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# Streptococcus pyogenes phage 5005.3

>M5005_Spy0291 acetyltransferase, GNAT family
ATGTTGATTAGACAGGTTCAAGGATCCGATTTGGAAGTTATTGCTACCAT
TGAAAGTGACAATTTTTCACCACAAGAAGCAACGACAAGAGCAGTTCTTG
AAGAGCACATACGGCTGATACCAGATACTTTTTTAGTGGCACTTATCGAT
CAGGAAATTGTTGGCTATATCGAAGGTCCAGTTGTCACTACTCCTATTTT
GGAGGATTCTTTGTTCCACGGGGTGACTAAAAATCCTAAAACTGGAGGCT
ATATTGCTATTACTAGTTTGTCCATAGCTAAACATTTTCAGCAACAAGGG
GTTGGGACAGCTTTGTTGGCGGCACTAAAAGATTTAGTAGTAGCGCAGCA
AAGAACAGGTCTTATTTTGACTTGTCATGATTACTTGATTTCCTATTATG
AAATGAATGGGTTTATTAACCAAGGAATTTCAGAGTCTCAACATGGTGGA
ACCCTTTGGTACCAAATGATTTGGAAACTTTAG
>M5005_Spy0107 fibronectin-binding protein
TTGAGAGGAGAGAAAATGAAAAAAACAAGGTTTCCAAATAAGCTTAATAC
TCTTAATACTCAAAGGGTATTAAGTAAAAACTCAAAACGATTTACTGTCA
CTTTAGTGGGAGTCTTTTTAATGATCTTCGCTTTGGTAACTTCCATGGTT
GGTGCTAAGACTGTTTTTGGTTTAGTAGAATCCTCGACGCCAAACGCAAT
AAATCCAGATTCAAGTTCGGAATACAGATGGTATGGATATGAATCTTATG
TAAGAGGGCATCCATATTATAAACAGTTTAGAGTAGCACACGATTTAAGG
GTTAACTTAGAAGGAAGTAGAAGTTATCAAGTTTATTGCTTTAATTTAAA
GAAAGCATTTCCTCTCGGATCAGATAGTAGTGTTAAAAAGTGGTATAAAA
AACATGATGGAATCTCTACAAAATTTGAAGATTATGCGATAAGCCCTAGA
ATTACGGGAGATGAGCTAAATCAGAAGTTACGAGCTGTTATGTATAATGG
ACATCCACAAAATGCCAATGGTATTATGGAAGGCTTGGAACCCTTGAATG
CTATCAGAGTTACACAAGAGGCGGTATGGTACTATTCTGATAATGCTCCT
ATTTCTAATCCAGATGAAAGTTTTAAAAGGGAGTCAGAAAGTAACTTGGT
TAGTACTTCTCAATTATCTTTGATGCGTCAAGCTTTGAAGCAACTGATTG
ATCCGAATTTGGCAACTAAAATGCCAAAACAAGTTCCGGATGATTTTCAG
CTAAGTATTTTTGAGTCTGAGGACAAGGGAGATAAATATAATAAAGGATA
CCAAAATCTTTTGAGTGGTGGTTTAGTTCCTACTAAACCACCAACTCCAG
GAGACCCACCAATGCCTCCAAATCAACCTCAAACGACTTCAGTACTTATT
AGAAAGTATGCTATAGGTGATTACTCTAAATTGCTTGAAGGTGCAACATT
ACAGTTGACAGGGGATAACGTGAATAGTTTTCAAGCGAGAGTGTTTAGCA
GTAATGATATTGGAGAAAGAATTGAACTATCAGATGGAACTTATACTTTA
ACTGAATTGAATTCTCCAGCTGGTTATAGTATCGCAGAGCCAATCACTTT
TAAGGTTGAAGCTGGCAAAGTGTATACTATTATTGATGGAAAACAGATTG
AAAATCCCAATAAAGAGATAGTAGAGCCTTACTCAGTAGAAGCATATAAT
GATTTTGAAGAATTTAGCGTTTTAACTACACAAAACTATGCAAAATTTTA
TTATGCAAAAAATAAAAATGGAAGTTCACAGGTTGTCTATTGCTTTAATG
CAGATCTAAAATCTCCACCAGACTCTGAAGATGGTGGGAAAACAATGACT
CCAGACTTTACAACAGGAGAAGTAAAATACACTCATATTGCAGGTCGTGA
CCTCTTTAAATATACTGTGAAACCAAGAGATACCGATCCTGACACTTTCT
TAAAACATATCAAAAAAGTAATTGAGAAGGGTTACAGGGAAAAAGGACAA
GCTATTGAGTATAGTGGTCTAACTGAGACACAATTGCGTGCGGCTACTCA
GTTAGCAATATATTATTTCACTGATAGTGCTGAATTAGATAAGGATAAAC
TAAAAGACTATCATGGTTTTGGAGACATGAATGATAGTACTTTAGCAGTT
GCTAAAATCCTTGTAGAATACGCTCAAGATAGTAATCCTCCACAGCTAAC
TGACCTTGATTTCTTTATTCCGAATAACAATAAATATCAATCCCTTATTG
GAACTCAGTGGCATCCAGAAGATTTAGTTGATATTATTCGTATGGAAGAT
AAAAAAGAAGTTATACCTGTAACTCATAATTTAACATTGAGAAAAACGGT
GACTGGTTTAGCTGGTGACAGAACTAAAGATTTCCATTTTGAAATTGAAT
TAAAAAATAATAAGCAAGAATTGCTTTCTCAAACTGTTAAAACAGATAAA
ACAAACCTCGAATTTAAAGATGGTAAAGCAACCATTAATTTAAAACATGG
GGAAAGTTTAACACTTCAAGGTTTACCAGAAGGTTATTCTTACCTTGTCA
AAGAAACAGATTCTGAAGGCTATAAGGTTAAAGTTAATAGCCAAGAAGTA
GCAAATGCTACAGTTTCAAAAACAGGAATAACAAGTGATGAGACACTTGC
TTTTGAAAATAATAAAGAGCCTGTTGTTCCTACAGGAGTTGATCAAAAGA
TCAATGGCTATCTAGCTTTGATAGTTATCGCTGGTATCAGTTTGGGGATC
TGGGGAATTCACACGATAAGGATAAGAAAACATGACTAG
>M5005_Spy1671 transcriptional regulator, MarR family
ATGAGTCATTTAGATAAGAACACCGCTTTGAAAGCCATGGTGGTGTTTCG
TAAAGCTCAGCGAACGCTAGATGCTTTTGGGGCTGATATTTTTAAAAAGG
CAGATTTAACAGCCACGCAGTTCAGTGTGCTTAAAGTACTATATACTAAA
GGCTGTATGCGAATCAATCACTTGATTGATTCTTTGTTAGCGACTTCGGG
GAATATGACTGTTGTACTAAATAATATGGAACGCAATGGCTGGATTAGCA
AGTGCAAAGACAAAACGGATAAAAGAGCCTATGTGGTTACCTTAACAGAT
AAGGGTACTCGCTTGATTGAAGCTGTTTTGCCTAAACACGTCGCACGGGT
GGAAGAAGCCTTTGCTGTTTTGACTGAAAAAGAACAACTTTGTCTGATTG
AACTTCTCAAAAAGTTCAAACAATTATAA
>M5005_Spy1819 hypothetical phage protein
ATGAAATTTTTTGAAGAAAATTATTCACAAGAAATACCTACTCGTATCAA
AAATTTAAGAAAAAAACACAATATTACACAAAGCGAACTAGGCAATGCAG
GTCAAGTTAGTCAAGTTGAAAGTGGTAAGCGACCAATTACGAGTTCGATG
TTAGTTTATTTAAATGCTCTAACCGCTTCGAACTATACGTATATCGTTTT
TGGAGAGTTAGATGAGTTTATTGAGAATCTGTTTCATTATTTTTTCAGTT
CTATTTTATATAGAGATTTAGAGGCTGTAGATGAAAACCTATATTCTTTC
ATGAGTGATGATTTAATTTCAATCCAATCAAGTTGTCTAAGTATTGCCAA
GACATTTGCAAATTTCAATATTCAAAGAAAAAGATTTATGATTTCTACTG
AAACTGAAATGGATACTTTTCACAAGAAAGATGACATTGACGTATGGGTT
GGTGGAAAAAGTTATAACCCCGCTAGGAGTTTTAGGAATAATCCAATAAA
TGAATTAACTGTTATTGATTTTGAAGAAATGGCTGATATTCTTTTGTTGA
TGTTGAGAGATAATCTAATTAGGTCGTTTGAAATTAATGTCTGCAACACA
CTGTTCGAATTAGATAAAAATGGTGAACCGACAACATTTAATCTAGATAA
AATTGACTCAATAATCAATAAGTGGTGGTCTGAGAATGTCTCAACAGAGA
TAATACCCAACCTCATAAAAAAACTTAGAGAAAATCCCTTGTTTAATATC
GGATTTATGGTAAATGATATATTAGAACGAATGTATAAAGAGGACATACC
AAAGTCTTACCTTACTTCTGTTCCATTAGTTATTTCCAAAAAAGCAAGGT
CAACTTTATCGATTAAGTCAAACGGAAGTCAAAAAATAGATAAATCAAAA
TTTGCACAGATTTTGTCCCTTTAG
>M5005_Spy1411 hypothetical cytosolic protein
ATGTCTAAAGTCAAAAAAATACCTTTACGAAAATCACTTGTTTCTGGTGA
AATTATTGCTAAACGAGATCTTCTTAGGATTGTAAAAACTAAGGATGGTC
AAGTTTTCATTGATCCAACTGGTAAACAAAATGGTCGTGGTGCTTATATC
AAATTAGACAATCAAGAGGCCTTAATGGCCAAGAAAAAACAAGTTTTCAA
CAGGAGTTTCTCAATGGACATTCCAGAAAGTTTTTACGATGACTTGATTG
CTTATGTTGATCACAAAATCAAAAGAAGAGAGTTAGGTCTTGACTAA
>M5005_Spy1583 hypothetical cytosolic protein
ATGGGAATTGAAAAGACAGTTAGTGAACTAGCTGATATTTTGGGAGTGAG
TCGTCAGGCCGTCAATAATCGTGTTAAGTCTTTACCCGAAGAAGATCTTG
ACAAAAATGAAAAAGGCGTTACTGTGGTTAAGCGCAGTGGTCTTGTTAAG
CTGGAAGAGATCTATAAAAAAACAATTTTTGACGATGAGCCTATCAGTGA
AGAAACGAAACAACGTGAGCTTTTAGAGATTCTCGTGGATGAGAAGAACA
CTGAAATCACGCGCCTTTATGAGCAACTCAAAGCCAAAGATGCTCAACTT
GCCTCAAAAGATGAGCAAATGCGTGTTAAAGACGTGCAGATCGCTGAAAA
AGATAAACAATTGGATCAGCAGCAACAATTAACTGCTAAAGCCATGGCTG
ATAAAGAAACCCTAAAATTAGAATTGGAAGAAGCTAAAGCAGAAGCCAAC
CAAGCTCGCTTACAAGTCGAAGAAGTTCAGGCTGAAGTTGGCCCTAAAAA
AGGCTTTTTCACCCGCTTGTTTGCGAAATAA
>M5005_Spy0888 transcriptional regulator, LysR family
ATGGATATTAGACAATTAACCTATTTTATTGCAGTTGCTGAAACAAAAAA
TCATTCCCACGCTGCTAAAAGTTTGTTTGTAACGCAACCTACTCTTTCTC
AATCAATTAAAAGGCTAGAGTCCTAG
>M5005_Spy0155 transcription antiterminator, BglG family
ATGATGATTTTAGATAAAAAGAGTTATGACTTGCTGTCTTATTTACTTAA
ACTAGAAACACCTGAGACAGTTATGGCCATTTCTCATGCTTTAAATCAGT
CACGTCGTAAAGTTTATTACCAGCTTGACAAAATTAATCAGGCTTTGCCA
AAGGGAGTAGATCAGATTATCTCTTATCCTAGACTTGGCATTCTTTTAAC
AGCTGATCAAAAAGCTGCTTGTCGCTTATTATTAGAAGAAGTGACTGATT
ATAATTATGTCATGAAAAGTGATGAGCGCAGACGCCTATCCTCGATTTAT
ATTGCGGTTTCCACTGAGCGCGTGACCATTGATAAACTGATGCAGATCAA
TGATGTGTCTCGTAACACGATTTTAAATGACCTGACTGAGTTAAGGGAAG
AACTGGAAGACAAACAATACAAGATTCAGCTTCATGCGACAAAGGCTAGG
GGATATTATTTTGGTTGTCATCCAATGGCTCTTATTCAATACCTGTACAA
ATTGTTAGTGGACGTTTACCAAGGTGGCAATACTAGCTTTATTGATATAT
TCAACCGTAAACTCTCAGAGATACAAGGCTTATCGGTTTATTTTTCTAAA
GATATTTTGACCTATTTTCATGAGTATCTCTTTTTATCTCAAGCTAGTTT
AGGAAAGACAATTAATACCCAAGATAGCCAATTCATGTTGCAGATTTTAC
CTTTCATGCTTTTAAGTTATCGTAATATGCGTCTTGATTCAGAAACAAAG
TCTGCTCTTAAACAAGAATTTCATTTGATTTGGAAACGTAAAGAATATCA
CATTGCTCAGGATTTAGCTAGAGAGCTTTACCATAATTTTAAGCTTCATT
TGGATGATATCGAAGTTAGTATGGTAGCGATGTTGATGTTGTCTTTTCGA
AAAGATCAAGATCATCACGTGGAAAGTCAAGATTATGACGACATGCGAGC
AACCATTAGTCACTTTATTGACCAGTTGGAGAGCCGTTATCAGTTACATT
TCACGCATAAACAGGATTTGCTGAAGCAGTTGACGACCCACTGTAAGGCG
CTCGTTTACCGTAAAGCTTATGGGATTTTTTTAGTTAATCCCTTAACAGA
CCATATTAAAGAAAAATACGAAGAATTGTTTGCTATGACTCAATCTTGTG
CCACTATTTTGGAACAAGATTGGACGATTAGCTTGACAGACGATGATATT
GCCTACTTGACTATCCATCTTGGGGGAGAGCTGCGTCACAATAATACAGA
GCAAGAAAAGACCAAACTCGTTATTGTTTCAGATGATGGGATAGGCATTC
AAAAGTTATTGTTCAAACAGTGTCAAAGGTATCTAGCAAATGGTCAGATT
GAAGCTGTTTTTACGACAGAACAGTATCAGAGTGTTTACGACCTTTTAGC
AGTCGATATGATTGTTGCTACTACAGATACGCTAAAGACTAAAATCCCGA
TGCTTATTGTTAACCCTATTTTAAGTGACGATGATATCATCAAATTGATA
CGCTTTTCAAAGCAAGGACGCTTGAGTGAGCACTCCCGCTTTTCTACAGA
GCTCACAAAAGCTATTGAAGCTGTTGTAAAAGATGAATCAGATCGTTATG
CCTTGGTTTCTAAAATTGAAAAACTCATTCATCGCGAGCTGCTATGA
>M5005_Spy1218 phage protein
ATGCCCGATAACACAATCGCCATCGAAAAAATTAAAAAGTATTTGCTTGA
TAACAACCTTAAACAAGTTGATCTAGCAGTTACTTATGGCAAAGAACCGC
AAGATGTGGCGAACATTCTTGCTGGACGAAAAAAAGACCCAGCATCAAAT
CGCTTTGTTTTAAAAGTTATTTCAGATTTAAAAATCAGATAG
>M5005_Spy1475 acetyltransferase
ATGGTTCAGCAAAGTCTCGTTATTGAAGAAGGCGTACCTCAAGATGCAAA
AGCTGTACTTTCCTTAGTGACGGCAGCTGCCAAAGAAACAGATTTTATAA
CAGGCGTAGAGACTATATTAGAGGCTACTCCTCAAGAATTGTCAGACTTT
TTATCAAGAAGTCAAACCTCTTTTATTGATTTTTGCCTGCTAGCTAGATT
AGATGAAAAAGTAGTAGGGCTTTTAAATCTTTCTGGGGAAGTATTATCCC
AAGGCCAAGCTGAAGCAGATGTATTTATGTTAGTTGCTAAGACTTACCGT
GGTTATGGTATCGGTCAATTATTGTTAGAGATTGCTCTTGATTGGGCTGA
AGAAAACCCTTATATCGAAAGCCTTAAGTTGGACGTTCAAGTAAGAAATA
CTAAGGCTATTTACCTGTATAAAAAGTATGGTTTTCGTATTGAAAGTATG
CGAAAAAACGACATCAAATCAAAAAATGGAGATGACTTAGATGTTTATCA
TATGCGTAAATCTGTAAGTCAGTAA
>M5005_Spy1747 sorbitol operon regulator
ATGAAAGAAGAACGCAGACGGCTCCTTGCCAAGGTGGCTTACTTGCATTA
TGTTCAAGGCAAGAGCCAAACCTTGATTTCAAAGGAAATGAATATCTACC
GAACAACGGTTTGTCGGATGTTAGCAAAAGCCAAGGAAGAAGGCATTGTT
CGGATTGAAATTGCCGACTATGATGCTGATTTATTTGCTTTAGAAGAATA
CGTGCGACAGCAGTATGGCTTGGAAAAACTAGACCTTGTGCCCAACCAGG
TTGAAGATACCCCAATGGATACCTTGACAAATGTTGCTAAAACAGCAGCT
GAGGTTTTTAGACATGTTGTTAAAGATGGCGATAAGATCGGTCTGTCCTG
GGGAGCGACTCTTTCTTGCTTGATGGATGAGTTAAATCCAAAAGCGATGA
AAGATGTGTTTATTTATCCTTTGGCAGGAGGACCTAGCCATATTAATGCC
AAATACCATGTCAATACCCTGGTTTACCGCTTGGCTCGCATCTTTCATGG
TAATAGCGCTTTTATGAACGCTATGGTCATTCAAGAAGACAAACACTTGG
CTAAGGGAATCTTACAATCTAAATACTTTAACGACATTTTAACAAGCTGG
GACCAGTTAGATCTTGCCTTAGTAGGAATTGGTGGGGAGCCTAATAGCCT
TGAGCAGAGCCAATGGCGTGATTTATTAACCAGCTCAGATCATGACCAAC
TCAAATATGAAAAAGCCGTTGGTGAAGTTTGTTGCCGTTTCTTTGATCAG
GCAGGTCAGCCAGTTTACACTGGCCTACAGGATCGAACTATTGGTATTTC
ACTAGAACAGTTGAGGCGTGTCCCCAAAACAATGGCTGTTGCAACAGGTA
AACACAAGGCTAAGGCAATATTGGCAGCCTTAAAAGCAGGTTTTATCAAT
TATCTAGTGACGGATAAAGAGACCATGCTAGCTGTTTTAGCGTTAGATGA
AGATATTGATCTTAATAACGTTCTTCTTTAA
>M5005_Spy0544 transcriptional regulator, GntR family
ATGCCAAAAGAACAACCACTCTATCTACAGATTGTTGATGACTTGGAAGT
GAAAATCAAAAAAAGCATGACAGAAAACGATAAGTTGTTGTCAGAACGAG
AATTAAGTGACCTTTACGGTGTTAGTCGTATCACGATTAGACTGACTCTT
AAGGAATTGGAATTACGAGACTTAATTTATAAAAAGCAGGGCAAGGGGAC
TTATGTTTCAGGAATCAAAGAACCTGCCACTGATTTATCAAGTACTTACA
GCTTTACAGAGCAGATGAAAAAAATGGGGAAAACTCCTAAAACAGAGATT
CTTTCTTTTGAACAGTATCAGGTAACACCTTACTTGTCTGGTCTCTTAGA
GCTTGATCCCGATACAGAAGTTTTTGAATTAGAACGCCTAAGGATTGCAG
ATGATATGCCCTTGATGTTTGAACGATCCTATATTCCTGCTCAGCCTTTT
CAGGGGTTAAGCATTGCGGACTTAAAGCGTAAAGCTTTGTACGATATCTT
TGCAAAGGACTATCAAGAAACAATCCGTCTTGCAGAAGAAGAGTTTTATG
CCAGCATTGCCTTGGACTATGAAGCAGGTCTCTTAGGCATTAAAAAGGGA
GATCCTGTCTTACATATTATTCGTAAAACTTATAATGATAAAAATATCTT
AATTGAATTGACTTTCAGCATTGCAAGGGCGGATCAGTTTAGGTACCGGG
TGCAACATCACCCTAATGGTTAA
>M5005_Spy1664 transcription antiterminator, BglG family
ATGCTATCTCATGAGCTCATCAGAAACTATCAACTCTTTTCTAAATATAA
AGGACATTCACTGGAGGCATTTGAATCCATTTTAAAGGCAAGCAAACGTC
ATATACTGGCAGATATTGCTAAAATCAATGACACGTTGTCACTCTATCAG
TTACCCCTTATTGCTCTGGACAGGCAGCTGGTTTATCCGCCAGACCTTAC
TGAAAAGGACTTGTTGAATCGCATGCTACCTACCTTAGACGACTATCTCT
TTCAAGATGAGCGTCTGGATATGATTATCATTTACATCATGATGGCTAAA
GAATTTATCTCCATTAACCACTTGGAAAGCTTGTTACGGCTCAGCAGAAA
TTCTGTTATTGCTGATTTAAACTTGGTGCGTGATCGGGTACAAGCTTTTC
AGGTAACTTTAGCTTACAATCGCCAGGATGGTTATTTTTTTGAAGGAGAA
CCCTTAGCCTTGCGGCGTCTCTTAGAATCAGCGGTCAGTTCTCTTTTGCA
AGTCACATCTGGACCTTGGGTGTTCAGTTACTTATTGCATGAACTTGGTT
TGCCCGACCAGAAAAAGGTGATGGCAGCAACGTTGGAGGAACTGAGCAGG
GAGAACCACTTAACTTTTATTTCGGAGAAATTGAGGGATTTGATTTATTT
TTTCTGCCTTCTCGCTCATCGACCATTTTCACGGAACGTAAGGGCTGAAG
CAGTGGATACTTTTCCTTTAGCTTCGCCAGCTGTTGAAACGATGGTGGAC
CAGTTATTGGTCAACTTCCCCAGTCTAACCGAAGAAAAATATTTGGTTCA
ATCTAGGTTACTTGGTTGTATCCAAGGTGACTTAGAGTTAGTCTTTCAGC
AACCTATTTATGACATTATGGAGGAAATCATCAATTCGGTGGCGGTTAAC
ACGGGATTGTCTATCACCGATACCCCAGAACTTCGTCAGAACCTATACAG
TCACCTTTTGCCAGCTTATTACCGACTTTACTACGACATTAACTTGACCA
ATCCTTTGAAGGAACAAATCAAACAAGATTATGAATCTCTCTTTTACTTG
GTCAAGCGCAGCCTTTCTCCTCTAGAAAAACAATTGGGGAAATCAGTTAA
TGAAGATGAGGTTGCTTATTTTACCATTCATTTTGGGAGATGGTTGCAGG
CCCCTAAGAAGAGGCCAAGCAATCAGCTGGTAGCCTTATCTGTTTGCCCT
AATGGCATTAGTTCGTCTCTGATGTTGGAGGCAACCTTGAAGGAACTTTT
TCCACAGCTACAGTTTATTAGGATTCACCAGCTGGACAAAATAAAGTTGT
TGGATCCAGCATCCTTTGATTTGATTTTTTCAACAGTAGCTTTTGACTGT
GCTAAACCTGTTTATGTGACGCAAGCTTTGATGGGACCTGTTGAAAAAAT
GATGTTGAAAAAGATGGTCTGTGATGACTTTCATCTTCCCTTGTCAGAGC
AATTCGCTTTGGATGATCTGTTGAGTATTATTCATAAACATACCACGATT
ACTAATAAAGAAGGACTTGTTAGTGATTTATCCCGTTACCTGATTGGTAA
CCATTTAACGATTGAAAAAGGAGGTCTAGGACTATTGGACTTGTTAACAG
CAGATTTTATTAGGCAGGCTGATGCTGTTTCGGATTGGCAGGAAGCGATT
CGTTTGGCTGCTCAGCCTTTACTAGAACACCAGATGATTGAAACATCTTA
TATCGATGGCATGATTGATTCGGTCAATGAGCTTGGGGCCTATATTGTTT
TAGCCCCTAAGGTGGCTGTTCCTCATGCGGCGCCTGAAAAAGGAACGCGG
CAGTTAGGCATGTCTCTCTTACAACTAAAAGAACCTGTCAGCTTTGATTT
GAAGCAAGAAGGTGATCCAGACAAGCAAGTGCAATTGATTTTTGTTTTGT
CTGCTGTGGATTCTAGTTCACATTTGAAGGCTTTGCAGGAACTGTCGTTG
ATTTTAGATGATGATGAACATATTGAGCAATTAATTGAGGCTAAGAATAC
TGAGGAAATAATGAGTCTGATTAGCCATATGATTGAAAAAGGAGACGAAT
CACATGATTAA
>M5005_Spy1131 transcriptional regulator, Cro/CI family
ATGGCAATGGAGGTTATTCTTAAAAATCGGCTCAAAGAATTACGAGCTAG
AGATGGAATTAATCAAACGGAAATGGCTAAACTGGCAGGAGTATCGAGGC
AGACCATCAGTCTCATTGAGCGTAACGAGTACACCCCATCAGTTATAATT
GCCATGAAAATTGCAAAGGTATTTCAGGAACCAGTTGAAGAGGTGTTTCG
TCTAGTGGAGGTCGAGGAATGA
>M5005_Spy0118 transcriptional regulator, LysR family
ATGAATATCTCAAGCTTGGCTTATTTTATTGAGATTGTTAATTGTGACTT
TAACTTAACCAAAGCAGCCCAAAAAAGTCATATTTCGCAACCCGCCCTTA
GTAGTTATATCAAGACTATCGAAAAAGAAGAAGGAGTCGTTTTATTCCAG
CGTCAAAAAGGGCGTCTAGTTGGACTAACTTCAGTCGGCGAACGCTTTTT
TGAAAATGCTAAGGTGGTTATCGCATCACATGAGCAATTAATGGCTGATT
TGCGGAGTGAATCCAAAAAATACAAAGGAGAAATTTCAATCGGTATTCCT
CAACTCATCTCTGGCATTGTTTTTTCTGAGCTCATTCCAAAACTCATCGA
AGAAAATCCCGAAGTTAAATTTCATATTGTAGAAACGGGTGCTTATGAAC
TGCAAAAAAACTGTTTCTAA
>M5005_Spy1392 transcriptional regulator, TetR family
ATGACTGATAAAGCACTCTCAAAAAGATCACTTCAAAACTTAACACAATT
TAATAAAGAAACACGACGCATAGCACGTGAATCTATGGAAATCGCCTTAC
TAAATCTTCTAGAAACAAAACCTTTAGGTGATATTACGATTTCAGAATTG
GTGACGAAAGCAGGAGTATCTCGTAACGCTTTTTATCGTAATTATACCTC
TAAAGAAGCCATTATAGAACAACTGTTAGTAGGGGTTATCCGTCGTATTT
TTCGTGGACTAAAACAATTTGATATTAAAACTCAGGCTTATCAAGCTTGG
CTCTATCTTTTTACTGAAGCTAAAAAAGAAGCTCAGCTTCTTAAAATGAT
TTTCAAACATCACCTGCACCATCTTCTAACACGATTAGTCACTAAACGTC
TGAAAGCTTATCAAAAATTAAAAGACAAAAAACAATCGCACTATAAGCGC
CTTTTTTGGAGCAATGCTATTGTTTCTGTCTTGACAAACTGGATTTCAGA
TGACATGATCGTTCCTGCCGAAGAAATGGCTGCTATGGGCTTGCCTCTAT
TAACGTAA
>M5005_Spy0914 phage transcriptional repressor
TTGTTGCATGTCAATAAAATGACAATATCTAATTGGGAAAAAGGTAAGAA
TATACCAAATGAAAAACATTTAAATGCCTTATTGCATCTATTCAATGTGA
CATCTGATTATTTCGACCCAAACTATAGATTGCTAACGCCTTATAACCAG
CTGACAATATCTAATAAAGAAAAAGTAATTGGCTATTCAGAGCGATTGTT
AAATCATCAAATAGACAAAAAATCTAAAGATCTCATAGATAAACCATCAC
AATTATATGCTTATCGGGTCTATGAAAGTTTATCTGCTGGTACTGGTTAC
TCCTATTTTGGTGATGGTAACTTTGATGTTGTCTTTTACGATGAACAATT
AGAATACGATTTTGCGTCTTGGGTTTTTGGAGATTCTATGGAGCCAACTT
ATTTAAATGGTGAAGTTGTTCTTATAAAACAAAATAGTTTTGATTACGAT
GGAGCAATTTATGCAGTCGAATGGGATGGGCAAACATATATCAAAAAGGT
ATTTCGTGAAGATGAGGGATTACGTCTAGTGTCCTTAAATAAAAAATATT
CTGATAAGTTTGCTCCCTATAGCGAAGAACCTCGCATTATTGGCAAAATT
ATCGCTAATTTTAGGCCCTTAGAAATTTAA
>M5005_Spy1700 acetyltransferase
ATGAAAATAATTGAGTACAAAGGAAATTACAGAGATGACCTCATTTTTAT
GGTCTTGGAAGCAAAAAATGCCTTAAGGAGAATTCCCAGCATTAACCCGG
ATCTTTTGACAATTGAAACAAGTTATTTGGAAAAAGAGGATTGTTTTTGG
CTAGCGGTCAATGAAGAAAGTCGTGTTATTGGCTCAATCGCTTATTCTTC
TATTCCCAAAACAAATGAGGTCTTCTTGCACCGTCTCTTCATCAAACCAA
GCTTAAAACATCAAGGCATTGGCAGTCAACTTCTGGCGTTTGCAGAAGAT
TATCTAAGGAAAATCGGCAAGAGTCATGTTCGTATCCACTTAGGTCAACC
TAAAGAACAATGGTTTGAATCTTATCGGTTTTATCCTAAACATGGTTATC
AATTCTATGATGACACGCATCTCATCAAGAAACTAATCTAA
>M5005_Spy0480 transcription accessory protein
ATGGAAAATAACAATAATCACAACATTGCAGAGGCTTTGTCAGTTAGTCT
CCATCAAATTGAACAGGTGCTTGCCCTAACAGCACAAGGCAATACCATTC
CCTTTATTGCACGTTACCGTAAAGAAGTAACAGGAAATCTAGATGAAGTG
GTGATTAAGTCCATTATTGATATGGATAAGTCTCTCACTACCCTGAATGA
GCGCAAAGCAACCATTCTCGCTAAAATTGAGGAACAGGGAAAACTGACAG
ATCAGTTACGAACGAGTATTGAAGCAACCGAGAAACTCGCTGATTTGGAA
GAGTTGTACCTGCCTTATAAGGAAAAACGCCGTACAAAAGCGACGATTGC
GCGTGAAGCAGGCTTGTTCCCATTAGCACGTTTGATTTTACAAAATGCGC
AAAACCTTGAAACAGCAGCAGAACCCTTTGTCACAGAAGGATTTGCCAGC
CCACAAGAAGCTCTAGCAGGAGCTGTGGACATCCTTGTGGAGGCCATGTC
AGAAGATGCTAAATTACGCTCTTGGACCTACAATGAGATTTGGCAGTACA
GCCGCTTAGTATCAACGCTTAAAGATGAGCAGTTGGATGAGAAAAAGGTT
TTCCAAATCTATTACGATTTTTCTGACCAAGTGTCTAACATGCAAGGATA
