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COG category: Transcription
Organism: Mycoplasma pneumoniae M129, M129

Number of genes found: 21

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# Mycoplasma pneumoniae M129, M129

>gid:853883  B01_orf168  conserved hypothetical protein
ATGTGCCCCAGTTCATTCGTACTGGTGATAAGATTGTGATTTCCACCATT
GACGGGAGCTATCGTGAACGGTACAACAAGTAAATTAACTAGAACCCAAA
GACGGATTGCAATTGTGGAGTTTATCTTCGCCACGCTGTTCTTTTTACCG
AAAACTGCTGACCAAATCCAAGCGGCCTTTTTGGACTATGATGTGCCAGA
ACGTCCGCTCAACGATTGGCAAAAAGAGATTGTCAAAGTCTTTAGTGAAC
GTTGTGTGGAATTCATTGAACTAATTGAAAACCAACAACAACGCAACCAA
GCAGAAGTACAAAGCAAGTACAACAAGGTTTCCGGTAAAAAAGTCGACTT
ATTGACTAAGGCCGTGATTCTCTGTGCTTTGAGCGAACAACACGCGCAAG
CGACTGATAAACCATTATTAATTAGTGAAGCCTTACTGATTATGGACCAC
TATTCCCAGGTACCCGAAAAGAAGCAAACCCATGCTTTATTGGATAAACT
CTTGTAA
>gid:854561  C12_orf172  conserved hypothetical protein
ATGAAACTACAAATTTTTAATACAAAGCTAGGATTACTAGCAGCTAAGAT
TTACTGAAAGTCCTGGAGACACCTAGGACTGTCTGAAGATGAAATTGTGT
CAATTGCGCTCCACGCCGAGCATGACTCCAAGAAGCGCTATGACCCCAAA
TACGGTTTGAGCTTTGAGACCTACTTGAAGTTAAATGGTGCTAACTTCAT
TAAGTCGAGTTACCGTAGCTTAATGAATAAGGTTGATGACTGAATTGGCT
TTAAGGACATGAAAACACTCGAGGAACAAAACACAGTCTCTTACACTCCT
GAAAACTATTTAAGAAGTGTAGAATTCCGTGAAATGGTGCACTTAGCGTT
TAAGAAAGCCAAGAATGAGGATGAACGTCAGGTGTTTGCGCTTTATGTAA
AGGGTTACAAAAATTTAGAGATTGCTAAAAAACTCAACCTAACGACCCGT
AGAGTGCGCTACCTAATTTCAATCTTTAAGGATCACATTAAGGTATTGAC
TAAACGGTATGGTTACTAG
>gid:854555  C12_orf839  conserved hypothetical protein
ATGCTGAAACAGATTTCCACTACCACTAAGAAAGAACCGTGAGTTAATTT
GTCCTTGTTAATGGTCCATAACTCCTTTTTGGACATTAACTACTTCTGAA
CCACCAACCTCAGCATCCATAAATACGGTAACTACCTCGTTAATAACCTC
AATAAGGCACAGTGAAACACGTTGTCGAGTGTTTTACAACTCAAAAAAGC
GCCCCATTCCGGTTTTTTGTGAACGGATCAACACAACTATATTCCGCTGC
ATCGCGTTAAAACCAACTTGTGTGAAAAAATTGAACTGGCCGCGGTGCAA
CAAAGCCATCCGTTTCACCAAACTATTCATGATTTTTTAAGACAAAGTAC
TTGTCCTAAAAAACGACAGCGTTTAATTGAAAAACTGCAAATTCCCAATG
AGTTGCGCTGATTTTTGGGCTTTAATGCACTCAAGAAGTTAAGCCAGTTT
GTGGTGTTTGAACTAGATAACACCAATAAGTTAACGAGTGAAACACTTAG
TCAGTTCTTCACCACTAAGTTTGTCAATAAGGTGTACTTTAACCAGATCC
AGTTTGAGTACAACAACTTTGTTGGTTTATTGGAAGACCATGAACGTGAC
CTAGTGGAATTTAGCACCCACTTCTTTAACAGCTTCTTTGAACAACCTGA
TCACTTAACTAAAAGTTTTTTTGAACAGTACTATGCGCTTACAAGACAAC
GAGAACGTTTACTGCACAATTTAAAAGTTCAAAGCTATGAAACCAAACAC
GGGGTTAATACCTACTTTGAAAATTTGCAAATTACCCGTGCACAACAGCA
AGCCAATCAGCTTAAGCGTGCCTTCAAAAAACAGCAGCGCAATTCGGTGC
AGCTGATTAACCGCTTTATGTCGTCCTTGTGGTGGAGTCAAACCAAGATT
AAGTTCAAGAGTATCTTTAACTTTTACAAAACCCGGATTTTGGAAAAACG
GATTGTAGCCAAGCGAATCCAAATCAAAATTTGACTGTTAAAGGAACTGA
AACAAATGCGCTTACTTAATCCCGATTTGTTAGTGAGCACAATTGCTGAA
AGTGAGCGCCTAGTAGAACAGTTAATGAGCAACATCCAGCGCTTGTACCA
GCAAATTTTGCAGCTAAAACCAGGTCAATCACTTAACTGAAAATACCAAG
CAATTAGCTTTGAATTGGAAAAGTTAACTAAGCCAATTGTTTTGACTCAT
GATGCGGTGATTGGTTTTTTAATTAAATCTCGTTTAGCTTTTTTGCAAGA
ATACGCTAAGGGCTTAAATCGCTGTGAGCAACACAACAAGCTGGTCAATG
AGTTAAAGCAAAACGTTCTGTTAAACCAAAACCAGTATAAGGGTGAGGTT
AGCCAAAGCTATTCGGTTGTAAACCAAAAGGCGGTTTTTAAGGGTTTTAT
CCAAACAGTTAAAGCAGCGCTTAACTACACTAAGTTAAAACACACCTTAG
ATCCGTTTAACCTAATGAATATTGTTCAAGAACGCTGTTTTGAACAACTC
TTAACTACTTACGAAAAATTAGATTGAACGAAATACGAATTGAACCAACT
CTACTTTGTGTGCCGTGCTTTATGAACTAACTTGCACAAACAAACACAAC
ACTTCTTTACCAAATACCAGTTTATTACCCATGGTGTGGTTGACTTTGTC
TTTAACCAAGGTCGGAATCAAACTCAGTTTGCCAGCTTAAAGGCCAACTT
AAACCGCGATTGAAATTCCCCGAAGTGAAAGTTACTGGTGAATAAAACAG
TTAATAAATACTTCGAAGCCAACTTGCACCACCCTCAAGCTTACTTGTTG
TTACCTAATCGTAATGCCACTACTTTAACAGAAGCAAACACCACTACCAT
AAACCAACTTAACTTAAAAACCCAGCTCAAACAGTGACGGGCACACTACC
ACCTCCTTTTACAAGACATTCGTTTAATCCAGTGGTTGTACAAAAAAGAA
ATTAAGCAAAAGCAACAGCAAATTAAAGCACTGCTAAAAAATTATGGCAC
TTTAAATAAGCTGCTCAATACTCAAATTAGTAAAGTCAATAACGTGGTAC
GCAAAACCTTCTTTGTGGATTCAGAAGAGTGTGATTTAAACCGTTTACAG
GCATCGAATAAGCTGCACTTTAATCTCTTAAACGCGATGGTGAATGTCAT
TAGTTTTTGTCTCAAAAAGTGCCGGCAAAATCCCAAAAAACTAAACCGTA
CTGCTAACCTCAAAATGCTGTTGGATAACACCTTTAAAAACGGTATTCCG
AGCTGAATGATCTTTAGCGATTTAAATAAAATTAACACCAAGCAACGCTT
TAAACTTTACCTGTTATTTAAGCTATTGTTACACCCCCAGTTGGTGTTGG
TCGACTCCTTTGTCAACTTTAACAAACACACTTATAACTTTACCCGTGGT
TTGTTAATTGCCCACCAAAACCAACAAGGCATTGCATATTTATTTAACGA
TCCGCACAATAACCTCGTAAAGGATTTTTTCACCCAAACAATTAACTTTG
AAACCAGAGCTAAAAACTAA
>gid:854126  K04_orf389  Ser/Thr/Tyr protein kinase
ATGGCACTAAATTTAAAGATTGGTGACATTGTCCAAAACAAGTACCGGAT
