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# Rickettsia felis URRWXCal2, URRWXCal2; California 2

>RF_pd39 Conjugative transfer protein TraA_Ti
ATGGAACGGAGCAGAAGCAAGAGAAAAAGAGCGGATTCTAGGACTGCATC
AGAAATAGAATTTTCACTACCACGTGAAGTAAGTAAGGAACTAAATATTA
GTTTGGTAGAAAAATATGTGAATGAGTATATAGTCGCAAGAGGAGTTGTA
TGTGATGTAAATATTCATTACGATAATCCTGATAATCCACATGTACATAT
TCAATATTTAACTAGAAAATTAGAGCGATTAGAGAATGGCGAAGTAGTAC
TTGGAAAAACAAAAAATAGAGAATTAGAAAGTACGAAGTTTTTATATTTT
TTGCGGGACAGGTGCGAGATAGAAATCAACAAAGTATATGAGGAAGCAGG
GTTACCATATAGAGTAACAGCTAAGTCATTTGAAACGCTTGGAATAGATC
AAATACCAAAGCTTCATATAGGACCAGCTCATCATATGCCTGCAACTGAG
CTTGAAGCAAAAAACAAAGAGATCATAGCTGAGAATGCAAAGAAGATATA
TGAGAGTCCTGAAATAGTATTTGGTCGCATTTCGTACACGAAACCAGTGT
TTACTAAAGAAGATATAGCTATAGCATTATCTGACGCTCTAATGGTGCAT
TTAGTATCAAAAGGAAGTGATATTGCAAAAGAGCAAGAGGCTATTAGAGC
ATTTGGTAAGGGCTTAGTAAATGAGCAAGCAGGTGATGGAAATACAGAAC
AAAATATAGTGAATGATGCAGTAGGAACTGCGGCAGGAGGTGGAGCAGAG
AATACAGATAGTAGCCAAGTAAAAGAGACCACTAACAACCCAGCTATCGA
GCATTTAAACAAGGAATATGGCGAGGAGTTTTTACGGCTTTACAATCAGC
TACTTGTATCTGACAAGATAGAGTTGATGGATCAGAAAGATTTGATGGGA
AGAACGCTATATTCCCTAAAATCAAGAGTAAATCTAGAACGTCGTTATGT
ATCTGCTATAGAGGAGTTAAATACTAAAGGCGAACATAAGCTGAATATTT
TAGATAACACTATTGGAGAGAGAAACAGTCTTAAGGAACAAATAGGTGAT
TTAGTAAATGTAGTAGGAGCAAACCTACAAAATAAGTTTAATGATAAGCT
AGGCAGTGGTTTAGGCTTAAAGCTTAATGTTTTTGGCAGCAAGAAGCATG
CATTTAGTGATGAGCAAATCAAAGCAATCCTCTCAGTCTGTAGTGGCTCT
GATATTAGTGTACTTGAAGGAAATCCCGGAGCTGGTAAGACTTTTGTGAT
GAAAGAGATAGTGCGTCAGTACAAAGCGGCAGGATTTAAGGTAGTAGGTA
CTGGACCAAGTAGTGTATCTGCTAAGGTTTTAAGTCGTAATGCTGGAATT
AAGGCAGATAATACGAGTTTGCTACGTAAGAAAATCGTAGAGTCCAAAGG
AGGCGACTTTAAGATAGATTTAAGCAGCAAATATTATGAGGAGGAGGAAT
ATTTAAAATCTATTGGTTGTGATTCGATTTTGAACTTTTTACGTTCTGAT
GTACTTGATAGTAAGACTGTATTGATCGTTGATGAGGCAAGCATGATTGA
GCTTGCTAATATGGACTATCTAGCTCACGAGGTCTTAAGGTCTAAGGCAA
AGCTAGTACTTGTTGGAGATAACAACCAGTTTACAGCTGTTGGTATGACT
GGAGCGTTTAACAAAGCACGTAAGATTGCAGGAGGAGTTAAGCTTACTGA
AGTAAGAAGACAGGAAAGAGTAGAGTACAGGCAGGCGACGAGAGCTATGG
GACGCTTTGCCATGCAGGAAGCCATTGAGATATATAGAAAATTAGACGTA
TTTAACATTAAGGATAATGAGCAGGAAGCTAAAACTAGCTTAGTTACGTC
ATTTGCTAAAGAATATACTGAGCAGATAGATAATCTTAAGAGAGATGATT
TAATAGCGATTAGAAGTATAGCAATTGGAGCATATACGAACGAGAAGGTA
GCTGATAACACAAGAGTAAGAAGTGAGCTAAAGCATAGCGGAGCATTAAA
