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COG category: Transcription
Organism: Aster yellows witches-broom phytoplasma AYWB

Number of genes found: 25

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# Aster yellows witches-broom phytoplasma AYWB

>AYWB_224 conserved hypothetical protein
ATGTTTAAAATCAAAAATAATTTATTATTGTTATTAAATGTATTTGTATT
CGCTTTTTTAGGATTATTTTTAATTAATAATAATCAACAAGTAATGGGGA
TGGATAAAGATATTGCTAGCACTAGTAATAATAACCCAAACATAACTAAT
TACTCTATTGAAGAAAATATAATTAATTTAAAATATAAAATTCGAGAAAA
TGCAGTTAAAAAAATAAATATAGAAAACGAAATACAACAATTATCAAATA
ATGAACCTAGAAAAAATACTCTTTTAACCTTAAAAAAAAATTTAGAAAAT
TTAATTAATAATCAAAAAGAACAATTAAAAACTTATCAAATACTTTTAAA
AACTTTAAATGATGAAAATAATTAA
>AYWB_571 conserved hypothetical protein
ATGACTGTTTTACGCACTTGTATAGTTTCTAAAAAAATTCAAGATATCAA
AAAAATGATCAGAATAAATAGTACTAAACAAGGAAAAGTATCTGTTGATT
TTAATTTAGCACTTCAAGGAAGAGGGGCATATCTAACCTTAAAACCTGAA
TATGTTATTTTGTCGCAAAAAAAGAAACTTTTAGATAAAAAACTCAAAAC
CCAAGTTCCTGAAGAAATATATCAAATCCTTTTAAAATTAATTGCTTCAA
AAACTTAG
>AYWB_206 conserved hypothetical protein
ATGTTAAGAGAAAAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAGTAAAAAGAATTT
AGAAATGCGTAATCAATTAATCGATTTACATTTGCCCTTAGTAAAAAAAC
TAGTTTCTAAATTTAAATATTATCCATGCGTACTTCAAAAACAAGATTTA
TACCAAGAAGGGTTTTTAGGATTAATCAAAGCTCTCAATAATTACCAAGA
TTTAGGTTATGACTTTATCGCTTATGCGGAACCAACTATAAAATCAGAAA
TCAGAGAATTAATAAGAAAAAGTCATTCACCTTCCGTTCCTCAAAAAACT
CATAAAACCAATAACCCTTCTTTTCAAGAAGAAAACACACACATGGCATT
ATCAAATCCTTAA
>AYWB_354 conserved hypothetical protein
ATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGATTTTTTTAAAAATAAAAAGAATTT
AGAAATTCGTAATCAATTAATCGAACTTCATTTGCCTTTATTAAAAAAAC
TAGCTTATCATTTTAAATATTACCCTAAAGTTTTAACTAAGGAGGATTTA
TATCAAGAAGGGATTTTAGGATTAATCAAAGCTCTAAATAATTACCAAGA
TTTAGGTTATGACTTTATCGCCTATGCAACACCAACAATAAAAAAAGCCA
CTCACCTTCAATTCCCCAAAAAACAAACAAACTACCGCCCAAAAACCAAA
CTCTATTTGTAG
>AYWB_045 conserved hypothetical protein
GTGAAGCAATTTAAATATTATCTGCTAGTTTTAACTAAAGAAGATTTATA
TCAAGAAGGGTTTTTAGGATTAATCAAAGCACTAAATAATTACGAAAATT
TAGATTATGACTTTATCACCTATACAACACCAACCATAAAATCGGAAATA
AAAGAACTAATAAGAAAAAGCAACTCACCTTAA
>AYWB_119 conserved hypothetical protein
ATGAAAAAAACCAAAACTCCAAAATCACTTTTGGAAACGGCTTATGACAT
TATGAAAAAACATCAAAATCCTGTTTCGGTCTATGATTTATTAAAACAAA
CATTGCAAAAACATCAAATCTCAAACAACAATCCCAATTTAGCTAATCAA
CTTTATTTAGACATCACTTTGAGTGGGAAATTTGTTTTTTGCGAAAACAA
TCAATTAATTATTAAAGAAAATAATAATTTTTTTTGGGATAAAGATTTTT
TTGAAAAAACTAAAACTTCAAACGACGAGCCTCTAGACGAAGATACCAAT
TTACAAGAATTAGATTTTGAGGATTTCCTTTCTGACAAAGACACTAACCA
AACTGACCCTCTAAAAGATGTTTTGCTTGATTTAGAAGGCGAACCTTCAG
