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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_pd58 Transposase
TTGGTTGGTATAGATATTGCAAAAAGAATTTTTCAAATTCATGGTGTAGA
TAAAAATGGTAATACGGTATTAAAGAAAAAATTGATGAGAGAACAGATTT
TAACATTTATGGCTAATTTGCCAAAATGTTTAGTGGGGACGGAAGCTTGT
GGTGGAGCTAGTTGGGCAAGAGAAATAACTAAATTGGATCATACAGTAAA
ACTGATGGCACCACAATTTGTCAAACCGTATGTCAAAACTAATAAAAACG
ATCAAGCTGATGCTGAAGCTATATGTGAAGCAGTAGCAGACCAAATATGA
>RF_pd60 hypothetical protein
TTGTCAGTAGGACGAAAAAATTGGCTTTTTGCTGGATCAGACAGTGGCGG
TCATACTGCCTCTATTATTTATTCCATTATCAAAACTGCTAAATTAAATC
ACATCAATCTTTGGAAATATTTACAAAAAGTACTTGCAATAATTCAGGAT
TATAGAGCTAATAAAGTTGAAGATCTCCTTCCCTGGAATATTTTACTAGA
TTAA
>RF_pd42 Ankyrin repeat
ATGCATCACTTAATTGATCAACTTAAATCTAAAAATAATATTTTCTATAT
AAGAGCACTAGTACCAATGATCGTGCTTTGTGTTTTATTAATTAGTAAGA
CAGTTTATGGATATGATACAAAATTAGAGCATTTATGTAAGGCTATCAGT
AATAACAATATAGACCTCGTAAAACAGGCTCAACAAAAATCACAATATAA
TCAACGATGTATCCAAGAGCGTGAAACACCTTTGATATTAGCCATCAGCA
ACAATAATATTAAAGTAGTACAAATGCTATTAGATTTTGGAGTTGATATA
GAACAAGAAGGACGATACGGTGGAGCAGCTCTATATAATGCTATTTGTCA
TGATACAAATATAGTGAAATTACTAATAAAGCATGGTGCAAATATAAATA
AACGCCTATCTGAGGGTAGTAGAGAAACGCCTTTAATAAAAGCTACTAAG
TGTTTTGAGAATGGTAGTATCGCTAACACAGAACATATTAAAATATTGCT
TAAGTATGGAGCTGATATAAATGCGAAAGATGTAAATGGTATTACAGCAT
TAAAAATGGCTGAGATGCAAAATGATCAAAGTGCAATCAATTTATTACGT
TCCTCTGGCAAAAAGTAA
>RF_pd07 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
TTGAGTCCTATTGAAACTTTGGTAAAACCATCAATTTTGAACACTATTGT
AGCAAAATTAGATGATTTACATTTATCAGCAACGCATAGTGACATAAAAG
GTGATGCTTTTGAATATTTTCTACGAAATTATGGAGGAGCTGATACTGAT
TTTGGCGAGTATTTCACTCCAAGACATATAGTAACTGCTTTGGTCAATTT
GCTAGACCCCAAGTTTGGTGAGAAAGTTTACGATCCATTTTGTGGTACTG
GAGGTATGCTTATTACATCGTATAAGCATATTTACGATAATTTAAGTTTA
AGAACACCGGAAAACATACAAAGATTAAAAAAACAGACTGTTTATGGCGG
GGAAATCACTAAGATGTATCGTATTGCTAAAATGAATATGATATTAGCAG
GAGATGGACATAGCAATATCGTAAGACAAAATAGTTATGGTACCCCTGAT
ACTATAAAGCAAATAGATGTTATTAAAGATGGTTTTGTTACTAAAGAGAA
TATAAAGATAAAATACGATGTAGTAATTAGCAATATGCCTTTTGGTCGTA
AAATGAAGACAGAGCATGCAGGGCTGTATGGTTTTAATACTAGATCAGCT
GAAATTACAGGAGTTTTACACTGTTTAAATTCATTAAATAATAATGAAAA
TGCAAGATTAGGCTTAATAGTTCCTGAGGGCATTTTGTTTGATAAAAGAG
AGCTGATAAGTATTAGGTCTATATCTTTGTCTGATGCCTTAATCTCCTCT
TCGTCTCCAGTAAATTTGTATATATGTTTAGTGATATTATTAATATTATC
ACTAATTCTTTGTGTGTTGCCGTTATCACCAATTACGGCTATACTTCTCT
CAGCTTCCTCTTCCATACTCATAGCAGCTACACCAAGAATGATATTGCTA
CTATTTCTTATCATCAGCTCATCTATTAACTTCTTGGTTCTTGATAATGC
TGTTAATCTAACTAGTAAACACTATAATATTAATTGGATATGTTATTAA
>RF_pd63 unknown
ATGGGCGGCAGTAACGCTGCTGATAGAGTCAATTGGAGTCAGCTTCAGTT
TCAGTGGCGGGATGCAATAATATGGCCTGATAATGATCAGCCAGGCTTTA
AAGCAGCAGAGGTGATAAAGGACAAGATTAACAAGGCAAATGAGCATATA
GGTTTTGTAAGCGTAGTTGATCCAAGAAGACTACAATTTGGCGGCAGTAC
TCACAAAGACTTATTGCCTGAGAAGTGGGATCAAGAAAAATCAAGTCATT
ATATTAAATATTTAGAGGCGACAGGTAAGGGCGGCGTAGCACATGATTAT
TTAAAATATGACTCAATAATGTATCAAGATATATTAACTAGTCTTGCGAT
GCGTGACGAGCGTTTAAGCAAAAGTATCAAGGAGTTAAGTGATAGCAACA
ATACTTCTGATATTGAGACTATAGAGCATCGAACTAAGTTAATAGATGAT
ACGCAAAATCTATACGAGAAAAAAGCGTTAGAATATAGCGGTATCGCAGG
TACAAATGTAGTATACAGAGGTCATTTGGAACTGATGGTGAAAAACTATG
GTGAATCACATGAGAAAGTAACATGA
>RF_pd01 Transposase
ATGCCATACAAAGAAAGAGCAAAAACAGGTTTACCAAGAAATGTAGATAA
ACCAAAATATAAAGTAACCAACTGGTCGCAATATAACAAGAGTTTAAGAC
AAAGAGGGATGATCAGCCTGTATTTTCCTGAAGGCGATTTAGAGTCTTTA
TTCATTAATGTCGAACCTTACGTAGAGGGAGAATCTGGGAGGGCAACGAC
ATACCAAGTACCATATATACAACTAATTTATACATTATATCGTTTATTTG
GTTTCGGACAGCGTCAAATAACAGGTTACTTGTGGTTTATTTTCGCAGAC
TCTATTAGAGGTCAAACAGTTTTGCAATAA
>RF_pd39 Conjugative transfer protein TraA_Ti
ATGGAACGGAGCAGAAGCAAGAGAAAAAGAGCGGATTCTAGGACTGCATC
AGAAATAGAATTTTCACTACCACGTGAAGTAAGTAAGGAACTAAATATTA
GTTTGGTAGAAAAATATGTGAATGAGTATATAGTCGCAAGAGGAGTTGTA
TGTGATGTAAATATTCATTACGATAATCCTGATAATCCACATGTACATAT
TCAATATTTAACTAGAAAATTAGAGCGATTAGAGAATGGCGAAGTAGTAC
TTGGAAAAACAAAAAATAGAGAATTAGAAAGTACGAAGTTTTTATATTTT
TTGCGGGACAGGTGCGAGATAGAAATCAACAAAGTATATGAGGAAGCAGG
GTTACCATATAGAGTAACAGCTAAGTCATTTGAAACGCTTGGAATAGATC
AAATACCAAAGCTTCATATAGGACCAGCTCATCATATGCCTGCAACTGAG
CTTGAAGCAAAAAACAAAGAGATCATAGCTGAGAATGCAAAGAAGATATA
TGAGAGTCCTGAAATAGTATTTGGTCGCATTTCGTACACGAAACCAGTGT
TTACTAAAGAAGATATAGCTATAGCATTATCTGACGCTCTAATGGTGCAT
TTAGTATCAAAAGGAAGTGATATTGCAAAAGAGCAAGAGGCTATTAGAGC
ATTTGGTAAGGGCTTAGTAAATGAGCAAGCAGGTGATGGAAATACAGAAC
AAAATATAGTGAATGATGCAGTAGGAACTGCGGCAGGAGGTGGAGCAGAG
AATACAGATAGTAGCCAAGTAAAAGAGACCACTAACAACCCAGCTATCGA
