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COG category: Transcription
Organism: Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN, BPEN

Number of genes found: 22

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# Candidatus Blochmannia pennsylvanicus str. BPEN, BPEN

>BPEN_640 putative transcriptional regulator protein (MarR family)
ATGAATAGATTAACAGACATTTCAAACATGGTAGAATCCTTATCCCGTAT
TTATCATCGTTTACGCAAAGAAATAAATGGTCAATTAATTAATGAAGGTC
TTTCAATGTCTAAAATGAAAATCTTGCATCTTATTACTACCGGAAAAACC
AGTGCAACAGACATTAAAAATTATATGGGGTTTTCATCAAGAACTGTTGT
AACAGTTCTTGATGCATTAGAAAAAGATGAAATGTTACGCCGACAACAAA
GTCTGACAGATCGTAGAGTAAAATACGTTTATATTACAGAAAAAGGACGC
GATAAATTACGTGTTGCTGAAGATACGCATAACATCATTTTAGATCGTAT
ATTTTCCCTTTTGTCTGATGTACAGCTTAAAAGCTTTAGAGAAGTATGCA
ATTTACTTGAAATACAACAAAAAAATAATATGGCAAAATAA
>BPEN_462 cspC, cold shock-like protein
ATGGCAAAAATTAAAGGTCAAGTAAAATGGTTTAATGAATCTAAAGGTTT
TGGTTTTATTACACCGTCAGATGGGAGCAAAGATGTATTTGTACATTTTT
CTGCCATTCAAGGAAATGGATTTAAGACTTTGTCTGAAGGTCAAAGCGTA
GAATTTGAAATTCAAGATGGACACAAAGGCCCATCTGCTGTAAACGTGAC
GGCTTTATGA
>BPEN_113 deaD, cold-shock DeaD box ATP-dependent RNA helicase
ATGTCGAAAACTGTAGACTCTTTTATAGATTTAGGATTAAATCGTTATAT
TGTCAATGTTTTACATGATGTTGGGTATACAAAACCTCTACCTATTCAAA
TTCAATGCATTCCATATTTATTAGCTGGATATGATGTGTTAGGAATGGCG
CATACAGGTAGCGGAAAAACTGCGGCATTTGTCTTACCATTATTACATAA
TGTTGATATTAACAATTCTTGTTCTCAAGGTTTAATTATAACGCCTACTC
GAGAGTTGGCGATACAAATTGGGAGAGTGTGTTCTAATTTTGCAAAATAT
ATGAAAAAAATAAATGTTGTTACTTTATATGGAGGGCAAAGTTATGGCAT
TCAATTAAGTGCTTTAAATAAGAGACCTCATATTATAGTAAGTACTCCAG
GTAGACTAATAGATCATTTAAACCGTGGAACTGCTAATTTATCTCAATTA
AAAACTTTAGTAATAGATGAAGCTGATGAAATGTTGCGCATGGGATTTCT
TGAAGATGTAGAGCGTATCATTAAAAATATTCCAGTTAAACGTCAAACAG
CATTATTTTCTGCTACTTTACCTATGGGTATTCGTCGTATAAGTTATCGA
TTTATGAACAATCCAAAAGAAGTATTTATCCATTCTAATACTAGCATGTG
TGCTAATATTAGACAAAGTTATTGGTTAGTACATTCAGGAATCGCTAAAC
ATGAGGCTTTAATGCGTTTTTTAGAAACAGAAGATTTTGACGCAGCTATT
GTTTTTGTTCGTACTAAATATGCAACGTTGGAGATTTCCGAAATATTAGA
GAGATTTGGTTATAATAGTGCAGCTTTGAATGGAGATATGAATCAAACAG
TACGACATCAGACATTAGATCGATTAAGGCATGGTAAGTTAGATATTCTT
ATAGCTACTGATGTTGCTGCACGTGGATTAGATGTTCATCGTATTAGTTT
AGTAATAAATTATGATATACCAATAAATTCTGATGCTTATATACATCGTA
TAGGTAGAACTGGTAGAGCAGGATGCATGGGAAAATCCTTATTATTTGTA
GAGCATAAAGAATATCGTTTGTTGCGTCATATTGAACGTAAAATAAAACT
AAAAATTCCAGAGGTTCAGTATCCTACCTCTGAAACTTTATTTGATTGTC
GATTATCGAGATTTACGAATAAAGTAGAATATCAATTAAGTACCGAGAAT
GATGATTTGGATGTATATCGATCTCTATTACCTCAAATAAAACCTAGAAG
AGATTTGACAACGGAAAATTTAGCAGCTGTTTTGCTGAAAATAGCGCAAG
GCAATCGTCCATTGGTATTCCCTCCAGATCCGATTATTAAAAATAAATCA
GTTTCTAAAATACGTATAAATAGTAATCGTCAAAATTGTTTTCGTGTTGA
AAATAGAGTTATTAAAACTAGGTTGCAATCTAAAATTTCTGATAATATGG
ATGCTTATCACATATCAGTAGGGCGTAATGATGGAGTTAAAATACGTCAT
ATTATTAGAGTGCTTTCGAATAATATTGCTAATATTCGCTATCACGAAAT
AGGTAATATTAAATTATTTTCCTTTCATGCTATTATTGAGTTAGACAAAG
GGTTATCTAGCAACAAAATATTAACGCAGTTGTCTCATGCACGTATTTTA
AATAAACCAATAAATATGAAATTTTTAGGTAATATGTCCTCATGTAATGA
TGTACATTGA
>BPEN_099 greA, transcription elongation factor
ATGAAGCGCATACCAATGACTTTACGTGGAGCTGAAAAGTTAAGAGAGGA
ACTAGATTATTTAAGAAATGTTCTTCGTCCAGAAATTATAAAGAATATTT
CCGAAGCGCGGGAGCATGGCGATTTAAAAGAAAATGCTGAGTATCATGCT