AAGAACAAAACAAAGATGATGACAAAATTGAAGATGATATTATTTTAGAA
GATAAAGATGATTACGAAGATCCATTAGAAGAAGAATACGAACATCTTTA
TGAAAAATAA
>AYWB_070 cspC, cold shock protein
ATGCAAGACAAAAAAGAACAGGGAACATGCAGATGGTTTTCTAAAGACAA
AGGCTACGGATTTATCATTTCAGCTGATGGGAAAGATATTTTCGTACATT
ACAGTTCTATTCAAACTGAAGTCTTTGGAAGAAAAACACTTAATGAAAAC
GACAAGGTGGAATTCACCGTTAAAGAAGGCGACCGCGGAGCTCAAGCTGT
AGATGTTGTTGTAGTTAACGAATAA
>AYWB_420 greA, transcription elongation factor GreA
ATGAATAATAAAATTTATGAACTTACCCAAACAGGAATAGAAAAATTAAA
AAAAGAATTAACTTTTTTAAAAGAAGTTAAAAGAAAAGAAAATTTAGAAG
CTTTAAAAGAAGCGCGCGAACAAGGGGATTTATCGGAAAACGCTGATTAT
GATGCTGCTAGAAACGAACAAGCTTTAATAGAACATCGCATTTCAGAAAT
CCAAAATATTTTAAAAAATGTCCGTGTAGTTAAAGTTTCCAAAGAAAGAG
AAGTAAGTATTGGGAAAAAAGTATCTTTGGAGCTTTTACACACCAAACAA
CAACAAGAAATTGAATTAGTAAGCACCTTGGAAGCAGATCCCTTTACAAA
CAAAATTTCGATTGAATCTCCTTTGGGGCAAAACATCAAAGGGCATCAAA
TAGGAGATATTGTTTTTGTTACCAGCGAAACTGGAAACACTTTTAGAGTC
AAAATTGTAGATGTCCAATAA
>AYWB_059 hrcA, heat-inducible transcription repressor
GTGATGAATATGCTTTCAGATAGAAAAAAATTAATCCTAAAGGCTGTAGT
TGAAAACTATTCACAAAAAAGACAACCAGTAGGTTCTAAAATGCTTACCT
ATTTACCTTATCTTAAATTTGCAAGTGCTACTATTCGTTATGATATGGTG
CAATTAGAAAAAGAGGGGTTTTTACAAAAAAATCATACTTCTAGTGGTAG
AGTTCCTTCTTTTAAGGGTTATGTTTACTATCTAAACCATTTATTAACGC
GTGATCATGATGTTGCTTGTATGTTTGAAAGCATTGACAAAGTGATTCAA
AAAAAGCGTTTTTGTAAAGGGCAAGTAATTAAAGAAGCTCTTAATTTGTT
AAATAATTTAACTAATTATACTACTATGGCAATTGGTTCTGATATTTTTA
ATAATAGTAAAATTACTAAAATTGATTTTATTCCTTTAAATAGTGCTCAA
GCTGTTATTTTGATTATTACTGATAAAGGAAATGTACAACATCAAAATAT
TTCTTTGGAACAAACAAAAGAAATTAGCATTTATGACCTTAAAGATGTAG
TGCAAGTAGTAAATGATTTGTTGAAAGATAAGTTTTTATCAGAAGCAGCC
CATATTATTCAAAGTGATTTTTTTAAAAAAACTATTGCTAAATATATTTG
TTTTCAAGAACAATTAATTGCTTTGTTTATGGAAGCTTTTAGTAGTTTTG
CCTCAGAGAATCTTTATTTTTCGGGGGTTTCTAAAATGCTTGAAAAACCT
GAATTAAACAATCCTGAAATTATTAAAAAATTTATGGGTCTTTTAGAGCG
TAAAGAATTATTAAAAATTATGTTAAATCAAGATAGTTTGTCTTTTAAAT
TTTCTGATGGCTTGCAACTTACTCCTTTAAAAGATTGTATGATTCTTTCT
ATTCCTTTCGATGTAAATCCTAATGAGAAAGGAAGAATTGCAGTTGTAGG
ACCTTCGTGGATGAAATATCCTAAAGTTATTCCTATTTTGGAATATTTGG
CAGTTCATTTATCTAAATTAAACGATCAAGAATAA
>AYWB_572 nusA, N utilization substance protein A
TTGATTAGTAAGAATTTTTTTAAACTTTTAGATAAAATCGCTCAAGAAAG
TGGTTTAGATAAAGACCAAGTTATTGATGCTTTTGCTAAAGGATTGATTT
CTGGTTGCAAAAAAAATCATAAAGTTAAAAGTTGTAAAATCCATTTAAAA
GAAGACAAAAGTGAAATTATTTTATATAAACAATTTTTGGTAGCTGACGA
AGCTACTATCAGCACTATTAATTTAAAAGAGTCAACTCCCATTACTCTTG
AAGAAGCTCAACAAATCAAGCCTCATGCTAAAATAGGTCAAGTAATTGAT
ATTAAAGTTGATCCTAAAGATTTTAATCTATACGCTGTCAAAGAATTTAA
AAATCAATTTAACGAAGAACTTACCAAAAAGAAAAGAGAAAACATTTATA
