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# Shigella flexneri 2a str. 301, 301

>CP0182 icsA/virG, IcsA (VirG), outermembrane protein exposed to the bacterial surface by a C-terminal autotransporter domain and involved in the movement of intracellul
ATGAATCAAATTCACAAATTTTTTTGTAATATGACCCAATGTTCACAGGG
GGGGGCCGGAGAATTACCTACGGTAAAGGAAAAAACATGCAAATTGTCTT
TTTCTCCTTTTGTTGTTGGTGCATCCCTGTTGCTCGGGGGGCCAATAGCT
TTTGCTACTCCTCTTTCGGGTACTCAAGAACTTCATTTTTCAGAGGACAA
TTATGAAAAATTATTAACACCTGTTGATGGACTTTCTCCCTTGGGAGCTG
GTGAAGATGGAATGGATGCGTGGTATATAACTTCTTCCAACCCCTCTCAT
GCATCTAGAACTAAGCTACGGATTAACTCTGATATTATGATTAGCGCAGG
TCATGGTGGTGCTGGTGATAATAATGATGGTAATAGTTGTGGCGGTAATG
GTGGTGACTCTATTACCGGATCTGACTTGTCTATAATCAATCAAGGCATG
ATTCTTGGTGGTAGCGGCGGTAGCGGTGCTGACCATAACGGTGATGGTGG
TGAGGCTGTTACAGGAGACAATCTGTTTATAATAAATGGAGAAATTATTT
CAGGTGGACATGGTGGCGATAGTTATAGTGATAGTGATGGGGGGAATGGA
GGTGATGCCGTCACAGGAGTCAATTTACCCATAATCAACAAAGGGACTAT
TTCCGGTGGTAATGGAGGTAACAATTATGGTGAGGGTGATGGCGGTAATG
GAGGTGATGCCATCACAGGAAGCAGCCTCTCTGTAATCAATAAGGGCACG
TTCGCTGGAGGCAACGGAGGTGCTGCTTACGGTTATGGTTATGATGGCTA
CGGTGGTAATGCTATCACAGGAGATAACCTGTCTGTAATCAACAATGGAG
CTATTTTAGGCGGTAATGGTGGACATTGGGGGGATGCTATAAATGGTAGC
AATATGACCATTGCTAATAGCGGATATATAATTTCAGGTAAAGAAGATGA
TGGAACACAAAATGTAGCAGGTAATGCTATCCACATCACTGGTGGAAACA
ATTCATTAATACTCCATGAAGGTTCTGTCATTACTGGTGATGTACAGGTT
AACAATTCATCCATTCTGAAAATTATCAACAATGATTACACTGGGACCAC
ACCAACTATTGAAGGTGATTTATGTGCTGGTGATTGTACAACTGTTTCAC
TATCAGGTAACAAATTCACTGTTTCAGGTGACGTTTCTTTTGGTGAGAAC
AGTTCTTTAAATTTAGCTGGAATCAGTAGTCTGGAAGCTTCTGGAAATAT
GTCATTTGGCAACAATGTAAAAGTGGAGGCTATTATAAATAACTGGGCGC
AGAAGGACTATAAACTGCTAAGTGCAGATAAAGGGATAACAGGTTTCAGT
GTTTCTAATATATCTATCATCAATCCGTTACTCACTACTGGTGCTATTGA
CTATACAAAAAGCTATATCAGTGACCAGAATAAATTGATCTACGGTTTGA
GCTGGAATGATACAGATGGCGACAGTCATGGAGAGTTCAATCTGAAAGAA
AACGCTGAACTTACTGTTAGTACTATTCTGGCAGATAATCTCAGCCATCA
TAATATAAATAGCTGGGACGGAAAATCCCTAACAAAATCAGGGGAGGGAA
CTCTCATTTTGGCGGAAAAAAATACCTACTCTGGTTTCACCAACATCAAT
