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COG category: Unclassified
Genomic element: Ti
Number of genes found: 72
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Agrobacterium tumefaciens str. C58 (Cereon), C58 | ||||||||
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Name | Locus tag | Product / Description | Genomic element | Type | Begin | Length | Strand | GC-content |
AGR_pTi_102 | AGR_pTi_102p | Ti | CDS | 94863 | 1188 | - | 0.520202 | |
AGR_pTi_103 | AGR_pTi_103p | Ti | CDS | 96284 | 717 | + | 0.601116 | |
AGR_pTi_104 | AGR_pTi_104p | Ti | CDS | 97009 | 585 | + | 0.601709 | |
AGR_pTi_107 | AGR_pTi_107p | Ti | CDS | 98601 | 489 | + | 0.515337 | |
AGR_pTi_108 | AGR_pTi_108p | Ti | CDS | 99118 | 393 | - | 0.577608 | |
AGR_pTi_112 | AGR_pTi_112p | Ti | CDS | 100645 | 165 | - | 0.539394 | |
AGR_pTi_115 | AGR_pTi_115p | Ti | CDS | 101762 | 276 | - | 0.554348 | |
AGR_pTi_157 | AGR_pTi_157p | Ti | CDS | 130397 | 630 | + | 0.630159 | |
AGR_pTi_172 | AGR_pTi_172p | Ti | CDS | 142685 | 753 | + | 0.626826 | |
AGR_pTi_179 | AGR_pTi_179p | Ti | CDS | 149764 | 414 | - | 0.60628 | |
AGR_pTi_180 | AGR_pTi_180p | Ti | CDS | 150283 | 1038 | + | 0.644509 | |
AGR_pTi_185 | AGR_pTi_185p | Ti | CDS | 152566 | 228 | - | 0.631579 | |
AGR_pTi_186 | AGR_pTi_186p | Ti | CDS | 152770 | 549 | + | 0.63388 | |
AGR_pTi_187 | AGR_pTi_187p | Ti | CDS | 153330 | 402 | + | 0.599503 | |
AGR_pTi_19 | AGR_pTi_19p | Ti | CDS | 15091 | 549 | + | 0.528233 | |
AGR_pTi_193 | AGR_pTi_193p | Ti | CDS | 161151 | 474 | + | 0.654008 | |
AGR_pTi_195 | AGR_pTi_195p | Ti | CDS | 161939 | 570 | + | 0.622807 | |
AGR_pTi_196 | AGR_pTi_196p | Ti | CDS | 162610 | 204 | + | 0.622549 | |
AGR_pTi_198 | AGR_pTi_198p | Ti | CDS | 162785 | 225 | + | 0.617778 | |
AGR_pTi_204 | AGR_pTi_204p | Ti | CDS | 163852 | 600 | + | 0.668333 | |
AGR_pTi_206 | AGR_pTi_206p | Ti | CDS | 164757 | 933 | + | 0.61522 | |
AGR_pTi_207 | AGR_pTi_207p | Ti | CDS | 165689 | 915 | + | 0.616393 | |
AGR_pTi_209 | AGR_pTi_209p | Ti | CDS | 166965 | 651 | + | 0.643625 | |
AGR_pTi_212 | AGR_pTi_212p | Ti | CDS | 168299 | 243 | - | 0.54321 | |
AGR_pTi_213 | AGR_pTi_213p | Ti | CDS | 168622 | 1407 | - | 0.574982 | |
AGR_pTi_214 | AGR_pTi_214p | Ti | CDS | 170091 | 870 | - | 0.554023 | |
AGR_pTi_216 | AGR_pTi_216p | Ti | CDS | 171611 | 285 | - | 0.607018 | |
AGR_pTi_217 | AGR_pTi_217p | Ti | CDS | 171988 | 357 | + | 0.633053 | |
AGR_pTi_219 | AGR_pTi_219p | Ti | CDS | 172663 | 171 | + | 0.614035 | |
AGR_pTi_22 | AGR_pTi_22p | Ti | CDS | 17028 | 2025 | + | 0.56 | |
AGR_pTi_224 | AGR_pTi_224p | Ti | CDS | 173549 | 336 | + | 0.592262 | |
AGR_pTi_226 | AGR_pTi_226p | Ti | CDS | 174257 | 399 | - | 0.593985 | |
AGR_pTi_234 | AGR_pTi_234p | Ti | CDS | 176615 | 246 | - | 0.621951 | |