GCTCGAGAACAACAAGGATTTTGTGAGGGTCGTATTCAAGAAATAGAGTC
TAAACTTTTTAATGCACATATTATAGATATTACCAAATTAACTACTGACG
ATAAAGTAGTTTTTGGCGCTACGGTTGGTGTTGAAAATTTGGATACAACA
TATAGACAAACGTATAGTATTGTAGGGGATGATGAGGCAAATCTTAAGGA
ACATATGATTTCTATCAATTCTCCTATTGCTAGAGGTTTGATTGGTCATA
AAGAAGGAGATATTGTTCGAATTAATACTCCAAAAGGAAAAGTAAGATAT
AAAATACTCCAGGTTAAATATTGTTAA
>BPEN_403 mntR, transcriptional regulator of mntH, Mn(2+) responsive
ATGACTAAAAATGAAGAAGTGTTGTCCAGTAATTTAGCGTGTTTTAAAAA
AAAAACAAATAATTTACAAGGATTTATCCAGGTTAGAGCAGCACATCGAC
GTGAGCTTATTGATGATTATATTGAATTAATTGCAGATTTAATTCAAGAA
CGCGGGGAAGCACGTCAAGTAGATTTAGCATTAAGACTTGGAGTAACGCA
ACCAACAGTAGCAAAAATGTTAAAAAAGTTGATAGCCTCTTCATTAATTA
AGCATAAACGTTATTGTGGGGTGTCGTTGACAAAACAAGGAAGGCAATTG
GCTTATGAAAATCATATACGACACAAAATTGTAAAAACTTTTTTAATAGA
TTTAGGCATCAATAAAAAAATTGCTCAAAGAGATGCAGAAGGTATCGAGC
ATCATGTTAGCAATGAAACATTGTTGGCATTTATTCAATTCTCTAAGCGC
TTCAATAAATAA
>BPEN_107 nusA, L factor
ATGAATAAAGAGATTTTGGCTGTTATAGAAGCAGTTTCTAATGAAAAAGC
TGTACCTCAAGAAAAAATTTTTGAAGCATTAGAAACAGCATTGGCTGCCG
CTACAAAAAAGAAATATGAACAAGATGTTGAAGTTCGTGTTGTAATTGAT
CGTAAATCAGGTCAGATTAATACATTTCGGAGGTGGGTTGTAGTGGAACA
AGTAACTCAACCTACTAAAGAAATTACATTAGATGCAGCTCGATTTGAGA
ATCCAAAAGTACAAATTTGTGATTACGTTGAAGATGTCATTGAATCTATT
AGTTTCGATCGTATTACAACTCAAACCGCAAAACAAGTTATTGTTCAAAA
GGTGCGTGAAGCTGAACGTGCAATTATTATAGAACAGTTTTTAAATCGAC
AGGGTGATATTGTTACAGGTATAGTAAAAAAAATTAATAGAGATAGTATA
AGTATAGATTTAGGAAATAATGCTGAAGGTATGATTAATAGAGAAGAAAT
GTTACCGCGTGAAAATTTTAGATTAGGAGATAGAATTCGTGGTATTCTTT
ATTTGGTGCGACCGGATTTTAAAGGTCCTCAATTACTTATCAGTCGTACT
AGGACTGAAATGTTGATTGAATTATTTCGTATTGAGGTACCTGAAATTGG
AGAAGAATTAATCACAATTAAAGCCGCAGCGCGAGATCCTGGTTCACGGG
CAAAAATTGCCGTCAAAACAAATGATAAGCGTATTGATCCAGTAGGAGCA
TGTGTAGGAATGAGAGGAGCACGTGTTCAGGCTGTGTCTGGTGAATTAGG
AGGAGAACGAGTAGATGTTATATTATGGGATGATAATCCTGTTCAATTTG
TTATCAATGCTATGTCTCCTGCTGATGTTGCGTCTATTGTGATAGATGAA
GATAAACATACAATGGATATTTCAGTAGAGGAAACTAATTTACCTCAGGC
TATTGGAAGGAATGGACAAAACATTCGTTTAGTATCTCAATTAAGCGGCT
GGGAACTCAATATTATGACTGTAGATGAGTTGGAAAAGAAACGTCAAGTT
GAAATATGTACTATCACAAACATTTTTATTCATTCCTTAAATATCAGTGA
GCAATTTGCTAAAATTTTAATTGATTCAGGGTTTTCTTCTCTTGAGGAGT
TAGCTTATGTACCTATGACAGAATTATTATCAATAAAAGAATTTGATAGA
AAAACAGTAGAAATAATTAGGGATCGCGCAAAAAGTGCTTTAAAGAATTT
TTCTGTGATTCATAATGAAAAAAATATTAAGGAAGATAATTATACTGCGG
CGGTTATTCATCCCGTTACAGGATTATTGAGATTGCCTAATATTGAATAT
AAATTAGCACTAACATTAGTTGAACGTGGTATTTCTACATTAGAAGAGTT
AGCTGAACAAGATATTTCGGATCTTTCCGATATTGAAGGATTAACTAAAG
AAAAAATTGGAGAATTAATTATGGAAGCCCGCAATATTTGTTGGTTTAAT
AATGATAACAAACATTAA
>BPEN_242 nusB, L factor
GTGAAAGCAATTAGTAGAAGGCGTGCTCGTGAATGTACATTGCAGGCATT
GTATTCTTGGCAAGTATCTAAAAATGATGTTAAAGAAATAGAACGTTATG
TTGTAACAGAGCAAGATATTCAAGATTGCAATATCTCTTACTTTCATGAA
TTATATATTGGAGTAATAAGTTGCGCTGAAGAATTGGATAAATTAATGAT
ACCGCATTTATCCCGCAATTTAGAGAAATTAGGTTATATTGAACATTCAG
TGTTACGTATCGCATTATTTGAGCTTACCAAATGTAATGATATACCATAT
AAAGTTGCCATTAATGAAGCAATTGAGCTTGTAAAAATTTTTGGAGCTGA
AAAAAGTCATAAATTTATTAATGGAGTATTAGATAAAATAGCCAATCAGC
TTTGTGTTAGTACAAACAATCATATTATTAAATAA
>BPEN_582 nusG, transcription antitermination protein
ATGACTGTCACATCAAAGAAACGTTGGTATGTTATTCAAGCATTTTCTGG
ATTTGAAAATCGTGTAGCTCATTCTTTGCGTGAGCATATTAAACTGCACA
