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Genomic element: pCTA

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# Chlamydia trachomatis A/HAR-13, A/HAR-13

>pCTA_0001 virulence plasmid integrase pGP7-D
ATGGGCTCGATGGCTTTCCATAAAAGTAGATTGTTCTTAACTTTTGGGGA
CGCGTCGGAAATTTGGTTATCTACTTTATCTCATCTAACTAGAAAAAATT
ATGCGTCTGGGATTAACTTTCTTGTTTCTTTAGAGATTCTGGATTTATCG
GAAACCTTGATAAAGGCTATTTCTCTTGACCACAGCGAATCTTTGTTTAA
AATCAAGTCTCTAGATGTTTTTAATGGAAAAGTCGTTTCAGAGGCCTCTA
AACAGGCTAGAGCGGCATGCTACATATCTTTCACAAAGTTTTTGTATAGA
TTGACCAAGGGATATATTAAACCCGCTATTCCATTGAAAGATTTTGGAAA
CACTACATTTTTTAAAATCCGAGACAAAATCAAAACAGAATCGATTTCTA
AGCAGGAATGGACAGTTTTTTTTGAAGCGCTCCGGATAGTGAATTATAGA
GACTATTTAATCGGTAAATTGATTGTACAAGGGATCCGTAAGTTAGACGA
AATTTTGTCTTTGCGCACAGACGATCTATTTTTTGCATCCAATCAGATTT
CCTTTCGCATTAAAAAAAGACAGAATAAAGAAACCAAAATTCTAATCACA
TTTCCTATCAGCTTAATGGAAGAGTTGCAAAAATACACTTGTGGGAGAAA
TGGGAGAGTATTTGTTTCTAAAATAGGGATTCCTGTAACAACAAGTCAGG
TTGCGCATAATTTTAGGCTTGCAGAGTTCCATAGTGCTATGAAAATAAAA
ATTACTCCCAGAGTACTTCGTGCAAGCGCTTTGATTCATTTAAAGCAAAT
AGGATTAAAAGATGAGGAAATCATGCGTATTTCCTGTCTCTCATCGAGAC
AAAGTGTGTGTTCTTATTGTTCTGGGGAAGAGGTAAGTCCTCTAGTACAA
ACACCCACAATATTGTGA
>pCTA_0003 virulence plasmid ParA family protein pGP5-D
GTGGGATGCAACTTGGCCCAATTTTTAGGGAAAAAAGTGTTACTTGCTGA
CCTAGACCCGCAATCCAATTTATCTTCTGGATTGGGGGCTAGTGTCAGAA
GTAACCAAAAAGGCTTGCACGACATAGTATACACATCAAACGATTTAAAA
TCAATCATTTGCGAAACAAAAAAAGATAGTGTGGACCTAATTCCTGCATC
ATTTTTATCCGAACAGTTTAGAGAATTGGATATTCATAGAGGACCTAGTA
ACAACTTAAAGTTATTTCTGAATGAGTACTGCGCTCCTTTTTATGACATC
TGCATAATAGACACTCCACCTAGCCTAGGAGGGTTAACGAAAGAAGCTTT
TGTTGCAGGAGACAAATTAATTGTTTGTTTAACTCCAGAACCTTTTTCTA
TTCTAGGGTTACAAAAGATACGTGAATTCTTAAGTTCGGTCGGAAAACCT
GAAGAAGAACACATTCTTGGAATAGCTTTGTCTTTTTGGGATGATCGTAA
CTCGACTAACCAAATGTATATAGACATTATCGAGTCTATTTACAAAAACA
AGCTTTTTTCAACAAAAATTCGTCGAGATATTTCTCTCAGCCGTTCTCTT
CTTAAAGAAGATTCTGTAGCTAATGTCTATCCAAATTCTAGGGCCGCAGA
