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COG category: Transcription
Genomic element: chromosome 2

Number of genes found: 23

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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRB0564 hypothetical protein
ATGCGAAGCGTAAATCTATTGGAAACTCAAATTAAAACGCTAAATCAATT
AAAAGAATTTTATATCGCATATAGCCGAGTCCCTAAGCCGATGGAATTCT
CACGGTTTGTCTCTATCAGTCGAAAAACGATTTATGTTCACTTTGAAGTC
TTTGTCGATATGGGAGTATTGATTGAAGTTAGCGACGGTTATGAATGGTC
AAAAATACCATATGAAGTGAAGCTTGTAGAGCGAAAGCAGGCGCAACCAA
AGAGCGGGCTTATTTGGGCTAACGGTCGTTAG
>PBPRB0384 hypothetical protein
ATGAAGGTCAATGAGTTAAAAGATATTTACCGCCACAAAAATGTGAGCGG
AATTAACTATCTACTCAATTTGATATGCCTCAAACATAACGCTCTAAAGC
ATTGTTTGGGTAAAAAGGAAATAATTATGACTTCACAAACTGGTATTATC
CGTAGCTTCAACTCTGCTGACAACAATGGCCTAATTACATGTGATCTTGG
TGGTGATATCCGCTTTGATGCATCAAGTGTAAATGGCGGTTTACCTGTAT
CAGGCAGCCTTGTTGAGTTCATCATGGATGACTCTTCAAATAAGCTTCAG
GCGATTAAAATTCGTTTAATCTAA
>PBPRB0426 putative exoribonuclease II
ATGACACAAACCTTCGCAAAATATACATTCCACAATCTTGGTTTTAGCGC
CCCAAATACGTATAGTGTCTGGGTTAATATTCTGAGACCGAGCATAATGT
TTCAAGATAATCCGCTGCTAGCCCAGCTTAAAAAACAAATTCAAGAAACC
CTTCCTAAAAAAGAAGGTAACGTAAAAGCGACTGACCGTGGCTTTGGCTT
TCTAGAAACTGATAATAAAGAAAGCTTTTTTATTCCGCCTAATTATATGA
AAAACGTAATGCACGGTGACCGCGTGATTGCTGTGATTCGTACAGAAAAA
GAGCGTGAAGTAGCCGAACCTCAGGAGCTGATAGAACAGAACCTGACACG
CTTTATTGGTCGCGTGAAGATGATCCACAACCGATTAAACGTTGTGCCTG
ATCACCCACAGCTAAAAGACGCAATAAAAGCACGCGCTTTTAAAGGGTTA
AACCCAGAAGAGCTGAGAGAAGGCGACTGGGTTGTAGCAAACCTAAATAG
CCACCCGCTAACCAATGCAAACAAACCGTTTACCTGTGTGATTAATGAAA
AAATCACTGACAGTAACGATAAAATTGCACCATGGTGGGTAACACTTGCC
CGCTATGAACTGCCTAACGCAGAGCCTGCACCGCAAGATAGCTGGAATAT
GCTAGACGAAGGTTTAGAGCGCCAAGATTTAACCGATATTCCGTTTATTA
CTATCGATGGTGAATCAACCAAAGATATGGATGATGCGATTCATACGGTT
AAGAAAGATGATGGTAACTTCGAAATCACGATTGCGATTGCCGATCCTAC
ATCTTACATCTCTGTTGGCGATAAAATGGATGATGAAGCACGTAAGCGCG
GATTCACCGTTTATCTACCTGGTCGTAATATCCCAATGCTTCCTCGTGAA
TTAAGCGATGAACTATGTTCATTGATTGAAAACGAGAAACGCCCTGTTAT
TTGTTGCCGTGTAACGGTTGATAGCGAAGGTGATATTCAAGACGACATCA
CGTTCTTTGCTGCATGGATTAAATCTCAGGCTCGTTTGGCGTATGACAAT
GTATCTGATCTTATTGAAAAAGGTCAGTCAGAAAAGTTAATGGCTAACGA
CGTTATTGCAGAACAAATCGATGCGCTTCACCAATTTGCTAATGTACGTA
GCAAGTGGCGTTCAAATAACGCAGTAGTATTCCCTGATCGTCCAGATTAT
CGCTTCGAACTCAGTGACGACAACGATGTTATCGCAATTCATACTGATCC
TCGCCGTACTTCAAATCGCATGATCGAAGAGGCAATGATTACAGCGAACA
TTTGTGCGGGTCGAGTATTAAGAGATAAATTCGGTACGGGTGTTTTCAAT
ATTCATAATGGTTTCCATCCTGAAAAGCTTGATACCGCGATGGAATTCTT
GCAAAAAGTTGAAGCGCCATTTGAAAAAGAAGAACTGAAAACCCTAGAAG
GTTTCAGTGCGCTTCGCCGTTGGTTAAATACGCTTGATTCAACGTATTTA
GATAACCGCCTACGTAAATTCCAAGCTTACAGTGAGGTTGGTAATCAACC
AGCTCCGCATTACGCTATGGGATTAGATGCTTACGCGACATGGACATCTC
CTATTCGTAAGTATGGCGATATGATTAACCACCGCCTTCTTAAAGCTGTT
