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COG category: Transcription
Organism: Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2
Number of genes found: 64
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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2 >RF_1207 Transcriptional regulator ATGGAAAGAATAGTGACCAACATGGATCAGCATGGTAGAGTGCTTATACC GGTATCAATTAGAGAAAGATTTAATATACATCCGGGTGAAAAAATCACCA TAGAAATTGAAAATAGTGAAATTAAAATCGTTAGCGTTGATAGTATAATT GATGAGATGCATAAGATTTTCACCAAAAATCAAATTGATAAAAATATTTC TATAGTAGATGATTTTATTGCTGAAAGACGTCAGGAATATTTAATTGAAG AAAAAAGAAGTAAAAGATGTCCAAAATAA >RF_p21 unknown ATGATGTATATAACAGCTCTGCAGTTAAAAGTTGCTCGGAATATTTTAGA TTTAGGGGTGCGCGACATTGCAGTATTATTACATGTTAGTAAAACTACAA TTAGCAAAGTAGAACTCAACAAAACTCGTGATTTTCTACCAAAACATAAT GCTGCACTTGTTCATTTTTTCTCTTGTAATAATATCTCTTTTCCTAATCC ATTTAGCATTCAATATAAACCACAAAATATAATTAATACCAACACAGAGA GTGCAATAACTAGATTTCAGTTAAAAGGCGCTCGATGCATTCTCAATATC AGTCAAGCCGATCTTGCTAAAGCATTAAATATAAATAGATCAGTAATAAT TGAGGCTGAAAAGTACCAAAATGAGCAACGCTTAACACTTTTTGGACAAC AGAAAGAACTTGAGATAATACAATTTTTTAATGATAATAATATTGTACTA TATGACCATTTGTCCTTGTTTTTTAGAAAAAGAGTAGACAAATGA >RF_0157 unknown ATGACAAGCTTATCTATTACTCTACCCGATAATATAGCTAAAGCTAGTAA 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Predicted transcriptional regulator ATGAATGTTTCTTTAACTCCTGAACTTGAAAAATATGTAAATAGACAGGT AGAAAGCGGCTTTTACCATTCTTCAAGTGAAGTTATAAGAGCAGCATTAC GTTTAATGGTCAAATCTGAAAATATTTCTCAAAATGCTCAGTTTGAAAAT TATAAAACATGGCTTAATCACGAAATACAGATTGGTTTAGACCAAGCTGC TGAAGGTAAATTAATTCCAGGAGAAAAAGCGTTACAAGATATTCGTGATT TTCGTAAAGCTTATTTAAAAAACAATGGTTAA >RF_1397 Prophage antirepressor ATGAATAATAGCGATGAACTTAATAAGTTAGTAATTTTTAAAGATAAAAC CATTAGAAGAATTTTGCATAACAACGAATGGTGGTTTTCAGTAGTAGACG TAGTAGGAGCATTGACTGATAGTAGTAATCCCGGAGCTTATTGGAGAAAA CTAAAGCAACGGTTAAACGAAGAAAAAAGTGAGGTCGTGACAAATTGTCA CGGGCTGAAATTAACTGCCACAGATGGGAAAAAATATATAACAGATTGTG CAAATACAGAATCATTACTTCGTATTATACAATCTATTCCGTCTCCAAAA GCAGAACCATTTAAACAATGGCTTGCTAAAGTCGGTTATGAGAGGATTCA AGAAATTTCTGATCCGGAAAAGTCAATTGATAGAGCAAGGGATAATTGGA AGCGACACGGACGTAGTGAGAAGTGGATTCAGCAACGTATGATGGGGCAG GAAACACGAAATAAATTAACTGACTATTGGAAAAATCATGAAGTAACGAA AGAGAGTGAATTTGCTATATTAACTAATATTATTCATCAAGAATGGACAG GTATAAGCATTAAAGAACACAAAAATATAAAGGGCTTAAAAAATCAAAAT TTACGTGATCACATGAACGAAGCAGAATTAATTTTTACTGCTCTTGCTGA ATTATCTACTCGTCAGGTAGCAGAAACTAATAATGCAACAGGCATGGAAG