GGGAACTGAAGTACAAATTAGCAGTGGCGGGCGAATGCTGTCGCTGATGA
AAGGCGACCGAATAGTATTTGAAGAGAATAGTTTAAGATACGGGATTAGT
AATGGAGAAGTAGGAACAATATTATCAGTCAAGCCTTCGGTTAAATCGTT
TAGTGGTGGTGCGAGTAGTAAAGGTGAGAGTGATGGCGACGGATTACTTA
AAATATTAGTCCATAAAGCAGATGGCTCAAAGGATATAATAAATATTGAT
ACTGCTTCTGACGCTGCAAATAATAAGTGGAGGATTAAATTAAATCATGG
ATACGCATTAACTGGTTACAAGTTACAAGGTGAGACGGTAGACCGAATGC
ATGTATATTTTGACCGCTCTATTGGATATGAGGCGTTTTTGGTGCTCATG
TCACGTCATAGAGAAGAGGTTAAGCTTCATGCGTCCGCAGAGGAGCTTGA
AAATATAGTGTATCAGCGTCTTGATAGTGATGTAGAGAAAGTTAGAAATC
AGTTCAAGATTAACAGCTATGAGATGCGAGATGAGACGCGTATTAATTCT
GCAGGGGAAGAATATACAGTTCAAGTAAAGGAAGAGATACCTAACTGGCT
AATCGGCTTAACTCTTGCAGTTAGCAGAAGAGCCAATAATAGCTTTGCAA
TAGACTATGGAAAGGGTGGTACTTTAGAAGGCAGTCAGCTAATCATCAAG
GAGTATTTAGAAGCACGGGGGTGA
>RF_pd66 Site-specific recombinases
ATGGCAAAAGTTGGATATGCACGCGTTAGTTCATTAGGTCAATTACTCAG
CATCCAATTAGATAAATTAAAAGATTGTGATAAAATATTTCAAGAAAAGA
AATCCGGTCTTGATGGAACAAGAAGTGCATTAAAAAATGCACTGGATTAT
GTACGTGAGGGCGATATCTTTATTGTTACAAAATTAGATAGGTTAGCACG
CTCTACTGCACATCTATGCAAAATAGCCGAGATTTTAAATCAGAAATCTG
TGGCTCTGAAAGTTTTAGATCAAAATATCGATACTAAAGATGCGACTGGT
CGGTTAATATTTAATGTGTTAGGAGCGATCGGACAATTTGAAACTGAGAT
TAGAGCCGAGAGGCAAATAGATGGAATCCTAAAAGCAAAAGAGCGAGGTA
TACAGTTTGGGAAGAAACAATACTTAACAAAGCAACAATTAAATGATCTT
AAAGAAAAACGAAAACAAGGTATTAAAATCAAAAACCTGATGCAAGAATT
CAATTTATCAAAAGCCTCAATATATCGCTATCTTGCACAGGAAGTATAA
>RF_pd54 Transposase
TTGGTAGTAAAAGTACGTCAAGATAAGCGGATTATCAACAAATCAGTATA
TGTTGCCTTAGGCATTGATTTAGAAGGGCGGAAAGATATTTTAGGACTGT
GGATCAGCGAGAATGAAGAGGCTAAATTTTGGCTTGGTAATTTTACTGAG
ATGAAAAATAGAGGTATGCAAGACATACTGATAGCATGTAGTGATAATCT
TAACGGTATGTCTGAAGCTATAGGTGCTGTTTTTCCAAAGACAGAGCATC
AATTATGTATTGTACATCAAATTAGAAATAGTTTACGATATGTATCATAT
AAGGACCGGAAAGAGCTTGCTGGTGATTTAAAACCTATTTATACAGCTAA
CACAGAAAAAGAAGCACTTTCCGCTTTAGAGGCTTTTGAATCTAAATGGA
GTAAACAATATCCTCAAATTGCTAAATCTTGGTATATTCATTGGGATAAT
CTAATGATTTTAGGATATCCTGAAGAAATAAGGAAAATAATTTATACAAC
AAATGCTGTGGAATCCGTTAATAGTCAACTCCGAAAAGTTACAAAAAATA
AACGTCTTTTTCCAAATGATAATGCTGTTTTTAAAAGCTTATATTTAGCA
ATTGACTACATGACCAAAAAATGGTCCATGCCTATCCCAAATTGGAATGC
GGCTATGGCTCATTTTTTAATAAAATTTGAAGAAAGAATCTAG
>RF_pd53 DNA polymerase III, epsilon subunit-like protein
TTGATAAGACTCAAGTTTCTTGAAGAAGTTGATATTATCATTGCCCACAA
TGCTGCATTTGATAGACCTTTTTTTGATAAAATGTTTCCTGAAGTTATAA