ATTACAGGTAACGAGCCGTCTCAGAAACCTGACGATACTGTCGGTGAAGA
GATTGCATTACACCGTCGTACACACCGTATGGCAGAACGTGGTGTTGCTG
ATTGGCTTTACATTCGCTTGCTAAAAAATGCAGTGAAAGAAGAAACAGTC
TTTACTGCTGAAATCTTCGATATTAATCGTGCTGGTATTCGAATTCGTTT
ACTTGAGATTGGTGCTTCGGCATTTATTCCGGGCTCGTTAATTGTTGATA
ATAAGCAACGTATTGTTTGTAGCGGCGATTTAGGTACAGTTTCTATTGAT
ACAGTACAAGAATATCAACTAGGTGATACTTTTGAAGTGAAGCTAGCGGA
AATTCGAACAGCAACACGTCAACTTGTTGCTAAACCTGTACAGCAGTTTC
CTGCACCTGAAGTTGATTCGGATGCAGCAGAGAAAGAAGAAGAGAAAGCA
TAA
>PBPRB0322 hypothetical protein
GTGACAATGTTCATTCCTGATATCTCAAATCGTACAGGCCCTAAATTTAT
GGCATTGGCCGATGCGTTAACTGAAGCCATTGAAAGCAATGAATTGGCAA
TAAACATGAAATTGCCACCACAGCGTATATTGTCATATCGCCTTGGAGTA
ACAGTCGGTACGGTTACCCGCGCCTATCAGGAATTAGAACTAAGAGGATT
GATTGAGCCAAAGGTGGGTAGCGGTACATATGTAAAAGATAGGCAATCTG
AACAGCAAACTTTTTATCACCCTGTGACGTCTCAAGAAGGTATAGATCTC
GCCATTTGTCGTCCACTATTGCTTAGCCAACAACAGCACCTGTCGACGAT
TCTGCAAGACTTATCTCACGAGCCCACCGCGCAAAAAGCCGTGCTCGATT
ATTACAGTGCCGAAGGATTACACGGGCATAATAAAACCTTGCAACAGTGG
CTAAGCGATCGCCTTAACGTTGATATCGATAATCGCCGCCTAATTTGGAC
ATATGGTGGTCAGCATAGCTTAGCCATTATTTTACAGTCACTTTCTCGCC
CTAAAGAAACCATTCTGGTTGAAGGATTATGTTACGCAGAATTCATCAAT
GCCTGTCAGCAGGCAGAACGTAAATTAGTGCCTGTGCAGCTGGATGATGA
TGGTATTATTCCTGAAGATTTAGAACTGCACTGCAAACGTCACAAACCAC
GGTTACTCTATTTAACCCCAGCAATTCAAAACCCAACAGGTACACAAATA
AATGATAGTCGTCGTCTAAAAATTATCGAGATTTGCCGTCGGTATAACGT
CTTAATTATTGAAGATGATGTGCTGTATTGCCCACCTAGTCACCGTAAAA
CGCCTTTGGTTGCAATAGCCCCCGACATCACTATTTATGTTGGTAGTTTC
TCTAAATATTTTGCCGGAGGGTTACGGGTCGGTTATCTCATCATGCCGCT
AACACTAAAAGATACCTTGCAACGAACATTGCGCGCCAATTGCATGCACA
TCAGCCCATTGATGATCGACCTCGTTTGTCGCTGGCTAACCAATGGGGCC
ATGGAAGCCGTTGATAAAGAAATCGCGCTGGAGCTTAGCGCACGGCATCG
GCTATTTAATCAGTATTTTCCACCACAGAATAATGCGGTTATTCCCGGAT
TTAACTGTTGGATACCCTTACCAGAGCCATTAACTGGCTATAGCTTTAGT
AAACTACTACGTAATAAAGGGATTCATGTTCGCGAAGCAGAAATGTTTGC
AGTGGGTCGTTACCCAGTACCAGCAGCAATACGTATATCACTCACAGGCC
CGGCTAGTCGTAGCCAACTCAAAACAGGCTTGATAATCATTAAAGAACAA
ATTGCCCTAGTAAAGCAACGCTAA
>PBPRB0459 hypothetical transcriptional regulator
ATGCTAGATAAAATGGCTTTCTTTGTATATGTCGTAAGAACAGGCTCTAT
TTCTGCTGCTGCACGTAAATTCAATATTTCAGTCTCGGCAGGCAGCCGCT
GGCTACAAGATCTAGAACAAAAATTTGGCATGCCGCTACACCGTCGTAGC
AACCGCTTATTAACACCTACCCCTGCGGGTCAAAAGCTGTTCGATGATTT
TTCACCCATGCTCGATAATTCCGAACATTTATGCCGTCAAATGCAAGAGT
TTCAGCAACACGACAAAGGACATATTGATATTGTTTGTACACCTGTTTAT
GCCTACCATTATTTAATGGACATGATCAGTGAATACCTTATAACGAACCC
AGATGTCACTTTTAACCTCAACATTACTCCTTGGGCATTAGACCATGCAG
CAGAAAGCGACTTAACAATCAGCGCCAATGCCTCTTATCAAGGCTACCGT
GAACATGATTTACACCTTGTTCGCCGTGAAATAATGCAAAGCCCATTTCG
CGTTGTTACTTCACAACACTATCTTGATCGTCAACCCGCACCACAAAAAC
CCTCTGATTTAACCCAGCATCAATGCTTATTTGCCACGACGTTAACGGGC
AGTAATGATTGGATTTTCACCCAAAATGGTGAAAGCCAGATAATAAAAGT
