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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_0038 Dihydrofolate reductase FolA
ATGAAAAATAGAAAAATCATCGGTATAATGGCATGTGACCCACAAGGGGT
GATAGGTAATAAAGGTCAGATGCCTTGGTCTTATACTAAGGAGTTTGAAT
ATTTTTATCAGACGGTAAAAAATAATATTATAGTCATGGGACGAAAAACC
TTTGACTCTATACCTGCAAAGATTTTAAAAAATTGTATTTGTATTGTTTT
TTCAAGAAATACACCGTTACAATCTTATAATAATAGAACTCTTCGGAAAC
TCGCTTATAGGGAGGAATTTGAAGGAGACACGGAACGCAGAACCGCAGCG
TACGTGAGGATTCGAGTACCGGATCGACGTACAAATTACCCCTAG
>RF_0780 unknown
ATGACTCATGATAATAATTTAAAACAAAATAATTCTTACATATTAGGTGT
AGGAGAAGCAGGTGCTAAAAATTTAGATTTGCAGCACCAGATGTTAAAGA
AAAATTCTATAAAGCAACTTGAAAAAGCTGGTTTAAAAGAGGGTACCATT
ATTTGGGATATTGGTTGTGGAAATGGTACAATGACTGAGATCATGGCATC
TAGAGTAGGTGATAGCGGGCAAGTATATGCAGTTGATATTAGCGAGCAAC
AAATCCAAATAGCAAAACAAAGAATTAAGAATGCAGGATTCAAAAATGTT
ACATTCATAGCTAGTGATCTTTACTCGCTCTTAAATAATAATTACTCAAA
AGCTGATATTGTCTATTCTAGATTACTATTAATGCATCTAAAGAATCCTG
TTGAAGCTATAAAGCTGATGAGTTCTTTATTAAAAAAAGAAGGAGTAATC
TCATTACAAGAATCTGCTCTAAATTCAGCTCTTCAAAAACTAAACAATCA
AGAATCTAATGAAAGTTTCAAACGTTATTACCGGCTTGTCATAACCTATG
GGCAAATTAACGGGGTTCACTATGATATAGGCAATAAATTAGCTACAATA
TGCCAAAATTTGAATATTTTTTCAAAAGTAGAACACTATATTTCTAGTTA
TGATTTAATGAATATAAAGACCTGCTCTTAG
>RF_0036 Pyrroloquinoline quinone (Coenzyme PQQ) biosynthesis protein C
ATGAAATTTTTAGAACAGCTTAATATAGATCTTGAACAATATAACCTTTT
AAATCATCCATTTTATCAATTATGGAATATGGGGAAACTTACTCATTCTA
CTTTACAAATTTACGCAAAAGAATATTATCATCACGTTACAGCTTTCCCA
CGTTATATAAGTGCAATACATTCCAAATGTAGTGATATAAAAGCTAGGCA
AATATTACTTGGTAATCTTATAGAAGAAGAGCAAGGTGAAGAAAATCACC
CGGAACTATGGAAACGTTTTGCTGAAGGGCTTGGATGTTTAAGAAGCCGG
CTCACTTCAGAACCTAAATTAAACTCAACTCAAAAACTTGTTCAAGGTTA
TTTTAACTTAACAGAGAAATCTTTTTCTATAGGTCTTGGAGCACTTTATG
CTTATGAGCGTCAAACTCCTGAAGTATCTGACTCTAAAATTCAAGGATTA
CAAAAATTTTATGGAATTTCAGATTACAGAACTTTACAATTTTTCATTGT
TCATAGTAAAGTTGATCAATGGCATACACAAGAATGTGCAAATTTGATTA
ATAATTTAAGCTCAAAAGAACAAAAATTAGTATATCAAGGAGCGATAAAA
GGTGCAAAACTACTATGGCAATTTCTAGACGGTATATATACTCGGTCAAT
TTCAAAAATTGGCTACGTCGTTCTACAAGATCTGCGGTACTCACGTATTA
AGTATACGCTCCGTTCCTCGCCTTGTGAACTCCTTGCTCTTTTTGAAATT
GACCTTCGTATACCAACTCTTCATTTACTCGAAGTATAA
>RF_0808 5-Formyltetrahydrofolate cyclo-ligase
ATGACAGTAACAATTACCAAGCAAGAGCTGCGGCTTTATTTCAAAGAATT
TTTAATAAAAAACCAAGATAAGATTAATTCCGACTTAGTCAAAAACTCCC
TAATCAATAAAATTAGCCGGTTATTAAAGGAGTTAAAAGTAAAGACAGTA
GGACTTTACTATCCTCTAAAATACGAGATTAACTTACTTGAAATAACAAC
CTTACATCCTGAAATAAGATTCTTCCTACCGAAAGTTATAAAAAATGAGA
TAAAATATTGTCCTTATCATTATAACGATCAGTTGGCTTTAGGTGCTTTT
AAAACCTATGAACCTATAAATAATGATTGTGTTATTCCTGAATTAGTTAT
TACCCCAGGACTTGCGTTTAGTAAGGACGGTTATAGACTTGGATACGGCA
AAGGACATTTTGACCGATATCTTAATAATAACTGA
>RF_1094 6-pyruvoyl tetrahydropterin synthase
ATGATAAAATGTACTCGTCGTATTGAGTTCGATGCAGGACATAGAATTAT
AGGACATCAAAATAAATGTCAATTCCTGCACGGTCATCGCTATGTTCTTG
AGATCGCTATAGCCGCAAACAAAACCGATAAACTTGGTATGGTAATCGAT
TTTGGTTTAATTAAGGATGTAGCTAAAAAATGGATTGATGAAAATTTTGA
TCATAGCTTAATCCTACATCAAGACGATAAGGAAATGGGGCAGCAAATAG
AAAATTGTACCGGTCAAAAAATATATTACATGCAGAATAACCCAACTGCA
GAAAATATAGCGACGCATTTAAAGAATGAAATTTTTCCTAAACTTTTTGT
AGGTCAAAACTTCTTCGTATCGAACCTCAAACTATATGAAACACCTAATT
GTTTTGTTGAGGTTTAA
>RF_0831 unknown
TTGCTTTTTATATTGGGGTACAAATATTGTATGAAATCGGTTTTATTAAC
TAGAAATATTGAAGAAAATAACGAAACTATAAAAGAAATAAGTAAATATA
ATTTAGATTTACGTTATATTCATTGTCCTTTAATTAAATATGAAACTCTA
GATTTTAATATTGATATTTTAGATAATTACTCAAATATAATAATTACTAG
TAAATACGCAGCAAATATCTTAGCCGGTTATAACTTAAAACAAGATATTT
GGGTAGTAGGTAGTAAGTCAAAACGATTATTAGGCAAGAAAGTAATTTAT
ACTGCTAAAAACGTGGAAGATTTGATTAAGCATTTTCCTCCTGATTTATA
TGAGCAGACTATATATTTATCTTCAAATGAAATTACTAAAGATTTGCCTA
ATAAAATAGCTAGACATATCATTTATAATGTAGAATATTTGAATGAGTTG
CCCGTATCTATTATAAAAGAATTTAAAAGCAATATTAGACATCTTTCCAA
ACCAGCTTATAGAGAGAAAGTTAAAGGAGACACGGAAGTGCTTGCCACCG
CAGCGTACATAGAAGTACGTGAGGATGCGAGTACCGGATCGACGTATAAA
TTACCTCTAGAAGCGAAGTTTAGGAAGATGTCTATTGATTTTATATTACT
TTATTCTCAGAATAGTGCTAAAACTTTTTTAAGATTATTACTTCAAAATA
ATTTACTAGAATATTTACAAGATAGTTTAGTTGTAGCTATAAGTTTGAAA
GTCGCAAATATAGTTAGACCTTTTATAAAAAATGTGGTTTATTGTGATGA
TCAAAACCCTAACGATATAATCAAGTTATTATCCGAAAATGCAAAAATTT
GGTAG
>RF_0997 Putative pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase (PHS)
ATGACAGTATTAAGCGAAAAAAAATGTATTCCGTGTGAGGGTGGTATTCC
GCCGCTTGAGAAAAAAGAAATTGATAAGTTATTAGTTCAATTACAAAGTA
AGTGGCAAGTGAATGAATTAGGGCATCTTTATAAAAAATATAAATTTCCT
AATTTTGTAAAAGCTATGGAATTTGCAAATAAGATAACTGAAATTGCAGA
GCAGGAAGCACATCATCCCGATTTAACTATATCTTGGGGAGCATGTAGTG
TGGAAATATGGACTCATAAAATCGACGGTCTTACTGAAAGTGACTTTATA
