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COG category: Transcription
Genomic element: chromosome 1

Number of genes found: 14

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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA2822 hypothetical protein
ATGATCATCTATAAGCATGGTAATGACATTTTTGAGCCTCAGAAAAGTGC
TTTTCGAACCACAGAAAGCACGACAAAACTCAGTGCGAGCGAAACTAAAG
TTTTGCAGTATTTGATTGAAAATAATGGCGAGATAATTACACGAGAAAAA
TTGCTAGAGATAGGATGGCCCAACAAAGTTGTTGTACCTAACTCACTGAA
TGTAGCCATTGCTAATTTAAGAAAAGCATTCAAAACCAAGATCGAAATTA
TTATCACGATTAAAGGTGCAGGATTTACGATTGCCAAAAATACCTTCATT
CAACATACGATACAACCAGAACCTATCTCTCTGGTTAATGAAGAAATGGA
TGCAGAAAAGTCAGATAAAAAAAACATAAGCATCCATAACGATGGTCATT
CAATAAGCAAATCTAAACGCCAACTATTTCAAACGGTATCTTTTAGTATT
TCTTTTGTGGTGGTATTTACGTGGGTCACGTTATGGGTAAGTAGCTGGCA
ATCGCCGCCTTGTATCAGTTTTAACGAACAAGAAATTTGCGGCAATATTG
AGTTGCTCAATCTTGAAGATCTTCCTAAAACAGCAAGTCGCTCTCTATAT
ATTGATTTTAAAGGTAACATTTATGAAGCACAGTAA
>PBPRA2744 ARSR, hypothetical transcriptional regulator, ArsR family
ATGGAATTAGAGTTTGTCGCGAAAGCACTAAAAGAGTTAGGCCATCCTAC
ACGGCTGTTTATTTTTAAACATCTGGTTAAATCGGGTCATGACGGGTTAC
CTGTTGGGCGATTACAGGAAGAGTTATCTATTCCTGGGTCAACTTTATCG
CACCACATCTCCAGTTTAATGTCAGCAGGTTTAGTGAAACAACACCGAGA
CGGACGTACTTTATACTGTCTTCCACAATATGATGTTTTAGAGGGCGTAA
TCGGTTTTCTACAAGATGAATGTTGCAGTACGACCACAGAATAA
>PBPRA2761 BB3971, hypothetical transcriptional regulator
ATGGATGTATCTTTTGAGCAACTGAAAAGCATGGTCGTTTTTGCCAAAAT
TGTCGAACAAGGGAGCTTCTCAGCTGCCGCGCGGCAACTAGGCTTATCTC
GTGGGGTCGTCAGCTATCACCTGAAAAAGCTTGAAGATCATATCGGCATG
CCGTTATTGAACCGTACCACGCGTAGCATTAGCCTAACCGATGCTGGTCA
ACGTTACTTTCAACGGTGTAAACGTATCAGTGAAGAAGCCGCTGCTGCCA
ACCTACAGATTGAAAACCTACGTGAAGAGCCTGAAGGCAAACTCACGATT
AGCGCCCCGGTGAATATCAGCATGCATACGATTGTGCCCGCGCTGAATAC
GTTCAAGACCTTATACCCAAAAATAGAAATAGATCTGAACCTGACCGACG
ATATCGTTAATATTATTCAAGAAGGGGTCGATTTAGCCATTCGAGGTGCG
CCACTTGCTGATTCTGGTTTGTACGCCAAAAAGCTGATGACCATGAAGAA
TATATTATGCGGATCACCCAGCTATTTTAACCAACACGGTATACCTCGCA
CCCCTGCAGAATTAGCCAATCATGAATGGGTGGTTTATAAGAAGACATCA
AAAATCCAAACCCTCACAAAAGGCACGCGATCATACAATGTGAAAATGCA
