Gene list
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COG category: Cell wall/membrane biogenesis
Genomic element: pSS_046
Number of genes found: 13
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# Shigella sonnei Ss046, Ss046 >SSO_P180 conserved hypothetical protein ATGAATATACTATTTACGGAATCATCACCGAATATAGGTGGTCAGGAATT ACAGGCTGTTGCTCAAATGAAGGCCCTGAAGAAAATGGGGCATTCAGTTC TGCTTGTCTGCAGGGAAAACAGCAAAATTGCTTTTGAAGCCAGTAAATTG GGAATTGATATCACATTCGCGTTATTTCGAAACAGTCTTCACATCCCTAC TGCATGGAGATTACTCGGAATAGTTCATGGTTTTCAGCCCAATGCAATCG TTTGTCACAGTGGGCATGATAGCAATATTGTTGGTTTAGTACGGTTATTC ACTTGGAAACATCCATTCAGAATTATCAGGCAAAAGACATATTTGACACG AAAAACAAAAGTTTTTTCAATAAATCATTTTTGCGATGAGGTGATTGTTC CCGGAACAAGTATGAAGACACATCTGGAGCAGGAAGGATGTCGAACCCGG GTTACTGTTGTGCCTCCAGGCTTTGATTTCCAGAAATTATACGTTGATTC CCGAAACAGTTTGCCTCCAAATGTTCTTTCTTGGCTGGCGTCCCGAAGGG GATGCCCCGTTATTGCTCAGGTAGGAATGTTGCGCCCGGAAAAAGGGCAC GAATTTATGTTGAATTTACTGTTCCATTTAAAAATGAATGGACGACAGTT CTGTTGGTTGATTGTGGGGTCTGGTTCGCCTGAACTGCGGGAGCATTTAC AGTATCAGATTGACAGTATGGGCATGCATGATGATGTTTTTATTGCTGAC AATGTTTTTCCTGCCGCCCCCGTATATCGGGTTGCCAGTCTGGTGGTTCT GCCTTCAGAAAACGAATCGTTTGGTATGGTACTGGCAGAAGCATCGGCAT TTTCTGTGCCTGTACTGGCCAGTCAGATTGGTGGAATCCCTGATGTTATT 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TTAGTCATCCATGTCTTTCTGTACATTATGCAGCAAAGTTATTAAATGAG TTTATGATGATGTATGGAAGAGGGTGGGAGGCTGTTGGAGCCTATAATGC AGGAACGTCTCCGAAAAAGAAAAAAGAAAGATTAAAGTACGCAGAGGATA TCTATAGACGCTATTTGCGGATAGCAGCAGAGAGCAAGCAGAATAATCGA AGGATATAA >SSO_P182 msbB2, MsbB2 ATGAAAAAATACAAATCCGAGTTTATTCCTGAATTTAAGAAAAATTATCT TTCCCCTGTTTACTGGTTTACATGGTTCGTTTTGGGAATGATTGCAGGTA TTTCAATGTTTCCCCCTTCATTCAGAGATCCTGTCTTGGCCAAAATAGGG CGTTGGGTGGGCAGATTGAGCAGAAAAGCTCGTCGCAGGGCGACGATTAA TTTATCGCTTTGTTTCCCGGAAAAGAGTGATACAGAACGGGAAATAATTG TCGACAATATGTTTGCCACAGCATTGCAATCCATAGTGATGATGGCAGAA CTGGCAATTCGTGGTCCGGAAAAGTTCCAGAAACGAGTGTTCTGGAAAGG CCTCGAAATTCTTGAGGAAATCCGGCACAATAACAGAAATGTGATTTTTC TGGTTCCCCATGGCTGGAGCGTGGATATTCCTGCAATGTTGCTGGCAGCT CAGGGGGAAAAAATGGCCGCCATGTTTCATCAGCAACGAAATCCAGTGAT TGATTATGTCTGGAATTCTGTACGGCGTAAATTCGGGGGGCGCTTACATT