TTGGCTGCAAAGATAGAAAGTATTAATTCTTAA
>RF_1241 S-adenosylmethionine synthetase MetK
ATGAAAAATTTTATATTCACATCCGAATCGGTTTCTGAAGGGCATCCGGA
CAAAATTGCCGATCAAATTTCAGATACGGTACTTGATGAAATTCTAAAGC
ATGACCCTAGTGGTCGTGTTGCCTGTGAAACATTTGTAACAACCAGTCTA
GTTTTAGTCGGCGGCGAAATTACTACTAGTACCTACGTGGATATTGAGCA
AATAGTACGAAGCAAGATACAAGAAACCGGCTATAATAATCCAAATTATG
GATTTGACGGTAGCTGTTGTGCCGTAATCTCGTCTATAATTAAACAATCG
CCCGATATAGCTATGGGTGTTGACAATTCAAATGACGATGAAATAGGTGC
AGGAGACCAAGGTATGGTTTTCGGTTATGCCTGTAATGAAACGGATAGTT
TAATGCCCGCACCGATTTACTACGCTCATTTATTAATGAAAAGGCAAGCA
TATTTACGTAAAAAAATATACTGTCTTGGCTTAGACCTGATGCAAAGTCA
CAAGTCACGTTACGATATGAAAATAACAAACCGATTGCCATTGATGCAGT
AG
>RF_0949 Predicted glutamine amidotransferases
ATGAATTCCCCGTTAAAAGAAATACCAAAACAAAACTTTGGGGCTAGTCA
TAGTAATATGGTACAAGAAATAGGGGGAAAAGATAGGCTGATAGATAAAA
AAGAGTTACTAAAAGTATCAGCAACAACCGAGCACGGAGAAATAGAAGGA
ACGGAATCACAGTTTGGCGCACCGATTCGTACTTTTCAGTTTCATCCTGA
AATGTTCAGTTCAGAGCCTAAATATCGAATTGAAGAGGTGGTGCGTGATA
AAAAAATCTTCGCATCATTTGTACAATCAGTGCAGACATTCGCTAATAAG
AAAAAGCTAGGAGTAAATATAGAATCTAAAGTACCGAAACAAAAAAGCTT
TAGAGCAATGGTCTCAGAACAGAGAAAAGAAACACCTATAGAAAGAGGTC
GCTAA
>RF_1242 S-adenosylmethionine synthetase MetK
GTGGACAGCTATGGAGGGATGGCAAGGCACGGCGGTGGTTGTTTTTCAGG
AAAAGATCCAACAAAAATAGATAGGTCGGCTGCTTACATGGCACGTTATA
TTGCTAAGAATATAGTAGGAGCAGGACTTGCTGATCGCTGTGAAATACAA
ATATCTTATGCAATAGGCGTTGCTGCTCCCGTATCTATTTATGCTGAAAC
TTTCGGTACTAGCAAATTAAGCAACGAACAAATTACTAAGCTCATAACAC
AGCATTTTGATATGCGTCCAGGCAGAATTATTAAACATCTTAAGCTTCGC
ACTCCATGTTATCAAAAAACAGCTTCTTACGATCATTTCGGTCGAGAAGA
CGAAAATTTTGCAGGGAGCAACTAG
>RF_0037 Dihydrofolate reductase FolA
ATGGTTGGAGGGGCAGAAATAGCGACTCTTTTCCTAGAGCAAAATCTTAT
TGATGAATTTTTACTTACAAAAATAAATAAAAATTATGATGGAGATGCTT
TTTTTCCTATTGATTTTCTAGCAGGATGGCATTCGGTAATAATAGACAAG
ACAAATAATTATCAAATTTACAAATTCATTAAATAA
>RF_0527 bioB, Biotin synthase
ATGAAAAAATGGACTTTTGACGAGGCTAAAGAAATCTTTAGCTTTTCGTT
TATGGAGCTGGTCTATCAAGCTCAAACAATACATCGTGCTAATTTTGATC
CTAATAAGATCCAAATCAGCAGCCTCTTAAGCATTAAAACAGGTAGTTGT
CCTGAAAATTGTAAATTCTGTCCTCAATCTTCTCACTATAAAACTTATGT
AAAAAAAGAGCCTTTAATGCAAATTGAGGATGTAATTACGGCAGCAAAAC
GTGCTAAAGCAGCAGGTAGTACTCGCTTTTGTATGGGAGCTGCGTGGCGT
GGTCCACGTGATGAGGATTTAAAACTGGTTTGCGAGATGATTAAGGAGGT
CAAAAAATTAGGCTTAGAAACTTGTGTTACTCTTGGTTTATTAAAAGAAC
ATCAAGCAGTTACGCTTAAAGAAGCTGGGCTTGATTTTTATAATCATAAT
ATTGATACTTCTGAAGAGTTTTATAATAAAATTATTACCACTCGTACTTT
TCAGGATAGGTTAGATACATTAAGGTATGTTCGGGCTTCCGGTATGAAAG
TATGCTGCGGCGGTATTTTAGGAATGGGAGAAACAAATGACGATCGTATT
AATATGATCTTAACTCTTGCAAATCTTGAAGAACCTGCTGAATCGGTAAC
TATCAATAAGCTGATAAAAATTCCAGGCACGCCATTAGAAAATGTACAAG
ATATTGATCCATTTGATTTTGTTCGAGTAATAGCTTTGGCAAGAATAATG
ATTCCAAAATCTTATATTCGTTTATCGGCAGGTAGGGAACAAATGTCTGA
TGAATTACAAGCTTTATGTATTATGGCAGGCGTTTATTCAATATTCTACG
GAGAAAAGATTTTAACCTCAGCTAATCCAATGCCTGAAAGAGACAATGAT
TTATTCCAGAAATTGGGAATTATACACTAA
>RF_0744 birA, Biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase
ATGACGACTACTAAAAAAATGAATATAGGTAAATTTAAACTAATTGTTTT
TGATGAAATAGACAGTACAAGCTCTGAGGCTATGAGAATTGCTAAGAGTA
ATAAAGTTGATTCAAACTATGCAGTACTTGCTAAATCTCAAACCAAAGCA
CGAGGTAGAAGCGGTAAAAATTGGCAGTCTAGGGTAGGTAACTTACATGT
AAGTTTACTAATAAAGCCTGATAAAGAGCTAGAATTATTACCGCAATTAT
CTTTTGTTACAGCACTTGCCGTCTATGATACTATGTCATCCCGTGGCCCC
GCCACGGGATTCAATCAATCAATAAACAATCTGGATCCCGTGGGGGGGCT
ACGGGATGACACTATACAACTAAAATGGCCCAATGATGTTTTAGTTAACG
GTCGGAAAATTGCCGGTATACTTCTTGAATCCGTTAAAGTAAAAAATAAT
TATTACCTTATTATCGGTATCGGTATTAATATCACCTATCACCCTGATAA
TATCGACCAGCCTACTACTAGCTTAATAAGCGAAAATCTACCTCCTATAG
AACCACAAGCTTTACTTGAAAAATTAATAGAGAATTTTGAAAAATATTAT
CAAATTTGGCATAATAACGGTTTTTCTTTTATTAGAAAAAAATGGTTAGA
ACATGCTTATAAGTTACATGAAAATATTAGCGTTAAATATCAAAATGATA
TAGTAACCGGCCTTTTTAAAGATATAGATAGTACCGGCAGAATAATATTG
CAACTACCTTCCAAAAAAATAATCTCTTTTTCCACTGCCGAACTTTTCTT
TTAG
>RF_0177 coaE, Dephospho-CoA kinase
ATGTTAGCAATAGGTATTACCGGTAGCTACGCATCGGGGAAAACTTTTAT
TTTGGATTATTTAGCAGAAAAAGGATATAAAACTTTTTGTGCCGATAGAT
GTATAAAAGAATTATATCAAGATTTGAGCGTACAAACTCAAATCTTAAAA
TTACTCCCTGAACTTGAATCTTTCAATATCGGAAAAATCAGCAATTTAAT
CTACAATAACGACCTAGCTAGAGAAAAATTACAAAATTTTATTTACCCAT
TACTGATAGATAAACTCATTTTATTTAAAAAAGAAAACGCTAATTCCAAA
TTTGGCTTTGCCGAAATACCTCTGCTCTATGAAGCTAAATTTGATAAATA
TTTTGATTTTGTCGTAACAATATACTGCTCTGAAGAAATAAGAATGCAAA
GAGCAATAACAAGAACTTCATTTGATATAGAGATTTATAATAAAATCAAA
GAAATTCAACTATCACAAGAGAGCAAAATAGCAAAAGCAGATTTTGCTAT
AAATAGCGGCGTTGATATGTTAGACTTGGAAAAACAAATAGAGAAGCTAA
TTCTCGTCATTGCGAGGAAATTGTAA
>RF_1077 coq7, Ubiquinone biosynthesis protein Coq7
TTGGAAAAGAGCAAGGAGACTATAAGGCGAGGAGCGGAGCGTATAATAAT
