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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA3495 C4817, putative nitrogen regulation protein
ATGAGCAAAGGATTGATATGGGTTGTTGATGATGACAGCTCAATTCGTTG
GGTATTAGAACGCACACTCAATGCAGCCGGATTACAATGCGAAACCTTTG
CCAGTGCCGATAATGTCATTGAAGCATTAGAGCGTAATGTTCCAGATGTA
TTGGTTTCAGATCTCCGGATGCCTGGCACTGATGGATTAACACTGCTTCG
TTCATTGCAAAAAGATTTCCCTGCATTGCCCGTTATCATCATGACGGCAC
ACTCTGACCTTGATGCCGCAGTTAACGCCTATCAAGAAGGAGCATTCGAA
TACCTACCTAAGCCTTTTGATATCGATGAAGCCGTCAATCTTGTTGAGCG
AGCTGTGACTCATAGCCAAGAGCAAAAACGCCAACAGCAGCCAGAAAGTG
ACACTAAAGCAGTACCGGAAATTATCGGCGAAGCCCCGGCAATGCAGGAA
GTATTCCGTGCAATCGGTCGTTTATCTCGCTCATCGATTTCAGTATTAAT
TAACGGTGAATCAGGCACAGGTAAAGAATTAGTCGCCCACGCCCTGCACC
GTCATAGCCCACGTAGCAAGCAAGCTTTTATTGCTTTGAATATGGCCGCA
ATACCTAAAGATTTAATTGAATCTGAATTATTCGGCCATGAGAAAGGAGC
ATTTACCGGCGCCAACAGCGTACGACAAGGGCGATTTGAACAAGCGAATG
GTGGCACACTGTTTCTCGATGAAATCGGCGATATGCCATTAGATATTCAA
ACCCGATTATTACGTGTATTGGCTGACGGACAATTTTATCGTGTTGGCGG
GCACTCTGCGGTTAATGTCGATGTTCGCATTATCGCGGCAACGCACCAAA
ACCTTGAAAAACTGGTTGCCGATGGCGGATTCCGAGAAGATTTATTCCAC
CGTTTAAATGTTATTCGGGTGCATATCCCTTCATTAAAAGATCGTCGCCA
AGACATACCACAATTAACACGACACTTTTTACAACGGGCGTCAGATGAAC
TCGCAGTTGAAGTGAAAACATTGCATCCAGATACTGTTGATGTGATCACG
AATCTCAATTGGCCGGGTAATGTTAGGCAATTAGAAAATACCTGTCGTTG
GTTAACAGTGATGGCAAGTGGTAATGAAATACTGCCTTCCGATCTCCCTC
CCGAGCTACTAGAAGCCCCTACGCTCATCAATGGTGAACCAACGAATTCA
CACTGGCATCATTCTTTGCAATGCTGGGCAAGAACAGCACTTCAACAAGG
AAACGACAATTTACTTGGCGAAGCGTTACCAGAATTTGAAAAAATCTTGC
TCGAAACGGCACTGGAACACACCCATGGCCATAAACAAGAAGCCGCCAAG
CTACTTGGCTGGGGCAGAAACACCTTAACCCGTAAACTCAAAGAGCTGAA
TATATCATCAGATTAA
>PBPRA3494 GLNL, putative nitrogen regulation protein
TTGATATTAACAAGGATGATAATCGTGACGACTGCCTTCACCCCTATAAT
TCTCAATAATTTAGTCACCGCAGTGATATTGCTTGATGAGCAACTCACCA
TGCGCTACGTCAATCCAGCAGCAGAACAATTACTGTCGTACAGTAAACGT
CGCTTACTGGGAGTCCGTCTTCCTAATTTATTGCAACATTCTTCGCTTGA
TATTGGTTTAATCCAAGCCACCTTGCAAAGCGGTCAAGGCTTAGCAGACA
GTGATGTCACCTTTGTTATCGATGGTAAACGCCATGCCTTAGAGTTAAAT
GCCAGCCCTATCTCTTGGCAGAAAGAGTTATTAATTCTGCTAGAACTCAA
ACCTATCGATCAGCAACGTCGTATCAGTCAAGAGCTGAGCCAACATGCTC
AGCAGCAAGCCGCCAAAGAATTAGTGCGCGGCTTAGCACACGAAATTAAA
AATCCGCTGGGTGGATTACGCGGTGCGGCTCAATTACTCGAAAAAACCCT