GCATTTAAACAAGGAATATGGCGAGGAGTTTTTACGGCTTTACAATCAGC
TACTTGTATCTGACAAGATAGAGTTGATGGATCAGAAAGATTTGATGGGA
AGAACGCTATATTCCCTAAAATCAAGAGTAAATCTAGAACGTCGTTATGT
ATCTGCTATAGAGGAGTTAAATACTAAAGGCGAACATAAGCTGAATATTT
TAGATAACACTATTGGAGAGAGAAACAGTCTTAAGGAACAAATAGGTGAT
TTAGTAAATGTAGTAGGAGCAAACCTACAAAATAAGTTTAATGATAAGCT
AGGCAGTGGTTTAGGCTTAAAGCTTAATGTTTTTGGCAGCAAGAAGCATG
CATTTAGTGATGAGCAAATCAAAGCAATCCTCTCAGTCTGTAGTGGCTCT
GATATTAGTGTACTTGAAGGAAATCCCGGAGCTGGTAAGACTTTTGTGAT
GAAAGAGATAGTGCGTCAGTACAAAGCGGCAGGATTTAAGGTAGTAGGTA
CTGGACCAAGTAGTGTATCTGCTAAGGTTTTAAGTCGTAATGCTGGAATT
AAGGCAGATAATACGAGTTTGCTACGTAAGAAAATCGTAGAGTCCAAAGG
AGGCGACTTTAAGATAGATTTAAGCAGCAAATATTATGAGGAGGAGGAAT
ATTTAAAATCTATTGGTTGTGATTCGATTTTGAACTTTTTACGTTCTGAT
GTACTTGATAGTAAGACTGTATTGATCGTTGATGAGGCAAGCATGATTGA
GCTTGCTAATATGGACTATCTAGCTCACGAGGTCTTAAGGTCTAAGGCAA
AGCTAGTACTTGTTGGAGATAACAACCAGTTTACAGCTGTTGGTATGACT
GGAGCGTTTAACAAAGCACGTAAGATTGCAGGAGGAGTTAAGCTTACTGA
AGTAAGAAGACAGGAAAGAGTAGAGTACAGGCAGGCGACGAGAGCTATGG
GACGCTTTGCCATGCAGGAAGCCATTGAGATATATAGAAAATTAGACGTA
TTTAACATTAAGGATAATGAGCAGGAAGCTAAAACTAGCTTAGTTACGTC
ATTTGCTAAAGAATATACTGAGCAGATAGATAATCTTAAGAGAGATGATT
TAATAGCGATTAGAAGTATAGCAATTGGAGCATATACGAACGAGAAGGTA
GCTGATAACACAAGAGTAAGAAGTGAGCTAAAGCATAGCGGAGCATTAAA
GGGAACTGAAGTACAAATTAGCAGTGGCGGGCGAATGCTGTCGCTGATGA
AAGGCGACCGAATAGTATTTGAAGAGAATAGTTTAAGATACGGGATTAGT
AATGGAGAAGTAGGAACAATATTATCAGTCAAGCCTTCGGTTAAATCGTT
TAGTGGTGGTGCGAGTAGTAAAGGTGAGAGTGATGGCGACGGATTACTTA
AAATATTAGTCCATAAAGCAGATGGCTCAAAGGATATAATAAATATTGAT
ACTGCTTCTGACGCTGCAAATAATAAGTGGAGGATTAAATTAAATCATGG
ATACGCATTAACTGGTTACAAGTTACAAGGTGAGACGGTAGACCGAATGC
ATGTATATTTTGACCGCTCTATTGGATATGAGGCGTTTTTGGTGCTCATG
TCACGTCATAGAGAAGAGGTTAAGCTTCATGCGTCCGCAGAGGAGCTTGA
AAATATAGTGTATCAGCGTCTTGATAGTGATGTAGAGAAAGTTAGAAATC
AGTTCAAGATTAACAGCTATGAGATGCGAGATGAGACGCGTATTAATTCT
GCAGGGGAAGAATATACAGTTCAAGTAAAGGAAGAGATACCTAACTGGCT
AATCGGCTTAACTCTTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAATAATAGCTTTGCAA
TAGACTATGGAAAGGGTGGTACTTTAGAAGGCAGTCAGCTAATCATCAAG
GAGTATTTAGAAGCACGGGGGTGA
>RF_pd41 Transposase
ATGAATAACAAAAATATACCAAAAGATTATAGCGAAGTAAGCGTAGCCGA
CACTAAAGCAAGTAATCGTCACCATGAGCAAGTAGACTTGGATAGTCACA
ACACTTCCGAGCGTCCAAGGCATGATGCTCTTATTCGCAAAGCTCTAGAG
AACCCACTAGTTGCCAAAGAGTTCTTTGAGATGCATCTGCCAAAAGAAAT
TAAAGCTATGTTCTCTTCTCATACTCTGAAGATGGAGAAAGAAAGCTTTG
TTGAAGCAGATCTAAAGCACTCTATATCTGATATCCTATTCTCAGCTAAG
TTTAAAGATAATACTGGATATCTTTGGGTTCTACTAGAGCATCAAAGTAC
TCCTGATCACTTCATGGCTTTTAGGCTATTTAAGTATATGACGGATATTG
CATCAAGGCATTTAACTCTTAATCCTAAATCTAAACATCTGCCTTTTGTA
TATCCATTAGTGTTCTACAATGGCAAAAAGAAATATAATGCTCCAAAGAA
TATCTGGGATCTATGCCAGCATAAAGAACTAATGCAAGATATTTGGACTA
AAGACCATAAGGTAGTAAATGTTCATGATATTCCTGATGAAGAATTAAAG
AAGAAAGCTTGGGCAGGAATACTACAATTCTTCATGAAACATATCCATGA
AAGAGACTTACTTAAAAGATGGTATGAGGTAGCTGATCTATTACCTGAAT
TTGCCAAACTTAATATTGGTATTGATTACCTAGAACTGATATTAACCTAT
ACATTGATTAAGATTGAGAAATCTGATAAAATAGAGTTAGAAAAATTATT
AAAATCTCGTCTTAATACCGAACAAGGAGAAAAACTTATGACTAGCTTAG
CTCATCATTGGGAACAACAAGGTGTAGAAAAAGGCATGCAGATTGGAGAA
GCTAAAGGCATGCAGATTGGTAGAAATGAAGGAAAGCATGAAAAAACTAT
AGAAGTAGCTAAAAATATGCTTTCTAATAATTACTCTATTCCTGAGGTTT
CTCGTATTACTGGTTTGTCTATCGCTGAAATTAACGATCTCCTTAAATCT
TAA
>RF_pd02 unknown
ATGAGTCCAAATCCAGATTTTATCACTATTGTGAAAATAGCAAATTATTT
TAATTGTGCGGTTGATCAAGTAGTGGGTAGACGCAAATTTTTACCTTCAA
TAAATTTAATAGTATCTTTTAATAATCCAGACTTAAATGACATAAATTCT
AATCTCTGTAATTTTTTAAAAGCAAAATTATCTCAAGATAATATATCACC
TTATTTATTAAGCAAAAATATTGGTTTTAGTAAAAAAATAATACATTGTT
TTTTAAAAGCAAACTCTCCTTATAAAATGCTTAGCACTAATGTTATTATC
GCACTTGCTGATTATTTTAATGTCTCTGTAGACGATATGATAGAACGATA
TCCTACAACCAAACAATAA
>RF_pd64 Transposase
GTGACTTATAGTATGAGTTGGATTATACTAAATGAAAAACTTATGGCAAA
GGCATATTCATACGATTTAAGAATACGAGTAATAAAAAGTTTAACAGAAG
GTAAAACAATAAAAGAGACTTCTGAGATATACTCTATTAGTAGGAAGACT
ATAATAGAGTGGAAAGAATTAAAGAAACAAACTGGGGATGTCAAAGCAAA
AAGTGGTTATCATACAGGACATCGTAGAATAATAAGAGACATAGAGGGAT
TTAAAAAATTTATAGAATTAAATTTTGATAAAACCACCATGGAGCTAGCT
AATAACTGA
>RF_pd43 Putative conjugative transfer protein TraD_F
TTGCTCCGAATCACTACATATTCAAGTAACTCAGAATTTGCCAAAGCATT
TGAGAATACTGCAGTTGCAGGAATGATAAATAACTCAGCTCCTGAGACTT
CTACTGGCGTACAAGCAACGCTTAGCAAGAATATCGCAGCTTTAAAGCAT
CTAGCCCCCATAAGGGATTTTTCAATTAGACAGTGGTGTAATGACGAAGA
AAACAAAAGCTGGTTATTTTTAACGGCACTTCCTAGCCAAAGAGCAACAC
TTAGCCCTTTATTATCTGCTTGGATTAGTGTGGCTTTAAAGTCATTAATG
AGCAGAGATATAGGAAGCACAGTAGAGAATCTTTGGTTTATTATGGATGA
GCTGCCTGCTCTTGGTAAAATCAATAGCTTAAATACAGCTCTTGCAGAAA
