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# Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343, ATCC 27343

>MCAP_0335 conserved hypothetical cytosolic protein
ATGATTATGACAAATACTATGATTAATAAAAATAAGAATCTAAGAAAAGA
TATCGCTTCAAATCAAATGTTAGAAAAGCATCAATTAATTAGAATTGTTA
AAAATAAAAATGACGAGATTTTTATTGATACTACTTATAAAGCTAATGGT
AGAGGTGTTTATCTAAAACCAGATTTAAATAGTTTAAAAATAGCAAGAGA
AAAAAATTTGATTGCAAAAAGTTTAAAATCAAAAATAGATGTATCTATTT
ATGATCAACTAGAAGAATTTATTAATGCAAAAAGATAA
>MCAP_0496 RelA/SpoT family protein
GTGCTCAATAAATATAATTATATGTCTTTTGATTATCGTGAAATTAGAGA
TTTTAAAGATTTATTAAGTGAGTTAAAAAAATATATTAAAAATAAAAGTG
AATTAGAACGTATTGAACAAGCTTATAAATATGCGTTTAAATGCCATTTT
AATCAAACTAGAAAAAATGGCGATCCTTATATTTATCATCCACTATCTGC
TGCTTATTATTTAGCTCAATGAAGAATGGGACCAAATACTATTATTGCTG
GATTATTACACGATATTTTAGAAGATACTCCTATTCAAAAAGAAGAACTT
GTAGAACTTTTTAATGAAGAAGTAGCCAATTTAGTTGAATCAGTTACTAA
AGTAAGTTTTTTTGCAAAAGAAAATCGTCAGCAAATTAAATCAAAATATT
TAAGAAAACTTTATTTATCAATGTCAAAAGATATTAGAGTAATTATTATT
AAAATTGCTGATAGATTACACAATATTTATACTATTAAAAACTTACGTTC
TGAAAAGCAAAAAATTATTGCTCAAGAAACATTAGAAATTTATTCAGCAA
TTGCTCATAGAATTGGTATGAAAAGTGCTAAGTCTTTATTAGAAGATAGA
TCATTTGAAATATTAAATCCAGAAGAGTTTAAAAAAATCACTGATTTATT
TAATAGTGATATGCAAAAACGTCAACAAATTATTAATGAAATTATAGTTA
ATCTTGAACAATATTTAAAAAAAGAAAAAAATATTAAAATAATTAGTATT
TTTGGAAGACCTAAAACTATATATTCTATTTATAGAAAAATGAATGTAAT
TGGTAAAAATTTTGAAGAAATTTCTGATTTATTAGCAATTAGAATTATTA
CAAAATCAATTGATGATTGCTATAAAATTTTAGGTTTTATTCATCAAAAA
TATATTCCCTTAGCTGGGAAATTTAAAGACTATATTGCAACTCCTAAAAA
TAATGTTTATCAATCACTTCACACTACTTTATCTGATTCAAATGGCAACA
TTTTTGAAATTCAAATTAGAACTGAAGAAATGAACCAAGTTGCTGAAACA
GGAGCAGCTGCACATTGAAGATATAAAGAAGGAGAAATTGTTGACATTGC
TAAAAAGCAAAAAGAAATAGATGATAAAATAGATATTTTTAGCCGCATTT
TAGATTTAGATAAATCTGAAGAACAACAATCAGTAATCGAACAATCAATT
AAAGATGATTTATTTACTGCTTCTATTTATGTTTTAACACCAAATGGAGC
TGTAATTACTTTACCTTATGGATCAACTGTTTTAGATTTTGCTTACAGAA
TTCATACTGAAATTGGTGAAAAAACAATTGGAGCTAGAATTAATGGAGTG
TTTTCACCAATTAATACTGTTTTAAAATCTGGGGAAGTTGTTGAAGTTAA
AACGTCTCCAAAACAAGAACCAACTCATGAATGATTAAAAATCGTAGTCA
CTTCAAATGCTAGAAATAGAATTAAAAAATATTTACAAAAGAAAATTAAT
GAAGAAACATTAGATAAAAAAGATCAGCAAAAAGAATTGATTAAAAAAAC
TGAAACTAATATTAATGCTTATATTAATCAAAAAGATTGGAAATGAAAGA
AAAAAACAGCTGATGAAATATTAGAAACAGTTAAATCAATGGGTTATAAT
TCATTAAATGATTTTTTATTAGATGTAGCTAAAGGTGAATTTACAATAAA
TCAAGCTGCTGAAAAGGTTTTTATAAAAGAAAATTATTCAAAAGATGATG
AAGCTTATGCAAGTATTAAATCAAAAATCATTTATGATACTAGTATTAAA
AATGATATTTTAGTTGATGGTATTAAAAATATTAAAACCACTTTAGCAAG
TTGTTGTATGCCAATTCCATATGAAGAAGTAGTTGGTTTTGTTACTAAAA
ATAGTGGAATTAAAGTACATCTAAAAGAATGTATAAATATTGATTGAACT
AATATGAAATCAAGATTAGTTGTTGTTCAGTGAAATGAAGCAGTTGCTGA
AAAAAATATGTATACTACTAAATTAAAGTATTTTGGAATTGATAGAAATA
AATTACTTTATGATATTAGTAAAATCATTTCAGGATTAAAAGTCTCAATT
ATTAATGCTAATATTTTTACTGATCAAAAATCATTATTATCTAGTGGAGA
GATTACTGTTAAAATCAAAAACAGCACTCAATTAACTCAAACAATTTCAG
CTTTAAGATCTATACCTGGAATTAATGGAGTTGAAAGAGGAATTTCAAAT
CAAAAGATTAAATAA
>MCAP_0851 transcriptional regulator of the fructose operon, DeoR family
ATGATTAAAGAACAAAGATATAAAGAGATTTTAAAAAAATTAGAAATAAA
TGAATTGCTTTCTTTAGATTTTCTATCAACTGATTTAAATATTCCCTTAA
CTACTTTAAGAAGAGATCTTAAAGAACTAGAACAAAGACATAAAGTTATT
AGAACGCATGGAGGAGTACAACTTAATAAAAGTAATTTAATTGTTGAAGA
CTATTTAGATAATAAGATCAATTTAAATATCCAAGCTAAACAACAAATTG
CTATTAAAGCTCTTAAAAAAATAAAGCCTAAAACTTGTATTTTTTTAGAT
TCAGGCTCAACAACTTATTATTTAGCAAAAATCTTAGATCCCAATTTAGA
TTTAAAAATCGTTACTAATTCAATTTTAAATGTTCAAGAATTAAGTAAAA
ATAATCATCAAAATATTTATTTATTAGGTGGAAAGTATCAAGTGGTTACT
AGTTCTATTTTAGGCTATCAAGCAGTCAATGATTTAAAAAACTATTCTTT
TGATTTAAGTTTTATTGGCATTAATGCAGTTGATGAACAAAATAATATTT
ATACAACTAGTGATGATCATGCTCAATTAAAAATTCAAGTGATTAAAAAT
TCAAATAAAAGTTATGGATTAGTTGATCAATCTAAAAAACATTCTAAATC
ATTTTATAAATTTGCTACAAACTTAGAATTAGAACTAATTGAAGATTAA
>MCAP_0058 N utilization substance protein B (nusB), putative
ATGGAAACCAAAATAAGTTTTTCTAAAAAAAGAAAACTACTGATCCAAGC
CTTTTATAAATATCAATTATTAAATGCTAGTATAGATTATATTTATCAAG
ATGTACTAGATGATGTTCAAAATTTTAATAATAAGCAATTGCTTTTTGAA
ATTAATCTTATTGCTGAAAAACAAGTTGATCTTATCAATCACATAAACAT
AAATATTTCTTCAAATTGAAAATGAGACAGAATTCCTGCTGTTATTAGAG
CCATTTTAATAGTCGGAACATATGAAATTTTATATACAGACACTCCAAAA
CCAGTTACTATTAATGAAATGGTTAATTATGTAAAAGAAATTGAGCCTGA
TTTTGATTACAAGTTTGTTAATGCAGTATTAGATAAAATAATTAAATAA
>MCAP_0448 conserved hypothetical protein
ATGAATCTAGACATTGTTAAACTAGATAAATTAATTTGTGATGCTAATAG
TATTGTAGTTGCTCTTGGTCCTGAAATTTTTTTAAAAAATAGTCAAAAGG
AATTTGAAGAAAACTTTTTTGATTTTATTAAAGAATTTAAATTTATAGAT
TTTAAACAAGCTAGTGTTTATCCATTTTTAGATATTTCAAATTATTGAGC
CTTTTTTTCAAGATTTATTAAATTGAATTATTTTGATAAAAAAGAGAATC
AAATTTTAAGTAATCTTAAAAACTATTTAGAAAATAAAAATTATTTTATT
TTAACAACTAATAGTGATCAAAGTTTAGAAGATCTAAATTTTGATTTAAA
TAAAATTTTTGAACTAGAAGCTAAATATAACTTATTAGAATGCTCTAAAA
