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COG category: Transcription
Organism: Ehrlichia canis str. Jake, Jake

Number of genes found: 26

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# Ehrlichia canis str. Jake, Jake

>Ecaj_0847 Ribonuclease III
ATGATAGAAACAATATCAAAAACTATAAAATATCATTTTAAAAATCCTCA
ACTACTACATGAAGCATTAACTCATCCGAGTATAATATCAAAGGATTCTC
TTAAATTTAACTATGAGAGACTAGAATTCTTAGGAGATGCAGTACTAAAC
ATAGTAATATCTGAAATGCTATTTAACATTTTTCCTAAGGATACAGAAGG
TAATCTTGCTAAAAAAAAAACAGCATTAGTGTGCGGTAACCAGTTAGTAA
AAGTAGCACAATCTATAAACTTAGGACAATTTATTATTATGTCAGATGGA
GAAAGAACTTGTGGTGGAGCTAATAATCACAACAATCTAGAAAACGCATT
AGAAGCACTAATAGGTGCAATATATCTTGATGGAGGGTTAACAGCCGCAC
AAAATTTCATTCATTCATTCTGGAAACACACTGCAATACATATGGATATT
CCACCTCAAGATGCAAAAACTATACTACAAGAATTCATACAAGGAAAAAG
ATTACCTGCTCCTACATATCATATCATAGATAAATCCGGACCAGATCACA
ATCCAATATTTACAGTAGAATTAAGAATCCCACTATACAAAACAATACAA
GCAACTGGTAATAATAAAAAACTAGCTGAACAGAAAGCAGCAAGTCTAAT
GTTAAATCAAATTAAAGATCAAATAAAATGA
>Ecaj_0170 DNA-directed RNA polymerase
ATGAAGATGTTGGATTTGTATGGCTATACTAGTATTGCACAATCATTTGA
TAAGATTTGTATATCTATAGCTAGTCCTGAAAGCATTAGAGCAATGTCGT
ATGGTGAGATTAAAGATATTTCTACTACTAATTACCGTACGTTTAAAGTG
GAAAAAGGAGGTCTTTTTTGTCCTAAAATTTTTGGACCTGTAAATGATGA
TGAATGTTTGTGCGGTAAGTACAGAAAAAAACGTTATAGAGGAGTAATTT
GTGAAAAGTGTGGAGTTGAGGTTACTTCTTCAAAGGTGCGTAGAGAAAGA
ATGGGTCATATAGAACTTGTGTCACCTGTAGCACATGTTTGGTTCCTAAA
GTCTTTGCCGTCTCGTATAGGTGCATTGCTTGATATGCCACTTAAGTTAA
TAGAAAGTATCCTATATAGTGGTGATTTTGTGGTAATTGACCCTATTGCG
ACTCCATTATCTAAGGGTGAGGTGATAAGTGAGAGTGCATACAATCAAGC
AAAGGATAATTATGGTGAGGATAGTTTTCTTGCTCTTACTGGAGCTGAGG
CTATTAGGGAATTGCTGGTGCGATTGGATTTACATGCAATTAATGCAAAT
CTTAGAACGGAGTTAGAGTCTACAACTTCAGAAATGAAGCGTAAGAAAAT
AGTCAAAAGGTTACGTATTGTTGAAAATTTTATAAATTCTGGTAATAAAC
CTGAATGGATGATATTAACTGTTATCCCAATTTTACCACCTGATTTAAGA
CCGCTAGTTTCTTTGGAAAATGGAAGACCAGCAGTTTCTGATTTAAATCA
TCATTATCGGACTATTATTAATCGTAATAATAGATTAGGTAAGTTATTAA
AATTGAATCCACCTGCAATTATGATTCGTAATGAAAAGAGAATGCTGCAG
GAAGCTGTAGATGCTCTTTTTGATAGTACACGTCGTAGTTATGTTTCTAA
TAAAGCAGGAAGTGTAGGATACAAGAAATCATTAAGTGATATGTTAAAAG
GTAAGCAAGGACGCTTTAGGCAAAACTTGCTAGGGAAAAGGGTAGATTAT
TCTGGCAGATCAGTAATTGTTGTAGGTCCTAACTTAAAATTACATCAGTG
TGGGTTACCAAAGAAAATGGCTCTTGAATTGTTTAAGCCGTTTATTTGTT
CTAAGCTGAAAATGTATGGTATTGTGCCAACAGTAAAGTTAGCAAATAAG
ATGATACAAAATGAAAAACCAGAAGTCTGGGATATTCTGGATGAAGTAAT
ACATGAACATCCAATATTATTAAATAGAGCTCCTACTTTGCATAGGCTAG
GGATACAAGCCTTTGATCCAGTATTAATAGAAGGGAAAGCAATACAATTA
CATCCTTTAGTATGTAGTGCTTTTAATGCTGATTTTGATGGAGATCAAAT
GGCTGTACATATCCCATTGTCATTAGAAGCACAGCTTGAAGCTAGAATAT
TAATGATGTCTACTAATAATATCTTAAGTCCTTCTAATGGTAAGCCAATA
ATTGTTCCTTCAAAAGATATAGTACTTGGTATATATTACTTAACTTTACA
AGATCAAGCACAGTCTGAAGATGAAGTTTTATTCTTTGGTGATTTTAGTC
ATGTGGAATATGCTTTACACAATAAGGATGTCCATCTATGTAGTAAAATT
AAATATAGGATGACTTATTGTAATTATGATGTAGAAGGGAATAAGCCTTC
ATATTATTCTAAAATTATTGAAACTACTCCTGGTAGGTTGATATTATGGC
AAATATTTCCACAACATAAGAATTTAACTTTTGATTTAATAAATCAAGTT
TTGACTGTAAAAGAAATTACATCAATAGTTGACTTAGTATATAGAAACTG
TGGTCAAAGTGAAACTGTTGAATTTTCAGATAAATTAATGTCTCTTGGGT
TTAAGTATGCTTCACAATCTGGTATTTCATTTGGATGTAAAGATATGATT
ATCCCAGATACTAAGACAATGCATGTAGATAATGCTAGTGATAAAATAAA
AGAGTTTGCTGTGCAGTATCAGGATGGTTTAATTACAAGAAGTGAAAGAT
ATAATAAAGTAATAGATGAGTGGTCTAAATGTACTGATCTAATAGCTAAA
GATATGATGAAAGCTATTTCTGTATATGATGAAGAAAATAAGTTGAATTC
TATTTATATGATGGCACATTCTGGGGCTAGAGGATCTGCATCGCAGATGA
AACAGTTATCTGGGATGAGAGGATTAATGGCTAAGCCTTCAGGTGAGATT
ATTGAAACTCCAATAATATCTAACTTCCGTGAAGGGTTGAATGTGTTTGA
ATATTTCAATTCAACTCATGGGGCAAGAAAAGGATTAGCAGATACTGCTT
TAAAGACTGCAAATTCTGGTTACTTGACTCGTAGGCTTGTTGATGTTGCT
CAAGATTGTATAGTTGTTGAATATGATTGCAAAACACACAATGGATTTGC
GATAAGGTCTGTTGTTGAAGGTGGTGCTGTAGTTGAAACATTAGATAATA
TTATACTTGGAAGGGTTGCTGCTGTTGATGTATATAACCCTATTACTGAA
GAGTTGCTTGTTAAAGCTGGAGAATTAATAGATGAAGCTAAAGTTGAGAA
GATAAAAATAGCAGGATTAGATGCTGTGAAGGTAAGATCACCTCTTACTT
GTGAAGCTAAAAAAGGTATTTGTGCTTTATGTTATGGTAGAGACCTTGCT
ATTGGTGATGTTGTGTCAATAGGTGAAGCTGTTGGTGTGATAGCTGCTCA
ATCTGTTGGTGAACCTGGTACTCAATTAACTATGCGTACTTTCCACGTGG
GTGGTACTGCAATGAGAGGTGTTGAAACTTCCAACTTAATAGCATTATTA
GATGCTAAAGCAAAATTAGTGAATAGTAATGTTGTTGAAGATAAACATGG
TAATAAGATTGTCATGAGTAGATCTTGTGAAATAGTATTGCTTGATAGTG
TTGGAAATGAAAAAATGCGTCATAATATACCTTATGGAGCAAGACTTTAT
GTTAACGATGGTCAATTTGTAAAAATTACAGAAAAAATTGCTGAATGGGA
TCCTTATACAATGCCTATTATTACAGAAAAGACTGGTATTATTAAGTATA
TGGATTTAATAGATGGTGTATCTATCAATGAAGTATTAGATGAGTCTACT
GGTATTTCTAATAGAGTAGTAGTTGATTGGAAATTACATTTACAAGGTGC
TAACCTGAGACCTAGACTAGTTTTAGTTGATGATAATGGTAATATAATTA
CATTATCTAATGGACTAGAAGCAAATTATTTCATACCGATAGGAGCAGTA
TTAAATGTACAAGATGGGCAAAAAGTTCATGCTGGTGATGTTATAACAAG
GATTCCAAGAGAATCTATAAAAACTAGAGATATTACAGGAGGGTTGCCTA
GAGTAATTGAGTTATTTGAAGCACGTCGTCCGAAAGAACATGCTATAGTA
AGTGATATTGATGGTTATGTTGAGTTTGGAAAAGATTATTATAGGTCTAA
