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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_p39 Conjugative transfer protein TraA_Ti
ATGGAACGGAGCAGAAGCAAGAGAAAAAGAGCGGATTCTAGGACTGCATC
AGAAATAGAATTTTCACTACCACGTGAAGTAAGTAAGGAACTAAATATTA
GTTTGGTAGAAAAATATGTGAATGAGTATATAGTCGCAAGAGGAGTTGTA
TGTGATGTAAATATTCATTACGATAATCCTGATAATCCACATGTACATAT
TCAATATTTAACTAGAAAATTAGAGCGATTAGAGAATGGCGAAGTAGTAC
TTGGAAAAACAAAAAATAGAGAATTAGAAAGTACGAAGTTTTTATATTTT
TTGCGGGACAGGTGCGAGATAGAAATCAACAAAGTATATGAGGAAGCAGG
GTTACCATATAGAGTAACAGCTAAGTCATTTGAAACGCTTGGAATAGATC
AAATACCAAAGCTTCATATAGGACCAGCTCATCATATGCCTGCAACTGAG
CTTGAAGCAAAAAACAAAGAGATCATAGCTGAGAATGCAAAGAAGATATA
TGAGAGTCCTGAAATAGTATTTGGTCGCATTTCGTACACGAAACCAGTGT
TTACTAAAGAAGATATAGCTATAGCATTATCTGACGCTCTAATGGTGCAT
TTAGTATCAAAAGGAAGTGATATTGCAAAAGAGCAAGAGGCTATTAGAGC
ATTTGGTAAGGGCTTAGTAAATGAGCAAGCAGGTGATGGAAATACAGAAC
AAAATATAGTGAATGATGCAGTAGGAACTGCGGCAGGAGGTGGAGCAGAG
AATACAGATAGTAGCCAAGTAAAAGAGACCACTAACAACCCAGCTATCGA
GCATTTAAACAAGGAATATGGCGAGGAGTTTTTACGGCTTTACAATCAGC
TACTTGTATCTGACAAGATAGAGTTGATGGATCAGAAAGATTTGATGGGA
AGAACGCTATATTCCCTAAAATCAAGAGTAAATCTAGAACGTCGTTATGT
ATCTGCTATAGAGGAGTTAAATACTAAAGGCGAACATAAGCTGAATATTT
TAGATAACACTATTGGAGAGAGAAACAGTCTTAAGGAACAAATAGGTGAT
TTAGTAAATGTAGTAGGAGCAAACCTACAAAATAAGTTTAATGATAAGCT
AGGCAGTGGTTTAGGCTTAAAGCTTAATGTTTTTGGCAGCAAGAAGCATG
CATTTAGTGATGAGCAAATCAAAGCAATCCTCTCAGTCTGTAGTGGCTCT
GATATTAGTGTACTTGAAGGAAATCCCGGAGCTGGTAAGACTTTTGTGAT
GAAAGAGATAGTGCGTCAGTACAAAGCGGCAGGATTTAAGGTAGTAGGTA
CTGGACCAAGTAGTGTATCTGCTAAGGTTTTAAGTCGTAATGCTGGAATT
AAGGCAGATAATACGAGTTTGCTACGTAAGAAAATCGTAGAGTCCAAAGG
AGGCGACTTTAAGATAGATTTAAGCAGCAAATATTATGAGGAGGAGGAAT
ATTTAAAATCTATTGGTTGTGATTCGATTTTGAACTTTTTACGTTCTGAT
GTACTTGATAGTAAGACTGTATTGATCGTTGATGAGGCAAGCATGATTGA
GCTTGCTAATATGGACTATCTAGCTCACGAGGTCTTAAGGTCTAAGGCAA
AGCTAGTACTTGTTGGAGATAACAACCAGTTTACAGCTGTTGGTATGACT
GGAGCGTTTAACAAAGCACGTAAGATTGCAGGAGGAGTTAAGCTTACTGA
AGTAAGAAGACAGGAAAGAGTAGAGTACAGGCAGGCGACGAGAGCTATGG
GACGCTTTGCCATGCAGGAAGCCATTGAGATATATAGAAAATTAGACGTA
TTTAACATTAAGGATAATGAGCAGGAAGCTAAAACTAGCTTAGTTACGTC
ATTTGCTAAAGAATATACTGAGCAGATAGATAATCTTAAGAGAGATGATT
TAATAGCGATTAGAAGTATAGCAATTGGAGCATATACGAACGAGAAGGTA
GCTGATAACACAAGAGTAAGAAGTGAGCTAAAGCATAGCGGAGCATTAAA
GGGAACTGAAGTACAAATTAGCAGTGGCGGGCGAATGCTGTCGCTGATGA
AAGGCGACCGAATAGTATTTGAAGAGAATAGTTTAAGATACGGGATTAGT
AATGGAGAAGTAGGAACAATATTATCAGTCAAGCCTTCGGTTAAATCGTT
TAGTGGTGGTGCGAGTAGTAAAGGTGAGAGTGATGGCGACGGATTACTTA
AAATATTAGTCCATAAAGCAGATGGCTCAAAGGATATAATAAATATTGAT
ACTGCTTCTGACGCTGCAAATAATAAGTGGAGGATTAAATTAAATCATGG
ATACGCATTAACTGGTTACAAGTTACAAGGTGAGACGGTAGACCGAATGC
ATGTATATTTTGACCGCTCTATTGGATATGAGGCGTTTTTGGTGCTCATG
TCACGTCATAGAGAAGAGGTTAAGCTTCATGCGTCCGCAGAGGAGCTTGA
AAATATAGTGTATCAGCGTCTTGATAGTGATGTAGAGAAAGTTAGAAATC
AGTTCAAGATTAACAGCTATGAGATGCGAGATGAGACGCGTATTAATTCT
GCAGGGGAAGAATATACAGTTCAAGTAAAGGAAGAGATACCTAACTGGCT
AATCGGCTTAACTCTTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAATAATAGCTTTGCAA
TAGACTATGGAAAGGGTGGTACTTTAGAAGGCAGTCAGCTAATCATCAAG
GAGTATTTAGAAGCACGGGGGTGA
>RF_p66 Site-specific recombinases
ATGGCAAAAGTTGGATATGCACGCGTTAGTTCATTAGGTCAATTACTCAG
CATCCAATTAGATAAATTAAAAGATTGTGATAAAATATTTCAAGAAAAGA
AATCCGGTCTTGATGGAACAAGAAGTGCATTAAAAAATGCACTGGATTAT
GTACGTGAGGGCGATATCTTTATTGTTACAAAATTAGATAGGTTAGCACG
CTCTACTGCACATCTATGCAAAATAGCCGAGATTTTAAATCAGAAATCTG
TGGCTCTGAAAGTTTTAGATCAAAATATCGATACTAAAGATGCGACTGGT
CGGTTAATATTTAATGTGTTAGGAGCGATCGGACAATTTGAAACTGAGAT
TAGAGCCGAGAGGCAAATAGATGGAATCCTAAAAGCAAAAGAGCGAGGTA
TACAGTTTGGGAAGAAACAATACTTAACAAAGCAACAATTAAATGATCTT
AAAGAAAAACGAAAACAAGGTATTAAAATCAAAAACCTGATGCAAGAATT
CAATTTATCAAAAGCCTCAATATATCGCTATCTTGCACAGGAAGTATAA
>RF_p38 Conjugative transfer protein TraA_Ti
TTGCATACGCATTCGCATATACAAAGAAGCAAGGGACAAAATGCTGTTGC
TAAAGCTGCATATATTTCTGCTAGTAAATTAGTATATAAAACTACCTGTC
ATGAAACTGGTGAGGAAATAAGTATAACCTTTGATTTTACACAAAAGCAA
GGAGTGATATATAGTAAGATATTTGTGCCTGAAGGCTTTGAAGACGCTGC
ATGGCTACAAGATAGAGAACAGTTATGGAACGGAGCAGAAGCAAGAGAAA
AAGAGCGGATTCTAGGACTGCATCAGAAATAG
>RF_p68 unknown
ATGGCTAAAGGATGGATTAAGGAGCAAGAAGAAAGCTTAATAACACAAAT
ATTAGCGGGTAAATTTTATCACAACTTATCTAATGAGATTCCTTGTGATA
GTCTGCCAGTTTTACAATCACCGAGTAATACCCAATATTGGGGTAACGAA
AATCCTTCTGTTAGTTCAGTATTACTTGCTGATATTGTTGCTAGTTGTAA
TAAGAAGCAAGATAATCTAGCTGGAGCTGCCACTTTCTTTCCTTTTATAG
ATAGTAGCTATGCATTACCTGATAGTATTGTTCCCGCATCATATTCGTTT
GCTACTAAAAATGGTATGACACTTTTTGGTGATTATCAGTATGGTGCCCA
TCGTTATTTTAAGGAACAATTAGTGTTTGGTCCTGAGGATTGTTCTACTG
CGGTAGGTAAAGCAACTTATCTGACTACCGATCAAATTAAAGATATAAAT
ACTACCAACATGCAAGCAGCGTATGAGGCCAGTATAGAAACAGGGAGCCC
AGACCCTAAATATCACTATCAAGCGGTAACTTTTTTAAGTGGTGATATTC
AAGATAGCCAGTTGAGATTAATTCAAGAAGGTGATATTTATCTTGTAAAG
GGTCACACAGCTCTTATTGCTACCAAACCTGATAGTAGAAGTACAATTAC
TACTATACAGTTTAATAGAGATATAGACTCGGCTGAAAATAAAATATTAG
GAGGTGGTACATATGATTATAATTTATGTGATAAAGCTAAAGAAATAAAA
ACTGGTATTTATATTTTACGTCCTACTACTGTACAACCTTTACATAAATC
TTATTCTTTGGGTGAATTGTTGAATCAAATTGACTCAAAATATTTAACTC
TTTTTCCTGATGGTCCTACAAATATTTCAGGAGATTGTAGAATATTTCTT
GAGGACAATACTACAAACATAGTTGGAGACACTGGTTATAGTACTGGACA
GTTTTAG
>RF_p29 unknown
ATGTCGATAGGTCAGAATTTGCAAAAATTTCTAACACAAAAAATCTCAGA
CATGAAAATAAAGAAAAAAGACTTTATCATGAAATGCGGTATTAAACAGC
CCGTTTTTAACAAAATCTTAGATGGGTCTTTAACCAATCCAAAACTCACT
ACTATAACGAAACTGGCAGATTTTTGTAATGCTTCCATTGATGAAATATT
AGGACGCGCTCCTAAATATTATTCATCAAAAAAACAGACTTTTAACCCGA
TTAACTCTCACTCTATTACAAATAATCTGCTATCTGTAGTAAAAAATACC
ATGACAGACCTTGATATTAGTGCATATCAACTAGCGAAAAGAATTCATGT
CAGTTCTAATACTTTAAATATGTTCCTAGATCCTAACGTCAGTGCTACGC
CCGGTGCTGCTACAACCCTTGCCCTTGCAAACTTTCTTGATGCCTCTATA
GATGATATGATCGGTAGAAGACCTCCATCACGCACACAAGAACAAAAGCG
AGATATTCCGAATCAACTATCCTCGCTTTTTAAGCAAGACCTTGAGAAGC
TTTCTGATATTAAACATTCTGTTAAATCTTCCGCTGCTCAAAATCAAAAC
ATTAAGAAAACTACCTCTATCAAGCACCTAAATAAACACAAAGATGAAGG
TAGAAGTCATTGA
>RF_p60 hypothetical protein
TTGTCAGTAGGACGAAAAAATTGGCTTTTTGCTGGATCAGACAGTGGCGG
TCATACTGCCTCTATTATTTATTCCATTATCAAAACTGCTAAATTAAATC
ACATCAATCTTTGGAAATATTTACAAAAAGTACTTGCAATAATTCAGGAT
TATAGAGCTAATAAAGTTGAAGATCTCCTTCCCTGGAATATTTTACTAGA
TTAA
>RF_p30 Transposase
ATGAATAATCATTTAGGATATAGCAAGTACAATCAAAGTGATGCTCAGAA
TTCACGTAATGGTTATAACACAAAGAATCTGATTACAAAGAATGGTGCTG
TTGAGATTGAAGTGCCAAGAGATAGAAATAGCAGTTTTGCACCATCATTA
GTAGCAAAGCGTCAAAGAAGGCTTGATGGTTTTGATGATAAAGTACTATC
TTTGTATGCTAAAGGTATGAGTTTATCAGATATAAAATTACAGCTTCAGG
AGTTATATGGAGCTGATGTAAGCGAGAGTTTAATTAGCCAAATCACAGAT
GATATAATAGAGGATGTTAAGCTATGGCAAAGCCGTCCATTAGATCCAGT
ATATGCTATAGTATTTTTTGATTGTTTAATAGTAAAAGTACGTCAGGATA
AACGGATTATCAATAAATCGGTATATGTTGCATTAGGTATTGATTTAGAA
GGGCGGAAAGATATTTTGGGATTATGGATCAGTGAGAATGAAGGGGCTAA
ATTTTGGCTTGGAAATTTTACTGAGATGAAAAATAGAGGTATACAAGACA
TACTGATAGCATGTAGCGATAACCTTAATGGTATGTCTGAAGCTATAGGT
GCTGTTTTTCCAAAGACGGAGCATCAATTATGTATTGTACATCAAATTAG
AAATAGTTTACGATATGTATCATATAAGGACCGGAAAGAGCTTGCTGGTG
ATTTAAAACCTATTTATACACTAGCACAGAAAAAGAAGCACTTTCCGCTT
TAG
>RF_p43 Putative conjugative transfer protein TraD_F
TTGCTCCGAATCACTACATATTCAAGTAACTCAGAATTTGCCAAAGCATT
TGAGAATACTGCAGTTGCAGGAATGATAAATAACTCAGCTCCTGAGACTT
