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Gene type: CDS
Gene type: CDS
Gene type: CDS
Genomic element: pRF
Number of genes found: 68
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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2 >RF_p67 Transposase TTGGATTATTCCTATAATTTTATAAGTTTGGAAGCCTCAAATGTTTTACG TGACTGGCTCTTAGAATTTTCTTTTATCTATGAAATAACTAAAAATCGTT ATTGTGCTAATTATGGACGTCCATCAATTGATCCTGTATTATTTTTTAGG ATGCAAATAATAAGTTACTTAATATGGTAA >RF_p36 unknown GTGGTACTATTATATATGAAAAGAAGACAAAAACAAACACTTTTCTATTT CTATGACTCAAACAACTTAAAAAAAGAGGCTGGCATGTACTTAAATATTA ATCAAAATATAAGTAATTTAACGAATATAGAAAAAGAGTTCATTGCTGAT AAATACGATGCAATTTTGTTTAACAATGGTAATTTAATGTTTAAAGCTAC TCATGGATGTTTACCACAGTTTCAAGAAGAAATAATTAAATTACTAGATA TAAAATTATTTCGTGAAGTTATAATCGAACATATATTTTTATATGAAATT AAGTTTTGTGAGGAAGAACTCAGAAATATGAGATTGAACAAAACACAGGA AAAGCAAATCCAAGAGAAGATCGATGAAATTAACCTATTAAAAACACAAT ATAAAACATGTATATCAATAAGTGCACCCAATAATTTAAACGATAAAGCA AAAATCAAGACTTTGCTAAATGATTATTATAGTGCTGTTTTAAACAGTGT ACAATGCAGCTCTTATTTAGATTCATTGTACAATTTTGCCTCCTCTTCTT GCGATAGCTATCATTACGATTCATACGATGGAGCTTTCTATATACCAAAG GAAGAGTTAAAAGAATGGGAAGAAATGCAAAAGGATAACGACAAAGAAAT AAAGATTTGCAGCACCCAGTATAAAGAATTACGTACACAGTACGTTAATT TACAAGAACAATTAAGCCAATTAGTCAATAATCTACAATGA >RF_p50 unknown ATGAAAAGGGTGTGTATGAGTAAATTACTTGGTGGTTGGAGTATGTCTTT AACTCGTTACCCATTTAATGAATTTGACTATATAATGTATGGTATGGTGA CAAATCTTGAAGAACTAACAACAGGAAGCATGGCTTCTCCGGGGTGGAGT CCAGAAAATGAACAAAAACCAGATAATAATCCTTGTTTTACAGGTAAAAG GCTTTGGGTTTATGGCGGGGGAGGATGTGCTCCTGAAGAAAAGCCCTCTA GTATGAATGACGTATCCCGCATTATATCTGCGACCATTAATAATGGTTGG GATGGTGTTGATTTTGATGACGAGTGTAATATGAACACTGCATTTGTTAT AAAAACAATGGAAAAACTCAAAGAAAATAGTAAAGAAACCAGTTTTGGTT TTATTGCAGGTTATTCTTATAACCATCCCAATACAGAAAAAGGGAAGAAG ATTACCGACAAAGTTAAGGCGATTATCGCATCAGGTCAATGTGATAGATT AGTGCATTATTGTTACGCTGCCGCAATGTGGAATCAAAATGATATTATCA ATAATGTAAAACAAGCATTAGTACAAAGCATCTCTTATGGCATAGAACAA GATAAAATTGTGTTAGCCTTGACTACTTTGGGTCTGACAGACTGGAATTT AAATTACTTTCTAGATCAAATTATTGATTTGAATTTAGGGGGGTTATTTA TATGGCGATATGATGAGTTGACTCCAAATCATTATAAGATTATCAAAAAA CGGTTAAATAAATTGTACTAG >RF_p56 Hyaluronidase