GCAGAAAATATGGCGGATGCTTTGTTGCAGGTATTCAGAACATATTTCAG
CTTGATAAAATATATGGCTCTGCTGCAGCTAATGATTTACTTGATTTGTT
TAATTCAAAGTTCATTTTTCGTGTTGGCGATCAGCAAACAGCACATAGAT
CGGCAATGATGCTAGGTGAGCAAGAAATACGCAAAACCCAAGAAAGTCTA
TCGTATGGCTCAAACACCATAAGAGATGGTGTTAATATCAATACTATAGA
ACAAAAGAAGATGCAGGTATTACCTGCTGAAATCATGTCTCTACCTAACT
TATCGTGTTTTGTAAAGTTAGCGGGACATTATCCGATTTCTAAATTGAAG
ATGAAATGGCAGAATTGA
>RF_pd49 Integrase
ATGAACTTAAATCAAAAAATAATAAAGTCAAAATTAGGTTTACTAGAATT
AGCTAAGAGTCTTGGTAGTATATCATCAGCATGTAAAGCGATGGGATATA
GTAGAGATAGTTATTACAGATTTAAAGAACTATATGAAACTGGTGGTGAA
GAAGCGTTATATGAAATTAGTCGAAGAAAGCCAATGAGTTGA
>RF_pd09 unknown
ATGAGCTCATTGATACATGTTACAATAATCACAATAATATTATATGTGCC
TAAAAATAAGCATATTACTATTTCAGATCTGAGTATATATGATGGGATAA
CACTCGTTCCTAAAAGCGGTGTATATAGCAAAATGGATGAGACTCGTGTA
TTTAATAAAGAGGCATTTGAAACCATTGAACTAGAAATCAATCCTCCCGA
CACCTCAAGCAATGCTTCGGATGATTCAGATGGTATTTCATCTACTTCGG
ATCAGCTGTCTAGCGATTCTTCAAGCGTTTTATGCAGTTCTTGCTGTAGT
TCTTTAGATATTTCAGATTTTTTATCATCTGATGATGATATGGACCTGAC
GGGTAACAATGCCGCTGATTTAGCAAATAACTAA
>RF_pd45 unknown
ATGTTATTTCAAATACTTCCAATATTTTGGATTATCGCTATTTGCGCTAA
AATACCGATGACAAAAAAACTTATTATGAAATTCCCAATTATTTCTAAAA
TATGGTTAATGCTACTAAAATTTATAAAGGACTTAGATATCAAGGGCATG
TATTCAAGCCCTAATAATTTAACTGGTTTTAGTTCAGATATGGGTAATCA
TAGAAGAGATGATGAACGATCTACCAGTCCGTCATATTTTTATTTGCCAT
ATAACATATACTATGAATCTGATAAATAG
>RF_pd54 Transposase
TTGGTAGTAAAAGTACGTCAAGATAAGCGGATTATCAACAAATCAGTATA
TGTTGCCTTAGGCATTGATTTAGAAGGGCGGAAAGATATTTTAGGACTGT
GGATCAGCGAGAATGAAGAGGCTAAATTTTGGCTTGGTAATTTTACTGAG
ATGAAAAATAGAGGTATGCAAGACATACTGATAGCATGTAGTGATAATCT
TAACGGTATGTCTGAAGCTATAGGTGCTGTTTTTCCAAAGACAGAGCATC
AATTATGTATTGTACATCAAATTAGAAATAGTTTACGATATGTATCATAT
AAGGACCGGAAAGAGCTTGCTGGTGATTTAAAACCTATTTATACAGCTAA
CACAGAAAAAGAAGCACTTTCCGCTTTAGAGGCTTTTGAATCTAAATGGA
GTAAACAATATCCTCAAATTGCTAAATCTTGGTATATTCATTGGGATAAT
CTAATGATTTTAGGATATCCTGAAGAAATAAGGAAAATAATTTATACAAC
AAATGCTGTGGAATCCGTTAATAGTCAACTCCGAAAAGTTACAAAAAATA
AACGTCTTTTTCCAAATGATAATGCTGTTTTTAAAAGCTTATATTTAGCA
ATTGACTACATGACCAAAAAATGGTCCATGCCTATCCCAAATTGGAATGC
GGCTATGGCTCATTTTTTAATAAAATTTGAAGAAAGAATCTAG
>RF_pd47 Conjugative transfer protein TraG
ATGGTACTTCCACTAACTTGCCTTGTAGGCGGTTTTAAGTTCTTTCAGTT
TTGGTGTAACTTTACAATATGGGTATCATCATGGCCAATATTTTACTCAC
TAGTGCATTGTTTAGGTATGTTATCATTATCAGGCAAGGTCAGCGTATTT
GGTGGTAATGGCATGAGCATCTTGTCACAAGGCTCATATTCTGAATATGC
ATTAAATACTTATGCAACATATCAGATGCTTGAATGTTTAGTGCCGCCTT
TATCTTGGGCGTTATTTAAAGCTTGCTCGCATGGTATGTCTATGCTTGCA
GGTCAGTTCTCGCCGCTTTCTGTTGCAAGTAGCGTTGCTGCAGGAATTGC
TGATAATAACCTCAGCATGGATAATGTAAGTATTGGTAATAGAACAATAT
CGCAGCAGAATCTAGCTCCATCTTTAATGATGGCAGACAGTTCATTACAG
AAAGCGTTGATACACTGA
>RF_pd55 Transposase
GTGTGTAAATTTCTCAAAGGTTATATAAAAGAAAATATAACAAAAAGAGG
GATTACAATGCCACAGAAACAAAATGCTGCAATGAATCAAGCGATAGATT
TATTGATCAATAATGATACAGATGTATCAACTTTATTCAAGGAAGATGGT
TTATTAAAAGAACTAACCAAGCACCTTGTAGAGAAAGCACTACAGTCTGA
GATGAATAATCATTTAGGATATAGCAAGTATAATCAAAGTGATGCCCAGA
ATTCACGTAATGGTTATAACACAAAGAATCTGATTACAAAGAATGGTGCT
GTTGAGATTGAAGTGCCAAGAGATAGAAATAGTAGCTTTGAACCATCATT
AGTAGCGAAGCGTCAAAGAAGACTTGATGGTTTTGATGATAAAGTACTAT
CCTTATATGCTAAAGGGATGAGTTTATCAGATATAAAATTACAGCTTCAG
GAGTTATATGGAGCTGATGTAAGCGAGAGCTTAATCGTAGGATTACAGAT
GATATAA
>RF_pd04 unknown
ATGCATAAATCTAAAATAAATCCGTTAGTAGAAAGTAAGCTTTCAAAAAC
TGTTGCAAAAATAATTTCAGAAAAACCTATAGAAAAAAGTGGATTTATTA
CCTCATCCAATAATAAAACAACTCATTATAAAACAAAAACCTTTCGTTTA
AGACAGCTAGATGCAGAAAACCTTATAAAAATTATTAAAGCTGTGAATCA
TTATAATCATAGAAAAACATATTCAGATTCCGAAGTTATTAGGGGTTTGA
TTAATTTCATATCAGATAATTTAGATACTAATATAAAAAAATTAACTAGT
TATATTAATTCTTCCTCATAA
>RF_pd66 Site-specific recombinases
ATGGCAAAAGTTGGATATGCACGCGTTAGTTCATTAGGTCAATTACTCAG
CATCCAATTAGATAAATTAAAAGATTGTGATAAAATATTTCAAGAAAAGA
AATCCGGTCTTGATGGAACAAGAAGTGCATTAAAAAATGCACTGGATTAT
GTACGTGAGGGCGATATCTTTATTGTTACAAAATTAGATAGGTTAGCACG
CTCTACTGCACATCTATGCAAAATAGCCGAGATTTTAAATCAGAAATCTG
TGGCTCTGAAAGTTTTAGATCAAAATATCGATACTAAAGATGCGACTGGT
CGGTTAATATTTAATGTGTTAGGAGCGATCGGACAATTTGAAACTGAGAT
TAGAGCCGAGAGGCAAATAGATGGAATCCTAAAAGCAAAAGAGCGAGGTA
TACAGTTTGGGAAGAAACAATACTTAACAAAGCAACAATTAAATGATCTT
AAAGAAAAACGAAAACAAGGTATTAAAATCAAAAACCTGATGCAAGAATT
CAATTTATCAAAAGCCTCAATATATCGCTATCTTGCACAGGAAGTATAA
>RF_pd57 Transposase
ATGAGGTTTGTACCAATTAAAACTGTAGAACAACAAGATATTTTATCAAT
TCATAGAGTAAGAGAGAGATTGATAAAAAATCGTACGGCACTTGCTAATG
AAATTAGGGGTCTACTACATGAATTTGGTTTTATTATTCCTCAAGGGATA
AATAAGGTTATGACAAAATTAACCGAAATTTTAGATGAAGGAAATTTAAG