ATATGGATACGATGTTCGGTGAAATCATGGTCCCAACAGAAGAAGTAGTC
GAAATGCGAGCTGGACAACGCAGAAAAAGCGAGCGTAAATTTTTTCCTGG
TTATGTATTGGTGCAGATGATCATGAATGATTCTAGTTGGCATTTAGTAA
AAAGTGTTCCACGTGTTATGGGTTTTGTTGGAGGAACATGCGATAAACCT
GCTCCTATTGGGGATAAAGAGGTTAATGATATTATGCATCGGTTGCAACA
AATAGGTGATAAACCTCGTCCTAAAACATTATTTGAACCTGGTGAGCTTA
TTCGAGTCAGTGATGGACCTTTTTCTGACTTTAATGCTGTAGTAGAAGAA
GTAGATTATGAAAAAAATCGTCTAAAAGTATCAGTTTCTATTTTTGGGCG
AGCCACTCCGGTAGAATTAGATTTTTCACAAGTTGAAAAATCTTAA
>BPEN_607 rho, transcription termination factor Rho
ATGAATCTTACAAAATTAAAAAACATACCAGTTTCTGAATTAGTACATCT
CGGAGAAAGTATGGGTCTAGAGAATTTAGCACGTATGCGCAAGCAAGATA
TTATTTTTGCTATTTTTAAACAACATGCTAAAACTGGAGAAGATATTTTT
GGGGATGGTGTATTAGAAATATTACAAGATGGTTTTGGGTTTCTTAGATC
TAGTGATAGCTCTTATCTTGCTGGACCAGATGATATTTATGTGTCTCCAA
GCCAGATTCGTCGTTTTAATTTACGTACTGGAGATACTATTTCTGGGAAA
ATTAGACCTCCAAAAGAAGGTGAACGTTATTTTGCATTGCTTAAAGTAAA
TGATGTAAATTATGATAAACCAGAAAATGCTCGTAATAAAATTTTGTTTG
AAAATCTTACTCCATTACATGCCAATTCACGATTACGCATGGAAAGAGGA
AATGGTTCTACGGAAGACTTAACCGCAAGAGTATTGGACCTGGCATCACC
TATTGGGCGCGGCCAGCGCGGTTTAATTGTAGCGCCTCCTAAAGCCGGAA
AAACCATACTTCTTCAAAATATTGCACAAAGCATTAGTCATAATCATCCA
GACTGCGTATCAATAGTGCTTTTGATAGATGAACGTCCAGAAGAAGTTAC
TGAAATGCAACGCTTAGTACACGGAGAAGTAATTGCATCTACCTTTGATG
AGCCAGCATCTCGTCATGTTCAAGTATCTGAAATGGTAATCGAGAAAGCT
AAGCGATTAGTAGAACACAAAAAAGATGTAATTATTTTGTTAGACTCCAT
TACTCGATTAGCAAGAGCCTATAATACTATAGTTCCTTCATCTGGAAAAG
TGTTGACAGGAGGGGTTGATGCCAATGCTTTACATCGTCCAAAACGCTTT
TTCGGAGCGGCTCGTAATATGGAAGAAGGAGGAAGCTTAACTATTATAGC
TACTGCTTTAATAGATACTGGATCAAAAATGGATGAAGTAATTTATGAAG
AATTTAAAGGAACTGGCAATATGGAATTGCATTTGTCAAGAAAAATAGCT
GAAAAGCGTGTTTTTCCGGCTATTGATTACAATCGTTCTGGAACTAGAAA
AGAAGAACTATTAACTACTCAAGATGAACTACAAAAAATATGGATTTTAC
GAAAAATTATTCATCCAATGAGTGAAATTGATGCAATGGAATTCATGATG
AATAAATTATCTATGACTAAAACCAATGATGAATTTTTTGATATGATGAA
GCGCTGTTAA
>BPEN_560 rnc, RNase III
ATGTTAGTTAATGCATTGCAAGAAAAACTTGGTTATATTTTTAATCGATA
TGACTTATTATTACAAGCGCTAACTCATAGAAGCTCTAGCAATCAACACA
ATGAAAGACTAGAATTTTTGGGCGACGCCATATTAAACTATGTAATAGCT
AATTTGTTATATCATAGGTTTCCTCATATTAGTGAAGGAGGTATGAGTAG
AATGCGTGCAAATTTGGTACGCGAAAATACATTGGCAACACTAGCACGAG
AATTTAATTTAGGAGATTATCTACAATTAGGACAAGGAGAACTAAAAAGC
GGGGGATATCAACGTGAATCCATTTTGGCCAATACAATAGAAGCGTTGAT
AGGCGGTATATTTTTAGATAGTAATATTCAAACTATTGAAATATTAATTA
TTAATTGGTATAAAATTCGTATAGATCATATGGATCCTTATGCTTCTTAT
GATACACAAAAAGATCCAAAAACTCGTCTGCAAGAATATATGCAACGCCG
TCGTTTGCCGTTACCTGTATATTGGATTAATCAAATAATTGGAGAGGCGC
ACAATCAAATATTTACGATAAATTGTCAAGTTAGTGAATTAACACAACCG
ATTATTGGATGCGGTTCTAGTCGGCGTAGAGCTGAACAAAATGCAGCAGC
AAAAGTTTTAGAGGCACTAGAACATAACCAAAACATATGA
>BPEN_223 rpoA, RNA polymerase, alpha subunit
ATGCAGAATTCTGTAATAGAATTTTTAAAACCACGCTTAGTAGATATTGA
ACAAATTACTGAAACACGTGCTAAAGTTACTCTGGAGCCGTTAGAACGAG
GGTTTGGCCATACTTTAGGAAACGCTCTACGTCGTATCTTACTTTCTTCA
ATGCCTGGATATGCTATAACAGAGGTTGAAATTGACGGGGTATTACATGA
ATATAGTACAAAAGAAGGTATACAAGAAGATGTTCTAGAGATTTTACTCA
ATTTAAAGAAATTAGCTATTAGAATTGAAGGAAAAGATAGCGTTACTTTA
ACTTTAAAAAAATCCGGTATTGGTCCTGTAATCGCAAATGATATTTTGTA
TGATAGTAATAGCGTAAAAATTGTTACCCCTAATCATATTATATGTCATA
TAACTGACAAGAATACATCTATTAGTATGAGTATTAAAGTGCAGCGCGGA