AATGTTCAAATCAACTTTATACAAATGATCAAGCGATTTTAAATATGGCT
AATAATCAAAAGAATTTAAAAGTTAATTTAAAATTAATTCCACGTTGTAG
TAAATGTAATAGTTATTTAAAAGTTCACACACGTTTTTGATGCCAAGTTG
TTATTGAAGATGAAAAATTAATAAATTCTAAAAATAAATATCAAGAATTT
TTAAATAAATATAAAAATCAAAAAATTTTATTTTGAGAAATTGGAGTTAA
TTACAATTATCACTTAACTATTAAAAAAGAATTTTGAAAAATGACTGAAC
AATTTAAAAATGCTACTTATTTAGCTATGAATCAAAAAGTTTATCGTATA
CCTTTAGAAATTAGATCAAAAACAATTACATATACTAATGATATTTATCA
AGCAATTAATAACTTATTGGAGGTAAAAAATGATACTTATAGAACCAATT
AG
>MCAP_0023 cold shock protein
ATGAGTACTGGTATAGTTAAATGATTTAATGATGAAAAAGGTTTTGGTTT
CATAACAAATGATTCTGATAATAAAGATGTTTTTGTTTATTTTGCAAATA
TTAATGTAAATGGTTATAAAACTTTAGAACAAGGTCAAAAAGTAAGTTAT
GAATTAAATAAAGGTATAAAGGGATTAGAGGCATTTAATGTTTCAATCAC
TAAATAG
>MCAP_0500 ATP-dependent RNA helicase, DEAD-DEAH box family
ATGAAATTTACTGATTTTGGTTTTAAAAAGTATATTAATGATACTTTAGA
TCAAATTGAATTTATTGCTCCTACTTCAATTCAACAAAAAGTAATTCCCT
TATTAAAAAAACACCAAAATGTTATTGCTTTAGCACATACTGGAACAGGT
AAAACTCACAGTTTTTTATTACCTATTTTAAATAACTTAAAATTAGAAGA
AAATGATAATTACGTTCAAGCAGTAATTATTAGTCCAACTAGAGAACTAA
GTTTACAAATTTATCAAAACACTAAACTATTTTTAAAAAATAATCCTTTA
ATTAATTGTAATTTATTTATTGGTGGAGAAGATATTAGTAAAAATATTGA
GCAGCTAGAAAAAAAACAACCACATATTGTAATTGGAACACCAACTAGAT
TAAAAGAACTTTATGATTTAAATAAACTAAGACTAACAACTACAAGTTAT
TTTATTATTGATGAATGTGATATGATTTTTGATCTAGGTTTTATTGAAGA
TGTTGATTATTTAATTTCTAAAATTAATCAAAATGTTACAATTGGAATAT
TTAGTGCAACTATTTCTCAACAACTTAGTGTATTTTGTAAAAAATATATT
AAAAATGCTCATTTTATTGATGATAGTCAAAATAAAATTTCAACAAGTAA
TGTTAAGCATATTTTAATTGATACTAAAAACAAAGAACTAGAGCAAAGCT
TAATACAAATTATTAATTCAATTAATCCTTTTTTATGTATTATTTTTGTT
AACCAAAAAGATGAAATTAGTAAAATAGTTGAAATTTTACATAAAAATAA
TATTAAACAAGTTGCTGAATTACATGGTAATCTACAACCAAGATTAAGAT
TATCAATGTTAAAAAAAATTCAAAATAATGAGTTTAAATATTTAGTTGCA
ACTGATGTTGCTTCTAGAGGTGTTGATATTAAAGGTGTAAGTCATATTAT
TTCAATTAATTTACCAAGTGATTTAACTTATTATATACATAGATCTGGAA
GAACTGGAAGAAATAATTCAACTGGATATAGTTATATAATTTATAATTTA
AAAAATAAAACTCAAATTGAAGAACTAATTAAAAAAGGGATTGAATTTGA
AACTAAAAAACTTATTGATAACCAATTAGTTGATATAAAAACTAATTATA
AAAAAGTTAAAGTTTTTAAAGAGTTAGATGCTGAGTCAAAACAAGTTATA
AATAAATATAAGAATAAAAAAGTAAAACCAAATTATAAAAAAAAAAGAAA
ACAAGAACTTGATAAAATTAAACAAAAAATACGACGTAAACATATTAAAG
AAAATATTGAAAAAATTAAAAAGGCAAAATATCAAAAAAGAAGATCAGAG
CTATTTGATTAG
>MCAP_0031 phosphosugar-binding transcriptional regulator, RpiR family, putative
ATGAGCATAGATTTATTAACAAAAATTAGAGATTTAATCCAAACAGATTG
TAATCAAGACTATAAAAATATTGGTGCTTTTTTATTAAAAAATTATTCTA
ATATAAGAAGTTTAACAATAACAAAAATATCGAAAGAGTGTAATACAAGT
CCAACACAAATTACAAGATTTGCTGAAAAGTTGAACTTAAAAGGCTTTAG
TGAATTAAAGTATAGACTAGATGATATTTCTAAATCAATTATTATAGATA
ATCAATTTATTCCAATTAGTTCAAGAATTGATGATAAAACAAAATTCTAT
AAAGATTATTTTGAAATATTAAATAACTCAATTAAACAACAAGAAGCTAA
TTTAAAAAATTTACCTATTAATGAAGTTGCTAATTTAATTAGTAAAGCTA
ATAAAGTTTATTTATTTGCTTTTAATCTTTCTTATAATATTTCAAAAAAC
TTTATTCAGCGTTTACGTTGATATCAAAAAGATGCTATTAGCGAATCAGA
CTATATTTCTATAAAAACCTATATTAATATAATTAAACCTGAAGATCTTG
TGATTTTAATTACAATTTCAGGTGAAAATGAATATATTAAAAATATAGCT
GAATCATTAAATAGAAAAGTAAAAATTGTCGGAATTGGTCCAAAGCAAAG
TTCTATGATTAATTTATTTGATAAATATTTGTATTTTCAAACTGATGAAT
CAGAATTGTGAAGTATTAATTCAATTAAAGCTCAACTTACAGTTCAACTT
TTAGATTTTGTTTATGTTAAATGATTAAAAAGTACTAAGAAAAAATAG
>MCAP_0262 serine/threonine protein kinase, putative
ATGCAAAAAACTAAAAAAGATCTTGGAATAGATAAAGACGCATTATTAAA
TCAAATTGTAAACAATCGATACAAATTAGTTAAATACTTAAACTCTGGTG
CTTTTGCAGTTGTTTTTAAAGCACTTGATTTAGATGCTTCTGTTTTAGAA
AAAAAAGATGTTTTTGTAGCAATAAAAATTATTTTAAAAGCTAAAAACAA
AAATATCGAAGCTATTAAAAAACGTTTATTTTTAGAAACAAATACTTTTG
CAAAATTATCCTTTTCTAAAAATATTGTTAAAATGAAAGATGTTTTTAGT
TGACAAAATTATTATGTAATTGTAATGGAATTGATTGATGGTGCTGATTT
AAGTAAAAAATTTAATGCTTATAATAATGTTTTATCTAACAAAGAATTTA
TTTATTATTTTTTACAAAGTACTAAAGGTTTAAAAGAAATTCATGATAAT
AATATTATTCATAGAGATGTTAAACCAGCAAATATTTTAATTGGAAATGA
CTCAAAAGTAAAAATTTCTGATTTTGGAATTTCTAAAATTAAAAGTATTA
TTTTAGATGATAGTCAAAATCATATTTCACCAGGAACTCCAAGATATACA
GCACCAGAACAGTTTTTAAATTTTGAATCAAGAAAAGATGCTTTTTATTT
TGAATCAGATATTTATTCAATTGGTGTGATTATGTATGAGTTTTTAACAG
GTGGTATGCTATTTTTAAACTATAATTCTAATACTGCTAGTTCTAAAGAA
AGAGAAAGAGCTAATTTTCAACAACATATTTTAAAAGAAGTTGTTAGACC
TAGAGAAATTAACCCAAATATTTCTCAAGCACTAGAAAATATTATTATGA
AATGCTTAGCTAAAGATTATAAAAATAGATATCATTCTTTTGATCAAATT
ATTGAAGATCTTCAAAAAGCAAAACAAGAACAAAATGTTAATCTTGATTT
TCCAAATATGTGATGAGAAAATGAGAGTTCTTTAAATATTAAAAACAACA
ATACTTTAAAATATCAATATTTTTTTAAAAATACTAATTCTAAATATTTT
ATTTTTTGAATTTTAATAGTTATAAGTATTTTTATTATTTTTTTAATAGC
ATTATTTTTGAAATAA
>MCAP_0617 transcriptional regulator, DeoR family
ATGTTAAAAGATCAAAGAAGACAAAAAATTCTTGAAATAGTAAATGAAAA
AGATTTTGTTACTAATAAACAGTTAGCAAAATTATTGTCTTCTACTATTC
AAACTATTATTAATGATATTTCTGAACTAGATAAAGAAAAAAAACTTTAC
AAAGTTTATGGTGGGGCAAAATCTGCAAATTCACTAGCAAAGCGTTATGA
GTTATTTGATGAAGAAAAACAACATATAAATATAGATATAAAAGATCTTA