ATTTTTTTAAACAACAAGAAGGCAAATTAATTAGTGCTAAAATTATTTCA
GAAAACGACAAATTTTATAATTTGGAATTAGAAAAAGAAATTACTACCTT
ACTTCCTAAAAAAGAAATTGCTTCAAATAATGAAATGCAAGTAGGTGAAA
GAATTCAAGTTTTTTTGTCAGAAGTAAAAAAAACTACCAAATGGCCTAAG
ATTTTTGTCAGTTGTAATCATGTTGGACTTGTAGTTAAAGTGTTAGAAGA
AAATATTCCTGAAATCCAAGAAGGCATCGTTAAAATTGCAGGTGTTGCCC
GCATTTCTGGCGAACGCACTAAAATTGGTTTATTTTCTTGTGATGCTCAA
ATAGATGCAATTGGCTCTTGTATTGGCGAAAGAAGCAACCGTATTAAAAA
TGTTATCAAAATCCTTAAAGGCGAAAAAATTGATTTATTTATTTGGAGCG
ACGATCCCCAAGAACTTATTGCAAATGCCCTTAAACCTGCTTCATGCCTT
CAAGTTGTCATCAAAGACGACATTAACAAATGCGCTCTTGCAATTGTACC
TGACGACCAGTTTTCTTTAGCAATTGGTAAATTAGGTAAAAATGTTAAAT
TAGCAGTGGAAGTAACTAAGTGGAATATTGATATCAAAACCTTAGATCAA
GCCCAAATAGAAGGATTAATTTAA
>AYWB_327 nusB, N utilization substance protein B
ATGAAACGTCCTCCAAATAAAAAAGAATCGCGTTTATTACGAATTGAATT
GATGAAATTATTATATCAATATGATTTTTACCAAAATAATTTGACTTTGT
CACAAACAAATACCAATCCCATTTTTACTTTTTTTCAAAAAATTATTACT
AAGCTTAAATTTATTGATGAAATTATTACCAAAAGTTTATATGATTATAA
AATAAATCGCCTTAACAAAGTAGACAGAGCAATCATTCGCCTAGCTACTT
ATGAATTGTTAGAAACAAACATTTCTCACGCCATTATAATCGATGAGGCA
ATAGAAATTACCAAACAATTCTGCAATTTAAACGATGAAAAACAACATAA
ATTCAACAATAAATTATTAGATCAAATATATCGACAATTACAAATGTATA
AAAAACTTATTACCTAA
>AYWB_466 nusG, transcription antitermination protein nusG
ATGAATAAAGCGGAAAAACAAATAAAAGAGACACAAGCGCAAGAAAAAGA
ATTCCAAAACACATGCCACCTTAAATGGTATATTGCCCAAACTTATTCAG
GTTATGAAAACGTTGTAAAAGATGATTTGTTAAGAAGAGTCGAAAGCATT
GGCATAGGTGATTTAGTATCTAATGTTTTGTCTCCTAAAGAAGAATATTA
TGAAACTCGTTTGGATGGAAAAAAGGTTAAAAAAGAGCGTAAAATGTATC
CTGGATACGTTTTTATTCAAATGATGATTACTGACCGATCTTGGTTTGTT
GTCAGAAACACTCCGAGAATTACTGGTTTTTTAGGTTCAAGCGGGATGGG
TTCTAAACCAGTTCCTTTATCTGAAAACGAAATCAATCCCGTTTTATTAA
AAATGGGTATCATCAACAAACCCGATTATAAAAAATTCATCGGCAAAAAA
GTAGAAATCATTTCTGGTTCTTTTGTGGGTCAAATAGGGCAAGTATCAAG
TATTGATGCAGACCGTGAAAAAATGATATTGGAAGTAGATTTGTTTGGTA
GAGCAACTCCAGTAGAAATTTCTTTCAACGACTTCAAAGAAATATTTTAA
>AYWB_143 rnc, dsRNA-specific ribonuclease
ATGAAAAACATCCAAATTCTTTTTCAAACCCTCAATATTTTTCCCAAAAA
CCTTGTCCTTTACAAACAGGCTCTTACACATAGCTCTTATTCTAACGAAC
AAACCCCACCTCAAGAAGACAACGAAAGACTTGAATTTTTAGGAGATGCC
ATCGTAGGCTTACTTATGGCTGACTATCTTTATTCCCAATCCAAAGAAGA
CGAAGGCATTATGACTAAAAAAAGAGCTCAGGCTGTGTGCGAAAAGTCGC
TTACCATCTACGCTCAAAAAATTGAATTGCAAAATTATCTTCTTTTAGGT
AAAGGTGAAAAAAACAAAGATTTTAATGCTAAAGGCATTATGGCAGACAC
TTTTGAAGCCTTATTTGGTGCTATTTATCTTGATTTAGGATATTTAACAG
CCAAAAAAGTTTTTCATAATATTGTCTTACCTCACTTAGCCAAAACTATT
TATATTATTGATTTTAAAACTCAATTACAAGAAATAGTTCAGTCAGAAAA
AAAAACTATCCAATATAAAATAGTCCAAGAACAAGGACCTGCTCATTCTA
AAAATTTTGTAGCAGAAGTCTATTTAGAAAAAAATCTTTTAGGAACAGGT
