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COG category: Transcription
Organism: Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum), APS

Number of genes found: 19

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# Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum), APS

>gid:449720  cspC  cold shock-like protein cspC
ATGGCTAAGATTAAAGGTCAAGTTAAGTGGTTCAACGAATCTAAAGGTTT
TGGTTTTATTACACCATCAGACGGAAGTAAAGACGTTTTTGTTCACTTTT
CTTCAATTCAGGGGAATGGATTTAAAACATTAACTGAAGGCCAAAATGTT
GAATTTGAAATTCAAGATGGACAAAAAGGACCTGCCGCAGTAAATGTTTT
TTCTCTATAA
>gid:449887  cspE  cold shock-like protein cspE
ATGTCCAAGATTAAAGGTAATGTTAAGTGGTTTAATGAATCTAAAGGTTT
TGGTTTTATTACTCCAGAAGACGGTAGTAAGGATGTGTTTGTTCATTTTT
CAGCAATACAAAGCAATGGATTTAAAACTTTAGCAGAAGGTCAGAGTGTT
GAATTCGAAATCACCGAAGGAGCAAAAGGACCATCTGCCGCTAATGTTAT
TAGTTTATAA
>gid:449770  deaD  ATP-dependent RNA helicase deaD
ATGACTCATATTGAAAGCACATTTTCTTTTCTTGGTTTAAATCCTTTTAT
TATTCAATCTTTAAATGAAATGGGATATGTTAAACCTTCCCCTATTCAAG
CATCTTGTATTCCCTTGCTTTTAGAAGGACGTGATGTATTAGGAATGGCA
CAAACTGGAAGTGGCAAAACGGCTGCTTTTTCATTACCGCTATTACACAA
TCTTAATATTAATTTAAAAGCTCCTCAAATATTAGTATTAGCTCCTACAA
GAGAATTAGCCGTCCAAGTAGCAGAAGCATTTTCAGATTTTTCTAAATAC
ATGATTGGAATTCATGTGTTACCTTTGTATGGTGGTCAAAGATACGAACT
CCAATTACGTGCACTACGACAAGGACCTCAAATTGTTGTAGGAACTCCAG
GTAGATTATTAGATCATTTAAAAAGAGGGACACTTAATCTTTCTAATTTA
CATGGATTAGTTTTAGATGAAGCAGATGAGATGTTACGTATGGGTTTTAT
TGAAGATGTAGAGACAATTATGGCTCAAATTCCGAAGGAACATCAAACTG
CATTATTTTCAGCTACTATGCCAGAAGCAATTCGTCGTATTTCTAAACGA
TTCATGAGAAATCCAAAAGAAATAAAAATACAGTCCAATATTACTACACG
TCCTGATATCAAACAAAGTTATTGGATGGTATATGGTCGAAAAACTGATG
CATTAATTCGTTTTTTAGAAGCCGAAGATTTTTCTGCTACAATCATTTTT
GTAAGAACTAAAAATGCAACTTTAGAAGTATCTGAAGCATTAGAACGTAA
TGGATATAATAGTGCCGCGTTAAATGGAGATATGAATCAAGCATTGCGTG
AACAAACTCTCGAAAGATTAAAAAATGGTAGATTAGATATTTTAATTGCT
ACAGATGTTGCGGCGCGTGGTTTAGATGTTGATCGTATAAGTTTTGTTAT
TAATTATGATATTCCTATGGACTCAGAATCTTATGTTCATCGTATAGGTC
GAACAGGTCGAGCAGGTCGAGCAGGTCGAGCGTTATTATTTGTTGAAAAT
CGTGAACGTCGTTTGCTACGTAATATTGAACGTACTATGAAACAATCTAT
TCCCGAAGTACAATTACCTAAAGTAGAATTATTATGTCAAAGACGTCTTG
AACAATTCGCAAAAAAAGTACAACAACAATTAGAAAGCCGAGATTTAGAT
GAATATAGTGCTTTATTAGATAAATTATACTCTACAGATGATTTAGATAT
AAAAACTTTAGCAGCCGCTTTGTTAAAAATGGCTCAAGGAGAACGTCCTT
TAATTATTAAACCTGATGTAATTAAACGTCAGTCTCGTGATTTATTGTTC
CAAGACGATCGTCGACGCGAAGACAACCGAAACAGTCGAACCCGTCGCGA
TCGTCGTGATATCAATAAAGACGCAGAGTTATATCGTATTGAAGTAGGTC
GTAATGATGGAGTTGAAGTACGTCATATAGTTGGAGCAATTGCTAATGAA
GGAAATATTAATAGTCGTAATATTGGTAATATTAAACTTTTTTCTTCTTA
TTCGACAATTGAATTGCCTAAGGGAATGTCTAAAGATTTATTACAAACCT
TTAATCGTACTAGAATATTAAATAAACCAATTAATATGAAATTATTACGA
GATTCAAGACATTATGAAAATAAGACAACTCATCGTTCTATTTTTAACAA
AGATAAAAATAGTAACCGTCGTGTTTCTGATGGTAGTTTCAATAAATCTA
ACTCTCCTAAAAAAACTGAATTTAAGTCATCTTTTTTTCGTCGTAGAAAT
GTTTAA
>gid:449798  fis  factor-for-inversion stimulation protein