CCAAAGTATGGGGATGCTCAAGAGTTGATATTGATTGGAAAGCTGAGAAA
ATAGAAAGCCATAAACTAGAATATCTTACTTATAAATATAATTTCTTTTA
TGAGGGACACAGAGCTGTTATAGACTGCCGCGCTGGGTTGCATTTACTTG
CTCAAACCTTACCTATTACTAAAACACTAGTATTAAAACAATTACTTAAT
AATTGCCATAAAACCAGATTTAATGTTTGGGTACACAATGCCCCTTATGA
CTCTAAAGATTTACTTAAATCTAGAGGCTATCGCTGGTCTATCAATCCAC
AAGCAAATTATAAAGCTTGGATGATTGAAGTATTTGAAGATACTCTCGAA
ACAGAGCTAACATTCCTGAATTCTAATGTTTACAAAACGCCCTATAATAT
CCCAGTACAAACCATAAACCCTTGTGATAGATTTATGGGATAA
>RF_pd60 hypothetical protein
TTGTCAGTAGGACGAAAAAATTGGCTTTTTGCTGGATCAGACAGTGGCGG
TCATACTGCCTCTATTATTTATTCCATTATCAAAACTGCTAAATTAAATC
ACATCAATCTTTGGAAATATTTACAAAAAGTACTTGCAATAATTCAGGAT
TATAGAGCTAATAAAGTTGAAGATCTCCTTCCCTGGAATATTTTACTAGA
TTAA
>RF_pd64 Transposase
GTGACTTATAGTATGAGTTGGATTATACTAAATGAAAAACTTATGGCAAA
GGCATATTCATACGATTTAAGAATACGAGTAATAAAAAGTTTAACAGAAG
GTAAAACAATAAAAGAGACTTCTGAGATATACTCTATTAGTAGGAAGACT
ATAATAGAGTGGAAAGAATTAAAGAAACAAACTGGGGATGTCAAAGCAAA
AAGTGGTTATCATACAGGACATCGTAGAATAATAAGAGACATAGAGGGAT
TTAAAAAATTTATAGAATTAAATTTTGATAAAACCACCATGGAGCTAGCT
AATAACTGA
>RF_pd55 Transposase
GTGTGTAAATTTCTCAAAGGTTATATAAAAGAAAATATAACAAAAAGAGG
GATTACAATGCCACAGAAACAAAATGCTGCAATGAATCAAGCGATAGATT
TATTGATCAATAATGATACAGATGTATCAACTTTATTCAAGGAAGATGGT
TTATTAAAAGAACTAACCAAGCACCTTGTAGAGAAAGCACTACAGTCTGA
GATGAATAATCATTTAGGATATAGCAAGTATAATCAAAGTGATGCCCAGA
ATTCACGTAATGGTTATAACACAAAGAATCTGATTACAAAGAATGGTGCT
GTTGAGATTGAAGTGCCAAGAGATAGAAATAGTAGCTTTGAACCATCATT
AGTAGCGAAGCGTCAAAGAAGACTTGATGGTTTTGATGATAAAGTACTAT
CCTTATATGCTAAAGGGATGAGTTTATCAGATATAAAATTACAGCTTCAG
GAGTTATATGGAGCTGATGTAAGCGAGAGCTTAATCGTAGGATTACAGAT
GATATAA
>RF_pd57 Transposase
ATGAGGTTTGTACCAATTAAAACTGTAGAACAACAAGATATTTTATCAAT
TCATAGAGTAAGAGAGAGATTGATAAAAAATCGTACGGCACTTGCTAATG
AAATTAGGGGTCTACTACATGAATTTGGTTTTATTATTCCTCAAGGGATA
AATAAGGTTATGACAAAATTAACCGAAATTTTAGATGAAGGAAATTTAAG
CCAGCTAGGTTATCAAACATTTAGTGAACTGAAAGAGGAGTTTTTGGATA
ATAATAAAAAAATAAAAGAGATAGAAAAAAGATTAAAAATAATCACTAGC
AACCTAACTCAATATCAACGATTAACAACTATACCTGGTCTTGGTTTAAT
TACTGCTACTGCTTTAATAGCATCAATAGGTAGTGCTACAAATTTTGACA
ATGGCAGGCAATTATCGGCATGGCTAGGATTAGTGCCAAGACAACATTCA
AGTGGTGGAAAAGATAAGCTGTTTGGAATTAGCAAGCGAGGTGATGTATA
CTTACGCACTTTATTAATTCAGGGGGCTAGAGCTGTACTAAATGCCAAGA
TAAGATTCACATCGGAAGAACAGAAATCTAAAAAAGATTTTAGCAAATTT