TCGTACTTTAGCCCTTAACCGTGGCGAAAAGTTAGGCATCTTAAAAGTGT
CTTTTGAGCATAACTTGGAGAAAATGCAACGCTTTTTCAGTGTGCGGTTC
AAAGAAACCAACCCTTATATTGAAGAGGTCATCAATCAGACCATCAAAAA
GAAAATTGTTCCAGCTATGGAAAGACGGGTTCGTTCAGAACTCAGTGATG
CCGCAGAAGATGGGGCTATCCACCTCTTTTCTGAAAATCTCCGTCATCTT
TTGTTAGTGTCTCCTTTAAAAGGGAAAATGGTTCTTGGGTTTGACCCTGC
CTTTCGAACAGGTGCAAAATTGGCTATCGTTGATCAGACTGGAAAATTGT
TGACTACTCAGGTTATTTATCCCGTAGCACCAGCTAGCCAAACGAAGATT
CAAGCAGCTAAAGAAACACTGACTCAGCTCATTGAGACTTACCAGATTGA
TATTATTGCCATTGGAAACGGAACAGCCAGTCGGGAAAGTGAAGCCTTTG
TAGCAGACGTTTTGAAAGATTTCCCAAATACGTCCTATGTCATCGTTAAC
GAAAGCGGTGCTTCTGTTTATTCAGCGTCAGAGTTAGCCCGCCATGAGTT
TCCAGACCTCACAGTGGAGAAGCGCTCTGCTATTTCTATTGCTCGTCGCT
TGCAAGACCCACTCGCAGAATTGGTTAAAATTGATCCTAAATCTATTGGC
GTCGGTCAGTACCAGCACGATGTGAGTCAGAAAAAGTTGAGTGAGAATCT
TGGTTTTGTTGTGGATACTGTGGTTAACCAAGTCGGTGTTAATGTGAACA
CGGCTAGTCCATCTTTATTAGCACATGTGTCAGGTTTGAACAAAACGATT
TCAGAAAATATTGTCAAATACCGCGAAGAAAATGGAGCACTGACATCACG
CGCTGACATCAAAAAAGTGCCGCGTTTAGGAGCCAAGGCGTTTGAGCAAG
CAGCAGGTTTTCTCAGAATTCCAGGAGCCAAAAATATTTTAGACAACACA
GGAGTTCACCCCGAGTCCTACCCAGCAGTCAAAGAACTCTTTAAGGTACT
TGGTATTCAGGACTTGGACGACGCTGCCAAGGCAACTTTAGCAGCAGTTC
AAGTTCCCCAAATGGCAGAAACATTGGCTATTGGGCAGGAAACCCTTAAA
GATATCATTGCTGATCTCCTTAAACCGGGTCGTGACCTTCGTGATGACTT
TGAAGCACCAATCTTACGTCAAGATATCCTTGATTTGAAAGATTTGGAAA
TTGGCCAGAAGCTTGAAGGAACTGTGAGAAACGTCGTTGACTTTGGTGCT
TTTGTAGACATTGGTGTTCATGAAGATGGGCTTATTCACATTTCTGAAAT
GAGCAAAACCTTTGTCAACCACCCTAGTCAAGTTGTTTCAGTGGGTGACT
TGGTAACTGTTTGGGTCTCTAAGATTGACTTGGACCGCCACAAGGTCAAT
CTCAGCCTATTGCCACCGCGTGACACTCACTAA
>M5005_Spy0654 transcriptional regulator, TetR family
ATGACAAAAGACAGACAAATCAAAAAAACAAAAACAGCTATCTATAGTGC
TTTTATTGCTTTATTACAAAAAAAAGAATATTCGAAAATAACTGTTCGAG
ATATGATTACACTTGCTAATGTAGGGAGATCAACCTTTTATGCACATTAT
GAAAGCAAAGAAATGTTACTAAAAGAACTCTGTGAAGAACTTTTTCATCA
TTTGTTTAGGCAAAAAAGAAATGTGACTTTTGAGGACTATTTGGTACATA
TTTTAAAGCATTTTGAACAAAATAAAGACAGCATTGCGACGTTGTTACTT
TCTAATGATCCCTATTTTTTATTAAGATTTAAAAACGAACTAGAACATGA
TGTTTACCCTAACTTGCGCTGCAAGTATATCGACAAAACGACTATTCCAG
AAGTATTCCTAAAACAATTTGTTCTATCTAGTTTTATAGAAACCTTAAAA
TGGTGGCTCCATCAAAGGCAAAGGATGTCTGCAAATGAACTATTAAAGTA
TTATTTAGAGCTCATAAAATAA
>M5005_Spy1786 transcriptional regulator, MarR family
ATGGAAGCAGACGGATTGGTTCATCGGGAAGTGTATGCAGAAGTGCCACC
TCGGGTGGAGTATTCCTTAACAGAAACTGGGTTGAGCTTAGCTCCTGTTA
TTGAAGCGATGTCGGATTGGGGCCAAACTTACCAAGAAAAACATGCCGAT
TTATTTGAAGAAGGCTAG
>M5005_Spy1265 ribose operon repressor
TTGAGATTGAAAAATCCCCATAAACTTATTTTACAAGGAGGTAAGGCTAT
GGTAACCATTAAACAAGTTGCTGAAGAAGCAGGTGTTTCTAGATCAACAG
TCTCCAGGTATATTTCTCAAAAAGGATATGTATCTGATGATGCAAGGCAT
AAAATCAAAGCAGCGATAGCAAAATTACATTACACTCCAAATGTCTTGGC
GCAGTCATTGAAGACGAAAAAAATCAACTAG
>M5005_Spy1825 transcriptional regulator, PadR family
ATGTATTTTCCAGTATCGGCTACCTTGATTGAATTTCTGATTTTAGCCAT
TGTCGAAAAAAATGATTCTTACGGTTACGATATTAGTCAAACCATTAAAC
TAGTGGCTAATATCAAAGAATCCACTCTCTATCCTATTCTTAAAAAATTG
GAGAAAGCAGGTTTTTTGACAACTTATAGTCAAGAACATCAGGGACGAAA
GCGTAAATATTATGCTGTCACTTCTTCGGGGAGAGCACAGCTGATTTTTC
TAAAAAAAGAATGGCAGAGCTATAAATTTGCCTTAGACGGGATTATTGAA
GGGAGCTTAAGACATGACAAGGACTGA
>M5005_Spy1104 cytosolic protein containing multiple CBS domains
ATGAGCAAACATCAAGATATTTTAGATTATTTAGAAAAACTTGCTATTGG
TAAAAAAGTGAGTGTTAGAAGCATTTCAAACCACTTAAAAGTAAGCGATG
GAACAGCCTACCGTGCTATTAAAGAGGCAGAAAATCGAGGTATTGTCGAA
ACCAAACCAAGAAGTGGAACTGTTCGTATTGAAAAAAAAGGACGGGTTCG
TATTGACCGTCTGACCTATTCCGAAATTGCTCGGATCAGTGATTCGGAAG
TGCTAGCGGGACATGCTGGTTTAGGACATGAATTTAGTAGGTTTTCAATT
GGTGCTATGACTCAACAAAATATTCGTCGTTACTTGGTCAAAGGAGGGTT
ATTAATAGTTGGGGATCGTGAAACGATTCAACTCTTAGCTCTTGAAAACC
ATAATGCCATTTTGGTGACGGGCGGATTTCCAGTATCCAAACGTGTTATT
GAAATGGCAAATAACCAACGAATCCCAGTTATGGTAACTCATTATGATAC
CTTTACTGTGGCAACAATGATTAATCACGCGCTATCTAATATTCGTATTA
AAACAGATCTCAAAACAGTTGAACAGGTAATGATACCTATTACAGATTAT
GGTTACCTTTGCGAAGACAGCTCTGTTGAAGAATTCAATACATTAATAAA
AAAAACACGACAAGTCAGGTTTCCTGTATTAGATTATAAAAGAAAAGTGA
TTGGTGTAGTTAGTATGCGTGATGTGGTGGATCAGTTGCCAACAACTAAG
CTTACCAAGGTCATGTCTAAAAATCCAATAACGGCTAGACCAAATACTAG
TCTTGCTAATATTAGCCAGAAAATGATCTTTGAAGATTTAAACATGTTAC
CTGTCACTGACGAAGAAAACAATTTACTTGGTATGATTACTCGTAGACAA
GCAATGGAAAATTTGCCAAATCACCAACCAAATAACCCCTATACTTATAG
TGAGCAAATACTTTCTAACCTTGAAGAAACGGTTGATTATTATCAAGTAG
TAGTTGAGCCAACAATGATTGATAGTGCTGGTAACATGTCAAACGGTGTT
ATTTCAGAGTTCTTAAAGGAAATTAGTATCAGAGCCCTCACGAAAAAGCA
CCAAAAAAATATCATTATCGAACAAATGATGGTATACTTTTTACATGCTA
TTCAAATTGAGGATGAATTAAAAATATATCCTAAAATCATTACTGAAAAT
AGACGAAGCAGCACCATTGATATTGAAATTTTTGTGGATGATCAAGTGAT
TGCTAAAGCTATTATTACAACGAAAATAAATTAG
>M5005_Spy1377 trans-acting positive regulator
ATGAAGATTGAAGACTTAATGGATAAGGAACGAAGGGCCCAATATCGTCT
CTTGGTGACCCTTTATCATGCTAAAGAAACGTTAAGGCTAAAAGACCTAA
TGAGGCTATCAAACTTGTCTAAAGTGACCCTATTAAAATACATTGACAAT
CTAAATCATTTGTGTCGAGAACAAGGTTTAGCCTGTCAATTACTTTTAGA
AAAAGACAGTCTGAGCTTAAAAGAAAATGGCCAGTTCCATTGGGAGGATT
TGGTAGCTCTGCTTCTCAAAGAATCGGTTGCCTATCAGATATTGACCTAC
ATGTACTGCCATGAACACTTTAACATCACCAACTTATCCGTTGAACTGAT
GGTTAGTGAAGCTACTCTAAACAGACAATTAGCTCACCTCAACCAGCTTT
TATCAGAATTTGATCTGGCGCTCTCGCAAGGCAGACAACTGGGAAGTGAG
CTTCAGTGGCGTTATTTCTATTTTGAATTGTTCCGCCATACCTTGACCAG
ACAAGGCATAGACGCCTTGGTCAATCAGTTAGACGCTTCGCATTTGGCTA
CCTTAATTGAGCGGCTGATTGGCCAGTCATTATCGGCAGAAGCCTTAGAA
CAATTATTGATTTGGTTGGCGATTTCGCAAGCGCGAATGTCCTTTCAAAA
AGGCTACAATGATCATTTTTTAAGAGATAGTGACTTTATGACATCTAATA
TTTTCTTTAAGCGCTTAGAAAGCATGCTTTTACATTACTTAAGACGCTAT
GCCCTTGAATTTGATGCTTTTGAAGCTAAGAGCCTCTTTGTCTTTTTGCA
TGCTTATCCTCTACTTCCTATTGCCAGCATGAAGTATAGTTTGGGTTTTG
GAGGTCCTATTGCTGATCACATTTCAGAAGCCTTATGGCTTTTAAAGAAG
GCTCATGTGATTATCCATCAGACAAAGGAGGAAATCATTTATGGCTTGGG
GATATTTTTTTCCAAAGCTTACTTTTTTAAAGGAGCTATCCTTAGTCAAC
CAACCAATAGCCAATACCTTTATCAATTAGTAGGCGAAGATAAAAGAGCG
CTTTTAAGGGTTATCATAAACCATTTAGTGCTGCAAATGGATCAGGAAAC
GGATTTCAGTCAGCAGTTGAGTGACGACGTTTTAGCATTGTTGATTTTTT
CCATTGAGCGCCACCATGAGCCTCTTTTAGTAGGGCTTGCCTTGGGGCAA
AATAAGGTGGAAGCAGCCATTGCGGAATTGGCCATTAGACGTCATTTGGG
GCATCGTAGGGATTTTCAATTAATGCCCTATGATCATCAGAAAGTTTATG
ATTGTCTGATTACCTATCAGACTGTCTGTTTACCGAGACAAGATTTACCC
TATTACCGGTTAAAACAGTATAGCTCCCCCTATGAACTCACTGCTTTAGA
AGCTTTTCTCAAAGACCTTTTCCAGCAAAAAAATACACGAGAAGAGGAAC
TCTCACTCAGCCCAGCAGCTAAGTCTAGTTTTGCACACAAAACTGTGTGA
>M5005_Spy1061 transcriptional regulator, LacI family
ATGATGACATCTAAAATTACCATTAAAGATATTGCACGAGAAGCCGGGGT
TTCTGTGGCGACCGTATCTTACGTGTTAAACCAGCGCAATGATCAAAAAA
TCAGCGAAGAAACCCGCAATAAAGTGCTACATATTAGTAACCTTCTTAAC
TATACACCTAATCAGGCAGCCAGGTCATTAGTCACACAACAATCAAACAG
TGTTGTCCTGTATTACAAATATGCAGATAGCATTTTAGCTAGGGCTGAAC
AACTGCATACCATTAGCTTTCTATCCCGCCTATTGCATGAGCAGGACTAT
CAGCTGGTTTGCCTAAATGAAGATAGCACTGAAAAATTTGACTGGGCAGA
CCTTATTCTGACCTTGGACGTTGATAATGATACCTTTTACAAAATTGGAA
AGCTTAATTTCAAACCCTTAATTGCCATTGATAGCTTTGTTAATGATCCC
CTCTTCTTTCAAATTAATACAGATTATGCTGCTCTCAAAGATCAGGCTAA
TCAGTTTTTTAAGGATGAACCTTATACCCTGCTTTCCTTGCCTATCACTA
ATCGTGAGCGATATGAGCATGTTTCTGCCTTCTTTCCAAGTTTGCACATT
GTAAACGACCTAAGAGAGCTAACCTACTTTGAAAAGGAAAATCTTTTACT
CATTGATGAGAGTTTGGATCAATTCTTTGTGAACTCTTCGCAAAAACTCT
GCTGCCCACGTTTTTCCCCCAAAAAAGGGCAAGTTATCTTAGAGACCATC
GAATGGGCCAAAAAACGCCAGCCTGATAAAAAACATAACCTTCTGGTGTA
A
>M5005_Spy1785 trehalose operon transcriptional repressor
ATGACAAAGTATGAACGTATTTATAAAGACCTCGAAACAAAAATAAACAA
AGACTTTTACAAAGAAGGGGATTTTTTACCTACTGAAATAGAATTGAGTC
AACAATACCAAGCTAGCCGAGATACCGTCCGCAAGGCTCTCTCACTTCTC
ACAAAGGCAGGTCTTATCCTCAAAAAACAAGGACGTGGCACCCAAGTGAT
TAGACATCATCAGATCATGTTCCCTATCTCAGAACTAACTAGTTATCAGG
AACTCGTCTCTTACTCAAATCTAGATTCTAAGACCAACGTCATTGCCATT
GATAAACTGATTGTGGATGAGACACTTTCAAAATTGACCGGTTTTAGCAA
AAACAGCTTGGTCTGGCGTGTTACACGCCAACGCGTTGTTGAGGGTGTGG
CTTCCGTCTTAGACATTGATTACCTTAGTAAAACTTTGGTGCCAATAATG
ACAAGGGAAATCGCAGAGCATTCTATTTATCAATATTTGGAAAAGGAACT
CCATCTCGCCATTGACTTTGCCCTCAAAGAGGTTACCATTGACCAAATAA
CCGATCGTGATAAAATTTTACTTGACCTTGGATCAGACCAACATGTTGTT
TCCGTCAAATCCAAAGTCTACCTTTCCAATAATAACCAATTCCAATTCAC
CGAGAGTCGCCATAAACTGGAAAAATTTAAATTTTTAGATTTTGCTCGGC
GCAGACCAAAATAA
>M5005_Spy1447 phage-related DNA helicase
GTGAGACTGCACGAGTATCAGGAATACGCTAAGACATGGATAGTAGAGCA
CCCTTATTGCGGCCTTTTACTTGACATGGGCCTTGGTAAAACGCTGACAA
CACTATCGGCGATAGATGAGATTCAAAATATTTTTTCCGAGGATCATAAG
ATTTTAATCGTAGCCCCTAAAAAAGTGGCGGAAGAAACGTGGCCTACGGA
GATTGAGAAATGGCATTTTGATTTCACCTACTCTAAAGTTTTGGGGAGCG
AGGGAAAACGAATTGAGGCGTTAGAAACAGAAGCTGATATCTATTTGATT
AATCGTGAGAATGTTACCTGGCTTGTTGAATACTACAAGACTAAATGGCC
GTTTACCTTTGTGGTTATTGATGAGCTGTCAAGCTTTAAGTCTAGTAAGT
CAAAACGGTTTAGGGCTTTGCGAAAAGTTAGACCGAAAGTCCAACGCCTT
GTAGGACTAACAGGAACCCCAGCGCCTAACAGTTTGATTGATTTGTGGCC
GCAGATTTATCTGATGGACAGAGGCGACAGGCTTGAGACTAGCCAGACTC
GATTTAAAGACAAGTATTTTGTTCCTGATAAGCGTAATGGTCCAATCATT
TACAGTTGGGCGCTTAGGGATGGCGCAGAAGCAGAAATCTATAACAAGAT
TGAGGACATCTGTGTCAGCATGAAAGCTAAAGACTATCTCAAGTTACCGC
CGCGAACCAACAACGTTGTATCAGTTAAGTTATCTAATATGAAAGCTTAC
AAACAGCTTGAAGCTGATTTGGTGTTGGAGTTTAAGGATAAGGAAATATC
TGCGGCTAACTCTGCGGTCTTGGCCAATAAATTACTTCAAATGGCTAATG
GTGCTATCTATGATGATGATAAATCAACAGTTGCTATACACGATGACAAA
CTTGACGCGCTTGAGGACATAGTAGAAGAAAGCCAAGGCCAGCCAATCTT
AGTTTTTTATCAGTATCAACATGATTTTGAAAGACTTAAGAAACGATTCC
CTCAGGCTGAAGAGTTGACGTCAGTTGACAAGTGGAATTCCGGGAAAATA
CCAATTCTTCTGTGTCACCCTCAATCAGCTGGGCATGGGCTTAATCTACA
AAAAGGCGGGCATATTATTGTTTGGTTTGGGCTAACGTGGAGTCTTGAAT
ATTATCAGCAAGCTAATGCCAGATTAGATAGACAAGGGCAGACAGAACCC
GTTATTGTGCACCACATTGTTGCAGAAAATACAGTTGATGAAAAAGTACT
TAGGATTTTACAAGGCAAAGAAAAAAATCAGAACGCCTTACTCGAAGCAG
TTAAGGCGCAGTTAGGAGTCTAG
>M5005_Spy0917 transcriptional regulator, GntR family
ATGTTACCAGCTTATATAAAAATTCATGATGCAATTAAAAAAGACATTGA
TCTGGGCATCTGGCCAATTGGTAGTCGCTTACCAAGTGAACGACATTTAG
CGGAACATTTCACCGTTAGTCGAATGACTCTACGGCAGGCTATTACATTA
CTAGTAGAAGAAGGGATTCTTGAAAGGCGGATAGGAAGTGGTACTTATGT
TGCCAGTCATCGTGTTCAAGAAAAAATGCGAGGAACAACAAGTTTCACAG
AAATTATACGCTCCCAAGGACGACAACCCTCCTCTAAATTATTATCCTAT
CAAAAGCAATTAGCTAGTGATACCGAAGTTAAAGAATTGAACTTAGACAA
AACAGACTTGGTCATTCGAATGGAACGTATCCGCTATGCAGACAGTGTCC
CTTTGGTGTACGAAATTGCTTCAATCCCAGAAAAATTTATAAAAACGGTT
AAACGAGCTGATATTACAGAACACTTTTTTCACTCATTGATAGCAAATGG
TTACGAGATTGGTAAAAGTAAACAGACAATCTACGCTAAGCTAGCAAGTG
AGCGTGTAGCCTCCTACTTGGAAGTTGCTAAAGGACATGCCATTTTGGCT
CTAACTCAGGTGTCTTACTTTACAGACGGCAAACCTTTTGAGTATGTCCG
CAGTCAGTATATCGGTGACCGTTTTGAATTTTACTTAGAAAATAATTAG
>M5005_Spy0440 transcriptional regulator
ATGAAATCAAAACTTGGTGCCACACTTAGAAAAGTTCGAAAAGGAAAGCA
AATTAGTCTGTGCTTCGTGGCAGATGAACACCTTTCAAAATCACAAATCT
CTCGTTTTGAGCGCGGGGAGTCAGAGATATCGTGTATCCGACTGATCAAT
ATTCTAGACAAATTACACATTACTTTGGATGAGTTTCTTATTTTACATGA
TGAAGACTATACCAATTCCGAAACATTTGCTAACCTGGTACAGTATATTC
GTAAGCAATATTCATCACAAAATATCAATAATATAGCATGTTTACTTTCC
GACACTTCTGATTACACTCTGAATTCTTTTGAGAAAACAATGGTAAAGTC
CATTTTACACACAATGGATTCAAGCATCATTCCATCAGATGATGAATTAC
TTCAACTAACAGATTATCTCTTTAAAGTTGAAAAATGGGGCTACTATGAA
ATCCTTTTGTTGGGTAACTGTGTACGAACAATTAACTACAACTCCTACTT
CCTATTGACAAAGGAGATGTTAAATAATTACATTTACTCTTCACGGAACA
AAACTAATAAACGAATTGTCACTCAGCTTGCTATAAATTGTTTCATTCTT
AGTATCAATAAGGAGGAATTTTCTAATTGCTCCTATTTAATTGATGAGAT
AAAAACCTTGTTAGATAATGAATTAAACTTCTATGAACAGACAGTTTTTC
TCTATGCAACAGGTTACTTTGAATTTAAGCGCCAATTAGAAACTGGAGTT
GAAAAGATGAAACAAGCCATACAAGTTCTTGATATTTTAAATGAAGACAA
GTTAAAATTACATTACGCTGACCATTTTGATAAACTAGTCAACAAAGATT
AA
>M5005_Spy0929 SIR2 family protein
GTGAGTAATTGGACAACCTATCCTCAGAAAAACCTCACCCAGGCAGAACA
ACTGGCCCAATTAATCAAAGAAGCAGATGCACTTGTAGTTGGTATTGGAG
CTGGCATGTCTGCAGCTGATGGTTTTACTTATATCGGGTCGCGTTTTGAG
ACGGCATTCCCAGATTTTATTGCTAAGTATCAGTTTTTGGATATGCTGCA
AGCTAGCCTTTTTGATTTTGAAGATTGGCAAGAATATTGGGCTTTTCAAA
GTCGCTTTGTCGCTTTGAATTATCTTGATCAGCCCGTAGGCCAGTCTTAT
CTTGATTTAAAAGAGATTTTGGGAACCAAAGACTATCATATTATTACTAC
TAATGCTGATAATGCTTTTTGGGTGGCTGGTTATGATCCTCATAACATTT
TTCACATTCAAGGAGAATATGGTTTGTGGCAATGTAGCCAGCACTGCCAT
CAGCAAACTTATAAGGACGATACGGTCATCCGTCAAATGATCGCAGAGCA
AAAAAACATGAAAGTCCCAGGTCAACTGATTCCTCATTGCCCTGAATGTG
AGGCGCCTTTTGAAATCAATAAGCGTAATGAAGAAAAAGGAATGGTTGAA
GATGCTGACTTTCATGCCCAAAAAGCACGTTATGAGGCTTTTTTATCAGA
ACATAAAGAGGGTAAAGTGCTTTATCTAGAAATTGGTGTGGGACATACGA
CGCCTCAGTTTATCAAACACCCCTTTTGGAAACGTGTCTCAGAAAATCCT
AATGCCTTATTCGTTACCTTGAATCACAAACATTACCGCATCCCTCTGTC
AATAAGGCGACAAAGCCTAGAACTGACAGAACACATTGCACAATTGATTA
GCGCCACAAAAACCATTTACCAAAAATCGTAA
>M5005_Spy0636 transcriptional regulator, LysR family
ATGAATATTCAACAATTACGCTATGTGGTAGCCATCGCTAATAATGGAAC
TTTTCGAGAAGCTGCCTCTAAATTGTTTGTCAGTCAGCCTAGCTTATCAG
TTTCTATCAAAGATTTAGAGGCGGAATTAGGGTTTCAAATTTTTAATCGG
ACTACTTCAGGAACAGTCTTGACAAGTCAAGGACTAGTTTTTTATGAGAA
AGCTTTAGAAGTAGTCAAGTCTTTTGATTCTTTTGAAAAAACCTTTTCTC
AAGCTGATCTGGATCAAAATGAATTTTCTATTGCTAGCCAACATTATGAC
TTTTTGCCACCTCTTATTACAGCTTTTTCGCAACAATACGATGGTCATCG
TGTCTTTCGTATCTTTGAATCAACAACTATTCAAATTTTAGATGAAGTTG
CTCAAGGAAACAGTGAAATTGGTATTATTTACTTGAATGTAGACAATCAA
AAAGGTCTCTTTCAGCGGATGGATAAGCTGGGCTTAGAATATGTTTCTCT
AATTCCTTTTACTACTCATATTTATCTTTCAAAAACGCATCCATTGGCTA
ATCGCGAAGCGCTTTATTTGAACGATATTCAAGGATTACCTGCGGTAAGG
TTTACCCAAGAAAGGGACGAGTATTTGTATTATTCTGAAAATTTTGTGGA
TACTAGTGAATGCCCTCGTATTTATAATGTGTCAGATAGGGCAACCTTGA
ACGGTATTTTAGAGAGAACCAATGCCTTTGCGACAGGATCAGGTTTTCTC
GATCATCGGAGTGTTAATGGGATTAAAGTGATACCTCTAGCTGATCATAT
TGACAATCAAATGATTTATGTCAAACGAAAAGATAAAAACCTTTCTGTTG
CTGGGGCCACTTTTGTGACTATTTTAAAAGACTATTTTGATAAAAGAAGG
AAGGCCTTAACATGA
>M5005_Spy1464 phage transcriptional regulator, Cro/CI family
ATGCTTTTTTATAGATATTTTTTGTCATCTCATAGAAAGGCTGACAAATC
AATGTTTTCAACATTCGAAAGAATTAAAGAACTTGCAAAATCAAGAGGTA
TTTCCTTGGGATTGCTTGAGGAAAAATTGGGATTGAGTAGAAATTCAATC
TATACAATTAAAAATAAAAAGCCTTCAGCAGAAAGACTACAACTAATCGC
TGACTACTTTCACGTATCAACCGATTACCTATTAGGTCGAACTGATAATC
CTAAGATTGCGCAAGATGGGCACGCTTCGGTCGCAATTGATCTAAAAAAA
GATGCAGAAGAGACTTTCTTCTTCGACGGTCACGAACTCAACGACGAGGA
TATAGACCTTATCACATCTATATTGGAAACGCGCATCAAAAATAGAAAAT
AG
>M5005_Spy1274 acetyltransferase
ATGGCAGATAAATTTGATGCCAATGACGAAACAAGAACGGTTTATGCAGT
CGTTTATGACAATGACCAGCCCGTTTCAACAGGACAATTTTTAGCTGAAA
CGAAAATAGAAGCACGATTGACACGCATTGTAACCTTAGCAGATTATTGT
GGTTGCGGTTATGGTGCCAAAGTCACTGAAGCGCTCGAAACTTATACCAG
ACGAGAAGGCTTTTACCAACTAACCATTCACAGTGAACTGACAGCACAAA
CCTTTTATGAAAACCTAGGTTATCAGTCCTATGGTCCCAAGTGTTTAGAA
GATGGTGAGTATTGTCAGTCCCTTGCAAAAACCATTCTTAAATGGGAGAA
GAATATGGACATAGCAATGCTAATTGCGATTGTTGGTGGTCTATTAGGCT
GCTATCTCTATCTCACAAAAAATAATTAA
>M5005_Spy1364 ATP-dependent RNA helicase
ATGTCATTTAAAGATTATCATTTTAAGCAATACGTTCAGCAAGCGCTGGA
AGAAATTGGCTTTGTCAATCCAACAGAGGTCCAGAAGCGGCTGATTCCTA
TTGTTAACTCCGGTCGTGACTTAGTTGGGGAATCAAAAACAGGTTCAGGG
AAAACCCACACCTTTTTGTTGCCCATTTTTGAAAAACTTGATGAAGCTAA
AGCAGAAGTGCAAGTCGTTATTACAGCACCTAGCCGTGAATTAGCAACTC
AAATTTTTGATGCTTGTAAACAGATTGCTAAGCACTTCCAAGAAGAGATT
CGTTTGGCCAACTATGTTGGAGGCACAGACAAACTCCGTCAGATTGAAAA
ACTAAAAGACAGCCAGCCGCATATTGTCATCGGGACCCCAGGTCGTATTT
ATGACTTGGTCAAGTCTGGTGATTTAGCGATTCATAAAGCAACGACCTTT
GTTGTGGATGAGGCCGATATGACCATGGACATGGGCTTTTTGGATACGGT
AGATAAGATTGCAGCTTCGCTTCCAAAATCTGTTCAGATTTTGGTGTTCT
CAGCAACTATTCCACAGAAATTACAACCCTTTTTGAAAAAATACTTGACC
AATCCTGTTATTGAACAAATCAAGACAAAGACCGTTATCGCAGATACCAT
TGATAACTGGCTTGTGTCGACAAAAGGGCGTGATAAGAATGGTCAACTGT
TAGAGATTCTCAAAACCATGCAGCCTTATATGGCTATGCTTTTTGTCAAT
ACCAAGGAACGCGCAGATGATTTGCATGCCTTTTTAACAGCTAATGGCTT
AAAAGTGGCTAAGATTCATGGGGGCATTCCTCCAAGAGAACGTAAGCGCA
TCATGAACCAAGTCAAAAAACTGGACTTTGAATACATTGTTGCCACAGAC
TTAGCAGCGCGTGGGATTGACATTGAAGGGGTCAGCCATGTGATCAATGA
CGCCATCCCACAAGACTTGTCTTTCTTTGTCCATCGTGTAGGCCGAACAG
GTCGAAATGGTATGGCAGGAACTGCCATTACACTTTACCAGCCAAGTGAC
GACTCAGATATCAAAGAGCTGGAAAAAATGGGGATTGCCTTTACACCGAA
GGTGCTCAAAAATGGAGAATTTCAAGATACCTATGACCGTGATCGCCGTC
AAAACCGTGAAAAAGCCTATCAAAAATTAGACACAGAAATGATTGGTTTG
GTCAAAAAGAAAAAGAAAAAAGTCAAACCAGGTTACAAGAAAAAAATTCA
GTGGGCGGTTGATGAAAAACGTCGCAAAGAACGTCGTGCTGAAAATCGTG
CTAAGGGCCGCGCTGAGCGTAAGGCCAAAAAACAACATTTTTAA
>M5005_Spy1219 phage transcriptional regulator, Cro/CI family
GTGTTTATAACATTTGAAAGGATAAAAGAACTTGCTAAAAAACAAGGTCT
TTCAATAAATTCTCTAGAAGAAAAGATGGGGTATAGTCGAAATACCATCT
ATGCTTTAAAACGAAACAAACCAGGTTCTGAAAAATTACAAGAGATTGCA
GACTATTTCCACGTCTCAACAGATTACTTGCTTGGTCGCACTGATAACCC
TGCAATTGCAAAAGATAACCAAGAATACACTTCTGAAGATCTACGAAAAA
TGGCCAAAAACGCCAAAACGTTCGATGGTAAGCCGCTTACTGAATCAGAT
ATTGAAGCAATACAAAATATTATTGAAATTTACTTGAAGGGAAGATAG
>M5005_Spy0991 transcriptional regulator, GntR family
