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COG category: Intracellular trafficking and secretion
Genomic element: pCD1

Number of genes found: 10

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# Yersinia pestis CO92, CO-92 Biovar Orientalis

>gid:869641  YPCD1.34c  putative membrane-bound Yop protein
ATGAATCCCCATGATCTTGAGTGGCTAAATCGTATTGGCGAGCGTAAAGA
TATCATGCTGGCAGTGCTGCTGTTAGCTGTGGTATTCATGATGGTCTTAC
CACTCCCCCCCCTTGTGTTGGACATTCTGATTGCTGTTAACATGACCATT
TCAGTGGTGTTGTTAATGATAGCGATCTATATCAACTCTCCTTTACAATT
TTCAGCTTTCCCTGCGGTGCTACTCGTTACCACGTTATTTCGTCTCGCAC
TTTCAGTTAGCACCACCCGCATGATCCTGCTACAAGCTGATGCGGGGCAG
ATTGTTTACACCTTTGGTAATTTCGTCGTTGGCGGTAACCTCATCGTCGG
GATTGTCATCTTCCTGATCATCACTATTGTGCAATTTTTAGTGATAACGA
AAGGCTCAGAACGTGTAGCAGAAGTTAGTGCCAGATTCTCTCTTGATGCG
ATGCCGGGTAAACAGATGAGTATCGATGGCGATATGCGAGCCGGGGTGAT
CGATGTCAATGAAGCGCGTGAGCGACGCGCGACGATAGAAAAAGAAAGCC
AAATGTTCGGTTCTATGGACGGCGCCATGAAGTTCGTCAAAGGGGATGCA
ATAGCCGGCCTCATTATTATCTTTGTCAATATATTAGGCGGCGTCACCAT
TGGTGTTACCCAAAAAGGATTAGCGGCCGCTGAGGCACTGCAACTCTATT
CCATCCTCACTGTCGGGGATGGGATGGTTTCTCAGGTACCTGCCCTGCTG
ATAGCTATTACCGCGGGTATTATCGTCACCCGCGTCTCTTCAGAAGATTC
ATCAGATCTGGGTAGCGATATTGGCAAACAGGTTGTCGCTCAGCCTAAAG
CCATGCTAATTGGTGGCGTACTGCTGTTGCTCTTTGGTCTTATCCCCGGC
TTCCCAACAGTCACCTTTCTGATTTTGGCGCTATTGGTAGGCTGTGGTGG
TTATATGCTCAGCCGTAAGCAGAGTCGTAATGACGAGGCTAATCAAGACC
TGCAATCCATACTGACGAGCGGTTCTGGCGCCCCGGCTGCTCGAACCAAA
GCCAAAACAAGTGGGGCAAACAAGGGCCGACTAGGGGAACAAGAAGCATT
TGCTATGACGGTTCCCTTGCTGATTGATGTAGATTCAAGCCAACAGGAAG
CACTGGAAGCGATAGCACTAAATGATGAGCTGGTTCGAGTGCGCCGTGCT
CTTTATCTTGATCTTGGCGTACCTTTCCCTGGGATCCATCTGCGTTTTAA
TGAGGGGATGGGTGAAGGCGAATATATTATTTCCTTGCAAGAAGTTCCAG
TGGCGCGAGGTGAGCTTAAGGCAGGTTATTTACTCGTGCGTGAATCCGTC
AGCCAACTCGAATTACTGGGTATACCCTATGAAAAAGGGGAACATTTGCT
ACCCGATCAGGAAGCTTTCTGGGTATCGGTTGAATATGAGGAGCGCCTGG
AAAAGTCTCAACTGGAATTTTTCTCTCATTCCCAAGTTCTAACCTGGCAT
CTTTCTCATGTCCTACGTGAATATGCCGAAGATTTCATTGGTATCCAAGA