AAGACGTATATTTATTAAGCCTGTAGATGATAAATTGACACCTGTTGAGT
ATTTGGTGCCTAAAGGTAAGCATACTATTGTGAATGAAGGTGACTTTGTA
CACAAAGGAGATTTATTAATGGATGGTGATCCTGATCCTCATGATATCTT
GCGTGTTTTAGGTGTTGAAGCACTGGCAAATTATATGATCTCTGAGATCC
AACAGGTTTATAGGCTACAAGGTGTACGTATTGATAATAAGCATATAGAA
ATAATCTTAAGACAAATGTTGCAAAAAGTTGAGATATTTGAACCAGGGGA
TACTATGTATTTAGTTGGAGAGAATATAGATATGGAAGAAGTAATAAAGA
CCAATAACAGCATGGTAAAGATGGGCAAATCTCCTGCTAAGTATGCTCCA
ATACTTCAAGGTATTACTAGAGCAAGTCTTGATACTAATTCATTTGTTTC
TGCAGCGTCATTCCAGGAGACTACGAAAGTTTTAACAGAAGCAGCATTTT
CTGGTAAGGAAGATTCTTTATATGGATTAAAGGAAAATGTAATAGTAGGT
AGATTAATACCTGCGGGTACTGGTTTCTTAATGAATAAGATAAAGAAACT
GTCTTTATTGAATAAGGAAGATTATTCTATGTATTATGATAGTGAATATC
AAGATCCTGCATTGTTACAATCTGATAGTAACAACTTTGGTCATGACTTG
CCAAAAGGTAATAATAATATTGTTGATTATTAG
>Ecaj_0468 Transcription termination factor NusA C-terminal duplication
ATGGTTAATCTACAGAATTTTGATAACTTAGAATTAATAAGGGTGGCTAA
GGATATTGCTGACCAAAAAGGCTTAAATTTGGATATAATAATAAGGGCTA
TAGAAGAAGCTATTCAATTAACTAGCCGCAGTAAGTATGGAAATTGTAAG
ATTAAAGTTACAGTAGATAGAAAAACTGGTGTTGTGTCAACTTATAGACA
AGTATTAGTTATTAATGATAATGGTGAAATTGTTATTCCTGAAAATAAGA
AAAGTGAAATAGATTCTTCTGATATAAGCAAATATAAGTTGATTACTTTA
ACGGAAGCTAAGCAAATTGATGAAAATGCTGAGGTTGGAGATATAATGCT
AGAGCATTTACCTGTTATTGATCTTGATTATAGTTCTGCTAAGATTGCAA
AGCAAAAAATTGCTCAAGTTATTATATCAGAAGAGCGTAAAAAGCAATAT
GAAGATTTTAAAGATCGTATAGGTGATATTGTTTATGGTACTGCTAAACG
TATAGAATATAATAATGTTATTGTAGATTTAAATGGAAATGAAGGTTATT
TATCAGCTGCAAATTTAATAAAAGGTGAAGTATTTCGTGTTGGAGACAGA
GTAAAAGCACATATAGAGGATGTAAGAAAAGAAAATTCAGGACCTCAAAT
ATTTCTTTCAAGAATAAGTAAAGGATTTATGGAACAATTGTTCAAGCAAG
AAATTCCAGAAATATATGATGGAATAGTGACAATTAAGGCAATAGCGAGA
GATCCAGGATCTAGGTCAAAGGTTGCTGTTTTTTCTTCAGATAAAAATAT
TGATCCAGTTGGTGCGTGTGTTGGTGCAAGAGGTGTAAGGATTCAGAGTA
TTATTTATGAATTGCATGGTGAGAAAATTGATGTAATTTTATATTCTCCA
GAACTTGCTAAATTTATAGTTAATGCTATAGCTCCAGCAGAGGTTTTAAA
GGTTATTATTGATGAAGATAAAGAAAAAGTAGAATTAATCATTCCTGAAA
ATCAGCTAAGTTTAGCAATTGGTAGATATGGACAGAATATTAGATTAGCA
TCGGAATTGATTGGTTGGAAAATAGATGTAATAGGTGATGAAACTGAATC
TAGTAGAAAAGCAAAAGAATTAAGTGAAGGATCAAAAATATTTGTTGAAG
GGTTAGATGTTGAGGAAATAATAGGACAATTATTGTTTACTGAAGGATTT
GTTAGTATTGAGGATATAGATCAAGCATCTGTTAGTGATATTGCTGCAAT
AGATGGGTTTAATGAAGAGATAGCAGAAGAGTTAAAAAGTAGAGCAGCTG
ATTATTTGACGCGTAAAGATGCTGAAATAAAGCAAATTTTAGATAATTTA
TCAGTTGATAAGGATGTTACTACTTTGCCATTTTTAAAACCAAGTGATAT
TATAGCATTGTCTGAGAATGGTATTAAAAGTCTTGAAGATATTGCTGGGT
TATGTACAGATGAATTTTTCGATATTGTTCCTAATATTGCGTTAACTAAG
GATCAAATTGACTCTGTTATATTAGAGTCTCGTAAAAAAATAGGATGGTT
ATAA
>Ecaj_0309 hypothetical protein
ATGCTAACAAGAGATCAACAAAGAGAAGCCATAGATAAAAGAAAGTTAAA
ACAGTATATAAAAGATACTGTATCAGAAAAGATTGATGATCCTCTTCTAG
ATATGACTAATATTACTCCATTATGTGTCACATTACTATTAGATGTTGAA
CCAGACTTCACTTTATTTAAAGAAAAAGTAATTGATATATTAAAAGAATA
TAATGACTTGATCGCAATACACTATTTACCAAAAGGGTTAACTATAGTTG
ATGATAGAACTTCAGAAATGTCATGGAATAGTGTGAAAGAATTACATAAA
TTATACCATAATCATCAACTATCAGTTGCAAGTAATGATGGTAGTAGTAT
TCTCACTAGACAAAAATTTAATCTTAGTCCTAACAAACAAGACATTATAA
TAGATAACAACTTAAAGTACAGAATTCAATATTACCTATTATCATCACTT
ATTGATCAATGCTTTGATACAGAAACTATAAAAACATATAGTGAAGAAGC
ATTATTCCTAACAGACAATACTAGAAAAAATATAATTCAGAAGCTAGGAG
AAATACTTCATCATCATGTACAAAAAAAAACTTTTTCTTCATACGCAAAA
TATTTAAAAAATTTATATGAAATACAAGAATTATACTTTACAGAAAAAGG
TTATGACCTATTAAGCACAACTCTACAACATATTACACTAAGAAAACTCA
ATATTACTCAACAAAACATGTCTTACACCTTTAGTCCTTTATTAGATAAT
GGATGTGATATCAATATAAACTGCAACATACCAGAATATGTAGATATATT
CCTAGAAACAAGCGATATTACAATCTCTGGAACAGTATATGGTAACATTT
TTAGTAAATACGGTAGTATTACTATTACTAATGCAAAAGAAGACTGTAGT
AAAAATGTAGTCTCCATATTTGGAGTTGTAAGCATTAATGGTAAAATAAT
TAATCAAAAATTACCTAATGAATTAATTATTAATTCTAACTTTTGTACAA
ATATAAAACGAAGTTCAATAATAACTCGACAAACAAACCTCTGTCAAACT
CCACAAACTATTTCATCATTTTCTTCAGAAGATTTTATTAATAACCAACA
TACAAATAATATAGATGCATTAAAAATAGAGCTCTTTAATGCAAAATTAC
AATATTATGCTATTATTGCATCTATAGAATGGCCTACCAAGCAACCTACA
TATAAAAATGCTGAATTGCTCTTCCAGGGTAAAATACAGTATACAGACAT
CATAGACAAACTATGTAATATAAACCAAAATACATTACCAAATATTAGGA
TTGACCATAGTATTAACCTACCTTTTCACAATGTATTCATAAAAGATAAA
AAATTAATAATTGAAAAATTAAACAAATTCATAGGAGTTTATTTAACAAC
ACGTACAAATAATGGTAAAGATTTCATAAAAAAATTTCATATAGATGAAA
TAGCAATACACAGTCAAACAGAATATGCACAACTAATACTTTATAATACA
AATATAACTATATTTGGTAAATTTCAAGGTCTTATACATACACATACAGG
AAATATTACAGTTATAGGAGAAATTAAAAAATCTAGGCTTACAACAAATA
CTGGACTCATTAGAATTAAGCCCAGTAATAGCAACGCCAACACAACCATA
GCTAGTGATTCTTTAATCATTGCTAAATATGGCACAATAGAAATCACAGG
TAAACACAACTATTGCTACATTAATGGTAATAAATTTATTACAAATCCAG
ATGAAACAAGTTCAGCAACAACATCACTTAATAAAACACACCCACAAACA
TCTACAAAAGCCATCACAAGTCAAAACAGCACTAAACATGCTATACCATT
TTCCAAAAATACTATACACTATCTGAATCATGTAAACATCATTGATAATA
TAGAAGCAGAAAATAGGCTACCTATAACTTTTTTTGATTATGGCGCCACA
ACATTCATTCATGATGTACATATAAAAGACAAAAAATTAATCCTAAGAAA
CCTAAATAACAACATAGCACTTCACCTAACAAATATTACATCTAACGGTA
