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COG category: Signal transduction mechanisms
Genomic element: chromosome

Number of genes found: 59

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# Streptococcus thermophilus LMG 18311, LMG 18311

>stu0052 conserved hypothetical protein
TTGCAGGTTCAAGCACCTAGACGGACACCAAAGATTCAACAAGTCGTCGA
GTTTGTCGAATCTTTGGATGACAACCACCGACTCAAGGGAAAAGAGGATG
GCGAGACTTATCTCATCGAGCCTAATGCTATTTCCAGAATTTACATCGAA
AATCGTCAAGTTCTAGCTGAAACTACTCAAGGAGACTATCACTTAGGCCT
ACGTCTCTATCAAGTTTTAGAAATATTGCCGGCCTACTTCATCAAAATCT
CACAGTCAGAGATTGTCAACCTCAAAGAAATTGAACGCTTCAACATCACC
CCTAACAGACTCGTAGAAATTCACCTAAAAACAAGGAAACTAGCTACTCA
TCACGCCGTTACCTCAAAGCAATAA
>stu0877 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGAAAAAAATAGTGAAAACAGTTTTGCTAGCCTGTCTTGTTATTTTGCC
TTTGTTTACGCTATCAGCTTGTAGCTCGCGCTCACATTTTGCAACTCAGA
AAGACCAGTGGCAAACTTATACCAAAGAAAAGAAAATCAAAATTGGTTTT
GATGCAACCTTTGTTCCTATGGGATATGAGGAAAAGGATGGTAGCTATAT
TGGTTTTGATATTGACTTGGCTAATGCAGTTTTTAAATTATATGGCATTG
ATGTTGAATGGCAAGCTATTGACTGGGATATGAAAGAAACTGAGTTGAAG
AATGGGACGATTGATCTTATTTGGAATGGTTACTCGGTTACAGATGAACG
TAAGCAGTCTGCAGACTTTACGGAACCTTATATGGTAAATGAACAAGTAC
TGGTAACCAAAAAGTCCTCAGGGATTGATTCTGTTGCAGGAATGGCAGGT
AAGACCTTAGGTGCTCAAGCTGGGTCGTCTGGTTATGATGCATTCAATGC
TTCTCCAAAAATTTTGAAGGATGTCGTTGCTAATCAAAAAGTTGTCCAAT
ATTCGACTTTTACACAAGCTTTGATTGACCTTAATAGTGGACGTATTGAT
GGCCTATTGATTGACCGTGTGTACGCTAATTACTACCTAGAAAAATCAGG
AGTTCTGGATCAGTATAATGTTATGCCTGCTGGTTACGAGGGAGAAAGCT
TTGCTGTAGGTGCTCGTAAGGTAGATAAGACACTAATAAAAAAAATCAAT
CAAGGATTTGAAACTCTTTATAAAAATGGAGAATTCCAAAAGATTTCTAA
CAAGTGGTTTGGTGAAGATGTCGCAACAGACCAAGTTAAAGGGAAAAGAT
AA
>stu0401 fructose PTS system component IIABC, truncated
ATGTTGCTTGACCTTCAAGCAACTACAAAGGAAGCTGCTATTGATGAAAT
GATTAACAGCTTGGTTGATAATGGTGTCGTGACTGACTTTGATGTTTTCA
AATCAGGCATTATGGCTCGTGAAGCACAAACATCAACTGGTTTGGGTGAT
GGAATTGCTATGCCACACAGTAAAAATGCTGCAGTAAAAGAAGCAACTGT
ACTTTTTGCTAAATCTAATAAAGGTGTGGATTACGGATCACTTGATGGTC
AACCTACCGACCTCTTCTTTATGATTGCAGCTCCAGAGGGGGCAAATGAC
ATTCACTTGGCTGCACTTGCTGAATTGTCAAAATACCTCATGCAAGATGG
TTTTGCAGACTGCTTGCGTCAGGTAACATCTGCGGATGAAGTGATTGAAG
CGTTTAATATTGGCGAAAAAGAAGCGCAAGCTGAGGAAGATAAGAAAGCA
CAAGCTGTTAAAGAAGCAGCTTCAAGCGACAAACCACTTATTGTAGCAGT
AACAGCTTGTACGACCGGTATTGCTCACATTTACATGGCTGAAGAATCAT
TGATTAAAACAGGTGAAAAAATGAGTGTCAATGTTCGTGTTGAAACTAAC
GGTGCCTCAGGTGTTGGAACACCAATGACCGCTGAAGAAATCAACAAGGC
TGTTGGTGTTATCATTGCAGCGGACAAGGCAGTTGAAACAGCATGCTTTA
ATGGTAAGAATTGA
>stu1393 unknown protein
TTGTGCACTGCTTCATTTGGTATCGCTGAAGAAGCATACAAATTCCGTAA
AAACTTAATCACAAAAGAAGAATTTTTACTAAATTCGCAAATCTTATGTA
TTGAAGTATCAGTTAGTGCATTATCCTCAATGCTAGGACATGCTGTAATT
CCAATAACTATTTTAGGAGCCGTTATTGAAAATAATATAGGAACTTTCCT
ATATGAAATCGCTAAAGATAATCTCACAATGAAAGAGAAATTACTAATAG
CAGATTATTTCAAAGAGATACAAGAATATAACTATTTTTTAGAGAATGAA
TTTGAATTATATAATCATCAACTTCAGAGAGATTAA
>stu0183 conserved hypothetical protein, putative protein kinase
ATGCAATTTAGTTTTGACTCTGATTTCAAAAAAATTGAGAAGTGTAAAAC
CTTAAAAGATGATTATTATAAATATGTTGAATTTGGGAGTGAGATTCCAC
GACAAGGGTGGAAAATTCATATTTCCTCAAATTTAGATAGTTATCAGATT
GTACTGAGATTGATCGTTGAATATTGTACAAAATATAAAATAGATTTTAA
ATACATATATAATAATAAGGTGCTAAAATATTTTTTATCTTCAGACTGTT
TTACGACCCAGGCTGGAAAGTGTATAACAATTTATCCTAAGAATGATAAA
TTGTTTAAAAATATTGTTTTAGACTTGGCTGATATATTGATTGGTTTCGA
AGGGCCGGTTGTTATATCAGATATGCAGTATAGAGATACCAACATTTTTT
ATAGGTATGGTGTAATGGCAGCACAATCAGACTATTTGTTAATTGGTGGT
ACTCCTATTATGGATAATAGGTCTTTTTTTGAGTTACCAAACGGCATTGA
GGATCCATTTGAAAACATTAATGATGAGTATCATAATGTAGCAACTTTTT
TAGGTTGTACAGTTGAACCTACTATGATTATACATGAGAGTGCCTCAGGT
AATGTATATGAATCGAAATATGATGGTAATGTTACTATTCTAAAGGAAGG
CCGTAAAAATATTTTGGGAACTAATAGTACTGCAATTGGAGATATAAAAA
ATGAGGAAAAGATAATAAAACAACTAGAAACTTTAGAAGGAATCCCTAAA
TACAGATTATCTTTTTATGAATGGGGAAATTACTATTTAGTTGAATCAAA
ATTGAAAGGGGACATGTTATCTTTGATAGCATCTAGTTTTCTATTCGAAA
GTATCCCTTTCTCAGATTTAGTGATGAAATTATTGATTTTATTTGATTCG
GTTCACCAAAAAGGTATTATTATCAATGATGTCAGCTCCAATAATATTTT
TGTTGATTTTACGGACGATGTATATGTATCACTTTGTGATTTTGGCTCAT
CCTACAATATTGTTGATTCTAACAGTGAAGAGGTTTTATCAATTAAATCA
AAAGGTGCAGGAATGACTATGACATTTTATGACCATAGCCATATTGAATT
AGGAGATAAGGAAAGAGATTTTCACAAATTAGGTTATACCTTAATGAACT
ATGTATTTCCGATAAATCAATATTTAAGACATGGTGTTTCTGGTAACGAG
GTATTAAAGATGTTCAGACAATTTTGTGTGATGACTTATCCTTCTGATAG
TATTTTTAAAGTTATTGAATTATTGATTAGACAACCATTGAATTGGAGAA
AAGATTTAGAAACATGTTTAAGACAAAGTAAAATAAGTACAGTTTTTAGG
AAACGTATAAATGATAGAACAAATCGATATTTTACTGCTGAGTTTATGAC
TAAATCTGAGAACTATGGCGATAGTTGTAGTTTGATTTATAAAAAAAGAT
ACTATTTTCTTGTACCAGAATTTAGTGAATGGTTAGAGAAAAATTATGGA
GAGTCTGTATTTTCAAATTCCTTTAAGATTTTTGATAAAAATTATGAAGA
ACTTAATATTGAAATATCAGAATATGGTCTGACACAACAATTGGGCAATA
TACTATTCTGGGTAAAAAATTGTAACGAATTTTCGTTTCATTCAGGTATT
GTTGGGCTTGGTCTAGAGGTTTTGTATGAATTAAAATTTAATCATCTAGA
TATACTTTATAAAGAGATACTAGATTTAATATATTTTAGGATAAAGTATA
GTATTAGCAATGATAATATTGTTGAAAATAATGGAATTTATGATGGAAAA
CTAGGCATAGTTTTATTTTTAGTAGAATATTATAAGTTGACGAAAGATGA
TATTATCCTTTTAGAGGCAAAAAGACTGTTTACTGAAGCTAGTCATGCTA
TTGTCCAAAAGGAAAATTATATTGAATTTGTTAATAGTTTTTCTGATAGT
ATTTCCACTCCCTATGTAAATGATGGCTTATCTGGTTATGTTTTATTGTC
TTTACAGTTATGGGAGTTAACTGGTGATGAAAACTATTTTAAGAAAGAAT
ATATTCGTTTTTTGACAAATATTTCATTTTGTAAGCGTAGAGATTTATTT
TCTGGACAACTGGGGATATCCTATGTTTTATATAAAGTTTCGCAGTCAAA
TTTTAGTACTATACAAGAATTAAATCTGACGAATAAAGCGATGAGACAGC
TGTCTAACTCTTCAATATTCGAGTTCAGAGAAAAGAATCGATTACATATC
TATGATTATTATCCTAATAATGAGGAGAGAGATGTAACTCATGAGTATCA
ATTTATGTTTAATCTATTTCTTACCCATCAGGAGGTTTAA
>stu0793 sensor histidine kinase (homolog to ciaH Spn), truncated
ATGCTGACTAAATTTTTCAATTATCTTTTCAGGAGAATCAAGTCAGACGG
CTTTAAGTCCTTCATCCATTTCTTTGCAACTTTTTCTGGTATTTTCCTTA
TCATGACTGTTATGATATTGCAGATTCTCAGTTATGGAGTTTATTCCAAT
GTTGACTCTAGTCTGAAAGCAGCAGTAACTAAGACCAATTCTTATTTGGA
AATGGAAATGCTAAAATGCGAATTTTTTCTGACTTCTGATGTAGATCAAA
ATAATACGGCAACTATCTATCAGGAGTATGATAGCAAAGCATATCGCTAG
>stu0112 conserved hypothetical protein
ATGAAAGCGATTATTACAGTTGTAGGTAAGGATAAAGCGGGTATTGTTGC
AGGTGTTGCGACTAAGATCGCAGAACTTGGTTTGAATATTGATGATATCA
CTCAAACAATCCTTGATGAATTCTTTACCATGATGGCGGTTGTATCATCG
GAAGATAAGAAAGATTTTACACACCTACGTGCTGAATTAGAAGCTTTTGG
TGAATCATTAAACGTCAAAATCAATATCCAAAGCTCAGCGATTTTTGATG
CTATGCACAACTTATAA
>stu0792 response regulator (homolog to ciaR Spn), truncated
TTGATTCTTTTGGACTTAATGTTACCTGAAAAAGATGGTTTTACAGTTCT
TAAAGAATTGCGTGAACAAGGAATAACGACTCCTGTTCTTATCATAACTG
CTAAGGAAAGTCTAGACGATAAGGGGCATGGCTTCGAAGTCGGAGCTGAT
GATTATCTAACCAAGCCTTTCTATTTAGAAGAATTGAAGATGCGTATTCA
GGCACTTTTGAAACGTTCTGGTAAATTTGATCAAAATACTTTTTCTTTTG
GAGATGTTTGTGTCAACCTTTCTACAAATTCAACTTATGTGGGTGATAAA
GAAGTAGAACTTCTTGGTAAAGAATTTGATTTATTAGTCTACTTCCTACA
AAATCAAAACGTTATTTTGCCCAAGTCGCAAATCTTTGATCGTCTTTAG
>stu1948 conserved hypothetical protein
ATGGAAGAACTAATTACACCAAGTGAAAAGAGAATCATTAATAGAAAAAA
AGGGGAAATATATGATTATATTTCATATTCAAATGCTTTTGTTCCTTATC
AAGGTTGGAAAATTCATATATCTGCTAATTTAATAGATTATCAGTCTATT
TTAGATAATGTTTACCATGTTTGTTCTATTTTTCAAACGCCATTTAAGTA
TATCAATAAAATATCTGAGTTATTCCGTATTTTATCAAAACACGTTTCGC
AATTAGAGATTGGAAAATTTATAACTATATATCCTAAAAACAAAGAAACT
TTTTTATTATTATTGGAAGAACTATATGATAAGATACCCAAATATACTGG
AGTTCAAATTTTGACAGATAGAAGTTATAAAGACTCAGAAATAATTTTTT
ATAGATATGGAGTAATGAATGCACGTTTAATTAATAATGAGCGACCAAAA
CTTAAATTTAATGGAACCTTTTATGAAGATATAACGGAACCATACTATAC
ATGTCCCCCATTTGTTGAAGATATCATATTTAATAAAGTTGTAGATGACT
ATAATATTGAATCTTTATTCCATGATAGATATCAAATGGAATCTATTATT
CATAAATCAGGAGCAGGTAATGTATATATTGCGATTGATACTATTAATGA
AGAAAAGGTTATTATAAAAGAAGCTAGAAAAAAAGTATATATTACAGAAA
AGATTTTAGCAATAGATCTCCTTTTAAATGAGAAATGTATTCTAAAAAAA