TGAAAAGCTAATCAACCGTGGCGGGATGAACTCTTACCTGTTTTTAGCGA
GCAACCTCCACGTCCAGGAATTTGGTCCACTGCAAAAGCGCCAGTTTACC
CGGTTGGTGTTAAAGGTAGTACAACGCACCGACAAGATTAACGACAACAA
CTGGAAGAAGTTTTTGGATGGAACCATTACCACGACACGGGTGTCACACA
AAAATCTGGTGCAAACCTTTGATGTAGTTAGCCCCCGTTTAAGCGTTTTG
AGTGAAAACCAGGTGATCGTTTTAGAGGACACGGTGATGATTGTAATGGA
GTATGTTGATGGTCCTTCTTTGCGTGAAATGCTCAACCAGAAGGGTTACT
TTAGTGTGCAGGAGGTGGTGTACTACTTTACAAAGCTAGTCAAAGTAATT
AACTACCTCCACAGTTTTGAACACCAAATTATTCACCGTGATCTAAAGCC
AGAAAACATCCTGTTTACGAGTAACTTGACTGACATTAAACTGCTTGACT
TTGGCATTGCTTCCGCTGTTATTCGTAACGCTGAGAAAACTGAAGTGTTA
ACGGACGAAAACTCGTTGTTTGGTACAGTTAGTTATATGACACCCGAAGT
GTTGGAAAGTACTGTCAACAAAGAAGGCAAACGGATTCGTAAACCCCCTA
CAGTGCAGTATGACATCTATTCATTAGGAGTTATTTTGTTTGAAATGTTA
GTCGGACGCGTACCGTTCAATAAATCGATTGATCCTAAAAAAGAACGGGA
AACCATCCAAAAGGCGCGTAACTTTGATGTACCTTTAATGGGAAACTTGC
GCAGTGATGTTCCGGTTAGTTTGGAAAACATTGTCTTTAAATGTACGGCT
GTTAAACGTGAAAACAGTAAGTGGATGTATAGTGACACGAAGCAACTCTT
GGCTGATTTGGCGCAATGACAAACCGAGCAAACCTTAATTAAACCAGTGC
ACGAACGTATTCTAGAAGGACAAAACGAAATGCGTGAACTAATGGTAAGT
AATTACCTACCGTGGTATTTAAGGAAGGGTGTTTTGATCTTTTTTTCTGT
TGTTTTATTAGCACTCTTAATTGCTGTAGTTAGCTTTTTTATTATTACTG
GGGTAGTTGTCCATTCGTAA
>gid:854353  deaD  RNA helicase, eIF4-A translation initiation factor
ATGCACTTCATTCAACCACTCCAAGCGTTCTTACAAACGAAGCACATTGT
TGAATTTTCATCTATTCAACAAGCTGTGTTTAAAGTTTGACCACGTCAAA
ATGTGGTTGGCATAGCCGAAACTGGTAGTGGTAAAACATTCGCTTACCTC
TTACCAGCGCTCAACCAAATTGATGTCACGCTCAACAAGCCCCAAGCGGT
GGTGTTTGTACCAACTAAGGAGTTGAAGTGGCAAATTTTAACGATCCTCA
ACGACATTAAAGCCAGCTTTACTGGTTTAAAGGTCAGTGAGAACTTCAAC
AGTAATGCCCACCTGATTGTGAGCTTAATTGGCAAAGACATTATTCTCCA
CGAAACGATTAAGTACGTTGTCTTTGATGAGGTCGACATGTTTTTGGAGG
ACAGTTCCCAAGCAGAGTGGATTAACTGTGTCCAACTGTTTCAAAAACAT
AAACCTCACTTTGGCTTTTTTAGTGCCACGTTATTTAACGAACAGCTCCA
GCAAATTCGCAAGCAAGTCGCACCTTTAACGGTCGTCAACCAAAAGAAAC
GTGCTTGAAAGCACTCTTTGGTGAAACACTTTCTGCTTAACCTCAACGGT
CAAGAACCGTTTGCTGGTTTATTAGCTTTACTCAACTACCACCATAACGA
ACAGGTCTTGGTCTTTTGTTCCAACGCTAAATCACTCAAACAACTCACTA
GTTTACTAGCCCACAACCAACTTAGCTTTAAAAGCCTCCATGGTCAACTA
ACGCCCAATGAGCGCAAACACATCTTTACTAGTGCCGCTAATAACACGGT
GAGGGTACTAGTGGTATCTGACTTACTAGCACGCGGCATTGATCTGCCCC
ACTTTAGTGTGGTCATTTCATGAGACTTACCCCTAGTGGATAGCTTTTAC
ATCCACCGTTCTGGTAGAGTAGCGCGTTTTAACAGTTGGGGCAATTCCTA
TGTGTTTGATTTACCGCATAACCAACACAAATTAACTAAGTTTGCCCATA
AAGGTATTTTGTTTAACAGTGTTCATTTAGAACGTGATGGTACTTTAAAG
TTCCCCCAACTTAAACAAAGCAAACAAAAACCAGCAGTATCCAGTGAACT
TAAAACTGCCATTAAGCGGATTAAGGCAGGATACAAGAAGGTCAAGCCTA
ACTATAAGAAGCGCCAAAAGCAGCAGATTGCGGAACTCTTTGCCAAGCGC
AAACAACGCCGTTCATGAAAAAACTTCTAA
>gid:854558  deaD  similar to ATP-dependent RNA helicase deaD
ATGGACTCAACTTTTAATGAACTAGGCGTCTCTCCTGCCTTAATTGCCAC
ACTCAAAGATAACAACATTAACCAACCAACTACGATTCAACAACTGGCTA
TTCCCCAGTTTCTCCAACATCAAAACCTGATTGTCCACTCCCCCACCGGC
ACTGGTAAAACCGCTGTTTTTGGCATTCCGGTCATTGAAACACTCCTTAA
AAAACCAAGTAAAGGTACGACCCAAACATTGGTAGTTGCACCTACCCGTG
AACTGGCCGAACAGATTAAAACCACCTTTATTAACTTTGCTAAACACACC
CATTTAAAGGTAGTGAGCTTAATTGGTGGCATCCCCATTTGACAACAACT
CAAACAACTAGAAAACCAACCAGAAATAGTTGTGGGCACTATGGGGCGGG
TGATGGACCTGTTAGAACGGGGTGTAATTAAGTTTGAACACCTAGAACAC
CTCATTATTGACGAGGTTGACCTAATGCTCGACCGTGGTTTTAAGAGAAA
ACTGTTTGATCTGTTAAGTCGCATTGAAAAGTTTGAACAAATTGCGGTTT
ATTCTGCTAGTTACAATGAAGAGACAATTGAAACAGCTAAACAAATTACC
AAGAATGGTATTTTCCTAGCAGCACCAGAATTAAAACAAAATGCCCCTGA
ACCAGATAACAAACTCATTGATCAATTTGTTTGTTATCTTTTTTCTAACC
GGAAGAAACAAGCCCTCTATTCTTTGGTATCGCAAACTAGAGCGAAGTCG
ATTATTGTTTTTTGTGACACCAAGAAGTTAGTTGATGAGCTGTGCATCTT
CTTGCGCAAGAATGATGTCAAAACTTATCCACTTCACGGGGACAAAGCGC
AGTTCATTCGCGAACGCAACTTAAAGCTGTTTGCTAACACAACTGCTCCT
ATAGTATTAGTAACAACTGATCTAATCGGTCGTGGTATCCATGTGGAAGG
GGTGGACATGGTAGTCAACTATTCCGCTTGTGTAAACTTTGAAACTTATT
TGCACCGGATGGGTCGCACAGGACGGAACAACCACAAGGGCTCATGTATT
ACCTTCTGTACCTCACACGAAAAGCAAGCATTTTTAAAGTTATTAGAACA
AGTTAACGACAAGCGCATTAGCCCTCTCCGCCCCATGCGCTTAAGGTTAA
TTCCCTTGAAGTGCAAAACCCAACCCAAGAAGGGGAAACTTTCCTTACAG
TCAGTGCAAAAGATTTACGTCAATCCTCGTTCCAATGGCACCTTTAAACG
CGTACCTTTAGCGGGGGATTTGTTTAAAAGCCGGATGCGTCAACCTGAGC
GGGACATGCAAAAGAACAAATTGCATGACAGTGATTGACAAAGCAATATG
TAA
>gid:854305  greA  
ATGGAACTTAACAAAAATTACCTTACCGAAGAGGGGCTAAAACAATTAGA
AGCGGAGCTGGAACACCTCATTCAAGTAAAACGTCCCGCTATTATTAAGT
TATTGCAAGAAGCCCGTGATCAGGGTGACTTGAGTGAAAACGCTGATTAC
