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COG category: Transcription
Organism: Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901, Z-2901
Number of genes found: 129
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# Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901, Z-2901 >CHY_1114 transcriptional regulator, MarR family ATGATTGATTTAAATGATAACGTCGGCAAGTATATATCATTTACCTGGCG CAACATGATTTCCTATATGGCTAAGAAAATGGAGCCACTGCACATCGGCG CCGGCCAGTATGCCTACCTTTTTTCCTTATACTTTAAGGATGGCCAGTCC CAGCAGGCTTTAAGCGACCGGTTGTTGGTGGATAAGGCAGCCACTGTCCG GGCTATTAAAAAGCTGGAAACTGCCGGTTATGTGGAAAGAAGACCGGATG AGCAGGACAAACGTTCCTTCAGGATTTTTCTTACAAAGAAGGGGAAAGCC ATAAGGCCACAGCTGGAGGCTATTGTGAAAGAGGTGCAGGAAATTCTCCT GGAGGGCATGTCCCCGAAAGAAAAGGCAATAATTAAAAGGCTGTTACAGC AAATGGCCAGTAATATCATCCGGGCCAACCGAGGCAGCTTTTAG >CHY_0924 transcriptional regulator, AraC family ATGCTTTTACCTAGTTTAACCCCCGATAAAGAGTTTGATACCGAAAAGGC GAAAATTTTATATTATGATTTTGTTAAACCAGTTAAAGCTACTTACTATT CCAAGAATTACTTAAGAATTTGTACAATTTTAGAAGGTAAAAAGCAAGTT TCGATAAATGAATTAGAGCGCGTCGAATATACTAAAGAGAACTTTGCAAT CTTAGCCCCTAATTCAAAGGTAGACTTAAACATCGAAAATAAAACCAAAG CTCTTGTTATTGAAGTCGATAATAATGTTGTTAATCAGTTAATTGAGAGG ATCCAATTTGAATTAGGCTATGAAGAAATAAAAAAAATTACCAATTACTT TTTCTTATGTAACTTTACTGAGGAAATGTTGGAAACTTATAAAAGGATTG TAAGGACCTTAAACAGCCAGGAAAAGGGCAAAGAGTTTTTGCTGGACCTC TATATCCAGGAAATGCTCTATGAAATATTAAAATTTAGAGGTGCAAAGGA AATTATAAACTCCGTAAAGAACGCCAGGATCAACAATATTTTAAGCTATA TTAATGAAAGTTATCATAAGAACATTAAAGTAGCCGATATTGCCAAAATT TTTGGAATGGAAGAGTATGAGTTTTGCAGATATTTTAAGACCTATACTTG CAAAACCCCAAAGGAATATATAAAAGAACTCAGACTTAAAAAAGCCAAGG AACTATTACAATATCAGAGCGTCACCGAAACCTGCTATGAGGTGGGCTAT GAAAATATTTCGTACTTCATCAAAGAATTTAAAAAAGCCTTCCAGATGAC CCCAAAGCAATACCAAAAGGAGGCAAAAAATAACAAAAAAGACGGGATGG ACCCGCCTACTTAA >CHY_0209 conserved domain protein ATGCAGATTGAAATTCGAGGGGCAGAAAAATTAAGCTTTCGCGAACGGCA AGTGGTAGTGCTAAAAGAAATGGGTTACACCAACGAACAGGTTGCCAAAA AATTAAAAATTAATGTGAGTTCCGTTGCCACCCTTTATAATCGTGCCAAA AGCAAAGGCTACCAGGTAGTGATAGTAATTCCAGGGGATCATCTGGGACT TTTTGATCCCGGGGATGAAGGGGAGGAAGAATAA >CHY_0143 RNA polymerase sigma-70 factor ATGGATCGGTTTTTAGAAAAGTGGCAGAAAGCAAGAAAAAGCCGGGAAGG GATGGAAGAACTTCTTAATTACCTGCGTCCACTCATTAAAAAGGCAGCTC AACGTTATCGCAATCCCTATCTAACCGAGGAAGACCTTATGCAGGAAGGG ATGATTGCGGTAATCGAAAGTGTTTACCGCTTTGACCCCGAGCGGGGGGT TTATTTTTTAAAGTACGTCCGGGAGATGGTGTATGGTAGGATTTATTCCC