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Genomic element: pCpGP1

Number of genes found: 7

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# Chlamydophila caviae GPIC

>CCAA00003 virulence plasmid integrase pGP8-D
GTGCGTAAAGACAATTCACTGCATAAGAGTTTGGATACAGTGTTTGGGAA
TAAAGTTTACCAAAGCAACCTATCACATCAGGAACTTCTTTCTATTAGAA
ATGAACGTATTTGGGAAGGACTAAGAGATATTCAACTTTCGGAAGCTATT
TTCATATGGTTATCCTCTTTAAATAATCATACAGCCAGATCTTATAAAGG
ATCTGTTTTAGCATTAGAGAAAATAGGTTTGATTTCCTTGAACATATCCT
TACAAGAATTTGCTCTGCTAAACCACAACATTATCTTAGACTCAATAAAA
CAAGTGCCTATGAAGATAATTCCTTGGTCAGAAGGAACGAAACAAGTGCG
TGCAGCATGTTACATATCTCTAACAAAATTCCTAAACCGAGCAACGTCTG
GATTAATTTCTATAGCTCAACCATCACACCAAGAATCTAATAAAACATTC
TATAAAATTAGAGACTTAGTCAAAACAAATGCCATGAATGAGGTTGAGCG
GGTTATGTTTTTAAAAGCCTTAGAAAAAATTAATCACAGAGACTGGCTAA
TAGCTCAAACTATTCTTCAAGGGGCAAAACGCGTAACAGAAGCTTTATCT
GTTACCGTAGATAAGATTTCGTTTGAAAATGGGACTATATCTTTTGATCA
AAGTAAAAGTAGAGGTATGTCCAAAACAACCATTATAACTTATCCACAAC
GGTTCATGAGACTGATGCAAAACTATGTGGGAAATAGGTTGGGACTGGTT
TTTATAACTAAAACTGGAAAAAGTGTTGGTTTAAAACAACTAGCTGGAAC
TTTCGCAAAAGCTGGGGTAAAAGCACGTATACCATTTAAAGTTACGCCCC
ATGTTTTAAGAGCCACGGCAGTAACTGAGTACAAGAAAATGGGTTGTTCA
GATTCTGACATTATGAAAGTGACAGGCCACTCGTCTTCAAAAATGATATA
CGCTTATGACAAATCAACAACATCGGAAAACGCATCGAAAAAAGTTTCGT
TGATTTAG
>CCAA00001 virulence protein pGP6-D
GTGAGTAAATTAATTAAAGAAGCGTCTGCATTTTTTCAAAAAAATCAGGA
AAACACGGTAAAAGAATTCCACAAAAAAGAATTTGCTATGGATGTTTTCT
CGATTTCTCTAAGCGAAGATGAGAAAGAAAAAATAGAAAACTTAATTGTT
AGCCAACACGGAAATTTCGATGATGAATGTAGTCATGGATTAGCTTCTAT
TAAACTATTAACAGGGCAGATCAAGTCTATACAAAAACAACATGTTCTTT
TAATCGGAGAAAAAATTTATAAAGTTAGAGAGATTTTAAGAGCTATGAAT
TCACCTGATACAACATTTTCAGCGTGGATAAATCTTGTTTTTCACACCAA
ATCTTCTGCTTATAATGCTCTAGGATATTACGAGTTATTTATTAGTCTTC
CAGACAAAGATACTAAATCTTTGTTTCAATCAATACCGTATAAAACAGCT
TACTTATTAGCCTCTAGAAAAGGGTCTGTTAAAGATAAGGTTAAAGTCTT
AGGCAAAATTGAGGGAATGTCAAATACTGCAGCTATAGATATCTTAAATA
GGTTTTTACCTTCCTTGAGGGCTTCTCAAACAGAAAGATCGATAAACTTT
GAAGATAAGAACAAAGAATTATCAGAAAAACTAATGGAAATTCTAAAAAC
GGTGTGTTCCGGTTTAGAATTATCAGAGTACAACAAGAATTTGCTACAAC
AGCTCTTCGAGAAGACTCTACAAGCTAATTCCAGATGCTGA
>CCAA00005 virulence protein pGP2-D
ATGGTGAAATCAGAAAATCAGATAATTAAAAGCTCACTACATTTAGAGAA
CCAAAAATTTGGAAGAAAACCTCAGCTATCAGAAGATCAACTCGAACTAT
TTTCCAGTATTTGTACGGAATCTAAAATCGAAGTTATAGGATTAGATCTA
CAACCTTCTCATTATCATGCTTTAGCTGCTATTCAAAAACTTCTAACAGC