CAAATCTCAAATCTAAATTTGGTGTCAACGAAGTAGTAATATACAGTGAT
GCTATAGAACATGCATATTTAATATTTCATGATACAGATGTAACCATAAT
TGGTAGTTTTTTCGGAATATTGCATACGAATAGGGGTAATATTAAAATTA
ATGGAGAAATCAAGAAGCTATCAAAAATTAGTACAAATGCTGGATCAATT
GAAATCACAGGAAAAGTTAACAAAGCAGAAATCACAGCAAACACTGGATC
AATTGAAATAAAACCTCACTCTAACGATCTCACAACAGAAGTAGCAATCA
ATAGTCCATTAACCGCTAAATATGGCACAGTGAAAATCACAGGTATACAT
TCTAGATGTCGCATTGATGGCAATCATGTAATCACAACCCAACCAAGCAG
CTGCATTCCTCACTCATGTCTGCAAAAACTTTCAGTAATACTTCCTTATT
TAGCAGATCCATTGTTATTATGA
>Ecaj_0280 RNA polymerase, omega subunit
ATGGCACGTCTTACAGTTGAAGAATGTATGGGTCGTACTAATAATAAGTT
TAAGCTAGTAATACTAGCAAGTCAAAGGGCTCATGACCTAAATTCTGGAG
CATGTCCAGTAATAAAGCACAAAAATGGCAAAAATACTGTTATTGCATTA
AAAGAGATAGCAGCAAAACAACTAGATGTATCTTCTTTGTTCAACTTGTC
AGTACAGAGATGTAGAAAATATATGGAAAAATTTATTAATTCAGATGAAC
AATGTGTTACTAATAAATCAAAAATTGACATATTTCAACAAAATGCAATA
ACTAGTAGTTTTAATGAATTAGGAAATAACTCAAACAATCAGGGCAGTAA
TCTTTTAGGCAGAGATAACTTTTTTTCCACTCCAGAAAATAGAAATACTA
GTAATACAGACTCTTAG
>Ecaj_0765 Transcription-repair coupling factor
ATGGGCAATATTAATAAATTTCTCAACATTCCACATACATTTGAGCCATT
TGTTATTATAAAAATGTATGCCAAAAAACTTATCAATTCTGCAATATATA
TAGTAGATAAAGAAACACAATTACATGATCTAGCATCAATATTTAAGTTC
TATATTCCAAGTCTTGAAGTAATAACATTCCCTGCATGGAATGCAATCCC
ATACAAAAAAAATTCTCCACACAATTCAGTAATGGCAGAACGAATTAAAG
TTCTATATTCACTAACTACTAAATGCAATAACACACCTTACATTATCCTT
TCAACAACTAATGCAATTATGCAAAAAGTACTCCCTCAAAATATTATATT
ACAGTCAGTACTAAAAATTACACTACAACAAAACATTACAAAACACGATA
TAGAATACTATTTAACACATTACGGATATAATCAATATTCAATAGTACAG
GACACAGGTGAGTTTGCTATTCTCAATAATAGTATTGACATCTTCCCAAT
GACTTACAAAAATCCTATAAGAATTCATCTACACAATAATTTTATACAAT
CTATCAATTATTTTAATCATACCACACAACTAATAGACAACAACTCCTTT
TTAGATGAGATTTTAATCTATCCAACTTCTGAACTAATCAAACAAAAAGC
AACTATAGATCTCTTTTCTAGAATCTACAAAACAAAAACAAACCAAGATC
AAAATTTATTAGATACAATAATTTCCGGTAAGAAACATACAGGAGAAGAA
AATTTTTTACCTTTATTCTACAAAGAAGAATTAAAAAATATTTTCAATTA
TATACCACAAAACTCTACAGTTATTTTTAGTGATAGAATCATCAACGAAA
TAGAACAATATAATAGCCAAATATATTTAAATTATAAATCTCAATTATTT
TATCAAGTACCTCCACATCAATTTTATATTAATCTTGAAGATTTTAAAAC
TATAACTCAACAGTTTAATAAGATTGTATTCTCACAACATAATAGTGCTA
ATAACAACAATTCCACATCTATAAATGCACAAAGTTTTAATATTACAACA
CAAATTCAACATGTTCCAAACTTTAAAGTTTTAGCACAAGATAAACAAGC
CAACATATTTGAAATCCTAACACAATACATTAATACTACATGTCAGACAA
AAAAACTAATAATAGCATGCAATTCCATCGGCTCCTTAGAATACATACAA
AATAAACTTAAAACATTAGGTATTAAACTATATAAAATCAATCATTACCA
AGAGATATTTTACTCACATAACATCACTATATTACCAACCAATCAAAGTT
TTATAACAAAATCCACCATCGTCATAACAGAACATGATTTACTATATAAA
CAAGAAGTGACAAATAAAAGTAACATCTCAAATATTATTAATAATAATAC
CAATTTAGACATTGGTGACATAGTAATACACAAAGATTATGGTATTGGAA
AGATAGTAGAACTTGAAACTACTAAAGTACTTGATAGCTACCATGATTTT
ATAAAAATAGAGTATTATAATAATGACAAACTATTTTTACCTGTAGAAAA
CATCAATCTTATATCTAAATACGGACAACAAAATCCTAACGTTACACTAG
ACAAACTAGGTAGCACATCATGGCAACAACGTAAAACTAAAATAAAAAAC
CACATCAAAAAAATTGCAAGAGAATTATTAGCTATAGAAGCAGCAAGGAA
ATTATCCACGGGTCAAATCTTTTGCAAAGATGAAAATTATCAACATTTCT
GTAACGAATTTTCTTATACGGAAACAGAAGATCAATTACAAGCCATAAAA
GATATGGAACATGACCTATCAAGTGGCAAAATAATGAACAGATTAATTTG
TGGAGACGTAGGTTTCGGAAAAACAGAAATAGCACTACGTGCAGCATTCT
TAGTAGCAAATAAGAATTATCAAGTAGCAGTTATAGTTCCAACAACTTTA
TTATGTAGGCAGCATTTTATTGTGTTTACCGAAAGATTCAAAAAATTTCC
AAATATCAAAATCAAACAACTATCTAAAATAGTTGAAAGATCTGAAATCA
AGAAAACAAAAGAAAGTTTATCATGTGGTCAAGTACAGATAATAATAGGA
ACACATGCTATATTAGCAAAGGATGTGACTTTTGCTAACCTAAGTTTGTT
AATTATAGATGAAGAACAACAGTTTGGAGTAAAACAAAAAGAATCATTAA
AAAAAATAAAAACAAACGTTCATGTAATTTCATTATCTGCAACTCCAATA
CCACGCACACTATACATGTCATTATGTGGAATAAAAGATTTAAGTTTAAT
AAAGACATCACCAAAAAACAGATTACCAGTAACAATTTGCACAACACACT
ATGACGATACCATAATAAAAGATGCCATAATACGTGAACACAATAGAGGA
GGTAGAGTATTTTACGTTTGCCCACAAATTAGCAATATAAAAAGCATTAG
TGATAACCTAACAAAATTAGTACCAGGAATTAAAATTAATACTGCTCATG
GACAACTTCCACCAACACAGCTTGATACAATAATGAATGATTTCTTTGAC
GGTAAATTTACAATATTACTCACTACATCAATTATAGAATGCGGATTAGA
TATTCCATTTGCTAACACAATAATCATACATAATGCAGACATGTTTGGAT
TAGCTCAACTTTACCAACTAAAAGGCAGAGTAGGACGTAGCAACATAAAA
GGTTTTGTATATTTTATATTATCAGAAAAAGTAACAAATAAACCTACTAC
CAAACTAGAAATTATACAATCAATAAATTCTATAAGTTCAGGATTTACTT
TATCACTACATGATATGGATATCAGAGGATTTGGAAATTTAGTAGGAGAA
GAACAATCAGGCAATATAAAAGATGTAGGGATCGAATTATATCAACAAAT
GCTAGAAGAAGAACTTAATATTCACAATGAAAATCCTAAAGATTTTGATC
ATATAAATATTAGTATCAATGTTAACATCAGAATTCCTGAACATTATATC
AAAGACATAGGACTAAGAATGCGTGTATACAAAAAAATTGGCAATCTTAA
GACAAAACAAGAGATAGATAACTATCATATAGAGTTAATCAACAAGTTTG
GCAATTTACCAAATGAAGTAGAAAATTTACTAAACACTATATATATAAAG
CAACTGTGTGCAAACATTGGTATCTACGAAATTGAGCAAGTAAAGAATAT
CATCTACCTAAGGATTCAGAGTAATACAACTTTCAAGCAAGAAGCACTTA
ATTATTTTATCAATAATCCTCTGATTTTCAAAATACAAAATAACAGCATA
TTAATGTTAATCAACAATAGCTCTTATTGTACTACAAGTTTTATTATACA
CCATCTTGGTAAAATAAACGCATTAAACTCAAGATAA
>Ecaj_0291 hypothetical protein
ATGATATTTAATAATTATACTATAAATGACATTGATAACCTGATAGATTA