ATGAATATTTTTTCGTTAGATACGTTTTCGTATGGAATTATAATGGGGTA TTACGGACCAGTATGGTCTAATGAAGTACTAATTGAATATGCTGATTTTT GTAAGAAATACGGGTATAAATATTTTATCTATGCACCAAAGATGGATAAG TTGTTACGTGATAATTGGAATATATTTTTTACTGAATCACGTGTTCAGGA ATTAAAAAATATCCGTGATACTTTTGAAGAAAAAGGTGTAGCTTTCGGTA TTGGATTGAGTCCACTAGGGCTTAATAACTTAAAAGATATAGAGAAAGTA GAAAAAGTACTACAACAGAAAATCACTCAAATCAATAATATTAATCCTAC TATTCTAGGTATATTTTTCGATGATATCAATAAAGACTCAATTGTTCCTG ACTTGGGAGTGGGGCAAGTACAGGTTGCTGAGTACATCGCACAAAGAAGT AATGCCCAGAATTTTGCCTCTGTTCCAAGCTATTACAGTAATGATCAAAT TTTACAACGTGTGTTAGGACCAACTCCTGAAAGTTATTTTGCTGATTTTA GTCAGTTAGATCAAAAGTTTTCTATATTTTGGACTGGAGAACATATTATG AGTGATGGTTATTCTCAAAAAGAATTAGATAATATTTCTAATAAACTAGG ACGTAAGGTATTAATATGGGATAATTATCCAGTTAATGATCCGACTTACC TAAAGGATCATTTGCGTATTTCAGGTATAGATAGACCTCAGGAGCTTTCT TCTTGGACTCCATCGATAGCTTTTAATCCTATGATACAACCAAATATGTC AAAAATTCCGTTATCTACAGCTCAATGTTTATTTTCTTCAGAGAAATATA ATAAGCGTGAAATATATATAGAAAAACTTATAGAACTATGTGGAAAAGAT TTAGCACAAGCTATAGATCAAAACTTACCATATTTTGAATTAAATGGTAT TAATCGAACTGAAACATCAAATATCAAACGTATGAAAGAGCTATTCTCCT TGTTTGCTGAGATAAACGAACAGCAATATACGCATGAAATTATCAAGTTA TTGGGGGGATCACAAGAAATATAA >RF_p48 Transposase ATGGATATGGCAATAGAATATCCAGCATATGGTCAGCTAAGAGTATCAAA TGAGCTTAAGAAGAGTGGAATACTTGTATCACCCGGAGAAGTGAGATCAA TTTGGTTACGTAATGATTTAAACAATATCAGTAAAAGGCTTAAAGCATTA GAAGCAAAGATGGCTCAGGATGGTATTGTTCTGACTGAAGCTCAGTTACA AGTACTAGAGAAGCGTCGTAATGAAAAAGAAGCACATGGAGAGATTGAGA CGCAGCATCCAGGTTATCTAGGATGTCAGGATACGTGTTATGTAGGTAAT TTTAAAGGTATAGGTAAGGTTTATTCTCAGGTATTTATTGATAGCTATAC TAGAGTAGTGGATGCTAAACTATATGCTGATAAAACAGCAATTACTGCTG CTGATATGCTTAATGACCGGGTGTTACCATGGTATGAGACGCAAGGGATA CCAATGCTGCGTATTCTTACAGATCGTGGGTCAGAATATAAGGGCAATAT AGAGCATCATGCTTTTGAGTTATTTCTTAGCATAGAAGGTATAGAACATA CTACAACTAAGGCATATTCTCCCCAAACAAATGGTATGTGTGAGCGTTTT AATAAAACCATGAAACAAGAATTCTTTGATACAGCAATGCGGAAAAAGAT TTATACAGATCTTGATGATTTACAATTAGATCTTGATATTTGGTTAGAGC ATTTCAATAATGAACGACTACATTCAGGAAAATATTGTTATGGTAAAACT CCTATGCAAACTTTTCAAGATAGTAAGAAATTAGCTATTGAAAAAAATAA TGAGATCTTGTACCTTGAATACTCGTCTGACAGTCAAAATTTAACTGACA ATCAGGTGCAAAATTTATAG >RF_p46 unknown TTGTCAGATCAATATGCAGCTACTAGTAGTAGACTAAACTCGCTATCGTC