATGAGTCAATTG
AAGAGTTCTATGACTTGATAAAAAATGACCTCTACAGTGAGGATATATCA
GTTTTCTCTCCAAAAGGTGAAGTTTTTACTCTTCCGCGAGGTGCAGTTGT
GCTTGATTTTGCTTATGCAATTCATACACATGTAGGAAATCATGCAAAAT
CTGCTCTTGTAAATAAAGCAAAAACATCACTTATTAATGAGCTTCACAAT
GGGGACATAGTTAAAATTGATGTTGATGAAAATATTATTACCAGATGTAG
CTGGCTTGATGCAGTAAAGACATCAAAAGCAAAAACAAATATGAGATATA
ACTGTAACGCAAGAGTAAGAGATGTTGATTCAAAATCTAGCATCAATATT
GTTGCAACAGCTATGAATTTAAATAGCTCGGTAATTGAAGCTTGGTTTGA
AAAAAATAGTTGTGATAAGAGAGCTACAATTGCTACTGATATTGAGCATC
TTAGAGATGTTGTTCAAAGATATATTGCAGAGATAGAAAAGAATAGTCGT
ATAAAAGGATTTCTATCGAGACGCAGATTCAAATTAAAACCATATAGCTT
TAGAGGTTTAGAGATATATAGCACATCAAATATAAATGATGTGGTTTTTG
ATTACTGCTGTCATCCAAAAAATGGCGATGAAATAATGGCTTTTTTAGAA
AAAAACAAAGCTCACGTTCATCATAAAATGTGCTCAAGTGCAACAAAAAA
GTTAGATGAGAAAGAGGCTATGGTTTTTGTAAGATGGGAGAAATTAAACA
TCTATAACTATAATATGATAGTTTCACTTCATAGCGGAGTTGGAACATTA
GCAGAGTTCTTAAACTTTTTAGCAAAATTAAAAATTGATATAAATCAGAT
TGAACTTGGAAAAAATAAGAGCGAATCTACGCGTTATTGTGAAATAGGAT
TTGAGTCAAAAGAAGCCGATATTAATGCACTACGTGCTAAAATCGAGCAA
AAAATAAAAGTAATACATTTTATTCGCACAGATGATGCGTATAGGTAG
>Tmden_1534 GreA/GreB family elongation factor
ATGCAAAAAATAGAGCCAATGACACTGTTTGGATATAACAAACTCCAAGC
TGAAGTAAAAAATATAAAAGAGGTTAAGAGACCTCGTGTTGTTAAAGATA
TAGAAGAGGCACTTGAACACGGTGACTTAAAAGAAAATGCTGAGTATCAC
GCAGCAAAAGAGCAGCAAAAGATTTTAGATAACCGTTTAGCTGAACTAGC
AGAACTAATTGGTTCTTCAAAGATAGTAGATCCAACTGAGCTTGAACATA
CTAAAGTCAGCTTTGGTTCAACTGTTGTTGTTTGTGATGTAATCAGCGAG
ATAGAATATACATATACAATAGTAGGTGGATGTGAATCAAACCCAGATAT
AGGGCTTATTTCGTTTAACTCTCCTTTAGCAAAACAGCTTCTTGGACGAG
AAGAGGGCGATGATGTAAAAGTTCAACTTCCAAATGGTCAAAAAGAGTTT
GAAATAATTGAAGTTACTTATAAGGAGATAGTCTTTGAGTGCCATTGA
>Tmden_0317 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGCGAATATTAGTTGTTGAAGATGATGAAAAAATTGCATCTTTCATAAA
AAAAGGTCTGCAAGAGGAGTCATACAGCGTTGATGTCACATCTAATGGAT
ATGAAGCTATCTATCTTGTAGAGACTAACTCTTATGATATTGTTTTGCTT
GATTTGATGATTCATGGACTTGGTGGGATAGATGTCTGTAAAAACATAAG
AGGCAAAAACATTGCAACTCCAATCATTATGCTAACAGCTAGAGATGCGA
TTAAAGATAAAGTTGAGGGTCTTGATTGTGGCGCAAATGACTACTTAACA
AAACCTTTTTCATTTGAGGAACTTTTAGCTCGTATCCGTTCCAAACTAAG
AACTACCTCAACTCTCTCAAGCACGATAGCTATAGCTGATTTAACTATAA
ATACAGCTCGTCGTGAAGTAAAGCGTGGAGATAAAAAGATTAACCTAACC
GCAAAAGAGTATGCCCTGCTTGAATACCTAGCAAGAAATTCCAAGAAGCT
CTTAAGTGAGACAATTATAAAAGAGAATCTAAGTGATATGGCAGAGGTCA
GTATGAGTAATATCGTAAATGTTTATATCTACCGTTTGCGCAATAAAATA
GATAAAGATTATGAGCCAAAACTTATACATACAGTAAGAGGATTAGGCTA
CATGTTAAGCGAGAAAGATGTTTAA
>Tmden_1439 transcriptional regulator, TetR family
TTGCTTAAGAAAAAAGAGAATAAAAAAGAACTTATAATGCAAGCAGCGTT
GGAACTCTTTGCTTCAAAAGGGTTTTATACTACTACTATCCCAGATATTG
CTGCTTCTTTGAAGATGAGTGTTGGCAACATGTATAACTATTTTAAATCA
AAAGATATTCTTGCTAGAGAAATTATAAAATATATCTCTGTATATCTGGG
TCAACAATTAAGAGAGATTAATGAACAAGATATATCAACTAAAGAAAAAA
CAAGAAAAATAATCGAGATTTATTTTAAAACTGCCTCCCTAAAACCTGAG
ATGATAGACTACTTTTTACGCATATATCTCTCAAACCGTGAAGTTTTTAA
AGATAGTTGCGAGGGGATGCTCTGCGTAAATGAGTTTGTAACTGAAATTA
TGATTTACTTTGAAGAGGGCGTTAAATGTGGAGATTTAAGAGAGCAGGAT
TTTTTCAGTGCTTTTGGACTTTTTATGGGTTATCTTGGTGGAATGGTTTT
TTTAAATGGTGAAAATATTTTGCCAAAAGATTTAAATGAATATGTAGATG
ATATATCTTTTAACATATACAAAGCCTTGTGCTCGGAGTAG
>Tmden_1096 putative phage repressor
ATGAAAAATTTTCTTGATATTGTTGAAGAGATAAAAAGTATTGTTTCTAG
TCAATACAGTGGGAAAAAAATATATGACAAAGATGTCGCTGATATACTTG
GAATCTCTCAGATGAATTTTGCTACGATGAAAAAAAGGAACAAAATTCCA
TTTGGAGAACTTTTAGATTTTTGTGCCTTAAAATCTATATCTATAAATTG
GCTTCTTTATGGGCAATCACCAGAGAGCCTCGTGGAAGCTACGAATAGAT
TTTTTATGATTAAATATTTTAGCGATGTAAGTGCTTCTGCTGGTGGTGGG
GCTGAACTTGAAAATGAATCAAACGAGATGATTAAAATTCCTCAAGAGTT
TGTAGCAATGCTAGGCGGGGAGAGAGAGCTTAAACATATAGAGGCTATAA
ACGTCTCTGGAGACTCTATGGAGCCAACTTTTAGCTACAACGATATAGTT
TTTATCAATAGAGATAAAAAGGATCTTCAAAGAGGTGGGATTTTTACGAT
TAGAACGGAATCTGGGCTATTTATAAAGAGAGTTCAAAAAAGAATAGATG
GAAAAATAGATGTAATTTCAGATAACCCAATTTACTCAACACAGACATTA
AATCTTGGTGAGATAGAGGTAATAGGACGAGTGGTAAGTAGATTTGGAAA
TGTTGACTAA
>Tmden_0152 transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family
ATGCCACTCATATCTACAAAAGGGTCTTATGGCTTAGCAGCGATATGTGA
GCTTAGCAAACGCAAAGAGAACTCTCCGATGCAAATTAAAGAGATAGCTT
TAAATGCTAATGTTCCACAAAACTATCTTGAACAGTTACTTGGCAAACTA
AGACGTGCAGGGTTAGTAGAGAGCATAAGAGGAGCCAAAGGCGGTTATAT
TTTAGCACGTCCACCACAAGATATAAAAATATTGGATATCTTAATGGCAC
TAGAGGATGATTTAAAAATAGTTGATACTTTGGTAGAGCATCCAATATTA
AAGCTTTTTTTTGAAGATGCAAGCGAGAGTGTAAAGAGTATTTTTAATAT
AAATATGATGGAACTCTCTGCTTACCAAAATAAATTTTTGAATTATAATA
TATAG
>Tmden_1056 transcriptional regulator, TetR family
ATGCCCGAAATTAGCATAGGTAAAGAAAAAACTGGTACAAAACAAAAGAT
ACTAAAATCTTCATCCAAACTCTTCTCTGAGCATGGATTTAAAGCTACTA
GCGTACGAAAAATAGCATCTGAGGTAGGAATAAGAGAGAGTGCTTTATAT
AATCACTTTAAAAACAAGGAAGAGATATTTTTATGCGTTGCAAAAGATAT
TTTTACTACACCATTCTCGCAAATAGATAGTGATATTAAAGAATCTGCAC
TAAAAGGAAAGGTATTTTTACAAAAATTTTCTATGCAATATAAGCTTCTT
ACATTTGATAAAAACAACGAAAATATGTTCAGGCTCTTGATGATTGAACT
TTTTCAAAATCAAGAACTTAGAGAGCAGTTTATAAGTGAATTTCACAATG
AAAACATCAAGATTTTATCTGAAGCCTTTTTTATTATGATGCAAAATTCT
CTTATTCGTTCTGCAGATCCGATGATGGTTGCTTATGAGTTTTTATCCAC
CCTCTTCTACATTAGATTGCAAGTTACGCTGCTTAGATTTGATGCGTTAT
CAACAAATGCGCTCTCAACTCAATTTGAAAAACATGTTGATTTTTTTTGG
GAGAGTATTAGGGTATAG
>Tmden_0403 NusB antitermination factor
ATGGCAACTAGACATCAAGCCAGAATGGCGGTTGTAAGCCTACTTTACGC
ATTTGATTTGGGTAATGGAAACATTGCAGAGCATACAGATGAGATTTTAG
AAGAGAAGAAGATTAGAAACAAACAAAAAGATTTTGCACTTACTCTTTAT
GAGGGTGTTATGGCAAACATAACTCCTGTTGATGAGGCGATAGTTAAGCA
CCTTAAAGATTGGGATTTTGAGAGACTTGGAGCTATCGAGAGAGCAACTC
TTAGACTTGCAACTTATGAGATACTTTTTGGAGAACTTGACTCTGCTGTT
GTCATAAATGAAGCAGTTGAAATAACAAAAGCGTTTGGAACAGAGCAGTC
ACCAAAGTTTATAAATGGTGTGCTTGACGCAATTTCTAAAGATAAGTAA
>Tmden_1566 Transcription-repair coupling factor
ATGTCTCAAAGCAGACTATTTAACTACTATAAAACCACAAAAAAATCAGA
TTTAGAGATTCTTCTTTGTGAGGATGCAAAAGAGGCACAAGAGCTAAAGA
GTGTAGCTCTGTTTTTTGGAAAAGAGGTTATTGTTTTTCCAGATTTTAGA
GCAACGCACGGCGATGATTTGAGAGTTTACAAAGAGGAGTTGCACCAGCT
CTTTAGCTCTTTGAGAAATTATTACAGCGCTAAAGTTAAGCCATTAATTA
TCTCTCCGCTAAAAACGCTACTCTTTGAGATGCCCCAAGAGTCTCTGCTT
AAATCAAGAGTTATAGAGTTTGGAGAAAAAATAGAGTTTAGAGCCTTTCA
ACAACAGATGCTCCTTTGGGGATACAACTTTGTTGATATGGTTCAAGTTG
AGGGCGAAATCTCTTTTAGAGGCGATATTATCGACATATATCCGCCATCA
AGCAAAATGCCACTTAGAATTTCACTCTTTGATAATGAGATAGAGCAGAT
AAAGTATTTTGAGCTTGAGTCTCAAAGAACGCAAAAAGAGGAGTTAGAGA
GTTTTGAACTTACTCCTGCTTTTTTCTCTTTGGATGAGAGCGAGTTTGAT
ATGTTAAATGAGAGAGTGCAAAAAAGTGAATTTGACTCTCTTGTAAAAGA
TATAGCATCTCTTGGTCTATGGCACCTTGATGATAGTGGTGTAAACTTTT
TAGAATCAAAAAATGTAAAGCTATCAAGAGAGCTAAATGCACCTCTTATA
GACGCTTACGCACTAAATAAACCAACAATTTCAAGAGAGTGTTTTAATGT
AGAGGTTTTAGAAGAGAGTGATGATTTTAAAGAGATTTCTGTCTCAGATT
TGCACGCATTTTTAAAAGTTCATAAAGCTAAAAAAACTACTATTATCGCC
TCAAATGAGGCAGTTATAAAACAAGCTGGGCTTTTTGATGTTAGTGGATT
GAAAATCCTTTACGCTCCATATATCTTAAATATCATGGGCAAAGATGAAC
TTGTAATTTCACTAAATAAACAAACTAAAATTAAGCGAAGAAGAAAAAGC
TCTATCTTGCTTGATGACCTTAAAGTAGGCGATTATGTTGTCCATGAAGA
TTATGGGGTTGGTATTTTTGAGGGGATTGAGCAGACAGAGATTCTTGGCG
GGGTAAAGGATTTTATAGTTATAAAGTATATCGGTGATGATAAGATTTTG
CTTCCAGTGGAAAATCTCGACGCCATTGACCGCTATATCGCTTCTGGTGG
GTCTGTTCCTGTTTTAGACAAGCTTGGTAAAGGAAGTTTTGGCAAACTCA
AAGAGAGCGTAAAAAAACGTCTCCTTGAGATAGCAGGGCAAATCGTAAAT
ACAGCTGCTGCGAGAGAGCTTATCACTGCGCCAAAAATAAACGTTGATGA
AGATGAGCTAAGAGCGTTTCAAAAGCTCTCAGGGTTTCTTTATACAGATG
ATCAGAGCCAATCAATCAACGAGATAATTACCCAGATGAGCTCAGGGCAC
ATCATGGATAGACTTCTTAGCGGAGATGTTGGTTTTGGTAAGACAGAAGT
TGCGATGAATACTATCTTTGCAGCCTATAAATCAGGCTTTCAATCGGCTC
TTATAGTTCCCACAACACTTCTCTCAGCACAACACTACCGCTCGCTTCAT
GAGAGATTTGATGCACTTGGTATAAAGTGCTCAAAACTGGATAGATTTGT
AAGTGCAAAAGATAAAACGAACATCATAAAAGCACTCTCAAGTGGAGATT
TGGATGTAGTTGTTGGAACTCACACTCTCTTCGATCTTGATTTTAAAAAG
CTCGGCGTGGTTATTATAGATGAAGAGCATAAGTTTGGGGTAAAGCAAAA
AGAGAAGATTAAAGAGCTTTATCATAATGTTCATCTTCTCTCAATGAGCG
CAACTCCAATCCCGCGTTCACTAAATCAAGCACTAAGCTCCATAAAGACG
ATGTCACAACTACTAACTCCGCCAAGCCAAAGACAGCCAGTTAGAACATT
TGTAAAAGCGTATGAAGAGAAGCTCATAAAAGAGGTGCTACTTCGTGAGA
TACGCAGAGGTGGACAGATATTTTATGTGCATAACTCCATAGATCATATG
CCTATAAAACTAGGCGAGTTAAAAGCACTTCTGCCATCACTAAGAGTTGT
TATGCTTCACTCAAAAATCTCTGCAACAGATACAGAAAAAGAACTCTTAA
AGTTTGAAGCAGGGGAGTATGACTTGATGCTTGCCACTTCAATCATAGAG
TCAGGCATCCACATGCCACGAGTAAATACGATTATAGTAGATGGTGCAGA
TAGATTTGGTATGGCAGATTTGCATCAGCTTAGAGGGCGTGTTGGACGCT
CAAATGTTGAGGGCTTTGCCTACTTTATAGTTAATGACAAAGAGACGCTA
ACGGATGAGGCAAAAAAAAGACTTTTAGCACTTGAATCAAACTCATTTTT
GGGAAGCGGTTCTGTTTTGGCTTACCATGATTTAGAGATACGTGGCGGTG
GAAATCTCGTCGGAGATGCACAAAGCGGACATATAAAAAATATAGGATAT
TCGCTCTATCTAAGGCTTCTTGAAGATGCTATCAAACTACTAAGCAATCA
AATGGAAGTTGAAAAGGCAAAAGTAGATATAAAGCTCACCATCTCAGCTT
TCGTCTCAGATGAAGTTGTAAAAGAGGATAGACTCCGTATAGATATATAT
AGAAGACTCTCCTCTTGCATAGATAGCGTTGAGATATATGAGATACAAGA
AGAGGTAATTGACAGATTTGGCGCACTTGATGCTCCAACAAAACAGTTCT