CTACTGGCGTACAAGCAACGCTTAGCAAGAATATCGCAGCTTTAAAGCAT
CTAGCCCCCATAAGGGATTTTTCAATTAGACAGTGGTGTAATGACGAAGA
AAACAAAAGCTGGTTATTTTTAACGGCACTTCCTAGCCAAAGAGCAACAC
TTAGCCCTTTATTATCTGCTTGGATTAGTGTGGCTTTAAAGTCATTAATG
AGCAGAGATATAGGAAGCACAGTAGAGAATCTTTGGTTTATTATGGATGA
GCTGCCTGCTCTTGGTAAAATCAATAGCTTAAATACAGCTCTTGCAGAAA
GCAGAAAATATGGCGGATGCTTTGTTGCAGGTATTCAGAACATATTTCAG
CTTGATAAAATATATGGCTCTGCTGCAGCTAATGATTTACTTGATTTGTT
TAATTCAAAGTTCATTTTTCGTGTTGGCGATCAGCAAACAGCACATAGAT
CGGCAATGATGCTAGGTGAGCAAGAAATACGCAAAACCCAAGAAAGTCTA
TCGTATGGCTCAAACACCATAAGAGATGGTGTTAATATCAATACTATAGA
ACAAAAGAAGATGCAGGTATTACCTGCTGAAATCATGTCTCTACCTAACT
TATCGTGTTTTGTAAAGTTAGCGGGACATTATCCGATTTCTAAATTGAAG
ATGAAATGGCAGAATTGA
>RF_p05 unknown
ATGCAATTATTTTATCCACTTGGGTTACCAAGTGAAAATATAGGTATACA
TGGGTTCCATGATACCACAAAGAATCAACCACAATCATACATCCCAATAA
CTGGATGTGTCTTATCTCACATATTATCATGCTCTAGGTTATCTTCCCTT
GAGAAGATGTATTTTATCTTAGCTGATTCTCTTATCTGTATTAACTCATC
TAAAGGACGTAATAGATCTATAGCTCTTCCTGCTACAAGCTGGGCTGAGA
GACTTTCTTGTTCTAAATCTAAAGTGTTTATATTACAGAAATCCCTAGAA
GATAAAGGATATTTCATTATATATAGAGATAAGAACGATCAGGGACAGAA
TAATCGTAATACTATTACTACTACTATTCCTGATCATGTTTTTAGTGATC
TTAAATATGAACCTGATAGATTTAATTTAAATTCTGATAGTGATATAGAG
ACTCAGAGTACTAATCATTCTCAGTCAGATAATCTAGATTCTATAGATAA
AACATTCATACCTACATTAGAAGGTAAGAGACAACATCTTGCAAAAACTA
AGATGTTTATTAGAGTACCTTATAAGTTCTTAAAAGAATTAAATTCTAAT
TGTAACATTTCTGCAACATCTAAAGTTGTATTATTACATCTTTTCACAAA
GATGTATAAATCTTCGGTTTGTAAGTACGATTATAACTGTTTTGGTAGTA
GATATGATTATGGCAACGCTGTTGATTATTTAACACAAAATTCAAATTCT
ATTGTTACATCATATCAAGAACTTCAACAAGAACTTAAATTACACAGAAA
TAGCCTTACTAAGGCATTACAGACTCTAGAAACAGCTAATCTTATTAAGA
GGGGTCAGATAGTTATTAAAAATGATAATTATTATAACAGCAGAGCTGAT
AAATCATTATGGAGAATATCTCTTGTAAATGCACTTCGTATAACTAATGA
TAGTACTCTTCATGAACAAAAAGGACAAATTGGATATGATGAGCAGGAAG
AACGATTTGATAAGACTCAGTTATTAATCAGTACCTCAAATACAACAATA
CGCACTAATGATCAGAAAAATGATACAGGCAAAAATAGGGTCCGAGAATC
CTTTTCGGAAAAGGGATGCACTAAACATGACCCTCCTTGCACTGATTCTG
GTCAATTATATATTAAATACTTTATAGTAAATAATAATATTAATAAAAAT
ATAGATTATATAGATGTAAAATCTGAAGAAGAGTTTTTGGAAAACGAGCT
TTGCTCGTTTCCATCTGAATCTTATAACAATTCTTTTAAAAGTTCTATTA
AGGCTAAACCATCTTGTTCTAATACTACCTCTGAATCCGCTGCAAGAACC
ATCAAAAATACATCTGAATATAAGGAACTAAGGAATTTCTATCCACTTTC
TGAACAAGATGTAGATACGCTTAACTTTAGAGCTGGTAGAGAATTTAGCA
ATAATTTTATGAATCAGTTATTACTGAAGCTCTACATCAAATATCCTGAG
AAGAGATTTAAGAACAAATTTTCGTTCTTAAGCTACATGGAGAAGATTCT
AAAGAATGAGAAGCATCAAGGACCTTTAGTAAATCATACAACATTTAGAT
TTAGCTGTAATATAGGAGCAATAGAGAAAAACTTACTCGAATATGAGAAA
TACTTAAACCAAATAGAAAGCTCATTTGATACCAGTAAAGATATGCAGAT
AAGGAAGAAGATAGCCGGAAGATTTAGTACTAATGTGGCATATGAAATAC
TAAAGGAGGTAGAGTTTAAAACAAACAATGATAATAGCTTTATACTTGCG
TTAGTTCCAAACCAACTTGCTTTAAGCGAGCGACAAATAGCAACATTAAG
TGAGCAACTAGAAGCAGTATATGGAATTAACGGTTATTACGTTACGGTGT
TGGAAGGAGATGTAAATCCTGAAGATGTAGAATATGCTGAAAGGAGTAGA
GGGAAAAAAGAGATAGCAATAGGAGTAAACAATGAAATGATTTATCCTAA
AACTGCAGTATTTGATAATGTAGAAAATGATACCCCTATTGATATTCCAG
CTAGTAACAGCGTTGTGAATACAACTAACGAAAACACCGTCTGGAATCAA
ATACGGAAAGGCTTAAGAGAAGAGCTAGGGGAAGCTGTAGATGAGACTTG
GTTTTCTAAAGCAGAGGCTAAAGAATGCAAGGAAACAAAAACCCTGACCC
TAACAATGCCAACAAGGTTTATGTCTGATTGGGTTAGAAATAATTACTCG
CATGTTATAAGAGGGCTTAGCGAAGGATATAAAATTAATTACAAATTTAA
GGAAGTGTTTAAATGCCATTATTAA
>RF_p20 unknown
ATGTTTATTAGAGTACCTTATCAGTTCTTAAAGCAATTAAATTCTAATTG
TAGCATTTCTGCAACATCTAGAGTAATAATGTTGTATCTTTTTACTAAGA
TTTATAAATCTTCTGCTAATAAGTACAATTATGATGATTCTGATAGTTCT
TTAACTCGTCATTCATACTCTATTGTTACTTCTTATAGGAAATTACAAAA
AGAACTTAAATTACACAGAAATTCTATTTCTAAAGCATTGAAGACTTTAG
AAGATAATAATTTTATCTCTAAACAGAGATTTTTCATAAAAGATACAGAA
GATTATAACAATAGCAGAGCTGATAAATCATTGTGGCAGATATCAGTGCT
TAATGTTCCATTTATCACCAATCATAATAATCGCCATACACAAGAAGCAG
TAATTAGCAATCAAACTAAGGTGGAATATAATAACAACGAAGCCTTGGAA
TCCTCTAAGGAATGGGAATGCACTAAATATGACCCTGCTTGCACTGATTA
TGGTCAATTATATAATAAAGACTTTTGTATTAAAGGATAG
>RF_p22 unknown
ATGGCATTAAAAAAACGTCCATTGCAGATTTCTCAACAAAAGATTGAGAA
TTTAGCAAATGAATTAGCAGATAAACCTTATGGTTATACAAAAGAAGATG
ATACTCTTGTGCGTACTACAATTTCACTCCCTGCTTCTGTTTTATTCAAA
TTAGAAGATCTCTCGAGACATAATAAACGGACAAGGAGCTCATTAAAATC
CGTGAGTGCAATAATCCGTGATTGTATTGCAAAATCTTTAAATATTTAA
>RF_p07 Type I restriction-modification system methyltransferase subunit
TTGAGTCCTATTGAAACTTTGGTAAAACCATCAATTTTGAACACTATTGT
AGCAAAATTAGATGATTTACATTTATCAGCAACGCATAGTGACATAAAAG
GTGATGCTTTTGAATATTTTCTACGAAATTATGGAGGAGCTGATACTGAT
TTTGGCGAGTATTTCACTCCAAGACATATAGTAACTGCTTTGGTCAATTT
GCTAGACCCCAAGTTTGGTGAGAAAGTTTACGATCCATTTTGTGGTACTG
GAGGTATGCTTATTACATCGTATAAGCATATTTACGATAATTTAAGTTTA
AGAACACCGGAAAACATACAAAGATTAAAAAAACAGACTGTTTATGGCGG
GGAAATCACTAAGATGTATCGTATTGCTAAAATGAATATGATATTAGCAG
GAGATGGACATAGCAATATCGTAAGACAAAATAGTTATGGTACCCCTGAT
ACTATAAAGCAAATAGATGTTATTAAAGATGGTTTTGTTACTAAAGAGAA
TATAAAGATAAAATACGATGTAGTAATTAGCAATATGCCTTTTGGTCGTA
AAATGAAGACAGAGCATGCAGGGCTGTATGGTTTTAATACTAGATCAGCT
GAAATTACAGGAGTTTTACACTGTTTAAATTCATTAAATAATAATGAAAA
TGCAAGATTAGGCTTAATAGTTCCTGAGGGCATTTTGTTTGATAAAAGAG
AGCTGATAAGTATTAGGTCTATATCTTTGTCTGATGCCTTAATCTCCTCT
TCGTCTCCAGTAAATTTGTATATATGTTTAGTGATATTATTAATATTATC
ACTAATTCTTTGTGTGTTGCCGTTATCACCAATTACGGCTATACTTCTCT
CAGCTTCCTCTTCCATACTCATAGCAGCTACACCAAGAATGATATTGCTA
CTATTTCTTATCATCAGCTCATCTATTAACTTCTTGGTTCTTGATAATGC
TGTTAATCTAACTAGTAAACACTATAATATTAATTGGATATGTTATTAA
>RF_p41 Transposase
ATGAATAACAAAAATATACCAAAAGATTATAGCGAAGTAAGCGTAGCCGA
CACTAAAGCAAGTAATCGTCACCATGAGCAAGTAGACTTGGATAGTCACA
ACACTTCCGAGCGTCCAAGGCATGATGCTCTTATTCGCAAAGCTCTAGAG
AACCCACTAGTTGCCAAAGAGTTCTTTGAGATGCATCTGCCAAAAGAAAT
TAAAGCTATGTTCTCTTCTCATACTCTGAAGATGGAGAAAGAAAGCTTTG
TTGAAGCAGATCTAAAGCACTCTATATCTGATATCCTATTCTCAGCTAAG
TTTAAAGATAATACTGGATATCTTTGGGTTCTACTAGAGCATCAAAGTAC
TCCTGATCACTTCATGGCTTTTAGGCTATTTAAGTATATGACGGATATTG
CATCAAGGCATTTAACTCTTAATCCTAAATCTAAACATCTGCCTTTTGTA
TATCCATTAGTGTTCTACAATGGCAAAAAGAAATATAATGCTCCAAAGAA
TATCTGGGATCTATGCCAGCATAAAGAACTAATGCAAGATATTTGGACTA
AAGACCATAAGGTAGTAAATGTTCATGATATTCCTGATGAAGAATTAAAG
AAGAAAGCTTGGGCAGGAATACTACAATTCTTCATGAAACATATCCATGA
AAGAGACTTACTTAAAAGATGGTATGAGGTAGCTGATCTATTACCTGAAT
TTGCCAAACTTAATATTGGTATTGATTACCTAGAACTGATATTAACCTAT
ACATTGATTAAGATTGAGAAATCTGATAAAATAGAGTTAGAAAAATTATT
AAAATCTCGTCTTAATACCGAACAAGGAGAAAAACTTATGACTAGCTTAG
CTCATCATTGGGAACAACAAGGTGTAGAAAAAGGCATGCAGATTGGAGAA
GCTAAAGGCATGCAGATTGGTAGAAATGAAGGAAAGCATGAAAAAACTAT
AGAAGTAGCTAAAAATATGCTTTCTAATAATTACTCTATTCCTGAGGTTT
CTCGTATTACTGGTTTGTCTATCGCTGAAATTAACGATCTCCTTAAATCT
TAA
>RF_p63 unknown
ATGGGCGGCAGTAACGCTGCTGATAGAGTCAATTGGAGTCAGCTTCAGTT
TCAGTGGCGGGATGCAATAATATGGCCTGATAATGATCAGCCAGGCTTTA
AAGCAGCAGAGGTGATAAAGGACAAGATTAACAAGGCAAATGAGCATATA
GGTTTTGTAAGCGTAGTTGATCCAAGAAGACTACAATTTGGCGGCAGTAC
TCACAAAGACTTATTGCCTGAGAAGTGGGATCAAGAAAAATCAAGTCATT
ATATTAAATATTTAGAGGCGACAGGTAAGGGCGGCGTAGCACATGATTAT
TTAAAATATGACTCAATAATGTATCAAGATATATTAACTAGTCTTGCGAT
GCGTGACGAGCGTTTAAGCAAAAGTATCAAGGAGTTAAGTGATAGCAACA
ATACTTCTGATATTGAGACTATAGAGCATCGAACTAAGTTAATAGATGAT
ACGCAAAATCTATACGAGAAAAAAGCGTTAGAATATAGCGGTATCGCAGG
TACAAATGTAGTATACAGAGGTCATTTGGAACTGATGGTGAAAAACTATG
GTGAATCACATGAGAAAGTAACATGA
>RF_p53 DNA polymerase III, epsilon subunit-like protein