AGATATTCTGAAGTTAACGCATGAAATAGCAAATATTTTGCATATCGAAT
ATGAACGAGATTACTCTCAGAGGACAACGTGA
>pCTA_0008 virulence plasmid integrase pGP8-D
ATGGGTAAAGGGATTTTATCTTTGCAGCAAGAAATGTCGTTAGAATATAG
CGAAAAGTCTTATCAGGAAGTTTTAAAAATTCGCCAAGAATCCTATTGGA
AACGCATGAAAAGCTTCTCCTTATTCGAAGTTATTATGCATTGGACCGCA
TCACTCAACAAACATACTTGTAGATCATATCGAGGATCTTTTTTGTCTTT
AGAAAAGATTGGTCTATTGTCTTTGGATATGAATCTGCAAGAGTTTTCCC
TTTTAAATCATAATCTAATCCTAGATGCGATTAAAAAAGTTTCCTCTGCC
AAGACTTCTTGGACCGAAGGTACTAAACAAGTTCGAGCAGCAAGCTATAT
TTCCTTAACAAGATTCCTAAACAGGATGACTCAAGGAATAGTCGCTATAG
CGCAACCTTCTAAACAAGAAAATAGTCGAACATTTTTTAAAACCAGGGAA
ATAGTAAAAACGGATGCGATGAACAGTTTGCAAACAGCATCCTTCCTAAA
AGAGCTAAAAAAAATCAACGCCCGGGATTGGTTGATCGCCCAGACAATGC
TCCAAGGAGGTAAACGCTCCTCTGAAGTCTTAAGCTTGGAGATTAGTCAG
ATTTGTTTCCAACAAGCTACCATTTCTTTCTCCCAGCTTAAGAACCGTCA
GACAGAAAAGAGGATTATTATAACTTATCCTCAGAAGTTTATGCACTTTC
TACAAGAGTACATCGGTCAACGAAGAGGTTTTGTCTTCGTAACTCGCTCC
GGAAAAATGGTGGGGTTAAGGCAAATCGCCCGCACGTTCTCTCAAGCAGG
ACTACAAGCTGCAATCCCTTTTAAGATAACCCCGCACGTGCTTCGAGCAA
CCGCTGTGACGGAGTACAAACGCCTAGGGTGCTCAGACTCCGACATAATG
AAGGTCACGGGACACGCAACCGCAAAGATGATATTTGCGTACGATAAATC
CTCTCGAGAAGACAATGCTTCAAAGAAGATGGCTCTAATATAG
>pCTA_0006 virulence plasmid protein pGP2-D
ATGGTAAATTATAGTAACTGCCACTTCATCAAAAGTCCTATCCACCTTGA
AAATCAGAAGTTTGGAAGAAGACCTGGTCAATCTATTAAGATATCTCCCA
AATTGGCTCAAAATGGGATGGTAGAAGTTATAGGTCTTGATTTTCTTTCA
TCTCATTACCATGCATTAGCAGCTATCCAAAGATTACTGACCGCAACGAA
TTACAAGGGGAACACAAAAGGGGTTATTTTATCCAGAGAATCAAATAGTT
TTCAATTTGAAGGATGGATACCAAGAATCCGTTTTACAAAAACTGAATTC
TTAGAGGCTTATGGAGTTAAGCGGTATAAAACATCCAGAAATAAGTATGA
GTTTAGTGGAAAAGAAGCTGAAACTGCTTTAGAAGCCTTATACCATTTAG
GACATCAACCGTTTTTAATAGTGGCAACTAGAACTCGATGGACTAATGGA
ACACAAATAGTAGACCGTTACCAAACTCTTTCTCCGATCATTAGGATTTA
CGAAGGATGGGAAGGTTTAACTGACGAAGAAAATATAGATATAGACTTAA
CACCTTTTAATTCACCATCTACACGGAAACATAAAGGGTTCGTTGTAGAG
CCATGTCCTATCTTGGTAGATCAAATAGAATCCTACTTTGTAATCAAGCC
TGCAAATGTATACCAAGAAATAAAAATGCGTTTCCCAAATGCATCAAAGT