TTGAGTTAATGGTTATAAAAGTATTAAGTCTCTCAAAAGGGATAAAAAGT
GTTTCAAACTATGGACAAAACATAACGATTACCTACATGGATGAGAAAAA
AGAGAGCATAAAATCAGACTCAAAAGATGATGATGACATCATAAAAGCGG
TGCTGAAGTATTTGAGAGCGTAA
>Tmden_0354 DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime
ATGAGTAAATTAGTACCTATTGAAGTAACAGAAGATAGAAGACCAACTGA
TATAAAGCAGATACAGTTTCGTTTGGCTTCTCCTGAAAAAGTGATGTCTT
GGAGTCACGGAGAAGTAAAAAAACCTGAAACTATTAACTATCGCACACTC
AAACCTGAGCGTGACGGACTTTTTTGTGCAAAAATATTTGGACCAGTTAG
AGACTATGAGTGTCTTTGTGGTAAATACAAAAAAATGCGTTATAAAGGTG
TTGTGTGTGAGAAGTGTGGTGTTGAAGTAACAAGCACAAAAGTTCGCCGT
ATCCGTATGGGGCATATAGAACTTGTAACTCCAGTAGCACATATTTGGTA
TGTGAGTTCATTACCTTCTCGTATAGGTACTCTTTTAGGCATTAAGATGA
AAGACCTTGAGCGCGTACTATATTATGAAGCATATATAGTTGAGAGCGGT
GGTGAAGCATATTATGATGCAGAAGCAAAAACGCCAGTTTTAAAATATGA
TGTTTTAAATGAAGAGCAGTACCGTACTCTTGTATCTAGATTTGGTGAAC
TTGGTTTTAAAGCTCGTATGGGTGGAGAAGTTGTTCGCGATCTTCTTGAT
TCTATCGATTTAGTTGATCTATTTACTCAACTAAAAGAAGATATTGAACT
TACAAAAAGTGAAGCAAAAACAAAAACTATTGCTAAGAGACTAAAAGTAA
TCGAGTCATTTTTAAATTCAGGAAATAACCCTGCATGGATGATGTTAACT
GTTTTACCTGTCCTTCCACCTGATTTGAGACCACTTGTAAGTCTTGATGG
TGGTAAATTTGCTGTTTCAGATGTAAATGACTTATATCGTCGTGTAATAA
ACCGTAATCAACGTCTTAAACGTCTTGTTGAGCTTGAAGCACCAGAAATT
ATTGTTAGAAATGAGAAGCGTATGCTTCAAGAATCAGTTGATGCACTGTT
TGATAACGGTCGTCGTGCAAATGCTGTTAAGGGAGCTAACAAACGTCCGC
TTAAGTCTTTGAGCGAAATTATTAAAGGTAAACAGGGTCGTTTTAGACAA
AACTTGCTTGGTAAACGTGTTGACTTCTCAGGTCGTACAGTAATCGTTGT
TGGACCATCTCTATCTATGGATGAGTGTGGATTACCTAAAAAAATGGCAC
TAGAGCTGTTCAAGCCACATTTGATTGCAAAACTTGAAGATAAGGGTTAT
GCAACAACTGTTAAAGCTGCGAAAAAGATGATTGAAGATAAAACTAATGA
AGTTTGGGAATGTTTGGCTGAGATAGTTGATGGCTATCCAGTACTACTAA
ACCGTGCACCAACGCTTCATAAGCTCTCAATTCAAGCATTTCACCCTAAG
CTAATTGATGGAAAAGCTATACAGCTTCATCCATTGGTTTGTGCTGCTTT
TAACGCCGACTTTGACGGTGACCAGATGGCTGTTCACATTCCTTTAAGTT
CTGCTGCAATTGCTGAAGCAAAAGTATTAATGCTAGCTTCTATGAATATT
CTTCTTCCTGCATCAGGAAAGGCTATTGCTACACCATCTCAAGATATGGT
TCTTGGAATTTACTACATTACATTAGAGAAAAATGGTGTAAAAGGTTCAA
ATAAACTTTTTGCAAACGTAGATGAAGTAAGAATTGCTATTGAGCATGAT
GCTCTTGATATTCATGCAAAAGTAAGAACAAGAGATGATGGAAGAATTAT
TCACACAACAGCAGGAAGAATGCTCTTAAAAGCTATTTTACCTAATTTTG
TTCCATCAGAACTTTGGAATAGAGTTATGAAGAAAAAAGCTATTAATGAA
GTGGTTGATTACGTTCAAAAACATGGCGGTATAGGCGTAACAGCAGGTTT
CTTAGATAGACTTAAGAACTTAGGATTTAAACATGCAACTGAAGCTGGTA
TATCTATCTCTATTGATGATATAAAAATACCTGCAGGAAAAGAAGCTAAA
ATCGCTGAATCAAAAAATAGAGTTTTTGAGATTCAAAAACAGTTTGAAGC
GGGTCTTTTAACTGAACAAGAGAGATATAATAAAATTATTGATGTTTGGA
CTGATACAAACAACACGCTAGCGACTCAGATGATGGATTTAGTTCAAACA
GACAAAGCTGGATTTAACTCGATTCATATGATGGCAGACTCAGGTGCTCG
TGGTTCGGCTGCACAAATTCGTCAGCTTGCTGGTATGCGTGGACTTATGG
CAAAACCAAGTGGTGAGATTATTGAGACACCAATTATTTCTAACTTTAAA
GAGGGATTAAATGTTGTTGAGTACTTTATTTCAACACACGGTGCTAGAAA
AGGTCTTGCCGATACTGCTCTAAAAACAGCAAATGCGGGTTATCTTACTC
GTAAACTTGTTGACGTTGCTCAAAATGTTAAGATTGTTGAACATGATTGT
CATACTCACGAGGGTATAGAGATTTCTGATATTAGTGATCAAAATACTCT
AATTGAATCTTTAGAAGATAGATTAAATGGTAGAGTTTTAGCAGATGATG
TAATTGACCCAATAAGCAATGAGATACTCTTTGCAGAGGGAACACTTCTT
GATGAAGTTAGTGCTAAAGTCATAGCAGAAGCTGGAATTAAGACGGCATA
TATCAGAACTCCAACTACATGTAAGAGTGAAAATGGTATTTGTGCACTAT
GTTATGGTGTGAACCTAGCAACAGGGCAGATAGTTCGCAGAGGAGAAGCT
GTTGGTATTATTGCTGCTCAGTCAATTGGTGAACCTGGTACTCAGCTAAC
ACTTAGAACATTCCACGTTGGGGGAACTGCAAGTTCAACTGCGCAAGAGA
GACAAGTTGTAGCTGAAAAAGAGGGCTTTATTCGTTACTATAACCTAAAA
ACTTATGTTTCAAAAGAGGGTAGAAATATAGTAGCAAACCGTAGAAATGC
AGCTGTCTTATTAGTAGAGCCAAAGATTAAAGCTCCATTTAGCGGTCGTG
TTGAAATTCAAACTGTTCATGATGAAGTAATTATTAGTGTTTCATCAAAG
ACAGATACAATTCGTTATGTATTGCGTAAAAATGAGATTGCTAAACCAAA
TGAGTTAGCTGGAGTTGGTGGACAAATAGAGGGTAAATATTACTTCCCTT
ATGAAAGTGGTGCAGAAGTTCAAGAATATGAGTCAATAGTTGAGACAATA
AAAGATGGTTGGAATGTTCCAAGTCGTATTCCTTATGCTTCTGAAGTGTT
AGTTGCAAATGGCGCACCTGTTACTCAAAAGATTTTTGCAAAAGAGGATG
GAGTTGTTAAATACTTCCTTCTTAGAGGTGACTATTTAGAGAGATTTGAA
GGATTAAAAGCTGGTTATGAAGTTATTGAAAAAGGACTTTTTGCAACTGT
TGTAGATTCAAATAATAGAGAAGCAGTACGTCATTACATTGCTCGTGGTT
CTATTATTGTAGCTGAGGACGATGCTGTAGTTGATCCAAAAACTCTTATC
GCTAAACCTAAAAATGATGAATCAACAGTAATAGCAGAGTGGGATCCATA
CTCTAATCCTATTATTTCTGAGACTAGCGGTACAGTTAAATTTGAAGATA
TTATTATTGGAACAACAGCAACTGAACAGTATGATGAGTTAACTGGTAAA
ACACGTTTAATGATTAGTGATCATGTTCCTGCTGAATATAAGCCAACAAT
AGTACTTGCTAGCGAAGATGGCGAACTATTAAGATACCAAGTTCAATCAA
AAACTTCTATTTATGTAGAAGATGGAGCTAAAGTTAAAGTTGCTGATATT
ATTGCAAAGACACCAAAAGCACTTCAAAAATCAAGCGATATTACAGGGGG
TCTTCCTCGTGTAAGTGAACTTTTTGAAGGTCGTCGTCCAAAAGCAACAG
CACTGATTTCTGAGATAGATGGTGTTGTATCATTTGGAAAATCTCTAAGA
GGTAAAATTAGAATCATAGTTGCTTCTGATAATGGAATATTAAAAGAGTA
TTTTGTTGATAAATCACACACTCCAGTTGTAAATAGCGGTGACTTTGTGC
ACGCTGGTGAGAGATTAACATCTGGTATTATCTCTTCACATGAGCTATTA
CGCATTATGGGTGTGAAAACACTTTATAACTACCTAGTAAGTGAAGTACA
GCAAGTTTACCGTTCTCAAGGTGTTAATATTTCAGATAAGCATATTGAAG
TTATATTTACACAGATGTTAAGACAGGTTAAAATTCTTAAATCTGGCGAT
ACTAAGTTTATAGAAGGTGATTTAATCTCTAAAGTTAAGTTTGCGCAAGA
GAATGAAAAAATTATAAAACTTGGCGGTCGTCCAGCTATTGCTGAGCCAT
TCTTGGTTGGTATTACAAGAGCCGCTGTATCAGCTGATAGTATTATCTCT
GCTGCATCTTTCCAAGATACTACAAAAGTATTAACAGAAGCTGCAGTTAG
TGCTAAAGTTGATGATTTAAATGATTTAAAAGAGAACGTAATTATTGGTC
GTACTATTCCTGTTGGAACTGGTATATATAAAGATCAAGAGATTATGTTT
GGATACAATTAA
>Tmden_0234 transcriptional regulator, XRE family
ATGCATATTTTGAATGATTTGACTCCAGCAGAACTAGAAAATTTCTATCG
AGATATTGGGAAAAATGTCAAAAATGCAAGAAAAGAAAAAAAGATTTCTC
AAATGCAGTTGGCTCTAGCCATAGGTCATAATTCTGTTGGACACATTGCA
AAAGCCGAGCTCTACAAATATGAGAAACATTTTAGTTTAGAGCAACTTTT
TAAAATATCTCGTATTTTAGACATATCTTTGCATGATTTAATACCGGAAT
AG
>Tmden_0025 DEAD/DEAH box helicase-like
ATGTCATTTACAACACTAGGTTTATCAGCTCCTATACTAAAAGCTATCAA
AGATCAGGGCTACACTAAGCCAACTCCAATCCAAAAACAAGCTATTCCAA
TTATCCTTAGTAAAAAAGATATTTTAGCAGGAGCACAGACGGGAACAGGT
AAAACAGCTGGCTTTACGCTTCCACTTCTTGAGCTTTTAAGCAGAGATAA
ATCATCTACTAAAAAGAGAATCCGAGCTCTTATTTTAACCCCAACACGAG
AGTTGGCGGCGCAAGTTGGAGAGAGTGTTTCTATTTATGGAAAATATCTC
TCTTTTACTTCAACTATTATTTACGGTGGAGTAAGTATAAACCCTCAGTT
AAGCGCTCTACGAAAAGGTGTTGATATAGTTATCGCAACTCCTGGAAGAT
TACTTGACCATCTCTCTCAAAAAAGCATAGATTTAAAGGATGTTGAGTTT
TTGGTGCTTGATGAAGCAGATAGAATGCTTGATATGGGCTTTATAAATGA
TATAAAAAAAGTTTTGGCTGTTCTTCCAAAAAATAAACAGACACTTCTTT
TTTCAGCTACATATTCAGATGAGATTAAAAAGCTCTCAGATCGTCTCTTA
AATTCACCAGTTCTTATAGAAGTTGAACGTCCAAACAAAACAGCACAAAG
CATAAAGCAGATAGTTTATCCAGTTGATAAAGAGCGTAAGCGTGAACTTT
TGGTTCATCTTATAAAAGAGGGAAAATGGCAACAAGTCCTTGTCTTTACA
AGAACGAAACATGGAGCAAATAAATTAAGTGCGCAACTTGAAAAAGATGG
TATAAGCTCAAGCGCTATACATGGAAACAAGAGCCAAAATGCGAGAATGA
AGGCTCTGCAAGAGTTTAAAGATGGCGATATAAGAGTTCTTGTTGCAACA
GATATAGCAGCAAGAGGGATAGATATAGATCAACTTCCACATGTAATAAA
CTATGAACTTCCGAATGTGCCAGAGGATTATGTTCACAGAATAGGCAGAA
CAGGGCGTGCTGGAAGCAGTGGAGATGCGATATCTCTTGTTTGTATAGAT
GAGCATGAATATCTATCAAGCATAGAAAAACTTATAAAAACTGATATTCA
AAAAGTTTGGTTAAAAGATTTTAAACCAGATCCAAGCATTAAAGCTGAGC
CTATAAATCAGGGCGGTCAAAGAGGTTCGCATAAGAAAAGAAGATAA
>Tmden_0258 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAGAGTTTTACTATTAGAAGATGAGTTCTCGCTAAGAATAAGTATAAA
AGAGTTTTTAGAAGATATAGATTACAGCGTTGATGATTTTGCTGATGGGC
TTGAGGCTCATGATGCTATATATGCAAAATCTTACGATTTGCTACTTCTA
GATATAAATGTACCATCCATGAGTGGTTTTGAACTTTTACAAAGTATCCG
AAAAGATGGAATTAAAATTCCAGCCATATTTTTAACTTCTATGACAGAGC
TTCAAGGTTTAAAAGAGGGTTATAGAAAAGGGTGTTGTGATTACATACGC
AAACCATTTGACCTCTTAGAGTTAGAGCTTAGAATAAAACAAGCCATAAG
AAGTTACTATCTTGATAATAGCGATATGGTAGAGCTTGGCGAGGGTTTTG
TGTATGACATGTTAAAGGGAAAACTAACTAAAGATGATAAAGAGATAGTT
TTAAGAAAGATAGAAAAAGATCTCTTAGAGATGCTTATAAAAAATAAAAA
CAGTGTTGTCTCTATGCAGATGTTTCAAGATGAAGTTTGGGGAGATTATG
TAGAGCCCTCAGCTATCCGTGTTCAGATAAATAACTTAAAACAGAAGCTC
TCAGAGACAATCATACATAACAGAAGAGGCTTAGGATATATAATTGAGAG
ATAA
>Tmden_0888 putative transcriptional acitvator, Baf
ATGCTTCTTTGTGATATTGGAAATACAACTTATCATTTTTTTGATGAAAA
CTCATCATACAAAGAGGATGCAAAACTCTTTAATCCATCATCCATAAAGA
GAGAAGTTTTTTATATATGTGTAAATTCCAGTGTAAAAGAGCGCCTATCT
TTGCTAGATAATTGGATTGATTTATCGCTACATGTAGATATGAGCAGATA
CTATAAAACAATGGGAATAGATAGAATTATGGCTTGTGAAGCGATAGAGA
GTGGCGTGGTTGTAGATGCGGGCAGTGCTATTACTGTAGATATCATAAAA
AATGGAAACTTTGAGGGCGGTTTTATATATGCTGGAGTTAAAGCCATGAA
TGAGTGTTATAAAAATATCTCCGCTCAACTTGAGTACTCATTTAACTTTG
AGCTTGATTTGGATAAAATGCCGAAAAATTCTCGTGATGCCATAAGTTAT
GGATACCTTGGGCTTCTTTATAAAGAGGTTGCCTCTTATGGTATGAAAAT
ATATCTTACAGGCGGAGATGCAGGGCAGTTTAGTAAACTTTTTTTAAACT
CAGATGTAGATGAGTTACTGCTTTTTAAGGGGATGAAAAATATTATGAAA
AAGGCGAATTTATGCTAA
>Tmden_0937 hypothetical protein
ATGACAACATTGAGCACAAAAAAGCAAGTTGCAAAATTTTTGGGTGTATC
TACATCAACAGTATCAAAATATATCGAAGATGGTCGTTTCACAGAGGAGA
TAGACTATTTTTATAACCATGATGGTAAAGAGGAGTTTATCCCAGAGGGA
ATTATAAAATTCAAGCAAGAGTTGAAGCACCGTAAATATGAGGTTAAAAA
AGTAGAAAAAACTTTAAATCCAATTGCCTCAAAATTTTTGAATAATCGAA
AGGTTGTTTCAAATGGCTAA
>Tmden_0546 GreA/GreB family elongation factor
ATGCAAGAGCCAATGAGCATAGAGGGATATGATGTCCTAATAGAAGAGTT