ACGTGAGCACCGCAGTTCTTATAAGACGACGCAGCCAATTTTTCAAATTA
AACGAGTATACATTATGCCAAGACCTGATTTTTCTGACCCTGACAAACAA
ATTCACGAAATAATTAGAGTTAATCATGCTGGAGAGTATGGAGCAAAAAG
AATTTATCAAGGGCAGCTAAAATATATCAAATCTCATAATGATCATATAT
TAATTAAAGAAATGCTTGATCACGAAGAGGTCCATCTAAATTATTTTGAA
AAAAAATTACTAGAAAAAGAAGTAAGACCCACGTTTTTATTATTTTTTTG
GCATCATTACGGATTTTTACTTGGTGCTTTATCTTCCTTGATGGGAATAA
AAACAGCGATGCTTGTTACCGAGAGTGTAGAAGAAGTAATAGAAAAACAT
TATGAACAGCAAATAAATTATTTAGAAAATAAAAATATTGAGCCGGAATT
ATTAAATAATATTATTAAATTTCGACTTGATGAAATTGAACATAAAAATA
TTGCTATAATGAATGATAGTACTGAGGCAGTATTTGCAGAAATAACTAGT
AAAATAGTGAAGATAATTTGTCGTATCTCTATAATTTTAAGTAAGAAAAT
TTAG
>RF_0740 folC, Folylpolyglutamate synthase
ATGCTAATGCCGCATTTTCCGGTGCCGACCTGGAAAAATAATATTAAATA
TGATCTTGAAAATATAACAAGACTTTTAAAAGCCTTAGGTAACCCTCATT
TAAGGCTTCCTCCCGTCATACATATAGCAGGTACAAACGGTAAAGGTTCA
AGCAGTGCTATGCTTAAAAGCATCTTTACGCTTGCCGGTTATAAGGTACA
TTGCTATACATCTCCTCATTTATTAGAATTTAATGAACGAATCGTAATAG
CAGGCGAGAAAATCTCGGATAATGAATTATGGCAGGTTTGTGAGGAGGTT
AGGGTAGCAAGCGAAAAATTTAATATCGAACCTAGCTTCTTTGAAGGTAC
TACGGCAGCAGCATTTGTAGCATTTGAGAAAACAAAAGCCGATATATTAA
TTTTAGAGACGGGACTAGGCGGTCGGTTAGACGCAACAAATATAATCGAG
CAGCCTCTAATTACCTTAATTACACCTATTTCATATGATCATATGGATAG
GCTCGGTAATACATTACCCCTAATAGCAGTTGAGAAAGCGGGTATCATGA
AGTCTCGCATTCCTTGTGTTATAAGTGTGCAAGCTTTGGAAGTTTATGAA
ACATTATTTACAAAGGCTGAAGAGTTAGAGGTACCGAGTTTTTGTTATGA
ATATGATTTCGGTATTAAAAAGACGGGCAACGGATTTATTTATTCATCAC
GAAATTTTAGTTATGAGTTTCCGACTCCTTCGCTACTTGGTGATCATCAA
TTAATAAATGCTGCAAGCGTTATTGCTTTAATAAGTTTGATAAATAAACA
ATTTAATATTAGCAACGAAATTATCTCTAAAGGACTGCAAAATACTATTT
GGCGGGCTAGAATCGAAAAAATAGAGCCGAAAAAATATTCTAAATTAATA
GGTGATAATGTTCAAATTTGGGTAGATGCAGCTCATAATAATAGCGGAGC
TCAAGTTTTGACAAATTGGATTCGTGATAACTTAAAATCACCGATATATT
TAATACTCGGTATGACTAAAAATAGGAATATCGAGGAGTTTTGCTCCTAC
TTTAAGGGTTTGACAATTAAAGGTTACGGTGTTAAAGTTTTATCCGAACC
ACTAAGCCATAGTGCAGAAACAATAAATTTGGAAGGCAGAAAGAGCGGGA
TTGATTTTAGCGAAAGCGACTCACTCGAAGAAGCGATTAGTAATATAAAG
AAGATAAACGGTGATAATAAAGCAAATATTATAATAACCGGATCGCTTTA
TTTAGCTTCCGATTTTTATAAATTGCTGCATTAA
>RF_0699 folD, Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase
ATGGAGACAAAAATAATAGTGAATAATATAATTGACGGTAAAGCGTTAGC
AAATGAGATACTAGCAGACTTAAAGCTAGAAATTCAAGAACTTAAAAGTC
AAACCAACACTTCACCAAAGCTTGCTATAGTACTAGTAGGCGATAATCCA
GCAAGCATTATTTATGTAAAAAATAAAATAAAAAATGCACATAAAATAGG
AATTGATACTTTATTAGTAAATCTATCTACTACTATTCATACTGATGATT
TAATATCGAAAATCAATGAGTTAAACCTTGATAACGAGATTTCGGGAATT
ATAGTTCAGCTTCCTTTGCCAAGCTCCATAGATAAAAATAAAATTTTATC
AGCAGTATCACCTTCTAAAGATATCGATGGTTTTCATCCTTTAAATGTCG
GTTATTTACATAGCGGGATTAGTCAGGGTTTTATACCCTGCACTGCCCTT
GGTTGTCTTGCAGTTATAAAAAAATACGAACCTAATTTAACCGGTAAAAA
CGTTGTAATTATTGGACGCTCGAATATAGTAGGTAAACCTTTAAGTGCAT
TACTGTTAAAAGAAGATTGCAGTGTTACTATTTGCCATTCCAAATCGCAA
AATCTAAGCTCTATCACTTCTAAAGCCGATATAGTTGTTGCGGCTATTGG
GTCACCTTTAAAATTCACTACCGAATATTTTGATCCTGAATCTATAGTAA
TTGATGTAGGAATTAATAGAATTAGCGGCAATAAGATTATCGGTGATGTT
GATTTTGAAAATGTTAAATCTAAAGTAAAATATATTACTCCTGTTCCTGG
CGGTATCGGACCGATGACTATTGCATTTTTACTTAAAAATACGGTTAAGG
CGTTTAAGGATTCTTATAGTACAGTATGTCATTCCTGCCTTTAG
>RF_0599 folE, GTP cyclohydrolase I
ATGAGTAAACCAACTAGAGAAGAAGCTAAAGAAGCGGTAAGAACGTTACT
AAAATTCATTGGTGAAGATCCAACTAGAGAAGGGTTGCTTAAAACCCCTG
ATAGAGTGGTTAACAGCTATACGGAAATATTTTCCGGTTATGGAAAGGAT
GTAGCTGAAATATTAAATACAAAATTTTACGATACTTGTAATTTTCAGGA
TTTTATCTTACTGAAAGATATAAAATTCACCTCTTTTTGTGAACATCATA
TGTTACCTTTTATCGGTACGGTGGATATAGCTTATATTCCTGATAATTGT
ATTGTCGGCATAAGCAAGTTAGCACGAATAGTAAATGCCTTTTCTAAAAG
ATTACAAATACAAGAAAAGATGACGGTACAAATAGCCGAAAGCGTACAGG
AGAATTTAAAGCCGCTTGGCGTTGCCGTTAAGATTTCTGCTTTACATAGT
TGTATGTCGATGCGTGGAGTGATGCAAGATAATAGTGTTATGAACACTAT
GCATTATACAGGGATATTTGCCGAGCAGCAGAAATATCGCTATGATTTTC
TGAATCTTACTGCTAAAAGGTAA
>RF_0039 folKP, Folate synthesis bifunctional protein
GTGAGGACCGAAGGACTTACAAAGCGACGAAGTCAATTTTTCAAATTCAG
CGAGTATACTATGATTTATATTTCTATAAGCAGTAATTTAGGTAATAGAC
TTTTAAATATTAAAAAAGCTTTAAATTTACTAAAAAGCTGTGATTTTAGA
TTGCTTAAGCAATCTATTATTTTTGAAACACAAGTTATTCTACCACCTAA
TGCAGATAAAGCTTGGAATAAGTCATATTTAAATATGGTGGTGCAGGGTA
AAAGTACTTTAACGCCTAGTAAACTTCTAATTGAGCTTAAAAAGATTGAA
AAACAACTAGGTCGAGCAGACTCTTACGATAAATGGTCTCCAAGAGTTAT
TGACTTAGATATCCTACTTTGGAGTAATTGCCATATAGATTTGCCTGATT
TAAAAATACCGCATCCTGAATTATTAAACAGACCGTTTCTTATTCATCTA
ATTGCAGGTTTAAGTTTGGAATGTCGTTATACATGTCCGACTAATAATTT
TTACAACAATAAAACCTTTGCAGAAATAGCACATTTAATTGAGAATCAAG
GAGTTATACGCTCTCTTGTTTTAAATCCTCAATTTGTCGGTATTTTAAAT
ATTACTCCTGATTCTTTTTCTGATGGAGGATTAAATTTTCATAAAGAAGA
TGCCGTTAGAAATTTTGTACGCTTGATAAATGAAGGGGCTACAATAATTG