CCCGGGAGGATGGGATAAAACCATTTATTCAGTCAGTACGCCAGGGATAC TGGGGGTATTACCTTCCAGATCAGGATCATGGTCCTGAATACAGTGAATT TGCTGATTTTTTTGCGACCTATAAAGCGACATTACCAATTATTGGACGTC TGATGAACATCAGTCAGGCTATGATTATACCGCTTTTCCCGGTTTATGAT GAAAAAAAACATTTCCTGACTATTGAAGTTCGGCCACCAATGGATGCATG CATTGCCAGCGCGGACAATAAAATGATTGCCCGACAAATGAACAAAACAG TGGAAATTTTGGTGGGGTCACATCCGGAACAGTATATCTGGGTTTTAAAA TTGTTAAAAACGCGCAAATCAAACGAAGCGGACCCGTACCCTTGA >SSO_P224 wbgT, putative UDP-glucose 6-dehydrogenase ATGTTCTATGTGCACTTTATGATGGATAAGAAAATGAAATTCGATACTTT GAATGCGAAAATTGGGATTATAGGCCTTGGTTATGTTGGATTGCCTCTTG CTGTTGAGTTTGGAAAGAAAGTAACGACGATTGGATTTGATATTAATAAG TCTCGTATTGATGAATTACGAAATGGTCACGATAGTACATTAGAGTGCTC AAATTTAGAGTTGTTAGAAGCAACTAAATTGACGTACGCCTGTTCATTAG ATGCACTAAAAGAGTGTAATGTATTTATTGTAACTGTTCCAACTCCAATT GATAAACATAAACAGCCAGATCTAACACCTCTAATTAAAGCATCTGAAAC ATTGGGTAAGATAATAAAGAAAGGCGATGTTATTATTTATGAGTCAACAG TTTACCCTGGAGCGACAGAAGAAGATTGTATACCAGTTGTAGAGAAAGTA TCAGGTCTTAAGTTTAATATTGATTTTTTTGCCGGTTATTCACCTGAGCG TATTAATCCTGGGGATAAAGAGCATCGTGTAACTAATATCCTTAAGGTGA CCAGTGGATCTACACCGGATGTTGCTGAGTATGTAGATCAGCTATATAAA TTAATAATTACTGTCGGTACGCATAAAGCATCATCGATAAAAGTAGCAGA GGCTGCAAAAGTAATTGAAAACACGCAGCGAGATGTCAATATTGCATTGA TTAATGAGTTATCTATTATATTTAATAAGTTAGGGATTGATACCTTAGAG GTTCTTGAGGCTGCAGGTACGAAGTGGAATTTTTTACCTTTTAGGCCCGG TTTAGTAGGTGGCCACTGTATAGGTGTAGATCCTTATTATCTTACACATA AAGCGCAAAGTGTCGGCTATCATCCGGAGATGATTTTAGCCGGACGTCGT TTAAATGATAGTATGGGGCAGTATGTCGTTTCCCAGTTAGTCAAAAAAAT GTTGAAACAACGGATTCAAGTTGAAGGGGCGAATGTGTTAGTGATGGGGC TTACATTTAAAGAGAATTGCCCAGATCTACGAAACACTAAAGTGATTGAT ATTATTTCAGAGTTAAAAGAATACAATATCAATATAGATATTATAGATCC ATGGTGTTCTACCGATGAGGCACAACATGAATATGGATTAACTTTATGTG AAGATCCTAAAGTTAATCATTATGATGCAATAATTATCGCTGTTGCACAC AATGAGTTTCGCGAGATGGGAGAGAGCGCTATTCGTGCATTAGGTAAAGA CGAGCACGTTTTGTTCGATTTAAAATATGTGCTTGATAAAAAAAGTATCG ATATGCGCTTGTAA >SSO_P225 wbgU, putative UDP-glucose 4-epimerase ATGGATATTTATATGTCTCGCTATGAAGAGATTACACAGCAGTTAATTTT TTCACCGAAAACTTGGTTAATTACTGGTGTCGCTGGCTTTATAGGATCAA ATCTTTTAGAAAAGTTACTTAAATTAAACCAGGTTGTTATTGGGTTAGAT AACTTTTCCACGGGACATCAATATAATCTTGATGAAGTTAAAACATTAGT