TTGAAAGGTAAAGTTGATATTCCAAATTACATTGAGTGCTTTACAATTGA
GGGAAATTTATATCTTGTTGAGGAATTCATTGATGGACAAAGATTGGATA
TTTTAAAGCCTGAATATAATTTGTTGATAAAACGAAATTCTAGCGAGTTA
GGAAGATATAATAAAAAAGTAAAAAAAATAATTTCTAATCTATTTTTAAG
TTTATATAAAATCCATCAGGAGGGAATAATATTAGAGGATATATCTTCAA
GTAATATTCTTTTAACAAATGATGATAGAGTATTTTTTATTGATCTCGAA
ACCGCATATAATAAGAATGATGGAATTATTGTTGAGACGACAAATGAATG
CTATCCCAAAAACATTTCTCAAAAAAATGAACAGCGAGATATTGTTAAAA
TGTGGTATTGTATAATTGATTTATTAACTAATTCTACTAGTCTTTTAAAA
TATGATAATACAGGAGTGAGTACCTTAAATTTATTTTATAAAATGAGTTT
AGAGAATAATTTACCTAAATCTTTAAGAAAAAAATTTATTAATGATTTTA
GTATAGTGGACTTTAAGAATACATTTATAATAAAATTTATTGAAATGGGT
TTAAATATAGAAAAAATAGTTAGAATGCAACAAGATTTAACAGAAACTAT
ACTTTCCCATAATACTTTTGAAATTCATGGAAAAACAATATTAGAGTCAA
TTGATAATTATAAATATATTAGTAATATGGATTTAAAATTTTCTAGCGAT
CCCAGTTTCTCTTCTCTTTATGATAATTGTAATAAAAGTATAGATGACTT
AATCGGAATCGCTATACTTGATAATAATTTTGAACTTTTTTTAAATTATA
ATTTAGATGAACTACTACATGATATGAGCTACTATCAAAAATATTATCTA
CTCAGACTTTTCAATGACACTAAAATATGTGATAGAGTCTACTTTATAAA
GGTCCTAAATTCAATCATCAAAAATGATATTAAGTGTATTGATGGAGTGA
AATATATAAAATCCAATGAGTATTTTAGCCCATATTTAATAACTGGTAAC
TCTGGGTTAATCATTGAACTTATTAAGTTCAGTAAAAATAACAATACAAT
GAAGTTCGATGAATGGATTAGAAGTTTATCAGAAGGAATTAGTTATACAT
ATGCTAAGGGAACCTCATTGTATTATGGATTAGCAGGATTGGGTTTGGCA
AATGCTTGGCTTTATTATTATTTTAAAGAAACTTCATTTCTTAAAACGAG
TATTAAGATTTGCGAACATATTTTTGATTTTTCTATTAAACAAAATACAA
AAACTATATTGATAGACCCGATGTCCGAAGAAATTGATTATACATATTCA
AAAGGAATGTTGGGGCAGTTGTACTTTATTAATGAGTTGCTAAATATAAT
TAAGGAATAA
>stu0152 transcriptional regulator, putative
ATGCGTCACCACACTATTCACCCTCAACTTGAACAAGTCTTCTCAGCCCC
CTATCTCAGACAATTACAGAAAGTCACCTTTCAAAAAGGCAATTACATTG
GCACTCAGGGACAGGATATCACTGAGTTAACCTACATTTTATCAGGTAGG
GTAAAAATTGTTCGCTCCCTATCCAATGGTAAAGAACACATCCTACAAAT
GCCTCAACAACCACAGCTACTGGGAGACGTTGAACTCATGACCAATCAAT
TAGCGGGTTCTTCAGTCATTGCTTTAGAAGAAGTTCAAGCAGCCCAGCTC
CCATTAAATAATAAAGAAGCACTCCTCAAAGACCCTATTTTTCTCTATCA
TATTGGGCGTAACCTAGCAATGGCCCTGCATAGACAGGGCATTACTGCCT
CAACGAATGCCAGCTACTTTGTCAAAGAGCGTCTAGCTACTCATATTTTG
AATATTGAGGAACAAGATATCTTTCAGTTATCACCATCCATTTTATCTTC
TAGTTTTGGGACTAGCTATCGACATGTACAGCGAGTCATCAAACAGTTTA
TCGACCAAGGAATCATTGAGAAGAAAGCTTTTAAAACCTATCGCATTTTA
CAGAGAGATAGCTTGGAAACCTTGGCTTTCATCGATTAA
>stu1492 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGAAAAAACTTTTCCTCGGGGCGATGGCTTTCCTTGTTGCTGTAACTTT
GGTAGCTTGTGGGTCAAAAAAAGACGCTGACGAATCTATTAAAGAAAATA
AAAAACTTGTCGTGGCTGTCAGCCCAGACTATCCACCATTTGAGTTCAAA
ACTTTGGTAGATGGTAAAGACCAAGTAGTTGGTTCAGATATCAAGTTGGC
ACAAGCTATTGCGAATGAACTCGGTGTTAAGCTTGAAGTTACAACAATGA
GCTTTGATAACGTGCTCTCAAGCCTTCAATCAGGTAAGGCTGATCTTGCT
ATTTCAGGTATCTCAGTAACAGACGAACGTAAGAAAACCTTTGATTTCTC
AGATCCTTACTATGAAACACAAAATGCTATCATCGTTCGTAAAGGTCAAG
AGTCTACTTACTCAAGTCTTGATGCTCTCAAAGGTAAGAAAGTAGCAGTT
CAAAAAGGTACCATTGAAGAAGGTCTTGCTAAGAAACAATTGAAAGATTC
AATAGTCATATCACTTACAGCAATGGGTGAGGCGATTAACGAGGTGAAAT
CTGGTCAAGTTGATGCTGTTGACCTTGAAAAACCAGTAGCAGAAGGTTAC
GTGGCACAAAATTCAGATTTGACCTTGGCAAGTGTTGCCCTCAAAGTTGA
TGATGGCGATGCAAAAGCAGTCGCTATGACTAAAGGCAACGACAAATTGA
AAGAAGCAGTCAATAAAGTCATCAAAAAATTGAAAGCAGATGGTACTTAC
GACGAGTATATCAAGGATGCTTCTAAATATACAGCAGCTGAATAA
>stu1175 conserved hypothetical protein
ATGGTAGTTATGACTAACGAAGAAAAAAAAATAGCTTATGACTTAATGCT
TGCTCAGGCTAATGTGCTATTTGCTAATGAAGACAACGCATTGGCTAATT
TTGCCAATGCCTCAGCTCTTTTAAATACAACTTTGCCAAACTCTGTGTTT
ACAGGTTTCTATCTGATGGATAATATCAAAAATGAGCTAATCCTTGGTCC
TTTTCAAGGTAATGTCTCTTGTGTTCGAATTGCCTTAGGTAAGGGTGTTT
GTGGCCAATCTGCTGCAGAAAATAGAACCTTGATTGTCCAAGATGTCACT
AAACATGCCAACTATATTGCCTGTGATTCTGCTGCTCGAAGTGAAATTGT
TGTCCCTATGGAAAAGGGTGGTAAATTAGTTGGTGTTCTTGATTTGGATT
CTCACCAAGTAGAAGACTATAACCAGGTGGATCAAGATTATCTGGAAGCA
TTTGTCAAAATATTACTTGAGGAAACTGATTTTACATTTGGAATGTTTGA
GGTAAACTAA
>stu1579 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGAAACTAACAAAGAAAATTTTTGCCCTATTAGCCCTCGTCTTTGCCTT
GGTGGCAGTGACTGCTTGCTCAAGTAACAGTAGCTCTGGTAAATCAACAG
CCAAAGCACGTACTATTGAAGAAATTAAGAAGAGTGGTGAGCTTCGTATC
GCCGTCTTTGCGGACAAGAAACCTTTCGGTTATGTAGATAACAAGGGTGC
TTACCAAGGTTACGATATTGGACTTGGTAACCGTTTGGCCAAAGACTTGG
GTGTTAAACCGAAATACGTCTCAGTAGATGCGGCCAACCGTGCAGAATTC
TTGATTTCAAACAAGGTAGATATTACGCTTGCCAACTTTACAGTAACTGA
TGAACGTAAGAAACAAGTGGACTTCGCCCTTCCTTACATGAAAGTCTCAA
TCGGTGTAGTGTCACCTAAAGACAAGGTCATTAAGGACGTTAAAGAGCTT
GAAGGCAAGACCTTGATTGTTACTAAGGGGACAACTGCTGAAACTTATTT
TGAAAAGAACTACCCAAATATCAAATTGCAAAAGTATGATCAATATAGCG
ATGCCTACCAAGCACTCCTTGATGGTCGTGGCGATGCCTTCTCAACAGAT
AATACAGAAGTTCTTGCTTGGGCTCTAGAAAACAAAGGCTATGAAGTCGG
AATCACATCACTTGGTGACCCAGATACTATCGCTCCAGCCGTTCAAAAAG
GTAACAAAGAACTCCTTGACTTTATCAATAAAGATATTAAGAAACTTGGC
GAAGAGAATTTCTTCCACAAAGATTATGAAAAAACACTTCACCCAACTTA
CGGTGATGCTGCTAAAGCTGATGACCTCGTTGTTGAAGGTGGCCAAGTGA
AATAA
>stu1942 unknown protein
ATGTTAAGATTTAATCAATTTGATTTACGTAGGGATTTTGAATTACCTAT
TTTTATAACTTTTGAAAATACGAACAATAGAATAGTCAAAAATAAAATTT
TGAAAGAATTTGGAATACATGGTTTTTTGATCAAAAATCATGAAAAAACA
ATTTTGAAAATGAATGGCTATCCGGAAAATATTATTGTTGATGAGTCACA
AAAATATAAAAATAGAGAAATAAATTGGTTTGCTGAGACTTGGGATGGAT
TGTTAAAGTTTAATTTTAATAATTTAAAATTAATAAAAACTGGCTCTTCT
AGTGGTCAGATACACTCATCTACTTGGGAGGTATTTGATTATTTTATATC
AAATAATTTCTGTTTTAATAACAATATTCGAAGCGCAATAGTTCAAATTG
ATGACTTAACAAAATGGTTATTGACAGACTTGAGTTTAGATTATGATGAT
TATAACTTTGAAACTAAAATTGATTCTTACCAAGATATAGAATTTAATAA
TCACAAATTTTCTATTGATATTATAAAGGGGTTTGAAGAAGAGATAAGTA
GTTTACAGAAAAAAATTGAAGCAAATGTACTAGTTGAATTTAATTTTGAA
GATAATTTAACAAAATATGAGACTAAATTAATAATAGATCAATTCAGAAA
TTTGGTGCAAATATTAACTGGAATGAATATCGGAGTAAATAAAATTTTGG
TAAATCAAAATTCTAATTGGATATTATCTAATTTATATCTACCTTCTATC
GAGGAGAGGAGTAAGAATTTCTCACAAACGAGTTACTCAAGATTGAGAGA
CAAGTTTAGTATAATACTCCAAAAGTGGTTCTCCAATAATAGGATACAAA
TATTATCCGCAAATTTTTTGCATGGTATTCATTATAATGTACCATTAGAT
ACTACTCTAATTGTGCTGGTTTCAGGAATTGAAATTTACTTTTCAAACTA
TAGAGAAAATAATAAGGAGATTTCGGCTAGGAAAAAAGTTGAAAAAGTAA
TTGAGTCTGTTGATGCTAGTTTGTCTAATTTTAAAAATACTCAGGAAATG
GAAAAATTCAGTAAGCTTATAATAGATAATAGAGTTTACAGAGTTCATGG
AACGAAACGAAAAAACATAATAGAATCTGAATATGAATTAAAAGAGCCAG
TTAAGCAATTAGAGAAGTATATTTATGATTTTATATTGCACAATTTAGGA
GTATGA
>stu1381 response regulator (homolog to RR08 Spn) uncoupled, truncated
ATGAAAAAGACAATTTTGCTGGTTGATAATGAGATAGATGTTCAAAACCG
CTATTTTTTACAGGCAGGATACGATGTTTTAGTTGCTCATGATGGCAAGG
AGGGATTAGAACTTTTCAGAAAAAAATCTATTGACCTCATCATCACAGAT
ATCATGATGCCCAATATGAACGGTTATGATTTTATCAGTGAGGTTCAATA
TATTGCTCCTAATCAACCCTTTCTCTTTACAACTGCTAAAACAAGCGAGC
AGGATAAGATTTATGGATTAAGTTTGGGGGGATATGATTTCATAGCCAAA
CCGTTTAGCCTGCGCGAATTGGTTTTAAGAGTGAATAATATCTTACGTCA
CCTTAGCCGTTGA
>stu0437 sensor histidine kinase, uncoupled, truncated
TTGGTAGTCTTTTTGGACACGACCTCTTATTATAATTCTTCCCAAGCCTT
GTTCAATCTTTCTATTCTTTTATCACTGTTTGCTTTTATCTTTTTTGTCA
TCATTGTCAGTGCTTTGTCAGGAATCGTCATTCGCCCCTTCATTCGAAAT
TATGAAAAGCAGCGACGTTTTATCACCAATGCTGGTCATGCATTAAAGAC
ACCGTTAGCTATTATTTCTGCTAATACGGAGCTACAGGAACTCATGACAG
GGGAGAATGAATGGCTCAAGTCAACTAATGACCAAGTGGCACGTTTGACT
AATCTAATCAATTCTCTTGTGGCTTTATCTCGTCTGGAGGAGCAGCCGGA
CATTGTTCTTCAAGATGTGGATTTTTCCTATATTACAGAGGATGCAGCCG
AGGACTTTAAGGGACCTGTCGTCCGAGATGGCAAATCCTTCGTTATGGAT
ATCACTCCAGATATCCATGTAAAATCCGAGGAAAAATCTCTCTTTGAACT
GGTAACTCTCCTAGTGGATAATGCTAACAAGTATTGTGATCCAGAAGGAA
CGGTTATGGTAAGACTTCGTCAGATTGGAAGAACGTGTAAAAGGGCTCAT
TTAGAAGTGTTAAATACCTATAAAGAAGGCAAGGAAGTTGATTATGGTAA
GTTTTTGAGCGCTTTTATCGTATTGATGAGTCTCATAATAACAAAGAGCA
CAGTGGTTTCGGCATAG
>stu1162 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGATTTTCAAAAAAATCTTACGTTACCTAACAGCCGTAAGCTTGGTGAT
TGCTACTGTTTTTCTGATCACAAATCACAAAACTGAGGCAGAAGATACTA
GCAAACTCCTAGATAGTAAGGCCGTCCAAAAGATCGTTAATCGAGGAACA