ATGCTAGAAAAAAAAACAAATACAGAATTTTTAGTTTTATCTACTACTAA
TACTCAAGATAAAAATATCAAACAACCTTTATGTGAATTAGTAAAAAAAT
CTTTAAAATATTATTTATCTAATTTAAATGGCAAAGATGTTAATAATTTA
TATGAATTAGCACTATCTGAATTAGAACAACCTCTTTTAGATATGATAAT
GCAGTATACCAGAGGAAATCAAACACGTGCTGCTTTAATGCTGGGAATTA
ATCGTAGTACATTGCGTAAAAAATTAAAGAAATATAGTATGAATTAA
>gid:449782  greA  transcription elongation factor greA
ATGATTAATCTAATTCCAATGACTGTAAGAGGGGCTGAAAAACTTCGTCG
AGAACTAAAAAAATTAAAAAGTATAAATCGTCCTCGTATTATTGCAGCAA
TAGCAGAAGCTAGAGAACATGGTGATTTAAAAGAGAATGCTGAATATCAT
TCAGCTCGTGAAGAACAGAGTTTCTGTGAAGGACGTATTAAAGAAATTGA
ATTAAAACTATCTAATTCTCAAATTATAGATGTAACAAAAATATCTAATA
ATGGCAGAGTAATTTTTGGTTCTACTGTTAGTATTTTAAATATTAAAAAC
AATGAAAAGTTTACCTATCGGATTGTAGGCGATGATGAATCTGATTTTAA
AAAAAATTTAATTTCTATTAATTCTCCAATAGCAAGAGGTCTTATTGGAA
AAGAAATTAATGATGTTGTAATCATATGTACACCAGGAGGTGATGTTGAA
TATAAAATTTTAAAGATAAATTACATATAA
>gid:449692  mfd  transcription-repair coupling factor
ATGAAAATTACAAAAAATAAAATTTTAAAAAACAAAAAAATTATTAATTT
TAAATATCAAAAATTACTAGATCTATTTTATAATGTAAATAATCAAAAAA
AAAATAATCAGTTATTGTCCTATTTATATTCATTTTCAGGAAAAATAATA
TTTTCTTTGACAGAAGAAAAATCTTTAAAAAAAATTTTAAGATTTTTAAT
GAGACATAAAATACACCCACAATATATTAAAAGAATTATTGATATTAAGA
AAGAAATTGATTATTTTTACATGATAGAAGAGATCAAAAATGGATTTATA
GATAAAAAAAATAATATTTTATTTCTTTGTACAAAAGATTTGTTGCCAAT
ATTAATTGATGATAAATATATTGGTAATATAAAAAAGAATACTAACAATA
TTAATAAATTTAACTTATCTCAATTGATTTTAAATCATCCAGTTATGCAT
ATTGAACACGGTATTGGAAGGTATAAAGGATTAACAACTATAGAAACTGC
TAGCATACAATCTGAATATCTTGTTATTTCATATGCAGAAGGGGATAAAT
TATATGTACCGGTTTCAAATCTACATCTTGTCTCACCTTATACCGGAACA
TCTATAGAAAATGCTCCTCTTCACAAATTAGGTGGTGATGATTGGAATAA
AGAAAAACATAAAATTAGTAAAACGGTTTACGATCATGCAGCACAATTAC
TACATATTTATGCAAAAAGAGAATCTAAAACAGGTTTTGCATTTAAAAAA
AACATAGAAAAATATGACTTGTTTTGTAATGACTGTTCTTTTAAAACAAC
ATCAGATCAAAATGAAGTAATGAAGTTCGTACTAAAAGACATGTCTAAAC
CAATTCCTATGGATCGTTTAATTTGTGGTGATGTCGGTTTCGGAAAGACT
GAAATAGCGATGCGTGCTTCTTTTTTAGCTGTATCTAATAAAAAACAAGT
AGCTATTTTAGTGCCAACTACTTTATTAGCACAACAACACTATAAAAATT
TCAAAATTCGTTTTTCTAATTGGCCTGTTAATATTAATATATTATCTAGA
TTTCAAACACAAAAAGAACAAGATTTAATTTTTAAGCATACTAAAAACGG
ACGAATTAATATAATAATAGGTACTCATAAACTGCTATTTAAAAATATAG
AATGGTGTAGTCTCGGACTATTAATTATTGATGAAGAACATAGGTTTGGC
GTGAGTCATAAAGAAATTATAAAAAAAATATATTCTAATATTGATATACT
GACTTTAACAGCTACGCCTATACCTCGTACTTTAAATATGGCTATGACTG
GTATAAAAGATCTATCTATTATAGCAAAACCTCCAGCTCAAAGATTGGCA
ATTAAAACTTTTATTCAAGAATATAGTCCTATATTAATAAGAAAAACAAT
ACTACGTGAAATATCAAGAGGCGGTCAAGTTTATTATATATATAATAAAG
TTCAAAATATCATGAACATCGCTGAAAGATTATCAATATTAATTCCCGAA
GCTAGTATTAAAATAGGTCATGGACAAATGAAGAATATAGATTTAAAAAA
AGTCATGAATGAATTTTACAACAATAAATTCAATGTCTTGATTTGTACTA
CGATTATTGAAAGTGGTGTTGATATAGCAAGAGCTAATACAATTATTATT
GAAAATTCTGATCATTTTGGATTATCTCAATTACATCAACTTCGCGGACG
TATTGGTCGATCAAATAATCAAGCATATGCTTTATTACTTGTCAACAATT
TTAATAAAATCACTTCAGATGCCAAAAAAAGATTAGAAGCAATTTCATCA