AACCCGCTATCTGCTCGAACAGATGGAAGGAGGCTATGGCGAATTAATTA
AAGAAGTACAAAGAATCGTTCCCTTACAACGAATGACCGAAATATTACAA
CGATTAGTTGGAGAAGATATTTCTATCCGTAATATGCGATCTATTCTTGA
AGCTATGGTGGAATGGGGACAAAAAGAGAAAGACGTCGTTCAACTCACAG
AATATATCCGCAGTAGTCTAAAACGTTATATCTGCTACAAATACGCTAAT
GGCAACAATATATTGCCGGCTTATCTTTTCGATCAAGAAGTAGAAGAAAA
AATTCGTAGCGGTGTGCGCCAAACCAGTGCAGGGAGTTATTTGGCATTGG
AGCCTGCTGTTACCGAGAGTTTACTTGAACAAGTTCGCAAGACTATTGGC
GATCTATCGCAAATCCAGAGTAAACCGGTGCTGATTGTTTCTATGGATAT
TCGTCGCTATGTGCGCAAACTGATTGAGAGCGAATACTATGGCTTGCCGG
TACTTTCATACCAAGAGCTGACTCAGCAGATTAATATCCAACCACTTGGA
CGAATTTGCTTATGA
>gid:869650  YPCD1.40  putative Yops secretion ATP synthase
ATGCTCTCACTAGATCAGATACCTCATCATATTCGTCATGGCATTGTAGG
TAGCCGCCTAATCCAAATTAGAGGACGTGTCACTCAAGTGACAGGAACGT
TATTAAAAGCGGTAGTGCCAGGTGTGCGCATCGGTGAGTTATGTTACTTA
CGTAACCCTGACAACAGCCTGTCTTTACAGGCTGAAGTCATAGGTTTTGC
CCAACATCAAGCATTACTTATTCCACTTGGTGAAATGTACGGGATATCTT
CTAATACTGAAGTTAGCCCGACAGGGACAATGCATCAGGTTGGGGTGGGT
GAACATCTGCTGGGACAGGTGTTGGATGGTTTAGGGCAGCCTTTCGATGG
GGGGCATCTCCCTGAACCGGCGGCTTGGTACCCAGTTTATCAGGATGCCC
CAGCGCCGATGAGCCGAAAACTTATTACCACACCACTTTCTTTGGGGATC
CGGGTTATTGACGGTTTGCTTACCTGTGGCGAGGGGCAAAGAATGGGCAT
CTTCGCGGCCGCCGGGGGGGGGAAAAGTACACTGCTTGCTTCGCTTATTC
GTAGTGCTGAAGTAGACGTAACCGTGCTGGCGCTTATTGGTGAGCGTGGA
CGCGAAGTGCGTGAGTTTATTGAGTCTGATTTAGGCGAAGAGGGGTTACG
CAAAGCGGTTCTCGTGGTGGCCACCTCGGATCGGCCCTCAATGGAAAGAG
CCAAAGCTGGATTCGTGGCGACATCTATTGCTGAATATTTTCGCGATCAA
GGGAAACGCGTATTGTTACTTATGGACTCTGTAACACGGTTTGCTCGTGC
TCAGCGTGAAATAGGCTTAGCTGCGGGAGAACCACCGACTCGCCGCGGTT
ATCCTCCGTCAGTATTTGCCGCTTTACCCCGTTTGATGGAAAGGGCTGGT
CAGTCCAGCAAAGGGTCAATTACGGCTCTCTATACCGTACTGGTCGAAGG
GGACGATATGACCGAACCCGTGGCCGACGAAACACGTTCGATACTTGATG
GTCATATTATTCTGTCACGGAAATTAGCGGCAGCTAATCATTATCCTGCC
ATTGACGTATTACGTTCAGCGAGCAGGGTGATGAATCAAATTGTCAGCAA
GGAGCACAAAACCTGGGCGGGGGACTTACGCCGTTTATTGGCCAAATATG
AAGAAGTGGAATTGCTGTTGCAAATCGGGGAGTACCAGAAAGGGCAAGAC
AAAGAGGCCGATCAAGCGATTGAACGCATGGGGGCGATTCGAGGATGGCT