TAAAGACTCGATGCTGCGTACTATGTCAGGTCAACAAGCGTTAGAGCTTG CAAGCCGCTTGATTGCAGAAGAAGCTCGCTCAATTGGGATCTCAGAGCAA GAGCAGATGCAGTTTAAAGATGCGGTGAGTACCGATAGTACAACTACTGA TAATACTATTATGAGAAATAATAAAGAAACAGCTACTAGCAATAATGCTA GCGTTGGTTTCAATGCTTTCGGCTTGGGAGGTGCTTCAGCAAGAGTATCG GCATCTAATAATACAAGTAGCAGCAGTGAAGAAGTGTTATCAAAAAAACA AACTATCAACAATGTACTTGAAAAAACAAAATCTGCACTTCAAGAAGGAA GACTCAATAGCTTTAATAGTGATACTCAATCACTAGCAAGAACTTTAAGT CAGAACTATCAGGAGCAGGAATCTATTGGTAGAGAAATATCTGATGCAAT ATCGGCTCAAGACCAGTTAAGTAGAAGTCGTCAATATGTAGCACAAAATG CAGCTACTATTGATCGTAATATGAATGAGCCGGTACTAAATGCTATAATA GATAGCAATATTCCGGGTGTTTCAAGTAAGGAGCAAGCTGCAAGATGGGC AAGAACTCATATACATGAGGCAGCTTCCATAGCAAACTCAGTAATGCCAG TTGATAATATAGCATTAGATAATGGTAGACATTTAAGTGGTATTAGCTCT GATGTAAAAAATATACCTATGCGTAGTGAGCAGCATTTAAAAAATGAATA TCAAGTGCAGACAGGTAAAATAGAAGCATCAGCTGATAAAATAAATAATA AGCAAGAATTAGCTTATCAAAGCGTTGAAACGAGATTAAATAATAATTTA AGTAACAGCGTAAAAGAAAGCTACAATAACTTAAATAATACTGCTCAGCT CGTAGAGCAGAAAGGTAAGAAAATAGAAGATCAGTATGAGGATACCTCGG ATTCTACTGTAAAAAGAACACTAGATGAAATAGGTAAAAACTCTAGATTA TAA >RF_p06 Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases ATGCCATTATTAAATGAACGTGATGTTGAAACACGAATTGAAGAACAACT TAAAAATCTTGAATGGATTGACAATCCTAGTTTACCTAATCGTAATGTTT ACAAACAAAATCCAAAAACAGAAAAACAGAGGAAAGCATTAGGTAGTAAG CGACCTGATTATACACTTTATCGTGATAATAGTGATGACCCCCTTATTGT TATTGAAGCGAAGCGACCTAATACAAATCTTTCACAAGCTTTAGAGCAAG GTAACAATTATGCTAAAGCTATTAATGCACCTATTGTTATAGCAACAGAT GGAATATTTGCTAAAACTTTTCATACTAAAATGCAGAAACCACTTTTTCT TGACAAGGAAGAAATTAGTAAGATTATTCAACAATCGTTAGCTATTGAAT ATATTGATAAGAACGAATATTTTAGCATTGATGAGAAAGTAATTAAAAGT CGAGACGAATTACTAACGATATTCAAAGAAATCAACAATCAATTCAAGGA TGCGGGAGTAAGTAGAGGATTGCCTCGAATTGAATTGTTTTGCAATCTTC TTTTCTTAAAAGTCATTACAGAATTAGTAGGTACTAATAGTCTTATTCAT TCGCTTCCGGACTGGTGCACATGGGATAAAATAAAGGCAAAAAAGGGAGA TGATTTATGGACTTTTATCAATACACAAGCTTTTGATTATTTAAGCTTTT GA >RF_p14 Ankyrin repeat GTGGTGAGTATGAAACAGGTAGAAAGACAGAAGCTTAATCAAAAATTAAT 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GGCTATGATGCTCACAGCAACATTAGATGCTAAAGCACATCCTAGCGTAG AATCAAGTATCTTAGAACCAAATCAAAGTTTTCTATTTGGTAAGGATTCT GCAGGAATTAGCACTAACGTGCCTTTACCACCAATCATGCCCCAGTCACC