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COG category: Replication, recombination and repair
Genomic element: chromosome

Number of genes found: 137

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# Streptococcus pyogenes phage 6180.4

>M28_Spy1140 DNA polymerase III, delta subunit
ATGATTGCGATAGAAAAGATTGAAAAACTGAGTAAAGAAAATTTGGGTCT
TATAACCCTTGTCACAGGAGATGACATTGGTCAGTATAGCCAGTTGAAAT
CCCGCTTAATGGAGCAGATTGCTTTTGATAAGGATGATTTGGCCTATTCT
TACTTTGATATGTCTGAGGCCGCTTATCAGGATGCAGAAATGGATCTAGT
GAGCCTACCCTTCTTTGCTGAGCAGAAGGTGGTCATTTTTGACCATTTGT
TAGATATCACGACCAATAAAAAAAGTTTCTTAAAAGAAAAAGACCTAAAG
GCCTTTGAAGCCTATTTAGAAAATCCCTTAGAGACTACTCGACTAATTAT
CTTTGCTCCAGGTAAATTGGATAGTAAGAGACGGCTTGTTAAGCTTTTGA
AACGTGATGCCCTTGTTTTAGAAGCCAACCCTCTGAAAGAAGCAGAGCTA
AGAACTTATTTTCAAAAATACAGTCATCAACTGGGTTTGGGATTTGAGAG
TGGCGCTTTTGAACAACTGCTTTTAAAATCAAACGATGATTTTAGTCAAA
TCATGAAAAACATGGCTTTTTTAAAAGCCTATAAAAAAACGGGAAATATT
AGCCTAACTGATATTGAGCAAGCCATTCCTAAAAGTTTACAAGACAATAT
TTTTGACTTAACCAGACTTGTCCTAGGAGGTAAAGTTGATGTGGCTAGAG
ATTTGATTCATGATTTACGCTTATCAGGGGAAGATGATATTAAATTAATT
GCTATTATGTTGGGGCAATTTCGCTTATATTTACAGCTTGCCATTCTTGC
TAAAGAAGGAAAATCAGAACAGCAGCTTGTAACCAGTTTGTCAGAGATAC
TTGATCGGCGGGTTAATCCTTACCAGGTCAAGTATGCGTTAAAGGATTCT
AGGACCTTATCTCTTGCCTTTCTAACAGGAGCGGTGAAAACCTTGATTGA
GACAGATTACCAGATAAAAACAGGACTTTATGAGAAGAGTTATCTAGTTG
ATATTGCTCTCTTAAAAATCATGACTCACTCTCAAAAATAG
>M28_Spy0032 hypothetical protein
GTGATTTGCCTGATGAGGTGGAGGAGTTTTAGGATGTATCTAAAGTATAT
ATTTAAAATAAAGGATAGGAATTTAGTATCGGATTATGAATCTTTAGTTC
GAAATTTGACAATCAATCTTCAAAAACTAGTTATTAAAGATAGAACTGCA
TTAATAGGGGATAAACAACTTCCAATTACGATATATTATCGTGGGGAGAA
TGAAAAGTTTCCTACGGGAATAGTAAAAGTTGAATCAGACTCAGTTGAAG
GATTAGAGTTATTTGATAAAACGATAAAGGAAATAGTTGGGAATGAAAGT
AGATTTGGAAAGTTCACATGTATATACGATGGAATAAGTACATATTATTC
AACAGAAATTTATTCTGAACTTCATGAAATTGAGCGTCGAACACAAGAGT
TTTTAAGGGAAGCATTTTTTCTGAGCGATAAAAGTGGGGAATTGAAAGAA
TATCAGGCAACTATCAAAAAAATGGATAGTAGTGATTTCTCATTCAGCAA
ATTAATTAATGAAATTTTTAAAGCAAGCGATATAACTGATACATTTATTG
ACCATGTTAGAGCGTGTGTTGAATTTGGAACAGTTCCAAATGGAGATTTA
TTACCAAAAAGTTTTTGGGATAGTTTAGATGACTCTTTACTAGATGATAA
AGAGCAAGGTTTAGAGATTAATAATTTATTAAATGAGATTCGTTCAACAA
GAAATACAATAGCTCACTGTAAAGAGTTTAAAAAGAAGGATTATATTAAT
TGTATAGAACAAGTTAAAAAATTAAAGCAAGCATTGGATAAAATAATAGC
CTCTATAGAGTCTACAGATATTTCTAAAATGTCACGAGAAGTGTCACGCA
TAAATAACTCCTTACAAGCCGATAATGACTACATCAAACAAAAATATTTT
ATAGAATATGATATTTTTGAAAAGGATATATTAGCTAGGACAGGGTTATT
AGAAATTGATTGGGAAAACGTTTCTGATGACATAGAGCCCTTAAAGATAC
ATCGTAACTTTTATGAATCAATTAGTGAAAAAACAGATTCTGAAGTTATA
GAAGAAATCAAAAATTTAGAAGATATAAATTTCACTGATGAAAAGGGTAA
TGATTTGGATGACTTAACCATTATTGTTCCTGCGCAAGACGAAGGATTTA
AAAGAGTCTTTCTAGGTCAACGAGAATGGTATGATATACGGATAGGAAAA
TCGAAAAGGAATAGGATTAAATATATCGCAGGATATGAAGTTGCACCAGA
GAGTGGTGTAAAGTACTGGGCTGAAGTGGATAAAATAGTTCCTTCAGATA
ACTATGTTGGTTACTGGAAAGTAATTTTTAAAGGAGAGGTGAAGGAATAT
TCAGAATATAAAAGATTAGGAAATACTTGGCCCCCTCAAAACAGTAGATA
CGTATCTAAAAAGGCTTTAGATGAAGCTAAATATTTATCGGATGTTTTTT
AA
>M28_Spy0165 transposase
TTGAATAGTCATCACACCTGTCAAACTCTTCAAGTCTCCCGTTCAGGTTT
CTATGCTTATTTAAAACGTCGTCTATCTTCAAAGCATGTTGAGAATGAAG
CTTTGAAGGAAATGATTAAAGACATTTTCTATGAACATAAAGAGCGTTAC
GGAAGTGTACGAATTACCCAAGAACTTTGTAGACGTGGCATCCATGTCAA
TCATAAACGTGTTGGTAGACTCCTTCATCAGCTAGGTCTCTATGCTAAAG
GAAGTCGATATCAATATAAATACTATAACCGTCGACGTTCTTCATGA
>M28_Spy1812 phage protein
ATGAGCAAGAAGAACGCTATTCGTAAGCTGAAAGAATTTCATAGATGGCA
ACGTATCGCTAATAGCCTTGATTTAACTTATACCGAGCTTTACCAGTTTG
ATATAGAGTACCATCCCACGCGCAGAAAACACCTTGAAATAAGCCGAGAA
TGCGCCCTAGAGGAACTAGACGCTATTAGGTATGCCATTAATCAACTGTC
TAAAGTAGAATATAGACAAATACTAATTGAGTGTTACTTGATCAGTGAGG
AAAAAACTCAACAAGACATTATGGAAGAACTTAACAGAAGTCAAAGCTGG
TATTATGAATCTAAGAAAAGAGCCTTGCTTGAGTTTGTGGAATTTTACAG
AGACGGGGCGCTAAAAAATAATGTTCGCTTATGA
>M28_Spy1864 DNA integration/recombination/invertion protein
ATGAACATAAAAGAATACAAAAAGAAGAACGGTACAATCATTTACCGCAC
TAGTGTCTATCTTGGTGTCGACCAGGTAACAGGTAAGAAGGCTCGCACAA
CTATTACAGCTTCAACTAAAAAAGGGGTTAAAATAAAAGCTCGTGATGCT
CTAAATAACTTTGCTATGAATGGCTATACCGTCAAAGAGAAGCCGACAGT
AACCACTTATAAAGAGCTAACAGCCCTTTGGTGGGAGAGTTACAAGAATA
CGATCAAACCAAACTCTCGGCAATCTATGGAAGGGATTGTAAGACTTCAT
ATTTTGCCCGCATTTGGGGATTGCAAGCTATCTAAGCTAACTACCCCTGT
TATTCAGCAACAAGTTAACAAGTGGGCTAACAACGCTAATAAGGGCATTA
AAGGCGCATATGCTAACTACAGTTTTCTAAATAATATCAATCGCCGTATT
CTACAATATGGCGTTACTATGCAAGTTATTGAACATAATCCAGCTCGTGA
CGTCATCATTCCTCGAAAACAAAATAACAAAGAACATAAGGTAAAGTTCT
TCAGCAATCAAGAACTAAAGCAATTCTTGAACTATTTAGATGACTTAGAT
TTATCTAGCTATGAAAACTTCTTTGATTACGTTCTTTATAAGACCTTGCT
TGCTACTGGTTGTCGGATTGGAGAAGTTCTAGCTCTTGAATGGTCTGATA
TTGATCTAAAAAAAGGAACTATCAAGGTTTCCAAAACTTTGAATAGATAT
CAGGAGACAAACACTCCTAAATCAAAAGCAGGATTAAGAGACATTGAGAT
TGATAGAGCTACCGTCTTACTTCTTAAGCAATATAAAAACCGTCAGCAAG
TTTTATCTTGGGATCTAGGACGGTCTGAGACGATTGTTTTTACTCCGTTT
ACCACAAAATACGCCTACGCTTGTTTGCTTAGAAAAAGGCTTCAAAAGCA
TTTTAAAGCTGCTGGCGTGCCTGATATTAGTTTCCACGGCTTCCGCCACA
CCCACGCTACAATTATGCTTTACGCTGGGATAGAGGCTAAAGACTTGCAA
TATAGACTAGGACACTCTAATATCTCAATGACATTGAATACTTATGTCCA
TGCAACAAAAGAAGGCGCTAAAAAAGCCGTCTCGATTTTTGAGACAGCTA
TTAGCAATTTATAA
>M28_Spy0296 DNA integration/recombination/invertion protein
ATGAAGAGTTATATTGAACCTTTTATTGCTAGCAAGGCTTTATCTCAAAA
TAGTCAAAAAGCTTATCGATACGATTTGCAACAGTTTTGTCAACTGATTG
GTGAACGTGTCAATCAAGACAAACTATTACTTTATCAAAATAGTATAGCT
AACCTCAGTTTATCTGCAAAAAAACGCAAATTATCAACAGCTAATCAATT
CTTATACTACTTGTATCAAATAAAGTATTTAAATAGCTATTTTCGATTAA
CAGACACCATGAAAGTGATGCGGACTGAGAAGCAGCAAGCTGCTATTATT
AATACTGATATTTTCTATCAAAAAACCCCTTTTGTGTGGGGGCAATTAAT
CAGCTTATTAATATTGGAGCTGGGTTTAACTCCGAGTGAAGTAGCTGGTA
TTGAAGTAGCTAACTTGGATTTAAATTTTCAAATGTTGACGCTAAAGACT
AAAAAAGGTGTGCGTGTATTACCTTTGTCGCAAATACTAATCCCTTTTTT
AGAACAACAACTCGTTGGCAAAGAAGCCTATCTTTTTGAACATCGAGGCA
TCCCTTTTTCAAGACAATGGTTTTTTAATCACCTAAAAACCTTTGTTCGA
AGTATTGGTTATGAAGGATTAACTGCTCAAAAATTACGAGAGCAATTTAT
TTTGAAAGAAAAACTAGCTGGTAAATCGATAATAGAACTTAGCGATATTC
TTGGGCTGAAAAGCCCTGTGACCTTAGAAAAATACTACAAATCATAA
>M28_Spy0857 ribonuclease HII
TTGGCAACTGACGCTAGGTTAGGTGTCCAAAAAGCGCTAAAAAGTCGACA
AAAGGCTATTCAGGCCGATTTAGCAGAGGAAGAACGATTAGAAGCCATGC
TTTCTTATGAAAAAGCGCTTTATAAAGAAGGCTACCAAGCCATTGCAGGT
ATTGATGAGGTGGGACGTGGCCCCCTAGCAGGTCCCGTTGTCGCAGCATG
TGTCATCTTACCTCAACATTGCAAAATTAAAGGTCTGAATGATTCTAAAA
AAATCCCTAAATCTAAGCATGAGACCATTTATCAGGCAGTGAAAGAAAAG
GCTTTGGCTATCGGTATCGGTATTATTGACAATCAGCTTATTGATGAGGT
CAATATTTATGAAGCAACCAAACTAGCTATGCTAGAAGCCATTAAACAGT
TGGAGGGCCAACTCACACAACCAGATTATCTCTTGATTGATGCCATGACA
TTGGATATTGCTATTTCGCAGCAGTCTATTCTTAAAGGCGATGCCAATTC
CTTGTCTATTGCAGCAGCATCAATTGTAGCTAAGGTCACCAGAGATCAGA
TGATGGCTAACTATGATCGCATTTTTCCTGGTTATGGCTTCGCTAAAAAT
GCAGGCTATGGCACCAAAGAACATTTACAGGGATTAAAAGCTTACGGCAT
AACGCCTATCCATCGTAAAAGTTTTGAACCTGTTAAATCCATGTGCTGCG
ATTCAACTAATCCTTAA
>M28_Spy0249 transposase
TTGAGAAAACAAGAGCAAGACCATCACAAACAGGACGTAAACCAAAAGAA
ACCTGAAGAAATGACTAAATTAGAGCGGCTTCAAGAAGAAAATGAATATC
TCAGAACTGAGGTTGCTTACTTAAAAAAACCGAGGAACTCCGTTTGA
>M28_Spy0381 transposase
ATGGCATCACTTGAAACGACGGAAAATCTCCTTACTTTCTATCAATTCCC
ACATCACATTTGGTCTAGCATTTACTCTACAAACTTGATTGAATCACTCA
ATAAAGAAATTAAGCGACAAAACAAGAAGAGAGTGGTTTTCCCAAATGAA
GAAGCCTTAGAACGATGTCTTGTAAGTATTTTCGAGGACTATAATATTAA
GTTCGGAGCTCGTATTCATAAAGGATTCGGAGCATGCTTTGACACACTTG
ATAGTTTATTTGACTAA
>M28_Spy0164 transposase
GTGTCTGTCTTGATAGACGTTTATAGTAGAAAGATTGTTGGTTGGGCAAT
GGGCCGACGTATGCAAGACAAGTTGGTAACAGAAGCTTTCAATCAAGCTT
ATAATAGAGAAAAGCCTAAAGAAGGGGTAATCGTCCATACAGATCAGGGT
TCTCAATATACCGGAGCATGA
>M28_Spy0530 DNA integration/recombination/invertion protein
TTGAAAATTTACGGAGATTATCACACGCACTTATTTAGACACTCGCATAT
ATCATTTTTAGCAGAAAAAGGGATACCGCTAAATGCGATAATGGATAGAG
TTGGTCACAGCGATCCAAAAACAACATTATCTATTTACAGTCACACAACT
GTAAACATGAAAGAAATTATAAATAAACAAACTGCCCCTTTTATGCCCCT
TTTAAAACCGGAATAA
>M28_Spy1406 ATP-dependent RNA helicase
ATGTCATTTAAAGATTATCATTTTAAGCAATACGTTCAGCAAGCGCTGGA
AGAAATTGGCTTTGTCAATCCAACAGAGGTCCAGAAGCGGCTGATTCCTA
TTGTTAACTCCGGTCGTGACTTAGTTGGGGAATCAAAAACAGGTTCAGGG
AAAACCCACACCTTTTTGTTGCCCATTTTTGAAAAACTTGATGAAGCTAA
AGCAGAAGTGCAAGTCGTTATTACAGCACCTAGCCGTGAATTAGCAACTC
AAATTTTTGATGCTTGTAAACAGATTGCTAAGCACTTCCAAGAAGAGATT
CGTTTGGCCAACTATGTTGGAGGCACAGACAAACTCCGTCAGATTGAAAA
ACTAAAAGGCAGCCAGCCGCATATTGTCATCGGAACCCCAGGTCGTATTT
ATGACTTGGTCAAGTCTGGTGATTTAGCGATTCATAAAGCAACGACCTTT
GTTGTGGATGAGGCCGATATGACCATGGACATGGGCTTTTTGGATACGGT
AGATAAGATTGCAGCTTCGCTTCCAAAATCTGTTCAGATTTTGGTGTTCT
CAGCAACTATTCCACAGAAATTACAACCCTTTTTGAAAAAATACTTGACC
AATCCTGTTATTGAACAAATCAAGACAAAGACCGTTATCGCAGATACCAT
TGATAACTGGCTTGTGTCGACAAAAGGGCGTGATAAGAATGGTCAACTGT
TAGAGATTCTCAAAACCATGCAGCCTTATATGGCTATGCTTTTTGTCAAT
ACCAAGGAACGCGCAGATGATTTGCATGCCTTTTTAACAGCTAATGGCTT
AAAAGTGGCTAAGATTCATGGGGGCATTCCTCCAAGAGAACGTAAGCGCA
TCATGAACCAAGTCAAAAAACTGGACTTTGAATACATTGTTGCCACAGAC
TTAGCAGCGCGTGGGATTGACATTGAAGGGGTCAGCCATGTGATCAATGA
CGCCATCCCACAAGACTTGTCTTTCTTTGTCCATCGTGTAGGCCGAACAG
GTCGAAATGGTATGGCAGGAACTGCCATTACACTTTACCAGCCAAGTGAC
GACTCAGATATCAAAGAGCTGGAAAAAATGGGGATTGCCTTTACACCGAA
GGTGCTCAAAAATGGAGAATTTCAAGATACCTATGACCGTGATCGCCGTC
AAAACCGTGAAAAAGCCTATCAAAAATTAGACACAGAAATGATTGGTTTG
GTCAAAAAGAAAAAGAAAAAAGTCAAACCAGGTTACAAGAAAAAAATTCA
GTGGGCGGTTGATGAAAAACGTCGCAAAGAACGTCGTGCTGAAAATCGTG
CTAAGGGCCGCGCTGAGCGTAACGCCAAAAAACAACATTTTTAA
>M28_Spy1392 methyltransferase
ATGAAAGAAACATTTAGATTAGTCGCAACTGCAGCCGCAGGTTTAGAAGC
TGTCGTTGGTAAAGAAGTCAGAGCACTAGGTTTTGATTGTCAGGTTGAAA
ATGGGAAAGTTTATTTTGAAGGTGATGTAGAAGCGATTGTTAAAACAAAT
CTTTGGTTACGTGCAGCAGATCGTATCAAAATTATCGTAGGACAATTTCC
TGCTAGAACCTTTGAAGAATTATTCCAAGGTGTCTTTGCCTTGGATTGGG
GAAATTATTTACCGCTAGGAGCTAAGTTTCCAATCTCAAAAGCCAAGTGT
GTCAAGTCAAAGCTACACAATGAGCCAAGTGTTCAGGCGATTACCAAAAA
AGCTGTTGTTAAGAAACTGCAAAAACATTTCCACAGGCCAGAAGGAGTTC
CTCTTCAAGAAGTTGGGTCAACGTTTAACATTGAGGTATCTATTTTAAAA
GACCAAGCCACTATTATGATTGACACGACAGGATCTAGCCTATTTAAACG
AGGGTACCGCGTTCAAAAGGGTGGGGCTCCTATTAAAGAAAATATGGCAG
CTGCTATCTTGGCCTTATCTAACTGGTTTCCAGATAAACCTCTGGTTGAT
CCCACCTGTGGATCGGGAACGTTTTGCATCGAGGCAGCCCTGATTGGGAT
GAATATTGCTCCAGGATTTAACCGTTCGTTTGCTTTTGAAGAATGGAGCT
GGGTAGATAAAGACATGGTGCAACAAGTTCGTGATGATGCCGAACAAGAA
GCTAATTATGAAATCGAATTAGATATTTCTGGCTTTGATATCGATGGCCG
CATGATTGAGATTGCTAAAAGTAATGCTGAAGAAGCTGGTTTATCTGATG
TGATTACCTTTAAGCAAATGCGTCTGCAAGACTTTCGAACAGACAAGGTT
AATGGTGTAGTGATATCAAATCCTCCTTATGGAGAACGGTTGCTTGATGA
CAAAGCGGTTGACATCTTGTATAATGAAATGGGACAAACCTTTGCACCAT
TGAAAACATGGAGCAAATTTATCCTTACAAGTGATGAACTTTTTGAACTA
AAATACGGGCAAAAAGCTGATAAAAAACGTAAACTTTATAACGGCACCCT
AAAAGTTGATTTGTACCAATTTTATGGGGAAAGGGTAAAGCGACATCTGA
TATAG
>M28_Spy1172 exodeoxyribonuclease VII large subunit
GTGAAAGGTGGCTTGATGGCAGATTATTTAACCGTCACTCATTTGACGAA
ATATTTAAAATTAAAATTTGACCGTGACCCTTATTTGGAACGGGTTTATC
TGACTGGTCAAGTGTCCAATTTTCGAAAACGACCAACTCATCAATATTTT
TCCTTAAAAGATGAAAGTGCTGTGATTCAAGCCACCATGTGGGCAGGAGT
CTATAAAAAACTAGGATTCGACCTAGAAGAAGGCATGAAAATTAATGTAA
TTGGGCGAGTCCAACTTTATGAACCTAGTGGCTCTTACTCTATCGTGATT
GAAAAGGCAGAGCCAGATGGTATAGGTGCCTTGGCTTTGCAGTTTGAACA
ATTAAAGAAAAAATTAACGGCAGAAGGTTATTTTGAGCAAAAACACAAGC
AGCCCTTGCCACAGTTTGTATCAAAAATTGGGGTCATTACAAGTCCTAGT
GGTGCTGTGATTCGAGATATTATCACAACCGTTTCACGGCGTTTTCCAGG
GGTTGAGATTTTATTATTCCCAACTAAAGTACAAGGTGATGGAGCCGCCC
AAGAAGTAGTGGCTAATATTCGAAGAGCCAATCAAAGAGAGGATTTGGAC
TTGCTCATTGTCGGCCGTGGAGGTGGCTCGATAGAAGACCTTTGGGCCTT
CAACGAGGAAATAGTGGTTCAGGCTATCTTTGAATCGCAACTTCCAGTGA
TTTCGAGTGTGGGTCATGAAACAGACACGACTTTAGCGGATTTTGTGGCA
GATCGCAGAGCAGCCACACCAACAGCAGCAGCAGAGTTAGCAACGCCTAT
TACAAAAACAGATCTTATGTCTTGGATAGTAGAGCGGCAAAATCGTTCCT
ATCAGGCCTGCTTGAGGCGGATTAAGCAACGGCAAGAGTGGGTGGATAAA
CTCTCGCAATCTGTTATTTTTAGGCAACCAGAACGATTATATGATGCCTA
CCTGCAAAAAATTGATCGCCTTAGCATGACCCTGATGAATACGATGAAAG
ATCGTCTGAGTTCCGCCAAAGAAAACAAGGTTCAGTTGGACCATTCCTTG
GCCAATAGTCAATTACAGACAAAAATCGAGCGATACCAAGACCGTGTTGC
TACCGCTAAGCGTTTACTGATGGCTAATATGGCTAGTCAATATGATAGTC
AGCTGGCTCGCTTTGAAAAAGCACAGGATGCTTTGCTATCACTGGATGCC
AGCCGAATTATCGCCCGTGGTTATGCAATGATTGAAAAAAATCAAGCACT
GGTAGCCTCTGTAAGTCAGATAACAAAGGGTGATCAGTTAACCATTAAGA
TGCGTGATGGACAATTAGATGTAGAGGTAAAAGATGTCAAAAACGAAAAC
ATTTGA
>M28_Spy1552 ribonuclease HIII
ATGAATACCTTAGTTTTGAAAATAGATGCTATACTGAGTAAACATTTAAA
AAAACAGCTAGCCCCCTACACCATCAGTAGCCAAAATATCTATGTAGCCT
TTGCTGCTAAAAAAAATGGGGTTACTGTTTTGCTGTACAAATCCGGAAAA
TTAGTTCTCCAGGGAAACGGTGCAAATGCTTTAGCTCAAGAGCTTAATCT
TCCAGTAGCTAAGACAGTTTTTGAAGCAAGCAACAATAGCCAAGATATAC
CTATAATCGGCAGTGATGAGGTGGGTAATGGCTCTTATTTTGGTGGGATT
GCTGTTGTGGCAAGTTTTGTCGATCCTAAAGATCATCCCTTCCTGAAAAA
GCTTGGGGTTGATGATTCTAAAAAATTATCGGATAAAACCATTCAACAGA
TTGCGCCTCTGTTAGAGAAACAAATACCTCATCAATCACTTCTCCTATCA
CCTAAAAAATATAACGAATTGGTTGGTAAAAGTAAACCATATAATACCAT
TTCTATCAAAGTTGCTCTTCATAACCAAGCTATTTTTTTGTTGTTACAAA
AAGGCATTCAACCTAAACAAATTGTTATTGATGCTTTCACTAGCCAATCA
AATTATGAAAAGCATCTAAAAAAGGAAAAAAACCATTTCCCAAATCCTCT
AACCTTTCAAGAAAAGGCAGAAAGTCACTATTTGGCTGTGGCTGTTAGCT
CTATCATTGCTAGAAATCTATTTTTAGACAATCTCGATCAATTAGGTCAA
GATTTAGGTTACCAACTCCCAAGCGGTGCTGGTTCAGCTTCAGATAAAGT
TGCTAGCCAACTCTTAGCCGCTTATGGTATGTCTAGCTTAGAATATAGTG
CTAAACTTCACTTCGCCAACACTCACAAAGCGCAAGCGCTTCTCACTAAA
TAA
>M28_Spy1302 transposase
GTGACTACGATGATTGATTTTATTATTTCTATTGATGATTGCGCAGTTGA
ATTGGATAGTCGTCAATCTTGGAAAATTCGCTACCCCTTATCAACCATTC
TATTTCTTGTCTTCGTTTGTCAGTTAGCTGGCATTGAAACCTGGAAGGAG
ATGGAAGATTTTATTGAAATGAATGAACCATTGTTTGCGACCTACGTTGA
TTTGAGTGAAGGTTGTCCGTCTCATGATACCTTAGAGCGTGTGATTAGTC
TTGTTAATACAGACCGTTTAAAAGAGCTTAAAGTTCAATTTGAGCAATCA
TTGACAAGCTTAGATGCCGTTCATCAACTGATTTCAGTGGACGGTAAAAC
GATTCGAGGCAATCGAGGTAAAAATCAGAAGCCTGTTCATATTGTAACGG
CTTATGATGGGGGTCATCATCTTAGTTTGGGACAGGTAGCGGTTGAGGAG
AAAAGTAATGAAATTGTTGCCATTCCTCAGTTATTGCGGACAATTGATAT
CCGTAAAAGCATTGTAACGATAGACGCAATGGGCACGCAGACGGCTATCG
TTGATACGATTATAAAAGGTAAAGCAGACTATTGCTTAGCCGTCAAAGGA
AATCAAGAAACACTTTATGATGATATTGCTCTTTATTTTAGTGATGTCAA
CTTATTGGAAGAACTCCAAGAAAATGCACAGTATTATCAGACTGTTGAAA
AATCTAGGGGACAGATTGAAGTTAGAGAATACTGGGTGTCTTCCGATATC
AAATGGTTGTGTCAAAACCATCCCAAATGGCATAAGTTACGTGGTATTGG
GATGACTCGTAATACGATTGATAAGGATGGTCAGCTGAGTCAAGAGAATC
GTTATTTTATCTTTAGCTTTAAGCCGGCTGTCCTCACATTTGCCAATTGT
GTACGAGGTCATTGGCAGATAGAGAGTATGCACTGGTTATTGGACGTTGT
TTATCATGAAGATCATCATCAGACATTGGATAAAAGAGCCGCATTTAACC
TAAATTTTATCCGAAAAATGTGCTTATATTTTCTCAAAGTGATGGTATTT
CCTAAAAAAGACCTCAGTTATCGTCGCAAACAACGGTATATTTCTGTCCA
TTTGGAAGATTATTTAGTCCAATTATTTGGAGAGAGAGGCTAA
>M28_Spy1780 hypothetical protein
ATGAGAATAATGGGACTTGATGTTGGCTCGAAAACGGTTGGTGTAGCTAT
TAGTGATCCTCTTGGCTTTACAGCCCAAGGACTTGAAATTATCAAGATTG
ATGAGGAAAAAGCAGAATTTGGCTTTACACGTTTAGAAGAGCTTGTTAAG
CAGTACCAAGTTGAACAGTTTGTTATTGGATTGCCAAAAAATATGAATAA
CACCAATGGTCCACGTGTTGATGCAAGTATAACTTATGGAAACCACATAG
AGCACCTCTTTGGACTTCCAGTCCATTATCAAGATGAACGATTGACGACT
GTTGAGGCAGAGCGTATGCTTATTGAGCAAGCTGACATTAGTCGTGGTAA
GCGAAAAAAAGTCATTGATAAATTAGCTGCACAACTCATTTTACAGAACT
ATTTAAATCGGAATTTTTAA
>M28_Spy1104 transposase
GTGACTACGATGATTGATTTTATTATTTCTATTGATGATTGCGCAGTTGA
ATTGGATAGTCGTCAATCTTGGAAAATTCGCTACCCCTTATCAACCATTC
TATTTCTTGTCTTCGTTTGTCAGTTAGCTGGCATTGAAACCTGGAAGGAG
ATGGAAGATTTTATTGAAATGAATGAACCATTGTTTGCGACCTACGTTGA
TTTGAGTGAAGGTTGTCCGTCTCATGATACCTTAGAGCGTGTGATTAGTC
TTGTTAATACAGACCGTTTAAAAGAGCTTAAAGTTCAATTTGAGCAATCA
TTGACAAGCTTAGATGCCGTTCATCAACTGATTTCAGTGGACGGTAAAAC
GATTCGAGGCAATCGAGGTAAAAATCAGAAGCCTGTTCATATTGTAACGG
CTTATGATGGGGGTCATCATCTTAGTTTGGGACAGGTAGCGGTTGAGGAG
AAAAGTAATGAAATTGTTGCCATTCCTCAGTTATTGCGGACAATTGATAT
CCGTAAAAGCATTGTAACGATAGACGCAATGGGCACGCAGACGGCTATCG
TTGATACGATTATAAAAGGTAAAGCAGACTATTGCTTAGCCGTCAAAGGA
AATCAAGAAACACTTTATGATGATATTGCTCTTTATTTTAGTGATGTCAA
CTTATTGGAAGAACTCCAAGAAAATGCACAGTATTATCAGACTGTTGAAA
AATCTAGGGGACAGATTGAAGTTAGAGAATACTGGGTGTCTTCCGATATC
AAATGGTTGTGTCAAAACCATCCCAAATGGCATAAGTTACGTGGTATTGG
GATGACTCGTAATACGATTGATAAGGATGGTCAGCTGAGTCAAGAGAATC
GTTATTTTATCTTTAGCTTTAAGCCGGCTGTCCTCACATTTGCCAATTGT
GTACGAGGTCATTGGCAGATAGAGAGTATGCACTGGTTATTGGACGTTGT
TTATCATGAAGATCATCATCAGACATTGGATAAAAGAGCCGCATTTAACC
TAAATTTTATCCGAAAAATGTGCTTATATTTTCTCAAAGTGATGGTATTT
CCTAAAAAAGACCTCAGTTATCGTCGCAAACAACGGTATATTTCTGTCCA
TTTGGAAGATTATTTAGTCCAATTATTTGGAGAGAGAGGCTAA
>M28_Spy0752 transposase
GTGACTACGATGATTGATTTTATTATTTCTATTGATGATTGTGCAGTTGA
ATTGGATAGTCGTCAATCTTGGAAAATTGGCTACCCCTTATCAACCATTC
TATTTCTTGTCTTCGTTTGTCAGTTAGCTGGCATTGAAACCTGGAAGGAG
ATGGAAGATTTTATTGAAATGAATGAACCATTGTTTGCGACCTACGTTGA
TTTGAGTGAAGGTTGTCCGTCTCATGATACCTTAGAGCGTGTGATTAGTC
TTGTTAATTCAGACCGTTTAAAAGAGCTTAAAGTTCAATTTGAGCAATCA
TTGACAAGCTTAGATGCCGTTCATCAACTGATTTCAGTGGACGGTAAAAC
GATTCGAGGCAATCGAGGTAAAAATCAGAAGCCTGTTCATATTGTAACGG
CTTATGATGGGGGTCATCATCTTAGTTTGGGACAGGTAGCGGTTGAGGAG
AAAAGTAATGAAATTGTTGCCATTCCTCAGTTATTGCGGACAATTGATAT
CCGTAAAAGCATTGTAACGATAGACGCAATGGGCACGCAGACGGCTATCG
TTGATACGATTATAAAAGGTAAAGCAGACTATTGCTTAGCCGTCAAAGGA
AATCAAGAAACACTTTATGATGATATTGCTCTTTATTTTAGTGATGTCAA
CTTATTGGAAGAACTCCAAGAAAATGCACAGTATTATCAGACTGTTGAAA
AATCTAGGGGACAGATTGAAGTTAGAGAATACTGGGTGTCTTCCGATATC
AAATGGTTGTGTCAAAACCATCCCAAATGGCATAAGTTACGTGGTATTGG
GATGACTCGTAACACGATTGATAAGGATGGTCAGCTGAGTCAAGAGAATC
GTTATTTTATCTTTAGCTTTAAGCCGGATGTCCTCACATTTGCCAATTGT
GTACGAGGTCATTGGCAGATAGAGAGTATGCACTGGTTATTGGACGTTGT
TTATCATGAAGATCATCATCAGACATTGGATAAAAGAGCCGCATTTAACC
TAAATTTTATCCGAAAAATGTGCTTATATTTTCTCAAAGTGATGGTATTT
CCTAAAAAAGACCTCAGTTATCGTCGCAAACAACGGTATATTTCTGTCCA
TTTGGAAGATTATTTAGTCCAATTATTTGGAGAAAGAGGCTAA
>M28_Spy0774 DNA-cytosine methyltransferase
ATGAGAGATATGCAGTTTTTAGATTTGTTTGCAGGAATTGGAGGCTTTCG
ATTGGGTTTAATTAATCAGTGCCATGAGTGTATTGGCTTTTGTGAGATTG
ATAAGTTTGCGAGGCAATCTTACAAAGCCATCTATGAGACCGAAGGAGAA
ATAGAATTTCATGACATTAGACAAGTCACAGACCAAGACTTTAGACAACT
TAGAGGGCAAGTGGATATCATCTGCGGTGGTTTTTCCCTTGTCAAGCATT
TTCACTCGCAGGCAGACGACTGGGATTTGAGGGCACTAGGAGAACTCTCT
TCTTTGAGATTACTCGAGCGACCAAACAGATAA
>M28_Spy0382 transposase
TTGTGTAAACACACAAAAAGGAATAAATCTTGTATAGTAGAGTTACGACA
CTTCACTAGAAAGAGATTTATTCCCATGACTCAGTTTACCACAGAATTAC
TTAACTTCCTAGCACAAAAACAAGATATTGATGAATTCTTTCGCTCCTCT
TTAGAAATAGCTATGAATGACCTCTTGCAAGTTGAACTATCAGCTTTTCT
TGGTTATGAACCTTATGAAAAAGAAGGTTACAACACAGGTAATAGCCGTA
ATGGGACTTATTCTCGTCAGTTTGAAACAAAGTATGGCTTAGTCAATTTA
ATCATCCCAAGAGATCGAAACGGCGAGTTTTCACCAGTTTTATTACCATC
TTATGCTAGACGAGATGACCACTTGGAAGAGATGGTGATCAAACTCTATC
AGACTGGCGTTACGACACGCGAAATCAGTGACATTATTGAGCGCATGTAT
GGTCACCACTTGTTTCTGAATGGAAGCCTCGTTATAAAAAGGTCATGGCA
TCACTTGAAACGACGGAAAATCTCCTTACTTTCTATCAATTCCCACATCA
CATTTGGTCTAGCATTTACTCTACAAACTTGA
>M28_Spy0632 cell surface protein
ATGAAGAAACATCTTAAAACAGTTGCCTTGACCCTCACTACAGTATCGGT
AGTCACCCACAATCAGGAAGTTTTTAGTTTAGTCAAAGAGCCGATTCTTA
AACAAACTCAAGCTTCTTCATCGATTTCTGGCGCTGACTACGCAGAAAGT
AGCGGTAAAAGCAAGTTAAAGATTAATGAAACTTCTGGCCCTGTTGATGA
TACAGTCACTGACTTATTTTCGGATAAACGTACTACTCCTGAAAAAATAA
AAGATAATCTTGCTAAAGGTCCGAGAGAACAAGAGTTAAAGGCAGTAACA
GAGAATACAGAATCAGAAAAGCAGATCACTTCTGGATCTCAACTAGAACA
ATCAAAAGAGTCTCTTTCTTTAAATAAAACAGTGCCATCAACGTCTAATT
GGGAGATTTGTGATTTTATTACTAAGGGGAATACCCTTGTTGGTCTTTCA
AAATCAGGTGTTGAAAAGTTATCTCAAACTGATCATCTCGTATTGCCTAG
TCAAGCAGCAGATGGAACTCAATTGATACAAGTAGCTAGTTTTGCTTTTA
CTCCAGATAAAAAGACGGCAATTGCAGAATATACCAGTAGGGCTGGAGAA
AATGGGGAAATAAGCCAACTAGATGTGGATGGAAAAGAAATTATTAACGA
AGGTGAGGTTTTTAATTCTTATCTACTAAAGAAGGTAACAATCCCAACTG
GTTATAAACATATTGGTCAAGATGCTTTTGTGGACAATAAGAATATTGCT
GAGGTTAATCTTCCTGAAAGCCTCGAGACTATTTCTGACTATGCTTTTGC
TCACCTAGCTTTGAAACAGATCGATTTGCCAGATAATTTAAAAGCGATTG
GAGAATTAGCTTTTTTTGATAATCAAATTACAGGTAAACTTTCTTTGCCA
CGTCAGTTAATGCGATTAGCAGAACGTGCTTTTAAATCAAACCATATCAA
AACAATTGAGTTTAGAGGAAATAGTCTAAAAGTGATAGGGGAAGCTAGTT
TTCAAGATAATGATCTGAGTCAACTAATGCTACCTGACGGTCTTGAAAAA
ATAGAATCAGAAGCTTTTACAGGAAATCCAGGAGATGATCACTACAATAA
CCGTGTTGTTTTGTGGACAAAATCTGGAAAAAATCCTTATGGTCTTGCTA
CTGAAAATACCTATGTTAATCCTGATAAGTCACTATGGCAGGAAAGTCCT
GAGATTGATTATACTAAATGGTTAGAGGAAGATTTTACCTATCAAAAAAA
TAGTGTTACAGGTTTTTCAAATAAAGGCTTACAAAAAGTAAAACGTAATA
AAAACTTAGAAATTCCAAAACAGCACAATGGTGTTACTATTACTGAAATT
GGTGATAATGCTTTTCGCAATGTTGATTTTCAAAATAAAACTTTACGTAA
ATATGATTTGGAAGAAGTAAAGCTTCCCTCAACTATTCGGAAAATAGGTG
CTTTTGCTTTTCAATCTAATAACTTGAAATCTTTTGAAGCAAGTGACGAT
TTAGAAGAGATTAAAGAGGGAGCCTTTATGAATAATCGTATTGAAACCTT
GGAATTAAAAGATAAATTAGTTACTATTGGTGATGCGGCTTTCCATATTA
ATCATATTTATGCCATTGTTCTTCCAGAATCTGTACAAGAAATAGGGCGT
TCAGCATTTCGGCAAAATGGTGCAAATAATCTTATTTTTATGGGAAGTAA
GGTTAAGACCATAGGTGAGATGGCATTTTTATCAAATAGACTTGAACATC
TGGATCTTTCTGAGCAAAAACAGTTAACAGAGATTCCTGTTCAAGCCTTT
TCAGACAATGCCTTGAAAGAAGTATTATTACCAGCATCACTGAAAACGAT
TCGAGAAGAAGCCTTCAAAAAGAATCATTTAAAACAACTGGAAGTGGCAT
CTGCCTTGTCCCATATTGCTTTTAATGCTTTAGATGATAATGATGGTGAT
GAACAATTTGACAATAAAGTGGTTGTTAAAACGCATCATAATTCCTACGC
ACTAGCAGATGGTGAGCATTTTATCGTTGATCCAGATAAGTTATCTTCTA
CAATGGTAGACCTTGAAAAGATTTTAAAACTAATCGAAGGTTTAGATTAT
TCTACATTACGTCAGACTACTCAAACTCAGTTTAGAGACATGACTACTGC
AGGTAAAGCGTTGTTGTCAAAATCTAACCTCCGACAAGGAGAAAAACAAA
AATTCCTTCAAGAAGCACAATTTTTCCTTGGCCGCGTTGATTTGGATAAA
GCCATAGCTAAAGCTGAGAAGGCTTTAGTGACCAAGAAGGCAACAAAGAA
TGGTCAGTTGCTTGAAAGAAGTATTAACAGAGCGGTATTAGCTTATAATA
ATAGCGCTATTAAAAAAGCTAATGTTAAGCGCTTGGAAAAAGAGTTAGAC
TTGCTAACAGGATTAGTTGAGGGAAAAGGACCATTAGCGCAAGCTACAAT
GGTACAAGGAGTTTATTTATTAAAGACGCCTTTGCCATTGCCAGAGTATT
ATATCGGATTGAACGTTTATTTTGACAAGTCTGGAAAATTGATTTATGCA
CTTGATATGAGTGATACTATTGGCGAGGGACAAAAAGACGCTTATGGTAA
TCCTATATTAAATGTTGACGAGGATAATGAAGGTTATCATGCCTTGGCAG
TTGCCACTTTAGCTGATTATGAGGGGCTCGACATCAAAACAATTTTAAAT
AGTAAGCTTAGTCAATTAACATCTATTCGTCAGGTACCGACTGCAGCCTA