TAAATTTTTGCTTGAAGTTGAAAAGCCGAAGACAGCGCAAGAAAAGCTTG
TTGCTGCGGCACTAGGAGACAGAAGTGAAAATGCAGATTATCAAGCAGCA
AAAGAGAAGTTAAGACATATAGACAAGAGATTGTTTTATTTAAATGCAAT
GATACAAAAAGCCCATATAATAGACCCCTCAACACTCTTACATACAAAAG
TTAGTTTTGGAAGCAGTGTTCGGATCTTAGATTTAGAGAGTGATAAAGAG
GAAGTCTATACAATCTGTGGAGTCTTAGAATCAGAGCCAGAAAATGGTCT
CATTAGCATACACTCTCCATTAGCACAAGTCATGCTTGGAAAGAGAGTTT
CTGATGAGTTTAAAATCCAGCTTCCTCTTATGAAAAAAGAGTATGAAATC
TTAGAAATTTACTATAAAAATATCTTTTCTCTCAAGAAAAATGTTCGCAA
AAAGTCCGATTTTGCTTTTCATTAA
>Tmden_2024 Ribonuclease III
ATGAGTAAAAACATAGAGGCATTAGAAGAGATTTTGGGATATAAGTTTAA
AAACCAGAAGCTCATTATCGAAGCGCTGACACATAAGAGTCACAAACAGC
CCTACGATAATGAGCGACTAGAATTTTTAGGTGACGCTGTTTTGGATTTG
ATAGTAGGAGAGTATCTTTTTTTTAAATTTGCATCTTCTGATGAGGGAAC
ACTCTCGAAGATAAGAGCTGCTCTTGTAAATGAAGATGGCTTTGAGAGAC
TGGCTAGATCTATTAATTTAGGTGAGTATATCTACCTCTCAAACGCAGAA
GAGAATAATGGCGGAAGAGAGAAAGCATCACTTTTATCAAACGCTTTTGA
GGCTATGATTGGAGCCATATATCTTGAATCAGGACTTGATATTGTAAAAC
CTATAGCCATAGGGATAATTGAGAGGAACTATCAGGAGATTTCACTAGAC
TCTCTCTTTAGAGATTATAAAACAACTCTTCAAGAGCTAACACAAGCTAG
ATTTGGTGAGACTCCAGAATATATAGTAGTTGCAAGCCGTGGACCTGATC
ATAAAAAAGAGTTTGAAGTTGCGGTAATTATTGAGGGCAAAGAGTACGCA
AGAGCCATTGGTAAGAGCAAAAAAATAGCTCAACAAGAAGCCGCAGAGAT
GGCGGTGAAGATACTAAAGGGAGATGTGTAG
>Tmden_1146 Superfamily II DNA and RNA helicases-like
ATGAGCGAAAAAAGCATTAAAACAACTAAAAAATATTATGACTATGTGAG
TGTTGGTAACCGAACTGCGCAAATGGCATATTTTGTACAACAACATGACA
AAAACAGAATGTTTGAAGAGTTACTAAAAACTCTACAAAACATGCAAATT
ATTGTTCTTGTAAAGAGTAAGCGAAATGCTGATGAGATCATGAGATATCT
AAATACCAAAGAAATCAAATCTATATCAGTTCATGGAAACCACAGAGTTG
CTCAAATAGAAGATGCACAAAAATCGTTTAATTCTAAAGAGACAAAAATA
TTAATAACTACAGATAGAATCTTGGAAAAACTAACACCTATGGAAGTACA
TGTAGTTGTAAATTATGACCTTCCACTAGAGGCATCTGATTACTTTAAAG
CTCTGCTTTTAGTTGATGAAATTGGTCAATCAATATCACTAATAGACCCA
GAAGATGAGGGAATGCTAGCTACAATTGAGCTAATGATGAAGTGTGAAAT
GGCTGAAGTTGAGATGAAACATTTTGAGCATACAGCCCGTGAAACAACAA
CTCCAAAAGAGAGAATAAACAAACCTCGTCACAAAAAAGTAGAGCAACGA
GCAAAGAAAAAGGCTGAAATAAAGTCTAAATGGGTGCCAAGCAAATAA
>Tmden_1767 DEAD/DEAH box helicase-like
ATGCAAGAAAATGCACAAACACAGACAGAAGAAAAGTTGATCACATTTGA
TGATTTAGGTTTAAAAAAAGAGATACTTCGCAGTGTCAAAGATGCTGGAT
TTACAGTTCCAAGTCCTATTCAAGCAGCGGCAATTCCGTTTATATTAGCG
GGGCGTGACATAGTTGGTCAAGCTCATACAGGAACAGGTAAAACAGCGGC
ATTTGGTCTTCCAGCACTTAACAATATCAACCCTAATGATGGTGTTGGCA
TACTAGTTATCACTCCAACGCGTGAACTAGCGACTCAGGTAAGTGATGAA
CTTTTCAAATATGGCAGAAACATAGGCGCTAGAACTGTAACAGTTTATGG
CGGAAGCTCTTATAACAGACAAATTGACTTAATCCAAAGAGGTGCAAGTG
TTGTTGTCGCAACTCCAGGAAGACTCTTGGACATACTCAAAAAGAACCTT
TTAAAAGATTTTGCTCCTAGCATAGTTGTTCTTGATGAAGCTGATGAGAT
GCTAGATATGGGCTTTTTAGATGATATTAATGAGATTTTCTCATACTTAC
CATCAAATCGTCAAACACTTCTATTCTCAGCTACTATGCCAAAGCCAATC
AAGCTTCTTGCTGAGAGAATCTTAGATAATCCTGAATTTATAAGTATCAC
AAAAGGTGAAACTACAAATACAGATATAAACCAAGAGTACTATGTAATTG
AAGAGAGTGAGAGAGATGACGCTATTATCCGTTTGATGGACGCTGAAGCT
TGTCAAAAGTCTATTGTATTTTGTAGAACAAAAAGCGAAGTAGATAGACT
ATCAAATGTTTTATCAAGCGCTGGATATTTAGCAAATGGTTTACATGGAG
ATATGGAACAACGCCAACGTGAAACAGTGATTAAAGGTTTTAAAAACAAT
GGTGTTAAAGTTTTAGTTGCAACAGACGTGGCAGCTCGTGGAATACATGT
AGATAATATTTCACATGTATTTAACTACCATATTCCTTTTGATCCTGAAT
CTTATGTTCATAGAATTGGGCGAACAGGACGTGCTGGAACTAAAGGTAAA
GCAATTACGCTTTTAACTCCTCTTGAGTTTAAAGAACTTCAACGTATTAA
AACTAAAGTTGGAACTACTATGACTCACGCCTTTGTTCCAAGTAAAAATG
ATTTGCGCGCAATTAACCTAAAATCAATAGCTACTTCAATTGAAGAGCAT
AACATTTATGATGAGGCACATCAGATTTTAGATATGTTAAAAGAGGATAT
TGATGAGCCGACTATCATGTTTAAACTTGTATCTATGATTTTAGATAGAC
AGGCAATTCAAGGACCAAATAGCATAGGAATTCCTGCTGAGAAACTAGCA
GCTATCTTAGAACGTGCTGATAAGAGAAGAGATTCTAAAGGTGGACGTGG
AAACTTCCGTGGAAACAGAAGCGCTCGCCCAAGTGGCGATAGAAATCGCT
CTGGAAGTGGAGATAGAAACCGCTCTTCAAGCAGTAGTGATAGACCTCGC
TCAAGTGAGGGTGGCGACAGAAATGCTCGCCCAAGTGGCGGTGGTTACCG
TGGAACTTCAAGCACAGGTGAGAGAAGCCGCCCAAGCGGTGATAGAAATC
GCACAAGCAGAAGCAGAGACTAA
>Tmden_0242 HipA-like-like
ATGAAACTTAATCAAACTGAAGAGATTATTCTAAATATTGTTACGAAAGA
GCAAGAAATAGTTGCTTCTGTGCTTATTGCAATAACTCAGATGAATCCTA
GAACTGTTCAAAGAGCTCTAAAAAAATTAGCAGAGTATGGACTTATTGAA
GCATTAGGCACGACAAAGGACAGACGCTATAAACGAATCTACAATAAGGA
TGAAGCACCACACCAATATATAGTCTTTAACAGTGGCGAAAAATCCGGAA
AACTCTCTTTTGGAAATGGAGAATATACTTTTGTATATGAGAACAACTAT
AAAGGTGAAGAGTTTGAAGGTTTAAAAAAAAGTTCTACCAACAAAAGTTC
AGAGTTGTTTGCATTTTTTGAAAACCTTATTCCAGAGTACGAACGAAGGG
AAAAGCTTTTACAAGGCAAAGAGGATTTAGGACTAGTTTTAGAAGAGTTA
AGCAACTCTCATGGTGCTTTGGATTTTATACCAATGAGTGAAGTACATAA
GTATGTATCTAACTACGGAAAAAGAGCAAGTTGGGTAAGTGTAAAAAATG
AAATACTACAAGATAATAATTTTCCAAATTTACTAGACTTTGAACTGCTA
ATTGATGATGATATCCTTGATGCCGAGTCAAATACGGAACATTCCGATTT
AAGTGGCTTTCAAACAAAAATAGATGTAGAAATTGATTTTAAAAACAAAC
AGATAAAAGAGTCTGATAGTGCAGAATATCTGTTAAAGCCACGCAATAAA
AAGAAACACAACTATTTTCATGTAGATGATGATGGGAAAAAGAGACATTT
TCCATATATTGCGTTTAATGAGCATTTATTTATGAGCTTTGCAAAGAACG
AGCTTGGTTTCAATGTACCATACACAGCTATTATAAAAGCAAAGGATATT
GACTACCACTATATAACAAAAAGATATGACCGCTATAAGGGGTTGAAGTA
TCCCCAAAAAGATTTTGCGCAGGTGTTAAATATACTGAGTAAAAATAAAT
ATAAAAGTGATAGTCAAACTCTATTTGAAGCAATTAATAAAACATTGATG
AACAAAGAGCAAAAGCTAGAAGCACTCCGTTTTTATTATTACAGCTACCT
AATTAAACATGCGGATTTACACCTCAAAAATATAGCTGCACTTAATATCG
GAAATAACAAGTATATTCTTTCACCTCTATATGATCTCATCTCTATAGGA
ATTTATAACGGTGATGCTTACGATATAGGCTTAGGTATGAAAAGCCCCTA
TAAAAAACCAAAAAACTGGAATATAAATGATTTTTACACTCTTGGCTCTG
CTATAGGTATTGCACCTATAGCTTTTAAAAAAGAGGCACGCAAAATAACT
AAGATATTTCTTCAAAAAATGCCCCAATACATCAAAAAAGTGCAAGAATT
TGAAAAAATACACCCTTTACCAATGCAACAGACTAGAGATTCTAAAAGTA
GTGCTACATTCTCAAAACGTTTAACAAGCATGTTTGAAAATAAAATCATA
CAACTTAAGAAAAGTGGAATTATTCAAGAACTAGAGTTAGTTCAAGAAGC
AGGTGGGTTACTCAATGCAGAAAAAAATTGA
>Tmden_0610 DEAD/DEAH box helicase-like
ATGTCATTTGAAAAATTAGGAGTTATAAAACCACTTCTTAGCGCTATAAA
AGATTTAGGCTATGAAAAACCTACAACTATACAAACAAGAGCAATTCCTC
TTATTTTGGCAAAAAGTGATGTCTTTGCAACAGCTCAAACAGGGACTGGT
AAAACCGCCGCTTTTGGTCTAGGGATGCTTCAAAGACTTAGAAAAACTTC
TGATGATAAACAGAGAGCTTTAAGAGGTCTTGTAATAGCGCCAACACGTG
AACTCTCTATCCAAATTTATGAAGATTTACAAAGTTATGCAAAAAATATG
GGCATAAATATTGCAGTTTTAGTAGGTGGAAAAGATTTAGAGAGTCAACA
AAAAATCTTAAAAGAGGGCGTTGATATAGTCATAGCAACACCAGGGCGAG
TGCTAGAGCATGTTGATAAAGGCTTGAGTTTGTCACATGTAGAGATTTTT
GTTCTTGATGAAGCTGATAGAATGCTAGATATGGGGTTTATGAAAGAGAT
TAGACGTATTCATCCGATTTTGCCAAAGAGACATCAAACACTTCTCTTCT
CAGCAACATTTAGTGACAAGGTAAGAAAACTCTCAAAACTCATACTAACA
AAGCCAGCATTTATAGAGACATCAAAAAAGAACTCTACTGTTGATACAAT
CAATCAAGTAGCTTATCTTGTAGATACCGAGAAAAAAGCCCCACTTTTAG
CATATATAATTGGCTCAAGAAATTTTAGACAAGTTTTAGTTTTCACAAGA
ACAAAAGCAAGTGCGGATCTTTTGGTAGTTGAGCTTAAAAAAGATGGACT
GAAGTGTGGAATAATTCATGGAGATAAAACTCAAGCAAACCGCTTAAAAA
CTTTAAATGAGTTTAAAGAGGGGAAAATCAAAGTTTTAGTTGCCACCGAT
ATCGCTTCAAGAGGTTTAGATATAGAGGAATTACCATTTGTCATAAACTA
TGAACTCCCATCAATTCCAGAGGATTATGTCCATAGAGTAGGGCGAACAG
GGCGTGCTGGGCGTGATGGAATGGCTATTAGTTTGATAGATATTTATGAG
AAATTTGATATAAAAGATATAGAAAAACTAATCGGGATGAAAATTCCACA
AGAAATTATTGCTGGATTTGAGCCAGATCCAACAATTCGCAGACTTGATC
AAGATGAACTAAAACTCAAAAGCGAACATAAAAAAGTAGAAGTAAAGCAT
GAGAGAAAACCTCGTAAAAAAGAGGATGGCTCTAAAAAAAGTGCTAATTA
TAAAAAGCCAGTTACGACTAAAAAAAGAAAAACGTCAAAACGTGATTAA
>Tmden_1858 transcriptional regulator, MerR family
ATGAAATACAAAGTATCTCAAATAGTAAAACTTACTCAAACTCCAAAATC
AACAATTTTATACTACATAAGAGAAGGGTTACTTCCAGAGGCAAAAAAAC
TAAAATCAAACGTTCATAGATACTCAGATATACATGTAGAGATTTTAGAG
TATATACGCTACATGAAGCAAGAGATGGGGAGCTCTAACGAAGAGCTCAA
AACAATGCTAAAAAATAAAAACAGCTCTTTATCCAGCTCTTTTTCGATGA
TAGCACCCATGATGCAGACACTAGAAAATATCCCAAAAAATGCAAAACAC
TACACAAAAGAGGAGTTTTTAAATGAGTATAATATTGAGAGAGAGTTTTT
AGAAGAGCTATTAAAAGATGATATTTTAATGCCTCTAGGGAGTGATGACT
TTACGCAAAAAGAGGCTTCTCTAATCAAGCTTGTAAAAAACTTTCAAGAG
ATGGGAGTTGAGCATAACATCCTAAGCGAGTATGTTGCTCACGCAAAAGC
TTTAGCAGAACTTGAATACAAAATGCAGAAAAATTTATGTGCAATTAGAG
ATGATGATAACTTTCAAACTCTATGGAAAATCATGTTTGAGACACTCTTT
GGTGCAAAAGAGTACATACATAAGCGCTCAACACATAAAGTTTTATATAA
GGCTCTCAAAGAGGAGATTTCAAAAAAGTAA
>Tmden_0225 hypothetical protein
ATGGCACAAAAATCATATGACAAAGCACTCTTTAGACTTATCTCCATACT
CTCTATGCTCACTAAAGATGAGAGACCGACTATCTCATCTTTGGCAGAGG
AGTTTAATGTTTCTAAAAGAACTATTCAGACAGATATTTATCAAAGACTC
CGTGGCTGGGATATTACCAAAGATAAATTTGGGAGGCTTGTTTTTAGGGA
TGGGGTTGATATATTTAATGCTATAGGAAAGTTTGGGAGGAAAGGTAAGC
GAGTAGTGTTTTAA
>Tmden_0814 hypothetical protein
ATGCATTCTTTAGTATTAAAAGTAGATGATGGGTTTTACACTCAGTTGTT
GTCTTTTTTAAATCAGAATAAGCGGCAAGTAAATATACTTGAAGATATAG
AAGATGATGGGTTTCCTGCTATTAGCACTGATGAAGCTAAACAAAGAGTA
TCTTCAGCAGTAGAAGAGTACAGAAGCGGTAATATGAAAACAGTACCTTA
CTCTCAAGGTATGGATGAAATCGATAAGTGGGTGAATAACCTCTAA
>Tmden_0947 putative transcriptional regulator
ATGAAACTACAAATTAACGAATCACAAAACATAGAGTTTAAACAAACTTG
GAGAGATGAGTATATCAAATGGCTTAGTGCATTTGGCAATACTGACGGTG
GGAAGCTATATATCGGTGTGGATGATGATGGCGGAATCAAAGGCATCGAC
AATGCCAAAAAACTACTTGAAGATATACCAAACAAAGTACGAGATATCTT
AGGCATCATGGTAGATGTCAATCTTTTGCAAGATGAAGATAAAGAGTACA
