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COG category: Signal transduction mechanisms
Genomic element: chromosome

Number of genes found: 72

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# Streptococcus pyogenes phage 6180.4

>M28_Spy1218 two-component sensor kinase
ATGAAGCGTTATCCCCTACTGGTCCAGTTGATTTCGTATGTTTTTGTGAT
CGTAATTGCCCTCATTACCACGCTTGGTTTGCTTTATTACCAGACGAGTT
CTCGTAATATCAGGCAACTAATTGAACGTGATACCCGGCAGAGCATTCGG
CAAAGTTCCCAATTTATTGACGCTTACATCAAGCCTCTTAAAGAAACAAC
TTCGGTGCTGGCGAAAAATACGGAAATTCAAGCCTTTGCTAGTCAAATTC
ATCAAGAAAATGACAAACAGGTTCTTCAGCTCATGAAGATGGTTCTTGCG
ACCAATTCCGATTTACAAGCAGCTGTTCTGGTGACTAAGGATGGTCGAAC
GGTGTCTACCAATTCTCAGTTGACCATGAAAACCTCTAGTGACATGATGG
CAGAACCCTGGTATAAAGCAGCCATAGACCGTCAGGCCATGCCAGTCTTG
ACCCCAGCTCGGCAATTATCCCTTTCTTCTAAAAAAGAATGGGTAGTTTC
TGTGACCCAAGAGGTAGTAGATAGGGCTGGGCATAATTTAGGTGTGCTAA
GACTTGATATTGCATACCCGACCATTAAAGCGTCTTTAGATCAGCTTCAG
CTAGGCCGCCAAGGCTTTGCCTTTATTGTGAATGATAAGCATGAATTTGT
TTACCATCCCAAAAAGAGTGTTTACAGTTCTTCTAAGGAGATGGCTGCGA
TGAAGCCTTATTTAGCGATTCAGAATGGTTACACTAAGGACAAGACATCT
TTTGTTTACCAAAAACTCATTCCTAACAGTCAATGGACTTTAGTGGGAGT
GGCGTCACTGGATCAGTTGCACCGGGTGCAGCGCCAAATTTTTTGGTCCT
TTCTTGGAACAGGGCTTCTAGCCTGTCTGATTTGTGGCTTTGCAACTGTC
TTAGCCTTACGCAGATGGATTCGTCCCATTCAACAATTGCAGCAAGTTAT
TCTTGCTATTCAAAAAGGAGATCGTCAGTTACGTGCCCAAGAAACGGGTT
CTCCAGAATTGACAAACCTTGCCCAACAGTTTAATGCGCTCTTAGATCAA
ATTGATAGCTTGATGGTTGCCGTTGCGGATAAGGAAAAGGCGATTGGGCA
GTATAGGTTACAAGCCTTGGCTAGTCAGATTAACCCGCATTTTCTCTATA
ACACCTTGGACACTATTATTTGGATGGCAGAATTTAATGACAGCAAGCGC
GTGGTAGAAGTGACCAAGTCTCTAGCTAAGTATTTTCGTTTGGCCCTTAA
TCAGGGGAACGAATACATTCGTTTGGCAGATGAACTGGATCACGTTAGCC
AATACCTCTTTATTCAAAAACAGCGCTATGGAGACAAGCTAAGTTATGAA
GTGCAAGGCTTAGATGTCTACGCAGACTTTGTTATTCCTAAGCTTATCTT
ACAGCCCTTAGTAGAAAATGCTATCTACCATGGCATCAAAGAAGTCGATC
GCAAAGGCATGATCAAGGTTACGGTATCTGATACAGCTCAGCATCTGGTG
TTGACTGTTTGGGATAATGGTAAAGGCATTGAAGACTCTTCACTGACCAA
TAGTCAGAGCTTGTTGGCTAGGGGAGGTGTGGGCCTTAAAAATGTTGACC
AGCGGTTAAAACTTCACTATGGTGAAGGCTACCACATGACCATTCATAGC
CAGTCAGACCAGTTCACTGAAATACAATTAACCCTTCCTAAAATGCATGA
ATTAATGGCAGACGACACACAGGAAAATGAGTAA
>M28_Spy0992 phage protein
ATGAATAAACGCATCAAGAAAAAACGTAAGTTAGAAACAGCAGTTGTGAT
GCTTGTTGCAGAAAATGCTATACAAGCAAAAGCTCTTAGAAATCAAAACA
AACAAATTGCAGAGCTGAGAGCGATTATACAACAAAACGTCCAAGCAATA
AATAGAGAGTTTGTAACTGCTAAAAACACGATTTTAGATAACCAATTAGC
TATTAAGTTAATTGGTGATGATGTTGGTCACATCAAGCAAAATTATAAGC
GGAAGTGGCGAAAATAA
>M28_Spy0575 arginine-binding protein
GTGACAAAAAGGAATAAATATACTATGAATTTTAAAAAAATAAGATTTGG
TTTTTTGCTTTGCCTCCTACTTTATCCTTTAGCAGCTTGTAATAAGTCTG
AACAACTTAATCACTACGAAAGAATTAAAAAAACAAGAAAATTAGTCGTT
GCTGTAAGCCCTGATTATGCTCCTTTTGAATTTAAAGCTTTAGTTAATGG
AAAAGATACTATTGTTGGAGCAGATGTTCAATTAGCTCAGGCTATTGCTG
ATGAATTAGACGTTGATCTTGAGCTTTCACCAATGAGTTTTGATAATGTT
TTGTCTAGTTTACAGACTGGTAAAGCTGATCTTGCTATTTCAGGAATCTC
ACATACTAAAGAAAGAGCTAAAGTATATGATTTTTCAATTCCTTACTATC
AGGCAGAAAACGCTATAGTGATGAGAGCATCTGATGCTAAAGTGACCAAA
AATATTAGTGACCTAAACGGTAAGAAAGTAGCCGCTCAAAAAGGTAGTAT
CGAGGAAGGTTTAGTTAAAATACAATTACCAAAGGCCAATCTGATTTCTT
TGACTGCTATGGGAGAAGCCATTAATGAACTAAAAGCAGGACAAGTCTAT
GCAGTTACCTTAGAAGCACCTGTAGCTGCTGGTTTTTTAGCCCAACATAA
GGATCTGGCTTTAGCACCCTTTAGCTTAAAAACCAGTGATGGAGATGCCA
AAGCAGTGGCCCTTCCTAAAAATAGTGGTGACTTAACCAAAGCCGTTAAT
AAGGTTATTGCTAAGTTAGATGAGCAAGAACGGTACAAGTCATTTATTGC
AGAGACAATAGCACTAACGAAAAATACTATGAAGTAA
>M28_Spy0262 ABC transporter substrate-binding protein
ATGATTAAAAAACAATATTTAGGAAGGGCAACAATTGCCCTAGCATCAAC
CCTTGTACTAGCAGCTTGTGGGTCATCAAAAACAGCTGAGTCAGGAAATC
AGGGGAGTTCTAAAGAAGTCTTATTTGCAACGGTTGGAACAACAGCTCCC
TTTTCTTATGAAAAAGGTGGTCAACTAACTGGCTACGATATCGAGGTGGC
TAAAGCAGTCTTTAAAGGATCGGATGATTACAGGGTGTCCTTTAAAAAAA
CAGAATGGTCTTCTATCTTTACAGGTTTGGACTCAGGAAAATACCAAATG
GGTGGTAACAATATTTCCTTTACCAAAGAGCGTTCAGCTAAGTACCTTTT
TTCTTATCCAATCGGATCAACACCTTCTGTTTTAGTTGTTCCAAAAGACA
GTGATATCAAGAGCTTTGATGATATCCAAGGGCATACGACACAAGTTGTT
CAAGGGACTACAAGTGTTGCACAGTTAGAAGACTTTAATAAGAAACACAG
TGACAACCCGGTTACTCTAAAATTCACCAATGAGAACATTACCCAAATGT
TAACCAATTTGAGTGAAGGCAAGGCAGATTTCAAGATTTTTGACGCTCCA
ACGGTTAACGCCATTATTAAAAATCAAGGGTTAGATAATCTCAAAACAAT
TGAACTCACCTCAACAGAGCAACCATTTATTTATTTTATCTTTAGTCAAG
ATCAAGAGAAATTGCAAAGCTTTGTTAACAAGCGTATTAAAGAGTTGACT
GCTGACGGAACTCTTAGCAAGCTTGCCAAAGAGCACCTTGGCGGTGATTA
CGTGCCATCAGATAAAGAGTTGAAACTTCCTACAGCTAACTAA
>M28_Spy1204 ATP-dependent protease La
ATGAAAAGACTTAAAAAAATCAAATGGTGGTTAGTGGGTCTGCTAGCTTT
AATCTCTTTGTTGCTAGCGTTATTTTTTCCGCTACCTTATTATATTGAAA
TGCCTGGAGGCGCTTACGATATTCGGACTGTCTTACAAGTCAATGGCAAA
GAAGACAAACGAAAAGGAGCTTACCAGTTTGTTGCAGTGGGCATTAGTCG
TGCCAGCCTCGCGCAGCTATTATATGCTTGGCTGACACCGTTTACTGAAA
TTAGTACAGCAGAAGATACAACAGGCGGATACAGCGATACTGATTTCCTT
CGAATTAATCAATTTTACATGGAAACATCACAAAATGCAGCTATTTATCA
AGCTTTATCCTTAGCTGGAAAACCAGTTACATTAGATTATAAAGGCGTAT
ATGTTTTAGACGTAAACAACGAATCTACTTTTAAAGGAACGTTACACTTA
GCAGATACTGTAACAGGTGTAAATGGTAAACAGTTTACTAGTTCAGCAGA
ACTTATTGACTATGTTTCTCACCTAAAACTAGGGGATGAAGTTACGGTTC
AGTTTACGAGTGATAATAAGCCTAAAAAAGGAGTTGGCCGTATTATCAAA
CTGAAAAATGGGAAAAATGGGATTGGCATTGCCTTGACTGATCATACAAG
TGTCAATTCAGAAGACACAGTGATCTTTAGTACTAAAGGAGTAGGAGGAC
CTAGTGCTGGTCTAATGTTTACTCTTGATATATATGATCAAATAACTAAA
GAAGATTTACGCAAGGGCCGTACAATTGCAGGTACAGGAACTATTGGCAA
GGATGGCGAAGTAGGAGATATTGGTGGTGCAGGTCTTAAAGTAGTTGCAG
CAGCTGAAGCTGGTGCAGATATATTTTTTGTTCCGAATAATCCTGTTGAT
AAGGAAATTAAAAAAGTTAATCCAAATGCTATAAGTAATTACGAAGAAGC
CAAACGGGCAGCCAAACGACTAAAGACCAAAATGAAGATTGTTCCTGTTA
CGACTGTTCAAGAGGCACTGGTTTATCTTCGCAAATAA
>M28_Spy0762 two-component response regulator
ATGTACAAATTAGTCATTATTGAAGATGAACATATTATTAGGAAATGGTT
GCGATACGCTATTGATTATAAAGCTTTAGATATTTTGGTCATTGGCGAGG
CTAAAGATGGCAAAGAAGGAGCTGTTTTAATCAAAGAGAGTCAACCAGAT
ATCGTTTTAACTGATATTAACATGCCCATCATGACAGCTTTTGACATGTT
TGAAGCAACAAAAGATCAAACTTACGCCAAAATTATTTTATCTGGCTATG
CCGATTTTCCAAATGCAAGATCTGCTATACACTACGGTGTACTTGAATTT
TTAACAAAACCGATTGAAAAAGCAGCTCTTTGGGAATGTCTTCAAACCAT
TATTGCTAAAATAGAAAAGCAAAAGGGGTCTAATCAAAAAACAGATGCTT
GCGTCTATATTCCCTTACCCCAGATGACTGATCAGATTCCTGAAGTAGTC
AAAGATATTTTGGAGTGGGTACATGCTCATTTTCAAGACAAGATCAGCAC
GAGCCGCCTAGCTCATGACTTAGGGTATAGTGAGAGTTATATCTATCAAA
ATATCAAAAAGCATCTTCAGATGCCTTTAAGTGATTACATTAATCAATAT
CGGATTAATCAGGCAATTCAATTGATGCAACAAGAACCAGATTTAATGGT
ATATGAAATAGCACAAGCTGTAGGTATTTATGACTATCGCTATTTTGATA
GGGTTTTTAAAAAGTATCTAGGACAAACTGTAAAGGCTTTTAAAGAAGAG
CATTTTATGAAGGATACCGATAGGAGTAAGCCATGTTAA
>M28_Spy0842 hypothetical protein
ATGTTAGATAGTTATATAAAACGTATTGTCATTCATCAATTTTCTCCCAA
TGACACTGAGTTACTGTTATCAGATCGTTTAGTGAGCATTACACCACGAA
TTGATGAATATTTCCGGAAAAAATTGGCTAAAGTGTTCTCGGATGAAGCC
AAACGGGGTCAGTTTGAGGCTAATAATACCTTTTTTACAACCATTGGTGA
TGATTTGTTGGAAACGTCTGTTACCATTGCCCAGTTATGGAAGGAAGCCT
TTGTTATTTCAGAGGATCAAAAAACCAATGATTTAGTCTTTGTCCAGTTT
GATAAGGATGGCGAACCCTTTTTTGCTTTCTTGCGAATTGCTTTGAAAGA
ACAGTTTGCTCACCTTTCTGACAATTATGAACATCCATTTACGGTGACGC
AGAATAATCTGCCGAGTCCCACCCAGACACCAGATGAAGCACTAGTCATT
AATCTCAAATCTGGTCAGTACTACTTGATTGAAAAGCGTGTGAAGCATAA
TGGCAGTTTTGCTAATTATTTTTCAGAACACCTCTTGAAAGTTACACCTG
AGCAATCTGTTAAAAAGTCTATCAAAATGATAGAACAAACCGCTCAAAAA
ATTGCAGAGCATTTTAATCAAGATGATTTTACTTTTCAGTCAAAGATGAA
ATCCACTCTTTTTAAGCAGTTAGAAGCAGACGACGTTTTATCACCAGAAA
AATTAGCTGACCAACTCTTTGATGATAATTTAACAGCCCGTTTAACCTTT
GTGGATCAAGTCAAAGATGTCATTCCAGAACCTATAAAAATTAGCGATAT
TGATCATTCTAGACAGATAAAAAAACTAGAAAATCAAAAGCTATCGTTAT
CAAACGGGATAGAATTAACAGTACCAAATGCCATTTATCAGGATGCTGAA
GCGGTTGAATTTTTGTTAAATGATGATGGGACTTATTCAATCTTGATTAA
AAATATAGAGGACATTAAAACCAAATAG
>M28_Spy0390 hypothetical protein
TTGCATCGATTGCCTAACCGTTTGATACCTGAGGAAGACAATAATAAACT
ATCACGAGTAGCCAAGGAAGTCGTTACTGAGCCAAGGCTAAATAACCCCT
TTTTGTTACCCAAGAAGGTTCTTTCGTTAGAAGATGATGCTGCTATCCTT
AATCATTTGGAGGAAGACCGTAATGTCAATAAGTTGTTCCTCGAGCCAGT
TGCGGCTGAAGCCAAGAGAGAAATTAATTTTCATCCAAGTGACCAGCAGG
TGACTGCTAAAGTTAAGGAGTCATCTGATTTTCATCAGAAACAGCACCAA
ACAGGGATTACTTATGGAGATGATACTCTGGCAGATCTGACGCATCATTT
GCTTCATTCAGATGGTGTTATTCCTAGTCTAAATGATAAGAGTGCTTAA
>M28_Spy0230 ABC transporter amino acid-binding protein
TTGAAACAGGAGACCTATATGAAAAAGCTAATCCTTAGCTGTTTGGTCGC
CTTGGCCCTTCTGTTTGGAGGAATGAGCCGGGCTCAAGCAAACCAATATT
TAAGAGTCGGAATGGAAGCAGCCTATGCTCCTTTTAACTGGACTCAAGAT
GACGCTTCAAACGGGGCTGTCCCTATTGAGGGAACTAGCCAATACGCCAA
CGGTTACGATGTCCAAGTCGCTAAAAAAGTCGCTAAAGCTATGAACAAAG
AACTGTTAGTCGTTAAGACCTCTTGGACCGGTTTAATTCCAGCATTAACT
TCTGGAAAAATCGATATGATCGCTGCTGGTATGAGTCCTACCAAAGAGCG
TAGAAACGAAATTAGCTTCTCAAACAGCTACTACACTAGCCAACCTGTTC
TAGTCGTAACTGCTAATGGCAAATATGCTGATGCAACAAGCCTCAAGGAT
TTTTCTGGAGCTAAAGTAACTGCCCAGCAAGGCGTTTGGCATGTCAATCT
CTTAACTCAACTAAAAGGTGCTAAGTTACAAACACCAATGGGAGATTTCT
CTCAAATGCGACAAGCCCTTACTTCGGGTGTTATCGATGCCTATATTTCT
GAACGGCCTGAAGCCATGACTGCTGAAGCTGCTGATAGCCGTTTGAAAAT
GATCACTCTTAAAAAAGGGTTTGCTGTTGCTGAATCAGATGCTGCTATCG
CTGTCGGAATGAAAAAAAATGACGATCGTATGGCAACTGTCAACCAAGTG
CTTGAAGGATTTTCTCAAACGGATCGTATGGCCCTGATGGATGATATGGT
TACCAAACAACCCGTGGAAAAGAAAGCCGAAGATGCTAAAGCATCATTTC
TAGGCCAAATGTGGGCTATTTTAAAAGGTAACTGGAAGCAATTCTTACGT
GGAACTGGAATGACCCTTCTGATTTCCATGGTCGGAACCATTACAGGTCT
CTTTATTGGATTATTAATCGGTATTTTCCGTACAGCTCCTAAAGCTAAGC
ATAAAGTAGCTGCCTTGGGACAAAAACTCTTTGGTTGGTTACTCACTATT
TACATCGAAATCTTCCGTGGGACACCTATGATTGTTCAATCTATGGTTAT
TTACTACGGAACAGCGCAAGCCTTTGGTATTTCGATCGACCGTACCCTAG
CGGCTATTTTTATCGTATCTATCAATACGGGTGCCTATATGAGTGAAATT
GTTCGCGGTGGTATTTTCGCTGTCGACAAAGGTCAATTCGAAGCAGCAAC
TGCTCTTGGCTTTACTCACGGACAAACCATGCGTAAAATCGTGCTACCAC
AAGTTGTTCGCAACATTTTACCAGCAACAGGTAATGAGTTTGTCATCAAT
ATCAAAGATACTTCTGTTTTGAATGTTATCTCTGTTGTGGAACTTTACTT
CTCAGGTAATACCGTAGCCACACAAACCTACCAATATTTCCAAACCTTTA
CGATTATCGCCATTATCTACTTTGTTCTTACCTTCACGGTGACACGTATT
CTTCGTCATATTGAACGCCGTTTCGATGCCGATACTTACACCACTGGAGC
AAACCAAATGCAGATTGCGGAGGTCTCAAATGTCTAA
>M28_Spy1346 two-component response regulator
ATGTATAAGGTATTATTAGTTGACGATGAATACATGATTCTACAAGGATT
AACCATGATTATTGATTGGCAGGCTCTTGGTTTTGACGTCGTTTCAACAG
CAAGATCAGGCCAGGAAGCCTTAGCCTATTTGACTCAGTACCCAGTGGAT
GTCATGATTTCAGATGTTACCATGCCTGGAATGACAGGACTGGATTTAAT
AGAAGCAGCTAAAACTAATCATCCTCAGCTACAAACCTTGATTTTATCTG
GTTATCAAGAATTCTCCTATGTGCAAAAGGCTATGGAATTAGAAACCAAG
GGGTATTTGCTAAAACCTGTGGATAAGGCAGAATTGCAGGCTAAAATGAA
ACAATTTAAAGACTGGTTGGATGCCCAGCAGGCTGAATCAATCCGGCAAG
AAACCTATCATGACAGCCTTCTGACACTGTGGTTAACAGATGAACTTAGT
GAAAAAGAATTTCATCAACTTAGCCAGGATCTCCCCGAGCATGCCCTAAC
AGGATTTACCGTGCTGTATGTGGAGTGTTCCGAGTGGATAGAAGAGATGG
AGGCTTATTTTAAGCAAGAAGAACAACCCTGTTACCTCAAAAAAGAAGAA
GACAAGAAGATTTACTTGGCGATTTTACTTGGGAGAGCCCAGCAAGCCAA
AGCCTTTACCAGTAATCTACAAAAGCAATTTTCAGAGAACATCCAACAAA
TCATCCTAGGAGAAACGGTTGATGACTGGGAAAATGTTTATGAGAGCTAC
AATCAGGTGCGCCAGAGTCTTTTTTACAATAGCCAAATGTCACAACCAAC
TGACAAAGGCAACAGTAAGCTTGAGATGCCAGAATCTCGGTTGCAATTTT
TTGCCTTTAACAAAGCATTGATGATTGGTGATGAGCCAACCATCTTGGCC
AAATTAGAAGCCATTTTTCATGAAATGAAGGCCTTGAACTTCTCACCAGA
GGATGTGAAGCATGTGTCGTTCTTGTTGTTCTCTGACATTTACCGTCAAT
TTCCCATTTTAGATAAAATGACTTATCTGTCCATGGTAAAAACTATTCAT
AACAGCCAATCCATTGATCGCATTTTGAGGGAACTAAAAAAAGTGTTGGA
TGTCACCAATCAGAACAATTCCCCTGAAAAACGTTATTCAGATTTAGTTA
