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COG category: Transcription
Organism: Onion yellows phytoplasma OY-M, onion yellows
Number of genes found: 36
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# Onion yellows phytoplasma OY-M, onion yellows >PAM424 hypothetical protein TTGGATGATGGAGATTTCAACAGAAAAAGACATTACACATTAGAAGATGA TCAATTAAAAGTTGATTGGGCTCATAAAAATACTTATGATTGGGAATATA ATAAAGATAAATTACCTAAAAGAAAAAAATATTTTAATGCTGATGTTTCC GTTAATTGGCAATTTGTAGCTAATAGTAAAGAATGTACTTTTGATGTTAA ATGGACATATGAAAAAGGAGAAGCAGTAAGTTTTTCAACAGTTCCAGTTC CCGAAGAAGACCATGCAGCCGAAAATGAATTACAAAATTATAAATTAGAA GCTTATAAATTAGTTCAAGAAGAAGATGTTGTAAAAGTAGTAAATAAATT AATGGCTGATGAAAAATTTCAGACTAAACTTCAAGAAAATGGATTACAAG AAGCATTACAAGAAACAGTAAAAGTATTATTGGATGAAGAAGTTAATAAT TTAGTTGTATCCCCAGTTAAAAAATTACTTTCAAATACAACTAATGAATT ATTATTGCAAGACGACAGAGACAAAAAAGTATTTAAAGATCAAGTTGAAG AACTAAACACAAAAGAAAAACTCCCAAAATCAGCTAAAAAATTAGTTTTA CAATTAGTAAAAGAGTATTTTAAAGAACAAGTTTTAGAAAATTTTGATGA TGAAGAAGACAAAGGATTAGTAAAAGCTTTTTTGAAAAATTTGTATTAG >PAM566 hypothetical protein ATGCGTAATCAATTAATCGATTTACATTTGTCTTTAGTAAAAAAACTAGT TTCTAAATTTAAATATTATCCATGCGTACTTCAAAAACAAGATTTATACC AAGAAGGAGTTTTAGGATTGATCAAAGCTTTAAATAATTATGTAGATTTA GGTTATGACTTTATCGCTTATGCGACACCAACTATCAAATCAGAAATCAG AGAATTAATAAGAAGGAGTTTAACGTCATTAGATTAA >PAM361 conserved hypothetical protein ATGTATCACAAATATAAACAACATCCTTTATTAAAAATGAGTCCTGTTGA TAAAAGACAAACATTATGTTTTAATAATGGAAAAAGAGGAGCTAAAAAAG CAACTCCTAAATTATTAGAAGATCTAGATTTTAAAAAAGCAGTTTTATTT GCTCTTAATAGAAGTGATGTAGGAGAAACTGTGGATGTATTTAGTGATGG AGAGTTGGCTGTTGTTCCTAAAATAACTTCTTTTTTAGAAGAACCTTTAA TGTATAATGAAAGCGAAGAACACAAAGCAAATATTCAAGATTTTGAACCT GAAAATAAAGGTTATAATCCAACTAAAGCTTATGAATTATTTAAAAAAGC TTATAATCATTTATTTGATGCAGATAAACAAAAAACAGTTGAAATAGAAT TTTTAGTTGCTAAAACACAAGAAGAAAGAGTTAACTTAGCTCGTTTTGTA AAAAACCAATTAGAAAATTGTTTTAATCAACAAGGAAAAAAGTAG >PAM412 hypothetical protein ATGAATACTAGTGATTTTTTCAAAAAAAATTTAGCAATTATTATTATATT TCTTTTTGGAATTTTTATCATTGTTGGTTTTTATCACCAAAGAAACAATT CTAAACTAAACAATGAAACATTGTCTCAATTAGAACCAAAATCAGAAGAA TCCAAACCTCTAAAAAATAAAAGCGACATTAAACCTTTTGAAATAGAAAA AAATGTGATTAAACAAATTATAGAAATTACAAGTTGCTTAAATATAACAA AAGAAGAAAAAGGTTTTTTTAATAAAGAATTACTACCTATAATGGAAAAA AACGACTTTTCTCTTTAA >PAM503 hypothetical protein ATGTTTTTAGAAAGGAATAAAATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGATTT TTTGAAAAATAAAAAGAATTTAGCAATTCGCGATCAATTAATCGAAATGC ATTTACCATTAGTAAAAAAAATAGCCAACCAATTTAAATACTTCCCTAAA TCACTCCAAAGAGAGGATTTATATCAAGGGTTTTTTGTAGGCGATTACTG A >PAM397 hypothetical protein ATGTTAAGACAAGAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAATAAACAGAATTT AGAAATTCGTAATCAATTAATCGAACTTCATTTGCCTTTGGTAAAAAAAC TAGTTTATCAATTTAAATATTATCCTCGAGTTTTAACTAAAGAAGATTTA TATCAAGAAGGCATTTTAGGATTAATCAAAGCCCTCAATCATTACCAAGA TTTAGGTTATGACTTTATCGCTTATGCTACTCCAACCATCAAATCGGAAA TAAGAGAAACAATAAGAAAAAGCCATTCACCTTCAATCCCGAAAAAAATC ACAAAAAGGGATAATTTTTCTTTTCAAGAAGAGTTTTATGAACCATATCA AATAAATAAACTGGAATCCCCATCAATTATGGTTAAAACAAGTTAA >PAM321 conserved hypothetical protein ATGTATCACAAATATAAACAACATCCTTTATTAAAAATGAGTCCTGTTGA TAAAAGACAAACATTATGTTTTAATAATGGAAAAAGAGGAGCTAAAAAAG CAACTCCTAAATTATTAGAAGATCTAGATTTTAAAAAAGCAGTTTTATTT GCTCTTAATAGAAGTGATGTAGGAGAAACTGTGGATGTATTTAGTGATGG AGAGTTGGCTGTTGTTCCTAAAATAACTTCTTTTTTAGAAGAACCTTTAA 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CATAAAAAGGATAATCTTTCTTTTCAAGAAGATTTTTGTGAACCGTATCA AATAAATAAACTAAATCCTCATCAATTATGGTTAAAACAAGTTAAGCATG AAAATTTTTTAAAAAAAATGAAAGCAAAATTAAGCGAAACCGAATTCAAA ATTATCCATTTAAGTTTTGGTGTTCCTTTAGGGAATATCAACGAAGATTA TCAAACTAGTTATTCGAATGAAGAAATAGCCCAAAAACTCCATTTATCTT TAAAACAAGTAGAAAATATTAAAAACATCGCTATCAAAAAATTAAAAAAA CAAAAAAACGTTAACCTTTCTCGTCCGTAA >PAM320 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGAATTTTTAAAAAATAAAAAGAATTT AGAAATACGAGATCAATTAATTGAACTTCATTTACCATTAATCAAAAAAA TAGTAAATCAATTTAAATATTATCCTCGAGTTTTAACTAAAGAAGATTTA TATCAAGAAGGGATTTTAGGATTAATCAAAGCCCTCAATCATTACCAAGA TTTAGGTTATGACTTTATTGCTTACGCAAATCCAACCATCAAATCGGAAA TCAAAGAACTTATTAGGAAAAGCCATTCTCCTTCAATCCCACAAAAAAAT CATAAAAAGGATAATCTTTCTTTTCAAGAAGATTTTTGTGAACCATATCA AATAAATAAACTAAATCCTCATCAATTATGGTTAAAACAAGTTAAGCATG AAAATTTTTTAAAAAAAATGAAAGCAAAATTAAGCGAAACCGAATTCAAA ATTATCCATTTAAGTTTTGGTGTTCCTTTAGGGAATATCAACGAAGATTA TCAAACTAGTTATTCGAATGAAGAAATAGCCCAAAAACTCCATTTATCTT TAAAACAAGTAGAAAATATTAAAAACATCGCTATCAAAAAATTAAAAAAA CAAAAAAACGTTAACCTTTCTCGTCCGTAA >PAM536 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit TTGTTTTTTAAAAGAAATAAAAAAAAGAAATTATACTCATCTTTTCTAAA AACGTTTTTAGAAAGGATTCAAATGAAAAGAAAAGATTTATTTTTACTTT TTTTAAAAAATAAAAAGAATTTTGAAATAAGAGATCAATTAATTGAACTT