TTGCGCAAAAAGCTAGTGAATATGTTAGTAATGGTGATCTGATCTTTTTA
GATACTGGAACAACAACAAAGCAAATGATCAAATACTTAATTAATAAAAA
AATAATTGTTGTTACTAATGGATATTCAATAGCTTTAGAGTTAGTTGAAC
AAGACATAGAAGTAATTTTATTAGGTGGATCAATTAATCCATCTACACAT
GCAACAATTGGTGAACTTGCTCTGAAAAATTTAGATAATTTTTATTTTGA
TAAGGTTTTTATAGGAATGAATAATTTATCATCACAACGTTTTTACACAA
CAAATATTAAAGAAGCATTAATAAAAGAAAAAGCTATTAAAAATTCTGAT
AAATCTTTTATATTAATGGATTCTTCTAAATTTGGTTCTAAAAATGTGAT
TAAAGTAGATGTTTTAAAAGAAACTATTTTAATAAGTGATAAATATACAG
ATGAATATAAAGGATTAATTATAAACCTTGAATAA
>MCAP_0192 transcriptional regulator, gntR family
ATGCAAGATAAGAAAAATAAAGAAATTACAGAACGTCAAAAAATTGTTAA
CTATTTATTAGATTTGATTGAGCATAAAAAAGTTGATTTTAAAACTCCTT
TACCAAGTGAATACTTTTTAGTAACTAAATTTAAAGTAAGTAGGGGAACT
GTAAGAAGTGCTTTTTCAGATTTAAAAACAAAAGGCTTAATTAAATCAGA
AAAAGGAGCAGGCTATTTTATAAATCCTGACTTTTCATTTAATAGAATTA
AATCAATTAGAAATCAACTATTTACAAATAAACAAGAAGTTTTTATTAAA
ACTGAATTAGATACTAGTAATTTAGTTACAATTATAAATAAATTACATTT
AAGTATTGATTTTAATCCTGATGATTATTTTTCATATATTAAAGTATTTT
ATGTAAATGATTTACCAGTAAGATATGCAAAATCATTTTTAAATAAAAAT
CTTTTTACTAACAATATAGATGTTGAAAAGATTAAAAAGTCTTTAATAGA
ATATCTAGAAGAAAATTCTATTAAACCTTTTAAACTAACTTCTATAATAG
AAGCTAAATTAAAAGATCAAATGACTAGAAATCTTTTAGTTGATAATCAT
CAAGATTATGTGATTTGTAGATATTCAGTTTTATATGATAAAAATAATAA
TATTATTGAAATTACTCAACACACTATTAATTTAGATCATTTTGAAACTT
CTTCAATTAAATATTTGTAA
>MCAP_0791 hypothetical protein
ATGAATATTATTGAAAAGATTAAGCAAAATAAAATTAATTTATCTCCACA
AGAATTAAAAGTGTGTGATTATATTCTAACTAATATTTCTGACTATCATA
ACTTTTCTGTAAAATCAATTTGTAAAAAATTAAATGTTCAACCTTCAGTG
ATTACTAAAACTTTAGTTAAACTTGAAATTGGTGGTTTAAAGCAATTAAT
TTCTTATCTAGAAAATAATTCTAATTTTTTTAAAGATGAAACAAAGTCAT
CCTTTGATAATATCATAGATGAATTTGAAAATAGATTAGAAGATTCGTTA
AAACAATTAAAAATTAATTTAGATATTAATTATTTAAAAGAAGTTGTTTA
CAAACTTTTGTCTAGTAAAAAAATTATTTTATTTTGTACTGGGAAAACTA
AAATTTTAGCTAATTTTTTATTTTTTCAATTATTAGAATTAAATTTATCA
GTTGAATTATTTTCTAATTTGTTTGATTCAAGAGCTTATAATGTTGAACA
AGCTGCTATTGTTGTTATTTCAACTTCTGGAAATAATAGTAAAATTAATC
GCTATTTAAACTTTATTTATAAAAGAAATACTAATGTAATTATTGCTATT
ACTTCTTCACCATTGCTAAAAACTGATATAAAAGTTGATTATCATATTCA
TGGTAGTGAAAATAACTTTTTTATAAATGATAATAGATCTAATCCAATGA
TTGAAAAATATAAAATTCAATATATTTTAGATTTAATCTTTTTACTAATT
ATTAACCAAATAGATTTAAATAATCTAAAATTTCAAGAAAAAGTAAAAAC
AACTAATTTAGTTTAG
>MCAP_0608 hypothetical protein
ATGACAATTTTTAATAAATTATTTGATTGGCAAAAAGAATTGATTATTAA
AAATAAACATAAAAATCAATTGGGATTGTTTTTAGATATGGGTAGTGGAA
AAACAATTTTAAGTTTAGGTTTTTGTGAAATTAATCAAGTTGATGCAATT
ATTATAATTGCTAGTAGAAGTAAAACTTTAGAAACCGCTGATCAAGATGC
TAGTTTTACAAATTATTTACAAAATGATTTAAAATTTAAATTTTATTTAA
AAACTAATTTAAAAAATGCCAGTTTTAATAATAATCAAAAAGAAGCGATT
ATCATTAATTATCATTCATTTTTATTAAATATTAATAAAGAAAACTTTTT
TAGTTATTTATCTGATTTTGTTAATGTACATAAAAATCAAAAAATAGCTA
TTATTCTTGATGAAAGCCAAAATATTAAAAATTCAAGAGCTTTAATTTCA
ATTGGTATTAAAAACTTTATTGATTTAGTTCAAAAACAAGCTTTTAACAC
TTATTTATACTTATTAAGTGGAACTCCACAAACTACTGGAGCTATTGATA
TGTTTAATCAGTTGAAATTTTTAGGTTTAAAAATGAGTAGATATCATTTT
GAAGATCAATTTTGTATTAAAACTCAATTTAATAACGCTTATCGTAAAGT
TTATAAAATTAATGGTTATAAAAATATAAAACAATTAGAACAATTAATTA
ATCAATTTGCTTTGACTACTAAAAATATTCCAACAATATATTTACCAAAA
CAACATTTTATTGGTATAAAACTACCAATTAGTAATGAATTTGAACTATT
TACAAATAAAAAAGTAACAGAATATGATTTACTAAACTTTTGTAATAAAA
ATAATATTAAATCAGACTATAAGCCAAGAGAATTAAATCTTATTAAAAAC
CCATATTATAAAAATTTAAGCTATCCTGATGATAAATGAATAGCTAGTGA
TGATGCATCTTTATGATTAAGAACTAGACAAATTTCAATTGGATTTCAAG
GTAATAGTAAAGATTATTATTGATTTGATTATTCAAGATTAAATAAATTA
GAACAACTTTTAATTGATAAAAGTGATAATTACATTATTTTTTATAATTA
CGATCCTGAGTTTGATGAAATTTATAAGATTTGTAAAAAACTAGATTATA
AAATTGATATTTGAAATGGTAATAAAAAAGATATTACTAATTATTTAGAA
TATTTAAATTTAGATAAAAAAGATAAAGCTAATAGCAAAAAACGTGTAAT
TATTGCAAATTATTCTTCTGGATCAACAGGAAATAATTGACAAGAATATG
ATAAAACTATTTTATTTTCTCTAGCAACTTATGGTTATCATGCTCAAGCT
TTAAAAAGAAATCACCGCATTGGATCTAAAAACACAATCACTTATTATAT
ATTTTTACAAGATAATTATTTAGAAAAATCAATGTTAGATTCTATAAAAA
AGCGTCAAAACTATAATAAAGAAATTTTTATAAAAAACATTAAAGAATTT
AGTAAACTAACAATTAAATATAAAAATAGAACCTTTGATTTTTAA
>MCAP_0492 ribonuclease III
ATGAATATTAAGAACTTTTTTGAAAAATATAACATAAAAATAAATGATCA
ACAAATATATAAAGAAGCTTTAACTCATAATTCATATGCTAATGAACGTA
AATTAAAATATTCTTATCAAAGATTAGAGTTTCTAGGTGATGCTATTTTA
CAAATGTATGTTTCAAAATTTTTATTTTTTCATTATTCTAAATTAGGTGA
AGGTGAACTAACTAGATTAAGATCAAGTACGGTTAGAGAAGAGTCATTAT
CTAGAATTGCTAAAGATATTAATTTAGGACAATTAATAAGATTAGGTCAT
GGTGAGTTAATGACTAAAGGTTATGAAAAACAATCAATTTTAGCTGATAT
ATTTGAAGCTCTAACTGCAGCTGTTTATATAGATCAAAATGAAGATGGAT
TATTAATTTGATTAGAACAAACCTTATTCAAATATATGAAAGATCCCACT
TTTATTAATGTTACAAAAGATTTTAAATCTGAACTACAAGAGTTATTACA
ATCAGAAAAAAGAAGTGATTTAAAATATATTATTGAAAATGAAGAATTTT
TTGTAAATGAAAATAAGACCTTGTATACAGTTAGTGTTAATTTAGATGGG
CAAAAATTCGGAGTTGGTAAAGGTTATTCTAAACAAGAAGCTGAACAAAA
TGCTGCTAGTGATTGTTTGTCAAAACTTAAAAAACCATTAACTAATTAA