GTGAAACCATTGATTGCATTCGCAAGGAATACCATCAAGAATTAACCCTT
AAAGCTATCGCTGATAGGTTACATGTCAATGGGGTTTATTTAGGGCAATG
CTTTAAAAATGAAACCGAGCGTAGTTTTACCCAGTACTTAAATCATGTTA
GGATTCAAAAAGCGCAACAGTTATTGCTTTACACCAACCAATCCATCAAT
GAAATTGCTTATGAAACAGGTTACAATACCAATCATTATTTTATCAAGAT
GTTTAAAAAGTTGAATGGTTTATCGCCAAAAGAGTTCAGAGATCGTTACA
AGGACAATTACCAAGCCATCAAGGGCGACCAGTAA
>M28_Spy1562 universal stress protein family
GTGGCCTTATTTTTAGTAGGTACAATTGGATTAAGCACGTTTAGATACAT
GACAATTGGATTAACATCAGAATATAGGCTTTGTCATGTTAAGATTGATC
TGTTGATCGTGAGAGCTAATAAAAAATGTTATAATACTATGAAATAA
>M28_Spy1503 universal stress protein family
ATGGATCGCTTTCAAAATGACTCAAAAAAGAGTATAATGAAAAAAAGAAT
AAAAGCTATTCTTGTCAAACTGTTAAAGGAGGACAGTTCTATGTCACTAA
AATATAAACGTATCCTCGTTGCTATTGATGGCTCTTATGAGTCTGAATTA
GCTTTCAATAAAGGCGTTAACGTAGCACTACGTAACGACGCTACCTTACT
ACTAGTACACGTTATTGATACCCGTGCCTTGCAAAGCGTAGCTACTTTTG
ATACTTACATCTATGAAAAATTAGAACAAGAAGCTAAGGATGTTTTAGAT
GATTTTGAAAAACAAGCACAGATAGCAGGAATTACAAACATCAAACAAAT
TATTGAATTTGGCAACCCCAAAAACTTACTAGCTCACGATATTCCAGATC
GTGAGAACGCTGATTTAATTATGGTAGGAGCTACTGGTCTTAATACCTTT
GAACGCCTCCTTATTGGCTCATCTTCTGAGTACATTATGCGACACGCTAA
GATTGACTTACTTGTAGTCCGAGATAGCACTAAAACACTCTAG
>M28_Spy0852 hypothetical protein
TTGCTAAAAAAATGTTTAACGATAGTAAAACACCGTCTAAAAGAAAGTAG
GTCTACAATGACTAAAAAAAATCATGGCGTTTTTTGGGGGTTGTTGCTTG
GATCAGCAGCAGCTAGCATTGCTTACTTAAGTTTATCGTCTTCCAAAAAA
GATCAACTCTTGAAAGATAGTGCTAAAAAAATAGATGATCTCAACGCTTA
CTTGCAAGATAAAAGTAAGCAAGTTCTGGATGCAGTATCGGAAAAAGTAC
AAGAATCCAAAGATGCTGTTGAAGTTTATGGTGGTATTGCCGCAGAAACC
GTTGAAGAAAAGTGGCAAGATACCAAAGATGCTGTTGAAGTTTACGGTGG
TATTGCCACAGAAACAGTTGAAGAATCTTTGGGACAGGTTAAAGAAAAGG
TAGAAGGAATTGGCGAAGCTACTAGCCAAACTATCCAATCTAAAATGGAA
AAACTCACCAGCGATAAGACAGATGCTGATGATGAAAAATAG
>M28_Spy1869 phosphoesterase, DHH family protein
GTGGAAGCTCTGTATTTCAGGGCTTTTTTATGGTATAATGTGTGCTTAAG
AGGTTATAAGATGAAAAAATTTCGTTTTGAAACCATTCATTTGATTATGA
TGGGATTGATTTTATTTGGACTACTGGCACTTTGTGTCAGTATTATGCAA
TCAAAAATATTAATATTATTAGCTATTTTTCTCGTTTTGCTATTTGTTGT
TGCTCTTTTATGGTATCAAAAAGAAGCTTATCACTTATCAGACTTAGCTC
ATATTGAGCTCTTAAATGAACAAACAGAAGATAACCTAAAAACGCTACTT
GATAATATGCCTGTTGGAGTAGTTCAATTTGATCAAGAGACCAACGCTGT
AGAATGGTATAATCCTTATGCAGAATTAATTTTTACAACTGAAGAGGGTT
TTATACAAAACAGTTTGATTCAGCAAATTATTACGGAAAAACGTCGTGAA
GATATTTCTCAAACATTTGAAGTTTCTGGTAATAAATACACTTCTTATAT
TGATGTATCATCAGGAATTTTTTATTTTTTTGATAGCTTTGTGGGAAACA
GGCAATTAGCTGATGCTAGTATGTTAAGACCGGTTGTTGGCATTATTTCG
GTTGATAATTATGATGATATCACTGATGATTTATCAGATGCAGATACCTC
AAAAATTAATTCATTTGTAGCTAACTTCATTGATGAGTTTATGGAGTCAA
AACGGATTTTTTACCGTCGTGTTAATATGGATCGCTACTATTTCTTTACA
GACTTTAAAACATTAAATGATTTGATGGATAATAAATTTTCTGTCTTAGA
AGAGTTTCGTAAAGAAGCTCAAGATGCTCAACGCCCTTTAACACTCAGCA
TAGGAATTTCTTTTGGTGAAGAAAATCATAGCCAGATTGGACAGGTAGCT
CTTGAGAATCTTAATATTGCGCTTGTTCGTGGTGGTGATCAGATTGTCAT
TCGTGAAAATGCGGATCATACGAATCCAATTTATTTCGGGGGAGGGTCTG
TTTCTACAGTTAAACGTTCAAGAACACGTACCCGTGCTATGATGACAGCT
ATTTCAGATCGAATCAAGATGGTGGACAATGTTTTTATTGTTGGACATAG
GAAACTTGATATGGATGCACTAGGTTCAGCTGTTGGTATGCAATTTTTCG
CAGGTAACATTATTGAAAATAGTTTTGCCGTTTACAATCCAGATGAGATG
AGTCCAGATATTGAAAGGGCTATTGAGCGATTGCAGGCTGACGGAAAGAC
TCGTCTAATCAGTGTTTCTCAAGCAATGGGTTTAGTGACTCCAAGATCAC
TTTTAGTAATGGTTGACCATTCTAAGATATCTTTAACACTTTCTAAAGAA
TTTTATGAACAGTTTCAAAATGTTATTGTAGTTGATCATCACAGAAGAGA
TGATGATTTTCCTGATAATGCTATCTTAACTTTTATTGAAAGTGGAGCAA
GTAGTGCTGCGGAGCTCGTCACTGAGTTAATTCAATTTCAAAATGCTAAA
AAACGTTTAAATAAGATCCAAGCCAGTGTTTTAATGGCAGGTATTATGCT
TGATACTAAAAATTTTTCTACGCGAGTGACAAGTCGTACCTTTGATGTCG
CTAGTTACCTAAGAAGCAAAGGAAGTGATAGTGTTGAAATTCAAAATATA
TCCGCAACAGATTTTGAAGAATATAAGCAAATAAATGAAATTATTTTACA
AGGAGAACGTCTTGGTGACAGTATCATTGTAGCTGCAGGAGAAAAAAATC
ATCTTTATAGCAATGTTATTGCTAGTAAAGCTGCAGATACGATACTGTCA
ATGGCTCACGTTGAGGCTAGCTTTGTATTAGTTGAAACAGCTTCTCATAA
GATTGCTATTTCAGCTAGAAGTCGTAGTAAAATCAATGTTCAACGTGTGA
TGGAAAAATTAGGTGGAGGAGGCCACTTTAATCTTGCTGCCTGTCAGTTA
ACGGATATCAGTCTTCCCCAAGCGAAGCACTTATTATTGAAAACTATTAA
TATGACAATGAAAGAAACAGGAGAAGTAGAATCATGA
>M28_Spy0972 phage protein
ATGATAGATTTTGTACAAATTGGTGCTTTTTGTGGCGCTGCTTTGTCTAT
CTTGGGTGTTTGGGGATTTATCGTCAATCCCTTTAAAAAAGCCATGGAAG
CTAATGAGTTTGCCATGGCTCAACTCAAGGACTCAATTAAGGAGTTAGCT
TATGAGCTTAAAAATCTTGATCGTGAACGTGAGATTACCAAAAAAATTAT
CGACAGACACGAGGAGCGTTTAGGTCGCGTAGAAGACGAAGTTATTATCA
ACAAGGAGCGTATTATTACGCTATTTAAAAAAGGAGAAGAAAAATGA
>M28_Spy0686 cystine-binding protein
ATGTTATACTATTCTTATCTTAATAAAGGAGTTACTATGAAGAAATCAGT
TACTTTACTGTCTATCGGACTTGCCAGCCTTTTATTGGCAGCATGTGCGC
CACATAAATCTCAAAAATCAAGTTGGGAGACTATCAAAGAAAAAGGGGTG
TTAAAAGTAGCTACCCCAGGAACCTATCAGCCAACTTCTTTTTACAACGA
TAATAATGAGTTAGTAGGTTACGAAGTAGATATGGTCAAGGAAATCGGTA
AACGACTTAACATTAAAGTCAAGTTTGTTGAAACAGGATTTGACCAAGCC
TTTACCTCAGTTGATAGTGGTCGAGTGGATATTTCTTTGAACAACTTTGA
CATTACCCCAAAACGTCAGAAAAAATACAATATCTCTACGCCTTATAAAT
ACGGGGTAGGAGGCATGATTGTCCGTGCTGATGGCAGCTCAAACATGGCT
AAAAAAGATCTTAGCGACTGGAAAGGAAAAAAAGCAGCTGGCGCTTCTGG
AACAGAGTACATGAAAGTAGCGCAAAAACAGGGAGCTGAACTGGTGACCT
ACGATAATGTTACAGGAGATGTTTATCTAAACGATGTGGCTAACGGTCGA
ACAGATTTCATTCCAAATGATTACCCAGCTCAAAAATTATTTGTGGATTA
CATGTTATCTCAAAATCCAAATCTAAATGTCAAAATGAGCGATGCTCAGT
ACAACCCAACCGAACAAGGAATTGTTATGAACAAAAAAGACGATAGCCTC
AAGAAAAAAATAGATGCTGTTATTAAAGACATGATAAAAGATGGTAGCTT
GAAGAAAATATCTGAAACCTACTATGCTGGTCAAGATTTGACAAAACCTT
TTGGCAAAGACAAAAAAATTCCCATCATTGATACGAAAGACGTTAACTAA
>M28_Spy1336 R28 protein
ATGTTTAGAAGGTCTAAAAATAACAGTTATGATACTTCACAGACGAAACA
ACGGTTTTCAATTAAGAAGTTCAAGTTTGGTGCAGCTTCTGTACTAATTG
GTCTTAGTTTTTTGGGTGGGGTTACACAAGGTAATCTTAATATTTTTGAA
GAGTCAATAGTTGCTGCATCTACAATTCCAGGGAGTGCAGCGACCTTAAA
TACAAGCATCACTAAAAATATACAAAACGGAAATGCTTACATAGATTTAT
ATGATGTAAAGAATGGATTGATTGATCCTCAAAACCTCATTGTATTAAAT
CCATCAAGCTATTCAGCAAATTATTATATCAAACAAGGTGCTAAATATTA
TAGTAATCCGAGTGAAATTACAACAACTGGTTCAGCAACTATTACTTTTA
ATATACTTGATGAAACTGGAAATCCACATAAAAAAGCTGATGGACAAATT
GATATAGTTAGTGTGAATTTAACTATATATGATTCTACAGCTTTAAGAAA
TAGGATAGATGAAGTAATAAATAATGCAAATGATCCTAAGTGGAGTGATG
GGAGTCGTGATGAAGTCTTAACTGGATTAGAAAAAATAAAAAAAGATATT
GATAATAATCCAAAAACACAAATAGATATTGATAATAAAATTAATGAAGT
CAATGAAATAGAGAAATTGTTAGTTGTATCGCTACCAGATAAAATTAAGT
ATTCGCCAGAGGCTAAGCATAGGACTGTTGAACAACACGCGGAATTAGAT
GCAAAAGATAGCATTGCAAATACAGATGAATTGCCATCAAATTCAACGTA
TAACTGGAAAAATGGTCATAAACCAGACACCTCAACATCAGGTGAAAAAG
ACGGAATTGTTGAAGTTCACTATCCAGATGGTACTGTTGATGATGTGAAT
GTTAAAGTAACCGTTACATCGAAAAAAACTGATAATACAGCTCCAACATT
AACCGTCACTCCAGAGCAACAGACTGTTAAAGTGGATGAAGATATTACCT
TTACGGTTACAGTTGAAGACGAAAATGAAGTTGAACTAGGTTTAGATGAT
CTTAAAGCTAAGTATGAAAATGATATCATTGGAGCTCGTGTTAAAATTAA
GTATCTTACTAAAGAACCTAATAAGAAAGTCATGGAAGTGACAATTATGA
AAGCTACTTTAGCAGATAAGGGCGCAATTACCTTTACTGCAAAAGATAAA
GCAGGTAATCAAGCAGAACCTAAGACAGTTACCATCAATGTTCTTCCGCT
TAAGGATAGCAACGAACCAAAAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAG
AAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAA
GGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGA
CAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTG
TAGATGTGACTGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAAT
GATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGC
AGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAG
CCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGACAAACCAGCAAAA
GTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATGTGACGGT
TAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAATGATCCAGCAGGTA
AGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATT
GGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCC
AGTTGATACAGCAACACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTT
ACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATGTGACTGTTAAGGTTGTCGAT
CCACGTACAGATGCCGATAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGT
CAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAG
ATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCA
ACACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTC
AAAAGATACTGTAGATGTGACGGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATG
CCGATAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAA
ACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGG
TACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGACA
AACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTA
GATGTGACGGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAATGA
TCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAG
AAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCC
TTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGT
TGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATGTGACTGTTA
AGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAATGATCCAGCAGGTAAG
GACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGG
TAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAG
TTGATACAGCAACACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTAC
CCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATGTGACGGTTAAGGTTGTCGATCC
ACGTACAGATGCCGATAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCA
AAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGAT
CTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAAC
ACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAA
AAGATACTGTAGATGTGACTGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCC
GATAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAAC
ACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTA
CAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGACAAA
CCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGA
TGTGACGGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAATGATC
CAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAA
GATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTT
TGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTG
TTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATGTGACGGTTAAG
GTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGA
CCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTA
ACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTT
GATACAGCAACACCGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCC
AGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATGTGACTGTTAAGGTTGTCGATCCAC
GTACAGATGCCGATAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAA
GTAGGAGAAACACCGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCT
TCCGAAAGGTACAACAGTAGCCTTTGAAGCTCCAGTTGATACAGCAACAC
CGGGAGACAAACCAGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAA
GATACTGTAGATGTGACGGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGA
TAAGAATGATCCAGCAGGTAAGGACCAAACGGTCAAAGTAGGAGAAACAC
CGAAGGCAGAAGATTCTATTGGTAACTTATCAGATCTTCCGAAAGGTACA
ACAGTAGCCTTTGAAACTCCAGTTGATACAGCAACACCGGGAGACAAACC
AGCAAAAGTTGTTGTGACTTACCCAGATGGTTCAAAAGATACTGTAGATG
TGACGGTTAAGGTTGTCGATCCACGTACAGATGCCGATAAGAATGATCCA
GCAGGTAAAAATCAGCAAGTCAAAGGTAAAGGAAATAAACTACCAGCAAC
AGGTGAGAATGCAACTCCATTCTTTAATGTTGCAGCTTTGACAATTATAT
CATCAGTTGGTTTATTATCTGTTTCTAAGAAAAAAGAGGATTAA