ATGCTTACACATTTATCGACTGGGTGATTACAGCAGCTGCGAAAAAGAGA
CGAAAATTAACTAAGGATAATTCTTGGCCAGAAAACTTGTTATTAAACGT
TAACGTTAAAAGTCTTGCATATATTTTAAGGATGAATCGGTACATCTGTA
CAAGGAACTGGAAAAAAATCGAGTTAGCTATCGATAAATGTATAGAAATC
GCCATTCAGCTTGGCTGGTTATCTAGAAGAAAACGTATTGAATTTCTGGA
TTCTTCTAAACTCTCTAAAAAAGAAATTCTATATCTAAATAAAGAGCGCT
TTGAAGAAATAACTAAGAAATCTAAAGAACAAATGGAACAATTAGAACAA
GAATCTATTAATTAA
>pCTA_0005 virulence plasmid protein pGP3-D
ATGGGAAATTCTGGTTTTTATTTGTATAACACTGAAAACTGCGTCTTTGC
TGATAATATCAAAGTTGGGCAAATGACAGAGCCGCTCAAGGACCAGCAAA
TAATCCTTGGGACAACATCAACACCTGTCGCAGCCAAAATGACAGCTTCT
GATGGAATATCTTTAACAGTCTCCAATAATTCATCAACCAATGCTTCTAT
TACAATTGGTTTGGATGCGGAAAAAGCTTACCAGCTTATTCTAGAAAAGT
TGGGAGATCAAATTCTTGATGGAATTGCTGATACTATTGTTGATAATACA
GTCCAAGATATTTTAGACAAAATCAAAACAGACCCTTCTCTAGGTTTGTT
GAAAGCTTTTAACAACTTTCCAATCACTAATAAAATTCAATGCAACGGGT
TATTCACTCCCAGTAGCATTGAAACTTTATTAGGAGGAACTGAAATAGGA
AAATTCACAGTCACACCCAAAAGCTCTGGGAGCATGTTCTTAGTCTCAGC
AGATATTATTGCATCAAGAATGGAAGGCGGCGTTGTTCTAGCTTTGGTAC
GAGAAGGTGATTCTAAGCCCTGCGCGATTAGTTATGGATACTCATCAGGC
GTTCCTAATTTATGTAGTCTAAGAACCAGCATTACTAATACAGGATTGAC
TCCAACAACGTATTCATTACGTGTAGGCGGTTTAGAAAGCGGTGTGGTAT
GGGTTAATGCCCTTTCTAATGGCAATGATATTTTAGGAATAACAAATACT
TCTAATGTATCTTTTTTGGAAGTAATACCTCAAACAAACGCTTAA
>pCTA_0002 virulence plasmid protein pGP6-D
GTGAACAAACTAAAAAAAGAAGCGGATGTCTTTTTTAAAAAAAATCAAAC
TGCCGCTTCTCTAGATTTTAAGAAGACACTTCCTTCCATTGAACTATTCT
CAGCAACTTTGAATTCTGAGGAAAGTCAGAGTTTGGATCGATTATTTTTA
TCAGAGTCCCAAAACTATTCGGATGAAGAATTTTATCAAGAAGACATCCT
AGCGGTAAAACTGCTTACTGGTCAGATAAAATCCATACAGAAGCAACACG
TACTTCTTTTAGGAGAAAAAATCTATAATGCTAGAAAAATCCTGAGTAAG
GATCACTTCTCCTCAACAACTTTTTCATCTTGGATAGAGTTAGTTTTTAG
AACTAAGTCTTCTGCTTACAATGCTCTTGCATATTACGAGCTTTTTATAA
ACCTCCCCAACCAAACTCTACAAAAAGAGTTTCAATCGATCCCCTATAAA
TCCGCATATATTTTGGCCGCTAGAAAAGGCGATTTAAAAACCAAGGTCGA
TGTGATAGGGAAAGTATGTGGAATGTCGAACTCATCGGCGATAAGGGTGT
TGGATCAATTTCTTCCTTCATCTAGAAACAAAGACGTTAGAGAAACGATA
GATAAGTCTGATTCAGAGAAGAATCGCCAATTATCTGATTTCTTAATAGA