TTCCACTGAACAGTGGAGTCGATTTTGCTTTATAGAAGGTGATATTCGAG ATCTCACTACCTGTGAGCAAGTTATGAAAGGTGTTGATCATGTCTTACAT CAGGCTGCGCTAGGTTCTGTACCTCGTTCAATTGTTGATCCTATAACAAC CAATGCAACTAATATTACTGGATTTTTGAATATCTTACATGCGGCTAAAA ATGCACAAGTACAAAGTTTTACTTATGCTGCATCAAGCTCAACTTATGGA GATCATCCCGCACTACCAAAAGTAGAGGAAAACATTGGTAATCCACTTTC TCCTTATGCAGTTACTAAATATGTTAACGAGATTTATGCTCAGGTATATG CTCGAACATATGGTTTTAAAACTATTGGATTACGTTATTTTAATGTATTT GGTCGTCGTCAAGATCCTAATGGAGCTTATGCTGCAGTAATTCCAAAATG GACAGCAGCAATGCTTAAAGGTGATGACGTATATATTAATGGCGATGGTG AAACGAGTCGTGATTTTTGTTATATAGATAATGTTATACAAATGAATATA TTATCTGCATTAGCGAAGGACAGTGCTAAAGATAATATATATAATGTTGC AGTTGGTGATAGAACAACGTTAAATGAATTATCTGGTTACATTTATGATG AGCTTAATTTAATTCACCATATCGATAAATTGAGCATTAAGTATAGAGAG TTTAGATCTGGAGATGTTAGGCATTCTCAGGCTGATGTTACTAAGGCTAT AGATTTACTAAAGTATAGACCAAATATAAAAATCAGAGAGGGATTACGAC TTTCAATGCCGTGGTATGTGAGATTTTTAAAAGGCTAA >SSO_P230 wbgW, putative glycosyltransferase GTGAGTGATGTTCTAGTATCTTTAATTATAGTTTGCTTTAATGCAGAGAA GTATATTGAAAAATCTCTTTTGGCATTTATTAATCAAGATGTTGGATTAG ATAAATTTGAATTGATTATTGTAGATGGGGATTCATCTGATAATACAATA TCTATTGTTCAGGATGTTTTTTCTAAACATAGCAACATTAAGCATAAAAT TATCAATAATAAAAAAAGAACTCTTGCTACGGGTTGGAATATTGGGGTGC TAGAAGCTAATGGTAAGTTTGTGTGTAGAGTTGATGCACATAGTGATATT CCAAATAACTATATATCTAAATTATTAGATGATTATTTTAATATTATGCA GTTTGATGATAGCGTTGTTGGTGTTGGAGGTGTATTAACTAATTCTTATA AAACTAAGTTTGGTTCAATTGTAGCGGATTTTTATGCATCGAAATTTGGT GTTGGTAATTCTCCATTTAGGTGCGTAGACAAAAATAATCGACTAAAAAA AACAGATACAGCTGTCTTTGCTTTATATAATAAAGATGTGTTTTTTGATG TTGGACTTTTTAATGAAGTATTAGATAGAAATCAAGATATTGATTTTCAT AAGAGAGTTTTAAGCAATAATTTGTCATTATATACAGATAATAGTTTATT TGTTGAGTATTATGTTAGAGATAATTTTAAAGATTTCATAAAGAAAGGTT TTCTTGATGGTTTTTGGGTTGTTATGTCTGGAGCATATTATTTTAGACAT ATAGTGCCACTTTTTTTTGTTTTGTATTTAATTGTATCTTTTTCTCTTTT CTTTGCTACTGGTGATTATATATATTTATCTTTTTTATTTTTTTATTTTC TTATTTCTATTTTGTTTTCAATTCGAGATGGGCGAAGTTTTATAGGTAGA GTATTTCTTCCTTTTATATTTTTGTCTTATCATATTTCTTATGGATGTGG ATCGTTATTATCTTTTTTGAAAAGGTATTTTAAATGA >SSO_P231 wbgX, putative glycosyltransferase ATGAAAAATTTTATTCCTTTTGCGTTACCTGAAATTGGCGAAGAAGAAAT