CTTAATGTTGGTGTTAAACAAGATGTCCCTAACTTTGGTTACTATTCTGC
TAAGACCAATAGATACGAAGGTATGGAAGTTGACCTTGCTAAAAAGATTG
CTGATGAGTTGAGAGTAAAAGTGAATTACATTCCAGTAACGACACAAACC
CGTGAACCTCTTATGGATAACGGTACTATTGACTTACTTATCGGTACTTA
TACTATCAATGATGAACGTAAGGCTTCTTATGCCATCTCTAATCCTTATT
ACCGTGATCAAATTGGTTTCTTAGTCCTAAAGGATTCAGGTATTAACAAA
ATCTCTGATTTGAATGGTAAGACTATCGGGGTTGCTCAAGGGGCATCAAC
TAAAGCCGCCTTGCAAGAATATTCCTCAGCCCATAATCTTAAGTTCAACT
ACGTTCAACTTGGTTCTTACCCGGAATTGGCTGTATCTCTTTACGCCCAC
CGTGTGGATGCTTTCTCAGTGGATAAATCTATCCTCTCTGGATATGAAAG
TAAGAAAACTAAAATATTGAACGAAGGTTTCAAAACACAAGATTATGGTA
TTGCTTCAAGCAAGTCTAACCAAGAGTTGATTGACTATACCAACGATTTG
ATAGCTAAATGGCAAAAAGATGGAAGTCTTCAAAAACTCTACGATAAATA
TAATTTGAAACCTGCTAAGGCTGAAAATAAATAG
>stu0291 ABC transporter substrate binding protein
ATGAAACTTAAAAAAATTCTTGGAATTACGGGTGTAGCCATTGCTTCAGT
GGCTTTGCTTGCTGCATGTTCATCTAAATCACCAAAAGAAGCATCTAAAT
CTTCAGGTGCTAAAGAAACAATTAACTTTGCCACTGTTGGGATAACAGCA
CCGTTCTCATATGAAGAAAACGGGGAATTGACTGGTTACGATGTGGAAGT
GGCTAAAGCAGTCTTCAAAAACTCTGACAAATATGAAGTGAAATTCAAAA
AAACAGAATGGTCTTCAGTCTTCACAGGTCTTGACTCAGCTAAATACCAA
ATGGCTGGGAACAATATCTCTTATTCAGAAGAACGTGCCCAAAAATATCT
CTTCTCATATCCAATTGCTACCACACCAGCTGTTTTGACTGTTCCAAAAG
ATAGTAATATTAAGAAATATGATGATATTGCTGGACACTCAACGCAGGTT
GTTCAAGGAACATCGACAGTTACTCAATTGACAGAGTTTAATGATAAACA
TTCAGACAAGCCAGTTGAACTTAACTACACAAATGAAAATATTGAACAAA
TGTTGACAAATTTGAATGAAGGCAAATATGACTTCAAGATCTTTGAAGCA
CAAACTGTTAATGCAATCATCAAAAACAATAAATTGAGCAACTTGAAGAC
TATTGAGCTTAAATCTGATGAACAACCATACATCTACTTCTTGTTCGCAG
ATAATCAAAAAGATCTTCAAAAATTTGTAAACAAACGTTTGGAAGAACTC
CAAAAAGATGGTACTTTGGCTAAGTTGGCTGAAAAATTCTTTGGAAACAA
AGATTATATTCCAACTAAAGATGCTTTGAAAGTTCCAAGCAAAAAATAA
>stu1637 conserved hypothetical protein
ATGTCTCAACAATATGAACATATTATGGTAGCCATCGACGGTTCTCACGA
ATCAGAGCTGGCCTTTCTCAAAGGTGTGCACGTTGCAAAACGTAATAACG
CACAGTTACTTTTAGTACATGTTATCGATACACGCGCCCTTCAAAGCATT
ATGACTTTCGATTCTTATATCTATGAAAAACTAGAAGACGAGGCTAAAGC
TGTATTGGCTAACTATGAACGTCAAGCCAGAGAAGCTGGTTTAACTAAGA
TTCGCAAAGTTATTGAGTTCGGTAATCCTAAGAGCCTTTTGGCTGTTGAT
ATCCCTGATAAGGAAAATGTTGACCTTATTATGATTGGTGCCACTGGTCT
CAATACTTTTGAGCGTCTGCTTGTCGGTTCATCTTCTGAGTACATTCTCC
GTCACGCAAAAGTCGACTTGCTCGTTGTTCGTGATTCTGAAAAAACGCTA
TAG
>stu1240 unknown protein
TTGGGTGGTTTGTGGGTAAATAGTAATAATACTGGTTTGGTTTATGACTT
AAATGGGAAGAAGTCAAAACTCGTTGTAGGCTATAGGGAAGAAGAAATCA
AAGAAATCTCTATTGGTCAGAAAGTTAGACAGAAGTTTGAAACAAGCTTA
GAAGACGTTAGTGATTCAAAACTAAAAACGATTGCTGATTTTGACAAGAA
ATACCAATTACAGACAAAAGAGGTTGTATTGGTAAAGACGGAAAGGGGTT
GGCTACTATAA
>stu1654 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGAGAGTATCGAGGATTATAGATATGAAAAAATGGCTTGCAGTCATGGG
GATTCTTGGCTTGTCAGTTATGACTTTGGCAGCTTGTGGAAACAAAGGTG
ACAGTAAGGTATCTGGTGAAAAGCAGACGATTACTGTTGCGACTGACTCT
GATACGGCACCTTTCACTTTTAAAAAAGGTGATGACTTCAAGGGTTATGA
TATTGATTTGGTAAAGGCTGTTTTTAAGGATTCAGACAAGTATGAGGTCA
AGTTTGTAACGACGCCTTTTGATTCCATCTTGACAGGGGTGGATTCTGGA
CGTTATCAGATTGCAGCTAATGATTTTAACTACAATGAAGAGCGTGCACA
GAAATATAGTTTTTCAGATCCGATTTCACGTTCTAACTATGCAATCATCA
GTGCTGAGGGTACAAAGTATACTAGCCTAGACGATTTGTCTGGGAAGACA
ACAGAAGTGCTTCCTGGCACTAACTACGCTCAGTTGCTTGAAAACTGGAA
CCACGCCAATGCGGACAAGACACCAATTACAATCAATTACGCTTCTAGCT
CGACGGGTCTTTCAACACGCGTTCAACACATTCAAGAAGGAAAAATTGAT
TTTATCCTTTATGATGCCATTTCGTCTGAGTACATTGTTAAAGATCAAGG
CTATAAGTTGGCTGTAAACAAGCTTAAAGATGATATCGGTATGAAGACTG
ATGGTCTTGAATACCTTCTTTTCTCAAAAAATAAGCAAGGTAAGGAACTC
AAGACTTTTGTCAATAAGCGTATCAAAGAGCTTAAGAAGGATGGAACCCT
TGCCAAACTCAGTAAGGAATACTTCGGTGGCGATTACGTCAGTGATTTGA
AATAA
>stu0975 amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein, truncated
ATGGGTGCCGAACTTGTTGTTTATGACAATGTTACCAATGATGTGTACAT
GCAAGACTTGGTAAATGGGCGTACAGACGTTATCGTTAACGATTACTATT
TGCAAAAAATGTCAGTAGCCGCTATCAAGGATAAGTACCCTGTTAAAATC
AACGATGGTATCTACAGTAACCCTTACTCAACAAGCTTTACTTTCTCATC
GAAGAATAAAACTCTTCAAGAAAAAGTTAATAAAGCCATCAAAGACATGA
AGGAAGATGGTGCCCTTACCAAGATTTCTGAGAAATTCTTTGCTGGTCAA
GACGTTACAAAGAAAACAAAAGTTGATTACACTGAGATTGATATCTCTGA
TGTTGAATAA
>stu0296 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGAAACTTAAAAAAATTCTTGGAATTACGGGTGTAGCCATTGCTTCAGT
GGCTTTGCTTGCTGCATGTTCATCTAAATCACCAAAAGAAGCATCTAAAT
CTTCAGGTGCTAAAGAAACAATTAACTTTGCCACTGTTGGGACAACAGCA
CCGTTCTCATATGAAGAAAACGGGGAATTGACTGGTTACGATGTGGAAGT
GGCTAAAGCAGTCTTCAAAGACTCTGACAAATATGAAGTGAAATTCCAAA
AAACAGAATGGTCTTCAGTCTTCACAGGTCTTGACTCAGCTAAATACCAA
ATGGCTGGGAACAATATCTCTTATTCAGAAGAACGTGCCCAAAAATATCT
CTTCTCATATCCAATTGGTACCACACCAGCTGTTTTGACTGTTCCAAAAG
ATAGTAATATTAAGAAATATGATGATATTGCTGGACACTCAACGCAGGTT
GTTCAAGGAACAACGACAGCTACTCAATTGACAGAGTTTAATGATAAACA
TTCAGACAAGCCAGTTGAACTTAACTACACAAATGAAAATATTACACAAA
TGTTGACAAGTTTGAATGAAGGCAAGTATGACTTCAAGATCTTTGATGCA
CCAACTGTTAATGCAATCATCAAAAACAATAAATTGAGCAACTTGAAGAC
TATTGAGCTTAAATCTGATGAACAACCATACATCTACTTCTTGTTCGCAG
ATAATCAAAAAGATCTTCAAAAATTTGTAAACAAACGTTTGGAAGAACTC
CAAAAAGATGGTACTTTGGCTAAGTTGGCTGAAAAATTCCTTGGAAACAA
AGATTATATTCCAACTAAAGATGCTTTGAAAGTTCCAAGCAAAAAATAA
>stu1495 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
TTGATTATGAAACCATGGAAAAAACTTTTATTGGGCCTTGCAGGTATCTT
TGCTTTGACATCTTTAGCGGCTTGTTCTTCATCGACTAACACATTAGATA
AAGTAAAAAATAAGGGGACTTTGACTGTCGCTCTTAATCCCCACTTTGCC
CCTTTTGAATTTAAAACAATCCAAGATGGTAAGGATACTATTGCTGGGGC
AGACATCGAAATTGCCAAGGTTATTGGTGATGAACTAGGTGTGAAAGTCA
AATTCTCTGAAATGTCTTTTGACAATGTCCTAGCCAGCGTTCAATCTGGT
AAAGCTGATATTGCCATTTCTGGTATATCAGCTACTAAAGAACGTCAGAA
AATTTTCGACTTTTCAGATACTTACTATGATTCTGAAACGGTTCTTCTTG
TCAAAAAAGATGCCACAGAAAAAACCTACAAACAAATCAGCGACTTTTCT
AAGAAATCTATAGCTGTTCAAAAAGGCTCAATTCAAGAAAATATTGCCAA
AGCTAATTTGTCGGATGCCAATGTGGTTTCCTTGGCGCAACCTGGTGAAG
CTATCAATGAGTTGAAATCAGGTCAAGTCGAAGGAGTGGTGCTAGAAAAG
GCTATCGCGAAAGGTTATGTGGACCAAAATAGTGATTTAACTATGTCAGA
TATTGCTCTAAAATCAGATTCAAACGATGCTTACGCTGTAGCGATGCCTA
AGGGCAGTGATGATCTTAAAGCCAAGGTTAATAAGATTATCGCTAAACTC
AAAAAAGAAGGTAAAATTGACAGCTATGTTCAAGATGCCTACGCTCTTTC
ACTTAAGAGTTCTAGCAAATCAGGAGTCACAATATGA
>stu2001 conserved hypothetical protein
ATGAAAAGATTTCACTTTGAAACTATTCACCTGATAATGATAGGACTAAT
TCTTTTTGGAATTGCTACCATTTTTGTCCGCGTATTACAAACGGAGTCTG
CACTCATTTTTGCGCTTTTTATCATTATGGTAGTAGTTGTTGCACTATTG
CATTACCAAAAGACAACATATGAGTCTTTGGAAATAGAACAATTAGATGA
ACTGAATCAGGATGTGGAAGCTTCTTTGAAGACTCTTCTTGAAAAGATGC
CTGTCGGAGTCGTTACTTTTGACGAAAATGACCATATTGAATGGTTCAAC
CCCTATGCTAAGTTAGTGCTTTCAGATGAATATGGGAACTTCAATAAGCA
GTTGATTGCAGATTTTATCTCCCAGAAACGAAAGGGGTCACCTTCGAATG
TGATAACTGTTGGTGACAATAAATACGCTGCCTTTGTGGATTTTGACAAT
AAGCTGACATATTTTATTGACAATGTTTATGATCAAGATGAAAATGTTGA
TCCAAATATGACTCGACCTGTTATTGGGATTATTTCAGTTGATAACTACG
ACGATGTGACAGGAAGTTTGCCAGATGCAGATGTTTCAAAAATCAATACA
TTTGTAGTAGGATTTATTTCTGAGTTTGCTAAGGCTAAGCATATTCATTA
TCGACGTATTGAAGGGGATCGTTTTTACTTCTTTACCAATTACAGTGTTT
TGACAGAATTCATGGATCAAAAGTTTTCTGTCTTGGATGACTTTCGTCAA
CAAGCACAAGAACGTGGTTTACCACTGACTTTGAGTATGGGAATATCCTT
TGGTACGCTTAAGCATGATCAAATCGGGCAAGTTGCTTTGCAGAACCTTA
ATATTGCACTTGTTCGAGGCGGAGATCAAGCTGTTGTTAAGGAAAATGAT
GATCACAAGGAACTTCTTTATTTTGGAGGAGGCTCTGTCTCAACAGTTAA
GCGTTCTCGTACAAGAACAAGGGCTATGATGACTGCAATTTCATATAAGT
TAAAAACAGTCGAAAAAGTATTTGTTGTAGGTCACAAAAATCTTGATATG
GATGCCTTAGGGGCTACTGTTGGTATGGCCCATTTTGCTAGTCAGATTGT
TAGAAAGAGCTATGCTGTTTATGATGATATGGCTATGAATACGGATATTG
AGCGTGCGGTAGAACGTTTGAAAGAAGATGGGCAGTCACCCCTTATTACA
CTCTCAGAAGCTGAAGAACTAGTCAACCAACACTCATTGCTAATTATGGT
TGACCATTCAAAAATCAATCTAACCCTATCTCAGGATTTTTATGATCGAT
TTAATGAAGTTATTGTCGTAGATCATCACCGTCGAGATGACGACTTCCCT
GAAAATGCAGTTTTGACTTTTATTGAAAGTGGAGCAAGCTCTGCTTGTGA
ATTGGTTACGGAGTTGTTACAATTTCAAGGGGCTCCAGAACGTTTGAGTA
AAATCCAAGCTTCTATCCTTATGGCAGGTATAATGCTGGATACCAAGAAT