CTTATATGAAATGAAAGAAGTGTTAGATTTAATACAAATAGATAATCAAC
TGTTAATCAAAATCATGAACACAATGTTGTTAACTTTTAATACGATTAAC
TCAACTATTGCAACATTTTTAAACGAGAAATGGTCTATAGACCGCATAAA
TTTAATCAGTCTTTCAATTATTAAAACTGCAGTTTGTGAATTAATTTGTT
CTAACACAGATGCAGTAATCATTATAAATGAATACGTTAATATAGCGAGT
CATATACTAGAAAAAACAGAAGTTAATTTTATTAATGCAATACTAAACCA
AGTAAAACTTACAGCACGTCTTACATTTGATAATGACATCAATAATTTCC
ATCACGTAGAACAATCAGAAAATTCCGCTGTCTTCAATAATACATAA
>Ecaj_0818 Transcriptional regulator
ATGAAAACAAGTAGTGATAATAGTATGATAGTTACTAGAATGAAGTACCA
AATGGATAAGATGGGAATAAATGCACGTGAACTAGCTCACAAAGCTGATG
TTGGAAAATCTTTTGTATATGATATACTAAGCGGAAAGTCAACAAATCCT
ACATCTAAAAAGTTAATGGCAATAGCAAAAGTGTTAAATGTTTCATTGTC
ATATTTAATTAGTGATGATAATTATACTTATGGGCAAGGTAATATGAATA
TACTACCTGTGTATGATTTAGAATTAGAAAACGGTAAAATATCATCTTCA
GGTGATGTGAATTTATATTTGTCTTCAAATATTAATTTAACTTCTAATAT
GAAAAATTTACGTGTATATTACGTAAAAGGTGATAGTATGATTCCAACGT
TGATGAATCAAGATGTTGTTTTAGTAGATATAGGTGATAAAATTCCTCAT
CCTGCTGGGTTATTTGTAATAGTTGATACAGTTGGTGTATCAATTAGGAG
ATTGGAGTATTTAAGAGAAAATCAAAAGATAAAGTTACATGTAGTTTCAG
ATAATAAGAAATATTCTTCTTATGAGTGTCATTTAGAAGACATGGAGATA
TTAGGAAGAGTAATTTGGTATGCACGGTCGTTGTAA
>Ecaj_0126 hypothetical protein
ATGACTAGCAACACATCAATACCAAAAAATCATGAATATTCTTTCAAATT
AGATATTGGAGAAAACTTATATTTCTTCTGCAATCATAACGTACATAAAG
TCAAAATCATAACAGAAGATAACACTGAAATAACAATGCCATCAAAAAAT
TATTTTTTTGTAGGGGACAAATTCTATGCACCATATAACAACTATTTTTA
TGATAACTATTTAAACATTCCAGCTGAATATCGATACATTAAAGTAGACC
ATATGCAATACAGAACTACTAATAATGAACAACCTCAAGATTTTTATAAC
TTAGTACTATGCGATAAAAATGGGGAAGAATATCGATATAATTACTACAA
ATTCTATATTAAACCAGAAAACATAATTGAAAAATCTGCAGAAATTAACT
TGAAAGAATATTACAATATACAACAATTAAAAGAAGGTGCTCCATTATTT
AAAATAGTTTCAGAACAACCAAACAACACTACTAAAGCTTCTACTGCTCT
CATTTTGGATATTTCTTCTAATCAGAAGTTCGCAAAATTAAGTCCTGAAG
CTTTACAATATAAACATTATCTAGATCGCAATTCTCCAACTTATGACACA
TTCACTCTCAGCTATTCAGATATTAGAAAACACCATGTAGATGAGCAAGA
GAAAATTAATCTACACAATATCAGAGATGATATACTACAAGCAGAAATGG
AAAATAACCCTATTTTCCTTGTAATACAAGATGGTAAGTATTTCTTCACA
GATGTAAAACAAGATCAACCATTAACTACAAGTTACAATACTGCATTAAA
AGTGTTAGCATCTGCTAACTTTCAAATAAATAATGTACCTAATGACAATT
GTTATGTAGATATGCATAAGAAATTCATTTTTAAAATCACAAAAAGCAAT
CTTCATACAGAACATGATAACAGTAAAAATCTTGCTAGCATAACATTAGA
AGGAAAAGAAATACCACTAATTTCTAATGACGACGATACACAGATTTTCT
ATGATGACTTCTCTTTCAAGTGTTATCAGAATTTCACTCAAGTATTTAAT
TATGATGAACCTATTATAGGATTAGACAAAGACTTCTATGAACCAATAAA
AGAAAAACTAAGTTCAAATAATATATATATCACTATTAAATCAGATGAAC
AAAATCATATTAAAACATACTTTTCCGATAAACAAGGAAATCATATACTT
GACTTACCTAATACAAAACTTACAGAGTATTTATCAACCATGTTACCATT
AGGTGATTTCTCAAATGAAGTACTAAACACTCATATAGAAGATATAGCAC
ATCAGAAATTAAGTGACACAACACAAAAACACGATACACTGAATCCAGAA
AAAAATTCTACAACTTTACAAAATTCAGTAAATGAAACAGCTGGTACCAA
TGATCCTCAATCTACTCAAAATGCAGTACATAAACATGACACTTTAGATA
CTCAAAAAGATAGTACAACGTCACAAAAGTCAGTAAATGACACAGCTAGT
ACCAATGATTCTCAATCTACTCAAAATGCAGTACACAAACATGACACTTT
AGATACTCAAAAAGATAGTACAACATCACAAAAGTCAGTAAATGAAACAG
CTAGTACCAATGATCCTCAACCTACTCAAAATGCAGTACATAAACATGAC
ACTTTAGATACTCAAAAAGATAGTACAACTTTACAAAAATTAGTAAGTGA
AGAACACAACATTAACAAAAGTAATACTAATATCAATGTAGAACAAAATA
TTGTATATTTCCCTCTGTCTAGAGAACATGTAAGTATTGTAGATAATATA
GAACAGAACAAACATCATGTATCTTTTAATCTTACATATGAAGAAATGTT
AAATTTCTATGAAGCAGTAAAAGAGCAGTATAGTTACGATGAAGTATTGA
TTGCATACAACAACATATTCAAAAATTATGGTAGAGAACAAAAAAATGAC
AATATTTATATTGATGGAGATAATCATATATTTATTGAGAATCATGATTT
TGGAATATTACAGTAA
>Ecaj_0411 protein of unknown function UPF0074
ATGTTGATTACAACAAGGCTGCGTTATGCTGTTATGTTTATGGTAAGTCT
AGCTCAAGAGTATTATATACTAAAAGGTAGTAATCAACCAAAAAAAATGT
CACATATTGCAGATAGCCAATCTCTTTCCGAAGGATACCTAGAACAAATT
ATCGCAAAATTAAAAAAGCAAGGATTAGTAAATTCAACAAAAGGTCCAGG
TGGAGGATATTTTTTAAATAAGTCTCCAAATATAATTACACTCAACTTAA
TACTTGAATCTATAGGAGAAAATATAAAAATTACAAGATGTAAAAACAAT
AATGTAATAAGATGCTTACCAAATAATGCAAAATGTATCACACACAATCT
ATGGGATAACATAGGTAATTATATTAAAAAATATCTAAATAGTATTTCAC
TAGAAGACATCATCAATAATAATTTCAAGCATAGTATCAAGCATAGTATC
AAGCATAGTAATATATTAAACAATGATGAGAATAAATACATATATGCAGA
TTACAATTCAACATCAACTATACTACCTGTAATCAAACAACAACTAGACA
ACTTATCTTCATTAAATATATACAATCCATCATCAACACACAAACTAGGT
CAAAATACAAGAAGCATCATAGAAAAAACAAGAGAGATAGCTATTAATAT
ACTAAATGCTAGAAATTATGATGTAATTTTCACTTCATCTGGAACAGAAG
CAAACAATTTAGTAATAAACAGTACTACTGAATACAAACACCTAATTTCT
TCTATAGAACATGTATCTATAATGAATTGTACTACAGATGCAGAATTAAT
CCCAGTAAACTCTAATGGAGTAATATGCTTGGATAGATTCAGTGAAACTC
TAAATAAATTTAAAGACAAAAAAGTTCTTGTATCAATAATGACAGCAAAT
AATGAAACTGGAGTTATTCAACCTATAAAAGAAATAGTAGAAATATCACA
TAAATTTGGCGCACTAGTACATACAGATGCTGTACAAGCATGTGGCAAAA
TCCATATAGATATTGAAAACTTAGGAGTAGATTTATTAACAATTTCATCA
CATAAACTAGGAAGTATTGCAGGAACTGGTGTATTGTTTTTCAATAGTAA
AAAAATAAAAATAAAACCTATGATATTAGGTGGAAATCAAGAGAAAGGGT
TACGTGCTGGTACTGAAAATATAATATCAATTTATTTATTATCTATCTCT
CTCAACAATTTGAAAGACTCTATAAAAAAAATGTCTACTGTAGAGAAATT
ACGTGATAAACTAGAGTATGAGATATTAAATTTAGTACCTGAAGCTCAAA
