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COG category: Transcription
Genomic element: chromosome 1

Number of genes found: 14

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# Photobacterium profundum, ss9

>PBPRA0644 hypothetical transcriptional regulator
ATGACTTTTAAGAATGCCCTTTGCATTCGTATAACGGTAGCGGGAAGCTT
TATAATGGGATATTTAGAAAGAATTAAACAGTTAGCTAAAATCCAAGGAA
TTAGCCAAAAGCAACTTGGCGAATCTTTGGGTCTTCAGCAAGGAACAATG
AGCCGTAAGTTATCGGGTAAATACGGTATTGAAGTCCGCGAACTAGAAAG
AATCGCTGTGACATTAAATACGTCTATCGGTTACCTTTTAACAGGGCAAA
TTGATACAAGCACTCAAGCAACGACAGCCATTACTCATGAGTCTTCACAA
GGTTCAACCTGTACTTACATCCCTATTATTCACCGTAAAGATTTTGGATC
TTTCATCGACGGTGAATCAGTAAATGTGGTCAGTAAACGCGTAATACCAC
AACACCTTGAACGTGATGATTGCTTGGGTTTATTTGTTGATAACGAAAAT
ATTTCGCAATGTGCACCTATTGGCAGCTATGCATTAGCCACCAAGCAAGC
GGCTTACCGCCCTAAACAACCAGTATTTGCATCGGTACGTAACAGTGAGC
CTGATTTTTATCACATGACTCAATTGGCTGATGGTGTTATCTTTTCGACA
TCCCAACCCGATTTCCCTAACCTCTTTGTCAATAATGATGAATTTAAAGT
TCACGGTTACATCATTCAATCAGATTGGGCTTACGATCGTTAA
>PBPRA0897 FLGM OR, putative negative regulator of flagellin synthesis FlgM
ATGGCAAGTATTGATCATCTGCGCAACAGTCAACCGATGACAACCGCTCG
GAATAATCAGAGTAAAGTAACGACAACATCATCAGGCAGTCAACCTACTT
CGGCACCAAGCTTGGGGCGACAAGATGCTGTTTCGTTAAGTTCACAAGGT
AAAGCTGTTGGTCAAATCCACCAACAACTAGCCACAGAACCTAGCTTTGA
TAGTGCAAAAGTCGCGGCAATTAAAGAAGCTATTTCAAGTGGCGCTTATG
TAGTTGATGCAGATAAACTCGCATCGAATATGATGAAGTTTGAAGATGAG
CTACGCGGGCTATAA
>PBPRA0714 LMO0547, putative transcriptional regulator, SorC family
ATGAGTGCAAATACCAATGATAGCCCACATGTTGATAGTGACTTATTGAC
CGAGATTGCTATCGCTTATTATCAAGACGGTGCGACTCAAGAAGAGATAT
CGAAAAAATTTGGCATGTCACGTGCCAAAGTGGGTCGTTTGCTTCGTCGT
GCTCGTGAAGAAGGAGTGGTTGACATTACGGTTAAATATCACCCTGTCTT
TAGCGAAAAGCTCGAGCAACAACTTATTGAACGTTTTAATCTAAAGCGCG
CATTGATTGCTCTTGATCAACCTGATGATAAAACCCAGCGACAACAAGTC
GCTAGCCTTGTTTCTAGTTATTTAGCCACGATTTTAACTGATGAAATGGT
AGTGACGGTTGGGCAGGGTCGAAACATAGCCTCGATTGCTAGCCATGTTG