GCAGGCATTCTAAAAATGGGGACAGTTGAAGCTATGACACGTACCGCTGG
TGTTATTGTTAATAAAGGTGCTACCTTGAATTTTTCAGGCATGAACCAAA
CTGTTAACACTTTATTAAATAGTGGGACTGTGCTAATCAATAATATTAAT
GCCCCTTTTTTGCCTGACCCCGTCATTGTCACAGGTAACATGACTCTGGA
GAAAAACGGTCATGTTATTCTCAATAATAGTTCGTCAAATGTCGGTCAGA
CCTATGTTCAGAAAGGTAATTGGCATGGAAAGGGCGGAATATTATCTTTG
GGCGCGGTTCTCGGCAATGACAACAGTAAAACTGACCGGCTGGAAATTGC
AGGCCATGCGTCTGGTATTACCTATGTTGCAGTGACAAATGAGGGAGGCT
CTGGAGATAAAACTCTTGAAGGTGTTCAAATTATTTCGACAGATTCTTCT
GATAAGAATGCTTTTATTCAGAAAGGCCGTATTGTTGCTGGTAGTTATGA
CTATCGCCTGAAACAGGGCACTGTATCTGGACTGAATACCAATAAGTGGT
ATCTAACTAGTCAGATGGATAATCAAGAATCAAAACAGATGAGCAATCAA
GAGTCTACTCAAATGAGTAGTCGCCGAGCTAGTTCACAGCTTGTATCTTC
ACTTAATTTGGGTGAAGGTAGTATTCACACATGGCGCCCTGAAGCTGGCA
GTTATATTGCTAACCTGATAGCAATGAACACGATGTTTAGTCCTTCTCTC
TATGACCGACACGGTAGCACTATTGTTGATCCTACTACAGGTCAGCTCAG
CGAAACCACCATGTGGATTCGTACTGTTGGTGGACATAATGAGCATAATT
TAGCTGATAGACAATTAAAAACCACAGCTAACAGGATGGTTTATCAGATT
GGTGGAGATATTTTGAAGACAAACTTCACTGATCATGATGGCTTGCATGT
GGGTATTATGGGAGCTTATGGATATCAGGATAGCAAAACTCATAATAAGT
ATACTAGTTATAGTTCACGAGGAACTGTGAGCGGTTATACTGCCGGTTTG
TACAGTTCTTGGTTTCAGGATGAAAAAGAACGAACAGGTCTATATATGGA
TGCTTGGTTGCAGTACAGTTGGTTTAATAATACAGTCAAAGGAGATGGGT
TAACTGGTGAGAAATATTCCAGCAAAGGAATAACAGGAGCTTTGGAAGCT
GGCTATATCTACCCAACCATACGCTGGACTGCTCATAATAATATTGACAA
CGCATTGTATCTCAATCCACAAGTCCAGATAACTAGGCATGGGGTAAAAG
CAAACGACTATATTGAACACAATGGCACTATGGTCACATCCTCTGGGGGC
AATAATATTCAAGCAAAATTGGGATTGCGTACATCCTTAATTAGTCAGAG
TTGTATCGATAAGGAGACTCTTCGTAAGTTCGAACCATTTTTGGAAGTGA
ATTGGAAATGGAGCTCAAAGCAATATGGTGTAATTATGAATGGCATGTCA
AATCACCAGATAGGCAACCGTAATGTGATTGAACTCAAAACTGGTGTGGG
GGGGCGTCTTGCAGATAACCTAAGCATCTGGGGAAACGTATCTCAGCAAT
TGGGTAATAACAGTTACAGAGACACCCAAGGTATTTTGGGTGTGAAATAT
ACCTTCTGA
>CP0271 icsP/sopA, IcsP (SopA), outermembrane protease of the OmpP family, involved in cleavage of surface exposed IcsA
ATGAAATTAAAATTCTTTGTACTTGCACTTTGTGTACCTGCGATCTTTAC
TACACATGCTACCACTAACTATCCACTTTTCATACCGGACAACATCAGTA
CGGATATTAGTCTAGGATCTCTGAGTGGCAAAACAAAAGAACGCGTTTAT