GAAGGTAGCACTAAAAAATCCGCTGAGCAAAAAGCAGCCCAACAAGCATT
GTCCAAAGTTGCCAAAACCAAAGACCTAATCAAAAACAAAGGCGTCAAAG
AAAAGGAGCTTTAA
>AYWB_495 rpoA, DNA-directed RNA polymerase alpha chain
ATGAAAAATCTTAAATTTATTAAACCTTTTTTTGTTGAAGAAATTGATGA
AAATCCCATTTCCGGGAAATTCACTATCAAACCTTTAGAAAGAGGATACG
GCATTACTGTGGGAAACGCCCTAAGAAGAGTTTTGTTATCTTCTTTGCCT
GGTGCTGCTATTGTAAATGTTAAAATTCAAGGAGTAGAACAAGAATTCAC
TACTATTCCGGGCGTTTATGAAGATGTCATGACAATTATTTTAAATTTAA
AAAAAATTGTTTTTGCCGTAGACGACGAATCAGATGATTTTGAAGAAAAA
TTAGAATTAATCGCTAAAGGACCACAACGCCTAACTGCTGCTTCTTTCGA
ACTGCCTGCAGGAGTTAAAATCATCAACCCCGATCATTACATTACCACCC
TTTCTGATGATGTTTGCTTTCATATGACAGTCACTATTAAAAAAGGCATC
GGTTATGTTGGTGCCAAAGAAAATAAAGTTCACATTGAAAATCAAGTAGG
CGTTATTGCAATTGACTCTTTATTTACTCCTGTTGTTAATGTTTCTTATC
AAGTAGAAAAAAAATTAGGCAATAAAGACGAATTAACTATTGAAATTACC
ACTAACGGCGCTCTTTTAGCTAAAGAAGCTTTAGCAACTGCAGCTAGCAT
TTTAGTAGATCATTTCAATGTTTTAGTAGAATTAAGCCAAAAACCTGCTC
ATGTAGAATTTGTTTCTGAATCTAAAAAAGAAGCCCATAATTACGTGCTA
GATTTAGAAATTGAACAATTAGATTTATCTGTAAGACTTTTCAACAGTCT
TAAAAGAGCAGGGATTGATACAGTTGCTTCTTTAGTGAAATTAAGTGAAA
AAGAAGTTGTCAAACTGAAAAGCCTAGGACGAAAATCTTTCCAAGAATTA
AAAGATAAATTTTTAGAATATGGTTTAGAATTCAACGATTACCTCAAAGA
AGCTTTGCATCATAGCGTTGAAGAAGACAAAGACAAACATTAA
>AYWB_461 rpoB, DNA-directed RNA polymerase beta chain
ATGGGTTATCATAATGTCAAATATGGCAAAAAAGCACAACGTCGTAATTA
TTCTAAAACAATTTATGATGTTGATTTGCCCAATTTAATTGAAATTCAAA
ACCAATCTTTTGATTGGTTTTTAAAACACGGTATTAAAGAATTATTGCAG
GATTTTTGTCCTATTGAAAGTTACAATGGGGATTTAAAAATTCACTTTGA
TGATTATTTTTTAACGCCTCCAAAATATAGCATTGAAGAAACTAAAATTA
AAGATATAAGTTATGTTGCCCAATTATTTGTCAAAACTACTTTAGAAAAT
GTTTTAACTGGCGAAACTAAACAAAGCAATATTTTGCTTACTGAATTGCC
TCTAATGACTTCTACTGGCACTTTTATCATCAATGGTACTGAAAGAGTAG
TAGTTTCTCAAATTGTACGTTCCGCTAGTGTTTATTTTGCAGGCAATTTT
GACATCAAACTCAATAGAACCATTTATTCTGGACAAGTAATTCCTTCACG
TGGTGCTTGGATCGAATACGAAGAAGGTTCTAAAGAAATTTTGTATGCCA
AACTAGATCGTTCCAAAAAAATCCCTTTGTCTAATTTTATTTATGCTCTA
GGATTTGACAGCAAAGAAGCAATCGAAAATGTTTTTGGTAAAAGTGCTAT
TCTTGATTCTGTTTTTGATAAAGAAACTGATATGGACTCAGATAACGCCT
TGGTAGAGTTGTATTCTAAAATCCGTCAAGGCGAAAAAGTTCCTGTCGAC
ACTGCCAGAGATTTCATCAGAACAAGACTTTTTGATCAAAAAAAATACGA
CCTGGCTAAAGTTGGAAGATATAAATTTAACAAAAAACTAGACGTTCTTA
CTCGAGCTGAAAACACTTATTTAGCTTGTGATTTTGTCAATCCTGAAAAC
CAAGAAATAATGATTGCACAAGATGAACTTTTAACCAAAGAAAAAATTGC
AATCCTGAAACAAAATCGTCATTTTTTGCTTCAAGAAATCTTTGATGCTA
AACACAATTTAGAAAACGAAACTGATGAAGAGATTTTAGCATATAAAAAA
TATCCTCAAAAAAATGAATTATTCACCAAAACTAACATCATCAACTCTCG
TACTGGTGAAGTTTTAGTAGCTAAAGATACTTTAGTTAACGACGATATTA
TCAATCATTTAAGGCACAATATTCACACTCTTGACGAAAAAGTATCTAAA