CCAGCTAGGTTATCAAACATTTAGTGAACTGAAAGAGGAGTTTTTGGATA
ATAATAAAAAAATAAAAGAGATAGAAAAAAGATTAAAAATAATCACTAGC
AACCTAACTCAATATCAACGATTAACAACTATACCTGGTCTTGGTTTAAT
TACTGCTACTGCTTTAATAGCATCAATAGGTAGTGCTACAAATTTTGACA
ATGGCAGGCAATTATCGGCATGGCTAGGATTAGTGCCAAGACAACATTCA
AGTGGTGGAAAAGATAAGCTGTTTGGAATTAGCAAGCGAGGTGATGTATA
CTTACGCACTTTATTAATTCAGGGGGCTAGAGCTGTACTAAATGCCAAGA
TAAGATTCACATCGGAAGAACAGAAATCTAAAAAAGATTTTAGCAAATTT
ACGCAATGGATGTTTAATTTATCTGAGCGAAGTGGTCATAATAAAACAAC
AGTTGCCATAGCTAATAAATTGGCAAGAGTTGTGTTTGCCGTACTCAGAT
CAGGAGATGATTATGTGGAGAGTAAAGTTTGCAGCTAA
>gid:882714    
CAGCATATTTTACAAAGTTTCAGACAAGATGAAGTTAAAGGTGAGTCTAC
ACGGCGTATAAAAATACGTGAGTACAGACGAGACCTGAAAAATTCGTTTG
TATCAAGCTTTGTGAA
>RF_pd53 DNA polymerase III, epsilon subunit-like protein
TTGATAAGACTCAAGTTTCTTGAAGAAGTTGATATTATCATTGCCCACAA
TGCTGCATTTGATAGACCTTTTTTTGATAAAATGTTTCCTGAAGTTATAA
CCAAAGTATGGGGATGCTCAAGAGTTGATATTGATTGGAAAGCTGAGAAA
ATAGAAAGCCATAAACTAGAATATCTTACTTATAAATATAATTTCTTTTA
TGAGGGACACAGAGCTGTTATAGACTGCCGCGCTGGGTTGCATTTACTTG
CTCAAACCTTACCTATTACTAAAACACTAGTATTAAAACAATTACTTAAT
AATTGCCATAAAACCAGATTTAATGTTTGGGTACACAATGCCCCTTATGA
CTCTAAAGATTTACTTAAATCTAGAGGCTATCGCTGGTCTATCAATCCAC
AAGCAAATTATAAAGCTTGGATGATTGAAGTATTTGAAGATACTCTCGAA
ACAGAGCTAACATTCCTGAATTCTAATGTTTACAAAACGCCCTATAATAT
CCCAGTACAAACCATAAACCCTTGTGATAGATTTATGGGATAA
>RF_pd46 unknown
TTGTCAGATCAATATGCAGCTACTAGTAGTAGACTAAACTCGCTATCGTC
TAAAGACTCGATGCTGCGTACTATGTCAGGTCAACAAGCGTTAGAGCTTG
CAAGCCGCTTGATTGCAGAAGAAGCTCGCTCAATTGGGATCTCAGAGCAA
GAGCAGATGCAGTTTAAAGATGCGGTGAGTACCGATAGTACAACTACTGA
TAATACTATTATGAGAAATAATAAAGAAACAGCTACTAGCAATAATGCTA
GCGTTGGTTTCAATGCTTTCGGCTTGGGAGGTGCTTCAGCAAGAGTATCG
GCATCTAATAATACAAGTAGCAGCAGTGAAGAAGTGTTATCAAAAAAACA
AACTATCAACAATGTACTTGAAAAAACAAAATCTGCACTTCAAGAAGGAA
GACTCAATAGCTTTAATAGTGATACTCAATCACTAGCAAGAACTTTAAGT
CAGAACTATCAGGAGCAGGAATCTATTGGTAGAGAAATATCTGATGCAAT
ATCGGCTCAAGACCAGTTAAGTAGAAGTCGTCAATATGTAGCACAAAATG
CAGCTACTATTGATCGTAATATGAATGAGCCGGTACTAAATGCTATAATA
GATAGCAATATTCCGGGTGTTTCAAGTAAGGAGCAAGCTGCAAGATGGGC
AAGAACTCATATACATGAGGCAGCTTCCATAGCAAACTCAGTAATGCCAG
TTGATAATATAGCATTAGATAATGGTAGACATTTAAGTGGTATTAGCTCT
GATGTAAAAAATATACCTATGCGTAGTGAGCAGCATTTAAAAAATGAATA
TCAAGTGCAGACAGGTAAAATAGAAGCATCAGCTGATAAAATAAATAATA
AGCAAGAATTAGCTTATCAAAGCGTTGAAACGAGATTAAATAATAATTTA
AGTAACAGCGTAAAAGAAAGCTACAATAACTTAAATAATACTGCTCAGCT
CGTAGAGCAGAAAGGTAAGAAAATAGAAGATCAGTATGAGGATACCTCGG
ATTCTACTGTAAAAAGAACACTAGATGAAATAGGTAAAAACTCTAGATTA
TAA
>RF_pd40 unknown
ATGCGTGAATGGAAGAGAGATATCGAAGCTGTTGGTAATATTACAAGATT
ACATAGCAAAATTCTAAGTCAGGCTACTAATTTAAAGAGTATCAAATTAG
ACGATACAAGTGCTGCTACTTCTTTTGAATTAGATTTAAACATCAAAGAT
TTAAAGATTGATCCATATAGCATTGCTCTTAGCGAGGTGCAAGATAGCTT
TAAATATGTTATTGAAAATATTTTAAAAGAAGCGAGAGAGGAGAAATCAG
AGAGTGCATACAGTAGTAAACAAGATAGCCTAGAGCCAAAAGCAATAAAA
GGCATCACTAATATTGATGGTAAGGCATGCATTAACTTCAAGGAGCTTGA
TAGCAAGCATCAAAGCAAAATCATCGCTATTTGTTTAAAAGAAAGTACCT
TTGAAAATCTTAAAGAAATCTTTGAGGAGTTAAAATTAGAAAAAGAAGTT
TTAAGAGATTACGCTTCAGTTATTTGTGATAGCTACTCTAGCGTGGTATC
TGCTGAAGATGCAAAGGAATTTAATAAACTAATTTTTGCTAAGAAAGATG
AGAGCAAGTTAGTTACGGAAAGCAAGGTCGAACTTAGAGCTTTAGTCCGT
GAGCAGAATTTTAGCAAGTCGGAAGAGAGAAAAACTCAGTTAGAAGAGCA
GATTACTATAGTTAAGGAGCAATCAGCTCAGCACGATGAGAAGTTAGTGG
AGATAGCCGGAAGAATATCAAATAGACTCTCGCTAATTAAGGAGCATACT
ACATTAGATAGTAGCTCTGTATTAATGGGTGAGCGGACGATTCAGTTAAA
TATTAACTATGAGACGCTACGCAAACATGCAGGTTACGATATGGCAGAAT
ATGAGGCTGGTAGTTTTAAAAAGAAATTAATAATATGTGCTGCAGCATTT
GCAATGTTAGTAGCTAGTTGCTGTATTTCATCATATATTGTATATAAGAA
GTTTCCGGGCAGAATTCAAATGCGTCATGATGGTCCGATGCATGTTGAAA
ATAGCAGTGTAATGCTACATTATCCGACTATTGGAAAAATAGACGGAACA
AATAATAAGAAAATTGGTAAATAG
>RF_pd12 unknown
ATGTTTAAAATAAAAAATATTACAAAAAGCATCAAGCACATAAAGAAAAT
ACTAACACCTAGTTCTCACAAAACGACATGTTCTAGCATAGTAGCATCGA
CATTTGATATGGAGACATCTAATAAAATTACCTCTGACTTTGGTTTTAGT
AAAAAGTATGTTGTGAATAACAGTAAAGAGATAGATTGGGTAGGAATCAG
GAAAGCAATATATAACAGATTTTCTGATGAGATCGATGCCACAAATATAC
AGAGCTTGGAGCAAGTTACGCCACTTGTTGCATCGAAACAACAAGGGTTT
AGTGCTACGAATGTAAATATCAATTGGGCAGAGATTAGGGCATTAATATA
TAACAGGTTTGCGGATGAAATACATGCGTGGAGCAAGAAGCAGCATGGTG
ATATTATAAAATATAGTCCAGTGAGAGATGTGAATGAAGAACTGGAGATA
ATAAAAGAGCAGGGATATAGTTTTGCAAAACAAAAAGCTGCTTTAAAAAG
GAGTATCACAGATAAATGGGACGAGATTGAGAGAATAAAATATTTGTCTC
AGGACACATCATGGAATACCAAGAGTCAACAGAAGCTATTATCACATGAT
AATAGTATTATTGGTAGAATGAAATTCTTGTCTATTAAGGGTTACTTATC
AAATTATGCTGGAGATGATGAGTTGTCACAATCCATCGATTCAGTAATCA