CATCCCAAGGAAGGGGGGAGAAAAATTAGTCAACTGGACTGGAAATACAG
TAATGCGACTATTGTTAGAGGTGGCATCGATTGGAAGCTAATTCCAAAAG
TGTCTTTCGGAGTTTCCGGTTGGACTACTTTAGGTAACCAGAAAGCAAGC
ATGGTTGATAAAGACTGGAACAATTCCAATACCCCTCAGGTATGGACCGA
CCAGAGCTGGCATCCCAATACGCATCTCCGTGATGCTAACGAATTCGAGC
TGAATCTTAAAGGTTGGTTATTAAATAATTTGGATTATCGACTTGGACTA
ATAGCAGGTTACCAAGAGAGTCGTTACAGTTTTAATGCAATGGGAGGGAG
TTATATTTATAGTGAAAACGGGGGGAGCAGGAATAAAAAAGGGGCACATC
CTAGTGGTGAAAGAACAATAGGTTACAAACAGCTCTTCAAAATACCTTAT
ATTGGATTAACTGCTAATTACCGCCATGAGAATTTTGAGTTTGGAGCAGA
ACTGAAATATAGTGGTTGGGTTCTTTCATCTGATACAGATAAACACTATC
AGACTGAGACAATTTTTAAAGATGAAATAAAAAACCAAAATTACTGCTCT
GTTGCTGCGAATATTGGATACTATGTCACCCCCAGTGCAAAATTTTATAT
AGAAGGCTCCAGAAATTACATTTCTAATAAAAAAGGTGATACATCTCTTT
ATGAGCAAAGTACCAATATATCTGGCACCATTAAAAATAGTGCAAGTATT
GAATATATTGGTTTTCTCACTTCCGCAGGTATAAAGTATATTTTTTGA
>CP0135 ipgF, IpgF, periplasmic protein, similarities to the catalytic site of lyzozymes
ATGTCCCGTTTCGTATTTATTTTGCTGTGTTTTATCCCATATTTAGGGAG
AGCTGATTGTTGGGATAAGGCTGGTGAAAGGTACAATATTCCATCAAGTT
TGTTAAAAGCGATTGCGGAAAAAGAATCCGGATTTAATAAATCTGCAGTC
AATGTTAATAACAATGGAAGTAAAGATTATGGTATAATGCAAATAAATGA
CTTTCATTCTAAAAGACTTAGAGAAATGGGATATTCTGAGGAAATGCTAA
TTAGTCATCCATGTCTTTCTGTACATTATGCAGCAAAGTTATTAAATGAG
TTTATGATGATGTATGGAAGAGGGTGGGAGGCTGTTGGAGCCTATAATGC
AGGAACGTCTCCGAAAAAGAAAAAAGAAAGATTAAAGTACGCAGAGGATA
TCTATAGACGCTATTTGCGGATAGCAGCAGAGAGCAAGCAGAATAATCGA
AGGATATAA
>CP0238 msbB2, MsbB2, probable lipid A transacetylase
ATGAAAAAATACAAATCCGAGTTTATTCCTGAATTTAAGAAAAATTATCT
TTCCCCTGTTTACTGGTTTACATGGTTCGTTTTGGGAATGATTGCAGGTA
TTTCAATGTTTCCCCCTTCATTCAGAGATCCTGTCTTGGCCAAAATAGGG
CGTTGGGTGGGCAGATTGAGCAGAAAAGCTCGTCGCAGGGCGACGATTAA
TTTATCGCTTTGTTTCCCGGAAAAGAGTGATACAGAACGGGAAATAATTG
TCGACAATATGTTTGCCACAGCATTGCAATCCATAGTGATGATGGCAGAA
CTGGCAATTCGTGGTCCGGAAAAGTTCCAGAAACGAGTGTTCTGGAAAGG
CCTCGAAATTCTTGAGGAAATTCGGCACAATAACAGAAATGTGATTTTTC
TGGTTCCCCATGGCTGGAGCGTGGATATTCCTGCAATGTTGCTGGCAGCT
CAGGGGGAAAAAATGGCCGCCATGTTTCATCAGCAACGAAATCCAGTGAT
TGATTATGTCTGGAATTCTGTACGGCGTAAATTCGGGGGGCGCTTACATT