GTGTTGTTCCTCATAAGAAATGTCGCTTTGTGAGTGGTATCGGTGGTACC
CATCGTTCTGGTAATGCCATTAATGCTGATCATATTTGTCGTTTATTGGC
GAAGAAATACGATGGTATTAGTGAAACCTTGTATGCGCCAGCTTACGTTG
AAGATATTAGAGTGAAAGAAGCCTTCATGAAAAACGGTACGATAAAAGAA
ACATTAGACCGTGCTCGTCGAGCTGATGTTGCTTTGGTCGGTGTTGGTGA
TATGAATGAAAATAGCCACATGGTTAAACTGGGTTGGTTTACGCCGCAAG
AAATTGTAGAAGCACGTATTCGAAAGGGTGTGGTGGGCGATATTGCGGGG
TATGATTTTTTTGATAGCCAAGGTAACCAAGCCGACACAATGATGAGTGA
TCGGGTGATTGGTTTGAGTATGGAAGAGCTACGACATATACCCACCGTGG
TTGTATCTGCTGCTGAAAACAGTAAAGCATTAGCGTTGTTAGGCGCATTA
CGATCTGGCGTTGTTGATGTTGTTGCGACCAGTGTGAGTAATGCACTGAC
GATATTAAATCTTGATCAGCAAATGAAGTAG
>PBPRA0801 NUSB, Putative NusB protein
GTGAAACCAGCTGCACGTCGTAATGCTCGTCATTTTGCTATCCAAGCAAT
TTATTCATGGCAGATCACGAAAGGTAATGTTGCGGAAATCGAGCAACAGT
TCCTTTCTGATGACAAATTTGAAGAAGAAGAGCACCAGGCTGATGCACCT
ATTCTTGCTGCACCACATACAGATCTGAACTACTTTCATGATCTTTTGAA
TGGTGTTGTACAGAACCATCAGGAATTGGACAGCAAGATGCGTCCTTACC
TTTCTCGTCCACTTCAAGATTTGGACCAGATGGAGCTTGCTCTACTTCGC
TTAGCGATGTATGAGATGACTAAACGTGAAGATGTTCCTTATAAAGTTGT
TATCAATGAAGCAATCGAATTAGCTAAGATATTCGGTGCTGAAGATAGCC
ACAAATTTGTGAACGGTGTGCTTGATAAAGCAGCACCAACACTTCGTAAA
AAGTAA
>PBPRA0796 PLU3900, putative RibX
ATGCATTGTCCTTTTTGTGGTGCCAATGACACCAAAGTAATCGATTCCCG
TTTAGTTGCAGATGGTCATCAAGTTCGTCGTCGTCGCCAATGTTTAGCGT
GCAATGAACGCTATACAACGTTTGAGACTGCCGAATTGGTGATGCCAAGA
GTGATAAAAACCGATGGCAACCGCGACTCGTTCAATGAAGATAAACTTCG
TGGTGGTATTCAGCGTGCGTTAGAAAAACGTCCGGTGAGCGCAGATGATA
TAGAACGTGCAATTAACACGATCAAGTCCCGTTTACGCGCGACGGGTGAA
CGTGAAGTACCATCAGATATGATTGGTAACTTAGTAATGGAAGCACTAAA
AGAATTGGATAAAGTTGCTTATATCCGCTTTGCTTCTGTTTATCGTAGTT
TTGAAGATATCCGTGAATTTGGCGAAGAAATTGCCAAGTTAGAAAAATAA
>PBPRA0849 PM1810, putative nitrate/nitrite response regulator protein
ATGACGTGTTGGAAAATAATGATAGTGGACGATCATCCACTTATGCGACG
TGGTATTGGTCAATTATTAAGCTTTGAACCAGATTTTGAAATGATTGGCG
AAGCAAGCAACGGAACAGATGCTGTTGCTATGGCACATGAAAAAAACCCC
GATCTTATTTTGCTTGATTTGAATATGAAAGGCATGTCTGGTCTTGATAC