AAATTAAAGATACATTGATCACAGAGTTTATGAATAGAGTCTATGATAAG
CATATGCATGCTACAGCGGCTCGGCAAAATGTAGCGGAGGCAATAACATT
TGACAGTTTAATAGATGAGCAAGAAGTGATGGTATTAGGAGAATAA
>RF_pd08 unknown
ATGGCACATATAGCTAAATACAAAATTGATGTAATAATACTTGGAATCGA
TTTAGAGGAGGTAGACGGCATTAAGATTTGTACTAGATTAAAGCAGAATC
CTTCTACTACTTATATACCTGTTGTCATGATAGCAGAAAAAGAGGATACT
GATATAAGAATTCAAGCTTTTAATGCAGGTGCAGATGAATTAATAACATA
TCCAATTAATATTATAGTGTTTACTAGTTAG
>RF_pd61 Transposase
ATGACTAATGAAGAGCATAATCAGAGGCAACAGCAAACAGACGTAAGTAC
AAATGGCGATGCTAATGATACTACTGCCGAGCGTCCAAGGCATGATGAGC
TATTTAAAAAGGTCATGAGTGAGCCTGTAGCTGCTCGTGAGTTTTTAGAG
CATTATTTGCCAGCGTCGTTTAAGAACAAGATTAATCTTAATAGTATTAA
AATAGAAAAGGAAAGTTTTGTTACTGAGGATTTACGCAAAAGATTTAGTG
ATGTCGTTTATTCTGTTTCTTTAAACAAGAATAATATTAAAGATAGTACT
ACTGGAAGTGCCAATAATGACAAAGCGTACGTTTACGTTCTGATCGAGCA
CCAGTCTAGTAGCGATTACTGGATAGCTTTTAGACTTTGGCAATATATGC
TTCTTTTATGCAAAAGACATAAGGACGCCAATAAAAATAAAAGTAATGCT
GCAGCAGAAAAAGATAATAAACTACCTCTAATATGTCCTATAGTAGTATA
CGCAAATGATAAGCTGTATAATGCTCCAAGGAGCTTTTGGGAGTTATTTG
AAGATTGCAAGACTGCTAAGGAAATGATGGGCGGCGAGTATTTACTTGTA
GACTTACAAAAACAAAGTGATGATGAGATAGAGCAAAAGAAGCATCTTGG
TATGATAGAGTATATGCTTAAACATATCAAAGCTCGTGATATCTTAAATC
TCTGGCAAAGTCTACTTGAGAAGTTTGAAAGTAGTATTGAAATAGATAAG
GAAAATGGCTACATTTACATTAAGTGGTTATTATGGTATAGTGACGCTAA
GGTATCTGAAGATAAACAAGTAGAGCTAGCTAAGATCATAGCAAAACACT
TAAATAAAGCAGATCAAGAGGGACTTATGAGAACTATTGCTGATAAATAT
ATTGATGAAGGCGTACAAAAAGGAATGGTCCAAGGCATGCAGATTGGTAG
AAATGAGGGCATGCAGATCGGGGAAGCAAGAGGAATGCAAATCGGGGAAG
CTAAAAGAACTATGGAAGTAGCTAAAAATATGCTTAATGCTGGTTCTGAT
ATTTCTTTTATCTCTAAAGTCACAGGACTTTCTATCTCTGAGCTCAACCA
ACTTCTCAAGTCCTAA
>RF_pd14 Ankyrin repeat
TTGCTTTTGTGTAAAATCAAAGGTTATACAGAAAGACAGAAGCTTAATCA
AAAATTAATGAGAGCTGCAGCTACAGGAGATATAGAGGCAGTACAAAAGC
TTGTGCTTCGTGGTGCTGATATATATTGTCGGGATCATCAAGGGGATACT
GCATTATCACTTGCAGCAGGTAGCGGTTATTTAGATATTTTAGATATTTA
A
>RF_pd10 unknown
ATGAGTTATAATCAAGAAGGATACGAATTTAAAATAACACAAGCATTTAA
TTGTTTAAATGACGCAATAGCTTTAACATATTCATCAGTAAATCATTTCT
TAGATATACCTAAGGTAATTAATAAATATGGAGTACTTGCTACTGTAGCT
TTATCAAAAACAAAACAATTAAATCTTACTGATACAAAGTTAGAGAGTAT
AGTAAAAAATGGTTTTATTATATATGAGGTAGTAGAAACAATAATCAAGG
CAAGTAATGCCATCACTAAAGATCAGCAACTGTTCAGTAAAGCTATAGAT
GATGGTTTAAATGCTGTAAATAAATTACAGGAGGCAGCGATTCATTTATC
AGGTGCTTATGAGCCTCTTGCTGAATATGTAACATCATTCTTTGGTAGTA
ATGATCAACATGAACCTTTATTATTTGATACATATACGCCTAACTCAACA
AGTGCTGTAAACGAAGGCTACCATCTGATAGGTAATAATGCTCAATTAAT
AGCGGTAGAAGTCTAA
>RF_pd59 unknown
ATGGAGATTAATGGTAAAAAAGCTAAAATATATTACAGTGATAGTGCTTC
GGCAGATGGGCCAGATTATGCTATTATAGATATTTCTAGTAAGAAGGCTA
AATATAAAAAAGCTACATATGACACTTCAAACCCCTCTAGCTCACATTCT
GACGATCACGAAAGAATGGAGTTAATAAATTCAAGTGATAACTCTATACA
AGATAACATTAATGTCATATCTTATAGTATTGTTAGTGCTGCGGCAAACA
AAACAGATTATATAAATACGTCTAGTAAAAGAGACAGATAA
>RF_pd67 Transposase
TTGGATTATTCCTATAATTTTATAAGTTTGGAAGCCTCAAATGTTTTACG
TGACTGGCTCTTAGAATTTTCTTTTATCTATGAAATAACTAAAAATCGTT
ATTGTGCTAATTATGGACGTCCATCAATTGATCCTGTATTATTTTTTAGG
ATGCAAATAATAAGTTACTTAATATGGTAA
>RF_pd05 unknown
ATGCAATTATTTTATCCACTTGGGTTACCAAGTGAAAATATAGGTATACA
TGGGTTCCATGATACCACAAAGAATCAACCACAATCATACATCCCAATAA
CTGGATGTGTCTTATCTCACATATTATCATGCTCTAGGTTATCTTCCCTT
GAGAAGATGTATTTTATCTTAGCTGATTCTCTTATCTGTATTAACTCATC
TAAAGGACGTAATAGATCTATAGCTCTTCCTGCTACAAGCTGGGCTGAGA
GACTTTCTTGTTCTAAATCTAAAGTGTTTATATTACAGAAATCCCTAGAA
GATAAAGGATATTTCATTATATATAGAGATAAGAACGATCAGGGACAGAA
TAATCGTAATACTATTACTACTACTATTCCTGATCATGTTTTTAGTGATC
TTAAATATGAACCTGATAGATTTAATTTAAATTCTGATAGTGATATAGAG
ACTCAGAGTACTAATCATTCTCAGTCAGATAATCTAGATTCTATAGATAA
AACATTCATACCTACATTAGAAGGTAAGAGACAACATCTTGCAAAAACTA
AGATGTTTATTAGAGTACCTTATAAGTTCTTAAAAGAATTAAATTCTAAT
TGTAACATTTCTGCAACATCTAAAGTTGTATTATTACATCTTTTCACAAA
GATGTATAAATCTTCGGTTTGTAAGTACGATTATAACTGTTTTGGTAGTA
GATATGATTATGGCAACGCTGTTGATTATTTAACACAAAATTCAAATTCT
ATTGTTACATCATATCAAGAACTTCAACAAGAACTTAAATTACACAGAAA
TAGCCTTACTAAGGCATTACAGACTCTAGAAACAGCTAATCTTATTAAGA
GGGGTCAGATAGTTATTAAAAATGATAATTATTATAACAGCAGAGCTGAT
AAATCATTATGGAGAATATCTCTTGTAAATGCACTTCGTATAACTAATGA
TAGTACTCTTCATGAACAAAAAGGACAAATTGGATATGATGAGCAGGAAG
AACGATTTGATAAGACTCAGTTATTAATCAGTACCTCAAATACAACAATA
CGCACTAATGATCAGAAAAATGATACAGGCAAAAATAGGGTCCGAGAATC
CTTTTCGGAAAAGGGATGCACTAAACATGACCCTCCTTGCACTGATTCTG
GTCAATTATATATTAAATACTTTATAGTAAATAATAATATTAATAAAAAT
ATAGATTATATAGATGTAAAATCTGAAGAAGAGTTTTTGGAAAACGAGCT
TTGCTCGTTTCCATCTGAATCTTATAACAATTCTTTTAAAAGTTCTATTA
AGGCTAAACCATCTTGTTCTAATACTACCTCTGAATCCGCTGCAAGAACC