>M28_Spy1616 sensory transduction protein kinase
ATGATAAGAATAAAAAACATAACAAAGAGTAAGTTCTTTGGGACTGCAAT
AATCTTGTTGCAACAATTAATAGCCTTGTTAATTTTGGTCTATAATCGAG
AGAACCTGTCTCTTCTTTTCTCTGAAAAAGTAGCTCTTGTAATGACCCTT
ATTGATACAGCTTTTATTTGGCTGGCAACAATATTACGCCAAAAACAAGG
TGATATTTTTAAAAGGATTATTTCTATCATCTCCTTAACAATTTGGCAAT
ACTTAGTATCTGTGCTGACAAGAGGAACTCCTCTCTTTTTAAGCAGTGGA
CTACAGATTATATTGCTCTATTGTTATACCGTTGAGATTACTAATTTAAT
ATTATATGGGCACAAACAATTTAAAGATAAGTTAGATAAGGGCTTGTTAA
TAATTATTTTTGTTTCTATAACTAGCCTTTTTGTTAATAGCATTTTATTT
AATTTTTTATTCCTGATGGTTTTTACTATTTTACACCTGTATCCGTTACT
AGTTATAGTGCTATATTATAGGTCCTTTAGGCAACAAATATCAGTTGTTA
GACGTTCATTGATACTATTTTCTTTACTTTTGCTGGTAATACTTGGTAGT
GAACTTTATGGAGAAATGCTAGATGTTAATCAAGCCTTTAATAATTTGGG
ATGGTATCTGTTTCCCCTTATAATGAGTGTAATATACTATTTTAAGACCA
TACATGATAAATTGAGTTTTGTTACCCAAAGATGGTTAGGTGATTACAAA
GCTCGTATAGAACTATTATTTCTACTTCTTATCCTTTGTTGGATTGTACT
CATGAAGGTATTAGTTAAAGATTTTTTGCTATTTTTTATAGTTGTTGACG
CAAGCACATTGTTTTGTCTAGTGGTAATTTCTTGCATCTTTTATTATTTA
AAAGACTCCAAACAAAATTTTGACTATGAAAATAGAAGACTGAACTATTT
TATGAAATCAGAGGAAAACATGAGAGTGGAGTTCTCAAATTATTTGCATG
ATGATGTTTTACAAAATATCATAGCGATAAAAAACTTGCTTTCTCTAGAA
AATAGTAATATAACACATGGTTTTATTGTTAATGAGTTGAATGATTTAGT
TTCTGGTATCAGAGATGAAATGGATACTTACTACCCAATAGTTCCCGCTA
ATCAAACAATGAAAGAAAACATACAGTCTCTTTTTGATGATATTGTTAAA
AGTAGAAAAAGTAATACCCTATTGTATTTTAACTGTTCAGATAATATGGT
AGTGCCATCCCCATATGGAGATATTGTTTATAGGTTTATAAAAGAGCTAA
TAAACAATGCTATAAAATATGGAGATGGAAAAGACATTCGTTTATCTTTA
ACGATTCAATCTGATATTATTATCATTGAGGAGAGCAATCAAGTAGTGGA
AAAAGTACACTCTATAAGTTATGGCAGAGGATTGAAATCATTTCAAGAAA
CACTAGCAGCTTTTGATGGAGATCTAGAACTACAAATGGATACTAAACAA
TTTACTATCAGAATATTACTTCCCATAGATTGGAAATTGTGTTATGAAGA
TTTTATTAATTGA
>M28_Spy0995 phage protein
ATGACCACCAGAAAGAGTAAATACTGGCGTGACCGTATCAAGAAAGAAAT
GGATGCTAAAGAGGCAGACGATATCTCTCTTGAGCAATCCATGAAGCAAT
TGCACGATTATCATTTCAGGAATATCGAAAAAGAAATTGAGTCGTTTTAT
CAACGTTATGCTGACAAAGAGAAAATAGACCTTTCAGAAGCCCGTAAGAG
AGCTTCTGAGCTTGATATTTCTGCTTACCAGAAGAAAGCTAAGGAACTTA
TTGCAAAGGCTGAGAAGCTACGAAAAGAGGGTAGAACGGTAACAAAAGCC
GACTTCACTCATCAAGAAAATGCAGACATGGCTATTTACAACTTAGCCAT
GAAAACCAACGCTTTAGAATTGTTGCGCTTGAATATCGACTTGGAGATGC
AAGAACTTGCCAACGGCGAACACAAGCTAACCAAGAAATTTCTTGACGAA
GGTTACCGTAAAGAGGTTGAGTTCCAAGCTGGGCTATTAGGATTATCAGT
TGCTAGCCAAGCGAATGTGAAAAACTTAGCTGATGCCGTTATTAATGCTA
ATTTCAAGGGAGCAAAATGGTCAGATAACATTTGGGACAGACAAGATAAG
TTACGTAGCATCATATCTCAAAGCGTCCAAAGTGCTATCCTAAAAGGTAA
AAATGGCTTAACTATTGCAAGAGATATTAGACGAGAGTTTGATGTGTCAG
CATCTTACGCAAAGCGACTAGCGATAACGGAGCATGCAAGGGTTCAGATG
GAAGTTGGTAGATTATCCATGGCGGAGAATGGCTTTGCTATGTTTGATAT
ATTGCCTGAGCCTAAAGCATGTGATGTTTGCAAGGATATAGCTAAGCATG
GTCCATATCACCTTGACAAGTGGAGAATAGGGGAAAACTCTCCGCCGTTT
CATCCGTATTGTCGTTGTGCAGTTGTAGGATTGGATAAGAAACAAGAAGA
AAAAGTGAATGATAAATCTGAAAAATTTGAAAACATAACACCGAATCTCA
TGCCATTATTTAGTAAGTTTGCAAGTAAAATAACAGATTTGCAACGTAAA
ATAGTGTACTCTGCTGATTTAGCAGATACCGGGTACATTAGAACACCGCA
TGCGTTTGATATAAACAATACCTTGCGAAATAAAGGCTACAATTATCTAA
ACGTTGATGATAAACTAATTACCGACACATTGGATAGTGTCATCTCGATA
AATTCAACTCCCAAAAATATAAAAGTATACCGATTTGATGATTTTGAGTT
ATTAGGTTCAATCAACGAACAAAACAATAATATTTTTGATTCAGGTAATT
TTATGGATAAATTAAACCAGGGAGGATTATCATACACCAACGATGGATAT
ACTTCTGCAAGTTATGATGTTAAAAAAAACGTGATGGGATATCGTCCTAT
TAAGACTGAAATAAAAGTACCTAAAGGAAGCCACGTTTATCTTACAGATA
ATGAGGAAGAAAGTGAAATTATACTACCACGAGGGACAAAGTATGATATA
ATTAATGCGAAGATAAATGAATATGAAGAAATAGAAATCACTATGGAAAT
AAGAAAGGAGTAA
>M28_Spy1214 transcription regulator, crp family
GTGATTCGAAGAGAAGATTATCAATACCTTAGAAAACTAAACGATTTTCG
CTACTTTTCTATTGAACAATTTGACAAAATTGTAGGGCAGATGGAATTCC
GAAAAGCTAAAAAGGACCATATCCTTTTTTTTGAGGGAGATAAAAGAGAT
AAGCTTTTTCTAGTGACCTCTGGTTATTTCAAGGTGGAGCAGTCCGATCA
ATCAGGAACCTTCATGTATACGGATTTCATCAGACACGGTACCATTTTTC
CTTACGGTGGCCTCTTTACAGATGATTATTACCATTTTTCAGTGGTAGCC
ATGACAGACGTGACTTATTTTTACTTTCCAGTCGATTTATTTGAAGATTA
TTCGCTTGAAAATCGTCTACAAATGAAACACTTATATAGTAAGATGTCTA
AACTGCTCGAGTTACATGAGTTGAGGGTTCGAAATTTGATTACATCAAGT
GCTAGTTCTCGTGTGATTCAGTCTCTGGCGATTTTGCTGGTTGAAATGGG
TAAAGACAGTGATACCTTACCTTTTCAATTAACAACAACAGATATTGCTC
AAATAAGTGGGACGACAAGAGAAACTGTTAGCCATGTGCTTAGGGATTTG
AAGAAGCAAGAATTGATTACCATAAAAGGTAAGTATTTGACTTATCTAGA
TAAAGACTATTTTTTACAATACACAAAGTGA
>M28_Spy1219 two-component response regulator
GTGTACTCATTGTTAATTGTAGAAGACGAATACCTTGTGCGCCAGGGTAT
TCGTTCTTTGGTTGATTTTAGCCAGTTCAAGATTGATAGGGTCAACGAAG
CAGAAAATGGCCAGTTGGCTTGGGACTTGTTTCAGAAAGAGCCTTATGAT
ATTGTTTTGACGGATATCAATATGCCCAAATTAAATGGGATTCAACTAGC
AGAACTCATTAAACAGGAATCCCCCCAAACTCATCTGGTATTTTTGACGG
GCTACGATGATTTTAACTATGCCTTATCTGCTTTGAAGTTAGGGGCAGAT
GATTACTTGCTCAAACCCTTTTCCAAGGCCGATGTGGAAGATATGTTAGG
AAAGCTCCAGCAAAAATTAGACCTTTCCAAGAAAACAGAAACCATCCAGG
AATTGGTTGAGCAGCCTCAAAAAGAAGTATCAGCAATAGCAATGGCTATT
CATGAGCGATTGGCAGATTCTGATTTGACCCTAAAAAGCTTGGCTCAGCA
GCTTGGTTTTAGCCCTAATTACCTTAGCGTCTTGATTAAAAAAGATTTAG
GGATGCCCTTTCAAGATTATCTGGTACAAGAACGGTTGAAAAAAGCCAAG
CTTCTCTTGTTAACCAGTAATCTTAAAATCTATGAAATTGCAGAGCAGGT
CGGTTTTGAGGACATGAATTATTTTTCTCAGCGCTTTAAGCAACTGGTAG
GCGTTACCCCAAGTCAGTATAAAAAAGGAGGCCAGGCATGA
>M28_Spy1652 transcription antiterminator, BglG family
TTGAGTCCAATTGCAGTCAAAAATGACTACGGACAATTGGACTCAATTTG
TCTTGAAAATGAAAACGCTTCATTTTATACTGACATTATAGGAGGAGATG
ACATGCTATCTCATGAGCTCATCAGAAACTATCAACTCTTTTCTAAATAT
AAAGGACATTCACTGGAGGCATTTGAATCCATATTAAAGACAAGCAAACG
TCATATACTGGCAGATATTGCTAAAATCAATGACACGTTGTCACTCTATC
AGTTACCCCTTATTGCTCTGGACAGGCAGCTGGTTTATCCGCCAGACCTT
ACTGAAAAGGACTTGTTGAATCGCATGCTACCTACCTTAGACGACTATCT
CTTTCAAGATGAGCGTCTGGACATGATTATCATTTACATCATGATGGCTA
AAGAATTTATCTCCATTAACCACTTGGAAAGCTTGTTACGGCTCAGCAGA
AATTCCGTTATTGCTGATTTAAACTTGGTGCGTGATCGGGTACAAGCTTT
TCAGGTAACTTTAGCTTACAATCGCCAGGATGGTTATTTTTTTGAAGGAG
AACCCTTAGCCTTGCGGCGTCTCTTAGAATCAGCGGTCAGTTCTCTTTTG
CAAGTTACATCAGGACCTTGGGTGTTCAGTTACTTATTGCATGAACTTGG
TTTGCCCGACCAGACAAAGGTGATGGCAGCAACGTTGGAGGAACTGAGCA
GGGAGAACCACTTAACTTTTATTTCGGAGAAATTGAGGGATTTGATTTAT
TTTTTCTGCCTTCTCGCTCATCGACCATTTTCACGGAACGTAAGGGCTGA
AGTAGTGGATACTTTTCCTTTAGCTTCGCCAGCTGTTGAAACGATGGTGG
ACCAGTTATTGGTCAACTTCCCCAGTCTAACCGAAGAGAAATATTTGGTT
CAATCTAGGTTACTTGGTTGTATCCAAGGTGACTTAGAGTTAGTCTTTCA
GCAACCTATTTATGACATTATGGAGGAAATCATCAATTCGGTGGCGGTTA
ACACGGGATTGTCTATCACCGATACCCCAGAACTTCGTCAGAACCTATAC
AGTCACCTTTTGCCAGCTTATTACCGACTTTACTACGACATTAACTTGAC
CAATCCTTTGAAGGAACAAATCAAACAAGATTATGAATCTCTCTTTTACT
TGGTCAAGCGCAGCCTTTCTCCTCTAGAAAAACAATTGGGGAAACCAGTT
AATGAAGATGAGATTGCTTATTTTACCATTCATTTTGGGAGATGGTTGCA
GGCCCCTAAGAAGAGGCCGAGCAATCAGCTGGTAGCCTTATCTGTTTGCC
CTAATGGCATCAGTTCGTCTCTGATGTTGGAGGCAACCTTGAAGGAACTT
TTTCCACAGCTACAGTTTATTAGGATTCACCAGCTGGACAAAATAAAGTT
GTTGGATCCAGCTTCCTTTGATTTGATTTTTTCAACAGTAGCTTTTGACT
GTGTTAAACCTGTTTATGTGACGCAAGCTTTGATGGGACCTGTTGAAAAA
ATGATGTTGAAAAAGATGGTCTGTGATGACTTTCATCTTCCCTTGTCAGA
GCAATTCGCTTTGGATGACCTGTTGAGTATTATTCATAAACACACCACGA
TTACTAATAAAGAAGGACTTGTTAGTGATTTATCCCGTTACCTGTTTGGT
AACCATTTAACGATTGAAAAAGGAGGTCTAGGACTATTGGACTTGTTAAC
AGCAGATTTTATTAGGCAGGCTGATGCTGTTTCGGATTGGCAGGAAGCGA
TTCGTTTGGCTGCTCAGCCTTTACTAGAACACCAGATGATTGAAACATCT
TATATCGACGGTATGATTGATTCGGTCAATGAGCTTGGAGCCTATATTGT
TTTAGCCCCTAAGGTGGCTGTTCCTCATGCGGCGCCTGAAAAAGGAACGC
GGCAGTTAGGCATGTCTCTCTTACAACTAAAAGAACCTGTCAGCTTTGAT
TTGAAGCAAGAAGGTGATCCAGACAAGCAAGTGCAATTGATTTTTGTTTT
GTCTGCTGTGGATTCTAGTTCACATTTGAAGGCTTTGCAGGAACTGTCGT
TGATTTTAGATGATGATGAACATATTGAGCAATTAATTGAGGCTAAGAAT
ACTGAGGAAATAATGAGTCTGATTAGCCATATGATTGAAAAAGGAGATGA
ATCACATGATTAA
>M28_Spy0036 protein tyrosine phosphatase
ATGAAAAAAGTATGTTTTGTCTGTCTGGGTAATATTTGTCGAAGCCCCAT
GGCTGAGTTTGTAATGAAGTCAATAGTATCAAGTGATGTTATGATGATAG
AAAGTCGTGCTACTTCTGATTGGGAGCATGGAAACCCTATTCACTCAGGT
ACACAGTCCATATTAAAAACTTACCAAATTAATTATGATATAACTAAATG
CTCCAAGCAGATAACTATAACTGATTTTAACACCTTTGACTATATTATTG
GTATGGATAGCGATAATGTGAAAAATCTCAAAGAGATGTCGCAACATCAA
TGGGACTCTAAAATCTACCTGTTTAGAGAAGGGGGTGTTCCTGATCCTTG
GTACACTAACGATTTTGAAGAAACCTACCAATTAGTTAGAAAAGGATGCC
AGGATTGGCTTTCTCGTTTAATGAGTAAAGAGTATTGA
>M28_Spy0761 two-component sensor kinase
ATGCGAGGTGAACAGGTGGAAGAACATTTTAAAAAACAATTACAAGATGA
TATTTCTAGACATTTTTCGTACCAATCGTTAATGTTATCATTGTTGCTAA
TTGGTCTTTTTATTATTTTTTCATTAGCGCCACAACAATTAGGCCTCTAT
CGTGATATCAATGCCACTGCAACCCGTTATCACCGTTTGATTAGCAAACA
AGAAGCCTTGCTTGATGACTTAGGGAAAAATAGCTTACTACCTTTTTTAA
ATAAAAACCTCAGCACTGCTGATTTAAGCAAGCACTATTTTCATTTGCGC
CATAGCAGCCAAACGTCACCAGAACTTTTACTATTTTCACCTAGTCAAGA
CCTTTTATTTGCTAGTAACCCACATTTAGGAAATGTTTTTAGTAAATCTG
TTTATATTCAAGAAGTCTTGAGAGCAGCTCATCCTCCAAAAACCTTGTTT
AAAGTTGCTATGGATAGTGAAGATGGTCACTACTTGATGATCATTAAGCC
AATGATTGATCAAAACCAACTAAAGGGATATGCTTTTTTAGTGATGAGTG
GCAAAGATTTTCTTCATCCTACAAAAACACTGACGTCAGAGTTGGTCATT
GCTGATAAGCTGGACAATACGTTTACGTTTTCCAATCGTGAGTTTATAGC
ATCTAGTCTAGATAAGATCAACAGTCAGTATTTACACCATTATTTTGTTT
TTCAAGATAATCGAGCCTTTATCACAAGAAAGGTTGCCTTACAAGGAGGT
CTTTGGCTTTACATGTATAGGCCCTTGATTCCAATGGTATCGGTGATGTT
ATTTTCACTTATTTCATCAGCTGTTATCTTTGTGATCTTGCAACGTAAAT
CAAGTGGTTTAGCTAACCGAATTGCAGCTAAAAATTCAAGAGCAATCAAT
CAAATGGTTAGAGATATGAGTGCGATCTCTCGGCAAGAAAAAAGACGTAT
TGACCTTGAGAGTCAAGATGAATTTCAATATTTATCTGATCAAATCAATC
AAATGGTAGAGCGATTGCAACAGTTACATGATAAAACGTTAGATTTGGAA
ACTCAAAAATTATTATTTGAAAAACGGATGTTAGAAGCTCAATTCAATCC
GCATTTCCTCTACAATACGCTAGAAACCATTTTGATTACGAGCCATTATG
ATTCTGCCCTAACAGAAAAAATTGTTATCCAATTGACAAAATTGTTGCGG
TATAGTCTCACGGATTCTAGCAAACCTGTCTTGCTCAAAGATGATTTAAG
TGTCATCGAGTCTTATTTAGTGATTAATCAGGTGCGGTTTGAAGAATTGC
AATATAGCATTAACCTATCCCCAGACCTTGATAGTCTTGCAGTGCCTAAA
TTGTTCTTGTTACCTTTGATAGAAAATGCCATCAAATATGGCTTGAAAGA
ACGACACGATGTCAAGATTAACATTGCTTGTTATTATCAAGATGACCATA
TTATTTTTTCTGTGCGAGATAATGGTTCGGGAATTGATGCTCATCACCAA
AAAGTGATTCGAGAGCAATTGGAAGCTGGAGAGTCACACCATGGGTTAAT
TAACTCTTATCGTCGACTTAAGTATCATTTTTCAGAAGTATCCTTGGTTT
TTGATCAAGGTGATAAACAGTTTAATGTTAGCTACCATGTTAAGGAGTAG
>M28_Spy1106 GAF domain-containing proteins
TTGACTGAAGCGAAAGATAGTCGTAAAAAATACTCGAATAGACCCAGATA
TGCTATAATAAAAGGTATGAATAAGTCTAAAAAAATTGAGCAATACCAAC
TAATGATAGCACAGGCAAAAGAGCTGTTTGCGAATGAATCAAATGCTTTG
GCTAATTTGTCAAATGCCAGCGCCCTGTTAAACATGACACTACCCAATTC
TGTTTTTGCGGGATTTTACCTTTTTGATGGGCAGGAATTAATTCTTGGCC
CTTTTCAAGGTAGGGTTTCTTGCGTCCATATCAAGCTTGGTAAAGGTGTT
TGTGGCGAATCAGCTCAGTCTCGTCGAACCATTATTATAAATGATGTGAA
GCAGCATGCCAACTATATTTCCTGTGATGCGGCAGCCATGAGTGAAATTG
TTGTGCCTATGGTGAAAGAAGGCCATTTGATTGGGGTGCTGGACTTGGAT
TCTAGCCTTGTAGCTGATTATGATGAGGTTGATCAAGAATACTTAGAGGC
CTTTGTGGACCTATTTCTTGAAAAGACCACGTTTACCTTTAACATGTTTG
GAGTTAAAAACTGA
>M28_Spy0954 histidine-binding protein
ATGATTATAAAAAAAAGAACCGTAGCAATTTTAGCCATAGCTAGTAGCTT
TTTCTTGGTAGCTTGTCAAGCTACTAAAGGTCTTAAATCAGGAGATGCTT
GGGGAGTTTACCAAAAGCAAAAAAGTATTACAGTTGGTTTTGACAATACG
TTTGTTCCTATGGGCTATAAGGATGAAAGCGGCAAATGCAAAGGTTTTGA
TATTGATTTGGCTAAAGAAGTTTTTCACCAATATGGACTCAAGGTTAACT
TTCAAGCTATTAATTGGGACATGAAAGAAGCAGAACTAAACAATGGTAAA
ATTGATGTAATCTGGAATGGTTATTCAATAACTAAGGAGCGTCAGGAAAA
GGTTGCCTTTACTGATTCTTACATGAGAAATGAACAAATTATTGTTGTCA
AAAAAAGATCTGATATTAAAACAATATCAGATATGAAACATAAAGTGTTA
GGAGCACAATCAGCTTCATCAGGTTATGACTCCTTGTTAAGAACTCCTAA