TCCTGACCCCTGTTACACTGAATATACCCAAATGATCATCGAGCAAGCCG
ATCGCCTACGAAACCTAGTCGACCGACTTTTGGGCCCGCAACGACCCGGT
TTACAAAAAATCGATAATATTCATATCGTCCTTGAAAAAGTGCGCCAGCT
CGTCAGCCTCGACTGCGGTGAAAAAATCAAACTGCATCGAGATTATGATC
CGAGCCTGCCCGATTTCACGATGGATTCCGAGCAACTAGAACAAGCCATC
TTGAATATTGTGAGCAATGCCGCTCTTGAATTACAGCAAGTGAGCGGGGG
TAATATCACCTTGAAAACACGCACTGCCCATCAAGCGTTGATTCAAGGCA
AAAGATACCGAATAGCGGCCAAAATAGACATTATTGACGACGGTCCAGGG
ATCCCTGATGAGATTCAAGACACCTTATTTTATCCAATGGTAACGGCCCG
AGAAGGCGGCACAGGATTAGGATTATCCATTGCGCGTAATTTGGTCGACC
AACACCACGGTAAAATAGAAGTTGTGAGTTGGCCAGGGCATACAAAATTC
ACGATTTATTTACCCATAAAGTAA
>PBPRA3401 PA3233, conserved hypothetical protein
ATGCCGGATAAATTCGACACATCAGTCACGCCCTTTGATCGTCTTCATCA
TGCTGAGCAAAAAATGCTGAAAGATGCATTAGATGTCGCTTATTACCGTG
AAGGCAATAAAATCATCACAACTGGTGACGCTTGCAACCATTTGTTTATT
ATCATTAAGGGAGGTGTTGAAGAAACCTCTTCTGATGGTACAGAAACCTA
TGCCCATTACGTCACTGACGATATGTTCGATGTACGTGCTCAGCTTGAAA
ATAAAAGCCGTCATGATTATATCGCGCTAGAAGATACACTCTGTTATCTC
TTACCTCGTGAAATTTTCATCGAGCTGTATCGTTCTAACGGGCAATTCGC
CGCCTATTTCGATAATAATTTAGCACGTCGTCAAAATTTAATTGAAGAGG
CACAGCGCCAACAAAATCTCGCCGAATTCATTTTGACAAAAGTGGATGAT
GACAACATTCAACCCTGCCTAATTGTGCCCCATGACACCGACTTAAAACG
GGTGACAGAAAAAATGCGCACCCAAGGCTTCGATGCCGCTCTGGTCGCAC
TTAATTCAACACCGCAATATGGCATTGTTACCCGCACCGATTTACTGCAT
GCGGTGATGTTAGATCAACTGCCTTCTGATACCCCAGTTAGTCAAATCGC
CACTACGCCAGTTATTAGCGTCAACAAAGATGATTTTTTGTTTAATGCCA
TGATTGCAATGACCCGTCATAAAGTGAAACGGGTACAAGTGCTTGATGCT
GGGCAAGTTGTTGGCATGTTAGATTTAACGCAAATCTTGAGCTTATTTTC
CACCCACTCTCACGTACTAACATTACGCATTGCACGTGCTGAAACCATTG
AAGAATTATCGCTAGCAGCCAGTAGCCAACAACGTTTAGTGGCAACCTTG
TTTAATAATGGTATTCATACGCTGTTTGTGATGGAACTGATCGCCTCGGT
AAATGAACAGATTATCGAAAAAGCCTTTCAATTAATTGTCCCGCCAACAA
TGCACAACTATTGCTGCTTCGTTGTAATGGGATCTGAAGGACGTGGCGAA
CAAATTTTAAAAACCGACCAGGATAATGCACTCATTATTCAAGATGGTGT
CGATTGGCCAGATTGTGCCAATGTCATGGATAAATTAACCCTTACATTAC
AACAACTCGGCTATCCACTTTGCCCAGGAAAAGTCATGGTGAACAACCCT
AAATGGGTGAAATCACAAAGTGAATGGTTACATACGATTAGTCGCTCTTG
CCAACAAGCAACCGAAGAATCCATGATGGATTTAGCGATACTTGCCGATA
GTCATGCTGTCGCAGGCAATCGCGTTTTACTCAACCCACTGCAAACCTAT
TTGCATCAGCAGTTAGCAGAAAAAGAACTGTTGTTATCTACTTTTACTCG
TCCTGCTTTGCGCTTCAGCGTACCTTTAACTCTATTTGGTAAAATAAAAT
