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COG category: Intracellular trafficking and secretion
Genomic element: pCP301
Number of genes found: 10
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# Shigella flexneri 2a str. 301, 301 >CP0182 icsA/virG, IcsA (VirG), outermembrane protein exposed to the bacterial surface by a C-terminal autotransporter domain and involved in the movement of intracellul ATGAATCAAATTCACAAATTTTTTTGTAATATGACCCAATGTTCACAGGG GGGGGCCGGAGAATTACCTACGGTAAAGGAAAAAACATGCAAATTGTCTT TTTCTCCTTTTGTTGTTGGTGCATCCCTGTTGCTCGGGGGGCCAATAGCT TTTGCTACTCCTCTTTCGGGTACTCAAGAACTTCATTTTTCAGAGGACAA TTATGAAAAATTATTAACACCTGTTGATGGACTTTCTCCCTTGGGAGCTG GTGAAGATGGAATGGATGCGTGGTATATAACTTCTTCCAACCCCTCTCAT GCATCTAGAACTAAGCTACGGATTAACTCTGATATTATGATTAGCGCAGG TCATGGTGGTGCTGGTGATAATAATGATGGTAATAGTTGTGGCGGTAATG GTGGTGACTCTATTACCGGATCTGACTTGTCTATAATCAATCAAGGCATG ATTCTTGGTGGTAGCGGCGGTAGCGGTGCTGACCATAACGGTGATGGTGG TGAGGCTGTTACAGGAGACAATCTGTTTATAATAAATGGAGAAATTATTT CAGGTGGACATGGTGGCGATAGTTATAGTGATAGTGATGGGGGGAATGGA GGTGATGCCGTCACAGGAGTCAATTTACCCATAATCAACAAAGGGACTAT TTCCGGTGGTAATGGAGGTAACAATTATGGTGAGGGTGATGGCGGTAATG GAGGTGATGCCATCACAGGAAGCAGCCTCTCTGTAATCAATAAGGGCACG 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component of the Mxi-Spa secretion machinery ATGAAAAAATTTAATATTAAATCTTTGACTCTCTTGATTGTATTGTTACC ATTGATAGTTAATGCTAATAATATTGACTCTCATTTATTAGAACAAAATG ACATAGCGAAATATGTTGCTCAAAGTGATACGGTAGGATCTTTTTTTGAA CGTTTTTCTGCGTTATTAAATTATCCTATTGTTGTTAGCAAACAAGCTGC AAAAAAGAGAATATCTGGGGAGTTTGATTTATCTAATCCAGAAGAAATGC TTGAAAAGCTGACATTACTTGTGGGACTCATATGGTATAAAGATGGAAAT GCATTATACATATATGACTCTGGAGAATTAATAAGCAAAGTTATTTTGCT GGAGAATATATCACTTAATTATCTTATTCAGTATCTGAAGGATGCTAACC TTTATGATCACAGATATCCTATAAGAGGAAACATTAGTGATAAAACATTC TATATATCTGGTCCTCCGGCATTGGTTGAACTGGTAGCTAATACAGCAAC TTTGCTTGATAAGCAGGTTTCTTCTATTGGGACAGATAAAGTTAATTTTG GGGTTATAAAATTAAAAAATACATTTGTTAGTGACAGAACTTATAATATG AGAGGGGAGGATATTGTCATCCCAGGGGTGGCTACTGTTGTAGAACGTTT ATTAAATAATGGTAAGGCTCTGAGTAACAGACAAGCCCAAAATGATCCGA TGCCACCCTTTAATATTACACAGAAAGTATCTGAGGATAGTAATGACTTT