TGCAGAGGTAATTGACTCTTTACGTTCAGGTTGGATTACGACAGGTCCTA AGGCTAAGCAATTTGAACAAGAATTTTCTAATTACCTAGGAGCGAACGTT CAATCATTAGCTGTTAACTCTGCTACGTCGGGCTTACATTTGGCTCTTGA AGCTGTTGGCGTAAAGCCGGGAGACCAAGTTATTGTCCCATCATATACAT TCACTGCTACTGCCGAAATTGTCAGGTACCTTGGTGCTGATCCTGTAATT GTTGATGTAGATCGTAAAACATTTAATATATCAGTTGATGCCATTGAGAA GGCTATTACTAATGAAACAAAGGCGATTATTCCAGTACACTTCGCTGGAT TAGCTTGTGACATGGATTCAATCTTATCAATTGCTAAAAAATATGACCTA AAGGTTGTCGAGGATGCCGCTCATGCATTTCCTACAACATATAAAGGAAG TAAGATAGGAACGCTTGATTCAGATGCTACGGTTTTTAGCTTCTACGCCA ATAAAACTATGACAACCGGTGAAGGCGGAATGGTTGTTTCAAAAAATAAA GATATAATTGAGCGTTGTAAGGTAATGCGTTTACATGGAATCAGTCGTGA CGCTTTTGACCGGTACCAGTCTAAAACTCCTTCTTGGTTTTATGAGGTTG TAGCTCCAGGGTTTAAATACAATATGCCTGATATCTGTGCGGCAATCGGT ATTCATCAACTTAGAAAGATCGATGATTTTCAGAAAAAACGTCAACGAAT GGCAAAAATTTACGATGATGCGTTAAAAGAATTGCCACTTGAATTGCCTG AATGGCCTACTAATGCTAGTGATATTCATGCTTGGCATCTATATCCTATC CGCTTAAAAACTGATTCGGCTATTAATCGCGATGATTTTATTAAGAAGTT ATCAGATCTTGGAATTGGTTGTTCTGTCCATTTTATACCGTTGCATAAGC AACCGGTTTGGCGTGATACATATAATTTGAACGCCAGTGACTTTCCAGTT TCTGAGGAGTGTTATTTAAATGAAATATCTATTCCTCTTTATACTAAAAT GACGGATCAAGATCAGTTGTTCGTTATCAAATCGATTAGACAATTATTTA TGTAA >SSO_P232 wbgY, putative glycosyltransferase ATGAAACGTATTTTTGATGTTATCGTGGCAGGCTTAGGCCTGCTTTTTCT ATTTCCTGTTTTTATCATTGTGTCAATGTTAATTGTTGCTGATTCTAAAG GGGGGGTTTTTTTTAGGCAGTATAGAGTTGGGAGATTTGGGAAAGATTTT AGGATACATAAATTTAGAACGATGTTTATCGATTCAGAAAAAAAAGGACG GATAACAGTTGGTCAAGATGCTCGGGTAACCAGAGTTGGATGGTATTTAC GGAAGTACAAAATCGATGAGCTTCCTCAATTGATAGATGTTCTTTCTGGA ACAATGAGTTTGGTTGGCCCAAGACCGGAAGTGAGGGAGTTTATTGATGA GTATCCTGATGATATAAGGGAAAAAGTTTTATCGGTTAGGCCAGGGATAA CTGACTTAGCATCTATAGAAATGGTAGATGAAAATGAGATTTTGTCTAGT TATGATGACCCACGTAGGGCTTATATAGATATAATTCTTCCAATCAAGCA AAGATATTATTTAGATTATGTTGCTAACAATTCAGTAAAGTATGATTGTG TGATAATTTGGAAAACTATTATTAAGATTTTGTCGCGATAA >SSO_P233 wbgZ, putative epimerase/dehydratase ATGATTGATAGAATATTGGAGCTGCCAAGAATTGTTAAGAGAGGTATCAT CATCTGCATTGATGTAGTTATGGTGATATTCTCATTTTGGTTGTCTTATT GGTTGAGGCTTGATGAGCAAACGGCTTTTCTTAGTGCACCGATGTGGTTT GCTGCAGCTATTCTTACCATATTTACCGTGTTTATATTTATCAGGATTGG GCTTTATCGGGCAGTCTTACGGTATGTTAGTGCAAAGATAATGTTGCTAA