CATTTACCATTAGTAAAAAAAATTAGTTCAAAATTCAAATATTACCCTAA ATTATTAACTAAAGAGGATTTATACCAAGAAGGCATCTTAGGATTAATCA AAGCCCTCGATAATTACCAAGATTTAGGTTATGATTTCATCGCCTACGCA ACTCCAACAATAAAATCAACAATCAACGAACTAATAAGAAAAAGCCACTC ACCTTCAATCCCCCAAAAAACCACCAAACCAAACAATATTAGTTTTAAAG AACAACATTATGAGCCCGATAGAATAACCAACCCAAACCCCCATCAATTA TGGCTAAAACAAGTAAATCACGAACAACTCATAAAAAAGCTAAAATCTAA ACTAAGCAAAAACGAATTCAATGTTATTTGTTTAAGTTTCGGCATCACCC TAGAAAACATAACCAAAAATCACCAACCAACTTTCACCAACCAAGAAATC TCCCAAAAACTAAATTTAAATTTAAGACAAGTAGAAACAATAAAAAACAT AGCAATTAGAAAACTAAGCCCAAATAACAAAAAATAA >PAM656 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ATGTTAAGAAAAGAATTATTTAAAGTTTTTTTAAAAAACAAAAAGAATTT AGAAATTCGTAATCAATTAATCACACTTCATTTACCATTAGTCAAAAAAA TAGTAAATCAATTTAAATATTATCCTCGAGTTTTAACTAAAGAAGATTTA TATCGAGAAGGAATTTTAGGATTAATCAAAGCCCTCAATCATTACCAAGA TTTAGGTTATGACTTTATCGCTTACGCTACTCCAACTATCAAATCTGAAA TCAATGAACTAATAAGAAAAAGCCATTCTCCTTCAATCCCCCAAAAAAAT CATAAAAAGGATAATCTTTCTTTTCGAGAAGAATTTTATGAACCATATCA AATAAATAAACTAAACCCCCATCAATTATGGTTAAAACAAGTTAATCATG AAATTTTTTTAAAAAAAATGAAAGTTAAGTTAAGCAAAACCGAATTCAAA ATTATCCATTTAAGTTTTGGTGTTCCTTTAGGGAACATCAATGAAGATTA TCAAAAATGTTATACCAACACCGAAATAGCTGAAAAACTTAATTTATCTT TAAAACAAGTAGAAAATATTAAAAACATCGCTATCAAAAAATTAAAAAAA TAA >PAM363 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAATAAAAAGAATTT AGAAATAAGAGATCAATTAATTGAACTTCATTTACCATTAGTAAAAAAAA TTAGTTCAAAATTCAAATATTACCCTAATTTTTTAACTAGAGATGATTTA TATCAAGAAGGAATTTTAGGATTAATCAAAGCACTAAATAATTACGAAGA TTTAGGCTATGACTTTATTGCTTACGCAAATCCAACCATCAAATCGGAAA TCAAAGAACTTATTAGGAAAAGTCATTCTCCTTCTGTTCCTCAAAAAAAT CATAAAGCTAATAATCTTTCTTTTCGAGAAGAACTTTATGAAACATATCA AAAAAATAATCTAAACCCTCATCAATTATGGTTAAAACAAATTAATCATG AAATTTTTTTAAATAAACTAACCAAAAAATTAAGTCCAAAGGCATTTCAT ATTATCTGCTTAAGCTTTGGTATTACTTTAGGAAATATTAATGAAGATTA TCAAAGATGTTATACCAACGCCGAAATCGCTGAACAACTTCATTTAAAAG TGAGACAAATCAAAAACATTAAAAACATCGCCATTAAAAAATTAAAAAAA TTATATAGAAAAGAGAAATAA >PAM040 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ATGTTAAGACAAGAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAATAAACAGAATTT AGAAATTCGTAATCAATTAATCGAACTTCATTTGCCTTTGGTAAAAAAAC TAGTTTATCAATTTAAATATTATCCTCGAGTTTTAACTAAAAAAGATTTA TATCAAGAAGGCATTTTAGGATTAATCAAAGCCCTCAATCATTACCAAGA TTTAGGATATGACTTTATGGCTTACGCTACACCAACCATCAAATCGGAAA