ACCTAAGTCTTTAGAAGTTAACGACAGTGATCTACTGCTTCAAGGTGTAA
CAAAAGGCGCTGGCATCGCTTATTTACCCGCATTTCTCGTTGAACCAGAG
ATAGAAAGCGGCCATCTTATTTCACTATTGGATGATTTCGATACCAGCGT
ATGGAGCCTCAACCTCTACTATCAGCCACCCGCCACCGCTTCTGCCGTCG
CCATTCATTTTAAACAATTTTTGTTGAAGCAATAA
>PBPRB0492 hypothetical protein
ATGCGTCCGTCAAGTATGAAAAAACGTCAACGCTACTTGGACGTTGCGAC
CGAGCTTTTTCTTGAACAGGGTTATGAAGCGACCGGTTTGGATCAATTAA
TCGAACGTTGCGGCGGTTCAAAACTCACCCTTTACAGCTATTTTGGTGAT
AAAAGAGGCTTGCTAAAAGCCGTTGTCCATGAAGTTACAGAGCAGTTGGG
CGAAGTGTTGAAGTTTGAAGCAACTGAGGAAGAGGAACTTAAAAACCAAT
TGGTTATGTTTGCTTGTAACTACATGAAATTCATATACGCTCCCAAAATG
TTGAAATTGTCTCGTTTGGTATTGGCAAACAATCAACAGGAGCCAGAGTT
AGTCAGTTATTTTCTTGAACGAGGAGCTCATCATTCTCAAAGCACCGTAC
TGGCATTTTTGGAACAGCAAGACCGCTTGGGCCGGTTGCAGATTGATGAC
GCGTTTCTGGCTTGTGAGCAATTATTGGGGGCACTTAAAGGTAACCGTCA
TATTGAGGCGTTGTATACCGACCGAGTGATGAATGAGCAAGAGATGACGC
GTTATGCTGAACACGCCATTAATGCCTTTTTACGCAGCTATCAATAA
>PBPRB0338 hypothetical protein
ATGAAGTCTAATGTTTGGATCAAGGCAGGTATAGTGATCATATATGGTTC
ATCTATAGATGCCTCTCCTCATCGTCACCACGCGATTCAACTGGCGTGGC
CTAGAAATGGCTGTAGCTGCAAACTAGATAATAATGAAATATCGACACCA
GTAATTATTGATTCTAACGTCGAGCATCAGCTACAAGTTGATGAGGGTTG
GATCTTGTTGGTCGAGCCCACTAGCGAATTAGGGGTGGAGCTATCTAAGA
AATTGGCAGGGCAACCTTCAAAAGTATTTAAAGTGCCTTTACCCACGATT
AAACATACAGAAGACATTGATGATTTAACTGTACTACTTTCCCCTTTATT
TGAAAGTTTAGCGCTTTCAAATCAATTTCCTCTCATCAATGAAAGTCAGA
TCGCGGATCATCGCATTAAAAAGCTATTACATGAACTCAACCAATGCTTA
GATGGGAAATGCCTTAAACCAAGCAATTGGCGGGCGTCTGATGTTGCTCA
AAAACTTGCTCTATCGGAGAGCCGCTTTCTTCACTTATTTAGCAAAGAGC
TGGGCATTCCTTGGCGACCATATTTGCTATGGTGTCGAATGATTTGTGCT
GTAAGAGCAATATTAAATGGAGAGTCTGCGACAGATGCTGCTCACATGGC
AGGCTTTTCTGATAGTGCGCATTTAAGCCGTACTTTTCGAAAAACATTTG
GAATGACCATTCGGCAAGCAAACGCTATTTTTCAAAAAAGTTAG
>PBPRB0342 hypothetical protein
TTGACTGCATCTCCTGAAGAATTATTTTCATTCTGTGCAACTGGCAGTTT
TCCATGGGATAAAAAGCAGATTGAAGAAACAGCAAAAGCTAGAAAAAATT
TAACTGTCTGTATTATTGCAGGGCAAGTTGTGGCTTTTAGTAATTTGTAC
AATGTTGTTCCAGGGGAAAGTGCATTTATTGGAAATGTTATCGTTGGCGA
AGATTTTAAAGGACAAGGCATCGGTAAGGGGTTAATCAAGCACATGATAG
AAGTTTGCAGGGAAACTTATGATGCAGTGCCGCATTTGTCGGTGTTTAAC
TTTAATACACGAGCTTTGTTAATGTATAGCAAATTAGGTTTTGAACCTTA
CTCTGTAGCAAAGCATATATCGCCCCAAGGCGAGAACGTTGCTTTAATCC
ATATGCGCCTGACGCAACGAATATAA
>PBPRB0467 ATU4514, Putative transcriptional regulator
ATGGAAGCTGAAAATACTTTATTAGAAGTGCCAAACGACCTCGACACTTT
ACGCGATTTGATTGTTAAGCGTTATGATAAGTTGAGCCAGCGACTACAGC
AAGTTGCTGATTATATTATGGCTCAACCGATGCTTGTTGCGGTTGAAACG
ATGGCGACGATAGCAGAGCAGGCCAATGTTCCGTTGTCTACCCTGAGTCG
TTTTGCTAATACAATGGGGTTCTCAGGCTTTAGCCAGATGCAGGCGTTAT
TTCGCGATCAGTACCTAAATCGCCCTCGTGACTACAAAGAGCGCGTTCGT
CAGGCACGTGATCAAGATTGCTTTGAACCTGAATCACCAACATCCATTTT
TCAAGATTATGGTGCTGCAAATATTGAAGCCATGGAACAGCTTCAAGTTT
CTGTTTCGCCACAGAAGCTTGAGCGAGCAGTATCGTTACTAGACAAGGCT