TTGAAATTATCACTGATAAATACCCATATCCTATAAGCTATAAAGGTTCA
TATTACTACAGAAGTGGAAGCACAACACAAGAGCTAAAAGGTGTTGCACT
TGATAAGTTTTTACTTAGAACACAAGGCAAAACTTGGGATAGTGTGCCAG
TACCTTATTTTGGAGATACAGATTTAGACCCTTATGCTTTTAAACTTTTT
AGAGACAAAGCCTCTAAAAAGAAGAGAATAGATCCTGAACTTTTAAAAGA
GAGTGATGATGTTTTAGTAGATAAATTGAGACTGCGAGAGGGTGATTATC
TCAAGCGAGCGACTGCACTACTTTTTGCAAAAGAGCCTATGAAATATGTC
ATGGGGAGTATGATCAAGATAGGATACTTTAAATCAAACACTGATTTAGT
CTATCAAGATGTGATAGAGGGTAATCTTTTTGAGCAAGTAGATAAAGCTA
TTGAACTAATCTTTACAAAATATCTCAGTGCTTTTATAACTTATGAAGGT
ATTCAAAGGGTGGAGAGCTTTCCTATTTCAGAATTAGCATTTAGAGAAGC
TCTTATCAATGCAGTTGTTCATAAAGATTATAGTTCACAAAACAGCATCC
AAATAAGTGTATATGATGATAAGCTTCTCATGTGGAATGCAGGAGATTTA
CCGCCACACTGGACTATAGATACACTTTTGCGAAAACATACATCCGAGCC
ACATAATCCTCTAGTTGCTTATCCTTTTTTCTTAGCTGGTTATATAGAGT
CTTGGGGAAGAGGAATAGAAAAAATCATAGAAGAATCACAAAAGTTTAAT
GGCATTACTCCACAATTTAGATGGGAAAATGGTTTGTGGGTGGAATTTTA
TTTTAATAATACCCCTAATAAAATAGAAAATACTGAAACTAGGGTAAAAG
CTAGGGTAAAAACTAGGGAGAAAATTTTGGAGCTTATTAGTGTGAATCCA
AATATTACCAATCAAGAGTTGGCAGATACACTAGAACTTACTGTTAAAGG
TATTGAGTGGCAAATTAAAAAACTAAAAGAAGATGGTAAGCTTGAAAGAA
TTGGCGGTGCGAAAGGCGGACATTGGGAGATTTTAAAATGA
>Tmden_0935 transcriptional regulator, LytR/AlgR family
GTGAAAATATTAATCGTTGATGATGAAGAGTTAGCTAGAAAAAGGTTGAT
TCGTATGCTTTTAACTCTGAAATATACAGAGGTACAAGAGGCTTGGGATG
CAGATGAAGCTAGAGAGATTTTTAAGAAAGATAGCTTTGATATAGTTTTT
TTAGATATAAATATGCCTCGTGTAAGTGGCATAGAGTTAGGTTATGAGTT
GAAATATTTGAACCCAGATGTTGGCATAATATTTCAAACAGCCTACGAGG
AGCATGCTCTGAAGGCTTTTGATATTGGTGCGGTTGCCTATCTTGTTAAA
CCTTATAGCATCGAGCAGCTGCAAGGCTCTATTAGACGCATAAAAGCTCC
TTTAATCCAAAAGAGAGAGTTTAAAATTTTAAGTAAATTTGGAGATAGCT
ATCTGCTTTTAAAGCCTCAAGAGATTTATTATGTCAAAGCTGATTTATCT
GAGGTAATGTTGCGAACTAGCAAGGGGTTTTCTTATTATGGAGAAAAGAT
TTCTAATCTACATGTAAAGCTGGAGAGTTTTGGTTTTATTCAGATTCACC
GTTCATATCTTATAAACAGCAATGAAATCAAAGATATACAAACCATAGAG
CAGAGCAAACTGCGTTTTTCATTTAAAAATAGCTCTGATACCATAGAGTC
TAGTAAAGATGGAGCAAAAGCTTTTAGAGAAAAATTTGCCTTTTTATAG
>Tmden_1504 cold-shock DNA-binding domain protein
ATGGCAGAATTGCTAGACGGATCAGTTAAATGGTTCAATGAAGAAAAAGG
TTATGGTTTCATTCAACAAGAAAATGGCGGTAAAGACGTATTTGTACACT
TTCGCCAAGTAAACAGAACAGGACCAGGTCGTGTTTCATTATCTGAAGGT
CAAAAGGTAACTTTTGAACTAGGAGAAGGTCAAAAAGGTCCTCAAGCTGA
GAATGTAACTCCTTTATAG
>Tmden_0024 hypothetical protein
ATGTCAAACTATGAAATCACCATAAAACACAATAAACATCGTATCCATCC
TTGTCCTAATGATAAAAAACTATCTCTTCTTGCACTTCTTCTAGAACAAA
ACAGCACTTTAAATATTTTAGTTGCTTCTTCGCAAGATAGGGAGCTTATA
AAAGAGGTAGCGGGGGCAAAAAACGTTACCGTTGCCCTTGATGATGAGTT
AACAAAAGCAGCAGATTTGATGTGTGATCTTCTTATAAGTTATGATTTAC
CCTCAGCTGAGATTTACATGTCAAGACTCCGAAGAGCAAAAGAGGGTGCA
ATAATACTTCTTGATATAAGTGAACAGAAAAATCTCTACCCAATTGAGAC
AATTCTTAAGAGAGTCATTAGACAAGACACCGTTTTAGGCTATGAGTATG
CGCCTCAAGAAAAGATGAAAATAGCTCAAAAATCCCTGCAAAAAGAAAAA
GGTGTTTACGCATTTGACCCAGATGCTCCACAGAAGCCTCTTTATAGTAA
AAAACAAACAGAATATAAAAAAACATTTGACAAGCCAAAGTATGATAAGT
CCAACTGGGATAAGCCAAAAAGAGATAATGAGGGTTCAGAGCGAAAACCA
TTTGAAAAACCAAAGTATGATAAACCTAAAACAGATGGCCAAAGAGCTGA
GCGTAAACCATTTGATAAACCTAAATGGGATAAACCTAAGTTTGATAAAA
CAAAAAATGATACTCAAGGCCCTGAGCACAAACCTTTTGATAAACCCAAA
TGGGATAAGCCAACAAGAGATGGCGAAAAGTCTGAGCGTAAGCCATTTGA
CAAGCCTAAATATGATGGTGAAAAGAAATATGATAAATCAGGCAAAAAGT
CAAATAAATTTTTAGGTAAAGACGATAGTGGCAAATCAAAATTCTCTGGC
AAAAGTGGTGAGAGAAATCATAAATATGATGGAAAGCCCAAGGAAAGCAT
TGAAGCACCAAAAAATGTAGGAAGAAAGATATCTATAAAAGAGCGAAAGC
CAAAAGATGCACCTAGCTCTTAA
>Tmden_0315 transcriptional regulator, ArsR family
ATGGATGTTTTTTTAAAAACTATTGGCGCAGTAAATGATTACACTAGAGT
TGAGATTCTTCATTATATAAATCAAAGTGGTGAAGTATGTGTCTGTGATA
TAGAAAATTCATTTTCAATGATTCAATCTCGTATATCAAGACATCTAAAA
ATTTTAAAAGATGCAGGATTTTTAAAGGTTGACAGACGTGGCAGATGGGC
TTTTTACAGTATTGTAGAACCTATGGATGAGTTTAGAGCATCAATTTTAA
AAGAGATTAACTCTCTAGGCATAAATATATCATTACAAAAAAAAGGATGC
AATCTTGAATAA
>Tmden_0208 response regulator receiver domain protein (CheY-like)
ATGTCTAGTGATGTTGATACTTCCTTATTAGACTGCCTTAGCTCTTTAAC
ACTTCTTTGTGTTGAAGACAACAAAACTACTCAGCTAATATATCACTCCA
TTTTTAAAAATATTACAAAGCGTGTCATTTTTGCAGATAATGGCAAAGAT
GGATTTGAAATATTTAAAACGCAAAAGATTGACATAATCATTACAGATTA
TGAGATGCCAAATTTAAATGGCATAGAGATGACAAAACTCATAAGAGAGC
TAGACAAAGATATCCCAATAATTCTTGTATCTGCGGTGCAAGAGATTGAT
ATTATCGTAGAAGCTCTTAAATTAAATGTAAATAATTTTTTAAAAAAACC
AATTATTCTTACAGAAGTTATTCAAGCTGTTGAAAAAGTCTCTAAAATAC
TTATAGCCGATAACTATCTACGTGAGAAAAGAGAAAAAAAATTAAAAGAG
CTTGAGACAAAAGGTAAATATAACTCTCTGCAAGAAGAGTTGGCATTTGC
CAAAGAACTAAATATTATCAGAAATGATTTTTACTACCAGATGCATGAAA
ACAGCTCCATTGCGCTTATTGATTTTTTCTATAAACCTCTTGATGTATTA
AGCGGAGACTCATACAGCGCAAGAGAGATAGATAAAAATATGCAACTCTA
TTTTATAATTGATGGAATGGGCAAAGGTCTCTCTGCCTCTTTAAGCTCAA
TGCTTTTAACTTCTTACTTAAATCATCTCATAGATAAGAGAGTTAATAAT
TTTGACTTCAAGAGCCTCATAAATAGTGCTGTTGAATATATAAAGCCTGT
TCTTCTTGAAGATGAAGCGATGTCAGCTGATTTTATGTTAATAGATTATA
AAAACTCAAAGTTGCACTATGCAAAATTTGCAATGCCCTCTTCTCTTCTG
CAAACAACTAATGGCAAGATAGTTAAAATCAAATCAAATAATGCCCCACT
TAGTAAATATATAAAAAAAATAAAAATATCATCATTTAATATCTCAAATA
TACTTAAATTTCTTTTTTACAGCGATGGAGTTGTTGAAAATAGTATTAGA
GAGAAAGATAAAACTTATGCAAATTATTTGCAAAGCGATTTTCTAGCCTC
TTTCACAAAAGATGAGTTAAGAGAAAAAATCCTTTGGAGGATAGATAAGC
AAGAAGATGATATGACTTTCATCTTTATAAATAGATTTAATCTGATGAAA
TATATCTCTAATGTTCAAAATGTTTTTGATACTTCTTTAGATGCAATAGA
GAAGGCAAATGAGTGGTATGGAGATTTTTGGAGCTGTACTAGCAGTGATT
ATAAGCTTATCTATAATGCTGGTGTCGTCTTTAATGAGCTGTTTATGAAT
GCTTATGAACATGGCAATCTTGGGCTTGATGCTCAGATGAAACATAAGCT
TATAAACGATGACAACTATTTTGCGACCTTAGAGAAGCTAGAGAAAACCT
GCAATAAAAAAATATCAGTATGTATAAATATTATTGAGTACAACTCAAAC
AAATATGTTACTACAGCCATAAGAGATGAGGGTGCTGGATTTGATACTCA
AATTCTTAGCGACATATTTAGAAATAGAAAAAATTTTAATGGAAGAGGTG
TTTATATTTCCAGACAAGCATCGCTTGGAATTTACTACAATACAAAAGGT
ACTAGTGTGCTGTTTTTACATAAACTTGAGAGTGAAAAAGCATAG
>Tmden_1409 ParB-like partition protein
ATGAAGACACAAAGATTAGGCAGAGGATTGGGTGAACTTTTAGGTGAAAT
TGATGAAGCTTATGAAAATGAGGTTCCTCAAAAGGACTCAATTGTAGAAA
TCCCTCTTAAAGATATAAGACCAAATCCATATCAACCAAGAAAACACTTT
GAAGAGAGTTCACTTTTTGAACTTGGAGAGTCTATAAAAAATGATGGACT
TATCCAACCAATTATAGTAACTGAAGATGTTGATGGCTATGTTTTAATTG
CTGGAGAGAGAAGACTTCGTGCATCAAAATTGGCAAAATTAAAAACAATT
CGTGCGATTGTTTTAAACAGTGATGAACAGAAGATGAGACAGTTTGCACT
TATTGAAAATATTCAAAGAGATGAGCTTAACTCTATTGAACTCGCACATG
CATATGGTGAACTTATTAAACTTCACAACATTACACAAGAAGAGCTATCT
ACAAAAATACATAAAAGTAGAACGCACATTACAAATACCATCAGACTTCT
GCAACTTTCGCAAAAAACTCAAAGAGCTCTTATTGAGAAAAAAATCACAA
CAGGCCACGCAAAAGTTTTAGTTGGACTTGATGAAAAGCAGCAGCAACTT
ATCGTAAACTCTATTATTGGACAAAAACTAAGTGTTAGAGAAGTTGAAAC
GGTTATTAAGAGTATGAAAAATAATAATAATGAAACAAAAAAAGAAAGTG
AAGTAACTTTATATGATTTTAAAGCTATAAAAGATAGATTGCTTCAGCTT
GGATTTATAGCAAAAAGTTCAAATAAAAATTTAACAATTGAGTTTAAGAA
CGAACTACAATTGGAGCTATTTCTACAAAACATATCAAAATAA
>Tmden_0436 transcriptional regulator, LysR family
ATGTTAAAAGATTTTGCCAAGTTACAAACCTTTTTAATGGTGATAAAAGA
GAAGAGTTTCTCTAAAGCATCTGCGAAGCTAGGTATCTCTCAACCTGCTG
TAACTCAACAAATAAAATTTATAGAAGATTATCTTGATACAAAAATTGTA
GATAGAAAAAAGAATGGTATTTTACTCACAAAAGAGGGTGAAGAGCTCTT
TAGAATTGCCACAAGACTTGAAAAAGCGATATCTGGTAGCGAAAAAGAGA
TTTTAAAAATAATTAATAAAGATTTTACGTTTGTTATGGGCTCTTCAAAT
GCAATCGGAAACTATATTCTTCCAAACTACCTAAGTGAAATCAAAAACAG
AATAAACAATAATGTTTATATGAACGTCGGTCTTTCTTGTGAAATAATTG
ATCAGCTTGAAGACAAAAAGATAGATGTTGCACTCATTGAATCTCCTGTT
TTTAGAGATGGAATTGTATATAGAGAGTGGGTTTTGGATGAGCTTGTTGT
ATTTTCAAATCAACCTTTAAAAAAACATCTAACCGCTGAGGATTTACTTG
GATTTGATTGGATTTGTAGAGATGAGCACTCTCATACACGCAAACTAACC
AGTGAAGCTTTTGATGAGATGGGTGTTCAGTGCAGTAATTTCCATGTGCT
AGGTATTTTGGGAAGCCCCACTGCTATTAAAGAGTCAATTTTACATGCAG
ATCCAAATTCTGAGAGACCAGTTGTATCAGTTATGTCAAAACATGTTATC
GCTGCTGAATTAGCAGAGGGAAAACTATTTGATGCAAGGTTGAAAAACTA
TAAAATAGAGAGAAATTTCTATATTGCCTATTTAAAAGATAGAAAACATG
ACGCTTTTGTCGATAATGTTGTAAACTATCTTCTTTCTCTAAACAAAGTT
TAA
>Tmden_0675 Protein of unknown function DUF448
ATGGCGAAAAAATTTAACCAGCCTCTTAGGATGTGTGTATCTTGTAGAGT
AAGAGATACTCAGATAAATCTTTTCAGACTTCAGTGCTTAGAATCACAAC
TTAGTCTTTTTAGAGGAAATGGTAGAAGTTTTTATATATGTAAAATTTGC
CTCAAAGATGAAAAAAAAGTATTAAAAGCCTTTATGCGACAGTGTAAAAG
CTCAGATAGAGATAAATTTTCGAACATACTAAAGGAGATCATCACTGATG
ACAGAAAAAGTTAG
>Tmden_0749 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGGAGGGTATTGTTTTGGTAGAATTTAAAAATTTTTGTGTTTTATATGC
AGAAGACGACTTAGAAGTTCAAGCAAATATCTCAAAGATTTTATCTTTGC
TTTTTTTAAAAGTACATGTAGCATCAGATGGAGAAGAGGCACTTGAGCTT
TTTAAAAAAAACAATATTCATATAATTATTACAGATTATGAGATGCCTAG
AGTAGATGGTTATAAATTTATCTTAAAAATAAGAGAGATGTCACAAACAA
TCCCTATAGTAGTTTTAAGCAGTCATACTCAAAAAGAGAAGCTTATGAAC
TGCATTCCCTTAAAATTGATAGAGTATCTTGAAAAACCGATTATTTACGA
AAAACTTTTACAAACTTTAAAAAAGTGTGTAAAAGAGATAAAAAACAGTG
CTGATGTTGAAGTTATGATAGGTGAGGATATTTTTTATAACATTGAATCA
AATCATATTCAAAAAAATGCTAAAACACTCAAACTGACTGCTTTAGAGAT
GAGAGCGTTTGAGTACATGTTTAGCAAAAAAAACATACTTGTATCTAATG