AGCTTGGATCACAATCAACACGTCCTTCTGCTTTAATTATTAATGAAGAT
GAAGAATATGCAAGGCTTGAGAATGTTCTTGAAGAGCTTAGGGAAGTTAT
AAAGGAAAAAGAAGTTATAGTCAGTATTAATAGTTTTACTCCTGAAGTAA
TTAAAAATGTTTTAAAAAAATACCCTATTTCCTGTATAAATTTGGTTAAA
AATAATCTAGATAATTATACATTACGATTAATTGCCGATTATAATTGTAA
AATTATTACTATGCACTCATTAGCCGTTCCACCGCAAAAACAAAAATGTC
TTGATTTCGATAACTCTCCGCTTGCTAACTTAAATATATGGGCAGAGCAA
GAAACAACAAAATTAGAAAAATATGGATTTGATAGAAAAAATATCATTCT
TGATCCTGGAATTGGTTTTGGAAAATCCGTTTATCAAAATTTATATATAT
TACAACATATGAAAAAATTTAAAAATCTAGGATGTGAGATATTGGTAGGA
CACTCACGAAAATCTTATATTTCTGCTTTTTATAATTCCAAAGCATCGGA
AAGAGATTTAGAAACAATAGCAATATCAAAATATTTAACAGAGCATGGAG
CTGATTATTTACGAGTGCATAATGTTATAGAGCATCAAAGATTTTTTGTA
ACAGACCATATGATTAAACTTTCATCTCATGAAAAATAG
>RF_0005 gltD, NADPH-dependent glutamate synthase beta chain and related oxidoreductases
ATGAAACTTGGTTTTAATCTAGATTTTAATGAATTAGATTTAACCGGACT
TAAAAAATTAGATCAAATATTTTTAGATTATCTCTTTAAAGCCGATAAAT
CTCTGCATAAAGATTTAATGTTATTTAGATCGACTCCTCTCTCCATTATT
CCACAAGATTATTCCGAATTTTTGCTAAAAATTTCCCCTCATTTAGACGA
TTTTTTAGCAGAGTTATTTTGTATTTCAAAAGAAGTAACGATATCAAGGT
TAAAACATAAAGATTTTGATATTATTTATGAATGTAAAAGAAAATTTGTT
CAGCGTGTTGCCGTAAAAAAATACCCACCGGAAAAAATAAAAGATATTGA
TTTTGAAGATGTGTATTTAAAGCTAACTGATTTAATAGGTACGAATTTTA
CCTCTAGAGAATTTGCCAAACAAATAATTATATGGCAACAGGATGAAAAG
AATTTTGCTGAAGAGTTGGATATAGCAGCTAGGTATGCAGCGTGCCGAGT
GTCATTCCGTGGCTTGACCGCCACAAATCGTCATTGCGAGCGACTGCAAG
AAGCGTGGCAATCTCATAAAAATGTCCTGAGATTGCCGCGTCGAGGCTTC
GCCTCTCCTCGCAATGACGGGAAAGTTGATCCTGTGGCGAGGCCACGGGA
TGACACTCTGTTTTCACAGGATGACATCCTATTTAACCTCCCTCAAAAAC
TAGATAAAGAAAATCTAATAGACGATAAAAAAATATTAAAATATCAAAAA
AATGAGAGAGTAGATTTTGACTATACAGATTCTTTTTTAAATCTAGATGA
AGCCTTAAACGCTTCTCATTATTGTATTTATTGCCATAAGCAAAGTAAGG
ATTCTTGTTCTAAGGGATTACTGCAACCCCAAAATCGTCATTGCGAGGAG
CGAAGCGACGTGGCAATCTCGTCAAATCTCCTGAGATTGCCACGCTCCTT
TCAGTCGCGTAGCTCAGACGGTTTAAAACAAGGCTGCCCTTTAAAACAAA
AAATTTCTGAGATGAACTATGTTAAGGCACAAGGCTTTAACTTAAGTGCT
CTTGCTATTATTGTTATTGATAATCCGATGGTTGCAGCAACAGGTCATAG
GATTTGTAATGATTGCTCTAGAGCTTGTATTTACCAAAAGCAAGATCCGG
TAAATATTCCTTTAATAGAATCAAATATTTTAGAAGAAACGCTTAAATTA
CCTTACGGTTTAGAGATATATCTACTTCTTACTCGTTGGAATCCGCTTAA
TATTTATGCTCCGCTTCCGAAAAAACCTACTAATTATAATATTTTAGTTA
CCGGTCTTGGTCCTGCAGGTTTTAGTCTTAGCTATTATTTATTACGGTCA
GGTCACAATGTCACAGCTATTGATGGCTTAAAAATTACCCCTTTACCTTT
TAACGTTCATAAGCCTATAAAATTTTGGCATGAATATAAAAATTTGTTAT
CGGAAAGAATGCCAAGAGGATTTGGAGGAGTAGCAGAATATGGTATAACT
GTTCGGTGGGATAAAAACAATCTTGATATATTGCGGTTAATACTAGAGAG
AAATAACAATTTCAAATATTATGACGGGGTAGCTTTAGATTTTAATATAA
CGAAAGAACAGGCTTTCGATTTGGGTTTTGACCATATAGCTTTTTGTATT
GGAGCGGGTCAGCCGAAAGTCTTAGATATAGAAAATTTTGAAGCTAAGGG
CGTAAAAACAGCTTCTGATTTCTTAATGACTTTGCAAAGCGGAGGAGCAT
TTTTGAAAAATTCTAATACTAATATGGTAATTAGAATGCCGATTGCGGTA
ATAGGCGGCGGTCTTACTTCCTTAGATGCAGCAACAGAAAGTTTATATTA
CTATAAAAAGCAAGTAGAGGAATTTGCTAAAAATTATATAGAAAAAGATT
TAACGGATGAAGATAAAAAAATAGCTGAAGAATTTATTGCTCATGCAAGA
TTATTTAAAGAAGCTAAGAGTAATGAAGAATTAAGAAAGGTTTTTAATAA
GCTTGGAGGAGCTACTGTTTATTATCGTGGAAGATTGCAAGATTCGTCGG
CATATAAATTAAATCACGAAGAGCTAATATATACATTAGCACTCGGTGTT
GATTTTAAAGAAAATATGCAGCCTTTAAGGATTAATGTTGATAAATACGG
TCATGTGGAGGGGGTGGAATTTAAGACTCGTCATTGCGAGCAGTCAAAGA
CTGCGTGGCAATCTCAGGAGTTTAGCTTAACAAGATTGCCGCGTCAATGC
TACGCATTTCCTCGCAATGACGTTAAAGCTAAAACCGTGATTATGGCAAT
CGGTATAGAAAATAACACTCAATTTGATGAGAATAAATATAGTTATTTCG
GTGATTGTAATCCTAAATATTTGGGAAGTGTAGTGAAAGCTCTTGCTAGT
AGCAAAGAAGGGTACGAGGCTATTAATAAAATACTTATAAATAATGCCCC
TAGCTTTAAAAATAGTTATAAAGATTTTTGTACGCAGCTTGATTATTTAT
TGATTAGTAGAATTCATAAAATAAATATTTTAGATGATAAAACTTTTGAG
TTGATAATTCATTCGCCGCTTGCTGCTAAAAATTTTAAGTTTGGACAGTT
TTTTCGCTTACAAAATTATTCTGAAGATATTGCTAGGTTAATAGAGCCGG
TAGCCTTAAGCGCTACAGATATTGATGTAGAAAAAGGTTTAATTAAATTT
GTAATTTATGAAGTCGGTAAATCTACTAGCTTATGTAAAACATTATCTGA
AAATGAGAAAGTAGCTTTAATGGGACCGACAGGCTCGCCGCTAGAAGTAC
CTCAAAATAAAAAAATAGTTATTGTTGATTCCGAAGTAGGTAATATAGGC
TTATTAAAAGTTCTAAAAGAAAATAATAATGAAGTTATATTTGTTACCTA
TCCTGATATAAAAATCCGTAAATTAGTTTCAGTGGATATAGTAATAATTA
ATACTTCTCCTGACATAATAGAAGAATTGCAAAGCCTAAAAAATGAAATA
TTCGGTGAAAATACGGAGCTAATAGTTAGCGTTAATTCATCGATGCAATG
TATGATGAAAGGAATCTGCGGACAATGTATACAAAAGGTTAAAGGGGAGC
AGAAATATATTTTTGCATGTAGTAGGCAAAATCAAAATGCAGAAATAGTT
GATTTTAAGAGCTTAAAAACTCGTTTACGCCAAAATTCTTTGCAAGAAAA
AATGCTCCGTCATTGCGAGCGACTATAG
>RF_1334 hemA, 5-aminolevulinic acid synthase
ATGTCTTATTACGATACTATATTTAGCAAACATATAGACAAAATTAAGAG
CGAAGGAAGATATCGAGAATTTAAAGCCTTAAAAAGACAAGCCGATAATT
TTCCTTTTGCAGAACACGCTAATAAACAAATAGTTATGTGGTGCATTAAT
GACTATTTGGGTATGAGTAAACATGCAAAAGTAATGCAAGCTTCTATAGA