TTGATAAGACTCAAGTTTCTTGAAGAAGTTGATATTATCATTGCCCACAA
TGCTGCATTTGATAGACCTTTTTTTGATAAAATGTTTCCTGAAGTTATAA
CCAAAGTATGGGGATGCTCAAGAGTTGATATTGATTGGAAAGCTGAGAAA
ATAGAAAGCCATAAACTAGAATATCTTACTTATAAATATAATTTCTTTTA
TGAGGGACACAGAGCTGTTATAGACTGCCGCGCTGGGTTGCATTTACTTG
CTCAAACCTTACCTATTACTAAAACACTAGTATTAAAACAATTACTTAAT
AATTGCCATAAAACCAGATTTAATGTTTGGGTACACAATGCCCCTTATGA
CTCTAAAGATTTACTTAAATCTAGAGGCTATCGCTGGTCTATCAATCCAC
AAGCAAATTATAAAGCTTGGATGATTGAAGTATTTGAAGATACTCTCGAA
ACAGAGCTAACATTCCTGAATTCTAATGTTTACAAAACGCCCTATAATAT
CCCAGTACAAACCATAAACCCTTGTGATAGATTTATGGGATAA
>RF_p47 Conjugative transfer protein TraG
ATGGTACTTCCACTAACTTGCCTTGTAGGCGGTTTTAAGTTCTTTCAGTT
TTGGTGTAACTTTACAATATGGGTATCATCATGGCCAATATTTTACTCAC
TAGTGCATTGTTTAGGTATGTTATCATTATCAGGCAAGGTCAGCGTATTT
GGTGGTAATGGCATGAGCATCTTGTCACAAGGCTCATATTCTGAATATGC
ATTAAATACTTATGCAACATATCAGATGCTTGAATGTTTAGTGCCGCCTT
TATCTTGGGCGTTATTTAAAGCTTGCTCGCATGGTATGTCTATGCTTGCA
GGTCAGTTCTCGCCGCTTTCTGTTGCAAGTAGCGTTGCTGCAGGAATTGC
TGATAATAACCTCAGCATGGATAATGTAAGTATTGGTAATAGAACAATAT
CGCAGCAGAATCTAGCTCCATCTTTAATGATGGCAGACAGTTCATTACAG
AAAGCGTTGATACACTGA
>RF_p12 unknown
ATGTTTAAAATAAAAAATATTACAAAAAGCATCAAGCACATAAAGAAAAT
ACTAACACCTAGTTCTCACAAAACGACATGTTCTAGCATAGTAGCATCGA
CATTTGATATGGAGACATCTAATAAAATTACCTCTGACTTTGGTTTTAGT
AAAAAGTATGTTGTGAATAACAGTAAAGAGATAGATTGGGTAGGAATCAG
GAAAGCAATATATAACAGATTTTCTGATGAGATCGATGCCACAAATATAC
AGAGCTTGGAGCAAGTTACGCCACTTGTTGCATCGAAACAACAAGGGTTT
AGTGCTACGAATGTAAATATCAATTGGGCAGAGATTAGGGCATTAATATA
TAACAGGTTTGCGGATGAAATACATGCGTGGAGCAAGAAGCAGCATGGTG
ATATTATAAAATATAGTCCAGTGAGAGATGTGAATGAAGAACTGGAGATA
ATAAAAGAGCAGGGATATAGTTTTGCAAAACAAAAAGCTGCTTTAAAAAG
GAGTATCACAGATAAATGGGACGAGATTGAGAGAATAAAATATTTGTCTC
AGGACACATCATGGAATACCAAGAGTCAACAGAAGCTATTATCACATGAT
AATAGTATTATTGGTAGAATGAAATTCTTGTCTATTAAGGGTTACTTATC
AAATTATGCTGGAGATGATGAGTTGTCACAATCCATCGATTCAGTAATCA
AAATTAAAGATACATTGATCACAGAGTTTATGAATAGAGTCTATGATAAG
CATATGCATGCTACAGCGGCTCGGCAAAATGTAGCGGAGGCAATAACATT
TGACAGTTTAATAGATGAGCAAGAAGTGATGGTATTAGGAGAATAA
>RF_p57 Transposase
ATGAGGTTTGTACCAATTAAAACTGTAGAACAACAAGATATTTTATCAAT
TCATAGAGTAAGAGAGAGATTGATAAAAAATCGTACGGCACTTGCTAATG
AAATTAGGGGTCTACTACATGAATTTGGTTTTATTATTCCTCAAGGGATA
AATAAGGTTATGACAAAATTAACCGAAATTTTAGATGAAGGAAATTTAAG
CCAGCTAGGTTATCAAACATTTAGTGAACTGAAAGAGGAGTTTTTGGATA
ATAATAAAAAAATAAAAGAGATAGAAAAAAGATTAAAAATAATCACTAGC
AACCTAACTCAATATCAACGATTAACAACTATACCTGGTCTTGGTTTAAT
TACTGCTACTGCTTTAATAGCATCAATAGGTAGTGCTACAAATTTTGACA
ATGGCAGGCAATTATCGGCATGGCTAGGATTAGTGCCAAGACAACATTCA
AGTGGTGGAAAAGATAAGCTGTTTGGAATTAGCAAGCGAGGTGATGTATA
CTTACGCACTTTATTAATTCAGGGGGCTAGAGCTGTACTAAATGCCAAGA
TAAGATTCACATCGGAAGAACAGAAATCTAAAAAAGATTTTAGCAAATTT
ACGCAATGGATGTTTAATTTATCTGAGCGAAGTGGTCATAATAAAACAAC
AGTTGCCATAGCTAATAAATTGGCAAGAGTTGTGTTTGCCGTACTCAGAT
CAGGAGATGATTATGTGGAGAGTAAAGTTTGCAGCTAA
>RF_p21 unknown
ATGATGTATATAACAGCTCTGCAGTTAAAAGTTGCTCGGAATATTTTAGA
TTTAGGGGTGCGCGACATTGCAGTATTATTACATGTTAGTAAAACTACAA
TTAGCAAAGTAGAACTCAACAAAACTCGTGATTTTCTACCAAAACATAAT
GCTGCACTTGTTCATTTTTTCTCTTGTAATAATATCTCTTTTCCTAATCC
ATTTAGCATTCAATATAAACCACAAAATATAATTAATACCAACACAGAGA
GTGCAATAACTAGATTTCAGTTAAAAGGCGCTCGATGCATTCTCAATATC
AGTCAAGCCGATCTTGCTAAAGCATTAAATATAAATAGATCAGTAATAAT
TGAGGCTGAAAAGTACCAAAATGAGCAACGCTTAACACTTTTTGGACAAC
AGAAAGAACTTGAGATAATACAATTTTTTAATGATAATAATATTGTACTA
TATGACCATTTGTCCTTGTTTTTTAGAAAAAGAGTAGACAAATGA
>RF_p62 unknown
ATGAATATCAATGATGTACCTGATAGTCACCACAAAGAGATAGCACGAGA
CGTGTATAGTACTATCTCAGAGTATAGTAATAGATACGCACTAGATGCTA
CTGACAAAAATAAGATTGCAAATTCAGTATATGAAGCACATTGCACGCTT
AAAGCGTGGCAGCAAAGATCGTATGCACAAGTTGCTACTAGCTACACAGT
CTATCAGGACCGACAGAAATACCTAGAACATAAAAGACTTGCTGATATAG
AAAGAGAATCGGAGCGTAAGACCTTAATAGAACATACGCAGCAAATCAAA
CATGAGATATTGGTAGCAAAAACAGTATCCGAGATATTTGTAGCTTTAGA
GAAAGATCAAAAGTTCTTTATAGAACAAAATGGCAATATTAAATATACAA
CATTTAATTATAAATTTGTGGATCTAGTGGAACAAGCTCTTGAATACAAG
GAACAAGAACTTTTACCTCAATTAAAAGATGCAGCAGCAGAAGCAGAACA
GCATGGGGTGTTCAGTACACAAGACATATTAGCAGAGCTTAAAGGTAGTA
AGGACTTAGCAGAGACATATAAGCACTTTGATAGCAGTTTAGAGCGTCAT
CATTTAGAAACTCAGCATCAGCAGATCAGAAAAGATAAAGTAGATGCTAA
AACTACCGATGAAATGTTAACTACAATTCGCCGTGAACATGAGTTCTTTA
AGTCTCTTAATGGCAAGCTTAAATATGCAGGGCAGTATGATAGCAGTGTA
TTATCTGCGATCTCGAATGCTAAGTCTATAGAGCAAGATAAGCTTATTAC
AAATATGCATAATATGGTAGTATATGCTAAGAAACATGGTATATTAAATG
ATCACGAGATACTAAATCAATTTAACTCTAATGATAGTCAAAATGTTCTT
AAGAATTTAAGTAAAACATGTGAGAAACATTATATGGATCGCCATAATGA
GAATATTAAGCAGCTATTAGATGATGAGCATGTGATAATAGGATCTAAGA
AATATTCCTGTCCGCTTAAATATATGAAGCATGAGATGCAGAATGATATA
CCAAGCTTTATAGATGAGAAGCAAATAGCTGCAACCTTTGCAAAAGTAAA
AGCAGAAGTTAAAGAGCTACGCCTAGAAAGAGAGTTAGAACATACAATGA
CGATGAGATTTTAA
>RF_p59 unknown
ATGGAGATTAATGGTAAAAAAGCTAAAATATATTACAGTGATAGTGCTTC
GGCAGATGGGCCAGATTATGCTATTATAGATATTTCTAGTAAGAAGGCTA
AATATAAAAAAGCTACATATGACACTTCAAACCCCTCTAGCTCACATTCT
GACGATCACGAAAGAATGGAGTTAATAAATTCAAGTGATAACTCTATACA
AGATAACATTAATGTCATATCTTATAGTATTGTTAGTGCTGCGGCAAACA
AAACAGATTATATAAATACGTCTAGTAAAAGAGACAGATAA
>RF_p19 unknown
ATGACCCTGCTTGCACTGATTATGGTCAATTATATAATAAAGACTTTTGT
ATTAAAGGATAGTATTATTGAAAATATAGATTATATAGATGGTAAAAAAA
AGTTTTTGGAAAACGAGCTTTGCTCGTTTCCATCTGAATCTTATAACAAT
TCTTTTAAAAGTTCTATTAAGGCTAAACCATCTTGTTCTAATACTACCTC
TGAATCCGCTGCAAGAACCATCAAAGATATATCTGAATATAAGGAACTAA
GGCATTTCTACCCACTTTCTGAAAAAGATATAGATACGCTTAACTTTAGA
GCTGGTAGAGAATTCAGCAATAATTTTATGAATCAGTTATTACTGAAGCT
CTACATCAAATATCCTGAGAAGAGATTTAAGAACAAATTCACATTCTTAA
GCTACATGGAGCAGATCCTTGCGAATGAGAAGCATCAAGGGCCTTTAGTA
AATCATACAAGCTTTAGGTTTAGCTGTAATATAGAGAAAAACTTACTCGA
ATATGAGAAATACCTAAACAAAATAGAGAGCTCATTTGATACAAGCAAAG
AAATGCAGGTAAGGAAGAAAATAGCAGGAAGATTTAGTACAGAATTAGCA
TATGAAATACTAACGAAAGTACAATTTAAGACAAACCATGGGAATAGTGT
TGTTGCTGCGTTAGTTCCAAACCAGCTTGCTTTAAGCGAGCGACAAATAG
CAACATTAAGTGAGCAATTAGAAGCAGTATATGGTGTAAACGGTTATTAT
GTACAGGAAGTTGAGCAAGAAGAGCAAATTACAGATATAAAAACTGAGGA
TGTAGGATATGATGAAGATGGCATATTGGAAGGTGGAAGAAAAGAAGAAA
TTGAAAAGAAAAATTCTAAAATCAAAGAGCCTGATATTATTTCTAGTAAC
AAAGATATTGGAATTTTAGATATAGGTAAGGAATTAGATGCAACCAACAA
AAACACAGTATGGCATCAAATCAGAAAAGGCTTAAGAAAAGAGTTAGGTG
AGCATATTGATCAAGCTTGGTTTGCAAAAGCAGAGGCTAAAGAATGCAGG
AACACTGGTCTACTCACGCTAACAATGCCAACAAGGTTCATGGCAGATTG
GGTACGGAATAACTACTCGCATGTGATACGGAGGCTTAGTGAAGGATATG
GGATTAAGAGGGTGGAGTATGGTATGCGTGATATTTTATAG
>RF_p40 unknown
ATGCGTGAATGGAAGAGAGATATCGAAGCTGTTGGTAATATTACAAGATT
ACATAGCAAAATTCTAAGTCAGGCTACTAATTTAAAGAGTATCAAATTAG
ACGATACAAGTGCTGCTACTTCTTTTGAATTAGATTTAAACATCAAAGAT
TTAAAGATTGATCCATATAGCATTGCTCTTAGCGAGGTGCAAGATAGCTT
TAAATATGTTATTGAAAATATTTTAAAAGAAGCGAGAGAGGAGAAATCAG
AGAGTGCATACAGTAGTAAACAAGATAGCCTAGAGCCAAAAGCAATAAAA
GGCATCACTAATATTGATGGTAAGGCATGCATTAACTTCAAGGAGCTTGA
TAGCAAGCATCAAAGCAAAATCATCGCTATTTGTTTAAAAGAAAGTACCT
TTGAAAATCTTAAAGAAATCTTTGAGGAGTTAAAATTAGAAAAAGAAGTT
TTAAGAGATTACGCTTCAGTTATTTGTGATAGCTACTCTAGCGTGGTATC
TGCTGAAGATGCAAAGGAATTTAATAAACTAATTTTTGCTAAGAAAGATG
AGAGCAAGTTAGTTACGGAAAGCAAGGTCGAACTTAGAGCTTTAGTCCGT
GAGCAGAATTTTAGCAAGTCGGAAGAGAGAAAAACTCAGTTAGAAGAGCA
GATTACTATAGTTAAGGAGCAATCAGCTCAGCACGATGAGAAGTTAGTGG
AGATAGCCGGAAGAATATCAAATAGACTCTCGCTAATTAAGGAGCATACT
