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COG category: Defense mechanisms
Genomic element: chromosome 1

Number of genes found: 4

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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA0886 FNV1836, putative type I restriction enzyme HsdR
TTGTCAGTTGTAGGTTGGAGTAACAACATGGTTAGTCAAACGAATGAAAT
GGCACTTGAAGCCGCTATCGAAAAAGCACTGGTTGGTATTACTACTGAAG
AACGTAAGCAAGGTATTGCAGAGCCTTTTGCCGTTTATAGCAAAGATCAT
GCGTACAGTATTGGCTTTCCGAGTGACTTTGACGCCAAATATGCAATTGA
TAAAACCTACTTCTGGCAATTCCTAGAAGATACTCAACCAACTGAGTTGG
AAAAGCTGCAAAGTAATAGCCCGAATGATTGGCAGCAAAAAGTACTTGAG
CGTTTTGACCGTCTTATCCGAAAACATGGTGTGCTGCACCTGCTGAAAAA
GGGACTTGCTGTAGATGATGCTCACTTGATGTTGATGTACCCAGCACCTT
TAGCCAGTAGTTCAGAATCGGTAACTAAGAACTTTAATGCCAATATCTTT
AGTGTGACTCGCCAAGTCCGTTACTCTCAAGCGAATCCATTACAAGAAAT
CGATATGGTTATCTTCATTAATGGTATTGCACTGGTAACGTTAGAATTAA
AAAATCATTGGACGGGGCAAACTGCGCGTTATCATGGTCAGAAGCAATAC
TGTAACGACCGAGATCAAACGCAACCTTTACTCAACTTTGCTCGTTGTTT
GGTTCACATGGCAGTGGACACAGAAGAAGTCTACATGACCACCAAATTAG
CAGGCAAAAAAACCTTTTTCCTACCTTTTAACAAGGGTAATAATCTAGGG
AAAGGAAACCCACCCAATGCTAATGGGCATAAGACAGCTTACTTATGGCA
AGAGGTTTTCAGCCGTGAAAGCTTAGCCAATATTATTCAGCACTTTGTTC
GCCTAGACGGTACATCTAAAGATCGTTTGGAGAAAAGAACGCTTTTCTTC
CCTCGTTATCAACAGATGGACGTCGTTCGTAAACTGATTGCGGATGCTGA
AAAAAATGGAGTTGGACAAACTTATTTGATCCAACATTCAGCAGGCTCTG
GTAAATCTAACTCCATTACATGGGCAGCCTATCAGCTTATTGAAGCTTAC
CCTGGTAACGAAACTGCCGCCGGAGGAAAGAGCTTAGAACAACCACTTTT
TGATTCTGTTATTGTGGTTACCGACCGTCGAATTCTAGATAAACAGCTAA
GAGAAAACATTCAGCAGTTCTCTGAAGTTAAAAACATTATTGTGCCAGCT
AATAAATCATCAGAGCTGAAGAGCGCGCTAGAACAAGGCAAAAAAATCAT
CATTACAACGATTCAGAAGTTCCCATTTATTATTGATGGTATTTCGGATC
TGAGTGATAAACGTTTTGCCGTTATTATCGATGAGGCACACAGTTCCCAG
TCAGGTTCGGCACATGACAACATGAACCGAGCGATGGGTAATGTTGAAGA
AGAGGCTGATGCTCAAGATAAAATCCTTGAAGCAATGAAGTCACGTAAGA
TGAGAGGCAATGCTTCCTATTTAGCTTTCACAGCAACACCGAAAAATACC
ACGTTAGAAAAATTTGGTCAGAAGCAACCTGATGGCAGTTATAAGCCATT
TCACTTGTATTCAATGAAACAAGCGATTGAAGAAGACTTCATTTTGGATG
TATTGGCAAGCTACAATACCTACAAAAGCTATTATGAGATTGAAAAATCA
ATCAGTGAAAATCCGCTGTTTAACAGTAAAAAGGCACAAAAAAAGCTAAA