TTCTCTACTCGTGTTACTAGTCGAACTTTTGATGTTGCCTCTTACCTTCG
TAGTTTAGGAAGTGACAGTGGAGAAATTCAAATGATTTCTGCTACGGATT
TTGACGAATATCGACGTATTAATGAGTTAATTATTGCAGGCGAACGAATT
ACTGATGATATAATCGTTGCTACAGGAGATAACCACAAGTGCTATAATAA
TGTTGTGATTGCTAAGGCGGCAGATACTATGCTTGCAATGGCTGGAATCG
AAGCAACCTTTGTTGTTGCTCGAACAAGTCACTCGACTGTAAACATATCT
TCTCGAAGCCATAATGCGATTAATGTACAACGTATTATGGAAAAATTAGG
TGGTGGTGGACATTTCAACCTAGCCGCCTGCCAATTACGAGACTGTAGTG
TTTCTCAAGCGCAAAATAAATTAATTGAAACTATTATGGGAGAGTTGGCT
CCCAAGGAGGATTAA
>stu1647 conserved hypothetical protein, putative protease
GTGGCAAACAAGACAAAATCTAAATCGCTATTAGAGAAAATGTGGCGTAT
TAAGTGGTGGTTATTAAGTATTTTTACGGTACTTTTCCTCCTTTTTGCCC
TCTTTTTCCCGCTCAATAATTACTATGTGGAGCTTCCGGGTGGTGCTTTT
GATACCAAGGAAGTCTTGACAGTGAATAAGAAAGCTGATGATTCTAAGGG
CTCCTATAATTTTGTGGCGGTGGCTCAAACCAAGGCGACTTTGGCCTTGA
TGCTCTATACTCAGTTTAATGATTTTGCAAAGCTTCAAACGGCTGAAGAG
GCAACTGGAAATTACTCTGATGAAGATTTCATGCGCATCAACCAATTTTA
CATGGAGACTTCTCAAAACCAAGCGGTTTATCAGGGCTTGACTCTGGCTG
GTAAGGAGGTTAGTTTGGAGTATATGGGTGTCTATGTGCTTCAGGTTGCT
GATGATTCTAGCTTCAAGGGTGTCCTCAATATTGCTGATACGGTGACGGC
TGTTAATGGTAAGACCTTTGATAATTCTACTGACATGATTAAATACGTTC
AAGGACTTAAGCTGGGTTCAAAGGTCAAGGTCACTTATATGAGAGATGGC
AAAGAAAAGACTGCTACTGGTAAGATTATTAAGATTGCCAATGGCAAAAA
TGGTATTGGTATCGGCCTAACGGACCATACTGAGATCAAGAGTCCTGAGA
ATGTTAAGTTTAAACTGGATGGTGTCGGTGGGCCAAGTGCTGGTCTTATG
TTTACCTTGGCTATTTACGATCAGGTGTCTGGTCAAGACCTCAAGGCTGG
CCGCAAGATTGCTGGTACAGGAACTATTGAAAAAGATGGGGCTGTCGGTG
ATATCGGTGGGGCCTATCTCAAGGTGAAATCTGCGGCTGATAGTGGCGCA
GACATTTTCTTCGTGCCAAATAATCTAGTAACTAAGGAAATGAAAAAGGC
TGATCCGGATGCCAAGACTAATTATCAAGAGGCCAAGGAAGCTGCTGAGA
AACTGGGGACCAAGATGAAAATCGTCCCTGTTAAAACAGCTCAAGAAGCC
ATTGATTATTTGAAAAAGACTAAATGA
>stu0159 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein/membrane-spanning protein
ATGAAAAAAATTATTATAGCCTGCTTTGCGGCTCTCCTCCTCGTTTTTGG
CGGATTATCAAGCGCTCAAGCAGACGAGTATCTCCGTGTTGGTATGGAAG
CTGCCTATGCACCTTTCAACTGGACACAGGATGATAACTCAAACGGAGCC
GTTCCAATCGAAGGTACTAAACAGTATGCCAACGGTTATGACGTGCAAAT
CGCTAAAAAAATCGCTGAAGCCCAAGGTAAGAAACCCTTGGTGGTCAAAA
CAGCTTGGACAGGTTTGATTCCTGCCCTCACTTCTGGCAAGATTGATATG
ATTATCGCAGGTATGAGTCCAACAGCTGAACGTCGTCAAGAAATCGACTT
TTCAGATAGATACTACCGTAGTGAACCTGTTATGGTTGTTAGCTCTGATG
GCGATTACGCCAAGGCTAAGAGCGTCAAGGATTTCAAAGATGCTAAAATC
ACAGGGCAACAAGGAGTTTACCTCTACAACTTGATTGATCAGATTCCAAA
TGTGAACAAACAAACTGCCATGGGGGACTTCGGTGCGATGCGGCAAGCCC
TTGCATCTGGTATCATCGATGGTTATGTCTCAGAGCGACCAGAAGCACGC
ACTGCTGAAAAAGCTAGCTCAAAATATAAGATGATTTCGCTTAAAGATGG
CGGCTTCCAGGTCTCAGACGATGATGTTTCCTTGGCTGTCGGTCTTCGTA
AAGGAGACAGCCAGCAAATGGAACAAGTCAATAAGGTTCTTGCTGGTATC
AGCCAAGAAAAGCGTGTCAAACTGATGGATCACATCATTGACATTCAACC
TGCAGATAAGACTGATGAAGCTAAAAAAGGAAACTTCTTTAGCCAAGTGA
CTACTATTATTGCTAAAAACTGGCCACAATTCTTGCGTGGTACAGCAATA
ACACTTCTTATCTCCATTATCGGTACTGTTGTCGGAACTTTTATCGGTCT
TATGATTGGTGTTTACCGTACAGCTCCTAAGGCTGCTAATAAATTTGTAG
CCTTGCTCCAAAAAATCTTCGGTTGGTTTCTTAACGTTTATATCGAAGTT
TTCCGTGGTACACCAATGATTGTACAATCTATGGTTATCTATTACGGTAC
TGCCCAAGCTTTTGGCATCAATATTGACCGTACACTGGCAGCTATATTCA
TTGTTTCTATTAACACCGGAGCCTACATGAGTGAAATTGTTCGTGGTGGT
ATCTTCGCTGTTGATAAGGGGCAATTCGAAGCTGCTACTGCTCTTGGTTT
TACCCACGGTCAAACCATGCGCAAGATTGTTCTTCCACAGGTTATCCGTA
ACATCTTGCCAGCCACTGGTAATGAGTTCGTCATTAATATTAAAGATACC
TCTGTGTTGAATGTTATCTCTGTTGTGGAACTTTACTTCGCAGGGAACAC
TGTTGCAACCCAAACTTACCAATACTTCCAAACGTTCTTTGTTATCGCAG
CGATCTACTTTGTTCTTACTTTCACAGTAACTCGCATCTTGCGTTATGTA
GAACGCCGTTTGGATCAAGATACTTACACACAAGGAGGAGGGGTTCACTA
A
>stu1509 hypothetical protein
ATGAATAATATTGAAATGATTATGGCTTCTTTTCGACAACATCAAGGATT
TTTGACCTTTCAACAAGTACTTGAAGAGAAATTACCTTACAAAATGTTGC
TGAGAATGATTGATGAGGGACAAGTAGAGGTTGAAGGAAAGGGGTTATAT
CGCCTCCCTGATACTTATCTGGACGAATGGTTTGTGACGCAGCAACGTTT
TTCAAAAGGAATTTTTTCTTTAGAAACAGCTCTTTGGTTACATGGATTAT
CACTAACAGTTCCTTTTGAGATGACTATGAGCTTCCCTTATGGAACCAAT
ACAAAAAATGTTAAATCAGAAGGTATACGTCCGATAGTTCTTCGTTCTTA
TTACGATGAAGGAATTATTGAGCTTGAGCGACAAGTGGGACAGAAGATTA
AGGTGTACGAGCCGGAGAGGGTTTTAGCAGAGTGTTTAAGACCAGTTTAT
CAAGTTGATGTTCAAGTTATAGCTCCTGCATTTAAGATGTATTTTCAAAA
TCACAAAGTTAACTATTCAAAACTGTTTCACTATGCACAGTTATTCAAGG
TGACTAATAAGTTGCAATCTTACATGGAGGTATTAACCTAA
>stu1939 protein-tyrosine phosphatase
ATGAATAAGGTTGTATTTGTTTGTCTGGGAAATATTTGTCGAAGCCCTAT
GGCGGAGTTTATAATGAAAGCGCTTGACCAAGATGGGTCTTTGCATATTG
AAAGTCGTGCAACTTCGTCTTGGGAACATGGAAATCCAGTTCACCAAGGA
ACTCAAAAGATTTTAAGGAAATATGCGGTTTCTTTTGATTCTTCCAAAGG
CTCACAACAGATAAGTCAGTCAGATTTTGAATTCTTTGATCTGATTGTGG
GGATGGATGAATCAAATGTTGAGGATCTCCTACAAGTATCTGCGGGTCGT
TATGACGATAAAATTAAGCTCTTTAGACCTGGTGGGGTTCCGGACCCATG
GTACACAGGTGATTTTGAAGAAACATACAATTTGGTAACTGCAGCTTGCC
AAGATTGGCTACAGTGGATTAGGGATAGACAATGA
>stu1380 response regulator (homolog to RR08 Spn) uncoupled, truncated
GTGACTCATGAGGTTCACATAGAGGACCAATCTTTGGAATTGACAGTGAA
ATCCTTTGAACTTCTATGGATATTGGCTAGCAATCCTGAGAGAGCCTTTT
CAAAGACGGAACTTTACGAGAAGGTATGGCAAGAGGAATATGTGGATGAT
AGCAATACACTCAATGTTCATATCCATGCTTTGAGGCAAGAGTTGACCAA
GTATACAAATTCAAATACTCCTGCTATCAAAACTGTTTGGGGTTTGGGCT
ATAAGATGGGAAGACCAAGAGATTGA
>stu0665 conserved hypothetical protein
ATGCCAAATCGCTTTTATAAGATACGAAAAAATAGACTCGTCGCCGGTGT
TCTTGCAGGTTTGGCAGATAAATTTGGCTGGAACCTCACTTTGGCTCGTG
TCTTAGCTATTATTCTCATGGTTTCCACGCAGTTTGGAATCTTCTTATAC
TTAGTTTTAGCCCTCCTCCTTCCTTATAAAGAGGATATTTATCCCGAAAT
AAAACTTAAGGATGGAAGAAAACGTAAAAACGCTGAACCTGTAGAAGACG
AGTGGAAATGGTGA
>stu0795 sensor histidine kinase (homolog to ciaH Spn), truncated
TTGTATTTGGCAAAATGGTCAAGACGGCCTATACAGGAAAGTCTTGAGAA
GCAGAAGACATTTGTTGAGAATGCTAGCCACGAGTTGCGTACGCCACTTG
CTGTAATTCAAAACCGCCTAGAGTCTCTTTTCCGCAAGCCAGAGTCTACA
ATTTTAGATAATTCAGAGAACATTGCTTATAGTCTAGATGAAGTCCGAAA
TATGCGTCTTTTGACGACCAATCTCTTGAATTTGACTCGTCGTGATGATG
GTATTAAACCAGAAATTGAAACTCTAGATTCTTCTTTCTTTGATAAAGTC
TTTACCAATTATGCTACGATTGCTGAAGAAAATGAAAAGGGGTTTACTGC
TCAAAATCAGGTTGGGCGCTCAATCAAAACTGATAAGACTCTATTGAAGC
AGCTCATGACAATTTTATTTGATAATGCTATCAAATATACAGAAGATGAT
GGCCAGGTGACCCTTACCGTTCGTACTAATGATCGTCATCTTTATATTAC
AGTGGCAGACAATGGCCCTGGTATTGCAGATGAAGATAAGAAAAAAATTT
TTGATCGTTTCTACCGAGTAGACAAAGATAGAACTAGACAAAAAGGTGGT
TTTGGGTTGGGCTTATCTTTGGCACAACAGATTGTTCTTGCACTTAAAGG
AACAATAATTGTCAAGGACAATCAGCCGAAGGGGACTATTTTTGAAGTTA
AAATTACCGGAGTCTAA
>stu0974 amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein, truncated
TTGGATGCGGTCTTTTTGGTTGCTTGCTCATCACAAAGTTCAGCTGACAA
GAACTGGGAAAAGATTGAGAAGCGTGGCAGTATTAAGGTTGCGACTGCTG
GAACTCTTTACCCACAAACTTACCACGACGATGATAACAATTTGACTGGT
TACGATGTTGAAATTCTTAAAGAAGTTGGGAAACGTCTTAAGTTAAAGAT
CGACTTCACTGAGATGGGCGTCGATGGTATGCTTACTTCTGTAAATAGTG
GTCAAGTAGATATCGCTAACTACTCACTAGAAGATGAGAATAACAACGTT
AAAAAATTCTTGCGTTCTGAACCATATAAGTATTCATTCACTTCTATGGC
GGTTCGTGAATCTGATAACCCAGGAATCTCTTCATGGGAAGACCTCAAAG
GTAAGAAAGCAGCGGGTGCTACAAGTACTAAATAG
>stu1494 polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein
ATGAAGAAATTTTGGTTTATGCTTACAGCCCTAGTTGCCACGTGTTTTCT
TGTTGCATGTAGGGGGAGTCAAGGAGTGAGCACAAAAACGATTAAGGAAA
ATAAGAAAATTGTCTTAGCGACAGAGTCTGAATTTGCACCATTTGAATTC
AAATCGTTGGTCAATGGCAAGGATACCTTAGTTGGAGCAGACATCGAGTT
GGCTAAAGCTATCGGGAAAAAACTTGGTGTGAAAGTTGAATTTTCTGTTA
TGTCTTTTGACAATGTCCTTGCTAGTGTGCAAAGTGGTAAAGCAGACATT
GCCATTGCAGGGATCTCGGTAACAGACGAGCGTAAAAAAGTCTATGATTT
TTCTGATAGCTACTATACCTCTGAAAATGTAGTGATTGTCAAAAAAGACA
AGGTAAATGATTTTACAAGTGCTGATAGTCTCGCTAAACAAACTGTCGGT
ACGCAAAAAGGGTCTGTTCAAGAAACAGTTGCTAAGAAACAATTCTCTAA
GGCAAGTGTGGTTTCACTCGCTTCAAATGGCGAGATGATTAACGAACTCA
AGTCAGGACAGATTCAAGCGGTTGTCCTTGAAAAAGCTATTGCAGAAGGT
TATATCGCACAAAATGATGCTTTAACCCTTGCCAGCTTTAACCTTAAGTC
AGATGGTTCAGATGCTTATGCAGTCGCGATACGTAAGGGTTCGGACGATT