TCATTTAGTTCAGTTACCAATAGTTCTATATTAGAGGATGTATCACTTAT TGCATATCCAGAAACCAATTCTATATTAGTCAAAGGTAATGATCAGCAAA TACAGATTATTCGCGATATTATCACTCAGTTAGATATAGCCAAACGACAT 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ATGAAATAATATCTGTGCTAGAACGCCATAATATTACTGCTAGAAAAGTT GATGGAGGTAAACAGGGGATCTCGGTACAAGTCGAAAAGGGGACATTTGC ATCGGCAGTTGATTTGATGCGCATGTACGATTTGCCAAATCCGGAGAGAG TTGATATCTCACAAATGTTTCCTACAGATTCATTAGTGTCTTCTCCAAGA GCTGAAAAGGCCCGTTTATATAGTGCTATTGAGCAACGGCTGGAACAGTC TTTAGTTTCTATTGGTGGTGTTATTTCGGCAAAAATACATGTTAGCTATG ATCTTGAAGAAAAAAATATATCTTCAAAACCGATGCATATATCAGTAATC GCTATATATGACTCACCGAAAGAGTCTGAACTATTAGTTAGTAATATTAA GCGATTTTTGAAAAACACCTTTTCTGATGTTAAGTATGAAAATATATCTG TCATATTAACTCCGAAAGAAGAATATGTTTATACAAATGTACAACCTGTT AAGGAAGTTAAATCGGAATTTTTAACAAATGAAGTAATATATTTATTTCT CGGGATGGCTGTACTAGTTGTCATTCTTTTGGTATGGGCATTCAAAACAG GGTGGTTCAAGAGAAACAAAATATGA >CP0070 sepA, SepA, extracellular serine protease of the IgA1 protease family, secreted by a C-terminal autotransporter domain ATGAACAAAATATATTATCTTAAGTATTGCCATATAACCAAAAGCCTGAT TGCTGTCTCCGAACTGGCCCGCAGGGTTACCTGCAAAAGCCATCGCAGAC TTTCACGTCGGGTTATTCTTACGTCTGTTGCAGCTTTATCACTTTCCTCG GCATGGCCAGCTCTGTCAGCAACGGTCAGTGCAGAGATCCCTTATCAGAT ATTCCGCGACTTTGCCGAGAATAAAGGTCAGTTTACGCCGGGGACCACGA ATATTTCCATTTACGACAAGCAGGGCAATCTGGTCGGTAAACTTGATAAA GCCCCGATGGCTGATTTCAGTAGTGCCACTATTACTACCGGTAGCCTGCC TCCGGGAGACCATACACTTTACTCCCCTCAGTATGTGGTTACCGCCAAAC ATGTCAGCGGTTCTGACACGATGAGCTTCGGATACGCCAAAAACACCTAT ACTGCGGTTGGTACAAATAATAATAGCGGTCTTGATATTAAAACCCGCCG CCTGAGTAAACTGGTGACAGAGGTGGCGCCGGCAGAAGTGTCTGACATCG GGGCTGTGAGCGGTGCCTATCAGGCCGGCGGACGCTTTACTGAATTCTAT CGCCTTGGGGGGGGGATGCAGTACGTCAAAGACAAAAATGGTAATCGCAC CCAAGTGTATACCAATGGCGGATTTCTTGTTGGGGGAACCGTCAGCGCGC TGAACTCCTATAACAACGGACAGATGATTACAGCTCAGACCGGTGACATT TTTAATCCCGCGAATGGACCTCTGGCTAATTATCTGAATATGGGGGACAG CGGCTCCCCCCTGTTTGCTTATGATTCCCTGCAAAAAAAATGGGTACTGA TTGGCGTGCTTTCCTCAGGAACTAACTATGGAAATAACTGGGTCGTCACC ACTCAGGATTTCCTTGGTCAGCAACCGCAAAATGATTTTGACAAAACTAT AGCCTACACCTCTGGTGAAGGAGTACTGCAGTGGAAATATGATGCGGCTA