CTGCCAGGGGACGCACGAGTTAAGCCATTTCAATGAGACGCTGAACTTAT
TGGAGACGCTGACCCAATGA
>gid:869657  YPCD1.43  putative type III secretion protein
ATGAGTTTGTTAACCTTGCCACAGGCCAAATTAAGTGAACTGTCGCTACG
TCAACGGCTCAGCCATTATCAACAAAACTACTTGTGGGAAGAGGGAAAAC
TCGAACTTACCGTCTCTGAGCCTCCTTCGTCTTTGAACTGTATATTACAG
TTACAATGGAAGGGAACGCACTTCACGCTCTACTGTTTTGGCAATGATCT
GGCTAACTGGTTAACCGCCGACTTACTAGGGGCTCCATTCTTTACTCTGC
CGAAAGAGTTGCAACTTGCGCTGTTGGAACGCCAGACAGTTTTCCTGCCG
AAACTGGTCTGTAATGATATAGCGACAGCGTCTCTTTCTGTCACGCAACC
TCTGTTGAGTTTGCGGCTGTCCCGAGATAATGCGCATATCTCCTTCTGGC
TAACCTCAGCTGAGGCTCTGTTCGCTCTGTTACCCGCACGACCCAATTCT
GAGCGCATACCTTTGCCTATCCTTATTTCTTTGCGTTGGCATAAAGTATA
CCTGACTCTAGATGAGGTTGATTCCCTTCGATTAGGTGATGTGTTGTTGG
CCCCTGAGGGGAGTGGGCCTAATTCGCCAGTACTCGCCTATGTTGGTGAG
AACCCTTGGGGCTACTTTCAATTACAATCAAATAAATTGGAGTTTATCGG
TATGAGTCATGAATCTGACGAACTTAACCCCGAACCATTGACCGATTTGA
ACCAACTTCCGGTTCAAGTTAGCTTTGAAGTGGGGCGGCAAATCTTAGAT
TGGCACACACTCACTAGCCTGGAGCCGGGTTCTCTTATTGATCTTACAAC
ACCTGTTGATGGTGAAGTGCGCTTGCTGGCTAACGGCCGGTTGCTTGGAC
ATGGTCGATTGGTCGAGATCCAAGGGCGCCTCGGGGTTCGAATTGAACGC
CTGACAGAGGTTACGATTTCATGA
>gid:869659  YPCD1.44  putative Yop secretion membrane protein
ATGATCCAGTTACCGGATGAAATTAATCTCATCATCGTTTTATCTTTGCT
GACTCTGCTTCCATTGATTTCGGTAATGGCTACATCGTTTGTCAAATTTG
CGGTGGTCTTTTCACTACTCCGCAATGCCCTTGGGGTACAGCAAATCCCC
CCCAACATGGCAATGTATGGCTTAGCAATCATCCTTAGTCTTTATGTAAT
GGCACCCGTTGGCTTCGCGACGCAAGACTATTTACAAGCTAATGAGGTTA
GCCTCACGAACATAGAATCTGTTGAGAAATTCTTTGATGAAGGGCTTGCC
CCCTATCGCATGTTCCTTAAGCAGCATATTCAAGCGCAAGAATACTCTTT
TTTTGTTGACAGCACTAAACAGTTATGGCCCAAGCAGTATGCTGACCGGT
TAGAGTCAGACAGCCTGTTCATTTTATTGCCTGCGTTTACGGTGAGTGAG
TTGACTCGAGCATTTGAGATAGGCTTTCTCATCTATTTACCATTTATCGT
CATTGACCTGGTTATTTCCAATATCTTGTTGGCAATGGGGATGATGATGG
TTTCCCCCATGACTATTTCACTGCCATTTAAATTGCTGCTATTTGTTTTA
CTTGATGGCTGGACACGACTCACGCATGGGCTGGTGATTAGCTACGGAGG
GTGA
>gid:869663  YPCD1.45  putative type III secretion protein
ATGAGTCAAGGTGACATAATTCACTTCACCAGTCAGGCATTATGGCTGGT