TCATAGAGCCGGTATTTTCCAAGCTATCCAAAATGCAGCGGCAGAAGCAG
AGCAGTTATTGCCTAAACCAGGTACGCACTCTGAGAAATCAAGCTCAAGT
GAATCTGCTAACTCTAAAGATAGAGGATTGCAATCAAACCCAAAAACGAA
TAGAGGACGACACTCTGCAATATTGCCTAGGACAGGGTCAAAAGGCAGCT
TTGTCTATGGAATCTTAGGTTACACTAGCGTTGCTTTACTGTCACTAATA
ACTGCTATAAAAAAGAAAAAATATTAA
>M28_Spy1848 phage protein
ATGTACAAACAAACTAACAAAACTTACGCCGATATTTTGGAAAAAGTTGA
AGCCGCAACAGCGCAATGGATTATTAGAAAAAAAGCTTCAAGCCTTAAAG
ATGACGTGATTATCACTGATGAGGATATACAAGCTGAGAAAGAGCGTATT
TTCATTGAGAAATATGGGACAGCACTGTTTGATTTTAAAATTGATAGCTA
CCGTAAAGAATTAGATGATTTAAAAATCAAAGCTCGTGAGCAAGTAAACC
AATTCAATGATTTTGTAAAGGAACTAGAACAAGACGACCGTTACACAGAA
CGTGGTAAAGTGGATTTATACCGAGCAGAGCGAAAAAAAGCTGAAAAGAC
CCTTAAAGAGATTGGAGAAGCTCAGCATAAACTTAATGTTGATATTCAAA
AGATTGAAGTAGAATCGGCTCAAAATGCTTGGAAAAAGTTAGAATCTGAA
ATGACGCCCGATTCAATCACCCCTAGTGAATATCAGTATTTAGAAATGAT
GTTATCACGTAATGATAGTGATGAAATGCGGAAAAAACTTGCTGAGAAGT
TCCATTACCATCTGATGGTCTTGGAGTATTTGAATGCTGACCGTAAATTT
GGAGAAGTTATCATCAAGCACCCATTAGAAGGGGTTAAAAATCAGTCAGT
TAATTATATTAAAATTGGGGATGTCCGATTGCCTGAGGTTTACGAAAGCA
CTTATATTCATGAACTTTTGAAGCATTACAAGAATGACATTTACTTTGGC
GAGAGCTACGCAAATCATGAATGGGATGAAGAGCAATGA
>M28_Spy1162 DNA-binding protein HU
ATGGCTAACAAACAAGATTTAATCGCAAAGGTTGCAGAAGCAACTGAATT
GACTAAAAAAGATTCAGCAGCAGCAGTTGATGCCGTGTTTTCTACAATCG
AAGCTTTCCTTGCTGAAGGTGAAAAAGTACAATTGATCGGTTTTGGTAAC
TTCGAAGTACGCGAACGTGCAGCTCGTAAAGGTCGTAACCCACAAACTGG
TGCAGAAATTGAAATTGCAGCTTCAAAAGTTCCAGCCTTCAAAGCTGGTA
AAGCTCTTAAAGACGCTGTTAAATAA
>M28_Spy1698 transposase
GTGACTACGATGATTGATTTTATTATTTCTATTGATGATTGCGCAGTTGA
ATTGGATAGTCGTCAATCTTGGAAAATTCGCTACCCCTTATCAACCATTC
TATTTCTTGTCTTCGTTTGTCAGTTAGCTGGCATTGAAACCTGGAAGGAG
ATGGAAGATTTTATTGAAATGAATGAACCATTGTTTGCGACCTACGTTGA
TTTGAGTGAAGGTTGTCCGTCTCATGATACCTTAGAGCGTGTGATTAGTC
TTGTTAATACAGACCGTTTAAAAGAGCTTAAAGTTCAATTTGAGCAATCA
TTGACAAGCTTAGATGCCGTTCATCAACTGATTTCAGTGGACGGTAAAAC
GATTCGAGGCAATCGAGGTAAAAATCAGAAGCCTGTTCATATTGTAACGG
CTTATGATGGGGGTCATCATCTTAGTTTGGGACAGGTAGCGGTTGAGGAG
AAAAGTAATGAAATTGTTGCCATTCCTCAGTTATTGCGGACAATTGATAT
CCGTAAAAGCATTGTAACGATAGACGCAATGGGCACGCAGACGGCTATCG
TTGATACGATTATAAAAGGTAAAGCAGACTATTGCTTAGCCGTCAAAGGA
AATCAAGAAACACTTTATGATGATATTGCTCTTTATTTTAGTGATGTCAA
CTTATTGGAAGAACTCCAAGAAAATGCACAGTATTATCAGACTGTTGAAA
AATCTAGGGGACAGATTGAAGTTAGAGAATACTGGGTGTCTTCCGATATC
AAATGGTTGTGTCAAAACCATCCCAAATGGCATAAGTTACGTGGTATTGG
GATGACTCGTAACACGATTGATAAGGATGGTCAGCTGAGTCAAGAGAATC
GTTATTTTATCTTTAGCTTTAAGCCGGATGTCCTCACATTTGCCAATTGT
GTACGAGGTCATTGGCAGATAGAGAGTATGCACTGGTTATTGGACGTTGT
TTATCATGAAGATCATCATCAGACATTGGATAAAAGAGCCGCATTTAACC
TAAATTTTATCCGAAAAATGTGCTTATATTTTCTCAAAGTGATGGTATTT
CCTAAAAAAGACCTCAGTTATCGTCGCAAACAACGGTATATTTCTGTCCA
TTTGGAAGATTATTTAGTCCAATTATTTGGAGAGAGAGGCTAA
>M28_Spy0859 DNA topoisomerase I
TTGGGAACAAAAACTACAACTAAGCCAAAAACGGGTACTAAAAAGTCCAC
CACTAAAAAGAAATCAACAGCGAAAAAAAATCTCGTTATTGTTGAATCAC
CTGCCAAAGCTAAGACTATTGAAAAATATCTTGGACGCAGTTATAAAGTT
GTTGCTTCGGTAGGACATATTCGTGACTTAAAAAAATCGTCTATGTCTAT
TGATTTTGATAATAATTATGAGCCACAATACATTAATATCCGTGGTAAGG
GATCCCTTATCAATTCTTTAAAAAAAGAAGCCAAAGCTGCTAAAAAAGTT
TATTTAGCTAGTGACCCGGATCGTGAGGGAGAGGCTATTTCTTGGCATTT
GTCACATATCTTAGGACTTGATCCTCAAGATAATAACCGAGTGGTTTTTA
ATGAAATTACGAAAGATGCAGTTAAACATGCCTTTGTGGAGCCTCGTCAG
ATTGATATGGACTTGGTAGATTCTCAACAAGCACGTCGTGTTTTGGACCG
TATTGTGGGATATTCCATTTCACCAATCCTTTGGAAAAAGGTCAAAAAAG
GACTTTCAGCAGGACGTGTCCAGTCGGTTGCTTTAAAACTCATCATTGAC
CGTGAAAATGACATCAAAGCATTTGTTCCAAAGGAATACTGGTCTATTGA
TGGTCTTTTTAAAAAAGGAACTAAAAAGTTTCAAGCGACTTTTTACGGTA
TTAATGGCAAAAAAACAAAGCTTGATAATAACAACGATGTCAAAGAGGTA
TTAGCAAAGCTAACAAATGAAGATTTTCTTGTCAGCAAGGTTGACAAGAA
AGAGCGACGTCGTAATGCTCCCTTACCTTACACAACATCATCTCTTCAAC
AAGATGCTGCTAATAAAATCAATTTCAGAACGCGTAAAACCATGATGGTA
GCCCAACAACTGTATGAGGGGATTCATTTAGGAGAAAATGGAACTCAAGG
TTTAATTACCTATATGCGTACGGATTCTACTCGTATCAGTCCAGTAGCAC
AAAACGATGCTGCTCAATTTATTATCAATCGCTTTGGAGCTAATTATTCA
AAACATGGTAATCGTGTCAAAAATACCAGTGGTGCTCAAGATGCTCACGA
GGCGATTCGTCCATCTAGTGTTAATCATACGCCAGACTCTATTGCCAAAT
ACCTTAACAAGGATCAGTTAAAACTTTATACGCTTATTTGGAATCGTTTT
GTGGCTAGCCAAATGACAGCAGCTGTTTTTGATACCGTAAAGGTGAATTT
GGAGCAAAATGGCGTGATTTTTGTTGCCAATGGTAGCCAAATGAAGTTTG
ATGGTTACATGGCTGTTTACAATGATTCCGATAAAAACAAAATGTTACCT
GAGATGGCAGAAGGAGAAACGGTTAAAAAAATATCGACCTCTCCAGAACA
GCACTTTACGCAGCCACCAGCTCGTTATTCTGAAGCAACTCTGATTAAAA
CGCTAGAAGAAAATGGTGTTGGACGTCCATCAACTTATGCCCCAACCTTA
GAAGTGATTCAACGCAGGTACTATGTTAAATTATCTGCTAAGCGCTTTGA
GCCAACTGAGCTTGGGGAAATTGTCAACAAGCTTATTGTCGAATTTTTCC
CAGATATTGTTGATGTTGCCTTTACTGCCGAGATGGAAGGTAAGCTAGAT
CAAGTTGAAATCGGAGAAGAACAATGGCAACATGTCATCGATCAATTCTA
TCAACCCTTTGTCAAAGAATTGAATAAGGCTGAGTCTGAAATTGAAAAGA
TTCAAATCAAAGATGAGCCAGCTGGTTTTGACTGTGATGTTTGTGGCCAC
CCAATGGTCATTAAGTTAGGACGTTTTGGGAAATTTTACGCGTGCAGCAA
CTTCCCTGAGTGTCGTAATACAAAAGCCATCACTAAAGAAATCGGTGTTA
CTTGTCCGGTTTGTCATAAAGGACAAGTTATCGAGCGTAAAACCAAAAAA
AATAGGATATTTTATGGTTGTGATCAGTATCCAGATTGTGAGTTTATCTC
GTGGGATTTACCTATTGGACGTGCTTGCCCTAAGTCAGGTGACTATCTTA
TTGAGAAAAAAGTTCGTGGTGGCAAACAAGTAATGTGTAGCAATGAGACC
TGTGATTACAAGGAAGAAAAAATTAAATAA
>M28_Spy1274 DnaD-like protein
ATGATGAAGAAGAAAGGAGAAGCATTGGACAAAAAAGAACTGTTTGATAA
TTTCCAAAATAATTGGATGCGTCTCTTATCACCATTTGAGATTGAAGACA
TTAATAAGTGGATTGACGAAGAGAAGATGCCTGTTGAAGTTGTTAACGAG
GCACTAAAATCGACAATTCTATACAACGCACCAAACCTTAGATACTTAAA
CAGAGTCTTGAACAACTGGAAGCGACAAGGGATTGATACAGTCGAGAAAG
TCGAATTTGCTAGGTTGCAATTTGAAAATAAAAAGCTCAGTCAAAATAAA
AATCATCAATCCAACGTCCCAAGCTGGTCGAATCCAGACTACAAAGAACC
AGATTTAAAAGAATTTGCACTAGGAAGCATAGACGGTATAGAAGATGGAT
CAGGAGATTTTTAA
>M28_Spy1072 transposase
ATGCTACTTGAGATCCTTGATTTATCACGCTCCACCTATTACTATCAAGT
GAAGCGACTAGCTCAAGGAGATAAGGATATAGAACTAAAGCATGTGATTC
GAGAGATTTATGATGAGCATAAAGGTAATTACGGTTATCGTCGTATTCAT
ATGGAGTTGCGTAACCGAGGATTTGTGGTCAATCATAAGAAGGTTCAACG
TCTCATGAAAGTCATGAGCCTAGCAGCCCGCATTCGTCGGAAGCGCAAGT
ATTCTTCTTACAAAGGAGAGGTTGGTAAGAAGGCTGATAATCTGATTAAA
CGTCACTTCGAAGGCTCTAAACCTTACGAAAAATGTTACACTGATGTGAC
GGAGTTGGCCTTACCTGAAGGAAAACTCTACTTATTACCTGTTCTTGACG
GCTATAACAGTGAGATTATTGATTTCACTCTGTCTCGGTCTCCTAACTTG
AAACAGGTTCAAACCATGCTTGAGAAGACTTTTCCAGCGGATTCATACAG
CGGAACTATTCTTCATAGTGACCAGGGGTGGCAATACCAACACCAGTCCT
ACCATGATTTTTTAGAGTCTAAAGGTATTTTGCCATCCACGTCCCGCAAA
GGGAATAGCCCGGATAACGGCATGATGGATTCCTTCTTTGGCATTCTCAA
ATCTGAAATGTTTTATGGACTCGAGACAACTTATCAATCACTTGATAAGC
TTGAAGAAGCTATTACAGATTACATTTTTTGCTACAACAACAAACGAATT
AAAGCAAAACTAAAAGGATTTAGTCCTGTCCAATACAGAACTAAATCCTT
TCAATAA
>M28_Spy0448 transposase
TTGGATAATCAAATTTATAGAAAACAAATACTTGAGATTTATACCAAAGC
AAACAAAAGACTTGGTGTGAAGTCTATCAAGGTCATTCTTCAAAGAGACT
ACGACACAAAAATCTCTGAAGGAAGAATTTACCGTCTTATGAAGAATATG
GCGCTCCCTAAAATGGCTACCGTTAAGCCAAAAACAGCTCTTAAAAGGAC
TCAAAAAACGTATCCTCAAAACTTACTCAACCAGAAATTTAATCCTGACA
AACCAAATCAAGTATGGTCTACTGACTTCACCTATATTTCTATTGGATAT
AAGAAATATGTCTATCTCTGCGCAATACTTGATCTCTATTCTAGAAAATG
TATTGCTTGGAAACTGAGTCATCATATGGATGCAAAGTTAGCATGTGACA
CTCTAGAATTAGCTCTTAATAAAAGAAAGATTGAAGGAACACTTCTCTTT
CATTCCGACCAAGGGTCACAATTTAAGGCCAGGAAATTGAGAAAAATAAT
TGATGACAACACTATCATGCATTCTTTTTCTAAACCTGGATATCCTTATG
ATAATGCCGTAACTGAAGCATTTTTCAAGTATTTAAAGCATAGACAAATC
AACCGAAAAAAGTATCAAAATATCAAACAGGTTCAATTAGACTGCTTTGA
ATACATTGAGAATTTTTATAACAATTACAACCCACATACGGCTAATCTAG
GACTAACCCCTAATCAGAAAGAAGAAAATTAG
>M28_Spy0169 transposase
ATGCTACTTGAGATCCTTGATTTATCACGCTCCACCTATTACTATCAAGT
GAAGCGACTAGCTCAAGGAGATAAGGATATAGAACTAAAGCATGTGATTC
GAGAGATTTATGATGAGCATAAAGGTAATTACGGTTATCGTCGTATTCAT
ATGGAGTTGCGTAACCGAGGATTTGTGGTCAATCATAAGAAAGTTCAACG
TCTCATGAAAGTCATGGGCCTAGCAGCCCGCATTCGTCGGAAGCGCAAGT
ATTCTTCTTACAAAGGAGAGGTTGGTAAGAAGGCTGATAATCTGATTAAA
CGTCACTTCGAAGGCTCTAAACCTTACGAAAAATGTTACACTGATGTGAC
GGAGTTGGCCTTACCTGAAGGAAAACTCTACTTATTACCTGTTCTTGACG
GCTATAACTGTGAGATTATTGATTTCACTCTGTCTCGGTCTCCTAACTTG
AAACAGGTTCAAACCATGCTTGAGAAGACTTTTCCAGCGGATTCATACAG
CGGAACTATTCTTCATAGTGACCAGGGGTGGCAATACCAACACCAGTCCT
ACCATGATTTTTTAGAGTCTAAAGGTATTCTGCCATCCATGTCCCGCAAA
GGGAATAGCCCGGATAACGGCATGATGGATTCCTTCTTTGGCATTCTCAA
ATCTGAAATGTTTTATGGACTCGAAAAGTCTTATAAAACCCTTGACAAGC
TTGAAGAAGCTATTACAGATTACATTTCTTACTACAACAACAAACGAATC
AAAGCAAAACTAAAAGGACTTAGTCCTGTCCAATACAGAACTAAATCCTT
TCAATAA
>M28_Spy1014 phage DNA/RNA helicase
GTGATGATTGTTAGTCCACCTGGAAGTGGTAAGTCAGTAGTCATTTCTGA
TATTGCTAAGTCAGCGACTCAAAAAAACGGACACGTTTTATTCTTGGTCC
ATCGCAAAGAATTAATTGACCAAATCACTAATAGTTTTAAATTCCATGGA
ATTGACATGAATAAAGTGGATTTAATGACAGTTGGTAAAGCTAAAAACCG
CTTGGATAAATTAACAAAACCAACCTTAATTATCACAGATGAGGGTCATC
ATGGGAAAGCTAGTACCTACCAAATAATCTATGAATACTTTTCAGACGTG
CCGAGGATTGGTTTTACTGCCACACCTTGGCGTCTATCAGGCGACGGTTT
TACAGACACTTACGATGTTATGGTTCTTGGTAAAACGGTCGAGTGGCTTA
TCAATAATAATAAACTTGCACCATATGATTATTACAGTGTTCTATCAATT
GATACTGCGAAATTAAAAGTACAAAACGGAGATTACTCCAATAAATCGAT
TGACGAATCATTTGGTAAAAAGATTTTTGGTGATGTAGTTCAAGAATATA
TAAAAAAAGCGAACGGTCAGAAAGCTATTTTATACGCTCACTCGGTAGAA
GCATCGCAGGCATTTGCTAAAGAATTCCAATCTATGGGAATTAATGCAAT
ACACGCAGATGCAAAAACGCCTAAAGCCAAACGGGATAAAATCATGAAAG
ATTTCCGTGACGGTAAGATACAAGTTATCTGTAACGTTGATTTGATATCA
GAAGGTTTCGATGTCCCAGATTGTACAGTAACTATTCTTTGTAGACCTAC
AAAATCATTAGTATTATTTTTGCAACAATCTATGCGGTCGATGAGATATC
AACCTAATAAAAAAGCCATCATTTTAGATCACGTAGGAAATTGGAATATT
CACGGCTTACCTGACACACCGCATCATTGGGAGAATTATTTCCGAGGAGG
GTGGAAGAAGAAGTCGAATAAAACTAACACGGTACACGCAAAAGAATGTT
CTGTGTGTTCGGCTTTGTGGCCACTTAGTCAACAGCTCTGTGAATTATGC
AATCATGATTTTGGATTGAAAGAAAAACAAGAGAAAGAACGCATAGAGGC
AGAACTTGAACTCATAAAACGTGAGCGGTTTAGAATCAAACAACTTGCTA
ATAAGAAGTTTGGTAAAGATTTAAAAACAAACTGGGAAATTGCCCAAGCT
AGAGTTAAAGACGCTGGTAAAGGAAAACCATTATATAAACTTATCTATTT
CTACTTAAAAACTGATTGGGTAGAAACAAACGTTAATGAACTTGCCGAAG
TAACAGGCAAGTCAGAAAAAGAAATATATAGCGCCTACAATTGGCTAAAA
AAGAAATTAAGAGGATAA
>M28_Spy0215 ribonuclease M5
TTGCAAAAGAAACGACTGCTAATGCAAAGAGGGTACTTAAGCTTGACTGA
AAAAATTAATATTCAAGAGGTTCTTGTTGTAGAAGGCAAGGACGACACGG
CTAACCTTCGCCGTTTTTACGAGGTGGATACCTATGAGACCAGAGGCTCT
GCTATCACTGAAGAAGATTTAGAACGGATTAACCGCCTAAATGACTTGCG
TGGTGTCATTGTTTTGACAGACCCAGATTATAATGGTGAGCGCATTCGTA
AGCTCATTATGGCAGCTGTGCCAACAGCTCGTCACGCCTTTTTAAACCGA
AACGAGGCGGTTCCGAGTTCTAAGAGTAAGGGCCGTTCCTTAGGGGTTGA
ACATGCCAATTTTGAGGACCTCCAAAAGGCACTTGCTCATGTCACTCAGC
AATATGATGATGAGTCTTATTTTGACATTCGTCAAACAGACCTGATTCGT
CTAGGGCTTTTAATGGCGTCAGATAGCCGTAAACGCAGGGAATACTTGGG
CGAAAAGCTCCGCATCGGCTATGCCAACGGCAAACAACTGCTCAAGCGCC
TCGAATTATTTGGCATTACCCTAGCAGAAGTGGAAGAAGTGATGGAGACA
TATGAGGAGTAA
>M28_Spy1303 DNA integration/recombination/invertion protein
ATGGCAACATATAGACAAAGAGGTAAAAAGAAATTATGGGATTATCGTGT
TTATGGTAAAGATGGAAAATTAATAGCATCTGGTTCAGGCTTTAGAACAA
AAAAAGAAGCATCATATGAAGCTTTAAAAATTGAGCAAAAAAAATATTAT
TCAGATGTTATAAATTCCAATGCTACATTATTTGAGATGTGGCAAATATG
GTATGATCTTGTTGTTGAGCCAAGTGAATTAGATATTCTTACTAAGCAAA
AATATCAAGCCCGAGGAAAGATAATTGAAAAATATTTATCTGATATCCCT
GCTAATAGAATTAAACATAGTAAGTATCAAGAATTTATTAAGTTTTATGG
TAAAAATGTAACTTTGAATTTAATGACTTGTTTGAATTCAGATATTAGAA
AGGTTATAATTTTTTTTAAAAGGGACGGAGTTTTAATTGAAGATTTTACA
GAAGGAGTTAAAATTTTTGGAAAACCATATAGGAAGTCGCCAGAGGATAA
GTATTTAAAAAGTATTGAAGATTATCAAAAATTATTAGCATATTTAAAAA
GAATAGCTAATTATTCAGACTCAATAATCCCTTTTTTTCTTTTCACAATG
TTACAAACTGGTTTTAGGTTTGGTGAAGCAATGGCAATAACTTGGGATGA
TATTGATTTTGAAAGAAATAGTATTTATACATATCGAAGATATTCTTCAA
TAAAAAAGGACTTTACAAAGCCTAAAACAAGGACTTCAATAAGGAGAGTT
CCAGTAAGTCATGATTTAAAAGAGTTATTGCTTGAACTAAAATTTCAACA
AGAAAGAATGCTGAGAGGTTTGCATATAAAAAATACAGATCAATTGATTT
TTTATGACTATAGGTTTGGTATGATATCAAATAATGCTGTTAACAAATTC
TTGGCAAGCTCATTGGAAAAATTAGAAATAGAATCTAAGATGTCATCAAC
AGGTGCTAGACATACTTATGGAAGTTATTTGTTGGCTAACGGAGTAGATA
TTTGGGCGGTTGCAAAATTAATGGGGCATAAAGATATCAAACAATTAATA
GAAACATATGGTCATTTGCTTCTGGAGGTGGAAGAAAAGGAAAATGATCA
GCTTTTAAAAATTCTTAATAATAAAGGTAGTTTTTAA
>M28_Spy1289 hypothetical cytosolic protein
ATGATGGTTTTAGTCACTTATGATGTAAATACGGAAACACCTGCTGGTAG
AAAAAGATTGCGTCATGTTGCCAAACTCTGTGTGGACTATGGGCAACGTG
TTCAAAATTCTGTTTTTGAATGTTCTGTGACACCCGCAGAATTTGTGGAT
ATAAAGCACCGCTTAACACAAATCATTGATGAGAAAACTGATAGTATTCG
CTTTTATTTATTGGGGAAAAATTGGCAGAGGCGTGTGGAAACACTTGGTC
GCTCAGACAGCTATGACCCAGATAAAGGTGTCTTATTATTGTAA
>M28_Spy0340 transposase
GTGGCTGTAGCGGAAACAAGTCTGGTTCAAAAAAACTGTCAGATCTCTGA
GCCCCTCAGACAAAAAGTCGCACAAACCTTGGTTAATCGAGGAGCTCTCA
CTAACATCGCTCAACAGTCGGCTATATCATCTTCTACCGTCTACCGAAAA
CTCAACCAGTTTGTAATCAAGGAAGACTTCTCTAAACTACCCGAGGTGTT
GTCTTGGGATGGATTTTCCTATCAAAAGGGCGAACTCGCCTTTATCGCTC
AAGATTTTGAGTCCAAAAAAATCATCTCCATACTGGACAACCGGCGACAA
ACAACCATTCGAAATCACTTCTTTAGATACTCTAAAGAGGCTAGAAACAG
TGTCAAAATCGTTACCGTTGATATGTCAGGAAGCTATATTTCGCTCATTA
AAAAGCTATTTCCTCAAGCTAACATCGTCCTAGATCGTTTCCTATTGTTC
AGCACATGA
>M28_Spy1335 transposase
TTGTATAACCATTGTATCACTAACTGCAATACAACGCAAACAAAAAAGAA
AATCGTATTTCCCAGTGAAGAGACCCTAGAACACTGTCTAGTCACACTAT
TTAATGATTACAACTTCAAGCAAGAACAACGAGTCCACAAAGGTTTTGGT
CATTGTACAGACACACTTGAAAGCCTATTTGATTAA
>M28_Spy0749 hypothetical cytosolic protein
ATGGCTGGTTGGCGTACTGTTGTGGTAAATACCCACTCGAAATTATCCTA
TAAGAATAATCATCTGATTTTTAAGGATGCCTATAAAACGGAGCTGATCC
ATTTATCAGAAATTGATATTTTGTTATTAGAAACGACCGATATTGTCTTG
TCCACTATGCTGGTAAAACGGCTAGTGGATGAGAATGTCCTTGTCATATT
CTGTGATGATAAACGATTACCAACAGCTATGCTGATGCCTTTTTATGGTC
GTCATGATTCGAGTTTACAGCTTGGGAAACAAATGTCCTGGTCAGAAACA
GTCAAATCGCAGGTTTGGACGACGATTATTGCTCAAAAGATTTTGAATCA
ATCTTGCTATCTAGGAGCATGCTCCTATTTTGAAAAATCCCAATCTATTA
TGGATTTATATCATGGTTTGGAAAATTTTGATCCGAGTAATCGAGAAGGG
CATGCAGCGAGAATTTATTTTAATACACTTTTTGGGAACGATTTCTCAAG
AGATTTGGAGCATCCAATCAATGCAGGTCTGGATTATGGTTATACTTTAT
TATTGAGTATGTTTGCGCGTGAAGTGGTTGTGTCTGGATGTATGACTCAG
TTTGGGCTTAAACACGCTAATCAGTTTAATCAGTTCAATTTTGCTAGCGA
TATTATGGAACCATTTAGGCCTTTGGTGGATAAGATTGTTTATGAAAATC
GAAATCAGCCTTTTCCCAAAATAAAGAGAGAGTTATTTACTTTGTTTTCA
GATACATTTTCATATAATGGTAAAGAGATGTATCTCACGAATATTATTAG
CGATTATACTAAAAAAGTTGTCAAAGCTCTGAATAATGAAGGGAAAGGAG
TTCCTGAATTTAGGATATGA
>M28_Spy1896 transposase
ATGGAAAACAAACCTTCTTCAACGCCTATTTCGCTGATAGTGGGCAACGT
GTCTATTAAACCAATCGATTTGCCTAAGGTGGTTAGTATCAGAAAACGTT
CTAAGAAAGTCATGAAGACGAATAAGAAGACTTTAGGTAAATCTATCGAA
GAACGTCCAGAATATATTAATGATCGTTCTGAATTTGGGCATTGGGAGAT
TGATTTGGTTCTCGGCAAGAAAACCAAAAGTGAAGCTGTTATGTTGACTT
TGGTAGAGCGCCAGACACGCTATGCACTAGGAGTTAAGCTAGAAGACAAG
CAGTCCCAAACCATTAACCGTGCTGTCACGCATCTCATCAGTCAGTATCC
TATTGCATCCATCACAGCGGATAATGGTTCTGAGTTTAGTTTACTCTCAG
ACTTAAAAGCTGTTGACGTTTACTTTGCACATCCCTATTCTTCACATGAG
AGAGGAACAAGCGAGAACTTCAATGGCCTCCTCAGAGAATATGTCCCTAA
AGGAGTCTCACTTAATCCACTAACCTCTGAAGAACTTGACAATGATATTA
CTGCCATCAATGAGCGCCTAAGACGACTTCTTCAATAG
>M28_Spy0855 hypothetical cytosolic protein
ATGATTTTTCCATCATTACCTTATTGGAAGGACCTCCCTGATTTAGACTT
ATATTTGGATCAAGTCTTACTTTATGTCAACCAGTGCACTGATTTTTCAG
AAGTGTCAGATAATAAATCACTAACGGCATCTATGATTAATAATTACGTC
AAGCATGGGTATGTGACTAAACCTATCAAGAAAAAATACCAAAAGCAACA
ACTAGCGCGCTTAATTGCCATCAGTTTGTTTAAAACGGTATTTCCTATTC
AAGATATTAGTCGTGTATTGGAGGAACTTCAGGCACAGGCTGATTCTGAA
AGTCTTTACAATACTTTTGTAACCTGTTGGAATCAGAAGGCTCCCATTGA
GGAGGACATTCCACCGATTGTGCAGGTTGCCTGTCAAACGGTCAAAGATT
ACCACAAAACTATTTATTTATTACAGGAGGTGATCCAATGA
>M28_Spy1789 DNA integration/recombination/invertion protein
ATGGAAAGGTTTATGATCATGAAAATAACAGAACATAAGAAGAAAAACGG
TACAATTGTTTATCGTGCTAGTATTTATCTAGGCATTGACCAAATGACAG
GTAAGAGAGTAAAAACAAGCATCACAGGAAGAACAAGAAAAGAAGTTAAT
CAAAAAGCCAAGCACGCGCAGTTTGACTTCCTATCTAATGGATCTACAAT
TAAAAGAAAAGTTGTGATTAAAACATTTAAAGAACTTAGTCATTTATGGC
TTGAAACCTATAAGTTAACAGTAAAGCCTCAAACTTATGATGCTACTGTT
ACTAGACTTAATCGACATATTATGCCAACTCTGGGCAATATGAAGGTTGA
TAAGATAACCGCTAGTGATATTCAAATGCTGATTAATAGATTATCTAAAT
ATTACGTCAATTATACTGCGGTACGTTCAGTCATCCGAAAAGTTCTCCAA
CAAGGAGTATTGCTAGGGCTAATAGATTATAACTCAGCAAGAGATATTAT
CCTTCCAAGGAAGCAGCCAAACGCTAAGAAAAAAGTTAAGTTTATTGATC
CGTCTGATTTGAAATCTTTTTTAGAACATTTAGAAACTAGTCAACACAAA
CGCTATAACCTTTACTTTGATGCAGTTCTCTACCAACTTTTATTATCCAC
TGGCTTGAGGATAGGCGAAGCCTGTGCATTAGAGTGGGGAGATATTGACC
TAGAAAATGGTACAATAGCCATTAATAAGACTTACAATAAAAATTTGAAG
TTTTTGAGTACAGCTAAAACCCAGTCAGGCAATAGAGTGATTAGTGTTGA
TAAAAAGACCCTTAGAAGCCTAAAGCTCTATCAAATGAGACAGCGACAAT
TATTTAATGAGGTTGGTGCGCGTGTGTCGGAGGTAGTGTTTGCCACACCA
ACACGAAAGTATTTTAATGCTTCGGTTAGACAAAGCGCTTTAGATACTAG
GTGTAAGGAAGCAGGGATTGAACGCTTTACCTTTCACGCTTTTAGACACA
CTCACGCTAGTTTATTGCTGAACGCAGGTATTAGTTATAAGGAACTTCAG
TACCGTCTAGGACATGCGAATATCAGCATGACTTTGGATACCTATGGCCA
TCTTTCTAAGGACAAAGAAAAAGAAGCTGTTTTATATTATGAAAAGGCTA
TGAATAATTTATAA
>M28_Spy0166 transposase
ATGCCAAGAAAAACCTTTGATAAAGCCTTCAAACTCTCTGCTGTAAAACT
CATCCTTGAGGAAGAGCAGTCTGTAAAAATGGTTAGTTCAACTTTAGAAA
TTCATCCCAATAGTCTTTATCGATGGATTCAAGAATATGAAAAATATGGA
GAAAGTGCGTTCCCAGGACATGGGAGCGCACTTCGTCATGCTCAATTTGA
GACAAAAAAACTTGAAAAAGAGCACAAACTGCTACAGGAGGAATTAGCTC
TTCTAAAAAAGTTCCAGGTCTTTTTGAAGCCAAACCGGAAATAA
>M28_Spy0373 uracil DNA glycosylase superfamily protein
ATGGATGATTTAACCAAAGCTATTATGGCAGATGAGGCTAATCTCTCCTA
TACCGAAAGAGGTATTTTTCCTTTATATGATGCTCCTCAAACAGCTAGGC
TTATTATTGTTGGCCAAGCTCCTGGAATAGTAGCTCAAGAAACCAAACTT
TACTGGAATGATCGTAGTGGCATCCGCTTACGAGACTGGCTAGGTGTGGA
CAATGACACCTTTTACCACTCAGGATTGTTTGGCATTATCCCTATGGATT
TCTATTATCCTGGTAAGGGAAAATCCGGTGACTTACCACCTAGAGAAGGT
TTTGCGGCTAAGTGGCACCCGCCATTAAGAGCATTGATGCCAGAAGTTGA
ATTGACGATTTTGGTTGGTCGCTATGCTCAGGACTTTTACCTTGGTAACA
AGGCTTACAAAACCTTAACTGAAACAGTCCGTCACTTTGAGGATTACTTG
CCAGACTATTTTCCACTTGTTCATCCTTCTCCAAGAAACCAATTGTGGTT
AGCTAAGAACCCCTGGTTTGAGCAGGATTTATTACCTATCTTGCAAAAAC
GTGTGGAGGCAATTCTAACCAAATAG
>M28_Spy1833 phosphohydrolase
ATGAAGGACTTATTAAAACAGTATCAGGCAAAACCACTAGGAGAGGAGAA
GCGGTACGCCGTATTTTTACCTCTTATTCTTGTCAATGATGACTGGCATG
TCTTATATGAAGTCAGAAGTCAGCATATTTCACAACCGGGGGAAGTTTCT
TTCCCAGGGGGACAAGTAGAAAATCAGGAGACACTTCAAGAAGCTGCTAT
CCGAGAAACAGTTGAGGAATTGACTGTTGATGCGTCCCAGATCCAGCTAT
GGGGTGAAATTGATTATTTAGTACAGTCTTCTAGAACTATTCATTGTTTC
GTTGGTCAATTAGTCGTTGATGACTGGAAAAGCATACAGCCTAACGAAGA
AGTTGACAAGGTCTTTATAGTACCTTTACGTCAGCTACTTTTCACTGATC
CTGTCTATTATCGTTTAGAAGCCACTCCTATTGAGACAACGGATTTTCCT
TTTGACCGTATTCGTAATGGGAAATACTACCAATTTAGTCAAGAGTACCG
TAGTATTCCGTTTTATGAAAATCTAGAAGAAACCATATGGGGAATGACTG
CCCAGTTTACTAAGTGTTTAACCGATATTCTAAATGATGAATCAATTGCA
AAGAAAAACCCCTCAGATATTGAAAATTCTAAGGGGAGATAG
>M28_Spy1334 hypothetical protein
ATGTCAACAGTAGCAGTAAGAGTTGATGATCAATTAAAAGATGATGCTAC
AGAACTTTTTCAATCCTTAGGGTTGGATATGAGTACAGCAGTAAAAATGT
TTTTGATTCAGTCTGTTAAAACTCAAAGTATTCCTTTTGAAATAAAAAAT
CAATCATCTGTTTCTGATGAAGAATTTCAAAATTTGGTAGAAACAAAATT
AAAAGGAATACGAGTTAAGGCTAGTGATCCAGAAAGTGTAAATGCGTTTT
TTGGAGATGAAGATTTTTCAGAATATGAGGAATATTTTAAATGA
>M28_Spy1146 hypothetical protein with endo/excinuclease domain
ATGACCACTAAAAAAGCTTATATGTATGTGTTAGAATGTGCAGATAAAAC
CCTCTACACTGGTTATACAACTGATTTGAAAAAGCGTTTAGCTACACATA
ACGCAGGAAAGGGGGCTAAATATACTCGCTACCGGTTACCTGTTTCTTTA
CTTTATTACGAAGTGTTTGATAGCAAAGAGGCTGCGATGAGCGCTGAAGC
ACTCTTTAAAAAACGAAAAACAAGAAGCCAGAAATTGGCCTATATTGCTA
CTCATCAAAAAGAAAAGAAAAATCATTGA
>M28_Spy1633 DNA integration/recombination/invertion protein
ATGATTGAGATTGGAGTTGACCCAGTAAATACAGCCAAAAGGTTAGGACA
TGCTAGTAGTCAAATAACTCTTGATACATACAGTCATGCTACTGCAGTCG
GAGAAGACAAATCAATCAAACAATTTGCTAACTATCTCAAAAATAACTAA
>M28_Spy0163 transposase
ATGAGTCGAAAAGGTAATCCATACGATAATGCACTCATGGAATCCTTTTA
TAAAACATTAAAAAGAGAGCTTGTCAATGATGCTCATTTCGCAACTATTG
AGCAAGCTCAGCTTGAGATTTTTAAATATAGTGAGACTTACTATAACCCT
AAACGTCTGCATTCAGCTTTAGGGTATCTCTCACCTGTAGAATTTGAAAA
AATAGTTACTCATTAG
>M28_Spy0536 transposase
GTGGTAACGGCTTTTCCATGTAATAGCTTTGTACTGGAGCTAGCTGACAA
AGCATTGTCAGCTATCATCCGTCAATCTACCTCTAAACGTATCTCTGACA
AGCGTGGGATCTACTTAGTGGAAAAACTTGTCTCATTAGCCAAGCAGTCT
TATTTTACTGTTACGAAAACCTCTCCGATGATAGAAGAGGTTCGCTACTA
TGCCAAAGAATTACTTAGACTTTCTGAACGTCGTCAAGCTATTTTTGATA
AGATGGTGGCGTTGGCTCAACCTTTACCAGAAGACAAGATTCTACGCTCT
ATTCCAAGTATCGCAGAAACAACTGCAACAAGTATTATTGGCGAACTCGG
TGCTATTCGTCGTTTTCAATCTGCTAATCAAATTAATGCTTTCATTGGGA
TTGACTTTAGACATTATGAGTCTGGCAACTATCTAGCTCAAGAGCACATT
ACCAAACGTGGGAATCCTTATGCTTCAAAGATTCTTTTCAAGTGTATCCA
TGACATTGCTTTTGCTAGTCATACCAATCCTTGTCATATCGCAGACTTCT
ATGAGAAACGAAAAAGGCAATCGCAAACAGCTTCAACCAAGCCACATACG
ATTGCCTCTAGACATTGCCTTGTCAGACAATGCTTTACCTCATAA
>M28_Spy1266 phage protein
GTGGTTAAATTTACAATACCGATTGAGCCAAAACCTCAAAAGCGCCCACG
CTTTAGCAGATGGAGCGGGGCTTACGAAGACAAAGATATGATGGCTTGGA
GGAAACAAGTCACAGACTATGTTAAAAACAATTACGAAGGGCCTTATTTT
GACGACGGTTTAAAAGTTGATGTTACTTTTTATCTAAAAGCACCAGAATT
GGTGTCTAAAAAGCCGTCAGAGCGTGCCAGAGATAAGACTAAACAAAAGT
ATCAGGATTATATAAACGAGCTCTTATATGTGCCGAAAAAACCAGATTTA
GACAATCTTGAAAAAGCAGTCTATGACAGCATATCAAAATCAGAGGTTGT
GTGGACAGATGACAACATCATTGTCGAGCACACTACGCGAAAGCTGTATA
GTCCAAATCCTAGAATCGAGGTAAAAATAAACGAATTATGA
>M28_Spy0444 RelB-domain protein
ATGTCGTTACAAAAAAGGAGGATAACCATGGCTAAAACGGGAACTTTGAA
TTTACGAGTTGATGATTCAGTAAAAAGTGCGGCAGATGATATTTTGAAAC
GCTTAGGTATTCCTATGTCAACTGCGATTGATATGTTTTTGAATCAGATT
ATTTTGACTGGGGGTATCCCATTTGATGTTTCTCTACCTGAAGCGCCTCA
ACGAGTTAATGTTGATTACATGAGTCAGGAGAAGTTTTATGATAAGCTTA
TCTTCAGCTTTGAAGATGCGAAAACTGGCAACCGCAAGGATGTCAGAGAA
TTTCTATCTCAATTGAAGGAAAATGCTTAA
>M28_Spy1871 phosphohydrolase
TTGATTGTTAGAAATGGTAAGAATTTTTTAACTAGAGATGCAGCTGACCA
ATATTACACCATTGGTGGTACAAGTTTGGTAGGTGAAAAAACGCATGAAA
CTGTTTTACGTGAAACCTTAGAGGAAGTTGGTATTCGAACTAAGGTTAAT
CAACTGGCTTTTGTGGTTGAGAATCATTTTGATATCGATGATGTTTTCTG
GCATAATATTGAATTTCATTATTTGGTAAGCCCCTTAGAAGACCCTAAAC
TAGAAATGATAGAGAATGCAAGCGACAGGTTTGTGAATGGATTCCAATCA
ATCAACTGGATCAAATGA
>M28_Spy1079 site-specific recombinase
ATGTCAAAAGAAAAAATAAAAGTATACCTCTATACACGAGTATCTACGTC
AATACAGATAGAGGGGTATTCGTTAGAGGCACAAAAATCACGAATGAAAG
CTTTTGCTATTTACAACGATTATGAAATTGTCGGAGAGTATGAAGATGCC