ATGTCTTGGAAATTTGAGGAAAAATCTCCTATTTATGCGCAGATAGCACA
ACATGTCATGATGCAAATTATTAGCCAAGAAATCAAGAGTGGTGATCAAC
TTCCAACTGTTCGTGAATATGCAGAAATCGCAGGTGTTAATCCTAACACC
ATGCAACGAGCGTTTACAGAACTTGAACGGGAAGGAATGGTTTATTCGCA
ACGTACTGCTGGCCGTTTTGTAACTGACGATCAAAAATTAATTGCTCGTA
AAAGACGAGAGTTAGCAATTAGTGAATTAGAATCATTTATCACCAATATG
ACAAAAATGGGATTTAGTCACACTGAGATTATCCCTGTTTTGACGAGCTT
TTTAAAGGAGGATTCACAATAA
>M5005_Spy0309 hypothetical cytosolic protein
ATGACGTATTTGTCACAGATAGAAGCGCTGCTATTTGTTGCAGGTGAAGA
AGGATTAAGTTTGCGACATCTAGCGTCTATGTTATCATTAACGCCAACAG
CTCTTCAACAGCAATTAGAAAAACTCTCTCAAAAGTATGAAAAAGATCAA
CATTCTAGTCTTTGCTTGATAGAAACAGCTAATACCTACAGGCTAGTAAC
TAAAGAAGGTTTTGCAGAACTCTTGCGTGCTTATGCCAAAACACCAATGA
ACCAAAGTTTATCTCGTGCGAGTTTAGAGGTCTTGTCTATTGTTGCATAC
AAACAACCTATTACACGAATAGAAATTGATGACATTCGAGGGGTAAACTC
CAGTGGAGCTTTGAGTAAATTATTGGCATTTGATCTCATTAGAGAAGCTG
GCAAAAAAGATGTGGTTGGGCGTCCTCATTTGTATGCGACAACAGATTAT
TTTCTGGACTATATGGGAATTAATCATTTAGACGAATTGATTGAAGTATC
TGCCGTTGAACCAGCAGATGAAGAGATTGCTCTTTTTAGGACACAAGACT
GA
>M5005_Spy0219 transcriptional regulator, RpiR family
ATGCCTAAAAACCACCGCCTAATTACCAAAATCGAAGCATCATTGGAACA
TATGACCAGTTTAGAAAAAGGGATTGCTCATTTTTTTATTACAACCGATC
TGACACCTCAAGAGTTGACCGCATCCGAGATAGTTAAGCGACTACACATC
TCTCAAGCCGCCTTGACTCGATTTGCAAAAAAATGTGGTTTTACTGGTTA
TCGTGCTTTTGCCTTTGATTACCTTCACAGTCTTCAAGAATCACAAGAGA
CTTTCCAATCTATTCACTTAGAATTGACAAAGCGCGTGCTGATGGACTAC
GACGCTCTTATTAATAAAACCTATGAGCTCGTTAATGAGGAAAAATTACT
GAACTTAGCCAAGCTGATCGATTCTTCTGAGCGAGTCTATTTCTTTGGCA
AAGGATCTTCTGGACTAGTAGCAAGAGAAATGAAGCTACGCTTTATGCGA
CTTGGTTTAATCTGTGATGCTTATTCAGACACTGATGGTTTTACTTGGGC
AAATAGCCTCGTCAATGAAAATTGCCTTGTTTTTGGTTTTTCTTTATCTG
GCAAAACAAACTCTGTCATCACAGCACTTCATCAAGCTAGTCAGCGAGGA
GCCAAAACTGTCCTCTTAACAACAGATAATCAAACCGAATTTGACGACTC
CTTAGATATTATTCCCGTATCATCAACTCACCAACTACATTATGGGAATC
GTGTGTCACCACAATTTCCTCTTCTTATTATGATGGACATTATTTATGCT
TACGTTTTAGCGATTGACAAACCGCACAAAGAAAAAATCTTCAAAAACAC
TATTATTGACAAAGAAAATAACGACCTTTAG
>M5005_Spy0886 transcriptional regulator, LysR family
TTGTCCCAAGGAAAAATCGATATTGGTCTCCTCTCCTTTCTAAGTATTCG
AAAGGATATTACCATTGAGCTATTACAAACGTCCACAAAAGGCTATAAGG
TCAGTATCGTTCTCCTCAAACAGCACCCTTTGGCGCAACATCCTCAGTTA
AAACTTAAAGATTTAAAAGGCTATAAGATTGCTTCTTTAAACGATCACTA
CATGTTAGGCGAAATGCTTCCTAGAAAATGCCGAGCTCTCGGTTTTGAAC
CAGATATTGTCTTTAAACACAATGATTGGGAAGTTCTTATTCATAGTTTG
CACGATTTAAATACCTTGACTATCCTCCCGAGTGATTTTGAGAGTCTTAA
TCAGGTAGATAACTTAGTTTGGATTCCTTTGCAAGATAAAAATAATTTTT
ACCCTATTGGGATTGCTTACCGAGATGATGCGAGTTTCAGTCCAGTTATT
GAGGAATTTTTAAGCCTTTTAAAAACGAACTAG
>M5005_Spy1050 phage transcriptional repressor
TTGAAATTAGGGGAAATAATAAAAAATTTCAGGGAAGAAAAAAAGTTATC
AATGGATAGGTTTGCTGAAAAATCTGGTCTTACTAAGGGGTATATTTCAA
TGCTTGAAAAAAACGAGCATCCGAAATCTAAAAAACCAATTATCCCTACA
GAAGAAACTTTGTTAAAAGTAGCAAAAGGGATGGGGGTTGATATTGATTT
TGTTTTGAGTAAATTAGATTCCGATCAAGAAATACAGATTAATATTTCTC
CTAAGAATATGTTAAATATGGATAATCCCTCCACTCCCACCACCCCAAAA
GTCGAACTTATCCCATCTACTCTACAAAAAATAAACTCTACTTCTTCTCA
ACTAGAACACAGTAGACAGATAATTGTTTTAGATACAGCTGAGACTTTAT
TGGAACAACAGAAAGAAATTAAAAACAACGAAGATACTATTGCCGAATTA
TTTTCTTACAACTACTACGACCACGCAGCTTCAGCTGGTACAGGTCAGTA
TCTAAATGATGTACAAGTAGAAAAAATTGAGTTACCAGTCGATTATGACG
CAGACTTTGTTATCCCTGTTTATGGTGATTCCATGGAACCGAAGTATCAC
TCTGGGGATTATGTATTTGTTAAGCTATCCGTAGAGCTTACAGATGGCGA
TATAGGCGTCTTTGAATACTATGGTGACGCTTATATCAAACAGCTACTTA
TAAATGACGAGGGGGCATTTCTGCACAGTTTAAATAGCAAGTATGAAGAT
ATACCGATAGATAGAGATAGTGATTTTAGGATTATTGGTGAAGTTGTTGG
AAGTTATTCGGGAAATCATAGCTAA
>M5005_Spy0924 transcriptional regulator, GntR family
ATGACAACAAAATATCAAACAATCATTTCCAATATCGAACAAGATATCCA
GAAACAGCGACTAAAAAAAGGGGACAAGCTACCTTCAATTAGGGTACTAA
GTAAGGTTTATTATTGTAGCAAAGATACTGTTCAGCGGGCTCTTTTAGAA
TTAAAATATCGTCACTTAATTTATGCTGTTCCTAAAAGTGGTTATTATGT
TTTGGGTAACGTAAGCATGCCCGATAATGTTCTTAATCTAAGTCTTGAAG
ATTATAATAATATGGCTTATGAAGATTTCCGACTCTGCTTAAATGAGGCC
TTAAGTGCTAAAGACAAATACCTCTTTCATTATTATCACAAAACCGAAGG
ACTAGAAGAACTAAGGGAAGCTTTGCTTCTTTACTTAGCTGAAAATAGTG
TTTACAGTAACAAAGACCAACTATTAATCACCTCTGGGACGCAACAAGCG
CTTTATATTTTATCACAAATGCCTTTTCCTAATACGGGCAAAACAATTCT
CCTTGAAAAGCCTACTTATCATCGGATGGAAGCTATTGTTGCTCAGTTAG
GATTACCCTATCAAACTATCTCTAGACACTTTAATGGCCTTGATTTAGAA
CTCTTAGAATCTTTATTTCAAACTGGCGATATTAAATTTTTTTACACGAT
TTCACGATTTTCACATCCTCTGGGACTTTCTTATAGCACTAAGGAAAAGG
AAGCTATTGTTCGTCTAGCACAACGATACCAGGTTTATATTTTAGAAGAT
GATTATTTAGGAGATTTTGTGAAACTTAAAGAGCCACCAATTCATTATTA
TGACACTCATCACCGAATCATCTACCTAAAATCTTTTTCAATGAGTGTTT
TTCCTGCACTCCGTATCGGAGCTCTAGTTTTACCGTCAGGTTTAAAACCT
CATTTTTTAACCCAAAAATCATTGATTGATTTAGACACGAACTTACTAAT
GCAAAAAGCATTAGCTCTTTATTTAGAAAATGGGATGTTTCAAAAAAATC
TTCGCTTTATTAAGCGTTATCTAAAACAGCGGGAACGTCAATTGGCTCTC
TTTTTAAAACAAAATTGCCCTGATATTCACTATCAACTAACCCCTACTCA
TTTAGTGATTGATTACACGACATCAGACTCTTATAGAAACTTTACATTAG
ATAAATCTGATAGAATAATAATAACTGGAAAAAAACGCTATCTCTCTATT
ACTATCAATCAACAAATACAAAGCAAATTAAACTCACTAATCAAAAATAC
TTGTGGAAAGAGCAACTAA
>M5005_Spy1495 transcriptional regulator,MarR family
TTGGAATATGACAAAATTAACCAATACTTAGTTGATATTTTCAACCGGAT
TTTGGTTATTGAAGAAATGAGCTTAAAGACGAGTCAGTTTAGTGATGTCT
CTTTAAAAGAGATGCACACTATTGAAATTATCGGCAAATATGATCAGGTG
ACTCCAAGTGATATCGCCAGAGAATTAATGGTAACGTTAGGGACAGTAAC
CACTAGCTTAAATAAATTAGAAGCAAAAGGTTATATCGCAAGAACGCGAT
CACGCTCAGATAGGCGAGTTGTTTACCTGTCATTAACAAAAAGGGGTCGA
CTTTTGGACCGCCTCCATGCAAAGTTCCATAAAAATATGGTTGGACATGT
CATTGCTGATATGAGTGATGAAGAGATGCAGGCATTGGTGCGTGGACTAG
GGAATCTACATCAATTTTTGGAGGATTTGGTTTAA
>M5005_Spy1024 phage protein
TTGGCAAGAGCAAATAAGGCAAAAATGCTTGATGCTATTGAGTTTAAATT
ATTAAATCCAACCGCTAATCAAGCACAAGTTGCGGAAATAATCGGTATCA
CAGACAGACAGCTACGAAATTGGGAAAATGACCCAGAAGATAAATCGGGT
TGGAATAAATTAAACGATGAAATCGCAGAAAAAGCTTTTGGCAAATATGC
TCTTTCTGCGATTGGAACGCTTGTTAATCTAAGCAAAAACGCAAAATCAG
AATTGGTAAGACTACAAGCTTCTCAAGATATCCTTGACCGAGCAGGTTAT
AAACCGACAGACAAGCAGGAAATCAGCATAGACGAGCCTATCGTACTTGC
TAATTCATGGGTGCAAGACAATGGTAGTTGA
>M5005_Spy1213 phage protein
ATGTGGGGTAAAATCGAAGCTCTATTAATTGAGAAAAAAATGACCAAATA
TGAACTGTCACAAAAGGCTGGATTGAACCAAAATTGCTTGATTGATCTAA
AGAAAGGAAGAAAAAAATCATTGAAATTTGATGATGTCGTTAAAATCGCC
GATGTCTTAGGTGTCAGCTTGGACGAATTCAGATAA
>M5005_Spy0195 transcriptional regulator, MarR family
ATGTCACAAGTGATAGGTGATTTACGTGAATTGATACATCAAATCGAACA
AATTAGTGATGAGATTGCAAAAAAATATGATGTAGAGCATCTAGCAGGTC
CTCAAGGTTATGTTCTTGTTTTTTTAGCTAAACACCAAAATCAAGAAATA
TTTGTCAAAGATATTGAAAAACAACTTCGTATCTCAAAGTCAGTTGCTAG
TCATTTAGTGAAACGTATGGTCAAAAATGGGTTTATCAATGTGATGCCTT
CCCAAGTGGATAAGCGTTATAAGCAAGTAGTGTTAGCGCAGGTTGGTAGA
GATAAATTGCCTTTGTTGCGGGAGTGTCGTAAGGATATCGAGCACTATTT
TTTAAAAGAAATTACAAAAGAAGAGTTGCTGACAGCGAAAAAAGTAATTG
AACAGCTCAAGCAAAATATGCTAACTTATAAAGGAGACAACGATGCTTAA
>M5005_Spy1045 transcriptional regulator
ATGACGAGGTTTGCAATTCAAAGATTGCGTGAAGAAAAGAAAATGTCTCA
AGAAGAGCTAGCCAATAAATCTGGAGTCTCACGAACTACTATATCTCTTA
TTGAAACCGATAAATCTACTACGGTTAAGCTAAGCACTCTTCAAAAATTG
GCAGTCGCTTTAGACGTACCTATTGGATATTTTTTTAAACATAATGTTTA
A
>M5005_Spy0284 putative regulatory protein
GTGCGTTGTCCAAAATGTAATTACCATAAATCGAGTGTTGTTGACAGTAG
ACAAGCTGAAGACGGCAACACCATTCGTCGTCGAAGAGAATGTGAACAGT
GTCATACTCGCTTTACTACCTTTGAGCGTGTTGAAGAACTCCCTTTATTA
GTCATCAAAAAAGATGGCACACGAGAGCAATTTTCTAGAGATAAAATATT
AAATGGGGTTGTTCAAAGTGCGCAAAAACGACCTGTCTCGAGCACAGATA
TTGAAAATGTCATTTCTCGTATTGAACAAGAAGTTCGAACAACCTACGAA
AATGAAGTGTCAAGTACTGCTATTGGTAATTTAGTGATGGATGAGTTGGC
CGAACTCGATGAAATCACATATGTACGCTTTGCTAGTGTCTACAAGAGTT
TCAAGGACGTTGATGAAATCGAAGAACTTTTGCAACAAATTACGAATCGC
GTACGCGGAAAGAAAAAACGTTTAAATAATGATGAAACCAATTGA
>M5005_Spy0680 two-component response regulator
ATGAAAATTTTGTTAGCTGAAGACGAATGGCAGATGTCTAATGTTTTGAC
AACTGCCATGACTCATCAAGGTTATGACGTTGATGTGGTTTTTAACGGTC
AAGAGGCAATTGATAAAGCCAAAGACAATGCATATGATATTATGATTTTA
GATATCATGATGCCGATTAAGTCTGGCATTGAGGCTTTAAAGGAGATTCG
CGCTTCAGGAAATTGCTCACATATTATTATGCTGACGGCTATGGCAGAAA
TTAATGACCGTGTTACCGGACTAGATGCGGGAGCTGATGATTATCTGACT
AAACCTTTCTCATTAAAAGAACTTTTAGCTAGATTAAGGTCGATGGAAAG
ACGAGTAGAAAGTTTTACTCCTCAGGTATTACAATTTGCTGGTGTCACAT
TAAATATTAATGAGCAAGAATTGAGTGCCGGTAATGCTATACGATTAGCT
TCTAAAGAAGGTAAATTAATGGCCTTTTTAATGTTAAATCAAGGAAAGTA
CTTGGATACTAAAACGCTTTACCAACATGTTTGGTCAGACCAAGAAGATT
ATGATACTTCTATTGTTTGGGTTTATATTTCTTATCTTCGTCAAAAATTA
TTAGCTATTCAAGCAAATGTCATTATTGCAGGTGATAAAGATACTAGCTA
TTGTTTATTAGAAAAATAG
>M5005_Spy0970 NAD-dependent K+ or Na+ uptake system component
GTGATAAGTCCTAAAAAAGAGATAACAAGTTCAAAATATCAAAAAATTGC
TATTTCAGTAGCTCAGCGTATCGCAAATGGCGAATATGAAGTGGGCGAAA
AGTTAAAGTCAAGAACTACTATCGCCTCGACATTTAATGTATCACCAGAA
ACGGCTCGTAAAGGCCTGAATATTTTAGCTGACTTGAAAATTTTGACTTT
AAAACATGGTAGTGGAGCTATTGTGCTGTCAAAAGAAAGAGCTATTGAGT
TTATAAATCAATACGAATCAACCCATTCCATCGCTGTTTTAAAAGAAAAA
ATACGTGAGACTATTAATGATCAGGGAAAAGCAATGGAAAAAATGGCTGT
TTTGGTTAATGATTTTTTAATGCAAAGTCAATCTGTTAGTAAGCAATACC
CATTAGCACCTTATGAGATTATTTGTAATCAAGATTCGGAACATTTTGGC
AAATCTATTGGTGTGTTAAATATCTGGCACCAGACAGGAGCAACTATCGT
CGCTATTGAACATGCTGGTCAGTTTATCGTTTCACCAGGTCCTTATTCTG
TTATTGAAAAAGGCGATCATATTTATTTCGTTGGTGATGAGTCAGTCATT
TCACGAATGAAGACCTTTTTTAATTTACGAAAAGGATTATAA
>M5005_Spy1343 transcriptional regulators, LysR family
TTGGATATTAAACAAATTCGTTATTTTATCGCAATCGTTGAAAATCATTT
TAACTTGAGCCAGGCGGCGGAACTGTTGTATGTGTCGCAGCCGACACTTA
GCATGATGATCAATGATTTTGAAAAAAGAGAAAATGTTAAGCTCTTCAAA
CGAAAAAGAGGTCGTATTATTGGGTTAACCTATCTTGGTGATAATTATTA
TAAGGACGCTCAAAAGGTTCTCAGTCTCTATGATGACATGTTTTTGAAAT
TGCATGATCACAGTAAAGGGTTAAAGGGAAGTATCAATATTGGTATTCCT
CCTCTTATTTTATCAGTTGTTTTCTCAGAAGTAATGCCAAAACTGATTTT
AGAAAATCCGGGGATTCAATTCAATGTTAAGGAGATTGGTGCTTACCAAC
TAAAAAATGAACTACTCGTGGGAAATGTTGACGTCGCAGTCTTGTTATCC
CCAACAGGCATCGCTGATAATTTGGTTGAGACTTATGAAATCCAGAGATC
AGAATTATCTGTATGCCTGTCTCCACGCCATCGTTTAGCTTCCAAAAAAG
TTATTCAGTGGGAAGATTTAACAGATGAACAACTTGCCCTATTTGATCCT
AGTTTCACGGTTCACCATTTAGTGCTTGAAGCTTGCGAGCGTCACCAAGT
CAGACCTAATATTATTTTGACGTCCTCTTCCTGGGATTTTATGCTTAATT
CTACCAAGATTAATCACAACGTCTTAACTATTTGTCCCAAACCTATTACA
GAATTATACCAATTAAAGGACATTAAGTGTATTCCAATGGAACGTCCCAT
TTCTTGGCGTGTTGTCTTAACACGCCTCCGGAAAAAAAGTTATTCTGAAA
TAGAAGCCTACATCATGGACGACTTGCTACAGTCTTTTTTTAAGTAG
>M5005_Spy1558 transcriptional regulator
ATGGAAATTGGTCAGCAAATTATTCGCTACCGTAAACAACAAGCGCTCTC
GCAAGAAAAATTAGCCGAGAAAGTCTATGTAAGCCGTCAGAGCATATCTA
ACTGGGAAAATGACAAAACTTACCCAGACATCCATAGCCTCTTACTCCTA
AGTCAAATTTTTCAAGTGAGCTTAGACCAACTCATTAAAGGAGACATTGA
GAAAATGAAATATACCATCACTCAGGTTGATAAAAAGAATTTTAAACGAG
ATACCAAAGTAATGGTAACATTGATGATACTATTAATGATTTCAAGTTAT
CCATTAGTCTATTTCTTAGAGTGGCTAGGACTTGGCATTTTTGTTTTATT
ATCGATAATTACTATGACTTATGCTAATCGTGTGGAACGTTTTAAGAAAA
AATATGATGTGCAACCTTATAAGGAAATCCTAGCTGTTTCAAATGGAAAA
TTATTAGACGAAATCGAAAAACGAGAAGAAAGAGCAACACTTCCTTATCA
GAAACCCCTTATTGTCACTGTATTTTTCCTCATTACTGTTGCTTTTGCTT
TTGCAAGTCGTTTTATGTTTACATGGTTATTCCATTGA
>M5005_Spy0451 transcriptional regulator
ATGAGATTTAGTTACAATAAATTATGGAAACTTCTTATTGATAAAGGTTG
GACCAAAACAAAGCTCAGGCAAGAAGCTGGGATTAGTTCTTCCACGATCG
CAAAATTGGGAAAAGGGGAAAATATCACTACTGATATTTTATTGGAAATT
TGTATTGCACTTGATTGTAAGATTGAAGATATAGTAGAAATTGTAGATAA
TAATATCTAG
>M5005_Spy1579 transcriptional regulator
ATGTCCGCCAAGAAAACTTTTTTTGCAAGTAATTTAAAGTACCTTAGATT
AAAAAAGAACATGGAACAATTAGAACTTGCTAATCTCCTAGGACGAAAAA
GCTCTTCTTCAATCAGTGAGTGGGAAAAAGGAAAATATACTCCAAAGTCT
GGTCTATTAAGTGATATTGCTGCTATCTTTGATGTTAGTTTAACCGCCCT
AATGGAAGAAGATTTAACCTTAGAAAATAAGGGAGTCTCTTATCAGTTGC
CACAACGAGAGTTAGCGATGATTTCAGAACAATTATCCGAAAATAACTAC
ACTAAGTGGGTTGACTTCGCACAAATTCTTTTAGAACAACAAGCTAAAGA
AGATCGTGAATTAGATAACCACTAA
>M5005_Spy0117 transcriptional regulator, LysR family
ATGAGTCACAAAACCTTTCAAGAGACGTTTGATAGTAATCCTAACATCTC
TATCAAAGCATTACATCGTCAAAACTTAGTAACTTTTGATAAAACCTTTA
TGATTAATCATCAGCTTACCACCTTATTTGAAGAAGCAAATAGTCTTCCT
GTAGTCAAATGTTATTCTGCCTCGTGGGATTTTTTATTAAATTGCACGCG
CTATTCCTCTTACCTAACAATCCTACCAAGACCTATTACTCATTTTGCTC
ATATGGACGGTTTAGTGGAGGTCCAACTGACCGAACATCCAAAATGGGAA
GTTGTTCTAGCCTCTCTCAAGCACAACAAAACAAGCCATTTAAAACATTA
TATCAAGCACACCATCTTAGATTATTTCATGAACCAGCGCTTCTAA
>M5005_Spy1648 transcriptional regulator, Cro/CI family
ATGAAGAACCTCAAATTAAAAGCAGCGCGTGCAGGCAAAGATTTGTCTCA
ACAAGCTCTAGCAGATTTGGTAGGCGTCTCCAGACAAACCATTGCGGCTG
TTGAAAAAGGTGATTACAACCCAACGATTAATCTTTGCATTGCCATTTGT
CGAGTGCTTGATAAGACTTTAGATGACCTTTTTTGGGAAGCTGATGATTC
TCGTTAA
>M5005_Spy0811 transcriptional regulator, Cro/CI family
ATGTATCCGCGTATTAGGAATTTGAGAGAAGATAACGATTTCACTCAAAA
GTTTGTTGCAAATTTACTTTCCTTCTCTCATGCAAATTATGCAAAAATTG
AGAGAGGAGAGGTTGCCTTAATGGCAGATGTTCTTGTGCAGTTTTATAAA
CTCTATAACGTCAGTATTGATTATTTATTAGGGCAAACAGATTATCCGTA
TCGTTTTCATAATAAATAA
>M5005_Spy1597 transcriptional regulator, MerR family
ATGAAAGAAAAAGAACTTAGACGCTCAATGGCTGTTTTTCCTATTGGAAC
GGTGATGACATTAACAGATCTCTCTGCGAGACAAATTCGCTATTATGAAG
ATCAAGGTTTAATTAAGCCTGAACGAACGCAAGGGAATCGGCGTATGTTT
TCCTTAAATGACATGGACCGACTTTTGGAAATTAAAGATTTTTTGTCTGA
GGGATTAAATATTGCAGCTATTAAACGCGAATATGTCGAGCGTCAAGGTA
AGTTAATGCAAAAACAAAAAGCTCTAACAGATGCAGATGTCAGACGGATC
TTACATGATGAAATGCTGACACAAAGCGGTTTTTCTACTCCCTCACAGCA
TATTGGTAATTTTCGTATTTAA
>M5005_Spy1264 ribose operon repressor
ATGCTAGGAAATATTTCAGACAGCGAAGCTCTTGAAGAAGAATACGTCCA
TGTCCTTCTTCAAAGCAATGCTGCTGGCATTATTACTACCCATGACTTTA
CAAAGCGGTATCCTACTCTTGCTATTCCAGTTGTAGTGGTAGATCGTGTT
GACCAAGAGACCCAGTACGGTGTCTTTTCAGATAATAGGACAGGGGGCTT
ATTGGCGGCTCAGACTGTCTGGCAAGCAGGGGCAAAAGAAGTTTTGTTAA
TAAGAGGTCCGCTGGATAATGCTGAAAACATTAATGAGCGGTTTGAAGCT
AGTTTTTCTTACCTTCAAAAACAAGACGTGACTATGTATGTGTGTGATAG
TCAGAATTTTGATTTTGAAAGTATTCAGCTAGAAGCTAGTTACAACCTCA
AGTGTTACCCAACAATAGACAGTATTATAGCACCTTCTGATATCCATGCT
ATTGCTTATATTCATGAACTGCATTCTCAAGGTAAAAAGATTCCTCAAGA
TGTTCAAATAATAGGTTATGATGACATTTTAATGAGTCAATTTATTTATC
CTTCTTTATCGACTATTCATCAATCCTCTTATTTGATGGGCCGTTATGCC
GCCGAATTAGTTTATACTATTGCTAGTCAATTAACTGTGAAAGCAAATCG
GATTAAATTGCCTGTTCACTACGTTGAGCGAGAAACAATAAGGAAAAGAT
AA
>M5005_Spy1581 transcriptional regulator, MerR family
ATGTCTCAATTCTATTCGACTGGAGAATTGGCCAACTTAGCTGGCGTTTC
TATTCGAACTGTCCAATACTATGACCAACGTGGGATTTTGATTCCGACAG
CATTGACAGCAGGTGGACGGCGACTCTATACGGATTCTGATTTAGAACAA
TTACGCATGATTTGCTTTCTGCGCGATTTGGGATTTTCCATTGAGCAGAT
TCGCAAAGTCTTAGCAGAGGAAAATGCAGCCCAGGTGCTGGAATTGCTTC
TAGTTGATCATATTGCGACTGCCAAGGAAGACTTGGCTGCAAAAGAGCAA
CAAGTTGACATAGCTGTCAAGATACTTGACAGACTTCGAAAACAAGACCC
CCAGTCACTAGATTTTCTGATGGACATTTCGCTTAGCATGAAAAATCAAA
AAGCTTGGAAAAAATTACAATGGAAGATGGGTATCAGTATATTTTTAGCC
ATTGTTTCATATGTAGGACTTATTTTACTATCTAGTTATCTGCAAAAATT
TTGGTTAGTTTATGTTGCTATGGGACTATTTCTACCAGGTTTCAGTTGGT
TGGTAATTTATTTTAGGAAGCAATTTATTTATCTCTGTCCCCATTGTCAT
CAGAAATTTGAACCTAGCTTTAATGAATTTGCCCTTGCAGGCCATACACC
ACGAACCAGAAAGTTAACCTGCTCCCATTGCCATCAAAAATCGTATTGCT
TGGAACTGGCAAAAGAGGACACTGTCTCAAGAAGATAA
>M5005_Spy1311 glucokinase
ATGAGCTTGTTATGTATTGATATAGGAGGCACTTCCCTTAAATTTGCCCT
CTGTCACAATGGCCAATTAAGCCAGCAAAGCAGCTTTCCCACTCCCTCTA
GTCTGGAAAAGTTTTACCAATTACTCGACCAAGAAGTTGCTCGTTACTCT
GCTTACCATTTCTCAGGTATTGCCATCAGTTCACCTGGGGCAGTCAATAA
AGAAAAGGGGGTTATCGAAGGCGCCAGCGCTATTCCCTACATTCACCATT
TTAAAATACAAGAGGCCTTAGAAGAACGGCTACATTACCCTATTTCTATC
GAAAATGATGCCAATTGTGCCGCCTTAGCTGAAGCTACCTTAGGGGCAGG
AAAAGGCGCTAGTAGCCTAGCCATGCTCGTTCTTGGTACTGGAGTTGGAG
GAAGCTTGGTCATTGATGGCAAGATTTACCATGGTGCCCACTTATTTGGG
GGCGAGTTTGGTTTCATGATCATGAACGACCGCTACCAAACCTTTAGTCA
GTTAGGGACAGTGGTAAATATGGCCAAGCGCTATAGTGCAATCGTCAATA
ACGGAAAAGATTATACTGGCAAAGCTGTCCTTGCCCTCGCAGAACAAGGA
GATCCCCTAGCACTCAAAGAAAGGCAGGTCTTTCTCCAAAGTTTAGCCAT
CGGTATTTTTAACATTCAACACGCCTTTGATCCTCAACTGATTTTAATCG
GGGGTGGTGTTTCCCAAGCTGACTTTCTACTGTCAGCGATTGAAGCTGAA
CTAGACAAACTCTACCAAGCCGTCGAAATCTCCGACCTTAGACCCCAATT
AGCTATTTGTCACTTTAAAAACGAAGCTAATCTTCTGGGAGCTGCCATTG
ATTTTTACCAAGAACACAAGGAGGCCTAA
>M5005_Spy0034 transcriptional regulator
ATGTTAGAACATTTTGGTGGAAAAGTAAAAGTGTTAAGACTTGAAAAGAG
GATTAGTCGCGAGGACTTGTGTGGGGATGAGTCTGAACTTTCTGTTCGTC
AATTAGCACGGATAGAACTAGGTCAATCCATACCAAGTTTAAGTAAGGTT
ATTTTTATTGCAAAAGCCTTAAACGTTAGTGTCGGTTACTTAACTGATGG
TGCTGATTTAGAACTACCTAAGCGTTACAAAGAATTAAAATACCTTATCT
TAAGGACACCAACTTACATGGATGATGGAAAATTACAAGTACGAGAAGAG
CAGTTTGATGAAATTTTTGAGGATTATTATGATAAATTACCAGAGGAAGA
GAAAATAATCATTGATTGTTTACAGGCAACTTTAGATACTTTATTGAGTG
AGAATACTAACTTTGGCATTGACTTACTTCAAGAATATTTTAATCAAATA
AAGACTAAGGTACGCTTTAGGCAAAATGATTTAATACTTCTAGAATTATA
TTTAGCTTATCTTGATATTGAGGGAATGGATGGACAATATTCAGATAAGA
TTTTTTATGATTCTTTATTAGATAATCTATCAGAACAATTTGAACAATTT