GATGCAGCAAAAGCACAGCAGGGTGAAATTGAAACCCGCATTGCTGAAAT
CCAAGACATTTTAGCCAACGTTAAGTTAATTAATGAGTCGCAAACAAAAA
AGGCTAATAAGGTTACCCTGGGTAGTACGGTCGAAATTTACGATTACAGT
TCGAAAACACACGAAAAGTACACCATTGTGGGAGCTTTAGAGGCTAATCC
CGAAGAACACCGCATCTCCAATGAATCCCCTTTGGCACACGCCATTTATG
GTCGTTTAGTGGATGATGAATGTGACGTAGTTGGCATAGAAGTGCCCTAC
CGGGTCAAAATTGTTAAGATCATTAACTGATAA
>gid:854073  mte1  adenine-specific methyltransferase EcoRI
GTGCATTACTTTAACCGCGCCAAAAAGGCAAAGAACAATGAGTTTTATAC
CTTGTTTGAAGACATTGCCGCTGAAGTGGCATGTTATCCCAATGCCTTTA
AGGGTAAGGTAGTGTTGTGTAATTGTAATGATGGTTACCAATCGAACTTC
TGGCAGTTTTTTCAAAGTCAGTTTCATGCTTTAGGACTCAAAAAACTAGT
TGCGATTGCTTTTAATCCACTTGGCAACAGTTATCAACTCAACTTCGATG
GAAAGGAAATAAAGGAACTACCTTTAGCTGGTAATGGCAGCTTTGACAGT
GCGGAAGCCATTGTTCTTTTAAAGCAAAGTGACATTGTGGTAACTAATCC
ACCGTTTAGCTTGTTTCAGGACTTTGTTTGTCTTTTAGCAGAGCATGGCA
AACAGTTTTTGGTTTTAGGTCACAATGGTGCTGTCGGTTATAATCAGATC
TTTAAGCTGTTTAAGGAAGAACAGTTGTGATATGGTCATACTGTTAACAG
TTCGATGTTGTTCCAAGTGCAGTCTAACTTTAAACTGTATGACCCCAAAA
GCGTTAACTTTGTTAAAAAGGATGGTCAACTGTTTCAAAAAGTACCGGGA
ATTTCCTGGTTTACAAACCTCAAGAAAAACCAACAACCAGCTTGACTAAA
AACAAAATCACGCTATCAGGGCAACGAACACAAATACCCCAAGTTTGACT
GGTATGATGCCATTTTTGTCAGTAAGGTTAAAGAAATTCCCCTAGACTGA
TTTGGTTACATGGGGGTGCCATTAACCTTTCTCAATTGCTTTAATCCCAA
ACAGTTTGAGCTAATTGATTGTCTAGCCAATCCCTACGCTACCCTAGACA
CATTAAAAACTAATGCTTATGTGAGATCACACCACGGTGATGTGAGGAAT
GTGAAGGGTAAGCGAAGGTATGTTAGGGTAGTGATTAAACAACGTCAAAA
TGTGATTTAA
>gid:854029  nusA  N-utilization substance protein A homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P32727, from B. subtilis
ATGAACAATCAATCAAATCACTTTACCAATCCTTTGTTACAACTGATTAA
GAACGTTGCCGAGACCAAGAATTTAGCCATCGATGATGTTGTTTTGTGTC
TTAAAACAGCATTAGCACAAACATACAAGAAGCATTTGAACTATGTCAAT
GTGGAAGTCAACATTGACTTTAACAAGGGCTTAATGCAAATTGAACAGCT
CTTCGATGTTGTAGATGATAACAATGAGGATTATGATGACTTTTTGGAAA
TGCCTTTAAGTGAGGCTAAGAAGCTCAATCCGAACCTAGAAGTTGGCGGG
GTGTTGCGCAAACCGGTTTCACTCAAAGACATTAAGGGCGATCTCATTAG
CAAAATGGTATTACTCTTCAACCAAAAGATTAACGAAACAGCTTTTAAAA
CGGTGATGAGTGACTTCATTAATGAAGTCGGTCAGGTAATTGAAGCTAGA
GTAGAGGACATTGATACGAACAAAGATGGTGGATTGAAGGGTTACATTGT
TAACTTGGAAACCACCAAGGGTTACATGCCTAAACGTGAGTTGAGTAAGG
GCGAAAAGCTAGATATTGGCAAGAAGTACCTCTTTGTGATTAAGGAAATC
CAAAAGCAATCTTCGATGTGACCAATTACGCTTTCCAGGAGTGATTCGCG
TTTACTGGAATTCTTGCTAAATTCCAACACTCCCGAAATTGCTAACGGTA
CGATCGAAATTAAAAAGATGGAACGCTCTCCTGGTACCAAGTCTAAGGTG
GCCGTGATTTCCAAAGACCCAGTAGTTGATCCGATTGCGGCCATTTTGGG
TCCCAAGGGCGAGCGCATTCGCGGCATTAGTGAAGAGTTTAACGGTGAGA
TCATTGATATTGTCATCTGAAATGAGGACAAGTTAAAGTTCTTGGTCAAC
GCTGTTTTACCGGCTGAAGTGGTCGGTTACAACATCCTTCAAGACGATGA
GCGCGATACCAGCATTGAAATCGTGGTACCCGCCAACCAGATTGCCAACG
TCTTTGGTTTTAAAGGAATTAACATTCGCTTAATTAGTAACCTAACGGGT
TGGAGTAGTGTGGACGTTTACACCGAAAAAGATGCTGCTGAACAAGGGAT
TGAATTCACCCGGGTCAACTTTCAACCCCAAGGTATTTTTGGCATCAAAA
AGCGCCGCGACAAGATCTCCAACAATCCACGCAACAACAACCAACAGCTC
GCATCTGATAAGGTGTTTTACACTTCGAAGGCCAATGTGGTTGATGATGA
GATCATAGTCGATCTAGCAAAGCAAGCGGAAGCCAAACGGGTCAAGCAAA
TCAAGCAGGAAGCAACTAAACCCGAGTTGCAATTACAACAAGAACTTAAC
CTCGAAGCAACCCCTAAGGTAGCTGCTCCAACCCCAACCCCTGCACCCCA
ACCAACTCCCGCACCAACTAAAGTTGAGCCAGTACCACCACCAGTAAGCG
TTACACCTAAGCCAATCCCCAAGGTCAATAAGCCCAAGCCAGTGGTTAAA
CCAAAATCAGTCTTTTCGATTACGGTTGAAGCGGATGACAGTAAGACTAA
ACCAGAAAAGTCAAGCGCTAAAACTAACACCCCACAAACGAAACAAACCT
TTGATAACTTTGACGATCTCTAG
>gid:853921  nusG  transcription antitermination factor
ATGGAACAAGTGGAATTAATCCCGCAATGATACGTTGCCCCTGTAAGTGT
TAAGGATGAAGCAGTTGTGCGAAACCTCAAAGCTAAGGTAAAAGCTTTGG
GATTTGACAACGAAATCTTAGATGTAAGGGTTTTGAAAGAACGCGAAGTC
ATCGAAGAAGTCTTTTCCTTAAAATCCGGCAAGCTGCCCCGTTCATTAAA
GAACACCGCTTTTACAAAGTGATTTGTGTTAGATGAAGACCGTTATTTAA
AGGTGAAGATTAGCGAGAAGAATTTACTAGGTCGTTACATCTACATTAAG
ATGATCTACAGTGAAGATGCATGACGCATTATCCGTAACTTCCCTGGTAT
TACTGGAATTGTTGGTTCCTCTGGTCGCGGTGCGTTACCAACTCCTTTAG
ACCAAGCCGATGCTGATAACCTCGAACAAATGCTTAAGGGTATTTCGGTC
AATCCGAAAAAGCGGGTGTTAGTGACCAACACTGCCATTGTGGAAATGGA
TGCGGACAAGTTTGACGAAAAGTGTCAGTACATTCTCAAGCACAAACAAG
TTAAACCCGAAGCAATTGCCCAAGTTAACGAATCTGGTGAAATCATTGAT
ACTAACCAGTTTGCGCAAGCTCTAATGGAAGCTAATAAGGCCGAACAAGA
CGAATGAAACGAGGATGTAGCGATTGTTAAAAGTGAAGCTAACAAGGTTG
ACCCATCAGTGTTAATTCCTTACTTGGGTAAATACGAAATTGTCGAAGGT
GACACTAAGGTCGATCAACTGCAACAATTTAGTGTTGGTAACTTAGTGGA
AGTCCACTTAACTGGTGCGATTCACATTCAAGGTCAAATTAAGGCTCTAT
ACCAAGGAACAATTAACAAAGCGGTAGTGGAAGTCGAATTAACCACCAAA