TACTTAAAGAAATCAATGCTGTCATCAAAGAGACCAAGGAGTCTGGAAAA
TTTGACCAATGGTTAAAAGAAGCATCAAGTTACAAACAAAGTAAGTAA
>stu1676 blpT, immunity/modification protein
ATGATGAAAAAAAGGACATTAACGCTATGGATGATGAGTTCAGCCTTGTT
ACTGAATCTATCGGTAGGAACTGCTTTAGCGGATGAGGTGGTAGAAACGG
GAGCTGATAATTCTCCAAAGGTTGAAGCAACCGAATCTACTCCAGTAGAA
CAACCATCAGATAGTCAGGAGCAGTCGCTTCCTGAAGATAAAGAGGCACC
AGCAGCGACTGAATCAGTAACCTTGGCTGAGTCTGAGGAGGAGACTGCAA
AAAATGATATCCCAGCAGTATCTCGTGAGGAATACGACGCTAACGTTGCT
GATTTACCTAAAATAAGTTTAGATGATGTGCGTAATGCCTTTACCGAGGA
TGGTCAGGCACATACGATTTATTTTGGACGTGGAACCTGTTACTATTGTC
GTCAATTTTCACCAGAGTTGAAGGTCTTGAACCAACTGATGGATGGTCGT
TTAGAGTATTACGATATAGATCGTGAGGATTTTGACCGAAACTATGTGTT
TGGTGAGATTGGTATTCCAGGTACACCTACACTACTTTATCTGGAAAATG
GTCAGCTATTATCAGGATGGGTTGGTGGTGGACCTGCTCAAACAGTTTAT
GACCATTTAGCCAGCTCTAGTCCACGTTTTATGACTTTGAATCAGGAACA
AACAACCATCTCTGAACCTCAAACTAAAACTGTTCGTCCTACACGAGTAA
CCGAAGAGAGTACGAAAGAGAAATCTTTGCCAACTGTTCAACCACAGCCG
ATGTCAACGGTTCAGAAGGAACTGAACGCTCAAACAGGGCAAATGGCACC
AATGACTGATAAAGTAGCAGACACAAAAGAATTCCCTAAAACAAATGACG
GTGAGCAATCACTTGTCTCTTTTGTGGGGGCATTAGCAATCTTAGCTTCA
CTCATGTTAGCACTGAGATATTATATTAAATAG
>stu1501 gnlP, glutamine ABC uptake transporter membrane-spanning protein
ATGAAGAAAAAACTTCTGACACTCTTTTTGAGTGTCATGTCAGCTCTCTT
TGTTTTCGGAGCTAAGGCATCTGCTAGCACGATTTCAGTAGTTTCAGATA
CAGCCTATGCCCCATTTGAATTCAAAGACTCTGATCAGACCTACAAGGGT
ATCGATGTTGATATTATCAACGAAGTTGCCAAACGTAAGAATTGGGATGT
TAACCAAACTTATCCTGGTTTTGATGCAGCCGTTAACGCAGTTCAGTCAG
GACAAGCAGACGCCCTCATGGCAGGTACAACTGTAACCGATGCACGTAAG
AAGGTCTTCACTTTTTCAGACACTTATTACGACACATCAATTGTTATTTA
CACTCGTAGCAACGACAAAGTCAGCGACTACAAACAATTGAAAGGTAAAA
CAGTTGGTGTTAAAAATGGTACCGCCGCTCAAACCTGGCTTGATAAAAAC
GCTAGCAAGTATGGTTTCACTGTTAAAACTTTTGACACTAGTGACTTGAT
GAACAACAGTTTGGACTCTGGTTCAGTTTATGCAGCCATGGACGACACAC
CAGTTGTTCAATATGCTATTGGTCAAGGTAAAGACTATGCTATCAACATA
AAGCCTGAATCTATCGGTAGCTTCGCTTTCGCTGTAAAAAAAGGTGGAAA
GCACGAAAGTCTTATCAAGGATTTCAATGAAGCCCTTAAGGAAATGAAGG
AAGACGGTACCTACGATGAAATCATGACCAAATGGTTGGGTGACTCAGCA
AAAGCTTCTTCAAAATCTTCATCGTCAAAACCGTCGGAAGCTCTTAACTT
GACTGGTGATGCTAATGCAAAAGCTACTCCTACTAAGGAAACTTACACCA
TCTCAATGGACTCATCGTTTGCACCATTTGAATATCAAAATGGTTCTGGT
AAGTATGTTGGTATCGACGTTGACATCATCAATGCCATTGCTAAAAACCA
AGGTTTCAATGTTAAATTAACTAACCCTGGTTTCGATGCATCACTTAATG
CCGTTCAATCTAGCCAAGCCGATGCGGTATTGGCTGGTATGACCATCACT
GATGCCCGTAAACAAATCTTTGATTTCTCAGATCCTTACTACACTTCAAA
CATTCGTTTAGCTGTGAAAAAAGGCTCTAACATTAAGAAATATGAAGATC
TCAAAGGTAAGACTGTTGGTGCCAAAAACGGAACATCTTCTTACTCTTGG
TTAGAAGAGAATGCCGACAAATATGGCTTCACGCTTCGTGCATACGATGA
AGCTTCTACTATGTATGATAGCTTGAACTCTGGTTCAATCGATTCCCTTA
TGGATGATGAAGCCGTACTTCTATACGCTATCCAACAAGGACGTAACTTT
GAAACACCTATTAAGGGAATCTCTACTGGTAAAGTTGGCTTTGCTGTTAA
AAAAGGGGCTAACCCTGAGTTGATTGAAATGTTCAACAATGGTTTAGCTG
CTATTGTTAAAGACGGTACTTACGATAAGATTATCAACAAATACCTTGAC
AATAACAAATCTAAAGAAAAGAGCTCAACCAATGTTCCCGATGAAACTAC
AATCGTAGGCTTAATTAAAAACAACTATAAACAACTTCTCCAAGGTCTTG
GAATTACCCTTGGATTGACCCTTCTTTCATTTGCTATTGCCATGATTATC
GGTATTATCTTCGGTATGATGGCAGTTGCACCAAACAAGACCCTTCGTGT
GATTTCACAAATCTTTGTTGACGTTGTCCGTGGTATTCCATTGATGATCG
TTGCAGCCTTCATCTATTGGGGTATTCCGAACTTGATTGAAAATATCACC
GGTCACCAGTCACCAATCAATAACTTCGTGGCTGCGACTATAGCCCTCTC
ACTTAATGGTGGTGCTTACATTGCTGAAATTGTGCGTGGTGGTATCGAAG
CTGTCCCTATTGGTCAGATGGAAGCCAGCCGAAGCTTGGGTGTCCCATAC
AATACAACAATGCGTAAGGTCATCTTGCCACAGGCTGTTCGTTTGATGTT
GCCAAACTTCATCAACCAATTTGTTATCTCATTGAAAGATACGACTATCG
TATCAGCTATCGGTTTGGTCGAACTCTTCCAAACTGGTAAAATCATCATT
GCTCGTAACTACCAATCATTCCGTATGTATGCGATTTTGGCCATCATTTA
CTTGGTCATCATCACATGCTTGACGAAATTGGCTAAACGACTAGAAAAGA
GACTTAAATAA
>stu0318 hk01, sensor histidine kinase (homolog to csrS/covS Spy)
ATGAGTAAATTATTTGGTAAAGTAACCATTAGAAAAAAGTTGACCATGAC
AACTGCTGTGGTCTTCTTTCTTGTATTGTCGATGTTCACTCTGGTTGTTG
TATTTTCAGCCAATACGCTTCTTTTGCAACGTGAACGTCAAAATGTAAAT
AATACAATCTCAAAAGTTGTTACTTATATCGAAAAGGACTGGGACTCTGA
TGAAGAGTTGAGTCCAGAGCCGCTTTTAGCGGCCCTTTATTCACCGAAAA
ATATCTATCCATCAATCATTAATGGAGTGCTTTCTGAAAAGCGTTCCTTA
GATGGTCAAGTTGCGGTTTCTAATAGATTATATTCCAACCAGTCTGTCTA
TGTTTATGACAAAAAGGGAACTTTTATCTTTACTTCTGAGGAGGATACAG
ACTCACCTCCAGGCATGTCTGAGGTCAATAAACTGAAGTTGGTTTCCTAT
AAAGGTAAACGTGGTTTCTTACTACAAGTTCCAATCTATGGCAAGGATAA
GAAGACCATTGTTGGGTATGCTCAAGTTTTCCATGATTTGGAATTCTACT
ATGCGTTAAAAGAGCGTTTAATTTTCCTATTGATATTCCTTGAAGTAGGA
ATGACGGTCTTAGTTATTGCAGTAACTGTAGTTGTCTTGACATCTATTCT
TCGTCCGATGAGGCAGTTACACGAAACGATGGGTATTATTATCGATTCGC
CAAGTGATTTGGAGCTTCGATCTAAGATTGAGAGTCATGATGAGATTGGT
GCTTTGGCACTTAACTTTAACTGTATGATGGATAAAATTCAAGAAAATAA
TCAGATGCAGATGCGTTTCTTGAGTGACGTCAGTCACGAATTACGTACTC
CCATTGCAGTTATTAAAGGACATATGGACCTCTTGCAACGTTGGGGTAAA
AATGATCCTGAAATCCTTGAAGAAAGTCTTGAAGCTGCAAGTCATGAAGC
CAACCGTATGACGATTATGATTAACGATATGTTGGATTCTATTCGTGTTA
AAGGGTCATTTGACAATCATAGAAATGATACATGTGATTTGAATTCTTCA
ATCCGTACGGTTATTGGGAATTTTCGTGTCCTACATGACGACTACCAATT
CTACCTCAATGATTCTGAGGGTTCAGATCGTCCAGCACAGATTTACAGCC
AGCACTTTGAACAGGTTATTACTATTTTGATTGATAATGCGGTCAAGTAT
TCGCCTGTTAATAAGAAAATCCAGATTACTATCAAGGCTCTGGAAGATGA
GATGCTGGTACAGGTACAGGATAATGGTGAGGGTATCTCTAAAGAAGATA
TTGAACATATATTTGAACGCTTCTATCGTTCAGATAAGGCGCGTAATCGT
ACGACAACCCAATCTGGTGTGGGTATTGGTTTATCAATCCTCTATCAAAT
TGTGGAAGCTTATCGATGCCATATCGATGTCAGTTCAGAACTTGGTGTGG
GTACACGTTTTGACCTCTACATTCCTTTTGCAGAGTCAGAAACTACGACA
CCTCAAATTGAAGGTTAA
>stu0542 hk02, sensor histidine kinase
ATGTTAGTAGGATTACGAATAATCAGTATCTTGTACGATTTATTTCTAGC
AAGTATGTTATTTTATAGACCATTGTCTAAAATCAATATGAAAAAGAAGC
CTTTAGTAGCCCTTTTTTTCATATTGATTTTTCATGGGGAACTCGTGTTC
CTATTCTCTGAAAGTCGTATTTTTTTGGTCAGTAATCTCCTTCTAAACAT
TTTAGAATACTATCTAATCGGTCTCAATTTTGATTATCCTATTCGCCAGT
CTTCCTTTTGGATTCTTTTACAAACTAGTCTAAGTTTGTTAGCAGGAGCT
GTCCTAAACCAAGGAATCCAACTAATTTTACCTTTAGGGGAACTATCAAA
AAATTTAGAAGCTATTAGTTTGTATCTCGGAATAAGTTTCTTCTTATCTA
CAGGAATAACTCTTATCTTACGAAAGCTTCTCCTATCCCATCAAAGGCTT
CGTATTGCTACTTCTAAGGGAAACTGGTTTTATCAGTTTATCGTGCCTCT
TTTATCTATTTTCTTTGCTTTTACAATATCTGCCATTCAAGGAGGGGTAT
TTGGAGCAGATTACCTGTCAATCATTTCTCTCTCATCTCTCATTGTATTA
ACTCTCTCCTCTCTTTATTTTAATCTGTACCTTGCTCGTCAACAGCAGCA
ATATTACCAAAACCAATTGGAAAAAGAACAATTACAGTTCCAAGTTCAAG
AAATACAACAATCTCAAGAAGAATATCAACGTCTCCAAAGCCTTCGGCAT
GACTTAAAAAATAAACATTTAACTCTTTTATCGCTTTTAGAGAAAAATCC
TGAAGAGGCAAAAGATTATCTTTATTCATTAACAGATAGTATAGTAGGTG
AACAAACTTTCTACTCTAAAAATCAAACTATTAATTTTTTACTTAATCAA
AAACTACATCATTTAAAAGATGAGATAGAAATGGAAATTGATTGCTTTGT
ACCACAAGAATTATCTATTCAACCAGATATTTTAGCTGTTATATTAGGAA
ACTGCCTAGACAATAGTATTACAGCTTGTCTCAGACTACCAAATAAAGAA
AGAAACTTATCACTTAATATCCGATACTTTCAACAAAATCTTTTTATCAA
TATTAGAAATAATTTTGATGAGAAAGAAAAATCTACTCGTAAATCCCGTC
AAAAAGATGGCTGGGGGTTGCGAAATATTGATGCTCTTGTTCAAGAATAT
CAAGGTAATATCAAACACTTTATAAAAGATGGACAATATCAAATAGAGAT
TTTATTACCAATAAAAATAGGGACTATTCCGACTAAAGAATTTTAG
>stu0902 hk04, sensor histidine kinase (homolog to spaK Bsu)
TTGGGGGATTGGTTACAAGTGGCACTAATAAAAAAACGAGAACACTCTCT
AAGAACAATCTTGTTATCTTATGTCGTCAGTCTTACAGTTCTCTCTGTAA
TCAGCAGTCTTCTTATTTTGTATTTGTTCAGCTTGTCTTTTCGTTTTGGA
GTTTTGATTCCAGCAAATCAAGTTGAGAGTGATTTGTCTGCTGTGAGAAG
TGATATTGAAACTTCTAAGGTCTTTAATCCCGAGATTTTACCTGATGGCA
CGAGTTATGTCTTTTTAACTAGGGATTTTAAGCTTAAAAAGTCTAACATG
CCTGTTAACTTGCAAGAAGAATCCTTACTAAATTACCAATTCAAGAATGC
TCACGGTGAGAAATACGGCTATTTTCAGTCTTTTGAACGATCAGATGGCA
TAGTCATTGTCAATTATCAACTATCACCTCGGTACCGTAATGAGTGGATG
AACCAGCATTTTCCCAATGCTGATCTTATGATGATTGGTTCAATGTTTGT
ATCTATCTTAATCATATTTATTATTTTAACTTTTTATTATGCAAATAAAT
TGAGTCAGCAACTTAAACCTATATTAAGGGTTACTGAAAAAATTTCCCAA
CAAGATTTGGATTTTCAAACTTCTCAGTCTACAATTAAGGAATTTAATCA
GGTTTTAAGTGGTTTGGATCATATGCGTATAGCACTTCGTGAGTCTTTGA
TGGAAAATTGGAAGGCAGAGCAAGATAAACAAAATCAGATTTCTGCCCTG