GCTAGTCCTTTCAATGCCGCCGGTGTTAGTGGCTGCGGTGGTAGGAACTT
TGGTATCTTTAGTACAAGCTTTAACGCAAATCCAAGAGCAAACTCTGGGC
TTCGTTATCAAATTGATCGCTGTGGTGGTCACACTGTTTGCTACCGCCTC
GTGGCTTGGTAATGAATTGCACAGTTTTGCAGAAATGACCATGATGAAGA
TACAAGGCATAAGATGA
>gid:869665  YPCD1.46  putative type III secretion protein
ATGATAGCGGATTTAATCCAAAGACCATTGCTCACTTATACCCTGCTGTT
GCCTCGTTTTATGGCTTGTTTTGTTATATTGCCAGTGTTAAGTAAACAGC
TCCTCGGTGGAGTATTGCTGCGTAATGGTATTGTCTGTTCATTGGCTCTT
TATGTCTATCCTGCCGTCGCTAACCAACCTTATATTGAGGTTGATGCGTT
TACGTTGATGCTGCTTATCGGCAAAGAGATCATACTGGGGTTATTGATTG
GGTTTGTGGCCACCATTCCTTTCTGGGCCTTAGAATCCGCAGGATTTATT
GTAGATAACCAAAGAGGTGCCGCGATGGCATCTCTACTCAATCCTGGACT
TGATAGTCAAACTAGTCCGACTGGTTTACTTTTGACTCAAACGTTAATAA
CAATTTTCTTCAGCGGAGGGGCTTTCCTCTCTTTGCTTTCAGCCCTCTTT
CACAGCTATGTAAATTGGCCGGTGGCCAGCTTTTTCCCTGCAGTTAGTGA
ACAGTGGGTTGATTTCTTTTATAACCAATTCAGCCAGATACTATTAATCG
CCGCTGTATTGGCTGCTCCTTTACTCATCGCTATGTTTTTAGCTGAATTT
GGACTTGCACTCATCAGTCGTTTTGCGCCTTCTTTAAACGTCTTTGTGCT
GGCTATGCCGATAAAAAGCGCGATAGCAAGCCTGTTGTTGGTTATCTACT
GTATGCAAATGATGAGTCATGCCAGTAAAGCAATGCTGTTGGTTATGGAT
CCTATAAGTTTACTGATCCCTGTTTTGGAGAAGTAA
>gid:869668  YPCD1.47  putative type III secretion protein
ATGAGCGGAGAAAAGACAGAGCAACCCACCCCGAAGAAAATCCGTGATGC
GCGCAAAAAGGGACAGGTAGCGAAAAGTAAGGAAGTGGTCTCTACTGCGC
TTATCGTCGCGCTGAGTGCGATGTTAATGGGGCTTTCTGACTACTATTTC
GAGCATTTTAGTAAGCTGATGCTAATCCCCGCAGAGCAGAGCTATCTTCC
TTTCTCGCAGGCGCTTAGCTATGTGGTTGACAATGTGTTGCTCGAGTTTT
TTTATCTCTGTTTTCCTTTGTTAACAGTGGCGGCATTAATGGCGATCGCA
TCTCATGTTGTGCAGTATGGTTTTCTTATAAGTGGTGAAGCAATTAAACC
GGATATTAAAAAAATCAATCCAATAGAGGGTGCCAAGCGTATCTTTTCCA
TCAAAAGTTTAGTGGAGTTTCTCAAATCCATTCTCAAGGTTGTTTTGCTC
AGTATACTCATCTGGATAATCATTAAGGGAAATCTAGTCACACTCTTGCA
GTTGCCAACCTGTGGAATTGAATGTATTACCCCTTTATTGGGGCAAATAC
TCCGGCAGTTGATGGTTATCTGTACTGTTGGCTTTGTGGTCATCTCCATA
GCCGACTATGCCTTTGAATACTATCAATATATTAAGGAACTTAAAATGAG
CAAGGATGAGATCAAACGCGAGTACAAAGAAATGGAGGGTAGCCCAGAAA
TCAAAAGCAAGCGTCGTCAGTTTCATCAAGAGATCCAATCGAGGAACATG