GGGTAGTATTACTACCAATAGTGCATCGGCAAGAACTGCGTTTGTGGTTG
GCGGACATGGCGTCGGACGTTTACCTATCTACGATGCATTACCGTTAATT
AAAGCCGGGCAACTCACCCCAATTTTAGAAGATTACGCATTAAGCGACAT
TACGATTTATGGTGTCTATCCGCCTCGGGCTGCAGATTCAAAAAAAATGC
GGTTACTACTCGATTACTTACAAGAACACTTCACTCAGTATGTAATGTGA
>PBPRA2762 BC0561, hypothetical Response regulator ofcitrate/malate metabolism
GTGTCATTGATTAGTGTTGTGATAGTTGAAGACAATGCCGGAATCGCAGA
GTTACATCGCCGTTGCTTAAGCCAGATTGCTGGTATCGAAATACAGGCGA
TGGCACACAGCTACCAAGAAGCCATCACGTTATTTGACGTGCTAAGCCCT
GATCTCGTATTGCTGGATGTGCAGCTTCCAGACGGGAGTGGGTTAGATTT
GTTGCGTTTACTGCGCGCTGAAAAACAAGAAACCGATGTGCTATTGATTA
CTGCCGCAAGAGATGTCGATACCCTGCAAGAAGCAATGCGAGGTGGGGTG
GTAGATTATATTCTAAAGCCTGTGGTTTTCTCGCGTTTAGAAGAGTCAAT
TACTAAGTATTTGGATTCAAGAGTGACCATGGCTGGGTTAGGTGCTATTG
AACAAAGCGATGTTGATGCCATGTTGATGCGCCCGAAAGAGCATAAGTCG
ACGGCCCAATTACCGAAAGGCATTGATAATGTCACGCTTGATAAAGTACG
TGAGTTATTTAAATCCAATGCCCAATTAACTGCAGAACAATCTGGGCAGT
TAATCGGTGCCAGCCGAACTACCGCAAGGCGCTACCTTGAATATTTGATC
AGTAGCGGTGAGTTGGAAGCAGATCTGAGCTACGGCACAGTGGGCCGACC
GGAGCGGGCGTATGTTAAGCGCACATAA
>PBPRA2775 C4153, hypothetical protein yhfZ
ATGCCAACAAAATATATAAAAAAAGAAGGTGCCGCTGTCATTAATATTGC
CCGATATTTAATGTCACAAAAAGAAGGTGCCCGTTTACGTACCATTGATT
CGTTGGCTGAAGAGTTCGAGCTGTCGGTTGGCTTAGTTCAGAAAGCCCTG
AAAAAGATTGAAGCAGATGGCGTGATTGCCCTTTCACGGCAAGGCCGCAA
TGGCACTTATATTTCTCGCTTAGACAGCGAAGAAATTGTCCGTCTGGCGG
GGCTAGGTCACGTTGTGTGTGCCATGCCGCTGCCTTACACCAAACATTAC
GAAGGATTGGCTAGCGGATTAAAAGCCCAGATGAGCAGCTTACCGTTGTA
TTTTGCCCACATGCGAGGTGCCAGCGTTAGAGCTAAATTATTAAGCTCCG
GTGTGCATGATATTGCCATTATGTCAAAGCTTGCAGCACAGAGTTACAGC
GATGGTTTGACTGTTGCCGTGAATTTGGGAAAGAACTCCTATTCGAACGA
TCACAGGGTAATTTACCGTAAGGGCGAGTATAGTGCCATCCGTCGTGTTG
GCGTCGACTCGGATTCTCCTGACCAGCAGATCCTGACTAAGCAGGCTTTT
CCGGATCAAGACATTGACATTGTCGAAATCAATTACGATGACAGTTTGGT
CCATTTGGCTAGCAGAAATATAGATGCGGTGATTTGGCTGACGGAAGCGA
TAGATATGGGTAATGTCGGTCTGGCAGAAAAATCGCTTAACCATATTCCC
CAGTGTGAAATGGCCTCTGAGGCAGTACTACTGGTTCGAAATGAAGCACC
GCATATTAAGGTACTCTTGAGAAATTTAATCAACAAGGATGCCTTGATCT
CTCATCAGAAAAAAGTAGTGACAGGCGAAATAACGCCGAGCTATTAG
>PBPRA2788 C4153, hypothetical protein yhfZ