GGGAAGTCTGGCAAGTCTATTGAAGGTAGAAAACAGTTCAATCGAATGAT
GGAAGATATAAAATCTGGAAAAGATGGAGTGTCTTTTGTTCTTGTGTTTA
AGTTATCAAGATTTGCAAGAAATGCCGCTGATGTTCTTTCTACACTTCAG
ATAATGCAGGATTATGGAGTTAATCTTATCTGCGTTGAAGATGGCATTGA
TTCATCTAAAGATGCTGGGAAACTAATGATTTCTGTTTTATCAGCTGTGG
CTGAAATAGAAAGAGAAAACATCCGTATTCAAACAATGGAAGGTCGCATT
CAAAAAGCAAGGGAAGGAAAATGGAATGGTGGCTTTGCTCCGTATGGATA
TAAACTTGAAGATGGCAAGCTGTTTATAAATGAGGAAGAGGCAGTTGCCA
TAAGAACGATTTTCGACCAGTATGTAAATACTACGATAGGAGCCAATGGG
CTATCTAAATACTTAGAGAATCATGGAATTAGAAAAATCCCAAGACAGAA
TGGAAAGAATCCTTTGTTTGATGCAGGACTTATAAGAAAGATATTAAAGA
ATCCTGTATATAATGGGAAAATAGCATTTGGAAGAAGAACTTTAGAAAAA
GTTCATGGTACAAGAAATGAATATAAGCAGGTTGAACAAGATGAATATCT
AATATCTGAAGGTATACATGAAGCTATAGTTTCCGACGAAGTTTGGCAAG
CTGCTCAGGTTAAGCTAAAATCTCAAGCAAAGAAATATGAGCATGTGAAT
AAAGGAAAAGATACACGCACGCACTTGCTTTCTGGAATTGTAAAATGCCC
TATATGTGGAGCGGGAATGTTTGGAAACAAGTGTACCAAGAAAAAGAAAG
ATGGCACAAAGTATAAAGATTTTTATTACTATGGTTGTAAACATAGGCAG
ATGATAAGAGGTCATAAGTGTACATTCCGTAAGCAAATTAGAGAAGAATT
GTTAGATGATGCTGTTGCAGAGGTGATTGTCAAGATTGTAAGTAATCCGA
AATTTGCTTCTATGATGCAAGAAAAAATCAACATGAAGGTGGACACCTCT
GAAATAGAAAAAGAAATAGATAATTACCAAAAGGAATTGAGGAAGAGTCA
TTCTACAAAGTTTAAGATAATTGAGGAAATAGATAATTTAGATGTTGAAG
ATAAGCACTATAAGAGAAGGAAACAGGATTTAGATGATAGACTATATCGT
ATGTATGACAAAATAGATGAATTAGAATCATCACTAATTGATGCGAAAGC
AAAGAAACAGACTATTGAAGCTGAAAAACTCACAGGAGATAACATATATA
AGGTTCTGATCTATTTTGATAAACTCTATAAAGTCATGAATGATGTAGAG
CGTAGACAGTTAATTACAGCTTTGATTTCTGAAATTCAAGTTTATGAAGA
AAAACAACCTAACGGACAATGGCTAAAATCAATTACTTTCAAGCTCCCAA
TTATAGACGATGACTTGAATATAAGTTTGGATAATAATGAACAAGTTGAG
TGTGTAAGTTTACTTGAGAAACGGAGTTAA
>M28_Spy0339 transposase
GTGTTACTTCTGCTCAATAACATCTTTAAAACGGCTTTGAACACCCTGAT
GCGATACAAAAACTATGTCACTAATGTCATTGAGCTTCCTTGTTCAAACG
CCAAACTAGAAGCAACCAATAAACTCATCAAACACATCAAACGCAATGCT
TTTGGCTTTCGGAACTTTGATAACTTTAAAAAACGCATTTACCTCGCTTT
GAACATAACAAAAGAGAAGACGAGTCTCGTCTCCTCACGTGTTTAG
>M28_Spy1105 DNA polymerase III subunit gamma/tau
ATGTATCAAGCTCTTTATCGGAAATACCGGAGCCAAACGTTTGACGAAAT
GGTGGGACAATCGGTTATTTCCACAACTTTAAAGCAGGCAGTTGAATCTG
GCAAGATTAGCCATGCTTATCTTTTTTCAGGTCCTAGAGGGACTGGGAAA
ACAAGTGCGGCAAAGATTTTTGCAAAGGCCATGAATTGTCCTAACCAAGT
CGATGGTGAACCCTGTAATCAATGCGATATTTGCCGAGATATCACGAATG
GAAGCTTGGAAGATGTGATTGAAATTGATGCTGCCTCGAATAATGGTGTT
GATGAAATTCGTGACATTCGAGACAAATCAACCTATGCGCCAAGTCGTGC
GACTTATAAGGTTTATATTATTGATGAGGTTCACATGTTATCAACAGGGG
CTTTTAATGCGCTTTTGAAAACTTTGGAAGAACCGACAGAAAATGTTGTC
TTTATCTTGGCAACAACGGAATTGCATAAAATTCCAGCCACTATTTTATC
TCGTGTGCAACGCTTTGAATTCAAAGCTATTAAGCAAAAAGCTATTCGAG
AGCATTTAGCCTGGGTTTTGGACAAAGAAGGTATTGCCTATGAGGTGGAT
GCTTTAAATCTCATTGCAAGGCGAGCAGAAGGAGGCATGCGTGATGCTTT
ATCTATTTTAGATCAGGCTTTGAGCTTGTCACCAGATAATCAGGTCACCA
TTGCAATTGCCGAAGAAATTACAGGTTCTATTTCCATGCTTGCTCTGGGT
GACTATGTTCGATATGTCTCCCAAGAACAGGCTACGCAAGCTCTGGCAGC
CTTAGAGACCATTTATGATAGTGGGAAGAGCATGAGCCGCTTTGCGACAG
ATTTATTGACCTATCTGCGTGATTTATTGGTGGTTAAAGCTGGCGGTGAC
AATCAGCGTCAGTCAGCTGTTTTTGATACCAATTTGTCTCTCTCGATAGA
TCGTATATTCCAAATGATAACAGTTGTTACTAGTCATCTCCCTGAAATCA
AAAAGGGAACCCATCCTCGGATTTATGCCGAAATGATGACTATTCAGCTA
GCTAAAGAAGAAGGAGTAGCGTTACCATCAGGTTTGTCATCAGATGTGAC
GACTGAAGTTGAGGGACTTAAACGTGAACTTAATCAGCTTAAGCAAGCCT
TGGCACAATTGCAAGCCAGTCCCAGTCCCTCACATGCTCCTGTAAAACCA
GCACAGGCTAAACCGAAACTAACCACTTACAAGATTGATCGGGTGAAAAT
ACTGAAAATCATGGAAGAAACGGTTCAAGATAGTCAGCAATCACGCCAAT
ACTTGGATGCCCTAAAAACAGCTTGGAATGAAATTTTAGACAGTATCTCA
GCTCAAGATAGAGCCTTACTAATGGGATCAGAGCCTGTTCTGGCCAATAG
TGAGAATGCTATTTTAGCTTTTGAAGCTGCTTTTAATGCTGAGCAAGCAA
TGAAGCGTACTGATTTGAATGCGATATTCGGCAACATTATGAGCAAAGCA
GCAGGCTTCTCACCTAATATTTTGGCAGTCCCTAAAGCTGATTTTCATCA
CATTCGTTCTGAGTTTGCCTTACAATTGAAAACTCAAAAGGCTTCTGACC
CTACAGAAGAGACGATAGAAGAAACCCTTGAGATTCCAGAAGGCTTTGAT
TTTCTAGTTGATAAAATTAATGCCGTTGAGGATTAA
>M28_Spy0793 integrase pseudogene
TTGAAAGTTCATACAACCTTGGAAAAGGATGAAAATGGAAATTGGTATCG
TAAAGACCAAACAAAAACGCCAGCAGGAGAACGTCTTATTGAGTTAGATG
ATGTGACAATAGTAGTATTGGAAAATTGGAGAAGAAATCAAGTAGTCAAT
ACTGACACAGATTTCATTATTTCACGGTTTGGTGAACCATTTTGTAAATC
AACGATTTGTCGAGTTATTAAGCACAAAGCTCAAGAAGTAGGAGTACCAG
TGATAACGGGAAAAGGCTTGCGACATAGTCATGCTTCCTATCTTATTAAT
GTTTTGAAAAAAGACATTCTGTACGTTGCAAAGTGTATGGGACATGCTGA
TAAGTCTACAACTTTGAATACATATAGTCACTGA
>M28_Spy1632 DNA integration/recombination/invertion protein
TTGCCAGTCATGGGAGAATTGCCCATTAACAAAACCTCCCCTTTAGACTG
CCAGAACTTCATCACCGATAAAGCAAAGACCTTTAAGAATATCAAGCAAA
TCAAGTCCTACACTGAAAAGATCTTTGATTTTGCCATCAAGATGAAACTG
CTCAAGCATAACCCTATGGCTGAAATCATTATGCCAAAGCGGAAAAAGAC
ACGAATAGAAAACTATTGGACGGTTCAAGAACTTCAGGAGTTTTTAGCCA
TAGTACTTCAGAAAGAGCCTTACAAGCACTACGCACTATTTCGGCTACTA
GCTTATAGCGGCCTTAAGGAAAGGCGAGCTATGCGCTCTTAA
>M28_Spy1083 nickase
TTGTCATATAATGACCATAATGCGACCAATAAACGAAAAAGGAGAGTTCT
TAGCAAGTCAAAAAAAGAATATATCCTAGATGAAAAAGGAGAAAAGATTT
TAAACAAAAATGGAAAACCTAAAACAAGAAAAGCAGAACTAACAATCTGG
AATGATAAGGGCAATGTAGAAAAATGGAGAGAAAATTTTTCAGACCTTTG
CAATGAATATCTAGCAAAAAACAAGATAGAAAAAAGAGTAGACCATAGGA
GTTTTAAAAGACAAAATTCTGATTATTTACCGACAATCCATTTAGGATCA
GCAGCAAGTGCAATGGAAAGAAAGGGAATAGAAACTGACAAAGGAAACTA
TAATAGAGAAATAAGAAAATATAACGACCTTGTAAAGACAATAAAAGAAG
AGATAAAAACATTAAAGGGTTGGATAGGAAATCTATTAGATAACCTATCT
ACTGCTTATGAAAAATTTAAGGATATAGAAAGAGATAAGGTAATAGACAA
CCCTAAACTTTTCAATCTAACAAATTATCTATTAACTTATTCAGAAATTC
AAAAAGAAAAAAGTAAATATCTAAAAGGATATGCCAAAACTAATAAAGAA
AAATATGACTTCAAAAAGCTAACAAGTGCATATAGTTATTTAAGAAAAAA
TAACATAGAAACCATAGGTCAGTTACAAACAAAAATAGAAACATTAAAGT
CTAATAGTTACAAACTAAATAAAAAAGCAAAGACAATCCATAAAGAAATG
GAAGATGTAGAAAAGAAAATTCTATACTATGAAATCTACAAAGCCAAAAA
AGGAGTTTATGAAGAATATCAAAAGAAAAATATATTCACAAAAGACACCT
TTTATAATAAACATAAGAAAGACATAGACCAATATAAAGTAGTAAGTGGG
AAATTAAAAAAACTCCTATCAGATAAGGAAAAACTAAGTCCTAAAAAATG
GAATGAAGAAAAAAATCTTTTAATGGTAAATCTTGAAGAAATAAATAAAG
AAAAAGACAAGATAAAAGATGAATACCAGGAAATTAATCATATAAAATAT
TCAGTAGATTTTGTAAATAAAGAACTTGGCATAGACTTATCCATAGAAAT
AGATAAGCTAATAAAACAAGGAGAAAAACCAAGTGTAATAGCACAGATTA
AAAAATTCCAAGACCAAGTCAATAAAGATAATGAATACAGAGAAAGTATG
AAAAACAAGAAAATGGATCAAGAAAGATAA
>M28_Spy1684 ATPase, AAA family
ATGCCTGATCATTTAGCGCTCAGAATGCGCCCCAAAACCATTTCAGAGGT
CATCGGACAAAAACACCTTGTTGGCGAAGGCAAAATCATCCGTCGCATGG
TGGAAGCAAATAGACTATCGTCCATGATCCTCTATGGCCCTCCAGGAATC
GGTAAAACTTCCATTGCTTCTGCTATTGCTGGTACTACTAGATATGCCTT
TCGGACCTTTAATGCCACCATTGACAGCAAAAAACGTCTCCAAGAAATTG
CGGAAGAAGCTAAATTTTCTGGTGGCTTGGTATTATTACTAGACGAGATT
CATCGCCTTGACAAGACAAAACAAGATTTTCTTTTACCTTTACTTGAGAA
TGGCACCATTATCATGATTGGCGCAACCACTGAGAACCCCTTCTTTTCAG
TGACACCCGCTATCAGAAGCAGGGTCCAGATTTTTGAATTGGAACCACTT
TCTAACGAGGATATTAAAACAGCCATTCAGCTAGCAATTTCCGACAAAGA
ACGGGGATTTCCTTTTTTAGTGACAATTGATGATGAGGCGCTAGATTTCA
TTGTTACCGCCACAAATGGAGACCTACGATCTGCTTATAATTCCTTGGAT
CTAGCAGTCATGTCTACTTCTCCTAATGAAGATAGTAGCCGTCATATTAG
TCTAGAGACAATGGAAAATAGTCTGCAGCGTAGTTATATTACCATGGATA
AAAACGGGGACGGGCATTATGATGTTTTATCTGCCTTACAAAAATCCATT
AGAGGTTCTGATGTCAATGCTAGCCTGCACTACGCCGCTCGTTTAGTAGA
AGCTGGAGACTTGCCTAGTTTAGCAAGACGATTGACCATTATTGCTTACG
AAGATATTGGCTTAGCCAACCCTGACGCCCAAGTTCATACCGTCACCGCA
CTAGATGCCGCTCAACGCATTGGTTTTCCAGAAGCTCGTATTCTTATCGC
TAACGTGGTCATTGATTTGGCTCTATCACCTAAATCCAATTCAGCTTATT
TAGCTATGGATGCAGCTTTAGCTGATTTGAGAACATCAGGTAACCTCCCC
ATTCCAAGGCATCTTAGAGACGGGCATTATGCTGGCAGTAAGGACCTAGG
CAATGCCAAAGATTACCTCTACCCACACGCCTACCCTGAAAAATGGGTCA
AACAACAATACCTACCAGATAAATTAGTAGGACATCATTATTTTGAAGCC
AATGAAACCGGTAAATACGAACGCGCACTTGGTTCAAATAAAGAGCGTAT
TGATAAGCTCTCAGACTGA
>M28_Spy0091 adenine-specific methyltransferase
GTGACACTTCTTTTCATTTCAAGTGTAATTTGGTATGATAAGGTTATGAC
TTTTGAAAAAATTGAAGAAGCTTATCAGCTGCTCTTAGAGAACTGTCAAC
TAATTGAAAATGATCTAAAAACACATATATACGATGCCATTGTTGAACAA
AACTCCTTTTATTTAGGGGCTGAGGGAGCTAGTCCTCAAGTTGCTCAAAA
TAGTGATAAACTGAAAGCCTTGTGCCTGACAAAAGAAGAATGGCGTAAGG
CCTACCAGTTTCTTTTTATTAAGGCAGCTCAGACGGAGCAACTCCAAGCC
AACCATCAGTTCACACCAGATGCTATTGGCTTCATTCTGCTGTATCTTTT
GGAACAATTGAGTGATAAAGATAGCTTAGAGGTACTTGAGATTGGAAGTG
GAACAGGGAACCTAGCCCAAACCCTTCTCAACAACACGAGCAAGAGCCTT
GATTATGTAGGGATTGAACTTGATGATCTCTTGATTGATCTGTCAGCCAG
TATTGCTGAGATAATGGATTCTTCAGCTCATTTTATTCAAGAAGATGCGG
TAAGGCCTCAATTACTAAAAGAAAGTGACATTGTCATCAGTGACTTACCA
GTTGGTTATTATCCTAACGATGATATTGCCAAACGGTACAAGGTGGCTAG
TTCAGATAAGCATACCTATGCCCATCATTTATTAATGGAACAGTCTTTAA
AATACTTGAAAAAAGACGGTTTTGCGATTTTTCTGGCACCAGTCAATTTA
TTGACGAGCCCTCAGAGCCAGTTATTGAAACAGTGGTTAAAAGATTATGC
TCAGGTGGTGACCTTGATTACGCTACCAGATTCTATTTTTGGTCATCCCT
CAAATGCCAAGTCCATTATTGTCTTACAAAAACAAACAGACCACCCAATG
GAAACCTTTGTCTATCCAATTCGGGATTTGAAGCTTGCAGAGAATATTCA
TGATTTTATGGAAAATTTCAAAAAATGGAAACTGAGTAATGTCAATTAA
>M28_Spy1290 hypothetical protein
ATGAAAAAGTTGCTAAATACCTTGTATTTGACGCAAGAAGATTTTTATGT
CACTAAAGAGGGCGATAACATTGTTATCAAGCAAGAAGGTAAGGTTCTCA
AACGGTTTCCGTTTCGGATTATTGACGGTATTGTCTGTTTTTCTTATTTG
GGTGTGTCGCCTGCTTTGGTGAAGTTATGTACGGAGAATCAGATTAATTT
ATCGTTTCATACACCACAAGGGCGTTTTTGTGGTCGCTATATTGGTTCAA
CCAATGGGAATGTGTTGTTGCGTAGAGAACATTATCGTTTATCTGATCGT
GAGGAATCTTTGGAATACGCAAAGCGGTTTATTTTGGCTAAAATTTCCAA
CTCAAGGAAATACTTGCTACGCTTTAAACGAGATCATCGTCAACAGATTG
ATACCAAGCTTTTTGAGGCTGTTAATGACGAATTGATATGGGCTTTAGAG
ATGGTTCAGGCAGCAGATAATAAAGACTCTTTAAGAGGGATTGAAGGCCA
AGCTGCTAATCAGTATTTTCGCATATTTAATGACCTGGTGTTGACGGACA
AAAAAACGTTTTACTTCCAAGGTCGGAGTAAACGACCACCCTTAGATTGT
GTTAATGCCCTCTTGTCTTTTGGTTACAGTTTACTGACCTTTGAATGTCA
ATCTGCCTTGGAAGCTGTCGGATTAGACAGTTACGTTGGTTTCTTTCACA
CGGATCGTCCTGGGTGTGCTAGTTTAGCGCTTGATTTAGTTGAAGAGTTC
CGCTCATATATTGTAGATCGTTTTGTCTTTTCATTAATTAATAAAGGACA
ACTTCAGAAAAAACACTTTGAGGTTAAAGAAAATGGTAGTATTTTAATGA
CGGAAAATGGCAGAGCTATTTTTATTGATTTGTGGCAGAAGCGTAAGCAT
ACTGAGGTAGAACATCCTTTTACAAAAGAGAAAGTAAAACTTATGTTATT
ACCCTATGTACAAGCGCAGCTTTTAGCTAAGGCCATACGAGGAGATTTAG
AAAGCTATCCACCTTTTATGGTTTAG
>M28_Spy0449 transposase
GTGTTACAATCTGTTTTAAAAGACACAAAAACGAAAGGACAACCTATGTC
AACAGTTAAACGCTACGATGAAGAATTCAAACAATCTCTTGTCAACCTTT
ATCAAACTGGAAAAACTCAGTCTGAACTCTGTAAAGACTATGGGGTATCC
GCTTCTGCGCTTGCAAAATGGATCAAACAGTATTCTCAAGTCAAACTCGA
AGATAATTCTGTACTTACTGCCAAGCAAATACAAGAGCTACAAAAACGTA
ATGCGCAGCTTGAAGAGGAGAACCTTATCCTAAAAAAAGCAAGTGCCATA
TTCATGCAAAACTTAAAGTAA
>M28_Spy1086 hypothetical protein
ATGAAAAAATTAGAACAAATCAGAAAAGAATCAAAAGAAATAAAAAATAA
AATTGACGATACAGAAGAAAGATTAAGGCAACTAAAAAATCAAGAAAAAA
AGATATTAAAACAAGACATAGAAAAAAGAAGAAAAGAAAGAACACATAGG
CTCATAACAAGAGGAGCAATCTTAGAAAGCCTTATAGAAAATGCAGAAGA
ACTAACAGATGAAGAAATAAAAATCCTACTAGAAGAAGCAATAAAGACAA
AAGAATTTAAAGAAACACTAAAACTAATGAGAGAAAATTAA
>M28_Spy1291 hypothetical protein
ATGGTCTATGCCGAAGATGATTATTTAATGCTATCAGGTATTCAGCATTT
CCAATTTTGTAAACGTCAATGGGCGTTGATCCATATTGAGCAACAATGGC
TTGATAATGAAGCGACAGCGCATGGACAGGTTTTACATACTAAAGCAGAT
AACCCTTACATTAAAGAAAAACGAAAAGAGCTTTTGGTCTCACGTGCTAT
GCCCATTTCTTCTGCAGAACTTGGACTTTCAGGAATTATGGATGTTGTGG
AATTTTATAAAGATGATCAAGGTGTGTCTTTGAGGGGAAAACGTGGGAAA
TGGTTACCAAAAGTTGTGGAATACAAGCGCGGAAAACCTAAAAAAGATAC
CAGAGATATTGTCCAGTTGGTGGCTCAGACCATGTGTTTAGAAGAAACGC
TAGACTGCGACATTAACGAAGGTTGTCTTTATTACCATAGTGTCAATCAA
AGAGTGATTGTTCCTATGACATCAGCTTTGCGTCAAGAAGTGAAGGAATT
AGCCGCAGAGATGCAAGAGGTTTATCAGAGTCAAATGCTACCTAAAGCAG
CTTATTTTAAAAACTGTCAGCTTTGTTCTTTAGTCGATATTTGTAAGCCC
AGGTTGAGTAAAAAAACAAGGAGTGTGTCGCGTTACATCAATGAGGCTAT
GACCAGTGAGGAGATGGACCTATGA
>M28_Spy0717 mutator protein T
ATGACTCAATTAGCAACCATTTGTTACATTGATAATGGCGATTCTTTGCT
ATTATTACACCGCAATAAAAAAGAAAATGATGTCCACAAAGGCAAGTGGA
TTTCAGTTGGGGGTAAGCTCGAGGCTGGTGAGACCCCAGATGAGTGTGCC
CGTCGTGAGATTTTAGAGGAAACCCATTTGACTGTTACAGAGATGGCCTT
TAAAGGAATCATTACTTTTCCAGAATTTACCCCTGGTCATGACTGGTATA
CCTATGTTTTTAAAGTAACAGGATTTGAAGGAGACCTCATTTCCGATGAA
GAGTCACGAGAAGGAACCTTGGAATGGGTACCTTACGATCAAGTGTTGGA
AAAGCCAACTTGGGAAGGTGATTATGACATTTTTAAATGGATTTTAGAAG
ACCGTCCTTTTTTCTCTGCCAAATTTACCTATGACCAAAACAACCAACTC
ATGGATAAATCTGTGACCTTTTATTGA
>M28_Spy1285 DNA integration/recombination/invertion protein
GTGATGCCAATATCCTATCTCAAAATCAGCACTCCCCAGCGCAAAGAGAG
AGGAAAAACAATGATTGAAAAATACACTAAAAAAGATGGCACAACTGCCT
ATCGCTTAAGAGCATACCTTGGGGTTGATCCCGTGACTGGTAAACAAGTC
AGGACAACTAGGCAAGGTTTTAAAACAGAAAGAGAAGCTAAAAGAGCCGA
GGTAAAACTTATTGATGATTTCCAGCGTCAAGGCGCTTGGAAAAGTAATG
ATAAAACTACATTTGACGATGTAGCTAAACTGTGGTTTGAGCAGTACCAA
AATACAGTCAAACCGTCAACATTTCTGGTTAACCAAAATTACTATAAAAC
AATTTTAAAGCCACATTTAGGGCAACTGCAAATGACGAAGATAACTGTCA
TGATTTGTCAAAAATTTGTGAATTGCCTGTCTCGATATAGCGGATATACG
CTTTATCTAAGTCTAGCAAACAGAATTTTTAAATTTGCTGTCAACTTAGG
TATTATTGATAACAACCCAATGAACAAGACGTTGAGATCAAAGTGCACTT
ACAAAAACGTGGATACACTCACCAAAAAATATTACACAAAAGAGGAATTG
AATACTTTCTTGAGGCTTGTGGAAGCTGAAGAAACTCTAGAGATGCGTCT
GATTTATAGATTGCTGAGTTATGGCGGTTTTAGGATTGGTGAATTAATAG
CTTTAAAAGATACCGACTTTGATTTCCGCAACAATACTATCAGCATTACA
AAAACCATTGCTTATACAAAAGAAGGATGGGCTGTACAATCTCCTAAAAC
CAAAAAAAGCAATCGCACTATATCAATGGACGCTGAGACCATGTCGTTAG
CCAAATTATATATTAAGCAAAGTATCAAACCTTTACACGGATCGTTTAAA
TTGTTTAATTTTGCTAGCGACACCGTGAGAAAAAGACTGGACAGATTTAT
ATTGAAGCATGGATTAAAAAGGATTACTCCCCACGGGTTTAGACATACCC
ACGCTTCGTTGTTGTTTGAGGCTGGGATTCCCGCTAAGATTGCACAAGAG
CGGTTAGGCCACGCTAAAATAGCAATCACGATGGATTTATATACTCACTT
GTCCAAAAAATCAAAGGATAATGTTGCTGACAAATTGGCCGAACTCGTCG
CTATTTAA
>M28_Spy0377 phosphohydrolase
TTGGCTATAATGAGAAAGAATACTAACATAGTAAAGCGAGATCATATGCC
ACAAGACTACATTTCTTATATCCGCTCCAAAGTTGGGCATGATAAGATTA
TTCTTAACTTTGCTGGTGGGATTTTGACCAATGATGACGGCAAGGTGCTG
ATGCAGTTGCGTGGTGATAAGAAAACCTGGGCTATTCCTGGTGGTACTAT
GGAACTGGGTGAGAGCTCTTTAGAGACTTGCAAACGTGAGTTCTTAGAGG
AAACCGGAATTGAGGTTGAAGCTGTTCGCTTACTGAATGTTTACACTCAT
TTTGAGGAAGTTTATCCCAACGGTGATGCTGTTCAGACTATTGTCTTTAT
CTATGAACTAACGGCTGTTTCTGATATGGCTATTGATAACTTTCATAATG
AGGAAACGCTCAAGTTACAGTTTTTCTCTCATGAGGAGATAGCAGAGTTA
GAGAGTGTCTCAGCCAAACATCGCCTGATGTTAGAGGAATATTTTAGTGA
TAGCTTTGCTATGGGGCATTAA
>M28_Spy0998 phage terminase small subunit
TTGGGGTCATTGGCATATTGCTTACCTCACTTTCTATACTTATATTATAC
ACATAAACAATGTAGATGTCAATGCAAAATACGCATAAAATACACAAAAG
GCGGTGATGGAAAATTGAGTAAATTAACACTAAAACAGAAGCGGTTTGCA
GATGAATACATCATCTCAGGGAATGCTATGGAGTCAGCTATAAAGGCTGG
GTATAGCCATAATTATTCCAAAGCACAGTCGCACAAGCTATTGGAAAATG
TTGGAATTAAAGAGTATCTTGATGAACGATTTGAAAAAATGGATTCCAAG
ACAATAGCAGACCAAAAAGAGGTATTGCAATATCTTTCTTCGGTCATGAG
AGGTGAGCAGCAAGAAAAAACACTCATCAGCATTGGAGAGCTTGGGCAAG
AAATAGTTGATATTGATGTAGGAGCAAAAGACAGGTTGAAAGCAGCTGAA
TTGCTTGGTAAGCGGTACAGATTGTTTACCGATAAGATAGAGGCTGAGGT
GCAAGGAACGGTGGTGTTTGTCAATGAAGACGACATACCAGACTAA
>M28_Spy0352 phosphohydrolase
ATGAAATTTGAAGAAAAAACGCTTAAGAGACAAACAGTTTTTGATGGTCA
TATTTTTAAAGTTGTTGTGGATGATGTTGAACTTCCCAACAATCTGGGGC
AATCCAAGCGAGAATTAATTTTTCATCGTGGTGCCGTTGCTGTTTTGGCT
ATTACTCCTGAACGTAAGATTCTCCTTGTCAAACAATACCGTAAGGCTAT
TGAACGTGTCTCATACGAGATCCCAGCGGGTAAGCTAGAGATTGGTGAGG
AAGGCTCAAAGCTAAAAGCTGCTGCACGTGAGCTAGAAGAAGAAACAGCC
TATACGGGGACATTGACGTTTTTGTATGAATTTTATACAGCGATTGGTTT
TTGCAACGAAAAAATCACACTTTTCTTAGCGACAGACCTAACACAAGTTG
CCAATCCCAAACCTCAAGACGACGATGAAGTTATCGAGGTCTTAGAGTTG
ACATATCAAGAGTGCATGGACTTAGTCGCTCAAGGTAAACTTGCTGACGC
TAAAACGTTGATTGCTTTGCAATACTATGCCTTACATTTTGGAGGTGAGC
AGTGA
>M28_Spy0170 transposase
TTGGGGTGCTATTTTTTTATGAAATTTAATCAAGAAACGAAAGTTAAGAT
TTATGAGTTACGGCAAATGGGAGAGTCCATTAAATCCATATCAAAAAAGT
TTGATATGGCAGAATCCGATCTCAAATATATGATTCGCTTGATTGATAGG
TATGGGGTAACCATTGTTCAAAAATGTAAGAATAATTATTATTCTCCAGA
ACTGAAGCAAGAGATAATAAATAAAGTCCTGATTGACGGCCAATCTCAGA
AACAAACATCCTTAGATTATGCTTTACTAACTTCTAGTATGCTCTCAAGG
TGGATAGCGCAATACAAGAAAAACGGTTATACTATTCTTGAAAAACCAAG
AGGGGGACCGAGTAAGATGGGGCGTAAACGTAAGAAAAATTTGGAAGAGA
TGACAGAGGTTGAACGTCTTCAGAAGGAATTAGAATACCCTAGAGCGGAG
AATGCTGTGCTAAAAAAGCTGAGAGAATACCGCTTGAGGGACGAAGTAAA
GCTCAAAGAGCAACAGAAATCATTCAAGCATTAA
>M28_Spy1321 transcriptional regulator, Cro/CI family
ATGAATCCAATGTATTTAAAGAAATTTAGGAAGAAATCAGGCTTAAAGCA
GAAAGAATTTGCAAAATGTATAGGTATTAGTCAAGCTATGTTATCTCAAT
ATGAATCTGGTAAGAAAAAATTATCTCTTGAAAAATTTCAAGAAATGAAA
ACACATTTTGGTTATTTGACTGATAATGATAGTTCAAGATTACAAGTGAC
AATTGACTATGTCAGGATTACGTTAAAAAGCGTTAGAGATTTGGAATTTT
TTTGTCGGAATTTTTTACATTGTCGATTTAAAGAATTTTCATCAGTTGAA
TCTAAGTTGATGAATTATAACCATATTTGGAAACGTGGAGATATTTGGAT
ATTTGATTATGCAGATAAACATGATACAGGAAACTATCAAATAACATTAC
AGCTATCTGGTCAAGGATGTAGACAATTAGAATTACTTATGGAACAAGAA
AATTTTGCTTGGTTAGATTGGCTAATCTACTTAAGACGTTCTTATCGAGA
TGAAATGAATGTTACACGTTTTGACTTAGCTATTGATGAATTGTATCTGG
GTAAGGATAGAGAAAATGAACACTTTCTTTTATCGGATATGATTGCCAAA
TATTATCATCATGAGTTAGCTTTTGAAAGTTTGCGAACATGGAATTATAT
TGGTGGTGGTGCTTTAAATTTTAATGATATGGAAGAAATTGAACAGAATC
GTCAAGGTATTTCGTTATATTTTGGTAGTCGACAGTCTGAAATGTATTTT
AACTTTTATGAGAAAAGGTATGAATTAGCTAAATTAGAGGGCATCTCTGT
TGAAGAATCTTTAGAAATATTTGAAATATGGAATCGGTATGAAATCCGAT
TATCTCAATCTAAGGCGAATGCAGTGGTAGATGAATTTATTTCTGGTATT
CCATTAGGAGAAATTGCGAGAGGATTGATTAATAGTAAAATTCAAGTTTA
TGATGGAAAAAATAAGTATGGTGCATTTATGGCTGATCAAAAGTGGCAGA
TGATGTTTGGAGGTGTTGAACCTCTAACATTTGTCACGAGACCAGAATCT
TATAATATTGAACGTACTATTCGCTGGTTGATTCATCAAGTATCTGATTC
TCTAGCTATGGTTAGTGAATATGACAGTATGATTGATGGGGATAATCTAC
AAATGATCATTAATTCTGGTGAAGTGAATGAACGAGGTGAAAAAATATTA
GAAACTATTCGATATAATCTAGGTTTAGATAAGGGGGCGTAG
>M28_Spy1071 transposase
TTGGGGTGCTATTTTTTTATGAAATTTAATCAAGAAACGAAAGTTAAGAT
TTATGAGTTACGGCAAATGGGAGAGTCCATTAAATCCATATCAAAAAAGT
TTGATATGGCAGAATCCGATCTCAAATATATGATTCGCTTGATTGATAGG
TATGGGGTAACCATTGTTCAAAAATGTAAGAATAATTATTATTCTCCAGA
ACTGAAGCAAGAGATAATAAATGAAGTCCTGATTGACGGCCAATCTCAGA
AACAAACATCCTTAGATTATGCTTTACCAACTTCTAGTATGCTCTCAAGG
TGGATAGCGCAATACAAGAAAAACGGTTATACTATTCTTGAAAAACCAAG
AGGGAGACCGAGTAAGATGGGGCGTAAACGTAAGAAAAATTTGGAAGAGA
TGACAGAGGTTGAACGTCTTCAGAAGGAATTAGAATACCTTAGAGCGGAG
AATGCTGTGCTAAAAAAGCTGAGAGAATACCGCTTGAGGGACGAAGTAAA
GCTCAAAGAGCAACAGAAATCATTCAAGCATTAA
>M28_Spy1206 methyltransferase
ATGAGAGTTGTATCAGGTGAATTTGGTGGGCGTCCTTTAAAGACGCTCGA
TGGAAAGATAACACGCCCTACTTCAGACAAAGTTAGAGGTGCGATTTTTA
ATATGATAGGACCTTACTTTAATGGTGGTCGTGTTTTAGATTTGTTTGCA
GGTTCAGGTGGATTAGCCATTGAGGCTGTTTCTCGTGGGATGTCTGCTGC
AGTTTTGGTTGAGAAGAATCGTAAAGCGCAAGCTATTATTCAAGACAATA
TTATAATGACTAAAGCTGAGAATCGGTTTACCTTGTTAAAAATGGAAGCT
GAGCGAGCTATTGATTGCTTGACTGGTCGATTTGACTTAGTCTTTTTAGA
CCCTCCTTATGCCAAAGAAACAATTGTGGCAACTATTGAAGCTTTAGCAG
CTAAAAACTTATTGAGTGAACAGGTTATGGTTGTCTGTGAGACAGATAAA
ACAGTCTTGTTGCCAAAAGAGATTGCAACGTTAGGTATTTGGAAAGAAAA
AATTTATGGAATTAGTAAGGTAACAGTTTATGTTAACTAA
>M28_Spy1277 phage protein
ATGATTATATCAAAAAAAGTCCGACGGCAATCGGACTCTAAAGAATACTA
TTTACTTAGATTATACCACGAAAGGGGTGATAAATCTATGCAATCACAAC
TTACTTACGATTTACTAAAAAAGCAGATAGCAGAAGAGCTTTTTGATGAG
TTTAAGAAACTCATACAGGAAAAAGATTTAGCGAATCAGTGGGTCAATCA
AACAACGCTCGTCAATGAATACGGCTACTCATGGCAAACTATAAAACGCA
TGGAGAGCTATGGCCTTAAATCTTTTAAAAACGGTAAAGACAAAATGTAT
TGTCTTGCTGATGTCAACGAAATCAAACACTTAATGAAACAATAA
>M28_Spy1033 DNA integration/recombination/invertion protein
TTGTACCTATTTTATCAAATTGAAAGATGGTATGCAATGAAAATTAAATC
ATATAAAAAGGAAAATGGTGAAACTGCTTATAAATTTCTTTTGTATGCCG
GTTATGTTAATGGAAAGAGAAAATATATTAGGCGAGAAGGTTTCAAAACT
AAGCAGGCTGCAAGGGAAACCTTAATTAGTTTGCAAGCTGAACTTGATAA
ACCTAAATCAAGTATGACGTTTGGTGTGTTAACTAAACAATGGCTAAACG
AATATGAAAAAACTGTCCAGGGCAGTACCTACTTAAAAACAGAAAGAAAT
ATTAATAAACATATTTTGCCAAAACTTGATAAAGTGAAGATTGGAGACAT
CAACCCACTACTTATCCAGCGGCTTACTGAAGAATGGTGCAACGATTTAA
AATATGGAGGAAAAATTCTTGGGCTTGTTAGGAATATCTTAAATCTAGCT
GTTAGATACGGATATATCAATAACAATCCAGCTTTGCCAATTACACCTCC
AAAAATAAAAAGGAAAAGAAAAATGAATAATAATTTTTATACACTTGATC
AACTTAAACAATTCCTTGAACTAGTTGAAAAAACTGACAACATTGAAAAA
ATAGCCTTGTTTAGATTATTAGCATTTACTGGAATACGAAAAGGGGAGCT
TCTGGCACTAACTTGGGATGATTTGAATGGTAATACTCTATCAATTAATA
AAGCTGTCACACGTACTCAAGTTGGACTAGAAATAGATGTTACGAAGACA
AAATCGAGCGATAGATTAATCAGCTTAGATGATGAAACTTTGGAAATTTT
ACAAGAACTTCATGAAACTTTTCCTACTTCTACTCTTATGTTCCAATCTG
AATCAGGTGGAATTATGACGCCAAGTTTACCACGAAAATGGCTATTGCAA
ATTATCAAAGGGACAGACTTACCACAAATCACAATTCATGGTTTCAGGCA
CACTCATGCAAGCTTACTTTTCGAATCAGGTCTATCCTTGAAACAGGTGC
AACATAGGTTAGGGCATGGAGATTTACAGACAACTATGAACGTATATACT
CACATCACGCAATCGGCAATTGATGACATTGGAACTAAATTCAATCAATT
TGTTACTAACAAGCAACTAGATTGA
>M28_Spy0440 chromosome segregation ATPases
ATGCTTATAGAAATGTGGTCTCCAGTATTTAAGAATCACGGAGAAATTCG
GGAATCAATCTGCTTCCACTATGGGTTAAACGTGATTATGGGGATGGATT
TAGCTGATAACTCTATCGGCAAATCCTCCTCACTATTAGCCATTGATTTC
ATCTTTGGAGGTAATAGCTATCTAAAATCAATTGCGGTTAAAAAATTAGG
TGATCATCCTATCTATTTCTGCTTTCAATTTGAGAAAAAGTTTTATTTTT
CAAGAGATACGGCCAACCCAGATATCATTCTAGTGTGTGACAAGAGCTAC
TCTCCAACCGGTGAAACAATGGACCTAGGAATTTTTCTTAACAAACTTAA
GAAACGATATCATTTAGATTCTCCAGAGCTATCATTCCGATTAGCTATGA
GTGGCTTCTTTAGGATTGCAGGAAAAAGTAATCAAAATACCGATTTCCCT
TTACAAGTTTATTCGAGCCAAAAATCTTCTGAATCTATTACTACTCTCAT
CCAACTGTTTAATTTGTATGATAACATTGCACGATACAAAGAACGTCTGA
AAGATAAGAGCGACCAGTTAACAACTTTTCGTAATGCTCGAAAGTATACC
TTCATCTCCAACCTGGTTGGCGGTAAAAAGCAATTTGAAGCAAATGTCTC
AGAAATAAAAAGATTGGAATATGATTTAGCACATCTCCAAGACACTCATC
AAGATAAAATTGACTCTGATGATATTGAGAAAAATCAACAAAAACTCCAG
CTTAGAAATACTAAGCTGGAGTTAGAAAGCAGTCTTCGGGACAAGCAAAG
ACGTCTTAAGCTATTGGACATCAGTATCGAATTTGGCTTATATCCTACTG
AATCTGACTTAACAGAGCTTCAACAATACTTCCCAGATACTAATCTCAAA
AAATTATATGAAGTTGAAGCTTACCACAAAAAATTGGAAACTATTTTAGA
TTCCGAATTCTCAACTGAACGTGAATCCCTAATAGCTGAGATCGACGAAT
TAGAGAGTCAATTAACAACTCTAAACCAAGAACTTCAAGAACTAGGAAAC
ATCCCAAATCTTTCAAGTGAGTACTTAGAAAGCTACTCTAAACTAACAGC
TACAATCAATGCACTAAAAGAACAAAACGAGGCCTACTTAAAGGAGTCTG
GTCTATCCAAAGAAAAATCAGAAGCGGACGCTGACTTGAAACGCAGTACA
GAAGATATCCTTCTAGATCTAGAAGTAAAAATCAACAGTAAGATGCGTGA
ATTCAATAACATTCTATATCCAGATATTCGCAAAGCTCCTCAAATTAACC
TCAATGCTCACAATAGCTACTCCTTCTATACACCAGATGATGATGGTACA
GGAACTAAGTTTAAAGGGATGATTGTATTCGACTTAGTAATGCTCTACCT
TACTAATCTGCCAGCACTCACACACGATTCATTACTCTTGAGTAATGTTA
GCTACCAAGCGACTGAAGCACTTTTGAAGCTGTATGACCAGTCAAGGTCA