TTTTTGGTAAAAATACACAACGTCTACCAAACACTACGTGTATTTCAATG
CCAAATGTAAGTAGTGAAATACAAACAATAAGCTTTGATATTGAAAATAT
TGCTGTTGGCAATGGATCAGCTTGTTCTTCTGGAACATTAACACGTTCTC
ATGTATTATCTGCAATGGGAATAGATGATGACATAGCTAAAAATTCAATT
AGGATTAGTCTTAGTCCTGATATAACAGAACATCAAATAAAAAAAATAGT
TAATTGTTGGTACAAAACATATCAAAACAACAAGTTACTAAAACTAAAAT
AG
>Ecaj_0894 Transcriptional regulator
ATGTCCATACATGCAAAAAACAAACAAAACAAACCAGAATATGCAAATGA
AATAAAAGCACATGACCCTTTAATCGAAGATTTGATAGAAAAAAACATAC
AACAACATAAATTTACAGGTGAAGGAATAAGACTTGATGTAGATGACTAT
GCTTCTAAAAATTTTAAGAAAGAAGGTGCTGAATCTACAAAAGAGTTAAA
AAGCGCAACAAAGGTTAGACCACATCCAGTTGACGAGTGTGTTGGAAAAG
AGATAAAAAGACAACGCATTATGAGAGGTATGAGCCAAAATCAGCTTGCA
AATAAATTAGGAATCACATTCCAACAAGTACAAAAATATGAGAAAGGAAC
AAATCGCATAGTAATTAGCAGACTATACCAGCTTGCAAGTGTACTCAATG
TTGAAGTAAGAGATATCATGTTAAAATTACAAGAAGATCTAAAAAATATC
TCATGTGACAATCCTATCACACCTCCACATGCACTCAGAGACAACGAAGA
AAAGTTCTTACCGGAATTTAACGATAGCAAGATAGATAGCAAAGAAGTTT
TAATGATGGTTAGAGCATACACTTGTATAAAAAATGAAAAAGTACGCAAC
ATAATTTATAATTTAGTTAAGGCACTATCTTTAGACAATAAATCATAA
>Ecaj_0929 ParB-like partition protein
ATGACAAAAAGACTAGGAAAAGGCATTTTTGAGTTAATAGGAAATAGTAA
TTTAGAAATCAACAATAACACCAGTAATAACATTAATACTAGCAATCACT
TAACAATGCCAATAAACTTATTAAACCCTAGTACATCACAACCAAGAAAA
ACTTTTGATCAAGCATCACTTAAAGAACTAGCAGAATCTATTTCTAAACA
CGGCATAATACAACCAATTATTATCAGGAAAAATCCACACAAAAAAGGTT
ATGAAATAATAGCAGGAGAAAGAAGATGGAGAGCCAGCATTTTAGCAAAA
TTAAAATCAGTACCCGTAATTGTAAAAGAAATAAGTGATAGTCAGTGTTT
AGAATTATCAATTATAGAAAATATACAAAGACAAGATTTAACACCTATAG
AAGAAGCAGAAGCATACTCTAATTTAATCAATACTTTTTCTTATACACAC
GAAGATTTAGCTTCTATTTTAGGTAAAAGTAGAAGTCATATTACAAATAT
GATAAGAATACTATCTTTACCACCTTCTATAAAATCAATGGTGAATGATA
AACTCATATCATTTGGACATGCTAGAGCTTTAATAAATATAGAGAATCCA
GAAGAAATAGCACAAAAAATTATTTCTTCAAACTTAAATGTAAGACAAAC
TGAATTACTAATCAAAAACTTACAAAAACCACACAGAAATAAAATCTTAG
AAAACTTCACAGAATTAGAGAATTCACTATCTGAAATGTTAAAACTAAAA
ATTAAAATAAAAGGATTAAATCACAAGGGAAATATTGTTATAAAATACAA
TAATCAACAACAATTTAATTCAATATTAGATAAATTAAAAAATCCAATAT
AA
>Ecaj_0705 Cold-shock DNA-binding domain
ATGTCTCAACGGTTAGTGGATGATTCAACTTACACTGGATATGTAAAGTG
GTTTAGTTCAGAAAAGGGTTATGGTTTTATTTGTAAAGATCAAGGTGATA
AGGTAAAAAATATTGGTCAAGATATTAAGGATATTTTTGTTCATATTACT
GCATTGCAGAGAAGCAAAATTGATGGTTTAAGAGAAGGCCAGAAAGTTAA
GTATCAACTTGATAAAAATAATGGAAAGTTTTCAGCTGTTAACCTTGAGG
TGTTAGAAAACTAA
>Ecaj_0125 protein of unknown function DUF193
ATGAAATGTCCTTTCTGTAATAATATTAATACTCAGGTAAAAGATTCAAG
AGCTATAGAAGATGACATTCTAATTAGAAGAAGAAGAATCTGTCTTGTAT
GTAATTCTAGATTTACTACAATTGAGAAATTGCTACTTAGGTCATTTATG
GTTATTAAGAAAAATGGTGAAACTGAACCATTTAATAAACAAAAATTACT
TTCTTCAATTTTAATAGCTACAAAAAAACGTCCTGTTAGCCATGAAGGAA
TAAATGTAATGGTTAATAATATTTTTTATGAGCTCGAAGGGAAAAAAGAA
AATGCTGTTCCAACTGATGTTATTGGTAAAATGGTAATGGATAATCTTTT
TAAATTAGATAAAGTTGCGTATGTTAGGTTTGCTTCTGTGTATATGAATT
TTAAGAACATAAATGATTTTAGTAATATAATAGCAAAAATAATTAATGAA
CAAATTCTTTAG
>Ecaj_0164 transcription antitermination protein NusG
ATGAAATATGAGTGGTATATTATTCAGGTATCATCTGGTAGCGAGGAAAA
AGTTTGTCAAGCTATTTTGGAAAATTCTTGTGTGTTAGGTTTAGGGGAAA
ATTTCCGTGAAGTTTTTATTCCATATGAAGAAGTTACCCGTGTTAAACAT
AATAAAAAGATATTGGTAAAAAGGAAGTTGTCACCAGGATATGTGTTTTT
GTATATGAATTTAAATGAGAATTCGATAAATTTTGTTAAGAGTATACCTA
GGGTATTAAATTTCTTAAACAATGATTTTGGTGTTCCTAAGGTTATTTCG
GATAGTGAAATGGAATCTATGCGTAAAAAGATGTGTCAAAGTGTAGTTGA
TGATACTAATGTTGTTAGTTTTGAAATTGGTGATGAAGTAGTCATTAATG
ACGGGTTATTTCAAGATTTCAATGGTAAGGTTGAATATATTAATGACGAT
AAAAAAATAGCGGGAGTCAGTGTTATGATATTTGGTAGGCTGACTAAAAT
AGAATTTAAGTTAGAGCATATACAAAAAGTGGAGGCGCAATCATGA
>Ecaj_0137 Transcription termination factor Rho
GTGTTAAATGAAAAAAAGAAAAGAACGAGATACGTTAGTAGAAAAAATGC
TAATAAGAATATATCAATTCAATCAACGGCAAATATTGTAGATAAATCAG
AAGAAGTAGGAGATAAAGAAGAAGTAGAAGGGAGTGCACAAGTAGAAGCA
CAAGAAGTGAAAGTGTTGGATTTGAGTGAATTGAAAAAGAAAAGTATAGA
AGATCTCTTGAAAATAGCAGAAGAACTTGGTGTTGTAAGTAATGGTAGAA
TGCTTAAACAGGAAATAATCTTTCACTTGATGAAAAAAGTTGTAAATGAT
GGAGGTGCAGCAATAGGAGGTGGAGTAGTAGAAATATTATCTGATGGATT
TGGATTCTTAAGATCTCCAGAAGCGAATTATGCTGCAAGTGGAGATGATG
TGTATATTTCTGCAGGTCAAATAAAAAAGTTTAATTTAAGAACTGGTGAT
ATAGTAAGTGGAGAAATAAGAGCTCCTAGTGAAAAAGAAAGATATTTTAC
TTTAGTAAAAGCACATAGTATAAATTTTACAGATATGGGAAAATTGCAAA
GATATGTACACTTTGATGATTTAATCCCATTGTACCCGGAAGAAAGAATA
CTCTTAGAAACTAATGATCCTGTTAGCTTGAGTAAAAAAGATATAAGTAT
GAGGGTAATAGATATAGTTGCTCCTTTGGGTAAAGGACAAAGAGCCCTTA
TAGTTGCTCCACCAAGAGCTGGAAAAACGATAATATTGCAACAAATAGCA
CATTCAATATCTGTCAATCACCCTGATATAGAGTTAATAGTTTTGTTAAT
AGGTGAAAGACCAGAAGAAGTTACAGATATGTGTAGATCTGTAAAAGGAG
AAGTAGTTAGTTCAACATTTGATGAACCTGGATATAGACATGTACAACTT
GCAGAAATTGTGATTGAAAAAGCAAAAAGAATGGTAGAACATAAGAAAAA
TGTTGTAATACTACTTGATTCAATTACAAGATTAGCAAGGGCATATAATT
CAGTGATACCATCATCAGGTAAGGTATTGACTGGAGGTGTGGATTCTAAT
GCTTTACAAAGACCAAAAAGATTCTTTGGTGCAGCAAGAAATATAGAAAA
TGGAGGTTCGTTGACGATAATAGCAACTGCTCTAATAGAAACAGGGTCAA