ATGTCCAAGCAATACATAAAAAAAGAAGGTGCCGCAGTCATCAATATTGC
TCGATATTTGATGTCACAAAAAGAAGGTGCCCGTTTACGTACCATTGATT
CGCTGGCTGAAGAGTTCGAGCTGTCGGTTGGCTTAGTTCAGAAAGCCCTG
AAAAAGATTGAAGCGGATGGGGTGATAGCCCTTTCACGGCAAGGCCGCAA
TGGCACTTATATTTCTCGCTTAGACAGTGAAAAAATTGTCCGTCTGGCGG
GGCTAGGTCACGTCGTGTGTGCCATGCCGCTGCCTTACATCAAACATTCA
GAAGGATTGGCTAGCGGATTAAAAGCCCAGATGAGCAGCTTACCGTTGTA
TTTTGCCCACATGCGAGGTGCCGGCGTTAGAGCTAAATTATTAAGCTCCG
GTGTACATGATATTGCCATTATGTCAAAGCTTGCAGCACAGAGTTACAGC
GATGGTTTGACGGTTGCCGTGAATCTGGGAAAGAACTCCTATTCGCACGA
TCACAGGGTGATTTACCGTAAGGGCGAATATGGTGGCATCCGCCGTGTTG
GCGTCGACTCGGATTCTCCTGACCAGCAGATCCTGACCAAACAGGCTTTT
CCGGATCAAGACATTGACATTGTCGAAATCAATTACGGTGACAGTTTGAT
CCATTTGGCTAGCAGAAATATAGATGCAGTGATTTGGCTGACGGAAGCAA
TAGATATGGATAACGTCGGTCTGGCAGAAAAATCGCTTAATCATATTCCC
CAGTGTGAAATGGCCTCTGAGGCAGTACTACTGGTTCGAAATGAAGCACC
GCATATTAAGGCACTCTTGAGAAATTTAATCAACAAGGATGCCCTGAATT
CTCATCAGAAAAAAGTCGTGACAGGCGAAATAACGCCGAGCTATTAG
>PBPRA2990 GCVA, putative transcriptional regulator, LysR family
ATGTCTAGACGATTACCACCGCTTAACTCATTGAAGGTCTTTGAAGCAGC
CGCACGGCACTTAAGTTTTACGCGAGCTGCGGAAGAGCTATTTGTCACAC
AAGCTGCTGTAAGCCACCAAATTAAAGCACTTGAAGAATTTCTTGGGCTT
AAATTATTCCGTCGTCGTAACCGTTCATTGTTGCTGACAGAAGAGGGGCA
AAGTTACTTTCTCGATATAAAAGATGTTTTTTCAGCGATATCTGAAGCAA
CAGATAAAGTGCTAGAAAGGGGGGCGAAAGGTGCGTTAACCATTAGTTTA
CCTCCTAGTTTTGCTATTCAATGGTTGGTGCCTCGTTTAGCTGATTTTAA
TGAGCAACATCCTGAGATTGATGTGCGTATTAAGGCGGTTGATTTAGATG
AGGGATCGTTAACGGATGATGTCGATGTCGCGATTTATTATGGTCGTGGC
AATTGGACTGGACTACGTGCTGACAAGCTGTATCAAGAATATTTATTACC
AGTTTGCTCACCGATGTTGCTCGCTGGCATTAAACCGTTACGCACCTTAA
GTGATTTGAAATTACATACTCTCTTACACGATACGTCGCGAAAAGAATGG
AAAAACTATGTTCGTCACTATGAGCTGACTGACATTAATGTGAATCAAGG
TCCGATTTTTAGCCACTCCACCATGGTATTACAGGCGGCTGTACATGGGC
AGGGAATTGCATTAGGCAATAATGTGCTTGCTCAGCCTGAATTAGATGCT
GGTCGCTTAGTGTGTCCGTTTGATGAAATATTAATGAGTAAAAACGCGTT
TTATTTGGTTTGTCAGGAACGACAAGCTGAAACTGGCCGTATTCAAGCCT
TCCGTGATTGGGTATTGGCAAAAGCGGCAAGAGAACAGGAAGATATTACG
GATGCCTAA
>PBPRA2732 PA0133, hypothetical transcriptional regulator
ATGAAACCAATAGATAATCTTGATATTCGCCTATTAAAGCTCTTTCTTAT
TATTGCTGATAGCGGCGGATTTTCTGCAGCCCAATATCAATTAAATATGC