GTTAAATGTAATGCGTGCTGAAGGTATTCTTGCCAGCATCGTAGTACTAA
CCGTTTCAGATAGTCGCTCTGATGTGAAAGCGCTAGTCGCTGCAGGTGCT
GATGGGTACTTATTGAAAGATACTGAACCCGATGAATTAATTAGCCTGCT
GAAGCAAGCGTTATGCGGTGGTAAAGCTTACAGCGATATTGTTCGAGAAC
ACTTAGAAAGTAATACAGAGCAAGATTGCCTATTAAGCTTGCTTACTGAT
AGAGAAACTCAAATATTACAAGAAGTTGCTAAAGGCTACCGTAATAAACA
AATTGCAGATGCGCTGTTTATTTCAGAAGCGACCGTTAAAGTACATATGA
AAAGTTTACTGAAAAAACTGCAAGTAAAATCACGTACAGCAGCCACTGTT
TTGTATTTAGAAGCACAAGGGCAGTAA
>PBPRA0939 PSPTO197, Putative flagellar-specific RNA polymerase sigma factor, FliA
GTGAATAAAGCGCTTGCTTATGGGCAATATAAAGAAAGCCCGCAAGCATT
TATCGAGCGCTATTCGTCGCTGGTTAAACGCATTGCGTATCACCTGATGG
GAAGGCTTCCGCCTAGCGTACAAGTCGAAGACTTGATTCAATCAGGTATG
ATTGGTTTGCTAGAAGCACAGCAAAATTATGATCCAACCAAAGGGGCGAG
TTTTGAAACCTTTGCGGGTATTCGTATTCGAGGAGCCATGCTAGATGATA
TTCGTCGTGGTGATTGGGTTCCTCGATCTGTGTATAAGAATAACCGACGC
ATTACCGAGGCCATGGCACAGCTTGAAAATAAGCTAGGTCGCGACCCAAC
AGATACAGAAATTGCCGAACATCTCGAAATGACGCTTGATCAGTACCATC
AAGCATTAAATGATGTTAATTGTGGGCGTCTTGTTGGCATGGATGATCTT
GGTGTGTCAGAAGATGCAGTGACAACCGAGGCGTCACGAGAAGAAAATCT
TCCCTTTCAGGGTGTTGTAGATGATAATTTCCGCCAATCTTTGGCTGATG
CCATTAAAACGCTCCCTGAAAGAGAGGCTTTGGTTCTATCACTTTATTAT
GACGAAGAACTTAATCTTAAAGAGATCGGAGTCGTTGTTGGGGTGAGTGA
GTCCCGAATTTGCCAGATTCATAGTCAGGCTATGCAACGTTTGCGCTCTA
AGCTAACCGCTTGGGCTGCTTAA
>PBPRA0736 R00763, Putative transcriptional regulator, LysR family
ATGAGTAAATTTCCCTCACTAAAACAGCTTCATTACCTTGTTACTTTGTT
TGAAACTCGTCATTTTGGCAAAGCAGCAATAAAGTGTTTTGTTAGCCAAT
CAACCCTGAGTTCAGGCATTCAAAATCTTGAAGAATTATTGAACTGCCAA
TTAATAGAGCGTGATAACAAATCGTTAGTCTTTACCTCTACAGGGGAAGA
GGTCGTGATACGTTCCCGTGAATTACTGGCACGTAGCCAAGATCTAATGG
AATTATCAAGTGGCGCAGGCGATGGTATGGAAGGCCAGCTTCGGGTGGGC
TGTATACCGACTATTGCACCATTCTTGCTGTGTGATTTGGTGCAAGAGGT
GAATCGTATGCACCCTAACTTGAATCTTCTGCTGCGCGAAGACACCACCA
CGAACCTGTTAGCAGCGTTACGTAATGGGGAAATGGATGTGCTGATCTTA
GCTTTGCCTATTGATATCAATAACATGCACAGCAAGATAGTAGGGCGAGA
TGCCTTTAAAATGGTGATCAGCAAAAATCAGGCTGAAAAAGTGAATGTTC