CGAGGTTACGTTCCAGCTTCTTCTAGGTTTCATTCTGAATCAGATATCTT
ACCAATTGGTCGGTTATTATTGGATGCATGTTATAGCCCGGTAGAAAGGA
TTTCTTATAATGTAGAAGCTGCTCGCGTTGAGCAACGTACAGATTTAGAT
AAACTAATTATTGATATGGAAACGGATGGAACTATAGAACCTGAAGAAGC
GATTAGGCGGGCAGCAACAATTTTATCTGAACAACTTGAAGCATTTATTG
ATTTAAGAGATATACATCAACCAGAACATAAAGAAGAAAAACCAGAATTT
GATCCAATCTTATTACGTCTTGTTGATGACTTAGAACTGACTGTACGTTC
TGCTAATTGTCTAAAAGCAGAATCTATTCACTATATTGGAGATTTAGTAC
AACGAACAGAAATAGAATTATTAAAAACCCCTAATTTAGGAAAAAAATCT
TTGACAGAGATAAAAGATGTATTAGCATCTCGCGGATTGTCTTTAGGAAC
ACGTTTAGAAAATTGGCCTCCTACGAATATTTTAGATAATTAA
>BPEN_577 rpoB, DNA-directed RNA polymerase, beta-subunit
ATGGTGTATTCTTATACTGAAAAGAAACGTATTCGTAAAGATTTTGGAAA
ACGCCCTCAGGTTTTGGATATTCCATATCTTCTTTCTATTCAGATTGATT
CTTTTCAAAAATTTATTAAACAAGATCCAGAGGAACCATGTGGACTGGAA
GCAGCTTTTAGATCTGTTTTTCCAATTAAAAGTTATAATGGCAACGCTGA
ATTACAATACATCAAATATCAATTAGGAGAACCAACGTTTGATGTGAAAG
AATGTCAGACACGTGGTGCTACCTTTTCTGCGCCGTTACGTGTACGCCTA
TGTTTAATTATTTATGAACGAGAAGGATTAAATAACATAATAAAAAATAC
CAAAGAACAAGAAGTATATATGGGTGAAATTCCTCTCATGACTAATAACG
GTACTTTTATTATCAATGGTATTGAACGGGTTATTGTATCTCAATTACAT
AGAAGTCCCGGTGTGTTTTTTGATAGCGATAAAGGTAAAACACATTCATC
CGGAAAAGTATTATATAATGCACGTATTATTCCATATCGTGGGTCTTGGT
TAGATTTTGAATTCGATTTAAAAGATAATTTATTTGTTCGAATTGATCGG
CGACGTAAGTTACCAGTAACAGTAATATTGCGTGCTTTAAATTATACTAC
CGATCAAATTTTAAATATATTCTTTAACAAAGTAATATACGAAATTCAGA
ATAATACATTATATATGCATTTAATCCCTGAAAGATTACGCGGTGAAACA
GCATCTTTTGATATTGCTGTTAATGGTGTTATATATGTAAAAAAAGGACG
TCGTATTGCAGCTAAACACATTCGTCAATTAAAAAAGGATAAAATTTCAA
AAATTGAAGTACCCATGGATTATATAATTGGTAAAGTTGTTATAAAAGAC
TATTTCGATAAGAACACGAATATACCTATTGTTACAGCTAATACAGAAAT
ATCTTCTGACATCTTGCATAACTTAATTCGATCAGGATATGAATCCATAG
AAACATTATTCAGCAATGATTTAGATTACGGTAATTACATCTCTGAAACT
TTGCGTATTGATGCAACTACAAATAAATTTGACGCATTAGTAGAAATTTA
TCGTGTAATGCGTCCAGGGGAACCTCCTACTAAAGAAGCTGCCGAATATT
TATTTGAAAATTTATTTTTTTCAGAAGAGCGTTATGACTTGTCTTCTGTA
GGAAGAATGAAATTCAATCGGTCATTACAACGAGTACAAATAGAAGATTT
AGGAACATTAAAAAAGGATGATATTGTTGATGTAATAAAAAAATTGATTG
ATATTAGAAACGGTAAAGGCGAAGTAGATGATATCGATCATTTGGGGAAT
CGACGTATTCGTTCTGTAGGTGAAATGGCAGAAAATCAATTTAGAATTGG
ATTAGTTAGAGTAGAACGCGCGGTAAAAGAACGCTTATCTTTAGGTGATT
TAGATGTGTTAACTCCTCAAGACTTGATTAATGCTAAACCAATTTCAGCT
GCAGTAAGAGAATTTTTTACTTCTAGCCAATTATCTCAGTTTATGGATCA
AAATAATCCATTATCAGAAATTACTCATAAACGTCGCATATCTGCTTTAG
GACCAGGAGGGCTAACTCGAGAACGTGCGGGATTTGAAGTACGTGATGTC
CATCCTACACATTATGGTAGAGTCTGCCCAATCGAAACTCCAGAAGGACC
AAATATAGGTTTAATTAATTCATTATCTGTATATGCTCGAGCTAATAAGT
ATGGATTTTTAGAAACTCCATACCGAAAAGTCCAAAATGGCGTTGTTAGT
AATGACATTCATTACTTATCTGCAATTGAAGAGGGTGATTTCGTTATTGC
TCAAGCAAATACAAACTTAAATTCAATAGGTGAATTTATTGACGATCTGG
TAACTTGCAGAAATAAAGGTGAATCTGGTCTTTTTAAAAAAGACCAAGTT
GATTACATGGATGTATCTACACAACAAATAGTTTCAGTCGCTGCTTCATT
AATCCCTTTTCTTGAGCACGATGATGCTAATCGTGCTCTTATGGGCGCAA
ACATGCAACGCCAAGCCGTTCCTGTTTTATGTAGTGAAAAACCATTAGTA
GGCACTGGAATGGAGCGCGCAGTAGCTATAGATTCTGGTGTTACCGTAGT
AGCTAAACGCGGCGGCGTCATTAAATATGTAGATGCATCACGTATTGTAA
TACATGTTAACAAGAATGAAACGCATACTGAAGAATCAGGAATTGATATC
TATCAATTAACAAAATATATTCGATCCAACCAAAATACTTGCATTAATCA
ACGTCCTTGCGTGTCTTTAGGAGAATTAGTAGAACATGGAGATGTTATAG
CAGATGGTCCATCTACTGATTTAGGAGAATTAGCTTTAGGTCAAAATATG