TACCAGTTGGTATTCTGGCCTCAACGTTATCTCTTGTCGTTATATCATAT TCGCTATCCATAATGTTGCCGCGCACTGTTGTCGGAATTTATTTTTTGGT TTTACTTTTACTGACATCAGGCTCTAGATTGCTTTTTAGAATGATACTTA ACTATGGAGTTAAGGGTAGTGCGCCTGTTTTGATTTATGGCGCTGGTGAA TCTGGCCGACAATTATTGCCAGCATTAATGCAGGCAAAAGAATATTTTCC TGTGGCATTTGTGGATGATAATCCTCGCTTGCATAAGGCTGTCATTCATG GTGTAACAGTTTATCCCTCGGATAAACTGAGTTACCTTGTAGATCGCTAT GGTATAAAGAAAATTCTTTTGGCGATGCCGAGCGTCAGTAAGTCACAAAG GCAGAAAGTGATTACTCGTTTAGAGCATCTACCGTGTGAAGTTCTCTCTA TTCCGGGTATGGTCGATTTAGTCGAAGGTCGAGCACAAATCAGTAATCTA AAAAAAGTATCGATTGATGACTTACTAGGTCGTGATCCGGTTGCTCCTGA TGCCAAATTGATGGCCGAAAACATTACTGGCAAAGCCGTTATGGTCACTG GGGCGGGAGGCTCGATCGGCTCTGAGCTTTGTCGTCAAATTGTTCGATAT AAGCCGGCCAAATTGGTTCTATTTGAACTGTCTGAATATGCCCTCTACGC TATTGAGAAAGAGCTCTCGGCGCTGTGTGACAAAGAAGTTTTGAATGTTC CAGTGATCCCTCTGTTGGGCTCGGTGCAGCGTCAGAATCGCTTACAGATG GTGATGAAGTCCTTTGGTATTCAAACGGTTTATCATGCGGCCGCTTATAA ACATGTGCCTCTGGTTGAGCATAATGTGGTGGAAGGGGTACGTAATAACG TGTTTGGTACCTTGTACTGCGCTGAGTCAGCGATCGAAAGTGGCGTTGAA ACTTTTGTGTTGATTTCCACCGATAAAGCGGTGCGCCCGACCAACACTAT GGGGACAACTAAGCGTCTGGCCGAATTGGTATTGCAGGCTTTGTCTGCAC GGCAAAGCCAAACTCGCTTTTGTATGGTGCGATTTGGTAATGTACTCGGT TCTTCGGGCTCTGTCGTGCCGTTGTTTGAAAAACAGATTGCCCAAGGTGG GCCAGTTACCTTGACTCATCGTGACATTATTCGCTATTTCATGACAATTC CGGAAGCATCACAGTTGGTGATTCAAGCGGGGGCGATGGGGCATGGCGGC GATGTCTTTGTCTTAGACATGGGCGATCCGGTCAAGATTTATGACTTAGC CAAACGCATGATCCGGTTAAGTGGCTTGAGTGTACGGGATGATAAAAATC CAGATGGCGATATTGCCATTGAAGTTACGGGATTACGTCCAGGTGAGAAA CTGTATGAAGAATTACTGATTGGTGATTCAGTTCAAGGTACCTCTCATCC ACGAATTATGACGGCCAACGAAGTGATGCTACCGTGGCAGGATCTATCGC TCTTACTTAAAGAGCTGGATCAAGCTTGTCATGACTTTGATCATGAGCGA ATTCGCAGTTTGTTGTTACAAGCACCAGCGGCATTCAATCCAACTGATGA TATTTGCGATCTAGTTTGGCAGCAGAAAAAATCGCTGTTATCACAAGCGA GCAATGTCATTCGCCTGTGA >SSO_P227 wzy, putative polysaccharide polymerase ATGTTAATATACCTATATCCTGTACTTTTGTTATTTAATATCCTTCCGGT TTTTTTTTATGGACAAATGAACTCTGATTTAGAGCGTTTTTTTGGAGTTC CTATTGGCTATATTCCAGATCTAATATTTTATTTCTTTGTTGTTTTAACA TCTATAATAACGTTGAGGTTTCACGTTTCTCTGTGGACAAAGAAATTATT ATTTTTAGGCATCATATTCCTGATTTATATCAGCATTCAGATGTTGTTGT