ACTGCTGAAAGATTTTATTAAAAATAAAGACGCTAATCAATATGAAACCT
TTACACAAGCTTTTATTGATTTAAAATCAGATCGTATCGATGGAATATTG
ATTGACAAAGTATATGCCAATTACTATTTAGCAAAAGAAGGGCAATTGGA
GAATTATCGGATGATCCCAACGACCTTTGAAAATGAAGCATTTTCGGTTG
GACTTAGAAAAGAAGACAAAACGTTGCAAGCAAAAATTAATCGTGCTTTC
AGGGTGCTTTATCAAAATGGCAAATTTCAAGCTATTTCTGAGAAATGGTT
TGGAGATGATGTTGCCACTGCCAATATTAAATCTTAA
>M28_Spy0661 two component system histidine kinase
TTGTTTATTAGAAAAATAGGAGGTGACATGTTTAATCGTATCCGTATTCG
TTTTATCATGATTGCTTCTATTGCCATTTTTATTATTTTAAGTTCAATTG
TTGGTATTATTAACACGGCACGCTGTTACCAAAGTCAACAAGAAATTAAC
CGTATTTTACATTTAATTTCCTCAAATAAAGGTAAATTACCTGGCACTAC
GGAAAGCTCTAAACGACTTGGAACGAAACTGTCTGAAGATAGCCTAAGCC
AGTTTCGGTATTATAGTGTCATTTTTAATGCTAATGGACATCTACTTTCT
TCTAATACTGCTAATATTTCAGCTTTAGATAGAGAAGAAGCCCAATATTT
TGCTAGACTTTTTGCTAAGTCTGGGGAAGAAAAAGGCAGTTACCGTCACC
AAGATAGTGTTTATTCGTACTTGATTACTCAGCTGCCAAATGAAGAAAAA
CTGGTTGTAATTTTAGATACTACCTTTTATTTTCGTAGTGTAGGAGATTT
ATTAGCTGTTTCAGTGATGTTGGCCTTTGGAGGATTTATCTTTTTTGTTG
TTTTAGTGAGTCTTTTTTCCGGTATGGTCATCAAACCTTTTGTCCAAAAT
TATGAGAAGCAGCGTCGCTTTATTACTAATGCAGGCCACGAGTTAAAAAC
ACCACTAGCCATTATCTCAGCCAATAATGAATTGGTCGAATTAATGACTG
GAGAATCAGAATGGACCAAGAGTACAAGTGATCAGGTGAAGCGATTGACA
GGCTTGATTAATCAAATGATTACTTTGGCTCGTTTGGAGGAACAGCCAGA
TGTGGTATTACATATGGTAGACTTTTCAGCTATTGCTCAAGATGCAGCTG
AAGATTTTAAGAGTCTGGTTTTGAAAGATGGTAAACGTTTTGATTTGACG
ATTCAGCCGAATATTATGATTAAAGCGGAGGAAAAGTCATTATTTGAACT
TGTGACAATTTTAGTTGATAATGCCAATAAATATTGTGATCCTAAAGGCT
TGGTCAAGGTATCTTTAACCACTATTGGAAGAAGACGAAAACGAGCGAAA
TTAGAAGTTTCTAATACCTATTTGGAAGGAAAATCCATTGATTACAGCCG
CTTTTTTGAACGCTTTTATCGTGAAGACGAATCCCATAATAGCAAAGAAA
AAGGCTATGGAATTGGTTTATCTATGGCAGAAAGTATGGTTAAGTTATTT
AAAGGAACGATAACTGTAAATTATAAAAACGATGCTATTGTTTTTACAGT
GGTGATTTAA
>M28_Spy1347 two-component sensor kinase
TTGATGAGTGTTAAAACATTGGGAAGGTATGTGACTAACCACTTTAAGCA
GGGTTTTTTGATTAATCGACTGATGAAATTATATAGCCTGCTAATTGTAA
GTTTTTTCACTTTAGCAGCTATTGGCTTGAGCAGTTATTCTATTAGTAGT
ACTTATAAAAGGGTGGATGCTGAGGCGCAGATGCGACTGGAGGAGACTCT
AGGTAGATTGCAGTTACAAAACGATATTACCCTACGGGTTTTAGACCAGT
TGGTTGGCCGTTCAGAAGATTACCATAACCTCTATCAATATATGACGTTA
ACCCCAAACCAATATTTTTCAAACGTTTTTGAAGACTGGGAAAAAGGAAA
AGACACGGTCCTATTTTCTGAAGAGGTGAGGCGTCTTTTTGACTTGTACC
CTGATGTGACTTCTATGACCCTACTGCTAGAGGACAGTAGTGCTTATCTG
TACGCCGATAGGGTCATTAAGACGGGTCGTTTGCTTTATAGCAAGCCTGA
AAAAGTAACCGGAAATGTTTTAGTTCGCTCCATTCGAAATCCAGAATCAG
GAGATGTGACAGGTCGTCTTTACCTGACCTTTGACAAACCACCGACTTTG
GTAGAGACACAGCAGGATCACTATTTAGCTACTTTTGCTTTTGATTACTA
TGGCCGCAAACTCTTCCATCAAGGAGGTCGGAGATTTCCTCATTTAGAGG
CTGAGGTTAAAAAGGCTATCAAGGCAGATCGGGCAGCTGATCTTAGTAAT
CTCAGCAAGGCTTATCGGATGCAGTACAATCGCTCGGGAGACCTCTTAGC
TTATGTGGCTGTCAGAAAATCCTATTTATTAGCGGAAGCTGTCAGGACAG
TTTTTGTGTATGGCCTTGTTTCTCTACTCTTAGCTTGGCTGTTATTGCAG
TTGCTCTTTAGGGTTTTCCGAAATTATATCCAGCAGGTTTCTGAAATTAC
GGATACTGTTGAAATGGTTGCAGCAGGCGATTTGTCTTTAACCATCGACA
ACAGCCACATGGAATTGGAACTGTATCATATCTCAGAAGCCATTAATCAG
ATGTTGGCCAGCATTAAAGCTTATATTGACGAAGTTTATGTGTTAGAGGT
AGAGCAACGAGATGCCCAAATGAGAGCTCTGCAGTCTCAAATCAACCCTC
ATTTTTTATACAACACGTTAGAGTATATTCGGATGTACGCCCTTAGTTGT
CAACAAGAAGAATTAGCAGATGTCATTTATGCCTTTGCGAGTTTGCTTCG
CAACAATATTAGCCAAGATAAGATGACCACCTTAAAAGAAGAACTGGCTT
TTTGTGAAAAGTACATTTACCTCTACCAAATGCGGTATCCAGATAGCTTC
GCTTATCATGTAAAAATTGATGAGAGTATTGCTGATTTAGCCATTCCTAA
ATTTGTCATTCAACCTCTCGTTGAAAATTATTTTGTGCATGGGATTGATT
ATAGTCGCCATGACAATGCACTAAGCATCAAGGCATTAGATGAGACGGAT
CATCTCTTGATTCAGGTGCTTGATAATGGACGTGGTATTAGTCAAGAGCG
CTTAGCAGATATGGAAAAAAGGCTTCAAGAGCACCAAACAACAGGCAATA
GCTCTATTGGTTTGCAAAATGTTTACCTCCGTCTTTTCCATCATTTTCGA
GACAGGGTTTCTTGGTCCATGGCTAAGGAGCCAAATGGTGGCTTTATCAT
TCAAATTAGGATTAGAAAGGATGTTTAA
>M28_Spy0660 two-component response regulator
ATGAAAATTTTGTTAGCTGAAGACGAATGGCAGATGTCTAATGTTTTGAC
AACTGCCATGACTCATCAAGGTTATGACGTTGATGTGGTTTTTAACGGTC
AAGAGGCAATTGATAAAGCTAAAGACAATGCATATGATATTATGATTTTA
GATATCATGATGCCGATTAAGTCTGGCATTGAAGCTTTAAAGGAGATTCG
CGCTTCAGGAAATTGCTCACATATTATTATGCTGACGGCTATGGCAGAAA
TTAATGACCGTGTTACTGGACTAGATGCGGGAGCTGATGATTATCTGACT
AAACCGTTCTCATTAAAAGAACTTTTAGCTAGATTAAGGTCGATGGAAAG
ACGAGTAGAAAGTTTTACTCCTCAGGTATTACAATTTGCTGGTGTCACAT
TAAATATTAATGAGCAAGAATTGAGTGCCGGTAATGCTATACGATTAGCT
TCTAAAGAAGGTAAATTAATGGCCTTTTTAATGTTAAATCAAGGAAAGTA
CTTGGATACTAAAACACTTTACCAACATGTTTGGTCAGACCAAGAAGATT
ATGATACTTCTATTGTTTGGGTTTATATTTCTTATCTTCGTCAAAAATTA
TTAGCTATTCAAGCAAATGTCATTATTGCAGGTGATAAAGATACTAGCTA
TTGTTTATTAGAAAAATAG
>M28_Spy1299 hypothetical cytosolic protein
GTGGCAAAACAAAAAAATCGTAAAAAAGCATTGAAGTTAGAAATGAAGCG
TAATGGCTTGTTAAAAAAAGCAGGTCAAGTTTTTGATAAGGCAGTTGAAA
GTGTTGAAACAGCCGTGGATAAAACCATTTCTGCTGGTAAAAATCTTGTG
GAAAAAGGCAGCCAAACGGTTGAAAACCTGACAGCAAGCAAGGAAAGACT
TACTCTTGATGAGTTTGCAGGGCAGCCAGTTGTAGCTGGTATCCGCTCTG
ACCTTGTCGAAACCCTATATGCAGAAGGCATCCATTCAGCGCAAGCTTTT
AAGGAGTGGACAGAAAAAGACCTCCTTGCTCTTAAGGGCATTGGCCCAGC
AACGGTTAAAAAATTGGTCGAAAATGGCGCAAGCTTTAAAAAATAG
>M28_Spy0434 hypothetical membrane associated protein
ATGTTTATGATGGATAAAACTGTTTTATATTTTGGGTTGGTTGAAATTTC
TTTTGATGTGCCTGACTTTATATTTCAAAAAATAAAAGAGCAGAATAATA
AAATTAGATATTATAGCAAATCAATAAATATATTAGGTAGTGTAAAATTT
ATTAACAGCAATCAGCAACTTATAGAATATGATGGCAATGGAAATATTTT
AGTTTATGGAAGATTAAAGTATTTTAAAGAAGGAATTTCATTATACTACA
TTGGAGAGTACTTAGCTGAATGTCTCTTGATTGAACATAGTGACACCTTA
TTAATTCATGCAGCAGCAGTTTATAATCCTTTATCTGGCCATTCAATTTT
ACTATTAGGAGATAAAGGTGCTGGAAAAACTACGGTTGCAATAAGGCTGT
GTATAGAACATGGGTATCATCTTATTGGTAATGACCAAGTAATATTTGGT
TCGAACTCTGGAATACTACTAACTTATGCAGGGACATCTTTCTTTAAAAT
AAGAAGGACAGCTGTTTTGTCGGACAATTTACTGTTTAAATTATTTAGCA
AATTTTTTAACCGTTCATTACAATTTAATAAGGCAAGTTGGGATGATAAA
ATTTCAATTTTCCCAAAGGAGTTGGGAATACGAACTTGTAATTTTTCTAC
TGAAATCTCAAAAATTTATTATATAAAGACAGACAAGAAAGAAAAGCAAA
TTTATCATTCAATTTGGAGTGATAGTTTAGCAAGTCTATATCTAAATGAG
CTATTGGGAAGGCATATTTCTGGACAGGTTGCATGTTTTCAATCAGATAA
TGGAAAATATTTTTCTACAATGCCTTTGATAAATTATGAAAAAAATAATC
GGGTACGAGAACAGATAGTGAAGGGTATTTTCGCTAAACAAAAATTATTT
AAAATTACAGCAGCTACGCCAGCTAAGATTGCAGAAGCGATTATAGAAAA
TGTTAAGAAAAACTCATAG
>M28_Spy1064 transcription antiterminator, BglG family
ATGTTATCAAAAAAAGAACTGGCCATCATAACATTTCTAATCCATCACAA
AGAGCAGTTTGTCTCTAGTGCAACTCTGGCTGAGGTTATTGGTATGAGTG
ACCGTACGGTTAGGAAATACCTCAAAGAACTGATCAGTAGCCTTCCTGAA
CACGGAGCTCACATCATTTCTAAACAAGGTCGAGGTTACTGCTTAGAAAT
TGACCACTCTATGGCATTTGACATCTTTTGGCAAGAAAGTGTGACGTCTA
AAAAACGTTTAGCAGATGTGACTCAAGTGGAAGAATCGGTTGATCGAGAA
GATTATGTGCTTCATAAATTCTTTTTTGAAGATGCCGTTCAGGATTTTGA
AGAGCTTTGTCAAGAATTGTATATCAGTCGGACAACTTTAAAACATGTTT
TAGCAGGCATTAAGGAGCGCATAATACCTTACCAGTTAGAGCTTGAAATA
ACTCACCAACATATTCAAATAAGAGGTAAAGAAGAGGACATTAGGCATTT
TATCATGGATTATTTTTTTGTTACTAGTTTTGATAACACCTTGTCCACCA
TGGTAGGTAATACCTTTCTTGAAGGTATTAATTTTGCAGAAATCATGATT
ATTGTCTTGGATGAATGTCGGGATGCTAAGTTGAAACTTTCTGATTTTGT
CATGAATAATCTAGTCTTGCATATTGCCCTAATGGTTCAGCGTATTCGAT
CGGGGTGTCCATTAGAACTGTTTTCCATTCCAATAGCTATTCGTCAGTCT
GATGAGTATCAAGTAGCTCTGCGCATTTTGTATCGAGTGGAAGAAGTGAT
GGGGATACGTTTTCCTAAAGAGGAGGCTAATTATATTGCACTGCATCTAA
AGGTCAAACATTCTGTTGGTAAGCATTGGCAAGATGATAATACCGATGAA
AAGTTGCAGGACCATTTAAAAGCATGTATTGCCAAGATTAGTCAATTGAC
AGGCATGACTTTAGAAACAGATACCAATTTATTTCAAGGTTTATTAGCCC
ACATGATGCCCTTGACCACACGTCTTGAAAACCATATTCAGCTGACTAAT
CCTTTAACTGAGGAAATTAAAAGCCAGTATCCTGAAATATTTACCCTTAC
CAAGCAGACCTTTTCGGATTTGCTTGTATGTCAAAAGAATGATGTCTCAG
ATGATGAATGGGCTTATATTAGTTTGCATTTAATGGCGGCCATTGAGCGT
TATTCAAACCGTCATAAATTGAGGGTTCTAGTAGTTTGTGCCACAGGTTA
TGGTAGTGCCATGATGTTGAAAAATCGCTTGGAAAAGGAATTTGAAGGAC
GTTTGCGTATTGTCGATGTTATCAGTTACTATGAAATAACCGAAGAGCGA
CTGAAAACCGTTGATTTGATTATTTCCTCTATCAGCCTTGCCAATCTGAT
GTTTTTAACACCAGTGATTACTGTCAGTGTTTTTTTGTCAAATCAGGATA
TTGAAACTATTCGACAATTTATTGGAGAACAAGAAGGTATCAAGAAAGAG
GTCAGTTTACCGTCACAGATGAGTTTAGCAAAAGCAGAGCAGCTTCTAAC
AGGTGTTTTTAGCCCTAATCGTTTTCTTTATTTAGACGAGAAAATCTCAA
AGGAAGACTTGCTTTTACGGATGATTGCTTGTCTTGACGAGGCGGGAACA
GAAACGTTTGTAGAGGACTTTTATCATCAAATGGTACTGAGGGAAAATTA
CAGCCCAGTCATCTATGGAGAAGTGCTTGCCTTTCCGCATCCTGCTAATC
CCATGACTTATTCTGAACAGGTAGTAGTGGCTATTTGCCGAGAGCCTCTT
GAGTGGGACAAGGCGCATCAAGCTGTTCATTTTGTCTTTCTATTATCCCC
GTCTAAAGGGCATAATCATAGGTTAAAATATGTATCACCAGGTTTGGCAT
CTTTTGTCAATCAGGTGGAGCTTCAGCAAGCGTTACTAGAAGAACCAAAT
TATTCCAAATTCATGACAGTGTTTACCCCACTTATTCATGATTAA
>M28_Spy0148 PTS system, 3-keto-L-gulonate specific IIA component
ATGAATTTAAAACAAGCCTTTATTGACAACAACTCCATCCGATTGGGGCT
AAGTGCTGATACTTGGCAAGAGGCTGTTCAATTAGCTGTTCAACCTTTGA
TTGATAGCAAAGCAGTGACGTCAGCTTACTACGACGCCATCATTGCATCA
ACAGAAAAATACGGCCCTTATTATGTGTTGATGCCAGGTATGGCTATGCC
CCATGCAGAAGCAGGTTTAGGCGTTAATCACAATGCATTTGCTTTGATTA
CACTAACAAAACCAGTTACCTTCTCAGATGGTAAAGAGGTTTCTGTTCTT
TTGACGTTGGCCGCTACAGACCCTTCTATTCACACAACAGTGGCTATCCC
ACAAATTGTGGCCTTGTTTGAACTAGATAACGCCATTGAACGCTTGGTGG
CCTGCCAAAGTCCTAAAGAGGTTCTAGAAATGGTAGAAGAATCAAAAAAT
AGCCCGTATTTAGAAGGTTTGGATTTAGACTCTTAA
>M28_Spy0112 transcriptional regulator, AraC family
ATGGTTATATTCGATTTAAAATATGTGCAAACATTACACAGCTTGTCTCA
ATTACCTATTTCAGTGATGTCACAAGATAAGGCACTTATTCAAGTATATG
GTAATGACGACTATTTATTATGTTACTATCAATTTTTAAAGCATCTAGCT
ATTCCTCAAGCCGCACAAGATGTTATTTTTTATGAGGGTTTATTTGAAGA
GTCCTTTATGATTTTTCCTCTTTGTCACTACATTATTGCCATTGGACCTT
TCTACCCTTATTCACTTAATAAAGACTATCAGGAACAATTAGCTAATAAT
TTTTTAAAACATTCTTCTCATCGTAGCAAAGAAGAGCTCTTGTCCTATAT
GGCACTTGTCCCACATTTTCCAATTAATAATGTGCGGAACCTTTTGATAG
CTATTGACGCTTTTTTTGACACACAATTTGAGACGACTTGCCAACAAACA
ATTCATCAATTGTTGCAGCATTCAAAACAGATGACTGCTGATCCTGATAT
CATTCATCGCCTTAAGCATATTAGCAAAGCATCTAGCCAATTACCGCCTG
TTTTAGAGCACCTAAATCATATTATGGATCTGGTAAAGCTAGGCAATCCA
CAATTGCTCAAGCAAGAAATCAATCGCATCCCCTTATCAAGTATCACCTC
ATCTTCTATTTCTGCTCTAAGGGCGGAAAAGAACCTCACTGTTATCTATT
TAACTAGGTTACTGGAATTCAGTTTTGTAGAAAATACTGACGTAGCAAAG
CATTATAGCCTTGTCAAATACTACATGGCCTTAAATGAAGAAGCGAGTGA
CTTGCTCAAAGTTTTGAGAATTCGCTGTGCAGCTATCATCCATTTTTCCG
AATCATTAACCAATAAAAGTATTTCTGATAAACGTCAAATGTACAATAGT
GTGCTTCATTATGTCGATAGTCACCTGTATTCCAAATTAAAGGTATCTGA
TATCGCTAAGCGCCTATATGTTTCCGAATCTCACTTACGTTCAGTCTTTA
AAAAATACTCAAATGTTTCCTTACAACATTATATTCTAAGTACAAAAATC
AAAGAAGCTCAACTACTCTTAAAACGAGGAATTCCTGTTGGAGAAGTGGC
TAAAAGCTTATATTTTTATGACACTACCCATTTTCATAAAATCTTTAAAA
AATACACGGGTATTTCTTCAAAAGACTATCTTGCTAAATACCGAGATAAT
ATTTAA
>M28_Spy1444 PTS system, galactose-specific IIA component
GTGTTTCCTAATATTCTATTTACTGAAGCAAGGACGCAGCCAGAGCTTTT
TGATCTTGTTGCTAGCTACTTGGAAAAGGTTGGGTATGTGACGCAAGAGT
ATCATCAGGCTTTAGTGGAGCGTGAGGCGGTATTTCCGACAGGACTCAAA
GTGGACCTCAAAGATGGGTCAGATATTTTGTATGCGGCTATTCCGCATAC
AGAAACCAAGTATTGCTTGGTTGATCAAGTGGTCTATGTTAGAAATAGTC
AAGCCCTTACCTTTAAGCACATGATTAATCCAGAGGAAGACTGTTTGGTA
ACGGATTTCTTCTTTATTATCAATAGTCAAAACGAGGGTCAAACGACGAT
TCTATCCAATCTCATTACCTTCTTTATTACGAAAGGCAATCTTAGCTATC
TAGCCAGTCTAAAAGATGATAAACAAGCTATTTCAAACTATTTAATAGAA
AAAGGAGTGTTTCAGCATGATTAA
>M28_Spy0464 stress-responsive transcriptional regulator PspC
GTGGAAACTAAATTCTATAAACAGCGAAAAAATCGCTTGGTTGCAGGTGT
TATTGCTGGTTTAGCAGATAAGTATGGTTGGGATCTTGCTCTAGCGCGTG
TCTTAGCGGCTCTTCTTATTTACGGAACTGGTTTTGGAGTTTTGCTTTAT
ATTTTGTTGGCCATCTTCTTACCTTACAAGGAAGACTTGCTTGAAGAACG
TTATGGCCGAGGTCCTCGTCGTCGTAAAGACGCTGATGTCTTAAATGAAG