ACCATCAGCTCCTCCAATTCCGCCTGTGCTCCCAGCTATGCCTGATTTCA TCAGCGATGCAAGTATTGGAGGGAAATCAGACAATAGGTCAGCACTACTT GAATCAATCAGGAATTTTGGCAAAAACATATTAAAAAAGTCAAGAAAGAA CCAAAGCCTAAAGTTGTATCTAGCGATGGCGGGGATTTAA >RF_p02 unknown ATGAGTCCAAATCCAGATTTTATCACTATTGTGAAAATAGCAAATTATTT TAATTGTGCGGTTGATCAAGTAGTGGGTAGACGCAAATTTTTACCTTCAA TAAATTTAATAGTATCTTTTAATAATCCAGACTTAAATGACATAAATTCT AATCTCTGTAATTTTTTAAAAGCAAAATTATCTCAAGATAATATATCACC TTATTTATTAAGCAAAAATATTGGTTTTAGTAAAAAAATAATACATTGTT TTTTAAAAGCAAACTCTCCTTATAAAATGCTTAGCACTAATGTTATTATC GCACTTGCTGATTATTTTAATGTCTCTGTAGACGATATGATAGAACGATA TCCTACAACCAAACAATAA >RF_p49 Integrase ATGAACTTAAATCAAAAAATAATAAAGTCAAAATTAGGTTTACTAGAATT AGCTAAGAGTCTTGGTAGTATATCATCAGCATGTAAAGCGATGGGATATA GTAGAGATAGTTATTACAGATTTAAAGAACTATATGAAACTGGTGGTGAA GAAGCGTTATATGAAATTAGTCGAAGAAAGCCAATGAGTTGA >RF_p04 unknown 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III, epsilon subunit-like protein TTGATAAGACTCAAGTTTCTTGAAGAAGTTGATATTATCATTGCCCACAA TGCTGCATTTGATAGACCTTTTTTTGATAAAATGTTTCCTGAAGTTATAA CCAAAGTATGGGGATGCTCAAGAGTTGATATTGATTGGAAAGCTGAGAAA ATAGAAAGCCATAAACTAGAATATCTTACTTATAAATATAATTTCTTTTA TGAGGGACACAGAGCTGTTATAGACTGCCGCGCTGGGTTGCATTTACTTG CTCAAACCTTACCTATTACTAAAACACTAGTATTAAAACAATTACTTAAT AATTGCCATAAAACCAGATTTAATGTTTGGGTACACAATGCCCCTTATGA CTCTAAAGATTTACTTAAATCTAGAGGCTATCGCTGGTCTATCAATCCAC AAGCAAATTATAAAGCTTGGATGATTGAAGTATTTGAAGATACTCTCGAA ACAGAGCTAACATTCCTGAATTCTAATGTTTACAAAACGCCCTATAATAT CCCAGTACAAACCATAAACCCTTGTGATAGATTTATGGGATAA >RF_p55 Transposase GTGTGTAAATTTCTCAAAGGTTATATAAAAGAAAATATAACAAAAAGAGG GATTACAATGCCACAGAAACAAAATGCTGCAATGAATCAAGCGATAGATT TATTGATCAATAATGATACAGATGTATCAACTTTATTCAAGGAAGATGGT TTATTAAAAGAACTAACCAAGCACCTTGTAGAGAAAGCACTACAGTCTGA GATGAATAATCATTTAGGATATAGCAAGTATAATCAAAGTGATGCCCAGA ATTCACGTAATGGTTATAACACAAAGAATCTGATTACAAAGAATGGTGCT GTTGAGATTGAAGTGCCAAGAGATAGAAATAGTAGCTTTGAACCATCATT AGTAGCGAAGCGTCAAAGAAGACTTGATGGTTTTGATGATAAAGTACTAT CCTTATATGCTAAAGGGATGAGTTTATCAGATATAAAATTACAGCTTCAG GAGTTATATGGAGCTGATGTAAGCGAGAGCTTAATCGTAGGATTACAGAT GATATAA >RF_p66 Site-specific recombinases ATGGCAAAAGTTGGATATGCACGCGTTAGTTCATTAGGTCAATTACTCAG