TTTTTCTTAGGAACTAAAGATATTTATCAAAAAGAAGCAGACCGTCAAGG
AGTTTTTAACGAAATTTTAGAAGTCTATACTTCAAAAGACGAATCAGGCA
AGTTATATAACAAAGTCAAACTTATTGGAAACGACCAAAGAGAAACCAAA
AAACACATTACTTTATCAGATGTTATTGCAAGCATTAATTATTATTTGAA
TCTTTATGAAAACGTAGGCACTGTTGATGATATCGATCATTTAGGTAATC
GTCGTTTAAGATTAATTGGAGAATTGTTAAAAAACCAATTTCGAATTGGT
CTTACCAGAGCTGAAAAAAATATCAAAGATATGATTTCTACTAGCAAATT
CGGTGAAGTTAACGGTCCAGGTGACCTAGTTAATTTTACTTTTTTAATGA
GTGTAATCAAAACTTTTTTCACAAACTCACGTTTATCACAATTCATGGAT
CAAATCAATCCTTTAGCAGAATTGACGCAAAAAAGAAGGGTATCAGCTCT
AGGTATCGGAGGAATTAATCGTGACCGCGCAGGCATTGAAGTTCGCGACG
TGCACAATTCCCACTACGGCAGATTATGTCCCATCGAAACTCCCGAAGGA
CCTTCCATTGGACTTATAACATCCCTTTCCACTTATGCCAAAGTCAATAA
GTACGGTTTTATCCAAACTCCTTTTTTTAAGGTTTTGCAACAAGACGGAA
AAACTACCCTTTCGCGGGACATAGACTATTTAACAGCTGACCAAGAAAAA
GAAGAAATTATTGCCTCAGCTGGGTTTGTTTTGGATGCCAATAATTCTTT
TCAAGATAAAAAAATAATTGCTCGTAGCAACGGCGAAACAGGCATTTTCG
AAAGAAACCAAATAACATATGCTGACGTTTCCCCTAAACAAATTGTCTCT
GTTGCAACTTCTTCGATTCCCTTTTTAGAACACAACGATGCTTCCAGAGC
TTTAATGGGAGCTAATATGCAACGTCAAGCAGTCCCTTTATTAATTCCTG
AATCGCCTATTGTAGGAACAGGTGTTGAATATCGCGCTGCCAAAGACTCA
GGTTGTTTAATTATTGCCCGTGAATCAGGGTTTGTTACTTATGTTGATGC
TCAAAAAATAATTATCACCAAAAAACCCAACCAAACTGTTTCATTAAATG
GTAAAACCCTTTACGATACCACCCAAGAATTTACCTATACCCAAGCCAAG
GTTTTATACGAAAACAACCATAAAGAATACCAAGCTGAATACACCCTCAT
CAACTTTGCCAAATCCAATCAAGATACTTTAGTGTTGCAAAAACCGATTG
TAGTTTTGGGAGAACATATCAATGAAGGCGATATTTTAGTAAGTGGACCT
TCTACATCTCAAGGCGAATTAGCACTTGGCAGAAATGTTACAGTGGCTTT
TATGACTTGGGAAGGTTATAACTATGAAGATGCCATCATTATGTCAGAAG
AATTAGTCAAACACGATGTCTACACTTCCATCCACATTGATAAATATGAA
GTCCAAACTAGAGAATTAAAAAAAGGTAGCGGTCAAGAAGAAATCACTAG
AGAAGTCCCTAACGTGGGCGCTGATGCTATTAAAAACCTTGACGAAAGAG
GAATTATTATTCCTGGTTCTGAAGTTAAAGAAGGCGATATTTTAGTAGGT
AAAATCACTCCTCAAGGAAATATCGAGCCTTCTCCTTCTGAAAAATTAAT
TCAAATCGTAATCGGTGAAAAAGCCCGCGAATATAAAGACTCTTCTTTAA
GAGTTCCTTTTGGTGAAGGAGGCATCGTCCAAAGTGTTCATTATTTCTCC
AGAAAAAATGGTGATGTTCTTCCTGCTGGTGTCAACGAAAACATCCGTGT
TTTCATCGCTAAAAAACGTAAAATCAACGAAGGCGATAAAATGGCAGGAC
GTCACGGGAACAAAGGTGTAATTTCTCGTATTTTACCTAAAGAAGATCTT
CCTTATATGGCAGACGGAACTCCAATTGACATCATGTTAAATCCTTTAGG
GGTTCCTAGTAGGATGAACATTGGACAAATTTTAGAAATCCATTTAGGAA
TGGCTGCCAAAAAATTAGGCATCAAAGTGGCAACTCCTGTTTTTGATGGC
GTTAATGACTACGACCTTAAAGAAATCATGAAAGAAGCCAATTTAGAACC
TGATGGCAAAATGGTTTTATATGACGGACGCACCGGCGAACCTTATGACA
GTCGTATTTCTGTAGGAGTTATGTATATGGTTAAATTATCTCACATGGTA
GATGACAAACTCCACGCCAGAAACGTAGGACCATACACTTTAGTTACCCA
ACAACCTATGGGAGGAAAAGTTCAAAACGGTGGACAACGCTTCGGTGAAA
TGGAAGTATGGGCACTTTATGCTTATGGAGCTGCTCACACCTTACAAGAA
ATTTTAACAGTCAAAAGCGATGATATTGTAGGTAGAAATAAAACTTATAG