GATACGATATATATTCAAGGTATGCGAAGGGCTTACCCCGTTGCATTTTA
TCTTTGGTATGCATTAATGAAATCAGACAACAACGTGGTGTTGCTTGATG
ACCATGGTGGCATGTTAGCCCCAATGACTCGCCGAATAAGCGATAAAGAT
GTATTGGTAACCATTACTTTTACACCTTATGCGCCAGAAACCAGTGAGTT
AATTAAGCTGGCATCTGAAAAGAATGTCCCCATTATTGCGATAACAGATA
ACCAAATGAATTCTCAAGGCAGTAAAATGGATGTTTGTTTTGAAGTGCAA
GAAGGGGAAGTGATGGGGTTCCGCTCTTTAAGTAGTTCAATGTATTTAGC
GCAAACATTAGCGGTTAGTCTGATGTGCCGAGAAACTAAATAA
>PBPRB0471 ATU4514, hypothetical transcriptional regulator
ATGTCTGCAGCTACCACGCTATCTGAATTAGAAGAGCAAATTCGTAATCG
ATATAACGAATTAAGCAAACGGCTGCAACAAGTCGCCGCGTATGTATTAG
AGAGCCATAACAGTATCGCTTTTGATACGGTTGCCGTTATTGCTGAACAA
GCGCAAGTGCCCCCTTCAACACTGATTCGTTTTGCTAATGCTTTTGACTT
CAAAGGCTTTAATGAAATGAAACAACTGTTTCGTCAAAACCTCGTTGAAG
AAACCACCAGCTACACTGACCGCGCACGCTTATTTAAAGAGTTAGACGAT
GCGTCGCCACCACCTGAAAACCCTATTGATATATTGCAAGAATTTGCCCG
AGCCAATAGCCAAGCCATGGAGCAGTTAGCCACTCAAACATCGGCCGATA
AACTGAATCAAGCGGTCGAGTTAATTGCTAACGCCGATAATATCTATCTG
ATCGGCCTGCGTCGTTCATTTAGCATCGCATCGTATTTAACCTATGCATT
ACGCCATTTAGAGCGCCGCGCTTTTTTAATTGATGGATTAGGTGGGATGT
TTCAAGAACAACTCAGTATGGTGGGGCCCAAAGATATTGTTATCTCTATC
AGCTTCTCTCCCTACGCTGAAGAAACCGTTAAATTAAGCGAGATCGTCAG
CAAGGCAGGGGCAAAGCAGGTTGTGATTACAGACAGCCAATTAAGCCCGC
TAGCAGCCTTTAGCGACGTATGTTTCGTGGTGAAAGAGGCAAAAGTGGAT
GCATTCCGTTCACAGTCTGCATCTTTCTGTCTTGCACAAACATTAGCGGT
ATCACTGGCGTTTAAAACCGAAAACGATCAATAA
>PBPRB0529 ECS4290, hypothetical acetyltransferase
ATGGAAGTGATTATTCGACATCTAGAATCGAAAGATATTGAGCAAGTTAA
AAATCTATACGCAGGAAAGAATGCTTATAGTGGAACACTTCAATTACCGC
TGCCTTCGCTTGATGCATGGAATAGGCGCCTAAGTGATTTACCTGCGGGG
GTGCATTCATTGGTTGCCGAGAAAGAAGGCGTCATAGTGGGGCAGCTAGG
CTTTGAAGTCTGTCAGAATGCGAGACGTAGGCATGTTGCTTCATTTGGTA
TGGCTGTACATGATGATTACCAAAAACAAGGAATAGGCAGTCAATTGCTT
AGTGAGATTATCGATCTTGCTGAAAATTGGCTTAATGTGCAGCGTATTGA
ACTGACAGTTTATACTGACAATCACTCTGCTATCGCCTTATATGAAAAGC
ATGGTTTCGTGATAGAAGGCGAATCAGTTAATTATGCATTTCGTAATGGG
TGCTACGTTAACGTGTATCAAATGGCAAGAGTAAAAAAGTAG
>PBPRB0427 PLU4523, putative ATP-dependent RNA helicase
ATGCTAGAATCTGTTACAGAATTTCGCCAATTAGATTTGGCTGACACACT
TTTATCTGCTCTTGACTCAATGGGCTTCGTTTCGCCAACTCCTATTCAGG
CGGCGTCAATTCCTCTACTTCTTACTGGTGTTGATGCACTTGGTAAGGCA
CAGACTGGTACTGGTAAAACGGCTGCGTTTTCACTACCTGTTCTAAATAA
AGTAGACCTTTCTCAGCATAAGCCTCAGGCTATCGTAATGGCTCCTACAC
GTGAGCTTGCGATTCAGGTTGCTGCAGAAATCAAAGTCCTTGGTCAGAAC
ATTAAAGGTCTTAAAGTTTTAGAGATTTACGGTGGTGCTTCTATCGTTGA
TCAAATGCGTGCACTTAAAAATGGTGCTCACATTGTTGTTGGTACTCCAG
GTCGTGTTAAAGACCTTATTTCACGTGATCGTCTGCACCTTGATGAAGTT
AGTACGTTTGTACTAGATGAAGCTGACGAAATGTTGAAAATGGGTTTTGT
TGATGACGTTACTTGGATCATGGAACAAGCTCCAGCATCGGCACAACGCG
TATTGTTCTCGGCTACTATGCCTCCAATCGTTAAGCAAATTGTTGACCGT
TTCCTACGTAACCCAGAGCGCATTGACGTAGCTGGCGAAAACCGTACTGT
ATCTCAAGTTTCACAGCAGTTCTGGATCGTTAAAGGCGTAGAAAAAGACG