ATGGCACCGGCACACTGACTCAGGGAAACACGACTTGGGATATGCATGGA AAGAAAGGAAATGATCTGAACGCAGGAAAAAACCTCCTGTTCACCGGCAA TAATGGCGAGGTCGTTCTGCAGAATTCCGTTAATCAGGGAGCTGGGTATC TGCAGTTTGCCGGCGATTACAGGGTGTCCGCCCTGAACGGCCAGACATGG ATGGGGGGCGGGATTATCACCGATAAAGGAACCCACGTTCTGTGGCAGGT GAACGGAGTTGCCGGTGATAACCTGCATAAAACTGGCGAAGGTACCCTGA CAGTAAACGGGACCGGTGTGAATGCAGGCGGACTCAAGGTGGGGGACGGT ACCGTTATTCTCAACCAGCAGGCGGATGCTGACGGAAAGGTACAGGCTTT CAGCTCTGTTGGTATTGCCAGCGGTCGTCCGACAGTTGTGCTTTCTGACT CACAGCAAGTTAATCCGGATAATATTTCGTGGGGATACCGTGGAGGACGT CTGGAACTGAATGGTAATAATCTGACCTTTACCCGTCTTCAGGCGGCTGA CTACGGGGCCATCATTACCAATAACAGTGAGAAAAAATCAACGGTAACAC TCGACCTTCAGACATTAAAAGCCAGTGACATCAATGTACCGGTTAATACT GTCAGTATTTTTGGGGGGAGAGGAGCGCCGGGAGACCTATATTATGACAG TTCTACCAAGCAATATTTCATCCTGAAAGCGAGTTCATATTCCCCGTTCT TCTCCGATCTGAACAACAGCAGTGTCTGGCAGAATGTCGGAAAAGATCGT AATAAAGCCATTGATACTGTGAAGCAACAAAAAATTGAGGCCAGCAGCCA GCCTTATATGTATCACGGCCAACTAAACGGCAATATGGATGTGAATATTC CGCAGCTCTCAGGTAAGGATGTACTGGCTCTTGATGGTTCAGTTAACCTG CCAGAAGGTTCGATAACCAAGAAGTCCGGCACGCTGATATTCCAGGGTCA TCCAGTTATTCATGCTGGAACGACGACTTCTTCCAGCCAGAGCGACTGGG AAACCCGTCAGTTTACGCTGGAAAAACTGAAACTCGATGCGGCAACATTC CATCTGTCCAGAAACGGCAAGATGCAGGGAGATATTAACGCCACCAATGG AAGTACAGTCATTCTGGGAAGTAGCCGTGTCTTTACTGACAGGAGTGACG GAACCGGTAATGCGGTCTTCTCTGTTGAAGGGAGTGCCACTGCAACCACA GTTGGTGACCAGAGTGATTACAGCGGAAATGTTACGCTGGAAAATAAATC ATCCCTGCAAATCATGGAGAGATTCACCGGTGGTATTGAGGCTTATGATA GCACCGTGAGTGTGACCTCTCAGAATGCTGTTTTTGACCGTGTTGGCAGC TTTGTCAACAGCAGCCTGACCCTCGGAAAAGGAGCAAAACTTACGGCTCA GAGCGGTATTTTCAGCACCGGGGCTGTGGATGTAAAAGAAAATGCTTCTC TGACCCTGACGGGGATGCCTTCTGCGCAGAAACAGGGGTATTACTCACCC GTAATTTCTACAACAGAAGGGATTAACCTCGAAGATAACGCCAGCTTTTC TGTTAAAAATATGGGCTATCTGAGTTCGGATATTCATGCAGGAACCACTG CGGCAACCATTAATCTGGGAGACAGTGATGCTGATGCAGGGAAGACGGAC TCTCCGTTATTCAGCTCCTTAATGAAGGGATATAACGCTGTTCTGAGAGG CAGTATTACGGGGGCACAGAGTACGGTAAATATGATCAATGCTCTGTGGT ACTCTGACGGAAAATCAGAGGCCGGTGCACTGAAGGCTAAGGGCTCGCGA ATTGAACTGGGGGACGGGAAACACTTTGCCACTTTACAAGTAAAAGAGCT TTCTGCAGATAATACCACGTTCCTGATGCATACCAACAACAGCCGGGCTG ACCAGTTGAATGTCACAGACAAACTGTCAGGCAGTAATAATAGCGTCCTG