CGAATTGCATTTATGCCTTGGAATGGATATAATTTTGAAGATTCGATGTT
GGTCTCGGAACGTGTAGTGCAAGAAGATAAATTTACAAGTATACATATTC
AAGAGTTAACTTGTGTATCTCGTGATACTAAATTAGGGCCTGAAGAAATC
ACGGCTGATATTCCAAATGTAGGAGAGACAGCTTTATCTAAATTAGATGA
ATCTGGAATTATCTATATCGGCGCAGAAGTAATAGGAGGAGATATCCTCG
TCGGGAAAGTTACACCCAAAGGAGAAACTCAATTAACACCAGAAGAGAAA
TTATTGCGTGCTATTTTTGGTGAAAAAGCATCCGATGTAAAAGATTCATC
TTTACGTGTTCCCAACGGGGTTTGTGGTACTGTAATTGATGTACAAATAT
TTACTAGAGATGGTATTAATAAAGATAAACGTTCATTAATAATTGAATCC
GAGAAATTAAAACAGGTTAAGAAAGATTTAAGTGAAGAATTACAAATTTT
TGAATCAGCTTTATTTGATCGTGTCTGCGATGTATTAATGACCAGTGGAA
TTGATAAAAAGAAATTGTTTGAAACTAGCCGCAATGCTTGGTTAGATTTG
GTGTTATCAGATCCAGAAAAACAATATCAATTATCTCAATTAACTAAACA
ATATTTTGATTTAAAACGCATGTTTGAAAAAAAATTAGAAATTCAACATC
GTAAAATCACTCAAGGAGATGAATTAGCTCCCGGTATTTTAAAAATAGTT
AAAGTATATTTAGCTGTAAAACGTCAGATACAACCTGGCGACAAAATGGC
AGGAAGACATGGAAATAAAGGAGTAATCTCTAAAATTAACCCCATTGAAG
ATATGCCATATGATCAACATGGAATACCGGTAGATATCGTACTCAATCCT
CTTGGAGTACCATCTCGAATGAATATTGGTCAAATTTTAGAAACACATCT
TGGTATGGCGGCAAAAGGTATCGGAGATAAAATAAACTTTATGTTGCAAC
AACATAAAGAAGCAAATCAATTAAGAAGATTTATGCAGCAAGCGTATAAT
TTAGGAGAAGGATCGCGTCAACACATCAATCTTAATTCATTTTCAGATAT
AGAAATATTAAAATTAGCTAAAAATTTAAAAAAAGGAATGCCTATTGCTA
CTCCGGTATTCGATGGGGCTACAGAAAAAGAAATTAAAGATCTTTTAAAA
TTATCCGGATTACCTAGTTCTGGTCAGATTACATTATTTGATGGGTGCAC
AGGAGAAGCATTCGAGAGACAAGTTACTGTGGGCTATATGTACATGTTAA
AACTAAATCATTTGGTAGACGATAAAATGCATGCACGTTCTACTGGTTCT
TATAGTTTAGTAACCCAACAACCACTGGGTGGGAAAGCTCAGTTTGGAGG
TCAACGTTTTGGAGAAATGGAAGTATGGGCATTAGAAGCTTATGGAGCAT
CATATACTTTACAAGAAATGTTAACTGTAAAATCAGATGATGTAAATGGA
CGTACTAAAATGTATAAAAATATTGTTGATGGCAATCATATGATGGAACC
GGGAATGCCTGAGTCTTTTAATGTTTTATTAAAAGAAATTCGTTCTTTAG
CAATTAATATTGAACTAGAAGATTAA
>BPEN_576 rpoC, DNA-directed RNA polymerase, beta-prime-subunit
GTGAAAGATTTACTTAGATTTTTTAAGATACAACATACTCAAATAGAAGA
ATTTAATGCAATCAAAATTGCACTTGCTTCTCCAGATATGATTAGATCCT
GGTCTTTTGGTGAAGTAAAAAAACCAGAGACTATTAATTACCGTACTTTT
AAACCTGAACGAGATGGTTTATTTTGTGCACGCATTTTTGGGCCTATTAA
AGATTATGAGTGCTTATGCGGAAAATATAAGCGTCTAAAACATCGCGGGG
TAGTTTGTGAAAAATGTGGAGTAGAAGTAACACAAAGCAAAGTACGACGT
GAACGCATGGGACATATCGAATTGGCTTCTCCTACTGCTCATATTTGGTT
TCTAAAATCATTACCCTCGCGTATTGGTTTGTTATTAGATATGCCATTAC
GTGATATAGAACGCGTTCTATATTTCGAATCCTATGTAGTAGTTGAAAGC
GGCATGACTAGTCTCGAATGTCGTCAGGTCTTAACTGAAGAAGAATATTT
AGATGCATTAGAAGAGTTTGGAGATGAATTTGAAGCTAAAATGGGAGCTG
AAGCCATTCAAATTTTATTGAGAAATACAAATTTAAAAAATGAATGTGAA
TACTTACGAGAAATATTAGAAGATAGTCATTCTGAAACTAAACGAAAAAA
AATAACAAAACGTATCAAATTAATTGAAGCATTTATATATTCTGAAAATA
AACCTGAATGGATGGTTTTAAATGTGTTGCCAGTACTACCTCCTGATTTA
AGACCATTAGTTCCATTAGATGGGGGGCGTTTTGCTACTTCTGATTTAAA
TGATTTATACCGTCGTGTTATTAATAGAAACAATAGATTAAAACGATTAT
TAGATTTAGCTGCTCCAGAAATCATAGTACGTAATGAAAAAAGAATGTTA
CAAGAAGCAGTAGATGCATTGCTAGATAACGGACGTAGAGGACGTGCCAT
TACTGGTTCTAACAAACGTCCTTTGAAATCTTTAGCTGACATGATTAAAG
GCAAACAAGGTAGATTTCGTCAGAATCTTTTAGGGAAACGTGTTGATTAT
TCCGGTCGCTCAGTAATCACTGTTGGACCCTACTTAAAATTACATCAATG
TGGATTACCAAAAAAAATGGCTTTAGAATTATTTAAGCCATTTATTTATG
GAAAATTAGAATTGCAAGGTTTTGCTAGTACTATTAAAGCGGCTAAAAAA
ATGGTAGATCGAGAAGAAGCTGTAGTATGGGATATTCTCGATAACGTAAT
TCGAGAGCATCCAGTAATGTTAAATCGTGCTCCTACATTACATAGGTTAG
GAATTCAAGCTTTTGAACCAGTATTAATAGAAGGAAAAGCTATTCAATTA