AAGAAGATGGCTGGTTCTGGTAA
>M28_Spy1228 phage protein
ATGATAGATTTTGTACAAATTGGTGCTTTTTGTGGCGCTGCTTTGTCTAT
CTTGGGTGTTTGGGGATTTATCGTCAATCCCTTTAAAAAAGCCATGGAAG
CTAATGAGTTTGCCATGGCTCAACTCAAGGACTCAATTAAGGAGTTAGCT
TATGAGCTTAAAAATCTTGACCGTGACCGTGAGATTACCAAAAAAATTAT
CGACCGCCACGAAGAGCGTTTAGGTCGTGTCGAAGATGAAGTCATTATTA
ATAAGGAGCGTATTGTCACGCTGTTTAAAAAAGGAGAAGAAAAATGA
>M28_Spy1337 transcriptional regulator, AraC family
GTGGTAACTCATATGATTGATTCTTTATTGTTGAAATCATTACACAGTCT
TCTAGGTCTAACTATTACTGTTTGTGATCAAAATTTTTCTGTTATCAGAG
AGTATAAATCCGATAAAACTATTTCACTTTTTTACAATCATTACCTTATT
TTAAGTAACTTTAGTAAAACTCAACATGATTTTTTATTTCATTATGGCTC
TTTAGGAGAACTTTTTCTTGTCCACCATATTCAACAATATTATATTATCA
TCGGTCCCTGGCGTAGCAATGCTATTGATCCTTTACTTCTTAAGAAAAAG
CTGACTGAAACACAAATCAATGCTAGTGAACAAGACTACTTTATTGATAG
ACTATCCCAATTACCTTTCTTCTCACTTAGTCAAATCCGAGAATTACTAA
TAGTAACCAATTATTGTCTAACTGGGGTTGTGAAAGATAAATTATCAGAG
CCCTTACATTACTACACGAAAGGGTGGAGCAACTCCTTTGATCTAGATAA
AATTAAGCAATTTTCTAAACAGAATATGAGTTCTTACAAATATCAGTATC
ATTTTGAAAATAATATTCTAAAAGCTGTTAAATCAGGTAGTGAATTTCTT
TTGAAAGAAACAGTGGAACACTTTAGCAATTCTATCGTACCTATAATCAG
TGGAGATGAATTGCGATCTGAAAAAAACTACTCCATCATTATTTATGATC
GTCTCTCACAGGCTACCATCCAAGCAGGACTTGATATCGAAACAGCTTAT
CGAGCACGAGATCGTTTTATAAAAGAAACCGAGTCAACTATAAGTCTAAA
TGAAGTTTTAAAATTACGTGATACTGCTATCTTATTCTATACTCAACAAG
TTGATTCTTTAAAAAGACATCTCGAAACCCCTCATTCTCAAACTATTGTC
GCAGTGATTCGATATCTTGAAAATAATCTAAATCGCTTTATTAAAACAGA
AGAAATAGCTAAAGAATGTCACATGAGTGAATCGAAGTTACGAAAACTAT
TTAAGCAAGAAAAACACATCACTATTCAACAATATTTTATAAACTTAAAA
ATCGAAGCTGCTAAGCAGTTACTAGACGAAAATAAGAAAGTAGAAGAAGT
TTCCAATTTACTTGGATTTTCCACTTCTTCTAATTTTTCAAGGACATTTA
AAAAAATAGTGGGAATTAGCCCACTAGAATATAAGCAAAAGCTTAAGACA
ATATAG
>M28_Spy1812 phage protein
ATGAGCAAGAAGAACGCTATTCGTAAGCTGAAAGAATTTCATAGATGGCA
ACGTATCGCTAATAGCCTTGATTTAACTTATACCGAGCTTTACCAGTTTG
ATATAGAGTACCATCCCACGCGCAGAAAACACCTTGAAATAAGCCGAGAA
TGCGCCCTAGAGGAACTAGACGCTATTAGGTATGCCATTAATCAACTGTC
TAAAGTAGAATATAGACAAATACTAATTGAGTGTTACTTGATCAGTGAGG
AAAAAACTCAACAAGACATTATGGAAGAACTTAACAGAAGTCAAAGCTGG
TATTATGAATCTAAGAAAAGAGCCTTGCTTGAGTTTGTGGAATTTTACAG
AGACGGGGCGCTAAAAAATAATGTTCGCTTATGA
>M28_Spy0953 cfa, cAMP factor
ATGAAACCCAAACACCTTCTCTGTCTTTCAACAGTTGTTGCTGGATTAGC
TTTATTTTCAACTATGACGCACTCAGTTTTAGCTGATGATGCTTCAAATC
CCGATACTATTTTAATGAATAACAACCAAGCGAATCTTCAAAGAGACGCT
CTAGTGCAAAAGCTTGATGAGGGACATCAACAATTAGAAGCTATTAAACA
TGAAGCTAAAGGTACTGATATTGAGGCTACTGTTAACAAAGCTATCGATG
CTGTTGATCACATGAAGAGTTCTATACGCTTCAATACTGAAACGATCTAT
GATTTTAGTTCAATTGGGGCAAGAGTAGAAGCATTATCAGATGCTATCAA
AGCAATCGTATTTTCCACAACCCAATTAACTCACAAAGTAGAAAAAGCGC
ATACTGATATGGGGTTTGCTATTACTAAATTAGTCATTCGTATTATAGAT
CCATTTGCATCTGTTGACGCTATCAAAGCTCAAGTACAAGAAATTAAAGC
ACTTGAGGAAAAAGTTATCAATTATCCTGATTTACAGCCAACAGACCGTG
CTACTATCTATACTAAAGCTAAACTAAATAAAGCTATTTGGAACACTCGT
TTAGAAAGAGATAAAAAGGTTTTAGGGATCAAATCATTTGACGTTTATAA
TAGACTTAACAAAGCTATCACACATGCGGTTGGTGTCCAACTAAATCCGA
CAACCACTGTTCAACAAGTTGACGATGAAGTTATTGCTGTGCAAAATGCT
TTGGAAACAGCTCTTAAGTCATAG
>M28_Spy0919 ciaH, sensor protein
ATGAATAAATTAAAAAAAGAGATTTTATCAGATAACTATAACCACTTTTT
TCATTTTTTTGCGGTTTTTACAGGTATTTTTGTCATTATGACTATTATTA
TCTTACAGATTATGCGGTTTGGCGTTTATTCGTCAGTTGATAGTAGTTTA
GTTTCTGTTAGTAATAATGCAAGTAGCTATGCTAATCGTACGATGGCTAG
AATATCTTCTTTTTACTTTGATACTGAAAATAACATTATTAAGGCGCTGC
CTGATTCAGATAGTTCTAAGTTATTAGGAACGCCTGCAGCTAATACAGAT
ATCATTTTGTTTAGTGCTAATGGAACAATTTTAAATGCTTTTGATGCGTT
TTCTAACTATCAAAATTTTCATTTAGATAAACGCCGGTTGGGGAGTATTG
AAACCACCAGTTTAATGAATTTTTATGGACAAGAAGAAAAATACCATACG
ATAACTGTAAGGGTTCATATCAAAAATTATCCTGCAGTTGCCTATATGAT
GGCAGTAGTAAATGTGGAACAATTAGACCGCGCTAATGAACGTTACGAGC
GCATTATTATTATAGTTATGAGTGTTTTTTGGCTAATTTCTATTTTAGCA
AGTATTTATTTAGCCAAGTGGAGCAGAAAACCTATTTTAGAAAGCTATGA
AAAACAAAAAATGTTTGTTGAAAATGCTAGTCATGAACTAAGGACCCCTT
TGGCGGTCTTACAGAATCGTCTGGAATCGCTTTTTCGTAAGCCCAACGAA
ACGATATTAGAAAATAGTGAGCATCTCGCTTCTAGTTTAGACGAGGTTCG
CAACATGCGCATCTTAACAACTAATTTATTAAATTTAGCAAGACGAGATG
ATGGCATTAATCCACAGTGGACTCATTTAGATACAGATTTTTTTAATGCT
ATTTTTGAGAATTATGAACTAGTTGCTAAAGAATATGGAAAAATATTTTA
TTTTCAGAACCAAGTCAATAGATCGTTAAGAATGGATAAGGCTTTACTAA
AACAATTAATAACGATTTTATTTGACAATGCTATTAAATATACAGATAAA
AATGGTATTATTGAAATTATAGTGAAAACAACGGACAAAAATTTATTAAT
TTCTGTTATTGATAATGGTCCAGGGATAACAGATGAAGAAAAGAAAAAGA
TTTTTGATCGTTTTTATCGAGTTGACAAAGCTAGAACACGGCAAACAGGT
GGATTTGGCTTGGGGTTGGCTTTAGCTCAGCAAATCGTGATGTCTTTAAA
AGGAAATATTACAGTAAAGGATAATGATCCTAAAGGTAGTATTTTTGAAG
TCAAATTATAA
>M28_Spy0920 ciaR, transcriptional regulatory protein
ATGATAAAAATATTATTAGTAGAAGATGACTTGAGCTTATCAAATTCCAT
TTTTGATTTTTTAGATGATTTTGCAGACGTCATGCAAGTTTTTGATGGCG
ATGAAGGTTTATACGAAGCAGAAAGTGGTATTTATGATTTGATTTTGTTA
GACCTTATGTTGCCGGAGAAAAATGGCTTTCAAGTCTTAAAAGAATTGCG
AGAAAAAGATATTAAAATTCCTGTATTGATCATGACAGCTAAAGAGGGTT
TAGATGATAAAGGTCACGGATTTGAATTAGGTGCTGATGATTATCTGACA
AAGCCGTTCTATTTAGAAGAGTTAAAAATGCGAATTCAAGCACTGTTAAA
AAGAACAGGGAAATTTGCAGATAAAAATATTAGTTTTGGCAATTTAGTGG
TCGACTTAGCTCGAAAAGAGGTGAAGGTTGAAGGGAAAGTAGTTGAATTA
CTTGGCAAAGAATTTGATTTGTTGGTGTATCTTTTGCAAAATCAAAACGT
TATTTTACCAAAGACACAAATTTTTGATCGTTTATGGGGATTCGATAGTG
ATACTACGATTTCGGTTGTTGAAGTTTACATTTCTAAAATAAGGAAAAAA
TTAAAAGGTACCCGTTTTGTTAACAGGCTTCAAACTTTAAGAAGCGTAGG
GTATATTCTAAAAAACAATGAATAA
>M28_Spy0274 covR, response regulator
ATGACAAAGAAAATTTTAATTATTGAAGATGAAAAGAATCTGGCTAGATT
CGTTTCTCTTGAGCTGCAACATGAGGGTTACGAAGTCATTGTTGAGGTCA
ATGGTCGTGAAGGGTTAGAAACTGCTTTGGAAAAAGAGTTTGATTTAATC
CTGCTTGACTTAATGTTACCAGAGATGGATGGTTTTGAAGTGACCCGTCG
TTTGCAAACCGAAAAAACAACGTATATCATGATGATGACTGCGCGTGATT
CTATTATGGATGTGGTTGCAGGTTTAGACCGCGGTGCAGACGACTATATT
GTTAAACCGTTTGCCATTGAAGAACTACTTGCCCGTATTCGTGCTATTTT
CCGCCGTCAAGATATTGAATCTGAGAAGAAAGTGCCTAGTCAAGGCATTT
ATCGAGATCTAGTTTTAAATCCACAAAACCGTTCAGTTAATCGTGGCGAC
GATGAGATTTCTCTCACTAAACGTGAATATGATTTGCTTAATATTTTGAT
GACTAATATGAATCGTGTCATGACACGTGAAGAATTATTGTCAAATGTTT
GGAAATATGATGAAGCCGTTGAGACTAATGTTGTAGATGTCTATATTCGT
TATCTCCGCGGCAAAATTGACATTCCAGGCAAGGAATCTTATATCCAAAC
AGTGCGTGGCATGGGATACGTTATTCGTGAGAAATAA
>M28_Spy0275 covS, CsrS
ATGGAAAATCAGAAACAAAAACAGAAGAAATATAAAAATTCGTTACCAAA
ACGACTATCTAATATCTTTTTTGTTCTTTTTTTCTGCATTTTCTCTGCCT
TTACACTGATTGCCTATAGTTCAACAAACTATTTCTTATTGAAGAAAGAA
AAGCAGTCAGTCTTTCAAGCTGTAAATATTGTTAGAGTTCGTCTTTCTGA
GGTGGACTCTAATTTTACATTAGAGAACTTAGCAGAAGTTTTGTACAAAA
ACGATAAAACACATCTGAGAATTGATGACAGAAAGGGCAGTCGAGTCATT
AGGAGTGAGCGCGATATCACAAATACTCTAGATGCGAATCAAGATATTTA
TGTCTATAACATTGATAAGCAGATGATTTTTACCACAGATAACGAAGAAT
CATCTCCTGGCTTGCATGGTCCTATCGGTCGGGTGTATCACGACCATATC
GAAGATCAGTATCGTGGGTTTTCCATGACACAAAAGGTATATTCTAATCG
GACTGGAAAATTTGTGGGCTATGTTCAAGTCTTTCATGATTTAGGCAATT
ATTATGTCATTAGAGCAAGACTGCTGTTTTGGCTACTAGTTGTTGAGTTA
TTTGGCACAAGCTTAGCCTATTTAATCATCTTAATTACTACGCGGCGCTT
TTTGAAGCCTTTACACAATTTACATGGAGTAATGCGTAATATCTCTGAAA
ATCCTAATAATTTAAACCTGCGCTCAGATATTTCGTCAGGAGATGAAATC
GAAGAATTGTCTGTTATCTTTGACAATATGTTAGACAAATTGGAGACACA
TACTAAGTTGCAATCACGTTTTATTAGTGATGTCAGCCATGAATTACGAA
CACCGGTTGCGATTATTAAAGGGCATATTGGTCTCTTACAACGTTGGGGT
AAAGATGACAGTGATATTCTTGAAGAAAGTTTGACAGCAACAGCGCATGA
GGCTGACCGTATGGCAATCATGATTAATGATATGTTAGACATGATTCGCG
TACAAGGCTCATTTGAGGGACATCAAAATGATATGACAGTTTTGGAAGAT
TCTATTGAAACTGTTGTTGGTAATTTTAGAGTTTTAAGAGAAGATTTTAT
CTTTACATGGCAGTCAGAAAATCCAAAAACGATAGCCCGTATTTATAAAA
ATCATTTTGAGCAGGCTTTGATGATTCTTATTGATAATGCTGTGAAGTAT
TCCCGTAAAGAAAAGAAAATCGCGATTAACCTTTCAGTGACTGGCAAACA
AGAAGCTATTGTTAGAGTTCAAGATAAAGGCGAAGGAATTTCTAAAGAAG
ATATTGAACATATCTTTGAACGCTTTTATAGAACGGATAAATCACGTAAT
CGAACAAGTACTCAGGCTGGATTAGGGATTGGCTTGTCTATTCTCAAGCA
AATTGTAGATGGGTATCATTTACAGATGAAGGTTGAAAGTGAATTAAATG
AAGGTTCAGTGTTTATCTTACATATTCCTTTGGCCCAGTCTAAAGAGAGT
TAG
>M28_Spy0807 dpiA, transcriptional regulatory protein
ATGAACGTTTTAATCATTGAAGATGATCCTATGGTGGATTTTATCCATCG
CAATTACCTCGAAAAACTAAATCTTTTTGATCGCATTATATCCAGCGACT
CTATGAAAGCTGTTCAAAGCATACTTACTGATTACGCAATTGACCTCATT
TTACTGGATATTCATATTACAGATGGCAATGGGATTCAATTTTTGGAGAA
ATGGCGTGCTCAGCATATTCCTTGCGAAGTCATTATTATTTCAGCCGCAA
ATGATGGGAATATTATCCGAGATGGTTTTCATTTAGGAATTATCGACTAC
CTCATCAAGCCCTTTACCTTTGAACGCTTTCAAGAAAGCATCCAACAGTT
TGTTACGCATCGAGAACATTTGGCCAATCAGCAACTAGAGCAGGCCCAAA
TTGACCAACTGAAATGTTTGACTAGCAAAAAAGACACTAAAAACAAACAA
TTGTTAGAAAAAGGCTTATCTGAATCCACTTTCCAGTGGATTATAGAAAA
TATCAAAGCCTTTGATCAACCTTTTACTATCCAAGAATTAGCTTCCGCTT
GTCACTTATCCCATGTCTCTGTCCGTAAATACATTGCTTATTTAGAAGAA
AATAAGCAACTGAACAGCCAACAAATTTTTACCAAGGTTGGTCGTCCCTA
TCGCGTGTACTGGTGA
>M28_Spy0808 dpiB, sensor kinase
ATGAAAAAACCACTACGTTTATGGGCCAGTTTATCGTTGATTTTGGTATC
TATGATTGTTGTCACAACCTCCCTATTTTACGGGATTATGCTACATGATA
CGCACCAATCCATCAAAAATCAGGAAACCCATTTGCTAACGTCAACTGGA
AAAATGTTAGCAAGTCATCAAGCAATTAAAGAATTACTCCTAAACAACCA
ACCAAATGCTAAAACAACAGCCTATACCAACTCCATTGCCTCCATCTATA
ACCTTGATTATGTGGTCGTGATGAACATGAAAGGGATTCGACTCACCCGT
CCTAACCCGAAAAATATCGGAAAACCTTTTCAAGGAGGTGATGAGGAGGC
TGTTCTAGCAGGAAAAAAGGTTATCTCTACCGCCAAGGGCACTTTAGGAA
AGTCACTTCGCTATCTAGTACCTGTGTTTGACGGTGACAAACAGATTGGT
GCTATTGCGGTTGGCATTAAACTAACTACCCTAAATGATGTGGCTTTAAC
GTCAAAACGCAATTATACCCTGTCTTTATTCCTTTGTCTTCTTATTAGTT
TACTGGTCACCAGTTTTATTTCTTTTCGACTCAAGCGTCAACTGCACCAG
TTAGAACCAAGTGAAATTTACCAGCTCTTTGAAGAGCGTAATGCCATGTT
GGATCAAATCGAAGCCGCCGTATTTGTGGTAGATAAAACTGGTATTTTAC
AATTATGCAATCAGGCTGGACAAGAGTTAATCGCTCGAAAATGCCAGTTG
GGAAAACCTACTGGCAACAGTTTCAATCACCTCTTTCCTGATTTTCCAAA
ACTTAGTTTGCAAGAGGGGCATGAACAACTCTTTCGGTATGGTGAGGAAG
ACTACTTGTTAGCCATTTCACCCATCTGTGTCAAAAACGATCACCGAGGC
CACATTATTTTCATGCGAGAAGCAGTTAAGGCTATTGATACCTTGGATCA
GCTAGCCTATACCACCGCCTATGCTTCTGCTCTACAAGCCCAAACTCATA
AATTCATGAATCAATTGCATGTTATTTATGGCTTAGTAGATATTGCTTAT
TATGACCAATTGAAAATTTATTTAGACAGTATTTTGGAGCCCGAAAATGA
AATTCTCACTAGCTTATCTGTCCTTGTTAAGGAGCCTCTTCTAGCTAGTT
TTCTCATTGGAGAGCAAGAGAAATACCAAGAATTAAATGTCCATCTCAAG
ATTGATGTTTTAAGCGAGATTCCTCATTCTGTTACCAAGAATCAACTTAA
TAATGGTTTGATGATTTACCGCTTTATCCATACTAATCTTCTAACCACAC
TGAGACCCAAATCACTCGTTTTGAGTATTCAACATGATCAGAATCATTTA
ATCAGCCATTACACCTTGACAGACAATTGGATTGATTTGGAGCGGGTACA
GCCTATTTTTGACTTACCTTATTTTCAACAGCTCTTGACCGATACAAATT
CCCAATTCCATCAACATCAAACCGTAACCGAGTTACAGTTCTCAGTGACA
ACACCTTATGTAGGATGGCAACATGAACGTTTTAATCATTGA
>M28_Spy0200 fasA, response regulator
ATGATGAACATTTTTATTCTTGAGGATGATTTTATCCAGCAGACACGCAT
AGAATCTATCGTAGTAGGCATCTTAAAAGAGACTAGAATACCATGTAATC
AGCTTGAAGTGTTCTCGACTCCTCAAAAATTATTTGAGAGTATCCAAGAA
AGAGGAGACCATCAGCTGTATTTTTTAGATATTGAAATTGGTGAATATAC
TCGTTGTGGGCTTGAATTAGCTGCAGCTATTCGACAAAAAGATCCTAATG
CCGTTATTGTGTTTGTCACCACTCATTCAGAATTTGCTCCTATTTCTTTT
AAATATAAGGTATCCGCTCTAGATTTTATTGATAAAGCAGGTGGTCAAAA
ACAGTTTAAAGAACAAATCGAAGAATGTATCCGATATACTTACGATATGA
TGTCTAGTCGTGAGTCAAAGGACATGTTTTTATTTGAGACTCCACAGACA
AGATTAAAATTGCCCTATAAGGATATTTTATACTTTGCTACAGCCACAAC
TCCTCACAAAGTTTGTTTATGGACTCAGACAGAAAGATTAGAGTTTTATG
GTAATCTATCTGAGATTCAAGCAGTAGCACCGAAACTTTTTTTGTGCCAT
AGATCCTACCTTGTGAATCTAGATAAGGTTGTTCGAATTGATAAGAGTAA
GCAGCTCCTTTATTTCGAAAATGGTGATTCTTGTATGGTATCACGATTAA
AAATGAAATGTCTGTTTGAACGGTGGGAGGCTCTTCGCTAA