GTTGATAATTTTGGAGGAGGTTTTTCTCTATCTAATCAAGATTTAGAAAT
TAGAGGAGTAGGTGAGATACTAGGTAAAGAACAAAGCGGACATATAAAAA
ATATAGGTTTTTCTTTATATATGGACTTGTTGAAAAATGCTATTGATTTA
CTAAAAAATGGAAAAATTTTTTCTGTTGAAAAATCATTAAAAAAACCATT
AGAAATTGATTTACATGTATCTTCCCTACTACCTAGTAGTTATATATTAG
ACATTAATACAAGATTATTTTTTTATAAAAAACTCGCCAACGCTATACAT
GAAAAACAAATAGAAGAAATAAAATATGAACTAATTGATCAATTTGGTAA
ACTACCTGATTTTTCTAAGAATTTAATTCTAATTGCTAAAATTCGATTAA
TAGCAGATAAAATTGGTATTAAATATATTAAATCTAATAATAACATAGGC
ATAATAGAATTTAATGATTATGGTTCTATAAATACTGAATATTTACTGAA
AATGTTTCAAAAAGAACCAAAAATCTGGAAAATGGAAACTTCTACAAGAA
TAAAATTTATTTTGCATTTAAAAAATGATTATTTGCGTCTCAAGTGGATT
ATTAATTTATTAAGAAATTTATTTAAAAAAAATATTTAA
>gid:449776  nusA  N utilization substance protein A
ATGAATAAAGAAATCTTAGCTGTTGTCGAGGCTGTTTCTAATGAAAAATC
TCTACCTCGCGAAAAAATTTTTGAAGCTTTAGAAATGGCATTAGCAACGG
CGACTAAGAAAAAACATGAACAAGAAATTGATATCAGAGTAAGTATTAAT
CGAAAAACTGGGGGCTTCACTACTTTTCGACGTTGGATGGTAGTAGAAAC
AGTAACTCAACCAACTAGAGAAATCACTTTAGAAGCAGCATGTTTTGATG
GCGAAAAAGTTTATCTTAATGATTATATAGAAGAACAAATTGAATCTGTT
GATTTTGATAGAATAACAACTCAAACTGCAAAACAAGTGATTGTTCAAAA
AGTTCGTGAAGCAGAACGAGCAATGTTAGTGGAACAATTTCGCAAATATA
CCGGTCAAATAATTACCGGAATAGTTAAAAAAATTAATCGAGACAACATA
ATGTTAGATCTAGGTAATAATGCTGAAGCATTAATTTTACGTGAAGGCAT
GCTGCCAAGAGAAAACTTTCGTCCAGGAGATCGTATTCGTGGTATTTTAT
ATGGGGTGTATCCAGAAGCTCGTGGTGCTCAGCTATTTATAAGTCGTTCA
AAAACTGAAATGCTTACTGAATTGTTTCGAATAGAAGTCCCTGAGATTGG
AGAAGAAGTAATCGAAATAAAAGCTGCTGCACGAGACCCAGGTTCTCGTG
CTAAAATTGCAGTTAAGACTAATGATAAGCGTATTGATCCTGTAGGAGCT
TGTGTGGGTATGAGAGGTGCTCGGGTACAAGCGGTATCTAGCGAATTATG
TGGAGAGCGTATTGATATTATTTTATGGGATGATAATCCAGCTCAATTCG
TTATAAATGCTATGGCTCCGGCTGATGTAGCTTCTATTGTTGTAGATGAG
GATTGTCATACTATGGATATAGCAGTAGATATAAATAATTTAGCTCAAGC
CATTGGTCGAAATGGTCAAAATGTTCGTTTAGCTTCTCAAATTAGTGGTT
GGGAATTAAATGTTATGACTACAGAAGATCTTCATTCTAAACATAAAGAA
GAAGCTCATACTGCTTTTAATTTTTTTAAAAAAAATTTAAATATAAATGA
AAATATTATTAAAATTTTAGTTAAAGAAGGTTTTTCTTCTCTTGAAGAGT
TGGCATACATACCATTTAACGAATTACTAGAAGTTAAAAATTTAACTGAA
GATCAAGCAAAAAAAGTACGTGAAGGCGCGAAAAGTAAACTTCTCTTAAT
GGAATCAGATAAAAATAAAATGATAATACAAGAAAGAAAAACAGAAAAAG
AGTTATTAAAAATAAATGGAATGAACGCAGTACTAGCTTTGCAATTAGCC
GAAAAAAATATATTTACTATAGAAGAATTAGCTGATCAAGGAATTGACGA
TTTAACTGATATTAAAAATTTAAATTCTGAACAAGCTGGGTTATTAATTA
TGACTGCTCGTAATATCTGTTGGTTTAGTAGTAAAGTCTGA
>gid:449861  nusB  N utilization substance protein B
ATGAAACCATCTTTTCGAAGAAAAGCACGCGCATGTGCATTACAAGTATT
GTATTCTTGGGAAATATCTCATAACAATATTAAAGAAAGTGCCATCTATT
TTTTAAAAGAAAAAAATAAAAAAAATATTGATATTGTATACTTTTATGAA
TTAATTATTGGAATTACATACGACTGTAAAAATATAGATAATTTAATGAA
ACCTTATTTATTTAGATCATTAAAAGAATTAGGACATATTGAAAGGGCAA
TTCTTAGAATTTCATTTTATGAATTACATAAAAGAAATGATATACCTTAT
AAAGTTTCAATTAATGAAGGTATTGAACTAGCTAAATTATTTGGTTCTGA
AGATAGTCATAAATTTATCAATGGTGTTTTAGATAAAGCAGTATTTAAAA
TGGGATATAACAAAAAAGTTGTTATCGCATAA
>gid:449437  nusG  transcription antitermination protein nusG
