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COG category: Replication, recombination and repair
Genomic element: pCP13

Number of genes found: 11

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# Clostridium perfringens str. 13, 13

>gid:876348  PCP04  probable transposase
ATGTCGAAAGATTTTTTAAGAAATTATATAAAGGAACAAAATTTTAATGA
TAGCAATAATGTTTTAAATTCATTGAAAGATTTATTTAATGATGTTCTTC
AAGAAGTGGTTTCAGCGGAGCTTGACGATATGCTTGGTTATGAAAAGAAT
TTAACTAATCAATTTTATAATAGTAGAAATGGTTATTCTAAAAAGACTAT
CAAATCAGAATTAGGTACAATAACTTTGAATATTCTAAGATATAGAAATT
AG
>gid:876349  PCP05  probable transposase
ATAATTTCAAAACATCAAAGGAATATTAATAGAATTGAGGATAAAAATTT
AAACCTATATGCATCAGGTATAACTACTAGAGACGTAGCAGGGCAAATAA
AAGCTCTATACGATATTGAAATAAGTGCTGAAACAGTATCTAATATAACA
AACAGAATAATGCCACTTGTAAGTGAATGGTAA
>gid:876350  PCP06  probable transposase
ATGTTATATACAACCAATGTTATAGAAAGCTTAAATAGTCAATTCAGAAA
ATTTACTAAAACTAAATTAATATTTCCGAATGATGTTAGTTTAATAAAAA
TGTTGTATTTAGCTACAGAGAAGGTTAATAAAAAATGGACTCGTAATTAC
CCGAACTAG
>gid:876354  PCP10  probable transposase
ATGAAGGAAGTCCTGAGTATTTGTATGAGTACTAATGAAGGCAGTAAGTT
CTGGTTATCTCCACATAAAGATAAAAAGGAATTTGCAAAAGACTTGAAAA
CTATTTACGGTTCAGTAAACGAAACAGAAGGTATGAAAAACTTAATTGAA
TTACGTGAAAAATGGGGTTCTAAGTATCCAAATGTCGTTAAAAGTTGGAA
AGATAATTGGGATAATCTTAGCACTTTCTTTTAG
>gid:876355  PCP11  probable transposase
ATGAAAATGTTGTATTTATCTAGAGAGAAAGTTAATAAAAAATGGACTCG
TAATTACCCGAATTGGGATTTAGTAATCAATGAATTAAAAATTTTATTGA
ATGAATATTTAAGTAAAGAATGTAAAAAAAAAAGAGCCTTGAGAAAGTGT
TCTAAAAGCTCTAAAATCCAAACTAAATGTATATTATTGCCTATTGTTGG
GCAAAATATACATAACAAATATTTTAGTCGATCAACTTAA
>gid:876356  PCP12  conserved hypothetical protein
ATGTTAGTACAAGATTTAGCTGAAGAATTAAATGTTACAAGAAGTGAAAT
TTATAATATACTTAGAAGAAAAAGATTTGCTCCACTTGTTAAAAAAAATG
GTTCTCAAATTATTATAGATAATGAACTTTCAGAATTACTAAAAGAAGAA
TTAGAAAAGAAAAAACAATTAACTCCTAAAGAAATAAAAAAAGAAACTAC
TGAAATACAACATGAGGTTTCAGTTACTGTTGATGAAGATTTCTTATATC
AAAATACTATAAACATATTACAATCACAAATTGAAAATAGAGATAAACAA
ATTGAATTTAAAGATAAGCAAATAAGTATTTTAAATACTATTATCGAAAA
TAACTTGAAAATAATAAAACAATTAGAAGAAAAGCAATCTTCCTATAAAA
ATTTACATGAAGAAATAGAACTTTTAAAAAATACATTATTAGATTTAACT
AAAAGAAAAAATAAAAAAAGATTTTCTATATTTTAA
>gid:876376  PCP32  probable resolvase
TTGGTCGATTATGATGTAAATGAAAGATTTATTCTTTCTAATAAATATAG
AGGTAAAACCTTAGATAGAGATGGATTAAATGAGCTTTTAATTATAATCA
GATCTGAAGCCACTTTAGTAGTAAAAGAAATAGATAGATTAGGTGAAAAT
CGAAAAGAAACTAAAGAGCTTAAACTATTTTTGTAA
>gid:876379  PCP35  conserved hypothetical protein