ACACATGACTTAAAGACGCCCCTAACAGTTGCTCGTGGAAATGCGGAACT
CTTAGCTATGACGTCCTTGGATGAAAATCAAACGGACTTGTTAGAGCATT
TTCAAAAAGGTATTGCACAGGTTGATACTTATGTAAAAGAGTTGTCAGAA
CTCAACAAAATGAGTTTGAAGAAGACCCTGACGCTTGAAGAAGTTCCAGC
TAAGGAATTTGTTGAAGACATTTACGATCAAACCTTGTCATTAGCTCAAA
CGAAACAAATCAATGTGGTATTTGACAAGAAGGAAATTGCGAAAGAAAGC
ATAGGCAATTGGGATAAGTCCTTGTTGAATCGAGCTATTATGAATATTGT
TTCAAATGCCGTAGTGCATACACCCAGTGGCAGTCAGTTGCTCCTGACCG
CTAGGATAGAAGAAGATGAATTCAAGTTTATATGCCTTGATTCTGGTCCT
GGATTTTCCCTTGAATCTCTTGAAAACGCTACTCAGCTATTTTATCAAGA
GGATAAAAGCAGACAGAGTCGCAATCATAGTGGCCTTGGTCTGACTATTG
CCAATGATATTATTCGTTTACACTATGGTAGTCTTTCTCTTGCAAATGAC
AATGGCACGGGTGGTGCTAAAGTGACTATCATTTTACCCCTTTTAAATAC
AGATGACTCCTAG
>stu1159 hk05, sensor histidine kinase (homolog to HK02/MicB Spn & HK02 Sth & VicK Spy)
ATGACTAGTATTGGCTTAAATATTACAAGCTTTGAACTGGCCTTACTCTT
TATGCTCCTCTTTGTTGCTTTCTATTTCATTTTTCTAGCTTATCGTGATT
ATCAACAGGTCAAAAATATCCGAAAGTTGACTAAGAGAGTCAAATCCCTT
ATGGCAGGTAATTATAATGAAAAATTATGCATAAAGGGAGATTCAGAGCT
TTTAGAGCTAGCTAATAGCTTGAATGATTTGTCGGACGTCTTTCGTTTGA
CACATGAAAATCTAATCCAGGAAAAAAACCGCTTATCATCTGTTCTTTCG
TACATGAGTGACGGGGTTATTGCGACCAATCGCCTTGGTCAGATTACTAT
GATTAATAGTACTGCCCAACGCTTGTTGAATTTAGATCGCGAAACTGCGA
CTCAGATGTCTATTTTGGATATATTAGATGGTGAGAATCCCTATACCTAT
AGTGAATTGTTGTCTAAGACACCCGAAATCCATCTGTCGCGTCGAGATGC
TAACGATGAATTTGTGACGCTACGTGTTAATTTTGCATTAATTCGTAAGG
AATCTGGTTTTATTTCAGGTCTGGTAGCCGTTCTTCATGATGCCACTGAG
CAGGAAAAAGAAGAGCGCGAACGCCGTCTCTTCGTATCAAATGTTAGTCA
CGAATTGCGGACGCCTTTAACTTCTGTGAAATCCTATCTTGAAGCGCTTG
ATGATGGTGCTCTCAACGAAGAGATTGCTCCAAACTTTATCAAAGTTTCT
TTAGATGAAACCAACCGCATGATGCGTATGATTACTGACCTCTTGGCATT
ATCTCGAATTGACAATAAAAGCACACAGCTTAATGTTGAAATGACAAACT
TTACAGCCTTTATGACCTATATCTTGAATCGGTTTGGTCAAATTAAGAGT
CAAGAAACTAATCCAGGTAAGTCTTATGAAATCATTCGAGATTACCCAGT
AAACTCTATTTGGGTGGAAATTGATACTGATAAGATGACCCAGGTCATAG
ATAATATACTTAATAATGCCATCAAGTATTCTCCTGATGGTGGGAAAATT
ACAGTATCTATGAAAACGACAGACACTCAGTTGATTGTTTCTATTTCTGA
CCAAGGTTTAGGAATTCCTAAAAAAGATTTACCTCTGATTTTTGACCGTT
TTTACCGTGTTGATAAGGCTAGAAGTCGTGCTCAGGGTGGAACAGGACTT
GGCTTATCCATTGCAAAAGAAATTGTTAAACAACATAATGGCTTCATTTG
GGCTAAGAGTGAGTATGGTAAGGGATCAACTTTTACAATTGTGCTTCCAT
ATGACCAGGACGCAATGATGGTCGATGAATGGGAGATGTAG
>stu1326 hk06, sensor histidine kinase (homolog to HK11 Spn)
GTGACCATGTTTAGAACATACCAGAAAAATGATTTTGCTTATTTTGTTAG
TCTGATTTTCCTAGTCTTCCCGATCTTAGGAGTTTTTGGTGGGTATTATC
CAGTCTGGACCCTAGTTTTGACGGGTCTGTTTACCATCGCTTATCTCCTT
ATAGTCTATTTGAAAAAAGCTTATAGTAAGTGGATTCCCTTTCTGTGGTT
TTACACTCTAGCTTACATTATCTTTATGTCCATTTCCTTCCAAGGTGGCA
TGATGTGGTTTGTTTTTTTCAATGTTAATCTTCTCGTTTGGCGATTTGAG
GATAGCATATCTTCTTATCGATTCTTATCCTTTCTAGCGACACTCTTGAT
TTTGACGTCATCATCCTTCCTACTGACAGACGATTTGAGCACCCACCTCA
TGTCCCTGGCTATTACTCTTTTTTCTTTGGGAATGTACTATTTTCAAAAT
CGTATGCGTCAGGAGAGAAAGATGGAAGAAGCCCTTGCGGAGAAGAATCG
GACCATCAATATCCTGTCCGCTGAAAATGAACGCAATCGTATTGGTCGTG
ATTTGCACGATACCTTAGGACACACCTTTGCCATGATGAGTCTCAAAACC
GAGTTGGCTCTAAAACAGATGGACAAGGAGCAGTATGATGCTGCTAGAAA
GAATCTGGAAGAATTGAACCAAATTAGCCGTGACTCCATGTACGAGGTGC
GTGAGATTATCAATCAGCTCAAGTACCGAACGGTAGCTGAGGAGTTACTG
GAACTCGAACGACTCTTTGACCTATCAGATATCATTTTGACCGTGGATAG
TAGCCTTGACTTAGACAGCCTGTCACCTGTTATCCAGTCGACCTTGTCCA
TGGTGCTTCGTGAACTGGCCAATAATGTCATTAAACATAGTCAGGCCGAG
AGATGTCAGATTCGTCTAAACCGTAATCATGGTATTGTCCTTGAGTTTGA
GGATGATGGTTGTGGCTTTGAGGAAGTCACAGGGCAAGAGCTACACAGTA
TCAGAGAGCGTCTCAGTTTGGTCGATGGAGACTTGGAAATCCTGTCTCAG
TCGCATCCAACAATCATTCGTGTGCATTTGAAAGAGGGAGGAAAAGCATG
A
>stu1335 hk07, sensor histidine kinase (homolog to HK01Spn & Sth)
ATGATGGATAAGCGTCAATTTATCAAATATCAGATTAGGTCTCGTCTACC
TTTCTATCTTTTGCTTATTTTTAATGGAATCATCTTGGTTTTGTTTGCTT
TTTTATTTGAAGAGGCAGCAGATATTCTTCATTATGCCTTGACCATACTG
ACATTTGTGGCCATCATCATAGCTATTTGGGACTTGGTTAGCTCTTATCA
GTCTTATAACTTAGCCTATCTCTATGAGAAAATGACACCATCAAGTCCTT
TAGAGTTTTATCTAGCTCAGGCCTTGGAAAATGCTAAGGAGAGTCAAATG
GTTCAGACTGAGGAGGAGCGCAAGCGCTATACAGATTTGATGGACTACTA
TACCCTTTGGGTGCATCAAATCAAGACGCCAATAGCAGCCAGTCAATTAT
TGTTAGGGGATGTTACAGATAGTAAAACGAGGGCTCTCTTGGAGCAAGAG
GTCTTCAAGATTGATGCCTACACCAATCTGGTCTTGCAGTATTTACGTTT
GGAAAACTTTCATGATGATTTGCAGTTGAGGCAGGTTGCATTAGACCCCT
TGGTTAAAGAAGTTGTTAAAAAGCATAGTATTTTCTTTATTCAAAAAGGA
TTAACTATTAATCTACATGACTTGGATGTTGAGGTCGTTACAGATGAAAA
ATGGCTCTTGGTTATCGTAGAGCAGGTCTTATCAAATAGTTTGAAGTACA
CAAAAAGTGGTGGCATTGACATTTACTTCAAAGATAATAGGCTTTATCTT
AAAGATTCTGGGATTGGTATCAAGGATAGTGATATTTTACGTGTCTTTGA
GCGTGGTTTTTCAGGTTACAATGGCCGCTTAACTCAGCAGTCGTCTGGAC
TGGGTCTCTATCTTTCAAAGAAAATAGCTGATCAGCTTGGACATGATATT
AGTATTAGCTCCCAAGTAGGTCAAGGAACCACAGTTTCCATTCATTTTCA
AAAGCAGAAGTTGGCTATTGATTAA
>stu1421 hk08, sensor histidine kinase (homolog to HK03 Spn)
ATGAAGAAACAGTACCTATTTTTAATCCTAACTTATTCAGTTGTTGTTTT
AATTGGGGTTACCCTTGTGGTTATGGATAGCTTTAACCTCAACTTTTCAC
TGGTTTTCGGTAGTATCTCTCAGGTATTTCACTTCCTTTTTAACATGTTT
TTTGTGGTTCTGAGTTTGCTCATTTTGCTGTATATTCTTTGGGCCATTGC
AAATGATAATAGTATGCGTTCGGTCAATCAAGACTTGCGTCGTATTATCA
ATAACCAACCTGTCAAACGTCAGGGAGATAGTGAGTTGGACAAGAATATG
ATGCGTCTATCTCATAAAATGCGTAAATTGACCAAGGATCTGCAAAAAAC
GGAAAATGCTCAGGCTTTGAAAAGTCGTGATATTATTAAGAAAGAGCGAG
GTCGCATTGCTCGAGATCTTCACGATACCGTTAGCCAGGAGCTTTTTGCG
GCTAGTATGATTCTATCTGGTGTTTCTCAGATGGTGGACCAGCTAAGTAA
GGAAGATTTACATCATCAGATTCAGGCAGTCGAGGCCTTGCTGACTGATG
CTCAAAATGATATGCGTGTCTTGCTTTTGCACCTTCGTCCGACAGAACTT
GAGAACAAGACTTTGCAGGAAGGCTTGCAGATGATTCTTAAAGAATTAAC
TGATAAATCCAATATCCGTGTTGTCTATAAGGATATGGTTAAGAAAGTGC
CTAAGCGTATTGAAGATAATCTCTTTAGGATTGCCCAAGAGTTTATCTCT
AATACCCTTAAGCACGCCAAGGCCAGCCAAATAGAGGTCTACCTCTATCA
AAATAGTCAGGAAATTCAGTTAAAAATGCTAGATAATGGTGTTGGTTTTG
ATTTGAATGCCTCGACTGACGAGATGAGTTATGGACTAAAAAATATCCAA
GAGCGTGTTGATGAAATGGCGGGAACTGTGCAGTTCCTATCAGCTAAAGG
TAAAGGGACGTCTATTGATGTTCGTGTGCCAATATTAAGAGGAGAAGACA
ATGTCGAATAA
>stu1687 hk09, sensor histidine kinase (homolog to BlpH Spn)
ATGTTAACAACGTTATGGCTACTTTTTCTCACCCTTTTAAGTGCAGGCCT
AGAAATTATTCTTTTCCTTTATTTAATGGGACAGAAGATTCGTCTGAGGT
ATTTTTTCCTACTCCTTATTTTTAATTTAGCCTTTAATTTTATTTATAAC
CACTCTTCTTGGTTTATCATTAAATTCTGGGGTGAGGATATCTACTATCT
TCTGCTCTCCTTCCTTTTATCCACTAAGACTAAAAAACCATTAAAAATAA
AGATTTTCAATGGTCTCTTCCCTGATATCCTCAACAACCTTAGTTTAAGA
CTGATTACTTTTTTTATCTTTCCTTTTTTTAATATTAGTATCACCGATTA
TAAAAGCTCTCTATTAATATCCATCCCTTCATCTATCGCACCTCTTTGTC
TATCATTTCTCTTTATTAAATTATTCAAGGAGAGTTTTACCATACTTCAA
AAGCAGAAATCAAATTCTCCGATTCAACATATTATTATAGTTGCTAACTT
TTTTATGTTTGGGTACACCCTACTGTTACAGTCCCTCATGTATCTTGAAA
ACACTACTCACTCTTCAACTTTGGAGCTTCGAAAACTCTGTGTTGTTATT
TCACTTGTCCTCTTCTTCATTATGATTGTCTTTTTAGAAAGAAACATTCG
TGAAATGATTCAAGGACAATTGGACTTCCAGAAAAATCTCCAGCTAGAGA
ATCTCTACACCTACAATAAACATATTGAATGTCTCTACAATTCTGTTCGT
AGTTTTAGACACGATTATAGTAATCTCTTAGTCACATTACGATTGGGGAT
AGATAAAGACGATATGGATATTGTCAAAGAAGTCTATGATAGTGTGCTTC
AAGAATCCGATAAACGATTAAATACAAGAAACTTTGACTTAGCTAGACTC
GTTAATATTCAGGATAATACTTTGAAAAGCCTTCTGTCCGCAAAAGTTTT
ACAAGCAGAAGAAGAAGGTATTGAAGCTCAGATTAGCATCCCAGAACCCA
TCCACTTGATTGGGATGGAGATTCTGGACTTCATTATCGTCACTTCTATT
TTTTTAGATAACGCTATTGAAGGTGCCATTCAAACTCAAAACCATAAAAT
TACTATTAGCTTTTGGGAAGATCATCGTTCACAGCTATTATCTATTAGCA
ATACCATAAGTGAAGAACAAACAGAAACTAAAACCATATTTGAAAGAGGT
GTCTCCAACAAGGGACGAGAGCGAGGCATTGGCCTTGCTAATGTCACAGA
AATCTTAGATAACTATATCAATGTAAACTTAGAAACACAGAGTAACAATT
TCTCATTCACACAACAATTAACAATAACTAAAAAGGCCTAA
>stu0394 luxS, autoinducer-2 production protein
ATGCCAAAAGACGTTACTGTTGAAAGTTTTGAACTTGATCACACCATTGT
AAAAGCACCTTATGTCCGTCTTATTTCAGAGGAAGTTGGACCTAAAGGAG
ATATCATCACAAACTTTGATATCCGTTTGATTCAACCTAATGAAAATAGT
ATTGATACAGGTGGTCTTCATACTATCGAACACCTACTCGCTAAACTGAT