TTGAACAAACAAGTCTTTTTAGCCTTCGATAAAGCCAGCTCTTATTCTCC
AGATGCTAATCAACTCTTGTCAGAAAATACGGTATTGAGACTCTCTAGTA
ACGGAAATGAACTCTACGGTATTTCATGGAACAAAGGAGAAAACTCAGAT
GAGATTTAG
>M28_Spy1143 comEA, ComE operon protein 1
ATGTTAGACGAATTATTAATTAAAGGAAAATCGTTTTTGAGAGAGCGGTA
TTTTCTGCCATACCTAATTAGTCTTTTATTAGGACTTTTTCTAATACTAA
GCTTCAGTTTTTTGTTCTGGGGAAATAGGCAGAGCAAGGCAGCCGTTCCT
GCTTTGAGAGAAATATCGCCTGTGAAACAGCAGGTTAGTGAAGAAAAAAA
GGAAATTCAAGAAGATAGCAGTATTTTAGTGGATTTAAAAGGCGCCGTAC
AAAAAGAGGGAGTTTATAAGCTAACTGCTAGCAGTCGTGTGCGAGATGTC
ATTGAACTAGCTGGAGGCCTAACTTCAGAAGCTGATAAACATGCTATTAA
TTTTGCAGAAAAACTAACTGATGAGCAAGTTGTTTATGTACCTAAACAAG
GAGAAGAGATTTCTGTGCTACCAAGATCATTAGTTTCTGGTAAAAAAGAA
ACTGCCAGCAAGGATCAGTCAAAGGTTCATATTAATAAGGCCAGCTTAGA
AGAACTACAACATATCCCAGGTATTGGTGCTAAAAGAGCTCAGGATATTA
TTGATATGAGAGATAAGTTAGGTGGTTTTAAAGCGTTAGAAGATCTCCGT
CAGGTTTCGGGGATTGGCGAAAAAACGCTCGAGAAATTAAAAGATGACAT
TTTCTTGGACTAA
>M28_Spy1368 comFA, ComF operon protein 1
ATGGAGTCTATTGAAAATAGTTATGGACGATTGTTGCTAGAAAGCCAGTT
ACCAGATTCAGCAAAGCAGCTTGCTCAACCTTTAAAAAGTGTAGTAATAT
CGAGAGGAAAAATGATTTGTCAACGTTGTCACTATCAGCTTGATGAAGAA
GCACGATTGCCAAATGGAGCCTATTATTGCCGATTTTGTCTTGTCTTTGG
ACGAAATCAATCAGATAAATTGCTCTATGCTATCCCACCTATGCATTTTC
CAAAAGGTAATTATCTGGTTTGGAGCGGTCAACTAACTGCTTATCAAGAG
ATGATTTCCCAACAATTATTAATCAATATGCAAAATCAAAAAACAACATT
AGTTCATGCTGTAACTGGTGCAGGAAAAACAGAAATGATTTATGCTGCGA
TTGAGGCGGTAATTAACACAGGTGGCTGGGTTTGCATTGCCAGCCCAAGA
GTAGATGTTTGTGTAGAGGTGGCTACTCGTTTATCCCAAGCCTTCTCCTG
CAGCATCTGTTTAATGCACGCAGAGTCTCTTCCTTATCAAAGAGCTCCTA
TTATAGTAGCCACAACGCATCAGCTGCTAAAATTTCACAAGGCTTTTGAT
CTCTTAATTATTGATGAAGTAGACGCATTCCCTTTTGTAAATAATATTCA
ACTTCATTATGCTGCAAGTCAGGCTTTAAAAGAAGGTGGCGCAAAGATTT
TATTAACTGCAACTTCAACTAGAACTTTAGAAAGAAAGGTAAACAAGGGA
GAAGTAGTCAAGCTGACATTGGCGAGACGCTTTAATAATAGGCCATTAGT
TATTCCGAAATTTATAAGAAGTTTTAATCTATTTAAAATGATACATCGGC
AAAAACTTCCTCCTAAAATTTTAAAATACTTAAAAAAACAAAGAAAAACA
GGCTATCCCCTTTTAATTTTTCTACCCACTATTATAATGGCAGAATCTGT
TACAGCAATCTTAAAAGAGTTATTGCCCGCCGAACAAATAGCTTGTGTTT
CTAGTCAATCACAAAACAGGAAAGAAGATATCACAGCTTTTCGTCAAGGG
AAAAAAACGATTTTAATTACAACAACAATTTTAGAAAGGGGTGTGACATT
TCCCCAAATTGATGTTTTTGTTCTTGGGTCTCATCATCGTGTCTATAGTT
CCCAAAGTCTTGTTCAAATTGCTGGACGAGTTGGAAGATCTATAGACAGA
CCAGACGGAACGTTATATTTCTTTCATGAAGGTATCAGTAAAGCAATGCT
ACTAGCAAGAAAAGAGATTAAAGAAATGAATTATAAAGGGTATTCGCATG
ATCTGTCTACTATGTCAACAAATTAG
>M28_Spy1148 deaD, ATP-dependent RNA helicase
TTGAAATTTACAGAATTTAACTTATCACAAGACATCCAATCAGCTGTTGT
TACCGCTGGTTTTGAGAAAGCATCTCCTATCCAGGAAATGACGATTCCTC
TCGCACTAGAAGGGAAGGATGTTATTGGTCAAGCACAAACAGGAACTGGT
AAAACAGCAGCGTTTGGTCTACCAACCTTGAATAAGATTCGTACTAACGA
AAATATCATCCAAGCATTGGTCATTGCACCAACGCGTGAATTGGCTGTAC
AAAGTCAGGAAGAATTGTTCCGTTTTGGACGTGAAAAAGGGGTTAAGGTT
CGCTCTGTTTACGGTGGATCAAGTATTGAAAAACAAATCAAAGCCCTTAA
ATCAGGTGCCCACATTGTCGTGGGAACACCGGGTCGCTTGTTAGATTTGA
TTAAGCGCAAGGCTCTTATTTTAGATCATGTGGAAACCTTAATCCTTGAT
GAAGCAGATGAAATGCTTAACATGGGATTCTTGGAAGACATTGAAGCTAT
TATTAGTCGTGTCCCAGCAGACCGTCAAACCTTGCTCTTCTCCGCAACGA
TGCCGGCACCTATTAAACAAATCGGGGTTAAATTCATGAAAGACCCTGAA
CATGTTCAAATTAAGAACAAAGAATTAACAAACGTCAATGTTGATCAATA
CTATGTTCGTGTGAAAGAACAAGAAAAATTTGATACTATGACCCGTCTGA
TGGATGTTAACCAGCCAGAATTATCCATCGTTTTTGGGCGGACTAAGCGC
CGAGTTGATGAAATTACACGTGGCTTGAAACTTCGTGGTTTCCGTGCCGA
AGGAATCCATGGTGATCTTGACCAAAATAAACGCTTACGTGTTATCCGTG
ATTTCAAAAACGACCAAATTGATATTCTTGTTGCCACTGATGTAGCAGCG
CGTGGCCTTGATATTTCAGGAGTTACCCACGTTTATAACTACGATATTAC
CCAAGATCCAGAAAGTTATGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGTGCCG
GTAAATCTGGTGAGTCTATCACTTTTGTCTCACCAAATGAGATGGGCTAC
CTCTCAATGATTGAGAACTTAACGAAAAAACAGATGAAACCTCTTCGTCC
AGCAACTGCTGAAGAGGCCTTTCAAGCCAAGAAAAAAGTAGCCCTCAAGA
AAATTGAACGCGACTTTGCGGATGAGACTATTCGTTCAAACTTTGATAAA
TTCAAAGGCGATGCTGTCCAATTGGCTGCCGAATTCACTCCTGAAGAATT
AGCTTTATATATTTTGAGCTTAACGGTTCAAGATCCAGATAGCTTACCGG
AAGTTGAAATTGCACGTGAAAAACCATTACCATTCAAATATGTGGGTGGT
GGTCACGGCAATAAAAATGGCAAAGGTGGTCGTGGACGTGACAACCGTAA
CCGTGGTGATCGCCGTGGTGGCTATCGTGGTGACCGTAACAGAGATGAGC
GTGATGGTGACCGTCGTCGTCAAAAACGTGATAAGCGTGATGGTCACGAT
GGCAGTGGCAACCGCGATTTCAAACGTAAATCAAAACGTAATAGTAAAGA
CTTTTTCAATAAAGAGAAAAAATCAAGTGCTAAAAATACTGGTTTTGTGA
TTCGTCACAAAGGTGAATAA
>M28_Spy1110 deaD2, ATP-dependent RNA helicase
ATGAATATAGAAACAATAGTAAAAGGAAGACGCATGATCACTAAATTTCC
CCCTCAATGGCAAGAAAAACTTGACCAAGTTGCATTTACCCATTTAACGC
CAATCCAAGAACAGGCCTTTCAACCTATTGTTGATGGTAAAAATTTCCTT
GGTATTAGCCCTACTGGGACGGGCAAGACCTTAGCTTATGTCTTTCCTAG
TCTATTGGCACTGACGCCTAAAAAGTCCCAACAACTACTCATTTTAGCCC
CTAATACCGAATTAGCTGGCCAAATTTTTGAAGTCACAAAGGATTGGGCA
CAGCCACTAGGCTTAACGGCACAACTCTTTATTTCTGGAACCAGTCAAAA
ACGTCAAATCGAACGCCTCAAAAAAGGTCCTGAAATCCTGATTGGGACCC
CTGGACGCATTTTTGAACTGATTAAATTGAAAAAAATCAAGATGATGTCT
GTCAACACCATTGTTTTAGATGAATATGACGAACTATTAGGTGATTCCCA
ATATGATTTTGTTCAAAAAATTAGCCACTATGTTCCTCGAGATCATCAAA
TGGTATACATGAGTGCTACTAATAAGGTGGATCAAACTTCCTTAGCTCCA
AATACATTCTGCATCGATCTTTCAGAGCAAACCAACGATGCTATTCAGCA
TTTTTACCTCATGGTTGACAAGCGCGAACGTACCGATTTATTACGAAAAT
TTGCTAATATTCCTCATTTTAGAGCTTTAGTCTTTTTCAACAGTTTATCT
GATTTGGGTGCTACGGAAGAACGTCTCCAATATAATGGAGCTGCTGCGGT
TTCCTTAGCGAGTGACATCAATGTCAAATTCCGTAAAACCATTCTCGAAA
AATTCAAATCCCACCAACTCTCCTTATTGTTAGCTACGGATCTTGTTGCT
CGGGGCATTGATATTGATAATCTTGACTATGTCATTCATTTTGATGTTGC
TCGTGATAAGGAAAATTATACTCACAGAGCTGGACGAACCGGCCGTATGG
GAAAATCTGGTATCGTTATTACCTTTGTTAGCCACCCTGAAGACCTCAAA
AAATTGAAAAAATTTGCTAAAGTCTCTGAAATCTCCCTCAAAAATCAACA
ACTTCATTTCATCAACTAG
>M28_Spy0514 dinG, ATP-dependent helicase
ATGTTTTGTTTTATAGATATAGCGTGCTATAATAGACTTACTATGACCCA
GAAAAAACTTAGAAAATATGCAGTAGTGGACTTGGAGGCTACTGGAGCAG
GTCCCAATGCTTCTATTATTCAGGTTGGGATTGTTATTATCCAAGGAAAT
AAAATTATTGATAGTTATGAAACAGATGTTAATCCTCATGAATCTTTGGA
TGAGCATATTGTTCATTTGACAGGTATTACGGATAAGCAGTTGGCTAAAG
CTCCGGATTTTGGTCAAGTGGCGCATCACATTTATCAATTGATTGAAGAT
TGTATTTTTGTTGCCCACAATGTAAAGTTCGATGCAAATTTATTGGCAGA
AGCTCTTTTTTTGGAAGGATATGAGTTAACAATACCACGTGTTGATACTG
TTGAATTAGCCCAACTATTTTTCCCTCGCTTTGAAAAGTATAACCTTAGT
CACCTATCTAGGCAGCTCAATATTGATTTGGCAGAAGCTCATACTGCTAT
TGCAGATGCAAGAGCTACAGCTATACTGTTTTTAAGACTTTTACAAAAAA
TTGAGAGCCTTCCAATTGAGTGCTTAGAAAGCTTATTAGCCTATTCAGAT
AGCCTGCTATTTGAAACAGCAATGGTCATTCAAGAAGGATTAGCCAAGGC
CAAACCTTATGATCCCAACAAATACATTAAAATCAGACAGATTCTCTTAC
CAAAGGGCTCAAAAGCTCTCAAGCCTTATCAAATATCAAAAAGCTTCCCT
ATTAATATGGCACTATTAGGTCTGGAAGAAAGGCCTAAACAGACTCAATT
TGCTCAGTTAATTGACGAAGATTACCATCAGGGAGTAGCTAGTTTTATTG
AAGCTCAGACAGGTATTGGAAAAACCTACGGCTACCTGCTACCCCTTTTG
GCAAAAGAAGATCAAAACCAAATCATTGTTAGTGTGCCAACCAAACTTCT
TCAAGACCAATTAATGGCTGGTGAAGTAGCTGCTATTCAAGAACAATTTC
ACATCGCCTGCCATAGTTTAAAAGGGCCTGCCAATTACCTAAAGCTAGAT
AGCTTTGCAGATAGTTTGGACCAAAATGACCAGAACCGTTTGGTGAATCG
TTATAAAATGCAATTATTGGTTTGGCTCTTAGAAACTAAGACAGGAGACC
TTGACGAAATCAAACAAAAGCAGCGCTTTGCCGCTTATTTTGAACAGCTT
AAGCACGATGGAGACATTAAGCAGTCTTCTGAATTTTACGATTATGATTT
TTGGAGAGTTAGTTATGAAAAAGCCAAAACAGCCCGTCTCCTGATTACCA
ACCATGCTTATTTTTTACACCGTGTTCAAGATGACAAGGACTTTACTAGA
AACAAGGTCTTGGTATTTGATGAGGCCCAAAAGCTGATGCTCCAATTAGA
TCAATTATCACGTCATCAGCTTAACCTGACGGTTTTTTTACAAACAATAC
AGGCCAAGTTAAGCAACCCTTTACCTCTTTTAGAAAAACGCTTATTGGAA
AGCTTGTCGTTTGAACTGGGACAAGTGTCAAGTGATTACTATCAAAATAA
AGAGCACCAGCTTGCTCATGATTGGTCTCGTATAGCTGGCTACGCCAAAG
AATTAACAGGAGCAGATTATCAAGAGTTACAAGCCTTTTTTGCTACCTCA
GATGGTGACTACTGGCTTAGTAGCGAAAAGCAAGAGGAGAAGCGAGTGAC
TTATCTAAACAGTGCTAGTAAGGCATTTATTCATTTCCAACAGCTCTTAC
CAGAAACGGTGAAAACTTATTTTGTTTCTGCCACTTTAACCATCAGCTCA
GAAGTAACCTTGGCAGACCTATTAGGTTTTGAAGAGTATCTCTATCATGT
CATTGAAAAGGATAAAAAGCAAGACCAGTTGGTGCTTGTTGATCAAGAGG
CGCCTATCGTGACAGAAGTCAGTGACCAAATCTATGTGGAAGCAATTGCA
AAACGAATCGAAAGCTTGAAGCAAGAGGGTTATCCTATTTTAGTGCTTTT
TAATTCTAAAAAACACTTGCTGTTGGTTTCAGACTATCTAGACCAATGGC
AAGTGCCTCACTTAGCGCAGGAAAAGAATGGAACAGCTTATAATATTAAA
AAACGGTTTGATCAAGGAGAGCAAACTATTTTGCTTGGTTTAGGTTCTTT
TTGGGAAGGAGTTGATTTTATTCAAGCGGATCGTATGATTACCCTTATCG
CACGATTGCCCTTTGATAACCCAGAGGATTTCTTTGTTAAGAAAATGAGT
CATTATCTATTGGAAAAAGGTAAAAATCCTTTCAGAGATTACTTCTTGCC
AATGACTATTTTGCGATTAAAACAGGCTATTGGTCGCACGATGCGTCGAC
AAGATCAAAAGTCAGTGGTTATTATTTTGGATCGTCGTCTCCTTACAAAG
TCCTATGGACAAGTTATTTTGGAAGGTCTCGGTCAGGAATTTTTGATTTC
TCAACAAAATTTTCACGATTGTCTAGTAGAAACGGACTGTTTTCTGATAT
AA
>M28_Spy1556 dinP, DNA polymerase IV
ATGCTTATTTTTCCACTGATTAATGACACGTCACGAAAAATCATCCATAT
TGACATGGATGCCTTTTTTGCTGCAGTTGAGGAAAGGGATAACCCTGCTT
TAAAAGGAAAGCCTGTTGTGATTGGGAAAGATCCAAGAGAAACAGGTGGT
CGCGGAGTTGTTTCCACTTGTAATTACGAAGCGAGAAAATATGGCATTCA
TTCGGCCATGAGCTCTAAGGAAGCTTATGAGCGTTGTCCCAAAGCCATTT
TTATTTCAGGAAATTATGAAAAGTATCGAACAGTTGGGGACCAGATCCGC
CGTATTTTTAAGCGTTATACTGATGTGGTAGAGCCCATGTCCATTGATGA
GGCCTATCTAGATGTCACCAACAATAAGTTGGGTATAAAATCAGCCGTCA
AAATAGCCAAGCTGATTCAGCATGATATCTGGAAAGAAGTAGGATTGACC
TGTTCAGCAGGTGTGTCTTATAACAAATTTTTGGCTAAATTGGCTAGTGA
TTTTGAAAAACCCCATGGCCTCACCCTAGTCTTGAAAGAAGATGCCCTGT
GCTTTTTAGCCAAACTCCCCATTGAAAAGTTTCATGGTGTTGGTAAAAAA
TCAGTTGAAAAACTGCATGACATGGGGATTTATACAGGACAGGATTTGTT
GGCAGTTCCTGAAATGACCTTGATTGATCATTTTGGTCGGTTTGGTTTTG
ACCTTTACCGTAAAGCGAGAGGCATCAGCAATTCTCCTGTCAAGTCTGAT
CGGATACGCAAGTCAATTGGCAGTGAGAGAACCTACGCTAAACTGCTTTA
TCAAGAAACAGACATCAAGGCAGAGATCAGTAAAAATGCTAAGCGCGTGG
CCGCTCTCTTACAAGACCATAAAAAGTTAGGCAAGACTATTGTACTCAAA
GTGCGTTATGCTGATTTTACCACCTTGACAAAACGTGTCACCTTGCCAGA
ATTAACCAGAAATGCCGCACAAATTGAGCAAGTAGCTGGGGATATTTTTG
ACAGCTTAAGCGAAAATCCTGCTGGTATCCGCCTGTTAGGGATAACCATG
ACCAATTTGGAGGATAAGGTAGCTGATATTTCCTTGGACCTATAG
>M28_Spy0001 dnaA, chromosomal replication initiator protein
ATGACTGAAAATGAACAAATTTTTTGGAACAGGGTCTTGGAATTAGCTCA
GAGTCAATTAAAACAGGCAACTTATGAATTTTTTGTTCATGATGCCCGTC
TATTAAAGGTCGATAAGCATATTGCAACTATTTACTTAGATCAAATGAAA
GAACTCTTTTGGGAAAAAAATCTTAAAGATGTTATTCTTACTGCTGGTTT
TGAAGTTTATAACGCTCAAATTTCTGTTGACTATGTTTTCGAAGAAGACC
TAATGATTGAGCAAAATCAGACCAAAATCAATCAAAAACCTAAGCAGCAA
GCCTTAAATTCTTTGCCTACTGTTACTTCAGATTTAAACTCGAAATATAG
TTTTGAAAACTTTATTCAAGGAGATGAAAATCGTTGGGCTGTTGCTGCTT
CAATAGCAGTAGCTAATACTCCTGGAACTACCTATAATCCTTTGTTTATT
TGGGGTGGCCCTGGGCTTGGGAAAACCCATTTATTAAATGCTATTGGTAA
TTCTGTACTATTAGAAAATCCAAATGCTCGAATTAAATATATCACAGCTG
AAAACTTTATTAATGAGTTTGTTATCCATATTCGCCTTGATACCATGGAT
GAATTGAAAGAAAAATTTCGTAATTTAGATTTACTCCTTATTGATGATAT
CCAATCTTTAGCTAAAAAAACGCTCTCTGGAACACAAGAAGAGTTCTTTA
ATACTTTTAATGCACTTCATAATAATAACAAACAAATTGTCCTAACAAGT
GACCGTACACCAGATCATCTCAATGATTTAGAAGATCGATTAGTTACTCG
TTTTAAATGGGGATTAACAGTCAATATCACACCTCCTGATTTTGAAACAC
GAGTGGCTATTTTGACAAATAAAATTCAAGAATATAACTTTATTTTTCCT
CAAGATACCATTGAGTATTTGGCTGGTCAATTTGATTCTAATGTCAGAGA
TTTAGAAGGTGCCTTAAAAGATATTAGTCTGGTTGCTAATTTCAAACAAA
TTGACACGATTACTGTTGACATTGCTGCCGAAGCTATTCGCGCCAGAAAG
CAAGATGGACCTAAAATGACAGTTATTCCCATCGAAGAAATTCAAGCGCA
AGTTGGAAAATTTTACGGTGTTACCGTCAAAGAAATTAAAGCTACTAAAC
GAACACAAAATATTGTTTTAGCAAGACAAGTAGCTATGTTTTTAGCACGT
GAAATGACAGATAACAGTCTTCCTAAAATTGGAAAAGAATTTGGTGGCAG
AGACCATTCAACAGTACTCCATGCCTATAATAAAATCAAAAACATGATCA
GCCAGGACGAAAGCCTTAGGATCGAAATTGAAACCATAAAAAACAAAATT
AAATAA
>M28_Spy0277 dnaB, replicative DNA helicase
ATGATGAAACCAATTGATACTTTTACATATCTAAAACGCAACAAAGTAAC
TCTTGATTCGGTGACTTTAATACAGTTGTACTTTCCAATTATTGGAAGTG
ACGCAGTCTCTATCTATCAATACTTTATTCACTTTTTTGACGATGGTTTA
CAACGTCATAAATTCAGCGATATTTTAAATCACCTACAGTTTGGTATGAA
ACGTTTTGAAGATGCTCTTGCCATATTGACAGCAATGGAATTAGTGAGTG
TGTATCAGCTATCAGATACATATCTCATTACGTTGCACCAGCCGCTTAGC
CGTGACTTGTTTTTTCAACATCCAGCTTATTCTCGATTATTAGAACAAAA
GATTGGAGAGGTAGCTGTCTCTGAGTTGCAGGTAACTGTCCCAAGTCAAG
CAAGAAATATTTCTAAGCGATTTTCGGATATTTTTGGGGTGCAAGGAGAT
TTGACGAACGTACCTCAAAAGCCACAAAAGAATTTTGACCTTTCAAGTTT
CCAGCAATTAATGGTTCGTGATGGGTTACAATTTGAAGATAATCAAAAAG
ATATCATCAGCCTTTACAGTATTGCTGAACAGTATGATATGACGTGGTTT
GATACTTATCAAATAGCTAAGGCGACGGCTGTTAATGGGAAAATTCGACC
TGAACGCTTATTGGCTAAAAAAAATCAAAGCATGACAAAACCAAGCAAAG
AAAATTTTTCACAGGCTGAGCAAATTATTTTGCGAGAAGCAAAGCAAGAC
AGTGCTTTAGTCTTTTTGGAAAAAATTAAAAAGGCTAGACGTGCAACGAT
TACTAAGGATGAACGCATTTTATTGCAAACATTGGCCAAAATGAATTTTC
TTGATGATGTTATCAATGTCATGGTGCTTTATACCTTTAATAAGACAAAA
TCTGCTAATTTACAGAAGAGTTATGTCTTAAAAATGGCCAATGATTTTGC
CTACCAAAAGGTGTCAACGGCTGAAGAAGCTATAGTGGTTTTGCGAGCCT
TCACGGATCGTCAAAGTCGTCGGCAATCAAAAGTAAAAACAAGTCAAAGC
AATGTGCCTAAGTGGAGCAATCCTGATTACCAAGAGACAACAAGTCAAGA
AGAGCAGGCGAAACTAGATCAGTTCAAACAGGCTGCTTTGAAGAGGTTAG
AAAACCTAGGAAAAGGGGGTGACTAG
>M28_Spy0709 dnaD, phage protein
ATGAGTTTTTTAGAACATTATAAGTCAGGTAATTTGGTTATCCCAAGTGC
CTTGCTTTTTCATTACAAAGATCTTTTTAAGAGCTCAGATGATTTTTTGG
TCTGGCAGTTTTTCTATCTTCAAAATACGACAAAGCGAGACGACTTAGCG
CCCAGTCAAATTGCTCATGCGCTTGGAAAATCAGTTGCTGATATTAATAA
AATCATTTCATCTTTGACTAGTCAAGGGCTTTTAGATATGCGGACAATTG
AACTTACTGGAGAAATTGAAATTATTTTTGATGCGAGTCCTGTGTTAGCC
AAGTTAGATCAATTGTTTGTCAGTCAAACGGCAACTGAAATTGACAAACA
AGAAACACCAAACCATTTCAAACGATTAGTTGATGAATTTGAACGTGAAT
TAGGACGATTCTTGAGTCCTTTTGAGTTAGAAGATCTTGAAAAAACGCTT
CGTGATGATAAAACAGATCCTGATTTGATACGAGAAGCTTTAAAAGAAGC
TGTCTTCAACGGCAAAACAAATTGGAAATATATCCAGGCTATCTTACGTA
ATTGGCGAAAAGAAGGTATTGTTAATCTTCGACAAGTAGAAGAACGTAGA
CGTGTTAGAGAAGGCGAAGATCTTTCTCAAGTGACGATATCAGAGGATTT
TCTATCTGCGATGAATTTATGGAGTGATTCATGA
>M28_Spy0962 dnaE, DNA polymerase III alpha subunit
ATGTTTGCTCAACTTGATACTAAAACTGTATACTCATTTATGGATAGTTT
AATTGACTTAAATCATTATTTTGAACGAGCAAAGCAATTTGGTTACCACA
CCATAGGAATCATGGATAAGGATAATCTTTATGGTGCTTACCATTTTATT
AAAGGTTGTCAAAAAAATGGACTGCAGCCAGTTTTAGGTTTGGAAGTAGA
GATTCTCTATCAAGAGCGGCAGGTGCTCCTTAACTTAATCGCCCAGAATA
CACAAGGCTATCATCAGCTTTTAAAAATTTCCACGGCAAAAATGTCTGGC
AAGCTTCATATGGATTACCTCTGCCAACATTTGGAAGGGATAGCGGTTAT
TATTCCTAGTAAGGGTTGGAGCGATACATTAGTGGTCCCTTTTGACTACT
ATATCGGTGTTGATCAGTATACTGATTTATCTCATATGGATTCTAAGAGG
CAGCTTATACCCCTAAGGACAGTTCGTTATTTTGCGCAAGATGATATGGA
AACCTTGCACATGTTGCATGCCATTCGAGATAACCTCAGTCTGGCAGAGA
CCCCTGTGGTAGAAAGTGATCAAGAGTTAGCAGATTGTCAACAACTAACC
ACCTTCTATCAAACACACTGCCCTCAAGCTCTACAGAATTTAGAAGACTT
AGTGTCAGGAATCTATTATGATTTCGATACAAATTTAAAATTGCCACATT
TTAATAGAGATAAGTCTGCCAAGCAAGAATTGCAAGACTTGACTGAGGCT
GGTTTGAAGGAAAAAGGATTGTGGAAAGAGCCTTATCAATCGCGCTTACT
GCGTGAATTGGTCATTATTTCTGACATGGGCTTTGATGATTATTTTTTGA
TTGTGTGGGATTTACTTCGCTTTGGACGCAGTAAAGGCTATTATATGGGT
ATGGGACGTGGCTCGGCGGCAGGTAGTCTAGTGGCTTATGCTCTGAACAT
TACAGGGATTGATCCAGTTCAACATGATTTGCTATTTGAGCGCTTTTTAA
ACAAAGAACGTTATAGCATGCCTGATATTGATATCGATCTTCCAGATATT
TACCGTTCAGAATTTCTACGGTATGTCCGAAATCGTTATGGTAGCGACCA
TTCGGCGCAAATTGTGACCTTTTCAACCTTTGGCCCTAAACAGGCTATTC
GTGATGTTTTCAAACGGTTCGGGGTTCCAGAATACGAACTGACTAATCTC
ACTAAAAAAATTGGTTTTAAAGATAGCTTGGCTACTGTCTATGAAAAGTC
AATCTCTTTTAGGCAGGTTATTAATAGTAGAACTGAATTTCAAAAGGCCT
TTGCTATTGCCAAGCGTATCGAAGGAAATCCAAGACAAACGTCCATTCAC
GCAGCTGGTATTGTGATGAGTGATGATACCTTGACCAATCATATTCCTCT
AAAATCGGGCGATGACATGATGATCACCCAGTATGATGCTCATGCGGTCG
AAGCTAATGGCCTGTTAAAAATGGATTTTTTGGGGTTAAGAAATTTGACC
TTTGTTCAAAAAATGCAAGAGAAGGTTGCTAAAGACTACGGGTGTCAGAT
CGATATTGCAGCCATTGATTTAGAAGACCCGCAAACGTTGGCACTTTTTG
CTAAAGGGGATACCAAGGGAATTTTCCAATTTGAACAAAATGGTGCTATT
AATCTTTTAAAACGGATTAAGCCACAACGTTTTGAAGAAATTGTTGCCAC
TACCAGTCTAAATAGACCAGGGGCAAGTGACTATACCACTAATTTCATTA
AACGAAGAGAAGGACAAGAAAAAATTGATTTGATTGATCCTGTGATTGCT
CCCATTTTAGAGCCAACTTACGGTATTATGCTTTATCAAGAACAAGTTAT
GCAGATTGCACAGATTTATGCTGGTTTTACGTTAGGCAAGGCCGACTTGT
TAAGGCGTGCCATGTCTAAAAAAAATCTACAAGAAATGCAAAAAATGGAA
GAAGACTTTATTGCTTCTGCTAAGCACCTAGGGAGAGCTGAAGAAACAGC
TAGAGGACTTTTTAAACGGATGGAAAAATTTGCAGGTTATGGTTTTAACC
GCAGCCATGCCTTTGCCTATTCAGCTTTAGCTTTTCAATTGGCTTATTTC
AAAGCCCATTACCCGGCTGTTTTTTACGATATCATGATGAATTATTCTAG
CAGTAACTATATCACAGATGCTCTAGAATCAGATTTTCAAGTAGCGCAAG
TTACCATTAATAGTATTCCTTACACTGATAAAATTGAAGCTAGCAAGATT
TACATGGGGCTGAAAAATATTAAGGGGTTGCCAAGGGATTTTGCTTATTG
GATTGTTGAGCAAAGACCATTTAATAGCGTAGAGGATTTTCTCACTAGAA
CTCCAGAAAAATATCAAAAAAAGGTTTTCCTTGAGCCTCTGATAAAAATA
GGTCTGTTTGATTGCTTTGAGCCTAACCGTAAAAAAATTATGGACAATTT
GGATGGTTTACTGGTATTTGTTAATGAGCTTGGTTCTCTTTTTTCAGATT
CGTCCTTTAGTTGGGTAGATACGAAAGATTACTCAGCAACTGAAAAATAT
TCTTTGGAACAGGAGATCGTTGGGGTTGGCATGAGCAAGCATCCTTTAAT
TGATATTGCTGAGAAAAGTACCCAAACTTTTACTCCCATTTCACAGTTAG
TCAAAGAAAGCGAAGCAGTCGTACTGATTCAAATAGATAGCATTAGGATC
ATTAGAACCAAAACAAGTGGGCAGCAAATGGCTTTTTTAAGTGTGAATGA
CACTAAGAAAAAGCTCGATGTCACACTTTTTCCACAAGAGTATGCTATTT
ATAAAGACCAATTAAAAGAAGGAGAATTCTATTACTTAAAAGGTAGAATA
AAAGAAAGAGACCATCGACTGCAGATGGTGTGTCAGCAAGTGCAAATGGC
TATTAGTCAAAAATATTGGTTATTAGTTGAAAACCATCAGTTTGATTCCC
AAATTTCTGAGATTTTAGGTGCCTTTCCAGGAACGACTCCAGTTGTTATT
CACTATCAAAAAAATAAGGAAACAATTGCATTAACTAAGATTCAGGTTCA
TGTAACAGAGAATTTAAAGGAAAAACTTCGTCCTTTTGTTCTGAAAACGG
TTTTTCGATAA
>M28_Spy0578 dnaG, DNA primase
ATGGGATTTTTATGGGGAGGTGACGATTTGGCAATTGACAAAGAAATGAT
TTCCCAAGTAAAAAATAGCGTTAATATTGTCGATGTCATTGGAGAAGTGG
TCAAACTTTCCCGATCAGGGCGGCATTATCTCGGGCTTTGCCCATTTCAT
AAGGAAAAGACACCCTCTTTCAATGTTGTTGAAGACAGACAATTTTTTCA
CTGCTTTGGCTGTGGAAAATCAGGGGATGTTTTTAAATTTATTGAGGAAT
ACCGCCAAGTCCCCTTCTTAGAAAGTGTTCAGATTATTGCCGATAAGACT
GGTATGTCGCTTAATATACCGCCAAGTCAGGCAGTACTTGCTAGCCAACA
CAAGCACCCTAATCACGCTTTGATGACACTTCATGAGGATGCTGCTAAAT
TTTACCATGCAGTTTTGATGACCACTACCATTGGTCAAGAAGCTAGGAAG
TACCTTTACCAGAGAGGCTTGGATGACCAATTAATTGAGCATTTCAATAT
TGGTTTAGCCCCAGATGAGTCAGATTATCTTTATCAAGCTCTTTCTAAAA
AATACGAGGAAGGTCAATTGGTTGCTTCAGGATTGTTTAACTTGTCCGAT
CAATCCAATACCATTTACGACGCCTTTCGAAATCGTATCATGTTTCCCTT
ATCAGATGACCGAGGGCATATTATTGCCTTTTCAGGACGTATCTGGACGG
CAGCTGATATGGAAAAGAGACAGGCCAAGTATAAAAATTCAAGAGGAACA
GTTCTTTTTAACAAATCTTATGAATTGTATCATCTGGACAAAGCAAGGCC
TGTTATTGCCAAAACCCATGAAGTGTTTCTAATGGAAGGGTTTATGGACG
TGATTGCCGCTTACCGTTCCGGCTATGAAAATGCTGTTGCTTCAATGGGG
ACGGCATTGACTCAAGAACATGTCAATCACCTTAAGCAAGTCACTAAAAA
AGTTGTTTTGATTTATGATGGTGACGATGCTGGACAACATGCTATTGCAA
AATCACTAGAATTGCTTAAAGATTTTGTTGTCGAAATTGTCAGAATCCCC
AATAAAATGGATCCTGACGAATTTGTACAACGGCATTCCCCAGAAGCATT
TGCAGATTTGCTTAAGCAGTCACGGATCAGTAGTGTTGAATTTTTTATTG
ATTACCTAAAACCTACTAATGTAGACAATCTGCAATCACAAATTGTTTAT
GTGGAGAAAATGGCACCATTGATTGCTCAATCACCATCCATCACAGCTCA
ACATTCGTATATTAACAAGATTGCTGATTTGTTGCCAAACTTTGACTATT
TTCAAGTAGAACAATCAGTAAATGCATTAAGGATTCAAGATAGGCAAAAG
CGTCAAGGTCAAATAGCTCAAGCCGTCAGCAATCTTGTGACCTTACCAAT
ACCAAAAAGTTTGACAGCTATTGCTAAGACAGAAAGTCATCTCATGCATC
GGCTCTTACATCATGACTATTTATTAAATGAATTTCGACATCGTGATGAT
TTTTATTTTGATACCTCTACCTTAGAAATACTTTATCAACGGCTGAAGCA
ACAAGGATACATTACATCTTATGATTTGTCAGAGATGTCAGAGGAAGTTA
ACCGTGCTTATTACAATGTTTTAGAAGAAAACCTTCCCAAAGAAGTAGCT
CTTGGTGAGATTGATGATATTTTATCCAAACGTGCCAAACTTTTAGCAGA
GCGCGATCTTCACAAACAAGGGAAAAAAGTTAGAGAATCTAGTAACAAAG
GCGATCATCAAGCGGCTCTAGAAGTACTAGAACATTTTATTGCGCAGAAA
CGAAAAATGGAATAG
>M28_Spy0278 dnaI, primosomal protein
ATGGAAAAGATTGGAGAAACCATGGCGAAATTGGGTCAAAACACTCGTGT
TAATAGCGACCAGTTGATTCAAACCATTTTAGCGGATCCTGAAGTAGCAA
GCTTCATCAGTCAACATCACTTATCTCAAGAGCAAATTAACCTTAGCTTA
TCTAAGTTCAATCAATTTTTGGTGGAACGCCAGAAGTATCAACTCAAAGA
TCCCTCTTATATTGCTAAGGGCTATCAGCCTATTCTAGCTATGAATGAGG
GCTACGCTGATGTGTCTTATTTGGAAACCAAAGAATTGGTAGAAGCTCAA
AAACAGGCAGCTATCTCTGAACGGATTCAACTGGTCAGTTTGCCAAAATC
CTATCGCCATATTCATTTACCAGATATTGATGTTAATAATGCGAGCCGTA
TGGAAGCTTTCTCTGCTATTTTAGATTTTGTGGAACAATACCCATCAGCA
GAGCAAAAAGGCTTATATTTGTACGGAGATATGGGAATTGGCAAGTCTTA
CTTGTTGGCTGCTATGGCCCATGAATTGTCTGAGAAAAAAGGTGTGTCAA
CGACCCTTCTACATTTTCCGAGCTTTGCCATTGATGTAAAAAATGCCATT
TCAAACGGCTCTGTTAAAGAAGAAATCGATGCGGTCAAAAATGTACCAGT
GCTCATTTTAGATGATATTGGTGCAGAGCAAGCCACTTCTTGGGTCCGTG
ATGAGGTGTTGCAGGTGATTTTACAATACCGTATGTTAGAGGAATTGCCA
ACCTTCTTTACCTCTAATTACAGCTTTGCGGATTTGGAGCGAAAATGGGC
AACCATCAAAGGAAGTGACGAAACTTGGCAGGCCAAACGTGTCATGGAAC
GCGTGCGTTATTTGGCTAGAGAGTTTCATTTAGAAGGGGCTAACCGCCGT
TAA
>M28_Spy0002 dnaN, DNA polymerase III, beta chain
ATGATTCAATTTTCAATTAATCGCACATTATTTATTCATGCTTTAAATGC
AACTAAACGTGCTATTAGCACTAAAAATGCCATTCCTATTCTTTCATCAA
TAAAAATTGAAGTCACTTCTACAGGAGTAACTTTAACAGGGTCTAACGGT
CAAATATCAATTGAAAACACTATTCCTGTAAGTAATGAAAATGCTGGTTT
GCTAATTACCTCTCCAGGAGCTATTTTATTAGAAGCTAGTTTTTTTATTA
ATATTATTTCAAGTTTGCCAGATATTAGTATAAATGTTAAAGAAATTGAA
CAACACCAAGTTGTTTTAACCAGTGGTAAATCAGAGATTACCTTAAAAGG
AAAAGATGTTGACCAGTATCCTCGTCTACAAGAAGTATCAACAGAAAATC
CTTTGATTTTAAAAACAAAATTATTGAAGTCTATTATTGCTGAAACAGCT
TTTGCAGCCAGTTTACAAGAAAGTCGTCCTATTTTAACAGGAGTTCATAT
TGTATTAAGCAATCATAAAGATTTTAAAGCAGTAGCGACTGACTCTCATC
GTATGAGCCAACGTTTAATCACTTTGGACAATACTTCAGCAGATTTTGAT
GTGGTTATTCCAAGTAAATCTTTGAGAGAATTTTCAGCAGTATTTACAGA
TGATATTGAGACCGTTGAGGTATTTTTCTCACCAAGCCAAATCTTGTTCA
GAAGTGAACACATTTCTTTTTATACACGCCTCTTAGAAGGAAATTATCCC
GATACAGATCGTTTATTAATGACAGAATTTGAGACGGAGGTTGTTTTCAA
TACCCAATCCCTTCGCCACGCTATGGAACGTGCCTTCTTGATTTCTAATG
CTACTCAAAATGGTACTGTTAAGCTTGAGATTACTCAAAATCATATTTCA
GCTCATGTTAACTCACCTGAGGTTGGTAAGGTAAACGAGGATTTAGATAT
TGTTAGTCAGTCTGGTAGTGATTTAACTATCAGCTTCAATCCAACTTACC
TTATTGAGTCTTTAAAAGCTATTAAAAGTGAAACAGTAAAAATTCATTTC
TTATCACCAGTTCGACCATTCACCCTAACACCAGGCGATGAGGAAGAAAG
TTTTATCCAATTAATTACACCAGTACGAACAAACTAA
>M28_Spy1570 dnaQ, DNA polymerase III, epsilon chain
ATGACGAAGGCCCTATCAGGGTCTTTTTTGGAGGAAAACATGAAACACTT
AGATACTTATATTGCCTTTGATTTAGAATTTAACACTGTCAATGACGTTA
GTCATGTCATTCAAGTATCAGCAGTCAAATATGACCACCATAAAGAAGTT
GACAGCTTTGACACCTATGTTTACACAGATGTTCCCTTACAGAGTTTTAT
CAATGGCCTAACAGGAATCACATCTGACAAGATTGCTGCGGCACCAAAAG
TAGAGGAGGTTATGGCTGCGTTTAAAAATTTTGTGGGAGAGTTACCACTG
ATTGGTTATAATGCTCAAAAATCTGACCTGCCTATTCTAGCTGAAAATGG
CTTAGATTTAAGGGACCAATACCAGATTGACCTCTTTGATGAAGCTTACG
ATAGACGTAGCGCAGACTTAAATGGGATTGCTAACCTTCGTCTGCAAACA
GTGGCAACCTTTTTAGGCATTAAGGGTCGAGGTCATAATAGCTTAGAAGA
TGCCAGAATGACAGCAGCAATCTATAAGTCATTTTTAGAAACAGATACAA