CGGGAAAATGTTAAACGCTCATCAGTGGTGGTAGCTAATCCGACCCATAT
TGCTATTGGTATTCTTTACAAGCGAGGGGAAACACCACTACCGTTGGTAA
CATTCAAATATACCGATGCCCAAGTTCAGACTGTGCGCAAAATAGCAGAA
GAAGAAGGGGTGCCTATTTTACAACGTATCCCATTAGCCCGTGCTCTTTA
TTGGGATGCGCTCGTCGATCACTATATTCCGGCTGAGCAAATAGAGGCCA
CAGCTGAAGTGCTACGATGGCTAGAAAGGCAAAATATCGAGAAACAACAT
TCCGAAATGTTATAA
>gid:869676  YPCD1.52  putative type III secretion protein
ATGGCTTTTCCGCTACATTCTTTTTTCAAGCGCGTACTCACCGGGACGTT
ACTGTTACTTTCTAACTATAGCTGGGCGCAAGAACTTGATTGGTTGCCTA
TACCTTATGTTTATGTGGCGAAGGGGGAAAGTTTACGCGATTTATTAATT
GATTTCAGCGCTAATTATGATGCTACAGTGGTAGTAAGCGATAAGATTAA
TGACAAAGTTTCCGGCCAGTTTGAGCATGATAACCCTCAGGATTTCCTAC
AGCATATTGCCTCCCTTTACAATTTGGTTTGGTACTATGATGGCAATGTG
CTCTACATTTTTAAAAATAGTGAGGTAGCGTCTCGTCTCATTCGTTTACA
GGAAAGTGAGGCCGCAGAGTTAAAGCTGGCATTACAACGTTCTGGTATAT
GGGAGCCTCGTTTTGGCTGGCGCCCTGATGCTAGCAACCGCCTTGTTTAC
GTCTCTGGTCCTCCTCGTTATCTTGAATTGGTTGAACAGACCGCAGCCGC
ATTGGAACAACAGACGCAAATTCGCAGTGAAAAAACAGGGGCATTAGCGA
TTGAGATTTTCCCTCTCAAATATGCATCAGCGAGCGATCGAACTATTCAT
TACCGTGATGACGAAGTGGCTGCTCCTGGGGTTGCAACGATACTTCAACG
CGTGTTAAGCGATGCCACAATCCAACAAGTGACAGTGGATAATCAGAGAA
TACCGCAGGCCGCTACCCGGGCTTCAGCTCAAGCCAAGGTTGAAGCGGAT
CCATCGCTCAATGCGATAATAGTGCGCGATTCTCCTGAGCGTATGCCAAT
GTATCAACGGTTAATTCATGCGCTTGATAAACCTAGCGCTCGTATTGAAG
TGGCGTTATCCATTGTCGATATAAATGCCGACCAACTTACTGAATTAGGT
GTGGACTGGCGAGTTGGCATTCGTACTGGCAACAATCATCAGGTGGTAAT
AAAAACAACCGGGGATCAAAGTAACATCGCTTCAAACGGTGCATTGGGTA
GTTTGATTGATGCTCGCGGGCTTGACTACCTATTAGCAAGAGTCAATTTA
CTTGAAAATGAAGGTTCGGCTCAAGTTGTTTCACGTCCGACCCTGCTAAC
ACAAGAAAATGCCCAAGCGGTGATTGATCACCATGAAACCTATTACGTCA
AAGTGACAGGTAAAGAAGTGGCTGAACTGAAAGGGATCACCTACGGCACT
ATGCTGCGTATGACACCAAGGGTGCTGACTCAAGGAGATAAGTCAGAAAT
CAGTCTCAATCTACACATTGAGGATGGGAACCAAAAACCGAATAGTTCAG
GGATTGACGGAATCCCCACTATCAGTCGTACGGTCGTTGATACTGTCGCT
CGCGTGGGACATGGCCAGAGTTTGATTATTGGTGGTATTTATCGTGACGA
ATTGAGTGTTGCTCTTAGTAAGGTGCCTTTGCTTGGTGATATTCCTTATC
TTGGCGCACTTTTCCGCCGTAAAAGTGAGTTAACTCGCCGTACGGTACGG