ACATTAGATAGTAGCTCTGTATTAATGGGTGAGCGGACGATTCAGTTAAA
TATTAACTATGAGACGCTACGCAAACATGCAGGTTACGATATGGCAGAAT
ATGAGGCTGGTAGTTTTAAAAAGAAATTAATAATATGTGCTGCAGCATTT
GCAATGTTAGTAGCTAGTTGCTGTATTTCATCATATATTGTATATAAGAA
GTTTCCGGGCAGAATTCAAATGCGTCATGATGGTCCGATGCATGTTGAAA
ATAGCAGTGTAATGCTACATTATCCGACTATTGGAAAAATAGACGGAACA
AATAATAAGAAAATTGGTAAATAG
>RF_p58 Transposase
TTGGTTGGTATAGATATTGCAAAAAGAATTTTTCAAATTCATGGTGTAGA
TAAAAATGGTAATACGGTATTAAAGAAAAAATTGATGAGAGAACAGATTT
TAACATTTATGGCTAATTTGCCAAAATGTTTAGTGGGGACGGAAGCTTGT
GGTGGAGCTAGTTGGGCAAGAGAAATAACTAAATTGGATCATACAGTAAA
ACTGATGGCACCACAATTTGTCAAACCGTATGTCAAAACTAATAAAAACG
ATCAAGCTGATGCTGAAGCTATATGTGAAGCAGTAGCAGACCAAATATGA
>RF_p45 unknown
ATGTTATTTCAAATACTTCCAATATTTTGGATTATCGCTATTTGCGCTAA
AATACCGATGACAAAAAAACTTATTATGAAATTCCCAATTATTTCTAAAA
TATGGTTAATGCTACTAAAATTTATAAAGGACTTAGATATCAAGGGCATG
TATTCAAGCCCTAATAATTTAACTGGTTTTAGTTCAGATATGGGTAATCA
TAGAAGAGATGATGAACGATCTACCAGTCCGTCATATTTTTATTTGCCAT
ATAACATATACTATGAATCTGATAAATAG
>RF_p34 DNA polymerase III, epsilon subunit-like protein
ATGAAGCACTATTGGACTAAAGATCATAAATATTATAGATTAACTACTCA
AGCTAATTTATTTGGTACTACTGACCTTATATGTAGCTGGGGTTCTTTGC
ACTCTAATAAAGGCAATTATAAAGTTATCCACTGTAACTCACCATATGAT
ATGGATAAGAATATTAAGCGTATTACTAGGATAAGGAAAGCAAGGGGGTA
TCAGCATACTCTTCCTATGCAAGAAGTATCTAATACTGCAGGTAAAGATT
TTAAATATAACAATCTAGAGCAAATAGCTGACATATTAAGTATCTCAGAT
CAGTATAAAGTTATTAAGCGATATACAAAACCTAATTTTTACCATTTACC
TGATAACACTCCAAAACAAATTGGGATATTTTTGGATACTGAAACTACCG
GCTTATCACATGAAAAAGACAAAATACTTGAACTTGGCATGGTAAAATTT
GAATATACTGAAGATGGACGTATTTATCAAATAGTCGATGAATTGAATCA
GTATCAAGATCCACAACAACCTATACCTTTACGAATCACTGAACTAACAG
GTATTACTGATGAAATGGTTCAAGGCAAGGCTATAGATCAAGAAGCAGTT
ACGCAGTTTCTTGAAAATGTTGATATTATTATTGCACACAATGCTTCATT
TGATAGACCGTTTTTTGATAAAATGTTTCTACACTTACCACCTAAAGCTT
GGGGATGCTCAAGAGCTGATATTGATTGGAAAGCTGAAAAAATAGAAAGC
CATAAACTAGAATATCTTGCTTATAAGTATAATTTCTTTTATGAAGGACA
TAGAGCTGTAACAGATTGTCTTGCTGGCTTGCATTTACTTGCTCAAACAT
TGCCTATTGCTAAACAACCAGTATTAAAGCAGTTACTTGTTAATTGCAAT
AAAACAAGATTTAAGATTTGGGCAAAAAATGCTCCTTATGATACAAAAGA
CTTACTGAAAGCTAGAGGCTATCGTTGGTCTACTCATCCTCAAGATAACT
ATAAAGCGTGGATAATTGAAGTATTTGAAGATAATCTTGAAATAGAACTA
GCATTTTTACGTTCTGATGTTTATAGCACACCTTATAACATCCCAGTACA
AACTATAAATCCTGTTGATAGATTTAGAGTTTAA
>RF_p64 Transposase
GTGACTTATAGTATGAGTTGGATTATACTAAATGAAAAACTTATGGCAAA
GGCATATTCATACGATTTAAGAATACGAGTAATAAAAAGTTTAACAGAAG
GTAAAACAATAAAAGAGACTTCTGAGATATACTCTATTAGTAGGAAGACT
ATAATAGAGTGGAAAGAATTAAAGAAACAAACTGGGGATGTCAAAGCAAA
AAGTGGTTATCATACAGGACATCGTAGAATAATAAGAGACATAGAGGGAT
TTAAAAAATTTATAGAATTAAATTTTGATAAAACCACCATGGAGCTAGCT
AATAACTGA
>RF_p42 Ankyrin repeat
ATGCATCACTTAATTGATCAACTTAAATCTAAAAATAATATTTTCTATAT
AAGAGCACTAGTACCAATGATCGTGCTTTGTGTTTTATTAATTAGTAAGA
CAGTTTATGGATATGATACAAAATTAGAGCATTTATGTAAGGCTATCAGT
AATAACAATATAGACCTCGTAAAACAGGCTCAACAAAAATCACAATATAA
TCAACGATGTATCCAAGAGCGTGAAACACCTTTGATATTAGCCATCAGCA
ACAATAATATTAAAGTAGTACAAATGCTATTAGATTTTGGAGTTGATATA
GAACAAGAAGGACGATACGGTGGAGCAGCTCTATATAATGCTATTTGTCA
TGATACAAATATAGTGAAATTACTAATAAAGCATGGTGCAAATATAAATA
AACGCCTATCTGAGGGTAGTAGAGAAACGCCTTTAATAAAAGCTACTAAG
TGTTTTGAGAATGGTAGTATCGCTAACACAGAACATATTAAAATATTGCT
TAAGTATGGAGCTGATATAAATGCGAAAGATGTAAATGGTATTACAGCAT
TAAAAATGGCTGAGATGCAAAATGATCAAAGTGCAATCAATTTATTACGT
TCCTCTGGCAAAAAGTAA
>RF_p10 unknown
ATGAGTTATAATCAAGAAGGATACGAATTTAAAATAACACAAGCATTTAA
TTGTTTAAATGACGCAATAGCTTTAACATATTCATCAGTAAATCATTTCT
TAGATATACCTAAGGTAATTAATAAATATGGAGTACTTGCTACTGTAGCT
TTATCAAAAACAAAACAATTAAATCTTACTGATACAAAGTTAGAGAGTAT
AGTAAAAAATGGTTTTATTATATATGAGGTAGTAGAAACAATAATCAAGG
CAAGTAATGCCATCACTAAAGATCAGCAACTGTTCAGTAAAGCTATAGAT
GATGGTTTAAATGCTGTAAATAAATTACAGGAGGCAGCGATTCATTTATC
AGGTGCTTATGAGCCTCTTGCTGAATATGTAACATCATTCTTTGGTAGTA
ATGATCAACATGAACCTTTATTATTTGATACATATACGCCTAACTCAACA
AGTGCTGTAAACGAAGGCTACCATCTGATAGGTAATAATGCTCAATTAAT
AGCGGTAGAAGTCTAA
>RF_p16 Putative Zn-dependent protease
ATGAAAAATAAGAATTATATCCAAAGAAGCAGTATGAGATTGGGCGAAAA
GGAGCAAAAAACTTATTTTAAGCAAGGCATTAACTTTTTGGATCAAGGGA
AATATGAGAAAGCTTTGCAGATATTTGGGATGCTTTTGATGGGAGAGTCA
AAAAATGCAAGTTTTCATTATTACAAAGGTAATACACTTCATAAGCTTAA
AAGATACGAGGAGGCATTAGAAAGTTTTAAGGCAGCAATAAAGTTAAAGC
CATGGGAGGGAGCATATTACTATGGCCTTGCTAGTAGTTATTACGCTGTT
GGTAATGGGACTGAAGGGCTTGAGGCTTTACAAAAAGCAGTATCTGTTTA
TGGGGCTTCAGAAAAAATATACCACAAACATAATATGCTTGCGGGCTTTA
AGAGGGTAGAAGGCGGACATCAAGAGATGCAATTGAATGTTGTGGCTCAC
ACAGCAATAGAGTCATGTAGTCATCTTAAACAATATGCAGAGGTAAAAGT
AGGAGATAATTATAGTTTTGGATTTATGAGATAA
>RF_p44 Putative conjugative transfer protein TraD_F
ATGAACATACAAGAGCAAGGTAGATTCACGCGAGGTGCACAAATCTTCGC
ACATCAGATTAGGATGCTTACGCAAGGCATCACTAATGCACTCACAGTGA
GTCTTACTGCGTCGTGTATGTGGTTAATATTCAGAATCCTTCAAAAAATC
AATATCTTAAGCCTATATTACTATTGCATAGAATGCTACGTGCAGCTAAA
GCTTGCGGTAGGTCAGTATTTCTATGACATCTCACAGATCGGTATAACAT
TCTATGATGTAAAAAGACAGGAATGGATATACCGCTCTGCTGAGGACTTC
ATTCACAAGTTTTGGTATGTAACAAAGCATGGTACTCAGATTACAAGCTT
CGGTTCTTGGCTTGCCGGCTCCGCTGCATTTGAAGTACTTGGTGTTTTTG
CTTTAACTATGCCTGGTATTACTATCTTTTTTTGGTATAGAGGCATCAAA
ACAATAGGCAGTCAGAAATTAAGAGGCATGGATTATGTACAAGCTTCTGA
GCTTACCAAAATCCTATCCAAAGAAAAAGTAGCATCTAATATTAAGTTTG
CAGGACTTCCTATTGTTAAGGATAGTGAAAGACAGCATATACTAATTACT
GGTACTACCGGCACTGGTAAAACCAATATGCTTAATGAGTTATTGCCTCA
AATACGAAGCAATAATGAAAAAGCTATCATTGTTGATATGACAGGATCAT
ATGTTAATAAATTCTATGATCCAAGTAATGGCGATATCATCCTGAATCCT
TTTGATTCACGCACCTCTAATTGGCTACCTTGGAATGATATAGTAGATAC
AGAGGATTTTGATGATCTTGCAAGTCACTTTTCAAGTAATAATGGTATGG
GACGAGCTAGCTTCTTTGATAGAACTGCTGAATTAGTACTTGCAGAAGCT
TTAAAGAAATACGCAGTAAGTAGAGATTAA
>RF_p55 Transposase
GTGTGTAAATTTCTCAAAGGTTATATAAAAGAAAATATAACAAAAAGAGG
GATTACAATGCCACAGAAACAAAATGCTGCAATGAATCAAGCGATAGATT
TATTGATCAATAATGATACAGATGTATCAACTTTATTCAAGGAAGATGGT
TTATTAAAAGAACTAACCAAGCACCTTGTAGAGAAAGCACTACAGTCTGA
GATGAATAATCATTTAGGATATAGCAAGTATAATCAAAGTGATGCCCAGA
ATTCACGTAATGGTTATAACACAAAGAATCTGATTACAAAGAATGGTGCT
GTTGAGATTGAAGTGCCAAGAGATAGAAATAGTAGCTTTGAACCATCATT
AGTAGCGAAGCGTCAAAGAAGACTTGATGGTTTTGATGATAAAGTACTAT
CCTTATATGCTAAAGGGATGAGTTTATCAGATATAAAATTACAGCTTCAG
GAGTTATATGGAGCTGATGTAAGCGAGAGCTTAATCGTAGGATTACAGAT
GATATAA
>RF_p09 unknown
ATGAGCTCATTGATACATGTTACAATAATCACAATAATATTATATGTGCC
TAAAAATAAGCATATTACTATTTCAGATCTGAGTATATATGATGGGATAA
CACTCGTTCCTAAAAGCGGTGTATATAGCAAAATGGATGAGACTCGTGTA
TTTAATAAAGAGGCATTTGAAACCATTGAACTAGAAATCAATCCTCCCGA
CACCTCAAGCAATGCTTCGGATGATTCAGATGGTATTTCATCTACTTCGG
ATCAGCTGTCTAGCGATTCTTCAAGCGTTTTATGCAGTTCTTGCTGTAGT
TCTTTAGATATTTCAGATTTTTTATCATCTGATGATGATATGGACCTGAC
GGGTAACAATGCCGCTGATTTAGCAAATAACTAA
>RF_p15 unknown
ATGTTTAAAATAGCAAGAACAGTAAAACAAATATATAATGCGGCAAGAAA
TATCCCTAAGTCTTTTCTTTCAAGTATTAACAATGGGCTTAAATATTGTA
GTCAAAGCAAAGGATATGTAGAGGATGCAAGCGAGGAGTTCAGCTTTTTA
AAGGCACCACGGGATCAGTTAAGCAAGGATTTAATTCAAGACAAATTTAA
GGCTTTTAAGCCAAATCTTCAGAATTTAGAAAATCTAAAGTCTACGCAAT
TATTAGATTCAGCAGAGATTAGAAAACTAATATATGCAAGATTTGCAGAT
GAGATAGCAGCTAAGCCAAGTGATACTGAAGAGAATCAGAACCTTGAGAC
CAAGAGCCATGCTACAAGAGGGCATGTAGAAACTTTTACCACTTACAATA
TTGCAGATGAGTTTAATGACTTAAGGGAGCAGGGATATAATTTTAAGGAG
CTGAGAAGTGCAATTATAAACCATAACTCATCTCAACAATCTGAAAATAT