TGCCTTGCTAAAATACGGTGTTGGATCAGGCGGAACTCGCAATATCGGCG
GTAATAATATTGCCATTCTTGAGCTTGAAAAAGAACTTGCAGATTTACAC
AAAAAGCAAGCAGCTTTAGTTTTTACATCCGGTTTTGTTGCAAATGATAC
AACGCTTGCAAGTCTTGCTAAAATCATGCCAGATATAGTATTTTTCTCTG
ATGAGCTAAATCATGCTTCAATAATTGCAGGAGTTACAAGTTCAAGAGCC
GAGAAATATATATATAGACATTTAGACGTTAAGCATCTAGAAGAGCTTTT
ACAATCAGTCGATATTAATAGACCGAAAATTATTGTTTTTGAATCGGCTT
ACTCTATGGACGGTTTTTTCTCACCTATCAAAGATATAATCAACTTAGCC
AAAAAATATAATGCTTTAACCTTTATCGATGAAGTTCATACGGTCGGTTT
ATACGGTAAACATGGAGGCGGTATTGCCGAGCTTCTTAATTGTAGCGATC
AAATCGATATTATTCAAGGTACACTTGCCAAAGCATATGGCACTATCGGC
GGTTATATCACTAGCAACCATAATTTAGTCGATGCTATAAGGCTAACCGC
TCCAGGATTTATTTTCACTACTTCATTACCGCCGGTAATTTCTACCGCTG
CAACGCATAGTATTAGACATCTTAAAGAATCGAATGAAGAACGAATAAAA
CATCAAGAAGTAGTTACAAAACTTAAAAATTCTTTTGAAAATTTTAATAT
ACCTTATTTGAAAAATGAAAGTCATATAGTGCCAATAATTATTGGTGATC
CGATTAAAGCAGCTAGTGCCTCAAATATGCTCCTTAATAAATATGGTATT
TACGTTCAACATATCAATTTTCCAACCGTACCGAGAGGTACGGAACGCCT
CCGAATCATCCCAACCCCTGCCCATACCGATAAAATGATCAATGATTTAT
CTATAGCCTTAGTGCATATATTTGCCGAACTTGATATAGAATTATCTTCT
ACAAAAGAACTAAACGAAGAAATACGCTTGAATCTTATTGCATAA
>RF_0856 hemB, Delta-aminolevulinic acid dehydratase
GTGAATTTTATGTACCCCCTTATTAGACTTAGAAGAAATAGAAAAGCTTT
TTGGCTTAGAGAATTAATAGCCGAAAGTAGCTTATCGGTTAATGATTTAG
TGCTGCCTTTATTTGTTGTTGAAGGACATAATGAAAGACAAGAAATTAAA
ACTATGTCCGGTATATATCGCTACTCTATAGATCAAATAGTAGAGACGGC
AAAAAAAGCAGCAGGACTTGGTATTAATGCTATTGCATTATTTCCTAGTA
TTGATCAAAGTCTAAAAAGTGAAAATGCCGATGAAGCTTATAATTTAGAT
AATTTAATATGTAGAACTATTAGAAGCATCAAAAATGCTAATATTGATAT
CGGTATAATATGTGATGTAGCACTTGATCCTTACACTACAAGCGGTCATG
ATGGTATTGTGCATCATGGGGAAGTTGATAATGATAGATCGGTAAGAGCT
TTATGTAATCAAGCATTAGTGCTAGCAAAAGCCGGAGTAGATATTGTTGC
ACCTTCCGATATGATGGATGGAAGAATCGGGGCTATAAGGGAATATCTTG
ACAAAGAGGGATTTATAAATGTTGGAATTCTTGCTTATGCCGCTAAATAT
GCTTCAAGCTTTTACGGTCCGTTTCGTGATGCTGTTAAGAGTAATAAAAA
GAATTATTTAGATAAATCAAGCTATCAAATGGATGTACGTAATATTAAGG
AAGCAATGCTTGAGATTGAGCATGATATAGCAGAGGGATCCGATATGGTT
ATGGTGAAGCCCGGTATGATGTTTTTGGATGTTATTCGTGAAGCGGCGAA
TAATTTTAATGCTAAAATTTTTGCATATCAGGTTAGCGGAGAATATGCAA
TGTTAAAATTTGCAGCAGAAGCAGGGGCAATTGATTGGGAGAAAGCTTTG
ATGGAGTCATTAATTAGTTTTAAACGTGCCGGTGCAACCGGTATATTTAC
CTATGCTGCTCTTGAAGTAGCTGAAATATTAAATAATACCCGATGA
>RF_0817 hemC, Porphobilinogen deaminase
ATGACAAATTCTATCAGAATAGGTACAAGAAAAAGTCCGCTTGCTTTAAT
ACAAACTAATTTAGTTATTCAACAAATCAAACAATTTTTTCCTGATATTA
ATTGTGAAATAGTACCCATTATTACTAGCGGTGATTTAATCCAAAATAAA
CCATTATACGATATAGGAGGTAAAGCTTTATTTTTAAAGGAAATAGAGCA
AGCTTTACTTGATAAAAAAATTGACTTAGCGGTTCATTCTTTAAAAGACG
TACCTGGTAGAATACCCGAAGAGCTAGTAATAGCTGCTATTTTAGAGCGT
GAAGACCCTAGAGACGTGTTTGTTTGTTTAAATTATAAATCCATAGAAGA
GCTACCGCAAAATGCCGTAATAGGTAGCTCGGCAGTACGAAGAAAAGCAT
TTATCCAAAAAATAAGATCGGATTTAAAGGTAACGGTTTTTAGGGGGAAT
ATTGATTCAAGAATAAAAAAGTTAATGACCGCCGAAGTTGACGCAACGAT
TTTAGCATATGCAGGGCTGAAAAGGCTCAGGGCGTTTAATCCGGAATATT
GCCATTTGATAGAGTATTCGCAGATGTTGCCGTGTATAGGGCAGGGAGTC
ATTGCAGTTGAAATACGACAAGACGATAATGCTATGCTTGAGATATGTAA
CCAAATTAATCATCTTCCTACCTTTGAGCTAATAAAGCCAGAAAGAGCTT
TTTTAGAATATCTAGACGCTAATTGTCGTACGCCAATTGCCGCTTACTCT
AAATATTTAGATGCGGATAATATACAAACCGATTTCATGCTCGGCAACCT
CGATTGCAGTAAAATAATCTTCCACACCGAAGTCACCGATATAAATACCT
CAAAAGAAGCAGGCATAAAAGCCGCTAAGATGATGTTAAATCAACTGGAT
AAATAG
>RF_1400 hemE, Uroporphyrinogen decarboxylase
ATGAAGCAAATTATAAATCCATTAAAAAGAAATAGTAATAAGATACCTAT
TTGGTTTATGCGTCAAGCAGGTAGATATTTGCCAGAATATAAAAAAGTAA
GAGAAAAAACAAAAAATTTTCTAGATTTTTGTTATGATGTTAATAAAGCA
ACGGAAGTAACCTTACAACCGATAAAACGTTATGGATTTGATGCAGCTAT
TATTTTTTCTGATATATTAGTTTTACCTCATGCTCTTGGATGGGAAGTAG
ATTTTAAAGAAAACATAGGACCTATATTAAAGCAGTTCAAATCACAAGAA
GATTTTAAATATCTACAAAGCAATCCGAATAATAAATTAGAGAAAGTTTA
TGAAATAATAAAAAAAGTAAAAGAAGAATTACCTTCCACCACTTCTTTAA
TAGGATTTGCGGGTAGTCCTTGGACAGTGATGAGTTACATGCTAGAAGGA
AAAGGAAAACAGGATTTTAAAACGAGCAAAAAATTTATATATGAAAATAA
AATACTTGCTAAAGAATTATTAAATTTTATTACGGAAAAAACAGCTGATC
ATCTTGTAAATCAAGCAAAATCGGGAGCAGATGTTTTAAAGCTTTTTGAT
TCATGGTCAGGAGTACTTGGAGAAGAGGAGTTTACTGAATTTGTAATAGA
GCCGACAAAAAAAATTATATTAAAAGTAAAAGAAGATTTTCCAAAAATTC
CTATAATTGCTTTTCCTAAAGGAGCGGTATTATTGTACGAAAAATTTATA
AAAGAAGTACCTATAGATATTTTAGCCGTAGATCAAATGGTTCCTCTTGA
AAAAATGAAAGAGTGGAGTGATAAAGTAATAGTACAAGGTAATTTAGATC
CAGTCGTATTATTAACTAATAAAGAAATTATCAAAGAAAAAGCTTATAAA
ATTCTTCAGACAATGAAAGGAAAGAATTTTATCTTTAATTTAGGGCATGG
TATTTTGCCTGAAACACCTCCGGAAAATGTAAAGTTTTTGACAGAATATG
TTAGGTTATATGAAGAAAAGAATAGCAATAGTACTTTTTAA
>RF_1396 hemF, Coproporphyrinogen III oxidase precursor
ATGAAAATAGAAAATAAAGAGATAGCTAGTAATTGGTTTACTGATTTACG