CCGTCAACGTATCGATGGCCTTATTGATTGCTCACCATTTGGTTGTCGTA
CAGGTTTTCATATGATCATGTGGGGAAAACAAGATCCTACGGAAATTGCC
AAAGTTATCAAATCTAGTCTTGAAGCTATTGCAAACGAAATTACTTGGGA
AGATGTTCCAGGAACTACTATTGAATCTTGTGGTAACTATAAGGATCACA
GCCTTCATTCAGCTAAGGAATGGGCTAAACTTATCCTTGAACAAGGCATC
TCAGACCAAGCCTTCGAACGTCATACCGTCTAA
>stu0162 mecA, negative regulator of genetic competence, putative
ATGGAAATGAAACAAATAAACGAGACAACTCTAAAAATCATGATTACCAT
GGAAGATCTTGAAGAACATGGTATGGAGCTGAAAGATTTCTTGATTCCCC
AGGAAAAAACAGAGGAATTTTTCTATACTGTCATGGATGAGTTGGACTTG
CCTGATAATTTTAAAAATAGTGGGATGTTGAGCTTCCGTGTCACGCCACG
AAAGGATCGTGTGGATGTTTTTGTGACTAAATCAGATCTTAAGGAAGCCC
TTGATTTCAATGATTTGTCAGATATGGAAGACTATTCAGGACTTTCTCCA
GAAGAATTCCTCAAAGCTCTTGAAGATAACTTTATGGATAAGGGAGATAT
TGAAGCCCACCATAAGCTCGAAGAGCATGATAAGACCTTGAAAGAGGTTG
ATGAGACTATGACAGAGCCGGCTAAGGAAGTGGCTGAGGAAACTATTCGT
GAAGATTATACTCACTATGTCTTGGCTTTCTCTGACTTTGATCAAGTAGT
GACCTTTGCGCAAGGTTTGAAGAATGTGTCAGTGGAGGGTTCTGAATTTT
ATAAACTTGGTGATGTCTACTATATGACTATCCTTCTTTACTTGGCTGAT
GAGCCTGATTATTACGCGAACAATATGTATGCGCGTTTTCTTGAATATGC
GAATGTGGCAGACCGAACACGTCCCTATCTACAAGAGCATGCAACAATCT
TGATGGAAGAGGACGCCTTACCGGTATTACAAGCAACGAAATGGAGCTAG
>stu0447 phoH, phosphate starvation-induced protein
TTGCAAGAGTATTCTGTTGAAATTACCCTAAATCACCCAGATGATGTCTT
GTCGCTTTTTGGAACCAATGAGCGTCATTTAAAACTCATTGAAGAAAACC
TAAATGTTATCATACATGCTCGAACAGAGCGTGTGCAAATCCTTGGGGAT
GACGAAGAAAGTGTCGAATTGGCCCGCTTGACCATTCAAGCTCTCCTTGT
TTTAGTGGAACGAGGAATGCTAGTTAACACTTCAGATGTTGTCGCGGCCT
TAACCATGGCTCAAGATGGTTCGATTGACAAGTTTGTCGCTTTATATGAA
GAAGAGATTATCAAGGACAACAGTGGTAAGCCTATTCGAGTGAAGACCTT
GGGGCAAAAGGTTTATGTTGATAGCATTAAAAGCCATGATGTGGTCTTTG
GGATTGGTCCAGCTGGTACAGGTAAAACCTTTTTAGCGGTCACTCTTGCA
GTCACAGCTCTTAAACGTGGTCAGGTTAAACGTATTGTTTTAACACGTCC
GGCGGTTGAGGCAGGTGAAAGTCTTGGCTTTTTGCCTGGCGATCTCAAGG
AAAAGGTAGATCCTTACCTTCGTCCCGTCTATGATGCCCTTTATCAAATT
CTTGGCAAAGAGCAGACGACTCGCCTCATGGAACGTGAAATTATTGAGAT
TGCCCCTCTTGCTTATATGCGTGGTCGTACCCTCGAAGATGCCTTTGTAA
TCCTTGATGAAGCGCAAAATACAACCATCATGCAGATGAAGATGTTCTTG
ACCCGTCTTGGTTTTAATTCTAAGATGATTGTCAATGGAGATATGAGTCA
GATTGACCTTCCACGTCGTGTTAAGTCTGGTCTTGTCGATGCCATGGAGA
AATTGAAGGGAATCAAGGCTATTGATTTTGTCCATTTCTCTGCTAGTGAT
GTCGTACGTCACCCAGTTGTTGCCGATATCATTAATGCTTATGAAAAAGA
TGCACCTAAGTTTAATCTTGAGGAAAAATCAGAGGGATCAGACCAGGCTG
AAGAAGTAGCATCAGGATTGACCGAATACCCAGTCATTAGTGCTGAGGAT
GTTAAAAAGTAA
>stu1426 pppL, phosphoprotein phosphatase
ATGGTTTTTTTATCGCTCAGTTGCGTAAGAAAGTCTAGGGTTACAGAGGA
GGAAACACTGACGCAAGTCAGAAAGAAAATTATGGAAATATCATTATTAA
CGGACATTGGCCAAAAACGGTCAAATAATCAAGATTTTGTTAATAAATTT
GTCAACAAGGCTGGTGTTACACTTGTCATTGTTGCAGATGGAATGGGTGG
ACACCGTGCTGGAAATATTGCCAGTGAGATGTCAGTATCTGACCTTGGTC
GTGACTGGATTAACACTGATCATCGTGAGTTGAGCCATATTCGTGATTGG
ATGATTGCTGCCATCGATGAAGAAAATCGTAAAATCTATGAGCTTGGTCA
AAATGAAGAATATAAAGGAATGGGAACGACTATCGAGGTTCTTGCCTTAG
TTGATAATGCTGTGATTTTCGCTCATGTTGGGGATTCACGTATTGCCCTT
ATCCGTAATGGTGAGTATAAGCAATTAACGAGCGATCACTCCTTGGTCAA
TGCTCTTATCAAGGCTGGTCAGTTGACAGAAGAAGAAGCTGCAGTTCACC
CACAACGTAATATTATTACGCAATCTATAGGGCAAGCTGCTCCAGTTGAA
GCAGATCTTGGTGTTCAACAATTGGAACCGGGAGATTATATTTTGGCCAA
TTCAGATGGATTGACTAATATGATTTCAATTGAACAGATTATTCATATTG
TTAACAGTCCTGGTCTTGTCGAAGAAAAAACCAGTCGTTTAGTTGCTGCT
GCCAATGAAGCCGGTGGTCATGATAATATTACAGTTGCTCTCATCGAAGT
AGAAAGTGAGGAAGGATAA
>stu0666 ptsK, Hpr kinase/phosphatase
ATGACAGTAACTGTTAAAATGTTGGTTGATAAGCTTAAACTTAAGGTTGT
CTATGGGAATGAGGAGCTTTTGGCAAAAGCGATAACAACGGCTGATATCT
CTCGTCCTGGTTTAGAAATGGTGGGTTATTTTGACTATTATTCACCAGAA
CGACTTCAGTTGGTTGGGATGAAGGAGTGGACCTACCTTAAAACCATGAC
TGCTAATAACCGTTATTCTGTTTTTGCTAATATATTTAGAGAGGAAACTC
CAGCTGTTATCGTGGCGCGTGGTCTTGAGATTCCAGAAGAGATGCTTCAA
GCTGCTAAGGAAAATGGTGTAGCAGTTCTTCAAGGACGCAACTCTACATC
ATCACTTTCAGGTGACATGTCTTGGTATCTCAACTCTCAATTAGCTGAAC
GTACTAGTGTCCATGGTGTTCTGGTAGATATCTACGGGATGGGTGTTCTT
ATTCAAGGGGACTCTGGTATCGGTAAGAGTGAGACAGCGCTCGAGTTGGT
GAAACGTGGCCACCGTCTAGTTGCTGATGACCGTGTAGATGTCTATGCTA
AGGATGAGGGAACTCTCTGGGGGGAACCTGCAGAAATTCTTCTCCATCTT
CTTGAAATCCGTGGGGTTGGTATCATTGACGTTATGAGTCTTTACGGAGC
TAGTGCTGTCCGTGATTCATCTCAAGTTCAGTTGTGCATATGTCTTGAGC
ATTTTGAAAATGACGAGGTCTTTGACCGTCTTGGAAATAGCAATGAAGAG
ATTGAATTACAGGGCGTTAAGATTCCACGTATCCGCATTCCTGTTAAGAC
AGGACGTAACGTGTCAGTCGTTATAGAAGCTGCAGCAATGAACTATCGTG
CTAAGCAAATGGGATATGATGCAACCAAAACTTTTAAGGACCGTTTGACT
GACCTCATTAGTAAGAATGGTGAAGACTAA
>stu0145 relA, (p)ppGpp synthetase
ATGGCTAAAGATAAAAATGTAACAGGAGAAGAAATTTTAGACGTTTGCTC
GTCCTATATGTCAGCAGATGATTTGAAATTAGTCGAAAAGGCCTGGCATT
ATGCGACGGATGCTCATAGTGAGCAATTTCGTCAGTCAGGAGAACCTTAT
ATAATCCACCCTATTCAAGTGGCAGGTATTTTGGCAGAGCTCCATCTTGA
TGCAGTAACAGTGGCCTGTGGTTTCTTGCATGATGTCGTTGAAGACACGG
AAAAGACGCTAGATGATTTAGAAGCGGATTTTGGTACGGATGTACGCAAT
ATTGTAGACGGTGTTACCAAGCTTGGTAAGGTTGAATATAAGTCTCACGA
GGAGCAGTTGGCTGAAAATCACCGTAAGATGCTTATGGCCATGTCTAAGG
ATATCCGAGTAATCTTGGTTAAGCTGGCAGACCGTTTGCACAATATGCGT
ACTCTCAAGCATCTTCGTAAGGATAAGCAGGAGCGCATTTCTCGTGAAAC
GATGGAAATTTACGCTCCTTTGGCCCACCGTTTGGGTATCAGCCGTATCA
AATGGGAATTGGAAGACACGGCTTTCCGTTACCTTAACGAGGTAGAATTT
TATAAGATTTCCCACATGATGAAGGAAAAACGCCGCGAGCGTGAGGCACT
TGTGGACGAGATTGTCTATAAAATTAAGACCTATACAGCTGAACAAGGGC
TTGTCGGTGATGTTTATGGCCGTCCAAAACACATCTACTCTATTTTTCGT
AAGATGCGTGACAAGAAGAAACGCTTTGATCAGATTTATGATTTGATTGC
TATTCGTTGTGTCATGGAGACGCATAGTGACGTTTATGCTATGTTGGGAT
ACATCCACGAGCTCTGGCGTCCTATGCCTGGACGTTTCAAAGACTATATT
GCCAATCCTAAATCCAATGGTTATCAGTCTATCCATACGACGGTTTATGG
TCCTAAAGGGCCTATTGAAATCCAAATCCGTACTAAGAAGATGCACCAAG
TTGCCGAATACGGGGTTGCAGCTCACTGGGCTTACAAGAAAGGTATCAAG
GGCAAGGTCGATTCGAAAGAGTCTGCTTTGGGAATGAATTGGATTAAAGA
TCTTGTGGAACTTCAAGATGCCTCAAATGGGGATGCTAAGGAATTTGTTG
ACTCTGTAAAAGAGGATATCTTCTCAGAGCGAATTTATGTCTTTACACCA
AAAGGTGATGTTCAGGAATTGCCTAAAGATTCAGGTCCTATTGACTTTGC
CTATGCCATCCATACCCAAGTCGGCGAGAAAGCCACAGGTGCCAAGGTTA
ATGGTCGTATGGTGCCTCTGACTGCCAAACTCAAGACGGGTGATGTGGTT
GAGATTATTACCAATGCTCATTCCTTTGGTCCTAGTCGTGACTGGATTAA
GATGGTCAAAACGACTAAGGCCAGAAATAAAATTCGTCAATTCTTTAAGA
ATCAAGACAAGGAAGCTTCAATCACCAAGGGTCGTGAGCTTTTGATAGCC
TATTTCCAAGAGCATGGCTATATTGCCAACAAGTACCTAGACAAGAAACA
TATAGAGGAGATCCTTCCTCGTATGAGTGTGCGTAGTGAGGAAGCTCTCT
ATGCTGCTGTTGGTTTTGGTGAAATTAGTGCCGCTGCGGTTTTCAATCGT
CTGACAGAAAAAGAACGCCGTGAGGAAGAGCGTGCTAAGGCAAAAGCTGA
AGCTGAAGAACTAATGAATGGTGGCGAAGTCAAGACTGAGAAGAAAGATG
TTCTCAAGGTTAAAAGTGAAAATGGAGTTATCATTCAAGGTGCCTCAGGT
CTCCTTATGCGTATCGCTAAGTGTTGTAACCCAGTACCTGGAGATGAGAT
TGAAGGTTATATCACTAAGGGACGTGGAATAGCTATTCATCGCTCAGATT
GTAATAATATCAAGAATCAAGAAGGTTATGAGCAACGTTTAATTGAAGTT
GAGTGGGATGAACGCAATACCAATAAATCTTACTTAGCTGAGATTGATAT
CTATGGCCTAAATCGTTCGGGTCTTTTGAACGATGTTCTTCAAATCTTGT
CAAATACAACCAAGAGCATTGCTTCGGTTAATGCACAACCAACTAAGGAT
ATGAAGTTTGCCAATATTCACGTTAGCTTTGAAATTGCTAATCTTATTGA
ATTGACTGGCCTTGTGGATAAAATTAAAATTATTCCAGATGTTTATAGTG
TTAAACGTACTAATGGTTAA
>stu0317 rr01, response regulator (homolog to csrR/covR Spy)
ATGAGCAAACGCATTTTGATTGTTGAAGATGAGAGAAACCTTGCTCGTTT
TGTCTCTCTTGAACTTCAACACGAAGGATACGACGTTGTGACAGCGGACA
ACGGACGCGAAGGACTTGAAATGGCACTTGAGAAAGATTTCGATCTTATT
CTCTTGGACCTTATGTTGCCTGAGATGGACGGTTTCGAAGTGACACGTCG
TCTCCAACAAGAAAAAGATACTTATATTATGATGATGACAGCTCGCGACT
CAATCATGGATATTGTTGCTGGTTTGGATCGTGGAGCTGATGACTATATT
ATAAAACCATTTGCGATTGAAGAACTGTTGGCACGTATTCGTGCAACCTT
CCGTCGTCAAGATATCGAAGCTACTAAGAAGGCACCAGCTAAAGCGTCAA
CCTATCGCGATTTAAAATTAGATGTTCAAAACCGTGCAGTTGTTCGCGGT
GATGAGGTAATTCCATTGACAAAACGTGAGTTTGATTTGTTGAACACACT
TTTAAGCAATATGAACCAAGTAATGACCCGTGAGGAACTCTTGCTTCAAG
TCTGGAAATATGATGACGTAATTGAAACAAACGTTGTAGATGTTTATATT
CGTTACTTACGTGGGAAAATCGACATTCCAGGTAAGGAATCATACATTCA
AACAGTACGAGGGATGGGTTACGTTATCCGTGAAAGATGA
>stu0543 rr02, response regulator