ACGCAGTTAATTAACTTGCCTTTAGAAAACCTAAGCTTTATCGAGGTTGA
GCAATCGCACTAG
>gid:854479  rnc  ribonuclease III
ATGAAAAATAAGAAAGATAAAACTCAAAAACCTAAGGTCATTGATGAAAA
GTTTGTCGCTTTTTTCAAGAGTTTAAACATTGAACCGCAAAACTGACAGT
TTTACGAAGATGCCTTTGTTCATTCTTCTTACGTTAATGAAAATGAAGAT
GCACGCGCAAGCTATGATCGATTGGAATTTTTAGGTGATGCCTTAATTGA
TTTCATAGTAGCGAAAAAACTGTTTGAGCTTTATCCCAATTACAACGAAG
GTATGTTGACCAGAACTAAGATTGAAATTGTTAAGGGCGAAAACCTCAAC
CGTATTGGGAAGGAATTGAACTTTGGCAATTTCATTAAGTTAGGTAAAGG
AATGCCGTATACTGAAACACTTTTTGGTGATGTACTAGAGGCGTTAGTGG
CAGCCATTTACGAAGACCTTGGCATAGAGAAAGCGAATCAATTTGTCGAA
GAACATATTTTTAAAAAAACTTACTCAGAAATTCTCAAGTACAACTTCTT
TTCACTGTTTCAAGAACAAAAGCTACCAGAACCTAGGGTACGGGTTAGTT
TAACTAGCAATAACCTTGTGTTGAGTATTATTGAGCTTAACGGTGACATT
ATCTGGTCACAAGCTGTACCTAACAGTAAACACTATGATGACAAGAGCGT
GTTAGAACACAATGCAATGTCAGCCTTTACCCAGTTTCTTAAAAGTGGTA
AAGGCATTAACTTTTTTAGTGACATTAAAAATAAGTTAGACAGTCAAAAG
CCTATGCGAGCTTTAACAGTTAGACCGAAAAAGATTAACTGAAAGGCACG
TAAACCAAAACTAAAAGCTTTAAAGAATAAGGTTAAAGCTGATTCGTAA
>gid:854066  rpoA  RNA polymerase alpha core subunit
ATGGAAAAGTTTTTAAAGTACGAAATAAAGGTAAATAACGAACAAGCACG
CGCTAACCCCAACTACGGCATCTTTGAAGTTGGACCACTCGAATCGGGCT
TTGTCATTACCATCGGTAATGCTATGCGCCGGGTGCTGTTGAGCTGTATT
CCAGGTGCCAGTGTGTTTGCACTCTCAATTTCGGGTGCCAAGCAAGAGTT
TGCTGCTGTGGAAGGGATGAAGGAAGATGTCACTGAAGTGGTGTTAAACT
TCAAGCAATTGGTAGTGAAGATTTCTGACCTTCTGTTTGAAGATGGTGAA
ATGGTCGAACCACCACTAGAACGTTGACCATTGTTAACGGTAACAGCTGA
GAAAGCGGGACCGGTGTATGCGAAGGACTTGGAGTGCCCAGCTGGCTTTG
AAGTGGTCAACAAGGACTTGTACCTGTTCTCGTTGCAAACTGACAAAAAG
GTAACAGTTAACGTGTATGTGAAACAAGGACGGGGGTTTGTTACTTTCTT
GGAAAACCGTGAAATGATTAATTCTTTGGGGATTATTGCCACTGACTCGA
ACTTCTCCCCGGTATTACACTGTGGTTATGAAGTACAGGAATTGAAAACT
TCCAAGCAAAAGATTACTGATCACTTAACTTTCAAAATTGCTACTAACGG
TGCCATATCCGCTGTGGATGCCTTTGCAATGGCTGCAAAGATCTTGATCG
AACACCTCAATCCGATTGTTAATGTCAACGAATCGATTAAGGCGTTGAAT
ATTATCCAAGAGAAAGCCGAAGAACGCCGTGTCCGTTCGTTTGCGAAGCA
AATTGAAGAGTTGGACTTTACCGTGCGTACCTTTAACTGTTTGAAGCGTA
GTGGGATCCACACCTTACAAGAGTTGTTGTCCAAGTCATTAGCTGATATT
CGTGAAATCCGTAACCTCGGTAAGAAATCGGAACGCGAAATTATTAAGAA
GGTACACGAATTAGGACTCAAATTAAGATCTTAG
>gid:854446  rpoB  RNA polymerase beta subunit
ATGTCACAAAAACCTAGTTTCTTTCAGAAAAAATACTCACCCACTGCTAC
CCGCCGTTACTATGGCAAAATTGCCACTGATTTTGTGCAACCTAATCTGG
CTGATATTCAGATTAGGAGCTATCAAACTTTTCTAGATCACGATCTGGAA
AACCTGATTGCTGCTTACTTTCCAATTAAGTCCCCTAATGATCGTTACAC
GATCAACTTTAAGGGTTTGCGTCGTACCGCTCCTGAACGTAATGAAGCCC
AATCACGCTCTGAGTCCAAGACCTATGAAATTGGTATTTACGCTGACTTA
GAATTAATTGATTCCGCTACCGGAACCATTAAAAAGCCGCGCAAATCCAA
GAAGAACAGTGCCACCAGTAGTGTCGATGGCGTTTTCTTAACTAACTTAC
CATTGATTACCCGCGATGGGGTCTTTATTGTCAACGGGATTGAGAAGTTT
GTGATTGCCCAAATTACCCGTTCACCGGGGATCTACATGCTCACTAAGTC
CCAGTTAAAATTGTCTAGTTCGCGTAAACGGGTACAAGAAGGTTATGTAT
GTGAAGTATTACCAGCCAACGGTTCGGTAATGCTGATCTACATCTCCAAT
AAAAAGAAGATTGAAGATGCCTTTGTGCAAATCTTGCTCCGGGATGCTGT
ACGTGAAGGGGCAAAGATCTTCCCTATTACCACCTTGCTCAAAGCCTTTG
GGATGAGTGGCAAGGAAATCCTCAAAGTTTTCAAAAACAACGAGTTTATT
ACCCGTTCCTTAGAAGCGGAAGTCTACAACGCTAAGGATTTCTTAAACAA
CGTTGACCCTGAAATTAAAAACTTATTAAGGGAATTCCGCGATGGCAAAA
CTGATCTCCGCCGTAAGGGGATTGCCTCTGACCAAAAGATCCGCAGCTTA
GTGAGTGACTATGTCCTTTTAGAAAAGGAACACAAAGCGCTCAGTGAAGC
TAAACCAAATGACCCTAAAGTAGGTCAGTTAGAAGCGGACATGGATGAGT
TGATGGATAAAATCATCACCGAACGGGCTGCTAAACACATTGTTCATGAA
TTGTCCATTTCACTACGTGGTTTAGAAAACACCGATGAATGTCCGGAAAA
CAGTTACCACGCTTTACTGTGTTCACGTTTCTTCCGTCAAAGAAGGTATA
ACCTCTCCGCTGCTGGTCGTTATAAGGTATCACGTAAGTTAAGAATTACC
GAGCGGATTTACCAAAAAACACTTGCTTGTGACCTTCATTTAAAAAACGG
GGAACTCTTATTAAAGAAGGGCACCTTATTAGTTAAAGAAGAAATCGACA
AGATTAAGCAAGCTGCCCAAAACAACCAAATTGACTTTGTCCAAAAGATT
AAGTTAACCACTGATGGTAGTGCTGTTAACCTTTCCCCTGAATCGTTGTT
GTATGAATCACTTGATGTTTATGTGAACAACGACAACTTCGATGTATCCG
TGCCAGTGGTGGGGATCCACAACGATAACGATCTCAATAAGGCAATTACT
TTAAGTGACTTTATTGCCTCGATTAGTTATGTGATTAACATCCCTTCGGC
CATCGGTAAGTACGATGACATTGATCACTTAGGTAACAAACGCGTCAAGT
TAATTAACGAGTTAATTAGTTCCCGTTTGGAAAGTGGAATCACCCGCATG
GAGCGCTTCTTAAAGGAAAAGCTCACAATTGCTGATGGAGTGAACCGTGG
TCAACAAATTAACGAAGAGGGTCAAGTAATTGAACAAGCGGAAAAGAAGG
AATTGACCATTAAATCCTTAATTAATTCCAAACCTATTCAAATTGTCATT
CGTGACTTCTTCAACACTCACCAGTTGACCCAGTTCTTAGATCACCAAAA
TCCACTTTCAGAATTAAGTAATAAGCGCCGGATTTCCGCCATGGGTCCAG
GGGGTATCTCCCGCGAAGACCCGAACTTGGATATCCGGGATGTGCACTAT
TCCCAATATGGTCGGATTTGTCCAATTGAAACACCGGAAGGGATGAACAT