CTGTTTATCATCGAACCACGGATTATTGACGAAGGTATTGCGCATCATTT
AGCGTTAGGTAATGGTCGGGATCTACGTACTGGTATCTTAGCTGTTGATG
AAATATCTAATCAAAGCACTACCTTGAATAAGTTATTAGGTGGCTTCCAG
TGTCAGCCTTTAAACAAAGCGCAAGAAGTGCAGAAATGGCTGAGTCAAAA
CAATAAATCATCCTATCTTACTCAGTGCAAGATGGACAAAAGTTTGGGAT
GGCGCGTGGTTGAAGGTGCTTGTACTCCCGCGGAATCATGGTGTGTTTCA
GCGCCTAAGCGTGGCGTATTGTGA
>gid:869685  YPCD1.59  putative type III secretion lipoprotein
GTGAAAGTTAAGACTTCACTGTCAACATTGATATTAATCTTGTTTTTAAC
TGGTTGCAAAGTTGATCTTTATACCGGAATTAGTCAGAAGGAAGGGAACG
AAATGCTTGCGCTGTTGCGCCAAGAAGGCCTTTCCGCAGACAAAGAGCCA
GACAAAGATGGGAAGATTAAGCTCTTGGTTGAGGAGTCAGATGTCGCTCA
GGCTATTGATATTCTCAAACGGAAGGGCTATCCACACGAGAGTTTCTCCA
CGTTACAGGATGTGTTCCCCAAAGATGGGTTGATATCTTCACCGATAGAA
GAGTTGGCGAGGCTTAATTATGCCAAGGCGCAAGAGATCTCCCGCACTTT
ATCTGAAATTGACGGGGTATTAGTGGCTCGAGTGCATGTCGTATTGCCTG
AAGAGCAAAATAACAAAGGTAAGAAGGGTGTAGCAGCATCCGCTTCGGTT
TTTATCAAGCATGCAGCAGATATTCAGTTTGATACCTACATACCTCAGAT
TAAACAATTAGTGAATAATAGTATTGAGGGGCTGGCCTATGATCGCATCA
GTGTCATTTTGGTGCCATCGGTAGATGTTCGTCAAAGCTCTCATTTACCT
CGTAACACGAGCATACTGTCAATTCAAGTGAGTGAAGAGTCAAAAGGGCA
TCTTATTGGCTTGTTGTCGTTGCTTATTTTGCTTTTGCCAGTGACCAATC
TTGCTCAATATTTTTGGTTACAACGCAAGAAGTGA
>gid:869688  YPCD1.61  putative type III secretion protein
ATGTCACAAACTTGTCAAACAGGTTACGCCTACATGCAGCCATTTGTTCA
AATAATACCAAGTAATCTCTCGCTCGCTTGCGGTCTGCGTATTTTGCGCG
CCGAAGATTACCAATCCAGTTTAACAACCGAAGAGTTGATTAGTGCCGCA
AAACAGGATGCTGAAAAGATCCTGGCTGACGCCCAAGAGGTTTATGAGCA
ACAAAAGCAGTTAGGATGGCAGGCTGGCATGGATGAGGCGCGTACCTTAC
AGGCGACTTTGATTCATGAAACACAGTTACAATGTCAGCAATTTTATCGC
CACGTCGAACAACAGATGAGTGAAGTTGTACTTTTGGCGGTACGTAAAAT
CCTCAATGACTATGATCAAGTGGCTATGACACTGCAAGTTGTGCGGGAGG
CTTTAGCCTTGGTGAGTAATCAGAAGCAAGTCGTGGTCAGGGTCAACCCT
GATCAGGCAGGAGCTATTCGTGAACAAATAGCTAAAGTACATAAAGACTT
CCCGGAAATAAGCTATTTAGAGGTGACTGCCGATGCGCGTTTGGATCAAG
GGGGCTGTATATTAGAGACTGAGGTAGGTATTATTGACGCGAGTATTGAT
GGGCAAATTGAAGCACTTTCTCGGGCAATATCTACCACTTTAGGACAAAT
GAAAGTTACAGAATAG