CCCGGGAGGATGGGATAAAACCATTTATTCAGTCAGTACGCCAGGGATAC
TGGGGGTATTACCTTCCAGATCAGGATCATGGTCCTGAATACAGTGAATT
TGCTGATTTTTTTGCGACCTATAAAGCGACATTACCAATTATTGGACGTC
TGATGAACATCAGTCAGGCTATGATTATACCGCTTTTCCCGGTTTATGAT
GAAAAAAAACATTTCCTGACTATTGAAGTTCGGCCACCAATGGATGCATG
CATTGCCAGCGCGGACAATAAAATGATTGCCCGACAAATGAACAAAACAG
TGGAAATTTTGGTGGGGTCACATCCGGAACAGTATATCTGGGTTTTAAAA
TTGTTAAAAACGCGCAAATCAAACGAAGCGGACCCGTACCCTTGA
>CP0236 rfbU, UDP-sugar hydrolase
ATGAATATACTATTTACGGAATCATCACCGAATATAGGTGGTCAGGAATT
ACAGGCTGTTGCTCAAATGAAGGCCCTGAAGAAAATGGGGCATTCAGTTC
TGCTTGTCTGCAGGGAAAACAGCAAAATTGCTTTTGAAGCCAGTAAATTG
GGGATTGATATCACATTCGCGTTATTTCGAAACAGTCTTCACATCCCTAC
TGCATGGAGATTACTCGGAATAGTTCATGGTTTTCAGCCCAATGCAATCG
TTTGTCACAGTGGGCATGATAGCAATATTGTTGGTTTAGTACGGTTATTC
ACTAGGAAACATCCATTCAGAATTATCAGGCAAAAGACATATTTGACACG
AAAAACAAAAGTTTTTTCAATAAATCATTTTTGCGATGAGGTGATTGTTC
CCGGAACAAGTATGAAGACACATCTGGAGCAGGAAGGATGTCGAACCCGG
GTTACTGTTGTGCCTCCAGGCTTTGATTTCCAGAAATTATACGTTGATTC
CCGAAACAGTTTGCCTCCAAATGTTCTTTCTTGGCTGGCGTCCCGAAGGG
GATGCCCCGTTATTGCTCAGGTAGGAATGTTGCGCCCGGAAAAAGGGCAC
GAATTTATGTTGAATTTACTGTTCCATTTAAAAATGAATGGACGACAGTT
CTGTTGGTTGATTGTGGGGTCTGGTTCGCCTGAACTGCGGGAGCATTTAC
AGTATCAGATTGACAGTATGGGCATGCATGATGATGTTTTTATTGCTGAC
AATGTTTTTCCTGCCGCCCCCGTATATCGGGTTGCCAGTCTGGTGGTTCT
GCCTTCAGAAAACGAATCGTTTGGTATGGTACTGGCAGAAGCATCGGCAT
TTTCTGTGCCTGTACTGGCCAGTCAGATTGGTGGAATCCCTGATGTTATT
CAGAATAACCAGACCGGGACATTGTTACCAGCAGGTAATAAGCACGCATG
GATGTGCGCCCTGAATGATTTTTTTAATGACCCTGGGCGTTTTTATCAGA
TGGCTCGCCAGGCAAAACAGGATATAGAAGAGCGGTTTGATATTAATAAA
ACTGCGTTAAAAATACTCACATTAGCGAAGCACAAGTAA
>CP0070 sepA, SepA, extracellular serine protease of the IgA1 protease family, secreted by a C-terminal autotransporter domain
ATGAACAAAATATATTATCTTAAGTATTGCCATATAACCAAAAGCCTGAT
TGCTGTCTCCGAACTGGCCCGCAGGGTTACCTGCAAAAGCCATCGCAGAC
TTTCACGTCGGGTTATTCTTACGTCTGTTGCAGCTTTATCACTTTCCTCG
GCATGGCCAGCTCTGTCAGCAACGGTCAGTGCAGAGATCCCTTATCAGAT
ATTCCGCGACTTTGCCGAGAATAAAGGTCAGTTTACGCCGGGGACCACGA