AAAATAAAATTGCAAGTAAAATAGGAGGAGGTATAGCTAAAAATGCTAAA ACGGCCTTGGAAAATAAAACCGGTAAGAAAGTAATCTCAACAGAAAATTA TTTACCGCCTAAACTTACAAAGTAA >RF_0354 Acetyltransferase ATGACACAAGATTTTGAAATTGTTTATGCCGAAGAAATGGATAAAACTCA TAGAACTATAATTATTGAGGCTTTGAACAAAGATGCTAGAGAAAAAAAGG GGTTAGTAGGAGATATTGAATCTTTTTCATTTTCTTGTTTAGATCAGGAT AAAAATTTTGTTGCAGGAATTAGCGGTATGAGTTCTTGGGGAGGGTTTTA TATTGATTCACTTTTTGTTAATGAAAATATAAGAAACCAAAATTACGGTA CTTTACTAATGCAGAAAGCTGAGGATTTAGCACGTGAACGAGACTGTAAT TTTATTCATCTTGTTACTATGGACTTCCAAGCAAAACCATTTTATGAGAA ACTTGGGTATAAAATTGAATTTGCTATGCACGGTTACGAAAAAGACTCTA TAATGTATTATTTAAGGAAAGATTTATGA >RF_0116 ParB-like partition proteins ATGGCGAAAAATAAAGGACTAGGAAGAGGGTTATCTTCATTACTTGGGGA AGAAGTTATTTCTATAGAATCAGAAATAATACAAATAATAAATATTGATA AAATAAGGCCGAATGAGAATCAGCCTAGAAAAAACTTTGAATATGATAAA ATAAAAGAATTAGCAGATTCTATATTGAATAATGGTTTATTACAGCCTAT TATTGTTGATAATAATTTCCAAATTATAGCAGGAGAGCGACGCTGGCGTG 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CTTTAACTAGAGCATTTACTAGAGTACAAAATCCAAATATTAGAAAAATA ATAATTGAACTTGTCAGATCAGTATCTATATCTTGTGAATAA >RF_0262 cspA, Cold shock-like protein ATGGCTACAAATATAGTAGGTAAAGTTAAGTGGTATAATTCTACGAAGAA TTTTGGATTTATTGAACAGGAAAATGGCGGCAAAGATGTGTTTGTACACA AATCAGCCGTAGATGCAGCAGGTTTACATAGCCTTGAAGAAGGACAATAT GTAATTTTTGATCTTGAAGAAAAGCAAGGAAAAGCCTACGCTGTTAACCT CAGAATTAAATAA >RF_0056 czcR, Transcriptional activator protein CzcR ATGAGAGTTTTGTTAATTGAAGAAGAGCCGGAAATGGCTAACTTAATTGA GCTAACTTTAGCTTCAGAAGGTATAGTTTGCGATAAAGCTTCAGTTGGTG TGGAAGGTTTAAGGCTTGGTAAAGTAGGTGGTTATGATCTAGTGATTTTA GATCTTATGTTACCGGATATTAATGGTTTTGAGATATTATTAAGATTGCG TGCTGCAAAAATAAAAACCCCAATCTTAATTTTATCTAGCTTAACGGATA CGGATCAAAAGATTACCGGTTTCTCTTCTGGAACCGATGATTATTTAACC AAGCCGTTTGTAAGAGAGGAATTAATTGCTAGAATTAAAGCTATAGTTAG ACGTTCTAAAGGTCATGTAGCATCAGTATTTAGGTTTGATAAGGTTAGCG TAAACCTAGATACTAGAACTGTAGAAGTTGACGGAAAAAAAGTACATTTG ACGAACAAAGAATATGCTATTTTAGAGCTATTAATACTCCGAAGAGGAAC TATTTTAACTAAAGAAATGTTCTTAAATCACTTATATAGTAGTGTTGACG 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TAAAGATGAACCGATTGTCTCGGAGCAGCTCTTTATTCCGACTATTAATT TAGGATTATCCGTCTTTATTCCTGATAATTATATATCCGATTCAGCCCTT AAACTTGGGCTATATAGAAGAATAGGTAATTTAAGCAATGAGATAGAAGT AGAGAAATTTAAAGATGAGATGATTGATAGATTCGGCTCACTACCGATTG AATTTAATAATTTACTTGATATTGTAAAAATAAAACTATTATGCTTTAAG TTAAATATTGAGAATTTGGATTCAGGAGATAACGGATTTGTGATTAAATT TTATAAAAATGCCGATATGACCGATAAAATTTTGAAGTTCGTTAGTACTT