TGGTTTAATCATGTCGTTGGCTTCCTTTGCCAAGATTGACGAAAACGGAT
TCCTAATGGCGCCTTACCGCAAGATTAAAAATGGTGTCATTACCGATGAA
GTTGAATACCTCACGGCATTAAGGGAAGACGAGCACATTATTGCCGAAAT
CTCTTCGTTGGTCAACATTGACGAAAACAACAAGATCTTAGATAAGGAAA
TTATTGGTCGTTACCGCTCGATGCAAGGGTTGTATGATCCCTCGAAGATT
GACTACATCGACGTGGCCCCTCATCAGGTAGTGTCCATCGGTTCGTCCTT
AATTCCCTTCTTGGAAAACGATGACTCAGCGCGGGCATTGATGGGTACCA
ACATGCAACGCCAAGCCTATCCTTTAATTAAGCCTTACGCTCCCGTTGTG
GGTACAGGTCAAGAGTACAAGATTGCTCGCGACTCCGGCTTGACGATGTT
AGCACCTTGCTCAGGTACGGTAAAGTATGTAGACAACAGTAAGATCACGA
TTGAAAGTGACAGTGGTGAACAGCACACTTTGGATCTAATTAAGTTTGAA
CGTTCCAACCAAAATACCTGCTACAACCACGTTCCCTTAGTAGAAAAGGG
GCAACGGGTAACTAAGGACGAAGTGATTGCTGATGGTCCTGCAGTTAACA
AGAGTGAGCTGTCTTTAGGGCAAAATGTCCTTGTCGCCTTTACGACCTGA
AACGGGTACAACTATGAGGATGCGATAGTGATTTCCGAGCGCTTAGTGAA
GGATGATGTTCTAACCTCCTTAACGATTAACGAATACGTAGCCCAGTGTT
TATCGACCAAAAACGGTGATGAACAAATTACCCGTGATATCCCCAACGTT
AGTGATGCTAACAAGCGTTACTTAGATGAAAACGGCATTATCATGGTCGG
TGCTGAAGTTAAGGAAGGTGATGTCCTTGTCGGTAAGGTATCCCCTAAGG
GACAGGTTGAAGTATCACCTGAAGAAAAGCTGTTTAAGGCCATTTTCCCT
GAAAGTGTGCAAAACGTCCGTGACTCTTCCTTAAAGCTCCCTCATGGTGG
TGATGGGATTGTGTCCTGTGTCAAGCGTTTTAGCATTGCCAACGGTAATG
AACTTAATGATGGTGTCATCGAAATGATTAAGGTCTATGTGGTGCAAAAA
CGCAAGATCCAAATCGGAGATAAGTTGGCAGGGCGCCATGGTAACAAAGG
GGTTATCTCTAAGGTTGTCCCAGTAGCGGACATGCCCCACTTAGAAGATG
GTACTCCAGTCGACATCCTCTTAAACCCACTGGGGGTACCGAGTCGGATG
AATATTGGCCAAATCTTTGAAATGCACTTGGGTTATGCAGCACATAACCT
TGCCAAGCGAATGTTAATTAGTGCTTGTTTTGATGACAAGAAGGCTCAAG
CACTTTCAACCGAAATTAACCAGCCACAGTACAAACTTGACCGCTTAATT
ACTGGTTTAAAAGCCCAAATTACGAACCGCGGTCTTAAAGACGAGCAGGC
AGCCTTGGCCCAACTCAATAACGGTGACATTGCTTTAGTGCTCAAGGAAA
TCGGCATGAGCTTTGATGACCTCCACTTTAAAGTAGCGACCCCGATCTTC
CAAGGGGTGAACTTCCAAGACTTGCAAGACATCATGGATGAAGCAGGATT
GAAACCAGCGGAAACGCACGGGAAGTTCAAGCTGATTGATGGTCGCACTG
GTTTACCATTTGAAAAACCAATTTCCTTGGGAATCATGTACATTATGAAG
TTAAACCACATGGTTGATGACAAGATCCATGCTCGCGCTGTCGGTCCTTA
CTCCAAGATTACCCAACAACCATTGGGTGGTAAATCACAAAATGGGGGCC
AACGCTTTGGGGAAATGGAAGTGTGAGCCTTGGAAGCTTACGGCGCTGCT
TACAACCTTCAGGAATTACTTACCATTAAGTCCGATGATGTGCAGGGCCG
GAATAAGGCCTATGCCGCGATCGTTAAGGGCGCTGCCTTCCCCGAACCAG
GTATCCCCGAATCGTTTAAACTGTTAACGAAGGAACTACAAGGGTTAGCG
TTGAGTGTGTCCTTTATTTACGATGACAACACCCAACAAGATTCCAACAA
CGTTTCAATTCTCCAAGCTGATGGAGAACAGGACGATCTCTTTAATGACT
TTGAATTTGACACGGAGGGTTATTAA
>gid:854445  rpoC  DNA-directed RNA polymerase beta' chain
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AATTAAGCTTTCGATTGCTTCCAACGACACGATCCTAAACTGATCCGAAG
GGGAAGTTACCAAGGCGGAAACGATTAACTATAAGTCCTTAAAACCCGAA
CCTGGTGGTTTGTTTGATGAAGCCATTTTTGGTCCAGTGAAGGACTATGA
GTGTGCTTGTGGGAAGTTTAAGAAGATTAAGTACCGTGGCGTGCGCTGTG
ATCGCTGTGGTGTTTGGGTAACCGAATCAATTGTGCGCCGGGAACGTATG
GGCCACATTGCCCTAGTCAGTCCGGTAGCGCACATCTGGATGTCGAAGGA
ACTGCCTTCCCCTTCCAAGATCTCCTTAGTGTTAAACATCTCTTATAAGG
AAGTGGAACAGGTCTTGTACTTTGTTAACTACATAGTATTAGATACTGGG
AAGATCAAAGATCCCAAGATCATGCCGTTTAAGTTTAAGGAAGTGTTGGA
CTTAGCAGGCAAGGGTTCTTTAACCACGCGGCAAAAAATGCGCCGGGTGA
TCGGTTACATCTTCCGGAACCTGATTAAGAACAGGAGTAGCGAAGACTAC
CGCAAGGGGAAGATCTTTTATGAAAGCTTAAAGAACAGTTCGTTACCGTT
CTCCTTAAATGATGCCTTTAACTACATTAAGAAGTACACTGGCTTCCGCG
TTGGTATCGGGGCTGAAGCCATTTTAGAATTGCTCAACAAGATTGACCTT
AACTATGAGTTTAGTAAGCTCAATGATGCGTTACGGAAGGCTAAGAAGGA
TAGTGTTGAGGATGCTAAGGTTAAAAAGATCTTGCGTCAATTGGAAACAA
TTAGCTGGTTTAGAAATTCGAAGCTGCACCCGAAAAACATGATCCTGCAC
ACGGTGCCAGTGATCCCGCCAGACATCCGGCCGATTATCCAGTTAGATGG
TGCTAAATTTACCACCAGTGACATTAATAACTTCTACAGAAGGGTAATTA
TCCGTAACGACCGTTTACGCCGCATCTTGGAAGATGGTACCGTACCTGCC
ATTGTGGTTAACAACGAAAAGCGCTTGTTACAAGAATCAGTTGATGCCTT
GTTTGACAACTCGTCGCGCCACAAGCCAGCGTTATCCAAAGACAAACGTT
CCTTGAAGTCACTCACCGACCGCTTAAAAGGGAAACAAGGGTTGTTCCGT
CACAACCTTTTAGGTAAACGGGTGGACTATTCTGGTCGGAGTGTAATTGT
GGTGGGTCCAGAACTAAAGATGTATGAGGTCGGGATTCCAGCATTAATGA
TCCTCAAGCTGTTCAAACCATTTATTATTCACGGGTTAATTAATAAGTTT
GACAGCAACGGTAACGAAATTAGACCAATTGCGTCCTCGATTCGGCAAGC
GGAGGACATGATTAAAAATCAGGACGACCTGATCTGGGGGATTGTGTATG
ATGTCATTAAGGACCGTCCGGTGTTATTAAACCGGGCACCTACTTTGCAC
CGTTTGGGAATACAGGCCTTTGAACCGCGGATTGTCGATGGGAAAGCGAT
TCGCCTACACCCGTTAGTGACCACTGCTTTTAACGCTGACTTTGACGGTG
ACCAGATGGCGGTGCACGTTCCGTTGAGCGAAAATGCCGTTAACGAAGCG
CGTGCTATTCTGTTAGCTTCCAAGCACATCTTGGGACTAAAAGATGGCCG
GCCAATTGTCACCCCAACCCAGGACATGGTGTTAGGTAACTATTACCTCA
CTACTGAGCGTAAGGGTCAAACGGGTGAAGGCATCATCTTTGGTACCGTG