AAGCAATGATTCGTATGCTTGAAACTGAAGAGAACATCGATGCGTCAATC
GTATTCGTTCGTACTCGTCAAGATACTGAGCGTCTAGCTGATTGGTTATC
TGCACGTGGCTGTAAAGCAGCAGCTCTACACGGTGATATTCCTCAGTCTT
TACGTGAGCGTACTGTTGACCATATTAAACGTGGTGTAATCGACGTTCTT
GTTGCAACTGACGTTGTTGCTCGTGGCCTTGATATTCAGCGTATTACACA
CGTATTTAACTACGACATTCCGTTCGATGTAGAATCTTACATCCACCGTA
TTGGTCGTACTGGTCGTGCTGGTCGTTCTGGTAAAGCGATCCTATTGGTT
CGTACAAACCAAATTCGTATGCTACGCACTATCGAGCGTGTAACTAAATC
TCGTATGGAAGAAATTCAACTTCCTAACCGTGATGCCGTTGCCGCTGCTC
GCTTGACTCGTTTAGGTCAAGAACTAGAATCACAGAAAGAACAAGCAACG
CTTGAAGCTTTTGTTGAACTAGTGGGTAAATTACAAGAAACAATCGATGT
TGATGCAACAACGCTTGCAGCGATGCTTCTTCAGCGTCAACAAGGTAACC
GTCCTTTATTCTATAAAGGTCCGGACCCAATGATTGCAGCTATTGATCGT
GAACAGCAACGTCGTGAGCGTCGTGGTAACGATGATCGTGGTACTCGCAA
CGAACGTGGCGGTGAACGTCGTTCAAACAACAGCGCTGATTGGGATACTT
ACCAATTACAAGTTGGCCGTGAGCAAGGCATTCAGGTTAAAGATATCGTT
GGCGCAATTGCAAACGAACTTGGCCTAAGCAAAGAGTTCATTGGTGCTAT
TAAACTAGCTCCTTCACATACTTTTGTTCAGCTTCCGAAGAAGATGTCAG
CAGAAGTTTCAGCACAACTTAAGAAGCTACGCATTCGTCAAAACGATGTA
AAAGCTGTTGTTGTTGAAGGTGAAGTTCTTCGCGAACACCGTCCACGTAA
CAGTGGTAGCCGTGATGGCGGCCGTGGTGGATACCGTGGTAACCGTGATA
GCAACGGTGGCGAGCGTCGTTTCGACCGCAACCGTGGTAGTGACAACCGT
GGTGGAAACCGTGGCAGCGCGAACAGCGACCGTCCACGTCGTCCAAGCGG
TGAGCGTAGCAACAACGCTTAA
>PBPRB0518 RS05428, hypothetical transcriptional regulator
ATGAAAATGGTCAGGCAAATTACTGTAAACCTGATCACCACACATTTAAG
TTTTTATCTTGATGGCGGTGAAAAAACCCATCGATTATACAATCGTGCTA
AACTTTTATATGGTGCCCCTGATAAGCTCTGTTTAATGCCTGCAGAGCAT
CAATCTGAGTGGCGATTTAGTTCTCGGTTTAAGTTTTTACATCTCTATTT
TGGGCATAACCATCTACAAAGTACATTCGAAAAAGCATTCGATAAAGAAG
GTCGGAATATTGAATTAATGGATCAAACATTTGTTGATGACAGCTACTTA
AGCAATATTATCCATCACACCTTATTACCACTGAATTGGCATGATCGTTC
AGATGCTCTCGCTTTTACGCACATTCAACAAATTGTTTACGTACATTTAT
TAAAAAATCACTGTAATGTTCAATTTAACATACCCAATATTACAGGCGGC
TTGTCACCCATTGTTGCAAAGCGAATCAATGAATATATTCATGACCACTT
AGATTCAAAGATTACTATTGAGCAACTGGCGAATATCGCTGAATTAAGTG
AATTTCACTTCTCTCGCATGTTTCATCAGTCATTCGGATCCCCCCCTCAT
CAATACGTACTCAAACTACGTACACAGCTCGCCGCAATGTTATTAAAGAC
AACCCAGCACCCTCTGGCTGATATCGCCATACAATGTGGCTTTTCTTCAC
AGCCCCATTTTACACTGCACTTTAAAACGTTTTTTTCGATAACTCCGGCT
AAGTATCGCCAGCTGCAACGTTAA
>PBPRB0310 RSC3129, hypothetical sigma-54 dependent transcriptional regulator
ATGGATTCGTTACCTCACACTCAGCAAGAAGATTGGTTATCGCAATCTTG
GCACCGAAGTCAGCAAGCTGGTTTAGATGAGCGACATCAGCCGGAGCATG
TACGCCTAGATAAAACCCAACTAGAGCAGCGACAACATATTGCCAACGTG
CTGATCAAAACGGTTGAACAGTTGGCTGTGCCGTTGTTTAACCAGATGTT
CGCAGGCACAAACAGTCGCTTGTTACTAACAGATACTGAAGGGGTGATTA
TTGGCTCGTGGGGGCAATCACGATTTGAACATCAACTCACAGGCATCGCG
TTAGAATCAGGCGTGTGTTGGCAAGAGAACCTAAAAGGGACGAATGCGAT
AGGTACAGCTTTGGCAGAAAAGCGCTTTGTTGCTGTGATTGGCGATCAAC
ATTTTATTCGTAAACACCGTTTTATCAGTTGCTCTGCTAGTCCAATTTGT
ACACCAGATGGCGAGTTACAAGGTGTACTCGATATAACGAGTGAGCAACA