CGCCATCGTTCAAGGAACTCAACTACCTAAACCAAGTATTCCTGAAAGTT
TTCGAGTTTTTATTAAAGAATTGCAATCTTTAGGATTGTACGTAGAATTA
ATTAAAACCGATACTAAAGAAAATGAAGTTAATAAATCCTTAATTGATTA
CAAAAAGGAAGGTTATAATTAA
>AYWB_460 rpoC, DNA-directed RNA polymerase beta' chain
ATGAGTGATAATAGATTATTTACTTCAGTAGAAACTTTAAATCTTTCGTC
TCCAGTTTTAGAAAAATTAAAACTTTCTGGAATCAATACTTTGGAGGATT
TTAACACTTTTACTTTAGAAGAGTTGAGGCTTTTACTGCAAGAAGCTTTT
TTAGAGGTTTTGCCTATCCTCAAAAACTTTGCCTTACCTCGCAATTTACA
AAATCTAGATTTGAGTGAGGCTGTTATTAACATCCTTACTGAACTAGGAA
TGGAAGATTTTCAAGATCTTTTGCAAACTAAAATGGCTGTCCTTACAAAA
TCATTTGAAACCAATCCCCTTGCTTTTCAAAAACTAAACGACCTATTTAA
GTTATATAATCATTTTCCTTCTATTTCATCTGATAAAGAATACGGTAGTA
GAGATTATGATTATTTTAAAATCCGTTTAGCTGCTCCTGAAGAAATCAGA
CAGTGGTCTTATGGTGAGGTTACCAGCTACGAAACAATTAACTATCGGAC
CTATAAACCAGAGATATCAGGATTATTTTGTCAAAAGATTTTTGGCCCAG
TAGTTGATTTCCAATGTGCTTGTTCTAAAAAACAAGTCAGTATCAAAAGT
CAATTTTGTAACAAATGTGGAGTTGAATTTACCGAAACCAAAGTGCGTCG
TGAAAGAATGGGGCACATTGAATTACAAACTCCAATCGTTCACACTTGGT
ACCTTAATTCTTCTCCCAGCCGTTTAGCTATTCTTTTAAATATCAAAACT
AAACAATTAGAAGAAATAGTTTATTATGTTTCTTACGTTGTAATTGATCC
TGGAAAAACTGAATTCAAACCTAAAGAAATTATTACAGAAACCCAATACA
GTGAAGCTCTTTATGAATTTGGAAACACTTTTGTAGCTTTAACAGGTGCC
GAAGCGGTTAAAAAATTACTAGAAAATCTCAACTTAGAAAAAACTATCAA
AGTCCTTCGCAAATCTTTATCGGAAAATTCCAAACAAAAAAGAGAAAGCA
TCATTAAAAGACTAGAAATCATCGAATCTTTTCATCAATCAGACAACAAA
CCTGAATGGATGGTAATGGATGTTATTCCTGTATTGCCTCCAGGATTAAG
ACCGATGGTTCCTTTAGATGGTGGTCGTTTTGCCACTACTGAAGTTAACG
ATCTTTACCGCCGTATCCTTAATCGCAACAATCGTTTAAAAAAACAAATG
CTCCAAAAAGCTCCTCGTTTAATCATTAAAAACGAAAAAAGAATGCTACA
AGAAGCAGTTGATGCTTTGTTTGATAATACCAAAACTAGCAAAAAAAACG
TTAACAATGTCGAAAAAAACCGTCCACTTAAATCTTTATCCGAAATGCTA
CGTGGCAAACAAGGGCGTTTCCGTCAAAATCTTTTAGGCAAAAGAGTTGA
TTATTCGGGACGCTCCGTAATTATTGTAGGTCCTGATTTAGAAATGCACC
AATGCGGCGTGCCTCGTGAAATGGCAATTATTTTGTTCAAACCTTTCATT
TTGAAAAAATTACAAGAAACCAAAGGTATCGATAAAAAAAACGCTAACAC
CATTTATGAAAAAATGAATGAAGAGGTTTGGAACGCCTTAGAAGAAGTAG
TCAAAGAACACCCAGTTCTTTTAAACCGCGCCCCAACGCTACACCGTTTA
GGAATTCAAGCTTTTGATCCTAAATTAATTGACGGCAAAGCCATTCGCTT
ACATCCTTTAGTTACGCCTGCCTTTAATGCCGATTTCGATGGCGACCAGA
TGGCAATTTATGTTCCTCTTTCTTTAGAAGCGCAGGCTGAAGCACGCTTA
TTGATGCTTGTTTCGAACAATATTTTAGACCCTAAAAATGGTAATCCAGT
AGTAACTCCTTCACAAGATATGGTTTTAGGGAATTACTATTTAACGATTG
AAGAAAAAAAAGATCGTACTATAAACAGTTATGATTCTGCCCAAAGAACT
GCAGAACACCAATTCAAACATCGTAATGAAGGAACCTTTTTTGCTGATAT
CAACGAAGCCAAAACTGCTTATCAAAATAAAGAAATCCATCTTCATACAA
GAATTTTTATCAAACCACAAACAATTAATTTATCATTTACCGAAGAACAA
CGTCAAAAATATTTAATGACTACTTTAGGAAAATTAATTTTTAATGACAT
TTTGCCTCCAAGCTTCCCCTACATTAATGAACCAACCCAGTTTAATTTGG