ACAAAGCATATCTCAGCCAGCAAGAAGAGGTAACCACAGATAACCCTTTC
GCAGCTTTGGGAGACTTTTTTGACTAA
>M28_Spy0320 dnaX, DNA polymerase III, delta' subunit
ATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACGAT
TTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTG
CTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAGCAG
AAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGA
ACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGA
TTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCCAACTTTTCTCAGACAGGA
TATGAAAACAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGACAAAATGCA
TGTCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAGTATATTGAGGAGCCTCAGGGAG
AAGCTTACATATTTTTATTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACC
ATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCT
TTACCAATTGGCACAAGAAAAGGGATTATTAAACCATCAGGCTAAGCTAG
TAGCCAAACTTGCCACAAATACCAGTCATCTAGAACGTCTGTTGCAAACG
AGCAAGCTTTTAGAACTGATAACTCAAGCAGAGCGTTTTGTATCTATTTG
GCTGAAAGATCAGTTGCAGGCATATTTAGCGTTGAACCGTCTGGTACAGT
TAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTG
CTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGT
CTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTTAATTTTCAAAACACAT
TAGAATATATGGTGATGTCAGAATAA
>M28_Spy0327 exoA, exodeoxyribonuclease III
ATGGGGGCTAGGTGCCCAAAGTCGCTTATCGTTTCGTTTTTTGTTACAAT
AACAACAAGACTATCTGTTAGAAAGAGAAACCAAATGAAACTGATTTCAT
GGAACATTGATTCCTTAAATGCTGCTCTCACAGGAGAGTCCCCTCGTGCG
CTTTTATCACGCGCTGTTTTAGACACTTTAGTCGCTCAAGATGCGGATAT
TATTGCCATCCAAGAAACTAAATTATCTGCTAAGGGGCCTACCAAAAAAC
ATATTGAGACCCTACTTAGTTACTTTCCAAACTATTTGCATGTGTGGCGT
TCTTCAGTTGAGCCTGCTAGGAAAGGCTATGCTGGCACCATGTTCCTGTA
CAAAAACACGTTAAACCCTGTCATTACTTTTCCAGAAATTGGTGCCCCAA
CAACAATGGATGCTGAGGGCCGTATCATTACCCTAGAATTTGAAGACTTT
TTCGTCACACAGGTTTATACGCCTAATGCTGGTGATGGTCTAAGACGGTT
AGATGACCGTCAAATTTGGGACCACAAATACGCTGATTATTTGACTGAAC
TGGATGCTCAAAAGCCTGTTTTGGCTACGGGAGATTACAACGTTGCCCAT
AAAGAGATTGATTTGGCAAATCCAAGCAGCAATCGACGTTCTCCTGGTTT
TACCGACGAAGAACGTCAAGGCTTTACTAACCTATTAGCAAGAGGCTTTA
CAGATACTTTTCGTCACTTGCACGGCGATATTCCTCATGTTTATACCTGG
TGGGCACAACGTAGTAAAACCAGCAAAATCAATAATACCGGTTGGAGAAT
TGACTATTGGCTAGCTTCAAACCGAATCGTGGATAAGGTTAAGCGTTCTG
AAATGATTTCTTCTGGGGAACGCCAAGACCATACGCCAATTTTACTAGAT
ATTGATCTCTAA
>M28_Spy0396 fpg, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
ATGCCAGAATTACCAGAAGTTGAAACGGTCCGACGAGGGCTTGAGACTTT
AGTGCTTGGCCAAGAAATTGTGGCTGTTACGCTTAAAGTGCCAAAGATGG
TTAAAACCGACTTAGAGACGTTTGCCCTGACCCTACCTGGTCAAATCATT
CAGTCAGTTGGCCGTCGGGGAAAATATTTATTAATTGATTTGGGGCAATT
AGTGTTGGTATCACATTTGCGGATGGAAGGCAAATATTTGCTTTTTCCAG
ATGAGGTCCCTGATAACAAACACTTTCATGTCTTTTTTGAATTGAAAAAT
GGTTCGACCTTGGTTTACCAAGATGTGCGTAAATTTGGAACCTTTGATTT
GATAGCAAAATCTCAATTATCAGCGTTTTTTGCCAAACGAAAACTAGGCC
CTGAACCAAAGAAAGAGACCTTTAAGTTAAAAACCTTTGAGGCTGCTCTG
CTATCCTCCCAAAAACCCATAAAACCACATCTGTTAGACCAGACCTTGGT
TGCTGGTTTAGGGAATATTTATGTGGACGAGGTACTTTGGGCTGCTAAGG
TTCATCCAGGAACTGCGTCTTCTAGGTTGAATAAGGCGGAGATAAAACGG
CTGCATGATGAAACCATACGAATCCTAGCTTTAGGAATTGAAAAGGGCGG
TTCGACCGTCCGTACTTACCGTAATGCTTTGGGAGCTGATGGCACCATGC
AGGACTATTTGCAGGTTTATGGTCAAACTGGGAAACCGTGTCCTCGTTGT
GGACAGGCTATTGTCAAATTAAAAGTTGGAGGAAGGGGGACGCACATTTG
TCCAAAATGCCAGAAAAAAAGACCATGA
>M28_Spy0848 gyrA, DNA gyrase subunit A
ATGCAAGATCGAAATTTAATTGACGTCAATCTGACAAGTGAAATGAAAAC
GAGTTTCATTGACTATGCCATGAGTGTCATTGTGGCAAGAGCTTTGCCAG
ATGTGCGTGATGGTCTGAAACCTGTGCATCGTCGTATTCTCTATGGGATG
AATGAACTCGGTGTGACACCTGATAAACCGCATAAAAAATCTGCTCGTAT
TACGGGTGATGTCATGGGTAAATATCACCCGCATGGGGATTCTTCTATTT
ATGAAGCTATGGTTCGTATGGCTCAGTGGTGGAGTTATCGCCATATGCTT
GTTGATGGCCATGGCAATTTTGGTTCTATGGATGGTGATGGTGCTGCCGC
TCAACGTTATACTGAAGCGCGCATGAGTAAAATTGCGCTTGAATTATTAA
GGGATATCAATAAAAATACCGTTAATTTTCAAGATAACTACGATGGAAGC
GAAAGAGAACCAGTAGTATTACCAGCTCGCTTTCCTAATTTATTAGTCAA
TGGAGCGACAGGGATTGCCGTTGGGATGGCAACTAACATTCCGCCTCATA
ATTTGGCAGAGTCTATTGATGCTGTCAAGATGGTAATGGAACATCCAGAC
TGTACAACAAGAGAGTTGATGGAAGTGATCCCTGGACCTGACTTTCCGAC
TGGTGCCCTTGTTATGGGGCGCTCAGGTATTCATAGGGCTTATGATACTG
GTAAAGGTTCTATCGTTTTACGCTCTCGAACAGAAATTGAAACAACTCAA
ACAGGTCGGGAACGTATTGTGGTTACTGAATTTCCCTATGGCGTCAATAA
AACGAAAGTGCATGAACACATTGTTCGTTTAGCACAAGAAAAAAGACTAG
AAGGTATTACAGCAGTTCGTGACGAATCTAGCCGTGAAGGAGTGCGTTTT
GTTATCGAGATTCGTCGAGAGGCATCCGCGACAGTTATCTTAAATAACCT
CTTTAAATTAACAAGCCTTCAGACGAATTTCAGTTTTAATATGTTGGCTA
TTGAAAATGGTGTGCCTAAAATATTGTCACTCAGACAAATCATTGATAAT
TACATTAGTCATCAAAAAGAAGTTATTATACGTCGCACCCGATTTGATAA
AGATAAAGCTGAAGCCAGAGCTCATATTTTAGAAGGCTTACTGATTGCCC
TTGATCATTTAGACGAAGTGATTGCTATTATTCGTAACAGTGAGACAGAT
GTCATTGCTCAGACAGAATTGATGTCACGTTTCGACTTGTCTGAACGCCA
AAGCCAAGCTATTTTGGATATGCGTTTGCGTCGTTTGACTGGTTTGGAAC
GTGATAAGATTCAATCAGAATATGATGATTTGTTGGCCTTGATTGCTGAC
TTATCTGATATTTTAGCCAAACCAGAACGTATTATCACTATCATCAAAGA
AGAAATGGATGAGATCAAGCGTAAATACGCTAACCCACGCCGTACAGAAT
TAATGGTCGGTGAAGTCCTTTCTCTAGAAGATGAAGACCTAATTGAAGAA
GAAGATGTTTTGATTACCTTGTCAAATAAAGGTTATATCAAGCGTCTTGC
TCAAGATGAATTTCGTGCCCAGAAGCGTGGTGGACGTGGCGTCCAAGGAA
CTGGAGTCAACAATGACGACTTTGTCCGTGAATTGGTATCAACAAGTACC
CATGATACTTTGCTCTTCTTTACGAATTTTGGGCGTGTCTATCGGTTGAA
AGCTTACGAAATTCCAGAATATGGTCGTACAGCAAAAGGTCTTCCAATTG
TTAATCTATTGAAATTAGAAGATGGTGAAACCATTCAAACTATTATCAAC
GCACGTAAGGAAGAAACAGCAGGTAAATCCTTCTTCTTTACAACGAAACA
AGGCATTGTCAAACGTACAGAAGTTTCAGAATTTAATAATATCCGTCAAA
ACGGTCTCCGTGCTCTTAAGTTGAAAGAGGGAGATCAGCTGATTAACGTC
CTTTTGACAAGCGGTCAGGATGATATTATCATTGGAACTCACTCCGGATA
TTCTGTTCGTTTTAATGAAGCAAGCATCCGCAACATGGGCCGATCAGCTA
CGGGTGTTCGCGGGGTTAAGCTTCGTGAAGATGATCGCGTTGTTGGCGCG
TCACGTATTCAAGATAACCAAGAAGTTCTTGTAATTACCGAAAATGGCTT
TGGTAAGAGAACAAGTGCTACAGACTATCCTACAAAAGGTAGGGGGGGAA
AAGGAATAAAAACAGCTAATATTACCCCTAAAAATGGTCAATTAGCTGGA
TTGGTTACCGTAGATGGTACAGAAGATATCATGGTGATTACAAATAAAGG
TGTCATTATTCGCACAAATGTTGCAAATATTTCGCAAACAGGTCGTGCTA
CTTTGGGTGTTAAAATTATGAAACTAGATGCTGATGCTAAGATTGTAACA
TTTACCTTGGTTCAGCCTGAAGATAGTAGTATCGCTGAAATCAATACTGA
TCGTGAAAATAGTATTTCAAAAAATAAAGATAATTAA
>M28_Spy0532 gyrB, DNA gyrase subunit B
ATGATTGAAGAAAATAAACATTTTGAAAAAAAAATGCAAGAATACGATGC
CAGTCAAATTCAGGTTCTAGAAGGGCTGGAGGCTGTCCGCATGCGTCCAG
GGATGTATATTGGCTCGACAGCTAAAGAGGGTTTGCATCATTTAGTCTGG
GAAATTGTTGACAACTCAATTGACGAAGCATTAGCAGGTTTTGCCTCTCA
TATTAAAGTCTTTATTGAAGCAGATAATTCCATTACAGTAGTAGATGATG
GCCGTGGAATTCCAGTTGACATCCAAGCCAAGACAGGACGTCCCGCCGTT
GAAACAGTTTTTACAGTCTTACACGCAGGTGGTAAATTTGGCGGAGGCGG
CTATAAGGTTTCTGGAGGATTGCATGGTGTAGGGTCATCTGTTGTTAATG
CTTTATCAACACAATTAGATGTGCGTGTTTATAAAAACGGCCAAATTCAT
TACCAAGAATTTAAACGCGGGGCAGTTGTAGCAGATCTTGAGGTCATTGG
AACCACTGATGTGACTGGAACAACGGTACACTTTACACCCGATCCAGAAA
TTTTTACCGAAACGACTCAGTTTGATTACAATGTTTTAGCAAAACGTATT
CAAGAGTTAGCCTTTTTGAATCGTGGTTTAAAAATTTCCATTACAGATAA
GCGCTCAGGTATGGAACAAGAAGAACATTTCCATTATGAAGGTGGAATTG
GTTCTTATGTTGAATTTTTAAATGATAAAAAAGATGTTATCTTTGAAACG
CCCATCTATACAGATGGTGAATTAGAAGGTATTGCAGTTGAAGTAGCCAT
GCAATACACGACTAGCTATCAAGAAACAGTCATGAGTTTTGCTAATAATA
TTCATACTCATGAAGGTGGAACGCATGAACAAGGCTTTAGAGCGGCTCTT
ACTCGGGTCATCAATGACTACGCTAAGAAAAATAAAATTCTTAAAGAAAA
TGAGGACAATTTGACAGGAGAAGATGTTCGTGAAGGTTTGACGGCGGTAA
TTTCTGTTAAGCATCCAAATCCTCAATTTGAAGGTCAAACCAAAACAAAA
TTGGGCAACTCAGAAGTGGTTAAGATCACTAATCGTCTCTTTAGTGAGGC
CTTTCAACGTTTTCTTTTGGAAAACCCACAAGTTGCTCGTAAGATTGTGG
AAAAAGGGATTTTGGCTTCTAAAGCTAGAATTGCAGCTAAGCGAGCCCGC
GAAGTCACCCGCAAAAAATCAGGCTTAGAAATTTCAAACTTACCTGGAAA
ATTAGCAGACTGTTCGTCAAATGATGCTAACCAAAACGAACTTTTCATCG
TCGAAGGAGATTCAGCGGGTGGGTCGGCCAAATCAGGTCGTAACCGAGAG
TTTCAAGCTATCTTGCCTATTCGCGGTAAAATTTTGAACGTGGAAAAAGC
AACTATGGATAAGATTCTTGCCAACGAAGAAATTAGAAGTCTTTTTACCG
CTATGGGTACAGGTTTTGGTGCAGATTTTGACGTGTCAAAAGCTCGCTAC
CAAAAGCTGGTTATCATGACCATTGCCGATGTGGATGGCGCTCATATTAG
AACCTTGCTTTTAACCTTGATTTACCGCTTTATGAGGCCTGTTCTAGAAG
CTGGCTATGTTTATATCGCCCAGCCACCTATTTATGGTGTTAAGGTCGGT
AGTGAGATTAAAGAGTACATTCAGCCAGGTATTGATCAAGAAGACCAATT
AAAAACAGCTCTTGAAAAATATAGTATTGGTCGTTCAAAACCAACTGTTC
AACGTTATAAAGGTCTTGGGGAAATGGATGACCATCAACTTTGGGAAACT
ACTATGGATCCTGAAAATCGTTTGATGGCGCGTGTGACAGTTGATGATGC
CGCAGAAGCAGATAAAGTATTTGATATGTTAATGGGAGATCGTGTTGAAC
CAAGACGTAATTTCATTGAGGAAAATGCGGTTTATAGTACACTGGATATT
TAG
>M28_Spy1867 holB, replicative DNA helicase
TTGGAGGTTATGAGGTTGCCTGAAGTAGCTGAATTACGAGTTCAACCCCA
AGATTTACTAGCAGAGCAATCTGTTCTTGGGTCAATCTTTATCTCACCTG
ATAAGCTGATTGCAGTGAGAGAATTTATCAGTCCAGACGATTTTTATAAG
TACGCTCATAAAATTATCTTTCGGGCAATGATTACCCTCAGCGATCGTAA
TGATGCCATTGATGCAACCACTATAAGAACAATCCTAGATGATCAAGATG
ATCTGCAAAGTATTGGTGGCTTATCCTATATTGTTGAACTAGTTAATAGT
GTCCCAACTAGTGCTAATGCAGAATATTATGCTAAAATTGTAGCTGAGAA
AGCTATGTTGCGTGATATTATTGCTAGGTTGACAGAATCTGTCAACCTAG
CTTATGATGAAATTTTAAAACCAGAAGAGGTTATCGCTGGAGTTGAGAGA
GCTTTAATTGAACTCAATGAACATAGTAATCGTAGTGGGTTTCGCAAAAT
TTCAGATGTGCTAAAAGTTAATTACGAGGCTTTAGAAGCACGTTCTAAGC
AGACTTCAAATGTTACAGGTTTACCAACTGGTTTTAGAGACCTTGACAAG
ATTACAACAGGTTTACACCCAGATCAATTAGTTATTTTAGCTGCTCGGCC
AGCAGTGGGGAAGACTGCCTTTGTTCTTAATATTGCGCAAAATGTGGGGA
CTAAGCAAAAAAAGACTGTTGCTATTTTTTCTTTGGAAATGGGTGCTGAA
AGTTTAGTAGATCGTATGCTTGCAGCAGAAGGAATGGTTGATTCGCACAG
TTTAAGAACAGGGCAACTCACAGATCAGGATTGGAATAATGTAACAATTG
CTCAGGGAGCTTTGGCAGAAGCACCGATTTATATTGACGATACGCCCGGG
ATTAAAATTACTGAAATCCGCGCAAGATCACGGAAATTGTCTCAAGAAGT
GGATGGTGGTTTAGGTCTTATCGTAATTGACTACTTACAGTTGATTACAG
GAACTAAACCCGAAAATCGTCAGCAAGAGGTTTCAGATATTTCAAGACAG
CTTAAAATCCTAGCTAAAGAATTGAAAGTACCAGTTATTGCCCTAAGTCA
GCTTTCTCGTGGCGTTGAGCAAAGGCAAGATAAACGACCAGTTTTATCAG
ATATTCGTGAATCAGGATCTATTGAGCAGGATGCCGATATTGTAGCCTTC
TTATACCGGGACGATTATTACCGTAAAGAAGGTGATGATGCTGAAGAAGC
TGTTGAAGATAACACAATTGAAGTTATCCTCGAGAAAAATAGAGCTGGGG
CGCGTGGAACAGTCAAACTGATGTTTCAAAAAGAATACAACAAATTCTCA
AGTATAGCCCAGTTTGAAGAAAGATAA
>M28_Spy0551 lig, NAD-dependent DNA ligase
ATGAAAAAACGCATAAAAGAATTAACAGATCTTCTTAACCGTTACCGTTA
TGACTATTATACTAAAGATGCCCCATCAGTTTCTGACAGTGACTATGATA
AGCTTTATCGTGAACTGGTGACTTTAGAGCAGTCATATCCCGAGTATGTC
TTGCAAGATAGCCCAACGCAGCAGGTTGGAGGGACTATTTTAAAGGGGTT
TGAAAAATATCGACATCAGTATCCGCTTTTTAGTTTGCAGGATGCTTTTT
CACGTGAGGAGCTGGATGCTTTTGATAAGCGCGTCAAGGCCGAATTTCCG
AATGCCACCTATCTAGCAGAGTTAAAAATTGATGGTTTATCTATTTCCTT
GAGTTATGAGAATGGCTTCTTACAGGTTGGAGCAACACGGGGTGATGGCA
ATATCGGTGAAAATATCACAGAAAATATTAAAAAAATAAAGGATATTCCT
CACCAATTGAGTGAGCCTTTAACCATCACCGTTCGAGGAGAGGCTTACAT
GTCTCGTCAGTCCTTTAAAGCGATCAATGAAGCACGCCAAGAAAATGGGG
AGACTGAATTTGCTAATCCTAGAAATGCTGCCGCTGGGACACTAAGGCAG
CTAGATACGGCAGTGGTTGCTAAGCGTCAACTAGCCACTTTTTTGTATCA
AGAAGCTAGTCCGACAGCTAGAAATCAACAAAATGAGGTCTTAGCAGAAT
TAGCAGATCTAGGTTTTTCAGTAAATCCGTATTATCAACTCACATCGTCT
ATGGATGAGATTTGGAATTTTATCAAAACTATTGAGGCAAAAAGAGATCA
ATTAGCTTATGACATAGATGGCGTTGTTATTAAAGTTAATAGCCTAGCCA
TGCAAGAAGAGCTAGGGTTTACGGTTAAAGCTCCACGCTGGGCTATTGCT
TACAAATTTCCAGCAGAAGAAAAAGAGGCAGAAATCCTTTCGGTTGACTG
GACAGTGGGACGAACAGGCGTGGTCACACCTACAGCGAATCTAACTCCTG
TGCAACTAGCGGGGACAACCGTGAGTCGTGCAACCCTACATAATGTGGAT
TATATTGCCGAAAAAGATATCCGTATTGGCGATACAGTGATTGTATATAA
GGCAGGGGACATTATTCCTGCTGTCTTAAATGTCGTTATGAGTAAGCGGA
ACCAGCAAGAAGTCATGCTTATTCCTAAACTATGCCCATCTTGTGGTAGT
GAATTAGTTCATTTTGAAGATGAGGTTGCTTTGCGTTGTATTAATCCGTT
GTGTCCTAGTTTGATTCAGCGAAGTTTGGAGCATTTTGCAAGTCGTGATG
CCATGAACATTACTGGGCTGGGACCAGCTATTGTGGAAAAACTATTTTTA
GCGGGGTTTGTTCATGATGTTGCTGATATTTACCAGTTGACCAAAGAAGA
TTTCATGCAATTAGATGGCATCAAAGAAAAGTCAGCTGATAAATTGCTCG
CTGCGATTGAGGCTTCTAAATCAAATTCAGCTGAAAAACTGTTATTTGGT
CTAGGAATTCGTCATATTGGCTCTAAGGTTAGTCGCTTAATTTTAGAGGT
ATACGGAGATATTTCTGCTCTTTTAACCGCTAAAGAAGAGGAAATCGCAA
GGATAGATGGTCTTGGCTCAACGATTGCTCAATCACTTACTCAATACTTT
GAACAAAAAACGGCTGCGATTTTAGTAGACGAGTTAAAGACAGCAGGTGT
CAACATGCATTACTCAGGTCAAAAAGTTAATAGTGACGCAGCGCTTTTTG
GTCTAACTGTTGTTTTAACTGGCAAATTAAATCAGCTGAACCGAAATGAG
GCCAAAGATAAATTAGAGGCATTAGGTGCCAAAGTTACTGGAAGTGTATC
TAAGAAAACAGATTTAGTTATTGCAGGTAGTGACGCTGGTTCTAAGCTAG
AAAAAGCAAAGAGCTTAGGAATTCGGATTGAAGATGAAGATTGGCTACGC
CAGCTTTAA
>M28_Spy1788 mutL, DNA mismatch repair protein
TTGTTATATCAACGTTTAGAAAGTGTTAAAAACAAAATTATGACAAACAT
TATTGAATTACCGGAAGTTCTCGCCAACCAAATTGCAGCTGGTGAAGTTG
TAGAAAGGCCAGCGAGTGTTGTCAAGGAATTGGTTGAGAATGCTATTGAT
GCTAAAAGTAGCCAGATTACCGTTGAAATTGAAGAGTCTGGCCTTAAGAT
GATACAGGTTACAGACAACGGTGAGGGAATGTCTCATGAAGATTTACCTT
TAAGTCTGCGTCGCCACGCTACTAGTAAAATTAAGAGTCAGAGTGATTTG
TTTAGAATTAGAACACTTGGCTTCCGTGGAGAGGCTTTACCGTCTGTTGC
CTCTATCAGTAAAATCACGATAAAAACAGCAACAAAAGAAGTCACTCACG
GTTCTCTTCTTATAGCTACTGGTGGGGAAATTGAGACACTTGAAGCGATC
TCAACTCCTACTGGAACCAAAATTAAGGTTGAAAACCTTTTTTACAACAC
GCCTGCTCGTCTCAAATATATGAAAAGTTTACAGGCAGAATTAGCTCACA
TTGTAGATGTGGTCAACCGGTTGAGTTTGGCACATCCAGAAGTTGCTTTC
ACACTGATTAGTGATGGTCGCCAATTAACTCAGACATCAGGAACTGGCGA
TTTACGCCAAGCAATTGCAGGGATCTATGGTTTGAATACTACCAAAAAAA
TGCTGGCTATCTCTAATGCTGATTTGGATTTTGAAGTTTCCGGCTATGTT
AGCTTGCCAGAGTTGACACGCGCCAACCGTAATTACATGACGATTTTGGT
TAATGGGCGTTACATCAAGAATTTCTTGCTTAATCGAGCAATTCTTGATG
GTTACGGTTCTAAGCTCATGGTTGGACGTTTCCCAATTGTTGTGATTGAT
ATTCAGATTGATCCCTATTTGGCCGATGTCAATGTTCATCCCACAAAACA
AGAGGTTCGTATTTCAAAAGAGCGTGAGTTGATGGCTTTAATTAGTACGG
CGATTTCTGAAAGTCTTAAGGAACAAGATTTGATTCCAGATGCTCTGGAA
AACTTAGCCAAATCAAGCACACGACATTTCTCTAAACCAGAGCAAACACA
ACTTCCTTTACAGTTTAGGGGACTTTATTATGATCCTCAAAAGAATGACT
TTTTTGCCAAAGAGTCGGCTGTCTCGGAAAAAATACCTGAAACTGATTTT
TATTTCGGCGCTGTTGACAACAGTGTAAAGGTTGAAAAAGCAGAGCTGTT
ACCCCACTCAGAAGAAGTTATAGGACCTTCTTCGGTTAAACACGCAAGTC
GTCCCCAGAATACCTTTATCGAGACTGATCATCCTAATCTTGACTTAAAA
AACAGACAAAAGTTATCTCAAATGCTAACCCGTTTGGAAAATGAAGAGCA
ATCAGTGTTTCCCGAATTGGATTATTTTGGTCAGATGCACGGAACTTATC
TCTTTGCTCAAGGTAAAGATGGCTTATTTATTATCGATCAGCATGCTGCT
CAAGAGCGGGTTAAATACGAATATTATCGTGATAAGATAGGTGAGGTTGA
CAGTAGTTTACAGCAATTGTTGGTGCCCTATTTGTTTGAGTTTTCTGGTT
CTGATTTCATTAACTTACAGGAGAAAATGGCACTCTTAAATGAAGTTGGT
ATCTTCTTAGAAGTTTATGGGCACAATACTTTCATTTTGAGGGAGCATCC
TATCTGGATGAAAGAAGAAGAGATTGCATCTGGTGTCTATGAAATGTGTG
ACATGTTACTTCTAACCAATGAGGTATCTATTAAAACTTACCGAGCAGAG
TTAGCTATTATGATGAGTTGTAAACGATCTATCAAGGCAAATCATAGCTT
GGATGATTATTCAGCAAGAAATCTGCTACTGCAATTGGCCCAATGTCAAA
ATCCTTATAACTGCCCTCATGGTAGACCCGTATTGATTAATTTTAGTAAG
GCAGATATGGAAAAAATGTTCCGTCGTATCCAAGAAAATCACACTAGCCT
GCGAGAGCTAGGAAAATATTAG
>M28_Spy1814 mutS, DNA mismatch repair protein
ATGGCAAAAACTAACATTTCTCCTGGAATGCAACAGTATCTGGACATCAA
AAAAGATTATCCAGATGCTTTTTTGCTTTTTAGGATGGGTGACTTTTATG
AATTATTTTACGAGGACGCTGTCAAAGCAGCACAACTCTTAGAAATTGGT
TTGACCAGTCGCAACAAGAATGCGGAAAATCCAATTCCTATGGCAGGCGT
GCCACATCATTCTGCCCAACAATACATTGATGTGTTAATTGAGTTGGGTT
ACAAGGTTGCTGTCGCAGAACAAATGGAAGACCCAAAGCAAGCTGTTGGG
GTGGTGAAGCGTGAGGTCGTTCAAGTCATAACTCCTGGAACGGTTGTGGA
TTCAGCTAAGCCAGATAGCGCCAATAACTTTTTGGTAGCTGTTGACTTTG
ATGGTTGCCGTTATGGATTGGCTTATATGGATGTGTCCACAGGTGAATTT
TGCGTGACAGATTTGGCGGACTTTACGAGTGTTCGTAGCGAAATCCAAAA
CCTCAAGGCAAAAGAAGTCTTACTAGGTTTTGATTTATCTGAAGAAGAAC
AGACGATTTTGGTCAAGCAGATGAATTTGCTGCTTTCTTATGAAGAAACG
GTCTATGAAGATAAATCTTTAATTGACGGCCAATTGACAACGGTAGAACT
GACAGCGGCAGGAAAACTCTTGCAATACGTTCACAAAACACAAATGCGAG
AACTCAGCCACTTGCAAGCATTGGTTCACTATGAGATCAAGGATTATTTG
CAGATGTCGTATGCCACTAAGTCAAGTTTAGATTTGGTAGAAAATGCTAG
GACTAATAAAAAACATGGAAGTCTCTATTGGCTGTTAGATGAAACCAAGA
CAGCTATGGGGATGAGGCTTTTGCGCTCATGGATTGATCGACCTTTGGTT
TCTAAAGAAGCTATTTTAGAGCGTCAAGAAATTATTCAAGTTTTTCTGAA
TGCTTTTATTGAGCGAACCGATTTAAGCAATAGTTTAAAAGGTGTTTACG
ACATCGAACGCTTATCTAGTCGCGTGTCTTTTGGTAAGGCAAATCCGAAA
GATTTACTTCAATTGGGGCATACCTTAGCCCAAGTGCCTTATATCAAAGC
TATCTTAGAGTCTTTTGACAGTCCTTGTGTTGACAAACTTGTCAATGATA
TTGACAGTTTGCCTGAGTTGGAATACTTGATTAGAACAGCCATTGATCCA
GATGCACCAGCAACTATTAGTGAAGGCAGTATTATTCGTACTGGTTTTGA
TGAGCGCTTGGACCATTATCGTAAAGTGATGCGAGAAGGAACAGGTTGGA
TTGCGGATATTGAGGCTAAAGAGCGTCAAGCAAGCGGCATTAATAACCTA
AAAATTGATTACAATAAAAAAGATGGTTATTATTTTCACGTTACGAATTC
AAATCTTAGCTTAGTTCCCGAGCATTTTTTCAGAAAGGCAACTTTAAAAA
ATTCTGAGCGTTATGGAACAGCAGAATTGGCTAAGATTGAAGGTCAGATG
TTAGAGGCTAGGGAAGAGTCATCTAGTTTAGAATACGATATTTTTATGTG
TATTCGAGCTCAAGTTGAAACCTATATTAATCGTTTACAGAAACTGGCTA
AAATTTTGGCAACGGTAGATGTTTTGCAAAGTTTAGCAGTCGTTGCTGAA
ACCAATCATTATATCCGGCCGCAGTTCAATGATAATCATGTGATTACAAT
TCAAGAAGGTCGTCACGCGGTTGTTGAAAAGGTTATGGGAGTGCAGGAAT
ACATTCCCAATAGTATCTCTTTTGACCAACAGACCAGTATTCAGCTGATT
ACAGGTCCAAATATGAGTGGTAAGTCGACTTATATGAGACAGCTGGCCTT
AACGGTTATCATGGCCCAGATGGGTTCATTTGTGGCTGCTGACCATGTTG
ATTTACCTTTATTTGATGCGATTTTTACGCGTATTGGGGCTGCTGATGAT
TTGATTTCTGGGCAATCAACCTTTATGGTGGAGATGATGGAAGCAAACCA
AGCAATCAAACGCGCAAGTGACAACTCTCTTATTCTATTTGATGAACTGG
GACGAGGTACGGCAACTTATGATGGTATGGCTTTAGCCCAGGCAATTATT
GAATATATCCATGATAGAGTTGGTGCTAAGACCATATTTGCAACGCATTA
TCATGAATTGACAGACTTGTCAACTAAGTTGACAAGTCTAGTCAATGTTC
ATGTAGCAACGCTTGAAAAAGATGGCGATGTTACCTTCCTTCATAAGATT
GCTGAGGGACCGGCGGATAAATCTTACGGTATTCATGTGGCAAAAATAGC
AGGACTGCCAAAATCCCTATTAAAGAGAGCAGACGAAGTTCTGACCCGTT
TAGAAACACAGTCACGATCTACTGAGATAATATCAGTCCCTTCACAAGTT
GAGTCAAGCAGCGCTGTTAGACAGGGGCAATTATCCCTTTTTGGTGATGA
AGAGAAAGCTCATGAGATTAGGCAAGCACTGGAAGCTATTGATGTCATGA
ACATGACCCCGCTTCAAGCAATGACAACCCTTTACGAATTGAAAAAGTTG
TTATAG
>M28_Spy1549 mutS2, DNA mismatch repair protein
GTGAGTTTCACCTTTAGGTTCTTTATTTACGAGAAACTGTTTAGAAATAA
AGAGAACGCATGGGAACTTAGTGACTTTCTTGCCACATTTTCCATCATTT
TAGGTATAATGAAGAGTATGAATAACAAGATTTTAGAGCAGTTAGAATTT
AACAAAGTTAAGGAATTGCTATTACCTTATCTCAAGACAGAACAATCACA
AGAAGAATTATTAGAGCTGGAGCCGATGACGGAGGCTCCTAAAATAGAAA
AAAGTTTTAATGAAATTTCTGACATGGAACAGATTTTTGTTGAACATCAC
TCATTTGGCATAGTCAGCCTAAGTTCAATCTCTGAGAGTTTAAAACGCTT
AGAGCTTTCAGCTGATCTTAATATTCAAGAACTTTTGGCTATCAAAAAAG
TTTTACAGAGTTCTTCGGATATGATTCACTTTTATTCTGATTTGGATAAT
GTTTCTTTCCAATCTTTGGATCGTTTGTTTGAAAATTTGGAACAATTCCC
TAATCTGCAAGGGTCTTTTCAAGCTATCAATGATGGTGGTTTTTTAGAAC
ATTTTGCGAGTCCAGAATTAGAGCGTATCCGTCGTCAATTAACAAATAGT
GAACGACGGGTTCGTCAGATTTTACAGGATATGCTTAAGGAAAAAGCAGA
GCTTTTATCAGAGAATCTAATCGCTAGTCGTAGTGGACGAAGTGTCCTAC
CAGTAAAAAATACTTATCGGAATCGTATTTCTGGTGTGGTTCATGACATC
TCTTCTTCAGGAAGTACTGTTTATATTGAGCCTCGTGCTGTAGTTACACT
AAACGAAGAGATAACTCAGCTTAGAGCTGACGAACGCCACGAAGAAGGTC
GTATTTTACACGCATTTTCAGACTTGTTAAGACCTCATGTCGCCACTATT
AGAAATAATGCATGGATTCTTGGGCATCTTGATTTTGTAAGGGCTAAATA
TCTTTTTATGTCTGATAATAAGGCGACGATACCTAAGATCTCTGATGACA
GCACGTTAGCATTAATCAATGTTCGTCATCCTCTTTTAAGTAATCCTGTG
GCTAATGACTTACATTTTGATCACGATTTAACTGCAATTGTCATCACTGG
TCCCAATACTGGTGGTAAGACGATTATGCTAAAAACACTCGGTTTAGCAC
AATTAATGGGACAGTCTGGTTTGCCAGTATTAGCGGATAAAGGTAGTAAA
ATTGCAGTATTTAACAATATCTTTGCAGATATTGGCGATGAGCAATCTAT
TGAACAAAGTCTATCAACTTTTTCTAGTCATATGACGCACATAGTCAGTA
TTTTAAACGAGGCTGACCGCAATAGTTTAGTTCTCTTTGATGAACTAGGA
GCAGGAACGGATCCTCAAGAAGGTGCTAGTTTGGCTATGGCTATTTTAGA
ACACCTTAGGTTAAGTCATATCAAAACGATGGCGACCACGCACTATCCAG
AATTAAAAGCTTATGGGATTGAGACAAATTTTGTAGAGAATGCGAGCATG
GAATTTGATGCCGAAACGCTTAGCCCCACGTATCGCTTTATGCAAGGAGT
TCCTGGACGATCAAATGCATTTGAAATTGCTTCTCGCCTTGGTTTAGCTC
CATTTATTGTTAAACAAGCTAAGCAGATGACAGATTCTGACTCAGATGTT
AACCGTATTATTGAACAGTTAGAGGCACAGACACTTGAGACACGTAGAAG
ACTGGATCATATTAAAGAAGTTGAACAAGAAAATCTCAAATTCAATCGTG
CGGTTAAGAAACTCTATAATGAATTTTCACATGAACGCGATAAAGAGTTA
GAAAAAATCTATCAAGAAGCTCAAGAAATTGTAGATATGGCTTTGAATGA
GAGTGATACTATCTTAAAAAAACTCAATGATAAGAGCCAATTAAAACCTC
ACGAAATTATAGATGCTAAGGCACAAATAAAAAAATTAGCACCTCAAGTT
GATTTATCAAAAAATAAAGTCTTAAATAAGGCTAAAAAAATCAAAGCAGC
TCGTGCCCCTAGAATTGGTGATGATATTATAGTGACTAGTTATGGACAGC
GAGGTACCTTAACTAGTCAATTAAAAGATGGCCGTTGGGAAGCACAAGTG
GGAATTATCAAAATGACATTAACACAAGATGAATTTAGCCTCGTTAGAGT
CCAAGAAGAACAGAAAGTCAAAAATAAACAGATTAATGTGGTTAAAAAGG
CTGATAGTTCTGGACCAAGAGCTCGACTTGATCTTAGAGGTAAAAGATAC
GAAGAAGCAATGCAAGAGTTAGATCATTTTATTGATCAAGCATTGCTTAA
CAATATGGGACAAGTTGATATCATTCATGGTATTGGTACAGGCGTTATTC
GTGAGGGAGTGACAAAATATCTTCGTCGTCATAAGCATGTTAAGCATTTT
GCTTATGCCTCACAAAATGCAGGGGGATCTGGCGCCACAATTGTAACGTT
AGGGTAA
>M28_Spy1180 mutT, mutator protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)
ATGATGATTCCAACATTTGGACATAAAAATGCACATAAAGACTATGTCAC
ACGTTACGGTGTCTATGCTATCATTCCCAATCACGAACAAACAAAAATTA
TTCTTGTTCAAGCTCCTAATGGTTCCTGGTTTTTACCTGGTGGTGAAATT
GAAGCAGGTGAAGGTCAGCTTCAGGCCCTAGAGCGTGAACTGATTGAAGA
ACTTGGTTTTTCTGCTACTATTGGTTCATATTACGGTCAGGCTGATGAAT
ATTTCTACTCTCGCCATCGTGATACCCACTTCTACCATCCTGCCTATCTT
TATGAAGTAACCGCATTTCAAGCCGTTTCTAAGCCCTTAGAAGATTTTAA
TAACTTAAGTTGGTTTTCTCCTATCGAGGCAATTGCTAAATTAAAACGAG
AGAGCCATCAATGGGGAGTCAAGGAATGGCAAAAAAAGCATCATTCTACT
AACTAA
>M28_Spy1544 mutY, A/G-specific adenine DNA glycosylase
ATGATTGAATTAAAAGATTATGGTATTAATATGTGGGATAATGAGACAAT
CGCTTCTTTTCGTCGCACACTTTTAGGGTGGTATGACCAAGAAAAACGTG
ATCTCCCTTGGCGAAGAACTACTAATCCATATTATATTTGGGTTTCTGAA
ATCATGTTGCAACAAACACAAGTTAATACGGTAATCCCTTATTATAAACG
TTTTCTAGAGTGGTTTCCTCAAATAAAAGATTTGGCAGACGCTCCTGAAG
AACAATTACTAAAGGCATGGGAGGGACTAGGCTATTATTCTCGGGTGCGT
AATATGCAAAAGGCTGCACAGCAAGTGATGGTTGATTTTGGTGGCATATT
TCCTCACACTTATGATGATATTGCTTCATTAAAAGGGATTGGTCCTTATA
CTGCAGGTGCTATCGCCAGCATCTCATTCAACTTACCAGAGCCTGCTGTT
GATGGCAATGTGATGCGTGTCATGGCTCGTTTGTTTGAAGTTAATTATGA
TATCGGTGACCCTAAAAATCGTAAAATTTTTCAAGCTATTATGGAAATAC
TAATTGACCCTGACAGACCCGGTGATTTTAACCAGGCACTTATGGATCTA
GGTACAGACATCGAATCCGCTAAGACACCTAGGCCTGATGAAAGCCCTAT
TCGTTTCTTTAACGCTGCTTATTTGAATGGTACTTATGGTAAATACCCCA
TAAAAAATCCAAAGAAAAAGCCTAAACCAATGCGAATTCAGGCTTTTGTC
ATTCGTAACCAAAATGGCCAATATCTACTGGAGAAAAATACTAAAGGGAG
ACTTCTAGGAGGTTTTTGGTCATTTCCTATTATCGAAACGTCACCTCTTT
CTCAACAATTAGATTTATTTGATGACAATCAATCCAACCCCATAATCTGG
CAAACCCAAAATGAAACTTTCGAAAGAGAATATCAATTAAAGCCCCAATG
GACTGATAATCACTTTCCAAATATTAAGCACACTTTTAGTCACCAGAAGT
GGACAATAGAACTCATAGAGGGGGTGGTCAAAGCAACAGATTTACCTAAT
GCTCCTCACCTAAAGTGGGTAGCAATTGAGGACTTTGCTCTGTATCCCTT
TGCAACACCGCAAAAGAAAATGCTAGAGACCTACTTAAAGCAGAAAAATG
CTTAA