ACTCTAATCAGGCAAAAATCAAACCGGATAATAAATTAGTATATATCAAG AAATTAGTAGATAAAAATATAATTGTTGAAGTGAATCAGTTACTTTGGAA ATTAGGGGGGTGTAGACTCGATGTCATTCCTAATACGTCATTGCGAGGAG CGAAGCGACGTGGCAATCTCATAAAGTAG >RF_0872 nusA, N utilization substance protein A, transcription termination factor NusA ATGTCTAATATAGGTAATGTAGAAATTTTACAAATTATAGATTCTGTAGC CCGTGAGAAAGGAATATCAAAAGAAATTTTGATTTCAACGGTTGAACAAG CGGTACAAGTAGCAGGACGAAAAAAATACGGTAATGAATATAATATTAAA GCTCAGATAAATAGGAAAACCGGTGAGATAAATCTTTTAAGAATCTTAAA AATAGTAGAAGATGTAGAAGATTACTTAACGCAAATCTCACTTGAAGAAG CTTTAATAAAGAATCCGGAAGCTAAAATCGGTGATGAGATATATGAATAT TTACCGCCTATTGATCATGCTAGAGTATCGGCTCAAGCTGCAAAACAAGT TATAACTCAACGTGTTATAGAAGCTGAACGTGAAAAGCAATATCATGACT TTAAAGATAGAAAAGGCGAAATTATAAACGGGATAGTTAAGAGAATAGAA TACGGTGATATAATAGTTGACTTGAGTCGTGCTGAAGCAATAATAAAAAA AGATCAATTAATTAAGGGTGAGAATTTTAAACCTAATGATCGTATAAAAG TATATGTACAGGATGTAAGGCAAGAAACAAAAGGACCGCAGATTTTCTTG TCTAGAGTAGATAACCAAATGCTGGTTAAGCTATTTAAGCTAGAAGTACC TGAAATTCTTGAAGATATTATTCAAATAAAATCAGTAGCACGTGATCCCG GTTCAAAAGCAAAAATAGCGGTATTTGCTTCGGATAGTAGTATAGATCCC GTAGGCTCATGCGTAGGTATTAGAGGTAATAGAGTAAAAGCCATAACAAA TGAGTTAAACGGAGAGAAAATTGATATAGTATTATGGAGTAATGATCTTG CACAGTTTATAGTTAATGCTCTTGCACCGCTTGCACCCGGGGAAATTACA AAAATTTTGATTGATGAGGATAGGCATAAGGTAGAAGTAGTAGTTTCGCA AGAAAATCAAAGTATTGCAATAGGTAGAAGAGGGCAGAATGTTCGTTTAG CTTCTAAGCTTACAGGTTGGAATATCGATATAATGACCGAAGAGCAAGAA TCAAAAAGAAGAAACGAAGAATTCTTAACTTCTACGGAATTATTTATGGA AGCTTTAGATGTTGAAGAAGTTATAGGACAGCTTTTATCGGTAACGGGAT TTAATTCGGTAGAACAAATCGCAACTAGTGAAGTTAGTGCTTTAACAAGA ATCGAAGGCTTTGAGGAAGAACTAGCCGTAGAGATCAAAAATCGAGCTAT TAATTACGTCGACCTTAAAAATGAAAAGATTATCAAAAAGCTAGAGGATC TGGGAGTTGAGCAAGAATTAATAGATATATTAGAATTACCGCTTGAATTA ATATTAAAATTTGCCGAATATGGTATAAAGACCATAGAAGATTTAGGAGA GATGAGCGTAAATGAATTTAAAAATTTAGCTCCAAATTCTAATATAACGG ACGAAAATATTAAATTGCTGATTAAAACTGCTAGACAGCATGGTAAATTA AAGGATAGTTAG >RF_1119 nusB, N utilization substance protein B ATGAGTTCAAATAAAATTAATAAAAAGTCGATTGCACGTATTGCAGCAGT GCAAGCTATTTATCAAAACATATTGCAAAATAATGATGATATGGATGATA TCATGCAAAATGTACTTTCTTTTTATCAAAATAATAATTCTACAACAGCT TTACCTGAGAATTTAAAAATATCATTAAGTATAAGTCATTTTAAAATGCT GGTAAAGTCAGTATTTGAAAATATTAATAAACTAGACGAAATTATCGACA ATCATTTAACAAACGATAAAGATCCTGCACATATGCCGATCTTACTCCGA GCTTTATTGCGGGTTAGTATATGTGAGCTATTATTTTGCCCTACTACTCC TGCTAAAGTAGTAATCAACGAATATACGGACATAGCAAATGATATGTTAA