ATGTTAAAACCCCTGATGCTTATTTTTTACCCCCAGGAACCAACCCCAAA
CAATTCTTAAAAAAACTTCCCACCCCCAAACCTTTCAACAAAAAATTCCT
ATCTATGATTATTGCATGTTTTTTCAAACAAATGAAAATTACAGAAACTT
CTAAAATGCTAGATCATATCAAAAACTTAGGTTTCAAGTATTCCACCATT
GCAGGAATTACAGTTTCATTTGCAGACATCAATACTTACTCCAATAAACA
AGAATTGTTACAAGAAGTAGAAACCCGCAATATTCAAATTGAGACTTGGC
ATAAAGATGGTTTTTTAACAGATGCCGAACGTCGTCGTTTAGTAATTAAC
GAATGGAAAACTATTCGTGATGAAATTCAAGAAGGTTTGATGAAAGAATT
CAAACAAGACAACCACATTTTTATGATGAGCGAAAGTGGAGCGCGTGGTA
GTGTTTCTAACTTTACTCAATTAGCAGGGATGAGAGGATTAATGAATAAC
CCTAAAGGTGAAATTATTGAAGTCCCTGTTAAAGCTTCTTTCCGAGAAGG
TCTGAAAGTTTCTGAGTTTTTTATCTCTACTCACGGCGCCCGTAAAGGTT
CAACTGATACTGCCCTCAAAACAGCTGAGTCAGGTTATCTAACACGTCGT
TTAGTTGACGTAACTCAAGATATTGTCGTTATTAAAGAAGACTGTAATAG
TGACCGCGGGTTTATTGTGGAAGCTATGATGAGTGATGGCAAAGAAATTG
TATCTCTCAAAAAACGCATTATGGGACGCTTTGCTAGTTGCGACATTTGT
CACCCCAAAACCAACACCCTTATTGTAGCGCGTAATGAATTAATTATCGA
GTCTAAAGCACAAGAAATTATTACTGCCAAAATTAAAAAAGTTCCTATTA
GAAGTATTTTAACTTGTAATTGTGAATATGGTATTTGTGCCAAAGACTAT
GGCGTAAATCTAGCTACTAACAAATTAGTAGAAATTGGCGAAGCTGTTGG
TGTTATTGCTGCTCAATCCATCGGTGAACCAGGAACTCAATTAACTATGA
GAACTTTCCATACTGGTGGAGTTGCTTCTGCCTCAGATATTACTCAAGGT
CTTCCAAGGATCGAAGAATTATTTGAAGTACGCAAACCTAAAGGAAAAGC
GCTAATTAGTGAATTAAAAGGAAAAATCAAAAAAATTGATAAAATCCGTT
CCCAAAATCCAGAAATTGTAATTACAGAAGAAAATGACCCTGACACAGAA
CACCGTTATATTTTGGAACCTAATGTTGATATTTTAGTAAGCAAAAACAA
CATTGTTTATCCTGGTCAAAAACTAACTTCTGGTTCGGTTGATCTAAAAG
AACTTTTAAGAGTGGCAGGAACAACAGAGGTTCAAAAATACATCTTAGAA
GAAGTACAAAAAGTTTATCGCGCCCAAAATGTTTATATCAGCGACAAACA
TATCGAAATTATTATTCACCAAATGTTTAAACAAATTTTAATTATTGATG
AAGGTGATACTCATCTTTTACCTGGCACAGAAATTACTATTAATAAATTT
AAAAAAGCTAATTTAAAAATGTTAGAAGAAAAAAAACGTTTAGCGGTGGG
ACGCCCTATTATTTTAGGAATTACGCGTTCTTCTTTAAGAAGTGATTCTT
TACTTTCAGCTGCATCTTTTCAAGAAACTACCAAAATTCTAATCGATGCT
GCCATCAAAGGGAAAACTGACCATCTTTACGGACTTAAAGAAAATGTTAT
TATTGGTGGCTTAATTCCTGCAGGAACAGGAATTTTAGAAACTACTTTAT
TTAAATATCCAAAAGAACCTGCAACCACTTCTGAACTTACTAAAAAAACC
AACCAAAATTAA
>AYWB_107 rpoD, RNA polymerase sigma factor RpoD
ATGGAATTAGATAACATAATCAAAACTTTAAATGAGCAAGCTGGAAGAAA
AAAAAAACTAACATCTCAATTAATTATTTCTTTTTTGCAAAATCAAAACA
TAAAAATACCATATCAACAAATAGCACAAAACTTAAACGAACAAGGGATT
CAAATTATTTCTTGCGAAACACAAGCAGCTACATCTCTAAATAAAAACCA
CAATAAAAATGATACAAACAACCAAACAAATACCCCCAATGATGTTTTTA
CTGACTTTGATTCCGGATCAACAAATGCAAATTTAGAAAAAACAGATGAA
AACAAAGATGAAGATAACACGCAAGACTCAGAAGAAGACATCCAGGATTT
TGACATTTCTGAAGAAGACTTAATATCAGATGAAAAAATCACAGAATTAG
AAGAAGATGAAGATGAAAAAATTTCTAAAGAAGAAATTTCTAAAATCCAT
TCTGATATTAAAATGGATGACTCAGTTCGCATGTATTTAAAAGAAATTGG