TGATTTATTGTGCAAAGAATTTGAAAAAATCGAAGAAGAATATGCACAGA
CAAAAGGTTTAAAACCGGCTAAGTTTGTACGTACAAGCTGGCAACGTAAC
GGCGGTGGCGGCGGTATTATGTCTCTCATGAAAGGAGAAGTATTTGAAAA
AGTCGGGGTTAATATATCTACCGTATTCGGTGAATTTTCTCCCGAATTCC
GTAGTGAAATTCCAGGAGCAGAGCTAGACGGGAAATTCTTTGCAACAGGC
ATTTCATTAGTCGCACATCTTAAATCGCCACTAATTCCCGCTATGCATTT
TAATACTCGTTATATAGAAACTTCTAAAAGTTGGTTTGGCGGCGGTGGCG
ATTTAACACCTTTCTATCCGAAAGAAAACGAAACTGCAAAGTTTCATGCA
GCTTTTAAAGAAGCGTGCGATAAGTATGATTCTAGCTATTATCCTAAATT
CAAAAAGCAATGTGACGAATATTTTTATCTAAAGCATCGAAAAGAGCCGA
GAGGAGTAGGCGGAATATTCTATGATTACTTAAATAGTGGTAATTTTGAA
CAGGATTTTGCTTTTACGCAGGATGTAGGTAGAGCTTTATTGTCGGTATA
TCCTGAAATCGTTAGAAGTAAGTTATTTTTACCTTGGACAACTGAGCAGA
AAGAATACCAACTTATAAGGCGGGGTAGATATGTAGAATTTAATTTGCTA
TATGACCGCGGTACTAAATTCGGCTTAATGACCGATGGAAATGTTGAAGC
AATATTAATGTCGCTACCACCTGAAGTAAAGTTTAATTGA
>RF_1399 hemH, Probable ferrochelatase
ATGTTAGGTTATATGAAGAAAAGAATAGCAATAGTACTTTTTAATTTAGG
AGGTCCAAAAAACCTTGAATCCGTAAAACCTTTTTTATTTAATTTATTCT
ATGACAAAGCTATAATTAATCTACCGAATCCATTCCGCTATATTATTGCA
AAAATAATTTCTACTACTAGAGAGAGAAAATCTCAAAAAATTTATTCTTT
AATCGGTGGAAAATCTTCTTTACTTCAGGAAACAGAGGAGCAGAAATTAG
CACTAACCGAAAAACTAAAGCAGCTCATAAAAGAAGATTTCGCTATTTTT
ATAAATATGAGATATTCAGCACCTTTTGCTAAAGAAGTAATAGATCAAAT
AAAAAAATATAATCCAAGCGAAATAATATTATTGCCTCTATATCCTCAAT
TTTCAAGTACTACGACAGGATCTTCGGTTAAAAATTTTTTACAAAACTTT
GATATTGATATCTCAATTAAAACAATTTGTTGTTATCCTCAAGAAGAAGA
TTTTATAAAAAGCCATGTTTCATTGATTAAGGAAAAACTATACGATGATG
ATAAAAATTTTCGTATATTATTTTCTGCTCATGGGTTACCTGAAAAAATA
ATAAAAGCAGGCGATCCTTATAGTTTTCAGATAAAAGAAACAGTAAAAGC
AATAGTTAAAGAATTAAATATAAAAGATCTAGATTATAAGATAACTTATC
AAAGTAGAGTAGGACCTATAGAGTGGTTAAAACCGAATACGGAAGATGAA
ATAGAGCTAGCAGGAAAGTTAAAAAAAGACATAATTATCGTACCTATATC
CTTTGTATCCGAGCATGTTGAAACACTAGTAGAACTTGATATTGAATATA
AATTAATCGCAGATAAATATGAAGTTCAATATACTCGAATTCCGACACTT
GGAACAAATAAAATTTTTATTAATAGTTTGACAAATATATTGCTGCAATT
TATTAATAAGGTTGATACTAATTTAGTTACGAGTAGCTCTAGTACAAGAA
TATGTCCAAACGAATTTACTAAATGTTTATGTAAATTAACAAATTAA
>RF_1100 hemN, Probable oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase
ATGAAAGTGACGGCAGATAATTTAAGCATTTATATTCACTGGCCGTTTTG
TTTGTCAAAATGTCCATATTGTGATTTTAATTCTCATGTGGTAAGCACTA
TAGATCATCATCAGTGGCTTAAATCCTATGAAACGGAAATAGAGTATTTT
AAAGATATTATTCAAAATAAATACATTAAATCTATTTTTTTCGGTGGTGG
TACTCCCTCTTTAATGAATCCTGTAGTCGTTGCAGGAATAATAAATAAAA
TCAGTAATCTAGCAATTATTGATAATCAAACCGAGATAACTCTAGAAACT
AATCCCACATCCTTTGAAACTGAGAAGTTTAAAGCATTCAAATCCGCCGG
AATTAATCGTGTTTCAATTGGAGTACAATCCTTAAAAGAAGACGATTTAA
AAAAATTAGGTAGAACTCATGATGCTTTGCAAGCCATCAAAACAATTGAG
GCAGCAAATTCGATTTTTCCAAGAGTATCATTTGATTTAATATATGCACG
TAGCGGTCAGAAATTAAAAGATTGGCAAGAAGAGTTAAAGCAAGCTATGC
GACTCGCAAACGGCCATATTTCTCTTTATCAATTGACTATCGAAAAAGGC
ACGCCTTTTTATAAATTATTTAAGGAGGGTAATCTGATTTTGCCGCATTC
AGATGCAGCAGCTGAGATGTATGAATGGACGAATCATTATCTAGAATCTC
AAAAATATTTGAGATATGAGATATCTAATTATGCTCTAGCAAATCAGGAA
TGTTTGCATAATTTGACTTATTGGAATTATAATAATTATTTAGGTATAGG
TCCTGGAGCCCATAGTAGAATAATTGAACCGGCAAGTTCGGTATCGGCAA
TTATGATGTGGCATAAACCTGAAAAATGGTTAGACTCGGTTAAAACAAAA
AATGTCGGTATTCAAACTAATGCTAAGCTAACAAATCAAGAAATAATCGA
AGAGATTTTAATGATGGGTTTACGTCTTAAAAGCGGTATAAATATTGCTG
AACTAGAGCAGAAAATAAACACAAAATTAGTTGATATTTTAGATATGAAT
AACTTGCAGAATTATCAAAATCAAGATTTAATTAAGTTAGATAAAAATAT
CTCTCTTACCGATAAAGGTTTAATGCTGCATAGTTATATAGTACCTAGAT
TAATTATATGA
>RF_0659 ilvE, Branched-chain amino acid aminotransferase
ATGACAATGATAAAACTAGAGCAAATTTTTTGGCATGTTTGGATTAATGG
TGATTTAGTTCCTTATCAATTCGCAAGGATTCATGTTTTAACTCATAGCC
TGCATTATTCAGGATCGGTGTTTGAGGGTGAGAGAGCTTATAACGGCAAA
GTTTTTAAGTTAAAAGAACATACGGAAAGATTAATAAAATCAGCAGAAGC
ATTAGGTTTGAAAGTACCTTATAGTGTGGACGAGATAATAAAAGCTCATG
AACTTGTAATAAAACAAAATAATATTAAGGATGCGTATATAAGACCGCTT
ATTTGGTGTGGAGACGAATCGCTAAATATTACTAATCCTGATTTGTCTAC
TAATCTTTTGATTGCCGGTATTCCATCAATGCCAAGGTCTTTTGAGAAAG
GTATAAATTTGCATGTAGGCCGCTGGCGTAAAGCAATACCTGATAGCACC
CCGGTACAATCTAAATCCGCCGCTCAATATAATATGGCAATAACGAGTAA
AAAAGAAGCTAAAGCTCTTGGCTATGATGATGCCTTATTACTTGATTATG
AAGGATATATTGCTGAATGCACTACAACAAATATTTTCTTTGTTAAAGAT
AAAACATTATATACTCCAATTGCCGATAGATTTTTAAACGGTATAACAAG
ACAGACTATTATTGAGATTGCAAAAGATTTAGGTCTAGAAGTAAAAGAAG
AGCGTTTGAAATTAGAGCAAATAGAGAATTTTACCGGATGTTTTGTTACA
GGCACGGCAATCGAGGTACAAAATATTGATTCTATAGATTTAGGCAATAA
AAAGATTACTTTTGATGATCATCAAATTGCAGATCGTTTGAAAAAAGAGT
ATGGGCGTATTGTTAGGGAGTAG
>RF_0839 ispB, Octaprenyl-diphosphate synthase
ATGAATATTATAGTAAAAATACAGCAAGATTTAAAAGATGAAGTAACTAA
GTTAAACGATTTAATCATTAGCTGTTTAAAAAGTGATGAAGAATTAATAG
AAACAGTAGGTAAATATTTACTAGAGGCGGGTGGTAAAAGAATTCGTCCG