>MCAP_0418 ROK family protein
ATGACTAATATAAAAAAATATTTATCTATTGATATTGGTGGAACTTCTAT
AAAATATGGTGTGTTTAATCAAGAATTACAACCTATATTTACTAATAGTA
TTAAAACTATTCCTATAAAAGATGAATTAATTAAGCAATTAATTGATATT
ATTGGCTCTAATTTACCATTTGATGGTATAGGTATAGCAACTGCTGGAGT
TGTTGATAAAAATGGAGTAATTAAATTTGCAAATCAAAATATTAAAAATT
ATTCTAATTTTGACTTAAAAACTTATATAAAAGATTTTTTAATTAGTTGT
AAAAATTTAGTTCCAATTGAAATTATTAATGATGCTAATAGCGCTAGTTA
TATTGAATATGTTAATGATAAAAAAATTAAAAATAGCATCACACTAACTT
TAGGAACTGGAGTTGGTATGGGGATTATTTTAAATGAAAAACTTTTTTTA
GGAAATAATGGTATAGCTGGAGAAATTGCAGCAATTAAAAATTCAAATAA
AATTATTGATACTGAATTATCTTGATCTAAATTTATTGAAAAACTAAATC
AACAAAAATATCATTATGATTCTAGTGATATTTGAACTTTATATAATCAA
AATGATTTTTATAAAGAACAAATAGATATTTATTTAGATAAATTAGTTAA
TTTATTATGTACAATTTCTTATTTATTATCTCCAGAAGTAATTTATCTTG
GTGGTGGGTTTAGTTATTGTAGTGAACAAATTTTAGAATTAATAAATATT
AGATTTAAAAAAGAATTTGTATTTTATAATATTAATCCAATACAAATAAA
ATATACTTTAAATAAAAATGATTCTGGTATTTTAGGAGTTTTACATTTAT
TAGTTGATAAACATTTTAAAAATTAG
>MCAP_0788 transcriptional regulator, DeoR family, putative
TTGATTTTAGAATTATTAACTAAACAATCTGATATTTATCAGAATGAATT
AATTTCAATTTTAAATGTAATAAAATCAGCAATTCAAAGAGATATTTCAA
AACTAAAAGATAAAAACTTAATTGATAATTTAAGTGATACTAGAATAAAT
AGTAAAAACATTAGATAA
>MCAP_0148 conserved hypothetical protein
GTGGTAATATTTATAGTGAATATAAAGGAACTCATACATATGAATTCACA
TAGTTTAGTTTTTAATTATAGAGATAATAAGCATTTTTTACAAGAAATGC
ACACAATCATTAAAAAAAGAGGATCAAAAACTTTTGAAGAGTGAATGGTT
AATAATAATTTTGATTCTGCATATGTTCGAGTAACTATTGTAAATGAAAG
AAATGGTGTTTTAGCTGTTAGTGGTTTTATTAAAAGTAAGGCTATTATTA
ATAAAACTACTTTAAATACAATTTTGCTAACTAATACTTTTACAAAATCA
AAAGAAAGCAACCCTTTAATGGTTAATGAATTAATCCAAGGTGTTGTTAA
AAAATATGAAAATATTTCTGATTTTATATATACTTTTTCTAATGTAGAAA
ATGATGATGTTTTGATTAGAAATGGTTTTAAAAAGATAAAAGAATATACT
TATTTTATGCAATGAGATCCTAACAAAGATGCAAAATTAAGTGTTTTAAA
AAGATTAGATTTAGATACTAATCAAGCTGATTTTGAATTTGTTAAAGATG
AACTATTTCATAGTAGTAAAAACAATTCTTTATTTTATATTAGAGAAGAT
GGGGCTTTATCCATTTATAGCTTATTAAAATATTATAGAAATAATGTGTT
TTATATTTCTAATTTAGATGCCATTGTAATTTTTTCTATTAATAATAAAA
CATTTCAATTAATTGGTTTATATTCAAAAAATGAAATTGATGTTTTAGAG
CTTTTAGAATCAATAGTACCAAAAGGTATTTCATTAATTGAATTTTATTT
TGTACCAAATATTAAAAATAAATTTGTTGTTAAAGAGTTAAGAAAAGTAA
TGGCTGCTGATTGTCAACATAGATCATTTTTATATGTAAAAGAAAGCACA
ACTAATTTAGAGGCTTCAAAGTTTGTTGTTCCTTTATTAAATAGATTAAA
ATAA
>MCAP_0132 DNA-directed RNA polymerase, delta subunit, putative
ATGTCAAAAGTTAGAAATCTGGATTTAGTGTATTCATATTTGCAAAACAC
TAAAACACCTTCAAGTTTAACTGAAATTTGAAAGTCAATCTCAAAAGATA
TAATTAGTCAAAAAAAAGATGAAATCTCAGTAATTGCAGATCTATATGGA
GACATGGTTCTTGATAATAGATTTGCTTTAACAACTGATAATTTGTGAGC
TTTAAGTTCTAATTCTTCAGTTGAAAATGTTAAAAAACAATACGATGATT
TTATTAATGATTCAGATCATAAACATAGATATGATGATTTAGATGATGAA
TTAGCAATAGATGATGATATGATGCTTGATGAAGATTATGATAATGATGA
CTTTACTCAAGATATAGATGATTTTGACGAAGATTTTGACGACATTGATA
ATTCATATATAGATGATGATGATGAATATAATCAATAA
>MCAP_0027 conserved hypothetical protein
ATGTTTAGTAGAGAAAGTGAAAAGATAGAGTTTAAAAAAAGTACAGCTGA
ATTAAAAGAAGCAGTAATTTCATTATGTGCAATGTTAAATAAAAGTAATG
GTGGAACTGTTTATTTTGGAATTAAAAATGATGGAACAATTATTGGACAA
CAAATTGGGAAAACAACAACAACTGATATTGTAAATGAAATAAAAAATTA
TATTAAACCAAATGTCTATCCAGATATTAAAGTTTTAGAAGAAAATGGTT
TAAGTTATATATCTGTTGAAGTTCATGGTACTGAAAAACCGTACTCAGCA
TATAGAAAATATTACATAAGAGTTGATGATCAAGATCAAGTTGTTGATAA
TAATGAACTTAGAAAATTATTTTTAACTAATGAATTTACTAACTTTAATT
GAGAAAAACTAGCAACAAAATATGGTGAAGAAGAAGTTGATGAAAAATTA
TTAATAAGTTATATAAGAAAAGCAAATGAACTAGGAAAGATTAACTTTAT
TTTTAAAAGTGTTAAGGAAACTTTAATAAAGTTAGAATTAATGGAAAATG
ATAAATTAAATAATGCCGGTTATTATCTATTCTCAAAAAATAAACCAATA
ACTATAAAATTAGGAAAGTTTTTAACAGATGAAAAAATAACACTTATTGA
TAATATTAGATTTAAAGGAAATATCTTTGAATGTATCAATAAGTCTATTG
AATATATAATTAATAACATTAATCAAGTGTATGTTTATAAAGATTTAAGA
AGAGTACCAGAACCAGAAATACCAATCAAAGCTATTCGTGAAATTGTAGT
AAATAGTTTTGTTCATATGAGAATAACTAATGGTGATTATAATGAAGTAT
CGATTTTTCCAAGTGAAGTAAGAATTTATAATCCAGGACATTTCCCATTA
AACACAACTCCATCAAGTTTTGCTGAAGGCAAGCTTTCATCTAAATTGAT
AAATCCACTTATAGCAACTACTTTATATAAGAACAATCTTGTTGAAAATT
TTGGAACTGGATTTCAAACTGTATTTAGTTTATGTAATAGCGAAAATATA
AAATACTCATATGATATTTCTAATTTTGGGTTTACTTTTAGTTTTTATAG
AAGAAAAACAGATGATGAATTTTTAAATGTTCAAAATAATATTAAAAATT
TAAATAGTGAATCTAGTACAAAATCTGAATCACAAACCTTATTATTAACC
TCTTTAGAAGAAAAAATTTTAAATTATTGTGATAGAAATGGAAAAATTTC
ATCATTAACAGAACTTGCAGATGAGTTTGATATGGCTTGAATAACAATGC
AAAGAACAGTTAGTAAATTAGTTAAGAAAAATATTTTAAAAAGAGTTGGT
TCTAATAAGATAGGTTATTGAGTACATATTGAAAAATAG
>MCAP_0013 conserved hypothetical protein
ATGGATGCTAAAAAGGTAATATTTAAACTTGATCAATTAGCAAAAGAGCG
TGGCACAACAATTGGAAATATTAGTAAAGTTATTTTAAATAATTTAGAAC
TTATTACTAATTTAACAATTTATAAAGTTGCTGATCTTTGTTTTGTTTCT
CCCTCAACAATCACTAGAGTTTGTCAAAAATATTTAGATATTTCTGGATT
TAGTGAATTACAAATTTTAATAAGAGTGTATTTAAATGAACAAGAAAAAC
AAGACAAAGATGAAAAAGAAGGTAAAAAAATTTCTAAATTTACTGAAATT
AAAGATGCTATTAATGTTACTGATGCATTAATTGATATTGCTGAAGTTGA