ATATTTCCATTTACGACAAGCAGGGCAATCTGGTCGGTAAACTTGATAAA
GCCCCGATGGCTGATTTCAGTAGTGCCACTATTACTACCGGTAGCCTGCC
TCCGGGAGACCATACACTTTACTCCCCTCAGTATGTGGTTACCGCCAAAC
ATGTCAGCGGTTCTGACACGATGAGCTTCGGATACGCCAAAAACACCTAT
ACTGCGGTTGGTACAAATAATAATAGCGGTCTTGATATTAAAACCCGCCG
CCTGAGTAAACTGGTGACAGAGGTGGCGCCGGCAGAAGTGTCTGACATCG
GGGCTGTGAGCGGTGCCTATCAGGCCGGCGGACGCTTTACTGAATTCTAT
CGCCTTGGGGGGGGGATGCAGTACGTCAAAGACAAAAATGGTAATCGCAC
CCAAGTGTATACCAATGGCGGATTTCTTGTTGGGGGAACCGTCAGCGCGC
TGAACTCCTATAACAACGGACAGATGATTACAGCTCAGACCGGTGACATT
TTTAATCCCGCGAATGGACCTCTGGCTAATTATCTGAATATGGGGGACAG
CGGCTCCCCCCTGTTTGCTTATGATTCCCTGCAAAAAAAATGGGTACTGA
TTGGCGTGCTTTCCTCAGGAACTAACTATGGAAATAACTGGGTCGTCACC
ACTCAGGATTTCCTTGGTCAGCAACCGCAAAATGATTTTGACAAAACTAT
AGCCTACACCTCTGGTGAAGGAGTACTGCAGTGGAAATATGATGCGGCTA
ATGGCACCGGCACACTGACTCAGGGAAACACGACTTGGGATATGCATGGA
AAGAAAGGAAATGATCTGAACGCAGGAAAAAACCTCCTGTTCACCGGCAA
TAATGGCGAGGTCGTTCTGCAGAATTCCGTTAATCAGGGAGCTGGGTATC
TGCAGTTTGCCGGCGATTACAGGGTGTCCGCCCTGAACGGCCAGACATGG
ATGGGGGGCGGGATTATCACCGATAAAGGAACCCACGTTCTGTGGCAGGT
GAACGGAGTTGCCGGTGATAACCTGCATAAAACTGGCGAAGGTACCCTGA
CAGTAAACGGGACCGGTGTGAATGCAGGCGGACTCAAGGTGGGGGACGGT
ACCGTTATTCTCAACCAGCAGGCGGATGCTGACGGAAAGGTACAGGCTTT
CAGCTCTGTTGGTATTGCCAGCGGTCGTCCGACAGTTGTGCTTTCTGACT
CACAGCAAGTTAATCCGGATAATATTTCGTGGGGATACCGTGGAGGACGT
CTGGAACTGAATGGTAATAATCTGACCTTTACCCGTCTTCAGGCGGCTGA
CTACGGGGCCATCATTACCAATAACAGTGAGAAAAAATCAACGGTAACAC
TCGACCTTCAGACATTAAAAGCCAGTGACATCAATGTACCGGTTAATACT
GTCAGTATTTTTGGGGGGAGAGGAGCGCCGGGAGACCTATATTATGACAG
TTCTACCAAGCAATATTTCATCCTGAAAGCGAGTTCATATTCCCCGTTCT
TCTCCGATCTGAACAACAGCAGTGTCTGGCAGAATGTCGGAAAAGATCGT
AATAAAGCCATTGATACTGTGAAGCAACAAAAAATTGAGGCCAGCAGCCA
GCCTTATATGTATCACGGCCAACTAAACGGCAATATGGATGTGAATATTC
CGCAGCTCTCAGGTAAGGATGTACTGGCTCTTGATGGTTCAGTTAACCTG
CCAGAAGGTTCGATAACCAAGAAGTCCGGCACGCTGATATTCCAGGGTCA
TCCAGTTATTCATGCTGGAACGACGACTTCTTCCAGCCAGAGCGACTGGG
AAACCCGTCAGTTTACGCTGGAAAAACTGAAACTCGATGCGGCAACATTC
CATCTGTCCAGAAACGGCAAGATGCAGGGAGATATTAACGCCACCAATGG