TGAAGAAAGAAACACCAGTGATAATAGAAGCGGTAAAAGCTTAAGCCAGC
GTATGAAAGAGCTGGTGGTATCAGGACATATATCAAGTTACTCGGGTGAG
TCAGGCTTAAAGGAAGAAGTAGAAAAGGTAATGCACCAGAAAGCATTAGT
GATCGAGGAGTTTATGCAAAAAGTGAATGAGAGATTGGGATTTGTGAGTG
TTGATAATTCAGTGTTGCTTGTTGATTCAGAAAATGATGAAGCTGGGACT
GATGCAACTAAGACAGATTTATTGGGTGAGTATTAA
>RF_p27 unknown
ATGAGTAAAGATGGACAAGATGATAAAAATGTAAATAATGAAAAAACACA
ACTGAATGATAACAACAGCAATAATAAGCAGGATCAAAAAGAAAATACTA
GCATCAATCACGATACTTTAACACCGGAGGCAGTTACCTCGCCATCAAAT
GCTAATATAGCAGATGAGCAAAATACTTCTCAGATAAATAGTGAATTTAA
TCAAGCCCCGAAGGCAGAAGGCATAACAAATGATCCTGTCGGGGTTGAGC
AGAACGAAACAAATAATAAGAAGGAACAGTCATCACCGGGTACTAATATA
GGCGATACACAAAAAAAGGAAGAAAGTGTTGATGCGAATAGAGAAGATAC
GAGCACGGAAGAGGACGAGCAAGCAGTAAAAGTTAGCGTAGAAGCAAAAG
AGAATGCTGTTCAAGCAGGTAATACACCTAATGAAGCTAAGGAGCAGGTT
ATTGCTAATAACGTTCCTACAGAACCGGATAAGCAAGATGCAGATAGTGT
AGATAAGGACTTAAAACAGTTATTATCTAGAATAGATAAAGGAGAGTCTT
CACAAAAATTAGAAGATGCTCAAGTTAAGAATGTACTTGGGGCAATTAAG
GCTCAACTTACCGCTACTGCAAATCCTGCTGAACTTGCACGTTTAGCGAG
TGCTGCAGCAAGTCTAGCATCAAGTACGAATAATCCTGAAATGCTAGAAC
AAATTAAAGGGATTCAAGCAGCGATTGCTAAAAAAGAAGAAACTGCGGAG
CAGATTGTTAATTCTGATATTGCTGCAGAGAATCTAGAAGTCCAAGAGCA
TCAAGATCCTGAGATGGTGCGAAAACATTTGGAGCACGAAGAAAGAAAAA
CAAGAATAGATAACAACTGGGCTGAATATGAAAAAATCGAAAAAGAATCA
AGAGAGAGATTAATAGCAAACAATAGGTTTTTAGATCAGATTTATAATGA
TCCTAATTCTTTAACCGAAGAGCAAAAAAGATTAGCTCGTGGACAGTATC
GTAGTACAGAAGAGAAAGAGGAGGTCGAACGAAAAGCACAACAAGACATT
GATTTTGCTAAAAGAACACATGAATTACATAGAGATTTAAAGCATGCAAT
TGAACATGAACAAGAACAACTCAATATATTAGCACCTAAGATAGAAATTG
AGCAAACTCGTGCAGGCAATGATGAATTGCTACAAAAGAAACAACAATAT
GAAGCAAACATCAGTTTATACAAAGAAAGATTAGAGCAACATATTAATCC
AGCTATAGCTGAATTGGATTTAGAGAGGGAAAAACTGTTAAAAGTAGTTG
ATACACACCCTGATTTAGTTAAAGACCGTATTAGAATTCATTTTGAAGGT
AATAGAGATAGATACGAAGAAATGAAAAATTTAAAAGGTGAACCAAAAGC
CTTAGAGGAAATGGAACAATTGATGAAAAAGGCGGGTCTTGAGAATAAGT
TAAATACAAAAAAAAGAGATAAAGTAGATGTGCCTCAATCAAAAGAGACC
ACATCTTCACAGGTAGTTTTATCTGACATTTCAACCAATAACAAACGACA
TAATATATTAGAAGAAACACTCAATATAGTAAGTGAAAATAAATTAGGAG
GTGTAGCAAAAGAAGTAATAAGTAATATACAAATTAAAGGGATAGAGAAT
GTAGGATGGTTAGGGGATGCCCAAAAAATGACCGGTAGATCAGTGACCGG
TCCCACTTCATCTGTAGGAAATGTTACTATTAAGCCGCCAGCACAAACTC
CAAGCGTACAAAAATTTGCTGCACGGGGTGCTAATATAATAAAAAAATAA
>RF_p67 Transposase
TTGGATTATTCCTATAATTTTATAAGTTTGGAAGCCTCAAATGTTTTACG
TGACTGGCTCTTAGAATTTTCTTTTATCTATGAAATAACTAAAAATCGTT
ATTGTGCTAATTATGGACGTCCATCAATTGATCCTGTATTATTTTTTAGG
ATGCAAATAATAAGTTACTTAATATGGTAA
>RF_p28 unknown
ATGCAATTTAAATATAAAAGGGTGAATATACCTGAAAATGATCAAAGTGG
TATTAATACATACCTATCTAATAAATATGTGAGGAAAGAAAATCTTACAT
TAATGCTCGCGAATTATGAAGAGCGTAGAAAATGCGAGGCAGATGAAGCA
TATAAAACTGATGAAATTCTAAGAGAAATATCAGATAATGGAAATAAAGA
TTCCACTTGGGATTTATTTTTAAATTTTGTTATAGGCGTAAAAGAGACGG
CATTTTACTTAGCAATGAGTGTAATTAATGGATATGGTATAACCCATAAT
GAATTCCTCATGTACCTCACTATGGCTATAGGAGTCAAGCTTGGTGATGA
AAAGACACTTGAGCTAGTAGGCGATGAAAAGATACCAGAGGAAACAAAGG
TATTAGCAGAAAGATGCATGGAGCGTATTAAATTTCATAAAGAAGAGGTT
TATAATAGAGACGTTATGTGGGAAGAAATTATGGCACGTGGGAAGGATTT
CGATAATCTAGTAAAATCAGAGTCAGGGCATTCATATTATGATTCAATAC
CGAATCAAGGTACAGTAATGAAAAAATGGTCTGTTTATGTAGAGCCTATT
ATAGAAGATAATGCAAATATACAGGTAGATATGACTGGACAAGAAAGCAG
CTGTTGTTGCTGCGTAATTATCTAA
>RF_p36 unknown
GTGGTACTATTATATATGAAAAGAAGACAAAAACAAACACTTTTCTATTT
CTATGACTCAAACAACTTAAAAAAAGAGGCTGGCATGTACTTAAATATTA
ATCAAAATATAAGTAATTTAACGAATATAGAAAAAGAGTTCATTGCTGAT
AAATACGATGCAATTTTGTTTAACAATGGTAATTTAATGTTTAAAGCTAC
TCATGGATGTTTACCACAGTTTCAAGAAGAAATAATTAAATTACTAGATA
TAAAATTATTTCGTGAAGTTATAATCGAACATATATTTTTATATGAAATT
AAGTTTTGTGAGGAAGAACTCAGAAATATGAGATTGAACAAAACACAGGA
AAAGCAAATCCAAGAGAAGATCGATGAAATTAACCTATTAAAAACACAAT
ATAAAACATGTATATCAATAAGTGCACCCAATAATTTAAACGATAAAGCA
AAAATCAAGACTTTGCTAAATGATTATTATAGTGCTGTTTTAAACAGTGT
ACAATGCAGCTCTTATTTAGATTCATTGTACAATTTTGCCTCCTCTTCTT
GCGATAGCTATCATTACGATTCATACGATGGAGCTTTCTATATACCAAAG
GAAGAGTTAAAAGAATGGGAAGAAATGCAAAAGGATAACGACAAAGAAAT
AAAGATTTGCAGCACCCAGTATAAAGAATTACGTACACAGTACGTTAATT
TACAAGAACAATTAAGCCAATTAGTCAATAATCTACAATGA
>RF_p14 Ankyrin repeat
GTGGTGAGTATGAAACAGGTAGAAAGACAGAAGCTTAATCAAAAATTAAT
GAGAGCTGCAGCTACAGGAGATATAGAGGCAGTACAAAAGCTTGTGCTTC
GTGGTGCTGATATATATTGTCGGGATCATCAAGGGGATACTGCATTATCA
CTTGCAGCAGGTAGCGGTTATTTAGATATTTTAGATATTTAA
>RF_p17 TPR, tetratricopeptide repeat domain
ATGAAAAAAAGAAATGAACAAGAAGCATTCAAACTCTTAACAAGTGGACA
ATTATTGGCATTGTATAGGAGTTATTCTAGAGCTGGAGAACTAAAATATG
CCTCTCCAGTTTTAGAGTATTTGTTGGAATCGACATATAGTGACGCAGAA
AGGTATTTTGAGAAAGCGGTTGTATTAAAAGAGATACTTAGAACAGAAGA
AGCACTTGAAGCGTGTGATAAGGCAATAGAGCTAAAGCCTGATTATGCGG
CAGCTTACGATTTAAATGGAAGAATTCTATATAGACCTTGGAAATACGAA
GAAGCAATCAAAGCCTTTGATAAGGTTATAGAACTTAATCCTGATTTTCA
GGACGTGTATTTAAACAAAGGATGGTGTTTAACTGAGATTGGGAGATATG
AGGAAGCGGTAGAATGCTTTAACATAGGTATAAAGAAAAATCAGTGTAGC
GAGGAATTATACGCAAGTAAGGCTTGGGTTCTTTTGCAAGAATTAAATCA
AAAAGATGAGGAAGCTTTGCAAGCGTATAAGAAAGCAATTGAGCTAAGTC
CCAAAGACAATATTTATTATTTTTTTGCCGCTCAAATATTAAAAGAATTA
GGGCAAGATGAGGAGGCTATAGCAATGATAGATGAGGCAATAGCGTTAGA
ACCTACTATGAAGGAATGCATTTTATATTGTTTTAAGAATGATGATTTTG
ACTATGTGGTGACATTAAGGAAGCGAGAGTGCATGAAGCTAACAAAAGCA
TATTTTCGTGAATAG
>RF_p54 Transposase
TTGGTAGTAAAAGTACGTCAAGATAAGCGGATTATCAACAAATCAGTATA
TGTTGCCTTAGGCATTGATTTAGAAGGGCGGAAAGATATTTTAGGACTGT
GGATCAGCGAGAATGAAGAGGCTAAATTTTGGCTTGGTAATTTTACTGAG
ATGAAAAATAGAGGTATGCAAGACATACTGATAGCATGTAGTGATAATCT
TAACGGTATGTCTGAAGCTATAGGTGCTGTTTTTCCAAAGACAGAGCATC
AATTATGTATTGTACATCAAATTAGAAATAGTTTACGATATGTATCATAT
AAGGACCGGAAAGAGCTTGCTGGTGATTTAAAACCTATTTATACAGCTAA
CACAGAAAAAGAAGCACTTTCCGCTTTAGAGGCTTTTGAATCTAAATGGA
GTAAACAATATCCTCAAATTGCTAAATCTTGGTATATTCATTGGGATAAT
CTAATGATTTTAGGATATCCTGAAGAAATAAGGAAAATAATTTATACAAC
AAATGCTGTGGAATCCGTTAATAGTCAACTCCGAAAAGTTACAAAAAATA
AACGTCTTTTTCCAAATGATAATGCTGTTTTTAAAAGCTTATATTTAGCA
ATTGACTACATGACCAAAAAATGGTCCATGCCTATCCCAAATTGGAATGC
GGCTATGGCTCATTTTTTAATAAAATTTGAAGAAAGAATCTAG
>RF_p50 unknown
ATGAAAAGGGTGTGTATGAGTAAATTACTTGGTGGTTGGAGTATGTCTTT
AACTCGTTACCCATTTAATGAATTTGACTATATAATGTATGGTATGGTGA
CAAATCTTGAAGAACTAACAACAGGAAGCATGGCTTCTCCGGGGTGGAGT
CCAGAAAATGAACAAAAACCAGATAATAATCCTTGTTTTACAGGTAAAAG
GCTTTGGGTTTATGGCGGGGGAGGATGTGCTCCTGAAGAAAAGCCCTCTA
GTATGAATGACGTATCCCGCATTATATCTGCGACCATTAATAATGGTTGG
GATGGTGTTGATTTTGATGACGAGTGTAATATGAACACTGCATTTGTTAT
AAAAACAATGGAAAAACTCAAAGAAAATAGTAAAGAAACCAGTTTTGGTT
TTATTGCAGGTTATTCTTATAACCATCCCAATACAGAAAAAGGGAAGAAG
ATTACCGACAAAGTTAAGGCGATTATCGCATCAGGTCAATGTGATAGATT
AGTGCATTATTGTTACGCTGCCGCAATGTGGAATCAAAATGATATTATCA
ATAATGTAAAACAAGCATTAGTACAAAGCATCTCTTATGGCATAGAACAA
GATAAAATTGTGTTAGCCTTGACTACTTTGGGTCTGACAGACTGGAATTT
AAATTACTTTCTAGATCAAATTATTGATTTGAATTTAGGGGGGTTATTTA
TATGGCGATATGATGAGTTGACTCCAAATCATTATAAGATTATCAAAAAA
CGGTTAAATAAATTGTACTAG
>RF_p46 unknown
TTGTCAGATCAATATGCAGCTACTAGTAGTAGACTAAACTCGCTATCGTC
TAAAGACTCGATGCTGCGTACTATGTCAGGTCAACAAGCGTTAGAGCTTG
CAAGCCGCTTGATTGCAGAAGAAGCTCGCTCAATTGGGATCTCAGAGCAA
GAGCAGATGCAGTTTAAAGATGCGGTGAGTACCGATAGTACAACTACTGA
TAATACTATTATGAGAAATAATAAAGAAACAGCTACTAGCAATAATGCTA
GCGTTGGTTTCAATGCTTTCGGCTTGGGAGGTGCTTCAGCAAGAGTATCG
GCATCTAATAATACAAGTAGCAGCAGTGAAGAAGTGTTATCAAAAAAACA