ATGCATGAGAGTCAAAAAAAGAGATGGTATGTATTACAAGCTTTTTCTGG
ATTCGAAAGTCGTGTAGCACAATCAATACGGGAACATGTGAAATTAAATC
AAATGGAAGATTTATTCGGAGAAGTAATGGTCCCTTCTCAAGAGGTTGTT
GAAATACGAGGTGGACAACGCAGAAAAAGCGAATATAAATTTTTTCCTGG
ATATGTTTTGATACAAATGAAAATGACAGATTCAACCTGGCATTTAATTA
GAAATGTCCCAAAAGTTTTAGGTTTTATTGGGGGGAAATCAGATAAACCT
TCACCGATTAGTGACAAAGAAGTAGAAATTATCATTAATAGACTACGTAA
AATTGGTAATAAACCAAGACCAAAAACCTTATTCGAACCAGGAGAAATGA
TCCGCGTCAATGATGGTCCTTTTGCTGATTTTAATGGTGTTGTAGAAGAA
GTTGATTATGAAAAAAGTAGACTGAAAGTTTCTGTTTCTATTTTTGGAAG
ATCTACTCCGGTCGAACTAGATTTTAGACAAGTTGAAAAAAATTAA
>gid:449994  rho  transcription termination factor rho
ATGAATCTTACCGCACTTAAAAATATGCCAGTGTCTGAATTAATTACTCT
TGGTGAAAAAATGGGGTTGGAAAATTTAGCGCGTATGCGTAAACAAGATA
TTATTTTTGCCATCCTTAAACAACATGCAAAAAGTGGAGAAGATATATTT
GGCGACGGTGTTTTAGAAATACTACAAGATGGATTTGGCTTTCTACGTTC
TGCAGATAGCTCTTATTTAGCTGGTCCTGATGATATTTATGTTTCACCGA
GTCAGATTCGTAGATTTAATCTACGTACAGGTGATACTATTGCTGGAAAA
ATAAGACCCCCTAAAGAAGGCGAAAGATATTTTGCTCTACTTAAAGTAAA
CGAAGTAAATTATGATAAACCTGAAAATGCAAGAAGCAAAATATTATTTG
AAAATTTAACACCATTACATGCCAATTCTAGACTACGAATGGAACGTGGA
AACGGATCAACCGAAGATTTAACCGCAAGAGTATTAGATTTAGCATCACC
AATCGGACGTGGACAAAGAGGATTAATTGTAGCTCCGCCAAAGGCAGGAA
AAACAATATTACTGCAAAATATAGCACAAAGTATTGCTTATAATCATCCA
GATTGCGTTTTAATGGTATTATTGATTGATGAAAGACCAGAAGAAGTTAC
TGAAATGCAAAGATTAGTTAAAGGAGAAGTAGTTGCCTCTACTTTTGACG
AACCTGCATCAAGACATGTTCAAGTGGCTGAAATGGTTATTGAAAAAGCA
AAAAGATTAGTAGAACATAAAAAAGATGTAATAATTTTACTTGATTCTAT
TACTCGTTTAGCAAGAGCCTATAATACAGTAGTACCTGCATCAGGAAAAG
TATTAACTGGAGGAGTAGATGCAAATGCTTTACATAGACCCAAGCGATTT
TTTGGTGCTGCGCGTAATGTGGAAGAAGGAGGAAGTTTGACAATCATTGC
AACTGCATTAGTTGATACTGGTTCTAAAATGGATGAGGTAATATACGAAG
AGTTTAAAGGAACAGGCAATATGGAGCTTCCATTATCTAGGAAAATTGCA
GAAAAGCGTGTTTTTCCAGCTATTGATTATAATCGATCTGGTACTAGAAA
AGAAGAATTATTAACTTTGCCAGATGAACTACAAAAAATGTGGATTTTAA
GAAAAATTATTCATCCTATGAGTGAAATAGATGCAATGGAATTTTTGCTT
AATAAACTTGCAATGACCAAAACAAATGATGAATTTTTTGATATGATGAA
ACGCTCTTAA
>gid:449664  rnb  exoribonuclease II
ATGTTTCAAAATAATCCATTACTTACACAGTTAAAAAAAAACCTACATGC
TAAATCACCACGTGTTGAAGGCATAGTAAAAAGCACTGAAAGAGGATTTG
GATTTTTAGAAGTTGATCCGCAAAAAAGTTATTTTATACCTCCAAAAAAT
ATGAAAAATGTTATGCATGGAGATAAAATAATTGCATTATTAACAACAGA
AAAAGATCGAGAAATAGTTGAACCTGAAAAATTAATTGAACCTTTTCTAA
ATAGATTTGTTGGAAAAATAGAGAAAAAAGACAATCGCTTATTTATTGTT
CCAGATTATCCGTTTTTAAAAGATCTTATAACATGTCAACCTAACAAAAA
TTGTATCAATATTTTTCAAAACGGAGATTGGGCTGTAGCTCAATTAAAAA
AACATAAACTCAAAGGAGATCATCTTTTTTATGCTGAGTTAACTGAAAAA
ATTACTCAAGAAGATGATCCATTAATACCATGGTGGGTAACTCTAGCACG
TCACGATCTTGACAGGAAAGAACCTTTAGCAGAAGACGATGATCTTATAT
TAAAAGAAAGCGATAATAGAAAAGATTTAACAGATTTAGATTTTATTACT
ATCGATAATACAAATACAAAAGATATTGATGATGCTCTTTTTGTAAGTGA
AAAAAATAATGGAGATATTTCTTTAATTGTCGCTATTGCAGATCCAACCG
CTTATATTAAACATGGTAGTAAATTAGATGTTATAGCATCTAAAAGAATA
TTTACAAATTATTTACCAGGTTTTAACATTCCTATGTTACCCCGTAATTT