CAACCAAGCAAGGAGTCGATATTAAACGGGGTGGGATCTTTCCAATCGTT
CATGGTATTCGGGCATTAGCCTTAGAAAATAAAATTGAACCCAATAATAC
CTTTGAACGCATTCATCAACTCGAATTGCGCAAAGTCTTAGAGCCAGCCA
CCGCGTCTAATTTAAGCGAAGCCCTTAAACTATTCATCAGAACCCGTTTA
CGCCAACAGCTTAACCACCAAGCCGGTGGACAAAGCCAGCAATTGAACGT
CAGTGACCTTAGTCGTGCTGAACGAGATCTACTGCGCCACAGCCTTCATG
TGGTAAAGAAGTTTAAAGAATGGCTCGGTTATCACTACCAAATAAGGGAT
TAA
>PBPRA3534 VV11110, hipothetical sensory box/GGDEF family protein
TTGTTGTTTATGCGTTTTATTATTTTATTCTTGATGGTCTTTTTTGTACT
CCCATCTTCTGCTGAGCCGTTAAAAAATACTCTCGTTATTCATTCTTACC
ACCAAGGTTTGTTATGGACAGATGCGTTGCAAGCAGGGTTAGAGTCAACA
ACACGGCCCTATAATATTCCATTGAATGTCAGTTATATGGATACCAAGCG
TTATCAGTCTGATTTCGATCTAGCTAAACGGCTAGAGATTTATCGCAATA
AATTAGCCAATGAAAAATTTGATGCGATCGTGGTGACAGATGATTATGCC
CTATGGTTAGTGAATCAACTTGCCGATGAAGTTGGTAATACACCGATAAT
TCTTGGTGGAATAAATGATTACAAACCAATGAAGCATGATCGGCTGAAGT
TCGTAACAGGAGTATTAGAGGTTGATAGTGTGGTTGATAATATTCAATTG
GCGCGTTCATTACAGCCAAACCTAAAACATATCTTCTTTTTGGCTGATGA
TACATTTACTGGGCGAACTTTTTGGGCGAAAGTTGAAAATTATTTAGCAC
AAGAGGCCATTAACAATATTCAATTTACGCGACTTCCGATTGATGAATTT
TCAACACTATTTGATAAAGCGAGTAAACTCCCTGCTGATTCAGCTGTGAT
TTTCCTGAGTTATTTTAAAGATAGTGCTGGGCGTTATATGGCGAGTGATG
TTTTTTTGCAGCAGTTCACTGAACGAGCTTCTGCACCGGTATACGTTTCT
TATCGTTATATGCTGGAGCTCGGAGCGACTGGCGGGGTTGTCACAAGTGG
GGTTGAACAAGGCAGTAAAATGGGGTCACTGTTGGTGAAAGTTCTTAATG
GTGATCTGAGTGAGGTTCCTGAATTTATTGATAATTCAACTCAGGTCGCT
TTTAACTACCAACAGCTTAAGCGGTGGGGGTTAACGGTTACCGATCAATA
TGCATTGTTAATCAATAAGCCAATGACCTGGTATGAATATTATAATAAAG
AGCTGAAAGCTCTCAGTATCTCAGTTGCATTGATGGGTGTTGTGATTTTT
TTATTAGTGCTGATAATTCGTCAATTACGAAAGAGTGAACAAGAACTACA
ACAAAGCCAAGCCCTGTTTGAGGGAGTATTCGACCAAAGTTTTCAATACA
TTGGCATCCTAGATTCGAGCGGCGTATTGATCTCTGGTAACTTTGCCTTA
CAGAACTTACTGGGGCATAAGATCATTAAATATGATCGTCCGTTATGGCG
TTGGCATTGCTGGCAACAAGAAATAGCCGTTAAGCTTAATCAGGCATTTA
TCTCAGCCCAGCAAGGACAGCTTCTTCGTTTTGAAGCGGCAGTGCAAAGC
GTTGATGATGGGATACGGGTATTAGATATCTCGATCAAAAATATGCCAAC
GGCTCAAGGTAACAGTGATCAAGTGTTGATTGAGGCGCGTGATGTTACCT
CTCGCCATCAGATGGAAGATAAATTACGTGAACGTGAAGTGAGCTATCGC
TTACTCTACGAACAACAGCCCGTCATTCTTTTAGCCATCGACAGTCAAGC
GCGTATTCAATCGGTGAATCAGTTTGCTGCCGATTTATTAGGTTATAAGA
AGCGTGATATGTTGGGGCATAAAGTGACTGATTTTTATTTAGATAATGCG
GTTTTACCGCAACAATTTATTTCAAGCTCTAGATTGAACGACGATCAAAT