TTGACCTTAAAGAAGCCAAATGAAAGATTTAAGGAAGCAGAGTTAAAAGT
TAGAGAATTAAAAAGAGAAGCAGAGCAAAGGGATGAGTATTATCCATATG
CTAAAACTAAATTAAAACTACACTATGCACCAGAGAAAGTAATACCTTTA
CATTTTGATATAGGAGATGGATATGTAAATGATCTGAAAGAATTGATTAA
TAAAGAGCTAAAATCGGCTCGATATGAAGATTTACGTAATAGTATAGATA
ATACATTGGATAACAAAGAAAAAGCGTTTAAAAAGGAAGTAGAGCCTTTT
TATGATATAAATAAATTAAAAGAGATTCCAATAGGAGATATTGCTGATAA
ACTTGGAATAGATACAGTTAAAAGAGGTAATAAACTATGGTGCAATTTAA
GAGGAGAAAAAACAGCTTCTTGTTGTATAAATATAGATAAAAATTACTTT
TATGATTTTGGAGGACAACCTGAAGGTGGAGATGGAATTAAGTTTGTATC
TAAAGCAGAAGGTATAAGTGCTAAGGATTCTATATATAGGTTAGCAGATA
TGTTTGGAATTGAACCTGAAAATAACATTGATAATAGTTTTAAGCCTAGT
TTTCATATATCAAATTCTGACTATAAAGAAATAGGAATAGAACCTAATAG
AGCTATGTTAAATGTTGATATTAATTTAGAAAGACAAAGTTTAGCAGAAG
TAATGGAATTAGAAAAATCATGTGCAAAGACTATGAATGAACTTGCTAAT
GATGATAAAAGTACATTTTTAAACATATTGAACTTTAAATCAATGCCAAT
AGTATATAACAATGCAAAAACTTATTACAGTTGTATAGAGAGAATAAATG
AATATGTAAAGGAATATAATTCACCTATTGATGGATTTAATTCATTAGAA
GTTTTATTATATAAAGATTTTACAAAGAGTTTAGAGGAAAAATTAAATAA
ACAAATAGATATTTTATATAGAGCTGGTATCAATGAAAGGATTGGATTTG
ATTTAAGTGAAGAAAAAGTAAACTTAAAGAAAGATTTAGATGATTTATTT
TCAGCTTCGCTATCTAATGGGGTTGAGGTTTACTATAATTCTAATCCTGA
TGAATTAAAAGTTATAAAATCTATAGAAGAATTTAGAGATTATGCTATTG
ATATATTAGTACCTGAATTAAGTGGTTTTGAAGTTTCTGAAGAAGAAATA
ACTAAAATGGAAAAGGAAGTTAAAAGTTGGACATATACAGATCTTTTAGA
ATTTTGTGAGGGCAATGATATAGAAATTGTGCCTTTAAAAAAAGAAAAAA
CTATTGAAATTGAAAAGCCTGTAAAAGAAGTTAGAATAAAAAATAAACCT
ATGGAACTATAA
>gid:876365  radC  DNA repair protein RadC
ATGAAAAAAATTGATGTTGTGAAAGTTTATGTTAAGAAAGAACAAAGCTT
ACAAATAGAGAAGGATATTATAAAAAAACCAGAGCAAGTTTTTGAAGTAG
TTAAGAACTTTTTAGGTGAAGTTGATAGAGAGTATTTAATAGTTATAGTG
CTTGATGTAAAAAATAAAATAAACTCAATTTCAGTTGCTTCAGTTGGTAC
ACTTAATTCTTCAATAGTACATCCAAGAGAAGTGTTTAAAACTGCAATAT
TAGCAAATGGAGCAAGTATTATTTTGGCTCATAATCATCCTTCAGGTGAT
ACATCACCAAGCAAAGATGATATAAACATAACTACAAGAATAAAAGAATG
TGGAGTGTTAATGGGAATTGAACTTTTAGATCATGTCATTTTAGGTGATG
AAAAATTTATTAGTTTAAAAAATGAAGGAATAATTTAA
>gid:876359  resP  resolvase
ATGTTAGTTGGATATGCAAGAGTTAGTACCGAAGGTCAAAGCTTAAATAG
ACAAATAGATATGTTAGTTGATTATGGTTTAGATAAGAGAAATATATATC
AAGAAAAAATAAGTGGTACTAAGCTGAGAAGGGATCAGCTAGATAAGATG
ATTGAAGAGCTTCAGGAAGGAGATACAGTTATAATTACTGATTTGACCAG
AATATCAAGAAGTACAAAGGATTTGTTAAATATTATAGATAGAATAAAGG
AAAAAGGAGCTAGTATTAAAAGTCTGAAAGATACATGGTTAGACACATCA
GGCGATAATCCATATAATAGCTTTTTATTAACTGTTATGAGTGGATTAAG
TCAATTAGAAAGGGACTTAATAAGCCAAAGGACTAAAGAAGGGTTGAGAA