ATCAGAAGATATATGTTCATTAAATCCTAACAAACGTCGCCCTGTATTGG
CATGTCATATTACGGTTTTAAAAAATGGAAATATCTCTAATAAAATTGAG
TTTTTTTTAGCCTGGATTAAATCAAAATCAAAATTATCTTACGATCATGT
TTCAGATTGGATTGAAAAAATAGGGTCATGGATACCACCAACAAAATCTA
TTGCAAATCAAATATTAATTTTACATCGTCTATGTTTATTACGTATAAAA
TGGCGCAAAAAAAATGCAGTGTTATTTAAGGATAGCATAGAATATCGCTT
CCATGTATCAGAACATGGAAAAATCATAGATGTGTTAATTGAAAAAAGGC
GTATTGCTCATAAAATTATTGAAGAATCTATGATAGTAGCAAATATATCT
GCTGCTAATTTTTTATCTAAAAATATTGGTTTTGGTATATATAATGTTCA
TTCTGGTTTTGATCTTGTTAATGCTGAAAATGCAGTATCCTTTTTGAGAA
GTTACAATTTAAACTTTACTGTGAAAGAAATAACTACATTGAAAGGTTTT
TGTAATCTAAGACGTGTATTGAATATTATATCTAATAATTACATCGATAG
TCGTATCCGTCGTTTTCAATCTTTTGGAGATTTCAGTACTATACCAGGAC
CACATTTTGCACTTGGTTTTTCAGAATATGCAACCTGGACTTCTCCTATT
CGTAAATATAGTGATATGATTAATCATCGTTTATTAAAATCTATTATAAA
AAAAGAAAAGTCAATTAAACCTGGTGAAGATATTAAAATAAAAATAAGTG
AACAAAGACGACGTAATAGAATGGCTGAAAGAGATGTTTTAGATTGGCTT
TATACTATATTTTTACAGAAAAAAAAATATCAAAACCAAAAATTTAACGC
GGAAATAACTGATATTTCTAGGAGTGGAATAAGAGCCAGATTAATAGAAA
ATGGTGCTAATGTTTTTATTCCTGGAACTCTAATACATCCTATTAGAGAA
GAATTAAATTTTAATCAAGAATCAGGAAAAGTTTTTATTAATGGTATTAT
GCATTATAAAATATCTGATTTGATTCAAGTCACTTTATCAGATATTCGTT
TGAAAACTCGTAGTATTATTGCCAAACCTGTATTTGAAAAATTTAAATAA
>gid:449656  rnc  ribonuclease III
ATGAATCATATTGTGACAAAAAAAATACAAAAAGTATTAGGATATACTTT
TACTCATAAGGATCTTTTAAAACAAGCATTAACACATCGTAGTGCGAGTA
GTAAACATAATGAACGACTGGAGTTTTTAGGCGATTCTATTCTAAGTTTC
GTTATCGCCAATGCTTTATATCAACATTTTCCATATATCGATGAGGGTGA
TATGAGTCGAATGAGAGCAACTTTAGTTCGAGGAAATACTTTAGCAGAAA
TCGCATATGAATTTGATTTAGGAGAATATTTAAAATTAGGACAGGGAGAA
TTAAAAAGTGGAGGTTTTCGTCGTGAATCTATTTTAGCCAATACTGTAGA
AGCTTTAATTGGAAGTATTTATTTAGATAGTAACATTAAAACAGTAGAAG
AATTAATATTAAAATGGTATGAAAAACGTTTAGAAAAAATTAGTCCTGGA
GACACACAAAAAGATCCTAAAACACGGTTGCAAGAGTATTTACAATCAAA
GCATTTATCTTTGCCTTTATATTTTATAGTTGAAGTATATGGTGAAGCTC
ATAATCAACTATTTACCATTCATTGTAAAATTAGTACCATTTCAGAATAT
TTGATTGGAACAGGTTCTAGTAGAAGAAAAGCTGAACAAGATGCAGCTCA
AAAAGCATTAATTAAATTAGGTGTAGAGTGA
>gid:449897  rpoA  DNA-directed RNA polymerase alpha chain
ATGCAGAATTCTATCATGGATTTTTTAAGACCACGTTTAGTTGATATTGA
ACAAATTAGTGCGACTCATACTAAAGTCACATTAGAACCATTAGAAAGAG
GATTTGGTCATACACTTGGAAATGCACTTCGTAGAATTCTCTTATCTTCC
ATGCCAGGATGTGCGGTAACTGAAGTTGAAATTGATGGAGTACTTCATGA
GTATAGTACTAAAGAGGGAGTGCAAGAAGACGTTTTAGAAATATTGTTAA
ATTTGAAAGCGTTAGCGGTAAAAGTTTATGGAAAAGATGAAACCCTTCTC
ACATTACATAAATCTGGTATTGGTTCTATTACTGCCGCAGATATCATACA
TGATGGAGATGTTGAAATCATCAAGCCGCAGCATGTAATCTGTCACTTAA
CTGATGAAAATGCTTCTATTAAAATGCGAATAAAAGTGCAACGTGGAAGA
GGCTATATTCCTGCATCTTCGAGAGTTCATTTAGAAGAAGATTCGCGACC
AATAGGTTGTTTGTTAGTAGATGCTTGTTATAGTCCAATTAATCGAATTT
CTTATAATGTAGAAGCTGCTCGAGTAGAACAAAGAACAGATTTAGATAAA
TTAGTTATTGAGATGGAAACTAACGGAACTATTGATCCAGAAGAAGCTAT
TCGACGAGCAGCTACTATTTTAGCAGAACAACTAGAAGCATTTGTTGATT
TAAGAGATATTCGTGAACCTGAATTCAAAGAAGAAAAACCTGAATTTGAA
CCTATTTTGTTACGTCCAGTAGATGATTTAGAACTTACAGTTCGTTCTGC