CATCCATTAGTCTGTGCTGCCTATAACGCGGATTTTGACGGTGATCAAAT
GGCAGTACACGTTCCATTAACACTAGAAGCTCAATTAGAAGCTAGAGCTT
TAATGATGTCTACTAATAATATTTTATCTCCTGCTAATGGAGAACCTATT
ATTGTTCCATCACAGGACGTAGTGTTAGGTTTGTATTATATGACTCGTGA
ACGTTCAAATGCTAAAGGTGAAGGAATGGTATTAACTGGCCCAAAAGAAG
CAGAATGTCTTTATCGTTTAGGCTTAGCTGATCTACATGCTCGTATTAAG
ATACGTATTACCGAATATGAATATGATAAAAACGGAGAATGGTCAAAAAA
AACAAATCTTGTCAATAGTACAATAGGACGCTCTATATTGTGGATGATTG
TTCCTAAAGGATTACCATTTATATTGGTCAATCAAGTATTAGGCAAGAAA
GCTATATCCACAATGTTAAATAATTGTTATCGTTTGCTAGGCATGAAAGC
TACTGTTATCTTAGCTGATCAAATTATGTATACTGGGTTTGCATATGCTG
CTCGTTCTGGAGCTTCTGTTGGTATTGATGACATGATGATTCCTTCGAAA
AAAGCGGATATAATCGATGAAGCGGAATCTGAAGTGGTAGAAATACAAGA
ACAATTTCAAACTGGATTGGTGACAGCAGGAGAACGTTATAACAAGGTTA
TTGATATTTGGGCTGCGGCTAATGAACGTGTTGCACAAGCAATGATGGAT
AATTTAGCTACTGAGACTGTGATGAATCGTAATGGACAACTAGAAAATCA
AGCTTCATTTAATAATATTTTTATGATGGCAGATTCTGGGGCTCGCGGAT
CAGCGGCACAAATTCGTCAACTTGCCGGAATGCGTGGTTTAATGGCAAAA
CCGGATGGATCAATTATTGAAACACCTATCACTGCAAATTTTCGAGAAGG
ATTAAATGTATTACAGTATTTTATTTCTACGCATGGAGCACGTAAAGGAT
TAGCTGATACTGCTTTAAAAACAGCTAATTCTGGTTATTTAACTCGTCGT
TTAGTAGATGTTGCTCAAGACTTAGTAATCACTCAAGACGATTGTGATAC
ATTTTCTGGCATTGTAATGAGTCCTGTTATTGAAGGAGGAGATGTAAAAG
AACCGCTACGAGAGCGTGTATTGGGTCGAGTTTTAGCAGAAGACATTCTA
GAATCCAATGCGGATACAGATAGTAAAGTATTGATTGTACGCAATACTTT
ATTAGACGAGTATTGGTGTGATGTTTTAGATGAACATTCCATTGATACTG
TCAAAGTGCGGTCTGTTGTGACTTGTGATACTGATTTTGGCGTTTGTTCA
AAATGTTATGGTCGAGATTTAGCTCGAGGTCAAATTGTAAATAAAGGAGA
AGCAATTGGCGTCATTGCTGCTCAATCTATCGGTGAGCCAGGCACTCAAT
TAACTATGCGGACCTTTCATATTGGGGGGGCCGCCTCCCGATCTGCTTTA
GAATCGAGCATTCAAATTAAAAACACGGGTACTGTCTGTTTAAAAAACAT
CAAATCCGTAATAAATGGAGAAGGAAAATTAGTAGTCATCTCACGTAACA
CCGAGCTTAAAATTATTGATCAATTTTCTCGTACCAAAGAAAGCTATAAA
GTACCGTATGGAGCTGTAATAACTAAAAAAAATGAAGAAAAAGTCATACA
TGGAGAAATAGTAGCTTATTGGGATCCACATACTATGCCAGTGATTGCTG
AAGTAAGTGGATTTATCCAATTTATTGATTTGATAGATGGCCAGAGTATT
GTTAAACAAACGGATGAATTAACGGGACTAACCTCTATTGTAGTATTAGA
TACCTCTGAACGTGTGAGTAGCGCTAAAGATTTAAGACCTACATTAAAAA
TAGTAGATATTAATGGTTACGATATCTTTATCCCAGGTACAGATGTGCCT
GTTCAATATTTTCTGCCTGGTAGAAGTGTAGTTCAATTAGTTGATGGATC
CAGAATTATTTGTGGAGATATATTAGCAAGATTACCACATGAAAGTAGTG
GTACTAAAGATATTACCGGCGGCCTACCGCGCGTTGCTGACCTCTTTGAA
GCACGTCGTCCAAAAGAATCGGCAATTTTAGCAGAAATTAGCGGGACCAT
TTCTTTTGGAAAAGAAACCAAAGGAAAACGTCGTTTAATGATATCTCCTA
TTGAAGACGGTGATGTATATGAAGAAATGATTCCCAAATGGCGTCATCTT
AATGTTTTTGAAGGTGAATACGTAGATCGTGGAGATATCATTTCTGATGG
ACCGGAATCTCCACACGATATTCTGAGATTACGTGGAGTTCACGCTGTAA
CTCGTTACATTGTAAATGAAGTGCAAGATGTTTATCGATTACAAGGAGTA
AAAATCAACGATAAACATATAGAAGTTATTGTGCGTCAAATGTTGCGTAA
AGCCACTGTGATTCGATCAGGCAGTTCTGATTTTTTAGTAGGTGAACAGG
TAGAATACTCACGTATTAAAATTGCTAATCGAAAATTAGAAAATGAAGGA
AAAGTAAAGATCAGCTTTATACGTAATTTATTAGGCATCACTAAAGCTTC
ATTAGCAACAGAATCATTTATTTCTGCGGCATCTTTTCAAGAAACAACAC
GTGTATTGACAGAATCATCTGTGGCTGGAAAGCGAGATGAACTACGTGGT
CTTAAAGAAAACGTCATTGTTGGTAGATTGATCCCTGCTGGAACTGGCTA
CTCTTATCATCAGGAGCGCGTACATCATCGTCATTTCAGTAATAAAAAAG
AAACAGAAAAATCTGTAATAACAAATATTTCTTCCCAAATTACAGCAGAT
GAAGCATCGGCGAATTTAACTGAACTATTAAACGCAACTTCTCCTAAATA
A
>BPEN_057 rpoD, RNA polymerase sigma-70 factor
ATGGAACATAACCCACAATCACAACTTAAGTTGCTCGTCACACTCGGGAA