GAATTAGATGAATTATTTATAGTTAATAAGATTATCATTGATATTTCATC
ACTAAGCTTAAAAAATAACCGACTTGATAATTTAGAAAAAGCGATTGAAA
TGAGTCAAAAAATTATGGCGAAAATTCAAGATTGGAATAGAATGCCTATT
TTAAAACTAATAGAATGGAAATATTTTTTAATCAAACAAAAAGATATAAT
AAAAGCAGAACAATCATTTATGAAGGCATGTTTGTTCGCCCAAATGACAG
CTGATCAGTATTTGGAAAACAAGTTAATTCAAGAGTGGGAAAAAGATGTT
AAAAGTTATTAA
>M5005_Spy0483 stress-responsive transcriptional regulator
GTGGAAACTAAATTCTATAAACAGCGAAAAAATCGCTTGGTTGCAGGTGT
TATTGCTGGTTTAGCAGATAAGTATGGTTGGGATCTTGCTCTAGCGCGTG
TCTTAGCGGCTCTTCTTATTTACGGAACTGGTTTTGGAGTTTTGCTTTAT
ATTTTGTTGGCCATCTTCTTACCTTACAAGGAAGACTTGCTTGAAGAACG
TTATGGCCGAGGTCCTCGTCGTCGTAAAGACGCTGATGTCTTAAATGAAG
AAGAAGATGGTTGGTTCTGGTAA
>M5005_Spy0968 transcriptional regulator, TetR family
ATGACCAAAAGACATACTGAAACCAAAGCTTATGTAAAGACCGCCTTAAC
CACCTTACTAACTGAACAATCTTTTGAAACTCTTACTGTCTCTGACCTTA
CTAAAAAGGCTGGTATCAATAGAGGAACCTTCTACCTCCACTACACTGAT
AAATTTGACATGATGAATCACTTCAAAAATGACACTCTGGATGATTTGTA
CCGTTTGTTAAATCAGGCTGAAATCTACACAGACACTCGACAAGTCCTCA
ATCAAACCTTGTCCTACCTTATAGAACATAGAGAATTTATAACCGCACTC
GCTACTATTTCTTACCTCAAATTTCCGCAACTCATCAAGGATTTCTGTTA
CCAATTTTTGACTACTATTACTGGTTTCCAAGACATTGTGACCAATCAAT
ACCATATTCCTTATCCCTATGCTTTAGAAGTTTACCTTGCCAGTATTGAG
AGCATTATCAGCTATTGGATTGCTAATGGCTATCAAGAAACCACTGAAGA
GGTTGCCGATATTATTCTCAAAGCAGTTACTCTAGACAATTAA
>M5005_Spy1748 transcriptional regulator, DeoR family
ATGATGAATCGATTAGAACGTATTATTCAACTGGTTTCCCAGAAGAAAAA
AATAGATGTTAACAGTTTATCAGAGCAATTAGACGTTTCGAAAGTAACCA
TTCGAAAAGACCTTGATAAGCTTGAAAGTAAGGGCTTGTTGCGACGGGAA
CATGGCTATGCGGTGCTAAACAGTGGCGATGACCTCAATGTACGCTTGTC
CTACAATTACAACATAAAGCGACGGATTGCAGAAAAAGCAGCTGAATTGG
TACAAGACAACGATACCATTATGATTGAATCTGGCTCAACCTGTGCCCTT
TTGGCAGAAGTGCTTTGCCAGACCAAACGAAATATTAAAGTCATTACCAA
TTCGTGCTTCATTGCCAACTACATTCGTCAATATAGTAGCTGTCAAATCA
TTTTACTGGGCGGTTATTACCAGCCCAATTCAGAGGTGACTGTTGGTCCT
TTATTGAAAGAAATGATATCCCTTTTTCATGTCAATCGTGTCTTTGTTGG
AACAGACGGTTTCAACAAAGATCTTGGCTTTATGGGCAAGGACATGATGC
GCTCAGAAGGGGTGCGTTACATGGCAGATGCTGCTGAGGAAGTGGTGATT
CTGACCGATTCCAGCAAGTTTTCAAAAACCAGTCTGGTACACCAGTTGTC
ATTAGCTGATGTCAATCGCGTCATTACAGACCAAGCACTAGACAAGCAAA
CACAAGAGTTATTAAGTGCTAGTGGTCTTGTTCTTGATTTTGTTTCTTAG
>M5005_Spy0866 phosphinothricin N-acetyltransferase
ATGTTGAGACCATTAAGTAAAACGGACTGTCCTATGCTACAAGAAATTAA
TGCCAAAGCCCTTGGCTATTTAGTTTCGCTTGACTTGTTAGAAAGGCAAT
ATGAACGATTGATTGAGGATTGCCATCACTATTTTTTAGCTTATGCCGAC
AAGGATACCAATCAATTATTAGGCTATGTTCACGCTGAACGGTATGAAAC
CCTTTATGCTTCTGATGGTCTTAATCTCTTGGGCTTGGCTGTTTTACCAG
CCTATCAGAGAAGGGGAATTGGGAGTGCCTTACTAAGGGCCCTGGAATCC
CAAGCTAGGCAGGAAGGCATTGCCTTTATTCGCCTCAATTCTGCCAGTCA
TCGTAAAGAAGCGCATGCTTTTTACCGAAACCTCGACTATGCAGATGATA
AAACACAATTACGATTCATCAAAAACTTACAAGGAGATGACAATGATTTT
TGA
>M5005_Spy1822 transcriptional regulator
TTGATGTTAAGTAAGTCCTTACAGGTTCCTTTAGAGCAACTAATAGCAGA
AGATATCCCAAAAATGACTTTAATTATTAAGGATGAGGAGATTAAACAAT
GTGATAGGAATACGCATATTATGTTATTTGGGACACTCCTAATTGCTATC
AGTATTTATCCTATAATGTCTTGGTTAGGTTGGTGGGGATATGGTCCGGT
TGCTATCTTATGGTTGATAATCATGCGTATCGCCTTAAGAATTGAGCGAT
TTAAAAAGACATATGATGTTCAGACTTACCGATAA
>M5005_Spy0218 N-acetylmannosamine kinase
ATGAAGCATTATTTAGCAATTGATATTGGTGGTACTGCTATCAAGTATGG
CTTGATTTCTGAAACAGGAGACCTGTTGGAAAAAGAGGAAATGGCCACTG
AGGCTTATAAAGGTGGTCCCTCTATTTTGGAAAAGGTCAAGGGCTTGGTA
AAGACCTATCAAGACCAAATGGATCTGGCTGGAGTGGCCATTTCTTCTGC
AGGAATGGTTAATCCTGATGAGGGAGAAATCTTTTATGCCGGCCCTCAGA
TTCCTAACTATGCTGGAACTCAGTTTAAAAAAGAGATTGAAGAGACTTTC
GGGTTACCGTGTGAAGTGGAAAACGATGTTAACTGTGCTGGTCTGGCCGA
AGCTATTTCTGGTAGTGCCAAGGATTATCCTGTGGCTCTTTGCTTGACAA
TTGGGACGGGAATCGGTGGCTGTTTATTGTTTAATTCCCAAGTTTTTCAT
GGTAGTAGTCATTCAGCTTGCGAAGTTGGTTACCTTCATTTGTCAGATGG
TCAGTTTCAGGATCTGGCATCTACCACAGCTCTTGTTCAAGAGGTGGTCT
TAGCTTATGGCGATGACATTAGCCAATGGGATGGTCGTCGTATTTTTGAG
CAGGCTAAAGCGGGTGATGCGATTTGTATAGCAGCCATTAGTAAGCAGGT
GGATTACTTAGGACAAGGTATTGCTAATATCTGCTACGTTGTTAACCCAA
ATGTGGTGGTGCTTGGTGGCGGTATCATGGCGCAAAAAGACTATTTAGCT
GATAAATTAAAGACAGCTCTTGATAGCTACTTGGTTTCTAGTCTTGCCAA
GAAAACTCAGCTGAAGTTTGCTAGTCATGGAAATAATGCTGGTATATTAG
GAGCTTACTACCATTTTAAACAAAAGAATGAGCGATCTTGTTCATTTATA
ACTCTTGAGAAAATCGAAAATAATTTAGCGAGTAGCTAA
>M5005_Spy1830 transcriptional regulator, TetR family
ATGGTCAACCGTAAAGAAAATACGAAGCAAGCAATTTTAAAAGCAATGGT
TATGTTACTAAAAACCGAAAGTTTTGACGATATTACCACAGTTAAATTAT
CTAAAAGAGCTGGAATTAGTCGCTCTAGTTTTTACACACACTATAAAGAT
AAATATGAAATGATTGACTATTATCAGCAAACCTTTTTTCACAAATTAGA
ATATATTTTTGAGAAAAAATATCAAAATAAAGAACAAGCCTTCCTTGAAG
TATTTGAATTTCTCCAAAGAGAACAGCTTCTCTCTTCCCTTTTGTCTGCT
AACGGTACTAAAGAAATACAGGCCTTTATCATCAATAAAGTTCGCCTACT
CATCACTACTGATTTACAGGACAAGTTCAGTACCGAAGAGTTATCTCAAA
CGGAAAAAGAATACCAAAGTATCTACTTAGCCCATGCTTTTTTTGGTGTC
TGTCAAAGTTGGATTGCTAAAGGTAAAAAAGAATCACCTCAAGAAATGAC
ACAATTCGTTCTCAAAATGCTTACGAGTACCTAA
>M5005_Spy0741 fibronectin-binding protein
ATGTCTTTTGACGGCTTTTTCTTACACCATTTAACCAACGAATTAAAAGA
GAACTTGCTTTACGGTCGTATCCAAAAGGTCAATCAACCCTTTGAACGGG
AACTTGTCTTAACCATTCGTAACCATCGCAAGAATTATAAATTGCTATTG
TCTGCCCATCCTGTTTTTGGAAGGGTACAAATCACCCAAGCAGACTTTCA
AAATCCTCAGGTACCTAATACCTTTACCATGATTATGCGTAAATACCTCC
AGGTGCAGTCATTGAGCAGTTAG
>M5005_Spy1340 DNA-directed RNA polymerase omega chain
ATGATGTTAAAACCTTCCATTGATACCTTATTAGATAAAGTACCATCCAA
GTATTCACTTGTGATTTTACAAGCCAAACGTGCCCATGAACTAGAAGCTG
GTGCCACTCCAACTCAAGAATTTAAATCAGTGAAGTCAACACTTCAGGCA
CTTGAAGAAATTGAATCAGGAAACGTTGTGATTCACCCAGATCCTTCAGC
TAAACGTGAAGCTGTCCGTGCTAAGATTGAGGCAGAACGCTTGGCCAAAG
AGGAAGAGGAACGTAAAATCAAAGAACAAATTGCCAAAGAAAAAGAAGAA
GAAGGAGAAAAAATCTAA
>M5005_Spy0164 parB-like nuclease
GTGAGTAATTTTATTAGTCCAGTCTATGAGATTAAATCAATTCCAATTGA
AAAGATTTCTCCAAATGATTATAATCCGAATTCAGTTGCTCCGCCTGAAA
TGAAATTATTGTATGATAGTATAAAATCTGATGGTTATACTATGCCGATT
GTTTGCTATTACGATAAGGAAGAGGATCGGTATAGTATTGTTGATGGTTT
TCATAGATATCGTATAATGCTAGATTATTCAGATATTTATGAAAGGGAAA
GTGGGAGATTACCTGTTTCTGTTATTGATAAGTCATTAGACTATCGAATG
GCTTCTACCATTCGACATAATAGAGCTAGAGGAAGTCATGATGTTGATTT
GATGAGTCAGATTGTAAAGGATCTTCATGAGTGTGGGCGAAGTGATAACT
GGATTGCAAAACATTTAGGAATGGATAAAGATGAAATTTTAAGACTGAAA
CAAATAACAGGATTGGCTTCTCTTTTTAAGGACCATGAGTTTAATCAATC
TTGGGAACCAGAAGAGCTATTAAATGAGTAA
>M5005_Spy0414 exoribonuclease II
ATGAAAGAAAGAATTATGACTTACCTCAAGGAGCATGGCAAGTCCAATGT
GAACGACTTGGCTGCGGCCTTGGAGATGGCTGGAGCTAAGCATTTTCCCA
GCCTTATTAAAACCATTTCCAAAATGGAAAGTCAGAGCCTGTTACGGTTT
TCAGATGATGGCAGTCTGGCTCTTAGAAAAGAGCGTGAAAAGAAAAAAGA
ACCTACTGTTCAGGGTGTTTTTCGTGCCAATAAAGCAGGCTTTGGTTTCT
TACATGTGGATGAGAATGAAGATGACATGTTTATCGGTCGTAATGATGTT
GGGTATGCTATTGATGGTGATACTGTCGAAGTAGTGGTTAAAAAGCCAGC
AGACCGTCTCAAAGGCACAGCGGCTGAAGCTAAGGTCGTTGCTATTGTTG
ACCGTTCTTTAAAAACAGCTGTTGGAACCTTTATTTTAGATGATGACAAA
CCAAAATATGCTGGTTATATCAGGTCCAAAAACCAAAAGATTCAACAAAA
AATCTATATCAAAAAAGAACCTGTTGTGCTTAAAGGCACTGAAATCATCA
AGGTTGATATTGATAAATACCCGATACGCGGGCACGATTATTTTGTAGCC
AGTGTGCGTGATATCGTAGGCCATCAAGGAGACGTTGGAATTGATGTCCT
AGAAGTCCTTGAATCGATGGATATCGTGTCAGAATTTCCAGCAGAAGTTT
TAGCTGAGGCCAATGCTATTTCAGAAGCACCAACTGCTAAAGATTTAATA
GGCCGTGTGGATTTGCGTCAAGAAACCACCATTACTATTGATGGTGCGGA
CGCCAAAGACTTAGATGATGCTATCCATATTAAGCTATTGGATAACGGGA
ATTATGAACTTGGGGTACATATTGCGGATGTCTCATATTATGTGACAGAA
GGATCTGCCCTTGATAAGGAAGCTATCGCCCGTGGCACTTCTGTCTATGT
CACCGATCGTGTGGTTCCGATGTTACCAGAGCGTTTGTCAAATGGCATCT
GCTCTTTGAACCCTAACATTGATCGTTTGACCCAGTCAGCCTTGATGGAA
ATTAATTCTCAAGGGCATGTGGTCAATTATCAAATCTGTCAATCAGTGAT
TAAGACAACTTACCGAATGACGTATAGTACGGTCAATGACATGATTGCAG
GAGATGAAGAAGCGCTCCAAGAATTCGCTAGCATTGCTGATGATGTGACC
CTCATGGTGGCTTTGCATAGGATTTTGGAAGCTATGCGGTCAAAACGAGG
CGCCTTGAATTTTGATACGCAAGAAGCAAAAATTATTGTTAATGACAAAG
GAATGCCGGTTGATGTGGTGCTTCGTCAAAGGGGCATTGCGGAGCGGATG
ATTGAATCCTTTATGCTAGCAGCCAATGAGTGTGTTGCGGAGCATTTTGC
AAAAGCTAAGTTACCGTTTATCTACCGTATTCACGAAGAACCAAAGGCCG
AAAAACTTCAACAATTTATTGATTACGCTAGCACCTTTGGTATTCACATT
CAAGGAACAGCCAACAAGATTTCTCAGGAAGCCTTGCAAGCCTTTATGGC
AAAAGTCGAAGGTCAACCAGGAGCAGAAGTGCTCAACATGATGCTTCTAC
GTTCCATGCAACAAGCGAGGTATTCTGAACATAATCATGGCCATTACGGT
TTGGCCGCAGAATATTACACTCACTTTACCAGTCCGATTCGTCGTTACCC
TGACTTATTGGTTCACCGCATGGTTCGTGAGTACAATCAACCTAGTCAAG
AAAAGCGCGACCATTTTGCTCAGATCATTCCAGAATTAGCAACATCTTCT
TCACAGTTAGAGCGTCGTGCTATTGATGCTGAACGCGTGGTTGAAGCCAT
GAAAAAAGCTGAGTATATGGCAGAGTATGTCGGCGAAGAATTTGACGGTA
TCGTTTCCAGTGTCGTTAAATTTGGTTTTTTTGTAGAATTGCCAAATACG
ATTGAAGGTTTGGTTCATATCACTAGCTTACCGGAATACTATCACTTTAA
TGAAAGAACGCTAAGCCTTCAAGGTGAAAAATCAGGTAAGGTCTTTAAGG
TCGGTCAACCTATTCGTGTGAAATTGGTTAAGGCTGACAAGGAAACTGGT
GACATTGACTTTGAGTATTTACCTAGCGACTTTGATGTGGTTGAAAAAAT
CAAGATGTCGGATAAAGCTAGTCGACGAGATCGCCGTAAATCCTCAAAAT
CATCTAAAGGGACAAAGAAAAAAGAACCTAAAGAAGTAGCCAAGGCAAAA
ACCAAGGGTAAAACTAAAAAAGGGTCTAAAAAACCATTTTACAAAGAACA
AGCAAAAAAGAAGAGTCGTAAAAGGAGTTAA
>M5005_Spy1083 transcription antiterminator, BglG family
ATGTTATCAAAAAAAGAACTGGCCATCATAACATTTCTAATCCATCACAA
AGAGCAGTTTGTCTCTAGTGCAACTCTGGCTGAGGTTATCGGTATGAGTG
ACCGTACGGTTAGGAAATACCTCAAAGAACTGATCAGTAGCCTTCCTGAA
CACGGAGCTCACATCATTTCTAAACAAGGTCGAGGTTACTGCTTAGAAAT
TGACCATTCTATGGCATTTGACATCTTTTGGCAAGAAAGTGTGACGTCTA
AAAAACGTTTGGCAGATGTGACTCAAGTGGAAGAATCGGTTGATCGAGAA
GATTATGTGCTTCATAAATTCTTTTTTGAAGATGCCGTTCAGGATTTTGA
AGAGCTTTGTCAAGAATTGTATATCAGTCGGACAACTTTAAAACATGTTT
TAGCAGGTATTAAGGAGCGCATAATACCTTACCAGTTAGAGCTTGAAATA
ACTCACCAACATATTCAAATAAGAGGTAAAGAAGAGGACATTAGGCATTT
TATCATGGACTATTTTTTTGTTACTAGTTTTGATAATACCTTGTCCACCA
TGGTAGGTAATACCTTTCTTGAAGGTATTAATTTTGCAGAAATCATGATT
ATTGTCTTGGATGAATGTCGGGATGCTAAGTTGAAACTTTCTGATTTTGT
CATGAATAATCTAGTCTTGCATATTGCCCTAATGGTTCAGCGTATTCGAT
CGGGGTGTCCATTAGAACTGTTTTCCATTCCAATAGCTATTCGTCAGTCT
GATGAGTATCAAGTAGCTCTGCGCATTTTGTATCGAGTGGAAGAAGTGAT
GGGGATACGTTTTCCTAAAGAGGAGGCTAATTATATTGCACTGCATCTAA
AGGTCAAACATTCTGTTGGTAAGCATTGGCAAGATGATAATACCGATGAA
AAGTTGCAGGACCATTTAAAAGCATGTATTGCCAAGATTAGTCAATTGAC
AGGCATGACTTTAGAAACAGATACCAATTTATTTCAAGGTTTATTAGCCC
ACATGATGCCCTTGACCATACGTCTTGAAAACCATATTCAGCTGACTAAT
CCTTTAACTGAGGAAATTAAAAGCCAGTATCCTGAAATATTTACCCTTAC
CAAGCAGACCTTTTCGGATTTGCTTGTATGTCAAAAGAATGATGTCTCAG
ATGATGAATGGGCTTATATTAGTTTGCATTTAATGGCGGCCATTGAGCGT
TATTCAAACCGTCATAAATTGAGGGTTCTAGTAGTTTGTGCCACAGGTTA
TGGTAGTGCCATGATGTTGAAAAATCGCTTGGAAAAGGAATTTGAAGGAC
GTTTGCGTATTGTCGATGTTATCAGTTACTATGAAATAACCGAAGAGCGA
CTGAAAACCGTTGATTTGATTATTTCCTCTATCAGCCTTGCCAATCTGAT
GTTTTTAACACCAGTGATTACTGTCAGTGTTTTTTTGTCAAATCAGGATA
TTGAAACTATTCGACAATTTATTGGAGAACAAGAAGGTATCAAGAAAGAG
GTCAGTTTACCGTCACAGATGAGTTTAGCAAAAGCAGAGCAGCTTCTAAC
AGGTGTTTTTAGCCCTAATCGTTTTCTTTATTTAGACGAGAAAATCTCAA
AGGAAGACTTGCTTTTACGGATGATTGCTTGTCTTGACGAGGCGGGAACA
GAAACGTTTGTAGAGGACTTCTATCATCAAATGGTACTGAGGGAAAATTA
CAGCCCAGTCATCTATGGAGAAGTGCTTGCCTTTCCGCATCCTGCTAATC
CCATGACTTATTCTGAACAGGTAGTAGTGGTTATTTGCCGAGAGCCTCTT
GAGTGGGACAAGGCGCATCAAGCTGTTCATTTTGTCTTTCTATTATCCCC
GTCTAAAGGGCATAATCATAGGTTAAAATATGTATCACCAGGTTTGGCAT
CTTTTGTCAATCAGGTGGAGCTTCAGCAAGCGTTACTAGAAGAACCAAAT
TATTCCAAATTCATGACAGTGTTTACCCCACTTATTCATGATTAA
>M5005_Spy1578 transcriptional regulator, Cro/CI family
GTGACCAAATCAACTTTAAAAGAGTTAAGAACAACAAAGAAAATGACACA
GCAGGAATTGTCTCACTTAACAGGTATTTCTGTCAGAACGATTGCTAGGT
ATGAAAAAGATACTAAAAAGCTAAGGCGAGCAAAATATGAGAAGCTAAAA
GGTATTGCACAAGCATTAGCGGTTTCCGTTGATGATATTTTTTTAGGAAT
AGATTCGGAATTTATGAACTAA
>M5005_Spy1099 transcriptional regulator, LytR family
ATGACAAAATACCCCATGGGTGGCCTTAGTCACCATGAAGAATTACGTTA
TTTTTATCTCCTAAGGAATTTGAGTTACCTTAGTGAGAATGAAAAAAAAG
AGTTTGCTTTTTTAAAATCTAAATTGGAAATTGGTCGAGCTTATGCTCCT
TCTAAGCAGCATTATAGGAAGTCAAAACGGCAAGAACCTTACTTTGAAGA
TGACTACTATAACGACTACTCACCAAATGATTTACTAGAAGATGATGACG
TCAATCATGACTCTTCTTTTGTTCCATATGGTTTACCGATATATCCTAAA
GAAGACAGATATTTAAACAAAAAAACAAAACTTACAGCTCGTAGACCTAT
AGATGCTCCGCAGCCTATTGATGAAGACGATGCTTTTTTAACAGAGTCTG
TTGCTCGTTGTGCTCTTCCTAGATCTCAAAAAAGGAAGCATAAGAAAAAA
GGATGTATGAAATGGTTTTTTAACATTCTTGGCTTATTGCTAATGACTGT
GCTTATGGGGTTAGGGTTGATGTTTGCAAAAGGGGTTTTTGATATTTCTA
CTAATAAAGCTAATTACAAACCAGCTGTTTCCCAAGCTTTTGATGGTCAA
GAAACTCAAGATGGTACGAACATTCTGATTTTGGGTTCTGACCAACGAGT
TACTCAAGGTTCTACAGATGCTCGCACAGATACCATTATGGTTGTCAATG
TCGGCAACCATGCTAAAAAAATAAAAATGGTCTCTTTTATGCGTGACACT
TTGATTAACATTCCAGGATACAGTTATAATGATAATTCGTATGATCTTAA
ATTAAATAGTGCATTTAATCTTGGAGAGCAAGAAGATCACCACGGAGCAG
AGTACGTTCGACGGGCCTTAAAACATAATTTTGATATCGACATTAAGTAT
TATGTGATGGTAGATTTTGAAACATTTGCAGAAGCTATTGACACCTTGTT
TCCAAATGGTGTTAAGATTGATGCCAAATTTGCGACAGTAGGTGGTGTAG
CTGTTGACTCCGTAGAAGTTCCAGATGACTTGCGAATGAAAAATGGGGTT
GTTCCCAACCAAACCATCGAAGTTGGAGAACAACGCATGGATGGTAGAAC
CTTGCTCAACTATGCTCGTTTCCGTAAAGATGACGAAGGAGATTTCGGAC
GAACCGTCCGGCAGCAACAGGTTATGTCAGCTGTTATGTCCCAAATCAAA
GACCCAACTAAACTCTTTACAGGGTCTGCGGCTATTGGTAAAATCTATGC
GCTGACTTCGACCAATGTTTCTTTCCCATTTGTTGTTAAAAATGGTGTTT
CTGTTTTAGGAAGTGGGAAAAATGGAGTTGAGCACGTGACCATCCCAGAA
AATGGGGATTGGGTTGACGAATACGATATGTATGGAGGACAAGCCCTTTA
CATAGATTTTGATAAGTATCAGAAAACGTTAGCCAAATTAGGTCTGCGCT
AA
>M5005_Spy1315 transcriptional regulator, GntR family
ATGACAAAATTATTATACAAAAAGATATATCATTTCATTAAAGAGCAGAT
AGCATCAGGTCGTTTGCAAATTGGTGACCGCCTACCTACTGAAAAAGAAT
TGTCAGAACAGTTCTCGGTTAGCCGTATCACTTCTAAGCGAGCGCTTGTA
GAACTGGAGCAAGAAGGCTTGATTACGAGAAGTCGTGGGAAAGGAAGCTT
CGTAGCTAAAAAGCAAGTGACGTCCCCTGAAGCGAATAAGGATTTATTGT
TGATTCTTCCTTTTGCTTCTGATTATGAATTGGGAGATTATGCTAAGGGA
ATTATGACCTCCATTGCTGAAACAGGTTACCGTCTCATGGTTCAATTGGC
CAGTACAGTAAGGTTAGACACCCTGTCAGACTATGCTGGGATTATTTATT
ATCCTGAAGATGTCAATCACAGTATTGATTTCCTGTTTTACTGCGACCAT
CATCACATTCCTCTAGTCTTGTTGGATAAATCTCTAGATCTTTTTCAGTT
TCCGTCTGTTGTAGCGGATAATAAAGGCGGTGCCTGTCAATTGACTCAGC
ACTTGATTGAGCAAGGCTGTGACCAGATTAGTTTTGTGGCAACAGGCTCT
TTTGGAGAAGTATCATCCGTTAGAGACCGTTATTTGGGTTACTTAGCGGC
AATGGCAGAATCGTCTCTAAAATCCCATTATTTTCCTAAGACAGAGACTG
AAACAACAGATGCTTATTTGGACCGTTTGGTGAAAACCTTATCGGAGACG
ACAGCCACTAAAAGGGGGCTTGTCGTGGAAAACGATTGGTTGGCTATTCA
GCTGATTCAAAAAATCACACAGGTAGGCTTATCTATTCCTGATCAAGTCG
CTATTGTAGGCTTTGATAATAGTCAAGCCTCCCGTTTGTTGAGTCCCAAA
TTAAGCACAGCAGCTCAAGATTTTTACCAAATGGGGCAAGAAGCAGCTAA
AGTCTTGTTGCAGATTATTCATGAGCCAGACCAAGCAGTGGTGTCTTGCC
AGTTACCTGTTCAAGTATTTATCAGAGAAAGTAGTCACTAA
>M5005_Spy0438 acpA, ribonuclease III
ATGAAACAGCTTGAAGAGTTACTCTCAACATCTTTTGATATTCAATTTAA
TGATTTGACTTTACTAGAAACAGCTTTTACCCACACCTCTTACGCTAACG
AGCATCGTCTCCTAAACGTTTCACATAATGAACGCTTGGAATTTTTAGGA
GACGCTGTTCTACAATTGATTATTTCAGAGTATTTATTTGCAAAGTATCC
TAAAAAGACAGAAGGAGATATGTCTAAGTTACGTTCCATGATTGTACGTG
AGGAAAGCTTGGCAGGTTTTTCACGATTTTGTTCTTTTGACGCTTATATC
AAACTAGGAAAAGGTGAGGAAAAGTCAGGTGGTCGCCGTCGTGATACTAT
TTTAGGAGACTTATTTGAAGCCTTTTTAGGTGCTCTTTTATTAGATAAGG
GGATTGATGCAGTACGTCGCTTCTTGAAACAAGTCATGATTCCTCAGGTG
GAAAAAGGGAATTTTGAAAGGGTTAAAGACTATAAAACTTGTCTTCAAGA
GTTTTTGCAAACAAAAGGTGATGTGGCTATTGATTATCAAGTCATTAGTG
AGAAAGGACCTGCCCATGCTAAACAATTTGAGGTATCGATAGTTGTTAAT
GGTGCTGTCCTTAGTAAAGGTTTAGGTAAGTCTAAAAAATTAGCGGAGCA
AGATGCTGCTAAAAATGCCCTTGCCCAACTTAGTGAGGTTTAG
>M5005_Spy0077 adcR, transcriptional regulator, MarR family
ATGGGGATTTTAGAAAAAAAACTTGATAACTTAGTAAATACTATTTTATT
AAAAGCAGAAAATCAGCATGAGTTATTATTTGGAGCTTGTCAAAGTGACG
TTAAGCTTACTAATACGCAAGAACATATTTTAATGTTACTATCTCAGCAA
CGTCTCACTAATACAGATTTGGCTAAGGCATTAAATATTAGTCAGGCGGC
AGTAACTAAGGCTATCAAGAGTTTGGTCAAACAAGACATGTTAGCAGGAA
CTAAGGATACGGTTGATGCTAGGGTGACTTATTTTGAATTAACCGAGTTA
GCTAAGCCTATTGCGTCAGAACATACCCATCATCATGATGAAACCTTAAA
TGTTTACAACCGTTTATTACAAAAATTCTCCGCGAAAGAATTAGAGATTG
TAGATAAGTTTGTAACAGTTTTTGCTGAGGAATTAGAAGGGTAA
>M5005_Spy1229 argR1, arginine repressor
ATGAAAAAGAGTGAACGACTTGAATTAATCAAAAAAATGGTTTTGACGCA
TCCAATTGAGACGCAACATGACCTCTTAAGATTATTGGCAGAGCATGGGT
TAGAATTAACCCAGGCTACTATTTCAAGAGACATGAATGAAATTGGTATA
GTAAAGATTCCTTCTGGCAGTGGACGTTACATCTATGGTCTTTCTCAAGA
TAGTGGAAAAAAGATCGTTCAAGGACCTAGATCGATAAAGAGCACTATTT
TAGCTGTATCTGACAAAACAAAAGGTTTAGAACAACACCTCTATTTAAAA
GTCGTACCTGGCAATAGTAAATTAATCAAACGTTATTTATTAGCAGATTT
TTCAAAAGCTATTTTTAGTCTTATTGCTGATGATGATAGTTTATTGTTAA
TTGCAAAGTCTCCTTCAGAAGCAGATATGATACGCCAAGAAATTTTGCTT
TGGATGCAGGGTATAACCTAG
>M5005_Spy1807 argR2, arginine repressor
ATGAATAAAATGGAGCGTCAACAGCAGATTAAGCGAATCATTCAAGCAGA
GCATATTGGCACACAAGAAGATATTAAAAATCACCTTCAAAAAGAAGGCA
TTGTGGTCACCCAAGCAACTCTATCTCGGGACTTAAGAGAAATTGGCCTT
TTGAAATTGAGAGATGAACAAGGCAAACTCTATTATAGTTTGTCTGAACC
CGTTGCAACACCATTTAGTCCTGAGGTGCGTTTTTATGTTTTGAAAGTTG
ATCGAGCAGGTTTTATGCTGGTTCTCCATACCAATTTAGGAGAGGCTGAT
GTTCTAGCTAATTTGATTGACAATGATGCCATTGAAGATATTCTAGGAAC