AAATGGATGAAGTGATATTTGAAGAATTTAAAGGTACAGGAAATTGTGAA
ATAATATTGGATAGAAAAATATCTGATAAAAGAGTATATCCAGCAATAGA
TATTTCAAAATCAGGTACAAGAAAAGAAGATATGTTAATAGATCATGTGT
GTTTGAAAAAAGTGTGGTTGTTAAGAAGGTTATTATCATCAATGGGTTCT
GTTGAAGCAATGGAATTTTTAAGAGATAAATTGTCTATAACTAAGGATAA
TAATGAGTTCTTTGATATGATGAATAGCTAA
>Ecaj_0817 Response regulator receiver: C terminal
ATGCGTATATTATTAATAGAAGATGATATTGCATGTGCAAAAGCAGTAGA
AGCTTCTTTATCTTCAGAAGGGCATTTTTGTGAAACTATGACTTCTGCTC
AGGATTGTTATGGTAGTATCATTCCGAAAAATGATGACTATGATGTAGTG
ATATTAGATATACATTTTCCTGGGAAAATAGATGGATATGATATTTTGGT
TAAGTTACGTGAATCTGGTATAAAAGTTCCAGTACTGATATTGTCATGTA
TTTCATCGGTATCACATAAAGTGAAAGGTTTATATTATGGTGCAGATGAT
TATGTCACTAAGCCTTTTCATAAGAGTGAGTTACTTGCAAGAATAAAAGC
TATTGTACGTCGCACTAGAGGACACCCTGAATCAATAGTACGTGTTGGTA
ATATTGCAATAAATCTTGATCATAAATGTGTTGAATGTAATGGTGAAATA
GTACATTTAACTAAGAAAGAATATGGTATGATAGAATTGTTATCGTCTAG
GTTAGGTACGGTTCTTACAAAGGAAATGTTTTTGTCGCATTTATATAGGG
AATTAGATGAACCTTCCGATGATAAAATTATAGATGTGTTTATGTGTAAG
CTTCGTAAAAAACTTAAAGTTGCTAATAACGGTAAGAATTACATAGAAAC
TGTTTGGGGACGTGGTTATGTATTAAAAGAATGTGTTGATGAAGATGAAA
ATGATGATAGAGAAGGATACAGATGGGACCATGATGGTGGGTCTAACATT
GATTCAGTTTATGGAGCACAAGAAGATAAAAAGTATGTTGAAGAAGCATA
A
>Ecaj_0084 Prokaryotic transcription elongation factor GreA
ATGGTATGGCTTATGAATAACTATATGAATGAAAGATTCCCTATTACAAA
AAGTGGGTTTGAAAAGCTTGAGTTAGAGTTAGAGTCATTAAAACATGAGA
GGCCTAAGATTATTAAATCTATTTCTGAGGCACGTGAATTAGGGGATTTG
TCTGAAAATGCAGAATATCATGCTGCTCGTGAAAGACAAGGATTAATAGA
AAGTAAGATAATGGAACTGGAGTCAAAGAGATCTAGAGCTGAGGTTATAG
ATGTGTCAAATCTGTCAGGTGATACTGTTATGTTTGGGGCAACTGTAACT
ATGTCTATATATGATGAACAAACTGGTAATACTGATGAGGTAGTCTATAA
GATTGTTGGTGAATATGAAGTTGACATCTCTAAACAAATGATTTCAATAA
AATCTCCTTTGGTTTTATCATTATTAGGAAAAAAGGAAGGTGATGTTGTA
GAAGTTAGAACTCCAAAAGGTGATTATAAAATATATAAAATTATAAAGAT
TGAATTTATATAA
>Ecaj_0108 regulatory protein, MerR
ATGAGTGGAAAGAAGCTATCGCAAAGTAGTAGTAAGCTTCAGACAATAGG
TGAAGTTGCAAAATGCTTGAATGTTGAACAGTATGTATTAAGGTTTTGGG
AAGAAAAGTTCCCTCAAATTAATCCTATTAAGCGTCGTGGTAGGAGGTTG
TATACGCAGGTTGATGTTGATATTTTGAAATATATTAAACATTTACTATA
TGATAAAGGGTATAAAATTAAAGGTGTACAACAGGAACTCAGTAAAAAAC
CTGTTAATATTGATAAAAGTAATGCTAGTGTGAAGCAGAATGTCTATAGA
GAAGGGTTGATAAGTTTACTAGATGATATGTTGAACTTAAGGAATGATTT
ATTAAAAAAGTTTGACGGAATGTAG
>Ecaj_0315 RNA polymerase sigma factor rpoD
ATGAAAGATCTACAAACAGATAAAGAATTGCTCAAAACACTTGTAAGTAA
GGGGCTAAAACAAGGCTTTGTTACATTCAACGATATCAACGATGTTTTCT
CTGATTATGTATTATCAGCTGATAATATAGATGAAACCATATCAATGCTT
CAAGATTCAGGCATTAATGTTCTCGAACAAAGTGATGAAGATGAAGCAAA
TAGCATAGTAGAAGAAAATAGAATAAAAGAAGACTTAGATGAAGATGATG
TATCAGATGGAGGTATAAAATCTTGGGATTTTGGGCAAACGGATGATCCT
ATACGCATGTATCTATGTGAAATGAGTTCAGTTGAATTACTCTCTCGTGA
AGGAGAAATTGAAATTGCAAAAAAAATAAAATCAGAAAAAGTAAATATGC
TAAGGTCATTAGTAGAATCTCCAGTAGTACTGCGTACATTCATGTCATGG
AGAGATGACTTAGTAAATGAACAAATAATGTTAAGAGATCTAATAGATTT
AGATGCAAATTACAGATATGAATTCCCAGAAAAATTTGCCGATGCTGATG
AAGCTAGTGTTTTAGATTACGATAAAGATTTAATAGATGAATCTGATGAA
GATACAGACATTTCAGAAGATGACGATGAAGAAAATGTTTCAATAAACGC
TTCAATATTGGAAATGGAAAATGCATTACTGCCTAAAGTTGTAAGTATTT
TAGATTCAGTAATTGCATCAGCAGAAAAAATTTTAGAACTCAAGAAACAG
TATCAAGGCAAAATTAATCAAGACATTGAAAAACAATACAACGATCTACA
TGATAGTATATGGGAAATGATATATCAAATTAAACTCAGTAATTCTGCAG
TATTATCAATCACACAACAAATCTATAGTTTAAGCAAATCAATCGCAGCA
GAAGAAGCTAAAATTATTTCCCTTGCTGAAAGTTATGGCATACAACGCAA
AGATTTTCTAGATGCATACAATACTAACTCTGTACTACAAAAAAAAGGTA
CTTCTCCACAATGGAACAATCTACTAGCAAATGAGGAAAGTAACATAGTA
AGTATGTATAGTAAAATTAAATTACTTTCTGGAGAGAACAACCTAACTGA
ATTTAAAGCACTAGTAACAAAAATACAAAAGCACGAACGTGCAGCAAATC
AAGCAAAGCAAGAGATGATTAAGGCAAATCTAAGATTAGTAGTATCAATT
GCAAAAAAATATTCAAACAGAGGCTTACAATTTCTAGATCTAGTACAAGA
AGGAAATATTGGATTAATGAAAGCAGTAGATAAATTTGACTATAAGCGTG
GATATAAATTTTCAACCTATGCAACGTGGTGGGTCAGGCAAGCAATTACC
AGAGCAATAGCAGATCAAGCACGTACTATTAGAATTCCTGTACATATGAT
TGAAACTGTAAATAAAATTAACCGTACGTTAAGACAAATGCTACATGAAA
TGGGCAGAGAACCAACACTAGAAGAACTATCAGCAAAATTAAATATTAAT
GTAGATAAAATACGTAAGGTCATGAAAATAGTCAAAGATCCTGTAAGTTT
AGAAAGTCCTATAGGAGATGATGATAGTAGTACATTTGGTGATTGCATAG
AAGATAAACGCGCAGTAAAACCAGAAGATGCAGCAGTATTAGCAGATTTA
AGAGAAATCACCACAAAGGTACTGTCAACATTAACACCAAAAGAAGAAAG
AATTTTACGTATGAGGTTTGGAATAGGTAAAGGTGGAAAAGATCATACTC
TAGAGGAGGTAGGAAAATTATTTAACGTAACAAGAGAACGTATACGACAA
ATTGAAGCAAAAGCTTTACGCAAATTACGTCATCCAAGCCGTGCAAGAAA
GCTCAGAGGGTTCTTTTAA
>Ecaj_0034 DEAD/DEAH box helicase:Helicase, C-terminal:TypeIII restriction enzyme, res subunit
ATGCATGATTTAAGCATATTTTCTAGCATATATATGTTACCTGGTGTTAA
TAAAGTAGTAGGTAATTTATTAAAGAAATTATGTGGTGGAGATAAAATCA
TAGATTTGTTATTCCATATACCACAGAACTATATAGATAGAAGGACTGGA
TTATCTGAAGAAGCTGTAGGTAAAATTGTAACTTTTATTGGGACTGTTAA
AAGTCATGGTTTTATTGGTGGTAGAAGAAAAGCTCAATATAAAATTGTTC
TTGATACATGTATTGGCGAAGTGTCATTGGTTTTTTTTCATTACTCTGTA