GTTGACTTTTTAAACAAACCAGCCAGTGAAATGAGCGTGACGTTAATTAC CGCACCGAAAGGGAGTGATGAGAAAACGTTCACTGCCGGTACGCAGCAGA TTGGTTTCAGTAACGTTACGCCAGTAATCAGCACGGAAAAAACGGATGAT GCCACAAAATGGGTGCTGACAGGATATCAGACTACCGCTGATGCCGGAGC CTCGAAAGCCGCAAAAGACTTTATGGCATCAGGTTATAAGTCCTTCCTTA CAGAGGTCAATAACCTGAACAAACGTATGGGTGACCTGCGGGATACTCAG GGGGATGCCGGTGTCTGGGCACGCATAATGAATGGTACCGGTTCGGCAGA TGGTGACTACAGCGATAACTACACTCACGTTCAGATTGGTGTCGACAGAA AGCATGAGCTGGACGGTGTGGATTTATTTACGGGGGCATTGCTGACCTAT ACGGACAGCAATGCAAGCAGCCACGCATTCAGTGGAAAAAACAAATCCGT GGGTGGCGGTCTGTATGCCTCTGCACTCTTTAATTCCGGAGCTTATTTTG ACCTGATTGGTAAATATCTCCATCATGATAATCAGCACACGGCGAATTTT GCCTCACTGGGAACAAAAGACTACAGCTCTCATTCCTGGTATGCCGGTGC TGAAGTTGGTTATCGTTACCACCTGACGAAAGAGTCCTGGGTGGAGCCAC AGATAGAGCTGGTTTACGGTTCTGTATCAGGAAAAGCTTTTAGCTGGGAA GACCGGGGAATGGCTCTGAGCATGAAAGACAAGGATTATAACCCACTGAT TGGCCGTACTGGTGTTGACGTGGGAAGAGCCTTCTCCGGAGACGACTGGA AAATCACAGCTCGAGCCGGGCTGGGTTATCAGTTCGACCTGCTGGCGAAC GGAGAAACGGTTCTGCAGGATGCTTCCGGAGAGAAACGTTTCGAAGGTGA AAAAGATAGCAGGATGCTGATGACGGTAGGGATGAATGCGGAAATTAAGG ATAATATGCGTTTGGGACTGGAGCTGGAGAAATCAGCGTTCGGGAAATAT AATGTGGATAATGCGATAAACGCCAACTTCCGTTATGTTTTCTGA >CP0153 spa24, Spa24, component of the Mxi-Spa secretion machinery ATGCTGAGTGACATGTCCCTCATCGCTACACTTTCTTTTTTTACGCTATT ACCATTTTTAGTTGCTGCTGGTACCTGTTATATAAAGTTTTCTATTGTTT TTGTAATGGTACGAAATGCACTTGGTTTGCAGCAGGTTCCATCAAATATG ACTCTCAATGGTATTGCATTGATTATGGCTTTGTTCGTGATGAAACCCAT TATTGAAGCTGGTTATGAAAATTATCTAAATGGCCCTCAAAAATTTGATA CAATATCTGATATTGTCCGTTTTTCTGATTCTGGCTTGATGGAATATAAG CAATACTTGAAAAAGCATACAGATCTTGAGTTAGCACGTTTTTTCCAAAG GTCTGAAGAAGAAAATGCTGATTTAAAGAGTGCAGAGAATAATGATTATT CATTGTTTTCCCTCTTGCCTGCATATGCGCTAAGTGAAATCAAAGATGCG TTCAAAATAGGTTTTTATTTATATTTGCCATTTGTTGTTGTTGATCTTGT TATTTCAAGCATTTTACTTGCACTTGGTATGATGATGATGAGTCCAATCA CAATATCAGTACCAATAAAACTTGTATTATTTGTTGCGCTTGATGGGTGG GGTATCCTGTCTAAGGCCTTGATTGAACAATATATCAATATTCCTGCTTA G >CP0155 spa29, Spa29, component of the Mxi-Spa secretion machinery ATGGACATTTCAAGCTGGTTCGAAAGTATTCATGTGTTTTTAATACTCCT GAACGGCGTTTTTTTTAGATTGGCTCCATTATTTTTCTTTCTTCCATTTT