CTTTTAACTATAATAACCGCTAAAATGTTTGATTATAAAGGCGATAATCA
TATAAAGCTCGCAAGTGCCGTTGAATTCATTCACACCGCTACATTGCTTC
ATGATGATGTGGTAGATGACAGCACTTTAAGAAGATTCAAACCTACCGCT
AACGTTATTTGGGGAAGTAAAACAAGTATTTTAGTGGGTGATTTCCTTTT
TAGTCAGTCTTTTAAGTTAATGGTAGCTTCCGGCTCTATTAAAGCTATGA
ATGTTCTAGCTAAAGCTTCAGCAATTATTTCCGAAGGGGAGGTAATACAG
CTGGTTAAGCTAAATGAGCGACGCATTATAACTATAGACGAATATCAGCA
AATAGTTAAATCTAAAACCGCCGAACTATTTGGAGCTTCTTGTGAAGTTG
GAGCTATTATAGCAGAGCAGGTAGACCATATTTCTAAAGATATGCGGGAC
TTTGGGAAATTACTCGGAACAATATTTCAGGTTATAGATGATCTACTTGA
TTATTTGGGCAATGATAAACAGGTAGGCAAAAATATCGGCGATGATTTCT
TAGAAGGAAAAGTTACGTTACCGCTGATTTTTTTATATAATAAGCTAGAG
CAAGATAAGCAGCTCTGGCTTGAAAATATAATTAAATGCGATAAGCGTAC
TAATGATGAGTTTATTAAAGTACGTGAATTGATGATTGAACATGAAATTC
ATAATGAAACAGTTAGTTATTTGAGTAACTTAGAAAATGAAGCAAATAAG
TTATTAAATAAAATTCCGGTTCAGAATAGTTATAAAGATTATTTATTTTC
AATTATTAGATTTATTTTAGACCGTTCTTATTAA
>RF_1187 lipA, Lipoic acid synthetase
GTGAATTTCAAAAATTGGCGTTGTCGTTCTATAAGAGTGCAGGTAGCCAC
GTATTATTATACGCTCCGCTCCTTGCCTTGTGAACTCCTCGCTCTTTTTG
AAATTGACCTTCGTATACAACTATTCATTTCACAGGAGTATATGTCTAAT
TTAAACAAAAGACCGGATTGGATAAAAGTAAAAGCTCCGAATTCCGCAGA
ATATTATAATACAAAAGATTTAATAAAGAATCTGAGATTAAATACTGTGT
GCGAGGAAGCTGCTTGTCCTAATATCGGTGAGTGCTGGTCGAAAAAACAT
GCAACCGTGATGATTTTAGGTTCGGTTTGTACTAGAGCCTGTAGGTTTTG
TAATGTCAAAACTGGTAGACCGGATTTGCTTGACCCGCACGAACCGCAAA
GGTTAGCGGAAGCGGTACAAAAGTTAAATCTTAAGCATGTAGTAATTACT
TCCGTCGATCGTGATGATCTTGATGATGGCGGAGCTACGCATTTTGCGGA
GTGTATTAGCGAAATTAGAAAATCATCGCCAAATACTACTATTGAGATTC
TAACTCCTGATTTTTTAAGAAAAGAAGGAGCAGCTGAAATAATAGCAAAT
GCAAAACCTGACGTCTTTAACCATAATGTCGAAACAGTCCCGTCTTTATA
CAAAACGATTAGACCAGGAGCTAGATATTATAATTCTTTAAGCTTACTTC
ACAATATCAAAAAATTATCTCCTGAAATTTTTACAAAATCCGGTATGATG
GTAGGGCTTGGAGAAGAAATAAGTGAAGTAATACAGGTTATGGATGATTT
AAGAGAAGCAAAGGTTGATTTTCTAACTATAGGGCAGTATCTGCAACCTA
CTAAAAATCATGCTGAGGTCGCAAAATATGTTACTCCCGAAGAGTTTAAA
TATTTAGAGCGAATAGCAAGAACAAAAGGATTCTTGATGGTTTCGGCAAC
CCCGCTAACCCGTTCTTCATACCATGCCGATGAGGATTTTCAAAAATTAA
AAGAGAATTACCAGCAGCGTCATTGCGAGGAGGCATGGCCTGCGTGA
>RF_1383 lipB, Probable lipoate-protein ligase B
ATGCTACAATTTATAACTATACCGAATCTTATGGATTATCGAGTTACTTT
GAAATTAATGGAAGATTACGTTAACAAAGTAATTAGTGATAATGAGCCGG
AAATTGTTTATTTAGTTGAACATTCGGAAGTATATACAGCCGGTACTAAT
TATAAACAAGAAGAATTATTAAATTACGGTGATATTCCGGTAATTTACAC
AGGACGTGGCGGTAAATTTACTTTTCATGGACCGGGTCAGCGTGTTATTT
ATCCAATTCTTAATTTAGCTTCACCAAATCGACACAAAGATTTAAAGCTA
TATATAAAAATGCTTGAAGAATGGATTATAAATAGCTTAAATTATTTTGG
AATTAAAACATATATTATTAAAGATAAAGTAGGAATTTGGGTAAAAGTAA
GGAAAGGTGAATTTGCTAAAATTGCTGCAATAGGTGTTAGAGTAAGAAAA
TGGGTTACATATCACGGTGTAGCTATAAATATTTCAACAGATTTAAGTAA
GTTTAGTGGGATTATTCCTTGTGGACTTGAAAATTCTTTAGTAACATCTT
TAAATCAGTTAGGAATTCATATTGAAATGTCTGAATTTGATAAAATTATT
CAAACTGAATTTAATAAAATATTTAAATGA
>RF_0231 ubiA, 4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase
ATGATAAACAAACTTTTACTTACTTTAAAATTAATGCGGGCAGATAAGCC
GGTACCTTATATATTAGTTTTTTTCCCTGCTTTATTTGGATTGCTGCTTG
CAAACCCTTCTAACACTGAATTAGCTTATTTATTACCGTTATTTATTTTA
GGTAGTATAACGACAAGGAGTAGCGGGTGTATTATTAACGATATATTTGA
TCGGAAATTTGATAAACATGTTGCAAGGACTAAAGACCGACCTTTAGCAA
GTGATGCTGTGTCTGTTTCTTATGCTATTTTTATACTCTTTATTCTTAGT
ATTATATCACTTTATATCTTGCTACTTTTAAACAAAACAGCCATATATAC
AGGTTTTTTTGCTGTAATAATGATTAGCCTATATCCGCTAACGAAACGTA
TTACCTACTTCCCGCAAGTATTTATGGGATTTACCTTTAAGCTAGGGGCA
TTAATAGCGTATGCGGCAGTTCAGAATAAACTTGATGCGGCAGCAATTAT
TATGTATTTAGCATGCTGTTTTTGGGCAACCGGCTATGATACGATTTACG
GATATATGGATATAAAAGACGATAAGAAAATAGGAGTGAAATCTTTAAGC
ATATATTTAGAGAACAAGCATCCTAAATTTTGGCTTTATGTATGCTATAT
AGGTTTTATATTATTATTTATCTTAGCAACAAAGATAGCTAACAATAATA
GCGACTATTTACCTATTTTAGCTGCTTTAATTTTACTGATATTGCAAGTA
GCAACTCTTGATACCCGAAACCCAGCTGATTGTATGACAAGGTTCAGAGC
TAATAATTACGTTGGGCTGCTTTTAAGTTTAGTATTTTATTAA
>RF_1299 ubiD, UbiD family decarboxylases
ATGAGCTTTAAAGATTTACCGGAGTTTTTAAAATTTTTAGAAAAAAACGG
TGAGCTAAAGCGTATTTCTACCCCAGTTAAAACTGACCTAGAAATTACTG
AAATTAGTAGAAGAGTATTAGCACAAGGCGGACCTGCATTACTTTTTGAA
AATGTTATAAAAGCCGACGGCACTAAATCCGATATACCTGTTCTAACTAA
TCTTTATGCTAGTATAAATCGTATTTGTATGGGACTTAAACTTAAGTCAC
CCAAAGAATTAAGAGAACTTGGCGTTTTACTAGCATTTCTTAAGCAGCCA
CAACCTCCCGCATCTTTTAAAGAAACATTGTCGATGTTACCGCTAGCAAA
GCGTATTTTTGCTATGTCTCCTAAAACTATATCAAAAGCAGCTTGTCATG
AAGTCGTTGTTGATAAACCGAATATCAATATATTACCGATTCAAAAATGT
TGGCCTGATGATATTTCACCTTTAATTACTTGGGGTATAGTAGTTACTAA
AGGTCCAACAAAAGATAAGGTGGATAATTACAACCTTGGCATATATAGAA
TGCAGGTTATTTCGGAAAATAAATTATTAATGCGTTGGTTAAAGTTACGG
GGCGGAGCAGAGCATCATAAACGTTGGAAAGAAGCAAAAAAAGAGCCGTT
TCCCGCCGCTATCGTTATTGGGGCAAATCCCGCGGTAACTTTGGCAGCGG