AATTCACTCGCAACAAACGCAATTATTGATTCAAAATATGGTGCAAGGAA
TTGAAAATAGCTTACTTTGCCAAGTGCCGGAAGGTGAGTACCGTGTCGAC
CTTGCGTTTGATAAACACTTACTCAATAGTGGGTGGCAAGGTATTGTGAT
TGCGAATAAAAGTGGTCATATCGTTGCGCATAATGCAGTGGCTGCACGGC
TATTATCTGAATCTTTATTAGAACCGACAATTTTAGGCTGTAACATTGAC
CATATTATTCAGGCAGCTCAATCTTCTCTTATTTCGACACAAACGGTTAA
CACTCAAAGTAATGATTTAGTCTTTCGTTGTCAGTCTATTCAGCCCATAA
GCAATCCGCGTTCGGGTATTTATTCTCCTTCTTGTCCGCTACACATGGGA
GATGACGTCATTGAACAAGCTTGGCAGCAAGCGTGTAAGTTAATAAATAA
AGATGTGACACTGCTGATTTTAGGGGAAACAGGGGTTGGGAAAGGCGAGT
TCATTAAACAGCTTCATCAATACAGTTCGCGTAATCAACATCCTTTAGTT
GCGGTAAATTGCGGTGCTTTACCACAAGATTTGATTGAATCTGAATTGTT
TGGTTATGCGCCCGGGGCGTTTACTGGCGCCAGTAAAGAGGGGTATCAGG
GTAAAGTGCGTCAGGCACATAAAGGGGTTTTGTTCTTAGATGAAATTGCA
GATATGCCATTATCAGCCCAGTGTCGTCTGTTGCATGTATTGCAAGAAAA
AGAAGTGGTGCCAGTAGGATCGAATGAAGCGTATAAAGTTGATATTCAAA
TTGTTGCGGCAACCCATAAAAACCTTGCACAGCTTGTTGAGGTGGGTGAG
TTTCGTCAGGATTTATATTATCGATTGAATGGTTTAATTATTACATTGCC
ACCGCTACGTGAAAGACAAGATAAAGCGGAATTAATTGTACATATTCACG
CAAAACATGCTGAAAATAATCAAAGTATATGTTCACACTTAACACGGCTG
TTAACGGAATATTCATGGCCGGGTAATATTCGAGAACTCGACAATACGCT
GCGTGTGGCATCCCTCTTATCAGATGATGCGGCTCAACTGACCATCGAGC
ACTTTCCTAATAATATTGTTACGCAGCTAGTATCAAACACGCATCAAAGC
TTATCGAAAACGGCTGTAACGAAAGATTTGAAAAGCACAGTCGATGATGC
GTTGCTTGAAACCTATCATGCTAACCAAGGTAATATCAGCAAGACATCTC
GAATGCTAAATATCAGCCGTAATACCTTGTATCGAAAATTAAAAAAACTG
GGAATAATGTGA
>PBPRB0512 SO3743, putative transcriptional regulator LuxT
ATGCCAAAGCGTAGTAAAGAAGATACAGAGATAACTATCCAAACAATTAT
GGATGCCGTTGTTGATCAAATTTTACGATTAGGTTACGACAAAATGTCGT
ATACAACATTGAGTAAGCAAACAGGGATTTCTCGTACTGGCATCAGCCAC
CATTTCCCAAAAAAACAAGACTTTGCTAACGCACTTGATGGTAGAATCTT
TCGTTTGTTTGTTGAAAGATTGAATCTTGAAAATGGTCTTGATGCATTTG
TGGCTAGCTGGGTTGAAGCGCTTGATGATGAAAAATTTAGTGCAATTTTA
CGCTTGCTATTCCACCATATCGTTTCTGCTGAAAACTCGAGTGAATTTGC
TCTGCGTGGTATTGAGCGCTTATATGCCATGTGCAAAGAACGTTACGGAG
ACGATAGCATTAAAGAGTTGGAATGGTTATTGGGTAAATCGCTAATTAGC
CTTGCTCGTTAA
>PBPRB0557 TM1330, hypotethical transcriptional regulator
GTGTTCCCCCTAGTTTCACTTAATTTCGAGGTGTTAATCATGATTAACAA
GGCTCTTAAGATTATCCGTCAGTTCCATAACGTTAAACAAGTGGAATTAG
CGCAAAAGTTAAACCTTTCAAAATCTTACCTTTCTGAAATTGAATCTGGA
AAAAAACCAGTCAATTTAGAGTTGTTAGATAAATACTCGAATCTTTTTGA
TATCCCAGTATCCTCGTTAGTGTTCTTTTCTGAGACAATTGGAAAAGAAG
GCAAAAATGCACAAAAATTCAGATATGCCTTTGCCGATAAAATACTAAAT
ATCATGGAATGGATGGCTATTAAAAATGAATCGAAAAAGGTCTAA
>PBPRB0378 UHPA, putative transcriptional regulator UhpA
ATGATGATTACAGTAGCCTTAGTTGACGACCACCTTATGGTACGTTCCGG
TTTTGCTCAGTTGCTTAATGTCGAATCAGATATTGAAGTAAAGGGTGAAT
ATGGTCGTGCAAGTGAAGCCTTTGCAGCATTATCAGTGTCCAATATCGAT
GTTGCCGTTATTGATATCTCGATGCCCGATGAAAGTGGCCTAATCCTATT
AGAAAAACTGCGCGCAAAACATCCTAATTTTAGAGCCATTATTCTTAGTA
TTTATGATTCAGCGTCTTTTGTAAGTAAAGCAATTGAAGCTGGCGCATGT