AAGAGTTGGGTTTTTATGTATATGACAGCCATGACTATAGTGTCGGTGCC
ATAAAAAACATCATCTATAGACTCAGAAAGAAACTAGGAAGAGAGTTTAT
GCAAAACCACAAAGATATTGGGTATATCTTAAAGAGTCTCTAA
>Tmden_1924 response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase
ATGAATACTATTACTGTTCTTGCTGTTGATGATGAGCCATTTAACTTAGA
TTTAATAGAATTAGCGTTTATGGATACAGAAAATATGAACCTAATCAAGG
CTATAAACGGGCAAGATGCTTTAGACAAACTTCAACATATAAATGCAAAT
GTTATACTCCTTGACCTTAGAATGCCTGTGATGGATGGCTTTGCAATGCT
AGAAAAAATAAAAAAAGACCCCATCTACTCAAAAATTCCAGTAATTATTG
TGACTGCAAATTCTGAAGAGAAAAACAGAGCCTTAGCGCTTGGCGCAAAT
GATTTTTTAGCAAAACCAGTCGATACAGTAGAGTTAAAACTGCGTACATT
AAACTATACAAAACTACATAAAAGCCAAGTAGCACTTGAAGAGCTAAACA
AAAACCTAGATAAATTAGTTATTCAGAGAACAGCCCAACTGCATGTAGCA
CTCAAACTTGCTCAAGAGACGGAGTATGAAGTATCTCTAAGGCTTGGTAT
GGCTAGTGAGTATAGAGATTTAGAAACAGGTATGCACATCAAGCGAATCA
GCCACTACTCTGCACTGTTAGGAAAACTCTCTGGCATGGACGAGGAGCAG
GAGAGACTACTTCTATACTCTTCTCCACTGCATGATATTGGTAAAATAGG
GATTCCTGATGCAATTTTACTAAAGCATGGAAAGCTCGATGACAAAGAGT
TTAAGCTAATGAAAGAGCATACTACTATCGGCGGATTAATGCTTAAAGAT
GGAGAGAGATACCCTATTATAAAAGCTGGGCAAATTATTGCACAACAGCA
TCATGAAAAATATGATGGTTCTGGTTATCCATTAGGTCTTAAGGGTGAGG
AGATACATATATACGCAAGAATAGTATCAATTGTTGATGTATTTGATGCT
TTATCATCAAAAAGAATTTATAAAGATGCTTTCCCACTAGAGAAGACCAT
AGAGATTATGAAAGATGGAGCTCGAACCCATTTTGACCCAATATTGCTAA
ATCTTTTTATTGATAACTTAGATAAATTTTTAGAGATAAGAGATAGTTTT
ACAGATGTCGATGAAACACCACATTTAATCAACCTAATAGAGGAGTATAG
ATGA
>Tmden_0282 response regulator receiver domain protein (CheY-like)
GTGAAAAATATAGTTATTATAGATGATGAGAGTGATATATTAAATATGCT
AGAGAGACATTTGTCTCGTGATAGTGAGTACAAAGTAAAAACGTTTAGTA
ATCCAATTAATGCTATCGCTTCACTTCCAAAAGATACAGATTTAATACTT
CTTGATATTATGATGCCTCAAATGAACGGTTTAGATGCACTTCCAAAACT
ACTTGAAGTAAATCCAAAAACAAAAGTTCTTATGATGATTGCATACTCAA
CTCTCGATAAAGTGCTCAATGCACACAGATATGGAGCAACTGATTATGTT
ATGAAACCATTTGCGTCACTTGATGTACTTAGCAAAAAAATCAAAGAAGT
TTTGAGAAAAAATTAA
>Tmden_1559 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAGTGCCAAGATTGTGGTTGTAGAGGATGAAGAGGATATTTTAGAACT
TATAGAGTACAACTTGGCAAAAGAGGGGTATGAGGTTATCGGTTTTTTAA
ATACAAAAAATCTTCAACAACTTCTCTATGAAGAGAGGATTGACCTTCTT
TTGATGGATAGAAACTTACCAAATGTCGAGGGGAGTGAATTTATATCTTT
ACTAAGAGAAAAAGGGTTTACTACACCTGTTATTTATCTAAGCGCGAAGA
GCCTTGATTCTGAGATAGAAGAGGGATTTTTAAGAGGTGGTGATGATTAT
ATTACTAAACCTTTTAACATGAGAGAACTACTTCTTCGCATAAAAGCTCT
ACTTAGAAGAACAACAAGAAATGTAGAAGATACAATCCTCTCTCATAGAG
ATTTAGTGCTTGAGAATAGAGAAAGAACTCTTAAAATTGATGGTAAAAAT
GTAGATATAACAAAGTTAGAGTTTGAGCTCCTAAGTGAATTTATTTTTAA
TAAAAACATTGTTTTAGATCGTGAGTATCTGCTAGAGCATGTATGGGATG
GCGCAGAGGATTATCAATATCAGACTGTAAATGTTGCAATAAATCGCCTA
AAAGAGAAGATAGATCCAGATAAAACAAAAGAGTACATACAAGCAGTACG
TGGTGTGGGTTATAAATTGTGCTAA
>Tmden_0247 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGTTAGAAACCCTCAAAGATAAAAGTATCTTGTTTTTAGAAGACAATCT
TGAATTTGCACAAAATACAATTGTTCTGCTCAATATTTTTATAAAAACTA
TTTATCATGTAGTTACAATAAGCCAAGCCAAAGCTATTTTAAAATCACGA
CATGTAGATATTATCATCTGCGATATTAAGCTTAAAAATGAGAATGGTCT
TGATTTTATAAAAGAGATTCGTTCATCCGATTTGTTAACTCCTATCATGA
TTATTAGCGGGCATAAAGATGAGTCGTTTTTGTTTCGTGCGATTCCGCTG
TATCTCTCAGCCTATCTTTTAAAACCCATAAAATACGAGGAACTAATCGA
AGCGTTGCAGATATGTAGTGAAAAAATCATAATAAATTCCAAAGAAAAAA
TCAATCTCAAAGATGGCTGGTGTTTTGACACAAAGCTCTGTATTTTGAAA
AAAGATGAAGAGGAGTATGCTCTAAATAAAAAAGAGGCTCAATTTATGAA
ACTCATAGCTTACAATAGTGAGCGGCTCATCACAAAAGAGATGCTACATG
AGAGCGTTTGGGAGTTTGAAGATATGAGCGATTCTGCAGTGACAAACTTT
ATGCTTCGCATAAGAAGACGCTTTGGCAAAAATTTTATCTACACAATTCC
AGACTTAGGATTTCGTTTTAATATTCATTAG
>Tmden_1505 GCN5-related N-acetyltransferase
GTGCAGATAAGAGAGCTTGATTTAAAAGAGTTACAGATGGCATACGATGT
TCTTTGCCAACTTCGTACAACACTCTCGTATAATGAGTTTGAAGACTTGA
TATATGAGATGAGAAGTATAGAATATAAGATGTTTGGAATTATGGATGGA
GAAAAACTTATAACTTATGCAGGCGCTGCAATACAGACTAATTTGTATGA
CAAAAGGCATCTTTTTTTATTTGATTTGGTAACATGTAAAGATTATAGGG
GAATGGGTTATGGAAAAATGATGCTTGAATTTCTGGCTGATTATGCAAAA
ATGGGGATGTGCCAAAATATAGTATTATCATCAGGATTTCAAAGAGAAGA
TGCTCATAGATTTTATGAAAAAAGTGGTTTTTTTAAAAAGAGTTTTGTTT
TTATAAAGGGAGTTTGA
>Tmden_1148 sigma-54 (RpoN)
ATGGCTCAACTAAGGCAGACGCAAAGCGTAGAAAACAGACATAAATTATC
AAATACTCTACGTAACTGGTTGCCTATTTTACACTCAAGTCTAAGCGATT
TAGGTGAGGCTATGTCTCCTTTCATTGATGCAAATCCAATCATAGAGATA
AGCTCTGGATTTGAGGATAGTTTTGAGAAATTAATTCCAAAAAAGATAGG
AAATAGCTCAGTTGCCAATACAAGAACTGAGCAGATAGAAGCACTTACTT
TTGTTAAAAAATCACTCTATGATGTTTTGGATGAGCAGATAGAAGCACCA
CTTTTTCCAACTCCAATTTCGCAAAAAATCGCCTCTTTTGTGGTTTGCAA
CCTTGATGAGAATGGCTATTATGAGGGAGATAGTGAAGAGTTTTGTAAAA
ATAACGCTATTACTATAGAAGAGTTTGAAAAGGTGCGTTTACGTTTTGCA
CACGTTGAACCAGTTGGAGTATGTGCTAAGAATCTCTTAGAGTCATTTCT
GTTTCAGTTAGACAGTTCAGATATAAGTGATAAAGTCTATCCACTCGCCA
TAAAGGTGATAAAAGATTTAGAAAATATTTATGATTATTCAAATGAGGCT
GGATTTTCTGAGGTTATGCGGGTGCTTACAACATTTAAAAACCCTCCTGC
TATTGAGTATCTTGAAGAGTCTGCACAGGTTATTCCTGATTTGATGATTT
TTTTTAATGACAATGACTCAATTGAAGTAAAACTAAATGATGCGTTTTAT
CCGATTATAAATATAGATACAAGCTACTCAATAGAACATGACTATGTCTC
ACAAAAAATAAAAGAGGCAAAGAGCTTAGTTGATGCCCTTGATATGAGAA
AAGCGACACTTTACAAAGTAGGGCTTATGATAGTTGAGTATCAGTATGAG
TTTTTTACAGGTGGCGCTATTATGCCACTCACGTTAAAGACATTGGCGGA
TGAGTTTGGACATAATCCATCAACCATATCAAGAGCTATTGCAAACAAGT
ATATCGCCTGTGATAGAGGTGTTTACGCTATGAAAGAGTTTTTCACAACT
GCTATTGATGAAGATGTGTCAAATGCAGCAATAAAAGAGTTTGTAATAGG
TGTAATAAAAAGTGAAAATAGAAAAAAGCCACTAAGCGATATGAAGCTCT
TAGAACTTATCCAAGATAAATTCAAAGTCCAAATGGTACGCCGTACTATT
GCAAAATATAGAAAACAATTAAACATAGCAGGTTCAAGTGAGCGAAAAAA
ACTCTATCATTTACATTAA
>Tmden_1430 Hydrogenase accessory protein HypB
ATGTGTAAAGATTGCGGTTGTTCTATAGTAGAACAAAGAGAGAGTCACTC
TCACGAACATCACCACCATGAAGATTCTCATCACGAACATCATCATGGAG
ACGAACACCATGGGTCTCATAAACATCTGCATGACAATCCGCAGTTAAAT
GATCCAAAAACGATTTCAATAATTTCAAAAATATTAGATAAAAATGATCA
CGAAGCTGGGCACAATAGAGCGCATTTCAACTCGCATAATGTTTTGTCTA
TAAACCTTATGAGCTCTCCTGGAAGCGGAAAAACTGCACTCCTAGAGGCT
TTAGTTGATGTTGCTGATTTTAAATTTAGTGTAATTGAGGGAGACCTTGA
GACTAGCCGTGATGCCGATAGACTAAAGGCTAAAGGGATAGAAGCACATC
AGATTCAAACAGGCTCAGCTTGTCATTTGGATGCGTTTATGGTTCATAAA
GCTCTTCATCACATGGACTTAGATAGTGTGGATGTCTGTTTTGTGGAGAA
TGTAGGAAACTTAGTTTGTCCTGCTAGTTATGATGTAGGAAGTCACTTAA
ACATAGTTCTAGTAAGTATTCCAGAGGGCGAAGACAAGATCGCAAAATAT
CCTGTTATGTTTCGCCAAGCTGATTTGATTCTTTTTACCAAAACAGACCT
GCTCCCATATTTTGAGTATGACATGCAAAAAGAGAAAGAGATGGCAAGAA
AGCTAAAGCCGAGTGTTGACATACTTGAAGTGAGCACCAAAGATGAAGAG
AGTATCAAGAGAGTTGCTTCTTGGATTAAGTTTAAAATGGAGATGAGATA
A
>Tmden_0884 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAGATTTTACTATTAGAAGATGATGTTATTTTATCTGAAATACTCTA
TGAGCACTTAAGTGAAAAAGGTTATGATGTCTCATCAGCTTATGATGGCG
AGGATGCTTATGAGAAGATTATAAATAGCCGTTTTGACTTTATGCTCTTT
GATGTAAATGTTCCACTTTTAAATGGATTTGAGTTGCTAAGACTCTTGGG
AGAGCAACATGTAAACATACCGACTATTTTTATCACATCATTAGATTCTG
CACATGATTTAAAAAGAGGGTTTGATTTGGGTTGTGATGATTATCTTAAA
AAACCTTTTGATTTAGTAGAACTTGATGCGAGGATAAATCATCTCTTAAG
AGTGCACAACTTAAACTCTTTACATGTAGTAATAGACGCTAAAAGTTATC
TTGACAAACTTACTTATGAACTTGTAAAGGGTGAGCAAAGAGTAAAACTA
TCAAAAAAAGATTTTGAAATCATAGAGTATTTTTTATCGCACAGAGAGAG
GATAATCTCACATGATGAGCTCGCAGCAAATATTTGGCTTGATTCTGAAA
CACCATCAGATTCAACACTTAGAACTTACATAAAAAACATCAGAATATAT
CTTGGAAAAGATTTTATAACTACTATAAAAGGAGTCGGTTATAGAGTTAA
CATCTAG
>Tmden_0531 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAAAACTACCTTATCCAAATCATAGAAGATGATTCATCTGTAAAAAA
ACTTTTAGAAATTACATTTAGAGAGCATAATCTAAACTATATCTCTTGTG
ATAACAAAAAAAATGCCATGATGCTTTTTTTAACACACTCTTCCGACCTG
CTTCTGGTAGATTTGGGCTTACCTGATGGTGATGGAAAAGAGTTTATAAG
AGAAATAAGAGAGATTTCAAAAGTTACAATAGTTGTTCTTAGTGCAAGAG
ATGATGAAAAAGAGATTGTTGCGGCTCTTGATGCAGGAGCGGATGACTAC
ATAACAAAACCTTTCTCGGTAAATGAGCTCTTAGCCAGAATCAGAGCAAA
TCTTAGACGCAGTATTAGTGGAGAAAATATCTCTAGCAAAATCACTTGTG
CCGAGCTAGAGATGGATATAGCCTCAAGAGATATATTTTTTAAAAACGAA
CAACTTAAACTCACACCAATTGAGTTTGAACTTCTTAAGTATTTTTTACT
AAATGCAAACAAAACACTTACCCACAAACAGATACTCAAAGAGGTTTGGG
GAGTTGGATATCAAAGTGAGATGCAGTATCTTAGAACGTATGTAAACACA
CTTAGAAAAAAGATAGAACAAAACAGCACAAGACCAACGTATATAAAAAC
AGAGTCTGGTATCGGTTATAGATTTTGTTGCAATAACTAA
>Tmden_0134 GCN5-related N-acetyltransferase
ATGAACACTACACTATATTTTTTAAGATCATCCGAACAAAAGATAGCAAC
TGATATGCTTAGATACGCTTATAGATTAGATGAGATAAACAAGGGTGTTG
AAGATTTCTCGGAGCTTGAAGTCTTTAGCAAATTTTATGGATTGAGCTCA
AAAGATTTAGGACTATACGCTCTAAGTGGGCACAATATAGCAGGTGCTGC
TTGGATAAGATTACTCAAAGAGAGCGATAATGCTATAGGTTTTATAAACG
ATAAAACAGCAGTTCTCTCTATCGCAGTAAAGCCAGAGTTTAGAAACAAA
GGTATAGGCAAGGCTATGCTTGAGCAACTTTTATTAGAAGCAGGAGCGCT
GTTTGAGGAGATAAGTGTAAGTGTGCTAAACAATGAAAAAGCACTCTCTT
ATTTTAAAAATTTTGGATTTGTTGAAGTTGAAAACTCTCTAAAGAAAAGC
GGAGTCGATAGAAGTGAAGTTATAACAATGCTTAAGAAGATACCAAATGA
GAGAGTCGTAAGACCATGTGATGGTTACGACCCCAGAAAATGGATGGATT
AA
>Tmden_0621 transcriptional regulator, AraC family
ATGAAAAAAGAGACATTACAAAAAAGAGTACAAATCGCCAATGCTATAAT
GTACTATATATATACGCATATAGATACAAATATAGCGATGGATGAGCTAA