TAAGAGAAATAATAAGAAAAAGCCATTCTCCTTCAATCCCACAAAAAAAT CATAAAACTGATAACCTTTCTTTTCGAGAAGAATTTTATGAACCATATCA AATAAATAAACTAAACCCTCATCAATTATGGTTAAAACAAGTTAAGCATG AAAAATTTTTAAAAAAAATGAAAGCTAAATTAAGCGAAACCAAATTCAAA ATTATCCATTTAAGTTTTGGCGTTCCTTTAGGGAATATCAACGAAGATTA TCAAAGATGTTATACCAACGCCGAAATCGCTGAAAAACTTAATTTATCTT TAAAACAAGTAGAAAATATTAAAAACATCGCTATCAAGAAATTAAAAAAA CATTAA >PAM323 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAATAAAAAGAATTT AGAAATAAGAGATCAATTAATTGAACTTCATTTACCATTAGTAAAAAAAA TTAGTTCAAAATTCAAATATTACCCTAATTTTTTAACTAGAGATGATTTA TATCAAGAAGGAATTTTAGGATTAATCAAAGCACTAAATAATTACGAAGA TTTAGGCTATGACTTTATTGCTTACGCAAATCCAACCATCAAATCGGAAA TCAAAGAACTTATTAGGAAAAGTCATTCTCCTTCTGTTCCTCAAAAAAAT CATAAAGCTAATAATCTTTCTTTTCGAGAAGAACTTTATGAAACATATCA AAAAAATAATCTAAACCCTCATCAATTATGGTTAAAACAAATTAATCATG AAATTTTTTTAAATAAACTAACCAAAAAATTAAGTCCAAAGGCATTTCAT ATTATCTGCTTAAGCTTTGGTATTACTTTAGGAAATATTAATGAAGATTA TCAAAGATGTTATACCAACGCCGAAATCGCTGAACAACTTCATTTAAAAG TGAGACAAATCAAAAACATTAAAAACATCGCCATTAAAAAATTAAAAAAA TTATATAGAAAAGAGAAATAA >PAM427 fliA, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit ATGTTAAGACAAAAATTATTTAAAGATTTTTTAAAAAATAAAAAGAATTT ATCAATTCGCGATCAATTAATCGAAATGCATTTGCCATTATTAAAAAAAA TAGTTAAACAATTTAAATATTTCCCTAAATCACTTCAAAGAGAAGATTTA TACCAAGAAGGAATTTTAGGTTTAATCAAAGCTTTAAATAATTACCAAGA TTTAGGTTATGACTTCATTGCTTATGCAATCCCAACAATTAAAAGTGAAA 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GCTGTTATTTTGATTATTACTGATAAAGGAAATGTACAACATCAAAATAT TTCTTTGGATCAAACAAAAGAAATTAGCATTTATGACCTTAAAGATGTAG TGCAAGTAGTAAATGATTTGTTGACAGATAAGTTTTTATCAGAAGCAGCC AACATTATTCAAAGTGATTTTTTTAAACAAACTATTGCTAAATATATTTG TTTTCAAGAACAATTAATTGCTTTGTTTATGGAAGTTTTTAGTAGTTTTG CCTCAGAGAATCTTTATTTTTCGGGGGTTTCTAAAATGCTTGAAAAACCT GAATTAAGTAATCCTGAAATTATTAAAAAATTTATGGGTCTTTTAGAGCG TAAAGAATTATTAAAAATTATGTTAAATCAAGATAGTTTGTCTTTTAAAT TTTCTGATGGCTTGCAACTTACCCCTTTAAAAGATTGTATGATTCTTTCT ATTCCTTTTGATGTAAATCCTAATGAGAAAGGAAGAATTGCAGTTGTAGG ACCTTCGTGGATGAAATATCCTAAAGTTATTCCTATTTTGGAATATTTGG CAGTTCATTTATCTAAATTAAACGATTAA >PAM148 nusA, transcription terminator TTGATTAGTAAGAATTTTTTTAAACTTTTAGATAAAATCGCTCAAGAAAG AGATTTAGATAAAGACCAAGTTATTGATGCTTTTGCTAAAGGATTGATTT CTGGTTGCAAAAAAAATCATAAAGTTAAAAGCTGTAAAATCGAGTTAAAA GAAGACAAAAGCGAAATTATTTTATATAAACAATTTTTGGTTGCCGACGA