CATGAAGCCCGCGCGGCATACGAAGCGGGCAAGGTGCACCTCCACGCCAT
TGTCGGCATTAGCACCAAAGCCTTTCCAAACAAGCACTTTGAAGCTCAAG
GTACTCTAATCACTACGGTTGGTAAGATTATCTTTAACGATGTGTTAGGG
GACAACATCCCTTACATTAATGAAGGGGAATTTGATGAACATGCGTGTCC
GCAAAAGTTCATAGTACCACCAAGTGGTGATGTGCGTGCTGCGATTGCCG
CACACCAAGTGCTCCCTGCCTTTGGTAAGAAGGTCATCTCCAAGTTAATT
GACTTACTTTACACGGTGGTTGAATTTAAGGATCTACCACGGATCTTGGA
AAACATTAAGGCCTTAGGCTTTAAGTACTCGACCCACTCTTCCACCACTG
TATCGGTGTTTGATATTCCGAAGTACTCCAACAAACAGCAGTACTTTGAT
GAAGCGGACCAACAGGTCTTGAAGTACAAGCAGTTTTACAACAAGGGTTT
ACTGACCGATGATGAACGGTATAAACGGGTGGTGAAACTGTGAAACGGTG
TGAAGGAAAAGGTGTCGAGTGAGATCCAGGACTTAATTAAACGTGAAGAG
TACCGTGATAACTCGATTGTTGTCATGGCCGATTCCGGGGCGCGGGGTAA
TATCTCCAACTTTACCCAGCTGTTTGGGATGCGGGGGTTAATGAGTAAGA
GCTTTAACTATGAACGCAACAACCAGTCCAAAATTATTAAGGACACGATT
GAGGTTCCTATTAAGCACTCCTTCCTGGAAGGTTTAACGATTAACGAGTA
CTTCAACTCATCTTATGGGGCGCGTAAGGGGATGACCGATACCGCCATGA
AAACGGCTAAGTCTGGTTACATGACCCGTAAACTGGTGGATGCAACCCAC
GAATTGATTATTAACCACGATGACTGTGGTACACGCAAGGGAATTGTGGT
CGAAGCAATTGTGGAAACCAAAACCCGTTCGTTGGTGGAATCACTGTTTG
ACCGCATTGTCAACCGTTACACGATTGGACCAATTTTAGATCCCGAAACC
AAGGCGGAAATTGTCCCTGCTAACAGCCTAATTACCCAAGAGTTAGCCAA
GCAAATTTGTGCCACTTCGATTAAACAAGTGTTAGTGCGCTCTGTGATTT
ACTGTGAACGCGAAAACGGCGTGTGTCAGTACTGTTTCGGGGTCGATTTG
TCCACCGGCAAACTGGTGGAATTGGGTACCGCTGTGGGTGTAATTGCAGC
GCAATCGATCGGTGAACCAGGAACCCAGTTAACGATGCGTACCTTCCACA
CCGGGGGGGTTTCGACCGAAAACAACTTGGCCCAAGGGTTTGAACGTTTA
AAGCAAATCTTTGAAGTAGTCGCCCCTAAGGATTACGAGCGCTGTGTCAT
TTCTGAAGTTAAGGGGGTAGTTAAATCGATTACTACCACCCAAAACGCGC
AGGAAGTGTTGATTGAATCTAGTGTCGATGAACGCACTTACTCGATTCCG
TTTAGTGCGCAACTGCGTGTCAAGGTCGGTGATGCAGTAGAACTAGGTTC
GAAGATTACCGAAGGTTCGATTGACATTCGCCAGTTATTACGGGTTGCTG
GGATCCAACGGGTACGCCAGTACATGATTGTCGAAATCCAAAAGGTGTAC
CGTATTCAGGGGATTGAGATTGCTGATAAGTATGTCGAAATTATTATCCG
CCAGTTGACGAGCTTACTCCAAGTAACCGATGCTGGCAGCAGTAACCTGT
TTGTGGGTCAACTGGTACACAGTCACCACCTCAATGAACTCAACAAGAGC
TTGTTGCTGTCGGGGAAGATGCCAGTGATTGCCATTAACCAGGTGTTTGG
GATCGATGAGGCGGCCAGCAAGTCGAACTCCTTCTTGAGTGCCGCATCCT
TCCAAGACACCAAGAAGATCTTGACCGATGCTGCGGTAAAAACCCAAGTT
GACTACCTCTTAGGGTTGAAAGAAAACGTGATCATTGGGGGTAAGATCCC
GGCTGGTACTGGGTTTTTAACCGATGAAGAATTGGCCTACCTCGGTGCCA
AAACGGTTCAAGAGGAGTATTAA
>gid:853877  rpoE  DNA-directed RNA polymerase delta subunit
ATGACTATGCAAGTAGAATACCTCGATCTCATCTCCCAAGCGAAGGAGAT
TGCTGAGACCCAATTTAAGGCGGAACCGTTTTCCTTTGATGCTATTTGAA
AGGAAGTAGTGAAGCACTTTAAGATCTCCAAACAAGACGAACCTAACCTA
ATTTCGCGGTTTTACCAAGACTTTTTGGAAGACCCTAACTTTGTTTATTT
AGGGGAACGCAACTGGAAGTTAAGGGACTTCATGAAGTTTGATGAATGGA
ACAAGATTTCCCAAGCAATGTTTGTGACCAAGGAAATCTTTGAAGAGGGT
TATGAAGACCTGTCCAACAAGAAGAAGGAAAACGAGGAAGAAGTGAATGA
CTTCATTATGGGCAATGATGGTGATGACAACAGTACCGGTGATGAAATTG
TGCAAGGACTCATTAACGATTTTCGCGACGATAACCAATAA
>gid:854241  sigA  Sigma-70 Factor Family
ATGTCATCGCCAAAGAAAAATTTCAAAAAACCTCAGCCTAAAACTGAAAA
TCAAAAACAAGCACTTAACGAAGAGCGCATTGCTGAACTTAAAAAGAGTC
GTATCCTCGGTAAAAACCGTCCGTTTAAAAAGATGATTTACGTTGACACT
AAGGCACAACGTAAACAAAAACACGAAAACGTAGCCTTTTTAAAAACGCT
TCAAGAAAACAAGGAGAGTGATGTACCAAAGAAGCGTCGCGGTCGAAAGC
CAAAACACGCACCTTTAAAGGAAAAGAACAACCTTAAGCTGTTTGATATT
TTAGAAGGCTCTCTAAAGAGTCATACCGAAAATGATGATACTAACAAGGT
AATTAGCCTGTTGGTGGAGGTGTGGGAGAAAAAGAACAAAAAGAAAGACA
ATAACTCGCTTTCCAACAAGGACATTGTTAATGTTTTGTCCAAGTTTGAA
CTCCCAGATGATGAAATTATCTTTGTTTTGGATGAACTGCGTGACAAGGG
AATTGAACTACCACATGATGTGGAAGAGCACATCCATGAGTTCCGTGCTA
ACCAAGACTTGTCGATCATTGACGAGGACATTGAAGAATTAACCACCAAA
AACATCTCTAATCGTGATAAGGTTGATGACAACGTACGTTTCTTTCTAGG
TTCGCTCGATTCTTCCAAGATGTTGGACTTTGAGTCTGAGCAGCGAATTG
CCAAAGTTTTAAACAGTACTGATGAAGAATCACGCAAGTATGCCATTAAT
CAACTGGTAACCTCTAACCTTAGGTTAGTGGTCTCCATTGCTAAAAAACA
CTTGGAAAGAGGATTGGATTTTAATGACCTTATCCAGGAAGGTAACCTAG
GACTTTTAAAGGCCATTTCCAAGTTTAACTGGTCATTGGGTAATAAGTTT
TCCACTTATGCTACTTGGTGGATTAAACAAGCGATTACTCGTGCTATTGC
TGATCAAGCACGTACGGTTCGGATTCCCGTACACATGGTGGAAACTATTA
ACCGTTTAGCTAAAGCTGAACGTGCCTTAAACCAAGAATTAGGACGCGAA
CCCACCGCGGAAGAGTTAGCGGAAAAAATGGGTGGTCAAGCTGAAGGGTT
TACAGTTAAAAAGATTGCTGAAATTAAACGTTTAAGCTTAGATCCTGTTT
CTTTAGATAAAACAGTGGGCCACGATGAAGAATCGCAGTTCGGTGACTTT
GTGCGTGATACTGATGCCCAAATGCCCGATGAGTTTACCGAAAGCCGTTC
TAATTACGAAAAGATTGATGAGTTGTTAAACAACTGTTTGTCCGAACAGG
AAGAATTAATTGTGCGGATGCGCATTGGTATGCCACCTTACAACGAAACC
AAAACACTCGATGAGGTAAGTCAAAAGATTAAGATTCCCCGCGAAAAGAT
TCGGCAAATAGAAACCAAAGCCATTCGCAAACTGCGTCAAGCAGTGCGTA