GTGAGGACTTAAAAATCAGTAAGTTTTATATGCACAGAATCTTTAAAGAT
GTATTTGGAAAAAATATATATGAGAGCATAAAATCTATCAGACTTCAAAA
AGCCTCAAATCTTCTTTTAACAAACAAATACTCAACAATCAGCGATGTGG
CAAATATCTGCGGGTACAGCTCTCAAACATCATTTTTGCGTGTATTTAAA
GAGCGTTTTAGTATGACTCCAAAAGAGTGGAAAAGTGGCGGATATAAGAA
GTTTTCACAGCGTATAATTGAACAATCTCCAAAAGCAAAAAAATCAACTG
CAAAATTTGACCACCTAGAGCCAACGATAGTAAAAATGCCACAAATGGAG
AGTTACTACATAAGACACAGCGGTTATAATGCGCTAATTAAGAGTACATG
GCAAAAGCTTCAAACATGGGTTTTTAGCAACAATATAACAGAATATAAAC
AGATAGCTCTTTTTCATGACAACCCAACGATAACGCCGCTTAATGAGTGT
CAATATGTTGCATGTATAGTCGTTGATAAAGGCGTTAAAGTAAAGAGTGA
CAGGTTACCAAAGTTTAATATCGCCGAGGGAATCTACGCAAAGTTTGATT
TAATCGCAGAACAAGGTGACATGTTAAAATTTATCCAGTGGCTCTATCAC
GAGTGGCTACCAAAGAGCGAGTACGAAACCACCACAAAACCACCCTATGT
TATATATAAAAAAAACAACTATCTCTCAGAAGACAGCAGATTTGACATAA
GTTTTTATCTCTCTATAAAGTTTTAA
>Tmden_0891 response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase
ATGGATGAAAAACAGACAATATTAATAGTAGATGACAAAGAAGAAAATAT
TGGCACTTTGAATAAATTGCTTCAAAAATACAACTTGCTAAGCGCTTCTG
ATGATAAAGATGCAATTGAGATACTATTTGGTGAAAATGAGATAGATTTA
ATTCTCTTAAATATCACAATGCTAAAGAGTGATGGTTGTGAAGTTTGCAA
AACTTTAAAAAATTCTCCAAAAACATACCATATTCCAATTATTTTTTTAA
GTTCTAAACATACACAAGAGGATATTCAAAAAGGGTTTGATGCGGGAGGC
GTTGACTATATCAGTAAACCATTTCATCCAGATGAACTTCTCTCAAGAGT
TTCTACACATCTTGCATTGAGGGCTTATGAGAAAAATTTAGAGTGCAGAG
TTCAAGAAGAGATACAAAAGAACAAATTTAAAGAGCAGATGATGTATCAA
CAATCTAAACAAGCTGCTCTTGGTGAACTTTTGATGCATATCTCATATCA
ATGGAAGCAACCTCTTGCATCTCTTTTATCTATAACTAAAAAAAACAGAC
AAAAAATACTCTCTTTGGACTCTTTTGACAAAGATGACTTTTTAGAGTCG
TTAAAAAAGTCAAAAGATATACTAGAGTTTATGTCTGAAACAATAGATAC
CTTTCAAAATTTCTATAAACCCTCATACGACACAAAAGAGTTCTCTCTCT
CCGATACCATATTAGAGATTCTCACAATTGTTGAGGGAACTTTCTACTTT
GATGACATAAAAATTTATATTATCTCACATGAGAGAGATACTGTTTTTGG
AAATCAAAATGAGTTCTCTCAAGTAGTATTTACTATTTTAAATAATGCAA
GAGAGATTTTTAAACTCAGAGATACAATAAACCCAGAGATACATATCTCT
GTTAATAATAAGAAAGTATCCATCAGTGATAACGGTGGTGGAATCAGGGG
AGAATCTTTTGATAATATATTTTCATACGACAACGATATGAACAATGAGT
TGCATTTAGGTCTTTATCTATCAAAAATCTTAGTTGAGAAAAACGGCGGA
GTTATAACTGCGGCAAATTCTAAAAATGGTGCTACTTTTACCATAGAGTT
TTTAACTTGGATGTAG
>Tmden_1365 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAAATTTTATATCTTGAAGATGACATAACTCTCTGTGATACTATTGC
GGAATATCTCATTGAAGAGGGGTTTGATGTTAAAGCAGTTTATGATGGAG
AAGAAGCTTTAGAGCAAGTTTACAAAGAGAGTTTTGATCTGTTTTTATTT
GATGTAAATGTTCCAAAAATCAATGGATTTAAGCTATTACATGAGTTAAG
AGGAGCAAATATTTTAACTCCTACCATCTTTACAACTTCACTTCAAGGTA
TAAATGATTTATCTATGGGTTATGAGAGTGGCGCTGATGACTATATCAAA
AAGCCCTTTGCCTTAAAAGAGCTACTCTTTCGCATAAAAGCACTTCTAAA
ACGAGAGTTTAAATCACAAAATTTTATTATTAAAATAGAAGATGGAGTAA
AGTTTAACACCTTTACAAATGAGCTATATATTAGGGAGCGAAAAACAGCA
CTAAACCCAAAAGAGACTCTTTTGCTAAAACTTCTTCTAAAACATCAAAA
TGAGTGCGTCTTGCTAGAGGATATCTACTCCGAGCTCTGGACACATGATG
AGCCATATAGCGATATGAGTTTAAGAACGTATATAAAAAATCTACGTAAA
CTTATAGGAAAAGAGATGATAATAAGCATAAAAAAAGTTGGATATAAACT
TGTACAGTAG
>Tmden_1991 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGAAGATTGAAAAAATTAGAGATATATCCATTTTGCTAGCCGAAGATGA
GAGTGAACTTCGTGAACTTTTACATGAGTATTTGCAACTGTTTTTTGGCA
GAGTTTATGCCGCTACCTCAGGAGATCAGGCGTATGATATCTACAAACAA
AAAAAGCCAGATATTATAATCACAGACATAAGTATGCCTAACCTTGATGG
TTTAGAGATGATAAGCAAGATAAGAGAGAGCGACAAAGAGACAAAAATTA
TAGTCATGAGTGCGCACTCTGAGCAAGAGAGGCTTCTTCTTGCTATTAAG
CTAAATCTTGAGTCATATCTTATTAAGCCCATAAAAACAGAAGCTTTGAA
GACTATTTTACTCGATATTGTAAAACACCTTAGAGAGAAATCTCGCCGCA
CTTATGTTACAGAAAACATCTATTGGGAACATGAGACAAACACACTTTGG
GGAAATTCAAAAGAGATAAAACTAAGAAAAATGGAGAGTATGCTTTTAAA
ACTCCTATTTTCAAGACCAAATGAGATTTTTTCCACAAAAGAGATTTTTG
ATTATCTACATGAAACAAAAAATGACAAAGAATTTTCAGTTCACGCAGTT
ACCTCTCTTATGAAAAGGTTACGCGCAAAACTTCCTAATGAAGTTATTCA
CAATATTTATGGTTCAGGATATAAGATAATTCCTATTTAG
>Tmden_0502 conserved hypothetical protein
ATGTCACTACTATTATTGATTGGATGTAGTTCTCAAAAAGAGGTAGTTGC
AAAGTCTGCTATATTTCAAAGTGTTTCAAATGATGAGGCTCTTCTTCTAA
GCAAAGAGAGCGATAATGGTTCTTGCCTGCGTTGTGGAATGGATTTAGTA
AAGTATTATAAAACAAATCATGCTGCATCTCTTGATGAAAAGATATACCA
ATATTGTTCAATTCACTGTTTACAAGATCACCTATATGACGGAGTATCAT
TAAAAAATCCTCAAGTTGTTGATATAAATAGTTTGAAATTTATTGGAGTT
GACAAAGCTTATTATGTAGTAGGTAGCAACGTAAAGGGCACTATGAGCAG
AATTAGCAAATATGCGTTCTCAAGCAAAGAAGAAGCAGAGATATTTCAAA
AAAAACATGGTGGTGAAGTGATGGATTTTTATAAGGCTTTAGAAGTAGCA
ACAAAGGATTTTAAAGAGCGAAGATAA
>Tmden_0009 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGGAAATATTAAAAAGTTATAATGCAATCATTGTTGATGACGACAAAAA
TATTTCTAGTAATATGTTTAAACTTCTAAAACTCTACTTCAAAGAAGTCC
ACTCTTTTGAAGATGCGGAGTCTGCTTTTGAGTTTATACAAGAAAACAGT
GTATCTATCATTATCAGCGATATTGAACTGCCTGGCATGAACGAATTAAA
ATTTGCAAAAAAGGTAAAAGAGTTTGATGAAAGTATTGAAATACTTATTT
TGACCTCGTTTGCAACACTAGAGTATCTCAAAGAAGCAGCCAGTTTGCAT
CTTATTGACTATCTTGAAAAGCCTATTTCTCTTGATAAATTAGAATCAAT
TTTACAAATATGCGCTCAAAAATTAAAGAAAAATTTACACTACAATATTT
TAATATCTAAGAACATCATAATTAACTTTTATAAAAAAGAGCTCTCCGTC
AAAGAGGAAGTTCATAAATTATCACATAGAGAGAGTTCATTACTAGAGAT
TTTACTACACGACAAAGGTAAAGTAGTGTCAAAAGAATTTTTAATGCAAG
AGTTATGGCAAGACACGGAAGGAACAAATGCAGCTCTTAGAAATCTACTC
TTGAGACTTAGAAAAAAACTTGGCGATAAAAAGATTATACAAAATCATCA
AAACTACGGATACTATATAGAATGA
>Tmden_0837 two component transcriptional regulator, winged helix family
TTGAATATAGAATCAATAACAGCTATAATAAAATTTAAAATTGATATAAA
AAGTGAGTCATACTTGAGCTCAAAAAAGTTATTAGCTAATACAAAACAAC
TTTCTATTCTGCTTGTTGAGGACCATGACGATTTACGAGAAAACACAAAA
GAGATTTTAAAAAAATTTTTTGATACAGTTGATGGCTCAAAAAATGGTGA
AGACGCATTAAAGAAGTACAAAGAGTTTCATAAAAATGAACTTAAATATT
ACGATATAGTCCTCTCAGACATCCAAATGCCGCGTTTAAATGGTGTTGAT
CTAGTTGAAAATATTTATGCTATAAATTCAGACCAGATTATAATAATTTT
ATCTGCTTTTGATAATTCAAAATATTTACTTCCACTTATAAATTTAGGTA
TCGAGCAATTTATAAAAAAACCTATTGACTATCAAGATTTAATGAAAGTA
TTATTAAAAACAACAAAAAAGATAATTTTAAAAAATGAACAAAAAAACAG
TTTTCAAACTCCTTCTCTTATAAAATTGGCTGGTCTTTGTACGTTTGACA
AAGAGACAAATATTTTACTGGTTGATAATGATATGGTTACGCTAACAAAG
TATGAGATTATATTTTTACAAATACTTACAGACAATATAGGAAAAATATA
CTCAAATGACGATATCACAAAACAGTATGATCTACTCAATGAAACGTTAG
ACATTATAAACATAAGAAAACTTGTCTCAAAACTTAGAAAAAAAATATCT
TTTAACTGCATAGAGAGCGTTTATGGAATAGGCTATAGAATAGTTCCACA
TTTTAACTAA
>Tmden_1945 DEAD/DEAH box helicase-like
ATGCCGTTTTCAAAACTTGGACTTTCGCAAAATATACTACAAGCACTAAA
GCAAAACGGCTTTACTAAACCAACACCTATTCAAGAGAGAGTTATTCCGC
TTGTGCTGGAGCGTCATGATATTATGGCAAAGGCTCAAACTGGAAGCGGG
AAGAGTGCCAGTTTTATTTTGCCTATTTTAGAGCTTTTATCTCGTGATAG
CTATGAGGGAAAAGCAAAGATAAAAGTCCTTGTTCTAACACCTACAAGAG
AGCTGACACAACAGATAGTTGAAGCTTTTAACACTTTTGGTGCGTTTATG
AGCAAGAAGCCAAAAGTTGTTGGTGTAATCGGCGGAGAGGGGATTGGAGA
GCAACTCTTTAACATTCAAAAAGGGTGCGATATCTTAGTTGCTACATCGG
GGCGCTTCCTTGATATTTTAAGTAAAAAACAGATGATTCTCTCACATGTA
GATTTTTTTGTTCTTGATGAAGCGGATAAAATGCTTGATTTTGGGTTTGC
AGAAGAGCTTGAACTTATCCTTGAAGCACTTGGGCAAAAGCGCCAAAACT
TACTCTTCTCAGCTACATATCCTCCAAAGATGCTCTTTATCGCTTCAAAG
ATTATGCAAAATCCCATTGAGGTTAGTGTAGAAGATGAAGAGCCAACAGT
TGAGAGTGTTGTTCAACGCGCTATTTTGGTAAGCAGAGAAAACCGCGCTC
CTCTTCTTAGACATCTCTTAAAGAGTGAAAAATATGAACTTGTAATTGTG
TTTATGTCAAGCAAAAGAGCTGCTGATAATATAGCTGCAAAGTTTAGAAA
ACATGGATTTAGCGCCGATTCGTTTCATGGCGATTTGCATCAAGAAGATA
GAAACTACACGCTAGAAGAGTTCAAAACAAAAAAACTCCAGATTTTATTT
GCCACTGATTTAGTCTCAAGAGGATTGGATATAAATGACATTACATGCGT
AATCAATTTTGACCTTCCGCGCTCAAGTGCTGACTACATACACCGCATAG
GACGAACGGCAAGAGCAGGTAAAGCTGGGATGGCTATCTCCTTTATAGAC
CATGAAGATGAGGCACATTTTCGCTTGATAGAAAAACGCTCAAACATCAG
ACTCAAAAGAGAGCAGATAGAGGGCTTTGAGCTTACTACAGAAGCGCCAA
AGAGAGAAAAAGGCAAAGAGCCTATAAAAGGCAAAGGCAAAAGTAAAAAG
GACAGAGCAAGAGAAGCAGCCGCAGGAATAAAGTAG
>Tmden_1105 sigma 28 (Flagella/Sporulation)
ATGACAGCAAAAGAACTCAACAAGGCTATTGAAACATTTTTCGCCAATCA
AAAGCCAAAAGAGTGTTCCACTTACGAATCACTTATAGAACTTTTTGACA
AACAACCAACAGCTGCACAAGCTGCAAATATTTTTAAACTAATACAGAAG
CATAAAGCTTGCATATATACATCATCAGAACATGCGAAATTGCTTAATGA
CAAAGAAGCAGAAGCTAGAAGAAGTGCTCAAAGAAAGATGATTGAGAATA
ACGAGACAGACAGCTTTGACATATTAAAAGAGCATGAACTGCTTGAGTGG
TCAAGATCTGATTCGCCTGTTCGTATGTATCTTCGTGAAATGGGTCAAAT
TCCACTGCTTACAAAAGAAGAAGAGATTGAGATAAGTAAGAAAATAGAAG
GCGGAGAGAGTATTATCATTGATGCAATCTGTTCTGTTCCATACCTAATA
GATTTTATACTTGACTATAGAGAGCCTCTGATAAACAGAGAAAGAAGAGT
TAAAGAGCTTTTTAAGAGCTTTGAAGATGAAAAAGACGAGAGTGATGATA
GTGAAGATAGCGATGATGATGTAGAAGATAGTGATGAAGAAAATGTAGTT
GAAAAAACATTAACTGCTAAAGATAAAAGTAGAGTAGAAAAAGTAACTAT
AAGCTTTAAAGCTTTAGAAAAAGCTAAAAAAGAGTGGATAAAACTTGCTG
AAAAATTAGCTGAAAATACTGATGCTGAACTCACAGCTGATCTCGTCATG
CATTATCTAAGCGCTACTTATAAAAAAGGGGTTTTAAAAGAGAGGCTATT
AGATCTAGGACCTACTTCAAAGCTCATAAATGAGCTTGTAAAAGCTATGG
AGACCGCACTAAAGAGTGATGAAGGTTATGATAAAGAGTTAAAAAGATTA
GAGTATAAACTACCTCTTTTCAATGCAACACTTAAAGCAAATCATAGAAT
ACTAGTTGATAAGATTTGTGATTTAACAAAAGAGGATATAGCTACTATGG
TGCCTGAAGCCACCATGGTTAGCACATACATGGAGATTAAGAAGTTAGTT
CAAACAAAAGAGGCTTCAAAAAATAGCTTTGATATGGATCCAGAAAAGTT
AGCAGATATTTTAGAACAGATTAAACGCGGTAAAAATATCTCTGAAATCT
CCAAAACAAAAATGGCTAAATCAAACCTTAGACTTGTTGTATCTATTGCT