CCCTTCGATATGCAGATTTACCAGATGAATCGGTTTTCTTGTTAGAGAAA
GAACATTGCTTAACGGATCATGCTGTTTCTGCGTGCAAGCTGACCACCAA
AGAAAAAATAAACCCCTTTACTGCCACAAGCTTACACACGTTAGTGCAGA
TGGTAGCGAATGGGTTAGGCACAACCTTTATTCCTCAAATGGCTATCGAT
CATGGCTTATTAGATAATCAAAACTTAGTTGTTATTGAGCCTCCAGGGCA
GGCTGCTTACCGTGAAATTGGTTTAGTGTGGCGCCCGACGTCTAGCCGAA
TCAAGACCTTTAACGGCCTTGCCGATATAGTAGAAGGACTTTTATAG
>PBPRA0645 RS02875, putative response regulator
ATGACACAATTTTCAACCGCGATAATTGCCGACGATGAACCGCTTTTACG
TCATCATTTAAATCGTTCTTTAGCCGAAGTATGGCCAGAACTCGAGATAG
TGGCGAGTGCTGAAAACGGAAAAGAAGCGTGGTTGAAAATCAATGAGCAT
CAACCAGACGTTGTATTTCTTGATATTCGCATGCCAGAATTAGACGGTAT
GTCACTGGCAAATAAACTCAAAAAAATGCCGACCCCACCCTTGATTGTTT
TTATTACCGCGTATGATGAATATGCAGTAAAAGCGTTTGAACAAAGTGCG
GTTGATTACTTATTAAAGCCTATTCCCGAATCACGCTTACAGACTGCCTG
CACTAAATTACAACACCAACTTTCAATGCAGCAATCAGAACAAAAACACC
CATCAAATGCACAATCGCAACCCGATATATCAGCATTAATCCAGCAAATT
CAACAGTTATCGACACAGTCTGAGCCACAATACCTCGCTTGGATAAAAGC
CAGCGCGGGTGATGACATTCATTTAATCGCGATATCCGATGTGCTCTATT
TTAAAGCGGAAGACAAATATGTATCGGTGTTTAAGCGATTACCCAATAAC
GCCGCTCAAGAATATATTATTCGTACATCACTGAAGGAATTGCTTGCACA
GCTCAATCCAGATTCATTTTGGCAAATACATCGTTCAACCGTCGTTAATG
TCGCAACCATTGAAAAAGTGAAGAAAGATCTAGCAGGAAGAATGTCAGTT
ATCATTGATGGGCAAAAGCTGCCTGTTAGCCGAACAGCGCAGAGTTTATT
TAAAGGAATGTAA
>PBPRA0770 SF2737, hypothetical protein
ATGCGCGCTATCCGGGCGTTACACGATGCAGGATTACAGGTACCTCAAGA
TATTTCAGTATTAGGCTTTGATAATGATCCTGCGGATGAGTTCACTATTC
CGAGTTTAACCACAATCATGCTTCCGGTGGAAGAAATGGCATATACCGCA
ATCAAGCAGGCATTGCAGTTAATCGATAAGCAAGAGATCAGCCCTATTGT
TCTATTTTCAGGCAACTTGATCGTTCGCGAATCAGTTGATCATTTGTGA
>PBPRA0721 STY0432, putative DNA-binding response regulator PhoB
ATGGTAAGAAGGATTCTTGTTGTAGAAGACGAAGCACCAATCCGCGAGAT
GTTGTGTTTTGTTCTAGAACAAAAAGGCTATCAACCCATTGAAGCCGAAG
ATTATGATGATGCATTAGAAAAAATTTGCGAACCTTATCCTGAATTGATT
CTAATGGATTGGATGTTACCGGGGGGCTCAGGCATTAACCTGATTAAGCA
CCTAAAGCGTGATGAGCTAACGCGTCAGATCCCTGTAGTAATGTTAACTG