AGAACAAGGATACTTAACTTTTTCTGAAGTTAATGATCATTTGCCAGAAG
ACATCGTGGATCCTGGTCAAATCGAAAATATAATCCAAATGATGAATGAT
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CTGTGCAAGCATTGACTAACGTTGACTCAGAGTTAGGCAGGACAACTGAT
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AGAAGGTGAAATAGATATTGCTAAAAGAATTGAAGACGGAATAAACCAAG
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GGGTTTTGTAGATCCTGATATAAATGAAAATATATCAATACACACAAACA
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GAAGAAGAAAATAATGATGAAAATAACATTGATCCAGAAATAGCCTATGT
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AATATAATGGACGAAATCACATTAAATCATCAAAAGAAATTTTAAAACTC
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TAATTATGAAATTATGTGTCGAGATTAGTAAAATGCCAAAAAAAAATTTC
ATAGCGTTATTTTCAGGAAACCAAACGAATAAAACATGGTTTAATACAGC
TTTATCTATGCACACATCATGGTCAGAAAAATTATATAAAGTTGATGAAG
ATGTGCAGAATAGTTTATCAAAATTACATCAAATTGAAAAAGAAACAGGA
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GTATGCTTATGTCAGAAGATAAAATTAGAAAAGTGTTAAAAATTGCTAAA
GAACCTATTTCTATGGAAACTCCTGTAGGAGATGATGAAGATTCTCATCT
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TGATCATACTCTAGAAGAGGTGGGTAAACAATTTGATGTAACCCGTGAAC
GTATTCGTCAAATAGAGGCGAAAGCTTTAAGAAAACTACGTCATCCTAGT
CGATCTGAAATATTGCGAAGTTTTTTGGATGATTAA
>BPEN_653 rpoH, RNA polymerase sigma-32 factor
ATGCCTAAATATATACAAAAAAATGTAACTTTAATTCCTCAAGGGAATTT
AGAAGCTTATATAAAAGTAGCCAATGCTTATACTATGTTAACAGCAGAAG
AAGAAAAAACATTAGCTAAACGCTTATACTATAATGGTGATTTAGATGCT
GCAAAAAAACTCATTGTATCACATTTAAGATTTGTTGTTCATGTTTCTCG
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ATATTGGTTTAATGAAAGCTGTTCGTCGATTTAATCCAGAGTTAGATGTT
CGTTTAGTATCATTTGCTGTACACTGGATTAAATCCGAAATTCATGAATA
TGTTTTAAAAAATTGGCGTATTGTAAAAATAGCTACCACTAAAGCGCAGC
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GTCAACACATTATTCGTGCCCGATGGTTAAATGTAGATAATAAAAGTACG
TTACAAGAATTAGCCAATCAATACGGTGTATCTGCTGAACGAGTACGTCA
ATTAGAAAAAAATGCCATGAAAAAAATGAAACTAATTATACAAAATTAA
>BPEN_642 rpoZ, DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega
ATGGCACGTATAACTGTACAGGATGCGGTAGAAAAAGTTGGTAATATATT
TGATTTAATATTAGTTGCCGCGCGACGTGCACGGCAAATGCAAATTGGTG
GAAAAGAAACATTAATTACGAAAAATAATAATGATAAATATACCGTGCTT
GCTCTCAGAGAAATAGAAGAAGACTTAATTACTAAAAAATAA
>BPEN_380 slyA, transcriptional activator for hemolysin (MarR family)
TTGGAATCACCATTAGGATCAGATTTAGCACGCCTCGTAAGAATATGGCG
TGCTTTAATTGATCATCGTTTAAAACCTTTAAAACTTACACAAACACATT
GGATTACATTGCATAATATTTGTCAATTACCTCCGGAACAATCTCAAATA
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CGATCAACTTGAAGAAAAATCATTAATTATAAGACATACTTGTCTGAATG
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AATGAAGTAAATCGTGTCATTTCTATCACTAGAAATGAAATTTTTAACGG
AATTAGTAATGAGGAAACAATTTTTCTAAATAAAATTATTTCTAAATTAG
AAAAAAACATTATAAATTTACATAATAAGAATTAG
>BPEN_540 ureG, putative urease accessory protein G
TTGTTATTAAATCAATATAGAAAACCATTGCGTATAGGTGTAGGAGGTCC
TGTAGGATCAGGTAAAACCGCATTACTTGAAGTGTTATGTAAAAGAATGA
AGGATAGCTATCAATTAGCGGTGGTGACTAATGATATTTATACTAAAGAA
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TGGAGTAGAAACTGGAGGATGTCCACATACTGCTATTCGTGAAGATGCTT
CTATGAATTTATTAGCTGTAGAAGAATTAATATCGAAGTTTAACAATTTG