AGGTTTTGTTGAACGCCAACAGCAGACTATCAACATCAAAGCGGAGATCA
TGCTTGATCACTTCATCCCTCATGTAGTGAACCCTAAGCTTCTAAAAGGA
AAGGCGAAAGGGATGGTGGTTACTCAGAACATTGAAACTGCTATTCGTTA
TTACAAGGCTATCTGCCGCCAGTTAAAAGAGCGAGGCAACCCATTCAAAG
TTATTCTTGCGTTTTCTGGAGAGAAAACGGTAGACGGCATTGAGTACACT
GAATCTGAAGTTAACGGTTTTGCTGATACCGAAACCAAAGACAAATTTGA
TACCGATGAATATCGTTTATTGATTGTTGCGAATAAATACTTAACAGGTT
TTGATCAACCGAAGCTTTCCGCTATGTATGTAGATAAAAAGCTTCAAGGA
GTTTTGGCTGTTCAGGCATTATCTCGATTAAATCGTTCTGCGCAAAAATT
GGATAAACGAACCGAAGATCTATTCATTCTCGATTTCTTTAACTCAACCG
ATGATATCAAGAAGTCGTTTGATGATTTCTATACTTCAACCAGCCTGTCT
GAAGCCACAGACGTCAATGTTCTGCACGAAATTAAAGATGGTTTGGATGA
CGTTGGTGTTTATGAATGGAGTGAGGTCGAGGAGTTCACAAAACGCTACT
TTGATGGTGACGATGCACAAGAACTAAGCATTTTACTGGATGTCGCGGTT
AATCGCTTTGAGCATGAATTACAACTTGAACAAGATGACCAAGCTGATTT
TAAGATCAAAGCAAAGCAATTCGTGAAGATATACGGTCAAATGGCTTCCA
TAATGCCTTATGAAGTGGTGGTTTGGGAGAAACTGTACTGGTTCCTTAAG
TTCCTTATTCCGAAGCTTAAAATCGAAGACACGGACGCTGACCAAATTGA
TGAGTTGTTAGAATCAGTGGATCTCTCTTCTTATGGTTTGCAACGAGTGA
AACTCAATCATACTATCGAGCTTGATGATTCTGAAACAGAAGTAGATCCA
CAGAATCCAAATGTACGTGGTTCTCATGGTGGTGATGAGGAGTTTGATCC
CCTAGATGACATCATTCGTAACTTTAACGAACGTTTCTTTGATGGTTGGA
GTGCAACCCCAGAAGAGCAAAAAGTGAAGTTCGTCAATATCCAAGCCAAC
ATACAAGATCATCCCGACTTCGAAGAAAAATATAAGAACAACCCAGATCC
ACATACACGTGAGCTAGCTTTTGAAAAAATCTTTAATGAAGTGATGTTGA
AGCGCAGGCGTGAAGATATGGAACTGTACAAATTACTAGCTAAAGATGCT
TCAATGAAGAGTTCTGTTATTCATAGCATGCAGAGCCGAATAGGGTATTG
A
>PBPRA0882 PD2072, putative DNA methylase HsdM
TTGTTTAGTTGGTCTATCGCAGATGACTGCCTTCGAGATGTTTACGTGCG
TGGTAAGTACCGTGACGTTATCTTGCCTATGGTCGTATTGCGTCGTTTAG
ATTCCCTGTTAGAAGCTACAAAAAAAGAAATTCTAGAAGAAGTAGCATTT
CAGCGTGATGAAATGGAATCGACTGAATTCGACAGCGCTCCACTAGAAGC
CATTACAGGCTATGTGTTCTACAACACCAGTAAGTGGACGCTCAAACAAA
TTACAGCGACAGCATCAAATAACCAACAGATCCTACTTGCTAACGTTGAA
GAATATTTGAATGGCTTTAGCGATAACGTAAAAGAAATCATCAAGTGCTT
TAAGCTCCAATCACAAATCCGTCACATGGCAGAAAAAGACATACTGCTTG
ATGTACTAGAAAAGTTCACTTCGCCAAACATCAACTTAACTCCAAATGTA
GTCGAAGACCCTGATGGCAATAAGCTACCTGCACTGTCTAACTTAGGTAT
GGGTTATGTGTTTGAAGAGCTAATCCGTAAATTTAACGAAGATAATAATG
AAGAAGCTGGTGAACACTTTACCCCTCGTGAAGTAATCGAGTTAATGACT