AAGCGCTACACAAATCGAGGATTACCTTTCCTTGATCTTATTCAAGAGGG
AAATATAGGGCTTATGAAAGCTGTTGACAAGTTTGAGTATCAAAAAGGTT
ACAAATTCTCAACTTATGCTACATGGTGGATTCGCCAAGCAATCTCTCGC
GCAATTGCAGATCAAGCAAGAACTATTCGTATCCCTATTCACATGATAGA
GACTATAAATCGTATTAACAAGATTATGCGTAAACACCTTCAAGAACATG
GTAAAGAGCCAGATGTTGAAGTAATTGCACTAGAAGTTGGTCTCTCAGTT
GAAAAAGTTAAAAATGTAATTAAAATCACAAAAGAGCCTATAAGTCTTGA
AGCACCTATTGGAAGTGAAGATGATGGGCGCTTTGGCGATTTTATTGAAG
ATAAAACATCGCTATCTCCTTCTGATGCTATCTTAAAAGATGACTTAAGA
GTTCAAATTGAGAGTGTTTTAGAGCAGCTAAATGAGAGAGAGAAAGCGGT
TATCAAGCTTCGCTTTGGAATTATGGATGATGAGTCTGATAGAACATTAG
AAGAGATTGGAAAAGAGCTCAATGTAACTCGTGAGAGAGTTCGTCAAATC
GAGTCAAGTGCAATCAAAAAATTAAAACATCCTAAAGTTGGAAGAAAACT
TAAAAATTATATAGAAGAGTAG
>Tmden_0123 Protein of unknown function DUF814
ATGAAACTATCACATTTAAAGCAGATTCTTGAGTATCTGCAAAAATTTAC
AAAAATTTCCTCAATTTACAGAGTTAGTGACACTATCATAAAGGTTTCTT
TTGATAGAGATGATGAGCTCTACTTTGAGATGGCGCGCTCAAACTCCAAG
ATATTTAAGTGTCTCTCTTATGCTCGCTCAAAAGTCTATAATGCACCATT
TGACGTGCTCTTAGCAAAGCGATTTAATCGTGCAAATATACTACATGTAG
AGCTTTTTGGTGGCGATAAAATTGTTCGCCTTAAAACCTCAGTTGCCTCC
GCATACAAAGAGGAGATTACCTATTTACAGTTTGAATTTACTGGAAAATA
TACAAATGTTATTATCTTAGATGAGAGTGAAATAGTTTTAGAAGCCCTGC
GGCATGTTGACCTTTTTTCATCATTTAGAGAGGTGCGAGTCGGGCAAAAG
CTACTTGATATTCCAGCTGCCCCATTTGAGGCAAAAGAGTATATTCTTGA
TGATGTTGAGTCGTTCTTATATGATGAGTATGAGCAAGAGCAGAGAGAAA
AACTTGCCTCTTTAAAAAAACAGAAAATCTCTCTTTTAAGTAAAAAACTA
AAAAAGTTAGAAAAACTATACACTACGCTAGATGATGAAGATGAGTTAGA
AGCAGAGGCGCAAAAATATAACCACTTTGGCAATCTTCTTTTGTCCAATA
TGCATACTATTCGCCCATACCAAAGAGTAGTTGAGCTTGATGATTATAAT
GGAGTAAAACAGAGGGTTGAGCTTCACAAAGAGTTTTCAACTCCTGCTAT
GATGGCAAATTCACTTTTTGCAAGAAGTAAAAAAGCAAAGCAGAGAGCTT
CACATCTACACATAGAGAGAGCTTCACTTATCTCAAAGATTGAGCATATA
AAGTTATTTATTCACACTGTAACAGAAGCTAAAGATATGGCAAAGATTCA
GCTGCTTTTTCCAAAAATATTACAGAGTAAAAAGATAAAAACAGATGATT
CGATAGAGACTTTTTGGATAGAGGGATATAAAGTAACTCTTGGAAAAAAT
GAAAAAGGAAACATAACGCTTCTTCAAAACGCACGTGCAAAAGATATCTG
GATTCACTTAAAAGAGCGTCCATCAGCACATGTAATCATCACAACAGATA
AACAAAATGTTCCTATGTCTGTTATAGAAGGGGCTGCAAGATTGTGTGTC
GATTTTACTATGTTTGAAAAAGACCGTTATTTGGTCGATTATACCCCAAG
AAGAGAAGTAACAATCCAAAGTGGTGCCAATGTACTTTATAATAAGTACA
AAACTATAGAGATAGACACTAGATAA
>Tmden_1288 putative transcriptional regulator, ArsR family
ATGTTGGATATGCAACAAAAAATAAAAATTTTTAAAGCTCTTGGTAATGA
AACACGTTTTTTGATTTTTAAAAATGTCTTTACGGGAGGTTATGTTTGCT
CTATTGATGATAAAAATGCCAAAATAGAAGCAAATCCACATGCTACATGT
GTAACAACTATAGCTAAACATTTTGATTTTTCCATGCCTACAATCTCTAA
ACATCTACAGCTGCTTCGTGAGGCAAATGTTATAAAAATGCAAAAAAAAG
CAAATAAGATATATATTGAGCCAAATATAGAGACTATTAGGGAGCTTGGT
GGTTGTTTTACAAAGTTGGTTGAAAATTTTGAAACAGACAGAGAACTCTT
CTTTGATGATATTGTTTTAAAATAG
>Tmden_0564 hypothetical protein
ATGATTTCACAACTAAATAGTGCGGGTGTTCGCACTGCTTATGCCAACAG
TTTTGGTGAAGCTAAAGAGGCTTCACAAAAAGGTACTCTTAGTGTTTCAA
AACAAGGAGACACTAGTAAAGTAGAGCAGATAAAAGATGCTATTGCTTCT
GGTGAATACAAAATAAATTTACAAACTCTCTCACAAAAGATTGCCCAAGA
GTTGTTGTAA
>Tmden_0725 transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family
ATGTTAATAACTCGTGCTAGTGAATATGCCATTCTCTCTCTTATAGTCCT
ATCTAAAGCTTCAGCTCCGATGGATAGCGAAACATTATCAACTCAACTCT
CAATTCCTAAAAGCTTTCTAGCAAAAATTCTTCAAGCCATGGCAAAACAT
GGTATTTTGAAGTCGTTTAAGGGCGTAAATGGCGGATTTTCTCTCTTGCT
TGAGCCTAAAGATATAAAAATGCTTCAAGTGATAGCGTCAGTTGAGGGAA
AGGCTCCAGCAGTTTTTGAGTGTTCACCATCAATGTACTCTTGCCCATCT
GGCAAAGCACAACTATGTTCACTCTGGCCATTTCTAAATAAACTACAAGG
GAAGATAGACTCTTTTTTAGCAGATTTAACTTTAGCAGATATTTTAGAGT
AG
>Tmden_2016 hypothetical protein
ATGATATATGATGTTTTTCCTTCAGCAATAGAGCTGAAAGATGTAGTTAG
ACAGTATGTTGTAGTGACTTCTTTAGAGGGCATAGAAAAGTTACTGTTTT
TACCAAATGGGTGTAACTTTATAATATTTAATAGAGGGTTTGATGGATAT
ATCAAAATTTATAATGAGGATAAAAGATTTCATATTCCAAAAAACTACTC
CATCAGCATTAAAAATAACAAGATAAAAAAATTTAAACTCTACGATAAGA
GCTTAGCCTCAAGTGTAAAACTTCCACTAATAATGGCAGAACTTACGCCA
ATTGGATTTTACAAACTCTTTAATAGAGATGCAACTATTTTAAATAAGTG
CTTTTTAGAAATCCAAGAGAATATAATTGATGAGTATTTTAGTCAGTTAT
ATACTCATGAGTGCGTGGAAGCTGAACTTAAATATCTCAATGATGCTCTA
GATAGGCTCCAAAAGTCATGTAACAATACTCGCATGTGCATACAAGATGT
TATGGATAAGATTATAAATATATACCGTTTTGAAGTAAGTGTAAAACATC
TTCTTGAAGAGTTTAGTTGCAGCAGAAGCAAACTTGAGAGAGAATTTAAA
AGAAACATCGGATTTACACCTAAAAATTTTATCTATATCTCAAAGTTTTG
CAAGACAGTACTCGCTTACATAGAAGATGATTGCGGATTTAACGAGATGG
AGTATCTATATAGTGATTATTCACATATGAACTCTGTTTTTAAAAAATTT
TTTGGTGCAAGTCCAAGTGTGGTTTTTGAAGATGTTACAAATAATAAAAT
TTTGTTATACCAGATGCAAAGAGCTCAAAAGCACTCAATCTAA
>Tmden_1631 hypothetical protein
ATGACAGAATTAGCAAAAATGATTTTTGAGCATACTGGCTCATTAATATT
AAACAAAAAACAGGTAGCACCATTAATTGGTAAAAGTGTAGCTTTTATCG
ATCAAGCAATCCATCAAAACAGATTGGAAAAAATACCAATGTTTACCAAA
AACGAAAGCGGCGGGGGTATTGAGTTTCACGTTGAAGATGTTGCAACTTT
TTTAGATTTTAAAAAACAAATAAAAAGTAAACAAATAGCATAG
>Tmden_0348 NusG antitermination factor
ATGGAGAAAAAAAACAGTCATCAATGGTACTCTATACAAACATATGGCAA
TGAGAGAACTGTTCGTTTAGCAATTTTAAATCTTATAGAAGAGATGAGAC
TACAAGACTTCATAACAGATGTTATAGTTCCTACAGAAGATGTTATAGAA
GTAAAAGATGGCAAGAAAAAAATATCTGAACGCTCACTTTATTCAGGTTA
TGTTTTTGCTAGAATCGAACTCAATACTGAGATTCAACATATAATTCAAT
CAATACCAAAAGTATCTGGATTTATTGGTGAAGCAAATATTCCTACACCA
CTTAGTGAGCATGACATAAATGTAATACTAGATCGTGTTCAAAATCGTGC
TGCGCCTAAGCCAAAGGTATTTTTTGATAATGGGGAGACTGTCCGAATTA
CAGATGGTCCATTTGCAAACTTTACGGCAACTGTAGATGAGTATGATTTA
GAGCATGGAACTTTAAAACTAAATGTTTCAATTTTTGGAAGAGCAACACC
AGTTGATATCTCTTATACTCAAGTTGAAAAAATAATTTAA
>Tmden_0804 hypothetical protein
ATGTCAGATTTCTTAATTGTTTTAGAAAAAATTAAATTATTTACTAATAC
TAGTTCAGATAAAGATGTTGCAGAAAAACTAGGTGTTAAACCAGATACGT
TGTCGCAGTGGAAAAAACGAAATAAAATACCATATTCAGAGTTATGTGTT
TTTGCAAATTTATATAATGTTGATTTGAATTGGTTGCTATTATCAGATAA
AGGAACTCAAAAAATCAGCTTGCCAGATTATCTTATCATTTTGGTTAATA
AATCATACGAATTAAATCGAATTGGTTTAACTGAAAATCTTTTAAAATTT
ATTTTTGAAAGTTCAATAAAACAAAAACTTAGAAGTTATGATAAATCAGT
TCCGTTTTTGAAGTACTTATTTTGGGATAGGTACGACACCTTGGCAAACT
TTAGATTAATGATGAGGGCTTTAAAAAAATTTAAAAAAGGTGATGTACAT
AATTTAAAAATAGAAGATTCTAAAGCTGTTTTAATTGATTTAATAAAAAA
TTACCAACTTACAATTGGCGATCGTACTGTATACACTATACGAAATAAAG
ATAAGAAAAATACCTTGAAATGGCTGGAAGATACTTTTGATGATTTAGAA
GCTTATGCTATCTTAATGGATATGGAGCTGGCTATAAAAGCCTTTGATGA
AGCTAAAGAATGGCTAAGTATTAATTTGCCAATCTTAAAAATCAAAGGCG
AAGAAGTATAG
>Tmden_1880 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGCAAGCCATACATAAAAAACTACACTCCCTTACTCTTTTGATTGCAGA
AGATGATGAGAGCACTCTAAAGTGGCTTAGTCGTGTTTTGTCCATCTATT
TCAAAGAGGTTAGAGTTGCAAAAGATGCCATGGAGGCTTTAGAGCTTTTT
GAACAAACTCCATCTGATGTTATCATCTCAGATATCCAGATGCCACAAGT
CGATGGTTTGCATCTTCTGCAAAAGATATCACTACTCTCTCCAAGTACCA
CGAGAGTTGTCATGACAGCTTACAATACCCCAGAGTACATTAACAGAGCG
GTAGAGTCAAATGTTGATTTTTATCTTAAGAAGCCAATAGATATAGATGA
ATTTTTAGTCGCAATAGCTTCAAGTAGAGCTAAAGTAGATGAGCAGGTGT
TTTTTTTAAATGAGGGCTACATGTATGACTACAAACAGAAGTTAGTAAAA
AAAGATGAGCAGAGTATAAAACTAACAAAAAAAGAGGTTTTGCTTCTTGA
ACTTTTGTTAAAAAACAGAAAATCTATAGTTAGTATAGAGCAGATTGAAC
ATAGCGTTTGGGAGGAGAGTGTTAGTGATGATGCTATTAGAATGGTGGTA
GTAGGTATCCGAAAAAAACTCTATCAAGGTGTTATAGAAAATGTTAAAGG
GCTTGGATATAGAGTAGAGTAG
>Tmden_0625 two component transcriptional regulator, winged helix family
TTGAGTAAGATTTTATTCTTAGAAGATGATCTGCTTTTTGCAGAGACTCT
GATTGATCTACTTGAAGAGAACAACATGGAAGTTGTTCACGTTCCAAATG
GTCAAGCCGCACTAGATAGAACCTTTAAAGAGAAGTTCAATCTCTATCTT
CTTGATATTAATGTGCCTCTCGTTGATGGCGTAACTCTGCTTAGAGAGTT
AAGAGAGTCTGATGATGATACTCCAGCAATTTTTTTGACTTCTCACAAAG
AAAAAGAGGTGTTAAAAAAAGGTTTTCTCTGCGGTGCAGATGACTTTATA
ACAAAGCCATTTGACGCTGATGAACTTATTTTGCGTATATTGGCAATAAT
TAAGAGAGCAAAAAAAGAGGATGTTACATGTATAGGATTACTTTGTAATG
ATGATACACATAAACGTTTTTTATATGATAATAAAGAGATAGAACTCTCA
AAAAAAGAGTATCAGCTACTGCGTCTGCTTATAAAACATGCAAACAACAC
TGTGCCAAAAGAGATGATAATAGACACACTTTGGAGTAGCAGTGAAGGCG
GAAGTGATGGAGCGCTGAGGGTTTATATCAACCGCATTAAACAACTTGTT
CCGCAAATAAATATAGAAAATATCAGAGGCGTTGGATATAAACTTGTTTC
GTAA
>Tmden_0968 response regulator receiver domain protein (CheY-like)
ATGAGTATTGTAAAAGAGTTAAAAGATTTTGCAAAAAATCTTAGTGTCAT
TATAGTTGAAGACGACAAGGCGCTAAATGAAGAGCTAGTTGGAGTTACAG
AACTATTTTTTAAAAGAGTCTTTTTTGCCTATAACGGTGTAGAAGCACTC
AGTATATACAAAAACAACAACATTGATATTGTCATAACAGATATAACTAT
GCCAAAAATGGATGGTGTAGTTCTTAGTAGAAATCTAAAGCAGATAAATC
CAAACCAAGACATAGTAGTTATCTCTGCGCATAGAGATATTGAGTATCTT
GTTAAACTTGTAGATATAGGAATAAAACAGCTTATCTACAAACCTTTTGA
TCATCAGGAGTTACTTTATAGACTTCTTAGAGTATGTGAAGACAAGGTTC
TCTCAAATAAGATGGATGAGTATAAAGAGGATTGCTCATCTCTTTTAAAC
ACCACAACAGTTGCAAATAATAGCATACAGAATAAAAAAGCAATTTATAA
AAATCAAAATAGAACTATTTTACATCTAAATTCTGAGATGGAACAAGATA
TTGAGTATCTCTTAGAGCTAAGAGATGATTTAGAAAATTTAGTTAATGAG
CTTCATTATGGGGTTGAGGTAAGTGTGATAAATGGGATTAGCTCTGTTCT
TTCAAAAATATACACTCTTCTCTCACAAATAGGGGCTACTACAAAAATAT
CTGTAGTTATATTTGAACTTGCAAACTTCTTAGAGAGTATCAACTTTGAG
CTATTGAGTGATGAGCAAAAATCAAAACTAGAAATGATGGAGTTTATTTA
TGATGATATTGCAAAATTTGTAGATTTGATATTTGTAAAAAGGGAAGTAC