>M28_Spy0710 nth, endonuclease III
ATGAGAATTGGAAAAGCAAGATTAGCAAAAGTCCTGACCATCATTGGTCA
AATGTTTCCTGAGGCTAAGGGAGAGTTAGACTGGGAAACACCTTTTCAAT
TGTTAATTGCGGTGATTTTATCAGCTCAAACGACAGATAAGGCCGTCAAT
AAGGTAACTCCTGGACTATGGCAGTCTTATCCAGAAATAGAAGACTTAGC
TTTTGCTGAACTTTCTGATGTTGAAAATGCTCTGAGAACGATTGGACTCT
ATAAAAATAAGGCCAAAAATATCATTAAAACTGCTCAGGCTATTCGTGAT
GATTTTAAGGGTCAAGTGCCAAAAACCCACAAAGAGCTTGAAAGTTTACC
GGGTGTTGGCCGAAAAACAGCCAATGTGGTATTGGCAGAGGTTTATGGTG
TTCCAGCTATTGCGGTTGATACTCATGTGGCTAGAGTCTCAAAGAGGCTC
AATATTTCATCACCAGATGCCGATGTCAAGCAGATTGAAGCAGATTTGAT
GGCTAAAATTCCAAAGAAAGATTGGATTATTACTCACCATCGATTGATTT
TCTTTGGACGCTACCATTGTTTAGCCAAAAAACCAAAATGTGAGATTTGT
CCCGTTCAGTCTTACTGTAAGTACTATCAAAATACTTATGGAAAATCGAA
AGCCTAG
>M28_Spy0692 parC, topoisomerase IV subunit A
TTGAATATGTCAAACATTCAAAACATGTCCCTTGAGGATATTATGGGAGA
ACGCTTCGGCCGTTATTCCAAGTATATTATTCAGGAACGGGCACTTCCTG
ATATTCGAGATGGATTGAAACCCGTTCAGCGTCGGATTCTTTATTCGATG
AATAAGGATGGCAATACTTTTGAAAAAGGTTACCGTAAATCAGCCAAATC
AGTTGGTAATATCATGGGGAATTTCCACCCGCATGGGGATTCCTCTATTT
ATGATGCCATGGTACGGATGAGTCAAAATTGGAAAAACCGTGAAATCCTT
GTTGAAATGCACGGAAATAATGGTTCAATGGATGGCGATCCGCCTGCGGC
TATGCGTTATACAGAAGCTCGCTTGTCTGAAATTGCAGGTTATCTTCTTC
AAGACATTGAAAAAAATACGGTCTCTTTTGCGTGGAACTTTGATGACACA
GAAAAAGAACCCACCGTTTTACCAGCAGCTTTTCCTAACTTACTTGTCAA
TGGGTCTTCTGGTATTTCCGCAGGCTATGCGACAGATATTCCACCGCACA
ATTTGTCAGAAGTGATTGATGCTGTTGTGTATATGATTGATCATCCCAAG
GCTAGCTTAGAGAAATTGATGGAATTTTTGCCTGGGCCAGATTTCCCGAC
AGGAGGCATTATCCAAGGAGCTGACGAAATCAAAAAAGCCTACGAAACAG
GTAAGGGACGTGTCGTTGTTCGCTCTAGGACGGAAATTGAGGAACTTAAA
GGTGGTAAACAACAAATTATTGTCACTGAGATTCCTTATGAAGTTAACAA
AGCAGTCTTGGTCAAAAAGATTGACGATGTTCGTGTTAACAATAAAGTCC
CAGGCATCGTAGAAGTACGTGATGAATCTGATCGCACAGGTCTTCGCATA
GCTATTGAGTTGAAAAAAGATGCAGATAGCCAAACCATTCTAAATTATTT
GTTGAAATACACAGACCTTCAAGTTAATTATAATTTCAATATGGTTGCCA
TTGATCACTTCACACCACGTCAAGTAGGGCTTCAAAAAATACTATCAAGC
TATATCAGTCACCGCAAAGATATTATTATTGAGCGGTCTAAATTCGATAA
AGCCAAAGCTGAAAAACGCCTCCACATTGTTGAAGGATTGATTCGTGTCT
TGTCCATCTTAGATGAGATTATTGCTTTGATTAGATCGTCTGACAATAAG
ACTGATGCTAAAGAAAATCTGAAAGTCAGCTATGATTTCTCTGAGGAACA
AGCAGAAGCGATTGTAACCTTGCAGCTTTATCGTTTAACTAATACCGATA
TTGTTACTCTCCAAAATGAAGAAAATGATTTAAGAGACTTAATCACGACC
CTTTCCGCTATTATCGGTGACGAAGCAACCATGTATAACGTCATGAAACG
TGAATTAAGAGAAGTGAAAAAGAAATTCGCCAATCCTCGTTTATCAGAGT
TACAAGCAGAAAGTCAAATCATTGAGATTGACACTGCCAGCTTGATTGCA
GAGGAAGAAACTTTTGTTAGTGTGACACGGGGCGGATACCTCAAAAGAAC
CAGCCCACGATCCTTCAATGCGTCTAGTTTGGAAGAAGTTGGCAAGAGAG
ATGATGACGAACTCATCTTCGTTAAACAGGCCAAAACAACAGAACACCTT
TTGTTGTTTACAACTTTAGGCAATGTCATTTACCGGCCAATCCATGAATT
GACCGATTTACGTTGGAAGGATATCGGTGAACATTTATCACAAACCATTT
CAAACTTCGCGACAGAAGAAGAGATTCTCTACGCTGATATTGTGACTTCC
TTTGACCAGGGCTTGTATGTGGCTGTCACACAAAATGGTTTTATCAAACG
CTTTGATCGTAAAGAACTAAGTCCTTGGCGAACTTATAAATCTAAATCAA
CCAAATATGTGAAGCTAAAGGATGACAAAGACCGCGTGGTTACCTTGTCA
CCAGTTATTATGGAAGACCTCCTATTAGTGACTAAAAATGGTTATGCTTT
GCGATTCTCCAGTCAGGAAGTGCCTATTCAAGGGTTGAAATCTGCTGGTG
TTAAAGGCATTAACTTGAAAAATGATGACAGCCTTGCCTCAGCCTTTGCT
GTGACAAGTAACTCTTTCTTTGTCTTAACTCAGAGGGGTTCTCTCAAACG
GATGGCTGTCGATGATATTCCTCAGACAAGTCGTGCCAATCGTGGACTAT
TGGTCCTACGAGAGTTAAAAACCAAACCTCATAGAGTTTTTCTGGCCGGA
GGCGTTCAATCAGATACTTCAGCTGAGCAGTTTGATTTGTTCACTGATAT
ACCTGAAGAAGAAACTAATCAACAAATGCTTGAAGTCATTAGTAAGACTG
GTCAAACCTACGAGATTGCTTTAGAAACGCTTTCGTTATCGGAAAGAACC
AGCAATGGCTCCTTTATTTCAGACACTATTTCGGATCAAGAAGTACTGGT
AGCTAGAACACGTTAA
>M28_Spy0691 parE, topoisomerase IV subunit B
GTGTTGACTAAGAAAGAAATTACAATTAATAATTATAATGACGATGCTAT
CCAAGTCCTAGAAGGGTTAGATGCTGTTCGCAAGCGTCCAGGGATGTATA
TCGGTTCAACAGATGCTACGGGATTGCACCACCTGATTTGGGAAATTGTT
GATAATGCTGTCGATGAGGCCTTGTCTGGTTTTGGAGATGATATTAAGGT
TGTTATCAATAAAGATGGCTCGGTCAGTGTGGCAGATAGCGGACGTGGAA
TGCCAACAGGTCAGCATGCCATGGGGATTCCCACCGTTCAAGTTATTTTT
ACGATTCTTCATGCAGGTGGTAAATTTGGTCAGGGTGGCTACAAAACGTC
AGGTGGTTTGCACGGTGTTGGCTCCTCTGTTGTCAATGCTTTGTCTGCCT
GGTTAGAAGTCGAAATCACAAGAGACGGGTCAGTGTATCGTCAGCGCTTT
GAAAATGGGGGGAAACCTGTTACAACCCTTAAAAAAGTTGGCACAGCTCC
TAAGTCTAAATCAGGAACGGTTGTAACCTTTATGCCAGATGATAAGATTT
TTTCAACTATTGACTTTAAGTTCAATACCATTTCAGAACGATTGAAAGAA
TCTGCTTTTCTTTTGAAAAATGTCAAGATGAGCTTGACAGATCTTCGTGG
AGATGACCCGATTATTGAAGAGTTTCATTATGAAAATGGGGTTCAAGATT
TCGTCGAATACCTCAATGAAGATAAGGAAACCTTGACACCTGTTATTTAC
ATGGAAGGTCAAGACCAAGACTTTCAAGTCGAGGTTGCTTTGCAGTATAA
CGATGGTTTCTCCGACAATATCTTATCCTTTGTAAACAATGTGCGCACCA
AAGATGGTGGAAGCCATGAAACGGGACTAAAGTCAGCTATTACCAAAGCG
ATGAATGACTATGCTCGTAAAACCAATCTCTTAAAAGAAAAGGATAAAAA
TCTAGAGGGCTCAGATTATCGAGAAGGACTCTCAGCAGTATTATCTATCT
TAGTTCCTGAGCAGCACTTGCAATTTGAAGGACAGACCAAAGACAAATTG
GGAAGTCCCTTAGCGAGACCTATTGTAGAGAGCATTGTTTCTGAAAAATT
AACCTTCTTTTTACTCGAAAATGGAGAAGTAGCTTCTCATCTAGTTCGCA
AAGCCATTAAAGCTAGAGATGCTCGCGAAGCTGCTCGAAAAGCGCGTGAT
GACTCACGTAATGGTAAGAAAAACAAAAAAGACAAAGGCTTGTTGTCGGG
AAAATTAACCCCAGCCCAGTCCAAAAATGCCAAGAAAAATGAATTGTATC
TGGTCGAAGGAGATTCTGCGGGAGGTTCAGCCAAACAAGGACGAGACCGC
AAATTTCAGGCTATTTTACCATTACGTGGCAAAGTTTTAAATACCGAAAA
AGCTAAGATGGCTGACATCTTGAAAAATGAAGAAATTAACACTATGGTTT
ATACCATTGGAGCTGGAGTGGGAGCTGACTTTAACCTCGAGGATATCAAC
TATGATAAGATTATTATCATGACCGATGCTGATACCGATGGGGCTCATAT
TCAGACTCTTTTGCTGACTTTCTTTTACCGTTATATGCGACCGTTGGTGG
AAGCAGGTCACGTTTATATTGCGCTTCCCCCGCTTTATAAAATGTCAAAA
GGTAAAGGTAAAACAGAGAAAGTGTCCTACGCTTGGACAGATGGTGAATT
AGAAGATTTACGTAAGGAATTTGGTAAAGGAGCTATTCTTCAACGCTATA
AAGGACTGGGTGAAATGAATGCTAACCAATTATGGGAAACCACTATGGAC
CCTGAAACCAGAACCCTTATTCGTGTTACTATTGACGACTTGGCAAGAGC
AGAGCGACGTGTTTCTGTGTTGATGGGTGACAAAGCAGCCCCACGCCGTC
AGTGGATCGAGGATAACGTCAAGTTTACCTTAGAAGAAAATACGGTGTTT
TAG
>M28_Spy0949 pcrA, DNA helicase II
ATGAATCCTTTATTAAATGGAATGAATGATCGGCAGGCACAAGCTGTTCA
AACAACTGAAGGCCCCTTATTGATTATGGCGGGGGCTGGTTCTGGTAAAA
CAAGGGTACTGACCCATCGTATTGCCTATTTAATTGATGAAAAATTTGTC
AATCCTTGGAATATTTTAGCTATTACCTTTACTAATAAGGCTGCGCGTGA
AATGAAAGAAAGAGCCTTGTCCTTAAATCCAGCTACTAAAGATACCTTAA
TTGCTACCTTTCACTCCATGTGTGTACGGATTCTGCGTCGTGAGGCTGAT
CACATTGGTTACAACCGAAACTTCACAATCGTGGATCCAGGTGAGCAACG
AACGTTGATGAAGCGCATTTTAAAACAATTAAATATAGACCCTAAAAAGT
GGAATGAACGTTCTATTTTAGGAACTATTTCAAACGCTAAAAATGATTTG
CTTGATGAAAAGGGATACGAGGCACAGGCTGCTGATATGTATAGTCAAAT
CGTAGCGAGGTGTTACAAAGCTTATCAGGAAGAATTACGACGTAGCGAAG
CACTTGACTTTGATGATTTAATCATGATGACGCTACGCCTGTTTGACGCT
AATCCTGACGTGTTAGCTTATTACCAGCAGCGTTACCAATACATTCATGT
GGATGAGTACCAAGATACCAACCATGCTCAATATCAGCTAATTAAATTGC
TAGCTTCTCGCTTTAAAAATATTTGCGTTGTTGGAGACGCTGATCAGTCT
ATCTATGGTTGGCGGGGAGCTGACATGCAAAATATTCTTGATTTTGAAAA
AGATTACCCAGATGCTAAGGTAGTGCTTTTAGAAGAAAACTATCGCTCTA
CCAAGAAAATTCTGCAAGCAGCTAACGACGTGATTAACAATAACCGTAAT
CGCCGTCCTAAGAAACTTTGGACACAAAATGCGGATGGTGAACAACTGGT
TTATTACCGGGCAAATGATGAGCGAGATGAGGCAGTATTTGTGGCCTCAA
CCATTAGCAATATGAGTCAAGAGCTTGGAAAAAACTTCAAAGATTTCGCT
GTTTTATACCGTACCAATGCCCAATCTCGGACCATTGAAGAAGCACTCTT
AAAATCCAATATTCCTTACACCATGGTTGGAGGCACCAAGTTTTACAGCC
GTAAAGAAATTCGGGATTTGATTGCCTATTTAACCATTGTTGCTAACCCT
GCTGATAATATTTCTTTTGAGCGGATTGTGAATGAGCCTAAACGAGGTGT
TGGTCCAGGAACGCTTGATAAACTGCGTCAGTTTGCCTATGAGAGTGACC
AGTCTTTATTAGAAGCAGCTTCAAATCTATTGATGTCCCCCTTGAAAGGT
AAAGCAGCACAAGCTATCATGGACTTGGCCAATATTCTCGGTCAGCTACG
TCAAGACCTAGATCAGATGAGTATCACCGACTTAGCAGAAGCTTTGTTAG
AAAAAACAGGTTATTTAGATAGCTTACGCCTGCAAAATACATTGGAAAGC
CAAGCCCGTATCGAAAATATCGAAGAATTCTTATCTGTTACCAAAAATTT
TGACGAGTCAAGTGCCTCTCAAGAAGAAGACGAAACCGGTGTTGATCGCT
TGGGACGTTTTTTAAACGATTTAGCACTGATTGCTGATACAGATGATTCC
CAAGCAGAAGCTGCTGAAGTAACCTTAATGACCCTACATGCTGCCAAAGG
CTTGGAGTTCCCTGTTGTTTTCTTAATTGGTATGGAAGAAGGTGTCTTCC
CCTTATCACGTGCCTCTGAAGATCCAGATGAATTGGAAGAAGAAAGACGT
TTAGCTTATGTCGGAATCACAAGAGCTGAAGAAGTTCTCTTTATGACCAA
TGCCAACACCAGAACCCTCTTTGGTAAAAGTAGTTATAACCGTCCAACAC
GCTTCTTGAAAGAAATTTCAGAGGAACTACTCTCTTATAAAGGATTGGCA
AGACCAGCACAATCTTCATTTGGTGTGCGTTTTTCTACTGAAACACACAC
ACAGTTTGGACAAGGGATGAGCCTATCAGAAGCCTTACAAGCTCGAAAGG
CCCAGGCTCAAGTAAGACAATCAGCACAGCCAATGCAGGCACATACGATA
CCATCAGCTTCAACTAGCTCAGTTTTACCGTTTGGTTCTAATAGCTCTGT
AGAAGAGGTCACTTGGCAGATTGGCGATATCGCTCACCATAAAAAATGGG
GAGACGGGACTGTGCTTGAGGTTTCAGGCTCCGGAAAAACGATGGAATTG
AAAATCAAATTTCCAGAAGTTGGTCTAAAGAAATTACTAGCAAGTGTTGC
TCCTATTGAGAAAAAATAA
>M28_Spy1175 phr, deoxyribodipyrimidine photolyase
TTGCATAGAAGAAAGGGATCTGTTATGGTTTCAGTGATGTGGTTTCGTAG
AGATTTAAGGATTGATGATCAAAAAGCTTTAGCTCATGCTATTGCTAGTC
AATCGCCAACCTTATGTGTGTTTCAATTTAACAAGGAGCAATTAAACCTG
CTACATAGTCGGAATCAATCTAGTTTTATTACTAGCGTTTTGGCTTTTAG
AAAGTTATTAAAATGTGAAAGTATTGACTTATATCTAATGTATGGAGACT
TAATGACCTGTTTTGAGCAATTATTGACACAATTAAAAGACTGGACAGAT
GTGTATTTTAACTATGATGAATCTGGATATGGTCGTTTACGTGATCAAAA
AGCAGCACAATTTTTCAAAAAAAATGGGATTGCTGTTCATACCTACCAAG
ATCACTATTTACATGGTAGTCAAGAGATCATTAACCAATCAGGTCAGCCT
TATAAAGTTTTTACGCCCTACTATAGGATTTGGCAAAATTATCCGAAAGA
GACTCCTATTAAAGTAGAACTATCGCAAGGCAGGTGGTTAAATCTTGAGA
CACCAGATGATGTTTTAAGGACTGTTGAGAGCTTTAAAGATGAAAAATAT
CAGGATGTTGCAACTTTTGATGAAGCGTCAAAACAACTAAATCGATTTAT
TCAAGACCAATTAGCAGCTTATCACGCTAATCGAGATTTTCCAGCGCAGC
TAGGGACGAGTCGGTTGTCTCCCTTTTTAAGAATAGGAGCTATTGGCATT
CGCACGGTATATCACGCTGTGCGTCAAGCACCAAATAGTCTAGGGCAAGC
TACTTTTTTAAAAGAATTAGCTTGGAGAGACTTTTACAATATGGTCTATG
TGGCTTATCCTGATCAGAAAACTCAGCCTATCCAAAAAGCCTTTTCTCAA
ATCGAATGGGTTAATAATCCTGACTGGTTTCAGTTGTGGAAAGAAGGTAA
AACGGGTTACCCTATTGTTGATGCTGCCATGCTTCAGTTACAAAAGACAG
GATGGATGCATAATCGTTTACGAATGATAGTAGCTTCTTTTTTAACTAAA
GATCTTTTATGTGATTGGCGTTTAGGAGAGCAGTATTTTCAACAACAACT
AATTGATTATGATGCTGCCAGTAATATCGGAGGATGGCAGTGGGCTGCTT
CCACTGGAACAGATGCTGTTCCTTATTTTAGAATATTTAATCCTGTTACT
CAAGGTAAGCGTTTTGATCCCAAAGGCGAGTTTATTAAAGCGTATTTGCC
TCAACTAGAACACGTTCCAGAGAAGTATCTCCACGAACCGTGGAAGATGC
CAAAATACCTTCAAGAGAGTGTATCCTGTATTATTGGCACAGACTATCCT
CAACCAATTGTCGATCATGCTAAACAACGTGAACAAGCTATTGCAAAGTA
TGAGTGGGCAAAAGAAAAAGCAAAAATAGAATGA
>M28_Spy0157 polA, DNA polymerase I
ATGGAAAACAAGAATAAATTACTATTAATTGATGGCTCATCTGTTGCCTT
TCGTGCCTTTTTTGCCCTCTACAATCAAATTGACCGCTTTAAAAATCATA
GCGGTCTTCATACCAATGCCATTTATGGCTTTCATTTGATGCTAGACCAC
ATGATGAAAAGAGTCCAGCCTACTCACGTGCTGGTGGCTTTTGATGCGGG
CAAAACCACCTTCCGAACAGAAATGTATGCCGATTATAAGGCGGGTCGCG
CCAAGACACCAGAGGAATTTCGTGAGCAGTTTCCTTATATTCGTGAGATG
TTGACAGCCCTTGGGATTGCTTATTATGAGTTGGAACACTACGAAGCAGA
CGATATTATCGGGACGCTTGATAAAATGGCGGAGCGCACAGAAGTGCCTT
TTGATGTGACCATTGTCAGTGGTGATAAAGATTTGATCCAGTTAACTGAC
GAAAATACCGTGGTTGAAATTTCTAAAAAAGGGGTTGCCGAATTTGAAGA
ATTCACACCGGCTTACCTCATGGAAAAAATGGGCTTGACGCCAAACCAGT
TTATTGACCTCAAAGCCTTGATGGGAGATAAATCGGATAATATTCCAGGA
GTGACCAAAATCGGTGAAAAAACTGGGCTCAAGCTCCTTCATGAATTTGG
TAGTTTGGAAGGCATTTACGAGCATATTGATGGATTCAAGGCCTCAAAAA
TGAAAGAAAACTTGATCAATGACCGTGACCAAGCTTTCCTATCTAAAACG
CTCGCCACTATCAATACAGCATCTCCTATCACAATTGGCTTAGATGATAT
TGTCTACAATGGTCCAGATGTTGCTAGCCTCTCTCAATTTTACGATGAGA
TGGATTTTGTGCAACTCAAGAAAGGTCTTGCTAGCCAGATGCCTCAAGAG
CCAGTAGCTGCCATTTCCTATCAAGAAGTGACCAATGTGTCTGCTGATTT
GTTTAGCGCAGAAGACATCTTCTACTTTGAAACGCTTCGGGATAATTACC
ATTGTGAGGCCATCATTGGTTTTGCTTGGGGACATGGTGAGCAGATTTAC
GCATCCACTGACCTTAGCCTATTAGCGACGGATAGTTTTAAGCAGGTCTT
CCAAAAACCCATTGCCACTTATGATTTTAAACGTAGCAAGGTCTTGTTGA
GCCACTTAGGAATTGAGTTGGTAGCACCTAGCTATGATGCTAGATTAGCT
AATTACCTTCTGTCAACTGTAGAAGACAATGAGCTTAGCACCATTGCCCG
CATTTTTACTGACATCTCTTTGGAAGAAGACGATACAGTCTATGGTAAAG
GTGCTAAACGGGCTGTTCCTGATAAAGACGTTTTACTAGAACACTTAGCT
CGTAAGGTCAAAGTATTATTAGATAGCAAGTCTCAAATGCTAGACAAGCT
TACTGCCCATGAGCAACTAGACCTCTATCAGAATATTGAATTGCCTTTGG
CTAATGTCCTTGCTAAAATGGAAATTGAAGGGATCAAGGTTAATAGGGCG
ACTTTGCAAGATATGGCAGAGCAAAACAAGGTCATTATTGAAGCGCTCAC
CCAAGAGATTTATGATATGGCTGGCCAAGAATTTAACATTAATTCGCCTA
AACAGCTGGGCAGTATCTTGTTTGAGAAGATGCAACTACCTCTTGAGATG
ACTAAGAAGACCAAAACAGGTTATTCTACAGCTGTTGATGTTTTGGAACG
TTTGGCACCGATTGCTCCAATTGTGGCTAAAATTTTGGATTACCGCCAGA
TTACTAAATTGCAATCCACCTATGTGATTGGTTTACAGGATTATATTCTG
GCTGATGGCAAGATTCATACCCGCTATGTGCAGGATCTCACCCAGACAGG
GCGTTTGTCTAGTGTGGACCCTAATCTTCAAAACATTCCCATTCGTTTGG
AACAGGGGCGTTTGATTCGTAAGGCCTTTACCCCATCTCATGAAGATGCC
GTCTTGTTGAGTTCAGATTACTCACAGATTGAATTGCGGGTACTGGCACA
TATTTCAGGGGATGAGCATTTGATTGCTGCCTTTAATGAAGGGGCAGACA
TTCATACCTCAACGGCTATGCGTGTGTTTGGGATTGACAAGGCAGCAGAT
GTTACTGCCAATGACCGCCGTAATGCCAAGGCTGTTAACTTTGGAATTGT
GTATGGGATTTCTGATTTTGGTTTGTCAAATAACCTTGGTATCACCCGTA
AACAGGCCAAGTCTTACATTGATACCTATTTTGAACGCTATCCTGGGATT
AAAGCCTATATGGAAAATGTGGTGCGTGAGGCTAAAGACAAGGGCTATGT
AGAGACCCTCTTTAAGCGTCGTCGTGAATTACCGGATATCAACTCTCGTA
ATTTCAACGTTCGCTCTTTTGCGGAGCGTACAGCCATCAACTCGCCCATT
CAAGGAAGCGCAGCTGATATTCTCAAAATCGCTATGATTAATCTGGATAA
GGCCTTGCAAGCAGGTGGTTTTAGAGCTAAAATGCTGCTTCAAGTGCATG
ATGAAATCGTTTTGGAAGTGCCAAATGATGAGTTGACTGCTATAAAAAAA
CTTGTCAAAGACACCATGGAAGCTGCTGTTGATTTAGCTGTTCCTTTATG
TGTCGATGAAAGTACTGGGCAGAGCTGGTACGAAGCCAAATAA
>M28_Spy1660 polC, DNA polymerase III alpha subunit
ATGTCAGATTTATTCGCTAAATTGATGGACCAGATAGAAATGCCACTTGA
CATGAGACGTTCAAGTGCCTTTTCATCTGCTGATATTATCGAGGTAAAGG
TGCATTCGGTGTCACGCTTGTGGGAATTTCATTTTGCCTTTGCGGCGGTT
TTACCGATTGCAACTTATCGTGAATTACATGATCGTTTGATAAGAACTTT
TGAGGCGGCTGACATTAAGGTAACCTTTGATATCCAAGCTGCTCAGGTGG
ATTATTCAGATGATCTGCTTCAAGCTTATTACCAAGAAGCTTTTGAGCAT
GCACCGTGTAATAGTGCTAGTTTTAAATCTTCTTTCTCAAAGCTCAAAGT
GACTTATGAGGATGACAAACTCATTATTGCAGCGCCAGGTTTTGTGAATA
ACGATCATTTTAGAAACAGTCATCTGCCTAATCTGGTCAAGCAATTTGAA
GCCTTTGGCTTTGGCACCTTGACCATAGATATGGTGTCAGATCAGGAGAT
GACTGAGCATTTGACCAAGGATTTTGTTTCCAGTCGTCAGGCTCTTGTGA
AAAAGGCTGTGCAGGATAATTTGGAAGCCCAAAAATCCCTTGAAGCCATG
ATGCCACCAGTTGAGGAAGCCACACCTGCTCCTAAGTTTGACTACAAGGA
ACGAGCAGCTAAGCGTCAGGCAGGGTTTGAAAAAGCGACCATCACACCAA
TGATTGAGATTGAGACCGAAGAAAACCGGATTGTCTTTGAGGGTATGGTT
TTTGATGTGGAGCGTAAAACGACTAGAACAGGTCGCCATATCATCAACTT
TAAAATGACAGACTATACCTCCTCGTTTGCTCTGCAAAAATGGGCCAAAG
ACGATGAGGAGCTCCGTAAATTTGACATGATTGCTAAGGGAGCTTGGTTA
CGGGTACAAGGGAATATTGAGACCAATCCTTTTACGAAGAGTCTCACCAT
GAATGTGCAGCAGGTCAAAGAAATTGTCCATCATGACCGCAAAGACCTGA
TGCCAGAAGGGCAAAAGCGGGTCGAACTTCATGCCCACACCAATATGTCT
ACCATGGACGCCTTACCGACAGTAGAAAGCTTGATTGATACGGCAGCCAA
GTGGGGACACAAGGCGGTTGCTATTACCGACCATGCTAATGTGCAAAGTT
TTCCTCATGGCTACCATAGGGCTCGCAAAGCTGGAATTAAGGCTATTTTT
GGCCTAGAAGCCAATATTGTTGAGGACAAGGTGCCTATTTCTTATGATCC
TGTTGATATGGATTTGCACGAAGCTACCTATGTGGTCTTTGACGTGGAAA
CCACAGGTCTATCTGCTATGAATAATGACCTGATTCAGATTGCGGCTTCC
AAAATGTTTAAAGGCAATATTGTAGAGCAGTTTGATGAATTCATTGATCC
TGGGCATCCTCTTTCTGCCTTTACCACCGAATTGACAGGGATTACCGATA
AGCATTTGCAGGACGCCAAGCCATTGGTTACCGTCCTAAAAGCTTTTCAG
GACTTTTGCAAAGATAGTATCTTGGTTGCCCACAACGCCAGTTTTGACGT
GGGCTTTATGAACGCCAATTATGAACGCCACGACTTGCCCAAAATCACAC
AGCCTGTGATTGATACCTTAGAATTTGCTAGAAACTTGTATCCTGAGTAC
AAGCGTCACGGTTTGGGACCGCTCACCAAGCGTTTCCAAGTGAGTCTAGA
CCACCATCATATGGCCAATTACGACGCGGAAGCCACAGGACGTCTTTTGT
TTATTTTTCTAAGAGATGCCAGAGAAAAGCATGGCATCAAAAATCTTTTG
CAACTCAATACAGATTTGGTAGCTGAGGATTCTTACAAAAAAGCGCGGAT
TAAGCATGCGACTATCTATGTGCAAAATCAGGTTGGCCTTAAAAATATGT
TTAAGTTGGTCAGCCTTTCCAATATTAAATATTTTGAAGGGGTGCCGCGT
ATTCCAAGAACCGTCTTAGATGCTCACAGAGAGGGTTTGTTACTTGGTAC
AGCTTGTTCTGACGGCGAGGTTTTTGATGCCGTTCTGACTAAAGGAATTG
ATGCGGCGGTTGATTTGGCTAAGTATTATGATTTTATCGAAATCATGCCA
CCAGCCATTTACCAGCCATTGGTTGTCCGTGAATTAATCAAAGACCAAGC
AGGTATTGAGCAGGTGATTCGTGACCTCATTGAAGTAGGGAAACGAGCTA
ATAAACCTGTACTTGCCACTGGAAATGTGCATTACCTAGAGCCTGAAGAA
GAGATTTACCGTGAAATTATTGTGCGTAGTCTCGGTCAGGGTGCCATGAT
TAATAGAACAATCGGCCGTGGGGAAGGGGCCCAACCTGCTCCCCTACCTA
AAGCGCACTTTAGAACAACCAATGAAATGCTGGATGAGTTTGCCTTTCTT
GGAAAAGACCTCGCTTATCAAGTGGTTGTAGAAAATACTCAGGATTTTGC
GGACCGTATTGAGGAAGTGGAAGTGGTTAAGGGCGATCTTTACACCCCGT
ATATTGACAAGGCCGAAGAGACGGTTGCCGAATTAACCTATCAAAAAGCC
TTTGAAATTTATGGTAATCCTCTCCCAGATATTATTGATTTACGCATTGA
AAAAGAGTTAACCTCTATCTTGGGGAACGGTTTTGCTGTGATTTATCTCG
CTTCCCAAATGCTTGTTAACCGGTCAAATGAGCGAGGCTATCTGGTTGGC
TCTAGGGGATCTGTAGGGTCTAGCTTTGTCGCCACCATGATTGGGATTAC
TGAGGTTAATCCTATGCCGCCTCACTACGTTTGCCCGTCCTGCCAACATT
CTGAATTTATCACAGATGGGTCAGTTGGATCTGGCTATGATTTGCCTAAT
AAACCCTGTCCGAAATGTGGCACCCCTTATCAAAAAGATGGGCAAGACAT
TCCCTTTGAGACCTTTCTTGGGTTTGATGGGGATAAGGTGCCCGATATTG
ATTTGAACTTCTCTGGTGATGACCAGCCCAGTGCCCATTTGGATGTCCGA
GATATTTTTGGTGACGAATACGCCTTTCGTGCTGGAACAGTTGGTACCGT
AGCAGAAAAAACAGCTTATGGATTTGTCAAAGGCTATGAACGCGACTATG
GCAAGTTCTATCGTGATGCTGAGGTGGATCGTCTAGCAGCAGGTGCTGCT
GGTGTGAAACGAACGACTGGGCAGCACCCTGGGGGGATTGTTGTTATTCC
TAATTACATGGATGTTTATGATTTTACCCCCGTGCAATATCCAGCAGATG
ATGTAACGGCTTCTTGGCAGACAACTCACTTTAACTTCCATGATATTGAT
GAAAACGTCTTGAAACTTGATATCCTAGGGCATGATGATCCGACCATGAT
TCGTAAACTTCAGGATTTATCGGGCATTGATCCTATTACTATCCCTGCTG
ATGATCCAGGTGTTATGGCTCTCTTTTCTGGGACAGAGATTTTGGGCGTT
ACCCCGGAACAAATTGGGACACCGACTGGTATGCTAGGCATTCCAGAATT
TGGAACCAACTTTGTTCGCGGCATGGTTAATGAGACGCATCCGACCACTT
TTGCGGAGCTTTTGCAGTTGTCTGGACTATCTCATGGAACCGATGTTTGG
CTTGGTAATGCACAAGATTTGATTAAAGAAGGCATTGCGACCCTAAAAAC
CGTTATCGGTTGTCGTGACGACATCATGGTTTACCTCATGCACGCAGGCT
TAGAACCGAAAATGGCCTTTACCATTATGGAGCGTGTGCGTAAGGGCCTC
TGGCTGAAAATTTCTGAGGAAGAACGTAATGGCTATATTGATGCCATGCG
AGAAAACAATGTGCCCGACTGGTACATTGAATCGTGTGGAAAAATCAAGT
ACATGTTCCCTAAAGCCCATGCGGCGGCCTATGTCTTGATGGCCCTTCGG
GTGGCTTATTTCAAGGTGCACCACCCCATTATGTATTATTGTGCTTATTT
CTCTATTCGTGCGAAGGCTTTTGAATTAAAAACCATGAGTGGTGGCTTAG
ATGCTGTTAAAGCAAGAATGGAAGATATTACTATAAAACGTAAAAATAAT
GAAGCCACCAATGTGGAAAATGACCTCTTTACAACCTTGGAGATTGTCAA
CGAAATGTTAGAACGCGGCTTTAAGTTTGGCAAATTAGACCTTTACAAAA
GTGATGCTATAGAATTCCAAATCAAAGGAGATACCCTTATCCCTCCATTT
ATAGCGTTAGAAGGTCTGGGTGAAAACGTGGCCAAGCAAATCGTTAAAGC
TCGTCAAGAAGGCGAATTCCTCTCTAAAATGGAATTGCGTAAACGAGGCG
GGGCATCGTCAACGCTCGTTGAGAAAATGGATGAGATGGGTATTTTAGGA
AATATGCCAGAAGATAATCAATTAAGTCTTTTTGATGACTTTTTCTAG
>M28_Spy1380 priA, primosomal protein N'
ATGTCCATGACAGAAAAGGAGAAGCAAATGGAAAAAGTAGCTCATGTGAT
TGTAGATATTCCATTGATGCAAACGGACAAGCCATTTTCTTATGGTATTC
CAAAAGAGTTAGTTTCTCTCGTGCAGCTTGGTTCTCGTGTGCATGTTCCT
TTTGGAAAAGGGAATCGTTTGTTGCAAGGCTTTGTTATTGGTTTTGGCCA
GGAAGATTCAAGCTCTCTTAAACTGATTCAGACCGTTTTAGATCCTGAGC
CAGTCCTAAACCAAGAACAATTGACCCTTGCTGATCAGCTTCGAAAAACA
GTTTTTTCTTATAAAATCACGCTCTTAAAAGCAATGATTCCTAATCTTCT
TAACTCTAACTATGATAAAGTGCTAAGGCCAGAGTCAGGTCTAAAAAAGC
CTGATAGGGACTTTCTTTTTGAAGGAAAACCATCTGTCTTATATTCTACC
TTAGACCGCGAGAAGGAAAAAATAGCTCTTAAGGGCATACAAGCTGGGCA
TATTACTGTTAGTTATTTAGCCAAAGACAAGAAAAACCTAAAGACAGAAA
AATATTATCACGTCGACTTAGACGCCTTAGCGGTACATCCCATCTCTAGT
CGTGCCAAAAAGCGTCAATTATTAAAAGACTATCTGCTAACCCATACGAA
GGAAGCTAAACTTGCAACGCTTTATCAAGCCTTTTCTAGAGATGTGGTGG
CTTACTTTGTGACAAATCACTTAATTCGTATTGACGAACGTCAAATTGAT
CGCAGTGAGCCCTATTTTGACCAGATCAAACCATCTTCTTTTTTAACCTT
AAATGAACAGCAGGCATCAGCTGTTACTGAAATTGTTGAGCAAATTGGGA
AACCGAGTAAACCTTTTTTGATTGAAGGTATTACAGGTTCGGGTAAGACA
GAAGTTTATCTTCATATCATCGAAGCGGTTTTAAAACAGGATAAGACAGC
CATTGTTTTAGTACCAGAAATTTCGTTGACTCCTCAGATGACCTCTCGTT
TTATTTCCCGTTTCGGAAAGCAAGTGGCTATTATGCATTCAGGCTTATCA
GATGGTGAAAAGTTTGATGAGTGGCGCAAGATAAAAACAGGACAGGCTAA
GGTTGTGGTTGGTGCCCGCTCTGCTATTTTCTCTCCACTAGAGCGGATTG
GTGCAATTATTATTGATGAGGAGCATGAATCAACCTATAAACAAGAAAGC
AACCCTAGATACCATGCCAGAGAGGTTGCCCTGCTCAGAGCTAAACACCA
TCAAGCAGTTGTGGTTATGGGCTCTGCTACGCCAAGTATTGAAAGCCGAG
CAAGGGCTAGTAAGGGTGTCTATCATTTTATTCAATTAACGAAAAGAGCA
AACCCTCTTGCTAAGATTCCAGAAGTAACGATTGTTGATTTTCGTGATTA
TATTGGACAGCAAGCAGTTAGTAATTTTACCCCATATTTGATTGATAAGA
TTAAAGAACGTTTGGTTAAAAAAGAACAAGTTGTCTTAATGTTAAATAGA
CGTGGTTATTCTAGTTTTGTGATGTGTCGGGACTGTGGTTATGTGGACAA
ATGTCCCAACTGTGATATCTCTTTAACCCTTCACATGGATACTAAAACTA
TGAATTGCCATTACTGTGGGTTTCAAAAACCTATCCCAATTACTTGTCCT
GAGTGTCATAGCAACAGTATCCGCTATTATGGCACTGGAACTCAAAAAGC
TTTTGATGAATTGCAAGGGGTTATCCCAGAAGCTAGGATCTTGAGAATGG
ATGTTGACACCACACGAAAAAAAAGAAGTCACAAAACCATACTAGATAGT
TTTGGTCGCCAGGAAGCAGATATTTTGTTAGGGACGCAAATGATTGCCAA
AGGACTGGATTTTCCAAATGTGACTTTAGTTGGGGTACTAAATGCAGATA
CCTCCTTAAATTTGCCAGATTTTCGAGCGTCAGAAAAAACGTTTCAATTG
TTAACACAGGTTGCTGGTCGGGCAGGCCGTGCCCATAAGCCAGGGGAAGT
CTTGATTCAAACTTATAATCCCGATCACTATGCTATTCAATTAGCTAAAC
AACAAGATTTTGAAGCCTTTTACCGTTATGAAATGGCGATTCGCCGTCAG
ATGGCTTATCCCCCTTACTACTTTACAGTGGGTATTACGCTTTCGCATCG
TTTAGAAGCATCGGTTGTAAAAAAAGCTTATCAAGTTACAGAACTGCTAA
AGAGTCACTTATCGGATAATATTAAAATATTAGGACCGACTCCTAAGCCA
ATTGCTAGAACACACAATTTATACCACTATCAAATTTTGTTAAAATACCG
TTTTGAAGATAACCTAGAAGAGACGCTCAATCGTATTCTTGATTGGAGTC
AAGAAGCAGATAATCGTCATTTAAAACTAATTATTGATTGTGAACCGCAA
CAATTTTTATAA
>M28_Spy0816 radC, DNA repair protein
ATGTATTCTATAAAATGTGATGATAATAAAGCCATGCCAAGAGAACGTTT
GATGCGACTAGGAGCAGAGTCTCTAAGTAATCAAGAATTATTAGCAATTT
TATTACGAACAGGTAATAAAGAAAAGCATGTCTTAGAGCTGTCATCCTAT
CTTTTATCGCATTTAGACAGTCTGGCAGATTTTAAAAAGATGTCTTTGCA
AGAATTACAACATTTGGCAGGTATAGGAAAAGTTAAAGCGATTGAAATTA
AAGCTATGATTGAGTTGGTTTCCCGAATTTTAGCGACCGATAAGACATTA
ACTGATAGCGTATTAACCAGTGTTCAGGTCGCTGAAAAAATGATGGCAGC
TTTAGGAGATAAAAAACAAGAGCATTTAGTCGTATTGTATTTAGATAATC
AAAATCGTATTTTTGAAGAAAAAACTATTTTTATTGGGACTGTCCGACGT
TCACTTGCAGAACCAAGAGAAATTTTATACTATGCCTGTAAAAATATGGC
GACTAGTCTCATTGTTATTCATAATCATCCTTCAGGAAATATTGAACCTA
GTTCTAACGATTATTGCTTTACTGAAAAAATAAAACGATCATGTGAAGAT
TTAGGCATTATCTGTCTAGATCACATTATCGTTAGCTATAAAGATTATTA
TAGTTTTCGAGAAAAATCAACCCTTTTTTAA
>M28_Spy1783 recA, RecA
TTGGCAAAAAAATTAAAAAAGAATGAAGAAATCACTAAGAAGTTTGGTGA
CGAACGTCGCAAAGCCCTTGATGATGCTTTGAAAAATATTGAAAAAGATT
TTGGTAAGGGCGCAGTGATGCGATTAGGAGAACGTGCAGAGCAAAAAGTT
CAGGTTATGAGTTCAGGAAGTCTAGCTCTTGATATTGCGCTTGGAGCTGG
TGGTTATCCTAAAGGACGTATCATCGAAATCTATGGTCCAGAGTCTTCCG
GTAAAACGACTGTGGCTTTACATGCTGTAGCACAAGCTCAAAAAGAAGGT
GGAATCGCAGCCTTTATCGATGCCGAGCATGCGCTTGATCCAGCTTATGC
TGCTGCGCTTGGGGTTAATATTGATGAACTCCTCTTGTCTCAACCAGATT
CTGGAGAACAAGGACTTGAAATTGCAGGTAAATTGATTGATTCTGGTGCG
GTTGATCTGGTTGTTGTCGATTCAGTAGCAGCTTTAGTGCCACGTGCTGA
AATTGATGGTGATATTGGCGATAGCCATGTCGGATTGCAAGCACGTATGA