ATCAATCGAGTATAAGTAAAAAAATGGGTGATTTGGAAACTCGCTTGGGC
ATGACATTATGCCAACGTGGAAGAAGTGGGTTTAAATTAACCAGTGATGG
GTTGAAGGTCTATGAGGCAAGCAAACAGTTATTTGATTGCATCGATGATT
TTCAAGTGAAAATCGACGAAATTCGTAATGTATCGAGCGGCAGTATTAAT
ATTGCTTTTACGGATAACTTAGCAACCAATAAAAATTGTCGGATCCAAAC
TGCGATCAATACCTTTTGTAATACGCATTCAAAGGTCAATATTAACACCC
AGATCTATGATTCATCTTTGATTGAAAAAAGTATATTGGAGAATAAACTA
GACGTTGGTATAACCTCTCCAGAAGTGCTTAAAAGCGGTCTTAAATATAT
TTATATTTTTAATGAAAAACAGCAATTATATTGTTCACCATCACATCTAA
TATTAGCTTTAAATCGCGAAGTCACAGTAGAAGATATTCTGGTACACCCT
GTTGTTGATCGTGGGCTGACCCATCATGTGACTCCTCTCAGTTATGCCAG
TGAGCATCTGTATAAGTCTACGACGACCAATATGGAGGCGACAGCTCATA
TGATTCTCTCAGGTCACTTTATTGGCTATCTTCCAGATCACTATGCACAG
ATATGGATTGAGCGTGATGAGATGGTGAGAATTTCTGCTATTCATGGGTT
GGAATATACCCCTAGCTTTTATCTGACTATTAATGAGAAAAATGACTTAT
CGTATGCGACAAAAGCACTAGTCACAGCAATATTAGATGCGCATGATGTT
AATACTAATTTCGAGTGA
>PBPRA2834 PP2551, hypothetical transcriptional regulator, LysR family
ATGAAGAGTCATAACCTCAATTTATTACGTACCTTACAAGTGCTGCTTGA
AGAGTGTCATGTCAGTCGTACTGCTGAGCGTTTACATATTACCCAATCAG
CAGTGAGTCGACAGTTAACCCAATTGCGTGAAGTATTTAACGATACATTG
TTAATACGTGAGGGGAATCGATTATTGCTGACACCACGTGCTGAAGCCTT
AAAGTTGAAGTTAGATTCCCTTTTGGCTGAGTGCAATAGTTTGTTTGAAC
CTGTCACCTTTCAGCCAGAACAATGGCAGGGTAAAGTGGTACTATCATCT
TCTGATTATGTCGCGCAATATATTCTTCCTGAAGTGGTTGAGCATTTACG
CGAGCACGCTCCACTCGTTAGTGTCGCTTATCAATTGTGGTCACCTAAAC
AGTTTGAACAATTAGCCGATCTCGATATTCAGTTTGTTTCTACCATGCTA
TCCGCTATTCCGGATGGTTTATGCGGAGAACCGATTGGGGCTGATTATCC
TGTGTGTGTGATGCGTTCTGATCACCCACTAGCGACGGCAGATACACTGC
AATTAAATGATTTTTTGTATTACGATCATGCATCAGTGACTGGTGGTGGA
GATAAAGACAGCTTTGTTGATTTGCGGTTAGCTGAACAAGGGTTAAGTCG
ACGGGTTAAGCTTTCGGTGCCTTTTTTTACTTCAGCACTTAATACTATTT
GTCGCTCTGATATGTTGTTGGTGATCCCTGAACATATTGCCGTAAATATG
AAGCAACTCTTTCCTATCACCTATTTCCCTCTGCCTATATCTGTGCCCGA
GCATAAATATTGGTTACTTTGGCATCCTAAATATAATAATGAACCGTCCC
ATCAGTGGATGCGAACATTACTTTTAACCACGATGCGAAGCTCTATGTAT
TCAATGCCTATGATTAATAATCATGAGGCTGATGAATTGTTTTGA
>PBPRA2765 S2371, putative transcriptional regulator, LysR family
GTGCGGTATTCACTCAAGCAACTGGCTGTATTTGAAGAGGTTGCGAGCTC