GTGCTAAAGCTAGGGGGAGAAATGGAGGAAGACCTTCTAAGAGAAATGAT
AAAGCTGATACGGTAGGGTTATTATATAGGGAAGGTTATAAAATAGTTGA
TATAGTAAAACAAACAGAGTTAAGTAGAGCAACTGTATATAGAATTTTAA
AAGACTTAAACTTAAAATAA
>gid:876391  topA  type I topoisomease
GTGAAAAAATTAGTAATAGCTGAAAAACCAAGTTTAGCAATGAATATAGT
AAAAGCTTTAAATTCAAGCGAGAGTTTTGAGAGGAAAGATGGTTATTTTG
AAAGTGAGAATTATATTATAAGTTTTGCTTTTGGTCATCTATTTAAGCTT
TATAATATAGAAGAGTACACAGGTGAGGATAAGGGAGCAAAGTGGAGAAA
TGATATACTTCCTTTTATTCCTAAAGAGTTTAAATTTAGTATAAAAGATG
ATGTCGGAGTTAAAAAACAATATAAGATTTTAGAAGAATTAATAAAAAGT
AATAGAGTAGATGAAATAGTGGCTTGTGGTGATGCAGATCGAGAAGGTGA
GGTTATTATTAGGCTTATAATAAATAATGTTTTTAATAATAATAGTATAA
ATAAAAAAGTAACTAGATTATGGTTGCCAGAGCAAACAACACAATCTATA
TTATATGGATTAAATAACTTAAAAGATATAGACACTTATAATAATCTTGC
AAATGAAGGATTTACAAGGACATTTTTAGACTGGCTTGTAGGAGTTAATC
TTACAAGATATGTTACTGTAAAATCTAAGCATTTATTTCCTGTAGGAAGG
GTATTAGTACCTATAGTACAAGCTATATATGAGAGAGATAAAAGCATAGA
GAACTTTGTTCCTGAAACATATTATCAAATTGAAAGTAATGAGAAAACTA
ATGATGAAATAATTAAATTAGTAGTTAAAGAACTTGCTTTTACTAAAAGT
GAATTTATTAAAGCTAAGAGCTTTGCAGATGAACTGAATACTTATGAAGC
TATAGTTATAAGTAAAGATACTAAAAAAGTTAAGAAACAACCTAGTAAGT
TATTTTCTTTAAGTAAACTTCAAAGTCTTTTAAGTAAAAAATATAAAATG
ACTTTTAAAGAAAGTTTAGAGTTAATTCAAAAACTATATGAAAAAGGGTT
TGTAACATATCCTAGAACTAATACAGAATATCTAGCTGAAGCAGAAAAAG
GTAAGGTAAAAGAAATAATAGATATTTTATGTTCAGAAGGGTATAATTTA
GAGTTTAAAGATAAGAAAACCATATTTGATGATAGTAAGATAGAAAGTCA
TAGTGCCATTACCCCTACTGTAAAGATACCTAAAGAAGATGAATTAAAGG
GTAAGATGTTAGATGTTTATAATACTATTAAAAATAGATTTATTTCAAAT
TTTTTAATAGAAGAAACATTGATTGATAGAACAATAATAAGAATAGAAGT
TGGAGATTTAGAATTTTCATTAAAAGGAGATGTCATAGTTCAAAAAGGAT
TTTTAGAATATGAGCCTATTAAGAAAGATGAAAATACACTTCCTAATCTT
AATGTCGGAGATAAGATAAATACTAATTTTAAAGCAATAGAAAAAGTGAC
ACAAGCACCAGGTAAAATGACAACAGAAATGCTTAGTAATTACCTTAAAA
ATCCTTTTAAGAATTATGAGATAGAAAATGAAGAAGAAGACTATAAAGCT
ATTTTAGATGGATTAGAAATAGGTACAGAAGCAACTAGAACTGGAATTAT
TGAAAATGCTAAAAAGTATAAATATATATCTGAAAATAAATCAGTTCTAT
CTATAGAACCATTAGGAAGAAAATTAATAGAAACATTAGATAAATTGAAT
GTAAATTTATCTAAAGAAAAAACAGTAGAATTTTCACGAATACTTAAAAA
GGTATATAAAAATGAATTAAATATAGATAGAGCAGTTGACTTAATTTCTA
ATGAATTAAAATCAATTTTAGAAGATAGTAAAAATATAGAGATTGAAGCA
ATAAAGGAAGAAAAAGAAGTTATAGGGAAATGTCCTCGTTGTGGCAAGAA
TATATATGAAACATCAAAATCATTTTCATGTGAAGGTTATAAAGATGAAC
CAAAGTGTCAGTTTAATATTTGGAAAGAAGATAAGTTTTTTAAGGATAAA
GGGAAGAAGGTTACAAAGTCAATTGCTAAAAATCTTTTAGCTGGAAAGAA
AGTGAAAATGACAGGTTTAAAAAAGAAAGATGGTAACGGTACTTATGATG
CTTTTGTTAGTTTAAATGATACTGGGAAGTATGTTAACTATAAATTAGAT
TTTAGTAAGTAG