AGR_pTi_24 | AGR_pTi_24p | Ti | CDS | 21244 | 2523 | + | 0.554102 | |
AGR_pTi_243 | AGR_pTi_243p | Ti | CDS | 182419 | 630 | + | 0.61746 | |
AGR_pTi_247 | AGR_pTi_247p | Ti | CDS | 185883 | 330 | - | 0.524242 | |
AGR_pTi_25 | AGR_pTi_25p | Ti | CDS | 24861 | 108 | + | 0.583333 | |
AGR_pTi_26 | AGR_pTi_26p | Ti | CDS | 25221 | 192 | + | 0.458333 | |
AGR_pTi_269 | AGR_pTi_269p | Ti | CDS | 199139 | 1008 | + | 0.541667 | |
AGR_pTi_277 | AGR_pTi_277p | Ti | CDS | 205892 | 939 | + | 0.510117 | |
AGR_pTi_278 | AGR_pTi_278p | Ti | CDS | 206911 | 138 | + | 0.492754 | |
AGR_pTi_28 | AGR_pTi_28p | Ti | CDS | 25426 | 1671 | + | 0.503291 | |
AGR_pTi_283 | AGR_pTi_283p | Ti | CDS | 209014 | 285 | - | 0.529825 | |
AGR_pTi_29 | AGR_pTi_29p | Ti | CDS | 27163 | 2055 | + | 0.522628 | |
AGR_pTi_291 | AGR_pTi_291p | Ti | CDS | 213955 | 171 | + | 0.502924 | |
AGR_pTi_3 | AGR_pTi_3p | Ti | CDS | 2987 | 798 | + | 0.562657 | |
AGR_pTi_30 | AGR_pTi_30p | Ti | CDS | 29647 | 330 | + | 0.618182 | |
AGR_pTi_39 | AGR_pTi_39p | Ti | CDS | 33790 | 1176 | - | 0.49915 | |
AGR_pTi_4 | AGR_pTi_4p | Ti | CDS | 3784 | 366 | + | 0.581967 | |
AGR_pTi_41 | AGR_pTi_41p | Ti | CDS | 36931 | 1611 | - | 0.500931 | |
AGR_pTi_42 | AGR_pTi_42p | Ti | CDS | 39542 | 732 | + | 0.493169 | |
AGR_pTi_43 | AGR_pTi_43p | Ti | CDS | 40981 | 696 | + | 0.50431 | |
AGR_pTi_45 | AGR_pTi_45p | Ti | CDS | 42155 | 945 | + | 0.504762 | |
AGR_pTi_51 | AGR_pTi_51p | Ti | CDS | 53978 | 561 | + | 0.486631 | |
AGR_pTi_55 | AGR_pTi_55p | Ti | CDS | 59495 | 1152 | - | 0.596354 | |
AGR_pTi_72 | AGR_pTi_72p | Ti | CDS | 76302 | 480 | - | 0.65625 | |
AGR_pTi_78 | AGR_pTi_78p | Ti | CDS | 79517 | 219 | - | 0.694064 | |
AGR_pTi_9 | AGR_pTi_9p | Ti | CDS | 6861 | 663 | + | 0.568627 | |
AGR_pTi_95 | AGR_pTi_95p | Ti | CDS | 88308 | 1320 | + | 0.584091 | |
AGR_pTi_98 | AGR_pTi_98p | Ti | CDS | 90860 | 1110 | + | 0.596396 | |
AGR_pTi_bx109 | AGR_pTi_bx109p | Ti | CDS | 161621 | 888 | + | 0.625 | |
AGR_pTi_bx125 | AGR_pTi_bx125p | Ti | CDS | 74617 | 360 | - | 0.569444 | |
AGR_pTi_bx129 | AGR_pTi_bx129p | Ti | CDS | 24143 | 327 | - | 0.544343 | |
AGR_pTi_bx139 | AGR_pTi_bx139p | Ti | CDS | 183574 | 309 | + | 0.546926 | |
AGR_pTi_bx142 | AGR_pTi_bx142p | Ti | CDS | 190339 | 297 | - | 0.575758 | |
AGR_pTi_bx147 | AGR_pTi_bx147p | Ti | CDS | 205080 | 270 | - | 0.540741 | |
AGR_pTi_bx162 | AGR_pTi_bx162p | Ti | CDS | 171567 | 1086 | - | 0.638122 | |
AGR_pTi_bx83 | AGR_pTi_bx83p | Ti | CDS | 46864 | 666 | + | 0.448949 | |
AGR_pTi_bx89 | AGR_pTi_bx89p | Ti | CDS | 35792 | 684 | + | 0.480994 | |
AGR_pTi_bx90 | AGR_pTi_bx90p | Ti | CDS | 97761 | 828 | + | 0.597826 | |
AGR_pTi_bx99 | AGR_pTi_bx99p | Ti | CDS | 55021 | 624 | - | 0.488782 | |
AGR_pTi_missing | AGR_pTi_missing in bx & glmr2p | Ti | CDS | 8547 | 168 | + | 0.553571 |