ATGAACACGAGATTGGTTTTGTGAATTCAATATTAGACAAAATAGCTCAA GAAAATAATAAAATTTCATGA >RF_1151 nusG, Transcription antitermination protein NusG GTGACAGAACAGAGTATAGATAATATATTGCCTTCTTCTGAAAAAAATGT AAAGCAGTGGTATGTAGTACATACGGCATCAGGAGCAGAGAAACGCATTA AAGAAGATATGCTTAGAAGAATCGCTAAACAGAAAATGACGGATTTTTTT GAAGATATATTAATACCTGTTTTTGGAGTTTCTGAAGTTAAACGCGGTAA AAATGTCAAGGTAGAAAAAAAACTAATGCCGAGTTATATCTTGATAAAGA TGAATATGACTGATAAATCTTGGCATTTAGTAAAAAATATACCAGGAGTA ACCGGCTTTTTAGGAAGCAAGACCACACCAAAAGCTCTTACGGAAAGCGA AATACAGAATATTTTTAATAATTTGGAAGCAGAAGCTAAAGAAACAAAGA ATTCTAAATTGTATGAAGTTGGTGAAATAGTGATTGTTACAGACGGTCCT TTTGAAACTTTCACCGGTACGGTAGAAGAAATAGATCAAGAAAAAAATAG GTTAAAAGTTTCAGTATCAATATTTGGTAAAGCAACTCCAATAGAACTAA ATTTTAACCAAGTAAAGAAAAACGATTAA >RF_0658 ompR, PetR protein ATGCAACCACATAAAGCACATATTTTAATCGTAGATGATGATAGCAGAAT ATTAGCACTTTTAAAGCAATTTTTAAATAAAAACGAGTTTTTAGTATCAA CGGCAAGCTCAGTCATAGAAGCTAAAAATCTATTAAAAACTTCTAATTAT GATTTAATTATTTTAGATGTTATGTTACCTGAAATAACAGGGCTTGATTT TGCTACTACTATAAGGGATGCCGGTAATAATATTCCTATAGTTATGCTTA CTGCTTTATCGGAAGCCGATGACCGTGTTAAAGGACTTGAAGCCGGTGCC TCTGATTACATAACTAAACCTTTTGAACCGCGAGAATTATTACTTCGGAT AAATAATTTAATTAATAATTATAATAACTTTAAAAAAGAAACGAATATAA TTAAATTCGGCAATAATTTCTATAATTTTGATACAAAGGAATTCACTAAG AACGATCAAATCATATCTCTTAGCTCTACCGAACAAAAATTACTTGAGAT 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>RF_0378 recG, ATP-dependent DNA helicase RecG GTGTATATGCTCTCTATTTTAGAAAAATTTTTATTTGCTCCTGTAAAAAC GTTCATCAATATACGTGAAGATACCGTCTCGGCTCTTAAGAGGCTCGGTA TTGACAATATTCGTGATTTACTGTTTTATCTACCGGTTTCATATCAAAAT AAAATATTATCGCCTAATTTAACTGGAGTTAGAGACGGCGAAATAATCCA AACGGAAGTCGTAATTGAGAGCGTTAATTTACCGAAAAAAGGTAATCAGC CTTTAAAGATTACGGCTAGCAATGATACTGGTTCGTTGTTATTAGTGTTT TTTCATAGGCCTCCACCGTTTATTTTTAATAAGCTGAAAGTTGGTACTTC TCATATTATTAGCGGTAAAGTACAATTTTTTGATCATTACTTACAGATTT CGCATCCTGAATTTGTTACGAATCCTAAACTCGCAAAAGAAATAGAGCCG ATTTATTCCCTGACATATTTACTTAGTAACAAGCAGCTATATTCATATAT CATAAAAGCGATGGATATCTTTGAAGAGAAGTGCAAGGGGCTTGAAGATA AGGAGGTAAAGGATTATTTGGATGAGGTATTGCAGAGTTTGAAAATGTTG CACTCTTTATGTCATTCCCGCCCCTTATGTCATTCCCGCGTAGGCGGGAA TCCGGAAAAAATGGATCCCGCGGTCTGGCCGCGGGATGACACCGTGGCTG CCAAAAAACAACTAGCCGCCAAAGAACTCATCGCTAATCAAATATCTCTT TTAAATGTACGCACGCAAATTGCCGGAAAACAAGGTAATATTTACCCTAA AGCTGCCGGCATTCAAGCAAATATATTAAATGAGTTAGGGTTTGAACTAA CTTCCTATCAAAAGCAGGTTATAGAAGAAATAGAACTTGAGCAAAGCGAT 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