ATCAAAAATACATCTGAATATAAGGAACTAAGGAATTTCTATCCACTTTC
TGAACAAGATGTAGATACGCTTAACTTTAGAGCTGGTAGAGAATTTAGCA
ATAATTTTATGAATCAGTTATTACTGAAGCTCTACATCAAATATCCTGAG
AAGAGATTTAAGAACAAATTTTCGTTCTTAAGCTACATGGAGAAGATTCT
AAAGAATGAGAAGCATCAAGGACCTTTAGTAAATCATACAACATTTAGAT
TTAGCTGTAATATAGGAGCAATAGAGAAAAACTTACTCGAATATGAGAAA
TACTTAAACCAAATAGAAAGCTCATTTGATACCAGTAAAGATATGCAGAT
AAGGAAGAAGATAGCCGGAAGATTTAGTACTAATGTGGCATATGAAATAC
TAAAGGAGGTAGAGTTTAAAACAAACAATGATAATAGCTTTATACTTGCG
TTAGTTCCAAACCAACTTGCTTTAAGCGAGCGACAAATAGCAACATTAAG
TGAGCAACTAGAAGCAGTATATGGAATTAACGGTTATTACGTTACGGTGT
TGGAAGGAGATGTAAATCCTGAAGATGTAGAATATGCTGAAAGGAGTAGA
GGGAAAAAAGAGATAGCAATAGGAGTAAACAATGAAATGATTTATCCTAA
AACTGCAGTATTTGATAATGTAGAAAATGATACCCCTATTGATATTCCAG
CTAGTAACAGCGTTGTGAATACAACTAACGAAAACACCGTCTGGAATCAA
ATACGGAAAGGCTTAAGAGAAGAGCTAGGGGAAGCTGTAGATGAGACTTG
GTTTTCTAAAGCAGAGGCTAAAGAATGCAAGGAAACAAAAACCCTGACCC
TAACAATGCCAACAAGGTTTATGTCTGATTGGGTTAGAAATAATTACTCG
CATGTTATAAGAGGGCTTAGCGAAGGATATAAAATTAATTACAAATTTAA
GGAAGTGTTTAAATGCCATTATTAA
>RF_pd68 unknown
ATGGCTAAAGGATGGATTAAGGAGCAAGAAGAAAGCTTAATAACACAAAT
ATTAGCGGGTAAATTTTATCACAACTTATCTAATGAGATTCCTTGTGATA
GTCTGCCAGTTTTACAATCACCGAGTAATACCCAATATTGGGGTAACGAA
AATCCTTCTGTTAGTTCAGTATTACTTGCTGATATTGTTGCTAGTTGTAA
TAAGAAGCAAGATAATCTAGCTGGAGCTGCCACTTTCTTTCCTTTTATAG
ATAGTAGCTATGCATTACCTGATAGTATTGTTCCCGCATCATATTCGTTT
GCTACTAAAAATGGTATGACACTTTTTGGTGATTATCAGTATGGTGCCCA
TCGTTATTTTAAGGAACAATTAGTGTTTGGTCCTGAGGATTGTTCTACTG
CGGTAGGTAAAGCAACTTATCTGACTACCGATCAAATTAAAGATATAAAT
ACTACCAACATGCAAGCAGCGTATGAGGCCAGTATAGAAACAGGGAGCCC
AGACCCTAAATATCACTATCAAGCGGTAACTTTTTTAAGTGGTGATATTC
AAGATAGCCAGTTGAGATTAATTCAAGAAGGTGATATTTATCTTGTAAAG
GGTCACACAGCTCTTATTGCTACCAAACCTGATAGTAGAAGTACAATTAC
TACTATACAGTTTAATAGAGATATAGACTCGGCTGAAAATAAAATATTAG
GAGGTGGTACATATGATTATAATTTATGTGATAAAGCTAAAGAAATAAAA
ACTGGTATTTATATTTTACGTCCTACTACTGTACAACCTTTACATAAATC
TTATTCTTTGGGTGAATTGTTGAATCAAATTGACTCAAAATATTTAACTC
TTTTTCCTGATGGTCCTACAAATATTTCAGGAGATTGTAGAATATTTCTT
GAGGACAATACTACAAACATAGTTGGAGACACTGGTTATAGTACTGGACA
GTTTTAG
>RF_pd62 unknown
ATGAATATCAATGATGTACCTGATAGTCACCACAAAGAGATAGCACGAGA
CGTGTATAGTACTATCTCAGAGTATAGTAATAGATACGCACTAGATGCTA
CTGACAAAAATAAGATTGCAAATTCAGTATATGAAGCACATTGCACGCTT
AAAGCGTGGCAGCAAAGATCGTATGCACAAGTTGCTACTAGCTACACAGT
CTATCAGGACCGACAGAAATACCTAGAACATAAAAGACTTGCTGATATAG
AAAGAGAATCGGAGCGTAAGACCTTAATAGAACATACGCAGCAAATCAAA
CATGAGATATTGGTAGCAAAAACAGTATCCGAGATATTTGTAGCTTTAGA
GAAAGATCAAAAGTTCTTTATAGAACAAAATGGCAATATTAAATATACAA
CATTTAATTATAAATTTGTGGATCTAGTGGAACAAGCTCTTGAATACAAG
GAACAAGAACTTTTACCTCAATTAAAAGATGCAGCAGCAGAAGCAGAACA
GCATGGGGTGTTCAGTACACAAGACATATTAGCAGAGCTTAAAGGTAGTA
AGGACTTAGCAGAGACATATAAGCACTTTGATAGCAGTTTAGAGCGTCAT
CATTTAGAAACTCAGCATCAGCAGATCAGAAAAGATAAAGTAGATGCTAA
AACTACCGATGAAATGTTAACTACAATTCGCCGTGAACATGAGTTCTTTA
AGTCTCTTAATGGCAAGCTTAAATATGCAGGGCAGTATGATAGCAGTGTA
TTATCTGCGATCTCGAATGCTAAGTCTATAGAGCAAGATAAGCTTATTAC
AAATATGCATAATATGGTAGTATATGCTAAGAAACATGGTATATTAAATG
ATCACGAGATACTAAATCAATTTAACTCTAATGATAGTCAAAATGTTCTT
AAGAATTTAAGTAAAACATGTGAGAAACATTATATGGATCGCCATAATGA
GAATATTAAGCAGCTATTAGATGATGAGCATGTGATAATAGGATCTAAGA
AATATTCCTGTCCGCTTAAATATATGAAGCATGAGATGCAGAATGATATA
CCAAGCTTTATAGATGAGAAGCAAATAGCTGCAACCTTTGCAAAAGTAAA
AGCAGAAGTTAAAGAGCTACGCCTAGAAAGAGAGTTAGAACATACAATGA
CGATGAGATTTTAA
>RF_pd06 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
ATGCCATTATTAAATGAACGTGATGTTGAAACACGAATTGAAGAACAACT
TAAAAATCTTGAATGGATTGACAATCCTAGTTTACCTAATCGTAATGTTT
ACAAACAAAATCCAAAAACAGAAAAACAGAGGAAAGCATTAGGTAGTAAG
CGACCTGATTATACACTTTATCGTGATAATAGTGATGACCCCCTTATTGT
TATTGAAGCGAAGCGACCTAATACAAATCTTTCACAAGCTTTAGAGCAAG
GTAACAATTATGCTAAAGCTATTAATGCACCTATTGTTATAGCAACAGAT
GGAATATTTGCTAAAACTTTTCATACTAAAATGCAGAAACCACTTTTTCT
TGACAAGGAAGAAATTAGTAAGATTATTCAACAATCGTTAGCTATTGAAT
ATATTGATAAGAACGAATATTTTAGCATTGATGAGAAAGTAATTAAAAGT
CGAGACGAATTACTAACGATATTCAAAGAAATCAACAATCAATTCAAGGA
TGCGGGAGTAAGTAGAGGATTGCCTCGAATTGAATTGTTTTGCAATCTTC
TTTTCTTAAAAGTCATTACAGAATTAGTAGGTACTAATAGTCTTATTCAT
TCGCTTCCGGACTGGTGCACATGGGATAAAATAAAGGCAAAAAAGGGAGA
TGATTTATGGACTTTTATCAATACACAAGCTTTTGATTATTTAAGCTTTT
GA
>RF_pd65 unknown
TTGCCTAATAAATTAGGTTATAGTTATAAAAAAAACTTTTCTTCATCCGA
AAAGGGATATTGGTCAAGGAATGAGTTTATATTGAAACTAAAAACTATAG
ATAAACAAGATTTATGTATATTGTGCTATGCCGTCATACTTAAGTTGCAG
CATTATAATTGGGATAGCTTATTAGCATATATTCAATGCTGTTTTTTGAA
TACAGAATCTACCATTAAAATATGGAATGTTCAAAGTAAAATTATTTCAG