AAATATTTAAAAAGCGTTTTAAAAGTAGGATCAGAGTGTGTAATAAGTGG
GACGTTGATTAGATTTTTTGAATGTCTGCAGATTACACATCCTGATTATA
TTATAACAGATGTTGGAAAATTTCATGATATTAGTATTATAGAACCTGTT
TATCCATTAATTAAAGGGGTAACTTCTAAAAGAATTTCAAAGTTAGTAAA
ACTGAGTATAGGATTATTACCTGATTTTCCTGAGTGGATAGATGAAAGGT
TGTTAAGGGATAATCAATGGGATAGCTGGAAAGAAAGTTTAATTAAAATA
CATCATCCAAAGACACTAGAAACTGTATCTTTACATAAAATGAGACTTGC
ATACGATGAATTGTTGAGTCATCAAATTTCTATGAAAATGGTAAGAAAGT
TTGATTGCAAACAAGGTGTCTCTATTATAAGTAAACGGATATACCATGAT
GATATTTTAAATAAATTACCTTTTAAATTAACAGCAGGACAGGAAGAAGT
AATATCTCAAATTACGGAGAGCCAGGCGTTAAACAGTAGGATGGTAAAAC
TATTAATAGGAGATGTAGGTAGTGGAAAAACTGTAGTAGCTTTGTTTGCT
ATTTTAAATGTCATAGAAAATGAAGGACAGGTAGCTTTTATGGCACCTAC
TGAAATATTGGCAGAACAGCATTATCGTTGGATACAGGGAATATTATCTG
GTATTCCGGTAAGTGTTGAGTTGTTAACAAGTAAAGTCAGGAAGAAGCAA
GATATTAAAAGAAAATTGCAACTTGGTGAATGTAAAGTGGTTGTTGGTAC
TCATGCTTTATTCCAAGATGGTGTTGATTTTAACAACCTTAACTTAATTA
TCATTGATGAACAACAAAGATTTGGAGTATTACAAAGAATGAAACTGATT
AATAAGAGTAATCTTGCAGATGTACTTTTTATGACAGCTACTCCTATTCC
TAGAACATTAGAACAAGTAGTATATGGTGATATAGATTGTTTAAGGTTAG
AAGATAAGCCTCATAATAGATTACCTATACATACTAGCATTATAAATATT
GAGAAGTTGTATGAGGTTGTTACAAAGTTACAGTTTGCTTTGCGAGATGG
AAATAAAGCATATTGGATTTGTCCTTATATTGAAGATTCAGAATTAGTGG
ATATTGCTGCAGCTGAAAAGCGTTTTTTTTCTTTAAAAGAAGTATTTGGT
CAGGAGGTTGGGTTAGTACACAGTCGTTTATCCAAAGTTGAAAGAGATGA
TGTTATGATGTCTTTTTATCATGGTACTATTAAATTGTTGGTTGCAACTA
CTGTAATAGAAGTGGGCGTAGATGTACCTGATGCTACTATAATTATTATA
GAAAATGCTGAGCAATTTGGTTTATCACAGCTTCATCAGTTACGTGGTAG
GGTTGGACGTAGTGATAAAGCTTCATTTTGTGTTTTATTACATGGTAGTA
TGGTGAGTAAAGTTGCTTATAAAAAACTGTGTATATTACGTAAATCTCAA
GATGGATTTTATATAGCTGAACAAGATTTGTTATTGCGTGGTAGTGGAGA
TGTTTTAGGTGTAAAGCAATCTGGGTTGTCGAATTTTAAATTTGCAGATA
TTTATAGTGATCAAAATCTGATTTCTATTGCTACTGAGCAGGCACAGGAA
ATTCTTAATGCAAATACAAAGTTAAATGATAATTTGGCTCAGTTATTGTG
TATGTTTGGTTATGATGTTTCTGCTATGAATTATTAG
>Ecaj_0169 DNA-directed RNA polymerase, beta subunit
ATGTCTTCTTCTGTAACTCCTACTAAATATGTATTAAATTCTTTTAATTC
AGTTCCTAGGTTATCTTATGCTAAATCAATAGATATAAAAGATTCTTTGA
CTGATTTAATAAAGATACAGAGGGATTCATATAATGCATTTATTGGTGTA
GGTCAGAATACTGAGAGTGGTATAAAGAATATTTTTGAATCTATGTTTCC
TATAGAGGATTTATTAGGTAGGGCTGTTCTTGAATTTGTCAGTTATAGTA
TTGGTGAACCGCAATATGATGAATATGAGTGTATAAAAAGAGGTATTACA
TTTTCTGTTCCTATACGTATAGTGTTGCGTTTTATAGTGTGGAAGGTACA
GGAAGTATCTTTTAAGGAAGTAAAGTATGTAGTAGATGAAGAGACTTCAG
AAAAGAGTATAAAGTACATAAAAGAACAGGAAGTTTCTATAGGAGATCTT
CCTACAATGACTCCTCATGGAACGTTTATCATAAATGGAATAGAAAGAGT
AATAGTATCACAAATGCATCGTTCTCCAGGGGTCTTTTTTGATAGTGATA
AAGGAAAAACTTATAGTTCTGGAAAGTTAATTTATTCAGCGAGGATTATT
CCTTACAGAGGTTCATGGTTAGATTTTGAATTTGATATAAAAGATATACT
TTATTTCCGTATTGATAGAAAGAGAAAGTTACCAGTTTCTTTGCTTTTAA
GAGCTTTAGGTTTATCTAATAATGATATTTTAAACACTTTTTATGATAAG
ATACGTTATGTAAAATGTGAGAAAGGGTGGATAGTACCTTTTGTTGTTGA
TAGGTTTAGAGGTGTTAGGCTATCACATGATCTAGTTGATGTCAATGGTA
ATGTATTGGTGAAAGCTAATACAAGAATTACCTTAAGGATGGCTAAAAAG
TTGGCTAATGATGGGCTTACAGAGTACTTGGTGCCATTTGCTGAAATTCA
AGGGTTATTTATTGCTAATGATTTGTTTGATCCTAGTGGTAATGCTTTGA
TTATATCTGCAGGTGAGAATATTACTAGTGAACATATAAATAAGTTAGAA
TTATTTGATATAAAAGAAATCTTTGTTTTAAATATAGATTTTCTAACAGT
TGGTCCATATATTTTAAATACTTTATTTTTAGATAAAAATGTAACTTATG
AGGATGCACTTTTTGAGATATATAAGGTTTTACGTTCTGGTGAATCACCT
AGTTTGGATACGATAAAAGCTTTTTTTGATGGATTGTTTTTTGAAAAAGA
AAGATATGATTTATCTACTGTTGGAAGAATAAAGTTAAACGATCATCTTG
GGTTAAATGTTAGTGAAGATATTACAGTATTGACTAAAGATGATATAATT
CATGTTATAAAAAAGTTAGTTCTGTTAAGGGATGGTGAAGGTTCTGTTGA
TGATATAGATCACCTTGGTAATCGTAGGGTAAGATCTGTTGGTGAATTTA
TTGAAAATCAATTTAGAATTGGGATATTGAGACTTGAAAGAATGATTATG
GATTACATGTCTTCTGTAAATTTTGATAATGCAATGCCATGTGATTTTGT
AAATCCTAAGATTTTAGCTACAGTTTTAAAAGATTTCTTTAGTTCTTCAC
AGCTTTCTCAGTTTATGGATCAGACTAATCCGTTATCTGAAGTTACACAT
AAGCGTAGATTGTCTGCTTTGGGCCCTGGTGGTTTGACTAGAGAAAGAGC
AGGGTTTGAAGTTAGAGATGTACATCCAACACATTATGGAAGAATTTGTC
CGATTGAAACTCCAGAAGGTCAAAATATTGGGTTAATTAGTAGTTTAGCT
ATCTATGCTCGTATTAATAAGCATGGGTTTATTGAAAGTCCTTATAGAAA
AGTTGATAAAGGAGTTGTTACTGATAAAGTTGAGTATTTACTAGCTATGC
AAGAAAGTAATTATTATATAGCAGATGCTAGTGCTACTCTTGATGAAAAC
AATCAGTTTGTTGATGATATGCTTTATTGTAGGCATGATGGAAATTTTGT
AATGGTTAAAAGGGAGGAAGTTGATTATATAGATGTTTCTCCAAAACAAA
TTGTTTCAGTTGCTGCATCTTTAATACCTTTCTTGGAAAATAATGATGCG
AACCGTGCTTTAATGGGTTCTAATATGCAGCGTCAAGCAGTTCCGCTATT
GAAAGCAGATGCTCCTTTGATCGGTACTGGTATGGAATCAATAGTCGCTG
CTGGATCTGGTACAGTTGTTTTAGCTAAACGTGGAGGTATTGTTCATAGA
GTAGATGGGTTGTATATAGTTATTCGTGCTTTTGATCAAGAGAAAAATGA
GTATTTGGGTGTTGATGTTTATAATTTGAGAAAATTTCAACGTTCTAATC
ATAATACTTGTATTAATCAGCGACCTTTAGTTAAACCTGGAGATTATGTA
AAAGCAAATGATGTAATAGCTGATGGATCAGCAATTGATCAAGGTGAACT
TGCTTTAGGTAAAAATGTGCTAGTGGCTTTCATGTCGTGGCAGGGTTATA
ATTTTGAGGATTCAATAGTTATTTCAAGTGAAGTTGTAAAAAAGGATGTC
TTTACTTCAATACATATAGAAGAATTTGAATGTGTAGTTAGAGATACTAC
ACTTGGTCCAGAAAAGATTATGAGATCTGTTCCTGATATCAATGAGGATA
GTTTATCTCATTTAGATGATGTTGGTATTGTGAACATTGGTGCTGAAGTT