CACCTTGTCTTTGACCCACTAAAAGGTAACCTACCACCCGTTATTACCCT
GTATGATCCCGCATGCGGAAGTGGCGGTATGCTGACAGAAGCACAGAATT
TCATCAAAGATCCAGAAGGTAAAATTAAAGCAACAAGTGATGTTTATCTT
TTTGGTAAAGAGATAAATGATGAGACCTACGCCATCTGTAAATCAGACAT
GATGATCAAAGGTGATAACCCTGAAAACATCCGTGTAGGCTCAACACTTT
CTACCGATGAATTCGCAGGTAAAACCTTCCACTACTGTCTTTCGAATCCA
CCTTACGGTAAGAGCTGGGCTAGTGAGCAGAAGTACATCAAAGATGGCAA
AGAAGTCATCGACTCTCGCTTTAAAGTTAAATTAAAAGATTACTGGGGGG
TTGAAGATACCTATGAAGCTATACCTCGCTCCAGTGACGGCCAGTTGCTG
TTCTTAATGGAAATGGTCAGCAAAATGAAATCCGTTAACAATGGAGTTGA
AGGTTCTCGTATTGCTTCCGTTCATAATGGGTCAAGCTTGTTCACCGGAG
ATGCAGGTGGCGGTGAAAGTAACATCCGTCGTTACATCATTGAAAACGAC
ATGCTAGAAGCTATTGTTCAACTACCAAATAACCTATTCTACAACACCGG
TATCACGACTTATATCTGGCTATTGTCTAACAACAAATTAGACAAGCGTA
AAGGACAAGTACAGCTAATTGATGCCAATCCACTTTACCGCAAGCTACGT
AAAAACCTTGGTGATAAAAACTGTGAGTTCTCACCTGAGCACATTCGTGA
AATAACCAAAACTTACCTAGATATGACAAAAGTGGAACGTACACTCGATG
AGAAAGGCGATCCGCAAGGTATTTCAACTAAAGTATTTGATAATGATGAT
TTTGGTTACTATAAGGTCAACATCGAGTGTCCTGATCGTCGTAATGCACA
ATTCAGCAGTGAACGTATTGAAACATTACGTTTTGATAAAGCTCTGCGTG
AGCCAATGGAATATATCTATAATACCTATGGTGAAGATGCTTATAAAGCC
GAAATACTGGCCAAGGAGAGCAAGGCCATACTTGCTTGGTGTGAAGAAAA
AGAAATCAGCCTCAATACCAAGAACCGTAATAAGCTGTTAGACGTTGCGA
CTTGGACAAGATTGGGTGATTTGATTGATATCGCTAACACGCTGATGAAA
GCTATTGGTACAGACATTTATAACGATTACAATCAATTCAAGGCAACTGT
CGATGCCGAGTTAAAATCGCGTAAGATCAAACTTTCTGCCCCAGAAAAAA
ATGCCATTTTAAATGCTGTCAGTTGGTATCACGAAAATGCAGAAAAAGTT
ATCAAGAAGAAGCTCAAACTAACTGGTAGCAAGCTTGACGAACTATTAAC
AAGCTGCGATTGCGATGAACATGAATTAGGTGATTTTGGTTATTACCTTA
TTGCAAAAGAAGACGGCGGTAAAGCTGGTGAATACATCACATATGAATCA
AATTCAGATCTGCGTGATGCCGAATCTATTCCTCTCAAACAAAGTATCTA
CCAGTACTTCCTTGATGAAGTGAAGCCACACGTTTCCGATTCATGGATCA
ACATCGATAGCACTAAAATTGGTTACGAGATCAGCTTTAACAAGCATTTC
TACCAGCATAAGCCGCTTCGCTCAATAGATGATGTAGCCAAAGACATCAT
TGCACTAGAGCAAAAAGCAGAAGGATTGATGGCAGAAATTCTTGGCATTT
CAGTATCAACACTGACTCATGAGGATGCGTAA
>PBPRA0650 VPA0560, putative ABC transporter ATP-binding protein
ATGATCCTATTTAATCAAATACAAAAAACTTACCAACTAGGCAATCAATC
AGTGCCTGCTTTGCAAGGTATCGACGGGCATATTCAAAAAGGTGACATGA