>M28_Spy0198 fasB, sensory transduction protein kinase
ATGGCTAATAGCGAATATATGTTTTTATTATTATCAATTATTGTCTATTA
TATGACAAAAATTTATATTTTTTCCTTTCTATCTGATATCACATTACCAG
TTTGGAAACAACTAACGATTTTGGCTTTAGCCCTATTTTTCAATCAGTTC
CCGTATTTGTCGCCATTGCTAATTGATCCTCTATTATTTTTAGTTGTTTT
AAGGCAAGAAACCAAGCAATTATTTTCTTTGAAAGCTCTTTTTTTGGCTG
TTGCACCTAGTGTTTTGGTGGATTTGCTATCTCGGTTTATGGGTACAATC
GTTATCCCCTATCTTTTTTTGTCGAGTGGTATTTATCTGGGTCATATTAT
CTTTGACTTGCTTGCTTATCTGCTGATTTTTCCAAGTTTTGCTATTATTA
ATTATATGATTGGAAAAGATTACAAGATGATATGCCAATCCGGATATTCG
AAACGATCGCATAATTTTTATCAAACATTGCTGATTTTTGTTTTGGTTTA
TTATGTGGACATTTTTGTCATTTTAGGATTTACGGACCCCTTTTTACATT
TTCATCATTCTCTTTTTGTTCCCACACCTTATAAGTTATTGTTTTTGATG
TTTATACTTCTTTTAGTTTATCTTCTATCTTATTTTAATCATAGTTCTAA
AGAATACCTTAAAAATGAGTTGAGAAGAGAACAACAAGCTTATATGACTA
ACTTAGAGACTTATGGGAAACATCTTGAGAAACTCTATCGAGATGTAAGA
GCTTTTCAAAGTGATTACCTGAGCCGTATAGAGCGTTTAGGTCAAGCCAT
TAAGAGTGAATCCATTACTCAGATTCAAGATATTTATGCCCAAACGGTTC
ATGAAGCTAACGACTACTGGGATGATAAACACTATAATATCTCGAAGCTT
AGGAAAATTAATATCTCATCGATTAAGAGCTTATTGTCAGCTAAAATTAT
CAGTGCGGAAAAATCAGGTATTGATTTGAATGTGGAAGTGCCAGATAATA
TAAAAGAGACTTACATTCCTGAGTTGGACTTACTATTGTTGATGTCTATT
TTTTGTGATAACGCCATTGAGGCAGCTCTTGAAGCACAGCAACCTCATAT
GTCAATTGCTTACTTTTTGTTAGATGACTATCAGATGTTTGTTGTGACAA
ATACGACTAAAAAAAAGGTAGACATTAACAAGATCTTTGAAGAAGGCTAT
TCTTCAAAAGGTTCAGAACGTGGTATCGGCCTTTCTAATGCGCAGCGTAT
TCTCAAAAAGTATCCTTATTTATCCTTGCGGACTAAAAGTTTTGATAAGG
AATTTAGCCAAACCTTGACCATGCCAAAGGAGGAGGTGGATAGATGA
>M28_Spy0199 fasC, sensory transduction protein kinase
ATGATGGTTATATACAGTATGGCTTTATTCTATGCTACCATCTTTATTAA
CAGCTGGGTCATTTTTGCAAAGGTTTCTGCTATTAAACTAAGCTGGAAAC
GGGTTAGCGTTATAGGCATTAGTTTTGTAATTGCTAATATGATATTTGAC
AAAGTCATTTTGATTGACCAACTGTTTTTTATTATTGTTAGTTTGTTAAG
TGCTCCGAAAAAGAAATTATTTGAGCATATGTTTAATGGTTTCTTTACTA
TCTTGATTGTCGAATTACTGTTTCGCGTCATCGGATCTTTCTTTTTACCA
GCTGTCTTAGGATTTAGCATTGGTCAAATTAATAATAACCTTAAGCTTTT
AGAGTTATGTTATCTTTTTGTATTACCAATATTTTATCTGTTTAGCTACA
TTTTCAGTATTGACTTAAGCTTAATAAGGTTTATCAGTGAAGATAAGATG
AAAAAGTGGGTATTTTGGATGAATACTGCCATGTTTTCTTACTACTTTTT
CGCCCATTTTTTGGTAACTGTGCAAAGCGGATTTCTTGCACTATATTTCC
AGTACCGGTCTATTTTAGTATTTATTTATTTAGCTATTTTTATTTGGGTT
ATTGTAAAATTAGATCGATTTGCTAAAGATCAGCTGTCACAAAAATTAAC
ACAAGCACAAAATGAACGTATTGCGTATCTGGAAAATTACAATCAATCGA
TTGAGCAACTTTACCGAGAAATCAGAACAGTTAAACATGATTCTGAAAAT
ATCTTAATTAGTCTAAAAGATAGTATCGATAGTGGTGATATAGATCTGAT
TACTAGAGTTTATGACACGGTTATTCAGCAATCGGCAACTTCTATGATGC
GCACAAATTATGAAATATCTTCTTTAGACAATATCAAAGAGGCTGTGATT
CGCAGTATCATGAATTCCAAATTGCTTGAAGCTCAGTATTTGGGTATTGA
ACTTTATATTGAGATTCCAGATGTTATCGATCATTTACCTATTAAGTTAA
TCGACTTAATTGTACTTTTTACTGGACTAGTGGACAATGCTATTGAGACA
GCCAAAGGCAGTAGACGTCCTTTTTTATCTATTGCATACTTTAAACAAGA
TAACAAGCAATTATTTATTATTGAAAATAGCACAAAAACCAATCGTGTGG
ATATAGCCAAACGCTTTGATGCTCAGCAGCAGAACTCAGCCCACTTTTTG
ACTGTTTTAGATAGTTACCCCCAAATAACGCTTTCGACTAAAAGTGACCA
TTATCGATTAAGACAATTGTTAGAAATGAGATAA
>M28_Spy0643 fruA, PTS system, fructose-specific IIABC component
ATGAAAATTCAAGATTTATTGAGAAAAGATATTATGATTCTCGATTTACA
GGCTATTTCTAAAGAAGTTGCCATTGACGAGATGATTACTAAATTAGTTG
AAAAAGATATTGTACATGATTTTGATGTCTTTAAAAAGAGTATCATGACA
CGTGAAGAACAAACATCAACAGGGCTTGGTGATGGGATTGCCATGCCTCA
TTCTAAAAATATTGTAGTAGATAAACCAGCGGTCTTGTTTGCGAAATCAA
ATAAAGGTGTGGATTATAAGGCTTTAGATGGTCAACCAACGGATCTCTTC
TTTATGATTGCTGCGCCTCAAGGAGCAAATGATACTCACTTGGCTGCGCT
AGCAGAATTATCACAATACCTTTTGAAAGACGGCTTTGCTGATAAACTTC
GTGCTGCAGCGACACCAGAAGCAGTCATTGCTGTTTTTGATGAAGCGTCA
ACAGCTAAAGAAGAAGTGGTTGCTCCAACAAGTGGTCAAGACTTTATCGT
TGCTGTTACAGCTTGTCCGACAGGAATTGCTCACACTTATATGGCAGAAG
AGGCTTTGAAAAAACAAGCTGCAGAAATGGGAGTAGCTATTAAAGTTGAA
ACAAACGGTGCTTCTGGTGTGGCTAATCGTTTAACCGCTGAAGATATTCA
GAGAGCTAAAGGAGTTATTGTTGCAGCTGATAAAGCGGTTGAAATGGACC
GTTTTGATGGTAAACAATTCATTGCTCGCCCTGTTGCAGATGGTATCAAG
AAAAGTCAGGAATTGATTTCTTTGATTTTAAACAATGAAGGAAACACTTA
TCATGCTAAAAATGGAAAATCTGAAACAGCAGTATCAACTGAGAAAACAA
GTTTAGGCGGTGCTTTCTATAAACACTTGATGGGCGGTGTCTCACAAATG
TTGCCATTTGTTATTGGTGGCGGGATTATGATTGCTCTAGCATTTTTATT
GGATAACATGCTTGGTGTGCCAAATGATCAGCTTGGAAGTCTTGGATCCT
ATCATGAAATAGCAGCTATTTTTATGAACATTGGTGGAGCAGCCTTTTCC
TTCATGTTACCAGTACTAGCAGGTTATATCGCTTATTCTATTGCTGAAAA
ACCGGGCTTAGTAGCTGGTTTTGTGGCAGGTGCCATTGCCTCAAATGGTC
TTGCTTTTGGTAAGGTACCATTTGCAGCAGGAGGAGAAGTGAGCTTGGGA
TTAACGGGCGTGCCATCAGGTTTCCTTGGGGCGCTTGTGGGTGGTTTCCT
TGCCGGTGGTGTTATTCTTGCCCTTCGTAAATTGTTGGCAGGCCTACCAC
GTTCTCTAGAAGGGGTTAAATCTATCCTCCTTTACCCATTACTTGGCGTC
CTTGTCACTGGTTTCTTGATGCTTTTTGTCAATATTCCAATGGCAGCTAT
TAACACAGCTCTTAATGATTTCTTACAAGGTCTTTCAGGAAGCTCTGCTG
TCCTTATGGGACTTCTTGTTGGTGGAATGATGGCTGTTGACATGGGTGGT
CCTGTTAATAAGGCAGCTTATGTTTTTGGTACAGGAACTTTAGCAGCTAC
TGTGGCAAATGGTGGTTCGGTCGTTATGGCCGCTGTTATGGCAGGTGGTA
TGGTACCTCCTCTTGCTGTTTTTGTAGCCACTCTCTTGTTTAAAGATAAA
TTTACCAAAGAAGAACGCGAATCAGGTTTGACCAACATTGTCATGGGACT
TTCTTTCATCACTGAAGGAGCAATCCCATTTGGCGCAGCTGACCCAGCGC
GTGCAATTCCTAGCTTTATTGCTGGTTCTGCCTTGACAGGAGCTCTTGTT
GGTTTGGCTGGCATTAAATTAATGGCGCCACATGGTGGTATCTTCGTAAT
CGCTTTAACAAGCAATCCAATCTTATATCTTGTCTTTGTTGTGATTGGTG
CCCTTGTATCAGGTATCTTATTTGGCGCTCTTCGCAAAAAAGCCTAA
>M28_Spy1057 glnH, transporter
ATGACGCACAAAATAAAAGTATTGCTGCTTGCGATAATGTCTATTTTTTT
GACATGCAATATTGCAAGTGCTGAAACTATTGCTATTGTTTCAGATACAG
CTTATGCCCCATTTGAATTTAAAGACTCAGATCAAATTTACAAAGGAATT
GACGTTGATATTATTAATGAAGTAGCCAAACGTCAATCTTGGGATTTCAG
TATGAGTTTCCCGGGTTTTGATGCAGCTGTAAATGCTGTACAATCTGGTC
AAGCGAGTGCTCTAATGGCCGGTACAACCATTACGAATGCTCGTAAGAAA
GTCTTTCATTTCTCAGAGCCATATTACGATACCAAAATTGTCATTGCGAC
ACGTAAAGCCAATGCCATCAAAAAATACAGTGACTTAAAAGGAAAAACGG
TCGGTGTTAAAAATGGAACAGCGGCTCAAGCCTTTTTGAATAACTATAAA
AAAAAGTATGATTATACTGTTAAAACATTTGACACAGGTGATCTTATGTA
TAATAGTTTATCTGCTGGTTCTATTGCCGCTGTTATGGATGATGAAGCGG
TTATCCAATACGCAATCAGCCAAAACCAAGATATTGCTATTAACATGAAA
GGAGAGCCCATTGGAAGCTTTGGGTTTGCTGTCAAAAAGGGAAGCGGATA
TGATTATCTAGTTAATGATTTCAATACAGCTCTTAAAGCTATGAAAGCTG
ATGGTACCTACCAAGCTATCATGACCAAGTGGTTAGGCACAGATGATAAA
GCTACCACCAGTCAGGCAACGGGAAATCCATCTGCCAAAGCTACACCTAT
AAAGGACAGTTATAAAATTGTCTCTGATTCGTCTTTTGCACCTTTTGAAT
TTCAAAATGGTAAGGGCAAATACGTTGGTATTGACATAGAATTAATCAAA
GCTATTGCTAAACAACAAGGTTTCAAAATTGAAATCGCTAATCCAGGTTT
CGATGCTGCCTTAAATGCTGTGCAATCTAGCCAAGCAGATGGGGTCATTG
CTGGTGCAACTATTACTGACGCTCGTAAAGCTATCTTTGATTTTTCTGAT
CCTTATTATACTTCTAATATCATTTTAGCTGTTAAAGCTGGAAAAAACAT
CAAGAACTATGAAGACTTAGACAGAAAAACAGTCGGTGCTAAAAACGGCA
CTTCATCTTACTCTTGGTTAAAAGAAAACGCTCCTAAATATGGTTATAAT
GTCAAGGCATTTGATGATGGTTCTAGCATGTATGATAGCTTAAATTCAGG
TTCTGTAGATGCTATCATGGATGATGAGGCGGTTCTTAAATACGCTATTT
CTCAAGGTCGTCGCTTTGAAACACCTCTTGAGGGCATTTCTACTGGTGAA
GTTGGTTTTGCTGTCAAGAAAGGAACTAATCCAGAATTAATCGAAATGTT
CAACAATGGCTTAGCTGCTCTCAAAAAATCTGGTCAGTATGATGACATTA
TAGATAAATACCTTGACTCTAAGAAAGCTGCAACTCCTTCTGAAAAAGGT
GCTGATGAGTCTACTATTTCAGGCCTATTATCAAATAACTACAAACAACT
ATTGGCAGGACTTGGAACCACGCTCAGTTTAACCCTTATTTCATTTGCTA
TTGCTATAATTATCGGGATCATCTTTGGGATGATGGCCGTGTCACCAACT
AAATCACTTCGACTCATTTCAACGGTCTTTGTAGACATTGTTCGAGGGAT
TCCTTTGATGATTGTGGCTGCCTTCATTTTCTGGGGAGTACCAAACCTTA
TCGAGAGTATGACCGGCCACCAGTCACCGATTAATGATTTCTTAGCTGCT
ACAATTGCACTGTCACTTAATGGCGGAGCCTATATTGCTGAAATTGTTCG
CGGTGGTATCGAAGCTGTTCCAGCAGGGCAAATGGAAGCTAGTCGAAGTC
TTGGTTTGTCTTACGGAACCACGATGAGAAAAGTAATTCTCCCACAAGCT
GTGAAACTAATGTTACCTAACTTTATCAATCAGTTTGTTATTTCATTGAA
GGATACAACAATCGTCTCAGCAATTGGTTTAGTGGAACTCTTCCAAACAG
GTAAAATCATTATTGCTAGAAATTACCAGTCGTTCCGTATGTATGCTATT
TTAGCAATTATTTACCTTATCATGATTACACTCTTAACAAGACTTGCAAA
ACGTTTAGAAAAGAGGCTTAACTAA
>M28_Spy0736 hylA, hyaluronate lyase precursor
GTGGTATATTTTTACTTAGTAAACCAATTTACTTTTATTATCTCATTTTT
ATATAGGAGGAATTTATCAGTGAATACTTATTTTTGCACACACCATAAAC
AATTACTACTTTATTCAAACCTATTCCTTAGCTTTGCTATGATGGGCCAA
GGAACTGCCATTTATGCCGATACACTGACTTCAAATTCAGAACCTAATAA
TACTTACTTTCAAACGCAAATGCTCACTACTACAGATAGCGAAAAAAAGG
TAGTACAGCCACAACAAAAAGACTACTATACTGAATTGTTAGACCAATGG
AACAGTATTATCGCAGGCAACGATGCTTATGATAAAACCAATCCTGACAT
GGTCACTTTTCATAATAAAGCTGAAAAGGATGCTCAAAACATTATTAAAA
GCTATCAAGGGCCTGACCACGAAAATAGAACTTACCTTTGGGAACATGCA
AAGGATTATTCCGCTTCTGCTAATATCACGAAAACTTACCGCAATATTGA
AAAAATAGCAAAACAGATCACTAATCCTGAGTCATGCTATTATCAAGATA
GTAAAGCTATTGCTATTGTAAAAGACGGTATGGCCTTCATGTATGAACAC
GCTTATAATCTAGATCGTGAAAATCATCAAACAACTGGAAAAGAAAACAA
AGAAAATTGGTGGGTTTATGAAATTGGAACTCCTCGTGCTATTAATAATA
CCTTATCCTTGATGTATCCTTATTTTACTCAAGAAGAAATCCTTAAATAC
ACAGCTCCAATCGAAAAATTTGTGCCTGACCCTACTCGTTTTAGGGTTCG
CGCTGCCAATTTTTCACCTTTTGAAGCCAATAGCGGAAATTTAATTGATA
TGGGGCGTGTTAAACTCATTTCCGGTATTCTTCGTAAAGATGATCTCGAA
ATTAGTGATACAATCAAAGCAATTGAGAAAGTTTTCACGCTAGTTGACGA
AGGAAATGGTTTTTACCAAGACGGTTCTTTAATTGATCACGTGGTTACTA
ACGCTCAAAGTCCACTTTATAAAAAAGGCATTGCTTACACTGGAGCTTAC
GGTAATGTTCTTATAGATGGCTTATCGCAATTAATTCCTATTATTCAAAA
AACAAAGTCTTCTATAGAAGCGGATAAAATGGCTACTATCTATCATTGGA
TTAACCATTCTTTTTTCCCTATCATCGTTCGTGGAGAAATGATGGATATG
ACTCGAGGGCGTTCTATCAGTCGTTTTAATGCTCAATCTCATGTTGCTGG
CATTGAAGCACTTCGTGCTATTTTACGTATTGCTGACATGTCTGAAGAGC
CTCACCGTTTGGCACTTAAAACACGTATAAAAACACTCGTCACACAAGGG
AATGCTTTTTACAATGTCTATGATAATTTGAAAACCTATCACGATATCAA
ACTTATGAAAGAACTGCTAAGTGATACTTCTGTTCCAGTCCAAAAACTTG
ATAGTTACGTAGCTAGTTTCAATAGTATGGATAAATTGGCACTATATAAT
AATAAACACGATTTTGCTTTTGGCCTATCAATGTTTTCGAATCGAACTCA
AAATTATGAAGCTATGAATAATGAAAATCTTCATGGCTGGTTTACTTCTG
ATGGAATGTTTTACCTATACAATAACGATTTAGGACACTACAGTGAAAAC
TATTGGGCAACTGTAAATCCCTACCGCTTACCTGGAACCACAGAAACTGA
GCAAAAACCACTAGAGGGAACTCCTGAGAATATTAAAACGAACTATCAAC
AAGTTGGCATGACTAGTCTCTCTGATGACGCTTTTGTTGCAAGTAAAAAA
CTTAATAACACAAGTGCTCTAGCTGCTATGACCTTCACTAATTGGAATAA
AAGCCTCACTCTCAATAAAGGGTGGTTTATCTTAGGAAACAAAATAATCT
TTGTTGGTAGCAATATCAAAAACCAATCATCTCACAAGGCGTATACAACT
ATTGAACAACGAAAAGAAAATCAAAAGCACCCTTACCATGCTTATGTTAA
CAATCAACCCGTTGACTTGAATAATCAGCTAGTTGATTTTACAAACACTA
AAAGTATTTTCCTTGAAAGTGATGATTCTGCTCAAAATATTGGTTACTAC
TTCTTCAAGCCAACAACACTTAGCATAAGTAAGGCACTTCAAACAGGGAA
ATGGCAAAACATAAAAGCTGATGACAAATCACCAGAAGCCATCAAAGAAG
TTTCAAATACCTTTATCACTATCATGCAAAACCATACTCAAGATGGCGAT
CGTTATGCCTATATGATGCTTCCAAATATGACTCGTCAAGAATTTGAAAC
CTATATTAGCAAGCTTGATATCGACTTGTTAGAAAACAATGACAAACTGG
CCGCTGTCTACGATCATGATAGTCAACAGATGCACGTCATTCACTATGAA
AAAAAAGCAACGATGTTTTCAAATCATAATCTTTCTCATCAAGGCTTTTA
TAGTTTTCCTCATCCTGTCAAGCAAAATCAACAATAA
>M28_Spy1708 ihk, two component system histidine kinase
GTGAGACTAATCAAAAAAACCTTTTTGGTCATCAATGGCTTAATTATTGT
AGTGGTTACCTCTATTTTGTTAGTGCTTTATTTTGCAATGCCAATTTATT
ACACCAAAGTCAAAGACAAAGAAGTTAAGCGTGAATTTGACCAAACAAGC
AAGCAAATCAAAGGCAAAACGGTAACCGAGATTAGAGATATCCTAACAAA
AAAAATCAACAAAGATAATATTTGGTACAGCTTAGTAGACAGTGATAACC
AACTGCTCTATCCTTCCTTGCAGCTGTTAGACGGCGTCAGTGAAAGCAAA
GACAGTCAAAATGTTAATATCGTCACCACCTTTGACAACTCTTATTCTAA
TGTTAAGGTGATGAGTCAAAAAGTAACCCTACGCGATGGAAAAAAAATGA
CATTGCTTGGGCAATCTTCACTTCAACCCGTAACAGATGCTAGCAAAGTT
CTCCTTGACCTCTACCCGTCACTATTGATGTTTTCAGTGACCGTAGGGAG
TATTGTCGCCTACTTATATAGTAGGACTTCTAGCCGGCGTATCCTTAGCA
TGTCACAAACCGCCAAAAAAATGGTCAACCTAGAACCAAACTTAACGTGT
ACCATTCACGGCAAAGATGAAATAGCAATGTTGGCTAGTGATATTAACCG
TTTGTATGCGAGTCTTTCAACGAGTATCAAATCCTTGCAAAAAGAGTATG
AAAAAGCTTCTGATTCAGAAAGAGAGAAATCTGAGTTTTTACGCATGACA