TGAGTCAGGCTATGCGTAAATTATCAGCTTCTATTAATAAAACAAAAACT
ATCGCTATCTTTATTAACCAATTGCGTGAAAAAGTTGGTGTCATGTTTGG
AAATCCTGAAACAACACCAGGTGGTCGAGCTTTGAAATTCTATGCTTCTG
TTCGGTTGGATGTGCGTGGAACAACTCAAATTAAAGGAACTGGTGACCAA
AAAGATAGCAGCATTGGTAAGGAGACCAAAATCAAGGTTGTTAAAAACAA
GGTCGCTCCGCCATTTAAGGTAGCAGAAGTTGAAATCATGTATGGGGAAG
GTATTTCTCGTACAGGGGAGCTTGTGAAAATTGCTTCTGATTTGGACATT
ATCCAAAAAGCAGGTGCTTGGTTCTCTTATAATGGTGAGAAGATTGGCCA
AGGTTCTGAAAATGCTAAGCGTTATTTGGCCGATCATCCAGAATTGTTTG
ATGAAATCGACCGTAAAGTACGTGTTAAATTTGGTTTGCTTGAAGAAAGC
GAAGAAGAATCTGCTATGGTAGTAGCATCAGAAGAAATCGATGATCTTGC
TTTAGATTTAGATAATGGTATTGAAATTGAAGATTAA
>M28_Spy1554 recD, exodeoxyribonuclease V alpha chain
ATGGAATACGTTTTTACAGGTACTGTTGATCGTATCATTTTTGAAAACCA
GGCTAATTTCTTTAAGATTCTCCTCCTTGCCATTGAGGATACAGACAGTG
ACATTGACGACTTTGAAATCATTATCACAGGAACGATGGCTGACATTATT
GAAGGAGATGACTACACCTTTTGGGGAGAATTGACCCAGCACCCTAAATA
TGGACAGCAACTCAAACTAAGCCGTTACCAAAAAATCAAACCTAGTTCAT
CTGGTTTGGTTAATTATTTCTCTAGCGACCATTTTAAGGGGATTGGTAAA
AAAACAGCGGAGAAAATCATTGCACTATATGGTCATAATACCATTGACCA
TATTTTAGAAGACCCAAGCAAATTAGAAACTATCTCTGGCCTATCTAAGG
CTAATCGTCAAGCCTTTGTCGCTAAACTAAAATTGAATTACGGCACAGAG
CAACTGATTGCTGGTCTCGTCGAACTTGGCCTTAGCAACCGTTTTGCCTT
TCAAGCGTTTGAAAAGTATAAAGAAGAGGCTCTTGACCTTGTTAAAGAAA
ATCCCTATCAGTTAGTCGAAGATCTACAAGGTTTTGGGTTTAAAATGGCA
GATGCTCTCGCTGAAAACTTAGGGATTGAAAGCGGCTCTCCGAAACGTTT
TCGTGCAGCCCTCCTTCACTGTCTCTTGGAAGAATCCATCAATCGAGGAG
ATACTTATGTTCAAGCACGACAATTATTAGACTTTGCCATTACACTCCTT
GAAGATGCACGTCAAGTAGAATGTGATCCTGCTGCTGTGGCTGAACAACT
AAGCGAGTTGATCATAGAGGGCAAAATCAAAAACAGTGACACCAAACTGT
TTGATGCTAGCCTTTATTTTGCTGAAGAAGGGATTGCTAACAACATCTCT
CGTCTCTTAGATACCCCTTTAAGTCAGTCATTTAGTCATGATACCATTCA
AACAACCATCCAAGCCGTTCAAAAAGACTTTGCCATCACCTATGACCAAG
TGCAGCAAGAAGCCATTACTAAGGCCTTAACCAGCAAGGTCTTTCTCCTA
ACAGGTGGTCCCGGAACAGGAAAAACAACTGTTATTCGAGGCATTTTGCA
GGCTTACGCGAACCTGCATCAGATTGATTTGGATAAAAAAGACCTTCCTA
TCTTGTTAGCAGCTCCAACAGGTCGGGCTGCACGTCGCATGAATGAGTTG
ACTGGACTTCCTAGCGCAACCATCCACAGGCACTTAGGCCTCAATGGCGA
CAACGATTACCAAGCCATGGAGGATTATCTAGACTGCGACCTGCTGATTG
TCGATGAATTTTCAATGGTGGATACCTGGCTTGCCAACCAGTTGTTAGGA
GCTATTAATTCAACAACTCAAGTGATTATTGTCGGAGATAGTGACCAGCT
TCCTTCGGTTGGACCCGGTCAAGTCCTGTCAGATCTTTTAAAAGTCAATA
GCCTGCCCCAAATCGCCTTGCAAAAGATATTTCGTCAATCCCAAGAATCT
ACTATTGTCAATTTGGCAGACCAGATGCGTCGAGGAATCTTAGCTGCTGA
CTTTCGTGATAAAAAAGCTGACCGTTCTTATTTTGAAGCCCAAGCAGCCT
TTATCCCTGACATGATTCAAAAAATTGTCCTATCTGCTATTAAAAGTGGC
ATCCCTGCTGAGGAAATTCAAATTTTAGCGCCTATGTACAAAGGACAAGC
TGGCATCAATCATCTTAATCAACTCATGCAAGAACTTCTCAATCCCTTGC
AAGGACAAACAGAATTTCTGTTCAATGATACGCATTTTCGTAAAGGTGAT
AAAGTCCTGCACTTAGTCAACGATGCTCAGTTGAATGTCTTTAACGGAGA
TATTGGTTATATTACAGATTTGATTCCTGCTAAATACACCGAATCTAAGC
AAGACGAATTAATCTTAGATTTTGACGGTAGCGAAGTCACGTACCCTAGA
AATGAATGGCTAAAATTAACCCTGGCCTATGCCATGAGCATTCATAAATC
GCAAGGGAGTGAGTTTCAAGTGGTGATTTTACCTATCACACGCCAAAGCG
GCCGACTCTTGCAACGAAATGTGATTTACACGGCCATTACTCGGTCTAAA
AGTAAGTTAATTCTGTTGGGAGAATATACTGCCTTTGAGTATGCTATTAA
ACACGAAGGCGATAAACGCCAAACCTACTTGATCGAACGCTTCCAAGAAC
AATCCGACTTAGCCTCCTCTCAATCAACAAACTCTAACCCCACTGAGAAC
TCTCAGTCAGATAATGATGATTTTAGGTTAACACCTGAGAATTATTCGAC
TATCGATTCGATGATAGGGCTTACAGAGTCAGATATTGCCCTCTTTTTCC
AGAAAAAATCCTAG
>M28_Spy1888 recF, DNA replication and repair protein recF
ATGTGGATTAAAGAGTTAGAGTTAAAACATTATCGCAATTATGACCACCT
GCTTGCCTCATTTTCGTCGGGTTTAAATGTCTTTATCGGTAATAATGCTC
AAGGAAAAACCAATTTTCTCGAGGCAATCTATTTTCTATCACTTACTAGA
AGTCATCGCACGAGGGCTGATAAAGAATTGATTCATTTTGATCACTCAAC
TGTTTCTCTTACTGGTAAGATTCAGCGTATTAGTGGTACTGTTGATTTAG
AAATCAATCTATCAGATAAAGGACGTGTGACAAAGATTAATGCGCTAAAG
CAAGCAAAATTATCTGATTATATTGGAACGATGATGGTTGTGCTTTTTGC
ACCAGAAGATTTGCAACTAGTTAAGGGAGCACCTAGCCTTCGTCGCAAAT
TTATCGACATTGACCTTGGTCAAATTAAGCCTGTTTACTTATCTGAGTTA
TCCCATTATAACCACGTGCTTAAACAGCGTAATAGCTATTTAAAAAGTGC
CCAACAAATTGATGCCGCTTTTCTAGCTGTTCTAGATGAGCAATTAGCTG
GCTATGGAGCCCGTGTCATGGAACATCGTATTGATTTTATCAATGCGTTA
GAGAAAGAAGCAAATACTCATCACCAAGCCATCTCAAATGGTTTAGAAAG
TCTCTCTCTCTCCTATCAGTCGTCAGTTGTCTTTGACAAAAAAACTAATA
TTTACCAACAATTTTTACACCAACTTGAAAAAAATCATCAGAAAGATTTC
TTCCGTAAAAACACTAGCGTTGGTCCACATCGCGATAACTTAGCCTTTTA
CATTAACGGGATGAATGCTAACTTTGCTAGTCAAGGTCAGCACCGCAGCC
TTATTCTTTCCTTAAAAATGGCTGAAGTTAGTTTAATGAAGGCCTTGACT
GGAGATAACCCCATTCTTTTACTAGACGATGTCATGAGCGAGCTAGACAA
TACACGACAAACAAAGTTACTTGAAACAGTAATTAAAGAAAATGTCCAAA
CCTTTATCACAACAACAAGTTTGGATCACCTGTCACAGTTGCCAGAAGGT
ATCCGTATTTTTCACGTAACAAAAGGAACCGTTCAAGTTGATTCTGATAT
TCACTAA
>M28_Spy1509 recG, ATP-dependent DNA helicase
ATGATATTAACAGCTCCTATGTCCAACTTAAAGGGATTTGGACCAAAATC
AGCAGAAAAATTTCAGAAATTAGATATTTATACAGTAGAAGATTTACTGC
TTTATTATCCGTTTCGCTATGAAGATTTTAAATCAAAATCTGTTTTTGAT
TTAGTGGATGGTGAAAAAGCAGTCATTACAGGCTTAGTCGTTACTCCAGC
TAATGTACAATATTATGGTTTTAAACGTAACCGTTTAAGTTTCAAATTGC
GTCAAGGGGAAGCTGTCTTAAATGTTAGTTTTTTTAATCAACCCTATTTA
GCTGATAAAATAGAACTTGGTCAAGAGGTAGCTGTTTTTGGTAAATGGGA
TGCCACTAAATCGGCTATTACTGGGATGAAGGTTTTAGCTCAAGTTGAAG
ATGACATGCAACCTGTTTATCGCGTAGCTCAGGGAATTTCACAGTCTACT
TTGATTAAAGCTATTAAGTCAGCTTTTGAAATCGATGCGCATTTGGAATT
GAAGGAAAATTTACCAGCTACTTTATTGGAAAAATACCGATTGATGGGTC
GTAGTCAGGCTTGTTTAGCTATGCATTTCCCAAAAGATATCACAGAGTAT
AAGCAAGCGCTCCGTCGGATTAAATTTGAAGAATTATTTTACTTTCAAAT
GAACCTTCAAGTTTTGAAAGCCGAAAATAGATCTGAAACAAATGGTTTGC
CTATTCTTTATAGTAAACATGCTATGGAGACAAAGATTTCCTCTTTACCC
TTTATTCTAACAAATGCTCAAAAGCGCTCTTTAGATGACATATTATCTGA
TATGTCATCGGGAGCTCATATGAATCGTTTATTGCAAGGAGATGTAGGAT
CAGGAAAGACAGTCATTGCTGGTCTATCAATGTATGCAGCTTATACAGCA
GGTTTTCAATCGGCTTTGATGGTTCCAACGGAAATCCTAGCTGAACAACA
CTACATTAGTCTGCAAGAGTTATTTCCAGATTTATCAATCGCTATATTAA
CTTCGGGTATGAAAGCAGCTGTCAAGCGTACGGTTTTAGCAGCTATTGCA
AATGGCTCGGTTGATATGATTGTAGGAACTCATGCTCTTATCCAAGACTC
GGTACAGTACCATAAACTGGGGCTTGTCATTACAGACGAGCAACATCGTT
TTGGTGTTAAACAGCGTAGAATTTTCCGTGAAAAGGGAGAAAATCCTGAT
GTTTTAATGATGACAGCCACCCCAATTCCCCGAACTCTAGCAATCACAGC
TTTTGGAGAAATGGATGTTTCTATTATTGATGAATTACCTGCCGGTCGTA
AACCTATTATGACACGCTGGGTGAAACACGAGCAGCTAGGTACTGTGTTG
GAATGGGTAAAAGGTGAATTGCAAAAAGATGCTCAAGTGTATGTCATTTC
ACCGTTGATTGAAGAATCAGAAGCTTTAGATTTAAAGAATGCAGTAGCAT
TGCATGCTGAATTATCTACTTATTTTGAAGGAATTGCTAAGGTTGCTCTT
GTACATGGACGTATGAAAAATGATGAAAAAGATGCTATAATGCAAGATTT
CAAGGATAAAAAAAGTCATATTTTAGTATCCACAACAGTTATTGAAGTAG
GGGTAAATGTCCCAAATGCAACGATCATGATTATTATGGATGCCGATCGT
TTTGGATTAAGTCAGTTACATCAACTTCGTGGGCGTGTTGGTCGTGGATA
TAAACAATCATACGCTGTTTTAGTGGCTAATCCCAAAACTGATTCGGGGA
AAAAACGAATGACAATCATGACAGAAACGACAGATGGTTTCGTTTTAGCT
GAGTCGGATTTAAAAATGCGTGGTTCTGGTGAAATCTTTGGTACTCGTCA
GTCTGGAATTCCAGAATTTCAAGTAGCTGATATCGTTGAGGATTATCCTA
TTTTAGAAGAAGCACGCAAAGTTTCTGCAGCGATTGTTTCTGATCCTAAC
TGGATATATGAAAAACAGTGGCAATTAGTGGCACAAAATATTAGAAAAAA
AGAAGTTTATGATTAA
>M28_Spy0707 recJ, single-stranded-DNA-specific exonuclease
ATGATTAAATCCAAATATAGCTGGAAAATAAAAGACAAGAAGCCAGATGA
TGGCTTCTTTAAGCTAGCAAAGACAAAAGGTCTAACCCAGACCGCCGCTC
AGTTGATTTATGAGCGAGGGATAAGGACTGAAGAAGCCTTAGATGAGTTT
TTAACAGCGGACTTGTCTCAACTGCATGATCCTTACTTGCTACATGACAT
GGCAAAAGCTGTGCCAAGAATTCGTCAAGCTATTGAAGAGGGCGAACGAA
TTCTCATTTACGGCGACTATGATGCTGATGGCATGACGTCGGCTTCTATT
GTCAAAGAAACCCTAGACATGATGGGAGCAGAGCCTTTGGTTTATCTTCC
CAACCGCTTTACAGATGGCTATGGCCCCAACCAGAGCGTCTATAAATATT
TTATTGAGCAGGAAGCTGTGTCCCTAATTATCACGGTTGATAATGGCGTG
GCCGGACATGAAGCGATTAGATATGCTCAAGAACAGGAAGTTGATGTCAT
TGTAACTGACCATCATAGCCTGCCTGAAGAATTGCCAGAAGCCTTTGCCA
TCATTCATCCTGAGCATCCTGATGCTGATTATCCCTTTAAACACTTAGCT
GGCTGTGGCGTTGCCTTTAAATTGGCAACAGCTTTGCTAGAAAGTTTACC
AACAGACTGTCTAGACTTGGTAGCTATTGGAACCATTGCCGATATGGTAA
GCTTGACAGGTGAAAACCGTGTTTTAGTCAAAAATGGTCTGGCCATGCTC
AAACACACCGAAAGAGTGGGCTTGCAGGAGTTGATGTCTTTGTCTCCTAT
TGATTTGGAACATTTTAATGAAGACGCTATTGGCTTTCAGATTGCTCCGC
AATTAAATGCTTTAGGGCGCTTAGATGACCCTAATCCAGCCATTGAGCTA
CTGACGGGCTTTGATGACCAAGAAGCTCAAGCGATTGCCTTGATGATTAA
GAAAAAAAATGAAGAGCGTAAGGCCTTAGTCCAAGACATTTTTGATCAAG
CGATGGCTATGGTTGATCCTCAAAAACCTGTTCAAGTCTTGGCACAAGCT
GGCTGGCATCCTGGTGTTCTTGGGATTGTCGCTGGTCGTATCATGGAAAC
TATTGGACAAACGGTCGTCGTTTTGACCATTGATAATGGCTTTGCAAAAG
GCTCGGCCAGAAGTTTAGAAGCTATTAATATTTTTGAAGCCTTGAATGGC
AAGCGTGAGTTATTTACAGCCTTTGGGGGACATGCTGGTGCAGCAGGAAT
GACCCTGCCCGTTGACAACTTGGAAGCTCTTTCAGACTTTCTTTGTCAGT
TTGTGATAGAACGTGGCTTAGATCAGACTGCCAAAAATACGTTAACTATT
GATGAAAGACTGTCTTTGGACGACCTTAGCCTTGATATTTTAAAGAGTTT
AGATAAATTAGCCCCTTATGGGATGGATCATCAAAAGCCGGTCTTTTATG
TCAAGGACATAAGGGTTAGTCAAGCGCGTACCATAGGGCAAGACCAGAGC
CATCTTAAATTTAAAGTCAGTCAGGGCAAAGCTTCCTTTGACGTACTGGC
TTTTGGTCAAGGAAGTCAACTGCAAGAGTTCCGACAAGCTACTGGTTTAG
AATTAGCAGTTACCTTATCTGTCAACCATTGGAATGGGAACACGAGTCTC
CAATTCATGTTAGTAGATGCTCGTGTTGACGGAGTGCAACTTCTTGACTT
AAGGACAAAAACAGCCAAAGTTCCTGAAGGTATTCCGACTATTGAAGAAG
ACCCAAATGCCAGAGTCATTCTGATTAATGACATCCCTGAAGATTTCAAA
ACCTGGCGCAACCAGTTTGTTCACAAGGATTTTGACGCCATCTATTTTAA
AAATCAGATGAAACATCCTTATTATTTAACAGGATTTGGCAGCAGAGAGC
AGTTTGCCAAGCTCTACAAAACCATCTATCAGTTTCCTGAATTTGATTTA
CGGCATAAATTGACAGAGTTGAGTCACTATTTAAACATAGAAAAACTTTT
ACTGATTAAGTTGATTCAAATTTTTGAAGAGTTGTCTTTTGTGACGATTG
ACGATGGGCTGATGACGGTTAACCCCCAAGCGCAAAAACGAGAGATTTCA
GAGAGCCACATTTACCAAGACTTAAAAGAATTGGTGAAATTTCAAGAAAT
CATGGCTTTGGCTAGCCCGAAAGAGATGTATGATTATTTGGTGAAATCAA
ACGATCAATAA
>M28_Spy1167 recN, DNA repair protein
GTGATGTTATTAGAAATTTCTATTAAAAATTTTGCTATTATTGATGAAAT
TTCCCTAAATTTTGAAAATGGTATGACGGTTTTGACGGGTGAAACTGGAG
CAGGAAAGTCTATTATCATTGATGCTATGAATATGATGCTTGGTGCGCGT
GCTAGTACAGAAGTGATTCGTCGTGGAGCTAATAAAGCAGAAATTGAGGG
GTTCTTTTCGGTAGATGCTACCCCAGAACTGGTTGCGTGTCTGGAATCAT
CAGGCATTGCTATGGAAGAAGAACTGATTATTCGCCGAGATATCTTTGCC
AATGGCAGAAGCGTGAGCCGCATTAATGGTCAGATGGTTAACCTAGCCAC
CTTAAAACAGGTCGGACAGTTTTTGGTAGATATTCATGGGCAACATGACC
AAGAAGAATTAATGCGACCACAGCTCCACCAGCAAATTTTGGACGCTTTT
GGTGATAAGGCTTTTGAGCAATTGAAAGAGAACTATCAGCTTATTTTTGA
TCGTTATAAAAGCTTGCGTCGCCAGGTTATTGACAAACAAAAAAATGAAA
AGGAACACAAAGATCGTATTGATATGTTGGCCTTTCAGATAGCAGAAATT
GAAGCTGCTGCCTTGAGTCGAGGTGAGGACGACCGGTTAAATCAAGAACG
TGATCGCTTAATGAACCACAAACAAATTGCTGATACCCTGACCAATGCCT
ACGTCATGCTAGATAATGACGATTTTTCAAGTCTATCCAATATTCGCTCT
AGCATGAATGACTTACTATCAATTGAGCAGTTTGATTCAGAGTACAAAGG
GATGTCGACTTCGATTTCTGAAGCCTATTATATTCTTGAAGAAGTGAGCA
AGCAATTATCAGATACCATTGACCAACTGGATTTTGATGGTGGGCGATTA
CAGGAAATTGAATTTCGCTTGGATACACTCAATAGCTTAACCCGTAAATA
CGGTGGTAATGTGAATGATGTGCTTGACTACTACGATAATATTATCAAAG
AATACCAGCTATTAACAGGAGACGACTTGTCTTCAGGGGATCTAGAATCA
GAATTGAAAGCCTTAGAAAAACAATTGGTTGCTGCAGCCACTAACTTGAG
TGAACGCCGCCATCAATTGGCAGAGCAATTAGAAGCTGAGATTAAAGCTG
AACTTAAGGAACTTTATATGGAAAAAGCAGATTTCAAAGTTCACTTTACC
ACATCAAAATTCAATCGTGATGGTAATGAAAGCTTGGAATTTTACATCTC
TACTAATCCAGGCGAAGGATTTAAGCCCCTTGTCAAGGTGGCTTCTGGAG
GAGAGTTATCACGCCTTATGTTAGCCATCAAGGCTGCTATTTCTAGAAAA
GAAGATAAGACGAGTATTGTTTTTGATGAAGTAGATACAGGTGTTTCTGG
TCGCGTTGCGCAAGCCATTGCCCAAAAAATTTATAAAATTGGGCGACATG
GGCAAGTTCTCGCTATTTCACACTTACCTCAAGTTATTGCTATTGCTGAT
TATCAGTATTTTATTTCTAAAGAAAGTAAAGAAGAGTCCACCGTTTCTAA
GGTAAGGTTATTAACTCCTGAAGAACGTGTGGAAGAAATTGCTAGCATGA
TTGCAGGAACAGATATGACACAAGCTGCTCTTACGCAGGCTCGTGAACTA
CTTGCCAAACATTAA
>M28_Spy0019 recO, DNA repair protein
ATGCAACTAACAGAATCACTAGGCATCGTTCTTTTTAATAGGAATTATCG
AGAAGATGATAAATTAGTCAAAATATTTACTGAAGTAGCAGGTAAGCAGA
TGTTTTTCGTGAAACATATTAGTCGTTCCAAAATGTCCTCAATCATTCAA
CCACTAACGATTGCTGATTTTATTTTCAAGTTAAATGATACAGGCTTGTC
TTATGTTGTTGACTATAGTAACGTTAACACTTATCGGTATATTAATAATG
ATATTTTTCGATTAGCCTATGCTAGTTATGTCTTAGCATTAGCTGATGCT
GCGATTGCAGATAATGAATCAGATTCGCATTTGTTTACGTTTTTGAAAAA
AACACTTGATTTGATGGAAGAGGGCCTAGATTATGAAATTTTGACAAATA
TTTTTGAAATTCAGATATTAGATCGTTTTGGTATTAGTCTAAACTTTCAT
GAGTGTGCCATTTGTCATCGCACTGATTTACCGCTTGATTTTTCCCATCG
TTTTTCAGCTGTACTTTGTTCTGAACATTATTACAAAGACAACCGACGTA
ATCATTTAGATCCAAATGTTATCTACTTGTTGAGTCGATTTCAAAAAATC
ACATTTGATGATTTGAGAACTATTTCATTGAATAAAGACATCAAAAAGAA
GCTTCGTCAGTTCATTGATGAGTTGTATCACGACTATGTAGGAATCAAAT
TAAAAAGTAAAACATTCATTGATAATTTAGTTAAGTGGGGAGATATTATG
AAATGA
>M28_Spy1153 recR, recombination protein
GTGCTTTATCCAACACCCATTGCAAAGTTAATTGACAGTTACTCTAAACT
TCCAGGAATTGGTATCAAGACGGCGACGAGATTAGCCTTTTATACTATTG
GAATGTCAAATGAAGATGTCAATGATTTTGCTAAAAACTTATTAGCAGCT
AAAAGAGAACTGACCTATTGTTCGATTTGTGGAAACCTTACCGATGACGA
TCCTTGTCACATTTGCACAGACACGAGCCGTGATCAGACGACCATTCTGG
TAGTAGAAGATGCTAAAGATGTTTCTGCCATGGAAAAAATCCAAGAGTAT
CATGGCTATTATCATGTGCTTCACGGCTTGATTTCGCCTATGAATGGTGT
GGGGCCAGATGACATCAACCTTAAAAGTTTAATTACCCGTCTAATGGATG
GTAAGGTGAGCGAAGTTATCGTAGCTACCAATGCCACAGCAGATGGGGAA
GCAACGTCCATGTATATTTCACGTGTCTTGAAACCAGCCGGGATTAAGGT
AACTCGTTTGGCAAGAGGTCTCGCAGTAGGTTCAGATATTGAGTATGCTG
ATGAAGTAACATTATTGAGAGCTATTGAGAATCGTACTGAACTTTAA
>M28_Spy0574 rexA, ATP-dependent nuclease subunit A
GTGCTTTTTAACATTAATGAGAAAGGAGAGCCACTTGTGATTTCTTTTGC
CCCATTTTTAAGCCCCGAAGCTATTAAACATTTACAAGAAAACGAAAGGT
GCAGTGATCAGTCTCAAAAACGCACAGCTCAACAAATTGAAGCAATTTAT
ACTAGTGGCCAAAATATACTTGTATCAGCTTCTGCTGGTTCAGGAAAAAC
CTTTGTAATGGTCGAACGCATACTTGATAAAATTTTGAGAGGTGTTTCAA
TTGATCGGCTTTTTATCTCAACCTTTACTGTTAAAGCAGCTACAGAACTG
CGTGAACGGATTGAAAACAAATTATACTCACAAATTGCTCAAACTACAGA
TTTTCAAATGAAAGTTTATTTAACAGAACAATTGCAATCTCTTGGTCAAG
CTGATATTGGTACTATGGATGCTTTTGCACAGAAAGTAGTAAGTCGCTAT
GGTTATAGCATTGGCATTTCATCCCAATTTCGTATCATGCAGGATAAAGC
AGAACAAGATGTTTTAAAGCAAGAGGTGTTTAGCAAACTCTTTAGTGAGT
TTATGAATCAAAAAGAGGCACCGGTGTTTAGGGCTCTTGTGAAAAATTTT
TCTGGTAACTGTAAAGACACTTCAGCTTTTAGAGAGTTAGTTTATACTTG
TTATTCTTTTAGCCAATCGACAGAAAATCCAAAAATATGGTTGCAAGAAA
ATTTTCTAAGCGCTGCTAAAACTTACCAAAGGCTTGAAGATATCCCGGAT
CATGATATTGAACTCTTACTTTTGGCAATGCAAGACACTGCAAATCAGCT
AAGAGATGTGACTGATATGGAAGATTATGGGCAGCTGACTAAGGCAGGTA
GCCGATCTGCTAAATACACTAAACACTTAACGATCATAGAAAAGTTGTCT
GATTGGGTGCGTGATTTTAAATGTTTGTATGGAAAAGCCGGATTGGATCG
GTTGATCAGAGATGTGACAGGCCTTATACCATCTGGGAATGATGTTACAG
TCTCGAAGGTAAAATACCCTGTTTTTAAGACCTTGCATCAAAAATTAAAA
CAATTTAGGCATTTAGAAACAATTTTAATGTATCAGAAAGACTGTTTTCC
CTTATTGGAACAGTTACAAGATTTTGTGCTTGCGTTTTCAGAAGCTTATT
TAGCTGTCAAAATACAAGAAAGTGCTTTTGAATTTTCAGATATTACACAC
TTTGCAATCAAAATTTTAGAGGAAAATACGGATATTCGCCAATCCTATCA
GCAACACTATCATGAGGTGATGGTTGATGAATATCAAGATAACAATCATA
TGCAAGAGCGACTCCTGACCTTACTATCGAACGGTCATAATCGCTTTATG
GTAGGAGATATCAAACAATCGATCTATCGATTTCGGCAAGCCGATCCTCA
GATTTTTAATCAAAAGTTTAGAGACTATCAAAAAAAACCTGAGCAGGGGA
AAGTGATTTTACTCAAAGAAAACTTTCGTAGCCAATCAGAGGTGTTAAAT
GTCAGCAATGCTGTTTTTAGTCACTTAATGGACGAATCAGTAGGAGACGT
CTTATACGATGAGCAACATCAGTTAATAGCAGGTAGTCATGCTCAAACAG
TCCCCTATCTAGACCGTCGTGCTCAGTTATTGCTATATAATAGCGATAAA
GATGATGGCAACGCCCCTTCAGATAGTGAGGGTATTTCATTTAGTGAGGT
TACAATTGTTGCCAAAGAAATTATTAAGCTTCACAATGATAAGGGTGTCC
CTTTTGAAGACATTACGTTACTCGTTTCTTCAAGAACAAGAAATGATATC
ATTTCTCATACATTCAATCAATATAGTATTCCTATAGTAACAGATGGTGG
GCAGCAAAACTATCTTAAATCTGTTGAAGTGATGGTTATGTTAGATACAT
TACGCACCATTAATAACCCAAGAAATGATTATGCCCTTGTGGCTTTACTG
CGCTCACCGATGTTTGCCTTTGATGAGGATGATTTAGCAAGAATAGCACT
TCAAAAAGACAATGAGCTAGATAAAGATTGCCTATATGACAAGATACAAA
GGGCTGTGATTGGAAGAGGTGCTCATCCTGAATTGATTCACGATACCTTG
CTTGGCAAGTTAAATATTTTTTTAAAGACGTTGAAAAGTTGGCGTCGATA
CGCTAAGCTAGGGTCGTTGTATGACTTGATTTGGAAAATTTTTAATGATC
GTTTTTATTTTGATTTTGTAGCTAGTCAAGCAAAAGCAGAACAAGCACAA
GCTAATCTATACGCATTAGCTCTACGTGCTAATCAGTTTGAAAAATCGGG
CTATAAAGGGCTATACCGTTTTATTAAAATGATTGATAAGGTACTTGAGA
CGCAAAATGACTTAGCAGATGTGGAAGTGGCTGCTCCTAAACAAGCTGTT
AATTTAATGACCATTCACAAGTCTAAAGGTTTACAATTTCCGTATGTATT
TATCCTTAATTGTGACAAGCGCTTCTCAATGACAGATATTCATAAATCAT
TTATTCTGAATCGGCAGCACGGTATCGGTATCAAGTACCTTGCAGATATC
AAAGGTTTACTTGGTGAAACAACACTCAATTCTGTTAAAGTAAGCATGGA
AACCTTACCTTATCAATTGAACAAACAAGAGTTGCGCTTAGCAACTTTAT
CAGAACAAATGCGCTTATTGTATGTTGCTATGACACGAGCTGAAAAAAAA
GTTTATTTTATTGGTAAAGCTAGTAAGAGCAAAAGTCAAGATATCACAGA
TCCTAAAAAGTTAGGCAAACTTTTGCCGCTGGCTTTACGAGAACAGTTAT
TGACATTCCAAGATTGGCTATTAGCAATAGCAGATATATTTTCAACTGAA
GATCTTTATTTTGATGTTCGCTTTATTGAAGATAGTGATTTGACACAAGA
GTCAGTCGGACGACTTCAAACACCACAGTTATTAAATCCAGATGATCTTA
AAGATAATCGTCAATCAGAAACAATTGCACGGGCTTTAGATATGTTAGAA
GCAGTGTCTCAATTGAATGCCAATTATGAAGCAGCTATTCATTTGCCAAC
AGTTCGAACGCCTAGCCAACTTAAGGCAGCTTACGAGCCTTTATTAGAAC
CCATTGGTGTAGATATTATAGAGAAATCTTCTCGATCGCTATCTGATTTT
ACTTTGCCACATTTTTCAAAAAAAGTAAAAGTTGAAGCAAGTCATATTGG
ATCAGCTCTTCATCAGTTGATGCAGGTGCTCCCTTTGTCAAAACCGATAA
ATCAACAAACGCTTTTAGACGCTTTAAGAGAAATTGATAGTAACGAAGAG
GTAAAAACAGCTCTTGATCTCAAAAAAATAGAGTCGTTCTTTTGTGATAC
AAGCCTAGGCCAATTTTTTCAGACTTACCAAAAACACTTGTATCGAGAAG
CACCATTTGCTATTTTAAAAGTTGACCCTATTAGTCAAGAAGAATATGTC
CTACGTGGTATTATAGATGCCTACTTTTTGTTTGATGATCATATTGTATT
AGTGGACTATAAAACAGATAAATACAAGCAGCCCATTGAGTTAAAAAAGC
GTTACCAACAACAGTTGGAGTTATATGCAGAAGCTCTCACTCAAACGTAT
AAACTTCCTGTGACTAAGCGCTATCTTGTTTTAATGGGAGGTGGAAAGCC
AGAAATTGTCGAAGTTTAA
>M28_Spy0573 rexB, ATP-dependent nuclease subunit B
ATGAAATTAATTTACACAGAGATGAGTTACTCGATGACAGAGATTTTGGT
GAATGAAGCACGAAAAGCTGCTGACCAAGGTTATCGAGTGTTCTATATTG
CTCCAAATTCTCTTTCATTTGAAAAGGAAAGAGAAGTCTTAACCTTATTG
CCTGAACGAGGGACTTTTTCGATAATAGTAACCCGGTTCGTTCAAATGTC
AAGGTATTTTACAGTTGAGAGCTCTCCTTCTAAGCAACATCTAGATGACA
CGACTTTGGCTATGATTTTTTATCGGGCCTTGATGCAATTAAAACCAGAA
GATTTGCCGAGTTATGGTCGTTTGCAAAATAATTCGGTTTTTATTGAACA
ACTAGTTGAGTTATATAAGGAATTAAAAAACGCACAATTAAGCGTACATG
ATTTAACAGGATTAGACCATCCTCAAAAACAAGAAGATCTTATTAAAATT
ATTGAGCTTGCAGAGACGATCATGATTCAGCAAGATTATAATCAAGATAG
TCCTCTACAATCTTTTGCAAGAGCAATTAAGTTAGGACTTTTAAATAACC
AACTATCAAAAACAGTTATTGTTATTGATGGTTTTTCACGTTTTTCAGCT
GAAGAGGATTATTTATTATCACTTTTAAATAACAACTGTCAAGAGGTCAT
CATTGGCAGTTATGTGAGTCAAAAAGCTTATCAAAAATCTTTTATTAAGG
GAAATATCTATGAGGCTAGCCTTCATTTTTTGCAAGATTTGGCTCAAAAA
TACCATATCAAGCCGGTATTTGCGACCTCTAATCAAGTGTTTAAACCAGC
CTTTTCACGGCTAACACAATTATTTGAAGCAACTCATGATTTTTCACAAG
TAGACTGGCAACTCCAAAAGAATGATCTTGATCACTTTAGCCTTTGGCAA
TGTCATCATCAAAAAGAGGAAATTGAACATGTAGCAAAATCCATTCGGCA
AAAGCTATATGAAGGTTACCGTTATAAGGATATCTTAGTGTTGCTAGGAG
ATATGGATGCTTATCAATTACAAATTGGGCCTATCTTTGATAAGTTTGAA
ATCCCCTACTATTTAGGAAAAGCAGAGCCTATGGCTGCCCATCCATTAGT
CCAATTTATAGAATCGCTCGAACGAAGTCAGCGCTATAATTGGCGTCGTG
AAGACATTTTAAACATGTTAAAATCAGGACTTTTTGGTTGTTTTGATGAT
AGTGATATTGATCGCTTTGAGGAATATACTCAGTTTGCAGATATTAAAGG
ATTTACTAAATTTTCAAAGCCTTTTACCATTAACTCTTCTAGGCAGTATC
CTCTTGACTTTTTAAATGAAATGAGACAAGACATCGTTTTACCTTTGCAA
GAATTGTTTAAGAGTCAAAAACAACTTGGTGCTTCACTTGTTGACAAATT
AATACTTTTTTTTAAAAAGATTAGATTAGCTGAGAATATGCAAGGTTTAG
CACAGTCCCAATTAGAGGTGGAAAAAAACGAAGAAGTTTGGAAAAGGTTT
ACAGATATTTTGACTTCTTTTCATCATATCTTTGGCCAAGAAAAATTACG
GCTATCAGATTGCCTTGCTTTAATCAAAACGGGAATGAAATCAGCTCAGT
ATCGTGTTGTTCCAGCGACATTAGATGTTGTCACTATTAAATCTTATGAC
CTTGTTCAACCACATTCAAAACCTTTCGTTTATGCAATTGGTCTAACTCA
ATCACATTTTCCTAAGCAAATTCACCATTCAGGACTACTTTCTGATCAAG
AGCGTGCTAGAATTAATGAAATAAGAAATTATCGTCATTTTGATATTGCT
AGTGCCGAAAATAGTAAAAAAAACCATCAAACTGCGTTATCTCTGTTTAA
TGCTGCTACTAAAGAGTTAGTTCTTAGTGTTCCAACGGTAATCAACGAGA
CATTCGATGATCTATCTCCTTATCTTAAAGAATTAATAAGCTTTGGGCTA
CCTCTTTTGGATAAAGGCAAAAACTATCTATCTTATGATAATAGCGATAT
TGGTAACTATAAAGCTCTCTTGTCACAAATTATTGCTATTAACCGACAAG
ATCTTATAGAAATGTCAGATCAAGATAAGATGTTTTGGACTGTTGTCTTA
CGTTATCTCAGGAAACAGTTAAGAAAGCAACAGCTAGAGCTACCTACTTC
AGATTATCGTTTATCAACAAAGCCTTTGTCTAAAGAAGTTATCGAGGTAT
GTTTTCCAAAGGGAATCCCTTTAAAGCTATCTGCAACTGCTTTAACCGTT
TTTTATAATAATCAGTACAACTATTTTTTGAAATATGTTTTGAATTTAAA
CAAAACAGAATCCATTCATCCAGATTCCAGAATTCATGGTCAATACTTGC
ATCGTGTCTTTGAGCGGTTAATGAAAGATCACACGCAAGAACCGTTTGAT
AATAAATTAAAACAAGCAATCTACCATACCAATCAAGAAAGTTTTTTTCA
GCAGGTTTACCAAGATAATGCCGAGGCTGAGTACAGTTTAGCTATACTAG
AAGATATTGTTAGATCAACAGCACCTATCTTGCAACTTAACCAAAACATA
AAGGTCATTGATCAAGAAAAGAACTTTCATCTGGATATGGGAAATGAGAT
ATTAGTCCACGGGATCATTGATCGTATTGACCAGCTGAGCGACGGTAGCT
TGGGCATTGTTGACTATAAATCAAGCGCGAATCAATTTGATATTGGGACC
TTTTATAATGGGTTGAGTCCACAACTAGTGACTTACCTCGCAGCCTTAAA
ACAGATCGCACCGCACGATATAAACCAATTATTTGGGGCTATGTACCTTC
ATTTGCAAGATCCTAAATTGGATCTAGTAACATTTAAACAAATTGATAAC
ACATTAGTGGAGAGTATCTATAAAGCGTTGACCTATAAAGGTATTTTTTC
AGAAGTCGAAAAAGAGCATCTATCTACTGGTGCTTACCAAACCAAAAATG
CTCTTTATTCCAATGACGAATTGGAAACACTTTTAAATTATAACAAGTAC
CTCTATCTTAAAGCTGCTAAACACATTAAAAAGGGACATTTTTTGATTAA
TCCTTATACAAGCGATGGTAAGACAGTTCAAGGAGATCAATTAAAAGCCA
TTACCCGTTTTGAAGCAGATCTTGACATGGCACAGGCAAGGCGACTAGTG
ACTCTCCCTGCTAAGGAGAAAAAAGAGTGCTTTTTAACATTAATGAGAAA
GGAGAGCCACTTGTGA
>M28_Spy1786 ruvA, holliday junction DNA helicase
ATGTACGATTATATTAAAGGTCAATTGACCAAAATTACGGCAAAATACAT
TGTCGTTGAAACAAATGGACTAGGCTATATTATCAATGTAGCCAATCCTT
ATAGCTTTACAGATAGTGTCAACCAACTGGTAACTATTTACCTGCATCAA
GTGATTCGTGAGGATGCTCACTTGTTGTTTGGGTTTCATACGGAAGACGA
AAAAGATGTTTTTCTGAAATTAATTTCTGTATCTGGCATTGGCCCCACAA
CAGCTCTTGCTATTGTGGCAGTTGATGATAATGAGGGACTTGTGAATGCC
ATTGATAACAGTGACATTAAGTACCTAATGAAATTTCCTAAAATTGGTAA
AAAAACAGCGCAGCAAATGGTTCTTGACTTAGCTGGCAAATTTGTGGAGG
CTCCACAAGAGACTGGTAATACCAAAGCGCGCAGCAATAAAGCAGGCAAT
ACTCAACTGGACGAAGCGATTGAAGCCCTCCTTGCCCTCGGTTATAAGGC
AGCGGAATTGAAGAAAATTCGTGCCTTCTTTGAAGGAACCTCTGAAACGG
CCGAACAATACATCAAATCAGCCCTTAAACTATTAATGAAAGGCTAG
>M28_Spy0035 ruvB, holliday junction DNA helicase
GTGCTGTTGACTGGTGGCGATTATAATAAAAGTAGGCCACTGCTCTCTTT
TACTTTATGTTATAATAGTCCTATGGCTAGAATTTTAGACAATGATGTAA
TGGGAAATGAGGAGTTTTCGGATCGGACTCTTCGCCCTCAATATCTACAC
GAATATATTGGACAAGATAAAGTTAAGGAACAATTCGCTATTTTTATAGA
AGCAGCTAAAAGACGTGACGAATCTTTAGACCATGTTTTATTATTTGGAC
CTCCAGGACTGGGAAAAACAACAATGGCATTTGTGATTGCCAATGAATTG
GGAGTTAATTTAAAGCAAACTTCAGGTCCTGCCGTTGAGAAAGCTGGAGA
TTTGGTAGCTATTTTAAATGAATTAGAACCAGGGGATATTTTGTTTATTG
ATGAAATTCACCGCATGCCAATGTCTGTTGAGGAAGTACTATATAGTGCT
ATGGAAGACTTCTATATTGATATTATGATTGGCGCTGGAGATACTAGTCG
TAGTATTCATTTGGATCTGCCTCCATTTACATTGATTGGTGCTACTACAC
GTGCAGGCATGTTATCTAATCCCCTCAGAGCTCGTTTTGGTATCACTGGT