CATTGCTGGTGCGGATACCTTGCTTGTGATTTGCAGAGACGAAGAGATTG
CTAAACGCTTTGAAAAAGATTTGGCTGCAGGCCTATGA
>M5005_Spy1110 birA, biotin operon repressor/biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] synthetase
ATGAAAACATCAGAAAAAATTTATCAATTACTGTCACAAACCGATGACTT
CGTCAGTGGGGAATATCTAGCAGATCAACTCAGTATCTCTCGTACATCCG
TTTGGAAATCCATCAAAAGTCTCGAAAATCAGGGGATTCAAATTGATTCT
TTAAAACACAAGGGCTACCGCATGGTACAAGGTGATATTTTATTACCCAA
AACCATTAGCCAAGGGCTTGGGATGCCAGTCACCTATACCCCTCACAGCC
AATCTACCCAATTAGATGCCAAACAAGGAATCGAAGCTCATAACAGCGCT
CCAAGGCTTTACCTAGCTCCTAGCCAAGAAGCTGCCAAAGGACGCCTCGA
TCGGCAATTTTTTTCAGCTAGCACCGGTGGTATTTACATGTCCATGTACC
TAAAACCCAATGTCCCTTATGCTGATATGCCTCCTTATACGATGATGGTT
GCTTCCAGTATTGTCAAAGCTATCTCGCGATTAACAGGCATTGATACAGA
AATCAAATGGGTAAACGACATCTATCTAGGTAACCATAAAGTTGCAGGGA
TTCTGACAGAAGCCATTACTTCTGTTGAAACTGGTTTAATCACCGATGTC
ATTATTGGGGTTGGTCTCAACTTTTTTGTCACCGACTTCCCAGAAGCGAT
TGCTCAAAAGGCAGGTTCTCTCTTTACCGAAAAACCGACTATCACGCGCA
ATGACCTTATCATTGACATCTGGAAATTATTCTTATCTATTCCTGTCAAG
GACCATGTCAAAGTTTACAAAGAAAAATCACTTGTTCTTAATAAACAAGT
GACCTTTATAGAAAATAGTCAAGAAAAACGTGCTATTGCGATTGATCTCA
CAGATCAAGGACACCTCATTGTACAGTTTGAAAATGGTGACCTTCAAACC
TTGCGAAGCGGTGAAATCAGTCTTTCTTCTTGGGAGAATTAG
>M5005_Spy1818 cadC, cadmium efflux system accessory protein
ATGGGCTGTGTTAGGCTAGGAGAAAAAATTATGAAAAAAGATAGTATCTG
TCAAGTGGGTGTTATAAATCAACAAAATGTTACAACCGCAACGAACTACC
TTGAAAAGGAAAAAGTCCAAAAATCACTTCGTATTTTATCAAAATTTACC
GATAATAAACAGATAAATATCATCTTTTATCTCCTTGCCGTCGAAGAACT
CTGTGTCTGCGATATAGCCTGTTTATTAAATCTCAGTATGGCATCTGCCT
CCCACCATCTTCGTAAACTAGCCAATCAAAACATCTTGGACACTAGAAGA
GAGGGGAAAATTATATATTATTTTATAAAAGATGAGGAAATCAGAGATTT
TTTTAATCAACTAGGATAA
>M5005_Spy0424 ccpA, catabolite control protein A
ATGAATACAGATGATACCATTACAATTTATGATGTTGCCCGTGAAGCTGG
TGTTTCAATGGCAACCGTTAGTCGTGTTGTTAATGGCAATAAAAATGTTA
AGGAAAATACACGTAAGAAAGTTTTAGAAGTTATTGATCGCCTTGACTAT
CGTCCCAATGCTGTCGCGCGTGGTCTCGCCAGCAAAAAGACAACAACCGT
TGGCGTTGTGATTCCAAATATTGCAAATAGTTATTTTTCTATCTTAGCTA
AGGGTATTGACGATATCGCCGCTATGTACAAATATAATATTGTGCTTGCC
TCCAGTGATGAAGATGATGACAAGGAGGTTAATGTTGTCAATACCCTTTT
TGCCAAGCAAGTGGATGGTATTATTTTTATGGGGCATCACTTGACAGAAA
AAATCCGGGCCGAGTTTTCACGCTCTCGTACTCCAGTTGTTTTGGCAGGA
ACTGTAGATCTTGATCATCAATTACCAAGCGTCAACATTGACTATAGAGC
TGCGGTGTCAAACGTTGTTGATATTTTAGCTGAAAATCATAAGTGTATCG
CTTTTGTGTCAGGACCACTCATTGATGATATCAATGGTAAAGTGCGCTTA
GCAGGTTACAAAGAAGGGTTGAAGCACAATAAGCTTGACTTCAAAGAAGG
CCTTGTTTTTGAAGCGAACTATTCTTATAAAGAAGGATTTGAATTGGCGC
AGCGCGTCATTAACTCAGGAGCAACAGCGGCTTATGTGGCTGAAGATGAA
TTGGCAGCGGGCCTTTTAAACGGCTTGTTTGAAGCAGGTAAACGCGTACC
AGAGGACTTTGAAATCATCACCAGCAACGATTCACCAGTGGTTCAATACA
CTCGTCCCAATTTGAGTTCTATCAGTCAACCTGTTTATGACTTAGGTGCT
GTTAGCATGCGGATGTTGACTAAAATCATGAACAAAGAAGAGTTGGAAGA
AAAAGAAATTCTTTTGAATCATGGTATTAAAAAACGTGGGACAACTAAGT
AA
>M5005_Spy0948 ciaR, transcriptional regulatory protein
ATGATAAAAATATTATTAGTAGAAGATGACTTGAGCTTATCAAATTCCAT
TTTTGATTTTTTAGATGATTTTGCAGACGTCATGCAAGTTTTTGATGGCG
ATGAAGGTTTATACGAAGCAGAAAGTGGTATTTATGATTTGATTTTGTTA
GACCTTATGTTGCCGGAGAAAAATGGCTTTCAAGTCTTAAAAGAATTGCG
AGAAAAAGATATTAAAATTCCTGTATTGATCATGACAGCTAAAGAGGGTT
TAGATGATAAAGGCCACGGATTTGAATTAGGTGCTGATGATTATCTGACA
AAGCCGTTCTATTTAGAAGAGTTAAAAATGCGAATTCAAGCACTGTTAAA
AAGAACAGGGAAATTTGCAGATAAAAATATTAGTTTTGGCAATTTAGTGG
TTGACTTAGCTCGAAAAGAGGTGAAGGTTGAAGGGAAAGTAGTTGAATTA
CTTGGCAAAGAATTTGATTTGTTGGTGTATCTTTTGCAAAATCAAAACGT
TATTTTACCAAAGACACAAATTTTTGATCGTTTATGGGGATTCGATAGTG
ATACTACGATTTCGGTTGTTGAAGTTTACATTTCTAAAATAAGGAAAAAA
TTAAAAGGTACCTGTTTTGTTAACAGGCTTCAAACTTTAAGAAGCGTAGG
ATATATTCTAAAAAACAATGAATAA
>M5005_Spy0899 citG, transcriptional regulator, GntR family
ATGAATCCTATTATCGAAGCCGTTAAACAAAATCTTGACCTATCAAGAAA
TATCCCTTTGAAAATAGCCTTTTATAACGCTCTTAAAAAGACCATTATTT
TGCGACAAATTCCTGTTGGAAGCCGCATTAATGAAAAAGAGTTTTCCATT
GCGCTTAATATTAGCAGGACACCTATTCGCTACGCTTTGGGATTATTGTC
TGAAGAACACCTTGTAGAGCACATTCCTAAAAAAGGCATTATTGTCAAAG
GAGTTAGTATCAAGGATGCCTGTGAAATTTTTGAAATTCGAAAAGCTCTA
GAGACTCTCGCAACAGTGCAAGCGATGCATTTAATGACAGAAGAAGATTT
TAAAGTCATGCATAACTTGTTGGAAGACTGTGAAACCTTTATCGCAGAGG
ATGACACCAATCGTATTTTGGATAATTTTAATGCCTTTAACAATTTGATT
TACAGCTATAGCCAAATGGTCCGCTTAAAAGAAATTGTGACAGAATTGCA
AGCTTATTTGGTCTACTTTAGAAAAATTTCGATTTCTTCAGTTGAACGCC
GTAAACGAGCTCTATCTGAACACTGGATGATTTACCGAGGTATGAAGAAC
AAAGATCATGAGCAAATTACGTTGATTACACATGAACACTTGAATAGCTC
ACTTGAATTTATCTTAAAAGAAATGAGGCCTGAGCAAAATGACTAA
>M5005_Spy1512 codY, transcription pleiotropic repressor
ATGCCTAACTTATTAGAAAAAACTCGTAAAATCACATCTATTTTGCAGCG
TTCCGTAGATAGCCTAGAAACAGAATTACCGTATAACACAATGGCATCTC
GCCTAGCAGATATCATTGACTGCAATGCTTGTATTATCAATGGCGGCGGC
ACACTGCTTGGTTATGCCATGAAATATAAAACTAACACTGATCGTGTTGA
GGAATTTTTTGAAGCTAAACAATTTCCAGATACTTATGTAAAGGCTGCTA
GCCGAGTTTACGATACAGAAGCTAACCTTTCTGTCGAAAATGAATTGACT
ATATTCCCTGTTGAGTCTAAAGACACTTATCCAGGAGGTCTAACGACTAT
TGCGCCGATTTATGGTGGAGGGATGCGCCTTGGATCACTCATTATCTGGC
GTAATGACAATGAGTTTAGTGATGATGATTTGATTTTGGTTGAGATCTCA
AGTACTGTTGTGGGGATTCAACTATTAAATCTTCAGACAGAAAACTTAGA
AGACACCATCCGTAAACAAACAGCGGTCAACATGGCAATTAATACGCTTT
CTTATTCAGAAATGAAAGCTGTTGCAGCAATTCTTGGAGAGTTAGATGGT
AACGAAGGACGATTGACAGCTTCTGTTATTGCTGATCGTATTGGTATTAC
CCGTTCTGTTATTGTCAATGCTCTGCGTAAACTAGAAAGTGCAGGGATTA
TTGAAAGTCGTTCTCTTGGTATGAAAGGGACATACCTCAAAGTTATCAAC
GAAGGTATTTTTGCTAAATTAAAAGAATTTTAA
>M5005_Spy1406 copY, copAB ATPases metal-fist type repressor
ATGCAACAGATATCAGCTGCTGAATGGGAAGTCATGCGTGTGGTGTGGGC
CAGTGGTGATATTAAAAGTAGCGATATTATTACTATTTTAAGGAAAAAAT
ATCAATGGTCAGATTCCACTATTAAGACCCTCATTGGTAGGCTAGTTAAA
AAAAATTTTTTAACGTCTTATCGGCAAGGAAGAGCTTATATTTATCAAGC
TCTTTTGGATGAGACTTTGCTACAAAAAGAAGCACTAGCGACTGTTTTAG
ACGGTATTTGTCAGCGGCAACACACGCGTCTACTTCTTGAACGGCTTTAT
CACTTACCGATGACCTTAGAGGAAATCGGGGCATTCCAAGAGCTACTAGA
AGTCAAAAAAGAAAATGCAGTTCTTGAGGTGCCGTGTAATTGTCTGCCTG
GGCAGTGCCACTGTCAGAGAAAGGAGACGTATTAA
>M5005_Spy0282 covR, response regulator
ATGACAAAGAAAATTTTAATTATTGAAGATGAAAAGAATCTGGCTAGATT
CGTTTCTCTTGAGCTGCAACATGAGGGTTATGAAGTCATTGTTGAGGTCA
ATGGTCGTGAAGGGTTAGAAACTGCTTTGGAAAAAGAGTTTGATTTAATC
CTGCTTGACTTAATGTTACCAGAGATGGATGGTTTTGAAGTGACCCGTCG
TTTGCAAACCGAAAAAACAACGTATATCATGATGATGACTGCGCGTGATT
CTATTATGGATGTGGTTGCAGGTTTAGACCGCGGTGCAGACGACTATATT
GTTAAACCGTTTGCCATTGAAGAACTACTTGCCCGTATTCGTGCTATTTT
CCGCCGTCAAGATATTGAATCTGAGAAGAAAGTGCCTAGTCAAGGCATTT
ATCGAGATCTAGTTTTAAATCCACAAAACCGTTCAGTTAATCGTGGCGAC
GATGAGATTTCTCTCACTAAACGTGAATATGATTTGCTTAATATTTTGAT
GACTAATATGAATCGTGTCATGACACGTGAAGAATTATTGTCAAATGTTT
GGAAATATGATGAAGCCGTTGAGACTAATGTTGTAGATGTCTATATTCGT
TATCTCCGCGGCAAAATTGACATTCCAGGCAAGGAATCTTATATCCAAAC
AGTGCGTGGCATGGGATACGTTATTCGTGAGAAATAA
>M5005_Spy0701 cpsY, transcriptional regulator, LysR family
ATGAATGAAGCTGCTAAGCAATTATTTATCACACAACCAAGTCTATCCAA
TGCGGTCAAGGATTTGGAAATGGAGATGGGCATTACCATTTTCAACCGAA
ATCCTAAAGGGATCACCTTGACAAAAGATGGGGTGGAATTTTTATCTTAT
GCTCGCCAAATTATAGAGCAAACATCACTGTTAGAAGACCGCTATAAAAA
CCACAATACTGGCCGAGAGCTCTTTAGCGTTTCATCTCAACATTATGCCT
TCGTAGTCAATGCATTTGTCTCACTCCTCAAGCGGACCGACATGACTCGG
TATGAACTCTTTTTGCGCGAGACAAGAACTTGGGAAATCATTGATGATGT
CAAAAACTTTCGATCTGAAATTGGTGTTCTCTTTATCAACGACTATAACC
GAGATGTCTTGACCAAATTATTTGATGACAATCATTTGACCGCCTCTCCA
TTATTTAAGGCACAGCCTCATATTTTTGTCAGCAAATCAAATCCTCTAGC
AACTAAAAGCCTATTAAGCATGGACGACTTGAGAGATTTTCCTTACCTGA
GCTATGACCAAGGGATTCACAACTCCTTTTATTTTTCAGAAGAGATGATG
TCCCAGATGCCCCACAACAAATCAATTGTGGTCAGTGACCGTGCCACCCT
CTTTAACTTAATGATTGGTTTAGATGGCTACACCGTTGCCAGTGGTATTC
TAAATAGCAATCTAAATGGTGACCAGATTGTGGCTATCCCGCTAGATGTC
CCTGACGAAATTGACATTGTTTTTATCAAGCATGAAAAAGCCAACTTGTC
CAAAATGGGGGAACGTTTTATCGAATACCTTCTCGAAGAAGTAACCTTTG
ATTAA
>M5005_Spy1589 crgR, transcriptional regulator, GntR family
ATGTCTACTAACGACTTAACCAAAAAACTCAAAAAACTTAAACATGTGCA
AGTATATAATACTATTTTTCAACTTATTCAAGATGGTACATATAGTCCTG
GCATGCAACTGCCATCAGAACCTGAACTTGCTAGACAGCTCAATGTCAGT
CGGATGACACTACGTAAATCCCTAGCCCTCCTCCAAGAGGATCATCTCAT
AAAAAATATCAGAGGAAAGGGAAATTTTATACTCAAGACTCCTGAAACTA
AATATCACCAAGGTTTCGAATATCTTCAACACCCCATATATGCAAGCCTA
TCATCTGACATCACAAAGGTTGAGTTGGAATATCGGATTGAAGTGCCCAC
TGTTGCCATTACAGCATCCCTAAAACAAGAAACTCCTGTTGTGATTATTG
TTGATCGCTGGTATCATAGCCAAAATAAAGCTATTGCTTATAGTTTATCT
TTTATCCCTATTGAGGTTATTTCTAAATATGCTATAAATCTCAATCAAGA
AGAGCCCCTTCTTACTTTCTTAGAAGAGAAAATCTATGAATCTGGTAAAG
CTTCTCATTCCTGCAACCAAATCGGCTATACCAAGACTGGCAATTACACA
GCAACTAAGTATACTCTATCAGAAAATAGTGCTTTTATTTTAATCCAAGA
AACTCTCTACAATGGTAAAGACATCTTGGTCTCAACCAAACACTACGTTC
CTGCTGATTTATTTGACTTAAAAGTTCAATCTCAAAGTTGCTAA
>M5005_Spy1765 csp, cold shock protein
ATGTATATGGCACAAGGTACAGTAAAATGGTTTAATGCTGAAAAAGGTTT
TGGTTTTATTTCAACTGAAAACGGTCAAGATGTCTTTGCACATTTTTCAG
CCATCCAAACTAATGGTTTTAAAACGTTAGAAGAAGGACAAAAAGTGGCA
TTTGACGTCGAAGAAGGTCAACGTGGACCTCAAGCAGTCAATATCACTAA
ATTGGCCTAA
>M5005_Spy1764 ctsR, transcriptional regulator
ATGCCAACCAAAAATACTTCAGACAGCATTGAAGAGTATATTAAAGAATT
ATTAGCTAAGTCAGGAATAGCAGAAATTAAGCGGTCCATGCTAGCAGATT
CGTTTCAAGTTGTCCCAAGTCAGATCAACTATGTCATTAAAACCCGTTTT
ACGGAGAGTCGAGGCTATGAAGTAGAGAGTAAACGAGGTGGTGGAGGCTA
TATTCGTATTGCCAAGGTTCATTTTTCAGACAAACACCATCTGATTGGCA
ATTTAATGGCAACTATTGAAGACTGTATCAGTGAGCAAGTTTTCACGGAC
TCGATACAATTGCTTTTTGACGAACACTTATTGACAGAGCGTGAGGGAAA
TATCATTTTGGCTGTGGCGTCTGATGATGTTTTAGGAACTGATGGTTCAA
CTATTCGTGCACGAATGCTCTATCGCTTATTGCAACGAATTGACAGAAAG
GGAAGCAATTAA
>M5005_Spy1154 deaD, ATP-dependent RNA helicase
TTGAAATTTACAGAATTTAACTTATCACAAGACATCCAATCAGCTGTTGT
TACCGCTGGTTTTGAGAAAGCATCTCCTATCCAGGAAATGACGATTCCTC
TCGCACTAGAAGGGAAGGATGTTATTGGTCAAGCACAAACAGGAACTGGT
AAAACAGCAGCGTTTGGTCTACCAACCTTGAATAAGATTCGTACTAACGA
AAATATCATCCAAGCATTGGTCATTGCACCAACGCGTGAATTGGCTGTAC
AAAGTCAGGAAGAATTGTTCCGTTTTGGACGTGAAAAAGGGGTTAAGGTT
CGCTCTGTTTACGGTGGATCAAGTATTGAAAAACAAATCAAAGCCCTTAA
ATCAGGTGCCCACATTGTCGTGGGAACACCGGGTCGCTTGTTAGATTTGA
TTAAGCGCAAGGCTCTTATTTTAGATCATGTGGAAACCTTAATCCTTGAT
GAAGCAGATGAAATGCTTAACATGGGATTCTTGGAAGACATTGAAGCTAT
TATTAGTCGTGTCCCAGCAGACCGTCAAACCTTGCTCTTCTCCGCAACGA
TGCCGGCACCTATTAAACAAATCGGGGTTAAATTCATGAAAGACCCTGAA
CATGTTCAAATTAAGAACAAAGAATTAACAAACGTCAATGTTGATCAATA
CTATGTTCGTGTGAAAGAACAAGAAAAATTTGATACTATGACCCGTCTGA
TGGATGTTAACCAGCCAGAATTATCCATCGTTTTTGGGCGGACTAAGCGC
CGAGTTGATGAAATTACACGTGGCTTGAAACTTCGTGGTTTCCGTGCCGA
AGGAATCCATGGTGATCTTGACCAAAATAAACGCTTACGTGTTATCCGTG
ATTTCAAAAACGACCAAATTGATATTCTTGTTGCCACTGATGTAGCAGCG
CGTGGCCTTGATATTTCAGGAGTTACCCACGTTTATAACTACGATATTAC
CCAAGATCCAGAAAGTTATGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGTGCCG
GTAAATCTGGTGAGTCTATCACTTTTGTCTCACCAAATGAGATGGGCTAC
CTCTCAATGATTGAGAACTTAACGAAAAAACAGATGAAACCTCTTCGTCC
AGCAACTGCTGAAGAGGCCTTTCAAGCCAAGAAAAAAGTAGCCCTCAAGA
AAATTGAACGCGACTTTGCGGATGAGACTATTCGTTCAAACTTTGATAAA
TTCAAAGGCGATGCTGTCCAATTGGCTGCCGAATTCACTCCTGAAGAATT
AGCTTTATATATTTTGAGCTTAACGGTTCAAGATCCAGATAGCTTACCGG
AAGTTGAAATTGCACGTGAAAAACCATTACCATTCAAATATGTGGGTGGT
GGTCACGGCAATAAAAATGGCAAAGGTGGTCGTGGACGTGACAACCGTAA
CCGTGGTGATCGCCGTGGCGGCTATCGTGGTGACCGTAACAGAGATGAGC
GTGATGGTGACCGTCGTCGTCAAAAACGTGATAAGCGTGATGGTCACGAT
GGCAGTGGCAACCGCGATTTCAAACGTAAATCAAAACGTAATAGTAAAGA
CTTTTTCAATAAAGAGAAAAAATCAAGTGCTAAAAATACTGGTTTTGTGA
TTCGTCACAAAGGTGAATAA
>M5005_Spy1117 deaD2, ATP-dependent RNA helicase
ATGATCACTAAATTTCCCCCTCAATGGCAAGAAAAACTTGACCAAGTTGC
ATTTACCCATTTAACGCCAATCCAAGAACAGGCCTTTCAACCTATTGTTG
ATGGTAAAAATTTCCTTGGTATTAGCCCTACTGGGACGGGCAAGACCTTA
GCTTATGTCTTTCCTAGTCTATTGGCACTGACGCCTAAAAAGTCCCAACA
ACTACTCATTTTAGCCCCTAATACCGAATTAGCTGGCCAAATTTTTGAAG
TCACAAAGGATTGGGCACAGCCACTAGGCTTAACGGCACAACTCTTTATT
TCTGGAACCAGTCAAAAACGTCAAATCGAACGCCTCAAAAAAGGTCCTGA
AATCCTGATTGGAACCCCTGGACGCATTTTTGAGCTGATTAAATTGAAAA
AAATCAAGATGATGTCTGTCAACACCATTGTTTTAGATGAATATGACGAA
CTATTAGGTGATTCCCAATATGATTTTGTTCAAAAAATTAGCCACTATGT
TCCTCGAGATCATCAAATGGTATACATGAGTGCTACTAATAAGGTGGATC
AAACTTCCTTAGCTCCAAATACATTCTGCATCGATCTTTCAGAGCAAACC
AACGATGCTATTCAGCATTTTTACCTCATGGTTGACAAGCGCGAACGTAC
AGATTTATTACGAAAATTTACTAATATTCCTCATTTTAGAGCTTTGGTCT
TTTTCAACAGTTTATCTGATTTGGGTGCTACGGAAGAACGTCTCCAATAT
AATGGAGCTGCTGCGGTTTCCTTAGCGAGTGACATTAATGTCAAATTCCG
TAAAACCATTCTCGAAAAATTCAAATCCCACCAACTCTCCTTATTGTTAG
CTACGGATCTTGTTGCTCGGGGCATTGATATTGATAATCTTGACTATGTC
ATTCATTTTGATGTTGCTCGTGATAAGGAAAATTACACTCACAGAGCTGG
ACGAACCGGCCGTATGGGAAAATCTGGTATCGTTATTACCTTTGTTAGCC
ACCCTGAAGACCTCAAAAAATTGAAAAAATTTGCTAAAGTCTCTGAAATC
TCCCTCAAAAATCAACAACTTCATTTCATCAACTAG
>M5005_Spy0536 dinG, ATP-dependent helicase
ATGACCCAGAAAAAACTTAGAAAATATGCAGTAGTTGACTTGGAGGCTAC
TGGAGCAGGTCCCAATGCTTCTATTATTCAGGTTGGGATTGTTATTATCC
AAGGAAATAAAATTATTGATAGTTATGAAACAGATGTTAATCCTCATGAA
TCTTTGGATGAGCATATTGTTCATTTGACAGGTATTACGGATAAGCAGTT
GGCTAAAGCTCCGGATTTTGGTCAAGTGGCGCATCACATTTATCAATTGA
TTGAAGATTGTATTTTTGTTGCCCACAATGTAAAGTTCGATGCAAATTTA
TTGGCAGAAGCTCTTTTTTTAGAAGGATATGAGTTAACAATACCACGTGT
TGATACTGTTGAATTAGCCCAACTATTTTTCCCTCGCTTTGAAAAGTATA
ACCTTAGTCACCTATCTAGGCAGCTCAATATTGATTTGGCAGAAGCTCAT
ACTGCTATTGCAGATGCAAGAGCTACAGCTATACTGTTTTTAAGACTTTT
ACAAAAAATTGAGAGCCTTCCAATTGAGTGCTTAGAAAGCTTATTAGTCT
ATTCAGATAGCCTGCTATTTGAAACAGCAATGGTCATTCAAGAAGGATTA
GCCAAAGCCAAACCTTATGATCCCAACAAATACATTAAAATCAGACAGAT
TCTCTTACCAAAGGGCTCAAAAGCTCTCAAGCCTTATCAAATATCAAAAA
GCTTCCCTATTAATATGGCACTATTAGGTCTGGAAGAAAGGCCTAAACAG
ACTCAATTTGCTCAGTTAATTGACGAAGATTACCATCAGGGAGTAGCTAG
TTTTATTGAAGCTCAGACAGGTATTGGAAAAACCTACGGCTACCTGCTAC
CCCTTTTGGCAAAAGAAGATCAAAACCAAATCATTGTCAGTGTGCCCACC
AAACTTCTTCAAGACCAATTAATGGCTGGTGAAGTAGCTGCTATTCAAGA
ACAATTTCACATCGCCTGCCATAGTTTAAAAGGGCCCGCCAATTACCTAA
AGCTAGATAGCTTTGCAGATAGTTTGGACCAAAATGACCAGAACCGTTTG
GTGAATCGTTATAAAATGCAATTATTGGTTTGGCTCTTAGAAACTAAGAC
AGGAGACCTTGACGAAATCAAACAAAAGCAGCGCTTTGCAGCTTATTTTG
AGCAGCTTAAGCACGATGGAGACATTAAGCAGTCTTCTGAATTTTACGAT
TACGATTTTTGGAGAGTTAGTTATGAAAAAGCCAAAACAGCCCGTCTCCT
GATTACCAACCATGCTTATTTTTTACACCGTGTTCAAGATGACAAGGACT
TTGCTAGAAACAAGGTCTTGGTCTTTGATGAGGCCCAAAAGCTGATGCTC
CAATTAGATCAATTATCACGTCATCAGCTTAACCTGACGGTTTTTTTACA
AACAATACAGGCCAAGTTAAGCAACCCTTTACCTCTTTTAGAAAAACGCT
TATTGGAAAGCTTGTCGTTTGAACTGGGACAAGTGTCAAGTGATTACTAT
CAAAATAAAGAGCACCAGCTTGCTCATGATTGGTCTCGTATAGCTGGCTA
CGCCAAAGAATTAACAGGAGCAGATTATCAAGAGTTACAAGCCTTTTTTG
CTACCTCAGATGGTGACTACTGGCTTAGTAGCGAAAAGCAAGAGGAGAAG
CGAGTGACTTATCTAAACAGTGCTAGTAAGGCATTTATTCATTTCCAACA
GCTCTTACCAGAAACGGTGAAAACTTATTTTGTTTCTGCCACTTTAACCA
TCAGCTCAGAAGTAACCTTGGCAGACCTATTAGGTTTTGAAGAGTATCTC
TATCATGTCATTGAAAAGGATAAAAAGCAAGACCAGTTGGTGCTTGTTGA
TCAAGAGGCGCCTATCGTGACAGAAGTCAGTGACCAAATCTATGTGGAAG
CAATTGCAAAACGAATCGAAAGCTTGAAGCAAGAGGGTTATCCTATTTTA
GTGCTTTTTAATTCTAAAAAACACTTGCTGTTGGTTTCAGACTATCTAGA
CCAATGGCAGGTGCCTCACTTAGCGCAGGAAAAGAATGGAACAGCTTATA
ATATTAAAAAACGGTTTGATCAAGGAGAGCAAACTATTTTGCTTGGTTTA
GGTTCTTTTTGGGAAGGAGTTGATTTTATTCAAGCGGATCGTATGATTAC
CCTTATCGCACGATTGCCCTTTGATAACCCAGAGGATTTCTTTGTTAAGA
AAATGAGTCATTATCTATTGGAAAAAGGTAAAAATCCTTTCAGAGATTAC
TTCTTGCCAATGACTATTTTGCGATTAAAACAGGCTATTGGTCGCACGAT
GCGTCGACAAGATCAAAAGTCAGTGGTTATTATTTTGGATCGTCGTCTCC
TTACAAAGTCCTATGGACAAGTTATTTTGGAAGGTCTCGGTCAGGAATTT
TTGATTTCTCAACAAAATTTTCACGATTGTCTAGTAGAAACGGACTGTTT
TCTGATATAA
>M5005_Spy0830 dpiA, transcriptional regulatory protein
ATGAACGTTTTAATCATTGAAGATGATCCTATGGTGGATTTTATCCATCG
CAATTACCTCGAAAAACTAAATCTTTTTGATCGCATTATATCCAGCGACT
CTATGAAAGCTGTTCAAAGCATACTTACTGATTACGCAATTGACCTCATT
TTACTGGATATTCATATTACAGATGGCAATGGGATTCAATTTTTGGAGAA
ATGGCGTACTCAGCATATTCCTTGCGAAGTCATTATTATTTCAGCCGCAA
ATGATGGGAATATTATCCGAGATGGTTTTCATTTAGGAATTATCGACTAC
CTCATCAAGCCCTTTACCTTTGAACGCTTTCAAGAAAGCATCCAACAGTT
TGTTACACATCGAGAACATTTGGCCAATCAGCAACTAGAGCAGGCCCAAA
TTGACCAACTGAAATGTTTGACTAGCAAAAAAGACACTAAAAACAAACAA
TTGTTAGAAAAAGGCTTATCTGAATCCACTTTCCAGTGGATTATGGAAAA
TATCAAAGTCTTTGATCAACCTTTTACTATCCAAGAATTAGCTTCCGCTT
GTCACTTATCCCATGTCTCTGTCCGTAAATACATTGCTTATTTAGAAGAA
AATAAGCAACTGAACAGCCAACAAATTTTTACAAAGGTTGGCCGCCCCTA
TCGCGTGTACTGGTGA
>M5005_Spy0206 fasA, response regulator
ATGATGAACATTTTTATTCTTGAGGATGATTTTATCCAGCAGACACGCAT
AGAATCTATCGTAGTAGGCATCTTAAAAGAGACTAGAATACCATGTAATC
AGCTTGAAGTGTTCTCGACTCCTCAAAAATTATTTGAGAGTATCCAAGAA
AGAGGAGACCATCAGCTGTATTTTTTAGATATTGAAATTGGTGAATATAC
TCGTTGTGGGCTTGAATTAGCTGCAGCTATTCGACAAAAAGATCCTAATG
CCGTTATTGTGTTTGTCACCACTCATTCAGAATTTGCTCCTATTTCTTTT
AAATATAAGGTATCCGCTCTAGATTTTATTGATAAAGCAGGTGGTCAAAA
ACAGTTTAAAGAACAAATCGAAGAATGTATCCGATATACTTACGATATGA