TTACGCCGATACCTGAGAATATCTCGGAGTATAATTTTGCAGGTTTACTC
GGTAATGAAAAAATAGAGCTGGTGCAATGCAAAACTATTGACTTAAAAGT
ACCTGCACATAGTGAAATAGTGCTAGAAGGTTATGTAAGTTTAGAGGAAT
ATTTACCTGAAGGCCCTTTTGGGGATCATACCGGATATTATAATGATGTT
GAGGAGTTTCCGGTCTTTACCGTAACTGCAATAACGATGAAGAAAAATCC
AGTATATTTAAGTACCTATACCGGAAAACCGCCTGATGAGCCGTCAATCT
TAGGTGAAGCATTAAATGAAATCTTTATTCCTATCTTGCAGCAGCAATTT
CCGGAAATAGTCGATTTTTGGCTTCCACCTGAAGGTTGTTCATATAGAAT
TGCGGTAGTATCGATTAAAAAATCTTATCCCGGTCATGCTAAAAGAATAA
TGCTTGGGATTTGGTCGTACTTACGGCAATTTATGTATAGTAAGTTTATT
ATAGTTGTAGATGATGATATTGATGTTCGTAATTGGCAAGAAGTAATTTG
GGCAATAGCAACAAGAAGCGATCCAAGGCGTGATACGAGCTTTATAGATA
ATTCTCCTATAGATTATTTAGATTTTGCATCACCTGATTCAGGGCTTGGT
AGTAAAATGGGAATAGATGCAACCGATAAAATATACCCTGAGACAAATAG
AAAATGGGGTAAAAAAATAGAAATGAGTCAGGAAGTTATCGACAAGGTTG
ATAGTATGTGGGATGGTTTAAAGATATAA
>RF_0243 ubiE, Ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE
ATGAACCAAACAAATTTTGGCTTTAAAAAAGTAGACTACACTAAAAAACA
AGGGTTAGTAAATAGCGTTTTTTCTAATGTCGCTGATAAGTATGATTTAA
TGAATGACTTAATGAGCTTTGGATTACATCGCTTATGGAAAGATGAATTT
AGTAGGCAAATTCCAAATCTTAACTCTCATATATTAGACGTCGCTAGCGG
TAGCGGTGATATCGCTTTAAAGCTTGCTAAAAAAGCAAGAGATAGAGGCA
ATAATATTGCTTTAACTTTAAGCGATATAAATGAAGAGATGCTAAAGAAT
GCTAAGAAAAAAGCAATTGATCTTAATTTATTTCAGAACCTTAAATTTAC
TGTAGCAAGTGCAGAAGAATTGCCTTTTTCAGATAATAGTTTTGATTATT
ATACTATAGCATTTGGTATTAGAAACGTACCTGACATTAATAAAGCTTTA
AAAGAAGCTTATAGAGTTCTAAAACCGATGGGTAAGTTTATATGCCTTGA
GTTTTCAAAGGTAAAAGAAAGTTATTTTAAAGATTTTTATAAATTTTATT
CATTTAGTATTATACCTACCATCGGTCAGGCAATCACCGGTAATAAAGAG
GCATATGAATATTTGGTCGAAAGTATCGAGTTATTCCCCTCACAAGACGA
GTTTAGAATAATGCTTAAAGAAGCAGGATTTGAAGAAGTTAGTTATAAAA
ATTTGAGCGGCGGAATAGTTGCTATTCACAGTGCGTATAAGATATGA
>RF_0414 ubiG, Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase
ATGTCTTCAATCGATAAAAAAGAATTAGAAAAATTTGAGAAAATTTCTCA
TAATTGGTGGAATAAGGATGGGGAATTCGGTATCTTACACCGCATAAATC
CTATTCGCCTTGAATATATAATAGAGAAAATAACCTCGCATTACAACGAT
ATTTCTAAATTAGAAATATTAGATGTCGGTTGCGGTGGAGGATTAATTGC
AACGCCTTTAGCTGCTCAAGGTTTTAACGTTACAGCCATTGATGCACTAC
AAAGTAATATTGAAACGGCAAGCACTTATGCTAAGGAAAACGGCGTAAAA
GTAAATTATTTACAATCTACTATAGAAGAATTACAGAGTGACAAGCTATA
TGATGTAGTAATTTGTCTTGAGGTTATTGAGCATGTAGAAAACGTGCAGC
AATTTATACTAAATTTGGTGGGGCATATTAAGCCAAACGGTATGGCAATA
ATTTCTACGATTAACCGTACTAAAAAAGCTTATGTACTTGGAATAATAGT
TGCTGAATATGTTTTAGGTTGGGTGCCTAAAAACACTCATGATTATAGCA
AATTCCTAAAACCGTCGGAAATTTATGAAATGCTTACGGATACCGACATT
GAAATTAAAGAGCTGAAAGGCTTGGTATATGATCCTGCTAAAAATGAATG
GAAATTAAGCAACGATATAGACGTAAATTATTTTATGTGTTTGGGGAGAA
AGACGAACCGTCATTGCAAGGAAATTACGAAGTAA
>RF_0893 ubiH, 2-polyprenyl-6-methoxyphenol 4-hydroxylase
ATGAAGCAGATAAAAACAAAACAGATTGATATTATTATTTTAGGATGTGG
CTTGAGCGGTATGCTAACTGCACTTTCTTTTGCACAAAAGGGTATAAAAA
CTACTATATTCGAGAGTAAATCGGTAAAAAGCCCGGAGTTTTTTAAAGAC
ATAAGAACAACTGCTTTAACGCCGTATTCTAAAAATTTCTTATTCTCTAT
TGGTATATGGGAAGAGCTTGAAAAGTTTGTGGCAAAAATGCAAGATGTAT
ATGTGGTAGATAATAAGGCTTCAGAGATATTAGATTTACGAAATGACGAT
GACGCTGTACTTGGATATGTGGCTAAGAATAGTGACTTTAAAAAAATATT
ATTATCAAAAATAGCTAATAATCCTTTGATAACGTTAATTGATAATAAGC
AATATCAAGAAGTTATAAGCCATAATGGCTACTCAATTATAAAATTTAAT
GATAAACAAATTAAATGTAGTTTATTAATTATATGTGATGGAGCAAATTC
AAAAGTGAGATCTCATTACTTTGCTAATGAAATTGAGAAACCTTATCAAA
CTGCTCTTACATTTAATATTAAGCATAAAAATCCGCATGAAAATTGTGCT
ATGGAGCATTTCCTGCCGCTTGGTCCTTTTGCTTTGCTGCCTTTAAAAAA
TCAATATGCTTCATCCGTAATATGGTCAACTTCTTCTGATCAAGCTGCTT
TAATTGTTAATTTGCCTGTAGAAGAAGTTAGATTTTTAACTCAAAGAAAT
GCCGGTAATTCTTTAGGTAAAATTACTATTGATAGTGAGATTAGTAGTTT
TCCGCTAAAAGCTCGTATAGCAAATAGATATTTTCATAATAAGATAGTGC
TTATTGCCGACACTGCTCACACAGTACATCCTTTAGCAGGACAGGGGCTT
AATCAAGGTATAAAGGATATAGAGGTTTTGAGTATGATTGTTAGTAATAA
CGGTACATTACAAGAATATCAAAAGCTAAGGCAAGAGGATAATTTTATTA
TGTATAAGCTGACTGATGAGTTAAATAATATTTTTTCAAATTATTCTAAA
AATTTAAGATGTTTAAGACAAATAGGGTTTAAGGCGATAAATAATTTTAA
GCCTATTAAAAACTTGATTACTAGCTATGCGATGGGGAGACGATAA
>RF_0859 ubiX, 3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate carboxy-lyase
ATGAATAAAGATAAAAAAATTATTATAGCAATTTCCGGAGCATCAGGTGC
TATATACGGTATTCGTTTGCTTGAAGTACTAAAAGAACAAAATATCGAAA
CTCATTTAGTTATTTCAGAGGGAGCAGCTCTTACTATAAAGCTTGAAACT
AAATATTCTATAGATGAAGTTAAGTTTCTCGCTAATTATTATTATGATGA
TAAAGATTTAGGTTCTACTATTTCAAGCGGCTCTTTTAAAACTTCAGGCA
TGATAATAGCCCCTTGTAGTATGAAGACCTTAGCAAGTATCGCTCACTCA
ATGGAAGATAGTTTAATTAGTAGAGCAGCAGGTGTTGTACTTAAAGATAG
ACGGAAACTTATTTTAATGACCCGTGAAACGCCTTTGCATATTGGACATT
TAGAAAATATGTTAAAAGTAGCGAATTACGGCGGTATCATAGCACCGCCC
GTGCCGGCTTTTTATAATAATCCTAAAGCAATAGATGATATAGTAAATCA
TTCTATTACTAGAGTTTTAGATTTTTTCGATATTGAAACTAATTTAATTA
AACGCTGGGGGAGTTATAAGCAATAA