TGTTTGGCGCCGGCAACTGAGATATAAGTGTGCAGAAGGTAAAGTGGTAT
GGGTGCGTGAAACTATTCGTTCAACTCAATCGAAATTGCAGCTTTTATTG
GTGGGTGAAGATATAACGTCAACACGCGAGCTTGAAGAAAAATTGGAATA
TCAGGCTTGCCATGATTACCTTACCGGGTTATTCAATCGCAACTATTTTG
AAACTCAGTTAGAAAATGTTTTAGTCGAAGCCAGAGAACATGAAACTCGT
CATGCGATGTTTTATATCGATTTAGATCAATTTAAAGTGATCAATGATAC
GGCTGGGCATGAAGCCGGAGATGAAGCATTAAAGCAGGTTGCATTACTGC
TACAAGAGATAACCCCTGAACACGCGACATTGTCGCGTTTAGGTGGGGAT
GAATTTGCCATTATTTTACGACATTGCACGCAACATGAAGCTGTGACATT
TGGTGATGAAATTCTACACTTGTTAGAAGGGGCTGAGTTTTTCTGGCAAA
GCACCCGTTTCAGTTTTAGTTGCTCGTTAGGTATTCGTTTAATTGATGAG
ACTGCAGGCTCTCCTCAACAGGTTCATGCACAAGCTGATACCGCTTGTTA
TGCAGCTAAAGACGAAGGGCGTAATCGTCTGCACCTCTATCACCCTGATG
ATGAAGAGCTCAAACGCCGTGAGTTGGAAATGGAATATGTGAACCATATT
CACAAAGCATTAGCTGAACAGCGATTTGAATTGCATGCCCAGCAAATTGC
ACCAGTGGCATCTGGCTCGACGAAGCAGCATTATGAAATATTGGTAAGAA
TGCGTAACAGTGATGGCAGCATGGTATCTCCAGGGCTCTTTATGCCCGCT
GCTGAGCGTTACAATATCGCTCACCTGATTGATCGTTATGTCGTAAAAGG
GGTTATTGAGTGGCTGCAAGCCAACAAAGAGGCCGTTGAAAAGCTAGAAT
TATGTTCGATTAACTTATCGGGGCAATCGATGGGAAATCGAGACTTTGTT
GGCTTCTTGATTGAGCAAATTCGTGATTCTGGTCTACCCCCCTCAAAGCT
GTGTTTAGAAATTACGGAAACGGCGGCAATCGGTAATATGAGTGAAGCCA
TTCAATTGTTTACTCAACTTAAGAACCTTGGCTGTCTTATTGCCTTGGAT
GATTTTGGATCGGGATTATCCTCATTTGGCTACCTGAAGCGGATGCCTGT
CGATATTATTAAAATTGACGGCATGTTTGTGCGTGATATTGCTGAAGATG
AAATGGATTTTGCGATGGTGAAAGCGATTAATGAACTTGCAAAGAAAATG
GGCAAACGAACGGTCGCTGAGTTTGTTGAAAATGAAGCTATTTTAATGCG
CTTACAAAGCCTTGGGGTAGATTACGCGCAAGGTTATTTATTTGGTAAGC
CGAAGCCTTTAGCGGAATTAGTCGCGGAATTAAGCCAAGATGAAATCTCG
GTGCTATAA
>PBPRA3395 XAC4180, putative transcriptional regulator, LuxR family
GTGCTAAATAGCACTCTTTTTTTCGATTTTTTCAGCAATACGCGGATTGA
GCATGATTATTACATCTATCGTCAAGCCTTGCCTGATCCAGCTCTTATCT
TGAGTGTTAACGAATTGATCTGGTTTTATAGCAGTGATAGCGTAATTAAA
AATAATAGTGAAAAGGTAGCCATGGACGCTCAATACACGATTGTTATCGC
TGATGATCACCCCTTGTTTCGTAATGCACTTTTTCAATCAGTGCATATGG
CGATCAGCGGTGCCAATCTACTCGAAGCTGAATCGCTTGATACCCTGCTC
AGCTTATTAGAAAAAGAAAATGATGTAGATTTATTGCTGCTCGATCTAAA
AATGCCGGGCGCGAATGGCATGTCAGGTTTAATTCAACTGCGTAACCAAT
ATCCAGACTTACCCATCGTCGTGATATCTGCCAGTGAAGAAATTACGGTT
GTAAAGCAGGTTCGCAGCCACGGTGCATTTGGCTTTATTCCTAAATCAAG
TGATATGCGCGCGCTAATCAGCGCCCTACATCAAGTGCTCGAAGGAGAAC
CCTTTTTTCCTGAAGGGCTCGGGGATGAAGATGATGAAATTAATGACCTT