GGGTACTTATCTAAACGATGTGGCCCCGTAGAATTAGTGACGGCCATACG
TACCGTCGCCAATGGTGATCGCTACCTCTGCGCCGATGCCTTATTTAACC
TCAGTAACGCACCTATCACGCCCAAAGCCTTAGACGCATTAACAAAGCGT
GAATACGAAGTCTTTACTCATCTTATTCAGGGTAAAGATGTTAAAGAGGC
CGGCATCATACTTTCTATTAGCTATAAAACTATTCATGTTCATCGCGCTA
ATATTCTCAGCAAACTGGGGCTGTCTAATAACGTCGATCTTATTCGTTTT
GCGCTTCAACATAAATTACTCGCAGAATAA
>PBPRB0351 VCA0689, conserved hypothetical protein
ATGTATACGGAAATGTTTAAATCTTTCTCTGAGCAAACTGAAAAAACACT
TGCACCTTACGCTAAATTTAACAAGCTATTTTCTAAAAATGTTGAAGAGC
TAACTGAGCTTCAACTTACAGCTGTTCGCACTTACAGTGAATTGGGTCTT
TCTCAGTTGAAAGCCGTTGGTGAAGTAAAAGATATGCAATCATTGGCAGA
GTTCAATGGCCAGCAGCTTGAAACACTAACGAAGCTTTCTCAGCAGTTAA
TGGAAGACAGCAAGAAGTTCTCATCAGTTGCACAAACATTTAAAACCGAA
GTTGAGGAACTAGTTGCAGAAAATGTAAAAGAAGTAACACCAGCATAA
>PBPRB0440 VP0514, hypothetical sigma-54 dependent transcriptional regulator
GTGATTTCGATGGTGACTCAATCTAAAAATAAATCAATAAATGGTCGTCT
TGTTGCAATTGGTTGTAATTATGAACCTTGGATTGCACTTCTTGAACAAT
CAGGATGGAAAACGCATTGTTGTTATGACCTTAGGACAGCAGATGCAATA
CTAGAAGAGTACAGCCCATGCATATGCATTGTTGATTTAAGCAATAACGA
TTTTAGCTTAAATAGTATTTCTTTGAGGGCAAATAAAACTAAGCAAGTAC
GTTGGATTGCACTAATTAAAAAAGAGCAGCTAGAAACGGATGTTATCTGT
CAGTTTATTAATAATTATTGTGTCGATTACTTTTCAATGCCGATCCCTAG
CACTTTACTCTTAGACACTGTCGGACATCAACTTGGTATGCTTGAGATAG
AAGCAAGAACTTGGGTTGAGGTAACGTCACAGCACGATATGGGACTGTAT
GGTGACTCTAAATCGGTGAAGCAACTTCGTGATATGGTTAGACGTGTAGC
ATCAACAGAAGTGAATGTTTTTCTTACTGGTGAAAATGGTACAGGGAAAG
AACTTATCGCGAAATCAATTCATAATTTATCTAAGCGTAAAAATGCACCT
TTTATTAATGTTAATTGCGGTTCATTAACATCAGATGAAGAGAAAATTGC
TTTTTTAAATTCGGCAACAAAGCTTCATGATGATGAAAAACCCAAATTTA
ATGGTACTATTTTACTCGATAATGTTGAAGAGTTGTCAAAAGAACTACAA
GATGAATTGTTAAGATATTTACAGGCACCTGCAGGGGAGTCTATAAATGA
AGACGTAAATTGCGATATACGTATTGTCGTTTCATCAAGTGCAGATCTTG
AAACTGCAGTTGCTAACGGTGAATTTAGTAAAGAGCTCTACTATCGCTTG
AATGTGTTCCATATAAAAGTGCCGACTCTTAGAGAGCGTGGTTCTGATAT
TTATCTTTTAGCAGAAAAATTTTTAGGTCAATTTTCTAATGAATATAATA
CATTAGCATCGAGTTTCTCTGAAGACTCTAAGCAGTTACTCTTACGCTAT
AGTTGGCCTGGTAATGTAAGAGAGTTGATGAATCAAGTAAAGCGTGCAGC
ATTGCTTGCTGAGGGTAGCGAAGTAAAAGCTGAGCATTTTGATTTGCCAA
GTAAATCTAACCTTAAGCAAAGCTTGCGTAATATTAAGGATGAAGCGGAA
AAAGATGTATTAGTCGCTGTACTTGAAACACACCGTGGTCAAGTTGCTTC
AGCGGCCAAAGATCTGGGTGTATCTCGCGCTACTATGTATCGTCTATTAA
ATAAACACAATATAGTTCCTGATGTTCGATATTATAATAATGGGCAAATG
GGTGAATAA
>PBPRB0449 VPA1299, hypothetical transcriptional regulator, TetR family
ATGTCTGTCAAGGAAAAGAAACGAGGTCGTCCAAGTGGAACATCGGGGCA
ATTGAGCGCAGATAAAATCATTGTTGCAGCTAAGTTCTTGGTGAAAGATG
ACGGGAAAATCCCCAGTATCCGTAAATTAGCGGGTAGCTTAGATGTGGAT
GCTATGGCGATTTATCATTATTTTGCGAATAAAAATGCGTTGTTGGAAGC
GGTAACGGTCTCGCTCATTGAAGCCATTTATGAACCGAAAGGCAGTGAAG
CTTGGCAAACAGAATTGATGGCATTGTGTAATAGCTATTTGTCGTTGTTA
CAAGCACATCCGGGGTTGCTACAAACCTTCTTAGGGATGACGTCGACAGG