AACTATCAACAATGTACTTGAAAAAACAAAATCTGCACTTCAAGAAGGAA
GACTCAATAGCTTTAATAGTGATACTCAATCACTAGCAAGAACTTTAAGT
CAGAACTATCAGGAGCAGGAATCTATTGGTAGAGAAATATCTGATGCAAT
ATCGGCTCAAGACCAGTTAAGTAGAAGTCGTCAATATGTAGCACAAAATG
CAGCTACTATTGATCGTAATATGAATGAGCCGGTACTAAATGCTATAATA
GATAGCAATATTCCGGGTGTTTCAAGTAAGGAGCAAGCTGCAAGATGGGC
AAGAACTCATATACATGAGGCAGCTTCCATAGCAAACTCAGTAATGCCAG
TTGATAATATAGCATTAGATAATGGTAGACATTTAAGTGGTATTAGCTCT
GATGTAAAAAATATACCTATGCGTAGTGAGCAGCATTTAAAAAATGAATA
TCAAGTGCAGACAGGTAAAATAGAAGCATCAGCTGATAAAATAAATAATA
AGCAAGAATTAGCTTATCAAAGCGTTGAAACGAGATTAAATAATAATTTA
AGTAACAGCGTAAAAGAAAGCTACAATAACTTAAATAATACTGCTCAGCT
CGTAGAGCAGAAAGGTAAGAAAATAGAAGATCAGTATGAGGATACCTCGG
ATTCTACTGTAAAAAGAACACTAGATGAAATAGGTAAAAACTCTAGATTA
TAA
>RF_p06 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases
ATGCCATTATTAAATGAACGTGATGTTGAAACACGAATTGAAGAACAACT
TAAAAATCTTGAATGGATTGACAATCCTAGTTTACCTAATCGTAATGTTT
ACAAACAAAATCCAAAAACAGAAAAACAGAGGAAAGCATTAGGTAGTAAG
CGACCTGATTATACACTTTATCGTGATAATAGTGATGACCCCCTTATTGT
TATTGAAGCGAAGCGACCTAATACAAATCTTTCACAAGCTTTAGAGCAAG
GTAACAATTATGCTAAAGCTATTAATGCACCTATTGTTATAGCAACAGAT
GGAATATTTGCTAAAACTTTTCATACTAAAATGCAGAAACCACTTTTTCT
TGACAAGGAAGAAATTAGTAAGATTATTCAACAATCGTTAGCTATTGAAT
ATATTGATAAGAACGAATATTTTAGCATTGATGAGAAAGTAATTAAAAGT
CGAGACGAATTACTAACGATATTCAAAGAAATCAACAATCAATTCAAGGA
TGCGGGAGTAAGTAGAGGATTGCCTCGAATTGAATTGTTTTGCAATCTTC
TTTTCTTAAAAGTCATTACAGAATTAGTAGGTACTAATAGTCTTATTCAT
TCGCTTCCGGACTGGTGCACATGGGATAAAATAAAGGCAAAAAAGGGAGA
TGATTTATGGACTTTTATCAATACACAAGCTTTTGATTATTTAAGCTTTT
GA
>RF_p02 unknown
ATGAGTCCAAATCCAGATTTTATCACTATTGTGAAAATAGCAAATTATTT
TAATTGTGCGGTTGATCAAGTAGTGGGTAGACGCAAATTTTTACCTTCAA
TAAATTTAATAGTATCTTTTAATAATCCAGACTTAAATGACATAAATTCT
AATCTCTGTAATTTTTTAAAAGCAAAATTATCTCAAGATAATATATCACC
TTATTTATTAAGCAAAAATATTGGTTTTAGTAAAAAAATAATACATTGTT
TTTTAAAAGCAAACTCTCCTTATAAAATGCTTAGCACTAATGTTATTATC
GCACTTGCTGATTATTTTAATGTCTCTGTAGACGATATGATAGAACGATA
TCCTACAACCAAACAATAA
>RF_p49 Integrase
ATGAACTTAAATCAAAAAATAATAAAGTCAAAATTAGGTTTACTAGAATT
AGCTAAGAGTCTTGGTAGTATATCATCAGCATGTAAAGCGATGGGATATA
GTAGAGATAGTTATTACAGATTTAAAGAACTATATGAAACTGGTGGTGAA
GAAGCGTTATATGAAATTAGTCGAAGAAAGCCAATGAGTTGA
>RF_p61 Transposase
ATGACTAATGAAGAGCATAATCAGAGGCAACAGCAAACAGACGTAAGTAC
AAATGGCGATGCTAATGATACTACTGCCGAGCGTCCAAGGCATGATGAGC
TATTTAAAAAGGTCATGAGTGAGCCTGTAGCTGCTCGTGAGTTTTTAGAG
CATTATTTGCCAGCGTCGTTTAAGAACAAGATTAATCTTAATAGTATTAA
AATAGAAAAGGAAAGTTTTGTTACTGAGGATTTACGCAAAAGATTTAGTG
ATGTCGTTTATTCTGTTTCTTTAAACAAGAATAATATTAAAGATAGTACT
ACTGGAAGTGCCAATAATGACAAAGCGTACGTTTACGTTCTGATCGAGCA
CCAGTCTAGTAGCGATTACTGGATAGCTTTTAGACTTTGGCAATATATGC
TTCTTTTATGCAAAAGACATAAGGACGCCAATAAAAATAAAAGTAATGCT
GCAGCAGAAAAAGATAATAAACTACCTCTAATATGTCCTATAGTAGTATA
CGCAAATGATAAGCTGTATAATGCTCCAAGGAGCTTTTGGGAGTTATTTG
AAGATTGCAAGACTGCTAAGGAAATGATGGGCGGCGAGTATTTACTTGTA
GACTTACAAAAACAAAGTGATGATGAGATAGAGCAAAAGAAGCATCTTGG
TATGATAGAGTATATGCTTAAACATATCAAAGCTCGTGATATCTTAAATC
TCTGGCAAAGTCTACTTGAGAAGTTTGAAAGTAGTATTGAAATAGATAAG
GAAAATGGCTACATTTACATTAAGTGGTTATTATGGTATAGTGACGCTAA
GGTATCTGAAGATAAACAAGTAGAGCTAGCTAAGATCATAGCAAAACACT
TAAATAAAGCAGATCAAGAGGGACTTATGAGAACTATTGCTGATAAATAT
ATTGATGAAGGCGTACAAAAAGGAATGGTCCAAGGCATGCAGATTGGTAG
AAATGAGGGCATGCAGATCGGGGAAGCAAGAGGAATGCAAATCGGGGAAG
CTAAAAGAACTATGGAAGTAGCTAAAAATATGCTTAATGCTGGTTCTGAT
ATTTCTTTTATCTCTAAAGTCACAGGACTTTCTATCTCTGAGCTCAACCA
ACTTCTCAAGTCCTAA
>RF_p48 Transposase
ATGGATATGGCAATAGAATATCCAGCATATGGTCAGCTAAGAGTATCAAA
TGAGCTTAAGAAGAGTGGAATACTTGTATCACCCGGAGAAGTGAGATCAA
TTTGGTTACGTAATGATTTAAACAATATCAGTAAAAGGCTTAAAGCATTA
GAAGCAAAGATGGCTCAGGATGGTATTGTTCTGACTGAAGCTCAGTTACA
AGTACTAGAGAAGCGTCGTAATGAAAAAGAAGCACATGGAGAGATTGAGA
CGCAGCATCCAGGTTATCTAGGATGTCAGGATACGTGTTATGTAGGTAAT
TTTAAAGGTATAGGTAAGGTTTATTCTCAGGTATTTATTGATAGCTATAC
TAGAGTAGTGGATGCTAAACTATATGCTGATAAAACAGCAATTACTGCTG
CTGATATGCTTAATGACCGGGTGTTACCATGGTATGAGACGCAAGGGATA
CCAATGCTGCGTATTCTTACAGATCGTGGGTCAGAATATAAGGGCAATAT
AGAGCATCATGCTTTTGAGTTATTTCTTAGCATAGAAGGTATAGAACATA
CTACAACTAAGGCATATTCTCCCCAAACAAATGGTATGTGTGAGCGTTTT
AATAAAACCATGAAACAAGAATTCTTTGATACAGCAATGCGGAAAAAGAT
TTATACAGATCTTGATGATTTACAATTAGATCTTGATATTTGGTTAGAGC
ATTTCAATAATGAACGACTACATTCAGGAAAATATTGTTATGGTAAAACT
CCTATGCAAACTTTTCAAGATAGTAAGAAATTAGCTATTGAAAAAAATAA
TGAGATCTTGTACCTTGAATACTCGTCTGACAGTCAAAATTTAACTGACA
ATCAGGTGCAAAATTTATAG
>RF_p01 Transposase
ATGCCATACAAAGAAAGAGCAAAAACAGGTTTACCAAGAAATGTAGATAA
ACCAAAATATAAAGTAACCAACTGGTCGCAATATAACAAGAGTTTAAGAC
AAAGAGGGATGATCAGCCTGTATTTTCCTGAAGGCGATTTAGAGTCTTTA
TTCATTAATGTCGAACCTTACGTAGAGGGAGAATCTGGGAGGGCAACGAC
ATACCAAGTACCATATATACAACTAATTTATACATTATATCGTTTATTTG
GTTTCGGACAGCGTCAAATAACAGGTTACTTGTGGTTTATTTTCGCAGAC
TCTATTAGAGGTCAAACAGTTTTGCAATAA
>RF_p04 unknown
ATGCATAAATCTAAAATAAATCCGTTAGTAGAAAGTAAGCTTTCAAAAAC
TGTTGCAAAAATAATTTCAGAAAAACCTATAGAAAAAAGTGGATTTATTA
CCTCATCCAATAATAAAACAACTCATTATAAAACAAAAACCTTTCGTTTA
AGACAGCTAGATGCAGAAAACCTTATAAAAATTATTAAAGCTGTGAATCA
TTATAATCATAGAAAAACATATTCAGATTCCGAAGTTATTAGGGGTTTGA
TTAATTTCATATCAGATAATTTAGATACTAATATAAAAAAATTAACTAGT
TATATTAATTCTTCCTCATAA
>RF_p31 Transposase
ATGATTTTCTTAGGATACCCTGAAGAAATACGGAAAATAATTTATACAAC
AAATGCTGTGGAATCTGTTAATAGTCAACTCCGAAAAGTCACAAAAAATA
AACGTGTTTTTCCAAATGATAATGCTGTTTTTAAAAGCTTATATTTGGCA
ATTGATTACATGACCAAAAAATGGTCCATGCCCATACCAAATTGGAATGC
GGCTATGGCTCATTTTTTAATAAAATTTGACGAAAGAATCTAG
>RF_p08 unknown
ATGGCACATATAGCTAAATACAAAATTGATGTAATAATACTTGGAATCGA
TTTAGAGGAGGTAGACGGCATTAAGATTTGTACTAGATTAAAGCAGAATC
CTTCTACTACTTATATACCTGTTGTCATGATAGCAGAAAAAGAGGATACT
GATATAAGAATTCAAGCTTTTAATGCAGGTGCAGATGAATTAATAACATA
TCCAATTAATATTATAGTGTTTACTAGTTAG
>RF_p56 Hyaluronidase
ATGAATATTTTTTCGTTAGATACGTTTTCGTATGGAATTATAATGGGGTA
TTACGGACCAGTATGGTCTAATGAAGTACTAATTGAATATGCTGATTTTT
GTAAGAAATACGGGTATAAATATTTTATCTATGCACCAAAGATGGATAAG
TTGTTACGTGATAATTGGAATATATTTTTTACTGAATCACGTGTTCAGGA
ATTAAAAAATATCCGTGATACTTTTGAAGAAAAAGGTGTAGCTTTCGGTA
TTGGATTGAGTCCACTAGGGCTTAATAACTTAAAAGATATAGAGAAAGTA
GAAAAAGTACTACAACAGAAAATCACTCAAATCAATAATATTAATCCTAC
TATTCTAGGTATATTTTTCGATGATATCAATAAAGACTCAATTGTTCCTG
ACTTGGGAGTGGGGCAAGTACAGGTTGCTGAGTACATCGCACAAAGAAGT
AATGCCCAGAATTTTGCCTCTGTTCCAAGCTATTACAGTAATGATCAAAT
TTTACAACGTGTGTTAGGACCAACTCCTGAAAGTTATTTTGCTGATTTTA
GTCAGTTAGATCAAAAGTTTTCTATATTTTGGACTGGAGAACATATTATG
AGTGATGGTTATTCTCAAAAAGAATTAGATAATATTTCTAATAAACTAGG
ACGTAAGGTATTAATATGGGATAATTATCCAGTTAATGATCCGACTTACC
TAAAGGATCATTTGCGTATTTCAGGTATAGATAGACCTCAGGAGCTTTCT
TCTTGGACTCCATCGATAGCTTTTAATCCTATGATACAACCAAATATGTC
AAAAATTCCGTTATCTACAGCTCAATGTTTATTTTCTTCAGAGAAATATA
ATAAGCGTGAAATATATATAGAAAAACTTATAGAACTATGTGGAAAAGAT
TTAGCACAAGCTATAGATCAAAACTTACCATATTTTGAATTAAATGGTAT
TAATCGAACTGAAACATCAAATATCAAACGTATGAAAGAGCTATTCTCCT
TGTTTGCTGAGATAAACGAACAGCAATATACGCATGAAATTATCAAGTTA
TTGGGGGGATCACAAGAAATATAA
>RF_p18 TPR, tetratricopeptide repeat domain
ATGAGGTCATTTATGAATATATCACACTATCCTTGTGTTGGCAATAGTAG
TAGGGTAGTACCTGCTCATTCCCACAAAGCTTTAGCTAGTGCTGCTTCTC
GGAGCGTTAGCAACTCTTGTGCATTACCACAAAAACCTCATTCACAAAAA
AGTACAAAAGATAAATTAGAATATAAAACTGAATCTAAAGCTGCAAGGTT