TAATTGTCTTAAAGCAGAAGCTATACATTATATTGGTGATTTAGTCCAAA
GAACTGAAGTAGAACTTTTAAAAACTCCGAATCTCGGTAAAAAATCTTTA
ACTGAAATTAAGGATGTCTTAGCTTCTCGTAGCTTATCTCTTGGTATGAG
ATTAGAGAATTGGCCTCCATCAAGTATTTTAGATGAATAA
>gid:449432  rpoB  DNA-directed RNA polymerase beta chain
ATGGTTTACTCTTATACCGAAAAAAAACGTATTCGTAAAGATTTTGGCAA
ACGTCCTAAAGTGTTAGATATACCATATCTTCTTTCGATTCAATTAAATT
CTTTTAAAAAATTTATTCAACCAGATTTATCAGGTCAACACGGATTAGAA
GCAGCATTTCGTTCTGTATTTCCTATTCGCGGTTATAATGGAAACTCTGA
ATTACAATATGTTAGTTACCGTTTAGGAGAAACAATATTTGATGTTAAAG
AATGTCAAATAAGAGGTGCTACTTATTCGGCGGCACTGAGAGTAAAATTA
CGCCTTGTTATCTACGAACGTGACATATTAGAAGCTACTGTTAAAGACAT
TAAAGAACAAGAAGTATATATGGGTGAAATTCCATTAATGACTAACAATG
GAACATTTATAATAAATGGAACAGAAAGAGTAGTTGTTTCTCAGTTACAC
CGTAGTCCTGGAGTCTTTTTTGATAGTGATAAAGGTAAAACACACTCCTC
AGGAAAAGTTCTATATAATGCCCGGATTATTCCTTATCGCGGTTCTTGGT
TAGATTTTGAATTTGATCCAAAAGATAATTTATTTGTTAGAATTGATAGA
CGTAGAAAGCTACCAGTAAGCATTATTTTGCGGGCTCTTAATTATAATAC
AGAAGAAATATTAAACATATTTTTTGAGAAAAATATTTTTAAAATAGAAA
ATAACAAAATTGTATTAGAATTAGTTCCCGAAAGACTCCGAGGTGAAACT
GCATCATTTAATATTAAAAAAAATGGAATAATATATGTAGAAAAAGGTCG
TCGTATTACTGCTAAACATATTCAAGAATTAAAAAATAATAAAATAAAAT
CTATCACAGTTCCTGTTGAATATATTCTTGGAAGAATTGTATCTAAAAAT
TATGTAGATAAAAAAACAGGCGAAACAATTATTTCTTCTAATACAGAATT
ATCTTTAGAGATATTAGAAAAATTAAAAAAATTAGGTTTCTACTCTATTG
AAACATTGTTTACTAATGATTTAGATCATGGTCCATATATATCAGAAACG
TTACGAATAGATTCATCTAATGATCGTATGAGTGCTTTAATAGAAATTTA
TCGAGTTATGAGGCCAGGAGAACCACCTACTAAAGAGGCAACAGAAAATT
TATTCGAAAATTTATTTTTTTCTGAAGACAGATACGATCTTTCTACTGTA
GGTAGAATGAAATTTAACAGATCCCTTTTACGTGAAGAAACTAAAGGTTC
AAGTACGTTAAATAAAGAAGACATCATTGATGTTATAAAAAAAATTATCG
ATATCCGAAATGGAAAAGGAGAAGTAGATGATATTGATCATCTAGGAAAT
CGACGTGTTAGATCAGTAGGTGAAATGGCGGAAAACCAATTTAGAATCGG
TTTAGTAAGAGTGGAAAGAGCAGTTAAAGAAAGATTGTCTATCGGCGATT
TAGATGCGCTTATGCCACAAGATATGATTAATGCTAAACCAATATCAGCT
GCGGTTAAAGAATTTTTTGGTTCTAGTCAATTATCACAATTTATGGATCA
AAATAATCCTTTATCAGAAATTACGCATAAAAGAAGAATTTCAGCATTAG
GTTTAGGTGGTTTAACCAGAGAAAGAGCAGGTTTTGAAGTTCGAGATGTA
CATCCAACACATTATGGACGAGTATGTCCTATCGAAACACCAGAAGGTCC
GAATATTGGATTAATTAATTCTTTATCTGTGTACGCTCAAACAAATTCTC
ATGGATTTTTAGAAACACCTTATCGAAAAGTTTGTAACGGTTTAGTTAGT
GAGGAAATTCATTATCTATCAGCTATAGAAGAAGGCAATTATATTATTGC
ACAAGCTAATACTAATATCGATAAAACTGGTTTTTTTACTGACGATTTAG
TAACTTGCCGACATAAAGGCGAATCTAGTTTATTCAACCGTAATCAAGTA
AATTATATGGATGTATCTACTCAACAAATTGTATCTGTTGGAGCGTCTTT
AATTCCTTTTCCTGAACATGATGATGCTAATAGAGCACTGATGGGTGCTA
ATATGCAACGTCAAGCAGTACCTACCCTTAAAACAGATAAACCTTTGATA
GGGACCGGAATGGAACGAGCAGTAGCAGTAGATTCTGGTGTTACAGCAGT
AGCTAAAAGAAGTGGTGTTGTTCAATATGTAGATGCTTCACGTATAGTAA
TAAAAGTAGATGAAAAAGAAATGTATTCAAGAGAAGCTGGAATAGATATT
TATAATCTTACTAAATATACTCGATCTAATCAAAATACTTGTATTAATCA
ACAGCCCTGCGTTAATTTAGGCGAAAAAATTAAAAAAGGTGATGTTCTAG
CAGACGGTCCATCTACAGATTTAGGAGAACTTGCATTAGGACAAAATATG
CGTGTAGCATTTATGCCATGGAATGGATACAATTTTGAAGATTCAATATT