TGTCTAGTCGTGAGTCAAAGGACATGTTTTTATTTGAGACTCCACAGACA
AGATTAAAATTGCCCTATAAGGATATTTTATACTTTGCTACAGCCACAAC
TCCTCACAAAGTTTGTTTATGGACTCAGACAGAAAGATTAGAGTTTTATG
GTAATCTATCTGAGATTCAAGCAGTAGCACCGAAACTTTTTTTGTGCCAT
AGATCCTACCTTGTGAATCTAGATAAGGTTGTTCGAATTGATAAGAGTAA
GCAGCTCCTTTATTTCGAAAATGGTGATTCTTGTATGGTATCACGATTAA
AAATGAAATGTCTGTTTGAACGGTGGGAGGCTCTTCGCTAA
>M5005_Spy0740 fbp, fibronectin-binding protein
ATGGGGAAGCACAGTAATATCATCTTGGTGGACCGTGCAGAAAATAAAAT
CATCGAATCCATTAAACATGTTGGTTTTTCACAAAACTCTTACCGCACCA
TTTTACCTGGCTCTACCTACATTGAGCCTCCTAAAACAGCTGCTGTTAAT
CCTTTTACAATTACAGATGTGCCTCTATTTGAAATCCTCCAAACACAAGA
ACTAACAGTTAAAAGCTTGCAACAGCATTTTCAAGGTTTGGGGCGAGACA
CCGCAAAAGAGTTGGCCGAGCTTCTGACCACAGACAAATTAAAACGGTTC
CGTGAGTTTTTTGCTAGACCTACTCAGGCAAATCTGACCACAGCTTCTTT
TGCGCCTGTTCTTTTCTCAGATAGTCATGCGACGTTTGAGACTTTGTCTG
ACATGCTTGACCACTTTTATCAAGACAAGGCTGAGCGTGACCGTATCAAT
CAGCAAGCCAGTGATTTGATCCACCGTGTGCAAACTGAACTGGACAAAAA
TCGCAACAAGCTAAGTAAGCAAGAAGCTGAGCTGCTAGCCACTGAAAATG
CTGAGTTGTTCCGTCAAAAAGGAGAATTATTGACCACCTACCTCAGTCTG
GTCCCAAACAACCAAGACTCTGTGATTTTAGACAATTATTATACAGGGGA
AAAAATTGAGATTGCCTTAGACAAGGCTCTGACACCAAATCAAAATGCTC
AACGTTATTTTAAAAAATACCAAAAGCTAAAAGAAGCTGTCAAACACTTA
TCTGGATTGATTGCCGATACCAAGCAAAGTATTACTTACTTTGAGAGCGT
AGACTACAATTTATCTCAAGCAAGTATCGACGACATCGAAGATATTCGCG
AAGAATTATATCAGGCTGGCTTTTTGAAAAGTCGCCAAAGAGACAAACGC
CATAAACGTAAAAAGCCTGAGCAGTACCTGGCTTCAGATGGAACAACCAT
TCTCATGGTGGGACGCAATAACTTGCAAAATGAAGAACTCACCTTTAAAA
TGGCTAAAAAAGGAGAACTCTGGTTCCATGCTAAGGATATCCCTGGAAGT
CATGTCATCATCAAAGACAATCTTGACCCAAGTGACGAGGTTAAAACTGA
TGCTGCCGAACTAGCTGCTTATTATTCGAAAGCTAGGTTATCAAATCTCG
TTCAGGTCGATATGATTGAAGCTAAAAAATTACACAAACCTAGTGGCGCC
AAGCCAGGATTTGTGACTTATACTGGTCAAAAAACTTTACGGGTTACTCC
TGACCAAGCCAAAATTCTCTCTATGAAATTATCCTGA
>M5005_Spy0660 fruR, fructose repressor
ATGGCAAAGATCACTGAAGAAAACTATGTTTCTTTAGAGGATTTAATGCA
ATTACTCAACTCCTCTGAGTCTACTATCCGTAGAGATCTAGGAGAGTTGG
AGCAAGAAGGACGGCTACATCGTGTTCATGGAGGTGCTGAACTTTTTCAC
TCTTTACAAGAGGAACTTTCGAACCAAGAAAAGTCTGTCAAAAACAGTCA
TATTAAAAAAGCTATTGCGCAAAGAGCCTCTCAGCTTATCTATGACAACG
ATGTGATCTTTATTGATGCTGGGACAACGACTGAATTTTTATTACCTTTT
TTACAAGCTAAAAATTTAACTGTAGTTACTAATTCTATTCATCATGCTGC
TAGATTAGTTGAACTCTCTATTGAGACGATTATTGTAGGGGGTTATGTCA
AACAAACGACCGATGCCAGTATTGGTAACGTAGCTTTGGAACAGATTAGG
CAGATGAATTTTGACAAGGCATTTCTTGGAATGAATGGTGTTGATGATTC
TTACCTGACGACTCCTGATATGGAAGAAGCAGTTATTAAAAAAGCGGTTC
TGTCAAATGCAAAATTAGCTTACATTTTAGTAGATGGCACTAAAATTGGT
CAGGTATCGTTTGTAAAAGTAGCTCCTATTAATGATGTGACTATTATTAC
ATTAGGAGGATCAGCAAGTATTCTTAAACAAATAAAGGAAAAGGCAAAGG
TGATTGAATTATGA
>M5005_Spy1257 glcK, glucokinase/Xylose repressor
ATGAGTCAAAAATTACTGGGGATTGATTTAGGTGGTACCACCATTAAATT
TGGAATTTTAACAGCAGCAGGAGAAGTCCAAGAAAAATGGGCAATTGAGA
CTAATATTTTAGAAGGAGGCAAACATATTGTCCCTGATATCATCGCTTCC
ATCAAACATCGCTTAGACTTGTATGGTCTAAGCAGTGCTGACTTTGTGGG
AATTGGTATGGGATCACCAGGAGCGGTTGACCGTGATACTAATACAGTTA
CTGGGGCATTCAACCTTAATTGGAAAGAAACCCAAGAAGTCGGTTCCGTT
GTTGAAAAAGAATTGGGCATTCCTTTTGCCATTGACAATGATGCCAATGT
GGCTGCCCTTGGTGAACGTTGGGTAGGTGCTGGTGAAAATAACCCAGATG
TCGTCTTCATGACACTTGGAACAGGTGTCGGTGGAGGCATTATTGCTGAT
GGTAACTTGATTCATGGTGTTGCAGGAGCAGGTGGTGAAATCGGCCACAT
GATTGTTGAGCCAGAAAATGGCTTTGCTTGTACTTGTGGCTCACACGGCT
GTTTGGAAACAGTAGCTTCAGCAACAGGAGTTGTCAAAGTGGCACGTTTA
CTGGCAGAAGCCTACGAAGGGGATTCAGCCATCAAAGCAGCTATTGACAA
TGGTGAAGGTGTTACCAGTAAAGACATTTTCATGGCGGCTGAAGCAGGGG
ATTCCTTTGCTGATTCTGTTGTGGAAAAGGTTGGTTACTACCTTGGCCTT
GCTTCAGCAAATATTTCCAATATCTTGAATCCAGACTCAGTGGTTATCGG
TGGGGGTGTGTCAGCAGCAGGAGAATTTCTACGCTCACGTATTGAAAAAT
ACTTTGTGACCTTCACTTTCCCACAAGTGAGGTATTCAACTAAAATTAAG
ATTGCAGAACTTGGCAATGATGCTGGAATTATCGGTGCAGCTAGCCTTGC
TCGACAATTTATCACAAAATAG
>M5005_Spy0293 greA, transcription elongation factor
ATGTTTGTGTTTCTGATTCGTTCAAAAAAGAAAAGAGAGAAAACAATTAT
GGCAGAAAAAACGTATCCGATGACCCTAACGGAAAAAGAACAACTTGAAA
AAGAACTTGAAGAATTAAAACTTGTGCGTCGTCCAGAAATAGTGGAGCGT
ATTAAAATTGCACGTTCGTATGGAGATCTTTCAGAGAACTCTGAATACGA
TGCCGCAAAAGATGAGCAAGCTTTTGTTGAAGGTCAAATTTCAACGCTTG
AAACTAAGATTCGCTATGCTGAAATCATTGACAGTGATGCTGTTGCAAAA
GATGAAGTCGCTATCGGAAAAACAGTTATCGTTCAAGAAGTTGGAACAAC
AGATAAAGATACTTATCATATTGTAGGTGCTGCTGGAGCAGATATCTTCT
CCGGAAAAATTTCAAATGAAAGCCCGATTGCTCAAGCTTTGATTGGTAAA
AAAACAGGTGACAAGGTTAGAATTGAATCACCAGCAGCTACTTATGATGT
TGAAATCATCAGCGTTGAAAAGACAAATTAA
>M5005_Spy1500 hrcA, heat-inducible transcription repressor
GTGATTACACAACGTCAAAATGATATTTTGAATTTAATCGTTGAGCTATT
TACACAAACTCATGAACCAGTAGGGTCTAAAGCTTTACAGAGAACGATTG
ATTCTAGTAGCGCCACTATTCGTAATGATATGGCAAAACTAGAGAAGTTG
GGATTGTTGGAAAAAGCGCACACTTCTAGTGGACGGATGCCAAGTCCAGC
TGGTTTTAAGTATTTTGTAGAGCACTCCCTCAGGCTAGATAGTATTGATG
AGCAAGATATTTATCATGTCATAAAAGCTTTTGATTTTGAAGCATTCAAA
TTAGAAGACATGCTTCAAAAAGCTAGTCACATTTTAGCGGAGATGACGGG
CTATACATCCGTTATTTTAGATGTGGAGCCAGCTCGTCAACGTTTAACAG
GGTTTGATGTTGTTCAGCTTAGCAACCATGATGCTCTAGCAGTCATGACT
TTAGATGAATCTAAGCCAGTGACAGTGCAGTTTGCTATTCCAAGAAACTT
TTTGACACGTGACTTGATAGCATTTAAAGCTATCGTAGAGGAGCGCTTGC
TGGATAATAGTGTCATAGATATTCATTATAAGTTGAGGACAGAAATTCCT
CAGATCGTTCAAAAGTATTTTGTGACTACGGATAATGTTTTACAACTATT
TGATTATGTTTTTTCAGAGCTGTTTTTGGAAACGGTATTTGTTGCTGGCA
AGGTAAATTCTTTAACGTATTCAGATCTATCAACGTATCAGTTTTTGGAT
AATGAACAGCAAGTAGCAATTTCTTTGAGGCAAAGTCTGAAAGAAGGTGA
GATGGCTTCTGTCCAAGTGGCAGATAGTCAAGAAGCCGCACTTGCAGATG
TGTCAGTTTTAACTCACAAATTTTTGATTCCTTACCGTGGGTTTGGACTC
CTGAGTTTGATTGGTCCTATTGATATGGATTATCGTAGGTCTGTTAGTTT
GGTAAACATTATTGGAAAGGTATTGGCTGCTAAATTAGGTGATTATTATC
GATACCTAAATTCTAACCATTATGAAGTTCACTGA
>M5005_Spy1725 irr, two-component response regulator
ATGTTTAAAATATTAGTAGTTGAAGATGATGATACCATCAGTCAAGTGAT
TTGTGAGTTTTTAAAAGCGAATAACTATGATCCAGATTGTGTATTTGATG
GCCAAGCTGCCTTAGACAAGTGGCAGACAACGTCTTATGATCTGATTATT
TTAGACATCATGCTCCCTTCCTTAAGTGGCTTAGAAGTGCTAAAAACAAT
TCGAAAGACATCAGATGTCCCTATTATTATGCTAACGGCATTAGATGACG
AGTACACACAGCTTGTAAGCTTCAACCATTTGATTAGTGATTATGTGACC
AAACCATTTTCACCACTCATTTTAATCAAACGTATCGAAAATGTATTACG
CGTCTCTACTCCAGATGAAAAGCGCCAAATCGGAGACTTACTTGTTGATG
AGACCGAACATAGCGTCTATTGGCAAGGAACATTGGTCAAACTAACCAAA
AAAGAATATGACATTATTGATTATTTAGCAAAACGTCACCAAAAAATTGT
CACCAGAGACCAATTGATGGATGACATATGGGGCTATTCTGAACTGGACA
CGCGTGTCCTTGACAACCACATCAAGAACCTTCGTAAAAAAATGACGGGT
ATTCCCCTCAAGACAATTACAGGCATGGGCTATTTATTGGGAGAGCGTGA
GTGA
>M5005_Spy1402 lacR.1, lactose phosphotransferase system repressor
ATGTTAAAAAGAGAAAGACTTCTAAAAATTACCGAAATAGTCAATGAGCA
AGGTATTGTTACTGTGAATGATATTATTCAGACTTTAAACGTTTCTGATA
TGACAGTTCGTAGAGACTTAGATGAACTGGAAAAAGCCGGCAAATTGATC
CGCATCCATGGAGGTGCACAAAGCATTACCATGCCTAATAAAAAAGAGCG
GTCAAATATTGAAAAACAAACCGTTCAAACAAAGGAAAAATGGGAACTAG
CTTCATATGCGACACAACTAGTCAATGATGGTGAAACAATCTTTATTGGT
CCAGGAACAACTTTAGAATGTTTCGCTGAGCAGTTAAAAAATCGTCAGAT
TCGCATTGTGACCAATAGCCTCCCTGTCTTTAACATCCTTCAGGACAGCG
AAACCATTGACCTGATTCTTATCGGTGGTGAATACCGATCTATTACAGGA
GCTTTTGTAGGGTCCCTTGCCAGTCAAAATATCTCATCCTTAAAATTTGC
CAAGGCTTTTATTAGCTGTAATGGTATTTATAAAAACGATATTGCAACTT
ATAGCGAAACTGAAGGAGAGATTCAAAAGCTAGCTTTTAATAATTCTATT
GAAAAATACCTCTTGGTAGATAACCAAAAATTCAATGCCTACGACTTCTT
CATTTTTTACCATTTAAACAACATTGATGCTGTTGTTACAGATTCGCAAA
TAACTGAGGACGTTATCGAACGTTATAGTCAGTTCACGCAATTATTAGTA
GCCCACGAAAACAAGGAGTAA
>M5005_Spy1639 lacR.2, lactose phosphotransferase system repressor
ATGAAAAAGAAAGAGCGTCATGAAAAAATTCTCGATATCTTAAAAGTTGA
CGGTTTTATAAAAGTAAAAGATATTATCGATGAAATGAACATCTCAGATA
TGACCGCTAGACGAGATCTCGATACATTGGCAGATAAAGGATTACTTATC
AGGACCCATGGTGGTGCTCAATATTTGGATTATTCTTCAGCAAAGGACGA
AGGTCACGAGAAAACACACACTGAAAAGAAGGTCTTACAGACTACCGAAA
AAAAACAAATTGCACAAAGAGCTAAAAACATTATTAAAGATGGCGAAACT
GTCTTTATAGGTCCAGGGACAACATTAGAGCATCTAGCTGTCGAATTGAA
AAATAGAAATATCAGAGTTATTACAAATAGCCTTCCTGTTTTTTTAATTT
TGCACCCGAGCACTACTATTGATTTGATTTTAATTGGTGGTGAATGTCGT
GAAATTACTGGTGCTTTTGTTGGTGCTATTGCCATTAATAACCTAGAAAC
ATTAACATTTTCAAAAGCTTTTGTCAGCGCAAACGCAGTTTACAATAATT
CTATTGCGACGTACAGTGATCTCGAAGGAGAAGTTCAAAGGGTTGCATTG
AATAATGCTGTTGAGAAAATCCTTCTAGTTGATAGTACCAAGTTTGAAAG
TTATGACTTCTATAATTTTTACCAACTAGATCAAGTGGACTTAATTGTGA
CTGATAAAAATGTGACAACTGATATCATAGAAAAGTACAAGAAATTCTCA
AAAATCATAATCGCTGACAAGTAA
>M5005_Spy0474 licT, transcription antiterminator, BglG family
ATGTTGATTAAACGCGTTTTAAACCATAATGCGGCGATTTCGACCAACCA
TCAAGGATTAGATATTTTATTGATGGGAAAAGGGATTGCCTTTGGAAAAA
AAGTTGGAGATAGTATTGAGCTTAATGCTATCGAAACATCATTTGTTTTA
AAAAATAGTGACAATATGAATCGCTTCACAGAGTTATTTATTACGGTGCC
ACAAGAAGTTGTTGCTTGCTCAGAGAGAATTATCAATCTAGGTAAAATTA
AATTAGGCAAAACCTTAGATGAAATTCTCTATATTAATTTAACGGATCAT
ATTCACTCTGCTATTGAAAGGCATGAGCAAGGAATGTTGATTCATAACCC
ACTACGGTGGGAAATTCAACGCTATTATCCTGATGAATATAGTCTAGGGG
TAAAAGCCTTAGAGCTAATTGAGCGTAATCTAGGAGTCACTCTAGCTATT
GATGAAGCAGCTTTTATTGCCATGCATTTTGTCAATGCTAGTTTGGACAC
TCCTTTTAAGGAGCCACATCGCCTGACGGAGATTGTTTCTTATATTGAGC
AAAAAATCAAAACAGACTTCAAAACAGAATTGGATGACACATCCATCGAT
TATTACCGCTTTATGACCCATATTAAATTATTTGCTCAACGTGTGTTATC
ACAGATGTCTTACGATGATGATGATGCGGAACTGCTTTTAGTGGTGAAAA
CGAAATACCCTAAAGAATATCGGTGCGTCTTAGATATTAGTGAGGAGATA
AAAAAGCGGTACAACTACCACCTTAATTCAAGCGAACTTTTGTATTTGAC
GGTTCATGTTAAACGTTTAGTGAAACATTTAAAGGAGACTTAA
>M5005_Spy1474 lytR, transcriptional regulator, LytR family
ATGAAAATTGGAAAAAAAATAGTTTTAATGTTCACAGCTATTGTGTTAAC
AACTGTCTTGGCATTAGGTGTCTATCTAACTAGTGCTTATACCTTCTCAA
CAGGAGAATTATCAAAGACCTTTAAAGATTTTTCGACATCTTCAAACAAA
AGTGATGCCATTAAACAAACAAGAGCTTTTTCTATCTTGTTGATGGGTGT
TGATACAGGCTCTTCAGAGCGTGCCTCCAAGTGGGAAGGAAACAGTGATT
CGATGATTTTGGTTACGGTTAATCCAAAGACCAAGAAAACAACTATGACT
AGTTTAGAACGAGATACCTTAACCACGTTATCTGGACCCAAAAATAATGA
AATGAATGGTGTTGAAGCTAAGCTTAACGCTGCTTATGCAGCAGGTGGCG
CTCAGATGGCTATTATGACCGTGCAAGATCTTTTGAATATCACCATTGAT
AACTATGTTCAAATTAATATGCAAGGCCTTATTGATCTTGTGAATGCAGT
TGGAGGGATTACAGTTACAAATGAGTTTGATTTTCCTATCTCGATTGCTG
AAAACGAACCTGAATATCAAGCTACTGTTGCGCCTGGAACACACAAAATT
AACGGTGAACAAGCTTTGGTTTATGCTCGTATGCGTTATGATGATCCTGA
GGGAGATTATGGTCGACAAAAGCGTCAACGTGAAGTCATTCAAAAGGTAT
TGAAAAAAATCCTTGCTCTTGATAGCATTAGCTCTTATCGGAAGATTTTA
TCTGCTGTAAGTAGTAATATGCAAACGAATATCGAAATCTCTTCTCGCAC
TATCCCTAGTCTATTAGGTTATCGTGACGCACTTAGAACTATTAAGACTT
ATCAACTAAAAGGAGAAGATGCCACTTTATCAGATGGTGGATCATACCAA
ATTGTTACCTCTAATCATTTGTTAGAAATCCAAAATCGTATCCGAACAGA
ATTAGGACTTCATAAGGTTAATCAATTAAAAACAAATGCTACTGTTTATG
AAAATTTGTATGGGTCAACTAAGTCTCAGACAGTAAACAACAACTATGAC
TCTTCAGGCCAGGCTCCATCTTATTCTGATAGTCATAGCTCTTACGCTAA
TTATTCAAGTGGAGTAGATACCGGCCAGAGTGCTAGTACAGACCAGGACT
CTACTGCTTCAAGCCATAGGCCAGCTACGCCGTCTTCTTCATCAGATGCT
TTAGCAGCTGATGAGTCTAGCTCATCAGGGTCTGGATCATTAGTTCCTCC
TGCTAATATCAACCCTCAGACCTAA
>M5005_Spy1057 malR, transcriptional regulator, LacI family
ATGGTAACAATAAAAGATGTCGCTCAAAAGGCAGGTGTTAACCCTTCGAC
GGTGAGTAGGGTATTAAAAGATAATCGATCTATTTCTATGAAGACAAAAG
AGAAGGTTAGAAAAGCGATGGCAGATTTGGGATATGTTCCAAATGTCGCA
GCACAGATTCTAGCGAGTGGTTTGACACACAATATAGGACTTGTTTTTCC
TCCTATTACAACTAGCGATAGATTAAGTGAACCTTTCTTTATGGAAATTT
TGTCGACTATTACTAACGAAGCTAAAGAATCTCATTTTACTGTGTCGATT
GCTACAGGTATATCTCTTGATGACCTGATAGAGCAAGTGAAACTGATGCA
TCTTCAAAAACGAGTTGATGGTTTTATTATTCTTTATTCTGATCAAGATG
ATCCTGTCAAAAAATATTTGATGACAAATAACTTACCATTTGTCATTGTA
GGTGCTCCACAAGGTGACACTAATAAAACCACTTATATTGATAATGATAA
TCAGCTAATGGCTAAAACAGCAGTAGAACACCTTTATCAAAAAGGCCATC
ACAACATATTATTTATAACAGATGATTTACTATCAGAAGTAACTTCTGAG
CGTTATCTTGGCTATTTGAAGGGTTGTTTTAAGCGATCTTTAAAAACAAA
GCCAATGCTGTTATTTGATCGTAAGGATCCTGTTAGCGTAGAAATATTGA
TGGAAACTATATCTTCCTTTAAAGCAACTGCCTTGGTTGTTGTTGGTGAT
GTTCTGGCTATTCGTATGGTACAGTTATTATCTTTTTATGATATAAAAGT
GCCAGATGATATGTCAATTATCACTTTTAATAATTCTAATTACGCTAAAT
TAATTCACCCTTATTTAACGACATTTGATATAAATGTTGAAAATCTTGGA
AAAATGTCTTTTAAGCAATTACTTGATATTATCAATTCCAATGAACAGAA
TCTTAGTCAGACTATTTTTGTTCCTTTTAGTTTAAAACAAAGAGAAAGCG
TCCGTGATATTAGTCATTAA
>M5005_Spy1720 mga, trans-acting positive regulator
ATGTATGTAAGTAAGTTGTTTACAAGTCAACAGTGGAGAGAACTAAAATT
AATCTCATACGTAACAGAAAACGCTGACGCCATTGGCGTCAAAGATAAAG
AACTCAGCAAAGCTCTCAACATCTCCATGTTAACATTGCAAACATGTCTC
ACTAACATGCAATTTATGAAGGAAGTGGGAGGAATTACCTATAAAAATGG
TTATATTACAATCTGGTACCATCAACATTGCGGTTTGCAAGAAGTCTATC
AGAAAGCTCTGAGACACTCTCAATCATTTAAATTGCTGGAGACCCTTTTT
TTCAGAGACTTCAACTCTTTGGAAGAATTAGCTGAAGAGCTCTTTGTGAG
CCTTTCAACACTCAAGCGTCTCATCAAAAAAACCAATGCCTATTTGATGC
ATACCTTTGGTATTACTATTTTAACTAGTCCCGTACAAGTATCAGGAGAT
GAACACCAGATTCGACTATTTTACCTCAAGTATTTTTCGGAAGCCTATAA
AATCTCAGAGTGGCCTTTTGGGGAAATCCTAAACTTAAAGAACTGTGAGC
GGCTACTCAGTTTAATGATAAAAGAGGTCGATGTGAGGGTTAATTTTACA
TTATTTCAGCACCTTAAAATACTAAGCTCAGTTAACTTGATTCGTTATTA
CAAGGGACACTCTGCCGTCTACGACAACAAAAAAACCAGTCAACGTTTTT
CTCAGCTCATCCAATCATCCTTAGAATTCCAAGACCTTTCACGCTTGTTT
CACCTCAAATTTGGACTATACCTAGATGAGACTACCATAGCTGAGATGTT
CTCTAATCACGTTAATGACCAATTAGAAATCGGTTATGCGTTTGATAGCA
TCAAACAAGACTCACCAACGGGCTGTCGAAAAGTGACCAACTGGGTTCAT
CTCCTTGATGAGTTAGAAATCAGGCTCAATCTCAGCGTCACCAACAAATA
CGAAGTAGCTGTCATCCTTCATAACACTACCGTATTGAAAGAAGAAGATA
TCACAGCTAATTACCTATTTTTCGATTACAAAAAAAGTTACCTCAACTTT
TACAAGCAAGAACACCCTCATCTTTATAAAGCATTTGTAGCAGGTGTAGA
AAAACTGATGCGTTCAGAGAAAGAACCTATCAGCACAGAGTTGACTAACC
AATTGATCTACGCCTTTTTCATCACTTGGGAAAATAGTTTCCTAAAAGTA
AATCAAAAAGATGAAAAAATTCGTCTTCTGGTGATTGAAAGAAGTTTTAA
CAGTGTTGGTAATTTCCTAAAAAAGTACGTCGGAGAGTTTTTTAGCATCA
CAAACTTCAATGAGCTAGATGCTCTGACCATCGATCTAGAAGAGATTGAA
AAACAGTATGATGTGATCGTGACAGATGTTATGGTAGGAAAAAGCGAAGA
GCTAGAAATTTTCTTTTTCCACAAAATGATTCCAGAAGCGATTATTGACA
AGCTCAATGCGTTTTTAAACATCAGCTTTGCAGACAGCTTGCCACTAGAC
AAACCCATCAACCCCTTGGACTTTCATCGCAAAGAGGTTATCTTACCCAC
TCCCCCCAACAAGTTGCATGCCCCCCCCTCCACAACTTAG
>M5005_Spy0407 mutR, transcriptional regulator
ATGGAAAAAGAACTCGGAAAAACCTTAAGGCGATTACGTAAGGGTAAGCA
GGTTAGCATTTCTTTTTTAGCAGATGAATACCTGTCCAAGTCACAAATTT
CAAGATTTGAACGAGGGGAATCAGAAATCACCTGCAGTCGCTTGCTTAAT
CTTTTGGATAAACTGAATATTACGATTGACGAATTTGTTTCGGCTCATTC
CAAGACGCATACGCATTTTTTCACGCTCTTAAGTCAGGCGAGAAAATGTT
ATGCTGAGAAAAACGTGGTTAAATTGACCAAACTGTTGAAGGATTATGCC
CATAAAGATTATGAACGAACGATGATTAAAGCTATTCTTTTTTCTATTGA
CTCCTCAATTGCACCTAGTCAAGAAGAATTGACTCGCCTCACAGATTATT
TATTTAAAGTGGAACAGTGGGGATATTATGAAATCATTCTTCTGGGGAAT
TGCTCGCGCTTCATGAATTACAATACCCTATTTTTATTGACTAAGGAAAT
GGTAGCATCTTTTGCTTATTCGGAACAAAATAAAACCAATAAAATGTTAG
TGACTCAGTTATCCATTAATTGTCTCATTATCAGTATTGACCATTCTTGC
TTTGAACATAGTCGCTATTTGATTAACAAAATTGATCTTTTGCTGCGAGA
CGAGCTCAATTTTTATGAAAAGACTGTTTTCTTATATGTGCATGGGTATT
ATAAATTAAAGCAGGAAGAAATGTCTGGAGAAGAGGACATGCGGCAGGCC
TTGCAGATTTTTAAGTATCTTGGAGAGGACTCATTGTATTATAGTTATAA
GGAACATTACCGTCAAATAGTGCTGGGAGGTAAGGGGGATGAGGACTGGT
CTGAGGCAGATTTATGA
>M5005_Spy1412 nusA, N utilization substance protein A
ATGAGCAAAGAAATGCTAGAAGCCTTCCGTATTTTGGAAGAAGAAAAACA
CATTGATAAAGCAGATATTATTGACGCAGTGACAGAATCATTAAAGTCTG
CCTATAAACGTCGCTATGGTCAATCAGAATCATGTGTTATTGAATTTAAT
GAAAAAACAGCTGATTTTCAAGTATTTACGGTTCGTGAGGTTGTTGAAGA
AGTTTTTGACAGCCGGCTTGAGATTAGTTTGAAAGATGCTCTTGCTATCA
GTTCTGCCTATGAATTGGGTGATAAGATTCGCTTTGAAGAATCTGTCAAT
GAATTTGGACGTGTCGCAGCTCAATCAGCTAAACAGACTATTATGGAAAA
GATGCGCCGCCAAATGCGTGAAGTGATGTTCAATGAATACAAAGAGCATG
AAGGTGAAATTATGACAGGAACAGTTGAACGGTTTGATCAACGTTTTATT
TATGTCAATCTTGGTTCCTTAGAAGCACAATTGTCTCACCAAGACCAGAT
TCCAGGTGAAACTTTCAAATCACATGACCGTATTGACGTTTATGTCTACA
AAGTTGAAAATAATCCTAAAGGAGTTAACGTCTTTGTTAGTCGTAGCCAT
CCAGAATTCATCAAACGTATTATGGAGCAAGAAATTCCTGAAGTCTTTGA
TGGTACTGTTGAAATCATGAGTGTTTCTCGTGAAGCAGGTGACCGCACCA
AGGTTGCTGTGCGCAGTCATAATCCTAACGTTGATGCCATCGGAACAATT
GTTGGACGTGGTGGAAGTAATATTAAAAAGGTCATCAGCAAGTTCCATCC
AAAACGTGTAGATGCTAAGACGGGGCTTGAAATTCCAGTTGAAGAAAATA
TTGACGTGATTCAATGGGTAGATGATCCAGCTGAGTTCATCTACAATGCC
ATTGCTCCGGCTGAAGTAGACATGGTACTTTTTGACGATGAAGATCTTAA
ACGTGCTACGGTAGTAGTTCCTGATAGCAAATTATCATTAGCTATCGGGC
GTCGCGGCCAAAATGTTCGTTTAGCGGCACATTTGACTGGCTACCGTATT
GATATCAAATCAGCTAGCGAATATGATCGTCTTGAGGCGGAAAAAGAAGC
AGCAACAGCTGTGGAAGAGCCAGTTGTTGACGATGTTATGACTGCCGAGG
AAGTATAA
>M5005_Spy1545 nusB, N utilization substance protein B
ATGACTAACAGCTTTCAAAATTCAAGAAGAGATTTGCGTGAACGTGCCTT
TCAGGCTTTATTTAACATAGAGATGGGAGCTGAGTTATTGGCAGCTTCTC
AGTTTGCCTATGGTTATGATAAAGTAACAGGGGAGGACGCTCAAGTATTG
GAGCTGCCGATTTTTTTATTAAGTCTTGTGACGGGTGTCAATAATCATAA
AGAAGAGTTGGATAACTTGATATCAACTCATTTGAAAAAAGGTTGGTCGT
TAGAACGCTTGACACTAACAGACAAAACGTTATTACGACTAGGTCTTTTT
GAAATCAAGTATTTTGACGAAACACCAGATCGTGTTGCACTAAACGAAAT
CATTGAAGTAGCTAAAAAATATTCTGATGAAACCTCTGCTAAATTTATTA
ATGGCTTACTTAGCCAATATGTCTCGGGAGCTCCTTCAGCAAATAAATCA
TAA