TCTGCTGGGGATATTTTGGTTGGTAAAGTTACTCCTCGTCCACCGATTTC
TTTACCACCAGAAACAAAGTTATTAGTGACTATTTTTGGTGAAAAAGTAT
TTGATTGTGTGGATTCTTCTTTATATTTACCTCTTGATGTTGAAGGTACA
GTAGTTGATGTTCATGTTTTTGTACGTCGTGGTGTTGAAGAAAATGACAG
ATCTCTCTTAATTAAGCAAAATGAAATTAATGGGTTCATAAAAGAGAGAG
ATTATGAAATTGATGTAGTTAGTGAATATTTTTATGATGAATTAAAGAGG
GTTTTAGTAAATTCTGGTGTCCAATGTAATAATCAGAATGTAAATGATTA
TTTAGAATCTACTCCAAAAAAAGATTGGTGGAATGTTAATTTGTCTGATG
AGACTGTATTGTTACAGATTAATAACTTAAGGGAAAAATTTGACTCAATG
ATTCAAAATGCTCATAGTAAGTTTGATCAAAAGATAGATAAGTTGAATTA
TGGTTATGATTTACCTCAAGGTGTTTTGTGTATAGTTAAAGTTTTTGTTG
CAGTAAAACATAATCTGCAGCCAGGTGATAAAATGTCTGGTAGGCATGGT
AATAAAGGTGTAATTTCTCGTATTGTACCTGTTGAAGATATGCCATATTT
AGAAGATGGAACTCCTGTTGATATTATACTTAATTCTTTAGGTGTACCTT
CTCGTATGAATGTTGGTCAAATTTTAGAAACGCACTTTGGATGGGCGTCT
GTTAACTTGGGTAAAAAGATAGGTCATATATTAGATAACATTGATGAATT
GACAATATCTCATTTAAGAAACTTTTTAGATCAAGTATATGATGGACAAG
ATTTAAAGTATAATATTCAGTCTATGAGTGATGAGGACCTTTTGGCTTTT
GCAGAAAGGTTACGTGGTGGTGTACCAATGGCAGCTCCAGTATTTGAAGG
GCCAAAGGATAGTCAGATTTCTAACTTATTAAAATTAGCTGATTTAGATG
TTTCAGGACAAGTAGATCTTTATGATGGAAGGATTGGTGAAAAATTTGAT
CGTAAAGTTACTGTAGGGTACATATATATGTTAAAGTTACATCACTTAGT
TGATGATAAAATACATGCAAGGTCTGTAGGTCCATATGGATTGGTTACTC
AGCAACCTTTAGGTGGGAAATCTCATTTTGGTGGTCAGCGTTTTGGAGAA
ATGGAATGTTGGGCACTGCAAGCTTATGGAGCTGCTTATACTTTACAAGA
AATGCTTACAGTTAAATCTGATGATATTGTTGGAAGGGTTAAAATTTATG
AGTCTATCATTAAAGGAGATAGTAATTTTGAGTGTGGTATACCAGAGTCG
TTTAATGTGATGGTGAAAGAGTTAAGATCATTATGTTTGGATGTTGCTTT
AAAGCAAGATAAGGATTTCTTAAGTAGTGAAGTAAACAATTAA
>Ecaj_0803 Transcription termination factor Rho
ATGTCAGAATCAGAAGATGTTGTATTAGATAGAGAGGTGTTAACTCCGGA
AGTATTAGAGAAACAAGAAGATAAATCAGAAGAAGTAGGAGATAAAGAAG
AAGTAGAAGGGAGTGCACAAGTAGAAGCACAAGAAGTGAAAGTGTTGGAT
TTGAGTGAATTGAAAAAGAAAAGTATAGAAGATCTCTTGAAAATAGCAGA
AGAACTTGGTGTTGTAAGTAATGGTAGAATGCTTAAACAGGAAATAATCT
TTCACTTGATGAAAAAAGTTGTAAATGATGGAGGTGCAGCAATAGGAGGT
GGAGTAGTAGAAATATTATCTGATGGATTTGGATTCTTAAGATCTCCAGA
AGCGAATTATGCTGCAAGTGGAGATGATGTGTATATTTCTGCAGGTCAAA
TAAAAAAGTTTAATTTAAGAACTGGTGATATAGTAAGTGGAGAAATAAGA
GCTCCTAGTGAAAAAGAAAGATATTTTACTTTAGTAAAAGCACATAGTAT
AAATTTTACAGATATGGGAAAATTGCAAAGATATGTACACTTTGATGATT
TAATCCCATTGTACCCGGAAGAAAGAATACTCTTAGAAACTAATGATCCT
GTTAGCTTGAGTAAAAAAGATATAAGTATGAGGGTAATAGATATAGTTGC
TCCTTTGGGTAAAGGACAAAGAGCCCTTATAGTTGCTCCACCAAGAGCTG
GAAAAACGATAATATTGCAACAAATAGCACATTCAATATCTGTCAATCAC
CCTGATATAGAGTTAATAGTTTTGTTAATAGGTGAAAGACCAGAAGAAGT
TACAGATATGTGTAGATCTGTAAAAGGAGAAGTAGTTAGTTCAACATTTG
ATGAACCTGGATATAGACATGTACAACTTGCAGAAATTGTGATTGAAAAA
GCAAAAAGAATGGTAGAACATAAGAAAAATGTTGTAATACTACTTGATTC
AATTACAAGATTAGCAAGGGCATATAATTCAGTGATACCATCATCAGGTA
AGGTATTGACTGGAGGTGTGGATTCTAATGCTTTACAAAGACCAAAAAGA
TTCTTTGGTGCAGCAAGAAATATAGAAAATGGAGGTTCGTTGACGATAAT
AGCAACTGCTCTAATAGAAACAGGGTCAAAAATGGATGAAGTGATATTTG
AAGAATTTAAAGGTACAGGAAATTGTGAAATAATATTGGATAGAAAAATA
TCTGATAAAAGAGTATATCCAGCAATAGATATTTCAAAATCAGGTACAAG
AAAAGAAGATATGTTAATAGATCATGTGTGTTTGAAAAAAGTGTGGTTGT
TAAGAAGGTTATTATCATCAATGGGTTCTGTTGAAGCAATGGAATTTTTA
AGAGATAAATTGTCTATAACTAAGGATAATAATGAGTTCTTTGATATGAT
GAATAGCTAA
>Ecaj_0385 Sigma-70 region 2:Sigma-70 region 4
ATGGTTTCATATATTAATATGTTAACAAATTCTATATTTTCTTTAACTCA
AGACAACTTAATGTCTTACATGAATGAGGTACACACATTTCCAATCTTAT
CTCCTGAGGAAGAGGATAGGCTAGCAAAAAATTGGTATGAAAATGGTATT
GTTGAAGATGCTCATAGGCTAGTCACTAGTCACTTAAGGTTAGTAGTAAA
AATCGCATTAAGTTTCAAAAATTATGGGTTACCACTTATAGAGTTAATAA
TGGAAGGAAACATAGGGTTGATGCAAGCTGTAAAAAAATTTAATCCTACA
CTTGGTTTTAGGTTATCTACTTATGCAATATGGTGGATCAAAGCTTCCAT
TAAAGATTACATACTTAAATCGTGGTCATGTATTAAAATCGGCACAACAC
AAGCACAAAGGAAATTATTTTTCAGCCTCAGGAAAATTAAACAAAAACTT
TTTAAATATAACAACATTACTCAAGACGATATAAAACTAATCGCAAATGA
ATGTTCTACATCTGAACAAGAAGTAGAACAAATGAATAGGTATTTTACTT
ACAGGGACAGGTCATTAAATGAAGTAGTATTTTCCAATGACAACCAAAAA
GGAATAGAATTACAAGAGATTATTAAATGTGACACACCAAATCAAGAAGA
CACATATCTGTTAAATGAAGAAGCAAGCCTAAAAGAGACCCTTATAACAC
AGGCTTTATCAACATTAAATGAAAGGTATCGAGATATATTTATAAGAAGA
AGATTGATCGAAAATCCTGACACTTTAGATACACTAAGCCAAGAATACAA
GATATCAAAGGAGAGAGTAAGGCAAATAGAAATGCATGCTTTCACTAAAG
TGAAAAATTTCATCATGCTTAAAAAGGAAGAACTTGGATTATTATTTATA
TAA
>Ecaj_0589 DNA-directed RNA polymerase
GTGATTTTCGACGAGGATTCTAATTCTGTTACTCAAGATTCGGGTTATAT
GACAGTAGGGAATGCGTATTCTAACGCAGTGGGTTATATATCCATGAGTG
ATCATTGGAGTAAGTTAACTAAGCCGTCTTCTATTAAAGTAGAGTCTAAT
GGTGCTTCTCCAAATAAAGCAGATTTAATTGTTGAGCCTCTTGAGAGTGG
TTTTGCTTTGACTTTAGGTAATGCTTTAAGAAGAGTGATGATGTCTTCTT
TGCGTGGTTTTGCTGTTTATGGTGTTGAAATAGAAAATGTTTTGCATGAA
TTTACCTCAATTTCTGGAGTTAGGGAAGATGTTACAGATATTCTGTTAAA
TATTAGTATGATGAGGGTAAAGCTTTCTGGTCTAAGTAATAAGGTTTTAT
CTCTTAGGGTTAAAGGACCATGTGAAGTAAGATCTGGAATGATCCCTGAT
ACTGATGATTGTATAATACTCAACAAAGATTTATTAATTTGTACATTAGA
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