TGTTGCGGGCGGAAAAGGCCAGAAGGGGTAAGGAAGTGCCGTTAGAGGAA TACCATATTGAGGTGCAGCATTTTGCCGAGGAACTGCCGACGATTAACTT TCCTCCGGGGGTTTTAACGCCCCGCCAGGAAAGCTTGATAACTTTAAAAT ACGAACGGGGAATTTCCCTGAGTGAAGTGGCGAAGATTTTAAAAATTACC CCGGCCGGTGCCTATGATTTGGAAAAACGGGCTCTTAATAAATTAAAAAA ATACTACCTCTCCTTAAAAACCAAATAA >CHY_1915 transcriptional regulator, AbrB family ATGGCAGAAGTGATAGTTTCCAGTAAGTACCAAATAGTGCTTCCGGCTGA AATCCGTAAAACCCTTGGAATAAAGAAAGGACAGCGCTTACATGTCCTTG TGGAAAATGGAAGTATACGTTTAATTCCAAGCCGTCCGCTTTCTGAAATG CGTGGTTTCTTACGGGGTATGGATACAAATATTGAGCGGGATGAGGAGGA ACGGTTTTGA >CHY_0512 transcriptional regulator, TetR family ATGAATCCAAAGATTCGGGCGATTTTAAAAGCTGCGGCTAAAGTGATGGC CCAAAAGGGCTTTGAAAAAGCTACCATGGATGAAATTGCTAAAATTAGTA AGGTAGCCAAGGGGACTTTATATTACTATTTCAAAAGTAAAGAGGAACTT TTTTTAAAGCTTACCCTTTCTATTCTTGAAGAATTAGAGGAAAGAACTAA AAAGGTTTTAGAGTTAAAAGTTTCGGCGGCGGAGAAACTTAGAGCTTTAA 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ATGGCAACAAAGGGATACAAACGGGAACACGGTCTTACCATCGAACAACT TAATGCTGTTGAACTTTTAGTTATGGGCAAGACCGATAAAGAAGTGGCCG AAGCTGTGGGAGTGAACCGGGTAACGGTTACAAAATGGCGGTTGTATGAC CCTTATTTTCAAGCTGAGTTAAACAGGAGGAGGAAAGAAATATGGGGCGT TGCAGTAGACAGGTTTAGAAGCCTTCTATTGAAGGCCCTGAATACGGTTG AGAAGGCCCTTAACGAGGGAGATACAAGGACGGCGGTTGAAATTCTCCGG ATGGCTGGACTGGACATGACAAAAGGGGGTGGCACTCTGGGGACATACCT TGTAGGTGAGACGGAAGCGGAAAAGATACTTGAGGAATTAGCAGAAGCGA AGAAGCGAGAAGAAACATTCAAGGCTTTTTCTGTTGCCGATTGGGAGAAG AAAAGCGTCCTTGACGAACTCGAAGAACTGGCAAGAAGATTGGAGAGGTT GCAGACCAGAACCGGAACATAG >CHY_2446 rrf2 family protein TTGGAGGAAGAGATGAATCTAACTCAGGCAACCGATTATGCATTTCGGGC GGTATTGTACTTGGCGAGAAAAGGGAATGGGGAGGTGGTAGAAGCCCAGG AAATTGCCGGGCGGGAAAATATCCCCTTAAGGTTTTTGCTAAAAATCCTG CGGCAGCTGGGACAAGCGGGGATTGTAAAATCTTACCGCGGGGTGGGGGG CGGTTTTAGTTTAGCTAAAGATCCGGAAGAAATAACACTTTTAGATGTGG TGGAAGCGGTGGAGGGACCGGTAAAGATTAACCGCTGCTTAATCGATCCC CAGTATTGCACCAGTCAGCGGGGTGGCCGGTGTGCCATTCACCAAGAGCT TTCCTTAATCCAAAATGATATCATTGCCCGGCTGGGAACGGTGAGTTTTA 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ATGCGCCAGGCACGTATTCGAGAACTTTTTTTGCAACATACAGGCCAGGA ATTAACTTCTAAGCAAATTACCGAGCTTTTAAATTTCCCTTTATCAGCGG AGCGAACAATTCGCAATGATATTAAAGAATTAATTAAACAGGGATTTCCT ATAGAAATTCTCCGCCGAGGGAAGTATCTCTTTAGAGGAAGAAAAACATC TTATCTAAGAAAAGATTTGCGCTTTGGCAGTGATGATATAAGGCAGCTTT GGCTTCTGGCGATAGTGGCTGAGAAAAGGGAAGTCAAAGTTCCGGAACTT TATAAGGAACTTGAGAAAAAGTTTAAAGAATTTGAGCAGGAAATAGGCTT