>M5005_Spy0138 nusG, transcription antitermination protein
ATGCTAGATTCATTTGATAAGGGCTGGTTCGTCCTCCAAACTTACTCAGG
CTACGAAAACAAAGTAAAAGAAAACCTCTTGCAACGTGCCCAAACCTATA
ACATGTTGGACAATATTTTGCGCGTCGAAATTCCGACACAAACGGTTAAC
GTTGAAAAAAATGGGCAAACCAAAGAAATCGAAGAAAATCGCTTTCCAGG
GTATGTCTTGGTTGAAATGGTCATGACAGATGAAGCTTGGTTTGTTGTGC
GTAACACACCAAACGTTACAGGTTTTGTGGGATCACACGGGAACCGATCA
AAACCAACACCACTTCTTGAAGAAGAAATCCGTGCTATCTTGTTGTCTAT
GGGTCAAACCATTGATGTCTTTGATACCAATATCAAAGAAGGTGATGTGG
TTCAGATCATAGACGGTGCCTTTATGGGACAAGAAGGTCGTGTGGTAGAA
ATCGAAAACAACAAAGTGAAGCTGATGCTCAACATGTTTGGCTCTGAAAC
AGTAGCAGAAGTTGAACTTTATCAAATTGCAGAACTATAG
>M5005_Spy1866 parB, chromosome partitioning protein
ATGTTTCTTATTCTATCCAGGAACTCCCTTATGACAAAAGAATTATTGAT
AGACCTACCAATTGAAGATATTGTTACAAATCCCTATCAGCCAAGGATAC
AATTTAATCAAAGAGAACTCCAAGACCTAGCAACTTCTATTAAATCAAAC
GGCCTCATTCAACCTATTATTGTTCGAAAATCTGACATTTTTGGCTATGA
GTTAGTTGCTGGAGAACGACGACTTAAAGCTTCAAAAATGGCTGGTCTAA
AAAAAGTTCCAGCTATCATCAAGAAGATCTCCACACTCGAGAGCATGCAA
CAAGCTATAGTTGAAAATTTACAACGTTCTAACCTTAACGCTATCGAAGA
AGCTAAAGCCTATCAGTTATTGGTTGAAAAAAAACACATGACTCACGATG
AGATTGCTAAATATATGGGAAAATCAAGACCTTATATTAGCAATACCTTA
CGTCTGTTACAACTCCCAGCACCTATCATTAAAGCAATTGAAGAAGGAAA
AATTAGTGCGGGACACGCGCGTGCTCTTTTAACTTTGAGTGATGATAAGC
AACAACTGTACCTCACTCATAAAATACAAAATGAAGGCCTAAGTGTTAGG
CAAATTGAGCAACTGGTTACTTCTACTCCAAGTTCGAAGCTATCTAAAAA
AACTAAAAATATTTTTGCCACTTCTTTAGAGAAACAATTGGCTAAATCAT
TGGGACTCTCTGTCAATATGAAGCTGACAGCAAACCATAGTGGGTACCTT
CAGATATCTTTTTCCAATGATGATGAATTAAACAGAATTATCAACAAGCT
AAAGTAG
>M5005_Spy1519 recG, ATP-dependent DNA helicase
ATGATATTAACAGCTCCTATGTCCAACTTAAAGGGATTTGGACCAAAATC
AGCAGAAAAATTTCAGAAATTAGATATTTATACAGTAGAAGATTTACTGC
TTTATTATCCGTTTCGCTATGAAGATTTTAAATCAAAATCTGTTTTTGAT
TTAGTGGATGGTGAAAAAGCAGTCATTACAGGCTTAGTCGTTACTCCAGC
TAATGTACAATATTATGGTTTTAAACGTAACCGTTTAAGTTTCAAATTGC
GTCAAGGGGAAGCTGTCTTAAATGTTAGTTTTTTTAATCAACCCTATTTA
GCTGATAAAATAGAACTTGGTCAAGAGGTAGCTGTTTTTGGTAAATGGGA
TGCCACTAAATCGGCTATTACTGGGATGAAGGTTTTAGCTCAAGTTGAAG
ATGACATGCAACCTGTTTATCGCGTAGCTCAGGGAATTTCACAGTCTACT
TTGATTAAAGCTATTAAGTCAGCTTTTGAAATCGATGCGCATTTGGAATT
GAAGGAAAATTTACCAGCTACTTTATTGGAAAAATACCGATTGATGGGTC
GTAGTCAGGCTTGTTTAGCTATGCATTTCCCAAAAGATATCACAGAGTAT
AAGCAAGCGCTCCGTCGGATTAAATTTGAAGAATTATTTTACTTTCAAAT
GAACCTTCAAGTTTTGAAAGCCGAAAATAAATCTGAAACAAATGGTTTGC
CTATTCTTTATAGTAAACGTGCTATGGAGACAAAGATTTCCTCTTTACCT
TTTATTCTAACGAATGCTCAAAAGCGCTCTTTAGATGACATATTATCTGA
TATGTCATCGGGAGCTCATATGAATCGTTTATTGCAAGGAGATGTAGGAT
CAGGAAAGACAGTCATTGCTGGTCTATCAATGTATGCAGCTTATACAGCA
GGTTTTCAATCGGCTTTGATGGTTCCAACGGAAATCCTAGCTGAACAACA
CTACATTAGTCTGCAAGAGTTATTTCCAGATTTATCAATCGCTATATTAA
CTTCGGGTATGAAAGCAGCTGTCAAGCGTACGGTTTTAGCAGCTATTGCA
AATGGCTCGGTTGATATGATTGTAGGAACTCATGCTCTTATCCAAGACTC
GGTACAGTACCATAAACTGGGGCTTGTCATTACAGACGAGCAACATCGTT
TTGGTGTTAAACAGCGTAGAATTTTCCGTGAAAAGGGAGAAAATCCTGAT
GTTTTAATGATGACAGCCACCCCAATTCCCCGAACTCTAGCAATCACAGC
TTTTGGAGAAATGGATGTTTCTATTATTGATGAATTACCTGCCGGTCGTA
AACCTATTATGACACGCTGGGTGAAACACGAGCAGCTAGGTACTGTGTTG
GAATGGGTAAAAGGTGAATTGCAAAAAGATGCTCAAGTGTATGTCATTTC
ACCGTTGATTGAAGAATCAGAAGCTTTAGATTTAAAGAATGCAGTAGCAT
TGCATGCTGAATTATCTACTTATTTTGAAGGAATTGCTAAGGTTGCTCTT
GTACATGGACGTATGAAAAATGATGAAAAAGATGCTATAATGCAAGATTT
CAAGGATAAAAAAAGTCATATTTTAGTATCCACAACAGTTATTGAAGTAG
GGGTAAATGTCCCAAATGCAACGATCATGATTATTATGGATGCCGATCGT
TTTGGATTAAGTCAGTTACATCAACTTCGTGGGCGTGTTGGTCGTGGATA
TAAACAATCATACGCTGTTTTAGTGGCTAATCCCAAAACTGATTCGGGGA
AAAAACGAATGACAATCATGACAGAAACGACAGATGGTTTCGTTTTAGCT
GAGTCGGATTTAAAAATGCGTGGTTCTGGTGAAATCTTTGGTACTCGTCA
GTCTGGAATTCCAGAATTTCAAGTAGCTGATATCGTTGAGGATTATCCTA
TTTTAGAAGAAGCACGCAAAGTTTCTGCAGCGATTGTTTCTGATCCTAAC
TGGATATATGAAAAACAGTGGCAATTAGTGGCACAAAATATTAGAAAAAA
AGAAGTTTATGATTAA
>M5005_Spy0517 regR, transcriptional regulator, LacI family
ATGCAGCGCAAAGTAACCATCAAAGATATTGCTGAATTAGCGAAAACTTC
AAAAACAACAGTTTCTTTCTACTTAAATGGCAGATTTGACAAGATGTCTG
AAGAAACTAAAAACCGCATCAGCGAGAGTATCAAAGCTACTAATTATAAA
CCGAGCATTGCTGCTAGAAGTCTCAATGCAAAATCGACTAAACTCATTGG
TGTTGTTATAGGTGACATCACAAACAGTTTTTCAAACCAAATTGTCAAAG
GAATTGAAAGCAAAGCCCAGGAATTTGGTTACCAAATTATCATCGGAAAC
AGCAACTACGACCCTTCTCGCGAAGATGAACTCATTGAAAAGATGCTCAA
TCTTGGTGTTGATGGTTTTATTATTCAACCAACTTCTAACTTTAGAAAAT
ATTCACGTATTATCGATATTAAAAAAAAGAAGGTTGTCTTTTTTGATAGC
CAACTTTACGAACATCGCACAAACTGGGTCAAAACTAATAATTATGATGC
TGTTTATGATACCATTCAACAATGTATCGATAAAGGTTATGAACATTTTA
TCATGATCACGGGTAACCCCAATTTACTTAGCACTCGTATTGAACGCGCT
TCAGGCTTCATTGATGTGTTAGAAGCTAATCATCTTACTCATCAAGAAAT
GATTATTGATGAAAATCAGACTTCTTCAGAGGCAATTGCTCAGTTTTTGC
AAGGATCACTGACTAAAAAGAGTTTGGTTTTTGTCCCCAATTGTTGGGCT
CTTCCAAAAGTATTTACAGCTATGAAGTCTCTTAAATTTAATATACCAGA
GATTGGACTAGTAGGATTTGATAACATTGAGTGGACAAAATTTTCTTCAC
CAACACTAACAACTATTATCCAACCCGCCTATGAAGAAGGCGAACAGGCT
ACTAAGATTTTAATCGATGATATTGAAGGTCACAGTCAAGAAGCCAAACA
ACAAATTTTTGACTGTCAAGTCAATTGGCAAGAATCAACTTTTTAA
>M5005_Spy1686 relA, GTPpyrophosphokinase/guanosine-3',5'-bis(diphosp hate)3'-pyrophosphohydrolase
ATGGCAAAAATAATGAACGTAACAGGAGAAGAAGTCATTGCCTTAGCGGC
CACCTATATGACCAAGGCTGATGTGGCTTTTGTGGCAAAGGCTTTAGCAT
ATGCAACAGCGGCCCATTTCTACCAAGTGAGAAAGTCAGGCGAACCCTAT
ATCGTCCATCCGATTCAGGTGGCGGGGATTCTGGCTGATTTGCATCTGGA
TGCTGTGACAGTTGCTTGTGGCTTTTTACATGATGTCGTAGAAGATACGG
ATATTACCTTAGATGAGATCGAAGCAGACTTTGGCCATGATGCTCGTGAT
ATCGTTGATGGTGTCACCAAGTTAGGTAAAGTTGAGTACAAATCTCATGA
GGAGCAACTCGCCGAAAACCATCGCAAAATGCTGATGGCTATGTCCAAAG
ATATTCGCGTGATTTTGGTGAAATTGGCTGACCGCCTGCATAATATGCGC
ACCCTCAAACATTTGCGCAAGGACAAACAAGAGCGCATTTCGCGCGAAAC
CATGGAAATCTATGCCCCCTTGGCGCATCGTTTGGGGATTAGTCGCATCA
AATGGGAACTAGAAGATTTGGCTTTTCGTTACCTCAATGAAACCGAATTT
TACAAAATTTCCCATATGATGAAAGAAAAACGTCGCGAGCGTGAAGCTTT
GGTAGAGGCTATTGTCAGTAAGGTCAAAACCTATACGACACAACAAGGGT
TGTTTGGAGATGTGTATGGCCGACCAAAACACATTTATTCGATTTATCGG
AAAATGCGGGACAAAAAGAAACGATTCGATCAGATTTTTGATCTGATTGC
CATTCGTTGTGTCATGGAAACGCAAAGCGATGTCTATGCTATGGTTGGCT
ATATTCATGAGCTTTGGCGTCCCATGCCAGGCCGCTTCAAGGATTATATT
GCAGCTCCTAAAGCTAATGGCTACCAGTCTATTCATACCACCGTGTATGG
GCCAAAAGGACCTATTGAGATTCAAATCAGAACTAAGGACATGCATCAAG
TGGCTGAGTACGGGGTTGCTGCTCACTGGGCTTATAAAAAAGGCGTGCGT
GGTAAGGTCAATCAAGCTGAGCAAGCCGTTGGCATGAACTGGATCAAAGA
GCTGGTAGAATTGCAAGATGCCTCAAATGGCGATGCAGTGGACTTTGTGG
ATTCGGTCAAAGAAGACATTTTTTCTGAACGGATTTATGTCTTTACACCG
ACAGGGGCCGTTCAGGAGTTACCAAAAGAATCAGGTCCTATTGATTTTGC
TTATGCGATCCATACGCAAATCGGTGAAAAAGCAACAGGTGCCAAAGTCA
ATGGACGTATGGTTCCTCTCACTGCCAAGTTAAAAACAGGAGATGTGGTT
GAAATCATCACCAATGCCAATTCCTTTGGCCCTAGTCGAGACTGGGTAAA
ACTGGTCAAAACCAATAAGGCTCGCAACAAAATTCGTCAGTTCTTTAAAA
ATCAAGACAAGGAATTGTCAGTGAATAAAGGCCGTGATTTGTTGGTGTCT
TATTTTCAAGAGCAGGGCTACGTTGCCAATAAATACCTTGACAAAAAACG
CATTGAAGCCATCCTTCCAAAAGTCAGTGTGAAGAGCGAAGAATCACTCT
ATGCAGCCGTTGGGTTTGGTGACATTAGTCCTATCAGTGTCTTTAACAAG
TTAACCGAAAAAGAGCGCCGTGAAGAAGAAAGGGCCAAGGCTAAAGCAGA
AGCTGAAGAATTGGTTAAGGGCGGTGAGGTCAAACACGAAAACAAAGATG
TGCTCAAGGTTCGCAGTGAAAATGGAGTCATTATCCAAGGAGCATCAGGC
CTCTTGATGCGGATTGCCAAGTGTTGTAATCCTGTACCTGGTGATCCTAT
TGACGGCTACATTACCAAAGGGCGTGGCATTGCGATTCACAGATCGGACT
GTCATAACATTAAGAGTCAAGATGGCTACCAAGAACGCTTGATTGAGGTC
GAGTGGGATTTGGACAATTCGAGTAAAGATTATCAGGCTGAAATTGATAT
CTATGGGCTCAATCGTAGTGGTCTGCTTAATGATGTGCTCCAAATTTTAT
CAAACTCAACCAAGAGCATATCGACAGTCAATGCTCAGCCGACCAAGGAC
ATGAAGTTTGCTAATATTCACGTGAGCTTTGGCATTCCAAATCTGACGCA
TCTGACCACTGTTGTCGAAAAAATCAAGGCAGTTCCAGATGTTTATAGCG
TGAAGCGGACCAATGGCTAA
>M5005_Spy1737 rgg, transcriptional regulator
ATGGAAATTGGTGAAACCGTTGAATTCATTAGGCATTCAAAAAACATTTC
GATTAAACAAGTTTGTGGTGATTATCTCACTAGGCAAACCTATTATCGTT
TTATTAAAAATAATCTTGACATTTCTTCGAAAAAGTTACTTTATATCTTA
GACAACTTGAATGTCAATGTTGATGAGTTTCTCTTTATTAGTAATAACTT
TAAACAATACAAAGAATTTATTGATATGGATACGGCAAAACATTATTTTG
AATGCCGAAACATAGAAGGTTTAAATCATATCCTTGATTCTTATAAAGAT
AGTAAGTCAACAAAGGAAAAGAACCTTTTTGCCTTGGTCAAGGTGTTATT
AGCAACTCTTACTGAGGAAGACTGTCTGACAGAGCGGACTTATTTGTCAA
ACTATCTTATTAATATTGAAACTTGGAGTCACTATGAGACTGTGCTTTTT
AATAATTGTATGTTTATTTTTGAGTCTTGCTTTATTGAGATGGTGTTTTC
AAAAGTTATTTTGAACCTCGATAAATACAATACCCTAAGGTATTATGGGA
ATGAATCGATTCGGATGTTTGTCAATATGTTGATTTTGTTTATTCAGCGA
CAAGAGTATGATAAAGCTTCTGAGATTTTGGCAAAAATTGAAGATTATCA
GCTAAATGATGATTGCTTATATGAACGGTGTTGTGTGTCTTTTTTTGATG
GCATTATTGGCCTCATAAATGGTAAAGAGGGGGCTGAGCAAAAGTGTGTG
CAGATCTTGGAGATCTTCCAATTACTTAATTGCAAAACGATCCATCATAT
GTTTCAAACCTACCTAAAAGCCATTAAACATAAACTGTCCTGA
>M5005_Spy0070 rpoA, DNA-directed RNA polymerase alpha chain
ATGATTGAGTTTGAAAAACCAATAATAACAAAAATTGATGAAAATAAAGA
TTACGGTAGATTTGTCATCGAACCACTTGAACGTGGCTACGGAACAACTC
TAGGTAATTCTCTTCGTCGTGTACTCTTGTCTTCACTTCCAGGTGCAGCA
GTAACATCAATTAAAATTGATGGAGTACTACACGAATTTGATACAATCCC
AGGTGTACGTGAAGATGTCATGCAAATTATCCTTAATGTTAAGGGACTTG
CTGTGAAATCATACGTCGAAGACGAAAAGATTATCGAACTTGAAGTAGAA
GGACCAGCAGAGGTAACAGCTGGTGATATTCTTACTGACAGTGATATCGA
ACTTGTTAACCCGGATCATTATCTTTTTACAATCGCTGAAGGACATTCTC
TACGTGCAACAATGACTGTTGCTAAAAAACGTGGTTATGTGCCAGCAGAA
GGCAACAAAAAAGATGATGCACCTGTGGGTACATTGGCAGTAGATTCAAT
CTATACGCCAGTTAAAAAAGTTAATTATCAAGTTGAACCTGCCCGTGTAG
GTAGCAATGATGGCTTTGATAAATTAACGATTGAAATCATGACAAACGGA
ACAATTATTCCTGAAGATGCTTTAGGTCTATCTGCTCGAGTTTTGATCGA
ACACTTAAACCTGTTTACTGATTTAACAGAGGTTGCAAAAGCTACCGAAG
TAATGAAAGAAACTGAAAAAGTGAACGATGAAAAGGTACTTGACCGCACC
ATCGAGGAGCTTGATTTATCCGTACGCTCATATAACTGTTTAAAACGTGC
AGGCATTAACACTGTCTTCGATTTAACAGAAAAATCTGAGCCTGAAATGA
TGAAAGTCCGTAATCTTGGACGTAAGAGCCTTGAAGAAGTTAAGGTTAAA
CTTGCTGACTTAGGTCTCGGACTAAAAAACGATAAATAA
>M5005_Spy0083 rpoB, DNA-directed RNA polymerase beta chain
TTGGCAGGACATGAAGTTCGATACGGAAAACACCGTACACGTCGTAGCTT
TTCAAGAATCAAAGAAGTTCTTGATTTACCAAATTTGATTGAAATTCAAA
CTGACTCATTCCAAGATTTCCTCGATTCAGGTTTGAAAGAAGTATTTGAA
GATGTACTTCCTATTTCAAACTTTACGGATACTATGGAACTTGAATTTGT
TGGTTACGAATTTAAAGAACCTAAATATACCCTTGAAGAAGCTCGTATCC
ACGATGCAAGTTATTCTGCACCAATCTTTGTTACCTTCCGTTTGGTCAAT
AAAGAAACTGGTGAGATTAAAACTCAAGAAGTCTTCTTTGGTGATTTCCC
AATCATGACGGAAATGGGTACCTTTATTATCAATGGTGGTGAACGTATCA
TCGTTTCTCAGTTGGTGCGTTCTCCAGGTGTTTATTTCAACGATAAAGTT
GATAAAAACGGTAAAGTTGGTTACGGATCAACAGTGATTCCTAACCGTGG
GGCTTGGTTGGAATTAGAGACTGACTCAAAAGACATTGCCTACACTCGTA
TTGACCGTACCCGTAAGATTCCATTCACAACCTTGGTTCGTGCCCTTGGT
TTCTCAGGTGATGATGAAATTGTTGATATCTTTGGTGAAAGCGACCTTGT
TCGTAATACCATTGAAAAAGACATTCACAAAAATCCAAGTGATTCTCGTA
CAGACGAAGCCCTTAAAGAAATTTACGAGCGTCTTCGTCCAGGTGAGCCA
AAAACTGCAGATAGCTCTCGTAGTCTTTTGATTGCGCGTTTCTTTGATGC
ACGTCGTTACGATTTGGCTGCGGTTGGTCGTTACAAAGTGAACAAAAAAC
TTAATATCAAGACTCGTCTTTTGAACCAAATCATTGCTGAAAACCTTGTG
GATGCTGAAACTGGCGAAATTTTGGTAGAAGCTGGAACTGAGATGACTCG
TAGCGTCATCGAATCCATCGAAGAACACCTTGACGGTGATTTGAACAAGT
TTGTTTACACACCAAATGATTACGCTGTGGTTACTGAACCAGTTGTCCTT
CAAAAGTTCAAGGTTGTGTCACCAATTGATCCTGATCGTGTAGTAACTAT
TGTTGGTAATGCCAATCCAGATGATAAGGTTCGTGCATTGACACCTGCTG
ATATTTTGGCAGAAATGTCTTACTTCTTGAACCTTGCTGAAGGTCTTGGA
AAAGTTGACGATATTGACCACTTGGGTAACCGTCGTATCCGTGCCGTTGG
TGAATTGCTTGCCAACCAATTCCGCATCGGTCTTGCTCGTATGGAGCGTA
ACGTGCGTGAGCGTATGTCTGTTCAAGACAACGATGTGTTAACACCACAA
CAAATCATCAATATCCGTCCTGTCACAGCAGCTGTCAAAGAATTCTTCGG
TTCGTCTCAGTTGTCACAGTTCATGGACCAACACAACCCATTGTCAGAGT
TGTCTCACAAACGTCGTTTATCTGCCTTAGGACCTGGTGGTTTGACACGT
GACCGTGCTGGTTATGAGGTTCGTGACGTGCATTACACGCACTATGGCCG
TATGTGTCCGATTGAAACACCTGAAGGACCAAACATTGGTTTGATTAATA
ACTTGTCTTCATTTGGACATCTTAATAAATATGGTTTCATCCAAACACCT
TACCGTAAGGTTGACCGTGCGACTGGTACGGTAACTAACGAGATTGTTTG
GTTGACTGCCGACGAAGAAGACGAATACACAGTTGCACAGGCCAATTCGA
AACTAAACGAAGATGGCACTTTTGCTGAAGAAATCGTTATGGGTCGTCAC
CAAGGTAATAACCAAGAATTTTCTGCAAGTGTTGTTGATTTCGTTGACGT
TTCCCCTAAACAGGTAGTTGCTGTTGCGACGGCATGTATTCCTTTCTTGG
AAAACGATGACTCCAACCGTGCCCTCATGGGTGCCAACATGCAACGTCAG
GCTGTGCCATTGATTGATCCAAAAGCACCATATGTTGGTACTGGTATGGA
ATATCAAGCTGCCCATGACTCAGGCGCTGCGGTGATTGCTCAGCAAAATG
GTAAAGTTGTCTTTTCTGATGCTGAAAAAGTGGAAATCCGTCGTCAAGAT
GGCTCGCTTGATGTTTACCACATTACCAAATTCCGTCGTTCAAACTCAGG
AACAGCCTATAACCAACGCACCCTTGTTAAAGTAGGAGACATTGTTGAAA
AAGGTGATTTCATCGCTGATGGACCTTCTATGGAAAATGGTGAAATGGCT
CTTGGACAAAACCCAGTCGTTGCTTACATGACTTGGGAAGGTTATAACTT
TGAGGATGCCGTTATCATGAGTGAGCGCCTTGTGAAAGAAGATGTCTACA
CATCTGTTCACTTGGAAGAATTCGAATCTGAAACGCGTGATACAAAACTT
GGCCCTGAAGAAATCACTCGGGAAATCCCAAATGTTGGTGAAGAAGCCCT
CAAAGACCTTGACGAAATGGGCATTATCCGTATCGGTGCTGAGGTTAAAG
AAGGCGACATCTTAGTAGGTAAAGTCACACCTAAAGGTGAAAAAGACCTT
TCTGCTGAAGAACGTTTACTTCACGCCATCTTTGGGGATAAATCGCGTGA
AGTGCGTGATACCTCACTTCGTGTCCCTCACGGTGGTGATGGTATCGTTC
GTGATGTGAAAATCTTTACACGCGCTAACGGCGATGAATTGCAATCAGGT
GTTAATATGCTTGTGCGTGTTTACATCGCTCAAAAACGTAAAATCAAGGT
CGGAGATAAAATGGCCGGTCGTCACGGAAACAAGGGTGTCGTTTCACGTA
TTGTACCAGTTGAAGACATGCCATACCTTCCAGATGGAACACCAGTTGAC
ATCATGTTGAACCCTCTTGGGGTGCCATCACGGATGAATATTGGTCAGGT
TATGGAACTTCACCTTGGTATGGCTGCTCGTAATCTTGGTATTCACATTG
CAACACCTGTCTTTGACGGGGCTTCATCAGAAGACCTTTGGGACACTGTT
CGTGAAGCTGGTATGGATAGCGATGCTAAGACGGTCCTTTATGATGGTCG
CACCGGTGAACCATTTGACAACCGTGTATCCGTTGGTGTCATGTATATGA
TCAAACTTCACCACATGGTTGATGATAAACTTCATGCCCGTTCTGTAGGA
CCATACTCACTTGTTACCCAACAGCCACTTGGTGGTAAAGCTCAATTTGG
TGGACAACGTTTTGGTGAGATGGAGGTTTGGGCCCTTGAAGCTTATGGTG
CATCAAATGTTCTTCAAGAAATCTTGACCTACAAGTCAGATGACGTCACA
GGACGTTTGAAAGCCTATGAAGCGATTACTAAAGGTAAACCAATTCCAAA
ACCAGGTGTACCAGAATCCTTCCGTGTTCTTGTAAAAGAATTGCAATCGC
TTGGTCTTGATATGCGTGTGCTTGACGAGGATGATAATGAAGTGGAACTT
CGTGATCTTGATGAAGGTGAAGACGATGACATTATGCATGTTGACGATCT
CGAGAAGGCACGTGAAAAACAAGCTCAAGAAACTCAAGAAGTTTCTGAAA
CAACTGACGAAAAATAA
>M5005_Spy0084 rpoC, DNA-directed RNA polymerase beta' chain
GTGGTTGACGTAAATCGTTTTAAAAGTATGCAAATCACATTAGCCTCACC
AAGTAAGGTCCGTTCATGGTCTTATGGTGAAGTTAAAAAACCTGAAACAA
TCAACTACCGTACATTAAAACCAGAACGTGAAGGACTCTTTGACGAAGTC
ATCTTTGGTCCAACAAAAGACTGGGAATGTGCGTGTGGTAAGTACAAACG
TATCCGTTATAAAGGGATCGTTTGTGATCGCTGTGGGGTTGAGGTAACTC
GTGCTAAAGTACGTCGTGAACGTATGGGTCACATTGAGTTAAAAGCTCCT
GTATCACATATCTGGTATTTCAAAGGGATTCCATCTCGTATGGGATTGAC
TCTTGATATGAGTCCTCGTGCCCTTGAAGAAGTGATCTATTTTGCGGCTT
ATGTGGTCATTGATCCAAAAGATACACCGCTTGAACCAAAATCATTATTA
ACAGAACGTGAATACCGTGAAAAACTACAAGAGTATGGTCATGGGTCATT
TGTCGCTAAGATGGGTGCTGAAGCCATTCAAGATCTCTTGAAACGTGTGG
ACTTGGCAGCTGAAATCGCTGAATTAAAAGAAGAGTTGAAATCTGCTTCT
GGTCAAAAACGGATTAAAGCAGTTCGTCGTTTAGACGTCCTTGATGCCTT
TAACAAATCTGGAAATAAACCAGAATGGATGGTTCTTAACATCCTGCCGG
TTATTCCACCAGATCTTCGTCCGATGGTTCAATTGGATGGTGGTCGTTTT
GCGGCATCAGACTTGAATGACTTGTACCGTCGTGTGATTAACCGTAATAA
CCGTTTGGCACGTTTGTTAGAACTTAATGCCCCTGGCATCATTGTTCAAA
ATGAAAAACGAATGCTTCAAGAAGCCGTTGATGCTTTGATTGATAATGGT
CGTCGTGGTCGTCCAATCACTGGACCAGGAAGTCGTCCATTGAAATCATT
GAGCCACATGCTTAAAGGTAAACAAGGGCGTTTCCGTCAAAACTTGCTTG
GTAAACGTGTAGACTTCTCTGGACGTTCCGTTATCGCTGTTGGTCCAACC
CTTAAAATGTATCAATGTGGTGTCCCACGTGAAATGGCTATCGAGCTTTT
TAAACCATTTGTAATGCGCGAAATTGTTGCCAAAGAATATGCTGGTAACG
TTAAAGCCGCTAAACGTATGGTTGAACGTGGCGACGAACGCATCTGGGAT
ATCTTAGAAGAAGTTATCAAAGAACACCCAGTCCTACTTAACCGCGCACC
GACTCTTCACAGACTTGGTATTCAGGCTTTTGAACCCGTTCTTATTGACG
GTAAGGCACTTCGTCTTCACCCACTTGTGTGTGAGGCCTACAATGCCGAC
TTCGATGGAGACCAAATGGCCATTCACGTGCCACTTTCAGAAGAAGCACA
AGCTGAAGCTCGTCTTTTGATGCTTGCTGCAGAGCACATCTTGAACCCTA
AAGATGGTAAACCAGTTGTTACTCCATCTCAGGATATGGTTCTTGGTAAC
TACTATCTTACGATGGAAGATGCTGGTCGCGAAGGCGAAGGTATGATTTT
CAAGGATAAAGACGAAGCTGTGATGGCATATCGTAATGGTTATGCTCATC
TTCATAGTCGTGTGGGTATCGCTGTTGACAGCATGCCAAACAAACCTTGG
AAAGACAATCAAAGACATAAAATCATGGTGACAACTGTTGGTAAGATTCT
CTTTAACGATATCATGCCAGAGGACCTTCCTTACCTCCAAGAGCCAAACA
ATGCCAACTTGACAGAAGGAACACCTGATAAATACTTCCTTGAACCTGGT
CAAGACATCCAAGAAGTGATTGATCGCTTAGACATCAATGTGCCATTTAA
GAAGAAAAACCTCGGTAACATCATTGCGGAAACCTTCAAACGTTTCCGTA
CAACAGAAACATCAGCCTTCCTTGACCGCTTGAAAGACCTTGGTTACTAC
CACTCAACCCTTGCTGGTTTGACAGTGGGTATCGCTGACATTCCTGTTAT
TGATAATAAAGCTGAAATCATTGATGCTGCTCACCATCGTGTTGAAGAAA
TTAACAAAGCCTTCCGTCGTGGTTTGATGACAGATGATGACCGTTATGTT
GCCGTTACAACAACATGGCGTGAAGCTAAAGAAGCCCTTGAAAAACGTCT
GATTGAAACACAAGATCCTAAGAACCCAATCGTTATGATGATGGACTCAG
GAGCTCGTGGTAACATCTCAAACTTCTCACAGCTTGCTGGTATGCGTGGT
TTGATGGCTGCTCCTAACGGACGCATCATGGAACTTCCTATCTTGTCAAA
CTTCCGTGAAGGTTTGAGCGTTTTGGAAATGTTCTTCTCAACCCACGGTG
CACGTAAAGGGATGACCGATACGGCCCTTAAAACAGCCGACTCAGGTTAC
CTTACTCGTCGTTTGGTTGACGTTGCCCAAGATGTTATCATTCGTGAGGA
CGATTGTGGCACTGATCGTGGTCTTCTTATCCGTGCTATTACAGATGGTA
AAGAAGTTACCGAAACGCTTGAAGAGCGTCTTCAAGGTCGTTACACACGT
AAATCAGTCAAACACCCTGAAACTGGTGAAGTCTTGATTGGTGCTGACCA
ATTAATCACTGAAGACATGGCTCGTAAGATTGTTGATGCAGGTGTTGAAG