CACGCGGTGAAGAAGAAGATAAAGTGCGTGGCTTAGAAGTGGGTGCTGAT
GATTACATCACCAAACCATTTTCACCGAAAGAGCTAATGGCACGTCTTAA
AGCGGTAATGCGCCGTGTATCACCTACGTCACTGGATGATGTTATTGATG
TACAAGGTTTGAAATTAGATCCTGTGTCGCACCGTGTAACAACGAATGAT
GAACCATTAGACATGGGGCCAACAGAGTTTAAGATGCTGCATTTCTTTAT
GACACACCAAGAGCGTGTATATAGTCGTGAGCAGTTGTTGAACAATGTAT
GGGGTACTAACGTGTATGTTGAAGATCGTACGGTTGATGTACACATTCGT
CGTTTGCGTAAAGCGCTTGAAGCGGGCGGGCACGATAAAATGGTACAAAC
CGTTCGTGGTGCGGGTTACCGGTTCTCGACACGTTTGTAA
>PBPRA0749 STY2790, hypothetical transcriptional regulator
ATGAGATTGACTTCAAAAGGAAGATATGCAGTAACTGCGATGCTTGACGT
CGCTCTGCATTCTCAAGATGGTCCAGTGCCTTTAGCGGATATTTCCGAAC
GACAAGGTATTTCACTGTCTTATTTAGAACAACTTTTCTCACGCCTACGT
AAAGCTGGCCTTGTGGCAAGTGTTCGTGGACCAGGTGGTGGTTATCGCTT
AGGTGAAGATGCTAATGATATCGCTGTAGGTATGGTTATCGCAGCTGTTG
ATGAATCGGTTGATGCTACAAAATGTCATGGTAAAGCTGACTGTCAAGGT
GGTGTACGCTGCTTAACACACACTTTATGGCATGACTTAAGCTCCCGTAT
CAGCGGCTTTTTGAATAACATCACTCTTGGTGAGTTGATGAGAGATAATA
ACGTTCAAGAGATTTCAGGTCGTCAAGATCAAGTTTTAAGCAATAGTTCG
CTAAGAACGTCTTTTGGACATAAAAAAACACACGATAGCACCACTATAGG
TGTCGATGTCCGCTCTTAG
>PBPRA0642 TRPR, putative trp operon repressor
ATGTCAACAACTCCGGAAACGGCTGATTTTACCGAGTGGCAACAGGTCGT
CGATTTACTTCGTCAGGCAGCATTAGAGCAGAAAGATGACGTGATGCTGA
AGCTATTACTTACCCCTGATGAAAGAGAAGCGTTATTGGCTCGCGTTAAT
ATTCTTCATGAGCTAATGAATGGGCAGCGTAGCCAACGAAAAATTAGTGA
ATTGTTAGGGGTTGGGGTAGCAACGATTACCCGAGGATCTAATGAATTAA
AGCATCAGAGCGACGATACAAAAGAATGGCTGGCTTCTTTATTAAAGAAG
CAACAGCAATAA
>PBPRA0657 VPA1044, hypothetical serine/threonine protein kinase
TTGTTTTTACATATATCAATTACATTATTCTCACTAACTCTAGGGGCGAA
CACAAAATACAATAAAAACACTATTGCACAAGAATCTTTTGAATATACTA
TTCTTTCCCAACTACTATTGGAGAAAACTCTCATGGAAAAACAACCTCAT
AAAAATAATAACCAACCTCAACATTCAAAAAACCATGAGATATCAAACCA
AGAAGATGATAATAACAAAACAATTATTAACACATCAAAAGCATCTTCGC
TAAAGAGTACCAAAGGTAACGATAACGGTTCTGGTGACATAAATAGTGAT
CTTTTAAATACAGTAATAAAAGGCAGGTATCGTATTGAATCACGTATTGG