TAGCTATGAAACATTGCAAAATGATTTTAAAGAGCTTGCAGCTCATGGAT TTTTGCTTAAAAAAGATGAAGTTTATCAACTTGGGAAAAAATTTTTACCT ATCTATCGCCACCGCATTAAGAAGGAGTTAAATGAAGTAATAAGGGAGTT AGAAAGAAAATATCGTTATATGCAATATAATCCTCTTTTAAGCGAGGTTT TAAATAAATTAAAAGCTTACCGCAATACTTTTATCTATACGATTGATACT CATATTGAAGAATATTTTGAAGAGAGAAGAAAAATCAGGTACTACCATGG TCCCCGGGAGCTTGTAGATGAAACTTTAATAATGATTAAAAACGAAATTA GTCGTGCTCTTTTTGAAGAAAAGAAAATAAAAGTTACTTATAAAGGAAAA GAACAATTTTTCTATCCCCTTGGCCTTGTGTATAACCAAAACAATCAGGC ATGGTATTTAATTGCCAAGCCTATAAGAAAAAGAGAGGCAGCCAAAAAAC TTCGCGTTGATCGGATTGAACAACTTGAAGTTTTAGAAGAGCCGATTCCT AAAGAGGTAGAAACTTGTGTTAAAGCCATGGTAGCCCCCGGTTGGGGAAT 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ATGGGCTTTTAGAAGCTTTAGGGGGAGAAGAGCGGGTGGTGAAAATTCTT TTGGAAGACAATGATTTATCCCCCGAGATTTTAGCCGAGTATTTCCTTGC CCATGCCAAATTACGCCACCAGAATGTCATTACCGATGACCAGACGGTAA TTGTGGTTCGTTTCTTTGAAAAGACAAGGAGTGAACGGGTTGTACGCTAA >CHY_1694 putative prophage LambdaCh01, transcriptional regulator ATGAAAGGAGATTGCAGCAATATTTATAAAATTGCAAGAAAAAATGCAGG GCTGACACAAGAAGAGGCAGCAGAAATGCTATACGTTAGCGTTAGAAGTT TAGCCGATTATGAAAGCGGTAAAACAATTCCTCCGGACGATGTAGTAGAA AGAATGATTGAAATTTACGATGCAAAGTACTTAGCTTATATGCATTTGAA AAACTCAACTAAAATTGGCAGGAGATATTTGCCGGATATTAGTTTAAATG ACATTTCCAGGGCTGTACTTAAGCTGCAAAAAGAACTAAACGATGTAGAG AAAATTAATCCGGAAATAATTGAAATAATTTGTGATGGAGAAATTGATGA AGATGAAAAGCCAAGATGGCAGCGCATTACAAAAGAAATCAACGAGATGG CAGGGGCAGCATTAACTGTGGTTTTCTCAGGTTAA >CHY_0010 stage 0 sporulation protein J ATGAAAAATAAAAAAGGTTTGGGTCGAGGGTTAAATGCTTTGATTCCCGA GGGAAAAATAAATTTAGAGCGGGAAAATGGTCTTGTGGAAATTAATGTTG AAAAAATAGTACCCAATCCCAAGCAGCCCCGTACGATTTTTAGCGAGGAA GCTTTAAAGGAGCTGGCCGAGTCAATTCAAAAGCACGGGGTTTTACAGCC 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CAGAATTGTTTCTAAGGAAGTAATTATGGAAAGGGTTTTAGCGGATTTTG CCGGAGTTAGCGATGAAAGCCTCAAATGGCATTTAAAAAATCTGAGAAAG AAGCTTCGGGATTTGGGATACGAAAATATTATTCTCTGTCATAAAGGTTA CGGTTATTCGTTTAATAAGGAAACCCTTTTTAATTTTGAATTTGATTAA >CHY_0813 transcriptional regulator, MarR family ATGAATATTAACGAAGAACTAAAACAAAAGCTTACCGAAGAGCTGGTGCG TACGGTGATTCAGTTTAAAAAAGGGGACGGATTTCACGGGCAACGTTTTG GGATTAAAAAAAGTGAATTAATCTTACTTGCCACCATGCGGGAGATGTGC GGTGAAGGCATTGATGGAGTAAAAGTTTCAGATCTAAGCCAGCGGCTTAA TATCACTCCGGCAGCGGTAACCCATATGTTAAATTCCCTGGAAGAAGGGG GATATATTGAACGCCTTCGCGACGCAAAAGACCGGCGCATAGTCATTGTA AGACCCTCGGCAAAAGGGAAGGAAATTTTAGAACAGGGGAAAAAAGAGAT