CACATGGAATACTATCAAGAAAAGGATTTGACAGAGATTGTGGAGCGTAC
AGCTACTATTTTTGAAATAAAAATAGACCATGAAGCTGCACGGAAATTAG
CTTGTCGCAGTAGAGGAACGCCCCGCATTGCTAATCGATTACTAAAACGA
GTGCGTGACTATGCTCAAATTATTGGTGATGGCATCATAACGGCTCAAAT
AACTGATAGAGCTTTGACTATGTTAGATGTTGACCGCGAAGGTCTCGATT
ACATTGATCAGAAAATTTTACGAACGATGATTGAGATGTATCAGGGAGGA
CCAGTTGGTTTGGGGACATTATCTGTGAATATTGCCGAGGAGCGTAATAC
AGTTGAAGAGATGTATGAACCCTACTTAATTCAAAAAGGCTTTCTCATGC
GAACACGAACAGGTCGTGTAGCGACTCAAAAGGCTTATCGTCATCTTGGC
TATCCCTATCAAAACACTTAA
>M28_Spy1715 sfbX, fibronectin-binding protein
ATGACTAAAAAATTTATTAAATCAGCAGTGATTCTAGGCTTAGCAAGCAT
AACCATCAGCATGACGCAACCCGTTGAAGCCATTTCAAATAGCTTAGAAT
ATCAAGCACAATACGAACGTGTCAAAGAAGAACTAGACGCATTAAAAGAA
AAGGGCCCAAAATTAGGAGAACGTTCCCTTTATTTTAGATTGGTGAATAA
ATTTCTAAGTTGGTTTGGCCAAGTCTGGGACCCACTCGCAATCAAAGAAA
CCGATTACCTGTTGGACCTCATCGGACAAGTCAATTACTTGGTGAGTAAC
ACCGAGTTTCAAGCCCCTGAGTACAAAGATGCTAAAAACAAACTAGACTT
AGCTGTAGCAGGCTATGACCTCTACCTAGCTAGAGAGAAAAAACGTGGTG
ATGCTCCTGATTACCAAGTGACCCAGCTAACGCTAGAACAGCTCAAAACC
ATCAAAAAGAAGATACGAGAGGCCCTCGAAACATTTGCACAAGAGGTCAA
AACAATCCAGCAAAAAAACCCAGACCTATTTCCCCATGCTTATGTTTTAA
ACGCTAAGAGCAAAGATATCACAGATAAAGCGCAACCCTTTTTAGTAAAT
AGTTACTACGATGTCTTTTATAAGCAGTTTTTATTCACTAATACAAATGA
CGGGTACAACTATAATAAAGAAGCAGACAATCTGACCTCGTATCAAAATC
TGATTAAAGAGCTATTAGGCTTAAAAGCTGAGATCGATCAGTTAACAAAA
GGCAAGACTGGCGATGACCGTTTAGAGATGTTAATGTGGCAATCAAAGTT
CACCTTATCTGATTCACGGAAAAAATCACACCTTAGCGCCTACTATACAC
AAGGCGAGTATGTCGATAAGGTGGTCCTATCTGAAGAAGCTCCCAACTTG
AGAACAGCAAAAGAAAAGGTCAAGACCTTAAAAGGGATCTTGCATGATTA
CTATGTTGAAACTAATAAGCCAGAAAAAGCTAAAAAGTATCATGTCGAGG
ACGAGACCTTGCCGTCTCAACCTGAGGCTCCTGCTACACCTGAAGCTCCT
GCTCCTGCTCCTGTTCCTGCTCCTGTTCCTGTTCCTGGTCAAAAACCAGC
AGAAGATGAGAGATCGCCACAAGCTACGGAGCCAGCTAACCCGTCAAAAG
AGGATTCCTCAACGGACGCATCTCAGGGATCTCACGATAGTGAAAACCCA
GCGACAGACAGTCCTTCTCAACCTCAGGCACCAGACCAAGGCAATCACCA
AAGTCAAGTGCCTAACGCCAAGCCTCAAACGGACAAGACGGACACTCCTA
ACGCCCCAGCCATCCCACAGGACACCCCAAAAGCGCCTGAGGCTGGTGGT
CAGAGTGGCCCCGCTGGGAACACTGAGGAGAAAGCTCCTGACTCTGGACC
TAAAGAGTCTGATCAAAGCTCATCTAAAGAGTCCCCATCCGTTGGCGAAG
ACACGACCCCTAATCAGCCAGATGTCCTTGTAGGTGGTCAAAGTGAGCCA
ATTGATATCACCGAAGACACAATCACTGACGCTCCTCCGACAGTATCTGG
GCACAACGCATCAACACAGCCCCAATCTGTGGTCGAAGACACAGCACCTC
AGCGCCCAGATGTCCTTGTAGGTGGTCAAAGCGAGCCAATCGATATCACC
CAAGATACCCAACCGGGCATGTCAGGCTCTAATGACGCTACCGTTATCAA
TGAAGATACAAAACCAAAACGCGTCTTCCACTTTGACAACAAAGAGCCAC
AAGCATCAGAAAAAGCGGCAGAGCAAAAACTTGCTCCTCATGATAGCCAC
ACAACCCCTCAAGCTTCAGATGATACAGCAGCCCCTCACTTGCCTGCATC
TGGAGATAAACCTGAAAAAGTGTTTGCACTTGCTGCCTTGACAATGGTCG
CAGCTGCAGGGCTACTCAGCAAAAAACGTCGCAACACCGACAAAAACTAG
>M28_Spy0858 smf, hypothetical protein
GTGAATCATTTTGAACTTTATAAGCTAAAGAAAGCTGGACTGACTAATAA
AAACATTCTCAATATTCTTGACTACCAAGAACACCAGGAAAAATCGTTGT
CACTTCGAGATATGGCCGTTGTTTCTGGTTGTAAGCATCCGTCTCACTTT
ATAGAAGCCTATAAGCAGTTAGATATTCAAAAATTAAAAATAGAATTTAA
ACAATTTCCTAGTATTTCTATCTTAGATAAGCATTACCCAATGGCATTGA
AAGAAATATACAATCCACCTGTCCTCTTGTTTTTTCAGGGAAATTTAGAC
CTTCTTGAGAAACCTAAATTAGCCATTGTCGGCTCCAGACGCTCAAGCGA
TACCGGAGTAAAGTCTGTCCGTAAAATTCTTAAAGAACTCGGGAACCGTT
TTGTGATTGTTAGCGGACTTGCTCGAGGTATCGACACTAGTGCTCATTTA
GCCTGCCTTAAAAATGGGGGACAAACTATCGCTATTATTGGAACAGGATT
GGATCGCTTTTACCCTAAAGAAAATAGGGAGTTGCAAACTTTCTTAGGGA
AAAATCATCTTGTGCTAACAGAATACGGTCCAGGAGAAGAAGCTTTATCT
TATCACTTTCCAGAACGGAATCGTATTATCGCAGGCCTTAGCCGAGGTAT
TCTTGTCGTTGAAGCAAAAAATCGTTCAGGTTCCTTGATTACTTGTCAAA
TTGGGATAGAAGAAGGCCGAGACATTTTTGCTGTCCCAGGAAACATTTTG
GACGGGAAATCCGAAGGTTGCCTTCAGTTAATTAAAGAGGGAGCAACATG
CGTCACATCGGGCATGGATATCCTTTCAGAGTACTAA
>M28_Spy0280 snf, phage-related DNA helicase
ATGATGGCTAGATTAATTCCAGGACGAGTAAGGAATGAAGGTATTAAGCT
TTATGAGCAAGGTTTAGTCTCATTCCAAGATGATAATAAAGGCATTCTTC
AAATAGAAGTGGAGACTTATCAGGTTCAATATGGAGCAGATGATGAGGAT
ATCACTTGTCAATGCGACACATTTCATATGAAACATTATTGCAAGCATAT
TGCAGCAGTCGAGTATTTTTTAAAAAATGATCAAAAAGGTAAGCTTTTTT
TAAAACAGTTAACAAATCAAACAAAAATCAAAGAAACAACAAAGAAAATG
ACATCTTTTGGTAGTCTCTTTTTAGATAGCTTAGCCATGAATGAAGATGA
TTCTGTTAAATACAGGCTGTCTGCTCTTGGTAGTCGAAGCCCTTTTTCGT
CAGATTACTGGTGGAGTCTGAAAATCAATCGTTTACCAGATGATCGTTCT
TATGTGATTCGAGATATTAAAGGCTTTTTGCAGCTTATTAAAAAAGAAGG
CTTTTATCAGATTGGAAAAAATTATTTTGAACAACTTTCATGGCTGCAGT
TTGACCCATCCAGTCAAGACCTTATTGAGTTTTTATGGCGCTTAGCATCT
AATACTGACAAAGGGGACAACGAGAACATTTTTCCAAATCATGCAAGGCA
TTTGCGCTTACCTAGTGGTTTTTTTGAAGAAGGTATTCACTATTTGACGT
CACTTTATGACTTTACTTTTGAGGGGCCTTCTCAAACTTATCATCATCTT
TTTGTCCGTTCTTTGGAAGCAGAGGCAGGCCTTTATGAGTTTAAAGTGGA
AGTGCATCGCAAATCTATTGAATTGCAAATTGCTGAAAAAAATGTGCAAT
ACCTCTTTGATAATGACTATCTTCTTTATCAAGATACCTTTTATCACTTG
ACGTTAAAGCAACGAAAAATGGTTCAGGCTATTCGTAGTCTGCCCATTGA
GGCCGACTTGGCTAAACATATTCATTTTGATTTGGATGATCATGCGAAAT
TAGCTGCAAGCTTATCAGATTTTAAACAGATCGGTCTAGTAGAGGCTCCT
AAAAGCTTTGCTATTAGAGACTTTGAGGTGACTTTTCAATTTGATTTGTT
AAATCGAGATGAAATCAGTTGTCAGCTTATGTTTGATTATGGCAATTACC
AAGTTAGTGACAAAGCAAGTTTAGAAGCACTTCCTTTTGCTAGTCATTTA
AAAAAAGAAGAAAAAATCAATCGTTCTTTACTTGCTTTTGGCTTCTCGCC
ACAATTTTACTCAAAAAAGCGACTAACAAGTGCAAAAGAGCTCTATACTT
TTTTTGAAGAAACAGTTCCATGTTTTGAGCGCTTAGGTAATGTTGCGTTG
AGTACAGCTATCCAAGCATTACAAGTGAAAGAAATGCCCAAGATCGCTAT
TAGACGCAATCAGGGATTACTAGATATTTCGTTTGATTTTTCAACCATTA
TTGAAAATGATATTGACCAAGCTGTTACAGCTCTTTTTCAAAATAATCCT
TATTTTGTGAGTCAAACAGGTCAATTAGTGGTTTTTGATGATGAAACTCA
AAAAGTTAGCAAAAGTTTACAAGAATTAAGAGCAAGACAGCTAAAAAATG
GTCACTTGCAACTGGATGGCATTAGAGCTCTACAAGTATCCAAACTTTTT
GAAGGCATGACATCTGTTCATTTTTCAAAGGAATTAGAAGAGTTAGCCTA
TCATTTGCAGCATCCTGAAACTTTTTCAATAAAACCGTTACCAGTTAAGG
CTCAAATGCGAGATTATCAACGCAACGGTGTTCAGTGGTTATCAATGCTC
AATCATTATGGCTTTGGTGGCATTTTAGCAGATGACATGGGACTTGGAAA
AACTCTCCAGACACTTGCTTTTTTAGCTAGTCACCTGAAATCAGATAGTA
AAGTGCTCATTTTATCTCCATCTAGTCTTATCTATAATTGGTTTGATGAA
TGTCAAAAATTCACACCTCAGCTAGATGTTGTAGTTTCTTACGGACTTAA
ACAAATCAGAGATCAAATCATCGAAGAAGGTCATCAAATAACCATAACCA
GCTATTCCTCCTTTAGACAGGATTTTGAGACCTATCAAGCGTTTCACTAC
GATTATCTTATCTTAGATGAAGCTCAAGTGATAAAAAATGCGCAAACTAA
GATTTCACACTGTTTACGTGCGTTTAATACAGCCAATTGTTTTGCGCTTT
CGGGCACTCCTATTGAAAATAAAATGCTTGAAATTTGGTCCATTTTCCAA
ATTGTTTTGCCAGGGTTGCTACCGACTAAAAAAGAGTTTTTAAAATTAAC
AGCTGAGCAAGTATCGCGCTATATCAAACCCTTTGTGATGCGTCGTAAAA
AAGAAGATGTCCTACCAGAATTACCTGATTTAATTGAAACTAATTATTCA
AACGAGATGACAGATGAACAAAAAGCTATTTACTTAGCGCAGTTAAGGCA
GATGAAAGATCAAATTCGAAATTCTAGTGATGTGGATATTAGCCGTCAAA
AAATTGAGATTTTATCTGGTATCACTCGATTGAGGCAAATCTGTGACACT
CCAAGTCTCTTTATGGATTACCAAGGCAAAAGTGGTAAGCTAGATAGTTT
GCGAATCTTATTGACACAAATTAAAGAAAATGGTCATCGGGCTTTGATTT
TTTCTCAATTTAGAGGGATGCTGGACTTGGCCAAGCAAGAGATGACTGCT
CTAGGATTGACCTCTTATCAAATGACCGGATCTACCCCTGCCAATGAACG
TCAAGAAATGACTAGAGCCTTTAATAACGGTTCCAAGGATGCTTTTTTGA
TTTCCCTCAAGGCAGGTGGAGTTGGAATCAACCTTACGGGAGCAGACACA
GTGATTTTAATCGATTTATGGTGGAATCCTGCTGTTGAAATGCAGGCAAT
CAGTCGCGCCTACCGTATTGGTCAAAAAGAAAACGTTGAAGTATATCGCT
TAATCACTCGAGGGACGATTGAAGAAAAGATTTTAGAGCTTCAAGAAAGT
AAGCGCAATTTGGTGACTACAGTTTTGGATGGCAATGAAAACCGAGCAAG
TATGTCCATTGAAGAAATAAAAGAAATTTTGGGGCTAAACACTCATTAA
>M28_Spy0100 ssb, single-strand DNA binding protein
ATGTATAATAAAGTGATAGCAATCGGTCGTTTGGTAGCTAAACCAGAATT
GGTAAAAACCGCTACGGATAAGCATGTAGCACGTCTCTCTTTAGCTGTTA
ATCGAAGATTTAAAAATGCTTCGGGAGAGCGAGAAGCGGATTTTATTTCA
ATTGTTGTTTGGGGAAAGTTAGCAGAAACTCTGGTTTCTTATGCTAGCAA
AGGTAGTTTGATGTCTATTGATGGCGAACTTAGGACCCGCAAGTATGATA
AAGATGGGCAAGTGCATTATGTGACAGAAGTTCTCTGCCAATCATTTCAA
CTGCTTGAAAGTCGTGCTCAGCGCGCTATGAGAGAAAATAATGTTACTAA
TGATCTAGTTGATTTAGTCTTAGAAGAAGATACTCTTCCCTTTTGA
>M28_Spy1268 ssb2.1, phage single-strand DNA binding protein
ATGATTAATAATGTAGTACTAGTTGGTCGCATGACCAAGGACGCAGAGCT
TCGCTATACAGCGAGTCAAGTAGCTGTAGCTACGTTCACACTTGCGGTAA
ACCGCAGATTTAAAGAGCAAAACGGGGAGAGAGAAGCAGATTTCATTAAC
TGTGTTATCTGGCGACAGTCTGCTGAAAATTTAGCCAACTGGGCTAAAAA
AGGTGCTTTGATCGGAGTTACGGGTCGTATTCAGACACGTAACTACGAAA
ACCAACAAGGACAACGTGTCTATGTAACAGAAGTTGTTGCAGATAATTTC
CAAATGTTGGAAAGTCGTAATCAACAATCTGGTCAAGGTAACTCTTCGCA
AAACGATAACAGTCAACCGTTTGGCAATTCAAACCCAATGGATATTTCAG
ACGATGATCTGCCGTTTTAA
>M28_Spy1541 ssb2.2, phage single-strand DNA binding protein
ATGATTAATAATGTAGTACTAGTTGGTCGTATGACCAAGGATGCAGAACT
TCGTTACACACCAAGTCAAGTAGCTGTGGCTACCTTCACACTTGCTGTTA
ACCGTACCTTTAAAAGCCAAAATGGTGAACGCGAGGCAGATTTCATTAAC
TGTGTGATCTGGCGTCAACCGGCTGAAAATTTAGCGAACTGGGCTAAAAA
AGGTGCCTTGATCGGAGTTACGGGTCGTATTCAGACACGTAACTACGAAA
ACCAACAAGGACAACGTGTCTATGTAACAGAAGTTGTTGCAGATAATTTC
CAAATGTTGGAAAGTCGTGCTACACGTGAAGGTGGCTCAACTGGCTCATT
TAATGGTGGTTTTAACAATAACACTTCATCATCAAACAGTTACTCAGCGC
CTGCACAACAAACGCCTAACTTTGGAAGAGATGATAGCCCATTTGGGAAC
TCAAACCCGATGGATATCTCAGATGACGATCTTCCATTCTAG
>M28_Spy1785 tag, DNA-3-methyladenine glycosylase
GTGTTTCACATGAAACGTTGTTCATGGGTTCCTAAGGATAACCAGCTTTA
CTGTGATTACCACGATTTAGAATGGGGTCAACCCCTACATGATGATAGAG
ATTTTTTTGAATTACTCTGCCTTGAAAGTTACCAGTCAGGCTTATCCTGG
CTGACTGTTTTGAAAAAACGCCAAGCTTTCAGAACTGTTTTTCATCATTA
CGACATTGCATCGGTTGCAGCCTTTACCTCGGAGGAAATGGCTGACGCTT
TAGAGAATCCATCCATCATTCGCCACAAGCTAAAGCTAGCAGCAACTGTC
AACAATGCTATCGCAGTACAGAAAATTCAAGAAGAGTTTGGTAGTTTTTC
AACTTATCTCTGGAATTTTGTTGGGGGAAAGCCAATTAACAACCTTGTCA
ATCAAGAGAATCTTGTTCCTGCTCAAACAGAATTATCTATTCGCTTAGCT
AAGGATTTAAAGAAAAGAGGATTTAAATTTTTAGGGCCTACAACGGTTTA
TTCTTTTATGCAAGCATCGGGTCTGGTAAATGACCATGAAGAGGCTTGTG
TTTTCAATAGAATCTTCTAA
>M28_Spy0214 tatD, sec-independent protein translocase protein
GTGTCAGCTAGCAAAGGGTTTTACGATCAACCTAAACGGCAGAAGTTCTC
ACCAAGTTTTCTGATGTGGTTAAGATCTTTATGTTATAATAACATCATGA
CAAATAAAGTAGAAAAACTAACTATTTTTGATACCCATACGCACCTGAAT
GTAGCAGAATTTCAAGGACACGAAACTGAAGAATTGACTTTGGCTCAAGA
AATGGGCGTGGCCTACCATAATGTGGTTGGCTTTGACCAGGCCACTATTA
GTGGAGCACTTGCTCTCGCAGACCAGTATCCTAACGTGTATGCTACTATT
GGATGGCACCCGACAGAAGCAGGATCTTATTCTGAAGCAGTTGAGGAGTC
TATCGTCTCTCAATTATCACATCCTAAAGTCATTGCCTTAGGTGAAATTG
GCTTAGACTATTATTGGATGGAGGACCCCAAAGAGGTGCAAATAGAGGTT
TTTAAGCGCCAAATGCAATTAGCAAAAGACCATGATTTGCCTTTTGTGGT
GCACACCCGCGATGCCTTGGAAGATACCTATGAGGTCATCAAAGCAGCTG
GTGTTGGCCCTCGTGGAGGCATCATGCATTCTTACTCAGGATCATTAGAG
ATGGCTGAACGTTTCATTGAACTTGGCATGATGATTTCTTTTTCAGGTGT
GGTCACTTTCAAAAAGGCCCTTGATATTCAAGAGGCAGCGCAGCACTTGC
CTTTGGATAAGATTTTGGTGGAAACAGATGCCCCTTATCTTACACCAGTT
CCAAAACGTGGCAAACAAAATCATACAGCTTATACCCGTTATGTGGTTGA
TAAAATCGCAGAGCTACGGGGAATGACCGTGGAAGAAGTTGCAAAAGAAA
CGACTGCTAATGCAAAGAGGGTACTTAAGCTTGACTGA
>M28_Spy0006 trcF, transcription-repair coupling factor
ATGAATATTTTAGAATTATTTAGTCAGAATAAGAAAGTCCAATCCTGGCA
CTCTGGATTAACCACCTTAGGAAGACAACTGGTAATGGGGTTATCGGGTT
CAAGTAAAGCATTGGCTATAGCTTCCGCTTATTTAGATGATCAAAAAAAA
ATAGTTGTGGTTACATCAACTCAAAATGAGGTTGAAAAATTAGCCAGCGA
TTTATCTAGTTTACTTGATGAAGAACTTGTTTTCCAATTTTTTGCAGACG
ATGTGGCTGCAGCGGAATTTATCTTTGCGTCAATGGATAAAGCTCTATCA
AGAATAGAAACCCTGCAATTTTTAGGGAATCCTAAATCTCAGGGCGTTTT
AATTGTTAGTTTATCAGGCTTAAGAACTTTATTGCCAAACCCAGATGTTT
TTACAAAGAGTCAGATTCAACTAACAGTTGGAGAAGATTATGATAGTGAT
ACTCTTACTAAACAACTGATGACAATTGGCTATCAGAAGGTCTCACAGGT
CATTAGTCCGGGAGAATTTAGCCGTCGAGGGGATATTTTAGATATCTATG
AGATTACACAAGAATTGCCTTATCGATTGGAATTTTTTGGCGATGATATT
GATAGTATTAGGCAATTTCATCCAGAAACTCAAAAATCTTTTGAACAACT
AGAAGGTGTTTTTATTAATCCAGCAAGTGATCTTATTTTTGAGGCTAGTG
ATTTTCAACGTGGCATTGAGCAATTAGAAAAGGCTCTACAAACAGCACAA
GATGATAAAAAATCTTATTTAGAAGATGTATTAGCTGTTTCAAAAAACGG
TTTTAAACATAAGGATATCCGTAAATTTCAATCATTATTTTACGAAAAAG
AGTGGTCATTATTAGATTATATTCCTAAGGGAACGCCAATCTTTTTTGAT
GATTTTCAAAAACTAGTTGATAAAAATGCAAGATTTGATTTAGAGATTGC
TAATCTCTTGACAGAAGATTTACAGCAAGGAAAGGCTCTTTCCAATCTTA
ACTACTTTGCAGATAATTATCGAGAGCTTAGGCACTATAAGCCAGCGACC
TTCTTTTCAAATTTTCATAAGGGACTTGGAAATATCAAATTTGATCAGAT
GCATCAGCTAACTCAGTATGCCATGCAGGAATTTTTTAATCAATTTCCTT
TGTTGATTGATGAGATTAAACGGTATCAAAAAAATCAAACAACGGTTATT
GTACAGGTAGAGTCTCAGTATGCTTACAAACGACTTGAAAAATCTTTTCA
AGATTACCAATTTCGCCTTCCTTTAGTGAGTGCTAATCAAATTGTTTCAC
GTGAATCACAAATTGTAATTGGAGCTATCTCCAGTGGTTTTTATTTTGCT
GATGAAAAGTTAGCGTTAATCACAGAGCGTGAAATTTATCATAAAAAGAT
CAAACGACGCGCTAGACGATCTAATATTAGCAATGCTGAGCGTTTGAAAG
ATTACAATGAGTTAGCAGTAGGTGATTACGTGGTTCATAATGTCCATGGT
ATCGGTCGCTTTCTTGGAATTGAAACGATTCAGATTCAGGGAATCCATCG
AGATTATGTTACTATTCAATATCAAAATTCAGACCGTATTTCTCTTCCAA
TTGACCAAATTGGTAGCTTATCAAAGTACGTTTCTGCTGATGGAAAAGAA
CCTAAAATTAATAAACTCAATGATGGTCGTTTCCAAAAGACAAAGCAAAA
GGTCGCTAGACAAGTAGAGGATATTGCTGATGACCTTCTAAAATTATATG
CTGAAAGAAGTCAGCAAAAAGGATTTTCATTTTCACCAGATGATGACTTG
CAGCGCGCTTTTGATGATGATTTTGCTTTTGTAGAAACAGAAGATCAACT
TAGGTCTATAAAGGAAATTAAAGCTGATATGGAGAGCATGCAGCCTATGG
ATCGTCTTTTAGTAGGCGATGTAGGATTTGGTAAGACAGAAGTAGCTATG
AGGGCAGCCTTTAAAGCGGTGAACGATCACAAACAAGTAGCTGTCTTAGT
TCCAACCACAGTCTTGGCCCAGCAGCATTATGAAAACTTCAAAGCACGCT
TTGAAAATTACCCTGTTGAGGTTGACGTCTTAAGTCGTTTCCGTAGTAAA
AAAGAGCAAGCTGAAACACTAGAACGTGTACGAAAAGGTCAAATTGACAT
TATTATCGGAACCCATCGACTCCTATCAAAAGATGTGGTCTTTTCTGATT
TAGGATTGATTGTGATTGATGAGGAACAACGGTTTGGTGTTAAGCATAAA
GAAACTTTAAAGGAATTAAAAACTAAGGTTGACGTCTTAACCTTAACAGC
TACTCCGATTCCTAGAACCTTACACATGTCTATGTTAGGTATCCGAGATT
TATCGGTTATTGAGACCCCACCAACCAATCGTTATCCTGTTCAAACCTAT
GTTTTGGAAAATAATCCAGGTCTCGTTAGAGAAGCTATCATTCGTGAAAT
GGATCGTGGAGGACAAATTTTTTACGTTTACAATAAAGTTGACACTATTG
AAAAGAAAGTTTCAGAGCTACAAGAATTAGTCCCAGAAGCTTCTATAGGT
TTTGTTCATGGGCAAATGAGTGAAATTCAACTTGAAAATACCTTGATTGA
CTTTATAAATGGTGATTATGATGTCCTTGTGGCTACAACAATCATCGAAA
CAGGAGTTGACATTTCTAATGTAAACACTTTGTTTATTGAGAATGCTGAT
CATATGGGATTGTCAACTTTATATCAACTACGAGGGCGCGTCGGAAGAAG
TAATCGTATTGCTTATGCTTACCTGATGTATCGTCCTGATAAGGTCCTAA
CAGAGGTTTCTGAAAAGCGTTTAGAGGCTATTAAAGGCTTTACTGAATTA
GGTTCAGGCTTCAAGATTGCTATGCGAGATTTGTCTATACGAGGAGCAGG
TAATATTTTAGGGGCTTCTCAGAGTGGCTTTATTGATTCGGTCGGTTTTG
AAATGTATTCTCAGTTATTGGAACAGGCTATTGCTAGCAAGCAAGGAAAA
ACGACTGTTCGCCAAAAAGGTAATACTGAAATCAATCTTCAGATTGACGC
CTATTTGCCAGATGATTACATATCAGATGAGCGTCAAAAAATTGACATTT
ACAAGCGTATTCGAGAAATTCAATCAAGAGAAGATTATCTCAATTTGCAG
GATGAGCTGATAGATCGTTTTGGAGAGTATCCTGATCAAGTTGCCTATTT
GTTAGAGATAGCTCTGCTAAAACATTATATGGACAATGCCTTTGCGGAAT
TAGTTGAACGCAAAAATAATCAGGTCATTGTTCGATTTGAAGTAACTTCT
TTAACTTATTTCTTGACTCAGGATTATTTCGAAGCCTTATCGAAAACCCA
TCTTAAAGCTAAAATTAGTGAACATCAGGGGAAAATCGATATCGTCTTTG
ACGTTCGCCATCAAAAAGATTATAGAATTTTAGAAGAATTGATGTTATTT
GGAGAAAGGCTTAGTGAGATAAAAATCAGAAAAAACAATTCAGTTTTTAA
ATAA
>M28_Spy0688 ung, uracil-DNA glycosylase
ATGGCTCATTCAATTTGGCATGAGAAAATCAAATCATTTTTGCCGGAGCA
TTACTACGGTCGCATCAATCACTTTTTAGATGAAGCCTATGCTTCCGGTC
TTGTCTATCCTCCACGAGAAAATGTCTTTAAAGCCTTACAAGTCACTCCT
TTGGAAGAAACCAAAGTGTTGATTTTAGGACAAGACCCTTATCATGGCCC
CAAACAGGCCCAGGGCTTATCATTTTCAGTTCCAGAAGAGATTTCTGCTC
CGCCATCCCTTATTAATATTTTAAAAGAATTAGCAGATGACATTGGTCCT
CGTGACCATCATGATTTAAGCACTTGGGCTAGTCAAGGGGTTCTGCTTTT
GAATGCTTGCTTAACAGTGCCAGCAGGCCAGGCTAATGGGCATGCAGGCT
TAATATGGGAGCCATTTACAGACGCTGTTATTAAAGTGCTGAATGAGAAA
GACAGCCCTGTAGTTTTCATTTTGTGGGGAGCTTATGCAAGGAAGAAAAA
AGCCTTCATTACTAATCCAAAGCACCACATCATCGAGAGTCCTCATCCAA
GCCCTTTGTCGTCTTATCGTGGCTTTTTTGGCAGCAAACCCTTTTCAAGA
ACAAATGCTATTTTAGAAAAAGAAGGCATGACTGGCATAGATTGGTTACA
ATAG
>M28_Spy1537 uvrA, excinuclease ABC subunit A
ATGAGGAGGGTGCCTTTAGGCACATTCAAGATGCAAAATAAAATAATAAT
TCATGGGGCAAGAGCCCACAATTTAAAAAATATTGACGTGGAAATTCCAC
GAGACAAATTAGTTGTCGTGACAGGGTTATCAGGGTCAGGAAAATCTAGT
CTAGCCTTTGATACTATTTATGCGGAAGGGCAACGTCGTTACGTAGAAAG
TTTATCAGCTTATGCTAGACAGTTCTTGGGTAATATGGAAAAACCAGATG
TGGATTCCATTGACGGTCTTAGCCCTGCTATTTCCATTGATCAAAAAACT
ACCAGTAAGAACCCCCGCTCAACGGTTGGTACGGTTACGGAAATCAATGA
TTATTTACGTTTACTATATGCGCGTGTGGGCACACCTTACTGTATTAATG
GGCATGGGGCCATTACAGCATCTTCTGCAGAACAAATTGTAGAGCAGGTC
TTAGCCCTCCCTGAACGGACACGCATGCAGATTTTAGCGCCTATTGTTCG
CCGGAAAAAAGGTCAACACAAAACCATTTTTGAGAAAATTCAAAAAGATG
GTTATGTCCGTGTGCGGGTTGACGGGGATATTTTTGACGTGACAGAAGTG
CCGGAGCTGTCCAAAAGTAAGATGCACAACATCGAGGTGGTTATTGACCG
TCTGGTTAATAAGGATGGTATTCGTAGCCGTTTATTTGATTCGGTTGAAG
CAGCTTTAAGGCTGGGAGATGGCTACCTTATGATTGACACTATGGATGGC
AATGAACTGCTCTTTTCTGAGCATTATTCCTGTCCTGTCTGTGGGTTTAC
GGTTCCTGAATTAGAACCAAGACTCTTCTCTTTTAATGCGCCGTTCGGCT
CTTGTCCGACCTGTGATGGGCTAGGCATTAAGTTGGAAGTGGATTTGGAC
TTGGTTGTTCCTGACCCAAGTAAGTCTTTGAGAGAGGGAGCTTTGGCGCC
TTGGAATCCTATTTCCTCCAATTATTACCCAACCATGCTTGAGCAAGCTA
TGGCAAGTTTTGGGGTGGATATGGATACACCTTTTGAGGCCTTGACTGAG
GAAGAAAGAGATTTAGTGCTTTATGGTTCAGGAGATAGAGAATTTCATTT
TCACTATGTGAATGATTTTGGTGGTGAGCGTAACATTGATATTCCTTTTG
AAGGTGTTGTGACTAATGTTAATCGTCGTTATCACGAAACTAATAGTGAT
TATACGCGCAATGTGATGCGTGGTTATATGAACGAATTGACCTGTGCGAC
TTGTCATGGTTACCGTTTGAATGACCAAGCCTTGTGTGTGCATGTGGGTG
GCGAAGAAGGACCTCATATTGGTCAAATTTCAGAATTATCGATTGCCGAC
CACTTGCAGTTGTTGGAAGAATTGGAACTCACAGAAAATGAAAGTACCAT
TGCTAAACCGATTGTCAAAGAAATTCATGACCGCCTGACCTTCTTAAATA
ATGTGGGACTGAATTATCTGACCTTGTCACGGGCTGCTGGGACTTTATCA
GGTGGTGAAAGTCAACGAATCAGGTTAGCGACACAAATTGGTTCTAACTT
ATCAGGGGTGATCTATATCTTGGATGAGCCTTCTATTGGATTGCACCAAA
GAGACAATGACCGTTTGATCGAAAGCCTGAAAAAAATGCGTGATTTGGGT
AATACCTTAATTGTGGTAGAACACGATGAAGACACCATGATGCAGGCAGA
CTGGCTGATTGATGTGGGGCCTGGGGCAGGTGAGTTCGGTGGAGAAATTA
TTGCCTCTGGAACGCCGAAACAAGTGGCTAAGAATAAAAAATCCATCACG
GGTCAATATTTGTCTGGTAAAAAATTCATTCCAGTGCCATTAGAGCGTCG
TTCTGGTAATGGGCGATTCATTGAAATAAAAGGAGCAGCGCAGAATAATC
TTCAAAGCCTCGACGTGAGATTCCCACTGGGTAAATTTATTGCGGTCACA
GGGGTATCAGGCTCAGGGAAATCAACCTTGGTTAATAGTATTTTGAAAAA
GGCTGTCGCCCAAAAATTAAACCGTAATGCTGATAAGCCTGGTAAATATC
ACTCTATTTCTGGTATTGAACATATTGAACGCTTGATTGACATTGACCAA
AGTCCGATTGGAAGGACGCCACGGTCAAATCCAGCCACCTATACGGGTGT
CTTTGATGATATTCGAGACTTGTTTGCCCAAACCAACGAAGCTAAGATTC
GTGGCTACAAAAAAGGCCGTTTCTCTTTTAATGTCAAAGGTGGGCGTTGT
GAGGCTTGTTCAGGTGATGGGATTATCAAAATCGAAATGCACTTTTTGCC
AGATGTTTATGTGCCTTGTGAGGTTTGCCACGGCAGACGGTATAATTCTG
AGACGCTTGAGGTGCATTATAAAGAAAAAAATATTGCTGAAGTACTTGAC
ATGACTGTCGATGATGCCTTGGTATTTTTCTCTGCTATCCCTAAAATTGC
CCGAAAAATTCAAACCATTAAGGATGTTGGTTTGGGTTATGTGACCTTGG
GTCAACCAGCTACTACTCTATCTGGAGGAGAAGCGCAGCGGATGAAATTA
GCTAGTGAATTGCACAAACGCTCGACAGGTAAGAGCTTGTATATCCTAGA
TGAGCCAACGACTGGTTTACACACAGATGATATTGCAAGGCTATTAAAAG
TTTTGGAACGCTTTGTAGACGATGGTAATACGGTTCTTGTGATTGAGCAT
AATTTGGACGTTATCAAATCTGCTGACCATATTATTGACTTAGGACCAGA
AGGTGGTGTCGGAGGTGGTCAGATTGTTGCCACGGGGACACCAGAAGAGG
TAGCTCAAGTTAAAGAAAGCTATACTGGTCATTATTTGAAAGTAAAACTA
CAACAATAG
>M28_Spy1056 uvrB, excinuclease ABC subunit B
ATGATTGATAAACGTGATGATAAACCATTTAAACTAAAATCAAAGTATAA
ACCGTCTGGTGATCAGCCACAAGCTATTGAAAGCCTAGTTGATAATATTG
AGGGCGGAGAAAAAGCTCAGATTCTCCTAGGTGCTACAGGAACGGGAAAA
ACATACACCATGAGCCAAGTAATTAGTAAAGTAAATAAACCTACCTTAGT
GATAGCTCACAATAAAACCTTAGCAGGACAATTATATGGTGAATTTAAAG
AATTTTTTCCAGACAATGCTGTGGAATACTTTGTTTCCTATTATGATTAC
TACCAACCTGAAGCATATGTCCCATCAAGCGACACCTATATCGAAAAAGA
TAGTTCAGTCAATGATGAAATCGATAAACTTCGCCATTCAGCCACCTCTT
CTTTACTTGAGCGTAACGATGTCATAGTGGTAGCTTCTGTATCTTGTATT
TATGGACTAGGTTCGCCAAAAGAGTACGCAGATTCAGCAGTCAGCCTACG
TCCAGGTCAGGAGATATCACGTGACACTTTGCTAAATCAATTAGTAGATA
TTCAATTTGAGCGTAATGATATTGATTTTCAACGCGGCTGTTTTCGTGTA
CGTGGCGATGTTGTTGAGGTCTTTCCAGCATCCAGGGATGAACATGCTTT
TCGGGTGGAATTTTTCGGGGATGAGATTGATCGTATATGTGAAATCGAAA
GTTTAACTGGGAAAACTATTGGAGAAGTTGACCATTTGGTTTTATTTCCA
GCTACTCACTTTGTAACAAATGATGAGCATATGGAGCAATCAATAGCCAA
AATTCAAGCAGAGTTAGCAGAGCAGTTACAGTTATTTGAATCTGAAGGTA
AACTACTAGAAGCACAGCGATTACGCCAAAGAACGGAATATGATATTGAA
ATGTTACGTGAAATGGGCTATACTAGCGGAGTCGAAAACTATTCCCGTCA
TATGGATGGCAGGTCACCAGGAGAACCTCCTTATACCTTGTTAGATTTCT
TCCCAGAAGATTTTTTAATTATGATTGATGAAAGTCACATGACAATGGGA
CAAATCAAAGGCATGTATAATGGTGACCAAGCCAGAAAACAAATGCTAGT
TGACTATGGTTTTCGATTGCCATCAGCTCTTGATAATCGTCCCTTAAGAC
GCGAGGAATTTGAAAGTCATGTGCACCAAATTATCTATGTTTCAGCAACG
CCTGGTGAATACGAAATGTCACAGACTAATACAATTATTGAGCAAATTAT
TCGTCCGACTGGGCTACTTGATCCTGAAATTGATGTAAGGCCAAGTATGG
GGCAAATGGATGATTTGTTGGGAGAAATTAACCAGCGCGTAGCGCGCGAT
GAACGGACGTTCATCACAACCTTAACTAAAAAAATGGCAGAAGATTTGAC
TGATTATCTAAAAGAGATGGGTGTCAAGGTCAAGTATATGCACAGTGATA
TTAAAACCTTAGAGCGGACAGAAATTATTCGTGATTTACGACTTGGTGTT
TTTGATGTCTTGATTGGAATCAATCTGCTCCGTGAAGGGATTGATGTGCC
AGAAGTTAGTCTTGTAGCCATTTTGGATGCTGATAAAGAGGGTTTCCTCC
GTAATGAACGCGGCTTGATTCAGACCATCGGTAGAGCAGCTCGAAACGTA
GATGGTCATGTCATTATGTATGCGGACAAGATGACAGATTCTATGCAGCG
GGCTATTGACGAAACGGCTCGTCGTCGTGAGATTCAAATAGCATATAACA
AAGCGCACGGCATCGTTCCACAAACTATAAAAAAAGACATCAGAGGCCTT
ATTAGTATAAGTAAAACAAGCCACAATGATATATCGAAAGAAGAGATGGA
TTATGAAAGTATGTCAAGAGGAGAACGAAAAGAAGCGATCAATGCTCTGC
AAAAACAAATGCAAGAGGCAGCTGAATTACTTGATTTCGAATTGGCAGCT
CAAATGCGAGACTTGATTTTAGAACTTAAATTAATGGACTAG
>M28_Spy0765 uvrC, excinuclease ABC subunit C
ATGAACGAACTGATTAAACATAAACTAGAACTCTTACCAGACAGCCCTGG
CTGTTACTTACATAAAGATAAAGAAGGAACTATTATCTATGTCGGTAAGG
CTAAGAATTTGAAAAAACGCGTCCGGTCCTATTTTCGTGGGAGCCATGAT
ACCAAAACAGAGTTACTAGTATCTGAGATTGTAGATTTCGAATATATTGT
AACAGAGTCAGATACCGAAGCGCTTTTGTTGGAAATTAACTTGATTCAAA
AAAATATGCCTAAGTACAACATCAAGTTAAAAGATGATAAATCTTATCCC
TTTCTCAAAATCACAAATGAGTCTTTTCCTCGGTTAGTGATTACAAGATA
TATTAAGAAAAATGATGGATTGTACTTTGGGCCCTACCCAGATTCTTACA
CTGCTAATGAAGTTAAAAAGTTATTAGATAGGATTTTTCCATTTAAAAAG
TGTAAAAATCCTATCAATAAGGTCTGTTTTTATTACCATTTAGGCCAGTG
CTGTGCTCATACCATTTGTCATACAGACAAGGCCTATTGGGATCGTTTAA
TTGATGATGTTAAGCACTTTTTAAATGGTAAAGATGACAAAATTATTGAA
GATCTTCGTTCTAAGATGTTAGCAGCTTCTGAAGAAATGGCATTTGAACG
TGCCGCTGAATATCGAGATTTGATTTCAGGTATTGCCACCATGCGCACCA
AGCAGCGGGTGATGAGCAAGGATTTGCAAGATAGAGATATCTTTGGCTAT
TATGTTGATAAGGGATGGATGTGTGTCCAAGTTTTCTTTGTGCGTCAAGG
GAAATTAATTCAGCGTGATGTTAACCTTTTTCCCTATTATAACGATGCAG
AAGAAGATTTCTTAACTTATATGGGGCAATTTTACCAAGATAAACAGCAT
TTCATCCCTAAAGAAGTCTTTATTCCAGAAGCTATTGATGAAGAACTGGT
AGCCGCTATTGTGCCAACCAAAATCATCAAACCCAAACGCGGTGAAAAAA
AACAACTGGTAGCTTTGGCTACTAAGAATGCTCGTGTTAGTCTGCAACAA
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