TAAATAACGGTATAATTTCTCCATCTATTAGAATACCTGTGATTTTTCTT GTTGCATCAGGATTAATTACTTCTGGTAAGGTAGACATAGGTTCTTCTGT TTTTGAACATGTTTATTTCCTTATGTTCAAGGAAATAATTGTTGGCCTCC TTCTCTCTTTTTGCTTGTCTCTTCCCTTTTGGATATTTCATGCTGTTGGT AGCATTATTGACAACCAGCGTGGGGCAACGCTTAGTAGTTCAATTGATCC TGCCAATGGTGTTGATACGTCTGAGTTGGCAAAATTTTTCAATCTTTTTT CTGCAGTTGTATTTCTATACAGTGGTGGTATGGTCTTTATTTTAGAATCC ATACAATTGTCTTATAATATATGCCCGTTATTTTCTCAATGTTCTTTCCG TGTCTCAAATATCTTAACATTTCTGACTTTATTGGCAAGTCAGGCTGTTA TTTTAGCCAGTCCTGTTATGATAGTATTGTTACTATCAGAAGTATTACTT GGTGTATTATCGAGATTTGCTCCGCAGATGAATGCTTTTTCCGTATCATT AACTATTAAAAGTTTACTTGCAATATTTATTATTTTCATCTGTTCTTCTA CTATTTACTTTTCTAAAGTTCAATTTTTCCTCGGTGAACATAAATTTTTC ACAAATCTATTTGTTAGATAA >CP0152 spa33, Spa33, component of the Mxi-Spa secretion machinery GTGTGTGGGGATTGGGTAATTCGTATTGATACATTATCTTTTTTGAAAAA AAAATACGAGGTATTTTCAGGATTTTCTACACAAGAATCTTTACTGCATT TATCAAAATGTGTCTTTATAGAGTCGTCATCTGTATTTTCGATTCCAGAA CTGTCTGATAAGATTACTTTCCGGATCACGAATGAAATCCAGTATGCAAC TACTGGGAGTCATTTATGCTGTTTTTCCTCTTCTTTAGGTATTATTTATT TTGACAAGATGCCGGTATTACGTAATCAAGTTTCTCTTGACTCATTGCAT CATCTTTTAGAGTTTTGCTTAGGTTCATCTAATGTAAGGCTGGCTACTTT AAAAAGAATTCGCACTGGTGATATAATCATAGTTCAGAAACTTTATAATT TATTATTGTGTAATCAAGTTATTATTGGGGATTATATTGTGAATGATAAT AATGAGGCAAAAATTAATCTGTCAGAAAGTAATGGTGAGTCAGAACACAC AGAAGTTTCTTTGGCATTATTCAATTATGATGATATCAATGTAAAAGTGG ACTTTATTCTTTTAGAAAAAAATATGACAATCAATGAACTAAAAATGTAT GTAGAAAACGAATTATTCAAGTTTCCCGATGACATAGTTAAACATGTAAA TATTAAAGTAAATGGTTCTTTGGTTGGGCATGGGGAACTTGTTTCTATTG AGGATGGTTATGGTATCGAGATTAGTTCTTGGATGGTAAAGGAGTAA >CP0156 spa40, Spa40, component of the Mxi-Spa secretion machinery ATGGCAAATAAAACAGAAAAGCCGACACCTAAAAAACTAAAGGATGCCGC AAAAAAAGGACAGTCATTTAAATTTAAGGATTTAACGACTGTTGTTATTA TTCTGGTAGGGACATTTACTATAATATCATTCTTTTCCTTAAGTGATGTA ATGCTCTTATACAGATATGTAATAATTAATGACTTCGAAATTAATGAGGG TAAATACTTTTTTGCAGTGGTTATTGTCTTTTTTAAGATAATTGGCTTCC CACTTTTTTTCTGTGTTCTTTCGGCTGTGTTGCCAACATTGGTTCAAACA AAGTTTGTTCTTGCGACTAAAGCTATCAAGATTGATTTTTCAGTATTAAA CCCTGTTAAAGGGTTAAAAAAAATATTTAGTATAAAGACAATAAAAGAAT