AGTTAGTATATCTCATGACCGCGATTCTGCTGGTTTTATGGATCAAGCGG
ATAATGCAAACCATAATACCCAATCCCCAACAGAATTATTTAACTCTAAG
AGCCAGTCACGTAAAACAATCACAGTATTAATAAGTTTTTTAAAACTCAG
CAAATATGATGATGCGTGGCTAAAGCTAGGCAAGCAATTACTGTTACTAC
ACAAAACTCCAAATAAGCAAAAATTCTATAGATCTGCATTATGTTGTTTT
AAATCATCAATCAAAGCTCATCCTGATAATCACGTTGCATATTACTTCAG
CGGCATCATATTGTGTCTTCTTGGAAGATACGAAGAAGCGGTTAGGATGT
TTTTGTCCAGTCTTCGTAAAAACGCAGAAACAAGTACTACTTTGCTACAT
ACATTATCGGAGATGTTAAGCATTACAGAGGGGATAAGACTTGCTACGGG
AGGCGAGGATGTAAATGGTATTGGTAATAGTGATGCAGCTGTGCAGCAAG
ATTCTTCATCAAATAACAGAGATACAATTAACAAGGATTCAATATTTAAT
AAAACTCTAGACAAGCTAGAGATGGCAATCATCAACAAACTTCAAAGATG
CAAAATAGAAGGAGCAGTAAGTAATAGTATGGCTAAAGAACAAGAGCAGT
GGAACAGATATTTTGAACTAGGGATGTATTGGTATGGAAGAGAGCAGGGG
AATCATAAGTCACTCATGTATTTTAGAAGATGTCTGCAACTAAACCCTAA
GAATGAACAAGCAAATTATTATGTTGGTCTGATAATGCAAAAGCAGGGTA
GATACCATGAGAGCTTAGAGGCTTATAAGCAAGCAATATCATTAAGACCT
GACGAGGGGTTTTATTACTATATGGCATCGCAAGTTTATACGGATTTAGA
AGAATCTAAGGAAGCAATAGAGATGATAGATAAGGCAATATCCTTATCAC
CTAAAGATATAGCGTATAGGAATATGAAAGAACATATATTACGTGCATTT
GGAATAGAGCAAGATTTAGTAGATATAGTGAAGATTACCGGTGAATTACC
TAAGGTTTAA
>RF_p24 unknown
ATGAGGTCATTTATGAATATATCACATCATCACACTGTTGGCAATAGTAG
TAAGCTATTTGCTGCTTCAAGCACAAATCAATCACAATATCTAGAGTCTG
ACTACTTTTTACCAGCTAGTTATAGCGAGAACTACTACAGTAGGAAGTAC
AGCAGATCAATAAGCAAAATTTCACGTATAGTATCTGCAAGCCTATTATC
GGCTATGATGCTCACAGCAACATTAGATGCTAAAGCACATCCTAGCGTAG
AATCAAGTATCTTAGAACCAAATCAAAGTTTTCTATTTGGTAAGGATTCT
GCAGGAATTAGCACTAACGTGCCTTTACCACCAATCATGCCCCAGTCACC
ACCATCAGCTCCTCCAATTCCGCCTGTGCTCCCAGCTATGCCTGATTTCA
TCAGCGATGCAAGTATTGGAGGGAAATCAGACAATAGGTCAGCACTACTT
GAATCAATCAGGAATTTTGGCAAAAACATATTAAAAAAGTCAAGAAAGAA
CCAAAGCCTAAAGTTGTATCTAGCGATGGCGGGGATTTAA
>RF_p33 unknown
ATGGTTAAGAAATCATTATTTTTAATTTTATTATGTATTCCAATATTATC
CGGATGTAAATGCTCAAAACATCACAATGCAAAACACCAGTATAATGAGT
ATAGCAAAACTGCATGTGGCAATCCTCCTCCGCCATGCGTACATCATGAA
GCACTTGTGACTCCATATTCAGGTCCTTTAGTAAGTATTGATTGCCCAAA
AGAGTCTCTAGGTCATCATTCAAAACATTATAAAAAACACCACAAAAAGC
ATAATAAAAGCCATGATATGACAGGAGCATTACCGCCAAAATATTTACAA
GTTAAGGATTTCAAGGAATGCCTTAGCACAGAGCAAGTATCCACATATAC
ACAATATTGTATGCCGGAACATAAACCAGAGCATTGTCCTTTTAACTCAT
GGCAGCAGCTAGTGAAATTAGATATGCCTAGATGCAAAGCTTAA
>RF_p65 unknown
TTGCCTAATAAATTAGGTTATAGTTATAAAAAAAACTTTTCTTCATCCGA
AAAGGGATATTGGTCAAGGAATGAGTTTATATTGAAACTAAAAACTATAG
ATAAACAAGATTTATGTATATTGTGCTATGCCGTCATACTTAAGTTGCAG
CATTATAATTGGGATAGCTTATTAGCATATATTCAATGCTGTTTTTTGAA
TACAGAATCTACCATTAAAATATGGAATGTTCAAAGTAAAATTATTTCAG
TACGTTGTGTAGATATCTTAAATAATAATGAATATATGCAAATCGTACAT
TCAGGCATAATATTGTTAATATTAATGTTACTTGCTATATGCGTTATGCC
TATTATTTTACTTACAGTATGCTTGATAATGTATACTATAATTTCAGAAC
TAAAGCGATTTTAG
>gid:882645    
CAGCATATTTTACAAAGTTTCAGACAAGATGAAGTTAAAGGTGAGTCTAC
ACGGCGTATAAAAATACGTGAGTACAGACGAGACCTGAAAAATTCGTTTG
TATCAAGCTTTGTGAA
>RF_p52 hspP1, Small heat shock protein
GTGAACACTTACTTAAGTGAGATCACAAATCTTATATATTATATAAATCT
AAAAGAGGTATGTATGTTATATAACAATATTAAATCATATTTGCTATCCG
GTATTACTGTCATTTTATTGACTGGTCATCCAGTTATTGCAGCTGATAAT
GTGAGTAAACCTGATAATAAATCTCAAACTGCTTACTTACAACATCCTCC
TGACCTACGCCCTTTTTCTATTTTTGATTACTACTTGGATAATATGTTTG
AGCATAAACTATCTGCATATAGCTCCAGTGCTATAAGAACTAAGTTTATT
ACTCAAGACAAGCAATATATCTTAGTACTAGAAGTGCCGGGGTATGATAA
AAGCCAAATTAAAGTCAAAGTAAATAGTAATAAATTATTTATCACCGGCA
ACGTAGAACAAAATAATAAATCTGAAGCTTCAGATGATTATACAAAACGA
AACTTCAATTATGTCGTTTCTTTATATGAAGATGTAGATCAAAACAATAT
TTCTTCAAACTTAAAGAATGGTATTTTGACGATTACTCTACCTCGTATCG
AAGTTAAGGAGAAAGATGCGAAAGAAATACCAATTCAATAG
>RF_p51 hspP2, Small heat shock protein
ATGTTTAATAAACTTATGGAGGTACTTATGTCTTTTAATTTACCACGTAT
TAGAAATAAATCTGAATTACAACATCATACAAATAAACAAAGTTATGTTG
ACGATGTTTTTAATAATTTCTTTAATGAAATAGCTTCATTTTCTTACCCT
ACCCATTACAATAATAAAATATTGTCACCTAGAACAGATATTACTGAAAA
TGAATCTGAATATCATTTAGAGGTAGAGTTACCTGGTGTAACGCAGGATA
ATATTGACCTTAAAATAGATAGTAATATCTTAACTATTGATGGTAAAAAG
GAACAATCGACTGAGAAAAAAGATCATAATTATCATATGAAAGAACGATA
TTATGGCTCTTTCTCTCGCTCCATTAGTTTACCATCTAATGTGGATGAAG
AACATGTAACAGCAAACTTTAAGGATGGTATATTGTCTATAAAAATACCT
AAAAAAGAACAAAGTAAGGCTAAGAAAATTAAAATATCATAA
>RF_p26 lon, ATP-dependent protease La, bacterial type
ATGAAAAATGTAGAATATCAAGAGAATATAGCTGAAGTGGAAGAAGTAAA
GATACGTCGTAAAAATATGAAGAGTTATGTATTAGCTCTTGAACTATGTA
ATAAAGTCATGAAAACAGATGGCATTGATAATATACCTCGTGAAGATCAT
ACCAATCTCTTTAACTTCAAAGTATATAAAAATGGCATAGTGGCACTGAG
CGAGTTATTAGTGCGGACTATAGATGAAAAAACAAAAATTAAAGATGAGA
AGTTAATAGAAGGGTACGAACCGATAATAAACTTACTTGAGAAATTCATT
AGACCTAAAAATGATGCAGAACATTATTTTAGGCAAGGTCAGAGGTTGTA
TGGGAATGGGGAATATGAAGAGGCATTAATATCTTTCGAGGAAGCAAGTA
ATATTATTACCCGTTCTATGTATTACCATCATAAAGGAAAAGCACTTTTA
AAGTTAGAGCGGGCAGAAGAGGCAATTAAAGCTTTCAATAGGGCGATAGA
GCTAAAGCCTGATTATGCTGAAGCTTATAATGAAAAAGGTTATGCTTTAG
CCAGTTTAGAAAAACATAACGACGCTATTAGCTGCTACAATAAGGCGATA
GCACTAAAGCCTGATTATGCAGATGCTTATCGTTGTAAGGGCGATATACT
CCATAATCTTAAGAGATACGAGGAAGCGATAAAAGAATATAACAAAGCTA
TAAAGCTAGATCCTAATTTTCAGCACGCATTAAATAATAAAAAGGAGGCA
CTACAAGCTATAGCACGTCAAGCAAGTGACAAAGATTTTGAAGTACTATT
ATCAAATACACCGCTGCCTTCAAATGTTGGAAAGGTAGCTGAGCAGAAAA
TAGCACGCCTTAAAGGCAGTCAGGGTAGTAATGACGGAGATAGAAGCTAC
ACAGAAAAATATCTAAACTATCTTTTCAGACTTCCATGGGGCAAGTATGA
TAAAGCATCTATTGATATTATCGAAGCTGAGAAAGTGCTAAACGAAAATC
AATATGGTCTTGAGAGCATTAAACAGAAGATTATAGAAGCTTTAGCATTC
ATGGCAAACTCTCAGAATGCCAAACCTCCAATACTATGTTTAGTTGATGC
TCCTGGAGTTGGAAAAACATCAATTGCTAAAATAATATCAAAAGCACTAA
ACCGCAAAAGCGTAACATTATCACTTGCTGGAGCAAGAGATGAGGACTTG
ATCAGGGGGTGTATGGATTTCTATATGGGTGCAAGACCCGGTAAAGTACT
GTCACTACTTTCTGAAGTAGGTAGTAGCAATCCCGTAATGATTTTAGACG
AAATAGATAAAATCAGTCAAGAAAGAGGGGCGTTACTTGAAGGAGCATTA
CTACAGTTAATAGATCCATCACAAAATGATAGCTTTACTGATGATTACTT
TGATTTTGGCTATGACATGTCAAAAGTATTTTTCATCGCCACAGCAAACT
CAATCGATAATATATCATATCCACTATTACATCGTATGGAAGTAATTGAT
ATTAGTGGTTATACCGATAATGAAAAAGTTAAAATCACACAAGATTACAT
CATACCAAAGCTAATGAAAGAGGCAAATGTTCCAAGCAACAAATTCACCC
TCTCAAACGAACTGATTAGGTACATCATCGAGAATTATACTTGGGAATCA
GGCGTAAGAGATATAGAGCGAAAAATAAAAGAGCTATTACAAAAATCTCT
CTTAGCAGAAGCAAGAAAGGAGCAAATCACCTTAAATAAGGAAACTATAG
AAGAATATTTCAAGCACTCTAAATATCACAAACAAAAACTACAAGATGAT
GAAGTTACTATTGGTATGATCAACGGTCTTGCTCATACAGCAAGGGGAGG
CGATTTAATTAAAATAGAAGCTTCAAAATACAAAGGTGACGGAAAGATTA
AAGCAACAGGCAAACTAGGAGAAGTATTAAAAGAATCAATAGATGCTGCG
ATGACCTGTTTAAAATCAAGCATAGATTCTAAAACTAAAGAAATCAACGA
TGACATATTAAAGACTCATGACATACATATACATCTGCCAGCAGGAGCAA
CGCCTAAAAACGGACCATCTGCGGGCATCACTATATATACGGCTCTTTAC
TCACTACTTAGTAACAAGAAGATCAGACAAGATATAGCAATGACTGGTGA
GATTACATTAAAGGGTAGAGTGCTTGAGATAGGGGGGCTTAAAGAAAAGC
TAACAGCTGCAGTAAGAGAAGGTATTAAGGAAGTCATCATCCCTAAGGAT
AACGAGCGTGACTTAGCCGAAATACCTGAGGAAATTAAGCAAGCACTAAT
AATACATACAGTATCAAATACTAGTGAGATACTAAGGATAGTATTTGATA
CTAAAGTATCTAATAAAAATACTAAACAAAAAACACCAAAGGAAAATATG
GGCAAAGTATTGCAATTTCCTAAACAGAAGAAAGATAAAAAGAATTGA
>RF_p03 parA1, Chromosome partitioning ParA family protein
GTGGTACGTGTGTATTACAATTGTATCACATGGAGATTGTGTATGTCCTC
TAAAATTATTGCAATAATAAATCAAAAAGGTGGTGTAGGTAAATCTACTA
TTGCTGTTAATCTTTCCTTTGGTTTATATAAAAAAACATCGCGAGTATTA
CTGATAGACCTTGATCCTCAGGCTCATTCCAGTTGTATATATTGCCCAGA
AACAATTTTATACGATAAAACGATTGCCACTGCTTTTATTAATAAAAAGA
TAGATATTAATAATTTAATATTAGAAGCAATAGTGCATAATGAAAAATTA