GTGAGGAGGTTTTCAATGTTAAAAGTTGCTATTTGTGATGACTCTGATAG
AGATGCTAGCCAATTAGAACATTATTTACTTTCTTATGATAAATTTCCTC
TAGAAACAAAACTTTATACAAATCCACAAAAACTCTTAAATCAGCGGACG
CCAGACATCCACTGTGTCTTTTTGGATATCAATATGCCAGGAATCAATGG
AATTGACGTAGCACAAAAGATTAGAAAATTTAATCCTTTCATTCCTATTA
TTTTTGTGACAAGTTATCGTGATTATATGGAACAAGTCTTCGAAGTTCAG
ACTTTTGACTATATCGTAAAACCGATAGAACCTCAAAAGTTAATGAAAGT
ATTGGATCGTATTTTGCGTTTTTTGGATATGGGCCAAGCACTTTTTACCT
TCTCATTTGGTAAACACAATTATTCTGTCCCTTCGAGCGATATTGTATTT
TTTGAGAAAGATAAACGTTCAGTATTTATATACACAAAGACAGGTACCTA
CAAGTCTCTACTAAAAACAAAAGAGATTTTGGAAAAACTCCCTAATTATT
TTATTCAAATTCATGCTTCCTATATTTTAAACCCCAAATACATCAAAGAC
TTTGATTCAAAAACAGTTACTATTTTACTAAATGGGACTGAAGAACACCT
ACTCCCAATTAGTAGAAAGTTTCAGTTTTCTTTTAAAGAAAAGTATTACA
GCTATCTAAGTGAAAGGCATTTTTAA
>stu0901 rr04, response regulator (homolog to spaR Bsu & DvnR Cdi)
ATGGCTCGAATACTTGTTATTGATGATCAAAAAGATATTGTTCAATTGGT
TGTAAAGGCTTTAGAGCTCCAAAACCATAATGTGACAGGGCTTACAAGTG
TTTTAGATTTGGATAAGAACTCTTTACCTCGATTTGACCTGATTTTACTG
GATATTATGATGCCTGATGTTGACGGTCTACAGTTTTGCCATGAGATTCG
AAATCAGGTGGATTGCCCAATCCTCTTTATTACAGCTAAAACGCAAGAAG
CAGACATTGTCCAAGGGTTGAGTTATGGTGCGGATGATTACATTTGCAAA
CCATTTGGGATTAAAGAACTCCAAGCGCGTGTTGCAGCTCACTTGAGACG
TGAACATCGTGAGCGTCACCATAAGCTTTCACTTGGGGAGTTTCAGTTTG
ACTTGTCTGCTCAAGAGCTTTATATTGAGAATCAGTTGTTAGATTTGACA
AAGTCGGAATATGGTATTTGCCAGTTTTTAGCTGAAAATAAAGGCCAAGT
CTTTTCAAAAGAACAAATCTACACGCATTTGTACGGCTATGAGGATAAAG
GCAGTCCGGCAGCAGTGGCTGAACATATCAAGAATATCCGTGCAAAGCTT
AAAGAAGTTGGGCAAAATCCTATTGAAACAGTTTGGGGGATTGGTTACAA
GTGGCACTAA
>stu1160 rr05, response regulator (homolog to RR02/MicA Spn & RR02 Sth &VicR Spy)
ATGAAAAAAATTCTAGTTGTTGATGATGAAAGACCAATCTCCGATATCAT
CAAGTTTAACCTTACTAAGGAGGGTTATGAAGTGGTTACGGCCTTTGATG
GGCGAGAAGCTTTGGAACAATTTGAAGCTAAAAAACCAGACTTGGTTATT
CTGGACTTGATGTTGCCTGAACTGGATGGTTTGGAAGTTGCCAAGGAAAT
CCGTAAAACGAGCCACACACCGATTATCATGCTTTCAGCTAAAGATAGTG
AGTTTGATAAGGTTATCGGATTAGAAATTGGGGCAGACGACTATGTGACT
AAGCCATTTTCTAACCGTGAATTGTTGGCACGTATTAAAGCCCACTTGCG
TCGTACAGAAACGATTGAAACTGCAGTAGAAGAGAGCTCTAACTCTGGCA
AACAAGAAATTTCAATTGGTGAGTTGATTATTGTTCCGGATGCCTTTGTT
GCTAAAAAACGTGGAAACGAAGTTGAGTTGACCCACCGTGAATTTGAGTT
ACTCTTCCATTTGGCAACTCATATGGGACAAGTTATGACGCGTGAACATT
TGCTTGAAACCGTTTGGGGCTATGACTATTTTGGGGATGTTCGTACTGTG
GACGTAACGATTCGTCGTCTGCGTGAAAAAATTGAAGATACACCTAGCCG
TCCTGAATATATCTTGACGCGTCGTGGTGTCGGTTATTACATGAAGAATT
ATGACTAG
>stu1325 rr06, response regulator (homolog to RR11 Spn)
ATGAAATTATTAGTTGCCGAAGACCAGTCAATGTTGAGGGATGCCCTCTG
CCAACTCCTCATGTTGGAGGACGATGTCGAAGAGGTCCATGCGGCCAGTG
ATGGTCAAGAAGCCATTACTCTCTTAGAAAAAGAGAAAGTCGACGTAGCC
ATTTTAGACATTGAAATGCCAGTTAAAACAGGCCCTGATGTTCTTGAGTG
GATTCGAGCCAACCAAAGAGAAACAAAGGTCGTTATTGTGACTACTTTCA
AACGTAAAGGCTATTTTAAACGAGCCCTTGCAGCCCAGGTAGATGCCTAC
GTTCTCAAAGAGCGTTCCATCAGTGACCTCATGGCGACCATCCATACCGT
CCTAGCAGGTCAAAAGGAGTATTCACCAGAGCTTGTCGAAGGTGTCGCCT
TTGACAATAATCCACTCAGCCAACGTGAACAAGAAGTATTGGCCATGGTT
GCCCAAGGGTCAACCAACCAAGAAATCGCTGAAAGCCTCTTTCTTTCAAA
TGGAACCGTCCGAAATTATATGACAGCCATCCTGACCAAACTTGATGCAG
GAAATCGAACAGACGCCGTCCGCATTGCCAAAGAAAAAGACTGGTTGGGA
TGA
>stu1336 rr07, response regulator (homolog to RR01Spn & Sth)
ATGCATAAGATTTTATTAGTTGAGGACGACGAGGTTATCCGTCAACAAGT
CAAAAAAATGCTAGAACAGTGGGGTTACGAAGTTGTTCTTGTTGAAGATT
TCATGGAAGTATTATCTATTTTTGTAAAAGTAGAGCCCCACTTGGTTCTT
ATGGACATTGGTTTACCTCTATTTAATGGTTATCATTGGTGTCAGGAAAT
TCGTAAGGTCTCCAAGGTGCCTATTATGTTCTTGTCTTCCAGAGATCAGG
CCATGGATATCGTTATGGCAATCAATATGGGTGGGGACGACTTTGTGACT
AAACCCTTTGACCAAAATGTTCTCTTGGCAAAAATTCAAGGGCTTTTGCG
CCGATCTTATGAGTTTGGAAAGGATCAGAATCTTTTGGAATATATGGGTG
TGATTTTGAACCTTAAGGCCATGGATCTGGTTTATCAGGGAGAAGTCGTT
TCTTTGACTAAGAACGAGTTTCAGATTTTACAAGTTCTCTTCGACCATGC
TGGAAATATCGTTAGTCGGGAAGACCTCATGAAGGAGCTTTGGAACAGTG
ACTTCTTTATTGATGATAATACCCTGTCTGTCAATGTGGCACGTTTACGT
AAGAAGTTAGAGGCTGTTGGTTTGAAGGACTTTATTGAAACCAAGAAAGG
TGTCGGTTACGGGTTGCGTCATGATGGATAA
>stu1420 rr08, response regulator (homolog to RR03 Spn)
ATGTCGAATAAGATTAATGTAATTTTGGTAGATGACCATGAAATGGTTCG
TTTAGGCCTTAAGAGTTTCTTGAATCTCCAAGGAGATGTAGAACTGGTTG
GAGAGGCAGAAAACGGCCGTGAGGGTGTCGATCTTGCCCTGGAGCTACGA
CCAGATGTCGTTGTTATGGACCTTGTTATGCCTGAGCTAGATGGTGTTCA
GGCGACTTTGGAATTGCTAAAAGAATGGCCTGAAGCTAAGATTCTAGTTT
TGACCAGCTATTTGGACAATGAAAAAATTTATCCAGTCATTGAAGCTGGC
GCCAAAGGCTATATGCTTAAAACGAGCAGTGCAGCAGAGATTCTAAATAG
TATCCGTAAGGTTTACCGTGGAGAGGAAGCTATCGAAACTGAGGTAGACA
ATAAGATTAAATACCATGATAGTCACCCGAACTTACATGATGACTTGACC
GCGCGCGAACGTGATATCTTAGCCCTCCTAGCTAAAGGCTATGACAATCA
AACCATTGCTAACGAACTTTTTATTTCTTTAAAAACCGTCAAGACTCATG
TGTCTAATATCCTTGGGAAATTAAATGTTGATGACCGTACTCAGGCTGTA
GTTTATGCCTTTAGACATCATCTGGTTTCACAGGATGATGAATAA
>stu1686 rr09, response regulator (homolog to BlpR Spn)
TTGAAGATTTACCTATTAGAAGATAATTCTATTCAGATGGGTCGCTTGGA
AGAGGCTGTGGCACATGAACTTAAATCCTTCGGAAAAGATCTATCTTGTG
TCCAGTCTTTTGACAAACCTGACCAGTTGTTATCAGCTATCACTTCTAAT
ACAAGCGATCAGATTTTCTTTCTTGATATTGAAATTAAAGGTGAAGATAA
GAAGGGACTTGATATCGCTAAAATCGTACGTCAAAATAACCCTTATGCTA
TCATTGCCTTTGTCACTACACATATAGAGTTCATGCCTCAAGCTTTTGGC
GTTACAGCCTATAAATACATCAATAAAACCTTAGATGAAGCTAGCTTTAG
AAAAGAAATAGGGGAAACCATTGCTCAAGTCTTCCCTATTAACGCAACTA
CCACGGATGAGTTTTTTCTCTACAAAACAGAGTCTCAATTAATAAACCTT
CCTATGGATCAAATTCTATACCTATCCACATCAGATATCAAACACCATGT
TCACCTCCAGACTATCCATACCCTCATGGATATCCGAGCAAATCTGGCAG
ACTTTAAAAAGATACACAAAAAGCTCTACCCATGCCATCGGTCCTATATC
GTCAATACAGATATGATCATCTCTGTCAACAAGACCAATTATGAAGCTAC
CTTAATTAATGGTCAAGTTCTACCAGTATCCCGTATGAAGATAGGAAAGA
TTGCACAGATTGTTGAGGAAAGAGGCAGATGA
>stu0729 typA, GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)
ATGACTAAACTTAGAGAAGACATCCGTAACGTTGCCATTATTGCCCACGT
TGACCACGGAAAAACAACACTTGTAGATGAATTGTTGAAACAATCACACA
CCCTTGATGAACGTATGGAACTTGATGAGCGTGCAATGGACTCAAACGAT
CTTGAAAAAGAACGTGGTATTACCATCCTTGCTAAGAATACAGCTGTTGC
TTACAATGGTACTCGTATTAATATCATGGACACACCAGGGCACGCGGATT
TTGGTGGAGAAGTTGAACGTATCATGAAAATGGTTGATGGTGTTGTTCTT
GTCGTCGATGCTTATGAAGGGACAATGCCTCAAACACGTTTTGTATTGAA
AAAAGCTCTTGAGCAAAATTTGACACCAATTGTTGTTGTCAACAAGATTG
ATAAACCCTCAGCTCGTCCTGAAGAAGTTGTTGATGAAGTCCTAGAGCTA
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TGCATCAGCTATTAATGGAACATCATCATTGTCTGATAATCCTGCCGATC
AAGAGCACACTATGGCTCCAATCTTCGACACTATTATAGATCACATCCCA
GCTCCTGTAGATAACTCAGATGAGCCACTTCAATTCCAAGTGTCACTTCT
TGACTACAACGACTTTGTTGGACGTATTGGTATTGGACGTATCTTTCGTG
GGACGGTAAAAGTTGGTGACCAAGTTACTCTTTCAAAACTTGATGGAACA
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TCGTGAAATTGAAGAAGCCAAGGCTGGTGACTTGATTGCTATCTCGGGTA
TGGAGGATATCTTCGTCGGTGAAACAATCACACCAACTGATGCTGTTGAA
CCATTACCAGTTCTTCATATTGATGAACCAACACTTCAAATGACTTTCTT
GGCGAATAACTCACCATTTGCTGGTCGCGAAGGTAAACACGTGACATCAC
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CGTGTTGAACCAACTGATTCACCAGATAAATGGACTGTCTCAGGCCGTGG
TGAATTGCACTTGTCAATCCTTATCGAAACAATGCGTCGTGAAGGATATG
AACTTCAAGTGTCACGTCCAGAAGTTATCATCAAGGAAATTGATGGAGTG
AAATGCGAACCATTTGAACGTGTTCAAATTGATACTCCAGAGGAGTACCA
AGGCTCAATCATCCAAGCTCTTTCAGAACGTAAAGGTGACATGCTTGATA
TGCAAATGGTTGGTAACGGCCAAACACGCCTTATCTTCCTTGTGCCAGCT
CGTGGACTTATCGGATTCTCTACTGAATTCTTGTCTATGACACGTGGTTA
TGGTATTATGAACCATACCTTTGATCAATATTTGCCGGTTGTTCCTGGTG
AGATTGGCGGACGTCACCGTGGTGCTCTCGTTTCTATCGATACAGGTAAA
GCGACAACTTACTCAATTATGCGTATTGAAGAACGTGGTACTATCTTTGT
TAACCCAGGTACTGAAGTTTATGAAGGTATGATTGTCGGTGAGAATGCTC
GTGAAAATGACCTTGGTGTTAACATTACTACAGCAAAACAAATGACAAAC
GTGCGTTCAGCTACTAAGGACCAGACGGCTGTTATCAAGACTCCACGTAT
ATTGACACTTGAGGAATCACTTGAATTCTTGGATGATGATGAATACATGG
AAGTAACACCTAAATCTATCCGCTTGCGTAAACAAATTTTGAATAAAGCA
GAGCGTGATAAAGCTAATAAACGTAAGAAAAAAAGCAGCGAAAGCTGA