ACCTGCCAATGTGTTTGTGGATCGCTTTTATATGGCTATCACGCCATTGA
ATCTTACGCTCGAACAAGTGAAAGATGCATTGGATCTGCTAGTGGATTAC
TTACATGGCTTTGCTTTGTCTCTAGAGTGTGGTGGGGCAGCGAGTGGTTT
GACAATAGTACACGCTGAAGGGCCATTACGTTTTTATATTCGAGCGCTCG
AACAGCACAGTGTTTGA
>PBPRB0409 VVA0761, putative transcriptional regulator
GTGAGACTTGTCGTCAAACTCTTTATTGACCGTATTCCTCGCCTTATGGA
TAAAAGCTACAAACAATTTCTGGTCGTCGCTGAGCTAAGTAATATTAGCC
TTGCAGCTAATCATCTCGGCATCAGCCAACCAACCCTAACGAATAACATG
AAGAAGCTGGAGGCAAGCTTTGGCGTACCTCTTTTTATCCGAAAATCGAA
AGGGGTTGAACTCACTGAATATGGTGTGCTCCTTCAAGAACAAGCGCTTG
AACTACAGCGACGACATGACTCATTACTGCATAAGATGGCTGATCTTATT
GAGAGAAAAACTGAAAAAATCAAAATGGGTACTGGTGATGCATGGTGGGA
AATTTTTGTAAAACAAGCATTGCAGCAATATAGTGCCAGCAACCCTTCAA
TCTCTATTCAGCTGGAATTTGGTAACCACCTTAAGCTGATGGATATGCTC
ATCCATGGTCAAATCGACCTTTTTGTTGGTCATGAAATTGTTGGTTTGTC
TCATCGGTGTAACGTCACATTCATCCCCCTTCTACAAGATAAAGAAGCAA
TGTTCGTACACCAAAACCATCCACTACTGGTGAACCATCGAGAAGAAGAT
ATGGCACTTTATCCTCTATTGCAGGTAACACCAGATTCAGAAGCTTACCT
GCATCTAATAGAAAACCCACAGCCCAAACAGCTAGAAAGAGATAGACAAA
AGGTATCAGAACGCATCGTTTACGAGATCAACTCACTGACTGCCAGTATC
GATATGCTAGCCTCGACAACCGCAATCATGCCGTATCCAATGAGTATGAC
TGACTACTTCGCGCAGGTAAATATTGTCCCGCTTCCATTAAAAAAAGAAG
GACAAAAAGGTACGGTTGGGATCTACCATTTAAATGAGTTATTGGTCGAC
CATGTTGCGGATATCAAGCAGCAGCTGATTTTGAATGGCCACTATCAAGC
ATGA
>PBPRB0327 Z0841, putative transcriptional regulatory protein KdpE
ATGGAGGGCAACATCTTGTCCTGTAAGGTATTAATCGTCGATGACGAACC
ACAAATCCATAAATTTATTCGTATTTCTCTTGTTGCCGAAGGGTTTGAAT
ATTTAGGTGCAACATCCATTCAATCGGCACTCGATTTGATTGAACGTGAA
CAGCCGCATTTAATCGTGCTCGATTTAGGGCTACCAGATGGTGATGGTAT
TGAATTGCTGACTACTGTCCGAACCAAGAGTAAGACTCCTATTCTGATCC
TAACAGCTCGAGATGAAGAGGATGAAAAAATCCACCTTCTGGAAGCAGGA
GCCAATGACTATCTCAGTAAGCCTTTTGGTATCCGAGAGCTTATAGTAAG
AATTAAAGTTTTAGTACGCGATTTAGTCGACGTTGCTCAAACACCTGATA
TCTTGACTTCAGGGAACCTAACACTTCAGCTAAGCACCAACCAATTATGG
CTAGGTAACCAAGAAATCGCTCTCACTAAAAAAGAATTTTCCTTCCTTAG
CATACTGGTGCAAAACGCAGGAAAATTAGTGAAGCAAGAGAACCTACTAG
AAGAGATATGGGGGAAAACACATACTCACGATAAACATTATCTGAGGATC
CTTGTTAGTCAACTCAGGAAAAAACTTAACGATAGTGCCGATATTCAATG
CGTTATTAAAACTGAATCAGGTCTTGGCTATCGTTTTGTTGTAGACCTCG
AGAATTAA
>PBPRB0361 Z5025, putative mannitol operon repressor
ATGGCACAAAGTGACCAAGAGTCAGACATCCTTGAACGATTAAGTGATAC
ATCTAATGTGCGAGGTTTCATTATCACTTCTGTCGAAGTGTTTGAAGAAG
CTGTCGATAGCTTAATCCAACGTATATTTCGTAAAGACGATTTCGCCGTT
AAGTCTGTGGTCGGTCCTTTACTGGATAACTCTGGCCCCTTAGGTGAAAT
AACGGTTCGCCTTAAGCTATTGCTGGGTTTAGGCGTTGTTTCACACAACA
TTTACCAAGATATCGATGCTTTTCTTAAACTGCGTGATTTTCTTAACAGC
GATGGTAGCGATTACTGTTTTACTGATCCCAAAATATTACAACCCATCAA
AAAAATGCATGCGGTACAAAATATGGGCGTGGTACAACTTGAAATCGCCT
CACCAAGTGACGATGTCGACCTTATTTTTTATCAAATGCAGTTAGCTCGC
CAAGAACAGATCATTAAGTCAGCGCTTGCCCTTGCAATTGCTGGCATCTG
TAATGAACTTGGTCGTGATAGTCCATTTTGA