CCATGGTGGTATGTGTGATGTTTATCGTGCAACTGATTTATTGCTTGAGG
CAGCTGGCGCATCAAGCCCTTTCGTCGCAATTAAAGCGCTACAAAATGAG
TTCTTTAATCAACCGGAAGCAGCAAAGGTATTGATAAATGAAGCTCAAAC
AACTCAGAAATTAAGCCACCCCAATATCATCCGTGTTTATGACTTTGGCA
TTGATAAAAAAATATGCTATTTAGTCATGGAATACCTTGATGGTGAAACC
TTAGATGTCGTAATTCAACGCTCTCGACCCCATGGTTTACCCTACAAACG
TGCTATTCCGTTACTCGATCAAATGCTATCTGCATTAAAGTATGCTCACC
AAAACGGTATTGTTCATGCTGATTTAAAACCAAGCAACATCATGCTAACT
CGAGATGGTGAAATTAAAATTTTTGATTTTGGTGTTGCTAAAAAGTTAGG
TGAAAATAACGATCAATACGCTGCAGTACAAGAAGAAACACTATCGGAAC
TCGGTGGTTATACGCCTAATTACGCCTCAATCAATCTGTTAGAGGGCAAC
GACCCTGAAATTAAGGATGATATTTTTGCGTTTAGCTGCATTAGTTATGA
GCTCTGTTCAAGTAAGCATCCTTTTAATCGCAAGCCTGCTGATGTAGCCC
AAAAGGAAAAAATTCAACCAATAAAACCTAAGCATTTAAATTCATCTAAA
TGGCGTATTATTCAACAAGGGCTATCATTATCCGCGAAAGAGCGTATCGG
TGATGCTGCTTTAATCAGCTCCCAATTACATCGCCAATACAAATCAACAG
CCATAATGATCACGGCTATTTTGAGCTTAAACTCTGTGGTCGGGTATGTA
TTGTATCAACAAAAAGAAGCCATTTTAGAACTAACAACCGACAATCGAAA
TTTGCACCAACACATTGAAGAAAGAGCAAAACTCGCAAATCTCAGTGCAC
GTGAAATCATTAAACAGCTCCCTGAATTATCAATTAATGCCCCCATTATT
GCCAGCGGTCTACTAAAAAGTAAGCAACGTGACGTTATTGCATTATACGA
ACACAATATTGACCTTATCTTTAATACACGAGAGAACTATTACCCAAATT
ATTACGCAATAGAAGCTGAATTAGCCGAAGTGAGCAAACTCTACCCTGAC
TCACATGCTATCAATGTACTGAGCACCGACATTTCAACCAGCTGGCAATC
AACTATCGATATTTTATCCAATCAGCTCAATACCGCTCTAGAAAAGGCAC
ATTATCAAATATCTGCCGATAGTAATATCTATGAGCTATTAACTAACCTT
AAAAATTTACGTCATGATATTCAATTTAAACCGACGTCATTGGCTGAAAA
GACCTATGCAACCCAGTATAAAAAAGCTGCTAACCAGCAAGATACTGAAA
CATTAGCAACCTTAATTCAGGTGGGAGAAACTTTCTTCTCAACAACAGAT
GAACATATCGCTCAATTACAGCATACAAAAATTCTACACAAAGCCACTCT
TCAACTGGAACAGTTCAAAGCCGCTAGAGAAGGCGATAAACCCGCCCCCT
TCCCATATGAATCTGCAGAACTTTTATATGCAAATAAATTTGATAAATTT
AACCACCAGCTTAAACGCGTGAACAGCGAATCGAAGTTAGACAAGTTACT
CAAGCAGGTAGATGAAATTGCTAAAGAGTTACCCGCTGATTTTTCATCAC
TCATTACCTTGCGCTTAGCAAGTGCTAATCAGTACCTCGATTTTTCAGAA
AAATGGCAAAAAAAGAGAAAGCAAAGCGCCGCACGTAATGCAATGAAAAA
AGCCACACATCAATTTAACTTAGTTGAAAAAGCACATTCACGATCATAA