GATATCATTTTTATTGAAAGTGGTGGAGATAATTTGAGTGCTACTTTTAG
TCCAGAATTGTCAGATTTAAATTTATACGTTATTGATGTAGCTGCAGGTG
ATAAAATACCTCGAAAAGGTGGACCAGGTATTACACGTTCTGATTTTTTA
ATAATTAACAAAATTGATTTAGCTGAATATGTAGGAGCATCTTTGGAAAT
AATGAATCGTGATACAAATCTTATGCGTAAAGGTTTACCGTGGTCTTTTA
CTAATTTAAAAACAGGTCATGGTGTACAATCCGTTGTTGATTTTATTTTG
AGACAACGGCTCTATTTGCAATAA
>BPEN_038 yidZ, putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)
ATGAATAATTTTGATTTCAATTTACTAATAATTCTCAATGCACTACTCGA
AGAGTATAGCGTAAACTTAGCGGCAAAAAAATTAAATGTCACTGCTCCAG
CTATTAGTAAATCTCTCAACAAAATACGCATTCTATTTAATGATCAAATT
TTAGTACGTAGTGGAACTAAATTAATCCCTACGCCTAAAGCAATCTCTCT
AAAAGAAAATATTAAAGAATTAGTGAACCGTATTGAATCAATATTCAACA
ACAACATAGTATTTGAACCTAAAATTACCACTATATCATTTACTATTGCA
TCGAACAACGCTATTCTTTTTATCCTTAATACCATCTTATTTCAAAAAAT
GAAAGATAAAGCTCCCAAAGCATTTATTCATTTAGTAAATGACTCAGACT
ACGATGATAATTTTTTAAGAAACCATACCATAGATTTATATATAGGAGAA
ATGCGCGCACTTAACCCAGAAATAACTATTCGAACTATCTACGTATCCAA
ATGTTGTATAATATCTCGGAATCATCATCCTATTTTGTCTCAAACTAAAA
ATATGGATAATTTATTAAAATATCAATTCATTAAAACCAAACATGAGTAT
TTAACCAACTCCGATGAACATAGTAAATATTTTTGGTCGGAGCGTAACTT
AATTGGTATTACCCCAGAATATATCACTACTGTAAACGCTATAATTCATT
CAGATGCACTAGCGATAATACCAGAATTTATATTAACAATGATACAAAAA
TTAAATATACCAATCACACATTTTAATACTGATTTAAATTTAGGAAAAAA
AAGCATTATTCAAGCATGGCATTCTAAACACAACCGCTCTTCCGCTCATA
AATGGCTACGAGAATTTACTAAAAAAATATTTTTAACTAGTATAGTATAA
>BPEN_401 yqeI, putative transcriptional regulator with C-terminal, effector domain of the bipartite response regulator
ATGAAATATGTCATTCAATCGACTATAATATTTGACACTACAGAATATAC
TCTGACATTATTAACTGATTCCAACACATCAGTAAAATTATCTAATTCTG
CCGGACGAGTATTAGAAGAGCTTATTAAACGACACAATATTGATATTTGT
GCACCAGTCACTCGAGAGCACTTGTTTTCAATCGTTTGGAGAGCTTATGG
ACTGGAACCATCTAACGGCAACTTAAATCAACAAATTAGTTTAATACGAA
AAACTTTAACGTCTTTTGGATTAGATTCCTCGTCCATTATAACTATTCCT
AAACGAGGGCTAAAGCTAAACAATCAATTGATTGTAGAAAAAATACACGA
AGATCAACCATGCGTATCTTCCCTTCTACATAAAACCACAGATCAAAACA
ATAATTTACTATCATCTTCTATCTTACTAAATATCAAAGCTCATATAAAA
TATATGATTACTCTGACGATAATGGCCGTAATATTACTCAGCATTGGTTT
TGTGTTTTTATACACTAAAAAAGATCATATTAAACTATATTGTTGCAAAG
AAATAAACTCATGTAATATTTGCGCTTTCCATTCAGAATTAGGATTTGAA
TGTAATGACTGCATTATGCAGTGCACCGAAATTACATAG
>BPEN_258 yqgE, putative transcriptional regulator
ATGTTAACACCACATAAGATAATAAATTTACAAAATCATTTTTTAATAGC
TATGCCGGCACTGCAAGATCCATTATTTAAACAATCAGTGGTATATATTT
GTGAACATAATGACGCAGGTGCTATGGGAATTGTCATTAATAAACTAGTG
ACACGATGTACGGTAGAGACTATATTAAACAATCTAAAGATTGTATCCCC
CACGCGCGATCCGTCTGTTCGATTAGATAATCCAGTATTTGCAGGAGGCC
CCTTATTAGATGATCGAGGTTTTATTTTACATACTCCTATAAAAGGTTTT
GGTTCTAGTGTTAACATTTCTTCAAAAGCTATGATTACTACTTCTAAAGA
TATTTTAGAAACTTTAGGAACCCCTAATCAACCAAAGGATGTATTGGTGG
CGCTTGGCTATTCTGGATGGGATAAAGGTCAATTAGAACATGAATTAATG
GAAAATACTTGGCTTACTGCTCCGGCTAATGAAACAATTTTATTTCATAC
TCCTATTATTGATCGTTGGCGCGCAGCTGCAAAAATATTAGGAATTGATA
TTTATAATATTGCTGATCAGACAGGTCATGCGTGA
>BPEN_046 yrbA, putative transcriptional regulator (BolA family)
ATGGTGGACATTATGGACGTGGATGATATTAAAAGTATTTTATTAAAAAA
TTTGGTATTAGATGAAGCATATGTCTCTTTATATAAGGATAATTATCAAA
TTATTGCTGTAAGTCATATTTTTTATGATGGTATGACTGAATTAGAACGG
CATAAAATTATATATGCTCCTCTTATGAAGTATATATTAAATAATGAAAT
TCATTCAATATCTATTCAAGCATTTAATCCTCAGGAATGGAACAAAAAGC
GTGGATTATGCGGGGTGTGA