AATAATCTCAAAATTATTCCTTCTAATATAAAACTTGCAACTGTTATTGA
GCAAATTAGTAGTACTGTTTACAGAGAAAGAATATTACAAAATCATTTAA
ACACTATAAAAAAAGATTATGATTATATAATTCTAGATTGTCCACCAACA
CTAGGGATATTAGCCGTAAATGCCATATATTGTGCAAATTCAATAATTAT
TCCTACAAATTATGGCAGGTATTCGCTAGATGGAATGGCTGATTTATTAA
CAGCGATTCAGGAAATCAAAGAGGATCACGATTACAAATTTTTTATTCTA
AAAAATTTGTATGAACAAAAAAATTCTCAAACTAATAGATATATTAATGA
ACAGTTAAAAGCTTTAGATGAACATTTATTAACGACTATTATTAGAAAAA
ATGAAGCTATTAACCAAGCACAAATTAATAATCTTCCTATACAAATATTT
AATAGTTCCTCAAAAGGTGCACAAGATTTTAGCTTATTAGTGGACGAGGT
AATACATTATGCATAA
>RF_p23 parA2, Plasmid stability protein ParA
ATGATTGTGATTATAGGAAGTAATAAAGGTGGTACAGGTAAAACAACTAC
TGCTACTAATATTGCATTAGCACTTGCATATAGCAATTATGATGTGTGTT
TAGTAGATGCTGATTTCCAAAGATCCGCATCACGTTGGCATCAAGATCGT
CAAGAAGCAAAACTTATGCCATCAATTACTTTGATAGAGAAATACGATAA
TATTTCCACTACTTTAGAAGAATTAGACAAAAAGTTTAATTACATTATAG
TGGACGTTGCTGGACGTAATAGCAGGGAAATGATTACAGGTTTAAGTGTT
GCTGACATACTAATATCCCCTCATCAAGCTAGTCAATTAGATTTAGATAC
GATAGTTGAATTACAAGAACAAATCATAAGAGTTAAAGATATTAATCCTA
AGTTGTCATCTTACATATTACACACCATGGCTAGCACGAACCCAACTGTA
AGAACAAATGAAAGAAAAGAATTTTTTGAGTATCTTAGTGATTTTCCGCA
GCTAAAACTATTAAATACATGTTGTTATTACCGAAAAATATATAGAGATG
TGATGCCTTTAGGGAAGGCAGTCATAGAATATAACAATTTACAAGCTAAA
AATGAAATACTAGAATTAATTAAAGAAGTGTTCTGA
>RF_p35 parB, ParB-like nuclease domain
ATGCAAATCGTAACCGTTGATCCAAAAGACTGCACTAGATGGAAGTATGC
TGATAGAGGTAACTTCGAGTTTGGTGATGTGGTTGAGCTTGCGAGCGACA
TCAAAAAGAATGGTCAAATAGAGCCTGTACATCTTCGCTATTGCAAACAT
GACCCAAAGTTCACGTATGAGATCATAGCAGGTAGTAGAAGATGGAAAGC
ATGCTTAGATGCTGAACTTCCGCTTAGAGCCGTAATTGAGGACGTCACTG
ACGAACATGCAGCAATCATTCAGATTAAGGAAAACCAAGGTCTTGACATA
TGCGACTATTCAAAAGGAATGTACTATACAAGATTACTTGCGGATTTAAG
TATAACGCAAGGACATCTTGCTAAGAACCTTGGCATATCAAGACAAAAAC
TTGTTAACTACTTGTATTTCGCTAAGATACCTAAAGAAATATGGGATACT
GTCGGTAATGTCACTAAAGTAACATCAAGAACAGCTTGCACCATTTTTTC
TCTATCTCAAAAAGGTAGTAAATATATTGAAGCTCTAATAGAATGTGCTG
ACGATATTAGAAAAGGTATTGGTGCTACCTCTTTAGAGACGCTAATACTT
TCTAAAGTTAAGAATGATATTAAAATATTAAGCCACTTTCCTCTAGCTCT
TGATGATGGCACTATTGTAGGTACTTGGAAAAATGGAGACTTCAAATTAA
ATAAAGATCTTAATATCAACAAGGACAAGTTCTTAAAACATATTCTGAAG
TTCTTTTGA
>RF_p11 pat2, Patatin-like phospholipase
ATGACAACAGCAATACACACACAACAAACATTTGAGCATATCGAACAGGG
AACAGTCGACAATATCAAGGGTGATAATACGACTCATGATAGTACATCAG
AATCCATCAAGAGTAACCGAATATTATCATTATCCGGAGGTGGAGTTAAG
GGGATAGCGGAGCTAGTGGTGCTAGCTGAGATAGAAGAGCGAACAGGTAA
ATCTATATCAGAATTATTTCCTATTATTTCCGGTACTAGTGTAGGCGGTC
TTATTGCGGGCTTGCTAACTATCCCAAAAGAGCAAGGCTCAAACATAGCT
AAATATAGTGCAAAAGATGCTTTGAAGATATTTACAGACGCAGCACCGAA
GATTTTTGAACATCATTGGTATGACGGAATAAAACAAATATTCACCCATA
AGCATAGTCAAGGACCATTAAAGGAAATATTAGAGCAGCATTTGGCAGGA
TTAAGATTAGATGATACAACATCTAGATTAATAATCCCTGTCACTGATTT
AGCAAGCAAAGATAAAGAGGTTAAGATATTTGATAGTCATGATTCTTATA
GTCCGCATATAAGAGTTCAGGACGTGTTACTAGCAACCACTGCAGCACCA
ACATATTTTAAGCCTGTAACTAATCAAGAGCATATTAAGGGTTATGAGAA
TCAAGAGGATGCACTATATGCGTATGCAGATGGAGGGCTTGGGGCTAATA
GACCGGCATATGAAGCACTCAAGATATTAAAGAACGGTCATAGTAGGGAA
GAGAATGCCAAAATACTTGATGATACTATGGTATTATCACTTAACTTTGA
TAATGATCATAAGGCTAGCAGCTCCATACCTAAGATAGGATTTGATGGAG
TAATAGGATGGCTTGTTAAAGGAAAGCTAGTTAGTCGTCTAATGCAAAGC
AGTGAAGATAGCTCCACAGCAGAGGTAAGAGTAGGTTTACCGGGCGAGGA
TGAGTTTGTGGAGGTGAAGCTACCTATTACTAAAGAGACAAGTAGTTTAG
ATAATAGTAGCCTTAAAAACATAGAAGCATTAGTAGCGGTAGGTCGTAAA
TATATAGAGGAGCATACGGAGCAGTTACAAAAGCTATGTGATAATTTAGT
AAAATATGTAGAGGTCGAGACTAAAGCTATGACTCATGAGAAAGCAGCAA
AAGACGCGGGGGGAGCAATAGAACTTGGTTCAGGCTTAGATTTAGAGAAT
AGTAGTGATGACGATGCTATGATAAATAAGGAAGCTATAGCAAATAGTAA
TGAAGATGCTAATAAGAGCGATGGTGATGATGTTGTAAGTAACTCTATTA
TCACCAATGAAAATAGAGAGCAGATACTGGACGGTATCAAGCAGTATCTC
ACATCATTTGCAAATGATAACCCTGATTTACAGGAAAATATTGTTCAGTA
TTTAACTTCTGTGAATGATTATAGTAATCAGGAATTAGAGAAGCTAATAC
TGGATTTTGCAGAAGGGCAAAAGGTAGTGCAAGAAATGGAGCTACATGAG
GCAGAGAGCGTACTTGCTCCTTATATGAGTTGCGGCATGGAAGCTAATCA
AGAAGCTATGGAACTTGAAGGGATAGATGATGAGGTACAAAATCATGAGG
TTTTGGCGTGA
>RF_p25 sca12, Cell surface antigen-like protein Sca12
GTGGGGACGATGATGATTGGAGTGGTGAGGATAGTATTTCAGATACTGAT
GGATATGACACTGTATACAAGTAGTGGTAGCGAATATTCTGAGGATAGTG
GCGACGAGGACGGGATACCAATTTCACCACCTGCGATTGAAGAGGATAGA
GCGGAACTTGACAGCATAAGAGAGTTGCAAGTATCAAGGCAATCATCAGC
TGTTGCAAGTAATGATAGCATTAATGAAGTAAGTTTTGCAGCAGACAGTA
GTGGTTTTAAAGAAGAGCAACAAGAAGAGAGTACCACGGAGAGCGATTTT
GAGATACTAGATGAGGTGGACGAAGAAGATAGTTTATCTAAAGATATATC
TACTAACTTAGGTGGTACCGTAAGCACTGAGCCACAAGAACAATCGACTG
CTAAAGATAAAGAAGAGTTGCTTAAAAAAGCGACCATTGCAGTAGCGTCA
CATAACCAAGCACGAGAGGCTAACAAAATATCCAGTAAACAGATCAGACA
CCGTATGTTTGTGAGGGATATATTAATATCTCCTGTATCTGCAGGGGAAG
ATGGCACAGACATTCTTGCTAGAATCATTGGATATCACATATGGAGTAGT
GGCACGCTTGGCAGCAACAAACAAAAATCTAAAGCAGACTTAAATGGCTA
TAGTAGCAAAATAGCTGGAGGCACTATTGGGCTAGAGCTTAACCTTGAAA
ATGACTTACTACTCGGTGCTAATTTTAGCAAATTTAGTAGCCGTGTTAAA
TATCAAGATCAAGGCGGGTCAAGTGATTTACGAAGCAGTACCGCAAGTAA
CAGAGCTAAATATGATACTCATATATTTAGTCTATACGGCTTAAGTCCAG
TAAGCCGTAATATGAGCGTTTCGGTCATAGGTTCAGCAGGACTTAGTAAA
GGCAGGAAAGCAAGATCAAAGTTATTGAGTTTTGAGCCTCATCTTAACTA
CAGAGTAGAGTTACCCAAAGCAGTAACGCTAATACCTCATATTGGGTTGA
GATACGAATATGAGAAAGCAAACGCTTACCAAGAGCAAATAGCAAGTAAC
CTGTCTATAGAGAGTGCTAAAAAGAGTTACCAAGCCTTAAGCGGTGAGAT
AGGTAGCAGAGTAATATTTGCTCCTATTAAACTAAATGGTAGTACTCCAC
GGGCAATATCAATAACACCAACGGTACATTTTTCGGTAGAGAGAAAAATA
GGTAGCAGGGGCACAAGCCATCCTTTCACTTTAACGTACTACGAGTCCAA
GCAAACTATCGGCACTGGTACCATATCAGCTAATGCTCAAAACGAAAGGA
CGAGTCTTAATGCTGGAGTCGGATTAATAGCAGCTAGTCAGAACATTAAG
CTAGAGCTATTGTACGACCAGCAAAGGCAAAGGCGATTTAAGAGTCATCA
AGGAGTTTTAAAGCTGAAGGTGAGTCTCTAG
>RF_p13 tmk, Thymidylate kinase
ATGAATAGCACTAATAGAGTTAAACGTGGCAGATTTATAACATTAGAAGG
TGTAGATGGCAGTGGTAAATCCACACAATGCCGTATATTAAAGGAATATT
TAATTTCTCGGGATATTCCTGTTATGTCAACTAGGGAGCCTGGAGGCACA
GAAATTGCTGAGGAGATGCGAAGTATCTTGGTACATAGAGATTTACTGCC
GATGTCGGAGTTATTGCAAGTGATGGCAGCACGCTATGATCATATTGTAA
AAAAGATTCTTCCCGCAATAGAAGCGGGCTATACGGTGATATGCGATAGA
TTCATTGATTCTACGGTCGTGTATCAAGGTTTAGAGATTGATAGTGGTAT
GGAACTCGTATACAGCTTGCATAAAAAGCTTATGCCCTCTATAATGCCGG
ACATTACGTTTTTCATTGATATAGAACCAGTATTAGCGATGGAAAGAGTA
AAAGTTCGTAATGGTAGTAACTATAGTAGCAGTAATTTGAGAAATAATAG
ATTTGATATTAAGGACTTAGATTATTACAAGAAGATCCATAATGGTTTTA
GAACATTAGCTGATAAATACCTGAAACGCATAAAGACAATTAAGGTAACG
GCTTTAAGTACACCAACACCAACACATAAGATTATCACGAGATATTATCA
AGGTTTGGATTTAGGATATGCCAAACAAATATGA
>RF_p32 tnpR, TnpR resolvase
ATGAGATTATTTGGCTATGCTAGGGTATCAACCAATCAGCAACTTTTAGA
CCTACAGATAAAACGTTTAAAAGATGCTGGGGTAAAAGAATCAAGAATAT
TCCATGACAAAGCAACAGGTAGTAACTTAGACAGAGCAGGGCTAAATAAC
TTATTGCATAAGGTAGAAGAAGGGGATGTAATATTGATTACCAAGTTAGA
TCGTTTAGGCAGAGATACTGCCGATATGATTAACTTAGTTAATCAGTTTG
CTAATATAGGTGTAGCTGTGCGTTTTCTTGATGATGGTATTAGTACGGAA
GGCAGTACGGGAAAAATGGTTATTACAATCCTAAGTGCAATAGCAGAGGC
CGAGAGAGCACGGATACTTGAAAGAACTAATGAAGGCAGGTTAGAGGCCA
AAACTAAAAAGGTATTAAGTTTGGTCGCAACCGTATTATAG
>RF_p37 traD_Ti, Conjugative transfer protein TraD_Ti
TTGTCCCTTGCTTCTTTGTATATGCGAATGCGTATGCAATTACAAAAAGC
AGTAGCCTTTGATCGTAAATCTGACGCTAGAAAAAAGATTATGCTAGGCG
GATTATTTGTTAAAGCAGGTCTTGATTACTTACATCCTGATAATGCTCAT
ATTCTTTACGGAATGTTACTTGATTGTAAGGAGCAATTAATCATTAATCC
GAAGATTATTGATAAGTGGAAAAGTAAAGGTCAGCAGCTACTTAAAAAAA
GTATTTGA