TCGCACGAGCTAAAGACACCAATCACCAGTGTTATCGGAATGATTGATGG
AATGCTCTATAATGTTGGTGACTTTGCAGATCGTGACAAATATTTGCGAA
AATGCCGAGACGTCCTTGAAGGGCAAGCCCAACTGGTTCAATCCATTTTA
TCTTTATCTAAGATTGAAACCCTAGCTTCTCAAAATCAAGAACTGTTTTC
ACTAAAAAGCAGCCTAGAAGAAGAAATGGAAGTCTTTCTCGTCTTATCAG
AACTAAAACATCTCAAAGTGACTATCAATCTCGAAGAACAATTCGTCAAA
GCCAATAAAGTATACCTACTAAAGGCGATTAAAAATATTATTGACAATGC
CTTTCACTATACCAAATCAGGCGGCCAAGTGATGATTCAACTAAAAGACA
ACCAACTAGTGATTAAAAATGAAGCAGAGACATTATTGACACAACAGCAG
ATGAAACAGTTATTCCAACCGTTTTATCGACCAGATTATAGTCGTAACAG
GAAAGACGGTGGTACAGGATTGGGGCTGTTTATCACCCACCAGATTCTTG
ATCAGCATCATCTGGCTTATCGCTTTGTTGTTCTTGATCAAAGATGGATG
GTATTTACGATTGATTTTCCATCCCATCATGACGATTGA
>M28_Spy1709 irr, two-component response regulator
ATGTTTAAAATATTAGTAGTTGAAGATGATGATACCATCAGTCAAGTGAT
TTGTGAGTTTTTAAAAGCGAATAACTATGATCCAGATTGTGTATTTGATG
GCCAAGCTGCCTTAGACAAGTGGCAGACAACGTCTTATGATCTGATTATT
TTAGACATCATGCTCCCTTCCTTAAGTGGCTTAGAAGTGCTAAAAACAAT
TCGAAAGACATCAGATGTCCCTATTATTATGCTAACGGCATTAGATGACG
AATACACACAGCTTGTAAGCTTCAACCATTTGATTAGTGATTATGTGACC
AAACCATTTTCACCACTCATTTTAATCAAACGTATCGAAAATGTATTACG
CGTCTCTACTCCAGATGAAAAGCGCCAAATCGGAGACTTACTTGTTGATG
AGACTGAACATAGCGTCTATTGGCAAGGAACATTGGTCAAACTAACCAAA
AAAGAATATGACATTATTGATTATTTAGCAAAACGTCACCAAAAAATTGT
CACCAGAGACCAATTGATGGATGACATATGGGGCTATTCTGAACTGGATA
CGCGTGTCCTTGACAACCACATTAAGAACCTTCGTAAAAAAATGACGGGT
ATTCCCCTCAAGACAATTACAGGCATGGGCTATTTATTGGGAGAGCGTGA
GTGA
>M28_Spy1671 lrp, leucine rich protein
ATGTGTTATAATGGTTTAAAGACCATCATGAAAGGAATGGCTATGGAGCT
AAAAGACTATTTTCCAGAGATGCAAGTAGGCCCTCATCCGTTAGGAGATA
AAGAGTGGGTGAGTGTCAAAGAAGGGGACCAATATGTGCATTTTCCCAAA
TCATGTTTATCCGAAAAAGAGCGCTTATTACTTGAGGTGGGGCTGGGTCA
GTGTGAGGTCTTGCAGCCGCTAGGGTCACCTTGGCAGCGGTATTTGCTTG
ATCATCAGGGCAATCCCCCTCAGCTGTTTGAGACTTCTCAGTTCATTTAC
CTCAATCATCAGCAGGCTTTACCAGATGACTTAGTTGAGTTGCTCCAACA
GATGATTGCAGGGCTTGAGGTCATTTTGCCTATCAGTGCAACTCAGACGG
CATTTTTATGCCGACAAGCAATCTCAATAAAGGTCTTGCGCTGGCTTGAA
GATCTCCTGCCAACGCTAGAAAGTGATTTTGGTTTGGCCTTAACCATGTT
TGTTGGAAATGCCTGGTATCAAGTAGCTGCGGGTACATTGAGAGAGTGTT
TTGAGGAGGAATGTCAGCTGTTAACGGCCTATTTAAGGCAACAATCAGGC
AGAAAATTATTAACATTTTCAGGACTGATGCTGTGGTCTTTGCTGTCGCA
CCACACTTTTTTGGCATTGACGCGTCAGTTTCACCAATCCCTAAGTCCTC
AAAGTGATATGGCCGATGTGGTTCACGCGCTATGGTCAGAACACGGCAAT
CTGGTGCAGACAGCGCAGCGCTTGTATATTCACCGTAACTCCTTGCAATA
CAAACTTGATAAATTTGCTCAGCAATCAGGACTCCACTTGAAGCAATTGG
ATGATTTAGCCTTTGCTCATCTCTTTTTGTTGAAATATTAG
>M28_Spy1390 luxS, autoinducer-2 production protein
TTGATCTGTTTTCTTAGCCTTTTCTCCTCCACAAGTAGCCACTTTCTCAC
TATTTGTGTTATGATAAAGTGTAAAACAAAGGAGATTGAAATGACAAAAG
AAGTTATCGTCGAAAGTTTTGAGCTAGATCATACTATTGTAAAGGCCCCT
TATGTTCGTCTTATTTCTGAAGAATTTGGACCCAAGGGCGATCGTATTAC
AAATTTTGATGTTCGCCTAGTGCAGCCTAACCAAAATTCTATTGAAACAG
CCGGTTTGCATACCATTGAACACTTACTTGCCAAGCTCATCCGCCAACGC
ATTGATGGGATGATTGATTGCTCTCCTTTTGGCTGTCGAACAGGTTTTCA
CCTTATCATGTGGGGAAAACACAGTTCTACTGATATTGCCAAGGTGATTA
AATCCAGCCTAGAAGAAATTGCAACTGGGATTACTTGGGAAGATGTTCCT
GGAACAACTCTTGAATCCTGTGGAAACTATAAGGATCATAGCCTCTTTGC
CGCCAAAGAATGGGCTCAATTGATTATTGATCAAGGGATTTCAGACGATC
CTTTTAGTCGCCATGTCATCTGA
>M28_Spy0234 mecA, negative regulator of genetic competence
TTGAGAATGGAAATGAAACAAATTAGCGAGACAACGCTAAAAATAACAAT
TAGTATGGACGATTTAGAAGAAAGAGGAATGGAGTTGAAAGATTTCTTGA
TTCCTCAAGAAAAAACAGAAGAGTTTTTCTATTCTGTGATGGACGAACTC
GATCTTCCAGATAATTTTAAAGATAGTGGTATGCTTAGTTTTCGAGTGAC
TCCACGCAAGGACCGTCTAGATGTTTTTGTTACCAAATCTGAGATAAATA
AAGATATTAATCTTGAAGATTTAGCAGAGTTTGGTGATATGTCCCAAATG
ACTCCGGAAGATTTTTTCAAGAGCTTGGAGCAATCCATGCGTGAAAAGGG
AGATGTCAAAGCTCATGAAAAATTGGAAAAAATTGAAGAGATAATGGAAG
ATGTTGTTGAAGCTACTCTAGCTAATCAGTCTGAGGCGGCTGATCCATCA
ACTAATCATGAGTCAGAACCTTTAGACTATGTCCATTATGTATTGGATTT
TTCAACGATTACAGAGGCAGTGGCTTTTGCTAAAACGATTGATTTTTCGA
TAGAAGCTTCAGAGTTATATAAGGGGAGCAACTGCTACCATATGACTATT
TTATTAGATGTTCAGCAACAACCATCTTATTTTGCGAATGTCATGTATGC
GAGATTGATTGAGCATGCAAACCCTGGATCAAAAACAAGAGCTTATTTAC
AAGAGCATGGCTTACAATTGATGCTTGATGGTGCTGTTGAGCAATTACAA
AAGATTGAGTTGGGATAA
>M28_Spy0372 phoH, PhoH
TTGCAAGAGTATTCTATTGACATTACCTTAACCCATCCTGATGATGTTTT
AGCTCTTTTTGGTAGCAACGAGCGTCATTTGAAGCTAATAGAAGCTCATT
TAGGAGTTATTGTTCACGCAAGAACCGAGCGAGTCCAAGTGATTGGTGAT
GATGAAGAAGCTGTGGAATTGGCTCGATTGACCATCAAAGCCCTACTGGT
TCTAGTGGGTCGTGGCATGGTGGTCAACACATCAGATGTGGTGACAGCTT
TATCTATGGCAGAATCTCATCAGATTGACCAATTTATGGCGCTTTATGAA
GAAGAAATCATTAAAGATAACTATGGTAAGGCAATACGAGTCAAAACATT
AGGTCAAAAAACCTATGTTGATAGTGTCAAACGTCATGATGTGGTTTTTG
GTGTAGGACCTGCAGGGACAGGGAAAACCTTCTTAGCTGTTACGCTTGCA
GTCACTGCTCTGAAAAGAGGACAGGTAAAGCGTATTATTTTGACGCGTCC
TGCGGTAGAAGCTGGTGAAAGCCTAGGTTTTTTACCAGGCGATTTGAAAG
AAAAGGTGGATCCTTACCTCAGACCTGTTTACGATGCCCTTTATCACATT
TTAGGCAAGGAACAAACCACACGCCTGATGGAACGAGATGTGATTGAGAT
TGCTCCGTTAGCTTATATGCGGGGTCGTACTCTGGATGACGCTTTTGTTA
TCTTAGATGAGGCTCAAAACACGACCATCATGCAAATGAAGATGTTTTTG
ACCCGTCTTGGTTTTAATTCTAAAATGATTGTCAATGGAGATACGAGTCA
GATTGACCTCCCTCGAAATGTCAAGTCTGGTTTGATTGATGCTACTCAGA
AATTACAAGGCATTAAACAGATTGATTTTGTCTATTTCTCTGCTAAGGAT
GTTGTCCGACATCCTGTTGTGGCTGATATTATCAAGGCTTATGAAACGTC
CTCAGAGGAGATGAAGGACTTACTAAAACCTAAGGCTAGTGACGTTGAAG
CTGATTACCAGCCAGGCTTGACAAAATACCCTGTGATTGGTCAAGAGCAC
TAA
>M28_Spy1377 pppL, protein phosphatase 2C
ATGAAGATTTCATTAAAAACAGACATTGGGCAAAAACGCTCAAACAATCA
AGATTTTATCAATAAGTTTGATAATAAAAAAGGCATCACTTTAGTGATTT
TAGCAGACGGTATGGGTGGCCACAGAGCTGGAAATATTGCCAGTGAGATG
ACAGTCACAGACCTGGGAAGAGAATGGGTAAAAACAGACTTCACAGAGTT
AAGTCAGATTAGAGATTGGTTATTTGAAACTATCCAGTCAGAAAATCAAC
GGATTTATGATCTAGGCCAATCAGAAGACTTTAAAGGAATGGGAACGACT
GTTGAAGCAGTAGCTTTAGTTGAATCTAGCGCCATTTATGCTCATATTGG
TGATTCACGGATTGGTCTTGTCCATGATGGGCATTATACCTTATTGACCA
GTGATCATTCTTTAGTGAATGAGTTGGTTAAGGCAGGACAGATCACAGAA
GAAGAAGCTGCTAGCCATCCACAAAGAAATATTATCACTCAATCTATTGG
TCAAGCTTCCCCAGTAGAGCCTGATTTAGGAGTGAGGGTTTTGGAGCCAG
GGGATTATCTTGTCATTAACAGTGATGGTCTAACCAATATGATTTCAAAT
GATGAAATTGTGACTATCTTGGGCAGTAAGGTTAGTCTTGATGAAAAAAA
CCAAGAAATGATTGACTTAGCTAACCTAAGAGGAGGCCTAGATAATATTA
CAATCGCTTTGGTTCACAACGAAAGTGAGGACGTCGAATGA
>M28_Spy0465 ptsK, hpr(ser) kinase
TTGGTGTCGTTGTTCTCATTTAGTAGTGAAAAAATGAGTATTTGCAAGGG
TCTAACGGTCGATTTGTGTTATAATATTGAAAAAGGAGAAATTATGACCG
TTACTGTAAAGATGCTAGTGCAAAAAGTTAAACTTGATGTGGTTTATGCT
ACAGATAACTTGTTGTCAAAAGAGATAACAACATCAGATATTTCACGTCC
AGGTCTTGAAATGACTGGTTATTTTGATTATTATGCTCCAGAAAGGTTGC
AGCTATTTGGAATGAAAGAGTGGTCTTATCTTACACAGATGACTTCTCAC
AACCGTTATTCTGTTTTAAAAGAGATGTTCAAAAAGGACACTCCTGCAGT
GGTTGTCTCTAGAAATTTAGCCATTCCAAAAGAAATGGTTCAAGCTGCAA
AAGAAGAAGGTATTTCACTTTTAAGTAGCCGTGTTTCAACTAGCCGCTTA
GCTGGAGAAATGTCTTATTTTCTTGACGCTTCTTTAGCTGAACGTACTAG
TGTTCACGGCGTTTTAATGGATATTTATGGTATGGGGGTTCTTATCCAAG
GGGATTCTGGAATTGGTAAAAGTGAGACTGGTTTAGAATTAGTTAAGCGA
GGGCATCGTTTGGTTGCAGATGACCGTGTGGATGTCTATGCCAAAGATGA
AGAAACCCTTTGGGGAGAGCCAGCAGAGATCTTGCGCCACTTGCTTGAAA
TTCGTGGGGTAGGTATTATTGATGTGATGTCGCTTTATGGAGCTAGTGCT
GTGAAGGACTCATCACAAGTTCAATTGGCCATTTACCTTGAAAACTTTGA
GGCTGGTAAAGTTTTTGATCGTCTCGGAAACGGTAATGAGGAGATAACTT
TCTCAGGAGTGAGAATCCCTCGTATTCGTATTCCGGTAAAAACAGGTCGA
AATGTTTCAGTGGTTATTGAAGCCGCTGCGATGAATCATCGGGCTAAAGA
AATGGGCTTTGATGCTACAAAAACTTTTGAAGATCGTTTAACTCAACTAA
TCACCAAAAATGAGGTGAGTCAATGA
>M28_Spy1674 relA, GTP pyrophosphokinase
ATGAGGAACGAAATGGCAAAAATAATGAACGTAACAGGAGAAGAAGTCAT
TGCCTTAGCGGCCACCTATATGACCAAGACTGATGTGGCTTTTGTGGCAA
AGGCTTTAGCATATGCAACAGCGGCCCATTTCTACCAAGTGAGAAAGTCA
GGCGAACCCTATATCGTCCATCCGATTCAGGTGGCGGGGATTCTGGCTGA
TTTGCATCTGGATGCTGTGACAGTTGCCTGTGGCTTTTTACATGATGTCG
TAGAAGATACGGATATTACCTTAGATGAGATCGAAGCAGACTTTGGCCAA
GATGCTCGTGATATCGTTGATGGTGTCACCAAGTTAGGTAAAGTTGAGTA
CAAATCTCATGAGGAGCAACTCGCCGAAAACCATCGCAAAATGCTGATGG
CTATGTCTAAAGATATTCGCGTGATTTTGGTGAAATTGGCTGACCGCCTG
CATAATATGCGCACCCTCAAACATTTGCGCAAGGACAAACAAGAGCGCAT
TTCGCGCGAAACCATGGAAATCTATGCCCCCTTGGCGCATCGTTTGGGGA
TTAGTCGCATCAAATGGGAACTAGAAGATTTGGCTTTTCGTTACCTCAAT
GAAACCGAATTTTACAAAATTTCCCATATGATGAAAGAAAAACGTCGCGA
GCGTGAAGCTTTGGTAGAGGCTATTGTCAGTAAGGTCAAAACCTATACGA
CACAACAAGGGTTGTTTGGAGATGTGTATGGCCGACCAAAACACATTTAT
TCGATTTATCGGAAAATGCGGGACAAAAAGAAACGTTTCGATCAGATTTT
TGATTTGATTGCTATCCGTTGTGTCATGGAAACGCAGAGCGATGTTTATG
CTATGGTTGGCTATATTCATGAGCTTTGGCGTCCCATGCCAGGCCGCTTC
AAGGATTATATTGCAGCTCCTAAAGCTAATGGCTACCAGTCGATTCATAC
CACTGTGTATGGACCAAAAGGACCTATTGAGATTCAAATCAGAACTAAGG
ACATGCATCAAGTGGCTGAGTACGGGGTTGCTGCTCACTGGGCTTATAAA
AAAGGCGTGCGTGGTAAGGTCAATCAGGCTGAGCAAGCCGTTGGCATGAA
CTGGATCAAAGAGCTGGTAGAATTGCAAGATGCCTCAAATGGCGATGCAG
TGGACTTTGTGGATTCGGTCAAAGAAGACATTTTTTCTGAACGGATTTAT
GTCTTTACACCGACAGGGGCCGTTCAGGAGTTGCCAAAAGAATCAGGTCC
TATTGATTTTGCTTATGCGATCCATACGCAAATCGGTGAAAAAGCAACAG
GTGCCAAAGTCAATGGACGTATGGTTCCTCTCACTGCCAAGTTAAAAACA
GGAGATGTGGTTGAAATCATCACCAATGCCAATTCCTTTGGCCCTAGTCG
AGACTGGGTAAAACTGGTCAAAACCAATAAGGCTCGCAACAAAATTCGTC
AGTTCTTTAAAAATCAAGACAAGGAATTGTCAGTGAATAAAGGCCGTGAT
TTGTTGGTGTCTTATTTTCAAGAGCAGGGCTATGTTGCCAATAAATACCT
TGACAAAAAACGCATTGAAGCGATCCTTCCAAAAGTCAGTGTGAAGAGCG
AAGAATCACTCTATGCAGCCGTTGGGTTTGGTGACATTAGTCCTATCAGT
GTCTTTAACAAGTTAACCGAAAAAGAGCGCCGTGAAGAAGAAAGGGCCAA
GGCTAAAGCAGAAGCTGAAGAATTGGTTAAGGGCGGTGAGGTCAAACACG
AAAACAAAGATGTGCTCAAGGTTCGCAGTGAAAATGGGGTCATTATCCAA
GGAGCATCAGGCCTCTTGATGCGGATTGCCAAGTGTTGTAATCCTGTACC
TGGTGATCCTATTGACGGCTATATTACCAAAGGGCGTGGCATTGCGATTC
ACAGATCGGACTGTCATAACATTAAGAGTCAAGATGGCTACCAAGAACGC
TTGATTGAGGTCGAGTGGGATTTGGACAATTCGAGTAAAGATTATCAGGC
TGAAATTGATATCTATGGGCTCAATCGTAGTGGCCTGCTCAATGATGTGC
TCCAAATTTTATCAAACTCAACCAAGAGCATATCGACAGTCAATGCTCAG
CCGACCAAGGACATGAAGTTTGCTAATATTCACGTGAGCTTTGGCATTCC
AAATCTGATGCATCTGACCACTGTTGTCGAAAAAATCAAGGCAGTTCCAG
ATGTTTATAGCGTGAAGCGGACCAATGGCTAA
>M28_Spy1359 rocA, sensory transduction protein kinase
ATGTTAGAAGATTTTCTTCAATTTTTAGGATTTATATTTTTAGATATTAT
TGAAATTATGTTAACGTTAAAGCTTTTTAGCTTTGTAAGTGCAATTCCGC
TTCGCCTGAAAAATATTTTTTATTTATCACTTAGTATGGTTTTGTTTCAA
GTAGTTTTTTGGGCTTTCTTTCCAGACCATTTCATTCTTGATGTTGTGAT
GTTGGCTCAGTTTCTTTTCTTTGCGCTTATAGCCCTATACTATGGTAAAT
CAATAAAAGCTAAGTTTTTAATGTTTTATGCCTTTTTTCCACTAGTGTCT
ATTAGTTTGGTTAAGCGATTTATTGTATTTTTTGTTATGCCATTGTTTGG
TATGCCTTATTCAGTTGTTAAACATAATACACTACTGATTTACAGCATTA
CTTGCTTTAGTATTTTTTTGATTTATCGCTGCATTCAAGTTTTTCATTTC
GATTTTTCAACCTGGCGCCAATATTTTCAATCACATAGAGCTAGTAAACT
ATTAGTGTTTACTAACTCTTCGATGGCTCTATATTACTTGTGTGTCCAAG
GGATAGATGTGATGTCGCCTTCTTTATCAGGACTTGCTACAACGACTGCT
CGTTCAATCATAGTGCTCTTTTATTTCATTTTGTTTCTTACTTTATTAAT
TCATTTAGAGCGTTATGTAAAACAAAACTCTATTGAGGCAATTGTGCAAC
AAAAAGAATATCGTGAGCTGATTAATTATAGTCAGCACCTTGGATTGCTG
TATCAAGATATTCAAGAGCTTAGGCAGCTATTAACTACCGTGTCCAGTCG
TCTTAAGATTGGAATCGAACAAAATGATATCTCTATTGTGAGACTTACTT
ATGAAGGTATCTTGAATGCTGAAAAGAATAATGCTAAAGATGACAGACTT
GATTTAACTTGTTTAGATAAATTACAAGTTGAAGCAATCAGACATATTGT
TTTAGCTAAATTAATTGAGGCAAAAAATAAGAAGCTTAAGGTTGAGGTAT
CGATTCCTAATTGTATTGCAACGTTTTTTCTAGAAGTAGTAGATTTCACT
AAGCTATTGTCATTTTTGTTAGATAATGCTATAGAAATGAGTTTGGAGAC
AAAGCAACCTTGCTTATCAATAGCATTTCTGGATCAAAACCATAAACTTG
TCATAGTCATTCAAAGCAGTACTAAACAAGGACAAAATGATAGTCAAAGC
GTGTTTGCTACACCGGCTTTGAAAAAAAGAGATGACTGGCAATTTGACTT
AAGGAATGTCACGACCATTTTAAATCGTTATGACTATCTCACAATTAGCT