TCTAAAAAGATTTTCTGGCTTGGTGGAATATTTAGGAGAAAAGGACACCA GCGAGTTAATCAGGCTTTTAAATAAAGCAAGCTATTACTTTAGAGAGGTG GCAAGATAA >CHY_0401 rrf2 family protein ATGCAGCTTACAAAACAGGGGGAATATGCTTTAATTGCCTTGATGGATCT GGCAAAACTGCCTAAAGGCCAGGTAGTACCGGTAAAAACCCTGGCGGAAA GGCTGATGTTGCCGGAGGCTTTTTTAGCAAAAATCGTGCAGTCTTTGGTT AAAGCAGGCCTTGTCTATACAGTAAAAGGACCGCAGGGGGGTGTTGCCCT 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GCGGCATAATCACTGCTACCGATGTTGCCGGTGCCGGGGAAGACGAGTTA GTGGAAAATTTAATGTCAAAAGATGTTATTTCCGCCAGTCCCGAAACGCC TATTGGTCATATAGCCAGGGTTATGACCTGGGACAGGATTGATTTGGTTC CGGTTGTGGATGAGTCTTTTAAGTTATTAGGCATTATTAGCCGCCAAAAT ATTATTGATGCTTTACAGCGGCTGGAAAGACAACCGCATTTTGGCGAAAC TTTAGAAGATCTTATTATAAAAAATTTCCATGTTGGTGAGGACGAAAACG GGATATTTTTAGAAGGAAAAATAAATGATTTTTTAATAAATGAACTGAGT ATGTTAAGTTCCACTGTTCTTTTATCCCTTTCCATTTTTTATGCCAATCT GATGGTGCGAAAAAAAGTTAAAGCTCCGGTAGTGGTTAATAATTTTTCTT TATCTCTGTTAACTCCCCTAACTTATGGAGAAACCCTTGTAGTTCGGGGT AAGTTGTTGTACCTGGAAAAAAGAAATGCAAAATTAGAGATAGATTTTTA TAGGCAAAGTAACCTGAATGCCAAAGCTTTAATTGAGGTTCGTTTAATTG AAAAATAA >CHY_2124 conserved domain protein ATGAGAGTAAAATTAATTTCCTTTCTTGGGACAAATAAATATATTCCTTG TCGTTATAAATTTGAAGAGGAGATTTCAAGTCCGAGTTATTTTATTCAAA TGGCTTTAGTCGAATTATTGACGAAAAAATTTTCTTATGAAATTGAAGCA GTAATTTTTACTACCGATGAAGCTTTTGAAAAAAATTGGTTAAAAGGAGA AGGTTATCCTGGGTTAGTTGAAGTGTTTAATGAATACCAGCAAAGAAATC CAAAATTTAAATTTCGGAATGTTATGGTACCTTCTGGGTTATTTGAAAAT 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GGGGTTACGAGTTTTTGGGAGATACCCGGACGGTGGATGTTCATATTCGT CATATACGACAAAAGATAGAAGATAATCCGGCAGATCCGGTTTACATCGA AACCGTTCGGGGAGTGGGTTACCGGTTCGGTGAGGAAAAGAAATGA >CHY_1098 transcriptional regulator, ArsR family ATGGACTTTTTGCTGGCGGAACTTGCCGAAATTTTTAAAGCTCTGGCCCA TCCTACCCGATTAAAGGTTATTTATTACCTAAAAGACCGCGAGCGCTGCG TCTGCGAATTTATTGAAGAATTTTCCTTAGAGCAGTCCAATATTTCCCAG CACTTGGCGGTTTTAAAGCGAGCGGGAATCGTTAGCTCCCGCCGGGTAGG ATTAAACGTTCATTACCGTCTTACCAACCCCAAATTTGTCGAACTGGTGG ATTTATTAAAAGATATCGTCATTGAAGAAACCAAAAAAGAAAGCGAAAAC CTTTTAAAGGGAGAGGATTTTAATGCTTAA >CHY_1745 transcriptional regulator, IclR family ATGGTTTTAGAAGAAAAAGAAAATAAATCGGGAGCCCCGGCCGTGGAAAT GGCTATCAAAATCTTAACTTATTTAAGTAGATACCGGAATAAAAACCGCA CCCTTGCCGAAATTGCCCGGGACTTAAATATCAATAAAAGTTCCTGCCAC CGGATATTGAAAGTTCTTCTGGATTACCGGCTGGTATCCTATGACAAAAA CACCAGGCAGTTCAGCCTGGGATCTTTTTTAATTGTTTTAGGTAGCCGGG