AAGTGACCATTCGTTCTGTCTTTACCTGTGCGACTCGTCATGGTGTCTGC
CGTCACTGTTATGGTATCAACTTGGCAACTGGTGATGCTGTTGAAGTGGG
TGAAGCAGTTGGTACTATTGCTGCCCAATCTATCGGTGAGCCTGGTACTC
AGCTTACCATGCGTACCTTCCACACGGGTGGTGTAGCCTCAAATACCGAT
ATCACCCAGGGTCTTCCTCGTATTCAAGAGATCTTTGAAGCACGTAATCC
TAAAGGGGAAGCGGTCATTACTGAAGTGAAAGGGAATGTCGTCGAGATTG
AAGAAGATGCGTCAACTCGTACCAAGAAAGTCTACGTTCAAGGAAAAACT
GGCATGGGCGAATATGTCATACCATTTACAGCACGTATGAAAGTTGAAGT
TGGCGACGAAGTTAATCGCGGAGCTGCCCTTACAGAAGGGTCAATTCAAC
CGAAACGTCTCCTTGAAGTGCGTGATACCTTGTCAGTTGAAACGTACCTT
CTTGCAGAAGTACAAAAAGTTTACCGTAGCCAAGGGGTAGAAATCGGAGA
CAAACACGTTGAGGTAATGGTTCGCCAAATGCTTCGTAAAGTTCGTGTCA
TGGATCCAGGTGATACAGACCTCCTTCCAGGTACACTTATGGATATTTCT
GATTTCACAGATGCTAACAAAGATATTGTTATCTCTGGTGGTATTCCTGC
GACATCTCGTCCTGTTCTTATGGGTATTACTAAGGCTTCCCTTGAAACCA
ATTCCTTCTTATCAGCTGCATCCTTCCAAGAAACAACTCGTGTTCTTACA
GATGCTGCTATCCGTGGTAAAAAAGATCATCTTCTTGGTCTTAAAGAAAA
TGTTATCATTGGTAAAATCATCCCAGCTGGTACTGGTATGGCTCGTTACC
GTAACATTGAACCACAAGCGATGAATGAGATTGAAGTGATTGATCATACA
GAAGTCTCAGCAGAAGCCGTTTTTACAGCAGAAGCAGAATAA
>M5005_Spy0600 rpoD, RNA polymerase sigma factor
ATGACAAAACAAAAAGAAATAACAACTTTTAACGTTCAAGTTGCGGAGTT
TATTCGCCATCACAAAAAAGAAGGAACAGCGATTGATGATGACGTGACCG
AAAAACTTGTCATTCCATTTGCTTTGGATGCTGATCAGATTGATGACTTA
CTTGAGCGGTTAACAGATGGTGGTATCTCGATTACGGATAAAGAAGGTAA
CCCATCATCAAAATACATTGTTGAAGAACCAAAACCAGAAGAATTAACTG
ATGAAGAATTAATTGGTAGTAATTCAGCTAAAGTAAACGACCCTGTCCGC
ATGTACCTCAAAGAAATTGGTGTGGTACCGCTTTTAACAAGTGAAGAGGA
AAAAGAATTGGCTGTTGCGGTTGCCAAGGGAGATTTAATGGCTAAACAAC
GTTTAGCGGAAGCAAACCTTCGTCTTGTTGTCTCAATTGCAAAACGTTAT
GTTGGACGTGGAATGCAATTTCTTGATTTAATTCAAGAAGGTAACATGGG
ACTCATGAAAGCTGTTGATAAATTTGATTATTCAAAAGGATTCAAATTCT
CAACTTATGCAACATGGTGGATTCGTCAAGCTATAACACGCGCAATTGCA
GATCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTTCATATGGTTGAAACCATTAA
TAAATTGGTTCGTGAACAACGTAACCTTCTTCAAGAACTTGGTCAAGATC
CAACGCCAGAACAAATCGCAGAACGTATGGAAATGACTCCAGACAAGGTT
CGTGAAATTCTAAAAATTGCTCAAGAACCTGTTTCTTTAGAAACACCAAT
TGGGGAAGAAGATGATAGTCACTTAGGTGATTTTATCGAAGATGAAGTTA
TTGAAAATCCAGTAGATTATACGACGCGTGTTGTTCTTCGTGAGCAATTG
GATGAAGTTTTAGATACGCTTACTGACCGTGAAGAGAACGTTCTTCGCCT
ACGCTTTGGCCTTGACGATGGTAAAATGCGTACGTTAGAGGACGTAGGTA
AAGTCTTTAATGTTACTCGTGAGCGCATTCGACAGATTGAAGCTAAAGCC
CTTAGAAAACTTCGCCATCCTAGTCGTAGTAAACAATTAAGAGACTTTAT
AGAGGACTAA
>M5005_Spy1611 rpoE, DNA-directed RNA polymerase delta chain
ATGGTAGAGAATGATAAAATAAGGAGAACTGCCTTGAAATTAGACGTATT
TGCAGGACAAGAAAAAAGCGAGCTTTCCATGATTGAAGTGGCGCGTGCCA
TTTTGGAAGAACGCGGTCGCGACAATGAGATGTACTTTAGCGATTTAGTC
AATGAGATTCAAAATTACTTAGGAAAATCTGATGCAGGTATTCGTCATGC
ATTACCATTTTTCTATACTGACTTAAATACGGATGGCTCATTTATTCCTC
TAGGTGAAAACAAATGGGGACTTCGTTCGTGGTATGCTATTGATGAAATT
GATGAAGAAATTATTACTCTAGAAGAAGATGAAGATGGCGCACAAAAACG
TAAGAAAAAACGCGTTAATGCTTTCATGGATGGAGATGAAGACGCTATTG
ATTATAGAGATGATGATCCAGAAGATGAAGATTTCACAGAAGAATCAGCT
GAGGTTGAATATGATGAAGAAGATCCAGATGATGAAAAATCAGAAGTGGA
GTCATATGATTCAGAATTGAATGAAATTATCCCTGAAGATGATTTTGAAG
AAGTTGATATCAATGAAGAAGACGAAGAAGATGAAGAAGATGAAGAACCA
GTTCTCTAA
>M5005_Spy1625 salR, transcriptional regulatory protein
ATGAAGATTTTATTAATTGATGACCACAGACTATTTGCAAAGAGTATCCA
ACTGTTATTCCAACAGTATGATGAAGTAGATGTCATAGATACGATTACTT
CTCATTTTAACGATGTGACGATTGATTTGTCTAAGTACGATATTATATTG
CTTGATATTAATTTAGCAAATATTTCTAAAGAAAATGGATTGGAGATAGC
AAAAGAACTCATACAGTCTACTCCTCATTTGAAAGTTGTTATGTTGACAG
GATATGTTAAATCAATCTATAGAGAGAGGGCAAAAAAAGTAGGAGCATAC
GGTTTTGTAGATAAAAATATAGACCCTAAACAACTCATTTCTATCTTAAA
AAAAGTGGATTCTGGAAAAAAGTATTTTGAACAAATCGAATCTCAGGATT
ATGTTGAATCTTTAACTGACCAGGAAATAGCTATCTTAAATTTGAGTAAG
AAAGGATTCTCTATAAAAGAAATAGAGGAAACGTTACAAATTAGTAGGAG
AACAGTATTTAATCATTTGACCCACATCTACTCAAAGCTTTTGGTAAATA
ATAAGCAGGAGGCTATCTACAAAGCCGAACAATTAGGGTATTTTATGGAT
TTCTGA
>M5005_Spy0367 scaR, iron-dependent repressor
ATGACGCCTAATAAAGAAGATTACTTGAAATGTATTTATGAAATTGGAGA
ACAAGAACCCAAGATTACAAATAAAATGGTTGCAGAAAAGATGCACGTTT
CGGCACCTGCCGTTTCAGAGATGATTAAAAAAATGATTTCACAAGGCTGG
ATTGTCAAAGATAAAGCAAAAGGCTATTTGCTAAAAGACAAAGGCTATGC
TCTTGTTGCTAACCTCTACCGCAAACACCGCTTGATTGAGGTATTTTTGA
TTCATCAGCTGGGCTATAATACCCAAGAAGTGCACCAAGAAGCTGAAGTC
TTAGAGCACACTGTCTCAGACTCCTTTATCGACCGTTTAGACAAGATCCT
TGATTTTCCAGATTTCTGCCCACACGGAGGGACTATTCCTCGCTATGGTC
AGCCTCTTGTCGAAATGAACACTACAACTCTCAACACCATCACGGAGTTG
GGACGGTTTCGTCTAAGCAGAATCCACGACCACTTTGATTTAATCCAGTA
TCTAGAAGCACATCACCTCAATATCAATACCGAGCTAACCTTAACTCAAA
TTGATACCTTTGCAAAAACCTATACGATTTGTTATGGCGACAAGGAACTT
GTCATCCCTGAAAATATTGCTAAGCAACTTTATGTCACAGCCCTTTAA
>M5005_Spy1539 scrK, fructokinase
GTGAGACATGGCTGTCTTGATAAGAGCCTGTGTCATCATAAAGATAAAAA
AGAACAAGAAAAAGGAGAAAACATGGGAAAATTATATGGAAGCATTGAAG
CTGGTGGGACAAAGTTTGTCTGTGCCGTGGGTGATGAGGAGTTTACAGTG
GTGGATAAAACACAATTTCCGACCACCACACCAGAAGAAACCATCGCGCG
AACCATCGCTTATTTTAAAGCTTTTGAGGCAGATTTGGCTGGAATGGCGA
TTGGTTCTTTTGGACCAATTGATATTGATCCGTCGTCAGAGACTTACGGT
TATATCACAACCACTCCTAAATCAGGCTGGGCTAATGTGGATTTGTTAGG
ACAACTTTCGGCTGCTTTTAAGATTCCTTTTGATGTGACAACAGATGTTA
ATAGCTCTGCTTATGGTGAGGTGCTTGCTCGTCCTGGTGTGGAAAGTTTG
GTCTATTACACCATAGGTACTGGTATTGGGGCGGGAGCTATTCAACATGG
CCACTTTATTGGGGGTTTAGGTCATACAGAAGCGGGTCATACCTATGTCA
TGCCCCATCCTGATGATATGGCCAAGGGATTTTTAGGTGTTTGCCCTTTT
CATAAAGGGTGTCTGGAAGGGATGGCAGCAGGTCCAAGTATTGAGGCCAG
AACGGGAGTGAGAGGTGAACGGCTTGATCAGGAAGCTGATGTTTGGGACA
TTCAAGCCTTCTACATTGCCCAAGCAGCGCTGCAAGCAACTATGCTTTAC
CGTCCTCAAGTGATTGTTTTTGGCGGAGGTGTCATGGCGCAAGAACATAT
GGTGTTGCGCGTGCATGATAAATTCACTGCCCTTTTAAGCGGTTATTTGC
CAGTCCCTGATTTGACAGACTACATTGTTACTCCAGCTGTTGCTGATAAT
GGCTCCGCTACTCTGGGAAATTTTGCTTTGGCCAAGTTGGCTGCACAAGG
AAAATAG
>M5005_Spy1544 scrR, sucrose operon repressor
GTGGTCGCAAAATTAACAGACGTGGCAGCCTTGGCGGGTGTCAGTCCAAC
AACTGTTTCGCGAGTAATCAACAAAAAAGGCTACCTTTCCCAAAAAACAG
TGAATAAGGTGAATAAGGCCATGCGTGAATTGGGCTACAAGCCTAACAAT
CTCGCTAGAAGTTTGCAAGGTAAATCAACCCAACTCATTGGGCTTATCTT
CCCCAACATTAGCAATATCTTTTACGCTGAATTAATTGAACATTTGGAAA
TTGAATTGTTTAAACAGGGCTACAAAACTATTATTTGCAATAGTGAACAT
AATCCCGTCAAAGAACGCGAATATTTAGAAATGCTTGCGGCCAATCAAGT
GGACGGCATTATTTCTTCCAGTCATAATTTGGGAATTGAGGATTATGAGC
GTGTCGAAGCTCCTATTGTAGCTTTTGACCGTAATCTAGCGCCAAATATC
CCGGTTATTTCTTCAGATAATTTTGAAGGTGGTAAATTAGCCGCACAAAC
TTTGCAAAAACACGGTTGTCAAAACATTGTCATGATTACAGGTAATGACA
ATTCTGATTCGCCCACAGGGTTGCGCCAGCTAGGGTTTAACTACCAGCTC
AAACGAAGTGCAGAAATCATCAAATTACCAAATAACCTATCTCCTGTTAG
ACGCGAAATGGAAATTAAATCCATTTTGGCAACCCGAAAACCTGATGGCC
TTTTCGTTTCTGATGATTTAACTGCTATCCTCATTATGAAAGTAGCCAAA
CAACTTCACATTACTATTCCAGAGGATATGAAAGTCATAGGTTATGATGG
AACGACATTTATCCAGCAATATGTTCCTCAATTAGCGACCATTCGTCAAC
CTATTGATGAGATTGCTAAATTGAGTGTCGAAATACTCATCAAAAAAATT
AAAAAAGAAAAAACCAGTAAAGACTATATTTTACCGATTACGCTACTTCC
AGGAGCAAGTATTTAA
>M5005_Spy0288 snf, SWF/SNF family helicase
ATGATGGCTAGATTAATTCCAGGACGAGTAAGGAATGAAGGTATTAAGCT
TTATGAGCAAGGTTTAGTTTCATTCCAAGATGATAATAAAGGCATTCTTC
AAATAGAAGTGGAGACTTATCAGGTTCAATATGGAGCAGATGATGAGGAT
ATCACTTGTCAATGCGACACATTTCATATGAAACATTATTGCAAGCATAT
TGCAGCAGTCGAGTATTTTTTAAAAAATGATCAAAAAGGTAAGCTTTTTT
TAAAACAGTTAACAAATCAAACAAAAATCAAAGAAACAACAAAGAAAATG
ACATCTTTTGGTAGCCTCTTTTTAGATAGCTTAGCCATGAATGAAGATGA
TTCTGTTAAATACAGGCTGTCTGCTCTTGGTAGTCGAAGCCCTTTTTCGT
CAGATTACTGGTGGAGTCTGAAAATCAATCGTTTACCAGATGATCGTTCT
TATGTGATTCGGGATATTAAAGGCTTTTTGCAGCTTATTAAAAAAGAAGG
CTTTTATCAGATTGGAAAAAATTATTTTGAACAACTTTCATGGCTGCAGT
TTGACCCATCTAGTCAGGCCCTTATTGAGTTTTTATGGCGCTTAGCATCT
GATACTGACAAAGGGGACAACGAGAACATTTTTCCAAATCATGCAAGGCA
TTTGCGCTTACCTAGTGGTTTTTTTGAAGAAGGTATTCACTATTTGACGT
CACTTTATGACTTTACTTTTGAGGGGCCTTCTCAAACTTATCATCATCTT
TTTGTCCGTTCTTTGGAAGCAGAGGCAGGCCTTTATGAGTTTAAAGTGGA
AGTGCATCGCAAATCTATTGAATTGCAAATTGCTGAAAAAAATGTGCAAT
ACCTCTTTGATAATGACTATCTTCTTTATCAAGATACCTTTTATCACTTG
ACGTTAAAGCAACGAAAAATGGTTCAGGCTATTCGTAGTCTGCCCATTGA
GGCCGACTTGGCTAAACATATTCATTTTGATTTGGATGATCATGCGAAAT
TAGCTGCAAGCTTATCAGATTTTAAACAGATCGGTCTAGTAGAGGCTCCT
AAAAGCTTTGCTATTAGAGACTTTGAGGTGACTTTTCAATTTGATTTGTT
AAATCGAGATGAAATCAGTTGTCAGCTTATGTTTGATTATGGCAATTACC
AAGTTAGTGACAAAGCAAGTTTAGAAGCACTTCCTTTTGCTAGTCATTTA
AAAAAAGAAGAAAAAATCAATCGTTCTTTACTTGCTTTTGGCTTCTCGCC
ACAATTTTACTCAAAAAAGCGACTAACAAGTGCAAAAGAGCTCTATACTT
TTTTTGAAGAAACAGTTCCATGTTTTGAGCGCTTAGGTAATGTTGCGTTG
AGTACAGCTATCCAAGCATTACAAGTGAAAGAAATGCCCAAGATCGCTAT
TAGACGCAATCAGGGATTACTAGATATTTCGTTTGATTTTTCAACCATTA
TTGAAAATGATATTGACCAAGCTGTTACAGCTCTTTTTCAAAATAATCCT
TATTTTGTGAGTCAAACGGGTCAATTAGTGGTTTTTGATGATGAAACTCA
AAAAGTTAGCAAAAGTTTACAAGAATTAAGAGCAAGACAGCTAAAAAATG
GTCACTTGCAACTGGATGGCATTAGAGCTCTACAAGTATCCAAACTTTTT
GAAGGCATGACATCTGTTCATTTTTCAAAGGAATTAGAAGAGTTAGCCTA
TCATTTGCAGCATCCTGAAACTTTTTCAATAAAACCGTTACCAGTTAAGG
CTCAAATGCGAGATTATCAACGCAACGGTGTTCAGTGGTTATCAATGCTC
AATCATTATGGCTTTGGTGGCATTTTAGCAGATGACATGGGACTTGGAAA
AACTCTCCAGACACTTGCTTTTTTAGCTAGTCACCTGAAATCAGATAGTA
AAGTGCTCATTTTATCTCCATCTAGTCTTATCTATAATTGGTTTGATGAA
TGTCAAAAATTCACACCTCAGCTAGATGTTGTGGTTTCTTACGGACTTAA
ACAAATCAGAGATCAAATCATCGAAGAAGGTCATCAAATAACCATAACCA
GCTATTCCTCCTTTAGACAGGATTTTGAGACCTATCAAGCGTTTCACTAC
GATTATCTTATCTTAGATGAAGCTCAAGTGATAAAAAATGCACAAACTAA
GATTTCACACTGTTTACGTGCGTTTAATACAGCCAATTGTTTTGCGCTTT
CGGGCACTCCTATTGAAAATAAAATGCTTGAAATTTGGTCCATTTTCCAA
ATTGTTTTGCCAGGGTTGCTACCGACTAAAAAAGAGTTTTTAAAATTAAC
AGCTGAGCAAGTATCACGCTATATCAAACCCTTTGTGATGCGTCGTAAAA
AAGAAGATGTCCTACCAGAATTACCTGATTTAATTGAAACTAATTATTCA
AACGAGATGACAGATGAACAAAAAGCTATTTACTTAGCGCAGTTAAGGCA
GATGCAAGATCAAATTCGAAATTCTAGTGATGTGGATATTAGCCGTCAAA
AAATTGAGATTTTATCTGGTATCACTCGATTGAGGCAAATCTGTGACACT
CCAAGTCTCTTTATGGATTACCAAGGCAAAAGTGGTAAACTAGATAGTTT
GCGAATCTTATTGACACAAATTAAAGAAAATGGTCATCGGGCTTTGATTT
TTTCTCAATTTAGAGGGATGCTGGACTTGGCCAAGCAAGAGATGACTGCT
CTAGGGTTGACCTCTTATCAAATGACGGGATCTACCCCTGCCAATGAACG
TCAAGAAATGACTAGAGCCTTTAATAACGGTTCCAAGGATGCTTTTTTGA
TTTCCCTCAAGGCAGGTGGAGTTGGAATCAACCTTACGGGAGCAGACACA
GTGATTTTAATCGATTTATGGTGGAATCCTGCTGTTGAAATGCAGGCAAT
CAGTCGCGCCTACCGTATTGGTCAAAAAGAAAACGTTGAAGTATATCGCT
TAATCACTCGAGGGACGATTGAAGAAAAGATTTTAGAGCTTCAAGAAAGT
AAGCGCAATTTGGTGACTACAGTTTTGGATGGCAATGAAAGCCGAGCAAG
TATGTCCATTGAAGAAATAAAAGAAATTTTGGGGCTAAACACTCATTAA
>M5005_Spy0804 srtR, nisin biosynthesis two-component response regulator
ATGTATAAGATTTTAGCCATAGATGATGATAAAGAAATTCTGAAGCTTAT
GAAGACTGCTTTGGAGATTGAAAATTATCATGTTATAACCTGTCAAGAGA
TAGAATTACCAATAGTTTTTGATGATTTTAAAGGATATGATTTGATCTTA
TTGGATATCATGATGCCTAATATAAGTGGAACTGAGTTTTGTTATAAAAT
TCGGGAAGAAGTTCATTCTCCAATTATTTTTGTTAGCGCTTTAGATGGCG
ATAATGAAATTGTCCAAGCTTTAAATATAGGGGGAGACGATTTTATTGTG
AAACCATTTAGCTTAAAACAATTCGTAGCTAAAGTTAACTCTCATTTGAA
GAGAGAAGAGAGAGCAAAGATAAAGAATGAGGCTGAGGAGAGAGTGAAGC
GTAGTTTTCCACCTATAGAAATCTATCTAGAGGAACGTATGTTATATATT
GATAAACAGCCGTTATTCCTGACTTATAGAGAGTACGAAATTTTAGAATT
ACTGTCACGTCATCCGTATAAAGTTTTCACAAAAGAAGAGATATATGAAC
AAGTATATAGCGATGAAGCTTCAGCATTGTTTCATTCTATTTCAGAATAT
ATCTATCAGATTAGAATGAAATTTTCAAGTTTTGGAATTAATCCAATAAA
AACTATTCGCGGGATTGGTTATAAATGGGATGTTTAA
>M5005_Spy0006 trcF, transcription-repair coupling factor
ATGGATATTTTAGAATTATTTAGTCAGAATAAGAAAGTCCAATCCTGGCA
CTCTGGATTAACCACCTTAGGAAGACAACTGGTAATGGGGTTATCGGGTT
CAAGTAAAACATTGGCTATAGCTTCCGCTTATTTAGATGATCAAAAAAAA
ATAGTTGTGGTTACATCAACTCAAAATGAGGTTGAAAAATTAGCCAGCGA
TTTATCTAGTTTACTTGATGAAGAACTTGTTTTCCAATTTTTTGCAGACG
ATGTGGCTGCAGCGGAATTTATCTTTGCGTCAATGGATAAAGCTCTATCA
AGAATAGAAACCCTGCAATTTTTAAGGAATCCTAAATCTCAGGGCGTTTT
AATTGTTAGTTTATCAGGCTTAAGAATTTTATTGCCAAACCCAGATGTTT
TTACAAAGAGTCAGATTCAACTAACAGTTGGAGAAGATTATGATAGTGAT
ACTCTTACTAAACAACTGATGACAATTGGCTATCAGAAGGTCTCACAGGT
TATTAGTCCAGGAGAATTTAGCCGTCGAGGGGATATTTTAGATATCTATG
AGATTACACAAGAATTGCCTTATCGATTGGAATTTTTTGGCGATGATATT
GATAGTATTAGGCAATTTCATCCAGAAACTCAAAAATCTTTTGAACAACT
AGAAGGTATTTTTATTAATCCAGCAAGTGATCTTATTTTTGAGGTTAGTG
ATTTTCAACGTGGCATTGAGCAATTAGAAAAGGCTCTACAAACAGCACAA
GATGATAAAAAATCTTATTTAGAAGATGTATTAGCTGTTTCAAAAAACGG
TTTTAAACATAAGGATATCCGTAAATTTCAATCATTATTTTATGAAAAAG
AGTGGTCATTATTAGATTATATTCCTAAGGGAACGCCAATCTTTTTTGAT
GATTTTCAAAAACTAGTTGATAAAAATGCAAGATTTGATTTAGAGATTGC
TAATCTCTTGACAGAAGATTTACAGCAAGGAAAGGCTCTTTCCAATCTTA
ACTACTTTACAGATAATTATCGAGAGCTTAGGCACTATAAGCCAGCGACC
TTCTTTTCAAATTTTCATAAGGGACTTGGAAATATCAAATTTGATCAGAT
GCATCAGCTAACTCAGTATGCCATGCAGGAATTTTTTAATCAATTTCCTT
TGTTGATTGATGAGATTAAACGGTATCAAAAAAATCAAACAACGGTTATT
GTACAGGTAGAGTCTCAGTATGCTTACGAACGACTTGAAAAATCTTTTCA
AGATTACCAATTTCGCCTTCCTTTAGTGAGTGCTAATCAAATTGTTTCAC
GTGAATCACAAATTGTAATTGGAGCTATCTCCAGTGGTTTTTATTTTGCT
GATGAAAAGTTAGCGTTAATCACAGAGCATGAAATTTATCATAAAAAGAT
CAAACGACGCGCTAGACGATCTAATATTAGCAATGCTGAGCGTTTGAAAG
ATTACAATGAGTTAGCAGTAGGTGATTACGTGGTTCATAATGTCCATGGT
ATCGGTCGCTTTCTTGGAATTGAAACGATTCAGATTCAGGGAATCCATCG
AGATTATGTTACTATTCAATATCAAAATTCAGACCGTATTTCTCTTCCAA
TTGACCAAATTAGTAGCTTATCAAAGTACGTTTCTGCTGATGGAAAAGAA
CCTAAAATTAATAAACTCAATGATGGTCGTTTTCAAAAGACAAAGCAAAA
GGTCGCTAGACAAGTAGAGGATATTGCTGATGACCTTCTAAAATTATATG
CTGAAAGAAGTCAGCAAAAAGGATTTTCATTTTCACCAGATGATGACTTG
CAGCGCGCTTTTGATGATGATTTTGCTTTTGTAGAAACAGAAGATCAACT
TAGGTCTATAAAGGAAATTAAAGCTGATATGGAGAGCATGCAGCCTATGG
ATCGTCTTTTAGTAGGCGATGTAGGATTTGGTAAGACAGAAGTAGCTATG
AGGGCAGCCTTTAAAGCGGTGAATGATCACAAACAAGTAGCTGTCTTAGT
TCCAACCACAGTCTTGGCCCAGCAGCATTATGAAAACTTCAAAGCACGCT
TTGAAAATTACCCTGTTGAGGTTGACGTCTTAAGTCGTTTCCGTAGTAAA
AAAGAGCAAGCTGAAACACTAGAACGTGTACGAAAAGGTCAAATTGACAT
TATTATCGGAACCCATCGACTCCTATCAAAAGATGTGGTCTTTTCTGATT
TAGGATTGATTGTGATTGATGAGGAACAACGGTTTGGTGTTAAGCATAAA
GAAACTTTAAAGGAATTAAAAACTAAGGTTGACGTCTTAACCTTAACAGC
TACTCCGATTCCTAGAACCTTACACATGTCTATGTTAGGTATCCGAGATT
TATCGGTTATTGAGACCCCACCAACCAATCGTTATCCTGTTCAAACCTAT
GTTTTGGAAAATAATCCAGGTCTCGTTAGAGAAGCTATCATTCGTGAAAT
GGATCGCGGAGGACAAATTTTTTACGTTTACAATAAAGTTGACACTATTG
AAAAGAAAGTTGCAGAGCTACAAGAATTAGTCCCAGAAGCTTCTATAGGT
TTTGTTCATGGGCAAATGAGTGAAATTCAACTTGAAAATACCTTGATTGA
CTTTATAAATGGTGATTATGATGTCCTTGTGGCTACAACAATCATCGAAA
CAGGAGTTGACATTTCTAATGTAAACACTTTGTTTATTGAGAATGCTGAT
CATATGGGATTGTCAACTTTATATCAACTACGAGGGCGCGTCGGAAGAAG
TAATCGTATTGCTTATGCTTACCTGATGTATCGTCCTGATAAGGTCCTAA
CAGAGGTTTCTGAAAAGCGTTTAGAGGCTATTAAAGGCTTTACTGAATTA
GGTTCAGGCTTCAAGATTGCTATGCGAGATTTGTCTATACGAGGAGCAGG
TAATATTTTAGGGGCTTCTCAGAGTGGCTTTATTGATTCGGTCGGTTTTG
AAATGTATTCTCAGTTATTGGAACAGGCTATTGCTAGCAAGCAGGGAAAA
ACGACTGTTCGTCAAAAAGGCAATACTGAAATCAATCTTCAGATTGATGC
CTATTTACCAGATGATTATATTGCAGATGAGCGCCAAAAAATTGACATTT
ACAAGCGTATTCGAGAAATTCAATCAAGAGAAGATTATCTCAATTTGCAA
GATGAGCTTATGGATCGTTTTGGAGAGTATCCTGATCAAGTTGCCTATTT
GTTAGAGATAGCTCTGCTAAAACATTATATGGACAATGCCTTTGCGGAAT
TAGTTGAACGCAAAAATAATCAGGTCATTGTTCGATTTGAAGTAACTTCT
TTAACTTATTTCTTGACTCAGGATTATTTCGAAGCCTTATCGAAAACCCA
TCTTAAAGCTAAAATTAGTGAACATCAGGGGAAAATCGATATCGTCTTTG
ACGTTCGCCATCAAAAAGATTATAGAATTTTAGAAGAATTGATGTTATTT
GGAGAAAGGCTTAGTGAGATAAAAATCAGAAAAAACAATTCAGTTTTTAA
ATAA
>M5005_Spy0435 vicR, two-component response regulator
ATGAAAAAAATACTTATTGTGGATGATGAAAAACCGATTTCTGACATTAT
TAAGTTTAATTTGACAAAAGAAGGTTATGACATTGTTACAGCTTTTGATG
GACGCGAAGCGGTAACAATTTTTGAAGAAGAAAAGCCAGATTTAATTATT
CTTGATTTGATGCTCCCTGAGTTGGACGGTCTTGAAGTAGCCAAGGAAAT
TCGTAAAACCAGTCATGTCCCGATTATTATGTTGTCGGCTAAAGATAGTG
AGTTTGACAAGGTTATTGGACTTGAAATTGGGGCTGATGATTACGTGACC
AAGCCCTTTTCTAATCGGGAATTGCTGGCGCGTGTCAAGGCTCATCTGCG
TCGTACCGAAACTATTGAAACGGCTGTTGCAGAAGAAAATGCTTCTTCAG
GTACACAGGAACTGACCATTGGTAATTTACAGATTTTACCAGATGCGTTT
GTTGCTAAAAAACATGGTCAAGAGGTAGAGTTGACCCATCGTGAATTTGA
ACTATTGCATCATCTAGCTAACCATATGGGGCAGGTGATGACACGAGAAC
ACTTATTGGAAATTGTTTGGGGATATGATTATTTTGGCGATGTGCGCACG
GTTGATGTGACTGTTCGTCGCCTCCGTGAAAAAATTGAAGACACACCAAG
TCGTCCTGAGTATATTTTAACAAGACGTGGTGTTGGGTACTACATGAAAT
CTTATGACTAG
>M5005_Spy1332 yvqC, two-component response regulator
ATGAGTAAGATAAAAGTGATATTGGTCGATGATCATGAAATGGTCCGCAT
GGGACTCAAGAGTTTTTTGAATTTACAAGCTGATATTGATGTCGTTGGTG
AGGCCTCTAATGGACGTGAAGGGGTTGATTTGGCATTGGCTTTGAAGCCA
GATGTTTTGGTTATGGATCTAGTGATGCCAGAGTTAGGCGGTGTTGAGGC
AACTTTAGAAGTCCTAAAAAAATGGAAAGAGGCTAAGGTACTTGTGTTAA
CTTCCTATCTAGATAATGAAAAGATATACCCTGTCATTGATGCAGGAGCG
AAGGGTTATATGTTAAAAACATCGAGTGCGGCTGAAATTTTAAATGCCAT
TCGCAAGGTTTCAAAGGGAGAGTTAGCTATTGAAACAGAAGTTGACAAAA
AAATTAAGGCGCATGATCAACACCCTGACTTGCATGAGGAACTAACAGCG
CGTGAGTATGACATTTTACACCTTTTAGCTAAAGGGTATGATAATCAGAC
CATCGCTGATGAACTCTTTATTTCCTTAAAAACCGTCAAAACACATGTGT
CCAATATTCTAGCCAAGTTAGAAGTTGGTGACCGAACCCAAGCGGTTGTC
TATGCTTTTCGACATCATTTAGTCCCCCAAGACGATAATTAA