CGCAGATTCATGATGGCATTTTAACCCAGTTAATAGAAATAGCTAAGCCT
GACTGA
>M28_Spy1615 salR, transcriptional regulatory protein
ATGAAGATTTTATTAATTGATGACCACAGACTATTTGCAAAGAGTATCCA
ACTGTTATTCCAACAGTATGATGAAGTAGATGTCATAGATACGATTACTT
CTCATTTTAACGATGTGACGATTGATTTGTCTAAGTACGATATTACATTG
CTTGATATTAATTTAACAAATATTTCTAAAGAAAATGGATTGGAGATAGC
AAAAGAACTCATACAGTCTACTCCTCATTTGAAAGTTGTTATGTTGACAG
GATATGTTAAATCAATCTATAGAGAGAGGGCAAAAAAAGTAGGAGCATAC
GGTTTTGTAGATAAAAATATAGACCCTAAACAACTCATTTCTATCTTAAA
AAAAGTGGATTCTGGAAAAAAGTATTTTGAACAAATCGAATCTCAGGATT
ATGTTGAATCTTTAACTGACCAGGAAATAGCTATCTTAAATTTGAGTAAG
AAAGGATTCTCTATAAAAGAAATAGAGGAAACGTTACAAATTAGTAGGAG
AACAGTATTTAATCATTTGACCCACATCTACTCAAAGCTTTTGGTAAATA
ATAAGCAAGAGGCTATCTACAAAGCCGAACAATTAGGGTATTTTATGGAT
TTCTGA
>M28_Spy0337 spyA, C3 family ADP-ribosyltransferase
GTGTCAGGGGGAACTATGCTAAAAAAGCGCTATCAACTGGCTATGATCCT
TCTTCTTAGCTGTTTTAGTCTAGTCTGGCAAACTGAGGGCTTGGTCGAGC
TTTTTGTCTGTGAGCACTATGAGCGGGCGGTTTGTGAGGGGACGCCTGCT
TATTTTACCTTTTCGGATCAAAAGGGCGCTGAGACACTGATTAAAAAGCG
CTGGGGCAAGGGTCTCGTCTACCCAAGGGCTGAGCAAGAGGCGATGGCTG
CTTATACCTGCCAGCAGGCAGCCCCTATCAACACCAGCCTAGACAAGACC
AAAGGTGAGCTCAGCCAACTCACGCCTGAGCTAAGGGATCAGGTGGCCCA
GCTCGATGCTGCGACTCACCGGCTAGTCATCCCGTGGAACATTGTGGTAT
ACCGCTATGTGTACGAGACGTTTTTGCGTGATATCGGTGTTTCACACGCT
GATCTCACGTCTTACTACCGTAACCATCAGTTTGACCCTCATATCCTTTG
TAAGATCAAGCTTGGCACACGCTACACCAAGCACAGTTTTATGAGCACGA
CAGCCTTGAAAAACGGCGCCATGACCCATCGACCGGTGGAGGTGCGCATC
TGTGTCAAAAAAGGGGCCAAGGCAGCCTTTGTCGAGCCTTATTCGGCTGT
GCCTTCAGAGGTTGAGCTCTTGTTTCCAAGAGGCTGTCAGCTGGAGGTCG
TTGGAGCTTACGTGTCACAAGACCAAAAAAAGCTCCACATAGAAGCGTAT
TTCAAGGGCAGTTTGTGA
>M28_Spy0780 srtK, sensor protein
TTGGTTATAAATGGGATGTTTAAAAAATATTCAATAAAAAATCGTGTTTG
GCGCGCCGTCGTTGAAATTGTCTTTGGAGTTTGTATCACTGTTTTAATGA
TTGCGATAATATCGCTTTCTTTTTCAAAGTTAAATATAGTGACATCTCAT
AATGTGGGAGAAGAATTTTATATTAAAGATAAACAGTCAATCAAACAGTT
GAACAATTATATGAAGACATTGGGATTAGATTATGTTGTTTTTGATAGAA
AAACAGATAAAGCTATGGAAGGAAAATATTTATCTAAAGAATTTTCTTTA
TTTAACGAAGTTGCAGAAGAAAAAAATAATCTGACTTTTAATTCTGTACA
TTATGATTTATATACTAATATCAATTATAATATTGTTATAAGATATAATG
AGATACCGGAGTTTTCTAACCATTACCTTAGAAATGTTTCATATAACATG
TTGACATTTTATATTCTGGGAATAGGAACGAGTATCAGCATTGTAGTTGC
TTTAACACGGTTTGTAAAAGAAATTTCTTTGAATTTCAAGGAAATCAAGA
AGTTAGCAAATAAAATGGGGATAGAAGTCCTTTCTGAAAATGAAAATTAT
TCTAAAATAATCGAGTTTGATGATATACTTAGAACTTTACATATTAAAGG
TGATAATTTGAAAAGTTTGATTGAGCGAGAAATATTGGAAAAGCAAGATC
TATCCTTTCAAATTGCAGCACTTTCGCATGATATAAAAACACCTTTAACG
GTTTTGAAAGGAAATCTTGAGTTATTAGAATTGACTACTTTAAATAAAAA
TCAGGAAGGTTATATTGTATCTATGAACAATAGTATTTCTGTTTTTGAAG
GCTATTTCAATTCTTTAATATCTTATACACGCATGCTTTCAGAGGATAGA
TCAGTGAAACTAATTTTAGTTGAGAAGCTATTAAGTGAGTTACATTTTGA
AGTCGATGACTTATTGAATATCAATAATATTGAATTTTCTATTTGTAATA
GACTTATTATCACTTCTTTTTATGGAGATGAGGAAAATCTGATAAGAGCT
CTTTCTAACCTTTTAGTTAATGCAATAAGATTTATGCCCGTATTAGATAA
AAAAATCGAAGTTATACTGTCTGAGTCAGGAGAGCAAATTCATTTTGAAA
TATGGAATAATGGTGAGCGTTTCAGTGATAGTACACTGAAAAAGGGAGAT
AAATTATTTTACACGGAAGATTATAGCAGAGGTAACAAACATTATGGAAT
CGGTTTGGCATTTGTTAAAGGCGTTGCTATCAAACACGGTGGGAATCTTC
AATTGAATAATCCAGCTAGAGGAGGTGCTAGCGCCATAATCTCGATAAAA
AAGAAAATTTAA
>M28_Spy0779 srtR, two-component response regulator
ATGTATAAGATTTTAGCCATAGATGATGATAAAGAAATTCTGAAGCTTAT
GAAGACTGCTTTGGAGATTGAAAATTACCATGTTATAACCTGTCAAGAGA
TAGAATTACCAATAGTTTTTGATGATTTTAAAGGATATGATTTGATCTTA
TTGGATATCATGATGCCTAATATAAGTGGAACTGAGTTTTGTTATAAAAT
TCGGGAAGAAGTTCATTCTCCAATTATTTTTGTTAGCGCTTTAGATGGCG
ATAATGAAATTGTCCAAGCTTTAAATATAGGGGGAGACGATTTTATTGTG
AAACCATTTAGCTTAAAACAATTCGTAGCTAAAGTTAACTCTCATTTGAA
GAGAGAAGAGAGAGCAAAGATAAAGAATGAGGCTGAGGAGAGAGTGAAGC
GCAGTTTTCCACCTATAGAAATCTATCTAGAGGAACGTATGTTATATATT
GATAAACAGCCGTTATTCCTGACTTATAGAGAGTACGAAATTTTAGAATT
ACTGTCACGTCATCCGTATAAAGTTTTCACAAAAGAAGAGATATATGAAC
AAGTATATAGCGATGAAGCTTCAGCATTGTTTCATTCTATTTCAGAATAT
ATCTATCAGATTAGAATGAAATTTTCAAGTTTTGGAATTAATCCAATAAA
AACTATTCGCGGGATTGGTTATAAATGGGATGTTTAA
>M28_Spy1564 srv, transcription regulator, crp family
ATGTTAATTTCTCTTGAAGATACAAATTATACATTGGTAAAAGAATATTT
GGAGAAAAGCGTGAATCATCACATTTTGCAACGGTATATTGATAATCATA
ACTTTCCTATCATTGAAAAAAGTTATCACAAGTACTTGACTTTTGAAAGT
CTCGAAGAGGACTTCACTTATATTTTAAAAGACGGCATTGTGAAACAGAG
TGTTCTTTCAAAATATGGAATGGAATTTAATTTGAGATATGTTACAGGAC
TTGAAATTACTTCTGTTCTCAACACTGGTTATTCAAAAGATATGGGAGAG
CCTTATAATGTTCGCATCGAGTCAGAGAAAGCTAGTTTTTACAAGGTTCG
CCGCTCAGCATTTTTAAAAGATATAAACGAAGATATTGAACTACAAGGAT
ATGTGAAGGACTTTTACCATAATCGTCTTCAAAAATCCATGAAAAAAATG
CAATGTATGTTAACTAACGGCCGTATCGGTGCCATTTCTACTCAAATATA
TGACTTAATGACCCTATTTGGCGAAGAACTACCAAATGGTCAAATTTTAA
TTAATTTTGTCATTACTAATGAGGAACTCGGTAAATTCTGTGGCATTTCT
ACCGCTAGCAGCGTCAGCCGTATTCTAAAACAGTTGAAAGAAAAAAACAT
CATTCGCATTGATAAACAACATATTATCATTACCAATCTTGATAAATTAA
AAGATAATATCGTTTTCTAA
>M28_Spy1194 typA, GTP-binding protein TypA/BipA
ATGACTAACTTAAGAAACGATATCCGTAACGTAGCGATTATTGCCCACGT
TGACCACGGAAAAACAACACTTGTAGATGAATTATTAAAACAATCCCATA
CTCTTGATGAGCGTAAAGAGCTTCAAGAGCGTGCCATGGATTCCAATGAC
CTTGAAAAAGAACGTGGGATTACAATCCTTGCGAAAAATACGGCAGTAGC
CTATAACGATGTTCGTATTAACATCATGGATACCCCAGGACACGCGGACT
TCGGTGGTGAAGTTGAACGTATCATGAAAATGGTTGACGGGGTTGTTCTT
GTTGTGGATGCCTACGAAGGAACAATGCCCCAGACGCGTTTCGTATTGAA
AAAAGCACTTGAGCAAAACCTTATCCCGATCGTTGTGGTGAACAAGATTG
ACAAACCTTCAGCTCGTCCAGCAGAAGTTGTAGATGAAGTGCTTGAATTA
TTCATCGAACTTGGTGCCGATGATGAGCAATTGGAATTCCCAGTTGTTTA
CGCATCAGCTATTAATGGAACATCATCATTATCAGATGACCCTGCTGACC
AAGAGCATACTATGGCACCGATCTTTGATACGATTATTGATCATATTCCA
GCGCCAGTTGATAATTCAGATGAGCCTTTGCAATTCCAAGTGTCACTTTT
GGACTACAACGATTTCGTAGGTCGTATCGGTATCGGTCGTGTTTTCCGTG
GTACTGTTAAAGTGGGTGACCAAGTAACTCTTTCAAAACTTGATGGTACC
ACTAAAAACTTCCGTGTTACAAAACTGTTTGGTTTCTTCGGTTTGGAACG
TCGTGAAATTCAAGAAGCTAAAGCAGGTGACTTGATTGCTGTTTCAGGTA
TGGAAGATATCTTTGTTGGAGAAACCATTACACCAACTGACTGTGTGGAA
GCTCTGCCAATTCTTCGTATTGATGAGCCAACACTTCAGATGACTTTCTT
GGTCAATAACTCTCCTTTTGCAGGTCGTGAAGGTAAATGGATCACGTCAC
GTAAGGTTGAAGAACGTCTTTTAGCAGAATTGCAAACAGACGTGTCACTT
CGTGTTGACCCAACAGATTCGCCAGATAAATGGACGGTTTCAGGGCGTGG
AGAATTGCATTTATCTATCCTCATTGAAACCATGCGCCGTGAAGGCTATG
AACTTCAAGTATCACGTCCAGAAGTTATCATCAAAGAAATTGATGGTGTC
AAATGTGAACCGTTTGAGCGTGTTCAAATTGATACACCAGAAGAATATCA
GGGTGCAATCATCCAGTCTCTTTCAGAACGTAAAGGGGATATGCTTGATA
TGCAGATGGTTGGTAATGGTCAAACGCGTTTGATTTTCTTGATTCCTGCA
CGTGGTTTGATTGGTTATTCAACAGAGTTTCTTTCAATGACACGTGGATA
TGGTATCATGAATCATACTTTTGATCAGTATCTACCGGTTGTTCAAGGAG
AAATCGGTGGCCGTCATCGTGGTGCCTTGGTTTCTATTGAAAATGGGAAA
GCAACGACATATTCAATCATGCGTATTGAAGAACGTGGAACTATCTTTGT
CAACCCAGGTACAGAAGTTTACGAAGGGATGATTGTTGGTGAAAACTCAC
GTGATAACGACCTTGGTGTTAACATTACAACAGCTAAGCAAATGACAAAT
GTCCGTTCAGCGACTAAAGATCAAACTGCAGTTATCAAGACGCCTCGTAT
CCTAACGCTTGAAGAATCATTAGAGTTCTTGAATGACGACGAATACATGG
AAGTAACGCCAGAATCTATCCGCTTGCGTAAACAAATCTTGAATAAAGCT
GCGCGTGATAAAGCTAATAAAAAGAAAAAATCAGCCGAATAG
>M28_Spy0424 vicK, two-component sensor histidine kinase
ATGACTAGAGATATCATTGGAAACTTATCCACATTTGAATTAGCGATCCT
TATCTTACTTGTTTTTGTTGCTTTTTACTTTATCCATCTTGCGGTGCGTG
ATTACCGAAATGCACGTATTATTCGGATGATGAGCCATAAAATCCGAGAC
TTGATTAATGGTCGCTATACTGATATAATCGACGAAAAAGCAGACATTGA
GTTAATGGAGCTTTCAGACCAGTTAAATGACCTATCAGATGTTTTTCGCT
TGACGCATGAAAATCTTGCCCAAGAAAAAAATCGCTTGGCAAGTATTTTG
GCTTATATGTCAGATGGTGTACTTGCTACAGACCGGTCTGGTAAAATCAT
CATGATTAACGAGACAGCTCGCAAGCAATTAAATTTAAGTAAAGAAGAGG
CACTAAAGAAAAACATTACAGATTTGTTAGAAGGTGATACTTCATATACC
TACCGTGATTTGGTATCTAAAACACCAGTGGTAACTGTTAATAGCCGAAA
TGATATGGGTGAGTTTGTCTCATTACGCTTGCGCTTTGCGTTGAATAGGA
GAGAGAGTGGTTTTATTTCGGGCTTGGTTGTGGTGCTCCATGACACCACA
GAACAAGAAAAAGAAGAACGTGAACGCCGTCTTTTTGTCTCTAATGTAAG
TCATGAATTAAGGACCCCTTTAACTTCGGTTAAATCCTACTTGGAGGCTC
TTGATGAAGGTGCACTTAAAGAAGATATTGCTCCAAGTTTCATAAAAGTT
TCTCTTGATGAAACTAATCGGATGATGCGTATGATTTCAGATCTTTTAAA
CCTGTCTCGGATTGATAATCAAGTAACCCAATTAGCAGTAGAGATGACTA
ATTTTACTGCTTTTATAACTTCTATTTTAAACAGATTTGATTTGGTTAAA
AATCAGCATACAGGTACAGGAAAAGTCTATGAAATTGTAAGAGATTACCC
TATTACCTCTGTCTGGATTGAAATTGATAATGATAAAATGACACAGGTTA
TCGAGAATATTTTGAACAATGCCATTAAGTATTCTCCAGATGGTGGAAAA
ATCACAGTCCGTATGAAAACAACAGATACCCAATTAATTATTTCCATTTC
AGACCAAGGACTAGGTATCCCTAAAACAGATTTGCCTCTTATTTTTGATC
GGTTCTATCGTGTAGACAAGGCAAGAAGTCGTGCCCAAGGAGGGACCGGT
CTAGGCCTTGCCATTGCTAAAGAAATCATCAAGCAGCACCATGGCTTTAT
CTGGGCTAAGAGTGACTATGGTAAAGGATCGACCTTTACTATTGTCTTGC
CTTATGAAAAAGATGCAGCCATCTATGAAGAATGGGAGGAAGATGTAGAC
TAA
>M28_Spy0423 vicR, two-component response regulator
ATGAAAAAAATACTTATTGTGGATGATGAAAAACCGATTTCTGACATTAT
TAAGTTTAATTTGACAAAAGAAGGTTATGACATTGTTACAGCTTTTGATG
GACGCGAAGCGGTAACAATTTTTGAAGAAGAAAAGCCAGATTTAATTATT
CTTGATTTGATGCTCCCTGAGTTGGACGGTCTTGAAGTAGCCAAGGAAAT
TCGTAAAACCAGTCATGTCCCGATTATTATGTTGTCGGCTAAAGATAGTG
AGTTTGACAAGGTTATTGGACTTGAAATTGGGGCTGATGATTACGTGACC
AAGCCCTTTTCTAATCGGGAATTGCTGGCACGTGTCAAGGCTCATCTGCG
TCGTACCGAAACTATTGAAACGGCTGTTGCAGAAGAAAATGCTTCTTCAG
GTACACAGGAACTAACCATTGGTAATTTACAGATTTTACCAGATGCGTTT
GTTGCTAAAAAACATGGTCAAGAGGTAGAGTTGACCCATCGTGAATTTGA
ACTATTGCATCATCTAGCTAACCATATGGGTCAGGTGATGACACGAGAAC
ACTTATTGGAAATTGTTTGGGGATATGATTATTTTGGCGATGTGCGCACG
GTTGATGTGACTGTTCGTCGTCTCCGTGAAAAAATTGAAGACACACCAAG
TCGTCCTGAGTATATTTTAACAAGACGTGGTGTTGGGTACTACATGAAAT
CTTATGACTAG
>M28_Spy1373 yvqC, two-component response regulator
ATGACGATGAGTAAGATAAAAGTGATATTGGTCGATGATCATGAAATGGT
CCGCATGGGACTCAAGAGTTTTTTGAATTTACAAGCTGATATTGATGTCG
TTGGTGAGGCCTCTAATGGACGTGAAGGGGTTGATTTGGCATTGGCTTTG
AAGCCAGATGTTTTGGTTATGGATCTAGTGATGCCAGAGTTAGGCGGTGT
TGAGGCAACTTTAGAAGTTCTAAAAAAATGGAAAGAGGCTAAGGTACTTG
TGTTAACTTCCTATCTAGATAATGAAAAGATATACCCTGTCATTGATGCA
GGAGCGAAGGGTTATATGTTAAAAACATCGAGTGCGGCTGAAATTTTAAA
TGCCATTCGCAAGGTTTCAAAGGGAGAGTTAGCTATTGAAACAGAAGTTG
ACAAAAAAATTAAGGCGCATGATCAACACCCTGACTTGCATGAGGAACTA
ACAGCGCGTGAGTATGATATTTTACACCTTTTAGCTAAAGGGTATGATAA
TCAGACCATCGCTGATGAACTCTTTATTTCCTTAAAAACCGTCAAAACAC
ATGTGTCCAATATTCTAGCCAAGTTAGAAGTTGATGACCGAACCCAAGCG
GTTGTCTATGCTTTTCGACATCATTTAGTCCCCCAAGACGATAATTAA
>M28_Spy1374 yvqE, two-component sensor protein
ATGAAAAAACGTTACTATGCTCTTGTTTGGCTCTACTCAACCATTACCAT
TTTATCTATTGTTTTTGTGGTCATGGATAATTTAGGAATCACTTTTAACT
ACCTTCGCAATCATTTATGGCAGGTCGAACGTCTAGGGTTTTCGATTTTA
TTGTTGATTGTTTCTGTGACTTTATTATTGTTGTTATTGTGGATTATTAT
GGATGATAACAGTAAGCGTAACATCAACCAAAATCTAAAATATATTCTCA
ATAATCGACGACTCTATCTAGATGAGACATCAGAAATCAATACTAATTTA
AGTCGACTTTCTAAAAAAATGTCTCACCTGACTGCTAACATGCAAAAGAA
AGAAAGTGCTTATATTCTTGATAGCCAAGAAGTTGTAAAACAAGAGCGCA
AACGAATTGCAAGAGATTTACATGACACAGTCAGTCAAGAGCTATTCGCT
TCGTCATTGATTTTATCAGGAATTTCAATGAGTTTGGAACAACTGGACAA
AACACAATTACAAACACAGTTAACAACGGTTGAAGCAATGTTGCAAAATG
CTCAAAATGATCTACGCATTCTCCTTTTGCATCTTAGACCTACCGAGCTA
GCTAATCGGACTTTATCTGAGGGCCTTCATATGATTCTTAAGGAATTAAC
AGATAAAAGTGATATTGAAGTCATTTATAAGGAAACCATTGCTCAGCTTC
CTAAAACAATGGAAGATAATCTTTTTAGAATTGCCCAAGAATTCATTAGC
AACACGTTAAAACATGCTAAAGCTAGTCGAATTGAAGTTTATCTCAATCA
AACCTCAACAGAATTACAATTGAAGATGATTGATGATGGTGTAGGATTTG
ATATGGATCAGGTAAGGGATTTGAGTTATGGTCTGAAGAATATTGAAGAC
CGTGTCAATGATTTAGCAGGAAACCTACATTTAATTAGTCAAAAAGGCAA
AGGAGTTTCCATGGATATTAGACTGCCGATAGTGAAGGGAGATGACGATG
AGTAA