TATCAGCGGATATATCAGGTGTCGTAATTTTATTATCGTTTTTTTCTAAT TTTATAGCTTTGGTTCTTTTGGTGTCATTTTGCATTGGTAAAGATGAGCT TTATTTAACTCATTCGGTTAGAAATATAAATGTTGTAATGTGTTTTGGTA TTATCTGTGGAGTTGTAAAATTATTTATTGGTTATTCTGAAGATAGTAAT TTTATAGTTTATTTAAATAGAAATGCCACCGCAATTATAGTAGTGTGCTT TTATTGTGTATATTCATACTTTTATCGTGGTCGAAAGTCTTGGTATGTCT CATCTGTATTGTACTCTCTGTTCTTTCTTTTTCTGGATAGCCGAGCAGGA ATAATATCATTTGCTATATCGTTGTTTTTTGTTTTTCTTCAGTTAACAAA GAAGGAAAAGTTATTAATATCATTGTTTTTTGTTCCTCTTCTAACTTTAG GTATTTCTTTTACTGATATAGGCACTCGTCTTGAACGAATGCTGTCTTCG TCACAGGTTATATTCTCTGGTGGTAACACTCTTACAAAAAGTCAGAATGA TTATCGTCGAGTTGAGTTAGTATTTATTGGGGTTGATGTTTTAAAAGAAA ATTATTTAATTGGCACTGGATTAGGTGTTGCAAATTATGTAAAGGCTATA GATAAAAAGTTTTTAGGAAGTACCAACTTTGGGTTGGCGCATAATTTTTA TTTATCTTATTCGGCTCAGTTAGGGATTATTGGTTTTATTTTGCTTATTT CTGTATTTTATATAATGCTGTCTCCAATTTTTAAATGCGGAGGGTATATT GGTAAAGGATGCGTTTTTGCTTTGGCTTTCTATGTCTTTTTTAATGAGTA TATATTGACGCCAGCGATATATATTTATATTTCTATTTTTTTATCGGTGG TTTTTATACGTAATTCTAAATAG >SSO_P223 wzz, O antigen chain length determinant protein ATGCCAAAAGCAGAGGATGAAATCGATCTTTTCGAGCTTTTAGGCACCTT GTGGAAGAAAAAATGGGTTATTTTATGTGTCACGTTGCTGACTACGGGGT TAGCAGCAGTGTATGCCTTTACCGCAAAAGAGCAGTGGACGGCTAAAACC TATATTCAAGCACCACGTATTGCTGAATTAGGCAGCTATCTTAAATTTCA CCAAGCGTATGCCCGAATATTAAATCAACCGTTAGATACGAATGCGTTGG CTAATGGATTGTTTTCCGATTTGATTTTGATTGCTGAATCGCCAGACACC AAAGTTAAATTTCTAGAGAGTACTGAGTATTATAAAAAGGAAACAAATAA TTTATCTACTGAACAAGATAAGAAAATTTGGTTAGCTGAGCAAGCGAATA AAGGTCTTGTGATTACGCCACCAAAGGAAAAGGGAAATACAAGTTACTAC ATAATACAAGCATCGGCAGACTCAGCGCAAGAGGCATATAAACTACTGCA GGGATATCTAAAGAATGTTAATAATCAAGCTGTAACATTAAGTCTTGATG AGTTTGGTCAAAATGTTAATACTCTTTTGGTTAATCTAAATAAAGAAATT ATTGACATAGATTTCCAGAGAAAATCAGAAAAGCTTGATCAAATAGCTCA TATTCAGCGAGATTTAACAACTGCGGAACAAGCCGGAATCATTGATTATC GCTCTAGCAAAGGCGGCTTCGATAATGCGCAAAGTAGCTATAAGTTCTTG CTCGGCGAAAAACTGTTATCAGCAGAGCTAAAAGCAACTAAAGATGCGCC AATTATTTACCCATTTAGATATTACGAAGTGAAACGTCAAATTGATGAGT TAGAAGGAATGTTACGCGATAACATTCAGGCGCAAGCATATCGATATCAA ATGAAGCCATCTGAGCCAGTTATAAAAGACAAACCCAACAAAGCATTAAT TTTGATTCTTGGTGCATTACCAGGGGCAATGTTTGCTATAGTTGGTACAT TAGTTTATGCGACATTAAAAGATAAAACCAAGTTAGATTAA