TACGTTGTGTAGATATCTTAAATAATAATGAATATATGCAAATCGTACAT
TCAGGCATAATATTGTTAATATTAATGTTACTTGCTATATGCGTTATGCC
TATTATTTTACTTACAGTATGCTTGATAATGTATACTATAATTTCAGAAC
TAAAGCGATTTTAG
>RF_pd50 unknown
ATGAAAAGGGTGTGTATGAGTAAATTACTTGGTGGTTGGAGTATGTCTTT
AACTCGTTACCCATTTAATGAATTTGACTATATAATGTATGGTATGGTGA
CAAATCTTGAAGAACTAACAACAGGAAGCATGGCTTCTCCGGGGTGGAGT
CCAGAAAATGAACAAAAACCAGATAATAATCCTTGTTTTACAGGTAAAAG
GCTTTGGGTTTATGGCGGGGGAGGATGTGCTCCTGAAGAAAAGCCCTCTA
GTATGAATGACGTATCCCGCATTATATCTGCGACCATTAATAATGGTTGG
GATGGTGTTGATTTTGATGACGAGTGTAATATGAACACTGCATTTGTTAT
AAAAACAATGGAAAAACTCAAAGAAAATAGTAAAGAAACCAGTTTTGGTT
TTATTGCAGGTTATTCTTATAACCATCCCAATACAGAAAAAGGGAAGAAG
ATTACCGACAAAGTTAAGGCGATTATCGCATCAGGTCAATGTGATAGATT
AGTGCATTATTGTTACGCTGCCGCAATGTGGAATCAAAATGATATTATCA
ATAATGTAAAACAAGCATTAGTACAAAGCATCTCTTATGGCATAGAACAA
GATAAAATTGTGTTAGCCTTGACTACTTTGGGTCTGACAGACTGGAATTT
AAATTACTTTCTAGATCAAATTATTGATTTGAATTTAGGGGGGTTATTTA
TATGGCGATATGATGAGTTGACTCCAAATCATTATAAGATTATCAAAAAA
CGGTTAAATAAATTGTACTAG
>RF_pd56 Hyaluronidase
ATGAATATTTTTTCGTTAGATACGTTTTCGTATGGAATTATAATGGGGTA
TTACGGACCAGTATGGTCTAATGAAGTACTAATTGAATATGCTGATTTTT
GTAAGAAATACGGGTATAAATATTTTATCTATGCACCAAAGATGGATAAG
TTGTTACGTGATAATTGGAATATATTTTTTACTGAATCACGTGTTCAGGA
ATTAAAAAATATCCGTGATACTTTTGAAGAAAAAGGTGTAGCTTTCGGTA
TTGGATTGAGTCCACTAGGGCTTAATAACTTAAAAGATATAGAGAAAGTA
GAAAAAGTACTACAACAGAAAATCACTCAAATCAATAATATTAATCCTAC
TATTCTAGGTATATTTTTCGATGATATCAATAAAGACTCAATTGTTCCTG
ACTTGGGAGTGGGGCAAGTACAGGTTGCTGAGTACATCGCACAAAGAAGT
AATGCCCAGAATTTTGCCTCTGTTCCAAGCTATTACAGTAATGATCAAAT
TTTACAACGTGTGTTAGGACCAACTCCTGAAAGTTATTTTGCTGATTTTA
GTCAGTTAGATCAAAAGTTTTCTATATTTTGGACTGGAGAACATATTATG
AGTGATGGTTATTCTCAAAAAGAATTAGATAATATTTCTAATAAACTAGG
ACGTAAGGTATTAATATGGGATAATTATCCAGTTAATGATCCGACTTACC
TAAAGGATCATTTGCGTATTTCAGGTATAGATAGACCTCAGGAGCTTTCT
TCTTGGACTCCATCGATAGCTTTTAATCCTATGATACAACCAAATATGTC
AAAAATTCCGTTATCTACAGCTCAATGTTTATTTTCTTCAGAGAAATATA
ATAAGCGTGAAATATATATAGAAAAACTTATAGAACTATGTGGAAAAGAT
TTAGCACAAGCTATAGATCAAAACTTACCATATTTTGAATTAAATGGTAT
TAATCGAACTGAAACATCAAATATCAAACGTATGAAAGAGCTATTCTCCT
TGTTTGCTGAGATAAACGAACAGCAATATACGCATGAAATTATCAAGTTA
TTGGGGGGATCACAAGAAATATAA
>RF_pd48 Transposase
ATGGATATGGCAATAGAATATCCAGCATATGGTCAGCTAAGAGTATCAAA
TGAGCTTAAGAAGAGTGGAATACTTGTATCACCCGGAGAAGTGAGATCAA
TTTGGTTACGTAATGATTTAAACAATATCAGTAAAAGGCTTAAAGCATTA
GAAGCAAAGATGGCTCAGGATGGTATTGTTCTGACTGAAGCTCAGTTACA
AGTACTAGAGAAGCGTCGTAATGAAAAAGAAGCACATGGAGAGATTGAGA
CGCAGCATCCAGGTTATCTAGGATGTCAGGATACGTGTTATGTAGGTAAT
TTTAAAGGTATAGGTAAGGTTTATTCTCAGGTATTTATTGATAGCTATAC
TAGAGTAGTGGATGCTAAACTATATGCTGATAAAACAGCAATTACTGCTG
CTGATATGCTTAATGACCGGGTGTTACCATGGTATGAGACGCAAGGGATA
CCAATGCTGCGTATTCTTACAGATCGTGGGTCAGAATATAAGGGCAATAT
AGAGCATCATGCTTTTGAGTTATTTCTTAGCATAGAAGGTATAGAACATA
CTACAACTAAGGCATATTCTCCCCAAACAAATGGTATGTGTGAGCGTTTT
AATAAAACCATGAAACAAGAATTCTTTGATACAGCAATGCGGAAAAAGAT
TTATACAGATCTTGATGATTTACAATTAGATCTTGATATTTGGTTAGAGC
ATTTCAATAATGAACGACTACATTCAGGAAAATATTGTTATGGTAAAACT
CCTATGCAAACTTTTCAAGATAGTAAGAAATTAGCTATTGAAAAAAATAA
TGAGATCTTGTACCTTGAATACTCGTCTGACAGTCAAAATTTAACTGACA
ATCAGGTGCAAAATTTATAG
>RF_pd44 Putative conjugative transfer protein TraD_F
ATGAACATACAAGAGCAAGGTAGATTCACGCGAGGTGCACAAATCTTCGC
ACATCAGATTAGGATGCTTACGCAAGGCATCACTAATGCACTCACAGTGA
GTCTTACTGCGTCGTGTATGTGGTTAATATTCAGAATCCTTCAAAAAATC
AATATCTTAAGCCTATATTACTATTGCATAGAATGCTACGTGCAGCTAAA
GCTTGCGGTAGGTCAGTATTTCTATGACATCTCACAGATCGGTATAACAT
TCTATGATGTAAAAAGACAGGAATGGATATACCGCTCTGCTGAGGACTTC
ATTCACAAGTTTTGGTATGTAACAAAGCATGGTACTCAGATTACAAGCTT
CGGTTCTTGGCTTGCCGGCTCCGCTGCATTTGAAGTACTTGGTGTTTTTG
CTTTAACTATGCCTGGTATTACTATCTTTTTTTGGTATAGAGGCATCAAA
ACAATAGGCAGTCAGAAATTAAGAGGCATGGATTATGTACAAGCTTCTGA
GCTTACCAAAATCCTATCCAAAGAAAAAGTAGCATCTAATATTAAGTTTG
CAGGACTTCCTATTGTTAAGGATAGTGAAAGACAGCATATACTAATTACT
GGTACTACCGGCACTGGTAAAACCAATATGCTTAATGAGTTATTGCCTCA
AATACGAAGCAATAATGAAAAAGCTATCATTGTTGATATGACAGGATCAT
ATGTTAATAAATTCTATGATCCAAGTAATGGCGATATCATCCTGAATCCT
TTTGATTCACGCACCTCTAATTGGCTACCTTGGAATGATATAGTAGATAC
AGAGGATTTTGATGATCTTGCAAGTCACTTTTCAAGTAATAATGGTATGG
GACGAGCTAGCTTCTTTGATAGAACTGCTGAATTAGTACTTGCAGAAGCT
TTAAAGAAATACGCAGTAAGTAGAGATTAA
>RF_pd52 hspP1, Small heat shock protein
GTGAACACTTACTTAAGTGAGATCACAAATCTTATATATTATATAAATCT
AAAAGAGGTATGTATGTTATATAACAATATTAAATCATATTTGCTATCCG
GTATTACTGTCATTTTATTGACTGGTCATCCAGTTATTGCAGCTGATAAT
GTGAGTAAACCTGATAATAAATCTCAAACTGCTTACTTACAACATCCTCC