CAAAATAGTTAGAACTCTTTATAGTACTAAAACTGTTGCTCTAATTTCTT
ATGATAATAGTGTTAAACATGCTGTTGCTGAACTTGCTGAAAAAATGAAT
TTAATTGGAATTCCACCTGTAATTATTAATCAACAAACTGATTTAGATTA
TTTTACAAAGATTTCTGATTTAAACTGATTATTTATTGTTATTTCACATT
TTGCAGAAAACAGCACTACATTTCAATCAATTTTACAATTAAAAAAGAAT
GGTTCAAAAATAGCTTTAATTTCAATGAATAAGCAAAACAAATATTCTAG
TGTTTGTGATTATTGAGTTAAATATGCTGTTAGTGATGATGATCCATTAC
AAAAAATTAAGCATTCTGCAAACTTTTCATTATTATATGTAGTTCAAGTT
TTATTTAATAGAATTTTAAAAAATGATAAACAACGTTTTGAAAAAATAAT
TAAAACTTTAAAGATTGATTAA
>MCAP_0336 transcription elongation protein nusA, putative
ATGCTAAACGGAACAGAACTATTAGAATCAATTAAATTAATAGAAAAAGA
AAAGGGAATTAGTAAAGAAAGTATTATAAATGGTCTTAAAGAAGGACTAC
AAAAAGCTTATGAAAGATTTTATGATACTGATGCAATTATTAAAATTGAT
ATTAATGAAAAAACAGGATCAATTACTATGCATCAAGAACTAAAAGTAGT
TGAAGAACTTGATGATGATTGATTAGAAATCACTTTACAAAAAGCAAAAT
TGCAAAACCCAAATGCTCAAATTGGAGATATCATTTATAAACCAATTGAA
TTTAGCGAAGAATTTTCAAGAATGGTAGTTAACCAAGTAAGACAAATTTT
TCAACAAAAAATTAGAGAAGCTGAAAGAGCTAGAATTTATGAACAATTTA
TAAGTTTAGAAGGTGAAGTTGTTCAAGCTAAAGTAGTTGGAATGAATAGA
GAAAATAATTATGTTCTAGATATTAATGGAACAACTGCTTATTTGTGAAA
AAATAAAACTATTAATAATGAAATTTTTCAAATAAATGAAATTATTGATG
TTTATATTGAAGTTGTTGAAAAAGAAAGTAAATTATCACAAATTGCTATT
TCAAGAACTGCTCCTGCTTTTTTAACAAAACTAATTGAAAGAGAAGTTCC
AGAAGTAAGAATGGGAATTGTTGAAATTAAAGGTGTAAGTCGTGAACCCG
GAAAACGTTCAAAAGTTGCTGTAGTTACTCATAATCAAAATGTTGAACCA
ATTGGAGCTATTATTGGAGTTGGTGGTAATAGAATTAATAGAATTAGTGA
TATTCTAAAAGGTGAAAAAATTGATGTTATTAGATGAAGTGATGATCAAA
TAACTTATTTAATTAATGCAATGACTCCTGTTAAAGTAATTTCAATTAAT
AAAATTGGTGATGAATATGACATTGTTGTTCCTGATTCTCAACTATCATT
AGCTATTGGAAAACAAGGAATAACTGCTAAACTAATTGCTAGCTTATTAA
AAAATAAAATTAATATTTTTTCTTATTCAATTGCTTTAAAAGAAAATATG
GATATTTTATGAAATGGTGATACTACAAAACAAGAAGTTGAAACTAATTC
ATACATTCCTAAAACTAAAATATCTAAAAAAGAAGAAAAAATAGTTAATA
CTATTATTAAAAAACCTATAAAGAAAAAAGAAGAAAACATTATTGATGTT
GATGCATTAATAGCCTTTCAAGCCGAAGTTGAACAAGAACAAGATGCAAA
AATTTATGAAGAAATTAATCAAGAACTTGCTGATGATAAAGTTCAACCAG
ATAGTGATAAAGTTAAAGCAATAGTTAATGTTATTAAAAATAGTGATGAT
GAAATCACTAAAGTTGAAATTAAAACAGATGATACAGCTGTTAATATCAC
AACTAATAACAATGTTGTTACAAATGATAAATTAGTAAATGATGAAATTA
AAACAGAAACTAAACCAAATCTAACTAAAATCGAAGTATCAAAACCTAAT
TTTAAAAAACAAAAACATAAAGAAGAATTAAATATTGATTTTAATTTAGA
AAATGAACCAGATATTGATGAAATTGATGCAAATTTAAAAGCATTTAATG
ATGCGATTTTAAAACAAGAAGATGAAGAAGATATTGATATTGATTCATTA
GATGATTATGACAAATACTATGATTAA
>MCAP_0097 Rnase R (VacB) and RNase II family 3'-5' exoribonucleases
ATGGAATCTAAAATTATTGAAATTTTAAAAACTAACAAACATAAAGTTAG
TTTAAATAAACTATTGACTTATTTTAATGCTTTAGATTATTCATTAATTA
AAAACTACTTAGACCAATTAGAAAAAAATAATAAAATCACTATTTCATTA
GAAAATAATATTTACTTATTAGATCAAATTTATAAAAAGGGAACTATTAA
ACTAAATCCAAAAGGTTTTGGATTTATAAATGATATTAATAAAATTAATG
ATGAAGATCATTTTATAGCCGGAGTTGATCTAAATAATAGTATTCATCAA
GATGAAGTAGTTTATATTTTAAAACAAGAAGAAGATAATAGATTAAAAGC
TATAGTTATTGATCTAATTAAAAGAAATAAAGTTTATTTAATTGGTGAAA
TAAATAGAAGTTTTGATAAAAGATTTTTAGATTTCATTCCAAACGATAAG
TCATTTGATAGTTTTAGATTTGTAATTGTTAATAAAAATGAATTTAAATA
TGAAGAATTTAATATTATTAAAGCAAAAATTATAAGCTGTAAAGAACGTA
AAATTTTTATAAGACTTATAAGAATTATTGGTAATAGTAAAAAAGCAAGT
GATCGCATTTTAGCAATAGCTGAAGAATTTGATATAAAAACTAGTTTTGA
TAAACAAACTCTAGATAATGCAAAACAAATTAATTTATCAACTGATAAAC
TAGAAAAAGAGTTTTTAAAAAGACAAAATAATTCTTTAGTTAATAAAACG
ATTGTTACAATTGATGGAATTGATTCAAAAGATTTAGATGATGCAATTTG
TGTTGAAAAATTAGAAAATAATAATTATAAACTATTTGTTGCTATTGCTG
ATGTTTCTTATTTTGTTAGATATAAAACTAGTTTAGACAAAGAAGCTTTA
TTAAGAGGTAATTCGACTTATTTAGCAAATAAAGTAATTCCAATGCTACC
AAACATCTTATCTGATGATTTGTGCTCATTAAATCCAAATACTAAAAAAT
TAGTTTTTGTATGTGAAATGGAATTTGATAATAACGCAAACATGTTAAAT
AAAAAAGTTTATGAATCAGTGATTATTTCTAAAGCTAGATTAAATTATGA
TGAAGTAAATAATTACTTTAAAACTAAAACTTGAACTCATGATGATAAAA
CTAAAAAAATGTTAGACATAGCTTATGAGTTGTATAAAAAATTAGAGAAT
TTAAAAGCTAAAAAGGGAACTATTAGTTTTGATGTTAGAGAGCCAAAAAT
TATTTTGGATAAAAATTTAAATGTAATTGATATTAAAACAAAAACAGCTG
ATCAAGCTGAAAAATTAATTGAACAATTTATGGTAAGTTGTAATGAAGCA
GTAGCTGAATTAATCTATCAAAAAGATTTACCTTTTTTATATAGAAATCA
TAATAAACCAGATGAAGATGAACTAATTAATTGATATAAATCACTAAAGA
CATTTGGAATTAATCCTAAATTAACTAATAAACAAGTTTTAGATCCAATA
TTTATTAATCACACTTTAAGTCAAATTAAAGAACAAATTAAAGATGAAAC
TGAAGTTGAATTATTAAATATTTCTTTATTAAGATATATGGATAAAGCTA
AATATGGATTAGAAAATATTGGTCATTTTGGTTTAGCTAGTGATTGTTAT
ACTCATTTTACTTCTCCAATTAGAAGATATTCAGATTTATTAGTTCATAG
ATATTTAAAACAATATCTAATTACAAAAGATCTAGAAAAAACTAGTTTAG
AAAATAATGCAAATTATGTTAATAAAGTAAGTAATATTATTAATGATACT
GAAACTAAAAGTGTTGAATGTGAAAGAGAAGTTATTAAGGCATGTATGTG
CGAATATATGCTAAATAAAGTTAATAATACTTATACAGCAACAATTTCAG
CAGTTTTAAAATTTGGAATTTTTATTCAATTAGATAATTTAGTTGAAGGA
TTAGTTCATATTTCAAATATGAATAGTGATTTAGTATATGATGAAACTAA
TCGTATTTTAATTAAACCTGATAATACTTATTATAGAATGGGTCAAAAAG
TCAAAGTTAAACTAATTAATGTTGATATTAAAAAAAGAACAATTGATTTT
GTTTTAATAGAATAA
>MCAP_0251 greA, transcription elongation factor GreA