GCCCAGAAAATAGCCTCATTAACTCCCCAGCAATATAAAGTGTTATGCAT
GCTGTCTGATGGTTTGCTTAATAAGCAAATTGCGTATGAGTTGAATGTAT
CAGAAGCAACAATCAAAGCTCACATGACTGCTATTTTTCGCAAGCTCGGG
GTTAAGAGTCGTACTCAGGCCGTGATTCTATTACAGCAAATGGATTTAAC
CCAATAG
>PBPRA3491 Y3803, putative virulence regulator BipA
GTGAATGTGAAATCCATGTCTAATCAACTGATCGATAAATTAAGAAATAT
CGCAATTATTGCTCACGTTGACCACGGTAAAACTACCCTGGTTGATAAAC
TACTACAGCAATCTGGCACGTTAGAGAGTCGCGGTGAAGCCGAAGAACGT
GTTATGGATTCTAATGATATCGAGAAAGAGCGTGGCATTACCATTCTTGC
TAAGAACACGGCAATTAACTGGAATGACTACCGCATCAATATCGTAGATA
CCCCTGGACACGCCGATTTCGGTGGTGAAGTTGAGCGTATCATGTCGATG
GTTGACTCAGTATTGCTTATCGTTGATGCAGTTGATGGTCCTATGCCACA
AACGCGTTTTGTAACGCAAAAAGCATTCGCACACGGCCTTAAGCCAATCG
TTGTAATCAACAAAATTGACCGTCCTGGCGCACGTCCAGAGTGGGTTATG
GATCAAATTTTTGACCTGTTTGATAACCTAGGCGCGACTGATGAGCAACT
AGATTTCACAACTGTTTATGCTTCTGCACTAAACGGCTGGGCAACAATGG
AAGAGGATACTGTTGGCGAAAATATGGAACCATTGTTCCAAGCGGTTGTT
GATAACGTTGCAGCCCCATTTGTTGACGTTGACGCTCCACTTCAGATGCA
AGTGTCTCAACTTGATTACAGCTCTTACGTAGGTGTTATCGGTGTTGCTC
GTATCGCTCGTGGTTCTGTTAAACCAAACCAGCAAGTGACTATCGTTAAT
GCTGAAGGCAAGAAGCGTAACGGTAAAATAGGTACAGTTCTTGGTTACCT
TGGTCTTGAGCGTAACGAAGTTGCAGTAGCTAAAGCGGGCGATATCGTCG
CTATCACAGGTCTTGGTGAGCTGAAAATTTCAGACACTATCTGTGACGTA
AACGAAGTTGAAGCTCTTCCTGCACTTTCTGTTGATGAACCAACAGTAAC
CATGACTTTCCAAGTAAACACGTCTCCGTTCGCGGGTAAAGAAGGTAAGT
TCGTTACTTCACGTAACATTCTTGAGCGTCTGCAGAAAGAACTTGTTCAT
AACGTAGCATTACGTGTTGAAGAAACTGACAGTCCAGATCGCTTCCGTGT
TTCAGGTCGTGGTGAACTTCACCTATCTATTCTGATCGAAAACATGCGTC
GTGAAGGTTTCGAGCTAGCAGTATCTCGTCCAGAAGTAATCATCAAAACT
GTTGATGGTGTGCTAATGGAACCGTTTGAAATGGTAACTATCGATGTGGT
TGAAGAGAACCAAGGTAGTGTCATGGAAAGCATCGGTATCCGTAAAGGTG
AGCTGAAAGATATGGCACCAGATGGTAAGGGCCGTGTTCGCATGGACTTT
ATGATGCCTTCTCGTGGTCTTATCGGTTTCCAAACAGAGTTCTTAACAAT
GACCTCTGGTTCTGGCCTTATCTACCACTCTTTCGATCACTACGGTCCCC
ACAAAGGTGGCGTTATCGGTCAACGTTCAAACGGCGTTTTGATCTCTAAC
GGTACGGGTAAAGCAGTAACATACTCACTGTTTAACCTTCAAGAACGTGG
TCGTCTGTTCTCTGAGCACGGTGATGAAGTATATGAAGGTCAGATTATCG
GTATTCACAACCGTGCTAACGATCTGACTATCAACTGTCTTCGTGGTAAG
CAGCTGACTAACGTTCGTGCATCTGGTACAGATGAAGCACAAACGCTATC
TCCTGCTATCAAGCACACGCTTGAGCAAGCTCTAGAATTCATTGATGATG
ATGAATTAGTAGAAGTTACACCAGTAAGCGTTCGTATCCGTAAGAAACTT
CTTACTGAAAACGATCGTAAGCGTGCAGGCCGTGCACCGAAGTAA