TACAAACTATAGAGGAAACCTAGAAGGATCCTACTTATCTAGAGAAACAA
ATACATTTAAGTTTGAAGGCACAATCCCAAGAATTAAATTTACCAAGGCA
GAATACCTAGAAGCTTATGGAGTGAAAAAATATAAGACTGCCAGAAATAA
GAATGAATTTGGTGGTAAAGAAGCGCTAATAGCCCTTGAAGCTTTGTATC
ACTTGGGAAACGAACCTTATTTGATAGTTGCTACAAGAAAGCGTTGGAAC
AAAGGAGAAGAGGTTGTTGATCGTTACCAAACGTTTTCTCCCATCTTACG
TATCTGTGAAGGCTGGGAAGGTCTAACTCCCAAAGAAAATAAAGCTTTGG
ATGAAGAACCTTTTCTTAACCTGATTTCTAAAAAACACAAAGGGTTCATC
ATAGAACCTTGTCCTATTATTGTAGATCAAATCGATTCCTATTTTGTTTT
GAAGCCTGCAAATATGTATCAAGAAATCAAGCTAAGATTTCCAAATGCTT
CAAAATTCACATACACATTCATAGATTGGATCGTCAGCACTGCAACAAGA
AAGAAAATGAATAGCTCGGGATTAAAAGAGTGGCCTGACAAAATAGAAAT
AGGGTTTGAAACCCTATCCTACACCTTAAGGATGAATCGGTATATTACTT
CTAGAAACTGGAAAAAAATAGAATCCGCTATTAATAGGTGTATCGAGATA
GCTATAGAGCTAAAATGGTTGAATAAACATGAAAGAATTCAAGGTAAAAC
CATTTCTAAAAAAGAAGTGTTTTATTTGAATAAAAGTAAATTTCAACAAA
TTTCAACAAATAAAACCATCCAAAACACAACAAACAATAATTAA
>CCAA00004 virulence plasmid replicative DNA helicase pGP1-D
ATGATAAAACAATCAGAGGAAGAGAGAGAACTATTAGATGTTGAGTTTTT
TGTTCTAGGACAAGCTGTTAATTATCTAGAACATGCGCATACAATTGTGC
GTAGGTTATCAGAGAATCATTTTAAATCAGAAAATCATAAGAACTTATTC
ATATTGATACGTGACATCTTAAGAGATAGGGATACGATTTCTATTTCTTT
GATTTGGGAGGAGATTAAAAGAAGAAATTTAGATAAACGCATGGATGTTT
CATATCTAATACATATGTCTCAAAATGCAGACATACCTATAGATCTAGAC
CACCATATTGATTTCTTACACGAAAAACATGTTAACAACCTTCTTAAAGA
ATTTTTAGACTCATCTTTTCAAGATTTCACAAGATATCCAAACAGACGTT
CACCGTTCACGCTTATAGATCAATTTAAAGAGCGTTTGGACGACATCCAT
AAAAAAACTTCATACCCTAGACGAAAAAATATAGGGAAAACGGTTTATGA
CATTTTTGCATCAGGTGATGATGGGAAGAACAGCGTTATATCTCAGATAC
GGCATAGGTATGACTATAGGTCAAGACATCAAATAGATTATGTTGATGGA
TTGTCTACAGGATACTCATCTATAGACGAGAACAGCATTATATTATCAAA
AGGAAACTTTGTTGTTGTCGCTGCAAGACCTGCCATGGGGAAAACAGCTT
TTGCTATAGATATAGCCCTTAATCTTGTTCTAGAACAGGAAAAGGCTGTG
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ATCAAATTTAAGCGAAATTTCATGCGAGCAATTAAAAAGAGGCAATTTCT
CTAGGGATGTCTTATCTAAAATAGAAAACATCGGTATGAGACTGAAAGGA
ACTCATTTTTTTATATGCGACAATAAAAGTACGGATTTAAATACTTTAAT
TGATCAAGCGCGAGAGTTGAGAGAAAATCAGGGTATAGATGCTTTATTTA
TAGATTACTTACAACTAATAGGATCAAACAAAAAGGCTGAGAATCGACAG
AATGAGATAGCTGAAATCTCGAGACAATTAAGAAAACTAGCAGGTGAGTT
ACAAATTCCTATTGTGTGTTTGTCTCAATTGTCAAGAAAAGTAGAAGACC
GTGGGGATAAAAGACCAATGTTATCTGACCTTAGAGATAGTGGTCAGATA
GAACAAGATGCGGATGTAATATTATTCTTACATAGAAAAGATTATTATTC
ACAAGAAGCTACAAAAGGACTTTCAGAAATCATCATCGGTAAAAATAGAC