ATAACCACATGAGCCTTTCCTTCATGAGGGGAAATGAAAAGAAGGATTAG
>gid:854296  spoT  p)ppGpp 3'-pyrophosphohydrolase
ATGTTTTACAATTGACTTAAATTATATAAATTTAGCAAAATGGCCACTTT
AGTTGAAATTGAACGCGATTTTTTACAAAAAACAGCCCAAAAATTTGCAC
CTGAAGTGGTTGCGTTGATTACTAAAGCACTCGATTACTCCAAAAAGTGA
CACGGTGAGCAAAAAAGGCTGAGTGGTGAACCGTTTTTTATCCATCCCTT
GAGAACAGCACTGCGCTTAGTGGAGTGAAACATGGACAGCAACACCGTGT
GTGCTGGTCTGTTACACGACATTATTGAAGATACCCAGGTCACTGAAGCT
GATTTAACTGCCATTTTTGGTAAAGAAATTACTGATTTAGTGGTAAAAGT
TACCAAAATTACCAGTGAATCCAAAAAACAACGCCAGCTAAACCGAAAGA
AAGAAGATTTAAACCTCAAAAGTTTGGTTAACATTGCGATGAGCTCGCAG
CAAGAGGTCAATGCTTTGGTGTTAAAGTTGGCCGACCGACTCGACAACAT
CTCCTCAATTGAATTTTTAGCAGTCGAAAAACAAAAGATTATTGCTAAAG
AAACACTCGAACTGTATGCCAAGATAGCCGGTCGAATTGGAATGTATCCC
GTTAAAACTCAACTAGCCGATCTTTCCTTTAAGGTATTAGATCCAAAAAA
CTTTAACAATACGCTGTCCAAGATTAACCAGCAAAAGGTCTTTTATGACA
ACGAATGGGGCAACTTTAAAAAACAGTTGGAAGAGATGCTGGAACAAAAC
CAGATTGAATACCGCTTAGAAAGTCGAATTAAAGGCATTTATTCTACTTA
TCAAAAATTAACCTTTCACGAGCAGAACATTGCCAAAATCCACGATCTGT
TCGCCATTCGTTTAATTGTGAAGTCAGAGTTGGATTGTTACCACTTACTT
GGTTTAATCCACCTCAACTTTACCGTGTTAATGAAACACTTTAAGGATTA
CATAGCATCCCCCAAACAAAACTTTTACCAATCAATCCACACGACTGTGC
GCTTGAAGGGTTTAAATGTGGAAATCCAGATTAGAACCCAACGAATGGAT
CATGTGAGCAAGTACGGTTTTGCTAGCCACTGGATTTACAAAGAGAAAAA
GGAAGGGTTATTGGCAAGTGCTTTACAAGTAAATTACTTAAACAGTAAAC
AAATGCATTCGCGCGATTTTTTTAAACGAATCTTTGGTACTGATATTATT
AAGGTTAATGTAAGTTCCGATAACGAACCTAACATAGTCAAAAAACTCAA
TGTTGAAAGTAACAGCAAGTTGCTCGATATTGCTTATGAGTTGTATCCCA
AACAGTTCAATAAATTAGAAAAAATCAAACTCGATGGGGTTGAGGTTATG
TCGTTTGACGTAACTGCCGAAAACGAAATGGTAATTGAGTTTTGTTTTGG
TAAAACCAATAACCTCAAACGGCGTTGGTTACGTTATATGAATAACCACG
TATTTCGCGAACGGGTTAAAAAGGATTTAAACAAGTTAAAGAAAGCGGTT
AAGTACAGTGAACTACCTCTATACGAAAAGGCCTTGGAAGAGTTGCACTT
AAAGCTAGCTGATGAAACCCAGATTAAACAACGCTTAAATGCTTTAGGGA
TCAAAAAACTGACAGAGTTCTTGGAATTAATCGAATACCCCCACTTCCCT
AAAAATGAGCATTTGTACTTTTTAGCTAGTAACAATCAGAAGTGAAGGGA
ATTGATTAAACCCATTAAGTTCGCTTTATCACAAGCTGTGTTCCAAAACT
CTTACTTTGAACAAATTGAGGGAATTTACATCACCAAAATTGTGATTGAA
ACCTGTTGCACAAAGATTCCTGACATGCCAGAACAAGTTATTGGCATCTT
AATGAAAAACATTCTCAGGGTACACCTTCATGATTGTAGGGAATTAGCTA
ATCAAAAGCAACCCAAAATTATTCCACTTTATTGAAATGCACACCAATTA
AAGATGCGACCACGTAAATTCCGCTGTCAAATTAACATTCGCGGTGTATG
GAGTGAAACAACGGTCAATAAAATTGTTCAAACCATTATTGAAGGTGATA
GCTATTTAGAACGAATTATTCCCAAGATCGATAAACAAAAAGATGAGTTT
GAGCTCAACATTACTATGTTTATCGACAACTATCACCAACTAATCACAAT
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AA
>gid:854121  vacB  3'-5' exoribonuclease, RNase R
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AGAGAACGGCAAACCTATTCCTCCGGGAATAGTTGTCAGGATGATGGAGA
ATCAAGCTGGTTTTCCGGGAAAGCAACAGGTATACAGAGCAATTGATGAC
TTGTTAGAATGACACATTTTTCGCAAGTCGGGTGGTGCTACAAACCAGCT
GTTAATTAACTATGAACTAGCTGATCCGGTATTGGATCAAAAGTTTCAGG
GCATTCTCAATTTAGGTAACAAGAACACTGGTTTTGTCCGTCCCTTAGAT
GATGACAAAACGGTGTACTATATCCATTTTTCCAACCTAGCGGGAGCACT
GGATGGTGATCTAGTTGAATTCTGTCCGCTCGACAAACCACAGGTAGGTG
ATAAGTTTGATGCTGCAGTGCTCAAAATTGTGAAGCGCTCCCGGGTGCTG
TACGCTGGTAACTTTTTGATTGAGTACTCCGATTTTGGTCAGGAGTTTCG
CATTGTTGCTGACAATCCTCGTTTTTACCTCACCCCGATTGTCAATAAGG
CCTCAGTTCCAGCTGAACTGGAGAGCAATACTAAGGTCGCTTTTCAAATT
GATGAGTATGATCCTGCAAATAACCTGTGTAAAGTCTCCATTCAGCAAAT
CTTGGGGAATAACGATGAACCGTTAATTAACCTCAAGGCGATTATGTTAG
ACCACTCGATTGTCTTTGAAGATAATGATGTGGTCGAACAACAAGCAGCG
AAGTTACAGTTTGATGAAAAAGAGCAGAGTAAGCCCTACCGCAAGGACTT
AACCGAACTTGCCTTTGTCACGATTGACCCCGCCACTTCCAAGGACTTGG
ATGATGCGATTTACGTCAAGCGCACCGACAAAGGTTTTGTTTTGTATGTT
GCCATTGCTGATGTGGCTTACTATGTGCAGCGCAACAGTGAACTTGACAT
TGAAGCCCGTCATAAAACAAGCTCAATTTACCTCCCGGGATACTATGTGG
TACCGATGTTACCAGAACGTTTATCAAACGAGCTGTGTTCTTTAAACCCA
AATGAAAAGCGGTATGTGGTGGTGTGTGAGTTGAACTTTGATCATGAAGC
ACGCTTAAACTTTAGTGAAGTGTATCCCGCTACCATTGTCTCCCAACGTC
GCTTTGCTTACAGTGAAGTTAATGATTGACTGGAAGACAGTGATGCTCTA
AAGGATGAAAGTGCAACAGTACTAGAGAGCTTAAAGGCTGGTTTTACCTT
GAGCGAATTGATTGCTGAACAGCGCAAAAAGAAGGGGACTATTGACCTAT
CTCACAGTGAAACAGAAGTAGTCGTTGATCAAAACTACTACCCGATTGAG
ATCCGTTTTCTCACCCACGGCAAGGCGGAAACAATGATCGAAAACCTAAT
GGTGGTTGCCAATGAAGCGGTGGCTTGAACACTTACAAACCACAAAGTTC
ACTTACCTTACCGGGTGCATCCCCGACCAAGCAAAAAGAAGTTACAAATG
TTGTTGGAAAACATTGTCGAGCTCAAAATTACCCAACCAAACTTTGTACT
CGATACGGTCACTTCCACCCAAATTGCGGCTTGGTTAAAGGAAAATAAGG
ACAACCCGAGCTATGACATCTTTGTCATCTTGTTATTAAGAACGCTAGGT