TCGTAGTGTGAGTAAGGCGGCAGACAATCTAGCATTAACCCAGTCAGCAA
CTAGCATGGCGTTATTACAGCTAGAAAAGATGTTAGGACGACCTTTGTTT
GAGCGGCAGGGCAAGCAAATGACATTAACGTACTGGGGATCGTGGTTAAG
ACCAAGGGCAAAACAGCTCTTATTTGATGCCCAGCAGATTGAACAAGGCT
TTTACGATCAGCATATTGTGAGTGGTGAAATCAGTATTTCAGCCAGTCAA
ACTGCCGCAGAACACTTGCTACCAGAGCTTATCAGTATTATTGATAAGGA
TTTCCCCGAGCTACGTATCAAGCTTAGAGTGAAAAATGCCCAGAAAGTGG
TTGATCACGTAAGAGATTTTGAATGTGAGTTGGGTATTATTGAAGGCCGT
TGTGATGATAGCCGTATTGAGCAAGAAGTATGGTGTCACGACCATCTTGT
GATTATTGCTTCTAAATATCACCCTTATGCCAAGCTAGATAAAGTCAGCT
TTGCACAGTTAGAGCAGGCACAATGGGTACTTCGAGAGCAAGGAGCAGGT
ACAAGGCAGAGTTTTGAAAGCGCATTACACGGTGTGATTGAAGATTTGAA
TGTTTGGCGGGAATATGAACAGATTTCAGTACTAAGAACATTAGTGACGA
ATGGCCCTTATTTAAGTTGTTTACCTTTTCTTGATGTTGTTAAGCATATA
GAACGTGGCGAGTTGGTGGCACTGAATGTTCCAGAGTTGAATATGAAGCG
AACGTTATCTTTTATTTGGCGTGCAGACTCGATTGAAAATCCGCTACGTG
ATTGCATTCGCCGTGAAGCGATCCGTATGATTAAAGATAGAAAATTGGAA
ATGTAA
>PBPRA2823 VPA0662, hypothetical SoxR, transcriptional regulators
TTGTCAAAAAGGGAATCTTCACAGAATAATAGAGTCCAACAACCTTACAT
AAGCTGTAATGTTCAAGAGGCGGGTATGAATATTAGCAACGTCGCAACAA
AAACAGGGTTAACCACCAAAACGATCCGATTCTATGAAGGGAAAGGAATT
ATTACAGTGCCAGAGCGTAGCAGCAATGGTTACCGCCTATATGGTGAAAA
GCATGTTGCAGAGTTAAACCTTATTCGTCGCTCACGTTTAGTTGGGTTTT
CTTTAGAGGAGTGTGGTGAATTACTGGCATTATCGCGGGATCCTAAGCGT
AAAAGTGCAGATGTAAAACTGAAAGCCCAGGAAAAGTTAATTGAAATTGA
TCATAAAATAGAGGAGTTATTGAAGATGAAGAAAACCCTGGAAACATTGA
CGAAACAATGCCCAGGGAATGAGGGGGCGGCATGCCCAATTATCGAGGGT
TTAAGCCAAGATTAA
>PBPRA3035 VV0691, putative response regulator
ATGATTAAAGCCATCGTGATTGATGATGAACTATATGCTCGCGAGGAACT
GATCGATCTTTTGCTTGATAGCGGCGAGATTGATGTTATCGATAGCTGCA
ATAACGCCATTGAAGGGTTAAAAAAAATAAATACGCTAAAGCCTGATGTG
ATTTTTTTAGATATTCAAATGCCGCAAATAACCGGGATCGAAATGCTGAG
TATGTTAGATCCCGACACCATGCCTAAAGTTGTGTTTGTTACGGCCTATG
ATGAATATGCCCTTAAAGCATTTGAAGATAATGCTTTCGATTACCTATTA
AAACCCGTTGAAACCTGTCGACTCGATAAAACAATCAAACGCCTTAAGCG
TGAGTATGAAGCAAAAGATTATTCACCGCTAATAGCAGACATGTTGGAAT
TGATTCCCTGTTCAGGTCACAACCGCATTTTACTGTTACGCCCTGAAGAC
ATCGAAGTGGCTTACTCGGATTTATCGGGAGTGCATATTTTAAGTACAGA
AACAAAAGCCAGTACTCAGCTAACCCTTAAAATTCTGGAAGAAAAAACCC