TTTTCAAAAGCATTCTGCTTCTTATTATTCTAGCATTAACAACCTATTTC TTTTGGATTAATGACCGAAAAATAATTTTTTCTCAGGTGTTTTCTAGTGT TGATGGCTTATATCTTATTTGGGGGAGGCTGTTTAAGGATATAATATTAT TTTTCTTGGCATTTTCTATTCTTGTTATTATTCTTGACTTTGTGATTGAG TTCATTTTATACATGAAAGATATGATGATGGATAAACAGGAGATAAAAAG AGAATATATAGAGCAAGAGGGACACTTTGAGACAAAGTCGAGAAGGCGTG AGTTGCATATCGAGATTCTTTCAGAGCAGACTAAATCTGATATACGTAAT TCAAAATTAGTGGTAATGAACCCGACTCATATTGCAATTGGTATTTATTT TAATCCAGAAATAGCGCCTGCACCTTTTATTTCTCTCATTGAAACTAACC AGTGTGCCTTGGCTGTCAGAAAATATGCAAATGAAGTTGGTATACCGACT GTGCGTGATGTGAAATTAGCTAGAAAACTATATAAAACACATACAAAATA TAGTTTTGTTGATTTTGAACACTTGGATGAAGTCCTACGTCTTATTGTTT GGCTTGAGCAGGTTGAAAACACTCATTAA >CP0149 spa47, Spa47, component of the Mxi-Spa secretion machinery, putative ATPase ATGAGCTATACAAAATTGCTCACTCAATTATCTTTTCCTAATAGAATCTC GGGGCCAATCTTGGAAACAAGTCTTAGCGATGTTTCGATTGGTGAGATTT GTAACATTCAGGCTGGAATTGAAAGTAATGAAATTGTTGCAAGAGCTCAG GTTGTAGGATTTCATGATGAAAAAACAATATTAAGCTTGATTGGAAATTC TCGTGGACTTTCACGGCAAACGTTGATTAAGCCCACTGCCCAGTTTCTTC ATACGCAAGTCGGCCGTGGATTATTGGGAGCAGTAGTCAATCCTTTAGGG GAGGTTACTGATAAGTTTGCTGTTACAGATAACAGTGAAATTCTTTATCG ACCTGTAGATAATGCTCCTCCGCTATATAGTGAAAGGGCTGCAATTGAGA AGCCTTTTTTAACAGGTATTAAGGTTATTGATTCTTTACTCACGTGTGGT GAAGGACAGCGAATGGGGATTTTTGCGTCAGCTGGTTGTGGCAAAACTTT TCTCATGAATATGCTCATTGAACATAGTGGTGCTGATATATATGTTATTG GGTTAATTGGTGAGCGAGGTCGAGAGGTTACTGAAACGGTTGATTATTTG AAAAACTCTGAGAAAAAAAGCAGGTGTGTTTTAGTATATGCAACTTCGGA TTACTCTTCGGTTGATCGTTGTAATGCTGCATATATAGCCACTGCTATAG CCGAATTTTTTAGGACTGAAGGACATAAAGTAGCGCTTTTTATTGATTCA TTAACAAGGTATGCCAGAGCATTACGTGATGTGGCCTTAGCCGCTGGAGA ATCACCTGCCAGAAGAGGCTATCCGGTTTCGGTTTTTGATAGCTTACCCA GACTTCTTGAAAGGCCAGGAAAGTTAAAGGCAGGTGGCTCTATTACTGCA TTTTACACTGTTCTTTTGGAGGATGATGATTTTGCTGATCCATTAGCTGA AGAGGTAAGATCCATTTTAGATGGACATATATATTTGAGCAGAAATCTAG CCCAAAAAGGACAATTTCCTGCAATTGATTCCTTAAAAAGTATAAGCAGG GTATTTACACAGGTTGTTGATGAAAAACATCGTATTATGGCCGCTGCATT TCGGGAGCTACTTTCTGAAATAGAAGAGCTAAGGACAATTATTGACTTTG GTGAATACAAACCGGGGGAGAATGCCTCTCAGGATAAAATCTACAACAAA ATATCTGTTGTTGAGAGTTTTCTGAAGCAAGATTATCGACTCGGTTTTAC TTATGAGCAGACAATGGAGCTTATTGGTGAAACAATTAGATAA