CTTCCGAATTCAACGACTACTTAAAAATTGCCAAACAGCATTTAAAAGAA TTAGCAGAAACCACCAAACAAACCTGTGTCCTTGTAGAGCCAATCGCCAA CAACCGCCTAGTTTACATTGCCAAAGAAGAGCCGGAGGCAGCAGTACGGA 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sigma factor for flagellar operon ATGGGAAGTGAGAGCTTGGATGTGGCCGGTTTGTGGAGGGAATATCGGCG AAATAAATCATTGCAACTGAGAAATGAGTTGCTGGAATATTACCTGCCTT TGGTCCGCAAGGTTTCCGCGGCCATGAGTTTAAAACTTCCCACCCACCTT TCCCGGGAGGATATCGAGGGCTACGGCATTATCGGGTTGATTGAAGCGGT GGAAACGTATGATCAGAACCGCGGGGTGAAGTTTGAATCGTACGCCTCTC TTAAGATTCGGGCGGCAATCATTGACGAGCTGCGGAAGCAAAACTTCCTA CCCCGTTCGGTGTGGGATAAGATAAAAAAAGTAACCACCAGCGAAGAAAT GCTGTTAAACGCCCTGGGGGAAGAGGTGCCGGTAGAGAAGGTAGCGGAGC AGCTGGGAGTAAGCGTCAGCGATGTTTTAAAGATAAAAACCTTAATTGCT TTAAAAAATCACCTTTCCTTAGATGAGATTATCGACCCCGAAGGTTCGGT TGACCGTTTTGCAGGGCTGGCGGATGATGAAAAGTATTCGCCGGAAAACA AATTTTTAAAAAGGGTTGAGATAGAAGAATTGCGAGAAGCGCTAAAGAGG CTTAGTGACCGGGAGCGGTTAATTTTACAGTTATTTTATGTAGAAGAGCT ATCGCTTAAGGAAATTGCCGCAGTGCTGGACATCTCCACATCCCGGGTTT CCCAGATAGCTTCAAAGGCTTTAGGGAAATTACGGAAATTGTTAAATGAA GGGGTTGGAGTTTAA >CHY_0270 glcK, glucokinase ATGGGAAATTATGTTGTGGGGATAGACCTGGGAGGTACGAAAATTTATAC TGCCCTGGCTAACTTAAATGGTGAAATAGTGGCGGAAGAAATTGAGCCGA CTACCAAAGACGAAACAAAACTTTTACACCAGCTTGGGAATATGGTTAAA 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ATGGAGAAATCTGGATACGGTATGTCGGTTCTGTTTCCAATAAATCTTGA AGGGGCTTTAGAAGCGCTTCTTTTTGTGAGTCCGGAACCCTTATCCCTGA AAAAAATTGCCCAGACGTTGGAATTATCCGTAGAGGAAGCAAAAGAAATA GTTTTGCGGTTGCAGGAAAAACTCGAGCAGGACCAGCGGGGTATAATGCT GCATTTTTCCGGGGAGGAGGTTTGGCTTACCACCCGCCCGGATTTTTCCG TTTATATAGAAAGGCTTTTTAAGCCCCCGGCCCAGCATTTAACCCAGGCG ACTTTGGAAACCTTGGCCATTATTGCTTACAAGCAACCGGTTACCAAAAC GGAAATTGAACTTATCCGGGGAGTAAAAGCCGATAGCTCTATCGCCACTC TTTTAGAAAAAGGGCTTATTGAAGAGGCGGGACGGAAAGACGCTCCCGGC CGTCCTATTATTTACAGGACCACTGCCAAGTTTTTGGAGTTTTTTGGCTT GAAAAGTCTCGATGAACTGCCACCGTTAAATTTGGAGAATGAAGCGGTAA ATGATGGAAATAATAATTTTGAGGAGTAA >CHY_2056 sigE, RNA polymerase sigma-E factor ATGGTTATTAAGAAATTTTTCTTTTGGCTCAAAAATTTATTTAAAAAATT TTTTGAGCGTCCGGGAGAGGTTTATTATATCGGTAGCCACGATATTCTAC CACCTCCCTTGAGTAGCGAGGAAGAAAATACTCTTTTGACGCTTTTGGTG CAGGGAGATGCCGCAGCAAAATCAACGTTGATCGAAAGAAACTTGCGCTT GGTTGTATACATAGCCCGGAAATTTGAAAATACCGGGGTAAATATTGAGG ACCTGGTTTCGATAGGAACGATTGGTTTGATAAAAGCGGTAAATACCTTT AATCCGGAAAAAAAAATTAAACTTGCCACTTATGCTTCCCGGTGCATTGA 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