ATGTCAAAAGAAATTATTTTAACTCAAGAAGGATTAGAAGAATTAAAAGC
AGAACTTAAAAATCTGTTAGAAGTTACTAGACCTAAAGTAATTGAAGAAC
TGGTTGAAGCTCGTAATCAAGGTGATTTATCTGAAAATGCCGATTATGAT
GCTGCTAGAAATAGACAAGCTGAAGTTGAAGCAAGAATTAAAGAAGTTGA
AACTTTAATCAATAGAGCTAAAGTTATTGATAATTCTAAAACTCATTCAA
CTGGTGAAGTTAAAATAGGATCAACTGTAGAATTTCTTTCAAGTCTAGAT
CATAAAACAAAAGAAATAAAAATTGTTGGAGCCATTGAAGCTGATCCTTT
TTCTCGTTTAATTTCTAATGAATCACCAATTGCTAAAGCTATTTTAGGTA
AAAAGATTGGTGATACTGTTGAAATTAAAGATATTTTAAAACCATATAAA
ATTACAATCAAAAGTATTAAATAA
>MCAP_0367 hrcA, heat-inducible transcription repressor HrcA
ATGTTAACTAAAAGACAAGTTAAAATTTTACAAACTATTGTTGAAGAATT
TATTAAAACTAATCAACCAGTTGGATCGAAAAGAATTTTAGAACTATTAG
ATATTAAAATATCTTCAGCAACAATTAGAAATGAATCAGCTATTTTAGAA
CATGAAGGTTATTTAGAAAAACAACACACTTCAAGTGGAAGAACACCTTC
AACTAAAGGCTATAGATATTATGTTGATAATATTATGAAACTAGATTCAG
CTGATTATACTAGATTAAAAATTTATTTAAACCAGTTATTAGATTTAAGA
AAATATGATATTGATAAAACGATTAATTATGCTAGTGAAATTATTAGTGA
ATTAACTAAAATGACAGCAGTTGTAATTAAAAAGCAAAATATAAAAAATA
TAAAGTTAAAAAAAATTGAACTAATATTATTATCAGAATTTTTAGCAAGT
GTATTATTTATTTTTTCTGATGGTGATGTGCAAAATAAAATGTTTAATTT
AAAAGATATTTCTTTATCTGATTTAAAAATTGCTATTAAATTATTTTCAG
ATTTTTTAGTTGATGTTAAATTAGATGAAATAGATCAATATTTAAATGAT
TTAAAGCATCAATTATCTTTAAGTATTAAACAATATGACTATGTTTTAAA
CACATTTATAAATACTATTTTAGAATCAAAAAATGAACAAAAAGAAACTC
ATGGAATGAGATATATGTTAGAAAATCCTGAGTTTAATGATACTAATAAA
TTAAAAAATGCAGTTAAATTAGTTGAACAATTATCTCCTTTTGATTGATT
TAATATTGCTTATGAATCTAATAAAAATATGAATAAAATAGCAATTAAAA
TTGGTAATGAAATCGACCAAATAAATGATGATATTTCAATGATTGCTACA
GAATTAAAAATTGGTAATTCTTCTACTGTTTTAACTTTAGTAGGTCCAAA
AAGAGTAGATTACAACCAAGTAAACCAGTTAATGAACTTAATTATTGAAA
TTATTAATGCAAAGGAGAATTAA
>MCAP_0114 nusG, transcription antitermination protein NusG
ATGACTTATGAAGAAATTAAACAACTAGAAGATGAGTTGTTAGAAGCTAA
GGGACAATGATTTGTAATTTCTTGTCAAACTGGACATGAAGAAAAAGTTC
TAGGTGATTTACAACAAAAAATTAAGTCAGCTAGCATTGAAGATGAAGTT
TTTTCAATAAAAATTTCAAAAGCAAATCAAGTAAGTAAATCAGGAAAAGC
TTCAATTAAAAATAAGTTTCCAGGTTATATTTTTATTAATATGATTATGA
GTGAAAAGGCTTGATTTTTAATTAGAAATACTCCTGGGGTAACTGGATTT
ATTGGTTCAAGTGGTCGTGGAGCTAAACCTTCTCCTTTAACTATTGAAGA
AACTTTAAATATGTTAGTACCAAATATTGAAGAGATTCAACAAGCTCATG
AAGAAGAAAAAGAACAAGAAACTAAACAAAAAAATGAAGCAGTTGCTAAA
AAAGCTTTATTTACTGCTGATTTTAAAATTGGTGATATTGTCAAAGTCAA
ATCTGGTATTCATGAAAATGAAGAAGGTACTGTTAAAGACATGGATTATT
CAAAAGGTGTAGCCTTTGTTGCTATTGAAATGTTTGGAAGATGAACTACT
TTAGAAGTTTCATTTAAAAATGTTGAACCTATTAAAGAATATTAA
>MCAP_0670 rpoA, DNA-directed RNA polymerase, alpha chain
ATGAAACAATTTGTGAGACCAGAATTTATTCTTTTAAAAGAAGGACAAGA
TAAAAATTACGGAAAATTTAGTGTATCGCCTCTAGAAAGAGGGTTTGGTA
TAACTTTAGGTAATGCGATTAGAAGAACTTTATTAGCAGCAACTCCCGGA
GCAAGTGTTTATGCGATAAAAATTGCTGGGGCAACTCATGAATTTACTTC
AATTCCAGGAATTATTGAAAATGTTACTAAAATTATTTTAAATATTAAAC
AATTAGTTTTAAGAATTGATACTTCTATATATAGTGATGATGAAGTTGTA
CAATTAAAAATTCGTTCTGATATTCAAGGTCCTGTATATGCTGGTGATTT
AGAATTACCAGCTGGTGTAGAAGTTTTAAATCAAGATTTATTAATAGCAA
CTATTAGTGAGGGTGGAATTTTAGATTTAGTTTTATATGCTAAAAATTCA
CGTGGTTATAAGACTTTTAAAGATAATAAAAATGAAAAAAATATTGAACC
AGGAATGATTACAATTGATTCAAACTACTCACCAATTATTAAAGTTGCAT
ATAGTGTAGATTCAGCAAAAATTGGAAGAGCTATTGATCTTGAAAAATTA
GAATTAGAAGTTACAACTGATGGTTCAATTACTGCAATTGATGCAATTAG
TATTGCTTCTAAAATTTTAGTTGCTCATTTAGAATTTTTTATTGATCTAA
ATCGTGAAATCAGTGTATTAGAAGTTATTGGTGTAAATCAAACTGATGAT
AAAGAATTAGATAGAACAGTTGAAGAATTAGATTTTACACAAAGAAGTTT
AAATTGTTTAAAACGTGCTGGAATAAATACATTAAGAGAATTAGTTACTA
AAAATGAAGACGAAATAGGTTCAATAAGAAATCTAGGACGTAAATCATTA
AAAGAAATTAAAGATAAAGTTGCTTCATTAGGATTAGCATTTAGACAATC
ATAA
>MCAP_0070 rpoB, DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGGCTTATAAAATTCGAAAAATCAATCGTAATGTAGAACGTCGTGATTA
TACTAAAGTATCAATGAATCTTTCTTTGCCAAATTTAATTGGTATTCAAA
CTGAGACTTTTGAATGATTTAAAACTAAAGGAATTCAAGAAGTTTTAGAT
GAATTTTTTCCAATTTTATCATTTGATGGATCTAGTGTTTTAACTTTAGA
AAATTGAGGTTTTAAAGAACCTAGATTATCTGTTAGACAAGCAAGAGAAG
AATCAAAAATTTATGATGCTCCAATTTATGCAAATTTAAAATTATCAGTT
AATAAAACTGAAGAAATCCAAAAAGAATTTGATGGTGTTGATCAAGAAGA
TACTTTAAAAGTTTTAACTCATTGATTAGAAGAAAAAACTGGTAATGGTA
ATATAACATTTAAACAGCAATCACAAAATTCTTATTTTTTTGAAATAACT
ATTAAAAAATCTGAAAAACCAGATTTAATTCAAATTGATATTATTGAAGA
TAAAAAAACTTCATTGATTTGTAATGTATCTATTTATAAATCAGGTGAAG
TGTTTTTAGGTGATTTTCCATTAATGACAGAAGCTGGAACTTTTATTATT
AATGGTTCTCAAAAAGTCATTGTATCTCAATTAGTAAGATCTCCAGGAGC
TTATTTTAATAAAGAATTAAATCGTAAAACTGGAGAAATGATTTATTTTG
CAGACATTATTCCAAGCAGAGGAACTTGATTAGAATATGAAACTGATTCT
AAAAAAATCGGAAGCGATGCAATCAATCCTTTATACGTAAAAATTGATAA
ATCAAGAAAAACTACAGCTACTTCTTTATTATTAGCTTTTGGTATTAGTA
AAGATGATATTTTAAATATTTTTGATAATGATGAAGTACTAGTTGAAACT
CTACAACAAGATTCAATTATTGGAGATTTTAAAATAGATTGATCAAATCA
AGTTCAAGAAATTTATAAAAAAATTAGACAAGGTGAAACTGCAACTAGTG
AAGGTGCTTCTAAATTTATTAATAGTATTTTATTTGATAAAAGAAAATAT
GATTTAACTAAAGCTGGAAGATTTAAATTAAAGCAAAAACTTTCTATTAA