CATCCAATTAGATAAATTAAAAGATTGTGATAAAATATTTCAAGAAAAGA AATCCGGTCTTGATGGAACAAGAAGTGCATTAAAAAATGCACTGGATTAT GTACGTGAGGGCGATATCTTTATTGTTACAAAATTAGATAGGTTAGCACG CTCTACTGCACATCTATGCAAAATAGCCGAGATTTTAAATCAGAAATCTG TGGCTCTGAAAGTTTTAGATCAAAATATCGATACTAAAGATGCGACTGGT CGGTTAATATTTAATGTGTTAGGAGCGATCGGACAATTTGAAACTGAGAT TAGAGCCGAGAGGCAAATAGATGGAATCCTAAAAGCAAAAGAGCGAGGTA TACAGTTTGGGAAGAAACAATACTTAACAAAGCAACAATTAAATGATCTT AAAGAAAAACGAAAACAAGGTATTAAAATCAAAAACCTGATGCAAGAATT CAATTTATCAAAAGCCTCAATATATCGCTATCTTGCACAGGAAGTATAA >RF_p17 TPR, tetratricopeptide repeat domain ATGAAAAAAAGAAATGAACAAGAAGCATTCAAACTCTTAACAAGTGGACA ATTATTGGCATTGTATAGGAGTTATTCTAGAGCTGGAGAACTAAAATATG CCTCTCCAGTTTTAGAGTATTTGTTGGAATCGACATATAGTGACGCAGAA 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CAATCGATAATATATCATATCCACTATTACATCGTATGGAAGTAATTGAT ATTAGTGGTTATACCGATAATGAAAAAGTTAAAATCACACAAGATTACAT CATACCAAAGCTAATGAAAGAGGCAAATGTTCCAAGCAACAAATTCACCC TCTCAAACGAACTGATTAGGTACATCATCGAGAATTATACTTGGGAATCA GGCGTAAGAGATATAGAGCGAAAAATAAAAGAGCTATTACAAAAATCTCT CTTAGCAGAAGCAAGAAAGGAGCAAATCACCTTAAATAAGGAAACTATAG AAGAATATTTCAAGCACTCTAAATATCACAAACAAAAACTACAAGATGAT GAAGTTACTATTGGTATGATCAACGGTCTTGCTCATACAGCAAGGGGAGG CGATTTAATTAAAATAGAAGCTTCAAAATACAAAGGTGACGGAAAGATTA AAGCAACAGGCAAACTAGGAGAAGTATTAAAAGAATCAATAGATGCTGCG ATGACCTGTTTAAAATCAAGCATAGATTCTAAAACTAAAGAAATCAACGA TGACATATTAAAGACTCATGACATACATATACATCTGCCAGCAGGAGCAA CGCCTAAAAACGGACCATCTGCGGGCATCACTATATATACGGCTCTTTAC TCACTACTTAGTAACAAGAAGATCAGACAAGATATAGCAATGACTGGTGA GATTACATTAAAGGGTAGAGTGCTTGAGATAGGGGGGCTTAAAGAAAAGC TAACAGCTGCAGTAAGAGAAGGTATTAAGGAAGTCATCATCCCTAAGGAT AACGAGCGTGACTTAGCCGAAATACCTGAGGAAATTAAGCAAGCACTAAT AATACATACAGTATCAAATACTAGTGAGATACTAAGGATAGTATTTGATA CTAAAGTATCTAATAAAAATACTAAACAAAAAACACCAAAGGAAAATATG 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Conjugative transfer protein TraD_Ti TTGTCCCTTGCTTCTTTGTATATGCGAATGCGTATGCAATTACAAAAAGC AGTAGCCTTTGATCGTAAATCTGACGCTAGAAAAAAGATTATGCTAGGCG GATTATTTGTTAAAGCAGGTCTTGATTACTTACATCCTGATAATGCTCAT ATTCTTTACGGAATGTTACTTGATTGTAAGGAGCAATTAATCATTAATCC GAAGATTATTGATAAGTGGAAAAGTAAAGGTCAGCAGCTACTTAAAAAAA GTATTTGA