GATACTTCGCATCATATGTTCCGGAGTTTCTTTGTCCTCCTATAACGAAA
ATCTTCTACAACAGCTTTTTGAACTTTTTAAGCAAAAGAGCTGA
>pCTA_0004 virulence plasmid protein pGP4-D
ATGCAAAATAAAAGAAAAGTGAGGGACGATTTTATTAAAATTGTTAAAGA
TGTGAAAAAAGATTTCCCCGAATTAGACCTAAAAATACGAGTAAACAAGG
AAAAAGTAACTTTCTTAAATTCTCCCTTAGAACTCTACCATAAAAGTGTC
TCACTAATTCTAGGACTGCTTCAACAAATAGAAAACTCTTTAGGATTATT
CCCAGACTCTCCTGTTCTTGAAAAATTAGAGGATAACAGTTTAAAGCTAA
AAAAGGCTTTGATTATGCTTATCTTGTCTAGAAAAGACATGTTTTCCAAG
GCTGAATAG
>pCTA_0007 dnaB_2, replicative DNA helicase
ATGAAAACTCGTTCCGAAATAGAAAATCGCATGCAAGATATCGAGTATGC
GTTGTTAGGTAAAGCTCTGATATTTGAAGACTCTACTGAGTATATTCTGA
GGCAGCTTGCTAATTATGAGTTTAAGTGTTCCCATCATAAAAACATATTC
ATAGTATTTAAATACTTAAAAGACAATGGATTACCTATAACTGTAGACTC
GGCTTGGGAAGAGCTTTTGCGGCGTCGTATCAAAGATATGGACAAATCGT
ATCTCGGGTTAATGTTGCATGATGCTTTATCAAATGACAAGCTTAGATCC
GTTTCTCATACGGTTTTCCTCGATGATTTGAGCGTGTGTAGCGCTGAAGA
AAATTTGAGCAATTTCATTTTCCGCTCGTTTAATGAGTACAATGAAAATC
CATTGCGTAGATCTCCGTTTCTATTGCTTGAGCGTATAAAGGGAAGGCTT
GATAGTGCTATAGCAAAGACTTTTTCTATTCGCAGCGCTAGAGGCCGGTC
TATTTATGATATATTCTCACAGTCAGAAATTGGAGTGCTGGCTCGTATAA
AAAAAAGACGAGCAGCGTTCTCTGAGAATCAAAATTCTTTCTTTGATGGC
TTCCCAACAGGATACAAGGATATTGATGATAAAGGAGTTATCTTAGCTAA
AGGTAATTTCGTGATTATAGCAGCTAGGCCATCTATAGGGAAAACAGCTT
TAGCTATAGACATGGCGATAAATCTTGCGGTTACTCAACAGCGTAGAGTT
GGTTTCCTATCTCTAGAAATGAGCGCAGGTCAAATTGTTGAGCGGATTAT
TGCTAATTTAACAGGAATATCTGGTGAAAAATTACAAAGAGGGGATCTCT
CTAAAGAAGAATTATTCCGAGTAGAAGAAGCTGGAGAAACAGTTAGAGAA
TCACATTTTTATATCTGCAGTGATAGTCAGTATAAGCTTAATTTAATCGC
GAATCAGATCCAGTTGCTGAGAAAAGAAGATCGAGTAGACGTAATATTTA
TCGATTACTTGCAGTTGATCAACTCATCGGTTGGAGAAAATCGTCAAAAT
GAAATAGCAGATATATCTAGAACCTTAAGAGGTTTAGCCTCAGAGCTAAA
CATTCCTATAGTTTGTTTATCCCAACTATCTAGAAAAGTTGAGGATAGAG
CAAATAAAGTTCCCATGCTTTCAGATTTGCGAGACAGCGGTCAAATAGAG
CAAGACGCAGATGTGATTTTGTTTATCAATAGGAAGGAATCGTCTTCTAA
TTGTGAGATAACTGTTGGGAAAAATAGACATGGATCGGTTTTCTCTTCGG
TATTACATTTCGATCCAAAAATTAGTAAATTCTCCGCTATTAAAAAAGTA
TGGTAA