TTGCTCTATGTGGGCCTTCAGGTTCAGGCAAAAGCACCCTACTGAATATT
CTTGGATTACTGGATATGGATTACCAAGGCGAGATCACGCTTGATGGAAA
AGCTTACCCAACAGAGCGATTAGCCGCTGCCAAAGTGCGTCGCCAGAAGC
TTGGGTTTGTATTCCAACGGTTCAACTTAGTGCCAGTCATGACGGCATTA
GAAAATGTTGCTTACCCGCTGCACCTCAATGGATACAGTAAACAGCAACA
AGACGAACTCGCGCTACAGATGCTAGAAAAAGTGGGATTGGGCGATTTTA
CTCAACATAGACCCGATAACCTTTCTGGCGGTCAACAACAACGTGTCGCA
ATTGCTCGGGCATTGGTTCATAAACCAACTTTAGTTATTGCTGATGAACC
GACCGCGAGCCTAGACAGCCAAAGCGCTAACGTAGTGATCGATATAATGA
AGCAGCTGGGGCATGAAATGGGCACTACCTTTATCGTCGCGACTCATGAT
CCTCGCATGGCGACCCGTTGCGATAGAAGCATCGCGCTATTTGATGGAAG
GCTGGCTAATCCAGCAAGTGATATAAGGGGCATGTCATGGGCAAGTTAG
>PBPRA0883 XF2722, hypothetical type I restriction-modification system specificity determinant
ATGAGTAGTGTAGCTATGATGCCCAAGTATGAGGCTTATAATGAGTCTGG
TGTTGAATGGATTGGTAATATTCCAGAGCATTGGAACATTACGAAAGCTA
AATATTTATTTAATGAAGTTGATGAACGTTCGGTCACGGGACACGAAGAG
CTTTTGTCTGTATCTCATATTACAGGCGTGACTCCACGTTCTGAAAAAAA
TGTCTCAATGTTTATGGCAGAGGACTACTCTGGCTCTAAAACCTGTCAAG
CGGATGATATTGTTTTCAATACCATGTGGGCATGGATGGGAGCATTAGGT
GTTTCAGAACGATCTGGTATAGTAAGTCCTTCTTATGGTGTTTTTAGGCA
AAAATTTACCAATACCTTTAATGCAAAGTATCTAGAATATTTACTTAAGA
CTCCCAAATATATCGAGCATTACAATAAGGTTTCAACAGGTCTTCACTCT
TCGCGTTTGCGTTTTTATGGTCACATGTTTTTTGACATGAAAATGGGCTA
TCCCCATATTGACGAACAAAATGGCATCATCAAGTTTTTAGATAATAAAA
CTAATAAAATTGATGAAGCTGCTGCTATTAAAGAAAAGCAAATCTCCCTG
CTCAAAGAGCGTAAGCAGATCATCATTCAACAAGCTGTGACTCGTGGTTT
AAACCCTGATGTACCAATGCGAGATTCTGGTGTTGATTGGATTGGCGAGA
TTCCTGATCATTGGTGCTCAGAGCCTATAAAGTATTCATTAAAGGGAATT
ATCGATTGTGAGCATAAAACAGCACCATTTGTTGATAAAAAAGAGTTTTT
TGTAGTTCGAACTTCAAATGTCAAGCAAGGCAAGCTTGTTATAGAAGATG
CAAAATATACAAATGAGTATGGTTATAAAGAGTGGACATCAAGAGGGGTT
CCGTTTCCAGGAGATATATTACTTACACGTGAGGCTCCCGCAGGTGAAGC
ATGTCTTGTTCCTGATGATAGAAAGTTGTGTTTGGGACAAAGAATGGTTT
GGTTAAAAGTAGACAGAACTAGGTTACTACCTGAATTCGCATTGTCATTA
ATCTATTCTTCAGTTGTGAGAACCTATATAGATTTTCTTTCAGCTGGCTC
TACTGTTCTTCATTTTAATATGGCAGATATTAAAAATATACCTGTCATAC
TTCCACCGATAAATGAACAAGCTATATTAGTCACACATATTAAAAAGCAC
TCAGATAAAATTGATAAAGCCATTGAACTGGAACAGCAACAGATATCCAA
GCTGAAAGAATATAAATCAATCCTAATCAACAGTGCTGTCACAGGTAAAA
TAAAGGTGGTTTAA