AAAGCCTTTTACATTGTTAATCCACTGATACACTTTAGCATTGGTTCACA
CCACTATACCCATTTCACTTCGCCCATCCGTCGCTATGCTGATTTAACGG
TACACCGTTTGTTGTGGATGAATCTGTTTACTCCAGAGCGTTTTACTGAC
ACTGAGCGTGAACAGCTCAACGCCGAGCTAGAACAAATTTGTGAAACCAT
TAACGATACTGAGATTAAGATTAATGGTTGTGAACGGACTGCCAACGATT
ACTTAACTACGCTGTATTTGTCTAAACAAGTGGGACAAACTTTCCACGGT
TTTATTTCCGCTATTACTAGTTTTGGCATCTTTATGCGAATGGATGAAAA
CAACTTTGATGGACTTATTAAGATTACCTCCATTCCCGAAGACTTCTTTG
TCTTTGAAAAGGATCGGATGGTGTTGCGCGGCAAACGCACCAACAAGGTT
TTTAGAATTGGTGATAGGTTAACCGCGAAACTGACTGAAATTGATACAGT
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>gid:853873  yb95  similar to helicases
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TTGTTTGGCTAACGTTGACAACTGCGTGCACATTGTAGCTGTATTGCTCA
AATACCACCAAATGCTAGTGGAGTCCAAACGCAGTTTTAACTTAGCTGAA
GCCTTTCACTTGGACTGTGATCAGGCCGAAATGCTGATTGAAAACCTCAG
TTTAGAGATTATTGCCGGGGGATGAAACTTTAAGCTGGGGTTCACGATTA
ACTTAGATAAGCACAATCCCCAACCGAGTGTCTTGCGCTTTTATTGTTGT
GATGCGACCTTTGTGTACTTCCTTCACTTGGAAAACGACACTTTGCACTC
AGTCGAATTGTCCAAGTTTAAACCAGAGGAACGCGCTACCTTACTCTTCT
TTGATAAATTGTGCAAGCAGTTTACAGTGGGGTATGACCGCAACAGTTTG
CTCTTTCCGTTAGCGGGTTTTTTAAAGGAGTTACAAGCCAACACGGAGCC
CACCATCTTTGTCTTTAACGATGACAAAATTGACAACATCCTCTTTTTAA
GGATTTCCAAAAAGCACCATGGTTTAAACCATGTTTGTGGTTTTAGTGGC
AAGAAGGTATTTGACTTTGTTACTTATAAACAAAAGGAAAAGCAGATTGT
GTTGCGCTCAGCGTACCTGAGTAAGTTCACTGACTTTAAGTTTCCTTACA
CCATTAACATCTACAAACTCCAGTTTGGGGAACCGCTGTTCTTTTACTTT
TTAATTCAGCTAAAGCGTGATGGCTTTAAGAACTTCTACTTTCAAAGTGA
AGACAGTATTGTCAAGGAAAAGGAATACCTACCGAAGCTGTACTTTAAGG
TCGAGTACGATCCGGTCAAAAACAAGTTTGTCAGTGATGCCTTCTTTAAG
TACAAGAACCACTTTAATAAGGGCACAACCACGGTGTATCCGCACCGCTA
TTACATGGCTAAAAAGTCGGATCGCGGTGGTTTTAACCGCTTGTTGTTTT
ACGAAGAGGCCGTGGAAAACTTCTACCAAGACCAGTTTGATTTGGGTTAC
TTCCGTAAGTTTGAACACCTACCGATCCAGGACAAAAACCAGATTGAGGC
CTTTAAAGCAGCGCTAGATGACTTAATGCCCGTGGATTTGGCTGAAGTGA
GTTTATCCGATAACTTACTCCACCAAAAACCGCTTCATTTTGCCCTGTCT
GATCTAGAAGCAGTTGCTGTTGATGACAAACAAATTAAGTTAAGTTTTGC
CCCTAGTGCGGTTGAACTGAAATTAATTAAACGGATCTTATCCGCTTACC
ATAAGGGCAATGTGGTCTGTATCGACCAGGAGAGTTGGTATGACCTCAAG
CAACCAGCTGCTAAAGAACTAATCCAGTTCTGAAACCAGTTTGACTTACG
CAACGCTACCAGTGATGGTAATCACATCTACCTCCCGAAATATTACTTGT
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GATGTACCGACCATTAAAAAGATTGAAGACCAAAACAACAACGTCTTTGA
CCTTTCCTTAGAACACAAAAAGATTACTTCACTGCGCAACTACCAACAAG
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GTTGGACAGCTATCTCAAAAACCACGTTAACCTCCCTAGCTTAATTATTG
TTCCGGCTTCTTTATTGTTGAACTGAAAGAGTGAGTTTGAAAAGTTTGCC
CCGCAAATTAAGGTCAAGGTAGCTAACATCCCTTCTAAGGAACGCGGTGA
GTTGTACGAAAAACTTACTAACGAAATCCTGATTGTGAGCTTTAACGTGT
TGCGCAGTGATGTGAAGTTAATTACCAAACAGCGCTTTCACTATGTTGTA
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TGCCAAAAAGGTGAAGGGCAACTTCTGTTTGGCCTTAACTGGTACGCCAA
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AGCTTTTTAGGGAACAAAAAGCAGTTTACCGACCAGTTTGAAAAGGAAAA
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AGAACGTGACCGCGGTTTGGAGGAAATTAAGCAAATCCAAGACAAGAGTT
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TTACCCAGTTCATTGATGTAATTGACCACTTTAAAGACACCTTTAAAGAG
CAGGGCATTGAGTACTTTATCTTTGATGGCCGTAAGTCTCCTAAAAGCCG
TCACAGTATTATCGAGAAGTTCAACAATGCCAAAAACCCTTGTGTGTTGT
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GCATTATTGCTAAAAATACGATTGAAGAGCGGGTCTGTCAAGTGCAGGCC
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CGAATCCTTGACCAATGAGGAATTATTACGTCTTTTTGAATAA
>gid:854181  ypuH  conserved hypothetical protein
ATGGACGCGACAATTAAGGTAACTAAACCCGTTTTAAAACAAAAGGATAG
CAGCGCTGCTAATTTAGTTGCTGCCATTTATGGGTTGTTGTTTGTAAGTG
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GCTTGGTCACCAAAATGGAGATCAAGGACTTTATCCACCGTTACCTACCC
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GACTCTAACCGTTACGGGGATGATTAA
>gid:853989  yqxE  protein (hrcA) homolog; similar to Swiss-Prot Accession Number P25499, from B. subtilis
ATGAAAAATTTAACTACCCGACAAGCCCAAATTCTCAAGGCCATCATCAA
CGAATATATTGCCTATCCAGTACCTGTTGGTAGTAAATTATTAACTAAAA
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AGGTTTATGGCATCCATTACCTAGCCCAACAACCAGAGTTTGCCAACCAG
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ATTAATACCACCAACGAAAGTAAGCACCAACTAGCGATAGTGGGTCCCAC
CCGGATGGACTACCAAAAGGTGAAAGCGTTATTGTTGACCCTCAAAGAAG
AGATCGAGGAGTACGATAAGCAACTTCACGGTGGTAAAACCACTAGCTCC
ACTTAA