ACGCAATGGATGTTTAATTTATCTGAGCGAAGTGGTCATAATAAAACAAC
AGTTGCCATAGCTAATAAATTGGCAAGAGTTGTGTTTGCCGTACTCAGAT
CAGGAGATGATTATGTGGAGAGTAAAGTTTGCAGCTAA
>RF_pd48 Transposase
ATGGATATGGCAATAGAATATCCAGCATATGGTCAGCTAAGAGTATCAAA
TGAGCTTAAGAAGAGTGGAATACTTGTATCACCCGGAGAAGTGAGATCAA
TTTGGTTACGTAATGATTTAAACAATATCAGTAAAAGGCTTAAAGCATTA
GAAGCAAAGATGGCTCAGGATGGTATTGTTCTGACTGAAGCTCAGTTACA
AGTACTAGAGAAGCGTCGTAATGAAAAAGAAGCACATGGAGAGATTGAGA
CGCAGCATCCAGGTTATCTAGGATGTCAGGATACGTGTTATGTAGGTAAT
TTTAAAGGTATAGGTAAGGTTTATTCTCAGGTATTTATTGATAGCTATAC
TAGAGTAGTGGATGCTAAACTATATGCTGATAAAACAGCAATTACTGCTG
CTGATATGCTTAATGACCGGGTGTTACCATGGTATGAGACGCAAGGGATA
CCAATGCTGCGTATTCTTACAGATCGTGGGTCAGAATATAAGGGCAATAT
AGAGCATCATGCTTTTGAGTTATTTCTTAGCATAGAAGGTATAGAACATA
CTACAACTAAGGCATATTCTCCCCAAACAAATGGTATGTGTGAGCGTTTT
AATAAAACCATGAAACAAGAATTCTTTGATACAGCAATGCGGAAAAAGAT
TTATACAGATCTTGATGATTTACAATTAGATCTTGATATTTGGTTAGAGC
ATTTCAATAATGAACGACTACATTCAGGAAAATATTGTTATGGTAAAACT
CCTATGCAAACTTTTCAAGATAGTAAGAAATTAGCTATTGAAAAAAATAA
TGAGATCTTGTACCTTGAATACTCGTCTGACAGTCAAAATTTAACTGACA
ATCAGGTGCAAAATTTATAG
>RF_pd58 Transposase
TTGGTTGGTATAGATATTGCAAAAAGAATTTTTCAAATTCATGGTGTAGA
TAAAAATGGTAATACGGTATTAAAGAAAAAATTGATGAGAGAACAGATTT
TAACATTTATGGCTAATTTGCCAAAATGTTTAGTGGGGACGGAAGCTTGT
GGTGGAGCTAGTTGGGCAAGAGAAATAACTAAATTGGATCATACAGTAAA
ACTGATGGCACCACAATTTGTCAAACCGTATGTCAAAACTAATAAAAACG
ATCAAGCTGATGCTGAAGCTATATGTGAAGCAGTAGCAGACCAAATATGA
>RF_pd63 unknown
ATGGGCGGCAGTAACGCTGCTGATAGAGTCAATTGGAGTCAGCTTCAGTT
TCAGTGGCGGGATGCAATAATATGGCCTGATAATGATCAGCCAGGCTTTA
AAGCAGCAGAGGTGATAAAGGACAAGATTAACAAGGCAAATGAGCATATA
GGTTTTGTAAGCGTAGTTGATCCAAGAAGACTACAATTTGGCGGCAGTAC
TCACAAAGACTTATTGCCTGAGAAGTGGGATCAAGAAAAATCAAGTCATT
ATATTAAATATTTAGAGGCGACAGGTAAGGGCGGCGTAGCACATGATTAT
TTAAAATATGACTCAATAATGTATCAAGATATATTAACTAGTCTTGCGAT
GCGTGACGAGCGTTTAAGCAAAAGTATCAAGGAGTTAAGTGATAGCAACA
ATACTTCTGATATTGAGACTATAGAGCATCGAACTAAGTTAATAGATGAT
ACGCAAAATCTATACGAGAAAAAAGCGTTAGAATATAGCGGTATCGCAGG
TACAAATGTAGTATACAGAGGTCATTTGGAACTGATGGTGAAAAACTATG
GTGAATCACATGAGAAAGTAACATGA
>RF_pd67 Transposase
TTGGATTATTCCTATAATTTTATAAGTTTGGAAGCCTCAAATGTTTTACG
TGACTGGCTCTTAGAATTTTCTTTTATCTATGAAATAACTAAAAATCGTT
ATTGTGCTAATTATGGACGTCCATCAATTGATCCTGTATTATTTTTTAGG
ATGCAAATAATAAGTTACTTAATATGGTAA