AGCTACTATGAGCACTATTAATTTAAAAGAGTCAACTCCCATTACTCTTG AAGAAGCCCAACAAATTAAGCCTCATGCCAAAATAGGTCAAGTAATTGAT ATTAAAGTTGATCCTAAAGATTTTAATCTATACGCTGTTAAAGAACTTAA 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AATAAATCGCCTTAACAAAGTAGACAGAGCAATCATTCGCTTAGCTACTT ATGAATTGTTAGAAACAAACATTTCTCATGCCATTATAATCGACGAGGCA ATAGAACTTACCAAACAATTCTGCAATTTAAACGATGAAAAACAACATAA ATTCAACAATAAATTATTAGATCAAATATATCAACAATTACAAATGTATA AAAAAACTTATTACCTAATTGAATTGAAAAACTACCCAAATAATAAATAA >PAM255 nusG, transcription antiterminator ATGAATAAAACAGAAAAACAAATAAAAGAGACACAAGCGCAAGAACAACA AGATCAAGAAAAAGACTCCCAAAATACATGTCACCTTAAATGGTATATTG CTCAAACTTATTCAGGTTATGAAAATGTTGTAAAAGACGATTTGTTAAGA AGAGTCGAAAGCATTGGCATAGGTGATTTAGTATCTAATGTTTTGTCTCC CAAAGAAGAATATTATGAAACTCGTTTGGATGGAAAAAAGGTTAAAAAAG AGCGTAAAATGTACCCCGGGTACGTTTTTATTCAAATGATGATTACTGAC CGATCTTGGTTTGTTGTCAGAAACACTCCGCGAATTACTGGTTTTTTAGG TTCCAGCGGGATGGGTTCTAAACCAGTTCCTTTATCTGAAAACGAAATCA ATCCTGTTTTATTAAAAATGGGCATCATCAATAAACCCGATTATAAAAAT TTTATCGGCAAAAAAGTAGAAATTATTTCTGGTTCTTTTTCGGGTCAAAT AGGGCAAGTATCAAGTATTGATGACGACCGTGAAAAAATGACAGTGGAAG TAGATTTGTTTGGTAGAGCAACTCCAGTAGAAATTTCTTTCAACGACTTC AAAGAAATATCTTAA >PAM608 rnc, dsRNA-specific ribonuclease ATGAAAAACATCCAAACTCTTTTTCAAACCCTCAATATCACTCCCCAAAA CCTTACCCTTTACAAACAAGCTCTTACCCACAGCTCTTATTCTAACGAAC AAAACCCACCCCAAGAAGACAACGAAAGACTTGAATTTTTAGGAGATGCC ATCGTAGGATTACTTATGGCTGACTATCTTTATTCCCAATCCAAAGAAGA CGAAGGCATTATGACTAAAAAAAGAGCTCAAGCGGTGTGTGAAAGGTCAC TTACCATCTACGCTCACAACATTGAATTGCAAAATTATCTTCTTTTAGGC AAAGGCGAAAAAAACAAAGATTTTAATGCTAAAAGTATTATAGCAGATAC TTTTGAAGCCTTATTTGGTGCTATTTATCTTGATTTAGGATATTTGACAG CCAAAAAAGTTTTTCATAATATTGTCTTACCTCACTTAGCCAAAACTATC TATATTATTGATTTTAAAACTCAATTACAAGAAATAGTTCAGTCAGAAAA AAAAACTATCCAATATAAAATAGTCCAAGAGCAAGGACCTGCTCATTCTA AAAATTTTGTAGCAGAAGTTTATTTAGAAAAAAATCTTTTAGGAACAGGT GAAGGCAGCACTAAAAAAGCCGCTGAGCAAAAAGCAGCCCAACAAGCATT ATCCAAAGTTGCCAAACCCAAAGACCTACTCAACAACAAAGGCGGCAAAG AAAAGGAGCTTCAATAA >PAM227 rpoA, DNA-directed RNA polymerase alpha subunit ATGAAAAATATTAAATTTATTAAACCTTTTTTTGTTGAAGAAATTGATGA AAATCCCATTTCTGGGAAATTCATCATTAAACCTTTAGAAAGAGGATACG GCATTACTGTAGGAAACGCTCTAAGAAGAGTTTTGTTATCTTCTTTGCCT GGTACTGCTATTGTAAATGTTAAAATTCAAGGAGTAGAACAAGAATTTAC 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