AGTCTCAGAAAGGGTTGTTCAAGAAGATCGCTTCACCACAATTCATATTC
AGGAGTTATCTTGTATATCAAGAGATACTAAATTAGGAGCAGAAGAAATT
AGTTCAGATATACCAAATGTAGGAGAAGCTGCATTATCTAAATTAGACGA
ATCAGGAATTGTTTATATTGGAGCAGAAGTAACTGGCGGCGACATACTAG
TTGGCAAAGTAACTCCAAAAGGGGAAACACAATTAACTCCAGAAGAAAAA
TTATTACGTGCTATTTTTGGTGAAAAAGCATCAGATGTAAAAGATTCTTC
ATTACGAGTACCGAATGGAGTATCAGGTACCGTGATAGATGTACAAATAT
TTACAAGAGATGGTGTAAAAAAAGATAAAAGAGCTTTAGAAATTGAAGAC
ATGCAACTGAAGAAAATCAAACAAGATCTTACTGAAGAATTCAAAATATT
TGAATCTAGTTTATTTACTCATATTAAAAAAACTTTTATATCGCTTGATA
TTGAAACAAAACAGCTTGATACACTACCTTTTGAAAAATGGTTTTCTGTA
GACATTAAACAAAAAGACAAAAAAAAAGAAATAGAAAAACTTGCTAAACA
ACATCATGAATTAAAAGAAGAATTTAATAAAAAAATAGAAATAAAACGTC
AAAAAATTACACAAGGCGATGATCTTGCTCCTGGTGTTTTAAAAATAGTT
AAAGTGTATTTAGCAGTTAAACGTCAGATTCAACCTGGCGATAAAATGGC
AGGAAGACATGGAAATAAAGGAGTAATTTCTAAAATTAATCCTGTTGAAG
ATATGCCTTATGACGAAAATGGTATACCAGTTGATATTGTTTTAAATCCA
TTAGGTGTACCCTCTCGTATGAATATCGGTCAGATACTAGAAACACATTT
AGGTATGGCGGCAAAAGGTATTGGTGATAAAATCAATCATATGCTTAAAA
CACAAGAAAAAATATCTAATTTACGAAAATTTATACAAAAAGCTTTTGAC
TTAGGAGATAACCTGAGACAAAAAGTAAATTTAGATACATTTTCCAATGA
AGAAATATTACGTTTAGCAAAGAATTTAAAAAATGGCATCCCTATTTCTA
CACCGGTATTTGATGGTGCACAAGAAAATGAAATAAAACAAATGTTGAAA
TTTGCAGGTTTACCTACTTCAGGTCAAATTATACTTTTTGATGGAAGAAC
AGGCGAAAAATTTGAAAGACCTGTTACTGTTGGTTATATGTATATGTTAA
AATTAAATCACTTAGTAGACGATAAAATGCATGCTCGTTCTACTGGATCT
TATAGTTTAGTGACTCAACAACCATTAGGTGGAAAAGCTCAGTTTGGTGG
ACAGCGTTTCGGTGAAATGGAAGTTTGGGCATTAGAGGCGTACGGAGCGT
CTTATACGTTACAAGAAATGTTAACCGTGAAATCTGATGACGTTAATGGA
AGAACTAAAATGTATAAAAATATTGTAGATGGAAATCATCAAATGGAACC
TGGAATGCCAGAATCTTTTAATGTACTTTTAAAAGAAATTCGGTCATTAG
GGATTAATATTGAACTAGAAAGCGAATAA
>gid:449431  rpoC  DNA-directed RNA polymerase beta' chain
GTGAAAGATTTACTAAAATTTCTAAAATCCCAAACTAAAAATGAAGATTT
TGATGCTATTAAAATCTCGTTAGCTTCACCTGATATGATCAGATCATGGT
CATTTGGGGAAGTCAAAAAACCTGAAACTATTAATTATCGTACATTTAAA
CCTGAACGAGATGGATTATTTTGTGCTCGCATTTTTGGTCCAGTAAAAGA
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CCATTAGTATGTGCAGCTTACAATGCTGATTTTGATGGAGACCAAATGGC
TGTCCATGTCCCATTAACTCTAGAATCACAGTTAGAAGCTAGAGCTTTAA
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AAAAATAATTCCTACTACTATAGGTCGAGCAATTTTGTGGATGATTATCC
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TGTTTTTTTTGCTGATCAAATTATGTACACCGGATTCGCTTATGCAGCAA
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GCAAATATCATCAATGAGGCTGAAATTGAAGTTGCTGAAATACAAGAACA
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ATCTTTTAATAGTATATTTATGATGGCTGATTCAGGGGCACGTGGTTCTG
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GAATGTATTACAATATTTTATTTCTACACATGGAGCTCGTAAAGGATTAG
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TTATCGATAATTTTGGAAGAACAAAAGAAAGCTATAAAGTTCCTTATGGA
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>gid:449453  rpoD  RNA polymerase sigma factor rpoD