ACGGTTCTGTATTTTCAACCAATTTAAGATTTAATTCATCTACAGGAAAA
TTCTCAGTTCAGAAAGAAGCATGGTGA
>CCAA00007 virulence protein pGP4-D
ATGAATGATAAACAGAATATGACTAACGATTTTATCAAAATTGTGAAAGA
TGTTGAGAAAGATTTCCCAGAACTAGATATCAAAATGAAGGTGCATAAGG
AAAAAATTACTTTTTTAAATTCTCCTTTAGAATTGTATCACAAAAGTATC
TCCGTTATTCTAAACCTGCTTAATCAAATACAAACATCTTTAGGTTTGTT
CCCCGACTCTCCTATAGTCGAACAAATGGAACATAGTAATTTAAAGCTGA
AAAAAGCTTTGATCATGTTGATTTTATCAAGAAAAGATATGTTCTCAAAA
GCTGAATAA
>CCAA00002 virulence plasmid integrase pGP7-D
ATGAGCGGTTTGAGTCACTATCATAAGAGTAGATTATTTCTAACAATTCT
AGAAGCAGCTAATGTATGGTTGGCCACTTTATCTCCTATTACAAGAAAGA
ACTATGCTTCGGGAATCAAGTTTCTAGTTTCTAATAATATATTAGATGGT
TCTATGAAGTTAGAAAGTTTAATCTGTTTCGATCATTGTGATGTTCTAAA
CAAGATAAAGTCTTTAACTTATACTTATACAGGTAAGACTGTTTCTGAAG
CTTCAAAACAAGCTAGAGCAGCTTGTTATATCTCTTTTACTAAATTTCTT
TATCGATTGACCAAAGGAGTTGTTAAGCAGGCATGCCCTTCTAGAGATTT
CGGAAATTCTACATTTTATAAAATTAGAGACAAGGTTAAGACAGAGTTTA
TTTCTAAGAAAGAATGGTTGTTATTTTTCGATTCTTTAAAAAGAATTAGT
TTTAGAGATTATCTGATAGGTAAATTAATCATTCAAGGCGTTAGGAAGTT
AAGTGAAGTTATTTCCTTAAGAACTGAGGATTTGTCTTTTGCTCAGAATC
AGGTCACCTTCAAAGTTAAAAAACGACAAAACAGATACCAAGAAGTTAAA
GTAAGCTATCCTAATTTCTTAATGCAGGAATTACGATCTTATCTTGGAAA
TAGAGAGGGTTGGGTTTTTATTTCTAGAGAGGGGGAGCAGGTAGCAATTA
ATCAGGTGTATTATTATTTCAAATTGGCTGAGAGTGATATTAATTCACCT
ATTAAAGTTACACCCCATGTTTTAAGAGCTAGTGCTTTAGCTTATTTGAA
AAAGATGGGTTTTGCTGATCAAGAAATAATGCGGATATCTTGTTTATCTT
CGACTCAAATGCTATCAGCATACGATACAGGTATGACTGACAATTTAACA
TCGCAACTGCCTTTAATATTTTAA
>CCAA00006 virulence protein pGP3-D
ATGGGTAATTCTGGTTTTTACTTAAACAACAACCAAAACTGTGTATTCGC
AGACAATATTAAAGTTGGTCAAATGCAAAACCCTTTGCAGGATCAACAAC
TTATACTTGGAACAACCTCCACACCAACAGCTGCAAAAATAACCGCTAAA
GAAGGTCTCAAAGTAGACTTTGAGACTGCAGATAGCAATAATGCTTCTAT
AAATTTATCAGTAGACTCTGATGCTCTATCAAAACTAATCTTAGATCAAA
TACAGAAGGATTTAGTAGACGCTATTATCGGGAATATAACAAATAGCTTG
ATACAAGAAGTTATAGATAAAATAATCTCTGATCCAACTCTAGCTTTAAC
TAAAGCTTTTAAGAACTTCTCTATATCAGACAAGATTCAGTGTAATGGAT
TGTTCACAAAAACTAATATTGGAACTCTTCTCGGGGGGACTGAGATTGGT
ACATTTACTATTACACCAGACAATGCTGATAGTATGTTCCTAATTTCTGC
CGATATCATCGCCTCTAGAATGGAAGGGAATGTTGTCCTAGCTCTAGTTA
AGGAAGGTGATTCTGCTCCTTGCGCTGTTAGTTATGGTTATTCATCTGGC
ATACCTAATGTTTGTTCATTAAGAACAGCCGTAAGCAATTCTGGAGCAAA
TCCAGTTACATTCTCATTAAGAGTAGGCGGAATGGAAAGTGGTGTAGTTT
GGGTTAACGCATTAGCAAATGGTGATTCTATCTTAGGGACAACAACAACA
TCGAATATATCGTTCTTAGAAGTCAAACAACAAACAAACGGTTAA