AAATAGAATTTTAAATAAAGTTATAGCTGAAGATATTCTTGATGCTAATA
ATAATGTGTTAATAGCTAAAGATACTGAAGTTACTAAAAATAATATTCAA
GAAATTTCTAAAATTTTAGATCAAGATGTAATGAGTATTGATTTAAAATA
TCTATCTGATATTCCAGGAAATAGAAAAGTTCAAAAAATTAGAGTTTATA
AAGATAGTGAACTAAAAACCGATACTACTTGTTTAATTGGTTTAACTAAT
TCATCTAATGAAGAATTCATAACAGTGGCTGATATTTTATCAACTGTTTC
TTATTTATTAAACTTAAAATATAACATTGGTGAAATTGATGATATTGATA
ACTTAGGAAACAGAAGAGTTAGAACTGTTGGTGAATTATTACAAAATCAA
TTTAGAATGGGATTAAACCGTATTGATAAAAATGTTAAAGAAAAATTAGC
TACAAGTGATTTGTATAAAGTTAAAACTTCAACAATTATTAATGCAAAAC
CTTTAACTGCAATTATTGGTGAGTTTTTCAATTTATCACAATTATCTCAA
TTTATGGATCAAATTAACCCATTATCAGAATTAACTAATAAACGTAGATT
AACAGCTTTAGGACCTGGTGGTTTATCAAGAGATAGAGCAGGATTAGAAG
TGCGTGACGTTCACCCATCTCATTATGGAAGAATTTGTCCTATTGAAACA
CCAGAAGGACCAAACATTGGATTAATTAATAACTTGTCAACTTATGCAAG
AGTTAATGAATATGGATTTATTACAACTCCATATAGAAAAGTTATTAATG
GAATTATTCAAAACGATCAAGTTGAATATTTAACAGCCGATCAAGAAAAA
AACTTTATTATCGCTCAATCTAATGTTAATCAAGATGAAAATGGAAAAAT
TTTAGATGAAATTATAGTTTCACGTTTTAATGGTGATGACTATATGGCTA
AAGTTGAAGAAATTCATTATATTGATGTTTCTCCAAAACAAATTGTTTCA
GTTGCTACAAGTGGTATTCCATTTTTAGAAAATGATGATGCTAACCGTGC
TTTAATGGGTGCTAACATGCAACGTCAAGCAGTACCTTTAATTAAGCCAG
AATCACCAATTGTTGCAACTGGTATTGAATTTGAAGCAGCACGTGATTCA
GGTGAGGCTATTGTTGCAAAAGAAGATGCAATTGTTAAATATGTTGATTC
AAAAACCATAATTACTGATGGAGAATCTGGAATTAGAACTTATATCTTAT
CAGATTATGAAAGATCAAATAATGGAACTTCATTAACTCAATCACCAATT
GTTAAAGTTGGAGATGTTGTTAAAAAAGGTGAAATTATTGCTGATGGTCC
ATCAATGGATCAAGGTGAATTAGCAATTGGTCAAAACGTGGTTGTTGCTT
TTTCAACTTATAATGGATACAACTTTGAAGATGCTATTGTTATGAGCGAA
AGAATTGTTATAGATGATCGCTTTACTTCAATTCATATTGATGAATATAC
TTTAGAAGTAAGAAATACAAAACAAGGGCAAGAAGAAGTAACTAGAGAAA
TTCCTAATATGTCAGAACAAGCTAAAAGACATTTAGATGCTGAAGGAATT
GTAGCTATTGGTACTGAAGTTAAAGTTGGAGATGTTTTAGTTGGAAAAGT
AACTCCAAAAGGACAAGTTCAACTTTCTCCAGAAGATAAATTATTACATG
CTATTTTTGGTGAAAAATCTAGAAATGTTAAAGATAATTCATTAAGAGTT
CCAAATGGTGGAGAAGGAATTGTTCAATCAATTAAACGTTTTAAAGCAAA
AAGCGCATTAAATCCTGATGGAATTGAATTACCAGCTGACATTATAGAAG
TAATTAAAGTTTATGTTGTTCAAAAACGTAAAATTCAAGAAGGAGATAAA
ATGTCTGGTCGACATGGAAACAAAGGTATTATTTCAAGAATTTTACCTAT
TGAAGACATGCCGCATTTAGAAGATGGAACACCAGTTGATATTATCTTAA
ACCCACAAGGGGTTCCTTCACGTATGAACATTGGACAAATTTTAGAAATC
CATTTAGGAATGGCTGCTAAAAAACTAAATCAAAAAGTTATTACTCCTGT
TTTTGAAGGATTAAATGAAAAAGAATTAGAAGAAATAATGGCTGAAGCTG
GAATGACAAATTATGGTAAAGTTACTTTAATTGATGGTCAAACTGGTGAA
CCATTTGATAAACCAATTGCTGTTGGAGTTATGTACATGTTAAAACTATC
TCACATGGTTGATGATAAAATTCATGCACGTAATGTTGGTCCTTATTCAT
TAATTACTCAACAACCATTAGGAGGAAAAGCTCAAAATGGTGGTCAACGT
TTTGGAGAAATGGAAGTATGAGCTTTAGAAGCTTATGGAGCTGCTCATAC
ATTACGTGAAATTCTAACAATTAAATCAGATGATATTAAAGGTCGTTCAA
AAACTTATGAAGCAATTGTTAGATCAAAAAGAATTCCTGAACCTGGAATT
CCAGAATCATTTAATGTTTTATCAAAAGAAATTATGGGATTAGGATTTAA
TATGTATATGATTGATGAAACTGGCGAAAAATCAGCAATTAATGCATATG
ATAAAAAGGACTTTGAAATTGATAATTATGATGATGAAATTCTAATCAAA
ACTGATAATTTATACATTGATGATCAAGATGTTGATGCTGAATTTGAAGA
TTTAACTTATGTTGATGAAAATGATATTTTAAACTCATTTGAACTAGATA
ATGAAGAAGAATAA
>MCAP_0071 rpoC, DNA-directed RNA polymerase beta' subunit
ATGGAAAATTTAAATCGTAAAAAAGCAATAAAAATTGAATTGGCTAACCC
TGATACAATTCGTTCATGATCACATGGAGAAGTTTTAAAACCAGAAACTA
TTAACTATAAAACATTAAAAGCCGAAAAAGATGGGTTATTTGATGAAAGA
ATTTTTGGTCCAACTAAAAACTATGAATGTGTTTGTGGAAGATATAAAAA
AGCCAACCCTATGAATAAAGGGAAAAAATGTGAAAAATGTGGTGTTGAAT
TAACTGAATCAATTGTTCGTAGAGAAAGAATGGGACATATTGAACTAGAA
GAACCAGTTACTCACATTTGAATGCTTAAAGTTGCTCCTTATAGAATTGC
TGCAATTTTAGATTTAAAAGCAAAAGAACTAGAAGAAGTAGTTTACTTTG
TTTCTCATATTGTTTTAGAACAAGGTAATCAAAGTCATTTTCTAGAAAAA
GAAGTTTTAGATTTAGGTTCATCAAGAATTACTAAAACTAGAGAAAAATT
GCAACTATCAATTTTAGATGTTATTGATCAAATTAATGATCCTGAGCATA
GAGATACTAAAAAGGCTAATAGATTATTAGAAGAATTAAAAAATACTTCT
ATTCCGTTTTCAATAGATGAAGCAACTAGTTTAATTAGTAAATATACTAA
TGCAAAATTTGGAATTGGAGCTAGAGCTGTTGAATATCTATTAGAAAAAG
TAGATTTAACTAAAGAAATTGAAGCAATTAAAATTCAGCTTGAAAATTCT
AAAAAAACCCCAAATGAAAGAACTAAATTATTAAAACGTTTAGAAACTTT
TGATTCTTTAAAACGTTCTAAACAACGTCCTGAATGAATGGTTATGAGAG
TGATTCCAGTTATTCCACCAGACATTCGTCCTATTATTCAATTAGATGGT
GGTCGTTTTACTACTTCTGAAATTAATGATTTATATAGAAGAATCATTAT
TAGAAATGAAAGATTAAAAAAAGTTAAGGAAATGGGTGCGCCTTCAATTA
TTGTTAATAACGAAAAACGTATGTTACAAGAAGCTGTTGATGCTCTATTT
GATAATGAAAGAAAGCCAAAACCAGTTCAAGGAAAAAATAAACGCCCATT
AAAATCTTTAACTAGTGTTTTAAAAGGAAAACAAGGTCGTTTTAGACAAA
ACTTATTGGGAAAACGTGTTGATTATTCAGCTAGATCAGTTATTGCAATT
GGACCAGATCTAAAAATGTATCAAGCAGGTTTACCAAGAGAAATGGCAAT
TACTTTATTTAAACCATTTGTTATTCAATGACTTCAAGATCATGAGTATG
CTGAAAATGTTAAAATTGCTGAAAAAATGTTATTACAAAATGATCCAAAA
GTTTGAGAGGCACTAGAACAAGTAATTAAAGACAGACCTGTATTGTTAAA
CCGTGCTCCTACACTACACCGTTTAGGAATTCAAGCATTTGAGCCTAAAT
TAGTTAAAGGAAAAGCAATTCGTTTACACCCACTAGTTACAACTGCATTC
AATGCTGACTTTGATGGTGATCAAATGGCAGTTCACGTACCTATTACAAA
AGAAGCTGTTGCTGAATCAAGAGCTTTAATGTTAGGTTCAAGCGCTATTT