TCAAATTCCTTTGCTTTCACTGGCAGAAGAACAAAAAAAATCCATTTTAG
TTTTTTTAGGAAAACAAGCCAAACAAAAGCTAGCCAAACATAAAACCAAA
GAAATTGAATTATCCGAAGATCAACTCCAAGAAGCACATGACCAAATCAA
ACAAGCAAGACGCGCAAAAGATATTTTGGTAGAATCCAATTATAGATTAG
TAGTTTCAATTGCCAAACGTTATATTGGAAGAGGAATTTTGTTTCTTGAT
TTAATTCAAGAAGGTAATATGGGCTTAATGCGTGCAGTAGATAAATTCGA
TTATCAAAAAGGATTTAAATTTTCTACTTATGCCACTTGGTGGATCAGAC
AAGCTATAACAAGAGCGATTGCCGATCAAGCAAGAACTATCCGAATTCCT
GTACACATCGTAGAAACTATTAATAAAATGGCACTTTGTACTCGAAAATT
AACTCAAAAACTTAAGAAAAAACCTACAGTCGAAGAGTTAGCCGACAAAA
TGAATATTTCTGCTGAAAAAATTCGCAGCATCCAATATATCGAAAAAAAA
CCCATCTCTTTGGAAGCCCCTGCACGAGAAAACGAAGAAGACGAAACTTC
TTTGGGCGATTTTATCTCAGATCCCAATATTTTATCTCCCCACGAATACA
TGATGAAAGAGGTAACTCAAAAACTTTTAGATGAAGTCCTAGAAAACACC
TTAACTGAACGCGAGGAAAAAGTATTAAAAATGCGCTATGGTCTTTTAGA
TGGAAAAACCCACACTTTAGAAGAAGTAGGTACTTTATTTGGAGTTACTA
GAGAAAGAATCCGCCAAATTGAATCAAAAGCTCTAAGACGACTCAGAACT
CCAGCTAAACAAAGCAAATTAAAAAGTTTGTACCACAACCACAAATAA
>AYWB_359 rpoD, RNA polymerase sigma factor
ATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAATAAAAAGAATTT
AGAAATTCGTAATCAATTAATCGAACTTCATTTACCTTTAGTAAAAAAAA
TAACTTATCATTTTAAATATTGCCCTAAAGTTTTAACTAAGGAGGATTTA
TATCAAGAAGGGATTTTAGGATTAATCAAAGCTCTAAATAATTACCAAGA
TTTAGGTTATGACTTTATCGCCTATGCAACACCAACAATAAAATCAGCAA
TCAATGAACTAATAAGAAAAAGCCATTCACCTTCAATTCCCCAAAAAACA
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>AYWB_194 rpoD, RNA polymerase sigma factor
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>AYWB_380 rpoD, RNA polymerase sigma factor
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>AYWB_654 rpoZ, DNA-directed RNA polymerase omega chain
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>AYWB_596 spoT, GTP pyrophosphokinase
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>AYWB_318 srmB, superfamily II DNA and RNA helicase
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>AYWB_054 srmB, superfamily II DNA and RNA helicase
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TACGTTTGTTAGACTTAAAAAAGGATTATTCAACTATCTTATTTGCAAAC
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TTTAGCTGATGCAGTTCACGGAGATTTAAAACAAAACCAAAGGCAATATG
TAATGAATAATTTTCGTAAAGGCAAAATCAAAATCTTAATTGCAACTGAT
GTAGCTGCAAGAGGTCTTGACATTTCTGACATCAAAATGGTAATTAACTA
TGACTTACCACATGAAGACGAAGTTTATGTTCACCGCATAGGAAGAACTG
GAAGAGCTGGTAAAAAAGGTTTAGCTTACAGTTTAATTAGTCCCAGAAAA
GTAAGCCAACTTAAAAAATTGGAATACTACTTAAAAGAAAAAATCACTTT
ACTAGATATTCCTTCTGTTCAAAGCATCAAATTACAAAATGCCAAGGATT
TAGAAAAAAAAATATTAAATATTATTGAAAAAAACAAGGAAGAAACTACT
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