AAGATACTTCATATTTAGAGGACTCTTTGCGTTCATCTCTTAGTCAATTA
AAACAGAGTGTTTTTAATGACTTTTTAGTTGAAGAAGAGTTCGAGTTATT
TTAA
>Tmden_0086 hypothetical protein
TTGAAGTTTTCAAGGGGGCTTTATGCCCTCCTTCTCACCCTTTTTTTTAA
CTCTTCATTGGTTGCACAATACTTATATAAAGATGAACTTATATTTAATC
CAGCATTTAATGTTGAGATAGAAAAACTAGGATCTGAGCTTTACGAAAAA
ACAGGCATCTCTCTTAGACTTGTTATGTTAAAAAAATTGCCAGATTCTAA
AAATATAGTAGAGTATGAAGAGCAACTCCTAGCAGAGTTTGATAAACCTA
CTATTTTGCTCACTTTTTCGCAGATGGATACAAAAGTGGATATTTTGGCG
AATGAGACATCTTTATATAACTATTTTGATAAAAAACAGATACTAAGTCC
AGTTGCTTCAGTAGTACAAGCTTTTACAATAGCACTATTTTATAGTGATA
GTTTTGCGATGTTTAAAGAGATTATAAGCGATTATGGCGGAACAATTATC
CCTCTTTTAGCTCAAAAATCAAAAGATAATGAGCTACTTGGCAAATATTC
AGGCTCAATGTTTAACGGTTATGCAGATATAGCAGACCAGATTGCATCAA
GTAAAGGTGTGGTGCTTGAAAATAGCGTGGGGAGTGCAAATCAGCAGAGT
ATATTTGTTGTAAAAGTATTATTTTACGGTTTTGTTCTTTATGGTATATA
TATGTATATTAAAAGAAAACTATATTTAAGAAAGCAGAAAAATGAAACTA
AATAA
>Tmden_0664 two component transcriptional regulator, winged helix family
ATGATTTCGCCAAAATATTCACTCATAGGACATAAATTTATGCGCATTCT
TATAATAGAAGATGAAGTTACATTAAATAAAATGCTAGCAGAGGGGCTAA
AAGAGTTTGGCTACCAAAGTGACGTTGTAGAGACTCTAAAAGATGGAGAG
TACTATCTTGACATTCGTAATTATGATTTAGTTCTAATGGATTGGATGCT
TCCAGATGGAAATAGTATTGATATCATAGGAGACATTAAAACAAAAACTC
CAAAAACTGTTGTTGTTGTTTTATCGGCTAGAGACGATAATGAGAGCGAA
ATTGAAGCACTAAAAAGCGGCGCTGATGACTATATCAGAAAACCATTTGA
TTTTGATGTTTTAGTTGCACGTCTTGAAGCACGTCTTCGTTTTGGTGGTA
GCAATATAATTGAAATTCAAGATTTAATAATCAACCCTGAAGAAGAAAAA
ATCACTTATAAAGAAGTTGAAATAGAGTTAAAAGGAAAACCTTTTGAAGT
TTTAACTCACCTAGCTCGTCACCGTGATCAAATAGTTTCAAAAGAACAAC
TACTTGACGCTATCTGGGAAGAGCCAGAACTTGTTACTCCAAACGTAATT
GAAGTTGCAATCAATCAAATCAGACAAAAAATGGACAAACCTTTAGGGAT
TACAACAATTGAGACTGTTCGTCGTCGTGGTTACCGTTTCTGTTTTCCAA
AAGAGATAAACTAA
>Tmden_0964 two component transcriptional regulator, winged helix family
TTGGAAAACATTTTGGATGAAAATATCTACTCGCCTGAGATAGATCTTTA
CGAGTTTAAAGAGCAGGTTATTGAACTAAGAAAATATACAAAAGAGATAA
ATATTCTAATCGCAGAGGATTATATAGTTCTGCAACAGAGTTTGTTTAAA
ATTTTTACTCCACTCTTTAAAGAAGTTGGTATCGCTTCTGATGGAGCAGA
GGGTTTGGAACTATATAAGAAAAAAGTCGCAAATGGTGAAAAATATGAGA
TTATCTTAAGTGATATAGCTATGCCAAATATGAATGGTGTTGAGATGACA
AAAAAGATAAGAGAGATAGATGATGAACAGATTATTTTCATATTTTCAGC
TTATCAAGACTCTGAGTATCTACTAGAACTTATAAACCTTGATATAAGAC
GTTTTTTGACAAAGCCTATTTCTCTTGAGACTCTATTTCACGAACTTCTT
ATAACATGTAGAGCTATTTATGGCAAAAAAGATTTGTCAAACAAGATAAC
TTTGCGAAGTAATGTTTATTACTACACAAGCGAGAGAGAACTCTATATAG
ATGAGATAGCTGTAAAACTATCAAACTATGAGAGACTTATCTTAGAGTTT
CTGCTATCAAAAATAAACAGCACCGTTTCAAATATTGAAATCATAAACTA
TCTCTATTTTAATGGCGTTGATGTAGAACTTGAAAACGTTCGTAAAATTG
TCTATAAACTCAGAAAAAAACTCTCAAATGACCTTATAGAAAATATTCAC
GCTATTGGATATCGCATTAAACAATAA
>Tmden_0353 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGTTAAATACTTTATATTCCGGAAATCGTCTTCGTGTAGACTTCTCTAA
AACCCCTCAACAAATAGAAGTACCAAATTTATTACAACTACAACAAAGCT
CATATAACAAGTTTTTAATGCTTGAGGAAAAAGATAGATCACAAAGTGGT
GTTGAAACAGTTTTTCAATCAGTTTTTCCAATTCATGATACTCAAAATAG
ATTGACTGTTGAGTATATTGATAGTGAAGTTGGAAAACCAAAATACACAG
TTAGAGAGTGTATGGAGCGTGGACTCACTTATGCAGTTAGCTTAAGAATG
AAAACGCGTCTTATTCTTTGGGATAGAGATGAAAATACAAAAGAGAAATT
AGGTGTAAAAGATATCAAAGAGCAGAGTATATTTGTTCGTGATATTCCAC
TTATGACAGAGAGAACTTCATTTATTATCAATGGTGTTGAGAGAGTTGTT
GTAAATCAGCTTCACCGCTCTCCAGGTGTTATCTTTAAAGAAGAGGAATC
AACTACTTCAGGCAATAAACTAATATATACTGGACAGATTATTCCAGATC
GTGGTTCATGGCTCTATTTTGAGTATGATCCAAAAGATATTCTTTATATG
AGAATAAATAAGCGTCGTAAAGTACCAGTTACAATCATGTTCCGTGCTCT
TGGGTACTCTAAACAAGATATCTTAAAACTTTTTTACCCAATTCAACATA
TTAACATCGTTGATAACAAATTTTTAATGTCATTTAATCCAAATGATTAC
TCTAGCAGATTAACTTATGACTTAGTTGACAAAAATGGAAAAATTCTTTT
AGCTTCAGGAAAAAGACTCTCCGCTAAAAAAGCACAAAATTTTATTGATG
AGGGTTTAAGTGAAGTTGAGTATCCATTAGAAGTTCTTTTAGATAGATAC
TTGGCAAAGCCAATAGTTGACCCTGAAACAGGCGAAATTCTCTTTGATGC
TATGACAAGAATTGATGAAACAAAACTTAAAAAACTGAGTGAAATTGGTG
TTAAAAACTTCAGTATTGCGAACGATTTGGCTGAAGGTGTGGATGGTTCA
ATTATAAATGCGTTTAATGCTGATGCAGATTCTCTAAAGTTACTAAAGCA
GACTGAAGATATAGAAGATGAAAACCATCTCTCAGCGATTCGTATATATA
AAGTAATGAGACCAGGTGAGCCAGTAACAAAAGAGGCTGCAAAAGTTTTT
GTAAATCAACTTTTCTTTGATCCAGAGAGATATGATTTGACAAAAGTCGG
TCGTATGAAGATGAATCATAAGTTGGGGCTAAATATTCCTGAATATATAA
CTGTTTTAACTCATGAAGATATTATAGAGTCTGTAAAATATGTTATCAAA
GTTAAAAATGGACAAGGACATATTGATGATAGAGATCACTTAGGTAATCG
TCGTATTCGTTCAATAGGTGAACTTTTAGGAAATGAGTTACATAACGGTT
TGATTAAGATGCAAAAAGCGATTCGTGATAAGCTCTCTACAATGAGTGGA
CCTATGAATGAGCTAATGCCTCATGATTTGATAAACTCAAAAATGATTAC
TTCAACAATCATGGAGTTTTTCTCAGGCGGGCAGCTATCACAATTTATGG
ATCAAACAAATCCTCTCTCGGAAGTAACACATAAGCGTCGTTTATCAGCT
CTTGGAGAGGGTGGACTTGTAAAAGAGCGTGCTGGATTTGAAGTACGTGA
CGTTCATCCAACTCACTATGGTAGAATTTGTCCGATTGAGACTCCAGAGG
GTCAAAATATTGGTCTTATCAATACGCTTGCAACTTACTCAAAAGTTAAT
GAGCATGGATTTATTGAAGCTCCATATAAAGTAATGAAAGAGGGAAAAGT
AACAGATGAGATTGTTTATTTAACAGCTACTCAAGAAGAGGGCAAGAAAA
TTGCTGCTGCTTCAAATAAGCTAGATAAAGATGGTCAATTTATAGATAAA
ATGGTTGTAACTAGAGTTGATGGAGAGATTCTTCACCGTCCTGTTACCGA
GTGTAACTATGCTGACTTGTCATCTCACATGGTTGTCGGTGTTGCCGCTT
CACTAATTCCATTCTTAGAACACGATGATGCAAACCGTGCTCTAATGGGT
GCAAACATGCAACGTCAAGCCGTTCCTCTTATTAAACATGAAGCGCCTAT
TGTTGGAACTGGCGTTGAAAAACTTGTTGCTCGTGACTCTTGGGAATGCG
TAAAGGCAAGACGTTCTGGTATTGTAGAAAAAGTAGATGGAAAACATATC
TATGTTATGGGAGATGATGATGGAGAAATCTATATAGATTACTATCCATT
GCAAAAAAACCTTCGTACTAACCAAAATACAGCATTTGGTCAAAAACCAA
TTGTAAATATTGGACAAAGAGTTGAAATTGGTCAAGTAATCGCCGATGGT
CCAAATATGGATCAAGGTGAACTTGCTCTTGGTGTTAATGCAATGGTTGC
GTTTATGCCTTGGAATGGATACAACTTTGAGGATGCTATTGTAATCTCTG
AGAGACTTATTCGTAAAGATGCTTTTACATCTGTTCATATCTATGAAAAA
GAGGTTGAAGCAAGAGAGCTAAAACATGGGGTAGAAGAGATTACTCGTGA
TATTCCAAATGTTAGAGATGATGAACTCTCTCACCTAGACGAGAGCGGTA
TTATCAAAATTGGTACGAATGTAACTGGTGGAATGATACTAGTCGGTAAA
GTTTCCCCAAAAGGTGAAGTAAAACCAACTCCAGAAGAGAGACTTCTTCG
TGCAATTTTTGGTGAAAAAGCGGGACATGTAATAAACAAATCTCTTTATT
GTCCTCCATCTATGGAAGGTGTTGTTGTTGATGTTAAAATCTTTACAAAA
AAAGGTTATGACAAAGATGCACGTACTCTTGAACTTGAAAAAGAGGAGCG
TGACTATTTAGAGCGTGAGCACTATGATAGACTTCTTATGATTGATAAAG
AGGAGATGTTAAGAGTTACAAAACTTCTTACAAAAGAGCCACTTATAAAC
GATATTAAAATTGGCAACACAAGTTATAAAGCTGGCGATATAATCAATGG
CGAAGATTTAGTTGAAGTGAATCGTTTTGCAATGAATGCCATAATTAAAT
CATTCAGTGAAGAGATTCAATCAGAATATAATAAAACTAAAAACTATTTC
CAAAAAGAGAAAAGACTCTTCCGTGATGAGCATGAAGAGAAGTTAAATAT
CCTAGAAAAAGATGACATTCTTCCAAATGGCGTTGTTAAACATGTAAAGA
TATATATTGCAACAAAGCGTCAACTAAAAGTTGGTGATAAAATGGCAGGA
CGTCATGGAAATAAGGGTATTGTCTCTACAATAGTACCTGAAGTTGACAT
GCCTTACATGGAAGATGGAAGAGGCGTTGATGTTTGTCTAAATCCTCTTG
GTGTTCCATCTCGTATGAATATCGGGCAAATATTAGAGATGCACCTTGGT
ATGGCTGGACGTGAGTTAGGGCATCAAATAACTAAAGAGTTTGAATCAAA
GCAAAAAGATTTTATTAAAAATCTTCGAGCTAAAATGATTGAAATAGCTG
ATGTTGCTCAGATGATGAATGCAGCTAAAACTCTTGGAGATATGAGTGAT
GAGTTGCTTCTGCACCATGCTCGTGACTGGTCAAGAGGTGTTAAGTTTGC
ATCGCCTATATTTGAGGGTGTAAATGCTGTAGAGTTTGAAAAACTTTTTG
CCCTTGCAAAAATGGACACAGATGGTAAAACAGTTCTTTATAACGGTTTG
ACTGGTGAGAAGATTAAAGAGCGTGTAAACGTTGGTTACATGTACATCCT
TAAGCTACATCACTTAGTTGATGAGAAGATTCATGCTCGTTCAACTGGAC
CATACTCACTTGTTACTCAACAACCAGTTGGTGGTAAAGCACTATTTGGT
GGACAGAGATTTGGAGAGATGGAAGTTTGGGCACTAGAAGCTTATGGGGC
TTCAGCAGTTTTAAAAGAGATGTTAACTATCAAATCAGATGATGTTGATG
GTCGTGTTCGTGCATATAAAGCTATTACAAAAGGTGAATTAGTTCCAGAA
TCTGGGATTCCTGAGACACTATTCGTATTGACAAAAGAGTTGCAATCACT
TGCTCTTGATGTAGAAATATTTGACGAGGTAGAAGATAATGAGTAA
>Tmden_0141 DEAD/DEAH box helicase-like
TTGAATAACGCAAAAGAGTTCTCAAATCTGAATCTAACTAAAGAGATGCT
TCATAACTTAAATGAGATAGGTTATACAAAGATGAGCGATATTCAAGAGC
AGAGTTTGCCTTTTATATTGGATGGTAAAGATGTAATAGCTCAGGCCAAA
ACAGGAAGTGGCAAAACAGCTGCGTTTGGTATAGGGCTACTTCATAAACT
TCAAGTAAAAAAGTTCAGAGTCCAAGCTCTTATCTTATGCCCAACTCGTG
AACTCTCAGATCAAGTAGCCCGTGAGCTAAGAGTTCTCGCTAGATTTTCA
CACAATATAAAAATTTTAACTCTCTGTGGAGGCGTGGCATTTGGTCCACA
ACTTGGCTCACTTCGTCATGGCGCACATATCATAGTCGGTACTCCAGGAC
GTATTTTAAAACACTTAAAAAAAGATACTCTATCTCTTGAAGATGTTGAT
ACGCTTGTGCTTGATGAAGCAGACAGAATGCTTGATATGGGATTTAGTGA
AGAGATAAATGAGGTTTTAGAGTTTGTTCCAAAAAACAGACAAACACTGC
TTTTCTCAGCGACCTATACGGATGAGATTTTAGACATAAGCAAGTCTATA
CAAAATGGTGCCATACACGTAAAGACAACTTCAACTGAAATCGCCAACAA
GATAGAGGAACGATTTTATGAGGTAAATAACGCAGATAAAATCAAAACAG
TTATAGATATTTTGAGCAATTTCAGACCTCAAAATGTGATTATCTTTGCT
AACACAAAAGTAGAAGTGGATGAGATAGCAAAAAGACTTCAAGAGAGTAA
AGTCGATGCACTGGCAATTCATGGTGATTTAGAGCAGTACGACAGAAACG
ATGTGTTAGTTCAGTTTGCTAACAAAAGTTGCCCTGTGTTAGTAGCAACT
GATGTTGCCGCACGTGGGCTTGATATAAAAGAACTCTCTATGGTTATAAA
CTATGACCTGCCTCACTCTCTTGAAACATATACTCACCGCATAGGCAGGA
CGGCAAGAGCTGGAGCTGAAGGATTGGCATTTACGCTTTATAGTGCTTAT
GAGGAAGAAAAAGTTGATGAGTATAAAAATGACAATCGTATCTTTGAATC
AAGCAAAACACTAAAAACTGTTAGTGGTTTTGTTATGAAGCCTCAAAACA
TCACTCTTGTAATTGAGGGTGGCAAAAAAGATAAAGTTCGTGCTGGAGAT
ATTTTAGGCGCATTAACAGGAGAAGCGGGACTTAGTGGTAGCTCAATTGG
TAAGATAGATATTTATGACAGACAGAGCTATGTAGCCATAGAAGCCTCTA
AAATAGATGAAGCACATGATAAGCTAAAGAGTGGAAAAATAAAAGGTAAA
AAGTTCTCAGTTTGGATTCTCTAA