CTCTTATTCGCTGTCATCGTCAATACTTAGTTCACCCACAAGCTATCCGG
GAAATTAAGTTATTGGATAATGGTCTCGCAGAAATTACAACCCAGTATGG
TCATCAAGTACCCGTCAGCCGCCGCTATTTGAAAGAGCTCAAAGATCGGT
TCGGCTTGAGCTAA
>PBPRA3001 YEIE, hypothetical transcriptional regulator
ATGAACATTGCGCTGAAGCAATTAAAAGTTTTCGTCACCGTCGCACAAGA
ACGGACCATTACGGCAGCAGCTGACAAACTATTTTTATCTAAGCCCGCTG
TCAGCATGGCGTTATCAGAACTCGAAAAACAACTCGACCATAAACTTTTT
GATCGCAATAATAATCGTCTTATCATTAATGAACAAGGCAAGCGATTGCT
TCCTCTAGCCGATGAATTACTGTCGCGCAGTCATTCCATTGAGAATTTAT
TTGATCAAACAGGCCCTGTCACAGGTAACCTGAAAATTGGCTCGAGTGAT
ACGGTAGGCAATCAAATTACCCCATTTTTATTGAGAGATTTTCGCGAGAG
CTCACAGCACTATAATCAATCACTGTTTATTTCTAATACCGCCCAGATTT
GTCACAAATTGAGTGAATTTGAACTCGATATCGGTTTAGTCGAAGGTAAA
GTACAGCAAAATGATCTTGTGACTGAACCTTGGCTCGATGATGAAATGGT
TGTAGTTTGCCACCCAAGTCATCCGTTAACCTTGATTAATAACCTGCGCT
TGGTCGATTTAGAAAACTCTGAGTGGGTACTAAGAGAGCCAGGGTCTGGC
ACACGTGAATTCTTTTTAAATCGCATATCACCTCGGTTAGAAAAGTGGCA
TCAAGCATTTGAACTCAACACCACCGAAGCGATCATCAATTGTGTAGCTG
CAAACTTAGGTATCACTTGCCTATCAAAGTTAGCCATTCAACATGCCGTG
AACGATAATCGATTGGTGATTCTTGAATTACCCTTAGATATGCGTCGCCA
ATATTGGTTACTTTTTCATAAAGAAAAATACCAAAGCCCACTTCTTAAAC
TATTCCTGAATTTTTGCCAGAAGTGGGATTTAAAGCGATAG
>PBPRA2717 Z5512, putative transcriptional regulator
ATGAGTACTGTATTTCTCGATATCATTGATACTGTTTTATCTGAACGGGA
GAATTTTAACCGTATTTGGTTTGCAGGTGATCAACATGCGCCTCCCGCCT
TTAGCTATCAAGTCAATTTTCCACGGCTGGAGCTGGTATTAAGTGGGGAA
TATATTAATCAACTCGAAGATCCCGTGATGGGAATTAGCGAAGTTAGCCT
AATGGCGGGTGATGCTATTTACATTCCCCCTAATACTTGGAATAAACCTA
ATTGGGAGAATGAATGTTCGGTATTGAGCTTACTGTTTGGCAAACGTCAA
TTGGGGTTCAGCTTAGTCAGTAAAGGCAAAGAAAGCGTTGGGTTTTACGA
CGTACAGAAGCACAGTATTCAGGCTTGGACTGGGCATGCTATCGACCACA
TTTTGAGTGCCCTGAATACCTTAGCCAAAGAGCCAAATCACAGCCCGATG
GATGAGCATTTGTTAATGGCATTATTGAGCTATTGCCGCACGATGATCCA
CTCACCCACGCAATCTGCAAAAACACGCAGTGAGGATCTTTATCAGGGGA
TTTGTATCTATATTCAAGAAAACTTTCACCGAGCGGTTACCCGTGAAACC
ATTGCACACCGCTTTAACGTCTCACCCAATCATCTTTCACGCTTATTTCG
CCAGCAAGGGCACATGCGGCTCGCCGATTATATCTGCTGGGTAAGGCTAG
AACGGGCAAAGTTCATGTTGAAAAAGTACCCTTTCCGCTTGCATGAAGTC
GCGACACGCTGCGGCTTCCAAGATGTGAATTATTTTTGTCGGGTATTTAA
AAACAAAACAGGCAGAACGCCAACGGAATACCGGGAGATAACATAA