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GGAGCAAGGGTATTTAACCTATTCTGAAGTGAATGATCATCTACCAGAAG
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GCTCAGTATCAGAGTATCCAGAAGCCATTACATATCTTCTTGAACAATAT
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GAATTATTATAAAATTATGTGTTGAAATATGTAAAATGCCAAAAAAAAAT
TTTATTAAAATTTTTCCAATAAAAAAAATTAACTATCTTTGGTTTATAAG
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GGCTTAACAATTGAACAAGTAAAAGATATTAATAAAAGAATGTCTATTGG
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GATTAGTTATTTCTATCGCAAAAAAATATACGAATAGAGGACTACAGTTT
TTAGACTTAATTCAAGAAGGAAATATTGGTTTAATGAAAGCTGTAGATAA
ATTTGAATACCGTCGTGGTTATAAGTTTTCAACTTATGCTACTTGGTGGA
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ACAAATGTTACAAGAAATAGGTCGAGAACCGACTCCAGAAGAACTTTCTG
AAAAAATGCTTATTCCTGAAGATAAAATTAGAAAAGTATTGAAAATAGCC
AAAGAACCGATCTCAATGGAAACACCTATTGGAGATGATGATGATTCACA
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CTACCTCTGAAAGTTTACGTTCTGCAACACATGATGTTCTATCAGGTTTA
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TACTGATCACACTTTAGAAGAAGTTGGAAAACAATTTGATGTTACTCGAG
AGAGAATTCGTCAAATAGAAGCAAAAGCACTTAGAAAACTACGTCATCCC
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>gid:449423  rpoH  RNA polymerase sigma-32 factor
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AATACCTTGCAGAATATCGCAAATAATTATGGAATTTCTGCAGAACGCGT
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CTTAA
>gid:449963  vacB  vacB protein
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GAGATTTTTAAAATCTGGAATGGCGATATTTTTCTACGTTCTAAATATAA
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ATAAAGATAATATTTCTAAAAAAGGTATTTATTTTGAAAATATAGAACCT
AAATTTGTTTTAGATTCTAACCTTCGAATTAAAAGTATTTATCAAAATAT
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TAGCTTCAGCTCGCTTTGTTGAGAAATATAAATATCCTGTTTTATTTCGT
AATCATGATCGTCCTAAAAAAGATAATGTTGTTAGTTTGCGTTTATTTTT
AAATGAATTAGGTTTTACATTGTTAGGAGGGGATTCCCCTGAATCTGTCC
ACTATTCAAATTTATTAAAAAATGTTTCTGATCGTCCTGAATATGAAATG
ATACAAACTGTATTATTACGTTCTATGACGCAAGCTGTATACTCTCCAGA
TAATCGTGGACATTTTGGTTTATCTCTATCTAGTTATGTTCATTTTACTT
CACCTATTAGACGTTATCCCGATCTTATATTACACAGAGTTATCAAATAT
TTGTTATTTAAAGATAAAAATACATCAAAAAGTAATTATAATTTTTATAG
TGCTCATTTATATAGTACGGGTGAAATAAAAAAAATAGGAGCACACTGTT
CTATAACTGAAAGACGTGCAGATGAAGCAAATAGAGATGTCATTGATTGG
TTGAAATGTGATTTTATGTATAAAAAAATCGGTTGTATACTAAATGGTGT
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TTGTCTTGGCGATGCTCTAAAAGTAAAAGTAATTTCTGTTAATCTGAATG
AAAAGAAAATAGAATTGTCTTTATATAAATCTAGTTGA
>gid:449783  yrbA  hypothetical protein
ATGGACAATCAAGAAATAAAATTATTACTTATTAAAAAATTAAATTTAGA
ACAAGCTAATATTACAGGAGACAGCAATCATATAAAAATAATTGCTATAG
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GCCCCTTTAATAGATATGATTAAAGAAAAACATATTCATGCTGTATCTAT
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