TGACCTACGCCCTTTTTCTATTTTTGATTACTACTTGGATAATATGTTTG
AGCATAAACTATCTGCATATAGCTCCAGTGCTATAAGAACTAAGTTTATT
ACTCAAGACAAGCAATATATCTTAGTACTAGAAGTGCCGGGGTATGATAA
AAGCCAAATTAAAGTCAAAGTAAATAGTAATAAATTATTTATCACCGGCA
ACGTAGAACAAAATAATAAATCTGAAGCTTCAGATGATTATACAAAACGA
AACTTCAATTATGTCGTTTCTTTATATGAAGATGTAGATCAAAACAATAT
TTCTTCAAACTTAAAGAATGGTATTTTGACGATTACTCTACCTCGTATCG
AAGTTAAGGAGAAAGATGCGAAAGAAATACCAATTCAATAG
>RF_pd51 hspP2, Small heat shock protein
ATGTTTAATAAACTTATGGAGGTACTTATGTCTTTTAATTTACCACGTAT
TAGAAATAAATCTGAATTACAACATCATACAAATAAACAAAGTTATGTTG
ACGATGTTTTTAATAATTTCTTTAATGAAATAGCTTCATTTTCTTACCCT
ACCCATTACAATAATAAAATATTGTCACCTAGAACAGATATTACTGAAAA
TGAATCTGAATATCATTTAGAGGTAGAGTTACCTGGTGTAACGCAGGATA
ATATTGACCTTAAAATAGATAGTAATATCTTAACTATTGATGGTAAAAAG
GAACAATCGACTGAGAAAAAAGATCATAATTATCATATGAAAGAACGATA
TTATGGCTCTTTCTCTCGCTCCATTAGTTTACCATCTAATGTGGATGAAG
AACATGTAACAGCAAACTTTAAGGATGGTATATTGTCTATAAAAATACCT
AAAAAAGAACAAAGTAAGGCTAAGAAAATTAAAATATCATAA
>RF_pd03 parA1, Chromosome partitioning ParA family protein
GTGGTACGTGTGTATTACAATTGTATCACATGGAGATTGTGTATGTCCTC
TAAAATTATTGCAATAATAAATCAAAAAGGTGGTGTAGGTAAATCTACTA
TTGCTGTTAATCTTTCCTTTGGTTTATATAAAAAAACATCGCGAGTATTA
CTGATAGACCTTGATCCTCAGGCTCATTCCAGTTGTATATATTGCCCAGA
AACAATTTTATACGATAAAACGATTGCCACTGCTTTTATTAATAAAAAGA
TAGATATTAATAATTTAATATTAGAAGCAATAGTGCATAATGAAAAATTA
AATAATCTCAAAATTATTCCTTCTAATATAAAACTTGCAACTGTTATTGA
GCAAATTAGTAGTACTGTTTACAGAGAAAGAATATTACAAAATCATTTAA
ACACTATAAAAAAAGATTATGATTATATAATTCTAGATTGTCCACCAACA
CTAGGGATATTAGCCGTAAATGCCATATATTGTGCAAATTCAATAATTAT
TCCTACAAATTATGGCAGGTATTCGCTAGATGGAATGGCTGATTTATTAA
CAGCGATTCAGGAAATCAAAGAGGATCACGATTACAAATTTTTTATTCTA
AAAAATTTGTATGAACAAAAAAATTCTCAAACTAATAGATATATTAATGA
ACAGTTAAAAGCTTTAGATGAACATTTATTAACGACTATTATTAGAAAAA
ATGAAGCTATTAACCAAGCACAAATTAATAATCTTCCTATACAAATATTT
AATAGTTCCTCAAAAGGTGCACAAGATTTTAGCTTATTAGTGGACGAGGT
AATACATTATGCATAA
>RF_pd11 pat2, Patatin-like phospholipase
ATGACAACAGCAATACACACACAACAAACATTTGAGCATATCGAACAGGG
AACAGTCGACAATATCAAGGGTGATAATACGACTCATGATAGTACATCAG
AATCCATCAAGAGTAACCGAATATTATCATTATCCGGAGGTGGAGTTAAG
GGGATAGCGGAGCTAGTGGTGCTAGCTGAGATAGAAGAGCGAACAGGTAA
ATCTATATCAGAATTATTTCCTATTATTTCCGGTACTAGTGTAGGCGGTC
TTATTGCGGGCTTGCTAACTATCCCAAAAGAGCAAGGCTCAAACATAGCT
AAATATAGTGCAAAAGATGCTTTGAAGATATTTACAGACGCAGCACCGAA
GATTTTTGAACATCATTGGTATGACGGAATAAAACAAATATTCACCCATA
AGCATAGTCAAGGACCATTAAAGGAAATATTAGAGCAGCATTTGGCAGGA
TTAAGATTAGATGATACAACATCTAGATTAATAATCCCTGTCACTGATTT
AGCAAGCAAAGATAAAGAGGTTAAGATATTTGATAGTCATGATTCTTATA
GTCCGCATATAAGAGTTCAGGACGTGTTACTAGCAACCACTGCAGCACCA
ACATATTTTAAGCCTGTAACTAATCAAGAGCATATTAAGGGTTATGAGAA
TCAAGAGGATGCACTATATGCGTATGCAGATGGAGGGCTTGGGGCTAATA
GACCGGCATATGAAGCACTCAAGATATTAAAGAACGGTCATAGTAGGGAA
GAGAATGCCAAAATACTTGATGATACTATGGTATTATCACTTAACTTTGA
TAATGATCATAAGGCTAGCAGCTCCATACCTAAGATAGGATTTGATGGAG
TAATAGGATGGCTTGTTAAAGGAAAGCTAGTTAGTCGTCTAATGCAAAGC
AGTGAAGATAGCTCCACAGCAGAGGTAAGAGTAGGTTTACCGGGCGAGGA
TGAGTTTGTGGAGGTGAAGCTACCTATTACTAAAGAGACAAGTAGTTTAG
ATAATAGTAGCCTTAAAAACATAGAAGCATTAGTAGCGGTAGGTCGTAAA
TATATAGAGGAGCATACGGAGCAGTTACAAAAGCTATGTGATAATTTAGT
AAAATATGTAGAGGTCGAGACTAAAGCTATGACTCATGAGAAAGCAGCAA
AAGACGCGGGGGGAGCAATAGAACTTGGTTCAGGCTTAGATTTAGAGAAT
AGTAGTGATGACGATGCTATGATAAATAAGGAAGCTATAGCAAATAGTAA
TGAAGATGCTAATAAGAGCGATGGTGATGATGTTGTAAGTAACTCTATTA
TCACCAATGAAAATAGAGAGCAGATACTGGACGGTATCAAGCAGTATCTC
ACATCATTTGCAAATGATAACCCTGATTTACAGGAAAATATTGTTCAGTA
TTTAACTTCTGTGAATGATTATAGTAATCAGGAATTAGAGAAGCTAATAC
TGGATTTTGCAGAAGGGCAAAAGGTAGTGCAAGAAATGGAGCTACATGAG
GCAGAGAGCGTACTTGCTCCTTATATGAGTTGCGGCATGGAAGCTAATCA
AGAAGCTATGGAACTTGAAGGGATAGATGATGAGGTACAAAATCATGAGG
TTTTGGCGTGA
>RF_pd13 tmk, Thymidylate kinase
ATGAATAGCACTAATAGAGTTAAACGTGGCAGATTTATAACATTAGAAGG
TGTAGATGGCAGTGGTAAATCCACACAATGCCGTATATTAAAGGAATATT
TAATTTCTCGGGATATTCCTGTTATGTCAACTAGGGAGCCTGGAGGCACA
GAAATTGCTGAGGAGATGCGAAGTATCTTGGTACATAGAGATTTACTGCC
GATGTCGGAGTTATTGCAAGTGATGGCAGCACGCTATGATCATATTGTAA
AAAAGATTCTTCCCGCAATAGAAGCGGGCTATACGGTGATATGCGATAGA
TTCATTGATTCTACGGTCGTGTATCAAGGTTTAGAGATTGATAGTGGTAT
GGAACTCGTATACAGCTTGCATAAAAAGCTTATGCCCTCTATAATGCCGG
ACATTACGTTTTTCATTGATATAGAACCAGTATTAGCGATGGAAAGAGTA
AAAGTTCGTAATGGTAGTAACTATAGTAGCAGTAATTTGAGAAATAATAG
ATTTGATATTAAGGACTTAGATTATTACAAGAAGATCCATAATGGTTTTA
GAACATTAGCTGATAAATACCTGAAACGCATAAAGACAATTAAGGTAACG
GCTTTAAGTACACCAACACCAACACATAAGATTATCACGAGATATTATCA
AGGTTTGGATTTAGGATATGCCAAACAAATATGA