TAGGACCAAAAGATGGAAAAGCTATTGTTACTCCAGGTCAAGATATCATT
TTAGGAAATTATTATTTAACTACTGAAGAAAAAAACGCTAAAGGACAAGG
AATGATTTTTTCAAGTTTAGATGAAGCGTTTATGGCTTATAATAGTGGTC
AAATTCATTTAAATTCATTGATTGGAATTGCTTTATCAGCTTTACCTGAA
GAAAAATTTAGTGATAAAAATCAAAGATTAAATTCTTATTTATTAACAAC
TGTTGGAAAACTTTACTTTAATCAAATTTTTGATGATAATTTCCCATGAA
TTAATTCAAATAATATTTGAAATGCTAAAGAAGCAGTTAAAGAATTTATT
TATGATTTTTCACAAGATATTGATAAAGTAATTGAAAATGTTCAAGTTCA
ACAACCAATTAAGAAAAAAGAATTATCACTTATTATTGAAAGATACTTTG
AAACTCATGGAGCTAGAAAAACTGCTGAAATGCTAGATAAAATGAAAGAT
CTAGGATTTAGTTTTTCAACAAAATCAGGAACTACAATTTCAGCTGGAGA
TGTTGTTGCTTTTACTCATAAATATGATGAATTTAAAGAAGCAGATCAAA
AAGTTGAACAAATTACTGATTTTTACAATATGGGTATGTTAACTAATAGT
GAAAAGAAACGTAGAATTATTGATGTTTGATCAGAAGTTAAAGATAAAAT
TCAAAATGAATTAGCAACAGTACTACGTAAAGATGTTAAAAATCCAATTT
TTGTAATGGTTGATTCAGGAGCCCGTGGTAATGTTTCAAACTTTACTCAA
TTAGTTGGTATGCGTGGATTAATGAATGACACTAAGGGAGATATTAAAGA
AATTCCTATTAAGTCATCATTCCGTGAGGGATTAACTGTTTCAGAATATT
TCGTTTCAACTCATGGAGCTAGAAAAGGTATGGCTGATATTGCCTTAAAA
ACTGCTGACTCAGGTTATTTAACTAGAAGATTAGTTGACGTTAGTCAAGA
AATTGTTGTTGTTAATGAAGATTGTGAACCAACCAAAGGATTTGAAGTAT
CAGCTATTATTGATACAAAACATGATAATGTTATTGTTCCACTAAAAGAT
AGATTGGTTGGAAGATTCACATTTGAAGACATTTATGATGATGATAAAAA
TCTAGTTGCTTCTGCTAATACATTAATTGATAAAAATATTGCTGAAAAAA
TTATTATGTCAGGAATTAGTTCAGTAATTATTAGATCAGTTTTAACTTGT
GATAATAAACGTGGTGTTTGTCAAAAATGTTATGGACTAAACTTAGCTAC
TGCTTCAGTTGTTAATATTGGTGAGCCAGTAGGAGTTATTGCTGCTCAAT
CAATTGGAGAACCAGGAACTCAATTAACAATGCGTAACTTCCATACAGGA
GGAGTTGCTGGTAATGTTGATATTACTCAAGGACTTCCTCGTATTAAAGA
ATTATTAGATGTTACAACTCCAAAAGGTGCTGTTGCTATAATTTCTGAAG
TTGATGGAGTAGTTAGTGAAATTGAAGATTATAATGGTGTATTTGTAATC
AATATTGTTACTGAAAATGAAGAAGTTAAAAAATATAAAACTGAATTTAA
TTCAGTATTACGTGTTGAACAAGGATCAAGTGTTATGGCTGGTCAAAAAT
TGACTGAAGGAGCTATTGATTTACACCAATTATTGGAGTTTGGTGGAATT
CAAGATGTGCAAAATTACATTTTAAAAGAAGTGCAAAAAGTTTATAGATT
ACAAGGTATTGAAATTTCAGACAAATATATTGAAATCATCATTAAACAAA
TGTTAAACAAAGTAAAAATTACTGATAGTGGTGATTCTGATTTATTACCT
GGAGAAATTATTACAATTCAAAACTATAAAGAAGTAGTACAAGATTGTAT
TGTTAAATCAATTAGACCACCTTTATCAAAAGCACAAATTTTTGGTATTA
AAAAAGCACCTTTAGAATCAAGTTCATGATTATCTTCTGCTTCATTCCAA
GATACTGCTAGAGTATTAACTAGAGCAATTATTAAAGGAAAAGAAGATAA
ATTAGAAGGATTAAAAGAAAATATTATGTTAGGTAATTTAATTCCAGCTG
GTACTGGTTTAACTGGAACTCAAGAAGTTGAACAACTAGCAGAACAATAC
CATAACAATGAATATTAA
>MCAP_0503 rpoD, RNA polymerase sigma factor RpoD
ATGGCTAAATTTAATAATAAATCAGAATTAAAAAAGATTGCTTCGTTTAA
TGATTTTTTAGATTATACAGTTTCATTTGCAAAAAAGAATAATAATAAAG
TTTCATCTGAAGAAATATTAGAAGTTTTTGCTAATATTTTTCCAAATGCT
TCAGATAATGAATCTGAAAAGTTATTAGATGTTTTACAAAATAAAGGTGT
GATTTTTTCAGATCTATTAGATGATCTTGTAGTAGAAGAAATAGAACAAC
ATGAAGAAGAAATTGAAGAAGTCAATTTAGATGAACTTGAAGAATTAGAA
AATTTAGAAGATCTAGAAGATTTAGATTTTGAATTAGATAATACTTCAAC
TAGTTTAGGTGATGATTTTGATGTACATATTAATGATGATCTAGATGAAT
TTAAGCAAGCAAAAAGCGCAGCTCTTAGAGGAAGAAAATCTGCTAAATCT
TCAAATCATATGAAATATCGCGTTGGTGGTATTAGTAATGAAACTAAAAT
TCAAGACATTATTAAAACATATTTTTATAAAATAGGTCAAGCTCCTATTT
TGACAAAAGATCAAGAAATAATGTATGCTAAAATGGCAGTTAGTGATGAT
CCTGAAGATGTTAAAGAAGGTAGAAATAAATTAATTGAATCAAACTTAAA
ACTAGTTATTTCTGTTGCTAGAAAACATTTAAATCGTGGATTAGATTTTG
CAGATTTAATTGAAGAAGGAAATATTGGTTTAATGAAAGCTGTTGATAAA
TTTGAATATGAAAAAGGATTTAAATTTTCAACTTATGCCACTTGATGAAT
TAGTCAAGCAATAACAAGAGCTATTGCTGATCAAGCAAGAACTATTAGAA
TTCCAGTACATATGGTTGAAACAATCAACAAGCTAGCAAGAGTTGAACGT
CAATTAACTCAAGAATTAGGAAGAGAACCTAATGCTGAAGAAATTGCTAA
TAGAGTTGGTGAGGGTATAACTTCTGATAAAGTTATTGAAATTAAAAAAC
TTTCAATTGAACCAGTAAGTTTAGAAAAACCTTTTGGTGATGAAGATGAT
ACTCATTTTGGAGATTTTGTTGAAGATAAAGATATGGTTTCTCCAAGTGA
ATACACTGAAAAAGAAATTCTAAAAGAAGTTATGGATAAAGTTTTTGAAG
ATATGCCACCAAGAGAAGAAAAAGTTATTAGAATGAGATATGGAATTGTT
CCAACAAGATTAAGAACTTTATTAAGACTTGCTCAAGAATGCAATGATAC
AAATGCTAAAGAATTAAAACAAGCAATTGAAGAATTAGATATTCATTTAG
ATACACCAATTGAAAAAGTTAGAAAATTTAATAATGAAATAATTAATAAT
AATCTAGCAAAATATGATTCAGCAAGAACTTTAGAAGAAGTTGGAAAAGA
ATTAAATGTTACTAGAGAAAGAATCAGACAAATTGAAGCAAAAACTATTA
GAAAATTAAAGCAACCATCACCAAATAATAAATCTGGAAAAACATTAAAA
GAATTTTATAAAGGATAG
>MCAP_0601 scpB, chromosomal segregation and condensation protein B
ATGAAACTACAATATAGTGCTATTATTGAAGGATTATTGTTTATTTATGG
AGATGATGGTGTTTCTTTATTAGATATTCAAACTGTTTTAGAAGATCTAA
AACCAACTGAAATTAAAGAAATCATAATTGAATTAAACAAAAAATATTTA
GCTGATCAATCTACTGCTTTTTGCATTCAAACTTATAAAAAAAATAATTA
TAGATTACAAACAAAACCTGAATTACACCCATATTTTGCTAAATTAGAAC
AATATAATGAAAACAAAAAATTATCTCATTCAACTATAGAAGTTTTATCA
ATTATTGCTTATAAACAACCAATTACAAAACAAAGTATTGAAGAAATTAG
AAATGTTGATTGTAGTTATCAACTTCACAAATTAAGAGAAAAAAGACTAA
TTAAAGTAGTTGGTAAAGATTTAGAAAATAATAGAAGTAATTTGTATGCA
ATTACTGATAATTTTTTTAAAGTTTTTAATATTAAAGGTGGAATTGAAGA
ATTACCAGTAATTAGTGATCAAGATATTAAACAAGCAATCCAAAACAATA
ATGAACAAAAACAAGCTCAACAAGTGGTTGATTTGTATGGTAATGTTGAT
GATTTTAATTTAGATAATCAAAATAATTAG