AAGTACAGTCATTCTGGGAAGTAGCCGTGTCTTTACTGACAGGAGTGACG
GAACCGGTAATGCGGTCTTCTCTGTTGAAGGGAGTGCCACTGCAACCACA
GTTGGTGACCAGAGTGATTACAGCGGAAATGTTACGCTGGAAAATAAATC
ATCCCTGCAAATCATGGAGAGATTCACCGGTGGTATTGAGGCTTATGATA
GCACCGTGAGTGTGACCTCTCAGAATGCTGTTTTTGACCGTGTTGGCAGC
TTTGTCAACAGCAGCCTGACCCTCGGAAAAGGAGCAAAACTTACGGCTCA
GAGCGGTATTTTCAGCACCGGGGCTGTGGATGTAAAAGAAAATGCTTCTC
TGACCCTGACGGGGATGCCTTCTGCGCAGAAACAGGGGTATTACTCACCC
GTAATTTCTACAACAGAAGGGATTAACCTCGAAGATAACGCCAGCTTTTC
TGTTAAAAATATGGGCTATCTGAGTTCGGATATTCATGCAGGAACCACTG
CGGCAACCATTAATCTGGGAGACAGTGATGCTGATGCAGGGAAGACGGAC
TCTCCGTTATTCAGCTCCTTAATGAAGGGATATAACGCTGTTCTGAGAGG
CAGTATTACGGGGGCACAGAGTACGGTAAATATGATCAATGCTCTGTGGT
ACTCTGACGGAAAATCAGAGGCCGGTGCACTGAAGGCTAAGGGCTCGCGA
ATTGAACTGGGGGACGGGAAACACTTTGCCACTTTACAAGTAAAAGAGCT
TTCTGCAGATAATACCACGTTCCTGATGCATACCAACAACAGCCGGGCTG
ACCAGTTGAATGTCACAGACAAACTGTCAGGCAGTAATAATAGCGTCCTG
GTTGACTTTTTAAACAAACCAGCCAGTGAAATGAGCGTGACGTTAATTAC
CGCACCGAAAGGGAGTGATGAGAAAACGTTCACTGCCGGTACGCAGCAGA
TTGGTTTCAGTAACGTTACGCCAGTAATCAGCACGGAAAAAACGGATGAT
GCCACAAAATGGGTGCTGACAGGATATCAGACTACCGCTGATGCCGGAGC
CTCGAAAGCCGCAAAAGACTTTATGGCATCAGGTTATAAGTCCTTCCTTA
CAGAGGTCAATAACCTGAACAAACGTATGGGTGACCTGCGGGATACTCAG
GGGGATGCCGGTGTCTGGGCACGCATAATGAATGGTACCGGTTCGGCAGA
TGGTGACTACAGCGATAACTACACTCACGTTCAGATTGGTGTCGACAGAA
AGCATGAGCTGGACGGTGTGGATTTATTTACGGGGGCATTGCTGACCTAT
ACGGACAGCAATGCAAGCAGCCACGCATTCAGTGGAAAAAACAAATCCGT
GGGTGGCGGTCTGTATGCCTCTGCACTCTTTAATTCCGGAGCTTATTTTG
ACCTGATTGGTAAATATCTCCATCATGATAATCAGCACACGGCGAATTTT
GCCTCACTGGGAACAAAAGACTACAGCTCTCATTCCTGGTATGCCGGTGC
TGAAGTTGGTTATCGTTACCACCTGACGAAAGAGTCCTGGGTGGAGCCAC
AGATAGAGCTGGTTTACGGTTCTGTATCAGGAAAAGCTTTTAGCTGGGAA
GACCGGGGAATGGCTCTGAGCATGAAAGACAAGGATTATAACCCACTGAT
TGGCCGTACTGGTGTTGACGTGGGAAGAGCCTTCTCCGGAGACGACTGGA
AAATCACAGCTCGAGCCGGGCTGGGTTATCAGTTCGACCTGCTGGCGAAC
GGAGAAACGGTTCTGCAGGATGCTTCCGGAGAGAAACGTTTCGAAGGTGA
AAAAGATAGCAGGATGCTGATGACGGTAGGGATGAATGCGGAAATTAAGG
ATAATATGCGTTTGGGACTGGAGCTGGAGAAATCAGCGTTCGGGAAATAT
AATGTGGATAATGCGATAAACGCCAACTTCCGTTATGTTTTCTGA